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Euteleosteomorpha	DUPLICATION
Euteleosteomorpha	DUPLICATION
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	153	ENSGT00390000012446	ENSGT01020000230587	ENSGT00390000007295	ENSGT00680000100065	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091 #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00940000167133	ENSGT00940000160544	ENSGT01090000259987.a.a.a.p	ENSGT00940000155992.c.a #13	ENSGT00530000063273.b.a.a	ENSGT00940000178952	ENSGT00720000108822 #12	ENSGT00940000153969.b #11	ENSGT00940000165503 #10	ENSGT00940000166532 #9	ENSGT00940000157440.m.a #8
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	88	ENSGT00390000012446	ENSGT00390000007295	ENSGT00390000017045	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091 #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000158542.b #29	ENSGT00940000159765 #30	ENSGT00940000155675.p.a #31	ENSGT00940000156186.l.b #32	ENSGT00940000165273 #33	ENSGT00940000165235.b #34	ENSGT00950000183184.a.a.a #35	ENSGT00940000154360.A.b.a #36	ENSGT00940000162768.B.a #37
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000012446	ENSGT00390000007295	ENSGT00390000017045	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091 #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000158542.b #29	ENSGT00710000108330	ENSGT00940000159765 #30	ENSGT00940000155675.p.a #31	ENSGT00940000156186.l.b #32	ENSGT00940000165273 #33	ENSGT00940000165235.b #34	ENSGT00950000183184.a.a.a #35	ENSGT00940000154360.A.b.a #36
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091 #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000158542.b #29	ENSGT00710000108330	ENSGT00940000159765 #30	ENSGT00940000155675.p.a #31	ENSGT00940000156186.l.b #32	ENSGT00940000165273 #33	ENSGT00940000165235.b #34	ENSGT00950000183184.a.a.a #35	ENSGT00940000154360.A.b.a #36
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091 #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000158542.b #29	ENSGT00710000108330	ENSGT00940000159765 #30	ENSGT00940000155675.p.a #31	ENSGT00940000156186.l.b #32	ENSGT00940000165273 #33	ENSGT00940000165235.b #34	ENSGT00940000177805	ENSGT00950000183184.a.a.a #35
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091.h #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000158542.b #29	ENSGT00710000108330	ENSGT00940000159765 #30	ENSGT00940000155675.p.a #31	ENSGT00940000156186.l.b #32	ENSGT00940000165273 #33	ENSGT00940000165235.b #34	ENSGT00940000177805	ENSGT00950000183184.a.a.a #35
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091.h #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000158542.b #29	ENSGT00710000108330	ENSGT00940000159765 #30	ENSGT00940000155675.p.a #31	ENSGT00940000156186.l.b #32	ENSGT00940000165273 #33	ENSGT00940000165235.b #34	ENSGT00940000177805	ENSGT00950000183184.a.a.a #35
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091.h #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000158542.b #29	ENSGT00710000108330	ENSGT00940000159765 #30	ENSGT00940000155675.p.a #31	ENSGT00940000156186.l.b #32	ENSGT00940000165273 #33	ENSGT00940000165235.b #34	ENSGT00940000177805	ENSGT00950000183184.a.a.a #35
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091.h #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000158542.b #29	ENSGT00940000159765 #30	ENSGT00940000155675.p.a #31	ENSGT00940000156186.l.b #32	ENSGT00940000165273 #33	ENSGT00940000165235.b #34	ENSGT00940000177805	ENSGT00950000183184.a.a.a #35	ENSGT00940000154360.A.b.a #36
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091.h #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000158542.b #29	ENSGT00940000159765 #30	ENSGT00940000155675.p.a #31	ENSGT00940000156186.l.b #32	ENSGT00940000165273 #33	ENSGT00940000165235.b #34	ENSGT00940000177805	ENSGT00950000183184.a.a.a #35	ENSGT00940000154360.A.b.a #36
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091.h #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000158542.b #29	ENSGT00940000159765 #30	ENSGT00940000155675.p.a #31	ENSGT00940000156186.l.b #32	ENSGT00940000165273 #33	ENSGT00940000165235.b #34	ENSGT00950000183184.a.a.a #35	ENSGT00940000154360.A.b.a #36	ENSGT00940000162768.B.a #37
Large yellow croaker	MODERN SPECIES		ENSLCRG00005014720 #7	hdac4 (ENSLCRG00005013772) #8	twist2 (ENSLCRG00005013760) #9	ENSLCRG00005013759 #10	asb1 (ENSLCRG00005013758) #11	traf3ip1 (ENSLCRG00005013756) #12	ADARB1 (ENSLCRG00005013696) #13	ENSLCRG00005013693 #14	ENSLCRG00005013688 #15	ENSLCRG00005013687 #16	zgc:162396 (ENSLCRG00005013685) #17	zgc:162780 (ENSLCRG00005013684) #18	ENSLCRG00005013683 #19	ybey (ENSLCRG00005013682) #20	usp37 (ENSLCRG00005013676) #21	cnot9 (ENSLCRG00005013674) #22	PLCD4 (ENSLCRG00005013664) #23	ZNF142 (ENSLCRG00005013660) #24	bcs1l (ENSLCRG00005013659) #25	CYP27A1 (ENSLCRG00005013658) #26	TNS1 (ENSLCRG00005012097) #27	igfbp5b (ENSLCRG00005012082) #28	igfbp2b (ENSLCRG00005012081) #29	slc4a3 (ENSLCRG00005009948) #30	COL5A2 (ENSLCRG00005007993) #31	gulp1a (ENSLCRG00005007966) #32	ENSLCRG00005007962 #33	ENSLCRG00005007405 #34	ENSLCRG00005007392 #35	lrrc3 (ENSLCRG00005007390) #36	pcbp3 (ENSLCRG00005007381) #37
European seabass	MODERN SPECIES	5	ENSDLAG00005022435	osgepl1 (ENSDLAG00005022441)	adat3 (ENSDLAG00005022449)	ENSDLAG00005022445	ormdl1 (ENSDLAG00005027751)	pms1 (ENSDLAG00005022460)	mstnb (ENSDLAG00005022521)	ENSDLAG00005022536	hibch (ENSDLAG00005022541)	LSS (ENSDLAG00005022621)	ENSDLAG00005022735	ENSDLAG00005022739	ENSDLAG00005022744 #19	YBEY (ENSDLAG00005034841) #20	USP37 (ENSDLAG00005022800) #21	CNOT9 (ENSDLAG00005022857) #22	PLCD4 (ENSDLAG00005022885) #23	ZNF142 (ENSDLAG00005023256) #24	zgc:136333 (ENSDLAG00005023265) #26	TNS1 (ENSDLAG00005023305) #27	igfbp5b (ENSDLAG00005024114) #28	igfbp2b (ENSDLAG00005024118) #29	slc4a3 (ENSDLAG00005024195) #30	ENSDLAG00005024788 #31	gulp1a (ENSDLAG00005004339) #32	ENSDLAG00005033365 #33	ENSDLAG00005004586 #34	ENSDLAG00005005708 #35	lrrc3 (ENSDLAG00005031007) #36	pcbp3 (ENSDLAG00005005870) #37	ENSDLAG00005006140
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	23	ENSSAUG00010009144	ENSSAUG00010004954	fkbp7 (ENSSAUG00010004880)	osgepl1 (ENSSAUG00010004873)	alkbh6 (ENSSAUG00010004870)	adat3 (ENSSAUG00010004867)	ormdl1 (ENSSAUG00010004864)	pms1 (ENSSAUG00010004800)	mstnb (ENSSAUG00010004791)	ENSSAUG00010004790	hibch (ENSSAUG00010004770)	lss (ENSSAUG00010004683)	ENSSAUG00010004668 #19	ybey (ENSSAUG00010004664) #20	usp37 (ENSSAUG00010004648) #21	cnot9 (ENSSAUG00010004638) #22	PLCD4 (ENSSAUG00010004216) #23	ZNF142 (ENSSAUG00010004108) #24	bcs1l (ENSSAUG00010004068) #25	zgc:136333 (ENSSAUG00010015642) #26	TNS1 (ENSSAUG00010015615) #27	igfbp5b (ENSSAUG00010015605) #28	igfbp2b (ENSSAUG00010015599) #29	slc4a3 (ENSSAUG00010015089) #30	COL5A2 (ENSSAUG00010014375) #31	gulp1a (ENSSAUG00010014239) #32	ENSSAUG00010014232 #33	ENSSAUG00010014112 #34	ENSSAUG00010014107	FAM171B (ENSSAUG00010014104) #35	lrrc3 (ENSSAUG00010014103) #36
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091.h #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000158542.b #29	ENSGT00940000159765 #30	ENSGT00940000155675.p.a #31	ENSGT00940000156186.l.b #32	ENSGT00940000165273 #33	ENSGT00940000165235.b #34	ENSGT00950000183184.a.a.a #35	ENSGT00940000154360.A.b.a #36	ENSGT00940000162768.B.a #37
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091.h #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000158542.b #29	ENSGT00940000159765 #30	ENSGT00940000155675.p.a #31	ENSGT00940000156186.l.b #32	ENSGT00940000165273 #33	ENSGT00940000165235.b #34	ENSGT00950000183184.a.a.a #35	ENSGT00940000154360.A.b.a #36	ENSGT00940000162768.B.a #37
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	13	ENSCGOG00000021571	ENSCGOG00000021597	fkbp7 (ENSCGOG00000021818)	osgepl1 (ENSCGOG00000021820)	alkbh6 (ENSCGOG00000021822)	pms1 (ENSCGOG00000021826)	adat3 (ENSCGOG00000021904)	ormdl1 (ENSCGOG00000021905)	mstnb (ENSCGOG00000021916)	ENSCGOG00000021934	hibch (ENSCGOG00000021938)	lss (ENSCGOG00000021990)	ENSCGOG00000022398 #19	ybey (ENSCGOG00000022413) #20	usp37 (ENSCGOG00000022416) #21	cnot9 (ENSCGOG00000022431) #22	PLCD4 (ENSCGOG00000022467) #23	ZNF142 (ENSCGOG00000023002) #24	bcs1l (ENSCGOG00000023004) #25	zgc:136333 (ENSCGOG00000023008) #26	TNS1 (ENSCGOG00000023029) #27	igfbp5b (ENSCGOG00000023194) #28	igfbp2b (ENSCGOG00000023204) #29	slc4a3 (ENSCGOG00000023208) #30	COL5A2 (ENSCGOG00000023213) #31	gulp1a (ENSCGOG00000023238) #32	ENSCGOG00000023244	ENSCGOG00000023247 #33	ENSCGOG00000023279 #34	ENSCGOG00000023443 #35	lrrc3 (ENSCGOG00000012897) #36
Pike perch	MODERN SPECIES	191	ENSSLUG00000019736	ENSSLUG00000018646	fkbp7 (ENSSLUG00000018593)	osgepl1 (ENSSLUG00000018585)	alkbh6 (ENSSLUG00000018581)	adat3 (ENSSLUG00000018579)	ormdl1 (ENSSLUG00000018570)	pms1 (ENSSLUG00000018218)	mstnb (ENSSLUG00000018180)	ENSSLUG00000018175	hibch (ENSSLUG00000017666)	lss (ENSSLUG00000016140)	ENSSLUG00000015955 #19	ybey (ENSSLUG00000015934) #20	usp37 (ENSSLUG00000015895) #21	cnot9 (ENSSLUG00000015860) #22	PLCD4 (ENSSLUG00000015812) #23	ENSSLUG00000015766 #25	ENSSLUG00000015731 #23
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091.h #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000158542.b #29	ENSGT00940000159765 #30	ENSGT00940000155675.p.a #31	ENSGT00940000156186.l.b #32	ENSGT00940000165273 #33	ENSGT00940000165235.b #34
Stickleback	MODERN SPECIES	16	ENSGACG00000002673	ENSGACG00000002657	fkbp7 (ENSGACG00000002654)	osgepl1 (ENSGACG00000002648)	alkbh6 (ENSGACG00000002647)	adat3 (ENSGACG00000002645)	ormdl1 (ENSGACG00000002642)	pms1 (ENSGACG00000002634)	mstnb (ENSGACG00000002630)	ENSGACG00000002627	hibch (ENSGACG00000002609)	lss (ENSGACG00000002592)	ENSGACG00000002570 #19	ybey (ENSGACG00000002567) #20	usp37 (ENSGACG00000002557) #21	cnot9 (ENSGACG00000002543) #22	PLCD4 (ENSGACG00000002540) #23	ZNF142 (ENSGACG00000002534) #24	zgc:136333 (ENSGACG00000002514) #26	TNS1 (ENSGACG00000002511) #27	igfbp5b (ENSGACG00000002508) #28	igfbp2b (ENSGACG00000002506) #29	slc4a3 (ENSGACG00000002501) #30	COL5A2 (ENSGACG00000002409) #31	gulp1a (ENSGACG00000002401) #32	ENSGACG00000002393 #33	ENSGACG00000002387 #34	gjc4b (ENSGACG00000002384)	CXCR2 (ENSGACG00000002380)	faima (ENSGACG00000002376)	ENSGACG00000002367
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Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091.h #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000158542.b #29	ENSGT00710000108330	ENSGT00940000159765 #30	ENSGT00940000155675.p.a #31	ENSGT00940000156186.l.b #32	ENSGT00940000165273 #33	ENSGT00940000165235.b #34	ENSGT00940000177805	ENSGT00950000183184.a.a.a #35
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Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	11	ENSBSLG00000011038	ENSBSLG00000011023	ENSBSLG00000011010	osgepl1 (ENSBSLG00000010975)	adat3 (ENSBSLG00000010966)	ormdl1 (ENSBSLG00000010956)	pms1 (ENSBSLG00000010729)	mstnb (ENSBSLG00000010624)	ENSBSLG00000010463	ENSBSLG00000010461	hibch (ENSBSLG00000009802)	lss (ENSBSLG00000009140)	ENSBSLG00000008957 #19	ybey (ENSBSLG00000008603) #20	usp37 (ENSBSLG00000007926) #21	cnot9 (ENSBSLG00000007738) #22	PLCD4 (ENSBSLG00000006962) #23	maip1 (ENSBSLG00000006940)	maip1 (ENSBSLG00000006922)	maip1 (ENSBSLG00000006900)	tyw5 (ENSBSLG00000006858)	ENSBSLG00000006848	ENSBSLG00000006516	RAB17 (ENSBSLG00000006286)	MLPH (ENSBSLG00000005933)	ENSBSLG00000005925	COL6A3 (ENSBSLG00000005154)	cops8 (ENSBSLG00000004929)	ENSBSLG00000004877	ENSBSLG00000026090	ENSBSLG00000025939
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Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091.h #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000158542.b #29	ENSGT00710000108330	ENSGT00940000159765 #30	ENSGT00940000155675.p.a #31	ENSGT00940000156186.l.b #32	ENSGT00940000165273 #33	ENSGT00940000165235.b #34	ENSGT00940000177805	ENSGT00950000183184.a.a.a #35
