Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	37																ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000002381.b	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00550000074994
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	1201																ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00940000165840
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	1025																ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00940000165840
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00940000161906	ENSGT00940000166153	ENSGT00940000164357	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00940000166270	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000002381.b	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00990000204256	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00940000166270	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00940000167952	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00990000204256	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543
Theria	ANCESTRAL SPECIES	62	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00940000167952	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00940000167952	ENSGT00390000009268	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Primates	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.`b.a ##19	ENSGT00990000204256	ENSGT00390000011666.`b.b #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Bushbaby	MODERN SPECIES	162	SYCE1L (ENSOGAG00000027541) #7	ADAMTS18 (ENSOGAG00000011951) #8	NUDT7 (ENSOGAG00000005648) #9	VAT1L (ENSOGAG00000005649) #10	CLEC3A (ENSOGAG00000005654) #11	ENSOGAG00000005657 #12	ENSOGAG00000031340 #13	DYNLRB2 (ENSOGAG00000000907) #14	CDYL2 (ENSOGAG00000000906) #15	CENPN (ENSOGAG00000006972) #16	ENSOGAG00000029620 #17	ENSOGAG00000029585 #18	ENSOGAG00000007967 #19	ENSOGAG00000007970 #20	BCO1 (ENSOGAG00000016237) #21	GAN (ENSOGAG00000012484) #22	CMIP (ENSOGAG00000016409) #23	PLCG2 (ENSOGAG00000006986) #24	ENSOGAG00000006999 #25	HSD17B2 (ENSOGAG00000012529) #26	MPHOSPH6 (ENSOGAG00000012532) #27	CDH13 (ENSOGAG00000009291) #28	HSBP1 (ENSOGAG00000015437) #29	MLYCD (ENSOGAG00000009296) #30	OSGIN1 (ENSOGAG00000034472) #31	NECAB2 (ENSOGAG00000009297) #32	SLC38A8 (ENSOGAG00000009301) #33	MBTPS1 (ENSOGAG00000009308) #34	HSDL1 (ENSOGAG00000009323) #35	DNAAF1 (ENSOGAG00000009325) #36	TAF1C (ENSOGAG00000009329) #37
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	51					ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.`b.a ##19	ENSGT00990000204256	ENSGT00390000011666.`b.b #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293.yc #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Mouse lemur	MODERN SPECIES	12	TERF2IP (ENSMICG00000041861)	DUXB (ENSMICG00000042018)	CNTNAP4 (ENSMICG00000012242)	MON1B (ENSMICG00000009221)	SYCE1L (ENSMICG00000028524) #7	ADAMTS18 (ENSMICG00000009225) #8	DYNLRB2 (ENSMICG00000000631) #14	CDYL2 (ENSMICG00000000633) #15	CMC2 (ENSMICG00000011915)	CENPN (ENSMICG00000011918) #16	ENSMICG00000011930 #17	C16orf46 (ENSMICG00000045406)	ENSMICG00000045290 ##19	ENSMICG00000011945 #20	BCO1 (ENSMICG00000014945) #21	GAN (ENSMICG00000014957) #22	MAF (ENSMICG00000043372) #13	WWOX (ENSMICG00000029194)	CLEC3A (ENSMICG00000047455) #11	VAT1L (ENSMICG00000009243) #10	ENSMICG00000041836 #8	NUDT7 (ENSMICG00000031936) #9	ADGRG5 (ENSMICG00000031680)	CCDC102A (ENSMICG00000027073)	ENSMICG00000012449	ENSMICG00000041838	ENSMICG00000028984	CES5A (ENSMICG00000003829)	ENSMICG00000003840	AMFR (ENSMICG00000003847)	NUDT21 (ENSMICG00000046719)
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	55				ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.`b.a ##19	ENSGT00990000204256	ENSGT00390000011666.`b.b #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293.yc #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	399						MAF (ENSPCOG00000020508) #13	DYNLRB2 (ENSPCOG00000028370) #14	CDYL2 (ENSPCOG00000017731) #15	ENSPCOG00000020662	CENPN (ENSPCOG00000020111) #16	ATMIN (ENSPCOG00000019245) #17	C16orf46 (ENSPCOG00000021267)	ENSPCOG00000016082 #19	ENSPCOG00000018154 #20	BCO1 (ENSPCOG00000011909) #21	GAN (ENSPCOG00000016506) #22	CMIP (ENSPCOG00000026783) #23	PLCG2 (ENSPCOG00000017491) #24	SDR42E1 (ENSPCOG00000024993) #25	HSD17B2 (ENSPCOG00000015807) #26	ENSPCOG00000014174 #27	CDH13 (ENSPCOG00000011394) #28	ENSPCOG00000013345	HSBP1 (ENSPCOG00000013114) #29	MLYCD (ENSPCOG00000014205) #30	OSGIN1 (ENSPCOG00000017513) #31	NECAB2 (ENSPCOG00000018699) #32	SLC38A8 (ENSPCOG00000001606) #33	MBTPS1 (ENSPCOG00000024773) #34	HSDL1 (ENSPCOG00000001727) #35	ENSPCOG00000027210 #36
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	420						DYNLRB2 (ENSPSMG00000005504) #14	CDYL2 (ENSPSMG00000005531) #15	CMC2 (ENSPSMG00000005556)	CENPN (ENSPSMG00000005594) #16	ATMIN (ENSPSMG00000005678) #17	C16orf46 (ENSPSMG00000005682)	ENSPSMG00000005725 ##19	ENSPSMG00000005766	ENSPSMG00000005782 #20	BCO1 (ENSPSMG00000005790) #21	GAN (ENSPSMG00000005802) #22	CMIP (ENSPSMG00000005904) #23	PLCG2 (ENSPSMG00000006135) #24	SDR42E1 (ENSPSMG00000006142) #25	HSD17B2 (ENSPSMG00000006150) #26	MPHOSPH6 (ENSPSMG00000006170) #27	CDH13 (ENSPSMG00000006218) #28	ENSPSMG00000006243 #29	MLYCD (ENSPSMG00000006247) #30	OSGIN1 (ENSPSMG00000006253) #31	NECAB2 (ENSPSMG00000006259) #32	SLC38A8 (ENSPSMG00000006263) #33	MBTPS1 (ENSPSMG00000006295) #34	HSDL1 (ENSPSMG00000006312) #35	ENSPSMG00000006316 #36	ENSPSMG00000006326 #37
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Tarsier	MODERN SPECIES	5652							DYNLRB2 (ENSTSYG00000007776) #14	CDYL2 (ENSTSYG00000011469) #15	CMC2 (ENSTSYG00000007059)	CENPN (ENSTSYG00000002871) #16	ATMIN (ENSTSYG00000036649) #17	C16orf46 (ENSTSYG00000035549)	ENSTSYG00000000248 #19	ENSTSYG00000026897 #20	BCO1 (ENSTSYG00000009405) #21	GAN (ENSTSYG00000036909) #22	CMIP (ENSTSYG00000028001) #23	PLCG2 (ENSTSYG00000014024) #24	SDR42E1 (ENSTSYG00000013803) #25	HSD17B2 (ENSTSYG00000013598) #26
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.x.b #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00550000076258	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00940000159769.b.d	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091.r #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.x.b #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00550000076258	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.m.a #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00940000159769.b.d	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738.b #16	ENSGT00390000013091.r #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.x.b #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.m.a #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	51	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00940000159769.b.d	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738.b #16	ENSGT00390000013091.r #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.x.b #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.m.a #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Capuchin	MODERN SPECIES	137	VAT1L (ENSCCAG00000029888) #10	CLEC3A (ENSCCAG00000018795) #11	WWOX (ENSCCAG00000033057)	ENSCCAG00000020493	MAF (ENSCCAG00000033131) #13	ENSCCAG00000023113	DYNLRB2 (ENSCCAG00000023094) #14	CDYL2 (ENSCCAG00000029391) #15	CMC2 (ENSCCAG00000019738)	CENPN (ENSCCAG00000025012) #16	ENSCCAG00000001760 #17	C16orf46 (ENSCCAG00000023525)	ENSCCAG00000031393 #19	PKD1L2 (ENSCCAG00000037509) #20	BCO1 (ENSCCAG00000033122) #21	GAN (ENSCCAG00000016849) #22	CMIP (ENSCCAG00000024316) #23	PLCG2 (ENSCCAG00000020986) #24	SDR42E1 (ENSCCAG00000037533) #25	HSD17B2 (ENSCCAG00000015333) #26	ENSCCAG00000022557 #27
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	137	NUDT7 (ENSSBOG00000031725) #9	VAT1L (ENSSBOG00000021201) #10	CLEC3A (ENSSBOG00000014185) #11	WWOX (ENSSBOG00000029958)	ENSSBOG00000033059	DYNLRB2 (ENSSBOG00000033490) #14	CDYL2 (ENSSBOG00000023679) #15	ENSSBOG00000020281	CMC2 (ENSSBOG00000026454)	ENSSBOG00000023971 #16	ENSSBOG00000020729 #17	C16orf46 (ENSSBOG00000029905)	ENSSBOG00000028280 #19	ENSSBOG00000023334 #20	BCO1 (ENSSBOG00000014568) #21	GAN (ENSSBOG00000024113) #22	CMIP (ENSSBOG00000003467) #23	PLCG2 (ENSSBOG00000026469) #24	SDR42E1 (ENSSBOG00000034896) #25	HSD17B2 (ENSSBOG00000033511) #26	ENSSBOG00000031580 #27	CDH13 (ENSSBOG00000019920) #28	HSBP1 (ENSSBOG00000027265) #29	ENSSBOG00000026816	MAP4K4 (ENSSBOG00000028082)	RFX8 (ENSSBOG00000019961)	CREG2 (ENSSBOG00000022650)	RNF149 (ENSSBOG00000030607)	CNOT11 (ENSSBOG00000030189)	ENSSBOG00000031710	TBC1D8 (ENSSBOG00000027309)
Marmoset	MODERN SPECIES	12	VAT1L (ENSCJAG00000014046) #10	CLEC3A (ENSCJAG00000039841) #11	WWOX (ENSCJAG00000014032)	MAF (ENSCJAG00000041654) #13	ENSCJAG00000084007	ENSCJAG00000080145	DYNLRB2 (ENSCJAG00000016709) #14	CDYL2 (ENSCJAG00000016685) #15	CMC2 (ENSCJAG00000072359)	CENPN (ENSCJAG00000016673) #16	ATMIN (ENSCJAG00000016670) #17	C16orf46 (ENSCJAG00000016662)	ENSCJAG00000083289 #19	ENSCJAG00000016609 #20	BCO1 (ENSCJAG00000077714) #21	GAN (ENSCJAG00000016571) #22	CMIP (ENSCJAG00000016538) #23	ENSCJAG00000080065	PLCG2 (ENSCJAG00000016515) #24	SDR42E1 (ENSCJAG00000054745) #25	HSD17B2 (ENSCJAG00000016505) #26	MPHOSPH6 (ENSCJAG00000016498) #27	CDH13 (ENSCJAG00000008343) #28	HSBP1 (ENSCJAG00000047707) #29	MLYCD (ENSCJAG00000000633) #30	OSGIN1 (ENSCJAG00000083606) #31	NECAB2 (ENSCJAG00000003789) #32	ENSCJAG00000003812 #33	MBTPS1 (ENSCJAG00000003829) #34	HSDL1 (ENSCJAG00000003920) #35	DNAAF1 (ENSCJAG00000003933) #36
Mas night monkey	MODERN SPECIES	517						MAF (ENSANAG00000034156) #13	ENSANAG00000037239	DYNLRB2 (ENSANAG00000037742) #14	CDYL2 (ENSANAG00000021651) #15	CMC2 (ENSANAG00000023151)	ENSANAG00000032681 #17	C16orf46 (ENSANAG00000033425)	ENSANAG00000022292 #19	ENSANAG00000025943 #20	BCO1 (ENSANAG00000031210) #21	GAN (ENSANAG00000033975) #22	ENSANAG00000033422	CMIP (ENSANAG00000021925) #23	PLCG2 (ENSANAG00000025033) #24	SDR42E1 (ENSANAG00000030613) #25	HSD17B2 (ENSANAG00000036673) #26	ENSANAG00000034555 #27	CDH13 (ENSANAG00000028622) #28	HSBP1 (ENSANAG00000038047) #29	MLYCD (ENSANAG00000033161) #30	OSGIN1 (ENSANAG00000010277) #31	NECAB2 (ENSANAG00000034372) #32	SLC38A8 (ENSANAG00000026554) #33	ENSANAG00000023392	MBTPS1 (ENSANAG00000037655) #34	HSDL1 (ENSANAG00000025556) #35
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.x.b #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00550000076258	ENSGT00620000089250	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00860000136182	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091.o #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.x.b.l #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00620000089250	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36
Gibbon	MODERN SPECIES	11	NUDT7 (ENSNLEG00000013280) #9	VAT1L (ENSNLEG00000013285) #10	CLEC3A (ENSNLEG00000030222) #11	WWOX (ENSNLEG00000013308)	ENSNLEG00000030521	MAF (ENSNLEG00000010420) #13	ENSNLEG00000010422 #14	CDYL2 (ENSNLEG00000010424) #15	ENSNLEG00000010438	CENPN (ENSNLEG00000010442) #16	ATMIN (ENSNLEG00000029083) #17	C16orf46 (ENSNLEG00000035295)	GCSH (ENSNLEG00000035315) #19	ENSNLEG00000010482 #20	BCO1 (ENSNLEG00000010612) #21	GAN (ENSNLEG00000010617) #22	ENSNLEG00000010677	CMIP (ENSNLEG00000010663) #23	PLCG2 (ENSNLEG00000010678) #24	SDR42E1 (ENSNLEG00000010695) #25	HSD17B2 (ENSNLEG00000010702) #26	MPHOSPH6 (ENSNLEG00000010725) #27	CDH13 (ENSNLEG00000010747) #28	HSBP1 (ENSNLEG00000035650) #29	MLYCD (ENSNLEG00000029910) #30	ENSNLEG00000010850 #31	ENSNLEG00000010863 #32	SLC38A8 (ENSNLEG00000010885) #33	MBTPS1 (ENSNLEG00000010901) #34	HSDL1 (ENSNLEG00000010992) #35	ENSNLEG00000010993 #36
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00860000136182	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091.o #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.x.b.l #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00620000089250	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36
Orangutan	MODERN SPECIES	7	NUDT7 (ENSPPYG00000007573) #9	VAT1L (ENSPPYG00000007574) #10	CLEC3A (ENSPPYG00000007575) #11	WWOX (ENSPPYG00000007576)	ENSPPYG00000007577	MAF (ENSPPYG00000041151) #13	ENSPPYG00000007579 #14	CDYL2 (ENSPPYG00000007580) #15	ENSPPYG00000007581	CENPN (ENSPPYG00000007582) #16	ATMIN (ENSPPYG00000007583) #17	C16orf46 (ENSPPYG00000007584)	GCSH (ENSPPYG00000007585) #19	ENSPPYG00000007586 #20	BCO1 (ENSPPYG00000007587) #21	GAN (ENSPPYG00000007588) #22	CMIP (ENSPPYG00000007738) #23	PLCG2 (ENSPPYG00000007589) #24	SDR42E1 (ENSPPYG00000007590) #25	HSD17B2 (ENSPPYG00000007591) #26	MPHOSPH6 (ENSPPYG00000007592) #27	CDH13 (ENSPPYG00000007593) #28	HSBP1 (ENSPPYG00000041045) #29	MLYCD (ENSPPYG00000007594) #30	OSGIN1 (ENSPPYG00000007595) #31	NECAB2 (ENSPPYG00000007596) #32	SLC38A8 (ENSPPYG00000007697) #33	MBTPS1 (ENSPPYG00000007597) #34	HSDL1 (ENSPPYG00000007598) #35	DNAAF1 (ENSPPYG00000007599) #36	TAF1C (ENSPPYG00000007600) #37
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00860000136182	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091.o #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.x.b.l #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00620000089250	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36
Gorilla	MODERN SPECIES	7	NUDT7 (ENSGGOG00000017049) #9	VAT1L (ENSGGOG00000009496) #10	CLEC3A (ENSGGOG00000009506) #11	WWOX (ENSGGOG00000042973)	ENSGGOG00000028287	ENSGGOG00000011454 #13	ENSGGOG00000008687 #14	CDYL2 (ENSGGOG00000006084) #15	ENSGGOG00000006740	CENPN (ENSGGOG00000002868) #16	ATMIN (ENSGGOG00000013004) #17	C16orf46 (ENSGGOG00000006688)	GCSH (ENSGGOG00000000232) #19	ENSGGOG00000000233 #20	BCO1 (ENSGGOG00000000237) #21	GAN (ENSGGOG00000014214) #22	CMIP (ENSGGOG00000000035) #23	ENSGGOG00000025361	PLCG2 (ENSGGOG00000017132) #24	SDR42E1 (ENSGGOG00000013178) #25	HSD17B2 (ENSGGOG00000016637) #26	MPHOSPH6 (ENSGGOG00000001405) #27	CDH13 (ENSGGOG00000012330) #28	ENSGGOG00000036564 #29	MLYCD (ENSGGOG00000008007) #30	SLC38A8 (ENSGGOG00000003919) #33	MBTPS1 (ENSGGOG00000010784) #34	HSDL1 (ENSGGOG00000016026) #35	DNAAF1 (ENSGGOG00000000941) #36	ENSGGOG00000043727 #36	TAF1C (ENSGGOG00000000942) #37
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091.o #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.x.b.l #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00620000089250	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36
Human	MODERN SPECIES	7	CLEC3A (ENSG00000166509) #11	WWOX (ENSG00000186153)	MAF (ENSG00000178573) #13	DYNLRB2 (ENSG00000168589) #14	CDYL2 (ENSG00000166446) #15	ENSG00000286221	CMC2 (ENSG00000103121)	CENPN (ENSG00000166451) #16	ENSG00000284512	ATMIN (ENSG00000166454) #17	C16orf46 (ENSG00000166455)	ENSG00000260643	GCSH (ENSG00000140905) #19	PKD1L2 (ENSG00000166473) #20	BCO1 (ENSG00000135697) #21	GAN (ENSG00000261609) #22	CMIP (ENSG00000153815) #23	PLCG2 (ENSG00000197943) #24	SDR42E1 (ENSG00000184860) #25	HSD17B2 (ENSG00000086696) #26	MPHOSPH6 (ENSG00000135698) #27	CDH13 (ENSG00000140945) #28	HSBP1 (ENSG00000230989) #29	MLYCD (ENSG00000103150) #30	OSGIN1 (ENSG00000140961) #31	NECAB2 (ENSG00000103154) #32	SLC38A8 (ENSG00000166558) #33	MBTPS1 (ENSG00000140943) #34	HSDL1 (ENSG00000103160) #35	DNAAF1 (ENSG00000154099) #36	TAF1C (ENSG00000103168) #37
Pan	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00860000136182	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091.o #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.x.b.l #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00620000089250	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36
Chimpanzee	MODERN SPECIES	7	VAT1L (ENSPTRG00000008374) #10	CLEC3A (ENSPTRG00000008375) #11	WWOX (ENSPTRG00000008376)	ENSPTRG00000049801	ENSPTRG00000047655	MAF (ENSPTRG00000045874) #13	DYNLRB2 (ENSPTRG00000008379) #14	CDYL2 (ENSPTRG00000008380) #15	CMC2 (ENSPTRG00000008382)	CENPN (ENSPTRG00000008383) #16	ATMIN (ENSPTRG00000008384) #17	C16H16orf46 (ENSPTRG00000008385)	GCSH (ENSPTRG00000008386) #19	ENSPTRG00000043634 #20	BCO1 (ENSPTRG00000008389) #21	GAN (ENSPTRG00000008391) #22	CMIP (ENSPTRG00000008393) #23	ENSPTRG00000052311	ENSPTRG00000042898	PLCG2 (ENSPTRG00000008395) #24	SDR42E1 (ENSPTRG00000008396) #25	HSD17B2 (ENSPTRG00000008397) #26	MPHOSPH6 (ENSPTRG00000008398) #27	CDH13 (ENSPTRG00000008400) #28	HSBP1 (ENSPTRG00000008401) #29	MLYCD (ENSPTRG00000008403) #30	OSGIN1 (ENSPTRG00000008404) #31	NECAB2 (ENSPTRG00000008406) #32	SLC38A8 (ENSPTRG00000008407) #33	MBTPS1 (ENSPTRG00000008408) #34	HSDL1 (ENSPTRG00000008409) #35
Bonobo	MODERN SPECIES	7	ADAMTS18 (ENSPPAG00000003071) #8	NUDT7 (ENSPPAG00000039743) #9	VAT1L (ENSPPAG00000027927) #10	CLEC3A (ENSPPAG00000022224) #11	WWOX (ENSPPAG00000038043)	ENSPPAG00000020043	ENSPPAG00000025636 #14	CDYL2 (ENSPPAG00000033654) #15	ENSPPAG00000031935	CENPN (ENSPPAG00000036057) #16	ENSPPAG00000017223 #17	C16orf46 (ENSPPAG00000040845)	ENSPPAG00000014722 #19	ENSPPAG00000038301 #20	BCO1 (ENSPPAG00000013810) #21	GAN (ENSPPAG00000040205) #22	CMIP (ENSPPAG00000042404) #23	PLCG2 (ENSPPAG00000039636) #24	SDR42E1 (ENSPPAG00000033148) #25	HSD17B2 (ENSPPAG00000037971) #26	MPHOSPH6 (ENSPPAG00000040858) #27	CDH13 (ENSPPAG00000039487) #28	ENSPPAG00000040330 #29	MLYCD (ENSPPAG00000040926) #30	OSGIN1 (ENSPPAG00000026986) #31	NECAB2 (ENSPPAG00000019159) #32	SLC38A8 (ENSPPAG00000027952) #33	MBTPS1 (ENSPPAG00000042255) #34	HSDL1 (ENSPPAG00000038992) #35	DNAAF1 (ENSPPAG00000024772) #36	TAF1C (ENSPPAG00000039257) #37
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00860000136182	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.x.b #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00620000089250	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293.fd #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	22							ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.x.b.i.b #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293.fd #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1836					ENSRROG00000044738	DYNLRB2 (ENSRROG00000034202) #14	CDYL2 (ENSRROG00000040508) #15	CMC2 (ENSRROG00000034163)	CENPN (ENSRROG00000006914) #16	ATMIN (ENSRROG00000040180) #17	C16orf46 (ENSRROG00000044557)	ENSRROG00000034467 #19	ENSRROG00000004213	ENSRROG00000038312 #20	BCO1 (ENSRROG00000042760) #21	GAN (ENSRROG00000000822) #22	CMIP (ENSRROG00000034726) #23	PLCG2 (ENSRROG00000045090) #24	SDR42E1 (ENSRROG00000032867) #25	HSD17B2 (ENSRROG00000040362) #26	MPHOSPH6 (ENSRROG00000033784) #27
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	901								CDYL2 (ENSRBIG00000033699) #15	CMC2 (ENSRBIG00000026007)	CENPN (ENSRBIG00000033117) #16	ATMIN (ENSRBIG00000044219) #17	C16orf46 (ENSRBIG00000039697)	ENSRBIG00000000931 #19	ENSRBIG00000044415 #20	BCO1 (ENSRBIG00000019930) #21	GAN (ENSRBIG00000041752) #22	CMIP (ENSRBIG00000043971) #23	PLCG2 (ENSRBIG00000030632) #24	ENSRBIG00000041712 #25
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00860000136182	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.x.b #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00620000089250	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.o.b #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293.fd #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	24	ADAMTS18 (ENSCSAG00000003611) #8	NUDT7 (ENSCSAG00000003596) #9	VAT1L (ENSCSAG00000003593) #10	CLEC3A (ENSCSAG00000003589) #11	WWOX (ENSCSAG00000003584)	ENSCSAG00000018475	DYNLRB2 (ENSCSAG00000003580) #14	CDYL2 (ENSCSAG00000003578) #15	CMC2 (ENSCSAG00000003575)	CENPN (ENSCSAG00000003572) #16	ATMIN (ENSCSAG00000003568) #17	C16orf46 (ENSCSAG00000003567)	GCSH (ENSCSAG00000003563) #19	PKD1L2 (ENSCSAG00000003536) #20	BCO1 (ENSCSAG00000003502) #21	GAN (ENSCSAG00000003492) #22	CMIP (ENSCSAG00000003464) #23	PLCG2 (ENSCSAG00000003427) #24	SDR42E1 (ENSCSAG00000003417) #25	HSD17B2 (ENSCSAG00000003413) #26	ENSCSAG00000003410 #27	CDH13 (ENSCSAG00000003407) #28	MLYCD (ENSCSAG00000003401) #30	OSGIN1 (ENSCSAG00000003392) #31	NECAB2 (ENSCSAG00000003387) #32	SLC38A8 (ENSCSAG00000003381) #33	MBTPS1 (ENSCSAG00000003375) #34	HSDL1 (ENSCSAG00000003370) #35	DNAAF1 (ENSCSAG00000003365) #36	TAF1C (ENSCSAG00000003346) #37	ADAD2 (ENSCSAG00000003310)
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00860000136182	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.x.b #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00620000089250	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.p #27	ENSGT00390000009212.o.b #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293.fd #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00860000136182	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.x.b #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.o.b #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293.fd #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	178	VAT1L (ENSMNEG00000021232) #10	CLEC3A (ENSMNEG00000035656) #11	ENSMNEG00000037686	ENSMNEG00000035509	WWOX (ENSMNEG00000011321)	MAF (ENSMNEG00000037088) #13	DYNLRB2 (ENSMNEG00000041692) #14	CDYL2 (ENSMNEG00000010839) #15	CMC2 (ENSMNEG00000032151)	CENPN (ENSMNEG00000037652) #16	ATMIN (ENSMNEG00000040533) #17	C16orf46 (ENSMNEG00000040087)	ENSMNEG00000032644 #19	ENSMNEG00000036656 #20	BCO1 (ENSMNEG00000039611) #21	GAN (ENSMNEG00000042633) #22	ENSMNEG00000009056	ENSMNEG00000038255	ENSMNEG00000044434	CMIP (ENSMNEG00000036250) #23	PLCG2 (ENSMNEG00000014560) #24	SDR42E1 (ENSMNEG00000036201) #25	HSD17B2 (ENSMNEG00000037692) #26	MPHOSPH6 (ENSMNEG00000040998) #27	ENSMNEG00000038514 #28
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.x.b #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00620000089250	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.o.b #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293.fd #29	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	12	ENSMFAG00000054515	ENSMFAG00000055442	ENSMFAG00000061675	MAF (ENSMFAG00000064321) #13	ENSMFAG00000059854	DYNLRB2 (ENSMFAG00000029001) #14	CDYL2 (ENSMFAG00000039809) #15	CMC2 (ENSMFAG00000030783)	CENPN (ENSMFAG00000032373) #16	ATMIN (ENSMFAG00000035738) #17	C16orf46 (ENSMFAG00000041497)	ENSMFAG00000041821 #19	PKD1L2 (ENSMFAG00000044240) #20	ENSMFAG00000057739	BCO1 (ENSMFAG00000035655) #21	GAN (ENSMFAG00000033724) #22	CMIP (ENSMFAG00000035465) #23	ENSMFAG00000054241	ENSMFAG00000054000	PLCG2 (ENSMFAG00000042565) #24	SDR42E1 (ENSMFAG00000040108) #25	HSD17B2 (ENSMFAG00000002586) #26	MPHOSPH6 (ENSMFAG00000002729) #27	CDH13 (ENSMFAG00000003153) #28	HSBP1 (ENSMFAG00000000302) #29	OSGIN1 (ENSMFAG00000000406) #31	NECAB2 (ENSMFAG00000041548) #32	SLC38A8 (ENSMFAG00000002345) #33	MBTPS1 (ENSMFAG00000032326) #34	HSDL1 (ENSMFAG00000041105) #35	ENSMFAG00000050749
Rhesus	MODERN SPECIES	12	ENSMMUG00000053231	ENSMMUG00000051334	MAF (ENSMMUG00000037756) #13	ENSMMUG00000002246	DYNLRB2 (ENSMMUG00000001907) #14	CDYL2 (ENSMMUG00000011847) #15	ENSMMUG00000064571	ENSMMUG00000065089	ENSMMUG00000052945	CENPN (ENSMMUG00000013082) #16	GCSH (ENSMMUG00000013088) #19	ATMIN (ENSMMUG00000013086) #17	C20H16orf46 (ENSMMUG00000013087)	ENSMMUG00000003662 #20	BCO1 (ENSMMUG00000047071) #21	GAN (ENSMMUG00000015029) #22	CMIP (ENSMMUG00000041581) #23	ENSMMUG00000053124	PLCG2 (ENSMMUG00000005334) #24	ENSMMUG00000062047	SDR42E1 (ENSMMUG00000020372) #25	HSD17B2 (ENSMMUG00000037580) #26	MPHOSPH6 (ENSMMUG00000022575) #27	CDH13 (ENSMMUG00000020114) #28	HSBP1 (ENSMMUG00000020115) #29	OSGIN1 (ENSMMUG00000009849) #31	NECAB2 (ENSMMUG00000029071) #32	SLC38A8 (ENSMMUG00000029070) #33	MBTPS1 (ENSMMUG00000020053) #34	HSDL1 (ENSMMUG00000020055) #35	DNAAF1 (ENSMMUG00000008568) #36
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.x.b #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00620000089250	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.p #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293.fd.d #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36
Olive baboon	MODERN SPECIES	9	ENSPANG00000038009	NUDT7 (ENSPANG00000018935) #9	ENSPANG00000038343	VAT1L (ENSPANG00000018199) #10	CLEC3A (ENSPANG00000051229) #11	ENSPANG00000037613	WWOX (ENSPANG00000017326)	DYNLRB2 (ENSPANG00000021879) #14	CDYL2 (ENSPANG00000015585) #15	CMC2 (ENSPANG00000039177)	ATMIN (ENSPANG00000010334) #17	C16orf46 (ENSPANG00000012567)	ENSPANG00000001043 #19	ENSPANG00000007353 #20	BCO1 (ENSPANG00000018039) #21	GAN (ENSPANG00000008267) #22	CMIP (ENSPANG00000000893) #23	PLCG2 (ENSPANG00000021730) #24	SDR42E1 (ENSPANG00000044754) #25	HSD17B2 (ENSPANG00000024392) #26	MPHOSPH6 (ENSPANG00000019619) #27	CDH13 (ENSPANG00000016956) #28	ENSPANG00000029444 #29	MLYCD (ENSPANG00000010882) #30	OSGIN1 (ENSPANG00000017404) #31	NECAB2 (ENSPANG00000015946) #32	SLC38A8 (ENSPANG00000015582) #33	MBTPS1 (ENSPANG00000010333) #34	HSDL1 (ENSPANG00000026306) #35	DNAAF1 (ENSPANG00000025135) #36	TAF1C (ENSPANG00000023897) #37
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.x.b #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00620000089250	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.p #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293.fd.d #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36
Drill	MODERN SPECIES	1030	MON1B (ENSMLEG00000033579)	SYCE1L (ENSMLEG00000043298) #7	ADAMTS18 (ENSMLEG00000040294) #8	NUDT7 (ENSMLEG00000044207) #9	VAT1L (ENSMLEG00000040020) #10	CLEC3A (ENSMLEG00000035474) #11	WWOX (ENSMLEG00000026450)	DYNLRB2 (ENSMLEG00000036024) #14	CDYL2 (ENSMLEG00000043686) #15	CMC2 (ENSMLEG00000043490)	CENPN (ENSMLEG00000043653) #16	ATMIN (ENSMLEG00000035981) #17	C16orf46 (ENSMLEG00000029776)	ENSMLEG00000026860 #20	BCO1 (ENSMLEG00000027065) #21	GAN (ENSMLEG00000037931) #22	ENSMLEG00000025440	ENSMLEG00000039722	CMIP (ENSMLEG00000041107) #23	PLCG2 (ENSMLEG00000036172) #24	SDR42E1 (ENSMLEG00000031944) #25	HSD17B2 (ENSMLEG00000033859) #26	MPHOSPH6 (ENSMLEG00000029763) #27	ENSMLEG00000033994 #28
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	96	NUDT7 (ENSCATG00000031071) #9	VAT1L (ENSCATG00000037460) #10	CLEC3A (ENSCATG00000037811) #11	ENSCATG00000031630	WWOX (ENSCATG00000038357)	MAF (ENSCATG00000041922) #13	DYNLRB2 (ENSCATG00000036839) #14	CDYL2 (ENSCATG00000043765) #15	CMC2 (ENSCATG00000036100)	CENPN (ENSCATG00000033167) #16	ATMIN (ENSCATG00000041468) #17	C16orf46 (ENSCATG00000036987)	ENSCATG00000029678 #19	ENSCATG00000040997 #20	BCO1 (ENSCATG00000044107) #21	GAN (ENSCATG00000037337) #22	ENSCATG00000033845	CMIP (ENSCATG00000015703) #23	PLCG2 (ENSCATG00000033923) #24	SDR42E1 (ENSCATG00000041320) #25	HSD17B2 (ENSCATG00000031945) #26	MPHOSPH6 (ENSCATG00000031117) #27	ENSCATG00000034788	CDH13 (ENSCATG00000033164) #28	HSBP1 (ENSCATG00000039295) #29	MLYCD (ENSCATG00000043712) #30	OSGIN1 (ENSCATG00000033225) #31	NECAB2 (ENSCATG00000032136) #32	SLC38A8 (ENSCATG00000044234) #33	MBTPS1 (ENSCATG00000018824) #34	HSDL1 (ENSCATG00000030136) #35
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Tree shrew	MODERN SPECIES	3582							DYNLRB2 (ENSTBEG00000000009) #14	CDYL2 (ENSTBEG00000000034) #15	CMC2 (ENSTBEG00000000038)	CENPN (ENSTBEG00000000039) #16	ATMIN (ENSTBEG00000000041) #17	C16orf46 (ENSTBEG00000000050)	GCSH (ENSTBEG00000000056) #19	PKD1L2 (ENSTBEG00000000066) #20	BCO1 (ENSTBEG00000000090) #21	ENSTBEG00000000096 #22
Glires	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00940000154420.B	ENSGT00940000167952	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.j #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00940000154420.B	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.i.b #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b.b #31	ENSGT00390000006658.b.a #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36
Rabbit	MODERN SPECIES	16	CLEC3A (ENSOCUG00000001866) #11	WWOX (ENSOCUG00000002504)	ENSOCUG00000035588	DYNLRB2 (ENSOCUG00000008578) #14	CDYL2 (ENSOCUG00000008581) #15	ENSOCUG00000035609	CMC2 (ENSOCUG00000013790)	ENSOCUG00000032694	CENPN (ENSOCUG00000000024) #16	ATMIN (ENSOCUG00000007807) #17	C16orf46 (ENSOCUG00000007811)	ENSOCUG00000011557 #19	ENSOCUG00000036494	ENSOCUG00000011939 #20	BCO1 (ENSOCUG00000001072) #21	GAN (ENSOCUG00000001073) #22	CMIP (ENSOCUG00000002120) #23	PLCG2 (ENSOCUG00000013105) #24	SDR42E1 (ENSOCUG00000016649) #25	HSD17B2 (ENSOCUG00000016655) #26	ENSOCUG00000024341 #27	CDH13 (ENSOCUG00000025617) #28	HSBP1 (ENSOCUG00000001286) #29	ENSOCUG00000016223 #30	ENSOCUG00000033324 #31	ENSOCUG00000010496 #31	ENSOCUG00000036566 #32
Pika	MODERN SPECIES	3054								CDYL2 (ENSOPRG00000003180) #15	CMC2 (ENSOPRG00000003190)	CENPN (ENSOPRG00000003202) #16	ATMIN (ENSOPRG00000003220) #17	C16orf46 (ENSOPRG00000003260)	GCSH (ENSOPRG00000003281) #19	ENSOPRG00000003293 #20	BCO1 (ENSOPRG00000003425) #21	GAN (ENSOPRG00000003458) #22	CMIP (ENSOPRG00000003491) #23	PLCG2 (ENSOPRG00000003571) #24
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00940000154420.B	ENSGT00940000167952	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.j #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00940000154420.B	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.j #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293.xc #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.j #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293.xc #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	26	NUDT7 (ENSHGLG00000011902) #9	VAT1L (ENSHGLG00000010671) #10	CLEC3A (ENSHGLG00000042627) #11	WWOX (ENSHGLG00000013627)	MAF (ENSHGLG00000037503) #13	DYNLRB2 (ENSHGLG00000009690) #14	CDYL2 (ENSHGLG00000018737) #15	ENSHGLG00000019436	ENSHGLG00000039367	CENPN (ENSHGLG00000050859) #16	ATMIN (ENSHGLG00000014861) #17	C16orf46 (ENSHGLG00000034703)	GCSH (ENSHGLG00000044660) #19	ENSHGLG00000038072 #20	BCO1 (ENSHGLG00000017639) #21	GAN (ENSHGLG00000018670) #22	CMIP (ENSHGLG00000009888) #23	PLCG2 (ENSHGLG00000014242) #24	SDR42E1 (ENSHGLG00000010816) #25	ENSHGLG00000038316 #26	MPHOSPH6 (ENSHGLG00000019140) #27	ENSHGLG00000045793	ENSHGLG00000018583	CIAO2B (ENSHGLG00000043672)	RRAD (ENSHGLG00000016885)	CDH16 (ENSHGLG00000019376)	PDP2 (ENSHGLG00000039814)	CA7 (ENSHGLG00000016917)	NAE1 (ENSHGLG00000018813)	TERB1 (ENSHGLG00000019160)	ENSHGLG00000017579
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24
Guinea pig	MODERN SPECIES	159															BCO1 (ENSCPOG00000014838) #21	GAN (ENSCPOG00000010223) #22	CMIP (ENSCPOG00000009622) #23	PLCG2 (ENSCPOG00000002213) #24	WFDC1 (ENSCPOG00000037405)	KCNG4 (ENSCPOG00000036399)	ADAD2 (ENSCPOG00000008685)	TAF1C (ENSCPOG00000010731) #37	DNAAF1 (ENSCPOG00000010723) #36	ENSCPOG00000010720	MBTPS1 (ENSCPOG00000006082) #34	SLC38A8 (ENSCPOG00000007080) #33	NECAB2 (ENSCPOG00000006616) #32	OSGIN1 (ENSCPOG00000006612) #31	MLYCD (ENSCPOG00000001087) #30	HSBP1 (ENSCPOG00000039250) #29	CDH13 (ENSCPOG00000010591) #28
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	229	ENSCLAG00000000207 #7	ADAMTS18 (ENSCLAG00000000225) #8	NUDT7 (ENSCLAG00000000398) #9	VAT1L (ENSCLAG00000000415) #10	CLEC3A (ENSCLAG00000000418) #11	WWOX (ENSCLAG00000000478)	DYNLRB2 (ENSCLAG00000000937) #14	CDYL2 (ENSCLAG00000000214) #15	CMC2 (ENSCLAG00000000295)	CENPN (ENSCLAG00000000300) #16	ATMIN (ENSCLAG00000000316) #17	ENSCLAG00000000329	GCSH (ENSCLAG00000000355) #19	PKD1L2 (ENSCLAG00000000118) #20	BCO1 (ENSCLAG00000000277) #21	GAN (ENSCLAG00000000989) #22	CMIP (ENSCLAG00000000406) #23	PLCG2 (ENSCLAG00000000592) #24
