Vertebrata DUPLICATION Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156963.a.a #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156963.a.a #22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156963.a.a #22 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156963.a.a #22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h ENSGT00940000164714 ENSGT00940000164203 ENSGT00390000014570 ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT00940000157756 ENSGT00940000157677 ENSGT00940000166103 ENSGT00390000013347.b ENSGT00940000157524 ENSGT00390000011947 ENSGT01020000230364.a.a.a.a.a.a ENSGT00390000000980 ENSGT01030000234592.A.b.a ENSGT00390000017365.b ENSGT00410000025882.a ENSGT00940000163109 ENSGT00940000159461 ENSGT00940000159388 ENSGT00940000156238 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 84 ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00530000063631.b.n.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000154923.C.x ENSGT00940000153541.C.a.a ENSGT00940000165924 ENSGT00940000167093 ENSGT00940000156060 ENSGT00940000159085 ENSGT00390000003093 ENSGT00940000167423 ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00940000164203 ENSGT00390000014570 ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT00940000157756 ENSGT00940000157677 ENSGT00940000166103 ENSGT00390000013347.b ENSGT00940000157524 ENSGT00390000000980 ENSGT01020000230364.a.a.a.a.a.a ENSGT00410000025882.a ENSGT00960000186826 ENSGT01000000214687 ENSGT00940000159461 ENSGT00940000159388 ENSGT00940000156238.a.a ENSGT01020000230364.a.a.a.b ENSGT01020000230364.a.a.a.a.b Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 479 ENSGT00940000158422.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 ENSGT00940000156963.a.a #22 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156963.a.a #22 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 186 ENSGT00940000164142 #10 ENSGT01100000263545.a.b.c.b #12 ENSGT00490000043380.b #13 ENSGT00720000108866 #14 ENSGT00940000161040.b ENSGT00950000183092.a.d.b #17 ENSGT00940000159439.a #18 ENSGT00990000205462 ENSGT00940000154129.hd #19 ENSGT00940000159006.c.b #20 ENSGT00390000009446 #21 ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT00530000064359.c.b.h #23 ENSGT00940000155946.c.a #24 ENSGT00940000154079.b.a #25 ENSGT00940000159944 #26 ENSGT00940000157955.d.b #27 ENSGT00940000154374.a ENSGT00940000156611.m.a Channel catfish MODERN SPECIES 24 ENSIPUG00000024881 #7 polb (ENSIPUG00000024873) #8 ENSIPUG00000024871 #9 ENSIPUG00000024868 #10 ENSIPUG00000024861 #11 ENSIPUG00000024859 #12 slc32a1 (ENSIPUG00000024855) #13 actr5 (ENSIPUG00000024841) #14 ENSIPUG00000024840 #15 cd63 (ENSIPUG00000024837) #16 stac3 (ENSIPUG00000024832) #17 Kif5a (ENSIPUG00000024824) #18 pcbp2 (ENSIPUG00000024819) #19 map3k12 (ENSIPUG00000024813) #20 AAAS (ENSIPUG00000024808) #21 ENSIPUG00000024802 #22 si:dkey-56i24.1 (ENSIPUG00000024783) #23 Angptl2 (ENSIPUG00000024781) #24 ralgps1 (ENSIPUG00000024769) #25 zbtb34 (ENSIPUG00000024765) #26 lmx1b (ENSIPUG00000024750) #27 ENSIPUG00000024748 #28 ENSIPUG00000024740 #29 ENSIPUG00000024736 #30 rabl2 (ENSIPUG00000024726) #31 ENSIPUG00000024722 #32 pbx3 (ENSIPUG00000024704) #33 ctu1 (ENSIPUG00000024664) #34 upb1 (ENSIPUG00000024648) #35 ENSIPUG00000024644 #36 ENSIPUG00000024639 #37 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 189 ENSGT00940000164142 #10 ENSGT01100000263545.a.b.c.b #12 ENSGT00490000043380.b #13 ENSGT00720000108866 #14 ENSGT00940000161040.b ENSGT00950000183092.a.d.b #17 ENSGT00940000159439.a #18 ENSGT00990000205462 ENSGT00940000154129.hd #19 ENSGT00940000159006.c.b #20 ENSGT00390000009446 #21 ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT00530000064359.c.b.h #23 ENSGT00940000155946.c.a #24 ENSGT00940000154079.b.a #25 ENSGT00940000159944 #26 ENSGT00940000157955.d.b #27 ENSGT00940000154374.a ENSGT00940000156611.m.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 200 ENSGT00950000183092.a.d.b #17 ENSGT00940000159439.a #18 ENSGT00990000205462 ENSGT00940000154129.hd #19 ENSGT00940000159006.c.b #20 ENSGT00390000009446 #21 ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT00530000064359.c.b.h #23 ENSGT00940000154079.b.a #25 ENSGT00940000155946.c.a #24 ENSGT00940000159944 #26 ENSGT00940000157955.d.b #27 ENSGT00940000155945.i.b ENSGT00940000163762.b #33 ENSGT00940000156611.n ENSGT00390000016543.c ENSGT00940000165688 ENSGT00390000003282.A ENSGT00390000014879.c.a.a.b ENSGT00390000000224 ENSGT00940000154966.ab.b ENSGT00940000160943 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 958 aaas (ENSPNAG00000000868) #21 ENSPNAG00000000899 #22 si:dkey-56i24.1 (ENSPNAG00000008343) #23 ralgps1 (ENSPNAG00000000941) #25 si:dkey-191c17.2 (ENSPNAG00000008376) zbtb34 (ENSPNAG00000008386) #26 Mexicana tetra MODERN SPECIES 21 mtor (ENSAMXG00000014520) angptl7 (ENSAMXG00000014537) qars1 (ENSAMXG00000014553) ogg1 (ENSAMXG00000033292) ENSAMXG00000039341 ENSAMXG00000040516 ENSAMXG00000032196 ENSAMXG00000036379 ENSAMXG00000014611 ENSAMXG00000029204 ENSAMXG00000032514 ENSAMXG00000019945 pcbp2 (ENSAMXG00000037819) #19 map3k12 (ENSAMXG00000014645) #20 aaas (ENSAMXG00000014649) #21 ENSAMXG00000014650 #22 si:dkey-56i24.1 (ENSAMXG00000034002) #23 ralgps1 (ENSAMXG00000014668) #25 angptl2b (ENSAMXG00000014684) #24 zbtb34 (ENSAMXG00000026343) #26 lmx1bb (ENSAMXG00000041930) #27 mvb12bb (ENSAMXG00000041643) ENSAMXG00000034680 ENSAMXG00000041410 ENSAMXG00000040610 #33 gapvd1 (ENSAMXG00000001364) ENSAMXG00000026054 syn1 (ENSAMXG00000001381) ENSAMXG00000040426 vgll4l (ENSAMXG00000038029) slc20a1a (ENSAMXG00000005646) Electric eel MODERN SPECIES 142 ENSEEEG00000014372 ENSEEEG00000014361 #10 ENSEEEG00000014355 #12 SLC32A1 (ENSEEEG00000014353) #13 actr5 (ENSEEEG00000014351) #14 ENSEEEG00000014349 stac3 (ENSEEEG00000014347) #17 ENSEEEG00000014344 kif5aa (ENSEEEG00000014340) #18 pcbp2 (ENSEEEG00000014220) #19 map3k12 (ENSEEEG00000014212) #20 aaas (ENSEEEG00000014185) #21 ENSEEEG00000014165 #22 angptl2b (ENSEEEG00000014150) #24 ralgps1 (ENSEEEG00000014145) #25 zbtb34 (ENSEEEG00000014141) #26 lmx1bb (ENSEEEG00000014125) #27 pbx3b (ENSEEEG00000014117) gapvd1 (ENSEEEG00000014113) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 199 ENSGT00940000161040.b ENSGT00950000183092.a.d.b #17 ENSGT00940000159439.a #18 ENSGT00940000154129.hd #19 ENSGT00940000159006.c.b #20 ENSGT00390000009446 #21 ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT00530000063509.B ENSGT00940000155232.t.a.b.a ENSGT00940000166809 ENSGT00940000155232.t.b.b ENSGT00390000011821 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 770 ENSGT00950000183092.a.d.b #17 ENSGT00940000159439.a.c #18 ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT01030000234859.c ENSGT00690000101915.i.a ENSGT00950000183078.a ENSGT00940000154389.a.r.a.a ENSGT00940000158406.y ENSGT00940000155063.c.a.c ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a Goldfish MODERN SPECIES 27 ENSCARG00000064726 stac3 (ENSCARG00000064704) #17 kif5aa (ENSCARG00000061667) #18 map3k12 (ENSCARG00000060481) #20 ENSCARG00000060430 #22 SLC5A7 (ENSCARG00000060301) ENSCARG00000060068 ENSCARG00000060039 il10rb (ENSCARG00000059996) ENSCARG00000048942 ENSCARG00000048362 ENSCARG00000048344 ENSCARG00000048332 ENSCARG00000048318 ihha (ENSCARG00000048285) mitd1 (ENSCARG00000048258) ENSCARG00000048229 creg2 (ENSCARG00000048190) MGAT4A (ENSCARG00000047479) coa5 (ENSCARG00000047421) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 643 ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT01030000234859.c ENSGT00690000101915.i.a ENSGT00950000183078.a ENSGT00940000154389.a.r.a.a ENSGT00940000158406.y ENSGT00940000155063.c.a.c ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a Common carp reference MODERN SPECIES 41 ENSCCRG00000011194 #14 ENSCCRG00000074698 ENSCCRG00000063746 ENSCCRG00000031102 ENSCCRG00000025564 ENSCCRG00000072006 ENSCCRG00000045990 ENSCCRG00000019314 #17 ENSCCRG00000058595 ENSCCRG00000018729 #18 ENSCCRG00000046669 #19 ENSCCRG00000067204 ENSCCRG00000027701 ENSCCRG00000022944 #20 ENSCCRG00000057367 ENSCCRG00000032536 #22 ENSCCRG00000061282 ENSCCRG00000061497 ENSCCRG00000026533 ENSCCRG00000030939 ENSCCRG00000035630 ENSCCRG00000052914 ENSCCRG00000030886 ENSCCRG00000039479 ENSCCRG00000006462 ENSCCRG00000060471 Golden-line barbel MODERN SPECIES 1984 ENSSGRG00000017549 #22 ENSSGRG00000017650 Zebrafish MODERN SPECIES 24 ENSDARG00000099799 igsf3l (ENSDARG00000104716) ENSDARG00000098461 bzw1b (ENSDARG00000099148) ENSDARG00000099207 #10 zgc:158320 (ENSDARG00000099373) ENSDARG00000099980 #12 actr5 (ENSDARG00000098235) #14 NDUFA4L2 (ENSDARG00000103114) stac3 (ENSDARG00000098883) #17 ENSDARG00000100407 kif5aa (ENSDARG00000098936) #18 pcbp2 (ENSDARG00000099039) #19 map3k12 (ENSDARG00000103651) #20 aaas (ENSDARG00000102274) #21 ENSDARG00000114697 #22 plbd2 (ENSDARG00000114245) ENSDARG00000099598 ENSDARG00000105042 cldn10b (ENSDARG00000104528) ENSDARG00000103337 ENSDARG00000100150 SLC5A7 (ENSDARG00000102336) ENSDARG00000110024 lims2 (ENSDARG00000014976) RANBP2 (ENSDARG00000093125) il10rb (ENSDARG00000078042) hycc2 (ENSDARG00000101696) MAP4K4 (ENSDARG00000098670) ENSDARG00000100461 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 154 ENSGT00720000108866 #14 ENSGT00490000043380.b #13 ENSGT01100000263545.a.b.c.b #12 ENSGT00940000167348 ENSGT00940000164142 #10 ENSGT00940000156300.l ENSGT01090000261049 ENSGT00940000155769.`b.a ENSGT00390000005874.i ENSGT00940000155514.d ENSGT00390000001016.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT01020000230394.e.b.a ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT00390000016951 ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT00390000006813 ENSGT00940000164642 ENSGT00940000163342.a.a.a ENSGT00730000111360.a ENSGT00640000091554 ENSGT00940000158393 ENSGT00940000161798 ENSGT00390000007075 ENSGT00940000163342.a.a.b.e ENSGT00940000163873.c.a ENSGT00940000155615.i.b ENSGT00940000154583.f ENSGT00390000017131 ENSGT00950000182846.a.a.b.b ENSGT00940000161090.B.c.b.b.b Atlantic herring MODERN SPECIES actr5 (ENSCHAG00000026751) #14 SLC32A1 (ENSCHAG00000026750) #13 ENSCHAG00000026748 #12 atp5f1e (ENSCHAG00000026747) ENSCHAG00000026729 #10 ENSCHAG00000026723 GNAS (ENSCHAG00000026666) VAPB (ENSCHAG00000026656) DCAF1 (ENSCHAG00000026637) DOCK3 (ENSCHAG00000025595) IFT122 (ENSCHAG00000024796) exorh (ENSCHAG00000024744) PLXND1 (ENSCHAG00000024489) TMCC1 (ENSCHAG00000024474) trh (ENSCHAG00000024472) ENSCHAG00000024394 #22 cs (ENSCHAG00000024358) ENSCHAG00000024341 ENSCHAG00000024336 ogg1 (ENSCHAG00000024331) nr2c2 (ENSCHAG00000024228) ENSCHAG00000024212 wdr46 (ENSCHAG00000024207) sult1st3 (ENSCHAG00000024205) ssuh2rs1 (ENSCHAG00000024187) grip2a (ENSCHAG00000023254) slc6a6a (ENSCHAG00000022868) ABTB1 (ENSCHAG00000022805) dnase1l4.1 (ENSCHAG00000022692) ENSCHAG00000022674 ENSCHAG00000022665 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000004786 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ENSGT00390000013867 ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 ENSGT00940000156963.a.a #22 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000004786 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ENSGT00390000013867 ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000158400 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182958.b.a.a.b ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00940000165736 ENSGT00940000163875.a.a ENSGT00650000093320.a.b.b.b ENSGT00940000178378 ENSGT00940000158894 ENSGT00940000158933 ENSGT00940000155766.a ENSGT00940000158156.b.a ENSGT00940000158549 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000004786 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ENSGT00390000013867 ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT01100000263502.A.b.a.a 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ENSGT00940000158894 ENSGT00940000158933 ENSGT00940000155766.a ENSGT00940000158156.b.a Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 404 SPDEF (ENSHCOG00000020452) pacsin1a (ENSHCOG00000020474) SMIM29 (ENSHCOG00000020479) hmga1a (ENSHCOG00000020487) GRM4 (ENSHCOG00000020506) ENSHCOG00000000816 snai1b (ENSHCOG00000020556) samhd1 (ENSHCOG00000020558) cfap20 (ENSHCOG00000001687) ENSHCOG00000001701 KBTBD12 (ENSHCOG00000001709) SLC26A6 (ENSHCOG00000001784) ENSHCOG00000001824 ENSHCOG00000001846 p4htma (ENSHCOG00000001858) ENSHCOG00000001885 #22 parapinopsina (ENSHCOG00000001902) ddx20 (ENSHCOG00000001915) kcnd3 (ENSHCOG00000001923) ENSHCOG00000001935 ENSHCOG00000001939 cttnbp2nlb (ENSHCOG00000001943) capza1b (ENSHCOG00000001958) ENSHCOG00000001985 ERC2 (ENSHCOG00000002033) wnt5a (ENSHCOG00000002059) ENSHCOG00000002069 LRTM1 (ENSHCOG00000002077) CACNA2D3 (ENSHCOG00000002092) atp6ap1lb (ENSHCOG00000002103) B4GALT3 (ENSHCOG00000002120) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000004786 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ENSGT00940000158894 ENSGT00940000158933 ENSGT00940000155766.a ENSGT00940000158156.b.a ENSGT00940000158549 ENSGT00940000155311.C.c ENSGT00940000164248.b.b ENSGT00940000161969 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ENSGT00390000013867.r ENSGT00390000013867.q.a.a.a ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000160885 ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00940000164203 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT00940000158400 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00940000165736 ENSGT00940000163875.a.a ENSGT00650000093320.a.b.b.b ENSGT00940000158894 ENSGT00940000158933 ENSGT00940000155766.a ENSGT00940000158156.b.a ENSGT00940000158549 ENSGT00940000155311.C.c ENSGT00940000164248.b.b ENSGT00940000161969 Javanese ricefish MODERN SPECIES 21 TOP1 (ENSOJAG00000002142) NCOA6 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ENSGT00940000163875.a.a ENSGT00650000093320.a.b.b.b ENSGT00940000178378 ENSGT00940000158894 ENSGT00940000158933 ENSGT00940000155766.a ENSGT00940000158156.b.a ENSGT00940000158549 ENSGT00940000155311.C.c Nile tilapia MODERN SPECIES 12 ENSONIG00000040188 ENSONIG00000027210 ENSONIG00000041779 ENSONIG00000033268 ENSONIG00000030474 ENSONIG00000040562 ENSONIG00000034749 ENSONIG00000012466 ENSONIG00000012465 ENSONIG00000012464 KBTBD12 (ENSONIG00000012463) SLC26A6 (ENSONIG00000012458) ENSONIG00000012449 ENSONIG00000012447 ENSONIG00000012448 ENSONIG00000012440 #22 parapinopsina (ENSONIG00000012438) ddx20 (ENSONIG00000012436) kcnd3 (ENSONIG00000012433) cttnbp2nlb (ENSONIG00000012432) capza1b (ENSONIG00000012423) ENSONIG00000012416 tlr9 (ENSONIG00000012415) ERC2 (ENSONIG00000012404) wnt5a (ENSONIG00000033977) CACNA2D3 (ENSONIG00000012391) LRTM1 (ENSONIG00000012401) atp6ap1lb (ENSONIG00000038649) B4GALT3 (ENSONIG00000012387) bgnb (ENSONIG00000012384) ENSONIG00000012383 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000160885 ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 ENSGT00940000177817 ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000158400 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00940000165736 ENSGT00940000163875.a.a ENSGT00650000093320.a.b.b.b ENSGT00940000178378 ENSGT00940000158894 ENSGT00940000158933 ENSGT00940000155766.a ENSGT00940000158156.b.a ENSGT00940000158549 ENSGT00940000155311.C.c Lyretail cichlid MODERN SPECIES 298 ENSNBRG00000020753 ENSNBRG00000020703 ENSNBRG00000020690 SLC26A6 (ENSNBRG00000020571) ENSNBRG00000020499 ENSNBRG00000020481 p4htma (ENSNBRG00000020471) ENSNBRG00000020341 #22 parapinopsina (ENSNBRG00000020265) ddx20 (ENSNBRG00000020244) kcnd3 (ENSNBRG00000020227) cttnbp2nlb (ENSNBRG00000020216) capza1b (ENSNBRG00000020185) ENSNBRG00000020132 tlr9 (ENSNBRG00000020006) ERC2 (ENSNBRG00000019924) wnt5a (ENSNBRG00000019895) LRTM1 (ENSNBRG00000019884) CACNA2D3 (ENSNBRG00000019856) atp6ap1lb (ENSNBRG00000019829) B4GALT3 (ENSNBRG00000019808) bgnb (ENSNBRG00000019793) ENSNBRG00000019782 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158422.b.a ENSGT00940000160885 ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 ENSGT00940000177817 ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000158400 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00940000165736 ENSGT00940000163875.a.a ENSGT00650000093320.a.b.b.b ENSGT00940000178378 ENSGT00940000158894 ENSGT00940000158933 ENSGT00940000155766.a ENSGT00940000158156.b.a ENSGT00940000158549 ENSGT00940000155311.C.c Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1125 ENSHBUG00000008275 ENSHBUG00000008266 ENSHBUG00000008249 ENSHBUG00000008234 P4HTM (ENSHBUG00000008128) ENSHBUG00000008116 ENSHBUG00000008080 #22 parapinopsina (ENSHBUG00000008035) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000158422.b.b ENSGT00940000160885 ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 ENSGT00940000177817 ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000158400 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00940000165736 ENSGT00940000163875.a.a ENSGT00650000093320.a.b.b.b ENSGT00940000158894 ENSGT00940000158933 ENSGT00940000155766.a ENSGT00940000158156.b.a ENSGT00940000158549 ENSGT00940000155311.C.c ENSGT00940000164248.b.b P. nyererei MODERN SPECIES 342 ENSPNYG00000014153 ENSPNYG00000014174 ENSPNYG00000014188 ENSPNYG00000014200 ENSPNYG00000014218 ENSPNYG00000014235 ENSPNYG00000014262 p4htma (ENSPNYG00000014298) ENSPNYG00000014315 ENSPNYG00000014334 ENSPNYG00000014340 #22 parapinopsina (ENSPNYG00000014377) ddx20 (ENSPNYG00000014433) kcnd3 (ENSPNYG00000014453) cttnbp2nlb (ENSPNYG00000014484) capza1b (ENSPNYG00000014542) ENSPNYG00000014597 tlr9 (ENSPNYG00000014712) ERC2 (ENSPNYG00000014839) wnt5a (ENSPNYG00000014913) CACNA2D3 (ENSPNYG00000014938) LRTM1 (ENSPNYG00000015012) atp6ap1lb (ENSPNYG00000015023) B4GALT3 (ENSPNYG00000015062) bgnb (ENSPNYG00000015093) tktb (ENSPNYG00000015170) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000158422.b.b ENSGT00940000160885 ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000158400 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00940000165736 ENSGT00940000163875.a.a ENSGT00650000093320.a.b.b.b ENSGT00940000158894 ENSGT00940000158933 ENSGT00940000155766.a ENSGT00940000158156.b.a ENSGT00940000158549 ENSGT00940000155311.C.c ENSGT00940000164248.b.b Zebra mbuna MODERN SPECIES 1103 ENSMZEG00005027060 ENSMZEG00005027062 ENSMZEG00005027064 ENSMZEG00005027066 ENSMZEG00005027073 ENSMZEG00005027077 ENSMZEG00005027078 ENSMZEG00005027079 #22 parapinopsina (ENSMZEG00005027080) ddx20 (ENSMZEG00005027081) kcnd3 (ENSMZEG00005027082) cttnbp2nlb (ENSMZEG00005027087) capza1b (ENSMZEG00005027089) ENSMZEG00005027090 tlr9 (ENSMZEG00005027093) ERC2 (ENSMZEG00005027094) wnt5a (ENSMZEG00005027095) CACNA2D3 (ENSMZEG00005027096) LRTM1 (ENSMZEG00005027102) atp6ap1lb (ENSMZEG00005027105) B4GALT3 (ENSMZEG00005027106) bgnb (ENSMZEG00005027109) ENSMZEG00005027113 Eastern happy MODERN SPECIES 12 ENSACLG00000009680 ENSACLG00000009658 ENSACLG00000009650 SLC26A6 (ENSACLG00000009634) ENSACLG00000009611 ENSACLG00000009607 p4htma (ENSACLG00000009597) ENSACLG00000009519 #22 parapinopsina (ENSACLG00000009496) ddx20 (ENSACLG00000009485) kcnd3 (ENSACLG00000009440) cttnbp2nlb (ENSACLG00000009257) capza1b (ENSACLG00000009206) ENSACLG00000009066 tlr9 (ENSACLG00000009053) ENSACLG00000009046 ERC2 (ENSACLG00000008999) wnt5a (ENSACLG00000008991) ENSACLG00000008988 LRTM1 (ENSACLG00000008980) CACNA2D3 (ENSACLG00000008943) atp6ap1lb (ENSACLG00000008913) B4GALT3 (ENSACLG00000008898) Midas cichlid MODERN SPECIES 145 KBTBD12 (ENSACIG00000012801) SLC26A6 (ENSACIG00000012835) ENSACIG00000012951 p4htma (ENSACIG00000012989) ENSACIG00000013014 ENSACIG00000013029 ENSACIG00000013041 #22 parapinopsina (ENSACIG00000013074) ddx20 (ENSACIG00000013095) kcnd3 (ENSACIG00000013129) cdk7 (ENSACIG00000013152) cttnbp2nlb (ENSACIG00000013295) capza1b (ENSACIG00000013329) ENSACIG00000013353 tlr9 (ENSACIG00000013414) ERC2 (ENSACIG00000013602) wnt5a (ENSACIG00000013632) CACNA2D3 (ENSACIG00000013644) LRTM1 (ENSACIG00000013713) atp6ap1lb (ENSACIG00000013727) B4GALT3 (ENSACIG00000013759) bgnb (ENSACIG00000013773) Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ENSGT00390000013867 ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000160885 ENSGT00940000156836.b 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ENSGT00940000160885 ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00940000164203 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000158400 ENSGT00940000164736 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182958.b.a.a.b ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00940000165736 ENSGT00940000163875.a.a ENSGT00650000093320.a.b.b.b ENSGT00940000158894 ENSGT00940000158933 ENSGT00940000155766.a ENSGT00940000158156.b.a ENSGT00940000158549 Spiny chromis MODERN SPECIES 1419 KBTBD12 (ENSAPOG00000016790) SLC26A6 (ENSAPOG00000017197) ENSAPOG00000017227 ENSAPOG00000017257 p4htma (ENSAPOG00000017266) ENSAPOG00000017350 #22 parapinopsina (ENSAPOG00000017376) DDX20 (ENSAPOG00000017383) Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ENSGT00390000013867 ENSGT00940000158422.b 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ENSAPEG00000006679 kcnd3 (ENSAPEG00000006660) ENSAPEG00000006632 cttnbp2nlb (ENSAPEG00000006616) capza1b (ENSAPEG00000006582) ENSAPEG00000006488 tlr9 (ENSAPEG00000006456) ERC2 (ENSAPEG00000006166) wnt5a (ENSAPEG00000006092) LRTM1 (ENSAPEG00000006036) CACNA2D3 (ENSAPEG00000005933) atp6ap1lb (ENSAPEG00000005903) B4GALT3 (ENSAPEG00000005871) Clown anemonefish MODERN SPECIES 567 ENSAOCG00000024109 ENSAOCG00000024123 DSCAML1 (ENSAOCG00000024156) ENSAOCG00000024173 fxyd6 (ENSAOCG00000024179) tmprss13b (ENSAOCG00000024190) il10ra (ENSAOCG00000024204) ENSAOCG00000024224 mre11a (ENSAOCG00000024238) ENSAOCG00000024252 ENSAOCG00000024254 DOCK10 (ENSAOCG00000024366) shox2 (ENSAOCG00000024387) ENSAOCG00000024398 #22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ENSGT01070000253760.b.a.a.b ENSGT00390000013867 ENSGT00940000158422.b 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ENSGT00950000182958.b.a.a.b ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00940000165736 ENSGT00940000163875.a.a ENSGT00650000093320.a.b.b.b ENSGT00940000158894 ENSGT00940000158933 ENSGT00940000155766.a ENSGT00940000158156.b.a ENSGT00940000158549 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ENSGT01070000253760.b.a.a.b ENSGT00390000013867 ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00940000164203 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000158400 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182958.b.a.a.b ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00940000165736 ENSGT00940000163875.a.a ENSGT00650000093320.a.b.b.b ENSGT00940000158894 ENSGT00940000158933 ENSGT00940000155766.a ENSGT00940000158156.b.a ENSGT00940000158549 ENSGT00940000155311.C.c Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ENSGT01070000253760.b.a.a.b ENSGT00390000013867 ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a.a ENSGT00940000164714 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000158400 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182958.b.a.a.b ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00940000165736 ENSGT00940000163875.a.a ENSGT00650000093320.a.b.b.b ENSGT00940000158894 ENSGT00940000158933 ENSGT00940000155766.a ENSGT00940000158156.b.a ENSGT00940000158549 ENSGT00940000155311.C.c Climbing perch MODERN SPECIES 20 ENSATEG00000004841 ENSATEG00000004700 ENSATEG00000026968 ENSATEG00000004919 ENSATEG00000003856 ENSATEG00000027611 ENSATEG00000029166 ENSATEG00000003834 ENSATEG00000003786 ENSATEG00000025564 ENSATEG00000003704 ENSATEG00000003254 ENSATEG00000003067 ENSATEG00000003030 p4htma (ENSATEG00000003026) ENSATEG00000002988 #22 ENSATEG00000002950 ddx20 (ENSATEG00000002941) kcnd3 (ENSATEG00000002911) ENSATEG00000029196 ENSATEG00000000381 cttnbp2nlb (ENSATEG00000000295) capza1b (ENSATEG00000000237) ENSATEG00000000128 tlr9 (ENSATEG00000000037) ENSATEG00000029721 ERC2 (ENSATEG00000023609) wnt5a (ENSATEG00000023598) LRTM1 (ENSATEG00000029459) CACNA2D3 (ENSATEG00000023582) ENSATEG00000023574 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 18 plcg1 (ENSBSLG00000008707) TOP1 (ENSBSLG00000008883) NCOA6 (ENSBSLG00000009604) GGT7 (ENSBSLG00000009620) ENSBSLG00000009729 snai1b (ENSBSLG00000009787) ENSBSLG00000009793 samhd1 (ENSBSLG00000009871) ENSBSLG00000010134 ENSBSLG00000010600 ENSBSLG00000010647 SLC26A6 (ENSBSLG00000010789) ENSBSLG00000011074 p4htma (ENSBSLG00000011277) ENSBSLG00000011285 ENSBSLG00000011799 #22 ddx20 (ENSBSLG00000012459) kcnd3 (ENSBSLG00000013133) ENSBSLG00000013458 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ENSMAMG00000009152 bgnb (ENSMAMG00000009130) ENSMAMG00000009116 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ENSGT01070000253760.b.a.a.b ENSGT00390000013867 ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000158400 ENSGT00940000164736 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182958.b.a.a.b ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00940000165736 ENSGT00940000163875.a.a ENSGT00650000093320.a.b.b.b ENSGT00940000158894 ENSGT00940000158933 ENSGT00940000155766.a ENSGT00940000158156.b.a ENSGT00940000158549 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000158400 ENSGT00940000164736 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182958.b.a.a.b ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00940000165736 ENSGT00940000163875.a.a ENSGT00650000093320.a.b.b.b ENSGT00940000158894 ENSGT00940000158933 ENSGT00940000155766.a ENSGT00940000158156.b.a ENSGT00940000158549 Turbot MODERN SPECIES 2 b4galt5 (ENSSMAG00000008219) ENSSMAG00000008194 aar2 (ENSSMAG00000008182) PRPF6 (ENSSMAG00000008112) SAMD10 (ENSSMAG00000022019) ZNF512B (ENSSMAG00000007941) UCKL1 (ENSSMAG00000007850) ENSSMAG00000007817 ENSSMAG00000007791 ENSSMAG00000007779 NKAIN4 (ENSSMAG00000007720) birc7 (ENSSMAG00000007685) YTHDF1 (ENSSMAG00000007635) BHLHE23 (ENSSMAG00000007626) SLC17A9 (ENSSMAG00000007607) ENSSMAG00000007529 #22 ENSSMAG00000007516 ddx20 (ENSSMAG00000007498) kcnd3 (ENSSMAG00000007465) ENSSMAG00000031531 ENSSMAG00000007421 cttnbp2nlb (ENSSMAG00000007406) capza1b (ENSSMAG00000007364) ENSSMAG00000028409 tlr9 (ENSSMAG00000029397) ERC2 (ENSSMAG00000007058) wnt5a (ENSSMAG00000007029) LRTM1 (ENSSMAG00000007023) CACNA2D3 (ENSSMAG00000006854) ENSSMAG00000006821 ENSSMAG00000006805 Tongue sole MODERN SPECIES 1 arl8a (ENSCSEG00000018609) ENSCSEG00000018578 prpf6 (ENSCSEG00000018561) ENSCSEG00000018498 uckl1a (ENSCSEG00000018479) ENSCSEG00000018474 ZBTB46 (ENSCSEG00000018454) bhlhe23 (ENSCSEG00000018451) slc17a9b (ENSCSEG00000018445) kcna2b (ENSCSEG00000018442) ngfa (ENSCSEG00000018434) uba1 (ENSCSEG00000018402) arhgef3l (ENSCSEG00000018397) tktb (ENSCSEG00000018345) ENSCSEG00000018334 ENSCSEG00000018305 #22 parapinopsina (ENSCSEG00000018278) ddx20 (ENSCSEG00000018265) ENSCSEG00000018263 kcnd3 (ENSCSEG00000018248) cttnbp2nlb (ENSCSEG00000018240) capza1b (ENSCSEG00000018213) KCNA10 (ENSCSEG00000018205) ENSCSEG00000018186 LGR6 (ENSCSEG00000018163) st14b (ENSCSEG00000018148) kcnd1 (ENSCSEG00000018138) gripap1 (ENSCSEG00000018111) plxna3 (ENSCSEG00000018064) bcap31 (ENSCSEG00000018042) ENSCSEG00000017993 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b 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ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000158400 ENSGT00940000164736 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182958.b.a.a.b ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00940000165736 ENSGT00940000163875.a.a ENSGT00650000093320.a.b.b.b ENSGT00940000158894 ENSGT00940000158933 ENSGT00940000155766.a ENSGT00940000158156.b.a ENSGT00940000158549 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3093 plcg1 (ENSSLDG00000025335) TOP1 (ENSSLDG00000025343) ENSSLDG00000025349 GGT7 (ENSSLDG00000025350) ENSSLDG00000025358 snai1b (ENSSLDG00000025359) ENSSLDG00000025361 samhd1 (ENSSLDG00000025364) ENSSLDG00000025367 ENSSLDG00000025370 KBTBD12 (ENSSLDG00000025372) SLC26A6 (ENSSLDG00000025374) ENSSLDG00000000099 P4HTM (ENSSLDG00000000213) ENSSLDG00000000223 ENSSLDG00000000259 #22 parapinopsina (ENSSLDG00000000286) ddx20 (ENSSLDG00000000437) ENSSLDG00000000451 kcnd3 (ENSSLDG00000000468) ENSSLDG00000000503 cttnbp2nlb (ENSSLDG00000000527) capza1b 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ENSTNIG00000015014 rhoaa (ENSTNIG00000015015) Fugu MODERN SPECIES 15 NCOA6 (ENSTRUG00000031596) GGT7 (ENSTRUG00000000439) ENSTRUG00000024255 snai1b (ENSTRUG00000000419) samhd1 (ENSTRUG00000027672) KBTBD12 (ENSTRUG00000031674) ENSTRUG00000027974 ENSTRUG00000026345 p4htma (ENSTRUG00000027605) ENSTRUG00000020777 KBTBD12 (ENSTRUG00000031116) SLC26A6 (ENSTRUG00000003313) ENSTRUG00000005480 ENSTRUG00000005983 p4htma (ENSTRUG00000022821) ENSTRUG00000006166 #22 parapinopsina (ENSTRUG00000006524) ddx20 (ENSTRUG00000023712) ENSTRUG00000026992 kcnd3 (ENSTRUG00000006840) ENSTRUG00000031525 ENSTRUG00000007021 cttnbp2nlb (ENSTRUG00000024712) capza1b (ENSTRUG00000027953) ENSTRUG00000020161 ENSTRUG00000007717 ERC2 (ENSTRUG00000025999) wnt5a (ENSTRUG00000020211) LRTM1 (ENSTRUG00000009363) CACNA2D3 (ENSTRUG00000008741) atp6ap1lb (ENSTRUG00000025087) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a 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ENSLBEG00000019390 tlr9 (ENSLBEG00000019463) ERC2 (ENSLBEG00000019496) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ENSGT01070000253760.b.a.a.b ENSGT00390000013867 ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000158400 ENSGT00940000164736 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182958.b.a.a.b ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00940000165736 ENSGT00940000163875.a.a ENSGT00650000093320.a.b.b.b ENSGT00940000178378 ENSGT00940000158894 ENSGT00940000158933 ENSGT00940000155766.a ENSGT00940000158156.b.a Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C 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ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000158400 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182958.b.a.a.b ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00940000165736 ENSGT00940000163875.a.a ENSGT00650000093320.a.b.b.b ENSGT00940000178378 ENSGT00940000158894 ENSGT00940000158933 ENSGT00940000155766.a ENSGT00940000158156.b.a ENSGT00940000158549 European seabass MODERN SPECIES 14 zhx3b (ENSDLAG00005011259) plcg1 (ENSDLAG00005011294) TOP1 (ENSDLAG00005011832) ENSDLAG00005012400 ENSDLAG00005012463 snai1b (ENSDLAG00005030730) ENSDLAG00005012562 ENSDLAG00005017152 ENSDLAG00005031741 ENSDLAG00005029353 ENSDLAG00005034887 ENSDLAG00005012598 ENSDLAG00005012609 ENSDLAG00005012657 ENSDLAG00005013230 ENSDLAG00005013500 #22 ENSDLAG00005035080 ENSDLAG00005013452 ENSDLAG00005014065 ddx20 (ENSDLAG00005014077) kcnd3 (ENSDLAG00005014320) ENSDLAG00005014370 cttnbp2nlb (ENSDLAG00005015350) capza1b (ENSDLAG00005015368) ENSDLAG00005015960 tlr9 (ENSDLAG00005016215) ERC2 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MODERN SPECIES 31 zhx3b (ENSSLUG00000003989) plcg1 (ENSSLUG00000002779) TOP1 (ENSSLUG00000002565) NCOA6 (ENSSLUG00000002497) GGT7 (ENSSLUG00000002432) ENSSLUG00000002412 snai1b (ENSSLUG00000002409) ENSSLUG00000002406 samhd1 (ENSSLUG00000001794) ENSSLUG00000001511 KBTBD12 (ENSSLUG00000022930) ENSSLUG00000022887 ENSSLUG00000021444 ENSSLUG00000021336 p4htma (ENSSLUG00000021330) ENSSLUG00000020353 #22 parapinopsina (ENSSLUG00000020269) ddx20 (ENSSLUG00000020230) kcnd3 (ENSSLUG00000020215) ENSSLUG00000017463 cttnbp2nlb (ENSSLUG00000017270) capza1b (ENSSLUG00000017066) ENSSLUG00000016868 tlr9 (ENSSLUG00000016835) ERC2 (ENSSLUG00000016820) wnt5a (ENSSLUG00000016776) LRTM1 (ENSSLUG00000016757) ENSSLUG00000016751 CACNA2D3 (ENSSLUG00000016732) atp6ap1lb (ENSSLUG00000016726) B4GALT3 (ENSSLUG00000016719) Channel bull blenny MODERN SPECIES 21 zhx3b (ENSCGOG00000021012) plcg1 (ENSCGOG00000021047) TOP1 (ENSCGOG00000022182) NCOA6 (ENSCGOG00000022309) GGT7 (ENSCGOG00000022320) ENSCGOG00000022366 snai1b 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ENSGT00940000164714 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT00940000163520.A.a.a.a.b.a.a ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00970000193381.a.a.c.b.a.b.a Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000004786 ENSGT00950000182893.a.a.b.a.c ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114.e.b ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ENSGT00390000013867.b.b ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a.d ENSGT00940000164714 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT00940000163520.A.a.a.a.b.a.a ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00970000193381.a.a.c.b.a.b.a.d ENSGT00970000193381.a.a.c.b.a.b.a.c ENSGT00940000155766.a ENSGT00940000158933 ENSGT00940000158894 ENSGT00650000093320.a.b.b.b ENSGT00940000163875.a.a ENSGT00940000165736 ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000182958.b.a.a.b.e.a ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00940000158400 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000004786 ENSGT00950000182893.a.a.b.a.c ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114.e.b ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ENSGT00390000013867.b.b ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a.d ENSGT00940000164714 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 ENSGT00940000156963.a.a #22 ENSGT00940000163520.A.a.a.a.b.a.a ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00970000193381.a.a.c.b.a.b.a.d ENSGT00970000193381.a.a.c.b.a.b.a.c ENSGT00940000158933 ENSGT00940000158894 ENSGT00650000093320.a.b.b.b ENSGT00940000163875.a.a ENSGT00940000165736 ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000182958.b.a.a.b.e.a ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00940000158400 ENSGT00940000158156.b.a.f Coho salmon MODERN SPECIES 16 zhx3b (ENSOKIG00005023903) plcg1 (ENSOKIG00005024051) TOP1 (ENSOKIG00005024944) ENSOKIG00005026316 GGT7 (ENSOKIG00005026380) ENSOKIG00005026703 snai1b 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ENSGT00940000156963.a.b ##22 Spotted gar MODERN SPECIES 647 plxna3 (ENSLOCG00000014612) PNCK (ENSLOCG00000014603) slc6a8 (ENSLOCG00000014590) bcap31 (ENSLOCG00000014585) slc35a2 (ENSLOCG00000014583) pim2 (ENSLOCG00000014577) otud5a (ENSLOCG00000014573) ENSLOCG00000017978 ELK1 (ENSLOCG00000014572) uxt (ENSLOCG00000014570) zgc:86609 (ENSLOCG00000014569) ENSLOCG00000014568 grm6a (ENSLOCG00000014563) abt1 (ENSLOCG00000014561) comtb (ENSLOCG00000014559) ENSLOCG00000014555 ##22 ENSLOCG00000014554 fam50a (ENSLOCG00000014548) alas2 (ENSLOCG00000014541) ENSLOCG00000014538 ENSLOCG00000014533 kcnd1 (ENSLOCG00000014523) gripap1 (ENSLOCG00000014510) MON1B (ENSLOCG00000014503) ptpn18 (ENSLOCG00000014499) ENSLOCG00000014494 renbp (ENSLOCG00000014488) FAM107A (ENSLOCG00000014487) nt5dc2 (ENSLOCG00000014477) zgc:162200 (ENSLOCG00000014473) apex2 (ENSLOCG00000014467) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT01050000244850.A.a.o.a ENSGT00940000162187 ENSGT00940000155869 ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963.b.b ENSGT00940000165528 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00390000005780.a ENSGT00940000160485 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00390000012692 ENSGT00940000157877.b.g ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00940000157503.i.a ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000161383.d.b ENSGT00940000159128 ENSGT00940000166313.b ENSGT00940000159563 ENSGT00990000203541.b Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 147 ENSGT01050000244850.A.a.o.a ENSGT00940000162187 ENSGT00940000155869 ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000163427.c ENSGT00940000158963.b.b ENSGT00940000165528 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00390000005780.a ENSGT00940000160485 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00390000012692 ENSGT00940000157877.b.g ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00730000111044 ENSGT00940000155480.d.m ENSGT00940000158685 ENSGT00940000157503.i.a ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000161383.d.b ENSGT00940000159128 Asian bonytongue MODERN SPECIES slc6a8 (ENSSFOG00015002806) slc6a8 (ENSSFOG00015033035) bcap31 (ENSSFOG00015002726) slc35a2 (ENSSFOG00015002690) pim2 (ENSSFOG00015002666) pim2 (ENSSFOG00015002649) otud5a (ENSSFOG00015030449) ENSSFOG00015002627 ENSSFOG00015002614 uxt (ENSSFOG00015002509) zgc:86609 (ENSSFOG00015002467) USP11 (ENSSFOG00015002379) grm6a (ENSSFOG00015002324) comta (ENSSFOG00015032003) abt1 (ENSSFOG00015031363) CDK16 (ENSSFOG00015002239) ##22 tsr2 (ENSSFOG00015002207) SRPK3 (ENSSFOG00015002090) PLXNB3 (ENSSFOG00015002059) abcd1 (ENSSFOG00015001977) ENSSFOG00015030516 ENSSFOG00015026264 ENSSFOG00015001950 cxxc1a (ENSSFOG00015001940) zgc:113363 (ENSSFOG00015032088) tfe3a (ENSSFOG00015001934) FGD1 (ENSSFOG00015001880) ENSSFOG00015001848 mecp2 (ENSSFOG00015029955) IRAK1 (ENSSFOG00015001632) HCFC1 (ENSSFOG00015001349) P. kingsleyae MODERN SPECIES 301 ENSPKIG00000023382 uxt (ENSPKIG00000023407) zgc:86609 (ENSPKIG00000023431) USP11 (ENSPKIG00000023476) grm6a (ENSPKIG00000023528) abt1 (ENSPKIG00000023588) comta (ENSPKIG00000023566) CDK16 (ENSPKIG00000023637) ##22 tsr2 (ENSPKIG00000023676) SRPK3 (ENSPKIG00000023691) PLXNB3 (ENSPKIG00000023729) abcd1 (ENSPKIG00000023779) ENSPKIG00000023796 ENSPKIG00000023805 cxxc1a (ENSPKIG00000023833) ENSPKIG00000023877 tfe3a (ENSPKIG00000023885) FGD1 (ENSPKIG00000023905) ENSPKIG00000023954 mecp2 (ENSPKIG00000023979) ENSPKIG00000023994 ENSPKIG00000024006 cdk20 (ENSPKIG00000024030) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 80 ENSGT00940000164289.a ENSGT01050000244850.A.a.o.a ENSGT00940000156776.c ENSGT00940000155869 ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000163427.c ENSGT00940000158963.b.b ENSGT00940000165528 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00390000005780.a ENSGT00940000160485 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00390000012692 ENSGT00940000157877.b.g ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00940000169444 ENSGT00940000157503.i.a ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b.v ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000159128 ENSGT00940000166313.b ENSGT00940000159563 Denticle herring MODERN SPECIES 1 plxna3 (ENSDCDG00000032471) ENSDCDG00000032001 slc6a8 (ENSDCDG00000030465) bcap31 (ENSDCDG00000030429) slc35a2 (ENSDCDG00000030422) pim2 (ENSDCDG00000030420) otud5a (ENSDCDG00000030287) ENSDCDG00000030264 ELK1 (ENSDCDG00000030257) uxt (ENSDCDG00000030254) zgc:86609 (ENSDCDG00000030234) USP11 (ENSDCDG00000026692) grm6a (ENSDCDG00000023855) abt1 (ENSDCDG00000023830) comta (ENSDCDG00000023828) CDK16 (ENSDCDG00000021622) ##22 tsr2 (ENSDCDG00000021609) SRPK3 (ENSDCDG00000020351) PLXNB3 (ENSDCDG00000015001) abcd1 (ENSDCDG00000014869) ENSDCDG00000014860 mbd1a (ENSDCDG00000014854) tfe3a (ENSDCDG00000014843) ENSDCDG00000014841 FGD1 (ENSDCDG00000014316) ENSDCDG00000014265 mecp2 (ENSDCDG00000013979) ENSDCDG00000013911 hcfc1b (ENSDCDG00000013119) cdk20 (ENSDCDG00000013012) ENSDCDG00000012998 Atlantic herring MODERN SPECIES 20 fkbp1ab (ENSCHAG00000000250) sdcbp2 (ENSCHAG00000000281) SNPH (ENSCHAG00000000315) ENSCHAG00000000334 ENSCHAG00000000355 ENSCHAG00000000376 ENSCHAG00000000439 ENSCHAG00000000466 ENSCHAG00000000504 uxt (ENSCHAG00000000675) zgc:86609 (ENSCHAG00000000813) USP11 (ENSCHAG00000001346) grm6a (ENSCHAG00000003869) abt1 (ENSCHAG00000006011) comta (ENSCHAG00000006027) CDK16 (ENSCHAG00000006163) ##22 tsr2 (ENSCHAG00000010385) SRPK3 (ENSCHAG00000010403) PLXNB3 (ENSCHAG00000010819) abcd1 (ENSCHAG00000014730) ENSCHAG00000015450 FGD1 (ENSCHAG00000015518) tfe3a (ENSCHAG00000015756) hcfc1b (ENSCHAG00000015879) cdk20 (ENSCHAG00000016474) ENSCHAG00000016693 HDAC6 (ENSCHAG00000016727) ENSCHAG00000018158 ENSCHAG00000018192 ENSCHAG00000018208 plp2a (ENSCHAG00000018231) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 91 ENSGT00940000160611 ENSGT00500000044947 ENSGT00950000182834.C ENSGT00940000165157 ENSGT00940000159410 ENSGT00940000154570.a.a ENSGT00390000009278.a ENSGT00940000166894 ENSGT00940000158374.d ENSGT00940000163942.a ENSGT00940000155056.b ENSGT00390000006665.b.g ENSGT00940000158963.b.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00390000012692 ENSGT00940000157877.b.g ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00940000169444 ENSGT00730000111044 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000156776.c ENSGT00940000155869 ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000163427.c ENSGT00940000161689 ENSGT00940000158963.b.b ENSGT00940000165528 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00390000005780.a ENSGT00940000160485 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00390000012692 ENSGT00940000157877.b.g ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00940000169444 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000157503.i.a ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000159128 ENSGT00940000166313.b Channel catfish MODERN SPECIES 24 ENSIPUG00000011620 Slc6a8 (ENSIPUG00000011661) bcap31 (ENSIPUG00000011713) slc35a2 (ENSIPUG00000011733) pim2 (ENSIPUG00000011752) otud5 (ENSIPUG00000011788) LRRN1 (ENSIPUG00000011826) elk1 (ENSIPUG00000011841) Uxt (ENSIPUG00000011857) zgc:86609 (ENSIPUG00000011878) usp11 (ENSIPUG00000011912) grm6a (ENSIPUG00000011995) abt1 (ENSIPUG00000012026) comt (ENSIPUG00000012058) comt (ENSIPUG00000012075) cdk16 (ENSIPUG00000012114) ##22 tsr2 (ENSIPUG00000012170) srpk3 (ENSIPUG00000012200) PLXNB3 (ENSIPUG00000012302) ABCD1 (ENSIPUG00000012423) CCDC120 (ENSIPUG00000012472) mbd1a (ENSIPUG00000012547) CXXC1 (ENSIPUG00000012610) ntpcr (ENSIPUG00000012672) zgc:113363 (ENSIPUG00000012710) tfe3a (ENSIPUG00000012922) FGD1 (ENSIPUG00000012986) ENSIPUG00000013003 mecp2 (ENSIPUG00000013019) irak1 (ENSIPUG00000013038) hcfc1 (ENSIPUG00000013092) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT00940000155869 ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000163427.c ENSGT00940000158963.b.b ENSGT00940000165528 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00390000005780.a ENSGT00940000160485 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT00940000158963.b.