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Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000018596.A.a.a	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00660000097455	ENSGT00730000111360	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00940000164714	ENSGT01050000244841.A.b.b.b	ENSGT00940000153394.d	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000164203	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00950000182994.B.a.a.b
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000018596.A.a.a	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00730000111360	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00940000164714	ENSGT01050000244841.A.b.b.b	ENSGT00940000153394.d	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000164203	ENSGT00940000154875 #32
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000018596.A.a.a	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00730000111360	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT01050000244841.A.b.b.b	ENSGT00940000153394.d	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00940000164203	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35
Theria	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00940000164203	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00940000164203	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37
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Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00910000147297 #8	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00940000164203	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36
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Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00910000147297 #8	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505.b ##10	ENSGT00910000147297 #8	ENSGT00390000001505.a.b #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00910000147634 #33	ENSGT00940000154875.k #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505.a.b #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000164003	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00910000147634 #33	ENSGT00940000154875.k.a #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505.a.b #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00910000147634 #33	ENSGT00940000154875.k.a #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863.g #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505.a.b #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150.c #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00910000147634 #33	ENSGT00940000154875.k.a #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863.g #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37
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Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	656	MST1 (ENSRROG00000027621)	APEH (ENSRROG00000003710)	BSN (ENSRROG00000032997) #7	DAG1 (ENSRROG00000042606) #9	NICN1 (ENSRROG00000035488) #10	AMT (ENSRROG00000031575) #11	TCTA (ENSRROG00000038446) #12	RHOA (ENSRROG00000031894) #14	ENSRROG00000031817 #15	USP4 (ENSRROG00000037639) #16	C3orf62 (ENSRROG00000025217) #17	ENSRROG00000029834 #18	IHO1 (ENSRROG00000039947) #19	C3orf84 (ENSRROG00000044252) #20	KLHDC8B (ENSRROG00000031709) #21	LAMB2 (ENSRROG00000036637) #22	USP19 (ENSRROG00000034752) #23	QARS1 (ENSRROG00000034983) #24	QRICH1 (ENSRROG00000044579) #25	IMPDH2 (ENSRROG00000004338) #26	NDUFAF3 (ENSRROG00000034732) #28	ENSRROG00000038492 #27	DALRD3 (ENSRROG00000038168) #29	WDR6 (ENSRROG00000033452) #30	P4HTM (ENSRROG00000032082) #31	ARIH2 (ENSRROG00000038192) #32	ENSRROG00000035582 #33	ENSRROG00000037514 #34	SLC25A20 (ENSRROG00000032888) #35	PRKAR2A (ENSRROG00000042248) #36	IP6K2 (ENSRROG00000031159) #37
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505.a.b #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00910000147634 #33	ENSGT00940000154875.k.a #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863.g #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505.a.b #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00910000147634 #33	ENSGT00940000154875.k.a #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863.g #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505.a.b #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00910000147634 #33	ENSGT00940000154875.k.a #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863.g #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505.a.b #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00910000147634 #33	ENSGT00940000154875.k.a #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863.g #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37
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Sooty mangabey	MODERN SPECIES	415	APEH (ENSCATG00000031753)	BSN (ENSCATG00000013946) #7	DAG1 (ENSCATG00000034325) #9	NICN1 (ENSCATG00000032696) ##10	AMT (ENSCATG00000040549) #11	TCTA (ENSCATG00000029652) #12	RHOA (ENSCATG00000018066) #14	GPX1 (ENSCATG00000012563) #15	USP4 (ENSCATG00000038050) #16	C3orf62 (ENSCATG00000038289) #17	ENSCATG00000040412 #18	IHO1 (ENSCATG00000030087) #19	C3orf84 (ENSCATG00000044627) #20	KLHDC8B (ENSCATG00000038940) #21	CCDC71 (ENSCATG00000039714)	LAMB2 (ENSCATG00000045276) #22	USP19 (ENSCATG00000041103) #23	QARS1 (ENSCATG00000037275) #24	QRICH1 (ENSCATG00000030540) #25	ENSCATG00000040928 #27	IMPDH2 (ENSCATG00000030723) #26	NDUFAF3 (ENSCATG00000039806) #28	DALRD3 (ENSCATG00000030159) #29	WDR6 (ENSCATG00000029974) #30	P4HTM (ENSCATG00000030517) #31	ARIH2 (ENSCATG00000008575) #32	ENSCATG00000038373 #34	SLC25A20 (ENSCATG00000033267) #35	PRKAR2A (ENSCATG00000040692) #36	IP6K2 (ENSCATG00000029664) #37	NCKIPSD (ENSCATG00000018616)
Olive baboon	MODERN SPECIES	11	HYAL3 (ENSPANG00000019037)	HYAL2 (ENSPANG00000000779)	TUSC2 (ENSPANG00000006145)	RASSF1 (ENSPANG00000016900)	ZMYND10 (ENSPANG00000012439)	NPRL2 (ENSPANG00000009525)	CYB561D2 (ENSPANG00000008258)	TMEM115 (ENSPANG00000026398)	GPX1 (ENSPANG00000029358) #15	USP4 (ENSPANG00000019009) #16	C3orf62 (ENSPANG00000024952) #17	IHO1 (ENSPANG00000010030) #19	C3orf84 (ENSPANG00000010290) #20	KLHDC8B (ENSPANG00000022042) #21	CCDC71 (ENSPANG00000006140)	LAMB2 (ENSPANG00000016084) #22	USP19 (ENSPANG00000008390) #23	QARS1 (ENSPANG00000016987) #24	QRICH1 (ENSPANG00000015576) #25	IMPDH2 (ENSPANG00000007209) #26	NDUFAF3 (ENSPANG00000009002) #28	DALRD3 (ENSPANG00000007062) #29	WDR6 (ENSPANG00000015575) #30	P4HTM (ENSPANG00000022971) #31	ARIH2 (ENSPANG00000016339) #32	SLC25A20 (ENSPANG00000003132) #35	ENSPANG00000051118	PRKAR2A (ENSPANG00000012986) #36	IP6K2 (ENSPANG00000015976) #37	NCKIPSD (ENSPANG00000018329)	CELSR3 (ENSPANG00000013159)
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505.a.b #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00940000154612.n.gb	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875.k.a #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863.g #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505.a.b #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00940000154612.n.gb	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875.k.a #32	ENSGT00940000157863.g #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077
Rhesus	MODERN SPECIES	11	APEH (ENSMMUG00000014540)	BSN (ENSMMUG00000014537) #7	DAG1 (ENSMMUG00000004683) #9	NICN1 (ENSMMUG00000031780) #10	AMT (ENSMMUG00000005452) #11	TCTA (ENSMMUG00000058903) #12	RHOA (ENSMMUG00000047476) #14	GPX1 (ENSMMUG00000012963) #15	C2H3orf62 (ENSMMUG00000049541) #17	USP4 (ENSMMUG00000000822) #16	IHO1 (ENSMMUG00000053526) #19	ENSMMUG00000062159	C2H3orf84 (ENSMMUG00000046787) #20	KLHDC8B (ENSMMUG00000002833) #21	CCDC71 (ENSMMUG00000002836)	LAMB2 (ENSMMUG00000002952) #22	USP19 (ENSMMUG00000002948) #23	QARS1 (ENSMMUG00000002943) #24	QRICH1 (ENSMMUG00000005660) #25	IMPDH2 (ENSMMUG00000005656) #26	NDUFAF3 (ENSMMUG00000058322) #28	DALRD3 (ENSMMUG00000005652) #29	WDR6 (ENSMMUG00000005649) #30	P4HTM (ENSMMUG00000006130) #31	ARIH2 (ENSMMUG00000039597) #32	SLC25A20 (ENSMMUG00000015418) #35	PRKAR2A (ENSMMUG00000000081) #36	IP6K2 (ENSMMUG00000014730) #37	NCKIPSD (ENSMMUG00000014720)	CELSR3 (ENSMMUG00000014707)	SLC26A6 (ENSMMUG00000031754)
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	11	APEH (ENSMFAG00000043600)	BSN (ENSMFAG00000042413) #7	DAG1 (ENSMFAG00000044374) #9	NICN1 (ENSMFAG00000044679) #10	AMT (ENSMFAG00000003688) #11	TCTA (ENSMFAG00000003146) #12	RHOA (ENSMFAG00000036093) #14	GPX1 (ENSMFAG00000035887) #15	C3orf62 (ENSMFAG00000053457) #17	USP4 (ENSMFAG00000043326) #16	IHO1 (ENSMFAG00000043646) #19	ENSMFAG00000058702	C3orf84 (ENSMFAG00000053517) #20	KLHDC8B (ENSMFAG00000044788) #21	CCDC71 (ENSMFAG00000056130)	LAMB2 (ENSMFAG00000030537) #22	USP19 (ENSMFAG00000040355) #23	QARS1 (ENSMFAG00000033478) #24	QRICH1 (ENSMFAG00000030312) #25	IMPDH (ENSMFAG00000044947) #26	ENSMFAG00000061406 #27	NDUFAF3 (ENSMFAG00000046307) #28	DALRD3 (ENSMFAG00000009642) #29	WDR6 (ENSMFAG00000037294) #30	P4HTM (ENSMFAG00000037567) #31	ARIH2 (ENSMFAG00000000139) #32	SLC25A20 (ENSMFAG00000037674) #35	PRKAR2A (ENSMFAG00000045665) #36	IP6K2 (ENSMFAG00000031559) #37	NCKIPSD (ENSMFAG00000031042)	CELSR3 (ENSMFAG00000045461)
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	563	APEH (ENSMNEG00000042039)	BSN (ENSMNEG00000044956) #7	DAG1 (ENSMNEG00000002150) #9	NICN1 (ENSMNEG00000028099) #10	AMT (ENSMNEG00000044694) #11	TCTA (ENSMNEG00000029672) #12	RHOA (ENSMNEG00000042186) #14	GPX1 (ENSMNEG00000043723) #15	USP4 (ENSMNEG00000036652) #16	C3orf62 (ENSMNEG00000041595) #17	ENSMNEG00000030741 #18	IHO1 (ENSMNEG00000041960) #19	ENSMNEG00000040259	C3orf84 (ENSMNEG00000040997) #20	KLHDC8B (ENSMNEG00000033867) #21	LAMB2 (ENSMNEG00000044894) #22	USP19 (ENSMNEG00000033317) #23	QARS1 (ENSMNEG00000035096) #24	QRICH1 (ENSMNEG00000029906) #25	ENSMNEG00000014164 #27	IMPDH2 (ENSMNEG00000036421) #26	NDUFAF3 (ENSMNEG00000033547) #28	DALRD3 (ENSMNEG00000043361) #29	WDR6 (ENSMNEG00000044323) #30	P4HTM (ENSMNEG00000036306) #31	ARIH2 (ENSMNEG00000040123) #32	ENSMNEG00000037742 #34	SLC25A20 (ENSMNEG00000039918) #35	PRKAR2A (ENSMNEG00000029768) #36	IP6K2 (ENSMNEG00000043825) #37	NCKIPSD (ENSMNEG00000020586)
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	14	RNF123 (ENSCSAG00000014794)	MST1 (ENSCSAG00000014934)	APEH (ENSCSAG00000014962)	BSN (ENSCSAG00000014973) #7	DAG1 (ENSCSAG00000014979) #9	NICN1 (ENSCSAG00000014988) #10	AMT (ENSCSAG00000015048) #11	TCTA (ENSCSAG00000015067) #12	RHOA (ENSCSAG00000015074) #14	GPX1 (ENSCSAG00000015079) #15	USP4 (ENSCSAG00000015089) #16	C3orf62 (ENSCSAG00000015100) #17	IHO1 (ENSCSAG00000015114) #19	C3orf84 (ENSCSAG00000015128) #20	KLHDC8B (ENSCSAG00000015133) #21	LAMB2 (ENSCSAG00000015160) #22	USP19 (ENSCSAG00000015179) #23	QARS1 (ENSCSAG00000015198) #24	QRICH1 (ENSCSAG00000015224) #25	IMPDH2 (ENSCSAG00000015243) #26	NDUFAF3 (ENSCSAG00000015235) #28	DALRD3 (ENSCSAG00000015253) #29	WDR6 (ENSCSAG00000015270) #30	P4HTM (ENSCSAG00000015286) #31	ARIH2 (ENSCSAG00000015355) #32	SLC25A20 (ENSCSAG00000015383) #35	PRKAR2A (ENSCSAG00000015391) #36	IP6K2 (ENSCSAG00000015398) #37	NCKIPSD (ENSCSAG00000015406)	CELSR3 (ENSCSAG00000015477)	SLC26A6 (ENSCSAG00000015510)
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505.a.b #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150.b #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875.k.a #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505.a.b #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150.b #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875.k.a #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505.a.b #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150.b.a.a #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875.k.a #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505.a.b #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150.b.a.a #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875.k.a #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725
Pan	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505.a.b #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00980000199418	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150.b.a.a #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875.k.a #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725
Chimpanzee	MODERN SPECIES	16	APEH (ENSPTRG00000014928)	BSN (ENSPTRG00000014927) #7	DAG1 (ENSPTRG00000014926) #9	NICN1 (ENSPTRG00000032494) #10	AMT (ENSPTRG00000014924) #11	TCTA (ENSPTRG00000014923)	RHOA (ENSPTRG00000014922) #14	GPX1 (ENSPTRG00000014921) #15	USP4 (ENSPTRG00000014920) #16	C3H3orf62 (ENSPTRG00000038744) #17	ENSPTRG00000038743 #18	IHO1 (ENSPTRG00000014915) #19	C3H3orf84 (ENSPTRG00000050096) #20	KLHDC8B (ENSPTRG00000014914) #21	CCDC71 (ENSPTRG00000014913)	LAMB2 (ENSPTRG00000014912) #22	USP19 (ENSPTRG00000014911) #23	QARS1 (ENSPTRG00000014910) #24	QRICH1 (ENSPTRG00000023070) #25	ENSPTRG00000052442 #27	IMPDH2 (ENSPTRG00000014908) #26	NDUFAF3 (ENSPTRG00000014907) #28	DALRD3 (ENSPTRG00000043430) #29	WDR6 (ENSPTRG00000014905) #30	P4HTM (ENSPTRG00000014903) #31	ARIH2 (ENSPTRG00000014902) #32	ENSPTRG00000038713 #34	SLC25A20 (ENSPTRG00000014900) #35	PRKAR2A (ENSPTRG00000014898) #36	IP6K2 (ENSPTRG00000014897) #37	NCKIPSD (ENSPTRG00000033842)
