Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT00390000002049.d	ENSGT00940000156893	ENSGT00390000018360	ENSGT00390000011497	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000154716	ENSGT00940000154201.a.a.b.d	ENSGT00940000164119	ENSGT01030000234515.a.b.a.a	ENSGT00940000157471	ENSGT00940000157585	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203 #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698 #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00390000007801	ENSGT00940000159919	ENSGT00940000161355	ENSGT00940000162071	ENSGT00940000165956	ENSGT00940000171931	ENSGT00940000154172	ENSGT00730000111747	ENSGT00530000063948.a	ENSGT00390000007266
Osteoglossocephalai	DUPLICATION
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT00390000002049.d	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.a	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698 #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795	ENSGT00390000003552
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT00390000002049.d	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.a	ENSGT00390000009491.c	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT00390000002049.d	ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.a	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00940000177093	ENSGT00940000159441.k #30	ENSGT01050000244814.b.b #31	ENSGT00390000016654 #32	ENSGT00390000006753.A	ENSGT00940000166343	ENSGT00940000160411.i	ENSGT00940000167905	ENSGT00390000017736.a	ENSGT00390000009359.a.b
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157781 #7	ENSGT00940000157068.d	ENSGT00940000164547.b.b #9	ENSGT00940000157621 #10	ENSGT00390000010337.B.a.b #11	ENSGT00950000182863.A.b #12	ENSGT00390000003305 #13	ENSGT00390000001515 #14	ENSGT00940000153769.F.n #15	ENSGT00520000055667 #16	ENSGT00390000017400 #17	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00940000177093	ENSGT00940000159441.k #30	ENSGT01050000244814.b.b #31	ENSGT00390000016654 #32	ENSGT00940000162969 #33	ENSGT00550000075124 #34	ENSGT01030000235056 #35	ENSGT00390000009864 #36	ENSGT00390000010577 #37	ENSGT00970000198307
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01030000235080	ENSGT00940000157781 #7	ENSGT00940000164547.b.b #9	ENSGT00940000157621 #10	ENSGT00390000010337.B.a.b #11	ENSGT00950000182863.A.b #12	ENSGT00390000003305 #13	ENSGT00390000001515 #14	ENSGT00940000153769.F.n #15	ENSGT00520000055667 #16	ENSGT00390000017400 #17	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b.o #26	ENSGT00940000164374.A.c.a.b #25	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00390000008061.j.b #28	ENSGT00610000087473 #29	ENSGT00940000177093	ENSGT00940000159441.k #30	ENSGT01050000244814.b.b #31	ENSGT00390000016654 #32	ENSGT00940000162969 #33	ENSGT00550000075124 #34	ENSGT01030000235056 #35
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	106	ENSGT00940000157781.e #7	ENSGT01030000234597.a.b.b.e.b.t.a.a #8	ENSGT00940000164547.b.b.c #9	ENSGT00940000157621.j #10	ENSGT00390000010337.B.a.b.v #11	ENSGT00950000182863.A.b.b #12	ENSGT00390000003305.c #13	ENSGT00390000001515.j.a #14	ENSGT00940000153769.F.n.b #15	ENSGT00520000055667.f #16	ENSGT00390000017400.b #17	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a.d #19	ENSGT00940000158423.j #20	ENSGT00390000002799.g #21	ENSGT00940000157203.c.b #22
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157781.e #7	ENSGT01030000234597.a.b.b.e.b.t.a.a #8	ENSGT00940000164547.b.b.c #9	ENSGT00940000157621.j #10	ENSGT00390000010337.B.a.b.v #11	ENSGT00950000182863.A.b.b #12	ENSGT00390000003305.c #13	ENSGT00390000001515.j.a #14	ENSGT00940000153769.F.n.b #15	ENSGT00520000055667.f #16	ENSGT00390000017400.b #17	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a.d #19	ENSGT00940000158423.j #20	ENSGT00390000002799.g #21	ENSGT00940000157203.c.b #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00940000156698.d.b #24	ENSGT00940000164374.A.c.a.b.a #25	ENSGT00900000141033.b.b.o.b #26	ENSGT00900000141074.s #27	ENSGT00390000008061.j.b.c.b.a.b.a #28	ENSGT00610000087473 #29	ENSGT00940000159441.k.e #30	ENSGT01050000244814.b.b.a #31	ENSGT00390000016654.v #32	ENSGT00940000162969.j #33	ENSGT00550000075124.h #34	ENSGT01030000235056.a.a #35	ENSGT00390000009864.a #36	ENSGT00390000010577.a #37
Common carp reference	MODERN SPECIES	47	ENSCCRG00000054598	upp1 (ENSCCRG00000043865) #7	stmn2a (ENSCCRG00000043852) #8	ENSCCRG00000069741 #9	ENSCCRG00000043829 #10	has2 (ENSCCRG00000017616) #11	sntb1 (ENSCCRG00000033150) #12	MTBP (ENSCCRG00000033144) #13	mrpl13 (ENSCCRG00000042788) #14	COL14A1 (ENSCCRG00000001581) #15	deptor (ENSCCRG00000075215) #16	dscc1 (ENSCCRG00000001270) #17	crabp2a (ENSCCRG00000001260) #19	ITGA10 (ENSCCRG00000004992) #20	polr3c (ENSCCRG00000001195) #21	rnf115a (ENSCCRG00000043890) #22	ENSCCRG00000043850 #23	ENSCCRG00000070677 #24	trim109 (ENSCCRG00000061675) #25	ENSCCRG00000001167 #26	fdps (ENSCCRG00000001171) #27	ENSCCRG00000001176 #28	ENSCCRG00000061967 #29	rcvrn2 (ENSCCRG00000001178) #30	ENSCCRG00000058707 #31	atg12 (ENSCCRG00000073200) #32	cdc42ep5 (ENSCCRG00000063157) #33	grwd1 (ENSCCRG00000034381) #34	flcn (ENSCCRG00000034164) #36	ENSCCRG00000055213	josd2 (ENSCCRG00000029519)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	221	upp1 (ENSSGRG00000014858) #7	stmn2a (ENSSGRG00000014855) #8	ENSSGRG00000014854 #9	ANKIB1 (ENSSGRG00000014802) #10	has2 (ENSSGRG00000014798) #11	sntb1 (ENSSGRG00000014791) #12	MTBP (ENSSGRG00000014788) #13	mrpl13 (ENSSGRG00000014782) #14	COL14A1 (ENSSGRG00000014336) #15	deptor (ENSSGRG00000014315) #16	dscc1 (ENSSGRG00000014277) #17	ENSSGRG00000014275 #18	crabp2a (ENSSGRG00000014269) #19	ITGA10 (ENSSGRG00000014164) #20	polr3c (ENSSGRG00000014139) #21	rnf115a (ENSSGRG00000014126) #22	GBA1 (ENSSGRG00000014092) #23	ENSSGRG00000014090 #24	trim109 (ENSSGRG00000014088) #25	ENSSGRG00000014086 #26	fdps (ENSSGRG00000014062) #27
Goldfish	MODERN SPECIES	7	ENSCARG00000041287	upp1 (ENSCARG00000041311) #7	stmn2a (ENSCARG00000041360) #8	ENSCARG00000041405 #9	ANKIB1 (ENSCARG00000041469) #10	has2 (ENSCARG00000041625) #11	sntb1 (ENSCARG00000041658) #12	MTBP (ENSCARG00000041712) #13	mrpl13 (ENSCARG00000041851) ##14	COL14A1 (ENSCARG00000042027) #15	deptor (ENSCARG00000044259) #16	dscc1 (ENSCARG00000044273) #17	crabp2a (ENSCARG00000044368) #19	ITGA10 (ENSCARG00000044418) #20	polr3c (ENSCARG00000044682) #21	rnf115a (ENSCARG00000045237) #22	GBA1 (ENSCARG00000047165) #23	dap3 (ENSCARG00000045394)	ENSCARG00000047529 #24	trim109 (ENSCARG00000047547) #25	ENSCARG00000047607 #26	fdps (ENSCARG00000047647) #27	ENSCARG00000047743 #28	rcvrn2 (ENSCARG00000047755) #30	ENSCARG00000047769 #31	atg12 (ENSCARG00000047797) #32	cdc42ep5 (ENSCARG00000047822) #33	grwd1 (ENSCARG00000047827) #34	zgc:174888 (ENSCARG00000047872) #35	flcn (ENSCARG00000047931) #36	leng9 (ENSCARG00000048465) #37
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	7		ENSGT00940000157781.f ##7	ENSGT01030000234597.a.b.b.e.b.t.a.b ##8	ENSGT00940000164547.b.b.d ##9	ENSGT00940000157621.i ##10	ENSGT00390000010337.B.a.b.u ##11	ENSGT00950000182863.A.b.a ##12	ENSGT00390000003305.d ##13	ENSGT00390000001515.i ##14	ENSGT00940000153769.F.n.a ##15	ENSGT00520000055667.e ##16	ENSGT00390000017400.a ##17	ENSGT00940000157619.a.a.c ##19	ENSGT00940000158423.i ##20	ENSGT00390000002799.h ##21	ENSGT00940000157203.c.a ##22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d.a ##24	ENSGT00900000141033.b.b.o.a ##26	ENSGT00900000141074.t ##27	ENSGT00390000008061.j.b.c.b.a.a ##28	ENSGT00940000177093	ENSGT00940000159441.k.f ##30	ENSGT01050000244814.b.b.b ##31	ENSGT00390000016654.u ##32	ENSGT00940000162969.i ##33	ENSGT00550000075124.g ##34	ENSGT01030000235056.a.b ##35	ENSGT00390000009864.b ##36	ENSGT00390000010577.b ##37
Goldfish	MODERN SPECIES	35	ENSCARG00000039278	rnf144b (ENSCARG00000039292)	upp1 (ENSCARG00000039324) ##7	stmn2a (ENSCARG00000039377) ##8	ENSCARG00000039390 ##9	ANKIB1 (ENSCARG00000039423) ##10	has2 (ENSCARG00000039506) ##11	sntb1 (ENSCARG00000039520) ##12	mrpl13 (ENSCARG00000039538) ##14	COL14A1 (ENSCARG00000039769) ##15	deptor (ENSCARG00000043410) ##16	dscc1 (ENSCARG00000043452) ##17	crabp2a (ENSCARG00000043578) ##19	ITGA10 (ENSCARG00000043627) ##20	polr3c (ENSCARG00000044180) ##21	rnf115a (ENSCARG00000044326) ##22	ENSCARG00000044398 ##24	ENSCARG00000044422 ##26	fdps (ENSCARG00000044457) ##27	ENSCARG00000044587 ##28	rcvrn2 (ENSCARG00000044591) ##30	ENSCARG00000044604 ##31	atg12 (ENSCARG00000044611) ##32	cdc42ep5 (ENSCARG00000044634) ##33	grwd1 (ENSCARG00000044638) ##34	zgc:174888 (ENSCARG00000044693) ##35	flcn (ENSCARG00000044733) ##36	ENSCARG00000045536	ENSCARG00000045573	josd2 (ENSCARG00000045631)	ube2s (ENSCARG00000045653)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT01030000235080.b	ENSGT00940000157781.f ##7	ENSGT01030000234597.a.b.b.e.b.t.a.b ##8	ENSGT00940000164547.b.b.d ##9	ENSGT00940000157621.i ##10	ENSGT00390000010337.B.a.b.u ##11	ENSGT00950000182863.A.b.a ##12	ENSGT00390000003305.d ##13	ENSGT00390000001515.i ##14	ENSGT00940000153769.F.n.a ##15	ENSGT00520000055667.e ##16	ENSGT00390000017400.a ##17	ENSGT00940000157619.a.a.c ##19	ENSGT00940000158423.i ##20	ENSGT00390000002799.h ##21	ENSGT00940000157203.c.a ##22	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d.a ##24	ENSGT00900000141033.b.b.o.a ##26	ENSGT00900000141074.t ##27	ENSGT00390000008061.j.b.c.b.a.a ##28	ENSGT00940000177093	ENSGT00940000159441.k.f ##30	ENSGT01050000244814.b.b.b ##31	ENSGT00390000016654.u ##32	ENSGT00940000162969.i ##33	ENSGT00550000075124.g ##34	ENSGT00390000009864.b ##36	ENSGT00390000010577.b ##37	ENSGT00950000183060.a.b.b.f	ENSGT00390000009228.a.a
Common carp reference	MODERN SPECIES	2	stmn2a (ENSCCRG00000054714) ##8	ENSCCRG00000071321 ##9	ENSCCRG00000052191 ##10	has2 (ENSCCRG00000076666) ##11	sntb1 (ENSCCRG00000005461) ##12	MTBP (ENSCCRG00000005425) ##13	mrpl13 (ENSCCRG00000076250) ##14	COL14A1 (ENSCCRG00000065350) ##15	ENSCCRG00000079224	deptor (ENSCCRG00000012964) ##16	dscc1 (ENSCCRG00000012960) ##17	crabp2a (ENSCCRG00000000451) ##19	ITGA10 (ENSCCRG00000029377) ##20	ENSCCRG00000074510	polr3c (ENSCCRG00000043910) ##21	rnf115a (ENSCCRG00000076214) ##22	dap3 (ENSCCRG00000043398)	ENSCCRG00000043356 ##24	trim109 (ENSCCRG00000081792) ##25	ENSCCRG00000001086 ##26	fdps (ENSCCRG00000001135) ##27	ENSCCRG00000001159 ##28	rcvrn2 (ENSCCRG00000074965) ##30	ENSCCRG00000066163 ##31	ENSCCRG00000072184	cdc42ep5 (ENSCCRG00000022129) ##33	grwd1 (ENSCCRG00000022133) ##34	zgc:174888 (ENSCCRG00000078473) ##35	ENSCCRG00000022139 ##37	ENSCCRG00000029521	josd2 (ENSCCRG00000053608)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	250													crabp2a (ENSSGRG00000025376) ##19	ITGA10 (ENSSGRG00000025369) ##20	polr3c (ENSSGRG00000025148) ##21	rnf115a (ENSSGRG00000025146) ##22	ENSSGRG00000025145 #23	GBA1 (ENSSGRG00000024991) #23	ENSSGRG00000024988	trim109 (ENSSGRG00000024985) ##25	ENSSGRG00000024981 ##26	fdps (ENSSGRG00000024955) ##27	ENSSGRG00000024954 ##28	ENSSGRG00000024953	rcvrn2 (ENSSGRG00000024952) ##30	ENSSGRG00000024951 ##31	atg12 (ENSSGRG00000024950) ##32	cdc42ep5 (ENSSGRG00000024949) ##33	grwd1 (ENSSGRG00000024930) ##34	flcn (ENSSGRG00000024779) ##36	leng9 (ENSSGRG00000024777) ##37
Zebrafish	MODERN SPECIES	7	stmn2a (ENSDARG00000033234) #8	fabp4b (ENSDARG00000002311) #9	ANKIB1 (ENSDARG00000076829) #10	UBE2O (ENSDARG00000100674)	has2 (ENSDARG00000036987) #11	sntb1 (ENSDARG00000041729) #12	MTBP (ENSDARG00000090447) #13	mrpl13 (ENSDARG00000056903) #14	COL14A1 (ENSDARG00000005762) #15	deptor (ENSDARG00000040930) #16	dscc1 (ENSDARG00000019907) #17	ENSDARG00000094303 #18	crabp2a (ENSDARG00000073978) #19	ITGA10 (ENSDARG00000002507) #20	polr3c (ENSDARG00000057562) #21	rnf115a (ENSDARG00000062450) #22	GBA1 (ENSDARG00000076058) #23	dap3 (ENSDARG00000078500)	ENSDARG00000090817	trim109 (ENSDARG00000062429) #25	ENSDARG00000078125 #26	fdps (ENSDARG00000040890) #27	ENSDARG00000095688 #28	ENSDARG00000094385 #29	zgc:162509 (ENSDARG00000070604) #28	ENSDARG00000095047 #29	rcvrn2 (ENSDARG00000019902) #30	ENSDARG00000038052 #31	atg12 (ENSDARG00000069545) #32	cdc42ep5 (ENSDARG00000062390) #33	grwd1 (ENSDARG00000004806) #34
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000235080	ENSGT00940000157781 #7	ENSGT00940000157068.d	ENSGT00940000164547.b.b #9	ENSGT00940000157621 #10	ENSGT00390000010337.B.a.b #11	ENSGT00950000182863.A.b #12	ENSGT00390000003305 #13	ENSGT00390000001515 #14	ENSGT00940000153769.F.n #15	ENSGT00520000055667 #16	ENSGT00390000017400 #17	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423.k #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00940000164374.A.c.a.a.a ##25	ENSGT00940000164374.A.c.a.b #25	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT01100000263479.H.d	ENSGT00940000159441.k #30	ENSGT01050000244814.b.b #31	ENSGT00390000016654 #32	ENSGT00940000162969 #33	ENSGT00550000075124 #34	ENSGT01030000235056 #35	ENSGT00390000009864 #36
Channel catfish	MODERN SPECIES		upp1 (ENSIPUG00000009618) #7	mrps2 (ENSIPUG00000009591)	stmn2a (ENSIPUG00000009580) #8	fabp4b (ENSIPUG00000009571) #9	ankib1 (ENSIPUG00000009420) #10	has2 (ENSIPUG00000009384) #11	sntb1 (ENSIPUG00000009370) #12	mtbp (ENSIPUG00000009168) #13	mrpl13 (ENSIPUG00000009071) #14	col14a1 (ENSIPUG00000008935) #15	deptor (ENSIPUG00000008868) #16	dscc1 (ENSIPUG00000008773) #17	crabp2a (ENSIPUG00000008754) #19	ITGA10 (ENSIPUG00000008701) #20	polr3c (ENSIPUG00000008657) #21	Rnf115 (ENSIPUG00000008615) #22	GBA (ENSIPUG00000008582) #23	dap3 (ENSIPUG00000008508)	ash1l (ENSIPUG00000008470) #24	ENSIPUG00000008434 ##25	NF7B (ENSIPUG00000008380) #25	ENSIPUG00000008355 #26	fdps (ENSIPUG00000008338) #27	ENSIPUG00000008325	VISI (ENSIPUG00000008303) #30	ENSIPUG00000008280 #31	atg12 (ENSIPUG00000008273) #32	cdc42ep5 (ENSIPUG00000008262) #33	grwd1 (ENSIPUG00000008247) #34	zgc:174888 (ENSIPUG00000008234) #35	flcn (ENSIPUG00000008174) #36
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT01030000235080	ENSGT00940000157781 #7	ENSGT00940000157068.d	ENSGT00940000164547.b.b #9	ENSGT00940000157621 #10	ENSGT00390000010337.B.a.b #11	ENSGT00950000182863.A.b #12	ENSGT00390000003305 #13	ENSGT00390000001515 #14	ENSGT00940000153769.F.n #15	ENSGT00520000055667 #16	ENSGT00390000017400 #17	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423.k #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00940000164374.A.c.a.a.a ##25	ENSGT00940000164374.A.c.a.b #25	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT01100000263479.H.d	ENSGT00940000159441.k #30	ENSGT01050000244814.b.b #31	ENSGT00390000016654 #32	ENSGT00940000162969 #33	ENSGT00550000075124 #34	ENSGT01030000235056 #35	ENSGT00390000009864 #36
Electric eel	MODERN SPECIES	33	stmn2a (ENSEEEG00000013238) #8	HEY1 (ENSEEEG00000013222)	fabp4b (ENSEEEG00000013042) #9	ANKIB1 (ENSEEEG00000013010) #10	has2 (ENSEEEG00000013001) #11	sntb1 (ENSEEEG00000012999) #12	MTBP (ENSEEEG00000012992) #13	mrpl13 (ENSEEEG00000012987) #14	COL14A1 (ENSEEEG00000012983) #15	deptor (ENSEEEG00000012975) #16	dscc1 (ENSEEEG00000012974) #17	crabp2a (ENSEEEG00000012971) #19	ENSEEEG00000012970	ITGA10 (ENSEEEG00000012968) #20	polr3c (ENSEEEG00000012964) #21	rnf115a (ENSEEEG00000012963) #22	GBA1 (ENSEEEG00000012886) #23	dap3 (ENSEEEG00000012878)	ENSEEEG00000012876	ENSEEEG00000012871 ##25	trim109 (ENSEEEG00000012868) #25	ENSEEEG00000012867 #26	ENSEEEG00000012866 #26	fdps (ENSEEEG00000012857) #27	ENSEEEG00000012856	rcvrn2 (ENSEEEG00000012855) #30	atg12 (ENSEEEG00000012852) #32	cdc42ep5 (ENSEEEG00000012851) #33	grwd1 (ENSEEEG00000012850) #34	zgc:174888 (ENSEEEG00000012849) #35	flcn (ENSEEEG00000012845) #36
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	28											ENSGT00520000055667 #16	ENSGT00390000017400 #17	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423.k #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00940000164374.A.c.a.a.a ##25	ENSGT00940000164374.A.c.a.b #25	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00940000159441.k #30	ENSGT01050000244814.b.b #31	ENSGT00390000016654 #32	ENSGT00940000162969 #33	ENSGT00550000075124 #34	ENSGT01030000235056 #35	ENSGT00390000009864 #36	ENSGT00390000010577 #37
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	235												ENSPNAG00000018812	crabp2a (ENSPNAG00000018777) #19	ITGA10 (ENSPNAG00000018752) #20	polr3c (ENSPNAG00000018675) #21	rnf115a (ENSPNAG00000018592) #22	GBA1 (ENSPNAG00000018577) #23	dap3 (ENSPNAG00000018561)	ENSPNAG00000018509 #24	ENSPNAG00000003528 ##25	ENSPNAG00000018478	trim109 (ENSPNAG00000018466) #25	ENSPNAG00000018455 #26	fdps (ENSPNAG00000018431) #27	rcvrn2 (ENSPNAG00000018380) #30	ENSPNAG00000018366 #31	atg12 (ENSPNAG00000003524) #32	cdc42ep5 (ENSPNAG00000003522) #33	grwd1 (ENSPNAG00000018330) #34	zgc:174888 (ENSPNAG00000018320) #35	flcn (ENSPNAG00000018306) #36
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	1077									ENSAMXG00000033758	deptor (ENSAMXG00000042482) #16	ENSAMXG00000037113 #18	dscc1 (ENSAMXG00000036662) #17	crabp2a (ENSAMXG00000034510) #19	ENSAMXG00000008293 #20	polr3c (ENSAMXG00000008273) #21	rnf115a (ENSAMXG00000030497) #22	ENSAMXG00000038537
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000164374.A.c.b.b ##25	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT01060000251363	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00940000164374.A.c.a.a ##25	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00940000159441.k #30	ENSGT01050000244814.b.b #31	ENSGT00390000016654 #32	ENSGT00390000006753.A	ENSGT00940000166343.j	ENSGT00940000160411.i	ENSGT00940000167905	ENSGT00390000017736.a
Denticle herring	MODERN SPECIES	15	trim108 (ENSDCDG00000003637) ##25	setdb1b (ENSDCDG00000003641)	arnt (ENSDCDG00000003664)	CERS2 (ENSDCDG00000003829)	ENSDCDG00000003843	RPRD2 (ENSDCDG00000003973)	prpf3 (ENSDCDG00000004010)	CIART (ENSDCDG00000004484)	ca14 (ENSDCDG00000004486)	ENSDCDG00000004488 #18	crabp2a (ENSDCDG00000004489) #19	ITGA10 (ENSDCDG00000004491) #20	polr3c (ENSDCDG00000004503) #21	ITGA10 (ENSDCDG00000004565) #20	polr3c (ENSDCDG00000004716) #21	rnf115a (ENSDCDG00000004727) #22	GBA1 (ENSDCDG00000004773) #23	ASH1L (ENSDCDG00000005288) #24	ENSDCDG00000005293 ##25	ENSDCDG00000005298 #26	fdps (ENSDCDG00000005308) #27	rcvrn2 (ENSDCDG00000005330) #30	ENSDCDG00000005331 #31	atg12 (ENSDCDG00000005333) #32	isoc2 (ENSDCDG00000005335)	ENSDCDG00000005339	ENSDCDG00000005342	epn1a (ENSDCDG00000005349)	sbk3 (ENSDCDG00000005375)	mfap5 (ENSDCDG00000005376)	NECAP1 (ENSDCDG00000005378)
