Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	59				ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00950000182946.lb.b #25	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #18	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00390000001254	ENSGT00940000155635	ENSGT00940000154614	ENSGT00940000154654.a.b	ENSGT01030000234606.b.e.b	ENSGT00390000010743.a.a	ENSGT00940000156236.a.a	ENSGT00730000111014.o.b	ENSGT00530000063751.a.a	ENSGT00940000160489	ENSGT01050000244879.a.a.a	ENSGT00940000155332.A	ENSGT00940000158800
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	52	ENSGT00940000162747	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a #7	ENSGT00940000156988 #8	ENSGT00940000159127 #9	ENSGT00950000182946.lb.b.h #10	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #18	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g #25	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000153837.a.a #7	ENSGT00940000156988 #8	ENSGT00940000180612	ENSGT00940000159127 #9	ENSGT00950000182946.lb.b.h #10	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #18	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT01100000263594.b	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g #25	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000156988 #8	ENSGT00940000180612	ENSGT00940000159127 #9	ENSGT00730000114327	ENSGT00950000182946.lb.b.h #10	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #18	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT01100000263594.b	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g #25	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT00940000159943 #28	ENSGT00940000155026.d #29	ENSGT00940000177981	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a	ENSGT00940000157668	ENSGT01030000237075	ENSGT00940000155136	ENSGT01030000234837
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a #7	ENSGT00940000156988 #8	ENSGT00940000159127 #9	ENSGT00730000114327	ENSGT00950000182946.lb.b.h #10	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #18	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g #25	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT00940000159943 #28	ENSGT00940000155026.d #29	ENSGT00940000177981	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a	ENSGT00940000157668	ENSGT01030000237075	ENSGT00940000155136	ENSGT01030000234837
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a #7	ENSGT00940000156988 #8	ENSGT00940000159127 #9	ENSGT00730000114327	ENSGT00950000182946.lb.b.h #10	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #18	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g #25	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT00940000159943 #28	ENSGT00940000155026.d #29	ENSGT00940000177981	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a	ENSGT00940000157668	ENSGT01030000237075	ENSGT00940000155136	ENSGT01030000234837
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a #7	ENSGT00940000156988 #8	ENSGT00940000159127 #9	ENSGT00730000114327	ENSGT00950000182946.lb.b.h #10	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #18	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g #25	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT00940000159943 #28	ENSGT00940000155026.d #29	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000177981	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a	ENSGT00940000157668	ENSGT01030000237075	ENSGT00940000155136	ENSGT01030000234837
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000162747	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a #7	ENSGT00940000156988 #8	ENSGT00940000159127 #9	ENSGT00950000182946.lb.b.h #10	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #18	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g #25	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT00940000159943 #28	ENSGT00940000155026.d #29	ENSGT00940000177981	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a	ENSGT00940000157668	ENSGT01030000237075	ENSGT00940000155136	ENSGT01030000234837