Bonobo	MODERN SPECIES	16	RNF123 (ENSPPAG00000033919)	APEH (ENSPPAG00000041077)	BSN (ENSPPAG00000037774) #7	DAG1 (ENSPPAG00000035837) #9	NICN1 (ENSPPAG00000029365) #10	AMT (ENSPPAG00000038969) #11	ENSPPAG00000041505	ENSPPAG00000031493 #14	ENSPPAG00000041840 #15	USP4 (ENSPPAG00000030591) #16	C3orf62 (ENSPPAG00000034256) #17	ENSPPAG00000028818 #18	IHO1 (ENSPPAG00000041728) #19	C3orf84 (ENSPPAG00000028447) #20	KLHDC8B (ENSPPAG00000043715) #21	LAMB2 (ENSPPAG00000034500) #22	USP19 (ENSPPAG00000042808) #23	QRICH1 (ENSPPAG00000028104) #25	ENSPPAG00000040709 #27	IMPDH2 (ENSPPAG00000028755) #26	NDUFAF3 (ENSPPAG00000037616) #28	DALRD3 (ENSPPAG00000037268) #29	WDR6 (ENSPPAG00000043035) #30	P4HTM (ENSPPAG00000034922) #31	ARIH2 (ENSPPAG00000037928) #32	ENSPPAG00000018979 #34	SLC25A20 (ENSPPAG00000032464) #35	PRKAR2A (ENSPPAG00000032093) #36	IP6K2 (ENSPPAG00000027364) #37	NCKIPSD (ENSPPAG00000011360)	CELSR3 (ENSPPAG00000031153)
Human	MODERN SPECIES	15	BSN (ENSG00000164061) #7	DAG1 (ENSG00000173402) #9	NICN1 (ENSG00000145029) #10	AMT (ENSG00000145020) #11	ENSG00000283189	TCTA (ENSG00000145022) #12	RHOA (ENSG00000067560) #14	ENSG00000290318	GPX1 (ENSG00000233276) #15	USP4 (ENSG00000114316) #16	C3orf62 (ENSG00000188315) #17	IHO1 (ENSG00000173421) #19	C3orf84 (ENSG00000236980) #20	KLHDC8B (ENSG00000185909) #21	CCDC71 (ENSG00000177352)	LAMB2 (ENSG00000172037) #22	USP19 (ENSG00000172046) #23	QARS1 (ENSG00000172053) #24	QRICH1 (ENSG00000198218) #25	ENSG00000290315	IMPDH2 (ENSG00000178035) #26	NDUFAF3 (ENSG00000178057) #28	DALRD3 (ENSG00000178149) #29	WDR6 (ENSG00000178252) #30	P4HTM (ENSG00000178467) #31	ARIH2 (ENSG00000177479) #32	SLC25A20 (ENSG00000178537) #35	PRKAR2A (ENSG00000114302) #36	IP6K2 (ENSG00000068745) #37	NCKIPSD (ENSG00000213672)	CELSR3 (ENSG00000008300)
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Gibbon	MODERN SPECIES	19	MST1 (ENSNLEG00000006866)	APEH (ENSNLEG00000006859)	BSN (ENSNLEG00000006857) #7	DAG1 (ENSNLEG00000006853) #9	NICN1 (ENSNLEG00000006851) #10	AMT (ENSNLEG00000029101) #11	ENSNLEG00000006843	RHOA (ENSNLEG00000006839) #14	ENSNLEG00000028108 #15	USP4 (ENSNLEG00000006829) #16	C3orf62 (ENSNLEG00000006828) #17	ENSNLEG00000006827 #18	IHO1 (ENSNLEG00000006825) #19	C3orf84 (ENSNLEG00000006823) #20	KLHDC8B (ENSNLEG00000006819) #21	LAMB2 (ENSNLEG00000006812) #22	USP19 (ENSNLEG00000006789) #23	ENSNLEG00000006772 #24	QRICH1 (ENSNLEG00000006752) #25	IMPDH2 (ENSNLEG00000006743) #26	ENSNLEG00000027818 #27	NDUFAF3 (ENSNLEG00000006739) #28	ENSNLEG00000006730 #29	WDR6 (ENSNLEG00000006728) #30	P4HTM (ENSNLEG00000006725) #31	ARIH2 (ENSNLEG00000006710) #32	SLC25A20 (ENSNLEG00000028002) #35	PRKAR2A (ENSNLEG00000030036) #36	IP6K2 (ENSNLEG00000006680) #37	NCKIPSD (ENSNLEG00000006672)	CELSR3 (ENSNLEG00000006656)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505.b ##10	ENSGT00910000147297 #8	ENSGT00390000001505.a.b #10	ENSGT00390000001505.a.a ##10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150.f #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972.e #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00910000147634 #33	ENSGT00940000154875.k #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836.h #36	ENSGT00940000154836.g.b #36
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Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00940000153783.b.b.c.b.d.a	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00910000147297 #8	ENSGT00390000001505.a.b #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150.f.b #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972.e #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00910000147634 #33	ENSGT00940000154875.k #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836.h #36	ENSGT00940000154836.g.b #36
Capuchin	MODERN SPECIES		ENSCCAG00000031188	DAG1 (ENSCCAG00000033794) #9	ENSCCAG00000037470	ENSCCAG00000027946 ##10	AMT (ENSCCAG00000030285) #11	ENSCCAG00000037011	TCTA (ENSCCAG00000020886) #12	ENSCCAG00000029968	ENSCCAG00000035444 #15	USP4 (ENSCCAG00000030853) #16	C3orf62 (ENSCCAG00000025866) #17	IHO1 (ENSCCAG00000030209) #19	C3orf84 (ENSCCAG00000036643) #20	KLHDC8B (ENSCCAG00000028139) #21	CCDC71 (ENSCCAG00000027094)	LAMB2 (ENSCCAG00000035337) #22	USP19 (ENSCCAG00000035273) #23	ENSCCAG00000037772 #24	QRICH1 (ENSCCAG00000037655) #25	IMPDH2 (ENSCCAG00000037618) #26	ENSCCAG00000025458 #27	NDUFAF3 (ENSCCAG00000030039) #28	DALRD3 (ENSCCAG00000033230) #29	WDR6 (ENSCCAG00000023576) #30	P4HTM (ENSCCAG00000025551) #31	ENSCCAG00000027394 #32	ENSCCAG00000023903	SLC25A20 (ENSCCAG00000022247) #35	ENSCCAG00000019997	ENSCCAG00000033868 #36	IP6K2 (ENSCCAG00000030328) #37
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	127	BSN (ENSSBOG00000027936) #7	ENSSBOG00000028754	DAG1 (ENSSBOG00000033298) #9	ENSSBOG00000033393 #8	NICN1 (ENSSBOG00000034672) #10	ENSSBOG00000027333 #11	TCTA (ENSSBOG00000027277) #12	RHOA (ENSSBOG00000035785) #14	GPX1 (ENSSBOG00000027004) #15	USP4 (ENSSBOG00000030849) #16	C3orf62 (ENSSBOG00000018327) #17	IHO1 (ENSSBOG00000021171) #19	C3orf84 (ENSSBOG00000030757) #20	KLHDC8B (ENSSBOG00000028793) #21	CCDC71 (ENSSBOG00000017842)	LAMB2 (ENSSBOG00000022847) #22	USP19 (ENSSBOG00000026675) #23	ENSSBOG00000025786 #24	QRICH1 (ENSSBOG00000019070) #25	IMPDH2 (ENSSBOG00000033937) #26	ENSSBOG00000016233 #27	NDUFAF3 (ENSSBOG00000020650) #28	DALRD3 (ENSSBOG00000019867) #29	WDR6 (ENSSBOG00000033806) #30	P4HTM (ENSSBOG00000031541) #31	ENSSBOG00000017416 #33	ARIH2 (ENSSBOG00000026411) #32	ENSSBOG00000014684 #34	SLC25A20 (ENSSBOG00000033387) #35	ENSSBOG00000028841 #36	ENSSBOG00000034262
Marmoset	MODERN SPECIES	6	RNF123 (ENSCJAG00000004025)	ENSCJAG00000065044	BSN (ENSCJAG00000004003) #7	DAG1 (ENSCJAG00000065054) #9	NICN1 (ENSCJAG00000003992) ##10	AMT (ENSCJAG00000003962) #11	TCTA (ENSCJAG00000070394) #12	ENSCJAG00000013657 #14	Gpx-1 (ENSCJAG00000070831) #15	USP4 (ENSCJAG00000003788) #16	C3orf62 (ENSCJAG00000003785) #17	IHO1 (ENSCJAG00000003765) #19	C3orf84 (ENSCJAG00000038262) #20	KLHDC8B (ENSCJAG00000003745) #21	CCDC71 (ENSCJAG00000003741)	LAMB2 (ENSCJAG00000003674) #22	USP19 (ENSCJAG00000003571) #23	QARS1 (ENSCJAG00000003457) #24	QRICH1 (ENSCJAG00000003440) #25	IMPDH2 (ENSCJAG00000003400) #26	NDUFAF3 (ENSCJAG00000003387) #28	DALRD3 (ENSCJAG00000003370) #29	WDR6 (ENSCJAG00000003354) #30	P4HTM (ENSCJAG00000003342) #31	ARIH2 (ENSCJAG00000003305) #32	ENSCJAG00000018377	SLC25A20 (ENSCJAG00000003285) #35	PRKAR2A (ENSCJAG00000003255) #36	IP6K2 (ENSCJAG00000003247) #37	NCKIPSD (ENSCJAG00000003195)	CELSR3 (ENSCJAG00000003177)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	1216	ENSANAG00000022804	BSN (ENSANAG00000037586) #7	ENSANAG00000035024 #8	DAG1 (ENSANAG00000026927) #9	ENSANAG00000031541	ENSANAG00000030342 ##10	AMT (ENSANAG00000027123) #11	TCTA (ENSANAG00000031226) #12	ENSANAG00000035201 #14	USP4 (ENSANAG00000027506) #16	C3orf62 (ENSANAG00000033847) #17	IHO1 (ENSANAG00000036680) #19	C3orf84 (ENSANAG00000023302) #20	KLHDC8B (ENSANAG00000026478) #21	CCDC71 (ENSANAG00000005027)	LAMB2 (ENSANAG00000020048) #22	USP19 (ENSANAG00000037255) #23	ENSANAG00000031868 #24	QRICH1 (ENSANAG00000037747) #25	ENSANAG00000019030 #27	IMPDH2 (ENSANAG00000025168) #26	NDUFAF3 (ENSANAG00000022893) #28	DALRD3 (ENSANAG00000030773) #29	WDR6 (ENSANAG00000031798) #30	P4HTM (ENSANAG00000029556) #31	ARIH2 (ENSANAG00000037602) #32	ENSANAG00000026659 #34	SLC25A20 (ENSANAG00000031990) #35	ENSANAG00000035935 #36	IP6K2 (ENSANAG00000027314) #37	NCKIPSD (ENSANAG00000021174)
Tarsier	MODERN SPECIES	6165												ENSTSYG00000035179	CUNH3orf84 (ENSTSYG00000036075) #20	KLHDC8B (ENSTSYG00000027898) #21	CCDC71 (ENSTSYG00000030196)	LAMB2 (ENSTSYG00000008546) #22	USP19 (ENSTSYG00000008541) #23	QARS1 (ENSTSYG00000008462) #24	QRICH1 (ENSTSYG00000013448) #25	IMPDH2 (ENSTSYG00000013437) #26	ENSTSYG00000031492 #27	NDUFAF3 (ENSTSYG00000013419) #28	DALRD3 (ENSTSYG00000029736) #29	WDR6 (ENSTSYG00000032831) #30	P4HTM (ENSTSYG00000012815) #31	ARIH2 (ENSTSYG00000004337) #32	SLC25A20 (ENSTSYG00000014696) #35	PRKAR2A (ENSTSYG00000014694) #36	IP6K2 (ENSTSYG00000002982) #37	NCKIPSD (ENSTSYG00000013422)	ENSTSYG00000032751
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077	ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00550000074807.d	ENSGT00940000163080	ENSGT00940000162391	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00980000198877	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00550000074807.d	ENSGT00940000163080	ENSGT00940000162391	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	50	RNF123 (ENSPCOG00000013664)	MST1 (ENSPCOG00000005348)	APEH (ENSPCOG00000028013)	BSN (ENSPCOG00000025030) #7	DAG1 (ENSPCOG00000023915) #9	NICN1 (ENSPCOG00000021271) #10	AMT (ENSPCOG00000016597) #11	TCTA (ENSPCOG00000018175) #12	RHOA (ENSPCOG00000014495) #14	GPX1 (ENSPCOG00000023726) #15	USP4 (ENSPCOG00000023286) #16	C3orf62 (ENSPCOG00000027475) #17	ENSPCOG00000023086	C3orf84 (ENSPCOG00000019596) #20	KLHDC8B (ENSPCOG00000005585) #21	LAMB2 (ENSPCOG00000003248) #22	USP19 (ENSPCOG00000021600) #23	QARS1 (ENSPCOG00000022610) #24	QRICH1 (ENSPCOG00000028140) #25	IMPDH2 (ENSPCOG00000027001) #26	NDUFAF3 (ENSPCOG00000014463) #28	DALRD3 (ENSPCOG00000027419) #29	WDR6 (ENSPCOG00000018888) #30	P4HTM (ENSPCOG00000006504) #31	ARIH2 (ENSPCOG00000019150) #32	SLC25A20 (ENSPCOG00000028137) #35	ENSPCOG00000028707	PRKAR2A (ENSPCOG00000028683) #36	IP6K2 (ENSPCOG00000021856) #37	NCKIPSD (ENSPCOG00000008716)	CELSR3 (ENSPCOG00000025025)
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	949				NICN1 (ENSPSMG00000026013) #10	AMT (ENSPSMG00000026012) #11	TCTA (ENSPSMG00000026011) #12	RHOA (ENSPSMG00000026009) #14	GPX1 (ENSPSMG00000026008) #15	ENSPSMG00000026006	USP4 (ENSPSMG00000026005) #16	C3orf62 (ENSPSMG00000026004) #17	ENSPSMG00000026003	C3orf84 (ENSPSMG00000026002) #20	KLHDC8B (ENSPSMG00000026001) #21	CCDC71 (ENSPSMG00000026000)	LAMB2 (ENSPSMG00000025999) #22	USP19 (ENSPSMG00000025998) #23	QARS1 (ENSPSMG00000025997) #24	QRICH1 (ENSPSMG00000025996) #25	NDUFAF3 (ENSPSMG00000025995) #28	DALRD3 (ENSPSMG00000025993) #29	WDR6 (ENSPSMG00000025992) #30	P4HTM (ENSPSMG00000025991) #31	ARIH2 (ENSPSMG00000025990) #32	SLC25A20 (ENSPSMG00000025989) #35	PRKAR2A (ENSPSMG00000025988) #36	IP6K2 (ENSPSMG00000025987) #37	NCKIPSD (ENSPSMG00000025986)	CELSR3 (ENSPSMG00000025984)	SLC26A6 (ENSPSMG00000025983)	TMEM89 (ENSPSMG00000025982)
Mouse lemur	MODERN SPECIES	5	MST1 (ENSMICG00000041447)	APEH (ENSMICG00000010662)	BSN (ENSMICG00000010621) #7	DAG1 (ENSMICG00000010618) #9	NICN1 (ENSMICG00000001261) #10	AMT (ENSMICG00000001251) #11	TCTA (ENSMICG00000043725) #12	RHOA (ENSMICG00000032818) #14	GPX1 (ENSMICG00000034931) #15	USP4 (ENSMICG00000043936) #16	C3orf62 (ENSMICG00000044230) #17	IHO1 (ENSMICG00000029553) #19	C3orf84 (ENSMICG00000026553) #20	KLHDC8B (ENSMICG00000007972) #21	CCDC71 (ENSMICG00000034099)	LAMB2 (ENSMICG00000007913) #22	USP19 (ENSMICG00000007895) #23	QARS1 (ENSMICG00000007885) #24	QRICH1 (ENSMICG00000028751) #25	IMPDH2 (ENSMICG00000007866) #26	NDUFAF3 (ENSMICG00000007862) #28	DALRD3 (ENSMICG00000007858) #29	WDR6 (ENSMICG00000007852) #30	P4HTM (ENSMICG00000007843) #31	ARIH2 (ENSMICG00000007837) #32	SLC25A20 (ENSMICG00000005028) #35	ENSMICG00000032432	PRKAR2A (ENSMICG00000001067) #36	ENSMICG00000034139	IP6K2 (ENSMICG00000014451) #37	NCKIPSD (ENSMICG00000030986)
Bushbaby	MODERN SPECIES	294	APEH (ENSOGAG00000011788)	BSN (ENSOGAG00000025887) #7	DAG1 (ENSOGAG00000014849) #9	NICN1 (ENSOGAG00000001885) #10	AMT (ENSOGAG00000001884) #11	TCTA (ENSOGAG00000001882) #12	ENSOGAG00000028489	GPX1 (ENSOGAG00000001880) #15	USP4 (ENSOGAG00000001877) #16	C3orf62 (ENSOGAG00000001876) #17	ENSOGAG00000029272	IHO1 (ENSOGAG00000029823) #19	ENSOGAG00000034043	KLHDC8B (ENSOGAG00000003967) #21	CCDC71 (ENSOGAG00000015471)	LAMB2 (ENSOGAG00000003963) #22	USP19 (ENSOGAG00000003957) #23	QARS1 (ENSOGAG00000003954) #24	QRICH1 (ENSOGAG00000033740) #25	IMPDH2 (ENSOGAG00000003945) #26	NDUFAF3 (ENSOGAG00000003941) #28	DALRD3 (ENSOGAG00000003937) #29	WDR6 (ENSOGAG00000003935) #30	P4HTM (ENSOGAG00000003931) #31	ARIH2 (ENSOGAG00000002263) #32	SLC25A20 (ENSOGAG00000001847) #35	PRKAR2A (ENSOGAG00000006822) #36	IP6K2 (ENSOGAG00000006819) #37	NCKIPSD (ENSOGAG00000031535)	CELSR3 (ENSOGAG00000006801)	SLC26A6 (ENSOGAG00000032822)
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Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077
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Guinea pig	MODERN SPECIES	8	RNF123 (ENSCPOG00000011432)	MST1 (ENSCPOG00000011422)	APEH (ENSCPOG00000011416)	BSN (ENSCPOG00000040726) #7	DAG1 (ENSCPOG00000034832) #9	NICN1 (ENSCPOG00000019324) #10	AMT (ENSCPOG00000023233) #11	TCTA (ENSCPOG00000035311) #12	RHOA (ENSCPOG00000014073) #14	USP4 (ENSCPOG00000010272) #16	C3orf62 (ENSCPOG00000026439) #17	IHO1 (ENSCPOG00000013672) #19	C3orf84 (ENSCPOG00000024951) #20	KLHDC8B (ENSCPOG00000031477) #21	CCDC71 (ENSCPOG00000010009)	LAMB2 (ENSCPOG00000009993) #22	USP19 (ENSCPOG00000009975) #23	QARS1 (ENSCPOG00000009967) #24	ENSCPOG00000009958 #25	IMPDH2 (ENSCPOG00000009955) #26	NDUFAF3 (ENSCPOG00000009951) #28	DALRD3 (ENSCPOG00000022699) #29	WDR6 (ENSCPOG00000000708) #30	P4HTM (ENSCPOG00000008347) #31	ARIH2 (ENSCPOG00000008337) #32	ENSCPOG00000012248	SLC25A20 (ENSCPOG00000009309) #35	PRKAR2A (ENSCPOG00000001218) #36	IP6K2 (ENSCPOG00000007856) #37	NCKIPSD (ENSCPOG00000020345)	CELSR3 (ENSCPOG00000034949)
