Bilateria	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000003574 #22
Chordata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000003574 #22
Vertebrata	ANCESTRAL SPECIES	361															ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	12						ENSGT00940000160168	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00390000004791	ENSGT00930000151043	ENSGT00940000159284	ENSGT00950000183190.a.b.a.b ##16	ENSGT00950000183190.a.a.b #16	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00390000012568	ENSGT00940000156236	ENSGT00390000010743.a	ENSGT01030000234606.b	ENSGT00940000154654	ENSGT00940000173158	ENSGT00530000063843.b	ENSGT00940000158333	ENSGT00950000183179.a	ENSGT00940000158069	ENSGT00940000161173	ENSGT00940000155924.b	ENSGT00530000063604.B	ENSGT00730000111014	ENSGT00530000063751.a
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	84	ENSGT00940000160470	ENSGT00950000183179.a	ENSGT00940000158333	ENSGT00530000063843.b	ENSGT00940000173158	ENSGT00940000154654	ENSGT01030000234606.b	ENSGT00390000010743.a	ENSGT00940000159284	ENSGT00950000183190.a.a.a.a ##16	ENSGT00950000183190.a.a.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00390000014243	ENSGT00940000156012	ENSGT01030000234558.C	ENSGT00390000014781	ENSGT00390000014594	ENSGT00940000159391	ENSGT00940000154149.b.a #23	ENSGT00940000154499	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00390000001254	ENSGT00940000155635	ENSGT00940000154614	ENSGT00530000063751.a	ENSGT00730000111014	ENSGT00390000012568
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	84	ENSGT00940000155924.b	ENSGT00940000161173	ENSGT00940000158069	ENSGT00940000160470	ENSGT00950000183179.a	ENSGT00940000158333	ENSGT00530000063843.b	ENSGT00940000173158	ENSGT00940000159284	ENSGT00950000183190.a.a.a.a ##16	ENSGT00950000183190.a.a.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00940000154149.b.a #23	ENSGT00940000154499	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00390000001254	ENSGT00940000155635	ENSGT00940000154614	ENSGT00940000154654	ENSGT01030000234606.b	ENSGT00390000010743.a	ENSGT00940000156236	ENSGT00390000012568	ENSGT00730000111014	ENSGT00530000063751.a	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	78	ENSGT00940000161173	ENSGT00940000166185	ENSGT00940000158069	ENSGT00940000160470	ENSGT00950000183179.a	ENSGT00940000158333	ENSGT00530000063843.b	ENSGT00940000173158	ENSGT00940000159284	ENSGT00950000183190.a.a.a.a ##16	ENSGT00950000183190.a.a.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00940000154149.b.a #23	ENSGT00940000154499	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00390000001254	ENSGT00940000155635	ENSGT00940000154614	ENSGT00940000154654	ENSGT01030000234606.b	ENSGT00390000010743.a	ENSGT00940000156236	ENSGT00390000012568	ENSGT00730000111014	ENSGT00530000063751.a	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	150								ENSGT00940000156132.g	ENSGT00940000159284	ENSGT00950000183190.a.a.a.a ##16	ENSGT00950000183190.a.a.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00940000154149.b.a.g.a ##23	ENSGT00940000154499	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00390000001254	ENSGT00940000155635	ENSGT00940000154614	ENSGT00940000154654.a.b	ENSGT01030000234606.b.e.b	ENSGT00390000010743.a.a	ENSGT00940000156236.a.a	ENSGT00940000154654.a.a	ENSGT01030000234606.b.e.a	ENSGT00390000010743.a.b	ENSGT00940000156236.b
Clupeocephala	DUPLICATION
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	301														ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00390000001254	ENSGT00940000155635	ENSGT00940000154614	ENSGT00940000154654.a.b	ENSGT01030000234606.b.e.b	ENSGT00390000010743.a.a	ENSGT00940000156236.a.a	ENSGT00730000111014.o.b	ENSGT00530000063751.a.a	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000160168.b.b
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	70	ENSGT00510000048988	ENSGT00940000157693	ENSGT00940000166530	ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00940000155705.a.a ##14	ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.a ##16	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00390000001254	ENSGT00940000155635	ENSGT00940000154614	ENSGT00940000154654.a.b	ENSGT01030000234606.b.e.b	ENSGT00390000010743.a.a	ENSGT00940000156236.a.a	ENSGT00730000111014.o.b	ENSGT00530000063751.a.a
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	91		ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00950000182946.lb.b #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00940000155705.a.a ##14	ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.a ##16	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00390000001254	ENSGT00940000155635	ENSGT00940000154614	ENSGT00940000154654.a.b	ENSGT01030000234606.b.e.b	ENSGT00390000010743.a.a	ENSGT00940000156236.a.a	ENSGT00730000111014.o.b	ENSGT00530000063751.a.a	ENSGT00940000160489	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	59				ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00950000182946.lb.b #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00390000001254	ENSGT00940000155635	ENSGT00940000154614	ENSGT00940000154654.a.b	ENSGT01030000234606.b.e.b	ENSGT00390000010743.a.a	ENSGT00940000156236.a.a	ENSGT00730000111014.o.b	ENSGT00530000063751.a.a	ENSGT00940000160489	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	52	ENSGT00940000162747	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a	ENSGT00940000156988	ENSGT00940000159127	ENSGT00950000182946.lb.b.h #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g ##9	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00530000063498.B #26
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000153837.a.a	ENSGT00940000156988	ENSGT00940000180612	ENSGT00940000159127	ENSGT00950000182946.lb.b.h #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT01100000263594.b	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g ##9	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00530000063498.B #26
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Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000156988	ENSGT00940000180612	ENSGT00940000159127	ENSGT00730000114327 #7	ENSGT00950000182946.lb.b.h #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT01100000263594.b	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g ##9	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT00940000159943 #27	ENSGT00940000155026.d #28	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000177981	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a #35	ENSGT00940000157668 #33	ENSGT00940000155136 #32	ENSGT01030000234837 #31	ENSGT00940000166794
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Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a	ENSGT00940000156988	ENSGT00940000159127	ENSGT00730000114327 #7	ENSGT00950000182946.lb.b.h #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT00940000159943 #27	ENSGT00940000155026.d #28	ENSGT00940000177981	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000159037 #29	ENSGT00950000183171.A.b.a.b #30	ENSGT00940000166794	ENSGT01030000234837 #31	ENSGT00940000155136 #32	ENSGT00940000157668 #33	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a #35
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Zig-zag eel	MODERN SPECIES	18	RHPN1 (ENSMAMG00000014859)	ENSMAMG00000014890	ENSMAMG00000014948	ENSMAMG00000015400 #7	ENSMAMG00000014977 #9	pomgnt1 (ENSMAMG00000014990) #10	TSPAN1 (ENSMAMG00000015037) #11	PIK3R3 (ENSMAMG00000015060) #13	MAST2 (ENSMAMG00000015099) #14	ENSMAMG00000015160 #17	ENSMAMG00000015165 #16	ENSMAMG00000015173 #17	prrx1b (ENSMAMG00000015198) #18	gorab (ENSMAMG00000024412) #19	ntmt2 (ENSMAMG00000015231) #21	kifap3a (ENSMAMG00000015251) #22	niban1a (ENSMAMG00000015296) #23	ENSMAMG00000015305 #24	ENSMAMG00000027044 #7	ENSMAMG00000026330 ##9	ENSMAMG00000015431 #25	ENSMAMG00000015463 #26	ENSMAMG00000015518	ENSMAMG00000015485	ENSMAMG00000015528	reep6 (ENSMAMG00000015545)	zgc:113223 (ENSMAMG00000015567)	ENSMAMG00000015587	SLC39A3 (ENSMAMG00000015606) #37	ENSMAMG00000015621 #29	THOP1 (ENSMAMG00000015663) #30
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000153837.a.a	ENSGT00940000156988	ENSGT00940000180612	ENSGT00940000159127	ENSGT00730000114327 #7	ENSGT00950000182946.lb.b.h #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT01100000263594.b	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g ##9	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT00940000159943 #27	ENSGT00940000155026.d #28	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a #35	ENSGT00940000157668 #33	ENSGT00940000155136 #32	ENSGT01030000234837 #31	ENSGT00940000166794	ENSGT00950000183171.A.b.a.b #30
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Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3176	ENSSLDG00000017469	ENSSLDG00000017453	NOS1AP (ENSSLDG00000017424)	ENSSLDG00000017410	ENSSLDG00000017392	pycr3 (ENSSLDG00000017378)	bmb (ENSSLDG00000017363)	SERPINB1 (ENSSLDG00000017322)	GFUS (ENSSLDG00000016998)	SERPINB1 (ENSSLDG00000016912)	ENSSLDG00000016881 #16	ENSSLDG00000016872	prrx1b (ENSSLDG00000016851) #18	gorab (ENSSLDG00000016829) #19	ntmt2 (ENSSLDG00000016809) #21	kifap3a (ENSSLDG00000016743) #22	niban1a (ENSSLDG00000016719) #23	TRMT1L (ENSSLDG00000016579) #24	ENSSLDG00000016388	ENSSLDG00000016313	ENSSLDG00000016289	ADCYAP1R1 (ENSSLDG00000016253)	ENSSLDG00000016216	ENSSLDG00000016189	ZC3H3 (ENSSLDG00000016166)	mafaa (ENSSLDG00000016154)	atpaf1 (ENSSLDG00000016141)	RHPN1 (ENSSLDG00000016111)	TUT4 (ENSSLDG00000016071)	gpx7 (ENSSLDG00000016054)	ENSSLDG00000016038
Barramundi perch	MODERN SPECIES	12										MAST2 (ENSLCAG00010009380) #14	ENSLCAG00010009351 #16	ENSLCAG00010009348 #17	prrx1b (ENSLCAG00010009338) #18	gorab (ENSLCAG00010009330) #19	ntmt2 (ENSLCAG00010009328) #21	kifap3a (ENSLCAG00010009279) #22	niban1a (ENSLCAG00010009219) #23	TRMT1L (ENSLCAG00010009200) #24	ENSLCAG00010009197 ##9	prpf38a (ENSLCAG00010009186) #25	ENSLCAG00010009176	ENSLCAG00010009173	ENSLCAG00010009169	ENSLCAG00010009157	ENSLCAG00010009145	nrd1b (ENSLCAG00010008718) #28	ENSLCAG00010008609 #27	ENSLCAG00010008606	orc1 (ENSLCAG00010008509) #26	ENSLCAG00010008482	ENSLCAG00010008469
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Ballan wrasse	MODERN SPECIES	595														gorab (ENSLBEG00000003750) #19	ntmt2 (ENSLBEG00000003726) #21	kifap3a (ENSLBEG00000003653) #22	niban1a (ENSLBEG00000003555) #23	TRMT1L (ENSLBEG00000003487) #24	ENSLBEG00000003466 ##9	ENSLBEG00000003450 ##9	orc1 (ENSLBEG00000003383) #26	ENSLBEG00000003362 ##9	ENSLBEG00000003351 ##9
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Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000162747	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a	ENSGT00940000156988	ENSGT00940000159127	ENSGT00950000182946.lb.b.h #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g ##9	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT00940000159943 #27	ENSGT00940000155026.d #28	ENSGT00940000177981	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a #35	ENSGT00940000157668 #33	ENSGT01030000237075	ENSGT00940000155136 #32	ENSGT01030000234837 #31
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000161068	ENSGT00940000162747	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a	ENSGT00940000156988	ENSGT00940000159127	ENSGT00950000182946.lb.b.h #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g ##9	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT00940000159943 #27	ENSGT00940000155026.d #28	ENSGT00940000153421.a.a.a.b	ENSGT00950000183039.B.b.c	ENSGT00950000183111.b.a.b	ENSGT00940000157769	ENSGT00940000156539	ENSGT00390000002505	ENSGT00940000161304.a.a	ENSGT00940000156073.c.b
Stickleback	MODERN SPECIES	8	mafaa (ENSGACG00000005347)	atpaf1 (ENSGACG00000005332)	RHPN1 (ENSGACG00000005320)	ENSGACG00000005282	gpx7 (ENSGACG00000005246)	ENSGACG00000005243 #9	pomgnt1 (ENSGACG00000005215) #10	TSPAN1 (ENSGACG00000005195) #11	PIK3R3 (ENSGACG00000005180) #13	ENSGACG00000005179	MAST2 (ENSGACG00000005151) #14	ENSGACG00000005129 #17	prrx1b (ENSGACG00000005111) #18	gorab (ENSGACG00000005104) #19	ntmt2 (ENSGACG00000005100) #21	kifap3a (ENSGACG00000005088) #22	niban1a (ENSGACG00000005076) #23	TRMT1L (ENSGACG00000005050) #24	ENSGACG00000005049 ##9	MYLK4 (ENSGACG00000005039)	ENSGACG00000005035	gmds (ENSGACG00000005020)	foxc1b (ENSGACG00000005016)	ENSGACG00000005011	foxq1b (ENSGACG00000005009)	exoc2 (ENSGACG00000004977)	ENSGACG00000004966	ENSGACG00000004962	BPHL (ENSGACG00000004957)	ENSGACG00000004955	SLC22A23 (ENSGACG00000004947)
Lumpfish	MODERN SPECIES	19	RHPN1 (ENSCLMG00005003769)	TUT4 (ENSCLMG00005003783)	gpx7 (ENSCLMG00005005048)	ENSCLMG00005005049 #9	pomgnt1 (ENSCLMG00005005057) #10	TSPAN1 (ENSCLMG00005005093) #11	PIK3R3 (ENSCLMG00005005105) #13	ENSCLMG00005006028	MAST2 (ENSCLMG00005006053) #14	ENSCLMG00005008597	ENSCLMG00005008599 #17	ENSCLMG00005008601 #17	prrx1b (ENSCLMG00005008603) #18	ENSCLMG00005008604 #19	ntmt2 (ENSCLMG00005008605) #21	kifap3a (ENSCLMG00005008607) #22	niban1a (ENSCLMG00005008686) #23	TRMT1L (ENSCLMG00005008807) #24	ENSCLMG00005008813 ##9	prpf38a (ENSCLMG00005008823) #25	orc1 (ENSCLMG00005008836) #26	ENSCLMG00005009096 #27	nrd1b (ENSCLMG00005009102) #28	ENSCLMG00005010500	ENSCLMG00005010502	ENSCLMG00005010503	mep1ba (ENSCLMG00005010504)	uhmk1 (ENSCLMG00005010513)	akr1a1b (ENSCLMG00005010518)	ENSCLMG00005010529	SHISAL2A (ENSCLMG00005010532)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000162747	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a	ENSGT00940000156988	ENSGT00940000159127	ENSGT00950000182946.lb.b.h #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g ##9	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT00940000159943 #27	ENSGT00940000155026.d #28	ENSGT00940000177981	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.b ##35	ENSGT00940000157668 #33	ENSGT00940000155136 #32	ENSGT01030000234837 #31	ENSGT00940000154660.b
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	18	atpaf1 (ENSCGOG00000001729)	RHPN1 (ENSCGOG00000001518)	TUT4 (ENSCGOG00000001260)	gpx7 (ENSCGOG00000001250)	ENSCGOG00000001245 #9	TSPAN1 (ENSCGOG00000001243) #11	pomgnt1 (ENSCGOG00000001217) #10	ENSCGOG00000001155 #13	MAST2 (ENSCGOG00000000759) #14	ENSCGOG00000000631	ENSCGOG00000000618 #16	ENSCGOG00000000611 #17	prrx1b (ENSCGOG00000000597) #18	gorab (ENSCGOG00000000591) #19	ntmt2 (ENSCGOG00000000587) #21	kifap3a (ENSCGOG00000000499) #22	niban1a (ENSCGOG00000000421) #23	TRMT1L (ENSCGOG00000000402) #24	prpf38a (ENSCGOG00000000397) #25	ENSCGOG00000000391 ##9	ENSCGOG00000000390 ##9	ENSCGOG00000000387	ENSCGOG00000000386 ##9	ENSCGOG00000000385 ##9	ENSCGOG00000000381 ##9	ENSCGOG00000000376 ##9	ENSCGOG00000000369 ##9	ENSCGOG00000000364 ##9	prpf38a (ENSCGOG00000000361) #25	ENSCGOG00000000355 ##9	ENSCGOG00000000352 ##9
Pike perch	MODERN SPECIES	203										MAST2 (ENSSLUG00000019061) #14	ENSSLUG00000018904 #16	ENSSLUG00000018882 #17	prrx1b (ENSSLUG00000018855) #18	gorab (ENSSLUG00000018848) #19	ntmt2 (ENSSLUG00000018843) #21	kifap3a (ENSSLUG00000016487) #22	niban1a (ENSSLUG00000016372) #23	TRMT1L (ENSSLUG00000016365) #24	zgc:103559 (ENSSLUG00000016348)	ENSSLUG00000016342 ##9	ENSSLUG00000016340 ##9	ENSSLUG00000016339 ##9	ENSSLUG00000016336 ##9	ENSSLUG00000016334 ##9	ENSSLUG00000016332 ##9	ENSSLUG00000016330 ##9	ENSSLUG00000016328 ##9	ENSSLUG00000016326 ##9
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a	ENSGT00940000156988	ENSGT00940000159127	ENSGT00730000114327 #7	ENSGT00950000182946.lb.b.h #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g ##9	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT00940000159943 #27	ENSGT00940000155026.d #28	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.b ##35	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a #35	ENSGT00940000157668 #33	ENSGT00940000155136 #32	ENSGT01030000234837 #31	ENSGT00940000154660.b
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	2	ENSSAUG00010012544 #27	orc1 (ENSSAUG00010012555) #26	ENSSAUG00010012577 #27	prpf38a (ENSSAUG00010012580) #25	ENSSAUG00010012588 ##9	ENSSAUG00010012593 ##9	ENSSAUG00010012596 ##9	pomgnt1 (ENSSAUG00010012601) #10	TSPAN1 (ENSSAUG00010012652) #11	PIK3R3 (ENSSAUG00010012678) #13	MAST2 (ENSSAUG00010013481) #14	ENSSAUG00010007557 #17	prrx1b (ENSSAUG00010007560) #18	gorab (ENSSAUG00010007575) #19	ntmt2 (ENSSAUG00010007576) #21	kifap3a (ENSSAUG00010007590) #22	niban1a (ENSSAUG00010007614) #23	TRMT1L (ENSSAUG00010007735) #24	ENSSAUG00010007843 ##9	ENSSAUG00010007846 #9	ENSSAUG00010007848	TUT4 (ENSSAUG00010007861)	gpx7 (ENSSAUG00010007871)	TUT4 (ENSSAUG00010007879)	ENSSAUG00010007893	ENSSAUG00010007898	ttr (ENSSAUG00010007903)	b4galt6 (ENSSAUG00010007906)	rfc4 (ENSSAUG00010007946)	ENSSAUG00010007959	b3gnt5a (ENSSAUG00010007972)
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a	ENSGT00940000156988	ENSGT00940000159127	ENSGT00730000114327 #7	ENSGT00950000182946.lb.b.h #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g ##9	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT00940000159943 #27	ENSGT00940000155026.d #28	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a #35	ENSGT00940000157668 #33	ENSGT00940000155136 #32	ENSGT01030000234837 #31	ENSGT00940000166794	ENSGT00950000183171.A.b.a.b #30
European seabass	MODERN SPECIES	17	RHPN1 (ENSDLAG00005010260)	ENSDLAG00005010201	ENSDLAG00005010194	ENSDLAG00005031434 #7	ENSDLAG00005010180 #9	pomgnt1 (ENSDLAG00005010107) #10	TSPAN1 (ENSDLAG00005010091) #11	PIK3R3 (ENSDLAG00005009702) #13	MAST2 (ENSDLAG00005007444) #14	ENSDLAG00005007220 #16	ENSDLAG00005030898 #17	prrx1b (ENSDLAG00005026578) #18	ENSDLAG00005029644	gorab (ENSDLAG00005034105) #19	ntmt2 (ENSDLAG00005007122) #21	kifap3a (ENSDLAG00005006960) #22	niban1a (ENSDLAG00005030465) #23	ENSDLAG00005006371 #24	ENSDLAG00005006336 ##9	ENSDLAG00005021756 ##9	ENSDLAG00005027689 ##9	ENSDLAG00005031368 ##9	ENSDLAG00005006324 ##9	ENSDLAG00005021292	ENSDLAG00005030797 #25	ARHGAP8 (ENSDLAG00005026790)	ENSDLAG00005028210	ENSDLAG00005028448	KIAA0930 (ENSDLAG00005005061)	fbxo7 (ENSDLAG00005005176)	ENSDLAG00005028562
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	489	si:ch211-262h13.5 (ENSLCRG00005007588)	ENSLCRG00005006443	gpc1a (ENSLCRG00005006437)	ENSLCRG00005006435	ENSLCRG00005006433 #9	pomgnt1 (ENSLCRG00005006376) #10	TSPAN1 (ENSLCRG00005006351) #11	PIK3R3 (ENSLCRG00005006158) #13	MAST2 (ENSLCRG00005006105) #14	ENSLCRG00005006101 #17	ENSLCRG00005006100	ENSLCRG00005006099 #17	prrx1b (ENSLCRG00005006097) #18	gorab (ENSLCRG00005006096) #19	ntmt2 (ENSLCRG00005006095) #21	kifap3a (ENSLCRG00005005844) #22	niban1a (ENSLCRG00005005824) #23	TRMT1L (ENSLCRG00005005814) #24	ENSLCRG00005005813 ##9	ENSLCRG00005005811 ##9	prpf38a (ENSLCRG00005005809) #25	ENSLCRG00005005808 ##9	orc1 (ENSLCRG00005005729) #26	ENSLCRG00005005722 #27	nrd1b (ENSLCRG00005001392) #28	ENSLCRG00005001356	frem1b (ENSLCRG00005000876)	nfia (ENSLCRG00005011783) #35	tm2d1 (ENSLCRG00005011776) #33	PATJ (ENSLCRG00005011765) #32	ENSLCRG00005011753 #31
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000153837.a.a	ENSGT00940000156988	ENSGT00940000180612	ENSGT00940000159127	ENSGT00950000182946.lb.b.h #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT01100000263594.b	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g ##9	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00530000063498.B #26
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Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	184					ENSGT00950000182946.lb.b.g.w ##9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT01050000245196	ENSGT00940000175770	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT01100000263594.b	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	280	sgta (ENSKMAG00000010962) #29	ENSKMAG00000010923	zgc:113223 (ENSKMAG00000010909)	ENSKMAG00000010903	ENSKMAG00000010888 ##9	pomgnt1 (ENSKMAG00000010794) #10	TSPAN1 (ENSKMAG00000010749) #11	PIK3R3 (ENSKMAG00000010703) ##13	MAST2 (ENSKMAG00000010659) #14	ENSKMAG00000010625	ENSKMAG00000010569 #16	ENSKMAG00000010538	prrx1b (ENSKMAG00000010521) #18	gorab (ENSKMAG00000010496) #19	ntmt2 (ENSKMAG00000010477) #21	kifap3a (ENSKMAG00000010433) #22	niban1a (ENSKMAG00000010363) #23	TRMT1L (ENSKMAG00000010310) #24	ENSKMAG00000010296	ENSKMAG00000010287 ##9
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	67					ENSGT00950000182946.lb.b.h #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT01100000263594.b	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00530000063498.B #26
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	90						ENSGT00950000182946.lb.b.h #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000158019
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000155265.b.b.b	ENSGT00940000155265.b.b.a	ENSGT00940000164676	ENSGT00940000153456.a	ENSGT00390000011521	ENSGT00950000182946.lb.b.h #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000158019	ENSGT01050000244924.a.a.b.a.a	ENSGT00390000007310	ENSGT00940000157967	ENSGT00940000159554	ENSGT01050000244887.A.a.b	ENSGT00390000010568	ENSGT00940000159571	ENSGT00940000156511.b.db	ENSGT00940000155899.e.a
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000155265.b.b.a	ENSGT00940000164676	ENSGT00940000153456.a	ENSGT00390000011521	ENSGT00950000182946.lb.b.h #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT01100000263594.b	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000158019	ENSGT01050000244924.a.a.b.a.a	ENSGT00390000007310	ENSGT00940000157967	ENSGT00940000159554	ENSGT01050000244887.A.a.b	ENSGT00390000010568	ENSGT00940000159571	ENSGT00940000156511.b.db	ENSGT00940000155899.e.a
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000155265.b.b.b	ENSGT00940000155265.b.b.a	ENSGT00940000164676	ENSGT00940000153456.a	ENSGT00390000011521	ENSGT00950000182946.lb.b.h #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #14	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT01100000263594.b	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00730000111085.A #25	ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000158019	ENSGT01050000244924.a.a.b.a.a	ENSGT00390000007310	ENSGT00940000157967	ENSGT00940000159554	ENSGT01050000244887.A.a.b	ENSGT00390000010568	ENSGT00940000159571	ENSGT00940000156511.b.db	ENSGT00940000155899.e.a
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	493								PIK3R3 (ENSHBUG00000020098) #13	ENSHBUG00000020193 #14	ENSHBUG00000020235 #14	ENSHBUG00000020249 #16	ENSHBUG00000020264	prrx1b (ENSHBUG00000020291) #18	gorab (ENSHBUG00000020307) #19	ntmt2 (ENSHBUG00000020336) #21	kifap3a (ENSHBUG00000020394) #22	niban1a (ENSHBUG00000020416) #23	ENSHBUG00000020432	TRMT1L (ENSHBUG00000000622) #24	prpf38a (ENSHBUG00000020572) #25	orc1 (ENSHBUG00000020582) #26	arl13b (ENSHBUG00000020619)	GGACT (ENSHBUG00000020632)	ENSHBUG00000020644	GGACT (ENSHBUG00000020671)	GGACT (ENSHBUG00000000819)	FARP1 (ENSHBUG00000020744)	chn1 (ENSHBUG00000020827)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	395	ENSNBRG00000005173	ENSNBRG00000005036	ENSNBRG00000004922	naprt (ENSNBRG00000004897)	C8orf82 (ENSNBRG00000004885)	ifit14 (ENSNBRG00000004880) #9	pomgnt1 (ENSNBRG00000004816) #10	TSPAN1 (ENSNBRG00000004720) #11	PIK3R3 (ENSNBRG00000004658) #13	MAST2 (ENSNBRG00000004570) #14	ENSNBRG00000004539 #17	ENSNBRG00000004532 #17	prrx1b (ENSNBRG00000004459) #18	gorab (ENSNBRG00000004446) #19	ntmt2 (ENSNBRG00000004426) #21	kifap3a (ENSNBRG00000004237) #22	niban1a (ENSNBRG00000004158) #23	TRMT1L (ENSNBRG00000004053) #24	prpf38a (ENSNBRG00000004013) #25	orc1 (ENSNBRG00000003807) #26	ENSNBRG00000003752	b4galt6 (ENSNBRG00000003712)	PTBP1 (ENSNBRG00000003676)	stil (ENSNBRG00000003594)	serpinc1 (ENSNBRG00000003451)	ENSNBRG00000003414	zbtb37 (ENSNBRG00000003403)	s1pr1 (ENSNBRG00000003385)	dph5 (ENSNBRG00000003361)	slc30a7 (ENSNBRG00000003233)	vcam1b (ENSNBRG00000003191)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	8	ENSONIG00000019474	ENSONIG00000019475	ENSONIG00000019477	naprt (ENSONIG00000019479)	C8orf82 (ENSONIG00000019480)	ENSONIG00000020776 #9	pomgnt1 (ENSONIG00000007857) #10	TSPAN1 (ENSONIG00000007856) #11	PIK3R3 (ENSONIG00000007853) #13	MAST2 (ENSONIG00000007847) #14	ENSONIG00000007844 #16	ENSONIG00000039886 #17	prrx1b (ENSONIG00000007843) #18	gorab (ENSONIG00000007842) #19	ntmt2 (ENSONIG00000007840) #21	kifap3a (ENSONIG00000007836) #22	fam129a (ENSONIG00000007826) #23	TRMT1L (ENSONIG00000007823) #24	prpf38a (ENSONIG00000007816) #25	ENSONIG00000007813	orc1 (ENSONIG00000007807) #26	ENSONIG00000007798	b4galt6 (ENSONIG00000007793)	PTBP1 (ENSONIG00000007784)	serpinc1 (ENSONIG00000007781)	zbtb37 (ENSONIG00000007779)	s1pr1 (ENSONIG00000020775)	dph5 (ENSONIG00000007778)	slc30a7 (ENSONIG00000007772)	ENSONIG00000035983	cdc14ab (ENSONIG00000007763)
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	141	psmg2 (ENSHCOG00000000861)	zgc:136493 (ENSHCOG00000003284)	ncaldb (ENSHCOG00000003277)	grhl2b (ENSHCOG00000003264)	znf706 (ENSHCOG00000003228)	ywhaz (ENSHCOG00000003217)	ENSHCOG00000003175	ENSHCOG00000003023	LIX1L (ENSHCOG00000003020)	sf3b4 (ENSHCOG00000003014)	ENSHCOG00000003007	SV2A (ENSHCOG00000003000)	ENSHCOG00000002979	tbxta (ENSHCOG00000002972)	nudc (ENSHCOG00000002958)	kifap3a (ENSHCOG00000002941) #22	ENSHCOG00000002934	zdhhc18b (ENSHCOG00000000084)	arhgef1a (ENSHCOG00000002904)	tpm3 (ENSHCOG00000002823)	ENSHCOG00000002818	ssr2 (ENSHCOG00000002806)	ENSHCOG00000002785	ENSHCOG00000002776	si:dkey-81h8.1 (ENSHCOG00000002751)	ENSHCOG00000002744	ENSHCOG00000002729	rps27.1 (ENSHCOG00000002726)	ENSHCOG00000002715	chrna11 (ENSHCOG00000002691)	snx27a (ENSHCOG00000002675)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	18	bmb (ENSMMDG00005014575)	pycr3 (ENSMMDG00005014576)	ENSMMDG00005014580	ENSMMDG00005014656 #7	orc1 (ENSMMDG00005014662) #26	prpf38a (ENSMMDG00005014677) #25	ifit15 (ENSMMDG00005014678) #9	pomgnt1 (ENSMMDG00005014683) #10	TSPAN1 (ENSMMDG00005014716) #11	PIK3R3 (ENSMMDG00005014769) #13	MAST2 (ENSMMDG00005015365) #14	ENSMMDG00005015432 #16	prrx1b (ENSMMDG00005015436) #18	gorab (ENSMMDG00005015441) #19	ntmt2 (ENSMMDG00005015445) #21	kifap3a (ENSMMDG00005015465) #22	niban1a (ENSMMDG00005015756) #23	TRMT1L (ENSMMDG00005000167) #24	ENSMMDG00005000317	ivns1abpa (ENSMMDG00005000333)	arpc5b (ENSMMDG00005000422)	PLA2G4A (ENSMMDG00005000444)	ptgs2b (ENSMMDG00005000495)	pdcb (ENSMMDG00005000506)	tprb (ENSMMDG00005000569)	prg4b (ENSMMDG00005000699)	FCHO1 (ENSMMDG00005000756)	rfx2 (ENSMMDG00005001128)	acsbg2 (ENSMMDG00005001835)	mllt1b (ENSMMDG00005004422)	acer1 (ENSMMDG00005004436)
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Protacanthopterygii	DUPLICATION
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Huchen	MODERN SPECIES	2440													prrx1b (ENSHHUG00000045823) #18	gorab (ENSHHUG00000045837) #19	ntmt2 (ENSHHUG00000045841) #21	kifap3a (ENSHHUG00000045847) #22	ENSHHUG00000045861 #23	ENSHHUG00000045867 #23
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Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000003015.c.c	ENSGT00940000166725.j	ENSGT00940000173535	ENSGT00940000157693.p	ENSGT00940000166530.d	ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT00730000111085.A.gb #25	ENSGT00950000182946.lb.b.k.a.b #9	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a.d #13	ENSGT00940000155705.b.v #14	ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.a.a ##16	ENSGT00940000159466.e.a #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a.c #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b.d #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00390000001254	ENSGT00940000155635.q	ENSGT00940000154614.le	ENSGT00940000154654.a.b	ENSGT01030000234606.b.e.b.h	ENSGT00390000010743.a.a.f	ENSGT00940000156236.a.a	ENSGT00390000012568.l	ENSGT00940000155117.f.a.g	ENSGT00940000154967.b.b.b.d	ENSGT00560000077332	ENSGT00940000155152.f.b.g.b	ENSGT00940000156725.e.b
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Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	63	ENSGT00620000088018.v.b	ENSGT00390000003015.c.c	ENSGT00940000166725.j	ENSGT00940000157693.p	ENSGT00940000166530.d	ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT00730000111085.A.gb #25	ENSGT00950000182946.lb.b.k.a.b #9	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a.d #13	ENSGT00940000155705.b.v #14	ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.a.a ##16	ENSGT00940000159466.e.a #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a.c #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b.d #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00390000001254	ENSGT00940000155635.q	ENSGT00940000154614.le	ENSGT00940000154654.a.b	ENSGT01030000234606.b.e.b.h	ENSGT00390000010743.a.a.f	ENSGT00940000156236.a.a	ENSGT00390000012568.l	ENSGT00940000155117.f.a.g	ENSGT00940000154967.b.b.b.d	ENSGT00560000077332	ENSGT00940000155152.f.b.g.b	ENSGT00940000156725.e.b
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Salmo	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000003015.c.c	ENSGT00940000166725.j	ENSGT00940000173535	ENSGT00940000157693.p	ENSGT00940000166530.d	ENSGT00530000063498.B #26	ENSGT00730000111085.A.gb #25	ENSGT00950000182946.lb.b.k.a.b #9	ENSGT00940000158851 #11	ENSGT00940000156259.a.a.d #13	ENSGT00940000155705.b.v #14	ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.a.a ##16	ENSGT00940000159466.e.a #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a.c #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b.d #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00390000001254	ENSGT00940000155635.q	ENSGT00940000154614.le	ENSGT00940000154654.a.b.f	ENSGT01030000234606.b.e.b.h	ENSGT00390000010743.a.a.f	ENSGT00940000156236.a.a	ENSGT00940000155117.f.a.g	ENSGT00940000154967.b.b.a	ENSGT00970000198334.C	ENSGT00940000154967.b.b.b	ENSGT00560000077332	ENSGT00940000155152.f.b.g.a.a
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Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000003574.a.d #22
