Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT00650000094757	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.a	ENSGT00940000177737	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT00650000094757	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000177737	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000177737	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000181262	ENSGT00940000165343.d	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000063960.g.b	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b.f	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00940000157552.s.a
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00530000063960.g.b	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b.f	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00390000004368
Turbot	DUPLICATION
Turbot	MODERN SPECIES	3	acot11b (ENSSMAG00000007286) #7	ssbp3b (ENSSMAG00000007250) #8	dio1 (ENSSMAG00000007191) #9	dio1 (ENSSMAG00000028072) #10	ENSSMAG00000007156 #11	ENSSMAG00000007119 #12	ENSSMAG00000007069 #13	ENSSMAG00000007049 #14	dnttip2 (ENSSMAG00000007037) #15	ENSSMAG00000026136 #16	ENSSMAG00000007019 #17	AGBL4 (ENSSMAG00000006977) #18	elavl4 (ENSSMAG00000006881) #19	dmrta2 (ENSSMAG00000006876) #20	faf1 (ENSSMAG00000006842) #21	ENSSMAG00000006636 #22	rnf11b (ENSSMAG00000030524) #23	TTC39A (ENSSMAG00000006580) #24	ENSSMAG00000006542 #25	calr (ENSSMAG00000006479) #26	tor3a (ENSSMAG00000006472) #27	osbpl9 (ENSSMAG00000006210) #28	abl2 (ENSSMAG00000006075) #29	soat1 (ENSSMAG00000006059) #30	ENSSMAG00000005967 #31	ENSSMAG00000005761 #32	ENSSMAG00000005776 #33	CEP350 (ENSSMAG00000005713) #34	qsox1 (ENSSMAG00000005701) #35	lhx4 (ENSSMAG00000005678) #36	acbd6 (ENSSMAG00000005658) #37
Turbot	MODERN SPECIES	20	septin3 (ENSSMAG00000013826)	ENSSMAG00000021663	serhl (ENSSMAG00000021742)	serhl (ENSSMAG00000013860)	mb (ENSSMAG00000035935)	ENSSMAG00000013896	zgc:158803 (ENSSMAG00000013905)	ENSSMAG00000013932	ENSSMAG00000013938	ENSSMAG00000013959	ENSSMAG00000013970	ENSSMAG00000014004	ENSSMAG00000014050	ENSSMAG00000014211	ap1m2 (ENSSMAG00000014240)	ENSSMAG00000030085 ##22	ENSSMAG00000014293	s1pr5b (ENSSMAG00000014302)	fdx2 (ENSSMAG00000014312)	ENSSMAG00000034429	ENSSMAG00000014340	ENSSMAG00000014349	ENSSMAG00000014359	HO-1 (ENSSMAG00000030685)	rnf11a (ENSSMAG00000014402)	ENSSMAG00000014430	dand5 (ENSSMAG00000014617)	ENSSMAG00000014639	ENSSMAG00000014671	ENSSMAG00000014684	ENSSMAG00000027463
Tongue sole	MODERN SPECIES	19	rgs12b (ENSCSEG00000014005)	chrna6 (ENSCSEG00000013997)	ENSCSEG00000013985	ENSCSEG00000013967	zgc:195282 (ENSCSEG00000013954)	pi4k2b (ENSCSEG00000013924)	htra3a (ENSCSEG00000013897)	GPR78 (ENSCSEG00000013891)	CPZ (ENSCSEG00000013882)	hmx4 (ENSCSEG00000013877)	hmx1 (ENSCSEG00000013871)	adra2c (ENSCSEG00000013863)	lrpap1 (ENSCSEG00000013834)	DOK7 (ENSCSEG00000013814)	ap1m2 (ENSCSEG00000013803)	CDKN2D (ENSCSEG00000013798) #22	ENSCSEG00000013791	keap1b (ENSCSEG00000013786)	s1pr5b (ENSCSEG00000013780)	fdx2 (ENSCSEG00000013776)	ENSCSEG00000013771	ENSCSEG00000013767	ENSCSEG00000013762	rnf11a (ENSCSEG00000013753)	NFIX (ENSCSEG00000013646)	dand5 (ENSCSEG00000013627)	ENSCSEG00000013616	pld6 (ENSCSEG00000013610)	elof1 (ENSCSEG00000013606)	PLPPR2 (ENSCSEG00000013598)	ENSCSEG00000013590
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00530000063960.g.b	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b.f	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00940000157552.s.a
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00530000063960.g.b.a	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b.f	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d.i	ENSGT00950000182944.A.b.d.j	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2982	serhl (ENSSLDG00000023844)	serhl (ENSSLDG00000023833)	mb (ENSSLDG00000023825)	pane1 (ENSSLDG00000023816)	zgc:158803 (ENSSLDG00000023807)	smdt1b (ENSSLDG00000023802)	ENSSLDG00000023792	ENSSLDG00000023789	SOX10 (ENSSLDG00000023781)	rnaseh2a (ENSSLDG00000023766)	MAST1 (ENSSLDG00000023742)	atg4da (ENSSLDG00000023718)	SMARCA4 (ENSSLDG00000023663)	ENSSLDG00000023644	ap1m2 (ENSSLDG00000023631)	CDKN2D (ENSSLDG00000023627) #22	ENSSLDG00000023625	keap1b (ENSSLDG00000023620)	s1pr5b (ENSSLDG00000023617)	fdx2 (ENSSLDG00000023600)	ENSSLDG00000023581	ENSSLDG00000023572	NEU3 (ENSSLDG00000023565)	NEU3 (ENSSLDG00000023560)	ENSSLDG00000023552	ENSSLDG00000023542	HMOX1 (ENSSLDG00000023531)	rnf11a (ENSSLDG00000023520)	NFIX (ENSSLDG00000023509)