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Tongue sole	MODERN SPECIES	7	ENSCSEG00000016444	fkbp7 (ENSCSEG00000016425)	ENSCSEG00000016419	osgepl1 (ENSCSEG00000016416)	alkbh6 (ENSCSEG00000016413)	adat3 (ENSCSEG00000016408)	ormdl1 (ENSCSEG00000016404)	ENSCSEG00000016396	ENSCSEG00000016375	ENSCSEG00000016370	hibch (ENSCSEG00000016344)	lss (ENSCSEG00000016324)	ENSCSEG00000016295 #19	ybey (ENSCSEG00000016288) #20	usp37 (ENSCSEG00000016207) #21	cnot9 (ENSCSEG00000016169) #22	PLCD4 (ENSCSEG00000016126) #23	ENSCSEG00000016104 #24	ENSCSEG00000016097	ENSCSEG00000016080 #27	ENSCSEG00000016040 #27	ENSCSEG00000016032 ##16	itgav (ENSCSEG00000016012)	ENSCSEG00000016007	MYLK (ENSCSEG00000015990)	ENSCSEG00000015955	ENSCSEG00000015947	ENSCSEG00000015911	ENSCSEG00000015805	ENSCSEG00000015785	ENSCSEG00000015779
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Seriola	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091.h #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000158542.b #29	ENSGT00710000108330	ENSGT00940000159765 #30	ENSGT00940000155675.p.a #31	ENSGT00940000156186.l.b #32	ENSGT00940000165273 #33	ENSGT00940000165235.b #34	ENSGT00940000177805	ENSGT00950000183184.a.a.a #35
Greater amberjack	MODERN SPECIES	21	ENSSDUG00000007339	ENSSDUG00000007349	fkbp7 (ENSSDUG00000007385)	osgepl1 (ENSSDUG00000007391)	alkbh6 (ENSSDUG00000007406)	adat3 (ENSSDUG00000007414)	ormdl1 (ENSSDUG00000007421)	pms1 (ENSSDUG00000007435)	mstnb (ENSSDUG00000007459)	ENSSDUG00000007475	hibch (ENSSDUG00000007481)	lss (ENSSDUG00000007508)	MCM3AP (ENSSDUG00000007571) #19	ybey (ENSSDUG00000007610) #20	usp37 (ENSSDUG00000007623) #21	cnot9 (ENSSDUG00000007667) #22	PLCD4 (ENSSDUG00000007711) #23	ZNF142 (ENSSDUG00000007730) #24	bcs1l (ENSSDUG00000007742) #25	zgc:136333 (ENSSDUG00000007765) #26	TNS1 (ENSSDUG00000007852) #27	igfbp5b (ENSSDUG00000007969) #28	igfbp2b (ENSSDUG00000007987) #29	ENSSDUG00000007994	slc4a3 (ENSSDUG00000008026) #30	COL5A2 (ENSSDUG00000008163) #31	gulp1a (ENSSDUG00000008263) #32	ENSSDUG00000008428 #33	ENSSDUG00000008445 #34	ENSSDUG00000008481	lrrc3 (ENSSDUG00000008494) #36
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3051	ENSSLDG00000015021	ENSSLDG00000015084	fkbp7 (ENSSLDG00000015200)	osgepl1 (ENSSLDG00000015220)	alkbh6 (ENSSLDG00000015256)	adat3 (ENSSLDG00000015266)	ormdl1 (ENSSLDG00000015274)	pms1 (ENSSLDG00000015291)	mstnb (ENSSLDG00000015315)	ENSSLDG00000015326	hibch (ENSSLDG00000015336)	lss (ENSSLDG00000015382)	MCM3AP (ENSSLDG00000016147) #19	ybey (ENSSLDG00000019474) #20	usp37 (ENSSLDG00000019488) #21	cnot9 (ENSSLDG00000019516) #22	PLCD4 (ENSSLDG00000019540) #23	ZNF142 (ENSSLDG00000019564) #24	bcs1l (ENSSLDG00000019606) #25	zgc:136333 (ENSSLDG00000019620) #26	TNS1 (ENSSLDG00000019664) #27	ENSSLDG00000019911	igfbp5b (ENSSLDG00000019917) #28	igfbp2b (ENSSLDG00000019928) #29	slc4a3 (ENSSLDG00000019942) #30	ENSSLDG00000019989	gulp1a (ENSSLDG00000020054) #32	ENSSLDG00000020075 #33	ENSSLDG00000020088 #34	ENSSLDG00000020135	ENSSLDG00000020139 #35
Barramundi perch	DUPLICATION
Barramundi perch	MODERN SPECIES	216	ENSLCAG00010001401	ENSLCAG00010000783	ENSLCAG00010000380	osgepl1 (ENSLCAG00010000367)	alkbh6 (ENSLCAG00010000357)	adat3 (ENSLCAG00010000350)	ormdl1 (ENSLCAG00010000333)	pms1 (ENSLCAG00010000283)	mstnb (ENSLCAG00010022821)	ENSLCAG00010022812	hibch (ENSLCAG00010022801)	lss (ENSLCAG00010022762)	ENSLCAG00010022745 #19	ybey (ENSLCAG00010022743) #20	usp37 (ENSLCAG00010022741) #21	cnot9 (ENSLCAG00010022735) #22	PLCD4 (ENSLCAG00010022517) #23	ENSLCAG00010022468 #24	ENSLCAG00010022467 #24	bcs1l (ENSLCAG00010022465) #25	zgc:136333 (ENSLCAG00010022461) #26	TNS1 (ENSLCAG00010022355) #27	igfbp5b (ENSLCAG00010022316) #28	igfbp2b (ENSLCAG00010022310) #29	ENSLCAG00010022307	slc4a3 (ENSLCAG00010022227) #30
Barramundi perch	MODERN SPECIES	1799																cnot9 (ENSLCAG00010021784) #22
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091 #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000158542.b #29	ENSGT00710000108330	ENSGT00940000159765 #30	ENSGT00940000155675.p.a #31	ENSGT00940000156186.l.b #32	ENSGT00940000165273 #33	ENSGT00940000165235.b #34	ENSGT00940000177805	ENSGT00950000183184.a.a.a #35
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091 #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000158542.b #29	ENSGT00710000108330	ENSGT00940000159765 #30	ENSGT00940000155675.p.a #31	ENSGT00940000156186.l.b #32	ENSGT00940000165273 #33	ENSGT00940000165235.b #34	ENSGT00940000177805	ENSGT00950000183184.a.a.a #35
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091 #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000158542.b #29	ENSGT00710000108330	ENSGT00940000159765 #30	ENSGT00940000155675.p.a #31	ENSGT00940000156186.l.b #32	ENSGT00940000165273 #33	ENSGT00940000165235.b #34	ENSGT00950000183184.a.a.a #35	ENSGT00940000154360.A.b.a #36
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000161939	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091 #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000158542.b #29	ENSGT00940000159765 #30	ENSGT00940000155675.p.a #31	ENSGT00940000156186.l.b #32	ENSGT00940000165273 #33	ENSGT00940000165235.b #34	ENSGT00950000183184.a.a.a #35	ENSGT00940000154360.A.b.a #36	ENSGT00940000162768.B.a #37
Chinese medaka	MODERN SPECIES	703	GLS (ENSOSIG00000012852)	fkbp7 (ENSOSIG00000012807)	DNAI2 (ENSOSIG00000012796)	osgepl1 (ENSOSIG00000012793)	alkbh6 (ENSOSIG00000012789)	adat3 (ENSOSIG00000012786)	ormdl1 (ENSOSIG00000012784)	pms1 (ENSOSIG00000012727)	mstnb (ENSOSIG00000012721)	ENSOSIG00000012720	hibch (ENSOSIG00000012281)	lss (ENSOSIG00000012228)	ENSOSIG00000012142 #19	ybey (ENSOSIG00000012136) #20	usp37 (ENSOSIG00000012075) #21	cnot9 (ENSOSIG00000012071) #22	PLCD4 (ENSOSIG00000010959) #23	ZNF142 (ENSOSIG00000010957) #24	bcs1l (ENSOSIG00000010956) #25	zgc:136333 (ENSOSIG00000010929) #26	ENSOSIG00000010923 ##27	TNS1 (ENSOSIG00000010884) #27
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	13	GLS (ENSORLG00000015157)	fkbp7 (ENSORLG00000015126)	ENSORLG00000024865	alkbh6 (ENSORLG00000015103)	osgepl1 (ENSORLG00000015117)	ormdl1 (ENSORLG00000015100)	pms1 (ENSORLG00000015090)	mstnb (ENSORLG00000015057)	ENSORLG00000015048	hibch (ENSORLG00000015037)	LSS (ENSORLG00000015003)	lss (ENSORLG00000028452)	MCM3AP (ENSORLG00000014980) #19	ybey (ENSORLG00000023922) #20	usp37 (ENSORLG00000014960) #21	cnot9 (ENSORLG00000014925) #22	PLCD4 (ENSORLG00000014901) #23	ZNF142 (ENSORLG00000014849) #24	bcs1l (ENSORLG00000014823) #25	zgc:136333 (ENSORLG00000014811) #26	ENSORLG00000028136	TNS1 (ENSORLG00000014781) #27	ENSORLG00000025476	ENSORLG00000022632	igfbp5b (ENSORLG00000030103) #28	igfbp2b (ENSORLG00000014695) #29	slc4a3 (ENSORLG00000030477) #30	COL5A2 (ENSORLG00000014658) #31	ENSORLG00000027152	gulp1a (ENSORLG00000014478) #32	ENSORLG00000025169
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091 #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00950000182996.b.b.c.b.h.b.a	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000158542.b #29	ENSGT00710000108330	ENSGT00940000159765 #30	ENSGT00940000155675.p.a #31	ENSGT00940000156186.l.b #32	ENSGT00940000165273 #33	ENSGT00940000165235.b #34	ENSGT00950000183184.a.a.a #35
Indian medaka	MODERN SPECIES	18	ENSOMEG00000022183	fkbp7 (ENSOMEG00000022136)	osgepl1 (ENSOMEG00000022115)	alkbh6 (ENSOMEG00000022075)	ormdl1 (ENSOMEG00000022066)	adat3 (ENSOMEG00000022041)	pms1 (ENSOMEG00000022030)	mstnb (ENSOMEG00000021961)	ENSOMEG00000021937	hibch (ENSOMEG00000021921)	lss (ENSOMEG00000021872)	lss (ENSOMEG00000021845)	ENSOMEG00000021796 #19	ybey (ENSOMEG00000021714) #20	usp37 (ENSOMEG00000021685) #21	cnot9 (ENSOMEG00000021642) #22	PLCD4 (ENSOMEG00000000898) #23	ZNF142 (ENSOMEG00000000914) #24	bcs1l (ENSOMEG00000021530) #25	zgc:136333 (ENSOMEG00000021503) #26	ENSOMEG00000021450	TNS1 (ENSOMEG00000021378) #27	igfbp5b (ENSOMEG00000020658) #28	igfbp2b (ENSOMEG00000020645) #29	igfbp2b (ENSOMEG00000020624) #29	slc4a3 (ENSOMEG00000020610) #30	COL5A2 (ENSOMEG00000020553) #31	gulp1a (ENSOMEG00000020451) #32	ENSOMEG00000020328	ENSOMEG00000020315	ENSOMEG00000020290 #33
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	13	ENSOJAG00000022473	fkbp7 (ENSOJAG00000022365)	osgepl1 (ENSOJAG00000022351)	alkbh6 (ENSOJAG00000022343)	adat3 (ENSOJAG00000022338)	ormdl1 (ENSOJAG00000022329)	pms1 (ENSOJAG00000022261)	mstnb (ENSOJAG00000022229)	ENSOJAG00000022224	hibch (ENSOJAG00000022179)	lss (ENSOJAG00000021730)	ENSOJAG00000021686	MCM3AP (ENSOJAG00000021610) #19	ybey (ENSOJAG00000021589) #20	usp37 (ENSOJAG00000021547) #21	cnot9 (ENSOJAG00000021505) #22	PLCD4 (ENSOJAG00000021256) #23	ZNF142 (ENSOJAG00000021212) #24	bcs1l (ENSOJAG00000021174) #25	zgc:136333 (ENSOJAG00000021136) #26	ENSOJAG00000021120	TNS1 (ENSOJAG00000020938) #27	igfbp5b (ENSOJAG00000020921) #28	igfbp2b (ENSOJAG00000020918) #29	ENSOJAG00000020910	slc4a3 (ENSOJAG00000019855) #30	ENSOJAG00000019263	gulp1a (ENSOJAG00000019141) #32	ENSOJAG00000019121 #33	ENSOJAG00000018181 #34	ENSOJAG00000018059 #35
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000166931	ENSGT00940000163205.d	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091 #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000158542.b #29	ENSGT00710000108330	ENSGT00940000159765.g #30	ENSGT00940000155675.p.a #31	ENSGT00940000156186.l.b #32	ENSGT00940000165273 #33	ENSGT00940000165235.b #34	ENSGT00940000177805	ENSGT00950000183184.a.a.a #35
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	241													ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091 #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00940000155400.B #27
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	136	lrrc3 (ENSKMAG00000018588) #36	pcbp3 (ENSKMAG00000018530) #37	ENSKMAG00000018460	ENSKMAG00000018283	CTDSP1 (ENSKMAG00000018212)	ENSKMAG00000018133	ENSKMAG00000018105	nabp1a (ENSKMAG00000018072)	cavin2a (ENSKMAG00000018058)	tmeff2a (ENSKMAG00000018018)	ENSKMAG00000018000	slc39a10 (ENSKMAG00000017958)	ENSKMAG00000017908 #19	ybey (ENSKMAG00000017890) #20	usp37 (ENSKMAG00000017787) #21	cnot9 (ENSKMAG00000017715) #22	PLCD4 (ENSKMAG00000017684) #23	ZNF142 (ENSKMAG00000017660) #24	bcs1l (ENSKMAG00000017637) #25	zgc:136333 (ENSKMAG00000017556) #26	ENSKMAG00000017529 #34	ENSKMAG00000017511 #33
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	408													ENSNFUG00015017543 #19	ybey (ENSNFUG00015017595) #20	usp37 (ENSNFUG00015017626) #21	RQCD1 (ENSNFUG00015017817) #22	PLCD4 (ENSNFUG00015017897) #23	ZNF142 (ENSNFUG00015019936) #24
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000166931	ENSGT00940000163205.d	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00390000013973.A.a.c.a.n	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091 #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b.n #26	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b.m #26	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000158542.b #29	ENSGT00710000108330	ENSGT00940000159765.g #30	ENSGT00940000155675.p.a #31	ENSGT00940000156186.l.b #32	ENSGT00940000165273 #33	ENSGT00940000165235.b #34	ENSGT00940000177805
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Clown anemonefish	DUPLICATION
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Orange clownfish	MODERN SPECIES	3	ENSAPEG00000003821	ENSAPEG00000003850	fkbp7 (ENSAPEG00000003880)	osgepl1 (ENSAPEG00000003890)	alkbh6 (ENSAPEG00000003934)	ormdl1 (ENSAPEG00000003961)	adat3 (ENSAPEG00000003977)	pms1 (ENSAPEG00000003991)	mstnb (ENSAPEG00000004012)	ENSAPEG00000004029	hibch (ENSAPEG00000004045)	lss (ENSAPEG00000004092)	ENSAPEG00000004174 #19	ybey (ENSAPEG00000004197) #20	usp37 (ENSAPEG00000004235) #21	cnot9 (ENSAPEG00000004365) #22	PLCD4 (ENSAPEG00000004394) #23	ZNF142 (ENSAPEG00000004469) #24	bcs1l (ENSAPEG00000004528) #25	zgc:136333 (ENSAPEG00000004557) #26	TNS1 (ENSAPEG00000004583) #27	ENSAPEG00000004603	ENSAPEG00000004619	igfbp5b (ENSAPEG00000004632) #28	igfbp2b (ENSAPEG00000004641) #29	slc4a3 (ENSAPEG00000004673) #30	ENSAPEG00000004861	gulp1a (ENSAPEG00000004993) #32	ENSAPEG00000005066 #33	ENSAPEG00000005085 #34	ENSAPEG00000005152