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	63	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000164003	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836.i.b #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077	ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b
Degu	MODERN SPECIES	49	MST1 (ENSODEG00000018247)	APEH (ENSODEG00000018298)	BSN (ENSODEG00000018261) #7	DAG1 (ENSODEG00000018370) #9	ENSODEG00000018172 #10	ENSODEG00000018166 #11	TCTA (ENSODEG00000018418) #12	ENSODEG00000018416	GPX1 (ENSODEG00000018240) #15	USP4 (ENSODEG00000018126) #16	C3orf62 (ENSODEG00000018275) #17	IHO1 (ENSODEG00000018168) #19	C3orf84 (ENSODEG00000018152) #20	KLHDC8B (ENSODEG00000018149) #21	CCDC71 (ENSODEG00000018170)	LAMB2 (ENSODEG00000018161) #22	USP19 (ENSODEG00000018209) #23	ENSODEG00000018381 #24	QRICH1 (ENSODEG00000018211) #25	ENSODEG00000018332 #26	NDUFAF3 (ENSODEG00000018257) #28	DALRD3 (ENSODEG00000018251) #29	WDR6 (ENSODEG00000018229) #30	P4HTM (ENSODEG00000018157) #31	ARIH2 (ENSODEG00000018288) #32	SLC25A20 (ENSODEG00000018156) #35	ENSODEG00000018180 #36	IP6K2 (ENSODEG00000018212) #37	NCKIPSD (ENSODEG00000018165)	CELSR3 (ENSODEG00000018319)	SLC26A6 (ENSODEG00000018141)
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	239	GMPPB (ENSCLAG00000009088)	AMIGO3 (ENSCLAG00000018108)	RNF123 (ENSCLAG00000008303)	MST1 (ENSCLAG00000010949)	APEH (ENSCLAG00000006987)	BSN (ENSCLAG00000006929) #7	DAG1 (ENSCLAG00000009430) #9	NICN1 (ENSCLAG00000007906) #10	AMT (ENSCLAG00000007577) #11	TCTA (ENSCLAG00000009163) #12	RHOA (ENSCLAG00000007531) #14	USP4 (ENSCLAG00000006925) #16	C3orf84 (ENSCLAG00000006773) #20	KLHDC8B (ENSCLAG00000007333) #21	CCDC71 (ENSCLAG00000006770)	LAMB2 (ENSCLAG00000012420) #22	USP19 (ENSCLAG00000009469) #23	QARS1 (ENSCLAG00000009982) #24	QRICH1 (ENSCLAG00000011484) #25	NDUFAF3 (ENSCLAG00000010367) #28	IMPDH2 (ENSCLAG00000010876) #26	DALRD3 (ENSCLAG00000010911) #29	WDR6 (ENSCLAG00000013367) #30	P4HTM (ENSCLAG00000012640) #31	ARIH2 (ENSCLAG00000007056) #32	SLC25A20 (ENSCLAG00000006666) #35	PRKAR2A (ENSCLAG00000013198) #36	IP6K2 (ENSCLAG00000016270) #37	NCKIPSD (ENSCLAG00000010729)	CELSR3 (ENSCLAG00000015824)	SLC26A6 (ENSCLAG00000011172)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	27	MST1 (ENSHGLG00000014647)	BSN (ENSHGLG00000014582) #7	DAG1 (ENSHGLG00000035745) #9	ENSHGLG00000049998	ENSHGLG00000043499	NICN1 (ENSHGLG00000014501) #10	AMT (ENSHGLG00000019416) #11	TCTA (ENSHGLG00000014711) #12	RHOA (ENSHGLG00000037920) #14	GPX1 (ENSHGLG00000014333) #15	USP4 (ENSHGLG00000014262) #16	C3orf62 (ENSHGLG00000032235) #17	CCDC36 (ENSHGLG00000045203) #19	C3orf84 (ENSHGLG00000047605) #20	KLHDC8B (ENSHGLG00000012255) #21	LAMB2 (ENSHGLG00000014718) #22	USP19 (ENSHGLG00000014432) #23	QARS1 (ENSHGLG00000014071) #24	QRICH1 (ENSHGLG00000013818) #25	IMPDH2 (ENSHGLG00000013375) #26	ENSHGLG00000012830 #28	ENSHGLG00000037627 #29	ENSHGLG00000044769 #30	P4HTM (ENSHGLG00000012350) #31	ENSHGLG00000012140 #32	Ctnnb1 (ENSHGLG00000014308)	ENSHGLG00000013251	ENSHGLG00000044049	TRAK1 (ENSHGLG00000012903)	CCK (ENSHGLG00000044393)	ENSHGLG00000012412
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077	ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077	ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077	ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	26	AMIGO3 (ENSUPAG00010022704)	MST1 (ENSUPAG00010022707)	APEH (ENSUPAG00010022710)	BSN (ENSUPAG00010022714) #7	DAG1 (ENSUPAG00010022721) #9	NICN1 (ENSUPAG00010022727) #10	AMT (ENSUPAG00010022728) #11	TCTA (ENSUPAG00010022731) #12	RHOA (ENSUPAG00010022734) #14	GPX1 (ENSUPAG00010022736) #15	USP4 (ENSUPAG00010022743) #16	IHO1 (ENSUPAG00010022748) #19	C3orf84 (ENSUPAG00010022750) #20	KLHDC8B (ENSUPAG00010022751) #21	CCDC71 (ENSUPAG00010022756)	LAMB2 (ENSUPAG00010022760) #22	USP19 (ENSUPAG00010022767) #23	QARS1 (ENSUPAG00010022784) #24	QRICH1 (ENSUPAG00010022787) #25	IMPDH2 (ENSUPAG00010022794) #26	NDUFAF3 (ENSUPAG00010022795) #28	DALRD3 (ENSUPAG00010022797) #29	WDR6 (ENSUPAG00010022801) #30	P4HTM (ENSUPAG00010022803) #31	ARIH2 (ENSUPAG00010022807) #32	SLC25A20 (ENSUPAG00010022813) #35	PRKAR2A (ENSUPAG00010022817) #36	ENSUPAG00010022820	IP6K2 (ENSUPAG00010022821) #37	NCKIPSD (ENSUPAG00010022823)	CELSR3 (ENSUPAG00010000011)
Squirrel	MODERN SPECIES	129	APEH (ENSSTOG00000013676)	BSN (ENSSTOG00000024936) #7	DAG1 (ENSSTOG00000023610) #9	NICN1 (ENSSTOG00000012434) #10	ENSSTOG00000012428 #11	TCTA (ENSSTOG00000011135) #12	RHOA (ENSSTOG00000004561) #14	GPX1 (ENSSTOG00000025544) #15	USP4 (ENSSTOG00000011315) #16	C3orf62 (ENSSTOG00000011308) #17	IHO1 (ENSSTOG00000011292) #19	C3orf84 (ENSSTOG00000025817) #20	KLHDC8B (ENSSTOG00000025019) #21	CCDC71 (ENSSTOG00000025759)	ENSSTOG00000031228	LAMB2 (ENSSTOG00000001866) #22	USP19 (ENSSTOG00000001848) #23	QARS1 (ENSSTOG00000001822) #24	QRICH1 (ENSSTOG00000001813) #25	NDUFAF3 (ENSSTOG00000001799) #28	IMPDH2 (ENSSTOG00000001805) #26	DALRD3 (ENSSTOG00000001789) #29	WDR6 (ENSSTOG00000001782) #30	P4HTM (ENSSTOG00000001776) #31	ARIH2 (ENSSTOG00000001766) #32	SLC25A20 (ENSSTOG00000003327) #35	PRKAR2A (ENSSTOG00000003312) #36	IP6K2 (ENSSTOG00000003496) #37	NCKIPSD (ENSSTOG00000023487)	CELSR3 (ENSSTOG00000028364)	SLC26A6 (ENSSTOG00000027369)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	19	MST1 (ENSMMMG00000004828)	APEH (ENSMMMG00000004875)	BSN (ENSMMMG00000004916) #7	DAG1 (ENSMMMG00000004993) #9	NICN1 (ENSMMMG00000005004) #10	AMT (ENSMMMG00000005018) #11	ENSMMMG00000005039 #12	RHOA (ENSMMMG00000005067) #14	GPX1 (ENSMMMG00000005079) #15	USP4 (ENSMMMG00000005114) #16	C3orf62 (ENSMMMG00000005162) #17	IHO1 (ENSMMMG00000005177) #19	C3orf84 (ENSMMMG00000005193) #20	KLHDC8B (ENSMMMG00000005206) #21	CCDC71 (ENSMMMG00000005226)	LAMB2 (ENSMMMG00000005235) #22	USP19 (ENSMMMG00000005310) #23	QARS1 (ENSMMMG00000005497) #24	QRICH1 (ENSMMMG00000005623) #25	IMPDH2 (ENSMMMG00000005658) #26	NDUFAF3 (ENSMMMG00000005669) #28	DALRD3 (ENSMMMG00000005693) #29	WDR6 (ENSMMMG00000005711) #30	P4HTM (ENSMMMG00000005724) #31	ARIH2 (ENSMMMG00000005739) #32	SLC25A20 (ENSMMMG00000005774) #35	PRKAR2A (ENSMMMG00000005788) #36	IP6K2 (ENSMMMG00000005847) #37	NCKIPSD (ENSMMMG00000005877)	CELSR3 (ENSMMMG00000005898)	SLC26A6 (ENSMMMG00000006052)
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077
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Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077
Prairie vole	MODERN SPECIES	13	Mst1 (ENSMOCG00000006858)	Apeh (ENSMOCG00000016042)	Bsn (ENSMOCG00000009384) #7	Dag1 (ENSMOCG00000002328) #9	Nicn1 (ENSMOCG00000022631) #10	Amt (ENSMOCG00000009959) #11	Tcta (ENSMOCG00000012055) #12	Rhoa (ENSMOCG00000015603) #14	Gpx1 (ENSMOCG00000017016) #15	Usp4 (ENSMOCG00000022148) #16	1700102P08Rik (ENSMOCG00000010012) #17	Iho1 (ENSMOCG00000018017) #19	BC048562 (ENSMOCG00000019645) #20	Klhdc8b (ENSMOCG00000020213) #21	Ccdc71 (ENSMOCG00000003307)	Lamb2 (ENSMOCG00000020853) #22	ENSMOCG00000015175	Usp19 (ENSMOCG00000017005) #23	Qars (ENSMOCG00000019363) #24	Qrich1 (ENSMOCG00000005427) #25	Impdh2 (ENSMOCG00000012803) #26	ENSMOCG00000018646 #28	Dalrd3 (ENSMOCG00000000771) #29	Wdr6 (ENSMOCG00000014975) #30	P4htm (ENSMOCG00000022327) #31	Arih2 (ENSMOCG00000016530) #32	Slc25a20 (ENSMOCG00000022798) #35	Prkar2a (ENSMOCG00000012678) #36	IP6K2 (ENSMOCG00000007892) #37	NCKIPSD (ENSMOCG00000021027)	Celsr3 (ENSMOCG00000014537)
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Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	18	Mst1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032676)	Apeh (MGP_CAROLIEiJ_G0032677)	Bsn (MGP_CAROLIEiJ_G0032678) #7	Dag1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032679) #9	Nicn1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032680) #10	Amt (MGP_CAROLIEiJ_G0032681) #11	Tcta (MGP_CAROLIEiJ_G0032682) #12	MGP_CAROLIEiJ_G0032683	MGP_CAROLIEiJ_G0032684 #15	Usp4 (MGP_CAROLIEiJ_G0032685) #16	1700102P08Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0032686) #17	Iho1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032687) #19	BC048562 (MGP_CAROLIEiJ_G0032688) #20	Klhdc8b (MGP_CAROLIEiJ_G0032689) #21	Ccdc71 (MGP_CAROLIEiJ_G0032690)	Lamb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0032691) #22	MGP_CAROLIEiJ_G0032692	Qars (MGP_CAROLIEiJ_G0032693) #24	Qrich1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032694) #25	Impdh2 (MGP_CAROLIEiJ_G0032695) #26	MGP_CAROLIEiJ_G0032696	Dalrd3 (MGP_CAROLIEiJ_G0032697) #29	Wdr6 (MGP_CAROLIEiJ_G0032698) #30	P4htm (MGP_CAROLIEiJ_G0032699) #31	Arih2 (MGP_CAROLIEiJ_G0032700) #32	Slc25a20 (MGP_CAROLIEiJ_G0032701) #35	Prkar2a (MGP_CAROLIEiJ_G0032702) #36	Ip6k2 (MGP_CAROLIEiJ_G0032703) #37	Nckipsd (MGP_CAROLIEiJ_G0032704)	Celsr3 (MGP_CAROLIEiJ_G0032705)	Slc26a6 (MGP_CAROLIEiJ_G0032706)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	1	Mst1 (MGP_PahariEiJ_G0015544)	Apeh (MGP_PahariEiJ_G0015545)	Bsn (MGP_PahariEiJ_G0015546) #7	Dag1 (MGP_PahariEiJ_G0015547) #9	Nicn1 (MGP_PahariEiJ_G0015548) #10	Amt (MGP_PahariEiJ_G0015549) #11	MGP_PahariEiJ_G0015550 #12	Rhoa (MGP_PahariEiJ_G0015551) #14	MGP_PahariEiJ_G0015552 #15	Usp4 (MGP_PahariEiJ_G0015553) #16	1700102P08Rik (MGP_PahariEiJ_G0015554) #17	Iho1 (MGP_PahariEiJ_G0015555) #19	BC048562 (MGP_PahariEiJ_G0015556) #20	Klhdc8b (MGP_PahariEiJ_G0015557) #21	Ccdc71 (MGP_PahariEiJ_G0015558)	MGP_PahariEiJ_G0015559 #22	Usp19 (MGP_PahariEiJ_G0015560) #23	Qars (MGP_PahariEiJ_G0015561) #24	Qrich1 (MGP_PahariEiJ_G0015562) #25	Impdh2 (MGP_PahariEiJ_G0015563) #26	Ndufaf3 (MGP_PahariEiJ_G0015564) #28	Dalrd3 (MGP_PahariEiJ_G0015565) #29	Wdr6 (MGP_PahariEiJ_G0015566) #30	P4htm (MGP_PahariEiJ_G0015567) #31	Arih2 (MGP_PahariEiJ_G0015568) #32	Slc25a20 (MGP_PahariEiJ_G0015569) #35	Prkar2a (MGP_PahariEiJ_G0015570) #36	Ip6k2 (MGP_PahariEiJ_G0015571) #37	Nckipsd (MGP_PahariEiJ_G0015572)	Celsr3 (MGP_PahariEiJ_G0015573)	Slc26a6 (MGP_PahariEiJ_G0015574)
Rat	MODERN SPECIES	18	Rnf123 (ENSRNOG00000033378)	Mst1 (ENSRNOG00000019680)	Apeh (ENSRNOG00000029572)	Bsn (ENSRNOG00000030714) #7	Dag1 (ENSRNOG00000019400) #9	Nicn1 (ENSRNOG00000049083) #10	Amt (ENSRNOG00000050214) #11	Rhoa (ENSRNOG00000050519) #14	Gpx1 (ENSRNOG00000048812) #15	LOC498675 (ENSRNOG00000046155) #17	Usp4 (ENSRNOG00000054863) #16	Iho1 (ENSRNOG00000048919) #19	LOC680045 (ENSRNOG00000047468) #20	Klhdc8b (ENSRNOG00000047867) #21	Ccdc71 (ENSRNOG00000048718)	Lamb2 (ENSRNOG00000047768) #22	Usp19 (ENSRNOG00000049531) #23	Qars1 (ENSRNOG00000060912) #24	Qrich1 (ENSRNOG00000025071) #25	Impdh2 (ENSRNOG00000031965) #26	Ndufaf3 (ENSRNOG00000020068) #28	Dalrd3 (ENSRNOG00000020159) #29	Wdr6 (ENSRNOG00000020185) #30	P4htm (ENSRNOG00000020249) #31	Arih2 (ENSRNOG00000031827) #32	Slc25a20 (ENSRNOG00000020288) #35	Prkar2a (ENSRNOG00000020284) #36	Ip6k2 (ENSRNOG00000020361) #37	Nckipsd (ENSRNOG00000031816)	Celsr3 (ENSRNOG00000053889)	Slc26a6 (ENSRNOG00000020450)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1657	Mst1 (ENSNGAG00000012975)	Apeh (ENSNGAG00000017302)	Bsn (ENSNGAG00000021371) #7	Dag1 (ENSNGAG00000002651) #9	Nicn1 (ENSNGAG00000003280) #10	Amt (ENSNGAG00000004673) #11	Tcta (ENSNGAG00000005564) #12	Rhoa (ENSNGAG00000007854) #14	Gpx1 (ENSNGAG00000015216) #15	Usp4 (ENSNGAG00000016905) #16	1700102P08Rik (ENSNGAG00000006755) #17	Iho1 (ENSNGAG00000008202) #19	BC048562 (ENSNGAG00000009611) #20	Klhdc8b (ENSNGAG00000010343) #21	Ccdc71 (ENSNGAG00000010873)	Lamb2 (ENSNGAG00000013899) #22	Usp19 (ENSNGAG00000017354) #23	Qars (ENSNGAG00000019897) #24	Qrich1 (ENSNGAG00000000436) #25	Impdh2 (ENSNGAG00000001022) #26	Ndufaf3 (ENSNGAG00000001095) #28	Dalrd3 (ENSNGAG00000002570) #29	Wdr6 (ENSNGAG00000000962) #30	P4htm (ENSNGAG00000006218) #31	Arih2 (ENSNGAG00000013630) #32	Slc25a20 (ENSNGAG00000014160) #35	Prkar2a (ENSNGAG00000015534) #36	Ip6k2 (ENSNGAG00000017095) #37	ENSNGAG00000018381	Celsr3 (ENSNGAG00000021190)	ENSNGAG00000017439
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	110	Mst1 (ENSJJAG00000023123)	Apeh (ENSJJAG00000020682)	Bsn (ENSJJAG00000013955) #7	Dag1 (ENSJJAG00000009842) #9	Nicn1 (ENSJJAG00000015944) #10	ENSJJAG00000005274 #11	Tcta (ENSJJAG00000015029) #12	ENSJJAG00000016295	Gpx1 (ENSJJAG00000005600) #15	Usp4 (ENSJJAG00000022821) #16	1700102P08Rik (ENSJJAG00000023977) #17	ENSJJAG00000016241 #19	BC048562 (ENSJJAG00000013435) #20	Klhdc8b (ENSJJAG00000012953) #21	Ccdc71 (ENSJJAG00000017724)	Lamb2 (ENSJJAG00000012896) #22	ENSJJAG00000003459	Usp19 (ENSJJAG00000018701) #23	Qars (ENSJJAG00000010985) #24	ENSJJAG00000003833 #25	ENSJJAG00000021596 #25	Impdh2 (ENSJJAG00000023299) #26	Ndufaf3 (ENSJJAG00000013949) #28	Dalrd3 (ENSJJAG00000020047) #29	Wdr6 (ENSJJAG00000018299) #30	P4htm (ENSJJAG00000013960) #31	Arih2 (ENSJJAG00000023246) #32	ENSJJAG00000012465 #36	Ip6k2 (ENSJJAG00000021908) #37	ENSJJAG00000007230	Celsr3 (ENSJJAG00000021460)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	426	Amigo3 (ENSDORG00000027444)	Mst1 (ENSDORG00000007508)	Apeh (ENSDORG00000007506)	Bsn (ENSDORG00000007502) #7	Dag1 (ENSDORG00000026820) #9	Nicn1 (ENSDORG00000003385) #10	Amt (ENSDORG00000003384) #11	Tcta (ENSDORG00000003383) #12	ENSDORG00000025671 #14	Gpx1 (ENSDORG00000003381) #15	Usp4 (ENSDORG00000007948) #16	1700102P08Rik (ENSDORG00000007947) #17	BC048562 (ENSDORG00000024843) #20	Klhdc8b (ENSDORG00000027491) #21	Ccdc71 (ENSDORG00000007398)	Lamb2 (ENSDORG00000007397) #22	Usp19 (ENSDORG00000007395) #23	ENSDORG00000007392 #24	ENSDORG00000029720 #24	Qrich1 (ENSDORG00000004362) #25	Impdh2 (ENSDORG00000004361) #26	Ndufaf3 (ENSDORG00000004360) #28	Dalrd3 (ENSDORG00000000367) #29	Wdr6 (ENSDORG00000028656) #30	P4htm (ENSDORG00000000362) #31	ENSDORG00000026187 #32	Slc25a20 (ENSDORG00000010459) #35	Prkar2a (ENSDORG00000004663) #36	Ip6k2 (ENSDORG00000008962) #37	Nckipsd (ENSDORG00000008960)	ENSDORG00000026062
