Gnathostomata	DUPLICATION
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	1743															ENSGT00940000155604	ENSGT00950000182903.a.b #22
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	264																ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01100000263613 #24	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000159816	ENSGT00390000003738.a.a	ENSGT00390000004049	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000161268	ENSGT00940000153249.b.c	ENSGT00930000151033
Actinopterygii	DUPLICATION
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	649																ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01100000263613 #24	ENSGT00940000163927.a.a #25
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	422																ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01100000263613 #24	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	87								ENSGT00530000063691.b	ENSGT00390000008657	ENSGT00390000010017	ENSGT00940000160771	ENSGT00390000013834	ENSGT00940000165258	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01100000263613 #24	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00640000091486.b	ENSGT00940000165960.a.a ##30	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.a.b.b #30	ENSGT00940000167107 #31	ENSGT00390000000592	ENSGT00940000165100.b	ENSGT00940000165987	ENSGT00390000018418
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	50			ENSGT00940000169954	ENSGT00600000085600	ENSGT00390000013368	ENSGT00510000047760	ENSGT01070000254383	ENSGT00940000180688	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01100000263613 #24	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.a.b.b #30	ENSGT00940000167107 #31	ENSGT00390000000592	ENSGT00940000165100.b	ENSGT00940000165987	ENSGT00390000018418	ENSGT00440000037582
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	207		ENSGT00940000169954	ENSGT00600000085600	ENSGT00390000013368	ENSGT00510000047760	ENSGT01070000254383	ENSGT00940000167160	ENSGT00940000180688	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01100000263613 #24	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.a.b.b #30	ENSGT00940000167107 #31	ENSGT00390000000592	ENSGT00940000165100.b.f	ENSGT00940000165987	ENSGT00440000037582	ENSGT00940000158001
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	210							ENSGT01090000260185	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01100000263613 #24	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.a.b.b #30	ENSGT01010000222656	ENSGT00940000167107 #31	ENSGT00940000156646.c #32	ENSGT00940000160303.a.a #33	ENSGT00940000166283 #34	ENSGT00650000094881 #35
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000005498 #9	ENSGT00390000013762.a.f #10	ENSGT00510000048151.a #11	ENSGT00940000154790.a.b #12	ENSGT00940000160125 #13	ENSGT01090000260185	ENSGT00940000154273.b #14	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01100000263613 #24	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.a.b.b #30	ENSGT01010000222656	ENSGT00940000167107.e ##31	ENSGT00940000167107.f #31	ENSGT00940000156646.c.a #32	ENSGT00940000160303.a.a #33	ENSGT00940000166283 #34	ENSGT00650000094881 #35
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	70	ENSGT00940000165127.b.a #7	ENSGT00940000165739.f.b #8	ENSGT00390000005498.a #9	ENSGT00390000013762.a.f.b #10	ENSGT00510000048151.a.d #11	ENSGT00940000154790.a.b.a #12	ENSGT00940000160125.l #13	ENSGT00940000154273.b.f #14	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844.e #16	ENSGT00940000159372.e #17	ENSGT00940000160289.j #18	ENSGT00940000161071.e #19	ENSGT00940000166370.d #20	ENSGT00730000112287.a #21	ENSGT00950000182903.a.b.i.i #22	ENSGT00940000158535.ab #23	ENSGT01100000263613.f #24	ENSGT00940000163927.a.a.bb #25	ENSGT00940000153491.b.b.b.a #26	ENSGT00940000166316.a #27	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.a.b.b.c #30	ENSGT00940000167107.f #31	ENSGT00940000156646.c.a.a.a #32	ENSGT00940000160303.a.a #33	ENSGT00940000166283.hb #34	ENSGT00650000094881.a.b #35	ENSGT00950000183121.a.c.b.a #36	ENSGT00510000050706.a #37
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	183	ENSGT00950000182924.A.a.d	ENSGT00940000165127.b.a #7	ENSGT00940000165739.f.b #8	ENSGT00390000005498.a #9	ENSGT00390000013762.a.f.b #10	ENSGT00510000048151.a.d #11	ENSGT00940000154790.a.b.a #12	ENSGT00940000160125.l #13	ENSGT00940000154273.b.f #14	ENSGT00940000159844.e #16	ENSGT00940000159372.e #17	ENSGT00940000160289.j #18	ENSGT00940000161071.e #19	ENSGT00940000166370.d #20	ENSGT00730000112287.a #21	ENSGT00950000182903.a.b.i.i #22	ENSGT00940000158535.ab #23	ENSGT01100000263613.f #24	ENSGT00940000163927.a.a.bb #25	ENSGT00940000153491.b.b.b.a #26	ENSGT00940000166316.a #27	ENSGT00390000014072.B.e #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.a.b.b.c #30	ENSGT00940000167107.f #31	ENSGT00940000156646.c.a.a.a #32	ENSGT00940000160303.a.a #33	ENSGT00940000166283.hb #34	ENSGT00650000094881.b ##35	ENSGT00510000050706.a #37	ENSGT00940000158001.f
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	226	ovol1a (ENSSGRG00000001893) #8	mus81 (ENSSGRG00000001892) #9	ENSSGRG00000001891 #10	tmem179ba (ENSSGRG00000001889) #11	prox3 (ENSSGRG00000001887) #12	snx15 (ENSSGRG00000001886) #13	ENSSGRG00000001884	ENSSGRG00000001883	ENSSGRG00000001881	BCL6B (ENSSGRG00000001879) #16	SLC16A13 (ENSSGRG00000001878) #17	acap1 (ENSSGRG00000001728) #18	agfg2 (ENSSGRG00000001723) #19	ENSSGRG00000001721 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSSGRG00000001719) #21	dvl2 (ENSSGRG00000001541) #22	ENSSGRG00000001532 #24	ponzr1 (ENSSGRG00000001531) #25	ENSSGRG00000001529 #26	ENSSGRG00000001307 #27	cnpy4 (ENSSGRG00000001273) #28	ENSSGRG00000001263	ENSSGRG00000001258	zgc:103586 (ENSSGRG00000001250) #31	slc3a2a (ENSSGRG00000001232) #32	zpax4 (ENSSGRG00000001200) #34	ENSSGRG00000001175 ##35	ENSSGRG00000001161 #36	tnfsf12 (ENSSGRG00000001141) ##37	CHD3 (ENSSGRG00000054786)	cyb5d1 (ENSSGRG00000054766)
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Goldfish	MODERN SPECIES	47	ENSCARG00000068323 #7	ovol1a (ENSCARG00000068326) #8	ENSCARG00000068333	ENSCARG00000068397 #10	tmem179ba (ENSCARG00000068422) #11	prox3 (ENSCARG00000068431) #12	snx15 (ENSCARG00000068447) #13	ENSCARG00000068468 #15	BCL6B (ENSCARG00000068480) #16	SLC16A13 (ENSCARG00000068491) #17	acap1 (ENSCARG00000068552) #18	agfg2 (ENSCARG00000068769) #19	ENSCARG00000068783 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSCARG00000068794) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSCARG00000068802)	dvl2 (ENSCARG00000068817) #22	acadvl (ENSCARG00000068888) #23	ENSCARG00000069113 #24	ponzr1 (ENSCARG00000069121) #25	ENSCARG00000069129 #26	ENSCARG00000069146 #27	cnpy4 (ENSCARG00000069150) #28	ENSCARG00000069157 #29	ENSCARG00000069178 #30	zgc:103586 (ENSCARG00000000191) #31	zgc:158423 (ENSCARG00000000262) ##32	zpax4 (ENSCARG00000000404) #34	ENSCARG00000000537 #35	ENSCARG00000000548 #36	tnfsf12 (ENSCARG00000000556) #37	CHD3 (ENSCARG00000000593)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000165739.f.a ##8	ENSGT00390000005498.b ##9	ENSGT00390000013762.a.f.a ##10	ENSGT00510000048151.a.c ##11	ENSGT00940000154790.a.b.b ##12	ENSGT00940000160125.k ##13	ENSGT01090000260185	ENSGT00940000154273.b.e ##14	ENSGT00940000159844.f ##16	ENSGT00940000159372.f ##17	ENSGT00940000160289.i ##18	ENSGT00940000161071.f ##19	ENSGT00940000166370.c ##20	ENSGT00730000112287.b ##21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i.j ##22	ENSGT00940000158535.`b ##23	ENSGT01100000263613.e ##24	ENSGT00940000163927.a.a.cb ##25	ENSGT00940000153491.b.b.b.b ##26	ENSGT00940000166316.b ##27	ENSGT00940000165960.a.b.b.d ##30	ENSGT01010000222656	ENSGT00940000167107.e ##31	ENSGT00940000156646.c.a.a.b ##32	ENSGT00650000094881.a.a ##35	ENSGT00800000125278	ENSGT00950000183121.a.c.b.b ##36	ENSGT00510000050706.b ##37	ENSGT00940000177727.a	ENSGT00940000158001.e
Goldfish	MODERN SPECIES	25	ENSCARG00000062528 ##7	ovol1a (ENSCARG00000062511) ##8	mus81 (ENSCARG00000062463) ##9	TMEM151A (ENSCARG00000062450) ##10	tmem179ba (ENSCARG00000062422) ##11	prox3 (ENSCARG00000062406) ##12	snx15 (ENSCARG00000062393) ##13	ENSCARG00000062379	ENSCARG00000062371 ##14	BCL6B (ENSCARG00000062355) ##16	SLC16A13 (ENSCARG00000062339) ##17	acap1 (ENSCARG00000062266) ##18	agfg2 (ENSCARG00000062191) ##19	ENSCARG00000062164 ##20	si:ch73-335l21.4 (ENSCARG00000062152) ##21	dvl2 (ENSCARG00000061847) ##22	acadvl (ENSCARG00000058232) ##23	ENSCARG00000058156 ##24	ponzr1 (ENSCARG00000058134) ##25	ENSCARG00000058113 ##26	ENSCARG00000058100 ##27	ENSCARG00000058022	ENSCARG00000057992 ##30	ENSCARG00000057973	ENSCARG00000057950 ##31	ENSCARG00000057942	ENSCARG00000057937	ENSCARG00000057931	ENSCARG00000057886	ENSCARG00000057858	ENSCARG00000057868
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	56	ENSGT00940000165739.f.a ##8	ENSGT00390000005498.b ##9	ENSGT00390000013762.a.f.a ##10	ENSGT00510000048151.a.c ##11	ENSGT00940000154790.a.b.b ##12	ENSGT00940000160125.k ##13	ENSGT00940000154273.b.e ##14	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844.f ##16	ENSGT00940000159372.f ##17	ENSGT00940000160289.i ##18	ENSGT00940000161071.f ##19	ENSGT00940000166370.c ##20	ENSGT00730000112287.b ##21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i.j ##22	ENSGT00940000158535.`b ##23	ENSGT01100000263613.e ##24	ENSGT00940000163927.a.a.cb ##25	ENSGT00940000153491.b.b.b.b ##26	ENSGT00940000166316.b ##27	ENSGT00390000014072.B.f #28	ENSGT00940000165960.a.b.b.d ##30	ENSGT01010000222656	ENSGT00940000167107.e ##31	ENSGT00940000156646.c.a.a.b ##32	ENSGT00800000125278	ENSGT00950000183121.a.c.b.b ##36	ENSGT00510000050706.b ##37	ENSGT00940000177727.a	ENSGT00940000158001.e
Common carp reference	MODERN SPECIES	6	ENSCCRG00000077729	ENSCCRG00000057527 ##7	ovol1a (ENSCCRG00000070411) ##8	mus81 (ENSCCRG00000028513) ##9	si:ch211-285j22.3 (ENSCCRG00000081031)	prox3 (ENSCCRG00000052974) ##12	snx15 (ENSCCRG00000057490) ##13	ENSCCRG00000028488 ##14	ENSCCRG00000028478 ##16	ENSCCRG00000040049 ##17	acap1 (ENSCCRG00000067284) ##18	agfg2 (ENSCCRG00000028440) ##19	ENSCCRG00000034175 ##20	si:ch73-335l21.4 (ENSCCRG00000082199) ##21	si:ch73-335l21.2 (ENSCCRG00000079520)	dvl2 (ENSCCRG00000021583) ##22	acadvl (ENSCCRG00000054675) ##23	ENSCCRG00000021604 ##24	ponzr1 (ENSCCRG00000081415) ##25	ENSCCRG00000021610 ##26	ENSCCRG00000066145 ##27	cnpy4 (ENSCCRG00000021658) #28	ENSCCRG00000079316	ENSCCRG00000057418 ##30	ENSCCRG00000077398	ENSCCRG00000056814 ##31	slc3a2a (ENSCCRG00000000400) ##32	ENSCCRG00000077189	sat2a.2 (ENSCCRG00000024255) ##36	tnfsf12 (ENSCCRG00000081345) ##37	ENSCCRG00000024284
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	199	ENSSGRG00000046458 ##7	ovol1a (ENSSGRG00000046457) ##8	mus81 (ENSSGRG00000046454) ##9	TMEM151A (ENSSGRG00000046453) ##10	tmem179ba (ENSSGRG00000046452) ##11	prox3 (ENSSGRG00000046450) ##12	snx15 (ENSSGRG00000046449) ##13	ENSSGRG00000046448 #15	BCL6B (ENSSGRG00000046447) ##16	SLC16A13 (ENSSGRG00000046446) ##17	acap1 (ENSSGRG00000046443) ##18	agfg2 (ENSSGRG00000046442) ##19	ENSSGRG00000046440 ##20	si:ch73-335l21.4 (ENSSGRG00000046438) ##21	si:ch73-335l21.2 (ENSSGRG00000046437)	dvl2 (ENSSGRG00000046435) ##22	acadvl (ENSSGRG00000045698) ##23	ENSSGRG00000045663 ##24	ponzr1 (ENSSGRG00000045661) ##25	ENSSGRG00000045659 ##26	ENSSGRG00000045602 ##27	cnpy4 (ENSSGRG00000045600) #28	ENSSGRG00000045599 ##32	slc3a2a (ENSSGRG00000045593) ##32	zpax4 (ENSSGRG00000045589) ##34	ENSSGRG00000045587 ##36	tnfsf12 (ENSSGRG00000045586) ##37	ENSSGRG00000045585	CHD3 (ENSSGRG00000042076)	cyb5d1 (ENSSGRG00000042018)	dnajc3b (ENSSGRG00000041931)
Zebrafish	MODERN SPECIES	22	TMEM151A (ENSDARG00000077986) #10	ENSDARG00000100885	si:ch211-285j22.3 (ENSDARG00000100703)	tmem179ba (ENSDARG00000056233) #11	prox3 (ENSDARG00000088810) #12	snx15 (ENSDARG00000020397) #13	ENSDARG00000069331 #14	BCL6B (ENSDARG00000069335) #16	SLC16A13 (ENSDARG00000055342) #17	acap1 (ENSDARG00000056346) #18	agfg2 (ENSDARG00000069334) #19	ENSDARG00000036414 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSDARG00000091234) #21	ENSDARG00000105541	si:ch73-335l21.2 (ENSDARG00000105617)	dvl2 (ENSDARG00000056184) #22	acadvl (ENSDARG00000016687) #23	ENSDARG00000077414 #24	ponzr1 (ENSDARG00000090444) #25	ENSDARG00000036420 #26	ENSDARG00000036422 #27	cnpy4 (ENSDARG00000055797) #28	ENSDARG00000105585	ENSDARG00000061850 #29	ENSDARG00000100712 #30	ENSDARG00000105530	zgc:103586 (ENSDARG00000036426) #31	slc3a2a (ENSDARG00000036427) #32	zgc:158423 (ENSDARG00000055791) ##32	ENSDARG00000098410 #33	zpax4 (ENSDARG00000079034) #34
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT00940000157623	ENSGT00940000160414.c	ENSGT00940000163776.a.a	ENSGT01030000234590.B.a.b	ENSGT00940000176904	ENSGT00550000075058	ENSGT01090000260185	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01100000263613 #24	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000157843	ENSGT00530000063624.B	ENSGT00390000005569	ENSGT00950000182963.b.b	ENSGT00940000153904.b	ENSGT00940000153284.a.mc.a	ENSGT00940000164592	ENSGT00940000165991
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Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	154				ENSGT01030000234590.B.a.b	ENSGT00940000176904	ENSGT00550000075058	ENSGT01090000260185	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01100000263613 #24	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000157843	ENSGT00530000063624.B	ENSGT00390000005569	ENSGT00950000182963.b.b	ENSGT00940000153904.b	ENSGT00940000153284.a.mc.a	ENSGT00940000164592	ENSGT00940000165991
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	9				ENSGT01030000234590.B.a.b	ENSGT00940000176904	ENSGT00550000075058	ENSGT01090000260185	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000155511.m	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01100000263613 #24	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000157843	ENSGT00530000063624.B	ENSGT00390000005569	ENSGT00950000182963.b.b	ENSGT00940000153904.b	ENSGT00940000153284.a.mc.a	ENSGT00940000164592	ENSGT00940000165991
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	7	faah2b (ENSAMXG00000004970)	TESK1 (ENSAMXG00000004969)	pik3c3 (ENSAMXG00000004965)	tm4sf5 (ENSAMXG00000034674)	si:dkey-85k7.7 (ENSAMXG00000041473)	mettl3 (ENSAMXG00000012824)	ENSAMXG00000043297	ENSAMXG00000036209 #15	ENSAMXG00000012978 #16	SLC16A13 (ENSAMXG00000013028) #17	acap1 (ENSAMXG00000013034) #18	ENSAMXG00000042645	ENSAMXG00000013079 #20	si:ch73-335l21.2 (ENSAMXG00000035766)	si:ch73-335l21.4 (ENSAMXG00000032709) #21	dvl2 (ENSAMXG00000013102) #22	acadvl (ENSAMXG00000013130) #23	ENSAMXG00000041941 #24	ponzr1 (ENSAMXG00000040115) #25	ENSAMXG00000013152 #26	ENSAMXG00000013165 #27	ENSAMXG00000042790	cnpy4 (ENSAMXG00000013200) #28	hdac8 (ENSAMXG00000013212)	cited1 (ENSAMXG00000026480)	rps4x (ENSAMXG00000013268)	NHSL2 (ENSAMXG00000013279)	arhgap36 (ENSAMXG00000013311)	ENSAMXG00000040967	ENSAMXG00000031893	rasl11a (ENSAMXG00000035770)
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	501				tm4sf5 (ENSPNAG00000025644)	si:dkey-85k7.7 (ENSPNAG00000025656)	mettl3 (ENSPNAG00000025734)	ENSPNAG00000025861	ENSPNAG00000025875 #15	ENSPNAG00000025921 #16	SLC16A13 (ENSPNAG00000025938) #17	acap1 (ENSPNAG00000026121) #18	ENSPNAG00000006524	ENSPNAG00000006858 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSPNAG00000026160) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSPNAG00000004016)	dvl2 (ENSPNAG00000005502) #22	acadvl (ENSPNAG00000026273) #23	ENSPNAG00000026294 #24	ponzr1 (ENSPNAG00000026305) #25	ponzr1 (ENSPNAG00000026318) #25	ENSPNAG00000026342 #26	ENSPNAG00000006479 #27
Electric eel	MODERN SPECIES	1219																dvl2 (ENSEEEG00000001538) #22	acadvl (ENSEEEG00000001057) #23	ENSEEEG00000001013 #24	ponzr1 (ENSEEEG00000001011) #25
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	120		ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000167160	ENSGT01070000254383	ENSGT00390000013368	ENSGT00600000085600	ENSGT00950000182899.C.b.g	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01100000263613 #24	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000167107 #31	ENSGT00390000000592	ENSGT00940000165100.b.f	ENSGT00940000165987	ENSGT00440000037582	ENSGT00940000158001	ENSGT00510000050706 #37
Denticle herring	DUPLICATION
Denticle herring	MODERN SPECIES		acadvl (ENSDCDG00000018419) #23	ENSDCDG00000018410	ENSDCDG00000018406	slx1b (ENSDCDG00000018404)	ENSDCDG00000018403	ENSDCDG00000018400	ENSDCDG00000018397	ENSDCDG00000018395 #15	BCL6B (ENSDCDG00000018389) #16	SLC16A13 (ENSDCDG00000018386) #17	acap1 (ENSDCDG00000014474) #18	agfg2 (ENSDCDG00000014353) #19	ENSDCDG00000014342 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSDCDG00000014339) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSDCDG00000014334)	dvl2 (ENSDCDG00000013898) #22	rell1 (ENSDCDG00000013858)	zgc:194930 (ENSDCDG00000013851)	ENSDCDG00000013845	NWD2 (ENSDCDG00000013836)	DTHD1 (ENSDCDG00000013827)	ENSDCDG00000013821	ENSDCDG00000005472	ENSDCDG00000005470	ENSDCDG00000005172	PCDH7 (ENSDCDG00000005151)	ENSDCDG00000005144	STIM2 (ENSDCDG00000005046)	tbc1d19 (ENSDCDG00000004801)	CCKAR (ENSDCDG00000004766)	RBPJ (ENSDCDG00000004747)
Denticle herring	MODERN SPECIES	23								ENSDCDG00000022588 #15	BCL6B (ENSDCDG00000022583) #16	SLC16A13 (ENSDCDG00000022580) #17	acap1 (ENSDCDG00000019848) #18	agfg2 (ENSDCDG00000019800) #19	ENSDCDG00000019798 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSDCDG00000019794) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSDCDG00000019792)	dvl2 (ENSDCDG00000019643) #22	rell1 (ENSDCDG00000019627)	zgc:194930 (ENSDCDG00000019623)
Atlantic herring	DUPLICATION
Atlantic herring	MODERN SPECIES	9	ponzr1 (ENSCHAG00000026106) #25	ENSCHAG00000026109 #24	acadvl (ENSCHAG00000026116) #23	ENSCHAG00000000638	ENSCHAG00000000662	slx1b (ENSCHAG00000000700)	ENSCHAG00000000730	ENSCHAG00000000767	ENSCHAG00000000809	ENSCHAG00000000832	ENSCHAG00000000877 #15	ENSCHAG00000000971 #16	SLC16A13 (ENSCHAG00000000996) #17	acap1 (ENSCHAG00000001229) #18	ENSCHAG00000001740 #20	dvl2 (ENSCHAG00000001757) #22	rell1 (ENSCHAG00000001773)	zgc:194930 (ENSCHAG00000001806)	NWD2 (ENSCHAG00000001829)	ENSCHAG00000001888	ENSCHAG00000001900	ENSCHAG00000002023	ENSCHAG00000002042	ENSCHAG00000002066	ENSCHAG00000002084	ENSCHAG00000002121	ednrab (ENSCHAG00000002158)	ENSCHAG00000003316	ednrab (ENSCHAG00000003519)	ENSCHAG00000003830	ENSCHAG00000003922
Atlantic herring	MODERN SPECIES	24	ENSCHAG00000018409	capga (ENSCHAG00000018279)	slc25a35 (ENSCHAG00000018248)	rangrf (ENSCHAG00000018244)	ENSCHAG00000018209	grk1b (ENSCHAG00000018194)	ENSCHAG00000018169	ENSCHAG00000018157	ENSCHAG00000018146	cldn15b (ENSCHAG00000018141)	sat2b (ENSCHAG00000018098) ##36	sat2b (ENSCHAG00000018090) ##36	ENSCHAG00000018061	ENSCHAG00000018056 ##30	ENSCHAG00000018051 ##30	DVL2 (ENSCHAG00000017981) #22	acadvl (ENSCHAG00000016368) #23	ENSCHAG00000016254	ENSCHAG00000016233	ENSCHAG00000016228	ENSCHAG00000016218	gucy2d (ENSCHAG00000012940)	si:ch211-284e13.11 (ENSCHAG00000012875)	ENSCHAG00000012860	slc12a9 (ENSCHAG00000012698)	gnb2 (ENSCHAG00000012631)	ENSCHAG00000012620	mink1 (ENSCHAG00000005262)	PLD2 (ENSCHAG00000002170)	chrne (ENSCHAG00000001547)	gltpd2b (ENSCHAG00000001492)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	80	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283 #34	ENSGT00940000163503.A.a.a.a	ENSGT01090000260185	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000154838.A.f.b.b	ENSGT01100000263613 #24	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00940000167107 #31	ENSGT00390000000592	ENSGT00940000165100.b	ENSGT00940000165987	ENSGT00390000018418
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	74	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283 #34	ENSGT00940000163503.A.a.a.a	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30
Cod	MODERN SPECIES	8	acap1 (ENSGMOG00000016844) #18	ENSGMOG00000028165	ENSGMOG00000030769	ENSGMOG00000031128	ENSGMOG00000028352	ENSGMOG00000025698	ENSGMOG00000029118	ENSGMOG00000031799	ENSGMOG00000036283	ENSGMOG00000030378	ENSGMOG00000026181	agfg2 (ENSGMOG00000016834) #19	ENSGMOG00000036442 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSGMOG00000014164) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSGMOG00000036358)	dvl2 (ENSGMOG00000014125) #22	acadvl (ENSGMOG00000014084) #23	intu (ENSGMOG00000005821)	ino80b (ENSGMOG00000005805)	ENSGMOG00000005784	mfap3l (ENSGMOG00000005769)	actn3b (ENSGMOG00000009617)	ENSGMOG00000027696	ccs (ENSGMOG00000009635)	ENSGMOG00000009644	ENSGMOG00000023814	zgc:101810 (ENSGMOG00000009710)	six7 (ENSGMOG00000009723)	b4gat1 (ENSGMOG00000009731)	nit1 (ENSGMOG00000009736)	pfdn2 (ENSGMOG00000024138)
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283 #34	ENSGT00940000163503.A.a.a.a	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT01010000222552	ENSGT00940000153648.b	ENSGT00940000153404.b
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	9	ENSMMDG00005023186	shbg (ENSMMDG00005023183)	NEURL4 (ENSMMDG00005023134)	ENSMMDG00005018080	ENSMMDG00005017977	zpax4 (ENSMMDG00005017972) #34	ENSMMDG00005017967	ENSMMDG00005017964 #15	BCL6B (ENSMMDG00005017961) #16	SLC16A13 (ENSMMDG00005017959) #17	acap1 (ENSMMDG00005017948) #18	agfg2 (ENSMMDG00005017929) #19	ENSMMDG00005017928 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSMMDG00005017925) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSMMDG00005017923)	dvl2 (ENSMMDG00005017908) #22	acadvl (ENSMMDG00005017165) #23	ENSMMDG00005017134	ponzr1 (ENSMMDG00005017133) #25	ENSMMDG00005017132 #27	ENSMMDG00005017128	cnpy4 (ENSMMDG00005017126) #28	ENSMMDG00005017042 #29	ENSMMDG00005017038 ##30	pcolceb (ENSMMDG00005016990)	per1b (ENSMMDG00005016500)	rell1 (ENSMMDG00005016478)	ENSMMDG00005016476	NWD2 (ENSMMDG00005016473)	DTHD1 (ENSMMDG00005016470)	ENSMMDG00005016277
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283 #34	ENSGT00940000163503.A.a.a.a	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT01010000222552	ENSGT00940000153648.b	ENSGT00940000153404.b
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	506	ENSHCOG00000011850	capgb (ENSHCOG00000011861)	POLR2A (ENSHCOG00000011874)	ENSHCOG00000011903	shbg (ENSHCOG00000011914)	NEURL4 (ENSHCOG00000011926)	ENSHCOG00000011945	ENSHCOG00000011968 #34	ENSHCOG00000011977	ENSHCOG00000011983 #15	BCL6B (ENSHCOG00000012012) #16	SLC16A13 (ENSHCOG00000012018) #17	acap1 (ENSHCOG00000012023) #18	agfg2 (ENSHCOG00000012027) #19	ENSHCOG00000012035 #20	dvl2 (ENSHCOG00000012079) #22	zgc:101810 (ENSHCOG00000012101)	six7 (ENSHCOG00000012114)	b4gat1 (ENSHCOG00000012128)	pfdn2 (ENSHCOG00000012134)	nit1 (ENSHCOG00000012143)	CLCN3 (ENSHCOG00000012213)	mfap3l (ENSHCOG00000012229)	AADAT (ENSHCOG00000012255)	ino80b (ENSHCOG00000012295)	intu (ENSHCOG00000012317)	cxcl19 (ENSHCOG00000012345)	trmt10b (ENSHCOG00000012351)	f13a1b (ENSHCOG00000012373)	tex261 (ENSHCOG00000012400)	vax2 (ENSHCOG00000012416)
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283 #34	ENSGT00940000163503.A.a.a.a	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00990000204615	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT01010000222552	ENSGT00940000153648.b
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283 #34	ENSGT00940000163503.A.a.a.a	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00990000204615	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT01010000222552	ENSGT00940000153648.b
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283 #34	ENSGT00940000163503.A.a.a.a	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00990000204615	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT01010000222552	ENSGT00940000153648.b
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283.o #34	ENSGT00940000166283.p #34	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT01100000263473.a.b.g.a.a.b.a.a.a.a.a.q.a	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a.q.b.a.a.a.a #25	ENSGT00940000163927.a.a.r #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00990000204615	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT01010000222552	ENSGT00940000153648.b
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283.o #34	ENSGT00940000166283.p #34	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT01100000263473.a.b.g.a.a.b.a.a.a.a.a.q.a.a.a	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a.q.b.a.a.a.a.a #25	ENSGT00940000163927.a.a.q.b.a.a.b #25	ENSGT00940000163927.a.a.q.b.a.a.a.a.b #25	ENSGT00940000163927.a.a.q.b.a.b.b #25	ENSGT00940000163927.a.a.q.a #25	ENSGT00940000163927.a.a.r.a.a.a #25	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b.j.b ##30	ENSGT00940000165960.b.j.a ##30	ENSGT00940000159305	ENSGT00940000163587.a.b.b.e.b
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283.o #34	ENSGT00940000166283.p #34	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT01100000263473.a.b.g.a.a.b.a.a.a.a.a.q.a.a.a	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a.q.b.a.a.a.a.a #25	ENSGT00940000163927.a.a.q.b.a.a.b #25	ENSGT00940000163927.a.a.q.b.a.a.a.a.b #25	ENSGT00940000163927.a.a.q.b.a.b.b #25	ENSGT00940000163927.a.a.q.b.a.a.a.b.b #25	ENSGT00940000163927.a.a.q.b.a.a.a.b.a #25	ENSGT00940000163927.a.a.q.a #25	ENSGT00940000163927.a.a.r.a.a.a #25	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b.j.b ##30	ENSGT00940000179579
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283.o #34	ENSGT00940000166283.p #34	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000177200.a.b	ENSGT00940000177278.a.b	ENSGT01100000263473.a.b.g.a.a.b.a.a.a.a.a.q.a.a.a	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a.q.b.a.a.a.a.a #25	ENSGT00940000163927.a.a.q.b.a.a.b #25	ENSGT00940000163927.a.a.q.b.a.a.a.a.b #25	ENSGT00940000163927.a.a.q.b.a.b.b #25	ENSGT00940000163927.a.a.q.b.a.a.a.b.b #25	ENSGT00940000163927.a.a.q.b.a.a.a.b.a #25	ENSGT00940000163927.a.a.q.a #25	ENSGT00940000163927.a.a.r.a.a.b.a #25	ENSGT00940000163927.a.a.r.a.a.b.b #25	ENSGT00940000163927.a.a.r.a.b #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT00390000014072.B #28
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Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000154035.a	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283.o #34	ENSGT00940000166283.p #34	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT01100000263473.a.b.g.a.a.b.a.a.a.a.a.q.a.a.a	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a.q.b.a.a.a.a.a #25	ENSGT00940000163927.a.a.q.b.a.a.b #25	ENSGT00940000163927.a.a.q.b.a.a.a.a.b #25	ENSGT00940000163927.a.a.q.b.a.b.b #25	ENSGT00940000163927.a.a.q.b.a.a.a.b.b #25	ENSGT00940000163927.a.a.q.b.a.a.a.b.a #25	ENSGT00940000163927.a.a.q.a #25	ENSGT00940000163927.a.a.r.a.a.b.a #25	ENSGT00940000163927.a.a.r.a.a.b.b #25	ENSGT00940000163927.a.a.r.a.b #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT00390000014072.B #28
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Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	716	NEURL4 (ENSHBUG00000018681)	ENSHBUG00000018434	ENSHBUG00000018362	zpax4 (ENSHBUG00000018348) #34	zpax4 (ENSHBUG00000018241) #34	ENSHBUG00000018213	ENSHBUG00000018190 #15	ENSHBUG00000018170 #16	ENSHBUG00000018155	SLC16A13 (ENSHBUG00000018123) #17	acap1 (ENSHBUG00000018093) #18	agfg2 (ENSHBUG00000017985) #19	ENSHBUG00000017939 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSHBUG00000017907) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSHBUG00000017898)	dvl2 (ENSHBUG00000017888) #22	acadvl (ENSHBUG00000017807) #23	ENSHBUG00000017747	ENSHBUG00000017739 #25	ponzr1 (ENSHBUG00000017729) #25	ponzr1 (ENSHBUG00000017714) #25	ponzr1 (ENSHBUG00000017703) #25	ponzr1 (ENSHBUG00000017699) #25	ponzr1 (ENSHBUG00000017693) #25	ponzr1 (ENSHBUG00000017644) #25
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Nile tilapia	MODERN SPECIES	15	ENSONIG00000037986	zpax4 (ENSONIG00000006698) #34	ENSONIG00000031698	ENSONIG00000004817 #15	ENSONIG00000004819 #16	ENSONIG00000007874	ENSONIG00000040467	ENSONIG00000037241	ENSONIG00000042817	SLC16A13 (ENSONIG00000004820) #17	acap1 (ENSONIG00000004822) #18	agfg2 (ENSONIG00000004827) #19	ENSONIG00000035777 #20	rnf227 (ENSONIG00000029883) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSONIG00000041253)	dvl2 (ENSONIG00000004831) #22	acadvl (ENSONIG00000004837) #23	ENSONIG00000004844	ENSONIG00000004845 #25	ponzr1 (ENSONIG00000027740) #25	ENSONIG00000033020 #25	ponzr1 (ENSONIG00000004851) #25	ponzr1 (ENSONIG00000037680) #25	ENSONIG00000033985	ENSONIG00000035443	ENSONIG00000027164	ENSONIG00000033948	ENSONIG00000034488	ENSONIG00000034063	ENSONIG00000036689	ENSONIG00000034338
Midas cichlid	MODERN SPECIES	1115	NEURL4 (ENSACIG00000016087)	ENSACIG00000016154	ENSACIG00000016243	zpax4 (ENSACIG00000016498) #34	ENSACIG00000016536	ENSACIG00000016561	ENSACIG00000016578 #15	BCL6B (ENSACIG00000016645) #16	ENSACIG00000016670	SLC16A13 (ENSACIG00000016763) #17	acap1 (ENSACIG00000016836) #18	agfg2 (ENSACIG00000016883) #19	ENSACIG00000016904 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSACIG00000016924) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSACIG00000016929)	dvl2 (ENSACIG00000016934) #22	acadvl (ENSACIG00000016983) #23	ENSACIG00000017014	ponzr1 (ENSACIG00000017024) #25	ENSACIG00000017033	ponzr1 (ENSACIG00000017048) #25	ponzr1 (ENSACIG00000017056) #25	ponzr1 (ENSACIG00000017079) #25	ENSACIG00000017091	ENSACIG00000017097	mych (ENSACIG00000017105)	mtss1 (ENSACIG00000017120)	ENSACIG00000017183	ENSACIG00000017193	ENSACIG00000017213	ENSACIG00000017228
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Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	1838															si:ch73-335l21.2 (ENSSPAG00000005097)	dvl2 (ENSSPAG00000004859) #22	acadvl (ENSSPAG00000004797) #23	ENSSPAG00000004767	ponzr1 (ENSSPAG00000004763) #25	ENSSPAG00000004729 #26	ENSSPAG00000004708 #27	ENSSPAG00000003792	cnpy4 (ENSSPAG00000003718) #28
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	95	ENSGT00940000165960.b.l.a.a ##30	ENSGT00940000165960.b.l.b ##30	ENSGT00940000165960.b.l.a.b ##30	ENSGT00940000166283.m #34	ENSGT00940000166283.n #34	ENSGT00940000163503.A.a.a.a	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00640000091486.a	ENSGT00940000166499	ENSGT01030000234573.B.c.b.b	ENSGT00940000159589	ENSGT00390000005147	ENSGT00600000084617	ENSGT00940000157482.e
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	92	ENSGT00940000165960.b.l.a.a ##30	ENSGT00940000165960.b.l.b ##30	ENSGT00940000165960.b.l.a.b ##30	ENSGT00940000166283.m #34	ENSGT00940000166283.n #34	ENSGT00940000163503.A.a.a.a	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a.p.a #25	ENSGT00940000163927.a.a.o #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00640000091486.a	ENSGT00940000166499	ENSGT01030000234573.B.c.b.b	ENSGT00940000159589	ENSGT00390000005147	ENSGT00600000084617
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1263			ENSAOCG00000017697 ##30	zpax4 (ENSAOCG00000001235) #34	zpax4 (ENSAOCG00000001239) #34	ENSAOCG00000017748	ENSAOCG00000017777	ENSAOCG00000017800 #15	ENSAOCG00000017838 #16	SLC16A13 (ENSAOCG00000001254) #17	acap1 (ENSAOCG00000017878) #18	agfg2 (ENSAOCG00000017905) #19	ENSAOCG00000017944 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSAOCG00000017956) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSAOCG00000017963)	dvl2 (ENSAOCG00000018028) #22
Orange clownfish	MODERN SPECIES	15	pcolceb (ENSAPEG00000007427)	ENSAPEG00000007464 ##30	ENSAPEG00000007474 ##30	ENSAPEG00000007498 ##30	zpax4 (ENSAPEG00000007523) #34	ENSAPEG00000007614 #34	ENSAPEG00000007630	ENSAPEG00000007660 #15	ENSAPEG00000007673 #16	SLC16A13 (ENSAPEG00000007690) #17	acap1 (ENSAPEG00000007709) #18	agfg2 (ENSAPEG00000007814) #19	ENSAPEG00000007847 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSAPEG00000007854) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSAPEG00000007863)	dvl2 (ENSAPEG00000007874) #22	acadvl (ENSAPEG00000007921) #23	ENSAPEG00000007981	ponzr1 (ENSAPEG00000007984) #25	ponzr1 (ENSAPEG00000007988) #25	ENSAPEG00000007997 #26	ENSAPEG00000008036 #27	ENSAPEG00000008372	cnpy4 (ENSAPEG00000008769) #28	ENSAPEG00000008805 #29	taf6l (ENSAPEG00000008884)	cth1 (ENSAPEG00000008930)	mta2 (ENSAPEG00000008941)	EML3 (ENSAPEG00000009039)	ecsit (ENSAPEG00000009076)	ENSAPEG00000009098
Spiny chromis	MODERN SPECIES	1289													ENSAPOG00000007565 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSAPOG00000007538) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSAPOG00000007534)	dvl2 (ENSAPOG00000007524) #22	acadvl (ENSAPOG00000007469) #23	ENSAPOG00000007455	ponzr1 (ENSAPOG00000007451) #25	ENSAPOG00000007440	ENSAPOG00000007421 #26
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283 #34	ENSGT00940000163503.A.a.a.a	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT01010000222552	ENSGT00940000153648.b	ENSGT00940000153404.b
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283.k #34	ENSGT00940000163503.A.a.a.a	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b.g ##30	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT01010000222552	ENSGT00940000153648.b	ENSGT00940000167169	ENSGT00940000157221.x
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Chinese medaka	MODERN SPECIES	633	ENSOSIG00000000966	shbg (ENSOSIG00000000967)	ENSOSIG00000001149	ENSOSIG00000001210	ENSOSIG00000001214 #34	ENSOSIG00000001216	ENSOSIG00000001217	ENSOSIG00000001218 #15	ENSOSIG00000001219 #16	SLC16A13 (ENSOSIG00000001220) #17	acap1 (ENSOSIG00000001224) #18	ENSOSIG00000001228 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSOSIG00000001229) #21	ENSOSIG00000001231	si:ch73-335l21.2 (ENSOSIG00000001232)	dvl2 (ENSOSIG00000001247) #22	acadvl (ENSOSIG00000004938) #23	ENSOSIG00000008762	ponzr1 (ENSOSIG00000008763) #25
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Javanese ricefish	MODERN SPECIES	9	POLR2A (ENSOJAG00000015228)	ENSOJAG00000015143	shbg (ENSOJAG00000015131)	ENSOJAG00000014320	ARHGEF15 (ENSOJAG00000014287)	zpax4 (ENSOJAG00000014205) #34	ENSOJAG00000014188	ENSOJAG00000014097 #15	ENSOJAG00000014073 #16	SLC16A13 (ENSOJAG00000014064) #17	acap1 (ENSOJAG00000012339) #18	agfg2 (ENSOJAG00000012184) #19	ENSOJAG00000012169 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSOJAG00000012153) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSOJAG00000012134)	dvl2 (ENSOJAG00000012069) #22	acadvl (ENSOJAG00000010840) #23	ENSOJAG00000010740	ponzr1 (ENSOJAG00000010731) #25	ENSOJAG00000010647 #26	ENSOJAG00000010619 #27	ENSOJAG00000010497 #29	ENSOJAG00000010485 ##30	pcolceb (ENSOJAG00000011565)	per1b (ENSOJAG00000011505)	rell1 (ENSOJAG00000011495)	ENSOJAG00000011485	NWD2 (ENSOJAG00000011479)	ENSOJAG00000011466	ENSOJAG00000011455	ENSOJAG00000010832
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Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	305	shbg (ENSCVAG00000005204)	NEURL4 (ENSCVAG00000005235)	ENSCVAG00000005345	ENSCVAG00000005386	zpax4 (ENSCVAG00000005399) #34	ENSCVAG00000005404	ENSCVAG00000005417	ENSCVAG00000005434 #15	ENSCVAG00000005449 #16	SLC16A13 (ENSCVAG00000005457) #17	acap1 (ENSCVAG00000000802) #18	agfg2 (ENSCVAG00000005503) #19	ENSCVAG00000005515 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSCVAG00000005519) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSCVAG00000005532)	dvl2 (ENSCVAG00000005544) #22	acadvl (ENSCVAG00000005610) #23	ENSCVAG00000005617	ponzr1 (ENSCVAG00000005629) #25	ponzr1 (ENSCVAG00000005635) #25	ponzr1 (ENSCVAG00000005648) #25	ENSCVAG00000005656 #26	ENSCVAG00000005665 #27	cnpy4 (ENSCVAG00000005696) #28	ENSCVAG00000005729 #29	ENSCVAG00000005736 ##30	pcolceb (ENSCVAG00000005741)	per1b (ENSCVAG00000005799)	rell1 (ENSCVAG00000005817)	ENSCVAG00000005820	NWD2 (ENSCVAG00000005860)
Mummichog	MODERN SPECIES	2336	ENSFHEG00000001701	ENSFHEG00000001691	zpax4 (ENSFHEG00000001684) #34	ENSFHEG00000001679 ##30	ENSFHEG00000001676	ENSFHEG00000000055	ENSFHEG00000001669 #15	BCL6B (ENSFHEG00000001661) #16	SLC16A13 (ENSFHEG00000001648) #17	ENSFHEG00000001644	ENSFHEG00000001642 #18	agfg2 (ENSFHEG00000001636) #19	ENSFHEG00000001626 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSFHEG00000001620) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSFHEG00000001618)	dvl2 (ENSFHEG00000001612) #22	acadvl (ENSFHEG00000001586) #23	ENSFHEG00000001575	ponzr1 (ENSFHEG00000001573) #25	ENSFHEG00000001570 ##26	ENSFHEG00000001557 #27	ENSFHEG00000001550	cnpy4 (ENSFHEG00000001548) #28	ENSFHEG00000001541	ENSFHEG00000001539 ##30
Aplocheiloidei	DUPLICATION
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	68										ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i.c #22	ENSGT00950000182903.a.b.i.d #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT00940000153648.b	ENSGT00940000167169
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1613	tp53 (ENSNFUG00015001875)	ENSNFUG00015001862	Nfu_g_1_014152 (ENSNFUG00015001836)	POLR2A (ENSNFUG00015001784)	ENSNFUG00015001758	shbg (ENSNFUG00015001748)	NEURL4 (ENSNFUG00015001727)	ENSNFUG00015001294	ENSNFUG00015001211	SLC16A13 (ENSNFUG00015001209) #17	acap1 (ENSNFUG00015001148) #18	ENSNFUG00015001124	ENSNFUG00015001118 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSNFUG00015001113) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSNFUG00015001110)	ENSNFUG00015001106 #22	ENSNFUG00015001102 #26	ENSNFUG00015001098 #27	ENSNFUG00015001089	CNPY4 (ENSNFUG00015001081) #28	ENSNFUG00015001074 #29	OLA.1520 (ENSNFUG00015001067) ##30	pcolceb (ENSNFUG00015001053)	per1b (ENSNFUG00015001033)	RELL1 (ENSNFUG00015001013)	NWD2 (ENSNFUG00015000999)	ENSNFUG00015000990	PCDH7B (ENSNFUG00015000982)	ENSNFUG00015000971	ENSNFUG00015000969	ENSNFUG00015000968
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	68									ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i.c #22	ENSGT00950000182903.a.b.i.d #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT00940000153648.b	ENSGT00940000167169	ENSGT00940000157221.x
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	90						ENSKMAG00000009495	ppdpfb (ENSKMAG00000009515)	ENSKMAG00000009535	nol4lb (ENSKMAG00000009573)	ENSKMAG00000009584	SLC16A13 (ENSKMAG00000009596) #17	acap1 (ENSKMAG00000009620) #18	agfg2 (ENSKMAG00000009661) #19	ENSKMAG00000009700 #20	si:ch73-335l21.2 (ENSKMAG00000009713)	dvl2 (ENSKMAG00000009737) #22	acadvl (ENSKMAG00000009786) #23	ENSKMAG00000009869	ponzr1 (ENSKMAG00000009877) #25	ponzr1 (ENSKMAG00000009891) #25	ENSKMAG00000009901	ENSKMAG00000009927 #26	ENSKMAG00000009965 #27	ENSKMAG00000009983	cnpy4 (ENSKMAG00000010015) #28	ENSKMAG00000010035 #29	ENSKMAG00000010053 ##30	ENSKMAG00000010063	per1b (ENSKMAG00000010097)	RELL1 (ENSKMAG00000010228)	ENSKMAG00000010244
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	395																dvl2 (ENSNFUG00015012251) #22	ACADVL (ENSNFUG00015011984) #23	CR376787.3 (ENSNFUG00015011944)
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283 #34	ENSGT00940000163503.A.a.a.a	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00990000204615	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT01010000222552	ENSGT00940000153648.b
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283 #34	ENSGT00940000163503.A.a.a.a	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00990000204615	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT01010000222552	ENSGT00940000153648.b
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Fugu	MODERN SPECIES	20	capgb (ENSTRUG00000024547)	POLR2A (ENSTRUG00000012320)	ENSTRUG00000012490	shbg (ENSTRUG00000012563)	NEURL4 (ENSTRUG00000012632)	ENSTRUG00000012888	ARHGEF15 (ENSTRUG00000013120)	ENSTRUG00000032936	ENSTRUG00000013176 #15	BCL6B (ENSTRUG00000013220) #16	SLC16A13 (ENSTRUG00000013229) #17	acap1 (ENSTRUG00000013366) #18	agfg2 (ENSTRUG00000023818) #19	ENSTRUG00000023735 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSTRUG00000025549) #21	dvl2 (ENSTRUG00000013550) #22	acadvl (ENSTRUG00000013710) #23	ENSTRUG00000013893	ponzr1 (ENSTRUG00000013896) #25	ENSTRUG00000027326 ##26	ENSTRUG00000014066 #27	cnpy4 (ENSTRUG00000014142) #28	ENSTRUG00000014351	ENSTRUG00000028673	pcolceb (ENSTRUG00000014354)	per1b (ENSTRUG00000014420)	rell1 (ENSTRUG00000022108)	ENSTRUG00000021077	NWD2 (ENSTRUG00000014613)	ENSTRUG00000014629	ENSTRUG00000014635
Tetraodon	MODERN SPECIES	14	ctdnep1a (ENSTNIG00000010142)	phf23b (ENSTNIG00000010143)	plscr3b (ENSTNIG00000010144)	tnk1 (ENSTNIG00000010145)	trmt44 (ENSTNIG00000010146)	GPR78 (ENSTNIG00000010147)	CPZ (ENSTNIG00000010148)	ENSTNIG00000010149	HMX1 (ENSTNIG00000010150)	ADRA2C (ENSTNIG00000010151)	SLC16A13 (ENSTNIG00000010152) #17	acap1 (ENSTNIG00000010153) #18	agfg2 (ENSTNIG00000010154) #19	ENSTNIG00000002043 #20	ENSTNIG00000010155	dvl2 (ENSTNIG00000010156) #22	acadvl (ENSTNIG00000010157) #23	ENSTNIG00000001266	ponzr1 (ENSTNIG00000010158) #25	ENSTNIG00000010159 #26	ENSTNIG00000010160 #27	cnpy4 (ENSTNIG00000006854) #28	ENSTNIG00000006853 #29	ENSTNIG00000006852	pcolceb (ENSTNIG00000006851)	ENSTNIG00000007200 ##30	pcolceb (ENSTNIG00000007199)	per1b (ENSTNIG00000007198)	rell1 (ENSTNIG00000007197)	ENSTNIG00000007196	ENSTNIG00000000703
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283 #34	ENSGT00940000163503.A.a.a.a	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00990000204615	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT01010000222552	ENSGT00940000153648.b
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	23	ENSLBEG00000027855	ENSLBEG00000027908	zpax4 (ENSLBEG00000027932) #34	zpax4 (ENSLBEG00000027955) #34	zpax4 (ENSLBEG00000027975) #34	ENSLBEG00000028010	ENSLBEG00000028059	ENSLBEG00000028069 #15	BCL6B (ENSLBEG00000028080) #16	SLC16A13 (ENSLBEG00000028091) #17	acap1 (ENSLBEG00000028135) #18	ENSLBEG00000028200	ENSLBEG00000028212 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSLBEG00000028217) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSLBEG00000028220)	dvl2 (ENSLBEG00000028224) #22	acadvl (ENSLBEG00000028251) #23	ENSLBEG00000028272	ponzr1 (ENSLBEG00000028275) #25	ENSLBEG00000028280 #26	ENSLBEG00000028290 #27	ENSLBEG00000028302	cnpy4 (ENSLBEG00000028306) #28	ENSLBEG00000028314 #29	per1b (ENSLBEG00000028344)	ENSLBEG00000028352 ##30	ENSLBEG00000028354 ##30	ENSLBEG00000028355 ##30	pcolceb (ENSLBEG00000028362)	rell1 (ENSLBEG00000028367)	ENSLBEG00000028381
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283 #34	ENSGT00940000163503.A.a.a.a	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00990000204615	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT01010000222552	ENSGT00940000153648.b
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283 #34	ENSGT00940000163503.A.a.a.a	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00990000204615	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT01010000222552	ENSGT00940000153648.b
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283 #34	ENSGT00940000163503.A.a.a.a	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00990000204615	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT01010000222552	ENSGT00940000153648.b
European seabass	MODERN SPECIES	16	ENSDLAG00005009038	shbg (ENSDLAG00005009083)	ENSDLAG00005009114	ENSDLAG00005009415	ENSDLAG00005011572	ENSDLAG00005017192 #34	ENSDLAG00005011650 #34	ENSDLAG00005011670	ENSDLAG00005011689 #15	ENSDLAG00005011710 #16	ENSDLAG00005011717 #17	acap1 (ENSDLAG00005011773) #18	agfg2 (ENSDLAG00005035081) #19	si:ch73-335l21.4 (ENSDLAG00005027260) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSDLAG00005013123)	dvl2 (ENSDLAG00005013146) #22	acadvl (ENSDLAG00005013699) #23	ENSDLAG00005014883	ENSDLAG00005033537	ponzr1 (ENSDLAG00005030607) #25	ENSDLAG00005014891 #26	ENSDLAG00005029560 #27	ENSDLAG00005014916	cnpy4 (ENSDLAG00005014925) #28	ENSDLAG00005014943 #29	ENSDLAG00005014985 ##30	ENSDLAG00005015002	ENSDLAG00005015012	ENSDLAG00005015065	RELL1 (ENSDLAG00005031395)	ENSDLAG00005015789
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	485	shbg (ENSLCRG00005005640)	NEURL4 (ENSLCRG00005005959)	ENSLCRG00005006956	ENSLCRG00005007293	zpax4 (ENSLCRG00005007445) #34	ENSLCRG00005007632	ENSLCRG00005007684	ENSLCRG00005007700 #15	ENSLCRG00005007717 #16	SLC16A13 (ENSLCRG00005007720) #17	acap1 (ENSLCRG00005007818) #18	agfg2 (ENSLCRG00005007925) #19	ENSLCRG00005007958 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSLCRG00005007990) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSLCRG00005008004)	dvl2 (ENSLCRG00005008034) #22	acadvl (ENSLCRG00005008338) #23	ENSLCRG00005009390	ponzr1 (ENSLCRG00005009426) #25	ponzr1 (ENSLCRG00005009455) #25	ENSLCRG00005009470 #26	ENSLCRG00005009490 #27	ENSLCRG00005009516	cnpy4 (ENSLCRG00005009556) #28	ENSLCRG00005009619 #29	ENSLCRG00005009701 ##30	ENSLCRG00005009713	ENSLCRG00005009723 ##30	pcolceb (ENSLCRG00005009731)	per1b (ENSLCRG00005009853)	rell1 (ENSLCRG00005009951)
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283 #34	ENSGT00940000163503.A.a.a.a	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370.h #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT01010000222552	ENSGT00940000153648.b	ENSGT00940000153404.b
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283 #34	ENSGT00940000163503.A.a.a.a	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370.h #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT01010000222552	ENSGT00940000153648.b	ENSGT00940000153404.b
Pike perch	MODERN SPECIES	147	shbg (ENSSLUG00000016947)	NEURL4 (ENSSLUG00000016363)	ENSSLUG00000014180	ENSSLUG00000014052	zpax4 (ENSSLUG00000014001) #34	ENSSLUG00000013984	ENSSLUG00000013976	ENSSLUG00000013967 #15	BCL6B (ENSSLUG00000013957) #16	SLC16A13 (ENSSLUG00000013953) #17	acap1 (ENSSLUG00000013809) #18	agfg2 (ENSSLUG00000013776) #19	ENSSLUG00000013770 #20	ENSSLUG00000013757 #21	si:ch73-335l21.2 (ENSSLUG00000013747)	dvl2 (ENSSLUG00000013613) #22	acadvl (ENSSLUG00000011111) #23	ENSSLUG00000010997	ponzr1 (ENSSLUG00000010992) #25	ENSSLUG00000010984 #26	ENSSLUG00000010902 #27	ENSSLUG00000010892	cnpy4 (ENSSLUG00000010885) #28	ENSSLUG00000010870 #29	ENSSLUG00000010865 ##30	pcolceb (ENSSLUG00000010820)	per1b (ENSSLUG00000010714)	ENSSLUG00000010678
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	9	ENSCGOG00000007275	shbg (ENSCGOG00000007281)	NEURL4 (ENSCGOG00000007296)	ENSCGOG00000007484	ENSCGOG00000007951	ENSCGOG00000007967	ENSCGOG00000007979 #15	ENSCGOG00000007986	BCL6B (ENSCGOG00000007989) #16	SLC16A13 (ENSCGOG00000007991) #17	acap1 (ENSCGOG00000008011) #18	agfg2 (ENSCGOG00000008274) #19	ENSCGOG00000008276 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSCGOG00000008281) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSCGOG00000008284)	dvl2 (ENSCGOG00000008312) #22	acadvl (ENSCGOG00000008965) #23	ENSCGOG00000009793	ponzr1 (ENSCGOG00000009796) #25	ENSCGOG00000009802 #26	ENSCGOG00000009809 #27	cnpy4 (ENSCGOG00000009825) #28	ENSCGOG00000009835 #29	ENSCGOG00000009900 ##30	pcolceb (ENSCGOG00000009905)	per1b (ENSCGOG00000009956)	rell1 (ENSCGOG00000010169)	ENSCGOG00000010170	NWD2 (ENSCGOG00000010171)	ENSCGOG00000010175	ENSCGOG00000010182
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00930000151033	ENSGT00940000161268	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370.h #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT01010000222552	ENSGT00940000153648.b	ENSGT00940000153404.b
Lumpfish	MODERN SPECIES	9	POLR2A (ENSCLMG00005014945)	ENSCLMG00005014943	shbg (ENSCLMG00005014942)	NEURL4 (ENSCLMG00005014940)	ENSCLMG00005012986	ENSCLMG00005012963	ENSCLMG00005012959	ENSCLMG00005012957 #15	BCL6B (ENSCLMG00005012956) #16	SLC16A13 (ENSCLMG00005012954) #17	acap1 (ENSCLMG00005012923) #18	agfg2 (ENSCLMG00005012922) #19	ENSCLMG00005012921 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSCLMG00005012920) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSCLMG00005012919)	dvl2 (ENSCLMG00005012796) #22	ENSCLMG00005012650	ENSCLMG00005012505	ENSCLMG00005012504	ENSCLMG00005012502	ENSCLMG00005012463	PTGDR2 (ENSCLMG00005012461)	ENSCLMG00005012460	ugt5g2 (ENSCLMG00005012459)	ponzr3 (ENSCLMG00005012458)	ENSCLMG00005012456	cldn7a (ENSCLMG00005012455)	chrnb1l (ENSCLMG00005012401)	chrnb1 (ENSCLMG00005012312)	fgf11a (ENSCLMG00005012311)	tmem102 (ENSCLMG00005012310)
Stickleback	MODERN SPECIES	7	capgb (ENSGACG00000019370)	POLR2A (ENSGACG00000019366)	shbg (ENSGACG00000019365)	NEURL4 (ENSGACG00000019362)	ENSGACG00000019361	ENSGACG00000019360	ENSGACG00000019358	ENSGACG00000019355	ENSGACG00000019354	ENSGACG00000019350 #15	BCL6B (ENSGACG00000019349) #16	SLC16A13 (ENSGACG00000019347) #17	acap1 (ENSGACG00000019339) #18	ENSGACG00000019338 #20	ENSGACG00000019337 #20	dvl2 (ENSGACG00000019331) #22	acadvl (ENSGACG00000019329) #23	ENSGACG00000019328	ponzr1 (ENSGACG00000019326) #25	ponzr1 (ENSGACG00000019324) #25	ENSGACG00000019319 #26	ENSGACG00000019318 #27	cnpy4 (ENSGACG00000019316) #28	ENSGACG00000019314 #29	pcolceb (ENSGACG00000019312)	per1b (ENSGACG00000019308)	RELL1 (ENSGACG00000019306)	NWD2 (ENSGACG00000019305)	ENSGACG00000019304	DTHD1 (ENSGACG00000019301)	ENSGACG00000019300
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283 #34	ENSGT00940000163503.A.a.a.a	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00990000204615	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT01010000222552	ENSGT00940000153648.b
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000161268.l	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283 #34	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a.b #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00990000204615	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT01010000222552	ENSGT00940000153648.b
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000161268.l	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283 #34	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00990000204615	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT01010000222552	ENSGT00940000153648.b	ENSGT00940000153404.b
Climbing perch	MODERN SPECIES	9	ENSATEG00000019644	ENSATEG00000027847	shbg (ENSATEG00000030089)	ENSATEG00000019768	ENSATEG00000019877	ENSATEG00000019994	ENSATEG00000020092	ENSATEG00000020103 #15	ENSATEG00000020121 #16	ENSATEG00000020132 #17	acap1 (ENSATEG00000020155) #18	agfg2 (ENSATEG00000027183) #19	ENSATEG00000020267 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSATEG00000020316) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSATEG00000020324)	dvl2 (ENSATEG00000029535) #22	acadvl (ENSATEG00000000024) #23	ENSATEG00000000171	ponzr1 (ENSATEG00000025198) #25	ponzr1 (ENSATEG00000028327) #25	ponzr1 (ENSATEG00000000277) #25	ENSATEG00000030189	ENSATEG00000000290 #26	ENSATEG00000000297 #27	cnpy4 (ENSATEG00000000305) #28	ENSATEG00000000312 #29	ENSATEG00000000331 ##30	ENSATEG00000028316	ENSATEG00000000342	ENSATEG00000000356	RELL1 (ENSATEG00000000367)
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	10	ENSBSLG00000009056	shbg (ENSBSLG00000008946)	ENSBSLG00000008162	ENSBSLG00000008144	zpax4 (ENSBSLG00000008099) #34	zpax4 (ENSBSLG00000008086) #34	ENSBSLG00000008072	ENSBSLG00000008057 #15	BCL6B (ENSBSLG00000008043) #16	SLC16A13 (ENSBSLG00000008024) #17	acap1 (ENSBSLG00000007907) #18	ENSBSLG00000007800	ENSBSLG00000007752 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSBSLG00000007731) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSBSLG00000007707)	dvl2 (ENSBSLG00000007703) #22	acadvl (ENSBSLG00000006887) #23	ENSBSLG00000005778	ponzr1 (ENSBSLG00000005772) #25	ponzr1 (ENSBSLG00000005759) #25	ENSBSLG00000005661 #26	ENSBSLG00000005631 #27	cnpy4 (ENSBSLG00000005604) #28	ENSBSLG00000005514 #29	ENSBSLG00000005463 ##30	ENSBSLG00000005443 ##30	ENSBSLG00000005381 ##30	ENSBSLG00000005348	pcolceb (ENSBSLG00000005246)	per1b (ENSBSLG00000004934)	rell1 (ENSBSLG00000004861)
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	9	ENSMAMG00000003351	ENSMAMG00000003283	shbg (ENSMAMG00000003273)	ENSMAMG00000003141	ENSMAMG00000003035	ENSMAMG00000003016	ENSMAMG00000002955 #34	ENSMAMG00000002891 #15	ENSMAMG00000002865 #16	ENSMAMG00000002851 #17	acap1 (ENSMAMG00000002823) #18	agfg2 (ENSMAMG00000002798) #19	ENSMAMG00000002780 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSMAMG00000002769) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSMAMG00000002760)	dvl2 (ENSMAMG00000002751) #22	acadvl (ENSMAMG00000002689) #23	ENSMAMG00000002674	ponzr1 (ENSMAMG00000027885) #25	ENSMAMG00000002637 #26	ENSMAMG00000002287 #27	ENSMAMG00000001953	cnpy4 (ENSMAMG00000001907) #28	ENSMAMG00000001649 #29	ENSMAMG00000025692 ##30	ENSMAMG00000001473	ENSMAMG00000001379	RELL1 (ENSMAMG00000001360)	ENSMAMG00000025977	NWD2 (ENSMAMG00000001275)	ENSMAMG00000001243
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283 #34	ENSGT00940000163503.A.a.a.a	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT01010000222552	ENSGT00940000153648.b	ENSGT00940000153404.b	ENSGT00940000167169
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Turbot	MODERN SPECIES	11	shbg (ENSSMAG00000009098)	ENSSMAG00000008874	ENSSMAG00000008790	ENSSMAG00000008739	ENSSMAG00000008693 #34	ENSSMAG00000008599 #34	ENSSMAG00000008560	ENSSMAG00000008546	ENSSMAG00000008475 #14	ENSSMAG00000008428 #16	ENSSMAG00000008415 #17	acap1 (ENSSMAG00000008356) #18	agfg2 (ENSSMAG00000008266) #19	ENSSMAG00000008255 #20	si:ch73-335l21.2 (ENSSMAG00000008249)	dvl2 (ENSSMAG00000008231) #22	acadvl (ENSSMAG00000008208) #23	ENSSMAG00000008220	ponzr1 (ENSSMAG00000008190) #25	ENSSMAG00000008158 #26	ENSSMAG00000008156 #27	cnpy4 (ENSSMAG00000008141) #28	ENSSMAG00000008116 #29	ENSSMAG00000022292 ##30	ENSSMAG00000008076	ENSSMAG00000008060	RELL1 (ENSSMAG00000008051)	ENSSMAG00000008047	NWD2 (ENSSMAG00000008034)	ENSSMAG00000007944	ENSSMAG00000007911
