Bilateria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903 #22 Chordata DUPLICATION Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.a #22 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES 1162 ENSGT00940000155604 ENSGT00950000182903.a #22 Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 1743 ENSGT00940000155604 ENSGT00950000182903.a.b #22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 264 ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000158535 ENSGT01100000263613 #24 ENSGT00940000160688 ENSGT00940000159816 ENSGT00390000003738.a.a ENSGT00390000004049 ENSGT00940000160289 #17 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000159844 #16 ENSGT00940000156022.a #14 ENSGT00940000165567 ENSGT00940000161268 ENSGT00940000153249.b.c ENSGT00930000151033 Actinopterygii DUPLICATION Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 649 ENSGT00950000182903.a.b.i #22 ENSGT00940000158535 ENSGT01100000263613 #24 ENSGT00940000163927.a.a #25 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 422 ENSGT00950000182903.a.b.i #22 ENSGT00940000158535 ENSGT01100000263613 #24 ENSGT00940000163927.a.a #25 ENSGT00940000153491.b.b.b ENSGT00940000166316 #26 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 87 ENSGT00530000063691.b ENSGT00390000008657 ENSGT00390000010017 ENSGT00940000160771 ENSGT00390000013834 ENSGT00940000165258 ENSGT00730000112287 #20 ENSGT00940000174877 #21 ENSGT00950000182903.a.b.i #22 ENSGT00940000158535 ENSGT01100000263613 #24 ENSGT00940000163927.a.a #25 ENSGT00940000153491.b.b.b ENSGT00940000166316 #26 ENSGT00390000014072.B #27 ENSGT00640000091486.b ENSGT00940000165960.a.a ##29 ENSGT00940000156128.a #28 ENSGT00940000165960.a.b.b ##29 ENSGT00940000167107 #30 ENSGT00390000000592 #31 ENSGT00940000165100.b #32 ENSGT00940000165987 #33 ENSGT00390000018418 #34 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000169954 ENSGT00600000085600 ENSGT00390000013368 ENSGT00510000047760 ENSGT01070000254383 ENSGT00940000180688 ENSGT00940000159844 #16 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000160289 #17 ENSGT00940000161071 #18 ENSGT00940000166370 #19 ENSGT00730000112287 #20 ENSGT00940000174877 #21 ENSGT00950000182903.a.b.i #22 ENSGT00940000158535 ENSGT01100000263613 #24 ENSGT00940000163927.a.a #25 ENSGT00940000153491.b.b.b ENSGT00940000166316 #26 ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a ENSGT00390000014072.B #27 ENSGT00940000156128.a #28 ENSGT00940000165960.a.b.b ##29 ENSGT00940000167107 #30 ENSGT00390000000592 #31 ENSGT00940000165100.b #32 ENSGT00940000165987 #33 ENSGT00390000018418 #34 ENSGT00440000037582 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 80 ENSGT00940000165567 ENSGT00940000159866 ENSGT00940000165211 ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a ENSGT00940000166283 ENSGT00940000163503.A.a.a.a ENSGT01090000260185 ENSGT00940000156022.a #14 ENSGT00940000159844 #16 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000160289 #17 ENSGT00940000161071 #18 ENSGT00940000166370 #19 ENSGT00730000112287 #20 ENSGT00940000174877 #21 ENSGT00950000182903.a.b.i #22 ENSGT00940000158535 ENSGT00940000154838.A.f.b.b ENSGT01100000263613 #24 ENSGT00940000163927.a.a #25 ENSGT00940000153491.b.b.b ENSGT00940000166316 #26 ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a ENSGT00390000014072.B #27 ENSGT00940000156128.a #28 ENSGT00940000165960.b #29 ENSGT00940000167107 #30 ENSGT00390000000592 #31 ENSGT00940000165100.b #32 ENSGT00940000165987 #33 ENSGT00390000018418 #34 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000155804.k.a ENSGT00530000063790.b ENSGT00940000155586.B ENSGT00940000155527.j.a #11 ENSGT00940000154658.a #13 ENSGT00950000182886.a.b ENSGT01090000260185.a ENSGT00940000154273.b ENSGT00940000159844 #16 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000160289 #17 ENSGT00940000161071 #18 ENSGT00940000166370 #19 ENSGT00730000112287 #20 ENSGT00940000174877 #21 ENSGT00950000182903.a.b.i #22 ENSGT01100000263613 #24 ENSGT00940000163927.a.a.v ##25 ENSGT00940000153491.b.b.b ENSGT00940000163927.a.a.u #25 ENSGT00940000166316 #26 ENSGT00390000014072.B #27 ENSGT00940000156128.a #28 ENSGT00940000165960.b #29 ENSGT00940000167107 #30 ENSGT00390000000592 #31 ENSGT00940000165100.b #32 ENSGT00940000165987 #33 ENSGT00390000018418 #34 ENSGT00440000037582 ENSGT00940000158001 #36 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 256 ENSGT00940000153617.B.h ENSGT00940000155804.k.a.a ENSGT00530000063790.b.d ENSGT00940000155586.B.g.b ENSGT00940000155527.j.a.e.a #11 ENSGT00940000154658.a.d #13 ENSGT00940000156022.a.c.b #15 ENSGT01090000260185.a ENSGT00940000156022.a.c.a #14 ENSGT00940000159844.h #16 ENSGT00940000160289.l #17 ENSGT00940000161071.i #18 ENSGT00940000166370.f #19 ENSGT00730000112287.h #20 ENSGT00940000174877 #21 ENSGT00950000182903.a.b.i.g.a #22 ENSGT00940000158535 ENSGT00940000154838.A.f.b.b ENSGT00940000164016.e ENSGT00940000161062.c.b ENSGT00940000160785 ENSGT00940000161538 ENSGT00940000160946 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00530000063790.b.d ENSGT00940000155586.B.g.b ENSGT00940000155527.j.a.e.a #11 ENSGT00940000154658.a.d #13 ENSGT00940000156022.a.c.b #15 ENSGT01090000260185.a.a ENSGT01090000260185.a.b ENSGT00940000154273.b.h ENSGT00940000156022.a.c.a #14 ENSGT00940000159844.h #16 ENSGT00940000160289.l #17 ENSGT00940000161071.i #18 ENSGT00940000166370.f #19 ENSGT00730000112287.h #20 ENSGT00940000174877 #21 ENSGT00950000182903.a.b.i.g.a #22 ENSGT00730000112044.e.a.b ENSGT01100000263613.c #24 ENSGT00940000163927.a.a.v.b ##25 ENSGT00940000153491.b.b.b.c ENSGT00940000166316.e #26 ENSGT00390000014072.B #27 ENSGT00940000156128.a.a #28 ENSGT00940000165960.b #29 ENSGT00940000167107 #30 ENSGT00390000000592.w.b #31 ENSGT00940000165100.b.c #32 ENSGT00940000165987.b #33 ENSGT00390000018418.j #34 ENSGT00440000037582.n.a ENSGT00940000158001.h #36 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155804.k.a.a ENSGT00530000063790.b.d ENSGT00940000155586.B.g.b ENSGT00940000155527.j.a.e.a #11 ENSGT00940000154658.a.d #13 ENSGT00940000156022.a.c.b #15 ENSGT01090000260185.a.a ENSGT00940000154273.b.h.a ENSGT00940000156022.a.c.a #14 ENSGT00940000159844.h #16 ENSGT00940000160289.l #17 ENSGT00940000161071.i #18 ENSGT00940000166370.f #19 ENSGT00730000112287.h #20 ENSGT00940000174877 #21 ENSGT00950000182903.a.b.i.g.a #22 ENSGT00730000112044.e.a.b ENSGT01100000263613.c #24 ENSGT00940000163927.a.a.u #25 ENSGT00940000153491.b.b.b.c ENSGT00940000166316.e #26 ENSGT00390000014072.B #27 ENSGT00940000156128.a.a #28 ENSGT00940000165960.b #29 ENSGT00940000167107 #30 ENSGT00390000000592.w.b #31 ENSGT00940000165100.b.c #32 ENSGT00940000165987.b #33 ENSGT00390000018418.j.a #34 ENSGT00940000158001.h.a #36 ENSGT00510000050706.d #37 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 239 ENSGT00940000154273.b.h.a ENSGT00940000156022.a.c.a #14 ENSGT00940000159844.h #16 ENSGT00940000160289.l #17 ENSGT00940000161071.i #18 ENSGT00940000166370.f #19 ENSGT00730000112287.h #20 ENSGT00940000174877 #21 ENSGT00950000182903.a.b.i.g.a #22 ENSGT00980000199875.b #23 Chinook salmon DUPLICATION Chinook salmon MODERN SPECIES 40 ADGRL3 (ENSOTSG00005041695) #11 ENSOTSG00005041609 #12 ENSOTSG00005041603 #13 ENSOTSG00005041601 #14 ENSOTSG00005041600 #15 BCL6B (ENSOTSG00005041595) #16 acap1 (ENSOTSG00005037711) #17 agfg2 (ENSOTSG00005037693) #18 ENSOTSG00005037692 #19 si:ch73-335l21.4 (ENSOTSG00005037688) #20 si:ch73-335l21.2 (ENSOTSG00005037687) #21 dvl2 (ENSOTSG00005037686) #22 ENSOTSG00005037678 #23 ENSOTSG00005037674 #24 ponzr1 (ENSOTSG00005037672) #25 ENSOTSG00005037670 #26 cnpy4 (ENSOTSG00005037667) #27 ENSOTSG00005037666 #28 ENSOTSG00005037665 #29 zgc:103586 (ENSOTSG00005037662) #30 fis1 (ENSOTSG00005037660) #31 cldn15a (ENSOTSG00005037658) #32 dnajc3b (ENSOTSG00005037588) #33 naa38 (ENSOTSG00005037586) #34 ENSOTSG00005037585 #35 CHD3 (ENSOTSG00005036981) #36 tnfsf12 (ENSOTSG00005036976) #37 Chinook salmon MODERN SPECIES 55 ADGRL3 (ENSOTSG00005042055) ##11 ENSOTSG00005046578 ##13 TRIP6 (ENSOTSG00005046586) ENSOTSG00005046589 ##14 BCL6B (ENSOTSG00005046590) ##16 acap1 (ENSOTSG00005046591) ##17 agfg2 (ENSOTSG00005046596) ##18 ENSOTSG00005046598 ##19 si:ch73-335l21.4 (ENSOTSG00005046600) ##20 dvl2 (ENSOTSG00005046604) ##22 ENSOTSG00005046662 ##23 ENSOTSG00005046664 ##24 ponzr1 (ENSOTSG00005046665) ##25 ENSOTSG00005046667 ##26 cnpy4 (ENSOTSG00005046668) ##27 ENSOTSG00005046669 ##28 ENSOTSG00005046670 ##29 zgc:103586 (ENSOTSG00005046671) ##30 fis1 (ENSOTSG00005046672) ##31 cldn15a (ENSOTSG00005046673) ##32 dnajc3b (ENSOTSG00005046674) ##33 naa38 (ENSOTSG00005046684) ##34 ENSOTSG00005046685 ##35 CHD3 (ENSOTSG00005046688) ##36 tnfsf12 (ENSOTSG00005047009) ##37 Coho salmon MODERN SPECIES 29 ENSOKIG00005047144 PTPRD (ENSOKIG00005029261) TYRP1 (ENSOKIG00005028467) LURAP1L (ENSOKIG00005028452) MPDZ (ENSOKIG00005022843) ADGRL3 (ENSOKIG00005016342) #11 ENSOKIG00005016099 ENSOKIG00005015595 #13 ENSOKIG00005015528 ENSOKIG00005015469 #15 BCL6B (ENSOKIG00005015446) #16 acap1 (ENSOKIG00005015336) #17 agfg2 (ENSOKIG00005015299) #18 ENSOKIG00005015281 #19 si:ch73-335l21.4 (ENSOKIG00005015257) #20 dvl2 (ENSOKIG00005015058) #22 ENSOKIG00005015036 ENSOKIG00005015029 #24 ENSOKIG00005015027 ponzr1 (ENSOKIG00005015022) #25 ENSOKIG00005015014 ENSOKIG00005015002 #26 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#32 dnajc3b (ENSOMYG00000030162) #33 ENSOMYG00000030086 ##34 Salmo ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000155804.k.a.a ENSGT00530000063790.b.d ENSGT00940000155586.B.g.b ENSGT00940000155527.j.a.e.a #11 ENSGT00940000154658.a.d #13 ENSGT00940000156022.a.c.b #15 ENSGT01090000260185.a.a ENSGT00940000154273.b.h ENSGT01090000260185.a.b ENSGT00940000156022.a.c.a #14 ENSGT00940000159844.h #16 ENSGT00940000160289.l #17 ENSGT00940000155511.m ENSGT00940000166370.f #19 ENSGT00730000112287.h #20 ENSGT00950000182903.a.b.i.g.a #22 ENSGT00940000158535.w ENSGT00730000112044.e.a.b ENSGT01100000263613.c #24 ENSGT00940000163927.a.a.v.b ##25 ENSGT00940000153491.b.b.b.c ENSGT00940000166316.e #26 ENSGT00390000014072.B #27 ENSGT00940000156128.a.a #28 ENSGT00940000165960.b #29 ENSGT00940000167107 #30 ENSGT00390000000592.w.b #31 ENSGT00940000165100.b.c #32 ENSGT00940000165987.b #33 ENSGT00390000018418.j #34 ENSGT00440000037582.n.a Atlantic salmon MODERN SPECIES 26 ENSSSAG00000076592 ci150 (ENSSSAG00000076598) 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ENSHHUG00000008605 #29 zgc:103586 (ENSHHUG00000008585) #30 fis1 (ENSHHUG00000008549) #31 cldn15a (ENSHHUG00000008529) #32 dnajc3b (ENSHHUG00000008435) #33 naa38 (ENSHHUG00000008426) #34 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 594 ENSGT01090000260185.b ENSGT00940000156022.a.d ##14 ENSGT00940000155527.j.a.e.b ##11 ENSGT00940000154658.a.c ##13 ENSGT00940000154273.b.g ENSGT00940000159844.g ##16 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000160289.k ##17 ENSGT00940000161071.j ##18 ENSGT00940000166370.e ##19 ENSGT00730000112287.g ##20 ENSGT00950000182903.a.b.i.g.b ##22 ENSGT01100000263613.d ##24 ENSGT00940000163927.a.a.v.a ##25 ENSGT00940000153491.b.b.b.d ENSGT00940000166316.f ##26 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000156337.c.h ENSGT00940000153617.B.g ENSGT00940000155804.k.a.b ENSGT00530000063790.b.c ENSGT00940000155586.B.g.a ENSGT00940000155527.j.a.e.b ##11 ENSGT00940000154658.a.c ##13 ENSGT01090000260185.b ENSGT00940000156022.a.d ##14 ENSGT00940000159844.g ##16 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000160289.k ##17 ENSGT00940000161071.j ##18 ENSGT00940000166370.e ##19 ENSGT00730000112287.g ##20 ENSGT00950000182903.a.b.i.g.b ##22 ENSGT00990000208909 ENSGT01100000263613.d ##24 ENSGT00940000163927.a.a.v.a ##25 ENSGT00940000153491.b.b.b.d ENSGT00940000166316.f ##26 ENSGT01000000221243 ENSGT00940000156128.a.b ##28 ENSGT00940000165054.A.d ENSGT00390000000592.w.a ##31 ENSGT00940000165100.b.d ##32 ENSGT00940000165987.a.a ##33 ENSGT00390000018418.i ##34 ENSGT00440000037582.m ENSGT00940000158001.g ##36 ENSGT00510000050706.c ##37 Salmo ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000153617.B.g ENSGT00940000155804.k.a.b ENSGT00530000063790.b.c ENSGT00940000155586.B.g.a ENSGT00940000155527.j.a.e.b ##11 ENSGT00940000154658.a.c ##13 ENSGT01090000260185.b ENSGT00940000156022.a.d ##14 ENSGT00940000159844.g ##16 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000160289.k ##17 ENSGT00940000161071.j ##18 ENSGT00940000166370.e ##19 ENSGT00730000112287.g ##20 ENSGT00940000174877 #21 ENSGT00950000182903.a.b.i.g.b ##22 ENSGT00990000208909 ENSGT01100000263613.d ##24 ENSGT00940000163927.a.a.u #25 ENSGT00940000163927.a.a.v.a ##25 ENSGT00940000153491.b.b.b.d ENSGT00940000166316.f ##26 ENSGT01000000221243 ENSGT00940000156128.a.b ##28 ENSGT00940000165054.A.d ENSGT00390000000592.w.a ##31 ENSGT00940000165100.b.d ##32 ENSGT00940000165987.a.a ##33 ENSGT00390000018418.i ##34 ENSGT00440000037582.n.b ENSGT00940000158001.g ##36 Atlantic salmon MODERN SPECIES 9 USP53 (ENSSSAG00000074275) PTPRD (ENSSSAG00000096916) tyrp-1 (ENSSSAG00000075543) LURAP1L (ENSSSAG00000122135) ENSSSAG00000075588 ENSSSAG00000076648 ##11 ENSSSAG00000079701 ##13 ENSSSAG00000117990 ENSSSAG00000079961 ##14 ENSSSAG00000079969 ##16 ENSSSAG00000079975 acap1 (ENSSSAG00000080011) ##17 agfg2 (ENSSSAG00000080121) ##18 ENSSSAG00000080127 ##19 si:ch73-335l21.2 (ENSSSAG00000080136) #21 dvl2 (ENSSSAG00000080142) ##22 ENSSSAG00000080197 ENSSSAG00000090733 ENSSSAG00000113794 ##24 ponzr1 (ENSSSAG00000080201) ##25 ENSSSAG00000098248 ENSSSAG00000080204 ENSSSAG00000080205 ##26 ENSSSAG00000080207 ENSSSAG00000080209 ##28 fis1 (ENSSSAG00000080211) ##31 cldn15a (ENSSSAG00000088850) ##32 dnajc3b (ENSSSAG00000080221) ##33 ENSSSAG00000040285 ##36 naa38 (ENSSSAG00000040010) ##34 ENSSSAG00000046781 ##37 River trout MODERN SPECIES 35 PTPRD (ENSSTUG00000005964) TYRP1 (ENSSTUG00000028684) LURAP1L (ENSSTUG00000028702) MPDZ (ENSSTUG00000028873) ADGRL3 (ENSSTUG00000033369) ##11 ENSSTUG00000040419 ##13 ENSSTUG00000040514 ENSSTUG00000040538 ##14 BCL6B (ENSSTUG00000040579) ##16 SLC16A13 (ENSSTUG00000040627) ENSSTUG00000040660 acap1 (ENSSTUG00000040685) ##17 agfg2 (ENSSTUG00000040829) ##18 ENSSTUG00000040864 ##19 si:ch73-335l21.4 (ENSSTUG00000040890) ##20 dvl2 (ENSSTUG00000040929) ##22 ENSSTUG00000041643 ENSSTUG00000041708 ##24 ponzr1 (ENSSTUG00000041721) #25 ENSSTUG00000041735 ENSSTUG00000041837 ##28 ENSSTUG00000041879 fis1 (ENSSTUG00000041897) ##31 cldn15a (ENSSTUG00000041935) ##32 dnajc3b (ENSSTUG00000041966) ##33 cyb5d1 (ENSSTUG00000042645) naa38 (ENSSTUG00000042692) ##34 CHD3 (ENSSTUG00000042921) ##36 tnfsf12 (ENSSTUG00000043460) ##37 ENSSTUG00000043472 ENSSTUG00000043519 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000153617.B.g ENSGT00960000188752.b.a.a.b ENSGT00940000155804.k.a.b ENSGT00530000063790.b.c ENSGT00940000155586.B.g.a ENSGT00940000155527.j.a.e.b ##11 ENSGT00940000154658.a.c ##13 ENSGT01090000260185.b ENSGT00940000156022.a.d ##14 ENSGT00940000159844.g ##16 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000160289.k ##17 ENSGT00940000161071.j ##18 ENSGT00940000166370.e ##19 ENSGT00730000112287.g ##20 ENSGT00950000182903.a.b.i.g.b ##22 ENSGT00990000208909 ENSGT01100000263613.d ##24 ENSGT00940000163927.a.a.v.a ##25 ENSGT00940000153491.b.b.b.d ENSGT00940000166316.f ##26 ENSGT01000000221243 ENSGT00940000156128.a.b ##28 ENSGT00940000165054.A.d ENSGT00390000000592.w.a ##31 ENSGT00940000165100.b.d ##32 ENSGT00940000165987.a.a ##33 ENSGT00390000018418.i ##34 ENSGT00440000037582.m ENSGT00940000158001.g ##36 ENSGT00510000050706.c ##37 Rainbow trout MODERN SPECIES 30 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ENSOJAG00000010497 #28 ENSOJAG00000010485 #29 pcolceb (ENSOJAG00000011565) per1b (ENSOJAG00000011505) rell1 (ENSOJAG00000011495) ENSOJAG00000011485 NWD2 (ENSOJAG00000011479) ENSOJAG00000011466 ENSOJAG00000011455 ENSOJAG00000010832 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000159866 ENSGT00940000165211 ENSGT01030000234571.b.b.a.a.b.e.a ENSGT00940000166283 ENSGT00940000163503.A.a.a.a ENSGT00940000163472.e.b ENSGT00940000176070 ENSGT00940000156022.a #14 ENSGT00940000159844 #16 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000160289 #17 ENSGT00940000161071 #18 ENSGT00940000166370 #19 ENSGT00730000112287 #20 ENSGT00940000174877 #21 ENSGT00950000182903.a.b.i #22 ENSGT00940000158535 ENSGT01020000230586 ENSGT00940000163927.a.a #25 ENSGT00940000153491.b.b.b ENSGT00940000166316 #26 ENSGT01030000234567.B.a.b.a.a ENSGT00390000014072.B #27 ENSGT00940000156128.a #28 ENSGT00940000165960.b #29 ENSGT00940000159264.f ENSGT00940000159217 ENSGT00940000159709 ENSGT01010000222552 ENSGT00940000153648.b 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herring MODERN SPECIES acadvl (ENSDCDG00000018419) ENSDCDG00000018410 ENSDCDG00000018406 slx1b (ENSDCDG00000018404) ENSDCDG00000018403 ENSDCDG00000018400 ENSDCDG00000018397 ENSDCDG00000018395 #14 BCL6B (ENSDCDG00000018389) #16 SLC16A13 (ENSDCDG00000018386) acap1 (ENSDCDG00000014474) #17 agfg2 (ENSDCDG00000014353) #18 ENSDCDG00000014342 #19 si:ch73-335l21.4 (ENSDCDG00000014339) #20 si:ch73-335l21.2 (ENSDCDG00000014334) #21 dvl2 (ENSDCDG00000013898) #22 rell1 (ENSDCDG00000013858) zgc:194930 (ENSDCDG00000013851) ENSDCDG00000013845 NWD2 (ENSDCDG00000013836) DTHD1 (ENSDCDG00000013827) ENSDCDG00000013821 ENSDCDG00000005472 ENSDCDG00000005470 ENSDCDG00000005172 PCDH7 (ENSDCDG00000005151) ENSDCDG00000005144 STIM2 (ENSDCDG00000005046) tbc1d19 (ENSDCDG00000004801) CCKAR (ENSDCDG00000004766) RBPJ (ENSDCDG00000004747) Denticle herring MODERN SPECIES 23 ENSDCDG00000022588 #14 BCL6B (ENSDCDG00000022583) #16 SLC16A13 (ENSDCDG00000022580) acap1 (ENSDCDG00000019848) #17 agfg2 (ENSDCDG00000019800) #18 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(ENSECRG00000010815) ENSECRG00000010812 ENSECRG00000010810 ##25 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 118 ENSGT00950000183063.c.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000167797 ENSGT00940000155439 ENSGT00940000164682 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000164152 ENSGT00940000157673 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000171017 ENSGT00530000063882.b ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00940000155604 ENSGT00950000182903.a.b.j ##22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 185 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183063.c.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000167797 ENSGT00940000155439 ENSGT00940000164682 ENSGT00390000006294 ENSGT01020000230768 ENSGT00940000164152 ENSGT00940000157673 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000171017 ENSGT00530000063882.b ENSGT00940000155604 ENSGT00950000182903.a.b.j ##22 ENSGT00940000165683 ENSGT00940000159223 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000160400 ENSGT00940000155470.b ENSGT00390000016972 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 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ENSGT00940000159223.c ENSGT00940000165683 ENSGT00940000161729.n ENSGT00730000111053 ENSGT00390000003912 ENSGT00940000162644 ENSGT00850000132319.a.a.a ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00940000165072 ENSGT00940000159041 ENSGT00940000155435.B.a ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b ENSGT00940000153936.a ENSGT00940000160348 ENSGT00950000182985.a.b.b Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00440000038181 ENSGT00940000153680.b ENSGT00390000006450 ENSGT00940000158353 ENSGT00950000183048.b.b.a.d.b.b ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b ENSGT00390000004912 ENSGT00940000165563.b ENSGT00940000171017 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000158330 ENSGT00390000016972 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000160400 ENSGT00950000182903.a.b.j ##22 ENSGT00940000159223.c ENSGT00940000165683 ENSGT00940000161729.n ENSGT00730000111053 ENSGT00390000003912 ENSGT00940000162644 ENSGT00850000132319.a.a.a ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00940000165072 ENSGT00940000159041 ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000160131 ENSGT00440000038181 ENSGT00940000153680.b ENSGT00390000006450 ENSGT00940000158353 ENSGT00950000183048.b.b.a.d.b.b ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.a.c ENSGT00390000004912 ENSGT00940000165563.b ENSGT00940000171017 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000158330 ENSGT00390000016972 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000160400 ENSGT00950000182903.a.b.j ##22 ENSGT00940000165683 ENSGT00940000161729.n ENSGT00730000111053 ENSGT00390000003912 ENSGT00940000162644 ENSGT00850000132319.a.a.a ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00940000165072 ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b ENSGT00940000159041 ENSGT00950000182985.a.b.b ENSGT00940000160348 ENSGT00940000153936.a Climbing perch MODERN SPECIES 4 PGM2L1 (ENSATEG00000020523) ENSATEG00000020482 ENSATEG00000020463 ENSATEG00000028562 ENSATEG00000026772 ENSATEG00000020437 ENSATEG00000026749 ENSATEG00000020416 ENSATEG00000020412 ENSATEG00000020405 ENSATEG00000020295 ENSATEG00000020202 rpl35a (ENSATEG00000020166) abcc5 (ENSATEG00000020009) rnpepl1 (ENSATEG00000019976) ENSATEG00000019864 ##22 mmp23bb (ENSATEG00000019844) ENSATEG00000019841 EIF2A (ENSATEG00000019832) ENSATEG00000019800 ENSATEG00000019772 ENSATEG00000028092 ENSATEG00000028384 ENSATEG00000026601 ENSATEG00000019708 ENSATEG00000019694 ENSATEG00000019595 ENSATEG00000025585 ENSATEG00000019563 ENSATEG00000019500 ENSATEG00000019487 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 4 DMWD (ENSBSLG00000002536) ENSBSLG00000002559 ENSBSLG00000002674 NYAP2 (ENSBSLG00000002694) ENSBSLG00000002711 ENSBSLG00000002728 ENSBSLG00000002738 polr2d (ENSBSLG00000002753) ENSBSLG00000002781 ENSBSLG00000002798 ABCF3 (ENSBSLG00000002811) ENSBSLG00000002887 rpl35a (ENSBSLG00000002959) abcc5 (ENSBSLG00000002971) rnpepl1 (ENSBSLG00000003039) ENSBSLG00000003050 ##22 ENSBSLG00000003574 MASP1 (ENSBSLG00000003765) ENSBSLG00000003912 sagb (ENSBSLG00000004093) ENSBSLG00000004525 ppp1r14ab (ENSBSLG00000004528) ENSBSLG00000004539 ENSBSLG00000004540 atg16l1 (ENSBSLG00000004817) ENSBSLG00000005236 ENSBSLG00000005248 ENSBSLG00000005274 ENSBSLG00000005316 ENSBSLG00000005328 ENSBSLG00000005361 Zig-zag eel MODERN SPECIES 4 ENSMAMG00000024805 ENSMAMG00000026416 ENSMAMG00000018843 ENSMAMG00000018830 ENSMAMG00000018823 ENSMAMG00000018809 ENSMAMG00000018798 ENSMAMG00000018789 ENSMAMG00000027299 ENSMAMG00000018751 ENSMAMG00000018699 ENSMAMG00000018675 rpl35a (ENSMAMG00000018665) abcc5 (ENSMAMG00000018636) rnpepl1 (ENSMAMG00000018623) ENSMAMG00000018559 ##22 ap2m1b (ENSMAMG00000018537) mmp23bb (ENSMAMG00000018519) ENSMAMG00000018507 EIF2A (ENSMAMG00000018484) ENSMAMG00000027173 ENSMAMG00000018459 ENSMAMG00000018391 ENSMAMG00000018381 ENSMAMG00000018356 ENSMAMG00000018290 ENSMAMG00000018275 ENSMAMG00000025327 ENSMAMG00000018262 ENSMAMG00000018253 ENSMAMG00000018182 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158353 ENSGT00950000183023.B ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.b ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b ENSGT00940000167612 ENSGT00390000004912 ENSGT00940000165563.b ENSGT00940000171017 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000158330 ENSGT00940000166255 ENSGT00390000016972 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000160400 ENSGT01020000230608 ENSGT00950000182903.a.b.j ##22 ENSGT00940000159223.c ENSGT00940000165683 ENSGT00940000161729.n ENSGT00730000111053 ENSGT00390000003912 ENSGT00940000162644 ENSGT00850000132319.a.a.a ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00940000165072 ENSGT00940000159041 ENSGT00940000155435.B.a ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b ENSGT00940000153936.a ENSGT00940000160348 ENSGT00950000182985.a.b.b Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000153680.b ENSGT00390000006450 ENSGT00940000158353 ENSGT00950000183023.B ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.b.g.a.b ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b ENSGT00940000167612 ENSGT00390000004912 ENSGT00940000165563.b ENSGT01040000241543 ENSGT00940000171017 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000158330 ENSGT00390000016972 ENSGT00940000160400 ENSGT00950000182903.a.b.j ##22 ENSGT00940000165683 ENSGT00940000161729.n ENSGT00730000111053 ENSGT00390000003912 ENSGT00940000162644 ENSGT00850000132319.a.a.a ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00940000165072 ENSGT00940000159041 ENSGT00940000155435.B.a ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b ENSGT00940000153936.a ENSGT00940000176181 ENSGT01030000234590.A.a.a ENSGT00940000153680.a Turbot MODERN SPECIES 15 spcs2 (ENSSMAG00000005637) rnf169 (ENSSMAG00000005619) lipt2 (ENSSMAG00000005600) PGM2L1 (ENSSMAG00000005573) ENSSMAG00000005570 ENSSMAG00000005552 ENSSMAG00000005558 ENSSMAG00000005542 ENSSMAG00000005522 ENSSMAG00000005487 ENSSMAG00000005475 ENSSMAG00000005408 ENSSMAG00000005384 rpl35a (ENSSMAG00000005341) ENSSMAG00000005325 ENSSMAG00000005299 ##22 mmp23bb (ENSSMAG00000005283) ENSSMAG00000030174 ENSSMAG00000005233 ENSSMAG00000005214 ENSSMAG00000005191 ENSSMAG00000034340 ENSSMAG00000005153 ENSSMAG00000005095 DGKD (ENSSMAG00000005021) ENSSMAG00000024387 ENSSMAG00000026583 atg16l1 (ENSSMAG00000034930) ENSSMAG00000031323 ENSSMAG00000023447 ENSSMAG00000036664 Tongue sole MODERN SPECIES 18 ENSCSEG00000006095 ENSCSEG00000006100 ENSCSEG00000006105 ENSCSEG00000006112 ENSCSEG00000006116 ENSCSEG00000006138 ENSCSEG00000006140 ENSCSEG00000006142 ENSCSEG00000006144 polr2d (ENSCSEG00000006147) ENSCSEG00000006151 ABCF3 (ENSCSEG00000006154) LRCH3 (ENSCSEG00000006184) rpl35a (ENSCSEG00000006207) rnpepl1 (ENSCSEG00000006216) ENSCSEG00000006219 ##22 mmp23bb (ENSCSEG00000006231) SERP1 (ENSCSEG00000006236) eif2a (ENSCSEG00000006247) tsen34 (ENSCSEG00000006278) clrn1 (ENSCSEG00000006287) ENSCSEG00000006289 si:dkey-5i3.5 (ENSCSEG00000006293) ENSCSEG00000006297 impdh1b (ENSCSEG00000006303) ENSCSEG00000006326 fam3c (ENSCSEG00000006349) btg1 (ENSCSEG00000006365) ENSCSEG00000006371 dcn (ENSCSEG00000006390) lum (ENSCSEG00000006414) Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183048.b.b.a.d.b.a ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.b.a.a.b ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b ENSGT00940000167612 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ENSTNIG00000002027 DGKD (ENSTNIG00000011195) ENSTNIG00000011193 sagb (ENSTNIG00000011192) atg16l1 (ENSTNIG00000011191) Fugu MODERN SPECIES 2 tagln (ENSTRUG00000027090) pcsk7 (ENSTRUG00000008000) bace1 (ENSTRUG00000007818) ENSTRUG00000032408 apoa-i (ENSTRUG00000030856) ENSTRUG00000024654 ENSTRUG00000025922 ENSTRUG00000031210 ech1 (ENSTRUG00000006958) usp2a (ENSTRUG00000026132) tbcela (ENSTRUG00000006818) usf1l (ENSTRUG00000021581) ubash3bb (ENSTRUG00000004824) polr2d (ENSTRUG00000004740) ABCF3 (ENSTRUG00000004104) ENSTRUG00000026449 ##22 mmp23bb (ENSTRUG00000003905) zgc:92744 (ENSTRUG00000018022) tsen34 (ENSTRUG00000032895) clrn1 (ENSTRUG00000004876) ENSTRUG00000002657 rpl35a (ENSTRUG00000003546) rnpepl1 (ENSTRUG00000024939) ENSTRUG00000001802 ENSTRUG00000028564 ENSTRUG00000003150 ENSTRUG00000029754 ENSTRUG00000003272 ENSTRUG00000026223 abcg1 (ENSTRUG00000031068) spcs2 (ENSTRUG00000033006) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b 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seabass MODERN SPECIES 3 ENSDLAG00005007416 ENSDLAG00005031776 ENSDLAG00005033663 ENSDLAG00005029361 ENSDLAG00005030288 ENSDLAG00005004035 ENSDLAG00005033204 ENSDLAG00005013721 ENSDLAG00005031788 ENSDLAG00005034405 ENSDLAG00005013879 ENSDLAG00005027064 rpl35a (ENSDLAG00005012978) abcc5 (ENSDLAG00005004785) rnpepl1 (ENSDLAG00005033486) ENSDLAG00005033666 ##22 ap2m1b (ENSDLAG00005031497) mmp23bb (ENSDLAG00005024567) ENSDLAG00005004179 ENSDLAG00005008055 ENSDLAG00005028273 ENSDLAG00005004857 ENSDLAG00005026870 DGKD (ENSDLAG00005018246) ENSDLAG00005017916 ENSDLAG00005004126 atg16l1 (ENSDLAG00005034415) ENSDLAG00005034127 ENSDLAG00005028029 ENSDLAG00005017026 ENSDLAG00005029057 Large yellow croaker MODERN SPECIES 479 ENSLCRG00005004069 ENSLCRG00005004068 ENSLCRG00005004067 ENSLCRG00005004066 ENSLCRG00005004065 ENSLCRG00005004063 ENSLCRG00005004062 ENSLCRG00005004061 polr2d (ENSLCRG00005004059) ENSLCRG00005004058 ABCF3 (ENSLCRG00005004043) LRCH3 (ENSLCRG00005004031) rpl35a (ENSLCRG00005004028) abcc5 (ENSLCRG00005003010) rnpepl1 (ENSLCRG00005002986) ENSLCRG00005002985 ##22 ap2m1b (ENSLCRG00005002833) mmp23bb (ENSLCRG00005002823) ENSLCRG00005002818 eif2a (ENSLCRG00005002283) tsen34 (ENSLCRG00005002276) MINDY4B (ENSLCRG00005002271) clrn1 (ENSLCRG00005002268) MASP1 (ENSLCRG00005002245) ENSLCRG00005002234 DGKD (ENSLCRG00005000665) ENSLCRG00005000582 sagb (ENSLCRG00005000416) atg16l1 (ENSLCRG00005000242) ENSLCRG00005000145 ENSLCRG00005000138 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00950000183048.b.b.a.c.b ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.b ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.b.a.a.b ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b ENSGT00940000167612 ENSGT00390000004912 ENSGT00940000165563.b ENSGT00940000171017 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000158330 ENSGT00390000016972 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000160400 ENSGT01020000230608 ENSGT00950000182903.a.b.j ##22 ENSGT00940000165747 ENSGT00940000159223.c ENSGT00940000165683 ENSGT00940000161729.n ENSGT00730000111053.d ENSGT00390000003912 ENSGT00940000162644 ENSGT00850000132319.a.a.a ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00940000165072 ENSGT00940000159041 ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b ENSGT00940000153936.a ENSGT00940000160348 ENSGT00950000182985.a.b.b Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00950000183023.B ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.a ENSGT00950000183048.b.b.a.c.b ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.b ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.b.a.a.b ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b ENSGT00390000004912 ENSGT00940000165563.b ENSGT00940000171017 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000158330 ENSGT00390000016972 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000160400 ENSGT01020000230608 ENSGT00950000182903.a.b.j ##22 ENSGT00940000165747 ENSGT00940000165683 ENSGT00940000161729.n ENSGT00730000111053.d ENSGT00390000003912 ENSGT00940000162644 ENSGT00850000132319.a.a.a ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00940000165072 ENSGT00940000159041 ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b ENSGT00940000153936.a ENSGT00940000160348 ENSGT00940000176181 ENSGT00950000182985.a.b.b Channel bull blenny MODERN SPECIES 279 ENSCGOG00000022530 ##22 ENSCGOG00000022534 Pike perch MODERN SPECIES 187 ece2b (ENSSLUG00000007872) ENSSLUG00000007836 ENSSLUG00000007831 polr2d (ENSSLUG00000007763) ENSSLUG00000007736 ENSSLUG00000007729 ABCF3 (ENSSLUG00000007538) ENSSLUG00000007181 ENSSLUG00000007132 ENSSLUG00000019826 rpl35a (ENSSLUG00000019823) ENSSLUG00000019819 abcc5 (ENSSLUG00000019812) rnpepl1 (ENSSLUG00000019806) ENSSLUG00000019801 ENSSLUG00000019796 ##22 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.b ENSGT00950000183048.b.b.a.c.b ENSGT00440000038181 ENSGT00940000153680.b ENSGT00390000006450 ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b ENSGT00940000167612 ENSGT00390000004912 ENSGT00940000165563.b ENSGT00940000171017 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000158330 ENSGT00390000016972 ENSGT00940000160400 ENSGT00950000182903.a.b.j ##22 ENSGT00940000159223.c ENSGT00940000165683 ENSGT00940000161729.n ENSGT00730000111053.d ENSGT00390000003912 ENSGT00850000132319.a.a.a ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00940000165072 ENSGT00940000159041 ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b ENSGT00940000153936.a ENSGT00940000160348 ENSGT00950000182985.a.b.b ENSGT01030000234590.A.a.a ENSGT00940000153680.a Stickleback MODERN SPECIES ENSGACG00000004603 ENSGACG00000004606 ENSGACG00000004608 ENSGACG00000004611 ENSGACG00000004612 spcs2 (ENSGACG00000004619) ENSGACG00000004628 lipt2 (ENSGACG00000004631) ENSGACG00000004636 polr2d (ENSGACG00000004639) ENSGACG00000004650 ABCF3 (ENSGACG00000004656) ENSGACG00000004682 rpl35a (ENSGACG00000004699) rnpepl1 (ENSGACG00000004711) ENSGACG00000004718 ##22 ENSGACG00000004728 ENSGACG00000004731 mmp23bb (ENSGACG00000004741) ENSGACG00000004745 eif2a (ENSGACG00000004748) tsen34 (ENSGACG00000004800) clrn1 (ENSGACG00000004805) MASP1 (ENSGACG00000004811) ENSGACG00000004816 ENSGACG00000004822 DGKD (ENSGACG00000004826) IWS1 (ENSGACG00000004866) wdr74 (ENSGACG00000004875) zgc:162872 (ENSGACG00000004876) ilkap (ENSGACG00000004890) Lumpfish MODERN SPECIES 4 ENSCLMG00005007505 spcs2 (ENSCLMG00005007507) lipt2 (ENSCLMG00005007509) ENSCLMG00005007511 ENSCLMG00005007513 polr2d (ENSCLMG00005007516) ENSCLMG00005007531 ENSCLMG00005007549 ABCF3 (ENSCLMG00005007561) LRCH3 (ENSCLMG00005008274) ENSCLMG00005008347 ENSCLMG00005008349 ENSCLMG00005008350 rpl35a (ENSCLMG00005008351) rnpepl1 (ENSCLMG00005008354) ENSCLMG00005008665 ##22 ap2m1b (ENSCLMG00005001382) mmp23bb (ENSCLMG00005001497) zgc:92744 (ENSCLMG00005001993) eif2a (ENSCLMG00005002005) tsen34 (ENSCLMG00005003919) clrn1 (ENSCLMG00005003920) MASP1 (ENSCLMG00005003921) ENSCLMG00005004156 DGKD (ENSCLMG00005004172) sagb (ENSCLMG00005005716) atg16l1 (ENSCLMG00005005723) ENSCLMG00005005735 spint2 (ENSCLMG00005005738) ENSCLMG00005005740 ENSCLMG00005005741 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158353 ENSGT00950000183023.B ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b 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Javanese ricefish MODERN SPECIES 4 ENSOJAG00000011519 rffl (ENSOJAG00000011668) eif4h (ENSOJAG00000011696) ENSOJAG00000012007 ENSOJAG00000012021 lipt2 (ENSOJAG00000012032) ENSOJAG00000012497 ENSOJAG00000012521 ENSOJAG00000012536 ENSOJAG00000012544 ENSOJAG00000012560 ABCF3 (ENSOJAG00000012572) rpl35a (ENSOJAG00000012766) rnpepl1 (ENSOJAG00000013262) ENSOJAG00000013293 ENSOJAG00000013313 ##22 mmp23bb (ENSOJAG00000013342) zgc:92744 (ENSOJAG00000013347) tsen34 (ENSOJAG00000014154) clrn1 (ENSOJAG00000014164) MASP1 (ENSOJAG00000014176) ENSOJAG00000014267 ENSOJAG00000015478 sagb (ENSOJAG00000015525) ENSOJAG00000015683 ENSOJAG00000016290 ENSOJAG00000016307 ENSOJAG00000016426 ENSOJAG00000016445 NYAP2 (ENSOJAG00000016464) atp1b3b (ENSOJAG00000016472) Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00940000162644 ENSGT00390000003912 ENSGT00730000111053 ENSGT00940000161729.n ENSGT00940000165683 ENSGT00390000004912 ENSGT00940000165563.b ENSGT00940000171017 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000158330 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ENSGT00940000162644 ENSGT00850000132319.a.a.a ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00940000165072 ENSGT00940000159041 ENSGT00940000155435.B.a ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b ENSGT00940000153936.a ENSGT00940000160348 ENSGT00950000182985.a.b.b Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00390000004912 ENSGT00940000165563.b ENSGT00940000171017 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000158330 ENSGT00390000016972 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000160400 ENSGT01020000230608 ENSGT00950000182903.a.b.j ##22 ENSGT00940000159223.c ENSGT00940000165683 ENSGT00940000161729.n ENSGT00730000111053 ENSGT00390000003912 ENSGT00940000162644 ENSGT00850000132319.a.a.a ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00940000165072 ENSGT00940000159041 ENSGT00940000155435.B.a ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b ENSGT00440000038181 ENSGT00940000153680.b ENSGT00390000006450 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 111 ENSGT00390000016972 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000160400 ENSGT01020000230608 ENSGT00950000182903.a.b.j ##22 ENSGT00940000159223.c ENSGT00940000165683 ENSGT00940000161729.n ENSGT00730000111053 ENSGT00390000003912 ENSGT00940000162644 ENSGT00850000132319.a.a.a ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00940000165072 ENSGT00940000159041 ENSGT00940000155435.B.a ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b ENSGT00440000038181 ENSGT00940000153680.b ENSGT00390000006450 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 97 ENSGT00560000077232.B.g.a ENSGT00940000155350.g ENSGT00940000156251.a ENSGT00950000182988.a.b.a ENSGT00530000063816.c.b ENSGT00390000010063 ENSGT00940000158330 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000171017 ENSGT00940000165563.b ENSGT00390000004912 ENSGT00390000016972 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000160400 ENSGT01020000230608 ENSGT00950000182903.a.b.j ##22 ENSGT00940000159223.c ENSGT00940000165683 ENSGT00940000161729.n ENSGT00730000111053 ENSGT00390000003912 ENSGT00940000162644 ENSGT00850000132319.a.a.a ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00940000165072 ENSGT00940000159041 ENSGT00940000155435.B.a ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b ENSGT00440000038181 ENSGT00940000153680.b ENSGT00390000006450 Clown anemonefish MODERN SPECIES 1367 aqp11 (ENSAOCG00000007596) clns1a (ENSAOCG00000000418) ENSAOCG00000007529 LRCH3 (ENSAOCG00000007507) ABCF3 (ENSAOCG00000007426) ENSAOCG00000007356 ENSAOCG00000007342 polr2d (ENSAOCG00000007295) rpl35a (ENSAOCG00000007269) abcc5 (ENSAOCG00000007240) rnpepl1 (ENSAOCG00000001967) ENSAOCG00000007107 ENSAOCG00000007097 ##22 ap2m1b (ENSAOCG00000007028) mmp23bb (ENSAOCG00000006964) zgc:92744 (ENSAOCG00000006932) eif2a (ENSAOCG00000006919) tsen34 (ENSAOCG00000006905) MINDY4B (ENSAOCG00000006871) clrn1 (ENSAOCG00000006840) MASP1 (ENSAOCG00000006825) Orange clownfish MODERN SPECIES 23 myo7aa (ENSAPEG00000018128) GDPD4 (ENSAPEG00000018279) pak1 (ENSAPEG00000018331) aqp11 (ENSAPEG00000018404) clns1a (ENSAPEG00000018416) LRCH3 (ENSAPEG00000018498) ABCF3 (ENSAPEG00000018567) ENSAPEG00000018642 ENSAPEG00000018652 polr2d (ENSAPEG00000018714) ENSAPEG00000018728 rpl35a (ENSAPEG00000018771) abcc5 (ENSAPEG00000018801) rnpepl1 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ENSSPAG00000012866 ##22 ap2m1b (ENSSPAG00000012833) mmp23bb (ENSSPAG00000012793) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b ENSGT00940000159041 ENSGT00390000003912 ENSGT00940000162644 ENSGT00850000132319.a.a.a ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00940000165072 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000158330 ENSGT01030000235136 ENSGT00390000016972 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000160400 ENSGT01020000230608 ENSGT00950000182903.a.b.j ##22 ENSGT00940000180004 ENSGT00940000165683 ENSGT00940000161729.n ENSGT00730000111053 ENSGT00940000171017 ENSGT00940000165563.b ENSGT00390000004912 ENSGT00940000167717 ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.a.a.a.b ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.a ENSGT00950000183048.b.b.a.d.b.b ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.b.a.a.b ENSGT00950000183023.B ENSGT00940000158353 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b ENSGT00940000159041 ENSGT00390000003912 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ENSGT00940000153680.b ENSGT00440000038181 ENSGT00940000160131 ENSGT00950000183048.b.b.a.c.b.ab Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT01030000234590.A.a.a ENSGT00940000160348 ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b ENSGT00940000159041.r ENSGT00390000003912 ENSGT00940000162644 ENSGT00850000132319.a.a.a ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00940000165072.c.b ENSGT00940000155604 ENSGT00940000158330 ENSGT00390000016972 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000160400 ENSGT00950000182903.a.b.j ##22 ENSGT00940000165683 ENSGT00940000161729.n ENSGT00730000111053 ENSGT00940000171017.f ENSGT00940000165563.b ENSGT00390000004912 ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.a.a ENSGT00950000183048.b.b.a.d.b.b ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.b.a.a.b ENSGT00940000155435.B.a ENSGT01010000222847.b ENSGT00950000183023.B ENSGT00940000158353 ENSGT00390000006450 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT01030000234590.A.a.a ENSGT00940000160348 ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a.m.b ENSGT00940000159041.r ENSGT00390000003912 ENSGT00940000162644 ENSGT00850000132319.a.a.a ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00940000165072.c.b ENSGT00940000155604 ENSGT00940000158330 ENSGT00390000016972 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000160400 ENSGT00950000182903.a.b.j ##22 ENSGT00940000165683 ENSGT00940000161729.n ENSGT00730000111053 ENSGT00940000171017.f ENSGT00940000165563.b ENSGT00940000167717 ENSGT00390000018035 ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.a.b ENSGT00950000183048.b.b.a.d.b.b ENSGT00950000183048.b.b.a.d.a.b.b.a.a.b ENSGT00940000155435.B.a ENSGT01010000222847.b ENSGT00950000183023.B ENSGT00940000158353 ENSGT00390000006450 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1096 ENSMZEG00005002518 ENSMZEG00005002509 atg16l1 (ENSMZEG00005002443) sagb (ENSMZEG00005002423) DGKD (ENSMZEG00005002330) tsen34 (ENSMZEG00005002313) MINDY4B (ENSMZEG00005002294) clrn1 (ENSMZEG00005002286) MASP1 (ENSMZEG00005002267) ENSMZEG00005002237 ABCF3 (ENSMZEG00005002173) ENSMZEG00005002113 rpl35a (ENSMZEG00005002093) abcc5 (ENSMZEG00005002058) rnpepl1 (ENSMZEG00005002048) ENSMZEG00005001966 ##22 mmp23bb (ENSMZEG00005001931) zgc:92744 (ENSMZEG00005001918) ENSMZEG00005001902 eif2a (ENSMZEG00005001832) ENSMZEG00005001819 ENSMZEG00005001783 ENSMZEG00005001773 ENSMZEG00005001759 ENSMZEG00005001755 ENSMZEG00005001745 ENSMZEG00005001731 ENSMZEG00005001727 ENSMZEG00005001699 pgm2l1 (ENSMZEG00005001675) lipt2 (ENSMZEG00005001668) P. nyererei MODERN SPECIES 613 atg16l1 (ENSPNYG00000023111) sagb (ENSPNYG00000023148) DGKD (ENSPNYG00000023183) ENSPNYG00000023191 MINDY4B (ENSPNYG00000023193) clrn1 (ENSPNYG00000023198) ENSPNYG00000023200 ENSPNYG00000023202 ENSPNYG00000023207 ABCF3 (ENSPNYG00000023211) ENSPNYG00000023220 rpl35a (ENSPNYG00000023240) ENSPNYG00000023244 abcc5 (ENSPNYG00000023247) rnpepl1 (ENSPNYG00000023257) ENSPNYG00000023263 ##22 mmp23bb (ENSPNYG00000023270) zgc:92744 (ENSPNYG00000023272) eif2a (ENSPNYG00000023276) ENSPNYG00000023283 ENSPNYG00000023288 ENSPNYG00000023293 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 838 DGKD (ENSHBUG00000016587) tsen34 (ENSHBUG00000016593) MINDY4B (ENSHBUG00000016616) clrn1 (ENSHBUG00000016627) MASP1 (ENSHBUG00000016638) ENSHBUG00000016653 ABCF3 (ENSHBUG00000016701) ENSHBUG00000016714 ENSHBUG00000016729 rpl35a (ENSHBUG00000016737) abcc5 (ENSHBUG00000016951) rnpepl1 (ENSHBUG00000017000) ENSHBUG00000017008 ENSHBUG00000017110 ##22 mmp23bb (ENSHBUG00000017168) zgc:92744 (ENSHBUG00000017184) eif2a (ENSHBUG00000017252) ENSHBUG00000017317 ENSHBUG00000017344 Nile tilapia MODERN SPECIES 5 atg16l1 (ENSONIG00000017239) sagb (ENSONIG00000017242) DGKD (ENSONIG00000017245) tsen34 (ENSONIG00000017253) MINDY4B (ENSONIG00000017254) ENSONIG00000033568 clrn1 (ENSONIG00000017256) MASP1 (ENSONIG00000017257) ENSONIG00000017263 ABCF3 (ENSONIG00000017264) ENSONIG00000017268 rpl35a (ENSONIG00000028756) ENSONIG00000033856 abcc5 (ENSONIG00000008285) ENSONIG00000040474 ENSONIG00000017280 ##22 mmp23bb (ENSONIG00000017283) zgc:92744 (ENSONIG00000030185) eif2a (ENSONIG00000017284) ENSONIG00000017290 ENSONIG00000039883 ENSONIG00000034727 ENSONIG00000017294 ENSONIG00000030906 rffl (ENSONIG00000037182) eif4h (ENSONIG00000001042) ANO7 (ENSONIG00000001045) ENSONIG00000041381 ENSONIG00000032051 ece2b (ENSONIG00000001048) ENSONIG00000036400 Midas cichlid MODERN SPECIES 97 ENSACIG00000024100 ##22 ENSACIG00000024099 mmp23bb (ENSACIG00000024098) zgc:92744 (ENSACIG00000024096) eif2a (ENSACIG00000024095) ENSACIG00000024093 ENSACIG00000024091 ENSACIG00000024090 AXL (ENSACIG00000024084) LGALS4 (ENSACIG00000024079) ENSACIG00000024074 rasgrp4 (ENSACIG00000024073) HNRNPUL1 (ENSACIG00000024072) opa3 (ENSACIG00000024071) ppp1r13l (ENSACIG00000024070) TMEM91 (ENSACIG00000024068) Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 255 ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000158535 ENSGT01100000263613 #24 ENSGT00940000160688 ENSGT00940000159816 ENSGT00390000003738.a.a ENSGT00390000004049 ENSGT00940000159866 ENSGT00940000160289 #17 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000159844 #16 ENSGT00940000156022.a #14 ENSGT00940000165567 ENSGT00940000161268 ENSGT00940000153249.b.c ENSGT00930000151033 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 137 ENSGT00940000161268 ENSGT00940000165567 ENSGT00940000156022.a #14 ENSGT00940000159844 #16 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000160289 #17 ENSGT00940000159866 ENSGT00390000004049 ENSGT00390000003738.a.a ENSGT00940000159816 ENSGT00940000160688 ENSGT00940000160672 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000158535 ENSGT00940000157956 ENSGT00940000162310 ENSGT00940000161727 Amniota ANCESTRAL SPECIES 79 ENSGT00940000153249.b.c ENSGT00940000161268 ENSGT00940000154035.a ENSGT00940000165258 ENSGT00940000160289 #17 ENSGT00940000159866 ENSGT00390000004049 ENSGT00390000003738.a.a.b ENSGT00940000159816 ENSGT00940000160688 ENSGT00940000160672 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000158535 ENSGT00940000157956 ENSGT00940000161727 ENSGT00940000162036 ENSGT00940000162017 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000159844 #16 ENSGT00940000156022.a #14 Sauria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000159706 ENSGT00940000160400 ENSGT00940000155470.b ENSGT00960000192626 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000165683 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000160672 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000171017 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00390000012141.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000167797 ENSGT00940000155439 ENSGT00940000164682 ENSGT00940000161767 ENSGT00390000006294 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a ENSGT00940000163497 ENSGT00940000159706 ENSGT00940000160400 ENSGT00940000155470.b ENSGT00960000192626 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000165683 ENSGT00940000155604 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000171017 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00390000012141.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000167797 ENSGT00940000155439 ENSGT00940000164682 ENSGT00390000006294 ENSGT00390000018195 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000160672 ENSGT00940000160688 ENSGT00940000159816 ENSGT00390000003738.a.a.b ENSGT00390000004049 ENSGT00940000159866 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000171017 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00390000012141.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000167797 ENSGT00940000155439 ENSGT00940000164682 ENSGT00390000006294 ENSGT00390000018195 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155604 ENSGT00390000003738.a.a.b ENSGT00390000004049 ENSGT00940000159866 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000171017 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00390000012141.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000167797 ENSGT00940000155439 ENSGT00940000164682 ENSGT00390000006294 ENSGT00390000018195 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT00390000003738.a.a.b ENSGT00390000004049 ENSGT00940000159866 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b.e.b.b ENSGT00530000063882.b.e.a ENSGT00950000182903.a.b #22 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 179 ENSGT00390000003738.a.a.b ENSGT00390000004049 ENSGT00940000159866 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496.h ENSGT00530000063882.b.e.a ENSGT00950000182903.a.b #22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 169 ENSGT00390000003738.a.a.b ENSGT00390000004049.fb ENSGT00940000159866 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B.