Degu	MODERN SPECIES	52	ADAMTS18 (ENSODEG00000013530) #8	NUDT7 (ENSODEG00000012841) #9	VAT1L (ENSODEG00000013630) #10	CLEC3A (ENSODEG00000015370) #11	WWOX (ENSODEG00000014111)	MAF (ENSODEG00000014515) #13	DYNLRB2 (ENSODEG00000012819) #14	CDYL2 (ENSODEG00000012881) #15	ENSODEG00000019996	CMC2 (ENSODEG00000014155)	CENPN (ENSODEG00000012974) #16	ATMIN (ENSODEG00000012463) #17	GCSH (ENSODEG00000013012) #19	PKD1L2 (ENSODEG00000013047) #20	BCO1 (ENSODEG00000013835) #21	GAN (ENSODEG00000014419) #22	CMIP (ENSODEG00000013897) #23	PLCG2 (ENSODEG00000014144) #24	ENSODEG00000020092
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00940000154420.B	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.i.a #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293.xc #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	8	ADAMTS18 (ENSSVLG00005015898) #8	NUDT7 (ENSSVLG00005015783) #9	VAT1L (ENSSVLG00005015671) #10	CLEC3A (ENSSVLG00005015615) #11	ENSSVLG00005015573	WWOX (ENSSVLG00005015526)	ENSSVLG00005015446 #13	DYNLRB2 (ENSSVLG00005015349) #14	CDYL2 (ENSSVLG00005015278) #15	CMC2 (ENSSVLG00005015210)	CENPN (ENSSVLG00005015134) #16	ENSSVLG00005015037 #17	C16orf46 (ENSSVLG00005014992)	ENSSVLG00005025763	BCO1 (ENSSVLG00005025719) #21	GAN (ENSSVLG00005025710) #22	ENSSVLG00005025705	PLCG2 (ENSSVLG00005025677) #24	SDR42E1 (ENSSVLG00005025668) #25	ENSSVLG00005025661	HSD17B2 (ENSSVLG00005025655) #26	MPHOSPH6 (ENSSVLG00005025646) #27	CDH13 (ENSSVLG00005025632) #28	HSBP1 (ENSSVLG00005025608) #29	MLYCD (ENSSVLG00005025603) #30	OSGIN1 (ENSSVLG00005025591) #31	NECAB2 (ENSSVLG00005025579) #32	SLC38A8 (ENSSVLG00005025564) #33	MBTPS1 (ENSSVLG00005025551) #34	HSDL1 (ENSSVLG00005025542) #35	ENSSVLG00005025537 #36
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00940000154420.B	ENSGT00390000004738.c #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.ob.b #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.i.a #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293.xc #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Alpin marmot	MODERN SPECIES	43	NUDT7 (ENSMMMG00000012478) #9	VAT1L (ENSMMMG00000012469) #10	CLEC3A (ENSMMMG00000012467) #11	WWOX (ENSMMMG00000012447)	ENSMMMG00000012440 #13	DYNLRB2 (ENSMMMG00000012433) #14	CDYL2 (ENSMMMG00000012427) #15	CMC2 (ENSMMMG00000012416)	ENSMMMG00000012414	ENSMMMG00000012408 #16	ATMIN (ENSMMMG00000012386) #17	C16orf46 (ENSMMMG00000012372)	ENSMMMG00000012364 #19	PKD1L2 (ENSMMMG00000012278) #20	BCO1 (ENSMMMG00000012247) #21	GAN (ENSMMMG00000012233) #22	CMIP (ENSMMMG00000012172) #23	ENSMMMG00000012168	PLCG2 (ENSMMMG00000012131) #24	SDR42E1 (ENSMMMG00000012120) #25	HSD17B2 (ENSMMMG00000012113) #26	ENSMMMG00000012102 #27	ENSMMMG00000012088	CDH13 (ENSMMMG00000012072) #28	MLYCD (ENSMMMG00000012063) #30	OSGIN1 (ENSMMMG00000012058) #31	NECAB2 (ENSMMMG00000012005) #32	SLC38A8 (ENSMMMG00000011987) #33	MBTPS1 (ENSMMMG00000011923) #34	HSDL1 (ENSMMMG00000011916) #35	ENSMMMG00000011906 #36
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738.c #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.ob.b #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.i.a.b #27
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	113	ADAMTS18 (ENSUPAG00010009111) #8	NUDT7 (ENSUPAG00010009093) #9	VAT1L (ENSUPAG00010009071) #10	CLEC3A (ENSUPAG00010009058) #11	WWOX (ENSUPAG00010009031)	MAF (ENSUPAG00010009006) #13	DYNLRB2 (ENSUPAG00010008995) #14	CDYL2 (ENSUPAG00010008980) #15	CMC2 (ENSUPAG00010008966)	ENSUPAG00010008959 #16	ATMIN (ENSUPAG00010008930) #17	C16orf46 (ENSUPAG00010008921)	ENSUPAG00010008909 #19	PKD1L2 (ENSUPAG00010008770) #20	BCO1 (ENSUPAG00010008730) #21	GAN (ENSUPAG00010008708) #22	CMIP (ENSUPAG00010008669) #23	ENSUPAG00010008662	PLCG2 (ENSUPAG00010008607) #24	SDR42E1 (ENSUPAG00010008582) #25	HSD17B2 (ENSUPAG00010008573) #26	ENSUPAG00010008571 #27
Squirrel	MODERN SPECIES	75	ADAMTS18 (ENSSTOG00000012392) #8	NUDT7 (ENSSTOG00000028240) #9	VAT1L (ENSSTOG00000005476) #10	CLEC3A (ENSSTOG00000005493) #11	WWOX (ENSSTOG00000028005)	DYNLRB2 (ENSSTOG00000023418) #14	CDYL2 (ENSSTOG00000013005) #15	CMC2 (ENSSTOG00000033130)	ENSSTOG00000030854 #16	ENSSTOG00000007345 #16	C16orf46 (ENSSTOG00000007385)	ATMIN (ENSSTOG00000007376) #17	GCSH (ENSSTOG00000016433) #19	PKD1L2 (ENSSTOG00000007401) #20	BCO1 (ENSSTOG00000007469) #21	GAN (ENSSTOG00000007492) #22	CMIP (ENSSTOG00000006702) #23	PLCG2 (ENSSTOG00000005756) #24	SDR42E1 (ENSSTOG00000027319) #25	HSD17B2 (ENSSTOG00000021305) #26	ENSSTOG00000019608 #27
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.j #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	337	Mon1b (ENSDORG00000003584)	Adamts18 (ENSDORG00000003587) #8	Nudt7 (ENSDORG00000011038) #9	Vat1l (ENSDORG00000005299) #10	Clec3a (ENSDORG00000014965) #11	Wwox (ENSDORG00000014966)	Maf (ENSDORG00000028766) #13	Dynlrb2 (ENSDORG00000000891) #14	Cdyl2 (ENSDORG00000011301) #15	ENSDORG00000010432	Cenpn (ENSDORG00000000402) #16	Atmin (ENSDORG00000029539) #17	1700030J22Rik (ENSDORG00000007829)	ENSDORG00000007831 #19	Bco1 (ENSDORG00000007838) #21	Gan (ENSDORG00000007841) #22	Cmip (ENSDORG00000007997) #23	Plcg2 (ENSDORG00000016026) #24	Sdr42e1 (ENSDORG00000007291) #25	Hsd17b2 (ENSDORG00000029871) #26	Mphosph6 (ENSDORG00000011060) #27	Cdh13 (ENSDORG00000015523) #28	ENSDORG00000009913	ENSDORG00000001345 #31	Necab2 (ENSDORG00000001348) #32	Slc38a8 (ENSDORG00000016238) #33	Mbtps1 (ENSDORG00000016240) #34	ENSDORG00000023331	Taf1c (ENSDORG00000003552) #37	Adad2 (ENSDORG00000003555)	Kcng4 (ENSDORG00000025718)
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.j #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	71	ENSJJAG00000020220	Vat1l (ENSJJAG00000023382) #10	Clec3a (ENSJJAG00000014430) #11	ENSJJAG00000009899 #12	ENSJJAG00000012328	Maf (ENSJJAG00000014133) #13	Dynlrb2 (ENSJJAG00000016140) #14	Cdyl2 (ENSJJAG00000022552) #15	ENSJJAG00000008503	ENSJJAG00000024117	Cenpn (ENSJJAG00000015350) #16	1700030J22Rik (ENSJJAG00000018191)	ENSJJAG00000016643 #19	Pkd1l2 (ENSJJAG00000024414) #20	Bco1 (ENSJJAG00000010752) #21	Gan (ENSJJAG00000022642) #22	Cmip (ENSJJAG00000010358) #23	Plcg2 (ENSJJAG00000021562) #24	Sdr42e1 (ENSJJAG00000021471) #25	Hsd17b2 (ENSJJAG00000021451) #26	ENSJJAG00000011414 #27	Cdh13 (ENSJJAG00000013901) #28	Hsbp1 (ENSJJAG00000019985) #29	Mlycd (ENSJJAG00000022297) #30	Osgin1 (ENSJJAG00000024206) #31	Necab2 (ENSJJAG00000022283) #32	Slc38a8 (ENSJJAG00000022116) #33	Mbtps1 (ENSJJAG00000011105) #34	ENSJJAG00000020947	ENSJJAG00000024115 #36	Taf1c (ENSJJAG00000010873) #37
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.j #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	717															Bco1 (ENSNGAG00000014407) #21	Gan (ENSNGAG00000015938) #22	Cmip (ENSNGAG00000017467) #23
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.j #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.j #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Mus	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.j #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.cb #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.j #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.cb #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.j #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.cb #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.j #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
spretus	MODERN SPECIES	17	Adamts18 (MGP_SPRETEiJ_G0032711) #8	Nudt7 (MGP_SPRETEiJ_G0032712) #9	Vat1l (MGP_SPRETEiJ_G0032713) #10	Clec3a (MGP_SPRETEiJ_G0032714) #11	Wwox (MGP_SPRETEiJ_G0032715)	MGP_SPRETEiJ_G0032716 #13	Dynlrb2 (MGP_SPRETEiJ_G0032717) #14	Cdyl2 (MGP_SPRETEiJ_G0032718) #15	Cmc2 (MGP_SPRETEiJ_G0032719)	Cenpn (MGP_SPRETEiJ_G0032720) #16	Atmin (MGP_SPRETEiJ_G0032721) #17	1700030J22Rik (MGP_SPRETEiJ_G0032722)	Gcsh (MGP_SPRETEiJ_G0032723) #19	Pkd1l2 (MGP_SPRETEiJ_G0032724) #20	Bco1 (MGP_SPRETEiJ_G0032725) #21	Gan (MGP_SPRETEiJ_G0032726) #22	Cmip (MGP_SPRETEiJ_G0032727) #23	Plcg2 (MGP_SPRETEiJ_G0032728) #24	Sdr42e1 (MGP_SPRETEiJ_G0032729) #25	Hsd17b2 (MGP_SPRETEiJ_G0032730) #26	Mphosph6 (MGP_SPRETEiJ_G0032731) #27	Cdh13 (MGP_SPRETEiJ_G0032732) #28	Hsbp1 (MGP_SPRETEiJ_G0032733) #29	Mlycd (MGP_SPRETEiJ_G0032734) #30	Osgin1 (MGP_SPRETEiJ_G0032735) #31	Necab2 (MGP_SPRETEiJ_G0032736) #32	Slc38a8 (MGP_SPRETEiJ_G0032737) #33	Mbtps1 (MGP_SPRETEiJ_G0032738) #34	Hsdl1 (MGP_SPRETEiJ_G0032739) #35	Dnaaf1 (MGP_SPRETEiJ_G0032740) #36	Taf1c (MGP_SPRETEiJ_G0032741) #37
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3379	ENSMSIG00000020331	Nudt7 (ENSMSIG00000020337) #9	Vat1l (ENSMSIG00000020396) #10	Clec3a (ENSMSIG00000020422) #11	Wwox (ENSMSIG00000020449)	ENSMSIG00000020647	Dynlrb2 (ENSMSIG00000020660) #14	Cdyl2 (ENSMSIG00000020716) #15	ENSMSIG00000020729	Cenpn (ENSMSIG00000020746) #16	Atmin (ENSMSIG00000020843) #17	1700030J22Rik (ENSMSIG00000020871)	ENSMSIG00000020877 #19	Pkd1l2 (ENSMSIG00000020891) #20	Bco1 (ENSMSIG00000021036) #21	Gan (ENSMSIG00000021114) #22	Cmip (ENSMSIG00000021151) #23	Plcg2 (ENSMSIG00000021222) #24	Sdr42e1 (ENSMSIG00000021283) #25	ENSMSIG00000021297 #26
Mouse	MODERN SPECIES	17	Adamts18 (ENSMUSG00000053399) #8	Nudt7 (ENSMUSG00000031767) #9	Vat1l (ENSMUSG00000046844) #10	Clec3a (ENSMUSG00000008874) #11	Wwox (ENSMUSG00000004637)	Maf (ENSMUSG00000055435) #13	Dynlrb2 (ENSMUSG00000034467) #14	Cdyl2 (ENSMUSG00000031758) #15	Cmc2 (ENSMUSG00000014633)	Cenpn (ENSMUSG00000031756) #16	Atmin (ENSMUSG00000047388) #17	1700030J22Rik (ENSMUSG00000031847)	Gcsh (ENSMUSG00000034424) #19	Pkd1l2 (ENSMUSG00000034416) #20	Bco1 (ENSMUSG00000031845) #21	Gan (ENSMUSG00000052557) #22	Cmip (ENSMUSG00000034390) #23	Plcg2 (ENSMUSG00000034330) #24	Sdr42e1 (ENSMUSG00000034308) #25	Hsd17b2 (ENSMUSG00000031844) #26	Mphosph6 (ENSMUSG00000031843) #27	Cdh13 (ENSMUSG00000031841) #28	Hsbp1 (ENSMUSG00000031839) #29	Mlycd (ENSMUSG00000074064) #30	Osgin1 (ENSMUSG00000074063) #31	Necab2 (ENSMUSG00000031837) #32	Slc38a8 (ENSMUSG00000034224) #33	Mbtps1 (ENSMUSG00000031835) #34	Hsdl1 (ENSMUSG00000034189) #35	Dnaaf1 (ENSMUSG00000031831) #36	Taf1c (ENSMUSG00000031832) #37
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	17	Adamts18 (MGP_CAROLIEiJ_G0031593) #8	Nudt7 (MGP_CAROLIEiJ_G0031594) #9	Vat1l (MGP_CAROLIEiJ_G0031595) #10	Clec3a (MGP_CAROLIEiJ_G0031596) #11	Wwox (MGP_CAROLIEiJ_G0031597)	Maf (MGP_CAROLIEiJ_G0031598) #13	Dynlrb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0031599) #14	Cdyl2 (MGP_CAROLIEiJ_G0031600) #15	Cmc2 (MGP_CAROLIEiJ_G0031601)	Cenpn (MGP_CAROLIEiJ_G0031602) #16	Atmin (MGP_CAROLIEiJ_G0031603) #17	1700030J22Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0031604)	Gcsh (MGP_CAROLIEiJ_G0031605) #19	Pkd1l2 (MGP_CAROLIEiJ_G0031606) #20	Bco1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031607) #21	Gan (MGP_CAROLIEiJ_G0031608) #22	Cmip (MGP_CAROLIEiJ_G0031609) #23	Plcg2 (MGP_CAROLIEiJ_G0031610) #24	Sdr42e1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031611) #25	Hsd17b2 (MGP_CAROLIEiJ_G0031612) #26	Mphosph6 (MGP_CAROLIEiJ_G0031613) #27	Cdh13 (MGP_CAROLIEiJ_G0031614) #28	Hsbp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031615) #29	Mlycd (MGP_CAROLIEiJ_G0031616) #30	Osgin1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031617) #31	Necab2 (MGP_CAROLIEiJ_G0031618) #32	Slc38a8 (MGP_CAROLIEiJ_G0031619) #33	Mbtps1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031620) #34	Hsdl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031621) #35	Dnaaf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031622) #36	Taf1c (MGP_CAROLIEiJ_G0031623) #37
Shrew mouse	MODERN SPECIES	12	Adamts18 (MGP_PahariEiJ_G0023191) #8	MGP_PahariEiJ_G0023192 #9	Vat1l (MGP_PahariEiJ_G0023193) #10	Clec3a (MGP_PahariEiJ_G0023194) #11	Wwox (MGP_PahariEiJ_G0023195)	Maf (MGP_PahariEiJ_G0023196) #13	Dynlrb2 (MGP_PahariEiJ_G0023197) #14	Cdyl2 (MGP_PahariEiJ_G0023198) #15	Cmc2 (MGP_PahariEiJ_G0023199)	Cenpn (MGP_PahariEiJ_G0023200) #16	Atmin (MGP_PahariEiJ_G0023201) #17	1700030J22Rik (MGP_PahariEiJ_G0023202)	Gcsh (MGP_PahariEiJ_G0023203) #19	Pkd1l2 (MGP_PahariEiJ_G0023204) #20	Bco1 (MGP_PahariEiJ_G0023205) #21	Gan (MGP_PahariEiJ_G0023206) #22	Cmip (MGP_PahariEiJ_G0023207) #23	Plcg2 (MGP_PahariEiJ_G0023208) #24	Sdr42e1 (MGP_PahariEiJ_G0023209) #25	Hsd17b2 (MGP_PahariEiJ_G0023210) #26	Mphosph6 (MGP_PahariEiJ_G0023211) #27	Cdh13 (MGP_PahariEiJ_G0023212) #28	Hsbp1 (MGP_PahariEiJ_G0023213) #29	Mlycd (MGP_PahariEiJ_G0023214) #30	Osgin1 (MGP_PahariEiJ_G0023215) #31	Necab2 (MGP_PahariEiJ_G0023216) #32	Slc38a8 (MGP_PahariEiJ_G0023217) #33	Mbtps1 (MGP_PahariEiJ_G0023218) #34	Hsdl1 (MGP_PahariEiJ_G0023219) #35	Dnaaf1 (MGP_PahariEiJ_G0023220) #36	MGP_PahariEiJ_G0023221 #37
Rat	MODERN SPECIES	10	ENSRNOG00000066574	Nudt7 (ENSRNOG00000011976) #9	Vat1l (ENSRNOG00000011989) #10	Clec3a (ENSRNOG00000070954) #11	Wwox (ENSRNOG00000012030)	Maf (ENSRNOG00000012428) #13	Dynlrb2 (ENSRNOG00000012450)	Cdyl2 (ENSRNOG00000042888) #15	Cmc2 (ENSRNOG00000068690)	Cenpn (ENSRNOG00000011296) #16	Atmin (ENSRNOG00000011422) #17	C19h16orf46 (ENSRNOG00000045541)	Gcsh (ENSRNOG00000011535) #19	Pkd1l2 (ENSRNOG00000045626) #20	Bco1 (ENSRNOG00000012027) #21	Gan (ENSRNOG00000012671) #22	Cmip (ENSRNOG00000013178) #23	Plcg2 (ENSRNOG00000051986) #24	Sdr42e1 (ENSRNOG00000051819) #25	Hsd17b2 (ENSRNOG00000013982) #26	Mphosph6 (ENSRNOG00000050087) #27	Cdh13 (ENSRNOG00000014371) #28	Hsbp1 (ENSRNOG00000014415) #29	Mlycd (ENSRNOG00000014522) #30	Osgin1 (ENSRNOG00000014948) #31	Necab2 (ENSRNOG00000015084) #32	Slc38a8 (ENSRNOG00000025503) #33	Mbtps1 (ENSRNOG00000015173) #34	Hsdl1 (ENSRNOG00000015576) #35	Dnaaf1 (ENSRNOG00000015590) #36	Taf1c (ENSRNOG00000015632) #37
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.j #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.j #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Prairie vole	MODERN SPECIES	12	ENSMOCG00000010114	Nudt7 (ENSMOCG00000015530) #9	Vat1l (ENSMOCG00000018479) #10	Clec3a (ENSMOCG00000016149) #11	Wwox (ENSMOCG00000013122)	Maf (ENSMOCG00000017607) #13	Dynlrb2 (ENSMOCG00000016123) #14	Cdyl2 (ENSMOCG00000021578) #15	ENSMOCG00000007353	Cenpn (ENSMOCG00000011952) #16	Atmin (ENSMOCG00000020741) #17	1700030J22Rik (ENSMOCG00000021044)	Gcsh (ENSMOCG00000000583) #19	Pkd1l2 (ENSMOCG00000017193) #20	Bco1 (ENSMOCG00000015152) #21	Gan (ENSMOCG00000022503) #22	Cmip (ENSMOCG00000009023) #23	Plcg2 (ENSMOCG00000014818) #24	Sdr42e1 (ENSMOCG00000021183) #25	Hsd17b2 (ENSMOCG00000021716) #26	ENSMOCG00000005132	Mphosph6 (ENSMOCG00000007125) #27	Cdh13 (ENSMOCG00000019245) #28	Hsbp1 (ENSMOCG00000017033) #29	Mlycd (ENSMOCG00000014323) #30	Osgin1 (ENSMOCG00000021893) #31	Slc38a8 (ENSMOCG00000011828) #33	Mbtps1 (ENSMOCG00000011449) #34	Hsdl1 (ENSMOCG00000017214) #35	Dnaaf1 (ENSMOCG00000019064) #36	Taf1c (ENSMOCG00000019673) #37
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	18	Vat1l (ENSPEMG00000015665) #10	Clec3a (ENSPEMG00000031227) #11	Wwox (ENSPEMG00000016944)	ENSPEMG00000030824	Maf (ENSPEMG00000019355) #13	Dynlrb2 (ENSPEMG00000019948) #14	Cdyl2 (ENSPEMG00000019625) #15	ENSPEMG00000020157	Cenpn (ENSPEMG00000002034) #16	Atmin (ENSPEMG00000019534) #17	ENSPEMG00000011494	1700030J22Rik (ENSPEMG00000014171)	Gcsh (ENSPEMG00000019328) #19	Pkd1l2 (ENSPEMG00000019583) #20	Bco1 (ENSPEMG00000020066) #21	Gan (ENSPEMG00000020147) #22	Cmip (ENSPEMG00000019741) #23	Plcg2 (ENSPEMG00000018570) #24	Sdr42e1 (ENSPEMG00000029375) #25	Hsd17b2 (ENSPEMG00000016574) #26	ENSPEMG00000031107	Mphosph6 (ENSPEMG00000019756) #27	Cdh13 (ENSPEMG00000019421) #28	ENSPEMG00000030115 #29	Mlycd (ENSPEMG00000019846) #30	Osgin1 (ENSPEMG00000020010) #31	Necab2 (ENSPEMG00000019626) #32	Slc38a8 (ENSPEMG00000024033) #33	Mbtps1 (ENSPEMG00000016147) #34	Hsdl1 (ENSPEMG00000013927) #35	Dnaaf1 (ENSPEMG00000000781) #36
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212.j #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Golden Hamster	MODERN SPECIES	654	ENSMAUG00000010341	ENSMAUG00000003225 #9	Vat1l (ENSMAUG00000016275) #10	Clec3a (ENSMAUG00000014441) #11	Wwox (ENSMAUG00000007520)	Maf (ENSMAUG00000021039) #13	Dynlrb2 (ENSMAUG00000010167) #14	Cdyl2 (ENSMAUG00000015698) #15	ENSMAUG00000011255	ENSMAUG00000017433 #16	Atmin (ENSMAUG00000015374) #17	1700030J22Rik (ENSMAUG00000012382)	ENSMAUG00000018099 #19	Pkd1l2 (ENSMAUG00000002511) #20	Bco1 (ENSMAUG00000008009) #21	ENSMAUG00000009114 #22	Cmip (ENSMAUG00000013194) #23	Plcg2 (ENSMAUG00000007620) #24	Sdr42e1 (ENSMAUG00000001530) #25	Hsd17b2 (ENSMAUG00000017677) #26	Mphosph6 (ENSMAUG00000011107) #27	Cdh13 (ENSMAUG00000006607) #28	Hsbp1 (ENSMAUG00000014829) #29	Mlycd (ENSMAUG00000016063) #30	Osgin1 (ENSMAUG00000006693) #31	Necab2 (ENSMAUG00000001187) #32	Slc38a8 (ENSMAUG00000015910) #33	Mbtps1 (ENSMAUG00000020490) #34	Hsdl1 (ENSMAUG00000011417) #35	ENSMAUG00000015395	Taf1c (ENSMAUG00000010064) #37
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	112	ENSCGRG00001019630	ENSCGRG00001011032	ENSCGRG00001011674	Wwox (ENSCGRG00001021234)	Maf (ENSCGRG00001007125) #13	Dynlrb2 (ENSCGRG00001000535) #14	Cdyl2 (ENSCGRG00001021515) #15	ENSCGRG00001019915	Cenpn (ENSCGRG00001022755) #16	ENSCGRG00001013048 #17	1700030J22Rik (ENSCGRG00001020202)	ENSCGRG00001023751 #19	ENSCGRG00001024350	Pkd1l2 (ENSCGRG00001022012) #20	Bco1 (ENSCGRG00001021072) #21	Gan (ENSCGRG00001010582) #22	Cmip (ENSCGRG00001020795) #23	Plcg2 (ENSCGRG00001019941) #24	Sdr42e1 (ENSCGRG00001011865) #25	Hsd17b2 (ENSCGRG00001014890) #26	ENSCGRG00001019665 #27	Cdh13 (ENSCGRG00001001385) #28	Hsbp1 (ENSCGRG00001016781) #29	Mlycd (ENSCGRG00001017150) #30	Osgin1 (ENSCGRG00001001559) #31	Necab2 (ENSCGRG00001019458) #32	Slc38a8 (ENSCGRG00001013617) #33	MBTPS1 (ENSCGRG00001022644) #34	Hsdl1 (ENSCGRG00001016417) #35	Dnaaf1 (ENSCGRG00001020629) #36	Taf1c (ENSCGRG00001015596) #37
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00940000167952	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES	1534															ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22
Common shrew	MODERN SPECIES	1931																GAN (ENSSARG00000011713) #22
Hedgehog	MODERN SPECIES	6839															ENSEEUG00000002059 #21	GAN (ENSEEUG00000002079) #22
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00940000167952	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Suina	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00940000167952	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	10	VAT1L (ENSCWAG00000003111) #10	CLEC3A (ENSCWAG00000003144) #11	WWOX (ENSCWAG00000003182)	MAF (ENSCWAG00000003304) #13	DYNLRB2 (ENSCWAG00000003320) #14	CDYL2 (ENSCWAG00000003341) #15	CMC2 (ENSCWAG00000003359)	ENSCWAG00000003362	CENPN (ENSCWAG00000003382) #16	ATMIN (ENSCWAG00000003427) #17	C16orf46 (ENSCWAG00000003437)	ENSCWAG00000003443 #19	ENSCWAG00000003448	ENSCWAG00000003458 #20	BCO1 (ENSCWAG00000003482) #21	GAN (ENSCWAG00000003493) #22	CMIP (ENSCWAG00000003539) #23	PLCG2 (ENSCWAG00000003695) #24	SDR42E1 (ENSCWAG00000003827) #25	HSD17B2 (ENSCWAG00000003852) #26	ENSCWAG00000003885	CDH13 (ENSCWAG00000003978) #28	ENSCWAG00000004352 #29	MLYCD (ENSCWAG00000004385) #30	OSGIN1 (ENSCWAG00000004417) #31	NECAB2 (ENSCWAG00000004455) #32	SLC38A8 (ENSCWAG00000004623) #33	MBTPS1 (ENSCWAG00000007673) #34	HSDL1 (ENSCWAG00000007716) #35	DNAAF1 (ENSCWAG00000007738) #36	TAF1C (ENSCWAG00000007882) #37
Pig	MODERN SPECIES	14	NUDT7 (ENSSSCG00000002697) #9	VAT1L (ENSSSCG00000002696) #10	CLEC3A (ENSSSCG00000034604) #11	WWOX (ENSSSCG00000027415)	ENSSSCG00000058620	MAF (ENSSSCG00000040607) #13	DYNLRB2 (ENSSSCG00000031421) #14	CDYL2 (ENSSSCG00000038128) #15	ENSSSCG00000032060	CENPN (ENSSSCG00000039216) #16	ENSSSCG00000032216 #17	C16orf46 (ENSSSCG00000035388)	ENSSSCG00000040203 #19	PKD1L2 (ENSSSCG00000039200) #20	BCO1 (ENSSSCG00000036572) #21	GAN (ENSSSCG00000002690) #22	CMIP (ENSSSCG00000002689) #23	PLCG2 (ENSSSCG00000002688) #24	SDR42E1 (ENSSSCG00000035182) #25	HSD17B2 (ENSSSCG00000038221) #26	ENSSSCG00000034572 #27	CDH13 (ENSSSCG00000002684) #28	HSBP1 (ENSSSCG00000057749) #29	MLYCD (ENSSSCG00000031450) #30	OSGIN1 (ENSSSCG00000032115) #31	SLC38A8 (ENSSSCG00000039218) #33	MBTPS1 (ENSSSCG00000002682) #34	HSDL1 (ENSSSCG00000002681) #35	DNAAF1 (ENSSSCG00000002675) #36	TAF1C (ENSSSCG00000002680) #37	ADAD2 (ENSSSCG00000034385)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000017352.d #7	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00940000167952	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Arabian camel	MODERN SPECIES	35	ADAMTS18 (ENSCDRG00005015619) #8	NUDT7 (ENSCDRG00005015789) #9	VAT1L (ENSCDRG00005015834) #10	CLEC3A (ENSCDRG00005015888) #11	WWOX (ENSCDRG00005015930)	ENSCDRG00005015981	DYNLRB2 (ENSCDRG00005016530) #14	CDYL2 (ENSCDRG00005016623) #15	ENSCDRG00005016716	CENPN (ENSCDRG00005016773) #16	ATMIN (ENSCDRG00005016854) #17	C16orf46 (ENSCDRG00005000122)	ENSCDRG00005000130 #19	PKD1L2 (ENSCDRG00005000189) #20	BCO1 (ENSCDRG00005000320) #21	GAN (ENSCDRG00005000345) #22	CMIP (ENSCDRG00005000438) #23	PLCG2 (ENSCDRG00005001023) #24	SDR42E1 (ENSCDRG00005001117) #25	HSD17B2 (ENSCDRG00005001133) #26	MPHOSPH6 (ENSCDRG00005001161) #27	CDH13 (ENSCDRG00005001202) #28	HSBP1 (ENSCDRG00005001270) #29	MLYCD (ENSCDRG00005001279) #30	OSGIN1 (ENSCDRG00005001288) #31	NECAB2 (ENSCDRG00005001312) #32	SLC38A8 (ENSCDRG00005001379) #33	MBTPS1 (ENSCDRG00005001411) #34	HSDL1 (ENSCDRG00005001452) #35	DNAAF1 (ENSCDRG00005001473) #36	TAF1C (ENSCDRG00005001497) #37
Alpaca	MODERN SPECIES	565															ENSVPAG00000008583 #21	GAN (ENSVPAG00000008584) #22
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT01000000214745.b.a	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.f #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00940000159996.b	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000004738.q.a #16	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738.r #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.f #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000004738.q.a #16	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738.r #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.f #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT01050000244868.a.a.a.b.a.b.b	ENSGT00940000162711	ENSGT00940000159996.b	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00990000203553.c.b	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000004738.q.a #16	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.f #19	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00940000159996.b.a	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00990000203553.c.b	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000004738.q.a #16	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.f #19	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000159996.b.a	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Narwhal	MODERN SPECIES	296	NUDT7 (ENSMMNG00015000278) #9	VAT1L (ENSMMNG00015000235) #10	CLEC3A (ENSMMNG00015000210) #11	WWOX (ENSMMNG00015000155)	ENSMMNG00015000027	MAF (ENSMMNG00015003720) #13	DYNLRB2 (ENSMMNG00015003694) #14	CDYL2 (ENSMMNG00015003666) #15	CENPN (ENSMMNG00015003599) #16	CMC2 (ENSMMNG00015003550)	ATMIN (ENSMMNG00015003532) #17	C16orf46 (ENSMMNG00015003505)	ENSMMNG00015003480	BCO1 (ENSMMNG00015003389) #21	ENSMMNG00015003355	GAN (ENSMMNG00015003328) #22	CMIP (ENSMMNG00015003203) #23	PLCG2 (ENSMMNG00015003113) #24	SDR42E1 (ENSMMNG00015003089) #25	HSD17B2 (ENSMMNG00015003068) #26	MPHOSPH6 (ENSMMNG00015003044) #27	CDH13 (ENSMMNG00015002972) #28	HSBP1 (ENSMMNG00015002935) #29	MLYCD (ENSMMNG00015002914) #30	OSGIN1 (ENSMMNG00015002851) #31	NECAB2 (ENSMMNG00015002809) #32	SLC38A8 (ENSMMNG00015002774) #33	MBTPS1 (ENSMMNG00015002703) #34	HSDL1 (ENSMMNG00015002679) #35	ENSMMNG00015002667 #36	TAF1C (ENSMMNG00015002638) #37
Beluga whale	MODERN SPECIES	12	VAT1L (ENSDLEG00000002079) #10	CLEC3A (ENSDLEG00000002066) #11	ENSDLEG00000002057 #12	ENSDLEG00000002047	ENSDLEG00000002038	MAF (ENSDLEG00000002029) #13	DYNLRB2 (ENSDLEG00000002002) #14	CDYL2 (ENSDLEG00000001993) #15	CENPN (ENSDLEG00000001968) #16	ENSDLEG00000001954	ATMIN (ENSDLEG00000001947) #17	CUNH16orf46 (ENSDLEG00000001938)	GCSH (ENSDLEG00000001922) #19	BCO1 (ENSDLEG00000001896) #21	ENSDLEG00000001893	GAN (ENSDLEG00000001871) #22	CMIP (ENSDLEG00000001842) #23	PLCG2 (ENSDLEG00000001817) #24	SDR42E1 (ENSDLEG00000001808) #25	HSD17B2 (ENSDLEG00000001788) #26	MPHOSPH6 (ENSDLEG00000001774) #27	CDH13 (ENSDLEG00000001760) #28	MLYCD (ENSDLEG00000001753) #30	OSGIN1 (ENSDLEG00000001743) #31	NECAB2 (ENSDLEG00000001725) #32	SLC38A8 (ENSDLEG00000001712) #33	MBTPS1 (ENSDLEG00000001673) #34	HSDL1 (ENSDLEG00000001650) #35	DNAAF1 (ENSDLEG00000001624) #36	TAF1C (ENSDLEG00000001592) #37	ADAD2 (ENSDLEG00000001541)
Vaquita	MODERN SPECIES	10	ADAMTS18 (ENSPSNG00000016335) #8	NUDT7 (ENSPSNG00000016645) #9	VAT1L (ENSPSNG00000016714) #10	CLEC3A (ENSPSNG00000016763) #11	WWOX (ENSPSNG00000016826)	ENSPSNG00000016902	MAF (ENSPSNG00000016924) #13	DYNLRB2 (ENSPSNG00000016981) #14	CDYL2 (ENSPSNG00000017043) #15	ENSPSNG00000017109	CENPN (ENSPSNG00000017184) #16	ATMIN (ENSPSNG00000017296) #17	C16orf46 (ENSPSNG00000017374)	ENSPSNG00000017406 #19	BCO1 (ENSPSNG00000017682) #21	GAN (ENSPSNG00000017829) #22	ENSPSNG00000017863	CMIP (ENSPSNG00000017922) #23	PLCG2 (ENSPSNG00000018224) #24	SDR42E1 (ENSPSNG00000018307) #25	HSD17B2 (ENSPSNG00000018349) #26	MPHOSPH6 (ENSPSNG00000018456) #27	CDH13 (ENSPSNG00000018575) #28	HSBP1 (ENSPSNG00000018883) #29	MLYCD (ENSPSNG00000018921) #30	OSGIN1 (ENSPSNG00000018976) #31	NECAB2 (ENSPSNG00000019029) #32	SLC38A8 (ENSPSNG00000019267) #33	MBTPS1 (ENSPSNG00000019360) #34	HSDL1 (ENSPSNG00000019399) #35	ENSPSNG00000019431 #36
Dolphin	MODERN SPECIES	2919															BCO1 (ENSTTRG00000006783) #21	GAN (ENSTTRG00000006791) #22	ENSTTRG00000006794	CMIP (ENSTTRG00000006796) #23	PLCG2 (ENSTTRG00000006798) #24	SDR42E1 (ENSTTRG00000006799) #25	HSD17B2 (ENSTTRG00000006800) #26	MPHOSPH6 (ENSTTRG00000006801) #27
Sperm whale	MODERN SPECIES	8	SYCE1L (ENSPCTG00005016040) #7	ENSPCTG00005016194 #8	NUDT7 (ENSPCTG00005016259) #9	VAT1L (ENSPCTG00005016341) #10	CLEC3A (ENSPCTG00005016505) #11	WWOX (ENSPCTG00005016572)	DYNLRB2 (ENSPCTG00005016690) #14	CDYL2 (ENSPCTG00005016738) #15	ENSPCTG00005016761	CENPN (ENSPCTG00005016837) #16	ATMIN (ENSPCTG00005016937) #17	C17H16orf46 (ENSPCTG00005016971)	ENSPCTG00005017009	ENSPCTG00005017044	ENSPCTG00005017248 #21	GAN (ENSPCTG00005017301) #22	ENSPCTG00005017350	PLCG2 (ENSPCTG00005017420) #24	SDR42E1 (ENSPCTG00005017582) #25	HSD17B2 (ENSPCTG00005017614) #26	MPHOSPH6 (ENSPCTG00005017703) #27	CDH13 (ENSPCTG00005017798) #28	HSBP1 (ENSPCTG00005018092) #29	ENSPCTG00005018157 #34	OSGIN1 (ENSPCTG00005018585) #31	ENSPCTG00005018655 #32	DNAAF1 (ENSPCTG00005018707) #36	ENSPCTG00005018799 #37	ADAD2 (ENSPCTG00005018834)	ENSPCTG00005018934	WFDC1 (ENSPCTG00005018951)
Blue whale	MODERN SPECIES	10	ADAMTS18 (ENSBMSG00010013750) #8	ENSBMSG00010013805	NUDT7 (ENSBMSG00010013822) #9	VAT1L (ENSBMSG00010013861) #10	CLEC3A (ENSBMSG00010013904) #11	WWOX (ENSBMSG00010013976)	MAF (ENSBMSG00010014160) #13	DYNLRB2 (ENSBMSG00010014210) #14	CDYL2 (ENSBMSG00010014282) #15	ENSBMSG00010014361	ENSBMSG00010014412 #16	ATMIN (ENSBMSG00010014471) #17	C16orf46 (ENSBMSG00010014516)	ENSBMSG00010014571 #19	BCO1 (ENSBMSG00010014729) #21	GAN (ENSBMSG00010014760) #22	ENSBMSG00010014813	CMIP (ENSBMSG00010014952) #23	PLCG2 (ENSBMSG00010015932) #24	SDR42E1 (ENSBMSG00010016016) #25	HSD17B2 (ENSBMSG00010016042) #26	ENSBMSG00010016071 #27	CDH13 (ENSBMSG00010016147) #28	ENSBMSG00010016302 #29	MLYCD (ENSBMSG00010016323) #30	ENSBMSG00010016347 #31	NECAB2 (ENSBMSG00010016382) #32	SLC38A8 (ENSBMSG00010016481) #33	MBTPS1 (ENSBMSG00010016533) #34	HSDL1 (ENSBMSG00010016575) #35	ENSBMSG00010016603 #36
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.h.a.a.b #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Yarkand deer	MODERN SPECIES	27	WWOX (ENSCHYG00000000219)	MAF (ENSCHYG00000000268) #13	DYNLRB2 (ENSCHYG00000000287) #14	CDYL2 (ENSCHYG00000000319) #15	ENSCHYG00000000338	ENSCHYG00000000345	ENSCHYG00000000359	ENSCHYG00000000384	ENSCHYG00000000403 #16	ATMIN (ENSCHYG00000000420) #17	C16orf46 (ENSCHYG00000000440)	ENSCHYG00000000480 #19	ENSCHYG00000000496	ENSCHYG00000000525 #20	BCO1 (ENSCHYG00000000591) #21	GAN (ENSCHYG00000000629) #22	CMIP (ENSCHYG00000000697) #23	PLCG2 (ENSCHYG00000000839) #24	SDR42E1 (ENSCHYG00000000977) #25	HSD17B2 (ENSCHYG00000000993) #26	ENSCHYG00000001028 #27	CDH13 (ENSCHYG00000001073) #28	ENSCHYG00000001159	HSBP1 (ENSCHYG00000001187) #29	MLYCD (ENSCHYG00000001202) #30	OSGIN1 (ENSCHYG00000001212) #31	NECAB2 (ENSCHYG00000001255) #32	SLC38A8 (ENSCHYG00000001331) #33	MBTPS1 (ENSCHYG00000001353) #34	HSDL1 (ENSCHYG00000001388) #35	DNAAF1 (ENSCHYG00000001408) #36
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908.e	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.h.a.a.b #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1191	CLEC3A (ENSMMSG00000006231) #11	WWOX (ENSMMSG00000006266)	ENSMMSG00000006308	MAF (ENSMMSG00000006317) #13	ENSMMSG00000006336	DYNLRB2 (ENSMMSG00000006363) #14	CDYL2 (ENSMMSG00000006390) #15	ENSMMSG00000006429	CENPN (ENSMMSG00000006463) #16	ENSMMSG00000006535 #17	C16orf46 (ENSMMSG00000006560)	ENSMMSG00000006588 #19	ENSMMSG00000006620	ENSMMSG00000006646 #20	BCO1 (ENSMMSG00000006711) #21	GAN (ENSMMSG00000006796) #22	CMIP (ENSMMSG00000006942) #23	ENSMMSG00000007554	PLCG2 (ENSMMSG00000007574) #24	SDR42E1 (ENSMMSG00000007630) #25	HSD17B2 (ENSMMSG00000007653) #26	MPHOSPH6 (ENSMMSG00000007688) #27	CDH13 (ENSMMSG00000007802) #28	HSBP1 (ENSMMSG00000008024) #29	MLYCD (ENSMMSG00000008057) #30	OSGIN1 (ENSMMSG00000008088) #31	NECAB2 (ENSMMSG00000008132) #32	SLC38A8 (ENSMMSG00000008252) #33	MBTPS1 (ENSMMSG00000008323) #34	HSDL1 (ENSMMSG00000008380) #35	ENSMMSG00000008415 #36
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908.e	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.h.a.a.b #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908.e	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.h.a.a.b.c.a.a #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Goat	MODERN SPECIES	9	ENSCHIG00000021638 #12	ENSCHIG00000018228	MAF (ENSCHIG00000022588) #13	ENSCHIG00000024635	POLR2C (ENSCHIG00000012072)	DOK4 (ENSCHIG00000024959)	DYNLRB2 (ENSCHIG00000011911) #14	CDYL2 (ENSCHIG00000012454) #15	CMC2 (ENSCHIG00000013555)	CENPN (ENSCHIG00000013032) #16	ATMIN (ENSCHIG00000022350) #17	C16orf46 (ENSCHIG00000023947)	ENSCHIG00000026231 #19	PKD1L2 (ENSCHIG00000004177) #20	BCO1 (ENSCHIG00000022901) #21	GAN (ENSCHIG00000025169) #22	CMIP (ENSCHIG00000006544) #23	PLCG2 (ENSCHIG00000017356) #24	SDR42E1 (ENSCHIG00000022692) #25	HSD17B2 (ENSCHIG00000002159) #26	ENSCHIG00000006189	MPHOSPH6 (ENSCHIG00000015522) #27	ENSCHIG00000013951	CDH13 (ENSCHIG00000011245) #28	HSBP1 (ENSCHIG00000019904) #29	MLYCD (ENSCHIG00000009133) #30	OSGIN1 (ENSCHIG00000019419) #31	NECAB2 (ENSCHIG00000009472) #32	SLC38A8 (ENSCHIG00000023079) #33	MBTPS1 (ENSCHIG00000002168) #34	HSDL1 (ENSCHIG00000008948) #35
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	5	ENSOARG00020022554	CLEC3A (ENSOARG00020022576) #11	WWOX (ENSOARG00020003215)	ENSOARG00020003259	MAF (ENSOARG00020003282) #13	DYNLRB2 (ENSOARG00020003305) #14	ENSOARG00020003382	CMC2 (ENSOARG00020003408)	CENPN (ENSOARG00020003427) #16	ENSOARG00020003451	ENSOARG00020003459 #17	ENSOARG00020003523 #19	ENSOARG00020003562	ENSOARG00020003601 #20	BCO1 (ENSOARG00020003735) #21	GAN (ENSOARG00020003869) #22	CMIP (ENSOARG00020004094) #23	PLCG2 (ENSOARG00020005201) #24	ENSOARG00020005853	ENSOARG00020005859	ENSOARG00020005864	SDR42E1 (ENSOARG00020005879) #25	HSD17B2 (ENSOARG00020005890) #26	MPHOSPH6 (ENSOARG00020005925) #27	CDH13 (ENSOARG00020005989) #28	ENSOARG00020006229 #29	MLYCD (ENSOARG00020006248) #30	OSGIN1 (ENSOARG00020006281) #31	NECAB2 (ENSOARG00020006332) #32	SLC38A8 (ENSOARG00020006633) #33	MBTPS1 (ENSOARG00020006764) #34
