Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000161082 ENSGT00940000160761 ENSGT00940000161543 ENSGT00390000003256 ENSGT00940000153766.A ENSGT00950000183100.B ENSGT00940000153408.A ENSGT00940000157048 ENSGT00940000155636 ENSGT00390000003812 ENSGT00390000018686 ENSGT00390000006493 ENSGT00940000157284 ENSGT00390000001121 ENSGT00940000157084 #21 ENSGT00940000158672 #22 ENSGT00490000044373 #23 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #24 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a ##25 ENSGT00940000157927 #26 ENSGT00940000159120 #27 ENSGT00390000013762.b.a #28 ENSGT00500000045766 ENSGT00940000159341 #29 ENSGT00940000158246 #30 ENSGT00390000006786 #31 ENSGT00550000074922 #34 ENSGT00390000010738 #36 ENSGT00600000085213 ENSGT00940000160171 #37 ENSGT00940000156406.b Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000161082 ENSGT00940000160761 ENSGT00940000161543 ENSGT00390000003256 ENSGT00940000153766.A ENSGT00950000183100.B ENSGT00940000153408.A ENSGT00940000157048 ENSGT00940000155636 ENSGT00390000003812 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Rodentia ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161082 ENSGT00940000160761 ENSGT00940000161543 ENSGT00390000003256 ENSGT00940000153766.A ENSGT00950000183100.B ENSGT00940000153408.A ENSGT00940000157048 ENSGT00940000155636 ENSGT00390000003812 ENSGT00390000018686 ENSGT00390000006493 ENSGT00940000157284 ENSGT00390000001121 ENSGT00940000157084 #21 ENSGT00940000158672 #22 ENSGT00490000044373 #23 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #24 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a ##25 ENSGT00940000157927 #26 ENSGT00940000159120 #27 ENSGT00390000013762.b.a #28 ENSGT00940000159341 #29 ENSGT00940000158246 #30 ENSGT00390000006786 #31 ENSGT00550000074922 #34 ENSGT00390000010738 #36 ENSGT00600000085213 ENSGT00940000160171 #37 ENSGT00940000156406.b ENSGT00940000158831 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161082 ENSGT00940000160761 ENSGT00940000161543 ENSGT00390000003256 ENSGT00940000153766.A ENSGT00950000183100.B ENSGT00940000153408.A ENSGT00940000157048 ENSGT00940000155636 ENSGT00390000003812 ENSGT00390000018686 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SPECIES 8 ENSGT00940000160761 ENSGT00940000161543 ENSGT00390000003256 ENSGT00940000153766.A ENSGT00950000183100.B ENSGT00940000153408.A ENSGT00940000157048 ENSGT00940000155636 ENSGT00390000003812 ENSGT00390000018686 ENSGT00390000006493 ENSGT00940000157284 ENSGT00860000135742 ENSGT00390000001121 ENSGT00940000157084 #21 ENSGT00940000158672 #22 ENSGT00490000044373 #23 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #24 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a ##25 ENSGT00940000157927 #26 ENSGT00940000159120 #27 ENSGT00390000013762.b.a #28 ENSGT00940000159341 #29 ENSGT00940000158246 #30 ENSGT00390000006786 #31 ENSGT00550000074922 #34 ENSGT00390000010738 #36 ENSGT00390000016534.A ENSGT00980000198488.m.a.b.a.b.a.b.b.b.a ENSGT00940000160171 #37 ENSGT00940000156406.b Murinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000160761 