Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.a #22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 91 ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000002188 ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712 ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054 ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 160 ENSGT00940000157032 ENSGT00530000063734.b ENSGT00950000183038.a.b.a ENSGT00390000010523.d ENSGT00930000150980.b ENSGT00940000159962 ENSGT01050000244940.a.a ENSGT00530000063607.a ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT01100000266433 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00500000044852.b ENSGT00940000164733 ENSGT00940000157032 ENSGT00530000063734.b ENSGT00950000183038.a.b.a ENSGT00390000016511 ENSGT00390000010523.d ENSGT00930000150980.b ENSGT00940000159962 ENSGT01050000244940.a.a ENSGT00530000063607.a ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT01100000266433 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.a ##35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b #36 Amniota ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00500000044852.b ENSGT00940000161446 ENSGT00940000157032 ENSGT00530000063734.b ENSGT00950000183038.a.b.a ENSGT00390000016511 ENSGT00390000010523.d ENSGT00930000150980.b ENSGT00940000159962 ENSGT01050000244940.a.a ENSGT00530000063607.a ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00940000154457.b ENSGT00950000183165.b.b Mammalia ANCESTRAL SPECIES 82 ENSGT00940000161971 ENSGT00500000044852.b ENSGT00940000161446 ENSGT00940000157032 ENSGT00530000063734.b ENSGT00950000183038.a.b.a ENSGT00390000016511 ENSGT00930000150980.b ENSGT00940000159962 ENSGT01050000244940.a.a ENSGT00530000063607.a ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00940000154457.b ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b #36 Theria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000002307 ENSGT00940000159065 ENSGT00940000155473 ENSGT00940000161281 ENSGT00940000155224 ENSGT00940000155489.b ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00390000002978 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.b #36 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000165904 ENSGT00940000163941.A ENSGT00940000159881.a.b.a ENSGT00940000159881.a.b.b ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.b #36 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000014843 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000162202.C ENSGT00940000163941.A ENSGT00940000159881.a.b.a ENSGT00940000159881.a.b.b ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00560000078683 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00940000154457.b Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00390000014843 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00560000078683 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.b #36 Primates ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159366 ENSGT00390000002978 ENSGT01100000263574.a ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00390000014843 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00560000078683 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.b #36 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00390000002978 ENSGT01100000263574.a ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.A ENSGT00390000014843 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00560000078683 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.b #36 Tarsier MODERN SPECIES 6705 LALBA (ENSTSYG00000007307) #17 KANSL2 (ENSTSYG00000009751) #18 CCNT1 (ENSTSYG00000025426) #19 TEX49 (ENSTSYG00000034408) #20 ADCY6 (ENSTSYG00000014642) #21 CACNB3 (ENSTSYG00000005384) #22 DDX23 (ENSTSYG00000005429) #23 RND1 (ENSTSYG00000027407) #24 CCDC65 (ENSTSYG00000007635) #25 FKBP11 (ENSTSYG00000007691) #26 ARF3 (ENSTSYG00000011564) #27 WNT10B (ENSTSYG00000035601) #28 WNT1 (ENSTSYG00000037339) #29 PRKAG1 (ENSTSYG00000013458) #30 KMT2D (ENSTSYG00000001131) #31 RHEBL1 (ENSTSYG00000036357) #32 DHH (ENSTSYG00000030517) #33 LMBR1L (ENSTSYG00000009959) #34 TUBA1B (ENSTSYG00000013266) #35 TUBA1A (ENSTSYG00000031483) #36 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00390000002978 ENSGT01100000263574.a ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.A ENSGT00390000014843 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00560000078683 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b.l.a #35 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00390000002978 ENSGT00910000147030 ENSGT01100000263574.a ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00390000014843 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 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ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b.m #35 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159366 ENSGT00950000183070.a.b.g.b.a.c.a ENSGT00390000002978 ENSGT00910000147030 ENSGT01100000263574.a ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00390000014843 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b.e #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b.m #35 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183070.a.b.g.b.a.c.a ENSGT00390000002978 ENSGT00910000147030 ENSGT01100000263574.a ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00950000182907.a.b.b.b.tb.b ENSGT00390000014843 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b.e #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b.m #35 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000183070.a.b.g.b.a.c.a ENSGT00390000002978 ENSGT00910000147030 ENSGT01100000263574.a ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00950000182907.a.b.b.b.tb.b ENSGT00390000014843 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b.e #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b.m #35 Pan ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00950000183070.a.b.g.b.a.c.a ENSGT00390000002978 ENSGT00910000147030 ENSGT01100000263574.a ENSGT00730000111596 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(ENSPPYG00000004477) #30 ENSPPYG00000029928 #31 RHEBL1 (ENSPPYG00000004479) #32 DHH (ENSPPYG00000004480) #33 LMBR1L (ENSPPYG00000004471) #34 TUBA1A (ENSPPYG00000004481) ##35 TUBA1C (ENSPPYG00000004482) #35 Gibbon MODERN SPECIES 23 TMEM106C (ENSNLEG00000017898) COL2A1 (ENSNLEG00000017893) SENP1 (ENSNLEG00000017891) PFKM (ENSNLEG00000017887) ASB8 (ENSNLEG00000017885) ENSNLEG00000028267 CCDC184 (ENSNLEG00000019275) ENSNLEG00000017884 ENSNLEG00000017883 ZNF641 (ENSNLEG00000017881) LALBA (ENSNLEG00000017877) #17 ENSNLEG00000017874 #18 CCNT1 (ENSNLEG00000017873) #19 ENSNLEG00000034433 #20 ADCY6 (ENSNLEG00000017868) #21 CACNB3 (ENSNLEG00000017866) #22 DDX23 (ENSNLEG00000017864) #23 RND1 (ENSNLEG00000028550) #24 FKBP11 (ENSNLEG00000017862) #26 CCDC65 (ENSNLEG00000017860) #25 ENSNLEG00000030380 #27 ENSNLEG00000030793 #28 WNT1 (ENSNLEG00000017855) #29 DDN (ENSNLEG00000017854) PRKAG1 (ENSNLEG00000017850) #30 KMT2D (ENSNLEG00000017849) #31 RHEBL1 (ENSNLEG00000017847) #32 DHH (ENSNLEG00000017846) #33 LMBR1L (ENSNLEG00000017843) #34 TUBA1A (ENSNLEG00000032990) ##35 ENSNLEG00000017835 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183070.a.b.g.b.a.d ENSGT00390000002978 ENSGT00910000147030 ENSGT01100000263574.a ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.A ENSGT00390000014843 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b.e #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00560000078683 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00950000183070.a.b.g.b.a.d ENSGT00390000002978 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.A ENSGT00390000014843 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b.e #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b.m #35 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000013208.v ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00950000183070.a.b.g.b.a.d ENSGT00390000002978 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00390000014843 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b.e #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b.m #35 Macaca ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000013208.v ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00950000183070.a.b.g.b.a.d ENSGT00390000002978 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00390000014843 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b.e #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b.m #35 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 196 PFKM (ENSMNEG00000036534) ENSMNEG00000039461 ASB8 (ENSMNEG00000036379) CCDC184 (ENSMNEG00000000953) ENSMNEG00000045356 ZNF641 (ENSMNEG00000044922) ENSMNEG00000028722 ENSMNEG00000032933 C12orf54 (ENSMNEG00000038960) OR8S1 (ENSMNEG00000032997) LALBA (ENSMNEG00000034387) #17 KANSL2 (ENSMNEG00000039608) #18 CCNT1 (ENSMNEG00000042465) #19 TEX49 (ENSMNEG00000028091) #20 ADCY6 (ENSMNEG00000043535) #21 CACNB3 (ENSMNEG00000029365) #22 DDX23 (ENSMNEG00000040016) #23 RND1 (ENSMNEG00000038480) #24 FKBP11 (ENSMNEG00000030125) #26 CCDC65 (ENSMNEG00000043967) #25 ARF3 (ENSMNEG00000032173) #27 WNT10B 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ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b.m #35 ENSGT00940000160203 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 2 PFKM (ENSMFAG00000037825) ASB8 (ENSMFAG00000002179) CCDC184 (ENSMFAG00000058649) H1-7 (ENSMFAG00000053048) ENSMFAG00000042792 ENSMFAG00000049420 ENSMFAG00000031362 OR8S1 (ENSMFAG00000043587) OR5BS1P (ENSMFAG00000060517) LALBA (ENSMFAG00000003340) #17 ENSMFAG00000050804 KANSL2 (ENSMFAG00000039042) #18 CCNT1 (ENSMFAG00000042457) #19 TEX49 (ENSMFAG00000041881) #20 ADCY6 (ENSMFAG00000039058) #21 CACNB3 (ENSMFAG00000041712) #22 DDX23 (ENSMFAG00000038666) #23 RND1 (ENSMFAG00000052114) #24 CCDC65 (ENSMFAG00000000659) #25 ARF3 (ENSMFAG00000036847) #27 WNT10B (ENSMFAG00000043880) #28 WNT1 (ENSMFAG00000034644) #29 DDN (ENSMFAG00000025897) PRKAG1 (ENSMFAG00000040023) #30 ENSMFAG00000052907 #31 ENSMFAG00000038689 #31 RHEBL1 (ENSMFAG00000035227) #32 LMBR1L (ENSMFAG00000031019) #34 DHH (ENSMFAG00000051486) #33 TUBA1B (ENSMFAG00000035643) #35 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ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b.e #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b.m #35 ENSGT00940000160203 Sooty mangabey MODERN SPECIES 571 SENP1 (ENSCATG00000043133) PFKM (ENSCATG00000027401) ASB8 (ENSCATG00000030950) ENSCATG00000032527 ENSCATG00000038030 ENSCATG00000021099 ZNF641 (ENSCATG00000043835) ENSCATG00000041332 C12orf54 (ENSCATG00000034097) OR8S1 (ENSCATG00000004425) LALBA (ENSCATG00000035302) #17 KANSL2 (ENSCATG00000039151) #18 CCNT1 (ENSCATG00000012742) #19 TEX49 (ENSCATG00000026325) #20 ADCY6 (ENSCATG00000031664) #21 CACNB3 (ENSCATG00000036744) #22 DDX23 (ENSCATG00000039797) #23 RND1 (ENSCATG00000026420) #24 FKBP11 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WNT10B (ENSMLEG00000023418) #28 WNT1 (ENSMLEG00000006250) #29 DDN (ENSMLEG00000042019) PRKAG1 (ENSMLEG00000040639) #30 KMT2D (ENSMLEG00000027718) #31 RHEBL1 (ENSMLEG00000043169) #32 DHH (ENSMLEG00000029947) #33 LMBR1L (ENSMLEG00000043801) #34 ENSMLEG00000026197 #35 Vervet Monkey MODERN SPECIES 2 ENSCSAG00000006302 CCDC184 (ENSCSAG00000019250) ENSCSAG00000006285 H1-7 (ENSCSAG00000019251) ZNF641 (ENSCSAG00000006278) ENSCSAG00000019252 ENSCSAG00000006275 C12orf54 (ENSCSAG00000006273) OR8S1 (ENSCSAG00000006270) OR5BS1P (ENSCSAG00000006266) LALBA (ENSCSAG00000006263) #17 KANSL2 (ENSCSAG00000006258) #18 CCNT1 (ENSCSAG00000006255) #19 TEX49 (ENSCSAG00000006250) #20 ADCY6 (ENSCSAG00000006246) #21 CACNB3 (ENSCSAG00000006242) #22 DDX23 (ENSCSAG00000006240) #23 RND1 (ENSCSAG00000006239) #24 CCDC65 (ENSCSAG00000006233) #25 FKBP11 (ENSCSAG00000006226) #26 ARF3 (ENSCSAG00000006224) #27 WNT10B (ENSCSAG00000006220) #28 WNT1 (ENSCSAG00000006212) #29 DDN (ENSCSAG00000006208) PRKAG1 (ENSCSAG00000006199) #30 KMT2D (ENSCSAG00000006178) #31 RHEBL1 (ENSCSAG00000006168) #32 DHH (ENSCSAG00000006163) #33 LMBR1L (ENSCSAG00000006161) #34 ENSCSAG00000006157 #35 TUBA1A (ENSCSAG00000006153) ##35 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00950000183070.a.b.g.b.a.d ENSGT00390000002978 ENSGT00910000147030 ENSGT01100000263574.a ENSGT00940000162121 ENSGT00390000007552.f.x.z ENSGT00390000014843 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b.e #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00560000078683 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b.m #35 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1192 ZNF641 (ENSRBIG00000032093) ENSRBIG00000032258 C12orf54 (ENSRBIG00000039534) OR8S1 (ENSRBIG00000033095) LALBA (ENSRBIG00000007431) #17 KANSL2 (ENSRBIG00000031481) #18 CCNT1 (ENSRBIG00000034059) #19 TEX49 (ENSRBIG00000040348) #20 ADCY6 (ENSRBIG00000020775) #21 CACNB3 (ENSRBIG00000027539) #22 DDX23 (ENSRBIG00000040362) #23 RND1 (ENSRBIG00000008703) #24 FKBP11 (ENSRBIG00000034219) #26 CCDC65 (ENSRBIG00000031835) #25 ENSRBIG00000040877 ARF3 (ENSRBIG00000044317) #27 WNT10B (ENSRBIG00000031686) #28 WNT1 (ENSRBIG00000040400) #29 DDN (ENSRBIG00000028117) PRKAG1 (ENSRBIG00000028288) #30 KMT2D (ENSRBIG00000028892) #31 RHEBL1 (ENSRBIG00000042716) #32 DHH (ENSRBIG00000033154) #33 LMBR1L (ENSRBIG00000042873) #34 ENSRBIG00000026839 ##35 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2523 ADCY6 (ENSRROG00000043634) #21 CACNB3 (ENSRROG00000041133) #22 DDX23 (ENSRROG00000028964) #23 RND1 (ENSRROG00000023951) #24 FKBP11 (ENSRROG00000026680) #26 CCDC65 (ENSRROG00000029231) #25 ENSRROG00000044310 ARF3 (ENSRROG00000042065) #27 WNT10B (ENSRROG00000044970) #28 WNT1 (ENSRROG00000006398) #29 DDN (ENSRROG00000032736) PRKAG1 (ENSRROG00000037662) #30 KMT2D (ENSRROG00000035460) #31 RHEBL1 (ENSRROG00000036462) #32 DHH (ENSRROG00000034891) #33 LMBR1L (ENSRROG00000044118) #34 TUBA1B (ENSRROG00000042978) #35 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155811 ENSGT00940000153832.f ENSGT00730000110905.b ENSGT00940000158580 ENSGT00530000063539.b ENSGT00940000162121 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162202.A ENSGT00390000014843 ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00560000078683 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b.l.a #35 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157033 ENSGT00940000155811 ENSGT00940000153832.f ENSGT00730000110905.b ENSGT00940000158580 ENSGT00940000162121 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162202.A ENSGT00390000014843 ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00560000078683 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.b #36 Marmoset MODERN SPECIES 21 FRS2 (ENSCJAG00000001774) ENSCJAG00000071407 LYZ (ENSCJAG00000001779) CPSF6 (ENSCJAG00000001798) CPM (ENSCJAG00000001828) ENSCJAG00000074436 ENSCJAG00000070721 ZNF641 (ENSCJAG00000082757) C12orf54 (ENSCJAG00000020725) OR5BS1P (ENSCJAG00000060436) LALBA (ENSCJAG00000020732) #17 KANSL2 (ENSCJAG00000020735) #18 CCNT1 (ENSCJAG00000020739) #19 TEX49 (ENSCJAG00000041983) #20 ADCY6 (ENSCJAG00000020756) #21 CACNB3 (ENSCJAG00000020762) #22 DDX23 (ENSCJAG00000020775) #23 RND1 (ENSCJAG00000051836) #24 FKBP11 (ENSCJAG00000046812) #26 CCDC65 (ENSCJAG00000020792) #25 ARF3 (ENSCJAG00000020800) #27 WNT10B (ENSCJAG00000020802) #28 WNT1 (ENSCJAG00000020813) #29 DDN (ENSCJAG00000048410) ENSCJAG00000020827 #30 ENSCJAG00000058349 #31 RHEBL1 (ENSCJAG00000020856) #32 DHH (ENSCJAG00000020862) #33 LMBR1L (ENSCJAG00000020863) #34 TUBA1B (ENSCJAG00000086136) #35 TUBA1A (ENSCJAG00000071730) ##35 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00550000074930.ab ENSGT00940000157033 ENSGT00940000155811 ENSGT00940000153832.f ENSGT00730000110905.b ENSGT00940000158580 ENSGT00940000162121 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(ENSCCAG00000029177) #23 RND1 (ENSCCAG00000034569) #24 CCDC65 (ENSCCAG00000036201) #25 ENSCCAG00000023694 FKBP11 (ENSCCAG00000032118) #26 ARF3 (ENSCCAG00000037739) #27 ENSCCAG00000033541 WNT10B (ENSCCAG00000037600) #28 WNT1 (ENSCCAG00000031046) #29 DDN (ENSCCAG00000030806) PRKAG1 (ENSCCAG00000017317) #30 KMT2D (ENSCCAG00000034677) #31 RHEBL1 (ENSCCAG00000021754) #32 DHH (ENSCCAG00000008770) #33 LMBR1L (ENSCCAG00000034639) #34 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 153 CACNB3 (ENSSBOG00000002898) #22 DDX23 (ENSSBOG00000025799) #23 RND1 (ENSSBOG00000001346) #24 CCDC65 (ENSSBOG00000023064) #25 ENSSBOG00000029649 ENSSBOG00000034756 FKBP11 (ENSSBOG00000023963) #26 ENSSBOG00000018490 ARF3 (ENSSBOG00000021606) #27 WNT10B (ENSSBOG00000016250) #28 WNT1 (ENSSBOG00000023811) #29 DDN (ENSSBOG00000021863) PRKAG1 (ENSSBOG00000021677) #30 KMT2D (ENSSBOG00000035169) #31 RHEBL1 (ENSSBOG00000035130) #32 DHH (ENSSBOG00000036092) #33 Mas night monkey MODERN SPECIES 1029 CCT2 (ENSANAG00000026639) FRS2 (ENSANAG00000029507) ENSANAG00000033517 YEATS4 (ENSANAG00000032795) LYZ (ENSANAG00000019339) CPSF6 (ENSANAG00000019240) CPM (ENSANAG00000038366) ENSANAG00000038209 ZNF641 (ENSANAG00000036405) C12orf54 (ENSANAG00000035791) LALBA (ENSANAG00000027355) #17 KANSL2 (ENSANAG00000029846) #18 CCNT1 (ENSANAG00000019549) #19 TEX49 (ENSANAG00000024703) #20 ADCY6 (ENSANAG00000030000) #21 CACNB3 (ENSANAG00000023621) #22 DDX23 (ENSANAG00000018663) #23 RND1 (ENSANAG00000032196) #24 CCDC65 (ENSANAG00000025259) #25 ENSANAG00000036811 FKBP11 (ENSANAG00000032791) #26 ENSANAG00000030850 ARF3 (ENSANAG00000025111) #27 ENSANAG00000020636 WNT10B (ENSANAG00000031838) #28 WNT1 (ENSANAG00000026167) #29 DDN (ENSANAG00000027078) PRKAG1 (ENSANAG00000029035) #30 KMT2D (ENSANAG00000024519) #31 RHEBL1 (ENSANAG00000025035) #32 DHH (ENSANAG00000023041) #33 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00390000002978 ENSGT01100000263574.a ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 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ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Mouse lemur MODERN SPECIES 29 HDAC7 (ENSMICG00000008981) VDR (ENSMICG00000009017) TMEM106C (ENSMICG00000001808) COL2A1 (ENSMICG00000009035) SENP1 (ENSMICG00000009067) ENSMICG00000009077 ASB8 (ENSMICG00000036562) ENSMICG00000043548 ZNF641 (ENSMICG00000007360) C12orf54 (ENSMICG00000044033) LALBA (ENSMICG00000027875) #17 KANSL2 (ENSMICG00000005369) #18 CCNT1 (ENSMICG00000045745) #19 TEX49 (ENSMICG00000046126) #20 ADCY6 (ENSMICG00000011825) #21 CACNB3 (ENSMICG00000017540) #22 DDX23 (ENSMICG00000017541) #23 RND1 (ENSMICG00000034995) #24 FKBP11 (ENSMICG00000017545) #26 CCDC65 (ENSMICG00000029612) #25 ARF3 (ENSMICG00000043617) #27 WNT10B (ENSMICG00000011017) #28 WNT1 (ENSMICG00000045219) #29 DDN (ENSMICG00000032556) PRKAG1 (ENSMICG00000035239) #30 KMT2D (ENSMICG00000017547) #31 RHEBL1 (ENSMICG00000017548) #32 DHH (ENSMICG00000017549) #33 LMBR1L (ENSMICG00000017550) #34 TUBA1B (ENSMICG00000046786) #35 TUBA1A (ENSMICG00000031961) ##35 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00390000002978 ENSGT01100000263574.a ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.B ENSGT00390000014843 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 91 KANSL2 (ENSPCOG00000024808) #18 CCNT1 (ENSPCOG00000024849) #19 TEX49 (ENSPCOG00000019022) #20 ADCY6 (ENSPCOG00000007340) #21 CACNB3 (ENSPCOG00000027005) #22 DDX23 (ENSPCOG00000025915) #23 RND1 (ENSPCOG00000021549) #24 ENSPCOG00000019265 #25 FKBP11 (ENSPCOG00000017728) #26 ARF3 (ENSPCOG00000001914) #27 WNT10B (ENSPCOG00000005304) #28 WNT1 (ENSPCOG00000015303) #29 DDN (ENSPCOG00000027752) PRKAG1 (ENSPCOG00000014137) #30 KMT2D (ENSPCOG00000023172) #31 RHEBL1 (ENSPCOG00000025412) #32 DHH (ENSPCOG00000000341) #33 LMBR1L (ENSPCOG00000021876) #34 TUBA1A (ENSPCOG00000014540) ##35 TUBA1C (ENSPCOG00000023706) #35 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 157 PFKM (ENSPSMG00000006723) ASB8 (ENSPSMG00000006381) CCDC184 (ENSPSMG00000006359) OR10AD1 (ENSPSMG00000006355) ENSPSMG00000006354 ZNF641 (ENSPSMG00000006343) ENSPSMG00000006325 C12orf54 (ENSPSMG00000006313) OR8S1 (ENSPSMG00000006307) OR5BS1P (ENSPSMG00000006293) LALBA (ENSPSMG00000006288) #17 KANSL2 (ENSPSMG00000006262) #18 CCNT1 (ENSPSMG00000006248) #19 TEX49 (ENSPSMG00000006230) #20 ADCY6 (ENSPSMG00000006198) #21 CACNB3 (ENSPSMG00000005832) #22 DDX23 (ENSPSMG00000005631) #23 RND1 (ENSPSMG00000005611) #24 CCDC65 (ENSPSMG00000005598) #25 FKBP11 (ENSPSMG00000005580) #26 ARF3 (ENSPSMG00000005561) #27 WNT10B (ENSPSMG00000005540) #28 WNT1 (ENSPSMG00000005535) #29 DDN (ENSPSMG00000005533) PRKAG1 (ENSPSMG00000005361) #30 KMT2D (ENSPSMG00000005275) #31 RHEBL1 (ENSPSMG00000005241) #32 DHH (ENSPSMG00000005234) #33 LMBR1L (ENSPSMG00000005135) #34 Bushbaby MODERN SPECIES 185 COL2A1 (ENSOGAG00000005487) SENP1 (ENSOGAG00000005497) PFKM (ENSOGAG00000005501) ASB8 (ENSOGAG00000005509) CCDC184 (ENSOGAG00000030121) OR10AD1 (ENSOGAG00000005517) H1-7 (ENSOGAG00000008945) ZNF641 (ENSOGAG00000005519) ENSOGAG00000034537 C12orf54 (ENSOGAG00000005674) OR8S1 (ENSOGAG00000005676) LALBA (ENSOGAG00000028012) #17 KANSL2 (ENSOGAG00000033595) #18 CCNT1 (ENSOGAG00000016794) #19 ADCY6 (ENSOGAG00000016801) #21 CACNB3 (ENSOGAG00000028602) #22 DDX23 (ENSOGAG00000016813) #23 RND1 (ENSOGAG00000034246) #24 CCDC65 (ENSOGAG00000006488) #25 FKBP11 (ENSOGAG00000006494) #26 ENSOGAG00000012858 #27 WNT10B (ENSOGAG00000016922) #28 WNT1 (ENSOGAG00000028669) #29 DDN (ENSOGAG00000013435) ENSOGAG00000013439 #30 KMT2D (ENSOGAG00000013443) #31 ENSOGAG00000013477 #32 DHH (ENSOGAG00000034671) #33 LMBR1L (ENSOGAG00000005451) #34 TUBA1B (ENSOGAG00000009435) #35 ENSOGAG00000032046 #35 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01100000263574.a ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00390000014843 ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.b #36 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 Tree shrew MODERN SPECIES 3505 CACNB3 (ENSTBEG00000016783) #22 DDX23 (ENSTBEG00000016909) #23 RND1 (ENSTBEG00000017126) #24 CCDC65 (ENSTBEG00000017191) #25 FKBP11 (ENSTBEG00000017269) #26 ARF3 (ENSTBEG00000017353) #27 Glires ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01100000263574.a ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00390000014843 ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.b #36 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.C ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00390000014843 ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.b #36 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.C ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00940000164920 ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.b #36 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.C ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00940000164920 ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.b #36 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.C ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00940000164920 ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.b #36 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.C ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00940000164920 ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.b #36 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01100000263574.a.f.b ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.C ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.b #36 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01100000263574.a.f.b ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00940000164920 ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.b #36 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Golden Hamster MODERN SPECIES 626 Pfkm (ENSMAUG00000016492) Asb8 (ENSMAUG00000019139) Ccdc184 (ENSMAUG00000010780) ENSMAUG00000019216 ENSMAUG00000014007 H1f7 (ENSMAUG00000010839) Zfp641 (ENSMAUG00000010993) Or8s16 (ENSMAUG00000011283) Or8s2 (ENSMAUG00000015201) ENSMAUG00000012783 Lalba (ENSMAUG00000013490) #17 Kansl2 (ENSMAUG00000015668) #18 Ccnt1 (ENSMAUG00000015960) #19 Tex49 (ENSMAUG00000010854) #20 Adcy6 (ENSMAUG00000011342) #21 Cacnb3 (ENSMAUG00000012005) #22 Ddx23 (ENSMAUG00000012336) #23 Rnd1 (ENSMAUG00000015221) #24 Ccdc65 (ENSMAUG00000015430) #25 Fkbp11 (ENSMAUG00000015766) #26 Arf3 (ENSMAUG00000011928) #27 Wnt10b (ENSMAUG00000012082) #28 Wnt1 (ENSMAUG00000012154) #29 Ddn (ENSMAUG00000011464) Prkag1 (ENSMAUG00000011761) #30 ENSMAUG00000012028 #31 ENSMAUG00000012521 #31 Rhebl1 (ENSMAUG00000013128) #32 Dhh (ENSMAUG00000013999) #33 Lmbr1l (ENSMAUG00000014206) #34 Prph (ENSMAUG00000015253) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 ENSCGRG00001009005 ENSCGRG00001001784 H1f7 (ENSCGRG00001006632) Zfp641 (ENSCGRG00001008450) Or8s5 (ENSCGRG00001007209) Or8s2 (ENSCGRG00001008762) Or8s10 (ENSCGRG00001009319) Or8s8 (ENSCGRG00001010259) ENSCGRG00001004394 Lalba (ENSCGRG00001004333) #17 Or11m3 (ENSCGRG00001010245) Kansl2 (ENSCGRG00001007756) #18 Ccnt1 (ENSCGRG00001010472) #19 Tex49 (ENSCGRG00001002641) #20 Adcy6 (ENSCGRG00001002443) #21 Cacnb3 (ENSCGRG00001007469) #22 Ddx23 (ENSCGRG00001015090) #23 Rnd1 (ENSCGRG00001004988) #24 Ccdc65 (ENSCGRG00001014624) #25 Fkbp11 (ENSCGRG00001012678) #26 Arf3 (ENSCGRG00001004437) #27 Wnt10b (ENSCGRG00001004015) #28 Wnt1 (ENSCGRG00001003166) #29 Ddn (ENSCGRG00001004300) Prkag1 (ENSCGRG00001003063) #30 Kmt2d (ENSCGRG00001004692) #31 Rhebl1 (ENSCGRG00001005736) #32 Dhh (ENSCGRG00001012548) #33 Lmbr1l (ENSCGRG00001008575) #34 ENSCGRG00001011667 #36 ENSCGRG00001007551 ##35 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01100000263574.a.f.a ENSGT01100000263574.a.f.b ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.C ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00940000160203 Prairie vole MODERN SPECIES 2 ENSMOCG00000002706 ENSMOCG00000015383 Pfkm (ENSMOCG00000021333) Asb8 (ENSMOCG00000017776) Ccdc184 (ENSMOCG00000003788) ENSMOCG00000001175 ENSMOCG00000001245 Zfp641 (ENSMOCG00000019174) ENSMOCG00000017621 ENSMOCG00000009420 Lalba (ENSMOCG00000018652) #17 Kansl2 (ENSMOCG00000010801) #18 Ccnt1 (ENSMOCG00000012712) #19 Tex49 (ENSMOCG00000022816) #20 Adcy6 (ENSMOCG00000013100) #21 Cacnb3 (ENSMOCG00000007254) #22 Ddx23 (ENSMOCG00000018987) #23 Rnd1 (ENSMOCG00000015821) #24 Ccdc65 (ENSMOCG00000000518) #25 Fkbp11 (ENSMOCG00000021965) #26 Arf3 (ENSMOCG00000020182) #27 Wnt10b (ENSMOCG00000021764) #28 Wnt1 (ENSMOCG00000017789) #29 Ddn (ENSMOCG00000016200) Prkag1 (ENSMOCG00000014481) #30 ENSMOCG00000010694 #31 ENSMOCG00000016455 #31 Rhebl1 (ENSMOCG00000004742) #32 Dhh (ENSMOCG00000000393) #33 Lmbr1l (ENSMOCG00000012252) #34 Tuba1c (ENSMOCG00000011887) #35 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 12 ENSPEMG00000030364 Zfp641 (ENSPEMG00000026282) ENSPEMG00000012906 Or8s5 (ENSPEMG00000026513) Or8s2 (ENSPEMG00000026284) ENSPEMG00000028993 Or8s10 (ENSPEMG00000027490) Or8s8 (ENSPEMG00000030973) ENSPEMG00000029296 Lalba (ENSPEMG00000007983) #17 Or11m3 (ENSPEMG00000024651) Kansl2 (ENSPEMG00000008795) #18 Ccnt1 (ENSPEMG00000016743) #19 Tex49 (ENSPEMG00000000495) #20 Adcy6 (ENSPEMG00000009690) #21 Cacnb3 (ENSPEMG00000014805) #22 Ddx23 (ENSPEMG00000011305) #23 Rnd1 (ENSPEMG00000014224) #24 Ccdc65 (ENSPEMG00000007520) #25 Fkbp11 (ENSPEMG00000009775) #26 Arf3 (ENSPEMG00000028616) #27 Wnt10b (ENSPEMG00000015297) #28 Wnt1 (ENSPEMG00000024721) #29 Ddn (ENSPEMG00000010537) Prkag1 (ENSPEMG00000015142) #30 ENSPEMG00000015938 #31 ENSPEMG00000015247 #31 Rhebl1 (ENSPEMG00000018904) #32 Dhh (ENSPEMG00000029701) #33 ENSPEMG00000029758 #35 Tuba1c (ENSPEMG00000025359) #35 Murinae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.C ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00940000164920 ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 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ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.b #36 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01100000263574.a.f.a.e.b.a.a ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00940000164920 ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 12 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ENSJJAG00000023273 #31 Dhh (ENSJJAG00000000231) #33 ENSJJAG00000000483 #34 Tuba1b (ENSJJAG00000003271) #35 Kangaroo rat MODERN SPECIES 361 Col2a1 (ENSDORG00000012020) Senp1 (ENSDORG00000000092) Pfkm (ENSDORG00000000094) Asb8 (ENSDORG00000027268) Ccdc184 (ENSDORG00000000096) ENSDORG00000027511 ENSDORG00000027881 Zfp641 (ENSDORG00000011810) ENSDORG00000025213 ENSDORG00000002609 Lalba (ENSDORG00000009838) #17 Kansl2 (ENSDORG00000001180) #18 Ccnt1 (ENSDORG00000002854) #19 Tex49 (ENSDORG00000023756) #20 Adcy6 (ENSDORG00000005171) #21 Cacnb3 (ENSDORG00000012657) #22 Ddx23 (ENSDORG00000012659) #23 Rnd1 (ENSDORG00000023400) #24 Ccdc65 (ENSDORG00000012748) #25 Arf3 (ENSDORG00000024681) #27 Wnt10b (ENSDORG00000010403) #28 Wnt1 (ENSDORG00000007735) #29 Ddn (ENSDORG00000028862) Prkag1 (ENSDORG00000006505) #30 ENSDORG00000024758 #31 ENSDORG00000027776 #31 Rhebl1 (ENSDORG00000006513) #32 Dhh (ENSDORG00000024818) #33 ENSDORG00000008221 #34 ENSDORG00000000156 Tuba1a (ENSDORG00000006812) ##35 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.C ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00390000014843 ENSGT00940000159881.a.a.b ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.b.b #36 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01100000263574.a ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00390000014843 ENSGT00940000159881.a.a.b ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 8 ZNF641 (ENSHGLG00000048585) ENSHGLG00000047797 ENSHGLG00000034108 ENSHGLG00000036300 ENSHGLG00000047106 ENSHGLG00000020517 ENSHGLG00000020586 OR5BS1P (ENSHGLG00000042484) ENSHGLG00000004311 #17 ENSHGLG00000050339 ENSHGLG00000033115 ENSHGLG00000003714 #18 ENSHGLG00000003361 #19 TEX49 (ENSHGLG00000007195) #20 ADCY6 (ENSHGLG00000004662) #21 CACNB3 (ENSHGLG00000007792) #22 DDX23 (ENSHGLG00000004292) #23 RND1 (ENSHGLG00000004112) #24 ENSHGLG00000048199 CCDC65 (ENSHGLG00000003786) #25 FKBP11 (ENSHGLG00000008146) #26 ARF3 (ENSHGLG00000050677) #27 WNT10B (ENSHGLG00000005760) #28 WNT1 (ENSHGLG00000004305) #29 DDN (ENSHGLG00000004151) PRKAG1 (ENSHGLG00000003937) #30 ENSHGLG00000050567 #31 RHEBL1 (ENSHGLG00000013261) #32 DHH (ENSHGLG00000034254) #33 LMBR1L (ENSHGLG00000014791) #34 ENSHGLG00000046022 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01100000263574.a ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00390000014843 ENSGT00940000164920 ENSGT00940000159881.a.a.b ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00940000154457.a.b Guinea pig MODERN SPECIES 9 ENSCPOG00000012386 ZNF641 (ENSCPOG00000002770) ENSCPOG00000036505 ENSCPOG00000012475 ENSCPOG00000040584 ENSCPOG00000039913 ENSCPOG00000013910 ENSCPOG00000000012 ENSCPOG00000033889 Lalba (ENSCPOG00000027342) #17 ENSCPOG00000024843 KANSL2 (ENSCPOG00000005760) #18 CCNT1 (ENSCPOG00000038705) #19 TEX49 (ENSCPOG00000030293) #20 ADCY6 (ENSCPOG00000030377) #21 CACNB3 (ENSCPOG00000003277) #22 DDX23 (ENSCPOG00000003278) #23 RND1 (ENSCPOG00000003220) #24 CCDC65 (ENSCPOG00000003221) #25 FKBP11 (ENSCPOG00000031801) #26 ARF3 (ENSCPOG00000040787) #27 WNT10B (ENSCPOG00000035034) #28 WNT1 (ENSCPOG00000024490) #29 DDN (ENSCPOG00000002960) PRKAG1 (ENSCPOG00000002966) #30 KMT2D (ENSCPOG00000002973) #31 RHEBL1 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ENSODEG00000003244 ZNF641 (ENSODEG00000003266) ENSODEG00000003293 ENSODEG00000003309 LALBA (ENSODEG00000003342) #17 ENSODEG00000003381 #18 ENSODEG00000003425 #19 TEX49 (ENSODEG00000003431) #20 ENSODEG00000003445 ADCY6 (ENSODEG00000003474) #21 CACNB3 (ENSODEG00000003562) #22 DDX23 (ENSODEG00000003592) #23 RND1 (ENSODEG00000003618) #24 CCDC65 (ENSODEG00000003640) #25 FKBP11 (ENSODEG00000003672) #26 ARF3 (ENSODEG00000004009) #27 WNT10B (ENSODEG00000004020) #28 WNT1 (ENSODEG00000004027) #29 DDN (ENSODEG00000004034) ENSODEG00000004046 #30 ENSODEG00000004064 #31 ENSODEG00000004083 #31 RHEBL1 (ENSODEG00000004107) #32 DHH (ENSODEG00000004129) #33 LMBR1L (ENSODEG00000004152) #34 ENSODEG00000004198 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01100000263574.a ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.C ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00390000014843 ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.b.b #36 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT01100000263574.a.g ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.C ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00940000159881.a.b.a ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.b.b #36 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01100000263574.a.g ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.C ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00940000159881.a.b.a ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.b.b #36 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 348 OR5BS1P (ENSUPAG00010008767) LALBA (ENSUPAG00010008774) #17 ENSUPAG00010008799 KANSL2 (ENSUPAG00010008805) #18 CCNT1 (ENSUPAG00010008871) #19 TEX49 (ENSUPAG00010008891) #20 ADCY6 (ENSUPAG00010008904) #21 CACNB3 (ENSUPAG00010008993) #22 DDX23 (ENSUPAG00010009132) #23 RND1 (ENSUPAG00010009175) #24 CCDC65 (ENSUPAG00010009212) #25 FKBP11 (ENSUPAG00010009234) #26 ARF3 (ENSUPAG00010009256) #27 WNT10B (ENSUPAG00010009270) #28 WNT1 (ENSUPAG00010009320) #29 DDN (ENSUPAG00010009325) PRKAG1 (ENSUPAG00010009337) #30 RHEBL1 (ENSUPAG00010009539) #32 DHH (ENSUPAG00010009573) #33 LMBR1L (ENSUPAG00010009579) #34 TUBA1B (ENSUPAG00010009604) #35 TUBA1C (ENSUPAG00010009626) #35 PRPH (ENSUPAG00010009633) Squirrel MODERN SPECIES 112 PFKM (ENSSTOG00000001938) ASB8 (ENSSTOG00000024076) CCDC184 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ENSMMMG00000022885 ENSMMMG00000022886 ENSMMMG00000022889 OR5BS1P (ENSMMMG00000022891) LALBA (ENSMMMG00000022893) #17 KANSL2 (ENSMMMG00000022904) #18 CCNT1 (ENSMMMG00000022910) #19 TEX49 (ENSMMMG00000022917) #20 ADCY6 (ENSMMMG00000022920) #21 CACNB3 (ENSMMMG00000022935) #22 DDX23 (ENSMMMG00000022958) #23 RND1 (ENSMMMG00000022971) #24 CCDC65 (ENSMMMG00000022974) #25 FKBP11 (ENSMMMG00000022980) #26 WNT10B (ENSMMMG00000022992) #28 DDN (ENSMMMG00000023006) ENSMMMG00000023013 #30 ENSMMMG00000023022 #31 ENSMMMG00000023038 #31 RHEBL1 (ENSMMMG00000023043) #32 DHH (ENSMMMG00000023054) #33 LMBR1L (ENSMMMG00000023056) #34 TUBA1A (ENSMMMG00000023062) ##35 TUBA1C (ENSMMMG00000023064) #35 PRPH (ENSMMMG00000023068) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 14 ASB8 (ENSSVLG00005010618) CCDC184 (ENSSVLG00005010675) OR10AD1 (ENSSVLG00005010756) H1-7 (ENSSVLG00005010817) ZNF641 (ENSSVLG00005010861) ENSSVLG00005010951 C12orf54 (ENSSVLG00005011007) OR5BS1P (ENSSVLG00005011139) LALBA (ENSSVLG00005011187) #17 ENSSVLG00005011295 ENSSVLG00005011395 KANSL2 (ENSSVLG00005011410) #18 CCNT1 (ENSSVLG00005011525) #19 TEX49 (ENSSVLG00005011832) #20 ADCY6 (ENSSVLG00005011914) #21 CACNB3 (ENSSVLG00005012131) #22 DDX23 (ENSSVLG00005012479) #23 RND1 (ENSSVLG00005012510) #24 CCDC65 (ENSSVLG00005012567) #25 FKBP11 (ENSSVLG00005012794) #26 ARF3 (ENSSVLG00005012987) #27 WNT10B (ENSSVLG00005013159) #28 WNT1 (ENSSVLG00005013249) #29 DDN (ENSSVLG00005013335) PRKAG1 (ENSSVLG00005013661) #30 ENSSVLG00005013748 #31 ENSSVLG00005013789 #31 RHEBL1 (ENSSVLG00005013912) #32 DHH (ENSSVLG00005013965) #33 LMBR1L (ENSSVLG00005014035) #34 TUBA1B (ENSSVLG00005014122) #35 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 81 ENSGT00390000014843 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.k #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00940000154457.a.a Rabbit MODERN SPECIES 15 ENSOCUG00000030542 PLCB1 (ENSOCUG00000007339) ENSOCUG00000038367 TMX4 (ENSOCUG00000007336) HAO1 (ENSOCUG00000011539) BMP2 (ENSOCUG00000011674) ENSOCUG00000021510 ENSOCUG00000030065 ENSOCUG00000038424 ENSOCUG00000008989 LYZG (ENSOCUG00000015834) #17 KANSL2 (ENSOCUG00000007379) #18 CCNT1 (ENSOCUG00000007383) #19 ADCY6 (ENSOCUG00000007394) #21 TEX49 (ENSOCUG00000007390) #20 CACNB3 (ENSOCUG00000007401) #22 DDX23 (ENSOCUG00000001414) #23 RND1 (ENSOCUG00000025362) #24 ENSOCUG00000035268 #25 CCDC65 (ENSOCUG00000026025) #25 ENSOCUG00000009574 #26 ARF3 (ENSOCUG00000039073) #27 WNT10B (ENSOCUG00000009580) #28 WNT1 (ENSOCUG00000026066) #29 DDN (ENSOCUG00000008404) ENSOCUG00000008409 #30 KMT2D (ENSOCUG00000006202) #31 RHEBL1 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#33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.b #36 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000166925 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000162202.C ENSGT00940000163941.A ENSGT00940000159881.a.b.a ENSGT00940000159881.a.b.b ENSGT00940000159881.a.a.b ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00560000078683 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.b #36 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000166925 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000159881.a.b.a ENSGT00940000159881.a.b.b ENSGT00940000159881.a.a.b ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000153832.f.y ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000162202.C ENSGT00940000159881.a.a.b ENSGT00940000159881.a.b.a ENSGT00940000159881.a.b.b ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 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ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000162202.C ENSGT00940000159881.a.a.b.c.b ENSGT00940000159881.a.b.a ENSGT00940000159881.a.b.b ENSGT00940000159881.a.a.b.c.a ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000153832.f.y ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00940000154457.b ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000162388.B.a ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000153832.f.y ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.a ##35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 Ursus ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000162388.B.b ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000159881.a.a.b.c.a ENSGT00940000162388.B.a 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DHH (ENSUAMG00000027067) #33 LMBR1L (ENSUAMG00000027066) #34 Polar bear MODERN SPECIES 262 ZNF641 (ENSUMAG00000006373) ENSUMAG00000006380 ENSUMAG00000006382 ENSUMAG00000006386 ENSUMAG00000006389 OR8S1 (ENSUMAG00000006392) ENSUMAG00000006394 ENSUMAG00000006397 ENSUMAG00000006405 LALBA (ENSUMAG00000006409) #17 ENSUMAG00000006431 KANSL2 (ENSUMAG00000006435) #18 CCNT1 (ENSUMAG00000006450) #19 TEX49 (ENSUMAG00000006472) #20 ADCY6 (ENSUMAG00000006483) #21 CACNB3 (ENSUMAG00000006493) #22 DDX23 (ENSUMAG00000006538) #23 RND1 (ENSUMAG00000006545) #24 CCDC65 (ENSUMAG00000006548) #25 ENSUMAG00000006550 FKBP11 (ENSUMAG00000006552) #26 ENSUMAG00000006555 #27 WNT10B (ENSUMAG00000006558) #28 WNT1 (ENSUMAG00000006560) #29 PRKAG1 (ENSUMAG00000006562) #30 ENSUMAG00000006564 ENSUMAG00000006565 #31 ENSUMAG00000006572 #31 RHEBL1 (ENSUMAG00000006580) #32 DHH (ENSUMAG00000006584) #33 LMBR1L (ENSUMAG00000006589) #34 Giant Panda MODERN SPECIES 7 ENSAMEG00000025327 ENSAMEG00000007377 C12orf54 (ENSAMEG00000006120) ENSAMEG00000030056 OR8S1 (ENSAMEG00000025995) ENSAMEG00000030502 ENSAMEG00000029295 ENSAMEG00000030163 OR5BS1P (ENSAMEG00000007376) LALBA (ENSAMEG00000007352) #17 ENSAMEG00000007338 KANSL2 (ENSAMEG00000007312) #18 CCNT1 (ENSAMEG00000007281) #19 TEX49 (ENSAMEG00000007279) #20 ADCY6 (ENSAMEG00000007210) #21 CACNB3 (ENSAMEG00000007171) #22 DDX23 (ENSAMEG00000007123) #23 RND1 (ENSAMEG00000028088) #24 CCDC65 (ENSAMEG00000007083) #25 ENSAMEG00000026161 #27 WNT10B (ENSAMEG00000007028) #28 WNT1 (ENSAMEG00000007017) #29 DDN (ENSAMEG00000028769) KMT2D (ENSAMEG00000006918) #31 RHEBL1 (ENSAMEG00000006903) #32 DHH (ENSAMEG00000006895) #33 LMBR1L (ENSAMEG00000006887) #34 TUBA1C (ENSAMEG00000025910) #35 PRPH (ENSAMEG00000000783) TROAP (ENSAMEG00000000850) C1QL4 (ENSAMEG00000030468) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000166925 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000162202.C ENSGT00940000159881.a.a.b.c.b ENSGT00940000159881.a.b.b ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000153832.f.y ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00940000154457.b ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Ferret MODERN SPECIES 450 OR8S1 (ENSMPUG00000020077) ENSMPUG00000014960 ENSMPUG00000020076 ENSMPUG00000020075 ENSMPUG00000020074 ENSMPUG00000020073 OR5BS1P (ENSMPUG00000014951) LALBA (ENSMPUG00000014936) #17 ENSMPUG00000020072 ENSMPUG00000014934 ENSMPUG00000014928 #18 CCNT1 (ENSMPUG00000014887) #19 ADCY6 (ENSMPUG00000014748) #21 CACNB3 (ENSMPUG00000014745) #22 DDX23 (ENSMPUG00000014739) #23 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#29 DDN (ENSNVIG00000007147) PRKAG1 (ENSNVIG00000007086) #30 KMT2D (ENSNVIG00000006871) #31 RHEBL1 (ENSNVIG00000006821) #32 DHH (ENSNVIG00000006799) #33 LMBRL (ENSNVIG00000006723) #34 ENSNVIG00000006708 ##35 TUBA1A (ENSNVIG00000006688) ##35 Canidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000159881.a.b.a ENSGT00940000159881.a.b.b ENSGT00940000159881.a.a.b.d ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B.d.a ENSGT00940000162388.B.d.b ENSGT00940000162388.B.c ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000153241.A.h ENSGT00940000153832.f.y ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000159881.a.b.b ENSGT00940000159881.a.a.b.d ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B.d.a.a ENSGT00940000162388.B.d.a.b ENSGT00940000162388.B.d.b ENSGT00940000162388.B.c ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000153241.A.h ENSGT00940000153832.f.y ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Dingo MODERN SPECIES 329 ENSCAFG00020013289 ENSCAFG00020013290 ENSCAFG00020013293 ENSCAFG00020013294 ENSCAFG00020013296 ENSCAFG00020013299 ENSCAFG00020013301 ENSCAFG00020013309 LALBA (ENSCAFG00020013310) #17 ENSCAFG00020013331 ENSCAFG00020013334 KANSL2 (ENSCAFG00020013339) #18 CCNT1 (ENSCAFG00020013349) #19 TEX49 (ENSCAFG00020013356) #20 ADCY6 (ENSCAFG00020013357) #21 CACNB3 (ENSCAFG00020013365) #22 DDX23 (ENSCAFG00020013383) #23 RND1 (ENSCAFG00020013386) #24 CCDC65 (ENSCAFG00020013387) #25 FKBP11 (ENSCAFG00020013388) #26 ARF3 (ENSCAFG00020013389) #27 WNT10B (ENSCAFG00020013394) #28 WNT1 (ENSCAFG00020013401) #29 DDN (ENSCAFG00020013406) PRKAG1 (ENSCAFG00020013408) #30 ENSCAFG00020013412 #31 RHEBL1 (ENSCAFG00020013417) #32 DHH (ENSCAFG00020013420) #33 LMBR1L (ENSCAFG00020013423) #34 TUBA1B (ENSCAFG00020013431) #35 TUBA1A (ENSCAFG00020013458) ##35 Dog MODERN SPECIES 19 OR8S7 (ENSCAFG00845025864) OR8S10 (ENSCAFG00845025838) cOR8S16 (ENSCAFG00845025719) cOR8S14 (ENSCAFG00845025678) ENSCAFG00845025649 ENSCAFG00845025608 ENSCAFG00845025579 ENSCAFG00845025546 OR5BS1P (ENSCAFG00845025525) LALBA (ENSCAFG00845025453) #17 LYZF2 (ENSCAFG00845025398) KANSL2 (ENSCAFG00845025163) #18 CCNT1 (ENSCAFG00845024989) #19 TEX49 (ENSCAFG00845024904) #20 ADCY6 (ENSCAFG00845024352) #21 CACNB3 (ENSCAFG00845023805) #22 DDX23 (ENSCAFG00845023512) #23 RND1 (ENSCAFG00845023432) #24 CCDC65 (ENSCAFG00845023368) #25 FKBP11 (ENSCAFG00845023275) #26 ENSCAFG00845022913 #27 WNT10B (ENSCAFG00845022647) #28 WNT1 (ENSCAFG00845022557) #29 DDN (ENSCAFG00845022517) PRKAG1 (ENSCAFG00845022388) #30 KMT2D (ENSCAFG00845021787) #31 RHEBL1 (ENSCAFG00845021547) #32 DHH (ENSCAFG00845021487) #33 LMBR1L (ENSCAFG00845021402) #34 TUBA1B (ENSCAFG00845021145) #35 ENSCAFG00845020819 Red fox MODERN SPECIES 32 ENSVVUG00000019532 ENSVVUG00000019535 ZNF641 (ENSVVUG00000019539) C12orf54 (ENSVVUG00000019545) ENSVVUG00000019553 ENSVVUG00000019556 ENSVVUG00000019563 ENSVVUG00000019564 ENSVVUG00000019568 LALBA (ENSVVUG00000019572) #17 ENSVVUG00000019578 ENSVVUG00000019583 CCNT1 (ENSVVUG00000019590) #19 TEX49 (ENSVVUG00000019619) #20 ADCY6 (ENSVVUG00000019630) #21 CACNB3 (ENSVVUG00000019645) #22 DDX23 (ENSVVUG00000019648) #23 RND1 (ENSVVUG00000019659) #24 CCDC65 (ENSVVUG00000019666) #25 ENSVVUG00000019671 #26 ARF3 (ENSVVUG00000019673) #27 WNT10B (ENSVVUG00000019690) #28 WNT1 (ENSVVUG00000019697) #29 DDN (ENSVVUG00000019700) PRKAG1 (ENSVVUG00000019735) #30 RHEBL1 (ENSVVUG00000020894) #32 DHH (ENSVVUG00000020895) #33 LMBR1L (ENSVVUG00000020897) #34 ENSVVUG00000020900 #35 ENSVVUG00000020903 ENSVVUG00000020906 Felidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000014843 ENSGT00980000199472 ENSGT00940000166925 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000159881.a.b.b ENSGT00940000159881.a.a.b ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000153832.f.y ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00980000199472 ENSGT00940000166925 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000159881.a.b.b ENSGT00940000159881.a.a.b ENSGT00940000162388.B.f ENSGT00940000162388.B.e ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000153832.f.y ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00980000199472 ENSGT00940000166925 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000159881.a.b.b ENSGT00940000159881.a.a.b ENSGT00940000162388.B.f ENSGT00940000162388.B.e ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000153832.f.y ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 lion MODERN SPECIES 7 ENSPLOG00000008846 ENSPLOG00000008861 C12orf54 (ENSPLOG00000008880) ENSPLOG00000008937 OR8S1 (ENSPLOG00000008958) ENSPLOG00000008974 ENSPLOG00000008991 ENSPLOG00000009003 OR5BS1P (ENSPLOG00000009032) LALBA (ENSPLOG00000009064) #17 ENSPLOG00000009119 ENSPLOG00000009151 KANSL2 (ENSPLOG00000009219) #18 ADCY6 (ENSPLOG00000009398) #21 TEX49 (ENSPLOG00000009719) #20 CACNB3 (ENSPLOG00000009811) #22 DDX23 (ENSPLOG00000010090) #23 RND1 (ENSPLOG00000010124) #24 CCDC65 (ENSPLOG00000010162) #25 FKBP11 (ENSPLOG00000010230) #26 ARF3 (ENSPLOG00000010349) #27 WNT10B (ENSPLOG00000010411) #28 WNT1 (ENSPLOG00000010521) #29 DDN (ENSPLOG00000010565) PRKAG1 (ENSPLOG00000010608) #30 KMT2D (ENSPLOG00000010784) #31 RHEBL1 (ENSPLOG00000010984) #32 DHH (ENSPLOG00000011041) #33 LMBR1L (ENSPLOG00000011098) #34 TUBA1B (ENSPLOG00000011373) #35 ENSPLOG00000011430 leopard MODERN SPECIES 77 ENSPPRG00000021185 C12orf54 (ENSPPRG00000008760) ENSPPRG00000005898 ENSPPRG00000021065 OR8S1 (ENSPPRG00000021056) ENSPPRG00000021040 ENSPPRG00000021024 ENSPPRG00000021009 ENSPPRG00000020998 LALBA (ENSPPRG00000005035) #17 ENSPPRG00000004625 KANSL2 (ENSPPRG00000004003) #18 CCNT1 (ENSPPRG00000002985) #19 TEX49 (ENSPPRG00000002478) #20 ADCY6 (ENSPPRG00000002220) #21 CACNB3 (ENSPPRG00000022329) #22 DDX23 (ENSPPRG00000015345) #23 RND1 (ENSPPRG00000014543) #24 CCDC65 (ENSPPRG00000014354) #25 FKBP11 (ENSPPRG00000013896) #26 ARF3 (ENSPPRG00000013155) #27 WNT10B (ENSPPRG00000011632) #28 WNT1 (ENSPPRG00000010414) #29 DDN (ENSPPRG00000009672) PRKAG1 (ENSPPRG00000009137) #30 RHEBL1 (ENSPPRG00000003212) #32 DHH (ENSPPRG00000002928) #33 LMBR1L (ENSPPRG00000002507) #34 TUBA1B (ENSPPRG00000001738) #35 ENSPPRG00000000268 #35 ENSPPRG00000022793 ##35 Tiger MODERN SPECIES 14 CCDC184 (ENSPTIG00000000266) ENSPTIG00000000278 ENSPTIG00000000286 ZNF641 (ENSPTIG00000013144) ENSPTIG00000000355 C12orf54 (ENSPTIG00000015156) OR8S1 (ENSPTIG00000000392) ENSPTIG00000000411 ENSPTIG00000000424 LALBA (ENSPTIG00000016605) #17 ENSPTIG00000017690 KANSL2 (ENSPTIG00000018738) #18 CCNT1 (ENSPTIG00000002066) #19 TEX49 (ENSPTIG00000007788) #20 ADCY6 (ENSPTIG00000009376) #21 CACNB3 (ENSPTIG00000014703) #22 DDX23 (ENSPTIG00000018873) #23 RND1 (ENSPTIG00000020347) #24 CCDC65 (ENSPTIG00000021454) #25 FKBP11 (ENSPTIG00000021680) #26 ARF3 (ENSPTIG00000002553) #27 WNT10B (ENSPTIG00000005637) #28 WNT1 (ENSPTIG00000007101) #29 DDN (ENSPTIG00000007916) PRKAG1 (ENSPTIG00000008554) #30 RHEBL1 (ENSPTIG00000020473) #32 DHH (ENSPTIG00000020962) #33 LMBR1L (ENSPTIG00000002708) #34 ENSPTIG00000007278 #35 ENSPTIG00000016981 #35 ENSPTIG00000018218 ##35 Cat MODERN SPECIES 238 ENSFCAG00000026701 C12orf54 (ENSFCAG00000052794) ENSFCAG00000034432 OR8S1 (ENSFCAG00000041999) ENSFCAG00000026373 ENSFCAG00000031127 ENSFCAG00000026209 ENSFCAG00000023498 ENSFCAG00000026779 LALBA (ENSFCAG00000050644) #17 ENSFCAG00000034992 KANSL2 (ENSFCAG00000029449) #18 ENSFCAG00000043415 #19 ADCY6 (ENSFCAG00000000079) #21 TEX49 (ENSFCAG00000022110) #20 CACNB3 (ENSFCAG00000000080) #22 DDX23 (ENSFCAG00000000082) #23 RND1 (ENSFCAG00000000084) #24 CCDC65 (ENSFCAG00000000085) #25 FKBP11 (ENSFCAG00000035568) #26 ARF3 (ENSFCAG00000037304) #27 WNT10B (ENSFCAG00000030007) #28 WNT1 (ENSFCAG00000000089) #29 DDN (ENSFCAG00000000090) PRKAG1 (ENSFCAG00000000091) #30 KMT2D (ENSFCAG00000000093) #31 RHEBL1 (ENSFCAG00000000096) #32 DHH (ENSFCAG00000043756) #33 LMBR1L (ENSFCAG00000000098) #34 TUBA1A (ENSFCAG00000038056) #36 ENSFCAG00000014767 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00390000014843 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000162388.C.b ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Equus ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00390000014843 ENSGT00980000199472 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000166925.b ENSGT00940000162388.C.b ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803.e ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000153832.f.y ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Donkey MODERN SPECIES 14 C12orf54 (ENSEASG00005030699) ENSEASG00005026426 OR8S1 (ENSEASG00005028324) ENSEASG00005023526 ENSEASG00005031846 ENSEASG00005023527 ENSEASG00005033241 ENSEASG00005024483 OR5BS1P (ENSEASG00005032536) ENSEASG00005000318 ENSEASG00005000118 #17 KANSL2 (ENSEASG00005000346) #18 CCNT1 (ENSEASG00005000368) #19 TEX49 (ENSEASG00005000382) #20 ADCY6 (ENSEASG00005000395) #21 CACNB3 (ENSEASG00005000426) #22 DDX23 (ENSEASG00005000455) #23 RND1 (ENSEASG00005000462) #24 CCDC65 (ENSEASG00005000473) #25 FKBP11 (ENSEASG00005037660) #26 ARF3 (ENSEASG00005032704) #27 WNT10B (ENSEASG00005000528) #28 WNT1 (ENSEASG00005000530) #29 DDN (ENSEASG00005038212) PRKAG1 (ENSEASG00005000627) #30 KMT2D (ENSEASG00005000816) #31 RHEBL1 (ENSEASG00005001042) #32 DHH (ENSEASG00005027549) #33 LMBR1L (ENSEASG00005001084) #34 TUBA1B (ENSEASG00005029815) #35 ENSEASG00005027053 ##35 Horse MODERN SPECIES 27 H1-7P (ENSECAG00000041866) OR8S2 (ENSECAG00000052177) C12orf54 (ENSECAG00000039802) ENSECAG00000037359 ENSECAG00000050123 OR8S24 (ENSECAG00000045091) OR8S33 (ENSECAG00000052992) OR8S34 (ENSECAG00000047119) OR8S15 (ENSECAG00000028893) ENSECAG00000034026 LALBA (ENSECAG00000001401) #17 ENSECAG00000010121 KANSL2 (ENSECAG00000013540) #18 CCNT1 (ENSECAG00000015768) #19 ADCY6 (ENSECAG00000022288) #21 CACNB3 (ENSECAG00000012018) #22 DDX23 (ENSECAG00000016681) #23 RND1 (ENSECAG00000020971) #24 CCDC65 (ENSECAG00000022789) #25 FKBP11 (ENSECAG00000006658) #27 WNT10B (ENSECAG00000008298) #28 WNT1 (ENSECAG00000009064) #29 DDN (ENSECAG00000007971) PRKAG1 (ENSECAG00000011134) #30 KMT2D (ENSECAG00000017946) #31 RHEBL1 (ENSECAG00000001442) #32 DHH (ENSECAG00000010603) #33 LMBR1L (ENSECAG00000011362) #34 ENSECAG00000033690 TUBA1B (ENSECAG00000059551) #35 TUBA1A (ENSECAG00000030778) ##35 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155489.b.f ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00390000002978 ENSGT01100000263574.a ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.A ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00950000183019.f.b.a.s.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 Megabat MODERN SPECIES 2398 ADCY6 (ENSPVAG00000009814) #21 CACNB3 (ENSPVAG00000009816) #22 DDX23 (ENSPVAG00000009818) #23 RND1 (ENSPVAG00000009824) #24 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155224 ENSGT00940000155489.b.f ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00390000002978 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.A ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.s.a #30 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 Microbat MODERN SPECIES 1028 CCDC184 (ENSMLUG00000017738) ENSMLUG00000023658 ENSMLUG00000003687 ZNF641 (ENSMLUG00000003695) ENSMLUG00000027444 ENSMLUG00000022240 OR5BS1P (ENSMLUG00000010889) LALBA (ENSMLUG00000010895) #17 ENSMLUG00000027828 ENSMLUG00000028621 ENSMLUG00000028552 KANSL2 (ENSMLUG00000012761) #18 CCNT1 (ENSMLUG00000010910) #19 TEX49 (ENSMLUG00000010932) #20 ADCY6 (ENSMLUG00000010943) #21 CACNB3 (ENSMLUG00000010986) #22 ENSMLUG00000011033 #23 RND1 (ENSMLUG00000011066) #24 CCDC65 (ENSMLUG00000011073) #25 FKBP11 (ENSMLUG00000011084) #26 ARF3 (ENSMLUG00000029846) #27 WNT10B (ENSMLUG00000011105) #28 WNT1 (ENSMLUG00000023725) #29 PRKAG1 (ENSMLUG00000011156) #30 KMT2D (ENSMLUG00000011179) #31 RHEBL1 (ENSMLUG00000008343) #32 DHH (ENSMLUG00000008353) #33 TUBA1B (ENSMLUG00000002622) #35 TUBA1A (ENSMLUG00000010845) ##35 ENSMLUG00000024840 #36 PRPH (ENSMLUG00000009808) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 1 COL2A1 (ENSRFEG00010006489) SENP1 (ENSRFEG00010007260) PFKM (ENSRFEG00010007343) ASB8 (ENSRFEG00010007697) CCDC184 (ENSRFEG00010007804) ENSRFEG00010007885 ZNF641 (ENSRFEG00010007923) ENSRFEG00010008030 OR5BS1P (ENSRFEG00010008042) LALBA (ENSRFEG00010008073) #17 ENSRFEG00010008162 ENSRFEG00010008258 #18 CCNT1 (ENSRFEG00010008442) #19 TEX49 (ENSRFEG00010008549) #20 ADCY6 (ENSRFEG00010008619) #21 CACNB3 (ENSRFEG00010008761) #22 DDX23 (ENSRFEG00010009126) #23 RND1 (ENSRFEG00010009261) #24 ENSRFEG00010009293 CCDC65 (ENSRFEG00010009326) #25 FKBP11 (ENSRFEG00010009367) #26 WNT10B (ENSRFEG00010009503) #28 WNT1 (ENSRFEG00010009601) #29 DDN (ENSRFEG00010009634) ENSRFEG00010009659 #30 ENSRFEG00010009959 #31 ENSRFEG00010010186 DHH (ENSRFEG00010010213) #33 LMBR1L (ENSRFEG00010010270) #34 TUBA1B (ENSRFEG00010010426) #35 ENSRFEG00010010573 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000163941.A ENSGT00940000159881.a.b.a ENSGT00940000159881.a.b.b ENSGT00940000159881.a.a.b ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.C.b ENSGT00940000162388.C.a ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00560000078683 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 Suina ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000017324 ENSGT00940000156419 ENSGT00940000155455 ENSGT00530000063817.b ENSGT00390000013899.a.a ENSGT00390000014700.a ENSGT01050000244879.b.a.b.a ENSGT00950000183132.A ENSGT00940000157835 ENSGT00390000015968 ENSGT00940000157255 ENSGT00940000167128 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00560000078683 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 Pig MODERN SPECIES 13 ABTB3 (ENSSSCG00000000162) ENSSSCG00000036971 CRY1 (ENSSSCG00000000164) MTERF2 (ENSSSCG00000039109) TMEM263 (ENSSSCG00000038968) RIC8B (ENSSSCG00000000167) RFX4 (ENSSSCG00000052141) POLR3B (ENSSSCG00000057209) TCP11L2 (ENSSSCG00000024881) CKAP4 (ENSSSCG00000000171) NUAK1 (ENSSSCG00000032861) C12orf75 (ENSSSCG00000031661) CCNT1 (ENSSSCG00000038181) #19 TEX49 (ENSSSCG00000000174) #20 ADCY6 (ENSSSCG00000000175) #21 CACNB3 (ENSSSCG00000032967) #22 DDX23 (ENSSSCG00000000176) #23 RND1 (ENSSSCG00000038562) #24 CCDC65 (ENSSSCG00000000179) #25 FKBP11 (ENSSSCG00000059895) #26 ENSSSCG00000032202 ARF3 (ENSSSCG00000051954) #27 WNT10B (ENSSSCG00000000182) #28 WNT1 (ENSSSCG00000000183) #29 DDN (ENSSSCG00000000184) PRKAG1 (ENSSSCG00000000185) #30 ENSSSCG00000035856 #31 ENSSSCG00000042640 #31 RHEBL1 (ENSSSCG00000000186) #32 DHH (ENSSSCG00000000188) #33 LMBR1L (ENSSSCG00000000189) #34 Chacoan peccary MODERN SPECIES 899 ABTB3 (ENSCWAG00000020574) ENSCWAG00000020556 CRY1 (ENSCWAG00000020554) MTERF2 (ENSCWAG00000020546) TMEM263 (ENSCWAG00000020539) RIC8B (ENSCWAG00000020465) RFX4 (ENSCWAG00000020335) POLR3B (ENSCWAG00000020275) TCP11L2 (ENSCWAG00000020258) CKAP4 (ENSCWAG00000020245) NUAK1 (ENSCWAG00000020234) ENSCWAG00000020216 CCNT1 (ENSCWAG00000020191) #19 TEX49 (ENSCWAG00000020170) #20 ADCY6 (ENSCWAG00000020127) #21 CACNB3 (ENSCWAG00000020007) #22 DDX23 (ENSCWAG00000019941) #23 RND1 (ENSCWAG00000019925) #24 CCDC65 (ENSCWAG00000019906) #25 FKBP11 (ENSCWAG00000019881) #26 ARF3 (ENSCWAG00000019853) #27 WNT10B (ENSCWAG00000019813) #28 WNT1 (ENSCWAG00000019782) #29 DDN (ENSCWAG00000019760) PRKAG1 (ENSCWAG00000019683) #30 RHEBL1 (ENSCWAG00000019080) #32 DHH (ENSCWAG00000019060) #33 LMBR1L (ENSCWAG00000019023) #34 TUBA1C (ENSCWAG00000018842) #35 PRPH (ENSCWAG00000018787) TROAP (ENSCWAG00000018696) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000014843 ENSGT00940000166925 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000159881.a.b.b ENSGT00940000159881.a.a.b ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.C.b ENSGT00940000162388.C.a ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT01100000263574.a.n ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.B ENSGT00390000014843 ENSGT00980000199472 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000159881.a.a.b ENSGT00940000162388.C.b ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.b #36 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 Arabian camel MODERN SPECIES 3 ZNF641 (ENSCDRG00005010093) ENSCDRG00005010078 ENSCDRG00005010054 C12orf54 (ENSCDRG00005009973) ENSCDRG00005009926 OR8S1 (ENSCDRG00005009912) ENSCDRG00005009891 ENSCDRG00005009869 ENSCDRG00005009851 OR5BS1P (ENSCDRG00005009797) LALBA (ENSCDRG00005009690) #17 KANSL2 (ENSCDRG00005009454) #18 CCNT1 (ENSCDRG00005009254) #19 TEX49 (ENSCDRG00005009197) #20 ADCY6 (ENSCDRG00005008996) #21 CACNB3 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ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000155489.b.f ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00390000002978 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000165904.b ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00390000014843 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b.cc #35 ENSGT00940000154457.a.a.c.a Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000161281 ENSGT00940000155224 ENSGT00940000155489.b.f ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00390000002978 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b.cc #35 ENSGT00940000154457.a.a.c.a Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161281 ENSGT00940000155224 ENSGT00940000155489.b.f ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00390000002978 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b.cc #35 ENSGT00940000154457.a.a.c.a Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000161281 ENSGT00940000155224 ENSGT00940000155489.b.f ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00390000002978 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b.cc #35 ENSGT00900000143450 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161281 ENSGT00940000155224 ENSGT00940000155489.b.f ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00390000002978 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000162121 ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b.cc #35 ENSGT00900000143450 Narwhal MODERN SPECIES 313 TMEM106C (ENSMMNG00015020428) COL2A1 (ENSMMNG00015020553) SENP1 (ENSMMNG00015020735) PFKM (ENSMMNG00015020844) ASB8 (ENSMMNG00015020972) CCDC184 (ENSMMNG00015021019) ENSMMNG00015021040 ZNF641 (ENSMMNG00015021069) ENSMMNG00015021120 ENSMMNG00015021133 LALBA (ENSMMNG00015021155) #17 KANSL2 (ENSMMNG00015021172) #18 CCNT1 (ENSMMNG00015021207) #19 TEX49 (ENSMMNG00015021216) #20 ADCY6 (ENSMMNG00015021235) #21 CACNB3 (ENSMMNG00015021282) #22 DDX23 (ENSMMNG00015021351) #23 RND1 (ENSMMNG00015021382) #24 CCDC65 (ENSMMNG00015021403) #25 FKBP11 (ENSMMNG00015021421) #26 ARF3 (ENSMMNG00015021435) #27 WNT10B (ENSMMNG00015021457) #28 WNT1 (ENSMMNG00015021481) #29 DDN (ENSMMNG00015021490) 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ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00960000190898 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000166925 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000159881.a.b.b ENSGT00940000159881.a.a.b ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.C.b ENSGT00940000162388.C.a ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803.i ENSGT00940000163803.j ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00960000190898 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162202.B ENSGT00940000162202.A ENSGT00390000014843 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000159881.a.b.b ENSGT00940000159881.a.a.b ENSGT00940000162388.C.a ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803.i ENSGT00940000163803.j ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 19 ENSOARG00020002130 C12orf54 (ENSOARG00020002119) ENSOARG00020002107 OR8S1 (ENSOARG00020002101) ENSOARG00020002087 ENSOARG00020002069 ENSOARG00020002038 ENSOARG00020002030 ENSOARG00020002016 ENSOARG00020002005 LALBA (ENSOARG00020001995) #17 KANSL2 (ENSOARG00020001947) #18 CCNT1 (ENSOARG00020001901) #19 TEX49 (ENSOARG00020001874) #20 ADCY6 (ENSOARG00020001829) #21 CACNB3 (ENSOARG00020001592) #22 DDX23 (ENSOARG00020001513) #23 RND1 (ENSOARG00020001495) #24 CCDC65 (ENSOARG00020001481) #25 FKBP11 (ENSOARG00020001464) #26 ARF3 (ENSOARG00020001435) #27 WNT10B (ENSOARG00020001413) #28 WNT1 (ENSOARG00020001399) #29 DDN (ENSOARG00020001388) PRKAG1 (ENSOARG00020001353) #30 KMT2D (ENSOARG00020001142) #31 RHEBL1 (ENSOARG00020001088) #32 DHH (ENSOARG00020001078) #33 LMBR1L (ENSOARG00020001056) #34 ENSOARG00020001038 #35 TUBA1A (ENSOARG00020000988) ##35 Goat MODERN SPECIES 24 ENSCHIG00000012693 ENSCHIG00000016938 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ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a.t #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 ENSGT00960000190898 Wild yak MODERN SPECIES 811 ENSBMUG00000022781 ENSBMUG00000022786 ENSBMUG00000022792 ENSBMUG00000022798 LALBA (ENSBMUG00000022803) #17 KANSL2 (ENSBMUG00000022822) #18 CCNT1 (ENSBMUG00000022863) #19 TEX49 (ENSBMUG00000022878) #20 ADCY6 (ENSBMUG00000022919) #21 CACNB3 (ENSBMUG00000022951) #22 DDX23 (ENSBMUG00000022978) #23 RND1 (ENSBMUG00000022988) #24 CCDC65 (ENSBMUG00000022996) #25 FKBP11 (ENSBMUG00000023022) #26 ARF3 (ENSBMUG00000023035) #27 WNT10B (ENSBMUG00000023052) #28 WNT1 (ENSBMUG00000023065) #29 DDN (ENSBMUG00000023077) PRKAG1 (ENSBMUG00000023104) #30 KMT2D (ENSBMUG00000023143) #31 RHEBL1 (ENSBMUG00000023169) #32 DHH (ENSBMUG00000023184) #33 LMBR1L (ENSBMUG00000023203) #34 TUBA1A (ENSBMUG00000023218) ##35 ENSBMUG00000023231 Domestic yak MODERN SPECIES 24 ENSBGRG00000000340 C12orf54 (ENSBGRG00000000348) ENSBGRG00000000359 ENSBGRG00000000426 ENSBGRG00000000434 ENSBGRG00000000442 ENSBGRG00000000448 ENSBGRG00000000452 ENSBGRG00000000462 ENSBGRG00000000479 #17 OR5BS1P (ENSBGRG00000000585) KANSL2 (ENSBGRG00000000597) #18 ENSBGRG00000000624 #19 TEX49 (ENSBGRG00000000640) #20 ADCY6 (ENSBGRG00000000673) #21 CACNB3 (ENSBGRG00000000782) #22 DDX23 (ENSBGRG00000000870) #23 RND1 (ENSBGRG00000000933) #24 CCDC65 (ENSBGRG00000000948) #25 ENSBGRG00000000979 #27 WNT10B (ENSBGRG00000001078) #28 WNT1 (ENSBGRG00000001101) #29 DDN (ENSBGRG00000001128) PRKAG1 (ENSBGRG00000001150) #30 ENSBGRG00000001218 #31 ENSBGRG00000001247 #31 RHEBL1 (ENSBGRG00000001273) #32 DHH (ENSBGRG00000001304) #33 LMBR1L (ENSBGRG00000001347) #34 TUBA1B (ENSBGRG00000001452) #35 ENSBGRG00000001508 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000166925 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000159881.a.b.b ENSGT00940000162388.A.a 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(ENSBTAG00000005859) #17 KANSL2 (ENSBTAG00000002693) #18 CCNT1 (ENSBTAG00000005861) #19 TEX49 (ENSBTAG00000054993) #20 ADCY6 (ENSBTAG00000005464) #21 CACNB3 (ENSBTAG00000021808) #22 DDX23 (ENSBTAG00000021810) #23 RND1 (ENSBTAG00000018773) #24 CCDC65 (ENSBTAG00000015825) #25 FKBP11 (ENSBTAG00000015828) #26 ARF3 (ENSBTAG00000051755) #27 WNT10B (ENSBTAG00000015347) #28 WNT1 (ENSBTAG00000015364) #29 DDN (ENSBTAG00000014424) PRKAG1 (ENSBTAG00000014426) #30 KMT2D (ENSBTAG00000014429) #31 RHEBL1 (ENSBTAG00000006557) #32 DHH (ENSBTAG00000000124) #33 LMBR1L (ENSBTAG00000044048) #34 TUBA1B (ENSBTAG00000012244) #35 ENSBTAG00000052201 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 24 C12orf54 (ENSBIXG00005021156) ENSBIXG00005021140 ENSBIXG00005021120 ENSBIXG00005021112 ENSBIXG00005021105 ENSBIXG00005021096 ENSBIXG00005006598 ENSBIXG00005021075 ENSBIXG00005003554 #17 OR5BS1P (ENSBIXG00005021006) KANSL2 (ENSBIXG00005006660) #18 CCNT1 (ENSBIXG00005020870) #19 ENSBIXG00005020791 TEX49 (ENSBIXG00005006658) #20 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DHH (ENSCHYG00000005055) #33 LMBR1L (ENSCHYG00000003957) #34 ENSCHYG00000003953 TUBA1B (ENSCHYG00000003929) #35 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 158 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 Hedgehog MODERN SPECIES 6227 ENSEEUG00000012142 #22 Common shrew MODERN SPECIES 4846 CACNB3 (ENSSARG00000004502) #22 DDX23 (ENSSARG00000004534) #23 RND1 (ENSSARG00000004593) #24 ENSSARG00000004603 #25 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000159881.a.a.a ENSGT00940000162202.C ENSGT00940000163941.A ENSGT00940000159881.a.b.a ENSGT00940000159881.a.b.b ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00940000154457.a.b Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 73 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000154457.a.a.o ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00940000160203 ENSGT00390000012132 Sloth MODERN SPECIES 8738 CACNB3 (ENSCHOG00000007069) #22 Armadillo MODERN SPECIES 311 TEX49 (ENSDNOG00000048512) #20 ADCY6 (ENSDNOG00000040679) #21 CACNB3 (ENSDNOG00000043665) #22 DDX23 (ENSDNOG00000043176) #23 RND1 (ENSDNOG00000035948) #24 CCDC65 (ENSDNOG00000006591) #25 ENSDNOG00000035391 #26 ARF3 (ENSDNOG00000010454) #27 WNT10B (ENSDNOG00000006613) #28 WNT1 (ENSDNOG00000006617) #29 DDN (ENSDNOG00000042932) PRKAG1 (ENSDNOG00000006640) #30 KMT2D (ENSDNOG00000041118) #31 RHEBL1 (ENSDNOG00000006437) #32 ENSDNOG00000039572 ENSDNOG00000004121 #35 PRPH (ENSDNOG00000035037) TROAP (ENSDNOG00000017843) Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000162202.A ENSGT00940000159881.a.a.a.f.a ENSGT00940000162202.C ENSGT00940000163941.A ENSGT00940000159881.a.b.a ENSGT00940000159881.a.b.b ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B.h ENSGT00940000162388.B.g ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00940000154457.a.b Tenrec MODERN SPECIES 6751 ADCY6 (ENSETEG00000015805) #21 CACNB3 (ENSETEG00000015811) #22 DDX23 (ENSETEG00000015816) #23 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000162202.A ENSGT00940000159881.a.a.a.f.a ENSGT00940000162202.C ENSGT00940000163941.A ENSGT00940000159881.a.b.a ENSGT00940000159881.a.b.b ENSGT00940000162388.A ENSGT00940000162388.B.h ENSGT00940000162388.B.g ENSGT00940000163803 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000165147 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00940000154457.a.b Elephant MODERN SPECIES 196 ENSLAFG00000026490 ENSLAFG00000011683 ENSLAFG00000027869 ENSLAFG00000029814 ENSLAFG00000029710 ENSLAFG00000030518 ENSLAFG00000026241 ENSLAFG00000031095 ENSLAFG00000021927 ENSLAFG00000027094 LALBA (ENSLAFG00000014199) #17 ENSLAFG00000030854 KANSL2 (ENSLAFG00000014200) #18 CCNT1 (ENSLAFG00000029881) #19 ADCY6 (ENSLAFG00000014218) #21 CACNB3 (ENSLAFG00000014224) #22 DDX23 (ENSLAFG00000014227) #23 RND1 (ENSLAFG00000010202) #24 CCDC65 (ENSLAFG00000004200) #25 FKBP11 (ENSLAFG00000004202) #26 ARF3 (ENSLAFG00000004207) #27 WNT10B (ENSLAFG00000004210) #28 WNT1 (ENSLAFG00000004211) #29 DDN (ENSLAFG00000022385) PRKAG1 (ENSLAFG00000005040) #30 KMT2D (ENSLAFG00000009989) #31 RHEBL1 (ENSLAFG00000010008) #32 DHH (ENSLAFG00000010011) #33 LMBR1L (ENSLAFG00000010017) #34 TUBA1B (ENSLAFG00000010021) #35 ENSLAFG00000029073 Hyrax MODERN SPECIES 5107 CACNB3 (ENSPCAG00000001967) #22 DDX23 (ENSPCAG00000002016) #23 RND1 (ENSPCAG00000002103) #24 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000159931 ENSGT00390000002307 ENSGT00940000159065 ENSGT00940000155473 ENSGT00940000155224 ENSGT00940000155489.b ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00390000002978 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 ENSGT00940000154457.a.b Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000159931 ENSGT00390000002307 ENSGT00940000159065 ENSGT00940000155473 ENSGT00940000155224 ENSGT00940000155489.b ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00390000002978 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a.i #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.b ##35 ENSGT00940000154457.a.b Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000159931 ENSGT00390000002307 ENSGT00940000159065 ENSGT00940000155473 ENSGT00940000155224 ENSGT00940000155489.b ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366 ENSGT00390000002978 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a.i #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.a ##35 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000159931 ENSGT00390000002307 ENSGT00940000159065 ENSGT00940000155473 ENSGT00940000155224 ENSGT00940000155489.b ENSGT00940000155440.d ENSGT00940000159366.g ENSGT00390000002978 ENSGT00730000111596 ENSGT00940000161726 #17 ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a.i #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.a ##35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.b ##35 Common wonbat MODERN SPECIES 1128 RPAP3 (ENSVURG00010005415) ENDOU (ENSVURG00010005446) RAPGEF3 (ENSVURG00010005514) SLC48A1 (ENSVURG00010005551) HDAC7 (ENSVURG00010005565) VDR (ENSVURG00010005603) COL2A1 (ENSVURG00010005638) SENP1 (ENSVURG00010005800) PFKM (ENSVURG00010005884) ASB8 (ENSVURG00010006046) ENSVURG00010006084 #17 KANSL2 (ENSVURG00010006093) #18 CCNT1 (ENSVURG00010006120) #19 TEX49 (ENSVURG00010006146) #20 ADCY6 (ENSVURG00010006156) #21 CACNB3 (ENSVURG00010006214) #22 DDX23 (ENSVURG00010006330) #23 RND1 (ENSVURG00010006356) #24 CCDC65 (ENSVURG00010006366) #25 ENSVURG00010006389 #26 ARF3 (ENSVURG00010006396) #27 WNT10B (ENSVURG00010006404) #28 WNT1 (ENSVURG00010006417) #29 ENSVURG00010006430 ENSVURG00010006434 #30 ENSVURG00010006474 #31 DHH (ENSVURG00010006554) #33 LMBR1L (ENSVURG00010006566) #34 ENSVURG00010006581 ##35 ENSVURG00010006586 ##35 ENSVURG00010006593 #35 koala MODERN SPECIES 309 SLC48A1 (ENSPCIG00000012639) HDAC7 (ENSPCIG00000012641) VDR (ENSPCIG00000036228) COL2A1 (ENSPCIG00000035466) SENP1 (ENSPCIG00000014356) PFKM (ENSPCIG00000015868) ENSPCIG00000032651 CCDC184 (ENSPCIG00000016483) ENSPCIG00000016482 ENSPCIG00000016478 LALBA (ENSPCIG00000004161) #17 KANSL2 (ENSPCIG00000027713) #18 CCNT1 (ENSPCIG00000027711) #19 TEX49 (ENSPCIG00000027707) #20 ADCY6 (ENSPCIG00000027700) #21 CACNB3 (ENSPCIG00000027695) #22 DDX23 (ENSPCIG00000027691) #23 RND1 (ENSPCIG00000002332) #24 ENSPCIG00000037193 #26 ENSPCIG00000035336 #25 Wallaby MODERN SPECIES 7526 CACNB3 (ENSMEUG00000009459) #22 DDX23 (ENSMEUG00000009477) #23 Tasmanian devil DUPLICATION Tasmanian devil MODERN SPECIES 4 HDAC7 (ENSSHAG00000002512) VDR (ENSSHAG00000026302) COL2A1 (ENSSHAG00000004561) SENP1 (ENSSHAG00000003840) PFKM 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ENSACAG00000008047 ESYT1 (ENSACAG00000007931) ENSACAG00000022592 Laterata ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154118.a.a.a.a.b ENSGT00940000154118.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000154118.a.a.a.b ENSGT00390000011466 ENSGT00440000033468.c.a ENSGT00940000154256 ENSGT00390000010523.d ENSGT00930000150980.b ENSGT00940000159962 ENSGT01050000244940.a.a ENSGT00530000063607.a ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00990000213996 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156785 ENSGT00940000156561.b ENSGT01030000234570.d.b.a.a.b ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b ENSGT00940000155746 ENSGT00530000063647.B Common wall lizard MODERN SPECIES 10 ENSPMRG00000022529 ENSPMRG00000022504 ENSPMRG00000022483 PRIM1 (ENSPMRG00000022380) ENSPMRG00000022361 PTGES3 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ENSGT00940000157032 ENSGT00530000063734.b ENSGT00950000183038.a.b.a ENSGT00390000016511 ENSGT00950000185385 ENSGT00930000150980.b ENSGT00940000159962 ENSGT01050000244940.a.a ENSGT00530000063607.a ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a.g #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B.h #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00940000154457.a.a painted turtle MODERN SPECIES 871 ENSCPBG00000019463 ENSCPBG00000019466 ACVR1B (ENSCPBG00000019469) TAMALIN (ENSCPBG00000019472) NR4A1 (ENSCPBG00000019477) ATG101 (ENSCPBG00000019481) ENSCPBG00000019483 PRPF40B (ENSCPBG00000019498) FMNL3 (ENSCPBG00000019686) TMBIM6 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(ENSTMTG00000021706) #18 CCNT1 (ENSTMTG00000021699) #19 ADCY6 (ENSTMTG00000021515) #21 ENSTMTG00000021438 #22 DDX23 (ENSTMTG00000021409) #23 CCDC65 (ENSTMTG00000021366) #25 FKBP11 (ENSTMTG00000021357) #26 ARF3 (ENSTMTG00000021353) #27 ENSTMTG00000021350 PRKAG1 (ENSTMTG00000021343) #30 ENSTMTG00000021337 #31 DHH (ENSTMTG00000021332) #33 LMBR1L (ENSTMTG00000021322) #34 C1QL4 (ENSTMTG00000021316) DNAJC22 (ENSTMTG00000021313) SPATS2 (ENSTMTG00000021304) MCRS1 (ENSTMTG00000021294) ENSTMTG00000021290 ENSTMTG00000021287 Emydidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.a.h #22 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 1345 ENSTMTG00000017768 #22 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00500000044852.b.e ENSGT00500000044852.b.f ENSGT00940000164733 ENSGT00940000157032 ENSGT00530000063734.b ENSGT00950000183038.a.b.a ENSGT00390000016511 ENSGT00950000185385 ENSGT00930000150980.b ENSGT00940000159962 ENSGT01050000244940.a.a ENSGT00530000063607.a ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B.g #25 ENSGT00940000153804.B.h #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00390000016495 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.b ##35 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 17 FIGNL2 (ENSGEVG00005000172) ENSGEVG00005000159 ENSGEVG00005000139 ENSGEVG00005000122 ACVR1B (ENSGEVG00005000089) TAMALIN (ENSGEVG00005000070) NR4A1 (ENSGEVG00005000057) ATG101 (ENSGEVG00005009687) ENSGEVG00005009641 PRPF40B (ENSGEVG00005009586) FMNL3 (ENSGEVG00005009313) TMBIM6 (ENSGEVG00005009215) KANSL2 (ENSGEVG00005009046) #18 CCNT1 (ENSGEVG00005008995) #19 ADCY6 (ENSGEVG00005008885) #21 CACNB3 (ENSGEVG00005008790) #22 DDX23 (ENSGEVG00005008745) #23 RND1 (ENSGEVG00005008717) #24 ENSGEVG00005008701 #25 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#34 TUBA1B (ENSPSIG00000002906) #35 ENSPSIG00000002936 PRPH (ENSPSIG00000002950) DNAJC22 (ENSPSIG00000002958) SPATS2 (ENSPSIG00000002965) Archosauria ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00500000044852.b ENSGT00940000164733 ENSGT00940000157032 ENSGT00530000063734.b ENSGT00950000183038.a.b.a ENSGT00390000016511 ENSGT00950000185385 ENSGT00930000150980.b ENSGT00940000159962 ENSGT01050000244940.a.a ENSGT00530000063607.a ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b #36 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.b ##35 ENSGT00940000154457.a.a Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 7 ENSCPRG00005001986 ENSCPRG00005001981 ENSCPRG00005001977 ACVR1B (ENSCPRG00005001974) NR4A1 (ENSCPRG00005001958) ATG101 (ENSCPRG00005001955) ENSCPRG00005001953 PRPF40B (ENSCPRG00005001883) FMNL3 (ENSCPRG00005001684) TMBIM6 (ENSCPRG00005001649) NCKAP5L (ENSCPRG00005001644) KANSL2 (ENSCPRG00005001635) #18 CCNT1 (ENSCPRG00005001632) #19 TEX49 (ENSCPRG00005001629) #20 ADCY6 (ENSCPRG00005001591) #21 CACNB3 (ENSCPRG00005001571) #22 DDX23 (ENSCPRG00005001479) #23 RND1 (ENSCPRG00005001427) #24 CCDC65 (ENSCPRG00005001417) #25 FKBP11 (ENSCPRG00005001392) #26 ARF3 (ENSCPRG00005001385) #27 Aves ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000154786.c ENSGT00940000156263 ENSGT00940000161971 ENSGT00500000044852.b ENSGT00940000164733 ENSGT00940000157032 ENSGT00530000063734.b ENSGT00950000183038.a.b.a ENSGT00390000016511 ENSGT00940000159962 ENSGT01050000244940.a.a ENSGT00530000063607.a ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b 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##35 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000156263 ENSGT00940000161971 ENSGT01070000255642 ENSGT00500000044852.b ENSGT00940000161446 ENSGT00940000157032 ENSGT00530000063734.b ENSGT00950000183038.a.b.a ENSGT00390000016511.i.a ENSGT00940000159962 ENSGT01050000244940.a.a ENSGT00530000063607.a ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.b ##35 ENSGT00940000160203 ENSGT00940000154457.b.db.b ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b #36 Great tit MODERN SPECIES 267 ENSPMJG00000006508 ENSPMJG00000006507 ENSPMJG00000006505 ENSPMJG00000006503 ENSPMJG00000006500 ACVR1B (ENSPMJG00000006497) TAMALIN 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ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b #36 ENSGT00940000154457.b.db.b ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.b ##35 ENSGT00940000160203 Medium ground finch MODERN SPECIES 302 ENSGFOG00000010953 ACVRL1 (ENSGFOG00000010958) ACVR1B (ENSGFOG00000010968) ATG101 (ENSGFOG00000006758) FMNL3 (ENSGFOG00000006796) TMBIM6 (ENSGFOG00000007142) KANSL2 (ENSGFOG00000007154) #18 CCNT1 (ENSGFOG00000007168) #19 CACNB3 (ENSGFOG00000007283) #22 DDX23 (ENSGFOG00000007288) #23 CCDC65 (ENSGFOG00000007303) #25 FKBP11 (ENSGFOG00000007309) #26 ARF3 (ENSGFOG00000007314) #27 WNT1 (ENSGFOG00000007318) #29 PRKAG1 (ENSGFOG00000007332) #30 ENSGFOG00000007361 #31 ENSGFOG00000007373 #31 DHH (ENSGFOG00000007390) #33 LMBR1L (ENSGFOG00000007411) #34 ENSGFOG00000007513 ##35 TUBA1A (ENSGFOG00000007521) #36 TUBA1C (ENSGFOG00000007528) #35 GLI1 (ENSGFOG00000007541) INHBC (ENSGFOG00000007580) Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 35 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ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00940000154457.a.a ENSGT00940000160203 ENSGT00940000155969 Golden eagle MODERN SPECIES 6 ENSACCG00020008299 SCN8A (ENSACCG00020008274) FIGNL2 (ENSACCG00020008253) ANKRD33 (ENSACCG00020008239) ENSACCG00020008217 ACVR1B (ENSACCG00020008193) TAMALIN (ENSACCG00020008179) NR4A1 (ENSACCG00020008170) ATG101 (ENSACCG00020008162) FMNL3 (ENSACCG00020008061) TMBIM6 (ENSACCG00020007934) NCKAP5L (ENSACCG00020007924) KANSL2 (ENSACCG00020007889) #18 CCNT1 (ENSACCG00020007866) #19 ADCY6 (ENSACCG00020007847) #21 CACNB3 (ENSACCG00020007825) #22 DDX23 (ENSACCG00020007807) #23 RND1 (ENSACCG00020007790) #24 CCDC65 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(ENSSHBG00005013129) #29 ENSSHBG00005013112 PRKAG1 (ENSSHBG00005013091) #30 ENSSHBG00005013072 #31 ENSSHBG00005013050 #31 RHEBL1 (ENSSHBG00005013025) #32 DHH (ENSSHBG00005013010) #33 LMBR1L (ENSSHBG00005012994) #34 TUBA1B (ENSSHBG00005012958) #35 ENSSHBG00005012920 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000154786.d ENSGT00940000154786.c ENSGT00940000156263 ENSGT00940000161971 ENSGT00500000044852.b ENSGT00940000164733 ENSGT00940000157032 ENSGT00530000063734.b ENSGT00950000183038.a.b.a ENSGT00390000016511 ENSGT00940000159962 ENSGT01050000244940.a.a ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b #36 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000165418 ENSGT00940000154786.d ENSGT00940000156263 ENSGT00940000161971 ENSGT00500000044852.b ENSGT00940000164733 ENSGT00940000157032 ENSGT00530000063734.b ENSGT00950000183038.a.b.a ENSGT00390000016511 ENSGT00940000159962 ENSGT01050000244940.a.a ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00950000183019.f.b.a.w #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b #36 ENSGT00390000016940.c.a ENSGT00730000111107 ENSGT00940000157144 ENSGT00950000183188.A.a Japanese quail MODERN SPECIES 55 KANSL2 (ENSCJPG00005002509) #18 CCNT1 (ENSCJPG00005002526) #19 ADCY6 (ENSCJPG00005002528) #21 ENSCJPG00005002610 #22 ENSCJPG00005002614 DDX23 (ENSCJPG00005002645) #23 ENSCJPG00005003136 CCDC65 (ENSCJPG00005003137) #25 RND1 (ENSCJPG00005003138) #24 ENSCJPG00005003141 Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000158200 ENSGT00940000165418 ENSGT00940000156263 ENSGT00940000161971 ENSGT00500000044852.b ENSGT00940000164733 ENSGT00940000157032 ENSGT00530000063734.b ENSGT00950000183038.a.b.a ENSGT00390000016511 ENSGT00940000159962 ENSGT01050000244940.a.a ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160329 #29 Turkey MODERN SPECIES 26 CRPPA (ENSMGAG00000010099) AGMO (ENSMGAG00000010089) DGKB (ENSMGAG00000010034) ETV1 (ENSMGAG00000010009) ENSMGAG00000007228 ENSMGAG00000007260 ENSMGAG00000002917 ENSMGAG00000007321 ENSMGAG00000021678 ENSMGAG00000022005 ENSMGAG00000012275 ENSMGAG00000018445 ENSMGAG00000007404 ENSMGAG00000007409 ENSMGAG00000007427 ENSMGAG00000021324 #22 ENSMGAG00000007454 ##22 ENSMGAG00000007487 ENSMGAG00000020483 ENSMGAG00000018324 ENSMGAG00000018238 ENSMGAG00000007578 ENSMGAG00000007520 ENSMGAG00000007644 ENSMGAG00000007688 ENSMGAG00000007705 ENSMGAG00000007735 ENSMGAG00000007744 ENSMGAG00000022867 ENSMGAG00000007787 ENSMGAG00000007849 Chicken MODERN SPECIES 27 ENSGALG00010025735 ENSGALG00010022277 SCN8A (ENSGALG00010022264) FIGNL2 (ENSGALG00010022248) ENSGALG00010022215 ACVR1B (ENSGALG00010022190) TAMALIN (ENSGALG00010025405) NR4A1 (ENSGALG00010025421) ATG101 (ENSGALG00010025496) ENSGALG00010025449 ENSGALG00010025425 ENSGALG00010023091 KANSL2 (ENSGALG00010023077) #18 CCNT1 (ENSGALG00010023074) #19 ADCY6 (ENSGALG00010022807) #21 CACNB3 (ENSGALG00010022767) #22 RND1 (ENSGALG00010022739) #24 DDX23 (ENSGALG00010022712) #23 CCDC65 (ENSGALG00010022592) #25 FKBP11 (ENSGALG00010022583) #26 ARF3 (ENSGALG00010022565) #27 WNT1 (ENSGALG00010022557) #29 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00940000154457.b Duck MODERN SPECIES 4230 ENSAPLG00000025380 #22 Pink-footed goose MODERN SPECIES 523 CACNB3 (ENSABRG00000004078) #22 DDX23 (ENSABRG00000004061) #23 RND1 (ENSABRG00000004045) #24 FKBP11 (ENSABRG00000004035) #26 CCDC65 (ENSABRG00000003962) #25 ARF3 (ENSABRG00000003900) #27 WNT1 (ENSABRG00000003878) #29 PRKAG1 (ENSABRG00000003860) #30 ENSABRG00000003854 ENSABRG00000003842 #31 ENSABRG00000003832 #31 DHH (ENSABRG00000003824) #33 LMBR1L (ENSABRG00000003807) #34 Anura ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183202.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.a ENSGT00940000158925 ENSGT00940000164733 ENSGT00940000157032 ENSGT00530000063734.b ENSGT00950000183038.a.b.a ENSGT00390000016511 ENSGT00930000150980.b ENSGT00940000159962 ENSGT01050000244940.a.a ENSGT00530000063607.a ENSGT00940000155808 #18 ENSGT00940000159544 #19 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000153804.B #25 ENSGT00940000159521 #26 ENSGT00940000160329 #29 ENSGT00940000160653 #28 ENSGT00950000183080.a.a #27 ENSGT01100000264854 ENSGT00950000183019.f.b.a #30 ENSGT00940000156707 #31 ENSGT00940000161665 #32 ENSGT00940000161132 #33 ENSGT00390000007809.a #34 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.a.b #35 ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.a.a.b ##35 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 5 TAMALIN (ENSLLEG00000027652) ENSLLEG00000027719 ATG101 (ENSLLEG00000004256) PRPF40B (ENSLLEG00000004278) FMNL3 (ENSLLEG00000004371) ENSLLEG00000004450 ENSLLEG00000004465 NCKAP5L (ENSLLEG00000004474) KANSL2 (ENSLLEG00000004488) #18 ENSLLEG00000004502 #19 ENSLLEG00000004513 #19 ENSLLEG00000004518 ENSLLEG00000004540 #21 ENSLLEG00000004573 ENSLLEG00000004576 CACNB3 (ENSLLEG00000004614) #22 ENSLLEG00000004692 DDX23 (ENSLLEG00000004713) #23 RND1 (ENSLLEG00000004741) #24 CCDC65 (ENSLLEG00000004751) #25 FKBP11 (ENSLLEG00000004767) #26 ENSLLEG00000004777 WNT1 (ENSLLEG00000004788) #29 WNT10B (ENSLLEG00000004802) #28 ENSLLEG00000004815 ENSLLEG00000004819 ARF3 (ENSLLEG00000004828) #27 ENSLLEG00000004843 PRKAG1 (ENSLLEG00000004865) #30 ENSLLEG00000004898 #31 ENSLLEG00000004907 Frog MODERN SPECIES 2 lpar6 (ENSXETG00000000557) rcbtb2 (ENSXETG00000000559) acvrl1 (ENSXETG00000031897) acvr1b (ENSXETG00000000572) tamalin (ENSXETG00000035527) nr4a1 (ENSXETG00000000579) prpf40b (ENSXETG00000000580) fmnl3 (ENSXETG00000000581) atg101 (ENSXETG00000036801) socs6 (ENSXETG00000009777) nckap5l (ENSXETG00000034494) kansl2 (ENSXETG00000009782) #18 adcy6 (ENSXETG00000009789) #21 ENSXETG00000047121 ENSXETG00000048861 cacnb3 (ENSXETG00000041393) #22 ddx23 (ENSXETG00000009807) #23 rnd1 (ENSXETG00000009811) #24 wdr45 (ENSXETG00000009814) ccdc65 (ENSXETG00000009815) #25 fkbp11 (ENSXETG00000009816) #26 wnt1 (ENSXETG00000009817) #29 wnt10b (ENSXETG00000011173) #28 arf3 (ENSXETG00000037951) #27 ENSXETG00000040047 prkag1 (ENSXETG00000011176) #30 ENSXETG00000048924 rhebl1 (ENSXETG00000011180) #32 ENSXETG00000036315 dhh (ENSXETG00000011181) #33 lmbr1l (ENSXETG00000011184) #34 Coelacanth MODERN SPECIES 320 ENSLACG00000017970 MARCHF9 (ENSLACG00000017934) ESYT1 (ENSLACG00000017835) ENSLACG00000017747 SMARCC2 (ENSLACG00000017661) RNF41 (ENSLACG00000017605) CCNT1 (ENSLACG00000017559) #19 TEX49 (ENSLACG00000022415) #20 ADCY6 (ENSLACG00000017248) #21 CACNB3 (ENSLACG00000017043) #22 DDX23 (ENSLACG00000016977) #23 RND1 (ENSLACG00000016845) #24 CCDC65 (ENSLACG00000016720) #25 FKBP11 (ENSLACG00000016698) #26 ENSLACG00000016685 ITGA7 (ENSLACG00000016510) BLOC1S1 (ENSLACG00000016210) RDH5 (ENSLACG00000016142) CD63 (ENSLACG00000015901) ENSLACG00000015812 PRPH (ENSLACG00000015277) ENSLACG00000014787 MMP19 (ENSLACG00000014580) PYM1 (ENSLACG00000014398) DGKA (ENSLACG00000013689) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 238 ENSGT00390000010463.a.a.a ENSGT00940000159780 ENSGT00530000063603.A ENSGT00940000164002 ENSGT00500000045104 ENSGT01050000244905.C ENSGT00940000160845 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000161404 ENSGT00390000011466 ENSGT00440000033468 ENSGT00940000154256 ENSGT00940000159490 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 95 ENSGT00940000157032 ENSGT00500000044852.b ENSGT00940000160422 ENSGT00940000166618 ENSGT01070000253775.a.d.b ENSGT00390000006679.a ENSGT01000000215164 ENSGT00530000063603.A ENSGT00940000164002 ENSGT00390000000335 ENSGT00500000045104 ENSGT01050000244905.C ENSGT00940000160845 ENSGT00390000010327 #20 ENSGT00940000155687 #21 ENSGT00950000182837.b.a #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00940000154578.A.d ENSGT00940000161404 ENSGT00390000011466 ENSGT00440000033468 ENSGT00940000154256 ENSGT00940000159490 ENSGT00390000016293 ENSGT01030000234570.d.b.a.a ENSGT00940000155746 ENSGT00940000155969 ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000156260 ENSGT01080000257420.C.b.a Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 103 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00390000000950.c.a ENSGT01030000240148 ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00530000063808.a ENSGT00950000183006.A.a.b ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00950000182824.a.b.b.d ENSGT00390000016224 ENSGT00550000074803 ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000154256.`c Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 94 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00530000063808.a ENSGT00950000183006.A.a.b ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00950000182824.a.b.b.d ENSGT00390000016224 ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000156263 ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a ENSGT01090000259987.a.a.b.f ENSGT00940000155440.c.b ENSGT01100000263685 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 346 ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT00940000156263.i ENSGT00950000183290 ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a ENSGT01090000259987.a.a.b.f Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01070000253744.a.a.a.a ENSGT00940000159962 ENSGT00940000156561.a.a ENSGT00940000164713 ENSGT00940000156107.e.a ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c.f ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT00940000156263.i ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a ENSGT01090000259987.a.a.b.f ENSGT00940000155440.c.b ENSGT01100000263685 Atlantic herring MODERN SPECIES 20 ENSCHAG00000026020 ENSCHAG00000026013 ENSCHAG00000026007 pa2g4b (ENSCHAG00000025882) erbb3b (ENSCHAG00000025795) ENSCHAG00000025787 ENSCHAG00000025785 fam3a (ENSCHAG00000025778) idh3g (ENSCHAG00000025715) AVPR2 (ENSCHAG00000025705) arhgap4a (ENSCHAG00000025658) zgc:158263 (ENSCHAG00000025650) G6PD (ENSCHAG00000025470) galnt6 (ENSCHAG00000025436) ADCY6 (ENSCHAG00000024297) #21 CACNB3 (ENSCHAG00000024204) #22 rnd1b (ENSCHAG00000024197) #24 ENSCHAG00000024192 dtx3 (ENSCHAG00000024186) ptges3a (ENSCHAG00000024182) mipa (ENSCHAG00000024180) stat6 (ENSCHAG00000024133) FIGNL2 (ENSCHAG00000024124) ENSCHAG00000024118 scn8aa (ENSCHAG00000017341) ENSCHAG00000017132 ENSCHAG00000017124 dip2ba (ENSCHAG00000014666) atf7a (ENSCHAG00000014452) asb8 (ENSCHAG00000014431) LARP4 (ENSCHAG00000014302) Denticle herring MODERN SPECIES 1 znf740b (ENSDCDG00000004192) csad (ENSDCDG00000004195) zgc:174906 (ENSDCDG00000004247) ENSDCDG00000004252 spryd3 (ENSDCDG00000004258) igfbp6b (ENSDCDG00000004262) erbb3b (ENSDCDG00000004294) ENSDCDG00000004767 fam3a (ENSDCDG00000004787) idh3g (ENSDCDG00000004857) AVPR2 (ENSDCDG00000005367) SSR4 (ENSDCDG00000005368) arhgap4a (ENSDCDG00000005373) galnt6 (ENSDCDG00000005384) ADCY6 (ENSDCDG00000005446) #21 CACNB3 (ENSDCDG00000009942) #22 RND1 (ENSDCDG00000014759) #24 dtx3 (ENSDCDG00000014772) ptges3a (ENSDCDG00000014784) mipa (ENSDCDG00000014793) stat6 (ENSDCDG00000014813) FIGNL2 (ENSDCDG00000014847) scn8aa (ENSDCDG00000014906) dip2ba (ENSDCDG00000017766) atf7a (ENSDCDG00000031816) asb8 (ENSDCDG00000031822) LARP4 (ENSDCDG00000031827) pfkma (ENSDCDG00000031837) ENSDCDG00000031921 C1QL4 (ENSDCDG00000031923) zgc:153867 (ENSDCDG00000031929) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182994.B.a.a.a.d.b ENSGT00940000156650.i ENSGT00940000154967.a.a.b ENSGT00940000163310.k.a ENSGT00990000203827 ENSGT00940000167346 ENSGT00390000001969.a ENSGT00940000156496.a.b ENSGT00940000157871.i ENSGT00940000154169.B ENSGT00940000156670 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000156263.i ENSGT00950000183290 ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a ENSGT01090000259987.a.a.b.f ENSGT00940000155440.c.b Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162980 ENSGT00950000182994.B.a.a.a.d.b ENSGT00940000156650.i ENSGT00940000154967.a.a.b ENSGT00990000203827 ENSGT00940000167346 ENSGT00390000001969.a ENSGT00940000156496.a.b ENSGT00940000157871.i ENSGT00940000154169.B ENSGT00390000008152.A.sb.b ENSGT00940000156670 ENSGT00940000167208 ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000156263.i ENSGT00950000183290 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a ENSGT00940000155440.c.b.a ENSGT00390000012132 ENSGT00940000157847 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00950000182835.c.c.g.b.c ENSGT00940000162980.j ENSGT00950000182994.B.a.a.a.d.b.a 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(ENSCARG00000067498) tardbpa (ENSCARG00000067593) pgd (ENSCARG00000067736) mxra8b (ENSCARG00000067830) aurkaip1 (ENSCARG00000067834) slc25a33 (ENSCARG00000067840) tmem201 (ENSCARG00000067874) ZNF385A (ENSCARG00000067942) tac3a (ENSCARG00000067949) c1galt1la (ENSCARG00000067958) sp5l (ENSCARG00000067972) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 332 ENSGT00950000182994.B.a.a.a.d.b.b ENSGT00940000156650.i.c.a ENSGT00940000154967.a.a.b ENSGT00990000203827 ENSGT00940000167346.k ENSGT00390000001969.a.e ENSGT00940000156496.a.b.a ENSGT00940000157871.i ENSGT00940000154169.B.h ENSGT00390000008152.A.sb.b.a ENSGT01010000222933 ENSGT00940000156670.b ENSGT00940000167208.b ENSGT00940000166246.A.a ENSGT00940000155687.e.b.a #21 ENSGT00950000182837.b.a.a.b #22 ENSGT00940000158666.a.a.c.a #24 ENSGT00940000161404.p ENSGT00940000154256.`c.b ENSGT00940000156260.d.e ENSGT01080000257420.C.b.a.c ENSGT00940000161971 ENSGT00940000156263.i.b ENSGT00950000183290 ENSGT00940000159697.j.b ENSGT00940000166391.p 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scn8aa (ENSDARG00000005775) ENSDARG00000093100 ENSDARG00000094330 dip2ba (ENSDARG00000005350) atf7a (ENSDARG00000011298) asb8 (ENSDARG00000003383) ENSDARG00000078401 pfkma (ENSDARG00000014179) Characiphysae DUPLICATION Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a.c #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000156263.i ENSGT01060000248949 ENSGT00950000183290 ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a ENSGT01090000259987.a.a.b.f Channel catfish MODERN SPECIES 6 pik3cd (ENSIPUG00000003962) Ctnnbip1 (ENSIPUG00000004041) clstn1 (ENSIPUG00000004076) lzic (ENSIPUG00000004245) nmnat1 (ENSIPUG00000004336) rbp7a (ENSIPUG00000004406) Ube4b (ENSIPUG00000004431) kif1b (ENSIPUG00000004571) pgd (ENSIPUG00000004946) ENSIPUG00000004982 tardbp (ENSIPUG00000004992) ENSIPUG00000005033 casz1 (ENSIPUG00000005083) pex14 (ENSIPUG00000005302) ADCY6 (ENSIPUG00000005351) #21 CACNB3 (ENSIPUG00000005603) #22 RND1 (ENSIPUG00000006152) #24 dtx3 (ENSIPUG00000006200) ptges3a (ENSIPUG00000006214) MIP (ENSIPUG00000006273) STAT6 (ENSIPUG00000006315) fignl2 (ENSIPUG00000006441) scn8aa (ENSIPUG00000006458) G6PD (ENSIPUG00000006519) dip2ba (ENSIPUG00000006696) atf7 (ENSIPUG00000007396) asb8 (ENSIPUG00000007486) LARP4 (ENSIPUG00000007514) pfkma (ENSIPUG00000007582) ENSIPUG00000007690 phf8 (ENSIPUG00000007719) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000165353 ENSGT00940000159157 ENSGT00560000077266.a ENSGT01040000240523 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00530000065281 ENSGT00390000012588 ENSGT00940000155566 ENSGT00940000164803 ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a.c #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000156263.i ENSGT00950000183290.b ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a ENSGT01090000259987.a.a.b.f ENSGT00940000155440.c.b Characoidei ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000159614 ENSGT00940000155712 ENSGT00940000160174 ENSGT00950000182978.A.a.a ENSGT00390000018318 ENSGT00940000165353 ENSGT00940000159157 ENSGT00560000077266.a ENSGT01040000240523 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00530000065281 ENSGT00390000012588 ENSGT00940000155566 ENSGT00940000164803 ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a.c #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000156263.i ENSGT00950000183290.b ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a ENSGT01090000259987.a.a.b.f ENSGT00940000155440.c.b Mexicana tetra MODERN SPECIES 6 myb (ENSAMXG00000004244) hbs1l (ENSAMXG00000004260) eya4 (ENSAMXG00000004355) rps12 (ENSAMXG00000035998) ENSAMXG00000039895 sh3bgrl2 (ENSAMXG00000037764) LCA5 (ENSAMXG00000039992) hmgn3 (ENSAMXG00000004392) PHIP (ENSAMXG00000004407) ENSAMXG00000039347 irak1bp1 (ENSAMXG00000042727) ENSAMXG00000031393 tbx18 (ENSAMXG00000036788) ENSAMXG00000004435 ADCY6 (ENSAMXG00000004455) #21 CACNB3 (ENSAMXG00000004503) #22 rnd1b (ENSAMXG00000019017) #24 dtx3 (ENSAMXG00000029886) ptges3a (ENSAMXG00000004536) mipa (ENSAMXG00000034729) stat6 (ENSAMXG00000040035) FIGNL2 (ENSAMXG00000025605) scn8aa (ENSAMXG00000004617) ENSAMXG00000004667 dip2ba (ENSAMXG00000004682) atf7a (ENSAMXG00000004711) asb8 (ENSAMXG00000039046) LARP4 (ENSAMXG00000036493) ENSAMXG00000012901 pfkma (ENSAMXG00000012908) ENSAMXG00000033335 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 5 tbpl1 (ENSPNAG00000026480) tcf21 (ENSPNAG00000026466) eya4 (ENSPNAG00000026443) rps12 (ENSPNAG00000026298) ENSPNAG00000004033 sh3bgrl2 (ENSPNAG00000026229) LCA5 (ENSPNAG00000026203) hmgn3 (ENSPNAG00000026146) PHIP (ENSPNAG00000026124) ENSPNAG00000025854 irak1bp1 (ENSPNAG00000025841) tbx18 (ENSPNAG00000005640) ENSPNAG00000025802 ADCY6 (ENSPNAG00000006362) #21 ENSPNAG00000025634 #22 CACNB3 (ENSPNAG00000025621) #22 rnd1b (ENSPNAG00000025583) #24 dtx3 (ENSPNAG00000025560) ptges3a (ENSPNAG00000003930) mipa (ENSPNAG00000025525) stat6 (ENSPNAG00000005198) FIGNL2 (ENSPNAG00000025378) scn8aa (ENSPNAG00000025349) ENSPNAG00000025084 ENSPNAG00000025077 dip2ba (ENSPNAG00000024990) atf7a (ENSPNAG00000024836) asb8 (ENSPNAG00000024821) ENSPNAG00000024770 ENSPNAG00000005490 pfkma (ENSPNAG00000024501) Electric eel MODERN SPECIES 1498 CACNB3 (ENSEEEG00000008005) #22 rnd1b (ENSEEEG00000007999) #24 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.a.a.d #22 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.a.a.d #22 Characoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.a.a.d #22 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 5 slc2a12 (ENSPNAG00000026490) tbpl1 (ENSPNAG00000026480) tcf21 (ENSPNAG00000026466) eya4 (ENSPNAG00000026443) rps12 (ENSPNAG00000026298) ENSPNAG00000004033 sh3bgrl2 (ENSPNAG00000026229) LCA5 (ENSPNAG00000026203) hmgn3 (ENSPNAG00000026146) PHIP (ENSPNAG00000026124) ENSPNAG00000025854 irak1bp1 (ENSPNAG00000025841) tbx18 (ENSPNAG00000005640) ENSPNAG00000025802 ADCY6 (ENSPNAG00000006362) #21 ENSPNAG00000025634 #22 CACNB3 (ENSPNAG00000025621) #22 rnd1b (ENSPNAG00000025583) #24 dtx3 (ENSPNAG00000025560) ptges3a (ENSPNAG00000003930) mipa (ENSPNAG00000025525) stat6 (ENSPNAG00000005198) FIGNL2 (ENSPNAG00000025378) scn8aa (ENSPNAG00000025349) ENSPNAG00000025084 ENSPNAG00000025077 dip2ba (ENSPNAG00000024990) atf7a (ENSPNAG00000024836) asb8 (ENSPNAG00000024821) ENSPNAG00000024770 ENSPNAG00000005490 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b 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ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT00950000183290 ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000162777 ENSGT01060000248949 ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 Cod MODERN SPECIES SMC1A (ENSGMOG00000008344) RIBC1 (ENSGMOG00000008343) HUWE1 (ENSGMOG00000008327) PHF8 (ENSGMOG00000008324) ENSGMOG00000025327 fam3a (ENSGMOG00000008311) idh3g (ENSGMOG00000008308) AVPR2 (ENSGMOG00000008306) ENSGMOG00000008305 arhgap4a (ENSGMOG00000008303) NAA10 (ENSGMOG00000008300) zgc:158263 (ENSGMOG00000008297) ENSGMOG00000008292 galnt6 (ENSGMOG00000008290) ENSGMOG00000008289 #21 ENSGMOG00000008288 #22 rnd1b (ENSGMOG00000009588) #24 dtx3 (ENSGMOG00000033095) ptges3a (ENSGMOG00000008282) mipa (ENSGMOG00000032495) stat6 (ENSGMOG00000008275) ENSGMOG00000028523 ENSGMOG00000022320 ENSGMOG00000008271 ENSGMOG00000031180 ENSGMOG00000008270 dip2ba (ENSGMOG00000008260) atf7a (ENSGMOG00000008255) asb8 (ENSGMOG00000008251) ENSGMOG00000008246 pfkma (ENSGMOG00000008238) Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000169526 