Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015355 #22 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES 543 ENSGT00390000015355 #22 ENSGT00390000006234 #23 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000169825 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00950000183159.a ENSGT00940000157306 ENSGT00390000000002.a.a.a ENSGT00940000157352 ENSGT00940000156979 ENSGT00940000156077 ENSGT00940000160078 ENSGT00940000160604 ENSGT00940000155155 ENSGT00670000098059 ENSGT00390000018294 #21 ENSGT00390000015355 #22 ENSGT00390000006234 #23 ENSGT00390000015224 #24 ENSGT00940000157489 #25 ENSGT00730000111066 #26 ENSGT00590000083165 ENSGT00940000155358 ENSGT00390000010054.b ENSGT00940000162201 ENSGT00940000157456 ENSGT00940000157949 ENSGT00940000156247 ENSGT00940000159709 ENSGT00940000153648.b ENSGT00940000153404.b ENSGT00940000160197 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00950000183159.a ENSGT00940000157306 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#26 ENSGT00590000083165 ENSGT00940000155358 ENSGT00390000017929 ENSGT00390000010054.b ENSGT00940000162201 ENSGT00940000162884 ENSGT00940000163662 ENSGT00940000157456 ENSGT00900000143434 ENSGT00940000157949 ENSGT00390000009693.p.b Cebidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00950000183159.a ENSGT00940000157306.n ENSGT00390000000002.a.a.a ENSGT00940000157352 ENSGT00940000156979.q.b ENSGT00940000156077 ENSGT00910000146901 ENSGT00940000160078 ENSGT00940000160604 ENSGT00940000155155.e ENSGT00670000098059 ENSGT00390000018294 #21 ENSGT00390000015355 #22 ENSGT00390000006234.b #23 ENSGT00390000015224.c.a.a.a.i ##24 ENSGT00940000157489 #25 ENSGT00730000111066 #26 ENSGT00590000083165 ENSGT00940000155358 ENSGT00390000017929 ENSGT00390000010054.b ENSGT00940000162201 ENSGT00940000162884 ENSGT00940000163662 ENSGT00940000157456 ENSGT00900000143434 ENSGT00940000157949 ENSGT00390000009693.p.b Marmoset DUPLICATION Marmoset MODERN SPECIES 15 TMEM33 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(ENSTTRG00000014278) Sperm whale MODERN SPECIES 18 TMEM33 (ENSPCTG00005012258) PHOX2B (ENSPCTG00005012317) LIMCH1 (ENSPCTG00005012462) ENSPCTG00005014187 ENSPCTG00005014242 APBB2 (ENSPCTG00005014603) NSUN7 (ENSPCTG00005014806) RBM47 (ENSPCTG00005014921) CHRNA9 (ENSPCTG00005015100) RHOH (ENSPCTG00005015193) N4BP2 (ENSPCTG00005015217) PDS5A (ENSPCTG00005015289) UBE2K (ENSPCTG00005015617) ENSPCTG00005015630 ENSPCTG00005015666 #21 UGDH (ENSPCTG00005015727) #22 LIAS (ENSPCTG00005015829) #23 RPL9 (ENSPCTG00005016711) ##24 KLB (ENSPCTG00005016744) #25 ENSPCTG00005016845 RFC1 (ENSPCTG00005016905) #26 WDR19 (ENSPCTG00005017116) KLHL5 (ENSPCTG00005017206) TMEM156 (ENSPCTG00005017296) FAM114A1 (ENSPCTG00005017381) TLR6 (ENSPCTG00005017439) TLR1 (ENSPCTG00005017458) TLR10 (ENSPCTG00005017472) KLF3 (ENSPCTG00005017490) TBC1D1 (ENSPCTG00005017560) PGM2 (ENSPCTG00005017784) Blue whale MODERN SPECIES 16 TMEM33 (ENSBMSG00010004410) PHOX2B (ENSBMSG00010004426) ENSBMSG00010004449 LIMCH1 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SPECIES 895 AGR3 (ENSBMUG00000020436) AGR2 (ENSBMUG00000020421) TSPAN13 (ENSBMUG00000020392) BZW2 (ENSBMUG00000020370) ANKMY2 (ENSBMUG00000020338) LRRC72 (ENSBMUG00000020320) SOSTDC1 (ENSBMUG00000020289) CRPPA (ENSBMUG00000020267) ENSBMUG00000020247 MEOX2 (ENSBMUG00000020230) AGMO (ENSBMUG00000020224) DGKB (ENSBMUG00000020164) ETV1 (ENSBMUG00000020038) ENSBMUG00000019942 SMIM14 (ENSBMUG00000019929) #21 UGDH (ENSBMUG00000019895) #22 LIAS (ENSBMUG00000019802) #23 ENSBMUG00000019692 ##24 KLB (ENSBMUG00000019680) #25 RFC1 (ENSBMUG00000019633) #26 WDR19 (ENSBMUG00000019534) KLHL5 (ENSBMUG00000019450) TMEM156 (ENSBMUG00000019375) FAM114A1 (ENSBMUG00000019349) TLR6 (ENSBMUG00000019289) TLR1 (ENSBMUG00000019266) KLF3 (ENSBMUG00000019245) Domestic yak MODERN SPECIES 25 LIMCH1 (ENSBGRG00000002320) UCHL1 (ENSBGRG00000002608) ENSBGRG00000002669 APBB2 (ENSBGRG00000002693) ENSBGRG00000002737 NSUN7 (ENSBGRG00000002761) RBM47 (ENSBGRG00000002798) CHRNA9 (ENSBGRG00000002828) RHOH (ENSBGRG00000002839) 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#25 Equus ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00950000183159.a ENSGT00940000157306 ENSGT00390000000002.a.a.a ENSGT00940000157352 ENSGT00940000156979 ENSGT00940000156077 ENSGT00940000160078 ENSGT00940000160604 ENSGT01000000219986 ENSGT00940000155155 ENSGT00670000098059 ENSGT00390000018294 #21 ENSGT00390000015355 #22 ENSGT00390000006234 #23 ENSGT00390000015224.d.l.e ##24 ENSGT00940000157489 #25 ENSGT00730000111066 #26 ENSGT00590000083165 ENSGT00940000155358 ENSGT00390000017929 ENSGT00390000010054.b ENSGT00940000162201 ENSGT00940000162884 ENSGT00940000163662 ENSGT00940000157456 ENSGT00940000157949 ENSGT00940000156247 ENSGT00940000159709 Horse MODERN SPECIES 22 ENSECAG00000046997 ENSECAG00000044569 TMEM33 (ENSECAG00000011773) PHOX2B (ENSECAG00000012846) LIMCH1 (ENSECAG00000013348) UCHL1 (ENSECAG00000018254) APBB2 (ENSECAG00000020719) NSUN7 (ENSECAG00000022673) RBM47 (ENSECAG00000004400) CHRNA9 (ENSECAG00000008189) RHOH (ENSECAG00000028270) 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Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00950000183159.a ENSGT00940000157306 ENSGT00390000000002.a.a.a ENSGT00940000157352 ENSGT00940000156979 ENSGT00940000156077 ENSGT00940000160078 ENSGT00940000160604 ENSGT00940000155155 ENSGT00670000098059 ENSGT00390000018294 #21 ENSGT00390000015355 #22 ENSGT00390000006234 #23 ENSGT00390000015224.c.a.a.a ##24 ENSGT00940000157489 #25 ENSGT00730000111066 #26 ENSGT00590000083165 ENSGT00940000155358 ENSGT00390000017929 ENSGT00390000010054.b ENSGT00940000162201 ENSGT00940000162884 ENSGT00940000163662 ENSGT00940000157456 ENSGT00940000157949 ENSGT00940000156247 ENSGT00940000159709 Elephant MODERN SPECIES 164 SLC30A9 (ENSLAFG00000007021) TMEM33 (ENSLAFG00000013039) PHOX2B (ENSLAFG00000022070) LIMCH1 (ENSLAFG00000008797) UCHL1 (ENSLAFG00000002494) APBB2 (ENSLAFG00000011950) NSUN7 (ENSLAFG00000011942) RBM47 (ENSLAFG00000011998) CHRNA9 (ENSLAFG00000000185) RHOH (ENSLAFG00000000188) 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ENSGT00940000157949 ENSGT01030000235076 ENSGT00940000156247 ENSGT00940000159709 ENSGT00390000013778 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00960000191907 ENSGT00950000183159.a ENSGT00940000157306 ENSGT00390000000002.a.a.a ENSGT00940000157352 ENSGT00940000156979 ENSGT00940000156077 ENSGT00940000160078 ENSGT00940000160604 ENSGT01000000219986 ENSGT00940000155155 ENSGT00670000098059 ENSGT00390000018294 #21 ENSGT00390000015355 #22 ENSGT00390000006234 #23 ENSGT00390000015224.d.l ##24 ENSGT00940000157489 #25 ENSGT00730000111066 #26 ENSGT00590000083165 ENSGT00940000155358 ENSGT00390000010054.b ENSGT00940000162201 ENSGT00940000157456 ENSGT00940000157949 ENSGT00940000156247 ENSGT00940000159709 ENSGT00390000013778 ENSGT00940000153648.b ENSGT00940000153404.b Laterata ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00960000191907 ENSGT00950000183159.a ENSGT00940000157306 ENSGT00390000000002.a.a.a ENSGT00940000157352 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(ENSSSAG00000000656) mtif3 (ENSSSAG00000000645) ENSSSAG00000000638 abhd10a (ENSSSAG00000000623) ENSSSAG00000000604 ENSSSAG00000100031 