Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Amniota ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000162859 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Theria ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000162859 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000162859 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00550000074831 #22 Common shrew MODERN SPECIES 3164 UBA3 (ENSSARG00000014005) #22 Hedgehog MODERN SPECIES 4175 UBA3 (ENSEEUG00000005430) #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Felidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000165570 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 Panthera ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000165570 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000165570 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 leopard MODERN SPECIES 57 FRMD4B (ENSPPRG00000014178) LMOD3 (ENSPPRG00000013735) ARL6IP5 (ENSPPRG00000013425) UBA3 (ENSPPRG00000012852) #22 TMF1 (ENSPPRG00000011772) EOGT (ENSPPRG00000011239) TAFA4 (ENSPPRG00000010647) TAFA1 (ENSPPRG00000010607) SUCLG2 (ENSPPRG00000010350) KBTBD8 (ENSPPRG00000008562) LRIG1 (ENSPPRG00000008399) SLC25A26 (ENSPPRG00000007884) MAGI1 (ENSPPRG00000007510) ADAMTS9 (ENSPPRG00000005550) PRICKLE2 (ENSPPRG00000005251) PSMD6 (ENSPPRG00000005003) ATXN7 (ENSPPRG00000004611) ENSPPRG00000004069 THOC7 (ENSPPRG00000004022) lion MODERN SPECIES 2 CNTN3 (ENSPLOG00000003083) PDZRN3 (ENSPLOG00000003033) PPP4R2 (ENSPLOG00000002914) GXYLT2 (ENSPLOG00000002888) SHQ1 (ENSPLOG00000002849) RYBP (ENSPLOG00000002820) PROK2 (ENSPLOG00000002807) GPR27 (ENSPLOG00000002789) EIF4E3 (ENSPLOG00000002754) FOXP1 (ENSPLOG00000002481) MDFIC2 (ENSPLOG00000002362) MITF (ENSPLOG00000002275) FRMD4B (ENSPLOG00000002200) LMOD3 (ENSPLOG00000002158) ARL6IP5 (ENSPLOG00000002134) UBA3 (ENSPLOG00000001974) #22 TMF1 (ENSPLOG00000001823) EOGT (ENSPLOG00000001756) TAFA4 (ENSPLOG00000001723) TAFA1 (ENSPLOG00000001704) SUCLG2 (ENSPLOG00000001663) KBTBD8 (ENSPLOG00000001624) LRIG1 (ENSPLOG00000001605) SLC25A26 (ENSPLOG00000001581) MAGI1 (ENSPLOG00000001257) ADAMTS9 (ENSPLOG00000000956) PRICKLE2 (ENSPLOG00000000862) PSMD6 (ENSPLOG00000000825) ATXN7 (ENSPLOG00000000770) THOC7 (ENSPLOG00000000726) C3orf49 (ENSPLOG00000000710) Tiger MODERN SPECIES 527 FRMD4B (ENSPTIG00000020157) LMOD3 (ENSPTIG00000020310) ARL6IP5 (ENSPTIG00000020370) UBA3 (ENSPTIG00000020487) #22 TMF1 (ENSPTIG00000020979) EOGT (ENSPTIG00000021116) TAFA4 (ENSPTIG00000021331) TAFA1 (ENSPTIG00000021377) SUCLG2 (ENSPTIG00000021434) KBTBD8 (ENSPTIG00000021601) ENSPTIG00000021661 LRIG1 (ENSPTIG00000000135) SLC25A26 (ENSPTIG00000001374) MAGI1 (ENSPTIG00000004210) Cat MODERN SPECIES 1 PDZRN3 (ENSFCAG00000040417) PPP4R2 (ENSFCAG00000029481) GXYLT2 (ENSFCAG00000011005) SHQ1 (ENSFCAG00000012781) RYBP (ENSFCAG00000043691) PROK2 (ENSFCAG00000032697) GPR27 (ENSFCAG00000041717) EIF4E3 (ENSFCAG00000025548) FOXP1 (ENSFCAG00000023059) MDFIC2 (ENSFCAG00000026251) MITF (ENSFCAG00000024419) ENSFCAG00000034689 FRMD4B (ENSFCAG00000009021) LMOD3 (ENSFCAG00000009020) ARL6IP5 (ENSFCAG00000041359) UBA3 (ENSFCAG00000023111) #22 TMF1 (ENSFCAG00000027162) EOGT (ENSFCAG00000006082) TAFA4 (ENSFCAG00000031787) TAFA1 (ENSFCAG00000041196) SUCLG2 (ENSFCAG00000007716) KBTBD8 (ENSFCAG00000011921) LRIG1 (ENSFCAG00000003151) SLC25A26 (ENSFCAG00000003149) MAGI1 (ENSFCAG00000009340) ADAMTS9 (ENSFCAG00000001564) PRICKLE2 (ENSFCAG00000012183) PSMD6 (ENSFCAG00000000573) ATXN7 (ENSFCAG00000031292) THOC7 (ENSFCAG00000023008) C3orf49 (ENSFCAG00000000570) Caniformia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00390000005052.s.a.a.b ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00390000005052.s.a.a.b ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Dingo MODERN SPECIES 401 PPP4R2 (ENSCAFG00020016753) SHQ1 (ENSCAFG00020016743) RYBP (ENSCAFG00020016734) PROK2 (ENSCAFG00020016730) GPR27 (ENSCAFG00020016727) EIF4E3 (ENSCAFG00020016724) FOXP1 (ENSCAFG00020012311) MDFIC2 (ENSCAFG00020012180) MITF (ENSCAFG00020012176) FRMD4B (ENSCAFG00020012082) LMOD3 (ENSCAFG00020012071) ARL6IP5 (ENSCAFG00020012069) UBA3 (ENSCAFG00020012058) #22 TMF1 (ENSCAFG00020011872) EOGT (ENSCAFG00020011855) ENSCAFG00020011853 TAFA4 (ENSCAFG00020011851) ENSCAFG00020011847 SUCLG2 (ENSCAFG00020011840) KBTBD8 (ENSCAFG00020011839) LRIG1 (ENSCAFG00020011611) SLC25A26 (ENSCAFG00020011583) ENSCAFG00020011579 MAGI1 (ENSCAFG00020011230) ADAMTS9 (ENSCAFG00020010936) PRICKLE2 (ENSCAFG00020010850) PSMD6 (ENSCAFG00020010838) ATXN7 (ENSCAFG00020010789) Dog MODERN SPECIES 12 CNTN3 (ENSCAFG00845006575) PDZRN3 (ENSCAFG00845006843) PPP4R2 (ENSCAFG00845007022) GXYLT2 (ENSCAFG00845007149) SHQ1 (ENSCAFG00845007261) ENSCAFG00845007398 PROK2 (ENSCAFG00845007491) GPR27 (ENSCAFG00845007528) ENSCAFG00845007732 FOXP1 (ENSCAFG00845008552) MDFIC2 (ENSCAFG00845009570) MITF (ENSCAFG00845009666) FRMD4B (ENSCAFG00845010033) LMOD3 (ENSCAFG00845010392) ARL6IP5 (ENSCAFG00845010437) UBA3 (ENSCAFG00845010556) #22 TMF1 (ENSCAFG00845010825) EOGT (ENSCAFG00845010941) TAFA4 (ENSCAFG00845011056) TAFA1 (ENSCAFG00845011082) SUCLG2 (ENSCAFG00845011161) KBTBD8 (ENSCAFG00845011463) LRIG1 (ENSCAFG00845011565) SLC25A26 (ENSCAFG00845011731) MAGI1 (ENSCAFG00845012111) ADAMTS9 (ENSCAFG00845012850) PRICKLE2 (ENSCAFG00845013396) PSMD6 (ENSCAFG00845013485) ATXN7 (ENSCAFG00845013551) THOC7 (ENSCAFG00845013663) C20H3orf49 (ENSCAFG00845013688) Red fox MODERN SPECIES 5 ENSVVUG00000013879 ENSVVUG00000013883 PPP4R2 (ENSVVUG00000013896) GXYLT2 (ENSVVUG00000013899) SHQ1 (ENSVVUG00000013906) RYBP (ENSVVUG00000013920) PROK2 (ENSVVUG00000013944) ENSVVUG00000013947 ENSVVUG00000013952 FOXP1 (ENSVVUG00000013954) MDFIC2 (ENSVVUG00000013970) MITF (ENSVVUG00000013975) FRMD4B (ENSVVUG00000014012) LMOD3 (ENSVVUG00000014067) ARL6IP5 (ENSVVUG00000014070) UBA3 (ENSVVUG00000014100) #22 TMF1 (ENSVVUG00000014445) EOGT (ENSVVUG00000014456) FAM19A4 (ENSVVUG00000014489) ENSVVUG00000014499 SUCLG2 (ENSVVUG00000014528) KBTBD8 (ENSVVUG00000014553) LRIG1 (ENSVVUG00000014568) SLC25A26 (ENSVVUG00000014581) ENSVVUG00000014619 MAGI1 (ENSVVUG00000014645) ENSVVUG00000014685 ADAMTS9 (ENSVVUG00000014705) PRICKLE2 (ENSVVUG00000014773) PSMD6 (ENSVVUG00000014782) ATXN7 (ENSVVUG00000014784) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000173944 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a.l ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00390000018085.a.b.a.c.b ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00950000185438 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Ursus ANCESTRAL SPECIES 89 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000173944 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a.l ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00390000018085.a.b.a.c.b ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00950000185438 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Polar bear MODERN SPECIES 251 PDZRN3 (ENSUMAG00000024035) PPP4R2 (ENSUMAG00000024034) GXYLT2 (ENSUMAG00000024033) SHQ1 (ENSUMAG00000024031) ENSUMAG00000024029 RYBP (ENSUMAG00000024028) PROK2 (ENSUMAG00000024025) EIF4E3 (ENSUMAG00000024023) FOXP1 (ENSUMAG00000024020) MDFIC2 (ENSUMAG00000024017) MITF (ENSUMAG00000024001) FRMD4B (ENSUMAG00000023999) ENSUMAG00000023998 LMOD3 (ENSUMAG00000023997) ARL6IP5 (ENSUMAG00000023996) UBA3 (ENSUMAG00000023994) #22 TMF1 (ENSUMAG00000023989) EOGT (ENSUMAG00000023987) TAFA4 (ENSUMAG00000023986) ENSUMAG00000023985 SUCLG2 (ENSUMAG00000023841) ENSUMAG00000023808 KBTBD8 (ENSUMAG00000023807) LRIG1 (ENSUMAG00000023677) SLC25A26 (ENSUMAG00000023664) ENSUMAG00000023661 MAGI1 (ENSUMAG00000023561) ENSUMAG00000023532 ENSUMAG00000023522 ATXN7 (ENSUMAG00000023518) ENSUMAG00000023514 American black bear MODERN SPECIES 5874 LMOD3 (ENSUAMG00000018503) ARL6IP5 (ENSUAMG00000018502) UBA3 (ENSUAMG00000018494) #22 TMF1 (ENSUAMG00000018489) Giant Panda MODERN SPECIES 14 ENSAMEG00000011395 PDZRN3 (ENSAMEG00000025975) PPP4R2 (ENSAMEG00000015164) GXYLT2 (ENSAMEG00000015150) SHQ1 (ENSAMEG00000015140) ENSAMEG00000015139 RYBP (ENSAMEG00000015131) PROK2 (ENSAMEG00000028947) EIF4E3 (ENSAMEG00000015115) FOXP1 (ENSAMEG00000015051) MDFIC2 (ENSAMEG00000025889) MITF (ENSAMEG00000017117) FRMD4B (ENSAMEG00000010064) LMOD3 (ENSAMEG00000010109) ARL6IP5 (ENSAMEG00000010112) UBA3 (ENSAMEG00000010117) #22 TMF1 (ENSAMEG00000010131) EOGT (ENSAMEG00000010169) ENSAMEG00000028238 TAFA1 (ENSAMEG00000025281) SUCLG2 (ENSAMEG00000002805) ENSAMEG00000004042 KBTBD8 (ENSAMEG00000004044) LRIG1 (ENSAMEG00000009584) SLC25A26 (ENSAMEG00000025165) ENSAMEG00000028898 ENSAMEG00000027547 MAGI1 (ENSAMEG00000014617) ADAMTS9 (ENSAMEG00000007511) PRICKLE2 (ENSAMEG00000007612) PSMD6 (ENSAMEG00000015235) Mustelinae DUPLICATION Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00550000074831.a #22 American mink MODERN SPECIES 841 ENSNVIG00000004641 #22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831.b #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Ferret MODERN SPECIES 163 ENSMPUG00000020109 CNTN3 (ENSMPUG00000017011) ENSMPUG00000017010 PDZRN3 (ENSMPUG00000017009) PPP4R2 (ENSMPUG00000017008) GXYLT2 (ENSMPUG00000017007) SHQ1 (ENSMPUG00000017006) RYBP (ENSMPUG00000017004) PROK2 (ENSMPUG00000017003) EIF4E3 (ENSMPUG00000017002) FOXP1 (ENSMPUG00000017001) MITF (ENSMPUG00000016972) FRMD4B (ENSMPUG00000016969) LMOD3 (ENSMPUG00000016967) ARL6IP5 (ENSMPUG00000016965) UBA3 (ENSMPUG00000016958) #22 TMF1 (ENSMPUG00000016957) EOGT (ENSMPUG00000016952) TAFA4 (ENSMPUG00000016951) SUCLG2 (ENSMPUG00000016950) KBTBD8 (ENSMPUG00000016949) ENSMPUG00000016948 ENSMPUG00000016947 LRIG1 (ENSMPUG00000016945) SLC25A26 (ENSMPUG00000016944) ENSMPUG00000016943 MAGI1 (ENSMPUG00000016939) ENSMPUG00000016938 ADAMTS9 (ENSMPUG00000016936) PRICKLE2 (ENSMPUG00000016934) PSMD6 (ENSMPUG00000016933) American mink MODERN SPECIES 630 LMOD3 (ENSNVIG00000008958) PRAF3 (ENSNVIG00000008963) UBA3 (ENSNVIG00000008993) #22 TMF1 (ENSNVIG00000009107) AER61 (ENSNVIG00000009207) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 Equus ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00940000163880 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Donkey MODERN SPECIES 13 ENSEASG00005002280 PDZRN3 (ENSEASG00005002263) PPP4R2 (ENSEASG00005002252) GXYLT2 (ENSEASG00005002247) SHQ1 (ENSEASG00005002237) RYBP (ENSEASG00005029789) PROK2 (ENSEASG00005033363) GPR27 (ENSEASG00005027995) EIF4E3 (ENSEASG00005002204) FOXP1 (ENSEASG00005002186) MDFIC2 (ENSEASG00005002178) MITF (ENSEASG00005002172) FRMD4B (ENSEASG00005002162) LMOD3 (ENSEASG00005002161) ARL6IP5 (ENSEASG00005031455) UBA3 (ENSEASG00005002027) #22 TMF1 (ENSEASG00005001971) EOGT (ENSEASG00005001959) TAFA4 (ENSEASG00005034543) ENSEASG00005030093 SUCLG2 (ENSEASG00005001928) KBTBD8 (ENSEASG00005001917) LRIG1 (ENSEASG00005001905) SLC25A26 (ENSEASG00005001893) MAGI1 (ENSEASG00005001878) ADAMTS9 (ENSEASG00005001635) PRICKLE2 (ENSEASG00005001555) PSMD6 (ENSEASG00005001544) ATXN7 (ENSEASG00005001537) THOC7 (ENSEASG00005001507) C3orf49 (ENSEASG00005001501) Horse MODERN SPECIES 7 CHL1 (ENSECAG00000024808) CNTN3 (ENSECAG00000013575) PDZRN3 (ENSECAG00000014864) PPP4R2 (ENSECAG00000000689) GXYLT2 (ENSECAG00000008483) SHQ1 (ENSECAG00000015673) RYBP (ENSECAG00000000266) GPR27 (ENSECAG00000032664) EIF4E3 (ENSECAG00000004471) FOXP1 (ENSECAG00000008974) ENSECAG00000054670 MDFIC2 (ENSECAG00000029574) MITF (ENSECAG00000005360) FRMD4B (ENSECAG00000016131) LMOD3 (ENSECAG00000008709) UBA3 (ENSECAG00000009659) #22 TMF1 (ENSECAG00000023300) EOGT (ENSECAG00000012398) TAFA4 (ENSECAG00000038857) TAFA1 (ENSECAG00000032991) ENSECAG00000029066 SUCLG2 (ENSECAG00000023254) KBTBD8 (ENSECAG00000007088) LRIG1 (ENSECAG00000009328) SLC25A26 (ENSECAG00000015020) MAGI1 (ENSECAG00000016431) ADAMTS9 (ENSECAG00000019880) PRICKLE2 (ENSECAG00000018642) PSMD6 (ENSECAG00000021193) ATXN7 (ENSECAG00000024801) THOC7 (ENSECAG00000000497) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 Megabat MODERN SPECIES 1799 LMOD3 (ENSPVAG00000000797) ARL6IP5 (ENSPVAG00000000796) UBA3 (ENSPVAG00000000793) #22 TMF1 (ENSPVAG00000000790) EOGT (ENSPVAG00000000789) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 8 GXYLT2 (ENSRFEG00010017092) SHQ1 (ENSRFEG00010017046) ENSRFEG00010017032 RYBP (ENSRFEG00010017002) ENSRFEG00010016965 PROK2 (ENSRFEG00010016865) GPR27 (ENSRFEG00010016845) EIF4E3 (ENSRFEG00010016785) ENSRFEG00010016733 FOXP1 (ENSRFEG00010016312) MDFIC2 (ENSRFEG00010016226) MITF (ENSRFEG00010015864) FRMD4B (ENSRFEG00010015709) LMOD3 (ENSRFEG00010015673) ARL6IP5 (ENSRFEG00010015607) UBA3 (ENSRFEG00010015449) #22 TMF1 (ENSRFEG00010014693) EOGT (ENSRFEG00010014576) TAFA4 (ENSRFEG00010014473) TAFA1 (ENSRFEG00010014395) SUCLG2 (ENSRFEG00010014251) ENSRFEG00010014173 KBTBD8 (ENSRFEG00010014117) ENSRFEG00010014101 LRIG1 (ENSRFEG00010013972) SLC25A26 (ENSRFEG00010013884) RPL39_1 (ENSRFEG00010013864) MAGI1 (ENSRFEG00010012442) ADAMTS9 (ENSRFEG00010012302) PRICKLE2 (ENSRFEG00010012124) PSMD6 (ENSRFEG00010011978) Microbat MODERN SPECIES 1060 ENSMLUG00000030331 FOXP1 (ENSMLUG00000007219) ENSMLUG00000025354 ENSMLUG00000026958 MDFIC2 (ENSMLUG00000025844) MITF (ENSMLUG00000002587) ENSMLUG00000030468 FRMD4B (ENSMLUG00000005465) LMOD3 (ENSMLUG00000005461) ARL6IP5 (ENSMLUG00000005457) UBA3 (ENSMLUG00000005450) #22 TMF1 (ENSMLUG00000005442) EOGT (ENSMLUG00000009777) ENSMLUG00000022215 ENSMLUG00000027207 ENSMLUG00000030730 ENSMLUG00000022506 SUCLG2 (ENSMLUG00000017294) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000165570 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Suina ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 Pig MODERN SPECIES 4 ENSSSCG00000041059 PPP4R2 (ENSSSCG00000037216) GXYLT2 (ENSSSCG00000011519) SHQ1 (ENSSSCG00000011518) RYBP (ENSSSCG00000025053) PROK2 (ENSSSCG00000026200) GPR27 (ENSSSCG00000036580) EIF4E3 (ENSSSCG00000011516) FOXP1 (ENSSSCG00000027675) MDFIC2 (ENSSSCG00000060340) ENSSSCG00000045079 