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Barramundi perch	MODERN SPECIES	151													ENSLCAG00010016910 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSLCAG00010016904) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSLCAG00010016903)	dvl2 (ENSLCAG00010016889) #22	acadvl (ENSLCAG00010016480) #23	ENSLCAG00010016401	ponzr1 (ENSLCAG00010016398) #25	ENSLCAG00010016393 #26	ENSLCAG00010016381 #27	cnpy4 (ENSLCAG00010016374) #28	ENSLCAG00010016372 #29	ENSLCAG00010016369 ##30	ENSLCAG00010016365 ##30	pcolceb (ENSLCAG00010016358)	per1b (ENSLCAG00010016329)	ENSLCAG00010016312	rell1 (ENSLCAG00010016305)	ENSLCAG00010016303	NWD2 (ENSLCAG00010016298)
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	66	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000165211	ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a	ENSGT00940000166283.t #34	ENSGT00940000166283.s #34	ENSGT00940000163503.A.a.a.a	ENSGT00940000176070	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370 #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01020000230586	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00940000159264.f	ENSGT00940000159217	ENSGT00940000159709	ENSGT01010000222552	ENSGT00940000153648.b	ENSGT00940000153404.b	ENSGT00940000167169
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Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3023	NEURL4 (ENSSLDG00000020750)	ENSSLDG00000020807	ENSSLDG00000020863	zpax4 (ENSSLDG00000020902) #34	zpax4 (ENSSLDG00000021045) #34	ENSSLDG00000021081	ENSSLDG00000021115	ENSSLDG00000021125 #15	ENSSLDG00000021148 #16	SLC16A13 (ENSSLDG00000021211) #17	acap1 (ENSSLDG00000021232) #18	agfg2 (ENSSLDG00000021280) #19	ENSSLDG00000021318 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSSLDG00000021327) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSSLDG00000021331)	dvl2 (ENSSLDG00000021340) #22	acadvl (ENSSLDG00000021367) #23	ENSSLDG00000021442	ponzr1 (ENSSLDG00000021451) #25	ENSSLDG00000021519 #27	cnpy4 (ENSSLDG00000022035) #28	ENSSLDG00000022088 #29	ENSSLDG00000022215 ##30	pcolceb (ENSSLDG00000022227)	per1b (ENSSLDG00000022250)	rell1 (ENSSLDG00000022313)	ENSSLDG00000022324	NWD2 (ENSSLDG00000022343)	DTHD1 (ENSSLDG00000022370)	ENSSLDG00000022450	PCDH7 (ENSSLDG00000022483)
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Northern pike	DUPLICATION
Northern pike	MODERN SPECIES	23	MPDZ (ENSELUG00000017678)	ADGRL3 (ENSELUG00000017939)	ENSELUG00000026228	ENSELUG00000018451	ENSELUG00000018661	ENSELUG00000026966	ENSELUG00000018725 #15	BCL6B (ENSELUG00000018787) #16	SLC16A13 (ENSELUG00000018819) #17	acap1 (ENSELUG00000018894) #18	agfg2 (ENSELUG00000018937) #19	ENSELUG00000018954 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSELUG00000018979) #21	dvl2 (ENSELUG00000019029) #22	ENSELUG00000019044	ENSELUG00000027323 #22	ENSELUG00000019034	ENSELUG00000019093 #24	ponzr1 (ENSELUG00000019120) #25	ponzr1 (ENSELUG00000019130) #25	ENSELUG00000019155 #26	ENSELUG00000019206 #27	cnpy4 (ENSELUG00000019246) #28	ENSELUG00000019259 #29	ENSELUG00000019296 ##30	ENSELUG00000031501 ##30	zgc:103586 (ENSELUG00000019315) #31	fis1 (ENSELUG00000019347)	cldn15a (ENSELUG00000019355)	dnajc3b (ENSELUG00000019390)	naa38 (ENSELUG00000031744)
Northern pike	DUPLICATION
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Northern pike	MODERN SPECIES	6	SPNS2 (ENSELUG00000008192)	ENSELUG00000008138	ENSELUG00000000297	fis1 (ENSELUG00000008092)	ENSELUG00000025227	ENSELUG00000008020	ENSELUG00000007981	ENSELUG00000031227	ENSELUG00000008004	cldn15b (ENSELUG00000007924)	sat2 (ENSELUG00000007897) ##36	ENSELUG00000007789 ##30	taf6 (ENSELUG00000007773)	ENSELUG00000007738	ENSELUG00000007711	DVL2 (ENSELUG00000001467) #22	acadvl (ENSELUG00000007636) #23	ENSELUG00000007581	klf5l (ENSELUG00000007518)	klf8 (ENSELUG00000007479)	cldn2 (ENSELUG00000007390)	rbm41 (ENSELUG00000007426)	PRRG3 (ENSELUG00000007351)	ENSELUG00000027456	ENSELUG00000007333	ENSELUG00000007289	ENSELUG00000007235	ENSELUG00000027175	ZPLD1 (ENSELUG00000007186)	alcama (ENSELUG00000007135)	CBLB (ENSELUG00000007002)
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	DUPLICATION
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Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000155804.k.a.a	ENSGT00530000063790.b.d	ENSGT00940000155586.B.g.b	ENSGT00940000155527.j.a.e.a	ENSGT00940000154658.a.d	ENSGT00940000156022.a.c.b #15	ENSGT01090000260185.a.a	ENSGT00940000154273.b.h.a #14	ENSGT00940000156022.a.c.a #15	ENSGT00940000159844.h #16	ENSGT00940000160289.l #18	ENSGT00940000161071.i #19	ENSGT00940000166370.f #20	ENSGT00730000112287.h #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i.g.a #22	ENSGT00730000112044.e.a.b	ENSGT01100000263613.c #24	ENSGT00940000163927.a.a.u #25	ENSGT00940000153491.b.b.b.c #26	ENSGT00940000166316.e #27	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00940000156128.a.a #29	ENSGT00940000165960.b ##30	ENSGT00940000167107 #31	ENSGT00390000000592.w.b	ENSGT00940000165100.b.c	ENSGT00940000165987.b	ENSGT00390000018418.j.a	ENSGT00940000158001.h.a	ENSGT00510000050706.d #37
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	239								ENSGT00940000154273.b.h.a #14	ENSGT00940000156022.a.c.a #15	ENSGT00940000159844.h #16	ENSGT00940000160289.l #18	ENSGT00940000161071.i #19	ENSGT00940000166370.f #20	ENSGT00730000112287.h #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i.g.a #22	ENSGT00980000199875.b
Chinook salmon	DUPLICATION
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Chinook salmon	MODERN SPECIES	40					ADGRL3 (ENSOTSG00005041695)	ENSOTSG00005041609	ENSOTSG00005041603	ENSOTSG00005041601 #15	ENSOTSG00005041600 #15	BCL6B (ENSOTSG00005041595) #16	acap1 (ENSOTSG00005037711) #18	agfg2 (ENSOTSG00005037693) #19	ENSOTSG00005037692 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSOTSG00005037688) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSOTSG00005037687)	dvl2 (ENSOTSG00005037686) #22	ENSOTSG00005037678	ENSOTSG00005037674 #24	ponzr1 (ENSOTSG00005037672) #25	ENSOTSG00005037670 #27	cnpy4 (ENSOTSG00005037667) #28	ENSOTSG00005037666 #29	ENSOTSG00005037665 ##30	zgc:103586 (ENSOTSG00005037662) #31	fis1 (ENSOTSG00005037660)	cldn15a (ENSOTSG00005037658)	dnajc3b (ENSOTSG00005037588)	naa38 (ENSOTSG00005037586)	ENSOTSG00005037585	CHD3 (ENSOTSG00005036981)	tnfsf12 (ENSOTSG00005036976) #37
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Rainbow trout	MODERN SPECIES	13	MPDZ (ENSOMYG00000043957)	ENSOMYG00000034945	ENSOMYG00000033362	ENSOMYG00000033004	ENSOMYG00000032995	ENSOMYG00000055106 #14	ENSOMYG00000032987	ENSOMYG00000032944 #14	ENSOMYG00000032847 #16	acap1 (ENSOMYG00000030898) #18	ENSOMYG00000071940	agfg2 (ENSOMYG00000030472) #19	ENSOMYG00000030390 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSOMYG00000030444) #21	ENSOMYG00000018086	dvl2 (ENSOMYG00000030433) #22	ENSOMYG00000030413	ENSOMYG00000030370 #24	ponzr1 (ENSOMYG00000049606) #25	ENSOMYG00000050850	ENSOMYG00000065068 #26	ENSOMYG00000030360 #27	cnpy4 (ENSOMYG00000030339) #28	ENSOMYG00000030332	ENSOMYG00000030322 #29	ENSOMYG00000050442 ##30	zgc:103586 (ENSOMYG00000030282) #31	fis1 (ENSOMYG00000030252)	ENSOMYG00000030212	dnajc3b (ENSOMYG00000030162)	ENSOMYG00000030086
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Atlantic salmon	MODERN SPECIES	26	ENSSSAG00000076592	ci150 (ENSSSAG00000076598)	ENSSSAG00000076710	ENSSSAG00000078516	ENSSSAG00000079215	ENSSSAG00000101481 #15	ENSSSAG00000079518	ENSSSAG00000109805 #14	ENSSSAG00000079541	ENSSSAG00000114456 #15	ENSSSAG00000079545 #16	acap1 (ENSSSAG00000087747) #18	ENSSSAG00000079568	ENSSSAG00000092192 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSSSAG00000079580) #21	dvl2 (ENSSSAG00000079590) #22	ENSSSAG00000079609 #23	ENSSSAG00000079611	ENSSSAG00000079612 #24	ponzr1 (ENSSSAG00000104990) #25	ENSSSAG00000079617 #26	ENSSSAG00000108254	ENSSSAG00000079625 #27	cnpy4 (ENSSSAG00000079629) #28	ENSSSAG00000079632 #29	zgc:103586 (ENSSSAG00000079641) #31	ENSSSAG00000079648	ENSSSAG00000097741	dnajc3b (ENSSSAG00000079658)	NAA38 (ENSSSAG00000079665)	cyb5d1 (ENSSSAG00000079666)
River trout	MODERN SPECIES	38	USP53 (ENSSTUG00000043882)	PTPRD (ENSSTUG00000044156)	TYRP1 (ENSSTUG00000050648)	LURAP1L (ENSSTUG00000050649)	MPDZ (ENSSTUG00000050655)	ADGRL3 (ENSSTUG00000050737)	ENSSTUG00000051008	ENSSTUG00000051014 #15	ENSSTUG00000030551	ENSSTUG00000030569	BCL6B (ENSSTUG00000030577) #16	acap1 (ENSSTUG00000030593) #18	ENSSTUG00000030841	ENSSTUG00000030850 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSSTUG00000030854) #21	dvl2 (ENSSTUG00000030865) #22	ENSSTUG00000031101	ENSSTUG00000031105 #24	ponzr1 (ENSSTUG00000031108) #25	ENSSTUG00000031117 #26	ENSSTUG00000031130 #27	cnpy4 (ENSSTUG00000031133) #28	ENSSTUG00000031140 ##30	zgc:103586 (ENSSTUG00000031150) #31	fis1 (ENSSTUG00000031167)	cldn15a (ENSSTUG00000031271)	dnajc3b (ENSSTUG00000031283)	naa38 (ENSSTUG00000031346)	cyb5d1 (ENSSTUG00000031358)	CHD3 (ENSSTUG00000031509)	tnfsf12 (ENSSTUG00000034203) #37
Huchen	MODERN SPECIES	503												ENSHHUG00000008833	ENSHHUG00000008822 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSHHUG00000008813) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSHHUG00000008791)	dvl2 (ENSHHUG00000008707) #22	ENSHHUG00000008689	ENSHHUG00000008685 #24	ponzr1 (ENSHHUG00000008684) #25	ENSHHUG00000008677 #26	ENSHHUG00000008643 #26	ENSHHUG00000008629 #26	ENSHHUG00000008626 #27	cnpy4 (ENSHHUG00000008620) #28	ENSHHUG00000008610 #29	ENSHHUG00000008605 ##30	zgc:103586 (ENSHHUG00000008585) #31	fis1 (ENSHHUG00000008549)	cldn15a (ENSHHUG00000008529)	dnajc3b (ENSHHUG00000008435)	naa38 (ENSHHUG00000008426)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	594					ENSGT01090000260185.b	ENSGT00940000156022.a.d #15	ENSGT00940000155527.j.a.e.b	ENSGT00940000154658.a.c	ENSGT00940000154273.b.g #14	ENSGT00940000159844.g #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289.k #18	ENSGT00940000161071.j #19	ENSGT00940000166370.e #20	ENSGT00730000112287.g #21	ENSGT00950000182903.a.b.i.g.b #22	ENSGT01100000263613.d #24	ENSGT00940000163927.a.a.v.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b.d #26	ENSGT00940000166316.f #27
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000156337.c.h	ENSGT00940000153617.B.g	ENSGT00940000155804.k.a.b	ENSGT00530000063790.b.c	ENSGT00940000155586.B.g.a	ENSGT00940000155527.j.a.e.b	ENSGT00940000154658.a.c	ENSGT01090000260185.b	ENSGT00940000156022.a.d #15	ENSGT00940000159844.g #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289.k #18	ENSGT00940000161071.j #19	ENSGT00940000166370.e #20	ENSGT00730000112287.g #21	ENSGT00950000182903.a.b.i.g.b #22	ENSGT00990000208909	ENSGT01100000263613.d #24	ENSGT00940000163927.a.a.v.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b.d #26	ENSGT00940000166316.f #27	ENSGT01000000221243	ENSGT00940000156128.a.b #29	ENSGT00940000165054.A.d	ENSGT00390000000592.w.a	ENSGT00940000165100.b.d	ENSGT00940000165987.a.a	ENSGT00390000018418.i	ENSGT00440000037582.m	ENSGT00940000158001.g	ENSGT00510000050706.c #37
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000153617.B.g	ENSGT00940000155804.k.a.b	ENSGT00530000063790.b.c	ENSGT00940000155586.B.g.a	ENSGT00940000155527.j.a.e.b	ENSGT00940000154658.a.c	ENSGT01090000260185.b	ENSGT00940000156022.a.d #15	ENSGT00940000159844.g #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289.k #18	ENSGT00940000161071.j #19	ENSGT00940000166370.e #20	ENSGT00730000112287.g #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i.g.b #22	ENSGT00990000208909	ENSGT01100000263613.d #24	ENSGT00940000163927.a.a.u #25	ENSGT00940000163927.a.a.v.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b.d #26	ENSGT00940000166316.f #27	ENSGT01000000221243	ENSGT00940000156128.a.b #29	ENSGT00940000165054.A.d	ENSGT00390000000592.w.a	ENSGT00940000165100.b.d	ENSGT00940000165987.a.a	ENSGT00390000018418.i	ENSGT00440000037582.n.b	ENSGT00940000158001.g
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	9	USP53 (ENSSSAG00000074275)	PTPRD (ENSSSAG00000096916)	tyrp-1 (ENSSSAG00000075543)	LURAP1L (ENSSSAG00000122135)	ENSSSAG00000075588	ENSSSAG00000076648	ENSSSAG00000079701	ENSSSAG00000117990	ENSSSAG00000079961 #15	ENSSSAG00000079969 #16	ENSSSAG00000079975 #17	acap1 (ENSSSAG00000080011) #18	agfg2 (ENSSSAG00000080121) #19	ENSSSAG00000080127 #20	si:ch73-335l21.2 (ENSSSAG00000080136)	dvl2 (ENSSSAG00000080142) #22	ENSSSAG00000080197	ENSSSAG00000090733	ENSSSAG00000113794 #24	ponzr1 (ENSSSAG00000080201) #25	ENSSSAG00000098248	ENSSSAG00000080204 #26	ENSSSAG00000080205 #27	ENSSSAG00000080207	ENSSSAG00000080209 #29	fis1 (ENSSSAG00000080211)	cldn15a (ENSSSAG00000088850)	dnajc3b (ENSSSAG00000080221)	ENSSSAG00000040285	naa38 (ENSSSAG00000040010)	ENSSSAG00000046781 #37
River trout	MODERN SPECIES	35	PTPRD (ENSSTUG00000005964)	TYRP1 (ENSSTUG00000028684)	LURAP1L (ENSSTUG00000028702)	MPDZ (ENSSTUG00000028873)	ADGRL3 (ENSSTUG00000033369)	ENSSTUG00000040419	ENSSTUG00000040514	ENSSTUG00000040538 #15	BCL6B (ENSSTUG00000040579) #16	SLC16A13 (ENSSTUG00000040627) #17	ENSSTUG00000040660	acap1 (ENSSTUG00000040685) #18	agfg2 (ENSSTUG00000040829) #19	ENSSTUG00000040864 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSSTUG00000040890) #21	dvl2 (ENSSTUG00000040929) #22	ENSSTUG00000041643	ENSSTUG00000041708 #24	ponzr1 (ENSSTUG00000041721) #25	ENSSTUG00000041735 #26	ENSSTUG00000041837 #29	ENSSTUG00000041879	fis1 (ENSSTUG00000041897)	cldn15a (ENSSTUG00000041935)	dnajc3b (ENSSTUG00000041966)	cyb5d1 (ENSSTUG00000042645)	naa38 (ENSSTUG00000042692)	CHD3 (ENSSTUG00000042921)	tnfsf12 (ENSSTUG00000043460) #37	ENSSTUG00000043472	ENSSTUG00000043519
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000153617.B.g	ENSGT00960000188752.b.a.a.b	ENSGT00940000155804.k.a.b	ENSGT00530000063790.b.c	ENSGT00940000155586.B.g.a	ENSGT00940000155527.j.a.e.b	ENSGT00940000154658.a.c	ENSGT01090000260185.b	ENSGT00940000156022.a.d #15	ENSGT00940000159844.g #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289.k #18	ENSGT00940000161071.j #19	ENSGT00940000166370.e #20	ENSGT00730000112287.g #21	ENSGT00950000182903.a.b.i.g.b #22	ENSGT00990000208909	ENSGT01100000263613.d #24	ENSGT00940000163927.a.a.v.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b.d #26	ENSGT00940000166316.f #27	ENSGT01000000221243	ENSGT00940000156128.a.b #29	ENSGT00940000165054.A.d	ENSGT00390000000592.w.a	ENSGT00940000165100.b.d	ENSGT00940000165987.a.a	ENSGT00390000018418.i	ENSGT00440000037582.m	ENSGT00940000158001.g	ENSGT00510000050706.c #37
Rainbow trout	MODERN SPECIES	30	TYRP1 (ENSOMYG00000025839)	LURAP1L (ENSOMYG00000025827)	MPDZ (ENSOMYG00000022089)	ENSOMYG00000075032	ENSOMYG00000013446	ENSOMYG00000012761	ENSOMYG00000012701	ENSOMYG00000074378 #14	ENSOMYG00000052636 #14	ENSOMYG00000012672 #16	ENSOMYG00000012661 #17	acap1 (ENSOMYG00000010288) #18	agfg2 (ENSOMYG00000009492) #19	ENSOMYG00000009460 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSOMYG00000009419) #21	dvl2 (ENSOMYG00000009408) #22	ENSOMYG00000009372	ENSOMYG00000009340 #24	ponzr1 (ENSOMYG00000009316) #25	ENSOMYG00000056354 #26	ENSOMYG00000009263 #27	ENSOMYG00000009246	ENSOMYG00000009224 #29	ENSOMYG00000052402	fis1 (ENSOMYG00000009200)	cldn15a (ENSOMYG00000009184)	dnajc3b (ENSOMYG00000008992)	NAA38 (ENSOMYG00000008869)	cyb5d1 (ENSOMYG00000008841)	CHD3 (ENSOMYG00000005962)	tnfsf12 (ENSOMYG00000003529) #37
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000153617.B.g	ENSGT00960000188752.b.a.a.b	ENSGT00940000155804.k.a.b	ENSGT00530000063790.b.c	ENSGT00940000155586.B.g.a	ENSGT00940000155527.j.a.e.b	ENSGT00940000154658.a.c	ENSGT01090000260185.b	ENSGT00940000156022.a.d #15	ENSGT00940000159844.g #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289.k #18	ENSGT00940000161071.j #19	ENSGT00940000166370.e #20	ENSGT00730000112287.g #21	ENSGT00950000182903.a.b.i.g.b #22	ENSGT00990000208909	ENSGT01100000263613.d #24	ENSGT00940000163927.a.a.v.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b.d #26	ENSGT00940000166316.f #27	ENSGT00940000156128.a.b #29	ENSGT00940000165054.A.d	ENSGT00390000000592.w.a	ENSGT00940000165100.b.d	ENSGT00940000165987.a.a	ENSGT00390000018418.i	ENSGT00440000037582.m	ENSGT00940000158001.g	ENSGT00510000050706.c #37	ENSGT00800000125278
Coho salmon	MODERN SPECIES	7	TYRP1 (ENSOKIG00005016952)	LURAP1L (ENSOKIG00005016940)	MPDZ (ENSOKIG00005010909)	ADGRL3 (ENSOKIG00005006122)	ENSOKIG00005005786	ENSOKIG00005005518	ENSOKIG00005005458	ENSOKIG00005005451 #15	ENSOKIG00005005445 #16	ENSOKIG00005005442	SLC16A13 (ENSOKIG00005005433) #17	acap1 (ENSOKIG00005005394) #18	agfg2 (ENSOKIG00005005355) #19	ENSOKIG00005005344 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSOKIG00005005335) #21	dvl2 (ENSOKIG00005005303) #22	ENSOKIG00005005280	ENSOKIG00005005274 #24	ponzr1 (ENSOKIG00005005264) #25	ENSOKIG00005005250 #26	ENSOKIG00005005243 #27	ENSOKIG00005005236 #29	ENSOKIG00005005230	fis1 (ENSOKIG00005005223)	cldn15a (ENSOKIG00005005215)	dnajc3b (ENSOKIG00005004918)	NAA38 (ENSOKIG00005004866)	cyb5d1 (ENSOKIG00005004853)	CHD3 (ENSOKIG00005004700)	tnfsf12 (ENSOKIG00005004677) #37	ENSOKIG00005004669
Chinook salmon	MODERN SPECIES	1	PTPRD (ENSOTSG00005024026)	ENSOTSG00005023889	TYRP1 (ENSOTSG00005023884)	MPDZ (ENSOTSG00005015616)	cdk6 (ENSOTSG00005015574)	ADGRL3 (ENSOTSG00005008372)	ENSOTSG00005008304	ENSOTSG00005008295	ENSOTSG00005008294 #15	ENSOTSG00005008291 #16	SLC16A13 (ENSOTSG00005008287) #17	acap1 (ENSOTSG00005002953) #18	agfg2 (ENSOTSG00005002772) #19	si:ch73-335l21.4 (ENSOTSG00005002763) #21	ENSOTSG00005002753 #20	dvl2 (ENSOTSG00005002746) #22	ENSOTSG00005002743 #24	ponzr1 (ENSOTSG00005002742) #25	ENSOTSG00005002729 #26	ENSOTSG00005002719 #27	ENSOTSG00005002704 #29	ENSOTSG00005002696	fis1 (ENSOTSG00005002690)	cldn15a (ENSOTSG00005002685)	dnajc3b (ENSOTSG00005002398)	naa38 (ENSOTSG00005002389)	cyb5d1 (ENSOTSG00005002377)	tnfsf12 (ENSOTSG00005002342) #37	ENSOTSG00005002337	ENSOTSG00005002326	NEURL4 (ENSOTSG00005001903)
Huchen	MODERN SPECIES	412						ENSHHUG00000014088	ENSHHUG00000015197	ENSHHUG00000016131	ENSHHUG00000016161 #15	BCL6B (ENSHHUG00000016168) #16	SLC16A13 (ENSHHUG00000016192) #17	acap1 (ENSHHUG00000016201) #18	agfg2 (ENSHHUG00000016247) #19	ENSHHUG00000016288 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSHHUG00000016299) #21	dvl2 (ENSHHUG00000016309) #22	ENSHHUG00000016421 #24	ponzr1 (ENSHHUG00000016423) #25	ENSHHUG00000016432 #26
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	1303														ENSGT00940000165960.a.a ##30	ENSGT00640000091486.b.`b.b	ENSGT00950000182903.a.b.i.h #22
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	129														ENSGT00940000165960.a.a ##30	ENSGT00640000091486.b.`b.b	ENSGT00950000182903.a.b.i.h #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000154838.A.f.b.b	ENSGT00940000164016.e	ENSGT00940000161062.c.b	ENSGT00940000160785	ENSGT00940000161538	ENSGT00940000160946	ENSGT00940000163093.a.b	ENSGT00510000047299.c	ENSGT00940000155158.q.b	ENSGT00390000000214.a.a.f	ENSGT00940000156881.h	ENSGT00940000156631.B	ENSGT00950000183018.a.d.b	ENSGT00530000064130
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	153														ENSGT00940000165960.a.a ##30	ENSGT00640000091486.b.`b.b	ENSGT00950000182903.a.b.i.h #22	ENSGT00940000158535.x #23	ENSGT00940000154838.A.f.b.b	ENSGT00940000164016.e	ENSGT00940000161062.c.b	ENSGT00940000160785	ENSGT00940000161538	ENSGT00940000160946	ENSGT00940000163093.a.b	ENSGT00510000047299.c	ENSGT00940000155158.r	ENSGT00390000000214.a.a.f	ENSGT00940000156881.h	ENSGT00940000156631.B.g	ENSGT00950000183018.a.d.b	ENSGT00530000064130
River trout	MODERN SPECIES	10					ENSSTUG00000010128	mrps17 (ENSSTUG00000010076)	ENSSTUG00000010044	ENSSTUG00000010041	septin4a (ENSSTUG00000009953)	mntb (ENSSTUG00000009947)	ENSSTUG00000009943	pafah1b1b (ENSSTUG00000009861)	ZPLD1 (ENSSTUG00000009819)	ENSSTUG00000009810 ##30	taf6 (ENSSTUG00000009794)	DVL2 (ENSSTUG00000009670) #22	acadvl (ENSSTUG00000008764) #23	ENSSTUG00000008704	klf5l (ENSSTUG00000008696)	klf8 (ENSSTUG00000008680)	cldn2 (ENSSTUG00000008677)	ripply1 (ENSSTUG00000008669)	PRRG3 (ENSSTUG00000008657)	ENSSTUG00000008644	pgap2 (ENSSTUG00000008636)	ENSSTUG00000008628	stim1b (ENSSTUG00000007559)	alcama (ENSSTUG00000007257)	ENSSTUG00000007085	ENSSTUG00000007054	ENSSTUG00000007049
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	23	LGI2 (ENSSSAG00000043307)	ENSSSAG00000111674	ENSSSAG00000043456	ENSSSAG00000045334	ENSSSAG00000113463	ENSSSAG00000063298	ENSSSAG00000045683	ENSSSAG00000045653	ENSSSAG00000010182	ENSSSAG00000096375	ENSSSAG00000005502	ENSSSAG00000045602	ENSSSAG00000084245 ##30	ENSSSAG00000045755	ENSSSAG00000049715	ENSSSAG00000047918 #22	ENSSSAG00000049619 #23	klf5l (ENSSSAG00000049796)	klf8 (ENSSSAG00000088225)	ENSSSAG00000107634	cldn2 (ENSSSAG00000086905)	ripply1 (ENSSSAG00000049824)	ENSSSAG00000102949	ENSSSAG00000049840	pgap2 (ENSSSAG00000049858)	ENSSSAG00000049978	ENSSSAG00000054868	ENSSSAG00000054962	ENSSSAG00000089981	ENSSSAG00000085065	ENSSSAG00000111565
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000160071.h	ENSGT00940000153394.c.b.b.c.a.a.a	ENSGT00940000162605	ENSGT00940000165017.b	ENSGT00940000154932.A.v	ENSGT00940000157478.b.c.a	ENSGT00940000157170.j	ENSGT00940000165144.a.b	ENSGT00390000010377.i	ENSGT00940000158861.B.d	ENSGT00390000007925	ENSGT00940000159852.a.d	ENSGT00950000182931.B.a.a.h	ENSGT00940000165960.a.a ##30	ENSGT00640000091486.b.`b.b	ENSGT00950000182903.a.b.i.h #22	ENSGT00940000158535.z #23	ENSGT00940000154838.A.f.b.b	ENSGT00940000164016.e	ENSGT00940000161062.c.b	ENSGT00940000160785	ENSGT00940000161538	ENSGT00940000160946	ENSGT00940000163093.a.b	ENSGT00510000047299.c	ENSGT00940000155158.q.b	ENSGT00390000000214.a.a.f	ENSGT00940000156881.h	ENSGT00940000156631.B	ENSGT00990000204242	ENSGT01030000235320
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000160071.h	ENSGT00940000153394.c.b.b.c.a.a.a	ENSGT00940000162605	ENSGT00940000165017.b	ENSGT00940000154932.A.v	ENSGT00940000157478.b.c.a	ENSGT00940000157170.j	ENSGT00940000165144.a.b	ENSGT00390000010377.i	ENSGT00940000158861.B.d	ENSGT00390000007925	ENSGT00940000159852.a.d	ENSGT00950000182931.B.a.a.h	ENSGT00940000165960.a.a ##30	ENSGT00640000091486.b.`b.b	ENSGT00950000182903.a.b.i.h #22	ENSGT00940000158535.z #23	ENSGT00940000154838.A.f.b.b	ENSGT00940000164016.e	ENSGT00940000161062.c.b	ENSGT00940000160785	ENSGT00940000161538	ENSGT00940000160946	ENSGT00940000163093.a.b	ENSGT00510000047299.c	ENSGT00940000155158.q.b	ENSGT00390000000214.a.a.f	ENSGT00940000156881.h	ENSGT00940000156631.B	ENSGT00990000204242	ENSGT01030000235320
Coho salmon	MODERN SPECIES	10	USP15 (ENSOKIG00005020661)	ENSOKIG00005022108	KDM5A (ENSOKIG00005023104)	ENSOKIG00005032206	atxn10 (ENSOKIG00005032218)	ENSOKIG00005032291	ENSOKIG00005032345	cdpf1 (ENSOKIG00005032837)	cdkn1ba (ENSOKIG00005032876)	ENSOKIG00005032887	ENSOKIG00005032906	ENSOKIG00005033012	ENSOKIG00005033029 ##30	ENSOKIG00005033041	TAF6 (ENSOKIG00005033072)	DVL2 (ENSOKIG00005033322) #22	acadvl (ENSOKIG00005034237) #23	ENSOKIG00005035616	ENSOKIG00005035657	klf5l (ENSOKIG00005035664)	klf8 (ENSOKIG00005035674)	cldn2 (ENSOKIG00005035682)	ripply1 (ENSOKIG00005035690)	PRRG3 (ENSOKIG00005035710)	ENSOKIG00005035720	pgap2 (ENSOKIG00005035752)	RHOG (ENSOKIG00005035771)	stim1b (ENSOKIG00005035839)	alcama (ENSOKIG00005036381)	CBLB (ENSOKIG00005036643)	ENSOKIG00005036954
Chinook salmon	MODERN SPECIES	8	ENSOTSG00005042274	ENSOTSG00005042271	USP15 (ENSOTSG00005037629)	ENSOTSG00005028815	KDM5A (ENSOTSG00005006577)	ENSOTSG00005006493	atxn10 (ENSOTSG00005006492)	ENSOTSG00005006490	cdpf1 (ENSOTSG00005006488)	cdkn1ba (ENSOTSG00005006487)	ENSOTSG00005006486	ENSOTSG00005006480	ENSOTSG00005006479	ENSOTSG00005006478 ##30	taf6 (ENSOTSG00005006469)	DVL2 (ENSOTSG00005006252) #22	acadvl (ENSOTSG00005006224) #23	ENSOTSG00005006221	klf5l (ENSOTSG00005006220)	klf8 (ENSOTSG00005006218)	cldn2 (ENSOTSG00005006217)	ripply1 (ENSOTSG00005006216)	PRRG3 (ENSOTSG00005006215)	ENSOTSG00005006213	ENSOTSG00005006211	pgap2 (ENSOTSG00005006210)	rhogb (ENSOTSG00005006208)	stim1b (ENSOTSG00005002701)	alcama (ENSOTSG00005002523)	CBLB (ENSOTSG00005002425)	ENSOTSG00005002171
Rainbow trout	MODERN SPECIES	6	ENSOMYG00000027072	ENSOMYG00000027062	ENSOMYG00000024412	ENSOMYG00000022721	ENSOMYG00000017351	ENSOMYG00000039259	ENSOMYG00000017178	atxn10 (ENSOMYG00000017104)	ENSOMYG00000017059	cdpf1 (ENSOMYG00000017030)	cdkn1ba (ENSOMYG00000017016)	ENSOMYG00000016973	ENSOMYG00000016941	ENSOMYG00000016929 ##30	ENSOMYG00000016803	ENSOMYG00000015917 #22	ENSOMYG00000013682 #23	ENSOMYG00000063575	ENSOMYG00000013455	ENSOMYG00000076000	klf5l (ENSOMYG00000013448)	klf8 (ENSOMYG00000013437)	cldn2 (ENSOMYG00000013409)	ripply1 (ENSOMYG00000013400)	ENSOMYG00000013391	ENSOMYG00000013381	pgap2 (ENSOMYG00000013371)	ENSOMYG00000013354	stim1b (ENSOMYG00000011142)	ENSOMYG00000010749	ENSOMYG00000071898
Huchen	MODERN SPECIES	1278											ENSHHUG00000041000	MYT1L (ENSHHUG00000040944)	ENSHHUG00000040938 ##30	ENSHHUG00000040934	ENSHHUG00000040928	DVL2 (ENSHHUG00000040924) #22
Osteoglossiformes	DUPLICATION
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	93	ENSGT00390000003738.a.a.d	ENSGT00950000183153.c.a.q	ENSGT00940000163587.a.b.b	ENSGT00940000159305.j	ENSGT00940000154035.a.f.b	ENSGT00940000160771	ENSGT00390000013834	ENSGT00940000165258	ENSGT00940000163503.A.a.a.b	ENSGT00390000000592.ib	ENSGT00940000165100.b.a	ENSGT00950000183121.a.c.a ##36	ENSGT00940000165960.a.a ##30	ENSGT00640000091486.b.bb	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.b.a	ENSGT00950000182903.a.b.i.a #22	ENSGT00940000158535.u #23	ENSGT00940000154838.A.f.b.b	ENSGT00940000166953	ENSGT00940000178676	ENSGT00940000164853.a.a.e	ENSGT00990000204023	ENSGT00940000167331.c	ENSGT00940000163913	ENSGT00940000159400	ENSGT01100000263556.a.a.q.d.cb	ENSGT00950000182899.C.b	ENSGT01000000214413.b.b.j	ENSGT00950000183196.A.w	ENSGT00940000160229	ENSGT00940000160933
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	13	wnt3 (ENSSFOG00015000492)	ormdl3 (ENSSFOG00015000476)	ENSSFOG00015000434	slc25a35 (ENSSFOG00015000398)	rangrf (ENSSFOG00015000389)	grk1b (ENSSFOG00015000349)	ENSSFOG00015032597	ENSSFOG00015000241	fis1 (ENSSFOG00015000211)	cldn15a (ENSSFOG00015000205)	sat2b (ENSSFOG00015027230) ##36	ENSSFOG00015000166	ENSSFOG00015021526 ##30	taf6 (ENSSFOG00015021494)	ENSSFOG00015021464	dvl2 (ENSSFOG00015021435) #22	acadvl (ENSSFOG00015021347) #23	ENSSFOG00015021312	ENSSFOG00015032329	ENSSFOG00015025016 #16	si:ch211-284e13.5 (ENSSFOG00015032825)	pgr (ENSSFOG00015021246)	gucy2d (ENSSFOG00015021100)	eif4e2rs1 (ENSSFOG00015021065)	ENSSFOG00015021029	slc12a9 (ENSSFOG00015021010)	ENSSFOG00015021005	ENSSFOG00015016802	gnb2 (ENSSFOG00015016821)	ENSSFOG00015017047	mink1 (ENSSFOG00015016892)
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	208	ENSPKIG00000001714	tp53 (ENSPKIG00000001744)	ENSPKIG00000001780	CAPG (ENSPKIG00000001804)	ENSPKIG00000001826	slc25a35 (ENSPKIG00000001860)	rangrf (ENSPKIG00000001893)	grk1b (ENSPKIG00000001928)	ENSPKIG00000001959	fis1 (ENSPKIG00000001987)	ENSPKIG00000002003	sat2b (ENSPKIG00000002021) ##36	ENSPKIG00000002044	ENSPKIG00000002057 ##30	ENSPKIG00000002086	dvl2 (ENSPKIG00000002139) #22
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	52			ENSGT00940000169954	ENSGT00600000085600	ENSGT00390000013368	ENSGT00510000047760	ENSGT01100000263491.a.b.b.c.a.b	ENSGT01090000260185	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000161071 #19	ENSGT00940000166370.i #20	ENSGT00730000112287 #21	ENSGT00940000174877	ENSGT00950000182903.a.b.i.b #22	ENSGT00940000158535.v #23	ENSGT01100000263613 #24	ENSGT00940000163927.a.a #25	ENSGT00940000153491.b.b.b #26	ENSGT00940000166316 #27	ENSGT00390000014072.B #28	ENSGT00640000091486.b.cb	ENSGT00940000156128.a #29	ENSGT00940000165960.a.b.b #30	ENSGT00940000167107 #31	ENSGT00390000000592.hb	ENSGT00940000165100.b.b	ENSGT00940000165987	ENSGT00390000018418	ENSGT00440000037582
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	275	sult6b1 (ENSPKIG00000007467)	ENSPKIG00000007454	ENSPKIG00000007433	ENSPKIG00000007419	slx1b (ENSPKIG00000007396)	zgc:112271 (ENSPKIG00000007368)	ENSPKIG00000007354	ENSPKIG00000007342	ENSPKIG00000007321 #15	SLC16A13 (ENSPKIG00000007295) #17	acap1 (ENSPKIG00000007239) #18	agfg2 (ENSPKIG00000007184) #19	ENSPKIG00000007153 #20	si:ch73-335l21.4 (ENSPKIG00000007139) #21	si:ch73-335l21.2 (ENSPKIG00000007128)	dvl2 (ENSPKIG00000007065) #22	ENSPKIG00000007046 #24	ponzr1 (ENSPKIG00000007023) #25	ENSPKIG00000006978 #26	ENSPKIG00000006945 #27	cnpy4 (ENSPKIG00000006916) #28	taf6 (ENSPKIG00000006892)	ENSPKIG00000006869 #29	ENSPKIG00000006848 #30	zgc:103586 (ENSPKIG00000006828) #31	FIS1 (ENSPKIG00000006754)	cldn15a (ENSPKIG00000006689)	dnajc3b (ENSPKIG00000006633)	ENSPKIG00000006614	cyb5d1 (ENSPKIG00000006579)	CHD3 (ENSPKIG00000006305)
Spotted gar	MODERN SPECIES	658	DMWD (ENSLOCG00000014351)	ENSLOCG00000014353	hif1al (ENSLOCG00000014356)	nccrp1 (ENSLOCG00000014359)	zgc:152863 (ENSLOCG00000014363)	pak4 (ENSLOCG00000014365)	ENSLOCG00000017563	ccdc9 (ENSLOCG00000014371)	sae1 (ENSLOCG00000014375)	ZC3H4 (ENSLOCG00000014380)	zgc:154093 (ENSLOCG00000017564)	ercc2 (ENSLOCG00000014383)	dpf1 (ENSLOCG00000014388)	ENSLOCG00000014391	ENSLOCG00000014393	dvl2 (ENSLOCG00000014396) #22	acadvl (ENSLOCG00000014404) #23	ENSLOCG00000014411 #24	ponzr1 (ENSLOCG00000014412) #25	ENSLOCG00000014415	ENSLOCG00000014441 #26	ENSLOCG00000014453 #27	ENSLOCG00000014455	ENSLOCG00000014456	mpdu1b (ENSLOCG00000014460)	sox19a (ENSLOCG00000014463)	eif4a1a (ENSLOCG00000014465)	senp3a (ENSLOCG00000014470)	tnk1 (ENSLOCG00000014472)	plscr3b (ENSLOCG00000014476)	phf23b (ENSLOCG00000014481)
Reedfish	MODERN SPECIES	11	ENSECRG00000004138	ENSECRG00000004124	ENSECRG00000004072 #27	ENSECRG00000004037 #26	ENSECRG00000004021	ENSECRG00000003982	ENSECRG00000003962	ENSECRG00000003955	ENSECRG00000003950	ENSECRG00000003945	ENSECRG00000003937	ENSECRG00000003931	ENSECRG00000003928	ENSECRG00000003913	ENSECRG00000003901	dvl2 (ENSECRG00000010909) #22	acadvl (ENSECRG00000010900) #23	ENSECRG00000010894 #24	ponzr1 (ENSECRG00000010892) #25	ENSECRG00000010887 ##25	ENSECRG00000010882 ##25	cldn7b (ENSECRG00000010876)	chrnb1l (ENSECRG00000010872)	chrnb1 (ENSECRG00000010857)	fgf11a (ENSECRG00000010833)	ENSECRG00000010825	tmem102 (ENSECRG00000010823)	tmem256 (ENSECRG00000010817)	nlgn2a (ENSECRG00000010815)	ENSECRG00000010812	ENSECRG00000010810 ##25
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	118	ENSGT00950000183063.c.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000167797	ENSGT00940000155439	ENSGT00940000164682	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157673	ENSGT00390000005285	ENSGT00940000171017	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00940000155604	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	185	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183063.c.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000167797	ENSGT00940000155439	ENSGT00940000164682	ENSGT00390000006294	ENSGT01020000230768	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157673	ENSGT00390000005285	ENSGT00940000171017	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00940000155604	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000159223	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00390000016972
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	33					ENSGT00390000012719.a.b	ENSGT00940000155414	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT01030000235136	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00940000155435.B.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00940000157650	ENSGT00390000013063.u
Pinecone sodierfish	DUPLICATION
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	4	zgc:92744 (ENSMMDG00005004942)	mmp23bb (ENSMMDG00005004932)	ENSMMDG00005004925	ENSMMDG00005004919	ENSMMDG00005021083	ENSMMDG00005021079	polr2d (ENSMMDG00005021074)	ENSMMDG00005021068	ENSMMDG00005021066	ABCF3 (ENSMMDG00005020762)	ENSMMDG00005020678	rpl35a (ENSMMDG00005020659)	abcc5 (ENSMMDG00005020651)	rnpepl1 (ENSMMDG00005019886)	ENSMMDG00005019860 ##22	ENSMMDG00005019845 ##22	MASP1 (ENSMMDG00005019790)	ENSMMDG00005019775	DGKD (ENSMMDG00005017004)	ENSMMDG00005016947	sagb (ENSMMDG00005016819)	atg16l1 (ENSMMDG00005014904)	ENSMMDG00005014821	ENSMMDG00005014812	ENSMMDG00005014810	ENSMMDG00005014809	ENSMMDG00005014806	fgf12b (ENSMMDG00005014801)	GALNT17 (ENSMMDG00005014797)	ENSMMDG00005014795	ENSMMDG00005014793
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	4	eif2a (ENSMMDG00005004959)	zgc:92744 (ENSMMDG00005004942)	mmp23bb (ENSMMDG00005004932)	ENSMMDG00005004925	ENSMMDG00005004919	ENSMMDG00005021083	ENSMMDG00005021079	polr2d (ENSMMDG00005021074)	ENSMMDG00005021068	ENSMMDG00005021066	ABCF3 (ENSMMDG00005020762)	ENSMMDG00005020678	rpl35a (ENSMMDG00005020659)	abcc5 (ENSMMDG00005020651)	rnpepl1 (ENSMMDG00005019886)	ENSMMDG00005019860 ##22	ENSMMDG00005019845 ##22	MASP1 (ENSMMDG00005019790)	ENSMMDG00005019775	DGKD (ENSMMDG00005017004)	ENSMMDG00005016947	sagb (ENSMMDG00005016819)	atg16l1 (ENSMMDG00005014904)	ENSMMDG00005014821	ENSMMDG00005014812	ENSMMDG00005014810	ENSMMDG00005014809	ENSMMDG00005014806	fgf12b (ENSMMDG00005014801)	GALNT17 (ENSMMDG00005014797)	ENSMMDG00005014795
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	64							ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT01030000235136	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00940000155435.B.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00940000160348	ENSGT00950000182985.a.b.b
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b	ENSGT00940000167612	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.b.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.b.b	ENSGT00940000167717	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT01030000235136	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00940000155435.B.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00940000160348	ENSGT00950000182985.a.b.b
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.a	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b	ENSGT00940000167612	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00940000166255	ENSGT01030000235136	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00940000155435.B.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00940000160348	ENSGT00950000182985.a.b.b
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.b.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b	ENSGT00940000167612	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00940000166255	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00940000155435.B.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00940000160348	ENSGT00950000182985.a.b.b
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00440000038181	ENSGT00940000153680.b	ENSGT00390000006450	ENSGT00940000158353	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.b.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000160131	ENSGT00440000038181	ENSGT00940000153680.b	ENSGT00390000006450	ENSGT00940000158353	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.b.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.a.c	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000159041	ENSGT00950000182985.a.b.b	ENSGT00940000160348	ENSGT00940000153936.a
Climbing perch	MODERN SPECIES	4	PGM2L1 (ENSATEG00000020523)	ENSATEG00000020482	ENSATEG00000020463	ENSATEG00000028562	ENSATEG00000026772	ENSATEG00000020437	ENSATEG00000026749	ENSATEG00000020416	ENSATEG00000020412	ENSATEG00000020405	ENSATEG00000020295	ENSATEG00000020202	rpl35a (ENSATEG00000020166)	abcc5 (ENSATEG00000020009)	rnpepl1 (ENSATEG00000019976)	ENSATEG00000019864 ##22	mmp23bb (ENSATEG00000019844)	ENSATEG00000019841	EIF2A (ENSATEG00000019832)	ENSATEG00000019800	ENSATEG00000019772	ENSATEG00000028092	ENSATEG00000028384	ENSATEG00000026601	ENSATEG00000019708	ENSATEG00000019694	ENSATEG00000019595	ENSATEG00000025585	ENSATEG00000019563	ENSATEG00000019500	ENSATEG00000019487
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	4	DMWD (ENSBSLG00000002536)	ENSBSLG00000002559	ENSBSLG00000002674	NYAP2 (ENSBSLG00000002694)	ENSBSLG00000002711	ENSBSLG00000002728	ENSBSLG00000002738	polr2d (ENSBSLG00000002753)	ENSBSLG00000002781	ENSBSLG00000002798	ABCF3 (ENSBSLG00000002811)	ENSBSLG00000002887	rpl35a (ENSBSLG00000002959)	abcc5 (ENSBSLG00000002971)	rnpepl1 (ENSBSLG00000003039)	ENSBSLG00000003050 ##22	ENSBSLG00000003574	MASP1 (ENSBSLG00000003765)	ENSBSLG00000003912	sagb (ENSBSLG00000004093)	ENSBSLG00000004525	ppp1r14ab (ENSBSLG00000004528)	ENSBSLG00000004539	ENSBSLG00000004540	atg16l1 (ENSBSLG00000004817)	ENSBSLG00000005236	ENSBSLG00000005248	ENSBSLG00000005274	ENSBSLG00000005316	ENSBSLG00000005328	ENSBSLG00000005361
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	4	ENSMAMG00000024805	ENSMAMG00000026416	ENSMAMG00000018843	ENSMAMG00000018830	ENSMAMG00000018823	ENSMAMG00000018809	ENSMAMG00000018798	ENSMAMG00000018789	ENSMAMG00000027299	ENSMAMG00000018751	ENSMAMG00000018699	ENSMAMG00000018675	rpl35a (ENSMAMG00000018665)	abcc5 (ENSMAMG00000018636)	rnpepl1 (ENSMAMG00000018623)	ENSMAMG00000018559 ##22	ap2m1b (ENSMAMG00000018537)	mmp23bb (ENSMAMG00000018519)	ENSMAMG00000018507	EIF2A (ENSMAMG00000018484)	ENSMAMG00000027173	ENSMAMG00000018459	ENSMAMG00000018391	ENSMAMG00000018381	ENSMAMG00000018356	ENSMAMG00000018290	ENSMAMG00000018275	ENSMAMG00000025327	ENSMAMG00000018262	ENSMAMG00000018253	ENSMAMG00000018182
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158353	ENSGT00950000183023.B	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b	ENSGT00940000167612	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00940000166255	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00940000155435.B.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00940000160348	ENSGT00950000182985.a.b.b
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000153680.b	ENSGT00390000006450	ENSGT00940000158353	ENSGT00950000183023.B	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.b.g.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b	ENSGT00940000167612	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT01040000241543	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000160400	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00940000155435.B.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00940000176181	ENSGT01030000234590.A.a.a	ENSGT00940000153680.a
Turbot	MODERN SPECIES	15	spcs2 (ENSSMAG00000005637)	rnf169 (ENSSMAG00000005619)	lipt2 (ENSSMAG00000005600)	PGM2L1 (ENSSMAG00000005573)	ENSSMAG00000005570	ENSSMAG00000005552	ENSSMAG00000005558	ENSSMAG00000005542	ENSSMAG00000005522	ENSSMAG00000005487	ENSSMAG00000005475	ENSSMAG00000005408	ENSSMAG00000005384	rpl35a (ENSSMAG00000005341)	ENSSMAG00000005325	ENSSMAG00000005299 ##22	mmp23bb (ENSSMAG00000005283)	ENSSMAG00000030174	ENSSMAG00000005233	ENSSMAG00000005214	ENSSMAG00000005191	ENSSMAG00000034340	ENSSMAG00000005153	ENSSMAG00000005095	DGKD (ENSSMAG00000005021)	ENSSMAG00000024387	ENSSMAG00000026583	atg16l1 (ENSSMAG00000034930)	ENSSMAG00000031323	ENSSMAG00000023447	ENSSMAG00000036664
Tongue sole	MODERN SPECIES	18	ENSCSEG00000006095	ENSCSEG00000006100	ENSCSEG00000006105	ENSCSEG00000006112	ENSCSEG00000006116	ENSCSEG00000006138	ENSCSEG00000006140	ENSCSEG00000006142	ENSCSEG00000006144	polr2d (ENSCSEG00000006147)	ENSCSEG00000006151	ABCF3 (ENSCSEG00000006154)	LRCH3 (ENSCSEG00000006184)	rpl35a (ENSCSEG00000006207)	rnpepl1 (ENSCSEG00000006216)	ENSCSEG00000006219 ##22	mmp23bb (ENSCSEG00000006231)	SERP1 (ENSCSEG00000006236)	eif2a (ENSCSEG00000006247)	tsen34 (ENSCSEG00000006278)	clrn1 (ENSCSEG00000006287)	ENSCSEG00000006289	si:dkey-5i3.5 (ENSCSEG00000006293)	ENSCSEG00000006297	impdh1b (ENSCSEG00000006303)	ENSCSEG00000006326	fam3c (ENSCSEG00000006349)	btg1 (ENSCSEG00000006365)	ENSCSEG00000006371	dcn (ENSCSEG00000006390)	lum (ENSCSEG00000006414)
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.b.a	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.b.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b	ENSGT00940000167612	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00940000166255	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00940000155435.B.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00940000160348	ENSGT00950000182985.a.b.b	ENSGT01030000234590.A.a.a
Barramundi perch	MODERN SPECIES	452	ENSLCAG00010022198	ENSLCAG00010022200	ENSLCAG00010022202	ENSLCAG00010022205	ENSLCAG00010022208	ENSLCAG00010022213	polr2d (ENSLCAG00010022217)	ENSLCAG00010022225	ENSLCAG00010022230	ABCF3 (ENSLCAG00010022252)	ENSLCAG00010022280	ENSLCAG00010022283	rpl35a (ENSLCAG00010022289)	abcc5 (ENSLCAG00010022300)	rnpepl1 (ENSLCAG00010022323)	ENSLCAG00010022348 ##22	ap2m1b (ENSLCAG00010001710)	mmp23bb (ENSLCAG00010001717)	serp1 (ENSLCAG00010001723)	eif2a (ENSLCAG00010001748)	tsen34 (ENSLCAG00010001822)	clrn1 (ENSLCAG00010001825)	MASP1 (ENSLCAG00010001828)	ENSLCAG00010001837	DGKD (ENSLCAG00010001852)	ENSLCAG00010001881	sagb (ENSLCAG00010001913)	atg16l1 (ENSLCAG00010002116)	ENSLCAG00010002651	ppp1r14ab (ENSLCAG00010002653)	ENSLCAG00010002656
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	67	ENSGT00390000006450	ENSGT00940000158353	ENSGT00950000183023.B	ENSGT00950000183048.b.b.a.c.b.x	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b	ENSGT00940000167612	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000180004	ENSGT00940000165747	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00940000155435.B.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00940000160348	ENSGT00950000182985.a.b.b
Greater amberjack	MODERN SPECIES	14	lipt2 (ENSSDUG00000006137)	pgm2l1 (ENSSDUG00000006104)	ENSSDUG00000006096	ENSSDUG00000006083	ENSSDUG00000006077	polr2d (ENSSDUG00000006060)	ENSSDUG00000005948	ENSSDUG00000005916	ABCF3 (ENSSDUG00000005827)	LRCH3 (ENSSDUG00000005730)	rpl35a (ENSSDUG00000005691)	ENSSDUG00000005669	abcc5 (ENSSDUG00000005591)	rnpepl1 (ENSSDUG00000005553)	ENSSDUG00000005544	ENSSDUG00000005526 ##22	ENSSDUG00000005500	mmp23bb (ENSSDUG00000005468)	SERP1 (ENSSDUG00000005451)	eif2a (ENSSDUG00000005404)	tsen34 (ENSSDUG00000005391)	clrn1 (ENSSDUG00000005375)	MASP1 (ENSSDUG00000005354)	ENSSDUG00000005334	DGKD (ENSSDUG00000005284)	ENSSDUG00000005272	sagb (ENSSDUG00000005239)	atg16l1 (ENSSDUG00000005038)	spint2 (ENSSDUG00000004998)	ENSSDUG00000004987	ENSSDUG00000004951
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3260																ENSSLDG00000006389 ##22	ENSSLDG00000006352	mmp23bb (ENSSLDG00000006324)	SERP1 (ENSSLDG00000006306)	eif2a (ENSSLDG00000006171)	tsen34 (ENSSLDG00000006144)	clrn1 (ENSSLDG00000006130)	MASP1 (ENSSLDG00000006115)	ENSSLDG00000006087	DGKD (ENSSLDG00000005990)	ENSSLDG00000005969	sagb (ENSSLDG00000005931)	atg16l1 (ENSSLDG00000005790)	spint2 (ENSSLDG00000005758)	ppp1r14ab (ENSSLDG00000005727)	ENSSLDG00000005713
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.a	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b	ENSGT00940000167612	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.b.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.b.b	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00940000155435.B.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00940000160348	ENSGT00950000182985.a.b.b
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	187														ENSGT00390000004912	ENSGT00940000155604	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00390000003912	ENSGT00850000132319.a.a.a
Tetraodon	MODERN SPECIES	26	ENSTNIG00000011219	ENSTNIG00000011217	ENSTNIG00000011218	abcg1 (ENSTNIG00000011216)	spcs2 (ENSTNIG00000001167)	ENSTNIG00000011215	lipt2 (ENSTNIG00000011214)	pgm2l1 (ENSTNIG00000011213)	ENSTNIG00000001942	polr2d (ENSTNIG00000011210)	ENSTNIG00000000201	ABCF3 (ENSTNIG00000011209)	LRCH3 (ENSTNIG00000011208)	rpl35a (ENSTNIG00000011207)	rnpepl1 (ENSTNIG00000011206)	ENSTNIG00000011205 ##22	mmp23bb (ENSTNIG00000011204)	zgc:92744 (ENSTNIG00000011203)	eif2a (ENSTNIG00000011202)	tsen34 (ENSTNIG00000011201)	clrn1 (ENSTNIG00000011200)	MASP1 (ENSTNIG00000011199)	ENSTNIG00000011198	ENSTNIG00000011197	ENSTNIG00000011196	DGKD (ENSTNIG00000011194)	ENSTNIG00000002027	DGKD (ENSTNIG00000011195)	ENSTNIG00000011193	sagb (ENSTNIG00000011192)	atg16l1 (ENSTNIG00000011191)
Fugu	MODERN SPECIES	2	tagln (ENSTRUG00000027090)	pcsk7 (ENSTRUG00000008000)	bace1 (ENSTRUG00000007818)	ENSTRUG00000032408	apoa-i (ENSTRUG00000030856)	ENSTRUG00000024654	ENSTRUG00000025922	ENSTRUG00000031210	ech1 (ENSTRUG00000006958)	usp2a (ENSTRUG00000026132)	tbcela (ENSTRUG00000006818)	usf1l (ENSTRUG00000021581)	ubash3bb (ENSTRUG00000004824)	polr2d (ENSTRUG00000004740)	ABCF3 (ENSTRUG00000004104)	ENSTRUG00000026449 ##22	mmp23bb (ENSTRUG00000003905)	zgc:92744 (ENSTRUG00000018022)	tsen34 (ENSTRUG00000032895)	clrn1 (ENSTRUG00000004876)	ENSTRUG00000002657	rpl35a (ENSTRUG00000003546)	rnpepl1 (ENSTRUG00000024939)	ENSTRUG00000001802	ENSTRUG00000028564	ENSTRUG00000003150	ENSTRUG00000029754	ENSTRUG00000003272	ENSTRUG00000026223	abcg1 (ENSTRUG00000031068)	spcs2 (ENSTRUG00000033006)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b	ENSGT00940000167717	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.b.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.b.a.a.b	ENSGT00940000167612	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00940000155435.B.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00940000160348	ENSGT00950000182985.a.b.b
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.a	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b	ENSGT00940000167612	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.b.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.b.b	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00940000155435.B.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00940000160348	ENSGT00950000182985.a.b.b
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT00940000153680.b	ENSGT00390000006450	ENSGT00940000158353	ENSGT00950000183023.B	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.b.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.b.a.a.b	ENSGT00940000167612	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00940000155435.B.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00940000160348	ENSGT00950000182985.a.b.b
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	49	ENSGT00940000153680.b	ENSGT00390000006450	ENSGT00940000158353	ENSGT00950000183023.B	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.b.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.b.a.a.b	ENSGT00940000167612	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00940000155435.B.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00940000176181	ENSGT00950000182985.a.b.b
European seabass	MODERN SPECIES	3	ENSDLAG00005007416	ENSDLAG00005031776	ENSDLAG00005033663	ENSDLAG00005029361	ENSDLAG00005030288	ENSDLAG00005004035	ENSDLAG00005033204	ENSDLAG00005013721	ENSDLAG00005031788	ENSDLAG00005034405	ENSDLAG00005013879	ENSDLAG00005027064	rpl35a (ENSDLAG00005012978)	abcc5 (ENSDLAG00005004785)	rnpepl1 (ENSDLAG00005033486)	ENSDLAG00005033666 ##22	ap2m1b (ENSDLAG00005031497)	mmp23bb (ENSDLAG00005024567)	ENSDLAG00005004179	ENSDLAG00005008055	ENSDLAG00005028273	ENSDLAG00005004857	ENSDLAG00005026870	DGKD (ENSDLAG00005018246)	ENSDLAG00005017916	ENSDLAG00005004126	atg16l1 (ENSDLAG00005034415)	ENSDLAG00005034127	ENSDLAG00005028029	ENSDLAG00005017026	ENSDLAG00005029057
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	479	ENSLCRG00005004069	ENSLCRG00005004068	ENSLCRG00005004067	ENSLCRG00005004066	ENSLCRG00005004065	ENSLCRG00005004063	ENSLCRG00005004062	ENSLCRG00005004061	polr2d (ENSLCRG00005004059)	ENSLCRG00005004058	ABCF3 (ENSLCRG00005004043)	LRCH3 (ENSLCRG00005004031)	rpl35a (ENSLCRG00005004028)	abcc5 (ENSLCRG00005003010)	rnpepl1 (ENSLCRG00005002986)	ENSLCRG00005002985 ##22	ap2m1b (ENSLCRG00005002833)	mmp23bb (ENSLCRG00005002823)	ENSLCRG00005002818	eif2a (ENSLCRG00005002283)	tsen34 (ENSLCRG00005002276)	MINDY4B (ENSLCRG00005002271)	clrn1 (ENSLCRG00005002268)	MASP1 (ENSLCRG00005002245)	ENSLCRG00005002234	DGKD (ENSLCRG00005000665)	ENSLCRG00005000582	sagb (ENSLCRG00005000416)	atg16l1 (ENSLCRG00005000242)	ENSLCRG00005000145	ENSLCRG00005000138
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00950000183048.b.b.a.c.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.b.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b	ENSGT00940000167612	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000165747	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053.d	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00940000160348	ENSGT00950000182985.a.b.b
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00950000183023.B	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.a	ENSGT00950000183048.b.b.a.c.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.b.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000165747	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053.d	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00940000160348	ENSGT00940000176181	ENSGT00950000182985.a.b.b
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	279																ENSCGOG00000022530 ##22	ENSCGOG00000022534
Pike perch	MODERN SPECIES	187	ece2b (ENSSLUG00000007872)	ENSSLUG00000007836	ENSSLUG00000007831	polr2d (ENSSLUG00000007763)	ENSSLUG00000007736	ENSSLUG00000007729	ABCF3 (ENSSLUG00000007538)	ENSSLUG00000007181	ENSSLUG00000007132	ENSSLUG00000019826	rpl35a (ENSSLUG00000019823)	ENSSLUG00000019819	abcc5 (ENSSLUG00000019812)	rnpepl1 (ENSSLUG00000019806)	ENSSLUG00000019801	ENSSLUG00000019796 ##22
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.c.b	ENSGT00440000038181	ENSGT00940000153680.b	ENSGT00390000006450	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b	ENSGT00940000167612	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000160400	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053.d	ENSGT00390000003912	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00940000160348	ENSGT00950000182985.a.b.b	ENSGT01030000234590.A.a.a	ENSGT00940000153680.a
Stickleback	MODERN SPECIES		ENSGACG00000004603	ENSGACG00000004606	ENSGACG00000004608	ENSGACG00000004611	ENSGACG00000004612	spcs2 (ENSGACG00000004619)	ENSGACG00000004628	lipt2 (ENSGACG00000004631)	ENSGACG00000004636	polr2d (ENSGACG00000004639)	ENSGACG00000004650	ABCF3 (ENSGACG00000004656)	ENSGACG00000004682	rpl35a (ENSGACG00000004699)	rnpepl1 (ENSGACG00000004711)	ENSGACG00000004718 ##22	ENSGACG00000004728	ENSGACG00000004731	mmp23bb (ENSGACG00000004741)	ENSGACG00000004745	eif2a (ENSGACG00000004748)	tsen34 (ENSGACG00000004800)	clrn1 (ENSGACG00000004805)	MASP1 (ENSGACG00000004811)	ENSGACG00000004816	ENSGACG00000004822	DGKD (ENSGACG00000004826)	IWS1 (ENSGACG00000004866)	wdr74 (ENSGACG00000004875)	zgc:162872 (ENSGACG00000004876)	ilkap (ENSGACG00000004890)
Lumpfish	MODERN SPECIES	4	ENSCLMG00005007505	spcs2 (ENSCLMG00005007507)	lipt2 (ENSCLMG00005007509)	ENSCLMG00005007511	ENSCLMG00005007513	polr2d (ENSCLMG00005007516)	ENSCLMG00005007531	ENSCLMG00005007549	ABCF3 (ENSCLMG00005007561)	LRCH3 (ENSCLMG00005008274)	ENSCLMG00005008347	ENSCLMG00005008349	ENSCLMG00005008350	rpl35a (ENSCLMG00005008351)	rnpepl1 (ENSCLMG00005008354)	ENSCLMG00005008665 ##22	ap2m1b (ENSCLMG00005001382)	mmp23bb (ENSCLMG00005001497)	zgc:92744 (ENSCLMG00005001993)	eif2a (ENSCLMG00005002005)	tsen34 (ENSCLMG00005003919)	clrn1 (ENSCLMG00005003920)	MASP1 (ENSCLMG00005003921)	ENSCLMG00005004156	DGKD (ENSCLMG00005004172)	sagb (ENSCLMG00005005716)	atg16l1 (ENSCLMG00005005723)	ENSCLMG00005005735	spint2 (ENSCLMG00005005738)	ENSCLMG00005005740	ENSCLMG00005005741
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158353	ENSGT00950000183023.B	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b	ENSGT00940000167717	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT01030000235136	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00940000155435.B.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00940000160348	ENSGT00950000182985.a.b.b
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00950000183048.b.b.a.c.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.b.b	ENSGT01100000263522.B.b.h.k.b	ENSGT01100000263522.B.b.h.k.a	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT01030000235136	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00940000160348	ENSGT01030000234590.A.a.a	ENSGT00940000153680.a	ENSGT00940000167283.b
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000155414	ENSGT00940000158551	ENSGT00940000153680.b	ENSGT00390000006450	ENSGT00940000158353	ENSGT00950000183023.B	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b.j	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00940000160348	ENSGT01030000234590.A.a.a	ENSGT00940000153680.a	ENSGT00940000167283.b
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22
Chinese medaka	MODERN SPECIES	2427																ENSOSIG00000001866 ##22
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000155414	ENSGT00940000158551	ENSGT00390000006450	ENSGT00940000158353	ENSGT00950000183023.B	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b.i.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b.j	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00940000160348	ENSGT01030000234590.A.a.a	ENSGT00940000153680.a	ENSGT00940000167283.b
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	4	ENSOJAG00000011519	rffl (ENSOJAG00000011668)	eif4h (ENSOJAG00000011696)	ENSOJAG00000012007	ENSOJAG00000012021	lipt2 (ENSOJAG00000012032)	ENSOJAG00000012497	ENSOJAG00000012521	ENSOJAG00000012536	ENSOJAG00000012544	ENSOJAG00000012560	ABCF3 (ENSOJAG00000012572)	rpl35a (ENSOJAG00000012766)	rnpepl1 (ENSOJAG00000013262)	ENSOJAG00000013293	ENSOJAG00000013313 ##22	mmp23bb (ENSOJAG00000013342)	zgc:92744 (ENSOJAG00000013347)	tsen34 (ENSOJAG00000014154)	clrn1 (ENSOJAG00000014164)	MASP1 (ENSOJAG00000014176)	ENSOJAG00000014267	ENSOJAG00000015478	sagb (ENSOJAG00000015525)	ENSOJAG00000015683	ENSOJAG00000016290	ENSOJAG00000016307	ENSOJAG00000016426	ENSOJAG00000016445	NYAP2 (ENSOJAG00000016464)	atp1b3b (ENSOJAG00000016472)