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Huchen	MODERN SPECIES	755														ENSHHUG00000009317 #17	prrx1b (ENSHHUG00000009326) #18	kifap3a (ENSHHUG00000009409) #22	niban1a (ENSHHUG00000009454) #23	ivns1abpa (ENSHHUG00000009468)	PLA2G4A (ENSHHUG00000009516)	ptgs2b (ENSHHUG00000009695)
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	103	ENSGT01030000235036	ENSGT00390000003015.c.d	ENSGT00940000166725.i	ENSGT01030000234931	ENSGT00510000048988	ENSGT00940000157693.o	ENSGT00940000166530.c	ENSGT00730000111085.A.fb #25	ENSGT00950000182946.lb.b.k.a.a #9	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000156259.a.a.c #13	ENSGT00940000155705.b.u #14	ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.a.b ##16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b.c #17	ENSGT00940000159466.e.b #18	ENSGT00390000003574.a.d #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b.c #23	ENSGT00940000155635.r	ENSGT01030000234606.b.e.b.g	ENSGT00390000010743.a.a.e	ENSGT00940000155117.f.a.h	ENSGT00940000155152.f.b.h	ENSGT00940000156725.e.a	ENSGT00940000158821.k	ENSGT00940000155446.g	ENSGT00390000007336.a.a.c	ENSGT00390000007029.e.a.b	ENSGT00940000157019.g.a.h	ENSGT00940000160748.a.d	ENSGT00390000000263.b	ENSGT00950000183070.a.a.mb.b.f
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River trout	MODERN SPECIES	33	ebna1bp2 (ENSSTUG00000008168)	CFAP57 (ENSSTUG00000008107)	TMEM125 (ENSSTUG00000008099)	ap1m3 (ENSSTUG00000006631)	C1orf210 (ENSSTUG00000006574)	tie1 (ENSSTUG00000005979)	mpl (ENSSTUG00000005928)	prpf38a (ENSSTUG00000005917) #25	ENSSTUG00000005913 #9	pomgnt1 (ENSSTUG00000005824) #10	PIK3R3 (ENSSTUG00000004411) #13	MAST2 (ENSSTUG00000004246) #14	ENSSTUG00000004176 ##16	ENSSTUG00000004149 #17	prrx1b (ENSSTUG00000004069) #18	kifap3a (ENSSTUG00000002766) #22	niban1a (ENSSTUG00000002614) #23	ivns1abpa (ENSSTUG00000002544)	arpc5b (ENSSTUG00000002513)	PLA2G4A (ENSSTUG00000001927)	ptgs2b (ENSSTUG00000001191)	b3galt2 (ENSSTUG00000001121)	crb1 (ENSSTUG00000001111)	nek7 (ENSSTUG00000000907)	lhx9 (ENSSTUG00000000861)	ENSSTUG00000000854	DENND1B (ENSSTUG00000000837)	ABHD8 (ENSSTUG00000000828)	dda1 (ENSSTUG00000000812)	ANO8 (ENSSTUG00000000647)	pde6d (ENSSTUG00000000605)
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Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000014984.q	ENSGT00620000088018.v.a	ENSGT01030000235036	ENSGT00390000003015.c.d	ENSGT00940000166725.i	ENSGT01030000234931	ENSGT00940000157693.o	ENSGT00940000166530.c	ENSGT00730000111085.A.fb #25	ENSGT00530000063632.A #10	ENSGT00940000156259.a.a.c #13	ENSGT00940000155705.b.u #14	ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.a.b ##16	ENSGT00940000159466.e.b #18	ENSGT01010000229774	ENSGT00390000003574.a.d #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b.c #23	ENSGT00940000155635.r	ENSGT01030000234606.b.e.b.g	ENSGT00390000010743.a.a.e	ENSGT00940000155152.f.b.h	ENSGT00940000156725.e.a	ENSGT00940000158821.k	ENSGT00940000155446.g	ENSGT00390000007336.a.a.c	ENSGT00390000007029.e.a.b	ENSGT00940000157019.g.a.h	ENSGT00940000160748.a.d	ENSGT00390000000263.b	ENSGT00950000183070.a.a.mb.b.f	ENSGT00980000198724
Coho salmon	MODERN SPECIES	1	ebna1bp2 (ENSOKIG00005004146)	CFAP57 (ENSOKIG00005004165)	ENSOKIG00005004187	TMEM125 (ENSOKIG00005004199)	ap1m3 (ENSOKIG00005004338)	ENSOKIG00005004696	tie1 (ENSOKIG00005004729)	mpl (ENSOKIG00005005163)	prpf38a (ENSOKIG00005005206) #25	pomgnt1 (ENSOKIG00005005244) #10	ENSOKIG00005005364 #13	MAST2 (ENSOKIG00005006912) #14	ENSOKIG00005008304 ##16	PRRX1 (ENSOKIG00005008357) #18	ENSOKIG00005008408	KIFAP3 (ENSOKIG00005008466) #22	ENSOKIG00005008659	NIBAN1 (ENSOKIG00005008670) #23	ivns1abpa (ENSOKIG00005008870)	ENSOKIG00005008894	PLA2G4A (ENSOKIG00005008974)	ptgs2b (ENSOKIG00005010606)	ENSOKIG00005010807	ENSOKIG00005010819	LHX9 (ENSOKIG00005010851)	DENND1B (ENSOKIG00005011000)	ABHD8 (ENSOKIG00005011045)	DDA1 (ENSOKIG00005011055)	ANO8 (ENSOKIG00005011092)	nr2f6b (ENSOKIG00005011192)	ENSOKIG00005011206
Chinook salmon	MODERN SPECIES		cfap144 (ENSOTSG00005013038)	ebna1bp2 (ENSOTSG00005013039)	CFAP57 (ENSOTSG00005013041)	ENSOTSG00005013047	TMEM125 (ENSOTSG00005013048)	ap1m3 (ENSOTSG00005013055)	ENSOTSG00005014171	tie1 (ENSOTSG00005014172)	mpl (ENSOTSG00005014182)	prpf38a (ENSOTSG00005014183) #25	pomgnt1 (ENSOTSG00005014187) #10	ENSOTSG00005014210	ENSOTSG00005014213 #13	ENSOTSG00005014483 ##16	prrx1b (ENSOTSG00005014500) #18	kifap3a (ENSOTSG00005014519) #22	niban1a (ENSOTSG00005023747) #23	ivns1abpa (ENSOTSG00005023749)	PLA2G4A (ENSOTSG00005023754)	ptgs2b (ENSOTSG00005023806)	ENSOTSG00005026809	ENSOTSG00005026811	crb1 (ENSOTSG00005026812)	nek7 (ENSOTSG00005026827)	lhx9 (ENSOTSG00005028017)	DENND1B (ENSOTSG00005028022)	ABHD8 (ENSOTSG00005028032)	dda1 (ENSOTSG00005028035)	ANO8 (ENSOTSG00005028038)	nr2f6b (ENSOTSG00005028040)	pde6d (ENSOTSG00005028041)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	22	EBNA1BP2 (ENSOMYG00000004302)	CFAP57 (ENSOMYG00000004476)	TMEM125 (ENSOMYG00000052670)	ap1m3 (ENSOMYG00000004877)	C1orf210 (ENSOMYG00000005222)	tie1 (ENSOMYG00000005480)	mpl (ENSOMYG00000005603)	prpf38a (ENSOMYG00000005627) #25	POMGNT1 (ENSOMYG00000005992) #10	ENSOMYG00000007606 #13	MAST2 (ENSOMYG00000009424) #14	ENSOMYG00000009687 ##16	ENSOMYG00000009726 #17	ENSOMYG00000031234 #18	ENSOMYG00000009797	ENSOMYG00000009964 #22	ENSOMYG00000056400	ENSOMYG00000010134 #23	ENSOMYG00000056789	ivns1abpa (ENSOMYG00000010178)	ENSOMYG00000010353	ptgs2b (ENSOMYG00000010634)	ENSOMYG00000071691	ENSOMYG00000011730	nek7 (ENSOMYG00000054062)	ENSOMYG00000054799	ENSOMYG00000050036	ENSOMYG00000011779	ENSOMYG00000074033	DENND1B (ENSOMYG00000052019)	ABHD8 (ENSOMYG00000011925)
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	203			ENSGT00940000154667.b.a	ENSGT00940000157607	ENSGT00390000004674.i.b	ENSGT00980000198596.B	ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a.q	ENSGT00390000004798	ENSGT00940000156132.h	ENSGT00940000164927.a	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00390000001254	ENSGT00940000155635	ENSGT00940000154614	ENSGT00940000154654.a.b.h	ENSGT01030000234606.b.e.b	ENSGT00390000010743.a.a	ENSGT00940000156236.a.a	ENSGT00730000111014.o.b	ENSGT00530000063751.a.a	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT01030000234633.A.a.b	ENSGT01030000234597.a.b.a.b	ENSGT00940000156618.c.a	ENSGT01050000244824.B	ENSGT00940000159860.e	ENSGT00940000157136.b	ENSGT00950000183149.C.b	ENSGT00940000166937	ENSGT00390000013141	ENSGT00940000164927.a	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466.d #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00390000001254	ENSGT00940000155635	ENSGT00940000154614	ENSGT00940000154654.a.b.h	ENSGT01030000234606.b.e.b	ENSGT00390000010743.a.a	ENSGT00940000156236.a.a	ENSGT00730000111014.o.b	ENSGT00530000063751.a.a	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000156852.d	ENSGT01030000234633.A.a.b	ENSGT01030000234597.a.b.a.b	ENSGT00940000156618.c.a	ENSGT01050000244824.B	ENSGT00940000159860.e	ENSGT00940000157136.b	ENSGT00950000183149.C.b	ENSGT00940000166937	ENSGT00390000013141	ENSGT00940000164927.a	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00940000159466.c #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00940000157620	ENSGT00940000153441.a.a	ENSGT00390000004612	ENSGT00390000017860.b	ENSGT00940000165355	ENSGT00950000182808.a.a.b.b	ENSGT00390000012305.a	ENSGT00610000086058.a	ENSGT00530000063690.a.a	ENSGT00390000003601.b.c.b	ENSGT00530000063690.a.b.a.b	ENSGT00940000156935	ENSGT00390000014817
Channel catfish	MODERN SPECIES	17	emilin1a (ENSIPUG00000007899)	Stmn4 (ENSIPUG00000007910)	Il17f (ENSIPUG00000007931)	MCM3 (ENSIPUG00000007956)	paqr8 (ENSIPUG00000008073)	znf395 (ENSIPUG00000008084)	pnoc (ENSIPUG00000008105)	PDIK1L (ENSIPUG00000008116)	elp3 (ENSIPUG00000008133)	slc25a24 (ENSIPUG00000008225)	ENSIPUG00000008267 #16	ENSIPUG00000008346	PRRX1 (ENSIPUG00000008362) #18	gorab (ENSIPUG00000008452) #19	mettl11b (ENSIPUG00000008461) #21	KIFAP3 (ENSIPUG00000008497) #22	niban1a (ENSIPUG00000008779) #23	c25h12orf57 (ENSIPUG00000008823)	srd5a3 (ENSIPUG00000008842)	TRMT1L (ENSIPUG00000008873) #24	cbr4 (ENSIPUG00000008908)	PALLD (ENSIPUG00000008999)	anapc4 (ENSIPUG00000009114)	slain2 (ENSIPUG00000009191)	lrg1 (ENSIPUG00000009218)	SLC10A4 (ENSIPUG00000009233)	zar1 (ENSIPUG00000009252)	FRYL (ENSIPUG00000009363)	OCIAD2 (ENSIPUG00000009794)	dcun1d4 (ENSIPUG00000009816)	lrrc66 (ENSIPUG00000009822)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000156852.d	ENSGT01030000234633.A.a.b	ENSGT01030000234597.a.b.a.b	ENSGT00940000156618.c.a	ENSGT01050000244824.B	ENSGT00940000159860.e	ENSGT00940000157136.b	ENSGT00950000183149.C.b	ENSGT00940000166937	ENSGT00390000013141	ENSGT00940000164927.a	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00940000159466.c #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00940000157620	ENSGT00940000153441.a.a	ENSGT00390000004612	ENSGT00390000017860.b	ENSGT00940000165355	ENSGT00950000182808.a.a.b.b	ENSGT00390000012305.a	ENSGT00610000086058.a	ENSGT00530000063690.a.a	ENSGT00390000003601.b.c.b	ENSGT00530000063690.a.b.a.b	ENSGT00940000156935	ENSGT00390000014817
Electric eel	MODERN SPECIES	250	ankef1a (ENSEEEG00000005449)	emilin1a (ENSEEEG00000005444)	stmn4 (ENSEEEG00000005443)	il17a/f3 (ENSEEEG00000005440)	mcm3 (ENSEEEG00000005426)	paqr8 (ENSEEEG00000005421)	znf395b (ENSEEEG00000005419)	pnocb (ENSEEEG00000005418)	si:ch211-63o20.7 (ENSEEEG00000005417)	elp3 (ENSEEEG00000005247)	slc25a24 (ENSEEEG00000005231)	ENSEEEG00000005222 ##16	prrx1b (ENSEEEG00000005218) #18	gorab (ENSEEEG00000005215) #19	ntmt2 (ENSEEEG00000005199) #21	kifap3a (ENSEEEG00000005154) #22	niban1a (ENSEEEG00000005136) #23	TRMT1L (ENSEEEG00000005125) #24	cbr4 (ENSEEEG00000005123)
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000156852.d	ENSGT01030000234633.A.a.b	ENSGT01030000234597.a.b.a.b	ENSGT00940000156618.c.a	ENSGT01050000244824.B	ENSGT00940000159860.e	ENSGT00940000157136.b	ENSGT00950000183149.C.b	ENSGT00940000166937	ENSGT00390000013141	ENSGT00940000164927.a	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00940000159466.c #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00940000157620	ENSGT00940000153441.a.a	ENSGT00390000004612	ENSGT00390000017860.b	ENSGT00940000165355	ENSGT00950000182808.a.a.b.b	ENSGT00390000012305.a	ENSGT00610000086058.a	ENSGT00530000063690.a.a	ENSGT00390000003601.b.c.b	ENSGT00530000063690.a.b.a.b	ENSGT00940000156935	ENSGT00390000014817
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	329	ankef1a (ENSPNAG00000029721)	emilin1a (ENSPNAG00000029714)	stmn4 (ENSPNAG00000029705)	il17a/f3 (ENSPNAG00000029698)	mcm3 (ENSPNAG00000029681)	paqr8 (ENSPNAG00000004508)	znf395b (ENSPNAG00000029097)	pnocb (ENSPNAG00000029078)	si:ch211-63o20.7 (ENSPNAG00000029063)	elp3 (ENSPNAG00000029054)	slc25a24 (ENSPNAG00000028987)	ENSPNAG00000028915 #16	PRRX1 (ENSPNAG00000028803) #18	gorab (ENSPNAG00000028768) #19	ntmt2 (ENSPNAG00000028749) #21	kifap3a (ENSPNAG00000028726) #22	niban1a (ENSPNAG00000005531) #23	TRMT1L (ENSPNAG00000004389) #24
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	18	stmn4 (ENSAMXG00000041709)	il17a/f3 (ENSAMXG00000039772)	mcm3 (ENSAMXG00000009797)	paqr8 (ENSAMXG00000025525)	znf395b (ENSAMXG00000009775)	pnocb (ENSAMXG00000042920)	si:ch211-63o20.7 (ENSAMXG00000009746)	elp3 (ENSAMXG00000009723)	slc25a24 (ENSAMXG00000009717)	ENSAMXG00000043606 ##16	ENSAMXG00000042731 #16	ENSAMXG00000036779	PRRX1 (ENSAMXG00000032983) #18	gorab (ENSAMXG00000035192) #19	ntmt2 (ENSAMXG00000009655) #21	kifap3a (ENSAMXG00000009625) #22	niban1a (ENSAMXG00000009608) #23	TRMT1L (ENSAMXG00000009602) #24	cbr4 (ENSAMXG00000036711)	PALLD (ENSAMXG00000009581)	ENSAMXG00000037574	ENSAMXG00000036278	mep1ba (ENSAMXG00000009554)	mcm3l (ENSAMXG00000032018)	si:ch211-191a24.4 (ENSAMXG00000035418)	TNS3 (ENSAMXG00000009528)	igfbp3 (ENSAMXG00000036513)	igfbp1a (ENSAMXG00000009512)	ENSAMXG00000035428	ENSAMXG00000039635	ENSAMXG00000020569
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000163104	ENSGT00950000182843.a.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000156852.d	ENSGT01030000234633.A.a.b	ENSGT01030000234597.a.b.a.b	ENSGT00940000157136.b	ENSGT00950000183149.C.b	ENSGT00940000166937	ENSGT00390000013141	ENSGT00940000164927.a	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466.d #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00390000001254	ENSGT00940000155635	ENSGT00940000154614	ENSGT00940000154654.a.b.h	ENSGT01030000234606.b.e.b	ENSGT00390000010743.a.a	ENSGT00940000156236.a.a	ENSGT00730000111014.o.b	ENSGT00530000063751.a.a	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791.c	ENSGT01030000234567.B.a.a.b.a.a.e.b	ENSGT00390000002738.b
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	350															ENSGT00390000008371.a.f #21	ENSGT00390000003574.a.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b.b #23	ENSGT00530000063646.a.d #24	ENSGT00390000001254.f	ENSGT00940000155635.u.a	ENSGT00940000154614	ENSGT00940000154654.a.b.h.d	ENSGT01030000234606.b.e.b.c	ENSGT00390000010743.a.a.a	ENSGT00940000156236.a.a.e	ENSGT00730000111014.o.b.a	ENSGT00530000063751.a.a.b	ENSGT00930000151043.d	ENSGT00940000164633.c.b	ENSGT00940000160168.b.a.n	ENSGT00940000166054
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	309																ENSGT00390000003574.a.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b.b #23	ENSGT00530000063646.a.d #24	ENSGT00390000001254.f	ENSGT00940000155635.u.a	ENSGT00940000154614.pe	ENSGT00940000154654.a.b.h.d	ENSGT01030000234606.b.e.b.c	ENSGT00390000010743.a.a.a	ENSGT00940000156236.a.a.e	ENSGT00730000111014.o.b.a	ENSGT00530000063751.a.a.b	ENSGT00930000151043.d	ENSGT00940000164633.c.b	ENSGT00940000160168.b.a.n	ENSGT00940000166054
Common carp reference	MODERN SPECIES	34	emilin1a (ENSCCRG00000075193)	stmn4 (ENSCCRG00000074692)	il17a/f3 (ENSCCRG00000067104)	mcm3 (ENSCCRG00000005245)	paqr8 (ENSCCRG00000072910)	znf395b (ENSCCRG00000005473)	pnocb (ENSCCRG00000059629)	si:ch211-63o20.7 (ENSCCRG00000054786)	elp3 (ENSCCRG00000047319)	slc25a24 (ENSCCRG00000047317)	ENSCCRG00000047315 #16	ENSCCRG00000030163 #17	prrx1b (ENSCCRG00000076310) #18	gorab (ENSCCRG00000055088) #19	ntmt2 (ENSCCRG00000022893) #21	kifap3a (ENSCCRG00000022274) #22	niban1a (ENSCCRG00000022247) #23	TRMT1L (ENSCCRG00000022240) #24	ENSCCRG00000079211	ivns1abpa (ENSCCRG00000022224)	HMCN1 (ENSCCRG00000012667)	arpc5b (ENSCCRG00000045534)	PLA2G4A (ENSCCRG00000042045)	ptgs2b (ENSCCRG00000047699)	pdcb (ENSCCRG00000059989)	tprb (ENSCCRG00000041197)	prg4b (ENSCCRG00000041122)	scyl3 (ENSCCRG00000041115)	sele (ENSCCRG00000041100)	selp (ENSCCRG00000040893)	lmx1a (ENSCCRG00000068329)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	472	sccpdhb (ENSSGRG00000041516)	SNAP25 (ENSSGRG00000041520)	ankef1a (ENSSGRG00000041525)	emilin1a (ENSSGRG00000041528)	stmn4 (ENSSGRG00000041532)	il17a/f3 (ENSSGRG00000041534)	mcm3 (ENSSGRG00000041541)	paqr8 (ENSSGRG00000041955)	znf395b (ENSSGRG00000041956)	pnocb (ENSSGRG00000041957)	si:ch211-63o20.7 (ENSSGRG00000041959)	elp3 (ENSSGRG00000041972)	slc25a24 (ENSSGRG00000042056)	prrx1b (ENSSGRG00000042108) #18	gorab (ENSSGRG00000042113) #19	kifap3a (ENSSGRG00000042116) #22	niban1a (ENSSGRG00000042191) #23	TRMT1L (ENSSGRG00000042192) #24	ivns1abpa (ENSSGRG00000042195)	HMCN1 (ENSSGRG00000042464)	arpc5b (ENSSGRG00000042479)	PLA2G4A (ENSSGRG00000042480)	ptgs2b (ENSSGRG00000042492)	pdcb (ENSSGRG00000042838)	tprb (ENSSGRG00000042845)	prg4b (ENSSGRG00000042976)	scyl3 (ENSSGRG00000042977)
Goldfish	DUPLICATION
Goldfish	MODERN SPECIES	1378															ntmt2 (ENSCARG00000030023) #21	kifap3a (ENSCARG00000030066) #22
Goldfish	MODERN SPECIES	2467																kifap3a (ENSCARG00000068334) #22	niban1a (ENSCARG00000039451) #23	TRMT1L (ENSCARG00000039460) #24	ENSCARG00000039487
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	58	ENSGT00940000156852.d.b	ENSGT01030000234633.A.a.b.a	ENSGT01030000234597.a.b.a.b.e	ENSGT00940000156618.c.a.a	ENSGT01050000244824.B.db.b	ENSGT00940000159860.e.b	ENSGT00940000157136.b.b	ENSGT00950000183149.C.b.c	ENSGT00940000166937.b	ENSGT00390000013141.a	ENSGT00940000164927.a.a	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b.a.a #16	ENSGT00940000159466.d.c.a #18	ENSGT00390000014886.i #19	ENSGT00390000008371.a.e #21	ENSGT00390000003574.a.b #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b.a #23	ENSGT00530000063646.a.c #24	ENSGT00390000001254.e	ENSGT00940000155635.u.b	ENSGT00940000154654.a.b.h.c	ENSGT01030000234606.b.e.b.d	ENSGT00390000010743.a.a.b	ENSGT00940000156236.a.a.f	ENSGT01030000234567.B.a.a.b.a.a.e.b	ENSGT00730000111014.o.b.b	ENSGT00530000063751.a.a.a	ENSGT00930000151043.c	ENSGT00390000004791.c.a	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633.d
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	257	ENSGT00940000156618.c.a.a	ENSGT01050000244824.B.db.b	ENSGT00940000157136.b.b	ENSGT00950000183149.C.b.c	ENSGT00940000166937.b	ENSGT00390000013141.a	ENSGT00940000164927.a.a	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b.a.a #16	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b.a.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466.d.c.a #18	ENSGT00390000014886.i #19	ENSGT00390000008371.a.f #21	ENSGT00390000008371.a.e #21	ENSGT00390000003574.a.b #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b.a #23	ENSGT00530000063646.a.c #24	ENSGT00390000001254.e	ENSGT00940000155635.u.b	ENSGT00940000154614.qe	ENSGT00940000154654.a.b.h.c	ENSGT01030000234606.b.e.b.d	ENSGT00390000010743.a.a.b	ENSGT00940000156236.a.a.f	ENSGT00730000111014.o.b.b	ENSGT00530000063751.a.a.a	ENSGT00930000151043.c	ENSGT00390000004791.c.a	ENSGT01030000234567.B.a.a.b.a.a.e.b	ENSGT00390000002738.b
Common carp reference	MODERN SPECIES	28	snap25a (ENSCCRG00000034090)	ankef1a (ENSCCRG00000032559)	emilin1a (ENSCCRG00000056865)	stmn4 (ENSCCRG00000068496)	il17a/f3 (ENSCCRG00000078734)	mcm3 (ENSCCRG00000020414)	znf395b (ENSCCRG00000007688)	si:ch211-63o20.7 (ENSCCRG00000066954)	elp3 (ENSCCRG00000007703)	slc25a24 (ENSCCRG00000062518)	ENSCCRG00000070865 #16	ENSCCRG00000069171 #17	prrx1b (ENSCCRG00000071513) #18	gorab (ENSCCRG00000023654) #19	ntmt2 (ENSCCRG00000037004) #21	kifap3a (ENSCCRG00000023708) #22	niban1a (ENSCCRG00000027491) #23	ENSCCRG00000028194	ivns1abpa (ENSCCRG00000028200)	HMCN1 (ENSCCRG00000021811)	arpc5b (ENSCCRG00000074120)	PLA2G4A (ENSCCRG00000045689)	ptgs2b (ENSCCRG00000045662)	pdcb (ENSCCRG00000073915)	tprb (ENSCCRG00000045588)	prg4b (ENSCCRG00000045562)	ENSCCRG00000038110	scyl3 (ENSCCRG00000049276)	si:dkey-97o5.1 (ENSCCRG00000049282)	zp3a.1 (ENSCCRG00000020935)	si:dkey-51e6.1 (ENSCCRG00000020942)
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Goldfish	DUPLICATION
Goldfish	MODERN SPECIES	39	itsn2a (ENSCARG00000066063)	ccn2a (ENSCARG00000066342)	moxd1 (ENSCARG00000066358)	il17a/f3 (ENSCARG00000066446)	mcm3 (ENSCARG00000066540)	paqr8 (ENSCARG00000067389)	znf395b (ENSCARG00000067406)	pnocb (ENSCARG00000067449)	si:ch211-63o20.7 (ENSCARG00000067453)	elp3 (ENSCARG00000067485)	slc25a24 (ENSCARG00000067716)	ENSCARG00000067854 #16	prrx1b (ENSCARG00000067889) #18	gorab (ENSCARG00000067913) #19	ntmt2 (ENSCARG00000067920) #21	kifap3a (ENSCARG00000067962) #22	ENSCARG00000068062	niban1a (ENSCARG00000068067) #23	TRMT1L (ENSCARG00000068128) #24	ivns1abpa (ENSCARG00000068328)	arpc5b (ENSCARG00000068377)	PLA2G4A (ENSCARG00000068417)	ptgs2b (ENSCARG00000068825)	pdcb (ENSCARG00000068919)	prg4b (ENSCARG00000068986)	scyl3 (ENSCARG00000068996)	si:dkey-97o5.1 (ENSCARG00000069052)	si:dkey-51e6.1 (ENSCARG00000069080)	sele (ENSCARG00000069128)	ENSCARG00000069208	ENSCARG00000069210
Goldfish	MODERN SPECIES	2055															ntmt2 (ENSCARG00000062957) #21	kifap3a (ENSCARG00000062992) #22	niban1a (ENSCARG00000063197) #23	TRMT1L (ENSCARG00000063393) #24	ENSCARG00000064492
Zebrafish	MODERN SPECIES	12	ankef1a (ENSDARG00000019135)	emilin1a (ENSDARG00000024537)	il17a/f3 (ENSDARG00000041976)	stmn4 (ENSDARG00000030106)	mcm3 (ENSDARG00000024204)	paqr8 (ENSDARG00000088828)	znf395b (ENSDARG00000024195)	pnocb (ENSDARG00000024189)	si:ch211-63o20.7 (ENSDARG00000042000)	elp3 (ENSDARG00000042005)	slc25a24 (ENSDARG00000008568)	ENSDARG00000054723 #16	prrx1b (ENSDARG00000042027) #18	gorab (ENSDARG00000042031) #19	ntmt2 (ENSDARG00000042033) #21	kifap3a (ENSDARG00000008639) #22	niban1a (ENSDARG00000042055) #23	TRMT1L (ENSDARG00000042057) #24	ENSDARG00000079036	ENSDARG00000094010	ivns1abpa (ENSDARG00000031100)	ENSDARG00000016936	arpc5b (ENSDARG00000019062)	PLA2G4A (ENSDARG00000017141)	ptgs2b (ENSDARG00000010276)	pdcb (ENSDARG00000017634)	tprb (ENSDARG00000016630)	prg4b (ENSDARG00000028163)	scyl3 (ENSDARG00000027046)	si:dkey-97o5.1 (ENSDARG00000042120)	zp3a.1 (ENSDARG00000042129)
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	178			ENSGT00940000154667.b.a	ENSGT00940000157607	ENSGT00390000004674.i.b	ENSGT00390000004798	ENSGT00390000004674.j	ENSGT00940000157064.a.b.a	ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a.q	ENSGT00940000156132.h	ENSGT00940000164927.a	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00390000001254	ENSGT00940000155635	ENSGT00940000154614	ENSGT00940000154654.a.b.h	ENSGT01030000234606.b.e.b	ENSGT00390000010743.a.a	ENSGT00940000156236.a.a	ENSGT00730000111014.o.b	ENSGT00530000063751.a.a	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633
Atlantic herring	MODERN SPECIES	1	ENSCHAG00000020364	ENSCHAG00000020355	ENSCHAG00000020330	ENSCHAG00000020293	ENSCHAG00000020274	ENSCHAG00000020245	ENSCHAG00000020237	henmt1 (ENSCHAG00000020231)	ENSCHAG00000020217	fam102bb (ENSCHAG00000020199)	slc25a24 (ENSCHAG00000019517)	ENSCHAG00000019331 #16	prrx1b (ENSCHAG00000019285) #18	gorab (ENSCHAG00000019279) #19	ntmt2 (ENSCHAG00000019275) #21	kifap3a (ENSCHAG00000018342) #22	niban1a (ENSCHAG00000017892) #23	TRMT1L (ENSCHAG00000017235) #24	ENSCHAG00000017205	ivns1abpa (ENSCHAG00000017145)	HMCN1 (ENSCHAG00000016511)	arpc5b (ENSCHAG00000016442)	PLA2G4A (ENSCHAG00000015900)	ptgs2b (ENSCHAG00000014478)	pdcb (ENSCHAG00000014371)	tprb (ENSCHAG00000010540)	prg4b (ENSCHAG00000010290)	scyl3 (ENSCHAG00000010242)	ENSCHAG00000010200	ENSCHAG00000010133	ENSCHAG00000010058
Denticle herring	MODERN SPECIES	270	gpsm2l (ENSDCDG00000010764)	stxbp3 (ENSDCDG00000010797)	ENSDCDG00000012363	ENSDCDG00000012379	ENSDCDG00000012389	ENSDCDG00000012401	fam102bb (ENSDCDG00000012430)	slc25a24 (ENSDCDG00000012454)	ENSDCDG00000012503	ENSDCDG00000012529 #16	ENSDCDG00000012581	prrx1b (ENSDCDG00000012595) #18	ENSDCDG00000012670	gorab (ENSDCDG00000012674) #19	ntmt2 (ENSDCDG00000012679) #21	kifap3a (ENSDCDG00000012684) #22	niban1a (ENSDCDG00000013239) #23	TRMT1L (ENSDCDG00000012707) #24	ENSDCDG00000013314	ENSDCDG00000013317	atf6 (ENSDCDG00000013319)	ENSDCDG00000013352	lmx1a (ENSDCDG00000013720)	TGM1 (ENSDCDG00000013724)	tbc1d7 (ENSDCDG00000013730)	ENSDCDG00000013732	ENSDCDG00000013733	ENSDCDG00000013735	ENSDCDG00000013737	ENSDCDG00000013738	exoc2 (ENSDCDG00000013742)
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	227				ENSGT00940000154667.b.a	ENSGT00940000157607	ENSGT00390000004674.i.b	ENSGT00390000004798	ENSGT00940000156132.h	ENSGT00940000164927.a	ENSGT00390000006876	ENSGT00940000156470.v.a	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b #16	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #17	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000154149.b.a.g.a ##23	ENSGT00940000154499	ENSGT00390000012568	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000160168.b.a	ENSGT00940000166054	ENSGT00940000166019	ENSGT01020000231030	ENSGT00930000151041	ENSGT00940000159221	ENSGT00940000157757.g.a
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	343													ENSGT00390000006876	ENSGT00940000156470.v.a	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000154149.b.a.g.a ##23	ENSGT00940000154499	ENSGT00390000012568	ENSGT00730000111014.p
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000157634.d	ENSGT00940000159735	ENSGT00950000183128.B	ENSGT00940000158429	ENSGT00390000012433.b	ENSGT00940000159923	ENSGT00940000160852	ENSGT00940000164586.h	ENSGT00940000159218.a	ENSGT00390000014590	ENSGT00520000060044	ENSGT00390000010157.a	ENSGT00390000006876	ENSGT00940000156470.v.a	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.g.a ##23	ENSGT00940000154499	ENSGT00940000162889	ENSGT00940000155682.g.b	ENSGT00390000018786	ENSGT00390000015228	ENSGT00390000018807	ENSGT00390000016988.a.a.b	ENSGT00390000016988.b	ENSGT00940000156882	ENSGT00390000010316	ENSGT00940000159677.a.a	ENSGT00940000163427.d	ENSGT00390000004859.c.b	ENSGT00940000160141.e.a
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	661											ENSGT01030000237605	ENSGT00940000154587.a.b.v	ENSGT00940000156470.u.b.d	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00940000159466.f #18	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.g.a ##23	ENSGT00940000154499.hb	ENSGT00940000155682.g.b.c	ENSGT00390000018786	ENSGT00390000016988.b	ENSGT00940000156882	ENSGT00390000010316
Huchen	DUPLICATION
Huchen	MODERN SPECIES	8290																KIFAP3 (ENSHHUG00000005642) ##22
Huchen	MODERN SPECIES	7285																ENSHHUG00000018330 ##22
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	51	ENSGT00940000157634.d.h	ENSGT00940000159735	ENSGT00950000183128.B.j	ENSGT00940000158429	ENSGT00390000012433.b.b	ENSGT00940000159923	ENSGT00940000160852	ENSGT00390000014590	ENSGT00520000060044	ENSGT00390000010157.a	ENSGT00940000156207.b.c.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154587.a.b.v	ENSGT00940000156470.u.b.d	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00940000159466.f #18	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.g.a ##23	ENSGT00940000155682.g.b.c	ENSGT00390000018786	ENSGT00390000015228	ENSGT00390000016988.b	ENSGT00940000156882	ENSGT00390000010316	ENSGT00950000183014.f.b.b.a.b	ENSGT01100000263556.a.a.p.a	ENSGT01090000260052.a.b.i	ENSGT00940000159827.e	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g	ENSGT00390000003289.m.a
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00940000157634.d.h	ENSGT00940000159735	ENSGT00950000183128.B.j	ENSGT00940000158429	ENSGT00390000012433.b.b	ENSGT00940000159923	ENSGT00940000160852	ENSGT00390000014590	ENSGT00520000060044	ENSGT00390000010157.a	ENSGT00940000156207.b.c.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154587.a.b.v	ENSGT00940000156470.u.b.d	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00940000159466.f #18	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.g.a ##23	ENSGT00940000154499.hb.d	ENSGT00940000162889.e.d	ENSGT00940000155682.g.b.c	ENSGT00390000018786	ENSGT00390000015228	ENSGT00390000016988.b	ENSGT00940000156882	ENSGT00390000010316	ENSGT00950000183014.f.b.b.a.b	ENSGT01100000263556.a.a.p.a	ENSGT01090000260052.a.b.i	ENSGT00940000159827.e	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v
Rainbow trout	MODERN SPECIES	29	csnk1g2a (ENSOMYG00000069481)	ENSOMYG00000065728	mknk2a (ENSOMYG00000008832)	ENSOMYG00000008864	yipf1 (ENSOMYG00000008888)	zgc:113691 (ENSOMYG00000008900)	ndc1 (ENSOMYG00000008961)	ENSOMYG00000009096	ENSOMYG00000009303	acadm (ENSOMYG00000009406)	ENSOMYG00000009432	ENSOMYG00000068137	ENSOMYG00000070813	ENSOMYG00000040367	ENSOMYG00000074048	kifap3b (ENSOMYG00000051848) ##22	ENSOMYG00000052984	ENSOMYG00000060736	ENSOMYG00000053433 ##23	rnf2 (ENSOMYG00000059763)	ENSOMYG00000060331	ENSOMYG00000053025	ENSOMYG00000008232	ENSOMYG00000066731	ENSOMYG00000008150	ENSOMYG00000008197	ENSOMYG00000030486	ENSOMYG00000065507	ENSOMYG00000069628	ENSOMYG00000055913	ENSOMYG00000070710
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	124	ENSGT00940000157634.d.h	ENSGT00940000159735	ENSGT00950000183128.B.j	ENSGT00940000158429	ENSGT00390000012433.b.b	ENSGT00940000159923	ENSGT00940000160852	ENSGT00390000014590	ENSGT00520000060044	ENSGT00390000010157.a	ENSGT00940000156207.b.c.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154587.a.b.v	ENSGT00940000156470.u.b.d	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00940000159466.f #18	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.g.a ##23	ENSGT00940000154499.hb.d	ENSGT00940000162889.e.d	ENSGT00940000155682.g.b.c	ENSGT00390000018786	ENSGT00390000015228	ENSGT00390000016988.b	ENSGT00940000156882	ENSGT00390000010316	ENSGT00950000183014.f.b.b.a.b	ENSGT01090000260052.a.b.i	ENSGT00940000159827.e	ENSGT00450000040296	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g
Coho salmon	MODERN SPECIES	23	st6galnac3 (ENSOKIG00005030131)	rabggtb (ENSOKIG00005030206)	acadm (ENSOKIG00005030270)	RPS8 (ENSOKIG00005030829)	hectd3 (ENSOKIG00005030910)	BEST4 (ENSOKIG00005031658)	ndc1 (ENSOKIG00005031718)	zgc:113691 (ENSOKIG00005031831)	yipf1 (ENSOKIG00005031840)	ENSOKIG00005031870	mknk2a (ENSOKIG00005031885)	ENSOKIG00005031961	ENSOKIG00005032008	mfsd12a (ENSOKIG00005032281)	prrx1a (ENSOKIG00005032405) #18	kifap3b (ENSOKIG00005032443) ##22	ENSOKIG00005032638 ##23	rnf2 (ENSOKIG00005032723)	COL6A1 (ENSOKIG00005032756)	COL6A2 (ENSOKIG00005032823)	zgc:162816 (ENSOKIG00005032965)	ENSOKIG00005032991	ENSOKIG00005033276	pecr (ENSOKIG00005033339)	ndufb3 (ENSOKIG00005033350)	ENSOKIG00005033361	XCR1 (ENSOKIG00005033419)	NEUROD6 (ENSOKIG00005033423)	ENSOKIG00005033428	bag1 (ENSOKIG00005033434)	ENSOKIG00005033493
Chinook salmon	MODERN SPECIES	681																kifap3b (ENSOTSG00005038726) ##22	ENSOTSG00005038755 ##23	rnf2 (ENSOTSG00005038757)
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000159735	ENSGT00940000158429	ENSGT00950000183128.B.i.a	ENSGT00940000165774	ENSGT00390000012433.b.b	ENSGT00940000159923	ENSGT00940000160852	ENSGT00390000014590	ENSGT00520000060044	ENSGT00390000010157.a	ENSGT00940000156207.b.c.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154587.a.b.v	ENSGT00940000156470.u.b.d	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00940000159466.f #18	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.g.a ##23	ENSGT00940000154499.hb.b	ENSGT00940000155682.g.b.c	ENSGT00390000018786	ENSGT00390000015228	ENSGT00390000016988.a.a.a.b.c	ENSGT00940000156882	ENSGT00390000010316	ENSGT00950000183014.f.b.b.a.b	ENSGT01100000263556.a.a.p.a	ENSGT01090000260052.a.b.i	ENSGT00940000159827.e	ENSGT00450000040296.q	ENSGT00550000074817.v	ENSGT00940000157341.g