MITF (ENSSSCG00000011514) FRMD4B (ENSSSCG00000011511) LMOD3 (ENSSSCG00000052599) ARL6IP5 (ENSSSCG00000033154) UBA3 (ENSSSCG00000011506) #22 TMF1 (ENSSSCG00000011510) EOGT (ENSSSCG00000011504) TAFA4 (ENSSSCG00000033199) ENSSSCG00000036134 TAFA1 (ENSSSCG00000042118) SUCLG2 (ENSSSCG00000011501) KBTBD8 (ENSSSCG00000011500) ENSSSCG00000046980 LRIG1 (ENSSSCG00000011499) SLC25A26 (ENSSSCG00000011498) MAGI1 (ENSSSCG00000011497) ENSSSCG00000047543 ADAMTS9 (ENSSSCG00000011496) PRICKLE2 (ENSSSCG00000011495) PSMD6 (ENSSSCG00000011494) Chacoan peccary MODERN SPECIES 950 CNTN3 (ENSCWAG00000020972) PDZRN3 (ENSCWAG00000020942) PPP4R2 (ENSCWAG00000020926) GXYLT2 (ENSCWAG00000020910) SHQ1 (ENSCWAG00000020894) RYBP (ENSCWAG00000020884) PROK2 (ENSCWAG00000020863) GPR27 (ENSCWAG00000020855) EIF4E3 (ENSCWAG00000020836) FOXP1 (ENSCWAG00000019255) MDFIC2 (ENSCWAG00000019169) MITF (ENSCWAG00000018514) FRMD4B (ENSCWAG00000018343) LMOD3 (ENSCWAG00000018312) ARL6IP5 (ENSCWAG00000018288) UBA3 (ENSCWAG00000017763) #22 TMF1 (ENSCWAG00000017660) EOGT (ENSCWAG00000017579) TAFA4 (ENSCWAG00000017540) TAFA1 (ENSCWAG00000017513) SUCLG2 (ENSCWAG00000017444) KBTBD8 (ENSCWAG00000017384) LRIG1 (ENSCWAG00000017334) SLC25A26 (ENSCWAG00000017276) MAGI1 (ENSCWAG00000015706) ADAMTS9 (ENSCWAG00000014975) PRICKLE2 (ENSCWAG00000014815) PSMD6 (ENSCWAG00000014720) ATXN7 (ENSCWAG00000014420) THOC7 (ENSCWAG00000014303) C3orf49 (ENSCWAG00000014198) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000165570 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 Arabian camel MODERN SPECIES 8 CNTN3 (ENSCDRG00005005902) PDZRN3 (ENSCDRG00005005789) PPP4R2 (ENSCDRG00005005747) GXYLT2 (ENSCDRG00005005730) SHQ1 (ENSCDRG00005005675) RYBP (ENSCDRG00005005642) PROK2 (ENSCDRG00005005609) GPR27 (ENSCDRG00005005582) EIF4E3 (ENSCDRG00005005567) FOXP1 (ENSCDRG00005003812) MDFIC2 (ENSCDRG00005003702) MITF (ENSCDRG00005003570) FRMD4B (ENSCDRG00005003460) LMOD3 (ENSCDRG00005003378) ARL6IP5 (ENSCDRG00005021188) UBA3 (ENSCDRG00005021145) #22 TMF1 (ENSCDRG00005021118) EOGT (ENSCDRG00005021103) TAFA4 (ENSCDRG00005021091) TAFA1 (ENSCDRG00005021082) SUCLG2 (ENSCDRG00005021068) KBTBD8 (ENSCDRG00005021054) LRIG1 (ENSCDRG00005021027) SLC25A26 (ENSCDRG00005021013) MAGI1 (ENSCDRG00005020840) ADAMTS9 (ENSCDRG00005020777) PRICKLE2 (ENSCDRG00005020751) PSMD6 (ENSCDRG00005020711) ATXN7 (ENSCDRG00005020697) THOC7 (ENSCDRG00005020683) C3orf49 (ENSCDRG00005020674) Alpaca MODERN SPECIES 1517 ENSVPAG00000001372 MITF (ENSVPAG00000001369) FRMD4B (ENSVPAG00000001367) LMOD3 (ENSVPAG00000001364) ARL6IP5 (ENSVPAG00000001363) UBA3 (ENSVPAG00000001360) #22 TMF1 (ENSVPAG00000001354) EOGT (ENSVPAG00000001350) TAFA4 (ENSVPAG00000001348) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000165570 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Pecora ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000165570 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 Yarkand deer MODERN SPECIES 16 PPP4R2 (ENSCHYG00000026369) GXYLT2 (ENSCHYG00000026357) SHQ1 (ENSCHYG00000026306) RYBP (ENSCHYG00000026283) PROK2 (ENSCHYG00000026260) EIF4E3 (ENSCHYG00000026240) FOXP1 (ENSCHYG00000024873) ENSCHYG00000024728 MDFIC2 (ENSCHYG00000024686) MITF (ENSCHYG00000024471) ENSCHYG00000024373 ENSCHYG00000024354 FRMD4B (ENSCHYG00000023741) LMOD3 (ENSCHYG00000023655) ARL6IP5 (ENSCHYG00000023632) UBA3 (ENSCHYG00000023036) #22 TMF1 (ENSCHYG00000022757) EOGT (ENSCHYG00000022524) TAFA4 (ENSCHYG00000022432) TAFA1 (ENSCHYG00000022393) SUCLG2 (ENSCHYG00000022142) KBTBD8 (ENSCHYG00000022084) LRIG1 (ENSCHYG00000021539) SLC25A26 (ENSCHYG00000021357) ENSCHYG00000021268 MAGI1 (ENSCHYG00000018496) ADAMTS9 (ENSCHYG00000017101) PRICKLE2 (ENSCHYG00000016954) PSMD6 (ENSCHYG00000016855) ATXN7 (ENSCHYG00000016316) THOC7 (ENSCHYG00000016054) Percora_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000165570 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1222 CNTN3 (ENSMMSG00000016378) PDZRN3 (ENSMMSG00000016262) PPP4R2 (ENSMMSG00000016216) GXYLT2 (ENSMMSG00000016163) SHQ1 (ENSMMSG00000016133) RYBP (ENSMMSG00000016107) PROK2 (ENSMMSG00000016060) GPR27 (ENSMMSG00000016039) EIF4E3 (ENSMMSG00000015972) FOXP1 (ENSMMSG00000014620) MDFIC2 (ENSMMSG00000014534) MITF (ENSMMSG00000013971) FRMD4B (ENSMMSG00000013878) LMOD3 (ENSMMSG00000013861) ARL6IP5 (ENSMMSG00000013836) UBA3 (ENSMMSG00000013729) #22 TMF1 (ENSMMSG00000013641) EOGT (ENSMMSG00000021538) TAFA4 (ENSMMSG00000021498) TAFA1 (ENSMMSG00000021464) SUCLG2 (ENSMMSG00000021420) ENSMMSG00000021399 KBTBD8 (ENSMMSG00000021352) ENSMMSG00000021329 LRIG1 (ENSMMSG00000021235) SLC25A26 (ENSMMSG00000021168) MAGI1 (ENSMMSG00000020250) ENSMMSG00000020165 ADAMTS9 (ENSMMSG00000019756) ENSMMSG00000019702 PRICKLE2 (ENSMMSG00000019648) Bovidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT00940000153886.a.a.k.b.b ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT00940000153886.a.a.k.b.b ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 10 CNTN3 (ENSOARG00020016622) PDZRN3 (ENSOARG00020016919) PPP4R2 (ENSOARG00020017177) GXYLT2 (ENSOARG00020017381) SHQ1 (ENSOARG00020017477) RYBP (ENSOARG00020017720) PROK2 (ENSOARG00020017771) GPR27 (ENSOARG00020017874) FOXP1 (ENSOARG00020017991) MDFIC2 (ENSOARG00020020710) MITF (ENSOARG00020020821) FRMD4B (ENSOARG00020021286) ENSOARG00020021609 LMOD3 (ENSOARG00020021653) ARL6IP5 (ENSOARG00020021679) UBA3 (ENSOARG00020021782) #22 TMF1 (ENSOARG00020022407) EOGT (ENSOARG00020022578) TAFA1 (ENSOARG00020022813) SUCLG2 (ENSOARG00020022864) ENSOARG00020023030 KBTBD8 (ENSOARG00020023050) LRIG1 (ENSOARG00020023098) SLC25A26 (ENSOARG00020023224) MAGI1 (ENSOARG00020023373) ADAMTS9 (ENSOARG00020024236) PRICKLE2 (ENSOARG00020024549) PSMD6 (ENSOARG00020024605) ATXN7 (ENSOARG00020024681) THOC7 (ENSOARG00020024776) C3orf49 (ENSOARG00020024817) Goat MODERN SPECIES 14 PPP4R2 (ENSCHIG00000006838) GXYLT2 (ENSCHIG00000011713) SHQ1 (ENSCHIG00000012271) RYBP (ENSCHIG00000026041) ENSCHIG00000012364 PROK2 (ENSCHIG00000020872) GPR27 (ENSCHIG00000006038) EIF4E3 (ENSCHIG00000024333) FOXP1 (ENSCHIG00000017707) MDFIC2 (ENSCHIG00000017880) MITF (ENSCHIG00000022111) ENSCHIG00000014889 FRMD4B (ENSCHIG00000015488) LMOD3 (ENSCHIG00000017627) ARL6IP5 (ENSCHIG00000021517) UBA3 (ENSCHIG00000015026) #22 TMF1 (ENSCHIG00000012583) EOGT (ENSCHIG00000014149) TAFA4 (ENSCHIG00000013665) SUCLG2 (ENSCHIG00000019725) ENSCHIG00000023345 KBTBD8 (ENSCHIG00000014682) LRIG1 (ENSCHIG00000012710) ENSCHIG00000002544 ENSCHIG00000012793 ENSCHIG00000008422 MAGI1 (ENSCHIG00000012723) ADAMTS9 (ENSCHIG00000017918) PRICKLE2 (ENSCHIG00000010654) PSMD6 (ENSCHIG00000024309) ATXN7 (ENSCHIG00000023713) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT00940000153886.a.a.k.b.b ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00390000006192.nb ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Bos ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.b.a.a.b.b.b.b.a.a.b ENSGT00940000162026.b ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00390000004856.w.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000156326 ENSGT00940000153886.a.a.k.b.b ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.b.a.a.b.a.a.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00390000006192.nb ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.b.a.a.b.b.b.b.a.a.b ENSGT00940000162026.b ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00390000004856.w.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.b.a.a.b.a.a.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00390000006192.nb ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Domestic yak MODERN SPECIES 14 RYBP (ENSBGRG00000021759) ENSBGRG00000021736 PROK2 (ENSBGRG00000021693) GPR27 (ENSBGRG00000021670) EIF4E3 (ENSBGRG00000021497) ENSBGRG00000021458 FOXP1 (ENSBGRG00000019865) MDFIC2 (ENSBGRG00000019713) ENSBGRG00000019667 MITF (ENSBGRG00000018873) FRMD4B (ENSBGRG00000017724) ENSBGRG00000017643 LMOD3 (ENSBGRG00000017594) ARL6IP5 (ENSBGRG00000017445) ENSBGRG00000017411 UBA3 (ENSBGRG00000016525) #22 TMF1 (ENSBGRG00000015776) EOGT (ENSBGRG00000015412) TAFA4 (ENSBGRG00000015297) ENSBGRG00000015251 TAFA1 (ENSBGRG00000015196) SUCLG2 (ENSBGRG00000014669) ENSBGRG00000014592 KBTBD8 (ENSBGRG00000014548) LRIG1 (ENSBGRG00000012866) SLC25A26 (ENSBGRG00000012436) MAGI1 (ENSBGRG00000010872) ENSBGRG00000010739 ENSBGRG00000010692 ENSBGRG00000010645 ADAMTS9 (ENSBGRG00000026643) Wild yak MODERN SPECIES 359 MDFIC2 (ENSBMUG00000011786) ENSBMUG00000011775 MITF (ENSBMUG00000011747) FRMD4B (ENSBMUG00000011656) LMOD3 (ENSBMUG00000011495) ARL6IP5 (ENSBMUG00000011430) UBA3 (ENSBMUG00000011407) #22 TMF1 (ENSBMUG00000011382) EOGT (ENSBMUG00000011307) TAFA4 (ENSBMUG00000011247) ENSBMUG00000011209 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.b.a.a.b.b.b.b.a.a.b ENSGT00940000162026.b ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00390000004856.w.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000156326 ENSGT00940000153886.a.a.k.b.b ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.b.a.a.b.a.a.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000160625.k.a.b ENSGT00940000155820 ENSGT00390000006192.nb ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT01100000263511.b.a.b.a.b.a.b.b.a.b.a.b.a.a.b.a.b Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 14 SHQ1 (ENSBIXG00005031362) RYBP (ENSBIXG00005031352) ENSBIXG00005031346 GPR27 (ENSBIXG00005031343) EIF4E3 (ENSBIXG00005031340) FOXP1 (ENSBIXG00005031327) MDFIC2 (ENSBIXG00005031313) ENSBIXG00005031312 MITF (ENSBIXG00005031308) ENSBIXG00005031303 ENSBIXG00005031301 FRMD4B (ENSBIXG00005031293) LMOD3 (ENSBIXG00005031283) ARL6IP5 (ENSBIXG00005031280) ENSBIXG00005031278 UBA3 (ENSBIXG00005031275) #22 TMF1 (ENSBIXG00005031267) EOGT (ENSBIXG00005031262) TAFA4 (ENSBIXG00005031260) TAFA1 (ENSBIXG00005031253) ENSBIXG00005031245 SUCLG2 (ENSBIXG00005031233) KBTBD8 (ENSBIXG00005031227) LRIG1 (ENSBIXG00005031216) SLC25A26 (ENSBIXG00005031207) ENSBIXG00005031202 MAGI1 (ENSBIXG00005031190) ENSBIXG00005031172 ENSBIXG00005031164 ADAMTS9 (ENSBIXG00005031151) PRICKLE2 (ENSBIXG00005031115) Cow MODERN SPECIES 14 GXYLT2 (ENSBTAG00000020481) SHQ1 (ENSBTAG00000005436) RYBP (ENSBTAG00000022689) ENSBTAG00000054670 PROK2 (ENSBTAG00000019330) GPR27 (ENSBTAG00000053030) EIF4E3 (ENSBTAG00000018862) FOXP1 (ENSBTAG00000016533) MDFIC2 (ENSBTAG00000048900) ENSBTAG00000009220 MITF (ENSBTAG00000006679) FRMD4B (ENSBTAG00000007624) ENSBTAG00000013059 LMOD3 (ENSBTAG00000021508) ARL6IP5 (ENSBTAG00000021506) UBA3 (ENSBTAG00000015556) #22 TMF1 (ENSBTAG00000015554) EOGT (ENSBTAG00000022681) TAFA4 (ENSBTAG00000003110) ENSBTAG00000049502 TAFA1 (ENSBTAG00000019041) ENSBTAG00000048492 SUCLG2 (ENSBTAG00000009541) KBTBD8 (ENSBTAG00000011081) LRIG1 (ENSBTAG00000010360) ENSBTAG00000051201 SLC25A26 (ENSBTAG00000037972) ENSBTAG00000051801 ENSBTAG00000050439 MAGI1 (ENSBTAG00000010581) ENSBTAG00000019048 American bison MODERN SPECIES 3333 CNTN3 (ENSBBBG00000022837) PDZRN3 (ENSBBBG00000022898) PPP4R2 (ENSBBBG00000008134) GXYLT2 (ENSBBBG00000022931) SHQ1 (ENSBBBG00000006026) RYBP (ENSBBBG00000006031) PROK2 (ENSBBBG00000022995) EIF4E3 (ENSBBBG00000023020) FOXP1 (ENSBBBG00000023930) MDFIC2 (ENSBBBG00000006278) MITF (ENSBBBG00000009019) ENSBBBG00000006419 FRMD4B (ENSBBBG00000006453) LMOD3 (ENSBBBG00000000194) ENSBBBG00000000181 UBA3 (ENSBBBG00000007824) #22 TMF1 (ENSBBBG00000008082) EOGT (ENSBBBG00000025364) Cetacea ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000006922.m.b.a.d ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873.z.a.a Blue whale MODERN SPECIES 2 ENSBMSG00010021950 RYBP (ENSBMSG00010021945) PROK2 (ENSBMSG00010021941) GPR27 (ENSBMSG00010021933) EIF4E3 (ENSBMSG00010021929) FOXP1 (ENSBMSG00010021028) ENSBMSG00010020804 MDFIC2 (ENSBMSG00010020784) MITF (ENSBMSG00010019612) ENSBMSG00010019391 ENSBMSG00010019371 ENSBMSG00010019343 FRMD4B (ENSBMSG00010019228) LMOD3 (ENSBMSG00010019153) ARL6IP5 (ENSBMSG00010019130) UBA3 (ENSBMSG00010018750) #22 TMF1 (ENSBMSG00010018575) EOGT (ENSBMSG00010018516) TAFA4 (ENSBMSG00010018478) TAFA1 (ENSBMSG00010018438) SUCLG2 (ENSBMSG00010018400) KBTBD8 (ENSBMSG00010018360) LRIG1 (ENSBMSG00010018168) SLC25A26 (ENSBMSG00010018085) MAGI1 (ENSBMSG00010016192) ADAMTS9 (ENSBMSG00010016033) PRICKLE2 (ENSBMSG00010015955) PSMD6 (ENSBMSG00010015926) ATXN7 (ENSBMSG00010015874) ENSBMSG00010015826 C3orf49 (ENSBMSG00010015790) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000012652.ab.a.k ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000006922.m.b.a.d ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873.z.a.b Sperm whale MODERN SPECIES 9 PPP4R2 (ENSPCTG00005017140) GXYLT2 (ENSPCTG00005017189) SHQ1 (ENSPCTG00005017281) ENSPCTG00005008959 RYBP (ENSPCTG00005008989) PROK2 (ENSPCTG00005009087) GPR27 (ENSPCTG00005009164) EIF4E3 (ENSPCTG00005009184) FOXP1 (ENSPCTG00005009284) MDFIC2 (ENSPCTG00005009636) MITF (ENSPCTG00005009685) ENSPCTG00005009977 FRMD4B (ENSPCTG00005010026) LMOD3 (ENSPCTG00005010268) ARL6IP5 (ENSPCTG00005010327) UBA3 (ENSPCTG00005010435) #22 TMF1 (ENSPCTG00005010922) EOGT (ENSPCTG00005011366) TAFA4 (ENSPCTG00005011477) TAFA1 (ENSPCTG00005011548) SUCLG2 (ENSPCTG00005011614) ENSPCTG00005011712 KBTBD8 (ENSPCTG00005011753) LRIG1 (ENSPCTG00005011798) SLC25A26 (ENSPCTG00005011855) MAGI1 (ENSPCTG00005011987) ADAMTS9 (ENSPCTG00005012968) PRICKLE2 (ENSPCTG00005013097) PSMD6 (ENSPCTG00005013205) ATXN7 (ENSPCTG00005013360) THOC7 (ENSPCTG00005013878) Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000012652.ab.a.k ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000006922.m.b.a.d ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873.z.a.b Dolphin MODERN SPECIES 1441 UBA3 (ENSTTRG00000015325) #22 TMF1 (ENSTTRG00000015306) EOGT (ENSTTRG00000015293) Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000012652.ab.a.k ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000006922.m.b.a.d ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00390000002517.a.b.b.c.b.a ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Vaquita MODERN SPECIES 2 SHQ1 (ENSPSNG00000022028) ENSPSNG00000022044 RYBP (ENSPSNG00000022051) PROK2 (ENSPSNG00000022078) GPR27 (ENSPSNG00000022094) EIF4E3 (ENSPSNG00000009818) FOXP1 (ENSPSNG00000010176) MDFIC2 (ENSPSNG00000011225) MITF (ENSPSNG00000011317) ENSPSNG00000011931 ENSPSNG00000011964 FRMD4B (ENSPSNG00000012000) ENSPSNG00000012258 LMOD3 (ENSPSNG00000012275) ARL6IP5 (ENSPSNG00000012328) UBA3 (ENSPSNG00000012433) #22 TMF1 (ENSPSNG00000012619) EOGT (ENSPSNG00000012709) TAFA4 (ENSPSNG00000012789) ENSPSNG00000012855 TAFA1 (ENSPSNG00000012870) SUCLG2 (ENSPSNG00000012959) KBTBD8 (ENSPSNG00000013050) ENSPSNG00000013140 LRIG1 (ENSPSNG00000013173) SLC25A26 (ENSPSNG00000013259) MAGI1 (ENSPSNG00000013508) ADAMTS9 (ENSPSNG00000014985) PRICKLE2 (ENSPSNG00000015122) PSMD6 (ENSPSNG00000015223) ATXN7 (ENSPSNG00000015407) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000012652.ab.a.k ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000006922.m.b.a.d ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00390000002517.a.b.b.c.b.a ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Beluga whale MODERN SPECIES 28 ENSDLEG00000007621 PPP4R2 (ENSDLEG00000007632) SHQ1 (ENSDLEG00000007662) ENSDLEG00000007675 RYBP (ENSDLEG00000007680) PROK2 (ENSDLEG00000007684) GPR27 (ENSDLEG00000007689) EIF4E3 (ENSDLEG00000007693) FOXP1 (ENSDLEG00000007703) MDFIC2 (ENSDLEG00000007714) MITF (ENSDLEG00000007717) ENSDLEG00000007725 FRMD4B (ENSDLEG00000007734) LMOD3 (ENSDLEG00000007747) ARL6IP5 (ENSDLEG00000007750) UBA3 (ENSDLEG00000007767) #22 TMF1 (ENSDLEG00000007791) EOGT (ENSDLEG00000007861) TAFA4 (ENSDLEG00000007891) ENSDLEG00000007893 ENSDLEG00000007895 ENSDLEG00000007899 SUCLG2 (ENSDLEG00000007909) KBTBD8 (ENSDLEG00000008004) ENSDLEG00000008026 LRIG1 (ENSDLEG00000008041) SLC25A26 (ENSDLEG00000008090) ENSDLEG00000008167 MAGI1 (ENSDLEG00000008577) ADAMTS9 (ENSDLEG00000010763) PRICKLE2 (ENSDLEG00000012899) Narwhal MODERN SPECIES 310 PPP4R2 (ENSMMNG00015020763) GXYLT2 (ENSMMNG00015020737) SHQ1 (ENSMMNG00015020699) ENSMMNG00015020691 RYBP (ENSMMNG00015020675) PROK2 (ENSMMNG00015020659) GPR27 (ENSMMNG00015020647) EIF4E3 (ENSMMNG00015020620) ENSMMNG00015020607 FOXP1 (ENSMMNG00015020256) MDFIC2 (ENSMMNG00015020084) MITF (ENSMMNG00015020021) FRMD4B (ENSMMNG00015019966) LMOD3 (ENSMMNG00015019939) ARL6IP5 (ENSMMNG00015019913) UBA3 (ENSMMNG00015019640) #22 TMF1 (ENSMMNG00015019536) EOGT (ENSMMNG00015019482) ENSMMNG00015019447 TAFA4 (ENSMMNG00015019429) TAFA1 (ENSMMNG00015019401) SUCLG2 (ENSMMNG00015019323) KBTBD8 (ENSMMNG00015019270) ENSMMNG00015019238 LRIG1 (ENSMMNG00015019175) SLC25A26 (ENSMMNG00015019127) MAGI1 (ENSMMNG00015018757) ADAMTS9 (ENSMMNG00015018336) PRICKLE2 (ENSMMNG00015018213) PSMD6 (ENSMMNG00015018161) ATXN7 (ENSMMNG00015017959) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 Primates ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000153510.a.f ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000153510.a.f ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00530000063786.a.m ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT01040000240967 ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00910000146882 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00530000063786.a.m ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT01040000240967 ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00910000146882 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00530000063786.a.m ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT01040000240967 ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00910000146882 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00530000063786.a.m ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT01040000240967 ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00910000146882 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00530000063786.a.m ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT01040000240967 ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00910000146882 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Pan ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000153510.a.f ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00530000063786.a.m ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT01040000240967 ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00910000146882 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Chimpanzee MODERN SPECIES 16 ENSPTRG00000044295 SHQ1 (ENSPTRG00000015106) RYBP (ENSPTRG00000051886) PROK2 (ENSPTRG00000015104) ENSPTRG00000048214 GPR27 (ENSPTRG00000015103) EIF4E3 (ENSPTRG00000015102) FOXP1 (ENSPTRG00000015101) MDFIC2 (ENSPTRG00000044422) ENSPTRG00000044227 MITF (ENSPTRG00000015100) FRMD4B (ENSPTRG00000015098) LMOD3 (ENSPTRG00000015097) ARL6IP5 (ENSPTRG00000015096) ENSPTRG00000048155 UBA3 (ENSPTRG00000015095) #22 TMF1 (ENSPTRG00000015094) EOGT (ENSPTRG00000015092) TAFA4 (ENSPTRG00000015091) TAFA1 (ENSPTRG00000015088) SUCLG2 (ENSPTRG00000046048) KBTBD8 (ENSPTRG00000015086) LRIG1 (ENSPTRG00000015085) SLC25A26 (ENSPTRG00000015084) ENSPTRG00000046672 MAGI1 (ENSPTRG00000015083) ADAMTS9 (ENSPTRG00000015082) PRICKLE2 (ENSPTRG00000015081) PSMD6 (ENSPTRG00000015078) ATXN7 (ENSPTRG00000015077) THOC7 (ENSPTRG00000015076) Bonobo MODERN SPECIES 16 ENSPPAG00000009897 GXYLT2 (ENSPPAG00000037639) ENSPPAG00000029534 SHQ1 (ENSPPAG00000027714) RYBP (ENSPPAG00000039197) PROK2 (ENSPPAG00000038388) ENSPPAG00000038441 ENSPPAG00000035020 FOXP1 (ENSPPAG00000039148) MDFIC2 (ENSPPAG00000036914) ENSPPAG00000030278 MITF (ENSPPAG00000041237) FRMD4B (ENSPPAG00000021170) LMOD3 (ENSPPAG00000033796) ARL6IP5 (ENSPPAG00000033634) UBA3 (ENSPPAG00000031816) #22 TMF1 (ENSPPAG00000042538) EOGT (ENSPPAG00000040173) TAFA4 (ENSPPAG00000038870) ENSPPAG00000032744 ENSPPAG00000033694 SUCLG2 (ENSPPAG00000035499) KBTBD8 (ENSPPAG00000041680) LRIG1 (ENSPPAG00000041400) SLC25A26 (ENSPPAG00000030070) ENSPPAG00000032911 ENSPPAG00000023910 ADAMTS9 (ENSPPAG00000027506) PRICKLE2 (ENSPPAG00000036788) PSMD6 (ENSPPAG00000008985) ATXN7 (ENSPPAG00000038542) Human MODERN SPECIES 15 EBLN2 (ENSG00000255423) PPP4R2 (ENSG00000163605) GXYLT2 (ENSG00000172986) SHQ1 (ENSG00000144736) RYBP (ENSG00000163602) PROK2 (ENSG00000163421) GPR27 (ENSG00000170837) EIF4E3 (ENSG00000163412) ENSG00000285708 FOXP1 (ENSG00000114861) MDFIC2 (ENSG00000242120) MITF (ENSG00000187098) FRMD4B (ENSG00000114541) LMOD3 (ENSG00000163380) ARL6IP5 (ENSG00000144746) UBA3 (ENSG00000144744) #22 TMF1 (ENSG00000144747) EOGT (ENSG00000163378) TAFA4 (ENSG00000163377) TAFA1 (ENSG00000183662) SUCLG2 (ENSG00000172340) KBTBD8 (ENSG00000163376) LRIG1 (ENSG00000144749) SLC25A26 (ENSG00000144741) MAGI1 (ENSG00000151276) ADAMTS9 (ENSG00000163638) PRICKLE2 (ENSG00000163637) PSMD6 (ENSG00000163636) ATXN7 (ENSG00000163635) THOC7 (ENSG00000163634) C3orf49 (ENSG00000163632) Gorilla MODERN SPECIES 16 SHQ1 (ENSGGOG00000034818) RYBP (ENSGGOG00000040802) PROK2 (ENSGGOG00000024537) ENSGGOG00000039593 GPR27 (ENSGGOG00000010203) ENSGGOG00000042096 FOXP1 (ENSGGOG00000010391) RNF151 (ENSGGOG00000009376) MDFIC2 (ENSGGOG00000043971) ENSGGOG00000026201 MITF (ENSGGOG00000024338) FRMD4B (ENSGGOG00000002181) LMOD3 (ENSGGOG00000015200) ARL6IP5 (ENSGGOG00000000983) ENSGGOG00000036802 UBA3 (ENSGGOG00000003959) #22 TMF1 (ENSGGOG00000006754) EOGT (ENSGGOG00000034885) TAFA4 (ENSGGOG00000010868) ENSGGOG00000012362 TAFA1 (ENSGGOG00000011732) ENSGGOG00000042425 SUCLG2 (ENSGGOG00000027438) KBTBD8 (ENSGGOG00000023751) LRIG1 (ENSGGOG00000014317) ENSGGOG00000036595 ENSGGOG00000042398 MAGI1 (ENSGGOG00000004958) ADAMTS9 (ENSGGOG00000015540) PRICKLE2 (ENSGGOG00000006935) PSMD6 (ENSGGOG00000004430) Orangutan MODERN SPECIES 16 PDZRN3 (ENSPPYG00000013713) PPP4R2 (ENSPPYG00000013715) GXYLT2 (ENSPPYG00000013716) ENSPPYG00000038319 SHQ1 (ENSPPYG00000013717) RYBP (ENSPPYG00000033076) PROK2 (ENSPPYG00000013719) GPR27 (ENSPPYG00000013720) EIF4E3 (ENSPPYG00000033784) FOXP1 (ENSPPYG00000013722) MDFIC2 (ENSPPYG00000041220) MITF (ENSPPYG00000013725) FRMD4B (ENSPPYG00000013726) LMOD3 (ENSPPYG00000013727) ARL6IP5 (ENSPPYG00000013728) UBA3 (ENSPPYG00000013729) #22 ENSPPYG00000038623 TMF1 (ENSPPYG00000013730) EOGT (ENSPPYG00000013731) ENSPPYG00000035430 TAFA1 (ENSPPYG00000013733) SUCLG2 (ENSPPYG00000013735) KBTBD8 (ENSPPYG00000038565) LRIG1 (ENSPPYG00000013737) SLC25A26 (ENSPPYG00000013738) MAGI1 (ENSPPYG00000013739) ADAMTS9 (ENSPPYG00000013740) PRICKLE2 (ENSPPYG00000013741) PSMD6 (ENSPPYG00000013743) ATXN7 (ENSPPYG00000013744) THOC7 (ENSPPYG00000013746) Gibbon MODERN SPECIES 13 ENSNLEG00000035814 GXYLT2 (ENSNLEG00000002790) ENSNLEG00000029680 SHQ1 (ENSNLEG00000002731) RYBP (ENSNLEG00000031222) PROK2 (ENSNLEG00000002696) ENSNLEG00000002684 FOXP1 (ENSNLEG00000002497) MDFIC2 (ENSNLEG00000030576) ENSNLEG00000002490 ENSNLEG00000029106 MITF (ENSNLEG00000002357) FRMD4B (ENSNLEG00000002248) LMOD3 (ENSNLEG00000002236) ARL6IP5 (ENSNLEG00000029362) UBA3 (ENSNLEG00000002198) #22 ENSNLEG00000031694 TMF1 (ENSNLEG00000002036) EOGT (ENSNLEG00000001976) TAFA4 (ENSNLEG00000001971) ENSNLEG00000001966 ENSNLEG00000001961 ENSNLEG00000018553 ENSNLEG00000007553 KBTBD8 (ENSNLEG00000007551) LRIG1 (ENSNLEG00000007544) ENSNLEG00000007539 ENSNLEG00000030874 MAGI1 (ENSNLEG00000011916) ADAMTS9 (ENSNLEG00000011854) ENSNLEG00000032900 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000004169.b ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.a.a ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00530000063786.a.m ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a.d.a ENSGT01040000240967 ENSGT00390000008631.a.c ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000000306.g ENSGT00940000163880 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00910000146882 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 425 ENSGT00940000154326.a.b.b.m.a.c ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a.d.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000000306.g ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1987 ENSRBIG00000038037 FRMD4B (ENSRBIG00000032228) LMOD3 (ENSRBIG00000015450) ARL6IP5 (ENSRBIG00000038228) UBA3 (ENSRBIG00000044270) #22 TMF1 (ENSRBIG00000044345) EOGT (ENSRBIG00000041912) TAFA4 (ENSRBIG00000039642) TAFA1 (ENSRBIG00000033651) ENSRBIG00000037847 ENSRBIG00000042558 KBTBD8 (ENSRBIG00000039346) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2398 ENSRROG00000038380 UBA3 (ENSRROG00000035874) #22 TMF1 (ENSRROG00000041607) EOGT (ENSRROG00000029870) TAFA4 (ENSRROG00000045447) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000004169.b ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.a.a ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00530000063786.a.m ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a.d.a ENSGT01040000240967 ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000000306.g ENSGT00940000163880 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00910000146882 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000004169.b ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.a.a ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00530000063786.a.m ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a.d.a ENSGT01040000240967 ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000000306.g ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00910000146882 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Macaca ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.a.a ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a.d.a ENSGT01040000240967 ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00910000146882 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.a.a ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a.d.a ENSGT01040000240967 ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 Rhesus MODERN SPECIES 11 PDZRN3 (ENSMMUG00000012661) ENSMMUG00000064384 PPP4R2 (ENSMMUG00000016959) GXYLT2 (ENSMMUG00000022507) SHQ1 (ENSMMUG00000009571) RYBP (ENSMMUG00000042444) PROK2 (ENSMMUG00000018494) GPR27 (ENSMMUG00000040565) EIF4E3 (ENSMMUG00000007780) FOXP1 (ENSMMUG00000002889) MDFIC2 (ENSMMUG00000057543) MITF (ENSMMUG00000002100) FRMD4B (ENSMMUG00000000387) LMOD3 (ENSMMUG00000008628) ARL6IP5 (ENSMMUG00000058373) UBA3 (ENSMMUG00000008620) #22 TMF1 (ENSMMUG00000008616) EOGT (ENSMMUG00000011090) TAFA4 (ENSMMUG00000050069) TAFA1 (ENSMMUG00000013847) SUCLG2 (ENSMMUG00000009693) KBTBD8 (ENSMMUG00000049226) ENSMMUG00000054412 LRIG1 (ENSMMUG00000001531) SLC25A26 (ENSMMUG00000001529) ENSMMUG00000057539 MAGI1 (ENSMMUG00000017510) ADAMTS9 (ENSMMUG00000000265) PRICKLE2 (ENSMMUG00000001513) PSMD6 (ENSMMUG00000001509) ATXN7 (ENSMMUG00000001508) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 11 GXYLT2 (ENSMFAG00000044294) SHQ1 (ENSMFAG00000039148) ENSMFAG00000048279 RYBP (ENSMFAG00000049247) PROK2 (ENSMFAG00000003820) ENSMFAG00000024958 GPR27 (ENSMFAG00000053255) EIF4E3 (ENSMFAG00000039909) FOXP1 (ENSMFAG00000033964) MDFIC2 (ENSMFAG00000042217) MITF (ENSMFAG00000038478) FRMD4B (ENSMFAG00000040109) LMOD3 (ENSMFAG00000044328) ARL6IP5 (ENSMFAG00000001584) ENSMFAG00000051018 UBA3 (ENSMFAG00000036648) #22 TMF1 (ENSMFAG00000037002) EOGT (ENSMFAG00000041998) TAFA4 (ENSMFAG00000020992) TAFA1 (ENSMFAG00000034201) SUCLG2 (ENSMFAG00000041500) KBTBD8 (ENSMFAG00000003507) LRIG1 (ENSMFAG00000033439) SLC25A26 (ENSMFAG00000000714) ENSMFAG00000047524 MAGI1 (ENSMFAG00000032287) ADAMTS9 (ENSMFAG00000036382) PRICKLE2 (ENSMFAG00000002702) PSMD6 (ENSMFAG00000040782) ENSMFAG00000055512 ATXN7 (ENSMFAG00000037665) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 106 FRMD4B (ENSMNEG00000041887) LMOD3 (ENSMNEG00000029599) ARL6IP5 (ENSMNEG00000044211) ENSMNEG00000041449 UBA3 (ENSMNEG00000038119) #22 TMF1 (ENSMNEG00000033820) EOGT (ENSMNEG00000042181) TAFA4 (ENSMNEG00000020663) TAFA1 (ENSMNEG00000037377) ENSMNEG00000043216 SUCLG2 (ENSMNEG00000041935) KBTBD8 (ENSMNEG00000042365) LRIG1 (ENSMNEG00000036965) SLC25A26 (ENSMNEG00000036231) ENSMNEG00000032876 MAGI1 (ENSMNEG00000031705) ADAMTS9 (ENSMNEG00000041827) PRICKLE2 (ENSMNEG00000017820) PSMD6 (ENSMNEG00000028262) ATXN7 (ENSMNEG00000037292) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000004169.b ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.a.a ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00530000063786.a.m ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a.d.a ENSGT01040000240967 ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000000306.g ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00910000146882 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Olive baboon MODERN SPECIES 11 GXYLT2 (ENSPANG00000023883) ENSPANG00000041507 SHQ1 (ENSPANG00000002881) ENSPANG00000043336 RYBP (ENSPANG00000046879) PROK2 (ENSPANG00000031802) GPR27 (ENSPANG00000037165) ENSPANG00000024441 FOXP1 (ENSPANG00000009084) MDFIC2 (ENSPANG00000040564) MITF (ENSPANG00000011565) ENSPANG00000030680 FRMD4B (ENSPANG00000022151) LMOD3 (ENSPANG00000011422) ARL6IP5 (ENSPANG00000006554) UBA3 (ENSPANG00000021492) #22 ENSPANG00000029557 TMF1 (ENSPANG00000014204) EOGT (ENSPANG00000012769) ENSPANG00000022502 TAFA4 (ENSPANG00000043583) TAFA1 (ENSPANG00000021491) SUCLG2 (ENSPANG00000019945) ENSPANG00000048748 ENSPANG00000040517 KBTBD8 (ENSPANG00000024439) ENSPANG00000045992 LRIG1 (ENSPANG00000014202) SLC25A26 (ENSPANG00000015066) MAGI1 (ENSPANG00000024536) ADAMTS9 (ENSPANG00000006402) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000004169.b ENSGT00940000162026 ENSGT00910000146944 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.a.a ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00530000063786.a.m ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a.d.a ENSGT01040000240967 ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000000306.g ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00910000146882 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Sooty mangabey MODERN SPECIES 650 SHQ1 (ENSCATG00000041238) RYBP (ENSCATG00000034872) ENSCATG00000036252 PROK2 (ENSCATG00000034783) ENSCATG00000004327 GPR27 (ENSCATG00000022613) ENSCATG00000042150 FOXP1 (ENSCATG00000044155) MDFIC2 (ENSCATG00000030313) ENSCATG00000035930 MITF (ENSCATG00000036190) FRMD4B (ENSCATG00000041747) LMOD3 (ENSCATG00000014427) ARL6IP5 (ENSCATG00000029543) ENSCATG00000029114 UBA3 (ENSCATG00000043878) #22 TMF1 (ENSCATG00000042507) EOGT (ENSCATG00000042477) ENSCATG00000041655 TAFA4 (ENSCATG00000041495) TAFA1 (ENSCATG00000043084) ENSCATG00000041909 ENSCATG00000015873 KBTBD8 (ENSCATG00000044556) LRIG1 (ENSCATG00000034849) SLC25A26 (ENSCATG00000041774) ENSCATG00000043667 MAGI1 (ENSCATG00000029406) ADAMTS9 (ENSCATG00000036951) PRICKLE2 (ENSCATG00000030722) PSMD6 (ENSCATG00000030183) Drill MODERN SPECIES 264 GXYLT2 (ENSMLEG00000000099) SHQ1 (ENSMLEG00000038493) RYBP (ENSMLEG00000038150) ENSMLEG00000037986 PROK2 (ENSMLEG00000030120) ENSMLEG00000010756 ENSMLEG00000038551 FOXP1 (ENSMLEG00000037250) MDFIC2 (ENSMLEG00000007420) ENSMLEG00000034644 MITF (ENSMLEG00000039415) FRMD4B (ENSMLEG00000034545) LMOD3 (ENSMLEG00000008625) ARL6IP5 (ENSMLEG00000032302) ENSMLEG00000035493 UBA3 (ENSMLEG00000043478) #22 TMF1 (ENSMLEG00000035288) EOGT (ENSMLEG00000026880) TAFA4 (ENSMLEG00000035873) TAFA1 (ENSMLEG00000028061) Vervet Monkey MODERN SPECIES 14 PDZRN3 (ENSCSAG00000011455) PPP4R2 (ENSCSAG00000011489) GXYLT2 (ENSCSAG00000011498) SHQ1 (ENSCSAG00000011514) RYBP (ENSCSAG00000011518) GPR27 (ENSCSAG00000018804) ENSCSAG00000011556 FOXP1 (ENSCSAG00000011581) ENSCSAG00000018802 MITF (ENSCSAG00000011595) ENSCSAG00000011601 ENSCSAG00000018800 FRMD4B (ENSCSAG00000011618) LMOD3 (ENSCSAG00000011626) ARL6IP5 (ENSCSAG00000011634) UBA3 (ENSCSAG00000011650) #22 TMF1 (ENSCSAG00000011667) EOGT (ENSCSAG00000011678) TAFA4 (ENSCSAG00000011689) ENSCSAG00000011694 SUCLG2 (ENSCSAG00000011704) KBTBD8 (ENSCSAG00000011713) LRIG1 (ENSCSAG00000011724) SLC25A26 (ENSCSAG00000011735) ENSCSAG00000011762 MAGI1 (ENSCSAG00000011889) ADAMTS9 (ENSCSAG00000011951) PRICKLE2 (ENSCSAG00000011960) PSMD6 (ENSCSAG00000011965) ATXN7 (ENSCSAG00000011977) THOC7 (ENSCSAG00000011986) Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00490000044176 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000153510.a.f ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831.c #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00910000146882 ENSGT00940000153783.b.b.c.a.a.b ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00490000044176 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000153510.a.f ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831.c #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00910000146882 ENSGT00940000153783.b.b.c.a.a.b ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Marmoset MODERN SPECIES 6 SHQ1 (ENSCJAG00000015131) RYBP (ENSCJAG00000053393) ENSCJAG00000083199 ENSCJAG00000079742 ENSCJAG00000074041 PROK2 (ENSCJAG00000080226) GPR27 (ENSCJAG00000040260) ENSCJAG00000044237 FOXP1 (ENSCJAG00000013138) ENSCJAG00000072251 MDFIC2 (ENSCJAG00000064939) MITF (ENSCJAG00000013260) FRMD4B (ENSCJAG00000013312) LMOD3 (ENSCJAG00000013357) ARL6IP5 (ENSCJAG00000044302) UBA3 (ENSCJAG00000013395) #22 TMF1 (ENSCJAG00000013491) EOGT (ENSCJAG00000013564) ENSCJAG00000080341 ENSCJAG00000083460 ENSCJAG00000077127 TAFA4 (ENSCJAG00000057637) ENSCJAG00000051437 ENSCJAG00000013607 SUCLG2 (ENSCJAG00000013610) ENSCJAG00000071204 KBTBD8 (ENSCJAG00000044815) ENSCJAG00000073045 ENSCJAG00000070503 LRIG1 (ENSCJAG00000013635) ENSCJAG00000052459 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00490000044176 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000153510.a.f ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831.c #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00910000146882 ENSGT00940000153783.b.b.c.a.a.b ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 156 PDZRN3 (ENSSBOG00000029197) PPP4R2 (ENSSBOG00000018839) ENSSBOG00000030623 GXYLT2 (ENSSBOG00000021809) ENSSBOG00000030665 SHQ1 (ENSSBOG00000021038) RYBP (ENSSBOG00000024112) PROK2 (ENSSBOG00000029837) EIF4E3 (ENSSBOG00000020647) FOXP1 (ENSSBOG00000027035) MDFIC2 (ENSSBOG00000022036) MITF (ENSSBOG00000023784) FRMD4B (ENSSBOG00000029694) LMOD3 (ENSSBOG00000031092) ARL6IP5 (ENSSBOG00000033916) ENSSBOG00000028598 #22 TMF1 (ENSSBOG00000024217) ENSSBOG00000036317 EOGT (ENSSBOG00000025714) TAFA4 (ENSSBOG00000027474) ENSSBOG00000027899 Capuchin MODERN SPECIES 147 GLYATL3 (ENSCCAG00000030719) CENPQ (ENSCCAG00000001112) ENSCCAG00000026912 FOXP1 (ENSCCAG00000032400) MDFIC2 (ENSCCAG00000000010) MITF (ENSCCAG00000030554) ENSCCAG00000026482 FRMD4B (ENSCCAG00000033149) LMOD3 (ENSCCAG00000027483) ARL6IP5 (ENSCCAG00000022257) ENSCCAG00000023356 #22 ENSCCAG00000003895 TMF1 (ENSCCAG00000002333) ENSCCAG00000037451 EOGT (ENSCCAG00000025152) TAFA4 (ENSCCAG00000024091) TAFA1 (ENSCCAG00000026684) SUCLG2 (ENSCCAG00000028963) KBTBD8 (ENSCCAG00000006761) LRIG1 (ENSCCAG00000033301) ENSCCAG00000023140 Mas night monkey MODERN SPECIES 1103 GXYLT2 (ENSANAG00000029166) ENSANAG00000033608 ENSANAG00000029241 RYBP (ENSANAG00000027832) PROK2 (ENSANAG00000025790) GPR27 (ENSANAG00000015856) EIF4E3 (ENSANAG00000031727) FOXP1 (ENSANAG00000028269) ENSANAG00000017661 ENSANAG00000020794 MDFIC2 (ENSANAG00000031584) MITF (ENSANAG00000033269) FRMD4B (ENSANAG00000034952) LMOD3 (ENSANAG00000020335) ARL6IP5 (ENSANAG00000021456) ENSANAG00000035877 #22 TMF1 (ENSANAG00000037546) EOGT (ENSANAG00000030876) TAFA4 (ENSANAG00000020763) TAFA1 (ENSANAG00000028819) SUCLG2 (ENSANAG00000033664) KBTBD8 (ENSANAG00000032012) LRIG1 (ENSANAG00000020533) SLC25A26 (ENSANAG00000034578) AMPH (ENSANAG00000023088) ENSANAG00000001067 VPS41 (ENSANAG00000027607) POU6F2 (ENSANAG00000032939) YAE1 (ENSANAG00000037569) ENSANAG00000022924 RALA (ENSANAG00000030583) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01040000240573 ENSGT00510000049102 ENSGT00940000160532 ENSGT00940000153568.B ENSGT00390000011515.d.a ENSGT00940000154817.b.b.b ENSGT00940000159158 ENSGT00390000000854.c.b.k.b.b.b ENSGT00940000159213 ENSGT00940000159862 ENSGT00940000155984 ENSGT00550000074972.f.a ENSGT00940000163000 ENSGT00940000156332 ENSGT00940000157211 ENSGT00550000074831.d #22 ENSGT00390000010354 ENSGT00390000006925 ENSGT00940000160618 ENSGT00390000006225 ENSGT00940000154846.b.k.b.a ENSGT00390000015352 ENSGT00390000008042.A.b ENSGT00940000156913.b ENSGT00950000183074.C ENSGT00940000160811 ENSGT00580000081600.c.b ENSGT00390000011294 ENSGT01010000222287.B.a.b.b ENSGT00680000100037.h ENSGT00940000154657.D Cebidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01040000240573 ENSGT00510000049102 ENSGT00940000160532 ENSGT00940000153568.B ENSGT00390000011515.d.a ENSGT00940000154817.b.b.b ENSGT00940000159158 ENSGT00390000000854.c.b.k.b.b.b ENSGT00940000159213 ENSGT00940000159862 ENSGT00940000155984 ENSGT00550000074972.f.a ENSGT00940000163000 ENSGT00940000156332 ENSGT00940000157211 ENSGT00550000074831.d #22 ENSGT00390000010354 ENSGT00390000006925 ENSGT00940000160618 ENSGT00390000006225 ENSGT00940000154846.b.k.b.a ENSGT00390000015352 ENSGT00390000008042.A.b ENSGT00940000156913.b ENSGT00950000183074.C ENSGT00940000160811 ENSGT00580000081600.c.b ENSGT00390000011294 ENSGT01010000222287.B.a.b.b ENSGT00680000100037.g.a.a.a ENSGT00940000154657.D Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00510000049102 ENSGT00940000160532 ENSGT00910000147318 ENSGT00940000153568.B ENSGT00390000011515.d.a ENSGT00940000154817.b.b.b ENSGT00940000159158 ENSGT00390000000854.c.b.k.b.b.b ENSGT00940000159213 ENSGT00940000159862 ENSGT00940000155984.a ENSGT00550000074972.f.a ENSGT00940000163000 ENSGT00940000156332 ENSGT00940000157211 ENSGT00550000074831.d #22 ENSGT00390000010354 ENSGT00390000006925 ENSGT00940000160618 ENSGT00390000006225 ENSGT00940000154846.b.k.b.a ENSGT00390000015352 ENSGT00390000008042.A.b ENSGT00940000156913.b ENSGT00950000183074.C ENSGT00940000160811 ENSGT00580000081600.c.b ENSGT00390000011294 ENSGT01010000222287.B.a.b.b ENSGT00680000100037.h ENSGT00940000154657.D Capuchin MODERN SPECIES 264 INHBB (ENSCCAG00000020837) ENSCCAG00000030578 ENSCCAG00000033995 ENSCCAG00000032365 EPB41L5 (ENSCCAG00000035288) PTPN4 (ENSCCAG00000022945) ENSCCAG00000018864 #22 ENSCCAG00000027740 CFAP221 (ENSCCAG00000030888) SCTR (ENSCCAG00000022567) TMEM37 (ENSCCAG00000018260) ENSCCAG00000026944 C2orf76 (ENSCCAG00000027500) STEAP3 (ENSCCAG00000022436) C1QL2 (ENSCCAG00000021464) MARCO (ENSCCAG00000022782) EN1 (ENSCCAG00000025559) ENSCCAG00000029759 CCDC93 (ENSCCAG00000029341) ENSCCAG00000021824 DDX18 (ENSCCAG00000023595) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 87 GYPC (ENSSBOG00000036265) CNTNAP5 (ENSSBOG00000019984) ENSSBOG00000030438 TSN (ENSSBOG00000028579) NIFK (ENSSBOG00000033603) CLASP1 (ENSSBOG00000035562) TFCP2L1 (ENSSBOG00000032812) ENSSBOG00000035033 GLI2 (ENSSBOG00000035626) INHBB (ENSSBOG00000027565) ENSSBOG00000025151 ENSSBOG00000032472 ENSSBOG00000015265 EPB41L5 (ENSSBOG00000032246) PTPN4 (ENSSBOG00000026744) ENSSBOG00000027599 #22 ENSSBOG00000022754 CFAP221 (ENSSBOG00000023657) SCTR (ENSSBOG00000006054) TMEM37 (ENSSBOG00000026372) ENSSBOG00000034654 C2orf76 (ENSSBOG00000034915) STEAP3 (ENSSBOG00000030743) C1QL2 (ENSSBOG00000022318) MARCO (ENSSBOG00000021263) ENSSBOG00000023327 INSIG2 (ENSSBOG00000027976) CCDC93 (ENSSBOG00000028952) ENSSBOG00000024815 ENSSBOG00000026304 ENSSBOG00000018990 Mas night monkey MODERN SPECIES 1247 ENSANAG00000035241 ENSANAG00000030445 ENSANAG00000029859 ENSANAG00000013823 ENSANAG00000009837 CLASP1 (ENSANAG00000025292) TFCP2L1 (ENSANAG00000023303) ENSANAG00000034754 GLI2 (ENSANAG00000034664) INHBB (ENSANAG00000029843) RALB (ENSANAG00000038113) ENSANAG00000028366 ENSANAG00000021804 EPB41L5 (ENSANAG00000021697) PTPN4 (ENSANAG00000038024) ENSANAG00000021459 #22 ENSANAG00000037319 CFAP221 (ENSANAG00000030979) SCTR (ENSANAG00000028043) TMEM37 (ENSANAG00000034529) ENSANAG00000038433 C2orf76 (ENSANAG00000021190) STEAP3 (ENSANAG00000008427) C1QL2 (ENSANAG00000030662) MARCO (ENSANAG00000036056) EN1 (ENSANAG00000035250) INSIG2 (ENSANAG00000021170) ENSANAG00000036273 CCDC93 (ENSANAG00000024755) ENSANAG00000028399 ENSANAG00000037489 Tarsier MODERN SPECIES 5661 FRMD4B (ENSTSYG00000013290) LMOD3 (ENSTSYG00000011117) ARL6IP5 (ENSTSYG00000033509) UBA3 (ENSTSYG00000011113) #22 ENSTSYG00000028474 TMF1 (ENSTSYG00000011111) EOGT (ENSTSYG00000008067) FAM19A4 (ENSTSYG00000001226) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 73 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur MODERN SPECIES 21 HSD17B11 (ENSMICG00000001078) HSD17B13 (ENSMICG00000008918) KLHL8 (ENSMICG00000006479) ENSMICG00000033298 ENSMICG00000038573 ENSMICG00000041648 TRIM7 (ENSMICG00000028707) ENSMICG00000032858 RACK1 (ENSMICG00000014201) TRIM52 (ENSMICG00000043353) ZNF354B (ENSMICG00000035274) PROP1 (ENSMICG00000027568) FRMD4B (ENSMICG00000045910) ENSMICG00000046450 ENSMICG00000042511 ENSMICG00000003407 #22 TMF1 (ENSMICG00000035913) EOGT (ENSMICG00000047274) TAFA4 (ENSMICG00000042440) ENSMICG00000047779 ENSMICG00000005904 NKX6-1 (ENSMICG00000042480) ENSMICG00000000970 ENSMICG00000047148 WDFY3 (ENSMICG00000004962) ARHGAP24 (ENSMICG00000028999) MAPK10 (ENSMICG00000014359) ENSMICG00000043784 Mouse lemur MODERN SPECIES 30 MSTN (ENSMICG00000043371) PMS1 (ENSMICG00000000830) ORMDL1 (ENSMICG00000031731) ENSMICG00000028485 ANKAR (ENSMICG00000000818) ASNSD1 (ENSMICG00000000812) SLC40A1 (ENSMICG00000000807) WDR75 (ENSMICG00000000797) COL5A2 (ENSMICG00000014230) COL3A1 (ENSMICG00000014169) GULP1 (ENSMICG00000016453) TFPI (ENSMICG00000031560) CALCRL (ENSMICG00000001266) ZSWIM2 (ENSMICG00000030781) FAM171B (ENSMICG00000045239) ENSMICG00000048105 #22 ITGAV (ENSMICG00000014269) ENSMICG00000031850 ZC3H15 (ENSMICG00000014245) FSIP2 (ENSMICG00000045896) ZNF804A (ENSMICG00000031657) NUP35 (ENSMICG00000006790) DUSP19 (ENSMICG00000006787) NCKAP1 (ENSMICG00000000966) FRZB (ENSMICG00000046694) ENSMICG00000006441 ENSMICG00000038154 PDE1A (ENSMICG00000001911) PPP1R1C (ENSMICG00000034129) ITPRID2 (ENSMICG00000012667) NEUROD1 (ENSMICG00000042141) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 211 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 640 MITF (ENSPCOG00000026384) FRMD4B (ENSPCOG00000025968) LMOD3 (ENSPCOG00000019527) ENSPCOG00000020725 UBA3 (ENSPCOG00000014784) #22 TMF1 (ENSPCOG00000018034) EOGT (ENSPCOG00000013655) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 657 RYBP (ENSPSMG00000016629) PROK2 (ENSPSMG00000016641) GPR27 (ENSPSMG00000016654) EIF4E3 (ENSPSMG00000016679) FOXP1 (ENSPSMG00000016990) MDFIC2 (ENSPSMG00000017390) MITF (ENSPSMG00000017533) FRMD4B (ENSPSMG00000017680) LMOD3 (ENSPSMG00000017702) ENSPSMG00000017713 UBA3 (ENSPSMG00000017781) #22 TMF1 (ENSPSMG00000017887) EOGT (ENSPSMG00000017952) TAFA4 (ENSPSMG00000017971) Bushbaby MODERN SPECIES 130 PPP4R2 (ENSOGAG00000011001) GXYLT2 (ENSOGAG00000006647) SHQ1 (ENSOGAG00000003898) ENSOGAG00000030955 ENSOGAG00000033425 PROK2 (ENSOGAG00000014593) GPR27 (ENSOGAG00000032511) EIF4E3 (ENSOGAG00000014590) ENSOGAG00000027936 FOXP1 (ENSOGAG00000008367) MDFIC2 (ENSOGAG00000030030) MITF (ENSOGAG00000000043) FRMD4B (ENSOGAG00000002705) LMOD3 (ENSOGAG00000002704) ARL6IP5 (ENSOGAG00000007773) UBA3 (ENSOGAG00000007771) #22 TMF1 (ENSOGAG00000007764) EOGT (ENSOGAG00000012093) TAFA4 (ENSOGAG00000012090) ENSOGAG00000028255 ENSOGAG00000006190 KBTBD8 (ENSOGAG00000024533) ENSOGAG00000024724 ENSOGAG00000006131 LRIG1 (ENSOGAG00000002220) ENSOGAG00000007944 SLC25A26 (ENSOGAG00000002219) ENSOGAG00000033711 MAGI1 (ENSOGAG00000000286) ADAMTS9 (ENSOGAG00000015548) PRICKLE2 (ENSOGAG00000009507) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 Tree shrew MODERN SPECIES 3082 LMOD3 (ENSTBEG00000001836) ARL6IP5 (ENSTBEG00000001491) UBA3 (ENSTBEG00000009581) #22 TMF1 (ENSTBEG00000008963) EOGT (ENSTBEG00000008388) TAFA4 (ENSTBEG00000007797) Glires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162859 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a Muroidea ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00440000035348.l ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00440000035348.l ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00440000035348.l ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 Prairie vole MODERN SPECIES 84 ENSMOCG00000009808 Pdzrn3 (ENSMOCG00000015544) ENSMOCG00000000955 Gxylt2 (ENSMOCG00000001994) Shq1 (ENSMOCG00000017836) ENSMOCG00000006102 Prok2 (ENSMOCG00000016202) Gpr27 (ENSMOCG00000010723) Eif4e3 (ENSMOCG00000020297) Foxp1 (ENSMOCG00000013376) Mdfic2 (ENSMOCG00000007282) Mitf (ENSMOCG00000021092) Frmd4b (ENSMOCG00000016753) Lmod3 (ENSMOCG00000013878) Arl6ip5 (ENSMOCG00000012711) Uba3 (ENSMOCG00000022540) #22 Tmf1 (ENSMOCG00000021252) Eogt (ENSMOCG00000010159) Tafa4 (ENSMOCG00000019487) Tafa1 (ENSMOCG00000005890) Suclg2 (ENSMOCG00000019822) ENSMOCG00000017135 Kbtbd8 (ENSMOCG00000014034) Lrig1 (ENSMOCG00000016641) Slc25a26 (ENSMOCG00000012219) Magi1 (ENSMOCG00000021420) Adamts9 (ENSMOCG00000020918) Prickle2 (ENSMOCG00000009205) Trh (ENSMOCG00000020778) ENSMOCG00000020109 Mrps25 (ENSMOCG00000000775) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 16 Gxylt2 (ENSPEMG00000005596) Shq1 (ENSPEMG00000000251) ENSPEMG00000017621 ENSPEMG00000028366 Prok2 (ENSPEMG00000030947) ENSPEMG00000026210 Gpr27 (ENSPEMG00000030430) Eif4e3 (ENSPEMG00000015380) Foxp1 (ENSPEMG00000010742) ENSPEMG00000026818 Mdfic2 (ENSPEMG00000002945) Mitf (ENSPEMG00000002848) Frmd4b (ENSPEMG00000018860) Lmod3 (ENSPEMG00000016784) Arl6ip5 (ENSPEMG00000016527) Uba3 (ENSPEMG00000014697) #22 Tmf1 (ENSPEMG00000012807) Eogt (ENSPEMG00000010950) Tafa4 (ENSPEMG00000009755) Nup50l (ENSPEMG00000030682) Tafa1 (ENSPEMG00000004313) Suclg2 (ENSPEMG00000017086) ENSPEMG00000030152 ENSPEMG00000007390 Lrig1 (ENSPEMG00000013717) Slc25a26 (ENSPEMG00000016974) ENSPEMG00000029600 Magi1 (ENSPEMG00000018842) Adamts9 (ENSPEMG00000001414) Prickle2 (ENSPEMG00000008467) Trh (ENSPEMG00000027938) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 Golden Hamster MODERN SPECIES 643 Pdzrn3 (ENSMAUG00000007003) Ppp4r2 (ENSMAUG00000010766) Gxylt2 (ENSMAUG00000021811) Shq1 (ENSMAUG00000022030) ENSMAUG00000010991 Rybp (ENSMAUG00000010834) Prok2 (ENSMAUG00000007849) Gpr27 (ENSMAUG00000010831) Eif4e3 (ENSMAUG00000019824) Foxp1 (ENSMAUG00000022171) Mdfic2 (ENSMAUG00000012915) Mitf (ENSMAUG00000004545) Frmd4b (ENSMAUG00000007225) Lmod3 (ENSMAUG00000010204) Arl6ip5 (ENSMAUG00000009657) Uba3 (ENSMAUG00000017525) #22 Tmf1 (ENSMAUG00000021427) Eogt (ENSMAUG00000017534) ENSMAUG00000020979 Tafa4 (ENSMAUG00000019968) Tafa1 (ENSMAUG00000019067) Suclg2 (ENSMAUG00000021321) ENSMAUG00000009672 Kbtbd8 (ENSMAUG00000017081) Lrig1 (ENSMAUG00000007470) Slc25a26 (ENSMAUG00000021604) ENSMAUG00000004998 Magi1 (ENSMAUG00000021226) ENSMAUG00000010107 Adamts9 (ENSMAUG00000021440) Prickle2 (ENSMAUG00000013569) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 144 Pdzrn3 (ENSCGRG00001017365) Ppp4r2 (ENSCGRG00001010724) Gxylt2 (ENSCGRG00001012822) Shq1 (ENSCGRG00001012583) Rybp (ENSCGRG00001020152) ENSCGRG00001005960 Prok2 (ENSCGRG00001020805) Gpr27 (ENSCGRG00001001036) Eif4e3 (ENSCGRG00001016500) Foxp1 (ENSCGRG00001015802) Mdfic2 (ENSCGRG00001018361) Mitf (ENSCGRG00001011883) Frmd4b (ENSCGRG00001020840) Lmod3 (ENSCGRG00001010389) Arl6ip5 (ENSCGRG00001018813) Uba3 (ENSCGRG00001022490) #22 Tmf1 (ENSCGRG00001018858) Eogt (ENSCGRG00001015087) Tafa4 (ENSCGRG00001013503) ENSCGRG00001008617 Nup50l (ENSCGRG00001006226) Tafa1 (ENSCGRG00001014933) Suclg2 (ENSCGRG00001011522) ENSCGRG00001004433 Kbtbd8 (ENSCGRG00001004948) Lrig1 (ENSCGRG00001020436) Slc25a26 (ENSCGRG00001000286) Magi1 (ENSCGRG00001004939) Adamts9 (ENSCGRG00001014518) Prickle2 (ENSCGRG00001005583) Trh (ENSCGRG00001019768) Murinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00440000035348.l ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 14 Gxylt2 (ENSRNOG00000005621) Actg1-ps9 (ENSRNOG00000062691) Shq1 (ENSRNOG00000005433) LOC120102351 (ENSRNOG00000005353) LOC120102174 (ENSRNOG00000033673) Prok2 (ENSRNOG00000010898) Ier3ip1-ps1 (ENSRNOG00000030004) Gpr27 (ENSRNOG00000010880) Eif4e3 (ENSRNOG00000010301) Foxp1 (ENSRNOG00000009184) Mdfic2 (ENSRNOG00000064294) Mitf (ENSRNOG00000008658) Frmd4b (ENSRNOG00000007764) Lmod3 (ENSRNOG00000032443) Arl6ip5 (ENSRNOG00000006818) Uba3 (ENSRNOG00000006221) #22 Tmf1 (ENSRNOG00000056462) Eogt (ENSRNOG00000024533) Tafa4 (ENSRNOG00000005830) Nup50-ps1 (ENSRNOG00000024560) LOC108353456 (ENSRNOG00000070575) Suclg2 (ENSRNOG00000005686) Kbtbd8 (ENSRNOG00000013390) AABR07031972.1 (ENSRNOG00000046899) LOC687056 (ENSRNOG00000065327) Lrig1 (ENSRNOG00000012952) Slc25a26 (ENSRNOG00000012831) ENSRNOG00000071067 LOC100361920 (ENSRNOG00000052174) Magi1 (ENSRNOG00000022060) ENSRNOG00000064824 Rat MODERN SPECIES 3 Cers4 (ENSRNOG00000001072) Dppa1-ps1 (ENSRNOG00000028544) Higd2al1 (ENSRNOG00000001071) Ccl25 (ENSRNOG00000028531) Elavl1 (ENSRNOG00000001069) Timm44 (ENSRNOG00000001058) Snapc2 (ENSRNOG00000001056) Tgfbr3l (ENSRNOG00000050573) Map2k7 (ENSRNOG00000001047) Lrrc8e (ENSRNOG00000028460) Prr36 (ENSRNOG00000028892) Evi5l (ENSRNOG00000001034) Cd209f (ENSRNOG00000042317) LOC100363064 (ENSRNOG00000001027) RGD1564571 (ENSRNOG00000066613) Uba3-ps2 (ENSRNOG00000054096) #22 LOC102554944 (ENSRNOG00000065641) ENSRNOG00000069757 LOC688858 (ENSRNOG00000062811) ENSRNOG00000066133 LOC100363914 (ENSRNOG00000069254) Cd209c (ENSRNOG00000042807) Clec4m (ENSRNOG00000029881) Cd209d (ENSRNOG00000001017) Cd209e (ENSRNOG00000028803) Cd209a (ENSRNOG00000040128) Clec4g (ENSRNOG00000054013) Fcer2 (ENSRNOG00000001005) Trappc5 (ENSRNOG00000001003) Mcemp1 (ENSRNOG00000028259) Retn (ENSRNOG00000001001) Mus ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00440000035348.l ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a.e ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00440000035348.l ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a.e ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00440000035348.l ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00390000016951 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 Mus_C ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a.e ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00440000035348.l ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00860000136051 ENSGT00860000136292 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00390000016951 Steppe mouse MODERN SPECIES 3014 ENSMSIG00000031617 Uba3 (ENSMSIG00000031611) #22 Tmf1 (ENSMSIG00000031609) Eogt (ENSMSIG00000031608) Tafa4 (ENSMSIG00000031606) Nup50l (ENSMSIG00000031603) Tafa1 (ENSMSIG00000031602) Suclg2 (ENSMSIG00000031599) spretus MODERN SPECIES 15 Pdzrn3 (MGP_SPRETEiJ_G0029720) Ppp4r2 (MGP_SPRETEiJ_G0029719) Gxylt2 (MGP_SPRETEiJ_G0029718) Shq1 (MGP_SPRETEiJ_G0029717) Rybp (MGP_SPRETEiJ_G0029716) Prok2 (MGP_SPRETEiJ_G0029715) Gpr27 (MGP_SPRETEiJ_G0029714) Eif4e3 (MGP_SPRETEiJ_G0029713) MGP_SPRETEiJ_G0029712 Foxp1 (MGP_SPRETEiJ_G0029711) Mdfic2 (MGP_SPRETEiJ_G0029710) Mitf (MGP_SPRETEiJ_G0029709) Frmd4b (MGP_SPRETEiJ_G0029708) Lmod3 (MGP_SPRETEiJ_G0029707) Arl6ip5 (MGP_SPRETEiJ_G0029706) Uba3 (MGP_SPRETEiJ_G0029705) #22 Tmf1 (MGP_SPRETEiJ_G0029704) Eogt (MGP_SPRETEiJ_G0029703) Tafa4 (MGP_SPRETEiJ_G0029702) Nup50l (MGP_SPRETEiJ_G0029701) Tafa1 (MGP_SPRETEiJ_G0029700) Suclg2 (MGP_SPRETEiJ_G0029699) Kbtbd8 (MGP_SPRETEiJ_G0029698) Lrig1 (MGP_SPRETEiJ_G0029697) Slc25a26 (MGP_SPRETEiJ_G0029696) Magi1 (MGP_SPRETEiJ_G0029695) MGP_SPRETEiJ_G0029694 MGP_SPRETEiJ_G0029693 Adamts9 (MGP_SPRETEiJ_G0029692) Prickle2 (MGP_SPRETEiJ_G0029691) Trh (MGP_SPRETEiJ_G0029690) Mouse MODERN SPECIES 15 Cntn3 (ENSMUSG00000030075) Pdzrn3 (ENSMUSG00000035357) Ppp4r2 (ENSMUSG00000052144) Gxylt2 (ENSMUSG00000030074) Shq1 (ENSMUSG00000035378) Rybp (ENSMUSG00000072872) Prok2 (ENSMUSG00000030069) Gpr27 (ENSMUSG00000072875) Eif4e3 (ENSMUSG00000093661) Foxp1 (ENSMUSG00000030067) Mdfic2 (ENSMUSG00000090667) Mitf (ENSMUSG00000035158) Frmd4b (ENSMUSG00000030064) Lmod3 (ENSMUSG00000044086) Arl6ip5 (ENSMUSG00000035199) Uba3 (ENSMUSG00000030061) #22 Tmf1 (ENSMUSG00000030059) Eogt (ENSMUSG00000035245) Tafa4 (ENSMUSG00000046500) Nup50l (ENSMUSG00000072878) Tafa1 (ENSMUSG00000059187) Suclg2 (ENSMUSG00000061838) Kbtbd8 (ENSMUSG00000030031) Lrig1 (ENSMUSG00000030029) Slc25a26 (ENSMUSG00000045100) Magi1 (ENSMUSG00000045095) Adamts9 (ENSMUSG00000030022) Prickle2 (ENSMUSG00000030020) Trh (ENSMUSG00000005892) Rbsn (ENSMUSG00000014550) Mrps25 (ENSMUSG00000014551) Shrew mouse MODERN SPECIES 11 Pdzrn3 (MGP_PahariEiJ_G0022443) Ppp4r2 (MGP_PahariEiJ_G0022442) Gxylt2 (MGP_PahariEiJ_G0022441) Shq1 (MGP_PahariEiJ_G0022440) Rybp (MGP_PahariEiJ_G0022439) Prok2 (MGP_PahariEiJ_G0022438) Gpr27 (MGP_PahariEiJ_G0022437) Eif4e3 (MGP_PahariEiJ_G0022436) MGP_PahariEiJ_G0022435 Foxp1 (MGP_PahariEiJ_G0022434) Mdfic2 (MGP_PahariEiJ_G0022433) Mitf (MGP_PahariEiJ_G0022432) Frmd4b (MGP_PahariEiJ_G0022431) Lmod3 (MGP_PahariEiJ_G0022430) Arl6ip5 (MGP_PahariEiJ_G0022429) Uba3 (MGP_PahariEiJ_G0022428) #22 Tmf1 (MGP_PahariEiJ_G0022427) Eogt (MGP_PahariEiJ_G0022426) Tafa4 (MGP_PahariEiJ_G0022425) Nup50l (MGP_PahariEiJ_G0022424) Tafa1 (MGP_PahariEiJ_G0022423) Suclg2 (MGP_PahariEiJ_G0022422) Kbtbd8 (MGP_PahariEiJ_G0022421) Lrig1 (MGP_PahariEiJ_G0022420) Slc25a26 (MGP_PahariEiJ_G0022419) Magi1 (MGP_PahariEiJ_G0022418) MGP_PahariEiJ_G0022417 MGP_PahariEiJ_G0022416 MGP_PahariEiJ_G0022415 MGP_PahariEiJ_G0022414 Adamts9 (MGP_PahariEiJ_G0022413) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 545 Mdfic2 (ENSNGAG00000003023) Mitf (ENSNGAG00000014658) Frmd4b (ENSNGAG00000014412) Lmod3 (ENSNGAG00000012605) Arl6ip5 (ENSNGAG00000011599) Uba3 (ENSNGAG00000023328) #22 Tmf1 (ENSNGAG00000022497) Eogt (ENSNGAG00000015400) Tafa4 (ENSNGAG00000020616) Tafa1 (ENSNGAG00000017655) Suclg2 (ENSNGAG00000014569) Kbtbd8 (ENSNGAG00000023811) ENSNGAG00000017225 Lrig1 (ENSNGAG00000012917) Slc25a26 (ENSNGAG00000005590) Magi1 (ENSNGAG00000015704) ENSNGAG00000024077 Adamts9 (ENSNGAG00000023263) Prickle2 (ENSNGAG00000020977) ENSNGAG00000014932 ENSNGAG00000022803 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 166 ENSJJAG00000008056 Cfap20dc (ENSJJAG00000004346) Fam3d (ENSJJAG00000001255) Fam107a (ENSJJAG00000000596) Acox2 (ENSJJAG00000024029) Kctd6 (ENSJJAG00000023801) Lmod3 (ENSJJAG00000023783) ENSJJAG00000023684 Uba3 (ENSJJAG00000004056) #22 ENSJJAG00000000648 Tmf1 (ENSJJAG00000021404) Eogt (ENSJJAG00000020125) Tafa4 (ENSJJAG00000023530) Tafa1 (ENSJJAG00000023297) Suclg2 (ENSJJAG00000023096) Kbtbd8 (ENSJJAG00000022687) Lrig1 (ENSJJAG00000021266) Slc25a26 (ENSJJAG00000019520) Magi1 (ENSJJAG00000013586) ENSJJAG00000011743 Adamts9 (ENSJJAG00000010155) Prickle2 (ENSJJAG00000004314) Flnb (ENSJJAG00000019304) ENSJJAG00000018689 Kangaroo rat MODERN SPECIES 331 Chl1 (ENSDORG00000010546) Cntn3 (ENSDORG00000000121) Pdzrn3 (ENSDORG00000002686) ENSDORG00000023761 Gxylt2 (ENSDORG00000010918) ENSDORG00000029850 Rybp (ENSDORG00000015021) Prok2 (ENSDORG00000006150) Eif4e3 (ENSDORG00000006531) Foxp1 (ENSDORG00000009604) Mdfic2 (ENSDORG00000029192) Mitf (ENSDORG00000003336) Frmd4b (ENSDORG00000002184) Lmod3 (ENSDORG00000000518) Arl6ip5 (ENSDORG00000029346) Uba3 (ENSDORG00000000516) #22 Tmf1 (ENSDORG00000000515) Eogt (ENSDORG00000000514) Tafa4 (ENSDORG00000028398) Tafa1 (ENSDORG00000008222) Suclg2 (ENSDORG00000016563) Kbtbd8 (ENSDORG00000000438) Lrig1 (ENSDORG00000003508) Slc25a26 (ENSDORG00000003507) Magi1 (ENSDORG00000012586) Adamts9 (ENSDORG00000001254) Prickle2 (ENSDORG00000005850) Psmd6 (ENSDORG00000007608) Atxn7 (ENSDORG00000007600) ENSDORG00000028787 Cdhr18 (ENSDORG00000027325) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000158653 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000162607 ENSGT00940000159882 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000156326 