Oryzias ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000005848 #8 ENSGT00940000156334.a.b ENSGT00390000003290 #10 ENSGT00940000155016 #11 ENSGT00940000160526 #12 ENSGT00940000156615.a #13 ENSGT00940000154818 ENSGT00390000008645 #14 ENSGT00940000158225.i.a #15 ENSGT00940000154983.c.b #16 ENSGT00940000160124 #17 ENSGT00950000182999.b.a.a #18 ENSGT00390000005378 #19 ENSGT00940000166611 #20 ENSGT00950000182885.B #21 ENSGT00950000182885.C.b #22 ENSGT00390000010777 #23 ENSGT00390000006088 #24 ENSGT00940000168896 #25 ENSGT00940000159081 #26 ENSGT00840000130048.b ENSGT00940000156419.b #28 ENSGT00940000155455.g.c #31 ENSGT00530000063817.b.b #32 ENSGT00940000154709.a.a ENSGT00940000158899 #33 ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b #34 ENSGT00940000153962.b ENSGT00940000155394.i.a.d ##35 ENSGT00390000000406 #36 ENSGT00940000156120.a #37 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000005848 #8 ENSGT00940000156334.a.b ENSGT00390000003290 #10 ENSGT00940000155016 #11 ENSGT00940000160526 #12 ENSGT00940000156615.a #13 ENSGT00940000154818 ENSGT00390000008645 #14 ENSGT00940000158225.i.a #15 ENSGT00940000154983.c.b #16 ENSGT00940000160124 #17 ENSGT00950000182999.b.a.a #18 ENSGT00390000005378 #19 ENSGT00940000166611 #20 ENSGT00950000182885.B #21 ENSGT00950000182885.C.b #22 ENSGT00390000010777 #23 ENSGT00390000006088 #24 ENSGT00940000168896 #25 ENSGT00940000159081 #26 ENSGT00840000130048.b ENSGT00940000156419.b #28 ENSGT00940000155455.g.c #31 ENSGT00530000063817.b.b #32 ENSGT00940000154709.a.a ENSGT00940000158899 #33 ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b #34 ENSGT00940000153962.b ENSGT00940000155394.i.a.d ##35 ENSGT00390000000406 #36 ENSGT00940000156120.a #37 Javanese ricefish MODERN SPECIES 15 TMCC3 (ENSOJAG00000023094) #7 ndufa12 (ENSOJAG00000023100) #8 ENSOJAG00000023148 #9 vezt (ENSOJAG00000023164) #10 METAP2 (ENSOJAG00000023181) #11 usp44 (ENSOJAG00000023208) #12 ntn4 (ENSOJAG00000023221) #13 amdhd1 (ENSOJAG00000023244) #14 tspan9b (ENSOJAG00000023257) #15 elapor2b (ENSOJAG00000023275) #16 klhl42 (ENSOJAG00000023323) #17 nrip2 (ENSOJAG00000023325) #18 itfg2 (ENSOJAG00000023327) #19 ascl1a (ENSOJAG00000023335) #20 pah (ENSOJAG00000023397) #21 th2 (ENSOJAG00000023523) #22 nup37 (ENSOJAG00000023532) #23 parpbp (ENSOJAG00000023537) #24 ENSOJAG00000023539 #25 igf1 (ENSOJAG00000023545) #26 ENSOJAG00000023553 #27 btbd11a (ENSOJAG00000023574) #28 ENSOJAG00000023593 #29 ENSOJAG00000023595 #30 cry1a (ENSOJAG00000023629) #31 MTERF2 (ENSOJAG00000023694) #32 syt10 (ENSOJAG00000023697) #33 ENSOJAG00000023700 #34 syt1a (ENSOJAG00000023710) #35 pawr (ENSOJAG00000023718) #36 ppp1r12a (ENSOJAG00000023721) #37 Indian medaka MODERN SPECIES 2 ndufa12 (ENSOMEG00000023833) #8 fgd6 (ENSOMEG00000000640) vezt (ENSOMEG00000002973) #10 metap2b (ENSOMEG00000002985) #11 usp44 (ENSOMEG00000002993) #12 ntn4 (ENSOMEG00000003007) #13 snrpf (ENSOMEG00000003018) amdhd1 (ENSOMEG00000003082) #14 tspan9b (ENSOMEG00000003109) #15 klhl42 (ENSOMEG00000003121) #17 nrip2 (ENSOMEG00000003128) #18 elapor2b (ENSOMEG00000003209) #16 itfg2 (ENSOMEG00000003265) #19 ascl1a (ENSOMEG00000003274) #20 pah (ENSOMEG00000003302) #21 th2 (ENSOMEG00000003320) #22 nup37 (ENSOMEG00000003353) #23 parpbp (ENSOMEG00000003398) #24 ENSOMEG00000003411 #25 igf1 (ENSOMEG00000003424) #26 ENSOMEG00000003451 btbd11a (ENSOMEG00000003530) #28 cry1a (ENSOMEG00000003568) #31 ENSOMEG00000003581 #32 tnnt2c (ENSOMEG00000003593) syt10 (ENSOMEG00000003610) #33 ENSOMEG00000003669 #34 cyb5r3 (ENSOMEG00000003698) syt1a (ENSOMEG00000003714) ##35 pawr (ENSOMEG00000003730) #36 ppp1r12a (ENSOMEG00000003801) #37 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000005848 #8 ENSGT00940000156334.a.b ENSGT00390000003290 #10 ENSGT00940000155016 #11 ENSGT00940000160526 #12 ENSGT00940000156615.a #13 ENSGT00940000164757 ENSGT00390000008645 #14 ENSGT00940000158225.i.a #15 ENSGT00940000154983.c.b #16 ENSGT00940000160124 #17 ENSGT00950000182999.b.a.a #18 ENSGT00390000005378 #19 ENSGT00940000166611 #20 ENSGT00950000182885.B #21 ENSGT00950000182885.C.b #22 ENSGT00390000010777 #23 ENSGT00390000006088 #24 ENSGT00940000168896 #25 ENSGT00940000159081 #26 ENSGT00840000130048.b ENSGT00940000156419.b #28 ENSGT00940000155455.g.c #31 ENSGT00530000063817.b.b #32 ENSGT00940000154709.a.a ENSGT00940000158899 #33 ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b #34 ENSGT00940000153962.b ENSGT00940000155394.i.a.d ##35 ENSGT00390000000406 #36 ENSGT00940000156120.a #37 Chinese medaka DUPLICATION Chinese medaka MODERN SPECIES 53 ENSOSIG00000007254 #16 klhl42 (ENSOSIG00000007247) #17 nrip2 (ENSOSIG00000007246) #18 itfg2 (ENSOSIG00000007245) #19 ascl1a (ENSOSIG00000007243) #20 pah (ENSOSIG00000007090) #21 th2 (ENSOSIG00000006727) #22 nup37 (ENSOSIG00000006723) #23 parpbp (ENSOSIG00000006718) #24 ENSOSIG00000006717 #25 igf1 (ENSOSIG00000006715) #26 ENSOSIG00000006713 ENSOSIG00000006712 btbd11a (ENSOSIG00000006349) #28 cry1a (ENSOSIG00000004452) #31 MTERF2 (ENSOSIG00000004407) #32 tnnt2c (ENSOSIG00000004405) syt10 (ENSOSIG00000004402) #33 ENSOSIG00000004396 #34 cyb5r3 (ENSOSIG00000003779) syt1a (ENSOSIG00000003691) ##35 Chinese medaka MODERN SPECIES 51 ENSOSIG00000010255 #16 klhl42 (ENSOSIG00000010254) #17 nrip2 (ENSOSIG00000010252) #18 itfg2 (ENSOSIG00000010251) #19 ascl1a (ENSOSIG00000010250) #20 pah (ENSOSIG00000008674) #21 th2 (ENSOSIG00000008247) #22 nup37 (ENSOSIG00000008243) #23 parpbp (ENSOSIG00000008240) #24 ENSOSIG00000008239 #25 ENSOSIG00000008238 ENSOSIG00000008237 igf1 (ENSOSIG00000008154) #26 btbd11a (ENSOSIG00000008093) #28 cry1a (ENSOSIG00000007925) ##31 MTERF2 (ENSOSIG00000007922) #32 tnnt2c (ENSOSIG00000007920) syt10 (ENSOSIG00000007919) #33 ENSOSIG00000007916 ENSOSIG00000007911 syt1a (ENSOSIG00000007909) #35 pawr (ENSOSIG00000007906) #36 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 15 TMCC3 (ENSORLG00000016684) #7 ndufa12 (ENSORLG00000023845) #8 fgd6 (ENSORLG00000016673) vezt (ENSORLG00000016663) #10 metap2b (ENSORLG00000016650) #11 usp44 (ENSORLG00000016627) #12 NTN4 (ENSORLG00000016622) #13 amdhd1 (ENSORLG00000016609) #14 tspan9b (ENSORLG00000016594) #15 ENSORLG00000016575 #16 klhl42 (ENSORLG00000016542) #17 nrip2 (ENSORLG00000016536) #18 itfg2 (ENSORLG00000016526) #19 ascl1a (ENSORLG00000016504) #20 pah (ENSORLG00000016500) #21 th2 (ENSORLG00000016488) #22 nup37 (ENSORLG00000016475) #23 parpbp (ENSORLG00000016457) #24 ENSORLG00000016450 #25 igf1 (ENSORLG00000016443) #26 ENSORLG00000027418 cox6b2 (ENSORLG00000016425) btbd11a (ENSORLG00000016422) #28 ENSORLG00000016390 #32 cry1a (ENSORLG00000016410) #31 tnnt2c (ENSORLG00000016386) syt10 (ENSORLG00000016381) #33 ENSORLG00000016372 #34 cyb5r3 (ENSORLG00000018656) syt1a (ENSORLG00000016339) ##35 pawr (ENSORLG00000026995) #36