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00530000064208.b.c.b	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908.e	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.a.a #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00910000146900	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36
American bison	MODERN SPECIES	3209	VAT1L (ENSBBBG00000019613) #10	CLEC3A (ENSBBBG00000019590) #11	WWOX (ENSBBBG00000019578)	MAF (ENSBBBG00000005288) #13	ENSBBBG00000005280	DYNLRB2 (ENSBBBG00000019521) #14	CDYL2 (ENSBBBG00000019511) #15	ENSBBBG00000008949	CENPN (ENSBBBG00000019457) #16	ATMIN (ENSBBBG00000019400) #17	C16orf46 (ENSBBBG00000005132)	ENSBBBG00000019376 #19	ENSBBBG00000005106	ENSBBBG00000007009 #20	BCO1 (ENSBBBG00000019337) #21	GAN (ENSBBBG00000008171) #22	CMIP (ENSBBBG00000009169) #23	PLCG2 (ENSBBBG00000004928) #24	SDR42E1 (ENSBBBG00000004897) #25	HSD17B2 (ENSBBBG00000019087) #26	MPHOSPH6 (ENSBBBG00000019077) #27	ENSBBBG00000019065	CDH13 (ENSBBBG00000019053) #28	ENSBBBG00000009154	HSBP1 (ENSBBBG00000008463) #29	MLYCD (ENSBBBG00000004830) #30	ENSBBBG00000018973 #31	ENSBBBG00000018968 #31	NECAB2 (ENSBBBG00000004817) #32	SLC38A8 (ENSBBBG00000018955) #33	MBTPS1 (ENSBBBG00000004806) #34
Bos	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00530000064208.b.c.b	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908.e	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.a.a.b #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00960000192777	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00910000146900	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908.e	ENSGT00390000004738.m #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.a.a.b #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00960000192777	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00910000146900	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	9	NUDT7 (ENSBIXG00005002142) #9	VAT1L (ENSBIXG00005002111) #10	CLEC3A (ENSBIXG00005005098) #11	WWOX (ENSBIXG00005002001)	MAF (ENSBIXG00005001960) #13	DYNLRB2 (ENSBIXG00005001913) #14	CDYL2 (ENSBIXG00005005167) #15	ENSBIXG00005005197	ENSBIXG00005005211 #16	ATMIN (ENSBIXG00005029184) #17	C16orf46 (ENSBIXG00005001704)	ENSBIXG00005001668 #19	ENSBIXG00005008306	ENSBIXG00005008337 #20	BCO1 (ENSBIXG00005008357) #21	GAN (ENSBIXG00005008371) #22	ENSBIXG00005008377	CMIP (ENSBIXG00005008441) #23	PLCG2 (ENSBIXG00005005354) #24	SDR42E1 (ENSBIXG00005008529) #25	HSD17B2 (ENSBIXG00005008546) #26	MPHOSPH6 (ENSBIXG00005000224) #27	CDH13 (ENSBIXG00005005903) #28	HSBP1 (ENSBIXG00005005940) #29	MLYCD (ENSBIXG00005006190) #30	ENSBIXG00005008933 #32	SLC38A8 (ENSBIXG00005008993) #33	MBTPS1 (ENSBIXG00005009072) #34	HSDL1 (ENSBIXG00005009109) #35	ENSBIXG00005000397 #36	TAF1C (ENSBIXG00005009142) #37
Cow	MODERN SPECIES	9	VAT1L (ENSBTAG00000018146) #10	CLEC3A (ENSBTAG00000046772) #11	WWOX (ENSBTAG00000015894)	ENSBTAG00000050959	MAF (ENSBTAG00000044192) #13	DYNLRB2 (ENSBTAG00000017752) #14	CDYL2 (ENSBTAG00000017112) #15	CMC2 (ENSBTAG00000017009)	CENPN (ENSBTAG00000011635) #16	ATMIN (ENSBTAG00000008213) #17	C18H16orf46 (ENSBTAG00000023765)	GCSH (ENSBTAG00000006795) #19	PKD1L2 (ENSBTAG00000012693) #20	ENSBTAG00000051615	BCO1 (ENSBTAG00000001026) #21	GAN (ENSBTAG00000009428) #22	ENSBTAG00000050732	CMIP (ENSBTAG00000013524) #23	PLCG2 (ENSBTAG00000002103) #24	SDR42E1 (ENSBTAG00000018394) #25	HSD17B2 (ENSBTAG00000003234) #26	MPHOSPH6 (ENSBTAG00000009746) #27	ENSBTAG00000054821	CDH13 (ENSBTAG00000034373) #28	HSBP1 (ENSBTAG00000053436) #29	MLYCD (ENSBTAG00000004248) #30	OSGIN1 (ENSBTAG00000012508) #32	SLC38A8 (ENSBTAG00000040086) #33	MBTPS1 (ENSBTAG00000010170) #34	HSDL1 (ENSBTAG00000018770) #35	DNAAF1 (ENSBTAG00000018771) #36
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00530000064208.b.c.b	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908.e	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.a.a.b #19	ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.b #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00960000192777	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36
Wild yak	MODERN SPECIES	2170				MAF (ENSBMUG00000006426) #13	ENSBMUG00000006431	DYNLRB2 (ENSBMUG00000006439) #14	CDYL2 (ENSBMUG00000006444) #15	CMC2 (ENSBMUG00000006462)	CENPN (ENSBMUG00000006510) #16	ATMIN (ENSBMUG00000006529) #17	C16orf46 (ENSBMUG00000006558)	ENSBMUG00000006574 #19	ENSBMUG00000006605	ENSBMUG00000006628 #20	BCMO1 (ENSBMUG00000006665) #21	GAN (ENSBMUG00000006681) #22	ENSBMUG00000006689	CMIP (ENSBMUG00000006723) #23
Domestic yak	MODERN SPECIES	12	CLEC3A (ENSBGRG00000024115) #11	ENSBGRG00000024103	WWOX (ENSBGRG00000023828)	MAF (ENSBGRG00000023768) #13	DYNLRB2 (ENSBGRG00000023709) #14	CDYL2 (ENSBGRG00000023605) #15	CMC2 (ENSBGRG00000023563)	CENPN (ENSBGRG00000023413) #16	ATMIN (ENSBGRG00000023349) #17	C16orf46 (ENSBGRG00000023267)	ENSBGRG00000023192 #19	ENSBGRG00000023174	ENSBGRG00000023167	ENSBGRG00000022947 #20	BCO1 (ENSBGRG00000022755) #21	GAN (ENSBGRG00000022506) #22	ENSBGRG00000022460	CMIP (ENSBGRG00000020212) #23	PLCG2 (ENSBGRG00000019275) #24	SDR42E1 (ENSBGRG00000019208) #25	HSD17B2 (ENSBGRG00000019120) #26	MPHOSPH6 (ENSBGRG00000019000) #27	CDH13 (ENSBGRG00000018217) #28	HSBP1 (ENSBGRG00000018120) #29	MLYCD (ENSBGRG00000018041) #30	ENSBGRG00000017454 #32	SLC38A8 (ENSBGRG00000017192) #33	MBTPS1 (ENSBGRG00000016838) #34	HSDL1 (ENSBGRG00000016765) #35	ENSBGRG00000016699 #36	TAF1C (ENSBGRG00000016626) #37
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
American mink	MODERN SPECIES	120	ADAMTS18 (ENSNVIG00000019828) #8	NUDT7 (ENSNVIG00000019873) #9	VAT1L (ENSNVIG00000019899) #10	CLEC3A (ENSNVIG00000019924) #11	WWOX (ENSNVIG00000019953)	DLRB2 (ENSNVIG00000020012) #14	CDYL2 (ENSNVIG00000020046) #15	CMC2 (ENSNVIG00000020052)	CENPN (ENSNVIG00000020073) #16	ATMIN (ENSNVIG00000020134) #17	C16orf46 (ENSNVIG00000020149)	GCSH (ENSNVIG00000020159) #19	ENSNVIG00000020171	ENSNVIG00000020185 #20	BCDO1 (ENSNVIG00000020212) #21	GAN (ENSNVIG00000020231) #22	CMIP (ENSNVIG00000020244) #23	PLCG2 (ENSNVIG00000020392) #24	SDR42E1 (ENSNVIG00000020459) #25	DHB2 (ENSNVIG00000020464) #26	MPHOSPH6 (ENSNVIG00000020481) #27	CDH13 (ENSNVIG00000020494) #28	ENSNVIG00000020595 #29	MLYCD (ENSNVIG00000020606) #30	OSGIN1 (ENSNVIG00000020614) #31	NECAB2 (ENSNVIG00000020618) #32	SLC38A8 (ENSNVIG00000020626) #33	MBTPS1 (ENSNVIG00000020642) #34	HSDL1 (ENSNVIG00000020668) #35	ENSNVIG00000020689 #36	TAF1C (ENSNVIG00000020696) #37
Ferret	MODERN SPECIES	203	ADAMTS18 (ENSMPUG00000009827) #8	NUDT7 (ENSMPUG00000009824) #9	VAT1L (ENSMPUG00000009815) #10	CLEC3A (ENSMPUG00000009809) #11	WWOX (ENSMPUG00000009803)	ENSMPUG00000009798	ENSMPUG00000009792 #13	DYNLRB2 (ENSMPUG00000009785) #14	CDYL2 (ENSMPUG00000009741) #15	ENSMPUG00000009732	ATMIN (ENSMPUG00000009728) #17	C16orf46 (ENSMPUG00000009721)	GCSH (ENSMPUG00000009677) #19	PKD1L2 (ENSMPUG00000009585) #20	CENPN (ENSMPUG00000009564) #16	GAN (ENSMPUG00000009551) #22	CMIP (ENSMPUG00000009536) #23	PLCG2 (ENSMPUG00000009243) #24	SDR42E1 (ENSMPUG00000009237) #25	HSD17B2 (ENSMPUG00000009231) #26	MPHOSPH6 (ENSMPUG00000009221) #27	ENSMPUG00000020013	CDH13 (ENSMPUG00000009207) #28	ENSMPUG00000009201	HSBP1 (ENSMPUG00000009190) #29	MLYCD (ENSMPUG00000009180) #30	OSGIN1 (ENSMPUG00000009146) #31	NECAB2 (ENSMPUG00000009022) #32	SLC38A8 (ENSMPUG00000008965) #33	MBTPS1 (ENSMPUG00000008948) #34	HSDL1 (ENSMPUG00000008941) #35
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908.c	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.o #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293.eb #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	109	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908.c	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091.l #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.o #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00940000164458.d	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293.eb #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
American black bear	MODERN SPECIES	143								ENSUAMG00000006664	ENSUAMG00000006668 #16	ENSUAMG00000006675 #17	C16orf46 (ENSUAMG00000006678)	ENSUAMG00000006680 #19	PKD1L2 (ENSUAMG00000006681) #20	ENSUAMG00000006690	BCO1 (ENSUAMG00000006693) #21	GAN (ENSUAMG00000006697) #22	ENSUAMG00000006702	CMIP (ENSUAMG00000006703) #23	PLCG2 (ENSUAMG00000006714) #24
Polar bear	MODERN SPECIES	162	NUDT7 (ENSUMAG00000015025) #9	VAT1L (ENSUMAG00000015030) #10	CLEC3A (ENSUMAG00000015050) #11	WWOX (ENSUMAG00000015058)	DYNLRB2 (ENSUMAG00000015064) #14	CDYL2 (ENSUMAG00000015069) #15	ENSUMAG00000015088	CENPN (ENSUMAG00000015095) #16	ATMIN (ENSUMAG00000015098) #17	C16orf46 (ENSUMAG00000015103)	ENSUMAG00000015107 #19	PKD1L2 (ENSUMAG00000015112) #20	ENSUMAG00000015144	BCO1 (ENSUMAG00000015159) #21	ENSUMAG00000015238	GAN (ENSUMAG00000015243) #22	CMIP (ENSUMAG00000015248) #23	PLCG2 (ENSUMAG00000015261) #24	SDR42E1 (ENSUMAG00000015268) #25	HSD17B2 (ENSUMAG00000015271) #26	MPHOSPH6 (ENSUMAG00000015279) #27	ENSUMAG00000015287	CDH13 (ENSUMAG00000015326) #28	HSBP1 (ENSUMAG00000015705) #29	MLYCD (ENSUMAG00000015708) #30	ENSUMAG00000015712 #31	ENSUMAG00000015716 #32	MBTPS1 (ENSUMAG00000015723) #34	HSDL1 (ENSUMAG00000015728) #35	DNAAF1 (ENSUMAG00000015742) #36	TAF1C (ENSUMAG00000015773) #37
Giant Panda	MODERN SPECIES	3	CLEC3A (ENSAMEG00000009612) #11	ENSAMEG00000009604	ENSAMEG00000018329	ENSAMEG00000018324	ENSAMEG00000008069	ENSAMEG00000029152	ENSAMEG00000010346 #13	ENSAMEG00000016964 #14	CDYL2 (ENSAMEG00000016966) #15	ENSAMEG00000013929	ATMIN (ENSAMEG00000013952) #17	C16orf46 (ENSAMEG00000024452)	ENSAMEG00000013959 #19	PKD1L2 (ENSAMEG00000029920) #20	BCO1 (ENSAMEG00000013973) #21	GAN (ENSAMEG00000014009) #22	CMIP (ENSAMEG00000014029) #23	PLCG2 (ENSAMEG00000014051) #24	SDR42E1 (ENSAMEG00000023929) #25	HSD17B2 (ENSAMEG00000029860) #26	MPHOSPH6 (ENSAMEG00000014150) #27	CDH13 (ENSAMEG00000006487) #28	HSBP1 (ENSAMEG00000006485) #29	MLYCD (ENSAMEG00000027054) #30	NECAB2 (ENSAMEG00000006457) #32	SLC38A8 (ENSAMEG00000006433) #33	MBTPS1 (ENSAMEG00000006349) #34	HSDL1 (ENSAMEG00000006337) #35	DNAAF1 (ENSAMEG00000006296) #36	TAF1C (ENSAMEG00000006277) #37	ADAD2 (ENSAMEG00000006263)
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908.a.b	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908.a.b	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Dingo	MODERN SPECIES	373	NUDT7 (ENSCAFG00020002293) #9	VAT1L (ENSCAFG00020002313) #10	CLEC3A (ENSCAFG00020002332) #11	WWOX (ENSCAFG00020002350)	MAF (ENSCAFG00020002357) #13	ENSCAFG00020002373 #14	CDYL2 (ENSCAFG00020002393) #15	ENSCAFG00020002425	ENSCAFG00020002429 #16	ENSCAFG00020002431 #16	ATMIN (ENSCAFG00020002436) #17	C16orf46 (ENSCAFG00020002439)	GCSH (ENSCAFG00020002440) #19	PKD1L2 (ENSCAFG00020002444) #20	BCO1 (ENSCAFG00020002476) #21	GAN (ENSCAFG00020002506) #22	ENSCAFG00020002531	CMIP (ENSCAFG00020002534) #23	PLCG2 (ENSCAFG00020002593) #24	SDR42E1 (ENSCAFG00020002962) #25	HSD17B2 (ENSCAFG00020002967) #26	ENSCAFG00020002991 #27	ENSCAFG00020003011	CDH13 (ENSCAFG00020003045) #28	HSBP1 (ENSCAFG00020003283) #29	MLYCD (ENSCAFG00020003288) #30	OSGIN1 (ENSCAFG00020003290) #31	NECAB2 (ENSCAFG00020003293) #32	SLC38A8 (ENSCAFG00020003299) #33	MBTPS1 (ENSCAFG00020003314) #34	HSDL1 (ENSCAFG00020003324) #35
Dog	MODERN SPECIES	33	NUDT7 (ENSCAFG00845022170) #9	VAT1L (ENSCAFG00845022047) #10	CLEC3A (ENSCAFG00845021995) #11	WWOX (ENSCAFG00845021522)	MAF (ENSCAFG00845021165) #13	DYNLRB2 (ENSCAFG00845021057) #14	CDYL2 (ENSCAFG00845020878) #15	ENSCAFG00845020815	CENPN (ENSCAFG00845020660) #16	ATMIN (ENSCAFG00845020541) #17	C16orf46 (ENSCAFG00845020475)	ENSCAFG00845020374 #19	ENSCAFG00845020020 #20	BCO1 (ENSCAFG00845019952) #21	ENSCAFG00845019918	GAN (ENSCAFG00845019691) #22	CMIP (ENSCAFG00845018752) #23	PLCG2 (ENSCAFG00845017949) #24	SDR42E1 (ENSCAFG00845017877) #25	HSD17B2 (ENSCAFG00845017721) #26	ENSCAFG00845017638 #27	CDH13 (ENSCAFG00845017012) #28	HSBP1 (ENSCAFG00845016653) #29	MLYCD (ENSCAFG00845016601) #30	OSGIN1 (ENSCAFG00845016421) #31	NECAB2 (ENSCAFG00845016292) #32	SLC38A8 (ENSCAFG00845016204) #33	MBTPS1 (ENSCAFG00845016031) #34	HSDL1 (ENSCAFG00845015934) #35	DNAAF1 (ENSCAFG00845015871) #36	TAF1C (ENSCAFG00845015822) #37
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.l.a #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000017515.o.a	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36
Cat	MODERN SPECIES	246	NUDT7 (ENSFCAG00000022107) #9	VAT1L (ENSFCAG00000004729) #10	CLEC3A (ENSFCAG00000028303) #11	WWOX (ENSFCAG00000022130)	MAF (ENSFCAG00000042273) #13	DYNLRB2 (ENSFCAG00000004084) #14	CDYL2 (ENSFCAG00000014748) #15	ENSFCAG00000022025	CMC2 (ENSFCAG00000004977)	CENPN (ENSFCAG00000035603) #16	ATMIN (ENSFCAG00000004979) #17	C16orf46 (ENSFCAG00000040782)	ENSFCAG00000013038 #19	PKD1L2 (ENSFCAG00000004981) #20	BCO1 (ENSFCAG00000004984) #21	GAN (ENSFCAG00000028273) #22	ENSFCAG00000036536	CMIP (ENSFCAG00000004986) #23	PLCG2 (ENSFCAG00000004987) #24	SDR42E1 (ENSFCAG00000024343) #25	HSD17B2 (ENSFCAG00000004989) #26	MPHOSPH6 (ENSFCAG00000004990) #27	CDH13 (ENSFCAG00000004387) #28	ENSFCAG00000047154	HSBP1 (ENSFCAG00000034194) #29	MLYCD (ENSFCAG00000011551) #30	NECAB2 (ENSFCAG00000026632) #32	MBTPS1 (ENSFCAG00000011554) #34	HSDL1 (ENSFCAG00000027235) #35	DNAAF1 (ENSFCAG00000011556) #36	TAF1C (ENSFCAG00000011557) #37
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.l.a #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Tiger	MODERN SPECIES	176							DYNLRB2 (ENSPTIG00000013255) #14	CDYL2 (ENSPTIG00000009990) #15	CMC2 (ENSPTIG00000007511)	CENPN (ENSPTIG00000019596) #16	ATMIN (ENSPTIG00000018927) #17	C16orf46 (ENSPTIG00000018481)	ENSPTIG00000018330 #19	ENSPTIG00000015213 #20	BCO1 (ENSPTIG00000014390) #21	GAN (ENSPTIG00000012567) #22	CMIP (ENSPTIG00000011336) #23	PLCG2 (ENSPTIG00000006583) #24	SDR42E1 (ENSPTIG00000006116) #25	HSD17B2 (ENSPTIG00000005395) #26	MPHOSPH6 (ENSPTIG00000000518) #27	CDH13 (ENSPTIG00000019366) #28	HSBP1 (ENSPTIG00000018555) #29	MLYCD (ENSPTIG00000018312) #30	OSGIN1 (ENSPTIG00000016465) #31	NECAB2 (ENSPTIG00000015250) #32	SLC38A8 (ENSPTIG00000014053) #33	MBTPS1 (ENSPTIG00000009246) #34	HSDL1 (ENSPTIG00000005993) #35	DNAAF1 (ENSPTIG00000001632) #36	ENSPTIG00000019244 #37
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.l.a #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
lion	MODERN SPECIES	15	SYCE1L (ENSPLOG00000018915) #7	ADAMTS18 (ENSPLOG00000018990) #8	NUDT7 (ENSPLOG00000019129) #9	VAT1L (ENSPLOG00000019173) #10	CLEC3A (ENSPLOG00000019239) #11	WWOX (ENSPLOG00000019311)	DYNLRB2 (ENSPLOG00000019543) #14	CDYL2 (ENSPLOG00000019594) #15	ENSPLOG00000019610	ENSPLOG00000019648 #16	ATMIN (ENSPLOG00000019710) #17	C16orf46 (ENSPLOG00000019742)	ENSPLOG00000019766 #19	PKD1L2 (ENSPLOG00000019863) #20	BCO1 (ENSPLOG00000020093) #21	GAN (ENSPLOG00000020158) #22	ENSPLOG00000020187	CMIP (ENSPLOG00000020262) #23	PLCG2 (ENSPLOG00000020573) #24	SDR42E1 (ENSPLOG00000020620) #25	HSD17B2 (ENSPLOG00000020638) #26	MPHOSPH6 (ENSPLOG00000020668) #27	CDH13 (ENSPLOG00000020733) #28	HSBP1 (ENSPLOG00000020851) #29	MLYCD (ENSPLOG00000020875) #30	OSGIN1 (ENSPLOG00000020893) #31	NECAB2 (ENSPLOG00000020932) #32	SLC38A8 (ENSPLOG00000021052) #33	MBTPS1 (ENSPLOG00000021100) #34	HSDL1 (ENSPLOG00000021130) #35	DNAAF1 (ENSPLOG00000005449) #36
leopard	DUPLICATION
leopard	MODERN SPECIES	60	NUDT7 (ENSPPRG00000011885) #9	VAT1L (ENSPPRG00000012251) #10	CLEC3A (ENSPPRG00000012420) #11	WWOX (ENSPPRG00000015480)	MAF (ENSPPRG00000016630) #13	DYNLRB2 (ENSPPRG00000017658) #14	CDYL2 (ENSPPRG00000020724) #15	ENSPPRG00000024339	CMC2 (ENSPPRG00000023624)	CENPN (ENSPPRG00000000055) #16	ATMIN (ENSPPRG00000000693) #17	C16orf46 (ENSPPRG00000000885)	ENSPPRG00000001521 #19	ENSPPRG00000003585 #20	BCO1 (ENSPPRG00000004167) #21	ENSPPRG00000019706 #22	ENSPPRG00000019730	GAN (ENSPPRG00000004887) #22	CMIP (ENSPPRG00000008468) #23	ENSPPRG00000008613	PLCG2 (ENSPPRG00000011326) #24	SDR42E1 (ENSPPRG00000011531) #25	HSD17B2 (ENSPPRG00000011942) #26	MPHOSPH6 (ENSPPRG00000012627) #27	ENSPPRG00000014633	CDH13 (ENSPPRG00000019564) #28	HSBP1 (ENSPPRG00000022445) #29	MLYCD (ENSPPRG00000025085) #30	OSGIN1 (ENSPPRG00000025067) #31	NECAB2 (ENSPPRG00000025055) #32	SLC38A8 (ENSPPRG00000025007) #33
leopard	MODERN SPECIES	60	CLEC3A (ENSPPRG00000012420) #11	WWOX (ENSPPRG00000015480)	MAF (ENSPPRG00000016630) #13	DYNLRB2 (ENSPPRG00000017658) #14	CDYL2 (ENSPPRG00000020724) #15	ENSPPRG00000024339	CMC2 (ENSPPRG00000023624)	CENPN (ENSPPRG00000000055) #16	ATMIN (ENSPPRG00000000693) #17	C16orf46 (ENSPPRG00000000885)	ENSPPRG00000001521 #19	ENSPPRG00000003585 #20	BCO1 (ENSPPRG00000004167) #21	ENSPPRG00000019706 #22	ENSPPRG00000019730	GAN (ENSPPRG00000004887) #22	CMIP (ENSPPRG00000008468) #23	ENSPPRG00000008613	PLCG2 (ENSPPRG00000011326) #24	SDR42E1 (ENSPPRG00000011531) #25	HSD17B2 (ENSPPRG00000011942) #26	MPHOSPH6 (ENSPPRG00000012627) #27	ENSPPRG00000014633	CDH13 (ENSPPRG00000019564) #28	HSBP1 (ENSPPRG00000022445) #29	MLYCD (ENSPPRG00000025085) #30	OSGIN1 (ENSPPRG00000025067) #31	NECAB2 (ENSPPRG00000025055) #32	SLC38A8 (ENSPPRG00000025007) #33	MBTPS1 (ENSPPRG00000024918) #34	HSDL1 (ENSPPRG00000024798) #35
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	6	MON1B (ENSRFEG00010007521)	ADAMTS18 (ENSRFEG00010007780) #8	NUDT7 (ENSRFEG00010008000) #9	VAT1L (ENSRFEG00010008062) #10	CLEC3A (ENSRFEG00010008108) #11	WWOX (ENSRFEG00010008177)	MAF (ENSRFEG00010008255) #13	DYNLRB2 (ENSRFEG00010008310) #14	CDYL2 (ENSRFEG00010008362) #15	CMC2 (ENSRFEG00010008437)	ENSRFEG00010008493 #16	ATMIN (ENSRFEG00010008777) #17	C16orf46 (ENSRFEG00010008835)	GCSH (ENSRFEG00010008913) #19	BCO1 (ENSRFEG00010008967) #21	GAN (ENSRFEG00010009014) #22	CMIP (ENSRFEG00010009132) #23	PLCG2 (ENSRFEG00010009626) #24	SDR42E1 (ENSRFEG00010009698) #25	HSD17B2 (ENSRFEG00010009719) #26	MPHOSPH6 (ENSRFEG00010009737) #27	CDH13 (ENSRFEG00010009815) #28	ENSRFEG00010010056 #29	MLYCD (ENSRFEG00010010090) #30	OSGIN1 (ENSRFEG00010010128) #31	NECAB2 (ENSRFEG00010010165) #32	SLC38A8 (ENSRFEG00010010227) #33	MBTPS1 (ENSRFEG00010010334) #34	HSDL1 (ENSRFEG00010010391) #35	DNAAF1 (ENSRFEG00010010447) #36	TAF1C (ENSRFEG00010010672) #37
Microbat	MODERN SPECIES	972	NUDT7 (ENSMLUG00000009335) #9	VAT1L (ENSMLUG00000009345) #10	CLEC3A (ENSMLUG00000009365) #11	WWOX (ENSMLUG00000009368)	ENSMLUG00000025894	DYNLRB2 (ENSMLUG00000001399) #14	CDYL2 (ENSMLUG00000001407) #15	CMC2 (ENSMLUG00000008494)	CENPN (ENSMLUG00000005884) #16	ENSMLUG00000005888 #17	C16orf46 (ENSMLUG00000005894)	GCSH (ENSMLUG00000005783) #19	ENSMLUG00000025067 #20	ENSMLUG00000028202	BCO1 (ENSMLUG00000014885) #21	GAN (ENSMLUG00000014891) #22	CMIP (ENSMLUG00000014899) #23	PLCG2 (ENSMLUG00000014908) #24	SDR42E1 (ENSMLUG00000015708) #25	HSD17B2 (ENSMLUG00000015714) #26	ENSMLUG00000000268 #27	ENSMLUG00000007609 #28	HSBP1 (ENSMLUG00000007636) #29	MLYCD (ENSMLUG00000002980) #30	OSGIN1 (ENSMLUG00000002987) #31	NECAB2 (ENSMLUG00000002998) #32	SLC38A8 (ENSMLUG00000003006) #33	MBTPS1 (ENSMLUG00000003013) #34	HSDL1 (ENSMLUG00000003026) #35	DNAAF1 (ENSMLUG00000003031) #36	TAF1C (ENSMLUG00000003039) #37
Megabat	MODERN SPECIES	698															BCO1 (ENSPVAG00000010940) #21	GAN (ENSPVAG00000010943) #22
Equus	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Donkey	MODERN SPECIES	20	ADAMTS18 (ENSEASG00005013537) #8	NUDT7 (ENSEASG00005013555) #9	VAT1L (ENSEASG00005013560) #10	CLEC3A (ENSEASG00005037444) #11	WWOX (ENSEASG00005013576)	MAF (ENSEASG00005031499) #13	DYNLRB2 (ENSEASG00005013585) #14	CDYL2 (ENSEASG00005013589) #15	CMC2 (ENSEASG00005023757)	CENPN (ENSEASG00005032181) #16	ATMIN (ENSEASG00005013597) #17	C16orf46 (ENSEASG00005028489)	GCSH (ENSEASG00005035967) #19	PKD1L2 (ENSEASG00005013610) #20	BCO1 (ENSEASG00005013625) #21	GAN (ENSEASG00005013631) #22	CMIP (ENSEASG00005013643) #23	PLCG2 (ENSEASG00005013661) #24	SDR42E1 (ENSEASG00005030350) #25	HSD17B2 (ENSEASG00005013674) #26	MPHOSPH6 (ENSEASG00005027868) #27	CDH13 (ENSEASG00005013691) #28	HSBP1 (ENSEASG00005034692) #29	MLYCD (ENSEASG00005013697) #30	OSGIN1 (ENSEASG00005013700) #31	NECAB2 (ENSEASG00005013703) #32	SLC38A8 (ENSEASG00005013707) #33	MBTPS1 (ENSEASG00005013712) #34	HSDL1 (ENSEASG00005013722) #35	DNAAF1 (ENSEASG00005027556) #36	TAF1C (ENSEASG00005013733) #37
Horse	MODERN SPECIES	22	ADAMTS18 (ENSECAG00000019006) #8	NUDT7 (ENSECAG00000009401) #9	VAT1L (ENSECAG00000009839) #10	CLEC3A (ENSECAG00000014778) #11	WWOX (ENSECAG00000016036)	MAF (ENSECAG00000033482) #13	DYNLRB2 (ENSECAG00000018830) #14	CDYL2 (ENSECAG00000019160) #15	CMC2 (ENSECAG00000000963)	CENPN (ENSECAG00000001041) #16	ATMIN (ENSECAG00000011923) #17	C3H16orf46 (ENSECAG00000015354)	GCSH (ENSECAG00000026862) #19	ENSECAG00000015980 #20	BCO1 (ENSECAG00000000280) #21	GAN (ENSECAG00000012155) #22	ENSECAG00000033092	CMIP (ENSECAG00000013542) #23	PLCG2 (ENSECAG00000000291) #24	SDR42E1 (ENSECAG00000011349) #25	HSD17B2 (ENSECAG00000012114) #26	CDH13 (ENSECAG00000021162) #28	MLYCD (ENSECAG00000022837) #30	OSGIN1 (ENSECAG00000023023) #31	NECAB2 (ENSECAG00000023746) #32	SLC38A8 (ENSECAG00000003354) #33	MBTPS1 (ENSECAG00000010283) #34	HSDL1 (ENSECAG00000009577) #35	DNAAF1 (ENSECAG00000013646) #36	TAF1C (ENSECAG00000015734) #37	ADAD2 (ENSECAG00000020331)
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	52	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	593									ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22
Armadillo	MODERN SPECIES	603								DYNLRB2 (ENSDNOG00000041975) #14	CDYL2 (ENSDNOG00000000515) #15	ENSDNOG00000004354	ENSDNOG00000042547 #17	C16orf46 (ENSDNOG00000036955)	GCSH (ENSDNOG00000017870) #19	PKD1L2 (ENSDNOG00000002410) #20	BCO1 (ENSDNOG00000000413) #21	GAN (ENSDNOG00000000417) #22
Sloth	MODERN SPECIES	2240																GAN (ENSCHOG00000008651) #22
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	50	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Tenrec	MODERN SPECIES	2500																GAN (ENSETEG00000013096) #22
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	94	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006658.b #31	ENSGT00950000183131.b.b #32	ENSGT00940000157764 #33	ENSGT00490000043404 #34	ENSGT00940000160053 #35	ENSGT00940000158494 #36	ENSGT00390000010767 #37
Elephant	MODERN SPECIES	458	NUDT7 (ENSLAFG00000015102) #9	VAT1L (ENSLAFG00000002783) #10	CLEC3A (ENSLAFG00000021345) #11	ENSLAFG00000012515 #12	ENSLAFG00000032762	MAF (ENSLAFG00000003211) #13	DYNLRB2 (ENSLAFG00000018336) #14	CDYL2 (ENSLAFG00000018183) #15	CMC2 (ENSLAFG00000004378)	CENPN (ENSLAFG00000004382) #16	ATMIN (ENSLAFG00000004383) #17	C16orf46 (ENSLAFG00000014008)	GCSH (ENSLAFG00000015586) #19	ENSLAFG00000013094 #20	BCO1 (ENSLAFG00000013100) #21	GAN (ENSLAFG00000013109) #22	CMIP (ENSLAFG00000013907) #23	PLCG2 (ENSLAFG00000001815) #24	SDR42E1 (ENSLAFG00000007085) #25	ENSLAFG00000001816 #26	MPHOSPH6 (ENSLAFG00000004842) #27	CDH13 (ENSLAFG00000000367) #28	ENSLAFG00000014112 #29	MLYCD (ENSLAFG00000008543) #30	OSGIN1 (ENSLAFG00000029645) #31	NECAB2 (ENSLAFG00000006053) #32	SLC38A8 (ENSLAFG00000006058) #33	MBTPS1 (ENSLAFG00000006060) #34	HSDL1 (ENSLAFG00000017715) #35	DNAAF1 (ENSLAFG00000006065) #36	TAF1C (ENSLAFG00000006068) #37
Hyrax	MODERN SPECIES	2560															BCO1 (ENSPCAG00000000200) #21	GAN (ENSPCAG00000000217) #22
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000017627.a	ENSGT00940000159330	ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b	ENSGT00390000006205.a	ENSGT00440000039029	ENSGT00940000160736	ENSGT00940000159084	ENSGT00500000045333	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.wb #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT01090000260024.A.a.b.a.b.a.a.a.b.b	ENSGT01090000260024.A.a.b.a.b.a.a.a.b.a.b	ENSGT01090000260024.A.a.b.a.b.a.a.a.b.a.a.a	ENSGT01090000260045.C.e.a.a.a.b.b.b.a	ENSGT00940000160213	ENSGT00940000155646	ENSGT00390000004263.b.n
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000017627.a	ENSGT00940000159330	ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b	ENSGT00390000006205.a	ENSGT00440000039029	ENSGT00940000160736	ENSGT00940000159084	ENSGT00500000045333	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.wb #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT01090000260024.A.a.b.a.b.a.a.a.b.b	ENSGT01090000260024.A.a.b.a.b.a.a.a.b.a.b	ENSGT01090000260024.A.a.b.a.b.a.a.a.b.a.a.a	ENSGT01090000260045.C.e.a.a.a.b.b.b.a	ENSGT01090000259995.a.b.c.b	ENSGT01090000259995.a.b.c.a	ENSGT00940000160213
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000017627.a	ENSGT00940000159330	ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b	ENSGT00390000006205.a	ENSGT00440000039029	ENSGT00940000160736	ENSGT00940000159084	ENSGT00500000045333	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.vb.a #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT01090000260024.A.a.b.a.b.a.a.a.b.b	ENSGT01090000260024.A.a.b.a.b.a.a.a.b.a.b	ENSGT01090000260024.A.a.b.a.b.a.a.a.b.a.a.a	ENSGT01090000260045.C.e.a.a.a.b.b.b.a	ENSGT01090000259995.a.b.c.b	ENSGT00940000160213	ENSGT00940000155646
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000159330	ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b	ENSGT00390000006205.a	ENSGT00440000039029	ENSGT00940000160736	ENSGT00940000159084	ENSGT00500000045333.b	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666.vb.a #19	ENSGT00940000165999	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006293.y #29	ENSGT01090000260024.A.a.b.a.b.a.a.a.b.b	ENSGT01090000260024.A.a.b.a.b.a.a.a.b.a.b	ENSGT01090000260024.A.a.b.a.b.a.a.a.b.a.a.a	ENSGT01090000260045.C.e.a.a.a.b.b.b.a	ENSGT01090000259995.a.b.c.b	ENSGT00940000160213
koala	MODERN SPECIES	47	ENSPCIG00000032789	ENSPCIG00000010969	STRN (ENSPCIG00000010971)	HEATR5B (ENSPCIG00000010975)	GPATCH11 (ENSPCIG00000010983)	ENSPCIG00000010984	SULT6B1 (ENSPCIG00000010986)	ENSPCIG00000010987	CMC2 (ENSPCIG00000032133)	CENPN (ENSPCIG00000010989) #16	ATMIN (ENSPCIG00000010990) #17	ENSPCIG00000010992	ENSPCIG00000010994 #19	ENSPCIG00000010998 #20	BCO1 (ENSPCIG00000011002) #21	GAN (ENSPCIG00000011004) #22	CMIP (ENSPCIG00000015315) #23	PLCG2 (ENSPCIG00000015304) #24	SDR42E1 (ENSPCIG00000015298) #25	HSD17B2 (ENSPCIG00000010747) #26	ENSPCIG00000036337	MPHOSPH6 (ENSPCIG00000010743) #27	ENSPCIG00000010739	ENSPCIG00000016009	CDH13 (ENSPCIG00000011670) #28	MLYCD (ENSPCIG00000009581) #30	ENSPCIG00000031065 #29	ENSPCIG00000022636	ENSPCIG00000022638	ENSPCIG00000022654	ENSPCIG00000031028
Common wonbat	MODERN SPECIES	574	FEZ2 (ENSVURG00010016777)	VIT (ENSVURG00010016752)	STRN (ENSVURG00010016708)	HEATR5B (ENSVURG00010016661)	GPATCH11 (ENSVURG00010016627)	ENSVURG00010016594	SULT6B1 (ENSVURG00010016574)	ENSVURG00010016569	CMC2 (ENSVURG00010016565)	CENPN (ENSVURG00010016556) #16	ATMIN (ENSVURG00010016546) #17	ENSVURG00010016541	ENSVURG00010016533	ENSVURG00010016487 #20	BCO1 (ENSVURG00010016469) #21	GAN (ENSVURG00010016455) #22	CMIP (ENSVURG00010016430) #23	ENSVURG00010016418	PLCG2 (ENSVURG00010016355) #24	SDR42E1 (ENSVURG00010016334) #25	HSD17B2 (ENSVURG00010016318) #26	MPHOSPH6 (ENSVURG00010016311) #27	CDH13 (ENSVURG00010016295) #28	ENSVURG00010016249	ENSVURG00010016238 #30	ENSVURG00010016224 #29	ENSVURG00010016221	ENSVURG00010016212	ENSVURG00010016207	ENSVURG00010016195	ENSVURG00010016187
Wallaby	MODERN SPECIES	3419																GAN (ENSMEUG00000001328) #22
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	1	ENSSHAG00000009712	ENSSHAG00000010867	VIT (ENSSHAG00000012061)	STRN (ENSSHAG00000012733)	HEATR5B (ENSSHAG00000013525)	GPATCH11 (ENSSHAG00000023702)	ENSSHAG00000001447	SULT6B1 (ENSSHAG00000004594)	ENSSHAG00000024600	ENSSHAG00000023635	ENSSHAG00000020527 #17	ENSSHAG00000026628	GCSH (ENSSHAG00000029630) #19	ENSSHAG00000005909 #20	BCO1 (ENSSHAG00000007696) #21	GAN (ENSSHAG00000008348) #22	ENSSHAG00000010454	PLCG2 (ENSSHAG00000011637) #24	SDR42E1 (ENSSHAG00000012555) #25	HSD17B2 (ENSSHAG00000031931) #26	ENSSHAG00000026367	MPHOSPH6 (ENSSHAG00000013630) #27	CDH13 (ENSSHAG00000008933) #28	ENSSHAG00000030969 #30	ENSSHAG00000002202	ENSSHAG00000026391	ENSSHAG00000025906	ENSSHAG00000021096	ENSSHAG00000031785	ENSSHAG00000028779	ENSSHAG00000026083
Opossum	MODERN SPECIES		FEZ2 (ENSMODG00000015390)	VIT (ENSMODG00000015382)	STRN (ENSMODG00000015376)	HEATR5B (ENSMODG00000015367)	GPATCH11 (ENSMODG00000015289)	ENSMODG00000015286	SULT6B1 (ENSMODG00000015278)	ENSMODG00000048395	CMC2 (ENSMODG00000025763)	CENPN (ENSMODG00000015271) #16	ATMIN (ENSMODG00000015266) #17	ENSMODG00000015261	ENSMODG00000050374	GCSH (ENSMODG00000039999) #19	BCO1 (ENSMODG00000015217) #21	GAN (ENSMODG00000015214) #22	CMIP (ENSMODG00000015208) #23	PLCG2 (ENSMODG00000015196) #24	SDR42E1 (ENSMODG00000015169) #25	HSD17B2 (ENSMODG00000015163) #26	ENSMODG00000023205	MPHOSPH6 (ENSMODG00000015131) #27	ENSMODG00000042788	CDH13 (ENSMODG00000015029) #28	ENSMODG00000040958	MLYCD (ENSMODG00000014843) #30	ENSMODG00000014830	ENSMODG00000045149	ENSMODG00000050070	ENSMODG00000041844	ENSMODG00000042906
Platypus	MODERN SPECIES	2	ENSOANG00000045608	ENSOANG00000041417	ENSOANG00000047621	ENSOANG00000038705	ENSOANG00000047125	ENSOANG00000046697	ZKSCAN2 (ENSOANG00000041167)	ENSOANG00000044812	ENSOANG00000002158	ENSOANG00000046532	ENSOANG00000039790	ENSOANG00000008735	ANKS3 (ENSOANG00000003821)	ENSOANG00000003819	ENSOANG00000042481 #21	GAN (ENSOANG00000009351) #22	PLCG2 (ENSOANG00000011330) #24	SDR42E1 (ENSOANG00000011331) #25	ENSOANG00000049044 #26	ENSOANG00000011333	MPHOSPH6 (ENSOANG00000040792) #27	CDH13 (ENSOANG00000049837) #28	MLYCD (ENSOANG00000011336) #30	ENSOANG00000043261 #29	KCNG4 (ENSOANG00000044990)	WFDC1 (ENSOANG00000011339)	ATP2C2 (ENSOANG00000011340)	MEAK7 (ENSOANG00000011342)	COTL1 (ENSOANG00000011343)	KLHL36 (ENSOANG00000039074)	USP10 (ENSOANG00000011345)
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00740000115581.e	ENSGT00940000158278	ENSGT00940000161681	ENSGT00390000007438	ENSGT00710000106790	ENSGT00940000159567	ENSGT00940000162200	ENSGT00940000157841	ENSGT00390000012708	ENSGT00390000014634	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000164357	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b.ab	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00940000166270	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00940000160959	ENSGT00940000154606	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b.ab	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498
tuatara	MODERN SPECIES	59			ADAMTS18 (ENSSPUG00000008883) #8	VAT1L (ENSSPUG00000008698) #10	CLEC3A (ENSSPUG00000008660) #11	ENSSPUG00000008653	WWOX (ENSSPUG00000008635)	MAF (ENSSPUG00000008626) #13	DYNLRB2 (ENSSPUG00000008618) #14	CDYL2 (ENSSPUG00000008611) #15	CMC2 (ENSSPUG00000008601)	CENPN (ENSSPUG00000008587) #16	GCSH (ENSSPUG00000008552) #19	PKD1L2 (ENSSPUG00000008505) #20	BCO1 (ENSSPUG00000008483) #21	GAN (ENSSPUG00000008470) #22	CMIP (ENSSPUG00000008429) #23	PLCG2 (ENSSPUG00000008391) #24	SDR42E1 (ENSSPUG00000008384) #25	HSD17B2 (ENSSPUG00000008318) #26	ENSSPUG00000008305	MPHOSPH6 (ENSSPUG00000008289) #27	ENSSPUG00000008273 #28	ENSSPUG00000008137 #28	MLYCD (ENSSPUG00000008100) #30	HSBP1 (ENSSPUG00000008085) #29	KCNG4 (ENSSPUG00000008081)	WFDC1 (ENSSPUG00000008075)	ATP2C2 (ENSSPUG00000008045)	MEAK7 (ENSSPUG00000008023)	COTL1 (ENSSPUG00000008015)