Greater amberjack	MODERN SPECIES	214															ap1m2 (ENSSDUG00000023256)	CDKN2D (ENSSDUG00000023261) #22	ENSSDUG00000023263	keap1b (ENSSDUG00000023265)	s1pr5b (ENSSDUG00000023268)	fdx2 (ENSSDUG00000023270)	ENSSDUG00000023273	ENSSDUG00000023275	NEU3 (ENSSDUG00000023278)	NEU3 (ENSSDUG00000023279)	ENSSDUG00000023281	ENSSDUG00000023284	HMOX1 (ENSSDUG00000023292)	rnf11a (ENSSDUG00000023294)	NFIX (ENSSDUG00000023300)	dand5 (ENSSDUG00000023316)	tspan34 (ENSSDUG00000023318)
Barramundi perch	DUPLICATION
Barramundi perch	MODERN SPECIES	43	hsh2d (ENSLCAG00010027025)	tax1bp3 (ENSLCAG00010027024)	slc1a6 (ENSLCAG00010027021)	ENSLCAG00010027020	pole4 (ENSLCAG00010027018)	ENSLCAG00010027016	ccl25b (ENSLCAG00010027015)	dnttip2 (ENSLCAG00010027011) #15	spata6 (ENSLCAG00010027010) #17	AGBL4 (ENSLCAG00010027008) #18	bend5 (ENSLCAG00010027001)	agbl4 (ENSLCAG00010026997) ##18	elavl4 (ENSLCAG00010026991) #19	dmrta2 (ENSLCAG00010026986) #20	faf1 (ENSLCAG00010026978) #21	ENSLCAG00010026971 #22	rnf11b (ENSLCAG00010026970) #23	TTC39A (ENSLCAG00010026966) #24	ENSLCAG00010026955 #25	calr (ENSLCAG00010026951) #26	tor3a (ENSLCAG00010026949) #27	osbpl9 (ENSLCAG00010026923) #28	abl2 (ENSLCAG00010026920) #29	soat1 (ENSLCAG00010026917) #30	CACNA1E (ENSLCAG00010025963) #33	ENSLCAG00010025365 #34	qsox1 (ENSLCAG00010025349) #35	lhx4 (ENSLCAG00010025342) #36	acbd6 (ENSLCAG00010025337) #37	xpr1a (ENSLCAG00010025321)	sin3b (ENSLCAG00010025277)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	113	ENSLCAG00010025898	serhl (ENSLCAG00010025881)	mb (ENSLCAG00010025873)	pane1 (ENSLCAG00010025871)	zgc:158803 (ENSLCAG00010025868)	smdt1b (ENSLCAG00010025863)	ENSLCAG00010025859	ENSLCAG00010025857	SOX10 (ENSLCAG00010025851)	rnaseh2a (ENSLCAG00010025845)	MAST1 (ENSLCAG00010025816)	atg4da (ENSLCAG00010025792)	SMARCA4 (ENSLCAG00010025736)	ENSLCAG00010025594	ap1m2 (ENSLCAG00010025411)	CDKN2D (ENSLCAG00010025359) #22	ENSLCAG00010025351	keap1b (ENSLCAG00010025348)	s1pr5b (ENSLCAG00010025347)	fdx2 (ENSLCAG00010025344)	ENSLCAG00010025338	ENSLCAG00010025336	ENSLCAG00010025333	ENSLCAG00010025331	ENSLCAG00010025327	ENSLCAG00010025325	ENSLCAG00010025324	ENSLCAG00010025320	ENSLCAG00010025315	HMOX1 (ENSLCAG00010025306)	rnf11a (ENSLCAG00010025300)
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000177737	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000181262	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00940000157552.s.a
Zig-zag eel	MODERN SPECIES		serhl (ENSMAMG00000003995)	ENSMAMG00000004067	mb (ENSMAMG00000003974)	ENSMAMG00000003936	zgc:158803 (ENSMAMG00000003914)	ENSMAMG00000003891	ENSMAMG00000003879	ENSMAMG00000003152	ENSMAMG00000003107	ENSMAMG00000026089	ENSMAMG00000002992	ENSMAMG00000002970	ENSMAMG00000002841	ENSMAMG00000002789	ap1m2 (ENSMAMG00000002700)	ENSMAMG00000025026 #22	ENSMAMG00000002687	keap1b (ENSMAMG00000002679)	s1pr5b (ENSMAMG00000002676)	fdx2 (ENSMAMG00000002665)	ENSMAMG00000025847	ENSMAMG00000002648	ENSMAMG00000002631	ENSMAMG00000027487	ENSMAMG00000027973	ENSMAMG00000002595	rnf11a (ENSMAMG00000027180)	ENSMAMG00000002467	dand5 (ENSMAMG00000002436)	ENSMAMG00000002427	ENSMAMG00000002400
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000177737	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00390000004368
Climbing perch	MODERN SPECIES		serhl (ENSATEG00000000406)	mb (ENSATEG00000000416)	ENSATEG00000000430	zgc:158803 (ENSATEG00000000437)	ENSATEG00000027300	ENSATEG00000000458	ENSATEG00000000464	ENSATEG00000000870	ENSATEG00000000908	ENSATEG00000000943	ENSATEG00000001031	ENSATEG00000001094	ENSATEG00000002785	ENSATEG00000002793	ap1m2 (ENSATEG00000002811)	ENSATEG00000002865 #22	keap1b (ENSATEG00000002872)	s1pr5b (ENSATEG00000002909)	fdx2 (ENSATEG00000002919)	ENSATEG00000026180	ENSATEG00000025191	ENSATEG00000002944	ENSATEG00000029628	ENSATEG00000002962	ENSATEG00000002973	NFIX (ENSATEG00000003018)	ENSATEG00000003118	ENSATEG00000003157	ENSATEG00000003181	ENSATEG00000026771	ENSATEG00000029063
Siamese fighting fish	DUPLICATION
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	15	tax1bp3 (ENSBSLG00000006164)	slc1a6 (ENSBSLG00000006168)	ENSBSLG00000006186	pole4 (ENSBSLG00000006189)	ENSBSLG00000006193	ccl25b (ENSBSLG00000006207)	gclm (ENSBSLG00000006210)	dnttip2 (ENSBSLG00000006215) #15	ENSBSLG00000006218 #16	ENSBSLG00000006219 #17	AGBL4 (ENSBSLG00000006221) #18	bend5 (ENSBSLG00000006226)	elavl4 (ENSBSLG00000006228) #19	dmrta2 (ENSBSLG00000006289) #20	faf1 (ENSBSLG00000006832) #21	ENSBSLG00000007629 #22	rnf11b (ENSBSLG00000007635) #23	TTC39A (ENSBSLG00000007641) #24	ENSBSLG00000007708	EPS15 (ENSBSLG00000007929) #25	calr (ENSBSLG00000008939) #26	tor3a (ENSBSLG00000009065) #27	osbpl9 (ENSBSLG00000000740) #28	abl2 (ENSBSLG00000000959) #29	soat1 (ENSBSLG00000000984) #30	soat1 (ENSBSLG00000001015) #30	CACNA1E (ENSBSLG00000001891) #33	CEP350 (ENSBSLG00000002121) #34	qsox1 (ENSBSLG00000002125) #35	lhx4 (ENSBSLG00000002126) #36	acbd6 (ENSBSLG00000002171) #37