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00940000164203	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875.r #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725
Rabbit	MODERN SPECIES	20	ENSOCUG00000030741	MST1 (ENSOCUG00000004997)	APEH (ENSOCUG00000004990)	ENSOCUG00000030238 ##7	DAG1 (ENSOCUG00000003439) #9	AMT (ENSOCUG00000013310) #11	TCTA (ENSOCUG00000013319) #12	RHOA (ENSOCUG00000013323) #14	ENSOCUG00000005938 #15	USP4 (ENSOCUG00000005926) #16	C3orf62 (ENSOCUG00000032815) #17	IHO1 (ENSOCUG00000005910) #19	C3orf84 (ENSOCUG00000022446) #20	KLHDC8B (ENSOCUG00000017588) #21	CCDC71 (ENSOCUG00000017593)	LAMB2 (ENSOCUG00000005101) #22	USP19 (ENSOCUG00000005092) #23	QARS1 (ENSOCUG00000005082) #24	QRICH1 (ENSOCUG00000017728) #25	IMPDH2 (ENSOCUG00000017724) #26	NDUFAF3 (ENSOCUG00000017721) #28	DALRD3 (ENSOCUG00000017715) #29	WDR6 (ENSOCUG00000017712) #30	ENSOCUG00000021347	P4HTM (ENSOCUG00000017707) #31	ARIH2 (ENSOCUG00000017699) #32	ENSOCUG00000029040 #34	SLC25A20 (ENSOCUG00000016420) #35	PRKAR2A (ENSOCUG00000012426) #36	IP6K2 (ENSOCUG00000012420) #37	CELSR3 (ENSOCUG00000025952)
Pika	MODERN SPECIES	6937																LAMB2 (ENSOPRG00000001102) #22	USP19 (ENSOPRG00000001062) #23
Tree shrew	MODERN SPECIES	4981									RHOA (ENSTBEG00000002417) #14	GPX1 (ENSTBEG00000001653) #15	USP4 (ENSTBEG00000008478) #16	C3orf62 (ENSTBEG00000007849) #17	ENSTBEG00000007701 #18	IHO1 (ENSTBEG00000007145) #19	KLHDC8B (ENSTBEG00000006660) #21	LAMB2 (ENSTBEG00000004366) #22
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00910000147297 #8	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00940000164203	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES	5												ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31
Hedgehog	MODERN SPECIES	6722															CCDC71 (ENSEEUG00000004319)	LAMB2 (ENSEEUG00000003858) #22	USP19 (ENSEEUG00000003708) #23
Common shrew	MODERN SPECIES	5652												C3orf62 (ENSSARG00000000077) #17	ENSSARG00000000075	IHO1 (ENSSARG00000000073) #19	KLHDC8B (ENSSARG00000000071) #21	LAMB2 (ENSSARG00000000065) #22	USP19 (ENSSARG00000000064) #23	QARS1 (ENSSARG00000000062) #24	QRICH1 (ENSSARG00000000061) #25	IMPDH2 (ENSSARG00000000060) #26	NDUFAF3 (ENSSARG00000000059) #28	WDR6 (ENSSARG00000000058) #30	P4HTM (ENSSARG00000000054) #31
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00910000147297 #8	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00940000164203	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00910000147297 #8	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00940000164203	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00910000147297 #8	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00940000164203	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00910000147297 #8	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00940000164203	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b.pb.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00940000164203	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b.pb.b #14	ENSGT00940000156150.l #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077	ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b.pb.b #14	ENSGT00940000156150.l #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077	ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b
American black bear	MODERN SPECIES	3810									ENSUAMG00000010043	GPX1 (ENSUAMG00000010044) #15	USP4 (ENSUAMG00000010047) #16	C3orf62 (ENSUAMG00000010049) #17	IHO1 (ENSUAMG00000010050) #19	C3orf84 (ENSUAMG00000010055) #20	KLHDC8B (ENSUAMG00000010057) #21	LAMB2 (ENSUAMG00000010060) #22	USP19 (ENSUAMG00000010064) #23	QARS1 (ENSUAMG00000010069) #24
Polar bear	MODERN SPECIES	255	APEH (ENSUMAG00000022664)	ENSUMAG00000022817 #7	DAG1 (ENSUMAG00000022818) #9	NICN1 (ENSUMAG00000022819) #10	AMT (ENSUMAG00000022820) #11	TCTA (ENSUMAG00000022824) #12	RHOA (ENSUMAG00000022826) #14	GPX1 (ENSUMAG00000022827) #15	ENSUMAG00000022834 #16	USP4 (ENSUMAG00000022843) #16	C3orf62 (ENSUMAG00000022863) #17	IHO1 (ENSUMAG00000022867) #19	C3orf84 (ENSUMAG00000022882) #20	KLHDC8B (ENSUMAG00000022885) #21	CCDC71 (ENSUMAG00000022889)	LAMB2 (ENSUMAG00000022957) #22	USP19 (ENSUMAG00000023181) #23	QARS1 (ENSUMAG00000023208) #24	QRICH1 (ENSUMAG00000023411) #25	IMPDH2 (ENSUMAG00000023416) #26	NDUFAF3 (ENSUMAG00000023429) #28	ENSUMAG00000023436 #29	WDR6 (ENSUMAG00000023456) #30	P4HTM (ENSUMAG00000023465) #31	ARIH2 (ENSUMAG00000023482) #32	SLC25A20 (ENSUMAG00000023485) #35	PRKAR2A (ENSUMAG00000000109) #36	IP6K2 (ENSUMAG00000000479) #37	NCKIPSD (ENSUMAG00000000487)	ENSUMAG00000000521	SLC26A6 (ENSUMAG00000000551)
Giant Panda	MODERN SPECIES	14	MST1 (ENSAMEG00000012393)	APEH (ENSAMEG00000012459)	BSN (ENSAMEG00000012523) #7	DAG1 (ENSAMEG00000024430) #9	NICN1 (ENSAMEG00000012544) #10	AMT (ENSAMEG00000012551) #11	ENSAMEG00000012580 #12	RHOA (ENSAMEG00000012584) #14	GPX1 (ENSAMEG00000012590) #15	USP4 (ENSAMEG00000012591) #16	C3orf62 (ENSAMEG00000012680) #17	IHO1 (ENSAMEG00000012682) #19	C3orf84 (ENSAMEG00000012687) #20	KLHDC8B (ENSAMEG00000030033) #21	CCDC71 (ENSAMEG00000020173)	LAMB2 (ENSAMEG00000012708) #22	USP19 (ENSAMEG00000012785) #23	QARS1 (ENSAMEG00000012838) #24	QRICH1 (ENSAMEG00000012907) #25	IMPDH2 (ENSAMEG00000012929) #26	NDUFAF3 (ENSAMEG00000012966) #28	DALRD3 (ENSAMEG00000012976) #29	WDR6 (ENSAMEG00000013002) #30	P4HTM (ENSAMEG00000026267) #31	ARIH2 (ENSAMEG00000013035) #32	SLC25A20 (ENSAMEG00000000469) #35	PRKAR2A (ENSAMEG00000000490) #36	IP6K2 (ENSAMEG00000000516) #37	NCKIPSD (ENSAMEG00000000528)	CELSR3 (ENSAMEG00000000572)	SLC26A6 (ENSAMEG00000000655)
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b.pb.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00940000164203	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077
Ferret	MODERN SPECIES	238	AMIGO3 (ENSMPUG00000019647)	MST1 (ENSMPUG00000013611)	APEH (ENSMPUG00000013722)	BSN (ENSMPUG00000013782) #7	DAG1 (ENSMPUG00000013807) #9	NICN1 (ENSMPUG00000013809) #10	AMT (ENSMPUG00000013810) #11	TCTA (ENSMPUG00000013838) #12	RHOA (ENSMPUG00000013840) #14	GPX1 (ENSMPUG00000013843) #15	USP4 (ENSMPUG00000013846) #16	IHO1 (ENSMPUG00000013850) #19	C3orf84 (ENSMPUG00000013861) #20	KLHDC8B (ENSMPUG00000013869) #21	CCDC71 (ENSMPUG00000019649)	LAMB2 (ENSMPUG00000013872) #22	USP19 (ENSMPUG00000014117) #23	QARS1 (ENSMPUG00000014198) #24	QRICH1 (ENSMPUG00000014264) #25	NDUFAF3 (ENSMPUG00000014271) #28	DALRD3 (ENSMPUG00000014288) #29	WDR6 (ENSMPUG00000014318) #30	ENSMPUG00000014321	ARIH2 (ENSMPUG00000014344) #32	SLC25A20 (ENSMPUG00000014350) #35	PRKAR2A (ENSMPUG00000014376) #36	IP6K2 (ENSMPUG00000014413) #37	NCKIPSD (ENSMPUG00000014415)	CELSR3 (ENSMPUG00000014422)	SLC26A6 (ENSMPUG00000014428)	UQCRC1 (ENSMPUG00000014540)
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Canidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00910000147297 #8	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524.a #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b.ob #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000013951.db.a	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836.f #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077
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Red fox	MODERN SPECIES	5	DAG1 (ENSVVUG00000029028) #9	ENSVVUG00000029029 #8	ENSVVUG00000029030	NICN1 (ENSVVUG00000029031) #10	AMT (ENSVVUG00000029036) #11	TCTA (ENSVVUG00000029052) #12	RHOA (ENSVVUG00000029053) #14	GPX1 (ENSVVUG00000029054) #15	USP4 (ENSVVUG00000029055) #16	C3orf62 (ENSVVUG00000029056) #17	CCDC36 (ENSVVUG00000029057) #19	ENSVVUG00000029059	C3orf84 (ENSVVUG00000029060) #20	KLHDC8B (ENSVVUG00000029061) #21	CCDC71 (ENSVVUG00000029062)	LAMB2 (ENSVVUG00000029063) #22	USP19 (ENSVVUG00000029068) #23	QARS1 (ENSVVUG00000029158) #24	QRICH1 (ENSVVUG00000029220) #25	NDUFAF3 (ENSVVUG00000029274) #28	WDR6 (ENSVVUG00000029289) #30	ENSVVUG00000029294	P4HTM (ENSVVUG00000029297) #31	ARIH2 (ENSVVUG00000029314) #32	SLC25A20 (ENSVVUG00000029398) #35	PRKAR2A (ENSVVUG00000029410) #36	ENSVVUG00000029412	IP6K2 (ENSVVUG00000029413) #37	NCKIPSD (ENSVVUG00000029416)	CELSR3 (ENSVVUG00000029449)	SLC26A6 (ENSVVUG00000029593)
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Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077
Equus	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000164003	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077	ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b
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Donkey	MODERN SPECIES	13	MST1 (ENSEASG00005011602)	APEH (ENSEASG00005011529)	ENSEASG00005011498	BSN (ENSEASG00005011503) #7	DAG1 (ENSEASG00005011493) #9	NICN1 (ENSEASG00005011490) #10	AMT (ENSEASG00005011487) #11	TCTA (ENSEASG00005037396) #12	ENSEASG00005038337	GPX1 (ENSEASG00005036373) #15	USP4 (ENSEASG00005011232) #16	C3orf62 (ENSEASG00005023591) #17	IHO1 (ENSEASG00005027665) #19	KLHDC8B (ENSEASG00005011155) #21	CCDC71 (ENSEASG00005011154)	LAMB2 (ENSEASG00005010965) #22	USP19 (ENSEASG00005010828) #23	QARS1 (ENSEASG00005010497) #24	QRICH1 (ENSEASG00005010463) #25	IMPDH2 (ENSEASG00005010445) #26	NDUFAF3 (ENSEASG00005033606) #28	DALRD3 (ENSEASG00005010427) #29	WDR6 (ENSEASG00005010422) #30	P4HTM (ENSEASG00005010415) #31	ARIH2 (ENSEASG00005010381) #32	SLC25A20 (ENSEASG00005010354) #35	PRKAR2A (ENSEASG00005010299) #36	IP6K2 (ENSEASG00005010284) #37	NCKIPSD (ENSEASG00005010268)	CELSR3 (ENSEASG00005010210)	SLC26A6 (ENSEASG00005009823)
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Megabat	MODERN SPECIES	19	AMIGO3 (ENSPVAG00000008760)	RNF123 (ENSPVAG00000008756)	MST1 (ENSPVAG00000008752)	APEH (ENSPVAG00000008750)	BSN (ENSPVAG00000008748) #7	DAG1 (ENSPVAG00000008746) #9	NICN1 (ENSPVAG00000008742) #10	AMT (ENSPVAG00000008741) #11	TCTA (ENSPVAG00000008739) #12	RHOA (ENSPVAG00000008738) #14	GPX1 (ENSPVAG00000008736) #15	USP4 (ENSPVAG00000008735) #16	C3orf62 (ENSPVAG00000008734) #17	IHO1 (ENSPVAG00000008733) #19	KLHDC8B (ENSPVAG00000008730) #21	LAMB2 (ENSPVAG00000008726) #22	USP19 (ENSPVAG00000008723) #23	QARS1 (ENSPVAG00000008720) #24	QRICH1 (ENSPVAG00000008718) #25	IMPDH2 (ENSPVAG00000008715) #26	NDUFAF3 (ENSPVAG00000008713) #28	DALRD3 (ENSPVAG00000008710) #29	WDR6 (ENSPVAG00000008708) #30	P4HTM (ENSPVAG00000008706) #31	ARIH2 (ENSPVAG00000008705) #32	ENSPVAG00000024251 #34	SLC25A20 (ENSPVAG00000008703) #35	PRKAR2A (ENSPVAG00000008700) #36
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077	ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b
Greater horseshoe bat	DUPLICATION
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	8	APEH (ENSRFEG00010005691)	BSN (ENSRFEG00010005833) #7	DAG1 (ENSRFEG00010005869) #9	NICN1 (ENSRFEG00010005912) #10	AMT (ENSRFEG00010006159) #11	TCTA (ENSRFEG00010006341) #12	RHOA (ENSRFEG00010006365) #14	GPX1 (ENSRFEG00010006388) #15	USP4 (ENSRFEG00010006437) #16	C3orf62 (ENSRFEG00010006582) #17	IHO1 (ENSRFEG00010006606) #19	C3orf84 (ENSRFEG00010006639) #20	KLHDC8B (ENSRFEG00010006686) #21	CCDC71 (ENSRFEG00010006704)	ENSRFEG00010006748 #22	LAMB2 (ENSRFEG00010006962) #22	USP19 (ENSRFEG00010007084) #23	QARS1 (ENSRFEG00010007205) #24	QRICH1 (ENSRFEG00010007287) #25	IMPDH2 (ENSRFEG00010007338) #26	NDUFAF3 (ENSRFEG00010007493) #28	DALRD3 (ENSRFEG00010007609) #29	WDR6 (ENSRFEG00010008055) #30	P4HTM (ENSRFEG00010007933) #31	ARIH2 (ENSRFEG00010008090) #32	SLC25A20 (ENSRFEG00010008130) #35	PRKAR2A (ENSRFEG00010008201) #36	IP6K2 (ENSRFEG00010008244) #37	NCKIPSD (ENSRFEG00010008286)	CELSR3 (ENSRFEG00010008356)	SLC26A6 (ENSRFEG00010008546)
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Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725
Suina	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077	ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b
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Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077
Arabian camel	MODERN SPECIES	8	MST1 (ENSCDRG00005005862)	APEH (ENSCDRG00005005764)	BSN (ENSCDRG00005005743) #7	DAG1 (ENSCDRG00005005724) #9	NICN1 (ENSCDRG00005005671) #10	AMT (ENSCDRG00005005389) #11	TCTA (ENSCDRG00005005330) #12	RHOA (ENSCDRG00005005306) #14	ENSCDRG00005005290 #15	USP4 (ENSCDRG00005005199) #16	C3orf62 (ENSCDRG00005005169) #17	IHO1 (ENSCDRG00005005122) #19	C3orf84 (ENSCDRG00005005088) #20	KLHDC8B (ENSCDRG00005005058) #21	CCDC71 (ENSCDRG00005005037)	LAMB2 (ENSCDRG00005004573) #22	QARS1 (ENSCDRG00005004349) #24	QRICH1 (ENSCDRG00005004282) #25	IMPDH2 (ENSCDRG00005004218) #26	NDUFAF3 (ENSCDRG00005004181) #28	DALRD3 (ENSCDRG00005004060) #29	WDR6 (ENSCDRG00005003990) #30	P4HTM (ENSCDRG00005003922) #31	ARIH2 (ENSCDRG00005003826) #32	PRKAR2A (ENSCDRG00005003620) #36	IP6K2 (ENSCDRG00005003526) #37	NCKIPSD (ENSCDRG00005003450)	CELSR3 (ENSCDRG00005014606)	SLC26A6 (ENSCDRG00005013706)	TMEM89 (ENSCDRG00005013618)	UQCRC1 (ENSCDRG00005013459)
Alpaca	MODERN SPECIES	2220																ENSVPAG00000009668 #22	USP19 (ENSVPAG00000009667) #23	QARS1 (ENSVPAG00000009664) #24	QRICH1 (ENSVPAG00000009662) #25	ENSVPAG00000009661 #28	ENSVPAG00000009657 #30	ARIH2 (ENSVPAG00000009656) #32	ENSVPAG00000015469 #34	SLC25A20 (ENSVPAG00000009655) #35