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00940000154606	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000157672	ENSGT01030000235333	ENSGT00940000160211	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.b	ENSGT00940000161738	ENSGT00550000075019	ENSGT00940000156131.a.b	ENSGT00940000157187	ENSGT00950000182966.B	ENSGT00940000157499	ENSGT00400000022168.b	ENSGT00940000156879	ENSGT00390000015672
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00940000154606	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000157672	ENSGT01030000235333	ENSGT00940000160211	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.b	ENSGT00940000161738	ENSGT00550000075019	ENSGT00940000156131.a.b	ENSGT00940000157187	ENSGT00950000182966.B	ENSGT00940000157499	ENSGT00400000022168.b	ENSGT00940000156879	ENSGT00390000015672
Lizard	MODERN SPECIES	803	ENSACAG00000043785	ENSACAG00000022476 #13	ENSACAG00000044705	ENSACAG00000041576	ENSACAG00000038945	ENSACAG00000008780 #14	ENSACAG00000008783 #15	CMC2 (ENSACAG00000008855)	CENPN (ENSACAG00000008859) #16	ATMIN (ENSACAG00000008885) #17	ENSACAG00000042178	ENSACAG00000043658	ENSACAG00000008905	PKD1L2 (ENSACAG00000008955) #20	BCO1 (ENSACAG00000009055) #21	GAN (ENSACAG00000009119) #22	CMIP (ENSACAG00000009149) #23	PLCG2 (ENSACAG00000009200) #24	SLC12A4 (ENSACAG00000009446)	ENSACAG00000009652	ENSACAG00000009728	DDX28 (ENSACAG00000009755)	DUS2 (ENSACAG00000009757)	NFATC3 (ENSACAG00000009839)	ESRP2 (ENSACAG00000009900)	ENSACAG00000009959	PLA2G15 (ENSACAG00000009961)	SMPD3 (ENSACAG00000010068)	PRMT7 (ENSACAG00000010119)	SLC7A6OS (ENSACAG00000010238)	ENSACAG00000044839
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00940000154606	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000157672	ENSGT01030000235333	ENSGT00940000160211	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.b	ENSGT00940000161738	ENSGT00550000075019	ENSGT00940000156131.a.b	ENSGT00940000157187	ENSGT00950000182966.B	ENSGT00940000157499	ENSGT00400000022168.b	ENSGT00940000156879	ENSGT00390000015672
Indian cobra	MODERN SPECIES	12	ADAMTS18 (ENSNNAG00000012235) #8	NUDT7 (ENSNNAG00000012179) #9	VAT1L (ENSNNAG00000012058) #10	CLEC3A (ENSNNAG00000012008) #11	WWOX (ENSNNAG00000011982)	MAF (ENSNNAG00000011944) #13	DYNLRB2 (ENSNNAG00000011901) #14	CDYL2 (ENSNNAG00000011876) #15	CMC2 (ENSNNAG00000011857)	CENPN (ENSNNAG00000011786) #16	ATMIN (ENSNNAG00000011761) #17	ENSNNAG00000011753	ENSNNAG00000011737	ENSNNAG00000011724	PKD1L2 (ENSNNAG00000011501) #20	GAN (ENSNNAG00000011360) #22	CMIP (ENSNNAG00000011311) #23	PLCG2 (ENSNNAG00000011138) #24	SLC12A4 (ENSNNAG00000011059)	DPEP2 (ENSNNAG00000010899)	ENSNNAG00000010849	DDX28 (ENSNNAG00000010315)	DUS2 (ENSNNAG00000010247)	NFATC3 (ENSNNAG00000010199)	ESRP2 (ENSNNAG00000010114)	ENSNNAG00000011995	PLA2G15 (ENSNNAG00000011953)	SMPD3 (ENSNNAG00000011920)	PRMT7 (ENSNNAG00000011831)	SLC7A6OS (ENSNNAG00000011789)	SLC7A6 (ENSNNAG00000011755)
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	82	ENSGT00940000161188.c.b	ENSGT00950000182964.a.b.b	ENSGT01100000263497.E.a.b	ENSGT00940000160900	ENSGT00940000159915	ENSGT00940000160231	ENSGT00940000159037	ENSGT00950000183171.A.b.a.b	ENSGT00940000160274	ENSGT00940000162661	ENSGT00390000014000	ENSGT00940000159993	ENSGT00940000158753	ENSGT00950000186377	ENSGT00510000047872	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000157672	ENSGT01030000235333	ENSGT00940000160211	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.b	ENSGT00940000161738	ENSGT00550000075019	ENSGT00940000156131.a.b	ENSGT00940000157187	ENSGT00950000182966.B	ENSGT00940000157499	ENSGT00400000022168.b	ENSGT00940000156879	ENSGT00390000015672
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000154593.b #12	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000157672	ENSGT01030000235333	ENSGT00940000160211	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.b	ENSGT00940000161738	ENSGT00550000075019	ENSGT00940000156131.a.b	ENSGT00940000157187	ENSGT00950000182966.B	ENSGT00940000157499	ENSGT00400000022168.b	ENSGT00940000156879	ENSGT00390000015672
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	67	NUDT7 (ENSPTXG00000006116) #9	VAT1L (ENSPTXG00000006115) #10	CLEC3A (ENSPTXG00000006113) #11	ENSPTXG00000006112	WWOX (ENSPTXG00000006111)	MAF (ENSPTXG00000006110) #13	DYNLRB2 (ENSPTXG00000006109) #14	CDYL2 (ENSPTXG00000006108) #15	CMC2 (ENSPTXG00000006106)	ENSPTXG00000006105	CENPN (ENSPTXG00000006104) #16	ATMIN (ENSPTXG00000006103) #17	ENSPTXG00000006102	GCSH (ENSPTXG00000006100) #19	PKD1L2 (ENSPTXG00000006096) #20	GAN (ENSPTXG00000006094) #22	CMIP (ENSPTXG00000006092) #23	PLCG2 (ENSPTXG00000006091) #24	SLC12A4 (ENSPTXG00000006090)	ENSPTXG00000006089	DPEP2 (ENSPTXG00000006087)	ENSPTXG00000006086	DDX28 (ENSPTXG00000006085)	DUS2 (ENSPTXG00000006052)	NFATC3 (ENSPTXG00000006051)	ESRP2 (ENSPTXG00000006050)	ENSPTXG00000006049	PLA2G15 (ENSPTXG00000006048)	SMPD3 (ENSPTXG00000006047)	PRMT7 (ENSPTXG00000006045)	SLC7A6OS (ENSPTXG00000006044)
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	41	ADAMTS18 (ENSNSUG00000010393) #8	NUDT7 (ENSNSUG00000010397) #9	VAT1L (ENSNSUG00000010399) #10	CLEC3A (ENSNSUG00000010400) #11	ENSNSUG00000010402 #12	WWOX (ENSNSUG00000010403)	MAF (ENSNSUG00000010404) #13	DYNLRB2 (ENSNSUG00000010408) #14	CDYL2 (ENSNSUG00000010409) #15	CMC2 (ENSNSUG00000010411)	CENPN (ENSNSUG00000010412) #16	ATMIN (ENSNSUG00000010415) #17	ENSNSUG00000010416	GCSH (ENSNSUG00000010417) #19	PKD1L2 (ENSNSUG00000010419) #20	GAN (ENSNSUG00000010426) #22	CMIP (ENSNSUG00000010432) #23	ENSNSUG00000010435	PLCG2 (ENSNSUG00000010437) #24	SLC12A4 (ENSNSUG00000010482)	ENSNSUG00000017961	ENSNSUG00000017962	DDX28 (ENSNSUG00000017963)	DUS2 (ENSNSUG00000017964)	NFATC3 (ENSNSUG00000017965)	ESRP2 (ENSNSUG00000017966)	ENSNSUG00000017970	PLA2G15 (ENSNSUG00000017971)	ENSNSUG00000017975	SLC12A3 (ENSNSUG00000017976)	NUP93 (ENSNSUG00000017977)
Blue-lipped sea krait	DUPLICATION
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	2142																GAN (ENSLLTG00000007805) #22
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	8369														ENSLLTG00000003589	LSM7 (ENSLLTG00000003634)	ENSLLTG00000003675 #22	ENSLLTG00000003709
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000157672	ENSGT00940000160211.a	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.b	ENSGT00940000161738	ENSGT00550000075019	ENSGT00940000156131.a.b	ENSGT00940000157187	ENSGT00950000182966.B	ENSGT00940000157499	ENSGT00400000022168.b	ENSGT00940000156879	ENSGT00390000015672	ENSGT00940000158295
Common wall lizard	MODERN SPECIES	16	VAT1L (ENSPMRG00000009558) #10	CLEC3A (ENSPMRG00000009550) #11	WWOX (ENSPMRG00000009541)	MAF (ENSPMRG00000009533) #13	ENSPMRG00000009527 #14	CDYL2 (ENSPMRG00000009518) #15	ENSPMRG00000009511	CENPN (ENSPMRG00000009503) #16	ATMIN (ENSPMRG00000009498) #17	ENSPMRG00000009494	ENSPMRG00000009488	ENSPMRG00000009483	GCSH (ENSPMRG00000009476) #19	PKD1L2 (ENSPMRG00000009431) #20	BCO1 (ENSPMRG00000009422) #21	GAN (ENSPMRG00000009402) #22	CMIP (ENSPMRG00000009390) #23	PLCG2 (ENSPMRG00000009303) #24	ENSPMRG00000009228	ENSPMRG00000009204	ENSPMRG00000009157	ENSPMRG00000009133	DDX28 (ENSPMRG00000009125)	DUS2 (ENSPMRG00000009109)	NFATC3 (ENSPMRG00000009098)	ESRP2 (ENSPMRG00000009073)	ENSPMRG00000009061	PLA2G15 (ENSPMRG00000009053)	ENSPMRG00000009042	SMPD3 (ENSPMRG00000009035)	ENSPMRG00000009028
Argentine black and white tegu	DUPLICATION
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	57	ADAMTS18 (ENSSMRG00000011269) #8	VAT1L (ENSSMRG00000011492) #10	WWOX (ENSSMRG00000011502)	ENSSMRG00000011503	MAF (ENSSMRG00000011520) #13	DYNLRB2 (ENSSMRG00000011551) #14	CDYL2 (ENSSMRG00000011552) #15	CMC2 (ENSSMRG00000011555)	CENPN (ENSSMRG00000011557) #16	ATMIN (ENSSMRG00000011558) #17	ENSSMRG00000011559	ENSSMRG00000011560	ENSSMRG00000011562	PKD1L2 (ENSSMRG00000011581) #20	BCO1 (ENSSMRG00000011589) #21	GAN (ENSSMRG00000011590) #22	CMIP (ENSSMRG00000011592) #23	PLCG2 (ENSSMRG00000011598) #24	SLC12A4 (ENSSMRG00000000008)	ENSSMRG00000000151	ENSSMRG00000000184	DDX28 (ENSSMRG00000000268)	DUS2 (ENSSMRG00000000287)	NFATC3 (ENSSMRG00000000337)	ESRP2 (ENSSMRG00000000355)	ENSSMRG00000000423	PLA2G15 (ENSSMRG00000000446)	SMPD3 (ENSSMRG00000000463)	PRMT7 (ENSSMRG00000000485)	SLC7A6OS (ENSSMRG00000000532)	SLC7A6 (ENSSMRG00000000545)
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	57																ENSSMRG00000004453 #22	CIAO2B (ENSSMRG00000004445)	MATCAP1 (ENSSMRG00000004439)	LCAT (ENSSMRG00000004438)	ENSSMRG00000004434	ENSSMRG00000004431	COG4 (ENSSMRG00000004408)	ATP6V0D1 (ENSSMRG00000004396)	HSD11B2 (ENSSMRG00000004395)	FHOD1 (ENSSMRG00000004393)	ENSSMRG00000004384	KCTD19 (ENSSMRG00000004358)	ENSSMRG00000004354	ST3GAL2 (ENSSMRG00000004351)	FCSK (ENSSMRG00000004082)	SF3B3 (ENSSMRG00000002475)
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT01060000249485	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00940000164357	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00940000166270	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000160275
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000164357	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00940000166270	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000160275
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	35	ADAMTS18 (ENSCPRG00005005562) #8	NUDT7 (ENSCPRG00005005600) #9	VAT1L (ENSCPRG00005005616) #10	CLEC3A (ENSCPRG00005005706) #11	WWOX (ENSCPRG00005005732)	ENSCPRG00005005777	MAF (ENSCPRG00005005799) #13	DYNLRB2 (ENSCPRG00005005821) #14	CDYL2 (ENSCPRG00005005831) #15	CMC2 (ENSCPRG00005005851)	ATMIN (ENSCPRG00005005860) #17	ENSCPRG00005005888	ENSCPRG00005005903	PKD1L2 (ENSCPRG00005005912) #20	BCO1 (ENSCPRG00005005937) #21	GAN (ENSCPRG00005005955) #22	CMIP (ENSCPRG00005005977) #23	PLCG2 (ENSCPRG00005006038) #24	SDR42E1 (ENSCPRG00005006053) #25	HSD17B2 (ENSCPRG00005006082) #26	ENSCPRG00005006255	ENSCPRG00005006261	ENSCPRG00005006265	MPHOSPH6 (ENSCPRG00005006275) #27	CDH13 (ENSCPRG00005006294) #28	MLYCD (ENSCPRG00005006313) #30	ENSCPRG00005006320	HSBP1 (ENSCPRG00005006321) #29	KCNG4 (ENSCPRG00005006329)	WFDC1 (ENSCPRG00005006344)	ATP2C2 (ENSCPRG00005006346)
Aves	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000164357	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087
Neognathae_b	DUPLICATION
Neognathae_b	DUPLICATION
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT01030000234669.A.e.a.a.a.a.a.a.a.c.a	ENSGT00940000153527.c.b.a.a.a.b.b	ENSGT00940000163073.e	ENSGT00940000159238.a	ENSGT00390000012434	ENSGT00940000158588	ENSGT00940000159972	ENSGT00530000063553.b.a	ENSGT00390000011943.b	ENSGT00940000160274	ENSGT00390000014000	ENSGT00940000155418.a.a	ENSGT00940000159993	ENSGT00940000158753	ENSGT00510000047872	ENSGT00940000155273.lb.a #22	ENSGT01030000234515.a.b.b.c
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	27				ENSGT00940000163073.e	ENSGT00940000164143.a	ENSGT00390000012434	ENSGT00940000158588	ENSGT00940000159972	ENSGT00530000063553.b.a	ENSGT00390000011943.b	ENSGT00940000160274	ENSGT00390000014000	ENSGT00940000159993	ENSGT00940000158753	ENSGT00510000047872	ENSGT00940000155273.lb.a #22	ENSGT01030000234515.a.b.b.c	ENSGT00940000158668.c.i.a.b	ENSGT00940000158995	ENSGT00940000163126	ENSGT00940000159478	ENSGT00940000161178	ENSGT00390000006553	ENSGT00910000144227.s.a	ENSGT00530000066804	ENSGT00940000164521	ENSGT00940000165063	ENSGT00940000160888	ENSGT00530000063460.B	ENSGT00940000164644	ENSGT00940000155528
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	28			ENSGT00940000154596.b.x.c.a.a	ENSGT00940000163073.e	ENSGT00940000164143.a	ENSGT00390000012434	ENSGT00940000158588	ENSGT00940000159972	ENSGT00530000063553.b.a	ENSGT00390000011943.b	ENSGT00940000160274	ENSGT00390000014000	ENSGT00940000159993	ENSGT00940000158753	ENSGT00510000047872	ENSGT00940000155273.lb.a #22	ENSGT01030000234515.a.b.b.c	ENSGT00940000158668.c.i.a.b	ENSGT00940000158995	ENSGT00940000163126	ENSGT00940000159478	ENSGT00940000161178	ENSGT00390000006553	ENSGT00530000066804	ENSGT00940000164521	ENSGT00940000165063	ENSGT00940000160888	ENSGT00530000063460.B	ENSGT00940000164644	ENSGT00940000155528	ENSGT00940000160775
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	29			ENSGT00940000154596.b.x.c.a.a	ENSGT00940000163073.e	ENSGT00940000164143.a	ENSGT00390000012434	ENSGT00940000158588	ENSGT00940000159972	ENSGT00530000063553.b.a	ENSGT00390000011943.b	ENSGT00940000160274	ENSGT00390000014000	ENSGT00940000159993	ENSGT00940000158753	ENSGT00510000047872	ENSGT00940000155273.lb.a #22	ENSGT01030000234515.a.b.b.c	ENSGT00940000158668.c.i.a.b	ENSGT00940000158995	ENSGT00940000163126	ENSGT00940000159478	ENSGT00940000161178	ENSGT00390000006553	ENSGT00530000066804	ENSGT00940000164521	ENSGT00940000165063	ENSGT00940000160888	ENSGT00530000063460.B	ENSGT00940000164644	ENSGT00940000155528	ENSGT00940000160775
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	29		ENSGT00940000154596.b.x.c.a.a	ENSGT00940000163073.e	ENSGT00940000164143.a	ENSGT00390000012434	ENSGT00940000158588	ENSGT00940000159972	ENSGT00530000063553.b.a	ENSGT00390000011943.b	ENSGT00940000160274	ENSGT00390000014000	ENSGT00940000159993	ENSGT00940000158753	ENSGT00510000047872	ENSGT00940000155273.lb.b #22	ENSGT00940000155273.lb.a #22	ENSGT01030000234515.a.b.b.c	ENSGT00940000158668.c.i.a.b	ENSGT00940000158995	ENSGT00940000163126	ENSGT00940000159478	ENSGT00940000161178	ENSGT00390000006553	ENSGT00530000066804	ENSGT00940000164521	ENSGT00940000165063	ENSGT00940000160888	ENSGT00530000063460.B	ENSGT00940000164644	ENSGT00940000155528	ENSGT00940000160775
Zebra finch	MODERN SPECIES	21	ENSTGUG00000016263	ENSTGUG00000000015	ENSTGUG00000029667	ENSTGUG00000000020	NDUFA11 (ENSTGUG00000026250)	ENSTGUG00000024287	RANBP3 (ENSTGUG00000000023)	SLC1A6 (ENSTGUG00000000032)	LONP1 (ENSTGUG00000000038)	RPL36 (ENSTGUG00000000049)	ENSTGUG00000022738	LMNB2 (ENSTGUG00000000051)	TIMM13 (ENSTGUG00000020964)	TMPRSS9 (ENSTGUG00000000057)	SPPL2B (ENSTGUG00000000063)	ENSTGUG00000025887 #22	ENSTGUG00000000068 #22	ENSTGUG00000000070	MARCHF2 (ENSTGUG00000000080)	ENSTGUG00000029625	ANGPTL4 (ENSTGUG00000000086)	KANK3 (ENSTGUG00000000089)	NDUFA7 (ENSTGUG00000018969)	ENSTGUG00000000098	ENSTGUG00000000100	ENSTGUG00000020421	POLE4 (ENSTGUG00000000102)	ENSTGUG00000019237	ENSTGUG00000000105	ELAVL1 (ENSTGUG00000000118)	MATK (ENSTGUG00000000123)
Common canary	MODERN SPECIES	44	ENSSCAG00000000220	ENSSCAG00000000237	ENSSCAG00000000245	NDUFA11 (ENSSCAG00000000256)	RANBP3 (ENSSCAG00000000274)	SLC1A6 (ENSSCAG00000000322)	LONP1 (ENSSCAG00000000414)	RPL36 (ENSSCAG00000000651)	LMNB2 (ENSSCAG00000000663)	TIMM13 (ENSSCAG00000000680)	ENSSCAG00000000685	ENSSCAG00000000694	ENSSCAG00000000706	SPPL2B (ENSSCAG00000000726)	LSM7 (ENSSCAG00000000739)	ENSSCAG00000000746 #22	ENSSCAG00000000751	CERS4 (ENSSCAG00000000761)	ENSSCAG00000000768	MARCHF2 (ENSSCAG00000000774)	ENSSCAG00000000780	ANGPTL4 (ENSSCAG00000000791)	KANK3 (ENSSCAG00000000806)	NDUFA7 (ENSSCAG00000000829)	ENSSCAG00000000837	ENSSCAG00000000842	ENSSCAG00000000847	ENSSCAG00000000860	ENSSCAG00000000890	ELAVL1 (ENSSCAG00000000962)	MATK (ENSSCAG00000000977)
Medium ground finch	MODERN SPECIES	144					ENSGFOG00000012682	ENSGFOG00000012679	NDUFA11 (ENSGFOG00000012672)	RANBP3 (ENSGFOG00000012662)	SLC1A6 (ENSGFOG00000012653)	LONP1 (ENSGFOG00000012543)	RPL36 (ENSGFOG00000012523)	LMNB2 (ENSGFOG00000012515)	TMPRSS9 (ENSGFOG00000012505)	SPPL2B (ENSGFOG00000012498)	ENSGFOG00000012497	ENSGFOG00000012495 #22	CERS4 (ENSGFOG00000012494)	ENSGFOG00000012491	ENSGFOG00000012490	MARCHF2 (ENSGFOG00000012488)	ENSGFOG00000012483	ANGPTL4 (ENSGFOG00000012478)	KANK3 (ENSGFOG00000012473)	ENSGFOG00000012467	ENSGFOG00000012463	ENSGFOG00000012457	ENSGFOG00000012450	ENSGFOG00000012426	ELAVL1 (ENSGFOG00000012421)	MATK (ENSGFOG00000012418)	ENSGFOG00000012415
Great tit	MODERN SPECIES	21				ENSPMJG00000004346	ENSPMJG00000004348	NDUFA11 (ENSPMJG00000004349)	RANBP3 (ENSPMJG00000004358)	SLC1A6 (ENSPMJG00000004370)	LONP1 (ENSPMJG00000004375)	RPL36 (ENSPMJG00000004382)	LMNB2 (ENSPMJG00000004383)	TIMM13 (ENSPMJG00000004388)	TMPRSS9 (ENSPMJG00000004393)	SPPL2B (ENSPMJG00000004404)	ENSPMJG00000004407 #22	ENSPMJG00000004411 #22	ENSPMJG00000004413	ENSPMJG00000004414	ENSPMJG00000004426	MARCHF2 (ENSPMJG00000004429)	ENSPMJG00000004446	ANGPTL4 (ENSPMJG00000004451)	KANK3 (ENSPMJG00000004465)	NDUFA7 (ENSPMJG00000004474)	ENSPMJG00000004478	RPS28 (ENSPMJG00000004504)	ENSPMJG00000004507	ENSPMJG00000004514	POLE4 (ENSPMJG00000004528)	ENSPMJG00000004531	ENSPMJG00000004552
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000153527.c.b.a.a.a.b.b	ENSGT00940000163073.e	ENSGT00940000159238.a	ENSGT00390000012434	ENSGT00940000158588	ENSGT00940000159972	ENSGT00530000063553.b.a	ENSGT00390000011943.b	ENSGT00940000160274	ENSGT00390000014000	ENSGT00940000159993.a	ENSGT00940000155418.a.a	ENSGT00940000159993.b	ENSGT00940000158753	ENSGT00510000047872	ENSGT00940000155273.lb.a #22	ENSGT01030000234515.a.b.b.c
Kakapo	MODERN SPECIES	13	CALR3 (ENSSHBG00005018541)	C19orf44 (ENSSHBG00005018538)	CHERP (ENSSHBG00005018536)	SLC35E1 (ENSSHBG00005018530)	MED26 (ENSSHBG00005018529)	TMEM38A (ENSSHBG00005018528)	ENSSHBG00005018526	SMIM7 (ENSSHBG00005018524)	SIN3B (ENSSHBG00005018521)	F2RL3 (ENSSHBG00005018516)	CPAMD8 (ENSSHBG00005018501)	HAUS8 (ENSSHBG00005018488)	MYO9B (ENSSHBG00005017297)	USE1 (ENSSHBG00005017255)	ENSSHBG00005017251	ENSSHBG00005017248 #22	LSM7 (ENSSHBG00005017245)	SPPL2B (ENSSHBG00005017241)	ENSSHBG00005017183	ENSSHBG00005017173	ENSSHBG00005017170	TIMM13 (ENSSHBG00005017163)	LMNB2 (ENSSHBG00005017159)	HNRNPM (ENSSHBG00005017146)	TIMM44 (ENSSHBG00005017134)	DUS3L (ENSSHBG00005017130)	ENSSHBG00005017126	ATCAY (ENSSHBG00005017123)	ENSSHBG00005017120	ENSSHBG00005017116	EEF2 (ENSSHBG00005017109)
Golden eagle	MODERN SPECIES	3	ENSACCG00020013668	ENSACCG00020013683	NDUFA11 (ENSACCG00020013705)	RANBP3 (ENSACCG00020013758)	SLC1A6 (ENSACCG00020013794)	LONP1 (ENSACCG00020013830)	ENSACCG00020013853	RPL36 (ENSACCG00020013872)	LMNB2 (ENSACCG00020013893)	TIMM13 (ENSACCG00020013930)	ENSACCG00020013947	ENSACCG00020014045	ENSACCG00020014235	SPPL2B (ENSACCG00020014307)	LSM7 (ENSACCG00020014318)	ENSACCG00020014334 #22	ENSACCG00020014349	RGS1 (ENSACCG00020014364)	RGS21 (ENSACCG00020014376)	RGS18 (ENSACCG00020014385)	RGS4 (ENSACCG00020014415)	RGS5 (ENSACCG00020014426)	HTATIP2 (ENSACCG00020014439)	ENSACCG00020014454	ENSACCG00020014486	ATF6 (ENSACCG00020014542)	OLFML2B (ENSACCG00020014565)	HSD17B7 (ENSACCG00020014578)	DDR2 (ENSACCG00020014598)	UAP1 (ENSACCG00020014625)	UHMK1 (ENSACCG00020014642)
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155273.lb.b #22
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155273.lb.b #22
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155273.lb.b #22
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155273.lb.b #22
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	29			ENSGT00940000154596.b.x.c.a.a	ENSGT00940000163073.e	ENSGT00940000164143.a	ENSGT00390000012434	ENSGT00940000158588	ENSGT00940000159972	ENSGT00530000063553.b.a	ENSGT00390000011943.b	ENSGT00940000160274	ENSGT00390000014000	ENSGT00940000159993	ENSGT00940000158753	ENSGT00510000047872	ENSGT00940000155273.lb.b #22	ENSGT00940000155273.lb.a #22	ENSGT01030000234515.a.b.b.c	ENSGT00940000158668.c.i.a.b	ENSGT00940000158995	ENSGT00940000163126	ENSGT00940000159478	ENSGT00940000161178	ENSGT00390000006553	ENSGT00530000066804	ENSGT00940000164521	ENSGT00940000165063	ENSGT00940000160888	ENSGT00530000063460.B	ENSGT00940000164644	ENSGT00940000155528
Zebra finch	MODERN SPECIES	21	ENSTGUG00000000015	ENSTGUG00000029667	ENSTGUG00000000020	NDUFA11 (ENSTGUG00000026250)	ENSTGUG00000024287	RANBP3 (ENSTGUG00000000023)	SLC1A6 (ENSTGUG00000000032)	LONP1 (ENSTGUG00000000038)	RPL36 (ENSTGUG00000000049)	ENSTGUG00000022738	LMNB2 (ENSTGUG00000000051)	TIMM13 (ENSTGUG00000020964)	TMPRSS9 (ENSTGUG00000000057)	SPPL2B (ENSTGUG00000000063)	ENSTGUG00000025887 #22	ENSTGUG00000000068 #22	ENSTGUG00000000070	MARCHF2 (ENSTGUG00000000080)	ENSTGUG00000029625	ANGPTL4 (ENSTGUG00000000086)	KANK3 (ENSTGUG00000000089)	NDUFA7 (ENSTGUG00000018969)	ENSTGUG00000000098	ENSTGUG00000000100	ENSTGUG00000020421	POLE4 (ENSTGUG00000000102)	ENSTGUG00000019237	ENSTGUG00000000105	ELAVL1 (ENSTGUG00000000118)	MATK (ENSTGUG00000000123)	ENSTGUG00000023054
Great tit	MODERN SPECIES	21					ENSPMJG00000004346	ENSPMJG00000004348	NDUFA11 (ENSPMJG00000004349)	RANBP3 (ENSPMJG00000004358)	SLC1A6 (ENSPMJG00000004370)	LONP1 (ENSPMJG00000004375)	RPL36 (ENSPMJG00000004382)	LMNB2 (ENSPMJG00000004383)	TIMM13 (ENSPMJG00000004388)	TMPRSS9 (ENSPMJG00000004393)	SPPL2B (ENSPMJG00000004404)	ENSPMJG00000004407 #22	ENSPMJG00000004411 #22	ENSPMJG00000004413	ENSPMJG00000004414	ENSPMJG00000004426	MARCHF2 (ENSPMJG00000004429)	ENSPMJG00000004446	ANGPTL4 (ENSPMJG00000004451)	KANK3 (ENSPMJG00000004465)	NDUFA7 (ENSPMJG00000004474)	ENSPMJG00000004478	RPS28 (ENSPMJG00000004504)	ENSPMJG00000004507	ENSPMJG00000004514	POLE4 (ENSPMJG00000004528)	ENSPMJG00000004531
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000165319	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273.mb #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087
Neognathae_c	DUPLICATION
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155273.mb.a #22
Golden eagle	MODERN SPECIES	25	ADAMTS18 (ENSACCG00020004303) #8	ENSACCG00020004275	NUDT7 (ENSACCG00020004265) #9	VAT1L (ENSACCG00020004257) #10	CLEC3A (ENSACCG00020004252) #11	WWOX (ENSACCG00020004239)	MAF (ENSACCG00020004213) #13	DYNLRB2 (ENSACCG00020004205) #14	CDYL2 (ENSACCG00020004193) #15	CMC2 (ENSACCG00020004182)	CENPN (ENSACCG00020004175) #16	ATMIN (ENSACCG00020004163) #17	ENSACCG00020004154	GCSH (ENSACCG00020004146) #19	PKD1L2 (ENSACCG00020004126) #20	ENSACCG00020004105 #22	ENSACCG00020004091 #22	CMIP (ENSACCG00020004071) #23	PLCG2 (ENSACCG00020003960) #24	SDR42E1 (ENSACCG00020003812) #25	HSD17B2 (ENSACCG00020003783) #26	ENSACCG00020003752	ENSACCG00020003741	ENSACCG00020003736	MPHOSPH6 (ENSACCG00020003725) #27	CDH13 (ENSACCG00020003709) #28	MLYCD (ENSACCG00020003692) #30	HSBP1 (ENSACCG00020003682) #29	KCNG4 (ENSACCG00020003669)	WFDC1 (ENSACCG00020003652)	ATP2C2 (ENSACCG00020003621)
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000165319	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273.mb.b #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087
Golden eagle	MODERN SPECIES	25	ENSACCG00020004275	NUDT7 (ENSACCG00020004265) #9	VAT1L (ENSACCG00020004257) #10	CLEC3A (ENSACCG00020004252) #11	WWOX (ENSACCG00020004239)	MAF (ENSACCG00020004213) #13	DYNLRB2 (ENSACCG00020004205) #14	CDYL2 (ENSACCG00020004193) #15	CMC2 (ENSACCG00020004182)	CENPN (ENSACCG00020004175) #16	ATMIN (ENSACCG00020004163) #17	ENSACCG00020004154	GCSH (ENSACCG00020004146) #19	PKD1L2 (ENSACCG00020004126) #20	ENSACCG00020004105 #22	ENSACCG00020004091 #22	CMIP (ENSACCG00020004071) #23	PLCG2 (ENSACCG00020003960) #24	SDR42E1 (ENSACCG00020003812) #25	HSD17B2 (ENSACCG00020003783) #26	ENSACCG00020003752	ENSACCG00020003741	ENSACCG00020003736	MPHOSPH6 (ENSACCG00020003725) #27	CDH13 (ENSACCG00020003709) #28	MLYCD (ENSACCG00020003692) #30	HSBP1 (ENSACCG00020003682) #29	KCNG4 (ENSACCG00020003669)	WFDC1 (ENSACCG00020003652)	ATP2C2 (ENSACCG00020003621)	MEAK7 (ENSACCG00020003585)
Kakapo	DUPLICATION
Kakapo	MODERN SPECIES	19	ENSSHBG00005010159	NUDT7 (ENSSHBG00005010142) #9	VAT1L (ENSSHBG00005010126) #10	CLEC3A (ENSSHBG00005010105) #11	WWOX (ENSSHBG00005010085)	ENSSHBG00005009983 #13	DYNLRB2 (ENSSHBG00005009960) #14	ENSSHBG00005009937 #15	CMC2 (ENSSHBG00005009923)	CENPN (ENSSHBG00005009907) #16	ENSSHBG00005009901 #17	ENSSHBG00005009897	GCSH (ENSSHBG00005000943) #19	PKD1L2 (ENSSHBG00005000921) #20	ENSSHBG00005000904 #21	ENSSHBG00005013352 #22	ENSSHBG00005013341 #23	PLCG2 (ENSSHBG00005012588) #24	SDR42E1 (ENSSHBG00005012498) #25	HSD17B2 (ENSSHBG00005012293) #26	ENSSHBG00005012234	ENSSHBG00005012218	ENSSHBG00005012207	MPHOSPH6 (ENSSHBG00005012198) #27	ENSSHBG00005012175 #28	MLYCD (ENSSHBG00005012147) #30	HSBP1 (ENSSHBG00005012133) #29	KCNG4 (ENSSHBG00005012125)	WFDC1 (ENSSHBG00005012110)	ATP2C2 (ENSSHBG00005012019)	MEAK7 (ENSSHBG00005011979)
Kakapo	MODERN SPECIES	4	ENSSHBG00005000308	ENSSHBG00005000309	ENSSHBG00005000312	ENSSHBG00005000314	ENSSHBG00005000317 #13	ENSSHBG00005000320	ENSSHBG00005000322 #15	ENSSHBG00005000324	ENSSHBG00005000326	ENSSHBG00005000328	ENSSHBG00005000330 #17	ENSSHBG00005000334	ENSSHBG00005000339	ENSSHBG00005000343 #21	ENSSHBG00005000344	ENSSHBG00005000347 #22	ENSSHBG00005000360 #23	ENSSHBG00005000369 #28	ENSSHBG00005000370	ENSSHBG00005000372	ENSSHBG00005000373	ENSSHBG00005000375	ENSSHBG00005000377	ENSSHBG00005000380	ENSSHBG00005000384	ENSSHBG00005000386	ENSSHBG00005000387	ENSSHBG00005000389	ENSSHBG00005000390	ENSSHBG00005000392	ENSSHBG00005000393
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a	ENSGT00390000001622	ENSGT00950000185219	ENSGT00950000182872.f.b.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00960000189518	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273.mb #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087
Great tit	MODERN SPECIES	2	CSNK2A2 (ENSPMJG00000014040)	GINS3 (ENSPMJG00000014038)	NDRG4 (ENSPMJG00000014035)	WWOX (ENSPMJG00000014034)	ENSPMJG00000014027	MAF (ENSPMJG00000014026) #13	ENSPMJG00000014018	CDYL2 (ENSPMJG00000014015) #15	CMC2 (ENSPMJG00000014012)	CENPN (ENSPMJG00000014005) #16	ATMIN (ENSPMJG00000014003) #17	PPP1R3E (ENSPMJG00000014002)	GCSH (ENSPMJG00000013998) #19	PKD1L2 (ENSPMJG00000013992) #20	BCO1 (ENSPMJG00000013991) #21	GAN (ENSPMJG00000013990) #22	CMIP (ENSPMJG00000013988) #23	PLCG2 (ENSPMJG00000013982) #24	SDR42E1 (ENSPMJG00000013981) #25	HSD17B2 (ENSPMJG00000013980) #26	ENSPMJG00000013978	ENSPMJG00000013977	ENSPMJG00000013976	MPHOSPH6 (ENSPMJG00000013975) #27	CDH13 (ENSPMJG00000013971) #28	MLYCD (ENSPMJG00000013963) #30	HSBP1 (ENSPMJG00000013962) #29	KCNG4 (ENSPMJG00000013958)	ENSPMJG00000013957	WFDC1 (ENSPMJG00000013956)	ATP2C2 (ENSPMJG00000013955)
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000001622	ENSGT00950000185219	ENSGT00950000182872.f.b.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00960000189518	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00940000161906	ENSGT00940000165999	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273.mb #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087
Flycatcher	MODERN SPECIES	2	CFAP20 (ENSFALG00000024771)	CSNK2A2 (ENSFALG00000006864)	ENSFALG00000006902	GINS3 (ENSFALG00000029037)	NDRG4 (ENSFALG00000006850)	ENSFALG00000006846	ENSFALG00000023580	MAF (ENSFALG00000006844) #13	ENSFALG00000006840 #15	CMC2 (ENSFALG00000026435)	ATMIN (ENSFALG00000006834) #17	CENPN (ENSFALG00000006835) #16	ENSFALG00000006829	PKD1L2 (ENSFALG00000006826) #20	BCO1 (ENSFALG00000006810) #21	GAN (ENSFALG00000006805) #22	CMIP (ENSFALG00000006794) #23	PLCG2 (ENSFALG00000006754) #24	SDR42E1 (ENSFALG00000023083) #25	HSD17B2 (ENSFALG00000006730) #26	ENSFALG00000014290	ENSFALG00000014286	ENSFALG00000014283	MPHOSPH6 (ENSFALG00000028959) #27	ENSFALG00000025591	CDH13 (ENSFALG00000006727) #28	ENSFALG00000006725 #30	ENSFALG00000026189 #29	KCNG4 (ENSFALG00000006721)	ENSFALG00000006716	ATP2C2 (ENSFALG00000006709)
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000001622	ENSGT00950000185219	ENSGT00950000182872.f.b.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00960000189518	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00940000161906	ENSGT00940000165999	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273.mb #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000001622	ENSGT00950000185219	ENSGT00950000182872.f.b.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00960000189518	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00940000161906	ENSGT00940000165999	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273.mb #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087
Zebra finch	MODERN SPECIES	2	CFAP20 (ENSTGUG00000004759)	CSNK2A2 (ENSTGUG00000004713)	GINS3 (ENSTGUG00000022921)	NDRG4 (ENSTGUG00000026031)	WWOX (ENSTGUG00000004614)	MAF (ENSTGUG00000004610) #13	ENSTGUG00000022634	CDYL2 (ENSTGUG00000004589) #15	CMC2 (ENSTGUG00000022858)	CENPN (ENSTGUG00000004579) #16	ATMIN (ENSTGUG00000004575) #17	PPP1R3E (ENSTGUG00000023284)	BCO1 (ENSTGUG00000004509) #21	GCSH (ENSTGUG00000004561) #19	PKD1L2 (ENSTGUG00000004529) #20	GAN (ENSTGUG00000004495) #22	CMIP (ENSTGUG00000004472) #23	PLCG2 (ENSTGUG00000004405) #24	SDR42E1 (ENSTGUG00000004400) #25	HSD17B2 (ENSTGUG00000004388) #26	nat4 (ENSTGUG00000004382)	nat2 (ENSTGUG00000004387)	ENSTGUG00000021722	MPHOSPH6 (ENSTGUG00000025891) #27	CDH13 (ENSTGUG00000004357) #28	MLYCD (ENSTGUG00000004352) #30	HSBP1 (ENSTGUG00000004346) #29	ENSTGUG00000028043	WFDC1 (ENSTGUG00000004342)	ENSTGUG00000004269	ENSTGUG00000021270
Common canary	MODERN SPECIES	14	CSNK2A2 (ENSSCAG00000006420)	GINS3 (ENSSCAG00000006492)	ENSSCAG00000006496	NDRG4 (ENSSCAG00000006499)	WWOX (ENSSCAG00000006512)	ENSSCAG00000006519	MAF (ENSSCAG00000006531) #13	ENSSCAG00000006546	CDYL2 (ENSSCAG00000006552) #15	CMC2 (ENSSCAG00000006557)	CENPN (ENSSCAG00000006563) #16	ATMIN (ENSSCAG00000006567) #17	ENSSCAG00000006569	PKD1L2 (ENSSCAG00000006577) #20	BCO1 (ENSSCAG00000006597) #21	GAN (ENSSCAG00000006604) #22	CMIP (ENSSCAG00000006615) #23	PLCG2 (ENSSCAG00000006629) #24	SDR42E1 (ENSSCAG00000006634) #25	HSD17B2 (ENSSCAG00000006639) #26	ENSSCAG00000006652	ENSSCAG00000006658	ENSSCAG00000006660	MPHOSPH6 (ENSSCAG00000006662) #27	CDH13 (ENSSCAG00000006672) #28	MLYCD (ENSSCAG00000006674) #30	HSBP1 (ENSSCAG00000006677) #29	KCNG4 (ENSSCAG00000006680)	WFDC1 (ENSSCAG00000006682)	ATP2C2 (ENSSCAG00000006685)	MEAK7 (ENSSCAG00000006700)
Medium ground finch	MODERN SPECIES	206													ENSGFOG00000009223	PKD1L2 (ENSGFOG00000009194) #20	BCO1 (ENSGFOG00000009178) #21	GAN (ENSGFOG00000009162) #22	CMIP (ENSGFOG00000009119) #23	PLCG2 (ENSGFOG00000009096) #24	SDR42E1 (ENSGFOG00000009090) #25	HSD17B2 (ENSGFOG00000009084) #26	ENSGFOG00000009078	ENSGFOG00000009076	MPHOSPH6 (ENSGFOG00000009071) #27	CDH13 (ENSGFOG00000009065) #28
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00390000017224	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087
Duck	DUPLICATION
Duck	MODERN SPECIES	3	CLEC3A (ENSAPLG00000022572) #11	WWOX (ENSAPLG00000009300)	ENSAPLG00000026540	MAF (ENSAPLG00000019538) #13	DYNLRB2 (ENSAPLG00000009314) #14	CDYL2 (ENSAPLG00000009316) #15	CMC2 (ENSAPLG00000009535)	CENPN (ENSAPLG00000009538) #16	ATMIN (ENSAPLG00000009633) #17	ENSAPLG00000027134	PPP1R3E (ENSAPLG00000020132)	GCSH (ENSAPLG00000021043) #19	ENSAPLG00000017829	ENSAPLG00000016688 #20	BCO1 (ENSAPLG00000010038) #21	GAN (ENSAPLG00000010354) #22	CMIP (ENSAPLG00000010524) #23	PLCG2 (ENSAPLG00000010652) #24	SDR42E1 (ENSAPLG00000001581) #25	HSD17B2 (ENSAPLG00000001835) #26	ENSAPLG00000002080	ENSAPLG00000002085	ENSAPLG00000002088	MPHOSPH6 (ENSAPLG00000018311) #27	CDH13 (ENSAPLG00000002525) #28	MLYCD (ENSAPLG00000021334) #30	HSBP1 (ENSAPLG00000028761) #29	WFDC1 (ENSAPLG00000013371)	KCNG4 (ENSAPLG00000013390)	ATP2C2 (ENSAPLG00000012448)	MEAK7 (ENSAPLG00000012412)
Duck	MODERN SPECIES	20	MARCHF2 (ENSAPLG00000010859)	ENSAPLG00000009418	ENSAPLG00000025050	ENSAPLG00000024808	ENSAPLG00000009942	NDUFA11 (ENSAPLG00000010040)	RANBP3 (ENSAPLG00000010044)	SLC1A6 (ENSAPLG00000010390)	LONP1 (ENSAPLG00000010693)	RPL36 (ENSAPLG00000018797)	LMNB2 (ENSAPLG00000011044)	TIMM13 (ENSAPLG00000016799)	TMPRSS9 (ENSAPLG00000011476)	SPPL2B (ENSAPLG00000011803)	LSM7 (ENSAPLG00000020930)	ENSAPLG00000029055 #22	ENSAPLG00000022757	ENSAPLG00000012475	FBN3 (ENSAPLG00000007523)	CTXN1 (ENSAPLG00000001242)	TIMM44 (ENSAPLG00000009557)	HNRNPM (ENSAPLG00000010149)	ENSAPLG00000024763	EEF2 (ENSAPLG00000010503)	PIAS4 (ENSAPLG00000010840)	SH3GL1 (ENSAPLG00000002520)	CHAF1A (ENSAPLG00000008289)	ENSAPLG00000007778	ENSAPLG00000022793	TNFAIP8L1 (ENSAPLG00000013525)	DPP9 (ENSAPLG00000013927)
