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Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb #8	ENSGT00940000157479 #9	ENSGT00940000153222.a.a #10	ENSGT00950000182959.a.a ##11	ENSGT00950000182959.a.b.b.a #11	ENSGT00390000013067.l.l #12	ENSGT00940000156120.a #13	ENSGT00390000000406 #14	ENSGT00940000155394.i.a #15	ENSGT00940000153962.b #16	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b #17	ENSGT00940000158899 #18	ENSGT00940000154709.a.a #19	ENSGT00530000063817.b.b #20	ENSGT00940000155455.g #21	ENSGT00940000156419.b #22	ENSGT01100000263533.b.b.a.a.a.b.a #23	ENSGT00940000159081 #24	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00390000006088 #26	ENSGT00390000010777 #27	ENSGT00950000182885.C.b #28	ENSGT00950000182885.B ##28	ENSGT00940000166611 #29	ENSGT00390000005378 #30	ENSGT00950000182999.b.a.a #31	ENSGT00940000160124 #32	ENSGT00940000154983.c.b #33	ENSGT00940000158225.i.a #34	ENSGT00390000008645 #35	ENSGT00940000154818 #36
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b.bb #8	ENSGT00940000157479 #9	ENSGT00940000153222.a.a #10	ENSGT00950000182959.a.a ##11	ENSGT00950000182959.a.b.b.a #11	ENSGT00390000013067.l.l #12	ENSGT00940000156120.a #13	ENSGT00390000000406 #14	ENSGT00940000155394.i.a #15	ENSGT00940000153962.b #16	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b #17	ENSGT00940000158899 #18	ENSGT00940000154709.a.a #19	ENSGT00530000063817.b.b #20	ENSGT00940000155455.g #21	ENSGT00940000156419.b #22	ENSGT01100000263533.b.b.a.a.a.b.a #23	ENSGT00840000130048.b	ENSGT00940000159081 #24	ENSGT00940000168896 #25	ENSGT00390000006088 #26	ENSGT00390000010777 #27	ENSGT00950000182885.C.b #28	ENSGT00950000182885.B ##28	ENSGT00940000166611 #29	ENSGT00390000005378 #30	ENSGT00950000182999.b.a.a #31	ENSGT00940000160124 #32	ENSGT00940000154983.c.b #33	ENSGT00940000158225.i.a #34	ENSGT00390000008645 #35
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Gilthead seabream	MODERN SPECIES	5	ppfia2 (ENSSAUG00010017685) #8	ACSS3 (ENSSAUG00010019831) #9	lin7a (ENSSAUG00010020149) #10	myf5 (ENSSAUG00010020150) ##11	myf6 (ENSSAUG00010020152) #11	rps16 (ENSSAUG00010020153) #12	ppp1r12a (ENSSAUG00010020166) #13	pawr (ENSSAUG00010020373) #14	syt1a (ENSSAUG00010020377) #15	cyb5r3 (ENSSAUG00010020421) #16	ENSSAUG00010020501 #17	syt10 (ENSSAUG00010012236) #18	tnnt2c (ENSSAUG00010012240) #19	ENSSAUG00010012243 #20	cry1a (ENSSAUG00010012268) #21	btbd11a (ENSSAUG00010014766) #22	ENSSAUG00010015101	igf1 (ENSSAUG00010015109) #24	pmch (ENSSAUG00010015234)	parpbp (ENSSAUG00010015235) #26	nup37 (ENSSAUG00010015237) #27	th2 (ENSSAUG00010015244) #28	pah (ENSSAUG00010015550) ##28	ascl1a (ENSSAUG00010017839) #29	ascl1a (ENSSAUG00010017842) #29	itfg2 (ENSSAUG00010017851) #30	nrip2 (ENSSAUG00010017853) #31	klhl42 (ENSSAUG00010017856) #32	elapor2b (ENSSAUG00010017867) #33	ENSSAUG00010018116	ENSSAUG00010018119
