Theria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000157364.C ENSGT00940000158952 ENSGT00940000163749 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00910000147025 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000007529 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157364.C ENSGT00940000158952 ENSGT00940000163749 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00910000147025 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000007529 Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158952 ENSGT00940000163749 ENSGT00900000143213 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00910000147025 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00950000185458 ENSGT00800000125307 ENSGT00940000156467 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158952 ENSGT00940000163749 ENSGT00900000143213 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00910000147025 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00950000185458 ENSGT00800000125307 ENSGT00940000156467 Primates ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000163055 ENSGT00940000157364.C ENSGT00940000158952 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00910000147025 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000007529 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000163055 ENSGT00940000157364.C ENSGT00940000158952 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00910000147025 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000007529 Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.b.s.a #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.b.s.a #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.b.s.a #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.b.s.a #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.b.s.a #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.b.s.a #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.b.s.a #22 Rhesus MODERN SPECIES 17 ENSMMUG00000063214 #7 SYNE2 (ENSMMUG00000001008) #8 ESR2 (ENSMMUG00000022839) #9 MTHFD1 (ENSMMUG00000001319) #10 AKAP5 (ENSMMUG00000042066) #11 ZBTB25 (ENSMMUG00000004747) #12 ZBTB1 (ENSMMUG00000004748) #13 ENSMMUG00000056063 #14 PLEKHG3 (ENSMMUG00000019170) #15 SPTB (ENSMMUG00000019172) #16 FNTB (ENSMMUG00000004340) #17 GPX2 (ENSMMUG00000021987) #18 RAB15 (ENSMMUG00000004339) #19 MAX (ENSMMUG00000004341) #20 FUT8 (ENSMMUG00000013848) #21 RPS27A (ENSMMUG00000013907) #22 ENSMMUG00000064786 #23 ENSMMUG00000059475 #24 CCDC196 (ENSMMUG00000006768) #25 GPHN (ENSMMUG00000009520) #26 ENSMMUG00000056927 #27 ENSMMUG00000057639 #28 GARIN2 (ENSMMUG00000029318) #29 PALS1 (ENSMMUG00000021417) #30 ATP6V1D (ENSMMUG00000021418) #31 EIF2S1 (ENSMMUG00000021419) #32 PLEK2 (ENSMMUG00000021420) #33 TMEM229B (ENSMMUG00000048801) #34 PIGH (ENSMMUG00000021327) #35 PLEKHH1 (ENSMMUG00000021326) #36 ARG2 (ENSMMUG00000015865) #37 Vervet Monkey MODERN SPECIES 26 ENSCSAG00000005268 ENSCSAG00000005264 TMPRSS11E (ENSCSAG00000005260) YTHDC1 (ENSCSAG00000005252) TMPRSS11B (ENSCSAG00000005243) ENSCSAG00000000429 TMPRSS11F (ENSCSAG00000005238) TMPRSS11A (ENSCSAG00000005227) TMPRSS11D (ENSCSAG00000005222) GNRHR (ENSCSAG00000005216) UBA6 (ENSCSAG00000005213) STAP1 (ENSCSAG00000005207) CENPC (ENSCSAG00000005202) ENSCSAG00000005197 ENSCSAG00000000428 ENSCSAG00000000427 #22 EPHA5 (ENSCSAG00000005186) TECRL (ENSCSAG00000005163) ADGRL3 (ENSCSAG00000005151) ENSCSAG00000005140 IGFBP7 (ENSCSAG00000005138) ENSCSAG00000000426 POLR2B (ENSCSAG00000005130) REST (ENSCSAG00000005119) ENSCSAG00000005117 HOPX (ENSCSAG00000005112) THEGL (ENSCSAG00000005107) ARL9 (ENSCSAG00000005100) SRP72 (ENSCSAG00000005079) PPAT (ENSCSAG00000005060) ENSCSAG00000000425 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.b.s.a #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.b.s.a #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.b.s.a #22 Gorilla MODERN SPECIES IVNS1ABP (ENSGGOG00000003025) HMCN1 (ENSGGOG00000001656) ENSGGOG00000022953 TPR (ENSGGOG00000003533) ODR4 (ENSGGOG00000012686) ENSGGOG00000002257 PDC (ENSGGOG00000024688) PTGS2 (ENSGGOG00000027916) PLA2G4A (ENSGGOG00000012337) BRINP3 (ENSGGOG00000008499) RGS18 (ENSGGOG00000017035) ENSGGOG00000039113 RGS21 (ENSGGOG00000036554) RGS1 (ENSGGOG00000001068) RGS13 (ENSGGOG00000001657) ENSGGOG00000037806 #22 RGS2 (ENSGGOG00000002750) UCHL5 (ENSGGOG00000004347) RO60 (ENSGGOG00000034815) ENSGGOG00000025783 CDC73 (ENSGGOG00000002210) B3GALT2 (ENSGGOG00000043709) KCNT2 (ENSGGOG00000026229) CFH (ENSGGOG00000012348) CFHR4 (ENSGGOG00000038930) ENSGGOG00000041722 CFHR5 (ENSGGOG00000002429) F13B (ENSGGOG00000016458) ASPM (ENSGGOG00000025635) ZBTB41 (ENSGGOG00000004843) ENSGGOG00000039671 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.b.s.a #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.b.s.a #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.b.s.a #22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 45 ENSSBOG00000022738 NEGR1 (ENSSBOG00000033521) ENSSBOG00000022428 ENSSBOG00000036028 ENSSBOG00000013268 PTGER3 (ENSSBOG00000032109) CTH (ENSSBOG00000004834) ENSSBOG00000033163 ANKRD13C (ENSSBOG00000035265) SRSF11 (ENSSBOG00000033461) LRRC40 (ENSSBOG00000033042) LRRC7 (ENSSBOG00000023202) ENSSBOG00000024654 DEPDC1 (ENSSBOG00000032526) RPE65 (ENSSBOG00000020711) ENSSBOG00000017047 #22 WLS (ENSSBOG00000029071) GNG12 (ENSSBOG00000023413) GADD45A (ENSSBOG00000026960) SERBP1 (ENSSBOG00000034290) IL12RB2 (ENSSBOG00000033618) IL23R (ENSSBOG00000031496) C1orf141 (ENSSBOG00000020938) SLC35D1 (ENSSBOG00000033454) MIER1 (ENSSBOG00000023688) DNAI4 (ENSSBOG00000021867) INSL5 (ENSSBOG00000021914) DYNLT5 (ENSSBOG00000026948) SGIP1 (ENSSBOG00000032865) PDE4B (ENSSBOG00000028805) LEPR (ENSSBOG00000024199) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.b.s.b ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.b.s.b ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.b.s.