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES		mb (ENSBSLG00000009908)	mettl14 (ENSBSLG00000009847)	mb (ENSBSLG00000009826)	ENSBSLG00000009814	zgc:158803 (ENSBSLG00000009773)	smdt1b (ENSBSLG00000009756)	ENSBSLG00000009704	KCNJ4 (ENSBSLG00000009531)	ENSBSLG00000009520	rnaseh2a (ENSBSLG00000009501)	ENSBSLG00000007984	atg4da (ENSBSLG00000007401)	SMARCA4 (ENSBSLG00000007283)	ENSBSLG00000005904	ap1m2 (ENSBSLG00000005447)	CDKN2D (ENSBSLG00000005390) #22	ENSBSLG00000005374	keap1b (ENSBSLG00000005218)	s1pr5b (ENSBSLG00000005182)	fdx2 (ENSBSLG00000005155)	ENSBSLG00000005130	ENSBSLG00000005116	ENSBSLG00000005091	ENSBSLG00000005031	HMOX1 (ENSBSLG00000004992)	rnf11a (ENSBSLG00000004959)	NFIX (ENSBSLG00000016432)	dand5 (ENSBSLG00000016422)	tspan34 (ENSBSLG00000016418)	ENSBSLG00000016412	pld6 (ENSBSLG00000016408)
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT00650000094757	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00940000157552.s.a
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00530000063960.g.b.f	ENSGT00530000063960.g.b.e	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00940000175590	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00390000004368
Fugu	MODERN SPECIES	8	ENSTRUG00000030710	serhl (ENSTRUG00000000033)	mb (ENSTRUG00000000034)	ENSTRUG00000000037	zgc:158803 (ENSTRUG00000000039)	ENSTRUG00000026631	ENSTRUG00000030066	KCNJ4 (ENSTRUG00000027165)	Sox10a (ENSTRUG00000033126)	rnaseh2a (ENSTRUG00000000049)	MAST1 (ENSTRUG00000001299)	atg4da (ENSTRUG00000001314)	ENSTRUG00000002369	ENSTRUG00000033211	ap1m2 (ENSTRUG00000003149)	cdkn2D (ENSTRUG00000003739) #22	ENSTRUG00000003757	keap1b (ENSTRUG00000003855)	s1pr5b (ENSTRUG00000004396)	fdx2 (ENSTRUG00000004468)	ENSTRUG00000019733	ENSTRUG00000019645	ENSTRUG00000021117	ENSTRUG00000004540	HMOX1 (ENSTRUG00000021266)	rnf11a (ENSTRUG00000027847)	NFIX (ENSTRUG00000005030)	charon (ENSTRUG00000005611)	tspan34 (ENSTRUG00000025232)	ENSTRUG00000005632	pld6 (ENSTRUG00000005778)
Tetraodon	MODERN SPECIES	10	atf7ip (ENSTNIG00000007160)	septin3 (ENSTNIG00000004228)	serhl (ENSTNIG00000005517)	mb (ENSTNIG00000005518)	ENSTNIG00000001651	zgc:158803 (ENSTNIG00000005519)	ENSTNIG00000004530	KCNJ4 (ENSTNIG00000004531)	ENSTNIG00000004532	rnaseh2a (ENSTNIG00000004533)	MAST1 (ENSTNIG00000004534)	atg4da (ENSTNIG00000004535)	SMARCA4 (ENSTNIG00000004536)	ENSTNIG00000004537	ap1m2 (ENSTNIG00000004538)	CDKN2D (ENSTNIG00000004539) #22	ENSTNIG00000004540	keap1b (ENSTNIG00000004541)	s1pr5b (ENSTNIG00000004542)	ENSTNIG00000006132	ENSTNIG00000006133	ENSTNIG00000006134	HMOX1 (ENSTNIG00000006135)	rnf11a (ENSTNIG00000006136)	ENSTNIG00000004024	NFIX (ENSTNIG00000003955)	dand5 (ENSTNIG00000006075)	tspan34 (ENSTNIG00000000549)	ENSTNIG00000006074	pld6 (ENSTNIG00000006073)	elof1 (ENSTNIG00000006072)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT00650000094757	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d	ENSGT00950000182944.A.b.c	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	287	serhl (ENSLBEG00000019986)	mb (ENSLBEG00000020009)	serhl (ENSLBEG00000020032)	pane1 (ENSLBEG00000020088)	zgc:158803 (ENSLBEG00000020118)	smdt1b (ENSLBEG00000020160)	ENSLBEG00000020143	ENSLBEG00000020228	ENSLBEG00000020466	rnaseh2a (ENSLBEG00000020494)	MAST1 (ENSLBEG00000020537)	atg4da (ENSLBEG00000020609)	SMARCA4 (ENSLBEG00000020655)	ENSLBEG00000020752	ap1m2 (ENSLBEG00000020783)	CDKN2D (ENSLBEG00000020818) #22	ENSLBEG00000020827	keap1b (ENSLBEG00000020837)	s1pr5b (ENSLBEG00000020859)	fdx2 (ENSLBEG00000020878)	ENSLBEG00000020889	ENSLBEG00000020905	NEU3 (ENSLBEG00000020919)	NEU3 (ENSLBEG00000020937)	NEU3 (ENSLBEG00000020949)	NEU3 (ENSLBEG00000020961)	ENSLBEG00000020977	ENSLBEG00000020993	HMOX1 (ENSLBEG00000021015)	rnf11a (ENSLBEG00000021032)	NFIX (ENSLBEG00000021105)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT00650000094757	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d	ENSGT00950000182944.A.b.c	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00530000063960.g.b	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d	ENSGT00950000182944.A.b.c.d	