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00390000012692 ENSGT00940000157877.b.g ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00940000169444 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000157503.i.a ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000159128 ENSGT00940000166313.b Electric eel MODERN SPECIES 1273 CDK16 (ENSEEEG00000005763) ##22 tsr2 (ENSEEEG00000005764) SRPK3 (ENSEEEG00000005798) PLXNB3 (ENSEEEG00000006723) Characoidei ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00390000012692 ENSGT00940000157877.b.g ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00940000169444 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000158685 ENSGT00940000157503.i.a ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000159128 Mexicana tetra MODERN SPECIES 21 grip2a (ENSAMXG00000036235) slc6a6a (ENSAMXG00000038150) ABTB1 (ENSAMXG00000040273) USP11 (ENSAMXG00000017309) zgc:86609 (ENSAMXG00000040575) uxt (ENSAMXG00000039548) ENSAMXG00000017384 ENSAMXG00000025140 otud5a (ENSAMXG00000038113) pim2 (ENSAMXG00000032454) slc35a2 (ENSAMXG00000017408) bcap31 (ENSAMXG00000017416) slc6a8 (ENSAMXG00000017442) ENSAMXG00000017457 comta (ENSAMXG00000016773) CDK16 (ENSAMXG00000016796) ##22 tsr2 (ENSAMXG00000016817) SRPK3 (ENSAMXG00000031741) PLXNB3 (ENSAMXG00000016869) abcd1 (ENSAMXG00000040510) ENSAMXG00000016916 cxxc1a (ENSAMXG00000016944) zgc:113363 (ENSAMXG00000035901) tfe3a (ENSAMXG00000038236) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 358 abt1 (ENSPNAG00000005087) comta (ENSPNAG00000024067) ENSPNAG00000024081 CDK16 (ENSPNAG00000024144) ##22 tsr2 (ENSPNAG00000024167) SRPK3 (ENSPNAG00000004866) PLXNB3 (ENSPNAG00000024448) abcd1 (ENSPNAG00000024508) ENSPNAG00000003831 mbd1a (ENSPNAG00000024566) cxxc1a (ENSPNAG00000006542) zgc:113363 (ENSPNAG00000005751) tfe3a (ENSPNAG00000024609) FGD1 (ENSPNAG00000005886) ENSPNAG00000024681 mecp2 (ENSPNAG00000024721) ENSPNAG00000024736 hcfc1b (ENSPNAG00000024755) cdk20 (ENSPNAG00000005669) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000160611 ENSGT00500000044947 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USP11 (ENSCARG00000049254) grm6a (ENSCARG00000050523) abt1 (ENSCARG00000050817) comta (ENSCARG00000050828) CDK16 (ENSCARG00000050894) ##22 ENSCARG00000053076 SRPK3 (ENSCARG00000053120) PLXNB3 (ENSCARG00000053158) ENSCARG00000053939 ENSCARG00000053994 cxxc1a (ENSCARG00000054070) zgc:113363 (ENSCARG00000054198) tfe3a (ENSCARG00000054238) FGD1 (ENSCARG00000054608) Goldfish MODERN SPECIES 3122 ENSCARG00000070086 abt1 (ENSCARG00000070087) comta (ENSCARG00000070089) CDK16 (ENSCARG00000070092) ##22 Common carp reference MODERN SPECIES 17 ptpn18 (ENSCCRG00000005561) plxna3 (ENSCCRG00000066638) ENSCCRG00000033025 slc6a8 (ENSCCRG00000033069) slc35a2 (ENSCCRG00000081173) otud5a (ENSCCRG00000077446) ENSCCRG00000069233 ENSCCRG00000019150 ENSCCRG00000058800 uxt (ENSCCRG00000068398) zgc:86609 (ENSCCRG00000075696) ENSCCRG00000042969 grm6a (ENSCCRG00000044676) abt1 (ENSCCRG00000025767) comta (ENSCCRG00000025764) ENSCCRG00000067741 ##22 SRPK3 (ENSCCRG00000025752) ENSCCRG00000030238 abcd1 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Northern pike MODERN SPECIES 11 slc35a2 (ENSELUG00000001521) slc6a8 (ENSELUG00000010479) USP11 (ENSELUG00000010436) ENSELUG00000010401 zgc:86609 (ENSELUG00000010388) ENSELUG00000026224 uxt (ENSELUG00000001230) ENSELUG00000005052 ENSELUG00000005075 otud5a (ENSELUG00000005004) pim2 (ENSELUG00000004786) grm6a (ENSELUG00000004674) ENSELUG00000025738 abt1 (ENSELUG00000007974) comta (ENSELUG00000029048) CDK16 (ENSELUG00000007866) ##22 ENSELUG00000027361 tsr2 (ENSELUG00000007768) ENSELUG00000007723 ENSELUG00000030150 bgnb (ENSELUG00000001635) B4GALT3 (ENSELUG00000010296) ENSELUG00000033720 ENSELUG00000010271 ddx20 (ENSELUG00000010260) ENSELUG00000025745 kcnd3 (ENSELUG00000010238) ENSELUG00000010330 Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 11703 ENSHHUG00000018620 ##22 Huchen MODERN SPECIES 658 ptpn18 (ENSHHUG00000007415) plxna3 (ENSHHUG00000005822) slc6a8 (ENSHHUG00000005394) bcap31 (ENSHHUG00000005381) slc35a2 (ENSHHUG00000005374) pim2 (ENSHHUG00000005361) otud5a (ENSHHUG00000005328) 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ENSGT00940000165736 ENSGT00940000163875.a.a ENSGT00650000093320.a.b.b.b Salmo ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156776.c.f ENSGT00940000155869 ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000163427.c ENSGT00940000158963.b.b.d ENSGT00940000165528 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00390000005780.a ENSGT00940000160485.k ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT00990000211545.I ENSGT00940000155317.a.a.r ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00390000012692 ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00940000164248.b.b ENSGT00940000155311.C.c ENSGT00940000158549 ENSGT00940000158156.b.a.f ENSGT00940000158400 ENSGT00940000155343.b ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182958.b.a.a.b.f ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00940000165736 ENSGT00940000163875.a.a ENSGT00650000093320.a.b.b.b River trout MODERN SPECIES 23 ENSSTUG00000049669 slc6a8 (ENSSTUG00000049592) bcap31 (ENSSTUG00000049584) slc35a2 (ENSSTUG00000049583) pim2 (ENSSTUG00000049580) otud5a (ENSSTUG00000049567) ENSSTUG00000049565 ENSSTUG00000049564 uxt (ENSSTUG00000049561) zgc:86609 (ENSSTUG00000049556) USP11 (ENSSTUG00000049221) grm6a (ENSSTUG00000048975) abt1 (ENSSTUG00000048946) ENSSTUG00000048941 comta (ENSSTUG00000048934) CDK16 (ENSSTUG00000047329) ##22 tsr2 (ENSSTUG00000047276) SRPK3 (ENSSTUG00000047250) bgnb (ENSSTUG00000047245) B4GALT3 (ENSSTUG00000047239) atp6ap1lb (ENSSTUG00000047237) ddx20 (ENSSTUG00000047111) KCND3 (ENSSTUG00000047097) ENSSTUG00000047096 ENSSTUG00000047092 ENSSTUG00000045749 cttnbp2nlb (ENSSTUG00000045686) capza1b (ENSSTUG00000044276) ENSSTUG00000044055 tlr9 (ENSSTUG00000044046) ERC2 (ENSSTUG00000044027) Atlantic salmon MODERN SPECIES 4 plxna3 (ENSSSAG00000117654) ENSSSAG00000099811 slc6a8 (ENSSSAG00000073066) bcap31 (ENSSSAG00000073971) slc35a2 (ENSSSAG00000073975) pim2 (ENSSSAG00000090531) otud5a (ENSSSAG00000073981) ENSSSAG00000073995 ENSSSAG00000073997 uxt (ENSSSAG00000073999) POB (ENSSSAG00000074008) ENSSSAG00000074048 grm6a (ENSSSAG00000117835) abt1 (ENSSSAG00000093372) comta (ENSSSAG00000076380) ENSSSAG00000076397 ##22 tsr2 (ENSSSAG00000076713) ENSSSAG00000076726 ENSSSAG00000107407 bgn (ENSSSAG00000076802) b4galt3 (ENSSSAG00000076803) ENSSSAG00000076805 ddx20 (ENSSSAG00000076815) ENSSSAG00000122210 kcnd3 (ENSSSAG00000115399) ENSSSAG00000103451 ENSSSAG00000099746 ENSSSAG00000075682 cttnbp2nlb (ENSSSAG00000089724) ENSSSAG00000114365 capza1b (ENSSSAG00000076983) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01050000244850.A.a.o.a.f ENSGT00940000155869 ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000163427.c ENSGT00940000158963.b.b.d ENSGT00940000165528 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00390000005780.a ENSGT00940000160485.k ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT00990000211545.I ENSGT00940000155317.a.a.r ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00390000012692 ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00940000164248.b.b ENSGT00940000155311.C.c ENSGT00940000158549 ENSGT00940000158156.b.a.f ENSGT00940000158400 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182958.b.a.a.b.e.a ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00940000165736 ENSGT00940000163875.a.a ENSGT00650000093320.a.b.b.b ENSGT00940000158894 Rainbow trout MODERN SPECIES 7 ENSOMYG00000054617 bcap31 (ENSOMYG00000039088) slc35a2 (ENSOMYG00000039080) pim2 (ENSOMYG00000070574) otud5a (ENSOMYG00000038621) ENSOMYG00000038448 ENSOMYG00000038424 uxt (ENSOMYG00000038408) zgc:86609 (ENSOMYG00000038259) ENSOMYG00000035226 grm6a (ENSOMYG00000058364) abt1 (ENSOMYG00000034903) ENSOMYG00000034885 comta (ENSOMYG00000034879) ENSOMYG00000049357 ENSOMYG00000034674 ##22 tsr2 (ENSOMYG00000034541) ENSOMYG00000034378 ENSOMYG00000054349 ENSOMYG00000034082 ENSOMYG00000033995 ENSOMYG00000070426 ddx20 (ENSOMYG00000033653) ENSOMYG00000050077 ENSOMYG00000052073 kcnd3 (ENSOMYG00000054558) ENSOMYG00000065458 ENSOMYG00000033405 cttnbp2nlb (ENSOMYG00000053702) capza1b (ENSOMYG00000039883) ENSOMYG00000039265 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000164289.a.c ENSGT01050000244850.A.a.o.a.f ENSGT00940000155869 ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182827.B ENSGT00940000158963.b.b.d ENSGT00940000165528 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00390000005780.a ENSGT00940000160485.k ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT00990000211545.I ENSGT00940000155317.a.a.r ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00390000012692 ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00940000164248.b.b ENSGT00940000155311.C.c ENSGT00940000158549 ENSGT00940000158156.b.a.f ENSGT00940000158400 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182958.b.a.a.b.e.a ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00940000165736 ENSGT00940000163875.a.a ENSGT00650000093320.a.b.b.b ENSGT00940000158894 Chinook salmon MODERN SPECIES 14 ptpn18 (ENSOTSG00005012519) plxna3 (ENSOTSG00005012512) slc6a8 (ENSOTSG00005011442) bcap31 (ENSOTSG00005011436) slc35a2 (ENSOTSG00005011435) otud5a (ENSOTSG00005011095) ENSOTSG00005011094 ENSOTSG00005011092 uxt (ENSOTSG00005011091) zgc:86609 (ENSOTSG00005011090) USP11 (ENSOTSG00005007925) grm6a (ENSOTSG00005007914) abt1 (ENSOTSG00005007913) ENSOTSG00005007912 comta (ENSOTSG00005007911) CDK16 (ENSOTSG00005007515) ##22 tsr2 (ENSOTSG00005007514) SRPK3 (ENSOTSG00005003664) ENSOTSG00005003633 ENSOTSG00005003630 parapinopsina (ENSOTSG00005003628) ENSOTSG00005003626 KBTBD12 (ENSOTSG00005003623) ENSOTSG00005003620 samhd1 (ENSOTSG00005003231) snai1b (ENSOTSG00005003220) ENSOTSG00005003218 ENSOTSG00005003216 GGT7 (ENSOTSG00005003182) ENSOTSG00005003176 ENSOTSG00005003172 Coho salmon MODERN SPECIES 16 plxna3 (ENSOKIG00005019794) slc6a8 (ENSOKIG00005019356) bcap31 (ENSOKIG00005019304) slc35a2 (ENSOKIG00005019267) otud5a (ENSOKIG00005019120) ENSOKIG00005019082 ENSOKIG00005019078 ENSOKIG00005019068 uxt (ENSOKIG00005019052) zgc:86609 (ENSOKIG00005018996) USP11 (ENSOKIG00005018744) grm6a (ENSOKIG00005018665) abt1 (ENSOKIG00005018653) ENSOKIG00005018646 comta (ENSOKIG00005018638) CDK16 (ENSOKIG00005016915) ##22 tsr2 (ENSOKIG00005016773) SRPK3 (ENSOKIG00005015985) ENSOKIG00005015901 bgnb (ENSOKIG00005015897) B4GALT3 (ENSOKIG00005015885) atp6ap1lb (ENSOKIG00005015875) ddx20 (ENSOKIG00005015610) ENSOKIG00005015561 ENSOKIG00005015555 kcnd3 (ENSOKIG00005015538) ENSOKIG00005015407 cttnbp2nlb (ENSOKIG00005015382) capza1b (ENSOKIG00005014677) ENSOKIG00005014284 tlr9 (ENSOKIG00005014221) Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156805 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00390000012692 ENSGT00940000157877.b.g ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00940000167532 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00390000003348 ENSGT00990000210258 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000157503.j ENSGT00730000111044 ENSGT00940000159563 ENSGT00990000203541.b Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 514 tspan7b (ENSHCOG00000002917) XDH (ENSHCOG00000002935) dnajc27 (ENSHCOG00000002948) ENSHCOG00000002955 creg1 (ENSHCOG00000002961) otud5a (ENSHCOG00000002974) slc35a2 (ENSHCOG00000002991) slc6a8 (ENSHCOG00000003009) bcap31 (ENSHCOG00000003029) plxna3 (ENSHCOG00000003075) gripap1 (ENSHCOG00000003180) kcnd1 (ENSHCOG00000003209) rad51c (ENSHCOG00000003223) ENSHCOG00000003571 abt1 (ENSHCOG00000003610) CDK16 (ENSHCOG00000003661) ##22 GRM6 (ENSHCOG00000003691) AMIGO1 (ENSHCOG00000003703) ENSHCOG00000003711 sort1b (ENSHCOG00000003722) ngrn (ENSHCOG00000003730) nfyal (ENSHCOG00000003767) ahcyl1 (ENSHCOG00000003816) pgm2l1 (ENSHCOG00000003850) ENSHCOG00000003912 ZNF335 (ENSHCOG00000003939) prok1 (ENSHCOG00000003950) lamtor5 (ENSHCOG00000004009) slc16a4 (ENSHCOG00000004036) RBM15 (ENSHCOG00000004048) ENSHCOG00000004058 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00990000210258 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b ##22 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00990000210258 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b ##22 Tetraodontidae DUPLICATION Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156963.a.b.e ##22 Fugu MODERN SPECIES 45 ENSTRUG00000030218 ##22 parapinopsina (ENSTRUG00000030578) ddx20 (ENSTRUG00000032023) Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000175919 ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b.f ##22 ENSGT00940000156477.d.b ENSGT00950000182872.f.a.a.a.a.a.a ENSGT00550000075050 ENSGT00940000160485 ENSGT00390000005780.a ENSGT00940000159667.a ENSGT00950000183062.a.b.b.b ENSGT00950000182835.c.c.g.a ENSGT00940000164454 ENSGT00940000167069 ENSGT00390000018621 ENSGT00940000156650.j ENSGT00940000156358 ENSGT00490000043329.a.a.a.vb.a ENSGT00940000166923 Fugu MODERN SPECIES 15 snx21 (ENSTRUG00000032323) SYP (ENSTRUG00000004025) ENSTRUG00000004245 HDAC6 (ENSTRUG00000004270) ENSTRUG00000026840 TFE3 (ENSTRUG00000005584) FGD1 (ENSTRUG00000005916) ENSTRUG00000025307 mecp2 (ENSTRUG00000031924) ENSTRUG00000006646 ENSTRUG00000027194 SRPK3 (ENSTRUG00000008496) ENSTRUG00000008947 rad51c (ENSTRUG00000031941) abt1 (ENSTRUG00000002298) CDK16 (ENSTRUG00000009222) ##22 ENSTRUG00000023944 ENSTRUG00000009677 rfc2 (ENSTRUG00000009924) USP11 (ENSTRUG00000010016) zgc:86609 (ENSTRUG00000019609) IQSEC2 (ENSTRUG00000010391) PDZD4 (ENSTRUG00000010583) ENSTRUG00000011128 ndnl2 (ENSTRUG00000030801) ENSTRUG00000011439 tafazzin (ENSTRUG00000011612) atp6ap1a (ENSTRUG00000026680) acss2 (ENSTRUG00000011909) ndnl2 (ENSTRUG00000024906) atp6ap1a (ENSTRUG00000011744) Tetraodon MODERN SPECIES 26 tafazzin (ENSTNIG00000006829) ENSTNIG00000006830 ndnl2 (ENSTNIG00000006831) PFKFB1 (ENSTNIG00000006832) ENSTNIG00000003492 PDZD4 (ENSTNIG00000003491) IQSEC2 (ENSTNIG00000014953) zgc:86609 (ENSTNIG00000014954) USP11 (ENSTNIG00000014955) rfc2 (ENSTNIG00000014956) ENSTNIG00000014957 ENSTNIG00000014958 ENSTNIG00000014959 ENSTNIG00000014960 abt1 (ENSTNIG00000014961) CDK16 (ENSTNIG00000014962) ##22 ENSTNIG00000014963 rad51c (ENSTNIG00000014964) ENSTNIG00000014965 ENSTNIG00000002273 XPO1 (ENSTNIG00000003360) cct4 (ENSTNIG00000003361) pus10 (ENSTNIG00000003362) ENSTNIG00000005303 ENSTNIG00000000317 ENSTNIG00000005304 ENSTNIG00000005305 ENSTNIG00000003614 abcd1 (ENSTNIG00000006189) gnl2 (ENSTNIG00000003733) dnali1 (ENSTNIG00000003732) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00990000210258 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b ##22 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00990000210258 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b ##22 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000181187 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b ##22 Gilthead seabream MODERN SPECIES 21 ENSSAUG00010020928 ENSSAUG00010020876 ENSSAUG00010020874 ENSSAUG00010020873 ENSSAUG00010020871 ENSSAUG00010020828 ENSSAUG00010020809 abcd1 (ENSSAUG00010020753) ENSSAUG00010020751 ENSSAUG00010020741 SRPK3 (ENSSAUG00010019271) tsr2 (ENSSAUG00010019259) grm6a (ENSSAUG00010018563) rad51c (ENSSAUG00010018550) abt1 (ENSSAUG00010018548) CDK16 (ENSSAUG00010018454) ##22 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000181187 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b ##22 European seabass MODERN SPECIES 14 ENSDLAG00005028443 ENSDLAG00005031463 ENSDLAG00005004067 ENSDLAG00005033657 ENSDLAG00005004085 ENSDLAG00005029985 abcd1 (ENSDLAG00005016340) ENSDLAG00005030649 SRPK3 (ENSDLAG00005031799) tsr2 (ENSDLAG00005029437) ENSDLAG00005014385 ENSDLAG00005014357 ENSDLAG00005027640 abt1 (ENSDLAG00005014326) ENSDLAG00005014307 ENSDLAG00005013270 ##22 ENSDLAG00005034043 ENSDLAG00005021803 ENSDLAG00005027562 ENSDLAG00005035011 ENSDLAG00005014655 ENSDLAG00005034848 