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.b.s.b ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 93 ENSSBOG00000026573 ENSSBOG00000028726 ENSSBOG00000019282 ENSSBOG00000030411 BMP7 (ENSSBOG00000029401) SPO11 (ENSSBOG00000032033) RAE1 (ENSSBOG00000027737) RBM38 (ENSSBOG00000031053) CTCFL (ENSSBOG00000029240) PCK1 (ENSSBOG00000020912) ZBP1 (ENSSBOG00000032730) PMEPA1 (ENSSBOG00000018423) C20orf85 (ENSSBOG00000032942) ANKRD60 (ENSSBOG00000026461) ENSSBOG00000030417 ENSSBOG00000033720 ##22 ENSSBOG00000030326 ENSSBOG00000031322 ENSSBOG00000032634 VAPB (ENSSBOG00000023022) APCDD1L (ENSSBOG00000030551) STX16 (ENSSBOG00000035326) NPEPL1 (ENSSBOG00000002808) ENSSBOG00000013127 ENSSBOG00000032092 NELFCD (ENSSBOG00000024245) CTSZ (ENSSBOG00000029319) TUBB1 (ENSSBOG00000031264) ATP5F1E (ENSSBOG00000032643) PRELID3B (ENSSBOG00000019233) ZNF831 (ENSSBOG00000031251) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000163055 ENSGT00940000157364.C ENSGT00940000158952 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b.t ##22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001.a ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00910000147025 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000007529 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000157364.C ENSGT00940000158952 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00940000166162 ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b.t ##22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001.a ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00910000147025 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT01030000234579.A.b.w ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000157364.C ENSGT00940000158952 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00940000166162 ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b.t ##22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001.a ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00910000147599 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000153727.b.n ENSGT00910000147025 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT01030000234579.A.b.w Gibbon DUPLICATION Gibbon DUPLICATION Gibbon MODERN SPECIES 23 FAM8A1 (ENSNLEG00000001130) NUP153 (ENSNLEG00000001141) KIF13A (ENSNLEG00000001201) ENSNLEG00000034312 NHLRC1 (ENSNLEG00000018685) TPMT (ENSNLEG00000035563) KDM1B (ENSNLEG00000001591) ENSNLEG00000001663 ENSNLEG00000033342 ENSNLEG00000032974 RNF144B (ENSNLEG00000001700) MBOAT1 (ENSNLEG00000001717) E2F3 (ENSNLEG00000033231) ENSNLEG00000030332 CDKAL1 (ENSNLEG00000001768) ENSNLEG00000030953 ##22 SOX4 (ENSNLEG00000001795) ENSNLEG00000031599 PRL (ENSNLEG00000001804) ENSNLEG00000001857 ENSNLEG00000027326 NRSN1 (ENSNLEG00000001860) DCDC2 (ENSNLEG00000001889) ENSNLEG00000031303 ENSNLEG00000001925 GPLD1 (ENSNLEG00000001930) ALDH5A1 (ENSNLEG00000002111) KIAA0319 (ENSNLEG00000002214) TDP2 (ENSNLEG00000002447) ACOT13 (ENSNLEG00000002546) C6orf62 (ENSNLEG00000036062) Gibbon MODERN SPECIES 23 CHRNB3 (ENSNLEG00000012932) CHRNA6 (ENSNLEG00000012940) THAP1 (ENSNLEG00000012946) RNF170 (ENSNLEG00000012949) HOOK3 (ENSNLEG00000012953) ENSNLEG00000012979 POMK (ENSNLEG00000012982) HGSNAT (ENSNLEG00000029760) ENSNLEG00000013005 ENSNLEG00000031617 ENSNLEG00000013008 DUSP22 (ENSNLEG00000010621) IRF4 (ENSNLEG00000010631) ENSNLEG00000027330 EXOC2 (ENSNLEG00000010643) ENSNLEG00000018872 ##22 ENSNLEG00000010829 ENSNLEG00000029356 ENSNLEG00000010830 GMDS (ENSNLEG00000010832) ENSNLEG00000035231 MYLK4 (ENSNLEG00000010906) WRNIP1 (ENSNLEG00000010928) SERPINB1 (ENSNLEG00000010958) SERPINB9 (ENSNLEG00000031330) SERPINB6 (ENSNLEG00000011022) ENSNLEG00000029196 NQO2 (ENSNLEG00000011051) ENSNLEG00000011073 RIPK1 (ENSNLEG00000011075) BPHL (ENSNLEG00000028923) Gibbon MODERN SPECIES 4 FSHR (ENSNLEG00000008784) NRXN1 (ENSNLEG00000031429) ENSNLEG00000028637 ASB3 (ENSNLEG00000008845) CHAC2 (ENSNLEG00000008894) ERLEC1 (ENSNLEG00000008901) GPR75 (ENSNLEG00000035582) PSME4 (ENSNLEG00000008976) ENSNLEG00000033783 ENSNLEG00000034601 C2orf73 (ENSNLEG00000009117) SPTBN1 (ENSNLEG00000009127) EML6 (ENSNLEG00000028369) RTN4 (ENSNLEG00000009159) CLHC1 (ENSNLEG00000009217) ENSNLEG00000031405 ##22 MTIF2 (ENSNLEG00000009228) ENSNLEG00000036115 CCDC88A (ENSNLEG00000009231) ENSNLEG00000009324 PPP4R3B (ENSNLEG00000009338) PNPT1 (ENSNLEG00000009354) EFEMP1 (ENSNLEG00000009393) CCDC85A (ENSNLEG00000009421) ENSNLEG00000035656 VRK2 (ENSNLEG00000009430) ENSNLEG00000009472 ENSNLEG00000028402 BCL11A (ENSNLEG00000029846) ENSNLEG00000009505 ENSNLEG00000009507 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000157364.C ENSGT00940000158952 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00940000166162 ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b.t ##22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001.a ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00910000147599 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000153727.b.n ENSGT00910000147025 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00940000156467 Orangutan DUPLICATION Orangutan MODERN SPECIES 21 GDAP1 (ENSPPYG00000018682) PI15 (ENSPPYG00000018683) CRISPLD1 (ENSPPYG00000018684) HNF4G (ENSPPYG00000018686) ZFHX4 (ENSPPYG00000018687) PEX2 (ENSPPYG00000018688) PKIA (ENSPPYG00000039401) ZC2HC1A (ENSPPYG00000018690) IL7 (ENSPPYG00000018691) ENSPPYG00000034923 STMN2 (ENSPPYG00000018692) HEY1 (ENSPPYG00000018693) MRPS28 (ENSPPYG00000018694) TPD52 (ENSPPYG00000039906) ENSPPYG00000038130 ENSPPYG00000020104 ##22 ZBTB10 (ENSPPYG00000018696) ZNF704 (ENSPPYG00000018697) PAG1 (ENSPPYG00000018698) ENSPPYG00000018699 PMP2 (ENSPPYG00000018703) FABP9 (ENSPPYG00000018701) FABP4 (ENSPPYG00000018702) ENSPPYG00000041605 ENSPPYG00000018705 ENSPPYG00000018706 IMPA1 (ENSPPYG00000039378) SLC10A5 (ENSPPYG00000030383) ZFAND1 (ENSPPYG00000018707) CHMP4C (ENSPPYG00000018708) SNX16 (ENSPPYG00000018704) Orangutan MODERN SPECIES 14 LHCGR (ENSPPYG00000012419) FSHR (ENSPPYG00000012418) NRXN1 (ENSPPYG00000012417) CHAC2 (ENSPPYG00000012416) ASB3 (ENSPPYG00000012415) ERLEC1 (ENSPPYG00000033647) GPR75 (ENSPPYG00000037778) PSME4 (ENSPPYG00000012412) TSPYL6 (ENSPPYG00000012411) ACYP2 (ENSPPYG00000012410) C2orf73 (ENSPPYG00000012409) SPTBN1 (ENSPPYG00000012408) EML6 (ENSPPYG00000012407) RTN4 (ENSPPYG00000012405) CLHC1 (ENSPPYG00000012404) ENSPPYG00000031054 ##22 MTIF2 (ENSPPYG00000012403) ENSPPYG00000012402 CCDC88A (ENSPPYG00000012401) CFAP36 (ENSPPYG00000029888) PPP4R3B (ENSPPYG00000012400) PNPT1 (ENSPPYG00000012399) EFEMP1 (ENSPPYG00000012398) CCDC85A (ENSPPYG00000012396) VRK2 (ENSPPYG00000033504) FANCL (ENSPPYG00000012394) BCL11A (ENSPPYG00000012393) ENSPPYG00000030113 PAPOLG (ENSPPYG00000012392) REL (ENSPPYG00000012391) PUS10 (ENSPPYG00000012390) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000157364.C ENSGT00940000158952 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00940000166162 ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b.t ##22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001.a ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00910000147599 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000153727.b.n ENSGT00910000147025 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT01030000234579.A.b.x.b Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000157364.C ENSGT00940000158952 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00940000166162 ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b.t ##22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001.a ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00910000147599 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000153727.b.n ENSGT00940000156983.a.a ENSGT01030000234579.A.b.x.b ENSGT00940000156467 Human MODERN SPECIES 11 