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00530000063960.g.b	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d	ENSGT00950000182944.A.b.c.d	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	481	serhl (ENSLCRG00005009226)	serhl (ENSLCRG00005009224)	mb (ENSLCRG00005009223)	pane1 (ENSLCRG00005009220)	zgc:158803 (ENSLCRG00005009217)	smdt1b (ENSLCRG00005009216)	ENSLCRG00005009215	KCNJ4 (ENSLCRG00005009214)	SOX10 (ENSLCRG00005009213)	rnaseh2a (ENSLCRG00005009186)	MAST1 (ENSLCRG00005008792)	atg4da (ENSLCRG00005008780)	SMARCA4 (ENSLCRG00005007894)	ENSLCRG00005002982	ap1m2 (ENSLCRG00005002656)	CDKN2D (ENSLCRG00005002639) #22	ENSLCRG00005002636	keap1 (ENSLCRG00005002628)	s1pr5b (ENSLCRG00005002624)	fdx2 (ENSLCRG00005002620)	ENSLCRG00005002617	ENSLCRG00005002614	NEU3 (ENSLCRG00005002612)	ENSLCRG00005002559	NEU3 (ENSLCRG00005002553)	ENSLCRG00005002548	ENSLCRG00005002542	ENSLCRG00005002538	HMOX1 (ENSLCRG00005002532)	rnf11a (ENSLCRG00005002528)	NFIX (ENSLCRG00005002487)
Gilthead seabream	MODERN SPECIES		serhl (ENSSAUG00010025353)	serhl (ENSSAUG00010025355)	mb (ENSSAUG00010025356)	ENSSAUG00010025357	zgc:158803 (ENSSAUG00010025358)	smdt1b (ENSSAUG00010025359)	ENSSAUG00010025362	KCNJ4 (ENSSAUG00010025363)	SOX10 (ENSSAUG00010025364)	rnaseh2a (ENSSAUG00010025366)	MAST1 (ENSSAUG00010025373)	atg4da (ENSSAUG00010025418)	SMARCA4 (ENSSAUG00010025426)	ENSSAUG00010025464	ap1m2 (ENSSAUG00010025874)	CDKN2D (ENSSAUG00010002999) #22	ENSSAUG00010003007	keap1b (ENSSAUG00010003018)	s1pr5b (ENSSAUG00010003030)	fdx2 (ENSSAUG00010003033)	ENSSAUG00010003043	NEU3 (ENSSAUG00010003053)	ENSSAUG00010003057	ENSSAUG00010003063	HMOX1 (ENSSAUG00010003067)	rnf11a (ENSSAUG00010003075)	NFIX (ENSSAUG00010003122)	dand5 (ENSSAUG00010003827)	tspan34 (ENSSAUG00010003831)	ENSSAUG00010003832	pld6 (ENSSAUG00010003834)
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT00650000094757	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.c	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT00650000094757	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00940000157552.s.a
Lumpfish	MODERN SPECIES		ENSCLMG00005002697	mb (ENSCLMG00005002698)	pane1 (ENSCLMG00005002699)	zgc:158803 (ENSCLMG00005002700)	smdt1b (ENSCLMG00005002701)	ENSCLMG00005002702	ENSCLMG00005002703	ENSCLMG00005002704	rnaseh2a (ENSCLMG00005002705)	ENSCLMG00005002707	ENSCLMG00005002709	atg4da (ENSCLMG00005002712)	SMARCA4 (ENSCLMG00005002722)	ENSCLMG00005003849	ap1m2 (ENSCLMG00005009306)	CDKN2D (ENSCLMG00005009709) #22	ENSCLMG00005009710	keap1b (ENSCLMG00005009711)	s1pr5b (ENSCLMG00005009713)	fdx2 (ENSCLMG00005009714)	zglp1 (ENSCLMG00005009715)	ENSCLMG00005009716	ENSCLMG00005009717	ENSCLMG00005009718	ENSCLMG00005009719	ENSCLMG00005009720	rnf11a (ENSCLMG00005009721)	NFIX (ENSCLMG00005009722)	dand5 (ENSCLMG00005009726)	tspan34 (ENSCLMG00005009728)	RAB3D (ENSCLMG00005009866)
Stickleback	MODERN SPECIES	4	BFAR (ENSGACG00000019548)	ENSGACG00000019547	ENSGACG00000019545	ears2 (ENSGACG00000019531)	ENSGACG00000019529	ENSGACG00000019526	ENSGACG00000019523	GTF3C1 (ENSGACG00000019516)	AXIN1 (ENSGACG00000019513)	thumpd1 (ENSGACG00000019511)	ENSGACG00000019510	ENSGACG00000019507	parn (ENSGACG00000019501)	ENSGACG00000019500	ap1m2 (ENSGACG00000019492)	CDKN2D (ENSGACG00000019491) #22	ENSGACG00000019488	ENSGACG00000019487	ENSGACG00000019486	keap1b (ENSGACG00000019479)	s1pr5b (ENSGACG00000019478)	fdx2 (ENSGACG00000019477)	ENSGACG00000019476	ENSGACG00000019475	ENSGACG00000019473	HMOX1 (ENSGACG00000019469)	rnf11a (ENSGACG00000019466)	ENSGACG00000019465	NFIX (ENSGACG00000019462)	dand5 (ENSGACG00000019460)	tspan34 (ENSGACG00000019454)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000063960.g.b.j.a	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.c	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a
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Channel bull blenny	MODERN SPECIES		serhl (ENSCGOG00000020536)	mb (ENSCGOG00000020540)	ENSCGOG00000020551	zgc:158803 (ENSCGOG00000020554)	smdt1b (ENSCGOG00000020607)	ENSCGOG00000020606	ENSCGOG00000020609	ENSCGOG00000020610	SOX10 (ENSCGOG00000020612)	rnaseh2a (ENSCGOG00000020614)	MAST1 (ENSCGOG00000020651)	atg4da (ENSCGOG00000020669)	SMARCA4 (ENSCGOG00000020723)	ENSCGOG00000021526	ap1m2 (ENSCGOG00000021610)	CDKN2D (ENSCGOG00000021666) #22	ENSCGOG00000021669	keap1b (ENSCGOG00000021671)	s1pr5b (ENSCGOG00000021673)	fdx2 (ENSCGOG00000021674)	ENSCGOG00000021676	ENSCGOG00000021677	NEU3 (ENSCGOG00000021678)	ENSCGOG00000021679	ENSCGOG00000021681	ENSCGOG00000021685	HMOX1 (ENSCGOG00000021690)	rnf11a (ENSCGOG00000021688)	NFIX (ENSCGOG00000021693)	dand5 (ENSCGOG00000021720)	tspan34 (ENSCGOG00000021722)