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000161068	ENSGT00940000162747	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a #7	ENSGT00940000156988 #8	ENSGT00940000159127 #9	ENSGT00950000182946.lb.b.h #10	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #18	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g #25	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT00940000159943 #28	ENSGT00940000155026.d #29	ENSGT00940000153421.a.a.a.b #30	ENSGT00950000183039.B.b.c #32	ENSGT00950000183111.b.a.b #33	ENSGT00940000157769 #34	ENSGT00940000156539 #35	ENSGT00390000002505 #36	ENSGT00940000161304.a.a #37	ENSGT00940000156073.c.b
Lumpfish	MODERN SPECIES	19	RHPN1 (ENSCLMG00005003769) #7	TUT4 (ENSCLMG00005003783) #8	gpx7 (ENSCLMG00005005048) #9	ENSCLMG00005005049 #10	pomgnt1 (ENSCLMG00005005057) #11	TSPAN1 (ENSCLMG00005005093) #12	PIK3R3 (ENSCLMG00005005105) #13	ENSCLMG00005006028 #14	MAST2 (ENSCLMG00005006053) #15	ENSCLMG00005008597 #16	ENSCLMG00005008599 #17	ENSCLMG00005008601 #18	prrx1b (ENSCLMG00005008603) #19	ENSCLMG00005008604 #20	ntmt2 (ENSCLMG00005008605) #21	kifap3a (ENSCLMG00005008607) #22	niban1a (ENSCLMG00005008686) #23	TRMT1L (ENSCLMG00005008807) #24	ENSCLMG00005008813 #25	prpf38a (ENSCLMG00005008823) #26	orc1 (ENSCLMG00005008836) #27	ENSCLMG00005009096 #28	nrd1b (ENSCLMG00005009102) #29	ENSCLMG00005010500 #30	ENSCLMG00005010502 #31	ENSCLMG00005010503 #32	mep1ba (ENSCLMG00005010504) #33	uhmk1 (ENSCLMG00005010513) #34	akr1a1b (ENSCLMG00005010518) #35	ENSCLMG00005010529 #36	SHISAL2A (ENSCLMG00005010532) #37
Stickleback	MODERN SPECIES	8	mafaa (ENSGACG00000005347)	atpaf1 (ENSGACG00000005332)	RHPN1 (ENSGACG00000005320) #7	ENSGACG00000005282 #8	gpx7 (ENSGACG00000005246) #9	ENSGACG00000005243 #10	pomgnt1 (ENSGACG00000005215) #11	TSPAN1 (ENSGACG00000005195) #12	PIK3R3 (ENSGACG00000005180) #13	ENSGACG00000005179	MAST2 (ENSGACG00000005151) #15	ENSGACG00000005129 #18	prrx1b (ENSGACG00000005111) #19	gorab (ENSGACG00000005104) #20	ntmt2 (ENSGACG00000005100) #21	kifap3a (ENSGACG00000005088) #22	niban1a (ENSGACG00000005076) #23	TRMT1L (ENSGACG00000005050) #24	ENSGACG00000005049 #25	MYLK4 (ENSGACG00000005039)	ENSGACG00000005035	gmds (ENSGACG00000005020)	foxc1b (ENSGACG00000005016)	ENSGACG00000005011	foxq1b (ENSGACG00000005009)	exoc2 (ENSGACG00000004977)	ENSGACG00000004966	ENSGACG00000004962	BPHL (ENSGACG00000004957)	ENSGACG00000004955	SLC22A23 (ENSGACG00000004947)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000162747	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a #7	ENSGT00940000156988 #8	ENSGT00940000159127 #9	ENSGT00950000182946.lb.b.h #10	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #18	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g #25	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT00940000159943 #28	ENSGT00940000155026.d #29	ENSGT00940000177981	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.b	ENSGT00940000157668	ENSGT00940000155136	ENSGT01030000234837	ENSGT00940000154660.b
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Pike perch	MODERN SPECIES	203										MAST2 (ENSSLUG00000019061) #15	ENSSLUG00000018904 ##18	ENSSLUG00000018882 #18	prrx1b (ENSSLUG00000018855) #19	gorab (ENSSLUG00000018848) #20	ntmt2 (ENSSLUG00000018843) #21	kifap3a (ENSSLUG00000016487) #22	niban1a (ENSSLUG00000016372) #23	TRMT1L (ENSSLUG00000016365) #24	zgc:103559 (ENSSLUG00000016348)	ENSSLUG00000016342 #25	ENSSLUG00000016340 #25	ENSSLUG00000016339 #25	ENSSLUG00000016336 #25	ENSSLUG00000016334 #25	ENSSLUG00000016332 #25	ENSSLUG00000016330 #25	ENSSLUG00000016328 #25	ENSSLUG00000016326 #25
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a #7	ENSGT00940000156988 #8	ENSGT00940000159127 #9	ENSGT00730000114327	ENSGT00950000182946.lb.b.h #10	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #18	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g #25	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT00940000159943 #28	ENSGT00940000155026.d #29	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.b	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a	ENSGT00940000157668	ENSGT00940000155136	ENSGT01030000234837	ENSGT00940000154660.b