Pink-footed goose	DUPLICATION
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	28	ENSABRG00000010910	NUDT7 (ENSABRG00000010920) #9	VAT1L (ENSABRG00000010924) #10	CLEC3A (ENSABRG00000010932) #11	WWOX (ENSABRG00000010937)	MAF (ENSABRG00000010950) #13	DYNLRB2 (ENSABRG00000010978) #14	CDYL2 (ENSABRG00000011016) #15	CMC2 (ENSABRG00000011023)	CENPN (ENSABRG00000011037) #16	ATMIN (ENSABRG00000011044) #17	ENSABRG00000011053	PPP1R3E (ENSABRG00000011069)	PKD1L2 (ENSABRG00000011097) #20	BCO1 (ENSABRG00000011129) #21	GAN (ENSABRG00000011136) #22
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	273	ENSABRG00000005917	ENSABRG00000005926	ENSABRG00000005931	ENSABRG00000005933	ENSABRG00000005934	RANBP3 (ENSABRG00000005938)	ENSABRG00000005945	SLC1A6 (ENSABRG00000005963)	LONP1 (ENSABRG00000005996)	RPL36 (ENSABRG00000006017)	LMNB2 (ENSABRG00000006047)	TIMM13 (ENSABRG00000006070)	TMPRSS9 (ENSABRG00000006083)	SPPL2B (ENSABRG00000006093)	LSM7 (ENSABRG00000006108)	ENSABRG00000006111 #22
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000165319	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087
Japanese quail	DUPLICATION
Japanese quail	MODERN SPECIES	2	NUDT7 (ENSCJPG00005014681) #9	VAT1L (ENSCJPG00005014682) #10	CLEC3A (ENSCJPG00005014683) #11	WWOX (ENSCJPG00005014684)	ENSCJPG00005014685	MAF (ENSCJPG00005014686) #13	DYNLRB2 (ENSCJPG00005014691) #14	CDYL2 (ENSCJPG00005014692) #15	ENSCJPG00005014693	CENPN (ENSCJPG00005014694) #16	ATMIN (ENSCJPG00005014695) #17	PPP1R3E (ENSCJPG00005014696)	ENSCJPG00005014697	PKD1L2 (ENSCJPG00005014698) #20	BCO1 (ENSCJPG00005014699) #21	GAN (ENSCJPG00005014700) #22	CMIP (ENSCJPG00005014701) #23	PLCG2 (ENSCJPG00005014704) #24	SDR42E1 (ENSCJPG00005014705) #25	HSD17B2 (ENSCJPG00005014706) #26	ENSCJPG00005014708	ENSCJPG00005014709	ENSCJPG00005014710	MPHOSPH6 (ENSCJPG00005014711) #27	CDH13 (ENSCJPG00005014715) #28	MLYCD (ENSCJPG00005014717) #30	HSBP1 (ENSCJPG00005014719) #29	KCNG4 (ENSCJPG00005014720)	WFDC1 (ENSCJPG00005014721)	ATP2C2 (ENSCJPG00005014722)	MEAK7 (ENSCJPG00005014723)
Japanese quail	MODERN SPECIES	20	ENSCJPG00005006119	ENSCJPG00005006114	ENSCJPG00005006111	ENSCJPG00005006106	ENSCJPG00005006105	RANBP3 (ENSCJPG00005006096)	SLC1A6 (ENSCJPG00005006091)	LONP1 (ENSCJPG00005006078)	ENSCJPG00005006077	LMNB2 (ENSCJPG00005006076)	TIMM13 (ENSCJPG00005006075)	TMPRSS9 (ENSCJPG00005006072)	KANK3 (ENSCJPG00005006068)	SPPL2B (ENSCJPG00005006065)	LSM7 (ENSCJPG00005006063)	ENSCJPG00005006062 #22	ENSCJPG00005006061	HNRNPM (ENSCJPG00005006060)	TIMM44 (ENSCJPG00005006059)	CTXN1 (ENSCJPG00005006058)	FBN3 (ENSCJPG00005005593)	ENSCJPG00005005576
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000165319	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087
Turkey	MODERN SPECIES	4	ENSMGAG00000022335	ENSMGAG00000000941	ENSMGAG00000022160	ENSMGAG00000018466	ENSMGAG00000000917	ENSMGAG00000000918	TRADD (ENSMGAG00000018981)	ENSMGAG00000000909	ENSMGAG00000000886	ENSMGAG00000000906	HSDL1 (ENSMGAG00000000871) #35	ENSMGAG00000000862 #32	ENSMGAG00000000801 #33	MBTPS1 (ENSMGAG00000000805) #34	OSGIN1 (ENSMGAG00000000787) #31	GAN (ENSMGAG00000006826) #22	ENSMGAG00000006759 #20	ENSMGAG00000006799 #21	ATMIN (ENSMGAG00000006738) #17	ENSMGAG00000006868 #15	ENSMGAG00000006719	ENSMGAG00000006725 #16	DYNLRB2 (ENSMGAG00000006708) #14	ENSMGAG00000018698 #13	ENSMGAG00000006687	ENSMGAG00000019485 #12	ENSMGAG00000006683 #11	ENSMGAG00000006649 #10	ENSMGAG00000019886 #9	ENSMGAG00000006670	ENSMGAG00000020260 #8
Chicken	DUPLICATION
Chicken	MODERN SPECIES	2	ENSGALG00010007735	NUDT7 (ENSGALG00010007765) #9	VAT1L (ENSGALG00010007767) #10	CLEC3A (ENSGALG00010007772) #11	WWOX (ENSGALG00010007789)	MAF (ENSGALG00010007800) #13	DYNLRB2 (ENSGALG00010007806) #14	CDYL2 (ENSGALG00010007817) #15	CMC2 (ENSGALG00010007847)	CENPN (ENSGALG00010007859) #16	ATMIN (ENSGALG00010007862) #17	PPP1R3E (ENSGALG00010009779)	GCSH (ENSGALG00010007869) #19	PKD1L2 (ENSGALG00010007876) #20	BCO1 (ENSGALG00010007880) #21	GAN (ENSGALG00010007324) #22	CMIP (ENSGALG00010007374) #23	PLCG2 (ENSGALG00010007393) #24	SDR42E1 (ENSGALG00010007403) #25	HSD17B2 (ENSGALG00010007439) #26	NAT (ENSGALG00010007432)	PNAT3 (ENSGALG00010007436)	PNAT10 (ENSGALG00010007465)	MPHOSPH6 (ENSGALG00010007500) #27	CDH13 (ENSGALG00010007529) #28	MLYCD (ENSGALG00010007544) #30	HSBP1 (ENSGALG00010007548) #29	KCNG4 (ENSGALG00010007585)	WFDC1 (ENSGALG00010007577)	ATP2C2 (ENSGALG00010007595)	TLDC1 (ENSGALG00010007610)
Chicken	MODERN SPECIES	20	ENSGALG00010027738	BTN1A1 (ENSGALG00010027725)	ENSGALG00010027718	ENSGALG00010027713	ENSGALG00010027710	ENSGALG00010027708	RANBP3 (ENSGALG00010027668)	SLC1A6 (ENSGALG00010027636)	LONP1 (ENSGALG00010027614)	RPL36 (ENSGALG00010027609)	LMNB2 (ENSGALG00010028375)	TIMM13 (ENSGALG00010028368)	TMPRSS9 (ENSGALG00010028362)	SPPL2C (ENSGALG00010028357)	LSM7 (ENSGALG00010028344)	ENSGALG00010028337 #22	ENSGALG00010028333	HNRNPM (ENSGALG00010028328)	TIMM44 (ENSGALG00010028316)	ENSGALG00010028311	FBN3 (ENSGALG00010028301)	ENSGALG00010028747	ENSGALG00010028292	ENSGALG00010028297	ENSGALG00010028283	ENSGALG00010028259	ENSGALG00010028253	MVP (ENSGALG00010028247)	ENSGALG00010028242
African ostrich	DUPLICATION
African ostrich	MODERN SPECIES	889							ENSSCUG00000012792	ENSSCUG00000012791	CDYL2 (ENSSCUG00000012787) #15	CENPN (ENSSCUG00000012783) #16	ATMIN (ENSSCUG00000012782) #17	ENSSCUG00000012781	ENSSCUG00000012779	PKD1L2 (ENSSCUG00000012773) #20	BCO1 (ENSSCUG00000012767) #21	GAN (ENSSCUG00000012766) #22	CMIP (ENSSCUG00000012759) #23	PLCG2 (ENSSCUG00000012749) #24	SDR42E1 (ENSSCUG00000012746) #25	HSD17B2 (ENSSCUG00000012744) #26	ENSSCUG00000012742	ENSSCUG00000012740	ENSSCUG00000012738	MPHOSPH6 (ENSSCUG00000012736) #27	CDH13 (ENSSCUG00000012728) #28	MLYCD (ENSSCUG00000012723) #30	HSBP1 (ENSSCUG00000012718) #29	KCNG4 (ENSSCUG00000012714)	WFDC1 (ENSSCUG00000012710)	ATP2C2 (ENSSCUG00000012678)	MEAK7 (ENSSCUG00000012668)
African ostrich	MODERN SPECIES	203														ENSSCUG00000002410	ENSSCUG00000002407	ENSSCUG00000002404 #22	ENSSCUG00000002402	ENSSCUG00000002395	FBN3 (ENSSCUG00000002355)	CTXN1 (ENSSCUG00000002291)	TIMM44 (ENSSCUG00000002285)	HNRNPM (ENSSCUG00000002277)	MARCHF2 (ENSSCUG00000002272)
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000161681	ENSGT00390000007438	ENSGT00710000106790	ENSGT00940000159567	ENSGT00940000162200	ENSGT00940000157841	ENSGT00390000012708	ENSGT00390000014634	ENSGT00390000001141	ENSGT00940000162546	ENSGT00940000160062	ENSGT00940000164357	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498
Chinese turtle	MODERN SPECIES	1051						DYNLRB2 (ENSPSIG00000003887) #14	ENSPSIG00000003882 #15	ENSPSIG00000003880 #15	CMC2 (ENSPSIG00000003876)	CENPN (ENSPSIG00000003873) #16	ATMIN (ENSPSIG00000003868) #17	C16orf46 (ENSPSIG00000003864)	ENSPSIG00000003859	PKD1L2 (ENSPSIG00000003740) #20	BCO1 (ENSPSIG00000003698) #21	GAN (ENSPSIG00000003693) #22	CMIP (ENSPSIG00000003580) #23	PLCG2 (ENSPSIG00000003341) #24	SDR42E1 (ENSPSIG00000003337) #25	HSD17B2 (ENSPSIG00000003303) #26	ENSPSIG00000001107	ENSPSIG00000003301	ENSPSIG00000001091	MPHOSPH6 (ENSPSIG00000018195) #27	CDH13 (ENSPSIG00000018164) #28
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000158278	ENSGT00940000161681	ENSGT00390000007438	ENSGT00710000106790.q	ENSGT00940000159567	ENSGT00940000162200	ENSGT00940000157841	ENSGT00390000012708	ENSGT00390000014634	ENSGT00390000001141	ENSGT00940000162546	ENSGT00940000160062.e	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006293.od #29	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000167286	ENSGT00940000154805.b.g	ENSGT00950000183008.a.a.b	ENSGT00940000154606	ENSGT00940000161906	ENSGT00950000182893.a.b	ENSGT00740000115581.e	ENSGT00940000158278	ENSGT00940000161681	ENSGT00710000106790.q	ENSGT00940000159567	ENSGT00940000157841	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006293.od #29	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	2769						CDYL2 (ENSCABG00000021598) #15	ENSCABG00000021596	ENSCABG00000021594	CENPN (ENSCABG00000021591) #16	ATMIN (ENSCABG00000021588) #17	C16orf46 (ENSCABG00000021586)	ENSCABG00000021581	ENSCABG00000021578	PKD1L2 (ENSCABG00000021574) #20	BCO1 (ENSCABG00000021570) #21	GAN (ENSCABG00000021567) #22
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	3	VAT1L (ENSGEVG00005015682) #10	CLEC3A (ENSGEVG00005015758) #11	WWOX (ENSGEVG00005015800)	ENSGEVG00005015858	MAF (ENSGEVG00005015870) #13	DYNLRB2 (ENSGEVG00005015907) #14	CDYL2 (ENSGEVG00005015928) #15	ENSGEVG00005015990	CENPN (ENSGEVG00005016003) #16	ATMIN (ENSGEVG00005016050) #17	C16orf46 (ENSGEVG00005016069)	PPP1R3E (ENSGEVG00005016079)	GCSH (ENSGEVG00005016103) #19	PKD1L2 (ENSGEVG00005016151) #20	BCO1 (ENSGEVG00005016447) #21	GAN (ENSGEVG00005016541) #22	CMIP (ENSGEVG00005016563) #23	ENSGEVG00005016596	PLCG2 (ENSGEVG00005016632) #24	SDR42E1 (ENSGEVG00005016717) #25	HSD17B2 (ENSGEVG00005016732) #26	ENSGEVG00005016762	ENSGEVG00005016789	ENSGEVG00005016819	MPHOSPH6 (ENSGEVG00005016869) #27	CDH13 (ENSGEVG00005016890) #28	MLYCD (ENSGEVG00005016971) #30	HSBP1 (ENSGEVG00005016989) #29	KCNG4 (ENSGEVG00005017003)	WFDC1 (ENSGEVG00005017047)	ATP2C2 (ENSGEVG00005017125)
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00940000161681	ENSGT00390000007438	ENSGT00710000106790.q	ENSGT00940000159567	ENSGT00940000162200	ENSGT00940000157841	ENSGT00390000012708	ENSGT00390000014634	ENSGT00390000001141	ENSGT00940000162546	ENSGT00940000160062.e	ENSGT00940000164357	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158070 #25	ENSGT00940000160204 #26	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212 #27	ENSGT00940000155218.B #28	ENSGT00390000005410 #30	ENSGT00390000006293.pd #29	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299.i	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498
painted turtle	MODERN SPECIES	708						DYNLRB2 (ENSCPBG00000000123) #14	CDYL2 (ENSCPBG00000024003) #15	CMC2 (ENSCPBG00000023998)	CENPN (ENSCPBG00000023991) #16	ATMIN (ENSCPBG00000023988) #17	ENSCPBG00000023985	ENSCPBG00000023980	ENSCPBG00000023978	PKD1L2 (ENSCPBG00000023969) #20	BCO1 (ENSCPBG00000023964) #21	GAN (ENSCPBG00000023962) #22	CMIP (ENSCPBG00000023954) #23	PLCG2 (ENSCPBG00000023944) #24	SDR42E1 (ENSCPBG00000023938) #25	HSD17B2 (ENSCPBG00000023906) #26	ENSCPBG00000023901	ENSCPBG00000023899	MPHOSPH6 (ENSCPBG00000023898) #27	CDH13 (ENSCPBG00000023893) #28	MLYCD (ENSCPBG00000023890) #30	HSBP1 (ENSCPBG00000023888) #29	KCNG4 (ENSCPBG00000023886)	WFDC1 (ENSCPBG00000023882)	ATP2C2 (ENSCPBG00000023713)	MEAK7 (ENSCPBG00000023628)	COTL1 (ENSCPBG00000023626)
Three-toed box turtle	DUPLICATION
Three-toed box turtle	DUPLICATION
Three-toed box turtle	DUPLICATION
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	2272	ENSTMTG00000013265 #11	ENSTMTG00000013288	ENSTMTG00000013305 #13	ENSTMTG00000013316 #14	ENSTMTG00000013328 #15	ENSTMTG00000013345	ENSTMTG00000013358 #16	ENSTMTG00000013372 #17	ENSTMTG00000013394	ENSTMTG00000013402	ENSTMTG00000013410	ENSTMTG00000013421 #20	ENSTMTG00000013433	ENSTMTG00000013451 #21	ENSTMTG00000013501 #22	ENSTMTG00000013515 #22	ENSTMTG00000013546 #23	ENSTMTG00000013651 #24	ENSTMTG00000014269 #25	ENSTMTG00000014279 #26	ENSTMTG00000014298	ENSTMTG00000014313	ENSTMTG00000014328 #27	ENSTMTG00000014339 #28	ENSTMTG00000014386 #30	ENSTMTG00000014461 #29	ENSTMTG00000014476	ENSTMTG00000014519	ENSTMTG00000014538	ENSTMTG00000014607	ENSTMTG00000014623
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	2272	ENSTMTG00000013228 #10	ENSTMTG00000013265 #11	ENSTMTG00000013288	ENSTMTG00000013305 #13	ENSTMTG00000013316 #14	ENSTMTG00000013328 #15	ENSTMTG00000013345	ENSTMTG00000013358 #16	ENSTMTG00000013372 #17	ENSTMTG00000013394	ENSTMTG00000013402	ENSTMTG00000013410	ENSTMTG00000013421 #20	ENSTMTG00000013433	ENSTMTG00000013451 #21	ENSTMTG00000013501 #22	ENSTMTG00000013515 #22	ENSTMTG00000013546 #23	ENSTMTG00000013651 #24	ENSTMTG00000014269 #25	ENSTMTG00000014279 #26	ENSTMTG00000014298	ENSTMTG00000014313	ENSTMTG00000014328 #27	ENSTMTG00000014339 #28	ENSTMTG00000014386 #30	ENSTMTG00000014461 #29	ENSTMTG00000014476	ENSTMTG00000014519	ENSTMTG00000014538	ENSTMTG00000014607
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	2267	ENSTMTG00000010854 #11	ENSTMTG00000010880	ENSTMTG00000010888	ENSTMTG00000010903	ENSTMTG00000010911	ENSTMTG00000010922 #13	ENSTMTG00000010934 #14	ENSTMTG00000010946 #15	ENSTMTG00000010976	ENSTMTG00000010997 #16	ENSTMTG00000011034 #17	ENSTMTG00000011045	ENSTMTG00000011081	ENSTMTG00000011104	ENSTMTG00000011124 #21	ENSTMTG00000011150 #22	ENSTMTG00000011182 #23	ENSTMTG00000011289 #24	ENSTMTG00000012327 #25	ENSTMTG00000012335 #26	ENSTMTG00000012349	ENSTMTG00000012366	ENSTMTG00000012392 #27	ENSTMTG00000012415 #28	ENSTMTG00000012475 #30	ENSTMTG00000012535 #29	ENSTMTG00000012560	ENSTMTG00000012630	ENSTMTG00000012651	ENSTMTG00000012723	ENSTMTG00000012740
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	323	ENSTMTG00000020964	ENSTMTG00000020957	RANBP3 (ENSTMTG00000020948)	ENSTMTG00000020942	SLC1A6 (ENSTMTG00000020930)	LONP1 (ENSTMTG00000020921)	RPL36 (ENSTMTG00000020915)	LMNB2 (ENSTMTG00000020896)	ENSTMTG00000020881	ENSTMTG00000020871	ENSTMTG00000020844	ENSTMTG00000020835	ENSTMTG00000020824	ENSTMTG00000020807	ENSTMTG00000020800	ENSTMTG00000020795 #22	ENSTMTG00000020643	ENSTMTG00000020619	FBN3 (ENSTMTG00000019349)	CTXN1 (ENSTMTG00000019144)	TIMM44 (ENSTMTG00000019096)	HNRNPM (ENSTMTG00000018939)	MARCHF2 (ENSTMTG00000018916)	ENSTMTG00000018897	ANGPTL4 (ENSTMTG00000018884)	ENSTMTG00000018856	ENSTMTG00000018843	NDUFA7 (ENSTMTG00000018834)	ENSTMTG00000018828	ENSTMTG00000018819	ENSTMTG00000018804
Anura	ANCESTRAL SPECIES	59	ENSGT00940000157553 #8	ENSGT00940000159631 #9	ENSGT00940000159184 #10	ENSGT00950000183186.B.a #11	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531 #13	ENSGT00390000011067.B #14	ENSGT00940000159646 #15	ENSGT00390000016908	ENSGT00390000004738 #16	ENSGT00390000013091 #17	ENSGT01000000220627	ENSGT00390000011666 #19	ENSGT00940000161577 #20	ENSGT00950000182913.A.b.b #21	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23
Frog	MODERN SPECIES	4	vat1l (ENSXETG00000012696) #10	clec3a (ENSXETG00000012694) #11	wwox (ENSXETG00000012689)	maf (ENSXETG00000000172) #13	dynlrb2 (ENSXETG00000024765) #14	cdyl2 (ENSXETG00000032985) #15	cmc2 (ENSXETG00000039714)	cenpn (ENSXETG00000000170) #16	atmin (ENSXETG00000000183) #17	ENSXETG00000036204	cdk10 (ENSXETG00000000185)	XB5887600 [provisional:cry1] (ENSXETG00000034974)	gcsh (ENSXETG00000047032) #19	pkd1l2 (ENSXETG00000032436) #20	bco1 (ENSXETG00000036664) #21	gan (ENSXETG00000018044) #22	ENSXETG00000046692	cmip (ENSXETG00000031832) #23	dnaaf1 (ENSXETG00000033921) #36	ENSXETG00000032337	ENSXETG00000040094	ENSXETG00000020037	hsf4 (ENSXETG00000030007)	fbxl8 (ENSXETG00000033251)	tradd (ENSXETG00000031794)	pdcd2l (ENSXETG00000020032)	b3gnt9 (ENSXETG00000042041)	phaf1 (ENSXETG00000031430)	cbfb (ENSXETG00000020027)	ENSXETG00000042792	gnao1 (ENSXETG00000020022)
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	1	CDT1 (ENSLLEG00000010745)	APRT (ENSLLEG00000010959)	GALNS (ENSLLEG00000011328)	TRAPPC2L (ENSLLEG00000012102)	PABPN1L (ENSLLEG00000012152)	CBFA2T3 (ENSLLEG00000012214)	ACSF3 (ENSLLEG00000012437)	CDH15 (ENSLLEG00000012694)	SLC22A31 (ENSLLEG00000012833)	ATMIN (ENSLLEG00000013064) #17	ENSLLEG00000013129	ENSLLEG00000013205	ENSLLEG00000013223	PKD1L2 (ENSLLEG00000013267) #20	BCO1 (ENSLLEG00000013530) #21	GAN (ENSLLEG00000013717) #22	CMIP (ENSLLEG00000014012) #23	ENSLLEG00000015284	ENSLLEG00000015328	HSDL1 (ENSLLEG00000015384) #35	ENSLLEG00000015567	ENSLLEG00000015888	ENSLLEG00000015974	ENSLLEG00000016045	ENSLLEG00000016065	ENSLLEG00000016178	ENSLLEG00000016261	ENSLLEG00000016341	BBS2 (ENSLLEG00000016420)	OGFOD1 (ENSLLEG00000016920)	NUDT21 (ENSLLEG00000017159)
Coelacanth	MODERN SPECIES	1860																GAN (ENSLACG00000009288) #22	ENSLACG00000008740	ENSLACG00000004942
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	288								ENSGT00940000161659	ENSGT00940000158995.a	ENSGT00940000163126	ENSGT00940000154595	ENSGT00390000000051	ENSGT00940000154412.C	ENSGT00950000183158.B.a.a	ENSGT00510000047872	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00940000165840	ENSGT00950000183158.B.b	ENSGT01030000234515.a.b.b	ENSGT00940000163715.b
Reedfish	MODERN SPECIES	17	banp (ENSECRG00000007281)	ENSECRG00000007404	kcng4a (ENSECRG00000007411)	ENSECRG00000007425	hsbp1a (ENSECRG00000007437) #29	ENSECRG00000007449	mlycd (ENSECRG00000007466) #30	CDH13 (ENSECRG00000007483) #28	mphosph6 (ENSECRG00000011341) #27	zgc:101040 (ENSECRG00000011378)	HSD17B2 (ENSECRG00000011401) #26	sdr42e1 (ENSECRG00000011435) #25	kiaa0513 (ENSECRG00000011475)	foxl1 (ENSECRG00000011508)	FOXC2 (ENSECRG00000011518)	GAN (ENSECRG00000011548) #22	CMIP (ENSECRG00000011662) #23	plcg2 (ENSECRG00000011694) #24	ATP2C2 (ENSECRG00000011749)	meak7 (ENSECRG00000011794)	cotl1 (ENSECRG00000011806)	klhl36 (ENSECRG00000011819)	ENSECRG00000011950	tat (ENSECRG00000011982)	ENSECRG00000012029	ano10b (ENSECRG00000012084)	ldhd (ENSECRG00000012109)	necap1 (ENSECRG00000012128)	ENSECRG00000012141	ENSECRG00000012194	ENSECRG00000012287
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000156938	ENSGT00940000164450.b	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00400000025006	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00390000010938	ENSGT00940000166375	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00530000065415	ENSGT00390000011116	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000156704	ENSGT00940000159150	ENSGT00940000166411	ENSGT00390000018698	ENSGT00940000157319	ENSGT00950000182863.A.a.a	ENSGT00390000003058.b.a.b	ENSGT00390000007852	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000015057
Spotted gar	DUPLICATION
Spotted gar	MODERN SPECIES	662	wfdc1 (ENSLOCG00000002319)	utp4 (ENSLOCG00000002332)	chtf8 (ENSLOCG00000002367)	has3 (ENSLOCG00000002379)	TANGO6 (ENSLOCG00000002394)	ENSLOCG00000002428	zc3h18 (ENSLOCG00000002443)	trhr2 (ENSLOCG00000002461)	zfpm1 (ENSLOCG00000002480)	ENSLOCG00000017589	banp (ENSLOCG00000002495)	ENSLOCG00000002519	kiaa0513 (ENSLOCG00000002529)	FOXC2 (ENSLOCG00000002557)	FOXL1 (ENSLOCG00000002568)	GAN (ENSLOCG00000002584) #22	CMIP (ENSLOCG00000002603) #23	plcg2 (ENSLOCG00000002618) #24	ATP2C2 (ENSLOCG00000002689)	meak7 (ENSLOCG00000002721)	cotl1 (ENSLOCG00000002734)	klhl36 (ENSLOCG00000002761)	tat (ENSLOCG00000002775)	nqo1 (ENSLOCG00000002794)	zgc:56622 (ENSLOCG00000002811)	pdf (ENSLOCG00000002834)	vps4a (ENSLOCG00000002848)	SNTB2 (ENSLOCG00000002866)	spire2 (ENSLOCG00000002891)	FANCA (ENSLOCG00000002909)	znf276 (ENSLOCG00000002928)
Spotted gar	MODERN SPECIES	657	ncln (ENSLOCG00000004061)	s1pr4 (ENSLOCG00000017630)	ENSLOCG00000004092	mfsd14a2 (ENSLOCG00000004101)	MYO9B (ENSLOCG00000004111)	use1 (ENSLOCG00000004161)	insrb (ENSLOCG00000004179)	ENSLOCG00000004244	enc3 (ENSLOCG00000017631)	ENSLOCG00000004259	ENSLOCG00000004281	timm13 (ENSLOCG00000004301)	TMPRSS9 (ENSLOCG00000004321)	sppl2 (ENSLOCG00000004334)	lsm7 (ENSLOCG00000004356)	ENSLOCG00000004375 #22	cers4a (ENSLOCG00000004390)	fbn2b (ENSLOCG00000004413)	CTXN1 (ENSLOCG00000017632)	timm44 (ENSLOCG00000004442)	hnrnpm (ENSLOCG00000004456)	marchf2 (ENSLOCG00000004473)	rab11ba (ENSLOCG00000004490)	ENSLOCG00000004508	PIP5K1C (ENSLOCG00000004517)	tjp3 (ENSLOCG00000004553)	ARHGAP45 (ENSLOCG00000004582)	polr2eb (ENSLOCG00000004599)	gpx4b (ENSLOCG00000004616)	sbno2a (ENSLOCG00000004643)	tm6sf2a (ENSLOCG00000004678)
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156938.f	ENSGT00940000156938.e	ENSGT00940000164450.b	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00400000025006	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00390000010938	ENSGT00940000166375	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT00390000018698	ENSGT01030000234925	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT00960000187029	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852	ENSGT00950000182808.b.b
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000002381.b	ENSGT00940000156938.f	ENSGT00940000164450.b	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00400000025006	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00390000010938	ENSGT00940000166375	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248783	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000235114	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852	ENSGT00950000182808.b.b
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000002381.b	ENSGT00940000156938.f	ENSGT00940000164450.b	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00400000025006	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00390000010938	ENSGT00940000166375	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248783	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000235114	ENSGT00390000015057
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	218																ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00940000165840	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248783	ENSGT00390000009077.d	ENSGT00390000001014.ab	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00730000111591.a	ENSGT00530000064743.b	ENSGT00550000074976.p.a	ENSGT01060000248794	ENSGT00940000159260.g	ENSGT00940000156019.c.a	ENSGT00940000155209.lb.e	ENSGT00620000087961.a.b.b	ENSGT00620000087961.b	ENSGT00940000158437	ENSGT00940000158203	ENSGT00940000156681	ENSGT01030000234595.B.c.b	ENSGT00940000154983.c.a	ENSGT00390000010221.z	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248783	ENSGT00390000009077.d	ENSGT00390000001014.ab	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154649.B.r	ENSGT00940000154649.B.q.a	ENSGT00940000157903
Channel catfish	MODERN SPECIES	23	si:dkey-5i3.5 (ENSIPUG00000007140)	ENSIPUG00000007127	rbm28 (ENSIPUG00000007103)	lepa (ENSIPUG00000007085)	LRRC4 (ENSIPUG00000007065)	HGF (ENSIPUG00000007029)	CACNA2D1 (ENSIPUG00000006897)	ENSIPUG00000006873	ENSIPUG00000006863	sema3e (ENSIPUG00000006750)	sema3ab (ENSIPUG00000006565)	sema3d (ENSIPUG00000006546)	grm3 (ENSIPUG00000006501)	elapor2a (ENSIPUG00000006479)	tmem243a (ENSIPUG00000006469)	gan (ENSIPUG00000006434) #22	cmip (ENSIPUG00000006302) #23	PLCG2 (ENSIPUG00000006196) #24	tldc1 (ENSIPUG00000006165)	COTL1 (ENSIPUG00000006136)	klhl36 (ENSIPUG00000006104)	zgc:56622 (ENSIPUG00000006082)	tat (ENSIPUG00000006050)	ENSIPUG00000006039	pak1 (ENSIPUG00000006002)	aqp11 (ENSIPUG00000005985)	clns1a (ENSIPUG00000005935)	RSF1 (ENSIPUG00000005914)	aamdc (ENSIPUG00000005882)	ints4 (ENSIPUG00000005782)	KCTD14 (ENSIPUG00000005769)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000154156.c.a	ENSGT00730000111591.a	ENSGT00530000064743.b	ENSGT00550000074976.p.a	ENSGT01060000248794	ENSGT00940000159260.g	ENSGT00940000156019.c.a	ENSGT00940000155209.lb.e	ENSGT00620000087961.a.b.b	ENSGT00940000158437	ENSGT00940000158203	ENSGT00940000156681	ENSGT01030000234595.B.c.b	ENSGT00940000154983.c.a	ENSGT00390000010221.z	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248783	ENSGT00390000009077.d	ENSGT00390000001014.ab	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154649.B.r	ENSGT00940000154649.B.q.a	ENSGT00940000157903
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00730000111591.a	ENSGT00530000064743.b	ENSGT00550000074976.p.a	ENSGT01060000248794	ENSGT00940000159260.g	ENSGT00940000156019.c.a	ENSGT00940000155209.lb.e	ENSGT00620000087961.a.b.b	ENSGT00620000087961.b	ENSGT00940000158437	ENSGT00940000158203	ENSGT00940000156681	ENSGT01030000234595.B.c.b	ENSGT00940000154983.c.a	ENSGT00390000010221.z	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248783	ENSGT00390000009077.d	ENSGT00390000001014.ab	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154649.B.r	ENSGT00940000154649.B.q.a	ENSGT00940000157903
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES		ENSPNAG00000022805	si:dkey-5i3.5 (ENSPNAG00000006690)	ENSPNAG00000022784	lepa (ENSPNAG00000022774)	lrrc4.2 (ENSPNAG00000022766)	ENSPNAG00000022756	HGF (ENSPNAG00000022744)	CACNA2D1 (ENSPNAG00000022699)	ENSPNAG00000022307	sema3e (ENSPNAG00000022177)	sema3ab (ENSPNAG00000022153)	sema3d (ENSPNAG00000022045)	grm3 (ENSPNAG00000022025)	elapor2a (ENSPNAG00000021987)	tmem243a (ENSPNAG00000021941)	GAN (ENSPNAG00000021919) #22	ENSPNAG00000021875	plcg2 (ENSPNAG00000021807) #24	meak7 (ENSPNAG00000021693)	cotl1 (ENSPNAG00000021674)	klhl36 (ENSPNAG00000021652)	zgc:56622 (ENSPNAG00000021612)	zgc:56622 (ENSPNAG00000021532)	zgc:56622 (ENSPNAG00000021493)	tat (ENSPNAG00000021482)	ENSPNAG00000021407	zgc:112052 (ENSPNAG00000021400)	UQCRFS1 (ENSPNAG00000021391)	rxylt1 (ENSPNAG00000021376)	SRGAP1 (ENSPNAG00000021355)	parp12a (ENSPNAG00000021230)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	9	ENSAMXG00000037345	ENSAMXG00000031862	lrrc4.2 (ENSAMXG00000026014)	HGF (ENSAMXG00000000786)	CACNA2D1 (ENSAMXG00000000816)	ENSAMXG00000043068	ENSAMXG00000041188	ENSAMXG00000042090	ENSAMXG00000038870	sema3e (ENSAMXG00000000874)	sema3ab (ENSAMXG00000000900)	sema3d (ENSAMXG00000000931)	grm3 (ENSAMXG00000000948)	elapor2a (ENSAMXG00000000958)	tmem243a (ENSAMXG00000038671)	GAN (ENSAMXG00000000968) #22	CMIP (ENSAMXG00000000971) #23	plcg2 (ENSAMXG00000000982) #24	meak7 (ENSAMXG00000000989)	cotl1 (ENSAMXG00000041084)	klhl36 (ENSAMXG00000000993)	zgc:56622 (ENSAMXG00000030151)	tat (ENSAMXG00000001000)	ENSAMXG00000037272	UQCRFS1 (ENSAMXG00000041728)	zgc:112052 (ENSAMXG00000036620)	rxylt1 (ENSAMXG00000001005)	SRGAP1 (ENSAMXG00000001013)	parp12a (ENSAMXG00000043787)	parp12a (ENSAMXG00000001021)	tbxas1 (ENSAMXG00000001025)
Electric eel	MODERN SPECIES	139		impdh1a (ENSEEEG00000010302)	ENSEEEG00000010303	si:dkey-5i3.5 (ENSEEEG00000010304)	rbm28 (ENSEEEG00000010306)	lepa (ENSEEEG00000010309)	lrrc4.2 (ENSEEEG00000010312)	HGF (ENSEEEG00000010313)	CACNA2D1 (ENSEEEG00000010316)	ENSEEEG00000010325	sema3e (ENSEEEG00000010379)	sema3ab (ENSEEEG00000010396)	sema3d (ENSEEEG00000010497)	grm3 (ENSEEEG00000010500)	elapor2a (ENSEEEG00000010504)	GAN (ENSEEEG00000010506) #22	CMIP (ENSEEEG00000010510) #23	plcg2 (ENSEEEG00000010526) #24	meak7 (ENSEEEG00000010921)	cotl1 (ENSEEEG00000010923)	klhl36 (ENSEEEG00000010925)	zgc:56622 (ENSEEEG00000010926)	tat (ENSEEEG00000010929)	ENSEEEG00000010931	zgc:112052 (ENSEEEG00000010933)	rxylt1 (ENSEEEG00000010935)	SRGAP1 (ENSEEEG00000010941)	parp12a (ENSEEEG00000010952)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	96	ENSGT01050000244806.b.a.b.c.a.a.b.b	ENSGT01050000244806.b.a.b.c.a.a.a.a.a.b.b.a.a	ENSGT01050000244887.B	ENSGT00500000044945.a	ENSGT01030000234515.b	ENSGT00390000003488.a.b.a	ENSGT00390000000777	ENSGT00940000154779.a.a.d	ENSGT00940000165007.b	ENSGT00940000158364.b	ENSGT00940000162148	ENSGT00940000160775	ENSGT00940000163917.a.a	ENSGT00730000111147	ENSGT00390000002505	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT01030000234515.a.b.b.a	ENSGT00950000183158.A.a	ENSGT00940000154412.C.d	ENSGT00390000000051.a	ENSGT00940000163706	ENSGT00390000008296.a	ENSGT00940000159248	ENSGT01100000263531.G.r.a.a	ENSGT00940000179034	ENSGT00940000153617.A.a.a	ENSGT01030000234559.a.a.a	ENSGT00390000003420.b	ENSGT00940000165115.a	ENSGT01040000240444.A.b.a.b.i.b	ENSGT01040000240444.A.b.a.b.i.a
Zebrafish	MODERN SPECIES	9	PRMT8 (ENSDARG00000040633)	CRACR2A (ENSDARG00000068231)	TMTC2 (ENSDARG00000035273)	ENSDARG00000093811	slc23a4 (ENSDARG00000052497)	BICD1 (ENSDARG00000079496)	fgd4a (ENSDARG00000101471)	nup205 (ENSDARG00000042530)	fam107b (ENSDARG00000026865)	ENSDARG00000063361	hipk2 (ENSDARG00000042518)	tbxas1 (ENSDARG00000002249)	parp12a (ENSDARG00000042496)	SRGAP1 (ENSDARG00000007461)	rxylt1 (ENSDARG00000063414)	GAN (ENSDARG00000100875) #22	C7H19orf12 (ENSDARG00000058857)	tat (ENSDARG00000069630)	zgc:56622 (ENSDARG00000099728)	klhl36 (ENSDARG00000030251)	cotl1 (ENSDARG00000026829)	plcg2 (ENSDARG00000068763) #24	meak7 (ENSDARG00000062951)	ENSDARG00000092862 #24	CMIP (ENSDARG00000062933) #23	CDH13 (ENSDARG00000014215) #28	mlycd (ENSDARG00000104732) #30	ENSDARG00000004529	hsbp1b (ENSDARG00000041921) #29	ENSDARG00000062964	kcng4a (ENSDARG00000062967)
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	49	ENSGT00950000183051.b.b.d	ENSGT00390000002362.q	ENSGT00390000018698.e	ENSGT00530000063956.b.a.b	ENSGT01030000235114.b	ENSGT00390000015057.g	ENSGT00940000153533.b.b	ENSGT00390000014299.g	ENSGT00940000164450.b.a	ENSGT00940000156938.f.a	ENSGT00390000002381.b.b	ENSGT00390000006293.n.b.b #29	ENSGT00940000166270.d	ENSGT00390000005410.c #30	ENSGT00940000155218.B.m #28	ENSGT00940000155273.e.a #22	ENSGT00390000018220.g #23	ENSGT00940000157517.i.a.a #24	ENSGT00940000158087.j	ENSGT00390000012498.b	ENSGT00940000157543.j	ENSGT00940000156704.e	ENSGT01060000248783.a.a	ENSGT00390000009077.d.d	ENSGT00390000001014.ab.b	ENSGT00390000003526.i	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000154649.B.t	ENSGT00940000157903.p	ENSGT00940000157742.b.a	ENSGT00530000063472.b.a.d
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00950000183051.b.b.d	ENSGT00390000002362.q	ENSGT00390000018698.e	ENSGT00530000063956.b.a.b	ENSGT01030000235114.b	ENSGT00390000015057.g	ENSGT00940000153533.b.b	ENSGT00390000014299.g	ENSGT00940000164450.b.a	ENSGT00940000156938.f.a	ENSGT00390000002381.b.b	ENSGT00390000006293.n.b.b #29	ENSGT00940000166270.d	ENSGT00390000005410.c #30	ENSGT00940000155218.B.m #28	ENSGT00940000155273.e.a #22	ENSGT00390000018220.g #23	ENSGT00940000157517.i.a.a #24	ENSGT00940000158087.j	ENSGT00390000012498.b	ENSGT00940000157543.j	ENSGT00940000156704.e	ENSGT01060000248783.a.a	ENSGT00390000009077.d.d	ENSGT00390000001014.ab.b	ENSGT00390000003526.i	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000154649.B.t	ENSGT00940000157903.p	ENSGT00940000157742.b.a	ENSGT00530000063472.b.a.d
Common carp reference	MODERN SPECIES	19	mtss1la (ENSCCRG00000065446)	ENSCCRG00000060225	uri1 (ENSCCRG00000079026)	si:dkey-238o13.4 (ENSCCRG00000060620)	ENSCCRG00000077464	vps9d1 (ENSCCRG00000017871)	utp4 (ENSCCRG00000017768)	wfdc1 (ENSCCRG00000017763)	ENSCCRG00000011764	kcng4a (ENSCCRG00000055874)	ENSCCRG00000011757	hsbp1b (ENSCCRG00000011750) #29	ENSCCRG00000010744	mlycd (ENSCCRG00000055883) #30	ENSCCRG00000011783 #28	ENSCCRG00000012578 #22	ENSCCRG00000013153 #23	COTL1 (ENSCCRG00000073190)	plcg2 (ENSCCRG00000036344) #24	meak7 (ENSCCRG00000036322)	klhl36 (ENSCCRG00000060551)	tat (ENSCCRG00000022064)	ENSCCRG00000060503	zgc:112052 (ENSCCRG00000070658)	ENSCCRG00000054465	ENSCCRG00000009344	ENSCCRG00000076944	parp12a (ENSCCRG00000023959)	tbxas1 (ENSCCRG00000053498)	hipk2 (ENSCCRG00000002774)	ENSCCRG00000023975
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	698																GAN (ENSSGRG00000013981) #22	CMIP (ENSSGRG00000013987) #23	plcg2 (ENSSGRG00000014005) #24	meak7 (ENSSGRG00000014208)	cotl1 (ENSSGRG00000014210)	klhl36 (ENSSGRG00000014211)	zgc:56622 (ENSSGRG00000014212)	tat (ENSSGRG00000014220)	zgc:112052 (ENSSGRG00000014870)	UQCRFS1 (ENSSGRG00000014871)	rxylt1 (ENSSGRG00000014873)	SRGAP1 (ENSSGRG00000014902)	ENSSGRG00000016721	parp12a (ENSSGRG00000016722)	tbxas1 (ENSSGRG00000016723)