Spiny chromis	MODERN SPECIES	2732													ENSAPOG00000016059 #19	ybey (ENSAPOG00000016069) #20	usp37 (ENSAPOG00000016082) #21	cnot9 (ENSAPOG00000016119) #22
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	1960										ENSSPAG00000015636	hibch (ENSSPAG00000015644)	lss (ENSSPAG00000015689)	ENSSPAG00000015778 #19	ybey (ENSSPAG00000015824) #20	usp37 (ENSSPAG00000015839) #21	cnot9 (ENSSPAG00000015881) #22	PLCD4 (ENSSPAG00000015928) #23	ZNF142 (ENSSPAG00000016019) #24
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091 #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00390000007295	ENSGT00390000012446	ENSGT01020000230587	ENSGT00390000015143	ENSGT00390000006303	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00390000017045	ENSGT00390000005949	ENSGT01100000263518.A.a.b	ENSGT00910000148192
Midas cichlid	MODERN SPECIES	33				bcs1l (ENSACIG00000004834) #25	ZNF142 (ENSACIG00000004854) #24	PLCD4 (ENSACIG00000004893) #23	ormdl1 (ENSACIG00000004924)	pms1 (ENSACIG00000004933)	mstnb (ENSACIG00000005038)	ENSACIG00000005048	hibch (ENSACIG00000005054)	lss (ENSACIG00000005086)	ENSACIG00000005137 #19	ybey (ENSACIG00000005308) #20	usp37 (ENSACIG00000005323) #21	cnot9 (ENSACIG00000005487) #22	zgc:136439 (ENSACIG00000005506)	ENSACIG00000005548	ENSACIG00000005575	slc40a1 (ENSACIG00000005588)	wdr75 (ENSACIG00000005615)	STAT4 (ENSACIG00000005777)	ENSACIG00000005855	ENSACIG00000006253	ENSACIG00000006272	fkbp7 (ENSACIG00000006305)	ENSACIG00000006316	osgepl1 (ENSACIG00000006320)	alkbh6 (ENSACIG00000006337)	adat3 (ENSACIG00000006347)	SYMPK (ENSACIG00000006357)
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091 #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00390000007295	ENSGT00390000012446	ENSGT01020000230587	ENSGT00390000015143	ENSGT00390000006303	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00390000017045	ENSGT00390000005949	ENSGT01100000263518.A.a.b	ENSGT00910000148192
Nile tilapia	MODERN SPECIES	7	zgc:136333 (ENSONIG00000007177) #26	ENSONIG00000032736	bcs1l (ENSONIG00000007176) #25	ZNF142 (ENSONIG00000007174) #24	PLCD4 (ENSONIG00000007170) #23	ormdl1 (ENSONIG00000018245)	pms1 (ENSONIG00000007164)	mstnb (ENSONIG00000007163)	ENSONIG00000020754	hibch (ENSONIG00000007161)	ENSONIG00000041682	lss (ENSONIG00000016840)	ENSONIG00000016836 #19	ybey (ENSONIG00000042756) #20	usp37 (ENSONIG00000016831) #21	cnot9 (ENSONIG00000016830) #22	zgc:136439 (ENSONIG00000038295)	asnsd1 (ENSONIG00000016829)	ENSONIG00000038814	slc40a1 (ENSONIG00000032283)	wdr75 (ENSONIG00000016827)	STAT4 (ENSONIG00000016817)	ENSONIG00000040122	ENSONIG00000016812	fkbp7 (ENSONIG00000016810)	osgepl1 (ENSONIG00000016808)	alkbh6 (ENSONIG00000035409)	adat3 (ENSONIG00000021155)	SYMPK (ENSONIG00000016802)	SLC35F5 (ENSONIG00000016798)	gpr39 (ENSONIG00000016797)
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091 #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00390000007295	ENSGT00390000012446	ENSGT00390000015143	ENSGT00390000006303	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00390000017045	ENSGT00390000005949	ENSGT01100000263518.A.a.b	ENSGT00910000148192	ENSGT00390000002215.i.a
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091 #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00390000007295	ENSGT00390000012446	ENSGT00390000015143	ENSGT00390000006303	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00390000017045	ENSGT00390000005949	ENSGT01100000263518.A.a.b	ENSGT00910000148192	ENSGT00390000002215.i.a
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	544							ormdl1 (ENSHBUG00000022540)	pms1 (ENSHBUG00000022546)	mstnb (ENSHBUG00000022560)	ENSHBUG00000022570	hibch (ENSHBUG00000022595)	lss (ENSHBUG00000000696)	ENSHBUG00000022726 #19	ybey (ENSHBUG00000022755) #20	usp37 (ENSHBUG00000022775) #21	cnot9 (ENSHBUG00000022819) #22	zgc:136439 (ENSHBUG00000022876)	asnsd1 (ENSHBUG00000022898)	slc40a1 (ENSHBUG00000022927)	wdr75 (ENSHBUG00000023108)	STAT4 (ENSHBUG00000000711)	ENSHBUG00000023262	ENSHBUG00000023387	fkbp7 (ENSHBUG00000023447)	osgepl1 (ENSHBUG00000023523)	alkbh6 (ENSHBUG00000023541)	adat3 (ENSHBUG00000023550)	SYMPK (ENSHBUG00000023564)	SLC35F5 (ENSHBUG00000023580)	ENSHBUG00000023593	gpr39 (ENSHBUG00000023600)
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091 #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00390000007295	ENSGT00390000012446	ENSGT00390000015143	ENSGT00390000006303	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00390000017045	ENSGT00390000005949	ENSGT01100000263518.A.a.b	ENSGT00910000148192	ENSGT00390000002215.i.a
P. nyererei	MODERN SPECIES	366	igfbp5b (ENSPNYG00000012598) #28	TNS1 (ENSPNYG00000012484) #27	zgc:136333 (ENSPNYG00000012405) #26	bcs1l (ENSPNYG00000012374) #25	ZNF142 (ENSPNYG00000012329) #24	PLCD4 (ENSPNYG00000012295) #23	ormdl1 (ENSPNYG00000012277)	pms1 (ENSPNYG00000012259)	mstnb (ENSPNYG00000012235)	ENSPNYG00000012220	hibch (ENSPNYG00000012136)	lss (ENSPNYG00000011989)	ENSPNYG00000011931 #19	ybey (ENSPNYG00000011909) #20	usp37 (ENSPNYG00000011888) #21	cnot9 (ENSPNYG00000011857) #22	zgc:136439 (ENSPNYG00000011840)	asnsd1 (ENSPNYG00000011819)	slc40a1 (ENSPNYG00000011792)	wdr75 (ENSPNYG00000011767)	STAT4 (ENSPNYG00000011623)	ENSPNYG00000011587	ENSPNYG00000011543	fkbp7 (ENSPNYG00000011516)	osgepl1 (ENSPNYG00000011500)	alkbh6 (ENSPNYG00000011487)	adat3 (ENSPNYG00000011478)	SYMPK (ENSPNYG00000011455)	SLC35F5 (ENSPNYG00000011426)	ENSPNYG00000011420	gpr39 (ENSPNYG00000011407)
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000155890.a.a #28	ENSGT00940000155400.B #27	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #26	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00940000156180.f #23	ENSGT00950000183178.b.a	ENSGT00940000157085	ENSGT00940000165813.b	ENSGT00940000167830	ENSGT00890000139491	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091 #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00390000007295	ENSGT00390000012446	ENSGT00390000015143	ENSGT00390000006303	ENSGT01050000244905.D	ENSGT00390000010463.a.b.c.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00510000048626	ENSGT00390000010706	ENSGT00390000017045	ENSGT00390000005949	ENSGT01100000263518.A.a.b	ENSGT00910000148192	ENSGT00390000002215.i.a
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Eastern happy	MODERN SPECIES	7	TNS1 (ENSACLG00000003009) #27	zgc:136333 (ENSACLG00000002973) #26	ENSACLG00000002949	bcs1l (ENSACLG00000002897) #25	ZNF142 (ENSACLG00000002891) #24	PLCD4 (ENSACLG00000002876) #23	ormdl1 (ENSACLG00000002790)	pms1 (ENSACLG00000002781)	mstnb (ENSACLG00000002763)	ENSACLG00000002757	hibch (ENSACLG00000002744)	lss (ENSACLG00000002587)	ENSACLG00000002461 #19	ybey (ENSACLG00000002438) #20	usp37 (ENSACLG00000002198) #21	cnot9 (ENSACLG00000002163) #22	zgc:136439 (ENSACLG00000002150)	asnsd1 (ENSACLG00000002117)	slc40a1 (ENSACLG00000002052)	wdr75 (ENSACLG00000002025)	STAT4 (ENSACLG00000001992)	ENSACLG00000001967	ENSACLG00000001961	ENSACLG00000001867	fkbp7 (ENSACLG00000001857)	osgepl1 (ENSACLG00000001841)	alkbh6 (ENSACLG00000001836)	adat3 (ENSACLG00000001830)	SYMPK (ENSACLG00000001813)	SLC35F5 (ENSACLG00000001791)	ENSACLG00000001784
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Rainbow trout	MODERN SPECIES	14	zgc:136439 (ENSOMYG00000013326)	ankar (ENSOMYG00000013340)	osgepl1 (ENSOMYG00000013364)	ENSOMYG00000072719	ENSOMYG00000013382	ormdl1 (ENSOMYG00000013398)	pms1 (ENSOMYG00000013452)	ENSOMYG00000059309	ENSOMYG00000077870	mstnb (ENSOMYG00000013485)	ENSOMYG00000055667	LSS (ENSOMYG00000013613)	ENSOMYG00000013755 #19	YBEY (ENSOMYG00000013844) #20	USP37 (ENSOMYG00000013941) #21	CNOT9 (ENSOMYG00000014285) #22	PLCD4 (ENSOMYG00000014350) #23	ZNF142 (ENSOMYG00000014477) #24	bcs1l (ENSOMYG00000014485) #25	ENSOMYG00000014513 #26	ENSOMYG00000068674	ENSOMYG00000014681	ENSOMYG00000016079	ENSOMYG00000016214	ENSOMYG00000016259 #13	agr1 (ENSOMYG00000016488)	traf3ip1 (ENSOMYG00000016497) #12	ENSOMYG00000065849	asb1 (ENSOMYG00000016548) #11	ENSOMYG00000076629 #10	twist2 (ENSOMYG00000016557) #9
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000012446.c	ENSGT00390000007295	ENSGT00680000100065	ENSGT00940000153744.A	ENSGT00950000183178.b.a.f.a.a	ENSGT00390000010706.d	ENSGT00950000183178.b.a.f.b	ENSGT00940000157085.i.a	ENSGT00940000165813.b.e	ENSGT00940000167830.c	ENSGT00890000139491.n	ENSGT00390000011570	ENSGT00940000156322 #19	ENSGT00950000183170.b.b #20	ENSGT00940000158091.f.b #21	ENSGT00390000001225.s.a #22	ENSGT00940000156180.f.h #23	ENSGT00940000163074 #24	ENSGT00390000005415 #25	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b.j #26	ENSGT00940000160544.f.a	ENSGT01090000259987.a.a.a.p.b	ENSGT00940000155992.c.a.c #13	ENSGT00530000063273.b.a.a.g	ENSGT00720000108822.c #12	ENSGT00940000153969.b #11	ENSGT00940000165503.j #10	ENSGT00940000166532.g #9	ENSGT00940000157440.m.a.c #8	ENSGT00680000100037.kb	ENSGT00940000164536.a.b.f
River trout	MODERN SPECIES	12	ENSSTUG00000014690	slc40a1 (ENSSTUG00000014698)	asnsd1 (ENSSTUG00000014713)	zgc:136439 (ENSSTUG00000014726)	ankar (ENSSTUG00000014736)	osgepl1 (ENSSTUG00000014780)	ormdl1 (ENSSTUG00000014859)	pms1 (ENSSTUG00000014898)	mstnb (ENSSTUG00000015112)	ENSSTUG00000015137	hibch (ENSSTUG00000015144)	lss (ENSSTUG00000015271)	MCM3AP (ENSSTUG00000015687) #19	ybey (ENSSTUG00000015835) #20	usp37 (ENSSTUG00000015852) #21	cnot9 (ENSSTUG00000016141) #22	PLCD4 (ENSSTUG00000016165) #23	ZNF142 (ENSSTUG00000016305) #24	bcs1l (ENSSTUG00000016310) #25	ENSSTUG00000016332 #26	vil1 (ENSSTUG00000016422)	ITGB2 (ENSSTUG00000018110)	ENSSTUG00000021455	ADARB1 (ENSSTUG00000021460) #13	agr1 (ENSSTUG00000021502)	traf3ip1 (ENSSTUG00000021506) #12	asb1 (ENSSTUG00000021531) #11	ENSSTUG00000021538 #10	twist2 (ENSSTUG00000021540) #9	hdac4 (ENSSTUG00000021569) #8	gjc4b (ENSSTUG00000022067)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	13	ENSSSAG00000091717	slc40a1 (ENSSSAG00000050163)	wdr75 (ENSSSAG00000050305)	zgc:136439 (ENSSSAG00000092441)	ankar (ENSSSAG00000049948)	osgepl1 (ENSSSAG00000049909)	adat3 (ENSSSAG00000049890)	ormdl1 (ENSSSAG00000049881)	pms1 (ENSSSAG00000049399)	mstnb (ENSSSAG00000049265)	ENSSSAG00000091097	LSS (ENSSSAG00000045554)	ENSSSAG00000121613 #19	YBEY (ENSSSAG00000045469) #20	USP37 (ENSSSAG00000044673) #21	CNOT9 (ENSSSAG00000044481) #22	PLCD4 (ENSSSAG00000042288) #23	ZNF142 (ENSSSAG00000042170) #24	BCS1 (ENSSSAG00000042144) #25	ENSSSAG00000041425 #26	vil1 (ENSSSAG00000033358)	ENSSSAG00000022772	ENSSSAG00000086387	ENSSSAG00000015780 #13	agr1 (ENSSSAG00000015737)	traf3ip1 (ENSSSAG00000118564) #12	asb1 (ENSSSAG00000015679) #11	TWST2 (ENSSSAG00000015666) #9	hdac4 (ENSSSAG00000006508) #8	ENSSSAG00000092726	gjc4b (ENSSSAG00000059516)
Huchen	MODERN SPECIES	234	asnsd1 (ENSHHUG00000032968)	zgc:136439 (ENSHHUG00000032971)	ankar (ENSHHUG00000032980)	osgepl1 (ENSHHUG00000033040)	adat3 (ENSHHUG00000033054)	ormdl1 (ENSHHUG00000033064)	pms1 (ENSHHUG00000033079)	mstnb (ENSHHUG00000033085)	ENSHHUG00000033186	ENSHHUG00000033190	lss (ENSHHUG00000033192)	MCM3AP (ENSHHUG00000033212) #19	ENSHHUG00000033234	ybey (ENSHHUG00000033242) #20	usp37 (ENSHHUG00000033257) #21	cnot9 (ENSHHUG00000033364) #22	PLCD4 (ENSHHUG00000033380) #23	ZNF142 (ENSHHUG00000034175) #24	bcs1l (ENSHHUG00000034182) #25	ENSHHUG00000034195 #26	zgc:66484 (ENSHHUG00000034208)	VIL1 (ENSHHUG00000034211)	ITGB2 (ENSHHUG00000034340)