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	2	ENSSAUG00010012544 #28	orc1 (ENSSAUG00010012555) #27	ENSSAUG00010012577 #28	prpf38a (ENSSAUG00010012580) #26	ENSSAUG00010012588 #25	ENSSAUG00010012593 #25	ENSSAUG00010012596 #25	pomgnt1 (ENSSAUG00010012601) #11	TSPAN1 (ENSSAUG00010012652) #12	PIK3R3 (ENSSAUG00010012678) #13	MAST2 (ENSSAUG00010013481) #15	ENSSAUG00010007557 #18	prrx1b (ENSSAUG00010007560) #19	gorab (ENSSAUG00010007575) #20	ntmt2 (ENSSAUG00010007576) #21	kifap3a (ENSSAUG00010007590) #22	niban1a (ENSSAUG00010007614) #23	TRMT1L (ENSSAUG00010007735) #24	ENSSAUG00010007843 #25	ENSSAUG00010007846 #10	ENSSAUG00010007848	TUT4 (ENSSAUG00010007861) #8	gpx7 (ENSSAUG00010007871) #9	TUT4 (ENSSAUG00010007879) #8	ENSSAUG00010007893	ENSSAUG00010007898	ttr (ENSSAUG00010007903)	b4galt6 (ENSSAUG00010007906)	rfc4 (ENSSAUG00010007946)	ENSSAUG00010007959	b3gnt5a (ENSSAUG00010007972)
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a #7	ENSGT00940000156988 #8	ENSGT00940000159127 #9	ENSGT00730000114327	ENSGT00950000182946.lb.b.h #10	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #18	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g #25	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT00940000159943 #28	ENSGT00940000155026.d #29	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a	ENSGT00940000157668	ENSGT00940000155136	ENSGT01030000234837	ENSGT00940000166794	ENSGT00950000183171.A.b.a.b
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Large yellow croaker	MODERN SPECIES	489	si:ch211-262h13.5 (ENSLCRG00005007588)	ENSLCRG00005006443	gpc1a (ENSLCRG00005006437)	ENSLCRG00005006435	ENSLCRG00005006433 #10	pomgnt1 (ENSLCRG00005006376) #11	TSPAN1 (ENSLCRG00005006351) #12	PIK3R3 (ENSLCRG00005006158) #13	MAST2 (ENSLCRG00005006105) #15	ENSLCRG00005006101 #18	ENSLCRG00005006100	ENSLCRG00005006099 #18	prrx1b (ENSLCRG00005006097) #19	gorab (ENSLCRG00005006096) #20	ntmt2 (ENSLCRG00005006095) #21	kifap3a (ENSLCRG00005005844) #22	niban1a (ENSLCRG00005005824) #23	TRMT1L (ENSLCRG00005005814) #24	ENSLCRG00005005813 #25	ENSLCRG00005005811 #25	prpf38a (ENSLCRG00005005809) #26	ENSLCRG00005005808 #25	orc1 (ENSLCRG00005005729) #27	ENSLCRG00005005722 #28	nrd1b (ENSLCRG00005001392) #29	ENSLCRG00005001356	frem1b (ENSLCRG00005000876)	nfia (ENSLCRG00005011783)	tm2d1 (ENSLCRG00005011776)	PATJ (ENSLCRG00005011765)	ENSLCRG00005011753
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	595														gorab (ENSLBEG00000003750) #20	ntmt2 (ENSLBEG00000003726) #21	kifap3a (ENSLBEG00000003653) #22	niban1a (ENSLBEG00000003555) #23	TRMT1L (ENSLBEG00000003487) #24	ENSLBEG00000003466 #25	ENSLBEG00000003450 #25	orc1 (ENSLBEG00000003383) #27	ENSLBEG00000003362 #25	ENSLBEG00000003351 #25
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000156988 #8	ENSGT00940000180612	ENSGT00940000159127 #9	ENSGT00730000114327	ENSGT00950000182946.lb.b.h #10	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #18	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT01100000263594.b	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g #25	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT00940000159943 #28	ENSGT00940000155026.d #29	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000177981	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a	ENSGT00940000157668	ENSGT00940000155136	ENSGT01030000234837	ENSGT00940000166794
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a #7	ENSGT00940000156988 #8	ENSGT00940000159127 #9	ENSGT00730000114327	ENSGT00950000182946.lb.b.h #10	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #18	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g #25	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT00940000159943 #28	ENSGT00940000155026.d #29	ENSGT00940000177981	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a	ENSGT00940000157668	ENSGT00940000155136	ENSGT01030000234837	ENSGT00940000166794
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a #7	ENSGT00940000156988 #8	ENSGT00940000159127 #9	ENSGT00730000114327	ENSGT00950000182946.lb.b.h #10	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #18	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT00940000159943 #28	ENSGT00940000155026.d #29	ENSGT00940000177981	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000159037	ENSGT00950000183171.A.b.a.b	ENSGT00940000166794	ENSGT01030000234837	ENSGT00940000155136	ENSGT00940000157668	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a