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT00950000183290 ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 21 ribc1 (ENSMMDG00005001654) l1cama (ENSMMDG00005001673) HUWE1 (ENSMMDG00005002216) phf8 (ENSMMDG00005017979) WNK3 (ENSMMDG00005018016) fam3a (ENSMMDG00005018102) idh3g (ENSMMDG00005018105) AVPR2 (ENSMMDG00005018415) ssr4 (ENSMMDG00005018455) arhgap4a (ENSMMDG00005018472) naa10 (ENSMMDG00005018485) zgc:158263 (ENSMMDG00005018493) G6PD (ENSMMDG00005018501) galnt6 (ENSMMDG00005018546) ADCY6 (ENSMMDG00005018588) #21 CACNB3 (ENSMMDG00005018594) #22 rnd1b (ENSMMDG00005018613) #24 ENSMMDG00005018615 dtx3 (ENSMMDG00005018618) ENSMMDG00005018622 ptges3a (ENSMMDG00005018644) mipa (ENSMMDG00005018648) stat6 (ENSMMDG00005018650) FIGNL2 (ENSMMDG00005018659) ENSMMDG00005018662 SCN8A (ENSMMDG00005018664) ENSMMDG00005018683 ENSMMDG00005018689 dip2ba (ENSMMDG00005018700) atf7a (ENSMMDG00005018783) asb8 (ENSMMDG00005018786) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000169526 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT00950000183290 ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 404 prozb (ENSHCOG00000000672) f10 (ENSHCOG00000007273) ENSHCOG00000007268 f7i (ENSHCOG00000007255) f7 (ENSHCOG00000007228) f7 (ENSHCOG00000007160) f7l (ENSHCOG00000007086) ENSHCOG00000007071 ssr4 (ENSHCOG00000007045) naa10 (ENSHCOG00000007025) arhgap4a (ENSHCOG00000007011) zgc:158263 (ENSHCOG00000000201) G6PD (ENSHCOG00000006870) galnt6 (ENSHCOG00000006831) ADCY6 (ENSHCOG00000006799) #21 CACNB3 (ENSHCOG00000006730) #22 ENSHCOG00000006499 fam184aa (ENSHCOG00000006358) ENSHCOG00000006317 ENSHCOG00000006307 ENSHCOG00000006293 ENSHCOG00000006275 TGDS (ENSHCOG00000006260) GPR180 (ENSHCOG00000006237) gart (ENSHCOG00000006215) n6amt1 (ENSHCOG00000006177) NCAM2 (ENSHCOG00000006163) ENSHCOG00000000192 arl13b (ENSHCOG00000006106) cbsa (ENSHCOG00000000738) u2af1 (ENSHCOG00000006043) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000169526 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT00950000183290 ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000169526 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT01060000248949 ENSGT00940000156263.k ENSGT00950000183290 ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000169526 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT00950000183290 ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 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ENSGT00940000155440.c.b Platyfish DUPLICATION Platyfish MODERN SPECIES ribc1 (ENSXMAG00000010952) l1cama (ENSXMAG00000010902) HUWE1 (ENSXMAG00000010828) phf8 (ENSXMAG00000010813) ENSXMAG00000021004 fam3a (ENSXMAG00000025512) idh3g (ENSXMAG00000010795) AVPR2 (ENSXMAG00000010783) ssr4 (ENSXMAG00000010777) arhgap4a (ENSXMAG00000010757) naa10 (ENSXMAG00000016782) zgc:158263 (ENSXMAG00000010739) G6PD (ENSXMAG00000010738) galnt6 (ENSXMAG00000010719) ADCY6 (ENSXMAG00000010656) #21 ENSXMAG00000029132 #22 CACNB3 (ENSXMAG00000010645) #22 rnd1b (ENSXMAG00000010632) #24 ENSXMAG00000028926 dtx3 (ENSXMAG00000010629) ptges3a (ENSXMAG00000010616) mipa (ENSXMAG00000010614) stat6 (ENSXMAG00000010611) FIGNL2 (ENSXMAG00000026987) ENSXMAG00000026382 SCN8A (ENSXMAG00000007895) ENSXMAG00000010605 dip2ba (ENSXMAG00000010552) atf7a (ENSXMAG00000010537) asb8 (ENSXMAG00000025707) ENSXMAG00000028242 Platyfish MODERN SPECIES l1cama (ENSXMAG00000010902) HUWE1 (ENSXMAG00000010828) phf8 (ENSXMAG00000010813) 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(ENSKMAG00000006281) stat6 (ENSKMAG00000006296) FIGNL2 (ENSKMAG00000006325) ENSKMAG00000006339 SCN8A (ENSKMAG00000006355) ENSKMAG00000006458 dip2ba (ENSKMAG00000006632) atf7a (ENSKMAG00000006747) asb8 (ENSKMAG00000006776) LARP4 (ENSKMAG00000006800) pfkma (ENSKMAG00000006849) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1624 smc1al (ENSNFUG00015006519) ribc1 (ENSNFUG00015006406) l1cama (ENSNFUG00015006292) HUWE1 (ENSNFUG00015006087) PHF8 (ENSNFUG00015005976) ENSNFUG00015005943 FAM3A (ENSNFUG00015005930) idh3g (ENSNFUG00015005905) AVPR2 (ENSNFUG00015005888) SSR4 (ENSNFUG00015005857) arhgap4a (ENSNFUG00015005846) NAA10 (ENSNFUG00015005801) galnt6 (ENSNFUG00015005752) ENSNFUG00015005749 ADCY6 (ENSNFUG00015005287) #21 CACNB3 (ENSNFUG00015004920) #22 RND1L (ENSNFUG00015004862) #24 Nfu_g_1_010243 (ENSNFUG00015004853) DTX3 (ENSNFUG00015004846) PTGES3A (ENSNFUG00015004816) mipa (ENSNFUG00015024084) stat6 (ENSNFUG00015024081) ENSNFUG00015024079 ENSNFUG00015024076 SCN8A (ENSNFUG00015024043) 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ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000169526 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT00950000183290 ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a Javanese ricefish MODERN SPECIES 21 smc1al (ENSOJAG00000023577) ribc1 (ENSOJAG00000023564) ENSOJAG00000023557 phf8 (ENSOJAG00000022991) ENSOJAG00000022936 fam3a (ENSOJAG00000022923) idh3g (ENSOJAG00000022809) AVPR2 (ENSOJAG00000022751) ssr4 (ENSOJAG00000022722) arhgap4a (ENSOJAG00000022713) naa10 (ENSOJAG00000022703) 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(ENSOMEG00000019214) #24 ENSOMEG00000019225 dtx3 (ENSOMEG00000019240) ptges3a (ENSOMEG00000019283) mipa (ENSOMEG00000019312) stat6 (ENSOMEG00000019401) FIGNL2 (ENSOMEG00000019430) ENSOMEG00000019441 SCN8A (ENSOMEG00000019478) ENSOMEG00000019530 dip2ba (ENSOMEG00000019595) atf7a (ENSOMEG00000019624) asb8 (ENSOMEG00000019634) LARP4 (ENSOMEG00000019749) pfkma (ENSOMEG00000019837) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000169526 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT00940000156263.k ENSGT00950000183290 ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a Chinese medaka MODERN SPECIES 1092 C1QL4 (ENSOSIG00000018647) tmem9 (ENSOSIG00000018648) smc1al (ENSOSIG00000018777) ENSOSIG00000020230 l1cama (ENSOSIG00000020268) phf8 (ENSOSIG00000005986) ENSOSIG00000006798 fam3a (ENSOSIG00000006800) idh3g (ENSOSIG00000006803) AVPR2 (ENSOSIG00000007500) ssr4 (ENSOSIG00000007519) zgc:158263 (ENSOSIG00000007674) G6PD (ENSOSIG00000007683) galnt6 (ENSOSIG00000007878) ADCY6 (ENSOSIG00000007926) #21 CACNB3 (ENSOSIG00000010747) #22 rnd1b (ENSOSIG00000010892) #24 ENSOSIG00000010894 dtx3 (ENSOSIG00000010895) ptges3a (ENSOSIG00000010896) mipa (ENSOSIG00000010897) stat6 (ENSOSIG00000010899) FIGNL2 (ENSOSIG00000010919) ENSOSIG00000010920 ENSOSIG00000010936 ENSOSIG00000013937 ENSOSIG00000013941 dip2ba (ENSOSIG00000014041) atf7a (ENSOSIG00000017505) asb8 (ENSOSIG00000017509) ENSOSIG00000017511 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 21 l1cama (ENSORLG00000007291) HUWE1 (ENSORLG00000007276) phf8 (ENSORLG00000007172) WNK3 (ENSORLG00000007137) idh3g (ENSORLG00000007106) fam3a (ENSORLG00000027045) ENSORLG00000028587 avpr2 (ENSORLG00000007088) ssr4 (ENSORLG00000007070) arhgap4a (ENSORLG00000023003) naa10 (ENSORLG00000007057) zgc:158263 (ENSORLG00000007039) ENSORLG00000007024 galnt6 (ENSORLG00000006993) ENSORLG00000006969 #21 ENSORLG00000006945 #22 rnd1b (ENSORLG00000023113) #24 ENSORLG00000026267 dtx3 (ENSORLG00000024916) ptges3a (ENSORLG00000030045) mipa (ENSORLG00000020190) stat6 (ENSORLG00000024001) FIGNL2 (ENSORLG00000006937) ENSORLG00000025881 ENSORLG00000025801 SCN8A (ENSORLG00000006930) ENSORLG00000006898 dip2ba (ENSORLG00000006887) atf7a (ENSORLG00000006799) asb8 (ENSORLG00000024296) ENSORLG00000006758 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a 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#24 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT01060000248949 ENSGT00940000156263.k ENSGT00950000183290 ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT01060000248949 ENSGT00940000156263.k ENSGT00950000183290 ENSGT00940000165418 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ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a Zebra mbuna MODERN SPECIES 1103 ribc1 (ENSMZEG00005027228) l1cama (ENSMZEG00005027229) HUWE1 (ENSMZEG00005027230) phf8 (ENSMZEG00005027233) WNK3 (ENSMZEG00005027234) fam3a (ENSMZEG00005027235) idh3g (ENSMZEG00005027236) AVPR2 (ENSMZEG00005027237) ssr4 (ENSMZEG00005027238) arhgap4a (ENSMZEG00005027239) naa10 (ENSMZEG00005027240) zgc:158263 (ENSMZEG00005027242) G6PD (ENSMZEG00005027244) galnt6 (ENSMZEG00005027246) ADCY6 (ENSMZEG00005027249) #21 ENSMZEG00005027254 #22 rnd1b (ENSMZEG00005000231) #24 dtx3 (ENSMZEG00005000276) ptges3a (ENSMZEG00005000280) mipa (ENSMZEG00005000282) stat6 (ENSMZEG00005000290) FIGNL2 (ENSMZEG00005000300) ENSMZEG00005000325 SCN8A (ENSMZEG00005000344) ENSMZEG00005000454 ENSMZEG00005000467 dip2ba (ENSMZEG00005001697) atf7a (ENSMZEG00005001761) asb8 (ENSMZEG00005001796) LARP4 (ENSMZEG00005001813) pfkma (ENSMZEG00005001836) Eastern happy MODERN SPECIES 12 l1cama (ENSACLG00000004611) HUWE1 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ENSGT00940000154409.eb.a Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A.g ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000154578.A.d ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT01060000248949 ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A.g ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d Orange clownfish MODERN SPECIES 22 l1cama (ENSAPEG00000001589) HUWE1 (ENSAPEG00000000881) phf8 (ENSAPEG00000000698) ENSAPEG00000000640 ENSAPEG00000000575 fam3a (ENSAPEG00000000539) idh3g (ENSAPEG00000000489) AVPR2 (ENSAPEG00000000467) ssr4 (ENSAPEG00000000443) arhgap4a (ENSAPEG00000000299) naa10 (ENSAPEG00000022239) zgc:158263 (ENSAPEG00000022216) G6PD (ENSAPEG00000022195) galnt6 (ENSAPEG00000022172) ADCY6 (ENSAPEG00000022104) #21 CACNB3 (ENSAPEG00000021951) #22 rnd1b (ENSAPEG00000021925) #24 ENSAPEG00000021915 dtx3 (ENSAPEG00000021909) ptges3a (ENSAPEG00000021897) mipa (ENSAPEG00000021881) pik3cd (ENSAPEG00000021824) tmem201 (ENSAPEG00000021802) foxl2l (ENSAPEG00000021793) her9 (ENSAPEG00000021780) ENSAPEG00000021743 ENSAPEG00000021691 KLHL17 (ENSAPEG00000021636) noc2l (ENSAPEG00000021569) SAMD11 (ENSAPEG00000021490) ENSAPEG00000021472 Clown anemonefish MODERN SPECIES 1575 l1cama (ENSAOCG00000009751) ENSAOCG00000009673 HUWE1 (ENSAOCG00000000593) phf8 (ENSAOCG00000002387) ENSAOCG00000000571 fam3a (ENSAOCG00000009383) idh3g (ENSAOCG00000002531) AVPR2 (ENSAOCG00000009354) ssr4 (ENSAOCG00000009309) arhgap4a (ENSAOCG00000009278) naa10 (ENSAOCG00000009245) zgc:158263 (ENSAOCG00000009194) G6PD (ENSAOCG00000009123) galnt6 (ENSAOCG00000009073) ADCY6 (ENSAOCG00000009049) #21 CACNB3 (ENSAOCG00000008945) #22 rnd1b (ENSAOCG00000008749) #24 ENSAOCG00000008722 dtx3 (ENSAOCG00000008710) ptges3a (ENSAOCG00000008702) mipa (ENSAOCG00000008686) Spiny chromis MODERN SPECIES 629 G6PD (ENSAPOG00000006982) galnt6 (ENSAPOG00000006925) ADCY6 (ENSAPOG00000006883) #21 CACNB3 (ENSAPOG00000006785) #22 rnd1b (ENSAPOG00000006342) #24 ENSAPOG00000006307 dtx3 (ENSAPOG00000006281) ptges3a 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Fugu DUPLICATION Fugu MODERN SPECIES 15 l1cama (ENSTRUG00000014373) HUWE1 (ENSTRUG00000014610) phf8 (ENSTRUG00000014867) ENSTRUG00000020630 fam3a (ENSTRUG00000015047) idh3g (ENSTRUG00000015080) ssr4 (ENSTRUG00000015280) arhgap4a (ENSTRUG00000015312) naa10 (ENSTRUG00000015343) zgc:158263 (ENSTRUG00000023337) G6PD (ENSTRUG00000015385) galnt6 (ENSTRUG00000015420) CACNB3 (ENSTRUG00000015617) #22 ENSTRUG00000033127 ADCY6 (ENSTRUG00000015455) #21 CACNB3 (ENSTRUG00000000500) #22 rnd1b (ENSTRUG00000028801) #24 ENSTRUG00000025546 dtx3 (ENSTRUG00000015669) ptges3a (ENSTRUG00000015676) mipa (ENSTRUG00000027356) stat6 (ENSTRUG00000015703) FIGNL2 (ENSTRUG00000015713) ENSTRUG00000030086 SCN8A (ENSTRUG00000015715) dip2ba (ENSTRUG00000015870) atf7a (ENSTRUG00000015923) ENSTRUG00000015939 ENSTRUG00000021701 def6a (ENSTRUG00000016125) ppardb (ENSTRUG00000016146) Fugu MODERN SPECIES 15 cacna1sb (ENSTRUG00000029231) smc1al (ENSTRUG00000014137) ribc1 (ENSTRUG00000014325) l1cama (ENSTRUG00000014373) HUWE1 (ENSTRUG00000014610) phf8 (ENSTRUG00000014867) ENSTRUG00000020630 fam3a (ENSTRUG00000015047) idh3g (ENSTRUG00000015080) ssr4 (ENSTRUG00000015280) arhgap4a (ENSTRUG00000015312) naa10 (ENSTRUG00000015343) zgc:158263 (ENSTRUG00000023337) G6PD (ENSTRUG00000015385) galnt6 (ENSTRUG00000015420) CACNB3 (ENSTRUG00000015617) #22 ENSTRUG00000033127 ADCY6 (ENSTRUG00000015455) #21 CACNB3 (ENSTRUG00000000500) #22 rnd1b (ENSTRUG00000028801) #24 ENSTRUG00000025546 dtx3 (ENSTRUG00000015669) ptges3a (ENSTRUG00000015676) mipa (ENSTRUG00000027356) stat6 (ENSTRUG00000015703) FIGNL2 (ENSTRUG00000015713) ENSTRUG00000030086 SCN8A (ENSTRUG00000015715) dip2ba (ENSTRUG00000015870) atf7a (ENSTRUG00000015923) ENSTRUG00000015939 Tetraodon MODERN SPECIES 24 l1cama (ENSTNIG00000015084) HUWE1 (ENSTNIG00000015085) ENSTNIG00000001095 phf8 (ENSTNIG00000015086) WNK3 (ENSTNIG00000015087) fam3a (ENSTNIG00000015088) idh3g (ENSTNIG00000015089) AVPR2 (ENSTNIG00000015090) ssr4 (ENSTNIG00000015091) arhgap4a (ENSTNIG00000015092) naa10 (ENSTNIG00000015093) zgc:158263 (ENSTNIG00000015094) G6PD (ENSTNIG00000015095) galnt6 (ENSTNIG00000015096) ADCY6 (ENSTNIG00000015097) #21 CACNB3 (ENSTNIG00000015098) #22 rnd1b (ENSTNIG00000015099) #24 dtx3 (ENSTNIG00000015100) ptges3a (ENSTNIG00000015101) mipa (ENSTNIG00000015102) stat6 (ENSTNIG00000015103) FIGNL2 (ENSTNIG00000015104) SCN8A (ENSTNIG00000015105) dip2ba (ENSTNIG00000015106) atf7a (ENSTNIG00000015107) asb8 (ENSTNIG00000015108) ENSTNIG00000015109 pfkma (ENSTNIG00000015110) def6a (ENSTNIG00000015111) ppardb (ENSTNIG00000015112) ENSTNIG00000001133 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000169526.a ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT00940000156263.k ENSGT00950000183290 ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000169526.a ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT00940000156263.k ENSGT00950000183290 ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000154578.A.d ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT00940000156263.k ENSGT00950000183290 ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000154578.A.d ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT00940000156263.k ENSGT00950000183290 ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a Large yellow croaker MODERN SPECIES 487 ribc1 (ENSLCRG00005006661) l1cama (ENSLCRG00005006668) HUWE1 (ENSLCRG00005007025) phf8 (ENSLCRG00005007102) ENSLCRG00005007118 fam3a (ENSLCRG00005007122) idh3g (ENSLCRG00005007128) AVPR2 (ENSLCRG00005007133) ssr4 (ENSLCRG00005007134) arhgap4a (ENSLCRG00005007135) naa10 (ENSLCRG00005007137) 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(ENSDLAG00005032563) ptges3a (ENSDLAG00005032503) mipa (ENSDLAG00005025616) ENSDLAG00005035116 stat6 (ENSDLAG00005023192) ENSDLAG00005023318 ENSDLAG00005023324 ENSDLAG00005023343 ENSDLAG00005030218 ENSDLAG00005023671 dip2ba (ENSDLAG00005001514) atf7a (ENSDLAG00005004486) asb8 (ENSDLAG00005031286) Gilthead seabream MODERN SPECIES 21 smc1al (ENSSAUG00010020123) ribc1 (ENSSAUG00010020173) l1cama (ENSSAUG00010020181) phf8 (ENSSAUG00010021826) ENSSAUG00010021896 fam3a (ENSSAUG00010021897) idh3g (ENSSAUG00010021899) AVPR2 (ENSSAUG00010021979) ssr4 (ENSSAUG00010021995) arhgap4a (ENSSAUG00010021999) naa10 (ENSSAUG00010022003) zgc:158263 (ENSSAUG00010022010) G6PD (ENSSAUG00010022016) galnt6 (ENSSAUG00010022026) ADCY6 (ENSSAUG00010022037) #21 CACNB3 (ENSSAUG00010022151) #22 rnd1b (ENSSAUG00010022163) #24 ENSSAUG00010022166 dtx3 (ENSSAUG00010022167) ptges3a (ENSSAUG00010022168) mipa (ENSSAUG00010022169) stat6 (ENSSAUG00010022172) FIGNL2 (ENSSAUG00010022180) ENSSAUG00010022181 ENSSAUG00010022198 ENSSAUG00010022966 dip2ba (ENSSAUG00010023031) atf7a (ENSSAUG00010025145) asb8 (ENSSAUG00010025148) LARP4 (ENSSAUG00010025150) pfkma (ENSSAUG00010025172) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000169526.a ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT00940000156263.k ENSGT00950000183290 ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000169526.a ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a ENSGT00940000155440.c.b Stickleback MODERN SPECIES 11 l1cama (ENSGACG00000008823) HUWE1 (ENSGACG00000008789) phf8 (ENSGACG00000008770) WNK3 (ENSGACG00000008755) fam3a (ENSGACG00000008732) idh3g (ENSGACG00000008709) AVPR2 (ENSGACG00000008681) ssr4 (ENSGACG00000008662) ENSGACG00000008657 arhgap4a (ENSGACG00000008645) naa10 (ENSGACG00000008630) zgc:158263 (ENSGACG00000008620) G6PD (ENSGACG00000008614) galnt6 (ENSGACG00000008590) ADCY6 (ENSGACG00000008575) #21 CACNB3 (ENSGACG00000008568) #22 rnd1b (ENSGACG00000008549) #24 dtx3 (ENSGACG00000008546) ptges3a (ENSGACG00000008508) mipa (ENSGACG00000008484) stat6 (ENSGACG00000008477) FIGNL2 (ENSGACG00000008474) ENSGACG00000008449 ENSGACG00000008441 dip2ba (ENSGACG00000008427) atf7a (ENSGACG00000008417) asb8 (ENSGACG00000008406) LARP4 (ENSGACG00000008381) pfkma (ENSGACG00000008357) ENSGACG00000008347 def6a (ENSGACG00000008311) Lumpfish MODERN SPECIES 22 HUWE1 (ENSCLMG00005003600) phf8 (ENSCLMG00005003573) ENSCLMG00005003561 ENSCLMG00005003559 ENSCLMG00005003556 fam3a (ENSCLMG00005003552) idh3g (ENSCLMG00005003051) AVPR2 (ENSCLMG00005002933) ssr4 (ENSCLMG00005002887) arhgap4a (ENSCLMG00005022292) naa10 (ENSCLMG00005022291) zgc:158263 (ENSCLMG00005022290) G6PD (ENSCLMG00005022284) galnt6 (ENSCLMG00005022283) ADCY6 (ENSCLMG00005022096) #21 CACNB3 (ENSCLMG00005021969) #22 rnd1b (ENSCLMG00005021967) #24 ENSCLMG00005021966 dtx3 (ENSCLMG00005021965) ptges3a (ENSCLMG00005021963) mipa (ENSCLMG00005021961) stat6 (ENSCLMG00005021957) FIGNL2 (ENSCLMG00005021953) ENSCLMG00005021951 SCN8A (ENSCLMG00005021937) ENSCLMG00005021932 dip2ba (ENSCLMG00005015557) atf7a (ENSCLMG00005015504) asb8 (ENSCLMG00005015503) LARP4 (ENSCLMG00005015498) pfkma (ENSCLMG00005015492) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000169526.a ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT00940000156263.k ENSGT00950000183290 ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a Channel bull blenny MODERN SPECIES 21 ribc1 (ENSCGOG00000012397) l1cama (ENSCGOG00000012422) HUWE1 (ENSCGOG00000013257) phf8 (ENSCGOG00000013396) ENSCGOG00000013877 fam3a (ENSCGOG00000013885) idh3g (ENSCGOG00000013894) AVPR2 (ENSCGOG00000013937) ssr4 (ENSCGOG00000013970) arhgap4a (ENSCGOG00000013984) naa10 (ENSCGOG00000013995) zgc:158263 (ENSCGOG00000014220) G6PD (ENSCGOG00000014249) galnt6 (ENSCGOG00000014885) ADCY6 (ENSCGOG00000014938) #21 CACNB3 (ENSCGOG00000016326) #22 rnd1b (ENSCGOG00000016494) #24 ENSCGOG00000016506 dtx3 (ENSCGOG00000016509) ptges3a (ENSCGOG00000016513) mipa (ENSCGOG00000016516) stat6 (ENSCGOG00000016536) ENSCGOG00000016566 ENSCGOG00000016574 SCN8A (ENSCGOG00000016731) ENSCGOG00000020935 ENSCGOG00000020937 dip2ba (ENSCGOG00000021001) atf7a (ENSCGOG00000022817) asb8 (ENSCGOG00000022819) LARP4 (ENSCGOG00000022825) Pike perch MODERN SPECIES 111 cacna1sb (ENSSLUG00000002284) smc1al (ENSSLUG00000002937) ribc1 (ENSSLUG00000008154) l1cama (ENSSLUG00000008276) phf8 (ENSSLUG00000011161) ENSSLUG00000011195 fam3a (ENSSLUG00000011205) idh3g (ENSSLUG00000011296) AVPR2 (ENSSLUG00000012485) ssr4 (ENSSLUG00000012492) naa10 (ENSSLUG00000012513) zgc:158263 (ENSSLUG00000012544) G6PD (ENSSLUG00000012638) galnt6 (ENSSLUG00000012809) ADCY6 (ENSSLUG00000012939) #21 CACNB3 (ENSSLUG00000014290) #22 rnd1b (ENSSLUG00000014310) #24 ENSSLUG00000014318 dtx3 (ENSSLUG00000014325) ptges3a (ENSSLUG00000014339) mipa (ENSSLUG00000014342) stat6 (ENSSLUG00000014360) FIGNL2 (ENSSLUG00000014393) SCN8A (ENSSLUG00000014786) ENSSLUG00000021202 ENSSLUG00000021209 dip2ba (ENSSLUG00000021314) atf7a (ENSSLUG00000022008) asb8 (ENSSLUG00000022012) LARP4 (ENSSLUG00000022026) pfkma (ENSSLUG00000022146) Ballan wrasse MODERN SPECIES 302 zgc:158263 (ENSLBEG00000012941) G6PD (ENSLBEG00000013007) galnt6 (ENSLBEG00000013081) ADCY6 (ENSLBEG00000013180) #21 ENSLBEG00000013400 #22 rnd1b (ENSLBEG00000013432) #24 ENSLBEG00000013472 dtx3 (ENSLBEG00000013502) ptges3a (ENSLBEG00000013539) mipa (ENSLBEG00000013589) stat6 (ENSLBEG00000013768) FIGNL2 (ENSLBEG00000013809) ENSLBEG00000013822 SCN8A (ENSLBEG00000013868) ENSLBEG00000013940 dip2ba (ENSLBEG00000014189) atf7a (ENSLBEG00000014449) ENSLBEG00000014481 asb8 (ENSLBEG00000014503) LARP4 (ENSLBEG00000014537) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000169526 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT00950000183290 ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000154578.A.d ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00950000183290 ENSGT00940000170524 ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a Zig-zag eel MODERN SPECIES 21 ribc1 (ENSMAMG00000006002) ENSMAMG00000005964 HUWE1 (ENSMAMG00000005766) ENSMAMG00000005572 ENSMAMG00000005507 fam3a (ENSMAMG00000005488) idh3g (ENSMAMG00000005461) AVPR2 (ENSMAMG00000005420) ENSMAMG00000004545 arhgap4a (ENSMAMG00000004425) NAA10 (ENSMAMG00000004390) zgc:158263 (ENSMAMG00000004352) ENSMAMG00000024746 galnt6 (ENSMAMG00000004300) ENSMAMG00000004146 #21 ENSMAMG00000004086 #22 rnd1b (ENSMAMG00000004070) #24 ENSMAMG00000026072 ENSMAMG00000028514 dtx3 (ENSMAMG00000004032) ptges3a (ENSMAMG00000004005) mipa (ENSMAMG00000003696) stat6 (ENSMAMG00000003596) ENSMAMG00000027371 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000154578.A.d ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00950000183290 ENSGT00940000170524 ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a Climbing perch MODERN SPECIES 20 ENSATEG00000021761 ribc1 (ENSATEG00000021740) ENSATEG00000021665 HUWE1 (ENSATEG00000021573) ENSATEG00000021514 WNK3 (ENSATEG00000021469) fam3a (ENSATEG00000021448) idh3g (ENSATEG00000021436) ENSATEG00000021411 ENSATEG00000021404 arhgap4a (ENSATEG00000021383) zgc:158263 (ENSATEG00000021345) ENSATEG00000021326 galnt6 (ENSATEG00000021315) ENSATEG00000021204 #21 ENSATEG00000021180 #22 rnd1b (ENSATEG00000025823) #24 ENSATEG00000026241 dtx3 (ENSATEG00000021146) ptges3a (ENSATEG00000021136) mipa (ENSATEG00000021018) stat6 (ENSATEG00000020969) ENSATEG00000026780 ENSATEG00000020946 ENSATEG00000027582 ENSATEG00000020885 ENSATEG00000020867 dip2ba (ENSATEG00000020804) atf7a (ENSATEG00000020751) asb8 (ENSATEG00000026798) ENSATEG00000020715 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000169526 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT00950000183290 ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000162777 ENSGT00940000162430 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000169526 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT00950000183290 ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000162430 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a Barramundi perch MODERN SPECIES 102 ribc1 (ENSLCAG00010020571) l1cama (ENSLCAG00010020538) HUWE1 (ENSLCAG00010019441) phf8 (ENSLCAG00010019206) ENSLCAG00010019187 fam3a (ENSLCAG00010019177) idh3g (ENSLCAG00010019172) AVPR2 (ENSLCAG00010019162) ssr4 (ENSLCAG00010019155) arhgap4a (ENSLCAG00010019139) naa10 (ENSLCAG00010019126) zgc:158263 (ENSLCAG00010019112) G6PD (ENSLCAG00010019073) galnt6 (ENSLCAG00010019052) ADCY6 (ENSLCAG00010018483) #21 CACNB3 (ENSLCAG00010018362) #22 rnd1b (ENSLCAG00010018360) #24 ENSLCAG00010018359 dtx3 (ENSLCAG00010018357) ptges3a (ENSLCAG00010018353) mipa (ENSLCAG00010018348) stat6 (ENSLCAG00010018342) FIGNL2 (ENSLCAG00010018331) ENSLCAG00010018329 ENSLCAG00010018327 SCN8A (ENSLCAG00010012545) ENSLCAG00010011169 dip2ba (ENSLCAG00010008981) atf7a (ENSLCAG00010008539) asb8 (ENSLCAG00010008530) LARP4 (ENSLCAG00010008525) Seriola ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000169526 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT00950000183290 ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000162430 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3155 ribc1 (ENSSLDG00000009524) l1cama (ENSSLDG00000009298) HUWE1 (ENSSLDG00000008966) phf8 (ENSSLDG00000008836) ENSSLDG00000008760 fam3a (ENSSLDG00000008712) idh3g (ENSSLDG00000008676) AVPR2 (ENSSLDG00000008621) ssr4 (ENSSLDG00000008589) arhgap4a (ENSSLDG00000008556) naa10 (ENSSLDG00000008517) zgc:158263 (ENSSLDG00000008428) G6PD (ENSSLDG00000008374) galnt6 (ENSSLDG00000008345) ADCY6 (ENSSLDG00000008229) #21 CACNB3 (ENSSLDG00000006055) #22 rnd1b (ENSSLDG00000005460) #24 ENSSLDG00000005449 dtx3 (ENSSLDG00000005439) ptges3a (ENSSLDG00000005403) mipa (ENSSLDG00000005389) stat6 (ENSSLDG00000005356) FIGNL2 (ENSSLDG00000005337) ENSSLDG00000005327 SCN8A (ENSSLDG00000005220) ENSSLDG00000005176 dip2ba (ENSSLDG00000005115) ENSSLDG00000005077 atf7a (ENSSLDG00000005028) asb8 (ENSSLDG00000004994) ENSSLDG00000004942 Greater amberjack MODERN SPECIES 23 ENSSDUG00000011690 ENSSDUG00000011683 fam3a (ENSSDUG00000011643) idh3g (ENSSDUG00000011616) AVPR2 (ENSSDUG00000011606) ssr4 (ENSSDUG00000011578) arhgap4a (ENSSDUG00000011553) naa10 (ENSSDUG00000011526) zgc:158263 (ENSSDUG00000011498) G6PD (ENSSDUG00000011472) ENSSDUG00000011458 galnt6 (ENSSDUG00000011446) G6PD (ENSSDUG00000011387) galnt6 (ENSSDUG00000011358) ADCY6 (ENSSDUG00000011320) #21 CACNB3 (ENSSDUG00000011285) #22 rnd1b (ENSSDUG00000011263) #24 ENSSDUG00000011251 dtx3 (ENSSDUG00000011239) ptges3a (ENSSDUG00000011203) mipa (ENSSDUG00000011093) stat6 (ENSSDUG00000011054) FIGNL2 (ENSSDUG00000011041) ENSSDUG00000011028 ENSSDUG00000011020 SCN8A (ENSSDUG00000010971) ENSSDUG00000010896 dip2ba (ENSSDUG00000010745) atf7a (ENSSDUG00000010687) asb8 (ENSSDUG00000010667) LARP4 (ENSSDUG00000010621) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a #24 ENSGT00940000169526 ENSGT00940000161404 ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971 ENSGT00940000170524 ENSGT00950000183290 ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000162777 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a ENSGT00940000159366 ENSGT00940000154409.eb.a Tongue sole MODERN SPECIES 1 ribc1 (ENSCSEG00000001548) l1cama (ENSCSEG00000001510) HUWE1 (ENSCSEG00000001466) phf8 (ENSCSEG00000001447) ENSCSEG00000001437 ENSCSEG00000001434 fam3a (ENSCSEG00000001428) idh3g (ENSCSEG00000001409) AVPR2 (ENSCSEG00000001404) ssr4 (ENSCSEG00000001399) arhgap4a (ENSCSEG00000001389) naa10 (ENSCSEG00000001327) zgc:158263 (ENSCSEG00000001313) galnt6 (ENSCSEG00000001291) ADCY6 (ENSCSEG00000001277) #21 CACNB3 (ENSCSEG00000001270) #22 rnd1b (ENSCSEG00000001268) #24 dtx3 (ENSCSEG00000001255) ptges3a (ENSCSEG00000001251) fam50a (ENSCSEG00000001241) ENSCSEG00000001240 ENSCSEG00000001235 ARHGAP4 (ENSCSEG00000001164) zgc:103759 (ENSCSEG00000001153) gss (ENSCSEG00000001125) tbpl1 (ENSCSEG00000001115) TCTE1 (ENSCSEG00000001107) pim1 (ENSCSEG00000001104) ENSCSEG00000001096 ENSCSEG00000001090 ENSCSEG00000001085 Turbot MODERN SPECIES 2 HUWE1 (ENSSMAG00000001712) ENSSMAG00000001577 ENSSMAG00000022001 ENSSMAG00000001536 ENSSMAG00000024916 fam3a (ENSSMAG00000001510) idh3g (ENSSMAG00000001478) AVPR2 (ENSSMAG00000001459) ENSSMAG00000001448 arhgap4a (ENSSMAG00000001421) NAA10 (ENSSMAG00000001400) zgc:158263 (ENSSMAG00000001327) ENSSMAG00000001281 galnt6 (ENSSMAG00000001232) ENSSMAG00000001128 #21 ENSSMAG00000001088 #22 rnd1b (ENSSMAG00000001076) #24 ENSSMAG00000001061 dtx3 (ENSSMAG00000001056) ptges3a (ENSSMAG00000001022) mipa (ENSSMAG00000027989) stat6 (ENSSMAG00000019671) ENSSMAG00000029304 ENSSMAG00000019660 ENSSMAG00000019657 ENSSMAG00000019612 ENSSMAG00000019581 dip2ba (ENSSMAG00000019523) atf7a (ENSSMAG00000019511) asb8 (ENSSMAG00000019500) ENSSMAG00000019473 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00950000182989.D.a.a.a ENSGT00390000008992 ENSGT01050000244882.b.c.b.a ENSGT00950000182824.a.b.b.c ENSGT00550000074803 ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00940000155687.e.b #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666.a.a.a #24 ENSGT00940000169526 ENSGT00940000161404 ENSGT00440000033468.k.b ENSGT00940000154256.`c ENSGT00940000156260.d ENSGT00940000170524 ENSGT00950000183290 ENSGT01060000248949 ENSGT00960000186993 ENSGT00940000156263.k ENSGT00940000165418 ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000155261.a.a Northern pike MODERN SPECIES 11 ribc1 (ENSELUG00000009494) l1cama (ENSELUG00000009638) HUWE1 (ENSELUG00000001062) phf8 (ENSELUG00000009858) ENSELUG00000029155 fam3a (ENSELUG00000009930) idh3g (ENSELUG00000009956) ssr4 (ENSELUG00000009981) AVPR2 (ENSELUG00000010021) arhgap4a (ENSELUG00000010080) naa10 (ENSELUG00000010216) zgc:158263 (ENSELUG00000010288) G6PD (ENSELUG00000010323) galnt6 (ENSELUG00000010359) ADCY6 (ENSELUG00000010417) #21 CACNB3 (ENSELUG00000010451) #22 rnd1b (ENSELUG00000010473) #24 dtx3 (ENSELUG00000010505) naca (ENSELUG00000010591) ptges3a (ENSELUG00000010660) mipa (ENSELUG00000010678) stat6 (ENSELUG00000010770) FIGNL2 (ENSELUG00000028965) ENSELUG00000010837 ENSELUG00000010863 ENSELUG00000010904 ENSELUG00000010953 dip2ba (ENSELUG00000011023) atf7a (ENSELUG00000011058) asb8 (ENSELUG00000034312) ENSELUG00000000395 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.a.a.m #22 Huchen MODERN SPECIES 3864 ENSHHUG00000043942 ENSHHUG00000043946 ENSHHUG00000043962 ENSHHUG00000043971 ENSHHUG00000043979 #22 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000155614.g ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e.c ENSGT00940000156319.db.a ENSGT00940000157847.s.a ENSGT00940000160145.a.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b.f ENSGT00950000182989.D.a.a.a.c ENSGT00390000008992.p ENSGT01050000244882.b.c.b.a.d ENSGT00950000182824.a.b.b.c.c ENSGT00550000074803.a.b ENSGT00940000167208.d ENSGT00940000166246.A.m.b ENSGT00940000155687.e.b.l #21 ENSGT00950000182837.b.a.a.n.a #22 ENSGT00940000158666.a.a.a.b #24 ENSGT00940000169526 ENSGT00940000161404.b ENSGT00440000033468.l ENSGT00940000154256.`c.d ENSGT00940000156260.d.c ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971.q.a ENSGT00960000186993.b ENSGT00940000170524.a ENSGT01060000248949 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ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e.c ENSGT00940000156319.db.a ENSGT00940000157847.s.a ENSGT00940000160145.a.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b.f ENSGT00950000182989.D.a.a.a.c ENSGT00390000008992.p ENSGT01050000244882.b.c.b.a.d ENSGT00950000182824.a.b.b.c.c ENSGT00550000074803.a.b ENSGT00940000167208.d ENSGT00940000166246.A.m.b ENSGT00940000155687.e.b.l #21 ENSGT00950000182837.b.a.a.n.a #22 ENSGT00940000158666.a.a.a.b #24 ENSGT00940000169526 ENSGT00940000161404.b ENSGT00440000033468.l ENSGT00940000154256.ac.d ENSGT00940000154256.`c.d ENSGT00940000156260.d.c ENSGT01080000257420.C.b.a ENSGT00940000161971.q.a ENSGT00940000170524.a ENSGT00940000156263.k.b ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b.h.a ENSGT00940000155261.a.a.c ENSGT00940000159366.e ENSGT00940000154409.eb.a.c Atlantic salmon MODERN SPECIES 4 ENSSSAG00000089762 ENSSSAG00000051542 idh3g (ENSSSAG00000051336) SSRD (ENSSSAG00000050861) ENSSSAG00000119143 ENSSSAG00000087001 ENSSSAG00000050815 ENSSSAG00000050780 zgc:158263 (ENSSSAG00000050770) ENSSSAG00000098866 galnt6 (ENSSSAG00000049562) ADCY6 (ENSSSAG00000040777) #21 ENSSSAG00000095598 ENSSSAG00000103771 ENSSSAG00000090459 ENSSSAG00000039238 #22 RND1 (ENSSSAG00000115763) #24 ENSSSAG00000039025 dtx3 (ENSSSAG00000038822) ENSSSAG00000110049 TEBP (ENSSSAG00000080677) ENSSSAG00000105200 stat6 (ENSSSAG00000080589) ENSSSAG00000090857 ENSSSAG00000118469 ENSSSAG00000083080 ENSSSAG00000086821 dip2ba (ENSSSAG00000109064) atf7a (ENSSSAG00000074545) ASB8 (ENSSSAG00000074543) ENSSSAG00000074534 River trout MODERN SPECIES 23 smc1al (ENSSTUG00000041015) ribc1 (ENSSTUG00000040906) l1cama (ENSSTUG00000040268) HUWE1 (ENSSTUG00000039268) phf8 (ENSSTUG00000039017) ENSSTUG00000038979 fam3a (ENSSTUG00000038966) idh3g (ENSSTUG00000038791) ssr4 (ENSSTUG00000038710) ENSSTUG00000038695 arhgap4a (ENSSTUG00000038682) naa10 (ENSSTUG00000038639) zgc:158263 (ENSSTUG00000038594) galnt6 (ENSSTUG00000037954) ADCY6 (ENSSTUG00000036121) #21 CACNB3 (ENSSTUG00000036026) #22 rnd1b (ENSSTUG00000036020) #24 ENSSTUG00000036016 dtx3 (ENSSTUG00000035988) ptges3a (ENSSTUG00000035965) mipa (ENSSTUG00000035954) stat6 (ENSSTUG00000035341) FIGNL2 (ENSSTUG00000035309) ENSSTUG00000035298 SCN8A (ENSSTUG00000033206) dip2ba (ENSSTUG00000027970) atf7a (ENSSTUG00000027744) asb8 (ENSSTUG00000027732) ENSSTUG00000027689 pfkma (ENSSTUG00000018386) ENSSTUG00000048192 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155614.g ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000157506.e.c ENSGT00940000156319.db.a ENSGT00940000157847.s.a ENSGT00940000160145.a.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b.f ENSGT00950000182989.D.a.a.a.c ENSGT00390000008992.p ENSGT01050000244882.b.c.b.a.d ENSGT00950000182824.a.b.b.c.c ENSGT00550000074803.a.b ENSGT00940000167208.d ENSGT00940000166246.A.m.b ENSGT00940000155687.e.b.l #21 ENSGT00950000182837.b.a.a.n.a #22 ENSGT00940000158666.a.a.a.b #24 ENSGT00940000169526 ENSGT00940000161404.b ENSGT00440000033468.l ENSGT00940000154256.