`b ENSGT00530000063882.b.e.a ENSGT00950000182903.a.b #22 Mainland tiger snake DUPLICATION Mainland tiger snake MODERN SPECIES 664 NEURL4 (ENSNSUG00000015543) ENSNSUG00000015771 ENSNSUG00000015772 ENSNSUG00000015773 #22 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 1712 ENSNSUG00000002897 #22 Eastern brown snake MODERN SPECIES 306 ENSPTXG00000011460 GPS2 (ENSPTXG00000011462) NEURL4 (ENSPTXG00000011488) ENSPTXG00000012322 ENSPTXG00000012325 ENSPTXG00000012327 ENSPTXG00000012329 DVL2 (ENSPTXG00000012335) #22 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 5570 DVL2 (ENSLLTG00000015378) #22 Lizard MODERN SPECIES 229 ENSACAG00000011181 #22 Laterata DUPLICATION Laterata ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000159372.i.a ENSGT00940000159372.i.b.a ENSGT00940000159372.i.b.b ENSGT00940000162017 ENSGT00940000160289 #17 ENSGT00940000160672 ENSGT00940000160688 ENSGT00940000159816 ENSGT00390000003738.a.a.b ENSGT00390000004049 ENSGT00940000159866 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b.c #22 ENSGT00940000158535 ENSGT00940000157956 ENSGT00940000161727.c.a.a ENSGT00940000162799 ENSGT00960000191608 ENSGT01100000264186 ENSGT00940000160853 ENSGT00940000154435.z ENSGT00390000000334 ENSGT00940000160598 ENSGT01050000244976.b.b.b.a.a.a ENSGT00940000158058 ENSGT00940000158661 ENSGT00950000183121.a.a.a.b ENSGT00950000183121.a.b Common wall lizard MODERN SPECIES 4 ENSPMRG00000011807 ENSPMRG00000011811 ENSPMRG00000011816 SLC16A11 (ENSPMRG00000011818) ACAP1 (ENSPMRG00000011823) #17 CLDN7 (ENSPMRG00000011827) SLC2A4 (ENSPMRG00000011830) YBX2 (ENSPMRG00000011832) ENSPMRG00000011836 GPS2 (ENSPMRG00000011843) NEURL4 (ENSPMRG00000011857) ENSPMRG00000011875 CTDNEP1 (ENSPMRG00000011878) GABARAP (ENSPMRG00000011885) PHF23 (ENSPMRG00000011891) ENSPMRG00000011895 #22 ENSPMRG00000011901 DLG4 (ENSPMRG00000011916) ENSPMRG00000011968 KCTD11 (ENSPMRG00000011974) ENSPMRG00000011978 ENSPMRG00000011982 ENSPMRG00000011987 ENSPMRG00000011990 ENSPMRG00000011994 ENSPMRG00000011996 NLGN2 (ENSPMRG00000011998) ENSPMRG00000012000 ENSPMRG00000012007 TMEM102 (ENSPMRG00000012009) FGF11 (ENSPMRG00000012011) Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 38 ENSSMRG00000003220 ENSSMRG00000003218 ENSSMRG00000003217 ENSSMRG00000003216 ACAP1 (ENSSMRG00000003212) #17 CLDN7 (ENSSMRG00000003210) SLC2A4 (ENSSMRG00000003207) YBX2 (ENSSMRG00000003205) ENSSMRG00000003202 GPS2 (ENSSMRG00000003191) NEURL4 (ENSSMRG00000003181) ENSSMRG00000003177 CTDNEP1 (ENSSMRG00000003176) GABARAP (ENSSMRG00000003164) PHF23 (ENSSMRG00000003160) DVL2 (ENSSMRG00000003154) #22 ACADVL (ENSSMRG00000003140) DLG4 (ENSSMRG00000003093) ENSSMRG00000003081 ENSSMRG00000003075 KCTD11 (ENSSMRG00000003072) ENSSMRG00000003062 ENSSMRG00000003059 ENSSMRG00000003054 TMEM256 (ENSSMRG00000003051) NLGN2 (ENSSMRG00000003049) TMEM102 (ENSSMRG00000003043) FGF11 (ENSSMRG00000003042) CHRNB1 (ENSSMRG00000002963) ENSSMRG00000002956 ENSSMRG00000002948 Laterata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.a.b.d #22 Common wall lizard MODERN SPECIES 243 ENSPMRG00000018999 #22 tuatara MODERN SPECIES 1445 FGF11 (ENSSPUG00000018278) NLGN2 (ENSSPUG00000018270) CLDN7 (ENSSPUG00000018265) ENSSPUG00000018261 ENSSPUG00000018257 ENSSPUG00000018254 YBX2 (ENSSPUG00000018250) ENSSPUG00000018242 ENSSPUG00000018239 ENSSPUG00000018229 NEURL4 (ENSSPUG00000018200) ENSSPUG00000018190 CTDNEP1 (ENSSPUG00000018176) GABARAP (ENSSPUG00000018166) PHF23 (ENSSPUG00000018155) DVL2 (ENSSPUG00000018112) #22 ENSSPUG00000018078 ENSSPUG00000018072 DLG4 (ENSSPUG00000017968) ENSSPUG00000017924 TMEM256 (ENSSPUG00000017919) ENSSPUG00000017911 #17 SLC16A11 (ENSSPUG00000017904) ENSSPUG00000017890 ENSSPUG00000017841 ATP1B2 (ENSSPUG00000017821) ENSSPUG00000017810 ZBTB4 (ENSSPUG00000017808) ENSSPUG00000017777 ENSSPUG00000017769 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000159706 ENSGT00940000160400 ENSGT00940000155470.b ENSGT00960000192626 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000165683 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000160672 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000171017 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00390000012141.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00940000164682 ENSGT00940000161767 ENSGT00390000006294 ENSGT00390000018195 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000159706 ENSGT00940000160400 ENSGT00940000155470.b ENSGT00960000192626 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000165683 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000160688 ENSGT00940000160672 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000171017 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00390000012141.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00940000164682 ENSGT00940000161767 ENSGT00390000006294 ENSGT00390000018195 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000163166.b.a.b.b.b ENSGT00950000185325 ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b ENSGT00940000163497 ENSGT00940000159706 ENSGT00940000160400 ENSGT00940000155470.b ENSGT00960000192626 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000165683 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000171017 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 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SPECIES 1126 ENSCPBG00000022178 ENSCPBG00000022181 ENSCPBG00000022184 ACAP1 (ENSCPBG00000022194) #17 NEURL4 (ENSCPBG00000022251) GPS2 (ENSCPBG00000022286) ENSCPBG00000022287 YBX2 (ENSCPBG00000022288) SLC2A4 (ENSCPBG00000022291) CLDN7 (ENSCPBG00000022296) ELP5 (ENSCPBG00000022298) CTDNEP1 (ENSCPBG00000022300) GABARAP (ENSCPBG00000022301) ENSCPBG00000022303 ENSCPBG00000022305 ENSCPBG00000022307 #22 ENSCPBG00000022310 #22 ACADVL (ENSCPBG00000022314) painted turtle MODERN SPECIES 1126 ENSCPBG00000022181 ENSCPBG00000022184 ACAP1 (ENSCPBG00000022194) #17 NEURL4 (ENSCPBG00000022251) GPS2 (ENSCPBG00000022286) ENSCPBG00000022287 YBX2 (ENSCPBG00000022288) SLC2A4 (ENSCPBG00000022291) CLDN7 (ENSCPBG00000022296) ELP5 (ENSCPBG00000022298) CTDNEP1 (ENSCPBG00000022300) GABARAP (ENSCPBG00000022301) ENSCPBG00000022303 ENSCPBG00000022305 ENSCPBG00000022307 #22 ENSCPBG00000022310 #22 ACADVL (ENSCPBG00000022314) Three-toed box turtle MODERN SPECIES 362 TNFSF13 (ENSTMTG00000020639) ENSTMTG00000020634 POLR2A (ENSTMTG00000020616) TP53 (ENSTMTG00000020609) ENSTMTG00000020605 ENSTMTG00000020598 ENSTMTG00000020590 ENSTMTG00000020585 ENSTMTG00000020583 YBX2 (ENSTMTG00000020576) ENSTMTG00000020561 ENSTMTG00000020557 CTDNEP1 (ENSTMTG00000020543) ENSTMTG00000020532 ENSTMTG00000020527 DVL2 (ENSTMTG00000020523) #22 Chinese turtle MODERN SPECIES 194 TP53 (ENSPSIG00000013302) ENSPSIG00000013297 #14 BCL6B (ENSPSIG00000013071) #16 SLC16A13 (ENSPSIG00000012961) ENSPSIG00000012957 #17 ENSPSIG00000012951 #17 NEURL4 (ENSPSIG00000012457) GPS2 (ENSPSIG00000012441) ENSPSIG00000012414 YBX2 (ENSPSIG00000012364) SLC2A4 (ENSPSIG00000011968) CLDN7 (ENSPSIG00000011946) ELP5 (ENSPSIG00000011869) CTDNEP1 (ENSPSIG00000011844) PHF23 (ENSPSIG00000011810) DVL2 (ENSPSIG00000011726) #22 ACADVL (ENSPSIG00000011582) ENSPSIG00000001254 DLG4 (ENSPSIG00000011575) ENSPSIG00000011537 KCTD11 (ENSPSIG00000001241) ENSPSIG00000011526 PLSCR3 (ENSPSIG00000011418) NLGN2 (ENSPSIG00000010559) TMEM102 (ENSPSIG00000010488) FGF11 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ENSGT00390000003738.a.a.b ENSGT00940000159816 ENSGT00940000160688 ENSGT00940000160672 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000158535 ENSGT00940000157956 ENSGT00940000161727 ENSGT00940000162017 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000159844 #16 ENSGT00390000014721 ENSGT00390000009664 ENSGT00390000016066 ENSGT00940000155191.b ENSGT00940000162807 ENSGT00730000111225 ENSGT00950000182887.C.a.a.b ENSGT00390000010184 ENSGT00390000002148 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162159 ENSGT00390000018162 ENSGT00940000162799 ENSGT00940000160289 #17 ENSGT00940000163910 ENSGT00940000159866 ENSGT00390000004049 ENSGT00390000003738.a.a.b ENSGT00940000159816 ENSGT00940000160688 ENSGT00940000160672 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000158535 ENSGT00940000157956 ENSGT00940000161727 ENSGT00940000162310 ENSGT00940000162036 ENSGT00940000162017 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000159844 #16 ENSGT00390000014721 ENSGT00390000009664 ENSGT00390000016066 ENSGT00940000155191.b ENSGT00940000162807 ENSGT00730000111225 ENSGT00950000182887.C.a.a.b Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000162159 ENSGT00390000018162 ENSGT00940000162799 ENSGT00940000160289 #17 ENSGT00940000163910 ENSGT00940000159866 ENSGT00390000004049 ENSGT00390000003738.a.a.b ENSGT00940000159816 ENSGT00940000160688 ENSGT00940000160672 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000158535 ENSGT00940000157956 ENSGT00940000161727 ENSGT00940000162310 ENSGT00940000162036 ENSGT00940000162017 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000159844 #16 ENSGT00390000014721 ENSGT00390000009664 ENSGT00390000016066 ENSGT00940000155191.b ENSGT00940000162807 ENSGT00730000111225 ENSGT00950000182887.C.a.a.b Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000162159 ENSGT00390000018162 ENSGT00940000162799 ENSGT00940000160289 #17 ENSGT00940000163910 ENSGT00940000159866 ENSGT00390000004049 ENSGT00390000003738.a.a.b ENSGT00940000159816 ENSGT00940000160688 ENSGT00940000160672 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000158535 ENSGT00940000157956 ENSGT00940000161727 ENSGT00940000162310 ENSGT00940000162036 ENSGT00940000162017 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000159844 #16 ENSGT00390000014721 ENSGT00390000009664 ENSGT00390000016066 ENSGT00940000155191.b ENSGT00940000162807 ENSGT00730000111225 ENSGT00950000182887.C.a.a.b Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000162159 ENSGT00390000018162 ENSGT00940000162799 ENSGT00940000160289 #17 ENSGT00940000163910 ENSGT00940000159866 ENSGT00390000004049 ENSGT00390000003738.a.a.b ENSGT00940000159816 ENSGT00940000160688 ENSGT00940000160672 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000158535 ENSGT00940000157956 ENSGT00940000161727 ENSGT00940000162310 ENSGT00940000162036 ENSGT00940000162017 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000159844 #16 ENSGT00390000014721 ENSGT00390000009664 ENSGT00390000016066 ENSGT00940000155191.b ENSGT00940000162807 ENSGT00730000111225 ENSGT00950000182887.C.a.a.b Elephant MODERN SPECIES 414 PLSCR3 (ENSLAFG00000031015) TNK1 (ENSLAFG00000010519) TMEM95 (ENSLAFG00000030785) KCTD11 (ENSLAFG00000020557) ACAP1 (ENSLAFG00000014924) #17 ENSLAFG00000030888 NEURL4 (ENSLAFG00000030118) GPS2 (ENSLAFG00000020547) ENSLAFG00000026475 YBX2 (ENSLAFG00000014006) SLC2A4 (ENSLAFG00000014001) ELP5 (ENSLAFG00000000748) CTDNEP1 (ENSLAFG00000000746) GABARAP (ENSLAFG00000000744) PHF23 (ENSLAFG00000022349) DVL2 (ENSLAFG00000021683) #22 ACADVL (ENSLAFG00000018641) DLG4 (ENSLAFG00000018637) ASGR1 (ENSLAFG00000018633) ASGR2 (ENSLAFG00000015889) ENSLAFG00000013636 SLC16A11 (ENSLAFG00000001191) SLC16A13 (ENSLAFG00000001193) BCL6B (ENSLAFG00000006642) #16 C17orf49 (ENSLAFG00000006639) 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#16 ENSGT00390000014721 ENSGT00390000009664 ENSGT00940000155191.b ENSGT00940000163215 ENSGT00940000162945 ENSGT00940000162835 ENSGT00940000163303 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000162159 ENSGT00390000018162 ENSGT00940000162799 ENSGT00940000160289 #17 ENSGT00940000163910 ENSGT00940000159866 ENSGT00390000004049 ENSGT00390000003738.a.a.b ENSGT00940000159816 ENSGT00940000160688 ENSGT00940000160672 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000158535 ENSGT00940000157956 ENSGT00940000161727 ENSGT00940000162310 ENSGT00940000162036 ENSGT00940000162017 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000159844 #16 ENSGT00390000014721 ENSGT00390000009664 ENSGT00940000155191.b ENSGT00940000163215 ENSGT00940000162945 ENSGT00940000162835 ENSGT00940000163303 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 77 TNK1 (ENSUPAG00010014874) TMEM95 (ENSUPAG00010014860) KCTD11 (ENSUPAG00010014856) ACAP1 (ENSUPAG00010014808) #17 ENSUPAG00010014750 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MODERN SPECIES 144 ENSNLEG00000008063 SLC2A4 (ENSNLEG00000008058) ENSNLEG00000008054 ENSNLEG00000008053 ENSNLEG00000035429 GABARAP (ENSNLEG00000028899) DVL2 (ENSNLEG00000008027) #22 ACADVL (ENSNLEG00000007995) DLG4 (ENSNLEG00000007961) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000161755 ENSGT00940000162159 ENSGT00390000018162 ENSGT00940000162799 ENSGT00940000160289 #17 ENSGT00940000159866 ENSGT00390000004049.bb ENSGT00390000003738.a.a.b ENSGT00940000159816 ENSGT00940000160688 ENSGT00940000160672 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B.eb.a ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000158535 ENSGT00940000157956 ENSGT00940000161727 ENSGT00940000162310 ENSGT00940000162036 ENSGT00940000154514.d.b ENSGT00940000162017 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000159844 #16 ENSGT00390000014721 ENSGT00390000009664.p.a ENSGT00390000016066 ENSGT00390000009664.o ENSGT00940000155191.b ENSGT00940000163215 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161755 ENSGT00940000162159 ENSGT00390000018162 ENSGT00940000162799 ENSGT00940000160289 #17 ENSGT00940000159866 ENSGT00390000004049.bb ENSGT00390000003738.a.a.b ENSGT00940000159816 ENSGT00940000160688 ENSGT00940000160672 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B.eb.a ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000158535 ENSGT00940000157956 ENSGT00940000161727 ENSGT00940000162310 ENSGT00940000162036 ENSGT00940000154514.d.b ENSGT00940000162017 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000159844 #16 ENSGT00390000014721 ENSGT00390000016066 ENSGT00390000009664.o ENSGT00940000155191.b ENSGT00940000163215 ENSGT00950000182894.C Vervet Monkey MODERN SPECIES 7 PLSCR3 (ENSCSAG00000011756) TNK1 (ENSCSAG00000011764) TMEM95 (ENSCSAG00000011774) KCTD11 (ENSCSAG00000000567) ACAP1 (ENSCSAG00000011788) #17 NEURL4 (ENSCSAG00000011806) ENSCSAG00000011825 GPS2 (ENSCSAG00000011817) YBX2 (ENSCSAG00000011857) SLC2A4 (ENSCSAG00000011874) CLDN7 (ENSCSAG00000011879) ELP5 (ENSCSAG00000011886) 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ENSGT00940000162036 ENSGT00940000154514.d.b ENSGT00940000162017 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000159844 #16 ENSGT00390000014721 ENSGT00390000009664.o ENSGT00940000155191.b ENSGT00940000163215 ENSGT00950000182894.C ENSGT00510000048837 Macaca ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161755 ENSGT00940000162159 ENSGT00390000018162 ENSGT00940000162799 ENSGT00940000160289 #17 ENSGT00940000159866 ENSGT00390000004049.bb ENSGT00390000003738.a.a.b ENSGT00940000159816 ENSGT00940000160688 ENSGT00940000160672 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B.eb.a ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000158535 ENSGT00940000157956 ENSGT00940000161727 ENSGT00940000162310 ENSGT00940000162036 ENSGT00940000154514.d.b ENSGT00940000162017 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000159844 #16 ENSGT00390000014721 ENSGT00390000009664.o ENSGT00940000155191.b ENSGT00940000163215 ENSGT00950000182894.C ENSGT00510000048837 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 94 ENSMNEG00000002232 ENSMNEG00000008269 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Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1512 PLSCR3 (ENSRBIG00000021022) TNK1 (ENSRBIG00000044312) TMEM95 (ENSRBIG00000035953) KCTD11 (ENSRBIG00000010955) ACAP1 (ENSRBIG00000028132) #17 NEURL4 (ENSRBIG00000038362) GPS2 (ENSRBIG00000022093) ENSRBIG00000032310 YBX2 (ENSRBIG00000040919) SLC2A4 (ENSRBIG00000033840) CLDN7 (ENSRBIG00000042592) ELP5 (ENSRBIG00000034570) CTDNEP1 (ENSRBIG00000042434) ENSRBIG00000027710 PHF23 (ENSRBIG00000027808) DVL2 (ENSRBIG00000031987) #22 ACADVL (ENSRBIG00000032751) DLG4 (ENSRBIG00000038115) ASGR1 (ENSRBIG00000036163) ASGR2 (ENSRBIG00000034825) CLEC10A (ENSRBIG00000034862) ENSRBIG00000028578 SLC16A11 (ENSRBIG00000040249) SLC16A13 (ENSRBIG00000030006) BCL6B (ENSRBIG00000041742) #16 RNASEK (ENSRBIG00000007939) C17orf49 (ENSRBIG00000030939) ALOX12 (ENSRBIG00000044539) ENSRBIG00000034350 TEKT1 (ENSRBIG00000030333) FBXO39 (ENSRBIG00000026028) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2022 NEURL4 (ENSRROG00000029947) GPS2 (ENSRROG00000040753) ENSRROG00000040501 YBX2 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ENSGT00730000111225 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162159 ENSGT00390000018162 ENSGT00940000162799 ENSGT00940000160289 #17 ENSGT00940000163910 ENSGT00940000159866 ENSGT00390000004049 ENSGT00390000003738.a.a.b ENSGT00940000159816 ENSGT00940000160688 ENSGT00940000160672 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000158535 ENSGT00940000157956 ENSGT00940000161727 ENSGT00940000162310.b ENSGT00940000162036 ENSGT00940000162017 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000159844 #16 ENSGT00390000014721 ENSGT00390000009664 ENSGT00940000155191.b ENSGT00940000162807 ENSGT00730000111225 ENSGT00950000182887.C.a.a.b ENSGT00390000010184 Chacoan peccary MODERN SPECIES 67 TNK1 (ENSCWAG00000003555) TMEM95 (ENSCWAG00000003541) KCTD11 (ENSCWAG00000003533) ACAP1 (ENSCWAG00000003510) #17 ENSCWAG00000003461 NEURL4 (ENSCWAG00000003360) ENSCWAG00000003311 ENSCWAG00000003284 YBX2 (ENSCWAG00000003262) SLC2A4 (ENSCWAG00000003179) CLDN7 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#22 ENSGT00940000158535 ENSGT00940000157956 ENSGT00940000161727 ENSGT00940000162310.b ENSGT00940000162036 ENSGT00940000162017 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000159844 #16 ENSGT00390000014721 ENSGT00390000009664 ENSGT00940000155191.b ENSGT00390000004322.a.b ENSGT00940000163215 ENSGT00940000162807 ENSGT00730000111225 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161755 ENSGT00940000162159 ENSGT00390000018162 ENSGT00940000160289 #17 ENSGT00940000163910 ENSGT00940000159866 ENSGT00390000004049 ENSGT00390000003738.a.a.b ENSGT00940000159816 ENSGT00940000160688 ENSGT00940000160672 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000158535 ENSGT00940000157956 ENSGT00940000161727 ENSGT00940000162310.b ENSGT00940000162036 ENSGT00940000162017 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000159844 #16 ENSGT00390000014721 ENSGT00390000009664 ENSGT00940000155191.b ENSGT00390000004322.a.b ENSGT00940000163215 ENSGT00940000162807 ENSGT00730000111225 Goat MODERN SPECIES 10 PLSCR3 (ENSCHIG00000021167) TNK1 (ENSCHIG00000008836) TMEM95 (ENSCHIG00000024443) ACAP1 (ENSCHIG00000017749) #17 ENSCHIG00000024951 NEURL4 (ENSCHIG00000018834) GPS2 (ENSCHIG00000004094) ENSCHIG00000025365 YBX2 (ENSCHIG00000016407) SLC2A4 (ENSCHIG00000020405) CLDN7 (ENSCHIG00000025376) ELP5 (ENSCHIG00000010521) CTDNEP1 (ENSCHIG00000006144) GABARAP (ENSCHIG00000021470) PHF23 (ENSCHIG00000007385) DVL2 (ENSCHIG00000025716) #22 ACADVL (ENSCHIG00000025328) DLG4 (ENSCHIG00000009974) ASGR1 (ENSCHIG00000016569) ASGR2 (ENSCHIG00000003690) SLC16A11 (ENSCHIG00000019140) SLC16A13 (ENSCHIG00000019049) BCL6B (ENSCHIG00000013253) #16 C17orf49 (ENSCHIG00000019869) RNASEK (ENSCHIG00000009505) ALOX12 (ENSCHIG00000025520) ENSCHIG00000010838 ENSCHIG00000018052 ALOX15 (ENSCHIG00000025642) PELP1 (ENSCHIG00000026719) ARRB2 (ENSCHIG00000015924) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 2 TMEM256 (ENSOARG00020014986) PLSCR3 (ENSOARG00020015038) TNK1 (ENSOARG00020015110) TMEM95 (ENSOARG00020015173) 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SPECIES 196 YBX2 (ENSUAMG00000014725) SLC2A4 (ENSUAMG00000014728) CLDN7 (ENSUAMG00000014731) ENSUAMG00000014735 CTDNEP1 (ENSUAMG00000014737) GABARAP (ENSUAMG00000014741) PHF23 (ENSUAMG00000014762) DVL2 (ENSUAMG00000014764) #22 ACADVL (ENSUAMG00000014768) DLG4 (ENSUAMG00000014776) ASGR1 (ENSUAMG00000014781) ASGR2 (ENSUAMG00000014786) Polar bear MODERN SPECIES 147 ENSUMAG00000015586 ENSUMAG00000015577 TNK1 (ENSUMAG00000015556) KCTD11 (ENSUMAG00000015551) ACAP1 (ENSUMAG00000015527) #17 ENSUMAG00000015517 NEURL4 (ENSUMAG00000015260) ENSUMAG00000015235 ENSUMAG00000015230 YBX2 (ENSUMAG00000015222) SLC2A4 (ENSUMAG00000015183) ELP5 (ENSUMAG00000015173) CTDNEP1 (ENSUMAG00000015165) GABARAP (ENSUMAG00000015154) PHF23 (ENSUMAG00000015146) ENSUMAG00000015136 #22 ACADVL (ENSUMAG00000014784) DLG4 (ENSUMAG00000014738) ASGR2 (ENSUMAG00000014668) CLEC10A (ENSUMAG00000014642) SLC16A13 (ENSUMAG00000014638) BCL6B (ENSUMAG00000014629) #16 RNASEK (ENSUMAG00000014624) C17orf49 (ENSUMAG00000014613) ALOX12 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(ENSAMEG00000016134) MED11 (ENSAMEG00000016133) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000162159 ENSGT00390000018162 ENSGT00940000162799 ENSGT00940000160289 #17 ENSGT00940000163910 ENSGT00940000159866 ENSGT00390000004049 ENSGT00390000003738.a.a.b ENSGT00940000159816 ENSGT00940000160688 ENSGT00940000160672 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000158535 ENSGT00940000157956 ENSGT00940000161727 ENSGT00940000162310.b ENSGT00940000162036 ENSGT00940000162017 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000159844 #16 ENSGT00390000014721 ENSGT00390000009664.f ENSGT00940000155191.b ENSGT00940000163215 ENSGT00940000162807 ENSGT00730000111225 ENSGT00950000182887.C.a.a.b Ferret MODERN SPECIES 237 PLSCR3 (ENSMPUG00000009978) TNK1 (ENSMPUG00000010053) ACAP1 (ENSMPUG00000010117) #17 ENSMPUG00000010131 NEURL4 (ENSMPUG00000010156) ENSMPUG00000019730 ENSMPUG00000010298 ENSMPUG00000010364 YBX2 (ENSMPUG00000010386) SLC2A4 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DVL2 (ENSNVIG00000002277) #22 ACADVL (ENSNVIG00000000794) DLG4 (ENSNVIG00000000149) ASGR2 (ENSNVIG00000000124) CLC10 (ENSNVIG00000000116) SLC16A11 (ENSNVIG00000000108) SLC16A13 (ENSNVIG00000000096) BCL6B (ENSNVIG00000020335) #16 ENSNVIG00000020282 ALOX12 (ENSNVIG00000020245) ENSNVIG00000020239 ALOX15 (ENSNVIG00000020197) PELP1 (ENSNVIG00000020156) ARRB2 (ENSNVIG00000020038) ENSNVIG00000020023 ENSNVIG00000019992 Canidae ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000162159 ENSGT00390000018162 ENSGT00940000162799 ENSGT00940000160289 #17 ENSGT00940000163910 ENSGT00940000159866 ENSGT00390000004049 ENSGT00390000003738.a.a.b ENSGT00940000159816 ENSGT00940000160688 ENSGT00940000160672 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000158535 ENSGT00940000157956 ENSGT00940000161727 ENSGT00940000162310.b ENSGT00940000162036 ENSGT00940000162017 ENSGT00940000159372 ENSGT00940000159844 #16 ENSGT00390000014721 ENSGT00390000009664 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MED11 (ENSPPRG00000021129) ZMYND15 (ENSPPRG00000020074) TM4SF5 (ENSPPRG00000016012) Cat MODERN SPECIES 245 PLSCR3 (ENSFCAG00000010894) TNK1 (ENSFCAG00000010893) TMEM95 (ENSFCAG00000010892) ACAP1 (ENSFCAG00000010890) #17 ENSFCAG00000050178 NEURL4 (ENSFCAG00000010887) GPS2 (ENSFCAG00000030260) ENSFCAG00000010886 YBX2 (ENSFCAG00000018097) SLC2A4 (ENSFCAG00000003061) CLDN7 (ENSFCAG00000031173) ELP5 (ENSFCAG00000002827) CTDNEP1 (ENSFCAG00000018399) GABARAP (ENSFCAG00000030191) PHF23 (ENSFCAG00000025727) DVL2 (ENSFCAG00000024333) #22 ACADVL (ENSFCAG00000002826) DLG4 (ENSFCAG00000002824) ASGR1 (ENSFCAG00000037175) SLC16A11 (ENSFCAG00000001354) BCL6B (ENSFCAG00000001356) #16 CE1H17orf49 (ENSFCAG00000049344) RNASEK (ENSFCAG00000001358) ALOX12 (ENSFCAG00000001355) PELP1 (ENSFCAG00000022191) ARRB2 (ENSFCAG00000013022) MED11 (ENSFCAG00000035264) CXCL16 (ENSFCAG00000029038) ZMYND15 (ENSFCAG00000027955) TM4SF5 (ENSFCAG00000039337) VMO1 (ENSFCAG00000008035) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 3 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(ENSOANG00000049055) ENSOANG00000007582 ZMYND15 (ENSOANG00000040839) TM4SF5 (ENSOANG00000045956) VMO1 (ENSOANG00000037759) ENSOANG00000036139 Anura ANCESTRAL SPECIES 356 ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000158535 ENSGT00940000157956 ENSGT00940000162310 ENSGT00940000161727 Frog MODERN SPECIES 3 atp1b2 (ENSXETG00000025056) tp53 (ENSXETG00000025055) ENSXETG00000046585 slc16a13 (ENSXETG00000046558) acap1 (ENSXETG00000017847) #17 neurl4 (ENSXETG00000017842) GPS2 (ENSXETG00000027787) ybx2 (ENSXETG00000041917) ENSXETG00000044000 ENSXETG00000045980 slc2a4 (ENSXETG00000045346) cldn7 (ENSXETG00000049181) elp5 (ENSXETG00000041810) ctdnep1 (ENSXETG00000043462) phf23 (ENSXETG00000049315) dvl2 (ENSXETG00000046940) #22 ENSXETG00000042676 ENSXETG00000044730 ENSXETG00000035305 ENSXETG00000041571 XB5946328 [provisional:or11l1] (ENSXETG00000041979) ENSXETG00000048316 or1s1 (ENSXETG00000045394) ENSXETG00000047633 ENSXETG00000046951 ENSXETG00000048992 ENSXETG00000047242 ENSXETG00000046762 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mccc1 (ENSCMIG00000014137) ENSCMIG00000014153 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 372 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000160400 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000165683 ENSGT00940000155604 ENSGT00530000063882.b ENSGT00940000171017 ENSGT00390000005285 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 511 ENSGT00390000016972 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000160400 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000165683 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 185 ENSGT00390000016972 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000160400 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000165683 ENSGT00950000182903.a.b.j ##22 ENSGT00940000155604 ENSGT00530000063882.b ENSGT00940000171017 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000157673 ENSGT00940000164152 ENSGT01020000230768 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000164682 ENSGT00940000155439 ENSGT00940000167797 ENSGT00950000183106.a.a.b Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000167797 ENSGT00940000155439.a.b ENSGT00940000164682 ENSGT01020000230768 ENSGT00940000164152.a ENSGT00940000157673 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000171017 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000158330 ENSGT00730000111263 ENSGT00390000016972 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000160400 ENSGT00950000182903.a.a.c ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000165683 ENSGT00940000157384 ENSGT00940000161729 ENSGT00730000111053 ENSGT00390000011725.d ENSGT00940000153655.A.b ENSGT00390000003912 ENSGT00890000139472 ENSGT00940000159812 ENSGT00940000162644 ENSGT00850000132319.a.a.a ENSGT01060000248589.B ENSGT01060000248589.A ENSGT01060000248592.C Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 75 ENSGT00940000159041 ENSGT00940000165072 ENSGT00720000108834 ENSGT00940000156389.b ENSGT00940000157403 ENSGT00390000004912 ENSGT00940000165563.b ENSGT00940000171017 ENSGT00940000164249.b.a.b.a.a ENSGT00940000155604 ENSGT00940000158330 ENSGT00730000111263 ENSGT00390000016972 ENSGT00940000155470.b 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ANCESTRAL SPECIES 296 ENSGT00390000004912 ENSGT00940000165563.b ENSGT00940000171017 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000158330 ENSGT00730000111263 ENSGT00390000016972 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000160400 ENSGT00950000182903.a.a.c ##22 ENSGT00940000159223.c ENSGT00940000165683 ENSGT00940000157384.b ENSGT00940000161729.n ENSGT00730000111053 ENSGT00940000156155 ENSGT00940000161826.B ENSGT00940000157259 ENSGT01080000257333.B ENSGT00990000204999 Atlantic herring MODERN SPECIES 25 ENSCHAG00000017330 ca4b (ENSCHAG00000017336) YWHAG (ENSCHAG00000017350) HSPB1 (ENSCHAG00000017355) ENSCHAG00000017424 polr2d (ENSCHAG00000017440) ENSCHAG00000017481 ENSCHAG00000017542 ENSCHAG00000017549 ABCF3 (ENSCHAG00000017563) LRCH3 (ENSCHAG00000017663) iqcg (ENSCHAG00000017893) rpl35a (ENSCHAG00000017909) abcc5 (ENSCHAG00000017969) rnpepl1 (ENSCHAG00000018769) DVL3 (ENSCHAG00000019103) ##22 ap2m1b (ENSCHAG00000019708) mmp23bb (ENSCHAG00000019802) ENSCHAG00000019869 pcyt1ab (ENSCHAG00000019880) 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(ENSDCDG00000022846) ENSDCDG00000022842 ENSDCDG00000022838 ENSDCDG00000022834 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT00940000155568 ENSGT00940000165402 ENSGT00390000017790 ENSGT00940000158758 ENSGT00940000162283.b ENSGT00940000154022.a.a ENSGT00940000156734.b ENSGT00390000004456 ENSGT00940000158268.a ENSGT00440000037417.A ENSGT00950000182976.a.b.d ENSGT00390000006758.b ENSGT00390000016972 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000160400 ENSGT00950000182903.a.a.c ##22 ENSGT00940000159223.c ENSGT00940000165683 ENSGT00940000157384.b ENSGT00940000161729.m.b.e.b ENSGT00730000111053 ENSGT00940000156155 ENSGT00940000180202 ENSGT00390000009497.b ENSGT00940000156536.e.a.i ENSGT00940000155350.g ENSGT00940000156251.a ENSGT00950000182988.a.b.a ENSGT00530000063816.c.b ENSGT00390000010063 ENSGT00530000064411.a Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00940000155568 ENSGT00940000165402 ENSGT00390000017790 ENSGT00940000158758 ENSGT00940000162283.b ENSGT00940000154022.a.a ENSGT00940000156734.b ENSGT00390000004456 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MODERN SPECIES 135 ENSPNAG00000019630 pex16 (ENSPNAG00000019643) ENSPNAG00000019654 large2 (ENSPNAG00000003607) ENSPNAG00000019835 KIFC3 (ENSPNAG00000019956) wt1b (ENSPNAG00000019996) eif3m (ENSPNAG00000020059) prrg4 (ENSPNAG00000020078) QSER1 (ENSPNAG00000020097) depdc7a (ENSPNAG00000020112) cstf3 (ENSPNAG00000020182) rpl35a (ENSPNAG00000020201) abcc5 (ENSPNAG00000020320) rnpepl1 (ENSPNAG00000020382) DVL3 (ENSPNAG00000020417) ##22 ENSPNAG00000020449 ENSPNAG00000020471 Mexicana tetra MODERN SPECIES 115 large2 (ENSAMXG00000017259) ENSAMXG00000036966 ENSAMXG00000014344 KIFC3 (ENSAMXG00000014323) wt1b (ENSAMXG00000039805) eif3m (ENSAMXG00000014287) prrg4 (ENSAMXG00000032262) QSER1 (ENSAMXG00000036761) depdc7a (ENSAMXG00000043313) cstf3 (ENSAMXG00000014198) rpl35a (ENSAMXG00000041448) ENSAMXG00000041419 abcc5 (ENSAMXG00000014147) rnpepl1 (ENSAMXG00000029654) ENSAMXG00000031190 DVL3 (ENSAMXG00000014040) ##22 ap2m1b (ENSAMXG00000014011) mmp23bb (ENSAMXG00000032267) pcyt1ab 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slc19a3b (ENSDARG00000061103) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 113 ENSGT00940000159041 ENSGT00940000165072 ENSGT00720000108834 ENSGT00940000156389.b ENSGT00940000157403 ENSGT00390000004912 ENSGT00940000165563.b ENSGT00940000171017 ENSGT00940000164249.b.a.b.a.a ENSGT00940000155604 ENSGT00940000158330 ENSGT00730000111263 ENSGT00390000016972 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000160400 ENSGT00950000182903.a.a.c ##22 ENSGT00940000159223.c ENSGT00940000165683 ENSGT00940000157384.b ENSGT00940000161729.m.b ENSGT00940000161729.n ENSGT00730000111053 ENSGT00390000003912 ENSGT00940000162644 ENSGT00850000132319.a.a.a ENSGT01060000248589.B ENSGT01060000248589.A ENSGT01060000248592.C ENSGT01030000234590.A.a.a ENSGT00940000153680.a ENSGT00940000158551 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000165093 ENSGT00940000157257.s.a ENSGT00390000009484 ENSGT00610000086058.b.w.a ENSGT00940000155499.c ENSGT00940000162967 ENSGT00950000183120.i.a ENSGT00940000155719.a.d ENSGT00970000197371 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ENSSSAG00000089572 MINDY4B (ENSSSAG00000072307) clrn1 (ENSSSAG00000072310) ENSSSAG00000112670 ENSSSAG00000072313 P2RY14 (ENSSSAG00000072319) ENSSSAG00000072322 rnf168 (ENSSSAG00000072327) ENSSSAG00000072337 ece2b (ENSSSAG00000048142) Huchen MODERN SPECIES 1325 ENSHHUG00000009266 rpl35a (ENSHHUG00000009350) abcc5 (ENSHHUG00000009391) rnpepl1 (ENSHHUG00000009990) DVL3 (ENSHHUG00000010076) ##22 ENSHHUG00000010155 mmp23bb (ENSHHUG00000010165) serp1 (ENSHHUG00000010180) eif2a (ENSHHUG00000010224) tsen34 (ENSHHUG00000010246) ENSHHUG00000010254 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 810 ENSGT00730000111263.a.a ENSGT00390000016972.h.a ENSGT00940000155470.b.r ENSGT00950000182903.a.a.c.h ##22 ENSGT00940000159223.c.g ENSGT00940000165683.d ENSGT00940000157384.b ENSGT01060000250696 ENSGT00730000111053.e Huchen MODERN SPECIES 1323 abcc5 (ENSHHUG00000008068) DVL3 (ENSHHUG00000008099) ##22 ap2m1b (ENSHHUG00000008546) mmp23bb (ENSHHUG00000008682) pcyt1ab (ENSHHUG00000008692) eif2a (ENSHHUG00000008875) serp1 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abcc5 (ENSSTUG00000001557) DVL3 (ENSSTUG00000001444) ##22 ap2m1b (ENSSTUG00000001394) mmp23bb (ENSSTUG00000001381) pcyt1ab (ENSSTUG00000001293) serp1 (ENSSTUG00000001287) eif2a (ENSSTUG00000001265) clrn1 (ENSSTUG00000001255) eif4h (ENSSTUG00000044184) RFFL (ENSSTUG00000044175) atp1b3b (ENSSTUG00000044170) tfdp2 (ENSSTUG00000044114) ece2b (ENSSTUG00000040330) NYAP2 (ENSSTUG00000040238) IRS1 (ENSSTUG00000040208) ENSSTUG00000040168 ENSSTUG00000040163 Atlantic salmon MODERN SPECIES 28 ENSSSAG00000102796 abcg1 (ENSSSAG00000042281) ENSSSAG00000109701 ENSSSAG00000102318 HMGB1 (ENSSSAG00000040208) ENSSSAG00000040288 ENSSSAG00000040173 ENSSSAG00000120507 ENSSSAG00000022030 iqcg (ENSSSAG00000020818) ENSSSAG00000018627 abcc5 (ENSSSAG00000042568) ENSSSAG00000085577 ##22 ENSSSAG00000096733 ENSSSAG00000087462 ENSSSAG00000004537 ##22 ENSSSAG00000110741 ap2m1b (ENSSSAG00000004585) mmp23bb (ENSSSAG00000004640) pcyt1ab (ENSSSAG00000004666) ENSSSAG00000004676 ENSSSAG00000083238 ENSSSAG00000004692 ENSSSAG00000004763 ENSSSAG00000095793 ENSSSAG00000094931 if4h (ENSSSAG00000004821) ENSSSAG00000004858 ENSSSAG00000004867 ENSSSAG00000083329 ENSSSAG00000072430 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000005712.i ENSGT01030000234583.a.a.d.m.a ENSGT00390000006030.d.a.a ENSGT00390000014189 ENSGT00950000183122.B.j ENSGT00940000156527.c ENSGT00940000155499.c.d ENSGT00390000009484 ENSGT00950000183120.i.a.b ENSGT00940000155719.a.d ENSGT00940000155604.o.b ENSGT00940000158330.y ENSGT00730000111263.a.a ENSGT00390000016972.h.a ENSGT00940000155470.b.r ENSGT00950000182903.a.a.c.h ##22 ENSGT00940000165747 ENSGT00940000165683.d ENSGT00940000157384.b ENSGT01060000250696 ENSGT00730000111053.e ENSGT00850000132319.a.a.a.c ENSGT00940000155414.n ENSGT00390000012719.a.a.a.e ENSGT01030000234579.A.b.a.d ENSGT00940000157909.p ENSGT00940000156921.g.a ENSGT00890000139453.b.e.b ENSGT00940000161579 ENSGT00940000161675.a ENSGT00510000047914.a.a.c Rainbow trout MODERN SPECIES 6 ENSOMYG00000047067 asl 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ENSGT00940000155470.b.r ENSGT00950000182903.a.a.c.h ##22 ENSGT00940000165747 ENSGT00940000165683.d ENSGT00940000157384.b ENSGT00730000111053.e ENSGT00850000132319.a.a.a.c ENSGT00940000155414.n ENSGT00390000012719.a.a.a.e ENSGT01030000234579.A.b.a.d ENSGT00940000157909.p ENSGT00940000156921.g.a ENSGT00890000139453.b.e.b ENSGT00940000161579 ENSGT00940000161675.a ENSGT00510000047914.a.a.c ENSGT00510000047914.b.f Coho salmon MODERN SPECIES 10 ncbp3 (ENSOKIG00005039800) ENSOKIG00005039812 tpst1l (ENSOKIG00005039822) crcp (ENSOKIG00005039833) asl (ENSOKIG00005039875) ZPLD1 (ENSOKIG00005040575) b3glcta (ENSOKIG00005040742) ENSOKIG00005042263 ENSOKIG00005042309 ENSOKIG00005042341 ABCF3 (ENSOKIG00005042407) LRCH3 (ENSOKIG00005042704) iqcg (ENSOKIG00005043027) RPL35A (ENSOKIG00005043034) ENSOKIG00005043066 DVL3 (ENSOKIG00005043103) ##22 ENSOKIG00005043324 ap2m1b (ENSOKIG00005043350) mmp23bb (ENSOKIG00005043497) pcyt1ab (ENSOKIG00005043523) ENSOKIG00005043597 ENSOKIG00005043605 EIF2A 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(ENSELUG00000001584) tnfaip1 (ENSELUG00000009327) SGSM2 (ENSELUG00000009376) tpst1 (ENSELUG00000009412) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000167797 ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439.a.a ENSGT00940000164682 ENSGT00390000006294.d ENSGT00940000164152.a ENSGT00940000157673 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000171017 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000158330 ENSGT00730000111263 ENSGT00390000016972 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000160400 ENSGT00950000182903.a.a.c ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000165683 ENSGT00940000157384 ENSGT00730000111053 ENSGT00390000011725.d ENSGT00390000003912 ENSGT00940000162644 ENSGT00850000132319.a.a.a ENSGT01060000248589.B ENSGT01060000248592.C ENSGT01030000234590.A.a.a ENSGT00940000153680.a ENSGT00940000158551 ENSGT00940000156921 ENSGT01030000234579.A.b.a P. kingsleyae MODERN SPECIES 101 alp3 (ENSPKIG00000013618) ENSPKIG00000013653 CLCN2 (ENSPKIG00000013719) chrd (ENSPKIG00000013883) thpo (ENSPKIG00000013931) zgc:153039 (ENSPKIG00000013967) ECEL1 (ENSPKIG00000013996) ABCF3 (ENSPKIG00000014055) ENSPKIG00000014138 LRCH3 (ENSPKIG00000014154) ENSPKIG00000014192 ENSPKIG00000014225 rpl35a (ENSPKIG00000014264) abcc5 (ENSPKIG00000014326) rnpepl1 (ENSPKIG00000014438) DVL3 (ENSPKIG00000014489) ##22 AP2M1 (ENSPKIG00000014529) mmp23bb (ENSPKIG00000014550) eif2a (ENSPKIG00000014595) selenot1a (ENSPKIG00000014644) tsen34 (ENSPKIG00000014674) SIAH2 (ENSPKIG00000014690) MINDY4B (ENSPKIG00000014705) clrn1 (ENSPKIG00000014724) GPR171 (ENSPKIG00000014733) P2RY14 (ENSPKIG00000014742) rnf168 (ENSPKIG00000014751) ANO7 (ENSPKIG00000014773) ece2b (ENSPKIG00000014828) atp1b3b (ENSPKIG00000014914) ENSPKIG00000014934 Asian bonytongue MODERN SPECIES 1 alp3 (ENSSFOG00015018556) fam131ab (ENSSFOG00015026074) CLCN2 (ENSSFOG00015018415) chrd (ENSSFOG00015018369) ENSSFOG00015032799 zgc:153039 (ENSSFOG00015018287) ECEL1 (ENSSFOG00015018229) ENSSFOG00015018169 ENSSFOG00015018158 ABCF3 (ENSSFOG00015018075) LRCH3 (ENSSFOG00015018030) ENSSFOG00015018008 rpl35a (ENSSFOG00015017998) abcc5 (ENSSFOG00015017938) rnpepl1 (ENSSFOG00015017828) DVL3 (ENSSFOG00015017762) ##22 ap2m1a (ENSSFOG00015017743) mmp23bb (ENSSFOG00015017722) PCYT1A (ENSSFOG00015017682) eif2a (ENSSFOG00015017634) selenot1a (ENSSFOG00015017602) tsen34 (ENSSFOG00015017579) ENSSFOG00015009785 MINDY4B (ENSSFOG00015017562) clrn1 (ENSSFOG00015017554) GPR171 (ENSSFOG00015017546) P2RY14 (ENSSFOG00015017540) ENSSFOG00015017442 rnf168 (ENSSFOG00015017412) ANO7 (ENSSFOG00015017392) ece2b (ENSSFOG00015017271) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 1129 ENSGT00950000182903.a.a.d ##22 ENSGT00940000165747 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 381 ENSGT00950000182903.a.a.d ##22 ENSGT00940000159223.d ENSGT00940000157384.a ENSGT00940000161729.m.a ENSGT00390000011725.d ENSGT00940000153655.A.b ENSGT00390000011127.d ENSGT00390000016906.a ENSGT01030000234567.B.a.b.a.b.b ENSGT00940000165275.A ENSGT00940000157030.c.a ENSGT00940000155435.A.b Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000158081.o.b ENSGT00940000153593.e.b ENSGT01030000234515.a.b.b.b ENSGT00940000154412.C.c.a ENSGT00390000000051.b ENSGT00940000163126.a.a ENSGT00940000158995.b ENSGT00940000154369.g.a ENSGT01030000234629.C.a ENSGT00940000162556.D.b.a ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b ENSGT00950000183179.b.b ENSGT00940000159675 ENSGT00940000160165.b ENSGT00900000141083.c.a ENSGT00950000182903.a.a.d ##22 ENSGT00940000159223.d ENSGT00940000157384.a ENSGT00940000161729.m.a ENSGT00940000180772 ENSGT00390000011725.d ENSGT00940000153655.A.b ENSGT00390000011127.d ENSGT00390000016906.a ENSGT01030000234567.B.a.b.a.b.b ENSGT00940000174564 ENSGT00940000165275.A ENSGT00940000157030.c.a ENSGT00940000155435.A.b ENSGT00940000177269 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153593.e.b ENSGT01030000234515.a.b.b.b ENSGT00940000154412.C.c.a ENSGT00390000000051.b ENSGT00940000163126.a.a ENSGT00940000163126.b.b ENSGT00940000158995.b ENSGT00940000154369.g.a ENSGT01030000234629.C.a ENSGT00940000162556.D.b.a 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ENSGT00940000155442.o ENSGT00940000155963.e ENSGT00940000157735 ENSGT00940000155353.a.a.b ENSGT00940000164127.b ENSGT00940000156075.a.b ENSGT00940000163262.b ENSGT00940000154076.B.b ENSGT00940000165265 ENSGT00940000175314 ENSGT00990000203766 ENSGT00940000171842 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158081.o.b ENSGT00940000153593.e.b ENSGT01030000234515.a.b.b.b ENSGT00940000154412.C.c.a ENSGT00390000000051.b ENSGT00940000163126.a.a ENSGT00940000158995.b ENSGT00940000154369.g.a ENSGT01030000234629.C.a ENSGT00940000162556.D.b.a ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b ENSGT00950000183179.b.b ENSGT00940000159675 ENSGT00940000160165.b ENSGT00900000141083.c.a ENSGT00950000182903.a.a.d ##22 ENSGT00940000159223.d ENSGT00940000157384.a ENSGT00390000005067.b ENSGT00940000155442.o ENSGT00940000155963.e ENSGT00940000157735 ENSGT00940000155353.a.a.b ENSGT00940000164127.b ENSGT00940000156075.a.b ENSGT00940000163262.b ENSGT00940000154076.B.b ENSGT00940000165265 ENSGT00940000175314 ENSGT00990000203766 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slc25a12 (ENSACIG00000019271) metap1d (ENSACIG00000019257) itga6b (ENSACIG00000019171) ENSACIG00000019156 rapgef4b (ENSACIG00000019105) ENSACIG00000019085 ENSACIG00000018936 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154149.b.a.h ENSGT00390000003574.b ENSGT00940000156236.a.b ENSGT01030000234515.a.b.b.b ENSGT00940000154412.C.c.a ENSGT00390000000051.b ENSGT00940000163126.a.a ENSGT00940000158995.b ENSGT00940000154369.g.a ENSGT01030000234629.C.a ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b ENSGT00950000183179.b.b ENSGT00940000159675 ENSGT00940000160165.b ENSGT00900000141083.c.a ENSGT00950000182903.a.a.d ##22 ENSGT00940000159223.d ENSGT00940000157384.a ENSGT00390000005067.b ENSGT00940000155442.o ENSGT00940000155963.e ENSGT00940000157735 ENSGT00940000155353.a.a.b ENSGT00940000164127.b ENSGT00940000156075.a.b ENSGT00940000163262.b ENSGT00990000211053 ENSGT00940000161352.f.b ENSGT00940000154076.B.b ENSGT00940000165265 ENSGT01030000235341 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154149.b.a.h ENSGT00390000003574.b ENSGT00940000156236.a.b ENSGT01030000234515.a.b.b.b ENSGT00940000154412.C.c.a ENSGT00390000000051.b ENSGT00940000163126.a.a ENSGT00940000158995.b ENSGT00940000154369.g.a ENSGT01030000234629.C.a ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b ENSGT00950000183179.b.b ENSGT00940000159675 ENSGT00940000160165.b ENSGT00900000141083.c.a ENSGT00950000182903.a.a.d ##22 ENSGT00940000159223.d ENSGT00940000157384.a ENSGT00390000005067.b ENSGT00940000155442.o ENSGT00940000155963.e ENSGT00940000157735 ENSGT00940000155353.a.a.b ENSGT00940000164127.b ENSGT00940000156075.a.b ENSGT00940000163262.b ENSGT00940000154076.B.b ENSGT00940000165265 ENSGT01030000235341 ENSGT00990000203766 ENSGT00940000171842 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000154149.b.a.h ENSGT00390000003574.b ENSGT00940000156236.a.b ENSGT01030000234515.a.b.b.b ENSGT00940000154412.C.c.a ENSGT00390000000051.b ENSGT00940000163126.a.a ENSGT00940000158995.b ENSGT00940000154369.g.a ENSGT01030000234629.C.a 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metap1d (ENSKMAG00000008227) itga6b (ENSKMAG00000008162) ENSKMAG00000008097 rapgef4b (ENSKMAG00000008019) ENSKMAG00000007980 ENSKMAG00000007931 ENSKMAG00000007901 ENSKMAG00000007866 epha4b (ENSKMAG00000007783) ENSKMAG00000007758 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157757.g.b ENSGT00940000154149.b.a.h ENSGT00390000003574.b ENSGT00940000156236.a.b ENSGT01030000234515.a.b.b.b ENSGT00940000154412.C.c.a ENSGT00390000000051.b ENSGT00940000163126.a.a ENSGT00940000158995.b ENSGT00940000154369.g.a ENSGT01030000234629.C.a ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b ENSGT00950000183179.b.b ENSGT00940000159675 ENSGT00900000141083.c.a ENSGT00950000182903.a.a.d ##22 ENSGT00940000159223.d ENSGT00940000157384.a ENSGT00390000005067.b ENSGT00940000155442.o ENSGT00940000155963.e ENSGT00940000157735 ENSGT00940000155353.a.a.b.g ENSGT00940000155353.a.a.b.h ENSGT00940000164127.b ENSGT00940000156075.a.b ENSGT00940000163262.b ENSGT00940000154076.B.b ENSGT00940000165265 ENSGT01030000235341 ENSGT00990000203766.b Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000157757.g.b ENSGT00940000154149.b.a.h ENSGT00390000003574.b ENSGT00940000156236.a.b ENSGT01030000234515.a.b.b.b ENSGT00940000154412.C.c.a ENSGT00390000000051.b ENSGT00940000163126.a.a ENSGT00940000158995.b ENSGT00940000154369.g.a ENSGT01030000234629.C.a ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b ENSGT00950000183179.b.b ENSGT00940000159675 ENSGT00900000141083.c.a ENSGT00950000182903.a.a.d ##22 ENSGT00940000159223.d ENSGT00940000157384.a ENSGT00390000005067.b ENSGT00940000155442.o ENSGT00940000155963.e ENSGT00940000157735 ENSGT00940000155353.a.a.b.g ENSGT00940000155353.a.a.b.h ENSGT00940000164127.b ENSGT00940000156075.a.b ENSGT00940000163262.b ENSGT00940000154076.B.b ENSGT00940000165265 ENSGT01030000235341.c ENSGT00990000203766.b Poecilia ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000157757.g.b ENSGT00940000154149.b.a.h ENSGT00390000003574.b ENSGT00940000156236.a.b ENSGT01030000234515.a.b.b.b ENSGT00940000154412.C.c.a ENSGT00390000000051.b ENSGT00940000163126.a.a 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ENSGT00900000141083.c.a ENSGT00950000182903.a.a.d ##22 ENSGT00940000159223.d ENSGT00940000157384.a ENSGT00390000005067.b ENSGT00940000155442.o ENSGT00940000155963.e ENSGT00940000157735 ENSGT00940000155353.a.a.b ENSGT00940000164127.b ENSGT00940000156075.a.b ENSGT00940000163262.b ENSGT00940000165265 ENSGT01030000235341.e ENSGT00990000203766 ENSGT00940000171842 ENSGT01100000263557.A.a Javanese ricefish MODERN SPECIES 8 OLFML2B (ENSOJAG00000014470) ENSOJAG00000014489 kifap3b (ENSOJAG00000014522) PDC (ENSOJAG00000014844) ENSOJAG00000014871 TIMM44 (ENSOJAG00000014954) rab11bb (ENSOJAG00000015481) MARCHF2 (ENSOJAG00000015558) slc25a36a (ENSOJAG00000015573) spsb4a (ENSOJAG00000015580) clstn2a (ENSOJAG00000015617) NMNAT3 (ENSOJAG00000016137) rbp1.1 (ENSOJAG00000016154) rbp2b (ENSOJAG00000016169) copb2 (ENSOJAG00000016214) dvl3a (ENSOJAG00000017146) ##22 ap2m1a (ENSOJAG00000017316) pcyt1aa (ENSOJAG00000017391) and3 (ENSOJAG00000017410) DYNC1I2 (ENSOJAG00000017447) slc25a12 (ENSOJAG00000018766) 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ENSOMEG00000019163 ENSOMEG00000000502 ENSOMEG00000019197 ENSOMEG00000019217 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154149.b.a.h ENSGT00390000003574.b ENSGT00940000156236.a.b ENSGT01030000234515.a.b.b.b ENSGT00940000154412.C.c.a ENSGT00390000000051.b ENSGT00940000163126.a.a ENSGT00940000158995.b ENSGT00940000154369.g.a ENSGT01030000234629.C.a ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b ENSGT00950000183179.b.b ENSGT00940000159675 ENSGT00940000160165.b ENSGT00900000141083.c.a ENSGT00950000182903.a.a.d ##22 ENSGT00940000159223.d ENSGT00940000157384.a ENSGT00390000005067.b ENSGT00940000155442.o ENSGT00940000155963.e ENSGT00940000157735 ENSGT00940000155353.a.a.b ENSGT00940000164127.b ENSGT00940000156075.a.b ENSGT00940000161352.f.b ENSGT00940000154076.B.b ENSGT00940000165265 ENSGT01030000235341.e ENSGT00990000203766 ENSGT00940000171842 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 8 ENSORLG00000024886 kifap3b (ENSORLG00000013884) pdca (ENSORLG00000013896) ENSORLG00000013903 ENSORLG00000026451 TIMM44 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ENSGT00940000155442.o ENSGT00940000155963.e ENSGT00940000157735 ENSGT00940000155353.a.a.b ENSGT00940000164127.b ENSGT00940000156075.a.b ENSGT00940000163262.b ENSGT00990000211053 ENSGT00940000161352.f.b ENSGT00940000154076.B.b ENSGT00940000165265 ENSGT00940000175314 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000153593.e.b ENSGT01030000234515.a.b.b.b ENSGT00940000154412.C.c.a ENSGT00390000000051.b ENSGT00940000163126.a.a ENSGT00940000158995.b ENSGT00940000154369.g.a ENSGT00990000206484 ENSGT01030000234629.C.a ENSGT00940000162556.D.b.a ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b ENSGT00950000183179.b.b ENSGT00940000159675 ENSGT00940000160165.b ENSGT00900000141083.c.a ENSGT00950000182903.a.a.d ##22 ENSGT00940000159223.d ENSGT00940000157384.a ENSGT00390000005067.b ENSGT00940000155442.o ENSGT00940000155963.e ENSGT00940000157735 ENSGT00940000155353.a.a.b ENSGT00940000164127.b ENSGT00940000156075.a.b ENSGT00940000163262.b ENSGT00990000211053 ENSGT00940000154076.B.b ENSGT00940000165265 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ENSGT00940000154369.g.a ENSGT01030000234629.C.a ENSGT00940000162556.D.b.a ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b ENSGT00950000183179.b.b ENSGT00940000159675 ENSGT00940000160165.b ENSGT00900000141083.c.a ENSGT00950000182903.a.a.d ##22 ENSGT00940000159223.d ENSGT00940000157384.a ENSGT00390000005067.b ENSGT00940000155442.o ENSGT00940000155963.e ENSGT00940000157735 ENSGT00940000155353.a.a.b ENSGT00940000164127.b ENSGT00940000156075.a.b ENSGT00940000163262.b ENSGT00940000154076.B.b ENSGT00940000165265 ENSGT00940000175314 ENSGT00990000203766 ENSGT00940000171842 Climbing perch MODERN SPECIES 8 upf1 (ENSATEG00000017867) ENSATEG00000017747 ENSATEG00000017729 ENSATEG00000017721 TIMM44 (ENSATEG00000029811) rab11bb (ENSATEG00000017696) ENSATEG00000017679 ENSATEG00000017649 spsb4a (ENSATEG00000017626) zgc:136870 (ENSATEG00000025289) clstn2a (ENSATEG00000017562) NMNAT3 (ENSATEG00000017549) rbp1.1 (ENSATEG00000017531) rbp2b (ENSATEG00000017508) copb2 (ENSATEG00000017430) ENSATEG00000017381 ##22 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ENSSMAG00000003972 ENSSMAG00000029868 ENSSMAG00000003935 ENSSMAG00000003909 Tongue sole MODERN SPECIES 12 pif1 (ENSCSEG00000012036) ENSCSEG00000012053 nsun4 (ENSCSEG00000012057) dmbx1a (ENSCSEG00000012068) ENSCSEG00000012095 CTXN1 (ENSCSEG00000012121) TIMM44 (ENSCSEG00000012127) rab11bb (ENSCSEG00000012149) MARCHF2 (ENSCSEG00000012156) slc25a36a (ENSCSEG00000012199) spsb4a (ENSCSEG00000012242) clstn2a (ENSCSEG00000012265) NMNAT3 (ENSCSEG00000012360) rbp1.1 (ENSCSEG00000012366) copb2 (ENSCSEG00000012387) dvl3a (ENSCSEG00000012425) ##22 ap2m1a (ENSCSEG00000012443) pcyt1a (ENSCSEG00000013124) and3 (ENSCSEG00000013163) DYNC1I2 (ENSCSEG00000013179) slc25a12 (ENSCSEG00000013220) metap1d (ENSCSEG00000013260) itga6b (ENSCSEG00000013305) ENSCSEG00000013346 ENSCSEG00000013353 rapgef4b (ENSCSEG00000013369) ENSCSEG00000013454 ENSCSEG00000013469 ENSCSEG00000013476 ENSCSEG00000013486 ENSCSEG00000013492 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000153593.e.b ENSGT01030000234515.a.b.b.b 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(ENSTNIG00000006035) ENSTNIG00000015345 PIP5K1C (ENSTNIG00000015344) GPX4 (ENSTNIG00000015343) C2CD4C (ENSTNIG00000015342) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158081.o.b ENSGT00940000153593.e.b ENSGT01030000234515.a.b.b.b ENSGT00940000154412.C.c.a ENSGT00390000000051.b ENSGT00940000163126.a.a ENSGT00940000158995.b ENSGT00940000154369.g.a ENSGT01030000234629.C.a ENSGT00940000162556.D.b.a ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b ENSGT00950000183179.b.b ENSGT00940000159675 ENSGT00940000160165.b ENSGT00900000141083.c.a ENSGT00950000182903.a.a.d ##22 ENSGT00940000159223.d ENSGT00940000157384.a ENSGT00390000005067.b ENSGT00940000155442.o ENSGT00940000155963.e ENSGT00940000157735 ENSGT00940000155353.a.a.b ENSGT00940000164127.b ENSGT00940000156075.a.b ENSGT00940000163262.b ENSGT00940000154076.B.b ENSGT00940000165265 ENSGT00940000175314 ENSGT00990000203766 ENSGT00940000171842 Ballan wrasse MODERN SPECIES 218 upf1 (ENSLBEG00000014862) HOMER3 (ENSLBEG00000014982) ENSLBEG00000015169 CTXN1 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ENSGT00940000154076.B.b ENSGT00940000165265 ENSGT00940000175314 ENSGT00990000203766 ENSGT00940000171842 Stickleback MODERN SPECIES 2 RAB3A (ENSGACG00000015513) jund (ENSGACG00000015511) pgpep1 (ENSGACG00000015509) upf1 (ENSGACG00000015504) ENSGACG00000015501 CERS4 (ENSGACG00000015496) ENSGACG00000015495 TIMM44 (ENSGACG00000015487) rab11bb (ENSGACG00000015479) MARCHF2 (ENSGACG00000015477) slc25a36a (ENSGACG00000015473) spsb4a (ENSGACG00000015471) clstn2a (ENSGACG00000015468) NMNAT3 (ENSGACG00000015460) copb2 (ENSGACG00000015455) dvl3a (ENSGACG00000015451) ##22 ap2m1a (ENSGACG00000015444) pcyt1aa (ENSGACG00000015442) and3 (ENSGACG00000015438) DYNC1I2 (ENSGACG00000015431) slc25a12 (ENSGACG00000015426) metap1d (ENSGACG00000015425) itga6b (ENSGACG00000015418) ENSGACG00000015416 ENSGACG00000015414 rapgef4b (ENSGACG00000015410) ENSGACG00000015407 ENSGACG00000015397 epha4b (ENSGACG00000015386) ENSGACG00000015381 PIP5K1C (ENSGACG00000015377) Lumpfish MODERN SPECIES 8 ENSCLMG00005009267 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SPECIES 8 uba52 (ENSMMDG00005016682) ENSMMDG00005016688 CTXN1 (ENSMMDG00005016693) TIMM44 (ENSMMDG00005016705) rab11bb (ENSMMDG00005016770) MARCHF2 (ENSMMDG00005016775) slc25a36a (ENSMMDG00005016779) spsb4a (ENSMMDG00005016781) zgc:136870 (ENSMMDG00005016783) clstn2a (ENSMMDG00005016797) ENSMMDG00005016891 NMNAT3 (ENSMMDG00005016893) rbp1.1 (ENSMMDG00005016895) rbp2b (ENSMMDG00005016897) copb2 (ENSMMDG00005016919) dvl3a (ENSMMDG00005018119) ##22 ap2m1a (ENSMMDG00005018230) pcyt1aa (ENSMMDG00005018238) and3 (ENSMMDG00005018246) DYNC1I2 (ENSMMDG00005018308) slc25a12 (ENSMMDG00005021392) metap1d (ENSMMDG00005021571) itga6b (ENSMMDG00005021580) ENSMMDG00005021594 rapgef4b (ENSMMDG00005021599) rapgef4b (ENSMMDG00005021605) ENSMMDG00005021609 ENSMMDG00005021626 epha4b (ENSMMDG00005021684) ENSMMDG00005021686 ENSMMDG00005021688 Cod MODERN SPECIES 21 ENSGMOG00000024170 ENSGMOG00000018197 ENSGMOG00000010623 ENSGMOG00000027799 ENSGMOG00000028248 ENSGMOG00000031425 ENSGMOG00000009211 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ENSGT00940000159889.b.b.a.a.b ENSGT00390000013003.e.b ENSGT00940000157143.c.b.f Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000015368.a.a.c.g ENSGT00940000157413.h.a ENSGT00940000158081.o.b.d ENSGT00940000153593.e.b.g.a ENSGT00940000154412.C.c.a ENSGT00390000000051.b.a ENSGT00940000163126.a.a.d ENSGT00940000158995.b.b ENSGT00940000154369.g.a.h ENSGT01030000234629.C.a.b ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b.d ENSGT00950000183179.b.b ENSGT00940000159675.a.a ENSGT00900000141083.c.a.a ENSGT00940000163467.a.b.b.a.b.e.b ENSGT00950000182903.a.a.d.e ##22 ENSGT00940000159223.d.a ENSGT00940000157384.a.d ENSGT00940000161729.m.a.b.a.a ENSGT00390000011725.d.z ENSGT00940000153655.A.b ENSGT00990000209702 ENSGT00390000011127.d.d ENSGT00390000016906.a ENSGT01030000234567.B.a.b.a.b.b ENSGT00940000174564.e ENSGT00940000165275.A ENSGT00940000157030.c.a.f ENSGT00940000159889.b.b.a.a.b ENSGT00390000013003.e.b ENSGT00940000157143.c.b.f Rainbow trout MODERN SPECIES 20 uba52 (ENSOMYG00000046709) ENSOMYG00000059679 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ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b.d ENSGT00950000183179.b.b ENSGT00940000159675.a.a ENSGT00900000141083.c.a.a ENSGT00940000163467.a.b.b.a.b.e.b ENSGT00950000182903.a.a.d.e ##22 ENSGT00940000159223.d.a ENSGT00940000157384.a.d ENSGT00940000161729.m.a.b.a.a ENSGT00390000011725.d.z ENSGT00940000153655.A.b ENSGT00990000209702 ENSGT00390000011127.d.d ENSGT00390000016906.a ENSGT01030000234567.B.a.b.a.b.b ENSGT00940000174564.e ENSGT00940000165275.A ENSGT00940000157030.c.a.f ENSGT00940000159889.b.b.a.a.b ENSGT00390000013003.e.b ENSGT00940000157143.c.b.f Chinook salmon MODERN SPECIES 2888 uba52 (ENSOTSG00005027254) ENSOTSG00005027252 CTXN1 (ENSOTSG00005027251) TIMM44 (ENSOTSG00005026371) rab11bb (ENSOTSG00005026342) MARCHF2 (ENSOTSG00005026341) SLC25A36 (ENSOTSG00005026340) slc25a36a (ENSOTSG00005026339) spsb4a (ENSOTSG00005026338) ENSOTSG00005026337 clstn2a (ENSOTSG00005026336) NMNAT3 (ENSOTSG00005026335) rbp1.1 (ENSOTSG00005026334) copb2 (ENSOTSG00005023103) ENSOTSG00005023098 dvl3a (ENSOTSG00005023093) ##22 ap2m1a (ENSOTSG00005023092) pcyt1aa (ENSOTSG00005023090) SERP1 (ENSOTSG00005023089) selenot1a (ENSOTSG00005023087) ENSOTSG00005023086 ENSOTSG00005023083 zgc:153615 (ENSOTSG00005023081) ENSOTSG00005023080 zp3b (ENSOTSG00005023079) ENSOTSG00005023078 arl14 (ENSOTSG00005023077) ppm1la (ENSOTSG00005023076) samhd1 (ENSOTSG00005022987) ENSOTSG00005022979 ENSOTSG00005022928 Coho salmon MODERN SPECIES 19 upf1 (ENSOKIG00005050636) HOMER3 (ENSOKIG00005050624) uba52 (ENSOKIG00005050621) ENSOKIG00005050619 CTXN1 (ENSOKIG00005050616) rab11bb (ENSOKIG00005050607) MARCHF2 (ENSOKIG00005050598) slc25a36a (ENSOKIG00005050589) TIMM44 (ENSOKIG00005050575) spsb4a (ENSOKIG00005050568) clstn2a (ENSOKIG00005050560) NMNAT3 (ENSOKIG00005050549) rbp1.1 (ENSOKIG00005050546) copb2 (ENSOKIG00005050504) ENSOKIG00005050484 dvl3a (ENSOKIG00005050468) ##22 ap2m1a (ENSOKIG00005050452) pcyt1aa (ENSOKIG00005050446) SERP1 (ENSOKIG00005050444) selenot1a (ENSOKIG00005050438) ENSOKIG00005050433 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ENSGT00940000159889.b.b.a.a.b ENSGT00390000013003.e.b ENSGT00940000157143.c.b.f River trout MODERN SPECIES 24 HOMER3 (ENSSTUG00000046586) uba52 (ENSSTUG00000046572) CTXN1 (ENSSTUG00000046563) TIMM44 (ENSSTUG00000046222) rab11bb (ENSSTUG00000046172) MARCHF2 (ENSSTUG00000046167) slc25a36a (ENSSTUG00000046079) spsb4a (ENSSTUG00000046068) ENSSTUG00000046064 clstn2a (ENSSTUG00000045666) NMNAT3 (ENSSTUG00000045643) rbp1.1 (ENSSTUG00000045630) rbp1.1 (ENSSTUG00000045623) copb2 (ENSSTUG00000045123) ENSSTUG00000045094 dvl3a (ENSSTUG00000044755) ##22 ap2m1a (ENSSTUG00000044679) pcyt1aa (ENSSTUG00000044654) SERP1 (ENSSTUG00000044645) selenot1a (ENSSTUG00000044625) ENSSTUG00000044619 ENSSTUG00000044605 ENSSTUG00000044601 zgc:153615 (ENSSTUG00000044589) ENSSTUG00000044576 zp3b (ENSSTUG00000044569) ENSSTUG00000044564 arl14 (ENSSTUG00000044551) ppm1la (ENSSTUG00000044539) ENSSTUG00000044526 ENSSTUG00000044513 Atlantic salmon MODERN SPECIES 22 upf1 (ENSSSAG00000077507) ENSSSAG00000077729 uba52 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(ENSHHUG00000025327) ENSHHUG00000025329 ENSHHUG00000025339 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 83 ENSGT00390000015368.a.a.c.h ENSGT00940000157413.h.b ENSGT00940000158081.o.b.c ENSGT00940000153593.e.b.g.a ENSGT01030000234515.a.b.b.b ENSGT00390000000051.b.b ENSGT00940000163126.a.a.c ENSGT00940000158995.b.a ENSGT00940000154369.g.a.g ENSGT01030000234629.C.a.a ENSGT00940000162556.D.b.a ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b.c ENSGT00940000159675.b ENSGT00940000160165.b ENSGT00900000141083.c.a.b ENSGT00950000182903.a.a.d.f ##22 ENSGT00940000159223.d.b ENSGT00940000157384.a.c ENSGT00940000161729.m.a.a ENSGT00940000180772 ENSGT00390000011725.d.y ENSGT00390000011127.d.c ENSGT00990000213680 ENSGT00940000174564.f ENSGT00940000157030.c.a.e ENSGT00940000155435.A.b ENSGT00940000177269 ENSGT00940000159889.b.b.a.a.a ENSGT00940000157143.c.b.e ENSGT00940000157414 ENSGT00940000157353 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000015368.a.a.c.h ENSGT00940000157413.h.b ENSGT00940000158081.o.b.c 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ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b.c ENSGT00990000213390 ENSGT00940000159675.b ENSGT00940000160165.b ENSGT00900000141083.c.a.b ENSGT00950000182903.a.a.d.f ##22 ENSGT00940000159223.d.b ENSGT00940000157384.a.c ENSGT00940000161729.m.a.a ENSGT00940000180772 ENSGT00390000011725.d.y ENSGT00390000011127.d.c ENSGT00990000213680 ENSGT00940000157030.c.a.e ENSGT00940000155435.A.b ENSGT00940000159889.b.b.a.a.a ENSGT00940000157143.c.b.e ENSGT00940000157414 ENSGT00940000157353 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b.c ENSGT00950000183138.a.a.b.v.b.d River trout MODERN SPECIES 13 HOMER3 (ENSSTUG00000045507) uba52 (ENSSTUG00000045528) ENSSTUG00000045550 TIMM44 (ENSSTUG00000045610) rab11bb (ENSSTUG00000046273) MARCHF2 (ENSSTUG00000046310) slc25a36a (ENSSTUG00000046315) spsb4a (ENSSTUG00000046366) ENSSTUG00000046370 zgc:136870 (ENSSTUG00000046379) ENSSTUG00000046381 clstn2a (ENSSTUG00000046411) ENSSTUG00000047323 rbp1.1 (ENSSTUG00000047325) copb2 (ENSSTUG00000047339) DVL3 (ENSSTUG00000025749) ##22 AP2M1 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ENSSSAG00000040265 e2f5 (ENSSSAG00000040523) ENSSSAG00000103244 ENSSSAG00000114496 ENSSSAG00000040548 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000015368.a.a.c.h ENSGT00940000157413.h.b ENSGT00940000158081.o.b.c ENSGT00940000153593.f ENSGT01030000234515.a.b.b.b ENSGT00390000000051.b.b ENSGT00940000163126.a.a.c ENSGT00940000158995.b.a ENSGT00940000154369.g.a.g ENSGT01030000234629.C.a.a ENSGT00940000162556.D.b.a ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b.c ENSGT00940000159675.b ENSGT00940000160165.b ENSGT00900000141083.c.a.b ENSGT00950000182903.a.a.d.f ##22 ENSGT00940000159223.d.b ENSGT00940000157384.a.c ENSGT00940000161729.m.a.a ENSGT00940000180772 ENSGT00390000011725.d.y ENSGT00390000011127.d.c ENSGT00940000174564.f ENSGT00940000157030.c.a.e ENSGT00940000155435.A.b ENSGT00940000177269 ENSGT00940000159889.b.b.a.a.a ENSGT00940000157143.c.b.e ENSGT00940000157414 ENSGT00940000157353 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.b.c Rainbow trout MODERN SPECIES 29 jund (ENSOMYG00000001855) pgpep1 (ENSOMYG00000001889) 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(ENSOTSG00005035232) otol1a (ENSOTSG00005035233) ENSOTSG00005035234 RC3H1 (ENSOTSG00005035236) ENSOTSG00005035237 e2f5 (ENSOTSG00005035238) ACKR4 (ENSOTSG00005035239) ENSOTSG00005035241 ENSOTSG00005035242 Huchen MODERN SPECIES 791 ENSHHUG00000035966 rbp1.1 (ENSHHUG00000035953) rbp2b (ENSHHUG00000035941) copb2 (ENSHHUG00000035698) dvl3a (ENSHHUG00000035656) ##22 AP2M1 (ENSHHUG00000035608) pcyt1aa (ENSHHUG00000035564) SERP1 (ENSHHUG00000035561) selenot1a (ENSHHUG00000035549) zgc:153615 (ENSHHUG00000035531) ENSHHUG00000035514 ppm1la (ENSHHUG00000035505) otol1a (ENSHHUG00000035494) ENSHHUG00000035490 RC3H1 (ENSHHUG00000035464) ENSHHUG00000035460 ENSHHUG00000035425 e2f5 (ENSHHUG00000035411) ACKR4 (ENSHHUG00000035406) ENSHHUG00000035403 Northern pike MODERN SPECIES 2 upf1 (ENSELUG00000020917) HOMER3 (ENSELUG00000020980) uba52 (ENSELUG00000027664) CERS4 (ENSELUG00000020996) CTXN1 (ENSELUG00000000927) TIMM44 (ENSELUG00000021107) rab11bb (ENSELUG00000021148) MARCHF2 (ENSELUG00000000931) slc25a36a (ENSELUG00000021181) spsb4a (ENSELUG00000021197) clstn2a (ENSELUG00000021303) NMNAT3 (ENSELUG00000021366) rbp1.1 (ENSELUG00000021393) rbp2b (ENSELUG00000021410) copb2 (ENSELUG00000021442) dvl3a (ENSELUG00000021493) ##22 ap2m1a (ENSELUG00000021515) pcyt1aa (ENSELUG00000021543) zgc:92744 (ENSELUG00000021578) selenot1a (ENSELUG00000021595) ENSELUG00000021606 zgc:153615 (ENSELUG00000021618) ENSELUG00000021639 zp3b (ENSELUG00000021647) ENSELUG00000021657 ppm1la (ENSELUG00000021679) ENSELUG00000021689 otol1a (ENSELUG00000021696) ENSELUG00000021713 ENSELUG00000021721 RC3H1 (ENSELUG00000021770) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 499 ENSGT00950000182903.a.a.d ##22 ENSGT00940000159223.d ENSGT00940000157384.a ENSGT00940000161729.m.a ENSGT00390000011725.d.`b ENSGT00940000153655.A.b ENSGT00390000011127.d ENSGT00390000016906.a Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT00940000155807.b ENSGT00940000155511.n.b ENSGT00390000001015.c ENSGT00990000204283 ENSGT00940000160511.a ENSGT01030000234579.A.b.b ENSGT00670000098080 ENSGT01000000214434.A.m ENSGT00940000162473 ENSGT00390000018687 ENSGT00940000156055 ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.a ENSGT00940000155439.a.a ENSGT00390000006294.d ENSGT00950000182903.a.a.d ##22 ENSGT00940000159223.d ENSGT00940000157384.a ENSGT00940000161729.m.b.g ENSGT00390000011725.d.`b ENSGT00390000011127.d ENSGT01030000234567.B.a.b.a.b.b Denticle herring MODERN SPECIES 14 zgc:110269 (ENSDCDG00000019891) agfg1b (ENSDCDG00000019886) fbxo36b (ENSDCDG00000019885) ENSDCDG00000019883 grk7a (ENSDCDG00000019881) atp1b3a (ENSDCDG00000019879) xrn1 (ENSDCDG00000019821) gk5 (ENSDCDG00000019810) ppp1r7 (ENSDCDG00000019802) ubxn7 (ENSDCDG00000019799) tfa (ENSDCDG00000019511) eif4g1a (ENSDCDG00000016816) fam131aa (ENSDCDG00000016769) CLCN2 (ENSDCDG00000016547) thpo (ENSDCDG00000016507) dvl3a (ENSDCDG00000016480) ##22 ap2m1a (ENSDCDG00000016469) pcyt1aa (ENSDCDG00000016456) SERP1 (ENSDCDG00000016448) selenot1a (ENSDCDG00000016445) zgc:153615 (ENSDCDG00000016441) ENSDCDG00000016415 ENSDCDG00000016414 ppm1la (ENSDCDG00000016413) ENSDCDG00000016411 ENSDCDG00000016409 RC3H1 (ENSDCDG00000016400) zgc:110366 (ENSDCDG00000016390) extl2 (ENSDCDG00000016386) ENSDCDG00000016365 DBT (ENSDCDG00000016356) Atlantic herring MODERN SPECIES 14 ENSCHAG00000016141 ENSCHAG00000016083 ENSCHAG00000016050 grk7a (ENSCHAG00000016043) atp1b3a (ENSCHAG00000016031) xrn1 (ENSCHAG00000012135) gk5 (ENSCHAG00000011477) ppp1r7 (ENSCHAG00000011431) ubxn7 (ENSCHAG00000011239) tfa (ENSCHAG00000010406) eif4g1a (ENSCHAG00000005617) fam131aa (ENSCHAG00000005480) CLCN2 (ENSCHAG00000002174) ENSCHAG00000002088 ENSCHAG00000001308 dvl3a (ENSCHAG00000000950) ##22 ap2m1a (ENSCHAG00000000899) pcyt1aa (ENSCHAG00000000780) SERP1 (ENSCHAG00000000757) selenot1a (ENSCHAG00000000724) DDR2 (ENSCHAG00000000563) ENSCHAG00000017284 rgs5b (ENSCHAG00000017250) ENSCHAG00000017225 ENSCHAG00000017213 NMUR1 (ENSCHAG00000016995) cpdp (ENSCHAG00000016978) ENSCHAG00000016918 med31 (ENSCHAG00000016908) ENSCHAG00000016891 RPS6KB2 (ENSCHAG00000016541) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT00940000154396.b.b.b ENSGT00940000156311.b.b ENSGT00940000163540 ENSGT00390000018059.b.b ENSGT00950000182827.C.a ENSGT00550000075090 ENSGT00940000156349.d ENSGT00940000164993.g ENSGT00390000014781 ENSGT00940000156350.g ENSGT00940000154811.B.a.b ENSGT00960000186677 ENSGT00940000166991 ENSGT00940000159223.d ENSGT00940000157384.a ENSGT00950000182903.a.a.d ##22 ENSGT00940000155918.c.b ENSGT00940000164792.b ENSGT00940000155406.h ENSGT00940000156280.a.a ENSGT00940000166821.a ENSGT00940000155281 ENSGT00940000158227 ENSGT00950000183019.f.a.c.b ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.a.b.b ENSGT00940000156961 ENSGT00940000154973.a.a ENSGT00940000154973.b ENSGT01100000263484.A.c.a.a.a ENSGT00390000010302 ENSGT00390000012807 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000154396.b.b.b ENSGT00940000156311.b.b ENSGT00940000163540 ENSGT00390000018059.b.b ENSGT00950000182827.C.a ENSGT00550000075090 ENSGT00940000156349.d ENSGT00940000164993.g ENSGT00390000014781 ENSGT00940000156350.g ENSGT00940000154811.B.a.b ENSGT00960000186677 ENSGT00940000166991 ENSGT00940000159223.d ENSGT00940000157384.a ENSGT00950000182903.a.a.d ##22 ENSGT00940000155918.c.b ENSGT00940000164792.b ENSGT00940000155406.h ENSGT00940000156280.a.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.a.b.a ENSGT00940000156961 ENSGT00940000154973.a.a ENSGT00940000154973.b ENSGT01100000263484.A.c.a.a.a ENSGT00390000010302 ENSGT00390000012807 ENSGT00940000160465.k.b ENSGT00940000153664.B.r ENSGT00940000154942.f ENSGT00400000022158.b Channel catfish MODERN SPECIES 26 tctex1d1 (ENSIPUG00000013268) ENSIPUG00000013257 bcl6ab (ENSIPUG00000013251) cmpk1 (ENSIPUG00000013193) FAM78B (ENSIPUG00000013178) slc35a3b (ENSIPUG00000013163) imp3 (ENSIPUG00000013142) c7h1orf21 (ENSIPUG00000013127) tsen15 (ENSIPUG00000013118) ENSIPUG00000013030 abi1b (ENSIPUG00000012914) ANXA13 (ENSIPUG00000012843) ENSIPUG00000012798 ENSIPUG00000012785 pcyt1aa (ENSIPUG00000012756) dvl3a (ENSIPUG00000012687) ##22 ENSIPUG00000012644 prtfdc1b (ENSIPUG00000012550) ENSIPUG00000012475 dpp6b (ENSIPUG00000012403) ENSIPUG00000012378 ENSIPUG00000012359 VPS4B (ENSIPUG00000012291) kdsr (ENSIPUG00000012232) BCL2 (ENSIPUG00000012216) PRKAG2 (ENSIPUG00000012142) NMUR1 (ENSIPUG00000012126) cpdp (ENSIPUG00000012115) ENSIPUG00000012096 tsc22d2 (ENSIPUG00000012081) pfn2a (ENSIPUG00000012039) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000154396.b.b.b ENSGT00940000156311.b.b ENSGT00940000163540 ENSGT00390000018059.b.b ENSGT00950000182827.C.a ENSGT00550000075090 ENSGT00940000156349.d ENSGT00940000164993.g ENSGT00390000014781 ENSGT00940000156350.g ENSGT00940000154811.B.a.b ENSGT00960000186677 ENSGT00940000166991 ENSGT00940000159223.d ENSGT00940000157384.a ENSGT00950000182903.a.a.d ##22 ENSGT00940000155918.c.b ENSGT00940000164792.b ENSGT00940000155406.h ENSGT00940000156280.a.a ENSGT00940000166821.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.a.b.a ENSGT00940000156961 ENSGT00940000154973.a.a ENSGT00940000154973.b ENSGT01100000263484.A.c.a.a.a ENSGT00390000010302 ENSGT00390000012807 ENSGT00940000160465.k.b ENSGT00940000153664.B.q.b.b ENSGT00940000153664.B.r Characoidei ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000160185 ENSGT00940000154396.b.b.b ENSGT00940000156311.b.b ENSGT00940000163540 ENSGT00390000018059.b.b ENSGT00950000182827.C.a ENSGT00550000075090 ENSGT00940000164993.g ENSGT00390000014781 ENSGT00940000156350.g ENSGT00940000154811.B.a.b ENSGT00960000186677 ENSGT00940000166991 ENSGT00940000159223.d ENSGT00940000157384.a ENSGT00950000182903.a.a.d ##22 ENSGT00940000155918.c.b ENSGT00940000164792.b ENSGT00940000155406.h ENSGT00940000156280.a.a ENSGT00940000166821.a ENSGT00950000183019.f.a.c.b ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.a.b.a ENSGT00940000156961 ENSGT00940000154973.a.a ENSGT00940000154973.b ENSGT01100000263484.A.c.a.a.a ENSGT00390000010302 ENSGT00390000012807 ENSGT00940000160465.k.b ENSGT00940000153664.B.q.b.b Red-bellied piranha MODERN SPECIES 91 dynlt5 (ENSPNAG00000017335) 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##22 ap2m1a (ENSLOCG00000008365) ENSLOCG00000008353 ENSLOCG00000008343 ENSLOCG00000008331 trim69 (ENSLOCG00000008317) ENSLOCG00000008306 slc19a3b (ENSLOCG00000008297) daw1 (ENSLOCG00000008284) sphkap (ENSLOCG00000008263) pid1 (ENSLOCG00000008242) dner (ENSLOCG00000008223) trip12 (ENSLOCG00000008188) fbxo36b (ENSLOCG00000008178) SLC16A14 (ENSLOCG00000008168) ENSLOCG00000008156 Reedfish MODERN SPECIES 10 ENSECRG00000006047 ephb3a (ENSECRG00000006085) hykk.2 (ENSECRG00000006140) NMUR1 (ENSECRG00000006171) pcyt1ab (ENSECRG00000004498) dynlt2b (ENSECRG00000004514) cpdp (ENSECRG00000004522) ENSECRG00000004538 RUBCN (ENSECRG00000004560) FYTTD1 (ENSECRG00000004587) LRCH3 (ENSECRG00000004616) ENSECRG00000004660 rpl35a (ENSECRG00000004668) abcc5 (ENSECRG00000004685) rnpepl1 (ENSECRG00000004729) dvl3a (ENSECRG00000004740) ##22 AP2M1 (ENSECRG00000004758) mmp23bb (ENSECRG00000004777) ABCF3 (ENSECRG00000004797) ENSECRG00000004811 ENSECRG00000004824 ECEL1 (ENSECRG00000004845) zgc:153039 (ENSECRG00000004861) chrd (ENSECRG00000004880) clcn2b (ENSECRG00000004911) ENSECRG00000004944 fam131ab (ENSECRG00000004957) alp3 (ENSECRG00000004981) ENSECRG00000005087 EIF4G1 (ENSECRG00000005110) ENSECRG00000005140 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 161 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000160400 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000165683 ENSGT00940000155604 ENSGT00530000063882.b ENSGT00940000171017 ENSGT00940000167666 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00390000012141.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a Coelacanth MODERN SPECIES 553 ENSLACG00000016168 ENSLACG00000016015 ABCC5 (ENSLACG00000015618) RNPEPL1 (ENSLACG00000015483) POLR2H (ENSLACG00000015017) DVL3 (ENSLACG00000014483) ##22 AP2M1 (ENSLACG00000013840) mmp23bb (ENSLACG00000013699) ABCF3 (ENSLACG00000013409) ENSLACG00000013252 ENSLACG00000013208 ENSLACG00000013080 CCDC150 (ENSLACG00000012460) ENSLACG00000011789 ALG3 (ENSLACG00000011542) ENSLACG00000010421 mul1a (ENSLACG00000010106) ECE2 (ENSLACG00000008806) PSMD2 (ENSLACG00000007998) EIF4G1 (ENSLACG00000004851) alp3 (ENSLACG00000003972) Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00530000063106.A ENSGT00950000183063.c.b.b ENSGT00950000183063.c.b.a ENSGT00940000157673 ENSGT00940000164152 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000159794 ENSGT00940000160041 ENSGT00940000166623 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000159706 ENSGT00940000160400 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000164221.b ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000165683 ENSGT00940000155604 ENSGT00530000063882.b ENSGT00940000171017 ENSGT00940000167666 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00390000012141.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a Amniota ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00530000063106.A ENSGT00950000183063.c.b.b ENSGT00950000183063.c.b.a ENSGT00940000157673 ENSGT00940000164152 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000159794 ENSGT00940000160041 ENSGT00940000166623 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000159706 ENSGT00940000160400 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000164221.b ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000165683 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000171017 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00390000012141.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000167797 ENSGT00940000155439 Sauria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183063.c.b.a ENSGT00940000157673 ENSGT00940000164152 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000159794 ENSGT00940000160041 ENSGT00940000166623 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a ENSGT00940000163497 ENSGT00940000159706 ENSGT00940000160400 ENSGT00940000155470.b ENSGT00960000192626 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000165683 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000160672 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000171017 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00390000012141.a Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000183063.c.b.a ENSGT00940000157673 ENSGT00940000164152 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000159794 ENSGT00940000160041 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b ENSGT00940000163497 ENSGT00940000159706 ENSGT00940000160400 ENSGT00940000155470.b ENSGT00960000192626 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000165683 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000160672 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000171017 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00390000012141.a Archosauria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000157673 ENSGT00940000164152 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000159794 ENSGT00940000160041 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000163166.b.a.a ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b ENSGT00940000163497 ENSGT00940000159706 ENSGT00940000160400 ENSGT00960000192626 ENSGT00940000155470.b ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000165683 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000160672 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00940000171017 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00390000012141.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B Aves ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000164152 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000159794 ENSGT00940000160041 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000163166.b.a.a ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.d ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.c ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.b 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ENSGT00530000063882.b ENSGT00940000171017 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00390000012141.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000157673 ENSGT00940000164152 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000159794 ENSGT00940000160041 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.d ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.c ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.b ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.a ENSGT00940000163497 ENSGT00940000159706 ENSGT00940000160400 ENSGT00940000155470.b ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00530000063882.b ENSGT00940000171017 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000164140 ENSGT00390000012141.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00940000164682 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000164152 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000159794 ENSGT00940000160041 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.d ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.c ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.a ENSGT00940000163497 ENSGT00940000159706 ENSGT00940000160400 ENSGT00940000155470.b ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00530000063882.b ENSGT00940000171017 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 Pink-footed goose MODERN SPECIES 106 ENSABRG00000006887 ENSABRG00000006886 CHRND (ENSABRG00000006878) CHRNG (ENSABRG00000006875) EIF4E2 (ENSABRG00000006862) ENSABRG00000006824 ENSABRG00000006789 ENSABRG00000006778 ENSABRG00000006770 ENSABRG00000006755 ENSABRG00000006745 CAPN10 (ENSABRG00000006494) RNPEPL1 (ENSABRG00000006233) ABCC5 (ENSABRG00000005246) EIF2B5 (ENSABRG00000004048) DVL3 (ENSABRG00000003117) ##22 AP2M1 (ENSABRG00000002384) ENSABRG00000002327 ABCF3 (ENSABRG00000000294) 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ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00530000063882.b ENSGT00940000171017 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000012141.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00940000164682 ENSGT00940000161767 Chicken MODERN SPECIES 38 ECEL1 (ENSGALG00010017702) ENSGALG00010017828 ENSGALG00010017861 CHRND (ENSGALG00010017868) CHRNG (ENSGALG00010017878) EIF4E2 (ENSGALG00010017905) CYP2AB5 (ENSGALG00010017917) CYP2AB4 (ENSGALG00010019033) CYP2AB3 (ENSGALG00010017924) CYP2AB2 (ENSGALG00010017931) CYP2AB1 (ENSGALG00010017945) CAPN10 (ENSGALG00010017958) RNPEPL1 (ENSGALG00010017972) ABCC5 (ENSGALG00010017985) EIF2B5 (ENSGALG00010017756) DVL3 (ENSGALG00010017773) ##22 AP2M1 (ENSGALG00010019023) ABCF3 (ENSGALG00010018008) ENSGALG00010015052 ENSGALG00010018609 ENSGALG00010015056 ENSGALG00010015059 EEF1AKMT4 (ENSGALG00010015063) ENSGALG00010015075 ECE2 (ENSGALG00010019004) PSMD2 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ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00390000012141.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a Golden eagle MODERN SPECIES 1 ENSACCG00020004112 ENSACCG00020004087 ECEL1 (ENSACCG00020004070) ENSACCG00020004059 ENSACCG00020004041 CHRND (ENSACCG00020004016) CHRNG (ENSACCG00020004003) EIF4E2 (ENSACCG00020003990) ENSACCG00020003978 ENSACCG00020003965 ENSACCG00020003956 CAPN10 (ENSACCG00020003935) RNPEPL1 (ENSACCG00020003919) ABCC5 (ENSACCG00020003891) EIF2B5 (ENSACCG00020003855) DVL3 (ENSACCG00020003832) ##22 AP2M1 (ENSACCG00020003790) ABCF3 (ENSACCG00020003759) ENSACCG00020003737 ENSACCG00020003731 VWA5B2 (ENSACCG00020003710) ALG3 (ENSACCG00020003691) EEF1AKMT4 (ENSACCG00020003679) CAMK2N2 (ENSACCG00020003666) ENSACCG00020003654 ECE2 (ENSACCG00020003627) PSMD2 (ENSACCG00020003582) EIF4G1 (ENSACCG00020003297) FAM131A (ENSACCG00020003092) ENSACCG00020003080 CLCN2 (ENSACCG00020002611) Kakapo MODERN SPECIES 25 ENSSHBG00005017712 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ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.a ENSGT00940000163497 ENSGT00940000159706 ENSGT00940000160400 ENSGT00940000155470.b ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00940000171017 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00390000012141.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000157673 ENSGT00940000164152 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000159794 ENSGT00940000160041 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.d ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.c ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.b ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.a ENSGT00940000163497 ENSGT00940000159706 ENSGT00940000160400 ENSGT00940000155470.b ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00940000171017 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00390000012141.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 Flycatcher MODERN SPECIES 28 ENSFALG00000007684 ECEL1 (ENSFALG00000007715) ENSFALG00000007727 ENSFALG00000007735 CHRND (ENSFALG00000007740) CHRNG (ENSFALG00000007743) ENSFALG00000007749 ENSFALG00000007787 ENSFALG00000007788 ENSFALG00000007789 ENSFALG00000007804 ENSFALG00000007839 ENSFALG00000025358 ABCC5 (ENSFALG00000007877) EIF2B5 (ENSFALG00000007923) DVL3 (ENSFALG00000007932) ##22 AP2M1 (ENSFALG00000007949) ABCF3 (ENSFALG00000007964) ENSFALG00000007997 ENSFALG00000024673 ALG3 (ENSFALG00000008021) EEF1AKMT4 (ENSFALG00000008024) ENSFALG00000024720 ENSFALG00000008033 PSMD2 (ENSFALG00000008037) EIF4G1 (ENSFALG00000008063) FAM131A (ENSFALG00000028566) ENSFALG00000008107 CLCN2 (ENSFALG00000008118) CHRD (ENSFALG00000008154) ENSFALG00000008174 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157673 ENSGT00940000164152 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000159794 ENSGT00940000160041 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.d ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a.c ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.b ENSGT00940000163166.b.a.b.a.b.a ENSGT00940000163497 ENSGT00940000159706 ENSGT00940000160400 ENSGT00940000155470.b ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00940000171017 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00390000012141.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 Medium ground finch MODERN SPECIES 12 ENSGFOG00000013069 CHRND (ENSGFOG00000013077) CHRNG (ENSGFOG00000013084) EIF4E2 (ENSGFOG00000013089) ENSGFOG00000013097 ENSGFOG00000013109 ENSGFOG00000013118 ENSGFOG00000013120 ENSGFOG00000013121 ENSGFOG00000013123 CAPN10 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ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00940000171017 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00390000012141.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 Common canary MODERN SPECIES 10 ENSSCAG00000014386 ENSSCAG00000014380 ECEL1 (ENSSCAG00000014374) ENSSCAG00000014365 ENSSCAG00000014359 CHRND (ENSSCAG00000014309) CHRNG (ENSSCAG00000014293) EIF4E2 (ENSSCAG00000014283) ENSSCAG00000014276 ENSSCAG00000014267 ENSSCAG00000014248 ENSSCAG00000014232 CAPN10 (ENSSCAG00000014223) ABCC5 (ENSSCAG00000014204) EIF2B5 (ENSSCAG00000014196) DVL3 (ENSSCAG00000014191) ##22 AP2M1 (ENSSCAG00000014188) ABCF3 (ENSSCAG00000014186) ENSSCAG00000014182 ENSSCAG00000014181 ALG3 (ENSSCAG00000014164) ENSSCAG00000014155 ENSSCAG00000014149 ECE2 (ENSSCAG00000014143) PSMD2 (ENSSCAG00000014134) EIF4G1 (ENSSCAG00000014123) FAM131A (ENSSCAG00000014118) ENSSCAG00000014115 CLCN2 (ENSSCAG00000013839) 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Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000183063.c.b.a ENSGT00940000157673 ENSGT00940000164152 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000159794 ENSGT00940000160041 ENSGT00940000166623 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a ENSGT00940000163497 ENSGT00940000159706 ENSGT00940000160400 ENSGT00940000155470.b ENSGT00960000192626 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000165683 ENSGT00940000155604 ENSGT00390000009210 ENSGT01040000240503.B ENSGT00940000157496 ENSGT00530000063882.b ENSGT00950000182903.a.b #22 ENSGT00940000171017 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00390000012141.a ENSGT00940000156921 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00950000183063.c.b.a ENSGT00940000157673 ENSGT00940000164152 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000159794 ENSGT00940000160041 ENSGT00940000166623 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000163166.b.a.b.a.a ENSGT00940000163497 ENSGT00940000159706 ENSGT00940000160400 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ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000163166.b.b.b.a.a.a.a Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 155 ENSGT00940000163497.a ENSGT00940000159706 ENSGT00940000160400 ENSGT00940000155470.b ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000163166.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000163166.b.b.b.a.b.b.a.b ENSGT00940000163166.b.b.b.a.b.b.a.a.a.a.a.a Eastern brown snake MODERN SPECIES 181 ENSPTXG00000017046 ENSPTXG00000017044 CAPN10 (ENSPTXG00000017040) RNPEPL1 (ENSPTXG00000017034) ABCC5 (ENSPTXG00000017024) EIF2B5 (ENSPTXG00000016994) DVL3 (ENSPTXG00000016983) ##22 AP2M1 (ENSPTXG00000016969) ENSPTXG00000016964 ENSPTXG00000016956 ENSPTXG00000016949 ENSPTXG00000016942 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 416 DVL3 (ENSNSUG00000007274) ##22 AP2M1 (ENSNSUG00000007278) ENSNSUG00000007281 ENSNSUG00000007282 ENSNSUG00000007285 ENSNSUG00000007286 Indian cobra MODERN SPECIES 3 ENSNNAG00000006727 ENSNNAG00000006699 ENSNNAG00000006625 ENSNNAG00000006587 CHRND 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ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000157155 ENSGT00390000015492.B ENSGT00530000063106.A ENSGT00950000183063.c.b.a ENSGT00940000157673 ENSGT00940000164152 ENSGT00940000157183.a.b ENSGT00940000159794 ENSGT00940000160041 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000159706 ENSGT00940000160400 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000164221.b ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132 Platypus MODERN SPECIES ENSOANG00000041868 ENSOANG00000045204 COPS7B (ENSOANG00000045588) EIF4E2 (ENSOANG00000048067) CHRNG (ENSOANG00000012957) CHRND (ENSOANG00000006528) PRSS56 (ENSOANG00000005505) ENSOANG00000008651 ECEL1 (ENSOANG00000001689) DIS3L2 (ENSOANG00000041984) ENSOANG00000038692 CAPN10 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ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 Wild yak MODERN SPECIES 2438 ENSBMUG00000020807 KLHL24 (ENSBMUG00000020797) YEATS2 (ENSBMUG00000020751) MAP6D1 (ENSBMUG00000020661) PARL (ENSBMUG00000020640) ENSBMUG00000020608 ENSBMUG00000020603 ABCC5 (ENSBMUG00000020592) ENSBMUG00000020542 ENSBMUG00000020525 ENSBMUG00000020501 EIF2B5 (ENSBMUG00000020467) DVL3 (ENSBMUG00000020415) ##22 AP2M1 (ENSBMUG00000020318) ABCF3 (ENSBMUG00000020236) VWA5B2 (ENSBMUG00000020086) ENSBMUG00000019893 EEF1AKMT4 (ENSBMUG00000019885) CAMK2N2 (ENSBMUG00000019881) ECE2 (ENSBMUG00000019815) PSMD2 (ENSBMUG00000019690) EIF4G1 (ENSBMUG00000019290) FAM131A (ENSBMUG00000018906) CLCN2 (ENSBMUG00000018855) POLR2H (ENSBMUG00000018678) THPO (ENSBMUG00000018627) CHRD (ENSBMUG00000018485) ENSBMUG00000018369 Domestic yak MODERN SPECIES ENSBGRG00000001679 MCF2L2 (ENSBGRG00000001502) KLHL6 (ENSBGRG00000001459) KLHL24 (ENSBGRG00000001442) ENSBGRG00000001430 YEATS2 (ENSBGRG00000001414) MAP6D1 (ENSBGRG00000001403) PARL (ENSBGRG00000001380) ENSBGRG00000001362 ENSBGRG00000001335 ENSBGRG00000001324 ABCC5 (ENSBGRG00000001081) ENSBGRG00000001030 ENSBGRG00000000975 EIF2B5 (ENSBGRG00000000921) DVL3 (ENSBGRG00000000862) ##22 AP2M1 (ENSBGRG00000000714) ABCF3 (ENSBGRG00000000581) VWA5B2 (ENSBGRG00000000310) ALG3 (ENSBGRG00000000258) EEF1AKMT4 (ENSBGRG00000000248) CAMK2N2 (ENSBGRG00000000240) ECE2 (ENSBGRG00000000211) PSMD2 (ENSBGRG00000000173) ENSBGRG00000000165 EIF4G1 (ENSBGRG00000003743) FAM131A (ENSBGRG00000003599) CLCN2 (ENSBGRG00000003313) POLR2H (ENSBGRG00000003267) THPO (ENSBGRG00000003222) CHRD (ENSBGRG00000003140) Cetacea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159676 ENSGT00940000161734 ENSGT00940000163715.a ENSGT00990000203899 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.b.b.b ENSGT00940000156739.a ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00470000042552 ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000158024.C ENSGT00940000163736 Blue whale MODERN SPECIES 15 ENSBMSG00010006280 MCCC1 (ENSBMSG00010006304) LAMP3 (ENSBMSG00010006362) MCF2L2 (ENSBMSG00010006391) B3GNT5 (ENSBMSG00010006443) KLHL6 (ENSBMSG00010006477) KLHL24 (ENSBMSG00010006493) YEATS2 (ENSBMSG00010006529) MAP6D1 (ENSBMSG00010006549) ENSBMSG00010006580 ENSBMSG00010006644 ABCC5 (ENSBMSG00010006752) ENSBMSG00010006800 ENSBMSG00010006825 EIF2B5 (ENSBMSG00010006865) DVL3 (ENSBMSG00010006957) ##22 AP2M1 (ENSBMSG00010007084) ABCF3 (ENSBMSG00010007145) VWA5B2 (ENSBMSG00010007220) ALG3 (ENSBMSG00010007286) EEF1AKMT4 (ENSBMSG00010007328) CAMK2N2 (ENSBMSG00010007339) ECE2 (ENSBMSG00010007367) PSMD2 (ENSBMSG00010007497) EIF4G1 (ENSBMSG00010007584) FAM131A (ENSBMSG00010007712) CLCN2 (ENSBMSG00010007788) POLR2H (ENSBMSG00010008055) THPO (ENSBMSG00010008075) CHRD (ENSBMSG00010008137) EPHB3 (ENSBMSG00010008212) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000159676 ENSGT00940000161734 ENSGT00940000163715.a ENSGT00990000203899 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.b.b.b ENSGT00940000156739.a ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00470000042552 ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000158024.C ENSGT00940000163736 Sperm whale MODERN SPECIES 1211 EIF2B5 (ENSPCTG00005021684) DVL3 (ENSPCTG00005021710) ##22 AP2M1 (ENSPCTG00005013065) ENSPCTG00005013321 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000159676 ENSGT00940000161734 ENSGT00940000163715.a ENSGT00990000203899 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.a ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00470000042552 ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000158024.C ENSGT00940000163736 Dolphin MODERN SPECIES 849 EIF2B5 (ENSTTRG00000003093) DVL3 (ENSTTRG00000003096) ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000159676 ENSGT00940000161734 ENSGT00990000203899 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.a ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000158024.C Vaquita MODERN SPECIES 15 ENSPSNG00000002025 MCCC1 (ENSPSNG00000002070) LAMP3 (ENSPSNG00000002153) MCF2L2 (ENSPSNG00000002227) B3GNT5 (ENSPSNG00000002266) ENSPSNG00000002280 KLHL6 (ENSPSNG00000002317) KLHL24 (ENSPSNG00000002350) YEATS2 (ENSPSNG00000002390) MAP6D1 (ENSPSNG00000002417) PARL (ENSPSNG00000002457) ABCC5 (ENSPSNG00000002555) 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Carnivora ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159676 ENSGT00990000203899 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000161734 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.b.b.b ENSGT00940000156739.a ENSGT00940000163899 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00990000203899 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000161734 ENSGT00940000154345.b ENSGT00390000006548.b.j.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.b.b.b 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(ENSPTIG00000015405) ##22 AP2M1 (ENSPTIG00000012982) ABCF3 (ENSPTIG00000011505) VWA5B2 (ENSPTIG00000010510) ALG3 (ENSPTIG00000009595) EEF1AKMT4 (ENSPTIG00000008844) ECE2 (ENSPTIG00000005514) PSMD2 (ENSPTIG00000021992) EIF4G1 (ENSPTIG00000017609) FAM131A (ENSPTIG00000017208) CLCN2 (ENSPTIG00000011904) POLR2H (ENSPTIG00000010551) THPO (ENSPTIG00000007662) ENSPTIG00000021284 ENSPTIG00000004523 EPHB3 (ENSPTIG00000020201) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.b.b.b ENSGT00940000156739.a ENSGT00940000163899 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132 lion MODERN SPECIES 9 CPN2 (ENSPLOG00000013346) HES1 (ENSPLOG00000013306) OPA1 (ENSPLOG00000012992) ENSPLOG00000012858 KLHL6 (ENSPLOG00000012815) KLHL24 (ENSPLOG00000012705) YEATS2 (ENSPLOG00000012576) MAP6D1 (ENSPLOG00000012510) ENSPLOG00000012396 ABCC5 (ENSPLOG00000012194) ENSPLOG00000012086 ENSPLOG00000011983 ENSPLOG00000011826 HTR3E (ENSPLOG00000011659) EIF2B5 (ENSPLOG00000011578) DVL3 (ENSPLOG00000011355) ##22 AP2M1 (ENSPLOG00000011217) ABCF3 (ENSPLOG00000010928) VWA5B2 (ENSPLOG00000010719) ALG3 (ENSPLOG00000010649) EEF1AKMT4 (ENSPLOG00000010618) CAMK2N2 (ENSPLOG00000010595) ECE2 (ENSPLOG00000010131) PSMD2 (ENSPLOG00000010003) EIF4G1 (ENSPLOG00000009545) FAM131A (ENSPLOG00000009442) CLCN2 (ENSPLOG00000008884) POLR2H (ENSPLOG00000008644) THPO (ENSPLOG00000008509) CHRD (ENSPLOG00000008011) ENSPLOG00000007927 leopard MODERN SPECIES 41 LAMP3 (ENSPPRG00000023853) MCF2L2 (ENSPPRG00000024122) B3GNT5 (ENSPPRG00000021466) ENSPPRG00000013180 KLHL6 (ENSPPRG00000011045) KLHL24 (ENSPPRG00000011024) YEATS2 (ENSPPRG00000010510) MAP6D1 (ENSPPRG00000010302) PARL (ENSPPRG00000010103) ABCC5 (ENSPPRG00000009156) HTR3D (ENSPPRG00000007564) ENSPPRG00000006147 ENSPPRG00000005616 HTR3E (ENSPPRG00000004092) EIF2B5 (ENSPPRG00000002680) DVL3 (ENSPPRG00000002369) ##22 AP2M1 (ENSPPRG00000001504) ABCF3 (ENSPPRG00000023037) VWA5B2 (ENSPPRG00000023611) ALG3 (ENSPPRG00000024472) EEF1AKMT4 (ENSPPRG00000022119) CAMK2N2 (ENSPPRG00000017944) ECE2 (ENSPPRG00000017151) PSMD2 (ENSPPRG00000009718) ENSPPRG00000008473 EIF4G1 (ENSPPRG00000008026) FAM131A (ENSPPRG00000008718) CLCN2 (ENSPPRG00000007844) POLR2H (ENSPPRG00000004001) ENSPPRG00000002693 CHRD (ENSPPRG00000001992) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000161734 ENSGT00940000159676 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.b.b.b ENSGT00940000156739.a ENSGT00940000163899 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00470000042552 ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156162.C.k ENSGT00940000154552 ENSGT00940000156941.h ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000159676 ENSGT00940000161734 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.b.b.b ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00470000042552 ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 Megabat MODERN SPECIES 1122 EIF2B5 (ENSPVAG00000004836) DVL3 (ENSPVAG00000004837) ##22 AP2M1 (ENSPVAG00000004838) ABCF3 (ENSPVAG00000004839) ENSPVAG00000004840 VWA5B2 (ENSPVAG00000004841) ALG3 (ENSPVAG00000004842) ECE2 (ENSPVAG00000004843) CAMK2N2 (ENSPVAG00000004844) PSMD2 (ENSPVAG00000004845) EIF4G1 (ENSPVAG00000004847) ENSPVAG00000004853 FAM131A (ENSPVAG00000004856) CLCN2 (ENSPVAG00000004861) POLR2H (ENSPVAG00000004869) THPO (ENSPVAG00000004871) CHRD (ENSPVAG00000004873) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156162.C.k ENSGT00940000154552 ENSGT00940000156941.h ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000159676 ENSGT00940000161734 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.b.b.b ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 11 ENSRFEG00010021147 MCCC1 (ENSRFEG00010021096) ENSRFEG00010021072 B3GNT5 (ENSRFEG00010021062) MCF2L2 (ENSRFEG00010021002) ENSRFEG00010020947 KLHL24 (ENSRFEG00010020928) ENSRFEG00010020902 YEATS2 (ENSRFEG00010020847) MAP6D1 (ENSRFEG00010020813) PARL (ENSRFEG00010020770) ABCC5 (ENSRFEG00010020607) ENSRFEG00010020530 ENSRFEG00010020478 EIF2B5 (ENSRFEG00010020434) DVL3 (ENSRFEG00010020376) ##22 AP2M1 (ENSRFEG00010020265) ABCF3 (ENSRFEG00010020127) VWA5B2 (ENSRFEG00010020098) ALG3 (ENSRFEG00010020076) EEF1AKMT4 (ENSRFEG00010020046) CAMK2N2 (ENSRFEG00010020020) ECE2 (ENSRFEG00010019914) PSMD2 (ENSRFEG00010019760) EIF4G1 (ENSRFEG00010016633) FAM131A (ENSRFEG00010016522) CLCN2 (ENSRFEG00010014736) POLR2H (ENSRFEG00010014541) THPO (ENSRFEG00010014434) CHRD (ENSRFEG00010014328) EPHB3 (ENSRFEG00010014243) Microbat MODERN SPECIES 951 MCCC1 (ENSMLUG00000012257) LAMP3 (ENSMLUG00000012272) B3GNT5 (ENSMLUG00000017017) MCF2L2 (ENSMLUG00000017007) KLHL6 (ENSMLUG00000005156) KLHL24 (ENSMLUG00000005165) YEATS2 (ENSMLUG00000004493) ENSMLUG00000027253 PARL (ENSMLUG00000004507) ABCC5 (ENSMLUG00000010786) ENSMLUG00000010854 ENSMLUG00000027954 ENSMLUG00000010874 ENSMLUG00000028418 EIF2B5 (ENSMLUG00000013520) DVL3 (ENSMLUG00000013532) ##22 AP2M1 (ENSMLUG00000013541) ABCF3 (ENSMLUG00000013549) VWA5B2 (ENSMLUG00000006386) ALG3 (ENSMLUG00000026847) ECE2 (ENSMLUG00000006407) PSMD2 (ENSMLUG00000006430) EIF4G1 (ENSMLUG00000012821) FAM131A (ENSMLUG00000012834) CLCN2 (ENSMLUG00000012839) POLR2H (ENSMLUG00000022295) THPO (ENSMLUG00000024139) CHRD (ENSMLUG00000013271) ENSMLUG00000001915 ENSMLUG00000022792 EPHB3 (ENSMLUG00000014723) Equus ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000154552 ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000161734 ENSGT00940000159676 ENSGT00940000163715.a ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.a ENSGT00940000163899 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132.h Horse MODERN SPECIES 10 MCCC1 (ENSECAG00000008214) LAMP3 (ENSECAG00000008113) MCF2L2 (ENSECAG00000008905) B3GNT5 (ENSECAG00000001863) ENSECAG00000049566 KLHL6 (ENSECAG00000016531) KLHL24 (ENSECAG00000021066) YEATS2 (ENSECAG00000008585) MAP6D1 (ENSECAG00000022418) PARL (ENSECAG00000022422) ABCC5 (ENSECAG00000007961) ENSECAG00000034302 ENSECAG00000013182 HTR3E (ENSECAG00000013750) EIF2B5 (ENSECAG00000018745) DVL3 (ENSECAG00000008877) ##22 AP2M1 (ENSECAG00000000242) ABCF3 (ENSECAG00000016827) VWA5B2 (ENSECAG00000011959) ALG3 (ENSECAG00000024917) CAMK2N2 (ENSECAG00000029306) ECE2 (ENSECAG00000015238) PSMD2 (ENSECAG00000022375) EIF4G1 (ENSECAG00000008046) FAM131A (ENSECAG00000000326) CLCN2 (ENSECAG00000006719) POLR2H (ENSECAG00000005828) THPO (ENSECAG00000005883) CHRD (ENSECAG00000011154) ENSECAG00000050282 ENSECAG00000045250 Donkey MODERN SPECIES 25 MCCC1 (ENSEASG00005015339) ENSEASG00005015308 MCF2L2 (ENSEASG00005015300) B3GNT5 (ENSEASG00005038666) ENSEASG00005028355 ENSEASG00005015289 KLHL24 (ENSEASG00005015287) YEATS2 (ENSEASG00005015265) MAP6D1 (ENSEASG00005026951) PARL (ENSEASG00005015210) ABCC5 (ENSEASG00005014831) ENSEASG00005029101 ENSEASG00005014738 HTR3E (ENSEASG00005014733) EIF2B5 (ENSEASG00005014406) DVL3 (ENSEASG00005014334) ##22 AP2M1 (ENSEASG00005014278) ABCF3 (ENSEASG00005014186) VWA5B2 (ENSEASG00005014165) ALG3 (ENSEASG00005014154) EEF1AKMT4 (ENSEASG00005014150) CAMK2N2 (ENSEASG00005032978) PSMD2 (ENSEASG00005014052) EIF4G1 (ENSEASG00005014019) FAM131A (ENSEASG00005031258) CLCN2 (ENSEASG00005013129) POLR2H (ENSEASG00005013088) THPO (ENSEASG00005013086) CHRD (ENSEASG00005013083) ENSEASG00005013546 ENSEASG00005036794 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.a.a ##22 Hedgehog MODERN SPECIES 5346 DVL3 (ENSEEUG00000012281) ##22 Common shrew MODERN SPECIES 4163 ENSSARG00000008891 ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161734 ENSGT00940000159676 ENSGT00990000203899 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.b.a ENSGT00940000156739.a ENSGT00940000163899 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132 Primates ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000164015 ENSGT00940000159676 ENSGT00940000161734 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.b.a ENSGT00940000163899 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154552.b ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000161734 ENSGT00940000159676 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.a ENSGT00940000163899 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132 Bushbaby MODERN SPECIES 378 ENSOGAG00000024553 ABCC5 (ENSOGAG00000016102) ENSOGAG00000016123 ENSOGAG00000007890 EIF2B5 (ENSOGAG00000016131) DVL3 (ENSOGAG00000016139) ##22 AP2M1 (ENSOGAG00000012286) ABCF3 (ENSOGAG00000033289) VWA5B2 (ENSOGAG00000010433) ALG3 (ENSOGAG00000032319) EEF1AKMT4 (ENSOGAG00000026060) CAMK2N2 (ENSOGAG00000025540) ECE2 (ENSOGAG00000015273) PSMD2 (ENSOGAG00000015282) EIF4G1 (ENSOGAG00000015291) CLCN2 (ENSOGAG00000034793) FAM131A (ENSOGAG00000015302) POLR2H (ENSOGAG00000001599) THPO (ENSOGAG00000026490) CHRD (ENSOGAG00000001601) EPHB3 (ENSOGAG00000032936) Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000159676 ENSGT00940000161734 ENSGT00940000164826 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.a.a ENSGT00940000156739.b.a.b ENSGT00940000163899 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000156921 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195.a.b ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000161734 ENSGT00940000164826 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.a.a ENSGT00940000156739.b.a.b ENSGT00940000163899 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000156921 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195.a.b ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132 ENSGT00940000158024.C Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 28 ENSPSMG00000022070 ENSPSMG00000022066 B3GNT5 (ENSPSMG00000022061) KLHL6 (ENSPSMG00000022051) KLHL24 (ENSPSMG00000022048) YEATS2 (ENSPSMG00000022030) MAP6D1 (ENSPSMG00000021982) PARL (ENSPSMG00000021936) ENSPSMG00000021860 ABCC5 (ENSPSMG00000021810) ENSPSMG00000021631 HTR3E (ENSPSMG00000021608) EIF2B5 (ENSPSMG00000021580) DVL3 (ENSPSMG00000021524) ##22 AP2M1 (ENSPSMG00000021479) ABCF3 (ENSPSMG00000021387) VWA5B2 (ENSPSMG00000021312) ALG3 (ENSPSMG00000021275) CAMK2N2 (ENSPSMG00000021256) ECE2 (ENSPSMG00000021210) PSMD2 (ENSPSMG00000021009) EIF4G1 (ENSPSMG00000020536) FAM131A (ENSPSMG00000020112) CLCN2 (ENSPSMG00000020050) POLR2H (ENSPSMG00000019838) THPO (ENSPSMG00000019800) CHRD (ENSPSMG00000019718) ENSPSMG00000019612 EPHB3 (ENSPSMG00000019601) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 51 MCCC1 (ENSPCOG00000020095) ENSPCOG00000009968 MCF2L2 (ENSPCOG00000023043) ENSPCOG00000025090 ENSPCOG00000025238 KLHL24 (ENSPCOG00000014525) YEATS2 (ENSPCOG00000018918) MAP6D1 (ENSPCOG00000027653) PARL (ENSPCOG00000010637) CYP2AB1 (ENSPCOG00000016717) ABCC5 (ENSPCOG00000025758) ENSPCOG00000015936 ENSPCOG00000027112 HTR3E (ENSPCOG00000024574) EIF2B5 (ENSPCOG00000010623) DVL3 (ENSPCOG00000020025) ##22 AP2M1 (ENSPCOG00000027377) ABCF3 (ENSPCOG00000005372) VWA5B2 (ENSPCOG00000024622) ALG3 (ENSPCOG00000017288) CAMK2N2 (ENSPCOG00000026701) ECE2 (ENSPCOG00000027101) PSMD2 (ENSPCOG00000002411) EIF4G1 (ENSPCOG00000026717) FAM131A (ENSPCOG00000026923) CLCN2 (ENSPCOG00000021839) POLR2H (ENSPCOG00000021194) ENSPCOG00000025834 CHRD (ENSPCOG00000013990) EPHB3 (ENSPCOG00000021424) MAGEF1 (ENSPCOG00000023097) Mouse lemur MODERN SPECIES MCF2L2 (ENSMICG00000049191) B3GNT5 (ENSMICG00000049049) ENSMICG00000049437 ENSMICG00000049467 KLHL24 (ENSMICG00000049481) YEATS2 (ENSMICG00000049411) MAP6D1 (ENSMICG00000049143) PARL (ENSMICG00000049265) CYP2AB1 (ENSMICG00000049184) ABCC5 (ENSMICG00000049116) ENSMICG00000049384 ENSMICG00000049301 ENSMICG00000049183 HTR3E (ENSMICG00000049068) EIF2B5 (ENSMICG00000049428) DVL3 (ENSMICG00000049000) ##22 