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Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a	ENSGT00940000156988	ENSGT00940000159127	ENSGT00730000114327 #7	ENSGT00950000182946.lb.b.h #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT00940000159943 #27	ENSGT00940000155026.d #28	ENSGT00940000177981	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000159037 #29	ENSGT00950000183171.A.b.a.b #30	ENSGT00940000166794	ENSGT01030000234837 #31	ENSGT00940000155136 #32	ENSGT00940000157668 #33	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a #35
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Zig-zag eel	MODERN SPECIES	18	RHPN1 (ENSMAMG00000014859)	ENSMAMG00000014890	ENSMAMG00000014948	ENSMAMG00000015400 #7	ENSMAMG00000014977 #9	pomgnt1 (ENSMAMG00000014990) #10	TSPAN1 (ENSMAMG00000015037) #11	PIK3R3 (ENSMAMG00000015060) #13	MAST2 (ENSMAMG00000015099) #14	ENSMAMG00000015160 #17	ENSMAMG00000015165 #16	ENSMAMG00000015173 #17	prrx1b (ENSMAMG00000015198) #18	gorab (ENSMAMG00000024412) #19	ntmt2 (ENSMAMG00000015231) #21	kifap3a (ENSMAMG00000015251) #22	niban1a (ENSMAMG00000015296) #23	ENSMAMG00000015305 #24	ENSMAMG00000027044 #7	ENSMAMG00000026330 ##9	ENSMAMG00000015431 #25	ENSMAMG00000015463 #26	ENSMAMG00000015518	ENSMAMG00000015485	ENSMAMG00000015528	reep6 (ENSMAMG00000015545)	zgc:113223 (ENSMAMG00000015567)	ENSMAMG00000015587	SLC39A3 (ENSMAMG00000015606) #37	ENSMAMG00000015621 #29	THOP1 (ENSMAMG00000015663) #30
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000153837.a.a	ENSGT00940000156988	ENSGT00940000180612	ENSGT00940000159127	ENSGT00730000114327 #7	ENSGT00950000182946.lb.b.h #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT01100000263594.b	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g ##9	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT00940000159943 #27	ENSGT00940000155026.d #28	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a #35	ENSGT00940000157668 #33	ENSGT00940000155136 #32	ENSGT01030000234837 #31	ENSGT00940000166794	ENSGT00950000183171.A.b.a.b #30
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Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3176	ENSSLDG00000017469	ENSSLDG00000017453	NOS1AP (ENSSLDG00000017424)	ENSSLDG00000017410	ENSSLDG00000017392	pycr3 (ENSSLDG00000017378)	bmb (ENSSLDG00000017363)	SERPINB1 (ENSSLDG00000017322)	GFUS (ENSSLDG00000016998)	SERPINB1 (ENSSLDG00000016912)	ENSSLDG00000016881 #16	ENSSLDG00000016872	prrx1b (ENSSLDG00000016851) #18	gorab (ENSSLDG00000016829) #19	ntmt2 (ENSSLDG00000016809) #21	kifap3a (ENSSLDG00000016743) #22	niban1a (ENSSLDG00000016719) #23	TRMT1L (ENSSLDG00000016579) #24	ENSSLDG00000016388	ENSSLDG00000016313	ENSSLDG00000016289	ADCYAP1R1 (ENSSLDG00000016253)	ENSSLDG00000016216	ENSSLDG00000016189	ZC3H3 (ENSSLDG00000016166)	mafaa (ENSSLDG00000016154)	atpaf1 (ENSSLDG00000016141)	RHPN1 (ENSSLDG00000016111)	TUT4 (ENSSLDG00000016071)	gpx7 (ENSSLDG00000016054)	ENSSLDG00000016038