Climbing perch	MODERN SPECIES	17	RHPN1 (ENSATEG00000003810) #7	ENSATEG00000003823 #8	ENSATEG00000003849 #9	ENSATEG00000028259	ENSATEG00000003890	ENSATEG00000030160	ENSATEG00000003903 #10	POMGNT1 (ENSATEG00000003917) #11	ENSATEG00000004022 #12	PIK3R3 (ENSATEG00000004078) #13	ENSATEG00000004325 ##18	ENSATEG00000004346 #18	prrx1b (ENSATEG00000004399) #19	gorab (ENSATEG00000004422) #20	ntmt2 (ENSATEG00000029904) #21	kifap3a (ENSATEG00000004457) #22	niban1a (ENSATEG00000004540) #23	ENSATEG00000004573 #24	ENSATEG00000004608 #26	ENSATEG00000004619 #27	ENSATEG00000013279 #28	ENSATEG00000004658 #29	ENSATEG00000004678	ENSATEG00000004698	ENSATEG00000004709	ENSATEG00000004759	ENSATEG00000004827	ENSATEG00000026072	PATJ (ENSATEG00000004917)	tm2d1 (ENSATEG00000004946)	nfia (ENSATEG00000004979)
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	15	ENSBSLG00000013834	ENSBSLG00000013818	ENSBSLG00000013811 #10	pomgnt1 (ENSBSLG00000013715) #11	TSPAN1 (ENSBSLG00000013694) #12	ENSBSLG00000013679	PIK3R3 (ENSBSLG00000013563) #13	ENSBSLG00000013282 #15	ENSBSLG00000013235	ENSBSLG00000013139 ##18	ENSBSLG00000013051 #18	prrx1b (ENSBSLG00000012451) #19	gorab (ENSBSLG00000012442) #20	ENSBSLG00000012437	ntmt2 (ENSBSLG00000012402) #21	kifap3a (ENSBSLG00000011776) #22	niban1a (ENSBSLG00000011377) #23	TRMT1L (ENSBSLG00000011357) #24	prpf38a (ENSBSLG00000011340) #26	orc1 (ENSBSLG00000011328) #27	ENSBSLG00000011312 #28	nrd1b (ENSBSLG00000009863) #29	sgta (ENSBSLG00000009554)	thop1 (ENSBSLG00000008008)	ENSBSLG00000007757	PATJ (ENSBSLG00000007730)	tm2d1 (ENSBSLG00000007293)	ENSBSLG00000007289	nfia (ENSBSLG00000006813)	ENSBSLG00000015664	SLC39A3 (ENSBSLG00000015655)
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	18	RHPN1 (ENSMAMG00000014859) #7	ENSMAMG00000014890 #8	ENSMAMG00000014948 #9	ENSMAMG00000015400	ENSMAMG00000014977 #10	pomgnt1 (ENSMAMG00000014990) #11	TSPAN1 (ENSMAMG00000015037) #12	PIK3R3 (ENSMAMG00000015060) #13	MAST2 (ENSMAMG00000015099) #15	ENSMAMG00000015160 #18	ENSMAMG00000015165 ##18	ENSMAMG00000015173 #18	prrx1b (ENSMAMG00000015198) #19	gorab (ENSMAMG00000024412) #20	ntmt2 (ENSMAMG00000015231) #21	kifap3a (ENSMAMG00000015251) #22	niban1a (ENSMAMG00000015296) #23	ENSMAMG00000015305 #24	ENSMAMG00000027044	ENSMAMG00000026330 #25	ENSMAMG00000015431 #26	ENSMAMG00000015463 #27	ENSMAMG00000015518	ENSMAMG00000015485	ENSMAMG00000015528	reep6 (ENSMAMG00000015545)	zgc:113223 (ENSMAMG00000015567)	ENSMAMG00000015587	SLC39A3 (ENSMAMG00000015606)	ENSMAMG00000015621	THOP1 (ENSMAMG00000015663)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000153837.a.a #7	ENSGT00940000156988 #8	ENSGT00940000180612	ENSGT00940000159127 #9	ENSGT00730000114327	ENSGT00950000182946.lb.b.h #10	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT01100000263594.b	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g #25	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT00940000159943 #28	ENSGT00940000155026.d #29	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a	ENSGT00940000157668	ENSGT00940000155136	ENSGT01030000234837	ENSGT00940000166794	ENSGT00950000183171.A.b.a.b
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	73										ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #18	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g #25	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT00940000159943 #28	ENSGT00940000155026.d #29	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a	ENSGT00940000157668	ENSGT00940000155136.mc	ENSGT00940000177900	ENSGT00950000183171.A.b.a.b	ENSGT00940000159037
Seriola	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159036	ENSGT00950000182930.A.b.k.a	ENSGT00950000182930.A.b.k.b	ENSGT00510000046975.b	ENSGT01090000260029.a.a.b.a.b	ENSGT00950000183014.f.b.b.a.a	ENSGT00950000183044.a.b	ENSGT00740000115898	ENSGT00390000004681.a.a	ENSGT00940000154573	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT01100000263594.b	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00940000155265.b.b.b	ENSGT01030000234528.B.b.b.bb.a	ENSGT00940000157362.d	ENSGT00940000166873	ENSGT00940000164912	ENSGT00940000161068	ENSGT00940000162747	ENSGT00390000012765	ENSGT00940000153837.a.a #7	ENSGT00940000156988 #8	ENSGT00940000159127 #9	ENSGT00940000155265.b.b.a	ENSGT00940000164676