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000159892 ENSGT00940000155865 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000162026 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000158653 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000162607 ENSGT00940000159882 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000156326 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000159892 ENSGT00940000155865 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000162026 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 Alpin marmot MODERN SPECIES 40 ENSMMMG00000004766 KBTBD8 (ENSMMMG00000004770) SUCLG2 (ENSMMMG00000004779) TAFA1 (ENSMMMG00000004799) ENSMMMG00000004803 FRMD4B (ENSMMMG00000004812) LMOD3 (ENSMMMG00000004950) ARL6IP5 (ENSMMMG00000004969) UBA3 (ENSMMMG00000004980) #22 TMF1 (ENSMMMG00000005057) EOGT (ENSMMMG00000006008) MITF (ENSMMMG00000006045) MDFIC2 (ENSMMMG00000006133) FOXP1 (ENSMMMG00000006149) ENSMMMG00000006861 PROK2 (ENSMMMG00000006869) RYBP (ENSMMMG00000006873) SHQ1 (ENSMMMG00000006887) GXYLT2 (ENSMMMG00000006933) ENSMMMG00000006977 PDZRN3 (ENSMMMG00000006989) CNTN3 (ENSMMMG00000007027) CHL1 (ENSMMMG00000007097) CNTN6 (ENSMMMG00000007205) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 188 ENSGT00940000158653 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000162607 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000156326 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000159892 ENSGT00940000155865 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000162026 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 Squirrel MODERN SPECIES 203 KBTBD8 (ENSSTOG00000020443) SUCLG2 (ENSSTOG00000020195) TAFA1 (ENSSTOG00000014757) FRMD4B (ENSSTOG00000028861) LMOD3 (ENSSTOG00000026793) ARL6IP5 (ENSSTOG00000025065) UBA3 (ENSSTOG00000003215) #22 TMF1 (ENSSTOG00000028312) EOGT (ENSSTOG00000003163) MITF (ENSSTOG00000005880) MDFIC2 (ENSSTOG00000021337) FOXP1 (ENSSTOG00000025624) EIF4E3 (ENSSTOG00000020469) PROK2 (ENSSTOG00000000976) RYBP (ENSSTOG00000000185) SHQ1 (ENSSTOG00000010043) GXYLT2 (ENSSTOG00000010059) PPP4R2 (ENSSTOG00000024451) PDZRN3 (ENSSTOG00000020243) CNTN3 (ENSSTOG00000010775) Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 106 SUCLG2 (ENSUPAG00010021955) TAFA1 (ENSUPAG00010021952) FRMD4B (ENSUPAG00010021932) LMOD3 (ENSUPAG00010021929) ARL6IP5 (ENSUPAG00010021927) UBA3 (ENSUPAG00010021916) #22 TMF1 (ENSUPAG00010021909) EOGT (ENSUPAG00010021904) MITF (ENSUPAG00010021833) MDFIC2 (ENSUPAG00010021824) FOXP1 (ENSUPAG00010021603) EIF4E3 (ENSUPAG00010021594) GPR27 (ENSUPAG00010021592) PROK2 (ENSUPAG00010021589) RYBP (ENSUPAG00010021587) SHQ1 (ENSUPAG00010021581) GXYLT2 (ENSUPAG00010021574) PPP4R2 (ENSUPAG00010021567) PDZRN3 (ENSUPAG00010021559) CNTN3 (ENSUPAG00010021535) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 10 ENSSVLG00005013731 ENSSVLG00005013708 ENSSVLG00005013669 ENSSVLG00005013626 ENSSVLG00005013547 ENSSVLG00005013464 ENSSVLG00005013369 ENSSVLG00005013309 ENSSVLG00005013244 SUCLG2 (ENSSVLG00005013123) ENSSVLG00005013072 TAFA1 (ENSSVLG00005013002) FRMD4B (ENSSVLG00005012609) LMOD3 (ENSSVLG00005012544) ARL6IP5 (ENSSVLG00005012505) UBA3 (ENSSVLG00005012414) #22 TMF1 (ENSSVLG00005012312) EOGT (ENSSVLG00005012215) MITF (ENSSVLG00005011612) MDFIC2 (ENSSVLG00005011514) FOXP1 (ENSSVLG00005010914) EIF4E3 (ENSSVLG00005010716) GPR27 (ENSSVLG00005010691) PROK2 (ENSSVLG00005010626) RYBP (ENSSVLG00005010589) SHQ1 (ENSSVLG00005010502) GXYLT2 (ENSSVLG00005010448) ENSSVLG00005010375 PDZRN3 (ENSSVLG00005010337) ENSSVLG00005010270 CNTN3 (ENSSVLG00005025887) Hystricomorpha DUPLICATION Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831.i #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00950000183042.b ENSGT00940000160913 ENSGT00940000156977 ENSGT00940000153110.A ENSGT00940000162216 ENSGT00390000015136 ENSGT00940000161154 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831.i #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00950000183042.b ENSGT00940000160913 ENSGT00940000156977 ENSGT00940000153110.A ENSGT00940000162216 ENSGT00390000015136 ENSGT00940000161154 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831.i #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00950000183042.b ENSGT00940000160913 ENSGT00940000156977 ENSGT00940000153110.A ENSGT00940000162216 ENSGT00390000015136 ENSGT00940000161154 Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 134 MYG1 (ENSODEG00000013685) ENSODEG00000013601 ESPL1 (ENSODEG00000014509) MFSD5 (ENSODEG00000014360) RARG (ENSODEG00000012669) ITGB7 (ENSODEG00000013660) ZNF740 (ENSODEG00000014638) CSAD (ENSODEG00000013041) SOAT2 (ENSODEG00000013152) IGFBP6 (ENSODEG00000013565) SPRYD3 (ENSODEG00000012727) TNS2 (ENSODEG00000014711) ENSODEG00000012941 ENSODEG00000012306 ENSODEG00000013629 ENSODEG00000013770 #22 KRT79 (ENSODEG00000012401) KRT4 (ENSODEG00000012992) KRT76 (ENSODEG00000012091) ENSODEG00000019921 KRT77 (ENSODEG00000011925) KRT1 (ENSODEG00000013558) KRT2 (ENSODEG00000013406) KRT73 (ENSODEG00000012304) ENSODEG00000012664 KRT72 (ENSODEG00000012462) KRT74 (ENSODEG00000012118) KRT71 (ENSODEG00000015167) KRT5 (ENSODEG00000013087) ENSODEG00000011556 ENSODEG00000011282 Degu MODERN SPECIES 100 ENSODEG00000003058 ENSODEG00000018912 NGLY1 (ENSODEG00000003087) OXSM (ENSODEG00000003134) LRRC3B (ENSODEG00000003166) NEK10 (ENSODEG00000003264) SLC4A7 (ENSODEG00000003429) EOMES (ENSODEG00000003480) AZI2 (ENSODEG00000003523) RBMS3 (ENSODEG00000003651) ENSODEG00000003736 TGFBR2 (ENSODEG00000003763) GADL1 (ENSODEG00000003807) STT3B (ENSODEG00000003894) OSBPL10 (ENSODEG00000003996) ENSODEG00000005650 #22 GPD1L (ENSODEG00000005683) ENSODEG00000005693 CMTM7 (ENSODEG00000005718) CMTM6 (ENSODEG00000005737) DYNC1LI1 (ENSODEG00000005766) Degu MODERN SPECIES 166 GRID2 (ENSODEG00000004271) ATOH1 (ENSODEG00000019172) ENSODEG00000004300 ENSODEG00000019018 SMARCAD1 (ENSODEG00000004334) ENSODEG00000004374 ENSODEG00000004665 BMPR1B (ENSODEG00000002331) UNC5C (ENSODEG00000002578) ENSODEG00000002793 ENSODEG00000002841 ENSODEG00000018856 ENSODEG00000002862 #22 RAP1GDS1 (ENSODEG00000002980) ENSODEG00000003118 TSPAN5 (ENSODEG00000001836) ENSODEG00000001896 ENSODEG00000018761 ENSODEG00000001933 ENSODEG00000001981 METAP1 (ENSODEG00000002092) ENSODEG00000002112 Degu MODERN SPECIES 71 ENSODEG00000019359 GXYLT2 (ENSODEG00000008178) SHQ1 (ENSODEG00000009192) RYBP (ENSODEG00000008699) PROK2 (ENSODEG00000007144) GPR27 (ENSODEG00000006497) EIF4E3 (ENSODEG00000006191) FOXP1 (ENSODEG00000007047) MDFIC2 (ENSODEG00000006638) MITF (ENSODEG00000009287) ENSODEG00000006902 FRMD4B (ENSODEG00000005588) LMOD3 (ENSODEG00000005409) ENSODEG00000007217 ARL6IP5 (ENSODEG00000006820) ENSODEG00000007097 #22 TMF1 (ENSODEG00000007699) EOGT (ENSODEG00000006871) TAFA4 (ENSODEG00000005744) ENSODEG00000019215 ENSODEG00000005339 ENSODEG00000019577 TAFA1 (ENSODEG00000006092) ENSODEG00000006681 ENSODEG00000005791 ENSODEG00000005325 KBTBD8 (ENSODEG00000005749) ENSODEG00000005664 LRIG1 (ENSODEG00000005673) SLC25A26 (ENSODEG00000006331) SLC41A3 (ENSODEG00000006800) Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 128 CNTN3 (ENSCLAG00000009614) PDZRN3 (ENSCLAG00000010964) PPP4R2 (ENSCLAG00000003231) GXYLT2 (ENSCLAG00000003908) SHQ1 (ENSCLAG00000004206) RYBP (ENSCLAG00000006008) PROK2 (ENSCLAG00000003618) EIF4E3 (ENSCLAG00000003818) FOXP1 (ENSCLAG00000004963) MDFIC2 (ENSCLAG00000003152) MITF (ENSCLAG00000003365) ENSCLAG00000004383 FRMD4B (ENSCLAG00000003792) LMOD3 (ENSCLAG00000006151) ARL6IP5 (ENSCLAG00000003471) UBA3 (ENSCLAG00000003651) #22 TMF1 (ENSCLAG00000004298) EOGT (ENSCLAG00000004823) TAFA4 (ENSCLAG00000011274) TAFA1 (ENSCLAG00000011025) SUCLG2 (ENSCLAG00000011578) KBTBD8 (ENSCLAG00000013659) LRIG1 (ENSCLAG00000003192) SLC25A26 (ENSCLAG00000003949) SLC41A3 (ENSCLAG00000004678) ALDH1L1 (ENSCLAG00000005505) KLF15 (ENSCLAG00000010869) CFAP100 (ENSCLAG00000015844) ZXDC (ENSCLAG00000007278) UROC1 (ENSCLAG00000003335) CHST13 (ENSCLAG00000005485) Guinea pig MODERN SPECIES 16 CNTN3 (ENSCPOG00000003218) PDZRN3 (ENSCPOG00000030488) PPP4R2 (ENSCPOG00000036245) ENSCPOG00000030150 GXYLT2 (ENSCPOG00000000442) SHQ1 (ENSCPOG00000011443) RYBP (ENSCPOG00000032177) PROK2 (ENSCPOG00000033908) EIF4E3 (ENSCPOG00000000391) FOXP1 (ENSCPOG00000003726) MDFIC2 (ENSCPOG00000036240) MITF (ENSCPOG00000014963) FRMD4B (ENSCPOG00000037444) LMOD3 (ENSCPOG00000013314) ARL6IP5 (ENSCPOG00000033968) UBA3 (ENSCPOG00000030763) #22 TMF1 (ENSCPOG00000013302) EOGT (ENSCPOG00000013299) TAFA4 (ENSCPOG00000013292) TAFA1 (ENSCPOG00000014183) SUCLG2 (ENSCPOG00000013421) KBTBD8 (ENSCPOG00000012739) LRIG1 (ENSCPOG00000002275) SLC25A26 (ENSCPOG00000002272) SLC41A3 (ENSCPOG00000007303) ALDH1L1 (ENSCPOG00000006449) KLF15 (ENSCPOG00000005315) CFAP100 (ENSCPOG00000002149) ZXDC (ENSCPOG00000002150) UROC1 (ENSCPOG00000002151) CHST13 (ENSCPOG00000015174) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 28 PDZRN3 (ENSHGLG00000003072) PPP4R2 (ENSHGLG00000002829) GXYLT2 (ENSHGLG00000002778) SHQ1 (ENSHGLG00000003637) RYBP (ENSHGLG00000040203) PROK2 (ENSHGLG00000046701) GPR27 (ENSHGLG00000002574) EIF4E3 (ENSHGLG00000019560) ENSHGLG00000040329 FOXP1 (ENSHGLG00000002984) MDFIC2 (ENSHGLG00000043866) MITF (ENSHGLG00000002575) FRMD4B (ENSHGLG00000003001) LMOD3 (ENSHGLG00000019110) ARL6IP5 (ENSHGLG00000039284) UBA3 (ENSHGLG00000019309) #22 TMF1 (ENSHGLG00000013960) EOGT (ENSHGLG00000014748) TAFA4 (ENSHGLG00000047561) ENSHGLG00000009657 TAFA1 (ENSHGLG00000007920) SUCLG2 (ENSHGLG00000006925) ENSHGLG00000021116 KBTBD8 (ENSHGLG00000011553) ENSHGLG00000011084 ENSHGLG00000002916 ENSHGLG00000041732 ENSHGLG00000038172 ENSHGLG00000010661 ENSHGLG00000008631 ENSHGLG00000007673 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00550000074831.j #22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00550000074831.j #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00550000074831.j #22 Degu MODERN SPECIES 382 ENSODEG00000002884 ENSODEG00000018883 ENSODEG00000002861 ENSODEG00000002844 ENSODEG00000002831 ENSODEG00000002816 AADACL3 (ENSODEG00000002802) ENSODEG00000002791 ENSODEG00000000869 ENSODEG00000000853 #22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 ENSGT00390000007318 Rabbit MODERN SPECIES 20 PPP4R2 (ENSOCUG00000006235) GXYLT2 (ENSOCUG00000016704) SHQ1 (ENSOCUG00000016695) RYBP (ENSOCUG00000011730) PROK2 (ENSOCUG00000006542) ENSOCUG00000000259 FOXP1 (ENSOCUG00000007155) ENSOCUG00000035312 ENSOCUG00000036468 MDFIC2 (ENSOCUG00000031604) MITF (ENSOCUG00000002190) ENSOCUG00000026608 FRMD4B (ENSOCUG00000002887) LMOD3 (ENSOCUG00000008188) ARL6IP5 (ENSOCUG00000008184) UBA3 (ENSOCUG00000008169) #22 TMF1 (ENSOCUG00000008154) ENSOCUG00000016492 EOGT (ENSOCUG00000012022) ENSOCUG00000031619 ENSOCUG00000038099 TAFA4 (ENSOCUG00000003703) ENSOCUG00000024623 TAFA1 (ENSOCUG00000031560) ENSOCUG00000034053 SUCLG2 (ENSOCUG00000012376) ENSOCUG00000026148 ENSOCUG00000034604 ENSOCUG00000031394 LRIG1 (ENSOCUG00000007510) SLC25A26 (ENSOCUG00000007507) Pika MODERN SPECIES 2753 MITF (ENSOPRG00000014729) FRMD4B (ENSOPRG00000014691) LMOD3 (ENSOPRG00000014678) ARL6IP5 (ENSOPRG00000014669) UBA3 (ENSOPRG00000014649) #22 TMF1 (ENSOPRG00000014625) EOGT (ENSOPRG00000014602) TAFA4 (ENSOPRG00000014591) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000165570 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000165570 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 Tenrec MODERN SPECIES 4028 FRMD4B (ENSETEG00000020157) ARL6IP5 (ENSETEG00000020156) UBA3 (ENSETEG00000020153) #22 TMF1 (ENSETEG00000020151) Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000165570 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 Elephant MODERN SPECIES 49 CNTN3 (ENSLAFG00000008082) ENSLAFG00000031602 ENSLAFG00000026536 PDZRN3 (ENSLAFG00000014734) PPP4R2 (ENSLAFG00000000513) GXYLT2 (ENSLAFG00000017357) ENSLAFG00000017601 RYBP (ENSLAFG00000003133) GPR27 (ENSLAFG00000015911) EIF4E3 (ENSLAFG00000001998) FOXP1 (ENSLAFG00000008006) MITF (ENSLAFG00000023153) FRMD4B (ENSLAFG00000001441) LMOD3 (ENSLAFG00000032473) ARL6IP5 (ENSLAFG00000004092) UBA3 (ENSLAFG00000004088) #22 TMF1 (ENSLAFG00000004084) EOGT (ENSLAFG00000004080) TAFA4 (ENSLAFG00000004079) SUCLG2 (ENSLAFG00000015283) KBTBD8 (ENSLAFG00000002923) ENSLAFG00000013671 SLC25A26 (ENSLAFG00000013666) ENSLAFG00000007076 ENSLAFG00000027480 ENSLAFG00000029554 ENSLAFG00000014523 KCNH2 (ENSLAFG00000003073) NOS3 (ENSLAFG00000007006) ATG9B (ENSLAFG00000026645) ABCB8 (ENSLAFG00000008773) Hyrax MODERN SPECIES 4591 LMOD3 (ENSPCAG00000010688) ARL6IP5 (ENSPCAG00000010652) UBA3 (ENSPCAG00000010541) #22 TMF1 (ENSPCAG00000010391) EOGT (ENSPCAG00000010281) Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 833 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 Armadillo MODERN SPECIES 4569 FRMD4B (ENSDNOG00000017561) LMOD3 (ENSDNOG00000005818) ARL6IP5 (ENSDNOG00000013506) UBA3 (ENSDNOG00000013479) #22 TMF1 (ENSDNOG00000013447) EOGT (ENSDNOG00000013422) ENSDNOG00000043422 TAFA4 (ENSDNOG00000043729) Sloth MODERN SPECIES 3678 LMOD3 (ENSCHOG00000013642) ARL6IP5 (ENSCHOG00000013636) UBA3 (ENSCHOG00000013626) #22 TMF1 (ENSCHOG00000013604) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873.c ENSGT00390000007318 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873.c ENSGT00390000007318 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873.c ENSGT00390000007318 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873.c ENSGT00390000007318 Common wonbat MODERN SPECIES 1012 PPP4R2 (ENSVURG00010008448) GXYLT2 (ENSVURG00010008424) ENSVURG00010008413 SHQ1 (ENSVURG00010008402) RYBP (ENSVURG00010008342) PROK2 (ENSVURG00010008305) ENSVURG00010008299 ENSVURG00010008289 EIF4E3 (ENSVURG00010008277) FOXP1 (ENSVURG00010008144) MDFIC2 (ENSVURG00010008101) MITF (ENSVURG00010007937) FRMD4B (ENSVURG00010007860) LMOD3 (ENSVURG00010007809) ARL6IP5 (ENSVURG00010007801) UBA3 (ENSVURG00010007758) #22 