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	5	ENSSSAG00000040446	hectd3 (ENSSSAG00000006655)	ENSSSAG00000077776	ENSSSAG00000097561	ENSSSAG00000095504	ENSSSAG00000082681	ndc1 (ENSSSAG00000077793)	zgc:113691 (ENSSSAG00000078175)	yipf1 (ENSSSAG00000078179)	ENSSSAG00000078182	mknk2a (ENSSSAG00000105404)	ENSSSAG00000083965	csnk1g2a (ENSSSAG00000040163)	mfsd12a (ENSSSAG00000120062)	prrx1a (ENSSSAG00000104687) #18	kifap3b (ENSSSAG00000110039) ##22	ENSSSAG00000047151 ##23	rnf2 (ENSSSAG00000093859)	ENSSSAG00000114011	ENSSSAG00000112044	ENSSSAG00000102193	ENSSSAG00000010340	ENSSSAG00000005914	ENSSSAG00000111495	ENSSSAG00000005923	ENSSSAG00000005944	pecr (ENSSSAG00000006003)	ENSSSAG00000006051	ENSSSAG00000006077	ENSSSAG00000121553	ENSSSAG00000102794
River trout	MODERN SPECIES	13	ENSSTUG00000002728	ENSSTUG00000002732	rabggtb (ENSSTUG00000002745)	acadm (ENSSTUG00000002833)	RPS8 (ENSSTUG00000004036)	hectd3 (ENSSTUG00000004172)	BEST4 (ENSSTUG00000004766)	ndc1 (ENSSTUG00000004812)	zgc:113691 (ENSSTUG00000005725)	yipf1 (ENSSTUG00000005728)	ENSSTUG00000005743	mknk2a (ENSSTUG00000005779)	csnk1g2a (ENSSTUG00000006517)	mfsd12a (ENSSTUG00000006728)	prrx1a (ENSSTUG00000006833) #18	kifap3b (ENSSTUG00000006848) ##22	ENSSTUG00000007018 ##23	ENSSTUG00000007104	rnf2 (ENSSTUG00000007110)	COL6A2 (ENSSTUG00000007125)	zgc:162816 (ENSSTUG00000007152)	ENSSTUG00000007173	ENSSTUG00000007203	pecr (ENSSTUG00000007212)	ndufb3 (ENSSTUG00000007219)	ENSSTUG00000007229	ENSSTUG00000007272	XCR1 (ENSSTUG00000007283)	neurod6b (ENSSTUG00000007286)	bag1 (ENSSTUG00000007290)	ENSSTUG00000007301
Northern pike	MODERN SPECIES	2	BEST4 (ENSELUG00000025851)	ENSELUG00000011734	ENSELUG00000011743	ndc1 (ENSELUG00000011782)	zgc:113691 (ENSELUG00000011797)	yipf1 (ENSELUG00000000429)	ENSELUG00000030647	ENSELUG00000011838	ENSELUG00000011864	znf414 (ENSELUG00000032352)	ENSELUG00000030847	mknk2a (ENSELUG00000000430)	CSNK1G2 (ENSELUG00000011991)	mfsd12a (ENSELUG00000001637)	prrx1a (ENSELUG00000012056) #18	kifap3b (ENSELUG00000012102) ##22	ENSELUG00000012243	ENSELUG00000012288 ##23	rnf2 (ENSELUG00000012310)	ivns1abpb (ENSELUG00000012365)	mrc1b (ENSELUG00000029154)	ENSELUG00000028016	COL6A1 (ENSELUG00000012467)	ENSELUG00000027054	COL6A2 (ENSELUG00000012520)	zgc:162816 (ENSELUG00000012541)	ENSELUG00000012606	CFAP410 (ENSELUG00000033795)	zgc:171772 (ENSELUG00000000463)	pecr (ENSELUG00000012660)	ndufb3 (ENSELUG00000012669)
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	191															ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00940000154499	ENSGT00940000164640	ENSGT00390000012596.e	ENSGT00940000157704.a.a	ENSGT00940000157718.c	ENSGT00940000153304.C	ENSGT00940000156181.B	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00530000063681.b.b
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	4															ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00940000154499	ENSGT00940000164640	ENSGT00390000012596.e	ENSGT00940000157704.a.a	ENSGT00940000157718.c	ENSGT00940000158610.d	ENSGT00940000153141.B.a	ENSGT00390000018710	ENSGT01040000240400.c.a.b.a.a.d
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	129															ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000153304.C	ENSGT00940000156181.B	ENSGT00940000156304.c.b	ENSGT00940000159203	ENSGT00940000164519.c.a	ENSGT00940000155899.e.b	ENSGT00940000156209.v.a	ENSGT00530000063681.b.b	ENSGT00940000156460.A	ENSGT00390000000867	ENSGT00940000156470.u.b	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00390000016559	ENSGT00940000159687	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000161095	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000153304.C	ENSGT00940000156181.B	ENSGT00940000156304.c.b	ENSGT00940000159203	ENSGT00940000164519.c.a	ENSGT00940000155899.e.b	ENSGT00940000156209.v.a	ENSGT00530000063681.b.b	ENSGT00940000156460.A	ENSGT00390000000867	ENSGT00940000156470.u.b	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00390000016559	ENSGT00940000159687	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000161095	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00950000182903.a.a.d	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000161095	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00950000182903.a.a.d	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00940000154395.a.a.a.b.a	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000161095	ENSGT00940000154882
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00950000182903.a.a.d	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00940000154395.a.a.a.b.a	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	64	dvl3a (ENSKMAG00000008628)	copb2 (ENSKMAG00000008663)	rbp2b (ENSKMAG00000008760)	rbp1.1 (ENSKMAG00000008788)	NMNAT3 (ENSKMAG00000008800)	clstn2a (ENSKMAG00000008838)	spsb4a (ENSKMAG00000008932)	slc25a36a (ENSKMAG00000008956)	MARCHF2 (ENSKMAG00000009002)	rab11bb (ENSKMAG00000009033)	TIMM44 (ENSKMAG00000009060)	CTXN1 (ENSKMAG00000009121)	CERS4 (ENSKMAG00000009138)	ENSKMAG00000009157	PDC (ENSKMAG00000009178)	kifap3b (ENSKMAG00000009197) ##22	ENSKMAG00000009283	ENSKMAG00000009312 ##23	OLFML2B (ENSKMAG00000009333)	ENSKMAG00000009357	dusp12 (ENSKMAG00000009384)	TPR (ENSKMAG00000009412)	odr4 (ENSKMAG00000009510)	dpydb (ENSKMAG00000009544)	ptbp2b (ENSKMAG00000009644)	CHD7 (ENSKMAG00000009724)	rab2a (ENSKMAG00000009799)	ca8 (ENSKMAG00000009850)	tox (ENSKMAG00000009900)	cryz (ENSKMAG00000009924)	DARS2 (ENSKMAG00000009973)
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1618	ENSNFUG00015017891	dvl3a (ENSNFUG00015017928)	COPB2 (ENSNFUG00015018238)	rbp2b (ENSNFUG00015019621)	NMNAT3 (ENSNFUG00015019671)	NMNAT3 (ENSNFUG00015019677)	clstn2a (ENSNFUG00015019721)	SPSB4 (ENSNFUG00015020062)	slc25a36a (ENSNFUG00015020070)	MARCH2 (ENSNFUG00015020081)	Nfu_g_1_020481 (ENSNFUG00015020092)	TIMM44 (ENSNFUG00015020126)	CTXN1 (ENSNFUG00015020167)	CERS4 (ENSNFUG00015020174)	OLPD-R (ENSNFUG00015020202)	KIFAP3B (ENSNFUG00015020250) ##22	ENSNFUG00015021367 ##23	OLFML2BB (ENSNFUG00015021376)	dusp12 (ENSNFUG00015021389)	prg4a (ENSNFUG00015021413)	TPRA (ENSNFUG00015021506)	C2H1ORF27 (ENSNFUG00015023001)	dpydb (ENSNFUG00015023011)	PTBP2B (ENSNFUG00015023143)	CHD7 (ENSNFUG00015023198)	ENSNFUG00015023291	RAB2A (ENSNFUG00015023295)	ENSNFUG00015023305	CA8 (ENSNFUG00015023308)	ENSNFUG00015023317	TOX (ENSNFUG00015023320)
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00950000182903.a.a.d	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00940000159675	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00940000154395.a.a.a.b.a	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000161095.hb	ENSGT00940000154882
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00950000182903.a.a.d	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00940000159675	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00940000154395.a.a.a.b.a	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000161095.hb	ENSGT00940000154882
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00950000182903.a.a.d	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00940000159675	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00940000154395.a.a.a.b.a	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000161095.hb	ENSGT00940000154882
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	204															ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00940000154395.a.a.a.b.a	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000161095.hb	ENSGT00940000154882
Amazon molly	MODERN SPECIES	422	dpydb (ENSPFOG00000005785)	ptbp2b (ENSPFOG00000005646)	CHD7 (ENSPFOG00000004891)	rab2a (ENSPFOG00000004786)	ca8 (ENSPFOG00000004700)	tox (ENSPFOG00000004558)	ENSPFOG00000004532	cryz (ENSPFOG00000004423)	DARS2 (ENSPFOG00000004144)	bpnt2 (ENSPFOG00000004054)	ENSPFOG00000004047	trnau1apb (ENSPFOG00000003938)	fitm1l (ENSPFOG00000003918)	ENSPFOG00000022209	PDC (ENSPFOG00000003868)	kifap3b (ENSPFOG00000003506) ##22	ENSPFOG00000024715 ##23	myh7 (ENSPFOG00000003432)	myh7 (ENSPFOG00000002250)	ENSPFOG00000022911	lhx8a (ENSPFOG00000002129)	klhl20 (ENSPFOG00000001873)	inhbb (ENSPFOG00000001729)
Sailfin molly	MODERN SPECIES	2949															PDC (ENSPLAG00000016820)	kifap3b (ENSPLAG00000016880) ##22	ENSPLAG00000016894 ##23	OLFML2B (ENSPLAG00000016911)
Guppy	MODERN SPECIES	447	dvl3a (ENSPREG00000014078)	ENSPREG00000014095	copb2 (ENSPREG00000014106)	rbp1.1 (ENSPREG00000014144)	NMNAT3 (ENSPREG00000014156)	clstn2a (ENSPREG00000014196)	spsb4a (ENSPREG00000014221)	ENSPREG00000014238	ENSPREG00000014251	MARCHF2 (ENSPREG00000014259)	rab11bb (ENSPREG00000014269)	TIMM44 (ENSPREG00000014295)	CTXN1 (ENSPREG00000014346)	ENSPREG00000014369	PDC (ENSPREG00000014388)	kifap3b (ENSPREG00000014417) ##22	ENSPREG00000014481 ##23	ENSPREG00000014488 ##23	OLFML2B (ENSPREG00000014496)	dusp12 (ENSPREG00000014521)	prg4a (ENSPREG00000014538)	ENSPREG00000014558	ENSPREG00000014589	odr4 (ENSPREG00000014667)	dpydb (ENSPREG00000014688)	ptbp2b (ENSPREG00000014711)	CHD7 (ENSPREG00000014744)	ENSPREG00000014865	ENSPREG00000014870	rab2a (ENSPREG00000014888)	ca8 (ENSPREG00000014912)
Platyfish	MODERN SPECIES	20	pcyt1aa (ENSXMAG00000019014)	ap2m1a (ENSXMAG00000019001)	dvl3a (ENSXMAG00000018981)	copb2 (ENSXMAG00000018937)	rbp1.1 (ENSXMAG00000018933)	NMNAT3 (ENSXMAG00000018929)	clstn2a (ENSXMAG00000018890)	spsb4a (ENSXMAG00000018887)	slc25a36a (ENSXMAG00000018866)	MARCHF2 (ENSXMAG00000018861)	rab11bb (ENSXMAG00000011926)	TIMM44 (ENSXMAG00000018819)	CTXN1 (ENSXMAG00000026623)	ENSXMAG00000018778	PDC (ENSXMAG00000018762)	kifap3b (ENSXMAG00000018739) ##22	ENSXMAG00000026629 ##23	OLFML2B (ENSXMAG00000018729)	ENSXMAG00000027606	dusp12 (ENSXMAG00000018722)	prg4a (ENSXMAG00000018717)	TPR (ENSXMAG00000018684)	odr4 (ENSXMAG00000018668)	dpydb (ENSXMAG00000018645)	ptbp2b (ENSXMAG00000018642)	CHD7 (ENSXMAG00000018590)	rab2a (ENSXMAG00000024267)	ca8 (ENSXMAG00000018565)	tox (ENSXMAG00000018560)	ENSXMAG00000024775	cryz (ENSXMAG00000018549)
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00950000182903.a.a.d	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00940000159675	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B	ENSGT00940000164879
Mummichog	MODERN SPECIES	2508															PDC (ENSFHEG00000001461)	kifap3b (ENSFHEG00000001453) ##22	ENSFHEG00000001441 ##23	OLFML2B (ENSFHEG00000001437)	dusp12 (ENSFHEG00000001434)	prg4a (ENSFHEG00000001429)	TPR (ENSFHEG00000001411)	odr4 (ENSFHEG00000001356)	dpydb (ENSFHEG00000001338)	ptbp2b (ENSFHEG00000001320)	CHD7 (ENSFHEG00000001311)	rab2a (ENSFHEG00000001296)	ca8 (ENSFHEG00000001294)	tox (ENSFHEG00000001293)	cryz (ENSFHEG00000001290)	DARS2 (ENSFHEG00000001285)	bpnt2 (ENSFHEG00000001277)
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	336						ENSCVAG00000016794	clstn2a (ENSCVAG00000016907)	spsb4a (ENSCVAG00000016921)	ENSCVAG00000016936	slc25a36a (ENSCVAG00000016985)	MARCHF2 (ENSCVAG00000016997)	rab11bb (ENSCVAG00000017021)	TIMM44 (ENSCVAG00000017060)	ENSCVAG00000017123	PDC (ENSCVAG00000017136)	kifap3b (ENSCVAG00000017254) ##22	ENSCVAG00000017271 ##23	OLFML2B (ENSCVAG00000017284)	dusp12 (ENSCVAG00000017311)	TPR (ENSCVAG00000017444)	odr4 (ENSCVAG00000017457)	dpydb (ENSCVAG00000017559)	ptbp2b (ENSCVAG00000017566)	CHD7 (ENSCVAG00000017584)	rab2a (ENSCVAG00000017623)	ca8 (ENSCVAG00000017645)	tox (ENSCVAG00000000458)	cryz (ENSCVAG00000017754)	DARS2 (ENSCVAG00000017840)	bpnt2 (ENSCVAG00000017851)	trnau1apb (ENSCVAG00000017866)
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00950000182903.a.a.d	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000161095	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000157384.a	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00950000182903.a.a.d	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000161095	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B
Indian medaka	MODERN SPECIES	10	pcyt1aa (ENSOMEG00000018447)	ap2m1a (ENSOMEG00000018414)	dvl3a (ENSOMEG00000018321)	copb2 (ENSOMEG00000018165)	rbp2b (ENSOMEG00000018095)	rbp1.1 (ENSOMEG00000018083)	NMNAT3 (ENSOMEG00000018039)	clstn2a (ENSOMEG00000017977)	spsb4a (ENSOMEG00000017906)	slc25a36a (ENSOMEG00000017859)	MARCHF2 (ENSOMEG00000017834)	rab11bb (ENSOMEG00000017806)	TIMM44 (ENSOMEG00000017767)	ENSOMEG00000017667	PDC (ENSOMEG00000017603)	kifap3b (ENSOMEG00000017545) ##22	ENSOMEG00000017421	dusp12 (ENSOMEG00000017380)	ENSOMEG00000017301	prg4a (ENSOMEG00000017284)	ENSOMEG00000017267	odr4 (ENSOMEG00000017193)	dpydb (ENSOMEG00000017058)	ptbp2b (ENSOMEG00000016950)	CHD7 (ENSOMEG00000016881)	rab2a (ENSOMEG00000016752)	ca8 (ENSOMEG00000016716)	tox (ENSOMEG00000016675)	ENSOMEG00000016646	cryz (ENSOMEG00000016621)	DARS2 (ENSOMEG00000016596)
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	8	pcyt1aa (ENSOJAG00000017391)	ap2m1a (ENSOJAG00000017316)	dvl3a (ENSOJAG00000017146)	copb2 (ENSOJAG00000016214)	rbp2b (ENSOJAG00000016169)	rbp1.1 (ENSOJAG00000016154)	NMNAT3 (ENSOJAG00000016137)	clstn2a (ENSOJAG00000015617)	spsb4a (ENSOJAG00000015580)	slc25a36a (ENSOJAG00000015573)	MARCHF2 (ENSOJAG00000015558)	rab11bb (ENSOJAG00000015481)	TIMM44 (ENSOJAG00000014954)	ENSOJAG00000014871	PDC (ENSOJAG00000014844)	kifap3b (ENSOJAG00000014522) ##22	ENSOJAG00000014489 ##23	OLFML2B (ENSOJAG00000014470)	dusp12 (ENSOJAG00000014454)	prg4a (ENSOJAG00000014427)	TPR (ENSOJAG00000011778)	odr4 (ENSOJAG00000011649)	ptbp2b (ENSOJAG00000009624)	rab2a (ENSOJAG00000022968)	ca8 (ENSOJAG00000022960)	tox (ENSOJAG00000022955)	ENSOJAG00000022952	cryz (ENSOJAG00000022906)	DARS2 (ENSOJAG00000022820)	bpnt2 (ENSOJAG00000022792)	trnau1apb (ENSOJAG00000022787)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159223.d	ENSGT00950000182903.a.a.d	ENSGT00900000141083.c.a	ENSGT00940000160165.b	ENSGT00940000159675	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.b	ENSGT01030000234629.C.a	ENSGT00940000154369.g.a	ENSGT00940000158995.b	ENSGT00940000163126.a.a	ENSGT00390000000051.b	ENSGT00940000154412.C.c.a	ENSGT01030000234515.a.b.b.b	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B	ENSGT00940000164879
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	8	ap2m1a (ENSORLG00000014164)	dvl3a (ENSORLG00000014122)	copb2 (ENSORLG00000014074)	rbp1.1 (ENSORLG00000014005)	rbp2b (ENSORLG00000028914)	clstn2a (ENSORLG00000022231)	ENSORLG00000026151	spsb4a (ENSORLG00000013981)	slc25a36a (ENSORLG00000013978)	ENSORLG00000013951	rab11bb (ENSORLG00000013938)	TIMM44 (ENSORLG00000013927)	ENSORLG00000026451	ENSORLG00000013903	pdca (ENSORLG00000013896)	kifap3b (ENSORLG00000013884) ##22	ENSORLG00000024886 ##23	ENSORLG00000013860	dusp12 (ENSORLG00000013816)	prg4a (ENSORLG00000013785)	ENSORLG00000013763	odr4 (ENSORLG00000013679)	dpydb (ENSORLG00000013626)	ptbp2b (ENSORLG00000013557)	CHD7 (ENSORLG00000013492)	rab2a (ENSORLG00000013432)	ca8 (ENSORLG00000013410)	tox (ENSORLG00000013382)	cryz (ENSORLG00000013362)	DARS2 (ENSORLG00000013328)	bpnt2 (ENSORLG00000013302)
Chinese medaka	MODERN SPECIES	522	ap2m1a (ENSOSIG00000020528)	dvl3a (ENSOSIG00000020491)	copb2 (ENSOSIG00000020483)	rbp2b (ENSOSIG00000020472)	rbp1.1 (ENSOSIG00000020468)	NMNAT3 (ENSOSIG00000020465)	clstn2a (ENSOSIG00000017760)	spsb4a (ENSOSIG00000017585)	slc25a36a (ENSOSIG00000017582)	MARCHF2 (ENSOSIG00000017579)	rab11bb (ENSOSIG00000017577)	ENSOSIG00000017572	TIMM44 (ENSOSIG00000017570)	ENSOSIG00000017515	PDC (ENSOSIG00000017506)	kifap3b (ENSOSIG00000017501) ##22	ENSOSIG00000017499 ##23	OLFML2B (ENSOSIG00000017493)	dusp12 (ENSOSIG00000017483)	prg4a (ENSOSIG00000017475)	TPR (ENSOSIG00000017181)	dpydb (ENSOSIG00000017085)	ptbp2b (ENSOSIG00000012898)	CHD7 (ENSOSIG00000012096)	rab2a (ENSOSIG00000012069)	ca8 (ENSOSIG00000012067)	ENSOSIG00000012066	ENSOSIG00000012065	cryz (ENSOSIG00000012019)	DARS2 (ENSOSIG00000010971)	bpnt2 (ENSOSIG00000010968)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000153304.C	ENSGT00940000156181.B	ENSGT00940000156304.c.b	ENSGT00940000159203	ENSGT00940000164519.c.a	ENSGT00940000155899.e.b	ENSGT00940000156209.v.a	ENSGT00530000063681.b.b	ENSGT00940000156460.A	ENSGT00390000000867	ENSGT00940000156470.u.b	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00390000016559	ENSGT00940000159687	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000161095	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	114									ENSGT00940000156460.A	ENSGT00390000000867	ENSGT00940000156470.u.b	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00390000016559	ENSGT00940000159687	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000161095	ENSGT00940000154882.g	ENSGT00940000154882.h
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	122															ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000161095	ENSGT00940000154882.g	ENSGT00940000154882.h.a
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	221															ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000161095	ENSGT00940000154882.g	ENSGT00940000154882.h.a
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	902																kifap3b (ENSAOCG00000012428) ##22	ENSAOCG00000012327 ##23	OLFML2B (ENSAOCG00000012303)
Orange clownfish	MODERN SPECIES	1	st6galnac3 (ENSAPEG00000011715)	rabggtb (ENSAPEG00000011563)	ENSAPEG00000011508	ENSAPEG00000011469	rps8a (ENSAPEG00000011451)	hectd3 (ENSAPEG00000011358)	BEST4 (ENSAPEG00000011320)	ENSAPEG00000011308	rab36 (ENSAPEG00000011251)	DEPDC5 (ENSAPEG00000011092)	mfsd12a (ENSAPEG00000011021)	csnk1g2a (ENSAPEG00000010965)	mrpl37 (ENSAPEG00000010957)	ACOT11 (ENSAPEG00000010881)	PDC (ENSAPEG00000010872)	kifap3b (ENSAPEG00000010797) ##22	ENSAPEG00000010784 ##23	ENSAPEG00000010760	dusp12 (ENSAPEG00000010728)	TPR (ENSAPEG00000010592)	odr4 (ENSAPEG00000010569)	dpydb (ENSAPEG00000010459)	ptbp2b (ENSAPEG00000010383)	CHD7 (ENSAPEG00000010332)	rab2a (ENSAPEG00000010294)	ca8 (ENSAPEG00000010277)	tox (ENSAPEG00000010263)	ENSAPEG00000010254	cryz (ENSAPEG00000010220)	cryz (ENSAPEG00000010159)	ENSAPEG00000010104
Spiny chromis	MODERN SPECIES	743								FBXO41 (ENSAPOG00000008297)	smox (ENSAPOG00000008286)	rnf24 (ENSAPOG00000008247)	eloa (ENSAPOG00000008202)	pithd1 (ENSAPOG00000008194)	lypla2 (ENSAPOG00000008159)	ENSAPOG00000008149	PDC (ENSAPOG00000008123)	kifap3b (ENSAPOG00000007985) ##22	ENSAPOG00000007852 ##23	OLFML2B (ENSAPOG00000007834)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	1691									ENSSPAG00000018002	mrpl37 (ENSSPAG00000018025)	csnk1g2a (ENSSPAG00000018042)	mfsd12a (ENSSPAG00000018084)	DEPDC5 (ENSSPAG00000018118)	rab36 (ENSSPAG00000018203)	PDC (ENSSPAG00000018229)	kifap3b (ENSSPAG00000018254) ##22	ENSSPAG00000018348 ##23	OLFML2B (ENSSPAG00000018374)
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000153304.C	ENSGT00940000156181.B	ENSGT00940000156304.c.b	ENSGT00940000159203	ENSGT00940000164519.c.a	ENSGT00940000155899.e.b	ENSGT00940000156209.v.a	ENSGT00530000063681.b.b	ENSGT00940000156460.A	ENSGT00390000000867	ENSGT00940000156470.u.b	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00390000016559	ENSGT00940000159687	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B	ENSGT00940000164879
Midas cichlid	MODERN SPECIES	754											csnk1g2a (ENSACIG00000000477)	mfsd12a (ENSACIG00000000513)	DEPDC5 (ENSACIG00000000549)	rab36 (ENSACIG00000000642)	PDC (ENSACIG00000000781)	kifap3b (ENSACIG00000000909) ##22	ENSACIG00000000951 ##23	OLFML2B (ENSACIG00000000986)	dusp12 (ENSACIG00000001051)	prg4a (ENSACIG00000001078)	TPR (ENSACIG00000001159)	odr4 (ENSACIG00000001253)	dpydb (ENSACIG00000001318)	ptbp2b (ENSACIG00000001387)	CHD7 (ENSACIG00000001590)	rab2a (ENSACIG00000001706)	ca8 (ENSACIG00000001725)	tox (ENSACIG00000001734)	cryz (ENSACIG00000001754)	DARS2 (ENSACIG00000001777)	bpnt2 (ENSACIG00000001817)
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	47																ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B	ENSGT00940000164879
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	46																ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B	ENSGT00940000164879
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	517			ENSNBRG00000001166	cryz (ENSNBRG00000001185)	tox (ENSNBRG00000001205)	ca8 (ENSNBRG00000001213)	rab2a (ENSNBRG00000001241)	CHD7 (ENSNBRG00000001280)	ptbp2b (ENSNBRG00000001492)	dpydb (ENSNBRG00000001729)	ENSNBRG00000001773	odr4 (ENSNBRG00000001802)	ENSNBRG00000001944	ENSNBRG00000002023	prg4a (ENSNBRG00000002049)	kifap3b (ENSNBRG00000002126) ##22	ENSNBRG00000002199	dusp12 (ENSNBRG00000002213)
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	51																ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000235305.b	ENSGT00950000182841.a.o.b
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	1283																kifap3b (ENSHBUG00000004640) ##22	ENSHBUG00000004568 ##23	OLFML2B (ENSHBUG00000004532)
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	46																ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000154882	ENSGT00950000182841.a.o.b	ENSGT01030000234618.B
P. nyererei	MODERN SPECIES	372															ENSPNYG00000013236	kifap3b (ENSPNYG00000013087) ##22	ENSPNYG00000013060 ##23	OLFML2B (ENSPNYG00000013033)	dusp12 (ENSPNYG00000013005)	prg4a (ENSPNYG00000012975)	TPR (ENSPNYG00000012808)	odr4 (ENSPNYG00000012767)	dpydb (ENSPNYG00000012672)	ptbp2b (ENSPNYG00000012610)	CHD7 (ENSPNYG00000012490)	rab2a (ENSPNYG00000012426)	ca8 (ENSPNYG00000012390)	tox (ENSPNYG00000012367)	cryz (ENSPNYG00000012297)	DARS2 (ENSPNYG00000012231)	bpnt2 (ENSPNYG00000012191)
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	51																ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000154882	ENSGT00950000182841.a.o.b	ENSGT01030000234618.B	ENSGT00940000164879
Eastern happy	MODERN SPECIES	9	xkr4 (ENSACLG00000000377)	RNF31 (ENSACLG00000000533)	ENSACLG00000000577	ENSACLG00000000583	dnajb6a (ENSACLG00000000589)	exoc3 (ENSACLG00000000613)	ENSACLG00000000678	ENSACLG00000000759	ENSACLG00000000832	rab3gap1 (ENSACLG00000000841)	KIF1C (ENSACLG00000000871)	ENSACLG00000001003	ENSACLG00000001034	ENSACLG00000001085	ENSACLG00000001091	kifap3b (ENSACLG00000001130) ##22	ENSACLG00000001245 ##23	ENSACLG00000001262	dusp12 (ENSACLG00000001272)	TPR (ENSACLG00000001327)	odr4 (ENSACLG00000001637)	dpydb (ENSACLG00000001822)	ptbp2b (ENSACLG00000001885)	ENSACLG00000002269	ENSACLG00000002293	rab2a (ENSACLG00000002599)	ca8 (ENSACLG00000002662)	tox (ENSACLG00000002718)	cryz (ENSACLG00000002758)	ENSACLG00000002797	DARS2 (ENSACLG00000002899)
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1100	ENSMZEG00005011138	mcm6 (ENSMZEG00005011109)	si:ch73-71c20.5 (ENSMZEG00005011092)	tmbim1a (ENSMZEG00005011084)	ENSMZEG00005011051	catip (ENSMZEG00005011036)	casp20 (ENSMZEG00005011021)	ENSMZEG00005011006	ENSMZEG00005010998	catip (ENSMZEG00005010978)	ENSMZEG00005010926	ENSMZEG00005010900	ENSMZEG00005010884	casp20 (ENSMZEG00005010871)	ENSMZEG00005010865	kifap3b (ENSMZEG00005010840) ##22	ENSMZEG00005010824 ##23	ENSMZEG00005010815	dusp12 (ENSMZEG00005010808)	TPR (ENSMZEG00005010788)	odr4 (ENSMZEG00005010748)	dpydb (ENSMZEG00005010698)	ptbp2b (ENSMZEG00005010677)	CHD7 (ENSMZEG00005010646)	rab2a (ENSMZEG00005010611)	ca8 (ENSMZEG00005010579)	tox (ENSMZEG00005010571)	cryz (ENSMZEG00005010551)	ENSMZEG00005010531	DARS2 (ENSMZEG00005010481)	sugt1 (ENSMZEG00005010451)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	9	penk (ENSONIG00000031930)	ENSONIG00000027788	jph1b (ENSONIG00000006316)	ENSONIG00000043147 #36	blvra (ENSONIG00000006324)	ENSONIG00000039789	ENSONIG00000024381	ENSONIG00000042802	ccr12a (ENSONIG00000020475)	ENSONIG00000006330	ENSONIG00000037299	ENSONIG00000006339	tmem68 (ENSONIG00000006342)	xkr4 (ENSONIG00000006346)	ENSONIG00000006347	kifap3b (ENSONIG00000016566) ##22	ENSONIG00000016571 ##23	ENSONIG00000016576	ENSONIG00000038331	dusp12 (ENSONIG00000016579)	prg4a (ENSONIG00000016584)	TPR (ENSONIG00000016590)	odr4 (ENSONIG00000016598)	dpydb (ENSONIG00000016599)	ptbp2b (ENSONIG00000016603)	CHD7 (ENSONIG00000016614)	rab2a (ENSONIG00000034587)	ca8 (ENSONIG00000016625)	tox (ENSONIG00000039081)	cryz (ENSONIG00000016629)	DARS2 (ENSONIG00000016633)
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000153304.C	ENSGT00940000156181.B	ENSGT00940000156304.c.b	ENSGT00940000159203	ENSGT00940000164519.c.a	ENSGT00940000155899.e.b	ENSGT00940000156209.v.a	ENSGT00530000063681.b.b	ENSGT00940000156460.A	ENSGT00390000000867	ENSGT00940000156470.u.b	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00390000016559	ENSGT00940000159687	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000161095	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000153304.C	ENSGT00940000156181.B	ENSGT00940000156304.c.b	ENSGT00940000159203	ENSGT00940000164519.c.a	ENSGT00940000155899.e.b	ENSGT00940000156209.v.a	ENSGT00530000063681.b.b	ENSGT00940000156460.A	ENSGT00390000000867	ENSGT00940000156470.u.b	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00390000016559	ENSGT00940000159687	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000161095	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	235												ENSGT00390000000867	ENSGT00940000156470.u.b	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00390000016559	ENSGT00390000003574.b ##22
Fugu	MODERN SPECIES	14	ENSTRUG00000033080	ENSTRUG00000031670	ENSTRUG00000023760	ENSTRUG00000022667	dusp12 (ENSTRUG00000004164)	ENSTRUG00000030217	ENSTRUG00000030372	ENSTRUG00000029715	ENSTRUG00000026300	ACOT11 (ENSTRUG00000004460)	mrpl37 (ENSTRUG00000004786)	CSNK1G2 (ENSTRUG00000004935)	ENSTRUG00000028952	mfsd12a (ENSTRUG00000005278)	DEPDC5 (ENSTRUG00000005539)	kifap3b (ENSTRUG00000005998) ##22	ENSTRUG00000028810	dnai4 (ENSTRUG00000006622)	DARS2 (ENSTRUG00000007129)	xpr1b (ENSTRUG00000006747)	ENSTRUG00000027320	bpnt2 (ENSTRUG00000007350)	ENSTRUG00000007454	fam110b (ENSTRUG00000022727)	ENSTRUG00000026267	ENSTRUG00000027351	ENSTRUG00000007696	ptf1a (ENSTRUG00000007713)	dlgap1a (ENSTRUG00000008401)	ENSTRUG00000032074	cahz (ENSTRUG00000008077)
Tetraodon	MODERN SPECIES	26	ENSTNIG00000005443	ENSTNIG00000005444	ENSTNIG00000005445	ENSTNIG00000000047	ENSTNIG00000001151	ENSTNIG00000000146	ercc3 (ENSTNIG00000005457)	ENSTNIG00000005458	ENSTNIG00000005466	ENSTNIG00000005473	ENSTNIG00000005474	ENSTNIG00000005918	SPATA5 (ENSTNIG00000005483)	BARHL1 (ENSTNIG00000005484)	APOBEC2 (ENSTNIG00000005485)	kifap3b (ENSTNIG00000005488) ##22	mpdu1b (ENSTNIG00000005491)	ENSTNIG00000005492	ENSTNIG00000005493	ENSTNIG00000005507	ENSTNIG00000005508	bcas2 (ENSTNIG00000005509)	otud3 (ENSTNIG00000005510)	ENSTNIG00000005516	ENSTNIG00000005520	ENSTNIG00000005522	ENSTNIG00000005523	SULF2 (ENSTNIG00000005524)	ENSTNIG00000005527	ENSTNIG00000005529 #32	nrd1b (ENSTNIG00000005530) #28
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000153304.C	ENSGT00940000156181.B	ENSGT00940000156304.c.b	ENSGT00940000159203	ENSGT00940000164519.c.a	ENSGT00940000155899.e.b	ENSGT00940000156209.v.a	ENSGT00530000063681.b.b	ENSGT00940000156460.A	ENSGT00390000000867	ENSGT00940000156470.u.b	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00390000016559	ENSGT00940000159687	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000161095	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	270								dusp12 (ENSLBEG00000024420)	blvra (ENSLBEG00000024394)	ccr12a (ENSLBEG00000024374)	mrpl37 (ENSLBEG00000024354)	csnk1g2a (ENSLBEG00000024330)	mfsd12a (ENSLBEG00000024279)	DEPDC5 (ENSLBEG00000024189)	PDC (ENSLBEG00000024098)	kifap3b (ENSLBEG00000024039) ##22	ENSLBEG00000024013	ENSLBEG00000023992	ENSLBEG00000023966	atpsckmt (ENSLBEG00000023938)	marchf6 (ENSLBEG00000023830)	ANKRD33B (ENSLBEG00000023797)	ctnnd2b (ENSLBEG00000023736)	ENSLBEG00000023630	ENSLBEG00000023582
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000153304.C	ENSGT00940000156181.B	ENSGT00940000166547.b	ENSGT00940000159203	ENSGT00940000164519.c.a	ENSGT00940000155899.e.b	ENSGT00940000156209.v.a	ENSGT00530000063681.b.b	ENSGT00940000156460.A	ENSGT00390000000867	ENSGT00940000156470.u.b	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00390000016559	ENSGT00940000159687	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000161095	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000153304.C	ENSGT00940000156181.B	ENSGT00940000166547.b	ENSGT00940000159203	ENSGT00940000164519.c.a	ENSGT00940000155899.e.b	ENSGT00940000156209.v.a	ENSGT00530000063681.b.b	ENSGT00940000156460.A	ENSGT00390000000867	ENSGT00940000156470.u.b	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00390000016559	ENSGT00940000159687	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000161095	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	13	ptf1a (ENSSAUG00010011904)	dlgap1a (ENSSAUG00010011870)	cahz (ENSSAUG00010011851)	ENSSAUG00010011849	gad3 (ENSSAUG00010011690)	exoc3 (ENSSAUG00010011682)	ENSSAUG00010011681	ENSSAUG00010011680	ENSSAUG00010011537	xkr4 (ENSSAUG00010011520)	tmem68 (ENSSAUG00010011516)	ENSSAUG00010011513	ENSSAUG00010011393	ccr12a (ENSSAUG00010011384)	PDC (ENSSAUG00010011382)	kifap3b (ENSSAUG00010010877) ##22	ENSSAUG00010010873 ##23	OLFML2B (ENSSAUG00010010872)	dusp12 (ENSSAUG00010010871)	prg4a (ENSSAUG00010010870)	TPR (ENSSAUG00010007971)	odr4 (ENSSAUG00010007955)	dpydb (ENSSAUG00010007417)	paxip1 (ENSSAUG00010007399)	en2b (ENSSAUG00010007396)	ENSSAUG00010005610	ENSSAUG00010005560	TMEM70 (ENSSAUG00010005557)	cyp7a1 (ENSSAUG00010005552)	ENSSAUG00010005550	sdr16c5a (ENSSAUG00010005547)
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000156181.B	ENSGT00940000166547.b	ENSGT00940000156304.c.b	ENSGT00940000159203	ENSGT00940000164519.c.a	ENSGT00940000155899.e.b	ENSGT00940000156209.v.a	ENSGT00530000063681.b.b	ENSGT00940000156460.A	ENSGT00390000000867	ENSGT00940000156470.u.b	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00390000016559	ENSGT00940000159687	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000161095	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	481	ENSLCRG00005017525	ENSLCRG00005017523	ttpa (ENSLCRG00005017518)	xpr1b (ENSLCRG00005017340)	ENSLCRG00005017332	dnai4 (ENSLCRG00005017327)	ENSLCRG00005017312	ENSLCRG00005017308	ACOT11 (ENSLCRG00005017196)	mrpl37 (ENSLCRG00005017194)	csnk1g2a (ENSLCRG00005016436)	mfsd12a (ENSLCRG00005016365)	DEPDC5 (ENSLCRG00005016299)	rab36 (ENSLCRG00005016286)	PDC (ENSLCRG00005016278)	kifap3b (ENSLCRG00005014508) ##22	ENSLCRG00005014491 ##23	OLFML2B (ENSLCRG00005014488)	TPR (ENSLCRG00005013257)	odr4 (ENSLCRG00005013208)	dpydb (ENSLCRG00005013062)	ptbp2b (ENSLCRG00005008471)	CHD7 (ENSLCRG00005002852)	rab2a (ENSLCRG00005002596)	ca8 (ENSLCRG00005002590)	tox (ENSLCRG00005002586)	ENSLCRG00005002583	cryz (ENSLCRG00005002576)	DARS2 (ENSLCRG00005000452)	bpnt2 (ENSLCRG00005000409)	ankrd45 (ENSLCRG00005000403)