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT00650000094757	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00530000063960.g.b	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000181262	ENSGT00940000165343.d	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00530000063960.g.b	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000181262	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000063960.g.b	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000181262	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT01090000261423	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000181262	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.b.a	ENSGT00530000063926.b
Orange clownfish	MODERN SPECIES	17	mb (ENSAPEG00000022796)	ENSAPEG00000022807	zgc:158803 (ENSAPEG00000022841)	smdt1b (ENSAPEG00000022857)	ENSAPEG00000022874	ENSAPEG00000022889	SOX10 (ENSAPEG00000022921)	rnaseh2a (ENSAPEG00000022937)	ENSAPEG00000022961	MAST1 (ENSAPEG00000022973)	ENSAPEG00000023018	atg4da (ENSAPEG00000023035)	SMARCA4 (ENSAPEG00000023108)	ENSAPEG00000023188	ap1m2 (ENSAPEG00000023204)	CDKN2D (ENSAPEG00000023215) #22	ENSAPEG00000023218	keap1b (ENSAPEG00000023223)	s1pr5b (ENSAPEG00000023229)	fdx2 (ENSAPEG00000023232)	ENSAPEG00000023241	ENSAPEG00000023251	NEU3 (ENSAPEG00000023257)	ENSAPEG00000023267	ENSAPEG00000023300	ENSAPEG00000023313	HMOX1 (ENSAPEG00000023325)	rnf11a (ENSAPEG00000023334)	NFIX (ENSAPEG00000023351)	dand5 (ENSAPEG00000023394)	tspan34 (ENSAPEG00000023403)
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1044	mb (ENSAOCG00000008982)	pane1 (ENSAOCG00000009012)	zgc:158803 (ENSAOCG00000009085)	smdt1b (ENSAOCG00000009097)	ENSAOCG00000009111	ENSAOCG00000009131	SOX10 (ENSAOCG00000009184)	rnaseh2a (ENSAOCG00000009217)	ENSAOCG00000009239	ENSAOCG00000009261	MAST1 (ENSAOCG00000009348)	atg4da (ENSAOCG00000009366)	SMARCA4 (ENSAOCG00000009450)	ENSAOCG00000009468	ap1m2 (ENSAOCG00000009505)	CDKN2D (ENSAOCG00000009517) #22	ENSAOCG00000002137	keap1b (ENSAOCG00000009527)	s1pr5b (ENSAOCG00000009535)	fdx2 (ENSAOCG00000009574)	ENSAOCG00000009617	ENSAOCG00000009625
Spiny chromis	MODERN SPECIES	88	serhl (ENSAPOG00000000089)	mb (ENSAPOG00000003952)	pane1 (ENSAPOG00000003964)	zgc:158803 (ENSAPOG00000003970)	smdt1b (ENSAPOG00000003995)	ENSAPOG00000004017	ENSAPOG00000004042	SOX10 (ENSAPOG00000004067)	rnaseh2a (ENSAPOG00000004101)	MAST1 (ENSAPOG00000004190)	atg4da (ENSAPOG00000004347)	atg4da (ENSAPOG00000004393)	SMARCA4 (ENSAPOG00000004542)	ENSAPOG00000004583	ap1m2 (ENSAPOG00000004630)	CDKN2D (ENSAPOG00000004642) #22	ENSAPOG00000000116	keap1b (ENSAPOG00000004671)	s1pr5b (ENSAPOG00000004684)	fdx2 (ENSAPOG00000004692)	zglp1 (ENSAPOG00000004713)	ENSAPOG00000004728	ENSAPOG00000004745	ENSAPOG00000004766	ENSAPOG00000004786	HMOX1 (ENSAPOG00000004803)	rnf11a (ENSAPOG00000004817)	NFIX (ENSAPOG00000004937)	dand5 (ENSAPOG00000004996)	ENSAPOG00000005041
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	239	serhl (ENSSPAG00000013461)	mb (ENSSPAG00000013443)	ENSSPAG00000013408	zgc:158803 (ENSSPAG00000013318)	ENSSPAG00000013302	ENSSPAG00000013289	ENSSPAG00000012865	SOX10 (ENSSPAG00000012804)	rnaseh2a (ENSSPAG00000012769)	ENSSPAG00000012759	MAST1 (ENSSPAG00000012704)	atg4da (ENSSPAG00000012672)	SMARCA4 (ENSSPAG00000012533)	ENSSPAG00000012489	ap1m2 (ENSSPAG00000012447)	CDKN2D (ENSSPAG00000012438) #22	ENSSPAG00000012424	keap1b (ENSSPAG00000012410)	s1pr5b (ENSSPAG00000012405)	fdx2 (ENSSPAG00000012392)	zglp1 (ENSSPAG00000012373)	ENSSPAG00000012365	ENSSPAG00000012355	ENSSPAG00000012346	NEU3 (ENSSPAG00000012338)	ENSSPAG00000012330	ENSSPAG00000012292	HMOX1 (ENSSPAG00000012255)	rnf11a (ENSSPAG00000012240)	NFIX (ENSSPAG00000012179)	dand5 (ENSSPAG00000012165)
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.a	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00940000157552.s.a
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.a.a	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00940000157552.s.a
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.a.a	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00940000157552.s.a