`c.d ENSGT00940000156260.d.c ENSGT01080000257420.C.b.a 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ENSGT00940000154409.eb.a.c Chinook salmon MODERN SPECIES 14 cacna1sb (ENSOTSG00005045984) smc1al (ENSOTSG00005045879) ribc1 (ENSOTSG00005045876) l1cama (ENSOTSG00005045875) phf8 (ENSOTSG00005045830) ENSOTSG00005045829 fam3a (ENSOTSG00005045828) idh3g (ENSOTSG00005045780) ssr4 (ENSOTSG00005045778) AVPR2 (ENSOTSG00005045777) arhgap4a (ENSOTSG00005045776) naa10 (ENSOTSG00005045775) zgc:158263 (ENSOTSG00005045774) galnt6 (ENSOTSG00005045621) ADCY6 (ENSOTSG00005045259) #21 CACNB3 (ENSOTSG00005045256) #22 rnd1b (ENSOTSG00005045255) #24 ENSOTSG00005045254 dtx3 (ENSOTSG00005045252) ENSOTSG00005045251 ptges3a (ENSOTSG00005045250) mipa (ENSOTSG00005045249) ENSOTSG00005045248 stat6 (ENSOTSG00005045246) FIGNL2 (ENSOTSG00005045245) ENSOTSG00005045244 SCN8A (ENSOTSG00005045197) dip2ba (ENSOTSG00005044982) atf7a (ENSOTSG00005044950) asb8 (ENSOTSG00005044949) ENSOTSG00005044948 Coho salmon MODERN SPECIES 16 ribc1 (ENSOKIG00005022440) l1cama (ENSOKIG00005022257) HUWE1 (ENSOKIG00005021459) phf8 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(ENSHHUG00000044781) pfkma (ENSHHUG00000044677) ENSHHUG00000044668 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 525 ENSGT00940000155614.h ENSGT00940000157506.e.d ENSGT00940000156319.db.b ENSGT00940000157847.s.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b.e ENSGT00950000182989.D.a.a.a.d ENSGT00390000008992.o ENSGT01050000244882.b.c.b.a.c ENSGT00950000182824.a.b.b.c.d ENSGT00550000074803.a.a ENSGT00940000167208.c ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A.m.a ENSGT00940000155687.e.b.k #21 ENSGT00950000182837.b.a.a.n.b #22 Huchen DUPLICATION Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 11017 ENSHHUG00000012160 #22 Huchen MODERN SPECIES 11085 ENSHHUG00000012994 #22 Huchen MODERN SPECIES 1918 ENSHHUG00000007135 #22 rnd1b (ENSHHUG00000007128) #24 dtx3 (ENSHHUG00000007102) ENSHHUG00000006911 mipa (ENSHHUG00000006855) ENSHHUG00000006849 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000155614.h ENSGT00940000157506.e.d ENSGT00940000156319.db.b ENSGT00940000157847.s.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b.e ENSGT00950000182989.D.a.a.a.d ENSGT00390000008992.o ENSGT01050000244882.b.c.b.a.c ENSGT00950000182824.a.b.b.c.d ENSGT00550000074803.a.a ENSGT00940000167208.c ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A.m.a ENSGT00940000155687.e.b.k #21 ENSGT00950000182837.b.a.a.n.b #22 ENSGT00940000158666.a.a.a.a #24 ENSGT00940000161404.a ENSGT00440000033468.k.b ENSGT00940000154256.`c.c ENSGT00940000156260.d.d ENSGT00940000161971.q.b ENSGT00940000170524.b ENSGT00940000156263.k.a ENSGT00940000165418 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b.h.b ENSGT00940000155261.a.a.d ENSGT00940000159366.f ENSGT01010000230234 ENSGT00940000156009.A.d.t ENSGT00940000154409.eb.a.d Salmo ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000155614.h ENSGT00940000157506.e.d ENSGT00940000156319.db.b ENSGT00940000157847.s.b ENSGT00940000160145.a.a ENSGT00950000183004.a.a.a.b.e ENSGT00950000182989.D.a.a.a.d ENSGT00390000008992.o ENSGT01050000244882.b.c.b.a.c ENSGT00950000182824.a.b.b.c.d ENSGT00550000074803.a.a 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ENSSTUG00000014092 rnd1b (ENSSTUG00000014087) #24 dtx3 (ENSSTUG00000014047) ENSSTUG00000013925 ptges3a (ENSSTUG00000013905) mipa (ENSSTUG00000013896) ENSSTUG00000013893 ENSSTUG00000013887 ENSSTUG00000013879 SCN8A (ENSSTUG00000013452) ENSSTUG00000013344 ENSSTUG00000013335 dip2ba (ENSSTUG00000007235) atf7a (ENSSTUG00000007055) ENSSTUG00000007045 Atlantic salmon MODERN SPECIES 6 ENSSSAG00000105043 ENSSSAG00000008173 HUWE1 (ENSSSAG00000009738) ENSSSAG00000009854 WNK3 (ENSSSAG00000094744) fam3a (ENSSSAG00000103659) idh3g (ENSSSAG00000010302) ssrd (ENSSSAG00000010584) ENSSSAG00000010725 ENSSSAG00000010799 ENSSSAG00000011256 zgc:158263 (ENSSSAG00000090990) ENSSSAG00000012488 ADCY6 (ENSSSAG00000024733) #21 ENSSSAG00000113151 ENSSSAG00000040958 #22 ENSSSAG00000114035 RND1 (ENSSSAG00000039073) #24 ENSSSAG00000089188 ENSSSAG00000103535 dtx3 (ENSSSAG00000041405) ENSSSAG00000041466 ENSSSAG00000041848 ENSSSAG00000096243 ENSSSAG00000099006 ENSSSAG00000041877 ENSSSAG00000041889 ENSSSAG00000041893 ENSSSAG00000112245 ENSSSAG00000082941 ENSSSAG00000103569 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000155614.h ENSGT00940000157506.e.d ENSGT00940000156319.db.b ENSGT00940000157847.s.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b.e ENSGT00950000182989.D.a.a.a.d ENSGT00390000008992.o ENSGT01050000244882.b.c.b.a.c ENSGT00950000182824.a.b.b.c.d ENSGT00550000074803.a.a ENSGT00940000167208.c ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A.n ENSGT00940000155687.e.b.k #21 ENSGT00950000182837.b.a.a.n.b #22 ENSGT00940000158666.a.a.a.a #24 ENSGT00940000161404.a ENSGT00440000033468.k.b ENSGT00940000154256.`c.c ENSGT00940000156260.d.d ENSGT00940000161971.q.b ENSGT00940000170524.b ENSGT00940000156263.k.a ENSGT00940000165418 ENSGT01060000252728 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.a.b.h.b ENSGT00940000155261.a.a.d ENSGT01010000230234 ENSGT00940000156009.A.d.t ENSGT00940000154409.eb.a.d Rainbow trout MODERN SPECIES 30 ENSOMYG00000015951 ENSOMYG00000064444 ENSOMYG00000016093 idh3g (ENSOMYG00000016155) SSRD (ENSOMYG00000017595) ENSOMYG00000017649 ENSOMYG00000064354 ENSOMYG00000017660 ENSOMYG00000017698 zgc:158263 (ENSOMYG00000018022) ENSOMYG00000018063 galnt6 (ENSOMYG00000018610) ADCY6 (ENSOMYG00000018723) #21 ENSOMYG00000074227 ENSOMYG00000054902 ENSOMYG00000018763 #22 RND1 (ENSOMYG00000059160) #24 ENSOMYG00000066780 dtx3 (ENSOMYG00000018816) ENSOMYG00000018830 tebp (ENSOMYG00000018852) ENSOMYG00000018869 ENSOMYG00000073294 ENSOMYG00000018889 ENSOMYG00000019217 ENSOMYG00000069492 ENSOMYG00000021292 ENSOMYG00000021319 ENSOMYG00000022051 atf7a (ENSOMYG00000028468) ENSOMYG00000028481 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 297 ENSGT00530000063808.a.g ENSGT00950000183006.A.a.b ENSGT00390000016224 ENSGT00530000063435.a.c ENSGT00940000166246.B ENSGT00940000155687.e.a.k #21 ENSGT00950000182837.b.a.b #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000155687.e.a.l #21 ENSGT00950000182837.b.a.a #22 ENSGT00940000158666 #24 ENSGT00390000011466 ENSGT00440000033468 ENSGT00940000154256.ac ENSGT00940000159490 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ENSGT00940000156260.c ENSGT00940000158489.a.a Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT01050000244882.b.c.b.a.a ENSGT00950000182824.a.b.b.c.f ENSGT00940000167208 ENSGT00530000063435.a.a.b ENSGT00940000166246.A ENSGT00390000008992 ENSGT00530000063808.a ENSGT00950000183006.A.a.b ENSGT00950000182824.a.b.b.c.e ENSGT00390000016224 ENSGT00550000074803 ENSGT00530000063435.a.a.a ENSGT00940000166246.B ENSGT00940000177752 ENSGT00940000155687.e.a #21 ENSGT00950000182837.b.a.b #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000160406 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000168127.a.b ENSGT00940000156172.a ENSGT00940000158060 ENSGT01020000230412.B.b.b.b.g.a ENSGT00940000159165 ENSGT00390000008161.a.a.a.b ENSGT00550000075016 ENSGT00390000007796 ENSGT01030000234633.B.b.a ENSGT00940000158138 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a.a Otophysi ANCESTRAL SPECIES 216 ENSGT00940000164714 ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000159233 ENSGT00550000075016 ENSGT00390000008161.a.a.a.b ENSGT00940000159165 ENSGT01020000230412.B.b.b.b.g.a ENSGT00940000158060 ENSGT00940000159731 ENSGT00550000074803 ENSGT00530000063435.a.a.a ENSGT00940000166246.B ENSGT00940000177752 ENSGT00940000155687.e.a #21 ENSGT00950000182837.b.a.b #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000160406 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000168127.a.b ENSGT00940000156172.a ENSGT00390000013764 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164714 ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000159233 ENSGT00550000075016 ENSGT00390000008161.a.a.a.b ENSGT00940000159165 ENSGT01020000230412.B.b.b.b.g.a ENSGT00940000158060 ENSGT00940000159731 ENSGT00550000074803 ENSGT00530000063435.a.a.a ENSGT00940000166246.B ENSGT00940000177752 ENSGT00940000155687.e.a #21 ENSGT00950000182837.b.a.b #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000160406 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00970000193593 ENSGT00940000168127.a.b ENSGT00940000156172.a ENSGT00390000013764 ENSGT00390000017515 ENSGT00940000156358 ENSGT00950000182982.B.c.a ENSGT00940000158762.e ENSGT00390000013839.c.a ENSGT00940000156537 ENSGT00940000163617 ENSGT00490000043329.a.a.a.vb.a Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164714 ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000159233 ENSGT00550000075016 ENSGT00390000008161.a.a.a.b ENSGT00940000159165 ENSGT01020000230412.B.b.b.b.g.a ENSGT00940000158060 ENSGT00940000159731 ENSGT00550000074803 ENSGT00530000063435.a.a.a ENSGT00940000166246.B ENSGT00940000177752 ENSGT00940000155687.e.a #21 ENSGT00950000182837.b.a.b #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000160406 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00970000193593 ENSGT00940000168127.a.b ENSGT00940000156172.a ENSGT00390000013764 ENSGT00390000017515 ENSGT00940000156358 ENSGT00950000182982.B.c.a ENSGT00940000158762.e ENSGT00390000013839.c.a ENSGT00940000156537 ENSGT00940000163617 ENSGT00490000043329.a.a.a.vb.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000177752 ENSGT00940000155687.e.a #21 ENSGT00950000182837.b.a.b #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000160406 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000168127.a.b ENSGT00940000156172.a ENSGT00390000013764 ENSGT00390000017515 ENSGT00940000156358 ENSGT00950000182982.B.c.a ENSGT00940000158762.e ENSGT00390000013839.c.a ENSGT00940000156537 ENSGT00490000043329.a.a.a.vb.a ENSGT00940000154897.q ENSGT00940000164303.b.b Red-bellied piranha MODERN SPECIES 681 ENSPNAG00000018942 ADCY6 (ENSPNAG00000003566) #21 ENSPNAG00000019083 cacnb3a (ENSPNAG00000019154) #22 ddx23 (ENSPNAG00000019203) #23 ENSPNAG00000019209 nkain4 (ENSPNAG00000019233) Mexicana tetra MODERN SPECIES 1075 ENSAMXG00000030287 cacnb3a (ENSAMXG00000017573) #22 ddx23 (ENSAMXG00000017597) #23 birc7 (ENSAMXG00000017607) nkain4 (ENSAMXG00000017613) ENSAMXG00000042890 ENSAMXG00000017622 gss (ENSAMXG00000017625) rps21 (ENSAMXG00000017628) acss2 (ENSAMXG00000040918) Electric eel MODERN SPECIES 327 ENSEEEG00000024565 p4htma (ENSEEEG00000024564) ENSEEEG00000024544 edem2 (ENSEEEG00000024535) prpf6 (ENSEEEG00000024534) SAMD10 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ENSGT00940000156172.a.b ENSGT00390000013764 ENSGT00390000015408.d ENSGT00940000160331.k.a ENSGT00950000182872.f.a.a.a.a.h ENSGT00940000156477.c.a ENSGT00940000164502.a.a.a ENSGT00940000159151.d ENSGT00390000007823 ENSGT00940000160988.o.a ENSGT00530000063759.b.c Common carp reference MODERN SPECIES 11 trim35-39 (ENSCCRG00000004201) ENSCCRG00000004209 edem2 (ENSCCRG00000081877) prpf6 (ENSCCRG00000070854) SAMD10 (ENSCCRG00000060768) ENSCCRG00000065517 ZNF512B (ENSCCRG00000068517) ENSCCRG00000067901 UCKL1 (ENSCCRG00000028016) ENSCCRG00000030018 ENSCCRG00000030009 naa10 (ENSCCRG00000068882) ENSCCRG00000001330 ADCY6 (ENSCCRG00000000942) #21 ENSCCRG00000077737 cacnb3a (ENSCCRG00000028155) #22 ddx23 (ENSCCRG00000028599) #23 nkain4 (ENSCCRG00000003812) ENSCCRG00000069159 ENSCCRG00000008571 gss (ENSCCRG00000008583) exosc10 (ENSCCRG00000008771) ndrg3b (ENSCCRG00000008783) phf20b (ENSCCRG00000011090) ENSCCRG00000025573 sulf2b (ENSCCRG00000056328) ENSCCRG00000078705 eef1a2 (ENSCCRG00000047001) 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ENSGT00940000158060 ENSGT01020000230412.B.b.b.b.h ENSGT00940000159165 ENSGT00390000008161.a.a.a.b ENSGT00550000075016 ENSGT00390000007796 Denticle herring MODERN SPECIES 1 FAM120C (ENSDCDG00000032409) IDH3G (ENSDCDG00000032201) AVPR2 (ENSDCDG00000032179) sephs3 (ENSDCDG00000032176) ENSDCDG00000032170 sat2b (ENSDCDG00000032166) ssr4 (ENSDCDG00000032162) ikbkg (ENSDCDG00000032154) cav4b (ENSDCDG00000032151) ARHGAP4 (ENSDCDG00000031960) zgc:103759 (ENSDCDG00000031919) naa10 (ENSDCDG00000031909) G6PD (ENSDCDG00000031449) ENSDCDG00000031409 ADCY6 (ENSDCDG00000030228) #21 cacnb3a (ENSDCDG00000030140) #22 ddx23 (ENSDCDG00000030100) #23 ENSDCDG00000030092 nkain4 (ENSDCDG00000030089) ENSDCDG00000030087 ENSDCDG00000030086 ZBTB46 (ENSDCDG00000030084) UCKL1 (ENSDCDG00000030026) ZNF512B (ENSDCDG00000030002) SAMD10 (ENSDCDG00000029996) prpf6 (ENSDCDG00000029824) aar2 (ENSDCDG00000029802) ebp (ENSDCDG00000029785) ccdc115 (ENSDCDG00000029779) ENSDCDG00000029778 apobec2b (ENSDCDG00000029776) Atlantic herring MODERN SPECIES 20 hsd17b10 (ENSCHAG00000014502) FAM120C (ENSCHAG00000014277) IDH3G (ENSCHAG00000013003) ENSCHAG00000012954 AVPR2 (ENSCHAG00000012945) sephs3 (ENSCHAG00000012863) ssr4 (ENSCHAG00000012745) ikbkg (ENSCHAG00000012691) cav4b (ENSCHAG00000012685) ARHGAP4 (ENSCHAG00000012336) zgc:103759 (ENSCHAG00000012285) naa10 (ENSCHAG00000011865) G6PD (ENSCHAG00000009740) ENSCHAG00000009446 ADCY6 (ENSCHAG00000005219) #21 cacnb3a (ENSCHAG00000004439) #22 ddx23 (ENSCHAG00000002348) #23 birc7 (ENSCHAG00000002269) nkain4 (ENSCHAG00000002231) mrpl17 (ENSCHAG00000002138) ENSCHAG00000002116 ENSCHAG00000002103 ENSCHAG00000002046 ZBTB46 (ENSCHAG00000002017) UCKL1 (ENSCHAG00000001194) ENSCHAG00000021710 prpf6 (ENSCHAG00000021497) aar2 (ENSCHAG00000021482) ENSCHAG00000021473 ENSCHAG00000021453 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00530000064137.a.a ENSGT00940000159439.a ENSGT00990000205462 ENSGT00940000154129.hd ENSGT00940000159006.c.b ENSGT00390000009446 ENSGT00940000155224.c.b 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5 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00940000154967.a.a.a ENSGT00950000182835.d.a.k.b ENSGT00940000155308.c ENSGT00940000154129.hd ENSGT00940000159006.c.b ENSGT00390000009446 ENSGT00940000155224.c.b ENSGT00390000010463.a.a.a.b ENSGT00940000159780 ENSGT00940000158414 ENSGT00390000003114.e.a.a ENSGT00530000063435.a.a.a ENSGT00940000166246.B ENSGT00940000155687.e.a #21 ENSGT00950000182837.b.a.b #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666.a.b #24 ENSGT00390000011466 ENSGT00440000033468 ENSGT00940000154256.ac ENSGT00940000159490 ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000156260.c ENSGT00940000158489.a.a ENSGT00950000183021.a.b.c ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00940000154897.q ENSGT00940000155532 ENSGT00390000002821 ENSGT00940000161930 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00940000154967.a.a.a ENSGT00950000182835.d.a.k.b ENSGT00940000155308.c ENSGT00940000154129.hd ENSGT00940000159006.c.b ENSGT00390000009446 ENSGT00940000155224.c.b 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ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00940000154967.a.a.a ENSGT00950000182835.d.a.k.b ENSGT00940000155308.c ENSGT00940000154129.hd ENSGT00940000159006.c.b ENSGT00390000009446 ENSGT00940000155224.c.b ENSGT00390000010463.a.a.a.b ENSGT00940000159780 ENSGT00940000158414 ENSGT00390000003114.e.a.a ENSGT00530000063435.a.a.a ENSGT00940000166246.B ENSGT00940000155687.e.a #21 ENSGT00950000182837.b.a.b #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666.a.b #24 ENSGT00390000011466 ENSGT00440000033468 ENSGT00940000154256.ac ENSGT00940000159490 ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000156260.c ENSGT00940000158489.a.a ENSGT00950000183021.a.b.c ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00940000154897.q ENSGT00940000155532 ENSGT00390000002821 ENSGT00940000161930 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00940000154967.a.a.a ENSGT00950000182835.d.a.k.b ENSGT00940000155308.c ENSGT00940000154129.hd ENSGT00940000159006.c.b ENSGT00390000009446 ENSGT00940000155224.c.b 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ENSTNIG00000005292 ENSTNIG00000000463 ENSTNIG00000005296 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154967.a.a.a ENSGT00950000182835.d.a.k.b ENSGT00940000155308.c ENSGT00940000154129.hd ENSGT00940000159006.c.b ENSGT00390000009446 ENSGT00940000155224.c.b ENSGT00390000010463.a.a.a.b ENSGT00940000159780 ENSGT00940000158414 ENSGT00390000003114.e.a.a ENSGT00530000063435.a.a.a ENSGT00940000166246.B ENSGT00940000177752 ENSGT00940000155687.e.a #21 ENSGT00950000182837.b.a.b #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666.a.b #24 ENSGT00390000011466 ENSGT00440000033468 ENSGT00940000154256.ac ENSGT00940000159490 ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000156260.c ENSGT00940000158489.a.a ENSGT00950000183021.a.b.c ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00940000154897.q ENSGT00940000155532 ENSGT00390000002821 ENSGT00940000161930 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154967.a.a.a ENSGT00950000182835.d.a.k.b ENSGT00940000155308.c ENSGT00940000154129.hd ENSGT00940000159006.c.b ENSGT00390000009446 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#22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666.a.b #24 ENSGT00390000011466 ENSGT00440000033468 ENSGT00940000154256.ac ENSGT00940000159490 ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000156260.c ENSGT00940000158489.a.a ENSGT00950000183021.a.b.c ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00940000154897.q ENSGT00940000155532 ENSGT00390000002821 ENSGT00940000161930 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000163310.l ENSGT00940000154967.a.a.a ENSGT00950000182835.d.a.k.b ENSGT00940000155308.c ENSGT00940000154129.hd ENSGT00940000159006.c.b ENSGT00390000009446 ENSGT00940000155224.c.b ENSGT00390000010463.a.a.a.b ENSGT00940000159780 ENSGT00940000158414 ENSGT00390000003114.e.a.a ENSGT00530000063435.a.a.a ENSGT00940000160845 ENSGT00940000155687.e.a #21 ENSGT00950000182837.b.a.b #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666.a.b #24 ENSGT00390000011466 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000163310.l ENSGT00940000154967.a.a.a ENSGT00950000182835.d.a.k.b ENSGT00940000155308.c ENSGT00940000154129.hd ENSGT00940000159006.c.b ENSGT00390000009446 ENSGT00940000155224.c.b ENSGT00390000010463.a.a.a.b ENSGT00940000159780 ENSGT00940000158414 ENSGT00390000003114.e.a.a ENSGT00530000063435.a.a.a ENSGT00940000166246.A.h ENSGT00940000155687.e.a #21 ENSGT00950000182837.b.a.b #22 Clown anemonefish MODERN SPECIES 706 ENSAOCG00000000684 pcbp2 (ENSAOCG00000010959) map3k12 (ENSAOCG00000011018) aaas (ENSAOCG00000011038) col2a1a (ENSAOCG00000011186) GLS2 (ENSAOCG00000011283) spryd4 (ENSAOCG00000011302) asic1a (ENSAOCG00000011349) gpd1a (ENSAOCG00000011387) G6PD (ENSAOCG00000011433) ADCY6 (ENSAOCG00000011541) #21 cacnb3a (ENSAOCG00000011603) #22 ADRA2A (ENSAOCG00000011626) ENSAOCG00000011643 zcchc9 (ENSAOCG00000011664) ntmt1 (ENSAOCG00000011698) Orange clownfish MODERN SPECIES 22 pfkfb2a (ENSAPEG00000017662) ENSAPEG00000017647 DLGAP4 (ENSAPEG00000017580) pcbp2 (ENSAPEG00000017523) map3k12 (ENSAPEG00000017464) aaas (ENSAPEG00000017442) col2a1a (ENSAPEG00000017315) ENSAPEG00000017291 GLS2 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(ENSAPOG00000003783) #24 prim1 (ENSAPOG00000003817) ENSAPOG00000003867 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 559 PFKFB2 (ENSSPAG00000017118) ENSSPAG00000017072 DLGAP4 (ENSSPAG00000017043) pcbp2 (ENSSPAG00000017005) map3k12 (ENSSPAG00000016973) aaas (ENSSPAG00000016943) col2a1a (ENSSPAG00000016836) GLS2 (ENSSPAG00000016797) spryd4 (ENSSPAG00000016788) asic1a (ENSSPAG00000016764) gpd1a (ENSSPAG00000016736) G6PD (ENSSPAG00000016676) ENSSPAG00000016585 ADCY6 (ENSSPAG00000016535) #21 cacnb3a (ENSSPAG00000016503) #22 ddx23 (ENSSPAG00000016482) #23 rnd1a (ENSSPAG00000016463) #24 prim1 (ENSSPAG00000016433) naca (ENSSPAG00000016360) ENSSPAG00000016343 ptges3b (ENSSPAG00000016316) baz2a (ENSSPAG00000016257) ENSSPAG00000016236 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163310.l ENSGT00950000182835.d.a.k.b ENSGT00940000155308.c ENSGT00940000154129.hd ENSGT00940000159006.c.b ENSGT00390000009446 ENSGT00940000155224.c.b ENSGT00390000010463.a.a.a.b ENSGT00940000159780 ENSGT00940000158414 ENSGT00390000003114.e.a.a ENSGT00530000063435.a.a.a ENSGT00940000166246.B ENSGT00940000177752 ENSGT00940000155687.e.a #21 ENSGT00950000182837.b.a.b #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666.a.b #24 ENSGT00390000011466 ENSGT00440000033468 ENSGT00940000154256.ac ENSGT00940000159490 ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000156260.c ENSGT00940000158489.a.a ENSGT00950000183021.a.b.c ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00940000154897.q ENSGT00940000155532 ENSGT00390000002821 ENSGT00940000161930 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00940000163310.l ENSGT00950000182835.d.a.k.b ENSGT00940000155308.c ENSGT00940000154129.hd ENSGT00940000159006.c.b ENSGT00390000009446 ENSGT00940000155224.c.b ENSGT00390000010463.a.a.a.b ENSGT00940000159780 ENSGT00940000158414 ENSGT00390000003114.e.a.a ENSGT00530000063435.a.a.a ENSGT00940000177752 ENSGT00940000155687.e.a #21 ENSGT00950000182837.b.a.b #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666.a.b #24 ENSGT00390000011466 ENSGT00440000033468 ENSGT00940000154256.ac ENSGT00940000159490 ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000156260.c ENSGT00940000158489.a.a ENSGT00950000183021.a.b.c ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00940000154897.q ENSGT00390000018730.A.e ENSGT00940000160902.c.b ENSGT00940000158073.a Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00940000163310.l ENSGT00950000182835.d.a.k.b ENSGT00940000155308.c ENSGT00940000154129.hd ENSGT00940000159006.c.b ENSGT00390000009446 ENSGT00940000155224.c.b ENSGT00390000010463.a.a.a.b ENSGT00940000159780 ENSGT00940000158414 ENSGT00390000003114.e.a.a ENSGT00530000063435.a.a.a ENSGT00940000177752 ENSGT00940000155687.e.a #21 ENSGT00950000182837.b.a.b #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666.a.b #24 ENSGT00390000011466 ENSGT00440000033468 ENSGT00940000154256.ac ENSGT00940000159490 ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000156260.c ENSGT00940000158489.a.a ENSGT00950000183021.a.b.c ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00940000154897.q ENSGT00390000002821 ENSGT00940000161930 ENSGT00390000018730.A.e Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00940000163310.l ENSGT00950000182835.d.a.k.b ENSGT00940000155308.c ENSGT00940000154129.hd ENSGT00940000159006.c.b ENSGT00390000009446 ENSGT00940000155224.c.b ENSGT00390000010463.a.a.a.b ENSGT00940000159780 ENSGT00940000158414 ENSGT00390000003114.e.a.a ENSGT00530000063435.a.a.a ENSGT00940000177752 ENSGT00940000155687.e.a #21 ENSGT00950000182837.b.a.b #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666.a.b #24 ENSGT00390000011466 ENSGT00440000033468 ENSGT00940000154256.ac ENSGT00940000159490 ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000156260.c ENSGT00940000158489.a.a ENSGT00950000183021.a.b.c ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00940000154897.q ENSGT00940000155532 ENSGT00390000002821 ENSGT00940000161930 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 346 ENSHBUG00000008603 PFKFB2 (ENSHBUG00000008677) ENSHBUG00000008692 DLGAP4 (ENSHBUG00000008711) pcbp2 (ENSHBUG00000008769) map3k12 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(ENSOMEG00000006382) #22 ddx23 (ENSOMEG00000006453) #23 prim1 (ENSOMEG00000006499) ENSOMEG00000006550 RND1 (ENSOMEG00000000154) #24 ptges3b (ENSOMEG00000006627) baz2a (ENSOMEG00000006706) ENSOMEG00000006750 mipb (ENSOMEG00000006781) rbm38 (ENSOMEG00000006805) ENSOMEG00000006823 zgc:113278 (ENSOMEG00000006851) prkcbp1l (ENSOMEG00000006900) ENSOMEG00000006965 ENSOMEG00000007014 col9a3 (ENSOMEG00000000165) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000017874.b ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00940000154967.a.a.a ENSGT00950000182835.d.a.k.b ENSGT00940000155308.c ENSGT00940000154129.hd ENSGT00940000159006.c.b ENSGT00390000009446 ENSGT00940000155224.c.b ENSGT00390000010463.a.a.a.b ENSGT00940000159780 ENSGT00940000158414 ENSGT00390000003114.e.a.a ENSGT00530000063435.a.a.a ENSGT00940000155687.e.a #21 ENSGT00950000182837.b.a.b #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666.a.b #24 ENSGT00390000011466 ENSGT00440000033468 ENSGT00940000154256.ac ENSGT00940000159490.h ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000156260.c ENSGT00940000158489.a.a ENSGT00950000183021.a.b.c ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00940000154897.q ENSGT00940000155532 ENSGT00390000002821 ENSGT00940000161930 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 21 ENSORLG00000013093 scube3 (ENSORLG00000013086) ENSORLG00000012982 pfkfb2a (ENSORLG00000012972) ENSORLG00000012896 pcbp2 (ENSORLG00000012872) map3k12 (ENSORLG00000012844) aaas (ENSORLG00000012807) col2a1a (ENSORLG00000012738) GLS2 (ENSORLG00000012493) spryd4 (ENSORLG00000012455) asic1a (ENSORLG00000012444) gpd1a (ENSORLG00000012433) G6PD (ENSORLG00000012416) ADCY6 (ENSORLG00000012382) #21 cacnb3a (ENSORLG00000012349) #22 ddx23 (ENSORLG00000012330) #23 rnd1a (ENSORLG00000012314) #24 prim1 (ENSORLG00000012281) ENSORLG00000012246 ptges3b (ENSORLG00000012236) baz2a (ENSORLG00000012214) ENSORLG00000028732 mipb (ENSORLG00000012169) rbm38 (ENSORLG00000012154) NCOA3 (ENSORLG00000012143) zgc:113278 (ENSORLG00000012075) prkcbp1l (ENSORLG00000012040) ENSORLG00000011946 ENSORLG00000028905 col9a3 (ENSORLG00000011918) Chinese medaka MODERN SPECIES 38 ENSOSIG00000023570 scube3 (ENSOSIG00000023565) ENSOSIG00000023558 pfkfb2a (ENSOSIG00000023250) DLGAP4 (ENSOSIG00000023129) pcbp2 (ENSOSIG00000023126) map3k12 (ENSOSIG00000023118) aaas (ENSOSIG00000023097) col2a1a (ENSOSIG00000020234) GLS2 (ENSOSIG00000019932) spryd4 (ENSOSIG00000019911) asic1a (ENSOSIG00000019885) gpd1a (ENSOSIG00000019868) G6PD (ENSOSIG00000019376) ADCY6 (ENSOSIG00000017442) #21 cacnb3a (ENSOSIG00000015610) #22 ddx23 (ENSOSIG00000015287) #23 prim1 (ENSOSIG00000015283) ENSOSIG00000015280 ptges3b (ENSOSIG00000015278) baz2a (ENSOSIG00000015272) ENSOSIG00000015271 mipb (ENSOSIG00000015270) rbm38 (ENSOSIG00000015269) NCOA3 (ENSOSIG00000015268) Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00940000154967.a.a.a ENSGT00950000182835.d.a.k.b ENSGT00940000155308.c ENSGT00940000154129.hd ENSGT00940000159006.c.b ENSGT00390000009446 ENSGT00940000155224.c.b ENSGT00390000010463.a.a.a.b ENSGT00940000159780 ENSGT00940000158414 ENSGT00390000003114.e.a.a ENSGT00530000063435.a.a.a ENSGT00940000166246.B ENSGT00940000155687.e.a #21 ENSGT00950000182837.b.a.b #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666.a.b #24 ENSGT00390000011466 ENSGT00440000033468 ENSGT00940000154256.ac ENSGT00940000159490.h ENSGT01050000247727 ENSGT00940000159490.g ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000156260.c ENSGT00940000158489.a.a ENSGT00950000183021.a.b.c ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00940000154897.q ENSGT00940000155532 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00940000154967.a.a.a ENSGT00950000182835.d.a.k.b ENSGT00940000155308.c ENSGT00940000154129.hd ENSGT00940000159006.c.b ENSGT00390000009446 ENSGT00940000155224.c.b ENSGT00390000010463.a.a.a.b ENSGT00940000159780 ENSGT00940000158414 ENSGT00390000003114.e.a.a ENSGT00530000063435.a.a.a ENSGT00940000166246.B ENSGT00940000155687.e.a #21 ENSGT00950000182837.b.a.b #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666.a.b #24 ENSGT00390000011466 ENSGT00440000033468 ENSGT00940000154256.ac ENSGT00940000159490.h ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000156260.c ENSGT00940000158489.a.a ENSGT00950000183021.a.b.c ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00940000154897.q ENSGT00940000161930 ENSGT00390000018730.A.e ENSGT00940000160902.c.b Mangrove rivulus MODERN SPECIES 13 scube3 (ENSKMAG00000011109) ENSKMAG00000011207 pfkfb2a (ENSKMAG00000011230) DLGAP4 (ENSKMAG00000011302) pcbp2 (ENSKMAG00000011367) map3k12 (ENSKMAG00000011456) aaas (ENSKMAG00000011524) col2a1a (ENSKMAG00000011552) GLS2 (ENSKMAG00000011645) spryd4 (ENSKMAG00000011681) asic1a (ENSKMAG00000011700) gpd1a (ENSKMAG00000011745) G6PD (ENSKMAG00000011771) ENSKMAG00000011803 ADCY6 (ENSKMAG00000011843) #21 cacnb3a (ENSKMAG00000011986) #22 ddx23 (ENSKMAG00000012060) #23 rnd1a (ENSKMAG00000012113) #24 prim1 (ENSKMAG00000012150) naca (ENSKMAG00000012234) ptges3b (ENSKMAG00000012312) baz2a (ENSKMAG00000012331) ENSKMAG00000012365 mipb (ENSKMAG00000012388) rbm38 (ENSKMAG00000012402) NCOA3 (ENSKMAG00000012422) zgc:113278 (ENSKMAG00000012450) prkcbp1l (ENSKMAG00000012490) ENSKMAG00000012559 col9a3 (ENSKMAG00000012601) ogfr (ENSKMAG00000012656) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1624 ENSNFUG00015016801 ppdpfa (ENSNFUG00015016834) Nfu_g_1_001629 (ENSNFUG00015016845) DNAJC5AA (ENSNFUG00015016851) GID8B (ENSNFUG00015016866) ENSNFUG00015016888 AAAS (ENSNFUG00015016928) COL2A1A (ENSNFUG00015017019) GLS2 (ENSNFUG00015017215) spryd4 (ENSNFUG00015017996) asic1a (ENSNFUG00015018020) GPD1A (ENSNFUG00015018465) G6PD (ENSNFUG00015018525) ENSNFUG00015019803 ADCY6A (ENSNFUG00015019862) #21 cacnb3a (ENSNFUG00015020935) #22 DDX23 (ENSNFUG00015021669) #23 ENSNFUG00015021712 RND1 (ENSNFUG00015021714) #24 CABZ01112331.1 (ENSNFUG00015021717) ENSNFUG00015021724 jph2 (ENSNFUG00015021726) CABLES2B (ENSNFUG00015021730) CCM2L (ENSNFUG00015021731) XKR7 (ENSNFUG00015021734) WDR46 (ENSNFUG00015021745) ENSNFUG00015021850 nr2c2 (ENSNFUG00015021858) MRPS25 (ENSNFUG00015021896) ZFYVE20 (ENSNFUG00015021902) ENSNFUG00015021911 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00940000154967.a.a.a ENSGT00950000182835.d.a.k.b ENSGT00940000155308.c ENSGT00940000154129.hd ENSGT00940000159006.c.b ENSGT00390000009446 ENSGT00940000155224.c.b ENSGT00390000010463.a.a.a.b ENSGT00940000159780 ENSGT00940000158414 ENSGT00390000003114.e.a.a ENSGT00530000063435.a.a.a ENSGT00940000166246.B ENSGT00940000155687.e.a #21 ENSGT00950000182837.b.a.b #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666.a.b #24 ENSGT00390000011466 ENSGT00440000033468 ENSGT00940000154256.ac ENSGT00940000159490.h ENSGT01050000247727 ENSGT00940000159490.g ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000156260.c ENSGT00940000158489.a.a ENSGT00950000183021.a.b.c ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00940000154897.q ENSGT00940000155532 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00940000154967.a.a.a ENSGT00950000182835.d.a.k.b ENSGT00940000155308.c ENSGT00940000154129.hd ENSGT00940000159006.c.b ENSGT00390000009446 ENSGT00940000155224.c.b ENSGT00390000010463.a.a.a.b ENSGT00940000159780 ENSGT00940000158414 ENSGT00390000003114.e.a.a ENSGT00530000063435.a.a.a ENSGT00940000166246.B ENSGT00940000155687.e.a #21 ENSGT00950000182837.b.a.b #22 ENSGT00940000155606.b #23 ENSGT00940000158666.a.b #24 ENSGT00390000011466 ENSGT00440000033468 ENSGT00940000154256.ac ENSGT00940000159490.h ENSGT01050000247727 ENSGT00940000159490.g ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000156260.c ENSGT00940000158489.a.a ENSGT00950000183021.a.b.c ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00940000154897.q ENSGT00940000155532 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000153185.a.a.b ENSGT00940000154967.a.a.a ENSGT00950000182835.d.a.k.b ENSGT00940000155308.c ENSGT00940000154129.hd ENSGT00940000159006.c.b ENSGT00390000009446 ENSGT00940000155224.c.b ENSGT00390000010463.a.a.a.b ENSGT00940000159780 ENSGT00940000158414 ENSGT00390000003114.e.a.a ENSGT00530000063435.a.a.a ENSGT00940000166246.B 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ENSGT00440000033468.k.a ENSGT00940000154256.ac ENSGT00940000159490 ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000156260.c ENSGT00940000158489.a.a Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000161040.b.b ENSGT00950000182883.b.a.b.b.b ENSGT00950000183092.a.d.b.a ENSGT00530000064137.a.a.b ENSGT00940000159439.a.a ENSGT00940000154129.hd.d ENSGT00940000159006.c.b.c ENSGT00390000009446.h ENSGT00940000155224.c.b.h ENSGT00390000010463.a.a.a.b.g ENSGT00940000159780.i ENSGT00940000158414.j.b ENSGT00390000003114.e.a.a.h ENSGT00530000063435.a.a.a.e ENSGT00990000211309 ENSGT00950000182837.b.a.b.c #22 ENSGT00940000155606.a.a.a ##23 ENSGT00940000158666.a.a.b.a #24 ENSGT00390000011466.e.b ENSGT00940000159490.e ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000156260.c.b ENSGT00940000158489.a.a.c.a ENSGT00950000183021.a.b.c.g ENSGT00510000046470.a.a.b.d ENSGT00940000154897.q.e ENSGT00940000155532.ud.a ENSGT00940000161930 ENSGT00390000018730.A.e.c ENSGT00940000160902.c.b.b