si:ch211-271b14.1 (ENSSSAG00000000481) b4galt4 (ENSSSAG00000000403) ENSSSAG00000000391 zbtb20 (ENSSSAG00000000377) ENSSSAG00000080912 ENSSSAG00000100491 #22 ENSSSAG00000080868 CDC23 (ENSSSAG00000118468) KIF20A (ENSSSAG00000080811) BRD8 (ENSSSAG00000080786) ENSSSAG00000080778 ppp3ca (ENSSSAG00000007197) ENSSSAG00000079415 ENSSSAG00000117516 zgc:100829 (ENSSSAG00000102979) puraa (ENSSSAG00000094267) nrg2a (ENSSSAG00000120654) ENSSSAG00000084909 ENSSSAG00000079289 ENSSSAG00000079267 ENSSSAG00000078241 River trout MODERN SPECIES 10 ENSSTUG00000006600 ENSSTUG00000006609 zdhhc23a (ENSSTUG00000006620) ATP6V1A (ENSSTUG00000006639) ENSSTUG00000006875 ENSSTUG00000006884 mtif3 (ENSSTUG00000006915) ENSSTUG00000006920 abhd10a (ENSSTUG00000006931) ENSSTUG00000006969 si:ch211-271b14.1 (ENSSTUG00000006996) b4galt4 (ENSSTUG00000007167) ENSSTUG00000007180 zbtb20 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ENSOTSG00005010050 WASF3 (ENSOTSG00005010052) mtif3 (ENSOTSG00005010054) ENSOTSG00005010055 abhd10a (ENSOTSG00005010057) ENSOTSG00005010060 ENSOTSG00005010061 si:ch211-271b14.1 (ENSOTSG00005010064) b4galt4 (ENSOTSG00005010070) ENSOTSG00005010073 zbtb20 (ENSOTSG00005010076) ENSOTSG00005010078 ugdh (ENSOTSG00005010079) #22 ENSOTSG00005010081 cdc23 (ENSOTSG00005010083) kif20a (ENSOTSG00005010087) ENSOTSG00005010101 dnajc18 (ENSOTSG00005010103) ppp3ca (ENSOTSG00005010114) ENSOTSG00005010420 CXXC5 (ENSOTSG00005010430) ENSOTSG00005010431 NRXN2 (ENSOTSG00005010437) ENSOTSG00005010651 PCNX3 (ENSOTSG00005010653) zgc:165604 (ENSOTSG00005010661) ENSOTSG00005010662 slc29a2 (ENSOTSG00005010664) Rainbow trout MODERN SPECIES 1 ENSOMYG00000062831 ENSOMYG00000046568 ENSOMYG00000046574 ENSOMYG00000046593 ENSOMYG00000046614 ENSOMYG00000046622 mtif3 (ENSOMYG00000046628) ENSOMYG00000046632 abhd10a (ENSOMYG00000046638) ENSOMYG00000046650 si:ch211-271b14.1 (ENSOMYG00000046685) b4galt4 (ENSOMYG00000046722) 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dnajc18 (ENSHHUG00000015141) ppp3ca (ENSHHUG00000015189) ENSHHUG00000016138 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 156 ENSGT00940000156043.fb.b ENSGT00390000017765.a.d ENSGT00940000159385.e.a ENSGT00940000153322.B.d.b.d ENSGT00940000164978.b.d ENSGT00940000160838 ENSGT00940000157596 ENSGT00940000158378.b ENSGT00940000159458.d ENSGT00940000160779 ENSGT00940000158617.e ENSGT00390000008142 ENSGT00940000165599.C ENSGT00940000154622.a.b.q.a ENSGT00940000153727.a ENSGT00390000015355.`b.b #22 ENSGT00940000161460 ENSGT00940000165282.b.b ENSGT00950000182950.A.h ENSGT00940000156931.e ENSGT00530000064262.pc.a.t ENSGT00940000166356.b ENSGT00940000165110.a.e ENSGT00940000153169.B.n.b ENSGT00940000154108.a.d.d ENSGT00940000157357.e.a.c ENSGT00950000183162.a.a.c.c ENSGT00940000158778.c.d ENSGT00940000164430.a.a ENSGT01080000257601.a ENSGT00940000154901.C.b Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000156043.fb.b ENSGT00390000017765.a.d ENSGT00940000159385.e.a ENSGT00940000153322.B.d.b.d 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ENSGT00940000153727.a ENSGT00390000015355.