AP2M1 (ENSMICG00000048935) ABCF3 (ENSMICG00000049418) VWA5B2 (ENSMICG00000049272) ALG3 (ENSMICG00000048992) EEF1AKMT4 (ENSMICG00000049030) CAMK2N2 (ENSMICG00000049125) PSMD2 (ENSMICG00000049512) EIF4G1 (ENSMICG00000049010) FAM131A (ENSMICG00000049438) CLCN2 (ENSMICG00000049507) ENSMICG00000048991 THPO (ENSMICG00000049369) CHRD (ENSMICG00000049478) ENSMICG00000049109 EPHB3 (ENSMICG00000049312) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000164015 ENSGT00940000159676 ENSGT00940000161734 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.b.a ENSGT00940000163899 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000158024.C Tarsier MODERN SPECIES 6677 DCUN1D1 (ENSTSYG00000012276) MCCC1 (ENSTSYG00000012606) LAMP3 (ENSTSYG00000002298) MCF2L2 (ENSTSYG00000005366) ENSTSYG00000030655 KLHL6 (ENSTSYG00000004245) KLHL24 (ENSTSYG00000003942) YEATS2 (ENSTSYG00000014192) PARL (ENSTSYG00000009129) CYP2AB1 (ENSTSYG00000027522) ABCC5 (ENSTSYG00000005257) HTR3D (ENSTSYG00000005292) HTR3C (ENSTSYG00000000352) HTR3E (ENSTSYG00000006428) EIF2B5 (ENSTSYG00000012456) DVL3 (ENSTSYG00000009154) ##22 AP2M1 (ENSTSYG00000006101) ABCF3 (ENSTSYG00000008490) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000164015 ENSGT00940000159676 ENSGT00940000161734 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.b.a ENSGT00940000163899 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000158024.C Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000154552.b.f ENSGT00940000156941.j ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000161734 ENSGT00940000159676 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063.p ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.b.a ENSGT00940000163899 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000158024.C Mas night monkey MODERN SPECIES 793 ENSANAG00000020880 MCCC1 (ENSANAG00000028235) LAMP3 (ENSANAG00000021411) MCF2L2 (ENSANAG00000030096) KLHL6 (ENSANAG00000034934) KLHL24 (ENSANAG00000030957) ENSANAG00000032967 YEATS2 (ENSANAG00000034729) MAP6D1 (ENSANAG00000031904) ENSANAG00000028369 ENSANAG00000032750 ABCC5 (ENSANAG00000022138) HTR3C (ENSANAG00000038263) HTR3E (ENSANAG00000037618) EIF2B5 (ENSANAG00000030694) DVL3 (ENSANAG00000020734) ##22 AP2M1 (ENSANAG00000035232) ABCF3 (ENSANAG00000032695) VWA5B2 (ENSANAG00000023436) ALG3 (ENSANAG00000036858) CAMK2N2 (ENSANAG00000026673) ECE2 (ENSANAG00000036188) PSMD2 (ENSANAG00000014874) EIF4G1 (ENSANAG00000029514) FAM131A (ENSANAG00000025503) CLCN2 (ENSANAG00000029687) POLR2H (ENSANAG00000020244) THPO (ENSANAG00000018591) CHRD (ENSANAG00000023833) EPHB3 (ENSANAG00000002566) VPS8 (ENSANAG00000004123) Cebidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000154552.b.f ENSGT00940000156941.j ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000161734 ENSGT00940000159676 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063.p ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.b.a ENSGT00940000163899 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000158024.C Marmoset MODERN SPECIES 6 ENSCJAG00000076242 ATP11B (ENSCJAG00000005176) DCUN1D1 (ENSCJAG00000005148) MCCC1 (ENSCJAG00000005103) ENSCJAG00000081113 MCF2L2 (ENSCJAG00000021205) B3GNT5 (ENSCJAG00000059459) KLHL6 (ENSCJAG00000021212) KLHL24 (ENSCJAG00000082211) YEATS2 (ENSCJAG00000021219) PARL (ENSCJAG00000021241) ABCC5 (ENSCJAG00000013172) HTR3C (ENSCJAG00000013149) HTR3E (ENSCJAG00000013139) EIF2B5 (ENSCJAG00000013108) DVL3 (ENSCJAG00000013060) ##22 AP2M1 (ENSCJAG00000012998) ABCF3 (ENSCJAG00000012959) VWA5B2 (ENSCJAG00000015206) ALG3 (ENSCJAG00000015172) EEF1AKMT4 (ENSCJAG00000065303) CAMK2N2 (ENSCJAG00000022233) ECE2 (ENSCJAG00000015132) PSMD2 (ENSCJAG00000034394) EIF4G1 (ENSCJAG00000014999) FAM131A (ENSCJAG00000046825) CLCN2 (ENSCJAG00000014964) POLR2H (ENSCJAG00000014959) ENSCJAG00000048180 CHRD (ENSCJAG00000014925) ENSCJAG00000077185 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156162.C.k ENSGT00940000154552.b.f ENSGT00940000156941.j ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000161734 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063.p ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.b.a ENSGT00940000163899 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000156921 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000158024.C ENSGT00390000010672 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 62 MCCC1 (ENSSBOG00000026219) ENSSBOG00000021035 MCF2L2 (ENSSBOG00000029425) KLHL6 (ENSSBOG00000020503) KLHL24 (ENSSBOG00000034313) YEATS2 (ENSSBOG00000024142) ENSSBOG00000029528 ENSSBOG00000026916 PARL (ENSSBOG00000023148) ABCC5 (ENSSBOG00000021176) ENSSBOG00000013776 HTR3C (ENSSBOG00000029560) ENSSBOG00000012724 HTR3E (ENSSBOG00000021223) EIF2B5 (ENSSBOG00000028500) DVL3 (ENSSBOG00000035979) ##22 ENSSBOG00000033126 ABCF3 (ENSSBOG00000029094) VWA5B2 (ENSSBOG00000026464) ALG3 (ENSSBOG00000029414) ECE2 (ENSSBOG00000032623) CAMK2N2 (ENSSBOG00000025366) PSMD2 (ENSSBOG00000023851) EIF4G1 (ENSSBOG00000026347) FAM131A (ENSSBOG00000023167) CLCN2 (ENSSBOG00000027612) POLR2H (ENSSBOG00000033101) THPO (ENSSBOG00000003075) CHRD (ENSSBOG00000017364) EPHB3 (ENSSBOG00000033735) VPS8 (ENSSBOG00000035918) Capuchin DUPLICATION Capuchin MODERN SPECIES 111 ENSCCAG00000023260 ENSCCAG00000024140 MCF2L2 (ENSCCAG00000019185) ENSCCAG00000030618 KLHL6 (ENSCCAG00000019228) KLHL24 (ENSCCAG00000036179) YEATS2 (ENSCCAG00000031021) ENSCCAG00000023201 MAP6D1 (ENSCCAG00000036644) PARL (ENSCCAG00000031887) ABCC5 (ENSCCAG00000025137) ENSCCAG00000031577 HTR3C (ENSCCAG00000031177) HTR3E (ENSCCAG00000037415) EIF2B5 (ENSCCAG00000028693) DVL3 (ENSCCAG00000035355) ##22 AP2M1 (ENSCCAG00000025069) ABCF3 (ENSCCAG00000027906) VWA5B2 (ENSCCAG00000032876) ALG3 (ENSCCAG00000025533) ECE2 (ENSCCAG00000023381) CAMK2N2 (ENSCCAG00000035659) PSMD2 (ENSCCAG00000033966) EIF4G1 (ENSCCAG00000037187) FAM131A (ENSCCAG00000015189) CLCN2 (ENSCCAG00000024395) POLR2H (ENSCCAG00000035087) THPO (ENSCCAG00000030833) CHRD (ENSCCAG00000030574) ENSCCAG00000031842 EPHB3 (ENSCCAG00000021502) Capuchin MODERN SPECIES 389 CCR6 (ENSCCAG00000023108) CEP43 (ENSCCAG00000002534) RNASET2 (ENSCCAG00000022079) RPS6KA2 (ENSCCAG00000032079) MPC1 (ENSCCAG00000027814) SFT2D1 (ENSCCAG00000030562) PRR18 (ENSCCAG00000031870) TBXT (ENSCCAG00000024677) ENSCCAG00000037393 ENSCCAG00000022749 ENSCCAG00000019705 ENSCCAG00000036924 ENSCCAG00000034417 ENSCCAG00000029815 ENSCCAG00000020853 ##22 C6orf118 (ENSCCAG00000037689) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000164015 ENSGT00940000159676 ENSGT00940000161734 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00910000147149 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.b.a ENSGT00940000163899 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B.a ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000158024.C Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000159676 ENSGT00940000161734 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00910000147149 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 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ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000158024.C ENSGT00940000163736 Sooty mangabey MODERN SPECIES 424 KLHL6 (ENSCATG00000032896) KLHL24 (ENSCATG00000034493) YEATS2 (ENSCATG00000034512) ENSCATG00000012966 ENSCATG00000033375 MAP6D1 (ENSCATG00000040800) PARL (ENSCATG00000012012) ABCC5 (ENSCATG00000029271) HTR3D (ENSCATG00000039231) HTR3C (ENSCATG00000043397) HTR3E (ENSCATG00000044422) EIF2B5 (ENSCATG00000043245) DVL3 (ENSCATG00000039827) ##22 AP2M1 (ENSCATG00000042400) ABCF3 (ENSCATG00000042195) VWA5B2 (ENSCATG00000041491) ALG3 (ENSCATG00000002971) CAMK2N2 (ENSCATG00000044862) ECE2 (ENSCATG00000037480) PSMD2 (ENSCATG00000037182) EIF4G1 (ENSCATG00000009656) FAM131A (ENSCATG00000040934) CLCN2 (ENSCATG00000039019) POLR2H (ENSCATG00000045313) THPO (ENSCATG00000029879) CHRD (ENSCATG00000033542) EPHB3 (ENSCATG00000039267) MAGEF1 (ENSCATG00000007663) Drill MODERN SPECIES 835 EIF2B5 (ENSMLEG00000028338) DVL3 (ENSMLEG00000033587) ##22 AP2M1 (ENSMLEG00000037216) ABCF3 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ENSGT00940000154552.b.g.a ENSGT00940000156941 ENSGT00940000164015 ENSGT00940000161734 ENSGT00940000159676 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.b.a ENSGT00940000163899 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B.a ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000158024.C Rhesus MODERN SPECIES 11 MCCC1 (ENSMMUG00000010553) LAMP3 (ENSMMUG00000010555) ENSMMUG00000053420 MCF2L2 (ENSMMUG00000001456) B3GNT5 (ENSMMUG00000031605) KLHL6 (ENSMMUG00000022115) YEATS2 (ENSMMUG00000008070) ENSMMUG00000064298 MAP6D1 (ENSMMUG00000019824) PARL (ENSMMUG00000013661) ABCC5 (ENSMMUG00000005515) HTR3D (ENSMMUG00000040299) HTR3C 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ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000158024.C ENSGT00940000163736 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 193 NEK10 (ENSRBIG00000038842) ENSRBIG00000044525 SLC4A7 (ENSRBIG00000031613) ENSRBIG00000036521 ENSRBIG00000033614 HTR3D (ENSRBIG00000032796) HTR3C (ENSRBIG00000036099) HTR3E (ENSRBIG00000033134) ENSRBIG00000035285 EIF2B5 (ENSRBIG00000043590) DVL3 (ENSRBIG00000028805) ##22 AP2M1 (ENSRBIG00000009213) ABCF3 (ENSRBIG00000019800) VWA5B2 (ENSRBIG00000032106) ALG3 (ENSRBIG00000040140) ECE2 (ENSRBIG00000036172) PSMD2 (ENSRBIG00000006300) EIF4G1 (ENSRBIG00000037279) FAM131A (ENSRBIG00000041210) CLCN2 (ENSRBIG00000005264) POLR2H (ENSRBIG00000032148) THPO (ENSRBIG00000042346) CHRD (ENSRBIG00000026452) EPHB3 (ENSRBIG00000029113) MAGEF1 (ENSRBIG00000024480) VPS8 (ENSRBIG00000037729) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1274 ENSRROG00000026783 B3GNT5 (ENSRROG00000008670) MCF2L2 (ENSRROG00000033313) KLHL6 (ENSRROG00000010778) KLHL24 (ENSRROG00000036034) YEATS2 (ENSRROG00000033714) ENSRROG00000036443 MAP6D1 (ENSRROG00000043284) PARL (ENSRROG00000042482) ABCC5 (ENSRROG00000044495) HTR3D (ENSRROG00000019651) HTR3C (ENSRROG00000040115) HTR3E (ENSRROG00000008280) ENSRROG00000032052 EIF2B5 (ENSRROG00000037560) DVL3 (ENSRROG00000034279) ##22 AP2M1 (ENSRROG00000036642) ABCF3 (ENSRROG00000043684) VWA5B2 (ENSRROG00000035763) ALG3 (ENSRROG00000045654) CAMK2N2 (ENSRROG00000041861) ECE2 (ENSRROG00000002110) PSMD2 (ENSRROG00000044729) EIF4G1 (ENSRROG00000004376) FAM131A (ENSRROG00000029240) CLCN2 (ENSRROG00000034513) POLR2H (ENSRROG00000040465) THPO (ENSRROG00000044393) CHRD (ENSRROG00000045705) EPHB3 (ENSRROG00000018942) MAGEF1 (ENSRROG00000006271) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159676 ENSGT00940000161734 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00910000147149 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000154037.A ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.b.a ENSGT00940000163899 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B.a ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000158024.C Gibbon MODERN SPECIES 1 LAMP3 (ENSNLEG00000006034) MCF2L2 (ENSNLEG00000006037) B3GNT5 (ENSNLEG00000018942) ENSNLEG00000006063 KLHL24 (ENSNLEG00000006066) YEATS2 (ENSNLEG00000006070) ENSNLEG00000034670 PARL (ENSNLEG00000006072) ABCC5 (ENSNLEG00000006079) ENSNLEG00000035193 ENSNLEG00000034463 HTR3C (ENSNLEG00000026619) HTR3E (ENSNLEG00000026869) EIF2B5 (ENSNLEG00000006103) ENSNLEG00000029322 DVL3 (ENSNLEG00000006124) ##22 AP2M1 (ENSNLEG00000006139) ABCF3 (ENSNLEG00000006173) VWA5B2 (ENSNLEG00000006214) ALG3 (ENSNLEG00000006230) ECE2 (ENSNLEG00000006276) PSMD2 (ENSNLEG00000006305) EIF4G1 (ENSNLEG00000006350) FAM131A (ENSNLEG00000027935) CLCN2 (ENSNLEG00000006373) ENSNLEG00000029447 THPO (ENSNLEG00000006409) CHRD (ENSNLEG00000006417) ENSNLEG00000018953 EPHB3 (ENSNLEG00000006254) MAGEF1 (ENSNLEG00000018943) Hominidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159676 ENSGT00940000161734 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00910000147149 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000154037.A ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.b.a ENSGT00940000163899 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B.a ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000158024.C Orangutan MODERN SPECIES 16 LAMP3 (ENSPPYG00000014332) MCF2L2 (ENSPPYG00000014333) B3GNT5 (ENSPPYG00000032259) KLHL6 (ENSPPYG00000029418) KLHL24 (ENSPPYG00000014335) YEATS2 (ENSPPYG00000014336) MAP6D1 (ENSPPYG00000035906) PARL (ENSPPYG00000014338) ABCC5 (ENSPPYG00000014339) ENSPPYG00000014340 HTR3C (ENSPPYG00000014341) HTR3E (ENSPPYG00000014342) ENSPPYG00000014343 EIF2B5 (ENSPPYG00000014344) ENSPPYG00000037065 DVL3 (ENSPPYG00000014345) ##22 AP2M1 (ENSPPYG00000014346) ABCF3 (ENSPPYG00000014347) VWA5B2 (ENSPPYG00000014349) ALG3 (ENSPPYG00000014350) EEF1AKMT4 (ENSPPYG00000014351) CAMK2N2 (ENSPPYG00000014352) ECE2 (ENSPPYG00000014353) PSMD2 (ENSPPYG00000014354) EIF4G1 (ENSPPYG00000025902) ENSPPYG00000014355 CLCN2 (ENSPPYG00000014356) POLR2H (ENSPPYG00000014357) ENSPPYG00000014358 CHRD (ENSPPYG00000014359) EPHB3 (ENSPPYG00000032019) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161734 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00910000147149 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 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ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000158024.C Human MODERN SPECIES 15 MCCC1 (ENSG00000078070) LAMP3 (ENSG00000078081) MCF2L2 (ENSG00000053524) B3GNT5 (ENSG00000176597) KLHL6 (ENSG00000172578) KLHL24 (ENSG00000114796) YEATS2 (ENSG00000163872) ENSG00000283765 MAP6D1 (ENSG00000180834) PARL (ENSG00000175193) ABCC5 (ENSG00000114770) HTR3D (ENSG00000186090) HTR3C (ENSG00000178084) HTR3E (ENSG00000186038) EIF2B5 (ENSG00000145191) DVL3 (ENSG00000161202) ##22 AP2M1 (ENSG00000161203) ABCF3 (ENSG00000161204) VWA5B2 (ENSG00000145198) ALG3 (ENSG00000214160) EEF1AKMT4 (ENSG00000284753) EEF1AKMT4-ECE2 (ENSG00000284917) CAMK2N2 (ENSG00000163888) ECE2 (ENSG00000145194) PSMD2 (ENSG00000175166) EIF4G1 (ENSG00000114867) FAM131A (ENSG00000175182) CLCN2 (ENSG00000114859) POLR2H (ENSG00000163882) THPO (ENSG00000090534) CHRD (ENSG00000090539) Pan ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159676 ENSGT00940000161734 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a 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Tree shrew MODERN SPECIES 2952 DVL3 (ENSTBEG00000010328) ##22 AP2M1 (ENSTBEG00000011500) ABCF3 (ENSTBEG00000011827) Glires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159676 ENSGT00940000161734 ENSGT00940000163715.a ENSGT00990000203899 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.b.a ENSGT00940000163899 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159676 ENSGT00940000161734 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a ENSGT00940000156739.b.a ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132 Rabbit MODERN SPECIES 5 ENSOCUG00000032488 ADIPOQ (ENSOCUG00000026268) B3GNT5 (ENSOCUG00000008691) MCF2L2 (ENSOCUG00000008674) KLHL6 (ENSOCUG00000007431) KLHL24 (ENSOCUG00000013065) YEATS2 (ENSOCUG00000011947) MAP6D1 (ENSOCUG00000011959) ENSOCUG00000007882 ENSOCUG00000022628 ABCC5 (ENSOCUG00000007887) ENSOCUG00000011732 ENSOCUG00000010112 ENSOCUG00000023795 EIF2B5 (ENSOCUG00000004536) DVL3 (ENSOCUG00000036386) ##22 AP2M1 (ENSOCUG00000004556) ABCF3 (ENSOCUG00000004565) VWA5B2 (ENSOCUG00000014683) ALG3 (ENSOCUG00000026514) EEF1AKMT4 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SPECIES 5 ENSGT00940000156162.C.k ENSGT00940000154552.b ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000161734 ENSGT00940000159676 ENSGT00990000203899 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000156162.C.k ENSGT00940000154552.b ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000159676 ENSGT00990000203899 ENSGT00940000161734 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 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SPECIES 2 ENSGT00940000156162.C.k ENSGT00940000154552.b ENSGT00940000156941 ENSGT00940000164015 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000159676 ENSGT00990000203899 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132 Kangaroo rat MODERN SPECIES 481 Sox2 (ENSDORG00000007481) Atp11b (ENSDORG00000009378) ENSDORG00000023700 Mccc1 (ENSDORG00000000473) ENSDORG00000000477 B3gnt5 (ENSDORG00000014358) ENSDORG00000000027 Klhl24 (ENSDORG00000025427) Yeats2 (ENSDORG00000014924) Parl (ENSDORG00000014935) Cyp2ab1 (ENSDORG00000026348) Abcc5 (ENSDORG00000014941) Eif2b5 (ENSDORG00000005107) Dvl3 (ENSDORG00000004638) ##22 Ap2m1 (ENSDORG00000004640) Abcf3 (ENSDORG00000024153) Vwa5b2 (ENSDORG00000007935) Alg3 (ENSDORG00000007936) Ece2 (ENSDORG00000007937) Psmd2 (ENSDORG00000007939) ENSDORG00000029000 ENSDORG00000010226 Fam131a (ENSDORG00000023946) Clcn2 (ENSDORG00000010613) Polr2h (ENSDORG00000027475) ENSDORG00000010616 Chrd (ENSDORG00000010617) Ephb3 (ENSDORG00000003084) ENSDORG00000025676 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000159676 ENSGT00990000203899 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 54 Bdh1 (ENSJJAG00000021958) Apod (ENSJJAG00000023745) Ppp1r2 (ENSJJAG00000003650) Acap2 (ENSJJAG00000023457) Xxylt1 (ENSJJAG00000023864) Fam43a (ENSJJAG00000010833) Lsg1 (ENSJJAG00000015513) Tmem44 (ENSJJAG00000011725) Klhl24 (ENSJJAG00000024367) Yeats2 (ENSJJAG00000017369) ENSJJAG00000003735 Parl (ENSJJAG00000009964) ENSJJAG00000020951 Abcc5 (ENSJJAG00000018438) Eif2b5 (ENSJJAG00000004949) Dvl3 (ENSJJAG00000011264) ##22 Ap2m1 (ENSJJAG00000024086) Abcf3 (ENSJJAG00000014872) Vwa5b2 (ENSJJAG00000011906) Alg3 (ENSJJAG00000000348) Camk2n2 (ENSJJAG00000023253) Ece2 (ENSJJAG00000014145) Psmd2 (ENSJJAG00000024332) ENSJJAG00000020262 ENSJJAG00000012185 Fam131a (ENSJJAG00000019311) Clcn2 (ENSJJAG00000015086) Polr2h (ENSJJAG00000015574) ENSJJAG00000018272 Chrd (ENSJJAG00000020171) ENSJJAG00000021068 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000159676 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(ENSNGAG00000021473) ENSNGAG00000023997 Thpo (ENSNGAG00000024253) Chrd (ENSNGAG00000002968) Ephb3 (ENSNGAG00000023003) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000002408 ENSGT00390000002511 ENSGT00390000010239 ENSGT00550000074919 ENSGT00940000164015 ENSGT00940000159676 ENSGT00990000203899 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132 Murinae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01090000259995.b.b.a.a.a.i ENSGT01090000259995.b.b.a.a.b ENSGT01090000259995.b.b.a.a.a.j ENSGT01090000259995.b.b.b ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000159676 ENSGT00990000203899 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132 Rat MODERN SPECIES 2 Or2l13c (ENSRNOG00000068165) Or2aj4 (ENSRNOG00000049950) Or2aj4b (ENSRNOG00000048434) Lamp3 (ENSRNOG00000022792) B3gnt5 (ENSRNOG00000046258) AABR07034706.1 (ENSRNOG00000038119) Klhl6 (ENSRNOG00000001908) Klhl24 (ENSRNOG00000033372) Yeats2 (ENSRNOG00000023107) Map6d1 (ENSRNOG00000001911) Parl (ENSRNOG00000023271) Cyp2ab1 (ENSRNOG00000042367) Abcc5 (ENSRNOG00000029178) Rps15al2 (ENSRNOG00000032877) Eif2b5 (ENSRNOG00000038160) Dvl3 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ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132 Shrew mouse MODERN SPECIES 3 MGP_PahariEiJ_G0016266 Or2l13 (MGP_PahariEiJ_G0016267) Or2l5 (MGP_PahariEiJ_G0016268) Or2l13b (MGP_PahariEiJ_G0016269) Lamp3 (MGP_PahariEiJ_G0016270) B3gnt5 (MGP_PahariEiJ_G0016271) A930003A15Rik (MGP_PahariEiJ_G0016272) Klhl6 (MGP_PahariEiJ_G0016273) Klhl24 (MGP_PahariEiJ_G0016274) Yeats2 (MGP_PahariEiJ_G0016275) Map6d1 (MGP_PahariEiJ_G0016276) Parl (MGP_PahariEiJ_G0016277) Cyp2ab1 (MGP_PahariEiJ_G0016278) Abcc5 (MGP_PahariEiJ_G0016279) Eif2b5 (MGP_PahariEiJ_G0016280) Dvl3 (MGP_PahariEiJ_G0016281) ##22 Ap2m1 (MGP_PahariEiJ_G0016282) Abcf3 (MGP_PahariEiJ_G0016283) Vwa5b2 (MGP_PahariEiJ_G0016284) Alg3 (MGP_PahariEiJ_G0016285) Ece2 (MGP_PahariEiJ_G0016286) Camk2n2 (MGP_PahariEiJ_G0016287) MGP_PahariEiJ_G0016288 MGP_PahariEiJ_G0016289 MGP_PahariEiJ_G0016290 Fam131a (MGP_PahariEiJ_G0016291) Clcn2 (MGP_PahariEiJ_G0016292) Polr2h (MGP_PahariEiJ_G0016293) Thpo (MGP_PahariEiJ_G0016294) Chrd (MGP_PahariEiJ_G0016295) MGP_PahariEiJ_G0016296 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01090000259995.b.b.a.a.a.i ENSGT01090000259995.b.b.a.a.b ENSGT01090000259995.b.b.a.a.a.j ENSGT01090000259995.b.b.b ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000159676 ENSGT00990000203899 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000156921 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 7 MGP_CAROLIEiJ_G0020562 Or2l5 (MGP_CAROLIEiJ_G0020563) MGP_CAROLIEiJ_G0020564 MGP_CAROLIEiJ_G0020565 Lamp3 (MGP_CAROLIEiJ_G0020566) B3gnt5 (MGP_CAROLIEiJ_G0020567) A930003A15Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0020568) Klhl6 (MGP_CAROLIEiJ_G0020569) Klhl24 (MGP_CAROLIEiJ_G0020570) Yeats2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020571) Map6d1 (MGP_CAROLIEiJ_G0020572) Parl (MGP_CAROLIEiJ_G0020573) Cyp2ab1 (MGP_CAROLIEiJ_G0020574) Abcc5 (MGP_CAROLIEiJ_G0020575) Eif2b5 (MGP_CAROLIEiJ_G0020576) Dvl3 (MGP_CAROLIEiJ_G0020577) ##22 Ap2m1 (MGP_CAROLIEiJ_G0020578) Abcf3 (MGP_CAROLIEiJ_G0020579) Vwa5b2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020580) Alg3 (MGP_CAROLIEiJ_G0020581) Ece2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020582) Camk2n2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020583) MGP_CAROLIEiJ_G0020584 MGP_CAROLIEiJ_G0020585 Eif4g1 (MGP_CAROLIEiJ_G0020586) Fam131a (MGP_CAROLIEiJ_G0020587) Clcn2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020588) Polr2h (MGP_CAROLIEiJ_G0020589) Thpo (MGP_CAROLIEiJ_G0020590) Chrd (MGP_CAROLIEiJ_G0020591) Teddm3 (MGP_CAROLIEiJ_G0020592) Mus_B ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01090000259995.b.b.a.a.a.i ENSGT01090000259995.b.b.a.a.b ENSGT01090000259995.b.b.a.a.a.j ENSGT01090000259995.b.b.b.i ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000159676 ENSGT00990000203899 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B.c ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132 Mouse MODERN SPECIES 7 Or2l13b (ENSMUSG00000061361) Or2aj4 (ENSMUSG00000068535) Or2aj5 (ENSMUSG00000062245) Or2aj6 (ENSMUSG00000060480) Lamp3 (ENSMUSG00000041247) B3gnt5 (ENSMUSG00000022686) A930003A15Rik (ENSMUSG00000075330) Klhl6 (ENSMUSG00000043008) Klhl24 (ENSMUSG00000062901) Yeats2 (ENSMUSG00000041215) Map6d1 (ENSMUSG00000041205) Parl (ENSMUSG00000033918) Cyp2ab1 (ENSMUSG00000022818) Abcc5 (ENSMUSG00000022822) Eif2b5 (ENSMUSG00000003235) Dvl3 (ENSMUSG00000003233) ##22 Ap2m1 (ENSMUSG00000022841) Abcf3 (ENSMUSG00000003234) Vwa5b2 (ENSMUSG00000046613) Alg3 (ENSMUSG00000033809) Eef1akmt4 (ENSMUSG00000115219) Eef1ece2 (ENSMUSG00000115293) Camk2n2 (ENSMUSG00000051146) Ece2 (ENSMUSG00000022842) Psmd2 (ENSMUSG00000006998) Eif4g1 (ENSMUSG00000045983) Fam131a (ENSMUSG00000050821) Clcn2 (ENSMUSG00000022843) Polr2h (ENSMUSG00000021018) Thpo (ENSMUSG00000022847) Chrd (ENSMUSG00000006958) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01090000259995.b.b.a.a.a.i ENSGT01090000259995.b.b.a.a.b ENSGT01090000259995.b.b.a.a.a.j ENSGT01090000259995.b.b.b.i ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000159676 ENSGT00990000203899 ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B.c ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000158024.C Steppe mouse MODERN SPECIES 2878 Or2l5 (ENSMSIG00000010498) Or2l13b (ENSMSIG00000010505) ENSMSIG00000010518 Lamp3 (ENSMSIG00000010525) B3gnt5 (ENSMSIG00000010550) A930003A15Rik (ENSMSIG00000010562) Klhl6 (ENSMSIG00000010572) Klhl24 (ENSMSIG00000010606) Yeats2 (ENSMSIG00000010643) Map6d1 (ENSMSIG00000010692) Parl (ENSMSIG00000010709) Cyp2ab1 (ENSMSIG00000010757) ENSMSIG00000010802 ENSMSIG00000010855 Eif2b5 (ENSMSIG00000010879) Dvl3 (ENSMSIG00000010921) ##22 spretus MODERN SPECIES 7 MGP_SPRETEiJ_G0021459 MGP_SPRETEiJ_G0021460 MGP_SPRETEiJ_G0021461 MGP_SPRETEiJ_G0021462 Lamp3 (MGP_SPRETEiJ_G0021463) B3gnt5 (MGP_SPRETEiJ_G0021464) A930003A15Rik (MGP_SPRETEiJ_G0021465) Klhl6 (MGP_SPRETEiJ_G0021466) Klhl24 (MGP_SPRETEiJ_G0021467) Yeats2 (MGP_SPRETEiJ_G0021468) Map6d1 (MGP_SPRETEiJ_G0021469) Parl (MGP_SPRETEiJ_G0021470) Cyp2ab1 (MGP_SPRETEiJ_G0021471) Abcc5 (MGP_SPRETEiJ_G0021472) Eif2b5 (MGP_SPRETEiJ_G0021473) Dvl3 (MGP_SPRETEiJ_G0021474) ##22 Ap2m1 (MGP_SPRETEiJ_G0021475) Abcf3 (MGP_SPRETEiJ_G0021476) Vwa5b2 (MGP_SPRETEiJ_G0021477) Alg3 (MGP_SPRETEiJ_G0021478) Ece2 (MGP_SPRETEiJ_G0021479) Camk2n2 (MGP_SPRETEiJ_G0021480) MGP_SPRETEiJ_G0021481 MGP_SPRETEiJ_G0021482 Eif4g1 (MGP_SPRETEiJ_G0021483) Fam131a (MGP_SPRETEiJ_G0021484) Clcn2 (MGP_SPRETEiJ_G0021485) Polr2h (MGP_SPRETEiJ_G0021486) Thpo (MGP_SPRETEiJ_G0021487) Chrd (MGP_SPRETEiJ_G0021488) Ephb3 (MGP_SPRETEiJ_G0021489) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000002511 ENSGT00390000010239 ENSGT00550000074919 ENSGT00940000164015 ENSGT00940000159676 ENSGT00990000203899 ENSGT00940000163715.a ENSGT00940000154345.b ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000155470.b ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 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ENSGT00940000158024.C Golden Hamster MODERN SPECIES 645 Parl (ENSMAUG00000004411) Abcc5 (ENSMAUG00000016654) Eif2b5 (ENSMAUG00000018803) Dvl3 (ENSMAUG00000018768) ##22 Ap2m1 (ENSMAUG00000021138) Abcf3 (ENSMAUG00000017666) Vwa5b2 (ENSMAUG00000008822) Alg3 (ENSMAUG00000019456) Camk2n2 (ENSMAUG00000009092) Ece2 (ENSMAUG00000011426) Psmd2 (ENSMAUG00000014316) ENSMAUG00000008684 Eif4g1 (ENSMAUG00000021452) Fam131a (ENSMAUG00000015455) Clcn2 (ENSMAUG00000020728) Polr2h (ENSMAUG00000016338) Thpo (ENSMAUG00000018682) Chrd (ENSMAUG00000019283) Ephb3 (ENSMAUG00000012646) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 382 ENSCGRG00001002545 ENSCGRG00001009167 ENSCGRG00001008005 Lamp3 (ENSCGRG00001020302) B3gnt5 (ENSCGRG00001009729) A930003A15Rik (ENSCGRG00001011504) ENSCGRG00001013945 Klhl24 (ENSCGRG00001016212) Yeats2 (ENSCGRG00001018275) Map6d1 (ENSCGRG00001019708) Parl (ENSCGRG00001023889) Cyp2ab1 (ENSCGRG00001000606) Abcc5 (ENSCGRG00001020997) ENSCGRG00001023699 Eif2b5 (ENSCGRG00001008638) Dvl3 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ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132 Prairie vole MODERN SPECIES 126 ENSMOCG00000005724 ENSMOCG00000002427 ENSMOCG00000001652 ENSMOCG00000001120 ENSMOCG00000022739 ENSMOCG00000001746 B3gnt5 (ENSMOCG00000018327) Klhl6 (ENSMOCG00000010299) Klhl24 (ENSMOCG00000001149) Yeats2 (ENSMOCG00000020307) Map6d1 (ENSMOCG00000016574) Parl (ENSMOCG00000015256) Cyp2ab1 (ENSMOCG00000006421) Abcc5 (ENSMOCG00000004720) Eif2b5 (ENSMOCG00000016708) Dvl3 (ENSMOCG00000012179) ##22 Ap2m1 (ENSMOCG00000014484) Abcf3 (ENSMOCG00000006812) Vwa5b2 (ENSMOCG00000003248) Alg3 (ENSMOCG00000017690) Ece2 (ENSMOCG00000001939) Camk2n2 (ENSMOCG00000012422) Psmd2 (ENSMOCG00000016565) Eif4g1 (ENSMOCG00000016131) Fam131a (ENSMOCG00000009027) Clcn2 (ENSMOCG00000001859) Polr2h (ENSMOCG00000004886) Thpo (ENSMOCG00000014210) Chrd (ENSMOCG00000016712) Ephb3 (ENSMOCG00000015859) Vps8 (ENSMOCG00000017404) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 3 Tbccd1 (ENSPEMG00000014115) Crygs (ENSPEMG00000017836) Dgkg (ENSPEMG00000015589) Etv5 (ENSPEMG00000006146) ENSPEMG00000024986 ENSPEMG00000030653 Tra2b (ENSPEMG00000020933) Klhl6 (ENSPEMG00000016219) Klhl24 (ENSPEMG00000005554) Yeats2 (ENSPEMG00000016656) ENSPEMG00000025222 Parl (ENSPEMG00000017067) Cyp2ab1 (ENSPEMG00000010910) Abcc5 (ENSPEMG00000009351) Eif2b5 (ENSPEMG00000009037) Dvl3 (ENSPEMG00000017805) ##22 Ap2m1 (ENSPEMG00000006895) Abcf3 (ENSPEMG00000013382) Vwa5b2 (ENSPEMG00000014803) Alg3 (ENSPEMG00000011841) Eef1akmt4 (ENSPEMG00000031228) Camk2n2 (ENSPEMG00000010089) Ece2 (ENSPEMG00000000352) Psmd2 (ENSPEMG00000011042) Eif4g1 (ENSPEMG00000017256) Fam131a (ENSPEMG00000028135) Clcn2 (ENSPEMG00000008108) Polr2h (ENSPEMG00000029633) Thpo (ENSPEMG00000009973) Chrd (ENSPEMG00000009578) Teddm3 (ENSPEMG00000025801) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000164015 ENSGT00940000159676 ENSGT00940000161734 ENSGT00940000163715.a ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a.b ENSGT00940000156739.b.b.a.a ENSGT00940000156739.a ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00470000042552 ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00940000154552 ENSGT00940000156941 ENSGT00940000164015 ENSGT00940000159676 ENSGT00940000161734 ENSGT00940000163715.a ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a.b ENSGT00940000156739.b.b.a.a ENSGT00940000156739.a ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096.m ENSGT00390000013904 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 Armadillo MODERN SPECIES 2155 DCUN1D1 (ENSDNOG00000019073) MCCC1 (ENSDNOG00000012070) LAMP3 (ENSDNOG00000033820) B3GNT5 (ENSDNOG00000010581) MCF2L2 (ENSDNOG00000010536) ENSDNOG00000046501 KLHL24 (ENSDNOG00000039799) YEATS2 (ENSDNOG00000012083) MAP6D1 (ENSDNOG00000036016) PARL (ENSDNOG00000035254) ABCC5 (ENSDNOG00000008128) ENSDNOG00000038053 ENSDNOG00000024009 ENSDNOG00000019232 EIF2B5 (ENSDNOG00000007493) DVL3 (ENSDNOG00000025319) ##22 AP2M1 (ENSDNOG00000015738) ABCF3 (ENSDNOG00000015742) VWA5B2 (ENSDNOG00000015749) ALG3 (ENSDNOG00000024389) CAMK2N2 (ENSDNOG00000045842) ECE2 (ENSDNOG00000025430) PSMD2 (ENSDNOG00000002073) EIF4G1 (ENSDNOG00000002245) CLCN2 (ENSDNOG00000005730) POLR2H (ENSDNOG00000044402) ENSDNOG00000031228 CHRD (ENSDNOG00000017753) Sloth MODERN SPECIES 3713 EIF2B5 (ENSCHOG00000002782) ENSCHOG00000002794 ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154552 ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000164015 ENSGT00940000159676 ENSGT00940000161734 ENSGT00940000163715.a ENSGT00940000154345.a ENSGT00940000156789 ENSGT00530000063947.B ENSGT00390000013063 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000156739.b.b.a.b ENSGT00940000156739.b.b.a.a ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096 ENSGT00390000013904 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00470000042552 ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132 Tenrec MODERN SPECIES 14684 DVL3 (ENSETEG00000012283) ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000154552 ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00940000164015 ENSGT00940000159676 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##22 ABCF3 (ENSSHAG00000002957) AP2M1 (ENSSHAG00000002742) VWA5B2 (ENSSHAG00000025990) ALG3 (ENSSHAG00000024834) EEF1AKMT4 (ENSSHAG00000032233) ECE2 (ENSSHAG00000004390) EIF4G1 (ENSSHAG00000031645) PSMD2 (ENSSHAG00000005548) FAM131A (ENSSHAG00000026992) CLCN2 (ENSSHAG00000005985) POLR2H (ENSSHAG00000006304) ENSSHAG00000032367 CHRD (ENSSHAG00000006533) ENSSHAG00000006741 EPHB3 (ENSSHAG00000008131) Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00530000063106.A ENSGT00950000183063.c.b.a ENSGT00940000157673 ENSGT00940000159794 ENSGT00940000160041 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000159706 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000160400 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000164221.b.a ENSGT00940000156739 ENSGT00940000164221.b.b ENSGT00940000163899 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096.e ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00470000042552 ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00530000063106.A ENSGT00950000183063.c.b.a ENSGT00940000157673 ENSGT00940000159794 ENSGT00940000160041 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000159706 ENSGT00940000163497 ENSGT00940000160400 ENSGT00940000155470.b ENSGT00940000164221.b.a ENSGT00940000156739 ENSGT00940000164221.b.b ENSGT00940000163899 ENSGT00510000047568 ENSGT00950000182903.a.a ##22 ENSGT00940000159223 ENSGT00940000155604 ENSGT00940000157096.e ENSGT00390000013904 ENSGT00940000164140 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00940000156921 ENSGT00940000153386.B ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 ENSGT00390000018195 ENSGT00390000006294 ENSGT00940000161767 ENSGT00940000164132.a koala MODERN SPECIES 109 ECEL1 (ENSPCIG00000003433) CHRND (ENSPCIG00000033624) CHRNG (ENSPCIG00000002497) EIF4E2 (ENSPCIG00000002486) CAPN10 (ENSPCIG00000002466) ENSPCIG00000002428 RNPEPL1 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ENSGT00950000183106.a.a.b ENSGT00940000155439 Frog MODERN SPECIES 5 htr2b (ENSXETG00000009523) psmd1 (ENSXETG00000009522) c2orf72 (ENSXETG00000033960) rpl35a (ENSXETG00000027871) iqcg (ENSXETG00000030781) lrch3 (ENSXETG00000014298) ENSXETG00000046089 fyttd1 (ENSXETG00000024516) capn10 (ENSXETG00000014297) rnpepl1 (ENSXETG00000037567) abcc5 (ENSXETG00000014295) ENSXETG00000033186 ENSXETG00000014294 eif2b5 (ENSXETG00000014293) ENSXETG00000035669 dvl3 (ENSXETG00000017275) ##22 ap2m1 (ENSXETG00000017276) ENSXETG00000037790 abcf3 (ENSXETG00000017277) ENSXETG00000040622 ENSXETG00000041513 ccdc150 (ENSXETG00000017278) vwa5b2 (ENSXETG00000017279) alg3 (ENSXETG00000017280) ttc16 (ENSXETG00000017281) EEF1AKMT4 (ENSXETG00000017282) camk2n2 (ENSXETG00000038611) ece2 (ENSXETG00000017285) psmd2 (ENSXETG00000017286) eif4g1 (ENSXETG00000017287) FAM131A (ENSXETG00000046551) Leishan spiny toad MODERN SPECIES 7 ENSLLEG00000024837 PSMD1 (ENSLLEG00000024950) HTR2B (ENSLLEG00000025791) ENSLLEG00000025817 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(ENSEBUG00000012730) ENSEBUG00000010756 Hagfish MODERN SPECIES 226 ENSEBUG00000015110 ENSEBUG00000013126 ap2m1b (ENSEBUG00000009535) ENSEBUG00000003527 #22 slc25a32a (ENSEBUG00000003959) TRAPPC9 (ENSEBUG00000006144) ENSEBUG00000006479 armc1l (ENSEBUG00000015457) ENSEBUG00000004830 bhlhe23 (ENSEBUG00000005280) ENSEBUG00000003150 ENSEBUG00000006999 ENSEBUG00000004534 ENSEBUG00000000882 ENSEBUG00000006593 ENSEBUG00000015382 ABCA2 (ENSEBUG00000012395) ENSEBUG00000015313 ENSEBUG00000009440 Lamprey MODERN SPECIES 5700 ENSPMAG00000001236 #22 Ciona ANCESTRAL SPECIES 1199 ENSGT00950000182903.a #22 ENSGT00730000112388.a Ciona intestinalis MODERN SPECIES 61 ENSCING00000000169 ENSCING00000000097 ENSCING00000000099 ENSCING00000019735 ENSCING00000021094 ENSCING00000000101 ENSCING00000007867 ENSCING00000024341 ENSCING00000020277 ENSCING00000016175 ENSCING00000025189 ENSCING00000016115 ENSCING00000024175 ENSCING00000001592 ENSCING00000000096 dsh (ENSCING00000009658) #22 ENSCING00000016092 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Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.b.a ##22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 836 ENSGT00390000001509 ENSGT00950000182903.b.a ##22 ENSGT00940000160679 ENSGT00940000161264 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 286 ENSGT00940000161763 ENSGT00940000157644 ENSGT01100000263537.b.a.a.a.b ENSGT00950000183160.C ENSGT00940000156199.b ENSGT00940000156173 ENSGT00940000160300 ENSGT00940000162229 ENSGT01010000222360.B ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509 ENSGT00950000182903.b.a ##22 ENSGT00940000160679 ENSGT00940000161264 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000159351 ENSGT00940000158459 ENSGT00940000161187 ENSGT00940000158097 ENSGT00550000076432 ENSGT00390000010165 ENSGT00400000023987 ENSGT00730000111059 ENSGT00940000160734 ENSGT00940000163776.b ENSGT00940000163707 ENSGT00390000015823 ENSGT00940000159239 ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509 ENSGT00950000182903.b.a ##22 ENSGT00940000165549 ENSGT00940000157644 ENSGT01100000263537.b.a.a.a.b ENSGT00950000183160.C 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ENSGT00940000163259 ENSGT00940000153876.A Horse MODERN SPECIES 11 GNB1 (ENSECAG00000021999) NADK (ENSECAG00000022883) SLC35E2B (ENSECAG00000001580) ENSECAG00000002115 ENSECAG00000014774 MIB2 (ENSECAG00000014796) FNDC10 (ENSECAG00000029352) SSU72 (ENSECAG00000030504) ATAD3A (ENSECAG00000028977) VWA1 (ENSECAG00000033093) TMEM88B (ENSECAG00000040229) ANKRD65 (ENSECAG00000028668) CCNL2 (ENSECAG00000018423) ENSECAG00000052561 MXRA8 (ENSECAG00000020731) DVL1 (ENSECAG00000020745) ##22 TAS1R3 (ENSECAG00000022351) CPTP (ENSECAG00000023234) INTS11 (ENSECAG00000023292) PUSL1 (ENSECAG00000006248) ACAP3 (ENSECAG00000007315) SCNN1D (ENSECAG00000010898) UBE2J2 (ENSECAG00000015293) SDF4 (ENSECAG00000017831) C1QTNF12 (ENSECAG00000016576) TNFRSF4 (ENSECAG00000019948) TTLL10 (ENSECAG00000021628) TNFRSF18 (ENSECAG00000020810) C2H1orf159 (ENSECAG00000021734) ENSECAG00000022844 RNF223 (ENSECAG00000022747) Donkey DUPLICATION Donkey MODERN SPECIES 25 ENSEASG00005014470 MMP23B (ENSEASG00005027459) MIB2 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SPECIES 154 SLC35E2B (ENSODEG00000008487) ENSODEG00000010865 MMP23B (ENSODEG00000008758) ENSODEG00000009109 ENSODEG00000008784 ENSODEG00000019880 ENSODEG00000011387 TMEM240 (ENSODEG00000010456) ATAD3A (ENSODEG00000009657) VWA1 (ENSODEG00000008967) TMEM88B (ENSODEG00000009276) MRPL20 (ENSODEG00000010734) ENSODEG00000008816 AURKAIP1 (ENSODEG00000008719) MXRA8 (ENSODEG00000011254) DVL1 (ENSODEG00000009749) ##22 TAS1R3 (ENSODEG00000008890) CPTP (ENSODEG00000008044) INTS11 (ENSODEG00000009761) PUSL1 (ENSODEG00000008247) ACAP3 (ENSODEG00000008249) UBE2J2 (ENSODEG00000007876) C1QTNF12 (ENSODEG00000008805) B3GALT6 (ENSODEG00000008567) SDF4 (ENSODEG00000010985) TNFRSF4 (ENSODEG00000008108) TNFRSF18 (ENSODEG00000007932) TTLL10 (ENSODEG00000010677) C1orf159 (ENSODEG00000008028) AGRN (ENSODEG00000011082) ISG15 (ENSODEG00000007979) Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 193 GNB1 (ENSCLAG00000007026) NADK (ENSCLAG00000006095) SLC35E2B (ENSCLAG00000006943) ENSCLAG00000009196 MMP23B 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(ENSPANG00000044589) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 161 ENSGT00940000159239.l ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509 ENSGT00950000182903.b.a ##22 ENSGT00940000160679 ENSGT00940000161763 ENSGT00940000157644 ENSGT00950000183160.C ENSGT00940000156199.b ENSGT00940000162685 ENSGT00940000156173 ENSGT00940000160300 ENSGT01010000222360.B ENSGT00730000111452 ENSGT00730000111424 ENSGT00940000160919 ENSGT00390000009794 ENSGT00940000158337 ENSGT00940000162007 Sooty mangabey MODERN SPECIES 384 VWA1 (ENSCATG00000030646) TMEM88B (ENSCATG00000005573) ENSCATG00000036576 MRPL20 (ENSCATG00000033927) CCNL2 (ENSCATG00000030730) AURKAIP1 (ENSCATG00000037072) MXRA8 (ENSCATG00000022961) DVL1 (ENSCATG00000032511) ##22 TAS1R3 (ENSCATG00000004750) CPTP (ENSCATG00000038599) INTS11 (ENSCATG00000005882) PUSL1 (ENSCATG00000018260) ACAP3 (ENSCATG00000034448) SCNN1D (ENSCATG00000036571) UBE2J2 (ENSCATG00000020483) C1QTNF12 (ENSCATG00000041036) SDF4 (ENSCATG00000039922) TNFRSF4 (ENSCATG00000039854) TNFRSF18 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thornscrub tortoise MODERN SPECIES 9 MIB2 (ENSGEVG00005015000) ENSGEVG00005014972 ENSGEVG00005014941 FNDC10 (ENSGEVG00005014924) ENSGEVG00005014899 TMEM240 (ENSGEVG00005014856) ATAD3A (ENSGEVG00005014743) VWA1 (ENSGEVG00005014520) ENSGEVG00005014456 ANKRD65 (ENSGEVG00005014406) MRPL20 (ENSGEVG00005014373) CCNL2 (ENSGEVG00005014330) ENSGEVG00005014274 AURKAIP1 (ENSGEVG00005014255) MXRA8 (ENSGEVG00005014188) DVL1 (ENSGEVG00005014137) ##22 TAS1R3 (ENSGEVG00005014058) CPTP (ENSGEVG00005014036) INTS11 (ENSGEVG00005013979) ENSGEVG00005013960 PUSL1 (ENSGEVG00005013943) ACAP3 (ENSGEVG00005013733) SCNN1D (ENSGEVG00005013380) UBE2J2 (ENSGEVG00005013320) C1QTNF12 (ENSGEVG00005013293) SDF4 (ENSGEVG00005013176) ENSGEVG00005013155 ENSGEVG00005013134 C1orf159 (ENSGEVG00005013086) RNF223 (ENSGEVG00005013055) ENSGEVG00005012962 Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 708 MIB2 (ENSCABG00000000600) ENSCABG00000000588 ENSCABG00000000583 ENSCABG00000000579 TMEM240 (ENSCABG00000000573) ATAD3A 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##22 ENSGT00940000160679 ENSGT00940000161763 ENSGT00940000157644 ENSGT00950000183160.C ENSGT00940000156199.b ENSGT00940000162685 ENSGT00940000156173 ENSGT00940000160300 ENSGT00940000162229 ENSGT01010000222360.B ENSGT00390000009794 ENSGT00940000163259 ENSGT00940000158337 ENSGT00940000163056 ENSGT00390000017652 Zebra finch MODERN SPECIES 14 ENSTGUG00000003018 MMP23B (ENSTGUG00000003041) MIB2 (ENSTGUG00000003045) ENSTGUG00000003080 FNDC10 (ENSTGUG00000022277) ENSTGUG00000021162 TMEM240 (ENSTGUG00000003081) ATAD3A (ENSTGUG00000003082) VWA1 (ENSTGUG00000003108) ENSTGUG00000003111 MRPL20 (ENSTGUG00000003113) CCNL2 (ENSTGUG00000003114) ENSTGUG00000019705 AURKAIP1 (ENSTGUG00000003131) MXRA8 (ENSTGUG00000003136) DVL1 (ENSTGUG00000003140) ##22 TAS1R3 (ENSTGUG00000003175) CPTP (ENSTGUG00000023000) INTS11 (ENSTGUG00000003192) PUSL1 (ENSTGUG00000003214) ACAP3 (ENSTGUG00000003217) CORT (ENSTGUG00000016939) ENSTGUG00000003252 TARDBP (ENSTGUG00000003255) ENSTGUG00000021390 CASZ1 (ENSTGUG00000003269) 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ENSGT00950000183160.C ENSGT00940000156199.b ENSGT00940000168348 ENSGT00940000162685 ENSGT00940000156173 ENSGT00940000160300 ENSGT00940000162229 ENSGT01010000222360.B ENSGT01100000265027 ENSGT00940000166589 ENSGT00940000160919 Laterata ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000158097 ENSGT00940000164637 ENSGT00550000076432 ENSGT00940000165349.d.a.a ENSGT00390000010165 ENSGT00400000023987 ENSGT00730000111059 ENSGT00940000160734 ENSGT00940000163776.b ENSGT00940000163707 ENSGT00390000015823 ENSGT00940000159239 ENSGT00940000165046 ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509 ENSGT00950000182903.b.a ##22 ENSGT00940000160679 ENSGT00940000161763 ENSGT00940000157644.b ENSGT01100000263537.b.a.a.a.b ENSGT00950000183160.C ENSGT00940000156199.b ENSGT00940000168348 ENSGT00940000162685.a ENSGT00940000156173 ENSGT00940000160300 ENSGT00940000162229 ENSGT01010000222360.B ENSGT01100000265027 ENSGT00940000166589 ENSGT00940000160919 Common wall lizard MODERN SPECIES 16 MIB2 (ENSPMRG00000014371) ENSPMRG00000014313 FNDC10 (ENSPMRG00000014304) ENSPMRG00000014299 ENSPMRG00000014290 ENSPMRG00000014282 ATAD3A (ENSPMRG00000014266) VWA1 (ENSPMRG00000014245) ENSPMRG00000014206 ANKRD65 (ENSPMRG00000014199) MRPL20 (ENSPMRG00000014195) CCNL2 (ENSPMRG00000014186) ENSPMRG00000014180 AURKAIP1 (ENSPMRG00000014175) MXRA8 (ENSPMRG00000014170) DVL1 (ENSPMRG00000014160) ##22 ENSPMRG00000014148 TAS1R3 (ENSPMRG00000014138) CPTP (ENSPMRG00000014133) INTS11 (ENSPMRG00000014116) ENSPMRG00000013914 ENSPMRG00000013883 ENSPMRG00000013876 ACAP3 (ENSPMRG00000013857) ENSPMRG00000013849 ENSPMRG00000013840 ENSPMRG00000013827 C1QTNF12 (ENSPMRG00000013820) B3GALT6 (ENSPMRG00000013819) SDF4 (ENSPMRG00000013812) ENSPMRG00000013809 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 60 ENSSMRG00000009076 MMP23B (ENSSMRG00000009077) MIB2 (ENSSMRG00000009078) ENSSMRG00000009080 FNDC10 (ENSSMRG00000009081) ENSSMRG00000009082 ENSSMRG00000009084 TMEM240 (ENSSMRG00000009086) ATAD3A (ENSSMRG00000009089) VWA1 (ENSSMRG00000009114) ENSSMRG00000009115 ANKRD65 (ENSSMRG00000009116) CCNL2 (ENSSMRG00000009118) AURKAIP1 (ENSSMRG00000009119) MXRA8 (ENSSMRG00000009120) DVL1 (ENSSMRG00000009123) ##22 TAS1R3 (ENSSMRG00000009124) CPTP (ENSSMRG00000009125) INTS11 (ENSSMRG00000009127) ENSSMRG00000009132 PUSL1 (ENSSMRG00000009133) ACAP3 (ENSSMRG00000009142) ENSSMRG00000009144 ENSSMRG00000009162 UBE2J2 (ENSSMRG00000009163) C1QTNF12 (ENSSMRG00000009165) B3GALT6 (ENSSMRG00000009170) SDF4 (ENSSMRG00000009171) ENSSMRG00000009172 ENSSMRG00000009174 TTLL10 (ENSSMRG00000009175) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000161187 ENSGT00940000158097 ENSGT00940000164637 ENSGT00550000076432 ENSGT00940000165349.d.a.a ENSGT00390000010165 ENSGT00400000023987 ENSGT00730000111059 ENSGT00940000160734 ENSGT00940000163776.b ENSGT00940000163707 ENSGT00390000015823 ENSGT00940000159239 ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509 ENSGT00950000182903.b.a ##22 ENSGT00940000160679 ENSGT00940000161763 ENSGT00940000157644 ENSGT01100000263537.b.a.a.a.b ENSGT00950000183160.C ENSGT00940000156199.b ENSGT00940000168348 ENSGT00940000162685 ENSGT00940000156173 ENSGT00940000160300 ENSGT00940000162229 ENSGT01010000222360.B ENSGT00940000166589 ENSGT00940000160919 ENSGT00390000009794 Lizard MODERN SPECIES 1359 DVL1 (ENSACAG00000013652) ##22 ENSACAG00000022407 TAS1R3 (ENSACAG00000013878) CPTP (ENSACAG00000036606) INTS11 (ENSACAG00000013975) ENSACAG00000014106 PUSL1 (ENSACAG00000014111) ENSACAG00000035039 Elapidae DUPLICATION Elapidae DUPLICATION Elapidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000164637 ENSGT00550000076432 ENSGT00940000165349.d.a.a ENSGT00390000010165 ENSGT00400000023987 ENSGT00730000111059 ENSGT00940000160734 ENSGT00940000163776.b ENSGT00940000163707 ENSGT00390000015823.g.a ENSGT00940000169328.a.b ENSGT00390000015823.g.b ENSGT00940000159239 ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509 ENSGT00950000182903.b.a.w.a ##22 ENSGT00940000161763 ENSGT00940000157644 ENSGT01100000263537.b.a.a.a.b ENSGT00950000183160.C ENSGT00940000156199.b ENSGT00940000168348 ENSGT00940000162685 ENSGT00940000156173 ENSGT00940000160300 ENSGT00940000162229 ENSGT01010000222360.B ENSGT00940000160919 ENSGT00390000009794 ENSGT00940000163259 ENSGT00940000153876.A Indian cobra MODERN SPECIES 9 MMP23B (ENSNNAG00000010740) MIB2 (ENSNNAG00000010770) ENSNNAG00000010807 FNDC10 (ENSNNAG00000010915) ENSNNAG00000010935 ENSNNAG00000010944 TMEM240 (ENSNNAG00000010972) ATAD3A (ENSNNAG00000010987) VWA1 (ENSNNAG00000011062) ENSNNAG00000011080 ENSNNAG00000011089 MRPL20 (ENSNNAG00000011104) CCNL2 (ENSNNAG00000011131) AURKAIP1 (ENSNNAG00000011250) MXRA8 (ENSNNAG00000011263) ENSNNAG00000011298 ##22 CPTP (ENSNNAG00000011385) INTS11 (ENSNNAG00000011406) ENSNNAG00000011530 PUSL1 (ENSNNAG00000011544) ACAP3 (ENSNNAG00000011608) ENSNNAG00000011980 ENSNNAG00000012001 UBE2J2 (ENSNNAG00000012015) C1QTNF12 (ENSNNAG00000012048) TTLL10 (ENSNNAG00000012071) C1orf159 (ENSNNAG00000012111) ENSNNAG00000012162 HES4 (ENSNNAG00000012256) ENSNNAG00000012280 NOC2L (ENSNNAG00000012390) Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000158459 ENSGT00940000161187 ENSGT00940000158097 ENSGT00550000076432 ENSGT00940000165349.d.a.a ENSGT00390000010165 ENSGT00400000023987 ENSGT00730000111059 ENSGT00940000160734 ENSGT00940000163776.b ENSGT00940000163707 ENSGT00390000015823.g.a ENSGT00940000159239 ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509 ENSGT00950000182903.b.a.w.a ##22 ENSGT00940000161763 ENSGT00940000157644 ENSGT01100000263537.b.a.a.a.b ENSGT00950000183160.C ENSGT00940000156199.b ENSGT00940000168348 ENSGT00940000162685 ENSGT00940000156173 ENSGT00940000160300 ENSGT00940000162229 ENSGT01010000222360.B.g ENSGT00940000160919 ENSGT00390000009794 ENSGT00940000163259 ENSGT00940000153876.A Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000158459 ENSGT00940000161187 ENSGT00940000158097 ENSGT00550000076432 ENSGT00940000165349.d.a.a ENSGT00390000010165 ENSGT00400000023987 ENSGT00730000111059 ENSGT00940000160734 ENSGT00940000163776.b ENSGT00940000163707 ENSGT00390000015823.g.a ENSGT00940000159239 ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509 ENSGT00950000182903.b.a.w.a ##22 ENSGT00940000161763 ENSGT00940000157644 ENSGT01100000263537.b.a.a.a.b ENSGT00950000183160.C ENSGT00940000156199.b ENSGT00940000168348 ENSGT00940000162685 ENSGT00940000156173 ENSGT00940000160300 ENSGT00940000162229 ENSGT01010000222360.B.g ENSGT00940000160919 ENSGT00390000009794.a ENSGT00940000163259 ENSGT00940000153876.A Eastern brown snake MODERN SPECIES 79 MMP23B (ENSPTXG00000011234) MIB2 (ENSPTXG00000010789) FNDC10 (ENSPTXG00000010786) ENSPTXG00000010785 ENSPTXG00000010783 TMEM240 (ENSPTXG00000010782) ATAD3A (ENSPTXG00000010781) VWA1 (ENSPTXG00000010776) ENSPTXG00000010766 ANKRD65 (ENSPTXG00000010765) ENSPTXG00000010759 ENSPTXG00000010758 ENSPTXG00000010757 AURKAIP1 (ENSPTXG00000010756) MXRA8 (ENSPTXG00000010754) DVL1 (ENSPTXG00000010753) ##22 CPTP (ENSPTXG00000010752) INTS11 (ENSPTXG00000010750) ENSPTXG00000010749 ENSPTXG00000010747 ACAP3 (ENSPTXG00000010744) ENSPTXG00000010741 SCNN1D (ENSPTXG00000010736) UBE2J2 (ENSPTXG00000010735) B3GALT6 (ENSPTXG00000010733) SDF4 (ENSPTXG00000010731) TTLL10 (ENSPTXG00000010730) ENSPTXG00000010729 ENSPTXG00000010728 RNF223 (ENSPTXG00000010727) ENSPTXG00000010725 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 5179 ENSLLTG00000010973 ANKRD65 (ENSLLTG00000010982) MRPL20 (ENSLLTG00000011007) CCNL2 (ENSLLTG00000011026) AURKAIP1 (ENSLLTG00000011093) MXRA8 (ENSLLTG00000011121) DVL1 (ENSLLTG00000004731) ##22 CPTP (ENSLLTG00000004744) INTS11 (ENSLLTG00000004753) ENSLLTG00000004774 PUSL1 (ENSLLTG00000004778) Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.b.a.w.b ##22 Indian cobra MODERN SPECIES 243 CTDNEP1 (ENSNNAG00000012959) GABARAP (ENSNNAG00000012972) ENSNNAG00000012996 ENSNNAG00000013010 ENSNNAG00000013028 ##22 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.b.a.w.b ##22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.b.a.w.b ##22 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 157 MMP23B (ENSNSUG00000012260) MIB2 (ENSNSUG00000012261) ENSNSUG00000012340 ENSNSUG00000012342 ENSNSUG00000012343 TMEM240 (ENSNSUG00000012344) ATAD3A (ENSNSUG00000012345) VWA1 (ENSNSUG00000012346) ENSNSUG00000000067 ANKRD65 (ENSNSUG00000000097) ENSNSUG00000000116 ENSNSUG00000000123 ENSNSUG00000000135 AURKAIP1 (ENSNSUG00000000143) MXRA8 (ENSNSUG00000000154) ENSNSUG00000000179 ##22 CPTP (ENSNSUG00000000185) INTS11 (ENSNSUG00000000206) ENSNSUG00000001442 PUSL1 (ENSNSUG00000001444) ACAP3 (ENSNSUG00000001447) ENSNSUG00000001549 SCNN1D (ENSNSUG00000001551) ENSNSUG00000001555 UBE2J2 (ENSNSUG00000001557) C1QTNF12 (ENSNSUG00000001558) B3GALT6 (ENSNSUG00000001562) ENSNSUG00000001563 TTLL10 (ENSNSUG00000001568) C1orf159 (ENSNSUG00000001584) RNF223 (ENSNSUG00000001596) Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.b.a.x ##22 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.b.a.x ##22 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 6066 ENSLLTG00000009827 ##22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.b.a.x ##22 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 439 ENSNSUG00000009072 CAPN10 (ENSNSUG00000009018) RNPEPL1 (ENSNSUG00000009017) ABCC5 (ENSNSUG00000009016) ENSNSUG00000009015 