ENSGT00940000158073.a.a Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000182883.b.a.b.b.b ENSGT00950000183092.a.d.b.a ENSGT00530000064137.a.a.b ENSGT00940000159439.a.a ENSGT00940000154129.hd.d ENSGT00940000159006.c.b.c ENSGT00390000009446.h ENSGT00940000155224.c.b.h ENSGT00390000010463.a.a.a.b.g ENSGT00940000159780.i ENSGT00940000158414.j.b ENSGT00390000003114.e.a.a.h ENSGT00530000063435.a.a.a.e ENSGT00990000211309 ENSGT00940000155687.e.a.e #21 ENSGT00950000182837.b.a.b.c #22 ENSGT00940000155606.a.a.a ##23 ENSGT00940000158666.a.a.b.a #24 ENSGT00390000011466.e.b ENSGT00940000159490.e ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000156260.c.b ENSGT00940000158489.a.a.c.a ENSGT00950000183021.a.b.c.g ENSGT00510000046470.a.a.b.d ENSGT00940000154897.q.e ENSGT00940000155532.ud.a ENSGT00940000161930 ENSGT00390000018730.A.e.c ENSGT00940000160902.c.b.b ENSGT00940000158073.a.a Salmo ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000161040.b.b ENSGT00950000182883.b.a.b.b.b ENSGT00950000183092.a.d.b.a ENSGT00530000064137.a.a.b ENSGT00940000159439.a.a ENSGT00940000154129.hd.d ENSGT00940000159006.c.b.c ENSGT00390000009446.h ENSGT00940000155224.c.b.h ENSGT00390000010463.a.a.a.b.g ENSGT00940000159780.i ENSGT00940000158414.j.b ENSGT00390000003114.e.a.a.h ENSGT00530000063435.a.a.a.e ENSGT00940000155687.e.a.e #21 ENSGT00950000182837.b.a.b.c #22 ENSGT00940000155606.a.a.a ##23 ENSGT00940000158666.a.a.b.a #24 ENSGT00390000011466.e.b ENSGT00440000033468.k.a.a.a ENSGT00940000154256.ac.c ENSGT00940000159490.e ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000156260.c.b ENSGT00940000158489.a.a.c.a ENSGT00950000183021.a.b.c.g ENSGT00510000046470.a.a.b.d ENSGT00940000154897.q.e ENSGT00940000155532.ud.a ENSGT00940000161930 ENSGT00390000018730.A.e.c River trout MODERN SPECIES 20 ENSSTUG00000009705 NXPH4 (ENSSTUG00000009701) stac3 (ENSSTUG00000009636) ENSSTUG00000009628 kif5aa (ENSSTUG00000009043) pcbp2 (ENSSTUG00000008714) map3k12 (ENSSTUG00000006942) aaas (ENSSTUG00000006827) col2a1a (ENSSTUG00000005939) GLS2 (ENSSTUG00000003616) spryd4 (ENSSTUG00000003291) 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ENSGT00950000183021.a.b.c.g ENSGT00510000046470.a.a.b.d ENSGT00940000154897.q.e ENSGT00940000161930 ENSGT00390000018730.A.e.c ENSGT00940000160902.c.b.b.a Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000182883.b.a.b.b.b ENSGT00950000183092.a.d.b.a ENSGT00530000064137.a.a.b ENSGT00940000159439.a.a ENSGT00940000154129.hd.d ENSGT00940000159006.c.b.c ENSGT00390000009446.h ENSGT00940000155224.c.b.h ENSGT00390000010463.a.a.a.b.g ENSGT00940000159780.i ENSGT00940000158414.j.b ENSGT00390000003114.e.a.a.h ENSGT00530000063435.a.a.a.e ENSGT00990000211309 ENSGT00940000155687.e.a.e #21 ENSGT00950000182837.b.a.b.c #22 ENSGT00940000155606.a.a.a ##23 ENSGT00940000158666.a.a.b.a #24 ENSGT00390000011466.e.a ENSGT00440000033468.k.a.b ENSGT00940000154256.ac.c ENSGT00940000159490.e ENSGT00940000156037.b ENSGT00940000156260.c.b ENSGT00940000158489.a.a.c.a ENSGT00950000183021.a.b.c.g ENSGT00510000046470.a.a.b.d ENSGT00940000154897.q.e ENSGT00940000161930 ENSGT00390000018730.A.e.c ENSGT00940000160902.c.b.b.a Chinook salmon DUPLICATION Chinook salmon MODERN SPECIES 7 ENSOTSG00005011118 NXPH4 (ENSOTSG00005011115) stac3 (ENSOTSG00005011087) ENSOTSG00005011086 kif5aa (ENSOTSG00005010625) pcbp2 (ENSOTSG00005010268) map3k12 (ENSOTSG00005009185) aaas (ENSOTSG00005008664) col2a1a (ENSOTSG00005005065) GLS2 (ENSOTSG00005005042) spryd4 (ENSOTSG00005005041) asic1a (ENSOTSG00005004975) GPD1 (ENSOTSG00005004664) G6PD (ENSOTSG00005002088) cacnb3a (ENSOTSG00005025195) #22 cacnb3a (ENSOTSG00005025193) #22 ddx23 (ENSOTSG00005025127) ##23 RND1 (ENSOTSG00005025121) #24 prim1 (ENSOTSG00005025120) naca (ENSOTSG00005025089) ptges3b (ENSOTSG00005025088) baz2a (ENSOTSG00005025086) ENSOTSG00005025081 mipb (ENSOTSG00005025079) rbm38 (ENSOTSG00005025076) NCOA3 (ENSOTSG00005025074) ENSOTSG00005025073 zgc:113278 (ENSOTSG00005025072) prkcbp1l (ENSOTSG00005013763) col9a3 (ENSOTSG00005013744) ogfr (ENSOTSG00005013743) Chinook salmon MODERN SPECIES 7 actr5 (ENSOTSG00005011121) ENSOTSG00005011118 NXPH4 (ENSOTSG00005011115) stac3 (ENSOTSG00005011087) ENSOTSG00005011086 kif5aa (ENSOTSG00005010625) pcbp2 (ENSOTSG00005010268) map3k12 (ENSOTSG00005009185) aaas (ENSOTSG00005008664) col2a1a (ENSOTSG00005005065) GLS2 (ENSOTSG00005005042) spryd4 (ENSOTSG00005005041) asic1a (ENSOTSG00005004975) GPD1 (ENSOTSG00005004664) G6PD (ENSOTSG00005002088) cacnb3a (ENSOTSG00005025195) #22 cacnb3a (ENSOTSG00005025193) #22 ddx23 (ENSOTSG00005025127) ##23 RND1 (ENSOTSG00005025121) #24 prim1 (ENSOTSG00005025120) naca (ENSOTSG00005025089) ptges3b (ENSOTSG00005025088) baz2a (ENSOTSG00005025086) ENSOTSG00005025081 mipb (ENSOTSG00005025079) rbm38 (ENSOTSG00005025076) NCOA3 (ENSOTSG00005025074) ENSOTSG00005025073 zgc:113278 (ENSOTSG00005025072) prkcbp1l (ENSOTSG00005013763) col9a3 (ENSOTSG00005013744) Coho salmon MODERN SPECIES 8 NXPH4 (ENSOKIG00005022376) stac3 (ENSOKIG00005022308) ENSOKIG00005022274 kif5aa (ENSOKIG00005022037) pcbp2 (ENSOKIG00005021572) map3k12 (ENSOKIG00005020315) aaas (ENSOKIG00005020045) col2a1a 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Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183092.a.d.b.b ENSGT00530000064137.a.a.a ENSGT00940000159439.a.b ENSGT00990000205462.a ENSGT00940000154129.hd.c ENSGT00940000159006.c.b.d ENSGT00390000009446.g ENSGT00940000155224.c.b.g ENSGT00390000010463.a.a.a.b.h ENSGT00940000159780.j ENSGT00940000158414.j.a ENSGT00390000003114.e.a.a.g ENSGT00530000063435.a.a.a.f ENSGT00940000166246.B ENSGT00940000155687.e.a.f #21 ENSGT00950000182837.b.a.b.d #22 ENSGT00940000155606.a.b ##23 ENSGT00990000211101 ENSGT00940000158666.a.a.b.b #24 ENSGT00390000011466.f ENSGT00440000033468.k.a.a ENSGT00940000154256.ac.d ENSGT00940000159490.f ENSGT00940000156260.c.a ENSGT00940000158489.a.a.c.b ENSGT00950000183021.a.b.c.h ENSGT00510000046470.a.a.b.c ENSGT00940000154897.q.f ENSGT00940000155532.ud.b ENSGT00940000181232 ENSGT00390000002821 Chinook salmon MODERN SPECIES 14 stac3 (ENSOTSG00005003150) ENSOTSG00005003209 kif5aa (ENSOTSG00005003254) ENSOTSG00005006588 pcbp2 (ENSOTSG00005006589) map3k12 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ENSECRG00000004523 ENSECRG00000004532 ENSECRG00000004543 ENSECRG00000004553 Reedfish MODERN SPECIES 187 ENSECRG00000017459 #22 ENSECRG00000019496 #23 Elephant shark MODERN SPECIES 354 CACNB3 (ENSCMIG00000002411) #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 88 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00940000165390 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 Elephant shark MODERN SPECIES 1531 ENSCMIG00000009436 ENSCMIG00000009438 MRAS (ENSCMIG00000009440) ENSCMIG00000009443 ENSCMIG00000009453 ptpn4a (ENSCMIG00000009460) epb41l5 (ENSCMIG00000009465) ENSCMIG00000009467 ralba (ENSCMIG00000009471) inhbb (ENSCMIG00000009478) gli2b (ENSCMIG00000009495) ENSCMIG00000009557 CLASP1 (ENSCMIG00000009629) nifk (ENSCMIG00000009671) ENSCMIG00000009673 cacnb4a (ENSCMIG00000009690) ##22 arl5a (ENSCMIG00000009716) NEB (ENSCMIG00000009874) ENSCMIG00000010196 tnfaip6 (ENSCMIG00000010237) ENSCMIG00000010239 ENSCMIG00000010241 ENSCMIG00000010243 ENSCMIG00000010244 ENSCMIG00000010245 ENSCMIG00000010248 ENSCMIG00000010258 ENSCMIG00000010264 ENSCMIG00000010279 ENSCMIG00000010283 nmi (ENSCMIG00000010291) Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00940000165390 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 131 ENSGT00940000165301 ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000002188 ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712 ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054 ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.b ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 Reedfish MODERN SPECIES 16 ENSECRG00000016787 ENSECRG00000016817 tsn (ENSECRG00000016831) IQCB1 (ENSECRG00000016851) eaf2 (ENSECRG00000016887) cyp27a3 (ENSECRG00000016905) slc15a2 (ENSECRG00000016943) hspbap1 (ENSECRG00000017023) slc49a4 (ENSECRG00000017045) SEMA5B (ENSECRG00000017076) pdia5 (ENSECRG00000017116) sec22a (ENSECRG00000017158) adcy5 (ENSECRG00000017181) hacd2 (ENSECRG00000017217) stam2 (ENSECRG00000017249) cacnb4a (ENSECRG00000017312) ##22 arl5a (ENSECRG00000017434) NEB (ENSECRG00000017571) rif1 (ENSECRG00000017982) tnfaip6 (ENSECRG00000018046) lancl1 (ENSECRG00000018081) mylz3 (ENSECRG00000018120) acadl (ENSECRG00000018174) ENSECRG00000018217 UNC80 (ENSECRG00000018287) rpe (ENSECRG00000018435) AGAP1 (ENSECRG00000018490) gbx2 (ENSECRG00000018677) ASB18 (ENSECRG00000018700) iqca1 (ENSECRG00000018772) ackr3b (ENSECRG00000018909) Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000165301 ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000002188 ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712 ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054 ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.b ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT01090000259987.b.b.a.b ENSGT00710000106813.A ENSGT00940000160130 ENSGT00940000157406 ENSGT00930000151029.i.a ENSGT00940000164835 ENSGT00940000158398 ENSGT00390000003114.e.b.a ENSGT00390000008796 ENSGT00530000063607.b ENSGT00390000002215 Spotted gar MODERN SPECIES 650 tsn (ENSLOCG00000002191) si:dkey-91i10.2 (ENSLOCG00000002209) iqcb1 (ENSLOCG00000002221) eaf2 (ENSLOCG00000002255) cyp27a3 (ENSLOCG00000002266) ENSLOCG00000002296 slc15a2 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ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.b.b ENSGT00940000154533.b.b.a.a ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT01090000259987.b.b.a.b Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00940000156507.i ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00940000159893 ENSGT00940000156712.b.a ENSGT00940000156797.c ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.c.a ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.b.b ENSGT00940000154533.b.b.a.a ENSGT00940000154533.b.a.b ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201.g ENSGT00940000157201.h ENSGT01090000259987.b.b.a.b ENSGT00940000165279.b ENSGT00940000156768 ENSGT00940000163494.a.a.c.b.a ENSGT00940000163322.a.a ENSGT00940000163148 ENSGT00940000163322.a.b.a.a ENSGT00940000164501 Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue MODERN SPECIES 16 HM13 (ENSSFOG00015004935) id1 (ENSSFOG00015004946) mrgbp 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SPECIES 13 tmem198b (ENSCHAG00000014979) ENSCHAG00000014998 ENSCHAG00000015015 ENSCHAG00000000665 cyp27c1 (ENSCHAG00000000920) ercc3 (ENSCHAG00000001369) ENSCHAG00000001707 ENSCHAG00000001732 ENSCHAG00000001759 ihhb (ENSCHAG00000001778) nhej1 (ENSCHAG00000001828) ENSCHAG00000001925 ENSCHAG00000005416 ENSCHAG00000005578 SEMA5B (ENSCHAG00000005803) cacnb4b (ENSCHAG00000006488) ##22 etv5b (ENSCHAG00000007132) ENSCHAG00000007311 ENSCHAG00000007992 ENSCHAG00000008071 Denticle herring MODERN SPECIES 15 MAP3K2 (ENSDCDG00000032579) ENSDCDG00000032522 tmem198b (ENSDCDG00000032510) desmb (ENSDCDG00000032508) dnpep (ENSDCDG00000032505) PTPRN (ENSDCDG00000032478) si:ch211-114n24.6 (ENSDCDG00000032455) bin1b (ENSDCDG00000032345) ihhb (ENSDCDG00000032330) nhej1 (ENSDCDG00000032328) NBEAL1 (ENSDCDG00000032124) STRADB (ENSDCDG00000032069) TRAK2 (ENSDCDG00000032064) ENSDCDG00000032059 SEMA5B (ENSDCDG00000031485) cacnb4b (ENSDCDG00000029114) ##22 etv5b (ENSDCDG00000029057) ENSDCDG00000028977 gca 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ENSGT01050000244857.B.b.g ENSGT00940000159052.m.b.b ENSGT00940000157018.i.b ENSGT01030000234748.b ENSGT00940000155515.a.a ENSGT00390000009987 ENSGT00390000010523.c.b.g.b Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00530000063564.b.a.a ENSGT00940000158714.c ENSGT01100000263502.A.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000000145.e ENSGT00970000193621 ENSGT00940000157728.a.a ENSGT00390000007225 ENSGT00950000183028.a.a.a.g.b.g.b ENSGT00530000063596.A.i ENSGT00950000183001.a.b.b.l ENSGT00390000011204 ENSGT00940000164385.a.a.a.b.d ENSGT00390000017581.b.b ENSGT00940000157360.c ENSGT00940000164275.f ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000165279.d ENSGT00940000153979.A ENSGT00940000154095.b.b.a.a ENSGT00390000003164 ENSGT00940000155522.g.b ENSGT00390000016940.c.b.b ENSGT00940000160306.o.a ENSGT00390000008812.a.b ENSGT01050000244857.B.b.g ENSGT00940000159052.m.b.b ENSGT00940000157018.i.b ENSGT00940000155515.a.a ENSGT00390000009987 ENSGT00390000010523.c.b.g.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a.y.a Channel catfish MODERN SPECIES 3 LRRFIP1 (ENSIPUG00000012031) st6gal2b (ENSIPUG00000012156) ecrg4b (ENSIPUG00000012174) ENSIPUG00000012185 nck2b (ENSIPUG00000012201) dph3 (ENSIPUG00000012211) Fhl2 (ENSIPUG00000012229) tgfbrap1 (ENSIPUG00000012271) GPR45 (ENSIPUG00000012376) MRPS9 (ENSIPUG00000012385) pou3f3b (ENSIPUG00000012430) ENSIPUG00000012444 ENSIPUG00000012540 TMEM182 (ENSIPUG00000012557) inpp4ab (ENSIPUG00000012606) CACNB4 (ENSIPUG00000012735) ##22 etv5b (ENSIPUG00000012808) gca (ENSIPUG00000012868) PTPRN (ENSIPUG00000012899) Dnpep (ENSIPUG00000012983) des (ENSIPUG00000013039) tmem198 (ENSIPUG00000013070) CDK5R1 (ENSIPUG00000013077) ENSIPUG00000013082 chpf (ENSIPUG00000013105) asic4 (ENSIPUG00000013144) ENSIPUG00000013184 ENSIPUG00000013188 gmppa (ENSIPUG00000013225) ENSIPUG00000013370 MYLK (ENSIPUG00000013381) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00950000183138.a.b.r.a ENSGT00530000063564.b.a.a ENSGT00940000158714.c ENSGT01100000263502.A.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000000145.e ENSGT00970000193621 ENSGT00940000157728.a.a ENSGT00950000183028.a.a.a.g.b.h ENSGT00530000063596.A.i ENSGT00950000183001.a.b.b.l ENSGT00390000011204 ENSGT00940000164385.a.a.a.b.d ENSGT00390000017581.b.b ENSGT00940000157360.c ENSGT00940000164275.f ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000165279.d ENSGT00940000153979.A ENSGT00940000154095.b.b.a.a ENSGT00390000003164 ENSGT00940000155522.g.b ENSGT00390000016940.c.b.b ENSGT00940000160306.o.a ENSGT00390000008812.a.b ENSGT00940000159281 ENSGT01050000244857.B.b.g ENSGT00940000159052.m.b.b ENSGT00940000157018.i.b ENSGT00940000155515.a.a ENSGT00390000009987 ENSGT00390000010523.c.b.g.b Electric eel MODERN SPECIES 81 mlpha (ENSEEEG00000018443) ENSEEEG00000018451 st6gal2b (ENSEEEG00000018454) ENSEEEG00000018458 ENSEEEG00000018462 nck2b (ENSEEEG00000018465) ENSEEEG00000018467 FHL2 (ENSEEEG00000018469) tgfbrap1 (ENSEEEG00000018481) GPR45 (ENSEEEG00000018482) mrps9 (ENSEEEG00000018498) pou3f3b (ENSEEEG00000018630) TMEM182 (ENSEEEG00000018631) inpp4ab (ENSEEEG00000018651) ENSEEEG00000019141 cacnb4b (ENSEEEG00000019174) ##22 etv5b (ENSEEEG00000019614) gca (ENSEEEG00000019619) ENSEEEG00000019620 dnpep (ENSEEEG00000019637) desmb (ENSEEEG00000019720) tmem198b (ENSEEEG00000019721) cdk5r2a (ENSEEEG00000019722) ENSEEEG00000019724 CHPF (ENSEEEG00000019725) asic4b (ENSEEEG00000019728) gmppab (ENSEEEG00000019738) MYLK (ENSEEEG00000019756) ENSEEEG00000019759 arl6ip6 (ENSEEEG00000019762) rprmb (ENSEEEG00000019763) Characoidei ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000166042.a ENSGT00950000183138.a.b.r.a ENSGT00530000063564.b.a.a ENSGT00940000158714.c ENSGT01100000263502.A.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000000145.e ENSGT00970000193621 ENSGT00940000157728.a.a ENSGT00950000183028.a.a.a.g.b.g.b ENSGT00530000063596.A.i ENSGT00950000183001.a.b.b.l ENSGT00390000011204 ENSGT00940000164385.a.a.a.b.d ENSGT00390000017581.b.b ENSGT00940000157360.c ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000165279.d ENSGT00940000153979.A ENSGT00940000154095.b.b.a.a ENSGT00390000003164 ENSGT00940000155522.g.b ENSGT00390000016940.c.b.b ENSGT00940000160306.o.a ENSGT00390000008812.a.b ENSGT01050000244857.B.b.g ENSGT00940000159052.n ENSGT01030000234748.b ENSGT00940000157018.i.b ENSGT00940000155515.a.a ENSGT00390000009987 ENSGT00390000010523.c.b.g.b Red-bellied piranha MODERN SPECIES 247 ENSPNAG00000020090 fhl2b (ENSPNAG00000003625) tgfbrap1 (ENSPNAG00000020165) GPR45 (ENSPNAG00000020176) mrps9 (ENSPNAG00000020186) pou3f3b (ENSPNAG00000020194) TMEM182 (ENSPNAG00000020241) inpp4ab (ENSPNAG00000020430) cacnb4b (ENSPNAG00000020505) ##22 etv5b (ENSPNAG00000020577) gca (ENSPNAG00000020598) PTPRN (ENSPNAG00000020618) dnpep (ENSPNAG00000020663) desmb (ENSPNAG00000020675) tmem198b (ENSPNAG00000020677) cryba2a (ENSPNAG00000020690) cdk5r2a (ENSPNAG00000020705) ENSPNAG00000020712 CHPF (ENSPNAG00000020733) Mexicana tetra MODERN SPECIES 4 ppp1r12c (ENSAMXG00000011556) psmd12 (ENSAMXG00000003863) nck2b (ENSAMXG00000039493) ENSAMXG00000031019 dph3 (ENSAMXG00000034392) ENSAMXG00000040105 fhl2b (ENSAMXG00000009663) rsph3 (ENSAMXG00000036446) tgfbrap1 (ENSAMXG00000009641) GPR45 (ENSAMXG00000042345) mrps9 (ENSAMXG00000009629) pou3f3b (ENSAMXG00000040679) ENSAMXG00000035618 TMEM182 (ENSAMXG00000034000) inpp4ab (ENSAMXG00000001687) cacnb4b (ENSAMXG00000034338) ##22 etv5b (ENSAMXG00000032420) gca (ENSAMXG00000002070) ENSAMXG00000033115 PTPRN (ENSAMXG00000002098) dnpep (ENSAMXG00000002139) desmb (ENSAMXG00000002143) tmem198b (ENSAMXG00000002185) cryba2a (ENSAMXG00000002203) cdk5r2a (ENSAMXG00000026091) ENSAMXG00000037439 CHPF (ENSAMXG00000042101) ENSAMXG00000042561 ENSAMXG00000040259 asic4b (ENSAMXG00000037643) gmppab (ENSAMXG00000015068) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000166042.a ENSGT00950000183138.a.b.r.a ENSGT00530000063564.b.a.a ENSGT00940000158714.c ENSGT01100000263502.A.a.a.a.b.b ENSGT00390000000145.e ENSGT00970000193621 ENSGT00940000157728.a.a.c.a ENSGT00390000007225 ENSGT00950000183028.a.a.a.g.b.g.b ENSGT00530000063596.A.i ENSGT00390000011204 ENSGT00940000164385.a.a.a.b.d ENSGT00390000017581.b.b ENSGT00940000157360.c ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000165279.d ENSGT00940000153979.A ENSGT00940000154095.b.b.a.a ENSGT00390000003164 ENSGT00940000155522.g.b ENSGT00390000016940.c.b.b ENSGT00940000160306.o.a ENSGT00390000008812.a.b ENSGT01050000244857.B.b.g ENSGT00940000159052.m.b.b ENSGT00940000157018.i.b ENSGT01030000234748.b ENSGT00940000155515.a.a ENSGT00390000009987 ENSGT00390000010523.c.b.g.b Cyprininae DUPLICATION Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000000145.e.b ENSGT00970000193621.c.a ENSGT00940000157728.a.a.c.a ENSGT00390000007225.bc ENSGT00950000183028.a.a.a.g.b.g.b.a ENSGT00530000063596.A.i.b ENSGT00390000011204.c ENSGT00940000164385.a.a.a.b.d.a ENSGT00390000017581.b.b.a ENSGT00940000157360.c.a.b ENSGT00950000182837.b.b.c.a.a.a ##22 ENSGT00940000165279.d.g ENSGT00940000154095.b.b.a.a.k.b ENSGT00940000155522.g.b.i ENSGT00390000016940.c.b.b.a.b ENSGT00940000160306.o.a.a.b ENSGT00390000008812.a.b.a ENSGT00940000159281.j ENSGT01050000244857.B.b.g.b ENSGT00940000159052.m.b.b.a ENSGT00940000157018.i.b.b ENSGT01030000234748.b.a ENSGT00940000157879.xb ENSGT00940000157879.yb.a.b ENSGT00940000155515.a.a.b ENSGT00390000010523.c.b.g.b.b Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 206 ENSGT00940000166042.a.a.a ENSGT00950000183138.a.b.r.a.a ENSGT00530000063564.b.a.a.a ENSGT00940000158714.c.d ENSGT01100000263502.A.a.a.a.b.b.a ENSGT00390000000145.e.b ENSGT00970000193621.c.a ENSGT00940000157728.a.a.c.a ENSGT00390000007225.bc ENSGT00950000183028.a.a.a.g.b.g.b.a ENSGT00530000063596.A.i.b ENSGT00390000011204.c ENSGT00940000164385.a.a.a.b.d.a ENSGT00390000017581.b.b.a ENSGT00940000157360.c.a.b ENSGT00950000182837.b.b.c.a.a.a ##22 ENSGT00940000165279.d.g Common carp reference MODERN SPECIES 10 ENSCCRG00000080846 mlpha (ENSCCRG00000040978) ENSCCRG00000075636 st6gal2b (ENSCCRG00000038377) tmtops2a (ENSCCRG00000007779) ecrg4b 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ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT01090000259987.b.b.a.b ENSGT00940000177452 ENSGT00940000165279.c ENSGT00940000163149.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.a ENSGT00940000163322.a.b.a.b ENSGT00940000164501.a.a.b.b ENSGT00940000163494.a.b.b ENSGT00940000164501.b ENSGT00940000163322.b ENSGT00940000177114 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT01090000259987.b.b.a.b ENSGT00940000177452 ENSGT00940000165279.c ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.b.b.a ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.a ENSGT00940000163322.a.b.a.b ENSGT00940000164501.a.a.b.b ENSGT00940000163494.a.b.b ENSGT00940000164501.b ENSGT00940000163322.b ENSGT00940000177114 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 13 ints6 (ENSMMDG00005022440) serpine3 (ENSMMDG00005022436) FAM124A (ENSMMDG00005022434) tsn (ENSMMDG00005022433) eaf2 (ENSMMDG00005022432) cyp27a3 (ENSMMDG00005022305) slc15a2 (ENSMMDG00005022292) hspbap1 (ENSMMDG00005022288) slc49a4 (ENSMMDG00005022281) SEMA5B (ENSMMDG00005022204) pdia5 (ENSMMDG00005021302) sec22a (ENSMMDG00005021281) adcy5 (ENSMMDG00005021278) hacd2 (ENSMMDG00005021275) stam2 (ENSMMDG00005021032) cacnb4b (ENSMMDG00005020501) ##22 arl5a (ENSMMDG00005020476) ENSMMDG00005020473 ENSMMDG00005020467 ENSMMDG00005020463 ENSMMDG00005020460 rif1 (ENSMMDG00005019828) tnfaip6 (ENSMMDG00005019808) itgb5 (ENSMMDG00005016369) ENSMMDG00005016307 etv5a (ENSMMDG00005016303) ENSMMDG00005016299 crygs3 (ENSMMDG00005016271) crygm3 (ENSMMDG00005016267) crygm5 (ENSMMDG00005016266) ENSMMDG00005016245 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.b.b ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00960000186941 ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT00940000155107.b.b ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 49 SEMA5B (ENSHCOG00000016432) pdia5 (ENSHCOG00000016469) sec22a (ENSHCOG00000016488) adcy5 (ENSHCOG00000016524) hacd2 (ENSHCOG00000016555) stam2 (ENSHCOG00000016562) CACNB4 (ENSHCOG00000016598) ##22 arl5a (ENSHCOG00000016616) ENSHCOG00000016733 ENSHCOG00000016753 ENSHCOG00000016772 ENSHCOG00000016784 TBC1D8 (ENSHCOG00000017043) PDCL3 (ENSHCOG00000017074) ENSHCOG00000017082 LONRF2 (ENSHCOG00000017093) ENSHCOG00000017274 ENSHCOG00000017382 ENSHCOG00000017385 ENSHCOG00000017389 ENSHCOG00000017425 RDX (ENSHCOG00000017470) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00970000193758 ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT00940000155107.b.b ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00940000154633.id.a Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00970000193758 ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT00940000155107.b.b ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00940000154633.id.a Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00970000193758 ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT00940000155107.b.b ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00940000154633.id.a Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00960000186941 ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT00940000155107.b.b ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00940000154633.id.a Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 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(ENSNFUG00015009737) eaf2 (ENSNFUG00015009727) cyp27a3 (ENSNFUG00015009577) SLC15A2 (ENSNFUG00015008615) HSPBAP1 (ENSNFUG00015008546) DIRC2 (ENSNFUG00015008529) ENSNFUG00015008523 SEMA5B (ENSNFUG00015007995) PDIA5 (ENSNFUG00015007813) SEC22A (ENSNFUG00015007779) adcy5 (ENSNFUG00015006978) PTPLB (ENSNFUG00015006878) stam2 (ENSNFUG00015006753) ENSNFUG00015006204 ##22 ARL5A (ENSNFUG00015006092) TBC1D8 (ENSNFUG00015005072) NMS (ENSNFUG00015005059) PDCL3 (ENSNFUG00015005043) LONRF2 (ENSNFUG00015005022) ENSNFUG00015024645 ENSNFUG00015010723 IL18R1 (ENSNFUG00015009023) CABZ01054962.1 (ENSNFUG00015008926) ENSNFUG00015008892 ENSNFUG00015008877 ENSNFUG00015008867 ENSNFUG00015008863 ENSNFUG00015008530 ENSNFUG00015008413 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b 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ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT00940000155107.b.b ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00940000154633.id.a Mummichog MODERN SPECIES 2252 serpine3 (ENSFHEG00000015502) FAM124A (ENSFHEG00000015510) tsn (ENSFHEG00000015531) si:dkey-91i10.2 (ENSFHEG00000015539) eaf2 (ENSFHEG00000015560) cyp27a3 (ENSFHEG00000015573) slc15a2 (ENSFHEG00000015672) hspbap1 (ENSFHEG00000000380) slc49a4 (ENSFHEG00000015726) SEMA5B (ENSFHEG00000015846) pdia5 (ENSFHEG00000015960) sec22a (ENSFHEG00000015970) adcy5 (ENSFHEG00000016114) hacd2 (ENSFHEG00000000574) stam2 (ENSFHEG00000016210) CACNB4 (ENSFHEG00000016221) ##22 arl5a (ENSFHEG00000016231) NEB (ENSFHEG00000016597) ENSFHEG00000016611 TBC1D8 (ENSFHEG00000016677) PDCL3 (ENSFHEG00000016702) ENSFHEG00000016707 ENSFHEG00000016728 LONRF2 (ENSFHEG00000016740) MAP4K4 (ENSFHEG00000016776) ENSFHEG00000016817 ENSFHEG00000016823 ENSFHEG00000016885 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 910 stam2 (ENSCVAG00000021076) CACNB4 (ENSCVAG00000020888) ##22 arl5a (ENSCVAG00000020833) NEB (ENSCVAG00000020792) TBC1D8 (ENSCVAG00000020465) PDCL3 (ENSCVAG00000020379) ENSCVAG00000020361 LONRF2 (ENSCVAG00000020308) Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b.e ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b.f ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT00940000155107.b.b ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00940000154633.id.a Poecilia ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00940000163342.a.b.a.a.db.a ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b.e ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b.f ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT00940000155107.b.b ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B 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ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00970000193758 ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b.c ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b.d ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT00940000178691 ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00950000182900.C Indian medaka MODERN SPECIES 18 serpine3 (ENSOMEG00000016276) FAM124A (ENSOMEG00000016312) tsn (ENSOMEG00000016335) si:dkey-91i10.2 (ENSOMEG00000016381) eaf2 (ENSOMEG00000016422) cyp27a3 (ENSOMEG00000016478) slc15a2 (ENSOMEG00000016561) hspbap1 (ENSOMEG00000016593) slc49a4 (ENSOMEG00000016617) SEMA5B (ENSOMEG00000016740) pdia5 (ENSOMEG00000016828) sec22a (ENSOMEG00000016874) adcy5 (ENSOMEG00000017031) hacd2 (ENSOMEG00000017075) stam2 (ENSOMEG00000017132) CACNB4 (ENSOMEG00000000427) ##22 arl5a (ENSOMEG00000017228) NEB (ENSOMEG00000017518) ENSOMEG00000017591 TBC1D8 (ENSOMEG00000017709) PDCL3 (ENSOMEG00000017760) ENSOMEG00000017777 LONRF2 (ENSOMEG00000017796) MAP4K4 (ENSOMEG00000018134) ENSOMEG00000018288 ENSOMEG00000018317 ENSOMEG00000018459 ENSOMEG00000018561 ENSOMEG00000018595 ENSOMEG00000018642 RDX (ENSOMEG00000018770) Javanese ricefish MODERN SPECIES 13 serpine3 (ENSOJAG00000020535) FAM124A (ENSOJAG00000020537) tsn (ENSOJAG00000020539) si:dkey-91i10.2 (ENSOJAG00000020552) eaf2 (ENSOJAG00000020558) cyp27a3 (ENSOJAG00000020575) slc15a2 (ENSOJAG00000020713) hspbap1 (ENSOJAG00000021111) slc49a4 (ENSOJAG00000021169) SEMA5B (ENSOJAG00000021249) pdia5 (ENSOJAG00000021691) sec22a (ENSOJAG00000021910) adcy5 (ENSOJAG00000022023) hacd2 (ENSOJAG00000022341) stam2 (ENSOJAG00000022370) CACNB4 (ENSOJAG00000022497) ##22 arl5a (ENSOJAG00000022605) ENSOJAG00000022657 TBC1D8 (ENSOJAG00000023120) ENSOJAG00000023138 PDCL3 (ENSOJAG00000023142) ENSOJAG00000023151 ENSOJAG00000023167 MAP4K4 (ENSOJAG00000023340) ENSOJAG00000023529 ENSOJAG00000023544 ENSOJAG00000023559 ENSOJAG00000023566 ENSOJAG00000023575 ENSOJAG00000023582 RDX (ENSOJAG00000023621) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00970000193758 ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b.c ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b.d ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT00940000178691 ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00950000182900.C Chinese medaka MODERN SPECIES 893 wdfy2 (ENSOSIG00000010074) ints6 (ENSOSIG00000010387) serpine3 (ENSOSIG00000012111) FAM124A (ENSOSIG00000012113) tsn (ENSOSIG00000012116) eaf2 (ENSOSIG00000012118) cyp27a3 (ENSOSIG00000012129) slc15a2 (ENSOSIG00000012930) slc49a4 (ENSOSIG00000014203) SEMA5B (ENSOSIG00000014210) pdia5 (ENSOSIG00000014796) sec22a (ENSOSIG00000016096) adcy5 (ENSOSIG00000016118) hacd2 (ENSOSIG00000017534) stam2 (ENSOSIG00000017555) CACNB4 (ENSOSIG00000017617) ##22 arl5a (ENSOSIG00000018187) NEB (ENSOSIG00000018414) TBC1D8 (ENSOSIG00000018987) PDCL3 (ENSOSIG00000018994) ENSOSIG00000018996 LONRF2 (ENSOSIG00000019009) ENSOSIG00000019043 ENSOSIG00000019292 ENSOSIG00000019299 ENSOSIG00000019304 ENSOSIG00000019305 ENSOSIG00000019306 ENSOSIG00000019314 ENSOSIG00000019371 dcaf6 (ENSOSIG00000019887) Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 13 FAM124A (ENSORLG00000023012) tsn (ENSORLG00000010049) si:dkey-91i10.2 (ENSORLG00000025250) eaf2 (ENSORLG00000010034) cyp27a3 (ENSORLG00000010014) slc15a2 (ENSORLG00000009993) hspbap1 (ENSORLG00000009946) slc49a4 (ENSORLG00000009930) SEMA5B (ENSORLG00000009896) ENSORLG00000025904 pdia5 (ENSORLG00000009839) sec22a (ENSORLG00000009807) adcy5 (ENSORLG00000009753) hacd2 (ENSORLG00000009719) stam2 (ENSORLG00000009689) CACNB4 (ENSORLG00000024066) ##22 arl5a (ENSORLG00000009664) ENSORLG00000009639 ENSORLG00000025341 ENSORLG00000029464 ENSORLG00000025648 TBC1D8 (ENSORLG00000009369) ENSORLG00000022389 PDCL3 (ENSORLG00000009325) ENSORLG00000009303 ENSORLG00000023781 LONRF2 (ENSORLG00000009293) ENSORLG00000009266 ENSORLG00000009213 ENSORLG00000024138 ENSORLG00000022543 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 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ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT00940000158407 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 148 ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00940000154533.b.b.b ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT00940000158407 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00950000182912.b.a.a.b.b.a.b.a.b.b.b.a.a.a.a.b.a.b.e ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a 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(ENSSPAG00000015634) stam2 (ENSSPAG00000015651) CACNB4 (ENSSPAG00000015726) ##22 arl5a (ENSSPAG00000015760) ENSSPAG00000015782 ENSSPAG00000015831 ENSSPAG00000015909 ENSSPAG00000015920 TBC1D8 (ENSSPAG00000015955) PDCL3 (ENSSPAG00000016008) ENSSPAG00000016037 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT00940000155107.b.b ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00940000154633.id.a ENSGT00940000157559 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT00940000155107.b.b ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00940000154633.id.a ENSGT00940000157559 Nile tilapia MODERN SPECIES 7 ints6 (ENSONIG00000017067) serpine3 (ENSONIG00000017064) FAM124A (ENSONIG00000042893) tsn (ENSONIG00000029221) eaf2 (ENSONIG00000017058) cyp27a3 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ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT00940000155107.b.b ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00940000154633.id.a ENSGT00940000157559 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 350 ints6 (ENSNBRG00000001247) serpine3 (ENSNBRG00000001217) FAM124A (ENSNBRG00000001208) tsn (ENSNBRG00000001193) si:dkey-91i10.2 (ENSNBRG00000001170) eaf2 (ENSNBRG00000001130) cyp27a3 (ENSNBRG00000001080) ENSNBRG00000001055 hspbap1 (ENSNBRG00000001045) slc49a4 (ENSNBRG00000001016) SEMA5B (ENSNBRG00000000946) pdia5 (ENSNBRG00000000886) sec22a (ENSNBRG00000000854) adcy5 (ENSNBRG00000000787) stam2 (ENSNBRG00000000648) CACNB4 (ENSNBRG00000000606) ##22 arl5a (ENSNBRG00000000570) ENSNBRG00000000440 ENSNBRG00000000370 ENSNBRG00000022341 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ENSGT00940000157559 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 549 eaf2 (ENSHBUG00000011171) cyp27a3 (ENSHBUG00000011199) slc15a2 (ENSHBUG00000011233) hspbap1 (ENSHBUG00000011249) slc49a4 (ENSHBUG00000011282) SEMA5B (ENSHBUG00000011332) pdia5 (ENSHBUG00000011423) sec22a (ENSHBUG00000000312) adcy5 (ENSHBUG00000011552) hacd2 (ENSHBUG00000011595) stam2 (ENSHBUG00000000315) CACNB4 (ENSHBUG00000011640) ##22 arl5a (ENSHBUG00000011659) ENSHBUG00000012438 ENSHBUG00000012490 ENSHBUG00000012582 TBC1D8 (ENSHBUG00000012658) PDCL3 (ENSHBUG00000012683) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a 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ENSPNYG00000011542 ENSPNYG00000011510 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT00940000155107.b.b ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00940000154633.id.a ENSGT00940000157559 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1098 