Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000155077.f	ENSGT00940000158583	ENSGT00940000156899 #7	ENSGT00940000155226.r #8	ENSGT00940000154832.n #9	ENSGT00390000010439 #10	ENSGT00940000160091 #11	ENSGT00940000156487 #12	ENSGT00940000160820 #13	ENSGT00390000002319 #16	ENSGT00940000153304.B #17	ENSGT00940000156982 #18	ENSGT00390000004660.C.a.b #19	ENSGT00940000158220 #20	ENSGT00940000156774 #21	ENSGT00390000018691 #22	ENSGT00940000159673 #23	ENSGT00530000063876.b #24	ENSGT00940000156540 #25	ENSGT00940000159098 #26	ENSGT00730000111179.b #27	ENSGT01030000234620.a.b.a #28	ENSGT00390000006996 #29	ENSGT00940000158836 #30	ENSGT00900000143157	ENSGT00940000154656 #34	ENSGT00940000156116.C #35	ENSGT00390000012924.b #36	ENSGT00940000154746 #37	ENSGT00390000019941	ENSGT00940000159887
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	11	PCNX4 (ENSSVLG00005002224) #7	DHRS7 (ENSSVLG00005002208) #8	PPM1A (ENSSVLG00005002171) #9	C14orf39 (ENSSVLG00005002129) #10	SIX6 (ENSSVLG00005002114) #11	ENSSVLG00005002107 #12	SIX4 (ENSSVLG00005002094) #13	ENSSVLG00005002084 #14	ENSSVLG00005002071 #15	MNAT1 (ENSSVLG00005002052) #16	TRMT5 (ENSSVLG00005002002) #17	SLC38A6 (ENSSVLG00005001956) #18	TMEM30B (ENSSVLG00005001934) #19	PRKCH (ENSSVLG00005001876) #20	HIF1A (ENSSVLG00005001642) #21	SNAPC1 (ENSSVLG00005001506) #22	SYT16 (ENSSVLG00005001481) #23	ENSSVLG00005001474 #24	KCNH5 (ENSSVLG00005001424) #25	RHOJ (ENSSVLG00005001376) #26	GPHB5 (ENSSVLG00005001358) #27	PPP2R5E (ENSSVLG00005001322) #28	WDR89 (ENSSVLG00005001301) #29	SGPP1 (ENSSVLG00005001258) #30	ENSSVLG00005001240 #31	ENSSVLG00005001225 #32	ENSSVLG00005001210 #33	SYNE2 (ENSSVLG00005000961) #34	ESR2 (ENSSVLG00005000779) #35	ENSSVLG00005000739 #36	MTHFD1 (ENSSVLG00005000661) #37
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000155077.f	ENSGT00940000158583	ENSGT00940000156899 #7	ENSGT00940000155226.r #8	ENSGT00940000154832.n #9	ENSGT00390000010439 #10	ENSGT00940000160091 #11	ENSGT00940000156487 #12	ENSGT00940000160820 #13	ENSGT00390000002319 #16	ENSGT00940000153304.B #17	ENSGT00940000156982 #18	ENSGT00390000004660.C.a.b #19	ENSGT00940000158220 #20	ENSGT00940000156774 #21	ENSGT00390000018691 #22	ENSGT00940000159673 #23	ENSGT00530000063876.b #24	ENSGT00940000156540 #25	ENSGT00940000159098 #26	ENSGT00730000111179.b #27	ENSGT01030000234620.a.b.a #28	ENSGT00390000006996 #29	ENSGT00940000158836 #30	ENSGT00900000143157	ENSGT00940000154656 #34	ENSGT00940000156116.C #35	ENSGT00390000012924.b #36	ENSGT00940000154746 #37	ENSGT00390000019941	ENSGT00940000159887
Alpin marmot	MODERN SPECIES	1					PPM1A (ENSMMMG00000020493) #9	C14orf39 (ENSMMMG00000020503) #10	SIX6 (ENSMMMG00000020533) #11	SIX1 (ENSMMMG00000020535) #12	ENSMMMG00000020537	MNAT1 (ENSMMMG00000020544) #16	TRMT5 (ENSMMMG00000020550) #17	SLC38A6 (ENSMMMG00000020558) #18	TMEM30B (ENSMMMG00000020577) #19	PRKCH (ENSMMMG00000020586) #20	HIF1A (ENSMMMG00000020603) #21	SNAPC1 (ENSMMMG00000020631) #22	SYT16 (ENSMMMG00000020656) #23	ENSMMMG00000020664 #24	KCNH5 (ENSMMMG00000020695) #25	RHOJ (ENSMMMG00000020711) #26	GPHB5 (ENSMMMG00000020716) #27	PPP2R5E (ENSMMMG00000020722) #28	ENSMMMG00000020739	WDR89 (ENSMMMG00000020745) #29	SGPP1 (ENSMMMG00000020751) #30	ENSMMMG00000020757	ENSMMMG00000020769 #34	ESR2 (ENSMMMG00000020849) #35	ENSMMMG00000020893 #36	MTHFD1 (ENSMMMG00000020925) #37	AKAP5 (ENSMMMG00000020940)