European seabass	MODERN SPECIES		ENSDLAG00005000050	ENSDLAG00005034775	ENSDLAG00005027883	ENSDLAG00005000055	ENSDLAG00005000057	ENSDLAG00005000058	ENSDLAG00005000059	ACOT11 (ENSDLAG00005000060)	mrpl37 (ENSDLAG00005027699)	ENSDLAG00005000061	ENSDLAG00005000062	ENSDLAG00005000063	ENSDLAG00005000064	ENSDLAG00005027010	ENSDLAG00005000128	ENSDLAG00005000237 ##22	ENSDLAG00005000351 ##23	ENSDLAG00005026926	dusp12 (ENSDLAG00005000361)	prg4a (ENSDLAG00005000363)	ENSDLAG00005028037	odr4 (ENSDLAG00005006309)	ENSDLAG00005000398	ENSDLAG00005000666	CHD7 (ENSDLAG00005001098)	rab2a (ENSDLAG00005001631)	ca8 (ENSDLAG00005035106)	tox (ENSDLAG00005026957)	ENSDLAG00005032927	ENSDLAG00005027625	ENSDLAG00005001782
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000166576	ENSGT00940000156220.l	ENSGT00940000161000	ENSGT00940000155751.b	ENSGT00390000012668.g.b	ENSGT00950000183056.B.b	ENSGT00390000000924	ENSGT00530000063681.b.b	ENSGT00940000156460.A	ENSGT00390000000867	ENSGT00940000156470.u.b	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00390000016559	ENSGT00940000159687	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b.h	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B	ENSGT00940000164879
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000164640	ENSGT00940000178091	ENSGT00390000012596.e	ENSGT00940000157704.a.a	ENSGT00940000157718.c	ENSGT00940000158610.d	ENSGT00940000153304.C	ENSGT00940000156181.B	ENSGT00940000156460.A	ENSGT00390000000867	ENSGT00940000156470.u.b	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00390000016559	ENSGT00940000159687	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT01070000253766.A.a.a.a	ENSGT00390000011782	ENSGT00390000018056	ENSGT00940000156130.a.b	ENSGT00950000183149.A.f	ENSGT00940000156731.q.b	ENSGT00940000156600.e	ENSGT00390000000924	ENSGT00950000183056.B.b	ENSGT00390000012668.g.b	ENSGT00940000161000	ENSGT00940000156220.l	ENSGT00940000166576	ENSGT00940000166844
Stickleback	MODERN SPECIES	2	rnf2 (ENSGACG00000014602)	ENSGACG00000014610	AGL (ENSGACG00000014614)	ENSGACG00000014621	PLPPR5 (ENSGACG00000014623)	tyw3 (ENSGACG00000014630)	ENSGACG00000014632	KCNH2 (ENSGACG00000014637)	ACOT11 (ENSGACG00000014650)	mrpl37 (ENSGACG00000014661)	csnk1g2a (ENSGACG00000014664)	mfsd12a (ENSGACG00000014668)	DEPDC5 (ENSGACG00000014670)	rab36 (ENSGACG00000014678)	PDC (ENSGACG00000014695)	kifap3b (ENSGACG00000014703) ##22	ENSGACG00000014711 ##23	xkr4 (ENSGACG00000014715)	tmem68 (ENSGACG00000014718)	ENSGACG00000014724	jph1b (ENSGACG00000014728)	penka (ENSGACG00000014732)	sdr16c5a (ENSGACG00000014733)	ENSGACG00000014747	ENSGACG00000014753	fam110b (ENSGACG00000014755)	ENSGACG00000014756	ptf1a (ENSGACG00000014760)	dlgap1a (ENSGACG00000014766)	cahz (ENSGACG00000014774)	ENSGACG00000014800
Lumpfish	MODERN SPECIES	8	AGL (ENSCLMG00005018629)	ENSCLMG00005018615	PALMD (ENSCLMG00005018614)	PLPPR5 (ENSCLMG00005018613)	tyw3 (ENSCLMG00005018611)	ENSCLMG00005018610	ENSCLMG00005018609	ACOT11 (ENSCLMG00005018596)	mrpl37 (ENSCLMG00005018595)	CSNK1G2 (ENSCLMG00005018230)	mfsd12a (ENSCLMG00005018180)	DEPDC5 (ENSCLMG00005007666)	rab36 (ENSCLMG00005007608)	ENSCLMG00005007606	PDC (ENSCLMG00005007605)	kifap3b (ENSCLMG00005007229) ##22	ENSCLMG00005007216 ##23	xkr4 (ENSCLMG00005007210)	tmem68 (ENSCLMG00005007204)	ENSCLMG00005007202	JPH1 (ENSCLMG00005007200)	penka (ENSCLMG00005007198)	sdr16c5a (ENSCLMG00005007197)	ENSCLMG00005007031	atg10 (ENSCLMG00005007026)	fam110b (ENSCLMG00005007014)	ENSCLMG00005007012	ptf1a (ENSCLMG00005007011)	ENSCLMG00005006998	cahz (ENSCLMG00005006995)	gad3 (ENSCLMG00005001849)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	24											ENSGT00940000156470.u.b	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00390000016559	ENSGT00940000159687	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b.h	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B	ENSGT00940000164879
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	130												CSNK1G2 (ENSCGOG00000017207)	mfsd12a (ENSCGOG00000017975)	rab36 (ENSCGOG00000017980)	PDC (ENSCGOG00000017993)	kifap3b (ENSCGOG00000017995) ##22
Pike perch	MODERN SPECIES	240									csnk1g2a (ENSSLUG00000025848)	mfsd12a (ENSSLUG00000025827)	DEPDC5 (ENSSLUG00000025786)	rab36 (ENSSLUG00000025743)	ENSSLUG00000025740	ENSSLUG00000025738	PDC (ENSSLUG00000025736)	kifap3b (ENSSLUG00000025690) ##22	ENSSLUG00000025588 ##23	ENSSLUG00000025586	dusp12 (ENSSLUG00000025580)	TPR (ENSSLUG00000025556)	odr4 (ENSSLUG00000025519)	dpydb (ENSSLUG00000025481)	ptbp2b (ENSSLUG00000025445)	CHD7 (ENSSLUG00000025341)	rab2a (ENSSLUG00000025294)	ca8 (ENSSLUG00000025290)	mfsd12a (ENSSLUG00000025286)	ENSSLUG00000025283	cryz (ENSSLUG00000025277)	ENSSLUG00000025265	DARS2 (ENSSLUG00000025262)
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00920000149161	ENSGT00940000158543	ENSGT00390000003140.A	ENSGT00940000165818	ENSGT00940000155161	ENSGT00940000156200.A	ENSGT00940000159742.rb	ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d	ENSGT00940000154805.b.g.e.b.c	ENSGT00990000203911	ENSGT00940000159432.C	ENSGT00530000063693.a.a	ENSGT00940000166060	ENSGT00940000157790	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B	ENSGT00940000164879
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00920000149161	ENSGT00940000158543	ENSGT00390000003140.A	ENSGT00940000165818	ENSGT00940000155161	ENSGT00940000156200.A	ENSGT00940000159742.rb	ENSGT00990000203911	ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d	ENSGT00940000154805.b.g.e.b.c	ENSGT00940000159432.C	ENSGT00530000063693.a.a	ENSGT00940000166060	ENSGT00940000157790	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B	ENSGT00940000164879
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	8	brinp2 (ENSMAMG00000012633)	ENSMAMG00000012609	ENSMAMG00000012571	ENSMAMG00000012550	ENSMAMG00000026207	ENSMAMG00000012535	ENSMAMG00000012523	myh7 (ENSMAMG00000012443)	ENSMAMG00000025663	myh7 (ENSMAMG00000012282)	fitm1l (ENSMAMG00000012201)	trnau1apb (ENSMAMG00000012192)	ENSMAMG00000012174	ENSMAMG00000012153	ENSMAMG00000012124	ENSMAMG00000012070 ##22	ENSMAMG00000012052 ##23	ENSMAMG00000012018	ENSMAMG00000011975	prg4a (ENSMAMG00000011941)	ENSMAMG00000011784	odr4 (ENSMAMG00000011684)	ENSMAMG00000011672	ENSMAMG00000011621	ENSMAMG00000011582	CHD7 (ENSMAMG00000011569)	rab2a (ENSMAMG00000011549)	ca8 (ENSMAMG00000011532)	ENSMAMG00000024843	tox (ENSMAMG00000011519)	ENSMAMG00000011494
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000156304.c.b	ENSGT00940000166547	ENSGT00940000159203	ENSGT00940000164519.c.a	ENSGT00940000155899.e.b	ENSGT00940000156209.v.a	ENSGT00530000063681.b.b	ENSGT00940000156460.A	ENSGT00390000000867	ENSGT00940000156470.u.b	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00390000016559	ENSGT00940000159687	ENSGT00940000157790	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B	ENSGT00940000164879
Climbing perch	MODERN SPECIES	8	ENSATEG00000026957	ENSATEG00000028546	ENSATEG00000004014	ENSATEG00000028612	ENSATEG00000003966	ENSATEG00000003925	ENSATEG00000003690	ENSATEG00000003817	ENSATEG00000003789	ENSATEG00000003741	ENSATEG00000003877	ENSATEG00000003538	ENSATEG00000003390	ENSATEG00000003368	ENSATEG00000003309	ENSATEG00000003176 ##22	ENSATEG00000003164 ##23	ENSATEG00000003154	dusp12 (ENSATEG00000003117)	ENSATEG00000002851	odr4 (ENSATEG00000002841)	ENSATEG00000002731	ENSATEG00000002722	CHD7 (ENSATEG00000002590)	rab2a (ENSATEG00000002553)	ca8 (ENSATEG00000028855)	ca8 (ENSATEG00000025910)	tox (ENSATEG00000002446)	ENSATEG00000002313	ENSATEG00000002270	ENSATEG00000002262
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	8	ENSBSLG00000024042	ENSBSLG00000024045	ENSBSLG00000024049	ENSBSLG00000024051	ENSBSLG00000024053	ENSBSLG00000024056	ENSBSLG00000024057	ENSBSLG00000024058	ENSBSLG00000024059	ENSBSLG00000024062	ENSBSLG00000024064	zgc:162816 (ENSBSLG00000024069)	ENSBSLG00000024076	CFAP410 (ENSBSLG00000024207)	zgc:171772 (ENSBSLG00000024214)	kifap3b (ENSBSLG00000024251) ##22	ENSBSLG00000024731 ##23	ENSBSLG00000024739	OLFML2B (ENSBSLG00000024746)	dusp12 (ENSBSLG00000024754)	prg4a (ENSBSLG00000024773)	odr4 (ENSBSLG00000024872)	dpydb (ENSBSLG00000024910)	ENSBSLG00000025384	ENSBSLG00000025402	stk11 (ENSBSLG00000025416)	SUGP1 (ENSBSLG00000025481)	rnf126 (ENSBSLG00000025588)	ENSBSLG00000025594	ENSBSLG00000025614	fzr1a (ENSBSLG00000025629)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00920000149161	ENSGT00940000158543	ENSGT00390000003140.A	ENSGT00940000165818	ENSGT00940000155161	ENSGT00940000156200.A	ENSGT00940000159742.rb	ENSGT00990000203911	ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d	ENSGT00940000154805.b.g.e.b.c	ENSGT00940000159432.C	ENSGT00530000063693.a.a	ENSGT00940000166060	ENSGT00940000157790	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B	ENSGT00940000164879
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00920000149161	ENSGT00940000158543	ENSGT00390000003140.A	ENSGT00940000165818	ENSGT00940000155161	ENSGT00940000156200.A	ENSGT00940000159742.rb	ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d	ENSGT00990000203911	ENSGT00940000154805.b.g.e.b.c	ENSGT00940000159432.C	ENSGT00530000063693.a.a	ENSGT00940000166060	ENSGT00940000159846.a.a.c	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863	ENSGT00940000159497	ENSGT00940000154882	ENSGT01030000234618.B	ENSGT00940000164879
Tongue sole	MODERN SPECIES	12	ENSCSEG00000021117	LRRC24 (ENSCSEG00000021115)	slc6a9 (ENSCSEG00000021110)	klf17 (ENSCSEG00000021108)	klhl20 (ENSCSEG00000021070)	lhx8a (ENSCSEG00000021069)	ENSCSEG00000021067	ENSCSEG00000021065	myh7 (ENSCSEG00000021064)	myh7 (ENSCSEG00000020930)	myh7 (ENSCSEG00000020685)	myh7l (ENSCSEG00000018616)	fitm1l (ENSCSEG00000018233)	trnau1apb (ENSCSEG00000018215)	ENSCSEG00000018199	kifap3b (ENSCSEG00000018181) ##22	ENSCSEG00000018169 ##23	ENSCSEG00000018165	dusp12 (ENSCSEG00000018154)	TPR (ENSCSEG00000018077)	odr4 (ENSCSEG00000018012)	dpydb (ENSCSEG00000017980)	ptbp2b (ENSCSEG00000017942)	CHD7 (ENSCSEG00000017886)	rab2a (ENSCSEG00000017211)	ca8 (ENSCSEG00000017183)	tox (ENSCSEG00000017169)	cryz (ENSCSEG00000017160)	DARS2 (ENSCSEG00000017136)	bpnt2 (ENSCSEG00000017120)	TMEM70 (ENSCSEG00000017131)
Turbot	MODERN SPECIES	19	ASTN1 (ENSSMAG00000016890)	brinp2 (ENSSMAG00000016971)	ENSSMAG00000017018	ENSSMAG00000017029	ENSSMAG00000017060	ENSSMAG00000033886	ENSSMAG00000019154	ENSSMAG00000013690	ENSSMAG00000037749	ENSSMAG00000019070	myh7l (ENSSMAG00000002571)	ENSSMAG00000001745	ENSSMAG00000001738	ENSSMAG00000001718	ENSSMAG00000001596	ENSSMAG00000001503 ##22	ENSSMAG00000001488 ##23	ENSSMAG00000001466	dusp12 (ENSSMAG00000001443)	prg4a (ENSSMAG00000001410)	ENSSMAG00000001286	odr4 (ENSSMAG00000001266)	ENSSMAG00000001180	ENSSMAG00000001131	CHD7 (ENSSMAG00000001030)	rab2a (ENSSMAG00000001002)	ca8 (ENSSMAG00000000968)	tox (ENSSMAG00000000920)	ENSSMAG00000000876	ENSSMAG00000000796	ENSSMAG00000017469
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00920000149161	ENSGT00940000158543	ENSGT00390000003140.A	ENSGT00940000165818	ENSGT00940000155161	ENSGT00940000156200.A	ENSGT00940000159742.rb	ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d	ENSGT00940000154805.b.g.e.b.c	ENSGT00990000203911	ENSGT00940000159432.C	ENSGT00530000063693.a.a	ENSGT00940000166060	ENSGT00940000159846.a.a.c	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000158863
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	129										ENSGT00500000044896	ENSGT01050000244924.a.b.h	ENSGT00940000153649.A	ENSGT00940000153886.a.b	ENSGT00940000157790	ENSGT00940000156236.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.h ##23	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00390000012568	ENSGT00390000000715	ENSGT00940000153167.B	ENSGT00940000167820	ENSGT00510000049326.b.a	ENSGT01050000244838.B.a	ENSGT00940000157139.b	ENSGT00940000158362	ENSGT00390000018302	ENSGT00940000158011
Greater amberjack	MODERN SPECIES	264									ca8 (ENSSDUG00000013961)	dpydb (ENSSDUG00000013875)	ptbp2b (ENSSDUG00000013833)	CHD7 (ENSSDUG00000013773)	rab2a (ENSSDUG00000013724)	kcnh2a (ENSSDUG00000013672)	PDC (ENSSDUG00000013654)	kifap3b (ENSSDUG00000013588) ##22	ENSSDUG00000013543 ##23	OLFML2B (ENSSDUG00000013527)	dusp12 (ENSSDUG00000013512)	prg4a (ENSSDUG00000013442)	TPR (ENSSDUG00000013362)	odr4 (ENSSDUG00000013326)	tmem53 (ENSSDUG00000013305)	toe1 (ENSSDUG00000013278)	si:ch73-382f3.1 (ENSSDUG00000013266)	ENSSDUG00000013249	elovl8a (ENSSDUG00000013211)	fabp6 (ENSSDUG00000013182)	zswim5 (ENSSDUG00000013129)	urod (ENSSDUG00000013106)	lyn (ENSSDUG00000012519)
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2655											ENSSLDG00000022663	CHD7 (ENSSLDG00000022595)	rab2a (ENSSLDG00000022555)	ENSSLDG00000022532	PDC (ENSSLDG00000022509)	kifap3b (ENSSLDG00000022470) ##22	OLFML2B (ENSSLDG00000022429)	dusp12 (ENSSLDG00000022399)	prg4a (ENSSLDG00000022384)	TPR (ENSSLDG00000022063)	odr4 (ENSSLDG00000021997)	tmem53 (ENSSLDG00000021988)	toe1 (ENSSLDG00000021979)	si:ch73-382f3.1 (ENSSLDG00000021969)	ENSSLDG00000021958	elovl8a (ENSSLDG00000021946)	fabp6 (ENSSLDG00000021872)	zswim5 (ENSSLDG00000021843)	urod (ENSSLDG00000021698)	lyn (ENSSLDG00000021626)	ENSSLDG00000021616
Barramundi perch	MODERN SPECIES	77				klhl20 (ENSLCAG00010008014)	ENSLCAG00010008180	lhx8a (ENSLCAG00010008184)	ENSLCAG00010008191	ENSLCAG00010008198	myh7 (ENSLCAG00010009514)	myh7 (ENSLCAG00010015140)	fitm1l (ENSLCAG00010015291)	trnau1apb (ENSLCAG00010015295)	ENSLCAG00010015299	kcnh2a (ENSLCAG00010015317)	PDC (ENSLCAG00010015351)	kifap3b (ENSLCAG00010015477) ##22	ENSLCAG00010015944 ##23	ENSLCAG00010015948	dusp12 (ENSLCAG00010015950)	ENSLCAG00010015951	prg4a (ENSLCAG00010015955)	TPR (ENSLCAG00010015959)	odr4 (ENSLCAG00010015965)	dpydb (ENSLCAG00010015993)	ptbp2b (ENSLCAG00010016065)	ENSLCAG00010016082
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	8														mfsd12a (ENSMMDG00005019925)	PDC (ENSMMDG00005019928)	KIFAP3 (ENSMMDG00005019998) ##22	ENSMMDG00005022316 ##23	ENSMMDG00005022320	dusp12 (ENSMMDG00005022322)	prg4a (ENSMMDG00005022325)	TPR (ENSMMDG00005022328)	odr4 (ENSMMDG00005022337)	rnf2 (ENSMMDG00005022338)	ENSMMDG00005022342	AGL (ENSMMDG00005022360)	ENSMMDG00005022480	PLPPR5 (ENSMMDG00005022483)	PLPPR4 (ENSMMDG00005022520)	ptbp2b (ENSMMDG00005022534)	dpydb (ENSMMDG00005022666)	ENSMMDG00005022676
Cod	MODERN SPECIES	21	ENSGMOG00000022214	ENSGMOG00000025577	ENSGMOG00000007436	ENSGMOG00000025885	ENSGMOG00000006947	ENSGMOG00000006956	ENSGMOG00000006972	ENSGMOG00000014481	ENSGMOG00000015473	ENSGMOG00000018917	ENSGMOG00000017508	ENSGMOG00000009060	ENSGMOG00000009051	ENSGMOG00000032715	ENSGMOG00000018518	ENSGMOG00000018107 ##22	ENSGMOG00000010376	ENSGMOG00000013075	ENSGMOG00000034702	ENSGMOG00000013119	ENSGMOG00000030154	ENSGMOG00000002403	ENSGMOG00000006396	cop1 (ENSGMOG00000006356)	ENSGMOG00000001009	ENSGMOG00000031909	brinp2 (ENSGMOG00000035387)	ENSGMOG00000001160	ENSGMOG00000001187	ENSGMOG00000013118	ENSGMOG00000036652
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	573														ENSGT00940000156470.u.b	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.g.a ##23	ENSGT00940000154499
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT01090000260100.B.b	ENSGT00940000158447	ENSGT00390000017498.b	ENSGT00940000153241.B.d	ENSGT00940000156474.a.a	ENSGT00940000156970.c.a	ENSGT00940000159656.a.b	ENSGT00940000161104	ENSGT00940000156577.b	ENSGT00940000157247.a.b	ENSGT00440000037733.e	ENSGT00940000158800.fb	ENSGT00390000006876	ENSGT00940000156470.u.b	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.g.a ##23	ENSGT00940000154499	ENSGT00940000154654.a.b.g	ENSGT01030000234606.b.e.a	ENSGT00390000010743.a.b	ENSGT00940000156236.b	ENSGT00390000012568	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT01020000231030	ENSGT00930000151041	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00940000164640	ENSGT00940000178091	ENSGT00390000012596.e
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	77	ENSGT00940000153241.B.d	ENSGT00940000156474.a.a	ENSGT00940000156970.c.a	ENSGT00940000159656.a.b	ENSGT00940000161104	ENSGT00940000156577.b	ENSGT00940000157247.a.b	ENSGT00440000037733.e	ENSGT00940000158800.fb	ENSGT00390000006876	ENSGT01030000237605	ENSGT00940000154587.a.b.m	ENSGT00940000156470.u.b	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00940000159466.d #18	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.g.a ##23	ENSGT00940000154499	ENSGT00390000001254	ENSGT00940000155635	ENSGT00940000154654.a.b.g	ENSGT01030000234606.b.e.a	ENSGT00390000010743.a.b	ENSGT00940000156236.b	ENSGT00390000012568	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00930000151041	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00940000164640	ENSGT00390000012596.e
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	63	ENSGT00940000158447	ENSGT00390000017498.b	ENSGT00940000153241.B.d	ENSGT00940000156474.a.a	ENSGT00940000156970.c.a	ENSGT00940000159656.a.b	ENSGT00940000161104	ENSGT00940000156577.b	ENSGT00940000157247.a.b	ENSGT00440000037733.e	ENSGT00940000158800.fb	ENSGT00390000006876	ENSGT00940000156470.u.b	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00940000159466.d #18	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.g.a ##23	ENSGT00940000154499	ENSGT00390000001254	ENSGT00940000155635	ENSGT00940000154654.a.b.g	ENSGT01030000234606.b.e.a	ENSGT00390000010743.a.b	ENSGT00940000156236.b	ENSGT00390000012568	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00940000166054.c	ENSGT00940000166019	ENSGT00940000159221.j	ENSGT00930000151041
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	74	ENSGT00940000158447	ENSGT00390000017498.b	ENSGT00940000153241.B.d	ENSGT00940000156474.a.a	ENSGT00940000156970.c.a	ENSGT00940000159656.a.b	ENSGT00940000161104	ENSGT00940000156577.b	ENSGT00940000157247.a.b	ENSGT00440000037733.e	ENSGT00940000158800.fb	ENSGT00390000006876	ENSGT00940000156470.u.b	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00940000159466.d #18	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00390000016193	ENSGT00940000154149.b.a.g.a ##23	ENSGT00940000154499	ENSGT00940000154654.a.b.g	ENSGT01030000234606.b.e.a	ENSGT00390000010743.a.b	ENSGT00940000156236.b	ENSGT00390000012568	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00940000166054.c	ENSGT00940000166019	ENSGT00940000159221.j	ENSGT00930000151041	ENSGT00940000157757.g.b
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	651															prrx1a (ENSPNAG00000029371) #18	kifap3b (ENSPNAG00000029466) ##22	MBLAC1 (ENSPNAG00000029470)	ENSPNAG00000004612 ##23	rnf2 (ENSPNAG00000029511)	ivns1abpb (ENSPNAG00000004658)	ENSPNAG00000029630	ENSPNAG00000029639
Mexicana tetra	MODERN SPECIES		ESPNL (ENSAMXG00000005914)	rab6bb (ENSAMXG00000005911)	aire (ENSAMXG00000029147)	amotl2b (ENSAMXG00000037844)	ENSAMXG00000005851	ENSAMXG00000042872	sap130b (ENSAMXG00000005800)	mllt1b (ENSAMXG00000005765)	znf414 (ENSAMXG00000005757)	ENSAMXG00000034186	ENSAMXG00000035043	mknk2a (ENSAMXG00000005705)	csnk1g2a (ENSAMXG00000005682)	mfsd12a (ENSAMXG00000030010)	prrx1a (ENSAMXG00000034043) #18	kifap3b (ENSAMXG00000005640) ##22	MBLAC1 (ENSAMXG00000005619)	ENSAMXG00000033851 ##23	rnf2 (ENSAMXG00000005594)	ivns1abpb (ENSAMXG00000005578)	ENSAMXG00000029027	ENSAMXG00000032845	arpc5a (ENSAMXG00000005548)	pla2g4aa (ENSAMXG00000005517)	ptgs2a (ENSAMXG00000005495)	pdca (ENSAMXG00000035849)	odr4 (ENSAMXG00000005471)	TPR (ENSAMXG00000005429)	ENSAMXG00000037159	prg4a (ENSAMXG00000005411)	ENSAMXG00000041881
Electric eel	MODERN SPECIES	19	agxtb (ENSEEEG00000020861)	KIF1A (ENSEEEG00000020844)	ESPNL (ENSEEEG00000020841)	rab6bb (ENSEEEG00000020809)	aire (ENSEEEG00000020805)	amotl2b (ENSEEEG00000020801)	ENSEEEG00000020773	sap130b (ENSEEEG00000020148)	mllt1b (ENSEEEG00000020134)	znf414 (ENSEEEG00000020133)	ENSEEEG00000020127	mknk2a (ENSEEEG00000020124)	csnk1g2a (ENSEEEG00000019777)	mfsd12a (ENSEEEG00000019746)	prrx1a (ENSEEEG00000019743) #18	kifap3b (ENSEEEG00000019739) ##22	NIBAN1 (ENSEEEG00000019737) ##23	rnf2 (ENSEEEG00000019736)	ivns1abpb (ENSEEEG00000019727)	ENSEEEG00000019723	arpc5a (ENSEEEG00000019719)	pla2g4aa (ENSEEEG00000019312)	ptgs2a (ENSEEEG00000019298)	pdca (ENSEEEG00000019297)	odr4 (ENSEEEG00000019296)	TPR (ENSEEEG00000018880)	prg4a (ENSEEEG00000018853)	ENSEEEG00000018709	dusp12 (ENSEEEG00000018703)	OLFML2B (ENSEEEG00000018702)	ENSEEEG00000018700
Channel catfish	MODERN SPECIES	8	ENSIPUG00000016576	katnal1 (ENSIPUG00000016551)	ENSIPUG00000016537	ENSIPUG00000016524	ENSIPUG00000016500	ENSIPUG00000016485	ENSIPUG00000016470	ENSIPUG00000016432	ENSIPUG00000016412	ENSIPUG00000016395	ENSIPUG00000016384	ENSIPUG00000016375	Csnk1g2 (ENSIPUG00000016316)	mfsd12a (ENSIPUG00000016251)	Prrx1 (ENSIPUG00000016228) #18	kifap3b (ENSIPUG00000016067) ##22	ENSIPUG00000016042	msh5 (ENSIPUG00000016018)	RH11 (ENSIPUG00000016013)	ROBO1 (ENSIPUG00000015850)	robo2 (ENSIPUG00000015618)	ENSIPUG00000015562	ENSIPUG00000015551	ENSIPUG00000015481	stim1a (ENSIPUG00000015417)	Rhog (ENSIPUG00000015404)	ENSIPUG00000015385	ENSIPUG00000015338	ENSIPUG00000015316	ENSIPUG00000015304	ENSIPUG00000015284
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT01090000260100.B.b	ENSGT00940000158447	ENSGT00390000017498.b	ENSGT00940000153241.B.d	ENSGT00940000156474.a.a	ENSGT00940000156970.c.a	ENSGT00940000159656.a.b	ENSGT00940000161104	ENSGT00940000156577.b	ENSGT00940000157247.a.b	ENSGT00440000037733.e	ENSGT00940000158800.fb	ENSGT00390000006876	ENSGT00940000156470.u.b	ENSGT00390000005318.a.a.b	ENSGT00390000003574.b ##22	ENSGT00940000154149.b.a.g.a ##23	ENSGT00940000154499	ENSGT00940000154654.a.b.g	ENSGT01030000234606.b.e.a	ENSGT00390000010743.a.b	ENSGT00940000156236.b	ENSGT00390000012568	ENSGT00730000111014.o.a	ENSGT00530000063751.a.b	ENSGT00940000166019.k.b	ENSGT01020000231030	ENSGT00930000151041	ENSGT00940000157757.g.b	ENSGT00940000164640	ENSGT00940000178091
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158447.w	ENSGT00940000153241.B.d.a	ENSGT00940000156474.a.a.m	ENSGT00940000156970.c.a	ENSGT00940000159656.a.b.b	ENSGT00940000161104.e	ENSGT00940000156577.b.c	ENSGT00940000157247.a.b.a	ENSGT00440000037733.e.a	ENSGT00940000158800.fb.b	ENSGT00390000006876.b	ENSGT00940000154587.a.b.r.b	ENSGT00940000156470.u.b.b.a.a	ENSGT00390000005318.a.a.b.e	ENSGT00940000159466.d.d.a #18	ENSGT00390000003574.b.c ##22	ENSGT00940000154149.b.a.g.a.b ##23	ENSGT00940000154499.kb	ENSGT00940000155635.v.a	ENSGT00940000154654.a.b.g.a	ENSGT01030000234606.b.e.a.a	ENSGT00390000010743.a.b.a	ENSGT00940000156236.b.c	ENSGT00390000012568.i	ENSGT00730000111014.o.a.d	ENSGT00530000063751.a.b.a	ENSGT00940000166019.k.b.b	ENSGT00930000151041.d	ENSGT00940000157757.g.b.c	ENSGT00940000164640.j	ENSGT00940000164178.eb
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	65	ENSGT00940000158447.w	ENSGT00940000153241.B.d.a	ENSGT00940000156474.a.a.m	ENSGT00940000156970.c.a	ENSGT00940000159656.a.b.b	ENSGT00940000161104.e	ENSGT00940000156577.b.c	ENSGT00940000157247.a.b.a	ENSGT00440000037733.e.a	ENSGT00940000158800.fb.b	ENSGT00390000006876.b	ENSGT00940000154587.a.b.r.b	ENSGT00940000156470.u.b.b.a.a	ENSGT00390000005318.a.a.b.e	ENSGT00940000159466.d.d.a #18	ENSGT00390000003574.b.c ##22	ENSGT00940000154149.b.a.g.a.b ##23	ENSGT00940000154499.kb	ENSGT00940000155635.v.a	ENSGT00940000154654.a.b.g.a	ENSGT01030000234606.b.e.a.a	ENSGT00390000010743.a.b.a	ENSGT00940000156236.b.c	ENSGT00390000012568.i	ENSGT00730000111014.o.a.d	ENSGT00530000063751.a.b.a	ENSGT00940000166019.k.b.b	ENSGT00930000151041.d	ENSGT00940000157757.g.b.c	ENSGT00940000164640.j	ENSGT00390000012596.e.a.a
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	120	zgc:161973 (ENSSGRG00000051483)	agxtb (ENSSGRG00000051491)	KIF1A (ENSSGRG00000051533)	ESPNL (ENSSGRG00000052112)	rab6bb (ENSSGRG00000052113)	aire (ENSSGRG00000052119)	amotl2b (ENSSGRG00000052122)	ENSSGRG00000052123	sap130b (ENSSGRG00000052129)	mllt1b (ENSSGRG00000052309)	znf414 (ENSSGRG00000052310)	mknk2a (ENSSGRG00000052314)	csnk1g2a (ENSSGRG00000052344)	mfsd12a (ENSSGRG00000052704)	prrx1a (ENSSGRG00000052732) #18	kifap3b (ENSSGRG00000052736) ##22	ENSSGRG00000052750 ##23	rnf2 (ENSSGRG00000052753)	ivns1abpb (ENSSGRG00000052764)	arpc5a (ENSSGRG00000052797)	pla2g4aa (ENSSGRG00000052805)	ptgs2a (ENSSGRG00000053062)	pdca (ENSSGRG00000053134)	odr4 (ENSSGRG00000053135)	TPR (ENSSGRG00000053144)	prg4a (ENSSGRG00000053163)	ENSSGRG00000053173	dusp12 (ENSSGRG00000053221)	OLFML2B (ENSSGRG00000053222)	ENSSGRG00000053223	agla (ENSSGRG00000053226)
Common carp reference	MODERN SPECIES	21	thap4 (ENSCCRG00000047678)	agxtb (ENSCCRG00000070674)	ENSCCRG00000041875	ENSCCRG00000052300	rab6bb (ENSCCRG00000053283)	aire (ENSCCRG00000052308)	amotl2b (ENSCCRG00000052311)	ENSCCRG00000034462	sap130b (ENSCCRG00000010106)	mllt1b (ENSCCRG00000070889)	znf414 (ENSCCRG00000073873)	mknk2a (ENSCCRG00000017949)	csnk1g2a (ENSCCRG00000018087)	mfsd12a (ENSCCRG00000062536)	prrx1a (ENSCCRG00000017974) #18	kifap3b (ENSCCRG00000031757) ##22	ENSCCRG00000017838 ##23	rnf2 (ENSCCRG00000062486)	ivns1abpb (ENSCCRG00000017789)	arpc5a (ENSCCRG00000017777)	pla2g4aa (ENSCCRG00000024484)	ptgs2a (ENSCCRG00000024657)	pdca (ENSCCRG00000071415)	odr4 (ENSCCRG00000014901)	TPR (ENSCCRG00000014978)	prg4a (ENSCCRG00000016984)	ENSCCRG00000017015	dusp12 (ENSCCRG00000016238)	ENSCCRG00000042467	ENSCCRG00000042438	ENSCCRG00000063112
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	103	ENSGT00940000158447.x	ENSGT00390000017498.b.a	ENSGT00940000153241.B.d.b	ENSGT00940000156474.a.a.n	ENSGT00940000159656.a.b.a	ENSGT00940000161104.f	ENSGT00940000156577.b.d.a.a	ENSGT00940000157247.a.b.b	ENSGT00440000037733.e.b	ENSGT00940000158800.fb.a	ENSGT00390000006876.a.a	ENSGT00940000154587.a.b.r.a	ENSGT00940000156470.u.b.a	ENSGT00390000005318.a.a.b.f	ENSGT00940000159466.d.d.b #18	ENSGT00390000003574.b.d ##22	ENSGT00940000154149.b.a.g.a.a ##23	ENSGT00940000154499.jb	ENSGT00940000155635.v.b	ENSGT00940000154654.a.b.g.b	ENSGT01030000234606.b.e.a.b	ENSGT00390000010743.a.b.b	ENSGT00940000156236.b.d	ENSGT00390000012568.j	ENSGT00730000111014.o.a.c	ENSGT00530000063751.a.b.b	ENSGT00940000166019.k.b.a	ENSGT01020000231030	ENSGT00930000151041.c	ENSGT00940000157757.g.b.d	ENSGT00940000164640.i
Goldfish	MODERN SPECIES	19	thap4 (ENSCARG00000017718)	zgc:161973 (ENSCARG00000017672)	agxtb (ENSCARG00000017409)	KIF1A (ENSCARG00000016941)	rab6bb (ENSCARG00000016881)	aire (ENSCARG00000016873)	amotl2b (ENSCARG00000016863)	ENSCARG00000016782	sap130b (ENSCARG00000014434)	mllt1b (ENSCARG00000014348)	znf414 (ENSCARG00000014337)	mknk2a (ENSCARG00000014238)	csnk1g2a (ENSCARG00000014185)	mfsd12a (ENSCARG00000014120)	prrx1a (ENSCARG00000014108) #18	kifap3b (ENSCARG00000013534) ##22	ENSCARG00000013488	ENSCARG00000013462 ##23	rnf2 (ENSCARG00000013446)	ivns1abpb (ENSCARG00000013421)	arpc5a (ENSCARG00000013402)	pla2g4aa (ENSCARG00000011571)	ptgs2a (ENSCARG00000010793)	pdca (ENSCARG00000010761)	odr4 (ENSCARG00000010697)	TPR (ENSCARG00000010379)	prg4a (ENSCARG00000010338)	ENSCARG00000010287	dusp12 (ENSCARG00000010268)	OLFML2B (ENSCARG00000010259)	ENSCARG00000010134
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000158447.x	ENSGT00390000017498.b.a	ENSGT00940000153241.B.d.b	ENSGT00940000156474.a.a.n	ENSGT00940000159656.a.b.a	ENSGT00940000161104.f.a	ENSGT00940000156577.b.d.a.a	ENSGT00940000157247.a.b.b	ENSGT00440000037733.e.b	ENSGT00940000158800.fb.a	ENSGT00390000006876.a.a	ENSGT00940000154587.a.b.r.a	ENSGT00940000156470.u.b.a	ENSGT00390000005318.a.a.b.f	ENSGT00940000159466.d.d.b #18	ENSGT00390000003574.b.d ##22	ENSGT00940000154149.b.a.g.a.a ##23	ENSGT00940000154499.jb	ENSGT00940000155635.v.b	ENSGT00940000154654.a.b.g.b	ENSGT01030000234606.b.e.a.b	ENSGT00390000010743.a.b.b	ENSGT00940000156236.b.d	ENSGT00390000012568.j	ENSGT00730000111014.o.a.c	ENSGT00530000063751.a.b.b	ENSGT00940000166019.k.b.a	ENSGT01020000231030	ENSGT00930000151041.c	ENSGT00940000157757.g.b.d	ENSGT00940000164640.i
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Zebrafish	MODERN SPECIES	11	agxtb (ENSDARG00000018478)	KIF1A (ENSDARG00000062024)	ESPNL (ENSDARG00000093112)	rab6bb (ENSDARG00000031343)	aire (ENSDARG00000056784)	amotl2b (ENSDARG00000061948)	ENSDARG00000077201	sap130b (ENSDARG00000079352)	mllt1b (ENSDARG00000031709)	znf414 (ENSDARG00000079229)	mknk2a (ENSDARG00000011373)	csnk1g2a (ENSDARG00000005458)	mfsd12a (ENSDARG00000061908)	ENSDARG00000093680	prrx1a (ENSDARG00000033971) #18	kifap3b (ENSDARG00000006862) ##22	NIBAN1 (ENSDARG00000023053) ##23	rnf2 (ENSDARG00000010381)	ivns1abpb (ENSDARG00000013946)	ENSDARG00000109615	ENSDARG00000113501	ENSDARG00000111218	ENSDARG00000111600	ENSDARG00000112109	ENSDARG00000113007	ENSDARG00000110969	ENSDARG00000111054	ENSDARG00000116868	ENSDARG00000112742	ENSDARG00000112714	ENSDARG00000109911
Osteoglossiformes	DUPLICATION
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Asian bonytongue	MODERN SPECIES	18	nek7 (ENSSFOG00015011686)	nr5a2 (ENSSFOG00015003694)	CAMSAP2 (ENSSFOG00015011601)	WDR47 (ENSSFOG00015011555)	ENSSFOG00015011521	ENSSFOG00015011454	ENSSFOG00015011433	stxbp3 (ENSSFOG00015011374)	ENSSFOG00015011293	ENSSFOG00015011251 ##25	eeig2a (ENSSFOG00015011213)	PRKAB2 (ENSSFOG00015011191)	ENSSFOG00015011132 #16	prrx1a (ENSSFOG00015011095) #18	gorab (ENSSFOG00015011069) #19	kifap3b (ENSSFOG00015011035) #22	ENSSFOG00015010963 ##23	eif4e2 (ENSSFOG00015010899)	CAPN10 (ENSSFOG00015010857)	ENSSFOG00015010836	tfr1a (ENSSFOG00015010794)	ENSSFOG00015010731	tmtopsb (ENSSFOG00015010704)	adipoqb (ENSSFOG00015010696)	and2 (ENSSFOG00015010681)	cops9 (ENSSFOG00015027033)	otos (ENSSFOG00015010657)	ENSSFOG00015024808	apoda.1 (ENSSFOG00015010637)	samd7 (ENSSFOG00015010619)	sec62 (ENSSFOG00015010606)