Atlantic herring	MODERN SPECIES	2	setdb1b (ENSCHAG00000006237)	arnt (ENSCHAG00000006547)	skp1 (ENSCHAG00000006968)	CERS2 (ENSCHAG00000006978)	CELF3 (ENSCHAG00000007001)	ENSCHAG00000007023	ENSCHAG00000007077	RPRD2 (ENSCHAG00000008220)	prpf3 (ENSCHAG00000008244)	CIART (ENSCHAG00000008352)	ca14 (ENSCHAG00000008369)	ENSCHAG00000008428 #18	crabp2a (ENSCHAG00000008445) #19	ITGA10 (ENSCHAG00000008460) #20	polr3c (ENSCHAG00000008491) #21	rnf115a (ENSCHAG00000009059) #22	GBA1 (ENSCHAG00000009079) #23	dap3 (ENSCHAG00000009237)	ENSCHAG00000009294	ENSCHAG00000009306 ##25	ENSCHAG00000009337	ENSCHAG00000009360 ##25	ENSCHAG00000009378 #26	fdps (ENSCHAG00000009413) #27	ddc (ENSCHAG00000009527)	ENSCHAG00000009937	ENSCHAG00000010189	ENSCHAG00000011004	ENSCHAG00000011544	VIRMA (ENSCHAG00000011668)	ENSCHAG00000011678
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	59											ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.b ##19	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00390000009491.c	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT00940000162189	ENSGT00390000003552
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000156893	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00390000011497	ENSGT00940000177218	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000004989.b	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00390000009491.c	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263484.C.b.b
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	230	ENSGT00390000011497	ENSGT00950000183094.a.m.d	ENSGT00940000159348.l.a	ENSGT00940000161136.h	ENSGT00940000154716.gc.a.g.a.b	ENSGT00940000161136.g.a	ENSGT00940000154716.gc.a.h	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f.j	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423.n #20	ENSGT00390000002799.c.b #21	ENSGT00940000158423.m #20	ENSGT00390000002799.d #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464.e.a #23	ENSGT00390000004989.b	ENSGT00390000009464.e.b.b #23	ENSGT00390000015248.c.b.b	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00530000063335.B.a.a.a.b	ENSGT00940000159989.v.a.a	ENSGT00950000182891.b.a.b.a	ENSGT00390000009491.c.s.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a.c
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	89	ENSGT00510000047412.a.b	ENSGT00940000154947.l	ENSGT00940000161506.f	ENSGT00390000008859.b.c.i.a	ENSGT00940000154743.A.a.a.k.a	ENSGT00940000160219	ENSGT00390000010641.i.a.c.b	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f.i.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423.n #20	ENSGT00390000002799.c.b #21	ENSGT00940000158423.m #20	ENSGT00390000002799.d #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464.e.a #23	ENSGT00390000004989.b	ENSGT00390000009464.e.b.b #23	ENSGT00390000015248.c.b.b	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00530000063335.B.a.a.a.a	ENSGT00940000159989.u	ENSGT00950000182891.b.a.b.b.a	ENSGT00940000159989.v.b	ENSGT00950000182891.b.a.b.a	ENSGT00390000009491.c.s.b	ENSGT00390000009491.c.s.a
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	279													ENSGT00940000157619.a.a.f #19	ENSGT00940000158423.n #20	ENSGT00390000002799.c.b #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464.e.a #23	ENSGT00390000004989.b	ENSGT00390000015248.c.b.b.a
River trout	DUPLICATION
River trout	MODERN SPECIES	30	ENSSTUG00000038761 #23	ENSSTUG00000038985	rnf115a (ENSSTUG00000038988) #22	polr3c (ENSSTUG00000039006) #21	ITGA10 (ENSSTUG00000039092) #20	crabp2a (ENSSTUG00000039501) #19	ENSSTUG00000039519 #18	arnt (ENSSTUG00000039545)	CERS2 (ENSSTUG00000039665)	CELF3 (ENSSTUG00000039686)	CERS2 (ENSSTUG00000039706)	arnt (ENSSTUG00000039732)	ENSSTUG00000039843 #18	ITGA10 (ENSSTUG00000039883) #20	polr3c (ENSSTUG00000040136) #21	rnf115a (ENSSTUG00000040508) #22	ENSSTUG00000040763 #23	ENSSTUG00000040875	dap3 (ENSSTUG00000040915)	ENSSTUG00000041590 #24	ENSSTUG00000041621 #26	fdps (ENSSTUG00000041654) #27	ENSSTUG00000041868	rab13 (ENSSTUG00000041909)	ENSSTUG00000041934	KCNN3 (ENSSTUG00000042076)	adar (ENSSTUG00000042135)	ENSSTUG00000043285	ENSSTUG00000043307	SNX27 (ENSSTUG00000043327)	ENSSTUG00000043338
River trout	MODERN SPECIES	30	ENSSTUG00000040875	ENSSTUG00000040763 #23	rnf115a (ENSSTUG00000040508) #22	polr3c (ENSSTUG00000040136) #21	ITGA10 (ENSSTUG00000039883) #20	ENSSTUG00000039843 #18	arnt (ENSSTUG00000039732)	CERS2 (ENSSTUG00000039706)	CELF3 (ENSSTUG00000039686)	CERS2 (ENSSTUG00000039665)	arnt (ENSSTUG00000039545)	ENSSTUG00000039519 #18	crabp2a (ENSSTUG00000039501) #19	ITGA10 (ENSSTUG00000039092) #20	polr3c (ENSSTUG00000039006) #21	rnf115a (ENSSTUG00000038988) #22	ENSSTUG00000038985	ENSSTUG00000038761 #23	ENSSTUG00000038736	ENSSTUG00000038717	dap3 (ENSSTUG00000038112)	ENSSTUG00000038045 #24	ENSSTUG00000037998 #26	fdps (ENSSTUG00000037851) #27	ENSSTUG00000037830	rab13 (ENSSTUG00000037804)	ENSSTUG00000048269	ENSSTUG00000048256	ENSSTUG00000048241	ENSSTUG00000048226	ENSSTUG00000048222
Atlantic salmon	DUPLICATION
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	11	ENSSSAG00000107138	ENSSSAG00000099999	ENSSSAG00000094688 #25	ENSSSAG00000050118	ENSSSAG00000005168	ENSSSAG00000113441	PRPF3 (ENSSSAG00000121892)	ENSSSAG00000050867	ENSSSAG00000119214	ENSSSAG00000105110	ENSSSAG00000114447	ENSSSAG00000005601	rabp (ENSSSAG00000045726) #19	ITGA10 (ENSSSAG00000119547) #20	polr3c (ENSSSAG00000006875) #21	rnf115a (ENSSSAG00000101171) #22	ENSSSAG00000111661 #23	asal (ENSSSAG00000005307)	dap3 (ENSSSAG00000057489)	ENSSSAG00000116239 #26	fdps (ENSSSAG00000005943) #27	ENSSSAG00000101786	rab13 (ENSSSAG00000092421)	ENSSSAG00000006134	ENSSSAG00000083944	ENSSSAG00000006245	adar (ENSSSAG00000043633)	ENSSSAG00000007592	ENSSSAG00000007496	ENSSSAG00000007514	ENSSSAG00000024510
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	24	ENSSSAG00000084036	ENSSSAG00000050586	CIART (ENSSSAG00000120551)	ENSSSAG00000050737	RPRD2 (ENSSSAG00000005473)	ENSSSAG00000005496	ENSSSAG00000090396	ENSSSAG00000060546	ENSSSAG00000065111	ENSSSAG00000116457	ENSSSAG00000059839	ENSSSAG00000081758	crabp2a (ENSSSAG00000082499) #19	polr3c (ENSSSAG00000005255) #21	ENSSSAG00000115950	rnf115a (ENSSSAG00000005342) #22	ENSSSAG00000099611 #23	ENSSSAG00000087453	ENSSSAG00000086072	dap3 (ENSSSAG00000005363)	ENSSSAG00000106544	ENSSSAG00000094933 #26	ENSSSAG00000008020 #27	ENSSSAG00000098643	ENSSSAG00000086818	ENSSSAG00000007965	ENSSSAG00000110410	ENSSSAG00000094347	adar (ENSSSAG00000006364)	ENSSSAG00000005257	ENSSSAG00000050443
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	62	ENSGT00940000154947.l.b	ENSGT00940000161506.e	ENSGT00390000008859.b.c.i.a	ENSGT00940000154743.A.a.a.k.b	ENSGT00390000008859.b.c.i.b	ENSGT00940000154743.A.a.a.k.a	ENSGT00940000160219	ENSGT00390000010641.i.a.c.b	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f.i.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423.m.d #20	ENSGT00940000158423.m.c #20	ENSGT00390000002799.d #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464.f #23	ENSGT00390000004989.b	ENSGT00390000015248.c.b.b.c.b	ENSGT00390000009464.e.a #23	ENSGT00390000015248.c.b.b.c.a	ENSGT00940000156698.d.e #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.a.a	ENSGT00940000159989.u	ENSGT00390000009491.c.s.b	ENSGT00950000182891.b.a.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243.m	ENSGT00940000164921.a.d.b.b.a
Rainbow trout	DUPLICATION
Rainbow trout	MODERN SPECIES	21	ENSOMYG00000074213	ENSOMYG00000000883	ENSOMYG00000000802	ENSOMYG00000077358	CIART (ENSOMYG00000000738)	ENSOMYG00000000719	RPRD2 (ENSOMYG00000000645)	ENSOMYG00000000639	ENSOMYG00000065942	ENSOMYG00000063165	ENSOMYG00000053266	ENSOMYG00000052016	ENSOMYG00000025402	ITGA10 (ENSOMYG00000056132) #20	polr3c (ENSOMYG00000000589) #21	rnf115a (ENSOMYG00000000557) #22	ENSOMYG00000062477	dap3 (ENSOMYG00000000989)	ENSOMYG00000002525	ENSOMYG00000040268	dap3 (ENSOMYG00000002465)	ENSOMYG00000001123	dap3 (ENSOMYG00000001940)	ENSOMYG00000066954	ENSOMYG00000000803 #24	ENSOMYG00000062525	ENSOMYG00000000788 #26	FDPS (ENSOMYG00000048301) #27	ENSOMYG00000065192	ENSOMYG00000059856	rab13 (ENSOMYG00000001312)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	11	ENSOMYG00000005324	ENSOMYG00000005055	ENSOMYG00000004943	ENSOMYG00000004840	RPRD2 (ENSOMYG00000004723)	ENSOMYG00000004621	ENSOMYG00000061678	ENSOMYG00000077550	ENSOMYG00000025358	arnt (ENSOMYG00000004218)	ENSOMYG00000003951 #18	crabp2a (ENSOMYG00000054803) #19	ENSOMYG00000050019	ITGA10 (ENSOMYG00000062913) #20	polr3c (ENSOMYG00000002374) #21	rnf115a (ENSOMYG00000002292) #22	ENSOMYG00000002171 #23	ENSOMYG00000065435	dap3 (ENSOMYG00000038844)	ENSOMYG00000056334 #24	ENSOMYG00000077518 #26	FDPS (ENSOMYG00000065726) #27	ENSOMYG00000066250	rab13 (ENSOMYG00000057150)	ENSOMYG00000001212	ENSOMYG00000049714	ENSOMYG00000074469	ENSOMYG00000061800	ENSOMYG00000075182	ENSOMYG00000065652	ENSOMYG00000062953
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	91	ENSGT00390000010641.i.a.d	ENSGT00940000164374.A.l.b #25	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000156893.`b.a	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00390000011497.h	ENSGT00950000183094.a.m.d	ENSGT00940000159348.l.a.a.a	ENSGT00940000154716.gc.a.h	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f.i.b.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423.m.c #20	ENSGT00390000002799.d.a #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464.e.a #23	ENSGT00390000015248.c.b.b.c.a	ENSGT00940000156698.d.e #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.a.a	ENSGT00940000159989.u	ENSGT00390000009491.c.s.b	ENSGT00950000182891.b.a.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243.m	ENSGT00940000164921.a.d.b.b.a	ENSGT00950000183212.C.c.b.a	ENSGT01100000263484.C.b.b.g	ENSGT01100000263484.C.b.b.h
Chinook salmon	DUPLICATION
Chinook salmon	MODERN SPECIES	31	tp53rk (ENSOTSG00005015877)	ENSOTSG00005015881	SERINC3 (ENSOTSG00005015883)	ENSOTSG00005015884	FNDC11 (ENSOTSG00005015885)	stk35l (ENSOTSG00005015886)	HELZ2 (ENSOTSG00005015887)	STMN3 (ENSOTSG00005015967) ##8	ENSOTSG00005015968	ENSOTSG00005015969	arfrp1 (ENSOTSG00005015970)	ENSOTSG00005015972	CHRNA4 (ENSOTSG00005015974)	KCNQ2 (ENSOTSG00005015978)	polr3c (ENSOTSG00005015982) #21	ENSOTSG00005015984 #22	ENSOTSG00005015985	dap3 (ENSOTSG00005015992)	tox2 (ENSOTSG00005016122)	SNTA1 (ENSOTSG00005016124) ##12	cbfa2t2 (ENSOTSG00005016127)	cbfa2t2 (ENSOTSG00005016129)	ENSOTSG00005016272	itcha (ENSOTSG00005016301)	pxmp4 (ENSOTSG00005022785)	ENSOTSG00005022787	eya2 (ENSOTSG00005022789)	ENSOTSG00005022796	rtf2 (ENSOTSG00005022798)	GCNT7 (ENSOTSG00005022803)	tfap2c (ENSOTSG00005022805)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	135									slc6a18 (ENSOTSG00005022637)	slc6a18 (ENSOTSG00005022635)	ENSOTSG00005022538	gstr (ENSOTSG00005022533)	rap2b (ENSOTSG00005022529)	P2RY1 (ENSOTSG00005022528)	polr3c (ENSOTSG00005022526) #21	rnf115a (ENSOTSG00005022507) #22	GBA1 (ENSOTSG00005022495) #23	dap3 (ENSOTSG00005021261)	ENSOTSG00005021239 #26	ENSOTSG00005021237 #26	fdps (ENSOTSG00005021232) #27	ENSOTSG00005021229	rab13 (ENSOTSG00005021204)	ENSOTSG00005021203	ENSOTSG00005021200
Coho salmon	DUPLICATION
Coho salmon	MODERN SPECIES	4	trim108 (ENSOKIG00005039269) #25	setdb1b (ENSOKIG00005039364)	ENSOKIG00005040259	CIART (ENSOKIG00005040281)	ENSOKIG00005040308	RPRD2 (ENSOKIG00005040488)	ENSOKIG00005040601	CELF3 (ENSOKIG00005041453)	CERS2 (ENSOKIG00005041548)	arnt (ENSOKIG00005041615)	ENSOKIG00005041724 #18	crabp2a (ENSOKIG00005041738) #19	ENSOKIG00005041755	ITGA10 (ENSOKIG00005041776) #20	polr3c (ENSOKIG00005041919) #21	rnf115a (ENSOKIG00005041962) #22	GBA1 (ENSOKIG00005042013) #23	dap3 (ENSOKIG00005042271)	ENSOKIG00005042469 #24	ENSOKIG00005042490 #26	ENSOKIG00005042498 #26	fdps (ENSOKIG00005042522) #27	ENSOKIG00005042646	rab13 (ENSOKIG00005042668)	ENSOKIG00005042706	ENSOKIG00005042754	ENSOKIG00005042863	ENSOKIG00005043059	ENSOKIG00005043116	SNX27 (ENSOKIG00005043176)	ENSOKIG00005043295
Coho salmon	MODERN SPECIES	11	ca14 (ENSOKIG00005001426)	ENSOKIG00005001422	prpf3 (ENSOKIG00005001403)	ENSOKIG00005001395	ENSOKIG00005001393	ENSOKIG00005001205	ENSOKIG00005001131	ENSOKIG00005001124	ENSOKIG00005001119	ENSOKIG00005001113	CERS2 (ENSOKIG00005001110)	ARNT (ENSOKIG00005001010)	ENSOKIG00005000959 #18	ITGA10 (ENSOKIG00005000888) #20	polr3c (ENSOKIG00005000854) #21	rnf115a (ENSOKIG00005000844) #22	ENSOKIG00005000826 #23	ENSOKIG00005000818	dap3 (ENSOKIG00005000813)	ENSOKIG00005000810	ENSOKIG00005000806	dap3 (ENSOKIG00005000789)	dap3 (ENSOKIG00005000696)	ENSOKIG00005000626 #26	fdps (ENSOKIG00005000578) #27	ENSOKIG00005000533	ENSOKIG00005000508	rab13 (ENSOKIG00005000497)	KCNN3 (ENSOKIG00005000486)	adar (ENSOKIG00005000401)	ENSOKIG00005000343
Huchen	DUPLICATION
Huchen	MODERN SPECIES	4294														ENSHHUG00000048643 #20	polr3c (ENSHHUG00000048630) #21	rnf115a (ENSHHUG00000048622) #22	GBA1 (ENSHHUG00000048567) #23	ENSHHUG00000048562	ENSHHUG00000048560	dap3 (ENSHHUG00000048494)
Huchen	MODERN SPECIES	4049															polr3c (ENSHHUG00000005217) #21	rnf115a (ENSHHUG00000005224) #22	ENSHHUG00000005241 #23	ENSHHUG00000005246 #23	ENSHHUG00000005252	dap3 (ENSHHUG00000005288)	ENSHHUG00000005352	ENSHHUG00000005372
Northern pike	MODERN SPECIES	19	NDUFV1 (ENSELUG00000014045)	setdb1b (ENSELUG00000013948)	ca14 (ENSELUG00000013739)	ENSELUG00000013661	prpf3 (ENSELUG00000013624)	RPRD2 (ENSELUG00000013579)	ENSELUG00000013552	ENSELUG00000013504	CELF3 (ENSELUG00000013477)	CERS2 (ENSELUG00000013435)	arnt (ENSELUG00000013390)	ENSELUG00000013307 #18	ENSELUG00000013287 ##19	ITGA10 (ENSELUG00000013251) #20	polr3c (ENSELUG00000013209) #21	rnf115a (ENSELUG00000013123) #22	GBA1 (ENSELUG00000013090) #23	ENSELUG00000013061	dap3 (ENSELUG00000000477)	ENSELUG00000012966 #24	ENSELUG00000012945 #26	fdps (ENSELUG00000012905) #27	ENSELUG00000012835	rab13 (ENSELUG00000012801)	RS27 (ENSELUG00000031053)	ENSELUG00000012748	ENSELUG00000027573	ENSELUG00000012564	adar (ENSELUG00000012523)	ENSELUG00000032503	ENSELUG00000033729
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000171776	ENSGT00940000154716.hc	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.b	ENSGT00390000009491.c	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.b	ENSGT00390000009491.c	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000266029	ENSGT01030000234782	ENSGT00940000162189
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	276	ENSHCOG00000006882	GABBR1 (ENSHCOG00000006927)	tnfb (ENSHCOG00000006938)	ENSHCOG00000000206	glrx3 (ENSHCOG00000006958)	bag6 (ENSHCOG00000006980)	tspan13a (ENSHCOG00000006990)	ENSHCOG00000006996	gpatch4 (ENSHCOG00000007016)	ENSHCOG00000007132	lmna (ENSHCOG00000007151)	ENSHCOG00000007164	rab11al (ENSHCOG00000000232)	rab25b (ENSHCOG00000007187)	lamtor2 (ENSHCOG00000007197)	rnf115a (ENSHCOG00000007208) #22	GBA1 (ENSHCOG00000007223) #23	dap3 (ENSHCOG00000007242)	ENSHCOG00000007261 #24	ENSHCOG00000007269 #26	fdps (ENSHCOG00000007300) #27	ENSHCOG00000007316	rab13 (ENSHCOG00000007440)	ENSHCOG00000007456	ENSHCOG00000007469	adar (ENSHCOG00000007480)	ENSHCOG00000007531	SNX27 (ENSHCOG00000007557)	ENSHCOG00000007573	ENSHCOG00000000693	ENSHCOG00000007586
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591	ENSGT01100000263852	ENSGT01030000234782
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591	ENSGT01100000263852	ENSGT01030000234782
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01060000248708	ENSGT00940000154947.l	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591	ENSGT01100000263852	ENSGT01030000234782
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT01060000248708	ENSGT00940000154947.l	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591	ENSGT01100000263852	ENSGT01030000234782
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	97	ENSLBEG00000025807	setdb1b (ENSLBEG00000025862)	arnt (ENSLBEG00000026037)	CERS2 (ENSLBEG00000026082)	CELF3 (ENSLBEG00000026140)	ENSLBEG00000026210	ENSLBEG00000026238	RPRD2 (ENSLBEG00000026261)	prpf3 (ENSLBEG00000026310)	CIART (ENSLBEG00000026371)	ca14 (ENSLBEG00000026406)	ENSLBEG00000026474 #18	crabp2a (ENSLBEG00000026486) #19	ITGA10 (ENSLBEG00000026514) #20	polr3c (ENSLBEG00000026567) #21	rnf115a (ENSLBEG00000026606) #22	GBA1 (ENSLBEG00000026624) #23	dap3 (ENSLBEG00000026641)	ENSLBEG00000026666 #26	fdps (ENSLBEG00000026711) #27	ENSLBEG00000026739	rab13 (ENSLBEG00000026779)	ENSLBEG00000000272	KCNN3 (ENSLBEG00000000309)	adar (ENSLBEG00000000352)	ENSLBEG00000000410	SNX27 (ENSLBEG00000000470)	ENSLBEG00000000532	GSDME (ENSLBEG00000000548)	pals2a (ENSLBEG00000000577)	NPY (ENSLBEG00000000596)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT01060000248708	ENSGT00940000154947.l	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591.c.a	ENSGT01100000263852	ENSGT01100000263591.d
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000161506	ENSGT01060000248708	ENSGT00940000154947.l	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000174526	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591.c.a	ENSGT01030000234782	ENSGT00940000162189
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000161506	ENSGT01060000248708	ENSGT00940000154947.l	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00390000011497	ENSGT00940000164936.a	ENSGT00940000156893	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000174526	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01030000234782	ENSGT00940000162189	ENSGT00390000003552