LHCGR (ENSG00000138039) FSHR (ENSG00000170820) NRXN1 (ENSG00000179915) ASB3 (ENSG00000115239) CHAC2 (ENSG00000143942) ERLEC1 (ENSG00000068912) GPR75 (ENSG00000119737) PSME4 (ENSG00000068878) ACYP2 (ENSG00000170634) TSPYL6 (ENSG00000178021) C2orf73 (ENSG00000177994) SPTBN1 (ENSG00000115306) EML6 (ENSG00000214595) RTN4 (ENSG00000115310) CLHC1 (ENSG00000162994) RPS27A (ENSG00000143947) ##22 MTIF2 (ENSG00000085760) CCDC88A (ENSG00000115355) CFAP36 (ENSG00000163001) PPP4R3B (ENSG00000275052) PNPT1 (ENSG00000138035) EFEMP1 (ENSG00000115380) CCDC85A (ENSG00000055813) VRK2 (ENSG00000028116) FANCL (ENSG00000115392) BCL11A (ENSG00000119866) PAPOLG (ENSG00000115421) REL (ENSG00000162924) PUS10 (ENSG00000162927) PEX13 (ENSG00000162928) SANBR (ENSG00000162929) Pan ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158952 ENSGT00950000182878.b.a.c.a.a.b.i.a ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00940000166162 ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b.t ##22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001.a ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00910000147599 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000153727.b.n ENSGT00940000156983.a.a ENSGT01030000234579.A.b.x.b ENSGT00940000156467 Bonobo MODERN SPECIES 14 NRXN1 (ENSPPAG00000040015) ASB3 (ENSPPAG00000037721) CHAC2 (ENSPPAG00000028207) ERLEC1 (ENSPPAG00000041587) GPR75 (ENSPPAG00000002907) PSME4 (ENSPPAG00000041872) ACYP2 (ENSPPAG00000029074) TSPYL6 (ENSPPAG00000017725) ENSPPAG00000022129 SPTBN1 (ENSPPAG00000020369) ENSPPAG00000020806 EML6 (ENSPPAG00000028028) ENSPPAG00000039335 ENSPPAG00000030361 CLHC1 (ENSPPAG00000027781) RPS27A (ENSPPAG00000034709) ##22 ENSPPAG00000039404 ENSPPAG00000042489 CCDC88A (ENSPPAG00000039357) CFAP36 (ENSPPAG00000039542) PPP4R3B (ENSPPAG00000035885) PNPT1 (ENSPPAG00000024705) EFEMP1 (ENSPPAG00000032517) CCDC85A (ENSPPAG00000031213) ENSPPAG00000028192 VRK2 (ENSPPAG00000033421) FANCL (ENSPPAG00000031399) ENSPPAG00000034116 ENSPPAG00000040673 BCL11A (ENSPPAG00000034227) ENSPPAG00000040162 Gorilla DUPLICATION Gorilla MODERN SPECIES 14 ENSGGOG00000036155 NRXN1 (ENSGGOG00000038758) CHAC2 (ENSGGOG00000039185) ASB3 (ENSGGOG00000000538) ERLEC1 (ENSGGOG00000000544) GPR75 (ENSGGOG00000012504) PSME4 (ENSGGOG00000005258) TSPYL6 (ENSGGOG00000003174) ACYP2 (ENSGGOG00000011114) C2orf73 (ENSGGOG00000016735) ENSGGOG00000039527 SPTBN1 (ENSGGOG00000011605) EML6 (ENSGGOG00000002787) RTN4 (ENSGGOG00000025845) ENSGGOG00000038513 RPS27A (ENSGGOG00000007678) ##22 MTIF2 (ENSGGOG00000007681) ENSGGOG00000038295 CCDC88A (ENSGGOG00000012381) CFAP36 (ENSGGOG00000002684) PPP4R3B (ENSGGOG00000014676) PNPT1 (ENSGGOG00000006867) EFEMP1 (ENSGGOG00000022559) ENSGGOG00000036302 CCDC85A (ENSGGOG00000011407) VRK2 (ENSGGOG00000012141) FANCL (ENSGGOG00000004094) ENSGGOG00000039338 ENSGGOG00000040840 BCL11A (ENSGGOG00000007337) ENSGGOG00000024123 Gorilla MODERN SPECIES 16 ENSGGOG00000025042 CNTN6 (ENSGGOG00000002403) ENSGGOG00000023041 CNTN4 (ENSGGOG00000001075) IL5RA (ENSGGOG00000001078) TRNT1 (ENSGGOG00000015286) CRBN (ENSGGOG00000008850) LRRN1 (ENSGGOG00000022843) ENSGGOG00000041496 SETMAR (ENSGGOG00000004932) SUMF1 (ENSGGOG00000015942) ITPR1 (ENSGGOG00000005486) BHLHE40 (ENSGGOG00000015864) ARL8B (ENSGGOG00000004952) EDEM1 (ENSGGOG00000002037) ENSGGOG00000041394 ##22 ENSGGOG00000026240 GRM7 (ENSGGOG00000034996) ENSGGOG00000036793 LMCD1 (ENSGGOG00000013915) SSUH2 (ENSGGOG00000025443) CAV3 (ENSGGOG00000000136) OXTR (ENSGGOG00000011995) ENSGGOG00000037974 RAD18 (ENSGGOG00000008391) SRGAP3 (ENSGGOG00000011175) THUMPD3 (ENSGGOG00000000604) SETD5 (ENSGGOG00000004026) LHFPL4 (ENSGGOG00000039691) MTMR14 (ENSGGOG00000003531) ENSGGOG00000041533 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158952 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00940000154882.eb ENSGT00390000011103.A ENSGT00940000166162 ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b.t ##22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001.a ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00910000147025 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT01030000234579.A.b.w ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158952 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00940000154882.eb ENSGT00390000011103.A ENSGT00940000166162 ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b.t ##22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001.a ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT01030000234579.A.b.w ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000018318.u.b.a.b.a.a.a Vervet Monkey MODERN SPECIES 22 COMMD6 (ENSCSAG00000017600) UCHL3 (ENSCSAG00000017598) LMO7 (ENSCSAG00000017595) KCTD12 (ENSCSAG00000018622) ACOD1 (ENSCSAG00000017593) CLN5 (ENSCSAG00000017592) FBXL3 (ENSCSAG00000017589) MYCBP2 (ENSCSAG00000017585) SCEL (ENSCSAG00000017575) SLAIN1 (ENSCSAG00000017572) EDNRB (ENSCSAG00000017566) OBI1 (ENSCSAG00000017565) RBM26 (ENSCSAG00000017563) NDFIP2 (ENSCSAG00000017557) SPRY2 (ENSCSAG00000018623) ENSCSAG00000000230 ##22 SLITRK1 (ENSCSAG00000000229) SLITRK6 (ENSCSAG00000000228) SLITRK5 (ENSCSAG00000000227) DCT (ENSCSAG00000017543) TGDS (ENSCSAG00000017539) GPR180 (ENSCSAG00000017536) SOX21 (ENSCSAG00000000226) ABCC4 (ENSCSAG00000017533) CLDN10 (ENSCSAG00000017528) DZIP1 (ENSCSAG00000017526) DNAJC3 (ENSCSAG00000017525) UGGT2 (ENSCSAG00000017524) ENSCSAG00000000225 OXGR1 (ENSCSAG00000000223) MBNL2 (ENSCSAG00000017523) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00910000148206 ENSGT00940000158952 ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00940000154882.eb ENSGT00390000011103.A ENSGT00940000166162 ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b.t ##22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001.a ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT01030000234579.A.b.w ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000018318.u.b.a.b.a.a.a Macaca ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158952 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00940000154882.eb ENSGT00390000011103.A ENSGT00940000166162 ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b.t ##22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001.a ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00530000063174.a.i.f ENSGT00910000147025 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT01030000234579.A.b.w ENSGT00940000156467 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 341 ENSMNEG00000040960 FSHR (ENSMNEG00000035866) NRXN1 (ENSMNEG00000004728) ENSMNEG00000033897 ASB3 (ENSMNEG00000042717) CHAC2 (ENSMNEG00000044372) ERLEC1 (ENSMNEG00000025610) PSME4 (ENSMNEG00000029938) ACYP2 (ENSMNEG00000042083) ENSMNEG00000042704 C2orf73 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ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001.a ENSGT00940000164709.a.b.b.a.a.b.a.a.