`b.b #22 ENSGT00940000161460 ENSGT00940000165282.b.b ENSGT00950000182950.A.h ENSGT00940000156931.e ENSGT00530000064262.pc.a.t ENSGT00940000166356.b ENSGT00940000165110.a.e.a ENSGT00940000165110.a.e.b ENSGT00940000153169.B.n.b ENSGT00940000154108.a.d.d ENSGT01100000266631 ENSGT00940000157357.e.a.c ENSGT00950000183162.a.a.c.c ENSGT00940000158778.c.d ENSGT00940000164430.a.a River trout MODERN SPECIES 3 ENSSTUG00000048033 si:ch211-271b14.1 (ENSSTUG00000048037) zgc:175280 (ENSSTUG00000048053) eif4e1b (ENSSTUG00000048092) CASR (ENSSTUG00000048102) b4galt4 (ENSSTUG00000048115) ENSSTUG00000048121 ENSSTUG00000048124 UPK1B (ENSSTUG00000048134) zbtb20 (ENSSTUG00000048148) si:dkey-251i10.3 (ENSSTUG00000048165) si:dkey-251i10.2 (ENSSTUG00000048489) ENSSTUG00000048504 ENSSTUG00000048517 wdr55 (ENSSTUG00000048531) ugdh (ENSSTUG00000048541) #22 CDC25C (ENSSTUG00000048582) ENSSTUG00000048599 ENSSTUG00000048601 cdc23 (ENSSTUG00000048607) kif20a (ENSSTUG00000048645) BRD8 (ENSSTUG00000048659) dnajc18 (ENSSTUG00000048690) ENSSTUG00000048707 ppp3ca (ENSSTUG00000048713) ENSSTUG00000048861 CXXC5 (ENSSTUG00000048873) ENSSTUG00000048875 ENSSTUG00000048879 puraa (ENSSTUG00000048881) nrg2a (ENSSTUG00000048890) Atlantic salmon MODERN SPECIES 2 abhd10a (ENSSSAG00000121960) ENSSSAG00000111616 si:ch211-271b14.1 (ENSSSAG00000004538) zgc:175280 (ENSSSAG00000004679) eif4e1b (ENSSSAG00000006438) casr (ENSSSAG00000006455) b4galt4 (ENSSSAG00000006476) ENSSSAG00000113793 ENSSSAG00000006485 zbtb20 (ENSSSAG00000006494) si:dkey-251i10.3 (ENSSSAG00000006520) si:dkey-251i10.2 (ENSSSAG00000006695) ADT2 (ENSSSAG00000006701) ENSSSAG00000006710 wdr55 (ENSSSAG00000006717) ENSSSAG00000080895 #22 CDC25C (ENSSSAG00000006736) ENSSSAG00000006766 cdc23 (ENSSSAG00000006796) kif20a (ENSSSAG00000007082) BRD8 (ENSSSAG00000007120) djc18 (ENSSSAG00000007138) ppp3ca (ENSSSAG00000045428) UB2D2 (ENSSSAG00000108861) ENSSSAG00000093928 ENSSSAG00000009630 puraa 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ENSGT00730000111066 #26 ENSGT00590000083165.h ENSGT00940000155358.u.a ENSGT00940000155358.u.b ENSGT00390000010054.b ENSGT00940000157456 ENSGT00940000157949 ENSGT00940000156247.x ENSGT00940000169057 ENSGT01030000235076 ENSGT00940000156247.w.a ENSGT00950000183041.B.g ENSGT00940000159636 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 133 ENSGT00940000158402 ENSGT00940000156077.g.b ENSGT00940000160078 ENSGT00940000164462.g ENSGT00940000155155.p.a ENSGT00670000098059.c.b ENSGT00390000018294 #21 ENSGT00390000015355.ab #22 ENSGT00390000006234.x #23 ENSGT00390000015224.d.b.b.a ##24 ENSGT00730000111066 #26 ENSGT00590000083165.h.d.a ENSGT00940000155358.t ENSGT00590000083165.h.c ENSGT00940000155358.u.b ENSGT00390000010054.b.c ENSGT00390000010054.b.d ENSGT00940000157456 ENSGT00940000157949 ENSGT00940000156247.x ENSGT00940000169057 ENSGT01030000235076 ENSGT00940000156247.w.a Salmo ANCESTRAL SPECIES 216 ENSGT00940000156077.g.b.e ENSGT00940000160078 ENSGT00940000164462.g ENSGT00940000155155.p.a ENSGT00670000098059.c.b ENSGT00390000018294 #21 ENSGT00390000015355.ab #22 ENSGT00390000006234.x #23 ENSGT00390000015224.d.b.b.b ##24 ENSGT00970000197621 ENSGT00390000015224.d.b.a ##24 ENSGT00730000111066 #26 Atlantic salmon DUPLICATION Atlantic salmon DUPLICATION Atlantic salmon MODERN SPECIES 631 ENSSSAG00000083981 pds5a (ENSSSAG00000108318) UBE2K (ENSSSAG00000117396) smim14 (ENSSSAG00000113748) #21 ugdh (ENSSSAG00000006724) #22 lias (ENSSSAG00000093601) #23 RPL9 (ENSSSAG00000058888) ##24 Atlantic salmon MODERN SPECIES 577 rhoh (ENSSSAG00000116196) n4bp2 (ENSSSAG00000100751) pds5a (ENSSSAG00000103269) UBE2K (ENSSSAG00000015380) smim14 (ENSSSAG00000087454) #21 ugdh (ENSSSAG00000093332) #22 lias (ENSSSAG00000121685) #23 rpl9 (ENSSSAG00000116626) ##24 rfc1 (ENSSSAG00000095619) #26 ENSSSAG00000121555 Atlantic salmon MODERN SPECIES 34 ugdh (ENSSSAG00000093640) #22 lias (ENSSSAG00000092994) #23 rpl9 (ENSSSAG00000032246) ##24 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 140 ENSGT00940000158402 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ENSGT00390000006234.x #23 ENSGT00390000015224.d.b.b.a ##24 ENSGT00730000111066 #26 ENSGT00590000083165.h.d.a