Lumpfish	MODERN SPECIES	7	cyp11c1 (ENSCLMG00005010177)	clk2b (ENSCLMG00005010167)	setdb1b (ENSCLMG00005010098)	arnt (ENSCLMG00005008812)	CERS2 (ENSCLMG00005008805)	CELF3 (ENSCLMG00005008804)	ENSCLMG00005008803	ENSCLMG00005002688	ENSCLMG00005002666	prpf3 (ENSCLMG00005002646)	ENSCLMG00005002641	ca14 (ENSCLMG00005002637)	crabp2a (ENSCLMG00005002635) #19	ITGA10 (ENSCLMG00005002630) #20	polr3c (ENSCLMG00005002406) #21	rnf115a (ENSCLMG00005002402) #22	GBA1 (ENSCLMG00005002138) #23	dap3 (ENSCLMG00005002077)	ENSCLMG00005002067	ENSCLMG00005002063 #26	fdps (ENSCLMG00005002034) #27	ENSCLMG00005002032	rab13 (ENSCLMG00005002029)	ENSCLMG00005002025	KCNN3 (ENSCLMG00005002023)	adar (ENSCLMG00005001707)	ENSCLMG00005001377	SNX27 (ENSCLMG00005012787)	ENSCLMG00005012786	ENSCLMG00005012778	ENSCLMG00005012774
Stickleback	MODERN SPECIES	19	ENSGACG00000011666	clk2b (ENSGACG00000011669)	ENSGACG00000011670	setdb1b (ENSGACG00000011675)	arnt (ENSGACG00000011686)	CERS2 (ENSGACG00000011695)	CELF3 (ENSGACG00000011707)	ENSGACG00000011722	ENSGACG00000011734	ENSGACG00000011789	prpf3 (ENSGACG00000011792)	ca14 (ENSGACG00000011803)	crabp2a (ENSGACG00000011813) #19	ITGA10 (ENSGACG00000011820) #20	polr3c (ENSGACG00000011829) #21	rnf115a (ENSGACG00000011841) #22	GBA1 (ENSGACG00000011848) #23	dap3 (ENSGACG00000011859)	ENSGACG00000011873 #26	fdps (ENSGACG00000011874) #27	ENSGACG00000011917	rab13 (ENSGACG00000011925)	ENSGACG00000011934	KCNN3 (ENSGACG00000011942)	adar (ENSGACG00000011951)	ENSGACG00000011957	SNX27 (ENSGACG00000011965)	ENSGACG00000011970	TMEM107 (ENSGACG00000011983)	TRIM46 (ENSGACG00000011991)	slc50a1 (ENSGACG00000012002)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000008859.b.c	ENSGT00940000161506	ENSGT00940000154947.l	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000174526	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591.c.a	ENSGT01030000234782	ENSGT00940000162189
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	7	clk2b (ENSCGOG00000002513)	setdb1b (ENSCGOG00000002878)	arnt (ENSCGOG00000002983)	CERS2 (ENSCGOG00000003927)	CELF3 (ENSCGOG00000003981)	ENSCGOG00000004667	ENSCGOG00000004683	ENSCGOG00000005086	ENSCGOG00000005088	prpf3 (ENSCGOG00000005098)	CIART (ENSCGOG00000005717)	ca14 (ENSCGOG00000005720)	crabp2a (ENSCGOG00000005736) #19	ITGA10 (ENSCGOG00000005744) #20	polr3c (ENSCGOG00000005762) #21	rnf115a (ENSCGOG00000005990) #22	GBA1 (ENSCGOG00000005999) #23	dap3 (ENSCGOG00000006143)	ENSCGOG00000006549	ENSCGOG00000006551 #26	fdps (ENSCGOG00000006560) #27	ENSCGOG00000006947	ENSCGOG00000006992	ENSCGOG00000007084	ENSCGOG00000007138	adar (ENSCGOG00000007148)	ENSCGOG00000007597	SNX27 (ENSCGOG00000007628)	ENSCGOG00000008146	ENSCGOG00000008147	ENSCGOG00000008148
Pike perch	MODERN SPECIES	15	clk2b (ENSSLUG00000011632)	setdb1b (ENSSLUG00000010791)	arnt (ENSSLUG00000008830)	ENSSLUG00000008743	CERS2 (ENSSLUG00000008735)	CELF3 (ENSSLUG00000008730)	ENSSLUG00000008552	ENSSLUG00000006094	ENSSLUG00000005975	prpf3 (ENSSLUG00000005921)	ENSSLUG00000005895	ca14 (ENSSLUG00000005873)	crabp2a (ENSSLUG00000005867) #19	ITGA10 (ENSSLUG00000005771) #20	polr3c (ENSSLUG00000005739) #21	rnf115a (ENSSLUG00000005724) #22	GBA1 (ENSSLUG00000005653) #23	dap3 (ENSSLUG00000005359)	ENSSLUG00000005291	ENSSLUG00000005273 #26	fdps (ENSSLUG00000005158) #27	ENSSLUG00000012718	rab13 (ENSSLUG00000012708)	ENSSLUG00000012690	KCNN3 (ENSSLUG00000012668)	adar (ENSSLUG00000012261)	ENSSLUG00000012233	SNX27 (ENSSLUG00000012186)	ENSSLUG00000012163	ENSSLUG00000012160	ENSSLUG00000012150
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000154947.l	ENSGT00940000174801	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591.d	ENSGT01030000234782	ENSGT00940000162189
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	8	pklr (ENSSAUG00010018486)	cyp11c1 (ENSSAUG00010017931)	clk2b (ENSSAUG00010017904)	ENSSAUG00010017900	setdb1b (ENSSAUG00010017197)	ENSSAUG00010017149	ENSSAUG00010016669	RPRD2 (ENSSAUG00010016655)	prpf3 (ENSSAUG00010016468)	ENSSAUG00010016459	ca14 (ENSSAUG00010016450)	ENSSAUG00010016443 #18	crabp2a (ENSSAUG00010016437) #19	ITGA10 (ENSSAUG00010016335) #20	polr3c (ENSSAUG00010016062) #21	rnf115a (ENSSAUG00010016057) #22	GBA1 (ENSSAUG00010015806) #23	ENSSAUG00010015774 #24	ENSSAUG00010015770 #26	fdps (ENSSAUG00010015664) #27	ENSSAUG00010015657	rab13 (ENSSAUG00010015654)	ENSSAUG00010015651	ENSSAUG00010015641	adar (ENSSAUG00010015349)	ENSSAUG00010015341	SNX27 (ENSSAUG00010014932)	ENSSAUG00010014923	ENSSAUG00010014921	ENSSAUG00010014920	ENSSAUG00010014918
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000154947.l	ENSGT00940000174801	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591.d	ENSGT01030000234782	ENSGT00940000162189
European seabass	MODERN SPECIES	6	ENSDLAG00005006550	clk2b (ENSDLAG00005006824)	ENSDLAG00005033042	ENSDLAG00005006849	ENSDLAG00005007305	ENSDLAG00005007549	ENSDLAG00005007638	ENSDLAG00005007823	RPRD2 (ENSDLAG00005033013)	ENSDLAG00005009487	CIART (ENSDLAG00005009769)	ENSDLAG00005009781	crabp2a (ENSDLAG00005009798) #19	ITGA10 (ENSDLAG00005009841) #20	polr3c (ENSDLAG00005011069) #21	rnf115a (ENSDLAG00005011219) #22	ENSDLAG00005011233 #23	dap3 (ENSDLAG00005011245)	ENSDLAG00005011394 #24	ENSDLAG00005011406 #26	fdps (ENSDLAG00005011432) #27	ENSDLAG00005011531	ENSDLAG00005028206	ENSDLAG00005014946	ENSDLAG00005011602	adar (ENSDLAG00005011759)	ENSDLAG00005011779	ENSDLAG00005011804	ENSDLAG00005031554	ENSDLAG00005030187	ENSDLAG00005034403
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	484	cyp11c1 (ENSLCRG00005005457)	setdb1b (ENSLCRG00005005494)	arnt (ENSLCRG00005006183)	CERS2 (ENSLCRG00005006848)	CELF3 (ENSLCRG00005006865)	ENSLCRG00005006884	ENSLCRG00005006911	ENSLCRG00005008092	prpf3 (ENSLCRG00005008101)	ENSLCRG00005008109	ca14 (ENSLCRG00005008112)	ENSLCRG00005008115 #18	crabp2a (ENSLCRG00005008118) #19	ITGA10 (ENSLCRG00005008129) #20	polr3c (ENSLCRG00005008200) #21	rnf115a (ENSLCRG00005008231) #22	GBA1 (ENSLCRG00005008261) #23	dap3 (ENSLCRG00005008373)	ENSLCRG00005008803 #26	fdps (ENSLCRG00005008808) #27	ENSLCRG00005008811	ENSLCRG00005008813	ENSLCRG00005008818	ENSLCRG00005008821	adar (ENSLCRG00005008829)	ENSLCRG00005009006	SNX27 (ENSLCRG00005009012)	ENSLCRG00005009363	ENSLCRG00005009364	s100a10b (ENSLCRG00005009365)	krtcap2 (ENSLCRG00005009366)
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	14														ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT00990000210733	ENSGT01030000234782	ENSGT00940000162189
Fugu	MODERN SPECIES	19	aicda (ENSTRUG00000007079)	nat14 (ENSTRUG00000007241)	ENSTRUG00000007250	il-11a (ENSTRUG00000027860)	rasip1 (ENSTRUG00000007545)	cox6b2 (ENSTRUG00000025595)	ENSTRUG00000007710	ENSTRUG00000008107	trpv6 (ENSTRUG00000009207)	ENSTRUG00000024780	zgc:92606 (ENSTRUG00000019706)	ENSTRUG00000020896	m6pr (ENSTRUG00000009804)	ITGA10 (ENSTRUG00000009933) #20	polr3c (ENSTRUG00000010726) #21	rnf115a (ENSTRUG00000025017) #22	GBA1 (ENSTRUG00000010884) #23	dap3 (ENSTRUG00000011013)	ENSTRUG00000030558 #26	fdps (ENSTRUG00000022938) #27	ENSTRUG00000011298	rab13 (ENSTRUG00000024177)	RPS27 (ENSTRUG00000031079)	KCNN3 (ENSTRUG00000009204)	adar (ENSTRUG00000008870)	ENSTRUG00000028031	SNX27 (ENSTRUG00000007624)	ENSTRUG00000031029	ENSTRUG00000028951	ENSTRUG00000024845	ENSTRUG00000023896
Tetraodon	MODERN SPECIES	23	isoc2 (ENSTNIG00000008112)	ENSTNIG00000008113	epn1a (ENSTNIG00000008114)	sbk3 (ENSTNIG00000008115)	mfap5 (ENSTNIG00000008116)	ENSTNIG00000008117	aicda (ENSTNIG00000008118)	nat14 (ENSTNIG00000008119)	ZNF628 (ENSTNIG00000001164)	ENSTNIG00000000618	rasip1 (ENSTNIG00000008120)	cox6b2 (ENSTNIG00000008121)	ENSTNIG00000013823	ITGA10 (ENSTNIG00000019500) #20	polr3c (ENSTNIG00000019501) #21	rnf115a (ENSTNIG00000019502) #22	ENSTNIG00000008297	trpv6 (ENSTNIG00000008298)	si:dkey-26c10.5 (ENSTNIG00000008299)	zgc:92606 (ENSTNIG00000008300)	ENSTNIG00000008301	ENSTNIG00000018313	GBA1 (ENSTNIG00000018314) #23	dap3 (ENSTNIG00000018315)	ENSTNIG00000018316 #24	ENSTNIG00000018317 #26	fdps (ENSTNIG00000018318) #27	ENSTNIG00000018319	ENSTNIG00000002315	adar (ENSTNIG00000018320)	ENSTNIG00000018321
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.b	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591	ENSGT01100000263852
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000174801	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591	ENSGT01030000234782	ENSGT00940000162189	ENSGT00390000003552
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000174801	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591	ENSGT01030000234782	ENSGT00940000162189	ENSGT00390000003552
Climbing perch	MODERN SPECIES	7	clk2b (ENSATEG00000023506)	ENSATEG00000023520	ENSATEG00000023530	ENSATEG00000023554	ENSATEG00000023560	ENSATEG00000023565	ENSATEG00000023568	RPRD2 (ENSATEG00000023579)	ENSATEG00000023583	CIART (ENSATEG00000029124)	ENSATEG00000023599	ENSATEG00000023603 #18	crabp2a (ENSATEG00000023607) #19	ITGA10 (ENSATEG00000023613) #20	polr3c (ENSATEG00000023618) #21	rnf115a (ENSATEG00000023621) #22	ENSATEG00000023624 #23	dap3 (ENSATEG00000023629)	ENSATEG00000023636 #24	ENSATEG00000026620 #26	fdps (ENSATEG00000023652) #27	ENSATEG00000029768	ENSATEG00000023662	ENSATEG00000029068	ENSATEG00000023679	adar (ENSATEG00000023684)	ENSATEG00000023690	ENSATEG00000023696	ENSATEG00000023700	ENSATEG00000029883	s100a10b (ENSATEG00000029568)
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	7	ENSBSLG00000022373	setdb1b (ENSBSLG00000022420)	arnt (ENSBSLG00000022577)	CERS2 (ENSBSLG00000022825)	CELF3 (ENSBSLG00000022896)	ADAMTSL4 (ENSBSLG00000022961)	ENSBSLG00000023026	RPRD2 (ENSBSLG00000023861)	prpf3 (ENSBSLG00000023892)	CIART (ENSBSLG00000023958)	ca14 (ENSBSLG00000023965)	crabp2a (ENSBSLG00000023990) #19	ENSBSLG00000023995	ITGA10 (ENSBSLG00000023999) #20	polr3c (ENSBSLG00000024030) #21	rnf115a (ENSBSLG00000024055) #22	GBA1 (ENSBSLG00000024067) #23	dap3 (ENSBSLG00000024407)	ENSBSLG00000024433 #24	ENSBSLG00000024451 #26	fdps (ENSBSLG00000013271) #27	ENSBSLG00000013617	rab13 (ENSBSLG00000013644)	ENSBSLG00000013690	KCNN3 (ENSBSLG00000014098)	adar (ENSBSLG00000014371)	ENSBSLG00000014707	SNX27 (ENSBSLG00000014764)	ENSBSLG00000014939	ENSBSLG00000014945	krtcap2 (ENSBSLG00000014949)
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	7	clk2b (ENSMAMG00000015189)	ENSMAMG00000015176	ENSMAMG00000015157	ENSMAMG00000015125	ENSMAMG00000015079	ENSMAMG00000015054	ENSMAMG00000015032	RPRD2 (ENSMAMG00000015021)	ENSMAMG00000014968	CIART (ENSMAMG00000014954)	ENSMAMG00000014923	ENSMAMG00000014912 #18	crabp2a (ENSMAMG00000025387) #19	ITGA10 (ENSMAMG00000014814) #20	polr3c (ENSMAMG00000014770) #21	rnf115a (ENSMAMG00000027527) #22	ENSMAMG00000014708 #23	ENSMAMG00000014691	ENSMAMG00000014682 #26	fdps (ENSMAMG00000014658) #27	ENSMAMG00000014620	rab13 (ENSMAMG00000014602)	ENSMAMG00000026447	ENSMAMG00000014521	adar (ENSMAMG00000014398)	ENSMAMG00000014369	ENSMAMG00000014325	ENSMAMG00000014312	ENSMAMG00000014301	ENSMAMG00000014288	ENSMAMG00000014258
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000174801	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.b	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591	ENSGT01100000263852
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000011379	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.a	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591
Turbot	MODERN SPECIES		ENSSMAG00000015398	ENSSMAG00000015418	ENSSMAG00000015501	ENSSMAG00000015634	ENSSMAG00000015652	ENSSMAG00000015682	RPRD2 (ENSSMAG00000025690)	ENSSMAG00000030192	ENSSMAG00000015739	CIART (ENSSMAG00000015791)	ENSSMAG00000015835	ENSSMAG00000015902 #18	ENSSMAG00000030369 ##19	ITGA10 (ENSSMAG00000015935) #20	polr3c (ENSSMAG00000016000) #21	rnf115a (ENSSMAG00000016084) #22	dap3 (ENSSMAG00000016184)	ENSSMAG00000036592 #26	fdps (ENSSMAG00000016292) #27	ENSSMAG00000016344	ENSSMAG00000031583	ENSSMAG00000016376	ENSSMAG00000016390	ENSSMAG00000016408	adar (ENSSMAG00000016465)	ENSSMAG00000016519	ENSSMAG00000016561	ENSSMAG00000016627	ENSSMAG00000016684	ENSSMAG00000034885	ENSSMAG00000025230
Tongue sole	MODERN SPECIES	4	setdb1b (ENSCSEG00000002988)	ENSCSEG00000002976	arnt (ENSCSEG00000002962)	CERS2 (ENSCSEG00000002591)	CELF3 (ENSCSEG00000002581)	ENSCSEG00000002578	ENSCSEG00000002562	RPRD2 (ENSCSEG00000002555)	prpf3 (ENSCSEG00000002532)	CIART (ENSCSEG00000002522)	ca14 (ENSCSEG00000002477)	ENSCSEG00000002472 #18	crabp2a (ENSCSEG00000002466) #19	ITGA10 (ENSCSEG00000002443) #20	polr3c (ENSCSEG00000002425) #21	rnf115a (ENSCSEG00000002414) #22	GBA1 (ENSCSEG00000002392) #23	dap3 (ENSCSEG00000002386)	ENSCSEG00000002383 #24	ENSCSEG00000002373 #26	fdps (ENSCSEG00000002370) #27	ENSCSEG00000002367	rab13 (ENSCSEG00000002358)	rps27.1 (ENSCSEG00000002346)	ENSCSEG00000002338	adar (ENSCSEG00000002318)	ENSCSEG00000002287	SNX27 (ENSCSEG00000002263)	DNAH5 (ENSCSEG00000002215)	ENSCSEG00000002205	ENSCSEG00000002203
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000011379	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591	ENSGT01100000263852	ENSGT01030000234782
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00390000011379	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000174526	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591	ENSGT01030000234782	ENSGT00940000162189
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2521	ENSSLDG00000015189	setdb1b (ENSSLDG00000015209)	arnt (ENSSLDG00000015250)	CERS2 (ENSSLDG00000015279)	CELF3 (ENSSLDG00000015302)	ENSSLDG00000015340	ENSSLDG00000015367	RPRD2 (ENSSLDG00000015396)	prpf3 (ENSSLDG00000015423)	CIART (ENSSLDG00000015471)	ca14 (ENSSLDG00000015501)	ENSSLDG00000015537 #18	crabp2a (ENSSLDG00000015550) #19	ITGA10 (ENSSLDG00000015567) #20	polr3c (ENSSLDG00000015614) #21	rnf115a (ENSSLDG00000015661) #22	GBA1 (ENSSLDG00000015679) #23	dap3 (ENSSLDG00000015702)	ENSSLDG00000015713	ENSSLDG00000015729 #26	fdps (ENSSLDG00000015757) #27	ENSSLDG00000015799	ENSSLDG00000015823	rps27.2 (ENSSLDG00000015842)
Greater amberjack	MODERN SPECIES	88	setdb1b (ENSSDUG00000007513)	arnt (ENSSDUG00000007319)	CERS2 (ENSSDUG00000007278)	CELF3 (ENSSDUG00000007239)	ENSSDUG00000007219	ENSSDUG00000007180	RPRD2 (ENSSDUG00000007155)	ENSSDUG00000007143	prpf3 (ENSSDUG00000006840)	CIART (ENSSDUG00000006818)	ca14 (ENSSDUG00000006746)	ENSSDUG00000006722 #18	crabp2a (ENSSDUG00000006713) #19	ITGA10 (ENSSDUG00000006650) #20	polr3c (ENSSDUG00000006590) #21	rnf115a (ENSSDUG00000006528) #22	GBA1 (ENSSDUG00000006503) #23	dap3 (ENSSDUG00000006478)	ENSSDUG00000006458	ENSSDUG00000006434 #26	fdps (ENSSDUG00000006385) #27	ENSSDUG00000006343	ENSSDUG00000006307	rps27.2 (ENSSDUG00000006257)	ENSSDUG00000006219	adar (ENSSDUG00000006183)	ENSSDUG00000006023	SNX27 (ENSSDUG00000005951)	ENSSDUG00000005923	ENSSDUG00000005908	ENSSDUG00000005903
Barramundi perch	MODERN SPECIES	185	ENSLCAG00010024574	setdb1b (ENSLCAG00010024595)	arnt (ENSLCAG00010024634)	CERS2 (ENSLCAG00010024661)	CELF3 (ENSLCAG00010024666)	ENSLCAG00010024687	ENSLCAG00010024719	RPRD2 (ENSLCAG00010024785)	prpf3 (ENSLCAG00010024818)	CIART (ENSLCAG00010024858)	ca14 (ENSLCAG00010024866)	ENSLCAG00010024871 #18	crabp2a (ENSLCAG00010024874) #19	ITGA10 (ENSLCAG00010024930) #20	polr3c (ENSLCAG00010025028) #21	rnf115a (ENSLCAG00010025041) #22	GBA1 (ENSLCAG00010025081) #23	dap3 (ENSLCAG00010025142)	ENSLCAG00010025169 #24	ENSLCAG00010025182 #26	fdps (ENSLCAG00010025211) #27	ENSLCAG00010025241	ENSLCAG00010025250	ENSLCAG00010025262	ENSLCAG00010025297	adar (ENSLCAG00010025308)	ENSLCAG00010025318	SNX27 (ENSLCAG00010025341)	ENSLCAG00010025370	ENSLCAG00010025372	ENSLCAG00010025375
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01030000234782	ENSGT00940000162189	ENSGT00390000003552
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01030000234782	ENSGT00940000162189	ENSGT00390000003552
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000174801	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01030000234782	ENSGT00940000162189	ENSGT00390000003552
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000165886.b	ENSGT00940000154947.l	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000174526	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01030000234782	ENSGT00940000162189	ENSGT00390000003552
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000161506	ENSGT00940000165886.b	ENSGT00940000154947.l	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000174526	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01030000234782	ENSGT00940000162189	ENSGT00390000003552
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	466						CELF3 (ENSHBUG00000003367)	ENSHBUG00000003381	ENSHBUG00000003411	RPRD2 (ENSHBUG00000003420)	prpf3 (ENSHBUG00000003493)	CIART (ENSHBUG00000003503)	ca14 (ENSHBUG00000003531)	crabp2a (ENSHBUG00000003556) #19	ITGA10 (ENSHBUG00000003585) #20	polr3c (ENSHBUG00000003619) #21	rnf115a (ENSHBUG00000003634) #22	GBA1 (ENSHBUG00000003642) #23	dap3 (ENSHBUG00000003658)	ENSHBUG00000003667	ENSHBUG00000003677 #26	fdps (ENSHBUG00000003690) #27	ENSHBUG00000003704	ENSHBUG00000003728	rps27.2 (ENSHBUG00000003753)	KCNN3 (ENSHBUG00000003795)	adar (ENSHBUG00000000091)	ENSHBUG00000003860	SNX27 (ENSHBUG00000003931)	ENSHBUG00000003952	s100a10b (ENSHBUG00000003959)	krtcap2 (ENSHBUG00000003975)
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000161506	ENSGT00940000165886.b	ENSGT00940000154947.l	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000174526	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01030000234782	ENSGT00940000162189	ENSGT00390000003552
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000161506	ENSGT00940000165886.b	ENSGT00940000154947.l	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000174526	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01030000234782	ENSGT00940000162189	ENSGT00390000003552
Eastern happy	MODERN SPECIES	2	rbp5 (ENSACLG00000020557)	clk2b (ENSACLG00000020529)	setdb1b (ENSACLG00000020489)	arnt (ENSACLG00000020427)	CERS2 (ENSACLG00000020370)	CELF3 (ENSACLG00000020342)	ENSACLG00000020296	ENSACLG00000020262	RPRD2 (ENSACLG00000020253)	prpf3 (ENSACLG00000020127)	CIART (ENSACLG00000020117)	ca14 (ENSACLG00000020088)	crabp2a (ENSACLG00000020063) #19	ITGA10 (ENSACLG00000020004) #20	polr3c (ENSACLG00000019970) #21	rnf115a (ENSACLG00000019901) #22	GBA1 (ENSACLG00000019877) #23	dap3 (ENSACLG00000019804)	ENSACLG00000019798	ENSACLG00000019774 #26	fdps (ENSACLG00000019710) #27	ENSACLG00000019675	ENSACLG00000019658	ENSACLG00000019643	rps27.2 (ENSACLG00000019602)	KCNN3 (ENSACLG00000019548)	adar (ENSACLG00000019448)	ENSACLG00000019229	SNX27 (ENSACLG00000019165)	ENSACLG00000019155	s100a10b (ENSACLG00000019151)
