Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00910000144592 #10	ENSGT00390000009209 #11	ENSGT00940000157354 #12	ENSGT00390000011804 #13	ENSGT00940000154150 #14	ENSGT00390000004746 #15	ENSGT00940000159347 #16	ENSGT00940000156563.f #17	ENSGT00940000157153.u #18	ENSGT00940000156563.e ##17	ENSGT00940000157153.v.b ##18	ENSGT00940000159059 #19	ENSGT00390000010872 #20	ENSGT00940000162937.b	ENSGT00940000162527 #21	ENSGT00940000162303.b #22	ENSGT00440000033640 #23	ENSGT00940000156211.b #25	ENSGT00390000008538 #26	ENSGT00940000162917 #29	ENSGT00390000002200.a.b #30	ENSGT00940000154635.a #32	ENSGT00950000182992.a.b.b #33	ENSGT00940000154968 #34	ENSGT00940000154824.a #35	ENSGT00390000001688	ENSGT00940000157532 #37	ENSGT00940000156113	ENSGT00390000006658.a.b	ENSGT00390000000521	ENSGT00940000153801.b
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00910000144592 #10	ENSGT00390000009209 #11	ENSGT00940000157354 #12	ENSGT00390000011804 #13	ENSGT00940000154150 #14	ENSGT00390000004746 #15	ENSGT00940000159347 #16	ENSGT00940000156563.f #17	ENSGT00940000157153.u #18	ENSGT00940000156563.e ##17	ENSGT00940000157153.v.b ##18	ENSGT00940000159059 #19	ENSGT00390000010872 #20	ENSGT00940000162937.b	ENSGT00940000162527 #21	ENSGT00940000162303.b #22	ENSGT00440000033640 #23	ENSGT00940000156211.b #25	ENSGT00390000008538 #26	ENSGT00940000162917 #29	ENSGT00390000002200.a.b #30	ENSGT00940000154635.a #32	ENSGT00950000182992.a.b.b #33	ENSGT00940000154968 #34	ENSGT00940000154824.a #35	ENSGT00390000001688	ENSGT00940000157532 #37	ENSGT00940000156113	ENSGT00390000006658.a.b	ENSGT00390000000521	ENSGT00940000153801.b
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00910000144592 #10	ENSGT00390000009209 #11	ENSGT00940000157354 #12	ENSGT00390000011804 #13	ENSGT00940000154150 #14	ENSGT00390000004746 #15	ENSGT00940000159347 #16	ENSGT00940000156563.f #17	ENSGT00940000157153.u #18	ENSGT00940000156563.e ##17	ENSGT00940000157153.v.b ##18	ENSGT00940000159059 #19	ENSGT00390000010872 #20	ENSGT00940000162937.b	ENSGT00940000162527 #21	ENSGT00940000162303.b #22	ENSGT00440000033640 #23	ENSGT00940000156211.b #25	ENSGT00390000008538 #26	ENSGT00530000063786.a.p #27	ENSGT00940000162917 #29	ENSGT00390000002200.a.b #30	ENSGT00940000154635.a #32	ENSGT00950000182992.a.b.b #33	ENSGT00940000154968 #34	ENSGT00940000154824.a #35	ENSGT00390000001688	ENSGT00940000157532 #37	ENSGT00940000156113	ENSGT00390000006658.a.b	ENSGT00390000000521