ENSDLAG00005018262 ENSDLAG00005033797 ENSDLAG00005028980 ENSDLAG00005028849 ENSDLAG00005033630 Large yellow croaker MODERN SPECIES 29 ENSLCRG00005021054 TFE3 (ENSLCRG00005021053) FGD1 (ENSLCRG00005020901) ENSLCRG00005020895 mecp2 (ENSLCRG00005020893) ENSLCRG00005020885 ENSLCRG00005020884 ENSLCRG00005020882 abcd1 (ENSLCRG00005020298) PLXNB3 (ENSLCRG00005020040) SRPK3 (ENSLCRG00005019999) ENSLCRG00005019997 grm6a (ENSLCRG00005019925) rad51c (ENSLCRG00005019923) abt1 (ENSLCRG00005019922) CDK16 (ENSLCRG00005019813) ##22 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00730000111044 ENSGT00940000159563 ENSGT00990000203541.b ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156805 ENSGT00940000156963.a.b ##22 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156805 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00390000002062 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000012692 ENSGT00940000157877.b.g ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00940000167532 ENSGT00940000160502 ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00990000203541.b ENSGT00940000159563 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000155877 Pike perch MODERN SPECIES 96 sult1st6 (ENSSLUG00000006894) ENSSLUG00000006885 ENSSLUG00000006879 ENSSLUG00000006872 rad51c (ENSSLUG00000006868) CDK16 (ENSSLUG00000006596) ##22 abt1 (ENSSLUG00000006557) GRM6 (ENSSLUG00000006540) tsr2 (ENSSLUG00000006530) SRPK3 (ENSSLUG00000005919) ENSSLUG00000004185 abcd1 (ENSSLUG00000002614) ENSSLUG00000002492 ENSSLUG00000002355 ENSSLUG00000002337 ENSSLUG00000002325 ENSSLUG00000002315 sypa (ENSSLUG00000002310) ENSSLUG00000002307 ENSSLUG00000001926 cxxc1a (ENSSLUG00000001738) Channel bull blenny MODERN SPECIES 123 CDK16 (ENSCGOG00000011326) ##22 ENSCGOG00000011300 ENSCGOG00000011298 or90a1 (ENSCGOG00000011293) ENSCGOG00000011234 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000157503.j ENSGT00730000111044 ENSGT00940000159563 ENSGT00990000203541.b ENSGT01030000234637.b.c.g ENSGT00940000160502 ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156805 ENSGT00940000156963.a.b ##22 Stickleback MODERN SPECIES 67 GRM6 (ENSGACG00000000297) ENSGACG00000000296 abt1 (ENSGACG00000000295) rad51c (ENSGACG00000000293) CDK16 (ENSGACG00000000290) ##22 ENSGACG00000000288 slc35a2 (ENSGACG00000000286) ENSGACG00000000285 bcap31 (ENSGACG00000000281) plxna3 (ENSGACG00000000280) GPR37L1 (ENSGACG00000000278) arl8a (ENSGACG00000000273) ENSGACG00000000270 st14b (ENSGACG00000000267) gripap1 (ENSGACG00000000262) itpr3 (ENSGACG00000000253) ENSGACG00000000249 ENSGACG00000000248 ENSGACG00000000239 ENSGACG00000000234 Lumpfish MODERN SPECIES 22 sypa (ENSCLMG00005000117) ENSCLMG00005000110 ENSCLMG00005000096 ENSCLMG00005000075 ENSCLMG00005017751 ENSCLMG00005017746 ENSCLMG00005017745 abcd1 (ENSCLMG00005017334) PLXNB3 (ENSCLMG00005016945) SRPK3 (ENSCLMG00005013236) tsr2 (ENSCLMG00005013178) ENSCLMG00005013176 GRM6 (ENSCLMG00005013175) abt1 (ENSCLMG00005013173) rad51c (ENSCLMG00005013172) CDK16 (ENSCLMG00005012987) ##22 ENSCLMG00005012971 samhd1 (ENSCLMG00005011739) snai1b (ENSCLMG00005011734) TP53INP2 (ENSCLMG00005011732) GGT7 (ENSCLMG00005011681) ENSCLMG00005011680 TOP1 (ENSCLMG00005011678) plcg1 (ENSCLMG00005010570) zhx3b (ENSCLMG00005010553) b4galt5 (ENSCLMG00005010144) EMILIN3 (ENSCLMG00005010141) aar2 (ENSCLMG00005010140) prpf6 (ENSCLMG00005010125) SAMD10 (ENSCLMG00005010106) ENSCLMG00005010103 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 2812 rad51c (ENSLBEG00000016744) abt1 (ENSLBEG00000016780) ENSLBEG00000016802 ##22 Ballan wrasse MODERN SPECIES 954 ENSLBEG00000017564 PLXNB3 (ENSLBEG00000017384) ENSLBEG00000017332 SRPK3 (ENSLBEG00000017286) tsr2 (ENSLBEG00000017316) ENSLBEG00000017259 grm6a (ENSLBEG00000017198) rad51c (ENSLBEG00000017178) abt1 (ENSLBEG00000017161) CDK16 (ENSLBEG00000017127) ##22 Zig-zag eel MODERN SPECIES 21 ENSMAMG00000011870 ENSMAMG00000011838 ENSMAMG00000011823 ENSMAMG00000011807 ENSMAMG00000011796 ENSMAMG00000011744 ENSMAMG00000011723 ENSMAMG00000011700 abcd1 (ENSMAMG00000011668) ENSMAMG00000011573 SRPK3 (ENSMAMG00000011547) tsr2 (ENSMAMG00000011540) grm6a (ENSMAMG00000011504) ENSMAMG00000011498 ENSMAMG00000011460 ENSMAMG00000011416 ##22 ENSMAMG00000025721 ENSMAMG00000011361 ENSMAMG00000011315 dip2ba (ENSMAMG00000011261) atf7a (ENSMAMG00000011234) asb8 (ENSMAMG00000027831) ENSMAMG00000011206 pfkma (ENSMAMG00000011141) ENSMAMG00000011104 DEF6 (ENSMAMG00000011078) ppardb (ENSMAMG00000011065) mkrn4 (ENSMAMG00000011051) fance (ENSMAMG00000011012) rpl10a (ENSMAMG00000011005) ENSMAMG00000010982 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159563 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000175919 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00940000156805 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000012692 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b ##22 Climbing perch MODERN SPECIES 20 ENSATEG00000019560 ENSATEG00000019532 ENSATEG00000019515 ENSATEG00000028169 ENSATEG00000026321 ENSATEG00000019432 ENSATEG00000019386 abcd1 (ENSATEG00000019330) ENSATEG00000019296 ENSATEG00000019117 SRPK3 (ENSATEG00000019084) ENSATEG00000019071 ENSATEG00000019019 tsr2 (ENSATEG00000019009) ENSATEG00000018998 ENSATEG00000018948 ##22 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000175919 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000155317.a.a.m ENSGT00940000156963.a.b ##22 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156963.a.b ##22 Tongue sole MODERN SPECIES 1 abt1 (ENSCSEG00000016929) rad51c (ENSCSEG00000016935) CDK16 (ENSCSEG00000016955) ##22 tsr2 (ENSCSEG00000017003) SRPK3 (ENSCSEG00000017017) ENSCSEG00000017060 abcd1 (ENSCSEG00000017155) ENSCSEG00000017213 ENSCSEG00000017270 ENSCSEG00000017284 ENSCSEG00000017325 ENSCSEG00000017332 FGD1 (ENSCSEG00000017343) ENSCSEG00000017362 ENSCSEG00000017371 CXXC1 (ENSCSEG00000017380) HDAC6 (ENSCSEG00000017407) ENSCSEG00000017474 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000175919 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000155317.a.a.m ENSGT00940000156963.a.b ##22 Seriola ANCESTRAL SPECIES 75 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000175919 ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000155317.a.a.m ENSGT00940000156963.a.b ##22 Greater amberjack MODERN SPECIES 150 FGD1 (ENSSDUG00000019849) ENSSDUG00000019824 mecp2 (ENSSDUG00000019809) ENSSDUG00000019781 ENSSDUG00000019763 ENSSDUG00000019722 abcd1 (ENSSDUG00000019696) PLXNB3 (ENSSDUG00000019515) ENSSDUG00000019492 SRPK3 (ENSSDUG00000019453) tsr2 (ENSSDUG00000019445) GRM6 (ENSSDUG00000019376) rad51c (ENSSDUG00000019366) abt1 (ENSSDUG00000019357) COMT (ENSSDUG00000019301) CDK16 (ENSSDUG00000019268) ##22 Yellowtail amberjack DUPLICATION Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2108 ENSSLDG00000015420 ##22 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2724 ENSSLDG00000006396 ENSSLDG00000006375 ENSSLDG00000006346 mecp2 (ENSSLDG00000006333) ENSSLDG00000006286 ENSSLDG00000006262 ENSSLDG00000006250 abcd1 (ENSSLDG00000006205) PLXNB3 (ENSSLDG00000005974) SRPK3 (ENSSLDG00000005703) tsr2 (ENSSLDG00000005598) GRM6 (ENSSLDG00000005543) rad51c (ENSSLDG00000005524) abt1 (ENSSLDG00000005513) COMT (ENSSLDG00000005333) CDK16 (ENSSLDG00000005240) ##22 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b ##22 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 368 ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b ##22 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b ##22 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 397 ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b ##22 Amazon molly MODERN SPECIES 890 abcd1 (ENSPFOG00000012630) PLXNB3 (ENSPFOG00000011896) SRPK3 (ENSPFOG00000022695) tsr2 (ENSPFOG00000011824) grm6a (ENSPFOG00000011555) rad51c (ENSPFOG00000011542) abt1 (ENSPFOG00000011510) CDK16 (ENSPFOG00000011288) ##22 ENSPFOG00000011271 Mummichog MODERN SPECIES 1377 abt1 (ENSFHEG00000022211) CDK16 (ENSFHEG00000022229) ##22 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b ##22 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 119 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156805 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00390000012692 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00950000182846.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156478 ENSGT00390000007823 ENSGT00940000159151 ENSGT00940000160318.c.a ENSGT00940000157078 ENSGT01100000263518.B.b.a.a ENSGT00940000159657.d.h ENSGT00940000157212.A ENSGT00940000164481.b.b ENSGT00940000155472.a.a ENSGT00720000108868 ENSGT00940000164289.a ENSGT01050000244850.A.a.o.a ENSGT01050000244850.A.a.p Orange clownfish MODERN SPECIES 22 ENSAPEG00000024096 FGD1 (ENSAPEG00000024070) ENSAPEG00000024051 mecp2 (ENSAPEG00000023997) ENSAPEG00000023917 ENSAPEG00000023882 abcd1 (ENSAPEG00000023814) ENSAPEG00000023797 ENSAPEG00000023723 PLXNB3 (ENSAPEG00000023646) SRPK3 (ENSAPEG00000023629) abt1 (ENSAPEG00000023617) rad51c (ENSAPEG00000023593) GRM6 (ENSAPEG00000023556) tsr2 (ENSAPEG00000023549) CDK16 (ENSAPEG00000023524) ##22 dnase1l1 (ENSAPEG00000023457) hm13 (ENSAPEG00000023409) mrgbp (ENSAPEG00000023381) SULF2 (ENSAPEG00000023292) ENSAPEG00000023270 ENSAPEG00000023263 ENSAPEG00000023201 GPR37L1 (ENSAPEG00000023190) arl8a (ENSAPEG00000023154) ENSAPEG00000023142 ENSAPEG00000023050 kcnd1 (ENSAPEG00000023041) gripap1 (ENSAPEG00000023013) ptpn18 (ENSAPEG00000022989) ENSAPEG00000022970 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111044 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT01070000253766.B.f.a ENSGT00390000016168.b ENSGT00400000022086.b.a.a ENSGT01030000234941.c ENSGT00600000085659.b ENSGT00940000155170 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.b ENSGT01050000244882.b.c.b.b ENSGT00940000154955.b ENSGT00940000158313.a.b ENSGT00940000158675.a ENSGT00940000160528.b ENSGT00940000156890.a.b ENSGT00940000154307.D Nile tilapia MODERN SPECIES 12 ENSONIG00000038680 TFE3 (ENSONIG00000000820) FGD1 (ENSONIG00000000817) ENSONIG00000030751 ENSONIG00000040360 ENSONIG00000000806 ENSONIG00000000801 ENSONIG00000000800 abcd1 (ENSONIG00000000793) PLXNB3 (ENSONIG00000000783) SRPK3 (ENSONIG00000000769) tsr2 (ENSONIG00000000763) grm6a (ENSONIG00000000755) abt1 (ENSONIG00000000750) rad51c (ENSONIG00000042488) CDK16 (ENSONIG00000000736) ##22 CCM2L (ENSONIG00000000732) ENSONIG00000000730 ENSONIG00000033261 ENSONIG00000039995 ENSONIG00000041257 ENSONIG00000040125 ENSONIG00000030712 ENSONIG00000014581 ENSONIG00000004087 ENSONIG00000033251 ENSONIG00000034031 ENSONIG00000031199 ENSONIG00000027297 ENSONIG00000040127 ENSONIG00000016583 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 397 ENSNBRG00000008595 TFE3 (ENSNBRG00000008566) FGD1 (ENSNBRG00000008517) ENSNBRG00000008488 mecp2 (ENSNBRG00000008411) ENSNBRG00000008359 ENSNBRG00000008338 ENSNBRG00000008309 abcd1 (ENSNBRG00000008264) PLXNB3 (ENSNBRG00000008035) SRPK3 (ENSNBRG00000007989) ENSNBRG00000007974 tsr2 (ENSNBRG00000007965) GRM6 (ENSNBRG00000007667) rad51c (ENSNBRG00000007632) ENSNBRG00000007616 ##22 xkr7b (ENSNBRG00000007600) ENSNBRG00000007589 ENSNBRG00000007573 ENSNBRG00000007547 ENSNBRG00000007543 ENSNBRG00000007534 ENSNBRG00000007515 ENSNBRG00000007485 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT01070000253766.B.f.a ENSGT00390000016168.b ENSGT00400000022086.b.a.a ENSGT01030000234941.c ENSGT00940000156038.a.a.d.a.i.a ENSGT00940000154285.a.a.c.a.e.a ENSGT01030000234941.d.a ENSGT00950000182888.a.a.a.f ENSGT00600000085659.b.cb.b ENSGT00600000085659.b.db ENSGT00940000155170 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.b ENSGT01050000244882.b.c.b.b ENSGT00940000154955.b Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000157503.j ENSGT00940000159438 ENSGT00390000003348 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00940000160502 ENSGT00940000167532 ENSGT00940000154102.b.a.b ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b.g ENSGT00390000012692 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000156805 ENSGT00390000002062 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT01070000253766.B.f.a ENSGT00390000016168.b ENSGT00400000022086.b.a.a ENSGT01030000234941.c.b ENSGT01030000234941.c.a ENSGT00940000156038.a.a.d.a.i.a ENSGT00940000154285.a.a.c.a.e.a ENSGT00950000183145.B.a.a.b.f.e.b.a.b ENSGT01030000234941.d.a ENSGT00950000182888.a.a.a.f ENSGT00600000085659.b.cb.a ENSGT00600000085659.b.db.d ENSGT00940000155170 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.b Eastern happy MODERN SPECIES 12 FGD1 (ENSACLG00000013633) ENSACLG00000013662 ENSACLG00000013679 ENSACLG00000013689 ENSACLG00000013767 ENSACLG00000013776 abcd1 (ENSACLG00000013880) ENSACLG00000013969 ENSACLG00000013976 SRPK3 (ENSACLG00000014229) ENSACLG00000014259 tsr2 (ENSACLG00000014269) grm6a (ENSACLG00000014320) rad51c (ENSACLG00000014360) abt1 (ENSACLG00000014378) CDK16 (ENSACLG00000014389) ##22 xkr7b (ENSACLG00000014562) ENSACLG00000014577 ENSACLG00000014591 ENSACLG00000014595 CABLES2 (ENSACLG00000014603) ENSACLG00000014623 ENSACLG00000014647 ENSACLG00000014651 ENSACLG00000014681 ENSACLG00000014688 ENSACLG00000014701 ENSACLG00000015000 ENSACLG00000015011 ENSACLG00000015032 ENSACLG00000015048 P. nyererei MODERN SPECIES 505 TFE3 (ENSPNYG00000020458) FGD1 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(ENSHBUG00000021124) ENSHBUG00000021135 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156963.a.b ##22 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 119 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00730000111044 ENSGT00390000017352 ENSGT00390000006665.b ENSGT00940000153231.A ENSGT00390000012929 ENSGT00390000016016.B ENSGT00940000160369 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000165541 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00390000005780.a ENSGT00390000018078 ENSGT00940000157571 ENSGT00940000165528 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000159633 Common wall lizard MODERN SPECIES 8 MON1B (ENSPMRG00000023782) ENSPMRG00000023781 IMP4 (ENSPMRG00000023780) ENSPMRG00000023779 ENSPMRG00000023778 RBM10 (ENSPMRG00000023777) NDUFB11 (ENSPMRG00000023776) ENSPMRG00000023775 ENSPMRG00000023774 UBA1 (ENSPMRG00000023773) ENSPMRG00000023772 ENSPMRG00000023771 ENSPMRG00000023770 ENSPMRG00000023769 ENSPMRG00000023768 CDK16 (ENSPMRG00000023766) ##22 USP11 (ENSPMRG00000023761) 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Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00730000111044 ENSGT00390000017352 ENSGT00390000006665.b ENSGT00940000153231.A ENSGT00390000012929 ENSGT00440000033468.d ENSGT01030000234607.A.a.b.a ENSGT00940000154563 ENSGT00390000016016.B ENSGT00940000160369 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000165541 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000163656 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00390000005780.a ENSGT00390000018078 ENSGT00940000157571 ENSGT00940000165528 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000162852.b.b Elapidae ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000153832.f.b.a.b ENSGT00940000153832.f.