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	55	ENSGT00940000162644	ENSGT00390000003912	ENSGT00730000111053	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00940000165683	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT01030000235136	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	66	ENSGT00940000162644	ENSGT00390000003912	ENSGT00730000111053	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00940000165683	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT01030000235136	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000162644	ENSGT00390000003912	ENSGT00730000111053	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00940000165683	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604.m	ENSGT00940000158330	ENSGT01030000235136	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.a.h	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.a.g	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00950000183048.b.b.a.c.b	ENSGT00940000160131	ENSGT00440000038181	ENSGT00940000153680.b	ENSGT00390000006450	ENSGT00940000158353.n	ENSGT00950000183023.B	ENSGT01100000263522.B.b.h.k.b.c	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.b.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.b.a
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000162644	ENSGT00390000003912	ENSGT00730000111053	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00940000165683	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604.m	ENSGT00940000158330	ENSGT01030000235136	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.a.g	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.c.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.b.a.a.b	ENSGT00940000160131	ENSGT00440000038181	ENSGT00940000153680.b	ENSGT00390000006450	ENSGT00940000158353.n	ENSGT00950000183023.B	ENSGT01100000263522.B.b.h.k.b.c	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.b.b
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000162644	ENSGT00390000003912	ENSGT00730000111053	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00940000165683	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604.m	ENSGT00940000158330	ENSGT01030000235136	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.a.g.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.b.a.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.a.g.a	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.b.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.b.a.a.b	ENSGT00940000160131	ENSGT00440000038181	ENSGT00940000153680.b	ENSGT00390000006450	ENSGT00940000158353.n	ENSGT00950000183023.B	ENSGT01100000263522.B.b.h.k.b.c
Amazon molly	MODERN SPECIES	587	MASP1 (ENSPFOG00000008436)	clrn1 (ENSPFOG00000008553)	MINDY4B (ENSPFOG00000008565)	tsen34 (ENSPFOG00000008679)	eif2a (ENSPFOG00000008701)	zgc:92744 (ENSPFOG00000008903)	mmp23bb (ENSPFOG00000008920)	polr2d (ENSPFOG00000008969)	ENSPFOG00000008989	ENSPFOG00000024373	ABCF3 (ENSPFOG00000009000)	LRCH3 (ENSPFOG00000009117)	rpl35a (ENSPFOG00000009510)	abcc5 (ENSPFOG00000009529)	rnpepl1 (ENSPFOG00000022551)	ENSPFOG00000009989 ##22	ENSPFOG00000020021	ENSPFOG00000020022	ENSPFOG00000020023	ENSPFOG00000024712	ENSPFOG00000022895	ENSPFOG00000024597	ENSPFOG00000020025	ENSPFOG00000020026	abcg1 (ENSPFOG00000010302)	spcs2 (ENSPFOG00000010481)	rnf169 (ENSPFOG00000010518)	lipt2 (ENSPFOG00000010535)	pgm2l1 (ENSPFOG00000010561)	ENSPFOG00000010797	ENSPFOG00000023722
Sailfin molly	MODERN SPECIES	461	clrn1 (ENSPLAG00000017327)	tsen34 (ENSPLAG00000017309)	eif2a (ENSPLAG00000017279)	zgc:92744 (ENSPLAG00000017245)	mmp23bb (ENSPLAG00000017230)	polr2d (ENSPLAG00000017210)	ENSPLAG00000017197	ENSPLAG00000017169	ABCF3 (ENSPLAG00000017150)	LRCH3 (ENSPLAG00000017076)	ENSPLAG00000017052	rpl35a (ENSPLAG00000017033)	abcc5 (ENSPLAG00000017014)	rnpepl1 (ENSPLAG00000017003)	ENSPLAG00000016997	ENSPLAG00000016989 ##22	ENSPLAG00000016937	ENSPLAG00000016927	ENSPLAG00000016918	ENSPLAG00000016912	ENSPLAG00000016902	ENSPLAG00000016898	abcg1 (ENSPLAG00000016889)	spcs2 (ENSPLAG00000016863)	rnf169 (ENSPLAG00000000383)	lipt2 (ENSPLAG00000016840)	pgm2l1 (ENSPLAG00000016838)	ENSPLAG00000016831	ENSPLAG00000016818	ENSPLAG00000016808	ENSPLAG00000016798
Guppy	MODERN SPECIES	443	tsen34 (ENSPREG00000021784)	eif2a (ENSPREG00000021793)	zgc:92744 (ENSPREG00000021804)	mmp23bb (ENSPREG00000021817)	ENSPREG00000021840	polr2d (ENSPREG00000021862)	ENSPREG00000021873	ABCF3 (ENSPREG00000021879)	ABCF3 (ENSPREG00000021886)	ENSPREG00000021905	ENSPREG00000021915	rpl35a (ENSPREG00000000610)	abcc5 (ENSPREG00000000648)	rnpepl1 (ENSPREG00000000869)	ENSPREG00000000944	ENSPREG00000000958 ##22	ENSPREG00000001073	ENSPREG00000001134	ENSPREG00000001140	ENSPREG00000001166	ENSPREG00000001175	abcg1 (ENSPREG00000001187)	spcs2 (ENSPREG00000001283)	lipt2 (ENSPREG00000001611)	pgm2l1 (ENSPREG00000001652)	ENSPREG00000001703	ENSPREG00000001708	ENSPREG00000001724	ENSPREG00000001732	ENSPREG00000001763	ENSPREG00000001850
Platyfish	MODERN SPECIES	9	ENSXMAG00000026831	MINDY4B (ENSXMAG00000014003)	tsen34 (ENSXMAG00000024266)	eif2a (ENSXMAG00000014008)	SERP1 (ENSXMAG00000014025)	mmp23bb (ENSXMAG00000014027)	polr2d (ENSXMAG00000014031)	ENSXMAG00000014037	ENSXMAG00000029286	ABCF3 (ENSXMAG00000014038)	LRCH3 (ENSXMAG00000014055)	rpl35a (ENSXMAG00000014075)	abcc5 (ENSXMAG00000014077)	rnpepl1 (ENSXMAG00000014126)	ENSXMAG00000027654	ENSXMAG00000014155 ##22	ENSXMAG00000014186	ENSXMAG00000014194	ENSXMAG00000014188	ENSXMAG00000014197	ENSXMAG00000029148	ENSXMAG00000027174	abcg1 (ENSXMAG00000014199)	spcs2 (ENSXMAG00000014237)	ENSXMAG00000025497	lipt2 (ENSXMAG00000013042)	pgm2l1 (ENSXMAG00000013046)	ENSXMAG00000023451	ENSXMAG00000019509	ENSXMAG00000030094	ENSXMAG00000024382
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	369									ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT01030000235136	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22
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Mummichog	MODERN SPECIES	1255														rnpepl1 (ENSFHEG00000012941)	ENSFHEG00000012949	ENSFHEG00000012975 ##22
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1615	DGKD (ENSNFUG00015003439)	ENSNFUG00015003425	MASP1 (ENSNFUG00015003420)	CLRN1 (ENSNFUG00015003418)	MINDY4B (ENSNFUG00015003413)	tsen34 (ENSNFUG00015003404)	EIF2A (ENSNFUG00015003375)	zgc:92744 (ENSNFUG00015003372)	MMP23BB (ENSNFUG00015003371)	polr2d (ENSNFUG00015003369)	ENSNFUG00015003368	ENSNFUG00015003367	ABCF3 (ENSNFUG00015003331)	LRCH3 (ENSNFUG00015003311)	rpl35a (ENSNFUG00015003307)	ENSNFUG00015003297 ##22	ENSNFUG00015003290	ENSNFUG00015003209	ENSNFUG00015003174	ENSNFUG00015003169	ENSNFUG00015003165	ENSNFUG00015003161	ENSNFUG00015003156	ENSNFUG00015003154	ENSNFUG00015003150	ENSNFUG00015003145	ARRB1 (ENSNFUG00015002135)	ENSNFUG00015001808	ATG16L2 (ENSNFUG00015001793)	mt-atp6 (ENSNFUG00015001778)	ANO7 (ENSNFUG00015001754)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.a	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b	ENSGT00940000167717	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT01030000235136	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00940000155435.B.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00940000160348	ENSGT00950000182985.a.b.b
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	64							ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00940000155435.B.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00440000038181	ENSGT00940000153680.b	ENSGT00390000006450
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	111												ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00940000155435.B.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00440000038181	ENSGT00940000153680.b	ENSGT00390000006450
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	97	ENSGT00560000077232.B.g.a	ENSGT00940000155350.g	ENSGT00940000156251.a	ENSGT00950000182988.a.b.a	ENSGT00530000063816.c.b	ENSGT00390000010063	ENSGT00940000158330	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00390000004912	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000159041	ENSGT00940000155435.B.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00440000038181	ENSGT00940000153680.b	ENSGT00390000006450
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1367				aqp11 (ENSAOCG00000007596)	clns1a (ENSAOCG00000000418)	ENSAOCG00000007529	LRCH3 (ENSAOCG00000007507)	ABCF3 (ENSAOCG00000007426)	ENSAOCG00000007356	ENSAOCG00000007342	polr2d (ENSAOCG00000007295)	rpl35a (ENSAOCG00000007269)	abcc5 (ENSAOCG00000007240)	rnpepl1 (ENSAOCG00000001967)	ENSAOCG00000007107	ENSAOCG00000007097 ##22	ap2m1b (ENSAOCG00000007028)	mmp23bb (ENSAOCG00000006964)	zgc:92744 (ENSAOCG00000006932)	eif2a (ENSAOCG00000006919)	tsen34 (ENSAOCG00000006905)	MINDY4B (ENSAOCG00000006871)	clrn1 (ENSAOCG00000006840)	MASP1 (ENSAOCG00000006825)
Orange clownfish	MODERN SPECIES	23	myo7aa (ENSAPEG00000018128)	GDPD4 (ENSAPEG00000018279)	pak1 (ENSAPEG00000018331)	aqp11 (ENSAPEG00000018404)	clns1a (ENSAPEG00000018416)	LRCH3 (ENSAPEG00000018498)	ABCF3 (ENSAPEG00000018567)	ENSAPEG00000018642	ENSAPEG00000018652	polr2d (ENSAPEG00000018714)	ENSAPEG00000018728	rpl35a (ENSAPEG00000018771)	abcc5 (ENSAPEG00000018801)	rnpepl1 (ENSAPEG00000018895)	ENSAPEG00000018951	ENSAPEG00000018966 ##22	ap2m1b (ENSAPEG00000019075)	mmp23bb (ENSAPEG00000019113)	zgc:92744 (ENSAPEG00000019137)	eif2a (ENSAPEG00000019145)	tsen34 (ENSAPEG00000019171)	MINDY4B (ENSAPEG00000019213)	clrn1 (ENSAPEG00000019249)	MASP1 (ENSAPEG00000019289)	ENSAPEG00000019359	DGKD (ENSAPEG00000019414)	ENSAPEG00000019474	sagb (ENSAPEG00000019499)	spcs2 (ENSAPEG00000019542)	rnf169 (ENSAPEG00000019558)	lipt2 (ENSAPEG00000019571)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	2386												rpl35a (ENSAPOG00000005979)	abcc5 (ENSAPOG00000005958)	rnpepl1 (ENSAPOG00000005878)	ENSAPOG00000005797	ENSAPOG00000005788 ##22
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	1534		ENSSPAG00000013474	ENSSPAG00000013457	aqp11 (ENSSPAG00000013426)	clns1a (ENSSPAG00000013399)	polr2d (ENSSPAG00000013386)	ENSSPAG00000013290	ENSSPAG00000013269	ABCF3 (ENSSPAG00000013145)	LRCH3 (ENSSPAG00000013100)	rpl35a (ENSSPAG00000013060)	ENSSPAG00000013044	abcc5 (ENSSPAG00000012992)	rnpepl1 (ENSSPAG00000012958)	ENSSPAG00000012944	ENSSPAG00000012866 ##22	ap2m1b (ENSSPAG00000012833)	mmp23bb (ENSSPAG00000012793)
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000159041	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT01030000235136	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000180004	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000167717	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.a	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.b.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.b.a.a.b	ENSGT00950000183023.B	ENSGT00940000158353
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000159041	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT01030000235136	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00940000171017.f	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00390000004912	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.b.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.b.a.a.b	ENSGT00950000183023.B	ENSGT00940000158353	ENSGT00390000006450	ENSGT00940000153680.b	ENSGT00440000038181	ENSGT00940000160131	ENSGT00950000183048.b.b.a.c.b.ab
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000159041.r	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT01030000235136	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00940000171017.f	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000155435.B.a	ENSGT01010000222847.b	ENSGT00950000183023.B	ENSGT00940000158353	ENSGT00390000006450	ENSGT00940000153680.b	ENSGT00440000038181	ENSGT00940000160131	ENSGT00950000183048.b.b.a.c.b.ab
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000159041.r	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072.c.b	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT01030000235136	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT01020000230608	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00940000171017.f	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000155435.B.a	ENSGT01010000222847.b	ENSGT00950000183023.B	ENSGT00940000158353	ENSGT00390000006450	ENSGT00940000153680.b	ENSGT00440000038181	ENSGT00940000160131	ENSGT00950000183048.b.b.a.c.b.ab
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT01030000234590.A.a.a	ENSGT00940000160348	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000159041.r	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072.c.b	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00940000171017.f	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00390000004912	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.a	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.b.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.b.a.a.b	ENSGT00940000155435.B.a	ENSGT01010000222847.b	ENSGT00950000183023.B	ENSGT00940000158353	ENSGT00390000006450
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT01030000234590.A.a.a	ENSGT00940000160348	ENSGT00940000153936.a	ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b	ENSGT00940000159041.r	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00950000183084.b.b	ENSGT00940000165072.c.b	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00940000171017.f	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000167717	ENSGT00390000018035	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.b.b	ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.b.a.a.b	ENSGT00940000155435.B.a	ENSGT01010000222847.b	ENSGT00950000183023.B	ENSGT00940000158353	ENSGT00390000006450
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1096	ENSMZEG00005002518	ENSMZEG00005002509	atg16l1 (ENSMZEG00005002443)	sagb (ENSMZEG00005002423)	DGKD (ENSMZEG00005002330)	tsen34 (ENSMZEG00005002313)	MINDY4B (ENSMZEG00005002294)	clrn1 (ENSMZEG00005002286)	MASP1 (ENSMZEG00005002267)	ENSMZEG00005002237	ABCF3 (ENSMZEG00005002173)	ENSMZEG00005002113	rpl35a (ENSMZEG00005002093)	abcc5 (ENSMZEG00005002058)	rnpepl1 (ENSMZEG00005002048)	ENSMZEG00005001966 ##22	mmp23bb (ENSMZEG00005001931)	zgc:92744 (ENSMZEG00005001918)	ENSMZEG00005001902	eif2a (ENSMZEG00005001832)	ENSMZEG00005001819	ENSMZEG00005001783	ENSMZEG00005001773	ENSMZEG00005001759	ENSMZEG00005001755	ENSMZEG00005001745	ENSMZEG00005001731	ENSMZEG00005001727	ENSMZEG00005001699	pgm2l1 (ENSMZEG00005001675)	lipt2 (ENSMZEG00005001668)
P. nyererei	MODERN SPECIES	613	atg16l1 (ENSPNYG00000023111)	sagb (ENSPNYG00000023148)	DGKD (ENSPNYG00000023183)	ENSPNYG00000023191	MINDY4B (ENSPNYG00000023193)	clrn1 (ENSPNYG00000023198)	ENSPNYG00000023200	ENSPNYG00000023202	ENSPNYG00000023207	ABCF3 (ENSPNYG00000023211)	ENSPNYG00000023220	rpl35a (ENSPNYG00000023240)	ENSPNYG00000023244	abcc5 (ENSPNYG00000023247)	rnpepl1 (ENSPNYG00000023257)	ENSPNYG00000023263 ##22	mmp23bb (ENSPNYG00000023270)	zgc:92744 (ENSPNYG00000023272)	eif2a (ENSPNYG00000023276)	ENSPNYG00000023283	ENSPNYG00000023288	ENSPNYG00000023293
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	838			DGKD (ENSHBUG00000016587)	tsen34 (ENSHBUG00000016593)	MINDY4B (ENSHBUG00000016616)	clrn1 (ENSHBUG00000016627)	MASP1 (ENSHBUG00000016638)	ENSHBUG00000016653	ABCF3 (ENSHBUG00000016701)	ENSHBUG00000016714	ENSHBUG00000016729	rpl35a (ENSHBUG00000016737)	abcc5 (ENSHBUG00000016951)	rnpepl1 (ENSHBUG00000017000)	ENSHBUG00000017008	ENSHBUG00000017110 ##22	mmp23bb (ENSHBUG00000017168)	zgc:92744 (ENSHBUG00000017184)	eif2a (ENSHBUG00000017252)	ENSHBUG00000017317	ENSHBUG00000017344
Nile tilapia	MODERN SPECIES	5	atg16l1 (ENSONIG00000017239)	sagb (ENSONIG00000017242)	DGKD (ENSONIG00000017245)	tsen34 (ENSONIG00000017253)	MINDY4B (ENSONIG00000017254)	ENSONIG00000033568	clrn1 (ENSONIG00000017256)	MASP1 (ENSONIG00000017257)	ENSONIG00000017263	ABCF3 (ENSONIG00000017264)	ENSONIG00000017268	rpl35a (ENSONIG00000028756)	ENSONIG00000033856	abcc5 (ENSONIG00000008285)	ENSONIG00000040474	ENSONIG00000017280 ##22	mmp23bb (ENSONIG00000017283)	zgc:92744 (ENSONIG00000030185)	eif2a (ENSONIG00000017284)	ENSONIG00000017290	ENSONIG00000039883	ENSONIG00000034727	ENSONIG00000017294	ENSONIG00000030906	rffl (ENSONIG00000037182)	eif4h (ENSONIG00000001042)	ANO7 (ENSONIG00000001045)	ENSONIG00000041381	ENSONIG00000032051	ece2b (ENSONIG00000001048)	ENSONIG00000036400
Midas cichlid	MODERN SPECIES	97																ENSACIG00000024100 ##22	ENSACIG00000024099	mmp23bb (ENSACIG00000024098)	zgc:92744 (ENSACIG00000024096)	eif2a (ENSACIG00000024095)	ENSACIG00000024093	ENSACIG00000024091	ENSACIG00000024090	AXL (ENSACIG00000024084)	LGALS4 (ENSACIG00000024079)	ENSACIG00000024074	rasgrp4 (ENSACIG00000024073)	HNRNPUL1 (ENSACIG00000024072)	opa3 (ENSACIG00000024071)	ppp1r13l (ENSACIG00000024070)	TMEM91 (ENSACIG00000024068)
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	255																ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT01100000263613 #24	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000159816	ENSGT00390000003738.a.a	ENSGT00390000004049	ENSGT00940000159866	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000161268	ENSGT00940000153249.b.c	ENSGT00930000151033
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	137	ENSGT00940000161268	ENSGT00940000165567	ENSGT00940000156022.a #15	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000161727
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	79	ENSGT00940000153249.b.c	ENSGT00940000161268	ENSGT00940000154035.a	ENSGT00940000165258	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00940000156022.a #15
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00960000192626	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000167797	ENSGT00940000155439	ENSGT00940000164682	ENSGT00940000161767	ENSGT00390000006294
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00960000192626	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000155604	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000167797	ENSGT00940000155439	ENSGT00940000164682	ENSGT00390000006294	ENSGT00390000018195
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	2					ENSGT00940000155604	ENSGT00940000160672	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000159816	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00390000004049	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000167797	ENSGT00940000155439	ENSGT00940000164682	ENSGT00390000006294	ENSGT00390000018195
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	2								ENSGT00940000155604	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00390000004049	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000167797	ENSGT00940000155439	ENSGT00940000164682	ENSGT00390000006294	ENSGT00390000018195
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	78								ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00390000004049	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b.e.b.b	ENSGT00530000063882.b.e.a	ENSGT00950000182903.a.b #22
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	179									ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00390000004049	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496.h	ENSGT00530000063882.b.e.a	ENSGT00950000182903.a.b #22
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	169										ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00390000004049.fb	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B.`b	ENSGT00530000063882.b.e.a	ENSGT00950000182903.a.b #22
Mainland tiger snake	DUPLICATION
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	664													NEURL4 (ENSNSUG00000015543)	ENSNSUG00000015771	ENSNSUG00000015772	ENSNSUG00000015773 #22
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	1712																ENSNSUG00000002897 #22
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	306									ENSPTXG00000011460	GPS2 (ENSPTXG00000011462)	NEURL4 (ENSPTXG00000011488)	ENSPTXG00000012322	ENSPTXG00000012325	ENSPTXG00000012327	ENSPTXG00000012329	DVL2 (ENSPTXG00000012335) #22
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	5570																DVL2 (ENSLLTG00000015378) #22
Lizard	MODERN SPECIES	229																ENSACAG00000011181 #22
Laterata	DUPLICATION
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000159372.i.a #17	ENSGT00940000159372.i.b.a #17	ENSGT00940000159372.i.b.b #17	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000160672	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000159816	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00390000004049	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b.c #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727.c.a.a	ENSGT00940000162799	ENSGT00960000191608	ENSGT01100000264186	ENSGT00940000160853	ENSGT00940000154435.z	ENSGT00390000000334	ENSGT00940000160598	ENSGT01050000244976.b.b.b.a.a.a	ENSGT00940000158058	ENSGT00940000158661	ENSGT00950000183121.a.a.a.b #36	ENSGT00950000183121.a.b #36
Common wall lizard	MODERN SPECIES	4	ENSPMRG00000011807	ENSPMRG00000011811 #17	ENSPMRG00000011816 #17	SLC16A11 (ENSPMRG00000011818)	ACAP1 (ENSPMRG00000011823) #18	CLDN7 (ENSPMRG00000011827)	SLC2A4 (ENSPMRG00000011830)	YBX2 (ENSPMRG00000011832)	ENSPMRG00000011836	GPS2 (ENSPMRG00000011843)	NEURL4 (ENSPMRG00000011857)	ENSPMRG00000011875	CTDNEP1 (ENSPMRG00000011878)	GABARAP (ENSPMRG00000011885)	PHF23 (ENSPMRG00000011891)	ENSPMRG00000011895 #22	ENSPMRG00000011901 #23	DLG4 (ENSPMRG00000011916)	ENSPMRG00000011968	KCTD11 (ENSPMRG00000011974)	ENSPMRG00000011978	ENSPMRG00000011982	ENSPMRG00000011987	ENSPMRG00000011990	ENSPMRG00000011994	ENSPMRG00000011996	NLGN2 (ENSPMRG00000011998)	ENSPMRG00000012000	ENSPMRG00000012007	TMEM102 (ENSPMRG00000012009)	FGF11 (ENSPMRG00000012011)
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	38	ENSSMRG00000003220	ENSSMRG00000003218 #17	ENSSMRG00000003217 #17	ENSSMRG00000003216 #17	ACAP1 (ENSSMRG00000003212) #18	CLDN7 (ENSSMRG00000003210)	SLC2A4 (ENSSMRG00000003207)	YBX2 (ENSSMRG00000003205)	ENSSMRG00000003202	GPS2 (ENSSMRG00000003191)	NEURL4 (ENSSMRG00000003181)	ENSSMRG00000003177	CTDNEP1 (ENSSMRG00000003176)	GABARAP (ENSSMRG00000003164)	PHF23 (ENSSMRG00000003160)	DVL2 (ENSSMRG00000003154) #22	ACADVL (ENSSMRG00000003140) #23	DLG4 (ENSSMRG00000003093)	ENSSMRG00000003081	ENSSMRG00000003075	KCTD11 (ENSSMRG00000003072)	ENSSMRG00000003062	ENSSMRG00000003059	ENSSMRG00000003054	TMEM256 (ENSSMRG00000003051)	NLGN2 (ENSSMRG00000003049)	TMEM102 (ENSSMRG00000003043)	FGF11 (ENSSMRG00000003042)	CHRNB1 (ENSSMRG00000002963)	ENSSMRG00000002956 #36	ENSSMRG00000002948 #36
Laterata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182903.a.b.d #22
Common wall lizard	MODERN SPECIES	243																ENSPMRG00000018999 #22
tuatara	MODERN SPECIES	1445	FGF11 (ENSSPUG00000018278)	NLGN2 (ENSSPUG00000018270)	CLDN7 (ENSSPUG00000018265)	ENSSPUG00000018261	ENSSPUG00000018257	ENSSPUG00000018254	YBX2 (ENSSPUG00000018250)	ENSSPUG00000018242	ENSSPUG00000018239	ENSSPUG00000018229	NEURL4 (ENSSPUG00000018200)	ENSSPUG00000018190	CTDNEP1 (ENSSPUG00000018176)	GABARAP (ENSSPUG00000018166)	PHF23 (ENSSPUG00000018155)	DVL2 (ENSSPUG00000018112) #22	ENSSPUG00000018078	ENSSPUG00000018072	DLG4 (ENSSPUG00000017968)	ENSSPUG00000017924	TMEM256 (ENSSPUG00000017919)	ENSSPUG00000017911 #18	SLC16A11 (ENSSPUG00000017904)	ENSSPUG00000017890 #17	ENSSPUG00000017841 #17	ATP1B2 (ENSSPUG00000017821)	ENSSPUG00000017810	ZBTB4 (ENSSPUG00000017808)	ENSSPUG00000017777	ENSSPUG00000017769
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00960000192626	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00940000164682	ENSGT00940000161767	ENSGT00390000006294	ENSGT00390000018195
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00960000192626	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00940000164682	ENSGT00940000161767	ENSGT00390000006294	ENSGT00390000018195
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000163166.b.a.b.b.b	ENSGT00950000185325	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00960000192626	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00940000164682	ENSGT00940000161767	ENSGT00390000006294	ENSGT00390000018195
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.a.b.b.b	ENSGT00950000185325	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00940000164682	ENSGT00390000006294	ENSGT00390000018195	ENSGT00940000165367
painted turtle	DUPLICATION
painted turtle	MODERN SPECIES	1126	ENSCPBG00000022178 #17	ENSCPBG00000022181 #17	ENSCPBG00000022184 #17	ACAP1 (ENSCPBG00000022194) #18	NEURL4 (ENSCPBG00000022251)	GPS2 (ENSCPBG00000022286)	ENSCPBG00000022287	YBX2 (ENSCPBG00000022288)	SLC2A4 (ENSCPBG00000022291)	CLDN7 (ENSCPBG00000022296)	ELP5 (ENSCPBG00000022298)	CTDNEP1 (ENSCPBG00000022300)	GABARAP (ENSCPBG00000022301)	ENSCPBG00000022303	ENSCPBG00000022305	ENSCPBG00000022307 #22	ENSCPBG00000022310 #22	ACADVL (ENSCPBG00000022314) #23
painted turtle	MODERN SPECIES	1126	ENSCPBG00000022181 #17	ENSCPBG00000022184 #17	ACAP1 (ENSCPBG00000022194) #18	NEURL4 (ENSCPBG00000022251)	GPS2 (ENSCPBG00000022286)	ENSCPBG00000022287	YBX2 (ENSCPBG00000022288)	SLC2A4 (ENSCPBG00000022291)	CLDN7 (ENSCPBG00000022296)	ELP5 (ENSCPBG00000022298)	CTDNEP1 (ENSCPBG00000022300)	GABARAP (ENSCPBG00000022301)	ENSCPBG00000022303	ENSCPBG00000022305	ENSCPBG00000022307 #22	ENSCPBG00000022310 #22	ACADVL (ENSCPBG00000022314) #23
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	362	TNFSF13 (ENSTMTG00000020639)	ENSTMTG00000020634	POLR2A (ENSTMTG00000020616)	TP53 (ENSTMTG00000020609)	ENSTMTG00000020605	ENSTMTG00000020598 #17	ENSTMTG00000020590 #17	ENSTMTG00000020585 #17	ENSTMTG00000020583	YBX2 (ENSTMTG00000020576)	ENSTMTG00000020561	ENSTMTG00000020557	CTDNEP1 (ENSTMTG00000020543)	ENSTMTG00000020532	ENSTMTG00000020527	DVL2 (ENSTMTG00000020523) #22
Chinese turtle	MODERN SPECIES	194	TP53 (ENSPSIG00000013302)	ENSPSIG00000013297 #15	BCL6B (ENSPSIG00000013071) #16	SLC16A13 (ENSPSIG00000012961) #17	ENSPSIG00000012957 #18	ENSPSIG00000012951 #18	NEURL4 (ENSPSIG00000012457)	GPS2 (ENSPSIG00000012441)	ENSPSIG00000012414	YBX2 (ENSPSIG00000012364)	SLC2A4 (ENSPSIG00000011968)	CLDN7 (ENSPSIG00000011946)	ELP5 (ENSPSIG00000011869)	CTDNEP1 (ENSPSIG00000011844)	PHF23 (ENSPSIG00000011810)	DVL2 (ENSPSIG00000011726) #22	ACADVL (ENSPSIG00000011582) #23	ENSPSIG00000001254	DLG4 (ENSPSIG00000011575)	ENSPSIG00000011537	KCTD11 (ENSPSIG00000001241)	ENSPSIG00000011526	PLSCR3 (ENSPSIG00000011418)	NLGN2 (ENSPSIG00000010559)	TMEM102 (ENSPSIG00000010488)	FGF11 (ENSPSIG00000010452)	ENSPSIG00000010147 #36	CHRNB1 (ENSPSIG00000009407)	ENSPSIG00000008844 #36	ENSPSIG00000008733	EIF4A1 (ENSPSIG00000008719)
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	58	ENSGT00390000000334	ENSGT00940000161755	ENSGT00940000162159	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b	ENSGT00390000010184	ENSGT00390000002148	ENSGT00390000000527	ENSGT01030000234590.B.a.b	ENSGT00390000009313
Theria	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00390000016066	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b	ENSGT00390000010184	ENSGT00390000002148
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00390000016066	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00390000016066	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00390000016066	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00390000016066	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b
Elephant	MODERN SPECIES	414	PLSCR3 (ENSLAFG00000031015)	TNK1 (ENSLAFG00000010519)	TMEM95 (ENSLAFG00000030785)	KCTD11 (ENSLAFG00000020557)	ACAP1 (ENSLAFG00000014924) #18	ENSLAFG00000030888	NEURL4 (ENSLAFG00000030118)	GPS2 (ENSLAFG00000020547)	ENSLAFG00000026475	YBX2 (ENSLAFG00000014006)	SLC2A4 (ENSLAFG00000014001)	ELP5 (ENSLAFG00000000748)	CTDNEP1 (ENSLAFG00000000746)	GABARAP (ENSLAFG00000000744)	PHF23 (ENSLAFG00000022349)	DVL2 (ENSLAFG00000021683) #22	ACADVL (ENSLAFG00000018641) #23	DLG4 (ENSLAFG00000018637)	ASGR1 (ENSLAFG00000018633)	ASGR2 (ENSLAFG00000015889)	ENSLAFG00000013636	SLC16A11 (ENSLAFG00000001191)	SLC16A13 (ENSLAFG00000001193) #17	BCL6B (ENSLAFG00000006642) #16	C17orf49 (ENSLAFG00000006639)	RNASEK (ENSLAFG00000020634)	ALOX12 (ENSLAFG00000004725)	ENSLAFG00000027821	ENSLAFG00000017224	PELP1 (ENSLAFG00000013717)	ARRB2 (ENSLAFG00000014386)
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	77							ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b	ENSGT00390000010184
Armadillo	MODERN SPECIES	3361							NEURL4 (ENSDNOG00000025485)	GPS2 (ENSDNOG00000044904)	ENSDNOG00000033912	YBX2 (ENSDNOG00000013746)	SLC2A4 (ENSDNOG00000013728)	CLDN7 (ENSDNOG00000045733)	ELP5 (ENSDNOG00000013687)	CTDNEP1 (ENSDNOG00000013673)	ENSDNOG00000011393	DVL2 (ENSDNOG00000023990) #22	ACADVL (ENSDNOG00000046949) #23	DLG4 (ENSDNOG00000001199)	ASGR1 (ENSDNOG00000008415)	ASGR2 (ENSDNOG00000043671)	CLEC10A (ENSDNOG00000019467)	SLC16A11 (ENSDNOG00000036613)	SLC16A13 (ENSDNOG00000043315) #17	BCL6B (ENSDNOG00000035586) #16	C17orf49 (ENSDNOG00000039235)	ENSDNOG00000023883	ALOX12 (ENSDNOG00000015512)	ALOX15 (ENSDNOG00000024854)	PELP1 (ENSDNOG00000010696)	ARRB2 (ENSDNOG00000034879)	MED11 (ENSDNOG00000025444)
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00900000143511	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00390000016066	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00900000143511	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000016066	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00900000143511	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00390000010184
Glires	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00900000143511	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00940000168661
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00900000143511	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00940000168661
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00900000143511	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727.b	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000161727.a	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	338	Neurl4 (ENSDORG00000000321)	Tmem256 (ENSDORG00000008651)	Plscr3 (ENSDORG00000008647)	Tnk1 (ENSDORG00000008646)	Tmem95 (ENSDORG00000000329)	Kctd11 (ENSDORG00000000326)	Acap1 (ENSDORG00000000323) #18	Gps2 (ENSDORG00000000318)	Eif5a (ENSDORG00000000315)	Ybx2 (ENSDORG00000010882)	Slc2a4 (ENSDORG00000010881)	Cldn7 (ENSDORG00000005235)	Elp5 (ENSDORG00000005233)	Ctdnep1 (ENSDORG00000005231)	Phf23 (ENSDORG00000005227)	Dvl2 (ENSDORG00000005221) #22	Acadvl (ENSDORG00000005215) #23	Dlg4 (ENSDORG00000029363)	Asgr1 (ENSDORG00000006793)	Asgr2 (ENSDORG00000012345)	Slc16a11 (ENSDORG00000005540)	Slc16a13 (ENSDORG00000005539) #17	Bcl6b (ENSDORG00000005538) #16	0610010K14Rik (ENSDORG00000005536)	Rnasek (ENSDORG00000023374)	Alox12 (ENSDORG00000005528)	ENSDORG00000015933	Pelp1 (ENSDORG00000013657)	Arrb2 (ENSDORG00000001356)	ENSDORG00000025701	Med11 (ENSDORG00000003293)
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00900000143511	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727.b	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000161727.a	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00900000143511	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727.b	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000161727.a	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00900000143511	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727.b	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000161727.a	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00900000143511	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727.b	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00940000168661
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b.k.a	ENSGT00390000003738.a.a.b.l	ENSGT00900000143511	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727.b	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b	ENSGT00390000010184
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	229	Tnk1 (ENSCGRG00001016895)	Tmem95 (ENSCGRG00001018271)	Kctd11 (ENSCGRG00001010083)	Acap1 (ENSCGRG00001021682) #18	2810408A11Rik (ENSCGRG00001007134)	Neurl4 (ENSCGRG00001004519)	Gps2 (ENSCGRG00001024581)	ENSCGRG00001022619	Ybx2 (ENSCGRG00001000751)	Slc2a4 (ENSCGRG00001014901)	Cldn7 (ENSCGRG00001017802)	Elp5 (ENSCGRG00001022354)	Ctdnep1 (ENSCGRG00001018299)	Gabarap (ENSCGRG00001022984)	Phf23 (ENSCGRG00001012022)	Dvl2 (ENSCGRG00001003711) #22	Acadvl (ENSCGRG00001012717) #23	Dlg4 (ENSCGRG00001023688)	Asgr1 (ENSCGRG00001018875)	Asgr2 (ENSCGRG00001021621)	ENSCGRG00001010936	ENSCGRG00001023521	ENSCGRG00001024648	Slc16a11 (ENSCGRG00001002856)	Slc16a13 (ENSCGRG00001023380) #17	Bcl6b (ENSCGRG00001013044) #16	0610010K14Rik (ENSCGRG00001013831)	Rnasek (ENSCGRG00001015323)	Alox12 (ENSCGRG00001015876)	Alox12e (ENSCGRG00001023570)	Pelp1 (ENSCGRG00001000840)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	406																ENSMAUG00000000497 #22
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727.b	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00940000168661
Prairie vole	MODERN SPECIES	15	Tnk1 (ENSMOCG00000015877)	Tmem95 (ENSMOCG00000012325)	Kctd11 (ENSMOCG00000002277)	Acap1 (ENSMOCG00000019117) #18	ENSMOCG00000012374	Neurl4 (ENSMOCG00000007919)	ENSMOCG00000018481	Eif5a (ENSMOCG00000017275)	Ybx2 (ENSMOCG00000013958)	Slc2a4 (ENSMOCG00000022395)	Cldn7 (ENSMOCG00000013341)	Elp5 (ENSMOCG00000015136)	Ctdnep1 (ENSMOCG00000020823)	Gabarap (ENSMOCG00000020064)	Phf23 (ENSMOCG00000008393)	Dvl2 (ENSMOCG00000013386) #22	Acadvl (ENSMOCG00000010073) #23	Dlg4 (ENSMOCG00000012746)	Asgr1 (ENSMOCG00000022069)	ENSMOCG00000001963	Asgr2 (ENSMOCG00000011407)	ENSMOCG00000004972	ENSMOCG00000020735	Slc16a11 (ENSMOCG00000019282)	Slc16a13 (ENSMOCG00000002637) #17	Bcl6b (ENSMOCG00000019797) #16	0610010K14Rik (ENSMOCG00000022728)	Rnasek (ENSMOCG00000022476)	Alox12 (ENSMOCG00000009911)	Alox12e (ENSMOCG00000006397)	ENSMOCG00000001938
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	21	Tnk1 (ENSPEMG00000019033)	Tmem95 (ENSPEMG00000019221)	Kctd11 (ENSPEMG00000006289)	Acap1 (ENSPEMG00000001348) #18	2810408A11Rik (ENSPEMG00000019019)	Neurl4 (ENSPEMG00000008124)	Gps2 (ENSPEMG00000009124)	ENSPEMG00000017457	Ybx2 (ENSPEMG00000018382)	ENSPEMG00000019078	Cldn7 (ENSPEMG00000025686)	ENSPEMG00000031352	Ctdnep1 (ENSPEMG00000008546)	Gabarap (ENSPEMG00000028299)	Phf23 (ENSPEMG00000016623)	Dvl2 (ENSPEMG00000013323) #22	ENSPEMG00000017590 #23	Dlg4 (ENSPEMG00000010669)	Asgr1 (ENSPEMG00000015766)	Asgr2 (ENSPEMG00000016855)	ENSPEMG00000012334	ENSPEMG00000016916	Slc16a11 (ENSPEMG00000008237)	Slc16a13 (ENSPEMG00000007251) #17	Bcl6b (ENSPEMG00000016932) #16	0610010K14Rik (ENSPEMG00000018977)	Rnasek (ENSPEMG00000026507)	Alox12 (ENSPEMG00000007278)	ENSPEMG00000028174	Alox15 (ENSPEMG00000006217)	Pelp1 (ENSPEMG00000008891)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727.b	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000161727.a	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225
Mus	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727.b	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036.h	ENSGT00940000161727.a	ENSGT00940000162036.g	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b.m	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727.b	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036.h	ENSGT00940000161727.a	ENSGT00940000162036.g	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b.m	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727.b	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036.h	ENSGT00940000161727.a	ENSGT00940000162036.g	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b.m	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727.b	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036.h	ENSGT00940000161727.a	ENSGT00940000162036.g	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807
spretus	MODERN SPECIES	2	Tnk1 (MGP_SPRETEiJ_G0017434)	Tmem95 (MGP_SPRETEiJ_G0017435)	Kctd11 (MGP_SPRETEiJ_G0017436)	Acap1 (MGP_SPRETEiJ_G0017437) #18	2810408A11Rik (MGP_SPRETEiJ_G0017438)	Neurl4 (MGP_SPRETEiJ_G0017439)	Gps2 (MGP_SPRETEiJ_G0017440)	Eif5a (MGP_SPRETEiJ_G0017441)	Ybx2 (MGP_SPRETEiJ_G0017442)	Slc2a4 (MGP_SPRETEiJ_G0017443)	Cldn7 (MGP_SPRETEiJ_G0017444)	Elp5 (MGP_SPRETEiJ_G0017445)	Ctdnep1 (MGP_SPRETEiJ_G0017446)	Gabarap (MGP_SPRETEiJ_G0017447)	Phf23 (MGP_SPRETEiJ_G0017448)	Dvl2 (MGP_SPRETEiJ_G0017449) #22	Acadvl (MGP_SPRETEiJ_G0017450) #23	Dlg4 (MGP_SPRETEiJ_G0017451)	Asgr1 (MGP_SPRETEiJ_G0017452)	Asgr2 (MGP_SPRETEiJ_G0017453)	MGP_SPRETEiJ_G0017454	Clec10a (MGP_SPRETEiJ_G0017455)	Slc16a11 (MGP_SPRETEiJ_G0017456)	Slc16a13 (MGP_SPRETEiJ_G0017457) #17	Bcl6b (MGP_SPRETEiJ_G0017458) #16	0610010K14Rik (MGP_SPRETEiJ_G0017459)	MGP_SPRETEiJ_G0017460	MGP_SPRETEiJ_G0017461	Alox12 (MGP_SPRETEiJ_G0017462)	Alox12e (MGP_SPRETEiJ_G0017463)	Alox15 (MGP_SPRETEiJ_G0017464)
Steppe mouse	MODERN SPECIES	2655											Cldn7 (ENSMSIG00000019075)	Elp5 (ENSMSIG00000019096)	ENSMSIG00000019119	ENSMSIG00000019179	Phf23 (ENSMSIG00000019212)	Dvl2 (ENSMSIG00000019225) #22	Acadvl (ENSMSIG00000019318) #23	Dlg4 (ENSMSIG00000019442)	Asgr1 (ENSMSIG00000019751)	Asgr2 (ENSMSIG00000019851)	Clec10a (ENSMSIG00000019875)	ENSMSIG00000019908	ENSMSIG00000019917	Slc16a13 (ENSMSIG00000019931) #17	Bcl6b (ENSMSIG00000019940) #16	0610010K14Rik (ENSMSIG00000019980)	Rnasek (ENSMSIG00000020112)	Alox12 (ENSMSIG00000020125)	Alox12e (ENSMSIG00000020169)	Alox15 (ENSMSIG00000020209)	Pelp1 (ENSMSIG00000020241)
Mouse	MODERN SPECIES	2	Tnk1 (ENSMUSG00000001583)	Tmem95 (ENSMUSG00000094845)	Kctd11 (ENSMUSG00000046731)	Acap1 (ENSMUSG00000001588) #18	2810408A11Rik (ENSMUSG00000018570)	Neurl4 (ENSMUSG00000047284)	Gps2 (ENSMUSG00000023170)	Eif5a (ENSMUSG00000078812)	Ybx2 (ENSMUSG00000018554)	Slc2a4 (ENSMUSG00000018566)	Cldn7 (ENSMUSG00000018569)	Elp5 (ENSMUSG00000018565)	Ctdnep1 (ENSMUSG00000018559)	Gabarap (ENSMUSG00000018567)	Phf23 (ENSMUSG00000018572)	Dvl2 (ENSMUSG00000020888) #22	Acadvl (ENSMUSG00000018574) #23	Dlg4 (ENSMUSG00000020886)	Asgr1 (ENSMUSG00000020884)	Asgr2 (ENSMUSG00000040963)	Mgl2 (ENSMUSG00000040950)	Clec10a (ENSMUSG00000000318)	Slc16a11 (ENSMUSG00000040938)	Slc16a13 (ENSMUSG00000044367) #17	Bcl6b (ENSMUSG00000000317) #16	0610010K14Rik (ENSMUSG00000020831)	Rnasek (ENSMUSG00000093989)	Alox12 (ENSMUSG00000000320)	Alox12e (ENSMUSG00000018907)	Alox15 (ENSMUSG00000018924)	Pelp1 (ENSMUSG00000018921)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	2	Tnk1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016598)	Tmem95 (MGP_CAROLIEiJ_G0016599)	Kctd11 (MGP_CAROLIEiJ_G0016600)	Acap1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016601) #18	2810408A11Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0016602)	Neurl4 (MGP_CAROLIEiJ_G0016603)	Gps2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016604)	Eif5a (MGP_CAROLIEiJ_G0016605)	Ybx2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016606)	Slc2a4 (MGP_CAROLIEiJ_G0016607)	Cldn7 (MGP_CAROLIEiJ_G0016608)	Elp5 (MGP_CAROLIEiJ_G0016609)	MGP_CAROLIEiJ_G0016610	Gabarap (MGP_CAROLIEiJ_G0016611)	Phf23 (MGP_CAROLIEiJ_G0016612)	Dvl2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016613) #22	Acadvl (MGP_CAROLIEiJ_G0016614) #23	Dlg4 (MGP_CAROLIEiJ_G0016615)	Asgr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016616)	Asgr2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016617)	MGP_CAROLIEiJ_G0016618	MGP_CAROLIEiJ_G0016619	Slc16a11 (MGP_CAROLIEiJ_G0016620)	Slc16a13 (MGP_CAROLIEiJ_G0016621) #17	Bcl6b (MGP_CAROLIEiJ_G0016622) #16	0610010K14Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0016624)	MGP_CAROLIEiJ_G0016623	MGP_CAROLIEiJ_G0016625	Alox12 (MGP_CAROLIEiJ_G0016626)	Alox12e (MGP_CAROLIEiJ_G0016627)	Alox15 (MGP_CAROLIEiJ_G0016628)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	5	Tnk1 (MGP_PahariEiJ_G0017729)	Tmem95 (MGP_PahariEiJ_G0017730)	Kctd11 (MGP_PahariEiJ_G0017731)	Acap1 (MGP_PahariEiJ_G0017732) #18	2810408A11Rik (MGP_PahariEiJ_G0017733)	Neurl4 (MGP_PahariEiJ_G0017734)	Gps2 (MGP_PahariEiJ_G0017735)	Eif5a (MGP_PahariEiJ_G0017736)	Ybx2 (MGP_PahariEiJ_G0017737)	Slc2a4 (MGP_PahariEiJ_G0017738)	Cldn7 (MGP_PahariEiJ_G0017739)	Elp5 (MGP_PahariEiJ_G0017740)	Ctdnep1 (MGP_PahariEiJ_G0017741)	Gabarap (MGP_PahariEiJ_G0017742)	Phf23 (MGP_PahariEiJ_G0017743)	Dvl2 (MGP_PahariEiJ_G0017744) #22	Acadvl (MGP_PahariEiJ_G0017745) #23	Dlg4 (MGP_PahariEiJ_G0017746)	Asgr1 (MGP_PahariEiJ_G0017747)	Asgr2 (MGP_PahariEiJ_G0017748)	MGP_PahariEiJ_G0017749	Clec10a (MGP_PahariEiJ_G0017750)	Slc16a11 (MGP_PahariEiJ_G0017751)	Slc16a13 (MGP_PahariEiJ_G0017752) #17	Bcl6b (MGP_PahariEiJ_G0017753) #16	0610010K14Rik (MGP_PahariEiJ_G0017755)	MGP_PahariEiJ_G0017754	MGP_PahariEiJ_G0017756	Alox12 (MGP_PahariEiJ_G0017757)	Alox12e (MGP_PahariEiJ_G0017758)	Alox15 (MGP_PahariEiJ_G0017759)
Rat	MODERN SPECIES	1	Kctd11 (ENSRNOG00000015669)	Tmem95 (ENSRNOG00000043507)	Acap1 (ENSRNOG00000015674) #18	LOC497940 (ENSRNOG00000015975)	Neurl4 (ENSRNOG00000016109)	Gps2 (ENSRNOG00000016360)	Eif5a (ENSRNOG00000016478)	Ybx2 (ENSRNOG00000017117)	Slc2a4 (ENSRNOG00000017226)	AABR07029863.4 (ENSRNOG00000061193)	Cldn7 (ENSRNOG00000017325)	Elp5 (ENSRNOG00000027628)	Ctdnep1 (ENSRNOG00000017352)	Gabarap (ENSRNOG00000017417)	Phf23 (ENSRNOG00000017657)	Dvl2 (ENSRNOG00000017915) #22	Acadvl (ENSRNOG00000018114) #23	Dlg4 (ENSRNOG00000018526)	Asgr1 (ENSRNOG00000018693)	Asgr2 (ENSRNOG00000030726)	Clec10a (ENSRNOG00000018715)	Slc16a13 (ENSRNOG00000018785) #17	Slc16a11 (ENSRNOG00000018748)	Bcl6b (ENSRNOG00000059956) #16	RGD1308134 (ENSRNOG00000018829)	Alox12 (ENSRNOG00000027037)	Alox12e (ENSRNOG00000019074)	Alox15 (ENSRNOG00000019183)	Pelp1 (ENSRNOG00000019268)	Arrb2 (ENSRNOG00000019308)	Med11 (ENSRNOG00000019384)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1746	Tnk1 (ENSNGAG00000021925)	Tmem95 (ENSNGAG00000022940)	Kctd11 (ENSNGAG00000010241)	Acap1 (ENSNGAG00000019699) #18	2810408A11Rik (ENSNGAG00000020654)	Neurl4 (ENSNGAG00000023441)	Gps2 (ENSNGAG00000010025)	Eif5a (ENSNGAG00000011003)	Ybx2 (ENSNGAG00000011707)	Slc2a4 (ENSNGAG00000013748)	Cldn7 (ENSNGAG00000015141)	Elp5 (ENSNGAG00000016691)	Ctdnep1 (ENSNGAG00000018537)	Gabarap (ENSNGAG00000019179)	Phf23 (ENSNGAG00000019840)	Dvl2 (ENSNGAG00000021399) #22	Acadvl (ENSNGAG00000009001) #23	Dlg4 (ENSNGAG00000014371)	Asgr1 (ENSNGAG00000022038)	Asgr2 (ENSNGAG00000023552)	ENSNGAG00000024124	Slc16a13 (ENSNGAG00000024247) #17	Slc16a11 (ENSNGAG00000024329)	Bcl6b (ENSNGAG00000017106) #16	0610010K14Rik (ENSNGAG00000019863)	Rnasek (ENSNGAG00000021419)	Alox12 (ENSNGAG00000021693)	ENSNGAG00000021978	Alox12e (ENSNGAG00000022388)	ENSNGAG00000000876	Pelp1 (ENSNGAG00000011496)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	168	Tnk1 (ENSJJAG00000021919)	Tmem95 (ENSJJAG00000000201)	Kctd11 (ENSJJAG00000013654)	Acap1 (ENSJJAG00000000486) #18	2810408A11Rik (ENSJJAG00000002636)	Neurl4 (ENSJJAG00000008773)	Gps2 (ENSJJAG00000011156)	Eif5a (ENSJJAG00000011834)	Ybx2 (ENSJJAG00000013072)	Slc2a4 (ENSJJAG00000013398)	Cldn7 (ENSJJAG00000023638)	Elp5 (ENSJJAG00000000138)	Ctdnep1 (ENSJJAG00000000567)	Gabarap (ENSJJAG00000002820)	Phf23 (ENSJJAG00000003815)	Dvl2 (ENSJJAG00000005340) #22	Acadvl (ENSJJAG00000010548) #23	Dlg4 (ENSJJAG00000012014)	Asgr1 (ENSJJAG00000013892)	ENSJJAG00000014250
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b	ENSGT00390000010184
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	12	ENSHGLG00000049999	SPEM2 (ENSHGLG00000009650)	NLGN2 (ENSHGLG00000041822)	TMEM256 (ENSHGLG00000018691)	PLSCR3 (ENSHGLG00000019015)	KCTD11 (ENSHGLG00000047152)	ENSHGLG00000018261	GPS2 (ENSHGLG00000011192)	ENSHGLG00000014186	ENSHGLG00000044131	SLC2A4 (ENSHGLG00000013185)	CLDN7 (ENSHGLG00000011140)	ELP5 (ENSHGLG00000041587)	CTDNEP1 (ENSHGLG00000016839)	GABARAP (ENSHGLG00000037772)	DVL2 (ENSHGLG00000009952) #22	ACADVL (ENSHGLG00000011018) #23	DLG4 (ENSHGLG00000010073)	ASGR1 (ENSHGLG00000011616)	ENSHGLG00000009539	ENSHGLG00000034256	ENSHGLG00000039896	ENSHGLG00000045230	ENSHGLG00000010039	ENSHGLG00000010750	RNASEK (ENSHGLG00000012296)	C17orf49 (ENSHGLG00000009897)	BCL6B (ENSHGLG00000013098) #16	ENSHGLG00000012038	ENSHGLG00000040120	ENSHGLG00000047766
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b	ENSGT00390000010184
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b	ENSGT00390000010184
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	174	PLSCR3 (ENSCLAG00000014430)	TNK1 (ENSCLAG00000012522)	TMEM95 (ENSCLAG00000013396)	ACAP1 (ENSCLAG00000011835) #18	ENSCLAG00000013536	NEURL4 (ENSCLAG00000014798)	GPS2 (ENSCLAG00000012750)	ENSCLAG00000013712	YBX2 (ENSCLAG00000010306)	SLC2A4 (ENSCLAG00000014647)	ELP5 (ENSCLAG00000014750)	CLDN7 (ENSCLAG00000015583)	CTDNEP1 (ENSCLAG00000011085)	GABARAP (ENSCLAG00000007883)	PHF23 (ENSCLAG00000007184)	DVL2 (ENSCLAG00000008610) #22	ACADVL (ENSCLAG00000009521) #23	DLG4 (ENSCLAG00000010331)	ASGR1 (ENSCLAG00000012374)	ASGR2 (ENSCLAG00000007744)	CLEC10A (ENSCLAG00000007810)	SLC16A11 (ENSCLAG00000010002)	SLC16A13 (ENSCLAG00000013278) #17	BCL6B (ENSCLAG00000014925) #16	C17orf49 (ENSCLAG00000009875)	RNASEK (ENSCLAG00000008824)	ALOX12 (ENSCLAG00000009075)	ENSCLAG00000008230	PELP1 (ENSCLAG00000009775)	ARRB2 (ENSCLAG00000011239)	MED11 (ENSCLAG00000010821)
Degu	MODERN SPECIES	139	ENSODEG00000020426	TMEM95 (ENSODEG00000017467)	KCTD11 (ENSODEG00000020512)	ACAP1 (ENSODEG00000017479) #18	NEURL4 (ENSODEG00000017430)	GPS2 (ENSODEG00000017752)	ENSODEG00000017377	YBX2 (ENSODEG00000017530)	SLC2A4 (ENSODEG00000017582)	ENSODEG00000020514	CLDN7 (ENSODEG00000017387)	ELP5 (ENSODEG00000017304)	ENSODEG00000017490	GABARAP (ENSODEG00000017476)	PHF23 (ENSODEG00000017333)	DVL2 (ENSODEG00000017448) #22	ACADVL (ENSODEG00000017418) #23	DLG4 (ENSODEG00000017252)	ASGR1 (ENSODEG00000017268)	ENSODEG00000020478	ASGR2 (ENSODEG00000017289)	ENSODEG00000017527	CLEC10A (ENSODEG00000017450)	ENSODEG00000017420	SLC16A11 (ENSODEG00000017518)	SLC16A13 (ENSODEG00000017767) #17	BCL6B (ENSODEG00000017360) #16	ENSODEG00000017485	RNASEK (ENSODEG00000017378)	ALOX12 (ENSODEG00000017256)	ENSODEG00000017037
Guinea pig	MODERN SPECIES	61	PLSCR3 (ENSCPOG00000009287)	TNK1 (ENSCPOG00000009564)	TMEM95 (ENSCPOG00000033494)	ACAP1 (ENSCPOG00000009885) #18	ENSCPOG00000021214	NEURL4 (ENSCPOG00000009550)	GPS2 (ENSCPOG00000035566)	ENSCPOG00000038013	YBX2 (ENSCPOG00000009543)	SLC2A4 (ENSCPOG00000031830)	CLDN7 (ENSCPOG00000020951)	ELP5 (ENSCPOG00000032736)	CTDNEP1 (ENSCPOG00000037721)	ENSCPOG00000012853	PHF23 (ENSCPOG00000033111)	DVL2 (ENSCPOG00000023401) #22	ACADVL (ENSCPOG00000020114) #23	DLG4 (ENSCPOG00000020815)	ASGR1 (ENSCPOG00000009813)	ASGR2 (ENSCPOG00000039341)	ENSCPOG00000009682	SLC16A13 (ENSCPOG00000030718) #17	SLC16A11 (ENSCPOG00000005851)	BCL6B (ENSCPOG00000004066) #16	C17orf49 (ENSCPOG00000004065)	RNASEK (ENSCPOG00000004064)	ALOX12 (ENSCPOG00000004058)	ENSCPOG00000025306	PELP1 (ENSCPOG00000000208)	ARRB2 (ENSCPOG00000032406)	MED11 (ENSCPOG00000035175)
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162945	ENSGT00940000162835	ENSGT00940000163303
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162945	ENSGT00940000162835	ENSGT00940000163303
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	77	TNK1 (ENSUPAG00010014874)	TMEM95 (ENSUPAG00010014860)	KCTD11 (ENSUPAG00010014856)	ACAP1 (ENSUPAG00010014808) #18	ENSUPAG00010014750	NEURL4 (ENSUPAG00010014532)	GPS2 (ENSUPAG00010014484)	ENSUPAG00010014451	YBX2 (ENSUPAG00010014438)	SLC2A4 (ENSUPAG00010014416)	CLDN7 (ENSUPAG00010014405)	ELP5 (ENSUPAG00010014373)	CTDNEP1 (ENSUPAG00010014358)	GABARAP (ENSUPAG00010014341)	PHF23 (ENSUPAG00010014321)	DVL2 (ENSUPAG00010014286) #22	ACADVL (ENSUPAG00010014220) #23	DLG4 (ENSUPAG00010014047)	ASGR1 (ENSUPAG00010013997)	ASGR2 (ENSUPAG00010013970)	CLEC10A (ENSUPAG00010013954)
Squirrel	MODERN SPECIES	195	TNK1 (ENSSTOG00000007672)	TMEM95 (ENSSTOG00000030735)	KCTD11 (ENSSTOG00000022117)	ACAP1 (ENSSTOG00000007588) #18	ENSSTOG00000024856	NEURL4 (ENSSTOG00000007523)	GPS2 (ENSSTOG00000020716)	ENSSTOG00000020652	YBX2 (ENSSTOG00000008630)	SLC2A4 (ENSSTOG00000008616)	CLDN7 (ENSSTOG00000001197)	ELP5 (ENSSTOG00000001194)	CTDNEP1 (ENSSTOG00000020211)	GABARAP (ENSSTOG00000024711)	PHF23 (ENSSTOG00000022541)	DVL2 (ENSSTOG00000008603) #22	ACADVL (ENSSTOG00000008582) #23	DLG4 (ENSSTOG00000008559)	ASGR1 (ENSSTOG00000008541)	ENSSTOG00000029607	ASGR2 (ENSSTOG00000027578)	SLC16A11 (ENSSTOG00000024724)	SLC16A13 (ENSSTOG00000025634) #17	BCL6B (ENSSTOG00000006365) #16	C17orf49 (ENSSTOG00000023220)	RNASEK (ENSSTOG00000006350)	ALOX12 (ENSSTOG00000006319)	ENSSTOG00000010664	ENSSTOG00000028642	OR3A1 (ENSSTOG00000020842)	ENSSTOG00000025587
Alpin marmot	MODERN SPECIES	92	TNK1 (ENSMMMG00000019484)	TMEM95 (ENSMMMG00000019482)	KCTD11 (ENSMMMG00000019479)	ACAP1 (ENSMMMG00000019466) #18	ENSMMMG00000019415	NEURL4 (ENSMMMG00000019309)	GPS2 (ENSMMMG00000019304)	ENSMMMG00000019282	YBX2 (ENSMMMG00000019268)	SLC2A4 (ENSMMMG00000019260)	CLDN7 (ENSMMMG00000019254)	ELP5 (ENSMMMG00000019251)	CTDNEP1 (ENSMMMG00000019241)	GABARAP (ENSMMMG00000019236)	PHF23 (ENSMMMG00000019227)	DVL2 (ENSMMMG00000019219) #22	ACADVL (ENSMMMG00000019195) #23	DLG4 (ENSMMMG00000018940)	ASGR1 (ENSMMMG00000018913)	ASGR2 (ENSMMMG00000018905)	ENSMMMG00000018884	SLC16A11 (ENSMMMG00000018851)	SLC16A13 (ENSMMMG00000018850) #17	BCL6B (ENSMMMG00000018844) #16	C17orf49 (ENSMMMG00000018813)	RNASEK (ENSMMMG00000018806)	ALOX12 (ENSMMMG00000018784)	ENSMMMG00000018739	ENSMMMG00000018732	OR3A1 (ENSMMMG00000018718)	ENSMMMG00000018712
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	12	PLSCR3 (ENSSVLG00005006852)	TNK1 (ENSSVLG00005006897)	TMEM95 (ENSSVLG00005006999)	KCTD11 (ENSSVLG00005007059)	ACAP1 (ENSSVLG00005007080) #18	ENSSVLG00005007180	NEURL4 (ENSSVLG00005007333)	GPS2 (ENSSVLG00005007679)	ENSSVLG00005007756	SLC2A4 (ENSSVLG00005007987)	CLDN7 (ENSSVLG00005008134)	ELP5 (ENSSVLG00005008205)	CTDNEP1 (ENSSVLG00005008230)	ENSSVLG00005008294	PHF23 (ENSSVLG00005008326)	DVL2 (ENSSVLG00005008374) #22	ACADVL (ENSSVLG00005008422) #23	DLG4 (ENSSVLG00005008616)	ASGR1 (ENSSVLG00005008890)	ASGR2 (ENSSVLG00005009019)	ENSSVLG00005009098	ENSSVLG00005009269	SLC16A11 (ENSSVLG00005009286)	SLC16A13 (ENSSVLG00005009320) #17	BCL6B (ENSSVLG00005009352) #16	C17orf49 (ENSSVLG00005009498)	RNASEK (ENSSVLG00005009408)	ALOX12 (ENSSVLG00005009559)	ENSSVLG00005009598	ENSSVLG00005009686	ENSSVLG00005009703
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b	ENSGT00390000010184	ENSGT00390000002148
Rabbit	MODERN SPECIES	10	ENSOCUG00000005534	PLSCR3 (ENSOCUG00000000983)	TNK1 (ENSOCUG00000025052)	TMEM95 (ENSOCUG00000021294)	ACAP1 (ENSOCUG00000015300) #18	ENSOCUG00000032904	GPS2 (ENSOCUG00000024249)	ENSOCUG00000015255	YBX2 (ENSOCUG00000015064)	SLC2A4 (ENSOCUG00000015240)	CLDN7 (ENSOCUG00000007002)	ELP5 (ENSOCUG00000007000)	CTDNEP1 (ENSOCUG00000027494)	GABARAP (ENSOCUG00000006997)	PHF23 (ENSOCUG00000006990)	DVL2 (ENSOCUG00000006978) #22	ACADVL (ENSOCUG00000006966) #23	DLG4 (ENSOCUG00000025772)	ASGR1 (ENSOCUG00000025713)	ASGR2 (ENSOCUG00000024115)	SLC16A11 (ENSOCUG00000007017)	SLC16A13 (ENSOCUG00000007013) #17	C17orf49 (ENSOCUG00000025664)	RNASEK (ENSOCUG00000032834)	ALOX12 (ENSOCUG00000021659)	ALOX15 (ENSOCUG00000022477)	PELP1 (ENSOCUG00000014885)	ZMYND15 (ENSOCUG00000015179)	ENSOCUG00000027827	ENSOCUG00000002750	ENSOCUG00000036572
Primates	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B.eb.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664.p.a	ENSGT00390000016066	ENSGT00390000009664.o	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000161755	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B.eb.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664.p.a	ENSGT00390000016066	ENSGT00390000009664.o	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000161755	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B.eb.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664.p.a	ENSGT00390000016066	ENSGT00390000009664.o	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00950000182894.C
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000161755	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049.bb	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B.eb.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664.p.a	ENSGT00390000016066	ENSGT00390000009664.o	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00950000182894.C
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000161755	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049.bb	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B.eb.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664.o	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00950000182894.C	ENSGT00510000048837	ENSGT00530000063869.A
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Pan	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000161755	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049.bb	ENSGT00390000003738.a.a.b.y.a	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210.i	ENSGT01040000240503.B.eb.a.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664.o	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00950000182894.C	ENSGT00510000048837	ENSGT00530000063869.A
Chimpanzee	MODERN SPECIES	8	NLGN2 (ENSPTRG00000008684)	TMEM256 (ENSPTRG00000030987)	PLSCR3 (ENSPTRG00000008683)	TNK1 (ENSPTRG00000008681)	TMEM95 (ENSPTRG00000008680)	KCTD11 (ENSPTRG00000008679)	ACAP1 (ENSPTRG00000033884) #18	GPS2 (ENSPTRG00000023046)	NEURL4 (ENSPTRG00000033982)	EIF5A (ENSPTRG00000008674)	CLDN7 (ENSPTRG00000008671)	ENSPTRG00000039212	CTDNEP1 (ENSPTRG00000008668)	GABARAP (ENSPTRG00000034115)	PHF23 (ENSPTRG00000008666)	DVL2 (ENSPTRG00000008665) #22	ACADVL (ENSPTRG00000008664) #23	DLG4 (ENSPTRG00000008663)	ASGR1 (ENSPTRG00000008662)	ASGR2 (ENSPTRG00000008661)	CLEC10A (ENSPTRG00000008659)	SLC16A11 (ENSPTRG00000008658)	SLC16A13 (ENSPTRG00000008657) #17	BCL6B (ENSPTRG00000008656) #16	RNASEK (ENSPTRG00000030994)	C17H17orf49 (ENSPTRG00000008655)	ALOX12 (ENSPTRG00000008653)	ENSPTRG00000044326	ENSPTRG00000022143	TEKT1 (ENSPTRG00000008651)	FBXO39 (ENSPTRG00000008650)