Barramundi perch	MODERN SPECIES	12										MAST2 (ENSLCAG00010009380) #14	ENSLCAG00010009351 #16	ENSLCAG00010009348 #17	prrx1b (ENSLCAG00010009338) #18	gorab (ENSLCAG00010009330) #19	ntmt2 (ENSLCAG00010009328) #21	kifap3a (ENSLCAG00010009279) #22	niban1a (ENSLCAG00010009219) #23	TRMT1L (ENSLCAG00010009200) #24	ENSLCAG00010009197 ##9	prpf38a (ENSLCAG00010009186) #25	ENSLCAG00010009176	ENSLCAG00010009173	ENSLCAG00010009169	ENSLCAG00010009157	ENSLCAG00010009145	nrd1b (ENSLCAG00010008718) #28	ENSLCAG00010008609 #27	ENSLCAG00010008606	orc1 (ENSLCAG00010008509) #26	ENSLCAG00010008482	ENSLCAG00010008469
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Ballan wrasse	MODERN SPECIES	595														gorab (ENSLBEG00000003750) #19	ntmt2 (ENSLBEG00000003726) #21	kifap3a (ENSLBEG00000003653) #22	niban1a (ENSLBEG00000003555) #23	TRMT1L (ENSLBEG00000003487) #24	ENSLBEG00000003466 ##9	ENSLBEG00000003450 ##9	orc1 (ENSLBEG00000003383) #26	ENSLBEG00000003362 ##9	ENSLBEG00000003351 ##9
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Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000162747	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a	ENSGT00940000156988	ENSGT00940000159127	ENSGT00950000182946.lb.b.h #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g ##9	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT00940000159943 #27	ENSGT00940000155026.d #28	ENSGT00940000177981	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a #35	ENSGT00940000157668 #33	ENSGT01030000237075	ENSGT00940000155136 #32	ENSGT01030000234837 #31
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000161068	ENSGT00940000162747	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a	ENSGT00940000156988	ENSGT00940000159127	ENSGT00950000182946.lb.b.h #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g ##9	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT00940000159943 #27	ENSGT00940000155026.d #28	ENSGT00940000153421.a.a.a.b	ENSGT00950000183039.B.b.c	ENSGT00950000183111.b.a.b	ENSGT00940000157769	ENSGT00940000156539	ENSGT00390000002505	ENSGT00940000161304.a.a	ENSGT00940000156073.c.b
Stickleback	MODERN SPECIES	8	mafaa (ENSGACG00000005347)	atpaf1 (ENSGACG00000005332)	RHPN1 (ENSGACG00000005320)	ENSGACG00000005282	gpx7 (ENSGACG00000005246)	ENSGACG00000005243 #9	pomgnt1 (ENSGACG00000005215) #10	TSPAN1 (ENSGACG00000005195) #11	PIK3R3 (ENSGACG00000005180) #13	ENSGACG00000005179	MAST2 (ENSGACG00000005151) #14	ENSGACG00000005129 #17	prrx1b (ENSGACG00000005111) #18	gorab (ENSGACG00000005104) #19	ntmt2 (ENSGACG00000005100) #21	kifap3a (ENSGACG00000005088) #22	niban1a (ENSGACG00000005076) #23	TRMT1L (ENSGACG00000005050) #24	ENSGACG00000005049 ##9	MYLK4 (ENSGACG00000005039)	ENSGACG00000005035	gmds (ENSGACG00000005020)	foxc1b (ENSGACG00000005016)	ENSGACG00000005011	foxq1b (ENSGACG00000005009)	exoc2 (ENSGACG00000004977)	ENSGACG00000004966	ENSGACG00000004962	BPHL (ENSGACG00000004957)	ENSGACG00000004955	SLC22A23 (ENSGACG00000004947)