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00530000063960.g.b	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.a.a	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.a	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.b	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	734	ENSHBUG00000005167	zgc:158803 (ENSHBUG00000005175)	smdt1b (ENSHBUG00000005194)	ENSHBUG00000005215	KCNJ4 (ENSHBUG00000005222)	ENSHBUG00000005242	rnaseh2a (ENSHBUG00000005267)	ENSHBUG00000005303	MAST1 (ENSHBUG00000005318)	atg4da (ENSHBUG00000005336)	SMARCA4 (ENSHBUG00000005447)	ENSHBUG00000005468	ENSHBUG00000005484	ENSHBUG00000006790	ap1m2 (ENSHBUG00000006969)	CDKN2D (ENSHBUG00000006917) #22	ENSHBUG00000006982	keap1b (ENSHBUG00000006989)	s1pr5b (ENSHBUG00000006993)	fdx2 (ENSHBUG00000007004)	ENSHBUG00000007015	ENSHBUG00000007027	ENSHBUG00000007502
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00530000063960.g.b	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.a.a	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.a	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.b	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a
P. nyererei	MODERN SPECIES	643	mb (ENSPNYG00000023965)	ENSPNYG00000023967	zgc:158803 (ENSPNYG00000023971)	smdt1b (ENSPNYG00000023975)	KCNJ4 (ENSPNYG00000023978)	ENSPNYG00000023985	rnaseh2a (ENSPNYG00000023986)	ENSPNYG00000023987	ENSPNYG00000023988	MAST1 (ENSPNYG00000023989)	atg4da (ENSPNYG00000023991)	SMARCA4 (ENSPNYG00000023995)	ENSPNYG00000024000	ENSPNYG00000024002	ap1m2 (ENSPNYG00000024003)	CDKN2D (ENSPNYG00000024004) #22	ENSPNYG00000024006	keap1b (ENSPNYG00000024008)	s1pr5b (ENSPNYG00000024012)	fdx2 (ENSPNYG00000024013)	zglp1 (ENSPNYG00000024014)	ENSPNYG00000024016	ENSPNYG00000024017
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.a.b	ENSGT00940000177737	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.c.a.a	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.a	ENSGT00950000182944.A.b.d.e	ENSGT00950000182944.A.b.d.f.b	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.b.a
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Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1109	zgc:158803 (ENSMZEG00005023852)	smdt1b (ENSMZEG00005023853)	ENSMZEG00005023854	KCNJ4 (ENSMZEG00005023855)	ENSMZEG00005023856	rnaseh2a (ENSMZEG00005023857)	ENSMZEG00005023858	ENSMZEG00005023859	atg4da (ENSMZEG00005023860)	SMARCA4 (ENSMZEG00005023861)	ENSMZEG00005023862	ENSMZEG00005023863	ENSMZEG00005023864	ENSMZEG00005023865	ap1m2 (ENSMZEG00005023866)	CDKN2D (ENSMZEG00005023867) #22	ENSMZEG00005023868	keap1b (ENSMZEG00005023869)	s1pr5b (ENSMZEG00005023870)	fdx2 (ENSMZEG00005023871)	ENSMZEG00005023872	ENSMZEG00005023873	ENSMZEG00005023874	NEU3 (ENSMZEG00005023875)	NEU3 (ENSMZEG00005023876)	ENSMZEG00005023877	NFIX (ENSMZEG00005023878)	dand5 (ENSMZEG00005023879)	tspan34 (ENSMZEG00005023880)	RAB3D (ENSMZEG00005023881)	pld6 (ENSMZEG00005023882)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	301	serhl (ENSNBRG00000018375)	serhl (ENSNBRG00000018405)	mb (ENSNBRG00000018430)	ENSNBRG00000018440	zgc:158803 (ENSNBRG00000018476)	smdt1b (ENSNBRG00000018490)	KCNJ4 (ENSNBRG00000018518)	ENSNBRG00000018705	rnaseh2a (ENSNBRG00000018731)	MAST1 (ENSNBRG00000018757)	atg4da (ENSNBRG00000018815)	SMARCA4 (ENSNBRG00000018865)	ENSNBRG00000018933	ENSNBRG00000018963	ap1m2 (ENSNBRG00000019060)	CDKN2D (ENSNBRG00000019096) #22	ENSNBRG00000019117	keap1b (ENSNBRG00000019129)	s1pr5b (ENSNBRG00000019138)	fdx2 (ENSNBRG00000019149)	zglp1 (ENSNBRG00000019171)	ENSNBRG00000019197	NEU3 (ENSNBRG00000019205)	ENSNBRG00000019216	ENSNBRG00000019223	HMOX1 (ENSNBRG00000019244)	rnf11a (ENSNBRG00000019250)	NFIX (ENSNBRG00000019307)	dand5 (ENSNBRG00000019412)	tspan34 (ENSNBRG00000019428)	RAB3D (ENSNBRG00000019454)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	18	serhl (ENSONIG00000018014)	serhl (ENSONIG00000018016)	Mb (ENSONIG00000018018)	ENSONIG00000018021	zgc:158803 (ENSONIG00000018025)	smdt1b (ENSONIG00000036008)	ENSONIG00000018028	KCNJ4 (ENSONIG00000018031)	ENSONIG00000018032	rnaseh2a (ENSONIG00000018033)	MAST1 (ENSONIG00000018034)	atg4da (ENSONIG00000031738)	SMARCA4 (ENSONIG00000018040)	ENSONIG00000018056	ap1m2 (ENSONIG00000018060)	CDKN2D (ENSONIG00000032001) #22	ENSONIG00000018063	keap1b (ENSONIG00000018066)	s1pr5b (ENSONIG00000021227)	fdx2 (ENSONIG00000018067)	ENSONIG00000033442	ENSONIG00000018068	neu3e (ENSONIG00000018070)	NEU3 (ENSONIG00000018069)	ENSONIG00000028184	ENSONIG00000018071	ENSONIG00000018073	HMOX1 (ENSONIG00000018076)	rnf11a (ENSONIG00000037073)	NFIX (ENSONIG00000018077)	dand5 (ENSONIG00000018078)
Midas cichlid	DUPLICATION