Greater amberjack	MODERN SPECIES	73	ENSSDUG00000021572	ENSSDUG00000021580	pycr3 (ENSSDUG00000021591)	bmb (ENSSDUG00000021603)	GFUS (ENSSDUG00000021654)	GFUS (ENSSDUG00000021667)	SERPINB1 (ENSSDUG00000021682)	ENSSDUG00000021696	ENSSDUG00000021705	ENSSDUG00000021712 ##18	ENSSDUG00000021725 ##18	ENSSDUG00000021730	prrx1b (ENSSDUG00000021734) #19	gorab (ENSSDUG00000021741) #20	ntmt2 (ENSSDUG00000021747) #21	kifap3a (ENSSDUG00000021766) #22	niban1a (ENSSDUG00000021794) #23	TRMT1L (ENSSDUG00000021807) #24	ENSSDUG00000021831	ENSSDUG00000021837	ADCYAP1R1 (ENSSDUG00000021845)	ENSSDUG00000021851	ENSSDUG00000021862	ZC3H3 (ENSSDUG00000021871)	mafaa (ENSSDUG00000021887)	atpaf1 (ENSSDUG00000021892)	RHPN1 (ENSSDUG00000021905) #7	TUT4 (ENSSDUG00000021923) #8	ENSSDUG00000021936 #8	ENSSDUG00000021945 #8	gpx7 (ENSSDUG00000021949) #9
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3176	ENSSLDG00000017469	ENSSLDG00000017453	NOS1AP (ENSSLDG00000017424)	ENSSLDG00000017410	ENSSLDG00000017392	pycr3 (ENSSLDG00000017378)	bmb (ENSSLDG00000017363)	SERPINB1 (ENSSLDG00000017322)	GFUS (ENSSLDG00000016998)	SERPINB1 (ENSSLDG00000016912)	ENSSLDG00000016881 ##18	ENSSLDG00000016872	prrx1b (ENSSLDG00000016851) #19	gorab (ENSSLDG00000016829) #20	ntmt2 (ENSSLDG00000016809) #21	kifap3a (ENSSLDG00000016743) #22	niban1a (ENSSLDG00000016719) #23	TRMT1L (ENSSLDG00000016579) #24	ENSSLDG00000016388	ENSSLDG00000016313	ENSSLDG00000016289	ADCYAP1R1 (ENSSLDG00000016253)	ENSSLDG00000016216	ENSSLDG00000016189	ZC3H3 (ENSSLDG00000016166)	mafaa (ENSSLDG00000016154)	atpaf1 (ENSSLDG00000016141)	RHPN1 (ENSSLDG00000016111) #7	TUT4 (ENSSLDG00000016071) #8	gpx7 (ENSSLDG00000016054) #9	ENSSLDG00000016038
Barramundi perch	MODERN SPECIES	12										MAST2 (ENSLCAG00010009380) #15	ENSLCAG00010009351 ##18	ENSLCAG00010009348 #18	prrx1b (ENSLCAG00010009338) #19	gorab (ENSLCAG00010009330) #20	ntmt2 (ENSLCAG00010009328) #21	kifap3a (ENSLCAG00010009279) #22	niban1a (ENSLCAG00010009219) #23	TRMT1L (ENSLCAG00010009200) #24	ENSLCAG00010009197 #25	prpf38a (ENSLCAG00010009186) #26	ENSLCAG00010009176	ENSLCAG00010009173	ENSLCAG00010009169	ENSLCAG00010009157	ENSLCAG00010009145	nrd1b (ENSLCAG00010008718) #29	ENSLCAG00010008609 #28	ENSLCAG00010008606	orc1 (ENSLCAG00010008509) #27	ENSLCAG00010008482	ENSLCAG00010008469
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000153837.a.a #7	ENSGT00940000156988 #8	ENSGT00940000180612	ENSGT00940000159127 #9	ENSGT00730000114327	ENSGT00950000182946.lb.b.h #10	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT01100000263594.b	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g #25	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT00940000159943 #28	ENSGT00940000155026.d #29	ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b	ENSGT00940000165098	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a.e.a	ENSGT00940000157668	ENSGT00940000155136	ENSGT00940000166794	ENSGT00940000177900	ENSGT00950000183171.A.b.a.b
Turbot	MODERN SPECIES	3	ENSSMAG00000034624	RHPN1 (ENSSMAG00000016240) #7	ENSSMAG00000016072 #8	ENSSMAG00000026133 #9	ENSSMAG00000016012	ENSSMAG00000015980	ENSSMAG00000015944 #10	TSPAN1 (ENSSMAG00000015857) #12	ENSSMAG00000015873 #11	ENSSMAG00000015713 #15	ENSSMAG00000015681 ##18	ENSSMAG00000022440	prrx1b (ENSSMAG00000015646) #19	gorab (ENSSMAG00000015639) #20	ntmt2 (ENSSMAG00000015625) #21	kifap3a (ENSSMAG00000015597) #22	niban1a (ENSSMAG00000015548) #23	ENSSMAG00000015425 #24	ENSSMAG00000025993 #25	ENSSMAG00000036494 #25	ENSSMAG00000034311 #25	ENSSMAG00000024407 #25	ENSSMAG00000015379 #26	ENSSMAG00000015352 #27	ENSSMAG00000037635	ENSSMAG00000015337 #28	ENSSMAG00000015223 #29	ENSSMAG00000015125	ENSSMAG00000022039	ENSSMAG00000037770	ENSSMAG00000014281
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Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000153837.a.a #7	ENSGT00940000156988 #8	ENSGT00940000180612	ENSGT00940000159127 #9	ENSGT00950000182946.lb.b.h #10	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #18	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT01100000263594.b	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g #25	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000156988 #8	ENSGT00940000180612	ENSGT00940000159127 #9	ENSGT00950000182946.lb.b.h #10	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT01050000245196	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #18	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT01100000263594.b	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g #25	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT00530000063404.b	ENSGT00940000155899.e.a	ENSGT00940000156511.b.db	ENSGT00940000159571	ENSGT00390000010568	ENSGT01050000244887.A.a.b	ENSGT00940000159554	ENSGT00940000157967	ENSGT00390000007310	ENSGT01050000244924.a.a.b.a.a