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00730000111044 ENSGT00390000006665.b ENSGT00940000153231.A ENSGT00390000012929 ENSGT00940000154563 ENSGT00390000016016.B ENSGT00940000160369.e.b ENSGT00940000160369.e.a ENSGT00390000003022 ENSGT00940000165541 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000163656 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 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ENSNSUG00000019513 CFP (ENSNSUG00000019512) TIMP1 (ENSNSUG00000019511) SYN1 (ENSNSUG00000019510) Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 9365 ENSLLTG00000016172 ENSLLTG00000016180 ENSLLTG00000016186 CDK16 (ENSLLTG00000016199) ##22 Indian cobra MODERN SPECIES 1 ENSNNAG00000006405 CXXC1 (ENSNNAG00000006449) ENSNNAG00000006474 MON1B (ENSNNAG00000006487) IMP4 (ENSNNAG00000006545) ENSNNAG00000006560 ADIPOR1 (ENSNNAG00000006577) ENSNNAG00000006602 ENSNNAG00000006641 ENSNNAG00000006650 ENSNNAG00000006688 ENSNNAG00000006719 ENSNNAG00000006730 UBA1 (ENSNNAG00000006816) ENSNNAG00000006869 CDK16 (ENSNNAG00000006888) ##22 USP11 (ENSNNAG00000007011) ENSNNAG00000007436 UXT (ENSNNAG00000007456) ELK1 (ENSNNAG00000007479) ENSNNAG00000007508 ENSNNAG00000007749 CFP (ENSNNAG00000007218) SYN1 (ENSNNAG00000007234) ARAF (ENSNNAG00000007323) ENSNNAG00000007446 ENSNNAG00000007454 ENSNNAG00000007465 OR1B1 (ENSNNAG00000007490) ENSNNAG00000007496 ENSNNAG00000007505 Lizard MODERN SPECIES 1 ENSACAG00000041420 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ENSGT00940000161209 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000159633 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 93 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000165541 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00390000016016.B ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000157571 ENSGT00940000165528 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000159633 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000153634.a ENSGT00390000017639 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.e ENSGT01030000234648.a.b.a.b.f ENSGT00390000002062 ENSGT00940000153832.e.b ENSGT00940000153832.e.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00730000111044 ENSGT00390000006665.b ENSGT00940000158975 ENSGT00940000165541 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369.g ENSGT00390000016016.B ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485.a ENSGT00390000018078 ENSGT00940000157571 ENSGT00940000165528 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000161081.m.a ENSGT00940000161978.f ENSGT00940000159633.a Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000153634.a ENSGT00390000017639 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.e ENSGT01030000234648.a.b.a.b.f ENSGT00390000002062 ENSGT00940000153832.e.b ENSGT00940000153832.e.a ENSGT00930000151076 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00730000111044 ENSGT00390000006665.b ENSGT00940000158975 ENSGT00940000165541 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369.g ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485.a ENSGT00390000018078 ENSGT00940000157571 ENSGT00940000165528 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000161081.m.a ENSGT00940000161978.e ENSGT00940000159633.b ENSGT00940000161978.f ENSGT00940000161081.n Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 169 CXXC1 (ENSGEVG00005014332) ENSGEVG00005014316 ENSGEVG00005014031 ENSGEVG00005013936 ENSGEVG00005013905 ENSGEVG00005021060 ENSGEVG00005021059 ENSGEVG00005021057 ENSGEVG00005021055 ENSGEVG00005021052 UBA1 (ENSGEVG00005021040) ENSGEVG00005021029 NDUFB11 (ENSGEVG00005021026) ENSGEVG00005021023 ENSGEVG00005021020 CDK16 (ENSGEVG00005021017) ##22 USP11 (ENSGEVG00005020943) ELK1 (ENSGEVG00005020871) ENSGEVG00005020868 ENSGEVG00005020867 ENSGEVG00005020863 ENSGEVG00005020862 Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2597 ENSCABG00000019583 ENSCABG00000019576 CDK16 (ENSCABG00000019568) ##22 ENSCABG00000019561 ENSCABG00000019559 UXT (ENSCABG00000019556) ELK1 (ENSCABG00000019552) ENSCABG00000019543 CFP (ENSCABG00000019540) TIMP1 (ENSCABG00000019538) ENSCABG00000019536 ARAF (ENSCABG00000019530) ENSCABG00000019526 ENSCABG00000019524 Emydidae ANCESTRAL SPECIES 177 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485.a ENSGT00940000161081.m.a ENSGT00940000161978.f ENSGT00940000159633.a Three-toed box turtle DUPLICATION Three-toed box turtle MODERN SPECIES 1468 ENSTMTG00000018993 ##22 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 1218 ENSTMTG00000009950 ##22 painted turtle MODERN SPECIES 1048 ENSCPBG00000002323 ENSCPBG00000002315 CXXC1 (ENSCPBG00000002265) MON1B (ENSCPBG00000002244) ENSCPBG00000002228 ENSCPBG00000002208 IMP4 (ENSCPBG00000002194) ENSCPBG00000002186 CCDC115 (ENSCPBG00000002174) ENSCPBG00000002152 UBA1 (ENSCPBG00000000967) ENSCPBG00000000720 RBM10 (ENSCPBG00000000458) ENSCPBG00000000376 ENSCPBG00000021994 CDK16 (ENSCPBG00000021984) ##22 USP11 (ENSCPBG00000021903) ENSCPBG00000021895 ENSCPBG00000021894 ENSCPBG00000021892 SYN1 (ENSCPBG00000021883) ARAF (ENSCPBG00000021876) ENSCPBG00000021870 ENSCPBG00000021868 ENSCPBG00000021865 ENSCPBG00000021863 RBM3 (ENSCPBG00000021859) ENSCPBG00000021855 ENSCPBG00000021853 ENSCPBG00000021850 ENSCPBG00000021845 Archosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156963.a.b ##22 Aves ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156963.a.b ##22 Neognathae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156963.a.b ##22 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 193 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000156963.a.b ##22 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 229 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000156963.a.b ##22 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 234 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000156963.a.b ##22 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 222 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000156963.a.b ##22 Medium ground finch MODERN SPECIES 572 ENSGFOG00000011881 ##22 ENSGFOG00000011886 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 226 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000156963.a.b ##22 Zebra finch MODERN SPECIES 38 ENSTGUG00000019253 ENSTGUG00000025859 ENSTGUG00000023188 SWS2 (ENSTGUG00000026520) LWS (ENSTGUG00000020605) ENSTGUG00000022784 ENSTGUG00000026390 ENSTGUG00000024305 ENSTGUG00000029033 ENSTGUG00000023368 ENSTGUG00000025286 ENSTGUG00000026718 SRPK3 (ENSTGUG00000021949) OTUD5 (ENSTGUG00000025602) ENSTGUG00000025634 ENSTGUG00000029601 ##22 ENSTGUG00000019568 ENSTGUG00000020951 ENSTGUG00000022796 ENSTGUG00000022259 ENSTGUG00000027775 ENSTGUG00000019736 ENSTGUG00000027947 ENSTGUG00000029102 UBA1 (ENSTGUG00000020872) ENSTGUG00000025459 IMP4 (ENSTGUG00000027791) ENSTGUG00000023635 ENSTGUG00000028522 ENSTGUG00000021493 ENSTGUG00000019503 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 157 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000156963.a.b ##22 Kakapo MODERN SPECIES 75 SMC1A (ENSSHBG00005008142) CCDC22 (ENSSHBG00005008204) ENSSHBG00005008222 NAA10 (ENSSHBG00005008241) HSD17B10 (ENSSHBG00005008270) PFKFB1 (ENSSHBG00005008286) ENSSHBG00005008296 GNL3L (ENSSHBG00005008311) HUWE1 (ENSSHBG00005009089) NDUFB11 (ENSSHBG00005019046) RBM10 (ENSSHBG00005019052) ENSSHBG00005019288 ENSSHBG00005019289 ENSSHBG00005019291 CDK16 (ENSSHBG00005019294) ##22 ENSSHBG00005019295 ENSSHBG00005019297 RELA (ENSSHBG00005019302) DRAP1 (ENSSHBG00005019305) ENSSHBG00005019307 ENSSHBG00005019310 ENSSHBG00005019314 DPF2 (ENSSHBG00005019320) CDC42EP2 (ENSSHBG00005019329) POLA2 (ENSSHBG00005019332) CAPN1 (ENSSHBG00005019338) SYVN1 (ENSSHBG00005019344) ENSSHBG00005019348 MRPL49 (ENSSHBG00005019350) FAU (ENSSHBG00005019353) Mammalia ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00390000017639 ENSGT01030000234648.a.b.a.b ENSGT00390000002062 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00730000111044 ENSGT00390000017352 ENSGT00390000006665.b ENSGT00940000164289.a ENSGT00940000153231.A ENSGT00390000012929 ENSGT00940000160369 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000165541 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000157571 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000159633 Theria ANCESTRAL SPECIES 102 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT01030000234582.f.a.a.a.b ENSGT00730000111220 ENSGT00940000161362 ENSGT00940000160128 ENSGT00940000164016 ENSGT00940000163673 ENSGT00940000162292 ENSGT00940000161704 ENSGT00940000163430 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000160369 ENSGT00390000012929 ENSGT00940000153231.A ENSGT00390000006665.b ENSGT00390000017352.a ENSGT00730000111044 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT01030000234648.a.b.a.b ENSGT00390000017639 ENSGT00940000153634.a ENSGT00940000160063 ENSGT00730000110895.b.b Opossum MODERN SPECIES 627 AWAT2 (ENSMODG00000004686) EDA (ENSMODG00000004650) EFNB1 (ENSMODG00000010895) ENSMODG00000004643 ENSMODG00000010888 ENSMODG00000010883 ENSMODG00000048367 ENSMODG00000042765 ENSMODG00000010869 ENSMODG00000010111 ENSMODG00000039347 SYN1 (ENSMODG00000010825) ENSMODG00000010849 CFP (ENSMODG00000010789) ENSMODG00000010777 CDK16 (ENSMODG00000010767) ##22 USP11 (ENSMODG00000010726) UBA1 (ENSMODG00000010677) RBM10 (ENSMODG00000010640) IMP4 (ENSMODG00000010577) ENSMODG00000010588 MON1B (ENSMODG00000010558) ENSMODG00000037413 CXXC1 (ENSMODG00000010555) ENSMODG00000010534 ABT1 (ENSMODG00000010429) GRM6 (ENSMODG00000010422) ENSMODG00000043220 WDR13 (ENSMODG00000010303) SUV39H1 (ENSMODG00000010324) WAS (ENSMODG00000010317) Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00730000111220 ENSGT00940000161362 ENSGT00940000160128 ENSGT00940000164016 ENSGT00940000163673 ENSGT00940000161062 ENSGT00940000162292 ENSGT00940000161704 ENSGT00940000163430 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000158975.e ENSGT00940000160369.a ENSGT00940000153231.A ENSGT00390000006665.b ENSGT00390000017352.a ENSGT00730000111044.b ENSGT00730000111044.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT01030000234648.a.b.a.b ENSGT00390000017639 ENSGT00940000153634.a ENSGT00940000160063 ENSGT00730000110895.b.b Tasmanian devil MODERN SPECIES 21 AWAT2 (ENSSHAG00000007709) EDA (ENSSHAG00000024660) ENSSHAG00000024662 ENSSHAG00000023477 ENSSHAG00000020670 ENSSHAG00000001954 ENSSHAG00000023200 ENSSHAG00000026374 ENSSHAG00000027148 ENSSHAG00000005470 ENSSHAG00000001846 ENSSHAG00000006228 ENSSHAG00000026397 ENSSHAG00000028647 ENSSHAG00000022245 ENSSHAG00000007378 ##22 ENSSHAG00000007468 ENSSHAG00000007608 ENSSHAG00000007724 ENSSHAG00000008267 ENSSHAG00000008415 ENSSHAG00000008525 ENSSHAG00000003967 ENSSHAG00000003661 ENSSHAG00000003493 ENSSHAG00000003137 ENSSHAG00000028465 ENSSHAG00000001207 ENSSHAG00000000138 ENSSHAG00000022637 ENSSHAG00000002882 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00940000164773 ENSGT01030000234582.f.a.a.a.b ENSGT00730000111220 ENSGT00940000161362 ENSGT00940000160128 ENSGT00940000164016 ENSGT00940000163673 ENSGT00940000161062 ENSGT00940000163430 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000158975.e ENSGT00940000160369.a ENSGT00940000153231.A ENSGT00390000006665.b ENSGT00730000111044.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.g ENSGT00390000017639 ENSGT00940000153634.a ENSGT00940000160063 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000161233 ENSGT00940000159173 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 58 ENSGT00940000164773 ENSGT01030000234582.f.a.a.a.b ENSGT00730000111220 ENSGT00940000161362 ENSGT00940000160128 ENSGT00940000164016 ENSGT00940000163673 ENSGT00940000161062 ENSGT00940000163430 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081.a ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000158975.e ENSGT00940000160369.a ENSGT00940000153231.A ENSGT00390000006665.b ENSGT00730000111044.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00390000002062 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.g ENSGT00390000017639 ENSGT00940000153634.a ENSGT00940000160063 ENSGT00730000110895.b.b ENSGT00940000161233 ENSGT00940000159173 koala MODERN SPECIES 294 ENSPCIG00000015921 AWAT2 (ENSPCIG00000015920) EDA (ENSPCIG00000015922) NALF2 (ENSPCIG00000015625) EFNB1 (ENSPCIG00000015627) ENSPCIG00000028810 ENSPCIG00000031961 ENSPCIG00000010027 KLF8 (ENSPCIG00000034820) ARAF (ENSPCIG00000028805) ENSPCIG00000033258 SYN1 (ENSPCIG00000028803) CFP (ENSPCIG00000028802) ENSPCIG00000034126 UXT (ENSPCIG00000028801) CDK16 (ENSPCIG00000028800) ##22 USP11 (ENSPCIG00000028796) UBA1 (ENSPCIG00000028009) RBM10 (ENSPCIG00000027962) IMP4 (ENSPCIG00000027960) MON1B (ENSPCIG00000027954) CXXC1 (ENSPCIG00000027942) ENSPCIG00000027937 ENSPCIG00000027936 GRM6 (ENSPCIG00000027935) ENSPCIG00000027932 WDR13 (ENSPCIG00000007549) SUV39H1 (ENSPCIG00000007547) ENSPCIG00000007542 SLC38A5 (ENSPCIG00000007378) TBC1D25 (ENSPCIG00000027924) Common wonbat MODERN SPECIES 1140 CDK16 (ENSVURG00010009119) ##22 Wallaby MODERN SPECIES 1184 ENSMEUG00000002746 ##22 ENSMEUG00000002752 UBA1 (ENSMEUG00000002758) Eutheria ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000004304 ENSGT00530000063528.B ENSGT00940000154517 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000162233 ENSGT00940000162231 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00390000012484 ENSGT00940000161233 ENSGT00730000111146 ENSGT01030000234564.a.a.b.a ENSGT00530000063715.a Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155616.c.b ENSGT00940000154517 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000162233 ENSGT00940000162231 ENSGT00550000076437 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00940000163698 ENSGT00390000012484 ENSGT00940000161233 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155616.c.b ENSGT00940000154517 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000162233 ENSGT00940000162231 ENSGT00550000076437 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00940000163698 ENSGT00390000012484 ENSGT00940000161233 Primates ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000154517 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00390000009776.i ENSGT00940000162233 ENSGT00940000162231 ENSGT00550000076437 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00940000163698 ENSGT00390000012484 ENSGT00940000161233 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000155616.c.b ENSGT00940000154517 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000162233 ENSGT00940000162231 ENSGT00550000076437 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00940000163698 ENSGT00390000012484 ENSGT00940000161233 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154517.e.b ENSGT00940000163638 ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000162233.v ENSGT00940000162231 ENSGT00550000076437 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00390000001278.b.a.b ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00940000163698 ENSGT00390000012484 ENSGT00940000161233 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000004965.db.b ENSGT00390000006931.r ENSGT00940000153112.D.n.