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000158583	ENSGT00940000156899 #7	ENSGT00940000155226.r #8	ENSGT00940000154832.n #9	ENSGT00550000074873.l.b.c	ENSGT00390000010439 #10	ENSGT00940000160091 #11	ENSGT00940000156487 #12	ENSGT00940000160820 #13	ENSGT00390000002319 #16	ENSGT00940000153304.B #17	ENSGT00940000156982 #18	ENSGT00390000004660.C.a.b #19	ENSGT00940000158220 #20	ENSGT00940000156774 #21	ENSGT00390000018691 #22	ENSGT00940000159673 #23	ENSGT00530000063876.b #24	ENSGT00940000156540 #25	ENSGT00940000159098 #26	ENSGT00730000111179.b #27	ENSGT01030000234620.a.b.a #28	ENSGT00390000006996 #29	ENSGT00940000158836 #30	ENSGT00900000143157	ENSGT00940000154656 #34	ENSGT00940000156116.C #35	ENSGT00390000012924.b #36	ENSGT00940000154746 #37	ENSGT00390000019941	ENSGT00940000159887
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	36				PPM1A (ENSUPAG00010008894) #9	ENSUPAG00010008916	C14orf39 (ENSUPAG00010008924) #10	SIX6 (ENSUPAG00010008981) #11	SIX1 (ENSUPAG00010008990) #12	SIX4 (ENSUPAG00010009001) #13	MNAT1 (ENSUPAG00010009017) #16	TRMT5 (ENSUPAG00010009026) #17	SLC38A6 (ENSUPAG00010009036) #18	TMEM30B (ENSUPAG00010009067) #19	PRKCH (ENSUPAG00010009074) #20	HIF1A (ENSUPAG00010009101) #21	SNAPC1 (ENSUPAG00010009139) #22	SYT16 (ENSUPAG00010009165) #23	ENSUPAG00010009178 #24	KCNH5 (ENSUPAG00010009203) #25	RHOJ (ENSUPAG00010009229) #26	GPHB5 (ENSUPAG00010009246) #27	PPP2R5E (ENSUPAG00010009259) #28	SGPP1 (ENSUPAG00010009322) #30	ENSUPAG00010009340	SYNE2 (ENSUPAG00010009394) #34	ESR2 (ENSUPAG00010011208) #35	ENSUPAG00010011334 #36	MTHFD1 (ENSUPAG00010011349) #37	AKAP5 (ENSUPAG00010011368)	ZBTB25 (ENSUPAG00010011372)	ZBTB1 (ENSUPAG00010011374)
Squirrel	MODERN SPECIES	95	PCNX4 (ENSSTOG00000005741) #7	DHRS7 (ENSSTOG00000007361) #8	ENSSTOG00000029945	PPM1A (ENSSTOG00000014586) #9	ENSSTOG00000021643	C14orf39 (ENSSTOG00000031022) #10	SIX6 (ENSSTOG00000014602) #11	SIX1 (ENSSTOG00000027309) #12	SIX4 (ENSSTOG00000029039) #13	MNAT1 (ENSSTOG00000023345) #16	TRMT5 (ENSSTOG00000011865) #17	SLC38A6 (ENSSTOG00000022614) #18	TMEM30B (ENSSTOG00000000288) #19	PRKCH (ENSSTOG00000009567) #20	Hif1a (ENSSTOG00000004833) #21	SNAPC1 (ENSSTOG00000004852) #22	SYT16 (ENSSTOG00000003906) #23	ENSSTOG00000002379 #24	KCNH5 (ENSSTOG00000002390) #25	RHOJ (ENSSTOG00000002406) #26	GPHB5 (ENSSTOG00000002414) #27	PPP2R5E (ENSSTOG00000028020) #28	WDR89 (ENSSTOG00000023352) #29	SGPP1 (ENSSTOG00000011129) #30	ENSSTOG00000033684	ENSSTOG00000008229 #34	ESR2 (ENSSTOG00000015102) #35	ENSSTOG00000021607 #36	MTHFD1 (ENSSTOG00000015527) #37	AKAP5 (ENSSTOG00000021366)	ZBTB25 (ENSSTOG00000015542)