Midas cichlid	MODERN SPECIES	595								ENSACIG00000008912 #16	ENSACIG00000008905 #17	bend5 (ENSACIG00000008860)	ENSACIG00000008842	AGBL4 (ENSACIG00000008810) #18	elavl4 (ENSACIG00000008793) #19	dmrta2 (ENSACIG00000008749) #20	faf1 (ENSACIG00000008712) #21	ENSACIG00000008680 #22	rnf11b (ENSACIG00000008644) #23	TTC39A (ENSACIG00000008612) #24	EPS15 (ENSACIG00000008531) #25	calr (ENSACIG00000008509) #26	tor3a (ENSACIG00000008486) #27	osbpl9 (ENSACIG00000008374) #28	abl2 (ENSACIG00000008184) #29	soat1 (ENSACIG00000008124) #30	ENSACIG00000008065	ENSACIG00000008034 #33	CACNA1E (ENSACIG00000007982) #33	CEP350 (ENSACIG00000007837) #34	qsox1 (ENSACIG00000007802) #35	lhx4 (ENSACIG00000007782) #36	acbd6 (ENSACIG00000007757) #37
Midas cichlid	MODERN SPECIES	1199	ENSACIG00000002373	serhl (ENSACIG00000002390)	mb (ENSACIG00000002412)	ENSACIG00000002427	zgc:158803 (ENSACIG00000002441)	smdt1b (ENSACIG00000002454)	KCNJ4 (ENSACIG00000002474)	ENSACIG00000002643	rnaseh2a (ENSACIG00000002658)	MAST1 (ENSACIG00000002693)	atg4da (ENSACIG00000003005)	SMARCA4 (ENSACIG00000003035)	ENSACIG00000003107	ENSACIG00000003155	ap1m2 (ENSACIG00000003239)	CDKN2D (ENSACIG00000003266) #22	ENSACIG00000003274	keap1b (ENSACIG00000003284)	s1pr5b (ENSACIG00000003324)	fdx2 (ENSACIG00000003335)	zglp1 (ENSACIG00000003353)	ENSACIG00000003377	NEU3 (ENSACIG00000003385)	ENSACIG00000003395	NEU3 (ENSACIG00000003415)	NEU3 (ENSACIG00000003494)	ENSACIG00000003519	ENSACIG00000003529	HMOX1 (ENSACIG00000003536)	rnf11a (ENSACIG00000003661)	NFIX (ENSACIG00000003674)
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT00650000094757	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT01030000234820	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00940000157552.s.a
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT01030000234820	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00940000165833	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00940000157552.s.a
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES		ENSORLG00000028999	serhl (ENSORLG00000004149)	mb (ENSORLG00000026103)	pane1 (ENSORLG00000004119)	ENSORLG00000004110	smdt1b (ENSORLG00000004088)	ENSORLG00000004082	ENSORLG00000004067	ENSORLG00000024031	rnaseh2a (ENSORLG00000004042)	ENSORLG00000022445	atg4da (ENSORLG00000004021)	ENSORLG00000003955	ENSORLG00000003886	ap1m2 (ENSORLG00000003846)	CDKN2D (ENSORLG00000003842) #22	ENSORLG00000003831	ENSORLG00000027541	keap1b (ENSORLG00000003823)	s1pr5b (ENSORLG00000003793)	fdx2 (ENSORLG00000029397)	ENSORLG00000024901	ENSORLG00000003779	ENSORLG00000003776	ENSORLG00000003769	ENSORLG00000028289	ENSORLG00000003753	rnf11a (ENSORLG00000022986)	NFIX (ENSORLG00000003734)	dand5 (ENSORLG00000003690)	tspan34 (ENSORLG00000003680)
Chinese medaka	MODERN SPECIES	272	ENSOSIG00000021706	serhl (ENSOSIG00000021711)	mb (ENSOSIG00000021717)	pane1 (ENSOSIG00000021730)	ENSOSIG00000021748	ENSOSIG00000021753	ENSOSIG00000021756	ENSOSIG00000021766	SOX10 (ENSOSIG00000021784)	rnaseh2a (ENSOSIG00000021790)	MAST1 (ENSOSIG00000021971)	atg4da (ENSOSIG00000022514)	SMARCA4 (ENSOSIG00000022566)	ENSOSIG00000022637	AP1M2 (ENSOSIG00000022846)	CDKN2D (ENSOSIG00000022850) #22	ENSOSIG00000022851	ENSOSIG00000022853	keap1b (ENSOSIG00000022855)	s1pr5b (ENSOSIG00000022856)	fdx2 (ENSOSIG00000022858)	ENSOSIG00000022860	ENSOSIG00000022863	ENSOSIG00000022867	ENSOSIG00000022869	ENSOSIG00000022870	ENSOSIG00000000088	HMOX1 (ENSOSIG00000000100)	rnf11a (ENSOSIG00000000109)	NFIX (ENSOSIG00000000182)	dand5 (ENSOSIG00000000234)
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT01030000234820	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00940000157552.s.a	ENSGT00390000004368
Javanese ricefish	MODERN SPECIES		septin3 (ENSOJAG00000018354)	ENSOJAG00000018446	serhl (ENSOJAG00000018454)	mb (ENSOJAG00000018470)	ENSOJAG00000018485	zgc:158803 (ENSOJAG00000018496)	smdt1b (ENSOJAG00000018524)	ENSOJAG00000018533	ENSOJAG00000018551	SOX10 (ENSOJAG00000018558)	rnaseh2a (ENSOJAG00000018576)	MAST1 (ENSOJAG00000018779)	atg4da (ENSOJAG00000020110)	ENSOJAG00000020541	ap1m2 (ENSOJAG00000021653)	CDKN2D (ENSOJAG00000021763) #22	ENSOJAG00000021769	keap1b (ENSOJAG00000021777)	s1pr5b (ENSOJAG00000021789)	fdx2 (ENSOJAG00000021790)	ENSOJAG00000021795	ENSOJAG00000021797	ENSOJAG00000021805	ENSOJAG00000021807	HMOX1 (ENSOJAG00000021814)	rnf11a (ENSOJAG00000021842)	NFIX (ENSOJAG00000021867)	dand5 (ENSOJAG00000021902)	tspan34 (ENSOJAG00000021920)	RAB3D (ENSOJAG00000021948)	pld6 (ENSOJAG00000021963)
