Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	645														ENSGT00940000166611.c	ENSGT00950000182885.B.c #21	ENSGT00950000182885.C.b.f #22	ENSGT00390000010777.j ##23	ENSGT00390000006088.i ##24	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081.s.b.b.a	ENSGT00390000014084.f	ENSGT01030000234578.B.a.g.b	ENSGT00950000183117.a.a.g	ENSGT00940000158254.e	ENSGT00940000155067.b.a	ENSGT00940000155067.a.y	ENSGT00390000002730.e.b.d
Huchen	MODERN SPECIES	4923															pah (ENSHHUG00000039234) #21	th2 (ENSHHUG00000039203) #22	nup37 (ENSHHUG00000039186) #23	parpbp (ENSHHUG00000039174) #24	ENSHHUG00000039154 #25
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	75	ENSGT00390000005848.fb	ENSGT00940000156334.a.b.d	ENSGT00390000003290.h.a.a	ENSGT00940000155016.bb	ENSGT00940000160526.i	ENSGT00940000156615.a.f	ENSGT00940000154818.e.a.b	ENSGT00390000008645.h.a	ENSGT00940000158225.i.a.c.b	ENSGT00940000154983.c.b.`b.b	ENSGT00940000160124.d	ENSGT00950000182999.b.a.a.m	ENSGT00390000005378.j	ENSGT00940000166611.d.b	ENSGT00950000182885.B.d ##21	ENSGT00950000182885.C.b.f #22	ENSGT00390000010777.j ##23	ENSGT00390000006088.i ##24	ENSGT00940000168896.d #25	ENSGT00940000159081.s.b.a	ENSGT00390000014084.e	ENSGT01030000234578.B.a.g.a.b	ENSGT00390000006747.p	ENSGT00950000183117.a.a.h	ENSGT00940000158254.f	ENSGT00940000155067.b.a.d.b	ENSGT00940000155067.a.z	ENSGT00650000094663.b	ENSGT00390000002730.e.b.c	ENSGT00950000183113.b.b.c.b.k	ENSGT00940000160161.e.a.m.a
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00390000005848.fb	ENSGT00940000156334.a.b.d	ENSGT00390000003290.h.b	ENSGT00940000155016.bb	ENSGT00940000160526.i	ENSGT00940000156615.a.f	ENSGT00940000154818.e.a.b	ENSGT00390000008645.h.a	ENSGT00940000158225.i.a.c.b	ENSGT00940000154983.c.b.`b.b	ENSGT00940000160124.d	ENSGT00950000182999.b.a.a.n	ENSGT00390000005378.j	ENSGT00940000166611.d.b	ENSGT00950000182885.B.d ##21	ENSGT00950000182885.C.b.f #22	ENSGT00390000010777.j ##23	ENSGT00390000006088.i ##24	ENSGT00940000168896.d #25	ENSGT00940000159081.s.b.b.b	ENSGT00390000014084.e	ENSGT01030000234578.B.a.g.a.b	ENSGT00390000006747.p	ENSGT00950000183117.a.a.h	ENSGT00940000158254.f	ENSGT00940000155067.b.a.d.b	ENSGT00940000155067.a.z	ENSGT00650000094663.b	ENSGT00390000002730.e.b.c	ENSGT00950000183113.b.b.c.b.k	ENSGT00940000160161.e.a.m.a.d
River trout	MODERN SPECIES	38	ndufa12 (ENSSTUG00000027092)	fgd6 (ENSSTUG00000027008)	vezt (ENSSTUG00000026912)	metap2b (ENSSTUG00000026865)	usp44 (ENSSTUG00000026836)	ntn4 (ENSSTUG00000026832)	snrpf (ENSSTUG00000026820)	amdhd1 (ENSSTUG00000026807)	tspan9b (ENSSTUG00000026783)	ELAPOR2 (ENSSTUG00000023331)	klhl42 (ENSSTUG00000023234)	ENSSTUG00000023224	nrip2 (ENSSTUG00000023213)	itfg2 (ENSSTUG00000023113)	ascl1a (ENSSTUG00000023105)	th2 (ENSSTUG00000021251) #22	nup37 (ENSSTUG00000020911) ##23	parpbp (ENSSTUG00000020858) ##24	ENSSTUG00000020854 #25	igf1 (ENSSTUG00000020604)	washc3 (ENSSTUG00000020568)	dram1 (ENSSTUG00000020559)	gnptab (ENSSTUG00000019408)	chpt1 (ENSSTUG00000019195)	mybpc1 (ENSSTUG00000018454)	ENSSTUG00000018414	spic (ENSSTUG00000018410)	ENSSTUG00000018398	atp6v1e1b (ENSSTUG00000018380)	ADA2 (ENSSTUG00000018295)	GALNT8 (ENSSTUG00000018260)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	26	ENSSSAG00000048798	TMCC3 (ENSSSAG00000106228)	nduac (ENSSSAG00000048771)	fgd6 (ENSSSAG00000048712)	vezt (ENSSSAG00000058593)	