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Reedfish	MODERN SPECIES	1	dhx9 (ENSECRG00000011613)	LAMC1 (ENSECRG00000011672)	ENSECRG00000011712	nmnat2 (ENSECRG00000011748)	smg7 (ENSECRG00000011797)	ncf2 (ENSECRG00000011944)	ENSECRG00000011998	ENSECRG00000012041	ENSECRG00000012051	ENSECRG00000012074	PRKAB2 (ENSECRG00000012088)	PDE4DIP (ENSECRG00000012215) #16	prrx1b (ENSECRG00000012545) #18	gorab (ENSECRG00000012565) #19	ntmt2 (ENSECRG00000012586) #21	kifap3b (ENSECRG00000012631) #22	niban1a (ENSECRG00000012729) #23	rnf2 (ENSECRG00000012765)	TRMT1L (ENSECRG00000012794) #24	SWT1 (ENSECRG00000012822)	ivns1abpb (ENSECRG00000012861)	ENSECRG00000012963	arpc5a (ENSECRG00000013132)	pla2g4aa (ENSECRG00000013153)	ENSECRG00000013186	ptgs2b (ENSECRG00000013201)	pdcb (ENSECRG00000013241)	odr4 (ENSECRG00000013288)	ENSECRG00000013322	ENSECRG00000013342	ENSECRG00000013393
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	628													ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	181													ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000161063	ENSGT00930000151041	ENSGT00940000159221	ENSGT00940000157757
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000005496	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00390000015399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000167297	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000005496	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00390000015399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099.g	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000167297	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774	ENSGT00940000154374.b	ENSGT00940000163762.a.a	ENSGT00390000004199	ENSGT00390000001322	ENSGT00940000156906	ENSGT00390000008608	ENSGT00940000163309	ENSGT00390000002659
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	62	ENSGT00940000154842.a.b	ENSGT00940000153464.A.b	ENSGT00510000047399	ENSGT00390000015399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000161099.h	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099.g	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000167297	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774	ENSGT00940000154374.b	ENSGT00390000004199	ENSGT00390000001322	ENSGT00940000156906	ENSGT00390000008608	ENSGT00940000163309	ENSGT00390000002659	ENSGT01020000230412.A.c.b.d
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154842.a.b	ENSGT00940000153464.A.b	ENSGT00510000047399	ENSGT00390000015399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000161099.h	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099.g	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000167297	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774	ENSGT00940000154374.b	ENSGT00390000004199	ENSGT00940000165310	ENSGT00940000156906.e	ENSGT00390000008608	ENSGT00390000011474	ENSGT00390000003866.a.b
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154842.a.b	ENSGT00940000153464.A.b	ENSGT00510000047399	ENSGT00390000015399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000161099.h	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099.g	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000167297	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774	ENSGT00940000154374.b	ENSGT00390000004199	ENSGT00940000165310	ENSGT00940000156906.e	ENSGT00390000008608	ENSGT00390000011474	ENSGT00390000003866.a.b	ENSGT00510000046975.b.q
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000013340	ENSGT00940000154842.a.b	ENSGT00940000153464.A.b	ENSGT00510000047399	ENSGT00390000015399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000161099.h	ENSGT00940000160945.a	ENSGT00940000161099.g	ENSGT00940000161339.c	ENSGT00940000167297	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774	ENSGT00940000154374.b	ENSGT00390000004199	ENSGT00940000165310	ENSGT00940000156906.f	ENSGT00940000156906.e	ENSGT00390000008608	ENSGT00390000011474	ENSGT00390000003866.a.b
Indian cobra	MODERN SPECIES	2	HSD17B7 (ENSNNAG00000002158)	DDR2 (ENSNNAG00000002186)	UAP1 (ENSNNAG00000002213)	METTL13 (ENSNNAG00000002251)	ITPA (ENSNNAG00000002275)	VAMP4 (ENSNNAG00000002284)	MYOC (ENSNNAG00000002298)	PRRC2C (ENSNNAG00000002426)	ENSNNAG00000002842	FMO1 (ENSNNAG00000002849)	FMO2 (ENSNNAG00000002856)	FMO3 (ENSNNAG00000002863)	ENSNNAG00000002893	PRRX1 (ENSNNAG00000002935) #18	GORAB (ENSNNAG00000002944) #19	KIFAP3 (ENSNNAG00000002965) #22	C1orf112 (ENSNNAG00000003016)	SCYL3 (ENSNNAG00000003103)	METTL18 (ENSNNAG00000003120)	ENSNNAG00000003123	ENSNNAG00000003129	SELE (ENSNNAG00000003136)	RXRG (ENSNNAG00000003164)	LMX1A (ENSNNAG00000003198)	ENSNNAG00000003278	ENSNNAG00000003303	NUF2 (ENSNNAG00000003321)	FMO5 (ENSNNAG00000003353)	ENSNNAG00000003382	ENSNNAG00000003511	ENSNNAG00000003779
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00390000013340	ENSGT00940000154842.a.b	ENSGT00940000153464.A.b	ENSGT00510000047399	ENSGT00390000015399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000161099.h	ENSGT00940000160945.a	ENSGT00940000161099.g	ENSGT00940000161339.c	ENSGT00940000167297.b	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791.i	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774	ENSGT00940000154374.b	ENSGT00390000004199	ENSGT00940000165310	ENSGT00940000156906.f	ENSGT00940000156906.e	ENSGT00390000008608	ENSGT00390000003866.a.b	ENSGT00510000046975.b.q
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00390000013340	ENSGT00940000154842.a.b	ENSGT00940000153464.A.b	ENSGT00510000047399	ENSGT00390000015399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000161099.h	ENSGT00940000160945.a	ENSGT00940000161099.g	ENSGT00940000161339.c	ENSGT00940000167297.b	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791.i	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774	ENSGT00940000154374.b	ENSGT00390000004199	ENSGT00940000165310	ENSGT00940000156906.f	ENSGT00940000156906.e	ENSGT00390000008608	ENSGT00390000003866.a.b	ENSGT00510000046975.b.q
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	172										ENSNSUG00000019077	FMO1 (ENSNSUG00000019078)	FMO2 (ENSNSUG00000019079)	FMO3 (ENSNSUG00000019095)	ENSNSUG00000019096	PRRX1 (ENSNSUG00000019098) #18	KIFAP3 (ENSNSUG00000019103) #22	SCYL3 (ENSNSUG00000019168)	C1orf112 (ENSNSUG00000019169)	METTL18 (ENSNSUG00000019170)	ENSNSUG00000019171	ENSNSUG00000019172	RXRG (ENSNSUG00000019208)	LMX1A (ENSNSUG00000019209)	ENSNSUG00000019210	ENSNSUG00000019211	ENSNSUG00000019212	NUF2 (ENSNSUG00000019213)
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	21	HSD17B7 (ENSPTXG00000004347)	DDR2 (ENSPTXG00000004348)	UAP1 (ENSPTXG00000004349)	METTL13 (ENSPTXG00000004350)	ITPA (ENSPTXG00000004351)	VAMP4 (ENSPTXG00000004352)	MYOC (ENSPTXG00000004354)	PRRC2C (ENSPTXG00000004355)	ENSPTXG00000004359	FMO1 (ENSPTXG00000004360)	FMO2 (ENSPTXG00000004361)	FMO3 (ENSPTXG00000004363)	ENSPTXG00000004364	PRRX1 (ENSPTXG00000004365) #18	GORAB (ENSPTXG00000004366) #19	KIFAP3 (ENSPTXG00000004367) #22	SCYL3 (ENSPTXG00000004368)	C1orf112 (ENSPTXG00000004370)	METTL18 (ENSPTXG00000004371)	ENSPTXG00000004372	SELE (ENSPTXG00000004374)	RXRG (ENSPTXG00000000087)	LMX1A (ENSPTXG00000000145)	ENSPTXG00000000502	ENSPTXG00000000509	ENSPTXG00000000521	NUF2 (ENSPTXG00000000535)	ENSPTXG00000000548	ENSPTXG00000000564	ENSPTXG00000000591	ADCY10 (ENSPTXG00000000702)
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	8906																KIFAP3 (ENSLLTG00000003617) #22
Lizard	MODERN SPECIES	914										ENSACAG00000036387	FMO2 (ENSACAG00000013187)	ENSACAG00000013117	ENSACAG00000013020	GORAB (ENSACAG00000013005) #19	NTMT2 (ENSACAG00000012993) #21	KIFAP3 (ENSACAG00000012884) #22	SCYL3 (ENSACAG00000012830)	ENSACAG00000034894	ENSACAG00000036834	ENSACAG00000012783	PRRC2C (ENSACAG00000029194)	VAMP4 (ENSACAG00000012702)	ENSACAG00000012674	METTL13 (ENSACAG00000012638)	UAP1 (ENSACAG00000012562)	ENSACAG00000012439	HSD17B7 (ENSACAG00000012384)	NPHS2 (ENSACAG00000012336)	ENSACAG00000012335	SOAT1 (ENSACAG00000028257)	ENSACAG00000012264
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	52									ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099.g	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000167297	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774	ENSGT00940000154374.b	ENSGT00390000004199	ENSGT00940000165310	ENSGT00940000156906.e	ENSGT00390000008608	ENSGT00390000011474	ENSGT00390000003866.a.b	ENSGT00390000007598
Common wall lizard	MODERN SPECIES	14	KIAA1614 (ENSPMRG00000004044)	STX6 (ENSPMRG00000004053)	IER5 (ENSPMRG00000004066)	ENSPMRG00000004075	ENSPMRG00000004123	CACNA1E (ENSPMRG00000004396)	ENSPMRG00000005747	ENSPMRG00000005755	ENSPMRG00000005766	FMO1 (ENSPMRG00000005791)	FMO2 (ENSPMRG00000005804)	FMO3 (ENSPMRG00000005816)	ENSPMRG00000005823	PRRX1 (ENSPMRG00000005831) #18	NTMT2 (ENSPMRG00000005838) #21	KIFAP3 (ENSPMRG00000005847) #22	SCYL3 (ENSPMRG00000005861)	C1orf112 (ENSPMRG00000005884)	ENSPMRG00000005904	ENSPMRG00000005910	SELE (ENSPMRG00000005914)	RXRG (ENSPMRG00000005928)	ENSPMRG00000005938	LMX1A (ENSPMRG00000005943)	PBX1 (ENSPMRG00000005959)	NUF2 (ENSPMRG00000005977)	ADCY10 (ENSPMRG00000005995)	ENSPMRG00000006036	ENSPMRG00000006047	ENSPMRG00000006066	ENSPMRG00000006079
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	20									SOAT1 (ENSSMRG00000023552)	FMO2 (ENSSMRG00000023551)	FMO3 (ENSSMRG00000023550)	ENSSMRG00000023549	PRRX1 (ENSSMRG00000023548) #18	GORAB (ENSSMRG00000023547) #19	NTMT2 (ENSSMRG00000023546) #21	KIFAP3 (ENSSMRG00000023544) #22	SCYL3 (ENSSMRG00000023543)	C1orf112 (ENSSMRG00000023542)	METTL18 (ENSSMRG00000023541)	ENSSMRG00000023540	RXRG (ENSSMRG00000023539)	LMX1A (ENSSMRG00000023538)	ENSSMRG00000023537	ENSSMRG00000023536	ENSSMRG00000023533	ENSSMRG00000023532	ENSSMRG00000023531	TMEM121 (ENSSMRG00000023530)	SPATA46 (ENSSMRG00000023528)	ENSSMRG00000023527	ENSSMRG00000023526
tuatara	MODERN SPECIES	133	UAP1 (ENSSPUG00000015046)	METTL13 (ENSSPUG00000014997)	ITPA (ENSSPUG00000014977)	ENSSPUG00000014968	ENSSPUG00000014958	ENSSPUG00000014948	ENSSPUG00000014944	PRRC2C (ENSSPUG00000014912)	FMO1 (ENSSPUG00000014892)	ENSSPUG00000014847	FMO3 (ENSSPUG00000014792)	ENSSPUG00000014765	PRRX1 (ENSSPUG00000014750) #18	ENSSPUG00000014737 #19	NTMT2 (ENSSPUG00000014727) #21	KIFAP3 (ENSSPUG00000013756) #22	SCYL3 (ENSSPUG00000013478)	ENSSPUG00000013474	ENSSPUG00000013466	ENSSPUG00000013458	ENSSPUG00000013454	ENSSPUG00000013450
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00390000015399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00960000190308	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099.g	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000167297	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00990000211606	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774	ENSGT00940000154374.b	ENSGT00940000163762.a.a	ENSGT00390000004199	ENSGT00390000001322	ENSGT00940000156906	ENSGT00390000008608	ENSGT00940000163309
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00390000005496	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00390000015399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00960000190308	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099.g	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00990000211606	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774	ENSGT00940000154374.b	ENSGT00940000163762.a.a	ENSGT00390000004199	ENSGT00390000001322	ENSGT00940000156906	ENSGT00390000008608	ENSGT00940000163309
Aves	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00950000185631	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.b	ENSGT00390000013502.b	ENSGT00390000005496	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00390000015399	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00990000211606	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774	ENSGT00940000154374.b	ENSGT00940000163762.a.a	ENSGT00390000004199	ENSGT00940000156906	ENSGT00390000008608	ENSGT00940000163309	ENSGT00390000002659
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.b	ENSGT00390000013502.b	ENSGT00390000005496	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00390000015399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00990000211606	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774	ENSGT00940000154374.b	ENSGT00940000163762.a.a	ENSGT00390000004199	ENSGT00940000156906	ENSGT00390000008608	ENSGT00940000163309	ENSGT00390000002659
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00950000185631	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.b	ENSGT00390000013502.b	ENSGT00390000005496	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00390000015399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774	ENSGT00940000154374.b	ENSGT00390000004199	ENSGT00940000156906	ENSGT00390000008608	ENSGT00940000163309	ENSGT00390000002659	ENSGT01020000230412.A.c.b.d	ENSGT00940000155161
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000172066	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.b	ENSGT00390000013502.b	ENSGT00390000005496	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00390000015399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774	ENSGT00940000154374.b	ENSGT00390000004199	ENSGT00940000156906	ENSGT00390000008608	ENSGT00940000163309	ENSGT00390000002659	ENSGT01020000230412.A.c.b.d	ENSGT00940000155161
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	84	ENSABRG00000022931	FASLG (ENSABRG00000022930)	SUCO (ENSABRG00000022929)	PIGC (ENSABRG00000022928)	DNM3 (ENSABRG00000022835)	METTL13 (ENSABRG00000022788)	ITPA (ENSABRG00000022787)	VAMP4 (ENSABRG00000022785)	MYOC (ENSABRG00000022784)	PRRC2C (ENSABRG00000022772)	FMO4 (ENSABRG00000022766)	FMO3 (ENSABRG00000022762)	PRRX1 (ENSABRG00000022760) #18	GORAB (ENSABRG00000022758) #19	NTMT2 (ENSABRG00000022753) #21	KIFAP3 (ENSABRG00000022748) #22	SCYL3 (ENSABRG00000022740)	C1orf112 (ENSABRG00000022738)	METTL18 (ENSABRG00000022737)	ENSABRG00000022736	ENSABRG00000022735	RXRG (ENSABRG00000022733)	LMX1A (ENSABRG00000022732)	PBX1 (ENSABRG00000022730)	NUF2 (ENSABRG00000022728)	LRRC52 (ENSABRG00000022727)	MGST3 (ENSABRG00000022725)	ALDH9A1 (ENSABRG00000022724)	TMCO1 (ENSABRG00000022722)	UCK2 (ENSABRG00000022721)	KLHL20 (ENSABRG00000022719)
Duck	MODERN SPECIES	26	FAM78B (ENSAPLG00000016430)	PRDX6 (ENSAPLG00000016432)	TADA1 (ENSAPLG00000005434)	ENSAPLG00000029878	FASLG (ENSAPLG00000005345)	SUCO (ENSAPLG00000004827)	PIGC (ENSAPLG00000001596)	DNM3 (ENSAPLG00000004816)	MYOC (ENSAPLG00000016603)	PRRC2C (ENSAPLG00000003698)	FMO4 (ENSAPLG00000003552)	FMO3 (ENSAPLG00000002757)	PRRX1 (ENSAPLG00000029163) #18	GORAB (ENSAPLG00000030796) #19	NTMT2 (ENSAPLG00000019259) #21	KIFAP3 (ENSAPLG00000002383) #22	SCYL3 (ENSAPLG00000006730)	C1orf112 (ENSAPLG00000006447)	METTL18 (ENSAPLG00000006329)	ENSAPLG00000006245	ENSAPLG00000005910	ENSAPLG00000025060	ENSAPLG00000020021	PBX1 (ENSAPLG00000030308)	NUF2 (ENSAPLG00000007357)	ALDH9A1 (ENSAPLG00000008067)	TMCO1 (ENSAPLG00000008558)	UCK2 (ENSAPLG00000018550)	ENSAPLG00000008931	CENPL (ENSAPLG00000000945)	DARS2 (ENSAPLG00000009344)
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00950000185631	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.b	ENSGT00390000013502.b	ENSGT00390000005496	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00390000015399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000161339.f	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774	ENSGT00940000154374.b	ENSGT00390000004199	ENSGT00940000156906	ENSGT00390000008608	ENSGT00940000163309	ENSGT00390000002659	ENSGT01020000230412.A.c.b.d	ENSGT00940000155161
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00950000185631	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.b	ENSGT00390000013502.b	ENSGT00390000005496	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00390000015399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000161339.f	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774	ENSGT00940000154374.b	ENSGT00390000004199	ENSGT00940000156906	ENSGT00940000163309	ENSGT00390000008608	ENSGT00390000002659	ENSGT01020000230412.A.c.b.d	ENSGT00940000155161
Turkey	MODERN SPECIES	1	ENSMGAG00000003509	ENSMGAG00000018146	ENSMGAG00000003531	ENSMGAG00000003561	ENSMGAG00000003570	ENSMGAG00000003571	ENSMGAG00000003669	ENSMGAG00000020310	ENSMGAG00000003715	ENSMGAG00000003950	ENSMGAG00000003877	METTL18 (ENSMGAG00000021860)	ENSMGAG00000003850	ENSMGAG00000003778	ENSMGAG00000020934	KIFAP3 (ENSMGAG00000003994) #22	ENSMGAG00000017392	ENSMGAG00000004030 #21	ENSMGAG00000004043 #19	ENSMGAG00000004058 #18	ENSMGAG00000017270	ENSMGAG00000017304	ENSMGAG00000019413	ENSMGAG00000004081	ENSMGAG00000004076	PRRC2C (ENSMGAG00000004134)	ENSMGAG00000004143	ENSMGAG00000004201	ENSMGAG00000004182	ENSMGAG00000004161	ENSMGAG00000004221
Chicken	MODERN SPECIES	37	ENSGALG00010013573	FASLG (ENSGALG00010013583)	SUCO (ENSGALG00010014928)	PIGC (ENSGALG00010013609)	DNM3 (ENSGALG00010013766)	METTL13 (ENSGALG00010013793)	ITPA (ENSGALG00010013848)	VAMP4 (ENSGALG00010014940)	MYOC (ENSGALG00010013859)	PRRC2C (ENSGALG00010013949)	FMO4 (ENSGALG00010013980)	FMO3 (ENSGALG00010014056)	PRRX1 (ENSGALG00010014076) #18	GORAB (ENSGALG00010014111) #19	METTL11B (ENSGALG00010014145) #21	KIFAP3 (ENSGALG00010014204) #22	SCYL3 (ENSGALG00010014221)	C1orf112 (ENSGALG00010014274)	METTL18 (ENSGALG00010014298)	ENSGALG00010014308	ENSGALG00010014318	RXRG (ENSGALG00010010515)	LMX1A (ENSGALG00010010535)	PBX1 (ENSGALG00010010577)	NUF2 (ENSGALG00010010605)	LRRC52 (ENSGALG00010010619)	ALDH9A1 (ENSGALG00010010635)	MGST3 (ENSGALG00010010662)	TMCO1 (ENSGALG00010014878)	UCK2 (ENSGALG00010010710)	KLHL20 (ENSGALG00010010743)
Japanese quail	MODERN SPECIES	26	FASLG (ENSCJPG00005021470)	SUCO (ENSCJPG00005021469)	PIGC (ENSCJPG00005021468)	DNM3 (ENSCJPG00005021464)	METTL13 (ENSCJPG00005021463)	ITPA (ENSCJPG00005021462)	VAMP4 (ENSCJPG00005021461)	MYOC (ENSCJPG00005021460)	PRRC2C (ENSCJPG00005021459)	FMO4 (ENSCJPG00005021458)	FMO3 (ENSCJPG00005021457)	PRRX1 (ENSCJPG00005021456) #18	GORAB (ENSCJPG00005021455) #19	NTMT2 (ENSCJPG00005021454) #21	ENSCJPG00005021453	KIFAP3 (ENSCJPG00005021452) #22	SCYL3 (ENSCJPG00005021450)	C1orf112 (ENSCJPG00005021449)	METTL18 (ENSCJPG00005021448)	ENSCJPG00005021447	ENSCJPG00005021446	RXRG (ENSCJPG00005021445)	LMX1A (ENSCJPG00005021443)	PBX1 (ENSCJPG00005021442)	NUF2 (ENSCJPG00005021437)	LRRC52 (ENSCJPG00005021436)	MGST3 (ENSCJPG00005021435)	ALDH9A1 (ENSCJPG00005021434)	TMCO1 (ENSCJPG00005021433)	UCK2 (ENSCJPG00005021432)	KLHL20 (ENSCJPG00005021431)
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.b	ENSGT00390000013502.b	ENSGT00390000005496	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00390000015399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00990000211606	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774	ENSGT00390000007919	ENSGT00550000075064	ENSGT00940000160542	ENSGT00390000011347	ENSGT00940000162643	ENSGT01050000244941.B.c	ENSGT00950000183110.a
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.b	ENSGT00390000013502.b	ENSGT00390000005496	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00390000015399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00990000211606	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774	ENSGT00940000154374.b	ENSGT00390000004199	ENSGT00940000156906	ENSGT00390000008608	ENSGT00940000163309	ENSGT00390000002659	ENSGT01020000230412.A.c.b.d
Golden eagle	MODERN SPECIES	3	SUCO (ENSACCG00020000747)	PIGC (ENSACCG00020000792)	DNM3 (ENSACCG00020000818)	METTL13 (ENSACCG00020000863)	ITPA (ENSACCG00020000889)	VAMP4 (ENSACCG00020000907)	MYOC (ENSACCG00020000921)	PRRC2C (ENSACCG00020001135)	FMO4 (ENSACCG00020001236)	FMO1 (ENSACCG00020001286)	ENSACCG00020001303	FMO3 (ENSACCG00020001313)	PRRX1 (ENSACCG00020001326) #18	GORAB (ENSACCG00020001337) #19	NTMT2 (ENSACCG00020001355) #21	KIFAP3 (ENSACCG00020001379) #22	SCYL3 (ENSACCG00020001415)	C1orf112 (ENSACCG00020001459)	METTL18 (ENSACCG00020001484)	ENSACCG00020001495	ENSACCG00020001517	RXRG (ENSACCG00020001542)	LMX1A (ENSACCG00020001559)	PBX1 (ENSACCG00020001582)	NUF2 (ENSACCG00020001616)	LRRC52 (ENSACCG00020001630)	MGST3 (ENSACCG00020001639)	ALDH9A1 (ENSACCG00020001657)	TMCO1 (ENSACCG00020001681)	UCK2 (ENSACCG00020001691)	KLHL20 (ENSACCG00020001706)
Kakapo	MODERN SPECIES	25	FASLG (ENSSHBG00005000862)	SUCO (ENSSHBG00005000859)	PIGC (ENSSHBG00005010158)	DNM3 (ENSSHBG00005010078)	METTL13 (ENSSHBG00005010035)	ITPA (ENSSHBG00005010008)	VAMP4 (ENSSHBG00005009981)	MYOC (ENSSHBG00005009968)	PRRC2C (ENSSHBG00005009830)	FMO4 (ENSSHBG00005009788)	ENSSHBG00005009781	FMO1 (ENSSHBG00005009773)	PRRX1 (ENSSHBG00005009761) #18	GORAB (ENSSHBG00005009754) #19	NTMT2 (ENSSHBG00005009741) #21	KIFAP3 (ENSSHBG00005009727) #22	SCYL3 (ENSSHBG00005009718)	C1orf112 (ENSSHBG00005009700)	ENSSHBG00005009694	METTL18 (ENSSHBG00005009691)	ENSSHBG00005009690	ENSSHBG00005009585	RXRG (ENSSHBG00005009554)	LMX1A (ENSSHBG00005009535)	PBX1 (ENSSHBG00005009520)	NUF2 (ENSSHBG00005009508)	LRRC52 (ENSSHBG00005009497)	MGST3 (ENSSHBG00005009486)	ALDH9A1 (ENSSHBG00005009474)	TMCO1 (ENSSHBG00005009460)	UCK2 (ENSSHBG00005009447)
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00950000185631	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.b	ENSGT00390000013502.b	ENSGT00390000005496	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00390000015399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774	ENSGT00390000007919	ENSGT00550000075064	ENSGT00940000154374.b	ENSGT00940000163762.a.a	ENSGT00390000004199	ENSGT00940000156906	ENSGT00390000008608	ENSGT00940000163309
Great tit	MODERN SPECIES	28	ENSPMJG00000010477	FASLG (ENSPMJG00000010479)	SUCO (ENSPMJG00000010480)	PIGC (ENSPMJG00000010481)	DNM3 (ENSPMJG00000010486)	METTL13 (ENSPMJG00000010489)	ITPA (ENSPMJG00000010490)	VAMP4 (ENSPMJG00000010491)	MYOC (ENSPMJG00000010492)	PRRC2C (ENSPMJG00000010521)	FMO4 (ENSPMJG00000010538)	FMO1 (ENSPMJG00000010539)	PRRX1 (ENSPMJG00000010541) #18	GORAB (ENSPMJG00000010542) #19	NTMT2 (ENSPMJG00000010545) #21	KIFAP3 (ENSPMJG00000010550) #22	SCYL3 (ENSPMJG00000010552)	C1orf112 (ENSPMJG00000010554)	METTL18 (ENSPMJG00000010557)	ENSPMJG00000010558	ENSPMJG00000010559	RXRG (ENSPMJG00000010560)	LMX1A (ENSPMJG00000010561)	PBX1 (ENSPMJG00000010572)	NUF2 (ENSPMJG00000010589)	LRRC52 (ENSPMJG00000010590)	MGST3 (ENSPMJG00000010591)	ALDH9A1 (ENSPMJG00000010592)	TMCO1 (ENSPMJG00000010593)	UCK2 (ENSPMJG00000010610)	KLHL20 (ENSPMJG00000010613)
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00950000185631	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.b	ENSGT00390000013502.b	ENSGT00390000005496	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00390000015399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774	ENSGT00390000007919	ENSGT00550000075064	ENSGT00940000154374.b	ENSGT00940000163762.a.a	ENSGT00390000004199	ENSGT00940000156906	ENSGT00390000008608	ENSGT00940000163309
Flycatcher	MODERN SPECIES	27	ENSFALG00000003815	ENSFALG00000014546	ENSFALG00000027355	FASLG (ENSFALG00000026011)	SUCO (ENSFALG00000007801)	PIGC (ENSFALG00000014545)	DNM3 (ENSFALG00000007806)	METTL13 (ENSFALG00000007811)	ENSFALG00000007818	MYOC (ENSFALG00000007826)	PRRC2C (ENSFALG00000007832)	FMO4 (ENSFALG00000007840)	PRRX1 (ENSFALG00000007866) #18	GORAB (ENSFALG00000025134) #19	NTMT2 (ENSFALG00000007875) #21	KIFAP3 (ENSFALG00000007881) #22	C1orf112 (ENSFALG00000007893)	METTL18 (ENSFALG00000014573)	ENSFALG00000028760	ENSFALG00000007904	RXRG (ENSFALG00000007912)	LMX1A (ENSFALG00000007925)	ENSFALG00000026337	PBX1 (ENSFALG00000007934)	NUF2 (ENSFALG00000007941)	LRRC52 (ENSFALG00000007953)	MGST3 (ENSFALG00000028914)	ALDH9A1 (ENSFALG00000007962)	TMCO1 (ENSFALG00000007966)	UCK2 (ENSFALG00000022933)	KLHL20 (ENSFALG00000007980)
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00950000185631	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.b	ENSGT00390000013502.b	ENSGT00390000005496	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00390000015399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774	ENSGT00390000007919	ENSGT00550000075064	ENSGT00940000159130	ENSGT01050000244887.A.a.a.b
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Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00950000185631	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.b	ENSGT00390000013502.b	ENSGT00390000005496	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00390000015399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774	ENSGT00390000007919	ENSGT00550000075064	ENSGT00940000159130	ENSGT01050000244887.A.a.a.b
Zebra finch	MODERN SPECIES	30	ENSTGUG00000027132	FASLG (ENSTGUG00000017264)	SUCO (ENSTGUG00000017265)	PIGC (ENSTGUG00000017266)	DNM3 (ENSTGUG00000017269)	METTL13 (ENSTGUG00000017274)	ITPA (ENSTGUG00000017279)	VAMP4 (ENSTGUG00000025061)	ENSTGUG00000026352	PRRC2C (ENSTGUG00000017290)	FMO4 (ENSTGUG00000017294)	FMO1 (ENSTGUG00000020993)	PRRX1 (ENSTGUG00000021736) #18	GORAB (ENSTGUG00000017299) #19	NTMT2 (ENSTGUG00000022465) #21	KIFAP3 (ENSTGUG00000017302) #22	SCYL3 (ENSTGUG00000017308)	C1orf112 (ENSTGUG00000017309)	METTL18 (ENSTGUG00000020231)	ENSTGUG00000029754	ENSTGUG00000017314	RXRG (ENSTGUG00000017315)	LMX1A (ENSTGUG00000017316)	PBX1 (ENSTGUG00000017317)	NUF2 (ENSTGUG00000017319)	ENSTGUG00000015814	MGST3 (ENSTGUG00000017321)	ALDH9A1 (ENSTGUG00000017326)	TMCO1 (ENSTGUG00000029026)	KLHL20 (ENSTGUG00000017330)	CENPL (ENSTGUG00000017334)
Common canary	MODERN SPECIES	63			FASLG (ENSSCAG00000002827)	SUCO (ENSSCAG00000002794)	PIGC (ENSSCAG00000002773)	DNM3 (ENSSCAG00000002592)	METTL13 (ENSSCAG00000002560)	ITPA (ENSSCAG00000002549)	ENSSCAG00000002542	MYOC (ENSSCAG00000002533)	PRRC2C (ENSSCAG00000002472)	FMO4 (ENSSCAG00000002455)	PRRX1 (ENSSCAG00000002449) #18	GORAB (ENSSCAG00000002447) #19	NTMT2 (ENSSCAG00000002438) #21	KIFAP3 (ENSSCAG00000002429) #22	SCYL3 (ENSSCAG00000002420)	C1orf112 (ENSSCAG00000002409)	METTL18 (ENSSCAG00000002406)	ENSSCAG00000002404	ENSSCAG00000002401	RXRG (ENSSCAG00000002368)	LMX1A (ENSSCAG00000002350)	ENSSCAG00000002345	NUF2 (ENSSCAG00000002335)	ENSSCAG00000002330	MGST3 (ENSSCAG00000002313)	ALDH9A1 (ENSSCAG00000002202)	TMCO1 (ENSSCAG00000002183)	UCK2 (ENSSCAG00000002177)	KLHL20 (ENSSCAG00000002169)
African ostrich	MODERN SPECIES	539	ENSSCUG00000005565	PRDX6 (ENSSCUG00000005563)	FASLG (ENSSCUG00000005560)	SUCO (ENSSCUG00000005555)	PIGC (ENSSCUG00000005549)	DNM3 (ENSSCUG00000005537)	METTL13 (ENSSCUG00000005523)	VAMP4 (ENSSCUG00000005519)	PRRC2C (ENSSCUG00000005499)	FMO4 (ENSSCUG00000005482)	FMO1 (ENSSCUG00000005473)	FMO3 (ENSSCUG00000005469)	PRRX1 (ENSSCUG00000005464) #18	ENSSCUG00000005461	NTMT2 (ENSSCUG00000005458) #21	KIFAP3 (ENSSCUG00000005456) #22	SCYL3 (ENSSCUG00000005453)	C1orf112 (ENSSCUG00000005441)	METTL18 (ENSSCUG00000005437)	ENSSCUG00000005434	ENSSCUG00000005432	RXRG (ENSSCUG00000005428)	LMX1A (ENSSCUG00000005424)	PBX1 (ENSSCUG00000005422)	NUF2 (ENSSCUG00000005412)	LRRC52 (ENSSCUG00000005411)	MGST3 (ENSSCUG00000005410)	ALDH9A1 (ENSSCUG00000005409)	TMCO1 (ENSSCUG00000005404)	UCK2 (ENSSCUG00000005400)	KLHL20 (ENSSCUG00000005393)
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	28	METTL13 (ENSCPRG00005004016)	ITPA (ENSCPRG00005004021)	VAMP4 (ENSCPRG00005004024)	MYOC (ENSCPRG00005004028)	ENSCPRG00005004035	PRRC2C (ENSCPRG00005004131)	ENSCPRG00005004882	FMO4 (ENSCPRG00005004886)	ENSCPRG00005004891	ENSCPRG00005004896	FMO2 (ENSCPRG00005004900)	FMO3 (ENSCPRG00005004925)	PRRX1 (ENSCPRG00005004927) #18	GORAB (ENSCPRG00005004935) #19	NTMT2 (ENSCPRG00005004944) #21	KIFAP3 (ENSCPRG00005004964) #22	SCYL3 (ENSCPRG00005004976)	C1orf112 (ENSCPRG00005004995)	METTL18 (ENSCPRG00005005011)	ENSCPRG00005005017	SELE (ENSCPRG00005005030)	RXRG (ENSCPRG00005005077)	LMX1A (ENSCPRG00005005117)	ENSCPRG00005005120	PBX1 (ENSCPRG00005005132)	NUF2 (ENSCPRG00005005146)	ADCY10 (ENSCPRG00005005155)	LRRC52 (ENSCPRG00005005180)	MGST3 (ENSCPRG00005005182)	ALDH9A1 (ENSCPRG00005005188)	UCK2 (ENSCPRG00005005203)
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000005496	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00960000190308	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099.g	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000167297	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00990000211606	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774	ENSGT00940000154374.b	ENSGT00390000004199	ENSGT00390000001322	ENSGT00940000156906	ENSGT00390000008608	ENSGT00940000163309	ENSGT00390000002659
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000158056.z	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00960000190308.b	ENSGT00960000190308.a	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099.g	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000167297	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00990000211606	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774.a.b	ENSGT00940000157774.a.a	ENSGT00940000154374.b	ENSGT00390000004199.k.a	ENSGT00390000001322	ENSGT00990000212540	ENSGT00390000004199.l	ENSGT00940000156906
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00390000005496	ENSGT00940000158056.z	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561.e	ENSGT00960000190308.a	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099.g	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000167297	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791.e	ENSGT00990000211606	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000004791.f	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774.b	ENSGT00940000157774.a.b	ENSGT00940000157774.a.a	ENSGT00940000154374.b	ENSGT00390000004199.k.a	ENSGT00390000001322	ENSGT00990000212540
Three-toed box turtle	DUPLICATION