EIF2B5 (ENSNSUG00000009014) ENSNSUG00000009013 ##22 Actinopterygii DUPLICATION Actinopterygii DUPLICATION Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.b.a.y.a ##22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.b.a.y.a ##22 Spotted gar MODERN SPECIES 664 LACTBL1 (ENSLOCG00000003404) ephb2b (ENSLOCG00000003331) ENSLOCG00000003320 VPS13D (ENSLOCG00000003214) dhrs3a (ENSLOCG00000003190) aadacl4 (ENSLOCG00000003171) CFAP107 (ENSLOCG00000003160) KLHDC7A (ENSLOCG00000003121) igsf21a (ENSLOCG00000003096) ENSLOCG00000018083 ARHGEF10L (ENSLOCG00000003027) rcc2 (ENSLOCG00000003000) padi2 (ENSLOCG00000002953) aurkaip1 (ENSLOCG00000002935) mxra8b (ENSLOCG00000002916) dvl1b (ENSLOCG00000002858) ##22 PLEKHG5 (ENSLOCG00000002820) NOL9 (ENSLOCG00000002798) klhl21 (ENSLOCG00000002774) THAP3 (ENSLOCG00000002750) dnajc11a (ENSLOCG00000002720) CAMTA1 (ENSLOCG00000002655) vamp3 (ENSLOCG00000002645) per3 (ENSLOCG00000002607) ENSLOCG00000002591 ENSLOCG00000002573 tnfrsf9b (ENSLOCG00000002559) ybx1 (ENSLOCG00000002530) ppih (ENSLOCG00000002496) taf10 (ENSLOCG00000002478) efhd2 (ENSLOCG00000002453) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 805 ENSGT00390000001509.a ENSGT00950000182903.b.a.y.a ##22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 735 ENSGT00390000001509.a ENSGT00950000182903.b.a.y.a ##22 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00530000063849.B ENSGT00940000165619.b ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00730000111186 ENSGT00390000008224 ENSGT00940000157076.j.c ENSGT00390000016889 ENSGT00940000160431 ENSGT00940000154102.a.h ENSGT01050000244888.a.b ENSGT00940000158083.b ENSGT00940000157665.b ENSGT00510000046843.a.b.l ENSGT00390000001509.a ENSGT00950000182903.b.a.y.a ##22 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00730000111186 ENSGT00390000008224 ENSGT00940000157076.j.c ENSGT00390000016889 ENSGT00940000160431 ENSGT00940000154102.a.h ENSGT01050000244888.a.b ENSGT00940000158083.b ENSGT00940000157665.b ENSGT00510000046843.a.b.l ENSGT00390000001509.a ENSGT00950000182903.b.a.y.a ##22 ENSGT00940000155740 ENSGT00940000156368.a ENSGT00940000154468.tb.a ENSGT00940000157830.c ENSGT00940000166479 ENSGT00950000182991.A.a.c.a.a ENSGT00940000161652.a ENSGT00950000182986.a.a ENSGT00390000006896 ENSGT00920000149095 ENSGT00940000162989.e ENSGT00940000164703.a ENSGT00940000157024.k.a ENSGT00940000158263 ENSGT00940000154404.b Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000166926 ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00730000111186 ENSGT00390000008224 ENSGT00940000157076.j.c.a ENSGT00940000160431 ENSGT00940000154102.a.h ENSGT01050000244888.a.b ENSGT00940000158083.b ENSGT00940000157665.b ENSGT00510000046843.a.b.l ENSGT00390000001509.a ENSGT00950000182903.b.a.y.a ##22 ENSGT00940000155740 ENSGT00940000154468.tb.a ENSGT00940000157830.c ENSGT00940000166479 ENSGT00950000182991.A.a.c.a.a ENSGT00950000182986.a.a ENSGT00390000006896 ENSGT00920000149095 ENSGT00940000162989.e ENSGT00940000164703.a ENSGT00940000157024.k.a ENSGT00940000158263 ENSGT00940000154404.b ENSGT00940000159692 ENSGT00390000014507.b Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000166926 ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00730000111186 ENSGT00390000008224 ENSGT00940000157076.j.c.a ENSGT00940000160431 ENSGT00940000154102.a.h ENSGT01050000244888.a.b ENSGT00940000158083.b ENSGT00940000157665.b ENSGT00510000046843.a.b.l ENSGT00390000001509.a ENSGT00950000182903.b.a.y.a ##22 ENSGT00940000155740 ENSGT00940000154468.tb.a ENSGT00940000157830.c ENSGT00940000166479 ENSGT00950000182991.A.a.c.a.a ENSGT00940000161652.a.d ENSGT00950000182986.a.a ENSGT00390000006896 ENSGT00920000149095 ENSGT00940000162989.e ENSGT00940000164703.a ENSGT00940000157024.k.a ENSGT00940000158263 ENSGT00940000154404.b ENSGT00940000159692 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000166926 ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00730000111186 ENSGT00390000008224 ENSGT00940000157076.j.c.a ENSGT00940000160431 ENSGT00940000154102.a.h ENSGT01050000244888.a.b ENSGT00940000158083.b ENSGT00940000157665.b ENSGT00510000046843.a.b.l ENSGT00390000001509.a ENSGT00950000182903.b.a.y.a ##22 ENSGT00940000155740 ENSGT00940000154468.tb.a ENSGT00940000157830.c ENSGT00940000166479 ENSGT00950000182991.A.a.c.a.a ENSGT00940000161652.a.d ENSGT00950000182986.a.a ENSGT00390000006896 ENSGT00940000164582.a ENSGT00920000149095 ENSGT00940000161149.e ENSGT00940000162989.f.a.a.k.b ENSGT00940000162989.f.a.a.k.a ENSGT00940000162989.e ENSGT00940000164703.a Red-bellied piranha MODERN SPECIES 774 PLEKHG5 (ENSPNAG00000000550) mxra8a (ENSPNAG00000007930) dvl1b (ENSPNAG00000007896) ##22 nfs1 (ENSPNAG00000000528) rbm39a (ENSPNAG00000007852) rem1 (ENSPNAG00000000491) ENSPNAG00000007818 pnp4a (ENSPNAG00000000481) Mexicana tetra MODERN SPECIES 14 ipo9 (ENSAMXG00000024731) kdm5ba (ENSAMXG00000024732) rabif (ENSAMXG00000044109) adipor1a (ENSAMXG00000038988) ENSAMXG00000036879 cyb5r1 (ENSAMXG00000032554) ENSAMXG00000044066 rnpep (ENSAMXG00000024736) inavab (ENSAMXG00000036669) GPR25 (ENSAMXG00000038527) olfml3b (ENSAMXG00000031992) ENSAMXG00000042600 SYT6 (ENSAMXG00000013910) ENSAMXG00000029492 mxra8a (ENSAMXG00000034886) dvl1b (ENSAMXG00000030033) ##22 nfs1 (ENSAMXG00000013809) rbm39a (ENSAMXG00000013781) rem1 (ENSAMXG00000035972) ENSAMXG00000032717 pnp4a (ENSAMXG00000013706) ENSAMXG00000029362 ENSAMXG00000030138 sox12 (ENSAMXG00000025593) ENSAMXG00000043197 trib3 (ENSAMXG00000034904) maf1a (ENSAMXG00000037097) zc3h11a (ENSAMXG00000009851) ENSAMXG00000033865 ENSAMXG00000033910 ENSAMXG00000009870 Electric eel MODERN SPECIES 185 timm17a (ENSEEEG00000009589) LMOD1 (ENSEEEG00000009586) shisa4 (ENSEEEG00000009584) ipo9 (ENSEEEG00000009328) kdm5ba (ENSEEEG00000008312) rabif (ENSEEEG00000008261) adipor1a (ENSEEEG00000008223) cyb5r1 (ENSEEEG00000008213) rnpep (ENSEEEG00000008184) inavab (ENSEEEG00000008183) GPR25 (ENSEEEG00000008182) olfml3b (ENSEEEG00000008180) SYT6 (ENSEEEG00000008171) PLEKHG5 (ENSEEEG00000008154) mxra8a (ENSEEEG00000008148) dvl1b (ENSEEEG00000008145) ##22 nfs1 (ENSEEEG00000008139) rbm39a (ENSEEEG00000008010) rem1 (ENSEEEG00000008008) ENSEEEG00000008007 pnp4a (ENSEEEG00000008006) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00730000111186 ENSGT00390000008224 ENSGT00940000157076.j.c ENSGT00390000016889 ENSGT00940000154563 ENSGT00940000153962.b ENSGT00940000160431 ENSGT00940000154102.a.h ENSGT01050000244888.a.b ENSGT00940000158083.b ENSGT00940000157665.b ENSGT00510000046843.a.b.l ENSGT00390000001509.a ENSGT00950000182903.b.a.y.a ##22 ENSGT00940000155740 ENSGT00940000156368.a ENSGT00940000154468.tb.a ENSGT00940000157830.c.c ENSGT00940000166479 ENSGT00950000182991.A.a.c.a.a ENSGT00940000161652.a ENSGT00950000182986.a.a ENSGT00390000006896 ENSGT00920000149095 ENSGT00940000162989.e ENSGT00940000162989.f.a.a.e.b ENSGT00940000162989.f.a.a.e.a ENSGT00940000161149.f ENSGT00940000164703.a Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000017780.f.eb ENSGT00940000159825.a.b.a ENSGT00730000111186.a.b ENSGT00390000008224.f ENSGT00940000157076.j.c.d ENSGT00390000016889.m.a ENSGT00940000154563.ib.b.a ENSGT00940000153962.b.k.a ENSGT00940000160431.c ENSGT00940000154102.a.h.b ENSGT01050000244888.a.b.f ENSGT00940000158083.b.b ENSGT00940000157665.b.a ENSGT00510000046843.a.b.l.b ENSGT00390000001509.a.b ENSGT00950000182903.b.a.y.a.a ##22 ENSGT00940000155740.q ENSGT00940000156368.a ENSGT00940000154468.tb.a.a ENSGT00940000157830.c.c.b ENSGT00940000166479.a ENSGT00950000182991.A.a.c.a.a.e ENSGT00940000161652.a.b ENSGT00950000182986.a.a.i ENSGT00390000006896.ab.b ENSGT00920000149095.c ENSGT00940000162989.e.v.a.b ENSGT00940000162989.f.a.a.e.b.a ENSGT00940000162989.f.a.a.e.a.a ENSGT00940000162989.e.v.b.b ENSGT00940000164703.a.b Goldfish MODERN SPECIES 2 sulf2a (ENSCARG00000013910) timm17a (ENSCARG00000017108) LMOD1 (ENSCARG00000017139) shisa4 (ENSCARG00000017148) kdm5ba (ENSCARG00000017231) rabif (ENSCARG00000018237) adipor1a (ENSCARG00000018257) cyb5r1 (ENSCARG00000018428) rnpep (ENSCARG00000020111) inavab (ENSCARG00000020166) GPR25 (ENSCARG00000020181) olfml3b (ENSCARG00000020191) SYT6 (ENSCARG00000020200) ENSCARG00000020249 mxra8a (ENSCARG00000020602) dvl1b (ENSCARG00000020655) ##22 ENSCARG00000020984 nfs1 (ENSCARG00000021029) si:ch211-15p9.2 (ENSCARG00000021553) rbm39a (ENSCARG00000021566) rem1 (ENSCARG00000021869) ENSCARG00000021881 pnp4a (ENSCARG00000021891) sox12 (ENSCARG00000021899) trib3 (ENSCARG00000021905) maf1a (ENSCARG00000021918) zc3h11a (ENSCARG00000021953) ENSCARG00000021967 ENSCARG00000022153 ENSCARG00000022192 cntn2 (ENSCARG00000022339) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000017780.f.eb ENSGT00940000159825.a.b.a ENSGT00730000111186.a.b ENSGT00390000008224.f ENSGT00940000157076.j.c.d ENSGT00390000016889.m.a ENSGT00940000154563.ib.b.a ENSGT00940000153962.b.k.a ENSGT00940000160431.c ENSGT00940000154102.a.h.b ENSGT01050000244888.a.b.f ENSGT00940000158083.b.b ENSGT00940000157665.b.a ENSGT00510000046843.a.b.l.b ENSGT00390000001509.a.b ENSGT00950000182903.b.a.y.a.a ##22 ENSGT00940000155740.q ENSGT00940000156368.a ENSGT00940000154468.tb.a.a ENSGT00940000157830.c.c.b ENSGT00940000166479.a ENSGT00950000182991.A.a.c.a.a.e ENSGT00940000161652.a.b ENSGT00950000182986.a.a.i ENSGT00390000006896.ab.b ENSGT00920000149095.c ENSGT00940000162989.e.v.a.b ENSGT00940000162989.f.a.a.e.b.a ENSGT00940000162989.f.a.a.e.a.a ENSGT00940000162989.e.v.b.b ENSGT00940000164703.a.b Common carp reference MODERN SPECIES 13 timm17a (ENSCCRG00000077656) ENSCCRG00000055207 shisa4 (ENSCCRG00000049278) ipo9 (ENSCCRG00000049729) kdm5ba (ENSCCRG00000049606) rabif (ENSCCRG00000048242) adipor1a (ENSCCRG00000004002) cyb5r1 (ENSCCRG00000072849) rnpep (ENSCCRG00000001600) inavab (ENSCCRG00000001430) ENSCCRG00000066386 olfml3b (ENSCCRG00000031911) ENSCCRG00000041823 ENSCCRG00000058955 mxra8a (ENSCCRG00000077142) dvl1b (ENSCCRG00000026785) ##22 nfs1 (ENSCCRG00000069924) si:ch211-15p9.2 (ENSCCRG00000058733) rbm39a (ENSCCRG00000059102) rem1 (ENSCCRG00000002868) ENSCCRG00000002901 sox12 (ENSCCRG00000059447) pnp4a (ENSCCRG00000074394) trib3 (ENSCCRG00000068078) maf1a (ENSCCRG00000078975) zc3h11a (ENSCCRG00000020316) ENSCCRG00000022299 chia.3 (ENSCCRG00000074395) chia.2 (ENSCCRG00000073801) ENSCCRG00000056312 cntn2 (ENSCCRG00000022069) Golden-line barbel MODERN SPECIES 2 arhgap46a (ENSSGRG00000052621) sulf2a (ENSSGRG00000052620) timm17a (ENSSGRG00000052612) LMOD1 (ENSSGRG00000052611) shisa4 (ENSSGRG00000052610) kdm5ba (ENSSGRG00000052400) rabif (ENSSGRG00000052388) adipor1a (ENSSGRG00000052375) rnpep (ENSSGRG00000052290) GPR25 (ENSSGRG00000052282) olfml3b (ENSSGRG00000052281) SYT6 (ENSSGRG00000052279) PLEKHG5 (ENSSGRG00000052277) mxra8a (ENSSGRG00000052274) ENSSGRG00000052273 dvl1b (ENSSGRG00000052147) ##22 nfs1 (ENSSGRG00000052143) si:ch211-15p9.2 (ENSSGRG00000052142) rbm39a (ENSSGRG00000052026) ENSSGRG00000052024 ENSSGRG00000052023 pnp4a (ENSSGRG00000052021) sox12 (ENSSGRG00000052019) trib3 (ENSSGRG00000052017) maf1a (ENSSGRG00000052016) zc3h11a (ENSSGRG00000052015) chia.3 (ENSSGRG00000052014) chia.2 (ENSSGRG00000052013) cntn2 (ENSSGRG00000051946) nfasca (ENSSGRG00000051840) PIK3C2B (ENSSGRG00000051817) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT00390000017780.f.db ENSGT00940000159825.a.b.b ENSGT00730000111186.a.a ENSGT00390000008224.e ENSGT00940000157076.j.c.c ENSGT00390000016889.m.b ENSGT00940000154563.ib.b.b ENSGT00940000153962.b.k.b ENSGT00940000160431.d ENSGT00940000154102.a.h.a ENSGT01050000244888.a.b.e ENSGT00940000158083.b.a ENSGT00940000157665.b.b ENSGT00510000046843.a.b.l.a ENSGT00390000001509.a.a ENSGT00950000182903.b.a.y.a.b ##22 ENSGT00940000155740.p ENSGT00940000154468.tb.a.b ENSGT00940000157830.c.c.a ENSGT00940000166479.b ENSGT00950000182991.A.a.c.a.a.f ENSGT00940000161652.a.a ENSGT00950000182986.a.a.j ENSGT00390000006896.ab.a ENSGT00920000149095.d ENSGT00940000162989.e.v.a.a ENSGT00940000162989.f.a.a.e.b.b ENSGT00940000162989.f.a.a.e.a.b ENSGT00940000162989.e.v.b.a ENSGT00940000164703.a.a ENSGT00940000157024.k.a.a Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000017780.f.db ENSGT00940000159825.a.b.b ENSGT00730000111186.a.a ENSGT00390000008224.e ENSGT00940000157076.j.c.c ENSGT00390000016889.m.b ENSGT00940000154563.ib.b.b ENSGT00940000153962.b.k.b ENSGT00940000160431.d ENSGT00940000154102.a.h.a ENSGT01050000244888.a.b.e ENSGT00940000158083.b.a ENSGT00940000157665.b.b ENSGT00510000046843.a.b.l.a ENSGT00390000001509.a.a ENSGT00950000182903.b.a.y.a.b ##22 ENSGT00940000155740.p ENSGT00940000154468.tb.a.b ENSGT00940000157830.c.c.a ENSGT00940000166479.b ENSGT00950000182991.A.a.c.a.a.f ENSGT00940000161652.a.a ENSGT00950000182986.a.a.j ENSGT00390000006896.ab.a ENSGT00920000149095.d ENSGT00940000162989.e.v.a.a ENSGT00940000162989.f.a.a.e.b.b ENSGT00940000162989.f.a.a.e.a.b ENSGT00940000162989.e.v.b.a ENSGT00940000164703.a.a ENSGT00940000157024.k.a.a Common carp reference MODERN SPECIES 42 arhgap46a (ENSCCRG00000003147) sulf2a (ENSCCRG00000041869) timm17a (ENSCCRG00000003079) ENSCCRG00000059754 shisa4 (ENSCCRG00000076617) ipo9 (ENSCCRG00000048310) kdm5ba (ENSCCRG00000048253) ENSCCRG00000048238 cyb5r1 (ENSCCRG00000047979) rnpep (ENSCCRG00000072647) inavab (ENSCCRG00000047975) olfml3b (ENSCCRG00000055204) ENSCCRG00000031917 ENSCCRG00000002410 mxra8a (ENSCCRG00000002558) dvl1b (ENSCCRG00000002587) ##22 nfs1 (ENSCCRG00000064687) rbm39a (ENSCCRG00000002686) rem1 (ENSCCRG00000065702) ENSCCRG00000020885 pnp4a (ENSCCRG00000074160) sox12 (ENSCCRG00000020877) maf1a (ENSCCRG00000020312) zc3h11a (ENSCCRG00000022259) ENSCCRG00000070871 ENSCCRG00000020338 chia.3 (ENSCCRG00000024762) ENSCCRG00000021889 cntn2 (ENSCCRG00000044626) nfasca (ENSCCRG00000052632) ENSCCRG00000076329 Golden-line barbel MODERN SPECIES 1 sulf2a (ENSSGRG00000037593) timm17a (ENSSGRG00000037628) LMOD1 (ENSSGRG00000037633) SHISA4 (ENSSGRG00000037634) ipo9 (ENSSGRG00000037642) kdm5ba (ENSSGRG00000037847) rabif (ENSSGRG00000038391) adipor1a (ENSSGRG00000038393) cyb5r1 (ENSSGRG00000038397) rnpep (ENSSGRG00000038402) GPR25 (ENSSGRG00000038655) olfml3b (ENSSGRG00000038656) SYT6 (ENSSGRG00000038657) PLEKHG5 (ENSSGRG00000038678) mxra8a (ENSSGRG00000038822) dvl1b (ENSSGRG00000038826) ##22 ENSSGRG00000038828 nfs1 (ENSSGRG00000038833) si:ch211-15p9.2 (ENSSGRG00000039053) rbm39a (ENSSGRG00000039136) rem1 (ENSSGRG00000039304) ENSSGRG00000039305 pnp4a (ENSSGRG00000039308) sox12 (ENSSGRG00000039311) trib3 (ENSSGRG00000039313) maf1a (ENSSGRG00000039316) zc3h11a (ENSSGRG00000039320) ENSSGRG00000039335 chia.2 (ENSSGRG00000040312) ENSSGRG00000040315 cntn2 (ENSSGRG00000040337) Goldfish MODERN SPECIES 29 timm17a (ENSCARG00000008998) LMOD1 (ENSCARG00000009015) shisa4 (ENSCARG00000009025) ipo9 (ENSCARG00000009059) kdm5ba (ENSCARG00000009486) rabif (ENSCARG00000009636) adipor1a (ENSCARG00000009644) cyb5r1 (ENSCARG00000009711) rnpep (ENSCARG00000009961) inavab (ENSCARG00000011315) GPR25 (ENSCARG00000011329) olfml3b (ENSCARG00000011333) SYT6 (ENSCARG00000011342) PLEKHG5 (ENSCARG00000011410) mxra8a (ENSCARG00000011585) dvl1b (ENSCARG00000011617) ##22 nfs1 (ENSCARG00000012273) rbm39a (ENSCARG00000012367) rem1 (ENSCARG00000012579) sox12 (ENSCARG00000012585) trib3 (ENSCARG00000012586) maf1a (ENSCARG00000012590) zc3h11a (ENSCARG00000012599) ENSCARG00000012607 chia.2 (ENSCARG00000012636) chia.1 (ENSCARG00000012993) cntn2 (ENSCARG00000013056) ENSCARG00000017378 nfasca (ENSCARG00000017635) PIK3C2B (ENSCARG00000024898) ENSCARG00000025240 Zebrafish MODERN SPECIES 2 timm17a (ENSDARG00000029510) LMOD1 (ENSDARG00000077261) shisa4 (ENSDARG00000006307) ipo9 (ENSDARG00000016753) kdm5ba (ENSDARG00000057093) rabif (ENSDARG00000002690) adipor1a (ENSDARG00000002912) cyb5r1 (ENSDARG00000018966) rnpep (ENSDARG00000012506) inavab (ENSDARG00000070571) GPR25 (ENSDARG00000057112) olfml3b (ENSDARG00000062171) SYT6 (ENSDARG00000031463) PLEKHG5 (ENSDARG00000025902) mxra8a (ENSDARG00000062222) dvl1b (ENSDARG00000055552) ##22 nfs1 (ENSDARG00000062237) si:ch211-15p9.2 (ENSDARG00000062241) rbm39a (ENSDARG00000011613) rem1 (ENSDARG00000020544) ENSDARG00000094037 pnp4a (ENSDARG00000057575) sox12 (ENSDARG00000025847) trib3 (ENSDARG00000016200) maf1a (ENSDARG00000013122) zc3h11a (ENSDARG00000009754) ENSDARG00000075745 chia.3 (ENSDARG00000009612) chia.2 (ENSDARG00000099185) chia.1 (ENSDARG00000100635) cntn2 (ENSDARG00000000472) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.b.a.y.a ##22 Denticle herring MODERN SPECIES 3 npepl1 (ENSDCDG00000021220) STX16 (ENSDCDG00000021217) mbd1b (ENSDCDG00000021207) ccdc120b (ENSDCDG00000021198) SRPK3 (ENSDCDG00000021100) comtb (ENSDCDG00000021086) grm6b (ENSDCDG00000020548) otud5b (ENSDCDG00000020507) inavab (ENSDCDG00000020505) GPR25 (ENSDCDG00000020501) ENSDCDG00000020498 olfml3b (ENSDCDG00000020495) SYT6 (ENSDCDG00000020492) PLEKHG5 (ENSDCDG00000020321) mxra8a (ENSDCDG00000020313) dvl1b (ENSDCDG00000020176) ##22 utp3 (ENSDCDG00000020147) ppcs (ENSDCDG00000020135) foxj3 (ENSDCDG00000020106) PRDM2 (ENSDCDG00000020063) kaznb (ENSDCDG00000020060) tmem51b (ENSDCDG00000020058) skib (ENSDCDG00000020056) PLCH2 (ENSDCDG00000019820) ENSDCDG00000019815 BRPF3 (ENSDCDG00000019812) MON1B (ENSDCDG00000019807) rnpep (ENSDCDG00000019376) cyb5r1 (ENSDCDG00000017805) adipor1a (ENSDCDG00000017765) rabif (ENSDCDG00000017761) Osteoglossiformes DUPLICATION Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 728 ENSGT00390000001509.a ENSGT00950000182903.b.a.y.a.c ##22 Asian bonytongue MODERN SPECIES 11 SRSF3 (ENSSFOG00015016485) ENSSFOG00015016502 ENSSFOG00015016515 ENSSFOG00015016558 ENSSFOG00015032402 ENSSFOG00015032556 MYBPH (ENSSFOG00015016590) NAV1 (ENSSFOG00015016607) csrp1b (ENSSFOG00015032432) tnni1b (ENSSFOG00015016719) ENSSFOG00015002455 ENSSFOG00015029098 b3galt6 (ENSSFOG00015002423) olfml3b (ENSSFOG00015002417) mxra8a (ENSSFOG00015002409) dvl1b (ENSSFOG00015002382) ##22 ENSSFOG00015024978 ENSSFOG00015002325 uts2a (ENSSFOG00015002300) per3 (ENSSFOG00015002214) vamp3 (ENSSFOG00015024431) CAMTA1 (ENSSFOG00015002158) ENSSFOG00015029360 DNAJC11 (ENSSFOG00015002075) PHF13 (ENSSFOG00015026093) fbxo2 (ENSSFOG00015002037) ENSSFOG00015028678 svbp (ENSSFOG00015032649) wnt4 (ENSSFOG00015026920) CDC42 (ENSSFOG00015030768) ap5b1 (ENSSFOG00015001933) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 206 ENSGT00940000153314.b.a.b ENSGT00940000156151 ENSGT00940000153798.A.b.h ENSGT00390000002421.a ENSGT00940000158724.b ENSGT00950000183083.b ENSGT00940000162571 ENSGT00940000155503.a.l ENSGT00950000183063.d.n ENSGT00940000160840 ENSGT00940000154964.y.a.r ENSGT00940000156792.g.a.i ENSGT00940000156138.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.y.a.d ##22 ENSGT00940000155203.b.f ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000162344 P. kingsleyae MODERN SPECIES 37 rcc2 (ENSPKIG00000010853) ARHGEF10L (ENSPKIG00000010753) dhrs3a (ENSPKIG00000010699) VPS13D (ENSPKIG00000010575) ENSPKIG00000010536 LRRC38 (ENSPKIG00000010525) ephb2b (ENSPKIG00000010481) alpl (ENSPKIG00000010443) ENSPKIG00000010429 ENSPKIG00000010376 ENSPKIG00000010288 SLC2A1 (ENSPKIG00000010233) rap1gapa (ENSPKIG00000010069) aurkaip1 (ENSPKIG00000009988) mxra8b (ENSPKIG00000009945) dvl1b (ENSPKIG00000009880) ##22 tnfrsf9a (ENSPKIG00000009839) Asian bonytongue MODERN SPECIES 11 ARHGEF10L (ENSSFOG00015017842) igsf21b (ENSSFOG00015017798) dhrs3a (ENSSFOG00015017778) VPS13D (ENSSFOG00015017530) ENSSFOG00015017488 ephb2b (ENSSFOG00015027254) ENSSFOG00015017403 alpl (ENSSFOG00015016876) EIF4G3 (ENSSFOG00015016664) ENSSFOG00015016631 ENSSFOG00015016608 SLC2A1 (ENSSFOG00015016582) RAP1GAP (ENSSFOG00015016410) aurkaip1 (ENSSFOG00015016363) MXRA8 (ENSSFOG00015025211) DVL1 (ENSSFOG00015016282) ##22 tnfrsf9a (ENSSFOG00015016270) CAMTA1 (ENSSFOG00015016227) dnajc11a (ENSSFOG00015014502) THAP3 (ENSSFOG00015014540) ENSSFOG00015014550 ENSSFOG00015014571 wnt4 (ENSSFOG00015014576) ENSSFOG00015014594 cldn19 (ENSSFOG00015014635) ENSSFOG00015014654 ENSSFOG00015031595 ENSSFOG00015014677 nucks1b (ENSSFOG00015026997) lemd1 (ENSSFOG00015027930) pm20d1.2 (ENSSFOG00015014750) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.b.a.y.b ##22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.b.a.y.b ##22 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 348 ENSGT00940000154964.y.b ENSGT00940000156792.g.b ENSGT00940000156138.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.y.b ##22 ENSGT00940000155203.a ENSGT00940000165359 ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000162344 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.b.a.y.b ##22 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 138 ENSGT00940000153798.A.b.h ENSGT00390000002421.a ENSGT00940000158724.b ENSGT00950000183083.b ENSGT00940000162571.d ENSGT00940000155503.b ENSGT00450000040404.b ENSGT00940000154436.c ENSGT00940000178714 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000154964.y.b ENSGT00940000156792.g.b ENSGT00940000156138.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.y.b ##22 ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 ENSGT00940000166327 ENSGT00390000011058.a.c ENSGT00940000155203.a ENSGT00940000167132 ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000162344 ENSGT00520000055578.a.a.c ENSGT00950000183032.A.b.b.b.a.b ENSGT00940000156364.a.b ENSGT00940000161936 ENSGT00400000022086.b.a.b ENSGT00390000013839.c.b ENSGT00940000158762.f ENSGT00950000182982.B.c.b Otophysi ANCESTRAL SPECIES 153 ENSGT00390000003768 ENSGT00940000182186 ENSGT00940000166932 ENSGT00940000158433 ENSGT00740000117154 ENSGT00940000156275.f ENSGT00940000165031.a ENSGT00950000182696.B.b.a ENSGT00940000164021.A ENSGT00950000182903.b.a.y.b ##22 ENSGT00940000166327 ENSGT00390000011058.a.c ENSGT00390000011058.a.d ENSGT00510000049583 ENSGT00940000160817 ENSGT00940000158192 ENSGT00940000155203.b ENSGT00860000133842.m ENSGT00530000063882.a ENSGT00940000160929 ENSGT00390000006113 ENSGT00940000159654 ENSGT00940000153675.a.b.a ENSGT00530000064721 ENSGT00390000003084 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00940000179490 ENSGT00390000009023 ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000167398 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000159001 ENSGT00950000183086.a.a.a ENSGT00940000161133 ENSGT00940000159079 ENSGT00940000162075.b ENSGT00940000164281 ENSGT00940000158954 ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.y.b ##22 ENSGT00390000011058.a.c ENSGT00940000155203.a ENSGT00940000167132 ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000162344 ENSGT00520000055578.a.a.c ENSGT00950000183032.A.b.b.b.a.b ENSGT00940000156364.a.b ENSGT00940000161936 ENSGT01070000253766.B.f.b ENSGT00400000022086.b.a.b.d ENSGT00390000013839.c.b ENSGT00940000158762.f ENSGT00950000182982.B.c.b ENSGT00390000018003.a Channel catfish MODERN SPECIES 6 ENSIPUG00000004982 pgd (ENSIPUG00000004946) kif1b (ENSIPUG00000004571) Ube4b (ENSIPUG00000004431) rbp7a (ENSIPUG00000004406) nmnat1 (ENSIPUG00000004336) lzic (ENSIPUG00000004245) clstn1 (ENSIPUG00000004076) Ctnnbip1 (ENSIPUG00000004041) pik3cd (ENSIPUG00000003962) foxl2l (ENSIPUG00000003938) tmem201 (ENSIPUG00000003890) slc25a33 (ENSIPUG00000022252) aurkaip1 (ENSIPUG00000022247) mxra8 (ENSIPUG00000022228) dvl1 (ENSIPUG00000022201) ##22 tnfrsf9a (ENSIPUG00000022188) ENSIPUG00000022160 uts2a (ENSIPUG00000022143) CAMTA1 (ENSIPUG00000022062) dnajc11a (ENSIPUG00000022044) asxl1 (ENSIPUG00000022022) pcmtd2a (ENSIPUG00000022007) MYT1 (ENSIPUG00000021964) NPBWR1 (ENSIPUG00000021953) OPRL1 (ENSIPUG00000021946) xkr7a (ENSIPUG00000021938) CABLES2 (ENSIPUG00000021909) ADRM1 (ENSIPUG00000021877) ENSIPUG00000021872 OSBPL2 (ENSIPUG00000021848) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000179490 ENSGT00390000009023 ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000167398 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000159001 ENSGT00950000183086.a.a.a ENSGT00940000161133 ENSGT00940000159079 ENSGT00940000162075.b ENSGT00940000164281 ENSGT00940000158954 ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.y.b ##22 ENSGT00390000011058.a.c ENSGT00940000155203.a ENSGT00940000167132 ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000162344 ENSGT00520000055578.a.a.c ENSGT00950000183032.A.b.b.b.a.b ENSGT00940000156364.a.b ENSGT00940000161936 ENSGT01070000253766.B.f.b ENSGT00400000022086.b.a.b.d ENSGT00390000013839.c.b ENSGT00940000158762.f ENSGT00950000182982.B.c.b ENSGT00390000018003.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000179490 ENSGT00390000009023 ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000167398 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000159001 ENSGT00950000183086.a.a.a ENSGT00940000161133 ENSGT00940000159079 ENSGT00940000162075.b ENSGT00940000164281 ENSGT00940000158954 ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.y.b ##22 ENSGT00390000011058.a.c ENSGT00940000155203.a ENSGT00940000167132 ENSGT00860000133842.n ENSGT00520000055578.a.a.c ENSGT00950000183032.A.b.b.b.a.b ENSGT00940000156364.a.b ENSGT00940000161936 ENSGT01070000253766.B.f.b ENSGT00400000022086.b.a.b.d ENSGT00940000158762.f ENSGT00950000182982.B.c.b ENSGT00390000018003.a ENSGT00940000168269 ENSGT01010000222287.A Red-bellied piranha MODERN SPECIES 5 ENSPNAG00000022414 pgd (ENSPNAG00000022407) kif1b (ENSPNAG00000022391) ube4b (ENSPNAG00000022255) rbp7a (ENSPNAG00000022152) nmnat1 (ENSPNAG00000022131) lzic (ENSPNAG00000022119) clstn1 (ENSPNAG00000003708) ctnnbip1 (ENSPNAG00000022044) pik3cd (ENSPNAG00000022019) foxl2l (ENSPNAG00000021865) tmem201 (ENSPNAG00000021854) slc25a33 (ENSPNAG00000021843) aurkaip1 (ENSPNAG00000021816) mxra8b (ENSPNAG00000021790) DVL1 (ENSPNAG00000021736) ##22 tnfrsf9a (ENSPNAG00000021704) ccdc187 (ENSPNAG00000021670) uts2a (ENSPNAG00000006189) CAMTA1 (ENSPNAG00000021547) ENSPNAG00000021486 dnajc11a (ENSPNAG00000021472) asxl1 (ENSPNAG00000021381) pcmtd2a (ENSPNAG00000021244) MYT1 (ENSPNAG00000021217) ENSPNAG00000007043 OPRL1 (ENSPNAG00000021088) xkr7a (ENSPNAG00000003665) CABLES2 (ENSPNAG00000021056) ENSPNAG00000021035 ENSPNAG00000021012 Mexicana tetra MODERN SPECIES 6 tardbpa (ENSAMXG00000030795) sst6 (ENSAMXG00000036385) pgd (ENSAMXG00000040266) kif1b (ENSAMXG00000013184) ube4b (ENSAMXG00000013206) rbp7a (ENSAMXG00000013244) nmnat1 (ENSAMXG00000030448) lzic (ENSAMXG00000013254) clstn1 (ENSAMXG00000013255) ctnnbip1 (ENSAMXG00000037045) pik3cd (ENSAMXG00000013276) tmem201 (ENSAMXG00000013301) slc25a33 (ENSAMXG00000013308) aurkaip1 (ENSAMXG00000013317) mxra8b (ENSAMXG00000039312) DVL1 (ENSAMXG00000013328) ##22 tnfrsf9a (ENSAMXG00000029430) ENSAMXG00000042124 uts2a (ENSAMXG00000039258) CAMTA1 (ENSAMXG00000013350) ENSAMXG00000032583 ENSAMXG00000039043 ENSAMXG00000031053 ednrab (ENSAMXG00000035645) ubxn10 (ENSAMXG00000038725) ddx19a (ENSAMXG00000015325) ENSAMXG00000034791 VWA5B1 (ENSAMXG00000032840) CAMK2N1 (ENSAMXG00000032815) mul1b (ENSAMXG00000036074) fam43b (ENSAMXG00000024828) Electric eel MODERN SPECIES 258 ENSEEEG00000022718 ENSEEEG00000022722 ENSEEEG00000022723 ube4b (ENSEEEG00000022728) rbp7a (ENSEEEG00000022752) nmnat1 (ENSEEEG00000022753) lzic (ENSEEEG00000022754) clstn1 (ENSEEEG00000022758) ctnnbip1 (ENSEEEG00000022765) pik3cd (ENSEEEG00000022770) foxl2l (ENSEEEG00000022834) tmem201 (ENSEEEG00000022837) slc25a33 (ENSEEEG00000022838) aurkaip1 (ENSEEEG00000022840) mxra8b (ENSEEEG00000022841) DVL1 (ENSEEEG00000022858) ##22 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000153116.A ENSGT00940000155762 ENSGT00990000205734 ENSGT00950000182914.a.a.b.b ENSGT00940000165161 ENSGT00940000157799 ENSGT00390000003768 ENSGT00940000182186 ENSGT00940000166932 ENSGT00940000158433 ENSGT00740000117154 ENSGT00940000156275.f ENSGT00940000165031.a ENSGT00950000182696.B.b.a ENSGT00940000164021.A ENSGT00950000182903.b.a.y.b ##22 ENSGT00940000166327 ENSGT00390000011058.a.c ENSGT00390000011058.a.d ENSGT00510000049583 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selenoi (ENSDARG00000060484) Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00940000154343.gb.f.a ENSGT00390000009023 ENSGT00940000157445.d ENSGT00390000009300.a.d ENSGT00940000167398 ENSGT00940000159001.f ENSGT00950000183179.b.a.o.b ENSGT00950000183086.a.a.a.e.a ENSGT00940000161133.g ENSGT00940000159079.f ENSGT00940000162075.b.c ENSGT00940000164281.a ENSGT00940000158954.a ENSGT00390000012802.k ENSGT00390000001509.b.b ENSGT00950000182903.b.a.y.b.c ##22 ENSGT00940000166327.i.a ENSGT00390000011058.a.c.a ENSGT00940000155203.a.b ENSGT00940000167132 ENSGT00860000133842.n.a ENSGT01000000220342 ENSGT00520000055578.a.a.c.pb ENSGT00950000183032.A.b.b.b.a.b.a.b ENSGT00940000156364.a.b.a ENSGT00940000161936.j ENSGT01070000253766.B.f.b.y ENSGT00400000022086.b.a.b.a ENSGT00390000013839.c.b.a ENSGT00940000158762.f.a ENSGT00950000182982.B.c.b.b.b Goldfish MODERN SPECIES 42 letmd1 (ENSCARG00000054891) zgc:56699 (ENSCARG00000054983) rprm3 (ENSCARG00000055017) nr4a1 (ENSCARG00000055024) 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(ENSCCRG00000048158) DVL1 (ENSCCRG00000042812) ##22 ENSCCRG00000071903 uts2a (ENSCCRG00000048921) tnfrsf9a (ENSCCRG00000077883) ENSCCRG00000069345 dnajc11a (ENSCCRG00000044755) thap3 (ENSCCRG00000074074) asxl1 (ENSCCRG00000053420) pcmtd2a (ENSCCRG00000044792) ENSCCRG00000044840 ENSCCRG00000044899 ENSCCRG00000044904 xkr7a (ENSCCRG00000011158) ENSCCRG00000011160 ENSCCRG00000072840 ENSCCRG00000011320 Golden-line barbel MODERN SPECIES 28 ENSSGRG00000012258 tardbpa (ENSSGRG00000012263) kif1b (ENSSGRG00000012300) ube4b (ENSSGRG00000017393) nmnat1 (ENSSGRG00000017625) lzic (ENSSGRG00000017626) clstn1 (ENSSGRG00000017683) ctnnbip1 (ENSSGRG00000018829) pik3cd (ENSSGRG00000018848) foxl2l (ENSSGRG00000020624) ENSSGRG00000020626 slc25a33 (ENSSGRG00000020628) slc25a33 (ENSSGRG00000020629) aurkaip1 (ENSSGRG00000020630) mxra8b (ENSSGRG00000020632) DVL1 (ENSSGRG00000020657) ##22 ccdc187 (ENSSGRG00000021727) uts2a (ENSSGRG00000021729) ENSSGRG00000021730 ENSSGRG00000021731 ENSSGRG00000021733 dnajc11a (ENSSGRG00000021734) thap3 (ENSSGRG00000022045) asxl1 (ENSSGRG00000022047) pcmtd2a (ENSSGRG00000022052) ENSSGRG00000022053 MYT1 (ENSSGRG00000022055) ENSSGRG00000022057 OPRL1 (ENSSGRG00000022064) xkr7a (ENSSGRG00000022070) ENSSGRG00000022072 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000153314.b.a.a.b ENSGT00940000156151 ENSGT00940000153798.A.b.h ENSGT00390000002421.a ENSGT00940000158724.b ENSGT00950000183083.b ENSGT00940000162571.d ENSGT00940000155503.b ENSGT00450000040404.b ENSGT00940000154436.c.b ENSGT00940000154964.y.b ENSGT00940000156792.g.b ENSGT00940000156138.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.y.b ##22 ENSGT00390000011058.a.c ENSGT00940000155203.a ENSGT00940000167132 ENSGT00860000133842.n ENSGT00520000055578.a.a.c ENSGT00950000183032.A.b.b.b.a.b ENSGT00940000156364.a.b ENSGT00940000161936 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000159974.b ENSGT01070000253766.B.f.b ENSGT00400000022086.b.a.b ENSGT00390000013839.c.b ENSGT00940000158762.f ENSGT00950000182982.B.c.b Atlantic herring MODERN SPECIES 20 ENSCHAG00000016535 VPS13D (ENSCHAG00000013866) dhrs3a (ENSCHAG00000013794) LRRC38 (ENSCHAG00000013788) EPHB2 (ENSCHAG00000012864) ENSCHAG00000012814 ENSCHAG00000012799 ENSCHAG00000011241 phc2a (ENSCHAG00000011193) ENSCHAG00000011160 slc2a1a (ENSCHAG00000010876) ENSCHAG00000010838 rap1gapa (ENSCHAG00000010735) aurkaip1 (ENSCHAG00000010712) mxra8b (ENSCHAG00000010705) DVL1 (ENSCHAG00000010594) ##22 ENSCHAG00000010578 ENSCHAG00000010549 ENSCHAG00000010535 CAMTA1 (ENSCHAG00000009617) dnajc11a (ENSCHAG00000008991) asxl1 (ENSCHAG00000008933) pcmtd2a (ENSCHAG00000008908) MYT1 (ENSCHAG00000008243) NPBWR1 (ENSCHAG00000008190) OPRL1 (ENSCHAG00000008183) xkr7a (ENSCHAG00000008172) ENSCHAG00000008159 ADRM1 (ENSCHAG00000008102) OSBPL2 (ENSCHAG00000007713) ENSCHAG00000007612 Reedfish MODERN SPECIES 16 ENSECRG00000005532 TMCO4 (ENSECRG00000005553) ENSECRG00000005583 otud3 (ENSECRG00000005593) ora4 (ENSECRG00000005608) ENSECRG00000005619 FNDC10 (ENSECRG00000005629) ssu72 (ENSECRG00000005637) TMEM240 (ENSECRG00000005645) ATAD3A (ENSECRG00000005677) vwa1 (ENSECRG00000005708) ENSECRG00000005714 mrpl20 (ENSECRG00000005727) aurkaip1 (ENSECRG00000005739) mxra8b (ENSECRG00000005746) DVL1 (ENSECRG00000005760) ##22 ENSECRG00000005822 ENSECRG00000006118 ENSECRG00000006137 ENSECRG00000006148 ENSECRG00000006153 MMEL1 (ENSECRG00000006168) prxl2b (ENSECRG00000006179) slc45a1 (ENSECRG00000006206) zgc:154075 (ENSECRG00000006260) odad1 (ENSECRG00000006280) tas1r3 (ENSECRG00000006305) ENSECRG00000006350 PLEKHG5 (ENSECRG00000006428) per3 (ENSECRG00000006458) VAMP3 (ENSECRG00000006481) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 182 ENSGT01010000222287.A ENSGT00390000001400 ENSGT00650000093633.a.b ENSGT00390000016392 ENSGT00650000093633.a.a ENSGT00940000167258 ENSGT00550000076432 ENSGT00390000010165 ENSGT00400000023987 ENSGT00730000111059 ENSGT00940000160734 ENSGT00940000163776.b ENSGT00390000015823 ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509 ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 544 ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509 ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 131 ENSGT00940000153314.b.a.a ENSGT00940000156151 ENSGT00940000153798.A.b.h ENSGT00390000002421.a ENSGT00940000158724.b ENSGT00950000183083.b ENSGT00940000162571 ENSGT00940000155503.b ENSGT00450000040404.b ENSGT00940000154436.c ENSGT00940000154964.y.b ENSGT00940000156792.g.b ENSGT00940000156138.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 ENSGT00940000166327 ENSGT00390000011058.a ENSGT00510000049583 ENSGT00940000160817 ENSGT00940000158192 ENSGT00940000155203.b ENSGT00940000155203.a ENSGT00940000167132 ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000162344 ENSGT00950000182977.B.b.b ENSGT00940000154332 ENSGT00940000165936 ENSGT00530000063320.A.j ENSGT00940000154098.b Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 138 ENSGT00390000002421.a ENSGT00940000158724.b ENSGT00950000183083.b ENSGT00940000162571.d ENSGT00940000155503.b ENSGT00450000040404.b ENSGT00940000154436.c ENSGT00940000178714 ENSGT00940000156454 ENSGT00940000154964.y.b ENSGT00940000156792.g.b ENSGT00940000156138.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.y.b ##22 ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 ENSGT00940000166327 ENSGT00390000011058.a.c ENSGT00940000155203.a ENSGT00940000167132 ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000162344 ENSGT00520000055578.a.a.c ENSGT00950000183032.A.b.b.b.a.b ENSGT00940000156364.a.b ENSGT00940000161936 ENSGT00400000022086.b.a.b ENSGT00390000013839.c.b ENSGT00940000158762.f ENSGT00950000182982.B.c.b Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 86 ENSGT00530000063255.A ENSGT01000000214440.B ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000155317.a.a.b ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158963.b.a ENSGT00940000154102.a.h ENSGT01050000244888.a.b ENSGT00940000160300.b.b ENSGT00940000158083.b ENSGT00940000157665.b ENSGT00510000046843.a.b.l ENSGT00390000001509.a ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 ENSGT00940000166327 ENSGT00500000044947 ENSGT00950000182834.C ENSGT00390000009278.a ENSGT00940000166894 ENSGT00940000158374.d ENSGT00940000163942.a ENSGT00940000155056.b ENSGT00390000006665.b.g ENSGT00940000160431 ENSGT00390000016889 ENSGT00940000157076.j.c ENSGT00390000008224 ENSGT00730000111186 ENSGT00940000159825.a.b Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring MODERN SPECIES 21 mbd1b (ENSCHAG00000009904) ccdc120b (ENSCHAG00000009963) ENSCHAG00000010017 ENSCHAG00000011442 grm6b (ENSCHAG00000011535) otud5b (ENSCHAG00000011755) inavab (ENSCHAG00000011825) ENSCHAG00000011837 GPR25 (ENSCHAG00000011855) ENSCHAG00000011879 olfml3b (ENSCHAG00000011888) ENSCHAG00000011906 ENSCHAG00000011913 ENSCHAG00000011957 mxra8a (ENSCHAG00000012742) ENSCHAG00000012766 ##22 ENSCHAG00000012774 ##22 utp3 (ENSCHAG00000012804) ppcs (ENSCHAG00000012821) foxj3 (ENSCHAG00000012858) ENSCHAG00000013043 PRDM2 (ENSCHAG00000013065) kaznb (ENSCHAG00000013169) kaznb (ENSCHAG00000013216) ENSCHAG00000013287 tmem51b (ENSCHAG00000013317) skib (ENSCHAG00000013389) PLCH2 (ENSCHAG00000013468) ENSCHAG00000013881 BRPF3 (ENSCHAG00000014010) MON1B (ENSCHAG00000014205) Atlantic herring MODERN SPECIES 21 ccdc120b (ENSCHAG00000009963) ENSCHAG00000010017 ENSCHAG00000011442 grm6b (ENSCHAG00000011535) otud5b (ENSCHAG00000011755) inavab (ENSCHAG00000011825) ENSCHAG00000011837 GPR25 (ENSCHAG00000011855) ENSCHAG00000011879 olfml3b (ENSCHAG00000011888) ENSCHAG00000011906 ENSCHAG00000011913 ENSCHAG00000011957 mxra8a (ENSCHAG00000012742) ENSCHAG00000012766 ##22 ENSCHAG00000012774 ##22 utp3 (ENSCHAG00000012804) ppcs (ENSCHAG00000012821) foxj3 (ENSCHAG00000012858) ENSCHAG00000013043 PRDM2 (ENSCHAG00000013065) kaznb (ENSCHAG00000013169) kaznb (ENSCHAG00000013216) ENSCHAG00000013287 tmem51b (ENSCHAG00000013317) skib (ENSCHAG00000013389) PLCH2 (ENSCHAG00000013468) ENSCHAG00000013881 BRPF3 (ENSCHAG00000014010) MON1B (ENSCHAG00000014205) rnpep (ENSCHAG00000014495) Denticle herring MODERN SPECIES 1 rcc2 (ENSDCDG00000029930) ARHGEF10L (ENSDCDG00000030050) igsf21b (ENSDCDG00000002966) dhrs3a (ENSDCDG00000002997) VPS13D (ENSDCDG00000003460) ENSDCDG00000004899 EPHB2 (ENSDCDG00000004922) ENSDCDG00000004993 ENSDCDG00000005206 phc2a (ENSDCDG00000017971) slc2a1a (ENSDCDG00000018015) rap1gapa (ENSDCDG00000018129) aurkaip1 (ENSDCDG00000018175) mxra8b (ENSDCDG00000018176) hykk.2 (ENSDCDG00000018180) DVL1 (ENSDCDG00000018196) ##22 ENSDCDG00000018240 ENSDCDG00000018244 CAMTA1 (ENSDCDG00000018246) ENSDCDG00000018252 dnajc11a (ENSDCDG00000018266) asxl1 (ENSDCDG00000018352) pcmtd2a (ENSDCDG00000018356) MYT1 (ENSDCDG00000018365) ENSDCDG00000018426 OPRL1 (ENSDCDG00000018436) tcea2 (ENSDCDG00000018609) xkr7a (ENSDCDG00000019065) CABLES2 (ENSDCDG00000019067) samhd1 (ENSDCDG00000019090) gss (ENSDCDG00000019196) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000156138.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 ENSGT00940000166327 ENSGT00390000011058.a ENSGT00510000049583 ENSGT00940000155203.a ENSGT00940000167132 ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000162344 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000153675.a.b.b ENSGT00940000165936 ENSGT00530000063320.A.j ENSGT00940000154098.b ENSGT00940000156659 ENSGT00940000162989.f.a.b ENSGT00940000157024.k.b Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f ENSGT00980000198631 ENSGT00940000153634.a ENSGT00890000139436.A.b.b ENSGT00940000157682.A ENSGT00940000166378 ENSGT00940000165056.b ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000161233 ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00940000156138.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 ENSGT00940000166327 ENSGT00390000011058.a ENSGT00510000049583 ENSGT00940000155203.a ENSGT00940000167132 ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000159408 ENSGT00940000153675.a.b.b ENSGT00940000165936 ENSGT00530000063320.A.j ENSGT00940000154098.b ENSGT00940000156659 ENSGT00940000162989.f.b ENSGT00940000162989.f.a.b ENSGT00940000157024.k.b Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f ENSGT00980000198631 ENSGT00940000153634.a ENSGT00890000139436.A.b.b ENSGT00940000157682.A ENSGT00940000166378 ENSGT00940000165056.b ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000161233 ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00940000156138.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 ENSGT00940000166327 ENSGT00390000011058.a ENSGT00510000049583 ENSGT00940000155203.a ENSGT00940000167132 ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000159408 ENSGT00940000153675.a.b.b ENSGT00940000153675.a.a.a.b ENSGT00950000182977.A.i.a ENSGT00940000154332 ENSGT00940000165936 ENSGT00530000063320.A.j ENSGT00940000154098.b ENSGT00940000156659 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 21 PDZD4 (ENSMMDG00005020324) porcn (ENSMMDG00005020321) wdr13 (ENSMMDG00005020292) ENSMMDG00005020278 ENSMMDG00005020274 tspy (ENSMMDG00005020269) sema3ga (ENSMMDG00005020264) ENSMMDG00005020254 SLC38A5 (ENSMMDG00005020199) apex2 (ENSMMDG00005020193) zgc:162200 (ENSMMDG00005020191) nt5dc2 (ENSMMDG00005019116) rap1gapa (ENSMMDG00005019086) aurkaip1 (ENSMMDG00005019083) mxra8b (ENSMMDG00005019079) dvl1b (ENSMMDG00005019076) ##22 ENSMMDG00005019073 ENSMMDG00005019072 uts2a (ENSMMDG00005019069) CAMTA1 (ENSMMDG00005019066) ENSMMDG00005019062 dnajc11a (ENSMMDG00005019034) fbxo44.3 (ENSMMDG00005019030) ENSMMDG00005019029 ENSMMDG00005019028 ENSMMDG00005019007 mfsd4ab (ENSMMDG00005018996) lemd1 (ENSMMDG00005018991) pm20d1.2 (ENSMMDG00005018956) ENSMMDG00005018947 ENSMMDG00005018457 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f ENSGT00980000198631 ENSGT00940000153634.a ENSGT00890000139436.A.b.b ENSGT00940000157682.A ENSGT00940000166378 ENSGT00940000165056.b ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000161233 ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00940000156138.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 ENSGT00940000166327 ENSGT00390000011058.a ENSGT00510000049583 ENSGT00940000155203.a ENSGT00940000167132 ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000159408 ENSGT00940000153675.a.b.b ENSGT00940000154332 ENSGT00940000165936 ENSGT00530000063320.A.j ENSGT00940000154098.b ENSGT00940000156659 ENSGT00940000162989.f.b ENSGT00940000162989.f.a.b Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 112 WNT2B (ENSHCOG00000007521) aurkaip1 (ENSHCOG00000007535) mxra8b (ENSHCOG00000007542) dvl1b (ENSHCOG00000007572) ##22 tnfrsf9a (ENSHCOG00000007579) ENSHCOG00000007599 ENSHCOG00000007627 ENSHCOG00000007639 dnajc11a (ENSHCOG00000007673) fbxo44.3 (ENSHCOG00000007679) ENSHCOG00000007687 ENSHCOG00000007698 mfsd4ab (ENSHCOG00000007729) pm20d1.2 (ENSHCOG00000007739) ENSHCOG00000007747 ENSHCOG00000007755 ENSHCOG00000007839 ENSHCOG00000007851 ENSHCOG00000007855 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f ENSGT00980000198631 ENSGT00940000153634.a ENSGT00890000139436.A.b.b ENSGT00940000157682.A ENSGT00940000166378 ENSGT00940000165056.b ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000161233 ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00940000156138.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 ENSGT00940000166327 ENSGT00390000011058.a ENSGT00510000049583 ENSGT00940000155203.a ENSGT00940000167132 ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000159408.u.b ENSGT00940000159408.u.a ENSGT00940000153675.a.b.b ENSGT00940000154332 ENSGT00940000165936 ENSGT00530000063320.A.j ENSGT00940000154098.b ENSGT00940000156659 ENSGT00940000162989.f.b.c Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f ENSGT00980000198631 ENSGT00940000153634.a ENSGT00890000139436.A.b.b ENSGT00940000157682.A ENSGT00940000166378 ENSGT00940000165056.b ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000161233 ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00940000156138.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 ENSGT00940000166327 ENSGT00390000011058.a ENSGT00510000049583 ENSGT00940000155203.a ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000159408.v ENSGT00940000159408.u.b ENSGT00940000159408.u.a ENSGT00940000153675.a.b.b ENSGT00940000154332 ENSGT00940000165936 ENSGT00530000063320.A.j ENSGT00940000154098.b ENSGT00940000156659 ENSGT00940000162989.f.b.d.b Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f ENSGT00980000198631 ENSGT00940000153634.a ENSGT00890000139436.A.b.b ENSGT00940000157682.A ENSGT00940000166378 ENSGT00940000165056.b ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000161233 ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00940000156138.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 ENSGT00940000166327 ENSGT00390000011058.a ENSGT00510000049583 ENSGT00940000155203.a ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000159408.v ENSGT00940000153675.a.a.a.b ENSGT00940000154332 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ENSGT00940000153634.a ENSGT00890000139436.A.b.b ENSGT00940000157682.A ENSGT00940000166378 ENSGT00940000165056.b ENSGT00970000193554 ENSGT00940000161233 ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00940000156138.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 ENSGT00940000166327 ENSGT00390000011058.a ENSGT00510000049583 ENSGT00940000155203.a ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000159408.u.a ENSGT00940000153675.a.a.a.b ENSGT00940000154332 ENSGT00940000165936 ENSGT00530000063320.A.j ENSGT00940000154098.b ENSGT00940000156659 ENSGT00940000162989.f.b.d.a ENSGT00940000162989.f.b.d.b ENSGT00940000162989.f.b.c Seriola ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f ENSGT00980000198631 ENSGT00940000153634.a ENSGT00890000139436.A.b.b ENSGT00940000157682.A ENSGT00940000166378 ENSGT00940000165056.b ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000161233 ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00940000156138.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 ENSGT00940000166327 ENSGT00390000011058.a ENSGT00510000049583 ENSGT00940000155203.a ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000159408.u.a ENSGT00950000182977.A.i.a.d ENSGT00940000165936 ENSGT00530000063320.A.j ENSGT00940000154098.b ENSGT00940000156659 ENSGT00940000162989.f.b.d.a ENSGT00940000162989.f.b.d.b.f ENSGT00940000178113.a Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2691 porcn (ENSSLDG00000024551) si:ch211-255g12.6 (ENSSLDG00000024544) wdr13 (ENSSLDG00000024436) ENSSLDG00000024429 ENSSLDG00000024422 tspy (ENSSLDG00000024418) sema3ga (ENSSLDG00000024406) ENSSLDG00000024391 SLC38A5 (ENSSLDG00000024361) apex2 (ENSSLDG00000024347) zgc:162200 (ENSSLDG00000024320) nt5dc2 (ENSSLDG00000024290) rap1gapa (ENSSLDG00000024238) aurkaip1 (ENSSLDG00000024222) mxra8b (ENSSLDG00000024213) dvl1b (ENSSLDG00000024196) ##22 tnfrsf9a (ENSSLDG00000024188) ccdc187 (ENSSLDG00000024169) uts2a (ENSSLDG00000024155) CAMTA1 (ENSSLDG00000024111) 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ENSATEG00000027823 ENSATEG00000023382 ENSATEG00000023379 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f ENSGT00980000198631 ENSGT00940000153634.a ENSGT00890000139436.A.b.b ENSGT00940000157682.A ENSGT00940000166378 ENSGT00940000165056.b ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000161233 ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00940000156138.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 ENSGT00940000166327 ENSGT00390000011058.a ENSGT00510000049583 ENSGT00940000155203.a ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000159408.v ENSGT00940000153675.a.a.b ENSGT00940000159408.u.b ENSGT00940000159408.u.a ENSGT00940000153675.a.b.b ENSGT00940000154332 ENSGT00940000165936 ENSGT00530000063320.A.j ENSGT00940000154098.b ENSGT00940000156659 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158061.a ENSGT00940000159931 ENSGT00390000002307.e ENSGT00390000016940.c.a.a ENSGT00730000111107 ENSGT00390000002174.a ENSGT00950000183178.a ENSGT00940000176879 ENSGT00390000013978.d ENSGT00390000001138.a ENSGT00950000183165.b.b.b.a.b.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00940000156138.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 ENSGT00940000166327 ENSGT00390000011058.a ENSGT00510000049583 ENSGT00940000155203.a ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000159408.v ENSGT00940000153675.a.b.b ENSGT00530000063320.A.j ENSGT00940000154098.b ENSGT00940000156659 ENSGT00940000162989.f.b.c ENSGT00940000157024.k.b ENSGT00940000154738.b ENSGT00940000164303.b.b ENSGT00940000162607.a Fugu MODERN SPECIES 15 pym1 (ENSTRUG00000028298) ENSTRUG00000023540 nemp1 (ENSTRUG00000014378) ormdl2 (ENSTRUG00000020522) ENSTRUG00000024051 PAN2 (ENSTRUG00000014260) ENSTRUG00000019526 ENSTRUG00000027061 ENSTRUG00000031366 ENSTRUG00000026404 ENSTRUG00000028112 nt5dc2 (ENSTRUG00000014116) rap1gapa (ENSTRUG00000014029) aurkaip1 (ENSTRUG00000020312) mxra8b (ENSTRUG00000013997) dvl1b (ENSTRUG00000013780) ##22 ENSTRUG00000022184 ENSTRUG00000024012 uii 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(ENSTNIG00000012552) ENSTNIG00000012553 NFASC (ENSTNIG00000012554) ENSTNIG00000012555 ENSTNIG00000012556 slc16a7 (ENSTNIG00000012557) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f ENSGT00980000198631 ENSGT00940000153634.a ENSGT00890000139436.A.b.b ENSGT00940000157682.A ENSGT00940000166378 ENSGT00940000165056.b ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000161233 ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00940000156138.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 ENSGT00940000166327 ENSGT00390000011058.a ENSGT00510000049583 ENSGT00940000155203.a ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000159408.v ENSGT00940000153675.a.a.b ENSGT00940000159408.u.b ENSGT00940000159408.u.a ENSGT00940000153675.a.b.b ENSGT00940000154332 ENSGT00940000165936 ENSGT00530000063320.A.j ENSGT00940000154098.b ENSGT00940000156659 Ballan wrasse MODERN SPECIES 4 porcn (ENSLBEG00000012498) si:ch211-255g12.6 (ENSLBEG00000012456) wdr13 (ENSLBEG00000012421) ENSLBEG00000012404 ENSLBEG00000012391 tspy (ENSLBEG00000012359) sema3ga (ENSLBEG00000012273) WAS (ENSLBEG00000012225) SLC38A5 (ENSLBEG00000012169) apex2 (ENSLBEG00000012139) zgc:162200 (ENSLBEG00000012086) nt5dc2 (ENSLBEG00000012012) rap1gapa (ENSLBEG00000011749) aurkaip1 (ENSLBEG00000011649) mxra8b (ENSLBEG00000011625) dvl1b (ENSLBEG00000011552) ##22 tnfrsf9a (ENSLBEG00000011509) ccdc187 (ENSLBEG00000011439) uts2a (ENSLBEG00000011403) CAMTA1 (ENSLBEG00000011296) dnajc11a (ENSLBEG00000011155) fbxo44.3 (ENSLBEG00000011094) ENSLBEG00000011042 ENSLBEG00000011013 mfsd4ab (ENSLBEG00000010978) ENSLBEG00000010940 G6PD (ENSLBEG00000010862) GPD1 (ENSLBEG00000010811) asic1a (ENSLBEG00000010758) spryd4 (ENSLBEG00000010736) GLS2 (ENSLBEG00000010632) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f ENSGT00980000198631 ENSGT00940000153634.a ENSGT00890000139436.A.b.b ENSGT00940000157682.A ENSGT00940000166378 ENSGT00940000165056.b ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000161233 ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00940000156138.