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT01100000263543.a.g.a.a.a.a ENSGT00950000182895.a.b.j.b.e.a ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT01100000263539.b.a.a.a.b.b.b.a.b.b.a.a.b ##14 ENSGT00940000156983.a.a Rhesus MODERN SPECIES 4 CHAC2 (ENSMMUG00000010639) ERLEC1 (ENSMMUG00000010640) GPR75 (ENSMMUG00000008105) ASB3 (ENSMMUG00000010634) PSME4 (ENSMMUG00000008104) ENSMMUG00000054164 ##23 TSPYL6 (ENSMMUG00000002154) ACYP2 (ENSMMUG00000002152) C13H2orf73 (ENSMMUG00000002155) ENSMMUG00000061616 ##14 SPTBN1 (ENSMMUG00000013541) ENSMMUG00000002075 EML6 (ENSMMUG00000021296) RTN4 (ENSMMUG00000021299) CLHC1 (ENSMMUG00000011346) RPS27A (ENSMMUG00000015563) ##22 MTIF2 (ENSMMUG00000030833) ENSMMUG00000019075 CCDC88A (ENSMMUG00000003003) CFAP36 (ENSMMUG00000007000) PPP4R3B (ENSMMUG00000007001) PNPT1 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PLEKHH1 (ENSMFAG00000038266) #36 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00910000148206 ENSGT00940000158952 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00940000154882.eb ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b.t ##22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001.a.b ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00950000182895.a.b.j.b.e.a ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00530000063174.a.i.f ENSGT00940000156983.a.a ENSGT01030000234579.A.b.w ENSGT00390000008802.m.a.a Olive baboon MODERN SPECIES 5 ENSPANG00000050504 ENSPANG00000019787 ASB3 (ENSPANG00000000697) CHAC2 (ENSPANG00000025448) ERLEC1 (ENSPANG00000009778) GPR75 (ENSPANG00000049693) PSME4 (ENSPANG00000014551) ENSPANG00000000195 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Black snub-nosed monkey DUPLICATION Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1345 ENSRBIG00000038469 ##22 ENSRBIG00000029097 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2444 ENSRBIG00000006801 ##22 ENSRBIG00000040288 ADCY7 (ENSRBIG00000032067) TENT4B (ENSRBIG00000042876) Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 3263 ENSRROG00000034784 ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 186 ENSRROG00000037457 ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158952 ENSGT00940000154980.u.b ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT01050000247958 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b.t ##22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001.a ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 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ENSOCUG00000004368 ENSOCUG00000037410 ASB17 (ENSOCUG00000002104) MSH4 (ENSOCUG00000016238) RABGGTB (ENSOCUG00000016230) ##17 ACADM (ENSOCUG00000013662) SLC44A5 (ENSOCUG00000005562) LHX8 (ENSOCUG00000003641) ENSOCUG00000024263 Pika MODERN SPECIES 1857 RPS27A (ENSOPRG00000010469) #22 MTIF2 (ENSOPRG00000010479) ENSOPRG00000010511 CCDC88A (ENSOPRG00000010518) CFAP36 (ENSOPRG00000010584) PPP4R3B (ENSOPRG00000010602) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158952 ENSGT00940000163749 ENSGT00900000143213 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 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jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 164 ENSJJAG00000014424 4930505A04Rik (ENSJJAG00000016821) Sptbn1 (ENSJJAG00000018403) Eml6 (ENSJJAG00000000895) ENSJJAG00000015093 ENSJJAG00000015191 Clhc1 (ENSJJAG00000015620) ENSJJAG00000016789 #22 Mtif2 (ENSJJAG00000017300) ENSJJAG00000020305 Prorsd1 (ENSJJAG00000021319) ENSJJAG00000015446 ENSJJAG00000017280 ENSJJAG00000017442 Cfap36 (ENSJJAG00000017803) Ppp4r3b (ENSJJAG00000018078) ENSJJAG00000018316 Pnpt1 (ENSJJAG00000019227) ENSJJAG00000019708 Efemp1 (ENSJJAG00000019884) Ccdc85a (ENSJJAG00000020531) ENSJJAG00000012274 ENSJJAG00000012256 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 133 Adamts2 (ENSJJAG00000001682) ENSJJAG00000010190 #22 Rufy1 (ENSJJAG00000013513) Hnrnph1 (ENSJJAG00000016203) ENSJJAG00000014052 Canx (ENSJJAG00000022784) Maml1 (ENSJJAG00000023847) ENSJJAG00000019535 Mgat4b (ENSJJAG00000021000) ENSJJAG00000012040 Mrnip (ENSJJAG00000010968) Tbc1d9b (ENSJJAG00000013138) ENSJJAG00000013685 Rnf130 (ENSJJAG00000014438) Rasgef1c (ENSJJAG00000016338) Mapk9 (ENSJJAG00000012308) Gfpt2 (ENSJJAG00000014420) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000163749 ENSGT00900000143213 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00860000135827 ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00800000125307 ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000007529 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1826 Fshr (ENSNGAG00000020967) Nrxn1 (ENSNGAG00000017496) ENSNGAG00000009682 Chac2 (ENSNGAG00000021028) ENSNGAG00000007293 Erlec1 (ENSNGAG00000003875) Asb3 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ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00800000125307 ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000007529 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00800000125307 ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000007529 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.b #22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 11 ENSPEMG00000005306 Lepr (ENSPEMG00000013702) Leprot (ENSPEMG00000016339) Dnajc6 (ENSPEMG00000010017) Ak4 (ENSPEMG00000016088) Jak1 (ENSPEMG00000004628) Raver2 (ENSPEMG00000001332) Cachd1 (ENSPEMG00000018442) ENSPEMG00000024764 ENSPEMG00000028140 Ror1 (ENSPEMG00000009106) Pgm1 (ENSPEMG00000000464) Efcab7 (ENSPEMG00000018535) Itgb3bp (ENSPEMG00000011292) Alg6 (ENSPEMG00000018498) ENSPEMG00000016606 #22 ENSPEMG00000026760 Atg4c (ENSPEMG00000012725) Angptl3 (ENSPEMG00000000689) Dock7 (ENSPEMG00000018126) Usp1 (ENSPEMG00000026352) Kank4 (ENSPEMG00000012891) L1td1 (ENSPEMG00000008068) Patj (ENSPEMG00000014313) Tm2d1 (ENSPEMG00000004612) Nfia (ENSPEMG00000005756) Gm12695 (ENSPEMG00000010497) ENSPEMG00000009838 ENSPEMG00000026151 Cyp2j9 (ENSPEMG00000000230) Cyp2j6 (ENSPEMG00000017727) Prairie vole DUPLICATION Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 1 Otc (ENSMOCG00000020681) Tspan7 (ENSMOCG00000021984) Mid1ip1 (ENSMOCG00000009515) ENSMOCG00000007720 ENSMOCG00000010154 ENSMOCG00000021216 ENSMOCG00000021841 ENSMOCG00000009697 Atp6ap2 (ENSMOCG00000010803) 1810030O07Rik (ENSMOCG00000009974) ENSMOCG00000016696 ENSMOCG00000016742 ENSMOCG00000005802 E330021D16Rik 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(ENSMAUG00000020899) ENSMAUG00000001312 Vrk2 (ENSMAUG00000013376) Fancl (ENSMAUG00000012141) Bcl11a (ENSMAUG00000010170) Papolg (ENSMAUG00000009088) Rel (ENSMAUG00000020172) Golden Hamster MODERN SPECIES 704 Fbxw8 (ENSMAUG00000002768) Tesc (ENSMAUG00000020503) Fbxo21 (ENSMAUG00000018464) ENSMAUG00000016929 Ksr2 (ENSMAUG00000015972) Wsb2 (ENSMAUG00000006596) Vsig10 (ENSMAUG00000000299) ENSMAUG00000012785 