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1093	rbp5 (ENSMZEG00005016127)	clk2b (ENSMZEG00005016119)	setdb1b (ENSMZEG00005016099)	arnt (ENSMZEG00005016081)	CERS2 (ENSMZEG00005016071)	CELF3 (ENSMZEG00005016013)	ENSMZEG00005015998	ENSMZEG00005015989	RPRD2 (ENSMZEG00005015983)	prpf3 (ENSMZEG00005015970)	CIART (ENSMZEG00005015953)	ca14 (ENSMZEG00005015942)	crabp2a (ENSMZEG00005015933) #19	ITGA10 (ENSMZEG00005015917) #20	polr3c (ENSMZEG00005015882) #21	rnf115a (ENSMZEG00005015878) #22	GBA1 (ENSMZEG00005015871) #23	dap3 (ENSMZEG00005015864)	ENSMZEG00005015860	ENSMZEG00005015850 #26	fdps (ENSMZEG00005015843) #27	ENSMZEG00005015829	ENSMZEG00005015817	rps27.2 (ENSMZEG00005015801)	KCNN3 (ENSMZEG00005015793)	adar (ENSMZEG00005015777)	ENSMZEG00005015513	SNX27 (ENSMZEG00005015476)	ENSMZEG00005015458	s100a10b (ENSMZEG00005015453)	krtcap2 (ENSMZEG00005015446)
P. nyererei	MODERN SPECIES	340	rbp5 (ENSPNYG00000003932)	clk2b (ENSPNYG00000003959)	setdb1b (ENSPNYG00000003997)	arnt (ENSPNYG00000004092)	CERS2 (ENSPNYG00000004111)	CELF3 (ENSPNYG00000004167)	ENSPNYG00000004203	ENSPNYG00000004232	RPRD2 (ENSPNYG00000004252)	prpf3 (ENSPNYG00000004279)	CIART (ENSPNYG00000004366)	ca14 (ENSPNYG00000004389)	crabp2a (ENSPNYG00000004411) #19	ITGA10 (ENSPNYG00000004429) #20	polr3c (ENSPNYG00000004504) #21	rnf115a (ENSPNYG00000004530) #22	GBA1 (ENSPNYG00000004543) #23	dap3 (ENSPNYG00000004551)	ENSPNYG00000004578	ENSPNYG00000004585 #26	fdps (ENSPNYG00000004603) #27	ENSPNYG00000004630	ENSPNYG00000004681	rps27.2 (ENSPNYG00000004718)	KCNN3 (ENSPNYG00000004786)	adar (ENSPNYG00000004823)	ENSPNYG00000004885	SNX27 (ENSPNYG00000004988)	ENSPNYG00000005030	s100a10b (ENSPNYG00000005042)	krtcap2 (ENSPNYG00000005070)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	421	clk2b (ENSNBRG00000003097)	setdb1b (ENSNBRG00000003147)	arnt (ENSNBRG00000003317)	CERS2 (ENSNBRG00000003338)	CELF3 (ENSNBRG00000003364)	ENSNBRG00000003412	ENSNBRG00000003429	ENSNBRG00000003446	prpf3 (ENSNBRG00000003462)	ENSNBRG00000003513	ca14 (ENSNBRG00000003555)	ENSNBRG00000003588 #18	crabp2a (ENSNBRG00000003596) #19	ITGA10 (ENSNBRG00000003630) #20	polr3c (ENSNBRG00000003707) #21	rnf115a (ENSNBRG00000003743) #22	GBA1 (ENSNBRG00000003782) #23	dap3 (ENSNBRG00000003880)	ENSNBRG00000003898 #26	fdps (ENSNBRG00000003942) #27	ENSNBRG00000004012	rab13 (ENSNBRG00000004124)	rps27.2 (ENSNBRG00000004408)	KCNN3 (ENSNBRG00000004458)	adar (ENSNBRG00000004510)	ENSNBRG00000004856	SNX27 (ENSNBRG00000004884)	ENSNBRG00000004933	s100a10b (ENSNBRG00000004944)	krtcap2 (ENSNBRG00000004954)	tmem107 (ENSNBRG00000004974)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	2	clk2b (ENSONIG00000006457)	ENSONIG00000035023	setdb1b (ENSONIG00000006454)	arnt (ENSONIG00000006431)	CERS2 (ENSONIG00000006425)	CELF3 (ENSONIG00000006421)	ENSONIG00000006410	ENSONIG00000006402	RPRD2 (ENSONIG00000006400)	prpf3 (ENSONIG00000006394)	CIART (ENSONIG00000032306)	ca14 (ENSONIG00000006390)	crabp2a (ENSONIG00000006388) #19	ITGA10 (ENSONIG00000006374) #20	polr3c (ENSONIG00000006370) #21	rnf115 (ENSONIG00000042941) #22	GBA1 (ENSONIG00000006359) #23	dap3 (ENSONIG00000006354)	ENSONIG00000006351 #24	ENSONIG00000028896 #26	fdps (ENSONIG00000006344) #27	ENSONIG00000006343	ENSONIG00000039850	ENSONIG00000032846	KCNN3 (ENSONIG00000006336)	adar (ENSONIG00000006335)	ENSONIG00000006328	SNX27 (ENSONIG00000006322)	ENSONIG00000032138	s100a10b (ENSONIG00000006321)	krtcap2 (ENSONIG00000031207)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	791	setdb1b (ENSACIG00000007359)	arnt (ENSACIG00000007549)	CERS2 (ENSACIG00000007675)	CELF3 (ENSACIG00000007698)	ENSACIG00000007730	ENSACIG00000007759	ENSACIG00000007828	ENSACIG00000007864	prpf3 (ENSACIG00000007876)	ENSACIG00000007911	ca14 (ENSACIG00000007927)	ENSACIG00000007970 #18	crabp2a (ENSACIG00000007975) #19	ITGA10 (ENSACIG00000008000) #20	polr3c (ENSACIG00000008064) #21	rnf115a (ENSACIG00000008100) #22	GBA1 (ENSACIG00000008199) #23	dap3 (ENSACIG00000008298)	ENSACIG00000008471	ENSACIG00000008477 #26	ENSACIG00000008516	rab13 (ENSACIG00000008584)	ENSACIG00000008615	KCNN3 (ENSACIG00000008628)	ENSACIG00000008652	adar (ENSACIG00000008672)
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	18											ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.a.a.b.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000264774	ENSGT01100000263852	ENSGT01030000234782
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000007266	ENSGT00940000160040.A	ENSGT00940000161355	ENSGT00940000159919.a	ENSGT00390000007801	ENSGT00940000158021.d	ENSGT00390000014827	ENSGT00940000165795.c	ENSGT00390000003552	ENSGT01030000234782	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000174526	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.a.a.b.b
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	1													ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000174526	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.a.a.b.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a.i	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000156893	ENSGT00940000155356.d.b.b.b.a.c.b.a.b	ENSGT01030000234782	ENSGT00390000003552	ENSGT00940000165795.c
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	3482			ENSAOCG00000011289	timm13 (ENSAOCG00000011298)	enc3 (ENSAOCG00000011316)	TRIM46 (ENSAOCG00000011370)	TMEM107 (ENSAOCG00000011397)	ENSAOCG00000002674	krtcap2 (ENSAOCG00000011426)	ENSAOCG00000011438	ENSAOCG00000011508	ca14 (ENSAOCG00000011538)	crabp2a (ENSAOCG00000011559) #19	ITGA10 (ENSAOCG00000011628) #20	polr3c (ENSAOCG00000011695) #21	rnf115a (ENSAOCG00000011711) #22
Orange clownfish	MODERN SPECIES	21	tgfb2 (ENSAPEG00000005097)	rrp15 (ENSAPEG00000005083)	vegfaa (ENSAPEG00000005064)	ENSAPEG00000005044	ENSAPEG00000004926	SNX27 (ENSAPEG00000004880)	ENSAPEG00000004798	adar (ENSAPEG00000004762)	ENSAPEG00000004743	KCNN3 (ENSAPEG00000004701)	tgfb2 (ENSAPEG00000004688)	ENSAPEG00000004639	crabp2a (ENSAPEG00000004598) #19	ITGA10 (ENSAPEG00000004512) #20	polr3c (ENSAPEG00000004426) #21	rnf115a (ENSAPEG00000004351) #22	GBA1 (ENSAPEG00000004328) #23	dap3 (ENSAPEG00000004308)	ENSAPEG00000004289	ENSAPEG00000004268 #26	fdps (ENSAPEG00000004219) #27	ENSAPEG00000004159	ENSAPEG00000004121	ENSAPEG00000004072	ENSAPEG00000004024 #18	ca14 (ENSAPEG00000004009)	ENSAPEG00000003957	ENSAPEG00000003946	krtcap2 (ENSAPEG00000003919)	ENSAPEG00000003904	TMEM107 (ENSAPEG00000003891)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	920														ITGA10 (ENSAPOG00000008659) #20	polr3c (ENSAPOG00000008722) #21	rnf115a (ENSAPOG00000008775) #22	TRIM46 (ENSAPOG00000008796)	TMEM107 (ENSAPOG00000008820)	ENSAPOG00000008834	krtcap2 (ENSAPOG00000008853)	ENSAPOG00000000242	ca14 (ENSAPOG00000008899)	crabp2a (ENSAPOG00000008940) #19	ENSAPOG00000008967 #20
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	443											ca14 (ENSSPAG00000022549)	ENSSPAG00000022543 #18	crabp2a (ENSSPAG00000022540) #19	ITGA10 (ENSSPAG00000022533) #20	polr3c (ENSSPAG00000022520) #21	rnf115a (ENSSPAG00000022514) #22	GBA1 (ENSSPAG00000022508) #23	dap3 (ENSSPAG00000022501)	ENSSPAG00000022497 #24	ENSSPAG00000022479 #26	fdps (ENSSPAG00000022468) #27	ENSSPAG00000022454	ENSSPAG00000022440	ENSSPAG00000022424	KCNN3 (ENSSPAG00000022408)	adar (ENSSPAG00000022397)	ENSSPAG00000022354	SNX27 (ENSSPAG00000022329)	ENSSPAG00000022315	ENSSPAG00000022302	ENSSPAG00000022297
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.a	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01090000260242	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591	ENSGT01100000263852	ENSGT01030000234782
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01090000260242	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.a	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591.l
Indian medaka	MODERN SPECIES	5	CERS2 (ENSOMEG00000009154)	CELF3 (ENSOMEG00000009131)	ENSOMEG00000009061	ENSOMEG00000009022	ENSOMEG00000008953	ENSOMEG00000008935	prpf3 (ENSOMEG00000000940)	CIART (ENSOMEG00000008836)	ca14 (ENSOMEG00000008792)	ENSOMEG00000008727	ENSOMEG00000008710	ENSOMEG00000008697 #18	crabp2a (ENSOMEG00000008684) #19	ITGA10 (ENSOMEG00000008660) #20	polr3c (ENSOMEG00000008558) #21	rnf115a (ENSOMEG00000008504) #22	GBA1 (ENSOMEG00000008476) #23	dap3 (ENSOMEG00000008436)	ENSOMEG00000008402 #24	ENSOMEG00000008381 #26	fdps (ENSOMEG00000008297) #27	ENSOMEG00000008258	rab13 (ENSOMEG00000008210)	rps27.1 (ENSOMEG00000008171)	KCNN3 (ENSOMEG00000008116)	adar (ENSOMEG00000008019)	ENSOMEG00000007844	SNX27 (ENSOMEG00000007740)	ENSOMEG00000007671	ENSOMEG00000000192	ENSOMEG00000000725
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	7	ENSOJAG00000001960	setdb1b (ENSOJAG00000020866)	arnt (ENSOJAG00000020250)	CERS2 (ENSOJAG00000020190)	CELF3 (ENSOJAG00000020014)	ENSOJAG00000019873	ENSOJAG00000019837	ENSOJAG00000019800	ENSOJAG00000019793	prpf3 (ENSOJAG00000019697)	ca14 (ENSOJAG00000019663)	ENSOJAG00000019652	crabp2a (ENSOJAG00000019646) #19	ITGA10 (ENSOJAG00000019505) #20	polr3c (ENSOJAG00000019474) #21	rnf115a (ENSOJAG00000019441) #22	GBA1 (ENSOJAG00000019129) #23	dap3 (ENSOJAG00000018913)	ENSOJAG00000018892 ##26	ENSOJAG00000018878 #26	fdps (ENSOJAG00000018806) #27	ENSOJAG00000018789	ENSOJAG00000018768	ENSOJAG00000018750	KCNN3 (ENSOJAG00000018584)	adar (ENSOJAG00000018317)	ENSOJAG00000018299	SNX27 (ENSOJAG00000018117)	ENSOJAG00000018045	ENSOJAG00000018031	ENSOJAG00000018018
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000154947.l	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01090000260242	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591.n	ENSGT01100000263591.m	ENSGT01100000263852
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	7	ENSORLG00000022513	setdb1b (ENSORLG00000010602)	arnt (ENSORLG00000010551)	CERS2 (ENSORLG00000010512)	CELF3 (ENSORLG00000010447)	ENSORLG00000010424	ENSORLG00000010391	RPRD2 (ENSORLG00000010343)	prpf3 (ENSORLG00000010330)	CIART (ENSORLG00000010295)	ca14 (ENSORLG00000010291)	ENSORLG00000024479 #18	crabp2a (ENSORLG00000010277) #19	ITGA10 (ENSORLG00000010249) #20	polr3c (ENSORLG00000010133) #21	rnf115a (ENSORLG00000010107) #22	gba (ENSORLG00000010079) #23	dap3 (ENSORLG00000010053)	ENSORLG00000022122 #24	ENSORLG00000028077 #26	fdps (ENSORLG00000010041) #27	ENSORLG00000010008	ENSORLG00000025395	ENSORLG00000009985	ENSORLG00000009976	adar (ENSORLG00000009955)	ENSORLG00000009945	SNX27 (ENSORLG00000009926)	ENSORLG00000023516	ENSORLG00000030425	ENSORLG00000026610
Chinese medaka	MODERN SPECIES	467	cyp11c1 (ENSOSIG00000018566)	setdb1b (ENSOSIG00000018480)	arnt (ENSOSIG00000017723)	CERS2 (ENSOSIG00000017658)	CELF3 (ENSOSIG00000017648)	ENSOSIG00000017644	ENSOSIG00000016026	ENSOSIG00000016009	ENSOSIG00000016008	ca14 (ENSOSIG00000016006)	ENSOSIG00000016001	ENSOSIG00000016000 #18	crabp2a (ENSOSIG00000015997) #19	ITGA10 (ENSOSIG00000015893) #20	polr3c (ENSOSIG00000015878) #21	rnf115a (ENSOSIG00000015876) #22	GBA1 (ENSOSIG00000015867) #23	dap3 (ENSOSIG00000015667)	ENSOSIG00000015664 #24	ENSOSIG00000015661 #26	fdps (ENSOSIG00000015565) #27	ENSOSIG00000015562	ENSOSIG00000015561	ENSOSIG00000015560	KCNN3 (ENSOSIG00000015437)	adar (ENSOSIG00000014326)	ENSOSIG00000014238	SNX27 (ENSOSIG00000013081)	ENSOSIG00000013067	ENSOSIG00000013064	ENSOSIG00000013063
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000174526	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591	ENSGT01100000263852
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000154947.l	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000174526	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243.h	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591	ENSGT01100000263852
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	81	ENSKMAG00000001130	setdb1b (ENSKMAG00000001197)	arnt (ENSKMAG00000001221)	CERS2 (ENSKMAG00000001244)	CELF3 (ENSKMAG00000001269)	ENSKMAG00000001330	ENSKMAG00000001354	RPRD2 (ENSKMAG00000001366)	prpf3 (ENSKMAG00000001390)	ENSKMAG00000001480	ca14 (ENSKMAG00000001496)	ENSKMAG00000001521 #18	crabp2a (ENSKMAG00000001532) #19	ITGA10 (ENSKMAG00000001549) #20	polr3c (ENSKMAG00000001574) #21	rnf115a (ENSKMAG00000001643) #22	GBA1 (ENSKMAG00000001722) #23	dap3 (ENSKMAG00000001741)	ENSKMAG00000001749	ENSKMAG00000001771 #26	fdps (ENSKMAG00000001823) #27	ENSKMAG00000001878	rab13 (ENSKMAG00000001908)	ENSKMAG00000001970	ENSKMAG00000002017	adar (ENSKMAG00000002086)	ENSKMAG00000002115	SNX27 (ENSKMAG00000002250)	ENSKMAG00000002335	ENSKMAG00000002363	ENSKMAG00000002379
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1614	CACNG6B (ENSNFUG00015020525)	u2af2a (ENSNFUG00015020527)	arnt (ENSNFUG00015020531)	CERS2 (ENSNFUG00015020543)	CELF3B (ENSNFUG00015020545)	ENSNFUG00015020548	ADAMTSL4 (ENSNFUG00015020567)	ENSNFUG00015020820	ENSNFUG00015020860	ENSNFUG00015021786	ca14 (ENSNFUG00015021788)	ENSNFUG00015021792 #18	crabp2a (ENSNFUG00015021796) #19	ITGA10 (ENSNFUG00015021802) #20	polr3c (ENSNFUG00015022032) #21	RNF115 (ENSNFUG00015022042) #22	GBA1 (ENSNFUG00015022075) #23	dap3 (ENSNFUG00015022122)	ENSNFUG00015022125	ENSNFUG00015022127 #24	ENSNFUG00015022129 #26	FDPS (ENSNFUG00015022132) #27	FAM189B (ENSNFUG00015022142)	rab13 (ENSNFUG00015022144)	ENSNFUG00015022145	KCNN3 (ENSNFUG00015022149)	ENSNFUG00015022168	ENSNFUG00015022170	SNX27B (ENSNFUG00015022194)	ENSNFUG00015022563	ENSNFUG00015022564
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000174526	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00530000063335.B.a.a.a.b	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000174526	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591	ENSGT01030000234782
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000174526	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591	ENSGT01030000234782	ENSGT00940000162189	ENSGT00390000003552
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	36					ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f.g	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000174526	ENSGT00940000156698.d #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a.g	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01030000234782	ENSGT00940000162189	ENSGT00390000003552	ENSGT00390000014827
Amazon molly	MODERN SPECIES	328				CERS2 (ENSPFOG00000013108)	CELF3 (ENSPFOG00000013307)	ENSPFOG00000013385	ENSPFOG00000013444	ENSPFOG00000013631	prpf3 (ENSPFOG00000013638)	CIART (ENSPFOG00000013718)	ca14 (ENSPFOG00000013735)	ENSPFOG00000020915 #18	crabp2a (ENSPFOG00000013813) #19	ITGA10 (ENSPFOG00000013856) #20	polr3c (ENSPFOG00000014106) #21	rnf115a (ENSPFOG00000014156) #22	GBA1 (ENSPFOG00000014161) #23	dap3 (ENSPFOG00000014273)	ENSPFOG00000024568	ENSPFOG00000022464 #24	ENSPFOG00000024756 #26	fdps (ENSPFOG00000014325) #27	ENSPFOG00000014386	ENSPFOG00000014418	ENSPFOG00000014443	rps27.1 (ENSPFOG00000014457)	ENSPFOG00000014468	KCNN3 (ENSPFOG00000014512)	adar (ENSPFOG00000014636)	ENSPFOG00000014681	SNX27 (ENSPFOG00000014797)
Sailfin molly	MODERN SPECIES	1597														ITGA10 (ENSPLAG00000018881) #20	polr3c (ENSPLAG00000018932) #21	rnf115a (ENSPLAG00000018983) #22	GBA1 (ENSPLAG00000018987) #23	dap3 (ENSPLAG00000018996)	ENSPLAG00000019014	ENSPLAG00000019024 #26	fdps (ENSPLAG00000019056) #27
Guppy	MODERN SPECIES	446	arnt (ENSPREG00000017435)	CERS2 (ENSPREG00000017409)	CELF3 (ENSPREG00000017378)	ENSPREG00000017342	ENSPREG00000017312	ENSPREG00000017293	RPRD2 (ENSPREG00000017269)	ENSPREG00000017263	prpf3 (ENSPREG00000017216)	ENSPREG00000017198	ca14 (ENSPREG00000017170)	ENSPREG00000017155 #18	crabp2a (ENSPREG00000017134) #19	ITGA10 (ENSPREG00000017097) #20	polr3c (ENSPREG00000017050) #21	rnf115a (ENSPREG00000017007) #22	MATN2 (ENSPREG00000016949)	ENSPREG00000016922	ENSPREG00000016898	ubr5 (ENSPREG00000016584)	ENSPREG00000016506	AZIN1 (ENSPREG00000016481)	atp6v1c1a (ENSPREG00000016458)	ENSPREG00000016409	rnf144b (ENSPREG00000016377)	sqlea (ENSPREG00000016354)	oxr1b (ENSPREG00000016303)	ENSPREG00000016243	zfpm2a (ENSPREG00000016198)	dpys (ENSPREG00000016163)	DCSTAMP (ENSPREG00000016152)
Platyfish	MODERN SPECIES	17	setdb1b (ENSXMAG00000016600)	arnt (ENSXMAG00000016545)	CERS2 (ENSXMAG00000016508)	CELF3 (ENSXMAG00000016475)	ENSXMAG00000016454	ENSXMAG00000016382	RPRD2 (ENSXMAG00000016368)	prpf3 (ENSXMAG00000016347)	ENSXMAG00000029619	ENSXMAG00000026817	ca14 (ENSXMAG00000016324)	ENSXMAG00000019942 #18	crabp2a (ENSXMAG00000016304) #19	ITGA10 (ENSXMAG00000016260) #20	polr3c (ENSXMAG00000016215) #21	rnf115a (ENSXMAG00000021206) #22	GBA1 (ENSXMAG00000016183) #23	dap3 (ENSXMAG00000016165)	ENSXMAG00000027540 #24	ENSXMAG00000021842 #26	fdps (ENSXMAG00000016139) #27	ENSXMAG00000016123	ENSXMAG00000016094	ENSXMAG00000016092	KCNN3 (ENSXMAG00000016062)	adar (ENSXMAG00000010557)	ENSXMAG00000010571	SNX27 (ENSXMAG00000010582)	ENSXMAG00000025120	s100a10b (ENSXMAG00000025542)	krtcap2 (ENSXMAG00000028313)
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154947.l	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716.gc.a	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000156893	ENSGT01030000234784 #18	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000174526	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074.w #27	ENSGT00900000141074.x #27	ENSGT00530000063335.B.a.a.b	ENSGT00940000159989	ENSGT00950000182891.b.a.b	ENSGT00950000182904.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C.c.b	ENSGT01100000263591.j	ENSGT01030000234782
Mummichog	MODERN SPECIES	2225	clk2b (ENSFHEG00000022294)	setdb1b (ENSFHEG00000022195)	arnt (ENSFHEG00000022149)	CERS2 (ENSFHEG00000021996)	CELF3 (ENSFHEG00000021947)	ENSFHEG00000021887	ENSFHEG00000021877	RPRD2 (ENSFHEG00000021755)	prpf3 (ENSFHEG00000021746)	CIART (ENSFHEG00000021699)	ca14 (ENSFHEG00000021685)	ENSFHEG00000021670 #18	crabp2a (ENSFHEG00000021658) #19	ITGA10 (ENSFHEG00000021641) #20	polr3c (ENSFHEG00000000872) #21	rnf115a (ENSFHEG00000021540) #22	GBA1 (ENSFHEG00000021460) #23	dap3 (ENSFHEG00000021426)	ENSFHEG00000021416	ENSFHEG00000021401 #26	fdps (ENSFHEG00000021384) #27	fdps (ENSFHEG00000021296) #27	ENSFHEG00000000524	rab13 (ENSFHEG00000021221)	ENSFHEG00000021179	KCNN3 (ENSFHEG00000021145)	adar (ENSFHEG00000021099)	ENSFHEG00000021075	SNX27 (ENSFHEG00000020901)	ENSFHEG00000000615	ENSFHEG00000020863