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Gorilla	MODERN SPECIES	8	ENSGGOG00000040573	ENSGGOG00000039735	ENSGGOG00000042434	ENSGGOG00000038897	ENSGGOG00000001685 #18	NEURL4 (ENSGGOG00000001677)	GPS2 (ENSGGOG00000001672)	EIF5A (ENSGGOG00000012032)	YBX2 (ENSGGOG00000007399)	SLC2A4 (ENSGGOG00000007389)	CLDN7 (ENSGGOG00000025438)	ELP5 (ENSGGOG00000025027)	CTDNEP1 (ENSGGOG00000013777)	GABARAP (ENSGGOG00000013770)	PHF23 (ENSGGOG00000005820)	DVL2 (ENSGGOG00000006765) #22	ACADVL (ENSGGOG00000006756) #23	DLG4 (ENSGGOG00000006737)	ASGR1 (ENSGGOG00000008200)	ASGR2 (ENSGGOG00000013515)	SLC16A11 (ENSGGOG00000001277)	SLC16A13 (ENSGGOG00000001274) #17	BCL6B (ENSGGOG00000009787) #16	ENSGGOG00000009778	ENSGGOG00000009783	ALOX12 (ENSGGOG00000009757)	ENSGGOG00000015890	TEKT1 (ENSGGOG00000015262)	FBXO39 (ENSGGOG00000023510)	XAF1 (ENSGGOG00000012268)	SLC13A5 (ENSGGOG00000000254)
Orangutan	MODERN SPECIES	8	PLSCR3 (ENSPPYG00000007914)	TNK1 (ENSPPYG00000007913)	ENSPPYG00000007912	KCTD11 (ENSPPYG00000040408)	ACAP1 (ENSPPYG00000007909) #18	NEURL4 (ENSPPYG00000007908)	GPS2 (ENSPPYG00000035492)	ENSPPYG00000007907	ENSPPYG00000034206	SLC2A4 (ENSPPYG00000007905)	CLDN7 (ENSPPYG00000007904)	ELP5 (ENSPPYG00000007903)	CTDNEP1 (ENSPPYG00000007902)	GABARAP (ENSPPYG00000007901)	PHF23 (ENSPPYG00000007900)	DVL2 (ENSPPYG00000007899) #22	ACADVL (ENSPPYG00000007898) #23	DLG4 (ENSPPYG00000007897)	ASGR1 (ENSPPYG00000007896)	ASGR2 (ENSPPYG00000007895)	CLEC10A (ENSPPYG00000007894)	SLC16A11 (ENSPPYG00000007893)	SLC16A13 (ENSPPYG00000007892) #17	BCL6B (ENSPPYG00000007891) #16	C17orf49 (ENSPPYG00000007890)	ENSPPYG00000007889	ALOX12 (ENSPPYG00000007882)	TEKT1 (ENSPPYG00000007886)	FBXO39 (ENSPPYG00000007885)	XAF1 (ENSPPYG00000007884)	SLC13A5 (ENSPPYG00000007883)
Gibbon	MODERN SPECIES	144										ENSNLEG00000008063	SLC2A4 (ENSNLEG00000008058)	ENSNLEG00000008054	ENSNLEG00000008053	ENSNLEG00000035429	GABARAP (ENSNLEG00000028899)	DVL2 (ENSNLEG00000008027) #22	ACADVL (ENSNLEG00000007995) #23	DLG4 (ENSNLEG00000007961)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000161755	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049.bb	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B.eb.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000154514.d.b	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664.p.a	ENSGT00390000016066	ENSGT00390000009664.o	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000161755	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049.bb	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B.eb.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000154514.d.b	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000016066	ENSGT00390000009664.o	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00950000182894.C
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	7	PLSCR3 (ENSCSAG00000011756)	TNK1 (ENSCSAG00000011764)	TMEM95 (ENSCSAG00000011774)	KCTD11 (ENSCSAG00000000567)	ACAP1 (ENSCSAG00000011788) #18	NEURL4 (ENSCSAG00000011806)	ENSCSAG00000011825	GPS2 (ENSCSAG00000011817)	YBX2 (ENSCSAG00000011857)	SLC2A4 (ENSCSAG00000011874)	CLDN7 (ENSCSAG00000011879)	ELP5 (ENSCSAG00000011886)	CTDNEP1 (ENSCSAG00000011895)	GABARAP (ENSCSAG00000011904)	PHF23 (ENSCSAG00000011910)	DVL2 (ENSCSAG00000011919) #22	ACADVL (ENSCSAG00000012021) #23	DLG4 (ENSCSAG00000012054)	ASGR1 (ENSCSAG00000012076)	ASGR2 (ENSCSAG00000012099)	CLEC10A (ENSCSAG00000012123)	SLC16A11 (ENSCSAG00000012139)	SLC16A13 (ENSCSAG00000012161) #17	BCL6B (ENSCSAG00000012171) #16	C17orf49 (ENSCSAG00000012189)	ENSCSAG00000012198	RNASEK (ENSCSAG00000012205)	ALOX12 (ENSCSAG00000012238)	ENSCSAG00000012313	TEKT1 (ENSCSAG00000012352)	FBXO39 (ENSCSAG00000012357)
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000161755	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049.bb	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B.eb.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000154514.d.b	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664.o	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00950000182894.C	ENSGT00510000048837
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000161755	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049.bb	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B.eb.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000154514.d.b	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664.o	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00950000182894.C	ENSGT00510000048837
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	94	ENSMNEG00000002232	ENSMNEG00000008269	TMEM95 (ENSMNEG00000038840)	KCTD11 (ENSMNEG00000022058)	ACAP1 (ENSMNEG00000031113) #18	NEURL4 (ENSMNEG00000043796)	GPS2 (ENSMNEG00000030659)	ENSMNEG00000033978	YBX2 (ENSMNEG00000045221)	SLC2A4 (ENSMNEG00000035083)	CLDN7 (ENSMNEG00000042130)	ELP5 (ENSMNEG00000029548)	CTDNEP1 (ENSMNEG00000044513)	GABARAP (ENSMNEG00000044432)	PHF23 (ENSMNEG00000042981)	DVL2 (ENSMNEG00000030065) #22	ACADVL (ENSMNEG00000018968) #23	DLG4 (ENSMNEG00000000151)	ASGR1 (ENSMNEG00000035740)	ASGR2 (ENSMNEG00000031700)	CLEC10A (ENSMNEG00000036531)	SLC16A11 (ENSMNEG00000044695)	SLC16A13 (ENSMNEG00000026561) #17	BCL6B (ENSMNEG00000041667) #16	C17orf49 (ENSMNEG00000029035)	RNASEK (ENSMNEG00000041447)	ALOX12 (ENSMNEG00000034755)	ENSMNEG00000044671	TEKT1 (ENSMNEG00000029745)	FBXO39 (ENSMNEG00000033346)	XAF1 (ENSMNEG00000026189)
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049.bb	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000166898.a.a.b.b.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B.eb.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000154514.d.b	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664.o	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00950000182894.C	ENSGT00510000048837
Rhesus	MODERN SPECIES	7	TNK1 (ENSMMUG00000015616)	TMEM95 (ENSMMUG00000006213)	KCTD11 (ENSMMUG00000039331)	ACAP1 (ENSMMUG00000006211) #18	NEURL4 (ENSMMUG00000006207)	GPS2 (ENSMMUG00000043527)	ENSMMUG00000006206	YBX2 (ENSMMUG00000022712)	SLC2A4 (ENSMMUG00000022709)	ENSMMUG00000055331	CLDN7 (ENSMMUG00000010551)	ELP5 (ENSMMUG00000010549)	CTDNEP1 (ENSMMUG00000010547)	GABARAP (ENSMMUG00000010545)	PHF23 (ENSMMUG00000010543)	DVL2 (ENSMMUG00000052091) #22	ACADVL (ENSMMUG00000010538) #23	DLG4 (ENSMMUG00000010536)	ASGR1 (ENSMMUG00000003247)	ASGR2 (ENSMMUG00000040495)	CLEC10A (ENSMMUG00000021177)	SLC16A11 (ENSMMUG00000021176)	SLC16A13 (ENSMMUG00000055158) #17	BCL6B (ENSMMUG00000016268) #16	C16H17orf49 (ENSMMUG00000016266)	ALOX12 (ENSMMUG00000016264)	ENSMMUG00000064520	ENSMMUG00000007535	TEKT1 (ENSMMUG00000021519)	FBXO39 (ENSMMUG00000009604)	XAF1 (ENSMMUG00000009602)
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	7	ENSMFAG00000040179	TNK1 (ENSMFAG00000031134)	TMEM95 (ENSMFAG00000028065)	ACAP1 (ENSMFAG00000039943) #18	NEURL4 (ENSMFAG00000026826)	GPS2 (ENSMFAG00000035529)	ENSMFAG00000038518	YBX2 (ENSMFAG00000039921)	SLC2A4 (ENSMFAG00000030627)	ENSMFAG00000065540	CLDN7 (ENSMFAG00000041154)	ELP5 (ENSMFAG00000038563)	CTDNEP1 (ENSMFAG00000002243)	GABARAP (ENSMFAG00000003346)	PHF23 (ENSMFAG00000032158)	DVL2 (ENSMFAG00000040838) #22	DLG4 (ENSMFAG00000032206)	ASGR1 (ENSMFAG00000035586)	ASGR2 (ENSMFAG00000051211)	CLEC10A (ENSMFAG00000043516)	ACADVL (ENSMFAG00000040305) #23	ENSMFAG00000058869	SLC16A11 (ENSMFAG00000045121)	SLC16A13 (ENSMFAG00000009701) #17	BCL6B (ENSMFAG00000042774) #16	C17orf49 (ENSMFAG00000031742)	RNASEK (ENSMFAG00000057972)	ALOX12 (ENSMFAG00000039492)	ENSMFAG00000003030	TEKT1 (ENSMFAG00000041601)	FBXO39 (ENSMFAG00000035935)
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000161755	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049.bb	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816.v	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B.eb.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000154514.d.b	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664.o	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00950000182894.C	ENSGT00510000048837
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000161755	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049.bb	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816.v	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B.eb.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664.o	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00950000182894.C	ENSGT00510000048837	ENSGT00530000063869.A
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	111	PLSCR3 (ENSCATG00000044542)	TNK1 (ENSCATG00000041204)	TMEM95 (ENSCATG00000041866)	ACAP1 (ENSCATG00000029717) #18	NEURL4 (ENSCATG00000031328)	ENSCATG00000020683	ENSCATG00000007470	ENSCATG00000043556	YBX2 (ENSCATG00000036919)	SLC2A4 (ENSCATG00000040614)	ELP5 (ENSCATG00000030737)	CLDN7 (ENSCATG00000034734)	CTDNEP1 (ENSCATG00000043726)	GABARAP (ENSCATG00000011089)	PHF23 (ENSCATG00000033239)	DVL2 (ENSCATG00000044527) #22	ACADVL (ENSCATG00000033884) #23	DLG4 (ENSCATG00000006943)	ASGR1 (ENSCATG00000041107)	ASGR2 (ENSCATG00000043894)	CLEC10A (ENSCATG00000037042)	ENSCATG00000040713	SLC16A13 (ENSCATG00000044626) #17	SLC16A11 (ENSCATG00000028441)	BCL6B (ENSCATG00000006169) #16	C17orf49 (ENSCATG00000028606)	RNASEK (ENSCATG00000042447)	ALOX12 (ENSCATG00000029692)	ENSCATG00000042227	TEKT1 (ENSCATG00000035097)	FBXO39 (ENSCATG00000035409)
Drill	MODERN SPECIES	1146	PLSCR3 (ENSMLEG00000032026)	TNK1 (ENSMLEG00000041665)	TMEM95 (ENSMLEG00000041500)	KCTD11 (ENSMLEG00000023466)	ACAP1 (ENSMLEG00000028095) #18	NEURL4 (ENSMLEG00000042547)	GPS2 (ENSMLEG00000040366)	ENSMLEG00000037572	YBX2 (ENSMLEG00000039452)	SLC2A4 (ENSMLEG00000029712)	CLDN7 (ENSMLEG00000029531)	ELP5 (ENSMLEG00000031259)	CTDNEP1 (ENSMLEG00000014681)	GABARAP (ENSMLEG00000038470)	PHF23 (ENSMLEG00000031839)	DVL2 (ENSMLEG00000035047) #22	ACADVL (ENSMLEG00000034444) #23	DLG4 (ENSMLEG00000040249)	ASGR1 (ENSMLEG00000031877)	ASGR2 (ENSMLEG00000043032)	CLEC10A (ENSMLEG00000028686)	SLC16A11 (ENSMLEG00000040831)	SLC16A13 (ENSMLEG00000038425) #17	BCL6B (ENSMLEG00000037861) #16	C17orf49 (ENSMLEG00000040153)	ALOX12 (ENSMLEG00000012272)	ENSMLEG00000039165	TEKT1 (ENSMLEG00000029193)	FBXO39 (ENSMLEG00000035098)	ENSMLEG00000035279	SLC13A5 (ENSMLEG00000041091)
Olive baboon	MODERN SPECIES	8	PLSCR3 (ENSPANG00000024192)	TNK1 (ENSPANG00000024191)	TMEM95 (ENSPANG00000024190)	KCTD11 (ENSPANG00000032916)	ACAP1 (ENSPANG00000024189) #18	NEURL4 (ENSPANG00000024188)	GPS2 (ENSPANG00000024187)	ENSPANG00000024186	YBX2 (ENSPANG00000024250)	SLC2A4 (ENSPANG00000024215)	CLDN7 (ENSPANG00000024214)	ELP5 (ENSPANG00000029962)	CTDNEP1 (ENSPANG00000024212)	GABARAP (ENSPANG00000045623)	PHF23 (ENSPANG00000024211)	DVL2 (ENSPANG00000024210) #22	ACADVL (ENSPANG00000024209) #23	DLG4 (ENSPANG00000024208)	ASGR1 (ENSPANG00000024207)	ASGR2 (ENSPANG00000024206)	CLEC10A (ENSPANG00000024205)	ENSPANG00000024204	SLC16A11 (ENSPANG00000024203)	SLC16A13 (ENSPANG00000024202) #17	BCL6B (ENSPANG00000024201) #16	C17orf49 (ENSPANG00000024200)	RNASEK (ENSPANG00000047083)	ALOX12 (ENSPANG00000024252)	TEKT1 (ENSPANG00000049171)	FBXO39 (ENSPANG00000024260)	XAF1 (ENSPANG00000024259)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000161755	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049.bb	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B.eb.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000154514.d.b	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664.o	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00950000182894.C	ENSGT00510000048837
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1512	PLSCR3 (ENSRBIG00000021022)	TNK1 (ENSRBIG00000044312)	TMEM95 (ENSRBIG00000035953)	KCTD11 (ENSRBIG00000010955)	ACAP1 (ENSRBIG00000028132) #18	NEURL4 (ENSRBIG00000038362)	GPS2 (ENSRBIG00000022093)	ENSRBIG00000032310	YBX2 (ENSRBIG00000040919)	SLC2A4 (ENSRBIG00000033840)	CLDN7 (ENSRBIG00000042592)	ELP5 (ENSRBIG00000034570)	CTDNEP1 (ENSRBIG00000042434)	ENSRBIG00000027710	PHF23 (ENSRBIG00000027808)	DVL2 (ENSRBIG00000031987) #22	ACADVL (ENSRBIG00000032751) #23	DLG4 (ENSRBIG00000038115)	ASGR1 (ENSRBIG00000036163)	ASGR2 (ENSRBIG00000034825)	CLEC10A (ENSRBIG00000034862)	ENSRBIG00000028578	SLC16A11 (ENSRBIG00000040249)	SLC16A13 (ENSRBIG00000030006) #17	BCL6B (ENSRBIG00000041742) #16	RNASEK (ENSRBIG00000007939)	C17orf49 (ENSRBIG00000030939)	ALOX12 (ENSRBIG00000044539)	ENSRBIG00000034350	TEKT1 (ENSRBIG00000030333)	FBXO39 (ENSRBIG00000026028)
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2022						NEURL4 (ENSRROG00000029947)	GPS2 (ENSRROG00000040753)	ENSRROG00000040501	YBX2 (ENSRROG00000041728)	SLC2A4 (ENSRROG00000025121)	ELP5 (ENSRROG00000030050)	CLDN7 (ENSRROG00000031667)	CTDNEP1 (ENSRROG00000034686)	GABARAP (ENSRROG00000001438)	PHF23 (ENSRROG00000043124)	DVL2 (ENSRROG00000033817) #22	ACADVL (ENSRROG00000038075) #23	DLG4 (ENSRROG00000040395)	ASGR1 (ENSRROG00000033532)	ASGR2 (ENSRROG00000032073)	CLEC10A (ENSRROG00000036649)	SLC16A11 (ENSRROG00000041729)	SLC16A13 (ENSRROG00000030913) #17	BCL6B (ENSRROG00000044570) #16	C17orf49 (ENSRROG00000031346)	RNASEK (ENSRROG00000032168)	ALOX12 (ENSRROG00000005708)	ENSRROG00000042073
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000161755	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049.`b	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B.eb.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00490000043413.a.a.b	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000153472.a.a.db.a.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664.o	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00950000182894.C	ENSGT00510000048837
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000161755	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049.`b	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B.eb.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00490000043413.b.b.a	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000153472.a.a.db.a.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664.o	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00950000182894.C	ENSGT00510000048837
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000161755	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049.`b	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B.eb.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00490000043413.b.b.a	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000153472.a.a.db.a.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664.o	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00950000182894.C	ENSGT00510000048837
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	74	PLSCR3 (ENSSBOG00000034606)	TNK1 (ENSSBOG00000035858)	TMEM95 (ENSSBOG00000027103)	KCTD11 (ENSSBOG00000013416)	ACAP1 (ENSSBOG00000023970) #18	NEURL4 (ENSSBOG00000011062)	ENSSBOG00000024039	ENSSBOG00000035796	YBX2 (ENSSBOG00000029566)	SLC2A4 (ENSSBOG00000011610)	CLDN7 (ENSSBOG00000024660)	ELP5 (ENSSBOG00000003805)	CTDNEP1 (ENSSBOG00000026432)	GABARAP (ENSSBOG00000026308)	PHF23 (ENSSBOG00000030570)	DVL2 (ENSSBOG00000023994) #22	ACADVL (ENSSBOG00000022789) #23	DLG4 (ENSSBOG00000035902)	ASGR1 (ENSSBOG00000021147)	ENSSBOG00000022646	ASGR2 (ENSSBOG00000000186)	ENSSBOG00000024197	CLEC10A (ENSSBOG00000033411)	SLC16A11 (ENSSBOG00000028639)	SLC16A13 (ENSSBOG00000036117) #17	BCL6B (ENSSBOG00000025653) #16	RNASEK (ENSSBOG00000020172)	ENSSBOG00000035354	ALOX12 (ENSSBOG00000034690)	TEKT1 (ENSSBOG00000036090)	FBXO39 (ENSSBOG00000031118)
Capuchin	MODERN SPECIES	72	TMEM256 (ENSCCAG00000032517)	PLSCR3 (ENSCCAG00000023748)	TNK1 (ENSCCAG00000027718)	TMEM95 (ENSCCAG00000018559)	ACAP1 (ENSCCAG00000027603) #18	NEURL4 (ENSCCAG00000024857)	GPS2 (ENSCCAG00000022434)	ENSCCAG00000027102	YBX2 (ENSCCAG00000025671)	SLC2A4 (ENSCCAG00000033065)	ENSCCAG00000019546	CLDN7 (ENSCCAG00000009643)	ENSCCAG00000031077	CTDNEP1 (ENSCCAG00000029663)	GABARAP (ENSCCAG00000026092)	DVL2 (ENSCCAG00000032602) #22	ACADVL (ENSCCAG00000025058) #23	DLG4 (ENSCCAG00000035701)	ASGR1 (ENSCCAG00000033493)	ENSCCAG00000032851	ASGR2 (ENSCCAG00000014111)	CLEC10A (ENSCCAG00000034585)	SLC16A11 (ENSCCAG00000033233)	SLC16A13 (ENSCCAG00000032968) #17	BCL6B (ENSCCAG00000023607) #16	RNASEK-C17orf49 (ENSCCAG00000022343)	ENSCCAG00000028552	ALOX12 (ENSCCAG00000022932)	TEKT1 (ENSCCAG00000032371)	FBXO39 (ENSCCAG00000033134)	XAF1 (ENSCCAG00000027517)
Marmoset	MODERN SPECIES	17	PLSCR3 (ENSCJAG00000016410)	TNK1 (ENSCJAG00000016438)	TMEM95 (ENSCJAG00000016445)	KCTD11 (ENSCJAG00000047213)	ACAP1 (ENSCJAG00000016450) #18	NEURL4 (ENSCJAG00000016494)	GPS2 (ENSCJAG00000036993)	ENSCJAG00000041936	ENSCJAG00000016581	SLC2A4 (ENSCJAG00000016587)	CLDN7 (ENSCJAG00000016622)	ELP5 (ENSCJAG00000016633)	CTDNEP1 (ENSCJAG00000016644)	GABARAP (ENSCJAG00000044745)	PHF23 (ENSCJAG00000016665)	DVL2 (ENSCJAG00000016678) #22	ACADVL (ENSCJAG00000016703) #23	DLG4 (ENSCJAG00000016759)	ASGR1 (ENSCJAG00000044555)	ENSCJAG00000014693	ASGR2 (ENSCJAG00000043957)	CLEC10A (ENSCJAG00000016819)	SLC16A11 (ENSCJAG00000016855)	SLC16A13 (ENSCJAG00000016892) #17	BCL6B (ENSCJAG00000016905) #16	C17orf49 (ENSCJAG00000045672)	RNASEK (ENSCJAG00000016931)	ALOX12 (ENSCJAG00000016940)	TEKT1 (ENSCJAG00000017179)	FBXO39 (ENSCJAG00000017188)	XAF1 (ENSCJAG00000017191)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	807	TMEM256 (ENSANAG00000032721)	PLSCR3 (ENSANAG00000038187)	TNK1 (ENSANAG00000029133)	TMEM95 (ENSANAG00000028552)	KCTD11 (ENSANAG00000020172)	ACAP1 (ENSANAG00000031333) #18	NEURL4 (ENSANAG00000021923)	GPS2 (ENSANAG00000025289)	ENSANAG00000021881	YBX2 (ENSANAG00000019540)	SLC2A4 (ENSANAG00000011190)	CLDN7 (ENSANAG00000033943)	ELP5 (ENSANAG00000022276)	CTDNEP1 (ENSANAG00000035132)	GABARAP (ENSANAG00000027944)	DVL2 (ENSANAG00000029709) #22	ACADVL (ENSANAG00000021917) #23	DLG4 (ENSANAG00000001842)	ASGR1 (ENSANAG00000021359)	ENSANAG00000010015	ASGR2 (ENSANAG00000036322)	ENSANAG00000033926	CLEC10A (ENSANAG00000029703)	SLC16A11 (ENSANAG00000023371)	SLC16A13 (ENSANAG00000023139) #17	BCL6B (ENSANAG00000038241) #16	C17orf49 (ENSANAG00000016676)	RNASEK (ENSANAG00000035331)	ALOX12 (ENSANAG00000023267)
Tarsier	MODERN SPECIES	4929		PLSCR3 (ENSTSYG00000034744)	TNK1 (ENSTSYG00000007455)	TMEM95 (ENSTSYG00000028979)	ACAP1 (ENSTSYG00000035079) #18	NEURL4 (ENSTSYG00000014159)	GPS2 (ENSTSYG00000014157)	EIF5A (ENSTSYG00000028146)	YBX2 (ENSTSYG00000030765)	SLC2A4 (ENSTSYG00000010734)	CLDN7 (ENSTSYG00000031793)	ELP5 (ENSTSYG00000011620)	CTDNEP1 (ENSTSYG00000011593)	GABARAP (ENSTSYG00000031305)	PHF23 (ENSTSYG00000030412)	DVL2 (ENSTSYG00000002261) #22	ACADVL (ENSTSYG00000002190) #23	DLG4 (ENSTSYG00000012919)	ASGR1 (ENSTSYG00000026893)	ASGR2 (ENSTSYG00000002009)	CLEC10A (ENSTSYG00000013939)	SLC16A11 (ENSTSYG00000002416)	SLC16A13 (ENSTSYG00000002406) #17	BCL6B (ENSTSYG00000010666) #16	CUNH17orf49 (ENSTSYG00000006904)	RNASEK (ENSTSYG00000006902)	ALOX12 (ENSTSYG00000036129)	ENSTSYG00000006863
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B.eb.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664.p.a	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00390000016717	ENSGT00950000182970.B	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b.u.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B.eb.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664.p.a	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00390000016717	ENSGT00950000182970.B	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b.u.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B.eb.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664.p.a	ENSGT00940000155191.b
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	637	PLSCR3 (ENSPCOG00000019945)	TNK1 (ENSPCOG00000016772)	TMEM95 (ENSPCOG00000021816)	KCTD11 (ENSPCOG00000003158)	ACAP1 (ENSPCOG00000023219) #18	NEURL4 (ENSPCOG00000027884)	GPS2 (ENSPCOG00000019041)	ENSPCOG00000019535	YBX2 (ENSPCOG00000006030)	SLC2A4 (ENSPCOG00000018310)	CLDN7 (ENSPCOG00000023094)	ELP5 (ENSPCOG00000027171)	CTDNEP1 (ENSPCOG00000015273)	GABARAP (ENSPCOG00000022187)	PHF23 (ENSPCOG00000007415)	DVL2 (ENSPCOG00000014485) #22	ACADVL (ENSPCOG00000020753) #23	DLG4 (ENSPCOG00000020354)	ASGR1 (ENSPCOG00000014855)	ASGR2 (ENSPCOG00000028328)	CLEC10A (ENSPCOG00000012952)	SLC16A11 (ENSPCOG00000018552)	SLC16A13 (ENSPCOG00000020281) #17	BCL6B (ENSPCOG00000026491) #16	C17orf49 (ENSPCOG00000028223)	RNASEK (ENSPCOG00000016702)	ALOX12 (ENSPCOG00000026242)
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	365	TNK1 (ENSPSMG00000019520)	TMEM95 (ENSPSMG00000019531)	KCTD11 (ENSPSMG00000019536)	ACAP1 (ENSPSMG00000019565) #18	ENSPSMG00000019603	NEURL4 (ENSPSMG00000019672)	GPS2 (ENSPSMG00000019707)	ENSPSMG00000019784	YBX2 (ENSPSMG00000019815)	SLC2A4 (ENSPSMG00000019885)	CLDN7 (ENSPSMG00000019920)	ELP5 (ENSPSMG00000019969)	CTDNEP1 (ENSPSMG00000020003)	GABARAP (ENSPSMG00000020022)	PHF23 (ENSPSMG00000020041)	DVL2 (ENSPSMG00000020077) #22	ACADVL (ENSPSMG00000020091) #23	DLG4 (ENSPSMG00000020384)	ASGR1 (ENSPSMG00000020635)	ASGR2 (ENSPSMG00000020649)	CLEC10A (ENSPSMG00000020674)	SLC16A11 (ENSPSMG00000020683)	SLC16A13 (ENSPSMG00000020691) #17	BCL6B (ENSPSMG00000020700) #16	C17orf49 (ENSPSMG00000020742)	ALOX12 (ENSPSMG00000020787)
Mouse lemur	MODERN SPECIES	7	PLSCR3 (ENSMICG00000012544)	TNK1 (ENSMICG00000017889)	ENSMICG00000010844	TMEM95 (ENSMICG00000012536)	ACAP1 (ENSMICG00000012513) #18	NEURL4 (ENSMICG00000012465)	GPS2 (ENSMICG00000036660)	ENSMICG00000028821	YBX2 (ENSMICG00000012453)	SLC2A4 (ENSMICG00000012447)	CLDN7 (ENSMICG00000012478)	ELP5 (ENSMICG00000026605)	CTDNEP1 (ENSMICG00000032783)	GABARAP (ENSMICG00000035720)	ENSMICG00000004320	DVL2 (ENSMICG00000004315) #22	ACADVL (ENSMICG00000004298) #23	DLG4 (ENSMICG00000004288)	ASGR1 (ENSMICG00000004281)	ASGR2 (ENSMICG00000012091)	CLEC10A (ENSMICG00000037927)	SLC16A11 (ENSMICG00000005931)	SLC16A13 (ENSMICG00000005926) #17	BCL6B (ENSMICG00000041989) #16	C17orf49 (ENSMICG00000014069)	ENSMICG00000045291	ENSMICG00000014044	ENSMICG00000004447	ENSMICG00000033884	ELAC2 (ENSMICG00000002428)	ARHGAP44 (ENSMICG00000002417)
Bushbaby	MODERN SPECIES	161	PLSCR3 (ENSOGAG00000014242)	TNK1 (ENSOGAG00000014239)	KCTD11 (ENSOGAG00000028322)	ACAP1 (ENSOGAG00000032602) #18	ENSOGAG00000034278	NEURL4 (ENSOGAG00000001072)	GPS2 (ENSOGAG00000031484)	ENSOGAG00000014230	YBX2 (ENSOGAG00000004392)	SLC2A4 (ENSOGAG00000004391)	CLDN7 (ENSOGAG00000026987)	ENSOGAG00000004390	CTDNEP1 (ENSOGAG00000004389)	GABARAP (ENSOGAG00000004388)	PHF23 (ENSOGAG00000030652)	DVL2 (ENSOGAG00000004386) #22	ACADVL (ENSOGAG00000004382) #23	DLG4 (ENSOGAG00000004379)	ASGR1 (ENSOGAG00000004377)	ASGR2 (ENSOGAG00000004376)	CLEC10A (ENSOGAG00000004374)	SLC16A11 (ENSOGAG00000004373)	SLC16A13 (ENSOGAG00000031541) #17	BCL6B (ENSOGAG00000027908) #16	C17orf49 (ENSOGAG00000001835)	ALOX12 (ENSOGAG00000004365)	ENSOGAG00000033944	DDX11 (ENSOGAG00000001975)	ENSOGAG00000026122	ALOX15 (ENSOGAG00000007949)	ENSOGAG00000016292
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00900000143511	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00390000016066	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES	6					ENSGT00940000161755	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT01050000245793	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23
Hedgehog	MODERN SPECIES	6967																DVL2 (ENSEEUG00000015271) #22	ACADVL (ENSEEUG00000015104) #23
Common shrew	MODERN SPECIES	708						TMEM95 (ENSSARG00000000540)	ACAP1 (ENSSARG00000000520) #18	NEURL4 (ENSSARG00000000497)	ENSSARG00000000495	YBX2 (ENSSARG00000000488)	SLC2A4 (ENSSARG00000000479)	CLDN7 (ENSSARG00000000476)	ENSSARG00000000470	GABARAP (ENSSARG00000000468)	PHF23 (ENSSARG00000000449)	DVL2 (ENSSARG00000000435) #22	ACADVL (ENSSARG00000000400) #23
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00900000143511	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00390000016066	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00390000016066	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225
Suina	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b	ENSGT00390000010184
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	67	TNK1 (ENSCWAG00000003555)	TMEM95 (ENSCWAG00000003541)	KCTD11 (ENSCWAG00000003533)	ACAP1 (ENSCWAG00000003510) #18	ENSCWAG00000003461	NEURL4 (ENSCWAG00000003360)	ENSCWAG00000003311	ENSCWAG00000003284	YBX2 (ENSCWAG00000003262)	SLC2A4 (ENSCWAG00000003179)	CLDN7 (ENSCWAG00000003146)	ELP5 (ENSCWAG00000003121)	CTDNEP1 (ENSCWAG00000003100)	GABARAP (ENSCWAG00000003088)	PHF23 (ENSCWAG00000003062)	DVL2 (ENSCWAG00000003040) #22	ACADVL (ENSCWAG00000002995) #23	DLG4 (ENSCWAG00000002442)	ASGR1 (ENSCWAG00000002332)	ASGR2 (ENSCWAG00000002299)	CLEC10A (ENSCWAG00000002278)	SLC16A11 (ENSCWAG00000002252)	SLC16A13 (ENSCWAG00000002235) #17	BCL6B (ENSCWAG00000002215) #16	C17orf49 (ENSCWAG00000002185)	RNASEK (ENSCWAG00000002170)	ALOX12 (ENSCWAG00000002144)	ALOX15 (ENSCWAG00000002074)	PELP1 (ENSCWAG00000002013)	ARRB2 (ENSCWAG00000001885)	MED11 (ENSCWAG00000001856)
Pig	MODERN SPECIES	3	TNK1 (ENSSSCG00000026142)	TMEM95 (ENSSSCG00000017945)	KCTD11 (ENSSSCG00000042089)	ACAP1 (ENSSSCG00000017943) #18	ENSSSCG00000017942	NEURL4 (ENSSSCG00000017941)	GPS2 (ENSSSCG00000017940)	ENSSSCG00000038359	YBX2 (ENSSSCG00000017938)	SLC2A4 (ENSSSCG00000023915)	CLDN7 (ENSSSCG00000017934)	ELP5 (ENSSSCG00000027514)	CTDNEP1 (ENSSSCG00000017935)	GABARAP (ENSSSCG00000017936)	PHF23 (ENSSSCG00000017937)	DVL2 (ENSSSCG00000025689) #22	ACADVL (ENSSSCG00000017947) #23	DLG4 (ENSSSCG00000024285)	ASGR1 (ENSSSCG00000024926)	ASGR2 (ENSSSCG00000017932)	CLEC10A (ENSSSCG00000056060)	SLC16A11 (ENSSSCG00000017925)	SLC16A13 (ENSSSCG00000017926) #17	BCL6B (ENSSSCG00000017927) #16	C17orf49 (ENSSSCG00000017928)	RNASEK (ENSSSCG00000017929)	ALOX12 (ENSSSCG00000060177)	ALOX15 (ENSSSCG00000017923)	PELP1 (ENSSSCG00000017924)	ARRB2 (ENSSSCG00000017918)	MED11 (ENSSSCG00000017919)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00390000016066	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000161755	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16
Arabian camel	MODERN SPECIES	7	PLSCR3 (ENSCDRG00005020933)	TNK1 (ENSCDRG00005020924)	TMEM95 (ENSCDRG00005020912)	ACAP1 (ENSCDRG00005020896) #18	ENSCDRG00005020888	NEURL4 (ENSCDRG00005020846)	GPS2 (ENSCDRG00005020826)	ENSCDRG00005020816	YBX2 (ENSCDRG00005020806)	SLC2A4 (ENSCDRG00005020775)	CLDN7 (ENSCDRG00005020758)	ELP5 (ENSCDRG00005020747)	ENSCDRG00005020733	GABARAP (ENSCDRG00005020726)	PHF23 (ENSCDRG00005020637)	DVL2 (ENSCDRG00005020618) #22	ACADVL (ENSCDRG00005020549) #23	DLG4 (ENSCDRG00005018407)	ASGR1 (ENSCDRG00005018292)	ASGR2 (ENSCDRG00005018256)	CLEC10A (ENSCDRG00005018221)	SLC16A11 (ENSCDRG00005018182)	SLC16A13 (ENSCDRG00005018168) #17	BCL6B (ENSCDRG00005018114) #16	ENSCDRG00005018086	ENSCDRG00005018040	ALOX12 (ENSCDRG00005017973)	C17orf49 (ENSCDRG00005017907)	ENSCDRG00005017877	ALOX15 (ENSCDRG00005017756)	PELP1 (ENSCDRG00005017042)
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00390000016066	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00390000004322.a.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00390000004322.a.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000161755	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00390000004322.a.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225
Goat	MODERN SPECIES	10	PLSCR3 (ENSCHIG00000021167)	TNK1 (ENSCHIG00000008836)	TMEM95 (ENSCHIG00000024443)	ACAP1 (ENSCHIG00000017749) #18	ENSCHIG00000024951	NEURL4 (ENSCHIG00000018834)	GPS2 (ENSCHIG00000004094)	ENSCHIG00000025365	YBX2 (ENSCHIG00000016407)	SLC2A4 (ENSCHIG00000020405)	CLDN7 (ENSCHIG00000025376)	ELP5 (ENSCHIG00000010521)	CTDNEP1 (ENSCHIG00000006144)	GABARAP (ENSCHIG00000021470)	PHF23 (ENSCHIG00000007385)	DVL2 (ENSCHIG00000025716) #22	ACADVL (ENSCHIG00000025328) #23	DLG4 (ENSCHIG00000009974)	ASGR1 (ENSCHIG00000016569)	ASGR2 (ENSCHIG00000003690)	SLC16A11 (ENSCHIG00000019140)	SLC16A13 (ENSCHIG00000019049) #17	BCL6B (ENSCHIG00000013253) #16	C17orf49 (ENSCHIG00000019869)	RNASEK (ENSCHIG00000009505)	ALOX12 (ENSCHIG00000025520)	ENSCHIG00000010838	ENSCHIG00000018052	ALOX15 (ENSCHIG00000025642)	PELP1 (ENSCHIG00000026719)	ARRB2 (ENSCHIG00000015924)
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	2	TMEM256 (ENSOARG00020014986)	PLSCR3 (ENSOARG00020015038)	TNK1 (ENSOARG00020015110)	TMEM95 (ENSOARG00020015173)	ACAP1 (ENSOARG00020015243) #18	ENSOARG00020015367	NEURL4 (ENSOARG00020016228)	GPS2 (ENSOARG00020017230)	YBX2 (ENSOARG00020017354)	SLC2A4 (ENSOARG00020017448)	CLDN7 (ENSOARG00020017686)	ELP5 (ENSOARG00020017795)	CTDNEP1 (ENSOARG00020017866)	GABARAP (ENSOARG00020017939)	PHF23 (ENSOARG00020018070)	DVL2 (ENSOARG00020018284) #22	ACADVL (ENSOARG00020018512) #23	DLG4 (ENSOARG00020019051)	ENSOARG00020021001	ASGR2 (ENSOARG00020021046)	CLEC10A (ENSOARG00020021092)	SLC16A11 (ENSOARG00020021137)	SLC16A13 (ENSOARG00020021188) #17	BCL6B (ENSOARG00020021221) #16	C17orf49 (ENSOARG00020021294)	RNASEK (ENSOARG00020021492)	ALOX12 (ENSOARG00020021553)	ENSOARG00020021573	ENSOARG00020021761	ENSOARG00020024303	ALOX15 (ENSOARG00020024320)
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B.cb.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00390000004322.a.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225
Bos	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210.g	ENSGT01040000240503.B.cb.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00390000004322.a.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210.g	ENSGT01040000240503.B.cb.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00390000004322.a.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	10	PLSCR3 (ENSBIXG00005003986)	TNK1 (ENSBIXG00005023345)	TMEM95 (ENSBIXG00005023385)	KCTD11 (ENSBIXG00005023396)	ENSBIXG00005007232	ACAP1 (ENSBIXG00005023621) #18	NEURL4 (ENSBIXG00005023902)	GPS2 (ENSBIXG00005023970)	ENSBIXG00005024068	YBX2 (ENSBIXG00005024122)	CLDN7 (ENSBIXG00005024167)	SLC2A4 (ENSBIXG00005004176)	CTDNEP1 (ENSBIXG00005024608)	GABARAP (ENSBIXG00005024650)	PHF23 (ENSBIXG00005024750)	DVL2 (ENSBIXG00005024794) #22	ACADVL (ENSBIXG00005024981) #23	DLG4 (ENSBIXG00005025633)	ASGR1 (ENSBIXG00005025712)	ASGR2 (ENSBIXG00005025811)	CLEC10A (ENSBIXG00005025845)	SLC16A11 (ENSBIXG00005025874)	SLC16A13 (ENSBIXG00005025912) #17	BCL6B (ENSBIXG00005025984) #16	C17orf49 (ENSBIXG00005026070)	ALOX12 (ENSBIXG00005026201)	ENSBIXG00005027412	ALOX15 (ENSBIXG00005027670)	ARRB2 (ENSBIXG00005027744)	PELP1 (ENSBIXG00005027839)	MED11 (ENSBIXG00005027870)
Cow	MODERN SPECIES	10	PLSCR3 (ENSBTAG00000017747)	TNK1 (ENSBTAG00000017739)	TMEM95 (ENSBTAG00000052395)	KCTD11 (ENSBTAG00000010532) #18	ENSBTAG00000045892	NEURL4 (ENSBTAG00000010519)	GPS2 (ENSBTAG00000010513)	EIF5A (ENSBTAG00000002018)	YBX2 (ENSBTAG00000009126)	SLC2A4 (ENSBTAG00000009190)	CLDN7 (ENSBTAG00000019448)	ELP5 (ENSBTAG00000019446)	CTDNEP1 (ENSBTAG00000019443)	GABARAP (ENSBTAG00000014883)	PHF23 (ENSBTAG00000014881)	DVL2 (ENSBTAG00000003075) #22	ACADVL (ENSBTAG00000003072) #23	DLG4 (ENSBTAG00000002564)	ASGR1 (ENSBTAG00000012071)	ASGR2 (ENSBTAG00000025101)	CLEC10A (ENSBTAG00000017895)	SLC16A11 (ENSBTAG00000020852)	SLC16A13 (ENSBTAG00000020853) #17	BCL6B (ENSBTAG00000020854) #16	C19H17orf49 (ENSBTAG00000021931)	RNASEK (ENSBTAG00000021932)	ALOX12 (ENSBTAG00000021933)	ENSBTAG00000053786	ALOX12E (ENSBTAG00000031933)	ALOX15 (ENSBTAG00000011990)	ARRB2 (ENSBTAG00000035587)
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210.h	ENSGT00390000009210.g	ENSGT01040000240503.B.cb.a	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00390000004322.a.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225
Domestic yak	MODERN SPECIES	10	PLSCR3 (ENSBGRG00000019762)	TNK1 (ENSBGRG00000019860)	TMEM95 (ENSBGRG00000020097)	ACAP1 (ENSBGRG00000020229) #18	ENSBGRG00000020404	NEURL4 (ENSBGRG00000020466)	GPS2 (ENSBGRG00000021162)	ENSBGRG00000021275	YBX2 (ENSBGRG00000021388)	SLC2A4 (ENSBGRG00000021445)	CLDN7 (ENSBGRG00000021527)	ENSBGRG00000021626	ENSBGRG00000021678	GABARAP (ENSBGRG00000021792)	PHF23 (ENSBGRG00000021863)	DVL2 (ENSBGRG00000022017) #22	ACADVL (ENSBGRG00000022258) #23	DLG4 (ENSBGRG00000023062)	ASGR1 (ENSBGRG00000024416)	ASGR2 (ENSBGRG00000024459)	CLEC10A (ENSBGRG00000024558)	SLC16A11 (ENSBGRG00000024648)	SLC16A13 (ENSBGRG00000024689) #17	BCL6B (ENSBGRG00000024699) #16	C17orf49 (ENSBGRG00000024751)	RNASEK (ENSBGRG00000024780)	ALOX12 (ENSBGRG00000024812)	ENSBGRG00000024892	ALOX15 (ENSBGRG00000025402)	ENSBGRG00000025459	PELP1 (ENSBGRG00000025469)
Wild yak	MODERN SPECIES	286	TMEM95 (ENSBMUG00000006650)	KCTD11 (ENSBMUG00000006660)	ACAP1 (ENSBMUG00000006676) #18	ENSBMUG00000006684	ENSBMUG00000006688	NEURL4 (ENSBMUG00000006717)	GPS2 (ENSBMUG00000006753)	ENSBMUG00000006766	YBX2 (ENSBMUG00000006793)	SLC2A4 (ENSBMUG00000006799)	CLDN7 (ENSBMUG00000006825)	ELP5 (ENSBMUG00000006843)	CTDNEP1 (ENSBMUG00000006861)	GABARAP (ENSBMUG00000006873)	PHF23 (ENSBMUG00000006921)	DVL2 (ENSBMUG00000006989) #22	ENSBMUG00000007006 #23
American bison	MODERN SPECIES	3166	TNK1 (ENSBBBG00000015053)	TMEM95 (ENSBBBG00000000804)	KCTD11 (ENSBBBG00000015018)	ACAP1 (ENSBBBG00000015001) #18	ENSBBBG00000003626	NEURL4 (ENSBBBG00000000855)	GPS2 (ENSBBBG00000001059)	ENSBBBG00000001095	YBX2 (ENSBBBG00000001150)	SLC2A4 (ENSBBBG00000001170)	ENSBBBG00000001226	ELP5 (ENSBBBG00000001242)	ENSBBBG00000003673	GABARAP (ENSBBBG00000003665)	PHF23 (ENSBBBG00000003661)	DVL2 (ENSBBBG00000014849) #22	ACADVL (ENSBBBG00000014766) #23	DLG4 (ENSBBBG00000014616)	ENSBBBG00000003298	ASGR2 (ENSBBBG00000003294)	CLEC10A (ENSBBBG00000003285)	SLC16A11 (ENSBBBG00000014363)	SLC16A13 (ENSBBBG00000014357) #17	BCL6B (ENSBBBG00000014349) #16	C17orf49 (ENSBBBG00000014332)	RNASEK (ENSBBBG00000014328)	ALOX12 (ENSBBBG00000003259)	ENSBBBG00000014314	ENSBBBG00000003249	ALOX15 (ENSBBBG00000014284)	PELP1 (ENSBBBG00000014246)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1135	TNK1 (ENSMMSG00000011445)	TMEM95 (ENSMMSG00000011410)	KCTD11 (ENSMMSG00000011389)	ACAP1 (ENSMMSG00000011353) #18	ENSMMSG00000011324	NEURL4 (ENSMMSG00000010852)	GPS2 (ENSMMSG00000010738)	ENSMMSG00000010649	YBX2 (ENSMMSG00000010606)	SLC2A4 (ENSMMSG00000010516)	CLDN7 (ENSMMSG00000010449)	ELP5 (ENSMMSG00000010403)	CTDNEP1 (ENSMMSG00000010304)	ENSMMSG00000010211	PHF23 (ENSMMSG00000010084)	DVL2 (ENSMMSG00000010027) #22	ACADVL (ENSMMSG00000009809) #23	DLG4 (ENSMMSG00000009318)	ASGR1 (ENSMMSG00000009174)	ASGR2 (ENSMMSG00000009118)	SLC16A11 (ENSMMSG00000008996)	SLC16A13 (ENSMMSG00000008955) #17	BCL6B (ENSMMSG00000008917) #16	C17orf49 (ENSMMSG00000008857)	RNASEK (ENSMMSG00000008768)	ALOX12 (ENSMMSG00000008692)	ENSMMSG00000008662	ENSMMSG00000008560	ALOX15 (ENSMMSG00000008442)	PELP1 (ENSMMSG00000008342)	ARRB2 (ENSMMSG00000008277)
Yarkand deer	MODERN SPECIES	28	TNK1 (ENSCHYG00000008282)	TMEM95 (ENSCHYG00000008232)	KCTD11 (ENSCHYG00000008213)	ACAP1 (ENSCHYG00000008077) #18	ENSCHYG00000008013	NEURL4 (ENSCHYG00000007461)	GPS2 (ENSCHYG00000007354)	ENSCHYG00000007256	YBX2 (ENSCHYG00000007191)	SLC2A4 (ENSCHYG00000007096)	CLDN7 (ENSCHYG00000007033)	ELP5 (ENSCHYG00000006986)	CTDNEP1 (ENSCHYG00000006924)	GABARAP (ENSCHYG00000006879)	PHF23 (ENSCHYG00000006709)	DVL2 (ENSCHYG00000006392) #22	ACADVL (ENSCHYG00000022231) #23	DLG4 (ENSCHYG00000020909)	ENSCHYG00000020655	ENSCHYG00000020619	ENSCHYG00000020562	ASGR2 (ENSCHYG00000020490)	CLEC10A (ENSCHYG00000020300)	SLC16A11 (ENSCHYG00000020413)	SLC16A13 (ENSCHYG00000020250) #17	BCL6B (ENSCHYG00000020161) #16	C17orf49 (ENSCHYG00000019976)	RNASEK (ENSCHYG00000019894)	ALOX12 (ENSCHYG00000019773)	ENSCHYG00000019674	ENSCHYG00000019632
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00390000016066	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b.c	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00390000016066	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b.c	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00390000016066	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049.r	ENSGT00390000003738.a.a.b.c	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b	ENSGT00390000010184
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049.r	ENSGT00390000003738.a.a.b.c	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b	ENSGT00390000010184
Beluga whale	MODERN SPECIES	43	TNK1 (ENSDLEG00000021019)	TMEM95 (ENSDLEG00000021008)	ACAP1 (ENSDLEG00000021002) #18	ENSDLEG00000020994	NEURL4 (ENSDLEG00000020984)	ENSDLEG00000020982	ENSDLEG00000020979	ENSDLEG00000020976	YBX2 (ENSDLEG00000020968)	SLC2A4 (ENSDLEG00000020954)	CLDN7 (ENSDLEG00000020941)	ELP5 (ENSDLEG00000020933)	CTDNEP1 (ENSDLEG00000020918)	GABARAP (ENSDLEG00000020910)	PHF23 (ENSDLEG00000020903)	DVL2 (ENSDLEG00000020853) #22	ACADVL (ENSDLEG00000020522) #23	DLG4 (ENSDLEG00000018956)	ASGR2 (ENSDLEG00000018738)	CLEC10A (ENSDLEG00000018726)	SLC16A11 (ENSDLEG00000018719)	SLC16A13 (ENSDLEG00000018712) #17	BCL6B (ENSDLEG00000018691) #16	C17orf49 (ENSDLEG00000018641)	RNASEK (ENSDLEG00000018622)	ALOX12 (ENSDLEG00000018597)	ALOX15 (ENSDLEG00000018567)	PELP1 (ENSDLEG00000018540)	ARRB2 (ENSDLEG00000017647)	MED11 (ENSDLEG00000017523)	CXCL16 (ENSDLEG00000017483)
Narwhal	MODERN SPECIES	316	TNK1 (ENSMMNG00015017686)	TMEM95 (ENSMMNG00015017714)	KCTD11 (ENSMMNG00015017769)	ACAP1 (ENSMMNG00015017802) #18	ENSMMNG00015017846	NEURL4 (ENSMMNG00015017966)	ENSMMNG00015018411	ENSMMNG00015018476	YBX2 (ENSMMNG00015018537)	SLC2A4 (ENSMMNG00015018591)	CLDN7 (ENSMMNG00015018623)	ELP5 (ENSMMNG00015018672)	CTDNEP1 (ENSMMNG00015018745)	GABARAP (ENSMMNG00015018803)	PHF23 (ENSMMNG00015018878)	DVL2 (ENSMMNG00015018997) #22	ACADVL (ENSMMNG00015019102) #23	DLG4 (ENSMMNG00015019382)	ASGR1 (ENSMMNG00015019627)	ENSMMNG00015019661	ASGR2 (ENSMMNG00015019675)	CLEC10A (ENSMMNG00015019698)	SLC16A11 (ENSMMNG00015019733)	SLC16A13 (ENSMMNG00015019762) #17	BCL6B (ENSMMNG00015019792) #16	C17orf49 (ENSMMNG00015019895)	RNASEK (ENSMMNG00015019840)	ALOX12 (ENSMMNG00015019970)	ALOX15 (ENSMMNG00015020041)	PELP1 (ENSMMNG00015020107)	ARRB2 (ENSMMNG00015020211)
Vaquita	MODERN SPECIES	12	TNK1 (ENSPSNG00000012413)	TMEM95 (ENSPSNG00000012657)	KCTD11 (ENSPSNG00000012799)	ACAP1 (ENSPSNG00000012902) #18	ENSPSNG00000013030	NEURL4 (ENSPSNG00000013138)	ENSPSNG00000014284	ENSPSNG00000014364	YBX2 (ENSPSNG00000014540)	SLC2A4 (ENSPSNG00000014687)	CLDN7 (ENSPSNG00000014878)	ELP5 (ENSPSNG00000015066)	CTDNEP1 (ENSPSNG00000015367)	GABARAP (ENSPSNG00000015452)	PHF23 (ENSPSNG00000015556)	DVL2 (ENSPSNG00000015755) #22	ACADVL (ENSPSNG00000015875) #23	DLG4 (ENSPSNG00000016309)	ASGR1 (ENSPSNG00000016894)	ASGR2 (ENSPSNG00000016960)	CLEC10A (ENSPSNG00000017153)	SLC16A11 (ENSPSNG00000017413)	SLC16A13 (ENSPSNG00000017493) #17	BCL6B (ENSPSNG00000017539) #16	ENSPSNG00000017667	RNASEK (ENSPSNG00000017798)	ALOX12 (ENSPSNG00000017879)	ENSPSNG00000017940	PELP1 (ENSPSNG00000018043)	ARRB2 (ENSPSNG00000018130)	MED11 (ENSPSNG00000018235)
Dolphin	MODERN SPECIES	1362	PLSCR3 (ENSTTRG00000009793)	TNK1 (ENSTTRG00000009791)	ENSTTRG00000009790	KCTD11 (ENSTTRG00000009789)	ACAP1 (ENSTTRG00000009788) #18	NEURL4 (ENSTTRG00000009786)	GPS2 (ENSTTRG00000009784)	ENSTTRG00000009783	YBX2 (ENSTTRG00000009780)	SLC2A4 (ENSTTRG00000009776)	CLDN7 (ENSTTRG00000009775)	ELP5 (ENSTTRG00000009772)	CTDNEP1 (ENSTTRG00000009770)	GABARAP (ENSTTRG00000009768)	PHF23 (ENSTTRG00000009766)	DVL2 (ENSTTRG00000009756) #22	ACADVL (ENSTTRG00000009737) #23	DLG4 (ENSTTRG00000009704)	ASGR1 (ENSTTRG00000009672)	ASGR2 (ENSTTRG00000009646)
Sperm whale	MODERN SPECIES	252									YBX2 (ENSPCTG00005013246)	SLC2A4 (ENSPCTG00005013364)	CLDN7 (ENSPCTG00005013537)	ELP5 (ENSPCTG00005013717)	CTDNEP1 (ENSPCTG00005013857)	GABARAP (ENSPCTG00005014005)	PHF23 (ENSPCTG00005014142)	DVL2 (ENSPCTG00005014347) #22	ACADVL (ENSPCTG00005014428) #23
Blue whale	DUPLICATION
Blue whale	MODERN SPECIES	12	TMEM95 (ENSBMSG00010021909)	KCTD11 (ENSBMSG00010021906)	ACAP1 (ENSBMSG00010021900) #18	ENSBMSG00010021881	NEURL4 (ENSBMSG00010021858)	GPS2 (ENSBMSG00010021850)	ENSBMSG00010021837	ENSBMSG00010021828	ENSBMSG00010021822	SLC2A4 (ENSBMSG00010021819)	CLDN7 (ENSBMSG00010021815)	ELP5 (ENSBMSG00010021799)	CTDNEP1 (ENSBMSG00010021782)	GABARAP (ENSBMSG00010021779)	PHF23 (ENSBMSG00010021764)	ENSBMSG00010021758 #22	ENSBMSG00010021756 #22	ACADVL (ENSBMSG00010021746) #23	DLG4 (ENSBMSG00010021144)	ASGR2 (ENSBMSG00010020744)	SLC16A11 (ENSBMSG00010020651)	SLC16A13 (ENSBMSG00010020623) #17	BCL6B (ENSBMSG00010020606) #16	C17orf49 (ENSBMSG00010020546)	RNASEK (ENSBMSG00010020512)	ALOX12 (ENSBMSG00010020498)	ALOX15 (ENSBMSG00010020453)	ARRB2 (ENSBMSG00010020362)	PELP1 (ENSBMSG00010020283)	MED11 (ENSBMSG00010020221)	ENSBMSG00010020187
Blue whale	MODERN SPECIES	12	KCTD11 (ENSBMSG00010021906)	ACAP1 (ENSBMSG00010021900) #18	ENSBMSG00010021881	NEURL4 (ENSBMSG00010021858)	GPS2 (ENSBMSG00010021850)	ENSBMSG00010021837	ENSBMSG00010021828	ENSBMSG00010021822	SLC2A4 (ENSBMSG00010021819)	CLDN7 (ENSBMSG00010021815)	ELP5 (ENSBMSG00010021799)	CTDNEP1 (ENSBMSG00010021782)	GABARAP (ENSBMSG00010021779)	PHF23 (ENSBMSG00010021764)	ENSBMSG00010021758 #22	ENSBMSG00010021756 #22	ACADVL (ENSBMSG00010021746) #23	DLG4 (ENSBMSG00010021144)	ASGR2 (ENSBMSG00010020744)	SLC16A11 (ENSBMSG00010020651)	SLC16A13 (ENSBMSG00010020623) #17	BCL6B (ENSBMSG00010020606) #16	C17orf49 (ENSBMSG00010020546)	RNASEK (ENSBMSG00010020512)	ALOX12 (ENSBMSG00010020498)	ALOX15 (ENSBMSG00010020453)	ARRB2 (ENSBMSG00010020362)	PELP1 (ENSBMSG00010020283)	MED11 (ENSBMSG00010020221)	ENSBMSG00010020187	ZMYND15 (ENSBMSG00010020085)
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00900000143511	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00390000016066	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00900000143511	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00940000168661
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664.f	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535.p #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664.f	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b	ENSGT00390000010184
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000162159	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT01050000245793	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535.p #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664.f	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b	ENSGT00390000010184
American black bear	MODERN SPECIES	196									YBX2 (ENSUAMG00000014725)	SLC2A4 (ENSUAMG00000014728)	CLDN7 (ENSUAMG00000014731)	ENSUAMG00000014735	CTDNEP1 (ENSUAMG00000014737)	GABARAP (ENSUAMG00000014741)	PHF23 (ENSUAMG00000014762)	DVL2 (ENSUAMG00000014764) #22	ACADVL (ENSUAMG00000014768) #23	DLG4 (ENSUAMG00000014776)	ASGR1 (ENSUAMG00000014781)	ASGR2 (ENSUAMG00000014786)
Polar bear	MODERN SPECIES	147	ENSUMAG00000015586	ENSUMAG00000015577	TNK1 (ENSUMAG00000015556)	KCTD11 (ENSUMAG00000015551)	ACAP1 (ENSUMAG00000015527) #18	ENSUMAG00000015517	NEURL4 (ENSUMAG00000015260)	ENSUMAG00000015235	ENSUMAG00000015230	YBX2 (ENSUMAG00000015222)	SLC2A4 (ENSUMAG00000015183)	ELP5 (ENSUMAG00000015173)	CTDNEP1 (ENSUMAG00000015165)	GABARAP (ENSUMAG00000015154)	PHF23 (ENSUMAG00000015146)	ENSUMAG00000015136 #22	ACADVL (ENSUMAG00000014784) #23	DLG4 (ENSUMAG00000014738)	ASGR2 (ENSUMAG00000014668)	CLEC10A (ENSUMAG00000014642)	SLC16A13 (ENSUMAG00000014638) #17	BCL6B (ENSUMAG00000014629) #16	RNASEK (ENSUMAG00000014624)	C17orf49 (ENSUMAG00000014613)	ALOX12 (ENSUMAG00000014567)	ALOX15 (ENSUMAG00000014549)	PELP1 (ENSUMAG00000014503)	ARRB2 (ENSUMAG00000014482)	MED11 (ENSUMAG00000014475)	ZMYND15 (ENSUMAG00000014455)	ENSUMAG00000014448
Giant Panda	MODERN SPECIES	8	TNK1 (ENSAMEG00000016650)	TMEM95 (ENSAMEG00000016648)	KCTD11 (ENSAMEG00000030333)	ACAP1 (ENSAMEG00000016614) #18	ENSAMEG00000016605	NEURL4 (ENSAMEG00000016578)	GPS2 (ENSAMEG00000016576)	ENSAMEG00000023620	YBX2 (ENSAMEG00000029011)	SLC2A4 (ENSAMEG00000016542)	CLDN7 (ENSAMEG00000016535)	ELP5 (ENSAMEG00000029386)	CTDNEP1 (ENSAMEG00000016529)	GABARAP (ENSAMEG00000016523)	PHF23 (ENSAMEG00000016519)	DVL2 (ENSAMEG00000016497) #22	ACADVL (ENSAMEG00000016448) #23	DLG4 (ENSAMEG00000016396)	ASGR1 (ENSAMEG00000016382)	ASGR2 (ENSAMEG00000016377)	CLEC10A (ENSAMEG00000028679)	SLC16A11 (ENSAMEG00000016346)	SLC16A13 (ENSAMEG00000016333) #17	BCL6B (ENSAMEG00000016319) #16	C17orf49 (ENSAMEG00000016312)	ENSAMEG00000029141	ENSAMEG00000015919	ENSAMEG00000016225	PELP1 (ENSAMEG00000016199)	ARRB2 (ENSAMEG00000016134)	MED11 (ENSAMEG00000016133)
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664.f	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b
Ferret	MODERN SPECIES	237	PLSCR3 (ENSMPUG00000009978)	TNK1 (ENSMPUG00000010053)	ACAP1 (ENSMPUG00000010117) #18	ENSMPUG00000010131	NEURL4 (ENSMPUG00000010156)	ENSMPUG00000019730	ENSMPUG00000010298	ENSMPUG00000010364	YBX2 (ENSMPUG00000010386)	SLC2A4 (ENSMPUG00000010408)	ELP5 (ENSMPUG00000010415)	CLDN7 (ENSMPUG00000010463)	CTDNEP1 (ENSMPUG00000010467)	GABARAP (ENSMPUG00000010473)	PHF23 (ENSMPUG00000010478)	DVL2 (ENSMPUG00000010482) #22	ACADVL (ENSMPUG00000010603) #23	DLG4 (ENSMPUG00000010615)	ASGR1 (ENSMPUG00000010621)	ASGR2 (ENSMPUG00000010653)	CLEC10A (ENSMPUG00000010660)	SLC16A13 (ENSMPUG00000010664) #17	SLC16A11 (ENSMPUG00000010666)	BCL6B (ENSMPUG00000010670) #16	C17orf49 (ENSMPUG00000010673)	ENSMPUG00000010687	ALOX12 (ENSMPUG00000010689)	ENSMPUG00000010716	ENSMPUG00000010722	ALOX15 (ENSMPUG00000010776)	PELP1 (ENSMPUG00000010785)
American mink	MODERN SPECIES	204	TNK1 (ENSNVIG00000002992)	TMEM95 (ENSNVIG00000002969)	KCTD11 (ENSNVIG00000002955)	ACAP1 (ENSNVIG00000002925) #18	ENSNVIG00000002885	NEURL4 (ENSNVIG00000002658)	GPS2 (ENSNVIG00000002621)	ENSNVIG00000002591	ENSNVIG00000002573	SLC2A4 (ENSNVIG00000002528)	CLDN7 (ENSNVIG00000002508)	ELP5 (ENSNVIG00000002421)	CNEP1 (ENSNVIG00000002384)	ENSNVIG00000002363	PHF23 (ENSNVIG00000002353)	DVL2 (ENSNVIG00000002277) #22	ACADVL (ENSNVIG00000000794) #23	DLG4 (ENSNVIG00000000149)	ASGR2 (ENSNVIG00000000124)	CLC10 (ENSNVIG00000000116)	SLC16A11 (ENSNVIG00000000108)	SLC16A13 (ENSNVIG00000000096) #17	BCL6B (ENSNVIG00000020335) #16	ENSNVIG00000020282	ALOX12 (ENSNVIG00000020245)	ENSNVIG00000020239	ALOX15 (ENSNVIG00000020197)	PELP1 (ENSNVIG00000020156)	ARRB2 (ENSNVIG00000020038)	ENSNVIG00000020023	ENSNVIG00000019992
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000163215	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b
Dog	MODERN SPECIES	33	PLSCR3 (ENSCAFG00845022022)	TNK1 (ENSCAFG00845021921)	TMEM95 (ENSCAFG00845021838)	KCTD11 (ENSCAFG00845021807)	ACAP1 (ENSCAFG00845021641) #18	NEURL4 (ENSCAFG00845021188)	GPS2 (ENSCAFG00845021055)	EIF5A (ENSCAFG00845020953)	YBX2 (ENSCAFG00845020876)	SLC2A4 (ENSCAFG00845020724)	CLDN7 (ENSCAFG00845020640)	ELP5 (ENSCAFG00845020498)	CTDNEP1 (ENSCAFG00845020365)	GABARAP (ENSCAFG00845020288)	PHF23 (ENSCAFG00845020187)	DVL2 (ENSCAFG00845020074) #22	ACADVL (ENSCAFG00845019619) #23	DLG4 (ENSCAFG00845018777)	ASGR1 (ENSCAFG00845018304)	ASGR2 (ENSCAFG00845017847)	CLEC10A (ENSCAFG00845017661)	SLC16A11 (ENSCAFG00845017537)	SLC16A13 (ENSCAFG00845017438) #17	BCL6B (ENSCAFG00845017365) #16	C5H17orf49 (ENSCAFG00845017228)	RNASEK (ENSCAFG00845017097)	ALOX12 (ENSCAFG00845017004)	ENSCAFG00845016876	ALOX15 (ENSCAFG00845016761)	ARRB2 (ENSCAFG00845016585)	PELP1 (ENSCAFG00845016354)
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Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844.b #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00390000016066	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844.b #16	ENSGT00390000009664	ENSGT00390000014721	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b	ENSGT00390000010184	ENSGT00390000002148	ENSGT00390000000527	ENSGT01030000234590.B.a.b
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000162159	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.a.b	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844.b #16	ENSGT00390000009664	ENSGT00390000014721	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b	ENSGT00390000010184	ENSGT00390000002148
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	13	TMEM256 (ENSRFEG00010014063)	PLSCR3 (ENSRFEG00010014123)	TNK1 (ENSRFEG00010014238)	TMEM95 (ENSRFEG00010014293)	ACAP1 (ENSRFEG00010014531) #18	ENSRFEG00010014623	NEURL4 (ENSRFEG00010014729)	GPS2 (ENSRFEG00010016061)	ENSRFEG00010016202	YBX2 (ENSRFEG00010016386)	Slc2a4 (ENSRFEG00010010483)	CLDN7 (ENSRFEG00010010829)	ELP5 (ENSRFEG00010010931)	CTDNEP1 (ENSRFEG00010010984)	PHF23 (ENSRFEG00010011156)	DVL2 (ENSRFEG00010011518) #22	ACADVL (ENSRFEG00010011639) #23	DLG4 (ENSRFEG00010011756)	ASGR1 (ENSRFEG00010012624)	ENSRFEG00010012668	ASGR2 (ENSRFEG00010012739)	ENSRFEG00010013044	ENSRFEG00010013071	SLC16A11 (ENSRFEG00010013260)	SLC16A13 (ENSRFEG00010013416) #17	BCL6B (ENSRFEG00010013464) #16	C17orf49 (ENSRFEG00010013817)	RNASEK (ENSRFEG00010013541)	ALOX12 (ENSRFEG00010013953)	ENSRFEG00010014183	ALOX15 (ENSRFEG00010014222)
Microbat	MODERN SPECIES	2279																DVL2 (ENSMLUG00000002591) #22	ACADVL (ENSMLUG00000002577) #23	DLG4 (ENSMLUG00000002562)	ASGR1 (ENSMLUG00000006434)
Megabat	MODERN SPECIES	988	SPEM1 (ENSPVAG00000005063)	NLGN2 (ENSPVAG00000005062)	TMEM256 (ENSPVAG00000005061)	PLSCR3 (ENSPVAG00000005060)	TNK1 (ENSPVAG00000005059)	TMEM95 (ENSPVAG00000005058)	ACAP1 (ENSPVAG00000005056) #18	NEURL4 (ENSPVAG00000005054)	GPS2 (ENSPVAG00000005052)	ENSPVAG00000005051	YBX2 (ENSPVAG00000005050)	SLC2A4 (ENSPVAG00000005048)	CLDN7 (ENSPVAG00000005046)	ELP5 (ENSPVAG00000005045)	CTDNEP1 (ENSPVAG00000005044)	DVL2 (ENSPVAG00000005043) #22	ACADVL (ENSPVAG00000005042) #23	DLG4 (ENSPVAG00000005040)	ASGR1 (ENSPVAG00000005039)
Equus	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000161755	ENSGT00940000162159	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162310.b	ENSGT00940000162036	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844.b #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b	ENSGT00390000010184
Donkey	MODERN SPECIES	4	PLSCR3 (ENSEASG00005019060)	TNK1 (ENSEASG00005019057)	KCTD11 (ENSEASG00005031326)	ACAP1 (ENSEASG00005019039) #18	ENSEASG00005019031	NEURL4 (ENSEASG00005018984)	ENSEASG00005018941	ENSEASG00005018931	YBX2 (ENSEASG00005018928)	SLC2A4 (ENSEASG00005018713)	CLDN7 (ENSEASG00005018688)	ELP5 (ENSEASG00005026605)	CTDNEP1 (ENSEASG00005018685)	GABARAP (ENSEASG00005028737)	PHF23 (ENSEASG00005018679)	DVL2 (ENSEASG00005018657) #22	ACADVL (ENSEASG00005018265) #23	DLG4 (ENSEASG00005017976)	ENSEASG00005033101	ASGR2 (ENSEASG00005017930)	ENSEASG00005037122	SLC16A11 (ENSEASG00005017919)	SLC16A13 (ENSEASG00005017917) #17	BCL6B (ENSEASG00005017913) #16	C17orf49 (ENSEASG00005030495)	RNASEK (ENSEASG00005017906)	ENSEASG00005017902	ENSEASG00005017890	ENSEASG00005017883	MED11 (ENSEASG00005036055)	CXCL16 (ENSEASG00005017868)
Horse	MODERN SPECIES	2	SPEM2 (ENSECAG00000003006)	TMEM256 (ENSECAG00000059628)	NLGN2 (ENSECAG00000016513)	PLSCR3 (ENSECAG00000015600)	TNK1 (ENSECAG00000015435)	KCTD11 (ENSECAG00000002911)	ACAP1 (ENSECAG00000014119) #18	NEURL4 (ENSECAG00000012093)	ENSECAG00000010480	SLC2A4 (ENSECAG00000007684)	YBX2 (ENSECAG00000009996)	CLDN7 (ENSECAG00000007289)	ELP5 (ENSECAG00000031994)	CTDNEP1 (ENSECAG00000006787)	PHF23 (ENSECAG00000029915)	DVL2 (ENSECAG00000002833) #22	ACADVL (ENSECAG00000024844) #23	DLG4 (ENSECAG00000024301)	ASGR1 (ENSECAG00000024206)	ASGR2 (ENSECAG00000023898)	CLEC10A (ENSECAG00000023871)	BCL6B (ENSECAG00000023771) #17	C17orf49 (ENSECAG00000023364)	ALOX12 (ENSECAG00000022015)	SLC16A11 (ENSECAG00000023791)	ALOX15 (ENSECAG00000038698)	ARRB2 (ENSECAG00000018471)	PELP1 (ENSECAG00000020780)	MED11 (ENSECAG00000018452)	ZMYND15 (ENSECAG00000017597)	CXCL16 (ENSECAG00000018406)
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000000334	ENSGT00940000161755	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721	ENSGT00390000009664	ENSGT00390000016066	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b	ENSGT00390000010184	ENSGT00390000002148
Opossum	MODERN SPECIES	1	FGF11 (ENSMODG00000006934)	TMEM102 (ENSMODG00000006926)	ENSMODG00000049809	ENSMODG00000006922	PLSCR3 (ENSMODG00000006876)	TMEM95 (ENSMODG00000027509)	ACAP1 (ENSMODG00000006852) #18	NEURL4 (ENSMODG00000006733)	GPS2 (ENSMODG00000006668)	ENSMODG00000006652	ENSMODG00000038830	SLC2A4 (ENSMODG00000006646)	CLDN7 (ENSMODG00000006609)	CTDNEP1 (ENSMODG00000006588)	PHF23 (ENSMODG00000006563)	DVL2 (ENSMODG00000006553) #22	ACADVL (ENSMODG00000006498) #23	DLG4 (ENSMODG00000006427)	ASGR1 (ENSMODG00000006260)	SLC16A11 (ENSMODG00000047654)	SLC16A13 (ENSMODG00000006181) #17	BCL6B (ENSMODG00000006161) #16	ENSMODG00000049190	RNASEK (ENSMODG00000038870)	ENSMODG00000043842	ENSMODG00000040251	ENSMODG00000050156	ENSMODG00000037675	ENSMODG00000025681	ENSMODG00000006013	ALOX15 (ENSMODG00000005718)
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00390000000334	ENSGT00940000161755	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721.k.a	ENSGT00390000009664	ENSGT00390000016066	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b	ENSGT00390000010184	ENSGT00390000002148
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00390000000334	ENSGT00940000161755	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721.k.a	ENSGT00390000009664	ENSGT00390000016066	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b	ENSGT00390000010184	ENSGT00390000002148
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00390000000334	ENSGT00940000161755	ENSGT00390000018162	ENSGT00940000162799	ENSGT00940000160289 #18	ENSGT00940000163910	ENSGT00940000159866	ENSGT00390000004049	ENSGT00390000003738.a.a.b	ENSGT00940000159816	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000161727	ENSGT00940000162017	ENSGT00940000159372 #17	ENSGT00940000159844 #16	ENSGT00390000014721.k.a	ENSGT00390000009664	ENSGT00940000155191.b	ENSGT00940000162807	ENSGT00730000111225	ENSGT00950000182887.C.a.a.b	ENSGT00390000010184	ENSGT00390000002148	ENSGT00390000000527