TMF1 (ENSVURG00010007723) EOGT (ENSVURG00010007661) TAFA4 (ENSVURG00010007643) TAFA1 (ENSVURG00010007612) ENSVURG00010007597 SUCLG2 (ENSVURG00010007574) KBTBD8 (ENSVURG00010007548) LRIG1 (ENSVURG00010006601) SLC25A26 (ENSVURG00010006536) ENSVURG00010006497 MAGI1 (ENSVURG00010006288) ADAMTS9 (ENSVURG00010006187) PRICKLE2 (ENSVURG00010006134) PSMD6 (ENSVURG00010006048) ATXN7 (ENSVURG00010006027) koala MODERN SPECIES 122 PDZRN3 (ENSPCIG00000003575) PPP4R2 (ENSPCIG00000003553) GXYLT2 (ENSPCIG00000003536) SHQ1 (ENSPCIG00000033419) RYBP (ENSPCIG00000035828) PROK2 (ENSPCIG00000035580) ENSPCIG00000007180 GPR27 (ENSPCIG00000007179) EIF4E3 (ENSPCIG00000011825) FOXP1 (ENSPCIG00000011818) MDFIC2 (ENSPCIG00000011815) MITF (ENSPCIG00000011814) FRMD4B (ENSPCIG00000011810) LMOD3 (ENSPCIG00000011808) ARL6IP5 (ENSPCIG00000011806) UBA3 (ENSPCIG00000010311) #22 TMF1 (ENSPCIG00000010308) EOGT (ENSPCIG00000010307) TAFA4 (ENSPCIG00000009587) ENSPCIG00000035890 ENSPCIG00000036876 ENSPCIG00000009129 SUCLG2 (ENSPCIG00000017113) KBTBD8 (ENSPCIG00000017120) Wallaby MODERN SPECIES 6691 UBA3 (ENSMEUG00000005417) #22 ENSMEUG00000005393 Tasmanian devil MODERN SPECIES PDZRN3 (ENSSHAG00000016709) PPP4R2 (ENSSHAG00000015837) GXYLT2 (ENSSHAG00000015594) SHQ1 (ENSSHAG00000015077) ENSSHAG00000013359 ENSSHAG00000031144 GPR27 (ENSSHAG00000022511) EIF4E3 (ENSSHAG00000008775) FOXP1 (ENSSHAG00000026979) MDFIC2 (ENSSHAG00000030086) MITF (ENSSHAG00000017522) FRMD4B (ENSSHAG00000013729) LMOD3 (ENSSHAG00000016539) ARL6IP5 (ENSSHAG00000029654) TMF1 (ENSSHAG00000016301) UBA3 (ENSSHAG00000016367) #22 EOGT (ENSSHAG00000016174) TAFA4 (ENSSHAG00000024690) ENSSHAG00000025563 SUCLG2 (ENSSHAG00000029903) KBTBD8 (ENSSHAG00000032152) LRIG1 (ENSSHAG00000011408) SLC25A26 (ENSSHAG00000024838) MAGI1 (ENSSHAG00000017371) ADAMTS9 (ENSSHAG00000014822) PRICKLE2 (ENSSHAG00000013056) PSMD6 (ENSSHAG00000012357) ATXN7 (ENSSHAG00000012231) THOC7 (ENSSHAG00000011615) C3orf49 (ENSSHAG00000011430) SNTN (ENSSHAG00000009729) Opossum MODERN SPECIES 5 GXYLT2 (ENSMODG00000003929) SHQ1 (ENSMODG00000003926) RYBP (ENSMODG00000038209) PROK2 (ENSMODG00000043726) GPR27 (ENSMODG00000003902) EIF4E3 (ENSMODG00000003899) FOXP1 (ENSMODG00000003884) ENSMODG00000027781 MDFIC2 (ENSMODG00000028056) ENSMODG00000028024 ENSMODG00000039201 MITF (ENSMODG00000003754) FRMD4B (ENSMODG00000003688) LMOD3 (ENSMODG00000003639) ARL6IP5 (ENSMODG00000049779) UBA3 (ENSMODG00000003622) #22 TMF1 (ENSMODG00000003468) ENSMODG00000003450 TAFA4 (ENSMODG00000029617) ENSMODG00000003405 SUCLG2 (ENSMODG00000003294) KBTBD8 (ENSMODG00000003276) LRIG1 (ENSMODG00000003264) SLC25A26 (ENSMODG00000003248) ENSMODG00000038114 ENSMODG00000051446 ENSMODG00000027350 ENSMODG00000027650 MAGI1 (ENSMODG00000003153) ENSMODG00000038875 ADAMTS9 (ENSMODG00000003140) Platypus MODERN SPECIES 84 CTSH (ENSOANG00000040239) RASGRF1 (ENSOANG00000042096) SPATA5L1 (ENSOANG00000006987) ENSOANG00000041052 ENSOANG00000046070 ENSOANG00000037173 ENSOANG00000050965 ENSOANG00000050666 GPR27 (ENSOANG00000005763) ENSOANG00000013094 FOXP1 (ENSOANG00000013093) MDFIC2 (ENSOANG00000051152) MITF (ENSOANG00000012406) FRMD4B (ENSOANG00000000486) ARL6IP5 (ENSOANG00000000488) UBA3 (ENSOANG00000000489) #22 TMF1 (ENSOANG00000000495) EOGT (ENSOANG00000000498) TAFA4 (ENSOANG00000049725) ENSOANG00000011749 SUCLG2 (ENSOANG00000001375) KBTBD8 (ENSOANG00000005913) LRIG1 (ENSOANG00000012379) ENSOANG00000012850 SLC25A26 (ENSOANG00000021347) MAGI1 (ENSOANG00000030734) ADAMTS9 (ENSOANG00000002273) PRICKLE2 (ENSOANG00000011930) ATXN7 (ENSOANG00000044322) THOC7 (ENSOANG00000050840) C3orf49 (ENSOANG00000000242) Sauria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Aves ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000162859 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00530000063647.A.a.d ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Golden eagle MODERN SPECIES 12 CNTN3 (ENSACCG00020008678) PDZRN3 (ENSACCG00020008644) PPP4R2 (ENSACCG00020008614) GXYLT2 (ENSACCG00020008596) SHQ1 (ENSACCG00020008571) RYBP (ENSACCG00020008553) PROK2 (ENSACCG00020008544) GPR27 (ENSACCG00020008536) EIF4E3 (ENSACCG00020008519) FOXP1 (ENSACCG00020008422) MDFIC2 (ENSACCG00020008280) MITF (ENSACCG00020008257) FRMD4B (ENSACCG00020008222) LMOD3 (ENSACCG00020008206) ARL6IP5 (ENSACCG00020008195) UBA3 (ENSACCG00020008140) #22 TMF1 (ENSACCG00020008119) EOGT (ENSACCG00020008102) TAFA4 (ENSACCG00020008089) TAFA1 (ENSACCG00020008077) SUCLG2 (ENSACCG00020008064) ENSACCG00020016712 KBTBD8 (ENSACCG00020016709) LRIG1 (ENSACCG00020016703) SLC25A26 (ENSACCG00020016695) MAGI1 (ENSACCG00020016667) ADAMTS9 (ENSACCG00020016650) PRICKLE2 (ENSACCG00020016643) PSMD6 (ENSACCG00020016638) ATXN7 (ENSACCG00020016632) THOC7 (ENSACCG00020016628) Kakapo MODERN SPECIES 3 ENSSHBG00005010670 GXYLT2 (ENSSHBG00005010727) SHQ1 (ENSSHBG00005010752) RYBP (ENSSHBG00005010792) PROK2 (ENSSHBG00005010813) GPR27 (ENSSHBG00005010828) EIF4E3 (ENSSHBG00005010834) FOXP1 (ENSSHBG00005010885) MDFIC2 (ENSSHBG00005010924) ENSSHBG00005010965 ENSSHBG00005010991 ENSSHBG00005011012 FRMD4B (ENSSHBG00005011065) LMOD3 (ENSSHBG00005011123) ARL6IP5 (ENSSHBG00005011174) UBA3 (ENSSHBG00005011214) #22 TMF1 (ENSSHBG00005011258) EOGT (ENSSHBG00005011329) TAFA4 (ENSSHBG00005011455) SUCLG2 (ENSSHBG00005011649) ENSSHBG00005014152 KBTBD8 (ENSSHBG00005014161) LRIG1 (ENSSHBG00005014201) SLC25A26 (ENSSHBG00005014260) MAGI1 (ENSSHBG00005014282) ADAMTS9 (ENSSHBG00005014460) PRICKLE2 (ENSSHBG00005014821) PSMD6 (ENSSHBG00005014829) ATXN7 (ENSSHBG00005014850) THOC7 (ENSSHBG00005014867) SNTN (ENSSHBG00005014875) Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000162859 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00950000185997 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000162859 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00950000185997 Common canary MODERN SPECIES 15 PPP4R2 (ENSSCAG00000008132) GXYLT2 (ENSSCAG00000008125) SHQ1 (ENSSCAG00000008114) RYBP (ENSSCAG00000008108) PROK2 (ENSSCAG00000008100) GPR27 (ENSSCAG00000008093) EIF4E3 (ENSSCAG00000008083) FOXP1 (ENSSCAG00000008063) MDFIC2 (ENSSCAG00000008028) ENSSCAG00000008022 ENSSCAG00000008018 MITF (ENSSCAG00000008001) FRMD4B (ENSSCAG00000007970) LMOD3 (ENSSCAG00000007965) ARL6IP5 (ENSSCAG00000007962) UBA3 (ENSSCAG00000007959) #22 TMF1 (ENSSCAG00000007954) EOGT (ENSSCAG00000007882) TAFA4 (ENSSCAG00000007848) TAFA1 (ENSSCAG00000007834) SUCLG2 (ENSSCAG00000007715) ENSSCAG00000007694 KBTBD8 (ENSSCAG00000007691) LRIG1 (ENSSCAG00000007642) SLC25A26 (ENSSCAG00000007630) MAGI1 (ENSSCAG00000007368) ADAMTS9 (ENSSCAG00000007307) PRICKLE2 (ENSSCAG00000007292) PSMD6 (ENSSCAG00000007252) ATXN7 (ENSSCAG00000007233) ENSSCAG00000007232 Zebra finch MODERN SPECIES 3 CNTN3 (ENSTGUG00000009960) PDZRN3 (ENSTGUG00000014523) ENSTGUG00000009943 SHQ1 (ENSTGUG00000009933) RYBP (ENSTGUG00000020831) PROK2 (ENSTGUG00000026872) GPR27 (ENSTGUG00000009928) EIF4E3 (ENSTGUG00000009923) FOXP1 (ENSTGUG00000009872) MDFIC2 (ENSTGUG00000022276) ENSTGUG00000009864 MITF (ENSTGUG00000009847) FRMD4B (ENSTGUG00000009791) LMOD3 (ENSTGUG00000009788) ARL6IP5 (ENSTGUG00000009784) UBA3 (ENSTGUG00000009733) #22 TMF1 (ENSTGUG00000009717) EOGT (ENSTGUG00000009683) TAFA4 (ENSTGUG00000024581) TAFA1 (ENSTGUG00000009669) SUCLG2 (ENSTGUG00000009643) ENSTGUG00000009630 KBTBD8 (ENSTGUG00000009627) LRIG1 (ENSTGUG00000009604) SLC25A26 (ENSTGUG00000009590) MAGI1 (ENSTGUG00000009560) ADAMTS9 (ENSTGUG00000009483) PRICKLE2 (ENSTGUG00000009461) PSMD6 (ENSTGUG00000009442) ATXN7 (ENSTGUG00000009416) THOC7 (ENSTGUG00000009431) Medium ground finch MODERN SPECIES 20 GXYLT2 (ENSGFOG00000004458) SHQ1 (ENSGFOG00000004475) RYBP (ENSGFOG00000004492) ENSGFOG00000004504 PROK2 (ENSGFOG00000004519) GPR27 (ENSGFOG00000004530) EIF4E3 (ENSGFOG00000004543) FOXP1 (ENSGFOG00000004570) MDFIC2 (ENSGFOG00000004631) ENSGFOG00000004645 ENSGFOG00000004688 MITF (ENSGFOG00000004714) FRMD4B (ENSGFOG00000004734) LMOD3 (ENSGFOG00000004784) ARL6IP5 (ENSGFOG00000004791) UBA3 (ENSGFOG00000004801) #22 TMF1 (ENSGFOG00000004844) EOGT (ENSGFOG00000005298) TAFA4 (ENSGFOG00000005317) TAFA1 (ENSGFOG00000005327) SUCLG2 (ENSGFOG00000005343) ENSGFOG00000005424 KBTBD8 (ENSGFOG00000005432) LRIG1 (ENSGFOG00000005456) SLC25A26 (ENSGFOG00000005568) MAGI1 (ENSGFOG00000005601) ADAMTS9 (ENSGFOG00000005699) PRICKLE2 (ENSGFOG00000005985) PSMD6 (ENSGFOG00000005991) ATXN7 (ENSGFOG00000005996) THOC7 (ENSGFOG00000006002) Flycatcher MODERN SPECIES 3 PDZRN3 (ENSFALG00000013445) PPP4R2 (ENSFALG00000013436) GXYLT2 (ENSFALG00000024120) SHQ1 (ENSFALG00000013428) RYBP (ENSFALG00000027888) PROK2 (ENSFALG00000013423) GPR27 (ENSFALG00000014506) EIF4E3 (ENSFALG00000028480) FOXP1 (ENSFALG00000013404) MDFIC2 (ENSFALG00000013397) ENSFALG00000013396 MITF (ENSFALG00000026731) FRMD4B (ENSFALG00000013372) LMOD3 (ENSFALG00000013370) ARL6IP5 (ENSFALG00000028538) UBA3 (ENSFALG00000013365) #22 TMF1 (ENSFALG00000013361) EOGT (ENSFALG00000026269) TAFA4 (ENSFALG00000013356) TAFA1 (ENSFALG00000013355) SUCLG2 (ENSFALG00000013349) ENSFALG00000013341 KBTBD8 (ENSFALG00000013332) LRIG1 (ENSFALG00000013324) SLC25A26 (ENSFALG00000013315) ENSFALG00000023566 MAGI1 (ENSFALG00000013283) ADAMTS9 (ENSFALG00000013265) PRICKLE2 (ENSFALG00000013263) PSMD6 (ENSFALG00000013261) ATXN7 (ENSFALG00000013254) Great tit MODERN SPECIES 3 PDZRN3 (ENSPMJG00000005657) ENSPMJG00000005654 GXYLT2 (ENSPMJG00000005617) SHQ1 (ENSPMJG00000005611) RYBP (ENSPMJG00000005603) PROK2 (ENSPMJG00000005599) GPR27 (ENSPMJG00000005597) EIF4E3 (ENSPMJG00000005596) FOXP1 (ENSPMJG00000005573) MDFIC2 (ENSPMJG00000005566) ENSPMJG00000005560 MITF (ENSPMJG00000005557) FRMD4B (ENSPMJG00000005549) LMOD3 (ENSPMJG00000005547) ARL6IP5 (ENSPMJG00000005544) UBA3 (ENSPMJG00000005263) #22 TMF1 (ENSPMJG00000005253) EOGT (ENSPMJG00000005244) TAFA4 (ENSPMJG00000005234) TAFA1 (ENSPMJG00000005221) SUCLG2 (ENSPMJG00000005212) ENSPMJG00000005202 KBTBD8 (ENSPMJG00000005200) LRIG1 (ENSPMJG00000005189) SLC25A26 (ENSPMJG00000005179) MAGI1 (ENSPMJG00000005138) ADAMTS9 (ENSPMJG00000005116) PRICKLE2 (ENSPMJG00000005105) PSMD6 (ENSPMJG00000005080) ATXN7 (ENSPMJG00000005075) THOC7 (ENSPMJG00000005073) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Pink-footed goose MODERN SPECIES 49 PDZRN3 (ENSABRG00000016746) PPP4R2 (ENSABRG00000016753) GXYLT2 (ENSABRG00000016756) SHQ1 (ENSABRG00000016761) RYBP (ENSABRG00000016768) PROK2 (ENSABRG00000016781) GPR27 (ENSABRG00000016783) EIF4E3 (ENSABRG00000016790) FOXP1 (ENSABRG00000016798) MDFIC2 (ENSABRG00000016818) ENSABRG00000016826 MITF (ENSABRG00000016841) FRMD4B (ENSABRG00000016861) LMOD3 (ENSABRG00000016894) ARL6IP5 (ENSABRG00000016899) UBA3 (ENSABRG00000016957) #22 TMF1 (ENSABRG00000017367) EOGT (ENSABRG00000017437) TAFA4 (ENSABRG00000017510) ENSABRG00000017534 SUCLG2 (ENSABRG00000017550) Duck MODERN SPECIES 4 PDZRN3 (ENSAPLG00000014073) PPP4R2 (ENSAPLG00000014045) GXYLT2 (ENSAPLG00000013945) SHQ1 (ENSAPLG00000013926) RYBP (ENSAPLG00000013882) PROK2 (ENSAPLG00000011432) GPR27 (ENSAPLG00000011697) EIF4E3 (ENSAPLG00000023114) FOXP1 (ENSAPLG00000011828) MDFIC2 (ENSAPLG00000023736) ENSAPLG00000011893 MITF (ENSAPLG00000011965) FRMD4B (ENSAPLG00000012468) LMOD3 (ENSAPLG00000013202) ARL6IP5 (ENSAPLG00000017744) UBA3 (ENSAPLG00000013254) #22 TMF1 (ENSAPLG00000013459) EOGT (ENSAPLG00000013712) TAFA4 (ENSAPLG00000014143) ENSAPLG00000014295 SUCLG2 (ENSAPLG00000014378) ENSAPLG00000014560 KBTBD8 (ENSAPLG00000014724) LRIG1 (ENSAPLG00000014836) SLC25A26 (ENSAPLG00000015089) MAGI1 (ENSAPLG00000015151) ENSAPLG00000027785 ADAMTS9 (ENSAPLG00000005973) PRICKLE2 (ENSAPLG00000003962) PSMD6 (ENSAPLG00000003464) ATXN7 (ENSAPLG00000003397) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Turkey MODERN SPECIES 5 ENSMGAG00000018290 GXYLT2 (ENSMGAG00000009655) PPP4R2 (ENSMGAG00000009674) SHQ1 (ENSMGAG00000009640) RYBP (ENSMGAG00000009639) PROK2 (ENSMGAG00000002367) GPR27 (ENSMGAG00000009633) EIF4E3 (ENSMGAG00000009619) FOXP1 (ENSMGAG00000009549) MDFIC2 (ENSMGAG00000009545) ENSMGAG00000009539 MITF (ENSMGAG00000009507) FRMD4B (ENSMGAG00000009466) LMOD3 (ENSMGAG00000009459) ARL6IP5 (ENSMGAG00000009453) UBA3 (ENSMGAG00000009393) #22 TMF1 (ENSMGAG00000009372) EOGT (ENSMGAG00000009335) TAFA4 (ENSMGAG00000009332) ENSMGAG00000009329 SUCLG2 (ENSMGAG00000009310) ENSMGAG00000009302 KBTBD8 (ENSMGAG00000022009) LRIG1 (ENSMGAG00000009269) SLC25A26 (ENSMGAG00000009255) MAGI1 (ENSMGAG00000009228) ADAMTS9 (ENSMGAG00000009150) PRICKLE2 (ENSMGAG00000009081) PSMD6 (ENSMGAG00000009125) ATXN7 (ENSMGAG00000009100) THOC7 (ENSMGAG00000009059) Chicken MODERN SPECIES 3 PDZRN3 (ENSGALG00010020350) PPP4R2 (ENSGALG00010020329) GXYLT2 (ENSGALG00010020309) SHQ1 (ENSGALG00010020307) RYBP (ENSGALG00010018991) PROK2 (ENSGALG00010019225) GPR173 (ENSGALG00010022232) EIF4E3 (ENSGALG00010022219) FOXP1 (ENSGALG00010022171) MDFIC2 (ENSGALG00010022083) ENSGALG00010022077 MITF (ENSGALG00010022062) FRMD4B (ENSGALG00010020127) LMOD3 (ENSGALG00010020088) ARL6IP5 (ENSGALG00010020070) UBA3 (ENSGALG00010020061) #22 TMF1 (ENSGALG00010020036) EOGT (ENSGALG00010020005) TAFA4 (ENSGALG00010019938) TAFA1 (ENSGALG00010019871) SUCLG2 (ENSGALG00010019767) ENSGALG00010019696 KBTBD8 (ENSGALG00010019650) LRIG1 (ENSGALG00010019323) SLC25A26 (ENSGALG00010019297) MAGI1 (ENSGALG00010020282) ADAMTS9 (ENSGALG00010020246) PRICKLE2 (ENSGALG00010020194) PSMD6 (ENSGALG00010020179) ATXN7 (ENSGALG00010020152) THOC7 (ENSGALG00010020141) Japanese quail MODERN SPECIES 3 GXYLT2 (ENSCJPG00005018661) SHQ1 (ENSCJPG00005018660) RYBP (ENSCJPG00005018659) PROK2 (ENSCJPG00005018655) GPR27 (ENSCJPG00005018654) ENSCJPG00005018653 EIF4E3 (ENSCJPG00005018652) FOXP1 (ENSCJPG00005018169) MDFIC2 (ENSCJPG00005018163) ENSCJPG00005018162 ENSCJPG00005018160 MITF (ENSCJPG00005018152) FRMD4B (ENSCJPG00005018142) LMOD3 (ENSCJPG00005018140) ARL6IP5 (ENSCJPG00005018138) UBA3 (ENSCJPG00005018109) #22 TMF1 (ENSCJPG00005018103) EOGT (ENSCJPG00005018101) TAFA4 (ENSCJPG00005018097) ENSCJPG00005018090 