ENSGT00590000083165.h.d.b.a ENSGT00940000155358.u.a ENSGT00940000155358.u.b ENSGT00390000010054.b.c Chinook salmon DUPLICATION Chinook salmon MODERN SPECIES 2437 ENSOTSG00005021461 #22 Chinook salmon MODERN SPECIES 2259 ENSOTSG00005020066 #22 Coho salmon DUPLICATION Coho salmon MODERN SPECIES 36 ENSOKIG00005037543 UBA6 (ENSOKIG00005037723) ENSOKIG00005038511 ENSOKIG00005038518 ENSOKIG00005038529 slit2 (ENSOKIG00005038820) ENSOKIG00005046021 CHRNA9 (ENSOKIG00005046043) ENSOKIG00005046066 rhoh (ENSOKIG00005046073) n4bp2 (ENSOKIG00005046086) ENSOKIG00005046097 ENSOKIG00005046103 ENSOKIG00005046110 ENSOKIG00005046310 #21 ugdh (ENSOKIG00005046318) #22 lias (ENSOKIG00005033952) #23 rpl9 (ENSOKIG00005034011) ##24 ENSOKIG00005034088 ENSOKIG00005034099 #26 ENSOKIG00005034108 #26 WDR19 (ENSOKIG00005034133) ENSOKIG00005034887 ENSOKIG00005034993 ENSOKIG00005035060 ENSOKIG00005035067 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CXXC5 (ENSELUG00000022501) zgc:100829 (ENSELUG00000022554) puraa (ENSELUG00000029128) nrg2a (ENSELUG00000022713) ENSELUG00000022722 ENSELUG00000027515 slc22a6l (ENSELUG00000022804) Northern pike MODERN SPECIES 24 ENSELUG00000034696 ENSELUG00000029825 ENSELUG00000028596 ENSELUG00000006576 hpf1 (ENSELUG00000006606) ENSELUG00000006657 ITLN1 (ENSELUG00000006682) CHRNA9 (ENSELUG00000034602) ENSELUG00000028783 CHRNA9 (ENSELUG00000006863) rhoh (ENSELUG00000006891) n4bp2 (ENSELUG00000006915) pds5a (ENSELUG00000007008) UBE2K (ENSELUG00000007059) smim14 (ENSELUG00000007081) #21 ugdh (ENSELUG00000007104) #22 lias (ENSELUG00000007134) #23 rpl9 (ENSELUG00000007202) ##24 rfc1 (ENSELUG00000007257) #26 ENSELUG00000028199 WDR19 (ENSELUG00000007343) ENSELUG00000007440 klhl5 (ENSELUG00000007490) fam114a1 (ENSELUG00000007539) klf3 (ENSELUG00000007562) TBC1D1 (ENSELUG00000007592) ENSELUG00000030717 pgm2 (ENSELUG00000007625) ENSELUG00000030668 zcchc7 (ENSELUG00000007648) pax5 (ENSELUG00000007769) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 125 ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.b ENSGT00390000013015 ENSGT00530000063669.a ENSGT00390000001577 ENSGT00940000154965.B ENSGT00940000162414 ENSGT00940000165139 ENSGT00940000158402 ENSGT00940000157037.a.c.b ENSGT00940000156077.g.b ENSGT00940000160078 ENSGT00940000164462 ENSGT00940000155155 ENSGT00670000098059.c.b ENSGT00390000018294 #21 ENSGT00390000015355 #22 ENSGT00390000006234 #23 ENSGT00390000015224.d ##24 ENSGT00730000111066 #26 ENSGT00590000083165 ENSGT00940000155358 ENSGT00390000010054.b ENSGT00940000157456 ENSGT00940000157949 ENSGT01030000235076 ENSGT00940000156247 ENSGT00950000183041.B.g ENSGT00940000171367 ENSGT00940000159636 ENSGT00940000154889 ENSGT00940000167725.b Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.b ENSGT00390000013015 ENSGT00530000063669.a ENSGT00390000001577 ENSGT00940000154965.B ENSGT00940000162414 ENSGT00940000158402 ENSGT00940000157037.a.c.b ENSGT01100000263538.A.a.a.b.a.c.a.b ENSGT00940000156077.g.b 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ENSGT00390000006234 #23 ENSGT00390000015224.d ##24 ENSGT00730000111066 #26 ENSGT00590000083165 ENSGT00940000155358 ENSGT00390000010054.b ENSGT00940000157456 ENSGT00940000157949 ENSGT00940000156247 ENSGT00950000183041.B.g ENSGT00940000171367 ENSGT00940000159636 ENSGT00940000154889 ENSGT00940000167725.b ENSGT00940000167725.a Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000001577 ENSGT00940000154965.B ENSGT00940000162414 ENSGT00940000158402 ENSGT00940000154757.xb.b ENSGT00940000163443 ENSGT00940000157037.a.c.b ENSGT01100000263538.A.a.a.b.a.c.a.b ENSGT00940000156077.g.b ENSGT00940000160078 