Indian medaka	MODERN SPECIES	21	ENSOMEG00000016237	serhl (ENSOMEG00000016261)	mb (ENSOMEG00000016290)	ENSOMEG00000016315	zgc:158803 (ENSOMEG00000016350)	smdt1b (ENSOMEG00000016364)	ENSOMEG00000016389	ENSOMEG00000016403	SOX10 (ENSOMEG00000016415)	rnaseh2a (ENSOMEG00000016454)	MAST1 (ENSOMEG00000000412)	atg4da (ENSOMEG00000016515)	SMARCA4 (ENSOMEG00000016626)	ENSOMEG00000000419	ap1m2 (ENSOMEG00000016714)	CDKN2D (ENSOMEG00000016735) #22	ENSOMEG00000016757	fdx2 (ENSOMEG00000000776)	ENSOMEG00000016799	ENSOMEG00000016816	keap1b (ENSOMEG00000016855)	ENSOMEG00000016869	ENSOMEG00000016899	HMOX1 (ENSOMEG00000016914)	rnf11a (ENSOMEG00000016928)	NFIX (ENSOMEG00000017131)	dand5 (ENSOMEG00000017180)	tspan34 (ENSOMEG00000017196)	RAB3D (ENSOMEG00000017217)	pld6 (ENSOMEG00000017243)	elof1 (ENSOMEG00000017257)
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT00650000094757	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000153469.a.a.l	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a	ENSGT00940000157552.s.a
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	138	ENSKMAG00000020046	mb (ENSKMAG00000020029)	ENSKMAG00000020017	zgc:158803 (ENSKMAG00000019994)	ENSKMAG00000019985	ENSKMAG00000019930	ENSKMAG00000019899	KCNJ4 (ENSKMAG00000019890)	SOX10 (ENSKMAG00000019870)	rnaseh2a (ENSKMAG00000019829)	MAST1 (ENSKMAG00000019681)	atg4da (ENSKMAG00000019629)	SMARCA4 (ENSKMAG00000019518)	ENSKMAG00000019458	ap1m2 (ENSKMAG00000019421)	CDKN2D (ENSKMAG00000019404) #22	ENSKMAG00000019395	keap1b (ENSKMAG00000019360)	s1pr5b (ENSKMAG00000019347)	fdx2 (ENSKMAG00000019336)	ENSKMAG00000019325	ENSKMAG00000019315	ENSKMAG00000019305	ENSKMAG00000019283	ENSKMAG00000019262	ENSKMAG00000019249	rnf11a (ENSKMAG00000019233)	NFIX (ENSKMAG00000019092)	dand5 (ENSKMAG00000019010)	tspan34 (ENSKMAG00000018993)	ENSKMAG00000018973
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1617	MB (ENSNFUG00015018903)	ENSNFUG00015018909	PANE1 (ENSNFUG00015018910)	zgc:158803 (ENSNFUG00015018917)	C3H22ORF32 (ENSNFUG00015018926)	ENSNFUG00015018928	ENSNFUG00015018933	ENSNFUG00015018937	SOX10 (ENSNFUG00015018941)	RNASEH2A (ENSNFUG00015018947)	MAST1 (ENSNFUG00015019007)	atg4da (ENSNFUG00015020523)	SMARCA4 (ENSNFUG00015020530)	ENSNFUG00015020613	ap1m2 (ENSNFUG00015022583)	Cdkn2d (ENSNFUG00015022781) #22	ENSNFUG00015022782	LRRC8E (ENSNFUG00015022783)	DDX5 (ENSNFUG00015022815)	Nfu_g_1_013649 (ENSNFUG00015023104)	ENSNFUG00015023110	TTBK1 (ENSNFUG00015023144)	TPC3 (ENSNFUG00015023162)	TMEM246 (ENSNFUG00015023205)	LGALSLA (ENSNFUG00015023207)	slc29a2 (ENSNFUG00015023212)	PELI1A (ENSNFUG00015023219)	vps54 (ENSNFUG00015023231)	ugp2a (ENSNFUG00015023325)	MDH1 (ENSNFUG00015023534)	otx2a (ENSNFUG00015023572)
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT00650000094757	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT00650000094757	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00390000012436.h	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a
Platyfish	MODERN SPECIES	19	serhl (ENSXMAG00000006867)	mb (ENSXMAG00000025476)	ENSXMAG00000006894	zgc:158803 (ENSXMAG00000006903)	ENSXMAG00000022941	ENSXMAG00000006923	ENSXMAG00000006940	ENSXMAG00000021473	rnaseh2a (ENSXMAG00000006953)	ENSXMAG00000027436	MAST1 (ENSXMAG00000006970)	atg4da (ENSXMAG00000007016)	SMARCA4 (ENSXMAG00000007030)	ENSXMAG00000007105	ap1m2 (ENSXMAG00000007151)	CDKN2D (ENSXMAG00000022409) #22	ENSXMAG00000007179	keap1b (ENSXMAG00000021448)	s1pr5b (ENSXMAG00000019815)	fdx2 (ENSXMAG00000005511)	ENSXMAG00000020994	ENSXMAG00000019816	ENSXMAG00000026103	ENSXMAG00000027376	ENSXMAG00000025089	ENSXMAG00000025662	HMOX1 (ENSXMAG00000007220)	rnf11a (ENSXMAG00000022184)	NFIX (ENSXMAG00000007238)	dand5 (ENSXMAG00000017343)	tspan34 (ENSXMAG00000024059)
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00530000063960.g.a	ENSGT00940000160809	ENSGT00390000017504	ENSGT00950000183213.a.a.a	ENSGT00390000017489.b	ENSGT00940000157340.k.a	ENSGT00650000094757	ENSGT01030000234586.A.b.a	ENSGT00940000158046.a.b	ENSGT00390000010768	ENSGT00940000157700.c	ENSGT00530000063000.a.a.b.j	ENSGT00940000156887.b	ENSGT00940000154819.a.b.c.b.d	ENSGT00940000159089	ENSGT00940000159801.B #22	ENSGT00940000165948	ENSGT00940000159543	ENSGT01050000244887.A.a.a.a.i	ENSGT00940000161143	ENSGT00470000042444	ENSGT00940000157140.b.b.a	ENSGT00950000182944.A.b.d	ENSGT00940000166140	ENSGT00940000165343.c.a	ENSGT00940000165343.d	ENSGT00390000017673.b.k	ENSGT00940000163721	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00530000063926.b	ENSGT00940000164506.b.a
Guppy	DUPLICATION
Guppy	DUPLICATION
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