Northern pike	MODERN SPECIES	15	asnsd1 (ENSELUG00000013854)	zgc:136439 (ENSELUG00000032874)	ankar (ENSELUG00000013809)	osgepl1 (ENSELUG00000013776)	adat3 (ENSELUG00000013736)	ormdl1 (ENSELUG00000013753)	pms1 (ENSELUG00000013725)	mstnb (ENSELUG00000013706)	ENSELUG00000013684	hibch (ENSELUG00000013663)	ENSELUG00000025026	lss (ENSELUG00000013601)	ENSELUG00000000499 #19	ybey (ENSELUG00000013338) #20	usp37 (ENSELUG00000013425) #21	cnot9 (ENSELUG00000013305) #22	PLCD4 (ENSELUG00000013282) #23	ZNF142 (ENSELUG00000013266) #24	bcs1l (ENSELUG00000013256) #25	zgc:136333 (ENSELUG00000013221) #26	zgc:66484 (ENSELUG00000013108)	vil1 (ENSELUG00000013040)	ITGB2 (ENSELUG00000012969)	ADARB1 (ENSELUG00000012944) #13	agr3 (ENSELUG00000012848)	traf3ip1 (ENSELUG00000012760) #12	asb1 (ENSELUG00000012649) #11	ENSELUG00000033219 #10	twist2 (ENSELUG00000012619) #9	hdac4 (ENSELUG00000012563) #8	IKZF2 (ENSELUG00000032332)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	140	ENSGT00390000013151.a.a.a	ENSGT00940000161997.a	ENSGT00940000160532.g	ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.b	ENSGT00940000154486.b.b.b	ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.b	ENSGT00940000154486.b.b.a.a	ENSGT00940000155311.B	ENSGT00530000063599.B	ENSGT00390000006330.a.a.b	ENSGT00390000010463.a.b.c.a	ENSGT01050000244905.A.a	ENSGT00940000167649	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00390000001225.t ##22	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029
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Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT01050000244823.d.b.a.b	ENSGT00390000013073	ENSGT00390000000292.B	ENSGT00940000157860	ENSGT00940000156365	ENSGT00390000010543	ENSGT00940000155318.b.b	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.a	ENSGT00390000000447	ENSGT00940000159255	ENSGT00690000103830	ENSGT00940000159602	ENSGT00940000159870	ENSGT01030000234765	ENSGT00940000164013	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a	ENSGT00940000164022	ENSGT00940000154344.b	ENSGT00940000161628	ENSGT00940000159942.a.c.a	ENSGT00940000159832	ENSGT00940000156607.a.a	ENSGT00390000014753	ENSGT00940000165158.b	ENSGT00940000161153	ENSGT00440000033720.a.a.b
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	55	ENSGT01030000234614.A.l.b	ENSGT01050000244823.d.b.a.b	ENSGT00390000013073	ENSGT00390000000292.B	ENSGT00940000157860	ENSGT00940000156365	ENSGT00390000010543	ENSGT00940000155318.b.b	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.a	ENSGT00390000000447	ENSGT00940000159255	ENSGT00690000103830	ENSGT00940000159602	ENSGT00940000159870	ENSGT00940000164013	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a	ENSGT00940000164022	ENSGT00940000154344.b	ENSGT00940000161628	ENSGT00940000159942.a.c.a	ENSGT00940000159832	ENSGT00940000156607.a.a	ENSGT00390000014753	ENSGT00940000165158.b	ENSGT00940000161153	ENSGT00440000033720.a.a.b
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	22										ENSGT00390000000447	ENSGT00940000159255	ENSGT00690000103830	ENSGT00940000159602	ENSGT00940000159870	ENSGT00940000164013	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a	ENSGT00940000164022	ENSGT00940000154344.b	ENSGT00940000161628	ENSGT00940000159942.a.c.a	ENSGT00940000159832	ENSGT00940000156607.a.a	ENSGT00390000014753	ENSGT00940000165158.b	ENSGT00940000161153	ENSGT00440000033720.a.a.b
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	23										ENSGT00390000000447	ENSGT00940000159255	ENSGT00690000103830	ENSGT00940000159602	ENSGT00940000159870	ENSGT00940000164013	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a	ENSGT00940000164022	ENSGT00940000154344.b	ENSGT00940000161628	ENSGT00940000159942.a.c.a	ENSGT00940000159832	ENSGT00940000156607.a.a	ENSGT00390000014753	ENSGT00940000165158.b	ENSGT00940000161153	ENSGT00440000033720.a.a.b
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000153648.a	ENSGT01030000234555.b	ENSGT00940000166665	ENSGT00940000153309	ENSGT00390000016794.d	ENSGT01050000244848.A.b.b	ENSGT00950000183022.b	ENSGT00610000086518.b.b	ENSGT00940000165189	ENSGT00390000000447	ENSGT00940000159255	ENSGT00690000103830	ENSGT00940000159602	ENSGT00940000159870	ENSGT00940000164013	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a	ENSGT00940000164022	ENSGT00940000168183	ENSGT00940000157622.a.a	ENSGT00940000163186	ENSGT00940000154344.b	ENSGT00940000161628	ENSGT00940000159942.a.c.a	ENSGT00940000159832	ENSGT00940000156607.a.a	ENSGT00390000014753
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	193										ENSGT00940000159870	ENSGT00940000159602	ENSGT00690000103830	ENSGT00940000159255	ENSGT00390000000447	ENSGT00940000164013	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	107	ENSGT00940000156913.b.j.a	ENSGT00940000160811.c.b	ENSGT00390000014037.d	ENSGT00940000154242.a.c	ENSGT00390000005345	ENSGT01070000253766.C.o.b	ENSGT00940000158831	ENSGT00940000156406.a	ENSGT00940000153470.a.a.a.a	ENSGT00940000159870	ENSGT00940000159602	ENSGT00690000103830	ENSGT00940000159255	ENSGT00390000000447	ENSGT00940000164013	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	130	ENSGT00940000156913.b.j.a	ENSGT00940000160811.c.b	ENSGT00390000014037.d	ENSGT00940000154242.a.c	ENSGT00390000005345	ENSGT01070000253766.C.o.b	ENSGT00940000158831	ENSGT00940000156406.a	ENSGT00940000153470.a.a.a.a	ENSGT00940000159870	ENSGT00940000159602	ENSGT00690000103830	ENSGT00940000159255	ENSGT00390000000447	ENSGT00940000164013	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	3469			ENSAOCG00000016423	ENSAOCG00000016441	ENSAOCG00000016485	XKR6 (ENSAOCG00000001862)	enpp4 (ENSAOCG00000016514)	clic5a (ENSAOCG00000016540)	mgat5 (ENSAOCG00000016625)	RCAN1 (ENSAOCG00000001156)	ENSAOCG00000016689	ENSAOCG00000016710	runx1 (ENSAOCG00000016739)	ENSAOCG00000016751	ENSAOCG00000016803	cnot9 (ENSAOCG00000016846) ##22	ENSAOCG00000016899 ##23	slx9 (ENSAOCG00000001977)	adarb1a (ENSAOCG00000001169) ##13	cep70 (ENSAOCG00000016992)	sowahcb (ENSAOCG00000017011)	vamp1a (ENSAOCG00000017028)	ENSAOCG00000001180	ENSAOCG00000001182	grap2a (ENSAOCG00000017139)	radil2a (ENSAOCG00000017170)	ENSAOCG00000017190
Orange clownfish	MODERN SPECIES	16	C1QL2 (ENSAPEG00000012569)	en1a (ENSAPEG00000012557)	ENSAPEG00000012504	ENSAPEG00000012490	ENSAPEG00000012355	XKR6 (ENSAPEG00000012311)	enpp4 (ENSAPEG00000012288)	clic5a (ENSAPEG00000012257)	mgat5 (ENSAPEG00000012172)	ENSAPEG00000012131	ENSAPEG00000012095	ENSAPEG00000012078	runx1 (ENSAPEG00000011997)	DONSON (ENSAPEG00000011848)	ENSAPEG00000011757	cnot9 (ENSAPEG00000011704) ##22	ENSAPEG00000011685 ##23	slx9 (ENSAPEG00000011677)	adarb1a (ENSAPEG00000011629) ##13	cep70 (ENSAPEG00000011536)	sowahcb (ENSAPEG00000011503)	ENSAPEG00000011488	GAPDH (ENSAPEG00000011459)	ENSAPEG00000011443	MAP4K4 (ENSAPEG00000011232)	chst10 (ENSAPEG00000011160)	rpl31 (ENSAPEG00000011120)	HECW2 (ENSAPEG00000011093)	gtf3c3 (ENSAPEG00000011007)	dmd (ENSAPEG00000010447)	ENSAPEG00000010270
Spiny chromis	MODERN SPECIES	1093													runx1 (ENSAPOG00000020606)	ENSAPOG00000020620	ENSAPOG00000020684	cnot9 (ENSAPOG00000020746) ##22	ENSAPOG00000020998 ##23	slx9 (ENSAPOG00000021046)	adarb1a (ENSAPOG00000021275) ##13	cep70 (ENSAPOG00000021352)	sowahcb (ENSAPOG00000021363)	ENSAPOG00000021381
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	886										RCAN1 (ENSSPAG00000003738)	ENSSPAG00000003713	ENSSPAG00000003699	runx1 (ENSSPAG00000003609)	DONSON (ENSSPAG00000003574)	ENSSPAG00000003543	cnot9 (ENSSPAG00000003506) ##22	ENSSPAG00000003366 ##23	ENSSPAG00000003331	adarb1a (ENSSPAG00000003299) ##13
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	51										ENSGT00390000000447	ENSGT00940000159255	ENSGT00690000103830	ENSGT00940000159602	ENSGT00940000159870	ENSGT00940000164013	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a	ENSGT00940000164022	ENSGT00940000168183	ENSGT00940000157622.a.a	ENSGT00940000163186	ENSGT00940000154344.b	ENSGT00940000161628	ENSGT00940000159942.a.c.a	ENSGT00940000159832	ENSGT00940000156607.a.a	ENSGT00390000014753
Midas cichlid	MODERN SPECIES	585													ENSACIG00000024287	RCAN1 (ENSACIG00000024290)	ENSACIG00000024292	cnot9 (ENSACIG00000024293) ##22	ENSACIG00000024295 ##23	slx9 (ENSACIG00000024296)	adarb1a (ENSACIG00000024297) ##13	cep70 (ENSACIG00000024298)	sowahcb (ENSACIG00000024300)	dhrsx (ENSACIG00000024301)
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	47										ENSGT00390000000447	ENSGT00940000159255	ENSGT00690000103830	ENSGT00940000159602	ENSGT00940000159870	ENSGT00940000164013	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a	ENSGT00940000164022	ENSGT00940000154344.b	ENSGT00940000161628	ENSGT00940000159942.a.c.a	ENSGT00940000159832	ENSGT00940000156607.a.a	ENSGT00390000014753	ENSGT00940000165158.b	ENSGT00940000161153	ENSGT00940000169304
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	66											ENSGT00390000000447	ENSGT00940000159255	ENSGT00690000103830	ENSGT00940000159602	ENSGT00940000159870	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a	ENSGT00940000164022	ENSGT00940000154344.b	ENSGT00940000161628	ENSGT00940000159942.a.c.a	ENSGT00940000159832	ENSGT00940000156607.a.a	ENSGT00390000014753	ENSGT00940000165158.b	ENSGT00940000161153
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	174								ENSGT00940000154344.b	ENSGT00940000161628	ENSGT00940000159942.a.c.a	ENSGT00940000159832	ENSGT00940000156607.a.a	ENSGT00390000000447	ENSGT00940000159602	ENSGT00940000159870	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a	ENSGT00940000168183
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1619	GYG2 (ENSNFUG00015009233)	ENSNFUG00015009305	ENSNFUG00015009445	PRKX (ENSNFUG00015009453)	ENSNFUG00015009467	nlgn4xa (ENSNFUG00015009479)	cep41 (ENSNFUG00015009529)	pudp (ENSNFUG00015009538)	runx1 (ENSNFUG00015009559)	ENSNFUG00015009602	ENSNFUG00015009621	ENSNFUG00015009629	URP2 (ENSNFUG00015009633)	CLIC6 (ENSNFUG00015009645)	RCAN1B (ENSNFUG00015009664)	RQCD1 (ENSNFUG00015009680) ##22	ENSNFUG00015009821 ##23	ENSNFUG00015010578	ENSNFUG00015010583	APG3L (ENSNFUG00015010599)	CARS2 (ENSNFUG00015010636)	ENSNFUG00015010684	GTF3C3 (ENSNFUG00015010693)	ENSNFUG00015011011	CHRM4A (ENSNFUG00015011027)	cryaa (ENSNFUG00015011042)	ENSNFUG00015011055	ankrd10a (ENSNFUG00015011073)	ENSNFUG00015011114	ENSNFUG00015011133	ENSNFUG00015011142
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	132	ENSKMAG00000011510	cab39l (ENSKMAG00000011414)	cdadc1 (ENSKMAG00000011381)	rcbtb1 (ENSKMAG00000011318)	FGF14 (ENSKMAG00000011283)	tubgcp3 (ENSKMAG00000011185)	ENSKMAG00000011159	ATP11A (ENSKMAG00000011106)	SOX1 (ENSKMAG00000011088)	arhgef7b (ENSKMAG00000010994)	ENSKMAG00000010829	ENSKMAG00000010754	zc3h13 (ENSKMAG00000010701)	ENSKMAG00000010672	ENSKMAG00000010629	cnot9 (ENSKMAG00000010565) ##22	ENSKMAG00000010505	ENSKMAG00000010470 ##23	slx9 (ENSKMAG00000010451)	adarb1a (ENSKMAG00000010426) ##13	cep70 (ENSKMAG00000010395)	sowahcb (ENSKMAG00000010375)	AIFM2 (ENSKMAG00000010356)	ENSKMAG00000010342	ENSKMAG00000010325
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000153534.A	ENSGT00390000003758	ENSGT00940000163254	ENSGT01060000248575.D.c.b.a.a	ENSGT00530000063484.b.b.d.b	ENSGT00940000154342.C	ENSGT01030000234555.a.b.f.b	ENSGT00390000016929	ENSGT00940000155466.e.a	ENSGT00390000000447	ENSGT00940000159255	ENSGT00690000103830	ENSGT00940000159602	ENSGT00940000159870	ENSGT00940000164013	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a	ENSGT00940000168183	ENSGT00940000163186	ENSGT00940000177894	ENSGT00940000164022	ENSGT00940000154344.b	ENSGT00940000161628	ENSGT00940000159942.a.c.a	ENSGT00940000159832	ENSGT00940000156607.a.a	ENSGT00390000014753
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	23															ENSGT00940000164013	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a	ENSGT00940000164022	ENSGT00940000163186	ENSGT00940000154344.b	ENSGT00940000161628	ENSGT00940000159942.a.c.a	ENSGT00940000159832	ENSGT00940000156607.a.a	ENSGT00390000014753	ENSGT00940000165158.b	ENSGT00940000161153
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	23															ENSGT00940000164013	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a	ENSGT00940000164022	ENSGT00940000154344.b	ENSGT00940000161628	ENSGT00940000159942.a.c.a	ENSGT00940000159832	ENSGT00940000156607.a.a	ENSGT00390000014753	ENSGT00940000165158.b	ENSGT00940000161153	ENSGT00440000033720.a.a.b
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	23															ENSGT00940000164013	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a	ENSGT00940000164022	ENSGT00940000154344.b	ENSGT00940000161628	ENSGT00940000159942.a.c.a	ENSGT00940000159832	ENSGT00940000156607.a.a	ENSGT00390000014753	ENSGT00940000165158.b	ENSGT00940000161153	ENSGT00440000033720.a.a.b