METAP2 (ENSSSAG00000048649)	USP44 (ENSSSAG00000048637)	SNRPF (ENSSSAG00000105295)	ENSSSAG00000048610	ENSSSAG00000107602	ENSSSAG00000111243	ENSSSAG00000096376	ENSSSAG00000046203	ENSSSAG00000119071	pah (ENSSSAG00000045956) ##21	th2 (ENSSSAG00000045042) #22	nup37 (ENSSSAG00000044831) ##23	parpbp (ENSSSAG00000044750) ##24	ENSSSAG00000107811 #25	ENSSSAG00000081749	ENSSSAG00000120885	IGF1 (ENSSSAG00000044375)	washc3 (ENSSSAG00000044345)	dram1 (ENSSSAG00000044327)	gnptab (ENSSSAG00000043341)	chpt1 (ENSSSAG00000089632)	mybpc1 (ENSSSAG00000003533)	ENSSSAG00000002961	spic (ENSSSAG00000002954)	ENSSSAG00000002945	atp6v1e1b (ENSSSAG00000116109)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000005848.fb	ENSGT00940000156334.a.b.d	ENSGT00390000003290.h.a.a	ENSGT00940000155016.bb	ENSGT00940000160526.i	ENSGT00940000156615.a.f	ENSGT00940000154818.e.a.a	ENSGT00390000008645.h.a	ENSGT00940000158225.i.a.c.b	ENSGT00940000154983.c.b.`b.b	ENSGT00940000160124.d	ENSGT00950000182999.b.a.a.m	ENSGT00390000005378.j	ENSGT00940000166611.d.b	ENSGT00950000182885.B.d.b ##21	ENSGT00950000182885.C.b.f #22	ENSGT00390000010777.j ##23	ENSGT00390000006088.i ##24	ENSGT00940000168896.d #25	ENSGT00940000159081.s.b.a.a	ENSGT00390000014084.e	ENSGT01030000234578.B.a.g.a.b	ENSGT00390000006747.p	ENSGT00950000183117.a.a.h	ENSGT00940000158254.f	ENSGT00940000155067.b.a.d.b	ENSGT00940000155067.a.z	ENSGT00650000094663.b	ENSGT00390000002730.e.b.c	ENSGT00950000183113.b.b.c.b.k	ENSGT00940000160161.e.a.m.a.a
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	64	ENSGT00390000005848.fb	ENSGT00940000156334.a.b.d	ENSGT00390000003290.h.a.a	ENSGT00940000155016.bb	ENSGT00940000160526.i	ENSGT00940000156615.a.f	ENSGT00940000164757.b	ENSGT00390000008645.h.a	ENSGT00940000158225.i.a.c.b	ENSGT00940000154983.c.b.`b.b	ENSGT00940000160124.d	ENSGT00950000182999.b.a.a.m	ENSGT00390000005378.j	ENSGT00940000166611.d.b	ENSGT00950000182885.B.d.b ##21	ENSGT00950000182885.C.b.f #22	ENSGT00390000010777.j ##23	ENSGT00390000006088.i ##24	ENSGT00940000168896.d #25	ENSGT00940000159081.s.b.a.a	ENSGT00390000014084.e	ENSGT01030000234578.B.a.g.a.b	ENSGT00390000006747.p	ENSGT00950000183117.a.a.h	ENSGT00940000158254.f	ENSGT00940000155067.b.a.d.b	ENSGT00940000155067.a.z	ENSGT00650000094663.b	ENSGT00390000002730.e.b.c	ENSGT00950000183113.b.b.c.b.k	ENSGT00940000160161.e.a.m.a.a
Coho salmon	MODERN SPECIES	29	ndufa12 (ENSOKIG00005021416)	fgd6 (ENSOKIG00005021469)	vezt (ENSOKIG00005022027)	METAP2 (ENSOKIG00005022135)	usp44 (ENSOKIG00005022428)	NTN4 (ENSOKIG00005022451)	ENSOKIG00005022464	amdhd1 (ENSOKIG00005022484)	tspan9b (ENSOKIG00005022504)	ELAPOR2 (ENSOKIG00005022714)	klhl42 (ENSOKIG00005023710)	ENSOKIG00005023729	itfg2 (ENSOKIG00005023741)	ENSOKIG00005023760	pah (ENSOKIG00005023911) ##21	th2 (ENSOKIG00005025899) #22	nup37 (ENSOKIG00005026624) ##23	parpbp (ENSOKIG00005026715) ##24	ENSOKIG00005026748 #25	igf1 (ENSOKIG00005026794)	washc3 (ENSOKIG00005027115)	dram1 (ENSOKIG00005027146)	gnptab (ENSOKIG00005027296)	chpt1 (ENSOKIG00005029016)	mybpc1 (ENSOKIG00005029297)	ENSOKIG00005030650	spic (ENSOKIG00005030681)	ENSOKIG00005030692	atp6v1e1b (ENSOKIG00005030717)	ADA2 (ENSOKIG00005030751)	GALNT8 (ENSOKIG00005030969)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	6	syt1a (ENSOTSG00005002082)	ndufa12 (ENSOTSG00005002087)	vezt (ENSOTSG00005002095)	METAP2 (ENSOTSG00005002179)	