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	329															polr3c (ENSCVAG00000022458) #21	rnf115a (ENSCVAG00000022495) #22	GBA1 (ENSCVAG00000022505) #23	dap3 (ENSCVAG00000022528)	ENSCVAG00000022543	ENSCVAG00000022613 #26	fdps (ENSCVAG00000022619) #27	ENSCVAG00000022631	ENSCVAG00000022649	ENSCVAG00000022667	KCNN3 (ENSCVAG00000022704)	adar (ENSCVAG00000022718)	ENSCVAG00000022917	SNX27 (ENSCVAG00000022996)	ENSCVAG00000023003	ENSCVAG00000023009	ENSCVAG00000000593
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	7	ENSMMDG00005007077	setdb1b (ENSMMDG00005006874)	arnt (ENSMMDG00005006813)	CERS2 (ENSMMDG00005006785)	CELF3 (ENSMMDG00005006781)	ENSMMDG00005006773	ENSMMDG00005001699	RPRD2 (ENSMMDG00005001477)	prpf3 (ENSMMDG00005001387)	CIART (ENSMMDG00005001358)	ca14 (ENSMMDG00005001354)	ENSMMDG00005001343 #18	crabp2a (ENSMMDG00005001337) #19	ITGA10 (ENSMMDG00005001325) #20	polr3c (ENSMMDG00005001235) #21	rnf115a (ENSMMDG00005016848) #22	GBA1 (ENSMMDG00005016674) #23	dap3 (ENSMMDG00005016665)	ENSMMDG00005016662	ENSMMDG00005016658 #26	fdps (ENSMMDG00005016653) #27	ENSMMDG00005016649	rab13 (ENSMMDG00005016644)	rps27.2 (ENSMMDG00005016636)	ENSMMDG00005016631	KCNN3 (ENSMMDG00005016624)	adar (ENSMMDG00005015430)	ENSMMDG00005015405	SNX27 (ENSMMDG00005015389)	s100w (ENSMMDG00005015374)	ENSMMDG00005015373
Cod	MODERN SPECIES	2	ENSGMOG00000012039	ENSGMOG00000023251	ENSGMOG00000034945	glipr2l (ENSGMOG00000016072)	ENSGMOG00000031680	ENSGMOG00000016100	ENSGMOG00000008535	ENSGMOG00000008551	ENSGMOG00000033521	ENSGMOG00000025191	ENSGMOG00000023405 #18	ENSGMOG00000037061	ENSGMOG00000026151	ITGA10 (ENSGMOG00000018921) #20	polr3c (ENSGMOG00000018937) #21	rnf115a (ENSGMOG00000018949) #22	ENSGMOG00000018954 #23	dap3 (ENSGMOG00000018965)	ENSGMOG00000031890 #26	fdps (ENSGMOG00000018991) #27	ENSGMOG00000019001	rab13 (ENSGMOG00000035469)	ENSGMOG00000019033	ENSGMOG00000035529	adar (ENSGMOG00000019052)	ENSGMOG00000019076	ENSGMOG00000034031	ENSGMOG00000019093	s100w (ENSGMOG00000032708)	ENSGMOG00000029217	ENSGMOG00000023656
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154947.k	ENSGT00940000164374.A #25	ENSGT00940000157471.a	ENSGT00940000157585	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.f	ENSGT00940000154716	ENSGT00940000161136	ENSGT00940000159348	ENSGT00950000183094.a.m	ENSGT00390000011497	ENSGT00390000018360.a	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.a #19	ENSGT00940000158423 #20	ENSGT00390000002799 #21	ENSGT00940000157203.c #22	ENSGT00390000009464 #23	ENSGT00390000015248	ENSGT00940000156698.a #24	ENSGT00900000141033.b.b #26	ENSGT00900000141074 #27	ENSGT00530000063335.B.a.a	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.a.a	ENSGT00940000157243	ENSGT00940000164921.a	ENSGT00950000183212.C	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795	ENSGT00390000003552
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	9	trim108 (ENSSFOG00015022196) #25	setdb1b (ENSSFOG00015022183)	arnt (ENSSFOG00015022161)	CERS2 (ENSSFOG00015030046)	celf3a (ENSSFOG00015022130)	ENSSFOG00015022109	ENSSFOG00015022086	RPRD2 (ENSSFOG00015022056)	prpf3 (ENSSFOG00015022014)	CIART (ENSSFOG00015021990)	ENSSFOG00015021982	ca14 (ENSSFOG00015021971)	crabp2a (ENSSFOG00015021942) #19	ITGA10 (ENSSFOG00015021906) #20	polr3c (ENSSFOG00015021863) #21	rnf115a (ENSSFOG00015021845) #22	GBA1 (ENSSFOG00015021833) #23	dap3 (ENSSFOG00015021822)	ash1l (ENSSFOG00015021808) #24	fdps (ENSSFOG00015021791) #27	ENSSFOG00015021777	ENSSFOG00015021754	ENSSFOG00015021749	KCNN3 (ENSSFOG00015010219)	adar (ENSSFOG00015021716)	ENSSFOG00015021703	snx27b (ENSSFOG00015021679)	icn (ENSSFOG00015021668)	s100a10a (ENSSFOG00015021665)	krtcap2 (ENSSFOG00015024681)	TRIM46 (ENSSFOG00015021605)
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	80											ENSPKIG00000015039 #18	ENSPKIG00000015024 #18	crabp2b (ENSPKIG00000015001) ##19	ITGA10 (ENSPKIG00000014936) #20	polr3c (ENSPKIG00000014883) #21	rnf115a (ENSPKIG00000014855) #22	GBA1 (ENSPKIG00000014818) #23	dap3 (ENSPKIG00000014766)	ash1l (ENSPKIG00000014675) #24	ENSPKIG00000014636 #26	fdps (ENSPKIG00000014612) #27	ENSPKIG00000014582	ENSPKIG00000014528	ENSPKIG00000014499	KCNN3 (ENSPKIG00000014466)	adar (ENSPKIG00000014435)	ENSPKIG00000014375	snx27b (ENSPKIG00000014279)	s100w (ENSPKIG00000014179)	icn (ENSPKIG00000014153)	s100a10b (ENSPKIG00000014135)
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157203.d ##22
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	127								ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00940000154716.hc	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.b.a	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.b	ENSGT00940000171931	ENSGT00940000168219	ENSGT00940000166691	ENSGT00940000159107.i	ENSGT00530000063948.a	ENSGT00940000154489.B.a	ENSGT00950000183065.B.f
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000015518	ENSGT00940000155256.d.b.b	ENSGT00940000158616	ENSGT00990000204044	ENSGT00730000111056.h	ENSGT00940000165835.b	ENSGT00390000003308.a.b	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.b.a	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.a	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00940000165795	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00390000010118.c.b	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.b
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	53	ENSGT00940000165835.b	ENSGT00390000003308.a.b	ENSGT00950000182929.B.a.b	ENSGT00950000182929.B.b.a	ENSGT00530000064050.a	ENSGT00940000154703.i	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00940000164936.a	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.b.a	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.a	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00940000162189	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00390000010118.c.b	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.b
Atlantic herring	MODERN SPECIES	10	ENSCHAG00000012111	apoa4a (ENSCHAG00000012113)	apoa4a (ENSCHAG00000012121)	ENSCHAG00000012150	ENSCHAG00000012162	psmd4a (ENSCHAG00000012208)	ENSCHAG00000012508	ENSCHAG00000012826	cers2a (ENSCHAG00000012840)	celf3a (ENSCHAG00000012901)	rprd2a (ENSCHAG00000012933)	ENSCHAG00000012941	mrps21 (ENSCHAG00000012972)	crabp2b (ENSCHAG00000012995) ##19	scamp3 (ENSCHAG00000013007)	ENSCHAG00000013044 ##22	lrrc71 (ENSCHAG00000014195)	rps27.1 (ENSCHAG00000014262)	chrna11 (ENSCHAG00000014329)	snx27a (ENSCHAG00000014659)	s100a10b (ENSCHAG00000014774)	trim46b (ENSCHAG00000014786)	dpm3 (ENSCHAG00000014792)	efna1a (ENSCHAG00000014797)	ENSCHAG00000014804	si:dkey-266f7.9 (ENSCHAG00000014808)	ENSCHAG00000014814	s100a11 (ENSCHAG00000014822)	s100u (ENSCHAG00000014831)	s100s (ENSCHAG00000014838)	ENSCHAG00000014859
Denticle herring	MODERN SPECIES	12	ENSDCDG00000028334	lipea (ENSDCDG00000028235)	ENSDCDG00000028055	tomm40l (ENSDCDG00000028040)	ENSDCDG00000028025	apoa4a (ENSDCDG00000028021)	apoea (ENSDCDG00000027971)	psmd4a (ENSDCDG00000027909)	cers2a (ENSDCDG00000027900)	celf3a (ENSDCDG00000027831)	ENSDCDG00000027819	ciarta (ENSDCDG00000027818)	mrps21 (ENSDCDG00000027816)	crabp2b (ENSDCDG00000027815) ##19	scamp3 (ENSDCDG00000027813)	ENSDCDG00000027810 ##22	ash1l (ENSDCDG00000026916) ##24	lrrc71 (ENSDCDG00000026899)	rps27.1 (ENSDCDG00000026898)	chrna11 (ENSDCDG00000026894)	snx27a (ENSDCDG00000026420)	s100a10b (ENSDCDG00000026404)	trim46b (ENSDCDG00000026385)	dpm3 (ENSDCDG00000026381)	efna1a (ENSDCDG00000026379)	ENSDCDG00000026377	si:dkey-266f7.9 (ENSDCDG00000026373)	cks1b (ENSDCDG00000026369)	ENSDCDG00000026366	s100a11 (ENSDCDG00000026364)	s100u (ENSDCDG00000026362)
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	64	ENSGT00940000166681	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00940000165795	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00940000157471.b	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01060000248708.b	ENSGT00940000154743.A.a.b	ENSGT00390000010641.i.b	ENSGT00940000163756.c.a	ENSGT01030000235274	ENSGT01010000223632	ENSGT00940000164382.b.a	ENSGT00510000046803.b.a.b	ENSGT00940000153298.i.b	ENSGT00940000159033	ENSGT00950000183106.a.b.a
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	75	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00940000165795	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00940000154716.hc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00940000157471.b	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01060000248708.b	ENSGT00940000154743.A.a.b	ENSGT00390000010641.i.b	ENSGT00940000163756.c.a	ENSGT01030000235274	ENSGT01010000223632	ENSGT00940000164382.b.a	ENSGT00510000046803.b.a.b	ENSGT00940000153298.i.b	ENSGT00940000159033	ENSGT00950000183106.a.b.a
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	61	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00940000165795	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00940000154716.hc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00940000157471.b	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01060000248708.b	ENSGT00940000154743.A.a.b	ENSGT00390000010641.i.b	ENSGT00940000163756.c.a	ENSGT01030000235274	ENSGT01010000223632	ENSGT00940000164382.b.a	ENSGT00510000046803.b.a.b	ENSGT00940000153298.i.b	ENSGT00940000159033	ENSGT00950000183106.a.b.a
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	82	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00940000165795	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.a.b	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00940000154716.hc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00940000157471.b	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01060000248708.b	ENSGT00940000154743.A.a.b	ENSGT00390000010641.i.b	ENSGT00940000163756.c.a.e
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	251	ENSPNAG00000004701	efna1a (ENSPNAG00000017599)	dpm3 (ENSPNAG00000017579)	trim46b (ENSPNAG00000017549)	s100a10a (ENSPNAG00000017454)	snx27a (ENSPNAG00000017445)	chrna11 (ENSPNAG00000017403)	rps27.1 (ENSPNAG00000017336)	cers2a (ENSPNAG00000017316)	celf3a (ENSPNAG00000017276)	rprd2a (ENSPNAG00000017205)	ENSPNAG00000017143	mrps21 (ENSPNAG00000017115)	crabp2b (ENSPNAG00000017056) ##19	scamp3 (ENSPNAG00000003461)	ENSPNAG00000003460 ##22	ash1l (ENSPNAG00000016981) ##24	lrrc71 (ENSPNAG00000016823)	setdb1a (ENSPNAG00000003444)	clk2a (ENSPNAG00000016768)	si:ch211-81a5.8 (ENSPNAG00000016739)	ENSPNAG00000016712	ndufv1 (ENSPNAG00000016658)	ENSPNAG00000016594
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	15	dpm3 (ENSAMXG00000025548)	trim46b (ENSAMXG00000009789)	s100a10a (ENSAMXG00000009806)	snx27a (ENSAMXG00000009816)	chrna11 (ENSAMXG00000009834)	ENSAMXG00000033744	ENSAMXG00000001908	cers2a (ENSAMXG00000009905)	celf3a (ENSAMXG00000009926)	ENSAMXG00000036838	rprd2a (ENSAMXG00000042601)	ciarta (ENSAMXG00000035450)	mrps21 (ENSAMXG00000032876)	crabp2b (ENSAMXG00000032195) ##19	scamp3 (ENSAMXG00000032081)	ENSAMXG00000042305 ##22	ash1l (ENSAMXG00000009994) ##24	lrrc71 (ENSAMXG00000031291)	setdb1a (ENSAMXG00000010030)	clk2a (ENSAMXG00000010041)	si:ch211-81a5.8 (ENSAMXG00000010045)	ENSAMXG00000039788	ENSAMXG00000036542	slc2a3a (ENSAMXG00000009319)	ENSAMXG00000029103	cacng6a (ENSAMXG00000030494)	cacng8a (ENSAMXG00000043635)	cacng7a (ENSAMXG00000029894)	ENSAMXG00000009395	GRIK5 (ENSAMXG00000014408)	ENSAMXG00000043063
Electric eel	MODERN SPECIES	59	si:dkey-266f7.9 (ENSEEEG00000006638)	ENSEEEG00000006640	efna1a (ENSEEEG00000006642)	dpm3 (ENSEEEG00000006645)	trim46b (ENSEEEG00000006649)	s100a10a (ENSEEEG00000006673)	snx27a (ENSEEEG00000006678)	chrna11 (ENSEEEG00000006704)	ENSEEEG00000006713	cers2a (ENSEEEG00000006778)	celf3a (ENSEEEG00000006785)	rprd2a (ENSEEEG00000006790)	mrps21 (ENSEEEG00000006801)	crabp2b (ENSEEEG00000006804) ##19	scamp3 (ENSEEEG00000006822)	ENSEEEG00000006823 ##22	lrrc71 (ENSEEEG00000006827)	setdb1a (ENSEEEG00000006828)	ENSEEEG00000006829	clk2a (ENSEEEG00000006851)	ENSEEEG00000007649	ndufv1 (ENSEEEG00000007653)	vamp1a (ENSEEEG00000007690)	IFFO1 (ENSEEEG00000007691)	ENSEEEG00000007706	ing4 (ENSEEEG00000007813)	FAM131B (ENSEEEG00000007815)	clcn1a (ENSEEEG00000007829)	ENSEEEG00000008475	necap1 (ENSEEEG00000008482)	epn1b (ENSEEEG00000008485)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000166681	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00940000165795	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00940000157471.b	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01060000248708.b	ENSGT00940000154743.A.a.b	ENSGT00390000010641.i.b	ENSGT00940000163756.c.a	ENSGT01030000235274.b	ENSGT01030000235274.a	ENSGT01010000223632	ENSGT00940000164382.b.a	ENSGT00510000046803.b.a.b.a	ENSGT00940000159033	ENSGT00950000183106.a.b.a
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	185	ENSGT00940000166681.a	ENSGT00940000159919.b.b	ENSGT00390000008892.a.b	ENSGT00940000158021.c.d	ENSGT00940000165795.g.b	ENSGT00950000183212.C.c.a.b	ENSGT00940000164921.b.e	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e.b	ENSGT00940000154716.gc.b.b	ENSGT00950000183094.a.n.b	ENSGT00390000018360.b.b	ENSGT00940000166610.e.b	ENSGT00940000157619.a.b.a.a ##19	ENSGT00940000160917.p	ENSGT00940000157203.d.a ##22	ENSGT00940000156698.c.b ##24	ENSGT00440000034367.a.b	ENSGT00940000157471.b.c	ENSGT00940000154947.k.f	ENSGT01060000248708.b.b	ENSGT00940000154743.A.a.b.b	ENSGT00390000010641.i.b.b	ENSGT00940000163756.c.a.h	ENSGT01030000235274.b.a	ENSGT01030000235274.a.b	ENSGT00510000046803.b.a.b.a.b	ENSGT00940000159033.j
Goldfish	DUPLICATION
Goldfish	MODERN SPECIES	38	rad21b (ENSCARG00000019793)	CSMD3 (ENSCARG00000019896)	ENSCARG00000020271	COL22A1 (ENSCARG00000020324)	kcnk9 (ENSCARG00000020351)	TRAPPC9 (ENSCARG00000020378)	rragcb (ENSCARG00000020462)	fhl3b (ENSCARG00000020478)	meaf6 (ENSCARG00000020488)	ENSCARG00000020508	rprd2a (ENSCARG00000020531)	ciarta (ENSCARG00000020546)	mrps21 (ENSCARG00000020549)	crabp2b (ENSCARG00000020553) ##19	scamp3 (ENSCARG00000020559)	ENSCARG00000020574 ##22	slc2a3a (ENSCARG00000020585)	clcn1a (ENSCARG00000020690)	ENSCARG00000021574	ing4 (ENSCARG00000021590)	IFFO1 (ENSCARG00000021620)	vamp1a (ENSCARG00000021633)	ENSCARG00000021644	ENSCARG00000021656	ENSCARG00000021677	ndufv1 (ENSCARG00000021898)	ENSCARG00000022844	si:ch211-81a5.8 (ENSCARG00000022865)	clk2a (ENSCARG00000022883)	setdb1a (ENSCARG00000022930)	lrrc71 (ENSCARG00000022956)
Goldfish	MODERN SPECIES	815														crabp2b (ENSCARG00000031543) ##19	scamp3 (ENSCARG00000031551)	ENSCARG00000031567 ##22	ash1l (ENSCARG00000031580) ##24
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000159919.b.b	ENSGT00390000008892.a.b	ENSGT00940000158021.c.d	ENSGT00940000165795.g.b	ENSGT00950000183212.C.c.a.b	ENSGT00940000164921.b.e	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e.b	ENSGT00940000154716.gc.b.b	ENSGT00950000183094.a.n.b	ENSGT00390000018360.b.b	ENSGT00940000166610.e.b	ENSGT00940000157619.a.b.b ##19	ENSGT00940000157619.a.b.a.a ##19	ENSGT00940000160917.p	ENSGT00940000157203.d.a ##22	ENSGT00940000156698.c.b ##24	ENSGT00940000157471.b.c	ENSGT00940000154947.k.f	ENSGT01060000248708.b.b	ENSGT00940000154743.A.a.b.b	ENSGT00390000010641.i.b.b	ENSGT00940000163756.c.a.h	ENSGT01030000235274.b.a.b	ENSGT01030000235274.a.b	ENSGT00510000046803.b.a.b.a.b	ENSGT00940000159033.i.a	ENSGT00950000183106.a.b.a.b	ENSGT00940000157383.g.a.j.a.b	ENSGT00940000167696.b	ENSGT00940000160313.b
Common carp reference	MODERN SPECIES	31	si:dkey-266f7.9 (ENSCCRG00000067905)	ENSCCRG00000059719	efna1a (ENSCCRG00000017809)	dpm3 (ENSCCRG00000068446)	trim46b (ENSCCRG00000042143)	s100a10a (ENSCCRG00000069788)	snx27a (ENSCCRG00000042297)	chrna11 (ENSCCRG00000006710)	ENSCCRG00000074680	cers2a (ENSCCRG00000072257)	celf3a (ENSCCRG00000076770)	rprd2a (ENSCCRG00000068133)	mrps21 (ENSCCRG00000080584)	crabp2b (ENSCCRG00000048557) ##19	scamp3 (ENSCCRG00000049033)	ENSCCRG00000007470 ##22	ash1l (ENSCCRG00000076046) ##24	setdb1a (ENSCCRG00000049021)	clk2a (ENSCCRG00000048580)	si:ch211-81a5.8 (ENSCCRG00000048562)	ENSCCRG00000076116	ndufv1 (ENSCCRG00000081798)	ENSCCRG00000048536	ENSCCRG00000048531	ENSCCRG00000048530	vamp1a (ENSCCRG00000064123)	ENSCCRG00000074568	ENSCCRG00000048485	ing4 (ENSCCRG00000048533)	ENSCCRG00000048534	clcn1a (ENSCCRG00000078740)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	307	ENSGT00390000008892.a.a	ENSGT00940000158021.c.c	ENSGT00940000165795.g.a	ENSGT00950000183212.C.c.a.a	ENSGT00940000164921.b.f	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.a	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e.a	ENSGT00940000154716.gc.b.a	ENSGT00950000183094.a.n.a	ENSGT00390000018360.b.a	ENSGT00940000166610.e.a	ENSGT00940000157619.a.b.b ##19	ENSGT00940000166610.f	ENSGT00940000157619.a.b.a.b ##19	ENSGT00940000160917.o	ENSGT00940000157203.d.b ##22	ENSGT00940000156698.c.a ##24	ENSGT00440000034367.a.a	ENSGT00940000157471.b.d	ENSGT00940000154947.k.e	ENSGT01060000248708.b.a	ENSGT00940000154743.A.a.b.a	ENSGT00390000010641.i.b.a	ENSGT00940000163756.c.a.g	ENSGT01010000223632	ENSGT00940000164382.b.a.j	ENSGT00510000046803.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159033.i.b	ENSGT00950000183106.a.b.a.a	ENSGT00940000157383.g.a.j.a.a	ENSGT00940000167696.a
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	52	ENSGT00390000008892.b	ENSGT00390000008892.a.a	ENSGT00940000158021.c.c	ENSGT00940000165795.g.a	ENSGT00950000183212.C.c.a.a	ENSGT00940000164921.b.f	ENSGT00950000182891.b.b.b.b.a	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e.a	ENSGT00940000154716.gc.b.a	ENSGT00950000183094.a.n.a	ENSGT00390000018360.b.a	ENSGT00940000166610.e.a	ENSGT00940000166610.f	ENSGT00940000157619.a.b.a.b ##19	ENSGT00940000160917.o	ENSGT00940000157203.d.b ##22	ENSGT00940000156698.c.a ##24	ENSGT00440000034367.a.a	ENSGT00940000157471.b.d	ENSGT00940000154947.k.e	ENSGT01060000248708.b.a	ENSGT00940000154743.A.a.b.a	ENSGT00390000010641.i.b.a	ENSGT00940000163756.c.a.g	ENSGT01010000223632	ENSGT00940000164382.b.a.j	ENSGT00510000046803.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159033.i.b	ENSGT00950000183106.a.b.a.a	ENSGT00940000157383.g.a.j.b	ENSGT00940000157383.g.a.j.a.a