serpine3 (ENSMZEG00005018707) FAM124A (ENSMZEG00005018713) tsn (ENSMZEG00005018715) si:dkey-91i10.2 (ENSMZEG00005018721) eaf2 (ENSMZEG00005018727) 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ENSTRUG00000015416 ENSTRUG00000021536 ENSTRUG00000015562 Tetraodon MODERN SPECIES 13 serpine3 (ENSTNIG00000015708) FAM124A (ENSTNIG00000000831) tsn (ENSTNIG00000015707) si:dkey-91i10.2 (ENSTNIG00000015706) eaf2 (ENSTNIG00000015705) cyp27a3 (ENSTNIG00000015704) slc15a2 (ENSTNIG00000015703) hspbap1 (ENSTNIG00000015702) slc49a4 (ENSTNIG00000015701) SEMA5B (ENSTNIG00000015700) pdia5 (ENSTNIG00000015699) sec22a (ENSTNIG00000015698) adcy5 (ENSTNIG00000015697) hacd2 (ENSTNIG00000001029) stam2 (ENSTNIG00000015696) CACNB4 (ENSTNIG00000015695) ##22 arl5a (ENSTNIG00000000814) NEB (ENSTNIG00000015694) ENSTNIG00000015693 TBC1D8 (ENSTNIG00000015692) PDCL3 (ENSTNIG00000015691) LONRF2 (ENSTNIG00000015690) MAP4K4 (ENSTNIG00000015689) ENSTNIG00000015688 ENSTNIG00000015687 ENSTNIG00000015686 ENSTNIG00000015685 ENSTNIG00000015684 ENSTNIG00000015683 ENSTNIG00000015682 ENSTNIG00000015681 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a 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ENSLBEG00000013709 ENSLBEG00000012883 ENSLBEG00000012864 ENSLBEG00000012809 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT00940000155107.b.b ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00940000154633.id.a ENSGT00940000157559 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b 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ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT00940000155107.b.b ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00940000154633.id.a ENSGT00940000157559 Large yellow croaker MODERN SPECIES 65 cyp27a3 (ENSLCRG00005015275) slc15a2 (ENSLCRG00005015312) hspbap1 (ENSLCRG00005015358) slc49a4 (ENSLCRG00005015362) SEMA5B (ENSLCRG00005015380) pdia5 (ENSLCRG00005016119) sec22a (ENSLCRG00005016860) adcy5 (ENSLCRG00005016872) hacd2 (ENSLCRG00005017822) stam2 (ENSLCRG00005017826) CACNB4 (ENSLCRG00005017846) ##22 arl5a (ENSLCRG00005018151) NEB (ENSLCRG00005018164) TBC1D8 (ENSLCRG00005018277) PDCL3 (ENSLCRG00005018340) ENSLCRG00005018341 ENSLCRG00005018342 ENSLCRG00005018344 European seabass MODERN SPECIES 5 ints6 (ENSDLAG00005012538) serpine3 (ENSDLAG00005013918) FAM124A (ENSDLAG00005013922) tsn (ENSDLAG00005013926) ENSDLAG00005013944 cyp27a3 (ENSDLAG00005013958) slc15a2 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ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT00940000157559 ENSGT00530000063927.a.b ENSGT00940000165376 ENSGT00940000162718 ENSGT00940000165604 Lumpfish MODERN SPECIES 13 ENSCLMG00005010967 ENSCLMG00005010966 FAM124A (ENSCLMG00005010963) tsn (ENSCLMG00005010961) eaf2 (ENSCLMG00005010957) cyp27a3 (ENSCLMG00005010750) slc15a2 (ENSCLMG00005010747) hspbap1 (ENSCLMG00005010746) slc49a4 (ENSCLMG00005010744) pdia5 (ENSCLMG00005009114) sec22a (ENSCLMG00005009107) ENSCLMG00005009106 adcy5 (ENSCLMG00005009105) hacd2 (ENSCLMG00005009104) stam2 (ENSCLMG00005009103) CACNB4 (ENSCLMG00005009034) ##22 ARL5A (ENSCLMG00005009031) ENSCLMG00005009026 ENSCLMG00005020758 ENSCLMG00005020756 TBC1D8 (ENSCLMG00005020726) PDCL3 (ENSCLMG00005020722) ENSCLMG00005020720 LONRF2 (ENSCLMG00005020705) ENSCLMG00005020245 ENSCLMG00005020229 ENSCLMG00005020228 ENSCLMG00005020225 ENSCLMG00005020218 ENSCLMG00005020217 ENSCLMG00005020213 Stickleback MODERN SPECIES 198 pdia5 (ENSGACG00000001238) sec22a (ENSGACG00000001235) adcy5 (ENSGACG00000001233) hacd2 (ENSGACG00000001232) stam2 (ENSGACG00000001225) CACNB4 (ENSGACG00000001218) ##22 arl5a (ENSGACG00000001204) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000016655.a.a.b ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00940000154633.id.a ENSGT00940000157559 ENSGT00530000063927.a.b Pike perch MODERN SPECIES 1 ints6 (ENSSLUG00000014407) serpine3 (ENSSLUG00000014394) 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ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT00940000155107.b.b ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00940000154633.id.a Carangaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00970000193758 ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT00940000155107.b.b ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00940000154633.id.a.a.a Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT00940000155107.b.b ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00940000154633.id.a.a.a ENSGT00940000157559 Turbot MODERN SPECIES 5 ints6 (ENSSMAG00000005656) serpine3 (ENSSMAG00000005778) FAM124A (ENSSMAG00000005813) tsn (ENSSMAG00000026082) si:dkey-91i10.2 (ENSSMAG00000005848) eaf2 (ENSSMAG00000005873) cyp27a3 (ENSSMAG00000005878) slc15a2 (ENSSMAG00000005904) hspbap1 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(ENSCSEG00000003354) PDCL3 (ENSCSEG00000003347) ENSCSEG00000003345 ENSCSEG00000003336 ENSCSEG00000003329 ENSCSEG00000003312 ccnyl1 (ENSCSEG00000003305) fzd5 (ENSCSEG00000003301) PLEKHM3 (ENSCSEG00000003299) LANCL3 (ENSCSEG00000003293) GRPR (ENSCSEG00000003291) asb11 (ENSCSEG00000003287) piga (ENSCSEG00000003284) Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00970000193758 ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT00940000155107.b.b ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00940000154633.id.a.a.b Seriola ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00940000180504 ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT00940000155107.b.b ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00940000154633.id.a.a.b Greater amberjack MODERN SPECIES 21 serpine3 (ENSSDUG00000011369) FAM124A (ENSSDUG00000011382) tsn (ENSSDUG00000011388) si:dkey-91i10.2 (ENSSDUG00000011404) eaf2 (ENSSDUG00000011419) cyp27a3 (ENSSDUG00000011448) slc15a2 (ENSSDUG00000011607) hspbap1 (ENSSDUG00000011859) slc49a4 (ENSSDUG00000011881) SEMA5B (ENSSDUG00000011942) pdia5 (ENSSDUG00000012035) sec22a (ENSSDUG00000012096) adcy5 (ENSSDUG00000012121) hacd2 (ENSSDUG00000012187) stam2 (ENSSDUG00000012211) CACNB4 (ENSSDUG00000012235) ##22 arl5a (ENSSDUG00000012261) NEB (ENSSDUG00000012291) ENSSDUG00000012644 TBC1D8 (ENSSDUG00000012655) PDCL3 (ENSSDUG00000012715) ENSSDUG00000012749 LONRF2 (ENSSDUG00000012768) ENSSDUG00000012823 ENSSDUG00000013083 ENSSDUG00000013116 ENSSDUG00000013124 ENSSDUG00000013156 ENSSDUG00000013210 ENSSDUG00000013237 ENSSDUG00000013349 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2832 SEMA5B (ENSSLDG00000011835) pdia5 (ENSSLDG00000011961) sec22a (ENSSLDG00000012018) adcy5 (ENSSLDG00000012045) hacd2 (ENSSLDG00000012094) stam2 (ENSSLDG00000012122) CACNB4 (ENSSLDG00000012176) ##22 arl5a (ENSSLDG00000012215) NEB (ENSSLDG00000012295) TBC1D8 (ENSSLDG00000012658) PDCL3 (ENSSLDG00000012691) ENSSLDG00000012705 LONRF2 (ENSSLDG00000012720) ENSSLDG00000012741 Barramundi perch MODERN SPECIES 559 HACD2 (ENSLCAG00010013290) stam2 (ENSLCAG00010013283) CACNB4 (ENSLCAG00010012825) ##22 arl5a (ENSLCAG00010012609) NEB (ENSLCAG00010012406) ENSLCAG00010012315 TBC1D8 (ENSLCAG00010012297) PDCL3 (ENSLCAG00010012288) ENSLCAG00010012283 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00940000180504 ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT00940000155107.b.b ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00940000154633.id.a Zig-zag eel MODERN SPECIES 13 serpine3 (ENSMAMG00000019529) FAM124A (ENSMAMG00000024614) tsn (ENSMAMG00000025392) si:dkey-91i10.2 (ENSMAMG00000019548) eaf2 (ENSMAMG00000019564) cyp27a3 (ENSMAMG00000019578) slc15a2 (ENSMAMG00000026378) hspbap1 (ENSMAMG00000026001) slc49a4 (ENSMAMG00000019623) SEMA5B (ENSMAMG00000019659) pdia5 (ENSMAMG00000019703) sec22a (ENSMAMG00000019731) adcy5 (ENSMAMG00000019746) hacd2 (ENSMAMG00000019801) stam2 (ENSMAMG00000019821) CACNB4 (ENSMAMG00000019860) ##22 ARL5A (ENSMAMG00000027277) NEB (ENSMAMG00000019894) ENSMAMG00000020181 ENSMAMG00000020192 ENSMAMG00000024626 ENSMAMG00000020227 ENSMAMG00000020244 ENSMAMG00000020327 ENSMAMG00000020340 ENSMAMG00000026143 ENSMAMG00000024378 ENSMAMG00000020363 ENSMAMG00000020372 ENSMAMG00000020376 ENSMAMG00000020394 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000160941 ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT00940000155107.b.b ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00940000154633.id.a ENSGT00940000157559 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 11 FAM124A (ENSBSLG00000004888) tsn (ENSBSLG00000026370) si:dkey-91i10.2 (ENSBSLG00000026366) eaf2 (ENSBSLG00000026362) cyp27a3 (ENSBSLG00000026352) slc15a2 (ENSBSLG00000026319) hspbap1 (ENSBSLG00000026317) slc49a4 (ENSBSLG00000026314) SEMA5B (ENSBSLG00000026308) pdia5 (ENSBSLG00000026268) sec22a (ENSBSLG00000026258) ENSBSLG00000026257 adcy5 (ENSBSLG00000026233) hacd2 (ENSBSLG00000026204) stam2 (ENSBSLG00000026132) ENSBSLG00000026022 ##22 arl5a (ENSBSLG00000025945) TBC1D8 (ENSBSLG00000025466) PDCL3 (ENSBSLG00000025447) ENSBSLG00000025438 LONRF2 (ENSBSLG00000025406) ENSBSLG00000025030 ENSBSLG00000025004 ENSBSLG00000025002 ENSBSLG00000024992 ENSBSLG00000024988 ENSBSLG00000024967 ENSBSLG00000024960 ENSBSLG00000024274 ENSBSLG00000024248 ENSBSLG00000024244 Climbing perch MODERN SPECIES 12 serpine3 (ENSATEG00000004161) FAM124A (ENSATEG00000004152) tsn (ENSATEG00000004115) si:dkey-91i10.2 (ENSATEG00000029540) eaf2 (ENSATEG00000004077) cyp27a3 (ENSATEG00000004072) slc15a2 (ENSATEG00000004067) hspbap1 (ENSATEG00000028873) slc49a4 (ENSATEG00000004012) SEMA5B (ENSATEG00000003908) pdia5 (ENSATEG00000003836) sec22a (ENSATEG00000003791) adcy5 (ENSATEG00000003696) hacd2 (ENSATEG00000003649) stam2 (ENSATEG00000028152) CACNB4 (ENSATEG00000003524) ##22 ARL5A (ENSATEG00000003498) NEB (ENSATEG00000002749) ENSATEG00000002673 ENSATEG00000002656 ENSATEG00000002636 ENSATEG00000002621 ENSATEG00000002499 ENSATEG00000002454 ENSATEG00000002411 ENSATEG00000002367 ENSATEG00000002356 ENSATEG00000002343 ENSATEG00000002260 ENSATEG00000002204 ENSATEG00000002198 Cod MODERN SPECIES 12 ints6 (ENSGMOG00000009262) serpine3 (ENSGMOG00000009253) FAM124A (ENSGMOG00000025071) tsn (ENSGMOG00000009247) si:dkey-91i10.2 (ENSGMOG00000028959) eaf2 (ENSGMOG00000010425) cyp27a3 (ENSGMOG00000010411) slc15a2 (ENSGMOG00000010389) hspbap1 (ENSGMOG00000010372) slc49a4 (ENSGMOG00000010357) pdia5 (ENSGMOG00000015375) sec22a (ENSGMOG00000014101) adcy5 (ENSGMOG00000014058) hacd2 (ENSGMOG00000026627) stam2 (ENSGMOG00000013013) CACNB4 (ENSGMOG00000013002) ##22 arl5a (ENSGMOG00000012994) NEB (ENSGMOG00000013381) ENSGMOG00000031755 ENSGMOG00000024933 rif1 (ENSGMOG00000003517) tnfaip6 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ENSGT00940000163494.a.a.c.b.a ENSGT00940000163494.a.a.c.a.c ENSGT00940000156768 ENSGT00940000165279.c ENSGT00940000177452 ENSGT01090000259987.b.b.a.b Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 260 ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 ENSGT00940000165279.d ENSGT00940000163494.a.a.c.a.d ENSGT00940000163494.a.a.c.b.b ENSGT00940000163322.a.a.b ENSGT00940000163148.a.a.b ENSGT00940000163148.a.b.a ENSGT00940000163494.a.b.a ENSGT00940000164501.a.a.b.a ENSGT00530000063480.a ENSGT00390000008096.B.e.b ENSGT00940000160342.g.a ENSGT00940000165242.d Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 223 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 95 ENSGT00940000157872 ENSGT00940000157849.n.c ENSGT00940000162479.a ENSGT00940000155360.B.k ENSGT00940000157269.a.b ENSGT00940000164275.f.d ENSGT00940000164275.f.c ENSGT00390000018553 ENSGT00940000153514.b.m.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000159848 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000157872 ENSGT00940000157849.n.c ENSGT00940000162479.a ENSGT00940000155360.B.k ENSGT00940000157269.a.b ENSGT00940000164275.f.d ENSGT00940000164275.f.c ENSGT00390000018553 ENSGT00940000153514.b.m.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000159848 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 ENSGT00940000165279.d ENSGT00940000163494.a.a.c.a.d ENSGT00940000163322.a.a.b ENSGT00940000163494.a.a.c.b.b ENSGT00940000179011 ENSGT00390000008096.B.e.b ENSGT00940000160342.g.a ENSGT00940000165242.d ENSGT00530000063669.b.b ENSGT00390000002403 ENSGT00950000183302 ENSGT00940000158367 ENSGT00940000161679.b ENSGT00940000154443.e ENSGT00940000159196 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000157872 ENSGT00940000157849.n.c ENSGT00940000162479.a ENSGT00940000155360.B.k ENSGT00940000157269.a.b ENSGT00940000164275.f.d ENSGT00940000164275.f.c ENSGT00390000018553 ENSGT00940000153514.b.m.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000159848 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 ENSGT01030000234765 ENSGT00390000008096.B.e.b ENSGT00940000160342.g.a ENSGT00940000165242.d ENSGT00530000063669.b.b ENSGT00390000002403 ENSGT00950000183302 ENSGT00940000158367 ENSGT00940000161679.b ENSGT00940000154443.e ENSGT00940000159196 ENSGT00940000153981.A ENSGT00640000091610 ENSGT00940000165189 ENSGT00610000086518.b.b Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000157872 ENSGT00940000157849.n.c ENSGT00940000162479.a ENSGT00940000155360.B.k ENSGT00940000157269.a.b ENSGT00940000164275.f.d ENSGT00940000164275.f.c ENSGT00390000018553 ENSGT00940000153514.b.m.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000159848 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 ENSGT01030000234765 ENSGT00940000153981.A ENSGT00940000159196 ENSGT00940000154443.e ENSGT00940000161679.b ENSGT00940000158367 ENSGT00950000183302 ENSGT00390000002403 ENSGT00530000063669.b.b ENSGT00940000165242.d ENSGT00940000160342.g.a ENSGT00390000008096.B.e.b ENSGT00530000063480.a ENSGT00940000164501.a.a.b.a ENSGT00940000163494.a.b.a Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000154776 ENSGT00940000159138 ENSGT00940000158310 ENSGT00940000164506.b.b ENSGT00940000160257 ENSGT00940000177903 ENSGT00940000160315 ENSGT00940000157552.s.b ENSGT00390000016298.a ENSGT00940000153514.b.m.b ENSGT00940000155502 ENSGT00390000007055 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b ENSGT00940000159848 ENSGT00940000166946 ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 ENSGT00940000165279.d ENSGT00940000163494.a.a.c.b.b ENSGT00940000163322.a.a.b ENSGT00940000164501.a.a.a.b ENSGT00940000164501.a.a.a.a.a ENSGT00940000163494.a.b.a ENSGT00940000164501.a.a.b.a ENSGT00530000063480.a ENSGT00390000008096.B.e.b ENSGT00730000111141 ENSGT00940000160394.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b Fugu MODERN SPECIES 20 hao1 (ENSTRUG00000009090) smg1 (ENSTRUG00000009037) fbxl16 (ENSTRUG00000008908) ENSTRUG00000021364 tspan35 (ENSTRUG00000008673) ENSTRUG00000008577 ENSTRUG00000020265 epor (ENSTRUG00000022478) rab3db (ENSTRUG00000008417) tmem205 (ENSTRUG00000024674) ndufs1 (ENSTRUG00000007977) kpnb3 (ENSTRUG00000007387) atg13 (ENSTRUG00000007133) creb3l1 (ENSTRUG00000007014) zgc:110699 (ENSTRUG00000023270) cacnb4.1 (ENSTRUG00000006633) ##22 etv5b (ENSTRUG00000028062) ENSTRUG00000006250 ENSTRUG00000023210 ENSTRUG00000005499 ENSTRUG00000020190 ENSTRUG00000021705 SATB2 (ENSTRUG00000032787) ENSTRUG00000019967 CHRM4 (ENSTRUG00000004253) DGKZ (ENSTRUG00000003102) cryaa (ENSTRUG00000002869) ENSTRUG00000025902 ankrd10a (ENSTRUG00000020089) vasa (ENSTRUG00000030182) UBE3A (ENSTRUG00000006347) Tetraodon MODERN SPECIES 18 ENSTNIG00000014186 hao1 (ENSTNIG00000014187) ENSTNIG00000014188 FBXL16 (ENSTNIG00000014189) ENSTNIG00000019672 ENSTNIG00000002611 ENSTNIG00000001720 ENSTNIG00000001791 rab3db (ENSTNIG00000005293) ENSTNIG00000004253 ndufs1 (ENSTNIG00000004252) kpnb3 (ENSTNIG00000004251) atg13 (ENSTNIG00000004250) HARBI1 (ENSTNIG00000004249) ENSTNIG00000004248 ENSTNIG00000014461 ##22 etv5b (ENSTNIG00000014462) ENSTNIG00000014463 ENSTNIG00000000360 ENSTNIG00000000847 ENSTNIG00000014464 ENSTNIG00000014465 ENSTNIG00000014466 ENSTNIG00000014467 ENSTNIG00000014468 ENSTNIG00000014469 DGKZ (ENSTNIG00000014470) cryaa (ENSTNIG00000014471) ENSTNIG00000014472 ankrd10a (ENSTNIG00000014473) ddx4 (ENSTNIG00000014474) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000157872 ENSGT00940000157849.n.c ENSGT00940000162479.a ENSGT00940000155360.B.k ENSGT00940000157269.a.b ENSGT00940000164275.f.d ENSGT00940000164275.f.c ENSGT00390000018553 ENSGT00940000153514.b.m.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000159848 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a 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ENSGT00940000166946 ENSGT00940000159848 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 ENSGT01030000234765 ENSGT00940000153981.A ENSGT00940000159196 ENSGT00940000154443.e ENSGT00940000161679.b ENSGT00940000158367 ENSGT00950000183302 ENSGT00390000002403 ENSGT00530000063669.b.b ENSGT00940000165242.d ENSGT00940000160342.g.a ENSGT00390000008096.B.e.b ENSGT00530000063480.a ENSGT00940000164501.a.a.b.a ENSGT00940000163494.a.b.a Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000157872 ENSGT00940000157849.n.c ENSGT00940000162479.a ENSGT00940000155360.B.k ENSGT00940000157269.a.b ENSGT00940000164275.f.d ENSGT00940000164275.f.c ENSGT00390000018553 ENSGT00940000153514.b.m.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000159848 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 ENSGT00940000165279.d ENSGT00940000163494.a.a.c.a.d ENSGT00940000163322.a.a.b ENSGT00940000163149.a.a Gilthead seabream MODERN SPECIES 16 ENSSAUG00010010439 ENSSAUG00010010414 etv5b (ENSSAUG00010010411) dhrsx (ENSSAUG00010010409) prrg2 (ENSSAUG00010010406) PRR12 (ENSSAUG00010010404) ENSSAUG00010010373 ENSSAUG00010010365 SLITRK2 (ENSSAUG00010010363) ENSSAUG00010010361 tspan4b (ENSSAUG00010010356) ENSSAUG00010010353 ENSSAUG00010010350 nosip (ENSSAUG00010010326) rcn3 (ENSSAUG00010010323) CACNB4 (ENSSAUG00010010040) ##22 sowahcb (ENSSAUG00010010031) odad3 (ENSSAUG00010010029) cep70 (ENSSAUG00010010027) adarb1a (ENSSAUG00010009927) slx9 (ENSSAUG00010009921) ENSSAUG00010009325 cnot9 (ENSSAUG00010009307) ENSSAUG00010009294 ENSSAUG00010009288 GPR180 (ENSSAUG00010009278) ENSSAUG00010009272 ENSSAUG00010008780 slc5a3a (ENSSAUG00010008769) ENSSAUG00010008767 ENSSAUG00010008766 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000157872 ENSGT00940000157849.n.c ENSGT00940000162479.a ENSGT00940000155360.B.k ENSGT00940000157269.a.b ENSGT00940000164275.f.d ENSGT00940000164275.f.c ENSGT00390000018553 ENSGT00940000153514.b.m.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000159848 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 ENSGT00940000165279.d ENSGT00940000163494.a.a.c.a.d European seabass MODERN SPECIES 15 tubgcp3 (ENSDLAG00005025561) ENSDLAG00005025632 ENSDLAG00005025656 arhgef7b (ENSDLAG00005025674) ENSDLAG00005025778 ENSDLAG00005025847 ENSDLAG00005025856 ENSDLAG00005025657 ENSDLAG00005025864 ENSDLAG00005029152 ENSDLAG00005025879 ENSDLAG00005025881 ENSDLAG00005032120 ENSDLAG00005025890 ENSDLAG00005025911 ENSDLAG00005025952 ##22 ENSDLAG00005025986 ENSDLAG00005025990 ENSDLAG00005033835 ENSDLAG00005011417 ENSDLAG00005001958 ENSDLAG00005034722 ENSDLAG00005001953 ENSDLAG00005025992 ENSDLAG00005025993 ENSDLAG00005025995 ENSDLAG00005025996 ENSDLAG00005025997 ENSDLAG00005025999 ENSDLAG00005026004 ENSDLAG00005026014 Large yellow croaker MODERN SPECIES 486 tubgcp3 (ENSLCRG00005022823) ATP11A (ENSLCRG00005022843) SOX1 (ENSLCRG00005023079) arhgef7b (ENSLCRG00005023088) ENSLCRG00005023190 ENSLCRG00005023257 ENSLCRG00005023260 unc50 (ENSLCRG00005023261) ndufs1 (ENSLCRG00005023262) zgc:110699 (ENSLCRG00005023265) creb3l1 (ENSLCRG00005023267) ENSLCRG00005023270 atg13 (ENSLCRG00005023275) kpnb3 (ENSLCRG00005023289) SEMA5B (ENSLCRG00005023321) CACNB4 (ENSLCRG00005023338) ##22 etv5b (ENSLCRG00005023557) ENSLCRG00005023561 ENSLCRG00005023563 SATB2 (ENSLCRG00005023566) ENSLCRG00005023568 ENSLCRG00005000862 ENSLCRG00005000884 ENSLCRG00005000951 fam184aa (ENSLCRG00005000981) ENSLCRG00005001029 ENSLCRG00005001031 ENSLCRG00005001043 plaat1l (ENSLCRG00005001056) ENSLCRG00005001061 dusp27 (ENSLCRG00005001063) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000157872 ENSGT00940000157849.n.c ENSGT00940000162479.a ENSGT00940000155360.B.k ENSGT00940000157269.a.b ENSGT00940000164275.f.d ENSGT00940000164275.f.c ENSGT00390000018553 ENSGT00940000153514.b.m.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000159848 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 ENSGT01030000234765 ENSGT00940000153981.A ENSGT00940000159196 ENSGT00940000154443.e ENSGT00940000161679.b ENSGT00940000158367 ENSGT00950000183302 ENSGT00390000002403 ENSGT00530000063669.b.b ENSGT00940000165242.d ENSGT00390000008096.B.e.b ENSGT00530000063480.a ENSGT00940000164501.a.a.b.a ENSGT00940000163494.a.b.a ENSGT00940000164501.a.a.a.a.b Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000157872 ENSGT00940000157849.n.c ENSGT00940000162479.a ENSGT00940000155360.B.k ENSGT00940000157269.a.b ENSGT00940000164275.f.d ENSGT00940000164275.f.c ENSGT00390000018553 ENSGT00940000153514.b.m.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000159848 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 ENSGT01030000234765 ENSGT00940000153981.A ENSGT00940000159196 ENSGT00940000154443.e ENSGT00940000161679.b ENSGT00940000158367 ENSGT00950000183302 ENSGT00390000002403 ENSGT00530000063669.b.b ENSGT00940000165242.d ENSGT00390000008096.B.e.b ENSGT00530000063480.a ENSGT00940000164501.a.a.b.a ENSGT00940000163494.a.b.a ENSGT00940000164501.a.a.a.a.b Pike perch MODERN SPECIES 9 tubgcp3 (ENSSLUG00000019071) ATP11A (ENSSLUG00000018831) ENSSLUG00000018752 SOX1 (ENSSLUG00000018748) ENSSLUG00000018742 arhgef7b (ENSSLUG00000018682) ENSSLUG00000018666 ENSSLUG00000018647 unc50 (ENSSLUG00000018635) ndufs1 (ENSSLUG00000018357) zgc:110699 (ENSSLUG00000018339) HARBI1 (ENSSLUG00000018331) atg13 (ENSSLUG00000018288) kpnb3 (ENSSLUG00000018227) SEMA5B (ENSSLUG00000018070) CACNB4 (ENSSLUG00000016995) ##22 ENSSLUG00000016922 GPR180 (ENSSLUG00000016911) TGDS (ENSSLUG00000016873) ENSSLUG00000013681 SLC5A3 (ENSSLUG00000013374) ENSSLUG00000013332 ENSSLUG00000013321 fam184aa (ENSSLUG00000013307) ENSSLUG00000013247 SATB2 (ENSSLUG00000013227) ENSSLUG00000013211 crygm6 (ENSSLUG00000013185) CRYGS (ENSSLUG00000013147) ENSSLUG00000013133 ENSSLUG00000013131 Channel bull blenny MODERN SPECIES 11 arhgef7b (ENSCGOG00000009531) ENSCGOG00000009396 ENSCGOG00000009350 ENSCGOG00000009342 ENSCGOG00000009326 ENSCGOG00000009315 unc50 (ENSCGOG00000009301) ndufs1 (ENSCGOG00000008954) ENSCGOG00000008946 zgc:110699 (ENSCGOG00000008944) creb3l1 (ENSCGOG00000008935) ENSCGOG00000008930 atg13 (ENSCGOG00000008766) kpnb3 (ENSCGOG00000008080) SEMA5B (ENSCGOG00000007498) CACNB4 (ENSCGOG00000007095) ##22 ENSCGOG00000007075 GPR180 (ENSCGOG00000007070) ENSCGOG00000007022 ENSCGOG00000003388 SLC5A3 (ENSCGOG00000003169) ENSCGOG00000003158 ENSCGOG00000003155 ENSCGOG00000003153 fam184aa (ENSCGOG00000002863) ENSCGOG00000002835 SATB2 (ENSCGOG00000002805) ENSCGOG00000002782 ENSCGOG00000002642 ENSCGOG00000021794 ENSCGOG00000021792 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000157872 ENSGT00940000157849.n.c ENSGT00940000162479.a ENSGT00940000155360.B.k ENSGT00940000157269.a.b ENSGT00940000164275.f.d ENSGT00940000164275.f.c ENSGT00390000018553 ENSGT00940000153514.b.m.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000159848 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 ENSGT01030000234765 Lumpfish MODERN SPECIES 11 ENSCLMG00005004962 mdh1b (ENSCLMG00005004965) retreg2 (ENSCLMG00005004966) ENSCLMG00005004978 ##30 cnppd1 (ENSCLMG00005006258) ENSCLMG00005006260 ENSCLMG00005006261 unc50 (ENSCLMG00005006262) NDUFS1 (ENSCLMG00005006264) zgc:110699 (ENSCLMG00005006484) ENSCLMG00005006485 ENSCLMG00005006486 atg13 (ENSCLMG00005006491) kpnb3 (ENSCLMG00005006494) SEMA5B (ENSCLMG00005006708) CACNB4 (ENSCLMG00005006794) ##22 ENSCLMG00005008472 mettl21a (ENSCLMG00005008474) CREB1 (ENSCLMG00005008475) klf7a (ENSCLMG00005008477) si:ch211-93g23.2 (ENSCLMG00005008480) RAMP1 (ENSCLMG00005008481) erbb4a (ENSCLMG00005008494) lancl1 (ENSCLMG00005010669) mylz3 (ENSCLMG00005010673) acadl (ENSCLMG00005010710) ENSCLMG00005010881 CTDSP1 (ENSCLMG00005010886) ENSCLMG00005010888 ENSCLMG00005010890 ENSCLMG00005010891 Stickleback MODERN SPECIES ENSGACG00000014859 tubgcp3 (ENSGACG00000014853) ATP11A (ENSGACG00000014851) SOX1 (ENSGACG00000014850) arhgef7b (ENSGACG00000014843) ENSGACG00000014838 ENSGACG00000014833 ENSGACG00000014831 unc50 (ENSGACG00000014827) ndufs1 (ENSGACG00000014821) zgc:110699 (ENSGACG00000014819) HARBI1 (ENSGACG00000014817) atg13 (ENSGACG00000014810) kpnb3 (ENSGACG00000014804) SEMA5B (ENSGACG00000014799) CACNB4 (ENSGACG00000014790) ##22 UNC80 (ENSGACG00000014773) ENSGACG00000014770 acadl (ENSGACG00000014754) ENSGACG00000014752 lancl1 (ENSGACG00000014735) erbb4a (ENSGACG00000014727) RAMP1 (ENSGACG00000014723) si:ch211-93g23.2 (ENSGACG00000014722) klf7a (ENSGACG00000014720) CREB1 (ENSGACG00000014712) mettl21a (ENSGACG00000014709) CYP4F8 (ENSGACG00000014669) stoml2 (ENSGACG00000014645) ENSGACG00000014643 ENSGACG00000014641 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000156984.a.a ENSGT00940000157872 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ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 ENSGT01030000234765 ENSGT00940000153981.A ENSGT00940000159196 ENSGT00940000154443.e ENSGT00940000161679.b ENSGT00940000158367 ENSGT00950000183302 ENSGT00390000002403 ENSGT00530000063669.b.b ENSGT00940000165242.d ENSGT00940000160342.g.a ENSGT00390000008096.B.e.b ENSGT00530000063480.a ENSGT00940000164501.a.a.b.a ENSGT00940000163494.a.b.a Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 82 ENSGT00940000164275.f.d ENSGT00390000018553 ENSGT00940000153514.b.m.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000159848 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 ENSGT01030000234765 ENSGT00940000163322.a.a.b ENSGT00940000164501.a.a.a.b ENSGT00940000164501.a.a.a.a.a ENSGT00940000163148.a.b.a ENSGT00940000163494.a.b.a ENSGT00940000164501.a.a.b.a ENSGT00390000008096.B.e.b ENSGT00940000160342.g.a ENSGT00940000165242.d ENSGT00530000063669.b.b ENSGT00390000002403 ENSGT00950000183302 ENSGT00940000158367 ENSGT00940000161679.b Turbot MODERN SPECIES 16 ccdc96 (ENSSMAG00000013576) ENSSMAG00000025442 TBC1D14 (ENSSMAG00000013479) kiaa0232 (ENSSMAG00000013437) S100P (ENSSMAG00000013420) S100P (ENSSMAG00000013426) ENSSMAG00000013315 ENSSMAG00000013290 ENSSMAG00000013238 ENSSMAG00000013147 ENSSMAG00000013130 ENSSMAG00000013115 ENSSMAG00000012948 ENSSMAG00000012862 ENSSMAG00000012818 ENSSMAG00000012768 ##22 ENSSMAG00000012754 ENSSMAG00000012717 ENSSMAG00000012617 ENSSMAG00000012481 ENSSMAG00000012593 ENSSMAG00000012587 ENSSMAG00000012470 ENSSMAG00000012396 ENSSMAG00000012373 ENSSMAG00000012347 ENSSMAG00000012312 ENSSMAG00000012260 ENSSMAG00000012251 ENSSMAG00000012237 ENSSMAG00000012225 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000156984.a.a ENSGT00940000157872 ENSGT00940000157849.n.c ENSGT00940000162479.a ENSGT00940000155360.B.k ENSGT00940000157269.a.b ENSGT00940000164275.f.d ENSGT00390000018553 ENSGT00940000153514.b.m.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000159848 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 ENSGT01030000234765 ENSGT00940000153981.A ENSGT00940000159196 ENSGT00940000154443.e ENSGT00940000161679.b ENSGT00940000158367 ENSGT00950000183302 ENSGT00390000002403 ENSGT00530000063669.b.b ENSGT00940000165242.d ENSGT00940000160342.g.a ENSGT00390000008096.B.e.b ENSGT00530000063480.a ENSGT00940000164501.a.a.b.a ENSGT00940000163322.a.b.a.a Barramundi perch MODERN SPECIES 165 rcbtb1 (ENSLCAG00010017866) ENSLCAG00010017889 tubgcp3 (ENSLCAG00010017896) ATP11A (ENSLCAG00010017994) SOX1 (ENSLCAG00010018822) arhgef7b (ENSLCAG00010018976) ENSLCAG00010019392 ENSLCAG00010019436 unc50 (ENSLCAG00010019438) ndufs1 (ENSLCAG00010019461) zgc:110699 (ENSLCAG00010019583) HARBI1 (ENSLCAG00010019629) atg13 (ENSLCAG00010019633) kpnb3 (ENSLCAG00010019658) SEMA5B (ENSLCAG00010019680) ENSLCAG00010019817 ##22 ENSLCAG00010020233 GPR180 (ENSLCAG00010020239) TGDS (ENSLCAG00010020243) ENSLCAG00010020255 SLC5A3 (ENSLCAG00010020306) ENSLCAG00010020315 ENSLCAG00010020325 ENSLCAG00010020330 ENSLCAG00010020336 fam184aa (ENSLCAG00010020344) ENSLCAG00010020352 CRYGS (ENSLCAG00010020356) SATB2 (ENSLCAG00010020360) ENSLCAG00010020362 crygm6 (ENSLCAG00010020364) Seriola ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000155814.m ENSGT00940000156984.a.a ENSGT00940000157872 ENSGT00940000157849.n.c ENSGT00940000162479.a ENSGT00940000155360.B.k ENSGT00940000157269.a.b ENSGT00940000164275.f.d ENSGT00390000018553 ENSGT00940000153514.b.m.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000159848 ENSGT00390000007055 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 ENSGT01100000263513.a.a.b.b.b.b.a.a.b.a.b.a.b.b.b ENSGT01030000234765 ENSGT00940000153981.A ENSGT00940000159196 ENSGT00940000154443.e ENSGT00940000161679.b ENSGT00940000158367 ENSGT00950000183302 ENSGT00390000002403 ENSGT00530000063669.b.b ENSGT00940000165242.d ENSGT00940000160342.g.a ENSGT00390000008096.B.e.b ENSGT00530000063480.a ENSGT00940000164501.a.a.b.a Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3005 rcbtb1 (ENSSLDG00000001219) ENSSLDG00000001271 tubgcp3 (ENSSLDG00000001312) ATP11A (ENSSLDG00000001419) SOX1 (ENSSLDG00000001549) arhgef7b (ENSSLDG00000001565) ENSSLDG00000001651 unc50 (ENSSLDG00000001793) ENSSLDG00000001831 ndufs1 (ENSSLDG00000001862) zgc:110699 (ENSSLDG00000001933) creb3l1 (ENSSLDG00000002002) atg13 (ENSSLDG00000002116) kpnb3 (ENSSLDG00000002270) SEMA5B (ENSSLDG00000002404) ENSSLDG00000002452 ##22 ENSSLDG00000002510 ENSSLDG00000002608 GPR180 (ENSSLDG00000002631) ENSSLDG00000002652 ENSSLDG00000002762 SLC5A3 (ENSSLDG00000002817) ENSSLDG00000002866 ENSSLDG00000002879 fam184aa (ENSSLDG00000002894) ENSSLDG00000003020 CRYGS (ENSSLDG00000003059) ENSSLDG00000003168 SATB2 (ENSSLDG00000003207) ENSSLDG00000003410 ENSSLDG00000003549 Greater amberjack MODERN SPECIES 343 arhgef7b (ENSSDUG00000023833) ENSSDUG00000023832 ENSSDUG00000023831 unc50 (ENSSDUG00000023830) ndufs1 (ENSSDUG00000023829) zgc:110699 (ENSSDUG00000023828) creb3l1 (ENSSDUG00000023827) atg13 (ENSSDUG00000023826) kpnb3 (ENSSDUG00000023825) SEMA5B (ENSSDUG00000023824) ENSSDUG00000023823 ##22 ENSSDUG00000023822 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000156984.a.a ENSGT00940000157872 ENSGT00940000157849.n.c ENSGT00940000162479.a ENSGT00940000155360.B.k ENSGT00940000157269.a.b ENSGT00940000164275.f.d ENSGT00390000018553 ENSGT00940000153514.b.m.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000159848 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 ENSGT01030000234765 ENSGT00940000153981.A ENSGT00940000159196 ENSGT00940000154443.e ENSGT00940000161679.b ENSGT00940000158367 ENSGT00950000183302 ENSGT00390000002403 ENSGT00530000063669.b.b ENSGT00940000165242.d ENSGT00940000160342.g.a ENSGT00390000008096.B.e.b ENSGT00530000063480.a ENSGT00940000164501.a.a.b.a ENSGT00940000163494.a.b.a Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000158559 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SPECIES 113 ENSGT00940000153309.a ENSGT00940000166665.c ENSGT01030000234555.b ENSGT00940000153648.a ENSGT00940000157440.m.b ENSGT00950000182803.B.d.b ENSGT00980000198599 ENSGT00940000162067 ENSGT00940000158619.p ENSGT00390000006915.c.c.a ENSGT00390000013608 ENSGT00530000063970.e ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 ENSGT01040000241517.a ENSGT00940000154840.b.f.c.b.f Japanese Medaka HdrR DUPLICATION Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 11 ENSORLG00000030551 ENSORLG00000022538 ENSORLG00000018742 ENSORLG00000018750 ENSORLG00000026671 aamp (ENSORLG00000026582) HDAC4 (ENSORLG00000029432) PRPS2 (ENSORLG00000006669) tmsb4x (ENSORLG00000026258) ENSORLG00000022250 ENSORLG00000006628 ENSORLG00000006619 gemin8 (ENSORLG00000006606) ENSORLG00000028378 SEMA5B (ENSORLG00000006593) cacnb4.1 (ENSORLG00000006530) ##22 ENSORLG00000029417 ENSORLG00000029925 ##22 ENSORLG00000022465 ENSORLG00000025191 ENSORLG00000029156 ENSORLG00000002122 ENSORLG00000022214 arpc2 (ENSORLG00000006502) ENSORLG00000029743 ENSORLG00000006480 SLC19A1 (ENSORLG00000006475) ENSORLG00000025970 cyp4f3 (ENSORLG00000006454) ENSORLG00000006418 ENSORLG00000029425 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 11 ENSORLG00000018742 ENSORLG00000018750 ENSORLG00000026671 aamp (ENSORLG00000026582) HDAC4 (ENSORLG00000029432) PRPS2 (ENSORLG00000006669) tmsb4x (ENSORLG00000026258) ENSORLG00000022250 ENSORLG00000006628 ENSORLG00000006619 gemin8 (ENSORLG00000006606) ENSORLG00000028378 SEMA5B (ENSORLG00000006593) cacnb4.1 (ENSORLG00000006530) ##22 ENSORLG00000029417 ENSORLG00000029925 ##22 ENSORLG00000022465 ENSORLG00000025191 ENSORLG00000029156 ENSORLG00000002122 ENSORLG00000022214 arpc2 (ENSORLG00000006502) ENSORLG00000029743 ENSORLG00000006480 SLC19A1 (ENSORLG00000006475) ENSORLG00000025970 cyp4f3 (ENSORLG00000006454) ENSORLG00000006418 ENSORLG00000029425 ENSORLG00000006397 FARP1 (ENSORLG00000006374) Chinese medaka MODERN SPECIES 5314 ENSOSIG00000014870 ENSOSIG00000014867 ENSOSIG00000014866 PRPS2 (ENSOSIG00000014513) ENSOSIG00000014512 ENSOSIG00000014511 ENSOSIG00000014508 rab9a (ENSOSIG00000014507) ENSOSIG00000014505 gemin8 (ENSOSIG00000014504) ENSOSIG00000014502 CACNB4 (ENSOSIG00000010663) ##22 ENSOSIG00000010658 ATP1A1 (ENSOSIG00000010030) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000157872 ENSGT00940000157849.n.c ENSGT00940000162479.a ENSGT00940000155360.B.k ENSGT00940000157269.a.b ENSGT00940000164275.f.d ENSGT00940000164275.f.c ENSGT00390000018553 ENSGT00940000153514.b.m.