ENSGT00940000164462 ENSGT00940000155155 ENSGT00670000098059.c.b ENSGT00390000018294 #21 ENSGT00730000111184 ENSGT00390000015355 #22 ENSGT00390000006234 #23 ENSGT00390000015224.d ##24 ENSGT00730000111066 #26 ENSGT00590000083165 ENSGT00940000155358 ENSGT00390000010054.b ENSGT00940000157456 ENSGT00940000157949 ENSGT00940000156247 ENSGT00950000183041.B.g ENSGT00940000159636 ENSGT00940000154889 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ENSTNIG00000017817 ENSTNIG00000017816 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000001577 ENSGT00740000116263 ENSGT00940000162414 ENSGT00940000158402 ENSGT00940000154757.xb.b ENSGT00940000163443 ENSGT00940000157037.a.c.b ENSGT01100000263538.A.a.a.b.a.c.a.b ENSGT00940000156077.g.b ENSGT00940000160078 ENSGT00940000164462 ENSGT00940000155155 ENSGT00670000098059.c.b ENSGT00390000018294 #21 ENSGT00730000111184 ENSGT00390000015355 #22 ENSGT00390000006234 #23 ENSGT00390000015224.d ##24 ENSGT00730000111066 #26 ENSGT00590000083165 ENSGT00940000155358 ENSGT00390000010054.b ENSGT00940000157456 ENSGT00940000157949 ENSGT00940000156247 ENSGT00950000183041.B.g ENSGT00940000171367 ENSGT00940000159636 ENSGT00940000154889 ENSGT00940000167725.b ENSGT00940000167725.a Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 3880 map9 (ENSLBEG00000019187) ENSLBEG00000019222 #22 Ballan wrasse MODERN SPECIES 173 ENSLBEG00000004757 ENSLBEG00000004751 chic2 (ENSLBEG00000004715) ENSLBEG00000004667 rhoh 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ENSGT00390000015224.d ##24 ENSGT00730000111066 #26 ENSGT00590000083165 ENSGT00940000155358 ENSGT00390000010054.b ENSGT00940000157456 ENSGT00940000157949 ENSGT00940000156247 ENSGT00950000183041.B.g ENSGT00940000171367 ENSGT00940000159636 ENSGT00940000154889 ENSGT00940000167725.b ENSGT00940000167725.a Perciformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000001577 ENSGT00740000116263 ENSGT00940000162414 ENSGT00940000158402 ENSGT00940000154757.xb.b ENSGT00940000157037.a.c.b ENSGT00940000155857.e.a ENSGT01100000263538.A.a.a.b.a.c.a.b ENSGT00940000156077.g.b ENSGT00940000160078 ENSGT00940000164462 ENSGT00940000155155 ENSGT00670000098059.c.b ENSGT00390000018294 #21 ENSGT00730000111184 ENSGT00390000015355 #22 ENSGT00390000006234 #23 ENSGT00390000015224.d ##24 ENSGT00730000111066 #26 ENSGT00590000083165 ENSGT00940000155358 ENSGT00390000010054.b ENSGT00940000157456 ENSGT00940000157949 ENSGT00940000156247 ENSGT00950000183041.B.g ENSGT00940000171367 ENSGT00940000159636 ENSGT00940000154889 ENSGT00940000167725.b ENSGT00940000167725.a Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063669.a ENSGT00390000001577 ENSGT00740000116263 ENSGT00940000162414 ENSGT00940000158402 ENSGT00940000154757.xb.b ENSGT00940000157037.a.c.b ENSGT01100000263538.A.a.a.b.a.c.a.b ENSGT00940000156077.g.b ENSGT00940000160078 ENSGT00940000164462 ENSGT00940000155155 ENSGT00670000098059.c.b ENSGT00390000018294 #21 ENSGT00730000111184 ENSGT00390000015355 #22 ENSGT00390000006234 #23 ENSGT00390000015224.d ##24 ENSGT00730000111066 #26 ENSGT00590000083165 ENSGT00940000155358 ENSGT00390000010054.b ENSGT00940000157456 ENSGT00940000157949 ENSGT00940000156247 ENSGT00950000183041.B.g ENSGT00940000171367 ENSGT00940000159636 ENSGT00940000154889 ENSGT00940000167725.b ENSGT00940000167725.a Pike perch MODERN SPECIES 69 ncapg (ENSSLUG00000011981) ENSSLUG00000012049 ENSSLUG00000012053 ENSSLUG00000012059 slit2 (ENSSLUG00000012413) ITLN1 (ENSSLUG00000020161) DRD5 (ENSSLUG00000020169) ENSSLUG00000020190 CHRNA9 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melk (ENSOJAG00000013178) ENSOJAG00000013456 ENSOJAG00000013483 