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00990000203969.c.a	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00990000203969.c.a	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00990000203969.c.a	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726.g #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00390000009949 #34	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00990000203969.c.a	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726.g #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077	ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00990000203969.c.a	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00860000135958 #18	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726.g #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077	ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b
Narwhal	MODERN SPECIES	310	APEH (ENSMMNG00015013189)	BSN (ENSMMNG00015013162) #7	DAG1 (ENSMMNG00015013146) #9	ENSMMNG00015013133	NICN1 (ENSMMNG00015013108) #10	AMT (ENSMMNG00015013041) #11	TCTA (ENSMMNG00015012991) #12	RHOA (ENSMMNG00015012980) #14	GPX1 (ENSMMNG00015012971) #15	USP4 (ENSMMNG00015012950) #16	C3orf62 (ENSMMNG00015012883) #17	IHO1 (ENSMMNG00015012868) #19	C3orf84 (ENSMMNG00015012850) #20	KLHDC8B (ENSMMNG00015012828) #21	CCDC71 (ENSMMNG00015012816)	LAMB2 (ENSMMNG00015012783) #22	USP19 (ENSMMNG00015012611) #23	QARS1 (ENSMMNG00015012503) #24	QRICH1 (ENSMMNG00015012459) #25	IMPDH2 (ENSMMNG00015012428) #26	NDUFAF3 (ENSMMNG00015012388) #28	DALRD3 (ENSMMNG00015012304) #29	WDR6 (ENSMMNG00015012270) #30	P4HTM (ENSMMNG00015012237) #31	ARIH2 (ENSMMNG00015012181) #32	SLC25A20 (ENSMMNG00015012135) #35	PRKAR2A (ENSMMNG00015012091) #36	IP6K2 (ENSMMNG00015012063) #37	NCKIPSD (ENSMMNG00015012044)	CELSR3 (ENSMMNG00015011980)	SLC26A6 (ENSMMNG00015011867)
Beluga whale	MODERN SPECIES	28	APEH (ENSDLEG00000014933)	BSN (ENSDLEG00000015162) #7	DAG1 (ENSDLEG00000015214) #9	ENSDLEG00000015224	NICN1 (ENSDLEG00000015239) #10	AMT (ENSDLEG00000015323) #11	RHOA (ENSDLEG00000015960) #14	GPX1 (ENSDLEG00000015976) #15	USP4 (ENSDLEG00000016063) #16	CUNH3orf62 (ENSDLEG00000017307) #17	ENSDLEG00000017319 #18	CCDC36 (ENSDLEG00000017335) #19	C3orf84 (ENSDLEG00000017359) #20	KLHDC8B (ENSDLEG00000017380) #21	CCDC71 (ENSDLEG00000017405)	LAMB2 (ENSDLEG00000017419) #22	USP19 (ENSDLEG00000017469) #23	QARS1 (ENSDLEG00000017603) #24	QRICH1 (ENSDLEG00000018099) #25	IMPDH2 (ENSDLEG00000018135) #26	NDUFAF3 (ENSDLEG00000018168) #28	DALRD3 (ENSDLEG00000018204) #29	WDR6 (ENSDLEG00000018228) #30	P4HTM (ENSDLEG00000018259) #31	ARIH2 (ENSDLEG00000018291) #32	ENSDLEG00000018315	SLC25A20 (ENSDLEG00000018329) #35	PRKAR2A (ENSDLEG00000018338) #36	IP6K2 (ENSDLEG00000018367) #37	NCKIPSD (ENSDLEG00000018395)	CELSR3 (ENSDLEG00000018506)
Vaquita	MODERN SPECIES	2	MST1 (ENSPSNG00000013285)	APEH (ENSPSNG00000013525)	BSN (ENSPSNG00000013663) #7	DAG1 (ENSPSNG00000013813) #9	ENSPSNG00000004157	NICN1 (ENSPSNG00000004182) #10	AMT (ENSPSNG00000004381) #11	TCTA (ENSPSNG00000004703) #12	RHOA (ENSPSNG00000004743) #14	GPX1 (ENSPSNG00000004763) #15	USP4 (ENSPSNG00000004797) #16	IHO1 (ENSPSNG00000004857) #19	C3orf84 (ENSPSNG00000004885) #20	KLHDC8B (ENSPSNG00000004916) #21	CCDC71 (ENSPSNG00000004946)	LAMB2 (ENSPSNG00000005009) #22	USP19 (ENSPSNG00000005218) #23	QARS1 (ENSPSNG00000005651) #24	QRICH1 (ENSPSNG00000005735) #25	ENSPSNG00000005779 #26	NDUFAF3 (ENSPSNG00000005911) #28	DALRD3 (ENSPSNG00000005963) #29	WDR6 (ENSPSNG00000006056) #30	P4HTM (ENSPSNG00000006122) #31	ARIH2 (ENSPSNG00000006175) #32	SLC25A20 (ENSPSNG00000006261) #35	PRKAR2A (ENSPSNG00000006412) #36	IP6K2 (ENSPSNG00000006547) #37	NCKIPSD (ENSPSNG00000006619)	CELSR3 (ENSPSNG00000006685)	SLC26A6 (ENSPSNG00000006903)
Dolphin	MODERN SPECIES	1494									RHOA (ENSTTRG00000017370) #14	GPX1 (ENSTTRG00000017369) #15	USP4 (ENSTTRG00000017365) #16	ENSTTRG00000017364 #17	IHO1 (ENSTTRG00000017363) #19	KLHDC8B (ENSTTRG00000017361) #21	CCDC71 (ENSTTRG00000017360)	LAMB2 (ENSTTRG00000017357) #22	USP19 (ENSTTRG00000017355) #23	QARS1 (ENSTTRG00000017352) #24	QRICH1 (ENSTTRG00000017351) #25	IMPDH2 (ENSTTRG00000017349) #26	NDUFAF3 (ENSTTRG00000017348) #28	DALRD3 (ENSTTRG00000017347) #29	WDR6 (ENSTTRG00000017346) #30	P4HTM (ENSTTRG00000017345) #31	ARIH2 (ENSTTRG00000017344) #32	ENSTTRG00000021379 #34	SLC25A20 (ENSTTRG00000017343) #35	PRKAR2A (ENSTTRG00000017342) #36	IP6K2 (ENSTTRG00000017341) #37	NCKIPSD (ENSTTRG00000017340)	CELSR3 (ENSTTRG00000017338)
Sperm whale	MODERN SPECIES	880															CCDC71 (ENSPCTG00005014019)	LAMB2 (ENSPCTG00005014044) #22	USP19 (ENSPCTG00005014196) #23
Blue whale	MODERN SPECIES	2	BSN (ENSBMSG00010010989) #7	DAG1 (ENSBMSG00010010968) #9	ENSBMSG00010010960	NICN1 (ENSBMSG00010010937) #10	AMT (ENSBMSG00010010835) #11	TCTA (ENSBMSG00010010765) #12	RHOA (ENSBMSG00010010749) #14	ENSBMSG00010010726 #15	USP4 (ENSBMSG00010010655) #16	C3orf62 (ENSBMSG00010010582) #17	ENSBMSG00010010572 #18	IHO1 (ENSBMSG00010010547) #19	C3orf84 (ENSBMSG00010010524) #20	KLHDC8B (ENSBMSG00010010507) #21	CCDC71 (ENSBMSG00010010496)	LAMB2 (ENSBMSG00010010468) #22	USP19 (ENSBMSG00010010311) #23	QARS1 (ENSBMSG00010010201) #24	QRICH1 (ENSBMSG00010010177) #25	IMPDH2 (ENSBMSG00010010156) #26	NDUFAF3 (ENSBMSG00010010129) #28	DALRD3 (ENSBMSG00010010094) #29	WDR6 (ENSBMSG00010010069) #30	P4HTM (ENSBMSG00010010026) #31	ARIH2 (ENSBMSG00010009985) #32	ENSBMSG00010009972	SLC25A20 (ENSBMSG00010009954) #35	PRKAR2A (ENSBMSG00010009907) #36	IP6K2 (ENSBMSG00010009894) #37	NCKIPSD (ENSBMSG00010009865)	CELSR3 (ENSBMSG00010009819)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077
Yarkand deer	MODERN SPECIES	16	APEH (ENSCHYG00000022817)	BSN (ENSCHYG00000022765) #7	DAG1 (ENSCHYG00000022724) #9	NICN1 (ENSCHYG00000022672) #10	AMT (ENSCHYG00000021143) #11	TCTA (ENSCHYG00000020985) #12	RHOA (ENSCHYG00000020943) #14	GPX1 (ENSCHYG00000020891) #15	USP4 (ENSCHYG00000020223) #16	C3orf62 (ENSCHYG00000020130) #17	ENSCHYG00000020109 #19	ENSCHYG00000020073	C3orf84 (ENSCHYG00000019991) #20	KLHDC8B (ENSCHYG00000019923) #21	CCDC71 (ENSCHYG00000019908)	LAMB2 (ENSCHYG00000018059) #22	USP19 (ENSCHYG00000017124) #23	QARS1 (ENSCHYG00000016793) #24	QRICH1 (ENSCHYG00000016705) #25	IMPDH2 (ENSCHYG00000016573) #26	NDUFAF3 (ENSCHYG00000016470) #28	DALRD3 (ENSCHYG00000016269) #29	WDR6 (ENSCHYG00000016106) #30	P4HTM (ENSCHYG00000015965) #31	ARIH2 (ENSCHYG00000015757) #32	ENSCHYG00000015710	SLC25A20 (ENSCHYG00000015575) #35	PRKAR2A (ENSCHYG00000015281) #36	IP6K2 (ENSCHYG00000015157) #37	NCKIPSD (ENSCHYG00000014934)	CELSR3 (ENSCHYG00000014491)
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT01030000235142.a	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT01030000235142.a	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077	ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b
American bison	MODERN SPECIES	3218	MST1 (ENSBBBG00000014000)	APEH (ENSBBBG00000013989)	BSN (ENSBBBG00000013959) #7	ENSBBBG00000003033	NICN1 (ENSBBBG00000003031) #10	AMT (ENSBBBG00000003011) #11	TCTA (ENSBBBG00000008744) #12	RHOA (ENSBBBG00000013828) #14	GPX1 (ENSBBBG00000013819) #15	USP4 (ENSBBBG00000013809) #16	C3orf62 (ENSBBBG00000002946) #17	IHO1 (ENSBBBG00000013760) #19	C3orf84 (ENSBBBG00000013731) #20	KLHDC8B (ENSBBBG00000002923) #21	CCDC71 (ENSBBBG00000002918)	LAMB2 (ENSBBBG00000013717) #22	USP19 (ENSBBBG00000013677) #23	QARS1 (ENSBBBG00000002795) #24	QRICH1 (ENSBBBG00000013477) #25	IMPDH2 (ENSBBBG00000002761) #26	NDUFAF3 (ENSBBBG00000013435) #28	DALRD3 (ENSBBBG00000013423) #29	WDR6 (ENSBBBG00000013397) #30	P4HTM (ENSBBBG00000013372) #31	ARIH2 (ENSBBBG00000013331) #32	SLC25A20 (ENSBBBG00000013306) #35	PRKAR2A (ENSBBBG00000001622) #36	IP6K2 (ENSBBBG00000013273) #37	NCKIPSD (ENSBBBG00000013266)	CELSR3 (ENSBBBG00000001641)	SLC26A6 (ENSBBBG00000013214)
Bos	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT01100000263480.a.b.b.a.a.b.b.a.a.b	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077	ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT01100000263480.a.b.b.a.a.b.b.a.a.b	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077	ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b
Cow	DUPLICATION
Cow	MODERN SPECIES	14	APEH (ENSBTAG00000011583)	BSN (ENSBTAG00000011581) #7	DAG1 (ENSBTAG00000011580) #9	NICN1 (ENSBTAG00000000387) #10	AMT (ENSBTAG00000002321) #11	TCTA (ENSBTAG00000022632) #12	RHOA (ENSBTAG00000004279) #14	GPX1 (ENSBTAG00000054195) #15	USP4 (ENSBTAG00000011899) #16	C22H3orf62 (ENSBTAG00000011894) #17	IHO1 (ENSBTAG00000009371) #19	C22H3orf84 (ENSBTAG00000000982) #20	KLHDC8B (ENSBTAG00000000981) #21	CCDC71 (ENSBTAG00000013932)	ENSBTAG00000055290 #22	LAMB2 (ENSBTAG00000022635) #22	USP19 (ENSBTAG00000018921) #23	QARS1 (ENSBTAG00000018928) #24	QRICH1 (ENSBTAG00000018924) #25	IMPDH2 (ENSBTAG00000031837) #26	NDUFAF3 (ENSBTAG00000018918) #28	DALRD3 (ENSBTAG00000018913) #29	WDR6 (ENSBTAG00000018910) #30	P4HTM (ENSBTAG00000005490) #31	ARIH2 (ENSBTAG00000005488) #32	SLC25A20 (ENSBTAG00000000191) #35	PRKAR2A (ENSBTAG00000014205) #36	IP6K2 (ENSBTAG00000021853) #37	NCKIPSD (ENSBTAG00000021850)	CELSR3 (ENSBTAG00000021846)	SLC26A6 (ENSBTAG00000038381)
Cow	MODERN SPECIES	14	MST1 (ENSBTAG00000011585)	APEH (ENSBTAG00000011583)	BSN (ENSBTAG00000011581) #7	DAG1 (ENSBTAG00000011580) #9	NICN1 (ENSBTAG00000000387) #10	AMT (ENSBTAG00000002321) #11	TCTA (ENSBTAG00000022632) #12	RHOA (ENSBTAG00000004279) #14	GPX1 (ENSBTAG00000054195) #15	USP4 (ENSBTAG00000011899) #16	C22H3orf62 (ENSBTAG00000011894) #17	IHO1 (ENSBTAG00000009371) #19	C22H3orf84 (ENSBTAG00000000982) #20	KLHDC8B (ENSBTAG00000000981) #21	CCDC71 (ENSBTAG00000013932)	ENSBTAG00000055290 #22	LAMB2 (ENSBTAG00000022635) #22	USP19 (ENSBTAG00000018921) #23	QARS1 (ENSBTAG00000018928) #24	QRICH1 (ENSBTAG00000018924) #25	IMPDH2 (ENSBTAG00000031837) #26	NDUFAF3 (ENSBTAG00000018918) #28	DALRD3 (ENSBTAG00000018913) #29	WDR6 (ENSBTAG00000018910) #30	P4HTM (ENSBTAG00000005490) #31	ARIH2 (ENSBTAG00000005488) #32	SLC25A20 (ENSBTAG00000000191) #35	PRKAR2A (ENSBTAG00000014205) #36	IP6K2 (ENSBTAG00000021853) #37	NCKIPSD (ENSBTAG00000021850)	CELSR3 (ENSBTAG00000021846)
Hybrid Bos Indicus	DUPLICATION
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	14	APEH (ENSBIXG00005011475)	BSN (ENSBIXG00005011525) #7	DAG1 (ENSBIXG00005011549) #9	AMT (ENSBIXG00005011718) #11	TCTA (ENSBIXG00005007432) #12	ENSBIXG00005006787	RHOA (ENSBIXG00005011793) #14	GPX1 (ENSBIXG00005011815) #15	C3orf62 (ENSBIXG00005005956) #17	USP4 (ENSBIXG00005011888) #16	IHO1 (ENSBIXG00005011909) #19	C3orf84 (ENSBIXG00005001208) #20	KLHDC8B (ENSBIXG00005011961) #21	CCDC71 (ENSBIXG00005000414)	ENSBIXG00005002536 #22	LAMB2 (ENSBIXG00005016314) #22	USP19 (ENSBIXG00005017369) #23	QARS1 (ENSBIXG00005017449) #24	QRICH1 (ENSBIXG00005017495) #25	IMPDH2 (ENSBIXG00005002847) #26	NDUFAF3 (ENSBIXG00005002855) #28	DALRD3 (ENSBIXG00005017624) #29	P4HTM (ENSBIXG00005002875) #31	WDR6 (ENSBIXG00005017807) #30	ARIH2 (ENSBIXG00005002897) #32	ENSBIXG00005002903	ENSBIXG00005017902 #35	ENSBIXG00005017935	PRKAR2A (ENSBIXG00005018013) #36	IP6K2 (ENSBIXG00005018059) #37	NCKIPSD (ENSBIXG00005002932)
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Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT01100000263480.a.b.b.a.a.b.b.a.a.b	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077	ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b
Domestic yak	MODERN SPECIES	14	DAG1 (ENSBGRG00000020861) #9	ENSBGRG00000020826	NICN1 (ENSBGRG00000020735) #10	AMT (ENSBGRG00000020243) #11	TCTA (ENSBGRG00000020134) #12	ENSBGRG00000020118	RHOA (ENSBGRG00000020019) #14	GPX1 (ENSBGRG00000019961) #15	USP4 (ENSBGRG00000019272) #16	C3orf62 (ENSBGRG00000019210) #17	ENSBGRG00000019151	C3orf84 (ENSBGRG00000019083) #20	KLHDC8B (ENSBGRG00000019038) #21	CCDC71 (ENSBGRG00000019022)	USP19 (ENSBGRG00000017987) #23	LAMB2 (ENSBGRG00000016632) #22	QARS1 (ENSBGRG00000015757) #24	QRICH1 (ENSBGRG00000015681) #25	IMPDH2 (ENSBGRG00000015395) #26	NDUFAF3 (ENSBGRG00000015330) #28	DALRD3 (ENSBGRG00000024128) #29	WDR6 (ENSBGRG00000024062) #30	P4HTM (ENSBGRG00000023980) #31	ARIH2 (ENSBGRG00000023826) #32	ENSBGRG00000023787	PRKAR2A (ENSBGRG00000023547) #36	IP6K2 (ENSBGRG00000023483) #37	NCKIPSD (ENSBGRG00000023323)	ENSBGRG00000023309	SLC26A6 (ENSBGRG00000022432)	TMEM89 (ENSBGRG00000022364)
Wild yak	DUPLICATION
Wild yak	MODERN SPECIES	2401							RHOA (ENSBMUG00000014394) #14	GPX1 (ENSBMUG00000014390) #15	USP4 (ENSBMUG00000014366) #16	C3orf62 (ENSBMUG00000014327) #17	IHO1 (ENSBMUG00000014305) #19	C3orf84 (ENSBMUG00000014279) #20	KLHDC8B (ENSBMUG00000014264) #21	CCDC71 (ENSBMUG00000014262)	ENSBMUG00000014250 #22	LAMB2 (ENSBMUG00000014195) #22	USP19 (ENSBMUG00000014055) #23	QARS1 (ENSBMUG00000013897) #24	QRICH1 (ENSBMUG00000013833) #25	IMPDH2 (ENSBMUG00000013821) #26	NDUFAF3 (ENSBMUG00000013786) #28	DALRD3 (ENSBMUG00000013752) #29	WDR6 (ENSBMUG00000013729) #30	P4HTM (ENSBMUG00000013710) #31	ARIH2 (ENSBMUG00000013680) #32	SLC25A20 (ENSBMUG00000013606) #35	PRKAR2A (ENSBMUG00000013542) #36	IP6K2 (ENSBMUG00000013503) #37	NCKIPSD (ENSBMUG00000013484)	CELSR3 (ENSBMUG00000013264)	SLC26A6 (ENSBMUG00000012744)