Common wonbat	MODERN SPECIES	34	ECI2 (ENSVURG00010004465) #7	FAM217A (ENSVURG00010004476) #8	PRPF4B (ENSVURG00010004483) #9	ENSVURG00010004506 #10	PXDC1 (ENSVURG00010004534) #11	SLC22A23 (ENSVURG00010004586) #12	PSMG4 (ENSVURG00010004617) #13	TUBB2A (ENSVURG00010004658) #14	BPHL (ENSVURG00010004675) #15	RIPK1 (ENSVURG00010004694) #16	ENSVURG00010004709 #17	ENSVURG00010004723 #18	IRF4 (ENSVURG00010004732) #19	EXOC2 (ENSVURG00010004782) #20	FOXF2 (ENSVURG00010004836) #21	FOXC1 (ENSVURG00010004905) #22	GMDS (ENSVURG00010004946) #23	ENSVURG00010004983 #24	MYLK4 (ENSVURG00010005033) #25	WRNIP1 (ENSVURG00010005089) #26	ENSVURG00010005123 #27	ENSVURG00010005129 #28	PSKH2 (ENSVURG00010005146) #29	ATP6V0D2 (ENSVURG00010005160) #30	ENSVURG00010005178 #31	WWP1 (ENSVURG00010005187) #32	RMDN1 (ENSVURG00010005240) #33	CPNE3 (ENSVURG00010005254) #34	CNGB3 (ENSVURG00010005271) #35	ENSVURG00010005290 #36	MMP16 (ENSVURG00010005320) #37
koala	MODERN SPECIES	296				SLC22A23 (ENSPCIG00000000903) #12	ENSPCIG00000000888	TUBB2B (ENSPCIG00000022050) #14	BPHL (ENSPCIG00000022052) #15	RIPK1 (ENSPCIG00000022064) #16	ENSPCIG00000012249 #17	ENSPCIG00000022067 ##17	DUSP22 (ENSPCIG00000037144) ##18	IRF4 (ENSPCIG00000022070) #19	EXOC2 (ENSPCIG00000022073) #20	FOXQ1 (ENSPCIG00000007926)	FOXF2 (ENSPCIG00000011639) #21	FOXC1 (ENSPCIG00000035615) #22
Wallaby	MODERN SPECIES	11048																FOXC1 (ENSMEUG00000003279) #22
Tasmanian devil	DUPLICATION
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	1	DNMT3B (ENSSHAG00000005171)	COMMD7 (ENSSHAG00000027760)	NOL4L (ENSSHAG00000030252)	ASXL1 (ENSSHAG00000009893)	KIF3B (ENSSHAG00000010523)	POFUT1 (ENSSHAG00000011051)	PLAGL2 (ENSSHAG00000011174)	TM9SF4 (ENSSHAG00000011314)	HCK (ENSSHAG00000011725)	CCM2L (ENSSHAG00000012041)	XKR7 (ENSSHAG00000032348)	ENSSHAG00000023973	TTLL9 (ENSSHAG00000012511)	ENSSHAG00000012740	ENSSHAG00000012864	ENSSHAG00000022905 #22	MYLK2 (ENSSHAG00000013080)	TPX2 (ENSSHAG00000013326)	BCL2L1 (ENSSHAG00000013693)	ENSSHAG00000000043	ID1 (ENSSHAG00000026472)	HM13 (ENSSHAG00000014206)	ENSSHAG00000014434	ENSSHAG00000023425	ENSSHAG00000028028	ENSSHAG00000025997	ENSSHAG00000021134	ENSSHAG00000002453	SOX12 (ENSSHAG00000020613)	ENSSHAG00000029313	TRIB3 (ENSSHAG00000005175)
Tasmanian devil	MODERN SPECIES		PXDC1 (ENSSHAG00000009869) #11	ENSSHAG00000029443	SLC22A23 (ENSSHAG00000023393) #12	PSMG4 (ENSSHAG00000030196) #13	TUBB2B (ENSSHAG00000007892) #14	TUBB2A (ENSSHAG00000021520) #14	BPHL (ENSSHAG00000014312) #15	RIPK1 (ENSSHAG00000014446) #16	ENSSHAG00000014609 #17	ENSSHAG00000015165 ##18	ENSSHAG00000022026 ##17	IRF4 (ENSSHAG00000015592) #19	EXOC2 (ENSSHAG00000001430) #20	FOXQ1 (ENSSHAG00000012341)	FOXF2 (ENSSHAG00000012720) #21	FOXC1 (ENSSHAG00000023841) #22	GMDS (ENSSHAG00000031057) #23	MYLK4 (ENSSHAG00000026920) #25	ENSSHAG00000014703 #26	ENSSHAG00000025112	ENSSHAG00000031754 #28	ENSSHAG00000022161	ENSSHAG00000009314	ENSSHAG00000028363 #28	PSKH2 (ENSSHAG00000009964) #29	ATP6V0D2 (ENSSHAG00000001125) #30	WWP1 (ENSSHAG00000004236) #32	RMDN1 (ENSSHAG00000005940) #33	CPNE3 (ENSSHAG00000006680) #34	ENSSHAG00000011704	MMP16 (ENSSHAG00000003247) #37