ENSOJAG00000013547 grhprb (ENSOJAG00000013668) Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00530000063669.a ENSGT00390000001577 ENSGT00940000162414 ENSGT00940000158402 ENSGT00940000154757.xb.b ENSGT00940000163443 ENSGT00940000157037.a.c.b ENSGT01100000263538.A.a.a.b.a.c.a.b ENSGT00940000156077.g.b ENSGT00940000160078 ENSGT00940000164462 ENSGT00940000155155 ENSGT00670000098059.c.b ENSGT00390000018294 #21 ENSGT00730000111184 ENSGT00390000015355 #22 ENSGT00390000006234 #23 ENSGT00390000015224.d ##24 ENSGT00730000111066 #26 ENSGT00590000083165 ENSGT00940000155358 ENSGT00390000010054.b ENSGT00940000157456 ENSGT00940000157949 ENSGT01030000235076 ENSGT00940000156247 ENSGT00950000183041.B.g ENSGT00940000159636 ENSGT00940000154889 ENSGT00940000165569 ENSGT00940000158694 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000013015 ENSGT00530000063669.a ENSGT00390000001577 ENSGT00940000162414 ENSGT00940000158402 ENSGT00940000163443 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ENSGT00390000015355 #22 ENSGT00390000006234 #23 ENSGT00390000015224.d ##24 ENSGT00730000111066 #26 ENSGT00940000155586.A.c ENSGT00940000155527.j.b.a ENSGT00990000203806.a ENSGT00390000011749 ENSGT00410000029064 ENSGT00390000000470.m ENSGT00390000005639.a.a.n ENSGT00390000010628.a ENSGT00530000063586.b.c.a ENSGT00940000154372.a.a.b ENSGT00940000154372.a.b.a ENSGT00940000155988.c Red-bellied piranha MODERN SPECIES 243 tasp1 (ENSPNAG00000029201) ENSPNAG00000029111 ENSPNAG00000029033 slit2 (ENSPNAG00000004473) ENSPNAG00000028448 PSME4 (ENSPNAG00000028254) GPR75 (ENSPNAG00000027792) erlec1 (ENSPNAG00000027770) ENSPNAG00000005964 CHRNA9 (ENSPNAG00000027649) rhoh (ENSPNAG00000027615) n4bp2 (ENSPNAG00000027604) pds5a (ENSPNAG00000006831) ube2kb (ENSPNAG00000027487) smim14 (ENSPNAG00000004233) #21 ugdh (ENSPNAG00000027414) #22 lias (ENSPNAG00000027333) #23 rpl9 (ENSPNAG00000027318) ##24 rfc1 (ENSPNAG00000027262) #26 ENSPNAG00000027246 ADGRL3 (ENSPNAG00000006104) ENSPNAG00000026718 gtf2e2 (ENSPNAG00000026699) smim18 (ENSPNAG00000026666) qdprb.4 (ENSPNAG00000026656) Mexicana tetra MODERN SPECIES 13 rps3a (ENSAMXG00000021691) sh3d19 (ENSAMXG00000021664) FHIP1A (ENSAMXG00000021663) gatb (ENSAMXG00000021662) dctpp1 (ENSAMXG00000025272) ENSAMXG00000041640 FBXW7 (ENSAMXG00000038524) GPR75 (ENSAMXG00000025271) erlec1 (ENSAMXG00000021660) CHRNA9 (ENSAMXG00000021659) rhoh (ENSAMXG00000025269) n4bp2 (ENSAMXG00000021658) pds5a (ENSAMXG00000021657) ube2kb (ENSAMXG00000034571) smim14 (ENSAMXG00000031990) #21 ugdh (ENSAMXG00000021654) #22 lias (ENSAMXG00000018746) #23 rpl9 (ENSAMXG00000041237) ##24 rfc1 (ENSAMXG00000021652) #26 ENSAMXG00000038437 ENSAMXG00000037739 ENSAMXG00000040505 ADGRL3 (ENSAMXG00000021645) ENSAMXG00000037417 smim18 (ENSAMXG00000025268) gtf2e2 (ENSAMXG00000021633) qdprb.4 (ENSAMXG00000035389) ldb2b (ENSAMXG00000021629) tapt1b (ENSAMXG00000013101) prom1b (ENSAMXG00000021625) fgfbp2b (ENSAMXG00000021623) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154778.d 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ENSSGRG00000020989 anxa5b (ENSSGRG00000020348) Zebrafish MODERN SPECIES rps3a (ENSDARG00000035692) mab21l2 (ENSDARG00000015266) LRBA (ENSDARG00000031108) slit2 (ENSDARG00000004246) ENSDARG00000094046 ENSDARG00000070098 ncapg (ENSDARG00000070109) fam184b (ENSDARG00000055099) ENSDARG00000092290 CHRNA9 (ENSDARG00000054680) rhoh (ENSDARG00000070121) n4bp2 (ENSDARG00000061451) pds5a (ENSDARG00000055022) ube2kb (ENSDARG00000013505) smim14 (ENSDARG00000005799) #21 ugdh (ENSDARG00000019838) #22 lias (ENSDARG00000022845) #23 rpl9 (ENSDARG00000037350) ##24 ENSDARG00000116939 