koala	MODERN SPECIES	167	TMEM256 (ENSPCIG00000037010)	PLSCR3 (ENSPCIG00000028839)	TMEM95 (ENSPCIG00000028837)	KCTD11 (ENSPCIG00000033874)	ACAP1 (ENSPCIG00000028835) #18	ENSPCIG00000031869	NEURL4 (ENSPCIG00000028823)	GPS2 (ENSPCIG00000028822)	ENSPCIG00000028821	YBX2 (ENSPCIG00000028819)	SLC2A4 (ENSPCIG00000028812)	CLDN7 (ENSPCIG00000019579)	CTDNEP1 (ENSPCIG00000019577)	GABARAP (ENSPCIG00000019575)	PHF23 (ENSPCIG00000035547)	DVL2 (ENSPCIG00000019572) #22	ACADVL (ENSPCIG00000019571) #23	DLG4 (ENSPCIG00000019570)	ASGR1 (ENSPCIG00000019568)	SLC16A11 (ENSPCIG00000009637)	SLC16A13 (ENSPCIG00000009638) #17	BCL6B (ENSPCIG00000009639) #16	ENSPCIG00000009640	ENSPCIG00000036275	ALOX12 (ENSPCIG00000009641)	ENSPCIG00000033022	ALOX15 (ENSPCIG00000017315)	PELP1 (ENSPCIG00000017329)	ARRB2 (ENSPCIG00000017331)	MED11 (ENSPCIG00000017333)	ENSPCIG00000017343
Common wonbat	MODERN SPECIES	746	ENSVURG00010002926	TMEM102 (ENSVURG00010002920)	NLGN2 (ENSVURG00010002903)	TMEM256 (ENSVURG00010002894)	PLSCR3 (ENSVURG00010002874)	TMEM95 (ENSVURG00010002859)	KCTD11 (ENSVURG00010002856)	ACAP1 (ENSVURG00010002817) #18	ENSVURG00010002791	YBX2 (ENSVURG00010002776)	SLC2A4 (ENSVURG00010002768)	CLDN7 (ENSVURG00010002741)	CTDNEP1 (ENSVURG00010002702)	GABARAP (ENSVURG00010002663)	PHF23 (ENSVURG00010002654)	DVL2 (ENSVURG00010002644) #22	ACADVL (ENSVURG00010002594) #23	DLG4 (ENSVURG00010002536)	ASGR1 (ENSVURG00010002494)	SLC16A11 (ENSVURG00010002485)	SLC16A13 (ENSVURG00010002473) #17	BCL6B (ENSVURG00010002457) #16	C17orf49 (ENSVURG00010002431)	ENSVURG00010002419	ALOX12 (ENSVURG00010002413)	ALOX15 (ENSVURG00010002198)	PELP1 (ENSVURG00010002128)	ARRB2 (ENSVURG00010002065)	MED11 (ENSVURG00010002054)	ENSVURG00010002050	ZMYND15 (ENSVURG00010001940)
Wallaby	MODERN SPECIES	8713															PHF23 (ENSMEUG00000012767)	DVL2 (ENSMEUG00000012746) #22	ACADVL (ENSMEUG00000012701) #23
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	3	ENSSHAG00000004553	NLGN2 (ENSSHAG00000024935)	TMEM256 (ENSSHAG00000030265)	PLSCR3 (ENSSHAG00000005753)	TMEM95 (ENSSHAG00000028736)	KCTD11 (ENSSHAG00000029375)	ACAP1 (ENSSHAG00000006376) #18	NEURL4 (ENSSHAG00000006810)	ENSSHAG00000007027	YBX2 (ENSSHAG00000007786)	ENSSHAG00000007858	CLDN7 (ENSSHAG00000008040)	GABARAP (ENSSHAG00000008127)	CTDNEP1 (ENSSHAG00000023184)	PHF23 (ENSSHAG00000008252)	DVL2 (ENSSHAG00000008295) #22	ACADVL (ENSSHAG00000008353) #23	DLG4 (ENSSHAG00000008419)	ASGR1 (ENSSHAG00000008647)	SLC16A11 (ENSSHAG00000001029)	SLC16A13 (ENSSHAG00000000686) #17	BCL6B (ENSSHAG00000000166) #16	ENSSHAG00000000989	ENSSHAG00000000343	ENSSHAG00000000754	ARRB2 (ENSSHAG00000000114)	ENSSHAG00000027155	ZMYND15 (ENSSHAG00000001411)	TM4SF5 (ENSSHAG00000001532)	VMO1 (ENSSHAG00000031860)	ENSSHAG00000002579
Platypus	MODERN SPECIES	88	NLGN2 (ENSOANG00000038162)	TMEM256 (ENSOANG00000048373)	PLSCR3 (ENSOANG00000044513)	TNK1 (ENSOANG00000042604)	ENSOANG00000050582	ENSOANG00000049255 #18	GPS2 (ENSOANG00000038447)	ENSOANG00000050785	ENSOANG00000050173	SLC2A4 (ENSOANG00000050559)	CLDN7 (ENSOANG00000036502)	ENSOANG00000031574	CTDNEP1 (ENSOANG00000039629)	GABARAP (ENSOANG00000014546)	PHF23 (ENSOANG00000045296)	DVL2 (ENSOANG00000037917) #22	ACADVL (ENSOANG00000008230) #23	DLG4 (ENSOANG00000040309)	ENSOANG00000038430	BCL6B (ENSOANG00000030076) #16	C17orf49 (ENSOANG00000022439)	RNASEK (ENSOANG00000049485)	ALOX12 (ENSOANG00000051347)	PELP1 (ENSOANG00000047313)	ENSOANG00000020297	MED11 (ENSOANG00000049055)	ENSOANG00000007582	ZMYND15 (ENSOANG00000040839)	TM4SF5 (ENSOANG00000045956)	VMO1 (ENSOANG00000037759)	ENSOANG00000036139
Anura	ANCESTRAL SPECIES	356																ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000158535 #23	ENSGT00940000157956	ENSGT00940000162310	ENSGT00940000161727
Frog	MODERN SPECIES	3	atp1b2 (ENSXETG00000025056)	tp53 (ENSXETG00000025055)	ENSXETG00000046585	slc16a13 (ENSXETG00000046558) #17	acap1 (ENSXETG00000017847) #18	neurl4 (ENSXETG00000017842)	GPS2 (ENSXETG00000027787)	ybx2 (ENSXETG00000041917)	ENSXETG00000044000	ENSXETG00000045980	slc2a4 (ENSXETG00000045346)	cldn7 (ENSXETG00000049181)	elp5 (ENSXETG00000041810)	ctdnep1 (ENSXETG00000043462)	phf23 (ENSXETG00000049315)	dvl2 (ENSXETG00000046940) #22	ENSXETG00000042676	ENSXETG00000044730	ENSXETG00000035305	ENSXETG00000041571	XB5946328 [provisional:or11l1] (ENSXETG00000041979)	ENSXETG00000048316	or1s1 (ENSXETG00000045394)	ENSXETG00000047633	ENSXETG00000046951	ENSXETG00000048992	ENSXETG00000047242	ENSXETG00000046762	ENSXETG00000048095	XB5717875 [provisional:plac8] (ENSXETG00000030771) ##25	ENSXETG00000043929 ##36
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	322																DVL2 (ENSLLEG00000028651) #22	ACADVL (ENSLLEG00000028756) #23
Coelacanth	MODERN SPECIES	642								ENSLACG00000015848	ENSLACG00000022440	ENSLACG00000015489 #24	ENSLACG00000015463	NEURL4 (ENSLACG00000015262)	GPS2 (ENSLACG00000015164)	SLC2A4 (ENSLACG00000014825)	ENSLACG00000014742	DVL2 (ENSLACG00000014608) #22	ENSLACG00000014482 #24	ACADVL (ENSLACG00000014264) #23	DLG4 (ENSLACG00000013289)	NUDT19 (ENSLACG00000013012)	ENSLACG00000012702	ENSLACG00000012482	ENSLACG00000012419	POLR2A (ENSLACG00000012071)	ENSLACG00000011485	grk1b (ENSLACG00000011283)	ENSLACG00000011205	ENSLACG00000011107	ENSLACG00000010774	GUCY2D (ENSLACG00000010494)	TRAPPC1 (ENSLACG00000009874)
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	859															ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683
Elephant shark	DUPLICATION
Elephant shark	MODERN SPECIES	1680									fgf12a (ENSCMIG00000013826)	ENSCMIG00000013828	ENSCMIG00000013829	GMNC (ENSCMIG00000013831)	ENSCMIG00000013833	ENSCMIG00000013836	eif2b5 (ENSCMIG00000013845)	ENSCMIG00000013887 ##22	DVL3 (ENSCMIG00000013891) ##22	ap2m1 (ENSCMIG00000013908)	ENSCMIG00000013941	ENSCMIG00000013958	CCDC39 (ENSCMIG00000013975)	fxr1 (ENSCMIG00000013999)	dnajc19 (ENSCMIG00000014072)	sox2 (ENSCMIG00000014077)	ATP11B (ENSCMIG00000014084)	dcun1d1 (ENSCMIG00000014124)	adprhl1 (ENSCMIG00000014127)	mccc1 (ENSCMIG00000014137)	ENSCMIG00000014153
Elephant shark	MODERN SPECIES	1680								fgf12a (ENSCMIG00000013826)	ENSCMIG00000013828	ENSCMIG00000013829	GMNC (ENSCMIG00000013831)	ENSCMIG00000013833	ENSCMIG00000013836	eif2b5 (ENSCMIG00000013845)	ENSCMIG00000013887 ##22	DVL3 (ENSCMIG00000013891) ##22	ap2m1 (ENSCMIG00000013908)	ENSCMIG00000013941	ENSCMIG00000013958	CCDC39 (ENSCMIG00000013975)	fxr1 (ENSCMIG00000013999)	dnajc19 (ENSCMIG00000014072)	sox2 (ENSCMIG00000014077)	ATP11B (ENSCMIG00000014084)	dcun1d1 (ENSCMIG00000014124)	adprhl1 (ENSCMIG00000014127)	mccc1 (ENSCMIG00000014137)	ENSCMIG00000014153
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	372													ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000155604	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00390000005285
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	511													ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	185													ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683	ENSGT00950000182903.a.b.j ##22	ENSGT00940000155604	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00390000005285	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT01020000230768	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000164682	ENSGT00940000155439	ENSGT00940000167797	ENSGT00950000183106.a.a.b
Osteoglossocephalai	DUPLICATION
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000167797	ENSGT00940000155439.a.b	ENSGT00940000164682	ENSGT01020000230768	ENSGT00940000164152.a	ENSGT00940000157673	ENSGT00390000005285	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00730000111263	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT00950000182903.a.a.c ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000157384	ENSGT00940000161729	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000011725.d	ENSGT00940000153655.A.b	ENSGT00390000003912	ENSGT00890000139472	ENSGT00940000159812	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT01060000248589.B	ENSGT01060000248589.A	ENSGT01060000248592.C
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	75	ENSGT00940000159041	ENSGT00940000165072	ENSGT00720000108834	ENSGT00940000156389.b	ENSGT00940000157403	ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000164249.b.a.b.a.a	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00730000111263	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT00950000182903.a.a.c ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000157384.b	ENSGT00940000161729.m.b	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00980000198670	ENSGT00890000139472	ENSGT00940000159812	ENSGT00940000155097	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT01060000248589.B	ENSGT01060000248589.A	ENSGT01060000248592.C
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	58						ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000164249.b.a.b.a.a	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00730000111263	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT00950000182903.a.a.c ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000157384.b	ENSGT00940000161729.m.b	ENSGT00730000111053	ENSGT00940000156155	ENSGT00390000009497.b	ENSGT00940000156536.e.a.i	ENSGT00940000155350.g	ENSGT00940000156251.a	ENSGT00950000182988.a.b.a	ENSGT00530000063816.c.b	ENSGT00390000010063	ENSGT00530000064411.a	ENSGT00390000011958
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	296							ENSGT00390000004912	ENSGT00940000165563.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00730000111263	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT00950000182903.a.a.c ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000157384.b	ENSGT00940000161729.n	ENSGT00730000111053	ENSGT00940000156155	ENSGT00940000161826.B	ENSGT00940000157259	ENSGT01080000257333.B	ENSGT00990000204999
Atlantic herring	MODERN SPECIES	25	ENSCHAG00000017330	ca4b (ENSCHAG00000017336)	YWHAG (ENSCHAG00000017350)	HSPB1 (ENSCHAG00000017355)	ENSCHAG00000017424	polr2d (ENSCHAG00000017440)	ENSCHAG00000017481	ENSCHAG00000017542	ENSCHAG00000017549	ABCF3 (ENSCHAG00000017563)	LRCH3 (ENSCHAG00000017663)	iqcg (ENSCHAG00000017893)	rpl35a (ENSCHAG00000017909)	abcc5 (ENSCHAG00000017969)	rnpepl1 (ENSCHAG00000018769)	DVL3 (ENSCHAG00000019103) ##22	ap2m1b (ENSCHAG00000019708)	mmp23bb (ENSCHAG00000019802)	ENSCHAG00000019869	pcyt1ab (ENSCHAG00000019880)	ENSCHAG00000019973	SERP1 (ENSCHAG00000019987)	eif2a (ENSCHAG00000001223)	dcun1d5 (ENSCHAG00000001384)	ENSCHAG00000001505	SIK3 (ENSCHAG00000001570)	TMEM25 (ENSCHAG00000002827)	ENSCHAG00000002863	ENSCHAG00000003028	srsf1a (ENSCHAG00000003126)	aldoca (ENSCHAG00000003237)
Denticle herring	MODERN SPECIES	4	tbxa2r (ENSDCDG00000033588)	PTPRS (ENSDCDG00000012580)	kdm4b (ENSDCDG00000009943)	uhrf1 (ENSDCDG00000009520)	ticam1 (ENSDCDG00000009432)	polr2d (ENSDCDG00000009415)	ENSDCDG00000009404	ENSDCDG00000009398	ENSDCDG00000009391	ABCF3 (ENSDCDG00000009274)	LRCH3 (ENSDCDG00000005887)	iqcg (ENSDCDG00000005632)	rpl35a (ENSDCDG00000005629)	abcc5 (ENSDCDG00000004955)	rnpepl1 (ENSDCDG00000004678)	DVL3 (ENSDCDG00000003858) ##22	ap2m1b (ENSDCDG00000003741)	mmp23bb (ENSDCDG00000003736)	pcyt1ab (ENSDCDG00000003720)	SERP1 (ENSDCDG00000003714)	eif2a (ENSDCDG00000003216)	dcun1d5 (ENSDCDG00000003094)	ENSDCDG00000003060	TMEM25 (ENSDCDG00000022870)	ENSDCDG00000022864	ENSDCDG00000022858	ENSDCDG00000022852	aldoca (ENSDCDG00000022846)	ENSDCDG00000022842	ENSDCDG00000022838	ENSDCDG00000022834
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	134	ENSGT00940000155568	ENSGT00940000165402	ENSGT00390000017790	ENSGT00940000158758	ENSGT00940000162283.b	ENSGT00940000154022.a.a	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT00950000182903.a.a.c ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000157384.b	ENSGT00940000161729.m.b.e.b	ENSGT00730000111053	ENSGT00940000156155	ENSGT00940000180202	ENSGT00390000009497.b	ENSGT00940000156536.e.a.i	ENSGT00940000155350.g	ENSGT00940000156251.a	ENSGT00950000182988.a.b.a	ENSGT00530000063816.c.b	ENSGT00390000010063	ENSGT00530000064411.a
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	66	ENSGT00940000155568	ENSGT00940000165402	ENSGT00390000017790	ENSGT00940000158758	ENSGT00940000162283.b	ENSGT00940000154022.a.a	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT00950000182903.a.a.c ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000157384.b	ENSGT00940000161729.m.b.e.b	ENSGT00730000111053	ENSGT00940000156155	ENSGT00940000180202	ENSGT00390000009497.b	ENSGT00940000156536.e.a.i	ENSGT00940000155350.g	ENSGT00940000156251.a	ENSGT00950000182988.a.b.a	ENSGT00530000063816.c.b	ENSGT00390000010063	ENSGT00530000064411.a
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	72	ENSGT00940000155568	ENSGT00940000165402	ENSGT00390000017790	ENSGT00940000158758	ENSGT00940000162283.b	ENSGT00940000154022.a.a	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT00950000182903.a.a.c ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000157384.b	ENSGT00940000161729.m.b.e.b	ENSGT00730000111053	ENSGT00940000156155	ENSGT00940000180202	ENSGT00390000009497.b	ENSGT00940000156536.e.a.i	ENSGT00940000155350.g	ENSGT00940000156251.a	ENSGT00950000182988.a.b.a	ENSGT00530000063816.c.b	ENSGT00390000010063	ENSGT00530000064411.a
Electric eel	DUPLICATION
Electric eel	MODERN SPECIES	134																ENSEEEG00000023646 ##22	DVL3 (ENSEEEG00000023644) ##22	ap2m1b (ENSEEEG00000023634)	mmp23bb (ENSEEEG00000023630)	pcyt1ab (ENSEEEG00000023605)	serp1 (ENSEEEG00000023601)	eif2a (ENSEEEG00000023596)	dcun1d5 (ENSEEEG00000023587)	capn5a (ENSEEEG00000023586)	myo7aa (ENSEEEG00000023580)	GDPD4 (ENSEEEG00000023572)	pak1 (ENSEEEG00000023532)	aqp11 (ENSEEEG00000023526)	clns1a (ENSEEEG00000023523)	ENSEEEG00000023518	aamdc (ENSEEEG00000023516)
Electric eel	MODERN SPECIES	134															ENSEEEG00000023646 ##22	DVL3 (ENSEEEG00000023644) ##22	ap2m1b (ENSEEEG00000023634)	mmp23bb (ENSEEEG00000023630)	pcyt1ab (ENSEEEG00000023605)	serp1 (ENSEEEG00000023601)	eif2a (ENSEEEG00000023596)	dcun1d5 (ENSEEEG00000023587)	capn5a (ENSEEEG00000023586)	myo7aa (ENSEEEG00000023580)	GDPD4 (ENSEEEG00000023572)	pak1 (ENSEEEG00000023532)	aqp11 (ENSEEEG00000023526)	clns1a (ENSEEEG00000023523)	ENSEEEG00000023518	aamdc (ENSEEEG00000023516)	INTS4 (ENSEEEG00000023515)
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	76	ENSGT00940000155568	ENSGT00940000165402	ENSGT00390000017790	ENSGT00940000158758	ENSGT00940000162283.b	ENSGT00940000154022.a.a	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT00950000182903.a.a.c ##22	ENSGT00940000159223.c	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000157384.b	ENSGT00940000161729.m.b.e.b	ENSGT00730000111053	ENSGT00940000156155	ENSGT00940000180202	ENSGT00390000009497.b	ENSGT00940000156536.e.a.i	ENSGT00940000155350.g	ENSGT00940000156251.a	ENSGT00950000182988.a.b.a	ENSGT00530000063816.c.b	ENSGT00390000010063	ENSGT00530000064411.a
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	135	ENSPNAG00000019630	pex16 (ENSPNAG00000019643)	ENSPNAG00000019654	large2 (ENSPNAG00000003607)	ENSPNAG00000019835	KIFC3 (ENSPNAG00000019956)	wt1b (ENSPNAG00000019996)	eif3m (ENSPNAG00000020059)	prrg4 (ENSPNAG00000020078)	QSER1 (ENSPNAG00000020097)	depdc7a (ENSPNAG00000020112)	cstf3 (ENSPNAG00000020182)	rpl35a (ENSPNAG00000020201)	abcc5 (ENSPNAG00000020320)	rnpepl1 (ENSPNAG00000020382)	DVL3 (ENSPNAG00000020417) ##22	ENSPNAG00000020449	ENSPNAG00000020471
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	115	large2 (ENSAMXG00000017259)	ENSAMXG00000036966	ENSAMXG00000014344	KIFC3 (ENSAMXG00000014323)	wt1b (ENSAMXG00000039805)	eif3m (ENSAMXG00000014287)	prrg4 (ENSAMXG00000032262)	QSER1 (ENSAMXG00000036761)	depdc7a (ENSAMXG00000043313)	cstf3 (ENSAMXG00000014198)	rpl35a (ENSAMXG00000041448)	ENSAMXG00000041419	abcc5 (ENSAMXG00000014147)	rnpepl1 (ENSAMXG00000029654)	ENSAMXG00000031190	DVL3 (ENSAMXG00000014040) ##22	ap2m1b (ENSAMXG00000014011)	mmp23bb (ENSAMXG00000032267)	pcyt1ab (ENSAMXG00000013963)	serp1 (ENSAMXG00000042435)	eif2a (ENSAMXG00000013924)	dcun1d5 (ENSAMXG00000013901)	ompa (ENSAMXG00000026326)	capn5a (ENSAMXG00000013893)	ENSAMXG00000030631	GDPD4 (ENSAMXG00000013818)	pak1 (ENSAMXG00000013796)	aqp11 (ENSAMXG00000031970)	clns1a (ENSAMXG00000013761)	RSF1 (ENSAMXG00000013740)	aamdc (ENSAMXG00000013718)
Channel catfish	MODERN SPECIES	23	arfgap2 (ENSIPUG00000012424)	ENSIPUG00000012466	pex16 (ENSIPUG00000012495)	large2 (ENSIPUG00000012569)	ENSIPUG00000012677	kifc3 (ENSIPUG00000012716)	wt1b (ENSIPUG00000012895)	eif3m (ENSIPUG00000012938)	prrg4 (ENSIPUG00000013041)	qser1 (ENSIPUG00000013066)	depdc7 (ENSIPUG00000013087)	CSTF3 (ENSIPUG00000013170)	rpl35a (ENSIPUG00000013354)	abcc5 (ENSIPUG00000013413)	RNPEPL1 (ENSIPUG00000013502)	DVL3 (ENSIPUG00000013533) ##22	ap2m1a (ENSIPUG00000013572)	mmp23bb (ENSIPUG00000013671)	ENSIPUG00000013734	pcyt1ab (ENSIPUG00000013777)	mtif2 (ENSIPUG00000013801)	serp1 (ENSIPUG00000013808)	eif2a (ENSIPUG00000013822)	dcun1d5 (ENSIPUG00000013886)	ENSIPUG00000014051	capn5a (ENSIPUG00000014062)	Omp (ENSIPUG00000014078)	myo7aa (ENSIPUG00000014087)	ENSIPUG00000014201	zgc:112052 (ENSIPUG00000014261)	UQCRFS1 (ENSIPUG00000014290)
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Cyprininae_a	DUPLICATION
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Goldfish	DUPLICATION
Goldfish	DUPLICATION
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Salmoninae	DUPLICATION
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River trout	MODERN SPECIES	18	DGKD (ENSSTUG00000020291)	ENSSTUG00000022359	IWS1 (ENSSTUG00000022379)	zgc:162872 (ENSSTUG00000022429)	trmt9b (ENSSTUG00000022449)	ENSSTUG00000022458	FRY (ENSSTUG00000022488)	ENSSTUG00000022912	ENSSTUG00000022926	hmgb1b (ENSSTUG00000022953)	ABCF3 (ENSSTUG00000022997)	ENSSTUG00000023416	rpl35a (ENSSTUG00000023585)	abcc5 (ENSSTUG00000023667)	rnpepl1 (ENSSTUG00000025421)	DVL3 (ENSSTUG00000026514) ##22	ap2m1b (ENSSTUG00000026661)	mmp23bb (ENSSTUG00000026725)	serp1 (ENSSTUG00000026750)	eif2a (ENSSTUG00000026755)	tsen34 (ENSSTUG00000026791)	MINDY4B (ENSSTUG00000026796)	clrn1 (ENSSTUG00000026798)	GPR171 (ENSSTUG00000026802)	ENSSTUG00000026808	P2RY14 (ENSSTUG00000026811)	ENSSTUG00000026818	rnf168 (ENSSTUG00000026825)	ANO7 (ENSSTUG00000026840)	ece2b (ENSSTUG00000027209)	ENSSTUG00000027306
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Salmo	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000007848.a.c	ENSGT00940000158353.k	ENSGT00390000006450.b	ENSGT00960000187097.a.a	ENSGT00940000153680.b.k.b	ENSGT00440000038181.xc	ENSGT00940000160131.i	ENSGT00390000009484	ENSGT00950000183120.i.a.b	ENSGT00940000155719.a.d	ENSGT00940000155604.o.b	ENSGT00940000158330.y	ENSGT00730000111263.b	ENSGT00390000016972.h.a	ENSGT00940000155470.b.q.b.a	ENSGT00950000182903.a.a.c.h ##22	ENSGT00940000159223.c.g	ENSGT00940000165683.d	ENSGT00940000157384.b	ENSGT00940000161729.m.b.d	ENSGT00730000111053.e	ENSGT00850000132319.a.a.a.c	ENSGT00940000155414.n	ENSGT00390000012719.a.a.a.e	ENSGT01030000234579.A.b.a.d	ENSGT00940000157909.p	ENSGT00940000156921.g.a	ENSGT00890000139453.b.e.b	ENSGT00940000161579	ENSGT00940000166749	ENSGT00510000047914.a.a.c
River trout	MODERN SPECIES	4	ENSSTUG00000005740	rnf169 (ENSSTUG00000005732)	ENSSTUG00000005730	spcs2 (ENSSTUG00000005716)	spcs2 (ENSSTUG00000005713)	abcg1 (ENSSTUG00000003981)	ENSSTUG00000003127	hmgb1b (ENSSTUG00000003100)	ENSSTUG00000003029	ABCF3 (ENSSTUG00000002081)	ENSSTUG00000002037	LRCH3 (ENSSTUG00000001998)	iqcg (ENSSTUG00000001978)	rpl35a (ENSSTUG00000001966)	abcc5 (ENSSTUG00000001557)	DVL3 (ENSSTUG00000001444) ##22	ap2m1b (ENSSTUG00000001394)	mmp23bb (ENSSTUG00000001381)	pcyt1ab (ENSSTUG00000001293)	serp1 (ENSSTUG00000001287)	eif2a (ENSSTUG00000001265)	clrn1 (ENSSTUG00000001255)	eif4h (ENSSTUG00000044184)	RFFL (ENSSTUG00000044175)	atp1b3b (ENSSTUG00000044170)	tfdp2 (ENSSTUG00000044114)	ece2b (ENSSTUG00000040330)	NYAP2 (ENSSTUG00000040238)	IRS1 (ENSSTUG00000040208)	ENSSTUG00000040168	ENSSTUG00000040163
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	28	ENSSSAG00000102796	abcg1 (ENSSSAG00000042281)	ENSSSAG00000109701	ENSSSAG00000102318	HMGB1 (ENSSSAG00000040208)	ENSSSAG00000040288	ENSSSAG00000040173	ENSSSAG00000120507	ENSSSAG00000022030	iqcg (ENSSSAG00000020818)	ENSSSAG00000018627	abcc5 (ENSSSAG00000042568)	ENSSSAG00000085577 ##22	ENSSSAG00000096733	ENSSSAG00000087462	ENSSSAG00000004537 ##22	ENSSSAG00000110741	ap2m1b (ENSSSAG00000004585)	mmp23bb (ENSSSAG00000004640)	pcyt1ab (ENSSSAG00000004666)	ENSSSAG00000004676	ENSSSAG00000083238	ENSSSAG00000004692	ENSSSAG00000004763	ENSSSAG00000095793	ENSSSAG00000094931	if4h (ENSSSAG00000004821)	ENSSSAG00000004858	ENSSSAG00000004867	ENSSSAG00000083329	ENSSSAG00000072430
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000005712.i	ENSGT01030000234583.a.a.d.m.a	ENSGT00390000006030.d.a.a	ENSGT00390000014189	ENSGT00950000183122.B.j	ENSGT00940000156527.c	ENSGT00940000155499.c.d	ENSGT00390000009484	ENSGT00950000183120.i.a.b	ENSGT00940000155719.a.d	ENSGT00940000155604.o.b	ENSGT00940000158330.y	ENSGT00730000111263.a.a	ENSGT00390000016972.h.a	ENSGT00940000155470.b.r	ENSGT00950000182903.a.a.c.h ##22	ENSGT00940000165747	ENSGT00940000165683.d	ENSGT00940000157384.b	ENSGT01060000250696	ENSGT00730000111053.e	ENSGT00850000132319.a.a.a.c	ENSGT00940000155414.n	ENSGT00390000012719.a.a.a.e	ENSGT01030000234579.A.b.a.d	ENSGT00940000157909.p	ENSGT00940000156921.g.a	ENSGT00890000139453.b.e.b	ENSGT00940000161579	ENSGT00940000161675.a	ENSGT00510000047914.a.a.c
Rainbow trout	MODERN SPECIES	6	ENSOMYG00000047067	asl (ENSOMYG00000046952)	ENSOMYG00000046886	ENSOMYG00000067966	b3glcta (ENSOMYG00000046747)	ENSOMYG00000046672	ENSOMYG00000046666	ENSOMYG00000061759	ENSOMYG00000046660	ENSOMYG00000046388	LRCH3 (ENSOMYG00000046118)	ENSOMYG00000060811	ENSOMYG00000046047	RPL35A (ENSOMYG00000046038)	ENSOMYG00000046026	ENSOMYG00000045800 ##22	ENSOMYG00000056745	ap2m1b (ENSOMYG00000045732)	mmp23bb (ENSOMYG00000045729)	pcyt1ab (ENSOMYG00000045723)	ENSOMYG00000076889	ENSOMYG00000045720	ENSOMYG00000045709	ENSOMYG00000045701	ENSOMYG00000045692	ENSOMYG00000045680	ENSOMYG00000045675	ENSOMYG00000045672	ENSOMYG00000045600	ENSOMYG00000045569	ENSOMYG00000045565
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00390000005712.i	ENSGT01030000234583.a.a.d.m.a	ENSGT00390000006030.d.a.a	ENSGT00390000014189	ENSGT00950000183122.B.j	ENSGT00940000156527.c	ENSGT00940000155499.c.d	ENSGT00390000009484	ENSGT00950000183120.i.a.b	ENSGT00940000155719.a.d	ENSGT00940000155604.o.b	ENSGT00940000158330.y	ENSGT00730000111263.a.a	ENSGT00390000016972.h.a	ENSGT00940000155470.b.r	ENSGT00950000182903.a.a.c.h ##22	ENSGT00940000165747	ENSGT00940000165683.d	ENSGT00940000157384.b	ENSGT00730000111053.e	ENSGT00850000132319.a.a.a.c	ENSGT00940000155414.n	ENSGT00390000012719.a.a.a.e	ENSGT01030000234579.A.b.a.d	ENSGT00940000157909.p	ENSGT00940000156921.g.a	ENSGT00890000139453.b.e.b	ENSGT00940000161579	ENSGT00940000161675.a	ENSGT00510000047914.a.a.c	ENSGT00510000047914.b.f
Coho salmon	MODERN SPECIES	10	ncbp3 (ENSOKIG00005039800)	ENSOKIG00005039812	tpst1l (ENSOKIG00005039822)	crcp (ENSOKIG00005039833)	asl (ENSOKIG00005039875)	ZPLD1 (ENSOKIG00005040575)	b3glcta (ENSOKIG00005040742)	ENSOKIG00005042263	ENSOKIG00005042309	ENSOKIG00005042341	ABCF3 (ENSOKIG00005042407)	LRCH3 (ENSOKIG00005042704)	iqcg (ENSOKIG00005043027)	RPL35A (ENSOKIG00005043034)	ENSOKIG00005043066	DVL3 (ENSOKIG00005043103) ##22	ENSOKIG00005043324	ap2m1b (ENSOKIG00005043350)	mmp23bb (ENSOKIG00005043497)	pcyt1ab (ENSOKIG00005043523)	ENSOKIG00005043597	ENSOKIG00005043605	EIF2A (ENSOKIG00005043626)	CLRN1 (ENSOKIG00005043720)	ENSOKIG00005043727	ENSOKIG00005043733	ENSOKIG00005043755	EIF4H (ENSOKIG00005043815)	RFFL (ENSOKIG00005043860)	ENSOKIG00005043878	tfdp2 (ENSOKIG00005043917)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	2937																DVL3 (ENSOTSG00005043100) ##22
Northern pike	MODERN SPECIES		FRY (ENSELUG00000021304)	ENSELUG00000007318	b3glcta (ENSELUG00000007337)	ENSELUG00000024871	ENSELUG00000007278	ENSELUG00000007211	ENSELUG00000007127	ENSELUG00000007110	hmgb1b (ENSELUG00000033398)	hmgb1b (ENSELUG00000007158)	ABCF3 (ENSELUG00000007079)	LRCH3 (ENSELUG00000006955)	iqcg (ENSELUG00000006766)	rpl35a (ENSELUG00000006731)	abcc5 (ENSELUG00000006569)	DVL3 (ENSELUG00000006488) ##22	ap2m1b (ENSELUG00000006397)	mmp23bb (ENSELUG00000006338)	serp1 (ENSELUG00000006307)	eif2a (ENSELUG00000006270)	SIAH2 (ENSELUG00000006254)	MINDY4B (ENSELUG00000006234)	clrn1 (ENSELUG00000006212)	GPR171 (ENSELUG00000006201)	ENSELUG00000009241	P2RY14 (ENSELUG00000009257)	ENSELUG00000009286	ift20 (ENSELUG00000001584)	tnfaip1 (ENSELUG00000009327)	SGSM2 (ENSELUG00000009376)	tpst1 (ENSELUG00000009412)
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000167797	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439.a.a	ENSGT00940000164682	ENSGT00390000006294.d	ENSGT00940000164152.a	ENSGT00940000157673	ENSGT00390000005285	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000158330	ENSGT00730000111263	ENSGT00390000016972	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000160400	ENSGT00950000182903.a.a.c ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000157384	ENSGT00730000111053	ENSGT00390000011725.d	ENSGT00390000003912	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT01060000248589.B	ENSGT01060000248592.C	ENSGT01030000234590.A.a.a	ENSGT00940000153680.a	ENSGT00940000158551	ENSGT00940000156921	ENSGT01030000234579.A.b.a
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	101	alp3 (ENSPKIG00000013618)	ENSPKIG00000013653	CLCN2 (ENSPKIG00000013719)	chrd (ENSPKIG00000013883)	thpo (ENSPKIG00000013931)	zgc:153039 (ENSPKIG00000013967)	ECEL1 (ENSPKIG00000013996)	ABCF3 (ENSPKIG00000014055)	ENSPKIG00000014138	LRCH3 (ENSPKIG00000014154)	ENSPKIG00000014192	ENSPKIG00000014225	rpl35a (ENSPKIG00000014264)	abcc5 (ENSPKIG00000014326)	rnpepl1 (ENSPKIG00000014438)	DVL3 (ENSPKIG00000014489) ##22	AP2M1 (ENSPKIG00000014529)	mmp23bb (ENSPKIG00000014550)	eif2a (ENSPKIG00000014595)	selenot1a (ENSPKIG00000014644)	tsen34 (ENSPKIG00000014674)	SIAH2 (ENSPKIG00000014690)	MINDY4B (ENSPKIG00000014705)	clrn1 (ENSPKIG00000014724)	GPR171 (ENSPKIG00000014733)	P2RY14 (ENSPKIG00000014742)	rnf168 (ENSPKIG00000014751)	ANO7 (ENSPKIG00000014773)	ece2b (ENSPKIG00000014828)	atp1b3b (ENSPKIG00000014914)	ENSPKIG00000014934
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	1	alp3 (ENSSFOG00015018556)	fam131ab (ENSSFOG00015026074)	CLCN2 (ENSSFOG00015018415)	chrd (ENSSFOG00015018369)	ENSSFOG00015032799	zgc:153039 (ENSSFOG00015018287)	ECEL1 (ENSSFOG00015018229)	ENSSFOG00015018169	ENSSFOG00015018158	ABCF3 (ENSSFOG00015018075)	LRCH3 (ENSSFOG00015018030)	ENSSFOG00015018008	rpl35a (ENSSFOG00015017998)	abcc5 (ENSSFOG00015017938)	rnpepl1 (ENSSFOG00015017828)	DVL3 (ENSSFOG00015017762) ##22	ap2m1a (ENSSFOG00015017743)	mmp23bb (ENSSFOG00015017722)	PCYT1A (ENSSFOG00015017682)	eif2a (ENSSFOG00015017634)	selenot1a (ENSSFOG00015017602)	tsen34 (ENSSFOG00015017579)	ENSSFOG00015009785	MINDY4B (ENSSFOG00015017562)	clrn1 (ENSSFOG00015017554)	GPR171 (ENSSFOG00015017546)	P2RY14 (ENSSFOG00015017540)	ENSSFOG00015017442	rnf168 (ENSSFOG00015017412)	ANO7 (ENSSFOG00015017392)	ece2b (ENSSFOG00015017271)
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	1129																ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000165747
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	381																ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00940000161729.m.a	ENSGT00390000011725.d	ENSGT00940000153655.A.b	ENSGT00390000011127.d	ENSGT00390000016906.a	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.b.b	ENSGT00940000165275.A	ENSGT00940000157030.c.a	ENSGT00940000155435.A.b
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	63	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00940000161729.m.a	ENSGT00940000180772	ENSGT00390000011725.d	ENSGT00940000153655.A.b	ENSGT00390000011127.d	ENSGT00390000016906.a	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.b.b	ENSGT00940000174564	ENSGT00940000165275.A	ENSGT00940000157030.c.a	ENSGT00940000155435.A.b	ENSGT00940000177269
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000163126.b.b	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000156948.i.a	ENSGT00940000159258.c
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314	ENSGT00990000203766	ENSGT00940000171842
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314	ENSGT00990000203766	ENSGT00940000171842
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00990000211053	ENSGT00940000161352.f.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00990000211053	ENSGT00940000161352.f.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314	ENSGT00990000203766	ENSGT00940000171842
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314	ENSGT00990000203766	ENSGT00940000171842
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314	ENSGT00990000203766	ENSGT00940000171842
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	56	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314	ENSGT00990000203766	ENSGT00940000171842
Orange clownfish	MODERN SPECIES	1	HOMER3 (ENSAPEG00000016482)	uba52 (ENSAPEG00000016505)	ENSAPEG00000016515	CTXN1 (ENSAPEG00000016527)	TIMM44 (ENSAPEG00000016535)	rab11bb (ENSAPEG00000016590)	MARCHF2 (ENSAPEG00000016600)	slc25a36a (ENSAPEG00000016623)	spsb4a (ENSAPEG00000016656)	zgc:136870 (ENSAPEG00000016668)	clstn2a (ENSAPEG00000016707)	NMNAT3 (ENSAPEG00000016768)	rbp1.1 (ENSAPEG00000016783)	rbp2b (ENSAPEG00000016791)	copb2 (ENSAPEG00000016809)	dvl3a (ENSAPEG00000016879) ##22	ap2m1a (ENSAPEG00000016947)	pcyt1aa (ENSAPEG00000016980)	and3 (ENSAPEG00000016994)	DYNC1I2 (ENSAPEG00000017015)	slc25a12 (ENSAPEG00000017081)	metap1d (ENSAPEG00000017137)	itga6b (ENSAPEG00000017165)	ENSAPEG00000017327	rapgef4b (ENSAPEG00000017407)	ENSAPEG00000017493	ENSAPEG00000017569	ENSAPEG00000017759	epha4b (ENSAPEG00000017822)	ENSAPEG00000017890	ENSAPEG00000017906
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1597											clstn2a (ENSAOCG00000020100)	NMNAT3 (ENSAOCG00000020036)	rbp1.1 (ENSAOCG00000002751)	rbp2b (ENSAOCG00000002783)	copb2 (ENSAOCG00000019988)	dvl3a (ENSAOCG00000019897) ##22	ap2m1a (ENSAOCG00000019817)	pcyt1aa (ENSAOCG00000001439)	and3 (ENSAOCG00000019759)	DYNC1I2 (ENSAOCG00000019739)	slc25a12 (ENSAOCG00000019677)	metap1d (ENSAOCG00000019615)	itga6b (ENSAOCG00000019592)	ENSAOCG00000001419	rapgef4b (ENSAOCG00000019479)	MAP3K20 (ENSAOCG00000019387)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	62	sobpb (ENSAPOG00000013625)	rock2b (ENSAPOG00000013574)	ENSAPOG00000013334	kcnf1a (ENSAPOG00000013311)	pdia6 (ENSAPOG00000013303)	hpcal1 (ENSAPOG00000013251)	ENSAPOG00000000355	ENSAPOG00000013141	ENSAPOG00000013125	ENSAPOG00000013108	ENSAPOG00000013014	NMNAT3 (ENSAPOG00000012878)	rbp1.1 (ENSAPOG00000012859)	rbp2b (ENSAPOG00000012843)	copb2 (ENSAPOG00000012799)	dvl3a (ENSAPOG00000012678) ##22	ap2m1a (ENSAPOG00000012661)	pcyt1aa (ENSAPOG00000012593)	and3 (ENSAPOG00000012551)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	1203											clstn2a (ENSSPAG00000007630)	NMNAT3 (ENSSPAG00000007608)	rbp1.1 (ENSSPAG00000007583)	rbp2b (ENSSPAG00000007569)	copb2 (ENSSPAG00000007462)	dvl3a (ENSSPAG00000007388) ##22	ap2m1a (ENSSPAG00000007327)	pcyt1aa (ENSSPAG00000007303)
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314	ENSGT00990000203766	ENSGT01090000261820	ENSGT00940000171842
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000157413.h	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314.a	ENSGT00940000175314.b	ENSGT00990000203766.d	ENSGT00990000203766.c
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000181786	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314.a	ENSGT00940000175314.b	ENSGT00990000203766.d	ENSGT00990000203766.c
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000181786	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314.a	ENSGT00940000175314.b	ENSGT00990000203766.d	ENSGT00990000203766.c
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	306	upf1 (ENSHBUG00000014694)	ENSHBUG00000014718	HOMER3 (ENSHBUG00000014740)	ENSHBUG00000014765	TIMM44 (ENSHBUG00000014769)	rab11bb (ENSHBUG00000014777)	MARCHF2 (ENSHBUG00000000436)	slc25a36a (ENSHBUG00000014826)	zgc:136870 (ENSHBUG00000014834)	spsb4a (ENSHBUG00000014842)	clstn2a (ENSHBUG00000014896)	NMNAT3 (ENSHBUG00000014910)	rbp1.1 (ENSHBUG00000014944)	rbp2b (ENSHBUG00000014989)	copb2 (ENSHBUG00000015177)	dvl3a (ENSHBUG00000015268) ##22	ap2m1a (ENSHBUG00000015302)	pcyt1aa (ENSHBUG00000015337)	DYNC1I2 (ENSHBUG00000015379)	slc25a12 (ENSHBUG00000000996)	metap1d (ENSHBUG00000015543)	itga6b (ENSHBUG00000000452)	ENSHBUG00000015594	rapgef4b (ENSHBUG00000015728)	ENSHBUG00000015760	ENSHBUG00000020163	epha4b (ENSHBUG00000020357)	ENSHBUG00000020385	ENSHBUG00000000845	ENSHBUG00000020405	ENSHBUG00000020410
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000157413.h	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314.a	ENSGT00940000175314.b	ENSGT00990000203766.d	ENSGT00990000203766.c
P. nyererei	MODERN SPECIES	299	upf1 (ENSPNYG00000003694)	HOMER3 (ENSPNYG00000003778)	ENSPNYG00000003807	uba52 (ENSPNYG00000003911)	TIMM44 (ENSPNYG00000004070)	rab11bb (ENSPNYG00000004098)	MARCHF2 (ENSPNYG00000004130)	slc25a36a (ENSPNYG00000004157)	spsb4a (ENSPNYG00000004191)	zgc:136870 (ENSPNYG00000004207)	clstn2a (ENSPNYG00000004231)	NMNAT3 (ENSPNYG00000004294)	rbp1.1 (ENSPNYG00000004312)	rbp2b (ENSPNYG00000004334)	copb2 (ENSPNYG00000004364)	dvl3a (ENSPNYG00000004421) ##22	ap2m1a (ENSPNYG00000004468)	pcyt1aa (ENSPNYG00000004498)	DYNC1I2 (ENSPNYG00000004520)	slc25a12 (ENSPNYG00000004566)	metap1d (ENSPNYG00000004632)	itga6b (ENSPNYG00000004683)	ENSPNYG00000004709	rapgef4b (ENSPNYG00000004732)	ENSPNYG00000004795	ENSPNYG00000004828	epha4b (ENSPNYG00000005040)	ENSPNYG00000005091	ENSPNYG00000005102	ENSPNYG00000005123	ENSPNYG00000005133
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000015368.a.a.c	ENSGT00940000157413.h	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00940000155442.o.a	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314.a	ENSGT00940000175314.b	ENSGT00990000203766.d	ENSGT00940000171842
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1100	upf1 (ENSMZEG00005003489)	HOMER3 (ENSMZEG00005003452)	ENSMZEG00005003430	CERS4 (ENSMZEG00005003420)	TIMM44 (ENSMZEG00005003361)	rab11bb (ENSMZEG00005003352)	MARCHF2 (ENSMZEG00005003339)	slc25a36a (ENSMZEG00005003295)	zgc:136870 (ENSMZEG00005003269)	spsb4a (ENSMZEG00005003260)	clstn2a (ENSMZEG00005003196)	NMNAT3 (ENSMZEG00005003102)	rbp1.1 (ENSMZEG00005003083)	rbp2b (ENSMZEG00005002902)	copb2 (ENSMZEG00005002832)	dvl3a (ENSMZEG00005002747) ##22	ap2m1a (ENSMZEG00005002719)	pcyt1aa (ENSMZEG00005002705)	DYNC1I2 (ENSMZEG00005002671)	slc25a12 (ENSMZEG00005002619)	metap1d (ENSMZEG00005002593)	itga6b (ENSMZEG00005002565)	ENSMZEG00005002549	rapgef4b (ENSMZEG00005002499)	ENSMZEG00005002479	ENSMZEG00005002470	ENSMZEG00005000681	epha4b (ENSMZEG00005000490)	ENSMZEG00005000472	ENSMZEG00005000460	ENSMZEG00005000450
Eastern happy	MODERN SPECIES	9	pgpep1 (ENSACLG00000007217)	upf1 (ENSACLG00000007181)	HOMER3 (ENSACLG00000007133)	CERS4 (ENSACLG00000007099)	TIMM44 (ENSACLG00000007080)	rab11bb (ENSACLG00000007076)	MARCHF2 (ENSACLG00000007071)	slc25a36a (ENSACLG00000007062)	zgc:136870 (ENSACLG00000007054)	spsb4a (ENSACLG00000007040)	clstn2a (ENSACLG00000006605)	NMNAT3 (ENSACLG00000006594)	rbp1.1 (ENSACLG00000006586)	rbp2b (ENSACLG00000006428)	copb2 (ENSACLG00000006378)	dvl3a (ENSACLG00000006365) ##22	ap2m1a (ENSACLG00000006350)	pcyt1aa (ENSACLG00000006334)	DYNC1I2 (ENSACLG00000006306)	slc25a12 (ENSACLG00000006243)	metap1d (ENSACLG00000006206)	itga6b (ENSACLG00000005796)	ENSACLG00000005763	rapgef4b (ENSACLG00000005633)	ENSACLG00000005595	ENSACLG00000004244	epha4b (ENSACLG00000003877)	ENSACLG00000003855	ENSACLG00000003843	ENSACLG00000003830	ENSACLG00000003827
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	300	ENSNBRG00000000632	HOMER3 (ENSNBRG00000000598)	uba52 (ENSNBRG00000000583)	CERS4 (ENSNBRG00000000500)	TIMM44 (ENSNBRG00000000376)	rab11bb (ENSNBRG00000000372)	MARCHF2 (ENSNBRG00000000345)	slc25a36a (ENSNBRG00000000318)	zgc:136870 (ENSNBRG00000022923)	spsb4a (ENSNBRG00000022916)	clstn2a (ENSNBRG00000022882)	NMNAT3 (ENSNBRG00000022863)	rbp1.1 (ENSNBRG00000022813)	rbp2b (ENSNBRG00000022801)	copb2 (ENSNBRG00000022777)	dvl3a (ENSNBRG00000022744) ##22	ap2m1a (ENSNBRG00000022722)	pcyt1aa (ENSNBRG00000022706)	DYNC1I2 (ENSNBRG00000022681)	slc25a12 (ENSNBRG00000022645)	metap1d (ENSNBRG00000022632)	itga6b (ENSNBRG00000022386)	ENSNBRG00000022303	rapgef4b (ENSNBRG00000022254)	ENSNBRG00000022209	ENSNBRG00000022041	epha4b (ENSNBRG00000021322)	ENSNBRG00000021165	ENSNBRG00000021155	ENSNBRG00000021143	ENSNBRG00000021130
Nile tilapia	MODERN SPECIES	9	upf1 (ENSONIG00000010452)	HOMER3 (ENSONIG00000010448)	ENSONIG00000031764	CERS4 (ENSONIG00000010441)	TIMM44 (ENSONIG00000010437)	ENSONIG00000035378	MARCHF2 (ENSONIG00000010434)	slc25a36a (ENSONIG00000010432)	spsb4a (ENSONIG00000010430)	ENSONIG00000043177	zgc:136870 (ENSONIG00000010431)	clstn2a (ENSONIG00000010418)	NMNAT3 (ENSONIG00000033479)	rbp2b (ENSONIG00000010410)	copb2 (ENSONIG00000042202)	dvl3a (ENSONIG00000010406) ##22	ap2m1a (ENSONIG00000010404)	pcyt1aa (ENSONIG00000010401)	DYNC1I2 (ENSONIG00000010393)	slc25a12 (ENSONIG00000010386)	metap1d (ENSONIG00000010384)	itga6b (ENSONIG00000010374)	ENSONIG00000010372	rapgef4b (ENSONIG00000010358)	ENSONIG00000010354	ENSONIG00000010339	epha4b (ENSONIG00000010319)	ENSONIG00000042550	ENSONIG00000032801	ENSONIG00000036788	ENSONIG00000031203
Midas cichlid	MODERN SPECIES	235	uba52 (ENSACIG00000019707)	ENSACIG00000019677	CTXN1 (ENSACIG00000019666)	TIMM44 (ENSACIG00000019644)	rab11bb (ENSACIG00000019631)	MARCHF2 (ENSACIG00000019618)	slc25a36a (ENSACIG00000019600)	zgc:136870 (ENSACIG00000019585)	spsb4a (ENSACIG00000019576)	ENSACIG00000019567	clstn2a (ENSACIG00000019526)	NMNAT3 (ENSACIG00000019503)	rbp1.1 (ENSACIG00000019416)	rbp2b (ENSACIG00000019401)	copb2 (ENSACIG00000019369)	dvl3a (ENSACIG00000019339) ##22	ap2m1a (ENSACIG00000019325)	pcyt1aa (ENSACIG00000019309)	ENSACIG00000019302	DYNC1I2 (ENSACIG00000019284)	slc25a12 (ENSACIG00000019271)	metap1d (ENSACIG00000019257)	itga6b (ENSACIG00000019171)	ENSACIG00000019156	rapgef4b (ENSACIG00000019105)	ENSACIG00000019085	ENSACIG00000018936
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000154149.b.a.h	ENSGT00390000003574.b	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00990000211053	ENSGT00940000161352.f.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT01030000235341
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000154149.b.a.h	ENSGT00390000003574.b	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT01030000235341	ENSGT00990000203766	ENSGT00940000171842
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000154149.b.a.h	ENSGT00390000003574.b	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT01030000235341	ENSGT00990000203766	ENSGT00940000171842
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1618	ENSNFUG00015021367	KIFAP3B (ENSNFUG00015020250)	OLPD-R (ENSNFUG00015020202)	CERS4 (ENSNFUG00015020174)	CTXN1 (ENSNFUG00015020167)	TIMM44 (ENSNFUG00015020126)	Nfu_g_1_020481 (ENSNFUG00015020092)	MARCH2 (ENSNFUG00015020081)	slc25a36a (ENSNFUG00015020070)	SPSB4 (ENSNFUG00015020062)	clstn2a (ENSNFUG00015019721)	NMNAT3 (ENSNFUG00015019677)	NMNAT3 (ENSNFUG00015019671)	rbp2b (ENSNFUG00015019621)	COPB2 (ENSNFUG00015018238)	dvl3a (ENSNFUG00015017928) ##22	ENSNFUG00015017891	LINGO3 (ENSNFUG00015017886)	ONECUT3 (ENSNFUG00015017880)	tcf3a (ENSNFUG00015017863)	UQCR11 (ENSNFUG00015017854)	mbd3a (ENSNFUG00015017839)	MEX3D (ENSNFUG00015017831)	BTBD2 (ENSNFUG00015016901)	eef2b (ENSNFUG00015016853)	RXFP3.2A (ENSNFUG00015016841)	SIRT6 (ENSNFUG00015016584)	CDC34B (ENSNFUG00015016568)	CACTIN (ENSNFUG00015016550)	sema4e (ENSNFUG00015016494)	STAP2A (ENSNFUG00015016469)
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	64	kifap3b (ENSKMAG00000009197)	PDC (ENSKMAG00000009178)	ENSKMAG00000009157	CERS4 (ENSKMAG00000009138)	CTXN1 (ENSKMAG00000009121)	TIMM44 (ENSKMAG00000009060)	rab11bb (ENSKMAG00000009033)	MARCHF2 (ENSKMAG00000009002)	slc25a36a (ENSKMAG00000008956)	spsb4a (ENSKMAG00000008932)	clstn2a (ENSKMAG00000008838)	NMNAT3 (ENSKMAG00000008800)	rbp1.1 (ENSKMAG00000008788)	rbp2b (ENSKMAG00000008760)	copb2 (ENSKMAG00000008663)	dvl3a (ENSKMAG00000008628) ##22	ap2m1a (ENSKMAG00000008592)	pcyt1aa (ENSKMAG00000008554)	ENSKMAG00000008520	DYNC1I2 (ENSKMAG00000008383)	slc25a12 (ENSKMAG00000008292)	metap1d (ENSKMAG00000008227)	itga6b (ENSKMAG00000008162)	ENSKMAG00000008097	rapgef4b (ENSKMAG00000008019)	ENSKMAG00000007980	ENSKMAG00000007931	ENSKMAG00000007901	ENSKMAG00000007866	epha4b (ENSKMAG00000007783)	ENSKMAG00000007758
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00940000154149.b.a.h	ENSGT00390000003574.b	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b.g	ENSGT00940000155353.a.a.b.h	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT01030000235341	ENSGT00990000203766.b
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00940000154149.b.a.h	ENSGT00390000003574.b	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b.g	ENSGT00940000155353.a.a.b.h	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT01030000235341.c	ENSGT00990000203766.b
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00940000154149.b.a.h	ENSGT00390000003574.b	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b.g	ENSGT00940000155353.a.a.b.h	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b
Guppy	DUPLICATION
Guppy	MODERN SPECIES	447	ENSPREG00000014481	kifap3b (ENSPREG00000014417)	PDC (ENSPREG00000014388)	ENSPREG00000014369	CTXN1 (ENSPREG00000014346)	TIMM44 (ENSPREG00000014295)	rab11bb (ENSPREG00000014269)	MARCHF2 (ENSPREG00000014259)	ENSPREG00000014251	ENSPREG00000014238	spsb4a (ENSPREG00000014221)	clstn2a (ENSPREG00000014196)	NMNAT3 (ENSPREG00000014156)	rbp1.1 (ENSPREG00000014144)	copb2 (ENSPREG00000014106)	ENSPREG00000014095 ##22	dvl3a (ENSPREG00000014078) ##22	ap2m1a (ENSPREG00000014057)	pcyt1aa (ENSPREG00000014022)	and3 (ENSPREG00000014008)	DYNC1I2 (ENSPREG00000013942)	slc25a12 (ENSPREG00000013884)	ENSPREG00000013866	metap1d (ENSPREG00000013845)	itga6b (ENSPREG00000013714)	ENSPREG00000013683	rapgef4b (ENSPREG00000013577)	ENSPREG00000013505	ENSPREG00000013439	ENSPREG00000013427	ENSPREG00000013413
Guppy	MODERN SPECIES	447	kifap3b (ENSPREG00000014417)	PDC (ENSPREG00000014388)	ENSPREG00000014369	CTXN1 (ENSPREG00000014346)	TIMM44 (ENSPREG00000014295)	rab11bb (ENSPREG00000014269)	MARCHF2 (ENSPREG00000014259)	ENSPREG00000014251	ENSPREG00000014238	spsb4a (ENSPREG00000014221)	clstn2a (ENSPREG00000014196)	NMNAT3 (ENSPREG00000014156)	rbp1.1 (ENSPREG00000014144)	copb2 (ENSPREG00000014106)	ENSPREG00000014095 ##22	dvl3a (ENSPREG00000014078) ##22	ap2m1a (ENSPREG00000014057)	pcyt1aa (ENSPREG00000014022)	and3 (ENSPREG00000014008)	DYNC1I2 (ENSPREG00000013942)	slc25a12 (ENSPREG00000013884)	ENSPREG00000013866	metap1d (ENSPREG00000013845)	itga6b (ENSPREG00000013714)	ENSPREG00000013683	rapgef4b (ENSPREG00000013577)	ENSPREG00000013505	ENSPREG00000013439	ENSPREG00000013427	ENSPREG00000013413	ENSPREG00000013401
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	228					ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b.g	ENSGT00940000155353.a.a.b.h	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b
Amazon molly	MODERN SPECIES	422	prg4a (ENSPFOG00000006768)	dusp12 (ENSPFOG00000006822)	ENSPFOG00000020348	OLFML2B (ENSPFOG00000006875)	ENSPFOG00000006956	CERS4 (ENSPFOG00000007021)	TIMM44 (ENSPFOG00000007215)	rab11bb (ENSPFOG00000024114)	MARCHF2 (ENSPFOG00000007476)	slc25a36a (ENSPFOG00000007512)	spsb4a (ENSPFOG00000007613)	clstn2a (ENSPFOG00000007644)	NMNAT3 (ENSPFOG00000008559)	rbp1.1 (ENSPFOG00000023452)	copb2 (ENSPFOG00000008606)	dvl3a (ENSPFOG00000008888) ##22	ap2m1a (ENSPFOG00000009058)	pcyt1aa (ENSPFOG00000009131)	and3 (ENSPFOG00000009203)	DYNC1I2 (ENSPFOG00000009232)	slc25a12 (ENSPFOG00000009599)	metap1d (ENSPFOG00000009936)	itga6b (ENSPFOG00000010117)	ENSPFOG00000010742	rapgef4b (ENSPFOG00000010884)	ENSPFOG00000011308	ENSPFOG00000011459
Sailfin molly	MODERN SPECIES	214												clstn2a (ENSPLAG00000015580)	NMNAT3 (ENSPLAG00000015557)	rbp1.1 (ENSPLAG00000015546)	copb2 (ENSPLAG00000015524)	dvl3a (ENSPLAG00000015479) ##22	ap2m1a (ENSPLAG00000015435)	pcyt1aa (ENSPLAG00000015415)	and3 (ENSPLAG00000015393)	DYNC1I2 (ENSPLAG00000015376)	slc25a12 (ENSPLAG00000015335)	metap1d (ENSPLAG00000015302)	itga6b (ENSPLAG00000015251)	itga6b (ENSPLAG00000014740)	ENSPLAG00000000611	rapgef4b (ENSPLAG00000014664)	ENSPLAG00000014600	ENSPLAG00000014560
Platyfish	MODERN SPECIES	20	OLFML2B (ENSXMAG00000018729)	ENSXMAG00000026629	kifap3b (ENSXMAG00000018739)	PDC (ENSXMAG00000018762)	ENSXMAG00000018778	CTXN1 (ENSXMAG00000026623)	TIMM44 (ENSXMAG00000018819)	rab11bb (ENSXMAG00000011926)	MARCHF2 (ENSXMAG00000018861)	slc25a36a (ENSXMAG00000018866)	spsb4a (ENSXMAG00000018887)	clstn2a (ENSXMAG00000018890)	NMNAT3 (ENSXMAG00000018929)	rbp1.1 (ENSXMAG00000018933)	copb2 (ENSXMAG00000018937)	dvl3a (ENSXMAG00000018981) ##22	ap2m1a (ENSXMAG00000019001)	pcyt1aa (ENSXMAG00000019014)	and3 (ENSXMAG00000019029)	DYNC1I2 (ENSXMAG00000019032)	slc25a12 (ENSXMAG00000019058)	metap1d (ENSXMAG00000019080)	itga6b (ENSXMAG00000019094)	itga6b (ENSXMAG00000024556)	ENSXMAG00000019139	rapgef4b (ENSXMAG00000019145)	ENSXMAG00000022912	ENSXMAG00000019208	epha4b (ENSXMAG00000019223)	ENSXMAG00000022129	ENSXMAG00000022854
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00940000154149.b.a.h	ENSGT00390000003574.b	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b.g	ENSGT00940000155353.a.a.b.h	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT01030000235341	ENSGT00990000203766.b
Mummichog	MODERN SPECIES	2326					ENSFHEG00000018261	CTXN1 (ENSFHEG00000018270)	TIMM44 (ENSFHEG00000018339)	rab11bb (ENSFHEG00000018353)	MARCHF2 (ENSFHEG00000018375)	slc25a36a (ENSFHEG00000018399)	spsb4a (ENSFHEG00000018422)	clstn2a (ENSFHEG00000018475)	NMNAT3 (ENSFHEG00000018505)	rbp1.1 (ENSFHEG00000018522)	copb2 (ENSFHEG00000018594)	dvl3a (ENSFHEG00000018651) ##22	ap2m1a (ENSFHEG00000018703)	pcyt1aa (ENSFHEG00000018749)	and3 (ENSFHEG00000018762)	DYNC1I2 (ENSFHEG00000018845)	slc25a12 (ENSFHEG00000018890)	metap1d (ENSFHEG00000018950)	itga6b (ENSFHEG00000019221)	ENSFHEG00000019239	rapgef4b (ENSFHEG00000019375)	ENSFHEG00000019391	ENSFHEG00000019643	epha4b (ENSFHEG00000020070)	ENSFHEG00000020095	ENSFHEG00000020099	ENSFHEG00000020110
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	467													NMNAT3 (ENSCVAG00000020804)	rbp1.1 (ENSCVAG00000020797)	copb2 (ENSCVAG00000020778)	dvl3a (ENSCVAG00000020678) ##22	ap2m1a (ENSCVAG00000020589)	pcyt1aa (ENSCVAG00000020539)	and3 (ENSCVAG00000020509)	DYNC1I2 (ENSCVAG00000020503)	slc25a12 (ENSCVAG00000020468)	metap1d (ENSCVAG00000020438)	itga6b (ENSCVAG00000020403)	ENSCVAG00000020381	itga6b (ENSCVAG00000020373)	ENSCVAG00000020353	rapgef4b (ENSCVAG00000020327)	ENSCVAG00000020242	ENSCVAG00000020163	epha4b (ENSCVAG00000019934)	ENSCVAG00000019920
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000154149.b.a.h	ENSGT00390000003574.b	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00990000211053	ENSGT00940000161352.f.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT01030000235341.e
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00940000154149.b.a.h	ENSGT00390000003574.b	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000165265	ENSGT01030000235341.e	ENSGT00990000203766	ENSGT00940000171842	ENSGT01100000263557.A.a
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	8	OLFML2B (ENSOJAG00000014470)	ENSOJAG00000014489	kifap3b (ENSOJAG00000014522)	PDC (ENSOJAG00000014844)	ENSOJAG00000014871	TIMM44 (ENSOJAG00000014954)	rab11bb (ENSOJAG00000015481)	MARCHF2 (ENSOJAG00000015558)	slc25a36a (ENSOJAG00000015573)	spsb4a (ENSOJAG00000015580)	clstn2a (ENSOJAG00000015617)	NMNAT3 (ENSOJAG00000016137)	rbp1.1 (ENSOJAG00000016154)	rbp2b (ENSOJAG00000016169)	copb2 (ENSOJAG00000016214)	dvl3a (ENSOJAG00000017146) ##22	ap2m1a (ENSOJAG00000017316)	pcyt1aa (ENSOJAG00000017391)	and3 (ENSOJAG00000017410)	DYNC1I2 (ENSOJAG00000017447)	slc25a12 (ENSOJAG00000018766)	metap1d (ENSOJAG00000020200)	itga6b (ENSOJAG00000020267)	ENSOJAG00000020498	rapgef4b (ENSOJAG00000020622)	ENSOJAG00000021675	epha4b (ENSOJAG00000022493)	ENSOJAG00000022740	ENSOJAG00000022750	ENSOJAG00000022760	ENSOJAG00000022765
Indian medaka	MODERN SPECIES	10	dusp12 (ENSOMEG00000017380)	ENSOMEG00000017421	kifap3b (ENSOMEG00000017545)	PDC (ENSOMEG00000017603)	ENSOMEG00000017667	TIMM44 (ENSOMEG00000017767)	rab11bb (ENSOMEG00000017806)	MARCHF2 (ENSOMEG00000017834)	slc25a36a (ENSOMEG00000017859)	spsb4a (ENSOMEG00000017906)	clstn2a (ENSOMEG00000017977)	NMNAT3 (ENSOMEG00000018039)	rbp1.1 (ENSOMEG00000018083)	rbp2b (ENSOMEG00000018095)	copb2 (ENSOMEG00000018165)	dvl3a (ENSOMEG00000018321) ##22	ap2m1a (ENSOMEG00000018414)	pcyt1aa (ENSOMEG00000018447)	and3 (ENSOMEG00000018463)	DYNC1I2 (ENSOMEG00000018565)	slc25a12 (ENSOMEG00000018711)	metap1d (ENSOMEG00000000484)	itga6b (ENSOMEG00000018880)	ENSOMEG00000018948	rapgef4b (ENSOMEG00000019051)	ENSOMEG00000019124	ENSOMEG00000019148	ENSOMEG00000019163	ENSOMEG00000000502	ENSOMEG00000019197	ENSOMEG00000019217
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000154149.b.a.h	ENSGT00390000003574.b	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000161352.f.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT01030000235341.e	ENSGT00990000203766	ENSGT00940000171842
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	8	ENSORLG00000024886	kifap3b (ENSORLG00000013884)	pdca (ENSORLG00000013896)	ENSORLG00000013903	ENSORLG00000026451	TIMM44 (ENSORLG00000013927)	rab11bb (ENSORLG00000013938)	ENSORLG00000013951	slc25a36a (ENSORLG00000013978)	spsb4a (ENSORLG00000013981)	ENSORLG00000026151	clstn2a (ENSORLG00000022231)	rbp2b (ENSORLG00000028914)	rbp1.1 (ENSORLG00000014005)	copb2 (ENSORLG00000014074)	dvl3a (ENSORLG00000014122) ##22	ap2m1a (ENSORLG00000014164)	pcyt1aa (ENSORLG00000014200)	and3 (ENSORLG00000014208)	DYNC1I2 (ENSORLG00000014246)	slc25a12 (ENSORLG00000014305)	metap1d (ENSORLG00000014320)	itga6b (ENSORLG00000014364)	ENSORLG00000014379	rapgef4b (ENSORLG00000014413)	ENSORLG00000014423	ENSORLG00000014526	ENSORLG00000027827	ENSORLG00000028529	ENSORLG00000025502	epha4b (ENSORLG00000014565)
Chinese medaka	MODERN SPECIES	522	ENSOSIG00000017499	kifap3b (ENSOSIG00000017501)	PDC (ENSOSIG00000017506)	ENSOSIG00000017515	TIMM44 (ENSOSIG00000017570)	ENSOSIG00000017572	rab11bb (ENSOSIG00000017577)	MARCHF2 (ENSOSIG00000017579)	slc25a36a (ENSOSIG00000017582)	spsb4a (ENSOSIG00000017585)	clstn2a (ENSOSIG00000017760)	NMNAT3 (ENSOSIG00000020465)	rbp1.1 (ENSOSIG00000020468)	rbp2b (ENSOSIG00000020472)	copb2 (ENSOSIG00000020483)	dvl3a (ENSOSIG00000020491) ##22	ap2m1a (ENSOSIG00000020528)	pcyt1aa (ENSOSIG00000020532)	and3 (ENSOSIG00000020533)	DYNC1I2 (ENSOSIG00000020580)	slc25a12 (ENSOSIG00000022063)	metap1d (ENSOSIG00000022361)	itga6b (ENSOSIG00000022367)	ENSOSIG00000022372	rapgef4b (ENSOSIG00000022441)	ENSOSIG00000022712	epha4b (ENSOSIG00000022815)	ENSOSIG00000022893	ENSOSIG00000022895	ENSOSIG00000022899	ENSOSIG00000022926
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT00990000206484	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00990000211053	ENSGT00940000161352.f.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT00990000206484	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00990000211053	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314	ENSGT00990000203766
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314	ENSGT00990000203766	ENSGT00940000171842
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000157413.h	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314	ENSGT00990000203766	ENSGT00940000171842
Climbing perch	MODERN SPECIES	8	upf1 (ENSATEG00000017867)	ENSATEG00000017747	ENSATEG00000017729	ENSATEG00000017721	TIMM44 (ENSATEG00000029811)	rab11bb (ENSATEG00000017696)	ENSATEG00000017679	ENSATEG00000017649	spsb4a (ENSATEG00000017626)	zgc:136870 (ENSATEG00000025289)	clstn2a (ENSATEG00000017562)	NMNAT3 (ENSATEG00000017549)	rbp1.1 (ENSATEG00000017531)	rbp2b (ENSATEG00000017508)	copb2 (ENSATEG00000017430)	ENSATEG00000017381 ##22	ENSATEG00000017335	ENSATEG00000017306	ENSATEG00000017285	DYNC1I2 (ENSATEG00000017227)	ENSATEG00000017182	METAP1D (ENSATEG00000017096)	ENSATEG00000017036	ENSATEG00000016949	ENSATEG00000016888	ENSATEG00000016658	ENSATEG00000016598	ENSATEG00000016571	ENSATEG00000016558	ENSATEG00000016542	ENSATEG00000016523
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	8	RAB3A (ENSBSLG00000026265)	jund (ENSBSLG00000026263)	upf1 (ENSBSLG00000026232)	HOMER3 (ENSBSLG00000026184)	CERS4 (ENSBSLG00000026180)	TIMM44 (ENSBSLG00000026140)	rab11bb (ENSBSLG00000026102)	MARCHF2 (ENSBSLG00000026100)	slc25a36a (ENSBSLG00000026093)	spsb4a (ENSBSLG00000026084)	clstn2a (ENSBSLG00000026017)	NMNAT3 (ENSBSLG00000025789)	rbp1.1 (ENSBSLG00000025786)	rbp2b (ENSBSLG00000025784)	copb2 (ENSBSLG00000025730)	dvl3a (ENSBSLG00000025490) ##22	ap2m1a (ENSBSLG00000025307)	pcyt1aa (ENSBSLG00000025304)	and3 (ENSBSLG00000025301)	DYNC1I2 (ENSBSLG00000025146)	slc25a12 (ENSBSLG00000024692)	metap1d (ENSBSLG00000024664)	itga6b (ENSBSLG00000024452)	ENSBSLG00000024401	rapgef4b (ENSBSLG00000024113)	ENSBSLG00000024079	epha4b (ENSBSLG00000022440)	ENSBSLG00000022299	ENSBSLG00000022297	ENSBSLG00000022296	ENSBSLG00000022292
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	8	ENSMAMG00000006299	uba52 (ENSMAMG00000006321)	ENSMAMG00000006327	ENSMAMG00000006355	ENSMAMG00000006367	rab11bb (ENSMAMG00000006378)	ENSMAMG00000006383	ENSMAMG00000024459	spsb4a (ENSMAMG00000006429)	zgc:136870 (ENSMAMG00000006438)	clstn2a (ENSMAMG00000006456)	NMNAT3 (ENSMAMG00000006484)	rbp1.1 (ENSMAMG00000006493)	rbp2b (ENSMAMG00000006509)	copb2 (ENSMAMG00000006528)	ENSMAMG00000006605 ##22	ENSMAMG00000006654	ENSMAMG00000006685	ENSMAMG00000006711	DYNC1I2 (ENSMAMG00000006738)	ENSMAMG00000006786	metap1d (ENSMAMG00000024396)	itga6b (ENSMAMG00000006870)	ENSMAMG00000006891	ENSMAMG00000006913	ENSMAMG00000007022	ENSMAMG00000007048	ENSMAMG00000007260	ENSMAMG00000027850	ENSMAMG00000007285	ENSMAMG00000007291