Goldfish	MODERN SPECIES	9	uri1 (ENSCARG00000003315)	pdf (ENSCARG00000003310)	ENSCARG00000003305	si:dkey-238o13.4 (ENSCARG00000003299)	vps9d1 (ENSCARG00000003279)	utp4 (ENSCARG00000003247)	wfdc1 (ENSCARG00000003234)	ENSCARG00000003224	kcng4a (ENSCARG00000003216)	ENSCARG00000003212	ENSCARG00000003206	hsbp1b (ENSCARG00000003196) #29	ENSCARG00000003030	mlycd (ENSCARG00000002988) #30	CDH13 (ENSCARG00000002900) #28	GAN (ENSCARG00000002843) #22	CMIP (ENSCARG00000002515) #23	plcg2 (ENSCARG00000002418) #24	meak7 (ENSCARG00000002355)	cotl1 (ENSCARG00000002341)	klhl36 (ENSCARG00000002326)	tat (ENSCARG00000002075)	ENSCARG00000002015	ENSCARG00000001998	zgc:112052 (ENSCARG00000001988)	UQCRFS1 (ENSCARG00000019476)	rxylt1 (ENSCARG00000019461)	ENSCARG00000019454	SRGAP1 (ENSCARG00000018400)	parp12a (ENSCARG00000018278)	tbxas1 (ENSCARG00000016708)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	371																ENSGT00940000155273.e.b #22	ENSGT00390000018220.h #23	ENSGT00940000157517.i.b #24	ENSGT00940000157517.i.a.b #24	ENSGT00940000158087.i	ENSGT00390000012498.a	ENSGT00940000157543.i	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704.f	ENSGT01060000248783.a.b	ENSGT00390000009077.d.c	ENSGT00390000001014.ab.a	ENSGT00390000003526.j	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154649.B.s	ENSGT00940000157903.o
Goldfish	MODERN SPECIES	37	arntl2 (ENSCARG00000039202)	si:ch211-245j22.3 (ENSCARG00000039167)	ppfibp1b (ENSCARG00000038782)	rfx4 (ENSCARG00000038580)	ric8b (ENSCARG00000038471)	ENSCARG00000038443	tmem263 (ENSCARG00000038431)	si:ch73-62b13.1 (ENSCARG00000038422)	mterf2 (ENSCARG00000038411)	zgc:153031 (ENSCARG00000038381)	cry1b (ENSCARG00000038306)	ABTB3 (ENSCARG00000037451)	mlc1 (ENSCARG00000037214)	panx2 (ENSCARG00000037126)	trabd (ENSCARG00000037099)	GAN (ENSCARG00000037011) #22	CMIP (ENSCARG00000036708) #23	ENSCARG00000036521 #24	plcg2 (ENSCARG00000036396) #24	meak7 (ENSCARG00000036367)	cotl1 (ENSCARG00000036354)	klhl36 (ENSCARG00000036341)	zgc:56622 (ENSCARG00000036307)	tat (ENSCARG00000036296)	ENSCARG00000036289	zgc:112052 (ENSCARG00000036284)	UQCRFS1 (ENSCARG00000036279)	rxylt1 (ENSCARG00000036270)	SRGAP1 (ENSCARG00000026412)	parp12a (ENSCARG00000026234)	tbxas1 (ENSCARG00000024586)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	337																ENSGT00940000155273.e.b #22	ENSGT00390000018220.h #23	ENSGT00940000157517.i.b #24	ENSGT00940000157517.i.a.b #24	ENSGT00940000158087.i	ENSGT00390000012498.a	ENSGT00940000157543.i	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704.f	ENSGT01060000248783.a.b	ENSGT00390000009077.d.c	ENSGT00390000001014.ab.a	ENSGT00390000003526.j	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154649.B.s	ENSGT00940000157903.o
Common carp reference	MODERN SPECIES	9	ENSCCRG00000002909	si:dkey-238o13.4 (ENSCCRG00000076860)	vps9d1 (ENSCCRG00000002930)	wfdc1 (ENSCCRG00000003102)	utp4 (ENSCCRG00000003012)	ENSCCRG00000059741	ENSCCRG00000071277	kcng4a (ENSCCRG00000071413)	ENSCCRG00000076308	ENSCCRG00000069488	ENSCCRG00000057858	hsbp1b (ENSCCRG00000080166) #29	ENSCCRG00000025982	mlycd (ENSCCRG00000059019) #30	ENSCCRG00000010604 #28	ENSCCRG00000010594 #22	ENSCCRG00000010492 #23	ENSCCRG00000010460 #24	plcg2 (ENSCCRG00000025028) #24	cotl1 (ENSCCRG00000056927)	klhl36 (ENSCCRG00000002713)	zgc:56622 (ENSCCRG00000082219)	tat (ENSCCRG00000009152)	ENSCCRG00000009297	zgc:112052 (ENSCCRG00000009301)	ENSCCRG00000073141	ENSCCRG00000022730	parp12a (ENSCCRG00000023927)	tbxas1 (ENSCCRG00000023933)	hipk2 (ENSCCRG00000000664)	ENSCCRG00000023982
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	87																GAN (ENSSGRG00000031733) #22	CMIP (ENSSGRG00000031735) #23	ENSSGRG00000031750 #24	plcg2 (ENSSGRG00000031752) #24	meak7 (ENSSGRG00000031758)	cotl1 (ENSSGRG00000031759)	klhl36 (ENSSGRG00000031760)	tat (ENSSGRG00000031765)	ENSSGRG00000032237	zgc:112052 (ENSSGRG00000032238)	UQCRFS1 (ENSSGRG00000032239)	rxylt1 (ENSSGRG00000032240)	SRGAP1 (ENSSGRG00000032241)	parp12a (ENSSGRG00000032579)	tbxas1 (ENSSGRG00000032617)	hipk2 (ENSSGRG00000032873)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155273.f #22
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	1127																ENSGT00940000155273.f #22	ENSGT01030000234515.a.b.b.a.b
Common carp reference	MODERN SPECIES	43	loxl5a (ENSCCRG00000032114)	mibp (ENSCCRG00000032098)	ENSCCRG00000032130	ENSCCRG00000032140	rx1 (ENSCCRG00000074717)	ENSCCRG00000032149	cherp (ENSCCRG00000039932)	ENSCCRG00000039920	ENSCCRG00000071901	ENSCCRG00000081960	ENSCCRG00000000659	ENSCCRG00000029714	ENSCCRG00000036744	ENSCCRG00000037260	ENSCCRG00000001187	ENSCCRG00000075148 #22	cers4a (ENSCCRG00000018102)	ENSCCRG00000064275	ENSCCRG00000071406	ENSCCRG00000074014	fbn2b (ENSCCRG00000016415)	timm44 (ENSCCRG00000048065)	ticam1 (ENSCCRG00000048082)	uhrf1 (ENSCCRG00000048086)	kdm4b (ENSCCRG00000048245)	ENSCCRG00000078533	ENSCCRG00000066939	ENSCCRG00000079558	ENSCCRG00000012380	ENSCCRG00000030978	ENSCCRG00000056764
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	71	ENSGT00940000156938.f	ENSGT00940000164450.b	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00400000025006	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00390000010938	ENSGT00940000166375	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00940000163421.a.c	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248783	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT00960000187029	ENSGT00390000015057
Denticle herring	MODERN SPECIES	8	pgghg (ENSDCDG00000027534)	cpt1b (ENSDCDG00000027010)	ENSDCDG00000026986	wfdc1 (ENSDCDG00000026983)	utp4 (ENSDCDG00000026978)	chtf8 (ENSDCDG00000026971)	has3 (ENSDCDG00000026968)	TANGO6 (ENSDCDG00000026964)	ENSDCDG00000026961	zc3h18 (ENSDCDG00000026957)	trhr2 (ENSDCDG00000026865)	zfpm1 (ENSDCDG00000026856)	ENSDCDG00000026854	ENSDCDG00000026852	kiaa0513 (ENSDCDG00000026843)	GAN (ENSDCDG00000026838) #22	CMIP (ENSDCDG00000026368) #23	plcg2 (ENSDCDG00000026188) #24	meak7 (ENSDCDG00000026175)	cotl1 (ENSDCDG00000026172)	klhl36 (ENSDCDG00000026171)	zgc:56622 (ENSDCDG00000025964)	tat (ENSDCDG00000024570)	ENSDCDG00000024547	pdf (ENSDCDG00000024538)	ENSDCDG00000024528	ENSDCDG00000024519	vps9d1 (ENSDCDG00000024505)	tbc1d15 (ENSDCDG00000023274)	tph2 (ENSDCDG00000022814)	ENSDCDG00000022801
Atlantic herring	DUPLICATION
Atlantic herring	MODERN SPECIES	19	FBXO31 (ENSCHAG00000020194)	ENSCHAG00000020499	fanci (ENSCHAG00000020519)	POLG (ENSCHAG00000021087)	rhcgb (ENSCHAG00000021162)	ENSCHAG00000021421	gdpgp1 (ENSCHAG00000021439)	ENSCHAG00000021457	zc3h18 (ENSCHAG00000021492)	trhr2 (ENSCHAG00000021504)	zfpm1 (ENSCHAG00000021509)	ces3 (ENSCHAG00000021517)	ENSCHAG00000021576	kiaa0513 (ENSCHAG00000021629)	foxl1 (ENSCHAG00000021864)	GAN (ENSCHAG00000021880) #22	CMIP (ENSCHAG00000022024) #23	ENSCHAG00000022596 #24	meak7 (ENSCHAG00000022817)	plcg2 (ENSCHAG00000022861) #24	cotl1 (ENSCHAG00000022902)	klhl36 (ENSCHAG00000022913)	zgc:56622 (ENSCHAG00000022930)	tat (ENSCHAG00000022985)	ENSCHAG00000023373	pdf (ENSCHAG00000023378)	ENSCHAG00000000628	ENSCHAG00000000677	vps9d1 (ENSCHAG00000001186)	tbc1d15 (ENSCHAG00000002137)	tph2 (ENSCHAG00000006084)
Atlantic herring	MODERN SPECIES	1	mibp (ENSCHAG00000004457)	loxl5a (ENSCHAG00000004515)	mydgf (ENSCHAG00000004580)	tnfaip8l1 (ENSCHAG00000004596)	CERS1 (ENSCHAG00000004630)	ncln (ENSCHAG00000004644)	s1pr4 (ENSCHAG00000004854)	MYO9B (ENSCHAG00000004904)	use1 (ENSCHAG00000005482)	insrb (ENSCHAG00000005950)	ARHGEF18 (ENSCHAG00000016034)	enc3 (ENSCHAG00000016176)	timm13 (ENSCHAG00000016192)	ENSCHAG00000016219	lsm7 (ENSCHAG00000016232)	ENSCHAG00000016253 #22	cers4a (ENSCHAG00000016263)	fbn2b (ENSCHAG00000016353)	CTXN1 (ENSCHAG00000019520)	timm44 (ENSCHAG00000020190)	hnrnpm (ENSCHAG00000019546)	ENSCHAG00000020582	marchf2 (ENSCHAG00000020646)	ENSCHAG00000020666	ENSCHAG00000020682	zgc:194221 (ENSCHAG00000020720)	C1QTNF7 (ENSCHAG00000020734)	CC2D2A (ENSCHAG00000020750)	fbxl5 (ENSCHAG00000021161)	CPEB2 (ENSCHAG00000021191)	ndnf (ENSCHAG00000021283)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000002381.b	ENSGT00940000156938.f	ENSGT00940000164450.b	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00400000025006	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00390000010938	ENSGT00940000166375	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248783	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000235114	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852	ENSGT00950000182808.b.b
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00390000002381.b.d	ENSGT00940000156938.f	ENSGT00940000164450.b	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00400000025006	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00390000010938	ENSGT00940000166375	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248783	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000235114	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852	ENSGT00950000182808.b.b
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000006293.s.a #29	ENSGT00390000002381.b.d.a.b	ENSGT00940000156938.f.c	ENSGT00940000164450.b	ENSGT00390000014299.f	ENSGT00940000153533.b.d	ENSGT00400000025006.c	ENSGT00390000010337.B.a.a.k	ENSGT00390000010938	ENSGT00940000166375	ENSGT00730000111190.e	ENSGT01100000263484.B.a.b	ENSGT00530000063823.b.a.h	ENSGT00940000166187	ENSGT00940000162251.i	ENSGT00940000155273.i.a #22	ENSGT00390000018220.f #23	ENSGT00940000157517.m.b #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498.d	ENSGT00940000157543.fb.a	ENSGT00940000156704.c	ENSGT00390000018698.c	ENSGT01030000235114.d	ENSGT00390000015057.a	ENSGT00390000007852	ENSGT00950000182808.b.b.d	ENSGT00950000182832.D.a.l	ENSGT00940000157319.v	ENSGT00950000182863.A.a.a.p	ENSGT00390000003058.b.a.b.j.a
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000006293.s.a #29	ENSGT00390000002381.b.d.a.b	ENSGT00940000156938.f.c	ENSGT00940000164450.b	ENSGT00390000014299.f	ENSGT00940000153533.b.d	ENSGT00400000025006.c	ENSGT00390000010337.B.a.a.k	ENSGT00390000010938	ENSGT00940000166375.g.b	ENSGT00730000111190.e	ENSGT01100000263484.B.a.b	ENSGT00530000063823.b.a.h	ENSGT00940000166187	ENSGT00940000162251.i	ENSGT00940000155273.i.a #22	ENSGT00390000018220.f #23	ENSGT00940000157517.m.b #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498.d	ENSGT00940000157543.fb.a	ENSGT00940000156704.c	ENSGT00390000018698.c	ENSGT01030000235114.d	ENSGT00390000015057.a	ENSGT00390000007852	ENSGT00950000182808.b.b.d	ENSGT00950000182832.D.a.l	ENSGT00940000157319.v	ENSGT00950000182863.A.a.a.p	ENSGT00390000003058.b.a.b.j.a
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00390000006293.s.a #29	ENSGT00390000002381.b.d.a.b	ENSGT00940000156938.f.c	ENSGT00940000164450.b	ENSGT00390000014299.f	ENSGT00940000153533.b.d	ENSGT00400000025006.c	ENSGT00390000010337.B.a.a.k	ENSGT00390000010938	ENSGT00940000166375.g.b	ENSGT00730000111190.e	ENSGT01100000263484.B.a.b	ENSGT00530000063823.b.a.h	ENSGT00940000166187	ENSGT00940000162251.i	ENSGT00940000155273.i.a #22	ENSGT00390000018220.f #23	ENSGT00940000157517.m.b #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498.d	ENSGT00940000157543.fb.a	ENSGT00940000156704.c	ENSGT00390000018698.c	ENSGT01030000235114.d	ENSGT00390000015057.a	ENSGT00940000158841.k	ENSGT00390000007852	ENSGT00950000182808.b.b.d	ENSGT00950000182832.D.a.l	ENSGT00940000157319.v	ENSGT00950000182863.A.a.a.p
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	1	ENSSSAG00000098771	ENSSSAG00000047600	ENSSSAG00000047581	cirh1a (ENSSSAG00000047440)	chtf8 (ENSSSAG00000047412)	has3 (ENSSSAG00000086235)	tango6 (ENSSSAG00000047325)	ENSSSAG00000108931	zc3h18 (ENSSSAG00000121415)	trhr2 (ENSSSAG00000047306)	zfpm1 (ENSSSAG00000047291)	ces3 (ENSSSAG00000046473)	ENSSSAG00000110381	ENSSSAG00000108970	ENSSSAG00000085944	ENSSSAG00000045924 #22	ENSSSAG00000045058 #23	plcg2 (ENSSSAG00000044956) #24	tldc1 (ENSSSAG00000044932)	cotl1 (ENSSSAG00000044891)	klhl36 (ENSSSAG00000044883)	tat (ENSSSAG00000007115)	pdf (ENSSSAG00000043597)	ENSSSAG00000007588	vps9d1 (ENSSSAG00000043474)	znf276 (ENSSSAG00000043366)	FANCA (ENSSSAG00000043299)	slc10a3 (ENSSSAG00000043287)	chmp1a (ENSSSAG00000043225)	ENSSSAG00000098130	vps4a (ENSSSAG00000034600)
River trout	MODERN SPECIES	37	HSBP1 (ENSSTUG00000016933) #29	ENSSTUG00000016942	kcng4a (ENSSTUG00000016954)	ENSSTUG00000016964	wfdc1 (ENSSTUG00000016970)	utp4 (ENSSTUG00000017003)	chtf8 (ENSSTUG00000017177)	has3 (ENSSTUG00000017184)	TANGO6 (ENSSTUG00000017199)	ENSSTUG00000017271	zc3h18 (ENSSTUG00000017301)	trhr2 (ENSSTUG00000017368)	zfpm1 (ENSSTUG00000017382)	ces3 (ENSSTUG00000017440)	foxl1 (ENSSTUG00000017632)	GAN (ENSSTUG00000017650) #22	CMIP (ENSSTUG00000017710) #23	ENSSTUG00000018001 #24	meak7 (ENSSTUG00000018023)	klhl36 (ENSSTUG00000018039)	cotl1 (ENSSTUG00000018061)	tat (ENSSTUG00000018107)	pdf (ENSSTUG00000018190)	si:dkey-238o13.4 (ENSSTUG00000018209)	vps9d1 (ENSSTUG00000018226)	ENSSTUG00000018302	slc10a3 (ENSSTUG00000007365)	chmp1a (ENSSTUG00000007368)	ENSSTUG00000007400	ENSSTUG00000007402	vps4a (ENSSTUG00000007423)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000006293.s.a #29	ENSGT00390000002381.b.d.a.b	ENSGT00940000156938.f.c	ENSGT00940000164450.b	ENSGT00390000014299.f	ENSGT00940000153533.b.d	ENSGT00400000025006.c	ENSGT00390000010337.B.a.a.k	ENSGT00390000010938	ENSGT00940000166375.g.b	ENSGT00730000111190.e	ENSGT01100000263484.B.a.b	ENSGT00530000063823.b.a.h	ENSGT00940000166187	ENSGT00940000162251.i	ENSGT00940000155273.i.a #22	ENSGT00390000018220.f #23	ENSGT00940000157517.m.b #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498.d	ENSGT00940000157543.fb.a	ENSGT00940000156704.c	ENSGT00390000018698.c	ENSGT01030000235114.d	ENSGT00390000015057.a	ENSGT00390000007852	ENSGT00950000182808.b.b.d	ENSGT00950000182832.D.a.l	ENSGT00940000157319.v	ENSGT00950000182863.A.a.a.p	ENSGT00390000003058.b.a.b.j.a
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000006293.s.a #29	ENSGT00390000002381.b.d.a.b	ENSGT00940000156938.f.c	ENSGT00940000164450.b	ENSGT00390000014299.f	ENSGT00940000153533.b.d	ENSGT00400000025006.c	ENSGT00390000010337.B.a.a.k	ENSGT00390000010938	ENSGT00940000166375.g.b	ENSGT00730000111190.e	ENSGT01100000263484.B.a.b	ENSGT00530000063823.b.a.h	ENSGT00940000166187	ENSGT00940000162251.i	ENSGT00940000155273.i.a #22	ENSGT00390000018220.f #23	ENSGT00940000157517.m.b #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498.d	ENSGT00940000157543.fb.a	ENSGT00940000156704.c	ENSGT00390000018698.c	ENSGT01030000235114.d	ENSGT00390000015057.a	ENSGT00390000007852	ENSGT00950000182808.b.b.d	ENSGT00950000182832.D.a.l	ENSGT00940000157319.v	ENSGT00950000182863.A.a.a.p	ENSGT00390000003058.b.a.b.j.a
Chinook salmon	MODERN SPECIES	10	hsbp1a (ENSOTSG00005004877) #29	ENSOTSG00005004874	KCNG4 (ENSOTSG00005004873)	ENSOTSG00005004870	wfdc1 (ENSOTSG00005004865)	utp4 (ENSOTSG00005004844)	chtf8 (ENSOTSG00005004842)	has3 (ENSOTSG00005004841)	TANGO6 (ENSOTSG00005004838)	ENSOTSG00005004837	zc3h18 (ENSOTSG00005004830)	trhr2 (ENSOTSG00005004829)	zfpm1 (ENSOTSG00005004825)	ces3 (ENSOTSG00005004738)	foxl1 (ENSOTSG00005004730)	GAN (ENSOTSG00005004653) #22	CMIP (ENSOTSG00005004650) #23	plcg2 (ENSOTSG00005004648) #24	meak7 (ENSOTSG00005004646)	cotl1 (ENSOTSG00005004644)	klhl36 (ENSOTSG00005004643)	tat (ENSOTSG00005004576)	pdf (ENSOTSG00005004573)	vps9d1 (ENSOTSG00005004540)	slc10a3 (ENSOTSG00005004538)	chmp1a (ENSOTSG00005004537)	vps4a (ENSOTSG00005004535)	SNTB2 (ENSOTSG00005004533)	spire2 (ENSOTSG00005004532)	adat1 (ENSOTSG00005004530)	wwp2 (ENSOTSG00005002481)
Coho salmon	MODERN SPECIES	14	hsbp1a (ENSOKIG00005049422) #29	ENSOKIG00005049417	kcng4a (ENSOKIG00005049415)	ENSOKIG00005049412	wfdc1 (ENSOKIG00005049409)	UTP4 (ENSOKIG00005049379)	chtf8 (ENSOKIG00005049368)	has3 (ENSOKIG00005049366)	TANGO6 (ENSOKIG00005049350)	ENSOKIG00005049337	zc3h18 (ENSOKIG00005049329)	trhr2 (ENSOKIG00005049319)	zfpm1 (ENSOKIG00005049309)	ces3 (ENSOKIG00005049181)	foxl1 (ENSOKIG00005049152)	GAN (ENSOKIG00005049120) #22	CMIP (ENSOKIG00005049093) #23	meak7 (ENSOKIG00005049085)	cotl1 (ENSOKIG00005049082)	klhl36 (ENSOKIG00005049081)	tat (ENSOKIG00005049024)	pdf (ENSOKIG00005049009)	ENSOKIG00005049006	ENSOKIG00005048999	vps9d1 (ENSOKIG00005048959)	ENSOKIG00005048887	slc10a3 (ENSOKIG00005048869)	chmp1a (ENSOKIG00005048852)	vps4a (ENSOKIG00005048831)	SNTB2 (ENSOKIG00005048821)	spire2 (ENSOKIG00005048818)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	11	ENSOMYG00000014805	kcng4a (ENSOMYG00000014797)	ENSOMYG00000074468	ENSOMYG00000014792	wfdc1 (ENSOMYG00000014783)	UTP4 (ENSOMYG00000014661)	chtf8 (ENSOMYG00000052693)	has3 (ENSOMYG00000014632)	TANGO6 (ENSOMYG00000014611)	ENSOMYG00000014597	zc3h18 (ENSOMYG00000014577)	trhr2 (ENSOMYG00000014531)	zfpm1 (ENSOMYG00000014525)	ces3 (ENSOMYG00000014114)	ENSOMYG00000014038	ENSOMYG00000013997 #22	ENSOMYG00000013932 #23	meak7 (ENSOMYG00000013887)	cotl1 (ENSOMYG00000013874)	klhl36 (ENSOMYG00000013869)	tat (ENSOMYG00000013818)	pdf (ENSOMYG00000013796)	ENSOMYG00000013779	vps9d1 (ENSOMYG00000013681)	ENSOMYG00000013582	ENSOMYG00000013545	chmp1a (ENSOMYG00000013532)	vps4a (ENSOMYG00000013414)	ENSOMYG00000013290	spire2 (ENSOMYG00000013243)	ENSOMYG00000063687
Huchen	MODERN SPECIES	501															foxl1 (ENSHHUG00000000168)	GAN (ENSHHUG00000000212) #22	CMIP (ENSHHUG00000000314) #23	meak7 (ENSHHUG00000000531)	cotl1 (ENSHHUG00000000539)	klhl36 (ENSHHUG00000000556)	tat (ENSHHUG00000000557)	pdf (ENSHHUG00000000639)	si:dkey-238o13.4 (ENSHHUG00000000649)	vps9d1 (ENSHHUG00000000678)	ENSHHUG00000000817	ENSHHUG00000000848	slc10a3 (ENSHHUG00000000908)	chmp1a (ENSHHUG00000000912)	vps4a (ENSHHUG00000000953)	SNTB2 (ENSHHUG00000001074)	spire2 (ENSHHUG00000001080)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	137												ENSGT00530000063823.b.a.g	ENSGT00940000163421.a.c.p	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251.j	ENSGT00940000155273.i.b #22	ENSGT00390000018220.e #23	ENSGT00940000157517.m.a #24	ENSGT00390000012498.c	ENSGT00940000157543.fb.b	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704.d	ENSGT01060000248783	ENSGT00390000018698.d	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000235114.c	ENSGT00390000015057.b	ENSGT00940000158841	ENSGT00950000182808.b.b.c	ENSGT00950000182832.D.a.k	ENSGT00940000158102
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000005410.f #30	ENSGT00390000006293.s.b #29	ENSGT00390000002381.b.d.a.a	ENSGT00940000156938.f.d	ENSGT00390000014299.e	ENSGT00940000153533.b.c	ENSGT00400000025006.d	ENSGT00390000010337.B.a.a.l	ENSGT00940000166375.g.a	ENSGT00730000111190.f	ENSGT01100000263484.B.a.a	ENSGT00530000063823.b.a.g	ENSGT00940000163421.a.c.p	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251.j	ENSGT00940000155273.i.b #22	ENSGT00390000018220.e #23	ENSGT00940000157517.m.a #24	ENSGT00390000012498.c	ENSGT00940000157543.fb.b	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704.d	ENSGT01060000248783	ENSGT00390000018698.d	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000235114.c	ENSGT00390000015057.b	ENSGT00940000158841	ENSGT00950000182808.b.b.c	ENSGT00950000182832.D.a.k	ENSGT00940000158102
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000006293.s.b #29	ENSGT00390000002381.b.d.a.a	ENSGT00940000156938.f.d	ENSGT00390000014299.e	ENSGT00940000153533.b.c	ENSGT00400000025006.d	ENSGT00390000010337.B.a.a.l	ENSGT00940000166375.g.a	ENSGT00730000111190.f	ENSGT01100000263484.B.a.a	ENSGT00530000063823.b.a.g	ENSGT00940000163421.a.c.p	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251.j	ENSGT00990000212684	ENSGT00940000155273.i.b #22	ENSGT00390000018220.e #23	ENSGT00940000157517.m.a #24	ENSGT00390000012498.c	ENSGT00940000157543.fb.b	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704.d	ENSGT01060000248783	ENSGT00390000018698.d	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000235114.c	ENSGT00390000015057.b	ENSGT00940000158841.l	ENSGT00950000182808.b.b.c	ENSGT00950000182832.D.a.k	ENSGT00940000158102
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	7	ENSSSAG00000069428	kcng4 (ENSSSAG00000069433)	wfdc1 (ENSSSAG00000069436)	ENSSSAG00000069460	ENSSSAG00000093260	has3 (ENSSSAG00000082559)	ENSSSAG00000006069	zc3h18 (ENSSSAG00000006103)	trhr2 (ENSSSAG00000006287)	zfpm1 (ENSSSAG00000006344)	ENSSSAG00000104260	ENSSSAG00000115335	kiaa0513 (ENSSSAG00000006384)	foxl1 (ENSSSAG00000046408)	ENSSSAG00000094793	ENSSSAG00000006490 #22	ENSSSAG00000006567 #23	plcg2 (ENSSSAG00000006779) #24	ENSSSAG00000091285	cotl1 (ENSSSAG00000098390)	klhl36 (ENSSSAG00000007057)	zgc:56622 (ENSSSAG00000007066)	tat (ENSSSAG00000043630)	ENSSSAG00000103785	ENSSSAG00000106292	ENSSSAG00000108664	ENSSSAG00000007601	znf276 (ENSSSAG00000007855)	ENSSSAG00000007864	chmp1a (ENSSSAG00000007872)	cdk10 (ENSSSAG00000007908)
River trout	MODERN SPECIES	8	ENSSTUG00000019329	kcng4a (ENSSTUG00000019314)	wfdc1 (ENSSTUG00000019284)	utp4 (ENSSTUG00000019208)	chtf8 (ENSSTUG00000019184)	has3 (ENSSTUG00000019168)	ENSSTUG00000019154	zc3h18 (ENSSTUG00000019089)	trhr2 (ENSSTUG00000019055)	ENSSTUG00000019040	zfpm1 (ENSSTUG00000019008)	ENSSTUG00000018999	kiaa0513 (ENSSTUG00000018952)	foxl1 (ENSSTUG00000018938)	ENSSTUG00000018925	GAN (ENSSTUG00000018910) #22	CMIP (ENSSTUG00000018876) #23	plcg2 (ENSSTUG00000018002) #24	cotl1 (ENSSTUG00000017933)	zgc:56622 (ENSSTUG00000017919)	tat (ENSSTUG00000016238)	ENSSTUG00000016173	pdf (ENSSTUG00000016167)	ENSSTUG00000016166	si:dkey-238o13.4 (ENSSTUG00000016146)	vps9d1 (ENSSTUG00000015964)	znf276 (ENSSTUG00000015947)	slc10a3 (ENSSTUG00000015934)	chmp1a (ENSSTUG00000015910)	cdk10 (ENSSTUG00000015802)	vps4a (ENSSTUG00000015511)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000166270.a	ENSGT00390000006293.s.b #29	ENSGT00390000002381.b.d.a.a	ENSGT00940000156938.f.d	ENSGT00390000014299.e	ENSGT00940000153533.b.c	ENSGT00400000025006.d	ENSGT00390000010337.B.a.a.l	ENSGT00940000166375.g.a	ENSGT00730000111190.f	ENSGT01100000263484.B.a.a	ENSGT00530000063823.b.a.g	ENSGT00940000163421.a.c.p	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251.j	ENSGT00940000155273.i.b #22	ENSGT00390000018220.e #23	ENSGT00940000157517.m.a #24	ENSGT00390000012498.c	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704.d	ENSGT01060000248783	ENSGT00390000018698.d	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000235114.c	ENSGT00390000015057.b	ENSGT00940000158841	ENSGT00950000182808.b.b.c	ENSGT00950000182832.D.a.k	ENSGT00940000158102	ENSGT00940000157319.u.a
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000166270.a	ENSGT00390000006293.s.b #29	ENSGT00390000002381.b.d.a.a	ENSGT00940000156938.f.d	ENSGT00390000014299.e	ENSGT00940000153533.b.c	ENSGT00990000211668	ENSGT00390000010337.B.a.a.l	ENSGT00940000166375.g.a	ENSGT00730000111190.f	ENSGT01100000263484.B.a.a	ENSGT00530000063823.b.a.g	ENSGT00940000163421.a.c.p	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251.j	ENSGT00940000155273.i.b #22	ENSGT00390000018220.e #23	ENSGT00940000157517.m.a #24	ENSGT00390000012498.c	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704.d	ENSGT01060000248783	ENSGT00390000018698.d	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000235114.c	ENSGT00390000015057.b	ENSGT00940000158841	ENSGT00950000182832.D.a.k	ENSGT00940000158102	ENSGT00940000157319.u.a	ENSGT00950000182863.A.a.a.o
Chinook salmon	MODERN SPECIES	30	si:ch211-216l23.2 (ENSOTSG00005042501)	ENSOTSG00005042500	CDH13 (ENSOTSG00005042499) #28	kcng4a (ENSOTSG00005042495)	wfdc1 (ENSOTSG00005042494)	utp4 (ENSOTSG00005042456)	ENSOTSG00005042448	has3 (ENSOTSG00005042447)	ENSOTSG00005042446	zc3h18 (ENSOTSG00005042440)	trhr2 (ENSOTSG00005042437)	zfpm1 (ENSOTSG00005042436)	ENSOTSG00005042435	foxl1 (ENSOTSG00005042434)	kiaa0513 (ENSOTSG00005042431)	GAN (ENSOTSG00005042429) #22	CMIP (ENSOTSG00005042423) #23	plcg2 (ENSOTSG00005042409) #24	cotl1 (ENSOTSG00005042400)	zgc:56622 (ENSOTSG00005042392)	tat (ENSOTSG00005042376)	ENSOTSG00005042372	ENSOTSG00005042371	ENSOTSG00005042370	si:dkey-238o13.4 (ENSOTSG00005042369)	vps9d1 (ENSOTSG00005042354)	znf276 (ENSOTSG00005042348)	chmp1a (ENSOTSG00005042345)	cdk10 (ENSOTSG00005042320)	vps4a (ENSOTSG00005040917)	SNTB2 (ENSOTSG00005040897)
Coho salmon	MODERN SPECIES	24	HSBP1 (ENSOKIG00005000388) #29	ENSOKIG00005000382	KCNG4 (ENSOKIG00005000375)	wfdc1 (ENSOKIG00005000367)	utp4 (ENSOKIG00005000344)	ENSOKIG00005000325	has3 (ENSOKIG00005000318)	ENSOKIG00005000309	zc3h18 (ENSOKIG00005000269)	trhr2 (ENSOKIG00005000241)	zfpm1 (ENSOKIG00005000226)	ENSOKIG00005000217	kiaa0513 (ENSOKIG00005000204)	FOXL1 (ENSOKIG00005000173)	ENSOKIG00005000109	GAN (ENSOKIG00005000077) #22	CMIP (ENSOKIG00005042981) #23	plcg2 (ENSOKIG00005042051) #24	cotl1 (ENSOKIG00005041974)	zgc:56622 (ENSOKIG00005041781)	tat (ENSOKIG00005041268)	ENSOKIG00005041220	pdf (ENSOKIG00005041182)	ENSOKIG00005041163	si:dkey-238o13.4 (ENSOKIG00005041136)	znf276 (ENSOKIG00005041115)	vps9d1 (ENSOKIG00005040352)	CHMP1A (ENSOKIG00005040197)	cdk10 (ENSOKIG00005039866)	vps4a (ENSOKIG00005039208)	SNTB2 (ENSOKIG00005039167)
Rainbow trout	MODERN SPECIES		ENSOMYG00000036248 #29	ENSOMYG00000036241	ENSOMYG00000036233	wfdc1 (ENSOMYG00000036223)	UTP4 (ENSOMYG00000036113)	chtf8 (ENSOMYG00000036062)	has3 (ENSOMYG00000036047)	il17c1 (ENSOMYG00000036039)	ENSOMYG00000065717	zc3h18 (ENSOMYG00000036010)	trhr2 (ENSOMYG00000035991)	zfpm1 (ENSOMYG00000035972)	ENSOMYG00000070951	kiaa0513 (ENSOMYG00000035940)	foxl1 (ENSOMYG00000035920)	ENSOMYG00000035909 #22	ENSOMYG00000035732 #23	plcg2 (ENSOMYG00000034841) #24	cotl1 (ENSOMYG00000034725)	ENSOMYG00000060326	zgc:56622 (ENSOMYG00000034660)	tat (ENSOMYG00000034119)	ENSOMYG00000034038	pdf (ENSOMYG00000034003)	ENSOMYG00000033981	si:dkey-238o13.4 (ENSOMYG00000033970)	vps9d1 (ENSOMYG00000033913)	znf276 (ENSOMYG00000033892)	ENSOMYG00000033885	chmp1a (ENSOMYG00000033856)	cdk10 (ENSOMYG00000032617)
Huchen	MODERN SPECIES	12												ENSHHUG00000022675	ENSHHUG00000022681	kiaa0513 (ENSHHUG00000022684)	foxl1 (ENSHHUG00000022695)	GAN (ENSHHUG00000022701) #22	CMIP (ENSHHUG00000022718) #23	plcg2 (ENSHHUG00000022735) #24	cotl1 (ENSHHUG00000022852)	klhl36 (ENSHHUG00000022860)	zgc:56622 (ENSHHUG00000022870)	tat (ENSHHUG00000022879)	ENSHHUG00000022911	pdf (ENSHHUG00000022915)	ENSHHUG00000022920	si:dkey-238o13.4 (ENSHHUG00000022925)	vps9d1 (ENSHHUG00000022948)	znf276 (ENSHHUG00000023153)	slc10a3 (ENSHHUG00000023167)	chmp1a (ENSHHUG00000023169)	cdk10 (ENSHHUG00000023171)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	996													ENSGT00940000160104	ENSGT00510000049239.a.d.a	ENSGT00940000159993	ENSGT00940000155273.j #22	ENSGT01030000234515.a.b.b.a.d	ENSGT00950000183158.B.b
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160888.c	ENSGT00940000165287.a.b	ENSGT00900000141362.a.b.a	ENSGT00390000005338.b	ENSGT00940000169448	ENSGT00940000176016	ENSGT00940000158588.d.a.a	ENSGT00950000182993.A.a.i.d	ENSGT00390000012434.b	ENSGT00390000007212.c	ENSGT00940000165636.d	ENSGT00390000014000.d	ENSGT00940000160104.v	ENSGT00940000159993	ENSGT00940000163715.b	ENSGT00940000155273.j #22	ENSGT01030000234515.a.b.b.a.d	ENSGT00950000183158.B.b	ENSGT00950000183158.A.e.b	ENSGT00940000154412.C.d.b	ENSGT00390000000051.a.a	ENSGT00940000154595.hb	ENSGT00940000163126.a.b.j.a	ENSGT00940000158995.a.h	ENSGT00940000163126.a.b.j.b	ENSGT00940000159258.d.c	ENSGT00940000161913.b	ENSGT00390000013841.db.b.b	ENSGT00950000183110.b.a.c.g	ENSGT00940000160036.f	ENSGT00940000159946.f
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155273.j #22
Rainbow trout	MODERN SPECIES		slc1a6 (ENSOMYG00000001100)	pole4 (ENSOMYG00000001207)	ENSOMYG00000001253	ccl25b (ENSOMYG00000056584)	ctns (ENSOMYG00000001351)	ENSOMYG00000001372	ENSOMYG00000070591	ndufa11 (ENSOMYG00000001434)	ENSOMYG00000001492	ENSOMYG00000001534	ENSOMYG00000001559	ENSOMYG00000001586	ENSOMYG00000060303	ENSOMYG00000001903	ENSOMYG00000056939	ENSOMYG00000002035 #22	cers4a (ENSOMYG00000002074)	ENSOMYG00000075861	ENSOMYG00000006445	ENSOMYG00000059265	ENSOMYG00000015162	hnrnpm (ENSOMYG00000016801)	ENSOMYG00000056328	ENSOMYG00000016866	ENSOMYG00000017055	rab11ba (ENSOMYG00000017065)	ENSOMYG00000017142	ENSOMYG00000017608	ENSOMYG00000017619	ENSOMYG00000017800	tm6sf2b (ENSOMYG00000018927)
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155273.j #22
Coho salmon	MODERN SPECIES	24	ccl44 (ENSOKIG00005001440)	pole4 (ENSOKIG00005001447)	ENSOKIG00005001454	ccl25b (ENSOKIG00005001459)	ctns (ENSOKIG00005001466)	ENSOKIG00005001474	RANBP3 (ENSOKIG00005001478)	ENSOKIG00005001482	ndufa11 (ENSOKIG00005001489)	VMAC (ENSOKIG00005001491)	larp6b (ENSOKIG00005001496)	ENSOKIG00005001498	timm13 (ENSOKIG00005001502)	ENSOKIG00005001506	ENSOKIG00005001523	ENSOKIG00005001563 #22	ENSOKIG00005001568	ENSOKIG00005001573	fbn2b (ENSOKIG00005001689)	CTXN1 (ENSOKIG00005003363)	timm44 (ENSOKIG00005003384)	hnrnpm (ENSOKIG00005003428)	ENSOKIG00005003507	marchf2 (ENSOKIG00005003528)	ENSOKIG00005003533	PIP5K1C (ENSOKIG00005003580)	gpx4a (ENSOKIG00005003635)	POLR2E (ENSOKIG00005003644)	tjp3 (ENSOKIG00005003661)	SBNO2 (ENSOKIG00005003865)	tm6sf2b (ENSOKIG00005006832)
Huchen	MODERN SPECIES	774												ENSHHUG00000026930	timm13 (ENSHHUG00000026907)	ENSHHUG00000026871	ENSHHUG00000026829	ENSHHUG00000026816 #22	ENSHHUG00000026809	ENSHHUG00000026796	ENSHHUG00000026736	ENSHHUG00000026692	ZNF830 (ENSHHUG00000026678)	ENSHHUG00000026666	ENSHHUG00000026661	ENSHHUG00000025447	prkacbb (ENSHHUG00000025140)	exosc4 (ENSHHUG00000025122)	GPAA1 (ENSHHUG00000025094)	ENSHHUG00000025065	MYLK4 (ENSHHUG00000025056)
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	41				ENSGT00940000153533.b	ENSGT00400000025006	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00390000010938	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248783	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT00960000187029	ENSGT01030000234925	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852
Cod	MODERN SPECIES	22	ENSGMOG00000001189	ENSGMOG00000017357	ENSGMOG00000014191	UTP4 (ENSGMOG00000014309)	chtf8 (ENSGMOG00000005356)	has3 (ENSGMOG00000014348)	TANGO6 (ENSGMOG00000014362)	ENSGMOG00000031470	zc3h18 (ENSGMOG00000015433)	trhr2 (ENSGMOG00000015189)	zfpm1 (ENSGMOG00000031027)	ces3 (ENSGMOG00000000154)	kiaa0513 (ENSGMOG00000002337)	ENSGMOG00000032692	ENSGMOG00000025504	ENSGMOG00000002280 #22	ENSGMOG00000002227 #23	plcg2 (ENSGMOG00000004227) #24	meak7 (ENSGMOG00000004193)	cotl1 (ENSGMOG00000004183)	klhl36 (ENSGMOG00000028672)	zgc:56622 (ENSGMOG00000004158)	tat (ENSGMOG00000004127)	pdf (ENSGMOG00000004104)	ENSGMOG00000029471	ENSGMOG00000030806	vps9d1 (ENSGMOG00000003989)	ENSGMOG00000023547	znf276 (ENSGMOG00000003784)	ENSGMOG00000003772	ENSGMOG00000023590
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00390000012935	ENSGT00940000157089.A	ENSGT00940000159073	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00400000025006	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00390000010938	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248783	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000234925	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000178458	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	20	cstpp1 (ENSMMDG00005020952)	ENSMMDG00005020950	cry2 (ENSMMDG00005020327)	utp4 (ENSMMDG00005020297)	chtf8 (ENSMMDG00005020288)	has3 (ENSMMDG00005020283)	TANGO6 (ENSMMDG00005020271)	ENSMMDG00005020265	zc3h18 (ENSMMDG00005020262)	trhr2 (ENSMMDG00005020258)	zfpm1 (ENSMMDG00005020257)	ces3 (ENSMMDG00005020251)	kiaa0513 (ENSMMDG00005020217)	foxl1 (ENSMMDG00005020210)	ENSMMDG00005020207	GAN (ENSMMDG00005020176) #22	CMIP (ENSMMDG00005020168) #23	cyb5r2 (ENSMMDG00005020163)	poglut3 (ENSMMDG00005020161)	sb:cb470 (ENSMMDG00005020159)	PPFIBP2 (ENSMMDG00005019709)	bmal1a (ENSMMDG00005018404)	btbd10a (ENSMMDG00005018367)	pth1a (ENSMMDG00005018364)	tcp11l1 (ENSMMDG00005018161)	hipk3a (ENSMMDG00005018148)	ENSMMDG00005018145	spon1b (ENSMMDG00005017999)	syt9b (ENSMMDG00005017970)	OLFML1 (ENSMMDG00005017963)	ENSMMDG00005017958