ENSCJPG00005018085 SUCLG2 (ENSCJPG00005018075) ENSCJPG00005018069 KBTBD8 (ENSCJPG00005018067) LRIG1 (ENSCJPG00005018060) SLC25A26 (ENSCJPG00005018055) MAGI1 (ENSCJPG00005018045) ADAMTS9 (ENSCJPG00005018038) PRICKLE2 (ENSCJPG00005018037) PSMD6 (ENSCJPG00005018035) ATXN7 (ENSCJPG00005018034) African ostrich MODERN SPECIES 756 ENSSCUG00000010895 UBA3 (ENSSCUG00000010888) #22 TMF1 (ENSSCUG00000010866) EOGT (ENSSCUG00000010841) TAFA4 (ENSSCUG00000010838) TAFA1 (ENSSCUG00000010835) SUCLG2 (ENSSCUG00000010832) ENSSCUG00000010829 KBTBD8 (ENSSCUG00000010827) LRIG1 (ENSSCUG00000010808) SLC25A26 (ENSSCUG00000010771) MAGI1 (ENSSCUG00000010757) ADAMTS9 (ENSSCUG00000010695) PRICKLE2 (ENSSCUG00000010599) PSMD6 (ENSSCUG00000010593) ATXN7 (ENSSCUG00000010590) THOC7 (ENSSCUG00000010585) Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 37 CNTN3 (ENSCPRG00005015706) PDZRN3 (ENSCPRG00005015721) PPP4R2 (ENSCPRG00005015732) GXYLT2 (ENSCPRG00005015736) ENSCPRG00005015737 RYBP (ENSCPRG00005015740) PROK2 (ENSCPRG00005015745) GPR27 (ENSCPRG00005015748) EIF4E3 (ENSCPRG00005015751) FOXP1 (ENSCPRG00005015769) MDFIC2 (ENSCPRG00005015832) MITF (ENSCPRG00005015838) FRMD4B (ENSCPRG00005015846) LMOD3 (ENSCPRG00005015864) ARL6IP5 (ENSCPRG00005015865) UBA3 (ENSCPRG00005015868) #22 TMF1 (ENSCPRG00005015874) EOGT (ENSCPRG00005015876) TAFA4 (ENSCPRG00005015878) ENSCPRG00005015882 ENSCPRG00005015885 SUCLG2 (ENSCPRG00005015887) ENSCPRG00005015888 KBTBD8 (ENSCPRG00005015890) LRIG1 (ENSCPRG00005015894) SLC25A26 (ENSCPRG00005015895) ENSCPRG00005015898 MAGI1 (ENSCPRG00005015934) ADAMTS9 (ENSCPRG00005016132) PRICKLE2 (ENSCPRG00005016258) ENSCPRG00005016274 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00650000094763 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 21 PPP4R2 (ENSGEVG00005018720) GXYLT2 (ENSGEVG00005018737) SHQ1 (ENSGEVG00005018751) RYBP (ENSGEVG00005018775) PROK2 (ENSGEVG00005018790) GPR27 (ENSGEVG00005018807) EIF4E3 (ENSGEVG00005018821) ENSGEVG00005018834 FOXP1 (ENSGEVG00005018847) MDFIC2 (ENSGEVG00005018869) ENSGEVG00005018889 MITF (ENSGEVG00005018917) FRMD4B (ENSGEVG00005018987) LMOD3 (ENSGEVG00005019002) ARL6IP5 (ENSGEVG00005019026) UBA3 (ENSGEVG00005004001) #22 TMF1 (ENSGEVG00005004020) EOGT (ENSGEVG00005004061) TAFA4 (ENSGEVG00005004105) ENSGEVG00005004121 SUCLG2 (ENSGEVG00005004135) ENSGEVG00005004158 KBTBD8 (ENSGEVG00005004176) LRIG1 (ENSGEVG00005004250) SLC25A26 (ENSGEVG00005004455) ENSGEVG00005004516 MAGI1 (ENSGEVG00005004948) ADAMTS9 (ENSGEVG00005006238) PRICKLE2 (ENSGEVG00005007020) PSMD6 (ENSGEVG00005007090) ATXN7 (ENSGEVG00005007114) Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 271 FOXP1 (ENSCABG00000001528) MDFIC2 (ENSCABG00000001532) ENSCABG00000001535 ENSCABG00000001537 MITF (ENSCABG00000001540) FRMD4B (ENSCABG00000001547) LMOD3 (ENSCABG00000001554) ARL6IP5 (ENSCABG00000001557) UBA3 (ENSCABG00000001584) #22 TMF1 (ENSCABG00000002492) EOGT (ENSCABG00000002970) TAFA4 (ENSCABG00000002975) Emydidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160975 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 painted turtle MODERN SPECIES 2383 SHQ1 (ENSCPBG00000006441) RYBP (ENSCPBG00000006439) PROK2 (ENSCPBG00000006431) GPR27 (ENSCPBG00000006421) EIF4E3 (ENSCPBG00000006415) ENSCPBG00000005362 C3orf80 (ENSCPBG00000005344) FOXP1 (ENSCPBG00000000850) MDFIC2 (ENSCPBG00000000641) ENSCPBG00000000607 ENSCPBG00000000573 MITF (ENSCPBG00000000513) FRMD4B (ENSCPBG00000000426) LMOD3 (ENSCPBG00000000394) ARL6IP5 (ENSCPBG00000000384) UBA3 (ENSCPBG00000000357) #22 TMF1 (ENSCPBG00000000268) EOGT (ENSCPBG00000000226) TAFA4 (ENSCPBG00000000202) ENSCPBG00000000182 ENSCPBG00000026901 ENSCPBG00000026898 SUCLG2 (ENSCPBG00000026891) ENSCPBG00000026885 KBTBD8 (ENSCPBG00000026884) LRIG1 (ENSCPBG00000026879) SLC25A26 (ENSCPBG00000026877) ENSCPBG00000026876 MAGI1 (ENSCPBG00000026871) ENSCPBG00000026862 ENSCPBG00000026851 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 33 GXYLT2 (ENSTMTG00000018007) SHQ1 (ENSTMTG00000017994) RYBP (ENSTMTG00000017980) PROK2 (ENSTMTG00000017933) GPR27 (ENSTMTG00000017910) EIF4E3 (ENSTMTG00000017896) FOXP1 (ENSTMTG00000017846) MDFIC2 (ENSTMTG00000017833) ENSTMTG00000017820 ENSTMTG00000017806 MITF (ENSTMTG00000017748) FRMD4B (ENSTMTG00000017669) LMOD3 (ENSTMTG00000017636) ENSTMTG00000017624 ARL6IP5 (ENSTMTG00000017618) UBA3 (ENSTMTG00000017592) #22 TMF1 (ENSTMTG00000017529) EOGT (ENSTMTG00000017077) TAFA4 (ENSTMTG00000017005) ENSTMTG00000016997 SUCLG2 (ENSTMTG00000016973) ENSTMTG00000016963 KBTBD8 (ENSTMTG00000016948) LRIG1 (ENSTMTG00000016908) SLC25A26 (ENSTMTG00000016891) ENSTMTG00000016884 MAGI1 (ENSTMTG00000016802) ADAMTS9 (ENSTMTG00000014575) PRICKLE2 (ENSTMTG00000014312) PSMD6 (ENSTMTG00000014295) ATXN7 (ENSTMTG00000014272) Chinese turtle MODERN SPECIES 839 EIF4E3 (ENSPSIG00000016957) FOXP1 (ENSPSIG00000008711) MDFIC2 (ENSPSIG00000008400) ENSPSIG00000007253 ENSPSIG00000006822 MITF (ENSPSIG00000012120) FRMD4B (ENSPSIG00000017130) LMOD3 (ENSPSIG00000016985) ARL6IP5 (ENSPSIG00000016018) UBA3 (ENSPSIG00000015303) #22 TMF1 (ENSPSIG00000015293) EOGT (ENSPSIG00000014016) TAFA4 (ENSPSIG00000014008) ENSPSIG00000000074 ENSPSIG00000013999 SUCLG2 (ENSPSIG00000013610) ENSPSIG00000013570 KBTBD8 (ENSPSIG00000013563) LRIG1 (ENSPSIG00000013027) SLC25A26 (ENSPSIG00000013022) ENSPSIG00000000073 DLK1 (ENSPSIG00000013018) ENSPSIG00000001502 ENSPSIG00000001483 ENSPSIG00000001467 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Laterata ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Common wall lizard MODERN SPECIES 10 PDZRN3 (ENSPMRG00000015257) ENSPMRG00000015274 SHQ1 (ENSPMRG00000015291) RYBP (ENSPMRG00000015294) PROK2 (ENSPMRG00000015300) GPR27 (ENSPMRG00000015304) EIF4E3 (ENSPMRG00000015314) FOXP1 (ENSPMRG00000015325) MDFIC2 (ENSPMRG00000015336) ENSPMRG00000015341 MITF (ENSPMRG00000015352) ENSPMRG00000015381 FRMD4B (ENSPMRG00000015388) LMOD3 (ENSPMRG00000015415) ARL6IP5 (ENSPMRG00000015419) UBA3 (ENSPMRG00000015448) #22 TMF1 (ENSPMRG00000015455) EOGT (ENSPMRG00000015468) TAFA4 (ENSPMRG00000015501) ENSPMRG00000015505 SUCLG2 (ENSPMRG00000015512) ENSPMRG00000015518 KBTBD8 (ENSPMRG00000015522) ENSPMRG00000015524 LRIG1 (ENSPMRG00000015530) ENSPMRG00000015538 SLC25A26 (ENSPMRG00000015542) ENSPMRG00000012517 ENSPMRG00000012518 ENSPMRG00000012519 MAGI1 (ENSPMRG00000012579) Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 30 ENSSMRG00000003079 GXYLT2 (ENSSMRG00000003071) SHQ1 (ENSSMRG00000003041) ENSSMRG00000002992 RYBP (ENSSMRG00000002983) PROK2 (ENSSMRG00000002900) GPR27 (ENSSMRG00000002896) EIF4E3 (ENSSMRG00000002895) ENSSMRG00000002882 FOXP1 (ENSSMRG00000002823) MDFIC2 (ENSSMRG00000002664) MITF (ENSSMRG00000002637) FRMD4B (ENSSMRG00000002580) LMOD3 (ENSSMRG00000002566) ARL6IP5 (ENSSMRG00000002565) UBA3 (ENSSMRG00000002519) #22 TMF1 (ENSSMRG00000002507) EOGT (ENSSMRG00000001044) TAFA4 (ENSSMRG00000001030) ENSSMRG00000000996 ENSSMRG00000000981 SUCLG2 (ENSSMRG00000000921) ENSSMRG00000000887 KBTBD8 (ENSSMRG00000000879) LRIG1 (ENSSMRG00000000805) SLC25A26 (ENSSMRG00000000770) ENSSMRG00000000733 MAGI1 (ENSSMRG00000000667) ADAMTS9 (ENSSMRG00000000159) PRICKLE2 (ENSSMRG00000000017) PSMD6 (ENSSMRG00000017409) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a.s ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a.s ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000160282 ENSGT00950000183062.a.a.a.s ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000162026 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000163880 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000166512 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 2 PDZRN3 (ENSNSUG00000006989) ENSNSUG00000006992 GXYLT2 (ENSNSUG00000006994) ENSNSUG00000006998 ENSNSUG00000006999 RYBP (ENSNSUG00000007004) PROK2 (ENSNSUG00000007007) GPR27 (ENSNSUG00000007008) EIF4E3 (ENSNSUG00000007010) FOXP1 (ENSNSUG00000007011) MITF (ENSNSUG00000007126) FRMD4B (ENSNSUG00000007211) LMOD3 (ENSNSUG00000007212) ARL6IP5 (ENSNSUG00000007213) ENSNSUG00000007214 UBA3 (ENSNSUG00000007215) #22 TMF1 (ENSNSUG00000007216) EOGT (ENSNSUG00000007219) TAFA4 (ENSNSUG00000007226) ENSNSUG00000007227 SUCLG2 (ENSNSUG00000007228) ENSNSUG00000007229 KBTBD8 (ENSNSUG00000007230) LRIG1 (ENSNSUG00000007277) SLC25A26 (ENSNSUG00000007291) ENSNSUG00000007339 MAGI1 (ENSNSUG00000007343) ADAMTS9 (ENSNSUG00000007617) PRICKLE2 (ENSNSUG00000007643) PSMD6 (ENSNSUG00000007645) ENSNSUG00000007649 Eastern brown snake MODERN SPECIES 3 CNTN3 (ENSPTXG00000000180) PDZRN3 (ENSPTXG00000000135) ENSPTXG00000000107 GXYLT2 (ENSPTXG00000000072) SHQ1 (ENSPTXG00000000044) RYBP (ENSPTXG00000004041) PROK2 (ENSPTXG00000004037) GPR27 (ENSPTXG00000004036) EIF4E3 (ENSPTXG00000004035) FOXP1 (ENSPTXG00000002890) MDFIC2 (ENSPTXG00000002874) MITF (ENSPTXG00000002872) FRMD4B (ENSPTXG00000002871) LMOD3 (ENSPTXG00000002870) ARL6IP5 (ENSPTXG00000002869) UBA3 (ENSPTXG00000002868) #22 TMF1 (ENSPTXG00000002867) EOGT (ENSPTXG00000002866) TAFA4 (ENSPTXG00000002865) ENSPTXG00000002864 SUCLG2 (ENSPTXG00000002863) ENSPTXG00000002861 KBTBD8 (ENSPTXG00000002860) LRIG1 (ENSPTXG00000002859) SLC25A26 (ENSPTXG00000002815) MAGI1 (ENSPTXG00000002562) ENSPTXG00000002527 ENSPTXG00000002518 PRICKLE2 (ENSPTXG00000002510) PSMD6 (ENSPTXG00000002506) ATXN7 (ENSPTXG00000002502) Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 6945 UBA3 (ENSLLTG00000012835) #22 TMF1 (ENSLLTG00000012862) Indian cobra MODERN SPECIES 1 ENSNNAG00000001768 GXYLT2 (ENSNNAG00000001742) ENSNNAG00000001725 ENSNNAG00000001713 RYBP (ENSNNAG00000001699) PROK2 (ENSNNAG00000001687) GPR27 (ENSNNAG00000001680) EIF4E3 (ENSNNAG00000001669) FOXP1 (ENSNNAG00000000627) MDFIC2 (ENSNNAG00000000344) MITF (ENSNNAG00000000297) ENSNNAG00000000263 FRMD4B (ENSNNAG00000006495) LMOD3 (ENSNNAG00000006462) ARL6IP5 (ENSNNAG00000006448) UBA3 (ENSNNAG00000006386) #22 TMF1 (ENSNNAG00000005900) EOGT (ENSNNAG00000005800) TAFA4 (ENSNNAG00000005772) ENSNNAG00000005763 SUCLG2 (ENSNNAG00000005733) ENSNNAG00000005715 KBTBD8 (ENSNNAG00000005697) ENSNNAG00000005679 SLC25A26 (ENSNNAG00000005554) ENSNNAG00000005526 MAGI1 (ENSNNAG00000004958) ADAMTS9 (ENSNNAG00000004589) PRICKLE2 (ENSNNAG00000004484) PSMD6 (ENSNNAG00000004451) ATXN7 (ENSNNAG00000004394) Lizard MODERN SPECIES 1 ENSACAG00000042966 ENSACAG00000038806 ENSACAG00000042406 FOXP1 (ENSACAG00000013683) ENSACAG00000043836 MDFIC2 (ENSACAG00000013680) ENSACAG00000039576 ENSACAG00000041007 ENSACAG00000028935 MITF (ENSACAG00000036061) ENSACAG00000043457 ENSACAG00000035967 FRMD4B (ENSACAG00000015389) LMOD3 (ENSACAG00000015388) ARL6IP5 (ENSACAG00000034873) UBA3 (ENSACAG00000015287) #22 TMF1 (ENSACAG00000015244) EOGT (ENSACAG00000015231) TAFA4 (ENSACAG00000029595) ENSACAG00000044038 ENSACAG00000035340 ENSACAG00000036987 ENSACAG00000045320 ENSACAG00000036765 ENSACAG00000041722 ENSACAG00000039146 ENSACAG00000040759 ENSACAG00000038998 SUCLG2 (ENSACAG00000015144) ENSACAG00000015111 KBTBD8 (ENSACAG00000015104) tuatara MODERN SPECIES 839 MDFIC2 (ENSSPUG00000012307) ENSSPUG00000012252 ENSSPUG00000012211 ENSSPUG00000012190 FRMD4B (ENSSPUG00000012173) ARL6IP5 (ENSSPUG00000012126) UBA3 (ENSSPUG00000012110) #22 TMF1 (ENSSPUG00000012051) EOGT (ENSSPUG00000012017) TAFA4 (ENSSPUG00000011995) ENSSPUG00000011992 SUCLG2 (ENSSPUG00000011973) KBTBD8 (ENSSPUG00000011960) ENSSPUG00000011940 LRIG1 (ENSSPUG00000011880) SLC25A26 (ENSSPUG00000011849) MAGI1 (ENSSPUG00000011816) ADAMTS9 (ENSSPUG00000011629) PRICKLE2 (ENSSPUG00000011565) PSMD6 (ENSSPUG00000011548) ATXN7 (ENSSPUG00000011533) ENSSPUG00000011528 Anura ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000162859 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865 ENSGT00940000159892 ENSGT00730000111641 ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000159731 ENSGT00390000008631.a ENSGT00550000074831 #22 ENSGT00390000010697 ENSGT00940000156493 ENSGT00940000159882 ENSGT00940000162607 ENSGT00390000010170.a.a ENSGT00940000164303 ENSGT00940000158653 ENSGT00940000158502 ENSGT00550000074950 ENSGT00940000155820 ENSGT00940000156409 ENSGT00940000153629.a.a ENSGT00510000046608.B ENSGT00940000157279 ENSGT00390000002873 Frog MODERN SPECIES 4 rybp (ENSXETG00000015914) prok2 (ENSXETG00000035599) gpr27 (ENSXETG00000031117) eif4e3 (ENSXETG00000046627) foxp1 (ENSXETG00000008510) ENSXETG00000043474 ENSXETG00000044720 MDFIC2 (ENSXETG00000044995) mgc147226 (ENSXETG00000000147) mitf (ENSXETG00000039276) frmd4b (ENSXETG00000016169) lmod3 (ENSXETG00000043756) arl6ip5 (ENSXETG00000036732) ENSXETG00000040721 ENSXETG00000040947 uba3 (ENSXETG00000016167) #22 tmf1 (ENSXETG00000016166) ENSXETG00000042531 eogt (ENSXETG00000016165) tafa4 (ENSXETG00000035258) ENSXETG00000047023 ENSXETG00000048185 tafa1 (ENSXETG00000047202) suclg2 (ENSXETG00000002522) ENSXETG00000031632 kbtbd8 (ENSXETG00000002518) lrig1 (ENSXETG00000002515) slc25a26 (ENSXETG00000026858) ENSXETG00000039347 magi1 (ENSXETG00000013130) ENSXETG00000046573 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 11 MDFIC2 (ENSLLEG00000028932) FOXP1 (ENSLLEG00000029038) ENSLLEG00000029545 EIF4E3 (ENSLLEG00000029555) ENSLLEG00000029590 RYBP (ENSLLEG00000029604) ENSLLEG00000029657 SHQ1 (ENSLLEG00000029669) GXYLT2 (ENSLLEG00000029705) ENSLLEG00000029725 PDZRN3 (ENSLLEG00000029758) ENSLLEG00000029787 ENSLLEG00000029794 ENSLLEG00000029807 ENSLLEG00000029831 UBA3 (ENSLLEG00000029864) #22 TMF1 (ENSLLEG00000029962) ENSLLEG00000029988 EOGT (ENSLLEG00000030010) TAFA4 (ENSLLEG00000030074) ENSLLEG00000030114 ENSLLEG00000030119 ENSLLEG00000030130 ENSLLEG00000030140 ENSLLEG00000030151 SUCLG2 (ENSLLEG00000030179) ENSLLEG00000030210 ENSLLEG00000030217 ENSLLEG00000030227 ENSLLEG00000030238 KBTBD8 (ENSLLEG00000030246) Coelacanth MODERN SPECIES 468 FOXP1 (ENSLACG00000006064) MITF (ENSLACG00000011547) FRMD4B (ENSLACG00000013132) LMOD3 (ENSLACG00000013863) ARL6IP5 (ENSLACG00000013944) UBA3 (ENSLACG00000014006) #22 TMF1 (ENSLACG00000014224) EOGT (ENSLACG00000014440) TAFA4 (ENSLACG00000015098)