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00990000211053	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314	ENSGT00990000203766
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314	ENSGT00990000203766	ENSGT00940000171842
Seriola	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314	ENSGT00990000203766	ENSGT00940000171842
Yellowtail amberjack	DUPLICATION
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3160	HOMER3 (ENSSLDG00000020840)	uba52 (ENSSLDG00000020739)	CERS4 (ENSSLDG00000020711)	CTXN1 (ENSSLDG00000020704)	TIMM44 (ENSSLDG00000020686)	rab11bb (ENSSLDG00000020676)	MARCHF2 (ENSSLDG00000020670)	slc25a36a (ENSSLDG00000020649)	zgc:136870 (ENSSLDG00000020640)	spsb4a (ENSSLDG00000020633)	clstn2a (ENSSLDG00000020561)	NMNAT3 (ENSSLDG00000020535)	rbp1.1 (ENSSLDG00000020526)	rbp2b (ENSSLDG00000020513)	copb2 (ENSSLDG00000020433)	ENSSLDG00000020405 ##22	dvl3a (ENSSLDG00000020388) ##22	ap2m1a (ENSSLDG00000020332)	pcyt1aa (ENSSLDG00000020304)	and3 (ENSSLDG00000020294)	DYNC1I2 (ENSSLDG00000020217)	slc25a12 (ENSSLDG00000020138)	metap1d (ENSSLDG00000020116)	itga6b (ENSSLDG00000020060)	ENSSLDG00000020020	rapgef4b (ENSSLDG00000019964)	ENSSLDG00000019929	ENSSLDG00000019745
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3160	uba52 (ENSSLDG00000020739)	CERS4 (ENSSLDG00000020711)	CTXN1 (ENSSLDG00000020704)	TIMM44 (ENSSLDG00000020686)	rab11bb (ENSSLDG00000020676)	MARCHF2 (ENSSLDG00000020670)	slc25a36a (ENSSLDG00000020649)	zgc:136870 (ENSSLDG00000020640)	spsb4a (ENSSLDG00000020633)	clstn2a (ENSSLDG00000020561)	NMNAT3 (ENSSLDG00000020535)	rbp1.1 (ENSSLDG00000020526)	rbp2b (ENSSLDG00000020513)	copb2 (ENSSLDG00000020433)	ENSSLDG00000020405 ##22	dvl3a (ENSSLDG00000020388) ##22	ap2m1a (ENSSLDG00000020332)	pcyt1aa (ENSSLDG00000020304)	and3 (ENSSLDG00000020294)	DYNC1I2 (ENSSLDG00000020217)	slc25a12 (ENSSLDG00000020138)	metap1d (ENSSLDG00000020116)	itga6b (ENSSLDG00000020060)	ENSSLDG00000020020	rapgef4b (ENSSLDG00000019964)	ENSSLDG00000019929	ENSSLDG00000019745
Greater amberjack	MODERN SPECIES	83	HOMER3 (ENSSDUG00000013419)	uba52 (ENSSDUG00000013436)	CERS4 (ENSSDUG00000013462)	CTXN1 (ENSSDUG00000013526)	TIMM44 (ENSSDUG00000013532)	rab11bb (ENSSDUG00000013558)	MARCHF2 (ENSSDUG00000013566)	slc25a36a (ENSSDUG00000013585)	spsb4a (ENSSDUG00000013610)	zgc:136870 (ENSSDUG00000013620)	clstn2a (ENSSDUG00000013636)	NMNAT3 (ENSSDUG00000013697)	rbp1.1 (ENSSDUG00000013706)	rbp2b (ENSSDUG00000013743)	copb2 (ENSSDUG00000013764)	dvl3a (ENSSDUG00000013838) ##22	ap2m1a (ENSSDUG00000013877)	pcyt1aa (ENSSDUG00000013919)	and3 (ENSSDUG00000013946)	DYNC1I2 (ENSSDUG00000013954)	slc25a12 (ENSSDUG00000014017)	metap1d (ENSSDUG00000014092)	itga6b (ENSSDUG00000014125)	ENSSDUG00000014202	rapgef4b (ENSSDUG00000014259)	ENSSDUG00000014339	ENSSDUG00000014373	epha4b (ENSSDUG00000014552)	ENSSDUG00000014588	ENSSDUG00000014598	ENSSDUG00000014711
Barramundi perch	MODERN SPECIES	69	HOMER3 (ENSLCAG00010021508)	uba52 (ENSLCAG00010021500)	CERS4 (ENSLCAG00010021499)	CTXN1 (ENSLCAG00010021496)	TIMM44 (ENSLCAG00010021394)	rab11bb (ENSLCAG00010021340)	MARCHF2 (ENSLCAG00010021331)	slc25a36a (ENSLCAG00010021326)	zgc:136870 (ENSLCAG00010021318)	spsb4a (ENSLCAG00010021315)	clstn2a (ENSLCAG00010021304)	NMNAT3 (ENSLCAG00010021301)	rbp1.1 (ENSLCAG00010021298)	rbp2b (ENSLCAG00010021293)	copb2 (ENSLCAG00010020835)	dvl3a (ENSLCAG00010020676) ##22	ap2m1a (ENSLCAG00010020671)	pcyt1aa (ENSLCAG00010020649)	and3 (ENSLCAG00010020638)	DYNC1I2 (ENSLCAG00010020244)	slc25a12 (ENSLCAG00010020138)	metap1d (ENSLCAG00010020111)	itga6b (ENSLCAG00010019951)	ENSLCAG00010019895	rapgef4b (ENSLCAG00010019866)	ENSLCAG00010019859	ENSLCAG00010019336	epha4b (ENSLCAG00010019077)	ENSLCAG00010019031	ENSLCAG00010019018	ENSLCAG00010019012
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157413.h	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT00990000206484	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00990000211053	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314	ENSGT00990000203766
Turbot	MODERN SPECIES	19	upf1 (ENSSMAG00000005055)	ENSSMAG00000005036	ENSSMAG00000004963	ENSSMAG00000004955	ENSSMAG00000004929	rab11bb (ENSSMAG00000004922)	ENSSMAG00000004909	slc25a36a (ENSSMAG00000004893)	ENSSMAG00000004876	spsb4a (ENSSMAG00000004857)	clstn2a (ENSSMAG00000004743)	NMNAT3 (ENSSMAG00000022760)	rbp1.1 (ENSSMAG00000004704)	rbp2b (ENSSMAG00000020703)	copb2 (ENSSMAG00000004635)	dvl3a (ENSSMAG00000004618) ##22	ENSSMAG00000004560	ENSSMAG00000004543	ENSSMAG00000004527	DYNC1I2 (ENSSMAG00000004501)	ENSSMAG00000004437	metap1d (ENSSMAG00000004402)	itga6b (ENSSMAG00000004319)	ENSSMAG00000004303	ENSSMAG00000004250	ENSSMAG00000004198	ENSSMAG00000004058	ENSSMAG00000003972	ENSSMAG00000029868	ENSSMAG00000003935	ENSSMAG00000003909
Tongue sole	MODERN SPECIES	12	pif1 (ENSCSEG00000012036)	ENSCSEG00000012053	nsun4 (ENSCSEG00000012057)	dmbx1a (ENSCSEG00000012068)	ENSCSEG00000012095	CTXN1 (ENSCSEG00000012121)	TIMM44 (ENSCSEG00000012127)	rab11bb (ENSCSEG00000012149)	MARCHF2 (ENSCSEG00000012156)	slc25a36a (ENSCSEG00000012199)	spsb4a (ENSCSEG00000012242)	clstn2a (ENSCSEG00000012265)	NMNAT3 (ENSCSEG00000012360)	rbp1.1 (ENSCSEG00000012366)	copb2 (ENSCSEG00000012387)	dvl3a (ENSCSEG00000012425) ##22	ap2m1a (ENSCSEG00000012443)	pcyt1a (ENSCSEG00000013124)	and3 (ENSCSEG00000013163)	DYNC1I2 (ENSCSEG00000013179)	slc25a12 (ENSCSEG00000013220)	metap1d (ENSCSEG00000013260)	itga6b (ENSCSEG00000013305)	ENSCSEG00000013346	ENSCSEG00000013353	rapgef4b (ENSCSEG00000013369)	ENSCSEG00000013454	ENSCSEG00000013469	ENSCSEG00000013476	ENSCSEG00000013486	ENSCSEG00000013492
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT00990000206484	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314	ENSGT00990000203766	ENSGT00940000171842
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000015368.a.a.c	ENSGT00940000157413.h	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT00990000206484	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000174809	ENSGT00940000163892.C.a.a	ENSGT00940000159258.c
Fugu	MODERN SPECIES	14	pgpep1 (ENSTRUG00000026311)	upf1 (ENSTRUG00000000150)	HOMER3 (ENSTRUG00000000171)	ENSTRUG00000000191	CTXN1 (ENSTRUG00000000204)	TIMM44 (ENSTRUG00000000206)	rab11bb (ENSTRUG00000033264)	MARCHF2 (ENSTRUG00000000243)	slc25a36a (ENSTRUG00000000258)	ENSTRUG00000000285	spsb4a (ENSTRUG00000023923)	clstn2a (ENSTRUG00000000290)	NMNAT3 (ENSTRUG00000000361)	rbp1.1 (ENSTRUG00000000390)	copb2 (ENSTRUG00000000411)	dvl3a (ENSTRUG00000000483) ##22	ap2m1a (ENSTRUG00000000587)	pcyt1aa (ENSTRUG00000000674)	and3 (ENSTRUG00000025029)	ENSTRUG00000000748	slc25a12 (ENSTRUG00000000852)	ENSTRUG00000001321	ENSTRUG00000002461	rapgef4b (ENSTRUG00000002566)	ENSTRUG00000004366	epha4b (ENSTRUG00000006416)	ENSTRUG00000031436	ccl20 (ENSTRUG00000025674)	ENSTRUG00000007447	GPX4 (ENSTRUG00000009426)	C2CD4C (ENSTRUG00000009442)
Tetraodon	MODERN SPECIES	6	ENSTNIG00000011072	RAB3A (ENSTNIG00000011073)	pgpep1 (ENSTNIG00000011075)	upf1 (ENSTNIG00000011076)	HOMER3 (ENSTNIG00000011077)	ENSTNIG00000011078	CTXN1 (ENSTNIG00000011079)	TIMM44 (ENSTNIG00000011080)	rab11bb (ENSTNIG00000011081)	MARCHF2 (ENSTNIG00000011082)	slc25a36a (ENSTNIG00000011083)	spsb4a (ENSTNIG00000011084)	clstn2a (ENSTNIG00000011085)	NMNAT3 (ENSTNIG00000011086)	copb2 (ENSTNIG00000011087)	dvl3a (ENSTNIG00000011088) ##22	ap2m1a (ENSTNIG00000011089)	pcyt1aa (ENSTNIG00000011090)	and3 (ENSTNIG00000011091)	DYNC1I2 (ENSTNIG00000011092)	slc25a12 (ENSTNIG00000011093)	metap1d (ENSTNIG00000011094)	itga6b (ENSTNIG00000011095)	rapgef4b (ENSTNIG00000011096)	ENSTNIG00000011097	ENSTNIG00000011098	epha4b (ENSTNIG00000006035)	ENSTNIG00000015345	PIP5K1C (ENSTNIG00000015344)	GPX4 (ENSTNIG00000015343)	C2CD4C (ENSTNIG00000015342)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314	ENSGT00990000203766	ENSGT00940000171842
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	218	upf1 (ENSLBEG00000014862)	HOMER3 (ENSLBEG00000014982)	ENSLBEG00000015169	CTXN1 (ENSLBEG00000015199)	TIMM44 (ENSLBEG00000015213)	rab11bb (ENSLBEG00000015248)	MARCHF2 (ENSLBEG00000015279)	slc25a36a (ENSLBEG00000015309)	spsb4a (ENSLBEG00000015356)	zgc:136870 (ENSLBEG00000015372)	clstn2a (ENSLBEG00000015393)	NMNAT3 (ENSLBEG00000015448)	rbp1.1 (ENSLBEG00000015461)	rbp2b (ENSLBEG00000015473)	copb2 (ENSLBEG00000015514)	dvl3a (ENSLBEG00000015569) ##22	ENSLBEG00000015680
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314	ENSGT00990000203766	ENSGT00940000171842
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314	ENSGT00990000203766	ENSGT00940000171842
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000171842
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	483	HOMER3 (ENSLCRG00005023593)	uba52 (ENSLCRG00005023591)	ENSLCRG00005023590	ENSLCRG00005023589	TIMM44 (ENSLCRG00005023576)	rab11bb (ENSLCRG00005023575)	MARCHF2 (ENSLCRG00005023574)	slc25a36a (ENSLCRG00005023573)	zgc:136870 (ENSLCRG00005023572)	spsb4a (ENSLCRG00005023571)	clstn2a (ENSLCRG00005023521)	NMNAT3 (ENSLCRG00005023515)	rbp1.1 (ENSLCRG00005023514)	rbp2b (ENSLCRG00005023513)	copb2 (ENSLCRG00005023427)	dvl3a (ENSLCRG00005023423) ##22	ap2m1a (ENSLCRG00005023420)	pcyt1aa (ENSLCRG00005023416)	and3 (ENSLCRG00005023413)	DYNC1I2 (ENSLCRG00005022746)	slc25a12 (ENSLCRG00005022120)	metap1d (ENSLCRG00005022102)	itga6b (ENSLCRG00005021995)	ENSLCRG00005021988	rapgef4b (ENSLCRG00005021982)	ENSLCRG00005021976	ENSLCRG00005021919	epha4b (ENSLCRG00005021730)	ENSLCRG00005021728	ENSLCRG00005021727	ENSLCRG00005021726
European seabass	MODERN SPECIES		upf1 (ENSDLAG00005005647)	ENSDLAG00005006531	ENSDLAG00005006568	ENSDLAG00005006586	ENSDLAG00005031877	rab11bb (ENSDLAG00005006977)	ENSDLAG00005007195	ENSDLAG00005007214	spsb4a (ENSDLAG00005007295)	zgc:136870 (ENSDLAG00005007302)	clstn2a (ENSDLAG00005007311)	NMNAT3 (ENSDLAG00005007373)	rbp1.1 (ENSDLAG00005027822)	rbp2b (ENSDLAG00005007381)	copb2 (ENSDLAG00005007428)	ENSDLAG00005008457 ##22	ENSDLAG00005008772	ENSDLAG00005008795	ENSDLAG00005008952	DYNC1I2 (ENSDLAG00005009088)	ENSDLAG00005012453	metap1d (ENSDLAG00005014493)	itga6b (ENSDLAG00005014588)	ENSDLAG00005014829	ENSDLAG00005014910	ENSDLAG00005017139	ENSDLAG00005017303	ENSDLAG00005019620	ENSDLAG00005034095	ENSDLAG00005020001	ENSDLAG00005020004
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	13	arhgap12b (ENSSAUG00010016958)	ENSSAUG00010016918	KIF5B (ENSSAUG00010013793)	pold3 (ENSSAUG00010013750)	ENSSAUG00010013200	CTXN1 (ENSSAUG00010013180)	rab11bb (ENSSAUG00010013144)	TIMM44 (ENSSAUG00010012552)	slc25a36a (ENSSAUG00010012537)	spsb4a (ENSSAUG00010012534)	clstn2a (ENSSAUG00010027604)	NMNAT3 (ENSSAUG00010027602)	rbp1.1 (ENSSAUG00010027601)	rbp2b (ENSSAUG00010027600)	copb2 (ENSSAUG00010027590)	dvl3a (ENSSAUG00010027548) ##22	ap2m1a (ENSSAUG00010027545)	pcyt1aa (ENSSAUG00010027543)	and3 (ENSSAUG00010027542)	DYNC1I2 (ENSSAUG00010027523)	slc25a12 (ENSSAUG00010027446)	metap1d (ENSSAUG00010027416)	itga6b (ENSSAUG00010027382)	ENSSAUG00010027365	rapgef4b (ENSSAUG00010027304)	ENSSAUG00010027286	ENSSAUG00010027017	epha4b (ENSSAUG00010026832)	ENSSAUG00010026828	ENSSAUG00010026824	ENSSAUG00010026822
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157413.h	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.f	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314	ENSGT00990000203766	ENSGT00940000171842
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000157413.h	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.f	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314	ENSGT00990000203766	ENSGT00940000171842
Pike perch	MODERN SPECIES	55	pgpep1 (ENSSLUG00000004242)	upf1 (ENSSLUG00000004153)	HOMER3 (ENSSLUG00000004119)	ENSSLUG00000004097	CTXN1 (ENSSLUG00000004074)	TIMM44 (ENSSLUG00000003631)	rab11bb (ENSSLUG00000003397)	MARCHF2 (ENSSLUG00000003365)	slc25a36a (ENSSLUG00000003329)	spsb4a (ENSSLUG00000003305)	clstn2a (ENSSLUG00000001936)	NMNAT3 (ENSSLUG00000001488)	rbp1.1 (ENSSLUG00000001482)	rbp2b (ENSSLUG00000024153)	copb2 (ENSSLUG00000023763)	dvl3a (ENSSLUG00000023682) ##22	ap2m1a (ENSSLUG00000023669)	pcyt1aa (ENSSLUG00000023650)	and3 (ENSSLUG00000023638)	DYNC1I2 (ENSSLUG00000021578)	slc25a12 (ENSSLUG00000019402)	metap1d (ENSSLUG00000019296)	ENSSLUG00000018774	rapgef4b (ENSSLUG00000018395)	ENSSLUG00000018366	ENSSLUG00000018016	epha4b (ENSSLUG00000017971)	ENSSLUG00000017961	ENSSLUG00000017954	ENSSLUG00000017942	ENSSLUG00000017938
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	8	upf1 (ENSCGOG00000015291)	HOMER3 (ENSCGOG00000015280)	uba52 (ENSCGOG00000015279)	ENSCGOG00000015260	CTXN1 (ENSCGOG00000015256)	TIMM44 (ENSCGOG00000014872)	rab11bb (ENSCGOG00000014861)	MARCHF2 (ENSCGOG00000014860)	slc25a36a (ENSCGOG00000014854)	spsb4a (ENSCGOG00000014851)	clstn2a (ENSCGOG00000014188)	NMNAT3 (ENSCGOG00000014162)	rbp1.1 (ENSCGOG00000014153)	rbp2b (ENSCGOG00000014126)	copb2 (ENSCGOG00000013176)	dvl3a (ENSCGOG00000012594) ##22	ap2m1a (ENSCGOG00000012546)	pcyt1aa (ENSCGOG00000012307)	and3 (ENSCGOG00000012296)	ENSCGOG00000010097	slc25a12 (ENSCGOG00000022233)	metap1d (ENSCGOG00000022166)	ITGA6 (ENSCGOG00000021796)	ENSCGOG00000021769	rapgef4b (ENSCGOG00000021434)	ENSCGOG00000021341	ENSCGOG00000021212	epha4b (ENSCGOG00000019000)	ENSCGOG00000018954	ENSCGOG00000018952	ENSCGOG00000018951
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157413.h	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.f	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00390000005067.b	ENSGT00940000155442.o	ENSGT00940000155963.e	ENSGT00940000157735	ENSGT00940000155353.a.a.b	ENSGT00940000164127.b	ENSGT00940000156075.a.b	ENSGT00940000163262.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000165265	ENSGT00940000175314	ENSGT00990000203766	ENSGT00940000171842
Stickleback	MODERN SPECIES	2	RAB3A (ENSGACG00000015513)	jund (ENSGACG00000015511)	pgpep1 (ENSGACG00000015509)	upf1 (ENSGACG00000015504)	ENSGACG00000015501	CERS4 (ENSGACG00000015496)	ENSGACG00000015495	TIMM44 (ENSGACG00000015487)	rab11bb (ENSGACG00000015479)	MARCHF2 (ENSGACG00000015477)	slc25a36a (ENSGACG00000015473)	spsb4a (ENSGACG00000015471)	clstn2a (ENSGACG00000015468)	NMNAT3 (ENSGACG00000015460)	copb2 (ENSGACG00000015455)	dvl3a (ENSGACG00000015451) ##22	ap2m1a (ENSGACG00000015444)	pcyt1aa (ENSGACG00000015442)	and3 (ENSGACG00000015438)	DYNC1I2 (ENSGACG00000015431)	slc25a12 (ENSGACG00000015426)	metap1d (ENSGACG00000015425)	itga6b (ENSGACG00000015418)	ENSGACG00000015416	ENSGACG00000015414	rapgef4b (ENSGACG00000015410)	ENSGACG00000015407	ENSGACG00000015397	epha4b (ENSGACG00000015386)	ENSGACG00000015381	PIP5K1C (ENSGACG00000015377)
Lumpfish	MODERN SPECIES	8	ENSCLMG00005009267	ENSCLMG00005009265	uba52 (ENSCLMG00005009262)	CERS4 (ENSCLMG00005009260)	CTXN1 (ENSCLMG00005009257)	TIMM44 (ENSCLMG00005009244)	rab11bb (ENSCLMG00005009159)	MARCHF2 (ENSCLMG00005009155)	slc25a36a (ENSCLMG00005009154)	spsb4a (ENSCLMG00005009153)	clstn2a (ENSCLMG00005009148)	NMNAT3 (ENSCLMG00005009145)	rbp1.1 (ENSCLMG00005009141)	rbp2b (ENSCLMG00005009140)	copb2 (ENSCLMG00005008047)	dvl3a (ENSCLMG00005007983) ##22	ap2m1a (ENSCLMG00005007959)	pcyt1aa (ENSCLMG00005007903)	and3 (ENSCLMG00005007900)	DYNC1I2 (ENSCLMG00005007699)	SLC25A12 (ENSCLMG00005002153)	metap1d (ENSCLMG00005002132)	ITGA6 (ENSCLMG00005001716)	rapgef4b (ENSCLMG00005008934)	MAP3K20 (ENSCLMG00005008789)	ENSCLMG00005008786	ENSCLMG00005008785	ENSCLMG00005008784	epha4b (ENSCLMG00005008782)	ENSCLMG00005008780	ENSCLMG00005008779
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	463															copb2 (ENSHCOG00000012717)	DVL3 (ENSHCOG00000012626) ##22	ap2m1a (ENSHCOG00000012620)	pcyt1aa (ENSHCOG00000012599)	ENSHCOG00000012582
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	8	uba52 (ENSMMDG00005016682)	ENSMMDG00005016688	CTXN1 (ENSMMDG00005016693)	TIMM44 (ENSMMDG00005016705)	rab11bb (ENSMMDG00005016770)	MARCHF2 (ENSMMDG00005016775)	slc25a36a (ENSMMDG00005016779)	spsb4a (ENSMMDG00005016781)	zgc:136870 (ENSMMDG00005016783)	clstn2a (ENSMMDG00005016797)	ENSMMDG00005016891	NMNAT3 (ENSMMDG00005016893)	rbp1.1 (ENSMMDG00005016895)	rbp2b (ENSMMDG00005016897)	copb2 (ENSMMDG00005016919)	dvl3a (ENSMMDG00005018119) ##22	ap2m1a (ENSMMDG00005018230)	pcyt1aa (ENSMMDG00005018238)	and3 (ENSMMDG00005018246)	DYNC1I2 (ENSMMDG00005018308)	slc25a12 (ENSMMDG00005021392)	metap1d (ENSMMDG00005021571)	itga6b (ENSMMDG00005021580)	ENSMMDG00005021594	rapgef4b (ENSMMDG00005021599)	rapgef4b (ENSMMDG00005021605)	ENSMMDG00005021609	ENSMMDG00005021626	epha4b (ENSMMDG00005021684)	ENSMMDG00005021686	ENSMMDG00005021688
Cod	MODERN SPECIES	21	ENSGMOG00000024170	ENSGMOG00000018197	ENSGMOG00000010623	ENSGMOG00000027799	ENSGMOG00000028248	ENSGMOG00000031425	ENSGMOG00000009211	ENSGMOG00000009200	slc25a36a (ENSGMOG00000023978)	spsb4a (ENSGMOG00000034486)	clstn2a (ENSGMOG00000009159)	NMNAT3 (ENSGMOG00000007890)	rbp1.1 (ENSGMOG00000026517)	rbp2b (ENSGMOG00000035830)	copb2 (ENSGMOG00000007877)	ENSGMOG00000007864 ##22	ENSGMOG00000007857	ENSGMOG00000007851	ENSGMOG00000025298	DYNC1I2 (ENSGMOG00000018897)	ENSGMOG00000018887	metap1d (ENSGMOG00000018879)	itga6b (ENSGMOG00000018855)	ENSGMOG00000033645	ENSGMOG00000018793	ENSGMOG00000018687	ENSGMOG00000031643	ENSGMOG00000026037	ENSGMOG00000032514	ENSGMOG00000026461	ENSGMOG00000034011
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	60	ENSGT00940000158081.o.b	ENSGT00940000153593.e.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00940000161729.m.a	ENSGT00390000011725.d	ENSGT00940000153655.A.b	ENSGT00390000011127.d	ENSGT00390000016906.a	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.b.b	ENSGT00940000174564	ENSGT00940000165275.A	ENSGT00940000157030.c.a	ENSGT00940000155435.A.b	ENSGT00940000159889.b.b.a.a	ENSGT00390000013003.e.b	ENSGT00940000157143.c.b
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	76	ENSGT00390000015368.a.a.c.g	ENSGT00940000157413.h.a	ENSGT00940000158081.o.b.d	ENSGT00940000153593.e.b.h	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b.a	ENSGT00940000163126.a.a.d	ENSGT00940000158995.b.b	ENSGT00940000154369.g.a.h	ENSGT01030000234629.C.a.b	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b.d	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675.a	ENSGT00900000141083.c.a.a	ENSGT00940000163467.a.b.b.a.b.e.b	ENSGT00950000182903.a.a.d.e ##22	ENSGT00940000159223.d.a	ENSGT00940000157384.a.d	ENSGT00940000161729.m.a.b	ENSGT00390000011725.d.z	ENSGT00940000153655.A.b	ENSGT00990000209702	ENSGT00390000011127.d.d	ENSGT00390000016906.a	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.b.b	ENSGT00940000174564.e	ENSGT00940000165275.A	ENSGT00940000157030.c.a.f	ENSGT00940000159889.b.b.a.a.b	ENSGT00390000013003.e.b	ENSGT00940000157143.c.b.f
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157413.h.a	ENSGT00940000158081.o.b.d	ENSGT00940000153593.e.b.g.a	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b.a	ENSGT00940000163126.a.a.d	ENSGT00940000158995.b.b	ENSGT00940000154369.g.a.h	ENSGT01030000234629.C.a.b	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b.d	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675.a.b	ENSGT00940000159675.a.a	ENSGT00900000141083.c.a.a	ENSGT00940000163467.a.b.b.a.b.e.b	ENSGT00950000182903.a.a.d.e ##22	ENSGT00940000159223.d.a	ENSGT00940000157384.a.d	ENSGT00940000161729.m.a.b.a.a	ENSGT00390000011725.d.z	ENSGT00940000153655.A.b	ENSGT00990000209702	ENSGT00390000011127.d.d	ENSGT00390000016906.a	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.b.b	ENSGT00940000174564.e	ENSGT00940000165275.A	ENSGT00940000157030.c.a.f	ENSGT00940000159889.b.b.a.a.b	ENSGT00390000013003.e.b	ENSGT00940000157143.c.b.f
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000015368.a.a.c.g	ENSGT00940000157413.h.a	ENSGT00940000158081.o.b.d	ENSGT00940000153593.e.b.g.a	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b.a	ENSGT00940000163126.a.a.d	ENSGT00940000158995.b.b	ENSGT00940000154369.g.a.h	ENSGT01030000234629.C.a.b	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b.d	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675.a.a	ENSGT00900000141083.c.a.a	ENSGT00940000163467.a.b.b.a.b.e.b	ENSGT00950000182903.a.a.d.e ##22	ENSGT00940000159223.d.a	ENSGT00940000157384.a.d	ENSGT00940000161729.m.a.b.a.a	ENSGT00390000011725.d.z	ENSGT00940000153655.A.b	ENSGT00990000209702	ENSGT00390000011127.d.d	ENSGT00390000016906.a	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.b.b	ENSGT00940000174564.e	ENSGT00940000165275.A	ENSGT00940000157030.c.a.f	ENSGT00940000159889.b.b.a.a.b	ENSGT00390000013003.e.b	ENSGT00940000157143.c.b.f
Rainbow trout	MODERN SPECIES	20	uba52 (ENSOMYG00000046709)	ENSOMYG00000059679	ENSOMYG00000046700	ENSOMYG00000046644	rab11bb (ENSOMYG00000046591)	ENSOMYG00000046583	slc25a36a (ENSOMYG00000046572)	ENSOMYG00000058056	spsb4a (ENSOMYG00000046561)	clstn2a (ENSOMYG00000046517)	NMNAT3 (ENSOMYG00000046471)	rbp1.1 (ENSOMYG00000003879)	rbp1.1 (ENSOMYG00000073442)	copb2 (ENSOMYG00000046308)	ENSOMYG00000046266	dvl3a (ENSOMYG00000046247) ##22	ENSOMYG00000046211	pcyt1aa (ENSOMYG00000046197)	SERP1 (ENSOMYG00000048273)	selenot1a (ENSOMYG00000046175)	ENSOMYG00000046167	ENSOMYG00000046154	ENSOMYG00000046134	zp3b (ENSOMYG00000046127)	ENSOMYG00000046124	ENSOMYG00000046121	ppm1la (ENSOMYG00000004863)	ENSOMYG00000069011	ENSOMYG00000046106	ENSOMYG00000046066	ENSOMYG00000046090
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000015368.a.a.c.g	ENSGT00940000157413.h.a	ENSGT00940000158081.o.b.d	ENSGT00940000153593.e.b.g.a	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b.a	ENSGT00940000163126.a.a.d	ENSGT00940000158995.b.b	ENSGT00940000154369.g.a.h	ENSGT01030000234629.C.a.b	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b.d	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675.a.a	ENSGT00900000141083.c.a.a	ENSGT00940000163467.a.b.b.a.b.e.b	ENSGT00950000182903.a.a.d.e ##22	ENSGT00940000159223.d.a	ENSGT00940000157384.a.d	ENSGT00940000161729.m.a.b.a.a	ENSGT00390000011725.d.z	ENSGT00940000153655.A.b	ENSGT00990000209702	ENSGT00390000011127.d.d	ENSGT00390000016906.a	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.b.b	ENSGT00940000174564.e	ENSGT00940000165275.A	ENSGT00940000157030.c.a.f	ENSGT00940000159889.b.b.a.a.b	ENSGT00390000013003.e.b	ENSGT00940000157143.c.b.f
Chinook salmon	MODERN SPECIES	2888	uba52 (ENSOTSG00005027254)	ENSOTSG00005027252	CTXN1 (ENSOTSG00005027251)	TIMM44 (ENSOTSG00005026371)	rab11bb (ENSOTSG00005026342)	MARCHF2 (ENSOTSG00005026341)	SLC25A36 (ENSOTSG00005026340)	slc25a36a (ENSOTSG00005026339)	spsb4a (ENSOTSG00005026338)	ENSOTSG00005026337	clstn2a (ENSOTSG00005026336)	NMNAT3 (ENSOTSG00005026335)	rbp1.1 (ENSOTSG00005026334)	copb2 (ENSOTSG00005023103)	ENSOTSG00005023098	dvl3a (ENSOTSG00005023093) ##22	ap2m1a (ENSOTSG00005023092)	pcyt1aa (ENSOTSG00005023090)	SERP1 (ENSOTSG00005023089)	selenot1a (ENSOTSG00005023087)	ENSOTSG00005023086	ENSOTSG00005023083	zgc:153615 (ENSOTSG00005023081)	ENSOTSG00005023080	zp3b (ENSOTSG00005023079)	ENSOTSG00005023078	arl14 (ENSOTSG00005023077)	ppm1la (ENSOTSG00005023076)	samhd1 (ENSOTSG00005022987)	ENSOTSG00005022979	ENSOTSG00005022928
Coho salmon	MODERN SPECIES	19	upf1 (ENSOKIG00005050636)	HOMER3 (ENSOKIG00005050624)	uba52 (ENSOKIG00005050621)	ENSOKIG00005050619	CTXN1 (ENSOKIG00005050616)	rab11bb (ENSOKIG00005050607)	MARCHF2 (ENSOKIG00005050598)	slc25a36a (ENSOKIG00005050589)	TIMM44 (ENSOKIG00005050575)	spsb4a (ENSOKIG00005050568)	clstn2a (ENSOKIG00005050560)	NMNAT3 (ENSOKIG00005050549)	rbp1.1 (ENSOKIG00005050546)	copb2 (ENSOKIG00005050504)	ENSOKIG00005050484	dvl3a (ENSOKIG00005050468) ##22	ap2m1a (ENSOKIG00005050452)	pcyt1aa (ENSOKIG00005050446)	SERP1 (ENSOKIG00005050444)	selenot1a (ENSOKIG00005050438)	ENSOKIG00005050433	ENSOKIG00005050428	zgc:153615 (ENSOKIG00005050423)	ENSOKIG00005050411	zp3b (ENSOKIG00005050407)	ENSOKIG00005050405	arl14 (ENSOKIG00005050400)	ppm1la (ENSOKIG00005050395)	ENSOKIG00005050393	ENSOKIG00005050390	RC3H1 (ENSOKIG00005050375)
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157413.h.a	ENSGT00940000158081.o.b.d	ENSGT00940000153593.e.b.g.b.a	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT00390000000051.b.a	ENSGT00940000163126.a.a.d	ENSGT00940000158995.b.b	ENSGT00940000154369.g.a.h	ENSGT01030000234629.C.a.b	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b.d	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00940000159675.a.b	ENSGT00940000159675.a.a	ENSGT00900000141083.c.a.a	ENSGT00940000163467.a.b.b.a.b.e.b	ENSGT00950000182903.a.a.d.e ##22	ENSGT00940000159223.d.a	ENSGT00940000157384.a.d	ENSGT00940000161729.m.a.b.a.a	ENSGT00390000011725.d.z	ENSGT00940000153655.A.b	ENSGT00990000209702	ENSGT00390000011127.d.d	ENSGT00390000016906.a	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.b.b	ENSGT00940000174564.e	ENSGT00940000165275.A	ENSGT00940000157030.c.a.f	ENSGT00940000159889.b.b.a.a.b	ENSGT00390000013003.e.b	ENSGT00940000157143.c.b.f
River trout	MODERN SPECIES	24	HOMER3 (ENSSTUG00000046586)	uba52 (ENSSTUG00000046572)	CTXN1 (ENSSTUG00000046563)	TIMM44 (ENSSTUG00000046222)	rab11bb (ENSSTUG00000046172)	MARCHF2 (ENSSTUG00000046167)	slc25a36a (ENSSTUG00000046079)	spsb4a (ENSSTUG00000046068)	ENSSTUG00000046064	clstn2a (ENSSTUG00000045666)	NMNAT3 (ENSSTUG00000045643)	rbp1.1 (ENSSTUG00000045630)	rbp1.1 (ENSSTUG00000045623)	copb2 (ENSSTUG00000045123)	ENSSTUG00000045094	dvl3a (ENSSTUG00000044755) ##22	ap2m1a (ENSSTUG00000044679)	pcyt1aa (ENSSTUG00000044654)	SERP1 (ENSSTUG00000044645)	selenot1a (ENSSTUG00000044625)	ENSSTUG00000044619	ENSSTUG00000044605	ENSSTUG00000044601	zgc:153615 (ENSSTUG00000044589)	ENSSTUG00000044576	zp3b (ENSSTUG00000044569)	ENSSTUG00000044564	arl14 (ENSSTUG00000044551)	ppm1la (ENSSTUG00000044539)	ENSSTUG00000044526	ENSSTUG00000044513
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	22	upf1 (ENSSSAG00000077507)	ENSSSAG00000077729	uba52 (ENSSSAG00000077735)	ENSSSAG00000077747	ENSSSAG00000077766	rab11bb (ENSSSAG00000077887)	marh2 (ENSSSAG00000077903)	slc25a36a (ENSSSAG00000101330)	spsb4a (ENSSSAG00000001822)	clstn2a (ENSSSAG00000001846)	nmnat3 (ENSSSAG00000095565)	rbp1.1 (ENSSSAG00000002082)	rbp1.1 (ENSSSAG00000084760)	copb2 (ENSSSAG00000002265)	ENSSSAG00000119258	ENSSSAG00000003034 ##22	ap2m1 (ENSSSAG00000072141)	ENSSSAG00000099258	PCY1A (ENSSSAG00000003115)	SERP1 (ENSSSAG00000003135)	selenot1a (ENSSSAG00000103633)	ENSSSAG00000003148	ENSSSAG00000003163	ENSSSAG00000111328	IL12p35b (ENSSSAG00000003180)	zp3b (ENSSSAG00000116730)	ENSSSAG00000003194	ENSSSAG00000106575	ppm1la (ENSSSAG00000003204)	ENSSSAG00000084240	ENSSSAG00000003222
Huchen	MODERN SPECIES	1342										ENSHHUG00000024583	NMNAT3 (ENSHHUG00000024587)	rbp1.1 (ENSHHUG00000024592)	copb2 (ENSHHUG00000024612)	ENSHHUG00000024749	ENSHHUG00000024752	dvl3a (ENSHHUG00000024769) ##22	ap2m1a (ENSHHUG00000025138)	pcyt1aa (ENSHHUG00000025172)	SERP1 (ENSHHUG00000025297)	selenot1a (ENSHHUG00000025327)	ENSHHUG00000025329	ENSHHUG00000025339
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	83	ENSGT00390000015368.a.a.c.h	ENSGT00940000157413.h.b	ENSGT00940000158081.o.b.c	ENSGT00940000153593.e.b.g.a	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00390000000051.b.b	ENSGT00940000163126.a.a.c	ENSGT00940000158995.b.a	ENSGT00940000154369.g.a.g	ENSGT01030000234629.C.a.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b.c	ENSGT00940000159675.b	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a.b	ENSGT00950000182903.a.a.d.f ##22	ENSGT00940000159223.d.b	ENSGT00940000157384.a.c	ENSGT00940000161729.m.a.a	ENSGT00940000180772	ENSGT00390000011725.d.y	ENSGT00390000011127.d.c	ENSGT00990000213680	ENSGT00940000174564.f	ENSGT00940000157030.c.a.e	ENSGT00940000155435.A.b	ENSGT00940000177269	ENSGT00940000159889.b.b.a.a.a	ENSGT00940000157143.c.b.e	ENSGT00940000157414	ENSGT00940000157353
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000015368.a.a.c.h	ENSGT00940000157413.h.b	ENSGT00940000158081.o.b.c	ENSGT00940000153593.e.b.g.b.b.a	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00390000000051.b.b	ENSGT00940000163126.a.a.c	ENSGT00940000158995.b.a	ENSGT00940000154369.g.a.g	ENSGT01030000234629.C.a.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b.c	ENSGT00940000159675.b	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a.b	ENSGT00950000182903.a.a.d.f ##22	ENSGT00940000159223.d.b	ENSGT00940000157384.a.c	ENSGT00940000161729.m.a.a	ENSGT00940000180772	ENSGT00390000011725.d.y	ENSGT00390000011127.d.c	ENSGT00990000213680	ENSGT00940000174564.f	ENSGT00940000157030.c.a.e	ENSGT00940000155435.A.b	ENSGT00940000177269	ENSGT00940000159889.b.b.a.a.a	ENSGT00940000157143.c.b.e	ENSGT00940000157414	ENSGT00940000157353
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000157413.h.b	ENSGT00940000158081.o.b.c	ENSGT00940000153593.e.b.g.b.b.a	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00390000000051.b.b	ENSGT00940000163126.a.a.c	ENSGT00940000158995.b.a	ENSGT00940000154369.g.a.g	ENSGT01030000234629.C.a.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b.c	ENSGT00990000213390	ENSGT00940000159675.b	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a.b	ENSGT00950000182903.a.a.d.f ##22	ENSGT00940000159223.d.b	ENSGT00940000157384.a.c	ENSGT00940000161729.m.a.a	ENSGT00940000180772	ENSGT00390000011725.d.y	ENSGT00390000011127.d.c	ENSGT00990000213680	ENSGT00940000157030.c.a.e	ENSGT00940000155435.A.b	ENSGT00940000159889.b.b.a.a.a	ENSGT00940000157143.c.b.e	ENSGT00940000157414	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b.c	ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b.d
River trout	MODERN SPECIES	13	HOMER3 (ENSSTUG00000045507)	uba52 (ENSSTUG00000045528)	ENSSTUG00000045550	TIMM44 (ENSSTUG00000045610)	rab11bb (ENSSTUG00000046273)	MARCHF2 (ENSSTUG00000046310)	slc25a36a (ENSSTUG00000046315)	spsb4a (ENSSTUG00000046366)	ENSSTUG00000046370	zgc:136870 (ENSSTUG00000046379)	ENSSTUG00000046381	clstn2a (ENSSTUG00000046411)	ENSSTUG00000047323	rbp1.1 (ENSSTUG00000047325)	copb2 (ENSSTUG00000047339)	DVL3 (ENSSTUG00000025749) ##22	AP2M1 (ENSSTUG00000025794)	pcyt1aa (ENSSTUG00000025829)	SERP1 (ENSSTUG00000025883)	ENSSTUG00000025900	selenot1a (ENSSTUG00000025910)	zgc:153615 (ENSSTUG00000025922)	ppm1la (ENSSTUG00000025944)	otol1a (ENSSTUG00000025973)	ENSSTUG00000025987	RC3H1 (ENSSTUG00000025995)	ENSSTUG00000026031	e2f5 (ENSSTUG00000026526)	ACKR4 (ENSSTUG00000026536)	ENSSTUG00000026541	ENSSTUG00000026571
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	5	ENSSSAG00000073752	ENSSSAG00000073759	rab11bb (ENSSSAG00000107231)	ENSSSAG00000073798	ENSSSAG00000086180	ENSSSAG00000087588	ENSSSAG00000073809	ENSSSAG00000087769	zgc:136870 (ENSSSAG00000073812)	clstn2a (ENSSSAG00000073830)	ENSSSAG00000111638	ENSSSAG00000074039	RET1 (ENSSSAG00000074041)	RBP2 (ENSSSAG00000074042)	copb2 (ENSSSAG00000074067)	ENSSSAG00000074540 ##22	ENSSSAG00000075127	pcyt1aa (ENSSSAG00000075137)	ENSSSAG00000075155	selenot1a (ENSSSAG00000039142)	zgc:153615 (ENSSSAG00000085417)	ENSSSAG00000039248	ENSSSAG00000090809	ENSSSAG00000039453	ENSSSAG00000104922	ENSSSAG00000039607	ENSSSAG00000040265	e2f5 (ENSSSAG00000040523)	ENSSSAG00000103244	ENSSSAG00000114496	ENSSSAG00000040548
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000015368.a.a.c.h	ENSGT00940000157413.h.b	ENSGT00940000158081.o.b.c	ENSGT00940000153593.f	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00390000000051.b.b	ENSGT00940000163126.a.a.c	ENSGT00940000158995.b.a	ENSGT00940000154369.g.a.g	ENSGT01030000234629.C.a.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b.c	ENSGT00940000159675.b	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a.b	ENSGT00950000182903.a.a.d.f ##22	ENSGT00940000159223.d.b	ENSGT00940000157384.a.c	ENSGT00940000161729.m.a.a	ENSGT00940000180772	ENSGT00390000011725.d.y	ENSGT00390000011127.d.c	ENSGT00940000174564.f	ENSGT00940000157030.c.a.e	ENSGT00940000155435.A.b	ENSGT00940000177269	ENSGT00940000159889.b.b.a.a.a	ENSGT00940000157143.c.b.e	ENSGT00940000157414	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b.c
Rainbow trout	MODERN SPECIES	29	jund (ENSOMYG00000001855)	pgpep1 (ENSOMYG00000001889)	upf1 (ENSOMYG00000002069)	ENSOMYG00000002121	uba52 (ENSOMYG00000002136)	ENSOMYG00000002163	ENSOMYG00000076562	ENSOMYG00000002736	rb11a (ENSOMYG00000003016)	ENSOMYG00000073077	slc25a36a (ENSOMYG00000003050)	spsb4a (ENSOMYG00000003071)	clstn2a (ENSOMYG00000003476)	rbp1 (ENSOMYG00000068944)	copb2 (ENSOMYG00000004282)	ENSOMYG00000004665 ##22	ap2m1 (ENSOMYG00000004709)	pcyt1aa (ENSOMYG00000004765)	ENSOMYG00000058103	ENSOMYG00000076782	selenot1a (ENSOMYG00000004828)	zgc:153615 (ENSOMYG00000004856)	ENSOMYG00000069296	ENSOMYG00000004891	ENSOMYG00000004921	ENSOMYG00000005000	ENSOMYG00000005143	e2f5 (ENSOMYG00000005177)	ENSOMYG00000005183	ENSOMYG00000067137	ENSOMYG00000056163
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00390000015368.a.a.c.h	ENSGT00940000157413.h.b	ENSGT00940000158081.o.b.c	ENSGT00940000153593.e.b.g.b.b.a	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00390000000051.b.b	ENSGT00940000163126.a.a.c	ENSGT00940000158995.b.a	ENSGT00940000154369.g.a.g	ENSGT01030000234629.C.a.a	ENSGT00940000162556.D.b.a	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b.c	ENSGT00940000159675.b	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00900000141083.c.a.b	ENSGT00950000182903.a.a.d.f ##22	ENSGT00940000159223.d.b	ENSGT00940000157384.a.c	ENSGT00940000161729.m.a.a	ENSGT00940000180772	ENSGT00390000011725.d.y	ENSGT00390000011127.d.c	ENSGT00940000174564.f	ENSGT00940000157030.c.a.e	ENSGT00940000155435.A.b	ENSGT00940000177269	ENSGT00940000159889.b.b.a.a.a	ENSGT00940000157143.c.b.e	ENSGT00940000157414	ENSGT00940000157353	ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b.c
Coho salmon	MODERN SPECIES	23	jund (ENSOKIG00005033465)	pgpep1 (ENSOKIG00005033478)	upf1 (ENSOKIG00005033533)	HOMER3 (ENSOKIG00005034071)	uba52 (ENSOKIG00005034082)	ENSOKIG00005034115	TIMM44 (ENSOKIG00005034165)	rab11bb (ENSOKIG00005034516)	MARCHF2 (ENSOKIG00005034573)	slc25a36a (ENSOKIG00005034598)	spsb4a (ENSOKIG00005034605)	ENSOKIG00005034614	clstn2a (ENSOKIG00005034701)	rbp1.1 (ENSOKIG00005035895)	ENSOKIG00005035958	DVL3 (ENSOKIG00005036594) ##22	AP2M1 (ENSOKIG00005036681)	pcyt1aa (ENSOKIG00005036745)	SERP1 (ENSOKIG00005036785)	ENSOKIG00005036801	selenot1a (ENSOKIG00005036806)	zgc:153615 (ENSOKIG00005036820)	ENSOKIG00005036839	PPM1L (ENSOKIG00005036858)	otol1a (ENSOKIG00005036876)	ENSOKIG00005036901	ENSOKIG00005036921	RC3H1 (ENSOKIG00005036932)	ENSOKIG00005037019	ENSOKIG00005037129	e2f5 (ENSOKIG00005037133)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	1	pgpep1 (ENSOTSG00005032074)	upf1 (ENSOTSG00005032079)	HOMER3 (ENSOTSG00005032705)	uba52 (ENSOTSG00005032711)	ENSOTSG00005032740	TIMM44 (ENSOTSG00005032758)	rab11bb (ENSOTSG00005034280)	MARCHF2 (ENSOTSG00005034282)	slc25a36a (ENSOTSG00005034288)	spsb4a (ENSOTSG00005034296)	zgc:136870 (ENSOTSG00005034297)	clstn2a (ENSOTSG00005034298)	rbp1.1 (ENSOTSG00005034697)	rbp2b (ENSOTSG00005034699)	copb2 (ENSOTSG00005034708)	DVL3 (ENSOTSG00005035208) ##22	AP2M1 (ENSOTSG00005035211)	pcyt1aa (ENSOTSG00005035227)	SERP1 (ENSOTSG00005035228)	selenot1a (ENSOTSG00005035229)	zgc:153615 (ENSOTSG00005035230)	ENSOTSG00005035231	ppm1la (ENSOTSG00005035232)	otol1a (ENSOTSG00005035233)	ENSOTSG00005035234	RC3H1 (ENSOTSG00005035236)	ENSOTSG00005035237	e2f5 (ENSOTSG00005035238)	ACKR4 (ENSOTSG00005035239)	ENSOTSG00005035241	ENSOTSG00005035242
Huchen	MODERN SPECIES	791												ENSHHUG00000035966	rbp1.1 (ENSHHUG00000035953)	rbp2b (ENSHHUG00000035941)	copb2 (ENSHHUG00000035698)	dvl3a (ENSHHUG00000035656) ##22	AP2M1 (ENSHHUG00000035608)	pcyt1aa (ENSHHUG00000035564)	SERP1 (ENSHHUG00000035561)	selenot1a (ENSHHUG00000035549)	zgc:153615 (ENSHHUG00000035531)	ENSHHUG00000035514	ppm1la (ENSHHUG00000035505)	otol1a (ENSHHUG00000035494)	ENSHHUG00000035490	RC3H1 (ENSHHUG00000035464)	ENSHHUG00000035460	ENSHHUG00000035425	e2f5 (ENSHHUG00000035411)	ACKR4 (ENSHHUG00000035406)	ENSHHUG00000035403
Northern pike	MODERN SPECIES	2	upf1 (ENSELUG00000020917)	HOMER3 (ENSELUG00000020980)	uba52 (ENSELUG00000027664)	CERS4 (ENSELUG00000020996)	CTXN1 (ENSELUG00000000927)	TIMM44 (ENSELUG00000021107)	rab11bb (ENSELUG00000021148)	MARCHF2 (ENSELUG00000000931)	slc25a36a (ENSELUG00000021181)	spsb4a (ENSELUG00000021197)	clstn2a (ENSELUG00000021303)	NMNAT3 (ENSELUG00000021366)	rbp1.1 (ENSELUG00000021393)	rbp2b (ENSELUG00000021410)	copb2 (ENSELUG00000021442)	dvl3a (ENSELUG00000021493) ##22	ap2m1a (ENSELUG00000021515)	pcyt1aa (ENSELUG00000021543)	zgc:92744 (ENSELUG00000021578)	selenot1a (ENSELUG00000021595)	ENSELUG00000021606	zgc:153615 (ENSELUG00000021618)	ENSELUG00000021639	zp3b (ENSELUG00000021647)	ENSELUG00000021657	ppm1la (ENSELUG00000021679)	ENSELUG00000021689	otol1a (ENSELUG00000021696)	ENSELUG00000021713	ENSELUG00000021721	RC3H1 (ENSELUG00000021770)
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	499																ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00940000161729.m.a	ENSGT00390000011725.d.`b	ENSGT00940000153655.A.b	ENSGT00390000011127.d	ENSGT00390000016906.a
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	104	ENSGT00940000155807.b	ENSGT00940000155511.n.b	ENSGT00390000001015.c	ENSGT00990000204283	ENSGT00940000160511.a	ENSGT01030000234579.A.b.b	ENSGT00670000098080	ENSGT01000000214434.A.m	ENSGT00940000162473	ENSGT00390000018687	ENSGT00940000156055	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.a	ENSGT00940000155439.a.a	ENSGT00390000006294.d	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00940000161729.m.b.g	ENSGT00390000011725.d.`b	ENSGT00390000011127.d	ENSGT01030000234567.B.a.b.a.b.b
Denticle herring	MODERN SPECIES	14	zgc:110269 (ENSDCDG00000019891)	agfg1b (ENSDCDG00000019886)	fbxo36b (ENSDCDG00000019885)	ENSDCDG00000019883	grk7a (ENSDCDG00000019881)	atp1b3a (ENSDCDG00000019879)	xrn1 (ENSDCDG00000019821)	gk5 (ENSDCDG00000019810)	ppp1r7 (ENSDCDG00000019802)	ubxn7 (ENSDCDG00000019799)	tfa (ENSDCDG00000019511)	eif4g1a (ENSDCDG00000016816)	fam131aa (ENSDCDG00000016769)	CLCN2 (ENSDCDG00000016547)	thpo (ENSDCDG00000016507)	dvl3a (ENSDCDG00000016480) ##22	ap2m1a (ENSDCDG00000016469)	pcyt1aa (ENSDCDG00000016456)	SERP1 (ENSDCDG00000016448)	selenot1a (ENSDCDG00000016445)	zgc:153615 (ENSDCDG00000016441)	ENSDCDG00000016415	ENSDCDG00000016414	ppm1la (ENSDCDG00000016413)	ENSDCDG00000016411	ENSDCDG00000016409	RC3H1 (ENSDCDG00000016400)	zgc:110366 (ENSDCDG00000016390)	extl2 (ENSDCDG00000016386)	ENSDCDG00000016365	DBT (ENSDCDG00000016356)
Atlantic herring	MODERN SPECIES	14	ENSCHAG00000016141	ENSCHAG00000016083	ENSCHAG00000016050	grk7a (ENSCHAG00000016043)	atp1b3a (ENSCHAG00000016031)	xrn1 (ENSCHAG00000012135)	gk5 (ENSCHAG00000011477)	ppp1r7 (ENSCHAG00000011431)	ubxn7 (ENSCHAG00000011239)	tfa (ENSCHAG00000010406)	eif4g1a (ENSCHAG00000005617)	fam131aa (ENSCHAG00000005480)	CLCN2 (ENSCHAG00000002174)	ENSCHAG00000002088	ENSCHAG00000001308	dvl3a (ENSCHAG00000000950) ##22	ap2m1a (ENSCHAG00000000899)	pcyt1aa (ENSCHAG00000000780)	SERP1 (ENSCHAG00000000757)	selenot1a (ENSCHAG00000000724)	DDR2 (ENSCHAG00000000563)	ENSCHAG00000017284	rgs5b (ENSCHAG00000017250)	ENSCHAG00000017225	ENSCHAG00000017213	NMUR1 (ENSCHAG00000016995)	cpdp (ENSCHAG00000016978)	ENSCHAG00000016918	med31 (ENSCHAG00000016908)	ENSCHAG00000016891	RPS6KB2 (ENSCHAG00000016541)
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	101	ENSGT00940000154396.b.b.b	ENSGT00940000156311.b.b	ENSGT00940000163540	ENSGT00390000018059.b.b	ENSGT00950000182827.C.a	ENSGT00550000075090	ENSGT00940000156349.d	ENSGT00940000164993.g	ENSGT00390000014781	ENSGT00940000156350.g	ENSGT00940000154811.B.a.b	ENSGT00960000186677	ENSGT00940000166991	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000155918.c.b	ENSGT00940000164792.b	ENSGT00940000155406.h	ENSGT00940000156280.a.a	ENSGT00940000166821.a	ENSGT00940000155281	ENSGT00940000158227	ENSGT00950000183019.f.a.c.b	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.a.b.b	ENSGT00940000156961	ENSGT00940000154973.a.a	ENSGT00940000154973.b	ENSGT01100000263484.A.c.a.a.a	ENSGT00390000010302	ENSGT00390000012807
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000154396.b.b.b	ENSGT00940000156311.b.b	ENSGT00940000163540	ENSGT00390000018059.b.b	ENSGT00950000182827.C.a	ENSGT00550000075090	ENSGT00940000156349.d	ENSGT00940000164993.g	ENSGT00390000014781	ENSGT00940000156350.g	ENSGT00940000154811.B.a.b	ENSGT00960000186677	ENSGT00940000166991	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000155918.c.b	ENSGT00940000164792.b	ENSGT00940000155406.h	ENSGT00940000156280.a.a	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.a.b.a	ENSGT00940000156961	ENSGT00940000154973.a.a	ENSGT00940000154973.b	ENSGT01100000263484.A.c.a.a.a	ENSGT00390000010302	ENSGT00390000012807	ENSGT00940000160465.k.b	ENSGT00940000153664.B.r	ENSGT00940000154942.f	ENSGT00400000022158.b
Channel catfish	MODERN SPECIES	26	tctex1d1 (ENSIPUG00000013268)	ENSIPUG00000013257	bcl6ab (ENSIPUG00000013251)	cmpk1 (ENSIPUG00000013193)	FAM78B (ENSIPUG00000013178)	slc35a3b (ENSIPUG00000013163)	imp3 (ENSIPUG00000013142)	c7h1orf21 (ENSIPUG00000013127)	tsen15 (ENSIPUG00000013118)	ENSIPUG00000013030	abi1b (ENSIPUG00000012914)	ANXA13 (ENSIPUG00000012843)	ENSIPUG00000012798	ENSIPUG00000012785	pcyt1aa (ENSIPUG00000012756)	dvl3a (ENSIPUG00000012687) ##22	ENSIPUG00000012644	prtfdc1b (ENSIPUG00000012550)	ENSIPUG00000012475	dpp6b (ENSIPUG00000012403)	ENSIPUG00000012378	ENSIPUG00000012359	VPS4B (ENSIPUG00000012291)	kdsr (ENSIPUG00000012232)	BCL2 (ENSIPUG00000012216)	PRKAG2 (ENSIPUG00000012142)	NMUR1 (ENSIPUG00000012126)	cpdp (ENSIPUG00000012115)	ENSIPUG00000012096	tsc22d2 (ENSIPUG00000012081)	pfn2a (ENSIPUG00000012039)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000154396.b.b.b	ENSGT00940000156311.b.b	ENSGT00940000163540	ENSGT00390000018059.b.b	ENSGT00950000182827.C.a	ENSGT00550000075090	ENSGT00940000156349.d	ENSGT00940000164993.g	ENSGT00390000014781	ENSGT00940000156350.g	ENSGT00940000154811.B.a.b	ENSGT00960000186677	ENSGT00940000166991	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000155918.c.b	ENSGT00940000164792.b	ENSGT00940000155406.h	ENSGT00940000156280.a.a	ENSGT00940000166821.a	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.a.b.a	ENSGT00940000156961	ENSGT00940000154973.a.a	ENSGT00940000154973.b	ENSGT01100000263484.A.c.a.a.a	ENSGT00390000010302	ENSGT00390000012807	ENSGT00940000160465.k.b	ENSGT00940000153664.B.q.b.b	ENSGT00940000153664.B.r
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000160185	ENSGT00940000154396.b.b.b	ENSGT00940000156311.b.b	ENSGT00940000163540	ENSGT00390000018059.b.b	ENSGT00950000182827.C.a	ENSGT00550000075090	ENSGT00940000164993.g	ENSGT00390000014781	ENSGT00940000156350.g	ENSGT00940000154811.B.a.b	ENSGT00960000186677	ENSGT00940000166991	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000155918.c.b	ENSGT00940000164792.b	ENSGT00940000155406.h	ENSGT00940000156280.a.a	ENSGT00940000166821.a	ENSGT00950000183019.f.a.c.b	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.a.b.a	ENSGT00940000156961	ENSGT00940000154973.a.a	ENSGT00940000154973.b	ENSGT01100000263484.A.c.a.a.a	ENSGT00390000010302	ENSGT00390000012807	ENSGT00940000160465.k.b	ENSGT00940000153664.B.q.b.b
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	91	dynlt5 (ENSPNAG00000017335)	insl5b (ENSPNAG00000017317)	bcl6ab (ENSPNAG00000017299)	cmpk (ENSPNAG00000017200)	FAM78B (ENSPNAG00000017171)	slc35a3b (ENSPNAG00000017158)	imp3 (ENSPNAG00000017113)	ENSPNAG00000017087	tsen15 (ENSPNAG00000017061)	ENSPNAG00000017047	abi1b (ENSPNAG00000005183)	ENSPNAG00000016940	anxa13l (ENSPNAG00000016925)	ap2m1a (ENSPNAG00000006812)	pcyt1aa (ENSPNAG00000003446)	dvl3a (ENSPNAG00000016757) ##22	GPR158 (ENSPNAG00000016692)	prtfdc1b (ENSPNAG00000016677)	ARHGAP21 (ENSPNAG00000016645)	dpp6b (ENSPNAG00000016604)	KMT2C (ENSPNAG00000016560)	ENSPNAG00000016500	PRKAG2 (ENSPNAG00000016490)	BCL2 (ENSPNAG00000016446)	ENSPNAG00000016440	kdsr (ENSPNAG00000016406)	vps4b (ENSPNAG00000016361)	ENSPNAG00000016313	NMUR1 (ENSPNAG00000016291)	cpdp (ENSPNAG00000016261)	ENSPNAG00000016146
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	7	SGIP1 (ENSAMXG00000018748)	ENSAMXG00000040810	dynlt5 (ENSAMXG00000036810)	bcl6ab (ENSAMXG00000032964)	cmpk (ENSAMXG00000036164)	FAM78B (ENSAMXG00000018730)	slc35a3b (ENSAMXG00000018726)	imp3 (ENSAMXG00000018715)	zgc:55943 (ENSAMXG00000036475)	tsen15 (ENSAMXG00000039126)	ENSAMXG00000037508	abi1b (ENSAMXG00000034858)	anxa13l (ENSAMXG00000036850)	ap2m1a (ENSAMXG00000029317)	pcyt1aa (ENSAMXG00000018644)	dvl3a (ENSAMXG00000018632) ##22	ENSAMXG00000018609	prtfdc1b (ENSAMXG00000018588)	ARHGAP21 (ENSAMXG00000018574)	dpp6b (ENSAMXG00000018543)	ENSAMXG00000042830	ENSAMXG00000036099	PRKAG2 (ENSAMXG00000001819)	BCL2 (ENSAMXG00000001829)	kdsr (ENSAMXG00000001843)	vps4b (ENSAMXG00000001866)	ENSAMXG00000034906	NMUR1 (ENSAMXG00000001875)	cpdp (ENSAMXG00000001885)	ENSAMXG00000043436	TSC22D2 (ENSAMXG00000032536)
Electric eel	MODERN SPECIES	28	ENSEEEG00000010320	dynlt5 (ENSEEEG00000010319)	ENSEEEG00000010318	bcl6ab (ENSEEEG00000010317)	CMPK1 (ENSEEEG00000010315)	FAM78B (ENSEEEG00000010314)	slc35a3b (ENSEEEG00000010245)	imp3 (ENSEEEG00000010233)	sec22ba (ENSEEEG00000010231)	ENSEEEG00000010230	tsen15 (ENSEEEG00000010229)	abi1b (ENSEEEG00000010160)	anxa13l (ENSEEEG00000010152)	ap2m1a (ENSEEEG00000010142)	pcyt1aa (ENSEEEG00000010138)	dvl3a (ENSEEEG00000010135) ##22	GPR158 (ENSEEEG00000010133)	prtfdc1b (ENSEEEG00000010129)	ARHGAP21 (ENSEEEG00000010125)	dpp6b (ENSEEEG00000010122)	ENSEEEG00000010120	ENSEEEG00000010104	ENSEEEG00000009832	BCL2 (ENSEEEG00000009818)	kdsr (ENSEEEG00000009816)	vps4b (ENSEEEG00000008910)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	61	ENSGT00940000154396.b.b.b	ENSGT00940000156311.b.b	ENSGT00940000163540	ENSGT00390000018059.b.b	ENSGT00950000182827.C.a	ENSGT00550000075090	ENSGT00940000156349.d	ENSGT00940000164993.g	ENSGT00390000014781	ENSGT00940000156350.g	ENSGT00940000154811.B.a.b	ENSGT00960000186677	ENSGT00940000166991	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00950000182903.a.a.d ##22	ENSGT00940000161729.m.a	ENSGT00390000011725.d.`b	ENSGT00940000153655.A.b	ENSGT00390000011127.d	ENSGT00390000016906.a	ENSGT00530000063273.a	ENSGT00390000003420.a.b.i.a	ENSGT00940000156826	ENSGT00940000157207.b	ENSGT00390000003478	ENSGT00940000159735	ENSGT00940000157634.d	ENSGT00940000156273	ENSGT00940000155917	ENSGT00390000005307
Cyprininae	DUPLICATION
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Reedfish	MODERN SPECIES	10	ENSECRG00000006047	ephb3a (ENSECRG00000006085)	hykk.2 (ENSECRG00000006140)	NMUR1 (ENSECRG00000006171)	pcyt1ab (ENSECRG00000004498)	dynlt2b (ENSECRG00000004514)	cpdp (ENSECRG00000004522)	ENSECRG00000004538	RUBCN (ENSECRG00000004560)	FYTTD1 (ENSECRG00000004587)	LRCH3 (ENSECRG00000004616)	ENSECRG00000004660	rpl35a (ENSECRG00000004668)	abcc5 (ENSECRG00000004685)	rnpepl1 (ENSECRG00000004729)	dvl3a (ENSECRG00000004740) ##22	AP2M1 (ENSECRG00000004758)	mmp23bb (ENSECRG00000004777)	ABCF3 (ENSECRG00000004797)	ENSECRG00000004811	ENSECRG00000004824	ECEL1 (ENSECRG00000004845)	zgc:153039 (ENSECRG00000004861)	chrd (ENSECRG00000004880)	clcn2b (ENSECRG00000004911)	ENSECRG00000004944	fam131ab (ENSECRG00000004957)	alp3 (ENSECRG00000004981)	ENSECRG00000005087	EIF4G1 (ENSECRG00000005110)	ENSECRG00000005140
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Coelacanth	MODERN SPECIES	553											ENSLACG00000016168	ENSLACG00000016015	ABCC5 (ENSLACG00000015618)	RNPEPL1 (ENSLACG00000015483)	POLR2H (ENSLACG00000015017)	DVL3 (ENSLACG00000014483) ##22	AP2M1 (ENSLACG00000013840)	mmp23bb (ENSLACG00000013699)	ABCF3 (ENSLACG00000013409)	ENSLACG00000013252	ENSLACG00000013208	ENSLACG00000013080	CCDC150 (ENSLACG00000012460)	ENSLACG00000011789	ALG3 (ENSLACG00000011542)	ENSLACG00000010421	mul1a (ENSLACG00000010106)	ECE2 (ENSLACG00000008806)	PSMD2 (ENSLACG00000007998)	EIF4G1 (ENSLACG00000004851)	alp3 (ENSLACG00000003972)
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00530000063106.A	ENSGT00950000183063.c.b.b	ENSGT00950000183063.c.b.a	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000166623	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000164221.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000155604	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000167666	ENSGT00390000005285	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00530000063106.A	ENSGT00950000183063.c.b.b	ENSGT00950000183063.c.b.a	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000166623	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000164221.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000167797	ENSGT00940000155439
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00950000183063.c.b.a	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000166623	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00960000192626	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00950000183063.c.b.a	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00960000192626	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.a.a	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00960000192626	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000160672	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B
Aves	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.a.a	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.d	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.c	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.b	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.a	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000160672	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.d	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.c	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.b	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.a	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000160672	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.d	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.c	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.b	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.a	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00940000164682
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.d	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.c	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.b.b	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.b.a	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.a	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	106	ENSABRG00000006887	ENSABRG00000006886	CHRND (ENSABRG00000006878)	CHRNG (ENSABRG00000006875)	EIF4E2 (ENSABRG00000006862)	ENSABRG00000006824	ENSABRG00000006789	ENSABRG00000006778	ENSABRG00000006770	ENSABRG00000006755	ENSABRG00000006745	CAPN10 (ENSABRG00000006494)	RNPEPL1 (ENSABRG00000006233)	ABCC5 (ENSABRG00000005246)	EIF2B5 (ENSABRG00000004048)	DVL3 (ENSABRG00000003117) ##22	AP2M1 (ENSABRG00000002384)	ENSABRG00000002327	ABCF3 (ENSABRG00000000294)	ENSABRG00000000192	ENSABRG00000000181	VWA5B2 (ENSABRG00000000095)	ALG3 (ENSABRG00000000083)
Duck	MODERN SPECIES	27	ENSAPLG00000012888	CHRND (ENSAPLG00000028659)	CHRNG (ENSAPLG00000019862)	EIF4E2 (ENSAPLG00000016200)	ENSAPLG00000018395	ENSAPLG00000031186	ENSAPLG00000020476	ENSAPLG00000021716	ENSAPLG00000025747	ENSAPLG00000000586	ENSAPLG00000002401	CAPN10 (ENSAPLG00000003326)	RNPEPL1 (ENSAPLG00000003566)	ABCC5 (ENSAPLG00000003817)	EIF2B5 (ENSAPLG00000005467)	DVL3 (ENSAPLG00000005855) ##22	AP2M1 (ENSAPLG00000006667)	ENSAPLG00000023373	RHBDD1 (ENSAPLG00000013107)	ENSAPLG00000013112	ENSAPLG00000027503	ENSAPLG00000025974	ENSAPLG00000014524	MFF (ENSAPLG00000003615)	MRPL44 (ENSAPLG00000017027)	AGFG1 (ENSAPLG00000007855)	ENSAPLG00000017361	SLC19A3 (ENSAPLG00000008141)	ENSAPLG00000029592	ENSAPLG00000008214	SPHKAP (ENSAPLG00000008536)
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.d	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.c	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.b	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.a	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00940000164682
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.d	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.c	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.b	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.a	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00940000164682	ENSGT00940000161767
Chicken	MODERN SPECIES	38	ECEL1 (ENSGALG00010017702)	ENSGALG00010017828	ENSGALG00010017861	CHRND (ENSGALG00010017868)	CHRNG (ENSGALG00010017878)	EIF4E2 (ENSGALG00010017905)	CYP2AB5 (ENSGALG00010017917)	CYP2AB4 (ENSGALG00010019033)	CYP2AB3 (ENSGALG00010017924)	CYP2AB2 (ENSGALG00010017931)	CYP2AB1 (ENSGALG00010017945)	CAPN10 (ENSGALG00010017958)	RNPEPL1 (ENSGALG00010017972)	ABCC5 (ENSGALG00010017985)	EIF2B5 (ENSGALG00010017756)	DVL3 (ENSGALG00010017773) ##22	AP2M1 (ENSGALG00010019023)	ABCF3 (ENSGALG00010018008)	ENSGALG00010015052	ENSGALG00010018609	ENSGALG00010015056	ENSGALG00010015059	EEF1AKMT4 (ENSGALG00010015063)	ENSGALG00010015075	ECE2 (ENSGALG00010019004)	PSMD2 (ENSGALG00010015085)	EIF4G1 (ENSGALG00010017540)	FAM131A (ENSGALG00010017554)	HSPB7L (ENSGALG00010017560)	CLCN2 (ENSGALG00010017575)	CHRD (ENSGALG00010015908)
Turkey	MODERN SPECIES	2	ENSMGAG00000008233	ECEL1 (ENSMGAG00000008296)	ENSMGAG00000008325	ENSMGAG00000008343	CHRND (ENSMGAG00000008354)	CHRNG (ENSMGAG00000008414)	ENSMGAG00000008475	ENSMGAG00000008500	ENSMGAG00000008585	ENSMGAG00000008590	ENSMGAG00000008598	ENSMGAG00000008744	ENSMGAG00000008792	ABCC5 (ENSMGAG00000008822)	EIF2B5 (ENSMGAG00000008878)	DVL3 (ENSMGAG00000008905) ##22	AP2M1 (ENSMGAG00000008959)	ABCF3 (ENSMGAG00000008981)	ENSMGAG00000019211	ALG3 (ENSMGAG00000009011)	EEF1AKMT4 (ENSMGAG00000020563)	ENSMGAG00000009039	PSMD2 (ENSMGAG00000017210)	EIF4G1 (ENSMGAG00000009232)	FAM131A (ENSMGAG00000009223)	ENSMGAG00000009216	CLCN2 (ENSMGAG00000016899)	ENSMGAG00000009672	ENSMGAG00000019141	ENSMGAG00000009035	ENSMGAG00000009147