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000012935	ENSGT00940000157089.A	ENSGT00940000159073	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00400000025006	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00390000010938	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248783	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000234925	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000178458	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	272	pard6a (ENSHCOG00000016948)	gal (ENSHCOG00000016937)	ENSHCOG00000016928	bcar1 (ENSHCOG00000016922)	bcar1 (ENSHCOG00000016881)	tmem170a (ENSHCOG00000016774)	ppp6r3 (ENSHCOG00000016763)	septin15 (ENSHCOG00000016725)	ENSHCOG00000016695	smpd3 (ENSHCOG00000000470)	ENSHCOG00000016674	ENSHCOG00000016670	ndrg4 (ENSHCOG00000016656)	foxl1 (ENSHCOG00000016581)	ENSHCOG00000016578	GAN (ENSHCOG00000000464) #22	ENSHCOG00000016534	ENSHCOG00000016494	far1 (ENSHCOG00000016475)	cyb5r2 (ENSHCOG00000016447)	poglut3 (ENSHCOG00000016440)	sb:cb470 (ENSHCOG00000016437)	ENSHCOG00000016431	ENSHCOG00000016411	bmal1a (ENSHCOG00000016399)	btbd10a (ENSHCOG00000000835)	ENSHCOG00000016371	zgc:162634 (ENSHCOG00000016364)	galnt18a (ENSHCOG00000016354)	slc12a3 (ENSHCOG00000016278)	gins3 (ENSHCOG00000015091)
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157089.A	ENSGT00940000159073	ENSGT00500000045734	ENSGT00390000010938	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00400000025006	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248721	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000234925	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000178458	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159073	ENSGT00500000045734	ENSGT00390000010938	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00400000025006	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00390000004877	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248721	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000234925	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000178458	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	5							ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00390000004877	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT01050000244866.C	ENSGT00940000163301.d.a.a.d	ENSGT00940000177147	ENSGT00940000163301.d.a.a.c.b	ENSGT00940000163301.d.a.a.c.a	ENSGT00940000158063	ENSGT00940000155883.a.a	ENSGT00940000155883.a.b.a.a	ENSGT00390000018132	ENSGT00940000153528.a.a	ENSGT00940000162243	ENSGT00390000017113	ENSGT00940000153577.C	ENSGT00390000014869
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00520000055620.B	ENSGT00980000201244	ENSGT00940000159483.a.a	ENSGT00940000163250.A.b	ENSGT00530000064134.a.a	ENSGT01050000246145	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT01050000245073.C	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT01050000245073.A	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00390000004877	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT01050000244866.C	ENSGT00940000163301.d.a.a.c.b.b.a	ENSGT00940000163301.d.a.a.c.b.a	ENSGT00940000163301.d.a.a.c.a	ENSGT00940000158063	ENSGT00940000153528.a.a	ENSGT00390000018132	ENSGT00940000155883.a.b.a.a	ENSGT00390000014869	ENSGT00960000187150	ENSGT00940000158492	ENSGT00940000163703.b	ENSGT00940000159811	ENSGT00940000158682
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00520000055620.B	ENSGT00980000201244	ENSGT00940000159483.a.a	ENSGT00940000163250.A.b	ENSGT00530000064134.a.a	ENSGT01050000246145	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT01050000245073.C	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT01050000245073.A	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT01050000244866.C	ENSGT00940000163301.d.a.a.c.b.b.b.b	ENSGT00940000163301.d.a.a.c.b.b.b.a	ENSGT00940000163301.d.a.a.c.b.b.a	ENSGT00940000163301.d.a.a.c.b.a	ENSGT00940000163301.d.a.a.c.a	ENSGT00940000158063	ENSGT00940000153528.a.a	ENSGT00390000018132	ENSGT00940000155883.a.b.a.a	ENSGT00390000014869	ENSGT00940000158492	ENSGT00940000163703.b	ENSGT00940000159811
Indian medaka	MODERN SPECIES	15	ENSOMEG00000000689	zc3h18 (ENSOMEG00000016281)	trhr2 (ENSOMEG00000016254)	ENSOMEG00000016227	ENSOMEG00000016219	zfpm1 (ENSOMEG00000016199)	ENSOMEG00000016185	ENSOMEG00000016177	ENSOMEG00000016165	ENSOMEG00000016133	ces3 (ENSOMEG00000016127)	kiaa0513 (ENSOMEG00000016070)	foxl1 (ENSOMEG00000015942)	ENSOMEG00000015933	ENSOMEG00000015918	GAN (ENSOMEG00000015902) #22	CMIP (ENSOMEG00000015849) #23	ENSOMEG00000015785	ENSOMEG00000015687	ENSOMEG00000015594	ENSOMEG00000015441	ENSOMEG00000015419	ENSOMEG00000015376	hsf4 (ENSOMEG00000015331)	phaf1 (ENSOMEG00000015279)	cbfb (ENSOMEG00000015215)	gnao1a (ENSOMEG00000000385)	cnot1 (ENSOMEG00000015124)	znf423 (ENSOMEG00000000376)	si:ch211-212o1.2 (ENSOMEG00000014726)	cbln1 (ENSOMEG00000014702)
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	20	IRX5 (ENSOJAG00000011451)	ENSOJAG00000011414	ENSOJAG00000011401	ENSOJAG00000011391	zc3h18 (ENSOJAG00000011374)	trhr2 (ENSOJAG00000011348)	ENSOJAG00000011327	vps8 (ENSOJAG00000007858)	ENSOJAG00000007599	zfpm1 (ENSOJAG00000007589)	ENSOJAG00000007497	ces3 (ENSOJAG00000007469)	kiaa0513 (ENSOJAG00000007339)	FOXL1 (ENSOJAG00000007306)	ENSOJAG00000007285	GAN (ENSOJAG00000007196) #22	ENSOJAG00000006855	ENSOJAG00000006833	ENSOJAG00000006825	ENSOJAG00000006373	ENSOJAG00000006224	ENSOJAG00000006060	hsf4 (ENSOJAG00000005982)	phaf1 (ENSOJAG00000005851)	cbfb (ENSOJAG00000005661)	ENSOJAG00000014878	znf423 (ENSOJAG00000014040)	si:ch211-212o1.2 (ENSOJAG00000014000)	cbln1 (ENSOJAG00000013954)	n4bp1 (ENSOJAG00000013938)	siah1 (ENSOJAG00000013917)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000162591	ENSGT00520000055620.B	ENSGT00940000159483.a.a	ENSGT00940000163250.A.b	ENSGT00530000064134.a.a	ENSGT01050000246145	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT01050000245073.C	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT01050000245073.A	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00390000004877	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT01050000244866.C	ENSGT00940000163301.d.a.a.c.b.b.a	ENSGT00940000163301.d.a.a.c.b.a	ENSGT00940000158063	ENSGT00940000153528.a.a	ENSGT00390000018132	ENSGT00940000155883.a.b.a.a	ENSGT00390000014869	ENSGT00960000187150	ENSGT00940000158492	ENSGT00940000163703.b	ENSGT00940000159811	ENSGT00940000158682	ENSGT00940000154837
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	20	ENSORLG00000028919	ENSORLG00000028664	ENSORLG00000029430	il17c (ENSORLG00000023466)	zc3h18 (ENSORLG00000014056)	trhr2 (ENSORLG00000014025)	ENSORLG00000014017	ENSORLG00000014006	zfpm1 (ENSORLG00000026867)	fcg2 (ENSORLG00000013975)	ces3 (ENSORLG00000013947)	ENSORLG00000027132	foxl1 (ENSORLG00000013881)	kiaa0513 (ENSORLG00000013904)	ENSORLG00000027472	GAN (ENSORLG00000013876) #22	CMIP (ENSORLG00000013857) #23	ENSORLG00000013826	ENSORLG00000013811	ENSORLG00000019947	ENSORLG00000027041	ENSORLG00000023654	hsf4 (ENSORLG00000013768)	ENSORLG00000013837	phaf1 (ENSORLG00000030399)	cbfb (ENSORLG00000024937)	gnao1a (ENSORLG00000013739)	cnot1 (ENSORLG00000013734)	ENSORLG00000025243	znf423 (ENSORLG00000013673)	si:ch211-212o1.2 (ENSORLG00000026020)
Chinese medaka	MODERN SPECIES	123										zfpm1 (ENSOSIG00000019542)	ENSOSIG00000019539	ces3 (ENSOSIG00000019474)	kiaa0513 (ENSOSIG00000019459)	foxl1 (ENSOSIG00000019451)	ENSOSIG00000019448	GAN (ENSOSIG00000019438) #22	CMIP (ENSOSIG00000019211) #23	ENSOSIG00000019129	ENSOSIG00000019024	ENSOSIG00000018988	hsf4 (ENSOSIG00000018975)	phaf1 (ENSOSIG00000018944)	cbfb (ENSOSIG00000018930)	ENSOSIG00000018916	ENSOSIG00000018913	ENSOSIG00000018911	cnot1 (ENSOSIG00000018890)	si:ch211-212o1.2 (ENSOSIG00000018341)	cbln1 (ENSOSIG00000018337)	n4bp1 (ENSOSIG00000018333)	siah1 (ENSOSIG00000018327)
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000168336	ENSGT00950000183151.a.a.b.b	ENSGT00940000156356	ENSGT00940000157335	ENSGT00940000153348.A	ENSGT00500000044916	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00390000004877	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00400000025006	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00390000010938	ENSGT01050000245029	ENSGT00940000159073	ENSGT00940000157089.A	ENSGT00390000012935	ENSGT00390000014757	ENSGT00950000183093.B.a.a	ENSGT00390000004930	ENSGT00940000154876.a.b.a	ENSGT00940000154876.a.b.b	ENSGT00950000182940.b.a.a.g.a
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00530000063553.b.b	ENSGT00940000168336	ENSGT00950000183151.a.a.b.b	ENSGT00940000156356	ENSGT00940000157335	ENSGT00940000153348.A	ENSGT00940000162251	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000166187	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00730000111190	ENSGT00940000170707	ENSGT00500000044916	ENSGT00390000004877	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00400000025006	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00390000010938
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00530000063553.b.b	ENSGT00940000168336	ENSGT00950000183151.a.a.b.b	ENSGT00940000156356	ENSGT00940000157335	ENSGT00940000153348.A	ENSGT00940000162251	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000166187	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00730000111190	ENSGT00940000170707	ENSGT00500000044916	ENSGT00390000004877	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00400000025006	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00390000010938	ENSGT00940000158682	ENSGT00940000159811	ENSGT00940000163703.b	ENSGT00940000158492	ENSGT00530000064134.a.a	ENSGT00940000179157	ENSGT00390000014869	ENSGT00940000153577.C	ENSGT00390000017113	ENSGT00940000162243
Platyfish	MODERN SPECIES	11	lonp2 (ENSXMAG00000006374)	il34 (ENSXMAG00000006373)	sf3b3 (ENSXMAG00000006334)	st3gal2 (ENSXMAG00000006324)	aars1 (ENSXMAG00000006282)	exosc6 (ENSXMAG00000006280)	foxl1 (ENSXMAG00000024110)	kiaa0513 (ENSXMAG00000006268)	ces3 (ENSXMAG00000006261)	zfpm1 (ENSXMAG00000009855)	trhr2 (ENSXMAG00000006255)	zc3h18 (ENSXMAG00000006239)	ENSXMAG00000006238	psme3ip1 (ENSXMAG00000006232)	ENSXMAG00000006231	GAN (ENSXMAG00000006216) #22	ENSXMAG00000029832	CMIP (ENSXMAG00000006193) #23	utp4 (ENSXMAG00000006171)	chtf8 (ENSXMAG00000006168)	has3 (ENSXMAG00000006159)	TANGO6 (ENSXMAG00000006148)	n4bp1 (ENSXMAG00000006141)	cbln1 (ENSXMAG00000022295)	si:ch211-212o1.2 (ENSXMAG00000027907)	znf423 (ENSXMAG00000006113)	si:ch211-216l23.2 (ENSXMAG00000023469)	cnot1 (ENSXMAG00000006031)	setd6 (ENSXMAG00000006024)	bbs2 (ENSXMAG00000006003)	B3GNT9 (ENSXMAG00000005991)
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00530000063553.b.b	ENSGT00940000168336	ENSGT00950000183151.a.a.b.b	ENSGT00940000156356	ENSGT00940000157335	ENSGT00940000153348.A	ENSGT00940000162251	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000166187.o	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00730000111190	ENSGT00940000170707	ENSGT00500000044916	ENSGT00390000004877	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00400000025006	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00390000010938	ENSGT00940000158682	ENSGT00940000159811	ENSGT00940000163703.b	ENSGT00940000158492	ENSGT00530000064134.a.a	ENSGT00940000179157	ENSGT00390000014869	ENSGT00940000153577.C	ENSGT00390000017113	ENSGT00940000162243
Guppy	MODERN SPECIES	458	il34 (ENSPREG00000019768)	sf3b3 (ENSPREG00000019669)	st3gal2 (ENSPREG00000019603)	aars1 (ENSPREG00000019562)	exosc6 (ENSPREG00000019548)	foxl1 (ENSPREG00000019542)	kiaa0513 (ENSPREG00000019529)	ENSPREG00000019506	ENSPREG00000019492	zfpm1 (ENSPREG00000019479)	trhr2 (ENSPREG00000019353)	zc3h18 (ENSPREG00000019303)	ENSPREG00000019288	psme3ip1 (ENSPREG00000019274)	ENSPREG00000019268	GAN (ENSPREG00000019243) #22	CMIP (ENSPREG00000019189) #23	utp4 (ENSPREG00000019070)	chtf8 (ENSPREG00000019045)	has3 (ENSPREG00000019033)	TANGO6 (ENSPREG00000018987)	n4bp1 (ENSPREG00000018960)	cbln1 (ENSPREG00000018926)	si:ch211-212o1.2 (ENSPREG00000018906)	znf423 (ENSPREG00000018878)	ENSPREG00000018862	cnot1 (ENSPREG00000018793)	setd6 (ENSPREG00000018719)	bbs2 (ENSPREG00000018681)	B3GNT9 (ENSPREG00000018666)	phaf1 (ENSPREG00000018639)
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00530000063553.b.b	ENSGT00940000168336	ENSGT00950000183151.a.a.b.b	ENSGT00940000156356	ENSGT00940000157335	ENSGT00940000153348.A	ENSGT00940000162251	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000166187.o	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00940000168053	ENSGT00940000170707	ENSGT00500000044916	ENSGT00390000004877	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00400000025006	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00390000010938	ENSGT00940000158682	ENSGT00940000159811	ENSGT00940000163703.b	ENSGT00940000158492	ENSGT00530000064134.a.a	ENSGT00940000179157	ENSGT00390000014869	ENSGT00940000153577.C	ENSGT00390000017113	ENSGT00940000162243
Sailfin molly	MODERN SPECIES	2555												ube2j1 (ENSPLAG00000011069)	ENSPLAG00000011037	psme3ip1 (ENSPLAG00000011022)	ENSPLAG00000011006	ENSPLAG00000010985 #22
Amazon molly	DUPLICATION
Amazon molly	MODERN SPECIES	759										zfpm1 (ENSPFOG00000003034)	trhr2 (ENSPFOG00000002930)	ENSPFOG00000002632	ENSPFOG00000022943	psme3ip1 (ENSPFOG00000002555)	ENSPFOG00000002549	GAN (ENSPFOG00000002391) #22	CMIP (ENSPFOG00000001857) #23	utp4 (ENSPFOG00000001510)	chtf8 (ENSPFOG00000001378)	has3 (ENSPFOG00000001327)	TANGO6 (ENSPFOG00000001019)
Amazon molly	MODERN SPECIES	303	tnfaip8l1 (ENSPFOG00000010668)	cope (ENSPFOG00000010691)	CERS1 (ENSPFOG00000010753)	ncln (ENSPFOG00000010844)	s1pr4 (ENSPFOG00000019999)	MYO9B (ENSPFOG00000011070)	use1 (ENSPFOG00000011442)	insrb (ENSPFOG00000011513)	ENSPFOG00000012136	ARHGEF18 (ENSPFOG00000012251)	enc3 (ENSPFOG00000012378)	ENSPFOG00000020000	timm13 (ENSPFOG00000012405)	ENSPFOG00000012424	lsm7 (ENSPFOG00000012467)	ENSPFOG00000012496 #22	cers4a (ENSPFOG00000012524)	fbn2b (ENSPFOG00000012783)	CTXN1 (ENSPFOG00000020001)	timm44 (ENSPFOG00000013565)	hnrnpm (ENSPFOG00000013612)	dmap1 (ENSPFOG00000013730)	RNF220 (ENSPFOG00000013774)	guk1b (ENSPFOG00000013888)	ENSPFOG00000013946	IQCA1 (ENSPFOG00000014080)	alkal1 (ENSPFOG00000021789)	ENSPFOG00000014169	nexn (ENSPFOG00000014196)	tab3 (ENSPFOG00000014274)	tmem47 (ENSPFOG00000014295)
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000000777	ENSGT00390000003488.a.b.a	ENSGT00390000003478	ENSGT01030000234515.b	ENSGT00500000044945.a	ENSGT01050000244887.B	ENSGT00940000156845	ENSGT00390000014361	ENSGT00940000155404.i.b	ENSGT00940000181720	ENSGT00940000157375.c	ENSGT00950000182983.B.a.a	ENSGT00390000014000	ENSGT00940000159993	ENSGT00510000047872	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT01030000234515.a.b.b.a	ENSGT00950000183158.A	ENSGT00940000154412.C.c.b	ENSGT00390000000051.a	ENSGT00940000154595	ENSGT00390000016466	ENSGT00390000016573.c.a	ENSGT00940000155815.p	ENSGT00940000168428.b.a	ENSGT00940000177273	ENSGT00940000168428.b.b.b	ENSGT00940000154067.c	ENSGT00940000159969.a	ENSGT00940000159600	ENSGT00730000111176
Sheepshead minnow	DUPLICATION
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	553						foxl1 (ENSCVAG00000015293)	kiaa0513 (ENSCVAG00000015381)	ces3 (ENSCVAG00000015396)	zfpm1 (ENSCVAG00000015402)	ENSCVAG00000015416	trhr2 (ENSCVAG00000015804)	zc3h18 (ENSCVAG00000015873)	ENSCVAG00000015894	psme3ip1 (ENSCVAG00000015911)	ENSCVAG00000015931	GAN (ENSCVAG00000015966) #22	ENSCVAG00000016014	utp4 (ENSCVAG00000016030)	chtf8 (ENSCVAG00000016040)	has3 (ENSCVAG00000016139)	TANGO6 (ENSCVAG00000016196)
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	142	mydgf (ENSCVAG00000021774)	tnfaip8l1 (ENSCVAG00000021771)	cope (ENSCVAG00000021751)	CERS1 (ENSCVAG00000021722)	ncln (ENSCVAG00000021714)	s1pr4 (ENSCVAG00000021655)	MYO9B (ENSCVAG00000021647)	use1 (ENSCVAG00000021584)	insrb (ENSCVAG00000021557)	ENSCVAG00000021533	ARHGEF18 (ENSCVAG00000021523)	enc3 (ENSCVAG00000021503)	timm13 (ENSCVAG00000021490)	ENSCVAG00000021461	lsm7 (ENSCVAG00000021091)	ENSCVAG00000021074 #22	cers4a (ENSCVAG00000021056)	fbn2b (ENSCVAG00000021044)	CTXN1 (ENSCVAG00000020871)	timm44 (ENSCVAG00000020856)	hnrnpm (ENSCVAG00000020838)	dmap1 (ENSCVAG00000020823)	RNF220 (ENSCVAG00000020747)	guk1b (ENSCVAG00000020727)	ENSCVAG00000020698	ENSCVAG00000020681	alkal1 (ENSCVAG00000020641)	ENSCVAG00000020634	nexn (ENSCVAG00000020621)	tab3 (ENSCVAG00000020548)	tmem47 (ENSCVAG00000020521)
Mummichog	DUPLICATION
Mummichog	MODERN SPECIES	481											trhr2 (ENSFHEG00000017184)	zc3h18 (ENSFHEG00000017164)	ENSFHEG00000017138	psme3ip1 (ENSFHEG00000017113)	ENSFHEG00000017070	GAN (ENSFHEG00000017051) #22	ENSFHEG00000016998	CMIP (ENSFHEG00000016988) #23	utp4 (ENSFHEG00000016892)	chtf8 (ENSFHEG00000016873)	has3 (ENSFHEG00000016862)	TANGO6 (ENSFHEG00000016855)	ENSFHEG00000016843
Mummichog	MODERN SPECIES	2394	cope (ENSFHEG00000005633)	CERS1 (ENSFHEG00000000880)	ncln (ENSFHEG00000005759)	s1pr4 (ENSFHEG00000005776)	MYO9B (ENSFHEG00000005893)	ENSFHEG00000005910	use1 (ENSFHEG00000005919)	insrb (ENSFHEG00000005985)	ENSFHEG00000005998	ARHGEF18 (ENSFHEG00000006212)	enc3 (ENSFHEG00000006243)	timm13 (ENSFHEG00000006257)	ENSFHEG00000006276	ENSFHEG00000006334	lsm7 (ENSFHEG00000006349)	ENSFHEG00000006356 #22	cers4a (ENSFHEG00000006377)	ENSFHEG00000006386	fbn2b (ENSFHEG00000006574)	CTXN1 (ENSFHEG00000006587)	timm44 (ENSFHEG00000006601)	dmap1 (ENSFHEG00000006666)	hnrnpm (ENSFHEG00000006712)	RNF220 (ENSFHEG00000006727)	guk1b (ENSFHEG00000006991)	ENSFHEG00000007009	ENSFHEG00000007021	ENSFHEG00000007040	ENSFHEG00000007061	alkal1 (ENSFHEG00000007065)	ENSFHEG00000007077
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	118	ENSGT00940000154837	ENSGT00530000063553.b.b	ENSGT00940000168336	ENSGT00950000183151.a.a.b.b	ENSGT00940000156356	ENSGT00940000157335	ENSGT00940000153348.A	ENSGT00500000044916	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00400000025006	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00390000010938	ENSGT01050000245029	ENSGT00940000159073
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	1283															ENSKMAG00000010229	GAN (ENSKMAG00000010187) #22
Turquoise killifish	DUPLICATION
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1622	il34 (ENSNFUG00015022360)	SF3B3 (ENSNFUG00015022368)	st3gal2 (ENSNFUG00015022391)	AARS (ENSNFUG00015022393)	EXOSC6 (ENSNFUG00015022404)	psme3ip1 (ENSNFUG00015022405)	ENSNFUG00015022406	zc3h18 (ENSNFUG00015022407)	trhr2 (ENSNFUG00015022408)	zfpm1 (ENSNFUG00015022409)	SMAD3 (ENSNFUG00015022410)	ENSNFUG00015022411	KIAA0513 (ENSNFUG00015022416)	foxl1 (ENSNFUG00015022423)	ACD (ENSNFUG00015022424)	GAN (ENSNFUG00015022427) #22	CMIP (ENSNFUG00015022438) #23	utp4 (ENSNFUG00015022455)	CHTF8 (ENSNFUG00015022474)	has3 (ENSNFUG00015022475)	TANGO6 (ENSNFUG00015011441)	ENSNFUG00015011452	gnmt (ENSNFUG00015011461)	ENSNFUG00015011469	ENSNFUG00015011494	ENSNFUG00015011528	ENSNFUG00015011540	cry2 (ENSNFUG00015011608)	ENSNFUG00015012607	ENSNFUG00015013054	ENSNFUG00015013067
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1626	cope (ENSNFUG00015025460)	CERS1 (ENSNFUG00015025459)	ncln (ENSNFUG00015025458)	ENSNFUG00015025455	s1pr4 (ENSNFUG00015025454)	MYO9B (ENSNFUG00015025453)	USE1 (ENSNFUG00015025452)	ENSNFUG00015025451	INSRB (ENSNFUG00015025450)	ARHGEF18 (ENSNFUG00015025449)	ENC1L (ENSNFUG00015025447)	timm13 (ENSNFUG00015025446)	ENSNFUG00015025445	ENSNFUG00015025444	lsm7 (ENSNFUG00015025443)	ENSNFUG00015025442 #22	cers4a (ENSNFUG00015025441)	fbn2b (ENSNFUG00015025440)	CTXN1 (ENSNFUG00015025439)	timm44 (ENSNFUG00015025438)	hnrnpm (ENSNFUG00015025437)	DMAP1 (ENSNFUG00015025436)	ENSNFUG00015025435	RNF220 (ENSNFUG00015025434)	guk1b (ENSNFUG00015025433)	ENSNFUG00015025432	IQCA1 (ENSNFUG00015025431)	ENSNFUG00015025430	ENSNFUG00015025429	nexn (ENSNFUG00015025428)	TAB3 (ENSNFUG00015025427)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000157089.A	ENSGT00940000159073	ENSGT00500000045734	ENSGT00390000010938	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00400000025006	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00390000004877	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248721	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000234925	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852	ENSGT00950000182808.b.b
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000177178	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a	ENSGT01030000234858	ENSGT00940000160892	ENSGT00550000074844	ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00390000004877	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000178458	ENSGT00390000015057	ENSGT01030000234925	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT00390000018698	ENSGT01060000248721	ENSGT00940000156704	ENSGT00610000087446	ENSGT00390000015889
Midas cichlid	MODERN SPECIES	740															ENSACIG00000015315	GAN (ENSACIG00000015288) #22	CMIP (ENSACIG00000015230) #23	plcg2 (ENSACIG00000015174) #24	meak7 (ENSACIG00000015149)	cotl1 (ENSACIG00000015139)	klhl36 (ENSACIG00000015118)	zgc:56622 (ENSACIG00000015094)	ENSACIG00000015092	vps9d1 (ENSACIG00000015034)	ENSACIG00000015013	ENSACIG00000014999	pdf (ENSACIG00000014977)	ENSACIG00000014970	tat (ENSACIG00000014941)	PIGY (ENSACIG00000014936)	zgc:162634 (ENSACIG00000014926)
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000177178	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a	ENSGT01030000234858	ENSGT00940000160892	ENSGT00550000074844	ENSGT01040000240400.c.a.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00390000004877	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000178458	ENSGT00390000015057	ENSGT01030000234925	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT00390000018698	ENSGT01060000248721	ENSGT00940000156704	ENSGT00390000015889	ENSGT00940000155456.f
Nile tilapia	MODERN SPECIES	19	tnni2a.4 (ENSONIG00000010787)	tnni2a.1 (ENSONIG00000010776)	ENSONIG00000029220	SYT8 (ENSONIG00000041185)	dldh (ENSONIG00000010769)	ENSONIG00000028992	ENSONIG00000030669	ENSONIG00000010767	zfpm1 (ENSONIG00000035110)	ENSONIG00000010760	ENSONIG00000034024	ENSONIG00000041520	slc13a1 (ENSONIG00000010754)	kiaa0513 (ENSONIG00000010750)	foxl1 (ENSONIG00000030034)	GAN (ENSONIG00000010745) #22	CMIP (ENSONIG00000010739) #23	meak7 (ENSONIG00000010723)	plcg2 (ENSONIG00000010726) #24	klhl36 (ENSONIG00000010716)	zgc:56622 (ENSONIG00000010709)	vps9d1 (ENSONIG00000010706)	ENSONIG00000032071	ENSONIG00000010702	pdf (ENSONIG00000010700)	ENSONIG00000042349	tat (ENSONIG00000010695)	zgc:162634 (ENSONIG00000031231)	galnt18a (ENSONIG00000030492)	ENSONIG00000041488	slc12a3 (ENSONIG00000010663)
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000177178	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a	ENSGT01030000234858	ENSGT00940000160892	ENSGT00550000074844	ENSGT01040000240400.c.a.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00390000004877	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000178458	ENSGT00390000015057	ENSGT01030000234925	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT00390000018698	ENSGT01060000248721	ENSGT00940000156704	ENSGT00390000015889	ENSGT00940000155456.f
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a	ENSGT01030000234858	ENSGT00940000160892	ENSGT00550000074844	ENSGT01040000240400.c.a.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.h	ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.g	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00390000004877	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000178458	ENSGT00390000015057	ENSGT01030000234925	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT00390000018698	ENSGT01060000248721	ENSGT00940000156704	ENSGT00390000015889	ENSGT00940000155456.f
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a	ENSGT01030000234858	ENSGT00940000160892	ENSGT00550000074844	ENSGT01040000240400.c.a.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.h	ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.g	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00390000004877	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000178458	ENSGT00390000015057	ENSGT01030000234925	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT00390000018698	ENSGT01060000248721	ENSGT00940000156704	ENSGT00390000015889	ENSGT00940000155456.f
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.b.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.b.a.c.a.a	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.b	ENSGT01030000234588.b.b.b.b.a.a.a	ENSGT01030000234858	ENSGT00940000160892	ENSGT00550000074844	ENSGT01040000240400.c.a.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.h	ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a.g	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00390000004877	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000178458	ENSGT00390000015057	ENSGT01030000234925	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT00390000018698	ENSGT01060000248721	ENSGT00940000156704	ENSGT00390000015889	ENSGT00940000155456.f
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1110	TNNI2 (ENSMZEG00005016110)	tnni2a.2 (ENSMZEG00005016116)	tnni2a.1 (ENSMZEG00005016126)	ENSMZEG00005016129	SYT8 (ENSMZEG00005016137)	dldh (ENSMZEG00005016147)	ENSMZEG00005016163	zfpm1 (ENSMZEG00005016182)	ces3 (ENSMZEG00005016193)	slc13a1 (ENSMZEG00005016201)	ENSMZEG00005016206	slc13a1 (ENSMZEG00005016213)	kiaa0513 (ENSMZEG00005016224)	foxl1 (ENSMZEG00005016238)	ENSMZEG00005016243	GAN (ENSMZEG00005016250) #22	CMIP (ENSMZEG00005016284) #23	plcg2 (ENSMZEG00005000123) #24	ENSMZEG00005000142	meak7 (ENSMZEG00005000154)	cotl1 (ENSMZEG00005000167)	klhl36 (ENSMZEG00005000205)	zgc:56622 (ENSMZEG00005000274)	ENSMZEG00005000313	vps9d1 (ENSMZEG00005000331)	ENSMZEG00005000354	ENSMZEG00005000383	ENSMZEG00005000397	pdf (ENSMZEG00005000424)	tat (ENSMZEG00005000436)	zgc:162634 (ENSMZEG00005000487)
Eastern happy	MODERN SPECIES	19	tnni2a.1 (ENSACLG00000001530)	ENSACLG00000001500	SYT8 (ENSACLG00000001358)	dldh (ENSACLG00000001270)	ENSACLG00000001259	zfpm1 (ENSACLG00000001201)	ces3 (ENSACLG00000001188)	ENSACLG00000001179	ENSACLG00000001172	ENSACLG00000001165	ENSACLG00000001131	slc13a1 (ENSACLG00000001095)	kiaa0513 (ENSACLG00000000993)	foxl1 (ENSACLG00000000884)	ENSACLG00000000869	GAN (ENSACLG00000000819) #22	CMIP (ENSACLG00000000732) #23	plcg2 (ENSACLG00000000692) #24	meak7 (ENSACLG00000000686)	cotl1 (ENSACLG00000000664)	klhl36 (ENSACLG00000000630)	zgc:56622 (ENSACLG00000000605)	vps9d1 (ENSACLG00000000572)	ENSACLG00000000208	ENSACLG00000024607	pdf (ENSACLG00000024630)	ENSACLG00000024594	tat (ENSACLG00000024554)	zgc:162634 (ENSACLG00000024539)	galnt18a (ENSACLG00000024512)	ENSACLG00000024452
P. nyererei	MODERN SPECIES	513								ENSPNYG00000006500	zfpm1 (ENSPNYG00000006516)	ces3 (ENSPNYG00000006596)	slc13a1 (ENSPNYG00000006774)	slc13a1 (ENSPNYG00000006849)	kiaa0513 (ENSPNYG00000006902)	foxl1 (ENSPNYG00000006944)	ENSPNYG00000006954	GAN (ENSPNYG00000006972) #22	CMIP (ENSPNYG00000007031) #23	plcg2 (ENSPNYG00000007118) #24	meak7 (ENSPNYG00000007362)	cotl1 (ENSPNYG00000007376)	zgc:56622 (ENSPNYG00000007404)	klhl36 (ENSPNYG00000007440)	ENSPNYG00000007475	ENSPNYG00000007483	ENSPNYG00000007491	ENSPNYG00000007518	pdf (ENSPNYG00000007534)	ENSPNYG00000007549	tat (ENSPNYG00000007558)	zgc:162634 (ENSPNYG00000007586)	galnt18a (ENSPNYG00000007610)
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	495								ENSHBUG00000018231	zfpm1 (ENSHBUG00000018289)	ces3 (ENSHBUG00000018302)	ENSHBUG00000018337	slc13a1 (ENSHBUG00000000540)	kiaa0513 (ENSHBUG00000018454)	foxl1 (ENSHBUG00000018482)	ENSHBUG00000018507	GAN (ENSHBUG00000018554) #22	CMIP (ENSHBUG00000018662) #23	plcg2 (ENSHBUG00000018683) #24	meak7 (ENSHBUG00000018703)	cotl1 (ENSHBUG00000018725)	klhl36 (ENSHBUG00000018751)	zgc:56622 (ENSHBUG00000018768)	ENSHBUG00000018797	vps9d1 (ENSHBUG00000018818)	ENSHBUG00000018832	pdf (ENSHBUG00000018841)	ENSHBUG00000018858	tat (ENSHBUG00000018907)	zgc:162634 (ENSHBUG00000018915)	galnt18a (ENSHBUG00000019040)	slc12a3 (ENSHBUG00000019106)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	402									ENSNBRG00000016459	ENSNBRG00000016471	ENSNBRG00000016481	ENSNBRG00000016491	kiaa0513 (ENSNBRG00000016505)	foxl1 (ENSNBRG00000016546)	ENSNBRG00000016558	ENSNBRG00000016567 #22	ENSNBRG00000016580	plcg2 (ENSNBRG00000016653) #24	meak7 (ENSNBRG00000016784)	cotl1 (ENSNBRG00000016810)	klhl36 (ENSNBRG00000016825)	zgc:56622 (ENSNBRG00000016847)	ENSNBRG00000016861	vps9d1 (ENSNBRG00000016884)	ENSNBRG00000016983	ENSNBRG00000016999	pdf (ENSNBRG00000017010)	ENSNBRG00000017017	tat (ENSNBRG00000017026)	PIGY (ENSNBRG00000017047)	galnt18a (ENSNBRG00000017054)
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000159073	ENSGT00390000010938.g	ENSGT00500000045734	ENSGT00390000010938.h	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00400000025006	ENSGT00940000153533.b.f	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000165840	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248721	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000234925	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	1547											ENSSPAG00000016571	ENSSPAG00000016591	kiaa0513 (ENSSPAG00000016606)	foxl1 (ENSSPAG00000016649)	ENSSPAG00000016658	GAN (ENSSPAG00000016671) #22	CMIP (ENSSPAG00000016729) #23	ENSSPAG00000016810
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	56	ENSGT00940000157089.A	ENSGT00940000159073	ENSGT00500000045734	ENSGT00390000010938.h	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00400000025006	ENSGT00940000153533.b.f	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00940000157517.l #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248721	ENSGT00390000018698	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852	ENSGT00950000182808.b.b	ENSGT00950000182832.D.a	ENSGT01060000250195	ENSGT00940000158102
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	73	ENSGT00940000157089.A	ENSGT00940000159073	ENSGT00500000045734	ENSGT00390000010938.h	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00400000025006	ENSGT00940000153533.b.f.a	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00940000165840	ENSGT00940000157517.l #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248721	ENSGT00390000018698	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852	ENSGT00950000182808.b.b	ENSGT00950000182832.D.a	ENSGT01060000250195
Orange clownfish	MODERN SPECIES	18	cry2 (ENSAPEG00000005191)	ENSAPEG00000005212	TANGO6 (ENSAPEG00000005303)	has3 (ENSAPEG00000005332)	chtf8 (ENSAPEG00000005370)	utp4 (ENSAPEG00000005422)	ENSAPEG00000005439	ENSAPEG00000005471	zc3h18 (ENSAPEG00000005491)	trhr2 (ENSAPEG00000005509)	zfpm1 (ENSAPEG00000005596)	ces3 (ENSAPEG00000005688)	kiaa0513 (ENSAPEG00000005757)	foxl1 (ENSAPEG00000005843)	ENSAPEG00000005862	GAN (ENSAPEG00000005883) #22	ENSAPEG00000005936	ENSAPEG00000005949	plcg2 (ENSAPEG00000006014) #24	meak7 (ENSAPEG00000006095)	cotl1 (ENSAPEG00000006109)	klhl36 (ENSAPEG00000006132)	zgc:56622 (ENSAPEG00000006173)	tat (ENSAPEG00000006198)	ENSAPEG00000006244	pdf (ENSAPEG00000006258)	ENSAPEG00000006276	vps9d1 (ENSAPEG00000006328)	znf276 (ENSAPEG00000006394)	slc10a3 (ENSAPEG00000006445)	chmp1a (ENSAPEG00000006460)
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	931													ces3 (ENSAOCG00000023324)	foxl1 (ENSAOCG00000023391)	ENSAOCG00000023406	GAN (ENSAOCG00000023424) #22
Spiny chromis	DUPLICATION