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	99	ENSTMTG00000007167	ENSTMTG00000007198	ENSTMTG00000007507	ENSTMTG00000007529	ENSTMTG00000007539	ENSTMTG00000007559	ENSTMTG00000007594	ENSTMTG00000007744	ENSTMTG00000007765	ENSTMTG00000007843	ENSTMTG00000007922	ENSTMTG00000007946	ENSTMTG00000007973 #18	ENSTMTG00000007998 #19	ENSTMTG00000008010 #21	ENSTMTG00000008030 #22	ENSTMTG00000008047	ENSTMTG00000008077	ENSTMTG00000008207	ENSTMTG00000008221	ENSTMTG00000008230	ENSTMTG00000008251	ENSTMTG00000008266	ENSTMTG00000008277	ENSTMTG00000008292	ENSTMTG00000008328	ENSTMTG00000008347	ENSTMTG00000008421	ENSTMTG00000008456	ENSTMTG00000008466	ENSTMTG00000008473
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	97	ENSTMTG00000020132	ENSTMTG00000020144	ENSTMTG00000020302	ENSTMTG00000020309	ENSTMTG00000020314	ENSTMTG00000020320	ENSTMTG00000020381	ENSTMTG00000020579	ENSTMTG00000020589	ENSTMTG00000020625	ENSTMTG00000020648	ENSTMTG00000020658	ENSTMTG00000020672 #18	ENSTMTG00000020679 #19	ENSTMTG00000020685 #21	ENSTMTG00000020726 #22	ENSTMTG00000009254	ENSTMTG00000009265	ENSTMTG00000009303	ENSTMTG00000009319	ENSTMTG00000009339	ENSTMTG00000009350	ENSTMTG00000009365	PBX1 (ENSTMTG00000009392)	ENSTMTG00000009496	ENSTMTG00000009577	ENSTMTG00000009611	ENSTMTG00000009625	ENSTMTG00000009634	ENSTMTG00000009653	ENSTMTG00000009681
painted turtle	MODERN SPECIES	856										FMO2 (ENSCPBG00000012902)	FMO3 (ENSCPBG00000012903)	ENSCPBG00000012979	PRRX1 (ENSCPBG00000012981) #18	GORAB (ENSCPBG00000012984) #19	NTMT2 (ENSCPBG00000012986) #21	KIFAP3 (ENSCPBG00000012997) #22	SCYL3 (ENSCPBG00000013009)	ENSCPBG00000013015	ENSCPBG00000013018	ENSCPBG00000013020	ENSCPBG00000013022	ENSCPBG00000013026	RXRG (ENSCPBG00000013027)	ENSCPBG00000013031	PBX1 (ENSCPBG00000013033)
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000158056.z	ENSGT00940000158056.y	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00960000190308.a	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099.g	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000167297	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00990000211606	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000161269	ENSGT00940000157774.a.b	ENSGT00940000157774.a.a	ENSGT00940000154374.b	ENSGT00390000004199.k.a	ENSGT00390000001322	ENSGT00990000212540	ENSGT00940000156906	ENSGT00390000008608
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	22	DNM3 (ENSGEVG00005007973)	METTL13 (ENSGEVG00005008159)	VAMP4 (ENSGEVG00005008184)	MYOC (ENSGEVG00005008207)	ENSGEVG00005008240	PRRC2C (ENSGEVG00005008302)	ENSGEVG00005008527	FMO1 (ENSGEVG00005008706)	FMO2 (ENSGEVG00005009023)	FMO3 (ENSGEVG00005009502)	ENSGEVG00005009582	ENSGEVG00005009597	PRRX1 (ENSGEVG00005009652) #18	GORAB (ENSGEVG00005009674) #19	NTMT2 (ENSGEVG00005009701) #21	KIFAP3 (ENSGEVG00005009848) #22	SCYL3 (ENSGEVG00005009920)	C1orf112 (ENSGEVG00005009988)	ENSGEVG00005010144	METTL18 (ENSGEVG00005010180)	ENSGEVG00005010194	ENSGEVG00005010248	RXRG (ENSGEVG00005010373)	ENSGEVG00005010664	ENSGEVG00005010705	ENSGEVG00005010737	ENSGEVG00005010770	NUF2 (ENSGEVG00005010795)	ENSGEVG00005010913	ENSGEVG00005010994	LRRC52 (ENSGEVG00005011033)
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	2346					MYOC (ENSCABG00000019590)	ENSCABG00000019589	PRRC2C (ENSCABG00000018983)	FMO4 (ENSCABG00000018855)	FMO1 (ENSCABG00000018809)	FMO2 (ENSCABG00000018748)	FMO3 (ENSCABG00000018691)	ENSCABG00000018689	PRRX1 (ENSCABG00000018688) #18	GORAB (ENSCABG00000018686) #19	NTMT2 (ENSCABG00000018685) #21	KIFAP3 (ENSCABG00000018683) #22	SCYL3 (ENSCABG00000018679)	C1orf112 (ENSCABG00000018673)	METTL18 (ENSCABG00000018671)	ENSCABG00000018670	SELE (ENSCABG00000018665)	RXRG (ENSCABG00000018628)	ENSCABG00000018624	ENSCABG00000018621	ENSCABG00000018619	ENSCABG00000018616	ENSCABG00000018613	NUF2 (ENSCABG00000018607)	ADCY10 (ENSCABG00000018604)	LRRC52 (ENSCABG00000018602)	MGST3 (ENSCABG00000018600)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	517										FMO3 (ENSPSIG00000010535)	ENSPSIG00000012147	ENSPSIG00000012162	PRRX1 (ENSPSIG00000012189) #18	GORAB (ENSPSIG00000012217) #19	NTMT2 (ENSPSIG00000012964) #21	KIFAP3 (ENSPSIG00000013082) #22	SCYL3 (ENSPSIG00000016479)	C1orf112 (ENSPSIG00000017185)	METTL18 (ENSPSIG00000000946)	ENSPSIG00000017843	ENSPSIG00000017846	RXRG (ENSPSIG00000004871)	LMX1A (ENSPSIG00000005639)
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00390000015399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000167297	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT00940000165676	ENSGT00940000160000	ENSGT00390000018525.a.b
Theria	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000167297	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT00940000165676	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000015231	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000015231	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	140															ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Armadillo	MODERN SPECIES	2124															NTMT2 (ENSDNOG00000037672) #21	KIFAP3 (ENSDNOG00000016340) #22	SCYL3 (ENSDNOG00000010260)	C1orf112 (ENSDNOG00000012235)	ENSDNOG00000012231	SELE (ENSDNOG00000019846)	SELL (ENSDNOG00000041443)	ENSDNOG00000045728	ENSDNOG00000007343	SELP (ENSDNOG00000019844)	F5 (ENSDNOG00000018263)	SLC19A2 (ENSDNOG00000018260)	CCDC181 (ENSDNOG00000045094)	BLZF1 (ENSDNOG00000045925)	NME7 (ENSDNOG00000002753)	ATP1B1 (ENSDNOG00000002871)	DPT (ENSDNOG00000030723)
Sloth	MODERN SPECIES	7311																KIFAP3 (ENSCHOG00000005760) #22
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	120	ENSGT00390000015231	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	123	ENSGT00390000005496	ENSGT00390000015231	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Elephant	MODERN SPECIES	325	PIGC (ENSLAFG00000026118)	DNM3 (ENSLAFG00000013295)	METTL13 (ENSLAFG00000008601)	VAMP4 (ENSLAFG00000004038)	MYOC (ENSLAFG00000017243)	PRRC2C (ENSLAFG00000017227)	ENSLAFG00000031524	FMO4 (ENSLAFG00000005836)	FMO1 (ENSLAFG00000022265)	FMO2 (ENSLAFG00000016530)	ENSLAFG00000009092	MROH9 (ENSLAFG00000006740)	PRRX1 (ENSLAFG00000007385) #18	GORAB (ENSLAFG00000029502) #19	NTMT2 (ENSLAFG00000001800) #21	KIFAP3 (ENSLAFG00000018434) #22	SCYL3 (ENSLAFG00000018090)	C1orf112 (ENSLAFG00000014427)	METTL18 (ENSLAFG00000014426)	SELE (ENSLAFG00000007166)	SELL (ENSLAFG00000007162)	SELP (ENSLAFG00000014536)	F5 (ENSLAFG00000001975)	SLC19A2 (ENSLAFG00000003370)	ENSLAFG00000030894	CCDC181 (ENSLAFG00000000540)	BLZF1 (ENSLAFG00000021576)	NME7 (ENSLAFG00000013069)	ATP1B1 (ENSLAFG00000013066)	DPT (ENSLAFG00000011745)	ENSLAFG00000017780
Hyrax	MODERN SPECIES	6842																KIFAP3 (ENSPCAG00000000492) #22
Tenrec	MODERN SPECIES	7267																KIFAP3 (ENSETEG00000016187) #22
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Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Suina	ANCESTRAL SPECIES	8													ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00990000213309	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b
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Pig	MODERN SPECIES	12	ALKAL1 (ENSSSCG00000033922)	ST18 (ENSSSCG00000006266)	PCMTD1 (ENSSSCG00000006267)	SNTG1 (ENSSSCG00000034495)	ENSSSCG00000045207	SNAI2 (ENSSSCG00000039568)	CLXN (ENSSSCG00000032887)	UBE2V2 (ENSSSCG00000022190)	MCM4 (ENSSSCG00000006273)	PRKDC (ENSSSCG00000006274)	CEBPD (ENSSSCG00000032367)	SPIDR (ENSSSCG00000006277)	PRRX1 (ENSSSCG00000031503) #18	GORAB (ENSSSCG00000006280) #19	NTMT2 (ENSSSCG00000006281) #21	KIFAP3 (ENSSSCG00000006282) #22	SCYL3 (ENSSSCG00000006283)	C1orf112 (ENSSSCG00000006284)	METTL18 (ENSSSCG00000006285)	ENSSSCG00000031622	ENSSSCG00000030960	ENSSSCG00000034809	ENSSSCG00000006286	SELL (ENSSSCG00000006287)	SELP (ENSSSCG00000006288)	F5 (ENSSSCG00000006289)	SLC19A2 (ENSSSCG00000006290)	CCDC181 (ENSSSCG00000028804)	BLZF1 (ENSSSCG00000022396)	NME7 (ENSSSCG00000006294)	ATP1B1 (ENSSSCG00000006296)
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Cetacea	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245159	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT00940000165676	ENSGT00390000015537.v.b
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00900000143258	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245159	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00940000155052.e.b.b.a	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b.b
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Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000015231	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245159	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00940000155052.f	ENSGT00390000009320.`b	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000005496	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245159	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00940000155052.f	ENSGT00390000009320.`b	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760
Narwhal	MODERN SPECIES	304	C1orf105 (ENSMMNG00015000581)	DNM3 (ENSMMNG00015000758)	METTL13 (ENSMMNG00015000981)	VAMP4 (ENSMMNG00015001024)	MYOC (ENSMMNG00015001050)	ENSMMNG00015001067	PRRC2C (ENSMMNG00015001122)	FMO4 (ENSMMNG00015001217)	FMO1 (ENSMMNG00015001252)	FMO2 (ENSMMNG00015001303)	FMO3 (ENSMMNG00015001356)	MROH9 (ENSMMNG00015001400)	PRRX1 (ENSMMNG00015001469) #18	GORAB (ENSMMNG00015001548) #19	NTMT2 (ENSMMNG00015001587) #21	KIFAP3 (ENSMMNG00015001648) #22	SCYL3 (ENSMMNG00015001743)	C1orf112 (ENSMMNG00015001809)	METTL18 (ENSMMNG00015001845)	SELE (ENSMMNG00015001895)	SELL (ENSMMNG00015002003)	SELP (ENSMMNG00015002136)	F5 (ENSMMNG00015002392)	SLC19A2 (ENSMMNG00015002427)	CCDC181 (ENSMMNG00015002465)	ENSMMNG00015002493	BLZF1 (ENSMMNG00015002503)	NME7 (ENSMMNG00015002536)	ATP1B1 (ENSMMNG00015002564)	DPT (ENSMMNG00015002583)	ENSMMNG00015002617
Beluga whale	MODERN SPECIES	73	SUCO (ENSDLEG00000021714)	PIGC (ENSDLEG00000021686)	DNM3 (ENSDLEG00000021666)	METTL13 (ENSDLEG00000021654)	VAMP4 (ENSDLEG00000021648)	MYOC (ENSDLEG00000021643)	PRRC2C (ENSDLEG00000021617)	FMO4 (ENSDLEG00000021606)	ENSDLEG00000021597	FMO2 (ENSDLEG00000021591)	FMO3 (ENSDLEG00000021580)	MROH9 (ENSDLEG00000021574)	PRRX1 (ENSDLEG00000021573) #18	GORAB (ENSDLEG00000021569) #19	NTMT2 (ENSDLEG00000021567) #21	KIFAP3 (ENSDLEG00000021422) #22	SCYL3 (ENSDLEG00000021371)	C1orf112 (ENSDLEG00000021363)	METTL18 (ENSDLEG00000021361)	SELE (ENSDLEG00000021359)	SELL (ENSDLEG00000021357)	SELP (ENSDLEG00000021355)	F5 (ENSDLEG00000021350)	ENSDLEG00000021344	SLC19A2 (ENSDLEG00000021342)	CCDC181 (ENSDLEG00000021341)	ENSDLEG00000021339	ENSDLEG00000021338	BLZF1 (ENSDLEG00000021336)	NME7 (ENSDLEG00000021335)	ATP1B1 (ENSDLEG00000021333)
Vaquita	MODERN SPECIES		PIGC (ENSPSNG00000016331)	ENSPSNG00000016096	DNM3 (ENSPSNG00000015058)	METTL13 (ENSPSNG00000014891)	VAMP4 (ENSPSNG00000014793)	MYOC (ENSPSNG00000014719)	ENSPSNG00000014646	PRRC2C (ENSPSNG00000014335)	FMO4 (ENSPSNG00000014234)	ENSPSNG00000014189	ENSPSNG00000014011	FMO3 (ENSPSNG00000013863)	MROH9 (ENSPSNG00000013570)	PRRX1 (ENSPSNG00000013415) #18	GORAB (ENSPSNG00000013376) #19	KIFAP3 (ENSPSNG00000012924) #22	SCYL3 (ENSPSNG00000012779)	C1orf112 (ENSPSNG00000012703)	METTL18 (ENSPSNG00000012677)	SELE (ENSPSNG00000012325)	SELL (ENSPSNG00000012162)	SELP (ENSPSNG00000011448)	F5 (ENSPSNG00000011252)	SLC19A2 (ENSPSNG00000011097)	ENSPSNG00000011048	BLZF1 (ENSPSNG00000011003)	NME7 (ENSPSNG00000010935)	ATP1B1 (ENSPSNG00000010838)	DPT (ENSPSNG00000010782)	ENSPSNG00000010714	ENSPSNG00000010654
Dolphin	MODERN SPECIES	3615															NTMT2 (ENSTTRG00000004086) #21	KIFAP3 (ENSTTRG00000004084) #22	SCYL3 (ENSTTRG00000004082)	C1orf112 (ENSTTRG00000004078)	SELE (ENSTTRG00000004071)	SELL (ENSTTRG00000004067)	SELP (ENSTTRG00000004061)	F5 (ENSTTRG00000004041)	SLC19A2 (ENSTTRG00000004034)	CCDC181 (ENSTTRG00000004027)	BLZF1 (ENSTTRG00000004003)
Sperm whale	MODERN SPECIES	15	NUF2 (ENSPCTG00005004722)	PBX1 (ENSPCTG00005004638)	ENSPCTG00005004612	ENSPCTG00005004602	LMX1A (ENSPCTG00005004564)	RXRG (ENSPCTG00005004523)	LRRC52 (ENSPCTG00005004505)	MGST3 (ENSPCTG00005004485)	TMCO1 (ENSPCTG00005004388)	ENSPCTG00005004343	FMO3 (ENSPCTG00005004320)	MROH9 (ENSPCTG00005004265)	PRRX1 (ENSPCTG00005004202) #18	GORAB (ENSPCTG00005004177) #19	NTMT2 (ENSPCTG00005004153) #21	KIFAP3 (ENSPCTG00005004091) #22	SCYL3 (ENSPCTG00005004042)	C4H1orf112 (ENSPCTG00005003999)	METTL18 (ENSPCTG00005003983)	SELE (ENSPCTG00005003943)	SELL (ENSPCTG00005003917)	SELP (ENSPCTG00005003782)	F5 (ENSPCTG00005003722)	SLC19A2 (ENSPCTG00005003670)	CCDC181 (ENSPCTG00005003634)	ENSPCTG00005003623	BLZF1 (ENSPCTG00005003605)	NME7 (ENSPCTG00005003534)	ATP1B1 (ENSPCTG00005003502)	ENSPCTG00005003490	DPT (ENSPCTG00005003481)
Blue whale	MODERN SPECIES		DNM3 (ENSBMSG00010000192)	METTL13 (ENSBMSG00010000057)	VAMP4 (ENSBMSG00010000032)	MYOC (ENSBMSG00010000019)	ENSBMSG00010010218	PRRC2C (ENSBMSG00010010101)	FMO4 (ENSBMSG00010010079)	ENSBMSG00010010063	FMO2 (ENSBMSG00010010038)	ENSBMSG00010010025	FMO3 (ENSBMSG00010010001)	MROH9 (ENSBMSG00010009960)	PRRX1 (ENSBMSG00010009919) #18	GORAB (ENSBMSG00010009883) #19	NTMT2 (ENSBMSG00010009859) #21	KIFAP3 (ENSBMSG00010009766) #22	SCYL3 (ENSBMSG00010009669)	C1orf112 (ENSBMSG00010009621)	METTL18 (ENSBMSG00010009612)	ENSBMSG00010009603	SELE (ENSBMSG00010009310)	SELL (ENSBMSG00010009263)	SELP (ENSBMSG00010009122)	F5 (ENSBMSG00010009032)	SLC19A2 (ENSBMSG00010009007)	CCDC181 (ENSBMSG00010008990)	ENSBMSG00010008982	BLZF1 (ENSBMSG00010008964)	NME7 (ENSBMSG00010008951)	ATP1B1 (ENSBMSG00010008937)	ENSBMSG00010008919
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245159	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00940000155052.e.b.b	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245159	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00940000155052.e.b.b	ENSGT00390000009400	ENSGT00390000010512.o.b	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245159	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00940000155052.e.b.b	ENSGT00390000009400	ENSGT00390000010512.o.b	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245159	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000167970.a.a	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00940000155052.e.b.b	ENSGT00390000009400	ENSGT00390000010512.o.b	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	3	ENSOARG00020012055	MYOC (ENSOARG00020012001)	ENSOARG00020011974	PRRC2C (ENSOARG00020011023)	FMO4 (ENSOARG00020010920)	FMO1 (ENSOARG00020010683)	FMO2 (ENSOARG00020010570)	ENSOARG00020010479	FMO3 (ENSOARG00020010410)	ENSOARG00020010372	MROH9 (ENSOARG00020010109)	PRRX1 (ENSOARG00020009957) #18	GORAB (ENSOARG00020009803) #19	ENSOARG00020009764	ENSOARG00020009731 #21	KIFAP3 (ENSOARG00020009331) #22	SCYL3 (ENSOARG00020009121)	C1orf112 (ENSOARG00020008897)	METTL18 (ENSOARG00020008877)	SELE (ENSOARG00020008826)	SELL (ENSOARG00020008728)	ENSOARG00020008710	SELP (ENSOARG00020008417)	SLC19A2 (ENSOARG00020008147)	CCDC181 (ENSOARG00020008091)	BLZF1 (ENSOARG00020008036)	ENSOARG00020008009	NME7 (ENSOARG00020007807)	ATP1B1 (ENSOARG00020007736)	DPT (ENSOARG00020007710)	ENSOARG00020007688
Goat	MODERN SPECIES	7	PIGC (ENSCHIG00000011675)	C1orf105 (ENSCHIG00000016777)	DNM3 (ENSCHIG00000010364)	METTL13 (ENSCHIG00000021452)	VAMP4 (ENSCHIG00000024905)	MYOC (ENSCHIG00000014072)	PRRC2C (ENSCHIG00000018196)	FMO4 (ENSCHIG00000024460)	FMO1 (ENSCHIG00000011059)	FMO2 (ENSCHIG00000020835)	ENSCHIG00000011205	FMO3 (ENSCHIG00000020694)	PRRX1 (ENSCHIG00000010202) #18	GORAB (ENSCHIG00000019410) #19	NTMT2 (ENSCHIG00000007982) #21	KIFAP3 (ENSCHIG00000019317) #22	SCYL3 (ENSCHIG00000002950)	C1orf112 (ENSCHIG00000016456)	METTL18 (ENSCHIG00000008379)	SELE (ENSCHIG00000005650)	SELL (ENSCHIG00000021725)	ENSCHIG00000010201	SELP (ENSCHIG00000024573)	F5 (ENSCHIG00000015374)	SLC19A2 (ENSCHIG00000012742)	CCDC181 (ENSCHIG00000012852)	ENSCHIG00000024610	ENSCHIG00000011560	ENSCHIG00000008894	ENSCHIG00000018251	NME7 (ENSCHIG00000009802)
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245159	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00940000155052.e.b.b	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b.d
Bos	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245159	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244.a.a	ENSGT00940000155052.e.b.b	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245159	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244.a.a	ENSGT00940000155052.e.b.b	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760
Domestic yak	MODERN SPECIES	5	METTL13 (ENSBGRG00000006552)	VAMP4 (ENSBGRG00000006462)	MYOC (ENSBGRG00000006423)	ENSBGRG00000006402	PRRC2C (ENSBGRG00000006273)	FMO4 (ENSBGRG00000006161)	FMO1 (ENSBGRG00000006062)	FMO2 (ENSBGRG00000006034)	ENSBGRG00000006029	ENSBGRG00000005979	FMO3 (ENSBGRG00000005869)	MROH9 (ENSBGRG00000005709)	PRRX1 (ENSBGRG00000005630) #18	GORAB (ENSBGRG00000005587) #19	NTMT2 (ENSBGRG00000005549) #21	KIFAP3 (ENSBGRG00000005284) #22	SCYL3 (ENSBGRG00000005219)	C1orf112 (ENSBGRG00000004950)	METTL18 (ENSBGRG00000004907)	SELE (ENSBGRG00000004787)	SELL (ENSBGRG00000004733)	SELP (ENSBGRG00000003978)	ENSBGRG00000003903	F5 (ENSBGRG00000003838)	SLC19A2 (ENSBGRG00000003770)	ENSBGRG00000003688	ENSBGRG00000003663	BLZF1 (ENSBGRG00000014617)	ENSBGRG00000014584	NME7 (ENSBGRG00000014307)	ATP1B1 (ENSBGRG00000014219)
Wild yak	MODERN SPECIES	1412	DNM3 (ENSBMUG00000021723)	METTL13 (ENSBMUG00000021613)	VAMP4 (ENSBMUG00000021607)	MYOC (ENSBMUG00000021602)	ENSBMUG00000021595	PRRC2C (ENSBMUG00000021480)	FMO4 (ENSBMUG00000021314)	FMO1 (ENSBMUG00000021306)	FMO2 (ENSBMUG00000021264)	ENSBMUG00000021236	FMO3 (ENSBMUG00000021223)	MROH9 (ENSBMUG00000021208)	PRRX1 (ENSBMUG00000021196) #18	GORAB (ENSBMUG00000021185) #19	NTMT2 (ENSBMUG00000021162) #21	KIFAP3 (ENSBMUG00000021135) #22	SCYL3 (ENSBMUG00000021030)	C1orf112 (ENSBMUG00000020956)	METTL18 (ENSBMUG00000020909)	SELE (ENSBMUG00000020899)	SELL (ENSBMUG00000020892)	SELP (ENSBMUG00000020869)	F5 (ENSBMUG00000020757)	SLC19A2 (ENSBMUG00000020730)	CCDC181 (ENSBMUG00000020704)	ENSBMUG00000020683	BLZF1 (ENSBMUG00000020674)	ENSBMUG00000020670	NME7 (ENSBMUG00000020639)	ATP1B1 (ENSBMUG00000020523)
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245159	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244.a.a	ENSGT00940000155052.e.b.b	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	7	ENSBIXG00005003731	DNM3 (ENSBIXG00005003773)	METTL13 (ENSBIXG00005022250)	VAMP4 (ENSBIXG00005022319)	MYOC (ENSBIXG00005003815)	ENSBIXG00005022368	PRRC2C (ENSBIXG00005022520)	FMO4 (ENSBIXG00005022627)	FMO1 (ENSBIXG00005003889)	FMO2 (ENSBIXG00005022712)	ENSBIXG00005022793	MROH9 (ENSBIXG00005022903)	PRRX1 (ENSBIXG00005022975) #18	GORAB (ENSBIXG00005023022) #19	NTMT2 (ENSBIXG00005007171) #21	KIFAP3 (ENSBIXG00005023204) #22	SCYL3 (ENSBIXG00005007231)	C1orf112 (ENSBIXG00005023391)	METTL18 (ENSBIXG00005023427)	SELE (ENSBIXG00005023462)	SELL (ENSBIXG00005023507)	SELP (ENSBIXG00005004040)	ENSBIXG00005023630	F5 (ENSBIXG00005004052)	ENSBIXG00005023683	SLC19A2 (ENSBIXG00005023733)	CCDC181 (ENSBIXG00005023767)	ENSBIXG00005023777	BLZF1 (ENSBIXG00005023817)	ENSBIXG00005007176	ENSBIXG00005004083
Cow	MODERN SPECIES	7	ENSBTAG00000048915	DNM3 (ENSBTAG00000014319)	METTL13 (ENSBTAG00000017721)	VAMP4 (ENSBTAG00000020591)	MYOC (ENSBTAG00000020342)	PRRC2C (ENSBTAG00000001821)	FMO4 (ENSBTAG00000016685)	FMO1 (ENSBTAG00000021408)	FMO2 (ENSBTAG00000002974)	ENSBTAG00000047256	FMO3 (ENSBTAG00000020597)	MROH9 (ENSBTAG00000006408)	PRRX1 (ENSBTAG00000004570) #18	GORAB (ENSBTAG00000003295) #19	NTMT2 (ENSBTAG00000021298) #21	KIFAP3 (ENSBTAG00000017727) #22	SCYL3 (ENSBTAG00000014794)	C16H1orf112 (ENSBTAG00000014793)	METTL18 (ENSBTAG00000021671)	SELE (ENSBTAG00000007307)	SELL (ENSBTAG00000011515)	SELP (ENSBTAG00000020755)	F5 (ENSBTAG00000017722)	SLC19A2 (ENSBTAG00000020266)	CCDC181 (ENSBTAG00000020264)	ENSBTAG00000024548	BLZF1 (ENSBTAG00000002690)	NME7 (ENSBTAG00000002689)	ATP1B1 (ENSBTAG00000002688)	DPT (ENSBTAG00000021211)	XCL1 (ENSBTAG00000009938)
American bison	MODERN SPECIES	2998										ENSBBBG00000015774	ENSBBBG00000015813	MROH9 (ENSBBBG00000015841)	PRRX1 (ENSBBBG00000015876) #18	GORAB (ENSBBBG00000015899) #19	NTMT2 (ENSBBBG00000015911) #21	KIFAP3 (ENSBBBG00000003985) #22	SCYL3 (ENSBBBG00000016089)	C1orf112 (ENSBBBG00000000769)	METTL18 (ENSBBBG00000000768)	SELE (ENSBBBG00000016203)	SELL (ENSBBBG00000016222)	SELP (ENSBBBG00000004051)	F5 (ENSBBBG00000016447)	SLC19A2 (ENSBBBG00000016487)	CCDC181 (ENSBBBG00000004074)	ENSBBBG00000016522	BLZF1 (ENSBBBG00000016544)	ENSBBBG00000006997	NME7 (ENSBBBG00000016575)	ATP1B1 (ENSBBBG00000000737)	DPT (ENSBBBG00000016591)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	192	VAMP4 (ENSMMSG00000015510)	MYOC (ENSMMSG00000015480)	ENSMMSG00000015456	PRRC2C (ENSMMSG00000015396)	ENSMMSG00000015372	ENSMMSG00000015353	FMO1 (ENSMMSG00000015305)	FMO2 (ENSMMSG00000015272)	ENSMMSG00000015253	FMO3 (ENSMMSG00000015237)	MROH9 (ENSMMSG00000015174)	ENSMMSG00000015161	PRRX1 (ENSMMSG00000015072) #18	GORAB (ENSMMSG00000015058) #19	NTMT2 (ENSMMSG00000015038) #21	KIFAP3 (ENSMMSG00000014898) #22	SCYL3 (ENSMMSG00000004616)	C1orf112 (ENSMMSG00000004531)	METTL18 (ENSMMSG00000004515)	SELE (ENSMMSG00000004499)	SELL (ENSMMSG00000004458)	SELP (ENSMMSG00000004417)	F5 (ENSMMSG00000004291)	SLC19A2 (ENSMMSG00000004241)	CCDC181 (ENSMMSG00000004221)	ENSMMSG00000004216	BLZF1 (ENSMMSG00000004208)	ENSMMSG00000004200	NME7 (ENSMMSG00000004188)	ATP1B1 (ENSMMSG00000004172)	DPT (ENSMMSG00000004162)
Yarkand deer	MODERN SPECIES	5	C1orf105 (ENSCHYG00000021065)	DNM3 (ENSCHYG00000020411)	METTL13 (ENSCHYG00000020262)	VAMP4 (ENSCHYG00000020162)	MYOC (ENSCHYG00000020117)	ENSCHYG00000020108	PRRC2C (ENSCHYG00000018041)	FMO4 (ENSCHYG00000017845)	ENSCHYG00000017749	FMO3 (ENSCHYG00000017633)	MROH9 (ENSCHYG00000017541)	ENSCHYG00000017498	PRRX1 (ENSCHYG00000017375) #18	GORAB (ENSCHYG00000017337) #19	NTMT2 (ENSCHYG00000017269) #21	KIFAP3 (ENSCHYG00000016951) #22	SCYL3 (ENSCHYG00000016688)	C1orf112 (ENSCHYG00000016144)	METTL18 (ENSCHYG00000015908)	SELE (ENSCHYG00000015811)	SELL (ENSCHYG00000015645)	SELP (ENSCHYG00000014921)	F5 (ENSCHYG00000014668)	SLC19A2 (ENSCHYG00000014514)	CCDC181 (ENSCHYG00000014390)	BLZF1 (ENSCHYG00000014299)	NME7 (ENSCHYG00000014089)	ATP1B1 (ENSCHYG00000014016)	DPT (ENSCHYG00000013923)	ENSCHYG00000013793	RGS7 (ENSCHYG00000012979)
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Arabian camel	MODERN SPECIES	13	DNM3 (ENSCDRG00005012306)	METTL13 (ENSCDRG00005012169)	VAMP4 (ENSCDRG00005012106)	MYOC (ENSCDRG00005012066)	MYOCOS (ENSCDRG00005012035)	ENSCDRG00005011989	FMO4 (ENSCDRG00005011927)	FMO1 (ENSCDRG00005011780)	FMO2 (ENSCDRG00005011724)	ENSCDRG00005011583	FMO3 (ENSCDRG00005011530)	MROH9 (ENSCDRG00005011362)	PRRX1 (ENSCDRG00005011204) #18	GORAB (ENSCDRG00005011132) #19	NTMT2 (ENSCDRG00005011069) #21	KIFAP3 (ENSCDRG00005010490) #22	SCYL3 (ENSCDRG00005010276)	C1orf112 (ENSCDRG00005009909)	METTL18 (ENSCDRG00005009855)	ENSCDRG00005009833	SELE (ENSCDRG00005009415)	SELL (ENSCDRG00005009308)	SELP (ENSCDRG00005008953)	F5 (ENSCDRG00005008773)	SLC19A2 (ENSCDRG00005008641)	CCDC181 (ENSCDRG00005008562)	BLZF1 (ENSCDRG00005008516)	NME7 (ENSCDRG00005008374)	ATP1B1 (ENSCDRG00005008319)	DPT (ENSCDRG00005008287)	ENSCDRG00005008249
Alpaca	MODERN SPECIES	27						PRRC2C (ENSVPAG00000005155)	FMO4 (ENSVPAG00000005153)	FMO1 (ENSVPAG00000005151)	FMO2 (ENSVPAG00000005149)	ENSVPAG00000005148	FMO3 (ENSVPAG00000005147)	ENSVPAG00000005145	PRRX1 (ENSVPAG00000005144) #18	GORAB (ENSVPAG00000005143) #19	NTMT2 (ENSVPAG00000005141) #21	KIFAP3 (ENSVPAG00000005139) #22	SCYL3 (ENSVPAG00000005138)	C1orf112 (ENSVPAG00000005136)	ENSVPAG00000005135	ENSVPAG00000005133	SELE (ENSVPAG00000005132)	ENSVPAG00000005131	SELP (ENSVPAG00000005130)	ENSVPAG00000005125	SLC19A2 (ENSVPAG00000005124)	CCDC181 (ENSVPAG00000005121)	BLZF1 (ENSVPAG00000005118)
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00900000143258	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556.j	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C.d	ENSGT00390000010760.l	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	65	ENSGT00390000005496	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168.g	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556.j	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C.d	ENSGT00390000010760.l	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
American black bear	DUPLICATION
American black bear	MODERN SPECIES	4946																ENSUAMG00000019127 #22
American black bear	MODERN SPECIES	8558																ENSUAMG00000001481 #22
Polar bear	MODERN SPECIES	99	ENSUMAG00000017939	METTL13 (ENSUMAG00000017931)	VAMP4 (ENSUMAG00000017916)	MYOC (ENSUMAG00000017906)	PRRC2C (ENSUMAG00000017826)	FMO4 (ENSUMAG00000017799)	FMO1 (ENSUMAG00000017788)	FMO2 (ENSUMAG00000017777)	ENSUMAG00000017766	ENSUMAG00000017759	ENSUMAG00000017755	MROH9 (ENSUMAG00000017740)	PRRX1 (ENSUMAG00000017715) #18	GORAB (ENSUMAG00000017687) #19	NTMT2 (ENSUMAG00000017682) #21	KIFAP3 (ENSUMAG00000017673) #22	SCYL3 (ENSUMAG00000017660)	C1orf112 (ENSUMAG00000017651)	METTL18 (ENSUMAG00000017650)	SELE (ENSUMAG00000017643)	SELL (ENSUMAG00000017637)	SELP (ENSUMAG00000017624)	F5 (ENSUMAG00000017484)	SLC19A2 (ENSUMAG00000017441)	CCDC181 (ENSUMAG00000017435)	BLZF1 (ENSUMAG00000017430)	NME7 (ENSUMAG00000017416)	ATP1B1 (ENSUMAG00000017397)	DPT (ENSUMAG00000017380)	ENSUMAG00000017370	TBX19 (ENSUMAG00000017347)
Giant Panda	MODERN SPECIES	18	DNM3 (ENSAMEG00000015495)	METTL13 (ENSAMEG00000030086)	VAMP4 (ENSAMEG00000016956)	MYOC (ENSAMEG00000016963)	ENSAMEG00000027876	PRRC2C (ENSAMEG00000016972)	FMO4 (ENSAMEG00000017014)	FMO1 (ENSAMEG00000017028)	FMO2 (ENSAMEG00000017040)	ENSAMEG00000017069	FMO3 (ENSAMEG00000026076)	MROH9 (ENSAMEG00000011106)	PRRX1 (ENSAMEG00000011111) #18	GORAB (ENSAMEG00000011116) #19	NTMT2 (ENSAMEG00000011123) #21	KIFAP3 (ENSAMEG00000011131) #22	SCYL3 (ENSAMEG00000011180)	ENSAMEG00000011204	METTL18 (ENSAMEG00000019804)	SELE (ENSAMEG00000011258)	SELL (ENSAMEG00000011311)	SELP (ENSAMEG00000011331)	F5 (ENSAMEG00000011403)	SLC19A2 (ENSAMEG00000011458)	CCDC181 (ENSAMEG00000011462)	BLZF1 (ENSAMEG00000011473)	NME7 (ENSAMEG00000011496)	ENSAMEG00000011522	DPT (ENSAMEG00000024315)	ENSAMEG00000029912	TBX19 (ENSAMEG00000004326)
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	128	ENSGT00390000005496	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063.g	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946
Ferret	MODERN SPECIES	217	VAMP4 (ENSMPUG00000015609)	ENSMPUG00000015608	ENSMPUG00000019763	PRRC2C (ENSMPUG00000015606)	FMO4 (ENSMPUG00000015604)	ENSMPUG00000019762	FMO1 (ENSMPUG00000015603)	FMO2 (ENSMPUG00000015602)	ENSMPUG00000015598	FMO3 (ENSMPUG00000015595)	MROH9 (ENSMPUG00000015592)	PRRX1 (ENSMPUG00000015588) #18	GORAB (ENSMPUG00000015585) #19	ENSMPUG00000015583	ENSMPUG00000015581	KIFAP3 (ENSMPUG00000015549) #22	SCYL3 (ENSMPUG00000015538)	C1orf112 (ENSMPUG00000015533)	METTL18 (ENSMPUG00000019761)	SELE (ENSMPUG00000015530)	SELL (ENSMPUG00000015515)	SELP (ENSMPUG00000015512)	F5 (ENSMPUG00000015504)	SLC19A2 (ENSMPUG00000015491)	CCDC181 (ENSMPUG00000015490)	BLZF1 (ENSMPUG00000015488)	NME7 (ENSMPUG00000015481)
American mink	MODERN SPECIES	507																KIFAP3 (ENSNVIG00000021338) #22	SCYL3 (ENSNVIG00000021618)	C1orf112 (ENSNVIG00000021680)	METTL18 (ENSNVIG00000021707)	SELE (ENSNVIG00000021715)	SELL (ENSNVIG00000021832)	ENSNVIG00000021840	ENSNVIG00000021889	F5 (ENSNVIG00000021919)	SLC19A2 (ENSNVIG00000022508)	CCDC181 (ENSNVIG00000022525)	BLZF1 (ENSNVIG00000022536)	ENSNVIG00000022543	ENSNVIG00000022546
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000007640.a.b.b	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b
Dingo	MODERN SPECIES	271	ENSCAFG00020018678	DNM3 (ENSCAFG00020018810)	METTL13 (ENSCAFG00020021213)	VAMP4 (ENSCAFG00020021237)	MYOC (ENSCAFG00020021241)	PRRC2C (ENSCAFG00020021350)	FMO4 (ENSCAFG00020022037)	FMO1 (ENSCAFG00020022043)	FMO2 (ENSCAFG00020022048)	ENSCAFG00020022057	FMO3 (ENSCAFG00020022071)	MROH9 (ENSCAFG00020022082)	PRRX1 (ENSCAFG00020022095) #18	GORAB (ENSCAFG00020022098) #19	NTMT2 (ENSCAFG00020022104) #21	KIFAP3 (ENSCAFG00020022130) #22	SCYL3 (ENSCAFG00020022638)	C1orf112 (ENSCAFG00020022649)	METTL18 (ENSCAFG00020022668)	ENSCAFG00020022669	SELE (ENSCAFG00020022673)	SELL (ENSCAFG00020022674)	SELP (ENSCAFG00020022676)	F5 (ENSCAFG00020022678)	SLC19A2 (ENSCAFG00020022694)	CCDC181 (ENSCAFG00020022700)	BLZF1 (ENSCAFG00020022702)	ATP1B1 (ENSCAFG00020022706)	DPT (ENSCAFG00020022709)	ENSCAFG00020022710	TBX19 (ENSCAFG00020022712)
Dog	MODERN SPECIES	35	DNM3 (ENSCAFG00845012888)	METTL13 (ENSCAFG00845013124)	VAMP4 (ENSCAFG00845000980)	MYOC (ENSCAFG00845001014)	MYOCOS (ENSCAFG00845001035)	PRRC2C (ENSCAFG00845001137)	FMO4 (ENSCAFG00845001330)	FMO1 (ENSCAFG00845001369)	FMO2 (ENSCAFG00845001415)	ENSCAFG00845001439	FMO3 (ENSCAFG00845001467)	MROH9 (ENSCAFG00845001591)	PRRX1 (ENSCAFG00845001662) #18	GORAB (ENSCAFG00845001687) #19	METTL11B (ENSCAFG00845001718) #21	KIFAP3 (ENSCAFG00845001773) #22	SCYL3 (ENSCAFG00845001874)	C7H1orf112 (ENSCAFG00845002005)	METTL18 (ENSCAFG00845002040)	ENSCAFG00845002058	SELE (ENSCAFG00845002098)	SELL (ENSCAFG00845002153)	SELP (ENSCAFG00845002229)	F5 (ENSCAFG00845002341)	SLC19A2 (ENSCAFG00845002427)	CCDC181 (ENSCAFG00845002455)	BLZF1 (ENSCAFG00845002482)	NME7 (ENSCAFG00845002507)	ATP1B1 (ENSCAFG00845002526)	DPT (ENSCAFG00845002540)	TBX19 (ENSCAFG00845002647)
Red fox	MODERN SPECIES	45			VAMP4 (ENSVVUG00000023307)	MYOC (ENSVVUG00000023313)	PRRC2C (ENSVVUG00000023445)	FMO4 (ENSVVUG00000025057)	FMO1 (ENSVVUG00000025082)	FMO2 (ENSVVUG00000025146)	ENSVVUG00000025155	FMO3 (ENSVVUG00000025162)	MROH9 (ENSVVUG00000025170)	PRRX1 (ENSVVUG00000025181) #18	GORAB (ENSVVUG00000025184) #19	METTL11B (ENSVVUG00000025190) #21	ENSVVUG00000025193	KIFAP3 (ENSVVUG00000025256) #22	SCYL3 (ENSVVUG00000026198)	CUNH1orf112 (ENSVVUG00000026202)	METTL18 (ENSVVUG00000026205)	SELE (ENSVVUG00000026208)	SELL (ENSVVUG00000026210)	SELP (ENSVVUG00000026212)	F5 (ENSVVUG00000026215)	SLC19A2 (ENSVVUG00000026219)	CCDC181 (ENSVVUG00000026220)	BLZF1 (ENSVVUG00000026222)	NME7 (ENSVVUG00000026230)	ATP1B1 (ENSVVUG00000026248)	DPT (ENSVVUG00000026254)	ENSVVUG00000026258	TBX19 (ENSVVUG00000026259)