Taok3 (ENSMAUG00000018083) Suds3 (ENSMAUG00000017338) Srrm4 (ENSMAUG00000013203) Hspb8 (ENSMAUG00000006639) Ccdc60 (ENSMAUG00000000676) Tmem233 (ENSMAUG00000019424) Prkab1 (ENSMAUG00000021090) ENSMAUG00000017719 #22 ENSMAUG00000013898 ENSMAUG00000016718 Bicdl1 (ENSMAUG00000012680) Rab35 (ENSMAUG00000009328) Gcn1 (ENSMAUG00000010431) ENSMAUG00000020622 Pxn (ENSMAUG00000013582) Sirt4 (ENSMAUG00000010509) Pla2g1b (ENSMAUG00000002929) Msi1 (ENSMAUG00000016820) ENSMAUG00000015008 Triap1 (ENSMAUG00000014091) Gatc (ENSMAUG00000012756) Srsf9 (ENSMAUG00000011403) ENSMAUG00000009393 Murinae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00800000125307 ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000007529 Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 10 Mmaa (ENSRNOG00000011618) LOC498933 (ENSRNOG00000011671) Zfp827 (ENSRNOG00000011697) Slc10a7 (ENSRNOG00000011991) Rbmxl1 (ENSRNOG00000062375) AABR07043626.1 (ENSRNOG00000033487) Pou4f2 (ENSRNOG00000012167) Ttc29 (ENSRNOG00000012342) ENSRNOG00000062839 Ednra (ENSRNOG00000012721) Tmem184c (ENSRNOG00000012860) Prmt9 (ENSRNOG00000012928) Arhgap10 (ENSRNOG00000013152) 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Fam131c (ENSRNOG00000023008) Clcnka (ENSRNOG00000052368) Clcnkb (ENSRNOG00000009897) Hspb7 (ENSRNOG00000029079) AC120594.1 (ENSRNOG00000054155) Zbtb17 (ENSRNOG00000010436) Spen (ENSRNOG00000033556) Fblim1 (ENSRNOG00000011774) Tmem82 (ENSRNOG00000011970) Plekhm2 (ENSRNOG00000012163) Ddi2 (ENSRNOG00000012274) Agmat (ENSRNOG00000012315) ##37 Dnajc16 (ENSRNOG00000012503) Casp9 (ENSRNOG00000012944) Cela2a (ENSRNOG00000013628) Rat MODERN SPECIES 9 Nme5 (ENSRNOG00000020118) Wnt8a (ENSRNOG00000020157) Fam13b (ENSRNOG00000020384) AABR07031691.1 (ENSRNOG00000060281) Pkd2l2 (ENSRNOG00000025489) Reep5 (ENSRNOG00000020167) ENSRNOG00000062486 Srp19 (ENSRNOG00000020204) Apc (ENSRNOG00000020423) Epb41l4a (ENSRNOG00000026050) Nrep (ENSRNOG00000068914) Stard4 (ENSRNOG00000020468) Camk4 (ENSRNOG00000020478) Wdr36 (ENSRNOG00000027355) Tslp (ENSRNOG00000058856) Rps27a-ps12 (ENSRNOG00000020492) #22 LOC498836 (ENSRNOG00000025687) AABR07031674.2 (ENSRNOG00000046154) Gypc (ENSRNOG00000029939) Tex51 (ENSRNOG00000061675) Bin1 (ENSRNOG00000012852) Ercc3 (ENSRNOG00000013180) Map3k2 (ENSRNOG00000014089) Proc (ENSRNOG00000014376) Iws1 (ENSRNOG00000014630) Myo7b (ENSRNOG00000015035) Gpr17 (ENSRNOG00000065480) Lims2 (ENSRNOG00000016021) Sft2d3 (ENSRNOG00000016216) Wdr33 (ENSRNOG00000011382) Polr2d (ENSRNOG00000016231) Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 5 ENSRNOG00000066757 Chac2 (ENSRNOG00000070799) Erlec1 (ENSRNOG00000007283) Gpr75 (ENSRNOG00000022176) Asb3 (ENSRNOG00000032471) Psme4 (ENSRNOG00000060340) AABR07016805.1 (ENSRNOG00000028222) Acyp2 (ENSRNOG00000042419) C14h2orf73 (ENSRNOG00000006356) Sptbn1 (ENSRNOG00000005434) Eml6 (ENSRNOG00000037462) Rtn4 (ENSRNOG00000004621) Ndufs5-ps1 (ENSRNOG00000052764) Clhc1 (ENSRNOG00000004456) Rps27a (ENSRNOG00000004426) #22 Mtif2 (ENSRNOG00000004161) Prorsd1 (ENSRNOG00000004145) Ccdc88a (ENSRNOG00000004057) Cfap36 (ENSRNOG00000003901) Ppp4r3b (ENSRNOG00000003712) Pnpt1 (ENSRNOG00000003600) Efemp1 (ENSRNOG00000003553) Ccdc85a (ENSRNOG00000003374) 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(ENSRNOG00000007404) Ermap (ENSRNOG00000000335) Mus ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00860000136227 ENSGT00390000005537 ENSGT00860000136277 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00800000125307 ENSGT00940000156467 Shrew mouse MODERN SPECIES 4 Chac2 (MGP_PahariEiJ_G0016721) Erlec1 (MGP_PahariEiJ_G0016722) Gpr75 (MGP_PahariEiJ_G0016723) Psme4 (MGP_PahariEiJ_G0016724) Acyp2 (MGP_PahariEiJ_G0016725) MGP_PahariEiJ_G0016726 Sptbn1 (MGP_PahariEiJ_G0016727) Eml6 (MGP_PahariEiJ_G0016728) Rtn4 (MGP_PahariEiJ_G0016729) Clhc1 (MGP_PahariEiJ_G0016730) Rps27a (MGP_PahariEiJ_G0016731) #22 Mtif2 (MGP_PahariEiJ_G0016732) Prorsd1 (MGP_PahariEiJ_G0016733) Ccdc88a (MGP_PahariEiJ_G0016734) Cfap36 (MGP_PahariEiJ_G0016735) Ppp4r3b (MGP_PahariEiJ_G0016736) Pnpt1 (MGP_PahariEiJ_G0016737) Efemp1 (MGP_PahariEiJ_G0016738) Ccdc85a (MGP_PahariEiJ_G0016739) Vrk2 (MGP_PahariEiJ_G0016740) MGP_PahariEiJ_G0016741 Fancl (MGP_PahariEiJ_G0016742) 5730522E02Rik (MGP_PahariEiJ_G0016743) Bcl11a (MGP_PahariEiJ_G0016744) MGP_PahariEiJ_G0016745 Papolg (MGP_PahariEiJ_G0016746) Mus_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00640000091672 ENSGT00940000154998.a.a ENSGT00940000154979 ENSGT00390000005989.a ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00860000136227 ENSGT00390000005537 ENSGT00860000136277 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00800000125307 ENSGT00940000156467 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 2 Nsg2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016174) 4930524B15Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0016173) Cpeb4 (MGP_CAROLIEiJ_G0016172) Bod1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016171) Stc2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016170) Chac2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016169) Erlec1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016168) Gpr75 (MGP_CAROLIEiJ_G0016167) Psme4 (MGP_CAROLIEiJ_G0016166) Acyp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016165) MGP_CAROLIEiJ_G0016164 Sptbn1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016163) Eml6 (MGP_CAROLIEiJ_G0016162) Rtn4 (MGP_CAROLIEiJ_G0016161) Clhc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016160) Rps27a (MGP_CAROLIEiJ_G0016159) #22 Mtif2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016158) Prorsd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016157) Ccdc88a (MGP_CAROLIEiJ_G0016156) Cfap36 (MGP_CAROLIEiJ_G0016155) Ppp4r3b (MGP_CAROLIEiJ_G0016154) Pnpt1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016153) Efemp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016152) Ccdc85a (MGP_CAROLIEiJ_G0016151) MGP_CAROLIEiJ_G0016150 Vrk2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016149) Fancl (MGP_CAROLIEiJ_G0016148) 5730522E02Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0016147) Bcl11a (MGP_CAROLIEiJ_G0016146) MGP_CAROLIEiJ_G0016145 Papolg (MGP_CAROLIEiJ_G0016144) Mus_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00640000091672 ENSGT00940000154998.a.a ENSGT00940000154979 ENSGT00390000005989.a ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00860000136227 ENSGT00390000005537 ENSGT00860000136277 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00800000125307 ENSGT00940000156467 Mouse MODERN SPECIES 2 Cpeb4 (ENSMUSG00000020300) Bod1 (ENSMUSG00000044502) Stc2 (ENSMUSG00000020303) Chac2 (ENSMUSG00000020309) Erlec1 (ENSMUSG00000020311) Asb3 (ENSMUSG00000020305) Gpr75 (ENSMUSG00000043999) Psme4 (ENSMUSG00000040850) Acyp2 (ENSMUSG00000060923) 