Climbing perch	MODERN SPECIES	11	ENSATEG00000014439	ENSATEG00000014434	ENSATEG00000014414	ENSATEG00000014379	ENSATEG00000028647	ENSATEG00000014346	ENSATEG00000014252	ENSATEG00000014215	ENSATEG00000014176	ENSATEG00000014144	ENSATEG00000026583	ENSATEG00000026007	ENSATEG00000014107	ENSATEG00000013779	ENSATEG00000013711	cnot9 (ENSATEG00000013696) ##22	ENSATEG00000013684 ##23	slx9 (ENSATEG00000026147)	adarb1a (ENSATEG00000013653) ##13	cep70 (ENSATEG00000025864)	ENSATEG00000013636	dhrsx (ENSATEG00000013588)	cd99 (ENSATEG00000013440)	gyg2 (ENSATEG00000013132)	MXRA5 (ENSATEG00000028724)	PRKX (ENSATEG00000025575)	ENSATEG00000012902	nlgn4xa (ENSATEG00000012873)	pudp (ENSATEG00000012775)	ENSATEG00000012765	ENSATEG00000028001
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	11											ENSMAMG00000026232	ENSMAMG00000026709	ENSMAMG00000025491	ENSMAMG00000000347	ENSMAMG00000000357	cnot9 (ENSMAMG00000000433) ##22	ENSMAMG00000000490 ##23	slx9 (ENSMAMG00000000551)	adarb1a (ENSMAMG00000000571) ##13	cep70 (ENSMAMG00000000607)	ENSMAMG00000026913	ENSMAMG00000000692	cd99 (ENSMAMG00000000711)	gyg2 (ENSMAMG00000000743)	MXRA5 (ENSMAMG00000000776)	PRKX (ENSMAMG00000000832)	nlgn4xa (ENSMAMG00000000885)	pudp (ENSMAMG00000028232)	ENSMAMG00000003024	STS (ENSMAMG00000003049)	ANOS1 (ENSMAMG00000025695)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	23															ENSGT00940000164013	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a	ENSGT00940000164022	ENSGT00940000163186	ENSGT00940000154344.b	ENSGT00940000161628	ENSGT00940000159942.a.c.a	ENSGT00940000159832	ENSGT00940000156607.a.a	ENSGT00390000014753	ENSGT00940000165158.b	ENSGT00940000161153
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	23															ENSGT00940000164013	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a	ENSGT00940000164022	ENSGT00940000168183	ENSGT00940000163186	ENSGT00940000154344.b	ENSGT00940000161628	ENSGT00940000159942.a.c.a	ENSGT00940000159832	ENSGT00940000156607.a.a	ENSGT00390000014753	ENSGT00940000165158.b
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00940000166136	ENSGT00390000012561.b.pb.b	ENSGT00950000183114.a.b.b	ENSGT00940000160639.a	ENSGT00390000013151.a.a.a	ENSGT00940000161997.a	ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.b	ENSGT00940000154486.b.b.a.a	ENSGT00530000063484.b.b.d.b	ENSGT00940000154342.C	ENSGT01030000234555.a.b.f.b	ENSGT00390000016929	ENSGT00940000155466.e.a	ENSGT00730000111141	ENSGT00940000164013	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a	ENSGT00940000164022	ENSGT00940000154344.b	ENSGT00940000161628	ENSGT00940000159942.a.c.a	ENSGT00940000159832	ENSGT00940000156607.a.a	ENSGT00390000014753	ENSGT00940000165158.b	ENSGT00940000161153	ENSGT00440000033720.a.a.b
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3147	ENSSLDG00000012103	ENSSLDG00000012138	sh3bp4a (ENSSLDG00000012152)	s100b (ENSSLDG00000012175)	ENSSLDG00000012183	ahr1b (ENSSLDG00000012205)	tmem47 (ENSSLDG00000012245)	ENSSLDG00000012286	dmd (ENSSLDG00000012633)	ENSSLDG00000013385	gtf3c3 (ENSSLDG00000013417)	ENSSLDG00000013474	ENSSLDG00000013504	ENSSLDG00000013582	ENSSLDG00000013596	cnot9 (ENSSLDG00000013620) ##22	ENSSLDG00000013642 ##23	slx9 (ENSSLDG00000013668)	adarb1a (ENSSLDG00000013681) ##13	cep70 (ENSSLDG00000013714)	sowahcb (ENSSLDG00000013778)	dhrsx (ENSSLDG00000013811)	cd99 (ENSSLDG00000013853)	gyg2 (ENSSLDG00000014009)	MXRA5 (ENSSLDG00000014480)	PRKX (ENSSLDG00000014506)	nlgn4xa (ENSSLDG00000014531)	pudp (ENSSLDG00000014549)	ENSSLDG00000014573	STS (ENSSLDG00000014588)	anos1a (ENSSLDG00000014603)
Greater amberjack	MODERN SPECIES	7	ENSSDUG00000013396	bzw1a (ENSSDUG00000013408)	aox5 (ENSSDUG00000013452)	AOX1 (ENSSDUG00000013779)	sh3bp4a (ENSSDUG00000015477)	s100b (ENSSDUG00000015497)	ENSSDUG00000015503	ahr1b (ENSSDUG00000015515)	tmem47 (ENSSDUG00000015528)	DMD (ENSSDUG00000015736)	ENSSDUG00000018370	gtf3c3 (ENSSDUG00000018401)	HECW2 (ENSSDUG00000018483)	ENSSDUG00000018550	ENSSDUG00000018596	cnot9 (ENSSDUG00000018622) ##22	ENSSDUG00000018654 ##23	slx9 (ENSSDUG00000018677)	adarb1a (ENSSDUG00000018690) ##13	cep70 (ENSSDUG00000018713)	sowahcb (ENSSDUG00000018751)	dhrsx (ENSSDUG00000018766)	cd99 (ENSSDUG00000018782)	gyg2 (ENSSDUG00000018811)	MXRA5 (ENSSDUG00000018841)	PRKX (ENSSDUG00000018892)	nlgn4xa (ENSSDUG00000019018)	pudp (ENSSDUG00000020114)	ENSSDUG00000020129	STS (ENSSDUG00000020141)	anos1a (ENSSDUG00000020157)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	624												ENSLCAG00010013722	ENSLCAG00010013718	ENSLCAG00010013716	ENSLCAG00010013711	cnot9 (ENSLCAG00010013701) ##22	ENSLCAG00010013632 ##23
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000153534.A	ENSGT00390000003758	ENSGT00940000163254	ENSGT01060000248575.D.c.b.a.a	ENSGT00530000063484.b.b.d.b	ENSGT00940000154342.C	ENSGT01030000234555.a.b.f.b	ENSGT00390000016929	ENSGT00940000155466.e.a	ENSGT00390000000447	ENSGT00940000159255	ENSGT00690000103830	ENSGT00940000159602	ENSGT00940000159870	ENSGT00940000164013	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a	ENSGT00940000164022	ENSGT00940000163186	ENSGT00940000154344.b	ENSGT00940000161628	ENSGT00940000159942.a.c.a	ENSGT00940000159832	ENSGT00940000156607.a.a	ENSGT00390000014753	ENSGT00940000165158.b	ENSGT00940000161153
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000158367	ENSGT00950000183302	ENSGT00390000002403	ENSGT00530000063669.b.b	ENSGT00940000165242.d	ENSGT00940000164275.f.d	ENSGT00940000157269.a.b	ENSGT00940000155360.B.k	ENSGT00940000162479.a	ENSGT00940000157849.n.c	ENSGT00940000157872	ENSGT00940000156984.a.a	ENSGT00940000153981.A	ENSGT01030000234765	ENSGT00940000164013	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a	ENSGT00940000164022	ENSGT00940000163186	ENSGT00940000154344.b	ENSGT00940000161628	ENSGT00940000159942.a.c.a	ENSGT00940000159832	ENSGT00940000156607.a.a.xb	ENSGT00940000156607.a.a.yb.b	ENSGT00390000014753	ENSGT00940000165158.b
Fugu	MODERN SPECIES	20	ENSTRUG00000028934	ENSTRUG00000021847	fam184aa (ENSTRUG00000017364)	ENSTRUG00000017359	ENSTRUG00000017357	ENSTRUG00000028094	ENSTRUG00000017337	arhgef7b (ENSTRUG00000017333)	SOX1 (ENSTRUG00000021237)	atp11a (ENSTRUG00000017330)	tubgcp3 (ENSTRUG00000017326)	FGF14 (ENSTRUG00000030093)	GPR180 (ENSTRUG00000007281)	ENSTRUG00000020625	ENSTRUG00000020502	cnot9 (ENSTRUG00000007110) ##22	PLCD4 (ENSTRUG00000006810) ##23	slx9 (ENSTRUG00000021414)	adarb1a (ENSTRUG00000006297) ##13	cep70 (ENSTRUG00000005903)	sowahcb (ENSTRUG00000028799)	ZBED1 (ENSTRUG00000027311)	cd99 (ENSTRUG00000005337)	gyg2 (ENSTRUG00000004929)	ENSTRUG00000029616	MXRA5 (ENSTRUG00000004815)	PRKX (ENSTRUG00000019829)	ENSTRUG00000022776	ENSTRUG00000027664	ENSTRUG00000026551	ENSTRUG00000027794
Tetraodon	MODERN SPECIES	18	ENSTNIG00000001981	ENSTNIG00000014514	SLC5A3 (ENSTNIG00000014513)	ENSTNIG00000014512	fam184aa (ENSTNIG00000014511)	ENSTNIG00000014510	ENSTNIG00000014509	ENSTNIG00000014508	arhgef7b (ENSTNIG00000014507)	SOX1 (ENSTNIG00000012196)	ATP11A (ENSTNIG00000014506)	tubgcp3 (ENSTNIG00000014505)	ENSTNIG00000014504	ENSTNIG00000014503	GPR180 (ENSTNIG00000014502)	cnot9 (ENSTNIG00000014501) ##22	PLCD4 (ENSTNIG00000014500) ##23	slx9 (ENSTNIG00000014499)	adarb1a (ENSTNIG00000014498) ##13	cep70 (ENSTNIG00000014497)	ENSTNIG00000014496	dhrsx (ENSTNIG00000014495)	cd99 (ENSTNIG00000014494)	gyg2 (ENSTNIG00000014493)	MXRA5 (ENSTNIG00000014492)	PRKX (ENSTNIG00000014491)	ENSTNIG00000014489	pudp (ENSTNIG00000014488)	ENSTNIG00000014487	STS (ENSTNIG00000014486)	anos1a (ENSTNIG00000014485)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000153534.A	ENSGT00390000003758	ENSGT00940000163254	ENSGT01060000248575.D.c.b.a.a	ENSGT00530000063484.b.b.d.b	ENSGT00940000154342.C	ENSGT01030000234555.a.b.f.b	ENSGT00390000016929	ENSGT00940000155466.e.a	ENSGT00390000000447	ENSGT00940000159255	ENSGT00690000103830	ENSGT00940000159602	ENSGT00940000159870	ENSGT00940000164013	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a	ENSGT00940000163186	ENSGT00940000164022	ENSGT00940000154344.b	ENSGT00940000161628	ENSGT00940000159942.a.c.a	ENSGT00940000159832	ENSGT00940000156607.a.a	ENSGT00390000014753	ENSGT00940000165158.b	ENSGT00940000162022
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	434								nlgn4xa (ENSLBEG00000017271)	PRKX (ENSLBEG00000017303)	MXRA5 (ENSLBEG00000017327)	gyg2 (ENSLBEG00000017431)	cd99 (ENSLBEG00000017580)	dhrsx (ENSLBEG00000017609)	ZBED1 (ENSLBEG00000017623)	ENSLBEG00000017646	cnot9 (ENSLBEG00000017715) ##22	ENSLBEG00000017882 ##23	slx9 (ENSLBEG00000017930)	adarb1a (ENSLBEG00000017967) ##13	cep70 (ENSLBEG00000018022)	sowahcb (ENSLBEG00000018070)	ENSLBEG00000018101	ENSLBEG00000018159
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000153534.A	ENSGT00390000003758	ENSGT00940000163254	ENSGT01060000248575.D.c.b.a.a	ENSGT00530000063484.b.b.d.b	ENSGT00940000154342.C	ENSGT01030000234555.a.b.f.b	ENSGT00390000016929	ENSGT00940000155466.e.a	ENSGT00390000000447	ENSGT00940000159255	ENSGT00690000103830	ENSGT00940000159602	ENSGT00940000159870	ENSGT00940000164013	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a	ENSGT00940000164022	ENSGT00940000163186	ENSGT00940000154344.b	ENSGT00940000161628	ENSGT00940000159942.a.c.a	ENSGT00940000159832	ENSGT00940000156607.a.a	ENSGT00390000014753	ENSGT00940000165158.b	ENSGT00940000162022
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000164501.a.a.b.a	ENSGT00530000063480.a	ENSGT00390000008096.B.e.b	ENSGT00940000160342.g.a	ENSGT00940000165242.d	ENSGT00530000063669.b.b	ENSGT00390000002403	ENSGT00950000183302	ENSGT00940000158367	ENSGT00940000161679.b	ENSGT00940000154443.e	ENSGT00940000159196	ENSGT00940000153981.A	ENSGT01030000234765	ENSGT00940000164013	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a	ENSGT00940000164022	ENSGT00940000163186	ENSGT00940000154344.b	ENSGT00940000161628	ENSGT00940000159942.a.c.a	ENSGT00940000159832	ENSGT00940000156607.a.a	ENSGT00390000014753	ENSGT00940000165158.b	ENSGT00940000162022
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00940000164501.a.a.b.a	ENSGT00530000063480.a	ENSGT00390000008096.B.e.b	ENSGT00940000160342.g.a	ENSGT00940000165242.d	ENSGT00530000063669.b.b	ENSGT00390000002403	ENSGT00950000183302	ENSGT00940000158367	ENSGT00940000161679.b	ENSGT00940000154443.e	ENSGT00940000159196	ENSGT00940000153981.A	ENSGT01030000234765	ENSGT00940000164013	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a	ENSGT00940000164022	ENSGT00940000163186	ENSGT00940000154344.b	ENSGT00940000161628	ENSGT00940000159942.a.c.a	ENSGT00940000159832	ENSGT00940000156607.a.a	ENSGT00390000014753	ENSGT00940000162022	ENSGT00940000161153
European seabass	MODERN SPECIES	15	ENSDLAG00005025995	ENSDLAG00005025996	ENSDLAG00005025997	ENSDLAG00005025999	ENSDLAG00005026004	ENSDLAG00005026014	ENSDLAG00005026019	ENSDLAG00005026021	ENSDLAG00005031339	ENSDLAG00005026056	ENSDLAG00005026143	ENSDLAG00005026144	ENSDLAG00005031991	ENSDLAG00005026146	ENSDLAG00005026149	ENSDLAG00005030529 ##22	ENSDLAG00005026184 ##23	cep70 (ENSDLAG00005026219)	ENSDLAG00005026222 ##13	slx9 (ENSDLAG00005026231)	ENSDLAG00005026232	ENSDLAG00005032574	ENSDLAG00005026406	gyg2 (ENSDLAG00005026240)	ENSDLAG00005034998	PRKX (ENSDLAG00005026244)	ENSDLAG00005026248	ENSDLAG00005002707	ENSDLAG00005027855	ENSDLAG00005034318	ENSDLAG00005031624
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	480														ENSLCRG00005022450	ENSLCRG00005022447	cnot9 (ENSLCRG00005022444) ##22	ENSLCRG00005022354 ##23	slx9 (ENSLCRG00005022336)	adarb1a (ENSLCRG00005022316) ##13	cep70 (ENSLCRG00005022311)	sowahcb (ENSLCRG00005022309)	dhrsx (ENSLCRG00005022308)	ZBED1 (ENSLCRG00005022307)	ZBED1 (ENSLCRG00005022301)	cd99 (ENSLCRG00005022298)	gyg2 (ENSLCRG00005022296)	MXRA5 (ENSLCRG00005022295)	ENSLCRG00005022293	tipin (ENSLCRG00005022289)	lctla (ENSLCRG00005022287)	crybgx (ENSLCRG00005022285)