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	7							ENSGT00950000182946.lb.b.g.w #25	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT01100000263594.b	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g.x #25	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT00530000063404.b	ENSGT00940000155899.e.a	ENSGT00940000169015	ENSGT00940000159571	ENSGT00390000010568	ENSGT01050000244887.A.a.b	ENSGT00940000159554	ENSGT00940000157967	ENSGT00390000007310	ENSGT01050000244924.a.a.b.a.a
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00950000183171.A.b.a.b	ENSGT00940000159037	ENSGT00940000160231	ENSGT00940000166036	ENSGT00940000165051	ENSGT00940000157046.D.d.d.a.a.b.b.b	ENSGT00950000182946.lb.b.g.w.b #25	ENSGT00950000182946.lb.b.g.w.a #25	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT01090000260029.a.b.a	ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.g	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g.x #25	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT00530000063404.b	ENSGT00940000155899.e.a	ENSGT00940000169015	ENSGT00940000159571	ENSGT00390000010568	ENSGT01050000244887.A.a.b	ENSGT00940000159554	ENSGT00940000157967	ENSGT00390000007310	ENSGT01050000244924.a.a.b.a.a
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT01100000263533.b.b.b.a.b.b.b.b.b.b.b	ENSGT01030000234576.D.a.a.b.a.a.a.a.a.b.b	ENSGT01100000263489.a.a.b.b.f.a.a.d	ENSGT00950000182946.lb.b.g.w.b #25	ENSGT00950000182946.lb.b.g.w.a #25	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00940000155705.a.a ##15	ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.a ##18	ENSGT01090000260029.a.b.a	ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.g	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g.x #25	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00950000183052.b.c.b.b.b.a.b.a	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT00530000063404.b	ENSGT00940000155899.e.a	ENSGT00940000156511.b.db	ENSGT00940000159571	ENSGT00390000010568	ENSGT01050000244887.A.a.b	ENSGT00940000159554	ENSGT00940000157967	ENSGT00390000007310
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01100000263533.b.b.b.a.b.b.b.b.b.b.b	ENSGT01030000234576.D.a.a.b.a.a.a.a.a.b.b	ENSGT01100000263489.a.a.b.b.f.a.a.d	ENSGT00950000182946.lb.b.g.w.b #25	ENSGT00950000182946.lb.b.g.w.a.b #25	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00940000155705.a.a ##15	ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.a ##18	ENSGT01090000260029.a.b.a	ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.g	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g.x #25	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00940000157046.D.d.d.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT01030000235075.a	ENSGT01090000260059.a.b.b.a.a.a.a.a.a.b.a.g.a.a.b.a.b.b.b.b.b.b.b	ENSGT00950000182774.b.a.b.a.b.a.b.c.b.a.b.b	ENSGT01100000263489.a.a.b.b.f.a.b.b.d.a.a.a.a.a	ENSGT01090000260059.a.b.b.a.a.a.a.a.a.b.a.g.a.a.b.a.b.b.b.b.b.b.a	ENSGT01100000263520.a.a.a.a.b.b.a.a.b.b	ENSGT00950000183052.b.c.b.b.b.a.b.a	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT00530000063404.b	ENSGT00940000155899.e.a
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Guppy	MODERN SPECIES	456	ENSPREG00000003193	ENSPREG00000003187	ENSPREG00000003177	ENSPREG00000003149	ENSPREG00000003134 #25	ENSPREG00000003121 #25	pomgnt1 (ENSPREG00000003100) #11	PIK3R3 (ENSPREG00000003065) ##13	ENSPREG00000003054 #15	ENSPREG00000003045	ENSPREG00000003019	ENSPREG00000003007	prrx1b (ENSPREG00000003001) #19	gorab (ENSPREG00000002992) #20	ntmt2 (ENSPREG00000002977) #21	kifap3a (ENSPREG00000002932) #22	niban1a (ENSPREG00000002912) #23	TRMT1L (ENSPREG00000002866) #24	ENSPREG00000002852 #25	prpf38a (ENSPREG00000002835) #26	ENSPREG00000002715	ENSPREG00000002696	ENSPREG00000002664	ENSPREG00000002642	ENSPREG00000002637	ENSPREG00000002627	ENSPREG00000002548	ENSPREG00000002181	ENSPREG00000002121	ENSPREG00000002108	ENSPREG00000002083