4930505A04Rik (ENSMUSG00000040919) Sptbn1 (ENSMUSG00000020315) Fem1al (ENSMUSG00000078157) Eml6 (ENSMUSG00000044072) Rtn4 (ENSMUSG00000020458) Clhc1 (ENSMUSG00000020461) Rps27a (ENSMUSG00000020460) #22 Mtif2 (ENSMUSG00000020459) Prorsd1 (ENSMUSG00000032673) Ccdc88a (ENSMUSG00000032740) Cfap36 (ENSMUSG00000020462) Ppp4r3b (ENSMUSG00000020463) Pnpt1 (ENSMUSG00000020464) Efemp1 (ENSMUSG00000020467) Ccdc85a (ENSMUSG00000032878) Vrk2 (ENSMUSG00000064090) Fancl (ENSMUSG00000004018) 5730522E02Rik (ENSMUSG00000032985) Bcl11a (ENSMUSG00000000861) A830031A19Rik (ENSMUSG00000055010) Papolg (ENSMUSG00000020273) Rel (ENSMUSG00000020275) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00640000091672 ENSGT00940000154998.a.a ENSGT00940000154979 ENSGT00390000005989.a ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00860000136227 ENSGT00390000005537 ENSGT00860000136277 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00800000125307 ENSGT00940000156467 spretus MODERN SPECIES 2 4930524B15Rik (MGP_SPRETEiJ_G0017017) Cpeb4 (MGP_SPRETEiJ_G0017016) Bod1 (MGP_SPRETEiJ_G0017015) Stc2 (MGP_SPRETEiJ_G0017014) Chac2 (MGP_SPRETEiJ_G0017013) Erlec1 (MGP_SPRETEiJ_G0017012) Asb3 (MGP_SPRETEiJ_G0017011) Gpr75 (MGP_SPRETEiJ_G0017010) Psme4 (MGP_SPRETEiJ_G0017009) Acyp2 (MGP_SPRETEiJ_G0017008) 4930505A04Rik (MGP_SPRETEiJ_G0017007) Sptbn1 (MGP_SPRETEiJ_G0017006) Eml6 (MGP_SPRETEiJ_G0017005) Rtn4 (MGP_SPRETEiJ_G0017004) Clhc1 (MGP_SPRETEiJ_G0017003) Rps27a (MGP_SPRETEiJ_G0017002) #22 Mtif2 (MGP_SPRETEiJ_G0017001) Prorsd1 (MGP_SPRETEiJ_G0017000) Ccdc88a (MGP_SPRETEiJ_G0016999) Cfap36 (MGP_SPRETEiJ_G0016998) Ppp4r3b (MGP_SPRETEiJ_G0016997) Pnpt1 (MGP_SPRETEiJ_G0016996) Efemp1 (MGP_SPRETEiJ_G0016995) Ccdc85a (MGP_SPRETEiJ_G0016994) MGP_SPRETEiJ_G0016993 Vrk2 (MGP_SPRETEiJ_G0016992) Fancl (MGP_SPRETEiJ_G0016991) 5730522E02Rik (MGP_SPRETEiJ_G0016990) Bcl11a (MGP_SPRETEiJ_G0016989) A830031A19Rik (MGP_SPRETEiJ_G0016988) Papolg (MGP_SPRETEiJ_G0016987) Steppe mouse MODERN SPECIES 2589 ENSMSIG00000023678 Eml6 (ENSMSIG00000023599) Rtn4 (ENSMSIG00000022888) Clhc1 (ENSMSIG00000022853) Rps27a (ENSMSIG00000022832) #22 Mtif2 (ENSMSIG00000022808) ENSMSIG00000022797 Ccdc88a (ENSMSIG00000022547) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000157364.C ENSGT00940000158952 ENSGT00940000163749 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00800000125307 ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000007529 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000157364.C ENSGT00940000158952 ENSGT00940000163749 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000007529 ENSGT00390000016883 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 23 CHAC2 (ENSHGLG00000019608) ERLEC1 (ENSHGLG00000019605) GPR75 (ENSHGLG00000019285) ENSHGLG00000019292 ENSHGLG00000033420 ENSHGLG00000036087 ENSHGLG00000021136 ENSHGLG00000042061 ENSHGLG00000032708 ENSHGLG00000038413 ENSHGLG00000019169 ENSHGLG00000019164 EML6 (ENSHGLG00000010907) RTN4 (ENSHGLG00000027971) CLHC1 (ENSHGLG00000040051) RPS27A (ENSHGLG00000042789) #22 MTIF2 (ENSHGLG00000009152) ENSHGLG00000032573 CCDC88A (ENSHGLG00000008470) ENSHGLG00000044471 ENSHGLG00000008137 ENSHGLG00000007808 ENSHGLG00000007480 EFEMP1 (ENSHGLG00000007156) CCDC85A (ENSHGLG00000006824) ENSHGLG00000040361 ENSHGLG00000044514 VRK2 (ENSHGLG00000006691) FANCL (ENSHGLG00000006628) BCL11A (ENSHGLG00000019600) ENSHGLG00000040216 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000007529 ENSGT00390000016883 Guinea pig MODERN SPECIES 48 MMRN1 (ENSCPOG00000005575) SNCA (ENSCPOG00000013970) GPRIN3 (ENSCPOG00000010370) FAM13A (ENSCPOG00000011119) HERC3 (ENSCPOG00000011101) ENSCPOG00000035198 PYURF (ENSCPOG00000034479) ENSCPOG00000014376 PPM1K (ENSCPOG00000031378) ENSCPOG00000014592 ENSCPOG00000030222 ENSCPOG00000031531 EML6 (ENSCPOG00000003169) ENSCPOG00000034679 ENSCPOG00000008064 RPS27A (ENSCPOG00000005819) #22 MTIF2 (ENSCPOG00000005823) ENSCPOG00000004666 CCDC88A (ENSCPOG00000004824) CFAP36 (ENSCPOG00000010993) PPP4R3B (ENSCPOG00000010998) PNPT1 (ENSCPOG00000011008) EFEMP1 (ENSCPOG00000002568) CCDC85A (ENSCPOG00000001873) VRK2 (ENSCPOG00000015550) FANCL (ENSCPOG00000015552) ENSCPOG00000032549 BCL11A (ENSCPOG00000007587) PAPOLG (ENSCPOG00000010306) REL (ENSCPOG00000011659) PUS10 (ENSCPOG00000011670) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000007529 ENSGT00390000016883 Degu MODERN SPECIES 89 ENSODEG00000019951 OTUD7B (ENSODEG00000011926) MTMR11 (ENSODEG00000012623) SV2A (ENSODEG00000011688) BOLA1 (ENSODEG00000020128) H2AC21 (ENSODEG00000019872) ENSODEG00000011653 H2BC21 (ENSODEG00000011247) ENSODEG00000013136 ENSODEG00000020205 H2BC18 (ENSODEG00000020003) EML6 (ENSODEG00000011885) ENSODEG00000012809 CLHC1 (ENSODEG00000012708) ENSODEG00000012372 RPS27A (ENSODEG00000013305) #22 MTIF2 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(ENSMMSG00000003548) Bovidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000163055 ENSGT00940000157364.C ENSGT00940000158952 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000007529 ENSGT00390000016883 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000163749 ENSGT00900000143213 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 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(ENSBTAG00000013001) ZNF140 (ENSBTAG00000040072) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156842 ENSGT00640000091487 ENSGT01060000248588.a.c.b ENSGT00940000156495 ENSGT00390000015714.ab ENSGT00940000156418 ENSGT00950000182891.a.a.b.a.b.a.m.a.a ENSGT00390000012736 ENSGT00390000009391.a ENSGT00940000154672 ENSGT00950000185266 ENSGT00390000010773 ENSGT00390000003125 ENSGT00940000158241 ENSGT00390000012574 ENSGT00910000144152.a.b #22 ENSGT00420000029769.b ENSGT00940000156950 ENSGT00940000156344 ENSGT00940000158645 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.b.a.a.a.a.a.b.b.a.a.