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Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
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leopard	MODERN SPECIES	4	ENSPPRG00000001133	DNM3 (ENSPPRG00000004896)	METTL13 (ENSPPRG00000006545)	VAMP4 (ENSPPRG00000007465)	MYOC (ENSPPRG00000007616)	PRRC2C (ENSPPRG00000011842)	FMO4 (ENSPPRG00000012099)	FMO1 (ENSPPRG00000012807)	FMO2 (ENSPPRG00000013227)	ENSPPRG00000013519	FMO3 (ENSPPRG00000014008)	MROH9 (ENSPPRG00000019935)	PRRX1 (ENSPPRG00000020823) #18	GORAB (ENSPPRG00000024403) #19	NTMT2 (ENSPPRG00000024292) #21	KIFAP3 (ENSPPRG00000023364) #22	SCYL3 (ENSPPRG00000022607)	C1orf112 (ENSPPRG00000003462)	SELE (ENSPPRG00000007257)	SELL (ENSPPRG00000007593)	SELP (ENSPPRG00000010498)	F5 (ENSPPRG00000013583)	ENSPPRG00000013883	SLC19A2 (ENSPPRG00000016714)	CCDC181 (ENSPPRG00000022585)	BLZF1 (ENSPPRG00000024249)	NME7 (ENSPPRG00000023098)	ATP1B1 (ENSPPRG00000022684)	DPT (ENSPPRG00000022606)	ENSPPRG00000000315	TBX19 (ENSPPRG00000000719)
Tiger	MODERN SPECIES	95															NTMT2 (ENSPTIG00000009605) #21	KIFAP3 (ENSPTIG00000005955) #22	SCYL3 (ENSPTIG00000002143)	C1orf112 (ENSPTIG00000016500)	SELE (ENSPTIG00000008666)	SELL (ENSPTIG00000001143)	SELP (ENSPTIG00000000157)	F5 (ENSPTIG00000016292)	SLC19A2 (ENSPTIG00000015219)	CCDC181 (ENSPTIG00000013879)	BLZF1 (ENSPTIG00000012889)	NME7 (ENSPTIG00000010167)	ATP1B1 (ENSPTIG00000008397)	DPT (ENSPTIG00000007521)	ENSPTIG00000006878	TBX19 (ENSPTIG00000003931)	SFT2D2 (ENSPTIG00000022001)
Cat	MODERN SPECIES	248	DNM3 (ENSFCAG00000037868)	METTL13 (ENSFCAG00000025669)	VAMP4 (ENSFCAG00000013371)	MYOC (ENSFCAG00000013370)	MYOCOS (ENSFCAG00000046154)	PRRC2C (ENSFCAG00000013365)	FMO4 (ENSFCAG00000012561)	FMO1 (ENSFCAG00000008437)	FMO2 (ENSFCAG00000008433)	ENSFCAG00000008430	FMO3 (ENSFCAG00000003013)	MROH9 (ENSFCAG00000026912)	PRRX1 (ENSFCAG00000025024) #18	GORAB (ENSFCAG00000027419) #19	NTMT2 (ENSFCAG00000023165) #21	KIFAP3 (ENSFCAG00000000812) #22	SCYL3 (ENSFCAG00000008153)	CF1H1orf112 (ENSFCAG00000008152)	METTL18 (ENSFCAG00000008151)	SELE (ENSFCAG00000035810)	SELL (ENSFCAG00000008149)	SELP (ENSFCAG00000008148)	F5 (ENSFCAG00000008147)	SLC19A2 (ENSFCAG00000007711)	CCDC181 (ENSFCAG00000007710)	BLZF1 (ENSFCAG00000012530)	NME7 (ENSFCAG00000009334)	ATP1B1 (ENSFCAG00000009332)	DPT (ENSFCAG00000022536)	ENSFCAG00000029190	TBX19 (ENSFCAG00000015047)
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Equus	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00900000143258	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000264276.b	ENSGT01100000263557.A.b.b
Donkey	MODERN SPECIES	17	DNM3 (ENSEASG00005017627)	ENSEASG00005034449	METTL13 (ENSEASG00005018330)	VAMP4 (ENSEASG00005018343)	MYOC (ENSEASG00005018348)	MYOCOS (ENSEASG00005023814)	PRRC2C (ENSEASG00005018518)	FMO4 (ENSEASG00005018947)	FMO1 (ENSEASG00005033259)	FMO2 (ENSEASG00005018955)	FMO3 (ENSEASG00005018963)	MROH9 (ENSEASG00005018967)	PRRX1 (ENSEASG00005018979) #18	GORAB (ENSEASG00005024298) #19	NTMT2 (ENSEASG00005032963) #21	KIFAP3 (ENSEASG00005018987) #22	SCYL3 (ENSEASG00005018993)	ENSEASG00005019006	METTL18 (ENSEASG00005019014)	ENSEASG00005019018	SELL (ENSEASG00005019020)	SELP (ENSEASG00005019024)	F5 (ENSEASG00005019035)	SLC19A2 (ENSEASG00005019041)	CCDC181 (ENSEASG00005019043)	BLZF1 (ENSEASG00005019044)	NME7 (ENSEASG00005019045)	ATP1B1 (ENSEASG00005019047)	DPT (ENSEASG00005019049)	ENSEASG00005032236	ENSEASG00005033904
Horse	MODERN SPECIES	26	ENSECAG00000050529	DNM3 (ENSECAG00000010369)	METTL13 (ENSECAG00000018565)	VAMP4 (ENSECAG00000013165)	MYOC (ENSECAG00000010454)	PRRC2C (ENSECAG00000016800)	FMO4 (ENSECAG00000013478)	FMO1 (ENSECAG00000057658)	FMO1 (ENSECAG00000006012)	FMO3 (ENSECAG00000057583)	MROH9 (ENSECAG00000009681)	ENSECAG00000057331	PRRX1 (ENSECAG00000008539) #18	GORAB (ENSECAG00000007221) #19	NTMT2 (ENSECAG00000003997) #21	KIFAP3 (ENSECAG00000002798) #22	SCYL3 (ENSECAG00000022282)	C5H1orf112 (ENSECAG00000008931)	METTL18 (ENSECAG00000006141)	ENSECAG00000038742	SELE (ENSECAG00000008423)	SELL (ENSECAG00000020122)	SELP (ENSECAG00000010918)	F5 (ENSECAG00000006860)	SLC19A2 (ENSECAG00000015797)	CCDC181 (ENSECAG00000008361)	BLZF1 (ENSECAG00000017383)	NME7 (ENSECAG00000011690)	ATP1B1 (ENSECAG00000017771)	DPT (ENSECAG00000016101)	ENSECAG00000057868
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000158056	ENSGT00900000143258	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000165676
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000158056	ENSGT00900000143258	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000165676
Microbat	MODERN SPECIES	1148									ENSMLUG00000009775	FMO2 (ENSMLUG00000006192)	ENSMLUG00000005807	MROH9 (ENSMLUG00000005793)	PRRX1 (ENSMLUG00000004501) #18	GORAB (ENSMLUG00000004497) #19	NTMT2 (ENSMLUG00000006657) #21	KIFAP3 (ENSMLUG00000006635) #22	SCYL3 (ENSMLUG00000006620)	C1orf112 (ENSMLUG00000006590)	METTL18 (ENSMLUG00000006577)	CHD1L (ENSMLUG00000007573)	ENSMLUG00000026620	ENSMLUG00000014453	ETV3 (ENSMLUG00000002030)	ETV3L (ENSMLUG00000024224)	ARHGEF11 (ENSMLUG00000010956)	PEAR1 (ENSMLUG00000001610)	NTRK1 (ENSMLUG00000010479)	INSRR (ENSMLUG00000010442)	SH2D2A (ENSMLUG00000025811)	PRCC (ENSMLUG00000010426)	HDGF (ENSMLUG00000010413)
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	14	ENSRFEG00010012488	DNM3 (ENSRFEG00010012189)	METTL13 (ENSRFEG00010012056)	VAMP4 (ENSRFEG00010011987)	MYOC (ENSRFEG00010011925)	MYOCOS (ENSRFEG00010011810)	PRRC2C (ENSRFEG00010010853)	FMO4 (ENSRFEG00010021519)	FMO1 (ENSRFEG00010021498)	FMO2 (ENSRFEG00010021472)	ENSRFEG00010021456	MROH9 (ENSRFEG00010021423)	PRRX1 (ENSRFEG00010021399) #18	GORAB (ENSRFEG00010021378) #19	NTMT2 (ENSRFEG00010021368) #21	KIFAP3 (ENSRFEG00010021316) #22	SCYL3 (ENSRFEG00010021291)	METTL18 (ENSRFEG00010021280)	C1orf112 (ENSRFEG00010021229)	SELE (ENSRFEG00010021038)	SELL (ENSRFEG00010020948)	SELP (ENSRFEG00010020919)	F5 (ENSRFEG00010020894)	SLC19A2 (ENSRFEG00010020858)	CCDC181 (ENSRFEG00010020832)	BLZF1 (ENSRFEG00010020803)	NME7 (ENSRFEG00010020775)	ATP1B1 (ENSRFEG00010020747)	DPT (ENSRFEG00010020722)	ENSRFEG00010020698	TBX19 (ENSRFEG00010020654)
Megabat	MODERN SPECIES	1111															NTMT2 (ENSPVAG00000015996) #21	KIFAP3 (ENSPVAG00000015994) #22	SCYL3 (ENSPVAG00000015993)	C1orf112 (ENSPVAG00000015990)
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES	1386															ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22
Common shrew	MODERN SPECIES	5910																ENSSARG00000008695 #22
Hedgehog	MODERN SPECIES	7867															NTMT2 (ENSEEUG00000006424) #21	KIFAP3 (ENSEEUG00000006338) #22
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00900000143258	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Primates	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000153524.b.a.a	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00550000074866.j
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00550000074866.j
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00550000076359	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886.a #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b.i	ENSGT01100000263557.A.b.b.j
Gorilla	MODERN SPECIES		VAMP4 (ENSGGOG00000023200)	ENSGGOG00000009164	MYOC (ENSGGOG00000027553)	MYOCOS (ENSGGOG00000039730)	PRRC2C (ENSGGOG00000011743)	FMO4 (ENSGGOG00000012578)	ENSGGOG00000026041	FMO1 (ENSGGOG00000010940)	FMO2 (ENSGGOG00000008887)	ENSGGOG00000025654	FMO3 (ENSGGOG00000016607)	MROH9 (ENSGGOG00000009223)	PRRX1 (ENSGGOG00000010196) #18	ENSGGOG00000044050 #19	NTMT2 (ENSGGOG00000011748) #21	KIFAP3 (ENSGGOG00000025510) #22	SCYL3 (ENSGGOG00000011643)	C1orf112 (ENSGGOG00000016160)	METTL18 (ENSGGOG00000015904)	SELE (ENSGGOG00000005841)	SELL (ENSGGOG00000024661)	SELP (ENSGGOG00000000935)	F5 (ENSGGOG00000010691)	SLC19A2 (ENSGGOG00000025385)	CCDC181 (ENSGGOG00000026920)	BLZF1 (ENSGGOG00000034839)	NME7 (ENSGGOG00000002502)	ATP1B1 (ENSGGOG00000002499)	DPT (ENSGGOG00000003563)	ENSGGOG00000037002	ENSGGOG00000002598
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00550000076359	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886.a #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b.i	ENSGT01100000263557.A.b.b.j
Pan	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155005	ENSGT00390000018145.db	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00550000076359	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886.a #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b.i	ENSGT01100000263557.A.b.b.j
Chimpanzee	MODERN SPECIES		VAMP4 (ENSPTRG00000001680)	ENSPTRG00000044817	MYOC (ENSPTRG00000001679)	ENSPTRG00000050426	PRRC2C (ENSPTRG00000001678)	FMO4 (ENSPTRG00000001676)	ENSPTRG00000049098	FMO1 (ENSPTRG00000001674)	FMO2 (ENSPTRG00000001672)	ENSPTRG00000001671	FMO3 (ENSPTRG00000001670)	MROH9 (ENSPTRG00000001669)	PRRX1 (ENSPTRG00000001668) #18	GORAB (ENSPTRG00000001667) #19	NTMT2 (ENSPTRG00000030294) #21	KIFAP3 (ENSPTRG00000001666) #22	SCYL3 (ENSPTRG00000001665)	ENSPTRG00000052083	C1H1orf112 (ENSPTRG00000001664)	METTL18 (ENSPTRG00000001663)	SELE (ENSPTRG00000001662)	SELL (ENSPTRG00000001661)	SELP (ENSPTRG00000001660)	F5 (ENSPTRG00000001659)	SLC19A2 (ENSPTRG00000001658)	CCDC181 (ENSPTRG00000001657)	BLZF1 (ENSPTRG00000001656)	NME7 (ENSPTRG00000001655)	ATP1B1 (ENSPTRG00000001653)	DPT (ENSPTRG00000001651)	ENSPTRG00000044293
Bonobo	MODERN SPECIES		VAMP4 (ENSPPAG00000028975)	ENSPPAG00000033093	MYOC (ENSPPAG00000042159)	ENSPPAG00000033768	PRRC2C (ENSPPAG00000037005)	FMO4 (ENSPPAG00000021769)	ENSPPAG00000006496	FMO1 (ENSPPAG00000042572)	FMO2 (ENSPPAG00000035336)	ENSPPAG00000039907	FMO3 (ENSPPAG00000033963)	MROH9 (ENSPPAG00000029015)	PRRX1 (ENSPPAG00000031154) #18	GORAB (ENSPPAG00000027813) #19	NTMT2 (ENSPPAG00000027290) #21	KIFAP3 (ENSPPAG00000028901) #22	SCYL3 (ENSPPAG00000039281)	C1orf112 (ENSPPAG00000031085)	METTL18 (ENSPPAG00000025508)	SELE (ENSPPAG00000040853)	SELL (ENSPPAG00000032392)	SELP (ENSPPAG00000033608)	F5 (ENSPPAG00000037858)	SLC19A2 (ENSPPAG00000043910)	CCDC181 (ENSPPAG00000028612)	BLZF1 (ENSPPAG00000033211)	NME7 (ENSPPAG00000040110)	ATP1B1 (ENSPPAG00000036327)	DPT (ENSPPAG00000014655)	ENSPPAG00000043037	ENSPPAG00000038938
Human	MODERN SPECIES		PIGC (ENSG00000135845)	DNM3 (ENSG00000197959)	METTL13 (ENSG00000010165)	VAMP4 (ENSG00000117533)	MYOC (ENSG00000034971)	MYOCOS (ENSG00000283683)	PRRC2C (ENSG00000117523)	FMO4 (ENSG00000076258)	FMO1 (ENSG00000010932)	FMO2 (ENSG00000094963)	FMO3 (ENSG00000007933)	MROH9 (ENSG00000117501)	PRRX1 (ENSG00000116132) #18	GORAB (ENSG00000120370) #19	NTMT2 (ENSG00000203740) #21	KIFAP3 (ENSG00000075945) #22	SCYL3 (ENSG00000000457)	METTL18 (ENSG00000171806)	SELE (ENSG00000007908)	SELL (ENSG00000188404)	C1orf112 (ENSG00000000460)	SELP (ENSG00000174175)	F5 (ENSG00000198734)	SLC19A2 (ENSG00000117479)	CCDC181 (ENSG00000117477)	BLZF1 (ENSG00000117475)	NME7 (ENSG00000143156)	ATP1B1 (ENSG00000143153)	DPT (ENSG00000143196)	XCL1 (ENSG00000143184)	XCL2 (ENSG00000143185)
Orangutan	MODERN SPECIES		METTL13 (ENSPPYG00000000509)	ENSPPYG00000000510	VAMP4 (ENSPPYG00000000511)	MYOC (ENSPPYG00000000512)	MYOCOS (ENSPPYG00000031558)	PRRC2C (ENSPPYG00000000513)	FMO4 (ENSPPYG00000000514)	FMO1 (ENSPPYG00000000515)	ENSPPYG00000000516	FMO2 (ENSPPYG00000000517)	FMO3 (ENSPPYG00000000518)	MROH9 (ENSPPYG00000000520)	PRRX1 (ENSPPYG00000036753) #18	GORAB (ENSPPYG00000000522) #19	NTMT2 (ENSPPYG00000000523) #21	KIFAP3 (ENSPPYG00000000524) #22	SCYL3 (ENSPPYG00000000525)	C1orf112 (ENSPPYG00000000526)	METTL18 (ENSPPYG00000000527)	SELE (ENSPPYG00000000528)	SELL (ENSPPYG00000000529)	SELP (ENSPPYG00000000530)	F5 (ENSPPYG00000000531)	SLC19A2 (ENSPPYG00000000532)	CCDC181 (ENSPPYG00000000533)	BLZF1 (ENSPPYG00000000534)	NME7 (ENSPPYG00000000535)	ATP1B1 (ENSPPYG00000000536)	ENSPPYG00000014387	DPT (ENSPPYG00000000537)	ENSPPYG00000000538
Gibbon	MODERN SPECIES	2	ENSNLEG00000031601	VAMP4 (ENSNLEG00000015204)	ENSNLEG00000031746	MYOC (ENSNLEG00000015190)	ENSNLEG00000032220	PRRC2C (ENSNLEG00000015178)	FMO4 (ENSNLEG00000015167)	FMO1 (ENSNLEG00000015160)	FMO2 (ENSNLEG00000015155)	ENSNLEG00000031939	FMO3 (ENSNLEG00000015146)	MROH9 (ENSNLEG00000015130)	PRRX1 (ENSNLEG00000015124) #18	GORAB (ENSNLEG00000015118) #19	NTMT2 (ENSNLEG00000015113) #21	KIFAP3 (ENSNLEG00000015085) #22	SCYL3 (ENSNLEG00000015072)	C1orf112 (ENSNLEG00000015050)	METTL18 (ENSNLEG00000015047)	SELE (ENSNLEG00000015020)	SELL (ENSNLEG00000034167)	SELP (ENSNLEG00000015004)	F5 (ENSNLEG00000014985)	SLC19A2 (ENSNLEG00000014974)	CCDC181 (ENSNLEG00000014970)	BLZF1 (ENSNLEG00000014962)	NME7 (ENSNLEG00000014942)	ATP1B1 (ENSNLEG00000014934)	DPT (ENSNLEG00000014925)	ENSNLEG00000014932	ENSNLEG00000034564
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000155005	ENSGT00390000018145.cb.b.a	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00920000149129.f	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b.e.a	ENSGT01100000263557.A.b.b.e.b
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00940000155005	ENSGT00390000018145.cb.b.a	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00920000149129.f	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	592																KIFAP3 (ENSRROG00000045651) #22	SCYL3 (ENSRROG00000004445)	C1orf112 (ENSRROG00000037658)	SELE (ENSRROG00000039520)	SELL (ENSRROG00000031645)	SELP (ENSRROG00000042724)	F5 (ENSRROG00000036062)	SLC19A2 (ENSRROG00000043039)	ENSRROG00000035492	CCDC181 (ENSRROG00000034091)	BLZF1 (ENSRROG00000029459)	NME7 (ENSRROG00000035754)
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	248													PRRX1 (ENSRBIG00000042362) #18	GORAB (ENSRBIG00000029786) #19	NTMT2 (ENSRBIG00000024463) #21	KIFAP3 (ENSRBIG00000030912) #22	SCYL3 (ENSRBIG00000044441)	C1orf112 (ENSRBIG00000040818)	SELE (ENSRBIG00000040228)	SELL (ENSRBIG00000044066)	SELP (ENSRBIG00000044311)	F5 (ENSRBIG00000029647)	SLC19A2 (ENSRBIG00000036238)	CCDC181 (ENSRBIG00000036613)	ENSRBIG00000044801	BLZF1 (ENSRBIG00000042267)	NME7 (ENSRBIG00000035287)	ATP1B1 (ENSRBIG00000040665)
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000155005	ENSGT00390000018145.cb.b.a	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00920000149129.f	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b.e.b	ENSGT01100000263557.A.b.b.e.a
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	17	SUCO (ENSCSAG00000011674)	PIGC (ENSCSAG00000000236)	DNM3 (ENSCSAG00000011661)	METTL13 (ENSCSAG00000011646)	VAMP4 (ENSCSAG00000011642)	MYOC (ENSCSAG00000011635)	ENSCSAG00000011627	FMO4 (ENSCSAG00000011620)	FMO1 (ENSCSAG00000011614)	FMO2 (ENSCSAG00000011608)	FMO3 (ENSCSAG00000011600)	MROH9 (ENSCSAG00000011588)	PRRX1 (ENSCSAG00000011575) #18	GORAB (ENSCSAG00000011571) #19	NTMT2 (ENSCSAG00000011565) #21	KIFAP3 (ENSCSAG00000011525) #22	SCYL3 (ENSCSAG00000011444)	C1orf112 (ENSCSAG00000011378)	METTL18 (ENSCSAG00000000235)	SELE (ENSCSAG00000011294)	SELL (ENSCSAG00000011287)	SELP (ENSCSAG00000011257)	F5 (ENSCSAG00000011149)	SLC19A2 (ENSCSAG00000011125)	CCDC181 (ENSCSAG00000011089)	BLZF1 (ENSCSAG00000011077)	NME7 (ENSCSAG00000011071)	ATP1B1 (ENSCSAG00000011067)	DPT (ENSCSAG00000011064)	ENSCSAG00000011061	ENSCSAG00000011060
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000018145.cb.b.a	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00920000149129.f	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT01090000260040.a.a.b.u	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b.e.b	ENSGT01100000263557.A.b.b.e.a
Macaca	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155005	ENSGT00390000018145.cb.b.a	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT01090000260040.a.a.b.u	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b.e.b	ENSGT01100000263557.A.b.b.f
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00980000202101.a.a.a	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00980000202103.B.a.a.b	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b.e.b
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES		VAMP4 (ENSMFAG00000031870)	MYOC (ENSMFAG00000041678)	MYOCOS (ENSMFAG00000039392)	PRRC2C (ENSMFAG00000000519)	FMO4 (ENSMFAG00000032860)	FMO1 (ENSMFAG00000045636)	FMO2 (ENSMFAG00000045183)	ENSMFAG00000033160	FMO3 (ENSMFAG00000039471)	MROH9 (ENSMFAG00000004437)	ENSMFAG00000062396	PRRX1 (ENSMFAG00000050061) #18	ENSMFAG00000055960	GORAB (ENSMFAG00000001853) #19	NTMT2 (ENSMFAG00000038829) #21	KIFAP3 (ENSMFAG00000030675) #22	SCYL3 (ENSMFAG00000002890)	C1orf112 (ENSMFAG00000039080)	METTL18 (ENSMFAG00000022253)	SELE (ENSMFAG00000001279)	SELL (ENSMFAG00000042617)	ENSMFAG00000051927	SELP (ENSMFAG00000036068)	F5 (ENSMFAG00000045747)	SLC19A2 (ENSMFAG00000039988)	CCDC181 (ENSMFAG00000041326)	BLZF1 (ENSMFAG00000042415)	NME7 (ENSMFAG00000037358)	ATP1B1 (ENSMFAG00000039661)	DPT (ENSMFAG00000045128)	ENSMFAG00000062392
Rhesus	MODERN SPECIES		ENSMMUG00000057650	VAMP4 (ENSMMUG00000023203)	MYOC (ENSMMUG00000013649)	MYOCOS (ENSMMUG00000056198)	PRRC2C (ENSMMUG00000013639)	FMO4 (ENSMMUG00000014230)	FMO1 (ENSMMUG00000005069)	FMO2 (ENSMMUG00000019727)	ENSMMUG00000056051	FMO3 (ENSMMUG00000007952)	MROH9 (ENSMMUG00000013380)	PRRX1 (ENSMMUG00000050865) #18	ENSMMUG00000063414	GORAB (ENSMMUG00000014674) #19	NTMT2 (ENSMMUG00000059773) #21	KIFAP3 (ENSMMUG00000010081) #22	SCYL3 (ENSMMUG00000016583)	C1H1orf112 (ENSMMUG00000016582)	METTL18 (ENSMMUG00000016581)	SELE (ENSMMUG00000016580)	SELL (ENSMMUG00000016579)	ENSMMUG00000054881	SELP (ENSMMUG00000013044)	F5 (ENSMMUG00000042510)	SLC19A2 (ENSMMUG00000013039)	CCDC181 (ENSMMUG00000000065)	BLZF1 (ENSMMUG00000021080)	NME7 (ENSMMUG00000021079)	ATP1B1 (ENSMMUG00000021078)	DPT (ENSMMUG00000002932)	XCL1 (ENSMMUG00000060218)
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	197														NTMT2 (ENSMNEG00000028723) #21	ENSMNEG00000029064	KIFAP3 (ENSMNEG00000034297) #22	SCYL3 (ENSMNEG00000036997)	C1orf112 (ENSMNEG00000043950)	METTL18 (ENSMNEG00000022283)	SELE (ENSMNEG00000032797)	SELL (ENSMNEG00000033134)	SELP (ENSMNEG00000040941)	F5 (ENSMNEG00000033899)	SLC19A2 (ENSMNEG00000035596)	CCDC181 (ENSMNEG00000035468)	BLZF1 (ENSMNEG00000038122)	NME7 (ENSMNEG00000031493)	ATP1B1 (ENSMNEG00000042381)	DPT (ENSMNEG00000044604)	ENSMNEG00000036621	ENSMNEG00000042673
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000002560	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.b	ENSGT00390000013502.b	ENSGT00390000015231	ENSGT00390000005496.e	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00390000018145.cb.b.a	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT01090000260040.a.a.b.u	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b.e.b	ENSGT01100000263557.A.b.b.e.a
Olive baboon	MODERN SPECIES		ENSPANG00000026213	TNFSF18 (ENSPANG00000021431)	TNFSF4 (ENSPANG00000017269)	FASLG (ENSPANG00000015049)	SUCO (ENSPANG00000005483)	C1orf105 (ENSPANG00000030704)	PIGC (ENSPANG00000011398)	DNM3 (ENSPANG00000030873)	METTL13 (ENSPANG00000013789)	VAMP4 (ENSPANG00000022546)	MYOC (ENSPANG00000012911)	MYOCOS (ENSPANG00000029590)	PRRX1 (ENSPANG00000008313) #18	GORAB (ENSPANG00000007228) #19	NTMT2 (ENSPANG00000019890) #21	KIFAP3 (ENSPANG00000004955) #22	SCYL3 (ENSPANG00000011375)	C1orf112 (ENSPANG00000005096)	METTL18 (ENSPANG00000000141)	SELL (ENSPANG00000020257)	SELE (ENSPANG00000007869)	SELP (ENSPANG00000011947)	ENSPANG00000040764	F5 (ENSPANG00000019750)	SLC19A2 (ENSPANG00000006361)	CCDC181 (ENSPANG00000008887)	BLZF1 (ENSPANG00000009151)	NME7 (ENSPANG00000017310)	ENSPANG00000047492	ATP1B1 (ENSPANG00000005097)	ENSPANG00000051371
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	112												ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT01090000260040.a.a.b.u	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b.e.b	ENSGT01100000263557.A.b.b.e.a
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	317												PRRX1 (ENSCATG00000030224) #18	GORAB (ENSCATG00000030390) #19	NTMT2 (ENSCATG00000030788) #21	ENSCATG00000035443	KIFAP3 (ENSCATG00000041024) #22	ENSCATG00000021035	SCYL3 (ENSCATG00000037412)	C1orf112 (ENSCATG00000034613)	SELE (ENSCATG00000022318)	SELL (ENSCATG00000038996)	SELP (ENSCATG00000030070)	F5 (ENSCATG00000033355)	SLC19A2 (ENSCATG00000023069)	CCDC181 (ENSCATG00000040283)	BLZF1 (ENSCATG00000034463)	NME7 (ENSCATG00000030857)	ATP1B1 (ENSCATG00000044473)	DPT (ENSCATG00000040191)	ENSCATG00000041701	ENSCATG00000039695
Drill	MODERN SPECIES	774												PRRX1 (ENSMLEG00000042343) #18	GORAB (ENSMLEG00000037041) #19	NTMT2 (ENSMLEG00000043458) #21	ENSMLEG00000031097	KIFAP3 (ENSMLEG00000031444) #22	SCYL3 (ENSMLEG00000038212)	C1orf112 (ENSMLEG00000043049)	METTL18 (ENSMLEG00000020534)	SELE (ENSMLEG00000043802)	SELL (ENSMLEG00000026854)	SELP (ENSMLEG00000027550)	F5 (ENSMLEG00000030909)	SLC19A2 (ENSMLEG00000043363)	CCDC181 (ENSMLEG00000042335)	BLZF1 (ENSMLEG00000042714)	NME7 (ENSMLEG00000039211)	ATP1B1 (ENSMLEG00000029426)	DPT (ENSMLEG00000036622)	ENSMLEG00000006813	ENSMLEG00000043761
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000156221.e.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000154418.a.a.g.a	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00390000015360.i.b
Mas night monkey	MODERN SPECIES	1256	MYOC (ENSANAG00000023819)	MYOCOS (ENSANAG00000024934)	PRRC2C (ENSANAG00000027242)	ENSANAG00000033737	ENSANAG00000037798	FMO4 (ENSANAG00000028774)	FMO1 (ENSANAG00000029043)	FMO2 (ENSANAG00000037111)	ENSANAG00000007884	ENSANAG00000037549	FMO3 (ENSANAG00000038350)	MROH9 (ENSANAG00000022237)	PRRX1 (ENSANAG00000023837) #18	GORAB (ENSANAG00000027377) #19	NTMT2 (ENSANAG00000032796) #21	KIFAP3 (ENSANAG00000013349) #22	SCYL3 (ENSANAG00000024270)	C1orf112 (ENSANAG00000021314)	SELE (ENSANAG00000032760)	SELL (ENSANAG00000037545)	ENSANAG00000034982	SELP (ENSANAG00000035384)	F5 (ENSANAG00000029646)	SLC19A2 (ENSANAG00000030143)	CCDC181 (ENSANAG00000001640)	BLZF1 (ENSANAG00000033556)	NME7 (ENSANAG00000029472)	ATP1B1 (ENSANAG00000033196)	DPT (ENSANAG00000028764)	ENSANAG00000032218	ENSANAG00000035650
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000156221.e.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000154418.a.a.g.a	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00390000015360.i.b
Marmoset	MODERN SPECIES	9	METTL13 (ENSCJAG00000009633)	VAMP4 (ENSCJAG00000040794)	MYOC (ENSCJAG00000071226)	MYOCOS (ENSCJAG00000045018)	PRRC2C (ENSCJAG00000009700)	ENSCJAG00000084417	FMO4 (ENSCJAG00000009773)	FMO1 (ENSCJAG00000009792)	FMO2 (ENSCJAG00000009848)	FMO3 (ENSCJAG00000042102)	MROH9 (ENSCJAG00000009912)	ENSCJAG00000078455	PRRX1 (ENSCJAG00000009928) #18	GORAB (ENSCJAG00000009937) #19	NTMT2 (ENSCJAG00000009943) #21	KIFAP3 (ENSCJAG00000009954) #22	SCYL3 (ENSCJAG00000010050)	C1orf112 (ENSCJAG00000010088)	METTL18 (ENSCJAG00000022732)	SELE (ENSCJAG00000010133)	SELL (ENSCJAG00000010174)	SELP (ENSCJAG00000010185)	F5 (ENSCJAG00000010195)	SLC19A2 (ENSCJAG00000010232)	CCDC181 (ENSCJAG00000010246)	BLZF1 (ENSCJAG00000010255)	NME7 (ENSCJAG00000010278)	ATP1B1 (ENSCJAG00000010317)	ENSCJAG00000063697	DPT (ENSCJAG00000082086)	ENSCJAG00000086614
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000153664.A.a.n.l.b	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000156221.e.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000154418.a.a.g.a	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00390000015360.i.b	ENSGT00940000160000
Bolivian squirrel monkey	DUPLICATION
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	55	VAMP4 (ENSSBOG00000029857)	ENSSBOG00000031227	MYOC (ENSSBOG00000025262)	MYOCOS (ENSSBOG00000026733)	PRRC2C (ENSSBOG00000035599)	ENSSBOG00000033925	FMO4 (ENSSBOG00000035448)	FMO1 (ENSSBOG00000007758)	FMO2 (ENSSBOG00000026912)	ENSSBOG00000030497	FMO3 (ENSSBOG00000022473)	MROH9 (ENSSBOG00000020592)	PRRX1 (ENSSBOG00000020067) #18	GORAB (ENSSBOG00000034976) #19	NTMT2 (ENSSBOG00000022692) #21	ENSSBOG00000025462 #22	SCYL3 (ENSSBOG00000028862)	C1orf112 (ENSSBOG00000029237)	SELE (ENSSBOG00000032236)	SELL (ENSSBOG00000022823)	SELP (ENSSBOG00000024062)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	163	CRAT (ENSSBOG00000009452)	PTPA (ENSSBOG00000025076)	C9orf50 (ENSSBOG00000026313)	NTMT1 (ENSSBOG00000018752) ##21	ASB6 (ENSSBOG00000028309)	PRRX2 (ENSSBOG00000030397)	ENSSBOG00000019940	PTGES (ENSSBOG00000023348)	TOR1B (ENSSBOG00000022661)	TOR1A (ENSSBOG00000011197)	C9orf78 (ENSSBOG00000028239)	USP20 (ENSSBOG00000025404)	FNBP1 (ENSSBOG00000021918)	GPR107 (ENSSBOG00000018705)	ENSSBOG00000028307	ENSSBOG00000000774 #22	ENSSBOG00000014367	TLE4 (ENSSBOG00000032458)	TLE1 (ENSSBOG00000036223)	ENSSBOG00000020269	ENSSBOG00000026895	ENSSBOG00000015921	RASEF (ENSSBOG00000029298)	FRMD3 (ENSSBOG00000003764)	ENSSBOG00000030804	UBQLN1 (ENSSBOG00000020552)
Capuchin	MODERN SPECIES	84						FMO1 (ENSCCAG00000020817)	FMO2 (ENSCCAG00000033286)	ENSCCAG00000023480	ENSCCAG00000033729	FMO3 (ENSCCAG00000026265)	MROH9 (ENSCCAG00000037701)	PRRX1 (ENSCCAG00000019169) #18	ENSCCAG00000030279	GORAB (ENSCCAG00000034220) #19	NTMT2 (ENSCCAG00000036256) #21	KIFAP3 (ENSCCAG00000010781) #22	SCYL3 (ENSCCAG00000028147)	C1orf112 (ENSCCAG00000025894)	SELE (ENSCCAG00000032933)	SELL (ENSCCAG00000028534)	SELP (ENSCCAG00000035312)	F5 (ENSCCAG00000020831)	SLC19A2 (ENSCCAG00000037913)	CCDC181 (ENSCCAG00000030458)	BLZF1 (ENSCCAG00000025439)	NME7 (ENSCCAG00000021546)	ATP1B1 (ENSCCAG00000035986)	DPT (ENSCCAG00000023611)	ENSCCAG00000034215	ENSCCAG00000029720	TBX19 (ENSCCAG00000036805)
Tarsier	MODERN SPECIES	2792															METTL11B (ENSTSYG00000002754) #21	KIFAP3 (ENSTSYG00000003475) #22	SCYL3 (ENSTSYG00000002936)	ENSTSYG00000002917
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000005496	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000005496	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Mouse lemur	MODERN SPECIES	11	VAMP4 (ENSMICG00000029221)	MYOC (ENSMICG00000003947)	ENSMICG00000043315	PRRC2C (ENSMICG00000003922)	ENSMICG00000037417	FMO4 (ENSMICG00000017120)	FMO1 (ENSMICG00000017112)	FMO2 (ENSMICG00000017108)	FMO3 (ENSMICG00000031362)	ENSMICG00000034478	ENSMICG00000047625	MROH9 (ENSMICG00000017099)	PRRX1 (ENSMICG00000017097) #18	GORAB (ENSMICG00000033096) #19	NTMT2 (ENSMICG00000029538) #21	KIFAP3 (ENSMICG00000012379) #22	SCYL3 (ENSMICG00000012358)	C1orf112 (ENSMICG00000012330)	SELE (ENSMICG00000012315)	SELL (ENSMICG00000012303)	SELP (ENSMICG00000012288)	F5 (ENSMICG00000012264)	SLC19A2 (ENSMICG00000012252)	CCDC181 (ENSMICG00000012243)	ENSMICG00000044788	NME7 (ENSMICG00000013198)	ATP1B1 (ENSMICG00000013186)	DPT (ENSMICG00000013173)	ENSMICG00000042806	TBX19 (ENSMICG00000007817)	SFT2D2 (ENSMICG00000028528)
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	74	ENSGT00390000005496	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	227							FMO4 (ENSPSMG00000025495)	FMO1 (ENSPSMG00000025500)	FMO2 (ENSPSMG00000025502)	FMO3 (ENSPSMG00000025507)	MROH9 (ENSPSMG00000025513)	PRRX1 (ENSPSMG00000025518) #18	GORAB (ENSPSMG00000025519) #19	ENSPSMG00000025520	NTMT2 (ENSPSMG00000025523) #21	KIFAP3 (ENSPSMG00000025554) #22	SCYL3 (ENSPSMG00000025561)	C1orf112 (ENSPSMG00000025568)	METTL18 (ENSPSMG00000025570)	SELE (ENSPSMG00000025573)	SELL (ENSPSMG00000025575)	SELP (ENSPSMG00000025582)	F5 (ENSPSMG00000025591)	SLC19A2 (ENSPSMG00000025598)	CCDC181 (ENSPSMG00000025603)	BLZF1 (ENSPSMG00000025609)	NME7 (ENSPSMG00000025617)	ATP1B1 (ENSPSMG00000025620)	FKBP15 (ENSPSMG00000025640)	SLC31A2 (ENSPSMG00000025641)	ZFP37 (ENSPSMG00000025642)
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	718	C1orf105 (ENSPCOG00000025017)	DNM3 (ENSPCOG00000014334)	METTL13 (ENSPCOG00000016474)	VAMP4 (ENSPCOG00000012807)	MYOC (ENSPCOG00000003108)	ENSPCOG00000001742	PRRC2C (ENSPCOG00000023617)	FMO4 (ENSPCOG00000024161)	FMO1 (ENSPCOG00000025533)	FMO2 (ENSPCOG00000021238)	FMO3 (ENSPCOG00000027022)	MROH9 (ENSPCOG00000019689)	PRRX1 (ENSPCOG00000014632) #18	GORAB (ENSPCOG00000024051) #19	NTMT2 (ENSPCOG00000015498) #21	KIFAP3 (ENSPCOG00000004619) #22	SCYL3 (ENSPCOG00000028841)	ENSPCOG00000021309	ENSPCOG00000016958	SELE (ENSPCOG00000015034)	SELL (ENSPCOG00000010365)	SELP (ENSPCOG00000007809)	F5 (ENSPCOG00000018129)	SLC19A2 (ENSPCOG00000023865)	CCDC181 (ENSPCOG00000015172)	BLZF1 (ENSPCOG00000028754)	NME7 (ENSPCOG00000028279)	ATP1B1 (ENSPCOG00000017666)	DPT (ENSPCOG00000024322)	ENSPCOG00000023040	ENSPCOG00000019192
Bushbaby	MODERN SPECIES	131	PIGC (ENSOGAG00000011768)	DNM3 (ENSOGAG00000011758)	METTL13 (ENSOGAG00000011755)	ENSOGAG00000026745	MYOC (ENSOGAG00000011752)	PRRC2C (ENSOGAG00000011742)	ENSOGAG00000031783	FMO4 (ENSOGAG00000016483)	FMO1 (ENSOGAG00000016479)	FMO2 (ENSOGAG00000016477)	FMO3 (ENSOGAG00000016468)	ENSOGAG00000016461	PRRX1 (ENSOGAG00000012582) #18	GORAB (ENSOGAG00000012584) #19	NTMT2 (ENSOGAG00000002539) #21	KIFAP3 (ENSOGAG00000010111) #22	SCYL3 (ENSOGAG00000010109)	C1orf112 (ENSOGAG00000010101)	METTL18 (ENSOGAG00000010096)	SELE (ENSOGAG00000010089)	SELL (ENSOGAG00000010080)	SELP (ENSOGAG00000010076)	ENSOGAG00000010063	SLC19A2 (ENSOGAG00000010060)	CCDC181 (ENSOGAG00000029896)	BLZF1 (ENSOGAG00000010058)	NME7 (ENSOGAG00000010051)	ATP1B1 (ENSOGAG00000010046)	DPT (ENSOGAG00000009625)	ENSOGAG00000011103	TBX19 (ENSOGAG00000004458)
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00900000143258	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Tree shrew	MODERN SPECIES	918																KIFAP3 (ENSTBEG00000005864) #22
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Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00900000143258	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01100000264964	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00900000143258	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00860000135681	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
