Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000160251 #8	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a #9	ENSGT00930000151073 #10	ENSGT00390000015005 #11	ENSGT00390000001958 #12	ENSGT00390000010711 #13	ENSGT00940000162223 #14	ENSGT00390000001017 #15	ENSGT00950000182931.A #16	ENSGT00950000183117.a.b #17	ENSGT01030000234578.B.b #18	ENSGT00390000017353 #19	ENSGT00940000159669 #20	ENSGT00940000163100.b	ENSGT00940000160210 #21	ENSGT00940000158688 #22	ENSGT00940000159534 #23	ENSGT00940000161331 #24	ENSGT00390000006247.tc #25	ENSGT00940000158411 #26	ENSGT00940000158161 #27	ENSGT00940000158860 #28	ENSGT00940000156542 #29	ENSGT00940000163477 #30	ENSGT00940000160669 #31	ENSGT00400000022095.b #32	ENSGT00950000182981.b.f.b #33	ENSGT00390000015805 #34	ENSGT00940000158169 #35	ENSGT00940000157663 #36	ENSGT00940000155416.a.b #37
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00530000063849.B #7	ENSGT00940000160251 #8	ENSGT01030000234555.a.a.b.a.b.a #9	ENSGT00930000151073 #10	ENSGT00390000015005 #11	ENSGT00390000001958 #12	ENSGT00390000010711 #13	ENSGT00940000162223 #14	ENSGT00390000001017 #15	ENSGT00950000182931.A #16	ENSGT00950000183117.a.b #17	ENSGT01030000234578.B.b #18	ENSGT00390000017353 #19	ENSGT00940000159669 #20	ENSGT00940000160210 #21	ENSGT00940000158688 #22	ENSGT00940000159534 #23	ENSGT00940000161331 #24	ENSGT00390000006247.tc #25	ENSGT00940000158411 #26	ENSGT00940000158161 #27	ENSGT00940000158860 #28	ENSGT00940000156542 #29	ENSGT00940000163477 #30	ENSGT00940000160669 #31	ENSGT00400000022095.b #32	ENSGT00950000182981.b.f.b #33	ENSGT00390000015805 #34	ENSGT00940000158169 #35	ENSGT00940000157663 #36	ENSGT00940000155416.a.b #37
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	142	INKA2 (ENSCLAG00000007395) #7	RAP1A (ENSCLAG00000006589) #8	ADORA3 (ENSCLAG00000006054) #9	ENSCLAG00000009052 #10	C1orf162 (ENSCLAG00000009693) #11	ATP5PB (ENSCLAG00000006182) #12	WDR77 (ENSCLAG00000005791) #13	OVGP1 (ENSCLAG00000005245) #14	PIFO (ENSCLAG00000007375) #15	DENND2D (ENSCLAG00000005887) #16	CEPT1 (ENSCLAG00000006226) #17	DRAM2 (ENSCLAG00000007313) #18	LRIF1 (ENSCLAG00000006529) #19	CD53 (ENSCLAG00000008592) #20	KCNA3 (ENSCLAG00000017746) #21	KCNA2 (ENSCLAG00000006952) #22	KCNA10 (ENSCLAG00000017689) #23	PROK1 (ENSCLAG00000006175) #24	LAMTOR5 (ENSCLAG00000005554) #25	SLC16A4 (ENSCLAG00000004685) #26	RBM15 (ENSCLAG00000008406) #27	KCNC4 (ENSCLAG00000008289) #28	SLC6A17 (ENSCLAG00000011786) #29	UBL4B (ENSCLAG00000009392) #30	ALX3 (ENSCLAG00000009014) #31	STRIP1 (ENSCLAG00000008340) #32	AHCYL1 (ENSCLAG00000005190) #33	CSF1 (ENSCLAG00000007673) #34	EPS8L3 (ENSCLAG00000009538) #35	GSTM3 (ENSCLAG00000007701) #36	GSTM2 (ENSCLAG00000011395) #37
Degu	MODERN SPECIES	125										COPG2 (ENSODEG00000004971)	TSGA13 (ENSODEG00000005295)	ENSODEG00000019319	LRIF1 (ENSODEG00000006876) #19	CD53 (ENSODEG00000007107) #20	KCNA3 (ENSODEG00000004643) #21	KCNA2 (ENSODEG00000019179) #22	KCNA10 (ENSODEG00000019298) #23	PROK1 (ENSODEG00000005529) #24	ENSODEG00000005563 #25	SLC16A4 (ENSODEG00000005794) #26	RBM15 (ENSODEG00000019343) #27	KCNC4 (ENSODEG00000004321) #28	SLC6A17 (ENSODEG00000004456) #29	ALX3 (ENSODEG00000004536) #31	STRIP1 (ENSODEG00000004829) #32	AHCYL1 (ENSODEG00000007560) #33	CSF1 (ENSODEG00000007919) #34	ENSODEG00000004287 #35	ENSODEG00000004609 #36	GSTM2 (ENSODEG00000005236) #37	ENSODEG00000005640
Guinea pig	MODERN SPECIES	2	INKA2 (ENSCPOG00000001816) #7	RAP1A (ENSCPOG00000032437) #8	ADORA3 (ENSCPOG00000032151) #9	C1orf162 (ENSCPOG00000025561) #11	ATP5PB (ENSCPOG00000014070) #12	WDR77 (ENSCPOG00000025009) #13	OVGP1 (ENSCPOG00000000902) #14	PIFO (ENSCPOG00000033762) #15	DENND2D (ENSCPOG00000003677) #16	CEPT1 (ENSCPOG00000011067) #17	DRAM2 (ENSCPOG00000003496) #18	ENSCPOG00000039442 #19	CD53 (ENSCPOG00000010280) #20	ENSCPOG00000023753	KCNA3 (ENSCPOG00000012373) #21	KCNA2 (ENSCPOG00000039886) #22	KCNA10 (ENSCPOG00000001971) #23	PROK1 (ENSCPOG00000039143) #24	LAMTOR5 (ENSCPOG00000033012) #25	SLC16A4 (ENSCPOG00000007529) #26	RBM15 (ENSCPOG00000007520) #27	KCNC4 (ENSCPOG00000012779) #28	SLC6A17 (ENSCPOG00000012775) #29	UBL4B (ENSCPOG00000036064) #30	ALX3 (ENSCPOG00000025705) #31	STRIP1 (ENSCPOG00000012774) #32	AHCYL1 (ENSCPOG00000011603) #33	ENSCPOG00000032571 #34	ENSCPOG00000013848 #35	GSTM3 (ENSCPOG00000009422) #36	GSTM1 (ENSCPOG00000007803)