Wild yak	MODERN SPECIES	2401								RHOA (ENSBMUG00000014394) #14	GPX1 (ENSBMUG00000014390) #15	USP4 (ENSBMUG00000014366) #16	C3orf62 (ENSBMUG00000014327) #17	IHO1 (ENSBMUG00000014305) #19	C3orf84 (ENSBMUG00000014279) #20	KLHDC8B (ENSBMUG00000014264) #21	CCDC71 (ENSBMUG00000014262)	ENSBMUG00000014250 #22	LAMB2 (ENSBMUG00000014195) #22	USP19 (ENSBMUG00000014055) #23	QARS1 (ENSBMUG00000013897) #24	QRICH1 (ENSBMUG00000013833) #25	IMPDH2 (ENSBMUG00000013821) #26	NDUFAF3 (ENSBMUG00000013786) #28	DALRD3 (ENSBMUG00000013752) #29	WDR6 (ENSBMUG00000013729) #30	P4HTM (ENSBMUG00000013710) #31	ARIH2 (ENSBMUG00000013680) #32	SLC25A20 (ENSBMUG00000013606) #35	PRKAR2A (ENSBMUG00000013542) #36	IP6K2 (ENSBMUG00000013503) #37	NCKIPSD (ENSBMUG00000013484)	CELSR3 (ENSBMUG00000013264)
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT01030000235142.a	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b.jb #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077
Goat	MODERN SPECIES	14	APEH (ENSCHIG00000007324)	BSN (ENSCHIG00000015658) #7	DAG1 (ENSCHIG00000015784) #9	ENSCHIG00000009691	NICN1 (ENSCHIG00000010612) #10	AMT (ENSCHIG00000017556) #11	TCTA (ENSCHIG00000014306) #12	RHOA (ENSCHIG00000013894) #14	GPX1 (ENSCHIG00000017983) #15	USP4 (ENSCHIG00000017572) #16	C3orf62 (ENSCHIG00000009739) #17	IHO1 (ENSCHIG00000009674) #19	C3orf84 (ENSCHIG00000015744) #20	KLHDC8B (ENSCHIG00000022366) #21	CCDC71 (ENSCHIG00000012608)	LAMB2 (ENSCHIG00000015310) #22	USP19 (ENSCHIG00000019576) #23	QARS1 (ENSCHIG00000022953) #24	QRICH1 (ENSCHIG00000016705) #25	IMPDH2 (ENSCHIG00000011336) #26	ENSCHIG00000008827 #27	NDUFAF3 (ENSCHIG00000022087) #28	DALRD3 (ENSCHIG00000018628) #29	WDR6 (ENSCHIG00000003628) #30	P4HTM (ENSCHIG00000013169) #31	ARIH2 (ENSCHIG00000027089) #32	SLC25A20 (ENSCHIG00000010462) #35	PRKAR2A (ENSCHIG00000023269) #36	IP6K2 (ENSCHIG00000016624) #37	NCKIPSD (ENSCHIG00000022149)	CELSR3 (ENSCHIG00000018245)
Rambouillet Sheep	DUPLICATION
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Siberian musk deer	DUPLICATION
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Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT00940000160077	ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b
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Tenrec	MODERN SPECIES	8755																ENSETEG00000017216 #22
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155781	ENSGT00940000159461	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b #14	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725	ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b	ENSGT00390000005336
Armadillo	MODERN SPECIES	864	AMIGO3 (ENSDNOG00000037102)	MST1 (ENSDNOG00000003406)	APEH (ENSDNOG00000031643)	BSN (ENSDNOG00000047457) #7	DAG1 (ENSDNOG00000016917) #9	NICN1 (ENSDNOG00000018341) #10	AMT (ENSDNOG00000002402) #11	TCTA (ENSDNOG00000002400) #12	RHOA (ENSDNOG00000046934) #14	USP4 (ENSDNOG00000012797) #16	C3orf62 (ENSDNOG00000019586) #17	IHO1 (ENSDNOG00000013880) #19	C3orf84 (ENSDNOG00000043752) #20	KLHDC8B (ENSDNOG00000032781) #21	ENSDNOG00000044903	ENSDNOG00000000033 #22	ENSDNOG00000031599	QARS1 (ENSDNOG00000014157) #24	QRICH1 (ENSDNOG00000014130) #25	IMPDH2 (ENSDNOG00000014105) #26	NDUFAF3 (ENSDNOG00000014096) #28	DALRD3 (ENSDNOG00000041605) #29	WDR6 (ENSDNOG00000033276) #30	P4HTM (ENSDNOG00000014050) #31	ARIH2 (ENSDNOG00000032223) #32	SLC25A20 (ENSDNOG00000000976) #35	ENSDNOG00000034621	PRKAR2A (ENSDNOG00000010826) #36	IP6K2 (ENSDNOG00000010809) #37	NCKIPSD (ENSDNOG00000025438)	SLC26A6 (ENSDNOG00000032436)
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Opossum	DUPLICATION
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Opossum	MODERN SPECIES	5	MST1 (ENSMODG00000012944)	APEH (ENSMODG00000012954)	BSN (ENSMODG00000012965) #7	DAG1 (ENSMODG00000012968) #9	NICN1 (ENSMODG00000022968) #10	AMT (ENSMODG00000012973) #11	TCTA (ENSMODG00000012978) #12	RHOA (ENSMODG00000042763) #14	GPX1 (ENSMODG00000012984) #15	USP4 (ENSMODG00000013001) #16	C3orf62 (ENSMODG00000013005) #17	ENSMODG00000043050 #19	ENSMODG00000013014 #20	KLHDC8B (ENSMODG00000013022) #21	ENSMODG00000013027	ENSMODG00000039230 #22	LAMB2 (ENSMODG00000013288) #22	USP19 (ENSMODG00000013305) #23	ENSMODG00000013310	QARS1 (ENSMODG00000013321) #24	QRICH1 (ENSMODG00000013333) #25	IMPDH2 (ENSMODG00000013354) #26	NDUFAF3 (ENSMODG00000022966) #28	DALRD3 (ENSMODG00000013362) #29	ENSMODG00000013296 #30	ENSMODG00000043990	P4HTM (ENSMODG00000013366) #31	ARIH2 (ENSMODG00000013374) #32	ENSMODG00000013383 #35	PRKAR2A (ENSMODG00000013392) #36	IP6K2 (ENSMODG00000013401) #37
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b.e.a #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00940000166951	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00940000164203	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b.e.a #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00940000166951	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00940000164203	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725
Wallaby	MODERN SPECIES	8084																LAMB2 (ENSMEUG00000010600) #22
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000013172	ENSGT00620000087961.a.b.a.a.a.b.f #7	ENSGT00390000008429 #9	ENSGT00390000001505 #10	ENSGT00940000157524 #11	ENSGT00390000004490 #12	ENSGT00950000182945.b.b.e.a #14	ENSGT00940000156150 #15	ENSGT00940000156645 #16	ENSGT00390000000252 #17	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00940000166951	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00940000164203	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00940000156310 #37	ENSGT00390000015725
koala	DUPLICATION
koala	MODERN SPECIES	75	RNF123 (ENSPCIG00000021575)	MST1 (ENSPCIG00000021592)	APEH (ENSPCIG00000021665)	DAG1 (ENSPCIG00000021945) #9	NICN1 (ENSPCIG00000011868) #10	AMT (ENSPCIG00000011871) #11	TCTA (ENSPCIG00000033201) #12	ENSPCIG00000011878 #14	GPX1 (ENSPCIG00000011881) #15	USP4 (ENSPCIG00000011972) #16	C3orf62 (ENSPCIG00000018125) #17	ENSPCIG00000018126 #19	ENSPCIG00000018127 #20	KLHDC8B (ENSPCIG00000018128) #21	ENSPCIG00000018130 #22	LAMB2 (ENSPCIG00000018185) #22	USP19 (ENSPCIG00000018723) #23	ENSPCIG00000018725	QARS1 (ENSPCIG00000018726) #24	QRICH1 (ENSPCIG00000018727) #25	ENSPCIG00000018761 #26	NDUFAF3 (ENSPCIG00000022141) #28	DALRD3 (ENSPCIG00000022151) #29	ENSPCIG00000022163 #30	ENSPCIG00000022172	P4HTM (ENSPCIG00000034973) #31	ARIH2 (ENSPCIG00000022175) #32	SLC25A20 (ENSPCIG00000022183) #35	PRKAR2A (ENSPCIG00000022186) #36	IP6K2 (ENSPCIG00000022187) #37	NCKIPSD (ENSPCIG00000022191)
koala	MODERN SPECIES	75	AMIGO3 (ENSPCIG00000021572)	RNF123 (ENSPCIG00000021575)	MST1 (ENSPCIG00000021592)	APEH (ENSPCIG00000021665)	DAG1 (ENSPCIG00000021945) #9	NICN1 (ENSPCIG00000011868) #10	AMT (ENSPCIG00000011871) #11	TCTA (ENSPCIG00000033201) #12	ENSPCIG00000011878 #14	GPX1 (ENSPCIG00000011881) #15	USP4 (ENSPCIG00000011972) #16	C3orf62 (ENSPCIG00000018125) #17	ENSPCIG00000018126 #19	ENSPCIG00000018127 #20	KLHDC8B (ENSPCIG00000018128) #21	ENSPCIG00000018130 #22	LAMB2 (ENSPCIG00000018185) #22	USP19 (ENSPCIG00000018723) #23	ENSPCIG00000018725	QARS1 (ENSPCIG00000018726) #24	QRICH1 (ENSPCIG00000018727) #25	ENSPCIG00000018761 #26	NDUFAF3 (ENSPCIG00000022141) #28	DALRD3 (ENSPCIG00000022151) #29	ENSPCIG00000022163 #30	ENSPCIG00000022172	P4HTM (ENSPCIG00000034973) #31	ARIH2 (ENSPCIG00000022175) #32	SLC25A20 (ENSPCIG00000022183) #35	PRKAR2A (ENSPCIG00000022186) #36	IP6K2 (ENSPCIG00000022187) #37
Common wonbat	DUPLICATION
Common wonbat	MODERN SPECIES	179																LAMB2 (ENSVURG00010015330) #22	USP19 (ENSVURG00010015483) #23
Common wonbat	MODERN SPECIES	1056	MST1 (ENSVURG00010018107)	APEH (ENSVURG00010018119)	BSN (ENSVURG00010018149) #7	DAG1 (ENSVURG00010018158) #9	NICN1 (ENSVURG00010018161) #10	AMT (ENSVURG00010018166) #11	TCTA (ENSVURG00010018195) #12	ENSVURG00010018206 #14	GPX1 (ENSVURG00010018210) #15	USP4 (ENSVURG00010018217) #16	C3orf62 (ENSVURG00010018240) #17	ENSVURG00010018249 #19	KLHDC8B (ENSVURG00010018258) #21	ENSVURG00010018269	ENSVURG00010018280	ENSVURG00010018298 #22	ENSVURG00010018344	QARS1 (ENSVURG00010018357) #24	QRICH1 (ENSVURG00010018382) #25	IMPDH2 (ENSVURG00010018392) #26	NDUFAF3 (ENSVURG00010018404) #28	DALRD3 (ENSVURG00010018421) #29	ENSVURG00010018436 #30	ENSVURG00010018443	P4HTM (ENSVURG00010018449) #31	SLC25A20 (ENSVURG00010018452) #35	PRKAR2A (ENSVURG00010018461) #36	IP6K2 (ENSVURG00010018463) #37	NCKIPSD (ENSVURG00010018472)	ENSVURG00010018484	SLC26A6 (ENSVURG00010018489)
Tasmanian devil	DUPLICATION
Tasmanian devil	MODERN SPECIES		DAG1 (ENSSHAG00000016867) #9	NICN1 (ENSSHAG00000031377) #10	AMT (ENSSHAG00000016474) #11	TCTA (ENSSHAG00000020820) #12	ENSSHAG00000016308 #14	GPX1 (ENSSHAG00000031759) #15	USP4 (ENSSHAG00000016024) #16	C3orf62 (ENSSHAG00000029899) #17	ENSSHAG00000015747 #19	ENSSHAG00000024380 #20	KLHDC8B (ENSSHAG00000027422) #21	ENSSHAG00000015577	ENSSHAG00000028406	ENSSHAG00000030662 #22	USP19 (ENSSHAG00000015212) #23	LAMB2 (ENSSHAG00000015322) #22	ENSSHAG00000031850	QRICH1 (ENSSHAG00000023020) #25	QARS1 (ENSSHAG00000015068) #24	IMPDH2 (ENSSHAG00000022188) #26	NDUFAF3 (ENSSHAG00000014794) #28	DALRD3 (ENSSHAG00000024349) #29	ENSSHAG00000014674 #30	ENSSHAG00000025091	ARIH2 (ENSSHAG00000014344) #32	SLC25A20 (ENSSHAG00000029717) #35	PRKAR2A (ENSSHAG00000023624) #36	IP6K2 (ENSSHAG00000012845) #37	CELSR3 (ENSSHAG00000012387)	SLC26A6 (ENSSHAG00000012116)	ENSSHAG00000031602
Tasmanian devil	MODERN SPECIES		BSN (ENSSHAG00000020766) #7	ENSSHAG00000021948	DAG1 (ENSSHAG00000016867) #9	NICN1 (ENSSHAG00000031377) #10	AMT (ENSSHAG00000016474) #11	TCTA (ENSSHAG00000020820) #12	ENSSHAG00000016308 #14	GPX1 (ENSSHAG00000031759) #15	USP4 (ENSSHAG00000016024) #16	C3orf62 (ENSSHAG00000029899) #17	ENSSHAG00000015747 #19	ENSSHAG00000024380 #20	KLHDC8B (ENSSHAG00000027422) #21	ENSSHAG00000015577	ENSSHAG00000028406	ENSSHAG00000030662 #22	USP19 (ENSSHAG00000015212) #23	LAMB2 (ENSSHAG00000015322) #22	ENSSHAG00000031850	QRICH1 (ENSSHAG00000023020) #25	QARS1 (ENSSHAG00000015068) #24	IMPDH2 (ENSSHAG00000022188) #26	NDUFAF3 (ENSSHAG00000014794) #28	DALRD3 (ENSSHAG00000024349) #29	ENSSHAG00000014674 #30	ENSSHAG00000025091	ARIH2 (ENSSHAG00000014344) #32	SLC25A20 (ENSSHAG00000029717) #35	PRKAR2A (ENSSHAG00000023624) #36	IP6K2 (ENSSHAG00000012845) #37	CELSR3 (ENSSHAG00000012387)
Platypus	DUPLICATION
Platypus	MODERN SPECIES	84	TADA3 (ENSOANG00000012084)	ARPC4 (ENSOANG00000012083)	ENSOANG00000012082	ENSOANG00000012081	CIDEC (ENSOANG00000041209)	JAGN1 (ENSOANG00000041559)	IL17RE (ENSOANG00000004459)	IL17RC (ENSOANG00000010509)	CRELD1 (ENSOANG00000004057)	ENSOANG00000042375	ENSOANG00000042177	KLHDC8B (ENSOANG00000013712) #21	ENSOANG00000012254	ENSOANG00000008128	ENSOANG00000046400 #22	LAMB2 (ENSOANG00000004144) #22	USP19 (ENSOANG00000002437) #23	ENSOANG00000036939	ENSOANG00000015022	QARS1 (ENSOANG00000014118) #24	QRICH1 (ENSOANG00000010904) #25	IMPDH2 (ENSOANG00000010907) #26	NDUFAF3 (ENSOANG00000010908) #28	DALRD3 (ENSOANG00000010909) #29	ENSOANG00000010910 #30	P4HTM (ENSOANG00000048877) #31	ARIH2 (ENSOANG00000041696) #32	SLC25A20 (ENSOANG00000007566) #35	PRKAR2A (ENSOANG00000020926) #36	IP6K2 (ENSOANG00000001845) #37	NCKIPSD (ENSOANG00000001846)
Platypus	MODERN SPECIES	84	CAMK1 (ENSOANG00000012085)	TADA3 (ENSOANG00000012084)	ARPC4 (ENSOANG00000012083)	ENSOANG00000012082	ENSOANG00000012081	CIDEC (ENSOANG00000041209)	JAGN1 (ENSOANG00000041559)	IL17RE (ENSOANG00000004459)	IL17RC (ENSOANG00000010509)	CRELD1 (ENSOANG00000004057)	ENSOANG00000042375	ENSOANG00000042177	KLHDC8B (ENSOANG00000013712) #21	ENSOANG00000012254	ENSOANG00000008128	ENSOANG00000046400 #22	LAMB2 (ENSOANG00000004144) #22	USP19 (ENSOANG00000002437) #23	ENSOANG00000036939	ENSOANG00000015022	QARS1 (ENSOANG00000014118) #24	QRICH1 (ENSOANG00000010904) #25	IMPDH2 (ENSOANG00000010907) #26	NDUFAF3 (ENSOANG00000010908) #28	DALRD3 (ENSOANG00000010909) #29	ENSOANG00000010910 #30	P4HTM (ENSOANG00000048877) #31	ARIH2 (ENSOANG00000041696) #32	SLC25A20 (ENSOANG00000007566) #35	PRKAR2A (ENSOANG00000020926) #36	IP6K2 (ENSOANG00000001845) #37
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000156378.b	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00730000111360	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00940000164714	ENSGT01050000244841.A.b.b.b	ENSGT00940000153394.d	ENSGT00420000030545.h	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000164203
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00640000091554	ENSGT00940000156378.b	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00730000111360	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00940000164714	ENSGT00420000030545.h	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000164203	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00640000091554	ENSGT00940000156378.b	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00730000111360	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00950000185305	ENSGT00420000030545.h	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000164203	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00510000048121
Testudinoidea	DUPLICATION
Testudinoidea	DUPLICATION
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156378.b	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00730000111360	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060.eb #22	ENSGT00940000156060.db.a #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00950000185305	ENSGT00420000030545.h	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000164203	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00510000048121