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 ENSGT00940000166327 ENSGT00390000011058.a ENSGT00510000049583 ENSGT00940000155203.a ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000159408.u.b ENSGT00940000159408.u.a ENSGT00940000153675.a.b.b ENSGT00950000182977.A.i.a.d ENSGT00940000159408.v ENSGT00940000153675.a.a.b ENSGT00940000154332 ENSGT00940000165936 ENSGT00530000063320.A.j ENSGT00940000154098.b Perciformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f ENSGT00980000198631 ENSGT00940000153634.a ENSGT00890000139436.A.b.b ENSGT00940000157682.A ENSGT00940000166378 ENSGT00940000165056.b ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000161233 ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00940000156138.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 ENSGT00940000166327 ENSGT00390000011058.a ENSGT00510000049583 ENSGT00940000155203.a ENSGT00940000165359.b ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000159408.v ENSGT00940000159408.u.b ENSGT00940000159408.u.a ENSGT00940000153675.a.b.b ENSGT00950000182977.A.i.a.d ENSGT00940000154332 ENSGT00940000165936 ENSGT00530000063320.A.j ENSGT00940000154098.b Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f ENSGT00980000198631 ENSGT00940000153634.a ENSGT00890000139436.A.b.b ENSGT00940000157682.A ENSGT00940000166378 ENSGT00940000165056.b ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000161233 ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00940000156138.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 ENSGT00940000166327 ENSGT00390000011058.a ENSGT00510000049583 ENSGT01010000230163 ENSGT00940000155203.a ENSGT00940000165359.b ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000159408.v ENSGT00940000153675.a.b.b ENSGT00950000182977.A.i.a.d ENSGT00940000165936 ENSGT00530000063320.A.j ENSGT00940000154098.b ENSGT00940000156659 ENSGT00940000162989.f.b.d.b Stickleback MODERN SPECIES 11 porcn (ENSGACG00000012184) si:ch211-255g12.6 (ENSGACG00000012198) wdr13 (ENSGACG00000012202) ENSGACG00000012208 ENSGACG00000012210 tspy (ENSGACG00000012214) sema3ga (ENSGACG00000012228) WAS (ENSGACG00000012237) SLC38A5 (ENSGACG00000012263) apex2 (ENSGACG00000012307) zgc:162200 (ENSGACG00000012309) nt5dc2 (ENSGACG00000012314) rap1gapa (ENSGACG00000012353) aurkaip1 (ENSGACG00000012359) mxra8b (ENSGACG00000012362) dvl1b (ENSGACG00000012365) ##22 ccdc187 (ENSGACG00000012372) uts2a (ENSGACG00000012378) ENSGACG00000012384 dnajc11a (ENSGACG00000012391) ENSGACG00000012425 ENSGACG00000012433 ENSGACG00000012439 ENSGACG00000012448 ENSGACG00000012480 mfsd4ab (ENSGACG00000012498) lemd1 (ENSGACG00000012510) pm20d1.2 (ENSGACG00000012521) ENSGACG00000012557 ENSGACG00000012562 ENSGACG00000012566 Lumpfish MODERN SPECIES 22 ENSCLMG00005008315 porcn (ENSCLMG00005008316) wdr13 (ENSCLMG00005008324) ENSCLMG00005008463 ENSCLMG00005008465 tspy (ENSCLMG00005008466) sema3ga 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ENSGT00940000166378 ENSGT00940000165056.b ENSGT00970000193554 ENSGT00940000161233 ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00940000156138.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 ENSGT00940000166327 ENSGT00390000011058.a ENSGT00510000049583 ENSGT00940000155203.a ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000159408.v ENSGT00940000153675.a.a.b ENSGT00940000154332 ENSGT00940000165936 ENSGT00530000063320.A.j ENSGT00940000154098.b ENSGT00940000156659 ENSGT00940000161149 ENSGT00940000162989.f.b.c ENSGT00940000162989.f.a.b European seabass MODERN SPECIES 14 ENSDLAG00005001738 ENSDLAG00005001755 ENSDLAG00005032306 ENSDLAG00005001807 ENSDLAG00005032858 tspy (ENSDLAG00005029345) ENSDLAG00005001952 ENSDLAG00005004947 ENSDLAG00005005075 ENSDLAG00005007844 ENSDLAG00005030570 ENSDLAG00005008051 ENSDLAG00005008325 aurkaip1 (ENSDLAG00005009924) mxra8b (ENSDLAG00005009934) DVL1 (ENSDLAG00005009961) ##22 tnfrsf9a (ENSDLAG00005010109) 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17 ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f ENSGT00980000198631 ENSGT00940000153634.a ENSGT00890000139436.A.b.b ENSGT00940000157682.A ENSGT00940000166378 ENSGT00940000165056.b ENSGT00970000193554 ENSGT00940000161233 ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000154471.a.a ENSGT00940000164911 ENSGT00940000156138.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b ENSGT00950000182903.b.a.z ##22 ENSGT00940000166327 ENSGT00390000011058.a ENSGT00510000049583 ENSGT00940000155203.a ENSGT00940000167132 ENSGT00860000133842.n ENSGT00940000159408.v ENSGT00940000153675.a.b.b ENSGT00940000153675.a.a.a.b ENSGT00940000154332 ENSGT00530000063320.A.j ENSGT00940000154098.b ENSGT00940000156659.g.a ENSGT00940000177848 ENSGT00940000156659.g.b Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f ENSGT00980000198631 ENSGT00940000153634.a ENSGT00890000139436.A.b.b ENSGT00940000157682.A ENSGT00940000166378 ENSGT00940000165056.b ENSGT00970000193554 ENSGT00940000161233 ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000154471.a.a 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(ENSHHUG00000046706) CAMTA1 (ENSHHUG00000046693) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00990000211391 ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f.b ENSGT00980000198631 ENSGT00940000153634.a.h ENSGT00940000160063.g.b.d ENSGT00890000139436.A.b.b.a ENSGT00940000166378.a ENSGT00940000165056.b.c ENSGT00970000193554.a.b ENSGT00940000161233.b ENSGT00940000154471.a.a.d ENSGT00940000164911.e.a ENSGT00940000156138.c.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b.c ENSGT00950000182903.b.a.z.e.a ##22 ENSGT00940000166327.f ENSGT00390000011058.a.a ENSGT00510000049583.k.b ENSGT00940000155203.a.f ENSGT00860000133842.n.c ENSGT00940000162344 ENSGT00940000159408.r ENSGT00940000153675.a.a.a.b.c.a ENSGT00940000178268.b ENSGT00940000177848.a ENSGT00940000156659.d ENSGT00940000162989.f.a.b ENSGT00940000157024.k.b.f ENSGT00940000154738.b ENSGT00940000162607.a.c Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000183062.a.b.b.a.b ENSGT00990000211391 ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f.b ENSGT00940000153634.a.h ENSGT00940000160063.g.b.d ENSGT00890000139436.A.b.b.a ENSGT00940000166378.a ENSGT00940000165056.b.c ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000161233.b ENSGT00940000154471.a.a.d ENSGT00940000164911.e.a ENSGT00940000156138.c.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b.c ENSGT00950000182903.b.a.z.e.a ##22 ENSGT00940000166327.f ENSGT00390000011058.a.a ENSGT00510000049583.k.b ENSGT00940000155203.a.f ENSGT00860000133842.n.c ENSGT00940000162344 ENSGT00940000159408.r ENSGT00940000153675.a.a.a.b.c.a ENSGT00940000178268.b ENSGT00940000177848.a ENSGT00940000156659.d ENSGT00940000162989.f.a.b ENSGT00940000157024.k.b.f ENSGT00940000154738.b ENSGT00940000162607.a.c Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183062.a.b.b.a.b ENSGT00990000211391 ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f.b ENSGT00940000153634.a.h ENSGT00940000160063.g.b.d ENSGT00890000139436.A.b.b.a ENSGT00940000166378.a ENSGT00940000165056.b.c ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000161233.b.a ENSGT00940000154471.a.a.d ENSGT00940000164911.e.a ENSGT00940000156138.c.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b.c ENSGT00950000182903.b.a.z.e.a ##22 ENSGT00940000166327.f ENSGT00390000011058.a.a ENSGT00510000049583.k.b ENSGT00940000155203.a.f ENSGT00860000133842.n.c ENSGT00940000162344 ENSGT00940000159408.r ENSGT00940000153675.a.a.a.b.c.a ENSGT00940000178268.b ENSGT00940000177848.a ENSGT00940000156659.d ENSGT00940000162989.f.a.b ENSGT00940000157024.k.b.f ENSGT00940000154738.b ENSGT00940000162607.a.c Chinook salmon DUPLICATION Chinook salmon MODERN SPECIES 2955 IQSEC2 (ENSOTSG00005035165) kdm5c (ENSOTSG00005034987) PDZD4 (ENSOTSG00005034940) porcn (ENSOTSG00005034922) wdr13 (ENSOTSG00005034748) ENSOTSG00005034747 tspy (ENSOTSG00005034745) sema3ga (ENSOTSG00005033706) WAS (ENSOTSG00005033699) SLC38A5 (ENSOTSG00005033424) zgc:162200 (ENSOTSG00005033421) ENSOTSG00005033073 rap1gapa (ENSOTSG00005033036) aurkaip1 (ENSOTSG00005033035) mxra8b (ENSOTSG00005033034) DVL1 (ENSOTSG00005033033) ##22 tnfrsf9a (ENSOTSG00005033032) ENSOTSG00005033030 uts2a (ENSOTSG00005033028) ENSOTSG00005033026 ENSOTSG00005033025 ENSOTSG00005033024 ENSOTSG00005033023 ENSOTSG00005033021 ENSOTSG00005033020 eef1g (ENSOTSG00005033014) polr2g (ENSOTSG00005033011) ENSOTSG00005032983 Chinook salmon MODERN SPECIES 14 PDZD4 (ENSOTSG00005035749) ENSOTSG00005035750 porcn (ENSOTSG00005035751) wdr13 (ENSOTSG00005035755) suv39h1b (ENSOTSG00005035758) ENSOTSG00005035760 tspy (ENSOTSG00005035761) sema3ga (ENSOTSG00005035763) WAS (ENSOTSG00005036108) ENSOTSG00005036112 zgc:162200 (ENSOTSG00005036260) ENSOTSG00005036263 rap1gapa (ENSOTSG00005036678) aurkaip1 (ENSOTSG00005037071) mxra8b (ENSOTSG00005037073) DVL1 (ENSOTSG00005037074) ##22 tnfrsf9a (ENSOTSG00005037079) ENSOTSG00005037080 uts2a (ENSOTSG00005037081) ENSOTSG00005037100 dnajc11a (ENSOTSG00005037101) THAP3 (ENSOTSG00005037145) ENSOTSG00005037149 CDC42 (ENSOTSG00005037186) ENSOTSG00005037188 ENSOTSG00005037189 PM20D1 (ENSOTSG00005037191) ENSOTSG00005037331 ENSOTSG00005037343 NFASC (ENSOTSG00005038263) ENSOTSG00005042186 Coho salmon MODERN SPECIES 16 ENSOKIG00005039877 porcn (ENSOKIG00005039906) wdr13 (ENSOKIG00005040141) suv39h1b (ENSOKIG00005040343) ENSOKIG00005040386 tspy (ENSOKIG00005040399) sema3ga (ENSOKIG00005040455) ENSOKIG00005041008 SLC38A5 (ENSOKIG00005041162) ENSOKIG00005041666 ENSOKIG00005041762 rap1gapa (ENSOKIG00005043234) ENSOKIG00005044516 aurkaip1 (ENSOKIG00005044530) mxra8b (ENSOKIG00005044553) DVL1 (ENSOKIG00005044585) ##22 tnfrsf9a (ENSOKIG00005044604) ENSOKIG00005044625 uts2a (ENSOKIG00005044639) ENSOKIG00005044678 dnajc11a (ENSOKIG00005044706) ENSOKIG00005044796 ENSOKIG00005044811 CDC42 (ENSOKIG00005044819) ENSOKIG00005044829 ENSOKIG00005044832 PM20D1 (ENSOKIG00005044871) ENSOKIG00005045308 NFASC (ENSOKIG00005046330) ENSOKIG00005046474 ENSOKIG00005046479 Rainbow trout MODERN SPECIES 7 ENSOMYG00000011101 ENSOMYG00000062902 ENSOMYG00000011158 ENSOMYG00000011289 suv39h1b (ENSOMYG00000011473) ENSOMYG00000011490 tspy (ENSOMYG00000011500) sema3ga (ENSOMYG00000011531) ENSOMYG00000011599 ENSOMYG00000011676 ENSOMYG00000011749 ENSOMYG00000011833 ENSOMYG00000012861 aurkaip1 (ENSOMYG00000012912) mxra8b (ENSOMYG00000012919) DVL1 (ENSOMYG00000012954) ##22 tnfrsf9a (ENSOMYG00000013030) ENSOMYG00000013043 uts2a (ENSOMYG00000013058) CAMTA1 (ENSOMYG00000046129) dnajc11a (ENSOMYG00000013122) THAP3 (ENSOMYG00000013171) ENSOMYG00000075195 ENSOMYG00000013181 ENSOMYG00000013191 ENSOMYG00000013218 ENSOMYG00000013224 ENSOMYG00000069046 ENSOMYG00000068224 ENSOMYG00000049959 ENSOMYG00000068169 Salmo ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f.b ENSGT00980000198631 ENSGT00940000153634.a.h ENSGT00940000160063.g.b.d ENSGT00890000139436.A.b.b.a ENSGT00940000166378.a ENSGT00940000165056.b.c ENSGT00970000193554.a.b ENSGT00940000161233.b ENSGT00940000154471.a.a.d ENSGT00940000164911.e.a ENSGT00940000156138.c.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b.c ENSGT00950000182903.b.a.z.e.b.b ##22 ENSGT00950000182903.b.a.z.e.a ##22 ENSGT00940000166327.f ENSGT00390000011058.a.a ENSGT00510000049583.k.b ENSGT00940000155203.a.f ENSGT00860000133842.n.c ENSGT00940000162344 ENSGT00940000159408.r ENSGT00940000153675.a.b.b.d ENSGT00940000153675.a.a.a.b.c.a ENSGT00940000178268.b ENSGT00940000177848.a ENSGT00940000156659.d ENSGT00940000162989.f.a.b ENSGT00940000157024.k.b.f ENSGT00940000154738.b Atlantic salmon MODERN SPECIES 4 ENSSSAG00000068176 ENSSSAG00000093801 ENSSSAG00000067495 suv39h1b (ENSSSAG00000067524) ENSSSAG00000067535 tspy (ENSSSAG00000067537) sema3ga (ENSSSAG00000067617) WASP (ENSSSAG00000071106) ENSSSAG00000071142 ENSSSAG00000071516 ENSSSAG00000071529 ENSSSAG00000107719 ENSSSAG00000093242 aurkaip1 (ENSSSAG00000074820) mxra8b (ENSSSAG00000074828) DVL1 (ENSSSAG00000063702) ##22 tnfrsf9a (ENSSSAG00000085238) ENSSSAG00000075855 uts2a (ENSSSAG00000091442) CAMTA1 (ENSSSAG00000093840) dnajc11a (ENSSSAG00000075872) THAP3 (ENSSSAG00000111460) ENSSSAG00000038910 CDC42 (ENSSSAG00000038975) ENSSSAG00000039097 ENSSSAG00000039161 ENSSSAG00000039296 ENSSSAG00000040954 ENSSSAG00000044914 fam19a1 (ENSSSAG00000064370) fam19a4 (ENSSSAG00000086359) River trout MODERN SPECIES 23 ENSSTUG00000012052 IQSEC2 (ENSSTUG00000012077) kdm5c (ENSSTUG00000012181) PDZD4 (ENSSTUG00000012464) porcn (ENSSTUG00000012508) wdr13 (ENSSTUG00000012564) suv39h1b (ENSSTUG00000012763) ENSSTUG00000012785 tspy (ENSSTUG00000012798) sema3ga (ENSSTUG00000012839) ENSSTUG00000030443 SLC38A5 (ENSSTUG00000030459) zgc:162200 (ENSSTUG00000030743) ENSSTUG00000030769 rap1gapa (ENSSTUG00000031382) DVL1 (ENSSTUG00000031592) ##22 tnfrsf9a (ENSSTUG00000031635) ccdc187 (ENSSTUG00000031645) uts2a (ENSSTUG00000031669) CAMTA1 (ENSSTUG00000031750) dnajc11a (ENSSTUG00000031795) ENSSTUG00000032054 ENSSTUG00000032083 CDC42 (ENSSTUG00000032102) ENSSTUG00000032124 ENSSTUG00000032154 PM20D1 (ENSSTUG00000032212) ENSSTUG00000032455 NFASC (ENSSTUG00000032990) ENSSTUG00000037241 TAFA1 (ENSSTUG00000037250) Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000153634.a.g ENSGT00940000160063.g.b.c 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ENSGT00950000183062.a.b.b.a.a ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f.a ENSGT00940000153634.a.g ENSGT00940000160063.g.b.c ENSGT00890000139436.A.b.b.b ENSGT00940000157682.A ENSGT00940000166378.b ENSGT00940000165056.b.d ENSGT00970000193554.a.a ENSGT00940000161233.a ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000154471.a.a.c ENSGT00940000156138.c.d ENSGT01030000236101 ENSGT00390000001509.b.d ENSGT00950000182903.b.a.z.e.b.a ##22 ENSGT00940000166327.e ENSGT00390000011058.a.b ENSGT00940000155203.a.e ENSGT00860000133842.n.d ENSGT00940000159408.q.a ENSGT00940000159408.q.b ENSGT00940000153675.a.b.b.c ENSGT00940000165936 ENSGT00530000063320.A.j ENSGT00940000154098.b ENSGT00940000156659.c ENSGT00940000157024.k.b.e ENSGT00940000164303.b.b ENSGT00940000162607.a.d ENSGT00940000155644.b.a.b.d Atlantic salmon MODERN SPECIES 6 ENSSSAG00000068151 suv39h1b (ENSSSAG00000068147) ENSSSAG00000107485 ENSSSAG00000110522 tspy (ENSSSAG00000068130) sema3ga (ENSSSAG00000067399) WASP (ENSSSAG00000067358) ENSSSAG00000066067 ENSSSAG00000066030 ENSSSAG00000066027 ENSSSAG00000116498 ENSSSAG00000108663 ENSSSAG00000116798 MXRA8 (ENSSSAG00000065749) ENSSSAG00000096581 ENSSSAG00000074869 ##22 tnfrsf9a (ENSSSAG00000084852) ENSSSAG00000063630 ENSSSAG00000087193 dcj11 (ENSSSAG00000063552) ENSSSAG00000063523 ENSSSAG00000101232 ENSSSAG00000063513 ENSSSAG00000063211 mfsd4ab (ENSSSAG00000089305) lemd1 (ENSSSAG00000063177) ENSSSAG00000091134 ENSSSAG00000063131 ENSSSAG00000042361 ENSSSAG00000041990 ENSSSAG00000114328 River trout MODERN SPECIES 20 porcn (ENSSTUG00000015320) wdr13 (ENSSTUG00000015371) suv39h1b (ENSSTUG00000015413) ENSSTUG00000015428 ENSSTUG00000015442 tspy (ENSSTUG00000015452) sema3ga (ENSSTUG00000015538) ENSSTUG00000017230 ENSSTUG00000017279 apex2 (ENSSTUG00000028293) zgc:162200 (ENSSTUG00000028307) ENSSTUG00000028320 rap1gapa (ENSSTUG00000028335) ENSSTUG00000028544 mxra8b (ENSSTUG00000028554) DVL1 (ENSSTUG00000028597) ##22 tnfrsf9a (ENSSTUG00000028764) ENSSTUG00000028788 CAMTA1 (ENSSTUG00000028830) dnajc11a (ENSSTUG00000028897) ENSSTUG00000028964 ENSSTUG00000028987 ENSSTUG00000029021 mfsd4ab (ENSSTUG00000029198) lemd1 (ENSSTUG00000029224) PM20D1 (ENSSTUG00000029293) NFASC (ENSSTUG00000029450) TAFA1 (ENSSTUG00000032373) TAFA3 (ENSSTUG00000032388) UBA3 (ENSSTUG00000032430) arl6ip5b (ENSSTUG00000032544) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f.a ENSGT00940000153634.a.g ENSGT00940000160063.g.b.c ENSGT00890000139436.A.b.b.b ENSGT00940000157682.A ENSGT00940000166378.b ENSGT00940000165056.b.d ENSGT00970000193554.a.a ENSGT00940000161233.a ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000154471.a.a.c ENSGT00940000164911.e.b ENSGT00940000156138.c.d ENSGT01030000236101 ENSGT00390000001509.b.d ENSGT00950000182903.b.a.z.e.b.b ##22 ENSGT00950000182903.b.a.z.e.b.a ##22 ENSGT00940000166327.e ENSGT00390000011058.a.b ENSGT00510000049583.k.a ENSGT00940000155203.a.e ENSGT00940000167132 ENSGT00860000133842.n.d ENSGT00940000159408.q.a ENSGT00940000159408.q.b ENSGT00940000153675.a.b.b.c ENSGT00940000165936 ENSGT00530000063320.A.j ENSGT00940000154098.b ENSGT00940000156659.c ENSGT00940000157024.k.b.e Huchen MODERN SPECIES 672 porcn (ENSHHUG00000022953) wdr13 (ENSHHUG00000022976) suv39h1b (ENSHHUG00000023052) ENSHHUG00000023054 ENSHHUG00000023056 tspy (ENSHHUG00000023061) sema3ga (ENSHHUG00000023071) ENSHHUG00000023181 ENSHHUG00000023193 apex2 (ENSHHUG00000023220) zgc:162200 (ENSHHUG00000023221) ENSHHUG00000023223 RAP1GAP (ENSHHUG00000023234) ENSHHUG00000024046 mxra8b (ENSHHUG00000024050) ENSHHUG00000024066 ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f.a ENSGT00940000153634.a.g ENSGT00940000160063.g.b.c ENSGT00890000139436.A.b.b.b ENSGT00940000157682.A ENSGT00940000166378.b ENSGT00940000165056.b.d ENSGT00970000193554.a.a ENSGT00940000161233.a ENSGT00530000063540.a ENSGT00940000154471.a.a.c ENSGT00940000164911.e.b ENSGT00940000156138.c.d ENSGT01030000236101 ENSGT00390000001509.b.d ENSGT00950000182903.b.a.z.e.b.b ##22 ENSGT00940000166327.e ENSGT00390000011058.a.b ENSGT00510000049583.k.a ENSGT00940000155203.a.e ENSGT00940000167132 ENSGT00860000133842.n.d ENSGT00940000159408.q.a ENSGT00940000159408.q.b ENSGT00940000153675.a.b.b.c ENSGT00940000165936 ENSGT00530000063320.A.j ENSGT00940000154098.b ENSGT00940000156659.c ENSGT00940000157024.k.b.e ENSGT00940000164303.b.b Salmo ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000183062.a.b.b.a.b ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f.b ENSGT00980000198631 ENSGT00940000153634.a.h ENSGT00940000160063.g.b.d ENSGT00890000139436.A.b.b.a ENSGT00940000166378.a ENSGT00940000165056.b.c ENSGT00970000193554.a.b ENSGT00940000161233.b ENSGT00940000154471.a.a.d ENSGT00940000164911.e.a ENSGT00940000156138.c.c ENSGT00390000012802 ENSGT00390000001509.b.c ENSGT00950000182903.b.a.z.e.b.b ##22 ENSGT00950000182903.b.a.z.e.a ##22 ENSGT00940000166327.f ENSGT00390000011058.a.a ENSGT00510000049583.k.b ENSGT00940000155203.a.f ENSGT00860000133842.n.c ENSGT00940000162344 ENSGT00940000159408.r ENSGT00940000153675.a.b.b.d 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ENSGT00940000157024.k.b.e ENSGT00940000164303.b.b Rainbow trout MODERN SPECIES 30 ENSOMYG00000046804 suv39h1b (ENSOMYG00000046786) ENSOMYG00000046783 ENSOMYG00000046781 tspy (ENSOMYG00000046775) sema3ga (ENSOMYG00000046760) ENSOMYG00000046740 ENSOMYG00000046696 ENSOMYG00000046669 ENSOMYG00000046665 ENSOMYG00000046663 ENSOMYG00000046652 ENSOMYG00000046313 ENSOMYG00000046203 mxra8b (ENSOMYG00000046198) ENSOMYG00000046181 ##22 tnfrsf9a (ENSOMYG00000046166) ENSOMYG00000046153 uts2a (ENSOMYG00000046142) ENSOMYG00000013065 ENSOMYG00000046110 dnajc11a (ENSOMYG00000046098) ENSOMYG00000046078 ENSOMYG00000046055 ENSOMYG00000045900 mfsd4ab (ENSOMYG00000045845) lemd1 (ENSOMYG00000045832) ENSOMYG00000045818 ENSOMYG00000049192 ENSOMYG00000043002 ENSOMYG00000042677 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01030000234564.a.a.b.a.f.a ENSGT00940000153634.a.g ENSGT00940000160063.g.b.c ENSGT00890000139436.A.b.b.b ENSGT00940000157682.A ENSGT00940000166378.b ENSGT00940000165056.b.d ENSGT00970000193554.a.a 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tnfrsf9a (ENSOKIG00005004394) ENSOKIG00005004336 uts2a (ENSOKIG00005004278) ENSOKIG00005043562 CAMTA1 (ENSOKIG00005043430) dnajc11a (ENSOKIG00005043362) ENSOKIG00005043352 ENSOKIG00005043310 ENSOKIG00005043281 ENSOKIG00005043108 mfsd4ab (ENSOKIG00005042966) lemd1 (ENSOKIG00005042926) ENSOKIG00005042912 ENSOKIG00005042824 NFASC (ENSOKIG00005040500) Chinook salmon MODERN SPECIES 7 ENSOTSG00005006698 porcn (ENSOTSG00005006665) wdr13 (ENSOTSG00005006636) suv39h1b (ENSOTSG00005006630) ENSOTSG00005006628 ENSOTSG00005006627 tspy (ENSOTSG00005006625) sema3ga (ENSOTSG00005006621) ENSOTSG00005006606 ENSOTSG00005006571 apex2 (ENSOTSG00005006565) zgc:162200 (ENSOTSG00005006564) rap1gapa (ENSOTSG00005006547) ENSOTSG00005006538 mxra8b (ENSOTSG00005006537) DVL1 (ENSOTSG00005006536) ##22 tnfrsf9a (ENSOTSG00005006535) ENSOTSG00005006533 uts2a (ENSOTSG00005006532) ENSOTSG00005006530 CAMTA1 (ENSOTSG00005006528) AGTR1 (ENSOTSG00005006526) gyg1b (ENSOTSG00005006525) bdh1 (ENSOTSG00005006524) ENSOTSG00005006523 ENSOTSG00005028583 dnajc11a (ENSOTSG00005028560) ENSOTSG00005028559 ENSOTSG00005028558 ENSOTSG00005028545 ENSOTSG00005028162 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.b.a.z.f ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.b.a.z.f ##22 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.b.a.z.f ##22 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.b.a.z.f ##22 Chinook salmon MODERN SPECIES 8 ncbp3 (ENSOTSG00005017567) ENSOTSG00005017566 tpst1l (ENSOTSG00005017565) crcp (ENSOTSG00005017563) asl (ENSOTSG00005015010) ZPLD1 (ENSOTSG00005014978) b3glcta (ENSOTSG00005014573) ENSOTSG00005014566 hmgb1b (ENSOTSG00005014563) ENSOTSG00005014561 ABCF3 (ENSOTSG00005014551) LRCH3 (ENSOTSG00005014549) iqcg (ENSOTSG00005014548) rpl35a (ENSOTSG00005014547) ENSOTSG00005014542 ENSOTSG00005014541 ##22 ENSOTSG00005014539 eif4h (ENSOTSG00005014528) RFFL (ENSOTSG00005014527) atp1b3b (ENSOTSG00005014526) tfdp2 (ENSOTSG00005014525) ece2b (ENSOTSG00005009106) NYAP2 (ENSOTSG00005009089) IRS1 (ENSOTSG00005009088) ENSOTSG00005009087 ENSOTSG00005009086 ENSOTSG00005009085 sst1.1 (ENSOTSG00005009084) ENSOTSG00005009083 ENSOTSG00005009082 ENSOTSG00005009081 Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.b.a.z.f ##22 Atlantic salmon MODERN SPECIES 28 ENSSSAG00000045377 ENSSSAG00000045342 rnf169 (ENSSSAG00000087927) ENSSSAG00000102796 abcg1 (ENSSSAG00000042281) ENSSSAG00000109701 ENSSSAG00000102318 HMGB1 (ENSSSAG00000040208) ENSSSAG00000040288 ENSSSAG00000040173 ENSSSAG00000120507 ENSSSAG00000022030 iqcg (ENSSSAG00000020818) ENSSSAG00000018627 abcc5 (ENSSSAG00000042568) ENSSSAG00000085577 ##22 ENSSSAG00000096733 ENSSSAG00000087462 ENSSSAG00000004537 ##22 ENSSSAG00000110741 ap2m1b (ENSSSAG00000004585) mmp23bb (ENSSSAG00000004640) pcyt1ab (ENSSSAG00000004666) ENSSSAG00000004676 ENSSSAG00000083238 ENSSSAG00000004692 ENSSSAG00000004763 ENSSSAG00000095793 ENSSSAG00000094931 if4h (ENSSSAG00000004821) ENSSSAG00000004858 Elephant shark MODERN SPECIES 1543 ENSCMIG00000006674 CLCN6 (ENSCMIG00000006678) ENSCMIG00000006679 ENSCMIG00000006681 ENSCMIG00000006684 ENSCMIG00000006687 si:dkeyp-104h9.5 (ENSCMIG00000006692) plod1a (ENSCMIG00000006750) mfn2 (ENSCMIG00000006931) ENSCMIG00000007110 ENSCMIG00000007113 ENSCMIG00000007118 PLEKHG5 (ENSCMIG00000007123) NOL9 (ENSCMIG00000007124) mxra8b (ENSCMIG00000007126) dvl1b (ENSCMIG00000007129) ##22 ENSCMIG00000007144 ENSCMIG00000007208 TAS1R1 (ENSCMIG00000007246) errfi1a (ENSCMIG00000007267) slc45a1 (ENSCMIG00000007283) ENSCMIG00000007314 ENSCMIG00000007321 ENSCMIG00000007325 mrps16 (ENSCMIG00000007332) pax7b (ENSCMIG00000007348) ENSCMIG00000007418 ENSCMIG00000007421 ENSCMIG00000007424 icmt (ENSCMIG00000007426) rnf207b (ENSCMIG00000007438) Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.b.b ##22 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903.b.b ##22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 1200 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 Elephant shark DUPLICATION Elephant shark MODERN SPECIES 2583 ENSCMIG00000002419 ##22 Elephant shark MODERN SPECIES 2141 dixdc1a (ENSCMIG00000012269) ##22 ENSCMIG00000012261 ENSCMIG00000012258 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 266 ENSGT00940000166045 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00940000166624 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000167059 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 119 ENSGT00940000166045 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00940000166624 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000167059 ENSGT00940000176045 ENSGT00390000001053 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00940000155743 ENSGT00940000164257 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a ENSGT00940000159163 ENSGT00390000016427 ENSGT01080000257365.b.a.a.a Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00390000000586 ENSGT00390000017499 ENSGT00940000166045 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00940000166624 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000166399 ENSGT00940000176045 ENSGT00390000001053 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00940000155743 ENSGT00940000164257 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a ENSGT00940000159163 ENSGT00390000016427 ENSGT01080000257365.b.a.a.a Amniota ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D 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ENSNSUG00000004158 ZW10 (ENSNSUG00000004159) ENSNSUG00000004160 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 3973 ENSLLTG00000002635 ##22 Lizard MODERN SPECIES 1555 ENSACAG00000045448 ##22 DLAT (ENSACAG00000022510) PIH1D2 (ENSACAG00000015437) ENSACAG00000015430 TIMM8B (ENSACAG00000042536) SDHD (ENSACAG00000015409) ENSACAG00000015396 ENSACAG00000037543 BCO2 (ENSACAG00000015299) ENSACAG00000040318 ENSACAG00000042981 ENSACAG00000043147 tuatara MODERN SPECIES 1213 ABCG4 (ENSSPUG00000010850) HINFP (ENSSPUG00000010800) POU2AF2 (ENSSPUG00000010786) POU2AF3 (ENSSPUG00000010774) POU2AF1 (ENSSPUG00000010760) BTG4 (ENSSPUG00000010746) LAYN (ENSSPUG00000010722) SIK2 (ENSSPUG00000010660) ALG9 (ENSSPUG00000010630) ENSSPUG00000010616 FDXACB1 (ENSSPUG00000010598) CFAP68 (ENSSPUG00000010574) CRYAB (ENSSPUG00000010558) HSPB2 (ENSSPUG00000010549) C11orf52 (ENSSPUG00000010535) DIXDC1 (ENSSPUG00000010466) ##22 DLAT (ENSSPUG00000010439) PIH1D2 (ENSSPUG00000010427) ENSSPUG00000010414 TIMM8B (ENSSPUG00000010397) ENSSPUG00000010380 ENSSPUG00000010364 TEX12 (ENSSPUG00000010347) BCO2 (ENSSPUG00000010330) ENSSPUG00000010314 ENSSPUG00000010291 SIPA1 (ENSSPUG00000010162) ENSSPUG00000010131 EHBP1L1 (ENSSPUG00000010122) ENSSPUG00000010108 MAP3K11 (ENSSPUG00000010050) Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00870000136508.c.a ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00940000153695.A ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00940000166624 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00960000189707 ENSGT00940000166399 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00940000180437 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT01070000254095 ENSGT00390000002752.s.a ENSGT00390000002752.t ENSGT00900000143181 ENSGT00390000002752.s.b Archosauria ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000157853 ENSGT00870000136508.c.a ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00940000153695.A ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00960000189707 ENSGT00940000166399 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.t ENSGT00900000143181 ENSGT00940000155743 ENSGT00990000212165 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000164257 Aves ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000157853 ENSGT00870000136508.c.a ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00940000153695.A ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00960000189707 ENSGT00940000166399 ENSGT00940000176045 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.t ENSGT00900000143181 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000164257 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a Neognathae ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00420000030454 ENSGT00940000153695.C ENSGT00390000017499 ENSGT00940000153695.A ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00940000166624 ENSGT00990000214235 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00960000189707 ENSGT00940000166399 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.t ENSGT00900000143181 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000164257 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00870000136508.c.a ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00940000153695.C ENSGT00390000017499 ENSGT00940000153695.A ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00990000214235 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00960000189707 ENSGT00940000166399 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.t ENSGT00900000143181 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000164257 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000157853 ENSGT00870000136508.c.a ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00940000153695.C ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00990000214235 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000166399 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.t ENSGT00940000155743 ENSGT00940000164257 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a ENSGT00940000159163 ENSGT00390000016427 ENSGT00940000153312.A Golden eagle MODERN SPECIES 24 HINFP (ENSACCG00020005700) POU2AF2 (ENSACCG00020005687) POU2AF3 (ENSACCG00020005677) ENSACCG00020005661 POU2AF1 (ENSACCG00020005638) BTG4 (ENSACCG00020005617) ENSACCG00020005604 LAYN (ENSACCG00020005587) SIK2 (ENSACCG00020005536) ALG9 (ENSACCG00020005480) FDXACB1 (ENSACCG00020005460) ENSACCG00020005438 CRYAB (ENSACCG00020005425) HSPB2 (ENSACCG00020005414) C11orf52 (ENSACCG00020005408) DIXDC1 (ENSACCG00020005358) ##22 DLAT (ENSACCG00020005324) PIH1D2 (ENSACCG00020005307) ENSACCG00020005296 SDHD (ENSACCG00020005285) IL18 (ENSACCG00020005278) BCO2 (ENSACCG00020005266) PTS (ENSACCG00020005254) NCAM1 (ENSACCG00020005219) ENSACCG00020005169 ANKK1 (ENSACCG00020005139) DRD2 (ENSACCG00020005098) TMPRSS5 (ENSACCG00020005043) ZW10 (ENSACCG00020005020) ENSACCG00020005006 CD3E (ENSACCG00020004996) Kakapo MODERN SPECIES 7 ABCG4 (ENSSHBG00005010980) HINFP (ENSSHBG00005010951) POU2AF2 (ENSSHBG00005010921) POU2AF3 (ENSSHBG00005010886) ENSSHBG00005010857 POU2AF1 (ENSSHBG00005010831) BTG4 (ENSSHBG00005010768) LAYN (ENSSHBG00005010712) SIK2 (ENSSHBG00005010655) ALG9 (ENSSHBG00005010613) FDXACB1 (ENSSHBG00005000697) ENSSHBG00005019796 CRYAB (ENSSHBG00005019792) HSPB2 (ENSSHBG00005019790) C11orf52 (ENSSHBG00005019786) DIXDC1 (ENSSHBG00005019774) ##22 DLAT (ENSSHBG00005019757) PIH1D2 (ENSSHBG00005019747) ENSSHBG00005019744 SDHD (ENSSHBG00005019736) IL18 (ENSSHBG00005019726) TEX12 (ENSSHBG00005019723) BCO2 (ENSSHBG00005019705) PTS (ENSSHBG00005019697) NCAM1 (ENSSHBG00005019689) ENSSHBG00005019684 ANKK1 (ENSSHBG00005019672) DRD2 (ENSSHBG00005019667) ENSSHBG00005019660 ZW10 (ENSSHBG00005019400) ENSSHBG00005019345 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000157853 ENSGT00870000136508.c.a ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00940000153695.C ENSGT00390000017499 ENSGT00940000153695.A ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00960000189707 ENSGT00940000166399 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.t ENSGT00900000143181 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000164257 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a ENSGT00940000159163 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000157853 ENSGT00870000136508.c.a ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00940000153695.C ENSGT00390000017499 ENSGT00940000153695.A ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445.l 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ENSGT00390000016427 ENSGT00940000153312.A ENSGT00940000153312.B Medium ground finch MODERN SPECIES 150 ENSGFOG00000012460 ALG9 (ENSGFOG00000012499) FDXACB1 (ENSGFOG00000012514) CRYAB (ENSGFOG00000012522) HSPB2 (ENSGFOG00000012526) ENSGFOG00000012530 DIXDC1 (ENSGFOG00000012534) ##22 DLAT (ENSGFOG00000012546) ENSGFOG00000012558 SDHD (ENSGFOG00000012561) IL18 (ENSGFOG00000012565) BCO2 (ENSGFOG00000012569) PTS (ENSGFOG00000012575) NCAM1 (ENSGFOG00000012605) ENSGFOG00000012842 ANKK1 (ENSGFOG00000012848) DRD2 (ENSGFOG00000012859) ZW10 (ENSGFOG00000012992) ENSGFOG00000013013 CD3E (ENSGFOG00000013019) MPZL2 (ENSGFOG00000013026) MPZL3 (ENSGFOG00000013031) Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00390000017499 ENSGT00940000153695.A ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445.l ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000166399 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00960000189801 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.t ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000164257 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a ENSGT00390000016427 ENSGT00940000153312.A ENSGT00940000153312.B Zebra finch MODERN SPECIES 17 NLRX1 (ENSTGUG00000000366) ABCG4 (ENSTGUG00000020058) ENSTGUG00000029615 HINFP (ENSTGUG00000000357) POU2AF2 (ENSTGUG00000000356) POU2AF3 (ENSTGUG00000023670) ENSTGUG00000000350 ENSTGUG00000028026 BTG4 (ENSTGUG00000000348) LAYN (ENSTGUG00000000344) SIK2 (ENSTGUG00000000335) ALG9 (ENSTGUG00000000331) CRYAB (ENSTGUG00000000320) HSPB2 (ENSTGUG00000025261) C11orf52 (ENSTGUG00000021076) DIXDC1 (ENSTGUG00000000315) ##22 DLAT (ENSTGUG00000000308) ENSTGUG00000000303 SDHD (ENSTGUG00000028553) IL18 (ENSTGUG00000000297) ENSTGUG00000029377 BCO2 (ENSTGUG00000000294) PTS (ENSTGUG00000025708) NCAM1 (ENSTGUG00000000275) ENSTGUG00000000270 ANKK1 (ENSTGUG00000000267) DRD2 (ENSTGUG00000000255) ZW10 (ENSTGUG00000000244) ENSTGUG00000000240 CD3E 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ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00390000003661 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00530000067880 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.x ENSGT01020000231542 ENSGT00390000002752.w.a ENSGT00390000002752.w.b ENSGT00390000014690 ENSGT00900000143181 ENSGT00940000155743 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00390000003661 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 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ENSGT00940000161758 ENSGT00940000155539.a.a Sloth MODERN SPECIES 7804 CRYAB (ENSCHOG00000001991) ENSCHOG00000001996 HSPB2 (ENSCHOG00000002003) C11orf52 (ENSCHOG00000002012) DIXDC1 (ENSCHOG00000002021) ##22 DLAT (ENSCHOG00000002045) PIH1D2 (ENSCHOG00000002060) NKAPD1 (ENSCHOG00000002064) Armadillo MODERN SPECIES 4253 POU2AF2 (ENSDNOG00000018153) POU2AF3 (ENSDNOG00000023573) POU2AF1 (ENSDNOG00000049279) ENSDNOG00000032776 BTG4 (ENSDNOG00000015793) HOATZ (ENSDNOG00000049033) ENSDNOG00000034901 SIK2 (ENSDNOG00000006715) PPP2R1B (ENSDNOG00000006743) ALG9 (ENSDNOG00000031232) FDXACB1 (ENSDNOG00000037748) CFAP68 (ENSDNOG00000041776) ENSDNOG00000047541 HSPB2 (ENSDNOG00000006783) C11orf52 (ENSDNOG00000034299) DIXDC1 (ENSDNOG00000017639) ##22 ENSDNOG00000002250 PIH1D2 (ENSDNOG00000002276) NKAPD1 (ENSDNOG00000005532) TIMM8B (ENSDNOG00000043182) IL18 (ENSDNOG00000014780) BCO2 (ENSDNOG00000014795) NCAM1 (ENSDNOG00000009390) ENSDNOG00000045915 DRD2 (ENSDNOG00000007008) ENSDNOG00000049068 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 151 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943.w ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00940000176045 ENSGT01030000238113 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a Tenrec MODERN SPECIES 4466 DIXDC1 (ENSETEG00000003504) ##22 ENSETEG00000003511 PIH1D2 (ENSETEG00000003520) Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 163 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943.w ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a Elephant MODERN SPECIES 340 ENSLAFG00000011999 ARHGAP20 (ENSLAFG00000004587) POU2AF2 (ENSLAFG00000008233) POU2AF1 (ENSLAFG00000007524) BTG4 (ENSLAFG00000011872) HOATZ (ENSLAFG00000022091) LAYN (ENSLAFG00000011873) SIK2 (ENSLAFG00000000276) PPP2R1B (ENSLAFG00000000279) CFAP68 (ENSLAFG00000014656) ALG9 (ENSLAFG00000014644) FDXACB1 (ENSLAFG00000014650) CRYAB (ENSLAFG00000006747) HSPB2 (ENSLAFG00000009648) C11orf52 (ENSLAFG00000009650) DIXDC1 (ENSLAFG00000010380) ##22 DLAT (ENSLAFG00000009668) PIH1D2 (ENSLAFG00000000391) NKAPD1 (ENSLAFG00000000390) TIMM8B (ENSLAFG00000000388) SDHD (ENSLAFG00000002763) IL18 (ENSLAFG00000028093) TEX12 (ENSLAFG00000003278) ENSLAFG00000025533 ENSLAFG00000000810 Hyrax MODERN SPECIES 3734 DIXDC1 (ENSPCAG00000006837) ##22 DLAT (ENSPCAG00000006943) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00390000003661 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00920000150760 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.x ENSGT01020000231542 ENSGT00390000002752.w.a ENSGT00390000002752.w.b ENSGT00390000014690 ENSGT00900000143181 ENSGT00940000155743 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00410000028767 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00920000150760 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 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ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.w.b ENSGT00390000014690 ENSGT00940000155743 ENSGT00900000143181 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00410000028767 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00530000067880 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.w.b ENSGT00390000014690 ENSGT00940000155743 ENSGT00900000143181 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a Equus ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000154633 ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b.o ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.w.b ENSGT00390000014690 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a ENSGT00940000159163 Donkey MODERN SPECIES 12 ARHGAP20 (ENSEASG00005010090) POU2AF2 (ENSEASG00005038793) POU2AF3 (ENSEASG00005010085) POU2AF1 (ENSEASG00005037560) BTG4 (ENSEASG00005010081) HOATZ (ENSEASG00005033895) LAYN (ENSEASG00005010072) SIK2 (ENSEASG00005010053) ENSEASG00005007402 ALG9 (ENSEASG00005007203) FDXACB1 (ENSEASG00005007198) CFAP68 (ENSEASG00005032215) HSPB2 (ENSEASG00005007190) CRYAB (ENSEASG00005007191) C11orf52 (ENSEASG00005030671) DIXDC1 (ENSEASG00005007160) ##22 DLAT (ENSEASG00005007061) PIH1D2 (ENSEASG00005007042) NKAPD1 (ENSEASG00005034597) ENSEASG00005037008 SDHD (ENSEASG00005028496) IL18 (ENSEASG00005006993) TEX12 (ENSEASG00005038817) BCO2 (ENSEASG00005006807) PTS (ENSEASG00005032413) ENSEASG00005038442 NCAM1 (ENSEASG00005006756) TTC12 (ENSEASG00005006742) ANKK1 (ENSEASG00005006737) DRD2 (ENSEASG00005006735) TMPRSS5 (ENSEASG00005006720) Horse MODERN SPECIES 28 ENSECAG00000057665 POU2AF2 (ENSECAG00000010032) POU2AF3 (ENSECAG00000010274) POU2AF1 (ENSECAG00000011348) BTG4 (ENSECAG00000012564) HOATZ (ENSECAG00000015877) LAYN (ENSECAG00000016154) SIK2 (ENSECAG00000018825) PPP2R1B (ENSECAG00000012108) ALG9 (ENSECAG00000024080) CFAP68 (ENSECAG00000011862) FDXACB1 (ENSECAG00000009561) CRYAB (ENSECAG00000012507) HSPB2 (ENSECAG00000012754) C7H11orf52 (ENSECAG00000012767) DIXDC1 (ENSECAG00000012987) ##22 DLAT (ENSECAG00000021375) PIH1D2 (ENSECAG00000012307) NKAPD1 (ENSECAG00000014411) TIMM8B (ENSECAG00000014836) SDHD (ENSECAG00000031721) ENSECAG00000059719 IL18 (ENSECAG00000015261) TEX12 (ENSECAG00000020108) BCO2 (ENSECAG00000020311) PTS (ENSECAG00000015565) PLET1 (ENSECAG00000031885) NCAM1 (ENSECAG00000019193) TTC12 (ENSECAG00000017966) ANKK1 (ENSECAG00000011781) DRD2 (ENSECAG00000013567) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00410000028767 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00530000067880 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.w.b ENSGT00390000014690 ENSGT00940000155743 ENSGT00900000143181 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a Megabat MODERN SPECIES 1329 ENSPVAG00000009590 POU2AF3 (ENSPVAG00000009595) POU2AF1 (ENSPVAG00000009597) BTG4 (ENSPVAG00000009598) HOATZ (ENSPVAG00000009600) LAYN (ENSPVAG00000009601) SIK2 (ENSPVAG00000009603) PPP2R1B (ENSPVAG00000009606) ALG9 (ENSPVAG00000009608) FDXACB1 (ENSPVAG00000009610) CFAP68 (ENSPVAG00000009611) CRYAB (ENSPVAG00000009612) ENSPVAG00000009613 HSPB2 (ENSPVAG00000009614) ENSPVAG00000009616 DIXDC1 (ENSPVAG00000009617) ##22 DLAT (ENSPVAG00000009618) PIH1D2 (ENSPVAG00000009619) NKAPD1 (ENSPVAG00000009620) TIMM8B (ENSPVAG00000009621) SDHD (ENSPVAG00000009622) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000154633 ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.w.b ENSGT00390000014690 ENSGT00940000155743 ENSGT00900000143181 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a Microbat MODERN SPECIES 1054 REXO2 (ENSMLUG00000009030) RBM7 (ENSMLUG00000023234) C11orf71 (ENSMLUG00000009042) NNMT (ENSMLUG00000029761) ZBTB16 (ENSMLUG00000002970) ENSMLUG00000008598 HTR3B (ENSMLUG00000008575) USP28 (ENSMLUG00000008539) ENSMLUG00000030441 SIK2 (ENSMLUG00000010657) PPP2R1B (ENSMLUG00000010693) ALG9 (ENSMLUG00000016726) FDXACB1 (ENSMLUG00000014872) CFAP68 (ENSMLUG00000028988) DIXDC1 (ENSMLUG00000012193) ##22 DLAT (ENSMLUG00000012212) PIH1D2 (ENSMLUG00000012219) NKAPD1 (ENSMLUG00000024705) TIMM8B (ENSMLUG00000012225) SDHD (ENSMLUG00000012228) ENSMLUG00000027380 TEX12 (ENSMLUG00000017694) BCO2 (ENSMLUG00000017695) PTS (ENSMLUG00000023388) ENSMLUG00000009366 ENSMLUG00000027294 NCAM1 (ENSMLUG00000011838) TTC12 (ENSMLUG00000011854) ANKK1 (ENSMLUG00000011881) DRD2 (ENSMLUG00000011890) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 2 ARHGAP20 (ENSRFEG00010010551) POU2AF2 (ENSRFEG00010011003) POU2AF3 (ENSRFEG00010011079) POU2AF1 (ENSRFEG00010011189) BTG4 (ENSRFEG00010011226) HOATZ (ENSRFEG00010011320) LAYN (ENSRFEG00010011444) SIK2 (ENSRFEG00010011852) PPP2R1B (ENSRFEG00010011926) ALG9 (ENSRFEG00010012163) CFAP68 (ENSRFEG00010012325) FDXACB1 (ENSRFEG00010012533) CRYAB (ENSRFEG00010012583) HSPB2 (ENSRFEG00010012673) C11orf52 (ENSRFEG00010012712) DIXDC1 (ENSRFEG00010012763) ##22 DLAT (ENSRFEG00010012904) PIH1D2 (ENSRFEG00010012995) NKAPD1 (ENSRFEG00010013081) ENSRFEG00010013172 SDHD (ENSRFEG00010013193) IL18 (ENSRFEG00010013367) TEX12 (ENSRFEG00010013443) ENSRFEG00010013472 NCAM1 (ENSRFEG00010013536) ENSRFEG00010014452 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ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003.k ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.w.b ENSGT00390000014690 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a ENSGT00940000159163 Panthera ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000154633 ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003.k 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CLDN25 (ENSMPUG00000019734) Ursidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000154633 ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003.n ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.w.a.a ENSGT00390000002752.w.a.b ENSGT00390000014690 ENSGT00940000155743 ENSGT00950000186376 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 Giant Panda MODERN SPECIES 18 FDX1 (ENSAMEG00000009142) ARHGAP20 (ENSAMEG00000009124) POU2AF2 (ENSAMEG00000023615) POU2AF3 (ENSAMEG00000004344) POU2AF1 (ENSAMEG00000029072) BTG4 (ENSAMEG00000004327) HOATZ (ENSAMEG00000030155) LAYN (ENSAMEG00000004312) SIK2 (ENSAMEG00000004288) 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ENSGT00390000002752.x ENSGT00390000014690 ENSGT00900000143181 ENSGT00940000155743 Suina ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154633 ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.w.b ENSGT00390000014690 ENSGT00940000155743 ENSGT00900000143181 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000155539.a.a ENSGT00940000159163 Pig DUPLICATION Pig MODERN SPECIES 17 ARHGAP20 (ENSSSCG00000015015) POU2AF2 (ENSSSCG00000015018) POU2AF3 (ENSSSCG00000015019) POU2AF1 (ENSSSCG00000015016) BTG4 (ENSSSCG00000015020) HOATZ (ENSSSCG00000015021) LAYN (ENSSSCG00000015022) SIK2 (ENSSSCG00000032941) PPP2R1B (ENSSSCG00000029538) ALG9 (ENSSSCG00000015023) ENSSSCG00000015027 FDXACB1 (ENSSSCG00000021871) CRYAB (ENSSSCG00000036724) C11orf52 (ENSSSCG00000015035) ENSSSCG00000049415 ##22 ENSSSCG00000015036 ##22 DLAT (ENSSSCG00000015030) PIH1D2 (ENSSSCG00000015031) NKAPD1 (ENSSSCG00000015044) TIMM8B (ENSSSCG00000023599) SDHD (ENSSSCG00000015034) IL18 (ENSSSCG00000015037) TEX12 (ENSSSCG00000058261) BCO2 (ENSSSCG00000015039) PTS (ENSSSCG00000015040) PLET1 (ENSSSCG00000032149) NCAM1 (ENSSSCG00000015045) ENSSSCG00000051311 TTC12 (ENSSSCG00000015047) DRD2 (ENSSSCG00000015048) ENSSSCG00000015049 Pig MODERN SPECIES 17 FDX1 (ENSSSCG00000035945) ARHGAP20 (ENSSSCG00000015015) POU2AF2 (ENSSSCG00000015018) POU2AF3 (ENSSSCG00000015019) POU2AF1 (ENSSSCG00000015016) BTG4 (ENSSSCG00000015020) HOATZ (ENSSSCG00000015021) LAYN (ENSSSCG00000015022) SIK2 (ENSSSCG00000032941) PPP2R1B (ENSSSCG00000029538) ALG9 (ENSSSCG00000015023) ENSSSCG00000015027 FDXACB1 (ENSSSCG00000021871) CRYAB 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NKAPD1 (ENSCWAG00000003402) TIMM8B (ENSCWAG00000003395) SDHD (ENSCWAG00000003372) IL18 (ENSCWAG00000003351) TEX12 (ENSCWAG00000003333) BCO2 (ENSCWAG00000003115) ENSCWAG00000003073 ENSCWAG00000003060 TSHB (ENSCWAG00000003050) TSPAN2 (ENSCWAG00000003035) NGF (ENSCWAG00000003021) VANGL1 (ENSCWAG00000002974) CASQ2 (ENSCWAG00000002945) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00410000028767 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00920000150760 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.w.b ENSGT01020000231542 ENSGT00390000002752.w.a ENSGT00390000002752.x ENSGT00390000014690 ENSGT00900000143181 ENSGT00940000155743 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 88 ENSGT00940000154633 ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.x ENSGT00390000014690 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a ENSGT00940000159163 Arabian camel MODERN SPECIES 26 ENSCDRG00005021923 POU2AF2 (ENSCDRG00005021925) ENSCDRG00005021926 POU2AF1 (ENSCDRG00005021927) BTG4 (ENSCDRG00005021928) HOATZ (ENSCDRG00005021930) LAYN (ENSCDRG00005021931) SIK2 (ENSCDRG00005021980) PPP2R1B (ENSCDRG00005022230) ALG9 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(ENSVPAG00000000060) PTS (ENSVPAG00000000061) ENSVPAG00000000062 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00410000028767 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00920000150760 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.w.b ENSGT00390000014690 ENSGT00900000143181 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a Pecora ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 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(ENSCHYG00000000844) ENSCHYG00000000866 IL18 (ENSCHYG00000000912) ENSCHYG00000000937 BCO2 (ENSCHYG00000000956) ENSCHYG00000001037 ENSCHYG00000001052 ENSCHYG00000001075 NCAM1 (ENSCHYG00000001186) TTC12 (ENSCHYG00000001569) DRD2 (ENSCHYG00000001660) ENSCHYG00000001689 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00920000150760 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.w.b ENSGT00390000014690 ENSGT00900000143181 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a Bovidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00920000150760 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.w.b ENSGT00390000014690 ENSGT00900000143181 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a Caprinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00920000150760 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.w.b ENSGT00390000014690 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a ENSGT00940000159163 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 6 ENSOARG00020015269 POU2AF3 (ENSOARG00020015480) POU2AF1 (ENSOARG00020015552) BTG4 (ENSOARG00020015591) HOATZ (ENSOARG00020015720) ENSOARG00020016124 SIK2 (ENSOARG00020016155) PPP2R1B (ENSOARG00020016474) ALG9 (ENSOARG00020017067) FDXACB1 (ENSOARG00020017610) CFAP68 (ENSOARG00020017683) CRYAB (ENSOARG00020017879) ENSOARG00020017997 HSPB2 (ENSOARG00020018038) C11orf52 (ENSOARG00020018078) DIXDC1 (ENSOARG00020018135) ##22 DLAT (ENSOARG00020018609) PIH1D2 (ENSOARG00020018775) NKAPD1 (ENSOARG00020018908) TIMM8B (ENSOARG00020019033) SDHD (ENSOARG00020019097) IL18 (ENSOARG00020019313) TEX12 (ENSOARG00020019390) BCO2 (ENSOARG00020019443) ENSOARG00020019588 PTS (ENSOARG00020019616) ENSOARG00020019701 NCAM1 (ENSOARG00020019782) TTC12 (ENSOARG00020020523) DRD2 (ENSOARG00020021004) TMPRSS5 (ENSOARG00020021191) Goat MODERN SPECIES 6 ARHGAP20 (ENSCHIG00000015605) POU2AF2 (ENSCHIG00000022867) ENSCHIG00000019618 POU2AF1 (ENSCHIG00000020104) BTG4 (ENSCHIG00000017012) HOATZ (ENSCHIG00000026923) LAYN (ENSCHIG00000017452) SIK2 (ENSCHIG00000013912) PPP2R1B (ENSCHIG00000019958) ALG9 (ENSCHIG00000017199) FDXACB1 (ENSCHIG00000017261) CFAP68 (ENSCHIG00000025925) ENSCHIG00000015620 CRYAB (ENSCHIG00000014088) HSPB2 (ENSCHIG00000025796) DIXDC1 (ENSCHIG00000013840) ##22 ENSCHIG00000020818 PIH1D2 (ENSCHIG00000014262) NKAPD1 (ENSCHIG00000012353) TIMM8B (ENSCHIG00000009368) SDHD (ENSCHIG00000002240) IL18 (ENSCHIG00000020991) TEX12 (ENSCHIG00000011647) BCO2 (ENSCHIG00000011184) ENSCHIG00000025544 ENSCHIG00000010511 NCAM1 (ENSCHIG00000013038) TTC12 (ENSCHIG00000006414) ANKK1 (ENSCHIG00000024082) DRD2 (ENSCHIG00000004216) TMPRSS5 (ENSCHIG00000017835) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00920000150760 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.w.b.a ENSGT01020000231542 ENSGT00390000002752.w.a.d ENSGT00390000002752.x ENSGT00390000014690 ENSGT00900000143181 ENSGT00940000155743 Bos ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00920000150760 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.w.b.a ENSGT00390000014690 ENSGT00900000143181 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000155539.a.a ENSGT00940000159163 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00920000150760 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT01070000253906.h.a.a.a.b ENSGT00390000002752.w.b.a ENSGT00390000014690 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000155539.a.a ENSGT00940000159163 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 6 FDX1 (ENSBIXG00005006592) ARHGAP20 (ENSBIXG00005019662) POU2AF2 (ENSBIXG00005003226) POU2AF3 (ENSBIXG00005005670) POU2AF1 (ENSBIXG00005019815) BTG4 (ENSBIXG00005003249) LAYN (ENSBIXG00005003290) SIK2 (ENSBIXG00005020155) PPP2R1B (ENSBIXG00005020240) ALG9 (ENSBIXG00005020330) CFAP68 (ENSBIXG00005003438) ENSBIXG00005006258 CRYAB (ENSBIXG00005020481) HSPB2 (ENSBIXG00005020506) C11orf52 (ENSBIXG00005007838) DIXDC1 (ENSBIXG00005020591) ##22 DLAT (ENSBIXG00005020650) PIH1D2 (ENSBIXG00005020707) NKAPD1 (ENSBIXG00005020770) TIMM8B (ENSBIXG00005020798) ENSBIXG00005007349 SDHD (ENSBIXG00005020869) IL18 (ENSBIXG00005020955) ENSBIXG00005020973 BCO2 (ENSBIXG00005021074) ENSBIXG00005021131 ENSBIXG00005021146 ENSBIXG00005021157 ENSBIXG00005003583 NCAM1 (ENSBIXG00005022045) TTC12 (ENSBIXG00005022216) Cow MODERN SPECIES 6 ENSBTAG00000049167 POU2AF2 (ENSBTAG00000044177) POU2AF3 (ENSBTAG00000052702) POU2AF1 (ENSBTAG00000006282) BTG4 (ENSBTAG00000034346) HOATZ (ENSBTAG00000034338) LAYN (ENSBTAG00000017901) SIK2 (ENSBTAG00000020272) PPP2R1B (ENSBTAG00000020277) ALG9 (ENSBTAG00000020279) FDXACB1 (ENSBTAG00000004949) CFAP68 (ENSBTAG00000004951) CRYAB (ENSBTAG00000000434) HSPB2 (ENSBTAG00000000440) C15H11orf52 (ENSBTAG00000008661) DIXDC1 (ENSBTAG00000008665) ##22 DLAT (ENSBTAG00000010709) PIH1D2 (ENSBTAG00000005156) NKAPD1 (ENSBTAG00000001999) TIMM8B (ENSBTAG00000002000) SDHD (ENSBTAG00000016266) ENSBTAG00000049455 IL18 (ENSBTAG00000000277) TEX12 (ENSBTAG00000016548) BCO2 (ENSBTAG00000034193) ENSBTAG00000054599 PTS (ENSBTAG00000049973) C15H11orf34 (ENSBTAG00000015810) NCAM1 (ENSBTAG00000005710) TTC12 (ENSBTAG00000010008) DRD2 (ENSBTAG00000010860) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 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ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00920000150760 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.w.b ENSGT00390000014690 ENSGT00900000143181 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00390000007225.g.