Japanese quail	MODERN SPECIES	27	ENSCJPG00005013725	ENSCJPG00005013726	CHRND (ENSCJPG00005013727)	CHRNG (ENSCJPG00005013728)	EIF4E2 (ENSCJPG00005013729)	ENSCJPG00005013731	ENSCJPG00005013732	ENSCJPG00005013733	ENSCJPG00005013735	ENSCJPG00005013736	CAPN10 (ENSCJPG00005013737)	RNPEPL1 (ENSCJPG00005013738)	ABCC5 (ENSCJPG00005013739)	ENSCJPG00005013740	EIF2B5 (ENSCJPG00005013741)	DVL3 (ENSCJPG00005013742) ##22	AP2M1 (ENSCJPG00005013743)	ABCF3 (ENSCJPG00005013744)	ENSCJPG00005013745	ENSCJPG00005013746	EEF1AKMT4 (ENSCJPG00005013748)	ALG3 (ENSCJPG00005013749)	CAMK2N2 (ENSCJPG00005013750)	PSMD2 (ENSCJPG00005013752)	EIF4G1 (ENSCJPG00005013753)	FAM131A (ENSCJPG00005013756)	ENSCJPG00005013757	CLCN2 (ENSCJPG00005013763)	CHRD (ENSCJPG00005013764)	ENSCJPG00005013765	POLR2H (ENSCJPG00005013766)
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.d	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.c	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.b	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.a	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000160672	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00950000183063.c.b.b	ENSGT00950000183063.c.b.a	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.d	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.c	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000160672	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a
Golden eagle	MODERN SPECIES	1	ENSACCG00020004112	ENSACCG00020004087	ECEL1 (ENSACCG00020004070)	ENSACCG00020004059	ENSACCG00020004041	CHRND (ENSACCG00020004016)	CHRNG (ENSACCG00020004003)	EIF4E2 (ENSACCG00020003990)	ENSACCG00020003978	ENSACCG00020003965	ENSACCG00020003956	CAPN10 (ENSACCG00020003935)	RNPEPL1 (ENSACCG00020003919)	ABCC5 (ENSACCG00020003891)	EIF2B5 (ENSACCG00020003855)	DVL3 (ENSACCG00020003832) ##22	AP2M1 (ENSACCG00020003790)	ABCF3 (ENSACCG00020003759)	ENSACCG00020003737	ENSACCG00020003731	VWA5B2 (ENSACCG00020003710)	ALG3 (ENSACCG00020003691)	EEF1AKMT4 (ENSACCG00020003679)	CAMK2N2 (ENSACCG00020003666)	ENSACCG00020003654	ECE2 (ENSACCG00020003627)	PSMD2 (ENSACCG00020003582)	EIF4G1 (ENSACCG00020003297)	FAM131A (ENSACCG00020003092)	ENSACCG00020003080	CLCN2 (ENSACCG00020002611)
Kakapo	MODERN SPECIES	25	ENSSHBG00005017712	ENSSHBG00005017693	ECEL1 (ENSSHBG00005017678)	ENSSHBG00005017658	ENSSHBG00005017640	CHRND (ENSSHBG00005017627)	CHRNG (ENSSHBG00005017623)	EIF4E2 (ENSSHBG00005017615)	ENSSHBG00005017607	ENSSHBG00005017597	ENSSHBG00005017588	CAPN10 (ENSSHBG00005017572)	RNPEPL1 (ENSSHBG00005017567)	ABCC5 (ENSSHBG00005017550)	EIF2B5 (ENSSHBG00005017537)	DVL3 (ENSSHBG00005017532) ##22	AP2M1 (ENSSHBG00005017524)	ABCF3 (ENSSHBG00005017509)	ENSSHBG00005017500	ENSSHBG00005017496	VWA5B2 (ENSSHBG00005017490)	ALG3 (ENSSHBG00005017484)	EEF1AKMT4 (ENSSHBG00005017477)	CAMK2N2 (ENSSHBG00005017469)	ENSSHBG00005017466	ECE2 (ENSSHBG00005015841)	PSMD2 (ENSSHBG00005015749)	EIF4G1 (ENSSHBG00005015714)	FAM131A (ENSSHBG00005015702)	ENSSHBG00005015699	ENSSHBG00005015694
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.d	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.c	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.b	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.a	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.d	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.c	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.b	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.a	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439
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Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.d	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.c	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.b	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.a	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439
Medium ground finch	MODERN SPECIES	12	ENSGFOG00000013069	CHRND (ENSGFOG00000013077)	CHRNG (ENSGFOG00000013084)	EIF4E2 (ENSGFOG00000013089)	ENSGFOG00000013097	ENSGFOG00000013109	ENSGFOG00000013118	ENSGFOG00000013120	ENSGFOG00000013121	ENSGFOG00000013123	CAPN10 (ENSGFOG00000013128)	RNPEPL1 (ENSGFOG00000013132)	ABCC5 (ENSGFOG00000013137)	ENSGFOG00000013141	EIF2B5 (ENSGFOG00000013146)	DVL3 (ENSGFOG00000013155) ##22	AP2M1 (ENSGFOG00000013170)	ABCF3 (ENSGFOG00000013180)	ENSGFOG00000013196	VWA5B2 (ENSGFOG00000013200)	ALG3 (ENSGFOG00000013208)	EEF1AKMT4 (ENSGFOG00000013211)	ENSGFOG00000013215	ECE2 (ENSGFOG00000013220)	PSMD2 (ENSGFOG00000013440)	EIF4G1 (ENSGFOG00000013491)	FAM131A (ENSGFOG00000013688)	CLCN2 (ENSGFOG00000013696)	CHRD (ENSGFOG00000013723)	ENSGFOG00000013730	POLR2H (ENSGFOG00000013736)
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Zebra finch	MODERN SPECIES	31	ECEL1 (ENSTGUG00000009882)	ENSTGUG00000009837	ENSTGUG00000009910	ENSTGUG00000009922	ENSTGUG00000021593	CHRND (ENSTGUG00000024595)	CHRNG (ENSTGUG00000009924)	EIF4E2 (ENSTGUG00000009955)	ENSTGUG00000009970	ENSTGUG00000009989	CAPN10 (ENSTGUG00000010021)	ENSTGUG00000009991	RNPEPL1 (ENSTGUG00000010032)	ABCC5 (ENSTGUG00000010048)	EIF2B5 (ENSTGUG00000010097)	DVL3 (ENSTGUG00000010112) ##22	AP2M1 (ENSTGUG00000010123)	ABCF3 (ENSTGUG00000010142)	ENSTGUG00000010165	ENSTGUG00000020466	ENSTGUG00000010170	ENSTGUG00000024697	ALG3 (ENSTGUG00000010178)	EEF1AKMT4 (ENSTGUG00000022737)	CAMK2N2 (ENSTGUG00000021822)	ENSTGUG00000010230	ECE2 (ENSTGUG00000010193)	PSMD2 (ENSTGUG00000010231)	EIF4G1 (ENSTGUG00000010269)	FAM131A (ENSTGUG00000028038)	ENSTGUG00000010320
Great tit	MODERN SPECIES	29	ECEL1 (ENSPMJG00000000433)	ENSPMJG00000000507	ENSPMJG00000000547	CHRND (ENSPMJG00000000665)	CHRNG (ENSPMJG00000000685)	EIF4E2 (ENSPMJG00000000745)	ENSPMJG00000000765	ENSPMJG00000000776	ENSPMJG00000000796	ENSPMJG00000000802	ENSPMJG00000000820	CAPN10 (ENSPMJG00000001270)	RNPEPL1 (ENSPMJG00000001306)	ABCC5 (ENSPMJG00000001321)	EIF2B5 (ENSPMJG00000001367)	DVL3 (ENSPMJG00000001391) ##22	AP2M1 (ENSPMJG00000001422)	ABCF3 (ENSPMJG00000001438)	ENSPMJG00000001455	VWA5B2 (ENSPMJG00000001460)	ALG3 (ENSPMJG00000001494)	EEF1AKMT4 (ENSPMJG00000001503)	CAMK2N2 (ENSPMJG00000001508)	ENSPMJG00000001515	ECE2 (ENSPMJG00000001542)	PSMD2 (ENSPMJG00000001590)	EIF4G1 (ENSPMJG00000001606)	FAM131A (ENSPMJG00000001650)	ENSPMJG00000001652	CLCN2 (ENSPMJG00000001659)	CHRD (ENSPMJG00000001677)
African ostrich	MODERN SPECIES	861	ECEL1 (ENSSCUG00000014104)	ENSSCUG00000014124	CHRND (ENSSCUG00000014144)	CHRNG (ENSSCUG00000014148)	EIF4E2 (ENSSCUG00000014151)	ENSSCUG00000014153	ENSSCUG00000014156	ENSSCUG00000014158	ENSSCUG00000014160	ENSSCUG00000014164	ENSSCUG00000014168	CAPN10 (ENSSCUG00000014186)	RNPEPL1 (ENSSCUG00000014191)	ABCC5 (ENSSCUG00000014210)	EIF2B5 (ENSSCUG00000014253)	DVL3 (ENSSCUG00000014269) ##22	AP2M1 (ENSSCUG00000014277)	ABCF3 (ENSSCUG00000014280)	ENSSCUG00000014282	ALG3 (ENSSCUG00000014289)	ENSSCUG00000014293	ECE2 (ENSSCUG00000014295)	PSMD2 (ENSSCUG00000014300)	EIF4G1 (ENSSCUG00000014328)	CLCN2 (ENSSCUG00000014410)	ENSSCUG00000014413	POLR2H (ENSSCUG00000014414)
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	30	ENSCPRG00005011934	ENSCPRG00005011918	CHRND (ENSCPRG00005011874)	CHRNG (ENSCPRG00005011869)	EIF4E2 (ENSCPRG00005011843)	ENSCPRG00005011833	ENSCPRG00005011815	ENSCPRG00005011795	ENSCPRG00005011763	ENSCPRG00005011757	CAPN10 (ENSCPRG00005011749)	RNPEPL1 (ENSCPRG00005011747)	ENSCPRG00005011740	ABCC5 (ENSCPRG00005011727)	EIF2B5 (ENSCPRG00005011698)	DVL3 (ENSCPRG00005011601) ##22	AP2M1 (ENSCPRG00005011583)	ENSCPRG00005011577	ABCF3 (ENSCPRG00005011569)	ENSCPRG00005011562	ENSCPRG00005011560	VWA5B2 (ENSCPRG00005011544)	ALG3 (ENSCPRG00005011534)	EEF1AKMT4 (ENSCPRG00005011532)	ENSCPRG00005011529	ECE2 (ENSCPRG00005011525)	PSMD2 (ENSCPRG00005011504)	EIF4G1 (ENSCPRG00005010865)	FAM131A (ENSCPRG00005010802)	ENSCPRG00005010793	CLCN2 (ENSCPRG00005010788)
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00950000183063.c.b.a	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.a.b.b.b	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00960000192626	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000160688	ENSGT00940000160672	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.a.b.b.b	ENSGT00950000185325	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00960000192626	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00950000183063.c.b.a	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.a.b.b.b	ENSGT00950000185325	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	32	ENSTMTG00000013215	ENSTMTG00000013192	CHRND (ENSTMTG00000013097)	ENSTMTG00000013075	ENSTMTG00000013063	CHRNG (ENSTMTG00000012891)	EIF4E2 (ENSTMTG00000012855)	ENSTMTG00000012832	ENSTMTG00000012825	ENSTMTG00000012772	CAPN10 (ENSTMTG00000012316)	RNPEPL1 (ENSTMTG00000012245)	ENSTMTG00000012184	ENSTMTG00000012157	EIF2B5 (ENSTMTG00000012140)	DVL3 (ENSTMTG00000012092) ##22	AP2M1 (ENSTMTG00000012065)	ENSTMTG00000012034	ABCF3 (ENSTMTG00000012006)	VWA5B2 (ENSTMTG00000011471)	ALG3 (ENSTMTG00000011419)	EEF1AKMT4 (ENSTMTG00000011413)	CAMK2N2 (ENSTMTG00000011402)	ENSTMTG00000011380	ECE2 (ENSTMTG00000011153)	PSMD2 (ENSTMTG00000011123)	EIF4G1 (ENSTMTG00000010999)	FAM131A (ENSTMTG00000010966)	ENSTMTG00000010948	ENSTMTG00000010939	ENSTMTG00000010851
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Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.a.b.b.b	ENSGT00940000163166.b.a.b.b.a	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00960000192626	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000155604	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	23	ENSGEVG00005019368	ECEL1 (ENSGEVG00005019434)	ENSGEVG00005019456	ENSGEVG00005019475	CHRND (ENSGEVG00005019489)	CHRNG (ENSGEVG00005019597)	EIF4E2 (ENSGEVG00005019775)	ENSGEVG00005019789	ENSGEVG00005019800	ENSGEVG00005019812	CAPN10 (ENSGEVG00005019825)	RNPEPL1 (ENSGEVG00005019837)	ABCC5 (ENSGEVG00005019846)	ENSGEVG00005019879	EIF2B5 (ENSGEVG00005004053)	DVL3 (ENSGEVG00005004090) ##22	AP2M1 (ENSGEVG00005004125)	ABCF3 (ENSGEVG00005004161)	ENSGEVG00005004192	VWA5B2 (ENSGEVG00005004245)	ALG3 (ENSGEVG00005004314)	EEF1AKMT4 (ENSGEVG00005004350)	CAMK2N2 (ENSGEVG00005004363)	ENSGEVG00005004378	ECE2 (ENSGEVG00005004413)	PSMD2 (ENSGEVG00005004487)	ENSGEVG00005004572	EIF4G1 (ENSGEVG00005004614)	FAM131A (ENSGEVG00005004688)	ENSGEVG00005004734	ENSGEVG00005004779
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	2264	ENSCABG00000012543	ENSCABG00000012613	CHRND (ENSCABG00000012620)	ENSCABG00000012707	EIF4E2 (ENSCABG00000012710)	ENSCABG00000012716	ENSCABG00000012720	ENSCABG00000012722	ENSCABG00000012725	ENSCABG00000012727	ENSCABG00000012730	RNPEPL1 (ENSCABG00000012731)	ABCC5 (ENSCABG00000012733)	EIF2B5 (ENSCABG00000012741)	ENSCABG00000012743	DVL3 (ENSCABG00000012746) ##22	AP2M1 (ENSCABG00000012818)	ENSCABG00000012824	ABCF3 (ENSCABG00000012827)	ENSCABG00000012831	ENSCABG00000012835	VWA5B2 (ENSCABG00000012848)	ALG3 (ENSCABG00000012871)	EEF1AKMT4 (ENSCABG00000012874)	CAMK2N2 (ENSCABG00000012877)	ENSCABG00000012880	ECE2 (ENSCABG00000012890)	PSMD2 (ENSCABG00000012934)	EIF4G1 (ENSCABG00000012937)	FAM131A (ENSCABG00000012953)	ENSCABG00000012981
Chinese turtle	MODERN SPECIES	2228	PDE6D (ENSPSIG00000017630)	COPS7B (ENSPSIG00000006766)	ENSPSIG00000007421	DIS3L2 (ENSPSIG00000007443)	ENSPSIG00000009801	ECEL1 (ENSPSIG00000011154)	CHRNG (ENSPSIG00000011304)	ENSPSIG00000012184	EIF4E2 (ENSPSIG00000012188)	ENSPSIG00000012261	ENSPSIG00000012274	CAPN10 (ENSPSIG00000012664)	RNPEPL1 (ENSPSIG00000012988)	ABCC5 (ENSPSIG00000013164)	EIF2B5 (ENSPSIG00000013933)	DVL3 (ENSPSIG00000014554) ##22	AP2M1 (ENSPSIG00000015193)	ENSPSIG00000015255	ABCF3 (ENSPSIG00000015267)	ENSPSIG00000015331	VWA5B2 (ENSPSIG00000015339)	ALG3 (ENSPSIG00000015727)	EEF1AKMT4 (ENSPSIG00000015771)	ECE2 (ENSPSIG00000015773)	PSMD2 (ENSPSIG00000016135)	ENSPSIG00000016610	ENSPSIG00000016626	FAM131A (ENSPSIG00000016632)	CLCN2 (ENSPSIG00000016683)	ENSPSIG00000017002	ENSPSIG00000017098
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00950000183063.c.b.a	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000166623	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00960000192626	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000155604	ENSGT00390000009210	ENSGT01040000240503.B	ENSGT00940000157496	ENSGT00530000063882.b	ENSGT00950000182903.a.b #22	ENSGT00940000171017	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00950000183063.c.b.a	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000166623	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00960000192626	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000163166.b.b.b.a.b.b	ENSGT00940000163166.b.b.b.a.a
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000166623	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.a.a	ENSGT00940000163166.a.a.a	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683
Common wall lizard	MODERN SPECIES	13	ENSPMRG00000019415	CHRND (ENSPMRG00000019392)	CHRNG (ENSPMRG00000019371)	EIF4E2 (ENSPMRG00000019358)	ENSPMRG00000019351	ENSPMRG00000019346	ENSPMRG00000019336	ENSPMRG00000019325	ENSPMRG00000019319	ENSPMRG00000019296	ENSPMRG00000019274	ENSPMRG00000019265	RNPEPL1 (ENSPMRG00000019252)	ABCC5 (ENSPMRG00000019232)	EIF2B5 (ENSPMRG00000019216)	DVL3 (ENSPMRG00000019203) ##22	AP2M1 (ENSPMRG00000019193)	ENSPMRG00000019173	ENSPMRG00000019145	ENSPMRG00000019138	ENSPMRG00000019132	ENSPMRG00000019129	ENSPMRG00000019122	ENSPMRG00000019112	ENSPMRG00000019091	ENSPMRG00000019082	ENSPMRG00000019079	ENSPMRG00000019076	ENSPMRG00000019062	ENSPMRG00000019056	ENSPMRG00000019048
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	111				ENSSMRG00000019710	ENSSMRG00000019711	ENSSMRG00000019712	EIF4E2 (ENSSMRG00000019713)	ENSSMRG00000019714	ENSSMRG00000019715	ENSSMRG00000019716	ENSSMRG00000019717	CAPN10 (ENSSMRG00000019718)	RNPEPL1 (ENSSMRG00000019719)	ABCC5 (ENSSMRG00000019720)	EIF2B5 (ENSSMRG00000019721)	DVL3 (ENSSMRG00000019722) ##22	AP2M1 (ENSSMRG00000019723)	ENSSMRG00000019724	ENSSMRG00000019725	ENSSMRG00000019726	ENSSMRG00000019728	ENSSMRG00000019729	ENSSMRG00000019730	ENSSMRG00000019731	ENSSMRG00000019732
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00950000183063.c.b.a	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.b.b.b.a.a	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00960000192626	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000163166.b.b.a	ENSGT00940000163166.b.b.b.a.a.a
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00530000063106.A	ENSGT00950000183063.c.b.a	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000163166.b.b.b.b.a.a	ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.a	ENSGT00940000163497.a	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000163166.b.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000163166.b.b.b.a.b.b.a.a.a.b	ENSGT00940000163166.b.b.b.b.b
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	175											ENSGT00940000163497.a	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000163166.b.b.b.a.a.a.a
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	155											ENSGT00940000163497.a	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000163166.b.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000163166.b.b.b.a.b.b.a.b	ENSGT00940000163166.b.b.b.a.b.b.a.a.a.a.a.a
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	181										ENSPTXG00000017046	ENSPTXG00000017044	CAPN10 (ENSPTXG00000017040)	RNPEPL1 (ENSPTXG00000017034)	ABCC5 (ENSPTXG00000017024)	EIF2B5 (ENSPTXG00000016994)	DVL3 (ENSPTXG00000016983) ##22	AP2M1 (ENSPTXG00000016969)	ENSPTXG00000016964	ENSPTXG00000016956	ENSPTXG00000016949	ENSPTXG00000016942
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	416																DVL3 (ENSNSUG00000007274) ##22	AP2M1 (ENSNSUG00000007278)	ENSNSUG00000007281	ENSNSUG00000007282	ENSNSUG00000007285	ENSNSUG00000007286
Indian cobra	MODERN SPECIES	3	ENSNNAG00000006727	ENSNNAG00000006699	ENSNNAG00000006625	ENSNNAG00000006587	CHRND (ENSNNAG00000006466)	ENSNNAG00000006436	ENSNNAG00000006421	ENSNNAG00000006318	ENSNNAG00000006295	ENSNNAG00000006269	ENSNNAG00000006249	CAPN10 (ENSNNAG00000006211)	RNPEPL1 (ENSNNAG00000006181)	ABCC5 (ENSNNAG00000006055)	EIF2B5 (ENSNNAG00000005974)	DVL3 (ENSNNAG00000005944) ##22	AP2M1 (ENSNNAG00000005877)	ENSNNAG00000005789	ENSNNAG00000005745	ENSNNAG00000005730	ENSNNAG00000005718	ENSNNAG00000005700	ENSNNAG00000005656	ENSNNAG00000005616	ENSNNAG00000005598	ENSNNAG00000005590	ENSNNAG00000005583	ENSNNAG00000005569	ENSNNAG00000018543	ENSNNAG00000018540	ENSNNAG00000018536
Lizard	MODERN SPECIES	859				ENSACAG00000042053	ENSACAG00000012056	ENSACAG00000028467	ENSACAG00000012051	ENSACAG00000011570	ENSACAG00000011299	ENSACAG00000011238	ENSACAG00000011186	ENSACAG00000038961	ABCC5 (ENSACAG00000010771)	EIF2B5 (ENSACAG00000010709)	ENSACAG00000041934	DVL3 (ENSACAG00000010552) ##22	AP2M1 (ENSACAG00000010513)	ENSACAG00000045017	ENSACAG00000001969	ENSACAG00000040643	ENSACAG00000010307	ENSACAG00000010263	ENSACAG00000038751	ENSACAG00000040311	ENSACAG00000029183	ENSACAG00000045170	ENSACAG00000036414	ENSACAG00000038980	ENSACAG00000039057	ENSACAG00000009906	ENSACAG00000009904
tuatara	MODERN SPECIES	1534	EIF4E2 (ENSSPUG00000012423)	ENSSPUG00000012445	ENSSPUG00000012455	CYP2AB14 (ENSSPUG00000012475)	CYP2AB15 (ENSSPUG00000012535)	CYP2AB16 (ENSSPUG00000012609)	CYP2AB17 (ENSSPUG00000012667)	CYP2AB18 (ENSSPUG00000012687)	CYP2AB20 (ENSSPUG00000012698)	CYP2AB21 (ENSSPUG00000012725)	CAPN10 (ENSSPUG00000012811)	RNPEPL1 (ENSSPUG00000013298)	ABCC5 (ENSSPUG00000013333)	ENSSPUG00000013405	EIF2B5 (ENSSPUG00000013415)	DVL3 (ENSSPUG00000013447) ##22	AP2M1 (ENSSPUG00000013637)	ENSSPUG00000013714	ABCF3 (ENSSPUG00000013725)	ENSSPUG00000013739	ENSSPUG00000013749	ENSSPUG00000013762	ALG3 (ENSSPUG00000013775)	EEF1AKMT4 (ENSSPUG00000013790)	CAMK2N2 (ENSSPUG00000013807)	ENSSPUG00000013813	ECE2 (ENSSPUG00000013820)	PSMD2 (ENSSPUG00000013845)	EIF4G1 (ENSSPUG00000013879)	ENSSPUG00000013969	ENSSPUG00000013974
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	49	ENSGT00940000157155	ENSGT00390000015492.B	ENSGT00530000063106.A	ENSGT00950000183063.c.b.a	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000164152	ENSGT00940000157183.a.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000164221.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Platypus	MODERN SPECIES		ENSOANG00000041868	ENSOANG00000045204	COPS7B (ENSOANG00000045588)	EIF4E2 (ENSOANG00000048067)	CHRNG (ENSOANG00000012957)	CHRND (ENSOANG00000006528)	PRSS56 (ENSOANG00000005505)	ENSOANG00000008651	ECEL1 (ENSOANG00000001689)	DIS3L2 (ENSOANG00000041984)	ENSOANG00000038692	CAPN10 (ENSOANG00000012323)	RNPEPL1 (ENSOANG00000009418)	ABCC5 (ENSOANG00000008866)	EIF2B5 (ENSOANG00000001406)	DVL3 (ENSOANG00000008082) ##22	AP2M1 (ENSOANG00000050848)	ABCF3 (ENSOANG00000044255)	VWA5B2 (ENSOANG00000048199)	ENSOANG00000042816	EEF1AKMT4 (ENSOANG00000051267)	CAMK2N2 (ENSOANG00000043760)	ECE2 (ENSOANG00000030877)	PSMD2 (ENSOANG00000007604)	EIF4G1 (ENSOANG00000005781)	FAM131A (ENSOANG00000050047)	CLCN2 (ENSOANG00000009942)	POLR2H (ENSOANG00000010454)	ENSOANG00000047057	CHRD (ENSOANG00000008145)	ENSOANG00000047799
Theria	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT00940000157155	ENSGT00390000015492.B	ENSGT00530000063106.A	ENSGT00950000183063.c.b.a	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000157183.a.b	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000164221.b	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00470000042552	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000164826	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00470000042552	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000163715.a	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00470000042552	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00470000042552	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00470000042552	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00470000042552	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00470000042552	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00940000156921	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Arabian camel	MODERN SPECIES		ENSCDRG00005002021	MCF2L2 (ENSCDRG00005002052)	B3GNT5 (ENSCDRG00005002144)	ENSCDRG00005002149	KLHL6 (ENSCDRG00005002158)	KLHL24 (ENSCDRG00005002173)	YEATS2 (ENSCDRG00005002196)	MAP6D1 (ENSCDRG00005002239)	PARL (ENSCDRG00005002270)	ENSCDRG00005002327	ABCC5 (ENSCDRG00005002355)	ENSCDRG00005002462	ENSCDRG00005002524	HTR3E (ENSCDRG00005002578)	EIF2B5 (ENSCDRG00005002686)	DVL3 (ENSCDRG00005002731) ##22	AP2M1 (ENSCDRG00005002765)	ABCF3 (ENSCDRG00005002817)	VWA5B2 (ENSCDRG00005002872)	ALG3 (ENSCDRG00005002897)	EEF1AKMT4 (ENSCDRG00005002912)	ECE2 (ENSCDRG00005002940)	PSMD2 (ENSCDRG00005003015)	EIF4G1 (ENSCDRG00005003100)	FAM131A (ENSCDRG00005003200)	CLCN2 (ENSCDRG00005003238)	POLR2H (ENSCDRG00005003368)	THPO (ENSCDRG00005003414)	CHRD (ENSCDRG00005003469)	ENSCDRG00005003545	EPHB3 (ENSCDRG00005003581)
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00470000042552	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000163715.a	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Yarkand deer	MODERN SPECIES	10	ENSCHYG00000013773	MCCC1 (ENSCHYG00000013336)	LAMP3 (ENSCHYG00000013102)	MCF2L2 (ENSCHYG00000013028)	ENSCHYG00000012973	ENSCHYG00000012825	KLHL24 (ENSCHYG00000012697)	ENSCHYG00000012636	YEATS2 (ENSCHYG00000011810)	PARL (ENSCHYG00000011557)	ABCC5 (ENSCHYG00000011061)	ENSCHYG00000010955	ENSCHYG00000010728	HTR3E (ENSCHYG00000010491)	EIF2B5 (ENSCHYG00000010374)	DVL3 (ENSCHYG00000010004) ##22	ENSCHYG00000009683	ABCF3 (ENSCHYG00000009398)	VWA5B2 (ENSCHYG00000009135)	ALG3 (ENSCHYG00000009074)	EEF1AKMT4 (ENSCHYG00000009036)	PSMD2 (ENSCHYG00000008396)	EIF4G1 (ENSCHYG00000007562)	FAM131A (ENSCHYG00000007456)	CLCN2 (ENSCHYG00000006630)	POLR2H (ENSCHYG00000006460)	THPO (ENSCHYG00000006400)	CHRD (ENSCHYG00000006315)	ENSCHYG00000006277	EPHB3 (ENSCHYG00000006169)	MAGEF1 (ENSCHYG00000006153)
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000163715.a	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	139	DCUN1D1 (ENSMMSG00000000928)	MCCC1 (ENSMMSG00000000836)	ENSMMSG00000000791	B3GNT5 (ENSMMSG00000000777)	KLHL6 (ENSMMSG00000000728)	KLHL24 (ENSMMSG00000000711)	YEATS2 (ENSMMSG00000000661)	MAP6D1 (ENSMMSG00000000647)	PARL (ENSMMSG00000000606)	ABCC5 (ENSMMSG00000000523)	ENSMMSG00000000472	ENSMMSG00000000406	ENSMMSG00000000331	HTR3E (ENSMMSG00000000244)	EIF2B5 (ENSMMSG00000000201)	DVL3 (ENSMMSG00000000155) ##22	AP2M1 (ENSMMSG00000000113)	ABCF3 (ENSMMSG00000000062)	VWA5B2 (ENSMMSG00000000029)	ALG3 (ENSMMSG00000012454)	EEF1AKMT4 (ENSMMSG00000012435)	CAMK2N2 (ENSMMSG00000012415)	ECE2 (ENSMMSG00000012292)	PSMD2 (ENSMMSG00000012141)	EIF4G1 (ENSMMSG00000011758)	FAM131A (ENSMMSG00000011699)	CLCN2 (ENSMMSG00000011628)	POLR2H (ENSMMSG00000011541)	THPO (ENSMMSG00000011450)	CHRD (ENSMMSG00000011283)	ENSMMSG00000011220
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000154552	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000163715.a	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000154552	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000163715.a	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES		DCUN1D1 (ENSOARG00020005500)	MCCC1 (ENSOARG00020005367)	ENSOARG00020005267	B3GNT5 (ENSOARG00020005246)	MCF2L2 (ENSOARG00020005175)	KLHL6 (ENSOARG00020005141)	KLHL24 (ENSOARG00020005097)	YEATS2 (ENSOARG00020004961)	MAP6D1 (ENSOARG00020004912)	PARL (ENSOARG00020004881)	ABCC5 (ENSOARG00020004748)	ENSOARG00020004672	ENSOARG00020004585	ENSOARG00020004391	EIF2B5 (ENSOARG00020004361)	DVL3 (ENSOARG00020004223) ##22	AP2M1 (ENSOARG00020004092)	ABCF3 (ENSOARG00020004044)	VWA5B2 (ENSOARG00020003898)	ALG3 (ENSOARG00020003862)	EEF1AKMT4 (ENSOARG00020003838)	CAMK2N2 (ENSOARG00020003814)	ECE2 (ENSOARG00020003310)	PSMD2 (ENSOARG00020003166)	EIF4G1 (ENSOARG00020003022)	FAM131A (ENSOARG00020002962)	CLCN2 (ENSOARG00020002595)	POLR2H (ENSOARG00020002486)	THPO (ENSOARG00020002426)	CHRD (ENSOARG00020002248)	ENSOARG00020002214
Goat	MODERN SPECIES		ENSCHIG00000012113	B3GNT5 (ENSCHIG00000007874)	MCF2L2 (ENSCHIG00000012229)	ENSCHIG00000023082	KLHL24 (ENSCHIG00000021673)	ENSCHIG00000010607	MAP6D1 (ENSCHIG00000017564)	YEATS2 (ENSCHIG00000013530)	PARL (ENSCHIG00000026220)	ABCC5 (ENSCHIG00000024341)	ENSCHIG00000026222	ENSCHIG00000019914	ENSCHIG00000015435	ENSCHIG00000017073	EIF2B5 (ENSCHIG00000026144)	DVL3 (ENSCHIG00000013014) ##22	AP2M1 (ENSCHIG00000018814)	ABCF3 (ENSCHIG00000018349)	VWA5B2 (ENSCHIG00000007439)	ALG3 (ENSCHIG00000015770)	CAMK2N2 (ENSCHIG00000018201)	ECE2 (ENSCHIG00000012826)	PSMD2 (ENSCHIG00000016997)	EIF4G1 (ENSCHIG00000009775)	FAM131A (ENSCHIG00000015881)	CLCN2 (ENSCHIG00000012282)	POLR2H (ENSCHIG00000006695)	THPO (ENSCHIG00000017758)	CHRD (ENSCHIG00000011375)	ENSCHIG00000020124	ENSCHIG00000009628
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000153525.g.b.a.n	ENSGT00940000164015	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223.n	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
American bison	MODERN SPECIES	3281	B3GNT5 (ENSBBBG00000007365)	ENSBBBG00000007417	KLHL6 (ENSBBBG00000003863)	KLHL24 (ENSBBBG00000003862)	ENSBBBG00000015498	YEATS2 (ENSBBBG00000002697)	PARL (ENSBBBG00000003851)	ENSBBBG00000015445	ENSBBBG00000015439	ABCC5 (ENSBBBG00000015427)	ENSBBBG00000003487	ENSBBBG00000003498	ENSBBBG00000001253	EIF2B5 (ENSBBBG00000001309)	ENSBBBG00000001371	DVL3 (ENSBBBG00000001379) ##22	AP2M1 (ENSBBBG00000015302)	ABCF3 (ENSBBBG00000015199)	VWA5B2 (ENSBBBG00000015159)	ALG3 (ENSBBBG00000015154)	EEF1AKMT4 (ENSBBBG00000015133)	CAMK2N2 (ENSBBBG00000015130)	ECE2 (ENSBBBG00000015118)	PSMD2 (ENSBBBG00000015048)	EIF4G1 (ENSBBBG00000003700)	FAM131A (ENSBBBG00000003585)	CLCN2 (ENSBBBG00000014739)	POLR2H (ENSBBBG00000014568)	THPO (ENSBBBG00000009127)	CHRD (ENSBBBG00000003393)	ENSBBBG00000003343
Bos	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000153525.g.b.a.n	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00390000017491.t.t.a.a	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223.n	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000153525.g.b.a.n	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000163715.a	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00390000017491.t.t.a.a	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223.n	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES		ENSBIXG00005019943	MCF2L2 (ENSBIXG00005019985)	ENSBIXG00005020055	KLHL24 (ENSBIXG00005020085)	ENSBIXG00005020097	YEATS2 (ENSBIXG00005020144)	MAP6D1 (ENSBIXG00005003322)	PARL (ENSBIXG00005020209)	ENSBIXG00005003364	ENSBIXG00005020252	ABCC5 (ENSBIXG00005003430)	ENSBIXG00005005742	ENSBIXG00005020515	ENSBIXG00005007343	EIF2B5 (ENSBIXG00005003518)	DVL3 (ENSBIXG00005006824) ##22	ENSBIXG00005006041	ABCF3 (ENSBIXG00005021033)	VWA5B2 (ENSBIXG00005021081)	ALG3 (ENSBIXG00005021154)	CAMK2N2 (ENSBIXG00005021179)	PSMD2 (ENSBIXG00005021531)	EIF4G1 (ENSBIXG00005021923)	FAM131A (ENSBIXG00005021986)	CLCN2 (ENSBIXG00005022492)	POLR2H (ENSBIXG00005022599)	THPO (ENSBIXG00005022636)	CHRD (ENSBIXG00005003880)	ENSBIXG00005022688	ENSBIXG00005022691	EPHB3 (ENSBIXG00005022730)
Cow	MODERN SPECIES		B3GNT5 (ENSBTAG00000010397)	ENSBTAG00000032217	MCF2L2 (ENSBTAG00000010394)	KLHL6 (ENSBTAG00000037951)	KLHL24 (ENSBTAG00000017450)	ENSBTAG00000014449	YEATS2 (ENSBTAG00000014451)	MAP6D1 (ENSBTAG00000014459)	PARL (ENSBTAG00000014460)	ENSBTAG00000052825	ABCC5 (ENSBTAG00000017666)	ENSBTAG00000039011	HTR3C (ENSBTAG00000016624)	ENSBTAG00000040304	EIF2B5 (ENSBTAG00000011414)	DVL3 (ENSBTAG00000019336) ##22	AP2M1 (ENSBTAG00000020106)	ABCF3 (ENSBTAG00000006920)	VWA5B2 (ENSBTAG00000040399)	ALG3 (ENSBTAG00000005652)	ECE2 (ENSBTAG00000051586)	CAMK2N2 (ENSBTAG00000005657)	ECE2 (ENSBTAG00000005658)	PSMD2 (ENSBTAG00000005660)	EIF4G1 (ENSBTAG00000012881)	FAM131A (ENSBTAG00000012273)	CLCN2 (ENSBTAG00000012284)	POLR2H (ENSBTAG00000040199)	THPO (ENSBTAG00000000476)	CHRD (ENSBTAG00000002878)	ENSBTAG00000050376
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000153525.g.b.a.n	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00390000017491.t.t.a.a	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223.n	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00960000190787	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767
Wild yak	MODERN SPECIES	2438				ENSBMUG00000020807	KLHL24 (ENSBMUG00000020797)	YEATS2 (ENSBMUG00000020751)	MAP6D1 (ENSBMUG00000020661)	PARL (ENSBMUG00000020640)	ENSBMUG00000020608	ENSBMUG00000020603	ABCC5 (ENSBMUG00000020592)	ENSBMUG00000020542	ENSBMUG00000020525	ENSBMUG00000020501	EIF2B5 (ENSBMUG00000020467)	DVL3 (ENSBMUG00000020415) ##22	AP2M1 (ENSBMUG00000020318)	ABCF3 (ENSBMUG00000020236)	VWA5B2 (ENSBMUG00000020086)	ENSBMUG00000019893	EEF1AKMT4 (ENSBMUG00000019885)	CAMK2N2 (ENSBMUG00000019881)	ECE2 (ENSBMUG00000019815)	PSMD2 (ENSBMUG00000019690)	EIF4G1 (ENSBMUG00000019290)	FAM131A (ENSBMUG00000018906)	CLCN2 (ENSBMUG00000018855)	POLR2H (ENSBMUG00000018678)	THPO (ENSBMUG00000018627)	CHRD (ENSBMUG00000018485)	ENSBMUG00000018369
Domestic yak	MODERN SPECIES		ENSBGRG00000001679	MCF2L2 (ENSBGRG00000001502)	KLHL6 (ENSBGRG00000001459)	KLHL24 (ENSBGRG00000001442)	ENSBGRG00000001430	YEATS2 (ENSBGRG00000001414)	MAP6D1 (ENSBGRG00000001403)	PARL (ENSBGRG00000001380)	ENSBGRG00000001362	ENSBGRG00000001335	ENSBGRG00000001324	ABCC5 (ENSBGRG00000001081)	ENSBGRG00000001030	ENSBGRG00000000975	EIF2B5 (ENSBGRG00000000921)	DVL3 (ENSBGRG00000000862) ##22	AP2M1 (ENSBGRG00000000714)	ABCF3 (ENSBGRG00000000581)	VWA5B2 (ENSBGRG00000000310)	ALG3 (ENSBGRG00000000258)	EEF1AKMT4 (ENSBGRG00000000248)	CAMK2N2 (ENSBGRG00000000240)	ECE2 (ENSBGRG00000000211)	PSMD2 (ENSBGRG00000000173)	ENSBGRG00000000165	EIF4G1 (ENSBGRG00000003743)	FAM131A (ENSBGRG00000003599)	CLCN2 (ENSBGRG00000003313)	POLR2H (ENSBGRG00000003267)	THPO (ENSBGRG00000003222)	CHRD (ENSBGRG00000003140)
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000163715.a	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00470000042552	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736
Blue whale	MODERN SPECIES	15	ENSBMSG00010006280	MCCC1 (ENSBMSG00010006304)	LAMP3 (ENSBMSG00010006362)	MCF2L2 (ENSBMSG00010006391)	B3GNT5 (ENSBMSG00010006443)	KLHL6 (ENSBMSG00010006477)	KLHL24 (ENSBMSG00010006493)	YEATS2 (ENSBMSG00010006529)	MAP6D1 (ENSBMSG00010006549)	ENSBMSG00010006580	ENSBMSG00010006644	ABCC5 (ENSBMSG00010006752)	ENSBMSG00010006800	ENSBMSG00010006825	EIF2B5 (ENSBMSG00010006865)	DVL3 (ENSBMSG00010006957) ##22	AP2M1 (ENSBMSG00010007084)	ABCF3 (ENSBMSG00010007145)	VWA5B2 (ENSBMSG00010007220)	ALG3 (ENSBMSG00010007286)	EEF1AKMT4 (ENSBMSG00010007328)	CAMK2N2 (ENSBMSG00010007339)	ECE2 (ENSBMSG00010007367)	PSMD2 (ENSBMSG00010007497)	EIF4G1 (ENSBMSG00010007584)	FAM131A (ENSBMSG00010007712)	CLCN2 (ENSBMSG00010007788)	POLR2H (ENSBMSG00010008055)	THPO (ENSBMSG00010008075)	CHRD (ENSBMSG00010008137)	EPHB3 (ENSBMSG00010008212)
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000163715.a	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00470000042552	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736
Sperm whale	MODERN SPECIES	1211															EIF2B5 (ENSPCTG00005021684)	DVL3 (ENSPCTG00005021710) ##22	AP2M1 (ENSPCTG00005013065)	ENSPCTG00005013321
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000163715.a	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00470000042552	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736
Dolphin	MODERN SPECIES	849															EIF2B5 (ENSTTRG00000003093)	DVL3 (ENSTTRG00000003096) ##22
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C
Vaquita	MODERN SPECIES	15	ENSPSNG00000002025	MCCC1 (ENSPSNG00000002070)	LAMP3 (ENSPSNG00000002153)	MCF2L2 (ENSPSNG00000002227)	B3GNT5 (ENSPSNG00000002266)	ENSPSNG00000002280	KLHL6 (ENSPSNG00000002317)	KLHL24 (ENSPSNG00000002350)	YEATS2 (ENSPSNG00000002390)	MAP6D1 (ENSPSNG00000002417)	PARL (ENSPSNG00000002457)	ABCC5 (ENSPSNG00000002555)	ENSPSNG00000002642	ENSPSNG00000002695	EIF2B5 (ENSPSNG00000002757)	DVL3 (ENSPSNG00000002831) ##22	AP2M1 (ENSPSNG00000002895)	ABCF3 (ENSPSNG00000002956)	VWA5B2 (ENSPSNG00000003004)	ALG3 (ENSPSNG00000003037)	EEF1AKMT4 (ENSPSNG00000003065)	CAMK2N2 (ENSPSNG00000003087)	ECE2 (ENSPSNG00000003181)	PSMD2 (ENSPSNG00000003385)	EIF4G1 (ENSPSNG00000003495)	CLCN2 (ENSPSNG00000003816)	POLR2H (ENSPSNG00000004087)	THPO (ENSPSNG00000004124)	CHRD (ENSPSNG00000004207)	EPHB3 (ENSPSNG00000004283)	ENSPSNG00000004471
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00990000211790	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a.i	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C
Narwhal	MODERN SPECIES	297	DCUN1D1 (ENSMMNG00015000639)	ENSMMNG00015000610	MCCC1 (ENSMMNG00015000549)	ENSMMNG00015000494	B3GNT5 (ENSMMNG00015000474)	MCF2L2 (ENSMMNG00015000373)	KLHL6 (ENSMMNG00015000283)	ENSMMNG00015000255	YEATS2 (ENSMMNG00015000154)	MAP6D1 (ENSMMNG00015004521)	PARL (ENSMMNG00015004493)	ABCC5 (ENSMMNG00015004426)	ENSMMNG00015004381	ENSMMNG00015004360	EIF2B5 (ENSMMNG00015004352)	DVL3 (ENSMMNG00015004323) ##22	AP2M1 (ENSMMNG00015004290)	ABCF3 (ENSMMNG00015004238)	VWA5B2 (ENSMMNG00015004220)	ALG3 (ENSMMNG00015004200)	EEF1AKMT4 (ENSMMNG00015004191)	CAMK2N2 (ENSMMNG00015004184)	ECE2 (ENSMMNG00015004138)	PSMD2 (ENSMMNG00015004070)	EIF4G1 (ENSMMNG00015004006)	FAM131A (ENSMMNG00015003961)	CLCN2 (ENSMMNG00015003648)	POLR2H (ENSMMNG00015003521)	ENSMMNG00015003491	CHRD (ENSMMNG00015003366)	EPHB3 (ENSMMNG00015003291)
Beluga whale	MODERN SPECIES	111	ENSDLEG00000011686	ENSDLEG00000011678	MCCC1 (ENSDLEG00000011656)	B3GNT5 (ENSDLEG00000011651)	LAMP3 (ENSDLEG00000011466)	KLHL6 (ENSDLEG00000011412)	KLHL24 (ENSDLEG00000011392)	YEATS2 (ENSDLEG00000011294)	MAP6D1 (ENSDLEG00000011273)	PARL (ENSDLEG00000011263)	ENSDLEG00000011228	ABCC5 (ENSDLEG00000011158)	ENSDLEG00000011105	EIF2B5 (ENSDLEG00000010324)	ENSDLEG00000010244 ##22	DVL3 (ENSDLEG00000010211) ##22	AP2M1 (ENSDLEG00000010183)	ABCF3 (ENSDLEG00000010127)	VWA5B2 (ENSDLEG00000010090)	ALG3 (ENSDLEG00000010058)	ECE2 (ENSDLEG00000010042)	CAMK2N2 (ENSDLEG00000010027)	ECE2 (ENSDLEG00000009852)	PSMD2 (ENSDLEG00000009795)	EIF4G1 (ENSDLEG00000009374)	FAM131A (ENSDLEG00000009303)	CLCN2 (ENSDLEG00000009222)	POLR2H (ENSDLEG00000009198)	THPO (ENSDLEG00000009154)	CHRD (ENSDLEG00000009087)	EPHB3 (ENSDLEG00000008994)
Suina	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000163715.a	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Pig	MODERN SPECIES	4	ENSSSCG00000034204	ENSSSCG00000031476	KLHL24 (ENSSSCG00000011775)	ENSSSCG00000057693	YEATS2 (ENSSSCG00000011776)	MAP6D1 (ENSSSCG00000032328)	PARL (ENSSSCG00000033424)	ENSSSCG00000042409	ENSSSCG00000011780	ABCC5 (ENSSSCG00000011782)	ENSSSCG00000062141	ENSSSCG00000011784	ENSSSCG00000024689	ENSSSCG00000039519	EIF2B5 (ENSSSCG00000011783)	DVL3 (ENSSSCG00000025374) ##22	AP2M1 (ENSSSCG00000024437)	ABCF3 (ENSSSCG00000028856)	VWA5B2 (ENSSSCG00000026185)	ALG3 (ENSSSCG00000021319)	EEF1AKMT4 (ENSSSCG00000054583)	CAMK2N2 (ENSSSCG00000053887)	ECE2 (ENSSSCG00000052048)	PSMD2 (ENSSSCG00000046387)	EIF4G1 (ENSSSCG00000030255)	FAM131A (ENSSSCG00000053702)	CLCN2 (ENSSSCG00000021581)	POLR2H (ENSSSCG00000022507)	THPO (ENSSSCG00000023909)	CHRD (ENSSSCG00000025270)	ENSSSCG00000033256
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	944	ATP11B (ENSCWAG00000011359)	DCUN1D1 (ENSCWAG00000011613)	MCCC1 (ENSCWAG00000011692)	LAMP3 (ENSCWAG00000011926)	MCF2L2 (ENSCWAG00000012097)	B3GNT5 (ENSCWAG00000012261)	KLHL6 (ENSCWAG00000012291)	KLHL24 (ENSCWAG00000012354)	ENSCWAG00000012399	YEATS2 (ENSCWAG00000012459)	MAP6D1 (ENSCWAG00000012551)	PARL (ENSCWAG00000012639)	ENSCWAG00000012805	ABCC5 (ENSCWAG00000012877)	EIF2B5 (ENSCWAG00000013130)	DVL3 (ENSCWAG00000013425) ##22	AP2M1 (ENSCWAG00000013500)	ABCF3 (ENSCWAG00000013641)	VWA5B2 (ENSCWAG00000013747)	ALG3 (ENSCWAG00000014017)	EEF1AKMT4 (ENSCWAG00000014041)	CAMK2N2 (ENSCWAG00000014083)	ECE2 (ENSCWAG00000014125)	PSMD2 (ENSCWAG00000014569)	EIF4G1 (ENSCWAG00000014801)	FAM131A (ENSCWAG00000015056)	CLCN2 (ENSCWAG00000015237)	POLR2H (ENSCWAG00000016703)	THPO (ENSCWAG00000016779)	CHRD (ENSCWAG00000016989)	ENSCWAG00000017479
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00470000042552	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00990000203899	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00390000006548.b.j.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00390000006548.b.j.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000164015	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00390000006548.b.j.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921.i	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
American mink	MODERN SPECIES	118	B3GNT5 (ENSNVIG00000016238)	ENSNVIG00000016235	MF2L2 (ENSNVIG00000016107)	KLHL6 (ENSNVIG00000016052)	ENSNVIG00000016043	KLH24 (ENSNVIG00000016026)	YEATS2 (ENSNVIG00000015940)	MAP6D1 (ENSNVIG00000015917)	PARL (ENSNVIG00000015862)	ABCC5 (ENSNVIG00000015808)	ENSNVIG00000015742	ENSNVIG00000015717	ENSNVIG00000015675	EIF2B5 (ENSNVIG00000015638)	ENSNVIG00000015622	DVL3 (ENSNVIG00000015573) ##22	AP2M1 (ENSNVIG00000015495)	ABCF3 (ENSNVIG00000015414)	VWA5B2 (ENSNVIG00000015366)	ALG3 (ENSNVIG00000015326)	EEF1AKMT4 (ENSNVIG00000015318)	CAMK2N2 (ENSNVIG00000015307)	ECE2 (ENSNVIG00000015164)	PSMD2 (ENSNVIG00000015085)	EIF4G1 (ENSNVIG00000014281)	FAM131A (ENSNVIG00000014247)	CLCN2 (ENSNVIG00000013886)	POLR2H (ENSNVIG00000013827)	THPO (ENSNVIG00000013715)	CHRD (ENSNVIG00000013620)	TEDM1 (ENSNVIG00000013606)
Ferret	MODERN SPECIES	176	MCCC1 (ENSMPUG00000002371)	LAMP3 (ENSMPUG00000002377)	MCF2L2 (ENSMPUG00000002378)	B3GNT5 (ENSMPUG00000019270)	KLHL6 (ENSMPUG00000002389)	KLHL24 (ENSMPUG00000002390)	ENSMPUG00000019273	YEATS2 (ENSMPUG00000002394)	MAP6D1 (ENSMPUG00000002396)	PARL (ENSMPUG00000002398)	ABCC5 (ENSMPUG00000002400)	ENSMPUG00000002404	ENSMPUG00000002407	HTR3E (ENSMPUG00000002410)	EIF2B5 (ENSMPUG00000002433)	DVL3 (ENSMPUG00000002442) ##22	AP2M1 (ENSMPUG00000002447)	ABCF3 (ENSMPUG00000002485)	VWA5B2 (ENSMPUG00000002493)	ALG3 (ENSMPUG00000002498)	ENSMPUG00000002532	CAMK2N2 (ENSMPUG00000002703)	PSMD2 (ENSMPUG00000002712)	EIF4G1 (ENSMPUG00000002829)	FAM131A (ENSMPUG00000002843)	CLCN2 (ENSMPUG00000002846)	POLR2H (ENSMPUG00000002852)	THPO (ENSMPUG00000002855)	CHRD (ENSMPUG00000002860)	ENSMPUG00000018870	EPHB3 (ENSMPUG00000002868)
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000164015	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b.kb	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223.p	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Giant Panda	MODERN SPECIES		DCUN1D1 (ENSAMEG00000015937)	MCCC1 (ENSAMEG00000015967)	LAMP3 (ENSAMEG00000015997)	B3GNT5 (ENSAMEG00000019887)	KLHL6 (ENSAMEG00000017427)	KLHL24 (ENSAMEG00000017409)	YEATS2 (ENSAMEG00000017390)	MAP6D1 (ENSAMEG00000017388)	PARL (ENSAMEG00000017375)	ABCC5 (ENSAMEG00000017331)	ENSAMEG00000017325	ENSAMEG00000028286	ENSAMEG00000028299	ENSAMEG00000017308	EIF2B5 (ENSAMEG00000017299)	DVL3 (ENSAMEG00000017270) ##22	AP2M1 (ENSAMEG00000017248)	ABCF3 (ENSAMEG00000017221)	VWA5B2 (ENSAMEG00000017211)	ALG3 (ENSAMEG00000017196)	EEF1AKMT4 (ENSAMEG00000027986)	CAMK2N2 (ENSAMEG00000017195)	ECE2 (ENSAMEG00000017169)	PSMD2 (ENSAMEG00000017151)	EIF4G1 (ENSAMEG00000017091)	FAM131A (ENSAMEG00000017090)	CLCN2 (ENSAMEG00000017021)	POLR2H (ENSAMEG00000017011)	THPO (ENSAMEG00000016994)	CHRD (ENSAMEG00000016940)	ENSAMEG00000019882
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000164015	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b.kb	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223.p	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
American black bear	MODERN SPECIES	6212														ENSUAMG00000005920	EIF2B5 (ENSUAMG00000005923)	DVL3 (ENSUAMG00000005926) ##22	AP2M1 (ENSUAMG00000005929)	ABCF3 (ENSUAMG00000005933)
Polar bear	MODERN SPECIES	270	B3GNT5 (ENSUMAG00000006915)	ENSUMAG00000006910	MCF2L2 (ENSUMAG00000006845)	KLHL6 (ENSUMAG00000006797)	KLHL24 (ENSUMAG00000006792)	YEATS2 (ENSUMAG00000006587)	PARL (ENSUMAG00000006500)	ENSUMAG00000006485	ENSUMAG00000006482	ENSUMAG00000006476	ENSUMAG00000006466	ENSUMAG00000006457	HTR3E (ENSUMAG00000006439)	EIF2B5 (ENSUMAG00000006171)	ENSUMAG00000006115 ##22	DVL3 (ENSUMAG00000006096) ##22	AP2M1 (ENSUMAG00000006081)	ABCF3 (ENSUMAG00000005606)	ALG3 (ENSUMAG00000005513)	EEF1AKMT4 (ENSUMAG00000005509)	ECE2 (ENSUMAG00000005417)	PSMD2 (ENSUMAG00000005394)	EIF4G1 (ENSUMAG00000005377)	FAM131A (ENSUMAG00000005374)	CLCN2 (ENSUMAG00000005267)	POLR2H (ENSUMAG00000005255)	THPO (ENSUMAG00000005251)	ENSUMAG00000005226	EPHB3 (ENSUMAG00000005220)	MAGEF1 (ENSUMAG00000005218)	ENSUMAG00000005212
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00390000006548.b.j.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Red fox	MODERN SPECIES	63	MCCC1 (ENSVVUG00000006835)	ENSVVUG00000006851	MCF2L2 (ENSVVUG00000006872)	B3GNT5 (ENSVVUG00000006884)	KLHL6 (ENSVVUG00000006905)	ENSVVUG00000006913	KLHL24 (ENSVVUG00000006919)	YEATS2 (ENSVVUG00000006927)	PARL (ENSVVUG00000006999)	ABCC5 (ENSVVUG00000007021)	HTR3D (ENSVVUG00000007131)	ENSVVUG00000007148	ENSVVUG00000007168	ENSVVUG00000007186	EIF2B5 (ENSVVUG00000007208)	DVL3 (ENSVVUG00000007239) ##22	AP2M1 (ENSVVUG00000007272)	ABCF3 (ENSVVUG00000007284)	VWA5B2 (ENSVVUG00000007308)	ALG3 (ENSVVUG00000007356)	EEF1AKMT4 (ENSVVUG00000007363)	CAMK2N2 (ENSVVUG00000007368)	ECE2 (ENSVVUG00000007481)	PSMD2 (ENSVVUG00000012151)	EIF4G1 (ENSVVUG00000012160)	FAM131A (ENSVVUG00000012207)	CLCN2 (ENSVVUG00000012222)	POLR2H (ENSVVUG00000012241)	THPO (ENSVVUG00000012250)	CHRD (ENSVVUG00000012254)	ENSVVUG00000012269
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00390000006548.b.j.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Dingo	MODERN SPECIES	159	B3GNT5 (ENSCAFG00020001231)	KLHL6 (ENSCAFG00020001252)	ENSCAFG00020001264	KLHL24 (ENSCAFG00020001271)	YEATS2 (ENSCAFG00020001349)	MAP6D1 (ENSCAFG00020002085)	PARL (ENSCAFG00020002113)	ENSCAFG00020002122	ENSCAFG00020002167	ENSCAFG00020002174	ENSCAFG00020002199	ENSCAFG00020002215	ENSCAFG00020002221	ENSCAFG00020002245	EIF2B5 (ENSCAFG00020002276)	DVL3 (ENSCAFG00020002289) ##22	AP2M1 (ENSCAFG00020002302)	ABCF3 (ENSCAFG00020002307)	VWA5B2 (ENSCAFG00020002324)	ALG3 (ENSCAFG00020002456)	EEF1AKMT4 (ENSCAFG00020002462)	CAMK2N2 (ENSCAFG00020002465)	ECE2 (ENSCAFG00020002475)	PSMD2 (ENSCAFG00020002491)	EIF4G1 (ENSCAFG00020002517)	FAM131A (ENSCAFG00020002537)	CLCN2 (ENSCAFG00020002549)	POLR2H (ENSCAFG00020002558)	THPO (ENSCAFG00020002562)	CHRD (ENSCAFG00020002565)	ENSCAFG00020002580
Dog	MODERN SPECIES	27	ENSCAFG00845021628	MCF2L2 (ENSCAFG00845021833)	KLHL6 (ENSCAFG00845022563)	ENSCAFG00845022671	KLHL24 (ENSCAFG00845022711)	YEATS2 (ENSCAFG00845023023)	ENSCAFG00845023901	MAP6D1 (ENSCAFG00845023943)	PARL (ENSCAFG00845024017)	ABCC5 (ENSCAFG00845024339)	ENSCAFG00845025304	ENSCAFG00845025381	ENSCAFG00845025476	HTR3E (ENSCAFG00845025561)	EIF2B5 (ENSCAFG00845025847)	DVL3 (ENSCAFG00845026259) ##22	AP2M1 (ENSCAFG00845026562)	ABCF3 (ENSCAFG00845026753)	VWA5B2 (ENSCAFG00845027007)	ALG3 (ENSCAFG00845027125)	EEF1AKMT4 (ENSCAFG00845027227)	CAMK2N2 (ENSCAFG00845027260)	ECE2 (ENSCAFG00845027368)	PSMD2 (ENSCAFG00845027526)	EIF4G1 (ENSCAFG00845027677)	FAM131A (ENSCAFG00845028022)	CLCN2 (ENSCAFG00845028147)	POLR2H (ENSCAFG00845028415)	THPO (ENSCAFG00845028504)	PSMD2 (ENSCAFG00845028614)	ENSCAFG00845028894
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000156941	ENSGT00940000164015	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Cat	MODERN SPECIES	240	LAMP3 (ENSFCAG00000028212)	B3GNT5 (ENSFCAG00000022706)	ENSFCAG00000029159	MCF2L2 (ENSFCAG00000014298)	ENSFCAG00000025637	KLHL6 (ENSFCAG00000015088)	KLHL24 (ENSFCAG00000025721)	YEATS2 (ENSFCAG00000003117)	MAP6D1 (ENSFCAG00000044280)	ENSFCAG00000003118	ABCC5 (ENSFCAG00000007784)	ENSFCAG00000004540	ENSFCAG00000007785	HTR3E (ENSFCAG00000007786)	EIF2B5 (ENSFCAG00000007787)	DVL3 (ENSFCAG00000007788) ##22	AP2M1 (ENSFCAG00000007789)	ABCF3 (ENSFCAG00000007790)	VWA5B2 (ENSFCAG00000007791)	EEF1AKMT4 (ENSFCAG00000037700)	ALG3 (ENSFCAG00000016274)	ECE2 (ENSFCAG00000018909)	PSMD2 (ENSFCAG00000007793)	ENSFCAG00000039762	EIF4G1 (ENSFCAG00000007794)	FAM131A (ENSFCAG00000007795)	CLCN2 (ENSFCAG00000007796)	POLR2H (ENSFCAG00000007797)	THPO (ENSFCAG00000007798)	CHRD (ENSFCAG00000007799)	ENSFCAG00000030113
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000156941	ENSGT00940000164015	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Tiger	MODERN SPECIES	186													ENSPTIG00000019646	HTR3E (ENSPTIG00000017614)	EIF2B5 (ENSPTIG00000016942)	DVL3 (ENSPTIG00000015405) ##22	AP2M1 (ENSPTIG00000012982)	ABCF3 (ENSPTIG00000011505)	VWA5B2 (ENSPTIG00000010510)	ALG3 (ENSPTIG00000009595)	EEF1AKMT4 (ENSPTIG00000008844)	ECE2 (ENSPTIG00000005514)	PSMD2 (ENSPTIG00000021992)	EIF4G1 (ENSPTIG00000017609)	FAM131A (ENSPTIG00000017208)	CLCN2 (ENSPTIG00000011904)	POLR2H (ENSPTIG00000010551)	THPO (ENSPTIG00000007662)	ENSPTIG00000021284	ENSPTIG00000004523	EPHB3 (ENSPTIG00000020201)
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	46					ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
lion	MODERN SPECIES	9	CPN2 (ENSPLOG00000013346)	HES1 (ENSPLOG00000013306)	OPA1 (ENSPLOG00000012992)	ENSPLOG00000012858	KLHL6 (ENSPLOG00000012815)	KLHL24 (ENSPLOG00000012705)	YEATS2 (ENSPLOG00000012576)	MAP6D1 (ENSPLOG00000012510)	ENSPLOG00000012396	ABCC5 (ENSPLOG00000012194)	ENSPLOG00000012086	ENSPLOG00000011983	ENSPLOG00000011826	HTR3E (ENSPLOG00000011659)	EIF2B5 (ENSPLOG00000011578)	DVL3 (ENSPLOG00000011355) ##22	AP2M1 (ENSPLOG00000011217)	ABCF3 (ENSPLOG00000010928)	VWA5B2 (ENSPLOG00000010719)	ALG3 (ENSPLOG00000010649)	EEF1AKMT4 (ENSPLOG00000010618)	CAMK2N2 (ENSPLOG00000010595)	ECE2 (ENSPLOG00000010131)	PSMD2 (ENSPLOG00000010003)	EIF4G1 (ENSPLOG00000009545)	FAM131A (ENSPLOG00000009442)	CLCN2 (ENSPLOG00000008884)	POLR2H (ENSPLOG00000008644)	THPO (ENSPLOG00000008509)	CHRD (ENSPLOG00000008011)	ENSPLOG00000007927
leopard	MODERN SPECIES	41	LAMP3 (ENSPPRG00000023853)	MCF2L2 (ENSPPRG00000024122)	B3GNT5 (ENSPPRG00000021466)	ENSPPRG00000013180	KLHL6 (ENSPPRG00000011045)	KLHL24 (ENSPPRG00000011024)	YEATS2 (ENSPPRG00000010510)	MAP6D1 (ENSPPRG00000010302)	PARL (ENSPPRG00000010103)	ABCC5 (ENSPPRG00000009156)	HTR3D (ENSPPRG00000007564)	ENSPPRG00000006147	ENSPPRG00000005616	HTR3E (ENSPPRG00000004092)	EIF2B5 (ENSPPRG00000002680)	DVL3 (ENSPPRG00000002369) ##22	AP2M1 (ENSPPRG00000001504)	ABCF3 (ENSPPRG00000023037)	VWA5B2 (ENSPPRG00000023611)	ALG3 (ENSPPRG00000024472)	EEF1AKMT4 (ENSPPRG00000022119)	CAMK2N2 (ENSPPRG00000017944)	ECE2 (ENSPPRG00000017151)	PSMD2 (ENSPPRG00000009718)	ENSPPRG00000008473	EIF4G1 (ENSPPRG00000008026)	FAM131A (ENSPPRG00000008718)	CLCN2 (ENSPPRG00000007844)	POLR2H (ENSPPRG00000004001)	ENSPPRG00000002693	CHRD (ENSPPRG00000001992)
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00470000042552	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000156162.C.k	ENSGT00940000154552	ENSGT00940000156941.h	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00470000042552	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767
Megabat	MODERN SPECIES	1122															EIF2B5 (ENSPVAG00000004836)	DVL3 (ENSPVAG00000004837) ##22	AP2M1 (ENSPVAG00000004838)	ABCF3 (ENSPVAG00000004839)	ENSPVAG00000004840	VWA5B2 (ENSPVAG00000004841)	ALG3 (ENSPVAG00000004842)	ECE2 (ENSPVAG00000004843)	CAMK2N2 (ENSPVAG00000004844)	PSMD2 (ENSPVAG00000004845)	EIF4G1 (ENSPVAG00000004847)	ENSPVAG00000004853	FAM131A (ENSPVAG00000004856)	CLCN2 (ENSPVAG00000004861)	POLR2H (ENSPVAG00000004869)	THPO (ENSPVAG00000004871)	CHRD (ENSPVAG00000004873)
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000156162.C.k	ENSGT00940000154552	ENSGT00940000156941.h	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.b.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	11	ENSRFEG00010021147	MCCC1 (ENSRFEG00010021096)	ENSRFEG00010021072	B3GNT5 (ENSRFEG00010021062)	MCF2L2 (ENSRFEG00010021002)	ENSRFEG00010020947	KLHL24 (ENSRFEG00010020928)	ENSRFEG00010020902	YEATS2 (ENSRFEG00010020847)	MAP6D1 (ENSRFEG00010020813)	PARL (ENSRFEG00010020770)	ABCC5 (ENSRFEG00010020607)	ENSRFEG00010020530	ENSRFEG00010020478	EIF2B5 (ENSRFEG00010020434)	DVL3 (ENSRFEG00010020376) ##22	AP2M1 (ENSRFEG00010020265)	ABCF3 (ENSRFEG00010020127)	VWA5B2 (ENSRFEG00010020098)	ALG3 (ENSRFEG00010020076)	EEF1AKMT4 (ENSRFEG00010020046)	CAMK2N2 (ENSRFEG00010020020)	ECE2 (ENSRFEG00010019914)	PSMD2 (ENSRFEG00010019760)	EIF4G1 (ENSRFEG00010016633)	FAM131A (ENSRFEG00010016522)	CLCN2 (ENSRFEG00010014736)	POLR2H (ENSRFEG00010014541)	THPO (ENSRFEG00010014434)	CHRD (ENSRFEG00010014328)	EPHB3 (ENSRFEG00010014243)
Microbat	MODERN SPECIES	951	MCCC1 (ENSMLUG00000012257)	LAMP3 (ENSMLUG00000012272)	B3GNT5 (ENSMLUG00000017017)	MCF2L2 (ENSMLUG00000017007)	KLHL6 (ENSMLUG00000005156)	KLHL24 (ENSMLUG00000005165)	YEATS2 (ENSMLUG00000004493)	ENSMLUG00000027253	PARL (ENSMLUG00000004507)	ABCC5 (ENSMLUG00000010786)	ENSMLUG00000010854	ENSMLUG00000027954	ENSMLUG00000010874	ENSMLUG00000028418	EIF2B5 (ENSMLUG00000013520)	DVL3 (ENSMLUG00000013532) ##22	AP2M1 (ENSMLUG00000013541)	ABCF3 (ENSMLUG00000013549)	VWA5B2 (ENSMLUG00000006386)	ALG3 (ENSMLUG00000026847)	ECE2 (ENSMLUG00000006407)	PSMD2 (ENSMLUG00000006430)	EIF4G1 (ENSMLUG00000012821)	FAM131A (ENSMLUG00000012834)	CLCN2 (ENSMLUG00000012839)	POLR2H (ENSMLUG00000022295)	THPO (ENSMLUG00000024139)	CHRD (ENSMLUG00000013271)	ENSMLUG00000001915	ENSMLUG00000022792	EPHB3 (ENSMLUG00000014723)
Equus	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000154552	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000163715.a	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132.h
Horse	MODERN SPECIES	10	MCCC1 (ENSECAG00000008214)	LAMP3 (ENSECAG00000008113)	MCF2L2 (ENSECAG00000008905)	B3GNT5 (ENSECAG00000001863)	ENSECAG00000049566	KLHL6 (ENSECAG00000016531)	KLHL24 (ENSECAG00000021066)	YEATS2 (ENSECAG00000008585)	MAP6D1 (ENSECAG00000022418)	PARL (ENSECAG00000022422)	ABCC5 (ENSECAG00000007961)	ENSECAG00000034302	ENSECAG00000013182	HTR3E (ENSECAG00000013750)	EIF2B5 (ENSECAG00000018745)	DVL3 (ENSECAG00000008877) ##22	AP2M1 (ENSECAG00000000242)	ABCF3 (ENSECAG00000016827)	VWA5B2 (ENSECAG00000011959)	ALG3 (ENSECAG00000024917)	CAMK2N2 (ENSECAG00000029306)	ECE2 (ENSECAG00000015238)	PSMD2 (ENSECAG00000022375)	EIF4G1 (ENSECAG00000008046)	FAM131A (ENSECAG00000000326)	CLCN2 (ENSECAG00000006719)	POLR2H (ENSECAG00000005828)	THPO (ENSECAG00000005883)	CHRD (ENSECAG00000011154)	ENSECAG00000050282	ENSECAG00000045250
Donkey	MODERN SPECIES	25	MCCC1 (ENSEASG00005015339)	ENSEASG00005015308	MCF2L2 (ENSEASG00005015300)	B3GNT5 (ENSEASG00005038666)	ENSEASG00005028355	ENSEASG00005015289	KLHL24 (ENSEASG00005015287)	YEATS2 (ENSEASG00005015265)	MAP6D1 (ENSEASG00005026951)	PARL (ENSEASG00005015210)	ABCC5 (ENSEASG00005014831)	ENSEASG00005029101	ENSEASG00005014738	HTR3E (ENSEASG00005014733)	EIF2B5 (ENSEASG00005014406)	DVL3 (ENSEASG00005014334) ##22	AP2M1 (ENSEASG00005014278)	ABCF3 (ENSEASG00005014186)	VWA5B2 (ENSEASG00005014165)	ALG3 (ENSEASG00005014154)	EEF1AKMT4 (ENSEASG00005014150)	CAMK2N2 (ENSEASG00005032978)	PSMD2 (ENSEASG00005014052)	EIF4G1 (ENSEASG00005014019)	FAM131A (ENSEASG00005031258)	CLCN2 (ENSEASG00005013129)	POLR2H (ENSEASG00005013088)	THPO (ENSEASG00005013086)	CHRD (ENSEASG00005013083)	ENSEASG00005013546	ENSEASG00005036794
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182903.a.a ##22
Hedgehog	MODERN SPECIES	5346																DVL3 (ENSEEUG00000012281) ##22
Common shrew	MODERN SPECIES	4163																ENSSARG00000008891 ##22
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Primates	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000164015	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154552.b	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Bushbaby	MODERN SPECIES	378											ENSOGAG00000024553	ABCC5 (ENSOGAG00000016102)	ENSOGAG00000016123	ENSOGAG00000007890	EIF2B5 (ENSOGAG00000016131)	DVL3 (ENSOGAG00000016139) ##22	AP2M1 (ENSOGAG00000012286)	ABCF3 (ENSOGAG00000033289)	VWA5B2 (ENSOGAG00000010433)	ALG3 (ENSOGAG00000032319)	EEF1AKMT4 (ENSOGAG00000026060)	CAMK2N2 (ENSOGAG00000025540)	ECE2 (ENSOGAG00000015273)	PSMD2 (ENSOGAG00000015282)	EIF4G1 (ENSOGAG00000015291)	CLCN2 (ENSOGAG00000034793)	FAM131A (ENSOGAG00000015302)	POLR2H (ENSOGAG00000001599)	THPO (ENSOGAG00000026490)	CHRD (ENSOGAG00000001601)	EPHB3 (ENSOGAG00000032936)
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000164826	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.a.a	ENSGT00940000156739.b.a.b	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195.a.b	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000164826	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.a.a	ENSGT00940000156739.b.a.b	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195.a.b	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	28			ENSPSMG00000022070	ENSPSMG00000022066	B3GNT5 (ENSPSMG00000022061)	KLHL6 (ENSPSMG00000022051)	KLHL24 (ENSPSMG00000022048)	YEATS2 (ENSPSMG00000022030)	MAP6D1 (ENSPSMG00000021982)	PARL (ENSPSMG00000021936)	ENSPSMG00000021860	ABCC5 (ENSPSMG00000021810)	ENSPSMG00000021631	HTR3E (ENSPSMG00000021608)	EIF2B5 (ENSPSMG00000021580)	DVL3 (ENSPSMG00000021524) ##22	AP2M1 (ENSPSMG00000021479)	ABCF3 (ENSPSMG00000021387)	VWA5B2 (ENSPSMG00000021312)	ALG3 (ENSPSMG00000021275)	CAMK2N2 (ENSPSMG00000021256)	ECE2 (ENSPSMG00000021210)	PSMD2 (ENSPSMG00000021009)	EIF4G1 (ENSPSMG00000020536)	FAM131A (ENSPSMG00000020112)	CLCN2 (ENSPSMG00000020050)	POLR2H (ENSPSMG00000019838)	THPO (ENSPSMG00000019800)	CHRD (ENSPSMG00000019718)	ENSPSMG00000019612	EPHB3 (ENSPSMG00000019601)