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	73	ENSGT00640000091554	ENSGT00940000156378.b	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00730000111360	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060.eb #22	ENSGT00940000156060.db.a #22
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Emydidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156060.db.a #22
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	1882																ENSTMTG00000019638 #22
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156060.db.b #22
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000156378.b	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00730000111360	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060.eb #22	ENSGT00940000156060.db.b #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT01050000244841.A.b.b.b	ENSGT00420000030545.h	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000164203	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00510000048121
painted turtle	MODERN SPECIES	847	TADA3 (ENSCPBG00000008847)	ARPC4 (ENSCPBG00000008842)	TTLL3 (ENSCPBG00000008831)	RPUSD3 (ENSCPBG00000008825)	JAGN1 (ENSCPBG00000008821)	ENSCPBG00000008818	IL17RC (ENSCPBG00000008800)	ENSCPBG00000008794	CRELD1 (ENSCPBG00000008789)	PRRT3 (ENSCPBG00000008778)	IHO1 (ENSCPBG00000008768) #19	KLHDC8B (ENSCPBG00000008754) #21	ENSCPBG00000008746	CCDC71 (ENSCPBG00000008741)	ENSCPBG00000008727 #22	LAMB2 (ENSCPBG00000008695) #22	USP19 (ENSCPBG00000008674) #23	ENSCPBG00000008654	ENSCPBG00000008650	QARS1 (ENSCPBG00000008614) #24	QRICH1 (ENSCPBG00000008585) #25	IMPDH2 (ENSCPBG00000004204) #26	NDUFAF3 (ENSCPBG00000004053) #28	DALRD3 (ENSCPBG00000004002) #29	WDR6 (ENSCPBG00000003992) #30	P4HTM (ENSCPBG00000003969) #31	ENSCPBG00000003958	ARIH2 (ENSCPBG00000003938) #32	SLC25A20 (ENSCPBG00000003921) #35	PRKAR2A (ENSCPBG00000003911) #36	HTD2 (ENSCPBG00000003897)
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	5																ENSGT00940000156060.db.b #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00950000185305	ENSGT00420000030545.h	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000164203	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00510000048121
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	21	ARPC4 (ENSGEVG00005010846)	ENSGEVG00005010805	TTLL3 (ENSGEVG00005010625)	RPUSD3 (ENSGEVG00005010561)	JAGN1 (ENSGEVG00005010538)	ENSGEVG00005010509	ENSGEVG00005010477	CRELD1 (ENSGEVG00005010448)	PRRT3 (ENSGEVG00005010395)	KLHDC8B (ENSGEVG00005010358) #21	CCDC71 (ENSGEVG00005010338)	ENSGEVG00005009975 #22	ENSGEVG00005009835 #22	ENSGEVG00005009770 #23	ENSGEVG00005009738	ENSGEVG00005009670 #22	ENSGEVG00005009358 #23	ENSGEVG00005009048	QARS1 (ENSGEVG00005008899) #24	QRICH1 (ENSGEVG00005008845) #25	IMPDH2 (ENSGEVG00005008788) #26	NDUFAF3 (ENSGEVG00005008759) #28	DALRD3 (ENSGEVG00005008702) #29	WDR6 (ENSGEVG00005008674) #30	ENSGEVG00005008651	P4HTM (ENSGEVG00005008597) #31	ARIH2 (ENSGEVG00005008565) #32	SLC25A20 (ENSGEVG00005008545) #35	PRKAR2A (ENSGEVG00005008524) #36	RPP14 (ENSGEVG00005008471)	HTD2 (ENSGEVG00005008441)
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00640000091554	ENSGT00940000156378.b	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00730000111360	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060.eb #22	ENSGT00940000156060.db.a #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00950000185305	ENSGT00420000030545.h	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000164203	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36
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Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	258												CRELD1 (ENSCABG00000022534)	PRRT3 (ENSCABG00000022531)	IHO1 (ENSCABG00000022528) #19	KLHDC8B (ENSCABG00000022527) #21	ENSCABG00000022516 #22	ENSCABG00000022508 #22	SLC35F1 (ENSCABG00000022505)
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00640000091554	ENSGT00940000156378.b	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00730000111360	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060.eb #22	ENSGT00940000156060.db.b #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT01050000244841.A.b.b.b	ENSGT00420000030545.h	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000164203	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36
painted turtle	MODERN SPECIES	847	CAMK1 (ENSCPBG00000008861)	TADA3 (ENSCPBG00000008847)	ARPC4 (ENSCPBG00000008842)	TTLL3 (ENSCPBG00000008831)	RPUSD3 (ENSCPBG00000008825)	JAGN1 (ENSCPBG00000008821)	ENSCPBG00000008818	IL17RC (ENSCPBG00000008800)	ENSCPBG00000008794	CRELD1 (ENSCPBG00000008789)	PRRT3 (ENSCPBG00000008778)	IHO1 (ENSCPBG00000008768) #19	KLHDC8B (ENSCPBG00000008754) #21	ENSCPBG00000008746	CCDC71 (ENSCPBG00000008741)	ENSCPBG00000008727 #22	LAMB2 (ENSCPBG00000008695) #22	USP19 (ENSCPBG00000008674) #23	ENSCPBG00000008654	ENSCPBG00000008650	QARS1 (ENSCPBG00000008614) #24	QRICH1 (ENSCPBG00000008585) #25	IMPDH2 (ENSCPBG00000004204) #26	NDUFAF3 (ENSCPBG00000004053) #28	DALRD3 (ENSCPBG00000004002) #29	WDR6 (ENSCPBG00000003992) #30	P4HTM (ENSCPBG00000003969) #31	ENSCPBG00000003958	ARIH2 (ENSCPBG00000003938) #32	SLC25A20 (ENSCPBG00000003921) #35	PRKAR2A (ENSCPBG00000003911) #36
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00640000091554	ENSGT00940000156378.b	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00730000111360	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00940000164714	ENSGT00420000030545.h	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000164203	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35
Aves	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00640000091554	ENSGT00940000156378.b	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00730000111360	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00940000164714	ENSGT00420000030545.h	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000164203	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00640000091554	ENSGT00940000156378.b	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00730000111360	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00940000164714	ENSGT00420000030545.h	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000164203	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00640000091554	ENSGT00940000156378.b	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00730000111360	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00940000164714	ENSGT00420000030545.h	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000164203	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00640000091554	ENSGT00940000156378.b	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00730000111360	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00940000164714	ENSGT00420000030545.h	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000164203	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36
Kakapo	MODERN SPECIES	3	OGG1 (ENSSHBG00005010686)	CAMK1 (ENSSHBG00005010646)	TADA3 (ENSSHBG00005010597)	ENSSHBG00005010558	RPUSD3 (ENSSHBG00005010534)	JAGN1 (ENSSHBG00005000972)	ENSSHBG00005000970	ENSSHBG00005000969	ENSSHBG00005018060	CRELD1 (ENSSHBG00005018057)	PRRT3 (ENSSHBG00005018053)	ENSSHBG00005018050	KLHDC8B (ENSSHBG00005018042) #21	ENSSHBG00005018034	CCDC71 (ENSSHBG00005018032)	LAMB2 (ENSSHBG00005017487) #22	USP19 (ENSSHBG00005016544) #23	ENSSHBG00005016461	ENSSHBG00005016456	QARS1 (ENSSHBG00005016441) #24	QRICH1 (ENSSHBG00005016422) #25	ENSSHBG00005016413 #27	IMPDH2 (ENSSHBG00005016402) #26	NDUFAF3 (ENSSHBG00005016388) #28	DALRD3 (ENSSHBG00005016365) #29	WDR6 (ENSSHBG00005016352) #30	ENSSHBG00005016345	P4HTM (ENSSHBG00005016338) #31	ARIH2 (ENSSHBG00005016333) #32	SLC25A20 (ENSSHBG00005016329) #35	PRKAR2A (ENSSHBG00005016314) #36
Golden eagle	DUPLICATION
Golden eagle	MODERN SPECIES	12	OGG1 (ENSACCG00020010217)	CAMK1 (ENSACCG00020010247)	TADA3 (ENSACCG00020010271)	ARPC4 (ENSACCG00020010285)	TTLL3 (ENSACCG00020010308)	RPUSD3 (ENSACCG00020010325)	JAGN1 (ENSACCG00020010336)	IL17RE (ENSACCG00020010363)	IL17RC (ENSACCG00020010397)	CRELD1 (ENSACCG00020010416)	PRRT3 (ENSACCG00020010432)	ENSACCG00020010449 #19	KLHDC8B (ENSACCG00020010458) #21	ENSACCG00020010479	CCDC71 (ENSACCG00020010491)	LAMB2 (ENSACCG00020010517) #22	ENSACCG00020010613 #22	USP19 (ENSACCG00020011256) #23	ENSACCG00020011898	ENSACCG00020011936	QARS1 (ENSACCG00020011978) #24	QRICH1 (ENSACCG00020012022) #25	IMPDH2 (ENSACCG00020012264) #26	NDUFAF3 (ENSACCG00020012422) #28	DALRD3 (ENSACCG00020012461) #29	ENSACCG00020012507 #30	P4HTM (ENSACCG00020012539) #31	ENSACCG00020012568	ARIH2 (ENSACCG00020012611) #32	SLC25A20 (ENSACCG00020012666) #35	PRKAR2A (ENSACCG00020012703) #36
Golden eagle	MODERN SPECIES	12	CAMK1 (ENSACCG00020010247)	TADA3 (ENSACCG00020010271)	ARPC4 (ENSACCG00020010285)	TTLL3 (ENSACCG00020010308)	RPUSD3 (ENSACCG00020010325)	JAGN1 (ENSACCG00020010336)	IL17RE (ENSACCG00020010363)	IL17RC (ENSACCG00020010397)	CRELD1 (ENSACCG00020010416)	PRRT3 (ENSACCG00020010432)	ENSACCG00020010449 #19	KLHDC8B (ENSACCG00020010458) #21	ENSACCG00020010479	CCDC71 (ENSACCG00020010491)	LAMB2 (ENSACCG00020010517) #22	ENSACCG00020010613 #22	USP19 (ENSACCG00020011256) #23	ENSACCG00020011898	ENSACCG00020011936	QARS1 (ENSACCG00020011978) #24	QRICH1 (ENSACCG00020012022) #25	IMPDH2 (ENSACCG00020012264) #26	NDUFAF3 (ENSACCG00020012422) #28	DALRD3 (ENSACCG00020012461) #29	ENSACCG00020012507 #30	P4HTM (ENSACCG00020012539) #31	ENSACCG00020012568	ARIH2 (ENSACCG00020012611) #32	SLC25A20 (ENSACCG00020012666) #35	PRKAR2A (ENSACCG00020012703) #36	RPP14 (ENSACCG00020012728)
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Great tit	DUPLICATION
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Duck	MODERN SPECIES	4	LSM3 (ENSAPLG00000014499)	SLC6A6 (ENSAPLG00000011407)	GRIP2 (ENSAPLG00000010553)	CCDC174 (ENSAPLG00000010346)	ENSAPLG00000010242	PLXNB1 (ENSAPLG00000008562)	ENSAPLG00000022004	SETD5 (ENSAPLG00000007096)	LHFPL4 (ENSAPLG00000019972)	ENSAPLG00000028999	MTMR14 (ENSAPLG00000006428)	IHO1 (ENSAPLG00000016107) #19	KLHDC8B (ENSAPLG00000019922) #21	ENSAPLG00000030196	ENSAPLG00000029637	LAMB2 (ENSAPLG00000008249) #22	USP19 (ENSAPLG00000007654) #23	ENSAPLG00000030026	ENSAPLG00000030295	QARS1 (ENSAPLG00000007248) #24	QRICH1 (ENSAPLG00000007130) #25	IMPDH2 (ENSAPLG00000006986) #26	NDUFAF3 (ENSAPLG00000024636) #28	DALRD3 (ENSAPLG00000006918) #29	WDR6 (ENSAPLG00000025697) #30	ENSAPLG00000006785	P4HTM (ENSAPLG00000006841) #31	ARIH2 (ENSAPLG00000006502) #32	SLC25A20 (ENSAPLG00000029472) #35	PRKAR2A (ENSAPLG00000006277) #36	RPP14 (ENSAPLG00000006272)
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	91										IL17RE (ENSABRG00000017585)	IL17RC (ENSABRG00000017595)	PRRT3 (ENSABRG00000017604)	IHO1 (ENSABRG00000017607) #19	KLHDC8B (ENSABRG00000017609) #21	CCDC71 (ENSABRG00000017612)	LAMB2 (ENSABRG00000017620) #22	USP19 (ENSABRG00000017644) #23	ENSABRG00000017664	ENSABRG00000017670	QRICH1 (ENSABRG00000017813) #25	IMPDH2 (ENSABRG00000017852) #26	NDUFAF3 (ENSABRG00000018501) #28	DALRD3 (ENSABRG00000018505) #29	WDR6 (ENSABRG00000018507) #30	P4HTM (ENSABRG00000018510) #31	ENSABRG00000018535	ARIH2 (ENSABRG00000018552) #32	SLC25A20 (ENSABRG00000018818) #35	PRKAR2A (ENSABRG00000018891) #36	RPP14 (ENSABRG00000018912)	HTD2 (ENSABRG00000018916)
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00640000091554	ENSGT00940000156378.b	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000005596.i	ENSGT00940000161421.b	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00730000111360	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00940000164714	ENSGT00420000030545.h	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000164203	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00510000048121
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157794	ENSGT00640000091554	ENSGT00940000156378.b	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000005596.i	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00730000111360	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00940000164714	ENSGT00420000030545.h	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000164203	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36	ENSGT00510000048121
Turkey	MODERN SPECIES	5	ENSMGAG00000016407	ENSMGAG00000008000	SETD5 (ENSMGAG00000007897)	LHFPL4 (ENSMGAG00000008224)	MTMR14 (ENSMGAG00000008243)	CPNE9 (ENSMGAG00000008248)	BRPF1 (ENSMGAG00000008276)	OGG1 (ENSMGAG00000008346)	CAMK1 (ENSMGAG00000008359)	TADA3 (ENSMGAG00000008391)	TTLL3 (ENSMGAG00000008412)	JAGN1 (ENSMGAG00000016819)	CRELD1 (ENSMGAG00000008449)	ENSMGAG00000008459 #19	ENSMGAG00000008466	LAMB2 (ENSMGAG00000008010) #22	USP19 (ENSMGAG00000008096) #23	ENSMGAG00000008103	ENSMGAG00000019310	QARS1 (ENSMGAG00000008134) #24	QRICH1 (ENSMGAG00000008194) #25	IMPDH2 (ENSMGAG00000008504) #26	NDUFAF3 (ENSMGAG00000019024) #28	DALRD3 (ENSMGAG00000008545) #29	ENSMGAG00000008550 #30	P4HTM (ENSMGAG00000008559) #31	ENSMGAG00000008569	ARIH2 (ENSMGAG00000008587) #32	SLC25A20 (ENSMGAG00000008643) #35	PRKAR2A (ENSMGAG00000008680) #36	RPP14 (ENSMGAG00000015512)
Chicken	DUPLICATION
Chicken	DUPLICATION