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00920000150760 ENSGT00940000157434 ENSGT00530000067880 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.w.b ENSGT00390000014690 ENSGT00900000143181 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00390000007225.g.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00920000150760 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.w.b ENSGT00390000014690 ENSGT00900000143181 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00390000007225.g.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00920000150760 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.w.b ENSGT00390000014690 ENSGT00900000143181 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00390000007225.g.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00920000150760 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.w.b ENSGT00390000014690 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a ENSGT00940000159163 Narwhal MODERN SPECIES 314 POU2AF3 (ENSMMNG00015020822) POU2AF1 (ENSMMNG00015020803) BTG4 (ENSMMNG00015020784) HOATZ (ENSMMNG00015020759) LAYN (ENSMMNG00015020702) ENSMMNG00015020676 SIK2 (ENSMMNG00015020657) PPP2R1B (ENSMMNG00015020590) ALG9 (ENSMMNG00015020498) FDXACB1 (ENSMMNG00015020533) CFAP68 (ENSMMNG00015020453) CRYAB (ENSMMNG00015020423) ENSMMNG00015020408 HSPB2 (ENSMMNG00015020390) C11orf52 (ENSMMNG00015020371) DIXDC1 (ENSMMNG00015020316) ##22 DLAT (ENSMMNG00015020268) PIH1D2 (ENSMMNG00015020249) NKAPD1 (ENSMMNG00015020221) TIMM8B (ENSMMNG00015020194) SDHD (ENSMMNG00015020131) IL18 (ENSMMNG00015020079) TEX12 (ENSMMNG00015020054) BCO2 (ENSMMNG00015019968) PTS 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(ENSDLEG00000010120) Vaquita MODERN SPECIES 19 POU2AF1 (ENSPSNG00000007506) ENSPSNG00000007489 BTG4 (ENSPSNG00000007443) HOATZ (ENSPSNG00000007386) LAYN (ENSPSNG00000007265) ENSPSNG00000007229 SIK2 (ENSPSNG00000007202) PPP2R1B (ENSPSNG00000007066) ALG9 (ENSPSNG00000006895) FDXACB1 (ENSPSNG00000006868) CFAP68 (ENSPSNG00000006813) ENSPSNG00000008642 CRYAB (ENSPSNG00000008589) HSPB2 (ENSPSNG00000008568) C11orf52 (ENSPSNG00000008533) DIXDC1 (ENSPSNG00000008416) ##22 DLAT (ENSPSNG00000008272) PIH1D2 (ENSPSNG00000008227) NKAPD1 (ENSPSNG00000008194) TIMM8B (ENSPSNG00000008160) SDHD (ENSPSNG00000008077) IL18 (ENSPSNG00000008022) TEX12 (ENSPSNG00000007981) BCO2 (ENSPSNG00000007808) PTS (ENSPSNG00000007745) ENSPSNG00000007674 ENSPSNG00000007635 NCAM1 (ENSPSNG00000006944) TTC12 (ENSPSNG00000006695) ANKK1 (ENSPSNG00000006624) DRD2 (ENSPSNG00000006528) Dolphin MODERN SPECIES 2913 BTG4 (ENSTTRG00000010435) CUNH11orf88 (ENSTTRG00000010454) LAYN (ENSTTRG00000010465) ENSTTRG00000010474 SIK2 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SPECIES 1 ENSGT00410000028767 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00390000016988.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003.w.a ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00940000154314.k.b.b.b.a ENSGT00390000002752.x ENSGT00390000014690 ENSGT00910000147129 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00390000016988.a.a.a.b.a.a 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(ENSCSAG00000000597) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00390000016988.a.a.a.b.a.a.d ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943.i ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003.w.a ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00940000154314.k.b.b.b.a ENSGT00390000010003.w.b ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00940000170702.a ENSGT00390000002752.x ENSGT00390000014690 ENSGT00910000147129 ENSGT00940000155743 Macaca ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154633 ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D 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ENSGT00940000170702.a ENSGT00390000002752.x ENSGT00390000014690 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000155539.a.a ENSGT00940000159163 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 5 FDX1 (ENSMFAG00000039761) ARHGAP20 (ENSMFAG00000036507) POU2AF2 (ENSMFAG00000034174) ENSMFAG00000043291 POU2AF1 (ENSMFAG00000042921) BTG4 (ENSMFAG00000036753) HOATZ (ENSMFAG00000036781) LAYN (ENSMFAG00000032480) SIK2 (ENSMFAG00000045653) PPP2R1B (ENSMFAG00000046304) ENSMFAG00000042463 CFAP68 (ENSMFAG00000000736) ENSMFAG00000003898 CRYAB (ENSMFAG00000034267) C11orf52 (ENSMFAG00000064854) DIXDC1 (ENSMFAG00000043024) ##22 ENSMFAG00000058006 ENSMFAG00000063524 PIH1D2 (ENSMFAG00000014227) NKAPD1 (ENSMFAG00000044738) TIMM8B (ENSMFAG00000051190) SDHD (ENSMFAG00000043016) IL18 (ENSMFAG00000040966) TEX12 (ENSMFAG00000002760) BCO2 (ENSMFAG00000037360) ENSMFAG00000049402 PTS (ENSMFAG00000035549) PLET1 (ENSMFAG00000044792) NCAM1 (ENSMFAG00000044864) TTC12 (ENSMFAG00000001067) DRD2 (ENSMFAG00000043416) Rhesus MODERN SPECIES 5 FDX1 (ENSMMUG00000060188) ARHGAP20 (ENSMMUG00000000527) POU2AF2 (ENSMMUG00000005445) ENSMMUG00000045402 POU2AF1 (ENSMMUG00000003244) BTG4 (ENSMMUG00000021438) HOATZ (ENSMMUG00000021439) LAYN (ENSMMUG00000030915) SIK2 (ENSMMUG00000030914) PPP2R1B (ENSMMUG00000014001) ALG9 (ENSMMUG00000014003) CFAP68 (ENSMMUG00000053898) HSPB2 (ENSMMUG00000058804) CRYAB (ENSMMUG00000022133) C14H11orf52 (ENSMMUG00000063234) DIXDC1 (ENSMMUG00000017565) ##22 DLAT (ENSMMUG00000017568) PIH1D2 (ENSMMUG00000019419) NKAPD1 (ENSMMUG00000019421) TIMM8B (ENSMMUG00000043558) SDHD (ENSMMUG00000015247) ENSMMUG00000062751 IL18 (ENSMMUG00000064111) TEX12 (ENSMMUG00000057431) BCO2 (ENSMMUG00000015249) PTS (ENSMMUG00000015255) PLET1 (ENSMMUG00000057633) ENSMMUG00000050981 NCAM1 (ENSMMUG00000004688) TTC12 (ENSMMUG00000014328) DRD2 (ENSMMUG00000014334) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 204 ARHGAP20 (ENSMNEG00000042524) POU2AF2 (ENSMNEG00000044667) POU2AF3 (ENSMNEG00000036284) POU2AF1 (ENSMNEG00000042844) BTG4 (ENSMNEG00000028670) HOATZ (ENSMNEG00000038512) LAYN (ENSMNEG00000037574) SIK2 (ENSMNEG00000042049) PPP2R1B (ENSMNEG00000036004) ALG9 (ENSMNEG00000002341) FDXACB1 (ENSMNEG00000041539) CFAP68 (ENSMNEG00000039043) CRYAB (ENSMNEG00000037606) HSPB2 (ENSMNEG00000032553) C11orf52 (ENSMNEG00000039595) DIXDC1 (ENSMNEG00000029280) ##22 ENSMNEG00000029907 PIH1D2 (ENSMNEG00000035252) NKAPD1 (ENSMNEG00000042583) TIMM8B (ENSMNEG00000031105) ENSMNEG00000036973 IL18 (ENSMNEG00000042906) TEX12 (ENSMNEG00000041137) ENSMNEG00000044106 BCO2 (ENSMNEG00000042740) PTS (ENSMNEG00000044409) PLET1 (ENSMNEG00000044600) ENSMNEG00000029485 NCAM1 (ENSMNEG00000037984) TTC12 (ENSMNEG00000032462) ANKK1 (ENSMNEG00000038963) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00390000016988.a.a.a.b.a.a.d ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943.i ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003.w.a ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00940000154314.k.b.b.b.a ENSGT00390000002752.x ENSGT00390000014690 ENSGT00910000147129 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 Olive baboon MODERN SPECIES 3 ENSPANG00000045078 ARHGAP20 (ENSPANG00000008965) POU2AF2 (ENSPANG00000019123) POU2AF3 (ENSPANG00000008131) POU2AF1 (ENSPANG00000040104) HOATZ (ENSPANG00000015380) BTG4 (ENSPANG00000030381) LAYN (ENSPANG00000015043) SIK2 (ENSPANG00000009881) PPP2R1B (ENSPANG00000010187) ALG9 (ENSPANG00000019268) CFAP68 (ENSPANG00000024229) CRYAB (ENSPANG00000029689) ENSPANG00000007280 C11orf52 (ENSPANG00000048111) DIXDC1 (ENSPANG00000006433) ##22 DLAT (ENSPANG00000004640) PIH1D2 (ENSPANG00000020254) NKAPD1 (ENSPANG00000004948) TIMM8B 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ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 Sooty mangabey MODERN SPECIES 138 ARHGAP20 (ENSCATG00000037266) POU2AF2 (ENSCATG00000039852) POU2AF3 (ENSCATG00000035023) POU2AF1 (ENSCATG00000039907) BTG4 (ENSCATG00000021924) HOATZ (ENSCATG00000012410) LAYN (ENSCATG00000042864) SIK2 (ENSCATG00000035649) PPP2R1B (ENSCATG00000027804) ALG9 (ENSCATG00000032428) FDXACB1 (ENSCATG00000035600) CFAP68 (ENSCATG00000040514) CRYAB (ENSCATG00000033292) HSPB2 (ENSCATG00000031737) C11orf52 (ENSCATG00000015191) DIXDC1 (ENSCATG00000034970) ##22 ENSCATG00000029342 PIH1D2 (ENSCATG00000037941) NKAPD1 (ENSCATG00000040296) TIMM8B (ENSCATG00000043002) SDHD (ENSCATG00000017950) IL18 (ENSCATG00000043884) TEX12 (ENSCATG00000041244) ENSCATG00000040959 BCO2 (ENSCATG00000040955) PTS (ENSCATG00000043932) PLET1 (ENSCATG00000021077) ENSCATG00000038711 NCAM1 (ENSCATG00000032945) TTC12 (ENSCATG00000036329) ANKK1 (ENSCATG00000021625) Drill MODERN SPECIES 621 ARHGAP20 (ENSMLEG00000042746) POU2AF2 (ENSMLEG00000043521) POU2AF3 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(ENSTBEG00000011479) NKAPD1 (ENSTBEG00000011735) TIMM8B (ENSTBEG00000011850) SDHD (ENSTBEG00000011856) IL18 (ENSTBEG00000011906) Glires ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00390000003661 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00920000150760 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.x ENSGT00390000014690 ENSGT00900000143181 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a Rodentia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00390000003661 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 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ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00390000003661 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00920000150760 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000167885 ENSGT00940000155479.hb.b ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.x ENSGT00390000014690 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a Northern American deer mouse MODERN SPECIES 20 Pou2af3 (ENSPEMG00000024931) Pou2af1 (ENSPEMG00000030398) Gm32742 (ENSPEMG00000010480) Btg4 (ENSPEMG00000030483) Hoatz (ENSPEMG00000013466) Layn (ENSPEMG00000015633) Sik2 (ENSPEMG00000026394) Ppp2r1b (ENSPEMG00000007407) Alg9 (ENSPEMG00000019918) Fdxacb1 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ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.x ENSGT00390000014690 ENSGT00900000143181 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a Golden Hamster MODERN SPECIES 635 Pou2af2 (ENSMAUG00000020649) Pou2af3 (ENSMAUG00000001055) Pou2af1 (ENSMAUG00000011912) Gm32742 (ENSMAUG00000010291) Btg4 (ENSMAUG00000019040) Hoatz (ENSMAUG00000011164) Layn (ENSMAUG00000008603) Sik2 (ENSMAUG00000003467) Ppp2r1b (ENSMAUG00000022093) Alg9 (ENSMAUG00000019745) Fdxacb1 (ENSMAUG00000019310) Cfap68 (ENSMAUG00000017205) Cryab (ENSMAUG00000018431) Hspb2 (ENSMAUG00000014712) 2310030G06Rik (ENSMAUG00000018715) Dixdc1 (ENSMAUG00000005681) ##22 Dlat (ENSMAUG00000014831) Pih1d2 (ENSMAUG00000014605) Nkapd1 (ENSMAUG00000014817) Timm8b (ENSMAUG00000012546) Sdhd (ENSMAUG00000018722) Il18 (ENSMAUG00000013370) Tex12 (ENSMAUG00000021667) Bco2 (ENSMAUG00000019834) Pts (ENSMAUG00000018576) Plet1 (ENSMAUG00000011494) ENSMAUG00000014097 Ncam1 (ENSMAUG00000021119) Ttc12 (ENSMAUG00000013995) Drd2 (ENSMAUG00000011091) Tmprss5 (ENSMAUG00000022000) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 284 Pou2af2 (ENSCGRG00001022704) Pou2af3 (ENSCGRG00001015209) Pou2af1 (ENSCGRG00001016957) Gm32742 (ENSCGRG00001024988) Btg4 (ENSCGRG00001016420) ENSCGRG00001019269 Layn (ENSCGRG00001020447) Sik2 (ENSCGRG00001011577) Ppp2r1b (ENSCGRG00001023914) Alg9 (ENSCGRG00001015585) Fdxacb1 (ENSCGRG00001023825) Cfap68 (ENSCGRG00001024590) Cryab (ENSCGRG00001014861) Hspb2 (ENSCGRG00001018827) 2310030G06Rik (ENSCGRG00001020385) Dixdc1 (ENSCGRG00001024992) ##22 Dlat (ENSCGRG00001001078) Pih1d2 (ENSCGRG00001012956) Nkapd1 (ENSCGRG00001016550) ENSCGRG00001017302 Sdhd (ENSCGRG00001022631) Il18 (ENSCGRG00001019119) Tex12 (ENSCGRG00001020522) Bco2 (ENSCGRG00001022068) Pts (ENSCGRG00001000740) Plet1 (ENSCGRG00001016581) Ncam1 (ENSCGRG00001008468) Ttc12 (ENSCGRG00001017552) Ankk1 (ENSCGRG00001015626) Drd2 (ENSCGRG00001020389) ENSCGRG00001012459 Murinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 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ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.x ENSGT00390000014690 ENSGT00940000155743 ENSGT00900000143181 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a Mus_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000000586 ENSGT00420000030454 ENSGT00390000017499 ENSGT00390000003661 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000002677 ENSGT00390000001844.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.x ENSGT00390000014690 ENSGT00940000155743 ENSGT00900000143181 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a Mus_B 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ENSGT00390000015195 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00510000048628 ENSGT00940000155479 ENSGT00390000010003 ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.x ENSGT00390000014690 ENSGT00940000155743 ENSGT00900000143181 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a spretus MODERN SPECIES 18 MGP_SPRETEiJ_G0033346 Pou2af2 (MGP_SPRETEiJ_G0033345) Pou2af3 (MGP_SPRETEiJ_G0033344) Pou2af1 (MGP_SPRETEiJ_G0033343) Btg4 (MGP_SPRETEiJ_G0033342) Hoatz (MGP_SPRETEiJ_G0033341) Layn (MGP_SPRETEiJ_G0033340) Sik2 (MGP_SPRETEiJ_G0033339) Ppp2r1b (MGP_SPRETEiJ_G0033338) Alg9 (MGP_SPRETEiJ_G0033337) Fdxacb1 (MGP_SPRETEiJ_G0033336) Cfap68 (MGP_SPRETEiJ_G0033335) Cryab (MGP_SPRETEiJ_G0033334) Hspb2 (MGP_SPRETEiJ_G0033333) 2310030G06Rik (MGP_SPRETEiJ_G0033332) Dixdc1 (MGP_SPRETEiJ_G0033331) ##22 Dlat (MGP_SPRETEiJ_G0033330) Pih1d2 (MGP_SPRETEiJ_G0033329) Nkapd1 (MGP_SPRETEiJ_G0033328) Timm8b (MGP_SPRETEiJ_G0033327) 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Pts (ENSMSIG00000006352) ENSMSIG00000006308 Mouse MODERN SPECIES 18 Pou2af2 (ENSMUSG00000036027) Pou2af3 (ENSMUSG00000079559) Pou2af1 (ENSMUSG00000032053) Gm32742 (ENSMUSG00000110266) Hoatz (ENSMUSG00000032057) Btg4 (ENSMUSG00000032056) Layn (ENSMUSG00000060594) Sik2 (ENSMUSG00000037112) Ppp2r1b (ENSMUSG00000032058) Alg9 (ENSMUSG00000032059) Fdxacb1 (ENSMUSG00000037845) Cfap68 (ENSMUSG00000037971) Cryab (ENSMUSG00000032060) Hspb2 (ENSMUSG00000038086) 2310030G06Rik (ENSMUSG00000032062) Dixdc1 (ENSMUSG00000032064) ##22 Dlat (ENSMUSG00000000168) Pih1d2 (ENSMUSG00000000167) Nkapd1 (ENSMUSG00000059820) Timm8b (ENSMUSG00000039016) Sdhd (ENSMUSG00000000171) Tex12 (ENSMUSG00000032065) Il18 (ENSMUSG00000039217) Bco2 (ENSMUSG00000032066) Pts (ENSMUSG00000032067) Plet1 (ENSMUSG00000032068) Rpl10-ps3 (ENSMUSG00000058443) Ncam1 (ENSMUSG00000039542) Ttc12 (ENSMUSG00000040219) Ankk1 (ENSMUSG00000032257) Drd2 (ENSMUSG00000032259) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 18 Arhgap20 (MGP_CAROLIEiJ_G0032207) Pou2af2 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ENSGT00390000001053 ENSGT00390000006602 ENSGT00950000182913.A.a ENSGT00390000002752.x ENSGT00390000014690 ENSGT00940000155743 ENSGT00940000161758 ENSGT00940000162060 ENSGT00940000155539.a.a ENSGT00940000159163 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 119 ENSCLAG00000015506 POU2AF3 (ENSCLAG00000012877) POU2AF1 (ENSCLAG00000015586) BTG4 (ENSCLAG00000013983) ENSCLAG00000014472 HOATZ (ENSCLAG00000013175) LAYN (ENSCLAG00000015787) SIK2 (ENSCLAG00000012999) PPP2R1B (ENSCLAG00000014651) ALG9 (ENSCLAG00000012949) FDXACB1 (ENSCLAG00000015613) CFAP68 (ENSCLAG00000012754) CRYAB (ENSCLAG00000013159) HSPB2 (ENSCLAG00000016288) C11orf52 (ENSCLAG00000016503) DIXDC1 (ENSCLAG00000014623) ##22 DLAT (ENSCLAG00000012017) PIH1D2 (ENSCLAG00000015278) NKAPD1 (ENSCLAG00000012317) TIMM8B (ENSCLAG00000012638) SDHD (ENSCLAG00000013294) IL18 (ENSCLAG00000012063) TEX12 (ENSCLAG00000014098) BCO2 (ENSCLAG00000015493) PTS (ENSCLAG00000014281) ENSCLAG00000013183 NCAM1 (ENSCLAG00000013591) TTC12 (ENSCLAG00000011783) ANKK1 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ENSGT00940000167059 ENSGT00940000163496.b.a Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00390000001844.a.b.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00940000163496.b.a ENSGT00390000008196 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00740000117097 ENSGT00950000182903.b.b ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000161544 ENSGT00940000157231.a.b Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00940000156445.m ENSGT00950000183066.a.a.b.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00940000163496.b.a ENSGT00390000008196 ENSGT00390000003308.b ENSGT00390000012668.j ENSGT00940000160797 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ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000161544 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 238 ENSGT00940000167059 ENSGT00940000157434.c ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b.h ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000161544 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b Denticle herring MODERN SPECIES 11 hepacama (ENSDCDG00000018913) NRGN (ENSDCDG00000018915) ENSDCDG00000018916 scn3b (ENSDCDG00000000170) drd2a (ENSDCDG00000000187) ankk1 (ENSDCDG00000000210) ENSDCDG00000000225 ENSDCDG00000000235 ENSDCDG00000000274 ENSDCDG00000000285 ENSDCDG00000000298 SIK2 (ENSDCDG00000000333) ppp2r1bb (ENSDCDG00000000430) nkapd1 (ENSDCDG00000000578) cryaba 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ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00410000028254 ENSGT00940000166045 ENSGT00390000001844.a.b.a.b ENSGT00940000156445.o.a ENSGT00950000183066.a.a.b.h ENSGT00940000167059 ENSGT00940000160928.n.a ENSGT00390000010003.h ENSGT00950000182913.A.a.b.a ENSGT00990000204384 ENSGT01030000234563.a.b ENSGT00940000156097.a ENSGT00540000072704 ENSGT00390000017207.i.a ENSGT00940000157434.c ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000163324 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000161544 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b Channel catfish MODERN SPECIES 8 ttc12 (ENSIPUG00000012033) zgc:162608 (ENSIPUG00000012088) ENSIPUG00000012100 LAYN (ENSIPUG00000012116) SIK2 (ENSIPUG00000012135) ppp2r1bb (ENSIPUG00000012183) c17h11orf57 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ENSGT00940000157434.c ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000163324 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000161544 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b Electric eel MODERN SPECIES 207 ankk1 (ENSEEEG00000016169) TTC12 (ENSEEEG00000016172) zgc:162608 (ENSEEEG00000016176) ENSEEEG00000016179 SIK2 (ENSEEEG00000016182) ppp2r1bb (ENSEEEG00000016201) nkapd1 (ENSEEEG00000016470) ENSEEEG00000016471 sdhdb (ENSEEEG00000016472) ENSEEEG00000016473 SORL1 (ENSEEEG00000016484) ENSEEEG00000016750 ubash3bb (ENSEEEG00000016751) gkup (ENSEEEG00000016754) arcn1b (ENSEEEG00000016755) dixdc1a (ENSEEEG00000016764) ##22 pih1d2 (ENSEEEG00000016766) ENSEEEG00000016771 ENSEEEG00000016776 ENSEEEG00000016780 ENSEEEG00000016785 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00410000028254 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ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00940000158386.d ENSGT00930000151039 ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT01030000234537.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 285 ENSGT00940000161725.e ENSGT00940000153195.A.e.b ENSGT00940000155796.c.b.c ENSGT00390000001474.j ENSGT00390000008920.c.b.h ENSGT00940000159702.n ENSGT00940000164285.b.f ENSGT00940000160922.k ENSGT00940000167059.d ENSGT00950000182903.b.b.o.a.c ##22 ENSGT00510000048581.d ENSGT00940000159163.w.b ENSGT01080000257365.b.a.a.a.l ENSGT00940000154616.a.b.a.a ENSGT00940000155743.a.d ENSGT00940000156093.e.b.c ENSGT00940000154313.c.b.i ENSGT01030000234537.b.g.a.b.b.a ENSGT00940000155900.j.c ENSGT00940000156937.a.b.h ENSGT00950000183064.a.b.a.a.f ENSGT00390000013297.u ENSGT00940000157590.d ENSGT00940000157231.a.b.d ENSGT00940000155457.a.b.h Huchen MODERN SPECIES 238 dph1 (ENSHHUG00000040602) ENSHHUG00000040662 hic1 (ENSHHUG00000040667) ENSHHUG00000040672 ENSHHUG00000040677 tsr1 (ENSHHUG00000040680) ENSHHUG00000040684 paf1 (ENSHHUG00000040766) GMFG (ENSHHUG00000040864) SAMD4B (ENSHHUG00000040868) socs9 (ENSHHUG00000040903) lrfn1 (ENSHHUG00000040904) nkapd1 (ENSHHUG00000040905) dixdc1a (ENSHHUG00000040909) ##22 ENSHHUG00000040913 TMPRSS5 (ENSHHUG00000040916) ENSHHUG00000040925 ZBTB16 (ENSHHUG00000040929) ncam1b (ENSHHUG00000040950) ENSHHUG00000041187 ENSHHUG00000041189 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a.d ENSGT00940000158386.d.c ENSGT00930000151039.f ENSGT00390000012403.o.b ENSGT00940000157112.b.d ENSGT00940000153694.A.i.b ENSGT00940000161725.e ENSGT00940000153195.A.e.b ENSGT00940000155796.c.b.c ENSGT00390000001474.j ENSGT00390000008920.c.b.h ENSGT00940000159702.n ENSGT00940000164285.b.f ENSGT00940000160922.k ENSGT00940000167059.d ENSGT00950000182903.b.b.o.a.c ##22 ENSGT00510000048581.d ENSGT00940000159163.w.b ENSGT01080000257365.b.a.a.a.l ENSGT00940000154616.a.b.a.a ENSGT00940000155743.a.d ENSGT00940000156093.e.b.c ENSGT00940000154313.c.b.i ENSGT00940000155900.j.c ENSGT00940000156937.a.b.h ENSGT00950000183064.a.b.a.a.f ENSGT00390000013297.u ENSGT00390000018295.f ENSGT00940000157590.d ENSGT00940000157231.a.b.d ENSGT00940000155457.a.b.h Salmo ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a.d ENSGT00940000158386.d.c ENSGT00930000151039.f ENSGT00390000012403.o.b ENSGT00940000157112.b.d ENSGT00940000153694.A.i.b ENSGT00940000161725.e ENSGT00940000153195.A.e.b ENSGT00940000155796.c.b.c ENSGT00390000001474.j ENSGT00390000008920.c.b.h ENSGT00940000159702.n ENSGT00940000164285.b.f ENSGT00940000160922.k ENSGT00940000167059.d ENSGT00950000182903.b.b.o.a.c ##22 ENSGT00510000048581.d ENSGT00940000159163.w.b ENSGT01080000257365.b.a.a.a.l ENSGT00940000154616.a.b.a.a ENSGT00940000155743.a.d ENSGT00940000156093.e.b.c ENSGT00940000154313.c.b.i ENSGT00940000155900.j.c ENSGT00940000156937.a.b.h ENSGT00950000183064.a.b.a.a.f ENSGT00390000013297.u ENSGT00390000018295.f ENSGT00940000157590.d ENSGT00940000157231.a.b.d ENSGT00940000155457.a.b.h River trout MODERN SPECIES 18 serpinf2b (ENSSTUG00000049164) ENSSTUG00000049175 ENSSTUG00000049189 rpa1 (ENSSTUG00000049208) rtn4rl1b (ENSSTUG00000023288) dph1 (ENSSTUG00000023299) hic1 (ENSSTUG00000023324) tsr1 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ENSOKIG00005016620 cadm1b (ENSOKIG00005016602) ENSOKIG00005016521 IGSF9B (ENSOKIG00005016206) JAM3 (ENSOKIG00005016147) vps26b (ENSOKIG00005016077) ENSOKIG00005015996 ENSOKIG00005015978 ENSOKIG00005015967 ENSOKIG00005015874 lim2.3 (ENSOKIG00005015852) Chinook salmon MODERN SPECIES 5 ENSOTSG00005003005 wdr81 (ENSOTSG00005003007) rpa1 (ENSOTSG00005003047) rtn4rl1b (ENSOTSG00005006253) dph1 (ENSOTSG00005006259) ENSOTSG00005006299 hic1 (ENSOTSG00005006300) tsr1 (ENSOTSG00005006302) TAOK1 (ENSOTSG00005006325) paf1 (ENSOTSG00005006596) GMFG (ENSOTSG00005007159) SAMD4B (ENSOTSG00005007160) socs9 (ENSOTSG00005007195) lrfn1 (ENSOTSG00005007197) ENSOTSG00005007198 dixdc1a (ENSOTSG00005007199) ##22 ENSOTSG00005007200 ncam1b (ENSOTSG00005007217) cadm1b (ENSOTSG00005011564) ENSOTSG00005011570 IGSF9B (ENSOTSG00005012242) JAM3 (ENSOTSG00005012272) vps26b (ENSOTSG00005012274) ENSOTSG00005012300 acad8 (ENSOTSG00005012302) ENSOTSG00005012306 ENSOTSG00005012309 HSPA8 (ENSOTSG00005012311) ENSOTSG00005012313 picalmb (ENSOTSG00005012322) ZPLD1 (ENSOTSG00005012832) Salmo ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a.c ENSGT00940000158386.d.d ENSGT00930000151039.e ENSGT00390000012403.o.a ENSGT00940000157112.b.c ENSGT00940000153694.A.i.a ENSGT00940000161725.f ENSGT00940000153195.A.e.a ENSGT00940000155796.c.b.d ENSGT00390000001474.i ENSGT00390000008920.c.b.g ENSGT00940000159702.m ENSGT00940000164285.b.e ENSGT00940000160922.l ENSGT00940000167059.c ENSGT00950000182903.b.b.o.a.d ##22 ENSGT00510000048581.c ENSGT00940000159163.w.a ENSGT00940000154616.a.b.a.b ENSGT00940000155743.a.c ENSGT00940000156093.e.b.d ENSGT00940000154313.c.b.j ENSGT00940000155900.j.d ENSGT00940000156937.a.b.g ENSGT00950000183064.a.b.a.a.e ENSGT00990000212249 ENSGT00940000157590.c ENSGT00390000013297.v ENSGT00940000157231.a.b.c ENSGT00940000155457.a.b.g ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a.c Atlantic salmon MODERN SPECIES 28 ENSSSAG00000050374 ENSSSAG00000093482 wdr81 (ENSSSAG00000050809) rpa1 (ENSSSAG00000050927) rtn4rl1b (ENSSSAG00000118489) dph1 (ENSSSAG00000057069) hic1 (ENSSSAG00000100552) tsr1 (ENSSSAG00000057108) ENSSSAG00000058152 ENSSSAG00000067211 ENSSSAG00000067219 ENSSSAG00000067239 ENSSSAG00000067630 ENSSSAG00000096792 cssa09h11orf57 (ENSSSAG00000067675) dixdc1a (ENSSSAG00000067651) ##22 pih1d2 (ENSSSAG00000067679) ENSSSAG00000067689 ENSSSAG00000113003 ENSSSAG00000067705 ncam1b (ENSSSAG00000067864) cadm1b (ENSSSAG00000066068) ENSSSAG00000074634 IGSF9B (ENSSSAG00000074827) ENSSSAG00000074910 vps26b (ENSSSAG00000074920) acad8 (ENSSSAG00000074968) thyn1 (ENSSSAG00000074929) ENSSSAG00000105377 ENSSSAG00000075060 lim2.3 (ENSSSAG00000075085) River trout MODERN SPECIES 4 rpa1 (ENSSTUG00000037438) rtn4rl1b (ENSSTUG00000039947) ENSSTUG00000039952 dph1 (ENSSTUG00000039958) hic1 (ENSSTUG00000039995) tsr1 (ENSSTUG00000040013) ENSSTUG00000040161 ENSSTUG00000040658 ENSSTUG00000040668 paf1 (ENSSTUG00000040701) ENSSTUG00000041276 SAMD4B (ENSSTUG00000041317) socs9 (ENSSTUG00000041754) lrfn1 (ENSSTUG00000041759) ENSSTUG00000041761 dixdc1a (ENSSTUG00000041770) ##22 pih1d2 (ENSSTUG00000041928) ENSSTUG00000041953 ZBTB16 (ENSSTUG00000041987) ncam1b (ENSSTUG00000042128) cadm1b (ENSSTUG00000045155) ENSSTUG00000045595 IGSF9B (ENSSTUG00000045999) JAM3 (ENSSTUG00000046269) vps26b (ENSSTUG00000046277) ENSSTUG00000046299 acad8 (ENSSTUG00000046313) ENSSTUG00000046462 ENSSTUG00000046504 lim2.3 (ENSSTUG00000046958) ENSSTUG00000046963 Huchen MODERN SPECIES 734 lrfn1 (ENSHHUG00000016813) nkapd1 (ENSHHUG00000016811) dixdc1a (ENSHHUG00000016792) ##22 pih1d2 (ENSHHUG00000016765) TMPRSS5 (ENSHHUG00000016738) ENSHHUG00000016728 ZBTB16 (ENSHHUG00000016720) ncam1b (ENSHHUG00000014979) cadm1b (ENSHHUG00000014925) Northern pike MODERN SPECIES serpinf2b (ENSELUG00000021114) wdr81 (ENSELUG00000021099) rpa1 (ENSELUG00000021071) rtn4rl1b (ENSELUG00000021055) dph1 (ENSELUG00000021037) hic1 (ENSELUG00000001329) tsr1 (ENSELUG00000020984) TAOK1 (ENSELUG00000020972) paf1 (ENSELUG00000020896) gmfg (ENSELUG00000026824) SAMD4B (ENSELUG00000020859) socs9 (ENSELUG00000020836) ENSELUG00000033838 lrfn1 (ENSELUG00000000910) nkapd1 (ENSELUG00000020805) dixdc1a (ENSELUG00000020754) ##22 TMPRSS5 (ENSELUG00000020696) ENSELUG00000020597 ZBTB16 (ENSELUG00000020592) ncam1b (ENSELUG00000020567) cadm1b (ENSELUG00000020478) ENSELUG00000020412 IGSF9B (ENSELUG00000000892) JAM3 (ENSELUG00000020271) vps26b (ENSELUG00000020245) thyn1 (ENSELUG00000020230) acad8 (ENSELUG00000020196) ENSELUG00000020171 ENSELUG00000020157 ENSELUG00000020146 lim2.3 (ENSELUG00000020108) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000162700.e.b.a ENSGT01030000234537.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000162700.e.b.a ENSGT01030000234537.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT01030000234537.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 232 serpinf2b (ENSHCOG00000001387) rpa1 (ENSHCOG00000001401) rtn4rl1b (ENSHCOG00000001407) 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ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a ENSGT00950000183206.a.b.a.a.a Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT01030000234537.b.i.a.b.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a ENSGT00950000183206.a.b.a.a.a Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a ENSGT00950000183206.a.b.a.a.a Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a ENSGT00950000183206.a.b.a.a.a Mangrove rivulus MODERN SPECIES 205 SLC13A5 (ENSKMAG00000005511) wdr81 (ENSKMAG00000005542) serpinf2b (ENSKMAG00000005578) rpa1 (ENSKMAG00000005605) rtn4rl1b (ENSKMAG00000005681) dph1 (ENSKMAG00000005696) hic1 (ENSKMAG00000005746) tsr1 (ENSKMAG00000005763) TAOK1 (ENSKMAG00000005831) paf1 (ENSKMAG00000005918) GMFG (ENSKMAG00000005989) SAMD4B (ENSKMAG00000006036) socs9 (ENSKMAG00000006057) lrfn1 (ENSKMAG00000006067) nkapd1 (ENSKMAG00000006081) dixdc1a (ENSKMAG00000006114) ##22 ENSKMAG00000006169 TMPRSS5 (ENSKMAG00000006191) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1615 RPA1 (ENSNFUG00015002329) rtn4rl1b (ENSNFUG00015002313) ENSNFUG00015002309 dph1 (ENSNFUG00015002279) HIC1 (ENSNFUG00015002255) TSR1 (ENSNFUG00015002204) TAOK1 (ENSNFUG00015002088) ENSNFUG00015002043 ENSNFUG00015002032 PAF1 (ENSNFUG00015002011) GMFG (ENSNFUG00015001975) SAMD4B (ENSNFUG00015001946) SOCS9 (ENSNFUG00015001929) MB21D2B (ENSNFUG00015001925) nkapd1 (ENSNFUG00015001921) DIXDC1A (ENSNFUG00015001887) ##22 PIH1D2 (ENSNFUG00015001870) TMPRSS5 (ENSNFUG00015001849) ZBTB16 (ENSNFUG00015001839) NCAM1B (ENSNFUG00015000860) ENSNFUG00015000457 ENSNFUG00015000454 ENSNFUG00015000450 ENSNFUG00015000448 cadm1b (ENSNFUG00015000343) ENSNFUG00015000296 ENSNFUG00015000279 IGSF9B (ENSNFUG00015000157) ENSNFUG00015000122 JAM3 (ENSNFUG00015000112) vps26b (ENSNFUG00015000102) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a 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1 hic1 (ENSPLAG00000022329) tsr1 (ENSPLAG00000022320) ENSPLAG00000022251 paf1 (ENSPLAG00000022106) ENSPLAG00000022096 SAMD4B (ENSPLAG00000022080) socs9 (ENSPLAG00000021990) lrfn1 (ENSPLAG00000021983) dixdc1a (ENSPLAG00000021976) ##22 nkapd1 (ENSPLAG00000021967) pih1d2 (ENSPLAG00000021963) TMPRSS5 (ENSPLAG00000021949) ZBTB16 (ENSPLAG00000021831) ncam1b (ENSPLAG00000021768) cadm1b (ENSPLAG00000020846) ENSPLAG00000020666 IGSF9B (ENSPLAG00000020652) JAM3 (ENSPLAG00000020600) vps26b (ENSPLAG00000020592) thyn1 (ENSPLAG00000020563) acad8 (ENSPLAG00000020544) ENSPLAG00000020489 Amazon molly MODERN SPECIES 314 ENSPFOG00000003695 wdr81 (ENSPFOG00000003795) serpinf2b (ENSPFOG00000003937) rpa1 (ENSPFOG00000003987) rtn4rl1b (ENSPFOG00000004323) dph1 (ENSPFOG00000004336) hic1 (ENSPFOG00000004471) TSR1 (ENSPFOG00000004483) ENSPFOG00000004764 paf1 (ENSPFOG00000004967) ENSPFOG00000005106 SAMD4B (ENSPFOG00000005162) socs9 (ENSPFOG00000020313) lrfn1 (ENSPFOG00000005278) nkapd1 (ENSPFOG00000005306) 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ENSXMAG00000018057 rpgrb (ENSXMAG00000018068) ENSXMAG00000001732 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 91 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000155900.j Sheepshead minnow MODERN SPECIES 126 SLC13A5 (ENSCVAG00000019271) wdr81 (ENSCVAG00000019330) serpinf2b (ENSCVAG00000019345) rpa1 (ENSCVAG00000019431) rtn4rl1b (ENSCVAG00000019443) dph1 (ENSCVAG00000019456) hic1 (ENSCVAG00000019465) tsr1 (ENSCVAG00000000506) TAOK1 (ENSCVAG00000019599) paf1 (ENSCVAG00000019660) ENSCVAG00000019693 SAMD4B (ENSCVAG00000019786) socs9 (ENSCVAG00000019793) lrfn1 (ENSCVAG00000000511) nkapd1 (ENSCVAG00000019811) dixdc1a (ENSCVAG00000019825) ##22 pih1d2 (ENSCVAG00000019888) TMPRSS5 (ENSCVAG00000020202) ZBTB16 (ENSCVAG00000020238) ncam1b (ENSCVAG00000020328) cadm1b (ENSCVAG00000020366) ENSCVAG00000020384 IGSF9B (ENSCVAG00000020425) Mummichog MODERN SPECIES 2486 lrfn1 (ENSFHEG00000003425) nkapd1 (ENSFHEG00000003417) dixdc1a (ENSFHEG00000003402) ##22 pih1d2 (ENSFHEG00000003389) TMPRSS5 (ENSFHEG00000003368) ZBTB16 (ENSFHEG00000003322) ncam1b (ENSFHEG00000003292) ENSFHEG00000003249 cadm1b (ENSFHEG00000003243) ENSFHEG00000003160 IGSF9B (ENSFHEG00000003125) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a ENSGT00950000183206.a.b.a.a.a Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a ENSGT00950000183206.a.b.a.a.a Javanese ricefish MODERN SPECIES 4 ENSOJAG00000020330 wdr81 (ENSOJAG00000020280) serpinf2b (ENSOJAG00000020269) rpa1 (ENSOJAG00000019905) rtn4rl1b (ENSOJAG00000019871) dph1 (ENSOJAG00000019785) hic1 (ENSOJAG00000019767) tsr1 (ENSOJAG00000019729) TAOK1 (ENSOJAG00000019353) paf1 (ENSOJAG00000019086) ENSOJAG00000019002 SAMD4B (ENSOJAG00000018903) socs9 (ENSOJAG00000018882) lrfn1 (ENSOJAG00000018876) nkapd1 (ENSOJAG00000018869) dixdc1a (ENSOJAG00000018854) ##22 pih1d2 (ENSOJAG00000018837) TMPRSS5 (ENSOJAG00000018823) ZBTB16 (ENSOJAG00000018810) ncam1b (ENSOJAG00000014382) ENSOJAG00000014019 cadm1b (ENSOJAG00000013900) ENSOJAG00000013421 IGSF9B (ENSOJAG00000013294) JAM3 (ENSOJAG00000013260) vps26b (ENSOJAG00000013205) thyn1 (ENSOJAG00000013189) acad8 (ENSOJAG00000012612) ENSOJAG00000012566 ENSOJAG00000012300 lim2.3 (ENSOJAG00000012251) Indian medaka MODERN 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ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT01030000234537.b.i.a.b.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT01030000234537.b.i.a.b.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 408 wdr81 (ENSHBUG00000017667) serpinf2b (ENSHBUG00000017692) rpa1 (ENSHBUG00000017773) rtn4rl1b (ENSHBUG00000017795) hic1 (ENSHBUG00000017815) dph1 (ENSHBUG00000000527) tsr1 (ENSHBUG00000017904) TAOK1 (ENSHBUG00000018010) paf1 (ENSHBUG00000018088) GMFG (ENSHBUG00000018025) SAMD4B (ENSHBUG00000018141) socs9 (ENSHBUG00000018149) lrfn1 (ENSHBUG00000018165) nkapd1 (ENSHBUG00000018178) pih1d2 (ENSHBUG00000018201) dixdc1a (ENSHBUG00000018219) ##22 TMPRSS5 (ENSHBUG00000018225) ZBTB16 (ENSHBUG00000018502) ncam1b (ENSHBUG00000020797) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT01030000234537.b.i.a.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT01030000234537.b.i.a.b.b.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a Eastern happy MODERN SPECIES 5 serpinf2b (ENSACLG00000006629) rpa1 (ENSACLG00000006640) rtn4rl1b (ENSACLG00000006657) dph1 (ENSACLG00000006967) hic1 (ENSACLG00000007589) tsr1 (ENSACLG00000007595) ENSACLG00000007609 TAOK1 (ENSACLG00000007616) paf1 (ENSACLG00000007700) GMFG (ENSACLG00000007731) SAMD4B (ENSACLG00000007916) socs9 (ENSACLG00000007932) lrfn1 (ENSACLG00000007942) ENSACLG00000007954 nkapd1 (ENSACLG00000007959) dixdc1a (ENSACLG00000007973) ##22 pih1d2 (ENSACLG00000007995) TMPRSS5 (ENSACLG00000008005) ZBTB16 (ENSACLG00000008054) ncam1b (ENSACLG00000008068) cadm1b (ENSACLG00000008512) ENSACLG00000008551 ENSACLG00000008555 ENSACLG00000008597 IGSF9B (ENSACLG00000009126) ENSACLG00000009201 vps26b (ENSACLG00000009256) thyn1 (ENSACLG00000009224) acad8 (ENSACLG00000009295) ENSACLG00000009321 ENSACLG00000009334 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1096 SLC13A5 (ENSMZEG00005007672) wdr81 (ENSMZEG00005007637) serpinf2b (ENSMZEG00005007599) rpa1 (ENSMZEG00005007551) rtn4rl1b (ENSMZEG00005007534) dph1 (ENSMZEG00005007514) hic1 (ENSMZEG00005007499) tsr1 (ENSMZEG00005007477) TAOK1 (ENSMZEG00005007413) paf1 (ENSMZEG00005007357) GMFG 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dixdc1a (ENSPNYG00000015776) ##22 pih1d2 (ENSPNYG00000015751) TMPRSS5 (ENSPNYG00000015660) ZBTB16 (ENSPNYG00000015514) ncam1b (ENSPNYG00000015417) cadm1b (ENSPNYG00000015375) ENSPNYG00000015322 IGSF9B (ENSPNYG00000015291) JAM3 (ENSPNYG00000015267) vps26b (ENSPNYG00000015248) thyn1 (ENSPNYG00000015238) acad8 (ENSPNYG00000015222) ENSPNYG00000015193 ENSPNYG00000014967 lim2.3 (ENSPNYG00000014931) hspa8b (ENSPNYG00000014900) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 370 SLC13A5 (ENSNBRG00000020398) wdr81 (ENSNBRG00000020527) serpinf2b (ENSNBRG00000020553) rpa1 (ENSNBRG00000020595) rtn4rl1b (ENSNBRG00000020623) dph1 (ENSNBRG00000020631) hic1 (ENSNBRG00000020714) tsr1 (ENSNBRG00000020728) TAOK1 (ENSNBRG00000020782) paf1 (ENSNBRG00000020821) GMFG (ENSNBRG00000020854) SAMD4B (ENSNBRG00000020861) socs9 (ENSNBRG00000020885) lrfn1 (ENSNBRG00000020888) nkapd1 (ENSNBRG00000020913) dixdc1a (ENSNBRG00000020972) ##22 pih1d2 (ENSNBRG00000021030) TMPRSS5 (ENSNBRG00000021051) ZBTB16 (ENSNBRG00000021111) ncam1b (ENSNBRG00000021190) cadm1b (ENSNBRG00000021714) ENSNBRG00000021768 ENSNBRG00000021779 IGSF9B (ENSNBRG00000021795) JAM3 (ENSNBRG00000021850) vps26b (ENSNBRG00000021992) thyn1 (ENSNBRG00000022016) acad8 (ENSNBRG00000022034) ENSNBRG00000022054 ENSNBRG00000022100 lim2.3 (ENSNBRG00000022310) Nile tilapia MODERN SPECIES 5 wdr81 (ENSONIG00000035720) serpinf2b (ENSONIG00000013139) rpa1 (ENSONIG00000013135) rtn4rl1 (ENSONIG00000039228) dph1 (ENSONIG00000013132) hic1 (ENSONIG00000021060) tsr1 (ENSONIG00000013131) TAOK1 (ENSONIG00000013130) paf1 (ENSONIG00000013125) GMFG (ENSONIG00000013124) SAMD4B (ENSONIG00000013121) socs9 (ENSONIG00000035585) ENSONIG00000031527 lrfn1 (ENSONIG00000011092) nkapd1 (ENSONIG00000011093) dixdc1a (ENSONIG00000011097) ##22 pih1d2 (ENSONIG00000011098) TMPRSS5 (ENSONIG00000011100) ZBTB16 (ENSONIG00000011103) ncam1b (ENSONIG00000011106) cadm1b (ENSONIG00000011112) ENSONIG00000011116 IGSF9B (ENSONIG00000011122) JAM3 (ENSONIG00000011124) ENSONIG00000039002 vps26b (ENSONIG00000011127) thyn1 (ENSONIG00000011129) acad8 (ENSONIG00000011133) ENSONIG00000011137 ENSONIG00000011140 lim2.3 (ENSONIG00000011143) Midas cichlid MODERN SPECIES 1363 lrfn1 (ENSACIG00000006538) nkapd1 (ENSACIG00000006555) dixdc1a (ENSACIG00000006597) ##22 pih1d2 (ENSACIG00000006658) TMPRSS5 (ENSACIG00000006687) ZBTB16 (ENSACIG00000006854) ncam1b (ENSACIG00000007046) cadm1b (ENSACIG00000007091) ENSACIG00000007117 IGSF9B (ENSACIG00000007127) JAM3 (ENSACIG00000007174) vps26b (ENSACIG00000007207) thyn1 (ENSACIG00000007224) acad8 (ENSACIG00000007273) ENSACIG00000007309 ENSACIG00000007369 lim2.3 (ENSACIG00000007397) hspa8b (ENSACIG00000007410) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b 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ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a ENSGT00950000183206.a.b.a.a.a Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a ENSGT00950000183206.a.b.a.a.a Ballan wrasse MODERN SPECIES 12 SLC13A5 (ENSLBEG00000021494) wdr81 (ENSLBEG00000021519) serpinf2b (ENSLBEG00000021564) rpa1 (ENSLBEG00000021604) rtn4rl1b (ENSLBEG00000021648) dph1 (ENSLBEG00000021673) hic1 (ENSLBEG00000021810) tsr1 (ENSLBEG00000021823) TAOK1 (ENSLBEG00000021868) paf1 (ENSLBEG00000021935) ENSLBEG00000021994 SAMD4B (ENSLBEG00000022021) socs9 (ENSLBEG00000022073) lrfn1 (ENSLBEG00000022086) nkapd1 (ENSLBEG00000022118) dixdc1a (ENSLBEG00000022169) ##22 pih1d2 (ENSLBEG00000022213) TMPRSS5 (ENSLBEG00000022255) ZBTB16 (ENSLBEG00000022299) ncam1b (ENSLBEG00000022449) cadm1b (ENSLBEG00000022839) ENSLBEG00000022898 ENSLBEG00000022931 ENSLBEG00000022945 IGSF9B (ENSLBEG00000023017) JAM3 (ENSLBEG00000023117) vps26b (ENSLBEG00000023141) thyn1 (ENSLBEG00000023171) acad8 (ENSLBEG00000023200) ENSLBEG00000023254 ROBO3 (ENSLBEG00000023305) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a ENSGT00950000183206.a.b.a.a.a Perciformes ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a ENSGT00950000183206.a.b.a.a.a Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a ENSGT00950000183206.a.b.a.a.a Stickleback MODERN SPECIES SLC13A5 (ENSGACG00000010876) ENSGACG00000010871 serpinf2b (ENSGACG00000010870) rpa1 (ENSGACG00000010856) rtn4rl1b (ENSGACG00000010854) dph1 (ENSGACG00000010850) hic1 (ENSGACG00000010848) tsr1 (ENSGACG00000010843) TAOK1 (ENSGACG00000010833) paf1 (ENSGACG00000010818) SAMD4B (ENSGACG00000010797) socs9 (ENSGACG00000010795) ENSGACG00000010793 lrfn1 (ENSGACG00000010789) ENSGACG00000010778 dixdc1a (ENSGACG00000010741) ##22 pih1d2 (ENSGACG00000010737) TMPRSS5 (ENSGACG00000010730) ZBTB16 (ENSGACG00000010711) ncam1b (ENSGACG00000010697) cadm1b (ENSGACG00000010693) ENSGACG00000010692 ENSGACG00000010684 IGSF9B (ENSGACG00000010675) ENSGACG00000010671 JAM3 (ENSGACG00000010665) vps26b (ENSGACG00000010648) thyn1 (ENSGACG00000010645) acad8 (ENSGACG00000010582) ENSGACG00000010573 ROBO3 (ENSGACG00000010555) Lumpfish MODERN SPECIES 4 SLC13A5 (ENSCLMG00005009099) wdr81 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ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a ENSGT00950000183206.a.b.a.a.a Channel bull blenny MODERN SPECIES 4 SLC13A5 (ENSCGOG00000023399) wdr81 (ENSCGOG00000023395) serpinf2b (ENSCGOG00000023384) rpa1 (ENSCGOG00000023202) rtn4rl1b (ENSCGOG00000023190) dph1 (ENSCGOG00000023151) hic1 (ENSCGOG00000023139) tsr1 (ENSCGOG00000023093) TAOK1 (ENSCGOG00000021777) GMFG (ENSCGOG00000021689) paf1 (ENSCGOG00000021582) SAMD4B (ENSCGOG00000021342) socs9 (ENSCGOG00000021326) lrfn1 (ENSCGOG00000021325) nkapd1 (ENSCGOG00000021324) dixdc1a (ENSCGOG00000021320) ##22 pih1d2 (ENSCGOG00000021317) TMPRSS5 (ENSCGOG00000021312) ZBTB16 (ENSCGOG00000021305) ncam1b (ENSCGOG00000020648) cadm1b (ENSCGOG00000020493) ENSCGOG00000020219 IGSF9B (ENSCGOG00000020021) JAM3 (ENSCGOG00000020016) vps26b (ENSCGOG00000019993) thyn1 (ENSCGOG00000019988) acad8 (ENSCGOG00000019680) ENSCGOG00000019673 ENSCGOG00000019079 lim2.3 (ENSCGOG00000019056) hspa8b (ENSCGOG00000012061) Pike perch MODERN SPECIES 130 lrfn1 (ENSSLUG00000016724) nkapd1 (ENSSLUG00000016728) dixdc1a (ENSSLUG00000016733) ##22 pih1d2 (ENSSLUG00000016740) TMPRSS5 (ENSSLUG00000016750) ZBTB16 (ENSSLUG00000016764) ncam1b (ENSSLUG00000016930) cadm1b (ENSSLUG00000020530) IGSF9B (ENSSLUG00000020636) JAM3 (ENSSLUG00000020639) vps26b (ENSSLUG00000020643) thyn1 (ENSSLUG00000020651) acad8 (ENSSLUG00000020660) ENSSLUG00000020677 ROBO3 (ENSSLUG00000020692) lim2.3 (ENSSLUG00000020739) hspa8b (ENSSLUG00000020839) ENSSLUG00000023335 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a ENSGT00950000183206.a.b.a.a.a Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a ENSGT00950000183206.a.b.a.a.a European seabass MODERN SPECIES 3 ENSDLAG00005023066 wdr81 (ENSDLAG00005023056) rpa1 (ENSDLAG00005022779) rtn4rl1b (ENSDLAG00005022764) dph1 (ENSDLAG00005022670) ENSDLAG00005022662 hic1 (ENSDLAG00005022658) tsr1 (ENSDLAG00005022639) ENSDLAG00005022489 ENSDLAG00005022309 ENSDLAG00005022296 ENSDLAG00005022184 ENSDLAG00005027951 ENSDLAG00005022176 ENSDLAG00005032735 dixdc1a (ENSDLAG00005022164) ##22 ENSDLAG00005031253 ENSDLAG00005022127 ncam1b (ENSDLAG00005018699) ENSDLAG00005018565 cadm1b (ENSDLAG00005034672) cadm1b (ENSDLAG00005034349) ENSDLAG00005018342 IGSF9B (ENSDLAG00005017671) JAM3 (ENSDLAG00005017645) vps26b (ENSDLAG00005017537) thyn1 (ENSDLAG00005029804) acad8 (ENSDLAG00005017513) ENSDLAG00005017505 ENSDLAG00005016080 lim2.3 (ENSDLAG00005032552) Large yellow croaker MODERN SPECIES 479 SLC13A5 (ENSLCRG00005005001) wdr81 (ENSLCRG00005005004) serpinf2b (ENSLCRG00005005009) rpa1 (ENSLCRG00005005016) rtn4rl1b (ENSLCRG00005005025) dph1 (ENSLCRG00005005030) hic1 (ENSLCRG00005005235) tsr1 (ENSLCRG00005005237) TAOK1 (ENSLCRG00005005244) paf1 (ENSLCRG00005005344) ENSLCRG00005006579 SAMD4B (ENSLCRG00005006585) socs9 (ENSLCRG00005006829) lrfn1 (ENSLCRG00005006831) nkapd1 (ENSLCRG00005006834) dixdc1a (ENSLCRG00005006839) ##22 pih1d2 (ENSLCRG00005006842) ENSLCRG00005006844 ZBTB16 (ENSLCRG00005006847) ncam1b (ENSLCRG00005006928) cadm1b (ENSLCRG00005015103) ENSLCRG00005015283 IGSF9B (ENSLCRG00005015290) JAM3 (ENSLCRG00005015291) vps26b (ENSLCRG00005015292) thyn1 (ENSLCRG00005015293) acad8 (ENSLCRG00005015295) ENSLCRG00005015299 ENSLCRG00005015309 lim2.3 (ENSLCRG00005015487) hspa8b (ENSLCRG00005015497) Gilthead seabream MODERN SPECIES 11 wdr81 (ENSSAUG00010002076) ENSSAUG00010002080 serpinf2b (ENSSAUG00010002082) rpa1 (ENSSAUG00010002185) rtn4rl1b (ENSSAUG00010006211) dph1 (ENSSAUG00010006218) hic1 (ENSSAUG00010006224) tsr1 (ENSSAUG00010006226) TAOK1 (ENSSAUG00010006238) paf1 (ENSSAUG00010006498) ENSSAUG00010007277 SAMD4B (ENSSAUG00010007284) ENSSAUG00010007305 lrfn1 (ENSSAUG00010007307) nkapd1 (ENSSAUG00010007309) dixdc1a (ENSSAUG00010007313) ##22 pih1d2 (ENSSAUG00010007317) TMPRSS5 (ENSSAUG00010007321) ZBTB16 (ENSSAUG00010007323) ncam1b (ENSSAUG00010007463) cadm1b (ENSSAUG00010016572) ENSSAUG00010016591 IGSF9B (ENSSAUG00010016618) JAM3 (ENSSAUG00010017100) vps26b (ENSSAUG00010017102) thyn1 (ENSSAUG00010017104) acad8 (ENSSAUG00010017107) ENSSAUG00010017115 ENSSAUG00010017166 lim2.3 (ENSSAUG00010019135) hspa8b (ENSSAUG00010019139) Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000163234.a.a ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a ENSGT00940000164443.b.b Tetraodon MODERN SPECIES 8 ENSTNIG00000016203 SLC13A5 (ENSTNIG00000016202) wdr81 (ENSTNIG00000016201) ENSTNIG00000016200 rpa1 (ENSTNIG00000016199) rtn4rl1b (ENSTNIG00000016198) dph1 (ENSTNIG00000016197) ENSTNIG00000001570 tsr1 (ENSTNIG00000016196) TAOK1 (ENSTNIG00000016195) paf1 (ENSTNIG00000016194) SAMD4B (ENSTNIG00000016193) socs9 (ENSTNIG00000001677) lrfn1 (ENSTNIG00000016192) ENSTNIG00000000148 dixdc1a (ENSTNIG00000016191) ##22 TMPRSS5 (ENSTNIG00000016190) ZBTB16 (ENSTNIG00000016189) ncam1b (ENSTNIG00000016188) cadm1b (ENSTNIG00000016187) ENSTNIG00000016186 IGSF9B (ENSTNIG00000016185) JAM3 (ENSTNIG00000016184) vps26b (ENSTNIG00000016183) thyn1 (ENSTNIG00000016182) acad8 (ENSTNIG00000016181) ENSTNIG00000016180 ENSTNIG00000016179 lim2.3 (ENSTNIG00000016178) ENSTNIG00000016177 ENSTNIG00000016176 Fugu MODERN SPECIES 2 ENSTRUG00000000909 SLC13A5 (ENSTRUG00000001862) wdr81 (ENSTRUG00000002991) serpinf2b (ENSTRUG00000003241) rpa1 (ENSTRUG00000003616) rtn4rl1b (ENSTRUG00000004030) dph1 (ENSTRUG00000004127) hic1 (ENSTRUG00000024667) tsr1 (ENSTRUG00000004665) ENSTRUG00000005168 paf1 (ENSTRUG00000005752) SAMD4B (ENSTRUG00000006063) socs9 (ENSTRUG00000019559) lrfn1 (ENSTRUG00000031108) nkapd1 (ENSTRUG00000022929) dixdc1a (ENSTRUG00000006613) ##22 pih1d2 (ENSTRUG00000023581) TMPRSS5 (ENSTRUG00000006768) ZBTB16 (ENSTRUG00000006950) ncam1b (ENSTRUG00000007164) cadm1b (ENSTRUG00000007218) ENSTRUG00000030310 IGSF9B (ENSTRUG00000007727) JAM3 (ENSTRUG00000002858) vps26b (ENSTRUG00000006004) thyn1 (ENSTRUG00000027328) ENSTRUG00000022225 ENSTRUG00000026045 lim2.3 (ENSTRUG00000025476) ENSTRUG00000027762 ENSTRUG00000020315 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 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ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a ENSGT00950000183206.a.b.a.a.a Climbing perch MODERN SPECIES 4 ENSATEG00000022067 wdr81 (ENSATEG00000022050) serpinf2b (ENSATEG00000022045) rpa1 (ENSATEG00000022024) rtn4rl1b (ENSATEG00000025242) dph1 (ENSATEG00000021994) hic1 (ENSATEG00000021972) tsr1 (ENSATEG00000021961) ENSATEG00000021921 ENSATEG00000021892 ENSATEG00000021879 ENSATEG00000021856 ENSATEG00000021848 ENSATEG00000021828 ENSATEG00000021822 dixdc1a (ENSATEG00000021813) ##22 pih1d2 (ENSATEG00000021795) ENSATEG00000021750 ENSATEG00000021683 ncam1b (ENSATEG00000020543) cadm1b (ENSATEG00000026836) ENSATEG00000020375 IGSF9B (ENSATEG00000020330) JAM3 (ENSATEG00000020309) vps26b (ENSATEG00000020277) thyn1 (ENSATEG00000020269) acad8 (ENSATEG00000020234) ENSATEG00000020206 ENSATEG00000020178 lim2.3 (ENSATEG00000030203) hspa8b (ENSATEG00000020128) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 4 ENSBSLG00000012939 SLC13A5 (ENSBSLG00000012964) wdr81 (ENSBSLG00000013023) rpa1 (ENSBSLG00000013029) rtn4rl1b (ENSBSLG00000013706) dph1 (ENSBSLG00000013741) hic1 (ENSBSLG00000014319) tsr1 (ENSBSLG00000014335) ENSBSLG00000014419 paf1 (ENSBSLG00000014785) ENSBSLG00000014844 SAMD4B (ENSBSLG00000014876) socs9 (ENSBSLG00000014973) lrfn1 (ENSBSLG00000015148) nkapd1 (ENSBSLG00000015192) dixdc1a (ENSBSLG00000015216) ##22 pih1d2 (ENSBSLG00000015313) ENSBSLG00000015338 ZBTB16 (ENSBSLG00000015373) ncam1b (ENSBSLG00000015471) cadm1b (ENSBSLG00000016757) ENSBSLG00000017022 IGSF9B (ENSBSLG00000017189) JAM3 (ENSBSLG00000017458) vps26b (ENSBSLG00000017514) thyn1 (ENSBSLG00000017586) acad8 (ENSBSLG00000017623) ENSBSLG00000017774 ROBO3 (ENSBSLG00000017802) lim2.3 (ENSBSLG00000018062) hspa8b (ENSBSLG00000018126) Zig-zag eel MODERN SPECIES 4 wdr81 (ENSMAMG00000018047) serpinf2b (ENSMAMG00000018041) rpa1 (ENSMAMG00000017993) rtn4rl1b (ENSMAMG00000026925) dph1 (ENSMAMG00000017955) hic1 (ENSMAMG00000017930) tsr1 (ENSMAMG00000017918) ENSMAMG00000017857 ENSMAMG00000017789 ENSMAMG00000017827 ENSMAMG00000017746 ENSMAMG00000017742 ENSMAMG00000024902 ENSMAMG00000017703 ENSMAMG00000017696 dixdc1a (ENSMAMG00000017670) ##22 pih1d2 (ENSMAMG00000028190) ENSMAMG00000017534 ENSMAMG00000017518 ncam1b (ENSMAMG00000017465) cadm1b (ENSMAMG00000026957) ENSMAMG00000017382 IGSF9B (ENSMAMG00000017304) JAM3 (ENSMAMG00000017287) vps26b (ENSMAMG00000017271) thyn1 (ENSMAMG00000017235) acad8 (ENSMAMG00000017198) ENSMAMG00000017126 ENSMAMG00000016895 lim2.3 (ENSMAMG00000016873) hspa8b (ENSMAMG00000016857) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a ENSGT00950000183206.a.b.a.a.a Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b.d ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a ENSGT00950000183206.a.b.a.a.a Barramundi perch MODERN SPECIES 240 dph1 (ENSLCAG00010027239) hic1 (ENSLCAG00010027235) tsr1 (ENSLCAG00010027233) TAOK1 (ENSLCAG00010027208) paf1 (ENSLCAG00010027179) GMFG (ENSLCAG00010027174) SAMD4B (ENSLCAG00010027170) socs9 (ENSLCAG00010027166) lrfn1 (ENSLCAG00010027164) nkapd1 (ENSLCAG00010027163) dixdc1a (ENSLCAG00010027160) ##22 pih1d2 (ENSLCAG00010027156) TMPRSS5 (ENSLCAG00010027151) ENSLCAG00010027147 ZBTB16 (ENSLCAG00010027145) ncam1b (ENSLCAG00010026921) cadm1b (ENSLCAG00010026814) ENSLCAG00010026809 IGSF9B (ENSLCAG00010026796) JAM3 (ENSLCAG00010026795) vps26b (ENSLCAG00010026793) thyn1 (ENSLCAG00010026791) Seriola ANCESTRAL SPECIES 70 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b.d ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2791 dph1 (ENSSLDG00000001942) hic1 (ENSSLDG00000002022) tsr1 (ENSSLDG00000002031) TAOK1 (ENSSLDG00000002059) paf1 (ENSSLDG00000002131) ENSSLDG00000002185 SAMD4B (ENSSLDG00000002209) socs9 (ENSSLDG00000002252) lrfn1 (ENSSLDG00000002263) nkapd1 (ENSSLDG00000002281) dixdc1a (ENSSLDG00000002293) ##22 pih1d2 (ENSSLDG00000002309) TMPRSS5 (ENSSLDG00000002333) Greater amberjack MODERN SPECIES 112 SLC13A5 (ENSSDUG00000011818) wdr81 (ENSSDUG00000011858) serpinf2b (ENSSDUG00000011907) rpa1 (ENSSDUG00000011949) rtn4rl1b (ENSSDUG00000012005) dph1 (ENSSDUG00000012018) ENSSDUG00000012054 hic1 (ENSSDUG00000012062) tsr1 (ENSSDUG00000012074) TAOK1 (ENSSDUG00000012120) paf1 (ENSSDUG00000012186) ENSSDUG00000012252 SAMD4B (ENSSDUG00000012292) lrfn1 (ENSSDUG00000012401) nkapd1 (ENSSDUG00000012405) dixdc1a (ENSSDUG00000012420) ##22 pih1d2 (ENSSDUG00000012487) TMPRSS5 (ENSSDUG00000012518) ZBTB16 (ENSSDUG00000012745) ncam1b (ENSSDUG00000012797) ENSSDUG00000013052 cadm1b (ENSSDUG00000013074) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01030000234550.a.a.c.a.b.a ENSGT00930000151039 ENSGT00940000158386.d ENSGT00390000012403.o ENSGT00940000157112.b ENSGT00940000153694.A ENSGT00940000161725 ENSGT00940000153195.A ENSGT00940000155796.c.b ENSGT00390000001474 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00940000159702 ENSGT00940000164285.b ENSGT00940000160922 ENSGT00940000167059 ENSGT00950000182903.b.b.o.a ##22 ENSGT00510000048581 ENSGT00940000159163 ENSGT00940000154616.a.b ENSGT00940000155743.a ENSGT00940000156093.e.b ENSGT00940000154313.c.b ENSGT00940000155900.j ENSGT00940000156937.a.b ENSGT00950000183064.a.b.a.a ENSGT00390000013297 ENSGT00940000157590 ENSGT00940000157231.a.b ENSGT00940000155457.