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	16	abat (ENSSAUG00010006554)	CRYGS (ENSSAUG00010008664)	ENSSAUG00010008666	fam184aa (ENSSAUG00010008675)	ENSSAUG00010008751	ENSSAUG00010008752	ENSSAUG00010008760	ENSSAUG00010008766	ENSSAUG00010008767	slc5a3a (ENSSAUG00010008769)	ENSSAUG00010008780	ENSSAUG00010009272	GPR180 (ENSSAUG00010009278)	ENSSAUG00010009288	ENSSAUG00010009294	cnot9 (ENSSAUG00010009307) ##22	ENSSAUG00010009325 ##23	slx9 (ENSSAUG00010009921)	adarb1a (ENSSAUG00010009927) ##13	cep70 (ENSSAUG00010010027)	odad3 (ENSSAUG00010010029)	sowahcb (ENSSAUG00010010031)	CACNB4 (ENSSAUG00010010040)	rcn3 (ENSSAUG00010010323)	nosip (ENSSAUG00010010326)	ENSSAUG00010010350	ENSSAUG00010010353	tspan4b (ENSSAUG00010010356)	ENSSAUG00010010361	SLITRK2 (ENSSAUG00010010363)	ENSSAUG00010010365
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	11	en1a (ENSMMDG00005003937)	ENSMMDG00005003941	ENSMMDG00005003950	ENSMMDG00005003968	ENSMMDG00005003973	SLC5A3 (ENSMMDG00005004000)	ENSMMDG00005005260	ENSMMDG00005012283	GPR180 (ENSMMDG00005012286)	ENSMMDG00005012288	ENSMMDG00005012289	ENSMMDG00005012299	runx1 (ENSMMDG00005012382)	DONSON (ENSMMDG00005012490)	ENSMMDG00005012493	cnot9 (ENSMMDG00005012494) ##22	ENSMMDG00005012527 ##23	slx9 (ENSMMDG00005013812)	adarb1a (ENSMMDG00005013819) ##13	ENSMMDG00005013927	DDRGK1 (ENSMMDG00005014127)	ENSMMDG00005014129	ddx4 (ENSMMDG00005014160)	UBE3A (ENSMMDG00005016321)	CNGA3 (ENSMMDG00005016743)	kpnb3 (ENSMMDG00005016767)	SEMA5B (ENSMMDG00005016835)	CACNB4 (ENSMMDG00005016911)	etv5b (ENSMMDG00005019229)	tmem237b (ENSMMDG00005019232)	MPP4 (ENSMMDG00005019240)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	140	ENSGT00940000160639.a	ENSGT00390000013151.a.a.a	ENSGT00940000161997.a	ENSGT00940000160532.g	ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.b	ENSGT00940000154486.b.b.b	ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.b	ENSGT00940000154486.b.b.a.a	ENSGT00940000155311.B	ENSGT00530000063599.B	ENSGT00390000006330.a.a.b	ENSGT00390000010463.a.b.c.a	ENSGT01050000244905.A.a	ENSGT00940000167649	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00390000001225.t ##22	ENSGT00390000001225.s.b ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00390000012561.b.pb.b	ENSGT00950000183114.a.b.b	ENSGT00940000160639.b.a.b.b.a	ENSGT00390000013151.a.a.a	ENSGT00940000161997.a	ENSGT00940000160532.g	ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.b	ENSGT00940000154486.b.b.b.a	ENSGT00940000155311.B	ENSGT00530000063599.B.m	ENSGT00390000006330.a.a.b	ENSGT00390000010463.a.b.c.a	ENSGT01050000244905.A.a	ENSGT00940000167649	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00390000001225.t ##22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.d ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00940000155238	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a	ENSGT00940000168183	ENSGT00940000163186	ENSGT00940000164022	ENSGT00940000154344.b	ENSGT00940000161628	ENSGT00390000002871	ENSGT00940000159942.a.c.a	ENSGT00940000159832	ENSGT00390000014753
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	747													ENSGT00940000167649.b	ENSGT01050000244905.A.a.n.a.b	ENSGT00390000005581.a.e	ENSGT00390000001225.t.a ##22	ENSGT00940000156180.e.e ##23	ENSGT00390000015709.d	ENSGT00940000155992.d.b ##13	ENSGT00390000009029.v	ENSGT00940000155238.`b.b	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a.e	ENSGT00940000164022.g.b
Huchen	MODERN SPECIES	13									ENSHHUG00000031115	mfsd6a (ENSHHUG00000031071)	nab1a (ENSHHUG00000031061)	glsa (ENSHHUG00000030927)	ENSHHUG00000030848	stat1a (ENSHHUG00000029325)	ftcd (ENSHHUG00000029280)	cnot9 (ENSHHUG00000029264) ##22	ENSHHUG00000029244 ##23	slx9 (ENSHHUG00000029182)	ADARB1 (ENSHHUG00000029164) ##13	cep70 (ENSHHUG00000029149)	septin10 (ENSHHUG00000029076)	sowahcb (ENSHHUG00000029068)	dhrsx (ENSHHUG00000029053)	ZBED1 (ENSHHUG00000029050)	cd99 (ENSHHUG00000029003)	MXRA5 (ENSHHUG00000028990)	PRKX (ENSHHUG00000028980)	pudp (ENSHHUG00000028978)	nlgn4xa (ENSHHUG00000028918)	ENSHHUG00000028911	STS (ENSHHUG00000028879)
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	49			ENSGT00940000160639.b.a.b.b.a.a	ENSGT00390000013151.a.a.a.c	ENSGT00940000161997.a.i	ENSGT00940000160532.g.g	ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.b.f	ENSGT00940000154486.b.b.b.a.a	ENSGT00530000063599.B.m.b	ENSGT00390000006330.a.a.b.d	ENSGT00390000010463.a.b.c.a.e	ENSGT01050000244905.A.a.m	ENSGT00940000167649.b	ENSGT01050000244905.A.a.n.a.b	ENSGT00390000005581.a.e	ENSGT00390000001225.t.a ##22	ENSGT00940000156180.e.e ##23	ENSGT00390000015709.d	ENSGT00940000155992.d.b ##13	ENSGT00390000009029.v	ENSGT00940000155238.`b.b	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a.e	ENSGT00940000164022.g.b	ENSGT00940000154344.b.g	ENSGT00940000159942.a.c.a.l	ENSGT00940000159832.l	ENSGT00390000014753.a	ENSGT00940000156607.a.a.mb.b	ENSGT00940000165158.b	ENSGT00940000161153.b	ENSGT00440000033720.a.a.b.c
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	48	ENSGT00940000167103.c	ENSGT00940000166136.d	ENSGT00390000012561.b.pb.b.d	ENSGT00940000160639.b.a.b.b.a.a	ENSGT00390000013151.a.a.a.c	ENSGT00940000161997.a.i	ENSGT00940000160532.g.g	ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.b.f	ENSGT00940000154486.b.b.b.a.a	ENSGT00530000063599.B.m.b	ENSGT00390000006330.a.a.b.d	ENSGT00390000010463.a.b.c.a.e	ENSGT01050000244905.A.a.m	ENSGT01050000244905.A.a.n.a.b	ENSGT00390000005581.a.e	ENSGT00390000001225.t.a ##22	ENSGT00940000156180.e.e ##23	ENSGT00390000015709.d	ENSGT00940000155992.d.b ##13	ENSGT00390000009029.v	ENSGT00940000155238.`b.b	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a.e	ENSGT00940000164022.g.b	ENSGT00940000154344.b.g	ENSGT00390000002871	ENSGT00940000159942.a.c.a.l	ENSGT00940000159832.l	ENSGT00390000014753.a	ENSGT00940000156607.a.a.mb.b	ENSGT00940000165158.b	ENSGT00940000161153.b
River trout	MODERN SPECIES	36	ARL4C (ENSSTUG00000050415)	sh3bp4a (ENSSTUG00000050422)	s100b (ENSSTUG00000050427)	ENSSTUG00000050431	ahr2 (ENSSTUG00000050438)	ENSSTUG00000050442	ahr1b (ENSSTUG00000050452)	ENSSTUG00000050473	ENSSTUG00000050477	mfsd6a (ENSSTUG00000050482)	nab1a (ENSSTUG00000050485)	glsa (ENSSTUG00000050506)	ENSSTUG00000050625	stat1a (ENSSTUG00000050679)	ftcd (ENSSTUG00000051044)	cnot9 (ENSSTUG00000051048) ##22	ENSSTUG00000051049 ##23	slx9 (ENSSTUG00000051051)	ADARB1 (ENSSTUG00000051056) ##13	cep70 (ENSSTUG00000051058)	ENSSTUG00000051064	sowahcb (ENSSTUG00000051086)	dhrsx (ENSSTUG00000051087)	cd99 (ENSSTUG00000051089)	MXRA5 (ENSSTUG00000000708)	PRKX (ENSSTUG00000000714)	pudp (ENSSTUG00000000723)	nlgn4xa (ENSSTUG00000000739)	ENSSTUG00000000821	STS (ENSSTUG00000000835)	anos1a (ENSSTUG00000000867)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	7	ENSSSAG00000104403	bzw1a (ENSSSAG00000108291)	aox5 (ENSSSAG00000058981)	ENSSSAG00000087803	sh3bp4a (ENSSSAG00000069340)	ENSSSAG00000069404	ahr2d (ENSSSAG00000071319)	ahr1b (ENSSSAG00000071494)	ENSSSAG00000071938	mfsd6a (ENSSSAG00000071941)	nab1a (ENSSSAG00000087426)	glsa (ENSSSAG00000072005)	ENSSSAG00000073463	stat1a (ENSSSAG00000073567)	ftcd (ENSSSAG00000076813)	cnot9 (ENSSSAG00000076829) ##22	ENSSSAG00000076833 ##23	ENSSSAG00000058191 ##13	cep70 (ENSSSAG00000076962)	ENSSSAG00000058588	ENSSSAG00000089233	ENSSSAG00000096164	cd99 (ENSSSAG00000077846)	ENSSSAG00000082674	ENSSSAG00000077880	ENSSSAG00000105329	ENSSSAG00000121769	ENSSSAG00000077900	ENSSSAG00000077914	pnpla4 (ENSSSAG00000077984)	STS (ENSSSAG00000077989)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	49				ENSGT00940000160639.b.a.b.b.a.a	ENSGT00390000013151.a.a.a.c	ENSGT00940000161997.a.i	ENSGT00940000160532.g.g	ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.b.f	ENSGT00940000154486.b.b.b.a.a	ENSGT00530000063599.B.m.b	ENSGT00390000006330.a.a.b.d	ENSGT00390000010463.a.b.c.a.e	ENSGT00940000167649.b	ENSGT01050000244905.A.a.n.a.b	ENSGT00390000005581.a.e	ENSGT00390000001225.t.a ##22	ENSGT00940000156180.e.e ##23	ENSGT00390000015709.d	ENSGT00940000155992.d.b ##13	ENSGT00390000009029.v	ENSGT00940000155238.`b.b	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a.e	ENSGT00940000164022.g.b	ENSGT00940000154344.b.g	ENSGT00940000159942.a.c.a.l	ENSGT00940000159832.l	ENSGT00390000014753.a	ENSGT00940000156607.a.a.mb.b.a	ENSGT00940000165158.b	ENSGT00940000161153.b	ENSGT00440000033720.a.a.b.c
Rainbow trout	MODERN SPECIES	9	aox5 (ENSOMYG00000021465)	ENSOMYG00000020913	sh3bp4a (ENSOMYG00000020902)	s100b (ENSOMYG00000020886)	ENSOMYG00000020864	ahr2 (ENSOMYG00000020725)	ENSOMYG00000020677	ahr1b (ENSOMYG00000020656)	mfsd6a (ENSOMYG00000020644)	nab1a (ENSOMYG00000020636)	glsa (ENSOMYG00000020604)	ENSOMYG00000069747	ENSOMYG00000020539	ENSOMYG00000020320	ftcd (ENSOMYG00000020057)	cnot9 (ENSOMYG00000020025) ##22	ENSOMYG00000070437 ##23	slx9 (ENSOMYG00000020014)	ENSOMYG00000019985 ##13	cep70 (ENSOMYG00000019938)	ENSOMYG00000019892	ENSOMYG00000019867	dhrsx (ENSOMYG00000019864)	cd99 (ENSOMYG00000019853)	ENSOMYG00000019828	ENSOMYG00000066841	ENSOMYG00000019812	ENSOMYG00000019805	ENSOMYG00000019624	ENSOMYG00000019532	STS (ENSOMYG00000019513)
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000012561.b.pb.b.d	ENSGT00950000183114.a.b.b	ENSGT00940000160639.b.a.b.b.a.a	ENSGT00390000013151.a.a.a.c	ENSGT00940000161997.a.i	ENSGT00940000160532.g.g	ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.b.f	ENSGT00940000154486.b.b.b.a.a	ENSGT00530000063599.B.m.b	ENSGT00530000063599.B.m.a.b	ENSGT00390000006330.a.a.b.d	ENSGT00390000010463.a.b.c.a.e	ENSGT00940000167649.b	ENSGT01050000244905.A.a.n.a.b	ENSGT00390000005581.a.e	ENSGT00390000001225.t.a ##22	ENSGT00390000015709.d	ENSGT00940000155992.d.b ##13	ENSGT00390000009029.v	ENSGT00940000155238.`b.b	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a.e	ENSGT00940000164022.g.b	ENSGT00940000154344.b.g	ENSGT00940000159942.a.c.a.l	ENSGT00940000159832.l	ENSGT00990000210900	ENSGT00940000156607.a.a.mb.b.a	ENSGT00940000165158.b	ENSGT00940000161153.b	ENSGT00440000033720.a.a.b.c	ENSGT01000000215583.a.b
Chinook salmon	DUPLICATION
Chinook salmon	MODERN SPECIES	5	ENSOTSG00005043572	bzw1a (ENSOTSG00005043571)	aox5 (ENSOTSG00005042834)	ARL4C (ENSOTSG00005042816)	sh3bp4a (ENSOTSG00005042815)	s100b (ENSOTSG00005042814)	ENSOTSG00005042813	ahr2 (ENSOTSG00005042811)	ENSOTSG00005042810	ahr1b (ENSOTSG00005042808)	mfsd6a (ENSOTSG00005042807)	nab1a (ENSOTSG00005042806)	glsa (ENSOTSG00005042156)	stat1a (ENSOTSG00005035552)	ftcd (ENSOTSG00005035320)	cnot9 (ENSOTSG00005035311) ##22	slx9 (ENSOTSG00005035306)	ADARB1 (ENSOTSG00005035206) ##13	cep70 (ENSOTSG00005035199)	ENSOTSG00005035149	sowahcb (ENSOTSG00005035148)	dhrsx (ENSOTSG00005035147)	ENSOTSG00005035146	ENSOTSG00005035145	MXRA5 (ENSOTSG00005035144)	ENSOTSG00005035143	ENSOTSG00005035142	nlgn4xa (ENSOTSG00005034500)	ENSOTSG00005034496	ENSOTSG00005034495	anos1a (ENSOTSG00005034492)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	31	aox5 (ENSOTSG00005024759)	ARL4C (ENSOTSG00005027585)	sh3bp4a (ENSOTSG00005027586)	s100b (ENSOTSG00005027588)	ENSOTSG00005027591	ahr2 (ENSOTSG00005027595)	ahr1b (ENSOTSG00005027603)	ENSOTSG00005027606	mfsd6a (ENSOTSG00005027610)	nab1a (ENSOTSG00005027616)	glsa (ENSOTSG00005019550)	ENSOTSG00005023358	stat1a (ENSOTSG00005023370)	ftcd (ENSOTSG00005023870)	ENSOTSG00005024390	cnot9 (ENSOTSG00005024392) ##22	slx9 (ENSOTSG00005024393)	ADARB1 (ENSOTSG00005024395) ##13	cep70 (ENSOTSG00005024396)	ENSOTSG00005024397	sowahcb (ENSOTSG00005024415)	cd99 (ENSOTSG00005024418)	MXRA5 (ENSOTSG00005024419)	PRKX (ENSOTSG00005024421)	ENSOTSG00005024423	nlgn4xa (ENSOTSG00005024424)	ahr2 (ENSOTSG00005024967)	ENSOTSG00005024972	s100b (ENSOTSG00005024974)	sh3bp4a (ENSOTSG00005024975)	ARL4C (ENSOTSG00005024981)