Common carp reference	MODERN SPECIES	12	ENSCCRG00000077525	dpm3 (ENSCCRG00000065825)	trim46b (ENSCCRG00000035422)	s100a10a (ENSCCRG00000075828)	snx27a (ENSCCRG00000035444)	chrna11 (ENSCCRG00000056448)	ENSCCRG00000075527	cers2a (ENSCCRG00000024592)	ENSCCRG00000060057	celf3a (ENSCCRG00000024042)	rprd2a (ENSCCRG00000024017)	ciarta (ENSCCRG00000049041)	mrps21 (ENSCCRG00000067203)	crabp2b (ENSCCRG00000070701) ##19	scamp3 (ENSCCRG00000060760)	ENSCCRG00000062250 ##22	ash1l (ENSCCRG00000048996) ##24	lrrc71 (ENSCCRG00000048989)	setdb1a (ENSCCRG00000048984)	clk2a (ENSCCRG00000053694)	si:ch211-81a5.8 (ENSCCRG00000057966)	ENSCCRG00000071140	ndufv1 (ENSCCRG00000017955)	ENSCCRG00000008447	ENSCCRG00000048537	ENSCCRG00000076586	ENSCCRG00000055597	ENSCCRG00000048473	ENSCCRG00000034649	clcn1a (ENSCCRG00000043732)	ENSCCRG00000030733
Zebrafish	MODERN SPECIES	10	efna1a (ENSDARG00000030326)	s100a10a (ENSDARG00000037425)	dpm3 (ENSDARG00000058650)	trim46b (ENSDARG00000058649)	snx27a (ENSDARG00000033804)	chrna11 (ENSDARG00000037427)	rps27.1 (ENSDARG00000023298)	cers2a (ENSDARG00000013704)	ENSDARG00000103224	celf3a (ENSDARG00000034668)	rprd2a (ENSDARG00000058089)	ciarta (ENSDARG00000058094)	mrps21 (ENSDARG00000070985)	crabp2b (ENSDARG00000030449) ##19	scamp3 (ENSDARG00000016765)	ENSDARG00000062900 ##22	ash1l (ENSDARG00000070981) ##24	lrrc71 (ENSDARG00000036412)	setdb1a (ENSDARG00000041243)	clk2a (ENSDARG00000062954)	si:ch211-81a5.8 (ENSDARG00000070972)	ENSDARG00000027192	ndufv1 (ENSDARG00000036438)	ENSDARG00000062962	si:rp71-15k1.1 (ENSDARG00000070964)	si:ch73-15n24.1 (ENSDARG00000079901)	ENSDARG00000070960	ENSDARG00000070959	vamp1a (ENSDARG00000031283)	IFFO1 (ENSDARG00000062976)	ing4 (ENSDARG00000030716)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00940000178110	ENSGT01030000234973	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000164936.a	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.b.a	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00960000187253	ENSGT00940000165795	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000178110	ENSGT01030000234973	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000164936.a	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234973	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00940000154716.hc	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000167191	ENSGT00940000170307	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00940000154716.hc	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000170307	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT00880000138402	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00940000154716.hc	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000170307	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT00880000138402	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00940000154716.hc	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000170307	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000170307	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	242	SLC4A7 (ENSSPAG00000003896)	HERPUD2 (ENSSPAG00000003878)	ADGRB1 (ENSSPAG00000003823)	ENSSPAG00000003800	hnrnpr (ENSSPAG00000003788)	dnajc8 (ENSSPAG00000003762)	ENSSPAG00000003731	clk2a (ENSSPAG00000003707)	cers2a (ENSSPAG00000003653)	celf3a (ENSSPAG00000003615)	rprd2a (ENSSPAG00000003596)	ciarta (ENSSPAG00000003560)	mrps21 (ENSSPAG00000003551)	crabp2b (ENSSPAG00000003533) ##19	scamp3 (ENSSPAG00000003521)	RNF115 (ENSSPAG00000003481) ##22	ash1l (ENSSPAG00000003361) ##24	lrrc71 (ENSSPAG00000003318)	ENSSPAG00000003305	ENSSPAG00000002752	chrna11 (ENSSPAG00000002685)	snx27a (ENSSPAG00000002624)	ENSSPAG00000002612	s100a10a (ENSSPAG00000002605)
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000170307	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT01100000264401	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	91								ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00940000162871.i	ENSGT00940000165795.d	ENSGT01100000264401	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b
Orange clownfish	MODERN SPECIES	8	trim46b (ENSAPEG00000008418)	ENSAPEG00000008465	s100a10a (ENSAPEG00000008476)	ENSAPEG00000008482	snx27a (ENSAPEG00000008493)	chrna11 (ENSAPEG00000008561)	ENSAPEG00000008592	clk2a (ENSAPEG00000008626)	cers2a (ENSAPEG00000008672)	celf3a (ENSAPEG00000008728)	rprd2a (ENSAPEG00000008782)	ciarta (ENSAPEG00000008798)	mrps21 (ENSAPEG00000008831)	crabp2b (ENSAPEG00000008837) ##19	scamp3 (ENSAPEG00000008897)	ENSAPEG00000008910 ##22	ash1l (ENSAPEG00000008936) ##24	ENSAPEG00000008974	ENSAPEG00000008994	scamp3 (ENSAPEG00000009017)	crabp2b (ENSAPEG00000009060) ##19	mrps21 (ENSAPEG00000009088)	ciarta (ENSAPEG00000009095)	ENSAPEG00000009175	dnajc8 (ENSAPEG00000009128)	hnrnpr (ENSAPEG00000009187)	ENSAPEG00000009230	ENSAPEG00000009243	ADGRB1 (ENSAPEG00000009268)	ENSAPEG00000009369	SLC4A7 (ENSAPEG00000009392)
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1065						TYMP (ENSAOCG00000013905)	lsm8 (ENSAOCG00000013926)	grip1 (ENSAOCG00000014019)	ENSAOCG00000000892	cand1 (ENSAOCG00000000921)	ENSAOCG00000014188	ciarta (ENSAOCG00000014201)	mrps21 (ENSAOCG00000014214)	crabp2b (ENSAOCG00000014237) ##19	scamp3 (ENSAOCG00000014254)	ENSAOCG00000014280 ##22	ash1l (ENSAOCG00000014299) ##24	ENSAOCG00000014327	myof (ENSAOCG00000014674)	aarsd1 (ENSAOCG00000014735)	ptges3l (ENSAOCG00000014828)	kat7b (ENSAOCG00000014886)	ENSAOCG00000014899	dlx4b (ENSAOCG00000014952)	dlx3b (ENSAOCG00000014963)	itga3b (ENSAOCG00000002539)	ENSAOCG00000015119	ENSAOCG00000015178	inab (ENSAOCG00000001059)	atp5md (ENSAOCG00000015202)	taf5 (ENSAOCG00000001060)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	392	SLC4A7 (ENSAPOG00000006779)	HERPUD2 (ENSAPOG00000006655)	ADGRB1 (ENSAPOG00000006630)	ENSAPOG00000006386	hnrnpr (ENSAPOG00000006236)	dnajc8 (ENSAPOG00000000170)	ENSAPOG00000006141	clk2a (ENSAPOG00000006118)	cers2a (ENSAPOG00000000162)	celf3a (ENSAPOG00000006015)	rprd2a (ENSAPOG00000005936)	ciarta (ENSAPOG00000001032)	mrps21 (ENSAPOG00000005886)	crabp2b (ENSAPOG00000005873) ##19	scamp3 (ENSAPOG00000005851)	ENSAPOG00000005830 ##22	ash1l (ENSAPOG00000005745) ##24	lrrc71 (ENSAPOG00000005692)	ENSAPOG00000005670	ENSAPOG00000005636	chrna11 (ENSAPOG00000005631)	snx27a (ENSAPOG00000005588)	icn (ENSAPOG00000005546)	s100a10a (ENSAPOG00000005537)	ENSAPOG00000005528	ENSAPOG00000005518	trim46b (ENSAPOG00000005472)	dpm3 (ENSAPOG00000005415)	efna1a (ENSAPOG00000005375)
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000157045.b	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00940000154716.hc	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Nile tilapia	MODERN SPECIES	13	HERPUD2 (ENSONIG00000019688)	ENSONIG00000032661	ADGRB1 (ENSONIG00000019689)	ENSONIG00000019691	hnrnpr (ENSONIG00000019692)	dnajc8 (ENSONIG00000019696)	ENSONIG00000036389	clk2a (ENSONIG00000019698)	cers2a (ENSONIG00000019701)	celf3a (ENSONIG00000019703)	rprd2a (ENSONIG00000019704)	ciarta (ENSONIG00000019706)	mrps21 (ENSONIG00000031832)	crabp2b (ENSONIG00000019709) ##19	scamp3 (ENSONIG00000019710)	ENSONIG00000019713 ##22	ash1l (ENSONIG00000019716) ##24	lrrc71 (ENSONIG00000028356)	ENSONIG00000019717	chrna11 (ENSONIG00000019719)	snx27a (ENSONIG00000019721)	ENSONIG00000038772	ENSONIG00000028947	s100a10a (ENSONIG00000031982)	trim46b (ENSONIG00000019724)	dpm3 (ENSONIG00000027309)	efna1a (ENSONIG00000038657)	ENSONIG00000032139	cks1b (ENSONIG00000027098)	ENSONIG00000019730	ENSONIG00000032250
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00940000154716.hc	ENSGT00940000177218	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT01030000234973	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	357	SLC4A7 (ENSHBUG00000019916)	HERPUD2 (ENSHBUG00000019940)	ADGRB1 (ENSHBUG00000019965)	ENSHBUG00000019981	hnrnpr (ENSHBUG00000019998)	dnajc8 (ENSHBUG00000020035)	ENSHBUG00000020068	clk2a (ENSHBUG00000020081)	cers2a (ENSHBUG00000020099)	celf3a (ENSHBUG00000001061)	rprd2a (ENSHBUG00000020156)	ciarta (ENSHBUG00000020170)	mrps21 (ENSHBUG00000020177)	crabp2b (ENSHBUG00000020191) ##19	scamp3 (ENSHBUG00000000613)	ENSHBUG00000000618 ##22	ash1l (ENSHBUG00000020326) ##24	lrrc71 (ENSHBUG00000020371)	ENSHBUG00000020403	ENSHBUG00000020523	chrna11 (ENSHBUG00000020580)	snx27a (ENSHBUG00000000631)	ENSHBUG00000020641	ENSHBUG00000020643	s100a10a (ENSHBUG00000020650)	trim46b (ENSHBUG00000020692)	dpm3 (ENSHBUG00000020711)	efna1a (ENSHBUG00000020735)	ENSHBUG00000020740	cks1b (ENSHBUG00000020757)	ENSHBUG00000020772
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT01030000234973	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT01030000234973	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a	ENSGT00940000168219
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1104	HERPUD2 (ENSMZEG00005026483)	ENSMZEG00005026485	ADGRB1 (ENSMZEG00005026487)	ENSMZEG00005026488	hnrnpr (ENSMZEG00005026489)	dnajc8 (ENSMZEG00005026491)	ENSMZEG00005026493	clk2a (ENSMZEG00005026495)	cers2a (ENSMZEG00005026498)	celf3a (ENSMZEG00005026501)	rprd2a (ENSMZEG00005026505)	ciarta (ENSMZEG00005026507)	mrps21 (ENSMZEG00005026509)	crabp2b (ENSMZEG00005026511) ##19	scamp3 (ENSMZEG00005026512)	ENSMZEG00005026514 ##22	ash1l (ENSMZEG00005026516) ##24	ENSMZEG00005026520	ENSMZEG00005026524	chrna11 (ENSMZEG00005026530)	snx27a (ENSMZEG00005026536)	ENSMZEG00005026538	ENSMZEG00005026540	s100a10a (ENSMZEG00005026541)	trim46b (ENSMZEG00005026543)	dpm3 (ENSMZEG00005026545)	efna1a (ENSMZEG00005026547)	ENSMZEG00005026548	cks1b (ENSMZEG00005026550)	ENSMZEG00005026551	ENSMZEG00005026555
Eastern happy	MODERN SPECIES	13	HERPUD2 (ENSACLG00000009278)	ADGRB1 (ENSACLG00000009396)	ENSACLG00000009509	hnrnpr (ENSACLG00000009513)	ENSACLG00000009533	ENSACLG00000009541	ENSACLG00000009563	clk2a (ENSACLG00000009581)	cers2a (ENSACLG00000009603)	celf3a (ENSACLG00000009631)	ENSACLG00000009641	ciarta (ENSACLG00000009644)	mrps21 (ENSACLG00000009659)	crabp2b (ENSACLG00000009662) ##19	scamp3 (ENSACLG00000009677)	ENSACLG00000009685 ##22	ash1l (ENSACLG00000009699) ##24	ENSACLG00000009727	ENSACLG00000009839	chrna11 (ENSACLG00000009856)	ENSACLG00000009864	snx27a (ENSACLG00000009901)	ENSACLG00000009936	ENSACLG00000009942	s100a10a (ENSACLG00000009958)	trim46b (ENSACLG00000009963)	dpm3 (ENSACLG00000009972)	efna1a (ENSACLG00000009980)	ENSACLG00000009983	ENSACLG00000009992	SHE (ENSACLG00000010028)
P. nyererei	MODERN SPECIES	397	SLC4A7 (ENSPNYG00000012457)	HERPUD2 (ENSPNYG00000012415)	ADGRB1 (ENSPNYG00000012249)	ENSPNYG00000012202	hnrnpr (ENSPNYG00000012138)	dnajc8 (ENSPNYG00000012076)	ENSPNYG00000012049	clk2a (ENSPNYG00000011683)	cers2a (ENSPNYG00000011548)	celf3a (ENSPNYG00000011518)	rprd2a (ENSPNYG00000011501)	ciarta (ENSPNYG00000011473)	mrps21 (ENSPNYG00000011464)	crabp2b (ENSPNYG00000011450) ##19	scamp3 (ENSPNYG00000011437)	ENSPNYG00000011388 ##22	ash1l (ENSPNYG00000011349) ##24	lrrc71 (ENSPNYG00000011319)	ENSPNYG00000011291	ENSPNYG00000011109	chrna11 (ENSPNYG00000011046)	snx27a (ENSPNYG00000011002)	ENSPNYG00000010908	ENSPNYG00000010893	s100a10a (ENSPNYG00000010880)	trim46b (ENSPNYG00000010844)	dpm3 (ENSPNYG00000010826)	efna1a (ENSPNYG00000010806)	ENSPNYG00000010787	cks1b (ENSPNYG00000010772)	ENSPNYG00000010753
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	302	ENSNBRG00000017941	ENSNBRG00000017909	ENSNBRG00000017899	hnrnpr (ENSNBRG00000017879)	dnajc8 (ENSNBRG00000017850)	ENSNBRG00000017827	clk2a (ENSNBRG00000017651)	cers2a (ENSNBRG00000017582)	celf3a (ENSNBRG00000017554)	ENSNBRG00000017540	ENSNBRG00000017527	ciarta (ENSNBRG00000017511)	mrps21 (ENSNBRG00000017499)	crabp2b (ENSNBRG00000017363) ##19	scamp3 (ENSNBRG00000017335)	ENSNBRG00000017283 ##22	ash1l (ENSNBRG00000017174) ##24	lrrc71 (ENSNBRG00000017131)	ENSNBRG00000017009	ENSNBRG00000016931	chrna11 (ENSNBRG00000016828)	snx27a (ENSNBRG00000016773)	ENSNBRG00000016749	ENSNBRG00000016739	s100a10a (ENSNBRG00000016655)	trim46b (ENSNBRG00000016613)	dpm3 (ENSNBRG00000016594)	efna1a (ENSNBRG00000016557)	ENSNBRG00000016520	cks1b (ENSNBRG00000016502)	ENSNBRG00000016435
Midas cichlid	MODERN SPECIES	708			ADGRB1 (ENSACIG00000010640)	ENSACIG00000010696	hnrnpr (ENSACIG00000010706)	ENSACIG00000010728	ENSACIG00000010745	clk2a (ENSACIG00000010767)	cers2a (ENSACIG00000010881)	celf3a (ENSACIG00000010932)	ENSACIG00000010965	ciarta (ENSACIG00000010998)	mrps21 (ENSACIG00000011012)	crabp2b (ENSACIG00000011022) ##19	scamp3 (ENSACIG00000011043)	ENSACIG00000011069 ##22	ash1l (ENSACIG00000011095) ##24	lrrc71 (ENSACIG00000011144)	ENSACIG00000011177	ENSACIG00000011189	chrna11 (ENSACIG00000011268)
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT01030000234973.b	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT00880000138402	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT00880000138402	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158728.k	ENSGT00940000157045.b	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a	ENSGT00940000168219
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1628	dpm3 (ENSNFUG00015020781)	trim46b (ENSNFUG00015020774)	ENSNFUG00015020771	S100A2 (ENSNFUG00015020767)	SNX27A (ENSNFUG00015020015)	Nfu_g_1_017837 (ENSNFUG00015019925)	ENSNFUG00015019877	ENSNFUG00015019823	cers2a (ENSNFUG00015019804)	celf3a (ENSNFUG00015019695)	RPRD2A (ENSNFUG00015019643)	C19H1ORF51 (ENSNFUG00015019628)	mrps21 (ENSNFUG00015019622)	CRABP2B (ENSNFUG00015019620) ##19	SCAMP3 (ENSNFUG00015019613)	ENSNFUG00015019604 ##22	ash1l (ENSNFUG00015019553) ##24	lrrc71 (ENSNFUG00015019525)	ENSNFUG00015019511	clk2a (ENSNFUG00015017431)	DNAJC8 (ENSNFUG00015017303)	ENSNFUG00015017293	hnrnpr (ENSNFUG00015017206)	ATPIF1A (ENSNFUG00015017174)	ENSNFUG00015017169	BAI1 (ENSNFUG00015016730)	HERPUD2 (ENSNFUG00015016703)	SLC4A7 (ENSNFUG00015015776)	EOMESA (ENSNFUG00015015647)	ENSNFUG00015015151	TGFBR2 (ENSNFUG00015015040)
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	2	TGFBR2 (ENSKMAG00000012650)	ENSKMAG00000012586	eomesa (ENSKMAG00000012496)	SLC4A7 (ENSKMAG00000012350)	HERPUD2 (ENSKMAG00000012304)	ADGRB1 (ENSKMAG00000012221)	hnrnpr (ENSKMAG00000012139)	clk2a (ENSKMAG00000012074)	cers2a (ENSKMAG00000012043)	celf3a (ENSKMAG00000011999)	rprd2a (ENSKMAG00000011981)	ciarta (ENSKMAG00000011969)	mrps21 (ENSKMAG00000011957)	crabp2b (ENSKMAG00000011938) ##19	scamp3 (ENSKMAG00000011904)	ENSKMAG00000011862 ##22	ash1l (ENSKMAG00000011776) ##24	lrrc71 (ENSKMAG00000011716)	ENSKMAG00000011647	ENSKMAG00000011606	chrna11 (ENSKMAG00000011541)	snx27a (ENSKMAG00000011486)	icn (ENSKMAG00000011467)	s100a10a (ENSKMAG00000011450)	trim46b (ENSKMAG00000011413)	dpm3 (ENSKMAG00000011399)	efna1a (ENSKMAG00000011385)	ENSKMAG00000011369	cks1b (ENSKMAG00000011353)	ENSKMAG00000011336	ENSKMAG00000011320
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT00880000138402	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	10		ENSGT01030000234973.b	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Mummichog	MODERN SPECIES	2348		ENSFHEG00000012679	ADGRB1 (ENSFHEG00000012665)	ENSFHEG00000012618	hnrnpr (ENSFHEG00000012603)	dnajc8 (ENSFHEG00000012569)	clk2a (ENSFHEG00000012546)	cers2a (ENSFHEG00000012539)	celf3a (ENSFHEG00000012530)	ENSFHEG00000012503	ENSFHEG00000012493	ciarta (ENSFHEG00000012441)	mrps21 (ENSFHEG00000012430)	crabp2b (ENSFHEG00000012423) ##19	scamp3 (ENSFHEG00000012403)	ENSFHEG00000012370 ##22	ash1l (ENSFHEG00000012308) ##24	ENSFHEG00000012228	ENSFHEG00000012201	ENSFHEG00000011989	chrna11 (ENSFHEG00000011932)	snx27a (ENSFHEG00000011889)	icn2 (ENSFHEG00000011845)	s100a10a (ENSFHEG00000011839)	ENSFHEG00000011834	trim46b (ENSFHEG00000011810)	dpm3 (ENSFHEG00000011770)	efna1a (ENSFHEG00000011761)	ENSFHEG00000000265	cks1b (ENSFHEG00000011707)	ENSFHEG00000011689
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	203	THBS1 (ENSCVAG00000018367)	ADGRB1 (ENSCVAG00000018336)	ENSCVAG00000018316	hnrnpr (ENSCVAG00000018291)	hnrnpr (ENSCVAG00000018246)	dnajc8 (ENSCVAG00000018231)	ENSCVAG00000018184	clk2a (ENSCVAG00000018175)	cers2a (ENSCVAG00000018116)	celf3a (ENSCVAG00000018056)	rprd2a (ENSCVAG00000018006)	ciarta (ENSCVAG00000017992)	mrps21 (ENSCVAG00000017982)	crabp2b (ENSCVAG00000017975) ##19	scamp3 (ENSCVAG00000017946)	ENSCVAG00000017930 ##22	ash1l (ENSCVAG00000017872) ##24	lrrc71 (ENSCVAG00000017850)	ENSCVAG00000017817	ENSCVAG00000017788	chrna11 (ENSCVAG00000017748)	snx27a (ENSCVAG00000017700)	icn (ENSCVAG00000017622)	s100a10a (ENSCVAG00000017616)	trim46b (ENSCVAG00000017607)	dpm3 (ENSCVAG00000017572)	efna1a (ENSCVAG00000017560)	ENSCVAG00000017556	cks1b (ENSCVAG00000017551)	ENSCVAG00000000772	ENSCVAG00000017519
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT00880000138402	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	55	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT00880000138402	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00980000200353	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	128	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT00880000138402	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00980000200353	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00940000173967	ENSGT00940000155363.w	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b
Sailfin molly	MODERN SPECIES	669										ENSPLAG00000019426	rprd2a (ENSPLAG00000019420)	ciarta (ENSPLAG00000019407)	mrps21 (ENSPLAG00000019397)	crabp2b (ENSPLAG00000019392) ##19	scamp3 (ENSPLAG00000019376)	ENSPLAG00000019370 ##22	ash1l (ENSPLAG00000019341) ##24	ENSPLAG00000019266	ENSPLAG00000019241	chrna11 (ENSPLAG00000019192)	SNX27 (ENSPLAG00000019158)	icn2 (ENSPLAG00000019125)	s100a10a (ENSPLAG00000019110)	trim46b (ENSPLAG00000019105)