rfc1 (ENSDARG00000054799) #26 ENSDARG00000094677 ADGRL3 (ENSDARG00000061121) smim18 (ENSDARG00000093064) gtf2e2 (ENSDARG00000012672) qdprb.1 (ENSDARG00000037378) ENSDARG00000116099 ldb2b (ENSDARG00000034896) tapt1b (ENSDARG00000061143) prom1b (ENSDARG00000034007) zmynd10 (ENSDARG00000002406) fgfbp2b (ENSDARG00000038056) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 67 ENSGT00390000017452 ENSGT00940000160184.c.b ENSGT00530000063713.b.a 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GCNT3 (ENSCHAG00000013464) GCNT3 (ENSCHAG00000013448) ENSCHAG00000013428 OTUD7A (ENSCHAG00000013399) klf13 (ENSCHAG00000013379) ENSCHAG00000013364 trpm1b (ENSCHAG00000010296) RAB8B (ENSCHAG00000010155) rps27l (ENSCHAG00000010048) ACSBG1 (ENSCHAG00000009594) DNAJA4 (ENSCHAG00000009400) idh3a (ENSCHAG00000008118) Atlantic herring MODERN SPECIES 14 mogs (ENSCHAG00000027770) ENSCHAG00000027769 FBXO41 (ENSCHAG00000027768) rnf24 (ENSCHAG00000027767) smox (ENSCHAG00000027766) ENSCHAG00000027764 ADRA1D (ENSCHAG00000027763) ENSCHAG00000027760 rbm47 (ENSCHAG00000027759) CHRNA9 (ENSCHAG00000027758) rhoh (ENSCHAG00000027755) n4bp2 (ENSCHAG00000027753) pds5a (ENSCHAG00000027709) UBE2K (ENSCHAG00000027698) smim14 (ENSCHAG00000027697) #21 ugdh (ENSCHAG00000027696) #22 lias (ENSCHAG00000027694) #23 rpl9 (ENSCHAG00000027693) ##24 rfc1 (ENSCHAG00000027684) #26 ENSCHAG00000027671 APBB2 (ENSCHAG00000027664) ENSCHAG00000027662 exosc9 (ENSCHAG00000027661) ENSCHAG00000027658 UBA6 (ENSCHAG00000027618) tmem144a (ENSCHAG00000027599) gria2a (ENSCHAG00000027466) glrba (ENSCHAG00000027372) kdm4c (ENSCHAG00000027249) ecpas (ENSCHAG00000026976) ENSCHAG00000026951 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00940000154372.a.a.a ENSGT00940000155988.a ENSGT00940000155372 ENSGT00390000012346 ENSGT00940000159958.a ENSGT00950000183159.a.v.b.w ENSGT00940000157306.ib ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.a ENSGT00940000157352.b ENSGT00940000156979.a ENSGT00940000156077 ENSGT00940000160078.b ENSGT00940000155155 ENSGT00670000098059.e.a ENSGT00390000018294 #21 ENSGT00390000015355 #22 ENSGT00390000006234 #23 ENSGT00390000015224.d ##24 ENSGT00730000111066 #26 ENSGT00590000083165 ENSGT00940000155358.n ENSGT00390000010054.b ENSGT00940000157456 ENSGT00940000157949.m ENSGT00940000156247 ENSGT01100000263913 ENSGT00940000164838.b ENSGT00950000183035.b.f ENSGT00530000063425.a.a.a.b.yd.b ENSGT00390000018004 ENSGT00940000160246.b Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 rps14 (ENSSFOG00015027181) 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DUPLICATION Reedfish MODERN SPECIES 2 ENSECRG00000014538 APBB3 (ENSECRG00000014499) SRA1 (ENSECRG00000014471) HMGXB3 (ENSECRG00000014406) sumo3a (ENSECRG00000014340) ENSECRG00000014313 csf1ra (ENSECRG00000014257) pdgfrb (ENSECRG00000014164) cdx1b (ENSECRG00000014111) camk2a (ENSECRG00000013873) ARSI (ENSECRG00000013768) tmco6 (ENSECRG00000013730) ndufa2 (ENSECRG00000013696) ik (ENSECRG00000013652) wdr55 (ENSECRG00000013620) ENSECRG00000013595 #22 hars (ENSECRG00000011628) DND1 (ENSECRG00000011600) zmat2 (ENSECRG00000011584) ENSECRG00000011487 ENSECRG00000011395 ENSECRG00000011316 ENSECRG00000011286 ENSECRG00000011243 ENSECRG00000011222 ENSECRG00000011206 ENSECRG00000011199 ENSECRG00000011193 ENSECRG00000011187 ENSECRG00000011183 ENSECRG00000011178 Reedfish MODERN SPECIES 13 APBB2 (ENSECRG00000003447) NSUN7 (ENSECRG00000003476) rbm47 (ENSECRG00000003505) CHRNA9 (ENSECRG00000003518) rhoh (ENSECRG00000003535) N4BP2 (ENSECRG00000003551) ENSECRG00000003567 ENSECRG00000003573 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