Platyfish	MODERN SPECIES	23	ENSXMAG00000027015 #25	ENSXMAG00000021979 #25	ENSXMAG00000028305 #25	pomgnt1 (ENSXMAG00000005621) #11	TSPAN1 (ENSXMAG00000005620) #12	PIK3R3 (ENSXMAG00000005376) ##13	MAST2 (ENSXMAG00000005398) #15	ENSXMAG00000005419 ##18	ENSXMAG00000025454	ENSXMAG00000020975	ENSXMAG00000025566	ENSXMAG00000019870	prrx1b (ENSXMAG00000005444) #19	gorab (ENSXMAG00000005448) #20	ntmt2 (ENSXMAG00000028054) #21	kifap3a (ENSXMAG00000005452) #22	niban1a (ENSXMAG00000005465) #23	TRMT1L (ENSXMAG00000003575) #24	ENSXMAG00000012288 #25	ENSXMAG00000027867	ENSXMAG00000026571	ENSXMAG00000025535	prpf38a (ENSXMAG00000026143) #26	ENSXMAG00000027916	ENSXMAG00000024641	ENSXMAG00000026680	ENSXMAG00000022803	ENSXMAG00000027988	ENSXMAG00000020039	ENSXMAG00000020042	ENSXMAG00000022711
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	344												ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.g	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00950000182946.lb.b.g.x #25	ENSGT00730000111085.A #26
Mummichog	MODERN SPECIES	898															ntmt2 (ENSFHEG00000014418) #21	kifap3a (ENSFHEG00000014398) #22	niban1a (ENSFHEG00000000343) #23	TRMT1L (ENSFHEG00000014328) #24	prpf38a (ENSFHEG00000014317) #26	ENSFHEG00000014298 #25	ENSFHEG00000014290
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	660													prrx1b (ENSCVAG00000011872) #19	gorab (ENSCVAG00000011881) #20	ntmt2 (ENSCVAG00000011905) #21	kifap3a (ENSCVAG00000012048) #22	niban1a (ENSCVAG00000012141) #23	TRMT1L (ENSCVAG00000012274) #24	ENSCVAG00000012280 #25	prpf38a (ENSCVAG00000012305) #26	ENSCVAG00000012316	ENSCVAG00000012322	ENSCVAG00000012335	midn (ENSCVAG00000012372)	atp5f1d (ENSCVAG00000012385)	CBARP (ENSCVAG00000012431)
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	184					ENSGT00950000182946.lb.b.g.w #25	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT01050000245196	ENSGT00940000175770	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT01100000263594.b	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	280	sgta (ENSKMAG00000010962)	ENSKMAG00000010923	zgc:113223 (ENSKMAG00000010909)	ENSKMAG00000010903	ENSKMAG00000010888 #25	pomgnt1 (ENSKMAG00000010794) #11	TSPAN1 (ENSKMAG00000010749) #12	PIK3R3 (ENSKMAG00000010703) ##13	MAST2 (ENSKMAG00000010659) #15	ENSKMAG00000010625	ENSKMAG00000010569 ##18	ENSKMAG00000010538	prrx1b (ENSKMAG00000010521) #19	gorab (ENSKMAG00000010496) #20	ntmt2 (ENSKMAG00000010477) #21	kifap3a (ENSKMAG00000010433) #22	niban1a (ENSKMAG00000010363) #23	TRMT1L (ENSKMAG00000010310) #24	ENSKMAG00000010296	ENSKMAG00000010287 #25
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	67					ENSGT00950000182946.lb.b.h #10	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #18	ENSGT01100000263594.b	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	90						ENSGT00950000182946.lb.b.h #10	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #18	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000158019
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000155265.b.b.b	ENSGT00940000155265.b.b.a	ENSGT00940000164676	ENSGT00940000153456.a	ENSGT00390000011521	ENSGT00950000182946.lb.b.h #10	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #18	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000158019	ENSGT01050000244924.a.a.b.a.a	ENSGT00390000007310	ENSGT00940000157967	ENSGT00940000159554	ENSGT01050000244887.A.a.b	ENSGT00390000010568	ENSGT00940000159571	ENSGT00940000156511.b.db	ENSGT00940000155899.e.a
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000155265.b.b.a	ENSGT00940000164676	ENSGT00940000153456.a	ENSGT00390000011521	ENSGT00950000182946.lb.b.h #10	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT01100000263594.b	ENSGT00950000183190.a.a.a.b #18	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000158019	ENSGT01050000244924.a.a.b.a.a	ENSGT00390000007310	ENSGT00940000157967	ENSGT00940000159554	ENSGT01050000244887.A.a.b	ENSGT00390000010568	ENSGT00940000159571	ENSGT00940000156511.b.db	ENSGT00940000155899.e.a