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.b.a ENSGT00950000183206.a.b.a.a.a Turbot MODERN SPECIES 15 ENSSMAG00000036949 wdr81 (ENSSMAG00000037150) ENSSMAG00000033734 serpinf2b (ENSSMAG00000030224) rpa1 (ENSSMAG00000005886) rtn4rl1b (ENSSMAG00000022259) dph1 (ENSSMAG00000005864) hic1 (ENSSMAG00000009823) tsr1 (ENSSMAG00000009504) ENSSMAG00000009776 ENSSMAG00000009602 ENSSMAG00000009583 ENSSMAG00000009543 ENSSMAG00000007492 ENSSMAG00000007497 dixdc1a (ENSSMAG00000007515) ##22 ENSSMAG00000007604 ENSSMAG00000007679 ncam1b (ENSSMAG00000007709) ENSSMAG00000007852 cadm1b (ENSSMAG00000007868) ENSSMAG00000007965 IGSF9B (ENSSMAG00000008008) JAM3 (ENSSMAG00000008357) vps26b (ENSSMAG00000008424) thyn1 (ENSSMAG00000008438) acad8 (ENSSMAG00000008465) ENSSMAG00000008491 ENSSMAG00000008504 lim2.3 (ENSSMAG00000008530) hspa8b (ENSSMAG00000008540) Tongue sole MODERN SPECIES 14 ENSCSEG00000015536 ilkap (ENSCSEG00000015521) zgc:162872 (ENSCSEG00000015464) ENSCSEG00000015451 wdr74 (ENSCSEG00000015450) IWS1 (ENSCSEG00000015437) PARL (ENSCSEG00000015428) ENSCSEG00000015423 ENSCSEG00000015410 ENSCSEG00000015404 ENSCSEG00000015370 ENSCSEG00000015355 ENSCSEG00000015352 lrfn1 (ENSCSEG00000015348) nkapd1 (ENSCSEG00000015331) dixdc1a (ENSCSEG00000015319) ##22 pih1d2 (ENSCSEG00000015314) TMPRSS5 (ENSCSEG00000015306) ZBTB16 (ENSCSEG00000015300) ncam1b (ENSCSEG00000015273) cadm1b (ENSCSEG00000015232) ENSCSEG00000015208 IGSF9B (ENSCSEG00000015158) JAM3 (ENSCSEG00000015145) vps26b (ENSCSEG00000015123) thyn1 (ENSCSEG00000015102) SYNRG (ENSCSEG00000014970) dusp14 (ENSCSEG00000014920) sirt2 (ENSCSEG00000014876) GJD2 (ENSCSEG00000014863) nop53 (ENSCSEG00000014834) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 4 rpa1 (ENSMMDG00005009866) tssk6 (ENSMMDG00005009818) rtn4rl1b (ENSMMDG00005009815) ENSMMDG00005009810 dph1 (ENSMMDG00005009750) hic1 (ENSMMDG00005009740) tsr1 (ENSMMDG00005009725) TAOK1 (ENSMMDG00005009489) ENSMMDG00005009453 PAF1 (ENSMMDG00005009443) ENSMMDG00005009430 SAMD4B (ENSMMDG00005009419) socs9 (ENSMMDG00005009414) lrfn1 (ENSMMDG00005009411) nkapd1 (ENSMMDG00005009409) dixdc1a (ENSMMDG00005009400) ##22 pih1d2 (ENSMMDG00005009387) TMPRSS5 (ENSMMDG00005009381) ZBTB16 (ENSMMDG00005009333) ncam1b (ENSMMDG00005007328) cadm1b (ENSMMDG00005007269) ENSMMDG00005007193 IGSF9B (ENSMMDG00005007175) JAM3 (ENSMMDG00005007136) vps26b (ENSMMDG00005007131) thyn1 (ENSMMDG00005007126) acad8 (ENSMMDG00005006510) ENSMMDG00005006504 ENSMMDG00005006501 lim2.3 (ENSMMDG00005006496) hspa8b (ENSMMDG00005006494) Cod MODERN SPECIES 7 ENSGMOG00000010418 wdr81 (ENSGMOG00000029087) serpinf2b (ENSGMOG00000010399) rpa1 (ENSGMOG00000010382) rtn4rl1b (ENSGMOG00000010378) dph1 (ENSGMOG00000010364) hic1 (ENSGMOG00000029695) ENSGMOG00000035587 tsr1 (ENSGMOG00000010336) ENSGMOG00000010315 ENSGMOG00000010296 ENSGMOG00000010285 ENSGMOG00000003493 ENSGMOG00000005835 ENSGMOG00000031821 dixdc1a (ENSGMOG00000005777) ##22 pih1d2 (ENSGMOG00000031364) ENSGMOG00000005741 ENSGMOG00000030701 ncam1b (ENSGMOG00000005679) ENSGMOG00000026359 cadm1b (ENSGMOG00000010500) ENSGMOG00000010483 IGSF9B (ENSGMOG00000010464) JAM3 (ENSGMOG00000010442) vps26b (ENSGMOG00000010435) thyn1 (ENSGMOG00000008655) acad8 (ENSGMOG00000010419) ENSGMOG00000023941 ENSGMOG00000010366 lim2.3 (ENSGMOG00000010361) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00940000163496.b.a ENSGT00390000008196 ENSGT00390000003308.b ENSGT00390000012668.h ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00740000117097 ENSGT00950000182903.b.b.p ##22 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000159682 ENSGT00940000163088 ENSGT00940000168885 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00390000012429 ENSGT00940000163496.b.b.b ENSGT00940000164445 ENSGT00940000163496.a ENSGT00390000014500 ENSGT00940000159828.a ENSGT00940000161091 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000162143 ENSGT00950000183204.a.a.a.a Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 223 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00940000166624 ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00940000161288 ENSGT00390000008196 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000159682 ENSGT00940000168885 ENSGT00940000163088 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00390000012429 ENSGT00390000014500 ENSGT00940000159828.a ENSGT00940000161091 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000162143 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 198 ENSGT00940000157648 ENSGT00390000014500 ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000163088 ENSGT00940000168885 ENSGT00940000159682 ENSGT00940000158605 ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000157648 ENSGT00390000014500 ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000163088 ENSGT00940000168885 ENSGT00940000159682 ENSGT00940000158605 ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00940000177141 ENSGT00950000183148.b.a.g.b 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ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00990000204242 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00940000177141 ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000168885 ENSGT00940000163088 ENSGT00940000159682 ENSGT00940000165141.b ENSGT00940000166239 ENSGT00940000158605 ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00990000204242 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00940000177141 ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000168885.b.b ENSGT00940000163088 ENSGT00940000168885.b.a ENSGT00940000159682 ENSGT00940000158605 ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00990000204242 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00940000177141 ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000014500 ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000168885.b.b ENSGT00940000168885.b.a ENSGT00940000159682 ENSGT00940000158605 ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00990000204242 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00940000177141 ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D Mangrove rivulus MODERN SPECIES 42 ENSKMAG00000022253 nectin1a (ENSKMAG00000022250) ENSKMAG00000022249 ENSKMAG00000022248 chek1 (ENSKMAG00000022245) ENSKMAG00000022242 ENSKMAG00000022241 ENSKMAG00000022240 alg9 (ENSKMAG00000022237) fdxacb1 (ENSKMAG00000022235) TOMM40L (ENSKMAG00000022233) 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ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D ENSGT00940000157181 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000014500 ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000163088 ENSGT00940000168885.b.a ENSGT00940000159682 ENSGT00940000165141.b ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00940000162446 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D ENSGT00940000157181 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000014500 ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000163088 ENSGT00940000168885.b.a ENSGT00940000159682 ENSGT00940000165141.b ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00940000162446 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D ENSGT00940000157181 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157648 ENSGT00390000014500 ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000163088 ENSGT00940000168885.b.a ENSGT00940000159682 ENSGT00940000165141.b ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b 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Sheepshead minnow MODERN SPECIES 379 ENSCVAG00000012921 alg9 (ENSCVAG00000012997) fdxacb1 (ENSCVAG00000013005) TOMM40L (ENSCVAG00000013077) bicdl2 (ENSCVAG00000013084) mia (ENSCVAG00000013088) CRYAB (ENSCVAG00000013098) DIXDC1 (ENSCVAG00000013112) ##22 dlat (ENSCVAG00000013147) zgc:165604 (ENSCVAG00000013165) PCNX3 (ENSCVAG00000013250) NRXN2 (ENSCVAG00000013423) pygma (ENSCVAG00000013455) slc22a6l (ENSCVAG00000013489) nrg2a (ENSCVAG00000013810) puraa (ENSCVAG00000013829) zgc:100829 (ENSCVAG00000013847) CXXC5 (ENSCVAG00000000348) ppp3ca (ENSCVAG00000013937) dnajc18 (ENSCVAG00000000929) ENSCVAG00000013954 gng8 (ENSCVAG00000013968) tmem45b (ENSCVAG00000013976) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000168885 ENSGT00940000163088 ENSGT00940000159682 ENSGT00940000158605.r ENSGT00940000158605.q ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b 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ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 5 snrnp35 (ENSORLG00000005673) ENSORLG00000005686 nectin1a (ENSORLG00000005697) ENSORLG00000024302 ENSORLG00000026908 chek1 (ENSORLG00000005727) ENSORLG00000026836 cfbl (ENSORLG00000005801) ENSORLG00000005821 fdxacb1 (ENSORLG00000005838) ENSORLG00000005871 bicdl2 (ENSORLG00000027576) mia (ENSORLG00000028211) cryaba (ENSORLG00000005891) ENSORLG00000005899 DIXDC1 (ENSORLG00000020151) ##22 dlat (ENSORLG00000021909) zgc:165604 (ENSORLG00000024481) PCNX3 (ENSORLG00000005917) ENSORLG00000005948 ENSORLG00000025532 pygma (ENSORLG00000006042) slc22a6l (ENSORLG00000006079) nrg2a (ENSORLG00000006095) puraa (ENSORLG00000006100) zgc:100829 (ENSORLG00000026494) CXXC5 (ENSORLG00000006108) ppp3ca (ENSORLG00000006170) dnajc18 (ENSORLG00000006189) ENSORLG00000026751 ENSORLG00000025967 Chinese medaka MODERN 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ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01060000248588.a.d.b ENSGT00940000155492.a.a ENSGT00940000157648 ENSGT00390000014500 ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000159682 ENSGT00940000165141.b ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00940000177141 ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01060000248588.a.d.b.a ENSGT00940000155492.a.a ENSGT00940000157648 ENSGT00390000014500 ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000159682 ENSGT00940000165141.b ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00940000177141 ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01060000248588.a.d.b.a ENSGT00940000155492.a.a ENSGT00940000157648 ENSGT00390000014500 ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000159682 ENSGT00940000165141.b ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00940000177141 ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D Orange clownfish MODERN SPECIES 6 ENSAPEG00000023532 ENSAPEG00000023569 snrnp35 (ENSAPEG00000023725) bud13 (ENSAPEG00000023734) ENSAPEG00000023743 nectin1a (ENSAPEG00000023774) chek1 (ENSAPEG00000023791) ENSAPEG00000023812 ENSAPEG00000023829 alg9 (ENSAPEG00000023842) fdxacb1 (ENSAPEG00000023857) TOMM40L (ENSAPEG00000023867) bicdl2 (ENSAPEG00000023880) mia (ENSAPEG00000023895) cryaba (ENSAPEG00000023906) DIXDC1 (ENSAPEG00000023912) ##22 dlat (ENSAPEG00000023928) zgc:165604 (ENSAPEG00000023956) PCNX3 (ENSAPEG00000023975) NRXN2 (ENSAPEG00000024071) ENSAPEG00000024087 pygma (ENSAPEG00000024093) slc22a6l (ENSAPEG00000024114) nrg2a (ENSAPEG00000024139) puraa (ENSAPEG00000024208) zgc:100829 (ENSAPEG00000024215) CXXC5 (ENSAPEG00000024231) ppp3ca (ENSAPEG00000024244) dnajc18 (ENSAPEG00000024250) ENSAPEG00000024255 ENSAPEG00000024271 Clown anemonefish MODERN SPECIES 1958 ENSAOCG00000007775 arhgap42a (ENSAOCG00000007737) snrnp35 (ENSAOCG00000007701) bud13 (ENSAOCG00000007679) ENSAOCG00000007665 nectin1a (ENSAOCG00000007642) chek1 (ENSAOCG00000007618) ENSAOCG00000007557 ENSAOCG00000007492 alg9 (ENSAOCG00000007472) fdxacb1 (ENSAOCG00000007455) TOMM40L (ENSAOCG00000007447) bicdl2 (ENSAOCG00000007431) mia (ENSAOCG00000007394) cryaba (ENSAOCG00000007378) DIXDC1 (ENSAOCG00000000393) ##22 dlat (ENSAOCG00000007355) Spiny chromis MODERN SPECIES 87 alg9 (ENSAPOG00000009114) fdxacb1 (ENSAPOG00000009041) TOMM40L (ENSAPOG00000009029) bicdl2 (ENSAPOG00000009009) mia (ENSAPOG00000008990) cryaba (ENSAPOG00000008978) DIXDC1 (ENSAPOG00000008950) ##22 dlat (ENSAPOG00000008912) zgc:165604 (ENSAPOG00000008843) PCNX3 (ENSAPOG00000000739) NRXN2 (ENSAPOG00000008586) ENSAPOG00000008410 pygma (ENSAPOG00000008402) slc22a6l (ENSAPOG00000008331) nrg2a (ENSAPOG00000008304) puraa (ENSAPOG00000008260) zgc:100829 (ENSAPOG00000008243) CXXC5 (ENSAPOG00000008221) ppp3ca (ENSAPOG00000008191) dnajc18 (ENSAPOG00000008124) BRD8 (ENSAPOG00000008109) gng8 (ENSAPOG00000008099) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 2668 DIXDC1 (ENSSPAG00000013639) ##22 dlat (ENSSPAG00000013610) zgc:165604 (ENSSPAG00000013594) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157648 ENSGT00390000014500.f ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000168885 ENSGT00940000159682 ENSGT00940000165141.b ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00990000204242 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00940000177141 ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000157648 ENSGT00390000014500.f ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000168885 ENSGT00940000159682 ENSGT00940000165141.b ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00990000204242 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00940000177141 ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D Nile tilapia MODERN SPECIES 1 snrnp35 (ENSONIG00000021361) bud13 (ENSONIG00000004913) ENSONIG00000004916 nectin1a (ENSONIG00000004917) ENSONIG00000034663 ENSONIG00000004919 chek1 (ENSONIG00000004923) ENSONIG00000004932 ENSONIG00000004937 alg9 (ENSONIG00000004938) fdxacb1 (ENSONIG00000004939) TOMM40L (ENSONIG00000004940) bicdl2 (ENSONIG00000004943) mia (ENSONIG00000027408) cryaba (ENSONIG00000041517) DIXDC1 (ENSONIG00000004949) ##22 ENSONIG00000005409 dlat (ENSONIG00000004954) zgc:165604 (ENSONIG00000027264) PCNX3 (ENSONIG00000004962) ENSONIG00000031040 pygma (ENSONIG00000004983) NRXN2 (ENSONIG00000004966) slc22a6l (ENSONIG00000004990) nrg2a (ENSONIG00000004994) puraa (ENSONIG00000021362) zgc:100829 (ENSONIG00000004999) CXXC5 (ENSONIG00000042757) ppp3ca (ENSONIG00000005001) BRD8 (ENSONIG00000005008) gng8 (ENSONIG00000005011) Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000014500.e ENSGT00390000014500.f ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000168885 ENSGT00940000159682 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(ENSNBRG00000006775) ##22 dlat (ENSNBRG00000006725) zgc:165604 (ENSNBRG00000006693) PCNX3 (ENSNBRG00000006561) ENSNBRG00000006549 NRXN2 (ENSNBRG00000006479) pygma (ENSNBRG00000006375) slc22a6l (ENSNBRG00000006329) nrg2a (ENSNBRG00000006035) puraa (ENSNBRG00000005980) zgc:100829 (ENSNBRG00000005964) CXXC5 (ENSNBRG00000005953) ppp3ca (ENSNBRG00000005899) dnajc18 (ENSNBRG00000005890) ENSNBRG00000005881 gng8 (ENSNBRG00000005867) Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000014500.e ENSGT00390000014500.f ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000168885 ENSGT00940000159682 ENSGT00940000165141.b ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00990000204242 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00940000177141 ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a.c ENSGT01100000263497.D Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 582 alg9 (ENSHBUG00000003474) fdxacb1 (ENSHBUG00000003489) ENSHBUG00000003502 bicdl2 (ENSHBUG00000003511) mia (ENSHBUG00000003535) cryaba (ENSHBUG00000000080) ENSHBUG00000003563 DIXDC1 (ENSHBUG00000000980) ##22 dlat (ENSHBUG00000003626) zgc:165604 (ENSHBUG00000003655) PCNX3 (ENSHBUG00000003768) ENSHBUG00000003775 NRXN2 (ENSHBUG00000003998) pygma (ENSHBUG00000004114) slc22a6l (ENSHBUG00000004138) nrg2a (ENSHBUG00000004528) puraa (ENSHBUG00000001122) zgc:100829 (ENSHBUG00000004599) CXXC5 (ENSHBUG00000004612) ppp3ca (ENSHBUG00000004661) dnajc18 (ENSHBUG00000004678) ENSHBUG00000000114 ENSHBUG00000004736 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000014500.e ENSGT00390000014500.f ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000168885 ENSGT00940000159682 ENSGT00940000165141.b ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00990000204242 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00940000177141 ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a.c ENSGT01100000263497.D P. nyererei MODERN SPECIES 359 alg9 (ENSPNYG00000012932) fdxacb1 (ENSPNYG00000012981) TOMM40L (ENSPNYG00000012995) bicdl2 (ENSPNYG00000013041) mia (ENSPNYG00000013114) cryaba (ENSPNYG00000013121) ENSPNYG00000013134 DIXDC1 (ENSPNYG00000013144) ##22 dlat (ENSPNYG00000013190) zgc:165604 (ENSPNYG00000013222) PCNX3 (ENSPNYG00000013254) NRXN2 (ENSPNYG00000013318) ENSPNYG00000013354 pygma (ENSPNYG00000013384) slc22a6l (ENSPNYG00000013491) nrg2a (ENSPNYG00000013643) puraa (ENSPNYG00000013832) zgc:100829 (ENSPNYG00000013845) CXXC5 (ENSPNYG00000013859) ppp3ca (ENSPNYG00000013871) dnajc18 (ENSPNYG00000013905) ENSPNYG00000013953 ENSPNYG00000013963 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000014500.f ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000168885 ENSGT00940000159682 ENSGT00940000165141.b ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00990000204242 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00940000177141 ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a.c ENSGT01100000263497.D Eastern happy MODERN SPECIES 1 ENSACLG00000020771 ENSACLG00000020753 nectin1a (ENSACLG00000020724) ENSACLG00000020710 chek1 (ENSACLG00000020646) ENSACLG00000020593 ENSACLG00000020570 alg9 (ENSACLG00000020512) fdxacb1 (ENSACLG00000020497) TOMM40L (ENSACLG00000020472) cryaba (ENSACLG00000020461) bicdl2 (ENSACLG00000020351) mia (ENSACLG00000020336) ENSACLG00000020309 cryaba (ENSACLG00000020295) DIXDC1 (ENSACLG00000020271) ##22 dlat (ENSACLG00000020195) zgc:165604 (ENSACLG00000020162) PCNX3 (ENSACLG00000020087) ENSACLG00000020068 NRXN2 (ENSACLG00000019751) pygma (ENSACLG00000019569) slc22a6l (ENSACLG00000019512) ENSACLG00000019496 nrg2a (ENSACLG00000019475) puraa (ENSACLG00000019437) zgc:100829 (ENSACLG00000019428) ENSACLG00000019417 CXXC5 (ENSACLG00000019404) ppp3ca (ENSACLG00000019333) dnajc18 (ENSACLG00000019300) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1092 ENSMZEG00005018915 ENSMZEG00005018906 bud13 (ENSMZEG00005018890) ENSMZEG00005018875 nectin1a (ENSMZEG00005018865) chek1 (ENSMZEG00005018841) ENSMZEG00005018826 ENSMZEG00005018823 alg9 (ENSMZEG00005018808) fdxacb1 (ENSMZEG00005018799) TOMM40L (ENSMZEG00005018793) bicdl2 (ENSMZEG00005018762) mia (ENSMZEG00005018754) cryaba (ENSMZEG00005018752) ENSMZEG00005018749 DIXDC1 (ENSMZEG00005018735) ##22 dlat (ENSMZEG00005018723) zgc:165604 (ENSMZEG00005018718) PCNX3 (ENSMZEG00005018678) ENSMZEG00005018665 NRXN2 (ENSMZEG00005018630) pygma (ENSMZEG00005018609) slc22a6l (ENSMZEG00005018595) nrg2a (ENSMZEG00005018590) puraa (ENSMZEG00005018587) zgc:100829 (ENSMZEG00005018581) ENSMZEG00005018576 CXXC5 (ENSMZEG00005018572) ppp3ca (ENSMZEG00005018561) dnajc18 (ENSMZEG00005018557) ENSMZEG00005018551 Midas cichlid MODERN SPECIES 888 ENSACIG00000004352 ENSACIG00000004270 ENSACIG00000004260 alg9 (ENSACIG00000004228) fdxacb1 (ENSACIG00000004208) TOMM40L (ENSACIG00000004087) bicdl2 (ENSACIG00000004024) mia (ENSACIG00000003982) cryaba (ENSACIG00000003961) DIXDC1 (ENSACIG00000003921) ##22 dlat (ENSACIG00000003890) zgc:165604 (ENSACIG00000003857) zgc:165604 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ENSGT00940000165141.b ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00990000204242 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00940000177141 ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000157648 ENSGT00390000014500 ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000163088 ENSGT00940000159682 ENSGT00940000165141.b ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00990000204242 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00940000177141 ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D Seriola ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155492.a.a ENSGT00940000157648 ENSGT00390000014500 ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000163088 ENSGT00940000159682 ENSGT00940000165141.b ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00940000177141 ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3035 arhgap42a (ENSSLDG00000017180) snrnp35 (ENSSLDG00000017209) bud13 (ENSSLDG00000017222) ENSSLDG00000017233 nectin1a (ENSSLDG00000017247) ENSSLDG00000017265 chek1 (ENSSLDG00000017279) ENSSLDG00000017305 ENSSLDG00000017332 alg9 (ENSSLDG00000017352) fdxacb1 (ENSSLDG00000017388) TOMM40L (ENSSLDG00000017396) bicdl2 (ENSSLDG00000017430) cryaba (ENSSLDG00000017555) mia (ENSSLDG00000017635) DIXDC1 (ENSSLDG00000017649) ##22 dlat (ENSSLDG00000017681) zgc:165604 (ENSSLDG00000017727) PCNX3 (ENSSLDG00000017779) NRXN2 (ENSSLDG00000018011) ENSSLDG00000018229 pygma (ENSSLDG00000018238) slc22a6l (ENSSLDG00000018286) nrg2a (ENSSLDG00000018318) puraa (ENSSLDG00000018361) zgc:100829 (ENSSLDG00000018371) CXXC5 (ENSSLDG00000018379) ppp3ca (ENSSLDG00000018396) dnajc18 (ENSSLDG00000018427) ENSSLDG00000018444 gng8 (ENSSLDG00000018472) Greater amberjack MODERN SPECIES 139 ENSSDUG00000004111 arhgap42a (ENSSDUG00000004158) bud13 (ENSSDUG00000004190) ENSSDUG00000004207 nectin1a (ENSSDUG00000004215) ENSSDUG00000004233 chek1 (ENSSDUG00000004256) ENSSDUG00000004343 ENSSDUG00000004392 alg9 (ENSSDUG00000004403) fdxacb1 (ENSSDUG00000004461) TOMM40L (ENSSDUG00000004481) bicdl2 (ENSSDUG00000004540) mia (ENSSDUG00000004559) cryaba (ENSSDUG00000004570) DIXDC1 (ENSSDUG00000004587) ##22 dlat (ENSSDUG00000004751) zgc:165604 (ENSSDUG00000004798) PCNX3 (ENSSDUG00000004829) NRXN2 (ENSSDUG00000004995) ENSSDUG00000005042 pygma (ENSSDUG00000005053) slc22a6l (ENSSDUG00000005131) nrg2a (ENSSDUG00000005225) puraa (ENSSDUG00000005278) zgc:100829 (ENSSDUG00000005287) CXXC5 (ENSSDUG00000005317) ppp3ca (ENSSDUG00000005326) dnajc18 (ENSSDUG00000005351) BRD8 (ENSSDUG00000005363) gng8 (ENSSDUG00000005386) Barramundi perch MODERN SPECIES 94 arhgap42a (ENSLCAG00010009682) snrnp35 (ENSLCAG00010009578) ENSLCAG00010009575 nectin1a (ENSLCAG00010009569) ENSLCAG00010009565 chek1 (ENSLCAG00010009544) ENSLCAG00010009529 LAYN (ENSLCAG00010009520) alg9 (ENSLCAG00010009483) fdxacb1 (ENSLCAG00010009461) TOMM40L (ENSLCAG00010009448) bicdl2 (ENSLCAG00010009437) mia (ENSLCAG00010009433) cryaba (ENSLCAG00010009429) ENSLCAG00010009420 DIXDC1 (ENSLCAG00010009397) ##22 dlat (ENSLCAG00010009379) zgc:165604 (ENSLCAG00010009373) PCNX3 (ENSLCAG00010009334) ENSLCAG00010009309 NRXN2 (ENSLCAG00010009066) pygma (ENSLCAG00010008927) slc22a6l (ENSLCAG00010008868) nrg2a (ENSLCAG00010008834) puraa (ENSLCAG00010008819) zgc:100829 (ENSLCAG00010008818) CXXC5 (ENSLCAG00010008811) ppp3ca (ENSLCAG00010008592) dnajc18 (ENSLCAG00010008535) ENSLCAG00010008523 gng8 (ENSLCAG00010008516) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000155492.a.a ENSGT00940000157648 ENSGT00390000014500 ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000159682 ENSGT00940000158605 ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00990000204242 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00940000177141 ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D Tongue sole MODERN SPECIES 10 ENSCSEG00000007232 PRRG3 (ENSCSEG00000007226) ripply1 (ENSCSEG00000007219) smfn (ENSCSEG00000007214) mrps31 (ENSCSEG00000007168) taf6 (ENSCSEG00000007143) sat2b (ENSCSEG00000007123) cldn15b (ENSCSEG00000007117) ##32 grk1b (ENSCSEG00000007108) slc25a35 (ENSCSEG00000007097) TOMM40L (ENSCSEG00000007089) mia (ENSCSEG00000007069) bicdl2 (ENSCSEG00000007033) cryaba (ENSCSEG00000007024) ENSCSEG00000007009 ENSCSEG00000006990 ##22 dlat (ENSCSEG00000006972) fdxacb1 (ENSCSEG00000006964) ENSCSEG00000006932 ins (ENSCSEG00000006922) nipal4 (ENSCSEG00000006897) ENSCSEG00000006891 ENSCSEG00000006870 ENSCSEG00000006863 ENSCSEG00000006844 ENSCSEG00000006841 ENSCSEG00000006832 ADRA1B (ENSCSEG00000006825) ENSCSEG00000006821 ENSCSEG00000006805 ENSCSEG00000006786 Turbot MODERN SPECIES 16 ENSSMAG00000009945 ENSSMAG00000010002 ENSSMAG00000010016 bud13 (ENSSMAG00000010031) ENSSMAG00000010043 ENSSMAG00000010050 chek1 (ENSSMAG00000010065) ENSSMAG00000010207 ENSSMAG00000010184 ENSSMAG00000010250 ENSSMAG00000010264 ENSSMAG00000010348 ENSSMAG00000029792 CRYAB (ENSSMAG00000021843) ENSSMAG00000031333 ENSSMAG00000010481 ##22 DLAT (ENSSMAG00000010578) zgc:165604 (ENSSMAG00000010658) ENSSMAG00000010691 ENSSMAG00000010982 ENSSMAG00000011208 pygma (ENSSMAG00000011237) slc22a6l (ENSSMAG00000011282) nrg2a (ENSSMAG00000011327) puraa (ENSSMAG00000011590) zgc:100829 (ENSSMAG00000011591) ENSSMAG00000011609 ppp3ca (ENSSMAG00000011621) ENSSMAG00000011706 ENSSMAG00000011723 gng8 (ENSSMAG00000011777) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01060000248588.a.d.b ENSGT00940000155492.a.a ENSGT00940000157648 ENSGT00390000014500 ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000159682 ENSGT00940000158605 ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000177141 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D Zig-zag eel MODERN SPECIES 5 ENSMAMG00000018941 ENSMAMG00000018927 bud13 (ENSMAMG00000018919) ENSMAMG00000018904 ENSMAMG00000018891 ENSMAMG00000025943 chek1 (ENSMAMG00000018766) ENSMAMG00000018724 ENSMAMG00000018708 ENSMAMG00000025479 fdxacb1 (ENSMAMG00000018674) ENSMAMG00000018667 ENSMAMG00000018657 ENSMAMG00000018633 CRYAB (ENSMAMG00000018619) ENSMAMG00000018611 ##22 DLAT (ENSMAMG00000018583) zgc:165604 (ENSMAMG00000018566) ENSMAMG00000018448 ENSMAMG00000018434 ENSMAMG00000018398 pygma (ENSMAMG00000018334) slc22a6l (ENSMAMG00000018301) nrg2a (ENSMAMG00000018282) puraa (ENSMAMG00000018267) zgc:100829 (ENSMAMG00000018248) ENSMAMG00000018232 ppp3ca (ENSMAMG00000018209) ENSMAMG00000024664 ENSMAMG00000018178 gng8 (ENSMAMG00000018142) Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155492.a.a ENSGT00940000157648 ENSGT00390000014500 ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000159682 ENSGT00940000158605 ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00940000162446 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000177141 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D Siamese fighting fish MODERN SPECIES 5 aldocb (ENSBSLG00000007198) RSKR (ENSBSLG00000007176) cct8 (ENSBSLG00000006981) ENSBSLG00000006946 tmigd1 (ENSBSLG00000006923) slc47a1 (ENSBSLG00000006467) ENSBSLG00000006088 ENSBSLG00000006086 slc25a1a (ENSBSLG00000006083) nle1 (ENSBSLG00000005989) INPP5K (ENSBSLG00000005973) PITPNA (ENSBSLG00000005928) slc43a2b (ENSBSLG00000005067) tmem135 (ENSBSLG00000004698) ENSBSLG00000004548 DIXDC1 (ENSBSLG00000004515) ##22 dlat (ENSBSLG00000004487) zgc:165604 (ENSBSLG00000004481) PCNX3 (ENSBSLG00000004465) ENSBSLG00000004458 NRXN2 (ENSBSLG00000004002) pygma (ENSBSLG00000002538) nrg2a (ENSBSLG00000026652) puraa (ENSBSLG00000026651) zgc:100829 (ENSBSLG00000026650) CXXC5 (ENSBSLG00000026648) ppp3ca (ENSBSLG00000026647) dnajc18 (ENSBSLG00000026645) BRD8 (ENSBSLG00000026644) gng8 (ENSBSLG00000026643) tmem45b (ENSBSLG00000026642) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000014500 ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000159682 ENSGT00940000165141.b ENSGT00940000166239 ENSGT00940000158605 ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00990000204242 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000177141 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000157648 ENSGT00940000155492.a.a ENSGT01060000248588.a.d.b ENSGT00940000161966 ENSGT00510000046760.a.bb ENSGT00940000154175 ENSGT00950000182901 ENSGT00550000074863 ENSGT00390000016675 ENSGT01100000263475.g.b.i.b.b.a.a ENSGT00940000174850 ENSGT00390000000378.d.a.o.a ENSGT00940000164330 ENSGT00390000017203 ENSGT00940000157434 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000177141 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT01100000263497.D ENSGT00940000157181 Fugu MODERN SPECIES 6 arhgap42a (ENSTRUG00000017091) ENSTRUG00000017086 ANGPTL5 (ENSTRUG00000017085) YAP1 (ENSTRUG00000025525) birc2 (ENSTRUG00000017077) rpl23a (ENSTRUG00000017075) ddx52 (ENSTRUG00000017071) heatr6 (ENSTRUG00000017066) ENSTRUG00000017063 ENSTRUG00000023105 DYNLL2 (ENSTRUG00000026915) ENSTRUG00000017062 ENSTRUG00000017058 pigs (ENSTRUG00000017055) cryaba (ENSTRUG00000017054) DIXDC1 (ENSTRUG00000017048) ##22 dlat (ENSTRUG00000017045) zgc:165604 (ENSTRUG00000023665) PCNX3 (ENSTRUG00000017037) ENSTRUG00000029346 NRXN2 (ENSTRUG00000017032) pygma (ENSTRUG00000017024) slc22a6l (ENSTRUG00000017018) nrg2a (ENSTRUG00000017016) puraa (ENSTRUG00000017015) zgc:100829 (ENSTRUG00000028340) CXXC5 (ENSTRUG00000017014) ppp3ca (ENSTRUG00000017009) dnajc18 (ENSTRUG00000020734) tmem45b (ENSTRUG00000016999) nfrkb (ENSTRUG00000016994) Tetraodon MODERN SPECIES 22 bud13 (ENSTNIG00000009983) snrnp35 (ENSTNIG00000009984) arhgap42a (ENSTNIG00000009985) ENSTNIG00000009986 ANGPTL5 (ENSTNIG00000009987) YAP1 (ENSTNIG00000009988) birc2 (ENSTNIG00000009989) ddx52 (ENSTNIG00000009990) heatr6 (ENSTNIG00000009991) ENSTNIG00000009992 ENSTNIG00000009993 pigs (ENSTNIG00000009994) cryaba (ENSTNIG00000009995) ENSTNIG00000009996 ENSTNIG00000009997 DIXDC1 (ENSTNIG00000009998) ##22 dlat (ENSTNIG00000009999) zgc:165604 (ENSTNIG00000000565) PCNX3 (ENSTNIG00000010000) nrxn2a (ENSTNIG00000010001) pygma (ENSTNIG00000010002) slc22a6l (ENSTNIG00000010003) nrg2a (ENSTNIG00000010004) puraa (ENSTNIG00000010005) zgc:100829 (ENSTNIG00000001289) ppp3ca (ENSTNIG00000010006) dnajc18 (ENSTNIG00000010007) gng8 (ENSTNIG00000010008) tmem45b (ENSTNIG00000010009) nfrkb (ENSTNIG00000010010) ENSTNIG00000010011 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000014500 ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000159682 ENSGT00940000165141.b ENSGT00940000166239 ENSGT00940000158605 ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00990000204242 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000177141 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D Ballan wrasse MODERN SPECIES 56 DIXDC1 (ENSLBEG00000005295) ##22 dlat (ENSLBEG00000005229) zgc:165604 (ENSLBEG00000005205) PCNX3 (ENSLBEG00000005127) ENSLBEG00000005079 NRXN2 (ENSLBEG00000005003) pygma (ENSLBEG00000004920) slc22a6l (ENSLBEG00000004881) nrg2a (ENSLBEG00000004849) puraa (ENSLBEG00000004827) zgc:100829 (ENSLBEG00000004807) CXXC5 (ENSLBEG00000004788) ppp3ca (ENSLBEG00000004713) dnajc18 (ENSLBEG00000004648) ENSLBEG00000004623 gng8 (ENSLBEG00000004601) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000014500 ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000159682 ENSGT00940000165141.b ENSGT00940000166239 ENSGT00940000158605 ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00990000204242 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000177141 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155492.a.a ENSGT00940000157648 ENSGT00390000014500 ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000159682 ENSGT00940000158605 ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00990000204242 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000177141 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155492.a.a ENSGT00940000157648 ENSGT00390000014500 ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000159682 ENSGT00940000158605 ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00940000162446 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000177141 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D European seabass MODERN SPECIES 4 ENSDLAG00005009225 ENSDLAG00005009205 ENSDLAG00005009195 ENSDLAG00005031565 ENSDLAG00005030324 ENSDLAG00005008709 ENSDLAG00005009121 ENSDLAG00005030600 ENSDLAG00005008491 ENSDLAG00005008476 ENSDLAG00005027713 ENSDLAG00005008429 ENSDLAG00005008428 CRYAB (ENSDLAG00005008399) 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CXXC5 (ENSSAUG00010008849) ppp3ca (ENSSAUG00010002652) dnajc18 (ENSSAUG00010002534) ENSSAUG00010002476 gng8 (ENSSAUG00010002463) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000155492.a.a ENSGT00940000157648 ENSGT00390000014500 ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000159682 ENSGT00940000165141.b ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00990000204242 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000177141 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01060000248588.a.d.b ENSGT00940000155492.a.a ENSGT00940000157648 ENSGT00390000014500 ENSGT00390000012429 ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00940000159682 ENSGT00940000165141.b ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00940000157434 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943 ENSGT00940000156392.b ENSGT00940000158735 ENSGT00940000155978.a.b ENSGT00950000183148.b.a.g.b ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D ENSGT00940000157181 Lumpfish MODERN SPECIES 5 ENSCLMG00005007033 arhgap42a (ENSCLMG00005005614) snrnp35 (ENSCLMG00005005595) bud13 (ENSCLMG00005005593) ENSCLMG00005005591 ENSCLMG00005005580 chek1 (ENSCLMG00005005568) ENSCLMG00005002522 ENSCLMG00005002482 alg9 (ENSCLMG00005001814) fdxacb1 (ENSCLMG00005001785) TOMM40L (ENSCLMG00005001779) bicdl2 (ENSCLMG00005001770) mia (ENSCLMG00005001768) 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ENSGT00940000154901.C.b ENSGT00940000158778.c ENSGT00950000183162.a.a.c ENSGT00940000157357.e.a ENSGT00940000154108.a.d ENSGT00940000165110.a ENSGT00940000166356 ENSGT00530000064262.pc.a ENSGT01100000263497.D Pike perch MODERN SPECIES 37 arhgap42a (ENSSLUG00000011066) snrnp35 (ENSSLUG00000011021) bud13 (ENSSLUG00000011018) ENSSLUG00000011012 nectin1a (ENSSLUG00000010993) chek1 (ENSSLUG00000010954) ENSSLUG00000010909 alg9 (ENSSLUG00000010777) fdxacb1 (ENSSLUG00000010765) TOMM40L (ENSSLUG00000010732) bicdl2 (ENSSLUG00000010719) mia (ENSSLUG00000010709) CRYAB (ENSSLUG00000010703) ENSSLUG00000010693 ENSSLUG00000010685 DIXDC1 (ENSSLUG00000010673) ##22 dlat (ENSSLUG00000010371) zgc:165604 (ENSSLUG00000010352) PCNX3 (ENSSLUG00000010106) ENSSLUG00000010050 NRXN2 (ENSSLUG00000009489) pygma (ENSSLUG00000009089) slc22a6l (ENSSLUG00000008998) nrg2a (ENSSLUG00000008791) puraa (ENSSLUG00000008766) zgc:100829 (ENSSLUG00000008759) CXXC5 (ENSSLUG00000008753) ppp3ca (ENSSLUG00000006024) dnajc18 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SPECIES 74 ENSGT00940000158694.b ENSGT00940000154175.e.b ENSGT00940000162143 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000159828.a ENSGT00390000014500 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT01060000251030 ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00940000160701 ENSGT00940000161288 ENSGT00940000160797 ENSGT00990000213477 ENSGT00390000003308.b ENSGT00390000008196 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943.eb.a ENSGT00940000159682 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00950000182901 ENSGT00940000154175.e.b ENSGT00940000162143 ENSGT00940000154936.d ENSGT00940000161227 ENSGT00390000014500 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT01060000251030 ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00940000160701 ENSGT00940000161288 ENSGT00940000160797 ENSGT00990000213477 ENSGT00390000003308.b ENSGT00390000008196 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943.eb.a ENSGT00940000159682 Rainbow trout MODERN SPECIES 364 c1qa (ENSOMYG00000062170) ENSOMYG00000068650 ENSOMYG00000067899 ENSOMYG00000022901 ENSOMYG00000062557 bud13 (ENSOMYG00000022913) ENSOMYG00000052902 ENSOMYG00000053302 ENSOMYG00000066701 ENSOMYG00000051849 ENSOMYG00000076663 ENSOMYG00000058010 crfb12 (ENSOMYG00000068068) ENSOMYG00000059204 ENSOMYG00000064437 ENSOMYG00000059754 ##22 ENSOMYG00000053744 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 151 ENSGT00950000182987.c.a.b.a ENSGT00940000160082.a.b ENSGT00940000154175.e.b ENSGT00940000162143 ENSGT00940000154936.d ENSGT00940000161227 ENSGT00390000014500 ENSGT00950000182952.A.a ENSGT00390000001844.a.b.a.a ENSGT00940000160701 ENSGT00940000161288 ENSGT00940000160797 ENSGT00990000213477 ENSGT00390000003308.b ENSGT00390000008196 ENSGT00950000182903.b.b.o.b ##22 ENSGT00940000154943.eb.a ENSGT00940000159682 Coho salmon MODERN SPECIES 21 aldocb (ENSOKIG00005028065) ENSOKIG00005028133 birc2 (ENSOKIG00005028163) ENSOKIG00005028387 ENSOKIG00005028396 ENSOKIG00005028421 bud13 (ENSOKIG00005028485) btg4 (ENSOKIG00005028510) ENSOKIG00005028518 ENSOKIG00005028529 hspb2 (ENSOKIG00005028541) bicdl2 (ENSOKIG00005028553) 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DIXDC1 (ENSSTUG00000022234) ##22 dlat (ENSSTUG00000022267) chek1 (ENSSTUG00000022460) Northern pike MODERN SPECIES 6 c1qc (ENSELUG00000011428) C1QB (ENSELUG00000011414) bud13 (ENSELUG00000011399) btg4 (ENSELUG00000000405) hoatz (ENSELUG00000011334) ENSELUG00000011321 alg9 (ENSELUG00000011298) fdxacb1 (ENSELUG00000011250) ufc1 (ENSELUG00000027671) TOMM40L (ENSELUG00000011180) ENSELUG00000030818 bicdl2 (ENSELUG00000002659) mia (ENSELUG00000002698) ENSELUG00000029064 hspb2 (ENSELUG00000002784) ENSELUG00000002962 ##22 dlat (ENSELUG00000003101) ENSELUG00000003278 ENSELUG00000003430 ENSELUG00000019432 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00390000001844.a.b.a.b ENSGT00940000156445 ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00940000163496.b.a ENSGT00390000008196 ENSGT00390000003308.b ENSGT00390000012668.h ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434 ENSGT00940000161288 ENSGT00740000117097 ENSGT00950000182903.b.b.p 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ENSGT00940000162143 ENSGT00950000183204.a.a.a.a ENSGT00950000183204.a.a.a.b Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000001844.a.b.a.b ENSGT00940000156445.o.a ENSGT00950000183066.a.a.b ENSGT00950000183090.D ENSGT00940000160701 ENSGT00940000163496.b.a ENSGT00390000008196 ENSGT00390000003308.b ENSGT00390000012668.h ENSGT00940000160797 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.b ENSGT00390000002905 ENSGT00940000157434.d ENSGT00940000161288 ENSGT00740000117097 ENSGT00950000182903.b.b.p ##22 ENSGT00940000159682 ENSGT00940000168885 ENSGT01100000263551.b.b.a ENSGT00940000156933.d.b ENSGT00390000012429 ENSGT00390000014500 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000162143 ENSGT00950000183204.a.a.a.a ENSGT00950000183204.a.a.a.b ENSGT00940000155492.a.a ENSGT00940000161966 ENSGT00510000047559 ENSGT00940000154175 Atlantic herring MODERN SPECIES 24 ENSCHAG00000002992 hoatz (ENSCHAG00000002967) LAYN (ENSCHAG00000002945) ppp2r1bb (ENSCHAG00000001788) alg9 (ENSCHAG00000001114) fdxacb1 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ENSDCDG00000014252 bicdl2 (ENSDCDG00000014238) mia (ENSDCDG00000014224) ENSDCDG00000014219 DIXDC1 (ENSDCDG00000014193) ##22 ENSDCDG00000014174 elmod1 (ENSDCDG00000014154) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000154943 ENSGT00390000016427 ENSGT01080000257365.b.a.a.a ENSGT00940000157670 ENSGT00940000158478 ENSGT00940000157705 ENSGT00940000154616.a.a ENSGT00940000155743.b ENSGT00940000156093.e.a ENSGT00550000075101 ENSGT00390000008673 ENSGT00940000154313.c.a ENSGT00940000155900.i ENSGT00940000156937.a.a ENSGT00390000012719.a.a.b ENSGT00950000182903.b.b.p ##22 ENSGT00550000074980 ENSGT00390000012905.d ENSGT00930000151482 ENSGT00550000075050 ENSGT00390000014835 ENSGT01100000263497.D ENSGT00940000157181 ENSGT00390000016213 ENSGT00940000164481.b.b.g ENSGT00940000163093.b ENSGT00390000004396.g ENSGT00870000136506 ENSGT00940000156709.d ENSGT01100000263476.D ENSGT00550000075103 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000016427 ENSGT01080000257365.b.a.a.a ENSGT00390000005702 ENSGT00940000157670 ENSGT00940000158478 ENSGT00940000157705 ENSGT00940000154616.a.a ENSGT00940000155743.b ENSGT00940000156093.e.a ENSGT00550000075101 ENSGT00390000008673 ENSGT00940000154313.c.a ENSGT00940000155900.i ENSGT00940000156937.a.a ENSGT00390000012719.a.a.b ENSGT00950000182903.b.b.p ##22 ENSGT00550000074980.g ENSGT00390000012905.d ENSGT00930000151482 ENSGT00550000075050 ENSGT00390000014835 ENSGT01100000263497.D ENSGT00940000157181 ENSGT00390000016213 ENSGT00940000164481.b.b.g ENSGT00940000163093.b.i.a ENSGT00940000163093.b.i.b.b ENSGT00940000163093.b.i.b.a ENSGT00390000004396.g ENSGT00870000136506 ENSGT00940000156709.d.c Channel catfish MODERN SPECIES 9 dlat (ENSIPUG00000000824) ZW10 (ENSIPUG00000000809) usp28 (ENSIPUG00000000801) HTR3B (ENSIPUG00000000785) HTR3A (ENSIPUG00000000773) zbtb16 (ENSIPUG00000000764) ncam1a (ENSIPUG00000000732) cadm1a (ENSIPUG00000024826) sc5d (ENSIPUG00000024820) anapc13 (ENSIPUG00000024817) ARHGAP32 (ENSIPUG00000024807) IGSF9B (ENSIPUG00000024798) jam3b (ENSIPUG00000024793) ENSIPUG00000024792 zgc:171740 (ENSIPUG00000024789) DIXDC1 (ENSIPUG00000024784) ##22 ddx10 (ENSIPUG00000024738) ENSIPUG00000024735 si:dkey-183i3.5 (ENSIPUG00000024734) rfc2 (ENSIPUG00000024732) sycn (ENSIPUG00000024731) gng8 (ENSIPUG00000024729) tmem45b (ENSIPUG00000024728) Nfrkb (ENSIPUG00000024727) st14b (ENSIPUG00000024720) ENSIPUG00000024716 ENSIPUG00000024712 ENSIPUG00000024702 ENSIPUG00000024701 ENSIPUG00000024700 ENSIPUG00000024698 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000016427 ENSGT01080000257365.b.a.a.a ENSGT00390000005702 ENSGT00940000157670 ENSGT00940000158478 ENSGT00940000157705 ENSGT00940000154616.a.a ENSGT00940000155743.b ENSGT00940000156093.e.a ENSGT00550000075101 ENSGT00390000008673 ENSGT00940000154313.c.a ENSGT00940000155900.i ENSGT00940000156937.a.a ENSGT00390000012719.a.a.b ENSGT00950000182903.b.b.p ##22 ENSGT00550000074980.g ENSGT00390000012905.d ENSGT00930000151482 ENSGT00550000075050 ENSGT00390000014835 ENSGT01100000263497.D ENSGT00940000157181 ENSGT00390000016213 ENSGT00940000164481.b.b.g ENSGT00940000163093.b.i.a ENSGT00940000163093.b.i.b.a ENSGT00390000004396.g ENSGT00870000136506 ENSGT00940000156709.d.c ENSGT01100000263476.D Characoidei ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000154943 ENSGT00390000016427 ENSGT01080000257365.b.a.a.a ENSGT00940000157670 ENSGT00940000158478 ENSGT00940000157705 ENSGT00940000154616.a.a ENSGT00940000155743.b ENSGT00940000156093.e.a ENSGT00550000075101 ENSGT00390000008673 ENSGT00940000154313.c.a ENSGT00940000155900.i ENSGT00940000156937.a.a ENSGT00390000012719.a.a.b ENSGT00950000182903.b.b.p ##22 ENSGT00550000074980.g ENSGT00940000169096 ENSGT00930000151482 ENSGT00550000075050 ENSGT00390000014835 ENSGT01100000263497.D ENSGT00940000157181 ENSGT00390000016213 ENSGT00940000164481.b.b.g ENSGT00940000163093.b.i.a ENSGT00940000163093.b.i.b.b ENSGT00940000163093.b.i.b.a ENSGT00390000004396.g ENSGT00870000136506 ENSGT00940000156709.d.c Red-bellied piranha MODERN SPECIES 57 cadm1a 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(ENSLOCG00000001229) LAYN (ENSLOCG00000001248) SIK2 (ENSLOCG00000001288) ppp2r1bb (ENSLOCG00000001319) alg9 (ENSLOCG00000001352) fdxacb1 (ENSLOCG00000001403) mia (ENSLOCG00000001418) cfap68 (ENSLOCG00000001435) cryabb (ENSLOCG00000001451) hspb2 (ENSLOCG00000001463) dixdc1a (ENSLOCG00000001475) ##22 dlat (ENSLOCG00000001499) pih1d2 (ENSLOCG00000001526) nkapd1 (ENSLOCG00000001540) gig2p (ENSLOCG00000017859) ubash3bb (ENSLOCG00000001560) ENSLOCG00000001595 sb:cb37 (ENSLOCG00000001610) ENSLOCG00000001706 tbcela (ENSLOCG00000001752) TECTA (ENSLOCG00000001765) SIK3 (ENSLOCG00000001801) pafah1b2 (ENSLOCG00000001838) SIDT2 (ENSLOCG00000001852) bicdl2 (ENSLOCG00000001903) ENSLOCG00000001926 Reedfish MODERN SPECIES 17 ppp2r1bb (ENSECRG00000014580) sik2a (ENSECRG00000014520) LAYN (ENSECRG00000014462) hoatz (ENSECRG00000014422) btg4 (ENSECRG00000014395) ENSECRG00000014373 bicdl2 (ENSECRG00000014335) ENSECRG00000014299 ENSECRG00000014269 ufc1 (ENSECRG00000014232) SORL1 (ENSECRG00000013876) ubash3bb 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ENSCSAVG00000004385 ##22 ENSCSAVG00000004369 ENSCSAVG00000004350 ENSCSAVG00000004343 ENSCSAVG00000004342 ENSCSAVG00000004338 ENSCSAVG00000004330 ENSCSAVG00000004324 ENSCSAVG00000004321 ENSCSAVG00000004320 ENSCSAVG00000004318 ENSCSAVG00000004316 ENSCSAVG00000004315 ENSCSAVG00000004309 ENSCSAVG00000004300 ENSCSAVG00000004291 Ciona intestinalis MODERN SPECIES 117 ENSCING00000000963 ENSCING00000014433 ENSCING00000023532 ENSCING00000019850 ENSCING00000018554 ENSCING00000014428 ENSCING00000019525 ENSCING00000009366 ##22 ENSCING00000024292 ENSCING00000014429 tcfl1 (ENSCING00000014430) ENSCING00000009365 ENSCING00000008205 ENSCING00000023235 ENSCING00000014422 ENSCING00000009369 ENSCING00000017933 ENSCING00000009373 ENSCING00000009372 ENSCING00000009371 ENSCING00000016825 ENSCING00000020030 ENSCING00000022773 Ecdysozoa ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182903 #22 Caenorhabditis elegans DUPLICATION Caenorhabditis elegans DUPLICATION Caenorhabditis elegans MODERN SPECIES 1 vhp-1 (WBGene00006923) gcy-12 (WBGene00001538) ZK622.1 (WBGene00022780) ZK622.4 (WBGene00022782) ZK622.5 (WBGene00044667) gur-5 (WBGene00001806) pmt-1 (WBGene00022781) drn-1 (WBGene00016911) frpr-4 (WBGene00016909) ptr-6 (WBGene00004221) T16D1.1 (WBGene00020539) pho-4 (WBGene00004023) pho-1 (WBGene00004020) EGAP2.1 (WBGene00017147) EGAP2.2 (WBGene00017148) dsh-1 (WBGene00001101) #22 C34F11.1 (WBGene00016413) C34F11.2 (WBGene00016414) C34F11.8 (WBGene00016417) ampd-1 (WBGene00016415) msp-50 (WBGene00003443) C34F11.5 (WBGene00016416) msp-49 (WBGene00003442) crh-2 (WBGene00016162) C27D6.12 (WBGene00044389) C27D6.3 (WBGene00016161) C27D6.1 (WBGene00016160) C27D6.15 (WBGene00303362) srb-1 (WBGene00005066) srb-3 (WBGene00005068) srb-5 (WBGene00005070) Caenorhabditis elegans MODERN SPECIES 1 lgc-56 (WBGene00001588) F09C12.6 (WBGene00017278) msp-74 (WBGene00003462) F09C12.8 (WBGene00017279) F09C12.2 (WBGene00017277) mpk-2 (WBGene00003402) C04G6.11 (WBGene00015459) C04G6.10 (WBGene00015458) C04G6.7 (WBGene00015457) C04G6.6 (WBGene00015456) C04G6.13 (WBGene00077489) C04G6.2 (WBGene00015453) txt-9 (WBGene00015455) pld-1 (WBGene00004040) C04G6.4 (WBGene00015454) dsh-2 (WBGene00001102) #22 C27A2.7 (WBGene00044386) C27A2.5 (WBGene00016153) C27A2.8 (WBGene00044387) smc-5 (WBGene00016151) pho-12 (WBGene00016152) C27A2.12 (WBGene00206373) rpl-22 (WBGene00004434) ify-1 (WBGene00002068) F33G12.6 (WBGene00018018) F33G12.7 (WBGene00044666) golg-2 (WBGene00018017) lrr-1 (WBGene00018016) F33G12.3 (WBGene00018015) wdr-83 (WBGene00018014) F59A6.13 (WBGene00303064) Caenorhabditis elegans MODERN SPECIES 1 F35C11.2 (WBGene00009401) nlp-5 (WBGene00003743) M110.7 (WBGene00010915) M110.9 (WBGene00010917) dab-1 (WBGene00000894) ifg-1 (WBGene00002066) M110.3 (WBGene00010913) M110.10 (WBGene00195142) twk-3 (WBGene00006658) M110.8 (WBGene00010916) col-76 (WBGene00000652) qua-1 (WBGene00004264) T05C12.9 (WBGene00011472) T05C12.8 (WBGene00011471) cct-1 (WBGene00000377) mig-5 (WBGene00003241) #22 dylt-3 (WBGene00011469) T05C12.4 (WBGene00011468) acr-14 (WBGene00000053) T05C12.1 (WBGene00011466) decr-1.3 (WBGene00011467) T05C12.15 (WBGene00219289) T05C12.11 (WBGene00011473) rrf-3 (WBGene00004510) emb-27 (WBGene00001281) pch-2 (WBGene00008641) tmem-138 (WBGene00008643) tub-1 (WBGene00006655) F10B5.3 (WBGene00008640) F10B5.2 (WBGene00008639) rpl-10 (WBGene00004421) Fruitfly MODERN SPECIES 26 CG15200 (FBgn0030278) CG11106 (FBgn0030280) CG44422 (FBgn0265595) CG15198 (FBgn0030283) Ir10a (FBgn0083979) sisA (FBgn0003411) l(1)10Bb (FBgn0001491) Gapvd1 (FBgn0030286) Kap3 (FBgn0028421) CG34348 (FBgn0085377) GCS1 (FBgn0030289) CG11756 (FBgn0030290) CG1738 (FBgn0030291) CG11752 (FBgn0030292) CG1737 (FBgn0030293) dsh (FBgn0000499) #22 Pa1 (FBgn0287454) hop (FBgn0004864) Tim8 (FBgn0027359) dlg1 (FBgn0001624) CG15196 (FBgn0030296) Gr10b (FBgn0030297) Or10a (FBgn0030298) Gr10a (FBgn0045502) Gs2 (FBgn0001145) Evi5 (FBgn0262740) Sk1 (FBgn0030300) HP5 (FBgn0030301) CG43155 (FBgn0262685) Cyp4g15 (FBgn0030304) Uba5 (FBgn0030305)