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT00940000160549 ENSGT00940000157483 ENSGT00940000158285 ENSGT00940000162586 ENSGT00940000162734 ENSGT00940000162931 ENSGT00940000163022 ENSGT00940000164587 Domestic yak MODERN SPECIES 7 ADAD1 (ENSBGRG00000010969) BLTP1 (ENSBGRG00000011087) ENSBGRG00000011330 TRPC3 (ENSBGRG00000011412) FSTL5 (ENSBGRG00000011704) ENSBGRG00000012294 RAPGEF2 (ENSBGRG00000012332) ENSBGRG00000012953 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ENSBMUG00000013245 #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158952 ENSGT00940000163749 ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00860000136122 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000160112.o.b ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00960000187413 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000007529 Blue whale DUPLICATION Blue whale MODERN SPECIES 20 MDFIC (ENSBMSG00010007534) FOXP2 (ENSBMSG00010007623) PPP1R3A (ENSBMSG00010008008) SMIM30 (ENSBMSG00010008012) GPR85 (ENSBMSG00010008014) BMT2 (ENSBMSG00010008021) TMEM168 (ENSBMSG00010008029) LSMEM1 (ENSBMSG00010008044) IFRD1 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American black bear MODERN SPECIES 2158 RTN4 (ENSUAMG00000019635) ENSUAMG00000019636 CLHC1 (ENSUAMG00000019637) RPS27A (ENSUAMG00000019638) #22 MTIF2 (ENSUAMG00000019639) ENSUAMG00000019640 Giant Panda DUPLICATION Giant Panda MODERN SPECIES 14 STON1 (ENSAMEG00000023761) GTF2A1L (ENSAMEG00000006495) ENSAMEG00000006534 FSHR (ENSAMEG00000000237) NRXN1 (ENSAMEG00000013969) ASB3 (ENSAMEG00000004591) CHAC2 (ENSAMEG00000004580) ERLEC1 (ENSAMEG00000004550) PSME4 (ENSAMEG00000004483) ENSAMEG00000029360 C2orf73 (ENSAMEG00000030021) SPTBN1 (ENSAMEG00000004191) EML6 (ENSAMEG00000004086) RTN4 (ENSAMEG00000004062) CLHC1 (ENSAMEG00000004031) ENSAMEG00000004017 #22 MTIF2 (ENSAMEG00000003983) ENSAMEG00000030167 ENSAMEG00000003982 CCDC88A (ENSAMEG00000003927) ENSAMEG00000029692 CFAP36 (ENSAMEG00000003905) PPP4R3B (ENSAMEG00000003843) PNPT1 (ENSAMEG00000003772) EFEMP1 (ENSAMEG00000003695) CCDC85A (ENSAMEG00000003685) VRK2 (ENSAMEG00000015844) FANCL (ENSAMEG00000015826) BCL11A (ENSAMEG00000015813) PAPOLG 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mink MODERN SPECIES 282 SPTBN1 (ENSNVIG00000001877) EML6 (ENSNVIG00000001968) RTN4 (ENSNVIG00000002042) CLHC1 (ENSNVIG00000002157) RPS27A (ENSNVIG00000002165) #22 MTIF2 (ENSNVIG00000002196) ENSNVIG00000002228 CCDC88A (ENSNVIG00000002285) CFAP36 (ENSNVIG00000003356) PPP4R3B (ENSNVIG00000003448) PNPT1 (ENSNVIG00000003555) EFEMP1 (ENSNVIG00000003700) ENSNVIG00000003769 CCDC85A (ENSNVIG00000003792) Canidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158952 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000185692 ENSGT00940000153425.a.b ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a.b #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 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(ENSCAFG00020005021) LRCH2 (ENSCAFG00020004981) ENSCAFG00020004972 Dog DUPLICATION Dog MODERN SPECIES 1 NRXN1 (ENSCAFG00845006920) ENSCAFG00845007601 ENSCAFG00845007623 ASB3 (ENSCAFG00845007688) CHAC2 (ENSCAFG00845007798) ERLEC1 (ENSCAFG00845007879) GPR75 (ENSCAFG00845008125) PSME4 (ENSCAFG00845008342) ENSCAFG00845009195 ENSCAFG00845009286 SPTBN1 (ENSCAFG00845009556) EML6 (ENSCAFG00845010062) RTN4 (ENSCAFG00845010381) ENSCAFG00845010592 CLHC1 (ENSCAFG00845010710) RPS27A (ENSCAFG00845010792) #22 MTIF2 (ENSCAFG00845010861) ENSCAFG00845011085 CCDC88A (ENSCAFG00845011215) CFAP36 (ENSCAFG00845011709) PPP4R3B (ENSCAFG00845011789) PNPT1 (ENSCAFG00845011925) EFEMP1 (ENSCAFG00845012060) CCDC85A (ENSCAFG00845012276) ENSCAFG00845012446 VRK2 (ENSCAFG00845012500) FANCL (ENSCAFG00845012667) BCL11A (ENSCAFG00845012955) ENSCAFG00845013045 PAPOLG (ENSCAFG00845013090) REL (ENSCAFG00845013250) Dog MODERN SPECIES 144 ENSCAFG00845021332 ACSL4 (ENSCAFG00845021378) ENSCAFG00845021460 TMEM164 (ENSCAFG00845021507) ENSCAFG00845021594 AMMECR1 (ENSCAFG00845021642) RTL9 (ENSCAFG00845021744) CHRDL1 (ENSCAFG00845021871) ENSCAFG00845022210 ENSCAFG00845022264 CAPN6 (ENSCAFG00845022341) DCX (ENSCAFG00845022487) ENSCAFG00845022656 ENSCAFG00845022707 SERTM2 (ENSCAFG00845022740) ENSCAFG00845022756 #22 ENSCAFG00845022820 ENSCAFG00845023179 TRPC5 (ENSCAFG00845023272) TRPC5OS (ENSCAFG00845023335) RTL4 (ENSCAFG00845023450) LHFPL1 (ENSCAFG00845023511) AMOT (ENSCAFG00845023646) ENSCAFG00845023745 ENSCAFG00845015589 ENSCAFG00845015615 ENSCAFG00845015637 ENSCAFG00845015656 ENSCAFG00845015677 ENSCAFG00845015701 HTR2C (ENSCAFG00845015792) Red fox DUPLICATION Red fox MODERN SPECIES 106 IRS4 (ENSVVUG00000010546) ENSVVUG00000010560 NXT2 (ENSVVUG00000010575) ENSVVUG00000010581 #7 ACSL4 (ENSVVUG00000010590) ENSVVUG00000010605 TMEM164 (ENSVVUG00000010648) ENSVVUG00000010662 AMMECR1 (ENSVVUG00000010664) RTL9 (ENSVVUG00000010675) CHRDL1 (ENSVVUG00000010692) PAK3 (ENSVVUG00000010723) CAPN6 (ENSVVUG00000010757) DCX (ENSVVUG00000010785) ENSVVUG00000010824 ENSVVUG00000010832 #22 ALG13 (ENSVVUG00000010854) TRPC5 (ENSVVUG00000010941) TRPC5OS (ENSVVUG00000010960) Red fox MODERN SPECIES 10 NRXN1 (ENSVVUG00000005879) ENSVVUG00000005903 ENSVVUG00000005943 ASB3 (ENSVVUG00000006060) CHAC2 (ENSVVUG00000006167) ERLEC1 (ENSVVUG00000006195) PSME4 (ENSVVUG00000007068) ENSVVUG00000007794 C2orf73 (ENSVVUG00000007804) SPTBN1 (ENSVVUG00000007915) EML6 (ENSVVUG00000009773) RTN4 (ENSVVUG00000009833) ENSVVUG00000009841 ENSVVUG00000009844 CLHC1 (ENSVVUG00000009864) RPS27A (ENSVVUG00000009891) #22 MTIF2 (ENSVVUG00000009923) ENSVVUG00000009931 CCDC88A (ENSVVUG00000009946) CFAP36 (ENSVVUG00000010025) PPP4R3B (ENSVVUG00000010031) PNPT1 (ENSVVUG00000010034) EFEMP1 (ENSVVUG00000010060) CCDC85A (ENSVVUG00000010112) ENSVVUG00000010147 ENSVVUG00000010149 VRK2 (ENSVVUG00000010175) FANCL (ENSVVUG00000010209) BCL11A (ENSVVUG00000010330) ENSVVUG00000010337 PAPOLG (ENSVVUG00000010344) Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.a ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.a ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.a ##22 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 465 ENSNGAG00000019288 Elovl6 (ENSNGAG00000023846) ENSNGAG00000024138 ##22 Lrit3 (ENSNGAG00000002073) Gar1 (ENSNGAG00000008268) Cfi (ENSNGAG00000012073) ENSNGAG00000019057 Pla2g12a (ENSNGAG00000019864) Casp6 (ENSNGAG00000021834) Mcub (ENSNGAG00000022593) Sec24b (ENSNGAG00000023895) Col25a1 (ENSNGAG00000001308) Etnppl (ENSNGAG00000019931) Ostc (ENSNGAG00000004125) ENSNGAG00000021739 Lef1 (ENSNGAG00000022789) Hadh (ENSNGAG00000023972) Cyp2u1 (ENSNGAG00000024149) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.a ##22 Guinea pig MODERN SPECIES 80 ZNF296 (ENSCPOG00000010291) GEMIN7 (ENSCPOG00000037844) PPP1R37 (ENSCPOG00000006371) NKPD1 (ENSCPOG00000026614) TRAPPC6A (ENSCPOG00000015115) BLOC1S3 (ENSCPOG00000035473) ENSCPOG00000020516 ENSCPOG00000024355 EXOC3L2 (ENSCPOG00000021579) MARK4 (ENSCPOG00000004117) CKM (ENSCPOG00000019609) ENSCPOG00000039314 KLC3 (ENSCPOG00000015599) ERCC2 (ENSCPOG00000015600) PPP1R13L (ENSCPOG00000015602) ENSCPOG00000036376 ##22 POLR1G (ENSCPOG00000033293) ERCC1 (ENSCPOG00000015606) FOSB (ENSCPOG00000015608) RTN2 (ENSCPOG00000011382) PPM1N (ENSCPOG00000034457) VASP (ENSCPOG00000010236) OPA3 (ENSCPOG00000035437) EML2 (ENSCPOG00000013465) GIPR (ENSCPOG00000002438) ENSCPOG00000035154 QPCTL (ENSCPOG00000019359) ENSCPOG00000022016 FBXO46 (ENSCPOG00000021847) MEIOSIN (ENSCPOG00000031479) SIX5 (ENSCPOG00000014282) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.a ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.a ##22 Bushbaby MODERN SPECIES 140 ENSOGAG00000002656 OSCP1 (ENSOGAG00000002654) LSM10 (ENSOGAG00000002653) STK40 (ENSOGAG00000002651) EVA1B (ENSOGAG00000025550) ENSOGAG00000028592 THRAP3 (ENSOGAG00000002648) MAP7D1 (ENSOGAG00000013476) TRAPPC3 (ENSOGAG00000029810) COL8A2 (ENSOGAG00000034217) ADPRS (ENSOGAG00000026312) TEKT2 (ENSOGAG00000032145) AGO3 (ENSOGAG00000010290) AGO1 (ENSOGAG00000010279) ENSOGAG00000004233 ENSOGAG00000032752 ##22 CLSPN (ENSOGAG00000004231) C1orf216 (ENSOGAG00000004230) PSMB2 (ENSOGAG00000002097) TFAP2E (ENSOGAG00000029197) NCDN (ENSOGAG00000034366) KIAA0319L (ENSOGAG00000002092) ZMYM4 (ENSOGAG00000017019) SFPQ (ENSOGAG00000027710) ENSOGAG00000032030 ZMYM6 (ENSOGAG00000003533) TMEM35B (ENSOGAG00000031032) DLGAP3 (ENSOGAG00000003530) SMIM12 (ENSOGAG00000028773) GJA4 (ENSOGAG00000024379) ENSOGAG00000003527 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.b ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.b ##22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 21 ENSMMSG00000002412 ENSMMSG00000002427 ZPLD1 (ENSMMSG00000002438) ENSMMSG00000002489 ENSMMSG00000002507 ENSMMSG00000002526 NFKBIZ (ENSMMSG00000002549) NXPE3 (ENSMMSG00000002592) ENSMMSG00000002610 ##22 CEP97 (ENSMMSG00000002625) RPL24 (ENSMMSG00000002654) ZBTB11 (ENSMMSG00000002682) PCNP (ENSMMSG00000002707) TRMT10C (ENSMMSG00000002724) ENSMMSG00000002729 SENP7 (ENSMMSG00000002791) IMPG2 (ENSMMSG00000003217) ENSMMSG00000003246 ENSMMSG00000003268 ABI3BP (ENSMMSG00000003297) TFG (ENSMMSG00000003469) ADGRG7 (ENSMMSG00000003498) TMEM45A (ENSMMSG00000003567) LNP1 (ENSMMSG00000003607) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000144152.a.a.b ##22 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1645 Sec11a (ENSNGAG00000000718) Nmb (ENSNGAG00000019540) Wdr73 (ENSNGAG00000015403) Zscan2 (ENSNGAG00000007642) Iqgap1 (ENSNGAG00000013234) Crtc3 (ENSNGAG00000015497) ENSNGAG00000014524 ENSNGAG00000018217 ##22 Blm (ENSNGAG00000001275) Furin (ENSNGAG00000012746) ENSNGAG00000019478 ENSNGAG00000020580 ENSNGAG00000015735 ENSNGAG00000000437 Unc45a (ENSNGAG00000001703) Rccd1 (ENSNGAG00000013437) Prc1 (ENSNGAG00000019170) Vps33b (ENSNGAG00000016165) Ngrn (ENSNGAG00000018847) Ttll13 (ENSNGAG00000020633) Gdpgp1 (ENSNGAG00000015420) Cib1 (ENSNGAG00000015587) Sema4b (ENSNGAG00000001047) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000163055 ENSGT00940000157364.C ENSGT00940000158952 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564.c ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000007529 ENSGT00390000016883 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 1205 ENSGT00910000144152.a #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b Armadillo MODERN SPECIES 1878 RPS27A (ENSDNOG00000004813) #22 MTIF2 (ENSDNOG00000004817) ENSDNOG00000041290 ENSDNOG00000036210 ENSDNOG00000034846 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000163055 ENSGT00940000157364.C ENSGT00940000158952 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564.c ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000007529 ENSGT00390000016883 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000163055 ENSGT00940000157364.C ENSGT00940000158952 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564.c ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b.b.a ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000007529 ENSGT00390000016883 Elephant MODERN SPECIES 438 LHCGR (ENSLAFG00000011056) FSHR (ENSLAFG00000017106) ENSLAFG00000000247 ENSLAFG00000029467 ASB3 (ENSLAFG00000010517) CHAC2 (ENSLAFG00000010523) ERLEC1 (ENSLAFG00000014394) GPR75 (ENSLAFG00000002828) PSME4 (ENSLAFG00000002830) ENSLAFG00000023366 C2orf73 (ENSLAFG00000029000) SPTBN1 (ENSLAFG00000012062) EML6 (ENSLAFG00000020864) RTN4 (ENSLAFG00000011641) CLHC1 (ENSLAFG00000016854) RPS27A (ENSLAFG00000023133) #22 MTIF2 (ENSLAFG00000007341) ENSLAFG00000007344 CCDC88A (ENSLAFG00000007346) CFAP36 (ENSLAFG00000017814) PPP4R3B (ENSLAFG00000017825) PNPT1 (ENSLAFG00000021462) EFEMP1 (ENSLAFG00000009070) CCDC85A (ENSLAFG00000002154) VRK2 (ENSLAFG00000012268) BCL11A (ENSLAFG00000003101) PAPOLG (ENSLAFG00000010404) REL (ENSLAFG00000013507) PUS10 (ENSLAFG00000010782) PEX13 (ENSLAFG00000000830) SANBR (ENSLAFG00000016305) Tenrec MODERN SPECIES 3961 RPS27A (ENSETEG00000010317) #22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000007529 ENSGT00390000016883 Opossum MODERN SPECIES ENSMODG00000004334 ENSMODG00000040115 CHAC2 (ENSMODG00000001593) ASB3 (ENSMODG00000001584) ERLEC1 (ENSMODG00000001631) GPR75 (ENSMODG00000023107) PSME4 (ENSMODG00000001673) ENSMODG00000049670 ENSMODG00000045772 ##24 ENSMODG00000025768 SPTBN1 (ENSMODG00000001736) ENSMODG00000037328 EML6 (ENSMODG00000001783) RTN4 (ENSMODG00000001803) CLHC1 (ENSMODG00000001813) RPS27A (ENSMODG00000001819) #22 MTIF2 (ENSMODG00000001833) ENSMODG00000001835 CCDC88A (ENSMODG00000001885) CFAP36 (ENSMODG00000001894) ENSMODG00000001935 PNPT1 (ENSMODG00000001984) EFEMP1 (ENSMODG00000002005) CCDC85A (ENSMODG00000002041) ENSMODG00000039070 ENSMODG00000040320 ENSMODG00000002056 ENSMODG00000002096 FANCL (ENSMODG00000002105) BCL11A (ENSMODG00000002114) PAPOLG (ENSMODG00000002160) Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000007529 ENSGT00390000016883 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000007529 ENSGT00390000016883 Wallaby MODERN SPECIES 5141 RPS27A (ENSMEUG00000008917) #22 MTIF2 (ENSMEUG00000008935) ENSMEUG00000008948 ENSMEUG00000008959 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000011103.A ENSGT00950000182980.a.b.b.b.bc ENSGT00390000005045 ENSGT00940000154864.b ENSGT00940000155564 ENSGT00940000156568 ENSGT00950000183166.a.a.a.b ENSGT00910000144152.a #22 ENSGT00900000141103 ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155559.b ENSGT00390000012785 ENSGT00390000018199.b ENSGT00390000014001 ENSGT00940000157837 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000007529 ENSGT00390000016883 Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 1017 ENSVURG00010014760 ENSVURG00010014727 ENSVURG00010014704 CHAC2 (ENSVURG00010014690) ASB3 (ENSVURG00010014669) ERLEC1 (ENSVURG00010014651) GPR75 (ENSVURG00010014637) PSME4 (ENSVURG00010014522) ENSVURG00010014502 ENSVURG00010014481 ENSVURG00010014468 SPTBN1 (ENSVURG00010014369) EML6 (ENSVURG00010014289) ENSVURG00010014197 CLHC1 (ENSVURG00010014155) ENSVURG00010014144 #22 MTIF2 (ENSVURG00010014139) ENSVURG00010014135 CCDC88A (ENSVURG00010014027) CFAP36 (ENSVURG00010013983) ENSVURG00010013950 PNPT1 (ENSVURG00010013927) ENSVURG00010013924 EFEMP1 (ENSVURG00010013908) CCDC85A (ENSVURG00010013878) VRK2 (ENSVURG00010013840) FANCL (ENSVURG00010013810) BCL11A (ENSVURG00010013786) PAPOLG (ENSVURG00010013767) REL (ENSVURG00010013755) PUS10 (ENSVURG00010013746) Common wonbat MODERN SPECIES 1060 IPP (ENSVURG00010017219) MAST2 (ENSVURG00010017233) PIK3R3 (ENSVURG00010017279) TSPAN1 (ENSVURG00010017292) POMGNT1 (ENSVURG00010017297) LURAP1 (ENSVURG00010017357) RAD54L (ENSVURG00010017319) LRRC41 (ENSVURG00010017363) 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