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	262	elapor2b (ENSLBEG00000008923) #33	klhl42 (ENSLBEG00000008995) #32	nrip2 (ENSLBEG00000009030) #31	itfg2 (ENSLBEG00000009067) #30	ascl1a (ENSLBEG00000009122) #29	pah (ENSLBEG00000009148) ##28	th2 (ENSLBEG00000009302) #28	nup37 (ENSLBEG00000009795) #27	parpbp (ENSLBEG00000009853) #26	ENSLBEG00000009881 #25	igf1 (ENSLBEG00000009904) #24	ENSLBEG00000009921	ENSLBEG00000009958 #23	ENSLBEG00000010011 #20	cry1a (ENSLBEG00000010050) #21	btbd11a (ENSLBEG00000010130) #22	ENSLBEG00000010191	ccnd2b (ENSLBEG00000010215)	tigarb (ENSLBEG00000010244)	fgf23 (ENSLBEG00000010263)	fgf6b (ENSLBEG00000010310)	rad51ap1 (ENSLBEG00000010326)	ENSLBEG00000010355	ENSLBEG00000010577	ADA2 (ENSLBEG00000010725)	atp6v1e1b (ENSLBEG00000010761)	ENSLBEG00000010784	spic (ENSLBEG00000010806)	ENSLBEG00000010853	mybpc1 (ENSLBEG00000011012)	chpt1 (ENSLBEG00000011369)
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000158094	ENSGT00940000157659	ENSGT00390000002796	ENSGT01010000222336.b.a.b.a	ENSGT00390000013067.l.l #12	ENSGT00940000156120.a #13	ENSGT00390000000406.d #14	ENSGT00940000155394.i.a #15	ENSGT00940000153962.b #16	ENSGT01050000244951.a.b.a.b.b #17	ENSGT00940000158899 #18	ENSGT00940000154709.a.a #19	ENSGT00530000063817.b.b #20	ENSGT00940000155455.g #21	ENSGT00940000165530.a.b	ENSGT00940000156419.b #22	ENSGT01030000234576.D.a.a.b.a.a.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000159081 #24	ENSGT00390000004984.b	ENSGT00390000006088 #26	ENSGT00390000010777 #27	ENSGT00950000182885.C.b #28	ENSGT00950000182885.B ##28	ENSGT00940000166611 #29	ENSGT00390000005378 #30	ENSGT00950000182999.b.a.a #31	ENSGT00940000160124 #32	ENSGT00940000154983.c.b #33	ENSGT00940000158225.i.a #34	ENSGT00390000008645 #35	ENSGT00940000154818 #36
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Tetraodon	MODERN SPECIES	11	RASSF3 (ENSTNIG00000012647)	ENSTNIG00000012648	creb3l2 (ENSTNIG00000012649)	acot14 (ENSTNIG00000012650)	rps16 (ENSTNIG00000012651) #12	ppp1r12a (ENSTNIG00000012652) #13	pawr (ENSTNIG00000012653) #14	ENSTNIG00000012654 #14	syt1a (ENSTNIG00000012655) #15	cyb5r3 (ENSTNIG00000012656) #16	ENSTNIG00000012657 #17	syt10 (ENSTNIG00000012658) #18	tnnt2c (ENSTNIG00000012659) #19	cry1a (ENSTNIG00000012660) #21	ENSTNIG00000012661	btbd11a (ENSTNIG00000012662) #22	ENSTNIG00000000656	igf1 (ENSTNIG00000012663) #24	pmch (ENSTNIG00000001324)	parpbp (ENSTNIG00000012664) #26	nup37 (ENSTNIG00000012665) #27	th2 (ENSTNIG00000012666) #28	pah (ENSTNIG00000012667) ##28	klhl42 (ENSTNIG00000012668) #32	elapor2b (ENSTNIG00000012669) #33	tspan9b (ENSTNIG00000012670) #34	amdhd1 (ENSTNIG00000012671) #35	snrpf (ENSTNIG00000012672) #36	ntn4 (ENSTNIG00000012673) #37	usp44 (ENSTNIG00000012674)	metap2b (ENSTNIG00000012675)