Spiny chromis	MODERN SPECIES	1105												ENSAPOG00000016561	kiaa0513 (ENSAPOG00000016621)	foxl1 (ENSAPOG00000016637)	ENSAPOG00000016658	GAN (ENSAPOG00000016717) #22
Spiny chromis	DUPLICATION
Spiny chromis	MODERN SPECIES	4416																ENSAPOG00000010178 #22
Spiny chromis	MODERN SPECIES	4415																ENSAPOG00000010192 #22
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157089.A	ENSGT00940000159073	ENSGT00500000045734	ENSGT00390000010938	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00400000025006	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248721	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000234925	ENSGT00390000015057	ENSGT00970000193565	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157089.A	ENSGT00940000159073	ENSGT00500000045734	ENSGT00390000010938	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00400000025006	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248721	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000234925	ENSGT00390000015057	ENSGT00970000193565	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000157089.A	ENSGT00940000159073	ENSGT00500000045734	ENSGT00390000010938	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00400000025006	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248721	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000234925	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852	ENSGT00950000182808.b.b
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	6	utp4 (ENSLBEG00000006956)	ENSLBEG00000006992	zc3h18 (ENSLBEG00000007020)	trhr2 (ENSLBEG00000007079)	ENSLBEG00000007101	ENSLBEG00000007123	ENSLBEG00000007146	ENSLBEG00000007201	ENSLBEG00000007230	ENSLBEG00000007257	zfpm1 (ENSLBEG00000007278)	ces3 (ENSLBEG00000007304)	kiaa0513 (ENSLBEG00000007334)	foxl1 (ENSLBEG00000007468)	ENSLBEG00000007497	GAN (ENSLBEG00000007542) #22	CMIP (ENSLBEG00000007670) #23	cry2 (ENSLBEG00000007779)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000012935	ENSGT00940000157089.A	ENSGT00940000159073	ENSGT00390000010938	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00400000025006	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248721	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000234925	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000174092	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00390000012935	ENSGT00940000157089.A	ENSGT00940000159073	ENSGT00390000010938	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00400000025006	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248721	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000234925	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000174092	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00390000012935	ENSGT00940000157089.A	ENSGT00940000159073	ENSGT00390000010938	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00400000025006	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248721	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000234925	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852	ENSGT00950000182808.b.b
Pike perch	MODERN SPECIES	67										trhr2 (ENSSLUG00000017968)	zfpm1 (ENSSLUG00000017956)	ces3 (ENSSLUG00000017928)	kiaa0513 (ENSSLUG00000017917)	foxl1 (ENSSLUG00000017913)	ENSSLUG00000017902	GAN (ENSSLUG00000017869) #22	CMIP (ENSSLUG00000017839) #23	plcg2 (ENSSLUG00000017308) #24	meak7 (ENSSLUG00000017263)	cotl1 (ENSSLUG00000017257)	klhl36 (ENSSLUG00000017253)	zgc:56622 (ENSSLUG00000017215)	tat (ENSSLUG00000016843)	ENSSLUG00000016817	ENSSLUG00000016812	pdf (ENSSLUG00000016810)	ENSSLUG00000016806	ENSSLUG00000016801	vps9d1 (ENSSLUG00000016782)	ENSSLUG00000016772	ENSSLUG00000016771
Channel bull blenny	DUPLICATION
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	20	mapk8ip1a (ENSCGOG00000003471)	cry2 (ENSCGOG00000003563)	ENSCGOG00000008118	TANGO6 (ENSCGOG00000008127)	has3 (ENSCGOG00000002619)	chtf8 (ENSCGOG00000002648)	utp4 (ENSCGOG00000002730)	ENSCGOG00000003108	zc3h18 (ENSCGOG00000003113)	trhr2 (ENSCGOG00000003126)	zfpm1 (ENSCGOG00000003130)	ces3 (ENSCGOG00000003135)	kiaa0513 (ENSCGOG00000003162)	foxl1 (ENSCGOG00000003172)	ENSCGOG00000003175	GAN (ENSCGOG00000003188) #22	CMIP (ENSCGOG00000003368) #23	plcg2 (ENSCGOG00000003710) #24	meak7 (ENSCGOG00000004651)	ENSCGOG00000004654	cotl1 (ENSCGOG00000004657)	klhl36 (ENSCGOG00000004662)	zgc:56622 (ENSCGOG00000004666)	tat (ENSCGOG00000004669)	pdf (ENSCGOG00000004673)	ENSCGOG00000004674	ENSCGOG00000004675	vps9d1 (ENSCGOG00000004688)	znf276 (ENSCGOG00000004701)	ENSCGOG00000004703	slc10a3 (ENSCGOG00000004714)
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	18	ENSCGOG00000006249	mydgf (ENSCGOG00000006251)	tnfaip8l1 (ENSCGOG00000006254)	cope (ENSCGOG00000006264)	ENSCGOG00000006455	s1pr4 (ENSCGOG00000006459)	MYO9B (ENSCGOG00000006491)	use1 (ENSCGOG00000007697)	insrb (ENSCGOG00000007810)	ARHGEF18 (ENSCGOG00000012239)	enc3 (ENSCGOG00000012243)	timm13 (ENSCGOG00000012245)	ENSCGOG00000012252	ENSCGOG00000012254	lsm7 (ENSCGOG00000012255)	ENSCGOG00000012261 #22	cers4a (ENSCGOG00000012265)	fbn2b (ENSCGOG00000012309)	CTXN1 (ENSCGOG00000012568)	timm44 (ENSCGOG00000012571)	hnrnpm (ENSCGOG00000012800)	dmap1 (ENSCGOG00000012828)	RNF220 (ENSCGOG00000012976)	guk1b (ENSCGOG00000012984)	ENSCGOG00000013037	PTBP1 (ENSCGOG00000013058)	EFNA2 (ENSCGOG00000013746)	ENSCGOG00000013749	ENSCGOG00000013751	ENSCGOG00000013753	ENSCGOG00000013767
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00390000014757	ENSGT00390000012935	ENSGT00940000157089.A	ENSGT00390000010938	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00400000025006	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00390000009899.a.d	ENSGT00390000014700.b.a.a	ENSGT00940000155112.A.c	ENSGT00940000156672.o.a	ENSGT00940000153717.b.g	ENSGT00390000005430	ENSGT00940000155391.a.a	ENSGT01100000263489.a.a.b.a.a.b.a.a.b	ENSGT00390000000221.A.d	ENSGT00390000006367.d	ENSGT00940000157791	ENSGT00940000153962.a	ENSGT00940000159028	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.a
Stickleback	MODERN SPECIES	14	setd6 (ENSGACG00000002601)	ENSGACG00000002591	ENSGACG00000002586	ENSGACG00000002581	ENSGACG00000002580	ENSGACG00000002579	ENSGACG00000002574	ENSGACG00000002572	ENSGACG00000002568	ENSGACG00000002565	trhr2 (ENSGACG00000002560)	zfpm1 (ENSGACG00000002554)	ces3 (ENSGACG00000002541)	kiaa0513 (ENSGACG00000002538)	ENSGACG00000002537	GAN (ENSGACG00000002529) #22	ENSGACG00000002528	ENSGACG00000002527	ppp6r3 (ENSGACG00000002520)	ric8a (ENSGACG00000002515)	ENSGACG00000002513	carmil2 (ENSGACG00000002509)	ctcf (ENSGACG00000002504)	ripor1 (ENSGACG00000002497)	ENSGACG00000002495	ENSGACG00000002490	ENSGACG00000002487	far1 (ENSGACG00000002476)	OVCH2 (ENSGACG00000002468)	cyb5r2 (ENSGACG00000002457)	poglut3 (ENSGACG00000002456)
Lumpfish	DUPLICATION
Lumpfish	MODERN SPECIES	21	ckap5 (ENSCLMG00005006695)	cstpp1 (ENSCLMG00005006681)	mapk8ip1a (ENSCLMG00005006678)	TANGO6 (ENSCLMG00005006670)	has3 (ENSCLMG00005006668)	chtf8 (ENSCLMG00005006667)	utp4 (ENSCLMG00005006659)	ENSCLMG00005006656	zc3h18 (ENSCLMG00005006641)	trhr2 (ENSCLMG00005006632)	zfpm1 (ENSCLMG00005006630)	ces3 (ENSCLMG00005006249)	kiaa0513 (ENSCLMG00005006245)	foxl1 (ENSCLMG00005006244)	ENSCLMG00005006242	GAN (ENSCLMG00005006232) #22	CMIP (ENSCLMG00005006136) #23	ppp6r3 (ENSCLMG00005005924)	ric8a (ENSCLMG00005005890)	ctcf (ENSCLMG00005005872)	ripor1 (ENSCLMG00005005870)	ENSCLMG00005005869	ENSCLMG00005005240	ENSCLMG00005005237	ENSCLMG00005005236	poglut3 (ENSCLMG00005005235)	PPFIBP2 (ENSCLMG00005003777)	bmal1a (ENSCLMG00005003168)	btbd10a (ENSCLMG00005003128)	PIGY (ENSCLMG00005003118)	zgc:162634 (ENSCLMG00005003115)
Lumpfish	MODERN SPECIES	19	tnfaip8l1 (ENSCLMG00005005794)	cope (ENSCLMG00005005717)	CERS1 (ENSCLMG00005005714)	ncln (ENSCLMG00005005696)	s1pr4 (ENSCLMG00005005694)	MYO9B (ENSCLMG00005003085)	use1 (ENSCLMG00005002825)	insrb (ENSCLMG00005022671)	ENSCLMG00005022613	ENSCLMG00005022612	ARHGEF18 (ENSCLMG00005022606)	enc3 (ENSCLMG00005022601)	timm13 (ENSCLMG00005022600)	ENSCLMG00005022599	lsm7 (ENSCLMG00005022598)	ENSCLMG00005022596 #22	cers4a (ENSCLMG00005022557)	fbn2b (ENSCLMG00005022553)	ENSCLMG00005022552	CTXN1 (ENSCLMG00005022551)	timm44 (ENSCLMG00005022460)	hnrnpm (ENSCLMG00005022453)	dmap1 (ENSCLMG00005022452)	ENSCLMG00005022451	guk1b (ENSCLMG00005022450)	ENSCLMG00005022449	ENSCLMG00005022448	ENSCLMG00005022447	zgc:153738 (ENSCLMG00005022442)	ENSCLMG00005022439	ENSCLMG00005022438
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000157089.A	ENSGT00940000159073	ENSGT00500000045734	ENSGT00390000010938	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00400000025006	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187.h	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248721	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000234925	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000174092	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	22	ENSSAUG00010022215	TANGO6 (ENSSAUG00010022213)	chtf8 (ENSSAUG00010022212)	ENSSAUG00010022211	utp4 (ENSSAUG00010022210)	zc3h18 (ENSSAUG00010022208)	ENSSAUG00010022206	ENSSAUG00010022204	trhr2 (ENSSAUG00010022202)	ENSSAUG00010022201	zfpm1 (ENSSAUG00010022200)	ces3 (ENSSAUG00010022197)	kiaa0513 (ENSSAUG00010022194)	ENSSAUG00010022193	ENSSAUG00010022192	GAN (ENSSAUG00010022189) #22	CMIP (ENSSAUG00010022145) #23	NTRK3 (ENSSAUG00010021890)	ENSSAUG00010021872	ENSSAUG00010021870	COX8b (ENSSAUG00010021868)	tmem170a (ENSSAUG00010021867)	ppp6r3 (ENSSAUG00010021811)	ric8a (ENSSAUG00010021803)	ENSSAUG00010021800	ENSSAUG00010021799	ENSSAUG00010021792	ctcf (ENSSAUG00010021787)	ripor1 (ENSSAUG00010021781)	ENSSAUG00010021770	ENSSAUG00010021769
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00940000157089.A	ENSGT00940000159073	ENSGT00500000045734	ENSGT00390000010938	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00400000025006	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187.h	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248721	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000234925	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852	ENSGT00950000182808.b.b
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	492	ENSLCRG00005005507	ifitm5 (ENSLCRG00005005506)	cry2 (ENSLCRG00005001537)	TANGO6 (ENSLCRG00005001387)	has3 (ENSLCRG00005001383)	chtf8 (ENSLCRG00005001380)	utp4 (ENSLCRG00005001377)	ENSLCRG00005023364	zc3h18 (ENSLCRG00005023362)	trhr2 (ENSLCRG00005023361)	zfpm1 (ENSLCRG00005023359)	ces3 (ENSLCRG00005023357)	kiaa0513 (ENSLCRG00005023351)	foxl1 (ENSLCRG00005023350)	ENSLCRG00005023348	GAN (ENSLCRG00005023343) #22	CMIP (ENSLCRG00005023322) #23	ENSLCRG00005023252	exosc6 (ENSLCRG00005023240)	aars1 (ENSLCRG00005023238)	st3gal2 (ENSLCRG00005023236)	ENSLCRG00005023234	hsf4 (ENSLCRG00005023233)	gnao1a (ENSLCRG00005023228)	cbfb (ENSLCRG00005023225)	phaf1 (ENSLCRG00005023209)	B3GNT9 (ENSLCRG00005023205)	bbs2 (ENSLCRG00005023202)	ENSLCRG00005023194	psme3ip1 (ENSLCRG00005023192)	cpne2 (ENSLCRG00005023173)
European seabass	DUPLICATION
European seabass	MODERN SPECIES	19	cry2 (ENSDLAG00005019570)	ENSDLAG00005029893	CHTF8 (ENSDLAG00005028361)	ENSDLAG00005034980	TANGO6 (ENSDLAG00005019502)	HAS3 (ENSDLAG00005019483)	UTP4 (ENSDLAG00005019458)	ENSDLAG00005019452	zc3h18 (ENSDLAG00005019413)	ENSDLAG00005019403	ENSDLAG00005019400	ENSDLAG00005005303	ENSDLAG00005034834	zfpm1 (ENSDLAG00005019395)	ENSDLAG00005019369	ENSDLAG00005019228 #22	ENSDLAG00005034219	ENSDLAG00005019352	ENSDLAG00005018676 #23	plcg2 (ENSDLAG00005018456) #24	cotl1 (ENSDLAG00005018434)	klhl36 (ENSDLAG00005018420)	zgc:56622 (ENSDLAG00005033989)	tat (ENSDLAG00005018405)	ENSDLAG00005030188	pdf (ENSDLAG00005026841)	ENSDLAG00005034328	ENSDLAG00005018363	ZNF276 (ENSDLAG00005018243)	vps9d1 (ENSDLAG00005018283)	ENSDLAG00005018264
European seabass	MODERN SPECIES	17	mibp (ENSDLAG00005018798)	loxl5a (ENSDLAG00005018726)	mydgf (ENSDLAG00005018703)	tnfaip8l1 (ENSDLAG00005030047)	ENSDLAG00005018560	ENSDLAG00005030951	ncln (ENSDLAG00005030273)	s1pr4 (ENSDLAG00005018036)	ENSDLAG00005014930	use1 (ENSDLAG00005028648)	insrb (ENSDLAG00005009460)	ENSDLAG00005009327	enc3 (ENSDLAG00005009313)	timm13 (ENSDLAG00005028836)	ENSDLAG00005027045	ENSDLAG00005009280 #22	cers4a (ENSDLAG00005034667)	ENSDLAG00005008432	ENSDLAG00005027887	timm44 (ENSDLAG00005007613)	ENSDLAG00005007457	dmap1 (ENSDLAG00005007370)	ENSDLAG00005007340	guk1b (ENSDLAG00005007285)	ENSDLAG00005029309	zgc:153738 (ENSDLAG00005007126)	alkal1 (ENSDLAG00005007111)	ENSDLAG00005007086	nexn (ENSDLAG00005006907)	tab3 (ENSDLAG00005006896)	tmem47 (ENSDLAG00005006885)
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000003488.a.b.a	ENSGT00390000003478	ENSGT01030000234515.b	ENSGT00500000044945.a	ENSGT01050000244887.B	ENSGT00940000156845	ENSGT00390000014361	ENSGT00940000155404.i.b	ENSGT00940000157375.c	ENSGT00950000182983.B.a.a	ENSGT00390000014000	ENSGT00940000159993	ENSGT00510000047872	ENSGT00940000162251	ENSGT00390000004877	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT01030000234515.a.b.b.a	ENSGT00950000183158.A	ENSGT00940000154412.C.c.b	ENSGT00390000000051.a	ENSGT00940000154595	ENSGT00390000016466	ENSGT00390000016573.c.a	ENSGT00940000155815.p	ENSGT00940000154756.B.v	ENSGT00940000154067.c	ENSGT00940000159969.a	ENSGT00940000159600	ENSGT00730000111176	ENSGT00940000159499	ENSGT00530000063484.b.b.d.a
Fugu	MODERN SPECIES	72	ENSTRUG00000029030	ENSTRUG00000027889	ENSTRUG00000027149	ENSTRUG00000028607	ENSTRUG00000026291	ENSTRUG00000026135	ENSTRUG00000032637	ENSTRUG00000031560	ENSTRUG00000027557	ENSTRUG00000029096	ENSTRUG00000028443	ENSTRUG00000030518	kiaa0513 (ENSTRUG00000001253)	foxl1 (ENSTRUG00000022141)	ENSTRUG00000025080	GAN (ENSTRUG00000002411) #22	ENSTRUG00000032209	CMIP (ENSTRUG00000001215) #23	ENSTRUG00000032611	ENSTRUG00000001061	exosc6 (ENSTRUG00000029773)	st3gal2 (ENSTRUG00000004825)	aars1 (ENSTRUG00000000907)	phaf1 (ENSTRUG00000000802)	B3GNT9 (ENSTRUG00000028196)	bbs2 (ENSTRUG00000030158)	has3 (ENSTRUG00000032372)	ENSTRUG00000032154	ENSTRUG00000000869	ENSTRUG00000033335	anpepb.1 (ENSTRUG00000006327)
Tetraodon	DUPLICATION
Tetraodon	DUPLICATION
Tetraodon	MODERN SPECIES	26	rab1aa (ENSTNIG00000004511)	ENSTNIG00000000505	ENSTNIG00000005866	TAAR1 (ENSTNIG00000004514)	TAAR1 (ENSTNIG00000004515)	TAAR1 (ENSTNIG00000001410)	ENSTNIG00000004517	RIMBP2 (ENSTNIG00000004518)	ENSTNIG00000004519	slc35c2 (ENSTNIG00000004520)	ENSTNIG00000000310	ces3 (ENSTNIG00000004525)	kiaa0513 (ENSTNIG00000004526)	foxl1 (ENSTNIG00000004527)	GAN (ENSTNIG00000004528) #22	GAN (ENSTNIG00000004529) #22	TSC22D3 (ENSTNIG00000001752)	limk1a (ENSTNIG00000004543)	limk1a (ENSTNIG00000004544)	sdf2l1 (ENSTNIG00000004545)	marveld2b (ENSTNIG00000004546)	oclnb (ENSTNIG00000004547)	gtf2h2 (ENSTNIG00000004548)	dhfr (ENSTNIG00000004549)	fam151b (ENSTNIG00000004550)	serpina7 (ENSTNIG00000004551)	carnmt1 (ENSTNIG00000004552)	trpm6 (ENSTNIG00000004554)	ENSTNIG00000004556	nucks1a (ENSTNIG00000004557)	ENSTNIG00000004571
Tetraodon	MODERN SPECIES	26	SPRED2 (ENSTNIG00000004509)	rab1aa (ENSTNIG00000004511)	ENSTNIG00000000505	ENSTNIG00000005866	TAAR1 (ENSTNIG00000004514)	TAAR1 (ENSTNIG00000004515)	TAAR1 (ENSTNIG00000001410)	ENSTNIG00000004517	RIMBP2 (ENSTNIG00000004518)	ENSTNIG00000004519	slc35c2 (ENSTNIG00000004520)	ENSTNIG00000000310	ces3 (ENSTNIG00000004525)	kiaa0513 (ENSTNIG00000004526)	foxl1 (ENSTNIG00000004527)	GAN (ENSTNIG00000004528) #22	GAN (ENSTNIG00000004529) #22	TSC22D3 (ENSTNIG00000001752)	limk1a (ENSTNIG00000004543)	limk1a (ENSTNIG00000004544)	sdf2l1 (ENSTNIG00000004545)	marveld2b (ENSTNIG00000004546)	oclnb (ENSTNIG00000004547)	gtf2h2 (ENSTNIG00000004548)	dhfr (ENSTNIG00000004549)	fam151b (ENSTNIG00000004550)	serpina7 (ENSTNIG00000004551)	carnmt1 (ENSTNIG00000004552)	trpm6 (ENSTNIG00000004554)	ENSTNIG00000004556	nucks1a (ENSTNIG00000004557)
Tetraodon	MODERN SPECIES		tnfaip8l1 (ENSTNIG00000015511)	cope (ENSTNIG00000015512)	CERS1 (ENSTNIG00000015513)	ncln (ENSTNIG00000015514)	s1pr4 (ENSTNIG00000015515)	ENSTNIG00000015516	use1 (ENSTNIG00000015517)	insrb (ENSTNIG00000015518)	ARHGEF18 (ENSTNIG00000015519)	enc3 (ENSTNIG00000015520)	enc3 (ENSTNIG00000015521)	timm13 (ENSTNIG00000015522)	ENSTNIG00000015523	ENSTNIG00000015524	lsm7 (ENSTNIG00000015525)	ENSTNIG00000015526 #22	cers4a (ENSTNIG00000015527)	fbn2b (ENSTNIG00000015528)	timm44 (ENSTNIG00000015529)	hnrnpm (ENSTNIG00000015530)	dmap1 (ENSTNIG00000015531)	guk1b (ENSTNIG00000015532)	ENSTNIG00000015533	zgc:153738 (ENSTNIG00000015534)	ENSTNIG00000015535	nexn (ENSTNIG00000015536)	tab3 (ENSTNIG00000015537)	tmem47 (ENSTNIG00000015538)	prrg1 (ENSTNIG00000019762)	cpox (ENSTNIG00000015539)	ENSTNIG00000015540
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157089.A	ENSGT00940000159073	ENSGT00500000045734	ENSGT00390000010938	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00400000025006	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248721	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000234925	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852	ENSGT00950000182808.b.b
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000012935	ENSGT00940000157089.A	ENSGT00940000159073	ENSGT00390000010938	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00400000025006	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00390000004877	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248721	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000234925	ENSGT00390000015057	ENSGT00970000193565	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	20	cstpp1 (ENSMAMG00000011696)	ENSMAMG00000011713	cry2 (ENSMAMG00000011756)	TANGO6 (ENSMAMG00000011798)	HAS3 (ENSMAMG00000011817)	chtf8 (ENSMAMG00000024260)	UTP4 (ENSMAMG00000011957)	ENSMAMG00000011967	zc3h18 (ENSMAMG00000011979)	ENSMAMG00000012010	zfpm1 (ENSMAMG00000012173)	ces3 (ENSMAMG00000012187)	kiaa0513 (ENSMAMG00000012203)	ENSMAMG00000012214	ENSMAMG00000012231	ENSMAMG00000012242 #22	ENSMAMG00000012289 #23	plcg2 (ENSMAMG00000012362) #24	meak7 (ENSMAMG00000012494)	cotl1 (ENSMAMG00000012505)	klhl36 (ENSMAMG00000012516)	zgc:56622 (ENSMAMG00000012553)	tat (ENSMAMG00000012593)	ENSMAMG00000012621	pdf (ENSMAMG00000012648)	ENSMAMG00000025342	ENSMAMG00000012663	vps9d1 (ENSMAMG00000012691)	ENSMAMG00000012746	ENSMAMG00000012762	ENSMAMG00000012768
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000012935	ENSGT00940000157089.A	ENSGT00940000159073	ENSGT00390000010938	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00400000025006	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00390000004877	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248721	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000234925	ENSGT00390000015057	ENSGT00970000193565	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852
Climbing perch	MODERN SPECIES	19	cstpp1 (ENSATEG00000005484)	ENSATEG00000026055	cry2 (ENSATEG00000005498)	TANGO6 (ENSATEG00000005557)	HAS3 (ENSATEG00000030007)	chtf8 (ENSATEG00000005576)	UTP4 (ENSATEG00000005607)	ENSATEG00000005620	zc3h18 (ENSATEG00000005626)	ENSATEG00000005634	zfpm1 (ENSATEG00000005697)	ces3 (ENSATEG00000005709)	kiaa0513 (ENSATEG00000005723)	ENSATEG00000005732	ENSATEG00000005752	ENSATEG00000005791 #22	ENSATEG00000005849 #23	plcg2 (ENSATEG00000005977) #24	ENSATEG00000006138	klhl36 (ENSATEG00000006170)	zgc:56622 (ENSATEG00000006212)	tat (ENSATEG00000006269)	ENSATEG00000006325	pdf (ENSATEG00000006343)	ENSATEG00000028101	ENSATEG00000006388	vps9d1 (ENSATEG00000006428)	ENSATEG00000028769	znf276 (ENSATEG00000006469)	ENSATEG00000006502	chmp1a (ENSATEG00000006509)
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	17	cry2 (ENSBSLG00000023115)	TANGO6 (ENSBSLG00000023438)	has3 (ENSBSLG00000023443)	ENSBSLG00000023490	ENSBSLG00000023580	chtf8 (ENSBSLG00000023582)	utp4 (ENSBSLG00000023600)	ENSBSLG00000023646	zc3h18 (ENSBSLG00000023654)	trhr2 (ENSBSLG00000023680)	zfpm1 (ENSBSLG00000023690)	ces3 (ENSBSLG00000023704)	kiaa0513 (ENSBSLG00000023723)	foxl1 (ENSBSLG00000023744)	ENSBSLG00000023746	GAN (ENSBSLG00000023750) #22	CMIP (ENSBSLG00000023763) #23	meak7 (ENSBSLG00000023846)	cotl1 (ENSBSLG00000023865)	klhl36 (ENSBSLG00000023879)	zgc:56622 (ENSBSLG00000023898)	tat (ENSBSLG00000000704)	ENSBSLG00000000914	pdf (ENSBSLG00000000917)	ENSBSLG00000000922	ENSBSLG00000000924	vps9d1 (ENSBSLG00000000926)	znf276 (ENSBSLG00000000937)	FANCA (ENSBSLG00000000941)	slc10a3 (ENSBSLG00000000950)	chmp1a (ENSBSLG00000000952)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157089.A	ENSGT00940000159073	ENSGT00500000045734	ENSGT00390000010938	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00400000025006	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248721	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000234925	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852	ENSGT00950000182808.b.b
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157089.A	ENSGT00940000159073	ENSGT00500000045734	ENSGT00390000010938	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00400000025006	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00940000165840	ENSGT00390000018220 #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248721	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000234925	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157089.A	ENSGT00940000159073	ENSGT00500000045734	ENSGT00390000010938	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00400000025006	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00940000170707	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000175365	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00940000165840	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT01060000248721	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000234925	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852	ENSGT00950000182808.b.b
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3283	ENSSLDG00000005566	cry2 (ENSSLDG00000005500)	ENSSLDG00000005476	TANGO6 (ENSSLDG00000005411)	has3 (ENSSLDG00000005307)	chtf8 (ENSSLDG00000005276)	utp4 (ENSSLDG00000005258)	ENSSLDG00000005237	zc3h18 (ENSSLDG00000005204)	trhr2 (ENSSLDG00000005157)	zfpm1 (ENSSLDG00000005129)	ces3 (ENSSLDG00000005094)	kiaa0513 (ENSSLDG00000005035)	foxl1 (ENSSLDG00000005001)	ENSSLDG00000004984	GAN (ENSSLDG00000004896) #22	ENSSLDG00000004812	plcg2 (ENSSLDG00000004667) #24	meak7 (ENSSLDG00000004631)	cotl1 (ENSSLDG00000004596)	klhl36 (ENSSLDG00000004548)	zgc:56622 (ENSSLDG00000004501)	tat (ENSSLDG00000004421)	ENSSLDG00000004394	pdf (ENSSLDG00000004374)	ENSSLDG00000004357	ENSSLDG00000004326	vps9d1 (ENSSLDG00000004304)	znf276 (ENSSLDG00000004288)	slc10a3 (ENSSLDG00000004272)	chmp1a (ENSSLDG00000004249)
Greater amberjack	MODERN SPECIES	86	ENSSDUG00000002889	ENSSDUG00000002898	TANGO6 (ENSSDUG00000002911)	has3 (ENSSDUG00000002947)	chtf8 (ENSSDUG00000002954)	utp4 (ENSSDUG00000002976)	ENSSDUG00000003024	zc3h18 (ENSSDUG00000003040)	trhr2 (ENSSDUG00000003096)	zfpm1 (ENSSDUG00000003117)	ces3 (ENSSDUG00000003148)	kiaa0513 (ENSSDUG00000003366)	foxl1 (ENSSDUG00000003405)	ENSSDUG00000003414	ENSSDUG00000003429	GAN (ENSSDUG00000003438) #22	ENSSDUG00000003487	plcg2 (ENSSDUG00000003625) #24	meak7 (ENSSDUG00000004482)	cotl1 (ENSSDUG00000004492)	klhl36 (ENSSDUG00000004504)	zgc:56622 (ENSSDUG00000004548)	tat (ENSSDUG00000004645)	ENSSDUG00000004674	pdf (ENSSDUG00000004692)	ENSSDUG00000004701
Barramundi perch	MODERN SPECIES	217	cry2 (ENSLCAG00010020865)	ENSLCAG00010020858	ENSLCAG00010020856	utp4 (ENSLCAG00010020852)	chtf8 (ENSLCAG00010020847)	has3 (ENSLCAG00010020845)	TANGO6 (ENSLCAG00010020843)	ENSLCAG00010020837	zc3h18 (ENSLCAG00010020827)	trhr2 (ENSLCAG00010020822)	zfpm1 (ENSLCAG00010020819)	ces3 (ENSLCAG00010020780)	kiaa0513 (ENSLCAG00010020730)	ENSLCAG00010020713	ENSLCAG00010020709	GAN (ENSLCAG00010020686) #22	CMIP (ENSLCAG00010020528) #23	plcg2 (ENSLCAG00010020245) #24	meak7 (ENSLCAG00010020206)	ENSLCAG00010020203	cotl1 (ENSLCAG00010020202)	klhl36 (ENSLCAG00010020196)	zgc:56622 (ENSLCAG00010020188)	tat (ENSLCAG00010020085)	ENSLCAG00010020054	pdf (ENSLCAG00010020051)	ENSLCAG00010020045	ENSLCAG00010020040	vps9d1 (ENSLCAG00010020012)
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000154779.a.a.d	ENSGT00390000000777	ENSGT00390000003488.a.b.a	ENSGT00390000003478	ENSGT01030000234515.b	ENSGT00500000044945.a	ENSGT01050000244887.B	ENSGT00940000156845	ENSGT00390000014361	ENSGT00940000155404.i.b	ENSGT00940000157375.c	ENSGT00950000182983.B.a.a	ENSGT00390000014000	ENSGT00940000159993	ENSGT00510000047872	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT01030000234515.a.b.b.a	ENSGT00940000154412.C.c.b	ENSGT00390000000051.a	ENSGT00940000154595	ENSGT00390000016466	ENSGT00390000016573.c.a	ENSGT00940000155815.p	ENSGT00940000167421	ENSGT00940000168428.b.a	ENSGT00940000177273	ENSGT00940000168428.b.b.b	ENSGT00940000154067.c	ENSGT00940000159969.a	ENSGT00940000159600	ENSGT00730000111176
Tongue sole	MODERN SPECIES	16	chst6 (ENSCSEG00000021800)	spire2 (ENSCSEG00000021801)	SNTB2 (ENSCSEG00000021802)	vps4a (ENSCSEG00000021803)	cdk10 (ENSCSEG00000021804)	chmp1a (ENSCSEG00000021805)	slc10a3 (ENSCSEG00000021806)	ENSCSEG00000021807	znf276 (ENSCSEG00000021808)	ENSCSEG00000021809	vps9d1 (ENSCSEG00000021810)	ENSCSEG00000021811	ENSCSEG00000021812	FOXL1 (ENSCSEG00000000271)	ENSCSEG00000000274	GAN (ENSCSEG00000000278) #22	ENSCSEG00000000282	kiaa0513 (ENSCSEG00000000289)	pdf (ENSCSEG00000000294)	ENSCSEG00000000298	tat (ENSCSEG00000000303)	zgc:56622 (ENSCSEG00000000316)	klhl36 (ENSCSEG00000000325)	cotl1 (ENSCSEG00000000329)	meak7 (ENSCSEG00000000335)	plcg2 (ENSCSEG00000000340) #24	zfpm1 (ENSCSEG00000000359)	trhr2 (ENSCSEG00000000364)	zc3h18 (ENSCSEG00000000372)	ENSCSEG00000000396	TANGO6 (ENSCSEG00000000404)
Turbot	DUPLICATION
Turbot	MODERN SPECIES	1	mapk8ip1a (ENSSMAG00000017870)	cry2 (ENSSMAG00000017909)	ENSSMAG00000017933	TANGO6 (ENSSMAG00000017941)	HAS3 (ENSSMAG00000017964)	chtf8 (ENSSMAG00000018002)	UTP4 (ENSSMAG00000018030)	ENSSMAG00000025463	zc3h18 (ENSSMAG00000018052)	ENSSMAG00000018100	zfpm1 (ENSSMAG00000018113)	ces3 (ENSSMAG00000000226)	kiaa0513 (ENSSMAG00000000230)	ENSSMAG00000000254	ENSSMAG00000000259	ENSSMAG00000000265 #22	ENSSMAG00000000282 #23	plcg2 (ENSSMAG00000000369) #24	meak7 (ENSSMAG00000000386)	cotl1 (ENSSMAG00000027950)	klhl36 (ENSSMAG00000000396)	zgc:56622 (ENSSMAG00000000410)	ENSSMAG00000037292	ENSSMAG00000033560	pdf (ENSSMAG00000032152)	ENSSMAG00000000425	ENSSMAG00000000426	vps9d1 (ENSSMAG00000000434)	znf276 (ENSSMAG00000000455)	FANCA (ENSSMAG00000000461)	slc10a3 (ENSSMAG00000000483)
Turbot	MODERN SPECIES	3	mydgf (ENSSMAG00000005280)	tnfaip8l1 (ENSSMAG00000031021)	ENSSMAG00000005216	ENSSMAG00000005198	ncln (ENSSMAG00000005136)	s1pr4 (ENSSMAG00000005123)	ENSSMAG00000004758	use1 (ENSSMAG00000004710)	insrb (ENSSMAG00000004638)	ENSSMAG00000029449	ENSSMAG00000004408	enc3 (ENSSMAG00000004360)	timm13 (ENSSMAG00000004298)	ENSSMAG00000004210	lsm7 (ENSSMAG00000004195)	ENSSMAG00000004184 #22	ENSSMAG00000004045	ENSSMAG00000022554	ENSSMAG00000004030	ENSSMAG00000003992	dmap1 (ENSSMAG00000003952)	ENSSMAG00000003948	ENSSMAG00000003928	guk1b (ENSSMAG00000003901)	ENSSMAG00000003886	ENSSMAG00000003849	ENSSMAG00000003615	alkal1 (ENSSMAG00000003554)	ENSSMAG00000003515	nexn (ENSSMAG00000003429)	tab3 (ENSSMAG00000003398)
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00390000006293 #29	ENSGT00390000002381.b	ENSGT00940000156938.e	ENSGT00940000164450.b	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00390000010337.B.a.a	ENSGT00390000010938	ENSGT00940000166375.a	ENSGT00730000111190	ENSGT01100000263484.B.a	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00940000166187	ENSGT00390000009535	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000155273 #22	ENSGT00390000018220.i #23	ENSGT00940000157517 #24	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543	ENSGT00940000166411	ENSGT00940000156704	ENSGT00390000018698	ENSGT01030000234925	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000007852	ENSGT00950000182808.b.b	ENSGT00950000182832.D.a	ENSGT00940000157319
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	22	hsbp1b (ENSSFOG00015022571) #29	ENSSFOG00015022575	KCNG4 (ENSSFOG00015022581)	ENSSFOG00015022589	wfdc1 (ENSSFOG00015022596)	utp4 (ENSSFOG00015022605)	has3 (ENSSFOG00015028764)	TANGO6 (ENSSFOG00015022639)	ENSSFOG00015022662	zc3h18 (ENSSFOG00015022688)	trhr2 (ENSSFOG00015022764)	zfpm1 (ENSSFOG00015026433)	ENSSFOG00015022870	kiaa0513 (ENSSFOG00015022903)	foxl1 (ENSSFOG00015027338)	GAN (ENSSFOG00015022951) #22	CMIP (ENSSFOG00015023002) #23	ENSSFOG00015023034	ENSSFOG00015023044	plcg2 (ENSSFOG00015023087) #24	plcg2 (ENSSFOG00015023185) #24	meak7 (ENSSFOG00015023215)	cotl1 (ENSSFOG00015030724)	klhl36 (ENSSFOG00015023227)	zgc:56622 (ENSSFOG00015023233)	tat (ENSSFOG00015023250)	pdf (ENSSFOG00015023265)	ENSSFOG00015023292	vps9d1 (ENSSFOG00015023270)	znf276 (ENSSFOG00015023301)	FANCA (ENSSFOG00015023311)
P. kingsleyae	DUPLICATION
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	23	mlycd (ENSPKIG00000003317) #30	ENSPKIG00000003361	ENSPKIG00000003451	KCNG4 (ENSPKIG00000003478)	wfdc1 (ENSPKIG00000003498)	utp4 (ENSPKIG00000003525)	has3 (ENSPKIG00000003565)	TANGO6 (ENSPKIG00000003592)	ENSPKIG00000003637	zc3h18 (ENSPKIG00000003664)	trhr2 (ENSPKIG00000003707)	zfpm1 (ENSPKIG00000003731)	ces3 (ENSPKIG00000003830)	kiaa0513 (ENSPKIG00000003996)	foxl1 (ENSPKIG00000004082)	GAN (ENSPKIG00000004115) #22	CMIP (ENSPKIG00000004161) #23	plcg2 (ENSPKIG00000004194) #24	meak7 (ENSPKIG00000004260)	cotl1 (ENSPKIG00000004291)	klhl36 (ENSPKIG00000004368)	zgc:56622 (ENSPKIG00000004405)	tat (ENSPKIG00000004444)	pdf (ENSPKIG00000004491)	ENSPKIG00000004510	vps9d1 (ENSPKIG00000004558)	znf276 (ENSPKIG00000004626)	ENSPKIG00000004656	slc10a3 (ENSPKIG00000004672)	chmp1a (ENSPKIG00000004700)	vps4a (ENSPKIG00000004735)
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	4	nmrk2 (ENSPKIG00000010393)	tnfaip8l1 (ENSPKIG00000010419)	CERS1 (ENSPKIG00000010433)	ncln (ENSPKIG00000010457)	s1pr4 (ENSPKIG00000010500)	MYO9B (ENSPKIG00000010594)	ENSPKIG00000010912	INSR (ENSPKIG00000010986)	ENSPKIG00000011061	ARHGEF18 (ENSPKIG00000011091)	enc3 (ENSPKIG00000011160)	timm13 (ENSPKIG00000011170)	ENSPKIG00000011197	sppl2 (ENSPKIG00000011242)	lsm7 (ENSPKIG00000011325)	ENSPKIG00000011358 #22	cers4a (ENSPKIG00000011374)	fbn2b (ENSPKIG00000011440)	CTXN1 (ENSPKIG00000011592)	timm44 (ENSPKIG00000011604)	rab11bb (ENSPKIG00000011640)	marchf2 (ENSPKIG00000011668)	ENSPKIG00000011703	PIP5K1C (ENSPKIG00000011758)	gpx4a (ENSPKIG00000011901)	cp (ENSPKIG00000011931)	hps3 (ENSPKIG00000011984)	anos1b (ENSPKIG00000012096)	ENSPKIG00000012168	ENSPKIG00000012202	si:ch211-262h13.5 (ENSPKIG00000012235)
Elephant shark	DUPLICATION
Elephant shark	MODERN SPECIES	1497	TMED6 (ENSCMIG00000014359)	wwp2 (ENSCMIG00000014011)	psmd7 (ENSCMIG00000013835)	dhx38 (ENSCMIG00000013794)	ENSCMIG00000013759	ENSCMIG00000013752	zfhx3b (ENSCMIG00000013746)	vps9d1 (ENSCMIG00000013739)	ENSCMIG00000013733	ENSCMIG00000013731	cdk10 (ENSCMIG00000013688)	chmp1a (ENSCMIG00000013620)	bco1 (ENSCMIG00000013602) #21	PKD1L2 (ENSCMIG00000013565) #20	gcshb (ENSCMIG00000013557)	GAN (ENSCMIG00000013554) #22	CMIP (ENSCMIG00000013528) #23	plcg2 (ENSCMIG00000013497) #24	sdr42e1 (ENSCMIG00000013476) #25	mphosph6 (ENSCMIG00000013473) #27	CDH13 (ENSCMIG00000013434) #28	ENSCMIG00000013420	mlycd (ENSCMIG00000013412) #30	ENSCMIG00000013404	ENSCMIG00000013400 #29	ENSCMIG00000013393	kcng4a (ENSCMIG00000013384)	wfdc1 (ENSCMIG00000013374)	ATP2C2 (ENSCMIG00000013306)	MEAK7 (ENSCMIG00000013273)	cotl1 (ENSCMIG00000013271)
Elephant shark	MODERN SPECIES	2635																ENSCMIG00000003227 #22