Amazon molly	MODERN SPECIES	377	HERPUD2 (ENSPFOG00000007443)	ADGRB1 (ENSPFOG00000007532)	ENSPFOG00000007873	hnrnpr (ENSPFOG00000007881)	dnajc8 (ENSPFOG00000007962)	clk2a (ENSPFOG00000008036)	ENSPFOG00000008168	ENSPFOG00000008178	cers2a (ENSPFOG00000008203)	celf3a (ENSPFOG00000008507)	rprd2a (ENSPFOG00000008634)	ciarta (ENSPFOG00000008690)	mrps21 (ENSPFOG00000008722)	crabp2b (ENSPFOG00000008725) ##19	scamp3 (ENSPFOG00000008731)	ENSPFOG00000008821 ##22	ash1l (ENSPFOG00000008852) ##24	ENSPFOG00000023082	ENSPFOG00000009008	ENSPFOG00000009016	chrna11 (ENSPFOG00000009080)	SNX27 (ENSPFOG00000009276)	icn2 (ENSPFOG00000009398)	ENSPFOG00000009404	trim46b (ENSPFOG00000009422)	dpm3 (ENSPFOG00000009593)	efna1a (ENSPFOG00000009606)	ENSPFOG00000009661	ENSPFOG00000009675	cks1b (ENSPFOG00000009707)	ENSPFOG00000009734
Guppy	MODERN SPECIES	441	ADGRB1 (ENSPREG00000018569)	ENSPREG00000018645	hnrnpr (ENSPREG00000018754)	dnajc8 (ENSPREG00000018781)	ENSPREG00000018798	clk2a (ENSPREG00000018819)	ENSPREG00000018849	cers2a (ENSPREG00000018868)	ENSPREG00000018888	celf3a (ENSPREG00000018923)	rprd2a (ENSPREG00000018979)	ciarta (ENSPREG00000018998)	mrps21 (ENSPREG00000019017)	crabp2b (ENSPREG00000019026) ##19	scamp3 (ENSPREG00000019041)	ENSPREG00000019064 ##22	ash1l (ENSPREG00000019101) ##24	lrrc71 (ENSPREG00000019135)	ENSPREG00000019180	ENSPREG00000019339	chrna11 (ENSPREG00000019402)	SNX27 (ENSPREG00000019441)	icn2 (ENSPREG00000019482)	s100a10b (ENSPREG00000019496)	trim46b (ENSPREG00000019553)	dpm3 (ENSPREG00000019597)	efna1a (ENSPREG00000019616)	ENSPREG00000019632	cks1b (ENSPREG00000019645)	ENSPREG00000019653	ENSPREG00000019668
Platyfish	MODERN SPECIES	4	HERPUD2 (ENSXMAG00000027325)	ADGRB1 (ENSXMAG00000014448)	ENSXMAG00000020284	hnrnpr (ENSXMAG00000014480)	ENSXMAG00000020983	dnajc8 (ENSXMAG00000027978)	clk2a (ENSXMAG00000014567)	ENSXMAG00000026806	cers2a (ENSXMAG00000014591)	celf3a (ENSXMAG00000014619)	rprd2a (ENSXMAG00000014636)	ciarta (ENSXMAG00000022811)	mrps21 (ENSXMAG00000029139)	crabp2b (ENSXMAG00000014642) ##19	scamp3 (ENSXMAG00000021817)	ENSXMAG00000014665 ##22	ash1l (ENSXMAG00000014673) ##24	lrrc71 (ENSXMAG00000014679)	ENSXMAG00000014681	ENSXMAG00000014698	chrna11 (ENSXMAG00000014725)	snx27a (ENSXMAG00000014739)	icn2 (ENSXMAG00000028927)	s100a10a (ENSXMAG00000014763)	trim46b (ENSXMAG00000027467)	dpm3 (ENSXMAG00000020287)	efna1a (ENSXMAG00000014802)	ENSXMAG00000029329	ENSXMAG00000025812	cks1b (ENSXMAG00000023898)	ENSXMAG00000014816
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000167191	ENSGT00940000170307	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT00880000138402	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT00880000138402	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT00880000138402	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	143	HERPUD2 (ENSLBEG00000027179)	ADGRB1 (ENSLBEG00000027108)	ENSLBEG00000027073	hnrnpr (ENSLBEG00000027047)	dnajc8 (ENSLBEG00000027024)	ENSLBEG00000027008	clk2a (ENSLBEG00000026994)	ENSLBEG00000026986	cers2a (ENSLBEG00000026958)	celf3a (ENSLBEG00000026936)	ENSLBEG00000026924	ciarta (ENSLBEG00000026913)	mrps21 (ENSLBEG00000026904)	crabp2b (ENSLBEG00000026897) ##19	scamp3 (ENSLBEG00000026887)	ENSLBEG00000026874 ##22	ash1l (ENSLBEG00000026843) ##24	lrrc71 (ENSLBEG00000026819)	ENSLBEG00000026791	ENSLBEG00000026760	chrna11 (ENSLBEG00000026728)	snx27a (ENSLBEG00000026687)	icn (ENSLBEG00000026669)	s100a10a (ENSLBEG00000026661)	trim46b (ENSLBEG00000026639)	dpm3 (ENSLBEG00000026614)	efna1a (ENSLBEG00000026593)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT00880000138402	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT00880000138402	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT00880000138402	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Lumpfish	MODERN SPECIES	2	HERPUD2 (ENSCLMG00005014485)	ADGRB1 (ENSCLMG00005014489)	ENSCLMG00005014509	hnrnpr (ENSCLMG00005014516)	dnajc8 (ENSCLMG00005014765)	ENSCLMG00005014771	clk2a (ENSCLMG00005014789)	ENSCLMG00005016125	cers2a (ENSCLMG00005016126)	celf3a (ENSCLMG00005016137)	rprd2a (ENSCLMG00005016141)	ciarta (ENSCLMG00005016145)	mrps21 (ENSCLMG00005016149)	crabp2b (ENSCLMG00005016151) ##19	scamp3 (ENSCLMG00005016155)	ENSCLMG00005016157 ##22	ash1l (ENSCLMG00005016162) ##24	lrrc71 (ENSCLMG00005016509)	ENSCLMG00005016510	ENSCLMG00005016513	chrna11 (ENSCLMG00005016514)	snx27a (ENSCLMG00005016520)	icn (ENSCLMG00005016680)	ENSCLMG00005016682	trim46b (ENSCLMG00005016689)	dpm3 (ENSCLMG00005016864)	efna1a (ENSCLMG00005016866)	ENSCLMG00005016867	cks1b (ENSCLMG00005016868)	ENSCLMG00005016869	ENSCLMG00005016871
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000157045.b	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Pike perch	MODERN SPECIES	13	HERPUD2 (ENSSLUG00000011153)	ENSSLUG00000011159	ADGRB1 (ENSSLUG00000011168)	ENSSLUG00000011206	hnrnpr (ENSSLUG00000011221)	dnajc8 (ENSSLUG00000011268)	ENSSLUG00000011294	clk2a (ENSSLUG00000011347)	cers2a (ENSSLUG00000012540)	celf3a (ENSSLUG00000012566)	ENSSLUG00000012582	ciarta (ENSSLUG00000012589)	mrps21 (ENSSLUG00000012593)	crabp2b (ENSSLUG00000012599) ##19	scamp3 (ENSSLUG00000012604)	ENSSLUG00000012608 ##22	ash1l (ENSSLUG00000012622) ##24	lrrc71 (ENSSLUG00000012776)	ENSSLUG00000012784	ENSSLUG00000012794	chrna11 (ENSSLUG00000012824)	snx27a (ENSSLUG00000012852)	icn2 (ENSSLUG00000012896)	s100a10a (ENSSLUG00000012898)	trim46b (ENSSLUG00000012907)	dpm3 (ENSSLUG00000012919)	efna1a (ENSSLUG00000012923)	ENSSLUG00000012927	cks1b (ENSSLUG00000012930)	ENSSLUG00000012935	ENSSLUG00000012942
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	2	ADGRB1 (ENSCGOG00000011999)	ENSCGOG00000012147	hnrnpr (ENSCGOG00000012155)	dnajc8 (ENSCGOG00000012271)	ENSCGOG00000012570	clk2a (ENSCGOG00000012582)	ENSCGOG00000013415	cers2a (ENSCGOG00000013441)	celf3a (ENSCGOG00000013635)	ENSCGOG00000014013	ENSCGOG00000014015	ciarta (ENSCGOG00000014018)	mrps21 (ENSCGOG00000014020)	crabp2b (ENSCGOG00000014022) ##19	scamp3 (ENSCGOG00000014033)	ENSCGOG00000014048 ##22	ash1l (ENSCGOG00000014064) ##24	lrrc71 (ENSCGOG00000014125)	ENSCGOG00000014127	ENSCGOG00000014140	chrna11 (ENSCGOG00000014164)	SNX27 (ENSCGOG00000014175)	icn (ENSCGOG00000014241)	s100a10a (ENSCGOG00000014244)	trim46b (ENSCGOG00000014248)	dpm3 (ENSCGOG00000014257)	efna1a (ENSCGOG00000014260)	ENSCGOG00000014268	ENSCGOG00000014271	cks1b (ENSCGOG00000014272)	ENSCGOG00000014295
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT00880000138402	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	17	HERPUD2 (ENSSAUG00010020364)	ADGRB1 (ENSSAUG00010020372)	ENSSAUG00010020382	hnrnpr (ENSSAUG00010020391)	dnajc8 (ENSSAUG00010004118)	ENSSAUG00010004240	clk2a (ENSSAUG00010004324)	ENSSAUG00010006251	cers2a (ENSSAUG00010006253)	celf3a (ENSSAUG00010006272)	ENSSAUG00010006362	ciarta (ENSSAUG00010006367)	mrps21 (ENSSAUG00010006368)	crabp2b (ENSSAUG00010006370) ##19	scamp3 (ENSSAUG00010006372)	ENSSAUG00010006374 ##22	ash1l (ENSSAUG00010006384) ##24	lrrc71 (ENSSAUG00010006921)	ENSSAUG00010006924	ENSSAUG00010006932	chrna11 (ENSSAUG00010006950)	SNX27 (ENSSAUG00010006968)	icn (ENSSAUG00010007211)	s100a10a (ENSSAUG00010007214)	trim46b (ENSSAUG00010007218)	dpm3 (ENSSAUG00010007413)	efna1a (ENSSAUG00010007414)	ENSSAUG00010007415	ENSSAUG00010007418	cks1b (ENSSAUG00010007420)	ENSSAUG00010007421
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157045.b	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	484	SLC4A7 (ENSLCRG00005012289)	HERPUD2 (ENSLCRG00005018433)	ADGRB1 (ENSLCRG00005018476)	ENSLCRG00005018671	hnrnpr (ENSLCRG00005018673)	dnajc8 (ENSLCRG00005018706)	ENSLCRG00005018719	clk2a (ENSLCRG00005018736)	cers2a (ENSLCRG00005018874)	celf3a (ENSLCRG00005018913)	rprd2a (ENSLCRG00005019043)	ciarta (ENSLCRG00005019073)	mrps21 (ENSLCRG00005019077)	crabp2b (ENSLCRG00005019080) ##19	scamp3 (ENSLCRG00005019083)	rnf115b (ENSLCRG00005019098) ##22	ash1l (ENSLCRG00005019160) ##24	lrrc71 (ENSLCRG00005019971)	ENSLCRG00005019987	ENSLCRG00005019996	snx27a (ENSLCRG00005020029)	chrna11 (ENSLCRG00005020038)	ENSLCRG00005020041	s100a10a (ENSLCRG00005020045)	trim46b (ENSLCRG00005020048)	dpm3 (ENSLCRG00005020077)	efna1a (ENSLCRG00005020081)	ENSLCRG00005020085	cks1b (ENSLCRG00005020090)	ENSLCRG00005020094	ENSLCRG00005020103
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	60										ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000177151	ENSGT00940000168219
Fugu	MODERN SPECIES	3	ENSTRUG00000027682	cndp2 (ENSTRUG00000012921)	ENSTRUG00000026302	ENSTRUG00000012739	SCRT1 (ENSTRUG00000012719)	ENSTRUG00000031799	zgc:63863 (ENSTRUG00000012626)	dgat1a (ENSTRUG00000012581)	cfap20 (ENSTRUG00000026308)	cers2a (ENSTRUG00000012292)	celf3a (ENSTRUG00000012064)	rprd2a (ENSTRUG00000012016)	mrps21 (ENSTRUG00000022345)	crabp2b (ENSTRUG00000011951) ##19	scamp3 (ENSTRUG00000011701)	ENSTRUG00000011671 ##22	ash1l (ENSTRUG00000022988) ##24	lrrc71 (ENSTRUG00000032494)	ENSTRUG00000029647	ENSTRUG00000019576	chrna11 (ENSTRUG00000011358)	snx27a (ENSTRUG00000011162)	icn (ENSTRUG00000019629)	s100a10a (ENSTRUG00000011151)	trim46b (ENSTRUG00000010910)	s100a10a (ENSTRUG00000011111)	dpm3 (ENSTRUG00000010902)	efna1a (ENSTRUG00000010820)	ENSTRUG00000010789	cks1b (ENSTRUG00000029865)	ENSTRUG00000025884
Tetraodon	MODERN SPECIES	16	cyp51 (ENSTNIG00000017535)	ENSTNIG00000017536	dus3l (ENSTNIG00000017537)	cndp2 (ENSTNIG00000017538)	RECQL4 (ENSTNIG00000017539)	SLC39A4 (ENSTNIG00000017540)	ENSTNIG00000017541	zgc:63863 (ENSTNIG00000017542)	dgat1a (ENSTNIG00000017543)	cfap20 (ENSTNIG00000017544)	cers2a (ENSTNIG00000017545)	celf3a (ENSTNIG00000017546)	ENSTNIG00000017547	crabp2b (ENSTNIG00000017548) ##19	scamp3 (ENSTNIG00000017549)	ENSTNIG00000000111 ##22	ash1l (ENSTNIG00000017550) ##24	ENSTNIG00000017551	ENSTNIG00000017552	chrna11 (ENSTNIG00000017553)	snx27a (ENSTNIG00000017554)	ENSTNIG00000017555	s100a10a (ENSTNIG00000017556)	trim46b (ENSTNIG00000017557)	dpm3 (ENSTNIG00000001321)	efna1a (ENSTNIG00000017558)	ENSTNIG00000017559	ENSTNIG00000017560	s100s (ENSTNIG00000017561)	SHE (ENSTNIG00000017562)	pygo2 (ENSTNIG00000017563)
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000170307	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157045.b	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000157045.b	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Climbing perch	MODERN SPECIES	2	ENSATEG00000008509	ENSATEG00000008564	ENSATEG00000008582	ENSATEG00000008686	ENSATEG00000008698	dnajc8 (ENSATEG00000008750)	ENSATEG00000008798	ENSATEG00000008818	cers2a (ENSATEG00000008841)	celf3a (ENSATEG00000008884)	rprd2a (ENSATEG00000008913)	ciarta (ENSATEG00000028086)	mrps21 (ENSATEG00000025909)	crabp2b (ENSATEG00000008948) ##19	scamp3 (ENSATEG00000008964)	ENSATEG00000008972 ##22	ash1l (ENSATEG00000009017) ##24	lrrc71 (ENSATEG00000027205)	ENSATEG00000009100	ENSATEG00000009118	ENSATEG00000009317	ENSATEG00000009350	ENSATEG00000009392	ENSATEG00000009397	trim46b (ENSATEG00000009408)	dpm3 (ENSATEG00000009449)	efna1a (ENSATEG00000009466)	ENSATEG00000009499	ENSATEG00000009515	ENSATEG00000009526	ENSATEG00000026985
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	2	eomesa (ENSBSLG00000009601)	SLC4A7 (ENSBSLG00000009041)	HERPUD2 (ENSBSLG00000008702)	ADGRB1 (ENSBSLG00000008325)	hnrnpr (ENSBSLG00000016539)	dnajc8 (ENSBSLG00000016525)	ENSBSLG00000016518	clk2a (ENSBSLG00000016387)	cers2a (ENSBSLG00000016364)	celf3a (ENSBSLG00000016315)	rprd2a (ENSBSLG00000016309)	ciarta (ENSBSLG00000016305)	mrps21 (ENSBSLG00000016301)	crabp2b (ENSBSLG00000016298) ##19	scamp3 (ENSBSLG00000016290)	ENSBSLG00000016284 ##22	ash1l (ENSBSLG00000016270) ##24	lrrc71 (ENSBSLG00000016260)	ENSBSLG00000016255	ENSBSLG00000016250	chrna11 (ENSBSLG00000016192)	snx27a (ENSBSLG00000016097)	ENSBSLG00000016079	s100a10b (ENSBSLG00000016077)	trim46b (ENSBSLG00000016069)	dpm3 (ENSBSLG00000016066)	efna1a (ENSBSLG00000016065)	ENSBSLG00000016062	cks1b (ENSBSLG00000016050)	ENSBSLG00000016041	ENSBSLG00000016034
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	2	ENSMAMG00000002146	ENSMAMG00000001990	ENSMAMG00000025183	ENSMAMG00000001861	ENSMAMG00000001632	dnajc8 (ENSMAMG00000001592)	ENSMAMG00000001581	ENSMAMG00000001543	cers2a (ENSMAMG00000001488)	celf3a (ENSMAMG00000001436)	rprd2a (ENSMAMG00000001402)	ciarta (ENSMAMG00000027139)	mrps21 (ENSMAMG00000025689)	crabp2b (ENSMAMG00000001364) ##19	scamp3 (ENSMAMG00000001304)	ENSMAMG00000001258 ##22	ENSMAMG00000001205	ENSMAMG00000001166	ENSMAMG00000000628	ENSMAMG00000000580	snx27a (ENSMAMG00000000511)	ENSMAMG00000027096	s100a10a (ENSMAMG00000000471)	trim46b (ENSMAMG00000000378)	dpm3 (ENSMAMG00000016864)	efna1a (ENSMAMG00000016844)	ENSMAMG00000016832	cks1b (ENSMAMG00000026635)	ENSMAMG00000016808	ENSMAMG00000024973	ENSMAMG00000024745
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000170307	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000170307	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.a
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000170307	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.b.a	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b
Greater amberjack	MODERN SPECIES	48	SLC4A7 (ENSSDUG00000019230)	HERPUD2 (ENSSDUG00000019210)	ADGRB1 (ENSSDUG00000018991)	ENSSDUG00000018906	hnrnpr (ENSSDUG00000018866)	dnajc8 (ENSSDUG00000018809)	ENSSDUG00000018794	clk2a (ENSSDUG00000018771)	cers2a (ENSSDUG00000018716)	celf3a (ENSSDUG00000018695)	rprd2a (ENSSDUG00000018680)	ciarta (ENSSDUG00000018656)	mrps21 (ENSSDUG00000018643)	crabp2b (ENSSDUG00000018627) ##19	scamp3 (ENSSDUG00000018597)	ENSSDUG00000018582 ##22	ash1l (ENSSDUG00000018480) ##24	lrrc71 (ENSSDUG00000018445)	ENSSDUG00000018423	ENSSDUG00000018270	chrna11 (ENSSDUG00000018229)	snx27a (ENSSDUG00000018214)	icn (ENSSDUG00000018209)	s100a10a (ENSSDUG00000018200)	trim46b (ENSSDUG00000018130)	dpm3 (ENSSDUG00000018108)	efna1a (ENSSDUG00000018101)	ENSSDUG00000018087	cks1b (ENSSDUG00000018075)	ENSSDUG00000018041	ENSSDUG00000018030
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2834	HERPUD2 (ENSSLDG00000013629)	ADGRB1 (ENSSLDG00000013658)	ENSSLDG00000013696	ENSSLDG00000013723	hnrnpr (ENSSLDG00000013790)	dnajc8 (ENSSLDG00000013819)	ENSSLDG00000013844	clk2a (ENSSLDG00000013868)	cers2a (ENSSLDG00000013896)	celf3a (ENSSLDG00000013940)	rprd2a (ENSSLDG00000013967)	ciarta (ENSSLDG00000013983)	mrps21 (ENSSLDG00000014000)	crabp2b (ENSSLDG00000014006) ##19	scamp3 (ENSSLDG00000014024)	ENSSLDG00000014064 ##22	ash1l (ENSSLDG00000014132) ##24	ENSSLDG00000014234	ENSSLDG00000014293	ENSSLDG00000014381	SNX27 (ENSSLDG00000014428)	icn (ENSSLDG00000014466)	s100a10b (ENSSLDG00000014481)	trim46b (ENSSLDG00000014551)	dpm3 (ENSSLDG00000014600)	efna1a (ENSSLDG00000014614)	ENSSLDG00000014634	cks1b (ENSSLDG00000014648)	ENSSLDG00000014665	ENSSLDG00000014676	s100u (ENSSLDG00000014685)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	279							ENSLCAG00010022083	clk2a (ENSLCAG00010022115)	cers2a (ENSLCAG00010022234)	celf3a (ENSLCAG00010022247)	rprd2a (ENSLCAG00010022260)	ciarta (ENSLCAG00010022265)	mrps21 (ENSLCAG00010022269)	crabp2b (ENSLCAG00010022272) ##19	scamp3 (ENSLCAG00010022275)	ENSLCAG00010022276 ##22	lrrc71 (ENSLCAG00010022303)	ENSLCAG00010022320	ENSLCAG00010022342	snx27a (ENSLCAG00010022387)	chrna11 (ENSLCAG00010022490)	icn (ENSLCAG00010022492)	s100a10a (ENSLCAG00010022493)	trim46b (ENSLCAG00010022498)	dpm3 (ENSLCAG00010022499)	efna1a (ENSLCAG00010022500)	ENSLCAG00010022502	cks1b (ENSLCAG00010022503)	ENSLCAG00010022506	ENSLCAG00010022508	s100u (ENSLCAG00010022510)
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	54			ENSGT00940000157432.A	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000175483	ENSGT00940000154947.k	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e	ENSGT00940000154716.gc.b	ENSGT00950000183094.a.n	ENSGT00390000018360.b	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920	ENSGT00940000165795.d	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000177151
Turbot	MODERN SPECIES	14	ENSSMAG00000001918	ENSSMAG00000001969	ENSSMAG00000002072	ENSSMAG00000002106	ENSSMAG00000002272	dnajc8 (ENSSMAG00000002355)	ENSSMAG00000002396	ENSSMAG00000002407	cers2a (ENSSMAG00000002429)	celf3a (ENSSMAG00000002478)	rprd2a (ENSSMAG00000002507)	ciarta (ENSSMAG00000002523)	mrps21 (ENSSMAG00000002544)	crabp2b (ENSSMAG00000002607) ##19	scamp3 (ENSSMAG00000002617)	ENSSMAG00000002626 ##22	ash1l (ENSSMAG00000002663) ##24	lrrc71 (ENSSMAG00000002819)	ENSSMAG00000029355	ENSSMAG00000002845	ENSSMAG00000002934	ENSSMAG00000002961	ENSSMAG00000002999	s100a10a (ENSSMAG00000034030)	trim46b (ENSSMAG00000003138)	dpm3 (ENSSMAG00000003191)	efna1a (ENSSMAG00000003221)	ENSSMAG00000026861	ENSSMAG00000025169	ENSSMAG00000003243	s100s (ENSSMAG00000003264)
Tongue sole	MODERN SPECIES	9	spag1a (ENSCSEG00000008256)	ENSCSEG00000008226	ADGRB1 (ENSCSEG00000008104)	ENSCSEG00000008062	hnrnpr (ENSCSEG00000008039)	dnajc8 (ENSCSEG00000008018)	ENSCSEG00000008006	clk2a (ENSCSEG00000007968)	cers2a (ENSCSEG00000007949)	celf3a (ENSCSEG00000007913)	rprd2a (ENSCSEG00000007901)	ciarta (ENSCSEG00000007893)	mrps21 (ENSCSEG00000007889)	crabp2b (ENSCSEG00000007867) ##19	scamp3 (ENSCSEG00000007851)	ENSCSEG00000007840 ##22	ash1l (ENSCSEG00000007773) ##24	lrrc71 (ENSCSEG00000007755)	lrrc71 (ENSCSEG00000007744)	ENSCSEG00000007730	ENSCSEG00000007620	chrna11 (ENSCSEG00000007567)	snx27a (ENSCSEG00000007535)	icn (ENSCSEG00000007528)	s100a10a (ENSCSEG00000007523)	trim46b (ENSCSEG00000007470)	dpm3 (ENSCSEG00000007456)	efna1a (ENSCSEG00000007442)	ENSCSEG00000007421	cks1b (ENSCSEG00000007408)	ENSCSEG00000007401
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	116						txnipa (ENSHCOG00000004936)	gatad2b (ENSHCOG00000004961)	gnrhr1 (ENSHCOG00000005629)	cers2a (ENSHCOG00000005722)	celf3a (ENSHCOG00000005746)	ENSHCOG00000005751	ENSHCOG00000005761	mrps21 (ENSHCOG00000005818)	mrps21 (ENSHCOG00000005872)	scamp3 (ENSHCOG00000005882)	ENSHCOG00000005896 ##22	ash1l (ENSHCOG00000005991) ##24	ENSHCOG00000006017