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Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00900000143258	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00860000135681	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00860000135681	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00860000135681	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Prairie vole	MODERN SPECIES	80	Vamp4 (ENSMOCG00000015230)	Myoc (ENSMOCG00000011618)	Myocos (ENSMOCG00000013431)	ENSMOCG00000021278	ENSMOCG00000012732	ENSMOCG00000013255	Fmo4 (ENSMOCG00000018998)	Fmo1 (ENSMOCG00000019601)	Fmo2 (ENSMOCG00000021105)	Fmo6 (ENSMOCG00000004171)	Fmo3 (ENSMOCG00000011022)	Mroh9 (ENSMOCG00000002855)	Prrx1 (ENSMOCG00000012879) #18	Gorab (ENSMOCG00000013670) #19	Mettl11b (ENSMOCG00000016125) #21	Kifap3 (ENSMOCG00000020097) #22	Scyl3 (ENSMOCG00000021134)	BC055324 (ENSMOCG00000015329)	Mettl18 (ENSMOCG00000023028)	Sele (ENSMOCG00000005745)	Sell (ENSMOCG00000021443)	Selp (ENSMOCG00000021475)	F5 (ENSMOCG00000005939)	Slc19a2 (ENSMOCG00000021117)	Ccdc181 (ENSMOCG00000022802)	Blzf1 (ENSMOCG00000000491)	Nme7 (ENSMOCG00000022787)	Atp1b1 (ENSMOCG00000007734)	ENSMOCG00000011949	Dpt (ENSMOCG00000016688)	ENSMOCG00000001226
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	2	Dnm3 (ENSPEMG00000019627)	Mettl13 (ENSPEMG00000019591)	Vamp4 (ENSPEMG00000019730)	ENSPEMG00000028765	Myoc (ENSPEMG00000007518)	Prrc2c (ENSPEMG00000019636)	Fmo4 (ENSPEMG00000019385)	Fmo1 (ENSPEMG00000019514)	Fmo2 (ENSPEMG00000019654)	Fmo6 (ENSPEMG00000019873)	Fmo3 (ENSPEMG00000020171)	Mroh9 (ENSPEMG00000019648)	Prrx1 (ENSPEMG00000019719) #18	Gorab (ENSPEMG00000019525) #19	Mettl11b (ENSPEMG00000026229) #21	Kifap3 (ENSPEMG00000020030) #22	Scyl3 (ENSPEMG00000019752)	BC055324 (ENSPEMG00000006940)	Mettl18 (ENSPEMG00000019435)	Sele (ENSPEMG00000019779)	Sell (ENSPEMG00000015680)	Selp (ENSPEMG00000020102)	F5 (ENSPEMG00000019577)	Slc19a2 (ENSPEMG00000019561)	Ccdc181 (ENSPEMG00000019471)	Blzf1 (ENSPEMG00000019649)	Nme7 (ENSPEMG00000020011)	ENSPEMG00000030544	Atp1b1 (ENSPEMG00000020031)	Dpt (ENSPEMG00000019351)	Xcl1 (ENSPEMG00000019474)
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Chinese hamster chok1gshd	DUPLICATION
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Murinae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00900000143258	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00860000135681	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
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Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00860000135681	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Mouse	MODERN SPECIES		Dnm3 (ENSMUSG00000040265)	Mettl13 (ENSMUSG00000026694)	Vamp4 (ENSMUSG00000026696)	Myoc (ENSMUSG00000026697)	Myocos (ENSMUSG00000091060)	Prrc2c (ENSMUSG00000040225)	Fmo4 (ENSMUSG00000026692)	Fmo1 (ENSMUSG00000040181)	Fmo2 (ENSMUSG00000040170)	Fmo6 (ENSMUSG00000095576)	Fmo3 (ENSMUSG00000026691)	Mroh9 (ENSMUSG00000071890)	Prrx1 (ENSMUSG00000026586) #18	Gorab (ENSMUSG00000040124) #19	Mettl11b (ENSMUSG00000040113) #21	Kifap3 (ENSMUSG00000026585) #22	Scyl3 (ENSMUSG00000026584)	BC055324 (ENSMUSG00000041406)	Mettl18 (ENSMUSG00000041396)	Sele (ENSMUSG00000026582)	Sell (ENSMUSG00000026581)	Selp (ENSMUSG00000026580)	F5 (ENSMUSG00000026579)	Slc19a2 (ENSMUSG00000040918)	Ccdc181 (ENSMUSG00000026578)	Blzf1 (ENSMUSG00000026577)	Nme7 (ENSMUSG00000026575)	Atp1b1 (ENSMUSG00000026576)	Dpt (ENSMUSG00000026574)	Xcl1 (ENSMUSG00000026573)	Tbx19 (ENSMUSG00000026572)
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spretus	MODERN SPECIES		Dnm3 (MGP_SPRETEiJ_G0015577)	Mettl13 (MGP_SPRETEiJ_G0015578)	Vamp4 (MGP_SPRETEiJ_G0015579)	Myoc (MGP_SPRETEiJ_G0015580)	Myocos (MGP_SPRETEiJ_G0015581)	Prrc2c (MGP_SPRETEiJ_G0015582)	MGP_SPRETEiJ_G0015583	Fmo1 (MGP_SPRETEiJ_G0015584)	Fmo2 (MGP_SPRETEiJ_G0015585)	Fmo6 (MGP_SPRETEiJ_G0015586)	Fmo3 (MGP_SPRETEiJ_G0015587)	Mroh9 (MGP_SPRETEiJ_G0015588)	Prrx1 (MGP_SPRETEiJ_G0015589) #18	Gorab (MGP_SPRETEiJ_G0015590) #19	Mettl11b (MGP_SPRETEiJ_G0015591) #21	Kifap3 (MGP_SPRETEiJ_G0015592) #22	Scyl3 (MGP_SPRETEiJ_G0015593)	BC055324 (MGP_SPRETEiJ_G0015594)	Mettl18 (MGP_SPRETEiJ_G0015595)	Sele (MGP_SPRETEiJ_G0015596)	Sell (MGP_SPRETEiJ_G0015597)	Selp (MGP_SPRETEiJ_G0015598)	F5 (MGP_SPRETEiJ_G0015599)	Slc19a2 (MGP_SPRETEiJ_G0015600)	Ccdc181 (MGP_SPRETEiJ_G0015601)	Blzf1 (MGP_SPRETEiJ_G0015602)	Nme7 (MGP_SPRETEiJ_G0015603)	Atp1b1 (MGP_SPRETEiJ_G0015604)	Dpt (MGP_SPRETEiJ_G0015605)	Xcl1 (MGP_SPRETEiJ_G0015606)	Tbx19 (MGP_SPRETEiJ_G0015607)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES		Dnm3 (MGP_CAROLIEiJ_G0014770)	Mettl13 (MGP_CAROLIEiJ_G0014771)	Vamp4 (MGP_CAROLIEiJ_G0014772)	Myoc (MGP_CAROLIEiJ_G0014773)	Myocos (MGP_CAROLIEiJ_G0014774)	Prrc2c (MGP_CAROLIEiJ_G0014775)	Fmo4 (MGP_CAROLIEiJ_G0014776)	Fmo1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014777)	Fmo2 (MGP_CAROLIEiJ_G0014778)	Fmo6 (MGP_CAROLIEiJ_G0014779)	Fmo3 (MGP_CAROLIEiJ_G0014780)	Mroh9 (MGP_CAROLIEiJ_G0014781)	Prrx1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014782) #18	Gorab (MGP_CAROLIEiJ_G0014783) #19	Mettl11b (MGP_CAROLIEiJ_G0014784) #21	Kifap3 (MGP_CAROLIEiJ_G0014785) #22	Scyl3 (MGP_CAROLIEiJ_G0014786)	BC055324 (MGP_CAROLIEiJ_G0014787)	Mettl18 (MGP_CAROLIEiJ_G0014788)	Sele (MGP_CAROLIEiJ_G0014789)	Sell (MGP_CAROLIEiJ_G0014790)	Selp (MGP_CAROLIEiJ_G0014791)	F5 (MGP_CAROLIEiJ_G0014792)	Slc19a2 (MGP_CAROLIEiJ_G0014793)	Ccdc181 (MGP_CAROLIEiJ_G0014794)	Blzf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014795)	Nme7 (MGP_CAROLIEiJ_G0014796)	Atp1b1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014797)	Dpt (MGP_CAROLIEiJ_G0014798)	Xcl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014799)	Tbx19 (MGP_CAROLIEiJ_G0014800)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	18	Dnm3 (MGP_PahariEiJ_G0028007)	Mettl13 (MGP_PahariEiJ_G0028008)	Vamp4 (MGP_PahariEiJ_G0028009)	Myoc (MGP_PahariEiJ_G0028010)	Myocos (MGP_PahariEiJ_G0028011)	Prrc2c (MGP_PahariEiJ_G0028012)	Fmo4 (MGP_PahariEiJ_G0028013)	Fmo1 (MGP_PahariEiJ_G0028014)	Fmo2 (MGP_PahariEiJ_G0028015)	Fmo6 (MGP_PahariEiJ_G0028016)	Fmo3 (MGP_PahariEiJ_G0028017)	Mroh9 (MGP_PahariEiJ_G0028018)	Prrx1 (MGP_PahariEiJ_G0028019) #18	Gorab (MGP_PahariEiJ_G0028020) #19	Mettl11b (MGP_PahariEiJ_G0028021) #21	Kifap3 (MGP_PahariEiJ_G0028022) #22	Scyl3 (MGP_PahariEiJ_G0028023)	BC055324 (MGP_PahariEiJ_G0028024)	Mettl18 (MGP_PahariEiJ_G0028025)	Sele (MGP_PahariEiJ_G0028026)	Sell (MGP_PahariEiJ_G0028027)	Selp (MGP_PahariEiJ_G0028028)	F5 (MGP_PahariEiJ_G0028029)	Slc19a2 (MGP_PahariEiJ_G0028030)	Ccdc181 (MGP_PahariEiJ_G0028031)	Blzf1 (MGP_PahariEiJ_G0028032)	Nme7 (MGP_PahariEiJ_G0028033)	Atp1b1 (MGP_PahariEiJ_G0028034)	Dpt (MGP_PahariEiJ_G0028035)	XCL1 (MGP_PahariEiJ_G0028036)	Tbx19 (MGP_PahariEiJ_G0028037)
Rat	MODERN SPECIES	4	AABR07021591.1 (ENSRNOG00000029459)	Mettl13 (ENSRNOG00000003042)	Vamp4 (ENSRNOG00000003071)	Myoc (ENSRNOG00000003221)	ENSRNOG00000066215	Prrc2c (ENSRNOG00000068743)	Fmo4 (ENSRNOG00000003400)	Fmo1 (ENSRNOG00000034191)	Fmo2 (ENSRNOG00000003510)	Fmo6 (ENSRNOG00000049851)	Fmo3 (ENSRNOG00000003620)	Mroh9 (ENSRNOG00000003698)	Prrx1 (ENSRNOG00000003720) #18	Gorab (ENSRNOG00000003861) #19	Ntmt2 (ENSRNOG00000025415) #21	Kifap3 (ENSRNOG00000002544) #22	Scyl3 (ENSRNOG00000025318)	LOC498265 (ENSRNOG00000059276)	Mettl18 (ENSRNOG00000025189)	Sele (ENSRNOG00000002723)	Sell (ENSRNOG00000002776)	Selp (ENSRNOG00000002794)	F5 (ENSRNOG00000057855)	Slc19a2 (ENSRNOG00000002839)	Ccdc181 (ENSRNOG00000002860)	Blzf1 (ENSRNOG00000002884)	Nme7 (ENSRNOG00000002898)	Atp1b1 (ENSRNOG00000002934)	Dpt (ENSRNOG00000002947)	Xcl1 (ENSRNOG00000002964)	Tbx19 (ENSRNOG00000002979)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1490																Kifap3 (ENSNGAG00000012030) #22
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	68	Myoc (ENSJJAG00000021766)	ENSJJAG00000000508	ENSJJAG00000012807	ENSJJAG00000012503	ENSJJAG00000021042	ENSJJAG00000020009	ENSJJAG00000019160	Fmo1 (ENSJJAG00000003360)	Fmo2 (ENSJJAG00000019599)	Fmo6 (ENSJJAG00000000583)	Fmo3 (ENSJJAG00000021700)	Mroh9 (ENSJJAG00000019807)	Prrx1 (ENSJJAG00000015281) #18	Gorab (ENSJJAG00000019951) #19	Mettl11b (ENSJJAG00000024419) #21	Kifap3 (ENSJJAG00000017802) #22	Scyl3 (ENSJJAG00000015600)	BC055324 (ENSJJAG00000018870)	Mettl18 (ENSJJAG00000018499)	Sele (ENSJJAG00000004484)	Sell (ENSJJAG00000011229)	Selp (ENSJJAG00000000498)	F5 (ENSJJAG00000020633)	Slc19a2 (ENSJJAG00000009790)	Ccdc181 (ENSJJAG00000002620)	Blzf1 (ENSJJAG00000012171)	Nme7 (ENSJJAG00000013080)	Atp1b1 (ENSJJAG00000017903)	Dpt (ENSJJAG00000021367)	Xcl1 (ENSJJAG00000014577)	ENSJJAG00000011688
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	346	H2ac25 (ENSDORG00000026130)	H2bc26-ps (ENSDORG00000024270)	ENSDORG00000005512	Sh3bp5l (ENSDORG00000007183)	Fasl (ENSDORG00000011897)	Suco (ENSDORG00000011895)	Pigc (ENSDORG00000030248)	Dnm3 (ENSDORG00000002505)	Mettl13 (ENSDORG00000011976)	Prrc2c (ENSDORG00000001422)	Fmo1 (ENSDORG00000029306)	Fmo2 (ENSDORG00000004731)	Fmo3 (ENSDORG00000006804)	ENSDORG00000003154 #18	Mettl11b (ENSDORG00000001437) #21	Kifap3 (ENSDORG00000001434) #22	ENSDORG00000030142	Slc19a2 (ENSDORG00000004902)	Blzf1 (ENSDORG00000015639)	Nme7 (ENSDORG00000015638)	Atp1b1 (ENSDORG00000015637)	Dpt (ENSDORG00000002652)	Tbx19 (ENSDORG00000014860)	Lox (ENSDORG00000025532)	1700034E13Rik (ENSDORG00000025106)	ENSDORG00000026417	Sncaip (ENSDORG00000014295)	Snx2 (ENSDORG00000015224)	Snx24 (ENSDORG00000015658)	Ppic (ENSDORG00000015659)	Prdm6 (ENSDORG00000009966)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00940000158946	ENSGT00390000009400	ENSGT00390000018244	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00940000158556	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000160168	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000004791	ENSGT00930000151043	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00940000154453.a.b.b	ENSGT01090000260098.B	ENSGT00940000161191.A	ENSGT00390000009751	ENSGT01090000259987.a.b	ENSGT00940000157169	ENSGT00950000183214.a.b.a.a	ENSGT00940000154926.x	ENSGT00940000156952	ENSGT00440000037780.a.l	ENSGT00940000156232.b	ENSGT00940000156625	ENSGT00940000156227.f	ENSGT00940000157325.w.b.b	ENSGT00390000001775.B
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00940000158946	ENSGT00390000009400	ENSGT00390000018244	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00940000158556	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000160168	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000004791	ENSGT00930000151043	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00940000154453.a.b.b	ENSGT01090000260098.B	ENSGT00940000161191.A	ENSGT00390000009751	ENSGT01090000259987.a.b	ENSGT00940000157169	ENSGT00950000183214.a.b.a.a	ENSGT00940000154926.x	ENSGT00940000156952	ENSGT00440000037780.a.l	ENSGT00940000156232.b	ENSGT00940000156625	ENSGT00940000156227.f	ENSGT00940000157325.w.b.b	ENSGT00390000001775.B
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00940000158946	ENSGT00390000009400	ENSGT00390000018244	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00940000158556	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000160168	ENSGT00390000000464	ENSGT00390000004791	ENSGT00930000151043	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00940000154453.a.b.b	ENSGT01090000260098.B	ENSGT00940000161191.A	ENSGT00390000009751	ENSGT01090000259987.a.b	ENSGT00940000157169	ENSGT00950000183214.a.b.a.a	ENSGT00940000154926.x	ENSGT00940000156952	ENSGT00440000037780.a.l	ENSGT00940000156232.b	ENSGT00940000156625	ENSGT00940000156227.f	ENSGT00940000157325.w.b.b	ENSGT00390000001775.B
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	169	ATP1B1 (ENSCLAG00000009477)	NME7 (ENSCLAG00000007842)	BLZF1 (ENSCLAG00000006177)	CCDC181 (ENSCLAG00000005303)	SLC19A2 (ENSCLAG00000014197)	F5 (ENSCLAG00000011798)	SELP (ENSCLAG00000005532)	SELL (ENSCLAG00000005466)	SELE (ENSCLAG00000004901)	METTL18 (ENSCLAG00000017821)	C1orf112 (ENSCLAG00000012920)	SCYL3 (ENSCLAG00000006650)	PRRX1 (ENSCLAG00000005839) #18	GORAB (ENSCLAG00000004310) #19	ENSCLAG00000007665 #21	KIFAP3 (ENSCLAG00000011056) #22	CCNY (ENSCLAG00000007722)	GJD4 (ENSCLAG00000006795)	ENSCLAG00000004507	ITGB1 (ENSCLAG00000005152)	NRP1 (ENSCLAG00000006531)	PARD3 (ENSCLAG00000009702)	ENSCLAG00000008213	CREM (ENSCLAG00000004793)	WAC (ENSCLAG00000008742)	MPP7 (ENSCLAG00000009095)	ENSCLAG00000012234	ODAD2 (ENSCLAG00000010273)	MKX (ENSCLAG00000009858)	RAB18 (ENSCLAG00000008819)	ENSCLAG00000008331
Degu	MODERN SPECIES	185												ENSODEG00000003657	PRRX1 (ENSODEG00000003609) #18	GORAB (ENSODEG00000003575) #19	NTMT2 (ENSODEG00000003278) #21	KIFAP3 (ENSODEG00000003030) #22	ENSODEG00000004619	ENSODEG00000004584	ENSODEG00000019065	CCNY (ENSODEG00000004550)	GJD4 (ENSODEG00000004448)	FZD8 (ENSODEG00000019358)	ENSODEG00000004409	ENSODEG00000004390	ENSODEG00000004382	ENSODEG00000004245	NRP1 (ENSODEG00000004113)	PARD3 (ENSODEG00000004622)	ENSODEG00000004486	ENSODEG00000004461	ENSODEG00000004444
Guinea pig	MODERN SPECIES	39	ATP1B1 (ENSCPOG00000039107)	NME7 (ENSCPOG00000004222)	BLZF1 (ENSCPOG00000007333)	CCDC181 (ENSCPOG00000024492)	SLC19A2 (ENSCPOG00000006894)	F5 (ENSCPOG00000006900)	SELP (ENSCPOG00000006911)	SELL (ENSCPOG00000035058)	SELE (ENSCPOG00000012409)	METTL18 (ENSCPOG00000027533)	C1orf112 (ENSCPOG00000012270)	SCYL3 (ENSCPOG00000026352)	PRRX1 (ENSCPOG00000014515) #18	GORAB (ENSCPOG00000012461) #19	NTMT2 (ENSCPOG00000039607) #21	ENSCPOG00000010161 #22	ENSCPOG00000014625	CCNY (ENSCPOG00000036251)	GJD4 (ENSCPOG00000000042)	ITGB1 (ENSCPOG00000009007)	NRP1 (ENSCPOG00000009021)	PARD3 (ENSCPOG00000015693)	CUL2 (ENSCPOG00000001702)	CREM (ENSCPOG00000015442)	WAC (ENSCPOG00000001713)	MPP7 (ENSCPOG00000001663)	ODAD2 (ENSCPOG00000009603)	MKX (ENSCPOG00000035405)	RAB18 (ENSCPOG00000032827)	PHYH (ENSCPOG00000007582)	ENSCPOG00000019290
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	20	SELP (ENSHGLG00000001876)	SELL (ENSHGLG00000048749)	ENSHGLG00000002768	METTL18 (ENSHGLG00000020074)	ENSHGLG00000018896	ENSHGLG00000019520	ENSHGLG00000036520	ENSHGLG00000021140	ENSHGLG00000038928	ENSHGLG00000019125	ENSHGLG00000020098	ENSHGLG00000042460 #18	GORAB (ENSHGLG00000042352) #19	ENSHGLG00000035430	ENSHGLG00000015659 #21	ENSHGLG00000015604 #22	ENSHGLG00000004698	ENSHGLG00000017243	ENSHGLG00000048131	ENSHGLG00000017330	ENSHGLG00000048887	ENSHGLG00000036147	ENSHGLG00000008225	ENSHGLG00000007906	ENSHGLG00000045127	ENSHGLG00000046042	PARD3 (ENSHGLG00000007597)	ENSHGLG00000043569	ENSHGLG00000044614	ENSHGLG00000006920	ENSHGLG00000039912
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01050000245064	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099.b	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01100000264964	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099.b	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Alpin marmot	MODERN SPECIES	29	METTL13 (ENSMMMG00000017943)	VAMP4 (ENSMMMG00000017953)	MYOC (ENSMMMG00000018016)	ENSMMMG00000018036	PRRC2C (ENSMMMG00000018040)	FMO4 (ENSMMMG00000018059)	FMO1 (ENSMMMG00000018072)	FMO2 (ENSMMMG00000018096)	ENSMMMG00000018109	FMO3 (ENSMMMG00000018122)	MROH9 (ENSMMMG00000018136)	ENSMMMG00000018167	PRRX1 (ENSMMMG00000018176) #18	ENSMMMG00000018202 #19	NTMT2 (ENSMMMG00000018220) #21	KIFAP3 (ENSMMMG00000018230) #22	SCYL3 (ENSMMMG00000018300)	C1orf112 (ENSMMMG00000018413)	METTL18 (ENSMMMG00000018443)	SELE (ENSMMMG00000018492)	SELP (ENSMMMG00000018590)	F5 (ENSMMMG00000018600)	SLC19A2 (ENSMMMG00000018667)	CCDC181 (ENSMMMG00000018669)	BLZF1 (ENSMMMG00000018679)	NME7 (ENSMMMG00000018711)	ATP1B1 (ENSMMMG00000018738)	DPT (ENSMMMG00000018754)	ENSMMMG00000018756	TBX19 (ENSMMMG00000018775)	SFT2D2 (ENSMMMG00000018779)
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000158056	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT01100000264964	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099.b	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	314									ENSUPAG00010010456	FMO3 (ENSUPAG00010010464)	MROH9 (ENSUPAG00010010467)	ENSUPAG00010010493	PRRX1 (ENSUPAG00010010497) #18	GORAB (ENSUPAG00010010512) #19	NTMT2 (ENSUPAG00010010514) #21	KIFAP3 (ENSUPAG00010010519) #22	SCYL3 (ENSUPAG00010010543)	C1orf112 (ENSUPAG00010010622)	METTL18 (ENSUPAG00010010675)	ENSUPAG00010010678	SELP (ENSUPAG00010010702)	F5 (ENSUPAG00010010738)	SLC19A2 (ENSUPAG00010010910)	CCDC181 (ENSUPAG00010010935)	BLZF1 (ENSUPAG00010010941)	NME7 (ENSUPAG00010010951)	ATP1B1 (ENSUPAG00010010998)	DPT (ENSUPAG00010011014)	ENSUPAG00010011020	TBX19 (ENSUPAG00010011029)	SFT2D2 (ENSUPAG00010011039)
Squirrel	MODERN SPECIES	81	METTL13 (ENSSTOG00000003852)	VAMP4 (ENSSTOG00000003843)	MYOC (ENSSTOG00000003836)	ENSSTOG00000034019	PRRC2C (ENSSTOG00000003769)	ENSSTOG00000021033	ENSSTOG00000028302	FMO1 (ENSSTOG00000003880)	FMO2 (ENSSTOG00000024938)	ENSSTOG00000003848	FMO3 (ENSSTOG00000003824)	MROH9 (ENSSTOG00000003777)	PRRX1 (ENSSTOG00000023298) #18	GORAB (ENSSTOG00000026492) #19	NTMT2 (ENSSTOG00000003081) #21	KIFAP3 (ENSSTOG00000003065) #22	SCYL3 (ENSSTOG00000003053)	C1orf112 (ENSSTOG00000003029)	METTL18 (ENSSTOG00000003028)	SELE (ENSSTOG00000008973)	SELL (ENSSTOG00000008958)	SELP (ENSSTOG00000008931)	F5 (ENSSTOG00000008897)	SLC19A2 (ENSSTOG00000008889)	CCDC181 (ENSSTOG00000023591)	BLZF1 (ENSSTOG00000011491)	NME7 (ENSSTOG00000011478)	ATP1B1 (ENSSTOG00000011473)	DPT (ENSSTOG00000029188)	ENSSTOG00000014588	TBX19 (ENSSTOG00000019913)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	3	DNM3 (ENSSVLG00005021575)	METTL13 (ENSSVLG00005021966)	ENSSVLG00005022026	MYOC (ENSSVLG00005022146)	MYOCOS (ENSSVLG00005022180)	PRRC2C (ENSSVLG00005022231)	FMO4 (ENSSVLG00005022471)	FMO1 (ENSSVLG00005022547)	FMO2 (ENSSVLG00005022662)	ENSSVLG00005022727	FMO3 (ENSSVLG00005022795)	MROH9 (ENSSVLG00005022870)	PRRX1 (ENSSVLG00005023012) #18	ENSSVLG00005023089 #19	NTMT2 (ENSSVLG00005023131) #21	KIFAP3 (ENSSVLG00005023187) #22	SCYL3 (ENSSVLG00005023322)	C1orf112 (ENSSVLG00005023367)	ENSSVLG00005023399	METTL18 (ENSSVLG00005023411)	ENSSVLG00005023504	ENSSVLG00005023929	ENSSVLG00005024116	SELL (ENSSVLG00005024196)	SELP (ENSSVLG00005024333)	ENSSVLG00005024389	F5 (ENSSVLG00005024439)	SLC19A2 (ENSSVLG00005024621)	CCDC181 (ENSSVLG00005024651)	BLZF1 (ENSSVLG00005024682)	NME7 (ENSSVLG00005024722)
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	159							ENSGT00940000160256.b	ENSGT00940000160945	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000162076	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244
Rabbit	MODERN SPECIES	4	DPT (ENSOCUG00000005174)	ATP1B1 (ENSOCUG00000006867)	ENSOCUG00000006873	BLZF1 (ENSOCUG00000008982)	FMO4 (ENSOCUG00000002795)	FMO1 (ENSOCUG00000002788)	FMO2 (ENSOCUG00000005177)	ENSOCUG00000005169	FMO3 (ENSOCUG00000003610)	MROH9 (ENSOCUG00000004105)	PRRX1 (ENSOCUG00000012272) #18	ENSOCUG00000039406	GORAB (ENSOCUG00000017965) #19	NTMT2 (ENSOCUG00000015746) #21	ENSOCUG00000027922	KIFAP3 (ENSOCUG00000013824) #22	SCYL3 (ENSOCUG00000013811)	C1orf112 (ENSOCUG00000013789)	METTL18 (ENSOCUG00000013780)	SELE (ENSOCUG00000017438)	SELL (ENSOCUG00000017432)	SELP (ENSOCUG00000016477)	F5 (ENSOCUG00000026781)	ENSOCUG00000038027	SLC19A2 (ENSOCUG00000025548)	CCDC181 (ENSOCUG00000000852)	ENSOCUG00000036962	PRRC2C (ENSOCUG00000015914)	MYOCOS (ENSOCUG00000030327)	MYOC (ENSOCUG00000015957)	VAMP4 (ENSOCUG00000015967)
Pika	MODERN SPECIES	4226																KIFAP3 (ENSOPRG00000000747) #22	SCYL3 (ENSOPRG00000000730)	C1orf112 (ENSOPRG00000000710)	METTL18 (ENSOPRG00000000705)	SELE (ENSOPRG00000000699)	ENSOPRG00000000690
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.a.b	ENSGT00940000160256.a.a	ENSGT00940000160945.g	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000167297	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000161063	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT00940000165676	ENSGT01100000263557.A.b.b	ENSGT00940000160000
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.a.b	ENSGT00940000160256.a.a	ENSGT00940000160945.g	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000167297	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000161063.f	ENSGT00940000161063.e.b	ENSGT00940000161063.e.a	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT00940000165676
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.a.b	ENSGT00940000160256.a.a	ENSGT00940000160945.g	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000167297	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000161063.f	ENSGT00940000161063.e.b	ENSGT00940000161063.e.a	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT00940000165676
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00510000047399	ENSGT00940000155005	ENSGT00940000158561	ENSGT00950000183161.b	ENSGT00940000160256.a.b	ENSGT00940000160256.a.a	ENSGT00940000160945.g.a	ENSGT00940000161099	ENSGT00940000162771	ENSGT00940000161339	ENSGT00940000167297	ENSGT00940000162280	ENSGT00940000159466 #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000000464	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000161063.f	ENSGT00940000161063.e.b	ENSGT00940000161063.e.a	ENSGT00940000158556	ENSGT00950000183022.a.b	ENSGT00390000018244	ENSGT00390000009400	ENSGT00940000158946	ENSGT01030000234579.C	ENSGT00390000010760	ENSGT00940000165676
Common wonbat	MODERN SPECIES	1026	METTL13 (ENSVURG00010005396)	VAMP4 (ENSVURG00010005385)	MYOC (ENSVURG00010005377)	PRRC2C (ENSVURG00010005291)	FMO4 (ENSVURG00010005175)	ENSVURG00010005141	ENSVURG00010005126	FMO2 (ENSVURG00010005109)	ENSVURG00010005086	FMO3 (ENSVURG00010005049)	ENSVURG00010004813	ENSVURG00010004761	PRRX1 (ENSVURG00010004718) #18	GORAB (ENSVURG00010004691) #19	NTMT2 (ENSVURG00010004667) #21	KIFAP3 (ENSVURG00010004572) #22	SCYL3 (ENSVURG00010004512)	C1orf112 (ENSVURG00010004410)	METTL18 (ENSVURG00010004399)	SELE (ENSVURG00010004387)	ENSVURG00010004358	SELP (ENSVURG00010004304)	F5 (ENSVURG00010004211)	SLC19A2 (ENSVURG00010004191)	CCDC181 (ENSVURG00010004178)	BLZF1 (ENSVURG00010004137)	NME7 (ENSVURG00010004120)	ATP1B1 (ENSVURG00010004104)	DPT (ENSVURG00010004063)	ENSVURG00010004041	ENSVURG00010004027
koala	MODERN SPECIES	257																KIFAP3 (ENSPCIG00000024029) #22	SCYL3 (ENSPCIG00000024032)	C1orf112 (ENSPCIG00000024034)	METTL18 (ENSPCIG00000024038)	SELE (ENSPCIG00000028787)	ENSPCIG00000028786	ENSPCIG00000034755	ENSPCIG00000028784	F5 (ENSPCIG00000028783)	SLC19A2 (ENSPCIG00000028782)	CCDC181 (ENSPCIG00000028780)	BLZF1 (ENSPCIG00000028779)	NME7 (ENSPCIG00000028778)	ATP1B1 (ENSPCIG00000007561)	DPT (ENSPCIG00000022676)	ENSPCIG00000034139
Wallaby	MODERN SPECIES	9813																ENSMEUG00000012868 #22
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	3	PIGC (ENSSHAG00000031778)	DNM3 (ENSSHAG00000023263)	METTL13 (ENSSHAG00000017290)	ENSSHAG00000017179	MYOC (ENSSHAG00000017025)	ENSSHAG00000016870	ENSSHAG00000016654	ENSSHAG00000016572	ENSSHAG00000025087	ENSSHAG00000016202	ENSSHAG00000016098	ENSSHAG00000015839	PRRX1 (ENSSHAG00000031839) #18	GORAB (ENSSHAG00000027057) #19	NTMT2 (ENSSHAG00000013039) #21	KIFAP3 (ENSSHAG00000011953) #22	SCYL3 (ENSSHAG00000011339)	C1orf112 (ENSSHAG00000010949)	METTL18 (ENSSHAG00000010921)	SELE (ENSSHAG00000010556)	ENSSHAG00000010339	SELP (ENSSHAG00000009722)	F5 (ENSSHAG00000008881)	SLC19A2 (ENSSHAG00000008381)	CCDC181 (ENSSHAG00000007871)	BLZF1 (ENSSHAG00000007669)	ENSSHAG00000005738	ENSSHAG00000024967	DPT (ENSSHAG00000022487)	ENSSHAG00000004166	ENSSHAG00000018950
Opossum	MODERN SPECIES	1	ENSMODG00000037255	MYOC (ENSMODG00000003796)	PRRC2C (ENSMODG00000003772)	ENSMODG00000003739	ENSMODG00000024999	ENSMODG00000050381	ENSMODG00000003717	FMO2 (ENSMODG00000003696)	ENSMODG00000003658	FMO3 (ENSMODG00000003637)	ENSMODG00000003611	ENSMODG00000003593	PRRX1 (ENSMODG00000003582) #18	GORAB (ENSMODG00000045113) #19	NTMT2 (ENSMODG00000003562) #21	KIFAP3 (ENSMODG00000003544) #22	SCYL3 (ENSMODG00000003449)	C1orf112 (ENSMODG00000003433)	METTL18 (ENSMODG00000003390)	SELE (ENSMODG00000003253)	ENSMODG00000028669	SELP (ENSMODG00000003164)	F5 (ENSMODG00000003126)	SLC19A2 (ENSMODG00000003071)	CCDC181 (ENSMODG00000003052)	BLZF1 (ENSMODG00000003015)	NME7 (ENSMODG00000003002)	ATP1B1 (ENSMODG00000002980)	DPT (ENSMODG00000040982)	ENSMODG00000027516	ENSMODG00000002933
Platypus	MODERN SPECIES	7	PIGC (ENSOANG00000000908)	DNM3 (ENSOANG00000000906)	METTL13 (ENSOANG00000036693)	ITPA (ENSOANG00000000904)	VAMP4 (ENSOANG00000039648)	MYOC (ENSOANG00000000901)	PRRC2C (ENSOANG00000000900)	FMO4 (ENSOANG00000000899)	ENSOANG00000000896	FMO3 (ENSOANG00000000895)	ENSOANG00000000894	ENSOANG00000000892	PRRX1 (ENSOANG00000037230) #18	GORAB (ENSOANG00000000891) #19	ENSOANG00000000888 #21	KIFAP3 (ENSOANG00000000884) #22	SCYL3 (ENSOANG00000000881)	METTL18 (ENSOANG00000016063)	ENSOANG00000000876	C1orf112 (ENSOANG00000000879)	ENSOANG00000000875	SELP (ENSOANG00000000873)	F5 (ENSOANG00000000866)	SLC19A2 (ENSOANG00000000864)	ENSOANG00000000862	BLZF1 (ENSOANG00000000860)	NME7 (ENSOANG00000000856)	ATP1B1 (ENSOANG00000000855)	DPT (ENSOANG00000000854)	ENSOANG00000003893	TBX19 (ENSOANG00000003892)
Anura	ANCESTRAL SPECIES	112													ENSGT00940000159466.n #18	ENSGT00390000014886 #19	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00930000151043	ENSGT00390000004791	ENSGT00390000002738.b	ENSGT00940000164633	ENSGT00940000160168	ENSGT00940000159221	ENSGT00940000157757	ENSGT00940000154842.a.b	ENSGT00390000013340	ENSGT00940000156906	ENSGT00390000008608	ENSGT00940000162687	ENSGT00390000002659	ENSGT01020000230412.A.c.b.d	ENSGT00390000018059.b
Frog	MODERN SPECIES	4	rgs2 (ENSXETG00000005675)	naaa (ENSXETG00000017223)	ro60 (ENSXETG00000017224)	notch2 (ENSXETG00000017225)	sec22b (ENSXETG00000025777)	imp3 (ENSXETG00000038538)	prkab2 (ENSXETG00000036380)	ENSXETG00000048243 #17	pde4dip (ENSXETG00000010192) #16	prrx1 (ENSXETG00000004727) #18	gorab (ENSXETG00000037580) #19	ENSXETG00000048083	ENSXETG00000034511	ntmt2 (ENSXETG00000004731) #21	ENSXETG00000024774	kifap3 (ENSXETG00000004733) #22	scyl3 (ENSXETG00000004735)	c1orf112 (ENSXETG00000004738)	ENSXETG00000004740	selp (ENSXETG00000004741)	SELE (ENSXETG00000048520)	ENSXETG00000034276	atf6 (ENSXETG00000004747)	olfml2b (ENSXETG00000004748)	ENSXETG00000034778	rxrg (ENSXETG00000004750)	ddr2 (ENSXETG00000004752)	XB5769266 [provisional] (ENSXETG00000004753)	hsd17b7 (ENSXETG00000004754)	lrrc52 (ENSXETG00000004755)	mgst3 (ENSXETG00000004756)
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	11	ENSLLEG00000021797	ENSLLEG00000021829	ENSLLEG00000021878	ENSLLEG00000021894	PICK1 (ENSLLEG00000021972)	ENSLLEG00000022954	PRRX1 (ENSLLEG00000023158) #18	ENSLLEG00000023233	GORAB (ENSLLEG00000023253) #19	ENSLLEG00000023299	ENSLLEG00000023314	ENSLLEG00000023333	ENSLLEG00000023389	ENSLLEG00000023412	NTMT2 (ENSLLEG00000023425) #21	KIFAP3 (ENSLLEG00000023539) #22	ENSLLEG00000025221	ENSLLEG00000025238	SCYL3 (ENSLLEG00000025271)	ENSLLEG00000025476	ENSLLEG00000026032	ENSLLEG00000026049	ENSLLEG00000026063	ENSLLEG00000026088	ENSLLEG00000026099	ENSLLEG00000026156	ENSLLEG00000026721	DUSP12 (ENSLLEG00000026925)	ENSLLEG00000027012	DDR2 (ENSLLEG00000027059)	ENSLLEG00000027477
Coelacanth	MODERN SPECIES	1405												PRRX1 (ENSLACG00000011357) #18	GORAB (ENSLACG00000010617) #19	NTMT2 (ENSLACG00000008139) #21	ENSLACG00000006983	KIFAP3 (ENSLACG00000005516) #22	PRKAB2 (ENSLACG00000004874)	ARPC5 (ENSLACG00000004478)	ENSLACG00000004081	NCF2 (ENSLACG00000002874)	ENSLACG00000002022	ENSLACG00000000316
Elephant shark	MODERN SPECIES	1526	ENSCMIG00000016729	dusp12 (ENSCMIG00000016750)	ENSCMIG00000016753	SELE (ENSCMIG00000016768)	si:dkey-51e6.1 (ENSCMIG00000016769)	si:dkey-97o5.1 (ENSCMIG00000016772)	scyl3 (ENSCMIG00000016774)	PRKAB2 (ENSCMIG00000016779)	ENSCMIG00000016783 ##16	ENSCMIG00000016785 #16	ENSCMIG00000016787 #16	ENSCMIG00000016789 #16	prrx1b (ENSCMIG00000016794) #18	ENSCMIG00000016800 #19	ntmt2 (ENSCMIG00000016804) #21	kifap3b (ENSCMIG00000016823) #22	ENSCMIG00000016848	pdcb (ENSCMIG00000016854)	ptgs2b (ENSCMIG00000017023)	pla2g4aa (ENSCMIG00000017464)	arpc5b (ENSCMIG00000017504)	ENSCMIG00000017509	ENSCMIG00000017512	ncf2 (ENSCMIG00000017513)	smg7 (ENSCMIG00000017614)	nmnat2 (ENSCMIG00000017826)	ENSCMIG00000017835	ENSCMIG00000017836	LAMC1 (ENSCMIG00000017858)	SHCBP1L (ENSCMIG00000017878)	dhx9 (ENSCMIG00000017886)
Cyclostomata	ANCESTRAL SPECIES	378															ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574 #22
Hagfish	MODERN SPECIES	1019	uck2b (ENSEBUG00000016796)	ENSEBUG00000016941	ENSEBUG00000010578	ENSEBUG00000013992	ENSEBUG00000006472	ENSEBUG00000008200	rpl28 (ENSEBUG00000009129)	ENSEBUG00000009350	ENSEBUG00000000775	ENSEBUG00000012190	NELFE (ENSEBUG00000017070)	ENSEBUG00000006123 ##16	ENSEBUG00000014556 #16	PRRX2 (ENSEBUG00000008573)	ENSEBUG00000011379 #21	kifap3b (ENSEBUG00000006977) #22	RABGAP1 (ENSEBUG00000009561)	b3galt2 (ENSEBUG00000007729)	ENSEBUG00000014252	ptena (ENSEBUG00000015793)	ENSEBUG00000008867	ENSEBUG00000008189
Ciona	ANCESTRAL SPECIES	361														ENSGT00930000151043	ENSGT00940000154912	ENSGT00390000003574 #22	ENSGT00940000157936
Ciona intestinalis	MODERN SPECIES		ENSCING00000003341	ENSCING00000010226	ENSCING00000019246	nf-e2 (ENSCING00000003373)	ENSCING00000003358	ENSCING00000002989	ENSCING00000010174	ENSCING00000013663	ENSCING00000022855	ENSCING00000024979	ENSCING00000012864	ENSCING00000012863	ENSCING00000005215	ENSCING00000024792	ENSCING00000005175	ENSCING00000005168 #22	ENSCING00000018236	ENSCING00000021606	gcnf (ENSCING00000005163)	ENSCING00000024785	ENSCING00000023615	ENSCING00000021735	ENSCING00000005159	ENSCING00000012871	ENSCING00000005223	ENSCING00000019515	ENSCING00000021617	ENSCING00000023514	ENSCING00000005260	ENSCING00000005244	ENSCING00000019278
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Ecdysozoa	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000003574 #22
Fruitfly	MODERN SPECIES	26	Gr10a (FBgn0045502)	Or10a (FBgn0030298)	Gr10b (FBgn0030297)	CG15196 (FBgn0030296)	dlg1 (FBgn0001624)	Tim8 (FBgn0027359)	hop (FBgn0004864)	Pa1 (FBgn0287454)	dsh (FBgn0000499)	CG1737 (FBgn0030293)	CG11752 (FBgn0030292)	CG1738 (FBgn0030291)	CG11756 (FBgn0030290)	GCS1 (FBgn0030289)	CG34348 (FBgn0085377)	Kap3 (FBgn0028421) #22	Gapvd1 (FBgn0030286)	l(1)10Bb (FBgn0001491)	sisA (FBgn0003411)	Ir10a (FBgn0083979)	CG15198 (FBgn0030283)	CG44422 (FBgn0265595)	CG11106 (FBgn0030280)	CG15200 (FBgn0030278)	CG1394 (FBgn0030277)	Antdh (FBgn0026268)	CG32668 (FBgn0052668)	Dlic (FBgn0030276)	rtv (FBgn0261277)	Lint-1 (FBgn0030274)	Ran (FBgn0020255)
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