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	51	MCCC1 (ENSPCOG00000020095)	ENSPCOG00000009968	MCF2L2 (ENSPCOG00000023043)	ENSPCOG00000025090	ENSPCOG00000025238	KLHL24 (ENSPCOG00000014525)	YEATS2 (ENSPCOG00000018918)	MAP6D1 (ENSPCOG00000027653)	PARL (ENSPCOG00000010637)	CYP2AB1 (ENSPCOG00000016717)	ABCC5 (ENSPCOG00000025758)	ENSPCOG00000015936	ENSPCOG00000027112	HTR3E (ENSPCOG00000024574)	EIF2B5 (ENSPCOG00000010623)	DVL3 (ENSPCOG00000020025) ##22	AP2M1 (ENSPCOG00000027377)	ABCF3 (ENSPCOG00000005372)	VWA5B2 (ENSPCOG00000024622)	ALG3 (ENSPCOG00000017288)	CAMK2N2 (ENSPCOG00000026701)	ECE2 (ENSPCOG00000027101)	PSMD2 (ENSPCOG00000002411)	EIF4G1 (ENSPCOG00000026717)	FAM131A (ENSPCOG00000026923)	CLCN2 (ENSPCOG00000021839)	POLR2H (ENSPCOG00000021194)	ENSPCOG00000025834	CHRD (ENSPCOG00000013990)	EPHB3 (ENSPCOG00000021424)	MAGEF1 (ENSPCOG00000023097)
Mouse lemur	MODERN SPECIES		MCF2L2 (ENSMICG00000049191)	B3GNT5 (ENSMICG00000049049)	ENSMICG00000049437	ENSMICG00000049467	KLHL24 (ENSMICG00000049481)	YEATS2 (ENSMICG00000049411)	MAP6D1 (ENSMICG00000049143)	PARL (ENSMICG00000049265)	CYP2AB1 (ENSMICG00000049184)	ABCC5 (ENSMICG00000049116)	ENSMICG00000049384	ENSMICG00000049301	ENSMICG00000049183	HTR3E (ENSMICG00000049068)	EIF2B5 (ENSMICG00000049428)	DVL3 (ENSMICG00000049000) ##22	AP2M1 (ENSMICG00000048935)	ABCF3 (ENSMICG00000049418)	VWA5B2 (ENSMICG00000049272)	ALG3 (ENSMICG00000048992)	EEF1AKMT4 (ENSMICG00000049030)	CAMK2N2 (ENSMICG00000049125)	PSMD2 (ENSMICG00000049512)	EIF4G1 (ENSMICG00000049010)	FAM131A (ENSMICG00000049438)	CLCN2 (ENSMICG00000049507)	ENSMICG00000048991	THPO (ENSMICG00000049369)	CHRD (ENSMICG00000049478)	ENSMICG00000049109	EPHB3 (ENSMICG00000049312)
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000164015	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C
Tarsier	MODERN SPECIES	6677	DCUN1D1 (ENSTSYG00000012276)	MCCC1 (ENSTSYG00000012606)	LAMP3 (ENSTSYG00000002298)	MCF2L2 (ENSTSYG00000005366)	ENSTSYG00000030655	KLHL6 (ENSTSYG00000004245)	KLHL24 (ENSTSYG00000003942)	YEATS2 (ENSTSYG00000014192)	PARL (ENSTSYG00000009129)	CYP2AB1 (ENSTSYG00000027522)	ABCC5 (ENSTSYG00000005257)	HTR3D (ENSTSYG00000005292)	HTR3C (ENSTSYG00000000352)	HTR3E (ENSTSYG00000006428)	EIF2B5 (ENSTSYG00000012456)	DVL3 (ENSTSYG00000009154) ##22	AP2M1 (ENSTSYG00000006101)	ABCF3 (ENSTSYG00000008490)
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000164015	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000154552.b.f	ENSGT00940000156941.j	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063.p	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C
Mas night monkey	MODERN SPECIES	793	ENSANAG00000020880	MCCC1 (ENSANAG00000028235)	LAMP3 (ENSANAG00000021411)	MCF2L2 (ENSANAG00000030096)	KLHL6 (ENSANAG00000034934)	KLHL24 (ENSANAG00000030957)	ENSANAG00000032967	YEATS2 (ENSANAG00000034729)	MAP6D1 (ENSANAG00000031904)	ENSANAG00000028369	ENSANAG00000032750	ABCC5 (ENSANAG00000022138)	HTR3C (ENSANAG00000038263)	HTR3E (ENSANAG00000037618)	EIF2B5 (ENSANAG00000030694)	DVL3 (ENSANAG00000020734) ##22	AP2M1 (ENSANAG00000035232)	ABCF3 (ENSANAG00000032695)	VWA5B2 (ENSANAG00000023436)	ALG3 (ENSANAG00000036858)	CAMK2N2 (ENSANAG00000026673)	ECE2 (ENSANAG00000036188)	PSMD2 (ENSANAG00000014874)	EIF4G1 (ENSANAG00000029514)	FAM131A (ENSANAG00000025503)	CLCN2 (ENSANAG00000029687)	POLR2H (ENSANAG00000020244)	THPO (ENSANAG00000018591)	CHRD (ENSANAG00000023833)	EPHB3 (ENSANAG00000002566)	VPS8 (ENSANAG00000004123)
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000154552.b.f	ENSGT00940000156941.j	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063.p	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C
Marmoset	MODERN SPECIES	6	ENSCJAG00000076242	ATP11B (ENSCJAG00000005176)	DCUN1D1 (ENSCJAG00000005148)	MCCC1 (ENSCJAG00000005103)	ENSCJAG00000081113	MCF2L2 (ENSCJAG00000021205)	B3GNT5 (ENSCJAG00000059459)	KLHL6 (ENSCJAG00000021212)	KLHL24 (ENSCJAG00000082211)	YEATS2 (ENSCJAG00000021219)	PARL (ENSCJAG00000021241)	ABCC5 (ENSCJAG00000013172)	HTR3C (ENSCJAG00000013149)	HTR3E (ENSCJAG00000013139)	EIF2B5 (ENSCJAG00000013108)	DVL3 (ENSCJAG00000013060) ##22	AP2M1 (ENSCJAG00000012998)	ABCF3 (ENSCJAG00000012959)	VWA5B2 (ENSCJAG00000015206)	ALG3 (ENSCJAG00000015172)	EEF1AKMT4 (ENSCJAG00000065303)	CAMK2N2 (ENSCJAG00000022233)	ECE2 (ENSCJAG00000015132)	PSMD2 (ENSCJAG00000034394)	EIF4G1 (ENSCJAG00000014999)	FAM131A (ENSCJAG00000046825)	CLCN2 (ENSCJAG00000014964)	POLR2H (ENSCJAG00000014959)	ENSCJAG00000048180	CHRD (ENSCJAG00000014925)	ENSCJAG00000077185
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000156162.C.k	ENSGT00940000154552.b.f	ENSGT00940000156941.j	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063.p	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00390000010672
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	62	MCCC1 (ENSSBOG00000026219)	ENSSBOG00000021035	MCF2L2 (ENSSBOG00000029425)	KLHL6 (ENSSBOG00000020503)	KLHL24 (ENSSBOG00000034313)	YEATS2 (ENSSBOG00000024142)	ENSSBOG00000029528	ENSSBOG00000026916	PARL (ENSSBOG00000023148)	ABCC5 (ENSSBOG00000021176)	ENSSBOG00000013776	HTR3C (ENSSBOG00000029560)	ENSSBOG00000012724	HTR3E (ENSSBOG00000021223)	EIF2B5 (ENSSBOG00000028500)	DVL3 (ENSSBOG00000035979) ##22	ENSSBOG00000033126	ABCF3 (ENSSBOG00000029094)	VWA5B2 (ENSSBOG00000026464)	ALG3 (ENSSBOG00000029414)	ECE2 (ENSSBOG00000032623)	CAMK2N2 (ENSSBOG00000025366)	PSMD2 (ENSSBOG00000023851)	EIF4G1 (ENSSBOG00000026347)	FAM131A (ENSSBOG00000023167)	CLCN2 (ENSSBOG00000027612)	POLR2H (ENSSBOG00000033101)	THPO (ENSSBOG00000003075)	CHRD (ENSSBOG00000017364)	EPHB3 (ENSSBOG00000033735)	VPS8 (ENSSBOG00000035918)
Capuchin	DUPLICATION
Capuchin	MODERN SPECIES	111	ENSCCAG00000023260	ENSCCAG00000024140	MCF2L2 (ENSCCAG00000019185)	ENSCCAG00000030618	KLHL6 (ENSCCAG00000019228)	KLHL24 (ENSCCAG00000036179)	YEATS2 (ENSCCAG00000031021)	ENSCCAG00000023201	MAP6D1 (ENSCCAG00000036644)	PARL (ENSCCAG00000031887)	ABCC5 (ENSCCAG00000025137)	ENSCCAG00000031577	HTR3C (ENSCCAG00000031177)	HTR3E (ENSCCAG00000037415)	EIF2B5 (ENSCCAG00000028693)	DVL3 (ENSCCAG00000035355) ##22	AP2M1 (ENSCCAG00000025069)	ABCF3 (ENSCCAG00000027906)	VWA5B2 (ENSCCAG00000032876)	ALG3 (ENSCCAG00000025533)	ECE2 (ENSCCAG00000023381)	CAMK2N2 (ENSCCAG00000035659)	PSMD2 (ENSCCAG00000033966)	EIF4G1 (ENSCCAG00000037187)	FAM131A (ENSCCAG00000015189)	CLCN2 (ENSCCAG00000024395)	POLR2H (ENSCCAG00000035087)	THPO (ENSCCAG00000030833)	CHRD (ENSCCAG00000030574)	ENSCCAG00000031842	EPHB3 (ENSCCAG00000021502)
Capuchin	MODERN SPECIES	389		CCR6 (ENSCCAG00000023108)	CEP43 (ENSCCAG00000002534)	RNASET2 (ENSCCAG00000022079)	RPS6KA2 (ENSCCAG00000032079)	MPC1 (ENSCCAG00000027814)	SFT2D1 (ENSCCAG00000030562)	PRR18 (ENSCCAG00000031870)	TBXT (ENSCCAG00000024677)	ENSCCAG00000037393	ENSCCAG00000022749	ENSCCAG00000019705	ENSCCAG00000036924	ENSCCAG00000034417	ENSCCAG00000029815	ENSCCAG00000020853 ##22	C6orf118 (ENSCCAG00000037689)
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000164015	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00910000147149	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00910000147149	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT01020000230401.a.a.b.b.t.eb	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156941	ENSGT00940000164015	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00910000147149	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	6	DCUN1D1 (ENSCSAG00000013212)	MCCC1 (ENSCSAG00000013226)	ENSCSAG00000013232	B3GNT5 (ENSCSAG00000018882)	MCF2L2 (ENSCSAG00000013245)	KLHL6 (ENSCSAG00000013258)	KLHL24 (ENSCSAG00000013266)	YEATS2 (ENSCSAG00000013383)	MAP6D1 (ENSCSAG00000013437)	PARL (ENSCSAG00000013473)	ABCC5 (ENSCSAG00000013503)	HTR3D (ENSCSAG00000013515)	HTR3C (ENSCSAG00000013533)	HTR3E (ENSCSAG00000013540)	EIF2B5 (ENSCSAG00000013546)	DVL3 (ENSCSAG00000013555) ##22	AP2M1 (ENSCSAG00000013562)	ABCF3 (ENSCSAG00000013570)	ENSCSAG00000018881	VWA5B2 (ENSCSAG00000013625)	ALG3 (ENSCSAG00000013667)	CAMK2N2 (ENSCSAG00000013676)	EEF1AKMT4 (ENSCSAG00000013680)	ECE2 (ENSCSAG00000013685)	PSMD2 (ENSCSAG00000013695)	EIF4G1 (ENSCSAG00000013704)	FAM131A (ENSCSAG00000013711)	CLCN2 (ENSCSAG00000013719)	POLR2H (ENSCSAG00000013724)	THPO (ENSCSAG00000013734)	CHRD (ENSCSAG00000013808)
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000164015	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00910000147139	ENSGT00910000147149	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000164015	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00910000147139	ENSGT00910000147149	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C
Olive baboon	MODERN SPECIES	11	ATP11B (ENSPANG00000015886)	DCUN1D1 (ENSPANG00000008386)	MCCC1 (ENSPANG00000006870)	LAMP3 (ENSPANG00000008975)	B3GNT5 (ENSPANG00000005729)	MCF2L2 (ENSPANG00000017801)	KLHL6 (ENSPANG00000010027)	KLHL24 (ENSPANG00000031538)	YEATS2 (ENSPANG00000025622)	MAP6D1 (ENSPANG00000010246)	PARL (ENSPANG00000011016)	ABCC5 (ENSPANG00000018752)	HTR3D (ENSPANG00000015215)	HTR3E (ENSPANG00000030960)	EIF2B5 (ENSPANG00000017089)	DVL3 (ENSPANG00000001019) ##22	AP2M1 (ENSPANG00000012299)	ABCF3 (ENSPANG00000005352)	VWA5B2 (ENSPANG00000020342)	ALG3 (ENSPANG00000019141)	EEF1AKMT4 (ENSPANG00000038392)	CAMK2N2 (ENSPANG00000035922)	ECE2 (ENSPANG00000004695)	PSMD2 (ENSPANG00000009701)	EIF4G1 (ENSPANG00000009907)	FAM131A (ENSPANG00000009226)	CLCN2 (ENSPANG00000006013)	POLR2H (ENSPANG00000020585)	THPO (ENSPANG00000021682)	CHRD (ENSPANG00000004697)	ENSPANG00000043611
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	52	ENSGT00940000164015	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00910000147139	ENSGT00910000147149	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	424				KLHL6 (ENSCATG00000032896)	KLHL24 (ENSCATG00000034493)	YEATS2 (ENSCATG00000034512)	ENSCATG00000012966	ENSCATG00000033375	MAP6D1 (ENSCATG00000040800)	PARL (ENSCATG00000012012)	ABCC5 (ENSCATG00000029271)	HTR3D (ENSCATG00000039231)	HTR3C (ENSCATG00000043397)	HTR3E (ENSCATG00000044422)	EIF2B5 (ENSCATG00000043245)	DVL3 (ENSCATG00000039827) ##22	AP2M1 (ENSCATG00000042400)	ABCF3 (ENSCATG00000042195)	VWA5B2 (ENSCATG00000041491)	ALG3 (ENSCATG00000002971)	CAMK2N2 (ENSCATG00000044862)	ECE2 (ENSCATG00000037480)	PSMD2 (ENSCATG00000037182)	EIF4G1 (ENSCATG00000009656)	FAM131A (ENSCATG00000040934)	CLCN2 (ENSCATG00000039019)	POLR2H (ENSCATG00000045313)	THPO (ENSCATG00000029879)	CHRD (ENSCATG00000033542)	EPHB3 (ENSCATG00000039267)	MAGEF1 (ENSCATG00000007663)
Drill	MODERN SPECIES	835															EIF2B5 (ENSMLEG00000028338)	DVL3 (ENSMLEG00000033587) ##22	AP2M1 (ENSMLEG00000037216)	ABCF3 (ENSMLEG00000042008)	VWA5B2 (ENSMLEG00000027486)	ALG3 (ENSMLEG00000035248)	ECE2 (ENSMLEG00000036718)	PSMD2 (ENSMLEG00000035735)	EIF4G1 (ENSMLEG00000035567)	FAM131A (ENSMLEG00000037842)	CLCN2 (ENSMLEG00000027990)	POLR2H (ENSMLEG00000039827)	THPO (ENSMLEG00000034666)	CHRD (ENSMLEG00000031355)	EPHB3 (ENSMLEG00000044283)	MAGEF1 (ENSMLEG00000027002)	VPS8 (ENSMLEG00000042688)
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000164015	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00910000147139	ENSGT00910000147149	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	563	LAMP3 (ENSMNEG00000039831)	ENSMNEG00000023945	MCF2L2 (ENSMNEG00000028315)	B3GNT5 (ENSMNEG00000027097)	KLHL6 (ENSMNEG00000022023)	KLHL24 (ENSMNEG00000039455)	YEATS2 (ENSMNEG00000042931)	ENSMNEG00000009930	MAP6D1 (ENSMNEG00000024173)	ENSMNEG00000040541	PARL (ENSMNEG00000031329)	ABCC5 (ENSMNEG00000030465)	HTR3D (ENSMNEG00000036660)	HTR3C (ENSMNEG00000036620)	EIF2B5 (ENSMNEG00000035864)	DVL3 (ENSMNEG00000030669) ##22	AP2M1 (ENSMNEG00000037624)	ABCF3 (ENSMNEG00000025213)	VWA5B2 (ENSMNEG00000034270)	ALG3 (ENSMNEG00000023448)	ECE2 (ENSMNEG00000041186)	CAMK2N2 (ENSMNEG00000037400)	PSMD2 (ENSMNEG00000036128)	EIF4G1 (ENSMNEG00000037668)	FAM131A (ENSMNEG00000042277)	CLCN2 (ENSMNEG00000031059)	POLR2H (ENSMNEG00000037272)	THPO (ENSMNEG00000032607)	CHRD (ENSMNEG00000043026)	EPHB3 (ENSMNEG00000041937)	MAGEF1 (ENSMNEG00000001725)
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156162.C.k	ENSGT00940000154552.b.g.a	ENSGT00940000156941	ENSGT00940000164015	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C
Rhesus	MODERN SPECIES	11	MCCC1 (ENSMMUG00000010553)	LAMP3 (ENSMMUG00000010555)	ENSMMUG00000053420	MCF2L2 (ENSMMUG00000001456)	B3GNT5 (ENSMMUG00000031605)	KLHL6 (ENSMMUG00000022115)	YEATS2 (ENSMMUG00000008070)	ENSMMUG00000064298	MAP6D1 (ENSMMUG00000019824)	PARL (ENSMMUG00000013661)	ABCC5 (ENSMMUG00000005515)	HTR3D (ENSMMUG00000040299)	HTR3C (ENSMMUG00000013846)	HTR3E (ENSMMUG00000047491)	EIF2B5 (ENSMMUG00000006562)	DVL3 (ENSMMUG00000006553) ##22	AP2M1 (ENSMMUG00000006557)	ABCF3 (ENSMMUG00000006558)	VWA5B2 (ENSMMUG00000018949)	ALG3 (ENSMMUG00000018951)	ECE2 (ENSMMUG00000018955)	CAMK2N2 (ENSMMUG00000018956)	PSMD2 (ENSMMUG00000000800)	EIF4G1 (ENSMMUG00000010934)	FAM131A (ENSMMUG00000007503)	CLCN2 (ENSMMUG00000007507)	POLR2H (ENSMMUG00000007524)	THPO (ENSMMUG00000007525)	CHRD (ENSMMUG00000007528)	EPHB3 (ENSMMUG00000003304)	MAGEF1 (ENSMMUG00000002953)
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	11	ENSMFAG00000003633	ATP11B (ENSMFAG00000035388)	MCCC1 (ENSMFAG00000000043)	LAMP3 (ENSMFAG00000042658)	ENSMFAG00000050998	MCF2L2 (ENSMFAG00000036484)	B3GNT5 (ENSMFAG00000011168)	ENSMFAG00000035316	YEATS2 (ENSMFAG00000045323)	MAP6D1 (ENSMFAG00000064027)	PARL (ENSMFAG00000036652)	ABCC5 (ENSMFAG00000038091)	HTR3C (ENSMFAG00000042002)	HTR3E (ENSMFAG00000001496)	EIF2B5 (ENSMFAG00000045589)	DVL3 (ENSMFAG00000035356) ##22	AP2M1 (ENSMFAG00000024802)	ABCF3 (ENSMFAG00000000479)	VWA5B2 (ENSMFAG00000033707)	ALG3 (ENSMFAG00000001621)	EEF1AKMT4 (ENSMFAG00000061218)	CAMK2N2 (ENSMFAG00000062559)	ECE2 (ENSMFAG00000045351)	PSMD2 (ENSMFAG00000037802)	EIF4G1 (ENSMFAG00000034331)	FAM131A (ENSMFAG00000028860)	CLCN2 (ENSMFAG00000041358)	POLR2H (ENSMFAG00000038115)	THPO (ENSMFAG00000044370)	CHRD (ENSMFAG00000001808)	EPHB3 (ENSMFAG00000037014)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	67	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00910000147149	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT01020000230401.a.a.b.b.t.eb	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	193						NEK10 (ENSRBIG00000038842)	ENSRBIG00000044525	SLC4A7 (ENSRBIG00000031613)	ENSRBIG00000036521	ENSRBIG00000033614	HTR3D (ENSRBIG00000032796)	HTR3C (ENSRBIG00000036099)	HTR3E (ENSRBIG00000033134)	ENSRBIG00000035285	EIF2B5 (ENSRBIG00000043590)	DVL3 (ENSRBIG00000028805) ##22	AP2M1 (ENSRBIG00000009213)	ABCF3 (ENSRBIG00000019800)	VWA5B2 (ENSRBIG00000032106)	ALG3 (ENSRBIG00000040140)	ECE2 (ENSRBIG00000036172)	PSMD2 (ENSRBIG00000006300)	EIF4G1 (ENSRBIG00000037279)	FAM131A (ENSRBIG00000041210)	CLCN2 (ENSRBIG00000005264)	POLR2H (ENSRBIG00000032148)	THPO (ENSRBIG00000042346)	CHRD (ENSRBIG00000026452)	EPHB3 (ENSRBIG00000029113)	MAGEF1 (ENSRBIG00000024480)	VPS8 (ENSRBIG00000037729)
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1274	ENSRROG00000026783	B3GNT5 (ENSRROG00000008670)	MCF2L2 (ENSRROG00000033313)	KLHL6 (ENSRROG00000010778)	KLHL24 (ENSRROG00000036034)	YEATS2 (ENSRROG00000033714)	ENSRROG00000036443	MAP6D1 (ENSRROG00000043284)	PARL (ENSRROG00000042482)	ABCC5 (ENSRROG00000044495)	HTR3D (ENSRROG00000019651)	HTR3C (ENSRROG00000040115)	HTR3E (ENSRROG00000008280)	ENSRROG00000032052	EIF2B5 (ENSRROG00000037560)	DVL3 (ENSRROG00000034279) ##22	AP2M1 (ENSRROG00000036642)	ABCF3 (ENSRROG00000043684)	VWA5B2 (ENSRROG00000035763)	ALG3 (ENSRROG00000045654)	CAMK2N2 (ENSRROG00000041861)	ECE2 (ENSRROG00000002110)	PSMD2 (ENSRROG00000044729)	EIF4G1 (ENSRROG00000004376)	FAM131A (ENSRROG00000029240)	CLCN2 (ENSRROG00000034513)	POLR2H (ENSRROG00000040465)	THPO (ENSRROG00000044393)	CHRD (ENSRROG00000045705)	EPHB3 (ENSRROG00000018942)	MAGEF1 (ENSRROG00000006271)
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00910000147149	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000154037.A	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C
Gibbon	MODERN SPECIES	1	LAMP3 (ENSNLEG00000006034)	MCF2L2 (ENSNLEG00000006037)	B3GNT5 (ENSNLEG00000018942)	ENSNLEG00000006063	KLHL24 (ENSNLEG00000006066)	YEATS2 (ENSNLEG00000006070)	ENSNLEG00000034670	PARL (ENSNLEG00000006072)	ABCC5 (ENSNLEG00000006079)	ENSNLEG00000035193	ENSNLEG00000034463	HTR3C (ENSNLEG00000026619)	HTR3E (ENSNLEG00000026869)	EIF2B5 (ENSNLEG00000006103)	ENSNLEG00000029322	DVL3 (ENSNLEG00000006124) ##22	AP2M1 (ENSNLEG00000006139)	ABCF3 (ENSNLEG00000006173)	VWA5B2 (ENSNLEG00000006214)	ALG3 (ENSNLEG00000006230)	ECE2 (ENSNLEG00000006276)	PSMD2 (ENSNLEG00000006305)	EIF4G1 (ENSNLEG00000006350)	FAM131A (ENSNLEG00000027935)	CLCN2 (ENSNLEG00000006373)	ENSNLEG00000029447	THPO (ENSNLEG00000006409)	CHRD (ENSNLEG00000006417)	ENSNLEG00000018953	EPHB3 (ENSNLEG00000006254)	MAGEF1 (ENSNLEG00000018943)
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00910000147149	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000154037.A	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C
Orangutan	MODERN SPECIES	16	LAMP3 (ENSPPYG00000014332)	MCF2L2 (ENSPPYG00000014333)	B3GNT5 (ENSPPYG00000032259)	KLHL6 (ENSPPYG00000029418)	KLHL24 (ENSPPYG00000014335)	YEATS2 (ENSPPYG00000014336)	MAP6D1 (ENSPPYG00000035906)	PARL (ENSPPYG00000014338)	ABCC5 (ENSPPYG00000014339)	ENSPPYG00000014340	HTR3C (ENSPPYG00000014341)	HTR3E (ENSPPYG00000014342)	ENSPPYG00000014343	EIF2B5 (ENSPPYG00000014344)	ENSPPYG00000037065	DVL3 (ENSPPYG00000014345) ##22	AP2M1 (ENSPPYG00000014346)	ABCF3 (ENSPPYG00000014347)	VWA5B2 (ENSPPYG00000014349)	ALG3 (ENSPPYG00000014350)	EEF1AKMT4 (ENSPPYG00000014351)	CAMK2N2 (ENSPPYG00000014352)	ECE2 (ENSPPYG00000014353)	PSMD2 (ENSPPYG00000014354)	EIF4G1 (ENSPPYG00000025902)	ENSPPYG00000014355	CLCN2 (ENSPPYG00000014356)	POLR2H (ENSPPYG00000014357)	ENSPPYG00000014358	CHRD (ENSPPYG00000014359)	EPHB3 (ENSPPYG00000032019)
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00910000147149	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000154037.A.m	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899.c	ENSGT00510000047568	ENSGT00390000008610.a.b.a.a.a.s.b	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C
Gorilla	MODERN SPECIES	16	B3GNT5 (ENSGGOG00000038086)	KLHL6 (ENSGGOG00000010394)	KLHL24 (ENSGGOG00000028174)	YEATS2 (ENSGGOG00000003713)	ENSGGOG00000044009	MAP6D1 (ENSGGOG00000027837)	PARL (ENSGGOG00000000416)	ENSGGOG00000036736	ABCC5 (ENSGGOG00000000418)	ENSGGOG00000036841	ENSGGOG00000007484	HTR3C (ENSGGOG00000039758)	HTR3E (ENSGGOG00000041086)	EIF2B5 (ENSGGOG00000007425)	ENSGGOG00000026674	DVL3 (ENSGGOG00000007433) ##22	AP2M1 (ENSGGOG00000007445)	ABCF3 (ENSGGOG00000007448)	VWA5B2 (ENSGGOG00000007552)	ALG3 (ENSGGOG00000007563)	EEF1AKMT4-ECE2 (ENSGGOG00000007568)	CAMK2N2 (ENSGGOG00000001936)	PSMD2 (ENSGGOG00000027136)	EIF4G1 (ENSGGOG00000013919)	POLR2H (ENSGGOG00000002912)	ENSGGOG00000038977	THPO (ENSGGOG00000000109)	CHRD (ENSGGOG00000000110)	EPHB3 (ENSGGOG00000016281)	MAGEF1 (ENSGGOG00000009456)	VPS8 (ENSGGOG00000013880)
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000154037.A.m	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899.d	ENSGT00940000163899.c	ENSGT00510000047568	ENSGT00390000008610.a.b.a.a.a.s.b	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C
Human	MODERN SPECIES	15	MCCC1 (ENSG00000078070)	LAMP3 (ENSG00000078081)	MCF2L2 (ENSG00000053524)	B3GNT5 (ENSG00000176597)	KLHL6 (ENSG00000172578)	KLHL24 (ENSG00000114796)	YEATS2 (ENSG00000163872)	ENSG00000283765	MAP6D1 (ENSG00000180834)	PARL (ENSG00000175193)	ABCC5 (ENSG00000114770)	HTR3D (ENSG00000186090)	HTR3C (ENSG00000178084)	HTR3E (ENSG00000186038)	EIF2B5 (ENSG00000145191)	DVL3 (ENSG00000161202) ##22	AP2M1 (ENSG00000161203)	ABCF3 (ENSG00000161204)	VWA5B2 (ENSG00000145198)	ALG3 (ENSG00000214160)	EEF1AKMT4 (ENSG00000284753)	EEF1AKMT4-ECE2 (ENSG00000284917)	CAMK2N2 (ENSG00000163888)	ECE2 (ENSG00000145194)	PSMD2 (ENSG00000175166)	EIF4G1 (ENSG00000114867)	FAM131A (ENSG00000175182)	CLCN2 (ENSG00000114859)	POLR2H (ENSG00000163882)	THPO (ENSG00000090534)	CHRD (ENSG00000090539)
Pan	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000154037.A.m	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899.d	ENSGT00510000047568	ENSGT00390000008610.a.b.a.a.a.s.b	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736
Chimpanzee	MODERN SPECIES	16	MCF2L2 (ENSPTRG00000015665)	B3GNT5 (ENSPTRG00000015666)	KLHL6 (ENSPTRG00000015667)	KLHL24 (ENSPTRG00000015669)	YEATS2 (ENSPTRG00000015670)	MAP6D1 (ENSPTRG00000015672)	PARL (ENSPTRG00000015673)	ENSPTRG00000048232	ABCC5 (ENSPTRG00000050934)	HTR3D (ENSPTRG00000015676)	HTR3C (ENSPTRG00000015677)	HTR3E (ENSPTRG00000015678)	ENSPTRG00000050156	EIF2B5 (ENSPTRG00000015679)	ENSPTRG00000015680	DVL3 (ENSPTRG00000015681) ##22	AP2M1 (ENSPTRG00000015682)	ABCF3 (ENSPTRG00000015683)	VWA5B2 (ENSPTRG00000015685)	ALG3 (ENSPTRG00000047056)	ECE2 (ENSPTRG00000015687)	CAMK2N2 (ENSPTRG00000015688)	PSMD2 (ENSPTRG00000015689)	EIF4G1 (ENSPTRG00000015690)	FAM131A (ENSPTRG00000015691)	CLCN2 (ENSPTRG00000015692)	POLR2H (ENSPTRG00000047600)	THPO (ENSPTRG00000015694)	CHRD (ENSPTRG00000015695)	EPHB3 (ENSPTRG00000015696)	MAGEF1 (ENSPTRG00000015697)
Bonobo	MODERN SPECIES	16	MCF2L2 (ENSPPAG00000032914)	B3GNT5 (ENSPPAG00000000714)	KLHL6 (ENSPPAG00000028141)	KLHL24 (ENSPPAG00000034331)	YEATS2 (ENSPPAG00000015640)	PARL (ENSPPAG00000037739)	ENSPPAG00000032200	ABCC5 (ENSPPAG00000029506)	ENSPPAG00000035283	ENSPPAG00000038501	HTR3C (ENSPPAG00000039021)	HTR3E (ENSPPAG00000028726)	ENSPPAG00000026468	EIF2B5 (ENSPPAG00000030604)	ENSPPAG00000033710	DVL3 (ENSPPAG00000041835) ##22	AP2M1 (ENSPPAG00000035664)	ABCF3 (ENSPPAG00000041562)	VWA5B2 (ENSPPAG00000027581)	ALG3 (ENSPPAG00000027959)	ECE2 (ENSPPAG00000027988)	PSMD2 (ENSPPAG00000035691)	EIF4G1 (ENSPPAG00000042782)	FAM131A (ENSPPAG00000036558)	CLCN2 (ENSPPAG00000032193)	POLR2H (ENSPPAG00000035658)	THPO (ENSPPAG00000031907)	CHRD (ENSPPAG00000034959)	EPHB3 (ENSPPAG00000034296)	MAGEF1 (ENSPPAG00000023136)	VPS8 (ENSPPAG00000038646)
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000163715.a	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Tree shrew	MODERN SPECIES	2952																DVL3 (ENSTBEG00000010328) ##22	AP2M1 (ENSTBEG00000011500)	ABCF3 (ENSTBEG00000011827)
Glires	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000163715.a	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	6				ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Rabbit	MODERN SPECIES	5	ENSOCUG00000032488	ADIPOQ (ENSOCUG00000026268)	B3GNT5 (ENSOCUG00000008691)	MCF2L2 (ENSOCUG00000008674)	KLHL6 (ENSOCUG00000007431)	KLHL24 (ENSOCUG00000013065)	YEATS2 (ENSOCUG00000011947)	MAP6D1 (ENSOCUG00000011959)	ENSOCUG00000007882	ENSOCUG00000022628	ABCC5 (ENSOCUG00000007887)	ENSOCUG00000011732	ENSOCUG00000010112	ENSOCUG00000023795	EIF2B5 (ENSOCUG00000004536)	DVL3 (ENSOCUG00000036386) ##22	AP2M1 (ENSOCUG00000004556)	ABCF3 (ENSOCUG00000004565)	VWA5B2 (ENSOCUG00000014683)	ALG3 (ENSOCUG00000026514)	EEF1AKMT4 (ENSOCUG00000037277)	CAMK2N2 (ENSOCUG00000025446)	ECE2 (ENSOCUG00000014702)	PSMD2 (ENSOCUG00000007058)	EIF4G1 (ENSOCUG00000006110)	FAM131A (ENSOCUG00000023671)	CLCN2 (ENSOCUG00000007065)	POLR2H (ENSOCUG00000007078)	THPO (ENSOCUG00000007080)	CHRD (ENSOCUG00000007084)	ENSOCUG00000023062
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156162.C.k	ENSGT00940000154552.b	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156162.C.k	ENSGT00940000154552.b	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000156162.C.k	ENSGT00940000154552.b	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	57							ENSGT00940000154345.b	ENSGT00540000070023.c.a.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	79						ENSGT00940000154345.b	ENSGT00540000070023.c.a.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000154783.f.n	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Squirrel	MODERN SPECIES	178						KLHL6 (ENSSTOG00000011318)	ENSSTOG00000030575	KLHL24 (ENSSTOG00000022762)	ENSSTOG00000029520	YEATS2 (ENSSTOG00000005349)	MAP6D1 (ENSSTOG00000028276)	PARL (ENSSTOG00000023222)	ENSSTOG00000019669	ABCC5 (ENSSTOG00000003886)	EIF2B5 (ENSSTOG00000021575)	DVL3 (ENSSTOG00000008239) ##22	AP2M1 (ENSSTOG00000008273)	ABCF3 (ENSSTOG00000008295)	VWA5B2 (ENSSTOG00000008179)	ALG3 (ENSSTOG00000028571)	CAMK2N2 (ENSSTOG00000023761)	ECE2 (ENSSTOG00000008215)	PSMD2 (ENSSTOG00000008234)	EIF4G1 (ENSSTOG00000021912)	FAM131A (ENSSTOG00000021429)	CLCN2 (ENSSTOG00000008267)	POLR2H (ENSSTOG00000008300)	THPO (ENSSTOG00000008312)	CHRD (ENSSTOG00000008321)	EPHB3 (ENSSTOG00000009427)	MAGEF1 (ENSSTOG00000014789)
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	67					KLHL6 (ENSUPAG00010003958)	ENSUPAG00010003949	KLHL24 (ENSUPAG00010003926)	ENSUPAG00010003918	YEATS2 (ENSUPAG00010003780)	MAP6D1 (ENSUPAG00010003771)	ENSUPAG00010003758	PARL (ENSUPAG00010003727)	ENSUPAG00010003684	ABCC5 (ENSUPAG00010003605)	EIF2B5 (ENSUPAG00010003579)	DVL3 (ENSUPAG00010003477) ##22	ENSUPAG00010003469	ABCF3 (ENSUPAG00010003427)	VWA5B2 (ENSUPAG00010003400)	ALG3 (ENSUPAG00010003339)	EEF1AKMT4 (ENSUPAG00010003328)	CAMK2N2 (ENSUPAG00010003323)	ECE2 (ENSUPAG00010003253)	PSMD2 (ENSUPAG00010003228)	EIF4G1 (ENSUPAG00010002903)	FAM131A (ENSUPAG00010002887)	CLCN2 (ENSUPAG00010002755)	POLR2H (ENSUPAG00010002737)	THPO (ENSUPAG00010002733)	CHRD (ENSUPAG00010002655)	ENSUPAG00010002644
Alpin marmot	MODERN SPECIES	65						KLHL6 (ENSMMMG00000006081)	ENSMMMG00000006096	KLHL24 (ENSMMMG00000006106)	YEATS2 (ENSMMMG00000006116)	MAP6D1 (ENSMMMG00000006183)	PARL (ENSMMMG00000006194)	ENSMMMG00000006241	ENSMMMG00000006246	ABCC5 (ENSMMMG00000006275)	EIF2B5 (ENSMMMG00000006358)	DVL3 (ENSMMMG00000006390) ##22	AP2M1 (ENSMMMG00000006465)	ABCF3 (ENSMMMG00000006539)	VWA5B2 (ENSMMMG00000006578)	ALG3 (ENSMMMG00000006608)	EEF1AKMT4 (ENSMMMG00000006671)	ECE2 (ENSMMMG00000006677)	PSMD2 (ENSMMMG00000006803)	EIF4G1 (ENSMMMG00000006821)	FAM131A (ENSMMMG00000007631)	CLCN2 (ENSMMMG00000007660)	POLR2H (ENSMMMG00000007825)	THPO (ENSMMMG00000007840)	CHRD (ENSMMMG00000007845)	ENSMMMG00000007976	ENSMMMG00000007979
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	1	DCUN1D1 (ENSSVLG00005005371)	MCCC1 (ENSSVLG00005005194)	ENSSVLG00005005088	ENSSVLG00005005061	B3GNT5 (ENSSVLG00005005047)	MCF2L2 (ENSSVLG00005005015)	KLHL6 (ENSSVLG00005004948)	KLHL24 (ENSSVLG00005004913)	YEATS2 (ENSSVLG00005004883)	MAP6D1 (ENSSVLG00005004847)	PARL (ENSSVLG00005004781)	ENSSVLG00005004738	ABCC5 (ENSSVLG00005004668)	ENSSVLG00005004623	EIF2B5 (ENSSVLG00005004601)	DVL3 (ENSSVLG00005004544) ##22	AP2M1 (ENSSVLG00005015912)	ABCF3 (ENSSVLG00005015804)	VWA5B2 (ENSSVLG00005015467)	ALG3 (ENSSVLG00005015409)	EEF1AKMT4 (ENSSVLG00005015366)	CAMK2N2 (ENSSVLG00005015328)	ECE2 (ENSSVLG00005014218)	PSMD2 (ENSSVLG00005013466)	EIF4G1 (ENSSVLG00005012942)	FAM131A (ENSSVLG00005012712)	CLCN2 (ENSSVLG00005012577)	POLR2H (ENSSVLG00005012448)	THPO (ENSSVLG00005012371)	CHRD (ENSSVLG00005012258)	ENSSVLG00005012180
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000160284	ENSGT00520000060726.b	ENSGT00940000158398	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000164826	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	27	ENSHGLG00000016779	ENSHGLG00000046654	ENSHGLG00000014640	ENSHGLG00000016655	ENSHGLG00000016757	ENSHGLG00000042633	ENSHGLG00000016744	ENSHGLG00000019330	MAP6D1 (ENSHGLG00000033592)	PARL (ENSHGLG00000017341)	ABCC5 (ENSHGLG00000017333)	ENSHGLG00000042584	HTR3E (ENSHGLG00000040578)	EIF2B5 (ENSHGLG00000017325)	ENSHGLG00000041686 ##22	DVL3 (ENSHGLG00000017314) ##22	AP2M1 (ENSHGLG00000016752)	ABCF3 (ENSHGLG00000016746)	VWA5B2 (ENSHGLG00000016728)	ALG3 (ENSHGLG00000016704)	EEF1AKMT4 (ENSHGLG00000045913)	CAMK2N2 (ENSHGLG00000044517)	ECE2 (ENSHGLG00000014845)	PSMD2 (ENSHGLG00000014466)	ENSHGLG00000013899	FAM131A (ENSHGLG00000013050)	CLCN2 (ENSHGLG00000012758)	POLR2H (ENSHGLG00000048890)	THPO (ENSHGLG00000043140)	ENSHGLG00000012005	ENSHGLG00000032546
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000000410	ENSGT00940000160284	ENSGT00940000158398	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000164826	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00390000010672
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000159742	ENSGT00940000160737	ENSGT00940000160284	ENSGT00940000158398	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000164826	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00390000010672
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	127	ENSCLAG00000014892	CDC25A (ENSCLAG00000014577)	NME6 (ENSCLAG00000014082)	OSBPL11 (ENSCLAG00000015182)	ENSCLAG00000015954	B3GNT5 (ENSCLAG00000017892)	MCF2L2 (ENSCLAG00000015254)	ENSCLAG00000015008	ENSCLAG00000015113	KLHL24 (ENSCLAG00000014813)	YEATS2 (ENSCLAG00000016934)	PARL (ENSCLAG00000014470)	ENSCLAG00000016420	ABCC5 (ENSCLAG00000014609)	EIF2B5 (ENSCLAG00000012914)	DVL3 (ENSCLAG00000014292) ##22	AP2M1 (ENSCLAG00000014315)	ABCF3 (ENSCLAG00000016152)	VWA5B2 (ENSCLAG00000012845)	ALG3 (ENSCLAG00000015577)	CAMK2N2 (ENSCLAG00000014688)	ECE2 (ENSCLAG00000012028)	PSMD2 (ENSCLAG00000015382)	EIF4G1 (ENSCLAG00000012942)	FAM131A (ENSCLAG00000013327)	CLCN2 (ENSCLAG00000015337)	POLR2H (ENSCLAG00000013016)	THPO (ENSCLAG00000013534)	CHRD (ENSCLAG00000017299)	EPHB3 (ENSCLAG00000012937)	VPS8 (ENSCLAG00000013054)
Degu	MODERN SPECIES	167	ENSODEG00000012608	CDC25A (ENSODEG00000013712)	NME6 (ENSODEG00000013578)	OSBPL11 (ENSODEG00000012476)	B3GNT5 (ENSODEG00000020343)	ENSODEG00000012517	KLHL24 (ENSODEG00000015151)	YEATS2 (ENSODEG00000015298)	MAP6D1 (ENSODEG00000013420)	PARL (ENSODEG00000013822)	ENSODEG00000014006	ABCC5 (ENSODEG00000014249)	ENSODEG00000012268	ENSODEG00000012404	EIF2B5 (ENSODEG00000012756)	DVL3 (ENSODEG00000012849) ##22	AP2M1 (ENSODEG00000012988)	ABCF3 (ENSODEG00000013982)	VWA5B2 (ENSODEG00000013878)	ALG3 (ENSODEG00000013548)	ECE2 (ENSODEG00000015263)	CAMK2N2 (ENSODEG00000012896)	PSMD2 (ENSODEG00000013158)	ENSODEG00000013872	ENSODEG00000012718	FAM131A (ENSODEG00000013175)	CLCN2 (ENSODEG00000014349)	ENSODEG00000013008	ENSODEG00000014007	CHRD (ENSODEG00000013793)	ENSODEG00000013444
Guinea pig	MODERN SPECIES	7	ENSCPOG00000022345	CDC25A (ENSCPOG00000001225)	ENSCPOG00000009093	NME6 (ENSCPOG00000004702)	OSBPL11 (ENSCPOG00000005842)	ENSCPOG00000037382	B3GNT5 (ENSCPOG00000035869)	KLHL6 (ENSCPOG00000001890)	KLHL24 (ENSCPOG00000012123)	YEATS2 (ENSCPOG00000012531)	MAP6D1 (ENSCPOG00000013222)	PARL (ENSCPOG00000013997)	ENSCPOG00000025499	ABCC5 (ENSCPOG00000011252)	EIF2B5 (ENSCPOG00000012458)	DVL3 (ENSCPOG00000026862) ##22	AP2M1 (ENSCPOG00000012463)	ABCF3 (ENSCPOG00000012469)	VWA5B2 (ENSCPOG00000027260)	ALG3 (ENSCPOG00000019613)	ECE2 (ENSCPOG00000013082)	PSMD2 (ENSCPOG00000009183)	EIF4G1 (ENSCPOG00000007336)	FAM131A (ENSCPOG00000031188)	CLCN2 (ENSCPOG00000009200)	POLR2H (ENSCPOG00000040303)	ENSCPOG00000030572	CHRD (ENSCPOG00000007354)	EPHB3 (ENSCPOG00000000977)	VPS8 (ENSCPOG00000010486)	C3orf70 (ENSCPOG00000001519)
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156162.C.k	ENSGT00940000154552.b	ENSGT00940000156941	ENSGT00940000164015	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	481			Sox2 (ENSDORG00000007481)	Atp11b (ENSDORG00000009378)	ENSDORG00000023700	Mccc1 (ENSDORG00000000473)	ENSDORG00000000477	B3gnt5 (ENSDORG00000014358)	ENSDORG00000000027	Klhl24 (ENSDORG00000025427)	Yeats2 (ENSDORG00000014924)	Parl (ENSDORG00000014935)	Cyp2ab1 (ENSDORG00000026348)	Abcc5 (ENSDORG00000014941)	Eif2b5 (ENSDORG00000005107)	Dvl3 (ENSDORG00000004638) ##22	Ap2m1 (ENSDORG00000004640)	Abcf3 (ENSDORG00000024153)	Vwa5b2 (ENSDORG00000007935)	Alg3 (ENSDORG00000007936)	Ece2 (ENSDORG00000007937)	Psmd2 (ENSDORG00000007939)	ENSDORG00000029000	ENSDORG00000010226	Fam131a (ENSDORG00000023946)	Clcn2 (ENSDORG00000010613)	Polr2h (ENSDORG00000027475)	ENSDORG00000010616	Chrd (ENSDORG00000010617)	Ephb3 (ENSDORG00000003084)	ENSDORG00000025676
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	14					ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	54	Bdh1 (ENSJJAG00000021958)	Apod (ENSJJAG00000023745)	Ppp1r2 (ENSJJAG00000003650)	Acap2 (ENSJJAG00000023457)	Xxylt1 (ENSJJAG00000023864)	Fam43a (ENSJJAG00000010833)	Lsg1 (ENSJJAG00000015513)	Tmem44 (ENSJJAG00000011725)	Klhl24 (ENSJJAG00000024367)	Yeats2 (ENSJJAG00000017369)	ENSJJAG00000003735	Parl (ENSJJAG00000009964)	ENSJJAG00000020951	Abcc5 (ENSJJAG00000018438)	Eif2b5 (ENSJJAG00000004949)	Dvl3 (ENSJJAG00000011264) ##22	Ap2m1 (ENSJJAG00000024086)	Abcf3 (ENSJJAG00000014872)	Vwa5b2 (ENSJJAG00000011906)	Alg3 (ENSJJAG00000000348)	Camk2n2 (ENSJJAG00000023253)	Ece2 (ENSJJAG00000014145)	Psmd2 (ENSJJAG00000024332)	ENSJJAG00000020262	ENSJJAG00000012185	Fam131a (ENSJJAG00000019311)	Clcn2 (ENSJJAG00000015086)	Polr2h (ENSJJAG00000015574)	ENSJJAG00000018272	Chrd (ENSJJAG00000020171)	ENSJJAG00000021068
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	11					ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	757												Abcc5 (ENSNGAG00000021995)	ENSNGAG00000020075	Parl (ENSNGAG00000015430)	Eif2b5 (ENSNGAG00000023841)	Dvl3 (ENSNGAG00000010230) ##22	Ap2m1 (ENSNGAG00000022188)	Abcf3 (ENSNGAG00000023909)	Vwa5b2 (ENSNGAG00000021963)	Alg3 (ENSNGAG00000008806)	Ece2 (ENSNGAG00000024299)	Camk2n2 (ENSNGAG00000024362)	Psmd2 (ENSNGAG00000010621)	ENSNGAG00000020539	ENSNGAG00000022175	Fam131a (ENSNGAG00000019596)	Clcn2 (ENSNGAG00000021473)	ENSNGAG00000023997	Thpo (ENSNGAG00000024253)	Chrd (ENSNGAG00000002968)	Ephb3 (ENSNGAG00000023003)
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000010239	ENSGT00550000074919	ENSGT00940000164015	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01090000259995.b.b.a.a.a.i	ENSGT01090000259995.b.b.a.a.b	ENSGT01090000259995.b.b.a.a.a.j	ENSGT01090000259995.b.b.b	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Rat	MODERN SPECIES	2	Or2l13c (ENSRNOG00000068165)	Or2aj4 (ENSRNOG00000049950)	Or2aj4b (ENSRNOG00000048434)	Lamp3 (ENSRNOG00000022792)	B3gnt5 (ENSRNOG00000046258)	AABR07034706.1 (ENSRNOG00000038119)	Klhl6 (ENSRNOG00000001908)	Klhl24 (ENSRNOG00000033372)	Yeats2 (ENSRNOG00000023107)	Map6d1 (ENSRNOG00000001911)	Parl (ENSRNOG00000023271)	Cyp2ab1 (ENSRNOG00000042367)	Abcc5 (ENSRNOG00000029178)	Rps15al2 (ENSRNOG00000032877)	Eif2b5 (ENSRNOG00000038160)	Dvl3 (ENSRNOG00000001708) ##22	Abcf3 (ENSRNOG00000001710)	Ap2m1 (ENSRNOG00000001709)	Vwa5b2 (ENSRNOG00000001707)	Alg3 (ENSRNOG00000001712)	Eef1akmt4 (ENSRNOG00000029529)	Ece2 (ENSRNOG00000001715)	Psmd2 (ENSRNOG00000001719)	Eif4g1 (ENSRNOG00000001738)	Fam131a (ENSRNOG00000063031)	Clcn2 (ENSRNOG00000001742)	Polr2h (ENSRNOG00000001748)	Thpol1 (ENSRNOG00000046850)	Chrd (ENSRNOG00000001750)	RGD1563956 (ENSRNOG00000025014)	RGD1560559 (ENSRNOG00000025031)
Mus	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01090000259995.b.b.a.a.a.i	ENSGT01090000259995.b.b.a.a.b	ENSGT01090000259995.b.b.a.a.a.j	ENSGT01090000259995.b.b.b	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Shrew mouse	MODERN SPECIES	3	MGP_PahariEiJ_G0016266	Or2l13 (MGP_PahariEiJ_G0016267)	Or2l5 (MGP_PahariEiJ_G0016268)	Or2l13b (MGP_PahariEiJ_G0016269)	Lamp3 (MGP_PahariEiJ_G0016270)	B3gnt5 (MGP_PahariEiJ_G0016271)	A930003A15Rik (MGP_PahariEiJ_G0016272)	Klhl6 (MGP_PahariEiJ_G0016273)	Klhl24 (MGP_PahariEiJ_G0016274)	Yeats2 (MGP_PahariEiJ_G0016275)	Map6d1 (MGP_PahariEiJ_G0016276)	Parl (MGP_PahariEiJ_G0016277)	Cyp2ab1 (MGP_PahariEiJ_G0016278)	Abcc5 (MGP_PahariEiJ_G0016279)	Eif2b5 (MGP_PahariEiJ_G0016280)	Dvl3 (MGP_PahariEiJ_G0016281) ##22	Ap2m1 (MGP_PahariEiJ_G0016282)	Abcf3 (MGP_PahariEiJ_G0016283)	Vwa5b2 (MGP_PahariEiJ_G0016284)	Alg3 (MGP_PahariEiJ_G0016285)	Ece2 (MGP_PahariEiJ_G0016286)	Camk2n2 (MGP_PahariEiJ_G0016287)	MGP_PahariEiJ_G0016288	MGP_PahariEiJ_G0016289	MGP_PahariEiJ_G0016290	Fam131a (MGP_PahariEiJ_G0016291)	Clcn2 (MGP_PahariEiJ_G0016292)	Polr2h (MGP_PahariEiJ_G0016293)	Thpo (MGP_PahariEiJ_G0016294)	Chrd (MGP_PahariEiJ_G0016295)	MGP_PahariEiJ_G0016296
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT01090000259995.b.b.a.a.a.i	ENSGT01090000259995.b.b.a.a.b	ENSGT01090000259995.b.b.a.a.a.j	ENSGT01090000259995.b.b.b	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	7	MGP_CAROLIEiJ_G0020562	Or2l5 (MGP_CAROLIEiJ_G0020563)	MGP_CAROLIEiJ_G0020564	MGP_CAROLIEiJ_G0020565	Lamp3 (MGP_CAROLIEiJ_G0020566)	B3gnt5 (MGP_CAROLIEiJ_G0020567)	A930003A15Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0020568)	Klhl6 (MGP_CAROLIEiJ_G0020569)	Klhl24 (MGP_CAROLIEiJ_G0020570)	Yeats2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020571)	Map6d1 (MGP_CAROLIEiJ_G0020572)	Parl (MGP_CAROLIEiJ_G0020573)	Cyp2ab1 (MGP_CAROLIEiJ_G0020574)	Abcc5 (MGP_CAROLIEiJ_G0020575)	Eif2b5 (MGP_CAROLIEiJ_G0020576)	Dvl3 (MGP_CAROLIEiJ_G0020577) ##22	Ap2m1 (MGP_CAROLIEiJ_G0020578)	Abcf3 (MGP_CAROLIEiJ_G0020579)	Vwa5b2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020580)	Alg3 (MGP_CAROLIEiJ_G0020581)	Ece2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020582)	Camk2n2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020583)	MGP_CAROLIEiJ_G0020584	MGP_CAROLIEiJ_G0020585	Eif4g1 (MGP_CAROLIEiJ_G0020586)	Fam131a (MGP_CAROLIEiJ_G0020587)	Clcn2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020588)	Polr2h (MGP_CAROLIEiJ_G0020589)	Thpo (MGP_CAROLIEiJ_G0020590)	Chrd (MGP_CAROLIEiJ_G0020591)	Teddm3 (MGP_CAROLIEiJ_G0020592)
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT01090000259995.b.b.a.a.a.i	ENSGT01090000259995.b.b.a.a.b	ENSGT01090000259995.b.b.a.a.a.j	ENSGT01090000259995.b.b.b.i	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.c	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Mouse	MODERN SPECIES	7	Or2l13b (ENSMUSG00000061361)	Or2aj4 (ENSMUSG00000068535)	Or2aj5 (ENSMUSG00000062245)	Or2aj6 (ENSMUSG00000060480)	Lamp3 (ENSMUSG00000041247)	B3gnt5 (ENSMUSG00000022686)	A930003A15Rik (ENSMUSG00000075330)	Klhl6 (ENSMUSG00000043008)	Klhl24 (ENSMUSG00000062901)	Yeats2 (ENSMUSG00000041215)	Map6d1 (ENSMUSG00000041205)	Parl (ENSMUSG00000033918)	Cyp2ab1 (ENSMUSG00000022818)	Abcc5 (ENSMUSG00000022822)	Eif2b5 (ENSMUSG00000003235)	Dvl3 (ENSMUSG00000003233) ##22	Ap2m1 (ENSMUSG00000022841)	Abcf3 (ENSMUSG00000003234)	Vwa5b2 (ENSMUSG00000046613)	Alg3 (ENSMUSG00000033809)	Eef1akmt4 (ENSMUSG00000115219)	Eef1ece2 (ENSMUSG00000115293)	Camk2n2 (ENSMUSG00000051146)	Ece2 (ENSMUSG00000022842)	Psmd2 (ENSMUSG00000006998)	Eif4g1 (ENSMUSG00000045983)	Fam131a (ENSMUSG00000050821)	Clcn2 (ENSMUSG00000022843)	Polr2h (ENSMUSG00000021018)	Thpo (ENSMUSG00000022847)	Chrd (ENSMUSG00000006958)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT01090000259995.b.b.a.a.a.i	ENSGT01090000259995.b.b.a.a.b	ENSGT01090000259995.b.b.a.a.a.j	ENSGT01090000259995.b.b.b.i	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.c	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000158024.C
Steppe mouse	MODERN SPECIES	2878	Or2l5 (ENSMSIG00000010498)	Or2l13b (ENSMSIG00000010505)	ENSMSIG00000010518	Lamp3 (ENSMSIG00000010525)	B3gnt5 (ENSMSIG00000010550)	A930003A15Rik (ENSMSIG00000010562)	Klhl6 (ENSMSIG00000010572)	Klhl24 (ENSMSIG00000010606)	Yeats2 (ENSMSIG00000010643)	Map6d1 (ENSMSIG00000010692)	Parl (ENSMSIG00000010709)	Cyp2ab1 (ENSMSIG00000010757)	ENSMSIG00000010802	ENSMSIG00000010855	Eif2b5 (ENSMSIG00000010879)	Dvl3 (ENSMSIG00000010921) ##22
spretus	MODERN SPECIES	7	MGP_SPRETEiJ_G0021459	MGP_SPRETEiJ_G0021460	MGP_SPRETEiJ_G0021461	MGP_SPRETEiJ_G0021462	Lamp3 (MGP_SPRETEiJ_G0021463)	B3gnt5 (MGP_SPRETEiJ_G0021464)	A930003A15Rik (MGP_SPRETEiJ_G0021465)	Klhl6 (MGP_SPRETEiJ_G0021466)	Klhl24 (MGP_SPRETEiJ_G0021467)	Yeats2 (MGP_SPRETEiJ_G0021468)	Map6d1 (MGP_SPRETEiJ_G0021469)	Parl (MGP_SPRETEiJ_G0021470)	Cyp2ab1 (MGP_SPRETEiJ_G0021471)	Abcc5 (MGP_SPRETEiJ_G0021472)	Eif2b5 (MGP_SPRETEiJ_G0021473)	Dvl3 (MGP_SPRETEiJ_G0021474) ##22	Ap2m1 (MGP_SPRETEiJ_G0021475)	Abcf3 (MGP_SPRETEiJ_G0021476)	Vwa5b2 (MGP_SPRETEiJ_G0021477)	Alg3 (MGP_SPRETEiJ_G0021478)	Ece2 (MGP_SPRETEiJ_G0021479)	Camk2n2 (MGP_SPRETEiJ_G0021480)	MGP_SPRETEiJ_G0021481	MGP_SPRETEiJ_G0021482	Eif4g1 (MGP_SPRETEiJ_G0021483)	Fam131a (MGP_SPRETEiJ_G0021484)	Clcn2 (MGP_SPRETEiJ_G0021485)	Polr2h (MGP_SPRETEiJ_G0021486)	Thpo (MGP_SPRETEiJ_G0021487)	Chrd (MGP_SPRETEiJ_G0021488)	Ephb3 (MGP_SPRETEiJ_G0021489)
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000010239	ENSGT00550000074919	ENSGT00940000164015	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000163715.a	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000002408	ENSGT00390000002511	ENSGT00390000010239	ENSGT00550000074919	ENSGT00940000164015	ENSGT00940000159676	ENSGT00990000203899	ENSGT00940000163715.a	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C
Golden Hamster	MODERN SPECIES	645													Parl (ENSMAUG00000004411)	Abcc5 (ENSMAUG00000016654)	Eif2b5 (ENSMAUG00000018803)	Dvl3 (ENSMAUG00000018768) ##22	Ap2m1 (ENSMAUG00000021138)	Abcf3 (ENSMAUG00000017666)	Vwa5b2 (ENSMAUG00000008822)	Alg3 (ENSMAUG00000019456)	Camk2n2 (ENSMAUG00000009092)	Ece2 (ENSMAUG00000011426)	Psmd2 (ENSMAUG00000014316)	ENSMAUG00000008684	Eif4g1 (ENSMAUG00000021452)	Fam131a (ENSMAUG00000015455)	Clcn2 (ENSMAUG00000020728)	Polr2h (ENSMAUG00000016338)	Thpo (ENSMAUG00000018682)	Chrd (ENSMAUG00000019283)	Ephb3 (ENSMAUG00000012646)
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	382	ENSCGRG00001002545	ENSCGRG00001009167	ENSCGRG00001008005	Lamp3 (ENSCGRG00001020302)	B3gnt5 (ENSCGRG00001009729)	A930003A15Rik (ENSCGRG00001011504)	ENSCGRG00001013945	Klhl24 (ENSCGRG00001016212)	Yeats2 (ENSCGRG00001018275)	Map6d1 (ENSCGRG00001019708)	Parl (ENSCGRG00001023889)	Cyp2ab1 (ENSCGRG00001000606)	Abcc5 (ENSCGRG00001020997)	ENSCGRG00001023699	Eif2b5 (ENSCGRG00001008638)	Dvl3 (ENSCGRG00001018864) ##22	Ap2m1 (ENSCGRG00001011476)	Abcf3 (ENSCGRG00001000537)	Vwa5b2 (ENSCGRG00001020976)	Alg3 (ENSCGRG00001010029)	Ece2 (ENSCGRG00001019837)	Camk2n2 (ENSCGRG00001011488)	Psmd2 (ENSCGRG00001017872)	Eif4g1 (ENSCGRG00001024063)	Fam131a (ENSCGRG00001014728)	Clcn2 (ENSCGRG00001008852)	Polr2h (ENSCGRG00001004900)	Thpo (ENSCGRG00001010258)	Chrd (ENSCGRG00001016660)	Teddm3 (ENSCGRG00001008819)	Ephb3 (ENSCGRG00001013531)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01090000259995.b.a.a.a.a.a.a	ENSGT01090000259995.b.b.a.a.a.g	ENSGT01090000259995.b.b.a.a.b	ENSGT01090000259995.b.b.b	ENSGT01090000259995.b.b.a.a.a.h.a.a.b	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Prairie vole	MODERN SPECIES	126	ENSMOCG00000005724	ENSMOCG00000002427	ENSMOCG00000001652	ENSMOCG00000001120	ENSMOCG00000022739	ENSMOCG00000001746	B3gnt5 (ENSMOCG00000018327)	Klhl6 (ENSMOCG00000010299)	Klhl24 (ENSMOCG00000001149)	Yeats2 (ENSMOCG00000020307)	Map6d1 (ENSMOCG00000016574)	Parl (ENSMOCG00000015256)	Cyp2ab1 (ENSMOCG00000006421)	Abcc5 (ENSMOCG00000004720)	Eif2b5 (ENSMOCG00000016708)	Dvl3 (ENSMOCG00000012179) ##22	Ap2m1 (ENSMOCG00000014484)	Abcf3 (ENSMOCG00000006812)	Vwa5b2 (ENSMOCG00000003248)	Alg3 (ENSMOCG00000017690)	Ece2 (ENSMOCG00000001939)	Camk2n2 (ENSMOCG00000012422)	Psmd2 (ENSMOCG00000016565)	Eif4g1 (ENSMOCG00000016131)	Fam131a (ENSMOCG00000009027)	Clcn2 (ENSMOCG00000001859)	Polr2h (ENSMOCG00000004886)	Thpo (ENSMOCG00000014210)	Chrd (ENSMOCG00000016712)	Ephb3 (ENSMOCG00000015859)	Vps8 (ENSMOCG00000017404)
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	3	Tbccd1 (ENSPEMG00000014115)	Crygs (ENSPEMG00000017836)	Dgkg (ENSPEMG00000015589)	Etv5 (ENSPEMG00000006146)	ENSPEMG00000024986	ENSPEMG00000030653	Tra2b (ENSPEMG00000020933)	Klhl6 (ENSPEMG00000016219)	Klhl24 (ENSPEMG00000005554)	Yeats2 (ENSPEMG00000016656)	ENSPEMG00000025222	Parl (ENSPEMG00000017067)	Cyp2ab1 (ENSPEMG00000010910)	Abcc5 (ENSPEMG00000009351)	Eif2b5 (ENSPEMG00000009037)	Dvl3 (ENSPEMG00000017805) ##22	Ap2m1 (ENSPEMG00000006895)	Abcf3 (ENSPEMG00000013382)	Vwa5b2 (ENSPEMG00000014803)	Alg3 (ENSPEMG00000011841)	Eef1akmt4 (ENSPEMG00000031228)	Camk2n2 (ENSPEMG00000010089)	Ece2 (ENSPEMG00000000352)	Psmd2 (ENSPEMG00000011042)	Eif4g1 (ENSPEMG00000017256)	Fam131a (ENSPEMG00000028135)	Clcn2 (ENSPEMG00000008108)	Polr2h (ENSPEMG00000029633)	Thpo (ENSPEMG00000009973)	Chrd (ENSPEMG00000009578)	Teddm3 (ENSPEMG00000025801)
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000164015	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000163715.a	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a.b	ENSGT00940000156739.b.b.a.a	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00470000042552	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	65	ENSGT00940000154552	ENSGT00940000156941	ENSGT00940000164015	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000163715.a	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a.b	ENSGT00940000156739.b.b.a.a	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096.m	ENSGT00390000013904	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767
Armadillo	MODERN SPECIES	2155	DCUN1D1 (ENSDNOG00000019073)	MCCC1 (ENSDNOG00000012070)	LAMP3 (ENSDNOG00000033820)	B3GNT5 (ENSDNOG00000010581)	MCF2L2 (ENSDNOG00000010536)	ENSDNOG00000046501	KLHL24 (ENSDNOG00000039799)	YEATS2 (ENSDNOG00000012083)	MAP6D1 (ENSDNOG00000036016)	PARL (ENSDNOG00000035254)	ABCC5 (ENSDNOG00000008128)	ENSDNOG00000038053	ENSDNOG00000024009	ENSDNOG00000019232	EIF2B5 (ENSDNOG00000007493)	DVL3 (ENSDNOG00000025319) ##22	AP2M1 (ENSDNOG00000015738)	ABCF3 (ENSDNOG00000015742)	VWA5B2 (ENSDNOG00000015749)	ALG3 (ENSDNOG00000024389)	CAMK2N2 (ENSDNOG00000045842)	ECE2 (ENSDNOG00000025430)	PSMD2 (ENSDNOG00000002073)	EIF4G1 (ENSDNOG00000002245)	CLCN2 (ENSDNOG00000005730)	POLR2H (ENSDNOG00000044402)	ENSDNOG00000031228	CHRD (ENSDNOG00000017753)
Sloth	MODERN SPECIES	3713															EIF2B5 (ENSCHOG00000002782)	ENSCHOG00000002794 ##22
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000154552	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000164015	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000163715.a	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a.b	ENSGT00940000156739.b.b.a.a	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00470000042552	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Tenrec	MODERN SPECIES	14684																DVL3 (ENSETEG00000012283) ##22
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154552	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00940000164015	ENSGT00940000159676	ENSGT00940000161734	ENSGT00940000163715.a	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000156739.b.b.a.b	ENSGT00940000156739.b.b.a.a	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00470000042552	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132
Elephant	MODERN SPECIES	261	ATP11B (ENSLAFG00000010151)	DCUN1D1 (ENSLAFG00000016514)	MCCC1 (ENSLAFG00000018018)	LAMP3 (ENSLAFG00000022746)	B3GNT5 (ENSLAFG00000000374)	ENSLAFG00000000369	ENSLAFG00000008616	KLHL24 (ENSLAFG00000008621)	YEATS2 (ENSLAFG00000010347)	ENSLAFG00000031362	PARL (ENSLAFG00000010360)	ABCC5 (ENSLAFG00000003077)	HTR3D (ENSLAFG00000003080)	ENSLAFG00000003081	EIF2B5 (ENSLAFG00000014782)	DVL3 (ENSLAFG00000000304) ##22	AP2M1 (ENSLAFG00000014784)	ABCF3 (ENSLAFG00000014791)	VWA5B2 (ENSLAFG00000015347)	ALG3 (ENSLAFG00000020938)	ECE2 (ENSLAFG00000017278)	CAMK2N2 (ENSLAFG00000015432)	PSMD2 (ENSLAFG00000001845)	EIF4G1 (ENSLAFG00000005471)	FAM131A (ENSLAFG00000003566)	CLCN2 (ENSLAFG00000003571)	POLR2H (ENSLAFG00000003573)	THPO (ENSLAFG00000026356)	CHRD (ENSLAFG00000030402)	ENSLAFG00000028752	ENSLAFG00000026752
Hyrax	MODERN SPECIES	4423																DVL3 (ENSPCAG00000007771) ##22	ENSPCAG00000007858	ABCF3 (ENSPCAG00000007912)
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00530000063106.A	ENSGT00950000183063.c.b.a	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000164221.b.a	ENSGT00940000156739	ENSGT00940000164221.b.b	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00470000042552	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767
Opossum	MODERN SPECIES	1	ENSMODG00000002592	ECEL1 (ENSMODG00000002624)	CHRND (ENSMODG00000002646)	CHRNG (ENSMODG00000002666)	ENSMODG00000002680	ENSMODG00000036608	CAPN10 (ENSMODG00000002704)	ENSMODG00000002737	ENSMODG00000002748	ABCC5 (ENSMODG00000003135)	ENSMODG00000037170	ENSMODG00000003149	ENSMODG00000045697	ENSMODG00000003162	EIF2B5 (ENSMODG00000003196)	DVL3 (ENSMODG00000003229) ##22	AP2M1 (ENSMODG00000003303)	ABCF3 (ENSMODG00000003339)	ENSMODG00000044245	ENSMODG00000040055	ENSMODG00000002899	ENSMODG00000041502	ENSMODG00000003057	ENSMODG00000049014	PFKL (ENSMODG00000003119)	ENSMODG00000003082	ENSMODG00000003134	ENSMODG00000046303	ENSMODG00000040790	ENSMODG00000023099	ENSMODG00000003218
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00530000063106.A	ENSGT00950000183063.c.b.a	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000164221.b.a	ENSGT00940000156739	ENSGT00940000164221.b.b	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00470000042552	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	3	DIS3L2 (ENSSHAG00000021383)	ENSSHAG00000023500	ECEL1 (ENSSHAG00000012440)	ENSSHAG00000022532	CHRNG (ENSSHAG00000012945)	ENSSHAG00000023788	ENSSHAG00000013299	ENSSHAG00000013380	ENSSHAG00000032078	ENSSHAG00000013852	ENSSHAG00000030431	ENSSHAG00000024590	ENSSHAG00000020989	EIF2B5 (ENSSHAG00000000803)	ENSSHAG00000026084 ##22	DVL3 (ENSSHAG00000029583) ##22	ABCF3 (ENSSHAG00000002957)	AP2M1 (ENSSHAG00000002742)	VWA5B2 (ENSSHAG00000025990)	ALG3 (ENSSHAG00000024834)	EEF1AKMT4 (ENSSHAG00000032233)	ECE2 (ENSSHAG00000004390)	EIF4G1 (ENSSHAG00000031645)	PSMD2 (ENSSHAG00000005548)	FAM131A (ENSSHAG00000026992)	CLCN2 (ENSSHAG00000005985)	POLR2H (ENSSHAG00000006304)	ENSSHAG00000032367	CHRD (ENSSHAG00000006533)	ENSSHAG00000006741	EPHB3 (ENSSHAG00000008131)
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00530000063106.A	ENSGT00950000183063.c.b.a	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000164221.b.a	ENSGT00940000156739	ENSGT00940000164221.b.b	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096.e	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00470000042552	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00530000063106.A	ENSGT00950000183063.c.b.a	ENSGT00940000157673	ENSGT00940000159794	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000164221.b.a	ENSGT00940000156739	ENSGT00940000164221.b.b	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096.e	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439	ENSGT00390000018195	ENSGT00390000006294	ENSGT00940000161767	ENSGT00940000164132.a
koala	MODERN SPECIES	109					ECEL1 (ENSPCIG00000003433)	CHRND (ENSPCIG00000033624)	CHRNG (ENSPCIG00000002497)	EIF4E2 (ENSPCIG00000002486)	CAPN10 (ENSPCIG00000002466)	ENSPCIG00000002428	RNPEPL1 (ENSPCIG00000002408)	ABCC5 (ENSPCIG00000025615)	ENSPCIG00000025616	HTR3E (ENSPCIG00000025617)	EIF2B5 (ENSPCIG00000025618)	DVL3 (ENSPCIG00000025623) ##22	AP2M1 (ENSPCIG00000025628)	ABCF3 (ENSPCIG00000025637)	VWA5B2 (ENSPCIG00000025638)	ALG3 (ENSPCIG00000025639)	EEF1AKMT4 (ENSPCIG00000025640)	CAMK2N2 (ENSPCIG00000025641)	ECE2 (ENSPCIG00000025642)	PSMD2 (ENSPCIG00000025643)	EIF4G1 (ENSPCIG00000025644)	FAM131A (ENSPCIG00000031283)	CLCN2 (ENSPCIG00000025653)	POLR2H (ENSPCIG00000033131)	ENSPCIG00000025656	CHRD (ENSPCIG00000025657)	ENSPCIG00000022806
Common wonbat	MODERN SPECIES	1044	COPS7B (ENSVURG00010022608)	NPPC (ENSVURG00010022615)	DIS3L2 (ENSVURG00010022618)	ENSVURG00010022653	ECEL1 (ENSVURG00010022774)	CHRNG (ENSVURG00010022787)	EIF4E2 (ENSVURG00010022799)	CAPN10 (ENSVURG00010022818)	ENSVURG00010022845	RNPEPL1 (ENSVURG00010022853)	ABCC5 (ENSVURG00010022881)	ENSVURG00010022943	ENSVURG00010022954	ENSVURG00010022972	EIF2B5 (ENSVURG00010023029)	DVL3 (ENSVURG00010023089) ##22	AP2M1 (ENSVURG00010023096)	ABCF3 (ENSVURG00010023108)	VWA5B2 (ENSVURG00010023118)	ALG3 (ENSVURG00010023128)	EEF1AKMT4 (ENSVURG00010023133)	CAMK2N2 (ENSVURG00010023136)	ECE2 (ENSVURG00010023143)	PSMD2 (ENSVURG00010023173)	EIF4G1 (ENSVURG00010023187)	FAM131A (ENSVURG00010023198)	CLCN2 (ENSVURG00010023211)	POLR2H (ENSVURG00010023222)	ENSVURG00010023226	CHRD (ENSVURG00010023229)	EPHB3 (ENSVURG00010000379)
Wallaby	MODERN SPECIES	5260															EIF2B5 (ENSMEUG00000002530)	DVL3 (ENSMEUG00000002544) ##22	ENSMEUG00000002558	ABCF3 (ENSMEUG00000002569)
Anura	ANCESTRAL SPECIES	8										ENSGT00390000012807	ENSGT00940000159706	ENSGT00940000160400	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00940000164221.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a ##22	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000165683	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000171017	ENSGT00390000005285	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00390000012141.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b	ENSGT00940000155439
Frog	MODERN SPECIES	5	htr2b (ENSXETG00000009523)	psmd1 (ENSXETG00000009522)	c2orf72 (ENSXETG00000033960)	rpl35a (ENSXETG00000027871)	iqcg (ENSXETG00000030781)	lrch3 (ENSXETG00000014298)	ENSXETG00000046089	fyttd1 (ENSXETG00000024516)	capn10 (ENSXETG00000014297)	rnpepl1 (ENSXETG00000037567)	abcc5 (ENSXETG00000014295)	ENSXETG00000033186	ENSXETG00000014294	eif2b5 (ENSXETG00000014293)	ENSXETG00000035669	dvl3 (ENSXETG00000017275) ##22	ap2m1 (ENSXETG00000017276)	ENSXETG00000037790	abcf3 (ENSXETG00000017277)	ENSXETG00000040622	ENSXETG00000041513	ccdc150 (ENSXETG00000017278)	vwa5b2 (ENSXETG00000017279)	alg3 (ENSXETG00000017280)	ttc16 (ENSXETG00000017281)	EEF1AKMT4 (ENSXETG00000017282)	camk2n2 (ENSXETG00000038611)	ece2 (ENSXETG00000017285)	psmd2 (ENSXETG00000017286)	eif4g1 (ENSXETG00000017287)	FAM131A (ENSXETG00000046551)
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	7	ENSLLEG00000024837	PSMD1 (ENSLLEG00000024950)	HTR2B (ENSLLEG00000025791)	ENSLLEG00000025817	RPL35A (ENSLLEG00000025895)	IQCG (ENSLLEG00000026019)	LRCH3 (ENSLLEG00000026117)	FYTTD1 (ENSLLEG00000027061)	ENSLLEG00000027191	CAPN10 (ENSLLEG00000027257)	RNPEPL1 (ENSLLEG00000027398)	ABCC5 (ENSLLEG00000027657)	ENSLLEG00000028036	ENSLLEG00000005432	EIF2B5 (ENSLLEG00000005512)	DVL3 (ENSLLEG00000005601) ##22	AP2M1 (ENSLLEG00000005759)	ENSLLEG00000005855	ABCF3 (ENSLLEG00000005959)	ENSLLEG00000006072	ENSLLEG00000006135	ENSLLEG00000006612	VWA5B2 (ENSLLEG00000006640)	ALG3 (ENSLLEG00000006707)	EEF1AKMT4 (ENSLLEG00000006753)	ENSLLEG00000006777	CAMK2N2 (ENSLLEG00000006789)	ENSLLEG00000006816	ENSLLEG00000006875	ENSLLEG00000006911	TINAG (ENSLLEG00000007159)