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	2	SLC4A7 (ENSMMDG00005009210)	HERPUD2 (ENSMMDG00005017606)	ADGRB1 (ENSMMDG00005017617)	ENSMMDG00005017621	hnrnpr (ENSMMDG00005017624)	dnajc8 (ENSMMDG00005017640)	ENSMMDG00005017648	clk2a (ENSMMDG00005017688)	cers2a (ENSMMDG00005019037)	celf3a (ENSMMDG00005019040)	rprd2a (ENSMMDG00005019047)	ciarta (ENSMMDG00005019051)	mrps21 (ENSMMDG00005019054)	crabp2b (ENSMMDG00005019059) ##19	scamp3 (ENSMMDG00005019065)	ENSMMDG00005019068 ##22	ash1l (ENSMMDG00005019071) ##24	lrrc71 (ENSMMDG00005019074)	ENSMMDG00005019077	ENSMMDG00005019098	chrna11 (ENSMMDG00005019119)	snx27a (ENSMMDG00005019134)	ENSMMDG00005019208	s100a10a (ENSMMDG00005019210)	trim46b (ENSMMDG00005019227)	dpm3 (ENSMMDG00005019358)	efna1a (ENSMMDG00005019360)	ENSMMDG00005019363	cks1b (ENSMMDG00005019366)	ENSMMDG00005019369	ENSMMDG00005019374
Cod	MODERN SPECIES	14	MRPL24 (ENSGMOG00000016999)	ENSGMOG00000017017	ENSGMOG00000017067	ENSGMOG00000017087	ENSGMOG00000017112	ENSGMOG00000036737	ENSGMOG00000028985	ENSGMOG00000034358	ENSGMOG00000017303	ENSGMOG00000017329	ENSGMOG00000015897	ENSGMOG00000017440	ENSGMOG00000017691	crabp2b (ENSGMOG00000005531) ##19	scamp3 (ENSGMOG00000005539)	ENSGMOG00000005577 ##22	ash1l (ENSGMOG00000026862) ##24	lrrc71 (ENSGMOG00000027589)	ENSGMOG00000005839	ENSGMOG00000005850	chrna11 (ENSGMOG00000014782)	snx27a (ENSGMOG00000019441)	ENSGMOG00000019446	ENSGMOG00000030600	s100a10a (ENSGMOG00000030248)	trim46b (ENSGMOG00000010964)	dpm3 (ENSGMOG00000020118)	efna1a (ENSGMOG00000033783)	ENSGMOG00000010947	cks1b (ENSGMOG00000023116)	ENSGMOG00000024951
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	119													ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b ##19	ENSGT00940000160917	ENSGT00940000157203.d ##22	ENSGT00940000156698.c ##24	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b	ENSGT00940000164921.b	ENSGT00950000183212.C.c.a	ENSGT00390000000920.j	ENSGT00440000034367	ENSGT00940000165795	ENSGT00940000158021.c	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b	ENSGT00940000166681	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b	ENSGT00940000154172.b.b
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	659				ENSGT00940000157432.A.f	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a.ob.a.a	ENSGT00390000012569.a.lb	ENSGT00940000154947.k.d	ENSGT00940000157471.b	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e.c	ENSGT00940000154716.gc.b.d	ENSGT00950000183094.a.n.c	ENSGT00390000018360.b.e	ENSGT00940000157619.a.b.f ##19	ENSGT00940000160917.v	ENSGT00940000157203.d.c ##22
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	48	ENSGT00940000157045.b.e	ENSGT00530000063023.B.f	ENSGT00390000017671.a.a.b	ENSGT00940000157432.A.f	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a.ob.a.a	ENSGT00390000012569.a.lb	ENSGT00940000154947.k.d	ENSGT00940000157471.b	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e.c	ENSGT00940000154716.gc.b.d	ENSGT00950000183094.a.n.c	ENSGT00390000018360.b.e	ENSGT00940000157619.a.b.f ##19	ENSGT00940000160917.v	ENSGT00940000157203.d.c ##22	ENSGT00940000156698.c.c ##24	ENSGT00950000182891.b.a.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b.c.b	ENSGT00940000164921.b.d	ENSGT00950000183212.C.c.a.c	ENSGT00390000000920.j.a	ENSGT00940000165795.f.a	ENSGT00970000197205.D	ENSGT00970000197205.B	ENSGT00940000158021.c.a	ENSGT00990000213475	ENSGT00940000159919.b.c	ENSGT00940000166681.i.a	ENSGT01010000222336.a.a.a.a.a
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157045.b.e	ENSGT00530000063023.B.f	ENSGT00390000017671.a.a.b	ENSGT00940000157432.A.f	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a.ob.a.a	ENSGT00390000012569.a.lb	ENSGT00940000154947.k.d	ENSGT00940000157471.b.e	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e.c	ENSGT00940000154716.gc.b.d	ENSGT00950000183094.a.n.c	ENSGT00390000018360.b.e	ENSGT00940000157619.a.b.f ##19	ENSGT00940000160917.v	ENSGT00940000157203.d.c ##22	ENSGT00940000156698.c.c ##24	ENSGT00950000182891.b.a.a	ENSGT00940000164921.b.d	ENSGT00950000183212.C.c.a.c	ENSGT00390000000920.j.a	ENSGT00940000165795.f.a	ENSGT00970000197205.D	ENSGT00970000197205.B	ENSGT00940000158021.c.a	ENSGT00990000213475	ENSGT00940000159919.b.c	ENSGT00940000166681.i.a	ENSGT01010000222336.a.a.a.a.a	ENSGT00950000182971.B.b.w.a	ENSGT00730000111747.b.e
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157045.b.e	ENSGT00530000063023.B.f	ENSGT00390000017671.a.a.b	ENSGT00940000157432.A.f	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a.ob.a.a	ENSGT00390000012569.a.lb	ENSGT00940000154947.k.d	ENSGT00940000157471.b.e	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e.c	ENSGT00940000154716.gc.b.d	ENSGT00950000183094.a.n.c	ENSGT00390000018360.b.e	ENSGT00940000157619.a.b.f ##19	ENSGT00940000160917.v	ENSGT00940000157203.d.c ##22	ENSGT00940000156698.c.c ##24	ENSGT00940000164921.b.d	ENSGT00950000183212.C.c.a.c	ENSGT00390000000920.j.a	ENSGT00940000165795.f.a	ENSGT00970000197205.D	ENSGT00970000197205.B	ENSGT00940000158021.c.a	ENSGT00940000159919.b.c	ENSGT00940000166681.i.a	ENSGT01010000222336.a.a.a.a.a	ENSGT00950000182971.B.b.w.a	ENSGT00730000111747.b.e	ENSGT00940000177151	ENSGT00940000168219.a
Coho salmon	MODERN SPECIES	8	ENSOKIG00005025460	ENSOKIG00005025515	HERPUD2 (ENSOKIG00005026004)	ADGRB1 (ENSOKIG00005026031)	ENSOKIG00005026216	hnrnpr (ENSOKIG00005026241)	dnajc8 (ENSOKIG00005026404)	clk2a (ENSOKIG00005026569)	ENSOKIG00005027160	cers2a (ENSOKIG00005027727)	celf3a (ENSOKIG00005027935)	rprd2a (ENSOKIG00005027984)	ciarta (ENSOKIG00005027997)	crabp2b (ENSOKIG00005028014) ##19	scamp3 (ENSOKIG00005028025)	ENSOKIG00005019989 ##22	ash1l (ENSOKIG00005019998) ##24	ENSOKIG00005020310	ENSOKIG00005020327	ENSOKIG00005020354	SNX27 (ENSOKIG00005020457)	ENSOKIG00005020618	s100a10a (ENSOKIG00005020627)	ENSOKIG00005020635	trim46b (ENSOKIG00005020646)	efna1a (ENSOKIG00005020700)	ENSOKIG00005020712	ENSOKIG00005020715	cks1b (ENSOKIG00005020717)	ENSOKIG00005020723	ENSOKIG00005020734
Chinook salmon	MODERN SPECIES	5	SLC4A7 (ENSOTSG00005013377)	ENSOTSG00005012867	HERPUD2 (ENSOTSG00005012859)	ADGRB1 (ENSOTSG00005012277)	ENSOTSG00005012261	ENSOTSG00005011733	dnajc8 (ENSOTSG00005011501)	clk2a (ENSOTSG00005010267)	ENSOTSG00005010266	cers2a (ENSOTSG00005010239)	celf3a (ENSOTSG00005010230)	rprd2a (ENSOTSG00005010227)	ciarta (ENSOTSG00005010224)	crabp2b (ENSOTSG00005010221) ##19	scamp3 (ENSOTSG00005010217)	ENSOTSG00005010214 ##22	ENSOTSG00005010194	chrna11 (ENSOTSG00005010149)	snx27a (ENSOTSG00005009884)	ENSOTSG00005009882	s100a10a (ENSOTSG00005009881)	ENSOTSG00005009880	ENSOTSG00005009879	ENSOTSG00005009878	trim46b (ENSOTSG00005009877)	efna1a (ENSOTSG00005009865)	ENSOTSG00005009864	ENSOTSG00005009862	cks1b (ENSOTSG00005009860)	ENSOTSG00005009858	ENSOTSG00005009857
Rainbow trout	MODERN SPECIES	9	ENSOMYG00000010766	ENSOMYG00000007482	ENSOMYG00000006610	ENSOMYG00000006112	ENSOMYG00000077778	ENSOMYG00000043110	dnjc8 (ENSOMYG00000043024)	ENSOMYG00000042945	ENSOMYG00000042924	cers2a (ENSOMYG00000042862)	celf3a (ENSOMYG00000024971)	rprd2a (ENSOMYG00000042841)	ciarta (ENSOMYG00000042838)	crabp2b (ENSOMYG00000042831) ##19	scamp3 (ENSOMYG00000042820)	ENSOMYG00000042816 ##22	ash1l (ENSOMYG00000042810) ##24	ENSOMYG00000042802	ENSOMYG00000049157	ENSOMYG00000042663	snx27a (ENSOMYG00000042083)	ENSOMYG00000042020	ENSOMYG00000042011	ENSOMYG00000042008	s100a10a (ENSOMYG00000042016)	trim46b (ENSOMYG00000041994)	ENSOMYG00000041987	ENSOMYG00000041983	ENSOMYG00000060014	ENSOMYG00000041977	ENSOMYG00000063155
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00940000157045.b.e	ENSGT00530000063023.B.f	ENSGT00390000017671.a.a.b	ENSGT00940000157432.A.f	ENSGT00940000165091.c	ENSGT00940000153511.a.ob.a.a	ENSGT00390000012569.a.lb	ENSGT00940000154947.k.d	ENSGT00940000157471.b	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e.c	ENSGT00940000154716.gc.b.d	ENSGT00950000183094.a.n.c	ENSGT00390000018360.b.e	ENSGT00940000157619.a.b.f ##19	ENSGT00940000160917.v	ENSGT00940000157203.d.c ##22	ENSGT00940000156698.c.c ##24	ENSGT00950000182891.b.a.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b.c.b	ENSGT00940000164921.b.d	ENSGT00950000183212.C.c.a.c	ENSGT00390000000920.j.a	ENSGT00940000165795.f.a	ENSGT00970000197205.D	ENSGT00970000197205.B	ENSGT00940000158021.c.a	ENSGT00990000213475	ENSGT00940000159919.b.c	ENSGT00940000166681.i.a	ENSGT01010000222336.a.a.a.a.a	ENSGT00950000182971.B.b
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	19	ENSSSAG00000063614	ENSSSAG00000063607	ENSSSAG00000107886	ENSSSAG00000063533	ENSSSAG00000084525	HNRPR (ENSSSAG00000061343)	dnjc8 (ENSSSAG00000059917)	ENSSSAG00000056033	ENSSSAG00000055973	cers2a (ENSSSAG00000055868)	celf3a (ENSSSAG00000055446)	rprd2a (ENSSSAG00000055435)	ciarta (ENSSSAG00000107330)	crabp2b (ENSSSAG00000055413) ##19	scamp3 (ENSSSAG00000055404)	ENSSSAG00000055397 ##22	ENSSSAG00000055243	ENSSSAG00000107195	ENSSSAG00000090235	chrna11 (ENSSSAG00000096453)	snx27a (ENSSSAG00000054800)	s100a10a (ENSSSAG00000118630)	ENSSSAG00000084587	s10a4 (ENSSSAG00000054772)	trim46b (ENSSSAG00000054481)	ENSSSAG00000119413	ENSSSAG00000054460	ENSSSAG00000116780	ENSSSAG00000097250	ENSSSAG00000054447	ENSSSAG00000054441
River trout	MODERN SPECIES	27	ENSSTUG00000040914	ENSSTUG00000040881	ENSSTUG00000040871	ADGRB1 (ENSSTUG00000039877)	ENSSTUG00000039826	hnrnpr (ENSSTUG00000039215)	dnajc8 (ENSSTUG00000039024)	clk2a (ENSSTUG00000037867)	setdb1a (ENSSTUG00000037595)	cers2a (ENSSTUG00000037420)	celf3a (ENSSTUG00000037316)	rprd2a (ENSSTUG00000037297)	ciarta (ENSSTUG00000037291)	crabp2b (ENSSTUG00000037284) ##19	scamp3 (ENSSTUG00000037278)	RNF115 (ENSSTUG00000037253) ##22	ash1l (ENSSTUG00000037149) ##24	ENSSTUG00000037109	chrna11 (ENSSTUG00000037089)	snx27a (ENSSTUG00000042380)	ENSSTUG00000042315	s100a10a (ENSSTUG00000042289)	ENSSTUG00000042278	ENSSTUG00000042240	trim46b (ENSSTUG00000042165)	ENSSTUG00000042141	efna1a (ENSSTUG00000042118)	ENSSTUG00000042113	ENSSTUG00000042045	ENSSTUG00000041948	ENSSTUG00000041915
Huchen	MODERN SPECIES	489	ENSHHUG00000048148	ENSHHUG00000048160	ENSHHUG00000048163	ENSHHUG00000048173	ENSHHUG00000048175	ENSHHUG00000048180	ENSHHUG00000048183	ENSHHUG00000048187	ENSHHUG00000048190	sema3e (ENSHHUG00000048195)	celf3a (ENSHHUG00000048275)	rprd2a (ENSHHUG00000048308)	ciarta (ENSHHUG00000048309)	crabp2b (ENSHHUG00000048311) ##19	scamp3 (ENSHHUG00000048313)	RNF115 (ENSHHUG00000048314) ##22	ash1l (ENSHHUG00000048316) ##24
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	164	ENSGT00940000157045.b.f	ENSGT00390000017671.a.a.a	ENSGT00940000178110	ENSGT00940000157432.A.e	ENSGT00940000167191	ENSGT00940000153511.a.ob.a.b	ENSGT00390000012569.a.mb	ENSGT00940000154947.k.c	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e.d	ENSGT00940000154716.gc.b.c	ENSGT00950000183094.a.n.d	ENSGT00390000018360.b.f	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b.e ##19	ENSGT00940000160917.u	ENSGT00940000157203.d.d ##22	ENSGT00940000156698.c.d ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00940000156698.c.c ##24	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b.d	ENSGT00940000164921.b.c	ENSGT00950000183212.C.c.a.d	ENSGT00390000000920.j.b	ENSGT00940000165795.f.b	ENSGT00970000197205.A	ENSGT00940000158021.c.b	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b.d	ENSGT00940000166681.i.b	ENSGT00950000182971.B.b
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	118	ENSGT00940000157045.b.f	ENSGT00390000017671.a.a.a	ENSGT00940000178110	ENSGT00940000157432.A.e	ENSGT00940000167191	ENSGT00940000153511.a.ob.a.b	ENSGT00390000012569.a.mb	ENSGT00940000154947.k.c	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e.d	ENSGT00940000154716.gc.b.c	ENSGT00950000183094.a.n.d	ENSGT00390000018360.b.f	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b.e ##19	ENSGT00940000160917.u	ENSGT00940000157203.d.d ##22	ENSGT00940000156698.c.d ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b.d	ENSGT00940000164921.b.c	ENSGT00950000183212.C.c.a.d	ENSGT00390000000920.j.b	ENSGT00970000197205.A	ENSGT00940000158021.c.b	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b.d	ENSGT00940000166681.i.b	ENSGT00940000166681.j	ENSGT00950000182971.B.b	ENSGT00730000111747.b.e
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00940000157045.b.f	ENSGT00390000017671.a.a.a	ENSGT00940000178110	ENSGT00940000157432.A.e	ENSGT00940000167191	ENSGT00940000153511.a.ob.a.b	ENSGT00390000012569.a.mb	ENSGT00940000154947.k.c	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e.d	ENSGT00940000154716.gc.b.c	ENSGT00950000183094.a.n.d	ENSGT00390000018360.b.f	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b.e ##19	ENSGT00940000160917.u	ENSGT00940000157203.d.d ##22	ENSGT00940000156698.c.d ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b.d	ENSGT00940000164921.b.c	ENSGT00950000183212.C.c.a.d	ENSGT00940000165956.f	ENSGT00940000165795.f.b	ENSGT00970000197205.C	ENSGT00970000197205.E	ENSGT00970000197205.A	ENSGT00940000158021.c.b	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b.d	ENSGT00940000166681.i.b
Rainbow trout	MODERN SPECIES	24	ENSOMYG00000011522	ENSOMYG00000071431	ENSOMYG00000008228	ENSOMYG00000075777	ENSOMYG00000031715	dnajc8 (ENSOMYG00000004831)	ENSOMYG00000004855	ENSOMYG00000062891	cers2a (ENSOMYG00000071708)	celf3a (ENSOMYG00000024025)	rprd2a (ENSOMYG00000062185)	ciarta (ENSOMYG00000023629)	mrps21 (ENSOMYG00000023645)	ENSOMYG00000060647	scamp3 (ENSOMYG00000069466)	ENSOMYG00000011264 ##22	ash1l (ENSOMYG00000011156) ##24	ENSOMYG00000004535	ENSOMYG00000004382	ENSOMYG00000004215	chrna11 (ENSOMYG00000011456)	snx27a (ENSOMYG00000005256)	ENSOMYG00000074965	s100a10a (ENSOMYG00000000673)	ENSOMYG00000034864	ENSOMYG00000034856	ENSOMYG00000059255	trim46b (ENSOMYG00000005457)	dpm3 (ENSOMYG00000070307)	efna1a (ENSOMYG00000038281)	ENSOMYG00000041980
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	96															ENSGT00940000160917.u	ENSGT00940000157203.d.d ##22	ENSGT00940000156698.c.d ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b.d	ENSGT00940000164921.b.c	ENSGT00950000183212.C.c.a.d	ENSGT00940000165956.f	ENSGT00940000165795.f.b	ENSGT00970000197205.C	ENSGT00970000197205.E	ENSGT00970000197205.A	ENSGT00940000158021.c.b	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b.d	ENSGT00940000166681.i.b
Coho salmon	MODERN SPECIES	5	ccdc32 (ENSOKIG00005012674)	pcmtl (ENSOKIG00005012688)	ENSOKIG00005012861	eml1 (ENSOKIG00005013228)	evla (ENSOKIG00005020892)	YY1 (ENSOKIG00005020986)	tpp1 (ENSOKIG00005021071)	MDGA2 (ENSOKIG00005021503)	KLHDC2 (ENSOKIG00005022925)	NEMF (ENSOKIG00005023080)	MOK (ENSOKIG00005023201)	WDR20 (ENSOKIG00005023272)	ENSOKIG00005023329	ENSOKIG00005023380	scamp3 (ENSOKIG00005023497)	ENSOKIG00005023525 ##22	ash1l (ENSOKIG00005023712) ##24	lrrc71 (ENSOKIG00005026347)	ENSOKIG00005026390	ENSOKIG00005026448	chrna11 (ENSOKIG00005026485)	snx27a (ENSOKIG00005026544)	ENSOKIG00005026985	s100a10a (ENSOKIG00005027005)	ENSOKIG00005027021	ENSOKIG00005027034	ENSOKIG00005027057	trim46b (ENSOKIG00005027102)	dpm3 (ENSOKIG00005027324)	efna1a (ENSOKIG00005027330)	ENSOKIG00005027348
Chinook salmon	MODERN SPECIES	529															scamp3 (ENSOTSG00005023615)	ENSOTSG00005023614 ##22
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158728.k.d	ENSGT00940000157045.b.f	ENSGT00390000017671.a.a.a	ENSGT00940000157432.A.e	ENSGT00940000167191	ENSGT00940000153511.a.ob.a.b	ENSGT00390000012569.a.mb	ENSGT00940000154947.k.c	ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e.d	ENSGT00940000154716.gc.b.c	ENSGT00950000183094.a.n.d	ENSGT00390000018360.b.f	ENSGT00940000166610	ENSGT00940000157619.a.b.e ##19	ENSGT00940000160917.u	ENSGT00940000157203.d.d ##22	ENSGT00940000156698.c.d ##24	ENSGT00440000034367	ENSGT00950000182891.b.b.a	ENSGT00950000182904.a.a.a.b.d	ENSGT00940000164921.b.c	ENSGT00950000183212.C.c.a.d	ENSGT00390000000920.j.b	ENSGT00940000165795.f.b	ENSGT00970000197205.C.b	ENSGT00970000197205.C.a	ENSGT00970000197205.A	ENSGT00940000158021.c.b	ENSGT00390000008892	ENSGT00940000159919.b.d	ENSGT00940000166681.i.b
River trout	MODERN SPECIES	29	eomesa (ENSSTUG00000032882)	SLC4A7 (ENSSTUG00000032913)	HERPUD2 (ENSSTUG00000033271)	ADGRB1 (ENSSTUG00000033292)	ENSSTUG00000033356	hnrnpr (ENSSTUG00000033377)	dnajc8 (ENSSTUG00000034036)	clk2a (ENSSTUG00000034141)	cers2a (ENSSTUG00000034904)	celf3a (ENSSTUG00000034924)	rprd2a (ENSSTUG00000035003)	ciarta (ENSSTUG00000035011)	mrps21 (ENSSTUG00000035022)	crabp2b (ENSSTUG00000035033) ##19	scamp3 (ENSSTUG00000035050)	ENSSTUG00000035067 ##22	ash1l (ENSSTUG00000035137) ##24	lrrc71 (ENSSTUG00000036681)	ENSSTUG00000036751	ENSSTUG00000036811	ENSSTUG00000036829	chrna11 (ENSSTUG00000036838)	snx27a (ENSSTUG00000036928)	ENSSTUG00000038439	ENSSTUG00000038449	s100a10a (ENSSTUG00000038454)	ENSSTUG00000038461	ENSSTUG00000038468	ENSSTUG00000038480	trim46b (ENSSTUG00000038500)	dpm3 (ENSSTUG00000038600)
Huchen	MODERN SPECIES	70	SLC4A7 (ENSHHUG00000032793)	HERPUD2 (ENSHHUG00000033105)	ADGRB1 (ENSHHUG00000033118)	hnrnpr (ENSHHUG00000033360)	ENSHHUG00000033394	dnajc8 (ENSHHUG00000033401)	clk2a (ENSHHUG00000033548)	ENSHHUG00000033730	cers2a (ENSHHUG00000033733)	celf3a (ENSHHUG00000033743)	rprd2a (ENSHHUG00000033815)	ciarta (ENSHHUG00000033820)	mrps21 (ENSHHUG00000033835)	crabp2b (ENSHHUG00000033844) ##19	scamp3 (ENSHHUG00000033855)	ENSHHUG00000033861 ##22	ash1l (ENSHHUG00000033874) ##24	ENSHHUG00000033897	lrrc71 (ENSHHUG00000033889)	ENSHHUG00000033900	ENSHHUG00000033946	ENSHHUG00000033959	ENSHHUG00000033963
Northern pike	MODERN SPECIES	9	s100u (ENSELUG00000008487)	s100a11 (ENSELUG00000008472)	ENSELUG00000008428	cks1b (ENSELUG00000008403)	ENSELUG00000001706	efna1a (ENSELUG00000033446)	dpm3 (ENSELUG00000001608)	trim46b (ENSELUG00000008327)	s100a10a (ENSELUG00000029139)	ENSELUG00000008197	snx27a (ENSELUG00000008184)	chrna11 (ENSELUG00000008156)	ENSELUG00000008074	RPS27 (ENSELUG00000007964)	scamp3 (ENSELUG00000007922)	ENSELUG00000007883 ##22	ash1l (ENSELUG00000007838) ##24	ENSELUG00000026674	lrrc71 (ENSELUG00000007788)	crabp2 (ENSELUG00000007739) ##19	mrps21 (ENSELUG00000025966)	FEL (ENSELUG00000007697)	ENSELUG00000032909	neu1 (ENSELUG00000007673)	prrc2a (ENSELUG00000001569)	CSNK2B (ENSELUG00000007616)	ENSELUG00000007598	ENSELUG00000030117	ENSELUG00000029130	ENSELUG00000029911	ENSELUG00000027731