ENSGT00940000161543 ENSGT00390000003256 ENSGT00940000153766.A ENSGT00950000183100.B ENSGT00940000153408.A ENSGT00940000157048 ENSGT00940000155636 ENSGT00390000003812 ENSGT00390000018686 ENSGT00390000006493 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ENSGT00940000157927 #26 ENSGT00940000159120 #27 ENSGT00390000013762.b.a #28 ENSGT00940000159341 #29 ENSGT00940000158246 #30 ENSGT00390000006786 #31 ENSGT00950000183178.a.q.b.b ENSGT00550000074922 #34 ENSGT00390000010738 #36 ENSGT00950000183098.b.a.a.o.b ENSGT00600000085213.a ENSGT00940000160171 #37 Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 276 ENSCAFG00020011996 ENSCAFG00020011999 ENSCAFG00020012005 POLR1C (ENSCAFG00020012018) ENSCAFG00020012020 ENSCAFG00020012040 POLH (ENSCAFG00020012045) GTPBP2 (ENSCAFG00020012050) MAD2L1BP (ENSCAFG00020012055) RSPH9 (ENSCAFG00020012059) MRPS18A (ENSCAFG00020012064) VEGFA (ENSCAFG00020012066) MRPL14 (ENSCAFG00020012077) TMEM63B (ENSCAFG00020012080) #21 ENSCAFG00020012093 #22 ENSCAFG00020012105 #22 MYMX (ENSCAFG00020012114) #23 SLC29A1 (ENSCAFG00020012121) #24 HSP90AB1 (ENSCAFG00020012151) ##25 SLC35B2 (ENSCAFG00020012221) #26 NFKBIE (ENSCAFG00020012224) #27 TMEM151B (ENSCAFG00020012227) #28 ENSCAFG00020012228 #29 AARS2 (ENSCAFG00020012236) #30 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RUNX2 (ENSCAFG00020012573) #37 Dog MODERN SPECIES 3 ABCC10 (ENSCAFG00845009128) DLK2 (ENSCAFG00845009184) TJAP1 (ENSCAFG00845009226) LRRC73 (ENSCAFG00845009293) YIPF3 (ENSCAFG00845009430) POLR1C (ENSCAFG00845009541) XPO5 (ENSCAFG00845009741) POLH (ENSCAFG00845010148) GTPBP2 (ENSCAFG00845010282) MAD2L1BP (ENSCAFG00845010340) RSPH9 (ENSCAFG00845010362) MRPS18A (ENSCAFG00845010419) VEGFA (ENSCAFG00845010533) MRPL14 (ENSCAFG00845010714) TMEM63B (ENSCAFG00845010814) #21 CAPN11 (ENSCAFG00845011002) #22 MYMX (ENSCAFG00845011194) #23 SLC29A1 (ENSCAFG00845011282) #24 ENSCAFG00845011600 ##25 SLC35B2 (ENSCAFG00845011652) #26 NFKBIE (ENSCAFG00845011706) #27 TMEM151B (ENSCAFG00845011741) #28 TCTE1 (ENSCAFG00845011779) #29 AARS2 (ENSCAFG00845011820) #30 SPATS1 (ENSCAFG00845011940) #31 ENSCAFG00845011963 CDC5L (ENSCAFG00845011982) #34 SUPT3H (ENSCAFG00845012174) #36 ENSCAFG00845012229 RUNX2 (ENSCAFG00845012369) #37 CLIC5 (ENSCAFG00845012631) Red fox MODERN SPECIES 7 ABCC10 (ENSVVUG00000028864) DLK2 (ENSVVUG00000028897) TJAP1 (ENSVVUG00000028902) LRRC73 (ENSVVUG00000028906) YIPF3 (ENSVVUG00000028909) POLR1C (ENSVVUG00000028922) XPO5 (ENSVVUG00000028952) POLH (ENSVVUG00000029086) GTPBP2 (ENSVVUG00000029087) MAD2L1BP (ENSVVUG00000029089) RSPH9 (ENSVVUG00000029090) MRPS18A (ENSVVUG00000029092) VEGFA (ENSVVUG00000029100) MRPL14 (ENSVVUG00000029108) TMEM63B (ENSVVUG00000029109) #21 CAPN11 (ENSVVUG00000029116) #22 MYMX (ENSVVUG00000029121) #23 SLC29A1 (ENSVVUG00000029123) #24 ENSVVUG00000029141 ##25 SLC35B2 (ENSVVUG00000029223) #26 NFKBIE (ENSVVUG00000029224) #27 TMEM151B (ENSVVUG00000029226) #28 TCTE1 (ENSVVUG00000029227) #29 AARS2 (ENSVVUG00000029231) #30 SPATS1 (ENSVVUG00000029239) #31 ENSVVUG00000029240 CDC5L (ENSVVUG00000029242) #34 SUPT3H (ENSVVUG00000029245) #36 ENSVVUG00000029248 ENSVVUG00000029249 RUNX2 (ENSVVUG00000029252) #37 Felidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161082 ENSGT00940000160761 ENSGT00940000161543 ENSGT00390000003256 ENSGT00940000153766.A ENSGT00950000183100.B ENSGT00940000153408.A.d ENSGT00940000157048 ENSGT00940000155636 ENSGT00390000003812 ENSGT00390000018686 ENSGT00390000006493 ENSGT00940000157284 ENSGT00390000001121 ENSGT00940000157084 #21 ENSGT00940000158672 #22 ENSGT00490000044373 #23 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #24 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a ##25 ENSGT00940000157927 #26 ENSGT00940000159120 #27 ENSGT00390000013762.b.a #28 ENSGT00940000159341 #29 ENSGT00940000158246 #30 ENSGT00390000006786 #31 ENSGT00550000074922 #34 ENSGT00600000085213.a ENSGT00390000010738 #36 ENSGT00940000160171 #37 ENSGT00940000154796.B.b ENSGT00940000156406.b Panthera ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000161082 ENSGT00940000160761 ENSGT00940000161543 ENSGT00390000003256 ENSGT00940000153766.A ENSGT00950000183100.B ENSGT00940000153408.A.d ENSGT00940000157048 ENSGT00940000155636 ENSGT00390000003812 ENSGT00390000018686 ENSGT00390000006493 ENSGT00940000157284 ENSGT00390000001121 ENSGT00940000157084 #21 ENSGT00940000158672 #22 ENSGT00490000044373 #23 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ENSGT00940000156406.b ENSGT00940000158831 lion MODERN SPECIES 5 ABCC10 (ENSPLOG00000004547) DLK2 (ENSPLOG00000004572) TJAP1 (ENSPLOG00000000250) LRRC73 (ENSPLOG00000000285) YIPF3 (ENSPLOG00000000311) POLR1C (ENSPLOG00000000371) XPO5 (ENSPLOG00000000454) POLH (ENSPLOG00000000519) GTPBP2 (ENSPLOG00000000576) MAD2L1BP (ENSPLOG00000000642) RSPH9 (ENSPLOG00000000669) MRPS18A (ENSPLOG00000000703) VEGFA (ENSPLOG00000000793) MRPL14 (ENSPLOG00000000912) TMEM63B (ENSPLOG00000000941) #21 CAPN11 (ENSPLOG00000000991) #22 MYMX (ENSPLOG00000001047) #23 SLC29A1 (ENSPLOG00000001064) #24 HSP90AB1 (ENSPLOG00000001099) ##25 SLC35B2 (ENSPLOG00000001133) #26 NFKBIE (ENSPLOG00000001153) #27 TMEM151B (ENSPLOG00000001184) #28 TCTE1 (ENSPLOG00000001207) #29 AARS2 (ENSPLOG00000001240) #30 SPATS1 (ENSPLOG00000001281) #31 CDC5L (ENSPLOG00000001318) #34 SUPT3H (ENSPLOG00000001375) #36 RUNX2 (ENSPLOG00000001488) #37 CLIC5 (ENSPLOG00000001669) ENPP4 (ENSPLOG00000001771) ENPP5 (ENSPLOG00000001784) leopard MODERN SPECIES 30 DLK2 (ENSPPRG00000011806) ENSPPRG00000011131 ENSPPRG00000010486 LRRC73 (ENSPPRG00000010283) YIPF3 (ENSPPRG00000010151) POLR1C (ENSPPRG00000009760) XPO5 (ENSPPRG00000009028) POLH (ENSPPRG00000007763) GTPBP2 (ENSPPRG00000007313) MAD2L1BP (ENSPPRG00000007127) RSPH9 (ENSPPRG00000006715) MRPS18A (ENSPPRG00000006429) VEGFA (ENSPPRG00000004713) MRPL14 (ENSPPRG00000000343) TMEM63B (ENSPPRG00000000314) #21 CAPN11 (ENSPPRG00000023373) #22 MYMX (ENSPPRG00000014823) #23 SLC29A1 (ENSPPRG00000023900) #24 HSP90AB1 (ENSPPRG00000024108) ##25 SLC35B2 (ENSPPRG00000024707) #26 NFKBIE (ENSPPRG00000019897) #27 TMEM151B (ENSPPRG00000018658) #28 TCTE1 (ENSPPRG00000018087) #29 AARS2 (ENSPPRG00000016970) #30 SPATS1 (ENSPPRG00000015208) #31 CDC5L (ENSPPRG00000014475) #34 SUPT3H (ENSPPRG00000014140) #36 RUNX2 (ENSPPRG00000013352) #37 ENSPPRG00000011377 CLIC5 (ENSPPRG00000010933) ENPP4 (ENSPPRG00000010642) Cat MODERN SPECIES 236 ABCC10 (ENSFCAG00000009727) DLK2 (ENSFCAG00000030746) LRRC73 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ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #24 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a ##25 ENSGT00940000157927 #26 ENSGT00940000159120 #27 ENSGT00390000013762.b.a #28 ENSGT00940000159341 #29 ENSGT00940000158246 #30 ENSGT00390000006786 #31 ENSGT00550000074922 #34 ENSGT00390000010738 #36 ENSGT00600000085213 ENSGT00940000160171 #37 ENSGT00940000156406.b ENSGT00940000158831 Donkey MODERN SPECIES 28 ABCC10 (ENSEASG00005003283) DLK2 (ENSEASG00005034606) TJAP1 (ENSEASG00005003315) LRRC73 (ENSEASG00005003324) YIPF3 (ENSEASG00005003330) POLR1C (ENSEASG00005003338) XPO5 (ENSEASG00005003351) POLH (ENSEASG00005003364) GTPBP2 (ENSEASG00005003383) MAD2L1BP (ENSEASG00005003479) MRPS18A (ENSEASG00005035068) RSPH9 (ENSEASG00005003482) VEGFA (ENSEASG00005003487) ENSEASG00005003494 TMEM63B (ENSEASG00005003502) #21 CAPN11 (ENSEASG00005003548) #22 MYMX (ENSEASG00005036007) #23 SLC29A1 (ENSEASG00005003698) #24 HSP90AB1 (ENSEASG00005003711) ##25 SLC35B2 (ENSEASG00005034890) #26 NFKBIE (ENSEASG00005003720) #27 TMEM151B 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ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161082 ENSGT00940000160761 ENSGT00940000161543 ENSGT00390000003256 ENSGT00940000153766.A ENSGT00950000183100.B ENSGT00940000153408.A.d ENSGT00940000157048 ENSGT00940000155636 ENSGT00390000003812 ENSGT00390000018686 ENSGT00390000006493 ENSGT00940000157284 ENSGT00390000001121 ENSGT00940000157084 #21 ENSGT00940000158672 #22 ENSGT00490000044373 #23 ENSGT00950000182898.a.a.a.a.b #24 ENSGT01020000230401.a.a.a.i.a.a ##25 ENSGT00940000157927 #26 ENSGT00940000159120 #27 ENSGT00390000013762.b.a #28 ENSGT00940000159341 #29 ENSGT00940000158246 #30 ENSGT00390000006786 #31 ENSGT00550000074922 #34 ENSGT00390000010738 #36 ENSGT00940000160171 #37 ENSGT00940000156406.b ENSGT00940000158831 ENSGT00940000160562 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 21 DLK2 (ENSRFEG00010004985) TJAP1 (ENSRFEG00010005002) LRRC73 (ENSRFEG00010005019) POLR1C (ENSRFEG00010005036) YIPF3 (ENSRFEG00010005052) XPO5 (ENSRFEG00010005070) POLH (ENSRFEG00010005154) GTPBP2 (ENSRFEG00010005213) MAD2L1BP 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TCTE1 (ENSMLUG00000005273) #29 AARS2 (ENSMLUG00000005280) #30 CDC5L (ENSMLUG00000012803) #34 SUPT3H (ENSMLUG00000016339) #36 RUNX2 (ENSMLUG00000000514) #37 CLIC5 (ENSMLUG00000013183) ENPP4 (ENSMLUG00000017693) ENSMLUG00000025818 Megabat MODERN SPECIES 2616 MRPL14 (ENSPVAG00000000305) TMEM63B (ENSPVAG00000000306) #21 CAPN11 (ENSPVAG00000000307) #22 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158672 #22 Hedgehog MODERN SPECIES 3454 CAPN11 (ENSEEUG00000012947) #22 Common shrew MODERN SPECIES 2596 ENSSARG00000010682 #22