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000155265.b.b.b	ENSGT00940000155265.b.b.a	ENSGT00940000164676	ENSGT00940000153456.a	ENSGT00390000011521	ENSGT00950000182946.lb.b.h #10	ENSGT00530000063632.A #11	ENSGT00940000158851 #12	ENSGT00940000156259.a.a #13	ENSGT00940000155705.b #15	ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ##18	ENSGT01100000263594.b	ENSGT00940000159466 #19	ENSGT00390000014886 #20	ENSGT00390000008371.a #21	ENSGT00390000003574.a #22	ENSGT00940000154149.b.a.g.b #23	ENSGT00530000063646.a #24	ENSGT00730000111085.A #26	ENSGT00530000063498.B #27	ENSGT01030000234624.b.b.c.a.a	ENSGT00940000158019	ENSGT01050000244924.a.a.b.a.a	ENSGT00390000007310	ENSGT00940000157967	ENSGT00940000159554	ENSGT01050000244887.A.a.b	ENSGT00390000010568	ENSGT00940000159571	ENSGT00940000156511.b.db	ENSGT00940000155899.e.a
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	493								PIK3R3 (ENSHBUG00000020098) #13	ENSHBUG00000020193 #15	ENSHBUG00000020235 #15	ENSHBUG00000020249 ##18	ENSHBUG00000020264	prrx1b (ENSHBUG00000020291) #19	gorab (ENSHBUG00000020307) #20	ntmt2 (ENSHBUG00000020336) #21	kifap3a (ENSHBUG00000020394) #22	niban1a (ENSHBUG00000020416) #23	ENSHBUG00000020432	TRMT1L (ENSHBUG00000000622) #24	prpf38a (ENSHBUG00000020572) #26	orc1 (ENSHBUG00000020582) #27	arl13b (ENSHBUG00000020619)	GGACT (ENSHBUG00000020632)	ENSHBUG00000020644	GGACT (ENSHBUG00000020671)	GGACT (ENSHBUG00000000819)	FARP1 (ENSHBUG00000020744)	chn1 (ENSHBUG00000020827)
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Nile tilapia	MODERN SPECIES	8	ENSONIG00000019474	ENSONIG00000019475	ENSONIG00000019477	naprt (ENSONIG00000019479)	C8orf82 (ENSONIG00000019480)	ENSONIG00000020776 #10	pomgnt1 (ENSONIG00000007857) #11	TSPAN1 (ENSONIG00000007856) #12	PIK3R3 (ENSONIG00000007853) #13	MAST2 (ENSONIG00000007847) #15	ENSONIG00000007844 ##18	ENSONIG00000039886 #18	prrx1b (ENSONIG00000007843) #19	gorab (ENSONIG00000007842) #20	ntmt2 (ENSONIG00000007840) #21	kifap3a (ENSONIG00000007836) #22	fam129a (ENSONIG00000007826) #23	TRMT1L (ENSONIG00000007823) #24	prpf38a (ENSONIG00000007816) #26	ENSONIG00000007813	orc1 (ENSONIG00000007807) #27	ENSONIG00000007798	b4galt6 (ENSONIG00000007793)	PTBP1 (ENSONIG00000007784)	serpinc1 (ENSONIG00000007781)	zbtb37 (ENSONIG00000007779)	s1pr1 (ENSONIG00000020775)	dph5 (ENSONIG00000007778)	slc30a7 (ENSONIG00000007772)	ENSONIG00000035983	cdc14ab (ENSONIG00000007763)
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	141	psmg2 (ENSHCOG00000000861)	zgc:136493 (ENSHCOG00000003284)	ncaldb (ENSHCOG00000003277)	grhl2b (ENSHCOG00000003264)	znf706 (ENSHCOG00000003228)	ywhaz (ENSHCOG00000003217)	ENSHCOG00000003175	ENSHCOG00000003023	LIX1L (ENSHCOG00000003020)	sf3b4 (ENSHCOG00000003014)	ENSHCOG00000003007	SV2A (ENSHCOG00000003000)	ENSHCOG00000002979	tbxta (ENSHCOG00000002972)	nudc (ENSHCOG00000002958)	kifap3a (ENSHCOG00000002941) #22	ENSHCOG00000002934	zdhhc18b (ENSHCOG00000000084)	arhgef1a (ENSHCOG00000002904)	tpm3 (ENSHCOG00000002823)	ENSHCOG00000002818	ssr2 (ENSHCOG00000002806)	ENSHCOG00000002785	ENSHCOG00000002776	si:dkey-81h8.1 (ENSHCOG00000002751)	ENSHCOG00000002744	ENSHCOG00000002729	rps27.1 (ENSHCOG00000002726)	ENSHCOG00000002715	chrna11 (ENSHCOG00000002691)	snx27a (ENSHCOG00000002675)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	18	bmb (ENSMMDG00005014575)	pycr3 (ENSMMDG00005014576)	ENSMMDG00005014580	ENSMMDG00005014656	orc1 (ENSMMDG00005014662) #27	prpf38a (ENSMMDG00005014677) #26	ifit15 (ENSMMDG00005014678) #25	pomgnt1 (ENSMMDG00005014683) #11	TSPAN1 (ENSMMDG00005014716) #12	PIK3R3 (ENSMMDG00005014769) #13	MAST2 (ENSMMDG00005015365) #15	ENSMMDG00005015432 ##18	prrx1b (ENSMMDG00005015436) #19	gorab (ENSMMDG00005015441) #20	ntmt2 (ENSMMDG00005015445) #21	kifap3a (ENSMMDG00005015465) #22	niban1a (ENSMMDG00005015756) #23	TRMT1L (ENSMMDG00005000167) #24	ENSMMDG00005000317	ivns1abpa (ENSMMDG00005000333)	arpc5b (ENSMMDG00005000422)	PLA2G4A (ENSMMDG00005000444)	ptgs2b (ENSMMDG00005000495)	pdcb (ENSMMDG00005000506)	tprb (ENSMMDG00005000569)	prg4b (ENSMMDG00005000699)	FCHO1 (ENSMMDG00005000756)	rfx2 (ENSMMDG00005001128)	acsbg2 (ENSMMDG00005001835)	mllt1b (ENSMMDG00005004422)	acer1 (ENSMMDG00005004436)