Coho salmon	MODERN SPECIES	7	ENSOKIG00005035046	bzw1a (ENSOKIG00005035073)	aox5 (ENSOKIG00005037375)	ENSOKIG00005050768	S100B (ENSOKIG00005050770)	ARL4C (ENSOKIG00005050771)	sh3bp4a (ENSOKIG00005050774)	ENSOKIG00005050777	ahr2 (ENSOKIG00005050781)	ahr1b (ENSOKIG00005050793)	mfsd6a (ENSOKIG00005050799)	nab1a (ENSOKIG00005050800)	glsa (ENSOKIG00005050832)	ENSOKIG00005050878	ftcd (ENSOKIG00005050884)	cnot9 (ENSOKIG00005050886) ##22	slx9 (ENSOKIG00005050888)	ADARB1 (ENSOKIG00005050894) ##13	cep70 (ENSOKIG00005050898)	ENSOKIG00005050905	SOWAHC (ENSOKIG00005050912)	dhrsx (ENSOKIG00005050914)	cd99 (ENSOKIG00005050915)	MXRA5 (ENSOKIG00005050917)	PRKX (ENSOKIG00005050918)	ENSOKIG00005050919	nlgn4xa (ENSOKIG00005050923)	ENSOKIG00005050925	ENSOKIG00005050926	ENSOKIG00005050929	ANOS1 (ENSOKIG00005050932)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	512											ENSGT00390000010463.a.b.c.a.f	ENSGT01050000244905.A.a.n.b	ENSGT00940000167649.a	ENSGT01050000244905.A.a.n.a.a	ENSGT00390000005581.a.f	ENSGT00390000001225.t.b ##22	ENSGT00940000156180.e.f ##23	ENSGT00390000015709.c	ENSGT00940000155992.d.a ##13	ENSGT00390000009029.u	ENSGT00940000155238.`b.a	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a.f	ENSGT00940000164022.g.a	ENSGT00940000154344.b.h	ENSGT00940000161628	ENSGT00390000002871	ENSGT00940000159942.a.c.a.k	ENSGT00940000159832.k	ENSGT00390000014753.b	ENSGT00940000156607.a.a.mb.a
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Salmo	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00940000161997.a.j	ENSGT00940000160532.g.h	ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.b.e	ENSGT00940000169027.c.a	ENSGT00940000153773.a.b	ENSGT00940000154486.b.b.b.a.b	ENSGT00940000155311.B	ENSGT00530000063599.B.m.a	ENSGT00390000006330.a.a.b.c	ENSGT00940000165672.r	ENSGT00390000010463.a.b.c.a.f	ENSGT01050000244905.A.a.n.b.a	ENSGT01050000244905.A.a.n.b.b	ENSGT00940000167649.a	ENSGT00390000005581.a.f	ENSGT00390000001225.t.b ##22	ENSGT00940000156180.e.f ##23	ENSGT00390000015709.c	ENSGT00940000155992.d.a ##13	ENSGT00390000009029.u	ENSGT00940000155238.`b.a	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a.f	ENSGT00940000164022.g.a	ENSGT00940000154344.b.h	ENSGT00940000161628	ENSGT00940000159942.a.c.a.k	ENSGT00940000159832.k	ENSGT00390000014753.b	ENSGT00940000156607.a.a.mb.a	ENSGT01060000249735	ENSGT00940000161153.a
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	8	S100B (ENSSSAG00000040846)	ENSSSAG00000040976	ahr2g (ENSSSAG00000045517)	ENSSSAG00000122068	ahr1b (ENSSSAG00000088295)	ENSSSAG00000045960	ENSSSAG00000045973	mfsd6a (ENSSSAG00000046008)	nab1a (ENSSSAG00000082005)	ENSSSAG00000046045	glsa (ENSSSAG00000046133)	stat1a (ENSSSAG00000102446)	stat1a (ENSSSAG00000056374)	ENSSSAG00000056556	ftcd (ENSSSAG00000056562)	cnot9 (ENSSSAG00000056588) ##22	ENSSSAG00000093879	ENSSSAG00000056655 ##23	cu070 (ENSSSAG00000111094)	ENSSSAG00000076949 ##13	cep70 (ENSSSAG00000058525)	ENSSSAG00000076980	ENSSSAG00000059284	dhrsx (ENSSSAG00000059294)	cd99 (ENSSSAG00000059521)	gyg2 (ENSSSAG00000059557)	ENSSSAG00000083022	ENSSSAG00000085889	ENSSSAG00000059684	ENSSSAG00000059730	ENSSSAG00000061329
River trout	MODERN SPECIES	32	sh3bp4a (ENSSTUG00000032651)	s100b (ENSSTUG00000032637)	ENSSTUG00000032602	ahr2 (ENSSTUG00000032386)	ENSSTUG00000032363	ENSSTUG00000032334	ahr1b (ENSSTUG00000032193)	ENSSTUG00000032145	mfsd6a (ENSSTUG00000032104)	ENSSTUG00000032080	glsa (ENSSTUG00000028542)	stat1a (ENSSTUG00000027560)	stat1a (ENSSTUG00000025375)	ENSSTUG00000025302	ftcd (ENSSTUG00000025218)	cnot9 (ENSSTUG00000025163) ##22	ENSSTUG00000022817 ##23	slx9 (ENSSTUG00000022681)	ADARB1 (ENSSTUG00000022639) ##13	cep70 (ENSSTUG00000048948)	ENSSTUG00000048846	sowahcb (ENSSTUG00000048827)	dhrsx (ENSSTUG00000048810)	cd99 (ENSSTUG00000048772)	gyg2 (ENSSTUG00000048768)	zgc:153142 (ENSSTUG00000048765)	MXRA5 (ENSSTUG00000048742)	ENSSTUG00000048723	pudp (ENSSTUG00000048715)	nlgn4xa (ENSSTUG00000048619)	ENSSTUG00000048604
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000160639.b.a.b.b.a.b	ENSGT00390000013151.a.a.a.d	ENSGT00940000161997.a.j	ENSGT00940000160532.g.h	ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.b.e	ENSGT00940000154486.b.b.b.a.b	ENSGT00940000155311.B	ENSGT00530000063599.B.m.a.a	ENSGT00390000006330.a.a.b.c	ENSGT00940000165672.r	ENSGT00390000010463.a.b.c.a.f	ENSGT01050000244905.A.a.n.b	ENSGT00940000167649.a	ENSGT01050000244905.A.a.n.a.a	ENSGT00390000005581.a.f	ENSGT00390000001225.t.b ##22	ENSGT00940000156180.e.f ##23	ENSGT00390000015709.c	ENSGT00940000155992.d.a ##13	ENSGT00390000009029.u	ENSGT00940000155238.`b.a	ENSGT00950000183003.a.a.b.c.a.f	ENSGT00970000198397	ENSGT00940000164807.E.a.a.a.b.b	ENSGT00940000157622.a.a.d	ENSGT00940000163186	ENSGT00940000164022.g.a	ENSGT00940000154344.b.h	ENSGT00940000161628	ENSGT00390000002871.c	ENSGT00940000159942.a.c.a.k
Rainbow trout	MODERN SPECIES	28	s100b (ENSOMYG00000043015)	ENSOMYG00000042998	ahr2 (ENSOMYG00000042973)	ahr1b (ENSOMYG00000042466)	ENSOMYG00000042395	mfsd6a (ENSOMYG00000042389)	nab1a (ENSOMYG00000042385)	ENSOMYG00000062063	ENSOMYG00000042380	glsa (ENSOMYG00000037999)	stat1a (ENSOMYG00000035706)	stat1a (ENSOMYG00000034815)	mstn2a (ENSOMYG00000034675)	stat1-2 (ENSOMYG00000029899)	ftcd (ENSOMYG00000028552)	cnot9 (ENSOMYG00000028478) ##22	ENSOMYG00000025557 ##23	slx9 (ENSOMYG00000024848)	ENSOMYG00000059934	ENSOMYG00000024220 ##13	cep70 (ENSOMYG00000024063)	ENSOMYG00000024029	ENSOMYG00000053356	ENSOMYG00000062304	ENSOMYG00000021692	cd99 (ENSOMYG00000021243)	gyg2 (ENSOMYG00000021209)	ENSOMYG00000057791	ENSOMYG00000072229	ENSOMYG00000021193	ENSOMYG00000021183
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000160532.h.d.a	ENSGT00950000182977.B.b.b.d	ENSGT00940000160532.h.d.b	ENSGT00530000065251.m.a	ENSGT00940000153773.a.b	ENSGT00940000154486.b.b.b.a.b	ENSGT00940000155311.B	ENSGT00530000063599.B.m.a.a	ENSGT00390000006330.a.a.b.c	ENSGT00940000165672.r	ENSGT00390000010463.a.b.c.a.f	ENSGT01050000244905.A.a.n.b	ENSGT00940000167649.a	ENSGT01050000244905.A.a.n.a.a	ENSGT00390000005581.a.f	ENSGT00390000001225.t.b ##22	ENSGT00940000156180.e.f ##23	ENSGT00390000015709.c	ENSGT00390000013151.a.a.b.d	ENSGT00940000160639.b.a.b.b.b.b.d	ENSGT00940000160639.b.a.b.b.b.b.c	ENSGT00940000166921.a	ENSGT00950000182860.a.b.b.d	ENSGT00950000183208.A.c.b.f	ENSGT00940000157233.d.h	ENSGT00530000064137.a.b.u.b	ENSGT00940000158526.t	ENSGT00390000000220.A.d	ENSGT00390000000220.B.c.b.b	ENSGT00390000015050.`b.a.f	ENSGT00940000157541.f.d.d
Chinook salmon	DUPLICATION
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Chinook salmon	MODERN SPECIES	31	ENSOTSG00005012333	casp2 (ENSOTSG00005012334)	ENSOTSG00005012336	FAM131B (ENSOTSG00005012953)	ENSOTSG00005012954	ENSOTSG00005012956	ENSOTSG00005012957	mfsd6a (ENSOTSG00005012959)	nab1a (ENSOTSG00005012963)	ENSOTSG00005012966	glsa (ENSOTSG00005012993)	stat1a (ENSOTSG00005021981)	ENSOTSG00005022141	stat1a (ENSOTSG00005022152)	ftcd (ENSOTSG00005022537)	cnot9 (ENSOTSG00005022994) ##22	ENSOTSG00005023001 ##23	slx9 (ENSOTSG00005023104)	cep70 (ENSOTSG00005023112)	ENSOTSG00005023141	sowahcb (ENSOTSG00005026699)	dhrsx (ENSOTSG00005026701)	ENSOTSG00005026704	cd99 (ENSOTSG00005026724)	gyg2 (ENSOTSG00005000756)	zgc:153142 (ENSOTSG00005001082)	MXRA5 (ENSOTSG00005001089)	ENSOTSG00005001107	pudp (ENSOTSG00005001145)	nlgn4xa (ENSOTSG00005001184)	ENSOTSG00005002174
Coho salmon	MODERN SPECIES	25	ENSOKIG00005005295	ENSOKIG00005005269	ahr2 (ENSOKIG00005005263)	ENSOKIG00005005251	ENSOKIG00005049356	ahr1b (ENSOKIG00005049321)	ENSOKIG00005049306	mfsd6a (ENSOKIG00005049297)	nab1a (ENSOKIG00005049290)	ENSOKIG00005049282	glsa (ENSOKIG00005048559)	stat1a (ENSOKIG00005048380)	ENSOKIG00005048365	ENSOKIG00005048097	ftcd (ENSOKIG00005047908)	cnot9 (ENSOKIG00005047863) ##22	ENSOKIG00005047090 ##23	slx9 (ENSOKIG00005047007)	ADARB1 (ENSOKIG00005046750) ##13	cep70 (ENSOKIG00005046714)	ENSOKIG00005046595	sowahcb (ENSOKIG00005046584)	dhrsx (ENSOKIG00005046567)	cd99 (ENSOKIG00005046547)	gyg2 (ENSOKIG00005046538)	zgc:153142 (ENSOKIG00005046528)	MXRA5 (ENSOKIG00005046522)	PRKX (ENSOKIG00005046509)	pudp (ENSOKIG00005046504)	ENSOKIG00005046403	STS (ENSOKIG00005046383)
Huchen	MODERN SPECIES	1732										glsa (ENSHHUG00000041545)	stat1a (ENSHHUG00000041513)	ENSHHUG00000041511	stat1a (ENSHHUG00000040560)	ENSHHUG00000040529	ftcd (ENSHHUG00000040391)	cnot9 (ENSHHUG00000040322) ##22	ENSHHUG00000040159 ##23	slx9 (ENSHHUG00000040143)	ADARB1 (ENSHHUG00000040100) ##13	cep70 (ENSHHUG00000040088)	septin10 (ENSHHUG00000039545)	sowahcb (ENSHHUG00000039534)
Northern pike	MODERN SPECIES	21	ARL4C (ENSELUG00000015699)	sh3bp4a (ENSELUG00000015726)	s100b (ENSELUG00000015744)	ENSELUG00000031760	RHCG (ENSELUG00000015813)	ENSELUG00000015840	ahr2 (ENSELUG00000015884)	ahr1b (ENSELUG00000015980)	ENSELUG00000016012	mfsd6a (ENSELUG00000016114)	nab1a (ENSELUG00000016158)	glsa (ENSELUG00000016228)	mstna (ENSELUG00000016246)	stat1a (ENSELUG00000016334)	ftcd (ENSELUG00000016402)	cnot9 (ENSELUG00000016480) ##22	ENSELUG00000016500 ##23	slx9 (ENSELUG00000016526)	ADARB1 (ENSELUG00000016573) ##13	cep70 (ENSELUG00000016655)	SEPTIN10 (ENSELUG00000016706)	sowahcb (ENSELUG00000016718)	ENSELUG00000016743	ZBED1 (ENSELUG00000016729)	cd99 (ENSELUG00000016776)	gyg2 (ENSELUG00000016821)	zgc:153142 (ENSELUG00000016846)	MXRA5 (ENSELUG00000016927)	PRKX (ENSELUG00000016968)	pudp (ENSELUG00000016995)	nlgn4xa (ENSELUG00000001445)
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	515														ENSGT00940000167649	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00390000001225 #22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	121	ENSGT00950000183114.a.b.b	ENSGT00940000160639.b.b	ENSGT00940000160639.a	ENSGT00390000013151.a.a.a	ENSGT00940000161997.a	ENSGT00940000160532.g	ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.b	ENSGT00940000154486.b.b.b	ENSGT00940000155311.B	ENSGT00530000063599.B.g	ENSGT00390000006330.a.a.b	ENSGT00390000010463.a.b.c.a	ENSGT01050000244905.A.a	ENSGT00940000167649	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00390000001225 #22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00390000015050.`b.b	ENSGT00940000157541.e	ENSGT01100000263596	ENSGT00940000156095.m.a	ENSGT00940000158559	ENSGT00940000155759.e.b	ENSGT00390000001170.a.b	ENSGT00940000153470.a.a.a.a	ENSGT00940000159094.e	ENSGT00940000156353.u.b	ENSGT00940000157211.k
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	170	ENSGT00940000160639.b.b	ENSGT00940000160639.a	ENSGT00390000013151.a.a.a	ENSGT00940000161997.a	ENSGT00940000160532.g.c	ENSGT00940000160532.g.d	ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.b	ENSGT00940000154486.b.b.b	ENSGT00940000155311.B	ENSGT00530000063599.B.g	ENSGT00390000006330.a.a.b	ENSGT00390000010463.a.b.c.a	ENSGT01050000244905.A.a	ENSGT00940000167649	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00390000001225 #22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00390000015050.`b.b
Channel catfish	MODERN SPECIES	19	bzw1a (ENSIPUG00000003696)	ENSIPUG00000003855	he1.2 (ENSIPUG00000005527)	ENSIPUG00000005763	ENSIPUG00000006298	sh3bp4a (ENSIPUG00000006332)	S100B (ENSIPUG00000006356)	ENSIPUG00000006377	ahr2 (ENSIPUG00000006401)	ahr1b (ENSIPUG00000006436)	ENSIPUG00000006485	mfsd6a (ENSIPUG00000006492)	stat1a (ENSIPUG00000006568)	mstna (ENSIPUG00000008665)	FTCD (ENSIPUG00000008676)	cnot9 (ENSIPUG00000008737) #22	ENSIPUG00000008758 ##23	fam207a (ENSIPUG00000008788)	adarb1 (ENSIPUG00000008816) ##13	mmadhca (ENSIPUG00000008913)	cep70 (ENSIPUG00000008869)	krt96 (ENSIPUG00000008945)	krt222 (ENSIPUG00000008981)	mettl21a (ENSIPUG00000009009)	dpp4 (ENSIPUG00000009029)	gcga (ENSIPUG00000009050)	PCYT2 (ENSIPUG00000009148)	GNAO (ENSIPUG00000009256)	npb (ENSIPUG00000009301)	sgsh (ENSIPUG00000009330)	slc26a11 (ENSIPUG00000009399)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	87						ENSGT00940000160532.g.d	ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.b.a	ENSGT00940000154486.b.b.b	ENSGT00940000155311.B	ENSGT00530000063599.B.g	ENSGT00390000006330.a.a.b	ENSGT00390000010463.a.b.c.a	ENSGT01050000244905.A.a	ENSGT00940000167649	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00390000001225 #22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00390000015050.`b.b	ENSGT00950000182969.B.c.a.b	ENSGT00940000159655	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000163944	ENSGT00390000005372.f	ENSGT00550000075065.b	ENSGT00940000164753.b	ENSGT00940000158204.d	ENSGT00390000013080	ENSGT01070000253775.b