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000162233.u.b ENSGT00940000162233.u.a ENSGT00940000162231 ENSGT00550000076437 ENSGT00940000153460.c.a.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00390000001278.b.a.b ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00390000001505.a.a ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00870000136506.ob.a.a ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00940000163698 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000154517.e.b.b ENSGT00940000163638 ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000162233.v ENSGT00940000162231 ENSGT00550000076437 ENSGT00940000153460.c.a.a ENSGT00550000074817.f ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00390000001505.a.a ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571.e.a ENSGT00390000018078.n.a 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ENSGT00550000076437 ENSGT00940000153460.c.a.a ENSGT00550000074817.f ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00390000001505.a.a ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571.e.a ENSGT00390000018078.n.a ENSGT00870000136506.ob.a.a ENSGT00390000018078.m ENSGT00940000162553 ENSGT00950000182878.b.b.`b.a.b.a.a.b.a.b ENSGT00940000162614 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000154517.e.b.b ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00910000148400 ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000162233.v ENSGT00940000162231 ENSGT00550000076437 ENSGT00940000153460.c.a.a ENSGT00550000074817.f ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00390000001505.a.a 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ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 Sooty mangabey MODERN SPECIES 160 ENSCATG00000039774 ENSCATG00000042335 ENSCATG00000004292 ENSCATG00000043305 KRBOX4 (ENSCATG00000037844) ENSCATG00000040786 CHST7 (ENSCATG00000002977) ENSCATG00000042960 SLC9A7 (ENSCATG00000031693) RP2 (ENSCATG00000012198) JADE3 (ENSCATG00000040949) RGN (ENSCATG00000043937) NDUFB11 (ENSCATG00000036487) RBM10 (ENSCATG00000018553) UBA1 (ENSCATG00000029449) CDK16 (ENSCATG00000036535) ##22 USP11 (ENSCATG00000034564) ZNF157 (ENSCATG00000039253) ZNF41 (ENSCATG00000037921) ARAF (ENSCATG00000030301) TIMP1 (ENSCATG00000014623) SYN1 (ENSCATG00000020680) CFP (ENSCATG00000044282) ENSCATG00000032230 ENSCATG00000020980 ZNF81 (ENSCATG00000034554) ZNF182 (ENSCATG00000032321) ENSCATG00000034191 ZNF630 (ENSCATG00000030829) ENSCATG00000038483 SSX1 (ENSCATG00000037901) Drill MODERN SPECIES 861 ENSMLEG00000006625 ENSMLEG00000042568 ENSMLEG00000026545 KRBOX4 (ENSMLEG00000032471) ENSMLEG00000031670 CHST7 (ENSMLEG00000017937) 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ENSGT00940000157571.e.a ENSGT00390000018078.n.a ENSGT00870000136506.ob.a.a ENSGT00940000162553 ENSGT00950000182878.b.b.`b.a.b.a.a.b.a.b ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 84 ENSMNEG00000013794 ENSMNEG00000034661 ENSMNEG00000033159 KRBOX4 (ENSMNEG00000028475) ZNF674 (ENSMNEG00000036545) CHST7 (ENSMNEG00000027662) SLC9A7 (ENSMNEG00000042344) ENSMNEG00000000096 ENSMNEG00000043108 RP2 (ENSMNEG00000026027) JADE3 (ENSMNEG00000035705) RGN (ENSMNEG00000036859) ENSMNEG00000040333 RBM10 (ENSMNEG00000038904) UBA1 (ENSMNEG00000044529) CDK16 (ENSMNEG00000015118) ##22 USP11 (ENSMNEG00000040837) ENSMNEG00000017605 ZNF157 (ENSMNEG00000038828) ZNF41 (ENSMNEG00000033342) ARAF (ENSMNEG00000032229) SYN1 (ENSMNEG00000026908) TIMP1 (ENSMNEG00000034163) CFP (ENSMNEG00000022170) ELK1 (ENSMNEG00000032482) UXT (ENSMNEG00000043201) ENSMNEG00000034469 ZNF81 (ENSMNEG00000031622) ENSMNEG00000030158 ZNF182 (ENSMNEG00000043954) ENSMNEG00000033196 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000154517.e.b.b ENSGT00940000163638 ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00980000202068.a.b.b ENSGT00940000162233.u.b ENSGT00940000162233.u.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000153460.c.a.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022.ab ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571.e.a ENSGT00390000018078.n.a ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00390000012484.e.b.a ENSGT00390000012484.f.a.a.a.b ENSGT00390000012484.f.a.b.b.b.b Rhesus MODERN SPECIES 327 ENSMMUG00000064397 ENSMMUG00000051143 KRBOX4 (ENSMMUG00000002986) ENSMMUG00000054641 ZNF674 (ENSMMUG00000002292) CHST7 (ENSMMUG00000019663) SLC9A7 (ENSMMUG00000003897) ENSMMUG00000052427 ENSMMUG00000049666 RP2 (ENSMMUG00000023018) JADE3 (ENSMMUG00000023016) RGN 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ALOX5 (ENSSBOG00000022827) MARCHF8 (ENSSBOG00000023929) ZFAND4 (ENSSBOG00000031112) ENSSBOG00000027915 ENSSBOG00000016555 ENSSBOG00000005385 Tarsier MODERN SPECIES 6394 UBA1 (ENSTSYG00000002600) CDK16 (ENSTSYG00000033240) ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000004304 ENSGT00530000063528.B ENSGT00940000154517 ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00390000009776.i ENSGT00940000162233 ENSGT00940000162231 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485.g ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00940000163698 ENSGT00390000012484 ENSGT00940000161233 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00390000004304 ENSGT00530000063528.B ENSGT00940000154517 ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00390000009776.i ENSGT00940000162233 ENSGT00940000162231 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485.g ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00940000163698 ENSGT00390000012484 ENSGT00940000161233 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00940000162233 ENSGT00940000162231 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485.g ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00940000163698 ENSGT00390000012484 ENSGT00940000161233 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 197 NDUFB11 (ENSPSMG00000015577) RBM10 (ENSPSMG00000015702) UBA1 (ENSPSMG00000015881) CDK16 (ENSPSMG00000015939) ##22 USP11 (ENSPSMG00000015971) ENSPSMG00000015987 ENSPSMG00000015992 ZNF157 (ENSPSMG00000015998) ZNF41 (ENSPSMG00000016042) ARAF (ENSPSMG00000016169) SYN1 (ENSPSMG00000016237) TIMP1 (ENSPSMG00000016294) CFP (ENSPSMG00000016328) ELK1 (ENSPSMG00000016340) UXT (ENSPSMG00000016355) ZNF81 (ENSPSMG00000016360) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 532 ENSPCOG00000022024 CHST7 (ENSPCOG00000005330) SLC9A7 (ENSPCOG00000023444) RP2 (ENSPCOG00000027727) JADE3 (ENSPCOG00000028501) RGN (ENSPCOG00000018769) NDUFB11 (ENSPCOG00000020853) RBM10 (ENSPCOG00000023562) UBA1 (ENSPCOG00000018127) CDK16 (ENSPCOG00000017857) ##22 USP11 (ENSPCOG00000023822) ZNF157 (ENSPCOG00000022946) ZNF41 (ENSPCOG00000027769) ENSPCOG00000025273 ARAF (ENSPCOG00000017135) SYN1 (ENSPCOG00000022095) TIMP1 (ENSPCOG00000027302) CFP (ENSPCOG00000027123) ELK1 (ENSPCOG00000002923) UXT (ENSPCOG00000017019) ZNF81 (ENSPCOG00000019656) ENSPCOG00000021977 ZNF182 (ENSPCOG00000017106) ENSPCOG00000028526 ENSPCOG00000025673 Mouse lemur MODERN SPECIES 169 ENSMICG00000036836 DIPK2B (ENSMICG00000037484) ENSMICG00000033383 ENSMICG00000031312 ENSMICG00000045898 ENSMICG00000036464 ENSMICG00000017373 SLC9A7 (ENSMICG00000014592) RP2 (ENSMICG00000007938) ENSMICG00000034055 JADE3 (ENSMICG00000043701) RGN (ENSMICG00000016929) NDUFB11 (ENSMICG00000027226) RBM10 (ENSMICG00000016937) UBA1 (ENSMICG00000016948) CDK16 (ENSMICG00000016965) ##22 USP11 (ENSMICG00000016972) ZNF157 (ENSMICG00000017445) ENSMICG00000017670 ZNF41 (ENSMICG00000008558) ARAF (ENSMICG00000016177) SYN1 (ENSMICG00000016204) TIMP1 (ENSMICG00000029917) CFP (ENSMICG00000047059) ELK1 (ENSMICG00000016244) UXT (ENSMICG00000016263) ENSMICG00000001433 ZNF81 (ENSMICG00000037260) ENSMICG00000032436 ZNF182 (ENSMICG00000037147) ENSMICG00000042910 Bushbaby MODERN SPECIES 268 ENSOGAG00000030146 ENSOGAG00000024976 ENSOGAG00000032270 ENSOGAG00000007940 ENSOGAG00000028839 ENSOGAG00000004321 CHST7 (ENSOGAG00000028254) SLC9A7 (ENSOGAG00000006216) ENSOGAG00000025193 RP2 (ENSOGAG00000029320) JADE3 (ENSOGAG00000000788) RGN (ENSOGAG00000010383) ENSOGAG00000032890 RBM10 (ENSOGAG00000008550) UBA1 (ENSOGAG00000015536) CDK16 (ENSOGAG00000008555) ##22 USP11 (ENSOGAG00000007884) ZNF157 (ENSOGAG00000016607) ENSOGAG00000005514 ARAF (ENSOGAG00000001163) SYN1 (ENSOGAG00000001164) TIMP1 (ENSOGAG00000001165) CFP (ENSOGAG00000011605) ELK1 (ENSOGAG00000011608) UXT (ENSOGAG00000011611) ZNF81 (ENSOGAG00000014983) ENSOGAG00000030385 ENSOGAG00000004403 ENSOGAG00000030057 ENSOGAG00000034309 SLC38A5 (ENSOGAG00000026543) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155616.c.b ENSGT00940000154517 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00390000009776.i ENSGT00940000162233 ENSGT00940000162231 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00940000162921 ENSGT00940000163698 ENSGT00390000012484 Glires ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155616.c.b ENSGT00940000154517 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00390000009776.i ENSGT00940000162233 ENSGT00940000162231 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 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ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022.s ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00940000162921 ENSGT00390000012484.d.f ENSGT01050000244888.b.a.c.a ENSGT00940000159688 ENSGT00860000135780 ENSGT00940000154359.f spretus MODERN SPECIES 19 Ndp (MGP_SPRETEiJ_G0034100) Efhc2 (MGP_SPRETEiJ_G0034101) Fundc1 (MGP_SPRETEiJ_G0034102) Dusp21 (MGP_SPRETEiJ_G0034103) Kdm6a (MGP_SPRETEiJ_G0034104) Dipk2b (MGP_SPRETEiJ_G0034105) Tex13c3 (MGP_SPRETEiJ_G0034106) Chst7 (MGP_SPRETEiJ_G0034107) Slc9a7 (MGP_SPRETEiJ_G0034108) Rp2 (MGP_SPRETEiJ_G0034109) Jade3 (MGP_SPRETEiJ_G0034110) Rgn (MGP_SPRETEiJ_G0034111) Ndufb11 (MGP_SPRETEiJ_G0034112) Rbm10 (MGP_SPRETEiJ_G0034113) Uba1 (MGP_SPRETEiJ_G0034114) Cdk16 (MGP_SPRETEiJ_G0034115) ##22 Usp11 (MGP_SPRETEiJ_G0034116) Araf (MGP_SPRETEiJ_G0034117) Syn1 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ENSGT00390000018078 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00940000162921 ENSGT00940000163698 ENSGT00390000012484 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00390000004304 ENSGT00530000063528.B ENSGT00940000154517 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00390000009776.i ENSGT00940000162231 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022.r ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00950000182810.A.a.a.gb.a.b ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000162553 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 94 ENSGT00390000004304 ENSGT00530000063528.B ENSGT00940000154517 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00390000009776.i ENSGT00940000162231 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022.r ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00950000182810.A.a.a.gb.a.b ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000162553 Squirrel MODERN SPECIES 102 NDP (ENSSTOG00000010960) EFHC2 (ENSSTOG00000014917) FUNDC1 (ENSSTOG00000025782) ENSSTOG00000007072 KDM6A (ENSSTOG00000001596) DIPK2B (ENSSTOG00000002326) ENSSTOG00000030183 CHST7 (ENSSTOG00000025227) SLC9A7 (ENSSTOG00000009492) RP2 (ENSSTOG00000009515) JADE3 (ENSSTOG00000015501) RGN (ENSSTOG00000014360) NDUFB11 (ENSSTOG00000026821) RBM10 (ENSSTOG00000014369) UBA1 (ENSSTOG00000010901) CDK16 (ENSSTOG00000014392) ##22 USP11 (ENSSTOG00000020152) ENSSTOG00000012404 ZNF157 (ENSSTOG00000032405) ZNF41 (ENSSTOG00000029528) ENSSTOG00000023055 ARAF (ENSSTOG00000003888) SYN1 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ZNF157 (ENSSVLG00005011477) ZNF41 (ENSSVLG00005011402) ENSSVLG00005011387 RBM39 (ENSSVLG00005011221) ARAF (ENSSVLG00005011146) TIMP1 (ENSSVLG00005011072) SYN1 (ENSSVLG00005011026) CFP (ENSSVLG00005010884) ELK1 (ENSSVLG00005010829) ENSSVLG00005010750 ZNF81 (ENSSVLG00005010677) ZNF182 (ENSSVLG00005010624) ENSSVLG00005010573 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000004304 ENSGT00530000063528.B ENSGT00940000154517.i ENSGT00940000161186.B ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000162233 ENSGT00940000162231 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00940000162921 ENSGT00390000012484 ENSGT00940000161233 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000161545 ENSGT00390000004304 ENSGT00530000063528.B ENSGT00940000154517.i ENSGT00940000161186.B ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00940000162921 ENSGT00940000161233 ENSGT00730000111146 ENSGT01030000234564.a.a.b.a Guinea pig MODERN SPECIES 132 CHST7 (ENSCPOG00000005183) SLC9A7 (ENSCPOG00000005176) RP2 (ENSCPOG00000007577) JADE3 (ENSCPOG00000014766) RGN (ENSCPOG00000013826) NDUFB11 (ENSCPOG00000002938) RBM10 (ENSCPOG00000002939) UBA1 (ENSCPOG00000002956) CDK16 (ENSCPOG00000005478) ##22 USP11 (ENSCPOG00000012076) ZNF157 (ENSCPOG00000035046) ENSCPOG00000037144 ARAF (ENSCPOG00000013107) SYN1 (ENSCPOG00000013114) TIMP1 (ENSCPOG00000013119) CFP (ENSCPOG00000007256) ELK1 (ENSCPOG00000009149) UXT (ENSCPOG00000009154) ZNF81 (ENSCPOG00000031196) ZNF182 (ENSCPOG00000031427) ENSCPOG00000032054 ENSCPOG00000030434 ENSCPOG00000026336 ENSCPOG00000035952 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 81 ENSGT00940000160514 ENSGT00940000161545 ENSGT00390000004304 ENSGT00530000063528.B ENSGT00940000154517.i ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00940000162921 ENSGT00940000161233 