Lumpfish	MODERN SPECIES	19	RHPN1 (ENSCLMG00005003769)	TUT4 (ENSCLMG00005003783)	gpx7 (ENSCLMG00005005048)	ENSCLMG00005005049 #9	pomgnt1 (ENSCLMG00005005057) #10	TSPAN1 (ENSCLMG00005005093) #11	PIK3R3 (ENSCLMG00005005105) #13	ENSCLMG00005006028	MAST2 (ENSCLMG00005006053) #14	ENSCLMG00005008597	ENSCLMG00005008599 #17	ENSCLMG00005008601 #17	prrx1b (ENSCLMG00005008603) #18	ENSCLMG00005008604 #19	ntmt2 (ENSCLMG00005008605) #21	kifap3a (ENSCLMG00005008607) #22	niban1a (ENSCLMG00005008686) #23	TRMT1L (ENSCLMG00005008807) #24	ENSCLMG00005008813 ##9	prpf38a (ENSCLMG00005008823) #25	orc1 (ENSCLMG00005008836) #26	ENSCLMG00005009096 #27	nrd1b (ENSCLMG00005009102) #28	ENSCLMG00005010500	ENSCLMG00005010502	ENSCLMG00005010503	mep1ba (ENSCLMG00005010504)	uhmk1 (ENSCLMG00005010513)	akr1a1b (ENSCLMG00005010518)	ENSCLMG00005010529	SHISAL2A (ENSCLMG00005010532)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000162747	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a	ENSGT00940000156988	ENSGT00940000159127	ENSGT00950000182946.lb.b.h #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g ##9	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT00940000159943 #27	ENSGT00940000155026.d #28	ENSGT00940000177981	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.b ##35	ENSGT00940000157668 #33	ENSGT00940000155136 #32	ENSGT01030000234837 #31	ENSGT00940000154660.b
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	18	atpaf1 (ENSCGOG00000001729)	RHPN1 (ENSCGOG00000001518)	TUT4 (ENSCGOG00000001260)	gpx7 (ENSCGOG00000001250)	ENSCGOG00000001245 #9	TSPAN1 (ENSCGOG00000001243) #11	pomgnt1 (ENSCGOG00000001217) #10	ENSCGOG00000001155 #13	MAST2 (ENSCGOG00000000759) #14	ENSCGOG00000000631	ENSCGOG00000000618 #16	ENSCGOG00000000611 #17	prrx1b (ENSCGOG00000000597) #18	gorab (ENSCGOG00000000591) #19	ntmt2 (ENSCGOG00000000587) #21	kifap3a (ENSCGOG00000000499) #22	niban1a (ENSCGOG00000000421) #23	TRMT1L (ENSCGOG00000000402) #24	prpf38a (ENSCGOG00000000397) #25	ENSCGOG00000000391 ##9	ENSCGOG00000000390 ##9	ENSCGOG00000000387	ENSCGOG00000000386 ##9	ENSCGOG00000000385 ##9	ENSCGOG00000000381 ##9	ENSCGOG00000000376 ##9	ENSCGOG00000000369 ##9	ENSCGOG00000000364 ##9	prpf38a (ENSCGOG00000000361) #25	ENSCGOG00000000355 ##9	ENSCGOG00000000352 ##9
Pike perch	MODERN SPECIES	203										MAST2 (ENSSLUG00000019061) #14	ENSSLUG00000018904 #16	ENSSLUG00000018882 #17	prrx1b (ENSSLUG00000018855) #18	gorab (ENSSLUG00000018848) #19	ntmt2 (ENSSLUG00000018843) #21	kifap3a (ENSSLUG00000016487) #22	niban1a (ENSSLUG00000016372) #23	TRMT1L (ENSSLUG00000016365) #24	zgc:103559 (ENSSLUG00000016348)	ENSSLUG00000016342 ##9	ENSSLUG00000016340 ##9	ENSSLUG00000016339 ##9	ENSSLUG00000016336 ##9	ENSSLUG00000016334 ##9	ENSSLUG00000016332 ##9	ENSSLUG00000016330 ##9	ENSSLUG00000016328 ##9	ENSSLUG00000016326 ##9
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a	ENSGT00940000156988	ENSGT00940000159127	ENSGT00730000114327 #7	ENSGT00950000182946.lb.b.h #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g ##9	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT00940000159943 #27	ENSGT00940000155026.d #28	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.b ##35	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a #35	ENSGT00940000157668 #33	ENSGT00940000155136 #32	ENSGT01030000234837 #31	ENSGT00940000154660.b