usp44 (ENSOTSG00005002893)	ntn4 (ENSOTSG00005002894)	ENSOTSG00005002904	amdhd1 (ENSOTSG00005002912)	tspan9b (ENSOTSG00005002932)	ELAPOR2 (ENSOTSG00005002955)	klhl42 (ENSOTSG00005003230)	nrip2 (ENSOTSG00005003233)	itfg2 (ENSOTSG00005003235)	ascl1a (ENSOTSG00005003242)	pah (ENSOTSG00005003250) ##21	th2 (ENSOTSG00005003334) #22	nup37 (ENSOTSG00005005743) ##23	ENSOTSG00005005772 #25	igf1 (ENSOTSG00005005780)	washc3 (ENSOTSG00005006733)	dram1 (ENSOTSG00005006735)	gnptab (ENSOTSG00005006744)	ENSOTSG00005007558	chpt1 (ENSOTSG00005007562)	mybpc1 (ENSOTSG00005007586)	ENSOTSG00005007587	spic (ENSOTSG00005007588)	ENSOTSG00005007590	atp6v1e1b (ENSOTSG00005007592)	ADA2 (ENSOTSG00005007597)	GALNT8 (ENSOTSG00005007620)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	13	USP44 (ENSOMYG00000016335)	ENSOMYG00000066266	ENSOMYG00000051830	ENSOMYG00000061312	ntn4 (ENSOMYG00000016346)	ruxf (ENSOMYG00000016386)	amdhd1 (ENSOMYG00000016400)	ENSOMYG00000068698	ENSOMYG00000016413	ENSOMYG00000016472	klhl42 (ENSOMYG00000017202)	ENSOMYG00000017211	itfg2 (ENSOMYG00000017221)	ENSOMYG00000017228	pah (ENSOMYG00000017392) ##21	th2 (ENSOMYG00000022464) #22	nup37 (ENSOMYG00000023359) ##23	ENSOMYG00000023418 #25	igf1 (ENSOMYG00000023593)	ENSOMYG00000023901	dram1 (ENSOMYG00000023912)	gnptab (ENSOMYG00000024139)	chpt1 (ENSOMYG00000024956)	mybpc1 (ENSOMYG00000025349)	spic (ENSOMYG00000026260)	ENSOMYG00000026269	atp6v1e1b (ENSOMYG00000026302)	ENSOMYG00000026324	GALNT8 (ENSOMYG00000026382)	GALNT8 (ENSOMYG00000026443)	DYRK4 (ENSOMYG00000005829)
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Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157275.a.a	ENSGT00390000005848.gb	ENSGT00940000156334.a.b.c	ENSGT00390000003290.h.a.b	ENSGT00940000155016.cb	ENSGT00940000160526.j	ENSGT00940000156615.a.e	ENSGT00940000154818.e.a.a	ENSGT00390000008645.h.b	ENSGT00940000158225.i.a.c.a	ENSGT00940000154983.c.b.`b.a	ENSGT00940000160124.c	ENSGT00950000182999.b.a.a.n	ENSGT00940000166611.c	ENSGT00950000182885.B.c #21	ENSGT00950000182885.C.b.e ##21	ENSGT00390000010777.i #23	ENSGT00390000006088.j #24	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00940000159081.s.b.b.a	ENSGT00390000014084.f	ENSGT01030000234578.B.a.h	ENSGT01030000234578.B.a.g.b	ENSGT00390000006747.o	ENSGT00950000183117.a.a.g	ENSGT00940000158254.e	ENSGT00940000155067.b.a.c	ENSGT00940000155067.a.y	ENSGT00650000094663.a	ENSGT00390000002730.e.b.d	ENSGT00950000183113.b.b.c.b.l
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Huchen	MODERN SPECIES	168	ndufa12 (ENSHHUG00000018016)	ENSHHUG00000018029	ENSHHUG00000018033	METAP2 (ENSHHUG00000018038)	usp44 (ENSHHUG00000018429)	ntn4 (ENSHHUG00000018470)	snrpf (ENSHHUG00000018483)	amdhd1 (ENSHHUG00000018661)	tspan9b (ENSHHUG00000018670)	ENSHHUG00000018711	klhl42 (ENSHHUG00000018789)	itfg2 (ENSHHUG00000018797)	nrip2 (ENSHHUG00000018932)	ascl1a (ENSHHUG00000018939)	pah (ENSHHUG00000018953) ##21	th2 (ENSHHUG00000019771) ##21	nup37 (ENSHHUG00000019915) ##23	parpbp (ENSHHUG00000020016) ##24	pmch (ENSHHUG00000020021)	igf1 (ENSHHUG00000020076)	washc3 (ENSHHUG00000020822)	dram1 (ENSHHUG00000020829)	GNPTAB (ENSHHUG00000020855)	chpt1 (ENSHHUG00000020874)	mybpc1 (ENSHHUG00000020917)	atp6v1e1b (ENSHHUG00000022007)	spic (ENSHHUG00000022035)	ADA2 (ENSHHUG00000022050)	GALNT8 (ENSHHUG00000022068)	DYRK4 (ENSHHUG00000022276)	rad51ap1 (ENSHHUG00000022304)