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Chicken	MODERN SPECIES	3	TADA3 (ENSGALG00010021568)	ARPC4 (ENSGALG00010021599)	ENSGALG00010021603	ENSGALG00010021616	RPUSD3 (ENSGALG00010021646)	JAGN1 (ENSGALG00010021657)	IL17RC (ENSGALG00010019246)	CRELD1 (ENSGALG00010019310)	PRRT3 (ENSGALG00010019315)	CCDC36 (ENSGALG00010021775) #19	KLHDC8B (ENSGALG00010021792) #21	ENSGALG00010021799	CCDC71 (ENSGALG00010021785)	ENSGALG00010022674 #22	LAMB2 (ENSGALG00010021762) #22	ENSGALG00010019255 #22	USP19 (ENSGALG00010022242) #23	SLC6A8 (ENSGALG00010020607)	SLC6A8 (ENSGALG00010019231)	ENSGALG00010022258	QARS (ENSGALG00010020619) #24	QRICH1 (ENSGALG00010020630) #25	IMPDH2 (ENSGALG00010020638) #26	NDUFAF3 (ENSGALG00010020653) #28	DALRD3 (ENSGALG00010020657) #29	ENSGALG00010020670 #30	P4HTM (ENSGALG00010020684) #31	ENSGALG00010020695	ARIH2 (ENSGALG00010020732) #32	SLC25A20 (ENSGALG00010020754) #35	PRKAR2A (ENSGALG00010020764) #36
Chicken	MODERN SPECIES	3	OGG1 (ENSGALG00010021546)	CAMK1 (ENSGALG00010021556)	TADA3 (ENSGALG00010021568)	ARPC4 (ENSGALG00010021599)	ENSGALG00010021603	ENSGALG00010021616	RPUSD3 (ENSGALG00010021646)	JAGN1 (ENSGALG00010021657)	IL17RC (ENSGALG00010019246)	CRELD1 (ENSGALG00010019310)	PRRT3 (ENSGALG00010019315)	CCDC36 (ENSGALG00010021775) #19	KLHDC8B (ENSGALG00010021792) #21	ENSGALG00010021799	CCDC71 (ENSGALG00010021785)	ENSGALG00010022674 #22	LAMB2 (ENSGALG00010021762) #22	ENSGALG00010019255 #22	USP19 (ENSGALG00010022242) #23	SLC6A8 (ENSGALG00010020607)	SLC6A8 (ENSGALG00010019231)	ENSGALG00010022258	QARS (ENSGALG00010020619) #24	QRICH1 (ENSGALG00010020630) #25	IMPDH2 (ENSGALG00010020638) #26	NDUFAF3 (ENSGALG00010020653) #28	DALRD3 (ENSGALG00010020657) #29	ENSGALG00010020670 #30	P4HTM (ENSGALG00010020684) #31	ENSGALG00010020695	ARIH2 (ENSGALG00010020732) #32
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000156378.b	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00730000111360	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00940000164714	ENSGT01050000244841.A.b.b.b	ENSGT00940000153394.d	ENSGT00420000030545.h	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000164203	ENSGT00940000154875 #32
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000156378.b	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00730000111360	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00940000164714	ENSGT01050000244841.A.b.b.b	ENSGT00940000153394.d	ENSGT00420000030545.h	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00940000164203	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000156378.b	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00730000111360	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00940000164714	ENSGT00940000153394.d	ENSGT00420000030545.h	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000164203	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35	ENSGT00940000154836 #36
Argentine black and white tegu	DUPLICATION
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Common wall lizard	DUPLICATION
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Common wall lizard	MODERN SPECIES	10	CAMK1 (ENSPMRG00000019817)	TADA3 (ENSPMRG00000019811)	ARPC4 (ENSPMRG00000019805)	ENSPMRG00000019795	ENSPMRG00000019790	RPUSD3 (ENSPMRG00000019782)	JAGN1 (ENSPMRG00000019778)	IL17RE (ENSPMRG00000019760)	IL17RC (ENSPMRG00000019740)	CRELD1 (ENSPMRG00000019728)	C3orf84 (ENSPMRG00000019699) #20	KLHDC8B (ENSPMRG00000019681) #21	ENSPMRG00000019673	CCDC71 (ENSPMRG00000019666)	ENSPMRG00000019663	ENSPMRG00000017713 #22	LAMB2 (ENSPMRG00000015114) #22	USP19 (ENSPMRG00000014705) #23	ENSPMRG00000014196	ENSPMRG00000014107	ENSPMRG00000014095	ENSPMRG00000014089	QARS1 (ENSPMRG00000013878) #24	QRICH1 (ENSPMRG00000013823) #25	IMPDH2 (ENSPMRG00000013803) #26	NDUFAF3 (ENSPMRG00000013795) #28	DALRD3 (ENSPMRG00000013785) #29	WDR6 (ENSPMRG00000013779) #30	ENSPMRG00000013772	P4HTM (ENSPMRG00000013765) #31	ARIH2 (ENSPMRG00000013741) #32
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00640000091554	ENSGT00940000156378.b	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00730000111360	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00950000185305	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00940000164714	ENSGT01050000244841.A.b.b.b	ENSGT00940000153394.d	ENSGT00420000030545.h	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35
Lizard	DUPLICATION
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Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156378.b.d	ENSGT00940000156378.b.c	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857.d	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00730000111360	ENSGT00980000198877	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00940000164714	ENSGT01050000244841.A.b.b.b	ENSGT00940000153394.d	ENSGT00420000030545.h	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621.g.b #29	ENSGT00390000014621.g.a #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35
Indian cobra	DUPLICATION
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Indian cobra	MODERN SPECIES	1	BRPF1 (ENSNNAG00000000879)	OGG1 (ENSNNAG00000000945)	ENSNNAG00000001157	ENSNNAG00000001203	TADA3 (ENSNNAG00000001245)	ARPC4 (ENSNNAG00000001264)	TTLL3 (ENSNNAG00000001283)	RPUSD3 (ENSNNAG00000001292)	JAGN1 (ENSNNAG00000001308)	ENSNNAG00000001313	ENSNNAG00000001329	CRELD1 (ENSNNAG00000001343)	ENSNNAG00000001369	C3orf84 (ENSNNAG00000001403) #20	KLHDC8B (ENSNNAG00000001437) #21	ENSNNAG00000001457 #22	LAMB2 (ENSNNAG00000001533) #22	USP19 (ENSNNAG00000001936) #23	ENSNNAG00000002819	ENSNNAG00000002829	ENSNNAG00000002833	ENSNNAG00000002836	ENSNNAG00000002846 #24	QRICH1 (ENSNNAG00000002859) #25	IMPDH2 (ENSNNAG00000002870) #26	NDUFAF3 (ENSNNAG00000002892) #28	ENSNNAG00000002905 #29	ENSNNAG00000002914 #29	ENSNNAG00000002924 #30	P4HTM (ENSNNAG00000002941) #31	ARIH2 (ENSNNAG00000002958) #32
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	69	ENSGT00940000157794.c	ENSGT00640000091554	ENSGT00940000156378.b.c	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857.d	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00980000198877	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00940000164714	ENSGT01050000244841.A.b.b.b	ENSGT00940000153394.d	ENSGT00420000030545.h	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621.g.b #29	ENSGT00390000014621.g.a #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35
Blue-lipped sea krait	DUPLICATION
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	6062																ENSLLTG00000009697 #22	USP19 (ENSLLTG00000009725) #23	ENSLLTG00000009785
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	6765																ENSLLTG00000015382 #22
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	67	ENSGT00640000091554	ENSGT00940000156378.b.d	ENSGT00940000156378.b.c	ENSGT00390000008947	ENSGT00390000016233	ENSGT00940000154857.d	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00980000198877	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00940000164714	ENSGT01050000244841.A.b.b.b	ENSGT00940000153394.d	ENSGT00420000030545.h	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621.g.b #29	ENSGT00390000014621.g.a #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00940000157863 #35
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	180	OGG1 (ENSNSUG00000004314)	CAMK1 (ENSNSUG00000004322)	ENSNSUG00000004422	ENSNSUG00000004459	ARPC4 (ENSNSUG00000004486)	TTLL3 (ENSNSUG00000004487)	RPUSD3 (ENSNSUG00000004492)	JAGN1 (ENSNSUG00000004497)	ENSNSUG00000004507	CRELD1 (ENSNSUG00000004509)	ENSNSUG00000004512	C3orf84 (ENSNSUG00000004516) #20	KLHDC8B (ENSNSUG00000004528) #21	CCDC71 (ENSNSUG00000004533)	ENSNSUG00000004534	LAMB2 (ENSNSUG00000004564) #22	USP19 (ENSNSUG00000005212) #23	ENSNSUG00000005768	ENSNSUG00000005769	ENSNSUG00000005770	ENSNSUG00000005771	QARS1 (ENSNSUG00000005772) #24	QRICH1 (ENSNSUG00000006247) #25	IMPDH2 (ENSNSUG00000006248) #26	NDUFAF3 (ENSNSUG00000006250) #28	ENSNSUG00000006253 #29	ENSNSUG00000006254 #29	WDR6 (ENSNSUG00000006255) #30	P4HTM (ENSNSUG00000006258) #31	ARIH2 (ENSNSUG00000006307) #32	SLC25A20 (ENSNSUG00000006388) #35
Eastern brown snake	DUPLICATION
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	100	CPNE9 (ENSPTXG00000012841)	BRPF1 (ENSPTXG00000012844)	OGG1 (ENSPTXG00000012847)	CAMK1 (ENSPTXG00000012848)	TADA3 (ENSPTXG00000012849)	ARPC4 (ENSPTXG00000012850)	TTLL3 (ENSPTXG00000012851)	RPUSD3 (ENSPTXG00000012852)	JAGN1 (ENSPTXG00000012853)	IL17RE (ENSPTXG00000012854)	ENSPTXG00000012855	C3orf84 (ENSPTXG00000012856) #20	KLHDC8B (ENSPTXG00000012857) #21	CCDC71 (ENSPTXG00000012858)	ENSPTXG00000012859 #22	LAMB2 (ENSPTXG00000012864) #22	USP19 (ENSPTXG00000009840) #23	ENSPTXG00000010167	ENSPTXG00000010168	ENSPTXG00000010169	ENSPTXG00000010170	QARS1 (ENSPTXG00000010171) #24	QRICH1 (ENSPTXG00000010172) #25	IMPDH2 (ENSPTXG00000010173) #26	NDUFAF3 (ENSPTXG00000010175) #28	DALRD3 (ENSPTXG00000010179) #29	ENSPTXG00000010184 #30	ENSPTXG00000010186 #30	P4HTM (ENSPTXG00000010190) #31	ARIH2 (ENSPTXG00000010213) #32	SLC25A20 (ENSPTXG00000010215) #35
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	100	MTMR14 (ENSPTXG00000012837)	CPNE9 (ENSPTXG00000012841)	BRPF1 (ENSPTXG00000012844)	OGG1 (ENSPTXG00000012847)	CAMK1 (ENSPTXG00000012848)	TADA3 (ENSPTXG00000012849)	ARPC4 (ENSPTXG00000012850)	TTLL3 (ENSPTXG00000012851)	RPUSD3 (ENSPTXG00000012852)	JAGN1 (ENSPTXG00000012853)	IL17RE (ENSPTXG00000012854)	ENSPTXG00000012855	C3orf84 (ENSPTXG00000012856) #20	KLHDC8B (ENSPTXG00000012857) #21	CCDC71 (ENSPTXG00000012858)	ENSPTXG00000012859 #22	LAMB2 (ENSPTXG00000012864) #22	USP19 (ENSPTXG00000009840) #23	ENSPTXG00000010167	ENSPTXG00000010168	ENSPTXG00000010169	ENSPTXG00000010170	QARS1 (ENSPTXG00000010171) #24	QRICH1 (ENSPTXG00000010172) #25	IMPDH2 (ENSPTXG00000010173) #26	NDUFAF3 (ENSPTXG00000010175) #28	DALRD3 (ENSPTXG00000010179) #29	ENSPTXG00000010184 #30	ENSPTXG00000010186 #30	P4HTM (ENSPTXG00000010190) #31	ARIH2 (ENSPTXG00000010213) #32
Anura	ANCESTRAL SPECIES	36			ENSGT00940000154857	ENSGT00940000161059	ENSGT00390000018596.A.a.a	ENSGT00390000005596	ENSGT00940000161421	ENSGT00730000111286	ENSGT00940000160255	ENSGT00660000097455	ENSGT00390000012418 #19	ENSGT00390000002177 #20	ENSGT00940000160815 #21	ENSGT00390000003093	ENSGT00940000155306.a	ENSGT00940000156060 #22	ENSGT00940000159085 #23	ENSGT00940000164714	ENSGT01050000244841.A.b.b.b	ENSGT00940000153394.d	ENSGT00550000074972 #24	ENSGT00940000155241 #25	ENSGT00940000157726 #26	ENSGT00910000146976 #27	ENSGT00390000018312 #28	ENSGT00390000014621 #29	ENSGT00420000029923 #30	ENSGT00390000014570 #31	ENSGT00940000164203	ENSGT00940000154875 #32	ENSGT00950000182994.B.a.a.b
Frog	MODERN SPECIES	4	cidec (ENSXETG00000023547)	rpusd3 (ENSXETG00000023546)	XB5950141 [provisional] (ENSXETG00000023542)	creld1 (ENSXETG00000023532)	ENSXETG00000036031	ENSXETG00000042322	ENSXETG00000022412	ENSXETG00000041849	ENSXETG00000045036	ENSXETG00000023522	iho1 (ENSXETG00000041762) #19	C3orf84 (ENSXETG00000040873) #20	klhdc8b (ENSXETG00000023516) #21	ENSXETG00000035111	ccdc71 (ENSXETG00000039218)	lamb2 (ENSXETG00000032994) #22	usp19 (ENSXETG00000008619) #23	slc6a8l (ENSXETG00000008612)	gpr22l (ENSXETG00000047479)	ENSXETG00000008605	pim1 (ENSXETG00000045263)	qars1 (ENSXETG00000009351) #24	qrich1 (ENSXETG00000009347) #25	ENSXETG00000035974 #27	impdh2 (ENSXETG00000009343) #26	ndufaf3 (ENSXETG00000024755) #28	dalrd3 (ENSXETG00000009339) #29	wdr6 (ENSXETG00000009340) #30	ENSXETG00000009337	arih2 (ENSXETG00000024753) #32	frzb2 (ENSXETG00000009335)
Leishan spiny toad	DUPLICATION
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	11	CIDEC (ENSLLEG00000028241)	JAGN1 (ENSLLEG00000028213)	IL17RE (ENSLLEG00000028072)	ENSLLEG00000027785	CRELD1 (ENSLLEG00000027721)	ENSLLEG00000027685	ENSLLEG00000027655	ENSLLEG00000027608	ENSLLEG00000027542	ENSLLEG00000027476	ENSLLEG00000027428 #20	KLHDC8B (ENSLLEG00000027384) #21	ENSLLEG00000027280	CCDC71 (ENSLLEG00000027265)	ENSLLEG00000027016 #22	LAMB2 (ENSLLEG00000026738) #22	ENSLLEG00000026400 #23	ENSLLEG00000025801	ENSLLEG00000025735	ENSLLEG00000025646	ENSLLEG00000025635	ENSLLEG00000025626	ENSLLEG00000025560	QARS1 (ENSLLEG00000025177) #24	QRICH1 (ENSLLEG00000024772) #25	IMPDH2 (ENSLLEG00000024470) #26	ENSLLEG00000024382 #27	NDUFAF3 (ENSLLEG00000024298) #28	HSD17B7 (ENSLLEG00000024177)	ENSLLEG00000024154	ENSLLEG00000023854
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	11	RPUSD3 (ENSLLEG00000028295)	CIDEC (ENSLLEG00000028241)	JAGN1 (ENSLLEG00000028213)	IL17RE (ENSLLEG00000028072)	ENSLLEG00000027785	CRELD1 (ENSLLEG00000027721)	ENSLLEG00000027685	ENSLLEG00000027655	ENSLLEG00000027608	ENSLLEG00000027542	ENSLLEG00000027476	ENSLLEG00000027428 #20	KLHDC8B (ENSLLEG00000027384) #21	ENSLLEG00000027280	CCDC71 (ENSLLEG00000027265)	ENSLLEG00000027016 #22	LAMB2 (ENSLLEG00000026738) #22	ENSLLEG00000026400 #23	ENSLLEG00000025801	ENSLLEG00000025735	ENSLLEG00000025646	ENSLLEG00000025635	ENSLLEG00000025626	ENSLLEG00000025560	QARS1 (ENSLLEG00000025177) #24	QRICH1 (ENSLLEG00000024772) #25	IMPDH2 (ENSLLEG00000024470) #26	ENSLLEG00000024382 #27	NDUFAF3 (ENSLLEG00000024298) #28	HSD17B7 (ENSLLEG00000024177)	ENSLLEG00000024154
Coelacanth	MODERN SPECIES	636	RBSN (ENSLACG00000009214)	TRH (ENSLACG00000009747)	ENSLACG00000011971	PLXND1 (ENSLACG00000012134)	ENSLACG00000012953	RHO (ENSLACG00000013050)	IFT122 (ENSLACG00000013147)	ENSLACG00000013513	ENSLACG00000013572	RPL32 (ENSLACG00000013692)	CAND2 (ENSLACG00000013720)	SEC13 (ENSLACG00000013908)	ENSLACG00000014016	ENSLACG00000014041	ENSLACG00000014341	LAMB2 (ENSLACG00000014833) #22	USP19 (ENSLACG00000015154) #23	ENSLACG00000015485	ENSLACG00000015953