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	84						ENSGT00940000160532.g.d	ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.b.a	ENSGT00940000154486.b.b.b	ENSGT00940000155311.B	ENSGT00530000063599.B.g	ENSGT00390000006330.a.a.b	ENSGT00390000010463.a.b.c.a	ENSGT01050000244905.A.a	ENSGT00940000167649	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00390000001225 #22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00390000015050.`b.b	ENSGT00950000182969.B.c.a.b	ENSGT00940000159655	ENSGT00940000157249	ENSGT00940000163944	ENSGT00390000005372.f	ENSGT00550000075065.b	ENSGT00940000164753.b	ENSGT00940000158204.d	ENSGT00390000013080	ENSGT01070000253775.b
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	802																cnot9 (ENSPNAG00000022564) #22	ENSPNAG00000022645 ##23	slx9 (ENSPNAG00000022664)	adarb1a (ENSPNAG00000022697) ##13	cep70 (ENSPNAG00000022802)	mmadhca (ENSPNAG00000022832)	krt96 (ENSPNAG00000003740)	KRT222 (ENSPNAG00000006816)	ENSPNAG00000022855
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	50			ENSAMXG00000013974	ENSAMXG00000043102	ahr2 (ENSAMXG00000013928)	ahr1b (ENSAMXG00000013907)	ENSAMXG00000026310	mfsd6a (ENSAMXG00000013890)	nab1a (ENSAMXG00000013878)	dnaaf1 (ENSAMXG00000037795)	glsa (ENSAMXG00000013859)	pipox (ENSAMXG00000037120)	stat1a (ENSAMXG00000013830)	mstna (ENSAMXG00000029840)	ftcd (ENSAMXG00000013790)	cnot9 (ENSAMXG00000013778) #22	ENSAMXG00000032795 ##23	slx9 (ENSAMXG00000030110)	adarb1a (ENSAMXG00000013675) ##13	cep70 (ENSAMXG00000013654)	mmadhca (ENSAMXG00000034884)	krt96 (ENSAMXG00000041340)	ENSAMXG00000032855	mettl21a (ENSAMXG00000037058)	dpp4 (ENSAMXG00000013549)	gcga (ENSAMXG00000039471)	pcyt2 (ENSAMXG00000035632)	ENSAMXG00000031693	nptxrb (ENSAMXG00000029357)	ENSAMXG00000013873	ENSAMXG00000029688
Electric eel	MODERN SPECIES	527					KCNB2 (ENSEEEG00000012601)	trpa1b (ENSEEEG00000012604)	MSC (ENSEEEG00000012607)	wdr83os (ENSEEEG00000012608)	ENSEEEG00000012610	mfsd6a (ENSEEEG00000012612)	nab1a (ENSEEEG00000012641)	glsa (ENSEEEG00000012646)	stat1a (ENSEEEG00000012649)	mstna (ENSEEEG00000012655)	ftcd (ENSEEEG00000012824)	cnot9 (ENSEEEG00000012825) #22	ENSEEEG00000012842 ##23	slx9 (ENSEEEG00000013296)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00950000183114.a.b.b.gb.a	ENSGT00950000183114.a.b.b.hb	ENSGT00940000160639.b.a.a	ENSGT00390000013151.a.a.a	ENSGT00940000161997.a	ENSGT00940000160532.g	ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.b	ENSGT00940000154486.b.b.b	ENSGT00940000155311.B	ENSGT00530000063599.B.g	ENSGT00390000006330.a.a.b	ENSGT00390000010463.a.b.c.a	ENSGT01050000244905.A.a	ENSGT00940000167649	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00390000001225 #22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00390000015709	ENSGT00940000155992.c.b ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00390000015050.`b.b	ENSGT00940000157541.e	ENSGT00940000156095.m.a	ENSGT00940000158559	ENSGT00940000155759.e.b	ENSGT00390000001170.a.b	ENSGT00940000153470.a.a.a.a	ENSGT00940000159094.e	ENSGT00940000156353.u.b	ENSGT00940000157211.k	ENSGT00950000182969.B.c.a.b
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.b.c	ENSGT00940000154486.b.b.b.f	ENSGT00940000155311.B	ENSGT00530000063599.B.g.d	ENSGT00390000006330.a.a.b.a	ENSGT00390000010463.a.b.c.a.a	ENSGT01050000244905.A.a.b	ENSGT00940000167649.f.a	ENSGT00530000063599.B.g.c	ENSGT00390000006330.a.a.b.b	ENSGT00390000010463.a.b.c.a.b	ENSGT01050000244905.A.a.a	ENSGT00940000167649.f.b	ENSGT00940000167649.e	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00390000001225.q #22	ENSGT00940000156180.e.a ##23	ENSGT00390000015709.b	ENSGT00940000155992.c.b.g ##13	ENSGT00390000015050.`b.b.b	ENSGT00940000157541.e.w	ENSGT00940000156095.m.a.b	ENSGT00940000158559.d	ENSGT00940000155759.e.b.a	ENSGT00390000001170.a.b.d	ENSGT00940000153470.a.a.a.a.e	ENSGT00940000159094.e.a	ENSGT00940000156353.u.b.f	ENSGT00940000157211.k.b	ENSGT00950000182969.B.c.a.b.f	ENSGT00940000159655.e
Goldfish	DUPLICATION
Goldfish	MODERN SPECIES	14	ENSCARG00000021065	ENSCARG00000021055	ENSCARG00000021049	ENSCARG00000021012	ENSCARG00000021004	ENSCARG00000020999	AhR2 (ENSCARG00000020982)	ahr1b (ENSCARG00000020953)	ENSCARG00000020943	mfsd6a (ENSCARG00000020932)	nab1a (ENSCARG00000020926)	glsa (ENSCARG00000019265)	stat1a (ENSCARG00000019108)	mstna (ENSCARG00000019065)	ftcd (ENSCARG00000018797)	cnot9 (ENSCARG00000018761) #22	ENSCARG00000018757	ENSCARG00000018748	ENSCARG00000018741	ENSCARG00000018738	ENSCARG00000018736	ENSCARG00000018733	ENSCARG00000018731	ENSCARG00000018723	ENSCARG00000018717	ENSCARG00000018714	ENSCARG00000018704	ENSCARG00000018686	ENSCARG00000018697	ENSCARG00000018675	ENSCARG00000018672
Goldfish	MODERN SPECIES	14	ENSCARG00000042799	ENSCARG00000042744	cela1.6 (ENSCARG00000042709)	ENSCARG00000040720	ENSCARG00000040642	ahr2 (ENSCARG00000040299)	ENSCARG00000040267	ahr1b (ENSCARG00000040185)	ENSCARG00000040156	mfsd6a (ENSCARG00000040144)	nab1a (ENSCARG00000040133)	glsa (ENSCARG00000036617)	stat1a (ENSCARG00000035963)	mstna (ENSCARG00000035931)	ftcd (ENSCARG00000034487)	cnot9 (ENSCARG00000034144) #22	ENSCARG00000030708 ##23	slx9 (ENSCARG00000030582)	adarb1a (ENSCARG00000030514) ##13	mmadhca (ENSCARG00000030491)	rnd3a (ENSCARG00000030471)	R3HDM1 (ENSCARG00000028063)	ccnt2b (ENSCARG00000027929)	TMEM163 (ENSCARG00000027906)	ENSCARG00000027898	ENSCARG00000027890	ENSCARG00000027881	ENSCARG00000009640	ENSCARG00000009620	ENSCARG00000009613	ENSCARG00000009606
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Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	144						ENSGT00990000210218	ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.b.c	ENSGT00940000154486.b.b.b.f	ENSGT00940000155311.B.k	ENSGT00530000063599.B.g.d	ENSGT00390000006330.a.a.b.a	ENSGT00390000010463.a.b.c.a.a	ENSGT01050000244905.A.a.b	ENSGT00940000167649.f.a	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00390000001225.r #22	ENSGT00940000156180.e.b ##23	ENSGT00390000015709.a	ENSGT00940000155992.c.b.h ##13	ENSGT00390000009029	ENSGT00390000015050.`b.b.a	ENSGT00940000157541.e.x	ENSGT00940000156095.m.a.a	ENSGT00940000158559.c	ENSGT00940000155759.e.b.b	ENSGT00390000001170.a.b.c	ENSGT00940000153470.a.a.a.a.f	ENSGT00940000159094.e.b	ENSGT00940000156353.u.b.e	ENSGT00940000157211.k.a	ENSGT00950000182969.B.c.a.b.e
Common carp reference	MODERN SPECIES	43	ENSCCRG00000066892	ENSCCRG00000029718	arl4ca (ENSCCRG00000068203)	sh3bp4a (ENSCCRG00000081633)	ENSCCRG00000076782	s100b (ENSCCRG00000069359)	ENSCCRG00000003704	ahr2 (ENSCCRG00000031831)	ahr1b (ENSCCRG00000005944)	ENSCCRG00000073877	mfsd6a (ENSCCRG00000039447)	nab1a (ENSCCRG00000054360)	glsa (ENSCCRG00000032031)	stat1a (ENSCCRG00000035713)	mstna (ENSCCRG00000035818)	cnot9 (ENSCCRG00000041798) #22	ENSCCRG00000028054 ##23	slx9 (ENSCCRG00000052631)	adarb1a (ENSCCRG00000020488) ##13	cep70 (ENSCCRG00000008917)	mmadhca (ENSCCRG00000057539)	rnd3a (ENSCCRG00000043088)	ENSCCRG00000008994	ENSCCRG00000000761	ccnt2b (ENSCCRG00000066766)	ENSCCRG00000000810	mgat5 (ENSCCRG00000077969)	ENSCCRG00000020887	ENSCCRG00000022437	ENSCCRG00000038513	ptpn4b (ENSCCRG00000038493)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	294	aox5 (ENSSGRG00000023726)	AOX1 (ENSSGRG00000023054)	arl4ca (ENSSGRG00000023030)	sh3bp4a (ENSSGRG00000023017)	s100b (ENSSGRG00000023015)	CNTNAP5 (ENSSGRG00000023011)	ahr2 (ENSSGRG00000023001)	ahr1b (ENSSGRG00000022942)	ENSSGRG00000022941	mfsd6a (ENSSGRG00000022940)	nab1a (ENSSGRG00000022939)	glsa (ENSSGRG00000022467)	stat1a (ENSSGRG00000021736)	ENSSGRG00000021728	ftcd (ENSSGRG00000021699)	cnot9 (ENSSGRG00000021698) #22	PLCD4 (ENSSGRG00000021487) ##23	slx9 (ENSSGRG00000021481)	adarb1a (ENSSGRG00000021475) ##13	mmadhca (ENSSGRG00000021472)	rnd3a (ENSSGRG00000021462)
Goldfish	MODERN SPECIES	41	ENSCARG00000047934	AOX1 (ENSCARG00000047824)	arl4ca (ENSCARG00000047805)	ENSCARG00000047783	sh3bp4a (ENSCARG00000047723)	s100b (ENSCARG00000047694)	ENSCARG00000040693	ahr2 (ENSCARG00000040345)	ENSCARG00000040333	ahr1b (ENSCARG00000040222)	mfsd6a (ENSCARG00000040194)	glsa (ENSCARG00000039255)	stat1a (ENSCARG00000034836)	mstna (ENSCARG00000034715)	ENSCARG00000034701	cnot9 (ENSCARG00000034596) #22	ENSCARG00000032255 ##23	adarb1a (ENSCARG00000031891) ##13	cep70 (ENSCARG00000031810)	mmadhca (ENSCARG00000031782)	rnd3a (ENSCARG00000031747)	R3HDM1 (ENSCARG00000031421)	ZRANB3 (ENSCARG00000030341)	ccnt2b (ENSCARG00000030214)	TMEM163 (ENSCARG00000030198)	mgat5 (ENSCARG00000030031)	ENSCARG00000029970	PTH2R (ENSCARG00000029891)	MRAS (ENSCARG00000029875)	ptpn4b (ENSCARG00000029749)	ENSCARG00000029718
Zebrafish	MODERN SPECIES	14	ENSDARG00000020054	arl4ca (ENSDARG00000057606)	sh3bp4a (ENSDARG00000020000)	s100b (ENSDARG00000057598)	ENSDARG00000093992	CNTNAP5 (ENSDARG00000075189)	ENSDARG00000096917	ahr2 (ENSDARG00000021833)	ahr1b (ENSDARG00000023537)	mfsd6a (ENSDARG00000032318)	nab1a (ENSDARG00000042940)	glsa (ENSDARG00000062812)	stat1a (ENSDARG00000006266)	mstna (ENSDARG00000042947)	ftcd (ENSDARG00000007421)	cnot9 (ENSDARG00000033855) #22	ENSDARG00000057975 ##23	slx9 (ENSDARG00000071500)	adarb1a (ENSDARG00000041609) ##13	cep70 (ENSDARG00000076965)	mmadhca (ENSDARG00000041602)	ENSDARG00000105974	rnd3a (ENSDARG00000076799)	ENSDARG00000101458	ZRANB3 (ENSDARG00000091538)	ccnt2b (ENSDARG00000036510)	TMEM163 (ENSDARG00000088227)	mgat5 (ENSDARG00000071506)	PTH2R (ENSDARG00000021186)	MRAS (ENSDARG00000062865)	ptpn4b (ENSDARG00000000183)
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00390000013151.a.a.a	ENSGT00940000160639.b.a.b.b.a	ENSGT00950000183114.a.b.b	ENSGT00390000012561.b.pb.b	ENSGT00940000166136	ENSGT00940000167103	ENSGT00940000157521.a.b	ENSGT00390000008033	ENSGT00950000183208.A.c.a	ENSGT00940000157233.c	ENSGT00390000016542	ENSGT00530000064137.a.b	ENSGT00940000158526	ENSGT00940000167649	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00390000001225 #22	ENSGT00940000156180.e ##23	ENSGT00500000044939	ENSGT00940000163253.b.c.a.e	ENSGT00390000005159.j	ENSGT00940000156444.c	ENSGT00940000155861.C.e	ENSGT00940000159606	ENSGT00940000158239.a.a.d	ENSGT00940000158239.a.b	ENSGT00860000133854	ENSGT00940000154319	ENSGT00940000153534.A	ENSGT00940000155099.k.b	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000155518.n
Denticle herring	MODERN SPECIES	15	sh3bp4a (ENSDCDG00000026424)	ENSDCDG00000026431	AOX1 (ENSDCDG00000026445)	bzw1a (ENSDCDG00000026614)	ENSDCDG00000026619	ENSDCDG00000026623	LRP1B (ENSDCDG00000026680)	KYNU (ENSDCDG00000026942)	ENSDCDG00000000205	zeb2b (ENSDCDG00000000270)	ACVR2A (ENSDCDG00000000525)	orc4 (ENSDCDG00000001038)	MBD5 (ENSDCDG00000001067)	mstna (ENSDCDG00000001073)	ftcd (ENSDCDG00000001081)	cnot9 (ENSDCDG00000001090) #22	ENSDCDG00000001319 ##23	cyp20a1 (ENSDCDG00000002398)	tmem237b (ENSDCDG00000002406)	zp2l2 (ENSDCDG00000002409)	MPP4 (ENSDCDG00000002418)	ALS2 (ENSDCDG00000002468)	cdk15 (ENSDCDG00000002501)	fzd7b (ENSDCDG00000002516)	sumo1 (ENSDCDG00000002518)	ENSDCDG00000002523	nop58 (ENSDCDG00000002539)	ENSDCDG00000002554	ENSDCDG00000002765	KCNH7 (ENSDCDG00000009421)	ENSDCDG00000009470
Atlantic herring	MODERN SPECIES	13	ENSCHAG00000015535	ENSCHAG00000015514	ENSCHAG00000013112	ENSCHAG00000013076	ENSCHAG00000012946	KYNU (ENSCHAG00000012715)	zeb2b (ENSCHAG00000012603)	ACVR2A (ENSCHAG00000012241)	orc4 (ENSCHAG00000011816)	ENSCHAG00000011781	ENSCHAG00000011763	ENSCHAG00000011749	mstna (ENSCHAG00000011741)	ENSCHAG00000011727	ftcd (ENSCHAG00000011671)	cnot9 (ENSCHAG00000011642) #22	ENSCHAG00000009301 ##23	cyp20a1 (ENSCHAG00000009217)	zp2l2 (ENSCHAG00000009198)	tmem237b (ENSCHAG00000009153)	MPP4 (ENSCHAG00000008043)	ALS2 (ENSCHAG00000007884)	cdk15 (ENSCHAG00000007829)	fzd7b (ENSCHAG00000007812)	sumo1 (ENSCHAG00000007753)	nop58 (ENSCHAG00000007579)	SP3 (ENSCHAG00000007545)	ENSCHAG00000006018	ENSCHAG00000005919	ENSCHAG00000005850	ENSCHAG00000005781