ENSGT00730000111146 ENSGT01030000234564.a.a.b.a Degu MODERN SPECIES 96 ENSODEG00000008341 ENSODEG00000007858 ENSODEG00000008191 SERPINI2 (ENSODEG00000009057) ENSODEG00000011903 CHST7 (ENSODEG00000019602) SLC9A7 (ENSODEG00000007868) RP2 (ENSODEG00000013823) ENSODEG00000008785 JADE3 (ENSODEG00000012906) ENSODEG00000019613 ENSODEG00000013303 ENSODEG00000007791 RBM10 (ENSODEG00000008955) UBA1 (ENSODEG00000009310) CDK16 (ENSODEG00000009017) ##22 USP11 (ENSODEG00000010135) ENSODEG00000019537 ZNF157 (ENSODEG00000008760) ARAF (ENSODEG00000010748) SYN1 (ENSODEG00000010912) TIMP1 (ENSODEG00000011225) CFP (ENSODEG00000009141) UXT (ENSODEG00000009123) ZNF81 (ENSODEG00000009602) ENSODEG00000009466 ZNF182 (ENSODEG00000010486) ENSODEG00000009058 ENSODEG00000009360 ENSODEG00000019635 FTSJ1 (ENSODEG00000009855) Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 223 MAOA (ENSCLAG00000001409) MAOB (ENSCLAG00000000988) NDP (ENSCLAG00000000805) EFHC2 (ENSCLAG00000001232) FUNDC1 (ENSCLAG00000000977) KDM6A 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(ENSHGLG00000001209) ##22 USP11 (ENSHGLG00000001371) ENSHGLG00000044888 ENSHGLG00000045718 ENSHGLG00000001450 ENSHGLG00000046479 ZNF41 (ENSHGLG00000049389) ENSHGLG00000043935 ENSHGLG00000000754 SYN1 (ENSHGLG00000000779) TIMP1 (ENSHGLG00000000794) CFP (ENSHGLG00000000905) ELK1 (ENSHGLG00000000926) UXT (ENSHGLG00000000945) ENSHGLG00000000969 ENSHGLG00000001046 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00530000063528.B ENSGT00940000155616.c.b ENSGT00940000154517 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00390000009776.i ENSGT00940000162231 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00390000012484 ENSGT00940000161233 ENSGT00730000111146 Rabbit MODERN SPECIES 1401 ENSOCUG00000029753 DUSP21 (ENSOCUG00000009969) KDM6A (ENSOCUG00000014741) DIPK2B (ENSOCUG00000014763) ENSOCUG00000017464 ENSOCUG00000023405 ENSOCUG00000022444 CHST7 (ENSOCUG00000004224) SLC9A7 (ENSOCUG00000004230) RP2 (ENSOCUG00000005647) JADE3 (ENSOCUG00000004676) RGN (ENSOCUG00000023725) NDUFB11 (ENSOCUG00000008371) RBM10 (ENSOCUG00000006454) UBA1 (ENSOCUG00000008376) CDK16 (ENSOCUG00000008394) ##22 USP11 (ENSOCUG00000008403) ENSOCUG00000028092 ZNF157 (ENSOCUG00000029541) ZNF41 (ENSOCUG00000029242) ARAF (ENSOCUG00000016449) SYN1 (ENSOCUG00000024150) TIMP1 (ENSOCUG00000010718) CFP (ENSOCUG00000015944) ELK1 (ENSOCUG00000010521) UXT (ENSOCUG00000010525) ENSOCUG00000036214 ENSOCUG00000037506 ENSOCUG00000032683 ENSOCUG00000034922 ENSOCUG00000023087 Pika MODERN SPECIES 5368 NDUFB11 (ENSOPRG00000005536) ENSOPRG00000005550 CDK16 (ENSOPRG00000005590) ##22 Tree shrew MODERN SPECIES 2330 NDUFB11 (ENSTBEG00000005317) RBM10 (ENSTBEG00000005519) UBA1 (ENSTBEG00000007050) CDK16 (ENSTBEG00000008356) ##22 USP11 (ENSTBEG00000009017) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000155616.c.b ENSGT00940000154517 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000162233 ENSGT00940000162231 ENSGT00550000076437 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00940000172800 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00940000163698 ENSGT00390000012484 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 370 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 Hedgehog MODERN SPECIES 2797 ENSEEUG00000015215 CDK16 (ENSEEUG00000015510) ##22 Common shrew MODERN SPECIES 264 ENSSARG00000004628 ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155616.c.b ENSGT00940000154517 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000162233 ENSGT00940000162231 ENSGT00550000076437 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00940000163698 ENSGT00390000012484 ENSGT00940000161233 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155616.c.b ENSGT00940000154517 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000154679.yb.a.a.b ENSGT00940000162233 ENSGT00940000162231 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00940000163698 ENSGT00390000012484 ENSGT00940000161233 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155616.c.b ENSGT00940000154517 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000154679.yb.a.a.b ENSGT00940000162233 ENSGT00940000162231 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000164959.g.b ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00940000163698 ENSGT00390000012484 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000155616.c.b ENSGT00940000154517 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000154679.yb.a.a.b ENSGT00940000162233 ENSGT00940000162231 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000164959.g.b ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00390000012484 ENSGT00940000161233 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000153498.A.n ENSGT00940000161186.B ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000154679.yb.a.a.b ENSGT00940000162233 ENSGT00940000162231 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00910000144184.q.b.b.a.b ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000164959.g.b ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00390000012484 ENSGT00940000161233 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000161186.B ENSGT00940000163638 ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000154679.yb.a.a.b ENSGT00940000162233 ENSGT00940000162231 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00910000144184.q.b.b.a.b ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000164959.g.b ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00390000012484 ENSGT00940000161233 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000155616.c.b ENSGT00940000154517 ENSGT00940000153498.A.n ENSGT00940000161186.B ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000162233 ENSGT00940000162231 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00390000012484 ENSGT00940000161233 ENSGT00730000111146 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000155616.c.b ENSGT00940000154517.eb 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ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00390000012484 ENSGT00940000161233 ENSGT00730000111146 Narwhal MODERN SPECIES 309 EFHC2 (ENSMMNG00015010609) FUNDC1 (ENSMMNG00015010659) ENSMMNG00015010677 ENSMMNG00015010689 KDM6A (ENSMMNG00015010815) DIPK2B (ENSMMNG00015011022) ENSMMNG00015011057 CHST7 (ENSMMNG00015011064) SLC9A7 (ENSMMNG00015011081) RP2 (ENSMMNG00015011124) JADE3 (ENSMMNG00015011147) RGN (ENSMMNG00015011169) ENSMMNG00015011201 RBM10 (ENSMMNG00015011244) UBA1 (ENSMMNG00015011312) CDK16 (ENSMMNG00015011386) ##22 USP11 (ENSMMNG00015011540) ZNF157 (ENSMMNG00015011599) ZNF41 (ENSMMNG00015011619) ARAF (ENSMMNG00015011640) SYN1 (ENSMMNG00015011681) TIMP1 (ENSMMNG00015011723) CFP (ENSMMNG00015011747) ELK1 (ENSMMNG00015011767) UXT (ENSMMNG00015011777) ENSMMNG00015011805 ZNF81 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ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000153700.ub.b.a.d ENSGT00940000153700.ub.b.a.c ENSGT00940000164993.e ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 Wild yak MODERN SPECIES 1085 ENSBMUG00000025805 RGN (ENSBMUG00000025816) NDUFB11 (ENSBMUG00000025822) RBM10 (ENSBMUG00000025840) UBA1 (ENSBMUG00000025866) CDK16 (ENSBMUG00000025899) ##22 ENSBMUG00000025924 ZNF157 (ENSBMUG00000025929) ZNF41 (ENSBMUG00000025931) ARAF (ENSBMUG00000025937) SYN1 (ENSBMUG00000025943) TIMP1 (ENSBMUG00000025948) CFP (ENSBMUG00000025953) ELK1 (ENSBMUG00000025958) UXT (ENSBMUG00000025964) Domestic yak MODERN SPECIES 69 ENSBGRG00000009984 ENSBGRG00000009995 AR (ENSBGRG00000010012) EDA2R (ENSBGRG00000010071) ENSBGRG00000010164 CHST7 (ENSBGRG00000010248) SLC9A7 (ENSBGRG00000010277) ENSBGRG00000010361 ENSBGRG00000010392 RP2 (ENSBGRG00000010488) JADE3 (ENSBGRG00000010592) RGN (ENSBGRG00000010764) NDUFB11 (ENSBGRG00000010871) RBM10 (ENSBGRG00000011021) UBA1 (ENSBGRG00000013460) CDK16 (ENSBGRG00000013811) ##22 ENSBGRG00000014621 ENSBGRG00000015200 ZNF41 (ENSBGRG00000015259) ARAF (ENSBGRG00000015517) SYN1 (ENSBGRG00000015712) TIMP1 (ENSBGRG00000015795) CFP (ENSBGRG00000016091) ENSBGRG00000016289 ENSBGRG00000016328 UXT (ENSBGRG00000016358) ENSBGRG00000016563 ENSBGRG00000016619 ENSBGRG00000016643 ENSBGRG00000016683 ZNF182 (ENSBGRG00000016702) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000156229.k.b ENSGT00940000153259.a.a.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00960000192921 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022.g ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485.c ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000164993 ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00390000012484.n ENSGT00940000163698 Goat MODERN SPECIES 29 ENSCHIG00000024352 ENSCHIG00000003138 ENSCHIG00000007149 EDA2R (ENSCHIG00000006486) ENSCHIG00000014804 CHST7 (ENSCHIG00000019628) SLC9A7 (ENSCHIG00000019865) RP2 (ENSCHIG00000011391) JADE3 (ENSCHIG00000018440) ENSCHIG00000011619 RGN (ENSCHIG00000011643) ENSCHIG00000019141 ENSCHIG00000011438 RBM10 (ENSCHIG00000000855) UBA1 (ENSCHIG00000021389) CDK16 (ENSCHIG00000014350) ##22 ENSCHIG00000017437 ENSCHIG00000010361 ZNF157 (ENSCHIG00000018961) ZNF41 (ENSCHIG00000009772) ARAF (ENSCHIG00000022672) SYN1 (ENSCHIG00000009868) TIMP1 (ENSCHIG00000010055) CFP (ENSCHIG00000020966) ELK1 (ENSCHIG00000010062) UXT (ENSCHIG00000021674) ENSCHIG00000006646 ENSCHIG00000012232 KDM5C (ENSCHIG00000012598) GLOD5 (ENSCHIG00000024585) GATA1 (ENSCHIG00000008990) Siberian musk deer MODERN SPECIES 237 AR (ENSMMSG00000000530) ENSMMSG00000000494 ENSMMSG00000000463 ENSMMSG00000000444 EDA2R (ENSMMSG00000000426) ENSMMSG00000000418 CHST7 (ENSMMSG00000000398) SLC9A7 (ENSMMSG00000000330) ENSMMSG00000000307 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(ENSCHYG00000015682) TIMP1 (ENSCHYG00000015815) CFP (ENSCHYG00000015864) ELK1 (ENSCHYG00000016063) ENSCHYG00000016212 ENSCHYG00000016354 MAGED1 (ENSCHYG00000016520) GSPT2 (ENSCHYG00000016695) ENSCHYG00000016717 ENSCHYG00000016771 ENSCHYG00000016796 Yarkand deer MODERN SPECIES 3 ENSCHYG00000014303 ENSCHYG00000014223 ENSCHYG00000014192 ENSCHYG00000014156 ENSCHYG00000014115 METTL17 (ENSCHYG00000013687) SLC39A2 (ENSCHYG00000013602) TPPP2 (ENSCHYG00000013488) ENSCHYG00000013460 ENSCHYG00000013436 NDRG2 (ENSCHYG00000012844) ARHGEF40 (ENSCHYG00000012433) TMEM253 (ENSCHYG00000012373) ZNF219 (ENSCHYG00000012271) OR5AU1 (ENSCHYG00000012244) ENSCHYG00000012216 ##22 ENSCHYG00000012113 RPGRIP1 (ENSCHYG00000010769) ENSCHYG00000010482 ENSCHYG00000010423 CHD8 (ENSCHYG00000010268) ENSCHYG00000010144 TOX4 (ENSCHYG00000009949) METTL3 (ENSCHYG00000009777) SALL2 (ENSCHYG00000009676) ENSCHYG00000009619 OR10G3 (ENSCHYG00000009604) ENSCHYG00000009578 OR4E2 (ENSCHYG00000009552) OR4E1 (ENSCHYG00000009527) ENSCHYG00000009499 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00390000004304 ENSGT00530000063528.B ENSGT00940000155616.c.b ENSGT00940000154517 ENSGT00940000161186.B ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00550000076437 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000164959.g.b ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00940000163698 ENSGT00390000012484 Arabian camel MODERN SPECIES 204 ENSCDRG00005020594 FUNDC1 (ENSCDRG00005020600) ENSCDRG00005020602 KDM6A (ENSCDRG00005020633) DIPK2B (ENSCDRG00005020807) ENSCDRG00005020818 ENSCDRG00005020827 ENSCDRG00005020859 SLC9A7 (ENSCDRG00005020882) RP2 (ENSCDRG00005020995) JADE3 (ENSCDRG00005020999) RGN 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ENSCWAG00000013071 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154517 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000161186.B ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000162233 ENSGT00940000162231 ENSGT00550000076437 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 ENSGT00940000160369 ENSGT00940000158975 ENSGT00940000156963.a.b ##22 ENSGT00940000160485 ENSGT00940000162890 ENSGT00940000163107 ENSGT00940000159633 ENSGT00940000161978 ENSGT00940000161081 ENSGT00940000161209 ENSGT00940000157571 ENSGT00390000018078 ENSGT00940000162553 ENSGT00940000162614 ENSGT00940000162205 ENSGT00940000163698 ENSGT00390000012484 ENSGT00940000161233 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000161186.B ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000154679.bc ENSGT00940000162233 ENSGT00940000162231 ENSGT00550000076437 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 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ZNF41 (ENSMLUG00000010765) ARAF (ENSMLUG00000014746) SYN1 (ENSMLUG00000014762) TIMP1 (ENSMLUG00000004075) CFP (ENSMLUG00000028893) ELK1 (ENSMLUG00000001776) ENSMLUG00000000341 ZNF81 (ENSMLUG00000011734) ZNF182 (ENSMLUG00000000480) ENSMLUG00000030438 ENSMLUG00000001798 SLC38A5 (ENSMLUG00000003966) FTSJ1 (ENSMLUG00000003977) PORCN (ENSMLUG00000003981) Microbat MODERN SPECIES 1401 ENSMLUG00000023058 ##22 ENSMLUG00000024555 LZTS1 (ENSMLUG00000008979) ATP6V1B2 (ENSMLUG00000008957) SLC18A1 (ENSMLUG00000012773) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES ENSRFEG00010002658 FUNDC1 (ENSRFEG00010002634) ENSRFEG00010002612 ENSRFEG00010002601 KDM6A (ENSRFEG00010002293) DIPK2B (ENSRFEG00010002159) ENSRFEG00010002145 ENSRFEG00010002113 SLC9A7 (ENSRFEG00010002085) RP2 (ENSRFEG00010002065) JADE3 (ENSRFEG00010002047) RGN (ENSRFEG00010002014) NDUFB11 (ENSRFEG00010001970) RBM10 (ENSRFEG00010001894) UBA1 (ENSRFEG00010001781) CDK16 (ENSRFEG00010001725) ##22 USP11 (ENSRFEG00010001651) ENSRFEG00010001630 ZNF157 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Elephant MODERN SPECIES 453 MAOB (ENSLAFG00000015027) NDP (ENSLAFG00000007780) EFHC2 (ENSLAFG00000013146) FUNDC1 (ENSLAFG00000015232) DUSP21 (ENSLAFG00000021812) KDM6A (ENSLAFG00000014811) DIPK2B (ENSLAFG00000006035) SLC9A7 (ENSLAFG00000003443) RP2 (ENSLAFG00000002392) ENSLAFG00000026968 JADE3 (ENSLAFG00000008541) RGN (ENSLAFG00000008548) NDUFB11 (ENSLAFG00000002899) RBM10 (ENSLAFG00000002900) UBA1 (ENSLAFG00000002798) CDK16 (ENSLAFG00000012276) ##22 USP11 (ENSLAFG00000012282) ENSLAFG00000021905 ENSLAFG00000028010 ARAF (ENSLAFG00000018079) TIMP1 (ENSLAFG00000022600) SYN1 (ENSLAFG00000018085) CFP (ENSLAFG00000003998) ELK1 (ENSLAFG00000015524) UXT (ENSLAFG00000006884) ZNF182 (ENSLAFG00000004532) ENSLAFG00000009001 ENSLAFG00000004535 ENSLAFG00000030834 FTSJ1 (ENSLAFG00000032618) ENSLAFG00000005437 Hyrax MODERN SPECIES 2212 UBA1 (ENSPCAG00000007278) CDK16 (ENSPCAG00000007402) ##22 USP11 (ENSPCAG00000007466) Tenrec MODERN SPECIES 559 CDK16 (ENSETEG00000003242) ##22 Platypus MODERN SPECIES 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