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	2	ENSSAUG00010012544 #27	orc1 (ENSSAUG00010012555) #26	ENSSAUG00010012577 #27	prpf38a (ENSSAUG00010012580) #25	ENSSAUG00010012588 ##9	ENSSAUG00010012593 ##9	ENSSAUG00010012596 ##9	pomgnt1 (ENSSAUG00010012601) #10	TSPAN1 (ENSSAUG00010012652) #11	PIK3R3 (ENSSAUG00010012678) #13	MAST2 (ENSSAUG00010013481) #14	ENSSAUG00010007557 #17	prrx1b (ENSSAUG00010007560) #18	gorab (ENSSAUG00010007575) #19	ntmt2 (ENSSAUG00010007576) #21	kifap3a (ENSSAUG00010007590) #22	niban1a (ENSSAUG00010007614) #23	TRMT1L (ENSSAUG00010007735) #24	ENSSAUG00010007843 ##9	ENSSAUG00010007846 #9	ENSSAUG00010007848	TUT4 (ENSSAUG00010007861)	gpx7 (ENSSAUG00010007871)	TUT4 (ENSSAUG00010007879)	ENSSAUG00010007893	ENSSAUG00010007898	ttr (ENSSAUG00010007903)	b4galt6 (ENSSAUG00010007906)	rfc4 (ENSSAUG00010007946)	ENSSAUG00010007959	b3gnt5a (ENSSAUG00010007972)
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a	ENSGT00940000156988	ENSGT00940000159127	ENSGT00730000114327 #7	ENSGT00950000182946.lb.b.h #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g ##9	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT00940000159943 #27	ENSGT00940000155026.d #28	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a #35	ENSGT00940000157668 #33	ENSGT00940000155136 #32	ENSGT01030000234837 #31	ENSGT00940000166794	ENSGT00950000183171.A.b.a.b #30
European seabass	MODERN SPECIES	17	RHPN1 (ENSDLAG00005010260)	ENSDLAG00005010201	ENSDLAG00005010194	ENSDLAG00005031434 #7	ENSDLAG00005010180 #9	pomgnt1 (ENSDLAG00005010107) #10	TSPAN1 (ENSDLAG00005010091) #11	PIK3R3 (ENSDLAG00005009702) #13	MAST2 (ENSDLAG00005007444) #14	ENSDLAG00005007220 #16	ENSDLAG00005030898 #17	prrx1b (ENSDLAG00005026578) #18	ENSDLAG00005029644	gorab (ENSDLAG00005034105) #19	ntmt2 (ENSDLAG00005007122) #21	kifap3a (ENSDLAG00005006960) #22	niban1a (ENSDLAG00005030465) #23	ENSDLAG00005006371 #24	ENSDLAG00005006336 ##9	ENSDLAG00005021756 ##9	ENSDLAG00005027689 ##9	ENSDLAG00005031368 ##9	ENSDLAG00005006324 ##9	ENSDLAG00005021292	ENSDLAG00005030797 #25	ARHGAP8 (ENSDLAG00005026790)	ENSDLAG00005028210	ENSDLAG00005028448	KIAA0930 (ENSDLAG00005005061)	fbxo7 (ENSDLAG00005005176)	ENSDLAG00005028562
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	489	si:ch211-262h13.5 (ENSLCRG00005007588)	ENSLCRG00005006443	gpc1a (ENSLCRG00005006437)	ENSLCRG00005006435	ENSLCRG00005006433 #9	pomgnt1 (ENSLCRG00005006376) #10	TSPAN1 (ENSLCRG00005006351) #11	PIK3R3 (ENSLCRG00005006158) #13	MAST2 (ENSLCRG00005006105) #14	ENSLCRG00005006101 #17	ENSLCRG00005006100	ENSLCRG00005006099 #17	prrx1b (ENSLCRG00005006097) #18	gorab (ENSLCRG00005006096) #19	ntmt2 (ENSLCRG00005006095) #21	kifap3a (ENSLCRG00005005844) #22	niban1a (ENSLCRG00005005824) #23	TRMT1L (ENSLCRG00005005814) #24	ENSLCRG00005005813 ##9	ENSLCRG00005005811 ##9	prpf38a (ENSLCRG00005005809) #25	ENSLCRG00005005808 ##9	orc1 (ENSLCRG00005005729) #26	ENSLCRG00005005722 #27	nrd1b (ENSLCRG00005001392) #28	ENSLCRG00005001356	frem1b (ENSLCRG00005000876)	nfia (ENSLCRG00005011783) #35	tm2d1 (ENSLCRG00005011776) #33	PATJ (ENSLCRG00005011765) #32	ENSLCRG00005011753 #31