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000159848 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 ENSGT00940000165279.d ENSGT00940000163494.a.a.c.a.d ENSGT00940000163494.a.a.c.b.b ENSGT00940000163322.a.a.b ENSGT00940000163149.a.a ENSGT00940000164501.a.a.a.a.a ENSGT00940000164501.a.a.a.a.b ENSGT00940000163494.a.b.a ENSGT00940000164501.a.a.b.a ENSGT00530000063480.a ENSGT00390000008096.B.e.b ENSGT00940000160342.g.a ENSGT00940000165242.d ENSGT00530000063669.b.b ENSGT00390000002403 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000155814.m ENSGT00940000156984.a.a ENSGT00940000157872 ENSGT00940000157849.n.c ENSGT00940000162479.a ENSGT00940000155360.B.k ENSGT00940000157269.a.b ENSGT00390000018553 ENSGT00940000153514.b.m.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000159848 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 224 ENSGT00940000158272.c.a ENSGT00940000157269.a.b ENSGT00390000018553 ENSGT00940000153514.b.m.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000159848 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 267 ENSGT00940000158272.c.a ENSGT00940000157269.a.b ENSGT00390000018553 ENSGT00940000153514.b.m.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000159848 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 Orange clownfish MODERN SPECIES 16 nudt15 (ENSAPEG00000017883) ENSAPEG00000017889 TRAK2 (ENSAPEG00000017902) STRADB (ENSAPEG00000017941) COL8A1 (ENSAPEG00000017967) ENSAPEG00000017980 ENSAPEG00000018019 unc50 (ENSAPEG00000018044) ndufs1 (ENSAPEG00000018082) zgc:110699 (ENSAPEG00000018136) creb3l1 (ENSAPEG00000018166) ENSAPEG00000018227 atg13 (ENSAPEG00000018265) kpnb3 (ENSAPEG00000018395) SEMA5B (ENSAPEG00000018473) CACNB4 (ENSAPEG00000018520) ##22 ENSAPEG00000018582 ENSAPEG00000018668 ENSAPEG00000018749 gpd2 (ENSAPEG00000018763) NR4A2 (ENSAPEG00000018813) ENSAPEG00000018821 ENSAPEG00000018852 ENSAPEG00000018929 abi2b (ENSAPEG00000019077) cyp20a1 (ENSAPEG00000019128) tmem237b (ENSAPEG00000019186) MPP4 (ENSAPEG00000019214) ALS2 (ENSAPEG00000019244) CHRNA2 (ENSAPEG00000019366) zgc:113142 (ENSAPEG00000019392) Clown anemonefish MODERN SPECIES 2819 kpnb3 (ENSAOCG00000018927) SEMA5B (ENSAOCG00000018976) CACNB4 (ENSAOCG00000019044) ##22 ENSAOCG00000019069 Spiny chromis MODERN SPECIES 1009 FILIP1L (ENSAPOG00000003756) ENSAPOG00000003826 ccdc28a (ENSAPOG00000003850) COL8A1 (ENSAPOG00000003863) ENSAPOG00000003953 unc50 (ENSAPOG00000003979) ndufs1 (ENSAPOG00000004032) zgc:110699 (ENSAPOG00000004054) ENSAPOG00000004070 HARBI1 (ENSAPOG00000004094) atg13 (ENSAPOG00000004174) kpnb3 (ENSAPOG00000004284) SEMA5B (ENSAPOG00000004349) CACNB4 (ENSAPOG00000004443) ##22 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1761 zgc:110699 (ENSSPAG00000012280) creb3l1 (ENSSPAG00000012261) atg13 (ENSSPAG00000012151) kpnb3 (ENSSPAG00000012065) SEMA5B (ENSSPAG00000011999) ENSSPAG00000011963 ##22 ENSSPAG00000011829 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000164275.f.c ENSGT00390000018553 ENSGT00940000153514.b.m.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000159848 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 ENSGT00940000165279.d ENSGT00940000163494.a.a.c.a.d ENSGT00940000163494.a.a.c.b.b ENSGT00940000163322.a.a.b ENSGT00940000163149.a.a ENSGT00940000164501.a.a.a.a.a ENSGT00940000163148.a.b.a ENSGT00940000163494.a.b.a ENSGT00940000164501.a.a.b.a ENSGT00530000063480.a ENSGT00390000008096.B.e.b ENSGT00940000160342.g.a ENSGT00940000165242.d ENSGT00530000063669.b.b ENSGT00390000002403 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000164501.a.a.a.a.a ENSGT00940000163149.a.a ENSGT00940000163322.a.a.b ENSGT00940000163494.a.a.c.b.b ENSGT00940000163494.a.a.c.a.d ENSGT00940000165279.d ENSGT00940000164275.f.c ENSGT00390000018553 ENSGT00940000153514.b.m.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000159848 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 ENSGT00940000164275.f.d ENSGT00940000157269.a.b ENSGT00940000155360.B.k ENSGT00940000160560.b.f.a.b.a.b.h ENSGT00940000160560.b.f.a.b.a.b.g.b ENSGT00940000162479.a ENSGT00940000157849.n.c ENSGT00940000157872 ENSGT00940000156984.a.a ENSGT00940000155814.m ENSGT00940000153676.b ENSGT00390000004360.a.b.a.a.b ENSGT00940000157874.q.a ENSGT01090000260082.d.a.b.o.a ENSGT00940000155107.b.a Nile tilapia MODERN SPECIES 14 crygs3 (ENSONIG00000015253) etv5b (ENSONIG00000015250) ENSONIG00000032717 ENSONIG00000015246 ENSONIG00000015241 ENSONIG00000015245 ENSONIG00000015239 unc50 (ENSONIG00000015234) ndufs1 (ENSONIG00000015225) zgc:110699 (ENSONIG00000015222) creb3l1 (ENSONIG00000015219) HARBI1 (ENSONIG00000015216) atg13 (ENSONIG00000015211) kpnb3 (ENSONIG00000015196) SEMA5B (ENSONIG00000015189) CACNB4 (ENSONIG00000015177) ##22 ENSONIG00000031938 ENSONIG00000015175 arhgef7b (ENSONIG00000015169) ENSONIG00000013227 SOX1 (ENSONIG00000021020) ATP11A (ENSONIG00000012309) tubgcp3 (ENSONIG00000012305) ENSONIG00000012303 rcbtb1 (ENSONIG00000012298) cdadc1 (ENSONIG00000012296) cab39l (ENSONIG00000012288) MCF2L (ENSONIG00000012277) ENSONIG00000012273 ENSONIG00000012268 MAP4K4 (ENSONIG00000012256) Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 29 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ENSGT00940000164275.f.c.a ENSGT00390000018553 ENSGT00940000153514.b.m.b ENSGT00940000166946 ENSGT00940000159848 ENSGT00940000154348.c.b.a.b.b ENSGT00390000007055 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b ##22 ENSGT00940000164275.f.d.e.b ENSGT00940000164275.f.d.e.a ENSGT00940000157269.a.b ENSGT00940000155360.B.k ENSGT00940000160560.b.f.a.b.a.b.h ENSGT00940000160560.b.f.a.b.a.b.g.b ENSGT00940000162479.a ENSGT00940000157849.n.c ENSGT00940000157872 ENSGT00940000156984.a.a ENSGT00940000155814.m ENSGT00940000153676.b ENSGT00390000004360.a.b.a.a.b ENSGT00940000157874.q.a ENSGT01090000260082.d.a.b.o.a Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 901 ENSHBUG00000015482 unc50 (ENSHBUG00000015498) ndufs1 (ENSHBUG00000015547) zgc:110699 (ENSHBUG00000015575) creb3l1 (ENSHBUG00000015586) HARBI1 (ENSHBUG00000015609) atg13 (ENSHBUG00000015720) kpnb3 (ENSHBUG00000015815) SEMA5B (ENSHBUG00000015867) CACNB4 (ENSHBUG00000015918) ##22 ENSHBUG00000016005 ENSHBUG00000016029 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unc50 (ENSNBRG00000020363) ENSNBRG00000020379 ENSNBRG00000020397 HARBI1 (ENSNBRG00000020442) atg13 (ENSNBRG00000020464) ENSNBRG00000020476 SEMA5B (ENSNBRG00000020483) CACNB4 (ENSNBRG00000020516) ##22 ENSNBRG00000020543 ENSNBRG00000020634 ENSNBRG00000020642 ENSNBRG00000020650 arhgef7b (ENSNBRG00000020678) ENSNBRG00000020744 ENSNBRG00000020781 ENSNBRG00000020806 Midas cichlid MODERN SPECIES 569 ENSACIG00000012082 ENSACIG00000012066 ENSACIG00000012051 ENSACIG00000011989 unc50 (ENSACIG00000011967) ENSACIG00000011948 ndufs1 (ENSACIG00000011916) CREB3L1 (ENSACIG00000011893) HARBI1 (ENSACIG00000011880) atg13 (ENSACIG00000011819) kpnb3 (ENSACIG00000011763) SEMA5B (ENSACIG00000011712) CACNB4 (ENSACIG00000011680) ##22 etv5b (ENSACIG00000011613) crygs3 (ENSACIG00000011597) ENSACIG00000011589 ENSACIG00000011578 ENSACIG00000011556 ENSACIG00000011546 crygmxl1 (ENSACIG00000011537) crygm6 (ENSACIG00000011526) ENSACIG00000011513 SATB2 (ENSACIG00000011479) CRYGS (ENSACIG00000011431) ENSACIG00000011362 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Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 155 ENSGT01000000221773 ENSGT00940000155390.k ENSGT01040000240385.A.b.b.a.a.a.b.a.a.a.b.a ENSGT01040000240385.A.b.b.a.a.a.b.a.a.a.b.b ENSGT00940000158202.t ENSGT00940000164538.c.b ENSGT00940000164538.c.a ENSGT00940000156712.a ENSGT00950000182837.b.b.c.b.c.a ##22 ENSGT00940000165279.d ENSGT00940000163494.a.a.c.a.d ENSGT00940000163494.a.a.c.b.b ENSGT00940000163322.a.a.b ENSGT00940000163148.a.a.b.o.b ENSGT00940000163148.a.a.b.p.b ENSGT00940000163148.a.a.b.o.a.e ENSGT00940000164501.a.a.b.a.d ENSGT00530000063480.a ENSGT00390000008096.B.e.b.e ENSGT00940000160342.g.a Coho salmon MODERN SPECIES 34 ENSOKIG00005044229 si:ch211-114n24.6 (ENSOKIG00005044162) bin1b (ENSOKIG00005044006) ihhb (ENSOKIG00005043952) nhej1 (ENSOKIG00005043931) ENSOKIG00005043922 NBEAL1 (ENSOKIG00005043107) ENSOKIG00005042992 ENSOKIG00005042978 ENSOKIG00005042958 ENSOKIG00005042916 ENSOKIG00005042877 TRAK2 (ENSOKIG00005042757) ENSOKIG00005042721 SEMA5B (ENSOKIG00005042195) 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Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.b.c.b.c.b ##22 Huchen MODERN SPECIES 3929 ENSHHUG00000047624 ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.b.c.b.c.b ##22 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.b.c.b.c.b ##22 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.b.c.b.c.b ##22 Coho salmon MODERN SPECIES 396 ENSOKIG00005045891 ##22 Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.b.c.b.c.b ##22 Atlantic salmon MODERN SPECIES 8 ENSSSAG00000097173 ENSSSAG00000107071 ENSSSAG00000043052 ENSSSAG00000104136 ENSSSAG00000043112 ENSSSAG00000020503 ENSSSAG00000113340 ENSSSAG00000009481 ENSSSAG00000007563 ENSSSAG00000031333 ENSSSAG00000083591 ENSSSAG00000031517 ENSSSAG00000085640 ENSSSAG00000018593 ENSSSAG00000090791 ENSSSAG00000020579 ##22 ENSSSAG00000041541 ENSSSAG00000055563 ENSSSAG00000095246 ENSSSAG00000087017 ENSSSAG00000090950 ENSSSAG00000006025 ENSSSAG00000108785 ENSSSAG00000042769 ENSSSAG00000103267 ENSSSAG00000006105 ENSSSAG00000040919 ENSSSAG00000039864 ENSSSAG00000042860 ENSSSAG00000106043 FZD5 (ENSSSAG00000083692) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.b.c.b.d ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.b.c.b.d ##22 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.b.c.b.d ##22 Rainbow trout MODERN SPECIES 28 ENSOMYG00000000609 ENSOMYG00000015415 ENSOMYG00000020098 ENSOMYG00000047474 bin1b (ENSOMYG00000014803) ENSOMYG00000053529 nhej1 (ENSOMYG00000014875) ENSOMYG00000015350 ENSOMYG00000021477 ENSOMYG00000058650 ENSOMYG00000011517 ENSOMYG00000020080 ENSOMYG00000070214 ENSOMYG00000011547 ENSOMYG00000065275 ENSOMYG00000057713 ##22 ENSOMYG00000051302 ENSOMYG00000011592 ENSOMYG00000066009 ENSOMYG00000031244 ENSOMYG00000011807 ENSOMYG00000011822 ENSOMYG00000011828 ENSOMYG00000011847 ENSOMYG00000011870 ENSOMYG00000051632 ENSOMYG00000039599 ENSOMYG00000011836 ENSOMYG00000011882 ENSOMYG00000011888 ENSOMYG00000011900 Huchen MODERN SPECIES 5868 ENSHHUG00000000315 ##22 Northern pike MODERN SPECIES 21 ENSELUG00000030053 dnpep (ENSELUG00000002103) PTPRN (ENSELUG00000002114) ENSELUG00000002120 bin1b (ENSELUG00000002132) ihhb (ENSELUG00000033121) nhej1 (ENSELUG00000002139) ENSELUG00000002142 NBEAL1 (ENSELUG00000002155) STRADB (ENSELUG00000002181) TRAK2 (ENSELUG00000002196) ENSELUG00000002202 ENSELUG00000002205 SEMA5B (ENSELUG00000002221) ENSELUG00000028923 ENSELUG00000002249 ##22 etv5b (ENSELUG00000002259) crygs3 (ENSELUG00000002262) ENSELUG00000002266 ENSELUG00000002268 ENSELUG00000002274 ENSELUG00000002275 ENSELUG00000002279 ENSELUG00000002284 ENSELUG00000002366 crygm6 (ENSELUG00000002289) ENSELUG00000002293 ENSELUG00000002297 mob4 (ENSELUG00000026640) ENSELUG00000002317 SATB2 (ENSELUG00000002340) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00390000011515 ENSGT00940000165301.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.d ##22 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.b.b ENSGT00940000154533.b.b.a.a ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT01090000259987.b.b.a.b ENSGT00940000177452 ENSGT00940000165279.c ENSGT00940000156768 ENSGT00940000163494.a.a.c.a ENSGT00940000163494.a.a.c.b.a ENSGT00940000163322.a.a.a ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.b ENSGT00940000163149.a.a Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00390000011515 ENSGT00940000165301.a ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.d ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.b.b ENSGT00940000154533.b.b.a.a ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT01090000259987.b.b.a.b ENSGT00940000177452 ENSGT00940000165279.c ENSGT00940000156768 ENSGT00940000163494.a.a.c.a.a ENSGT00940000163494.a.a.c.b.a ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.b ENSGT00940000163149.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.a ENSGT00940000163322.a.b.a.b Otophysi ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000154533.b.b.b ENSGT00940000154714 ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000164632.a ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.d ##22 ENSGT00940000165301.a ENSGT00390000011515 ENSGT00940000154817.b.a ENSGT00940000159158 ENSGT00390000013973.A.a.c.a ENSGT00940000159213.q.a ENSGT00940000159862.a ENSGT00940000165735 ENSGT00940000155984.j ENSGT00940000157521.a.a ENSGT00940000154840.b.e.b ENSGT00940000154840.b.e.a.a.a ENSGT01090000260459 ENSGT01050000244827.B ENSGT00940000154065.b Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157234 ENSGT00940000161024.c ENSGT00980000198897 ENSGT00390000000917 ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055.i ENSGT00950000182837.b.b.d ##22 ENSGT00940000165301.a ENSGT00390000011515 ENSGT00940000154817.b.a ENSGT00940000159158 ENSGT00390000013973.A.a.c.a ENSGT00940000159213.q.a ENSGT00940000159862.a ENSGT00940000165735 ENSGT00940000155984.j ENSGT00940000157521.a.a ENSGT00940000154840.b.e.b ENSGT01090000260459 ENSGT00940000154840.b.e.a.a.b.b.a.b ENSGT01090000260564 ENSGT01050000244827.B Channel catfish MODERN SPECIES 25 ENSIPUG00000001876 UBXN4 (ENSIPUG00000001849) rab3gap1 (ENSIPUG00000001801) R3HDM1 (ENSIPUG00000001676) epc2 (ENSIPUG00000001653) acvr2aa (ENSIPUG00000001630) zeb2a (ENSIPUG00000001605) gtdc1 (ENSIPUG00000001575) arhgap15 (ENSIPUG00000001559) arglu1 (ENSIPUG00000001542) efnb2a (ENSIPUG00000001518) sec22a (ENSIPUG00000001444) adcy5 (ENSIPUG00000001390) PTPLB (ENSIPUG00000001338) stam2 (ENSIPUG00000001294) cacnb4a (ENSIPUG00000001244) ##22 ENSIPUG00000001224 zgc:162396 (ENSIPUG00000001213) ENSIPUG00000001199 ENSIPUG00000001178 zgc:162396 (ENSIPUG00000001171) zgc:162396 (ENSIPUG00000001159) ENSIPUG00000001157 ENSIPUG00000001152 dnaaf1 (ENSIPUG00000001139) ENSIPUG00000001123 ENSIPUG00000001087 dnajc3 (ENSIPUG00000001056) UGGT2 (ENSIPUG00000001011) hs6st3b (ENSIPUG00000000988) oxgr1 (ENSIPUG00000000985) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00940000161024.c ENSGT00980000198897 ENSGT00390000000917 ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055.i ENSGT00950000182837.b.b.d ##22 ENSGT00940000165301.a ENSGT00390000011515 ENSGT00940000154817.b.a ENSGT00940000159158 ENSGT00390000013973.A.a.c.a ENSGT00940000159213.q.a ENSGT00940000159862.a ENSGT00940000165735 ENSGT00940000155984.j ENSGT00940000157521.a.a ENSGT00940000154840.b.e.b ENSGT01090000260459 ENSGT00940000154840.b.e.a.a.b.b.a.b ENSGT01090000260564 ENSGT01050000244827.B Characoidei ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157234 ENSGT00940000161024.c ENSGT00980000198897 ENSGT00390000000917 ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055.i ENSGT00950000182837.b.b.d ##22 ENSGT00940000165301.a ENSGT00390000011515 ENSGT00940000154817.b.a ENSGT00940000159158 ENSGT00390000013973.A.a.c.a ENSGT00940000159213.q.a ENSGT00940000159862.a ENSGT00940000165735 ENSGT00940000155984.j ENSGT00940000157521.a.a ENSGT00940000154840.b.e.b ENSGT01090000260459 ENSGT00940000154840.b.e.a.a.b.b.a.b ENSGT01090000260564 ENSGT01050000244827.B Red-bellied piranha MODERN SPECIES 157 GNAS (ENSPNAG00000027980) ENSPNAG00000027901 ENSPNAG00000027862 ENSPNAG00000027847 ENSPNAG00000027817 ENSPNAG00000027767 slc15a2 (ENSPNAG00000027708) hspbap1 (ENSPNAG00000027696) slc49a4 (ENSPNAG00000027688) SEMA5B (ENSPNAG00000027619) pdia5 (ENSPNAG00000004786) sec22a (ENSPNAG00000006712) adcy5 (ENSPNAG00000005959) hacd2 (ENSPNAG00000004163) stam2 (ENSPNAG00000004160) cacnb4a (ENSPNAG00000026955) ##22 Mexicana tetra MODERN SPECIES 10 COL4A2 (ENSAMXG00000003576) rab20 (ENSAMXG00000003504) naxd (ENSAMXG00000003485) ENSAMXG00000031456 eaf2 (ENSAMXG00000003472) cyp27a3 (ENSAMXG00000003468) slc15a2 (ENSAMXG00000003462) hspbap1 (ENSAMXG00000003445) slc49a4 (ENSAMXG00000003421) SEMA5B (ENSAMXG00000003356) pdia5 (ENSAMXG00000003302) sec22a (ENSAMXG00000003288) adcy5 (ENSAMXG00000003268) hacd2 (ENSAMXG00000043141) stam2 (ENSAMXG00000003240) cacnb4a (ENSAMXG00000031115) ##22 ENSAMXG00000003151 nifk (ENSAMXG00000029665) clasp1a (ENSAMXG00000003132) ENSAMXG00000029579 gli2a (ENSAMXG00000043175) ENSAMXG00000032025 inhbb (ENSAMXG00000003122) ENSAMXG00000030861 ENSAMXG00000039380 ralba (ENSAMXG00000038817) LRP1B (ENSAMXG00000002960) ENSAMXG00000034219 atp1a1b (ENSAMXG00000033172) ENSAMXG00000033714 mab21l3 (ENSAMXG00000002838) Electric eel MODERN SPECIES 1028 cacnb4a (ENSEEEG00000011181) ##22 ENSEEEG00000011704 nifk (ENSEEEG00000011706) clasp1a (ENSEEEG00000011709) tfcp2l1 (ENSEEEG00000011713) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 80 ENSGT00940000154840.b.e.b ENSGT00940000157521.a.a ENSGT00940000155984.j ENSGT00940000165735 ENSGT00940000159862.a ENSGT00940000159213.q.a ENSGT00940000156507 ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.d ##22 ENSGT00940000165301.a ENSGT00390000011515 ENSGT00940000154817.b.a.i ENSGT00940000159158 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 264 ENSGT00940000156797.g ENSGT00940000158470.f ENSGT00940000158054.d.l ENSGT00530000062962.a.a.c.a ENSGT00940000157055.g ENSGT00950000182837.b.b.d.a ##22 ENSGT00940000165301.a.b ENSGT00390000011515.t ENSGT00940000154817.b.a.i.a ENSGT00680000100037.ib ENSGT00390000011294 ENSGT00940000156180.f.b ENSGT00940000163074.c ENSGT00390000005415.f ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b.u.a ENSGT00940000156322.k ENSGT00390000011570 ENSGT00390000008796.b ENSGT00390000008796.a ENSGT00940000158398.l ENSGT00940000164835.b Goldfish MODERN SPECIES 49 nyx (ENSCARG00000053575) gpr34b (ENSCARG00000053550) GPR82 (ENSCARG00000053544) caska (ENSCARG00000051129) ENSCARG00000050902 ENSCARG00000050891 ENSCARG00000050884 ENSCARG00000050861 ralba (ENSCARG00000050852) inhbb (ENSCARG00000050827) pdia5 (ENSCARG00000049245) sec22a (ENSCARG00000049115) adcy5 (ENSCARG00000047744) hacd2 (ENSCARG00000047667) stam2 (ENSCARG00000047170) cacnb4a (ENSCARG00000040051) ##22 ENSCARG00000039878 nifk (ENSCARG00000039738) clasp1a (ENSCARG00000036353) ddx18 (ENSCARG00000036167) ccdc93 (ENSCARG00000035128) PLCD4 (ENSCARG00000034226) bcs1l (ENSCARG00000034105) ENSCARG00000033943 CYP27A1 (ENSCARG00000033764) ENSCARG00000033696 lss (ENSCARG00000033527) LMLN (ENSCARG00000033137) OSBPL11 (ENSCARG00000032901) ENSCARG00000032882 snx4 (ENSCARG00000031157) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 120 ENSGT00940000156797.g ENSGT00940000158470.f ENSGT00940000158054.d.l ENSGT00530000062962.a.a.c.a ENSGT00940000157055.g ENSGT00950000182837.b.b.d.a ##22 ENSGT00940000165301.a.b ENSGT00390000011515.t ENSGT00940000154817.b.a.i.a ENSGT00680000100037.ib ENSGT00390000011294 ENSGT00940000156180.f.b ENSGT00940000163074.c ENSGT00390000005415.f ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b.u.b ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b.u.a ENSGT00940000156322.k ENSGT00390000008796.b ENSGT00940000158398.k ENSGT00940000164835.a ENSGT00930000151029.i.a.d Common carp reference MODERN SPECIES 46 mab21l3 (ENSCCRG00000006629) ENSCCRG00000013640 ENSCCRG00000064948 ralba (ENSCCRG00000078850) inhbb (ENSCCRG00000077270) gli2a (ENSCCRG00000068447) slc15a2 (ENSCCRG00000029349) hspbap1 (ENSCCRG00000029323) slc49a4 (ENSCCRG00000029311) SEMA5B (ENSCCRG00000039334) pdia5 (ENSCCRG00000044266) sec22a (ENSCCRG00000026263) adcy5 (ENSCCRG00000025295) hacd2 (ENSCCRG00000014361) stam2 (ENSCCRG00000014368) cacnb4a (ENSCCRG00000027408) ##22 ENSCCRG00000027351 nifk (ENSCCRG00000027193) clasp1a (ENSCCRG00000031849) ddx18 (ENSCCRG00000082863) ccdc93 (ENSCCRG00000051767) ENSCCRG00000081111 ENSCCRG00000080565 ENSCCRG00000040847 ENSCCRG00000066492 ENSCCRG00000051718 lss (ENSCCRG00000051707) ENSCCRG00000051693 OSBPL11 (ENSCCRG00000051686) ENSCCRG00000051685 snx4 (ENSCCRG00000065337) Golden-line barbel MODERN SPECIES 548 pdia5 (ENSSGRG00000005632) sec22a (ENSSGRG00000005826) adcy5 (ENSSGRG00000005882) hacd2 (ENSSGRG00000008295) stam2 (ENSSGRG00000008341) cacnb4a (ENSSGRG00000008817) ##22 ENSSGRG00000012343 nifk (ENSSGRG00000012344) clasp1a (ENSSGRG00000012503) ddx18 (ENSSGRG00000020616) ccdc93 (ENSSGRG00000020709) ZNF142 (ENSSGRG00000020845) bcs1l (ENSSGRG00000020850) ENSSGRG00000020906 CYP27A1 (ENSSGRG00000020907) ENSSGRG00000020914 OSBPL11 (ENSSGRG00000021049) ENSSGRG00000021135 snx4 (ENSSGRG00000021145) znf148 (ENSSGRG00000021482) slc12a8 (ENSSGRG00000021484) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 208 ENSGT00940000154840.b.e.b ENSGT00940000157521.a.a.e.b ENSGT00940000155984.j.b ENSGT00940000165735 ENSGT00940000159862.a.d ENSGT00940000159213.q.a.c ENSGT00940000156507.m ENSGT00940000159893.c ENSGT01030000234625.D.l ENSGT00940000156712.b.f ENSGT00940000156797.h ENSGT00940000158470.e ENSGT00940000158054.d.k ENSGT00530000062962.a.a.d ENSGT00940000157055.h ENSGT00950000182837.b.b.d.b ##22 ENSGT00940000165301.a.a ENSGT00390000011515.s ENSGT00940000154817.b.a.i.b ENSGT00940000159158 ENSGT00680000100037.hb ENSGT00940000156180.f.a ENSGT00940000163074.d ENSGT00390000005415.e ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b.v ENSGT00940000156322.l Goldfish MODERN SPECIES 27 atp1a1b (ENSCARG00000031589) ENSCARG00000031028 ralba (ENSCARG00000030954) inhbb (ENSCARG00000030932) gli2a (ENSCARG00000030903) slc15a2 (ENSCARG00000029432) hspbap1 (ENSCARG00000029340) slc49a4 (ENSCARG00000029317) SEMA5B (ENSCARG00000028729) pdia5 (ENSCARG00000026398) sec22a (ENSCARG00000026338) ENSCARG00000026333 adcy5 (ENSCARG00000025868) hacd2 (ENSCARG00000025797) stam2 (ENSCARG00000024836) cacnb4a (ENSCARG00000020293) ##22 ENSCARG00000020109 nifk (ENSCARG00000020098) clasp1a (ENSCARG00000039713) tfcp2l1 (ENSCARG00000039181) ddx18 (ENSCARG00000037348) ENSCARG00000037194 PLCD4 (ENSCARG00000036214) ZNF142 (ENSCARG00000036187) CYP27A1 (ENSCARG00000035837) ENSCARG00000035732 LMLN (ENSCARG00000035514) OSBPL11 (ENSCARG00000035336) ENSCARG00000035324 snx4 (ENSCARG00000033042) znf148 (ENSCARG00000032898) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000154840.b.e.b ENSGT00940000157521.a.a.e.b ENSGT00940000155984.j.b ENSGT00940000165735 ENSGT00940000159862.a.d ENSGT00940000159213.q.a.c ENSGT00940000156507.m ENSGT00940000159893.c ENSGT01030000234625.D.l ENSGT00940000156712.b.f ENSGT00940000156797.h ENSGT00940000158470.e ENSGT00940000158054.d.k ENSGT00530000062962.a.a.d ENSGT00940000157055.h ENSGT00950000182837.b.b.d.b ##22 ENSGT00940000165301.a.a ENSGT00390000011515.s ENSGT00940000154817.b.a.i.b ENSGT00940000159158 ENSGT00680000100037.hb ENSGT00940000156180.f.a ENSGT00940000163074.d ENSGT00390000005415.e ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b.v ENSGT00940000156322.l ENSGT00390000011570 ENSGT00390000008796.a ENSGT00940000158398.l ENSGT00940000164835.b ENSGT00930000151029.i.a.c Common carp reference MODERN SPECIES 41 ENSCCRG00000017784 ENSCCRG00000066265 ralba (ENSCCRG00000056318) ENSCCRG00000057965 inhbb (ENSCCRG00000076082) gli2a (ENSCCRG00000016620) slc15a2 (ENSCCRG00000016646) hspbap1 (ENSCCRG00000016640) slc49a4 (ENSCCRG00000016624) SEMA5B (ENSCCRG00000016665) pdia5 (ENSCCRG00000031383) sec22a (ENSCCRG00000031424) adcy5 (ENSCCRG00000026276) hacd2 (ENSCCRG00000031550) stam2 (ENSCCRG00000031574) cacnb4a (ENSCCRG00000042133) ##22 ENSCCRG00000059087 nifk (ENSCCRG00000017649) clasp1a (ENSCCRG00000052056) tfcp2l1 (ENSCCRG00000047436) PLCD4 (ENSCCRG00000047719) ENSCCRG00000040826 bcs1l (ENSCCRG00000080918) ENSCCRG00000051725 ENSCCRG00000052655 lss (ENSCCRG00000074874) ENSCCRG00000052654 OSBPL11 (ENSCCRG00000017660) ENSCCRG00000017670 snx4 (ENSCCRG00000017677) znf148 (ENSCCRG00000054529) Golden-line barbel MODERN SPECIES 213 ralba (ENSSGRG00000010880) ENSSGRG00000010888 inhbb (ENSSGRG00000010890) gli2a (ENSSGRG00000010894) hspbap1 (ENSSGRG00000011206) slc49a4 (ENSSGRG00000011284) SEMA5B (ENSSGRG00000011289) pdia5 (ENSSGRG00000011309) sec22a (ENSSGRG00000011365) adcy5 (ENSSGRG00000011401) hacd2 (ENSSGRG00000012367) stam2 (ENSSGRG00000012411) cacnb4a (ENSSGRG00000012793) ##22 ENSSGRG00000013160 clasp1a (ENSSGRG00000013305) tfcp2l1 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(ENSDARG00000061373) bcs1l (ENSDARG00000012295) ENSDARG00000033802 CYP27A1 (ENSDARG00000069186) CYP27A1 (ENSDARG00000088013) cyp27a1.4 (ENSDARG00000055159) ENSDARG00000021402 lss (ENSDARG00000061274) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 815 ENSGT00950000182837.b.b.d ##22 ENSGT00940000154714 Denticle herring MODERN SPECIES 19 nqo1 (ENSDCDG00000019386) nqo1 (ENSDCDG00000019412) ENSDCDG00000019487 tyw5 (ENSDCDG00000019727) maip1 (ENSDCDG00000019732) HECW2 (ENSDCDG00000019742) stk17b (ENSDCDG00000019832) zgc:153521 (ENSDCDG00000019834) ftcdnl1 (ENSDCDG00000019835) nabp1a (ENSDCDG00000019837) cavin2a (ENSDCDG00000019840) tmeff2a (ENSDCDG00000019844) ENSDCDG00000019846 slc39a10 (ENSDCDG00000019850) ENSDCDG00000019852 cacnb4a (ENSDCDG00000019917) ##22 arl5a (ENSDCDG00000022634) zgc:113337 (ENSDCDG00000022761) ENSDCDG00000022774 CFAP91 (ENSDCDG00000022779) nr1i2 (ENSDCDG00000022788) gsk3ba (ENSDCDG00000022805) GPR156 (ENSDCDG00000023143) LRRC58 (ENSDCDG00000023144) fstl1b (ENSDCDG00000023155) ENSDCDG00000023463 ENSDCDG00000023615 NALF1 (ENSDCDG00000023622) ENSDCDG00000023625 abhd13 (ENSDCDG00000023627) tnfsf13b (ENSDCDG00000023628) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.b.d ##22 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.b.d ##22 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.b.d ##22 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.b.d ##22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.b.d ##22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.b.d ##22 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.b.d ##22 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.b.d ##22 Tetraodon DUPLICATION Tetraodon MODERN SPECIES 26 ENSTNIG00000002151 ENSTNIG00000002150 stk35 (ENSTNIG00000002149) stk38a (ENSTNIG00000002148) ezh2 (ENSTNIG00000004203) ENSTNIG00000002147 ENSTNIG00000006222 ENSTNIG00000002146 ENSTNIG00000002145 ENSTNIG00000002144 rtn4a (ENSTNIG00000002143) pctp (ENSTNIG00000002142) ENSTNIG00000002141 ssr1 (ENSTNIG00000002140) ENSTNIG00000002139 ENSTNIG00000002137 ##22 ENSTNIG00000002136 ##22 ENSTNIG00000000642 ENSTNIG00000002134 sars1 (ENSTNIG00000002133) znhit1 (ENSTNIG00000019748) ENSTNIG00000002130 ldb3b (ENSTNIG00000002129) ciao2a (ENSTNIG00000002128) ENSTNIG00000002127 ENSTNIG00000002126 ENSTNIG00000002125 ENSTNIG00000002124 wdr33 (ENSTNIG00000002122) ENSTNIG00000000506 lta4h (ENSTNIG00000000836) Tetraodon MODERN SPECIES 26 ENSTNIG00000002120 lta4h (ENSTNIG00000000836) ENSTNIG00000000506 wdr33 (ENSTNIG00000002122) ENSTNIG00000002124 ENSTNIG00000002125 ENSTNIG00000002126 ENSTNIG00000002127 ciao2a (ENSTNIG00000002128) ldb3b (ENSTNIG00000002129) ENSTNIG00000002130 znhit1 (ENSTNIG00000019748) sars1 (ENSTNIG00000002133) ENSTNIG00000002134 ENSTNIG00000000642 ENSTNIG00000002136 ##22 ENSTNIG00000002137 ##22 ENSTNIG00000002139 ssr1 (ENSTNIG00000002140) ENSTNIG00000002141 pctp (ENSTNIG00000002142) rtn4a (ENSTNIG00000002143) ENSTNIG00000002144 ENSTNIG00000002145 ENSTNIG00000002146 ENSTNIG00000006222 ENSTNIG00000002147 ezh2 (ENSTNIG00000004203) stk38a (ENSTNIG00000002148) stk35 (ENSTNIG00000002149) ENSTNIG00000002150 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.b.d ##22 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.b.d ##22 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.b.d ##22 Tongue sole MODERN SPECIES 5 PLN (ENSCSEG00000002332) fam184aa (ENSCSEG00000002310) tubgcp3 (ENSCSEG00000002300) ATP11A (ENSCSEG00000002286) ENSCSEG00000002262 ENSCSEG00000002258 SLC19A1 (ENSCSEG00000002256) ENSCSEG00000002255 atg13 (ENSCSEG00000002249) ENSCSEG00000002244 creb3l1 (ENSCSEG00000002240) ndufs1 (ENSCSEG00000002226) ENSCSEG00000002222 unc50 (ENSCSEG00000002219) kpnb3 (ENSCSEG00000002177) ENSCSEG00000002163 ##22 ENSCSEG00000002156 tdgf1 (ENSCSEG00000002152) zgc:113625 (ENSCSEG00000002150) ENSCSEG00000002148 dnajc25 (ENSCSEG00000002144) ENSCSEG00000002141 ENSCSEG00000002134 dync2i2 (ENSCSEG00000002119) sptan1 (ENSCSEG00000001900) ODF2 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ENSGT01030000234625.D ENSGT00940000156712.b ENSGT00940000156797 ENSGT00940000158470 ENSGT00940000158054.d ENSGT00530000062962.a.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.d ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.b.b ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT01090000259987.b.b.a.b ENSGT00940000177452 ENSGT00940000165279.c ENSGT00940000156768 ENSGT00940000163494.a.a.c.a.c ENSGT00940000163494.a.a.c.b.a ENSGT00940000163322.a.a.a ENSGT00940000163148.a.b.b.b.d ENSGT00940000163148.a.a.a.a ENSGT00940000163322.a.b.a.a ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.a Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156712.b.g.a ENSGT00940000156797.l ENSGT00940000158470.h ENSGT00940000158054.d.a ENSGT00530000062962.a.a.e ENSGT00940000157055.e ENSGT00950000182837.b.b.d.e ##22 ENSGT00940000154714.c ENSGT00940000154533.b.b.b.c.a ENSGT00390000012204.i ENSGT00940000157201.k ENSGT01090000259987.b.b.a.b.m ENSGT00940000177452 ENSGT00940000165279.c.c ENSGT00940000156768.x.a.a 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(ENSHHUG00000050757) ENSHHUG00000050682 ENSHHUG00000050659 ENSHHUG00000050658 ENSHHUG00000050655 ENSHHUG00000050653 ENSHHUG00000050651 ENSHHUG00000050649 ENSHHUG00000050646 ENSHHUG00000050643 ENSHHUG00000050625 ENSHHUG00000050621 ENSHHUG00000050616 rif1 (ENSHHUG00000050574) tnfaip6 (ENSHHUG00000050573) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 286 ENSGT00940000154817.b.a.g ENSGT00390000011515.w ENSGT00940000153568.B.q ENSGT00940000164632.a.a ENSGT00390000017724.a.b.e ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a.d ENSGT00940000156507.p ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D.n ENSGT00940000156712.b.g.b ENSGT00940000156797.k ENSGT00940000158470.g ENSGT00940000158054.d.b ENSGT00530000062962.a.a.f ENSGT00940000157055.f ENSGT00950000182837.b.b.d.f ##22 ENSGT00940000154714.d ENSGT00940000154533.b.b.b.c.b ENSGT00390000012204.j ENSGT00940000157201.l ENSGT01090000259987.b.b.a.b.n ENSGT00940000165279.c.d ENSGT00940000156768.x.a.b ENSGT00940000163494.a.a.c.a.c.a ENSGT00940000163322.a.a.a.b 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ENSGT00940000163148.a.b.b.b.c.a.a ENSGT00940000163148.a.a.a.a Salmo ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154817.b.a.g ENSGT00390000011515.w ENSGT00940000153568.B.q ENSGT00940000164632.a.a ENSGT00390000017724.a.b.e ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000156507.p ENSGT00940000159893 ENSGT01030000234625.D.n ENSGT00940000156712.b.g.b ENSGT00940000156797.k ENSGT00940000158470.g ENSGT00940000158054.d.b ENSGT00530000062962.a.a.f ENSGT00940000157055.f ENSGT00950000182837.b.b.d.f ##22 ENSGT00940000154714.d ENSGT00940000154533.b.b.b.c.b ENSGT00390000012204.j ENSGT00940000157201.l ENSGT01090000259987.b.b.a.b.n ENSGT00940000165279.c.d ENSGT00940000156768.x.a.b ENSGT00940000163494.a.a.c.a.c.a ENSGT00940000163148.a.a.b.p.a.a ENSGT00940000163322.a.a.a.b ENSGT00940000163148.a.b.a ENSGT00940000163148.a.a.b.p.a.b.a ENSGT00940000163148.a.b.b.b.c.a.b.a ENSGT00940000163148.a.b.b.b.d.a.a.b.b ENSGT00940000163148.a.b.b.b.c.a.b.b River trout MODERN SPECIES 12 tfcp2l1 (ENSSTUG00000048305) clasp1a 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ENSOTSG00005046927 ENSOTSG00005046928 ENSOTSG00005046930 ENSOTSG00005046931 Coho salmon MODERN SPECIES 18 nifk (ENSOKIG00005032513) tsn (ENSOKIG00005032530) si:dkey-91i10.2 (ENSOKIG00005032548) eaf2 (ENSOKIG00005032556) ENSOKIG00005032562 slc15a2 (ENSOKIG00005032584) hspbap1 (ENSOKIG00005032690) ENSOKIG00005032735 slc49a4 (ENSOKIG00005032789) SEMA5B (ENSOKIG00005032967) pdia5 (ENSOKIG00005033311) sec22a (ENSOKIG00005006193) adcy5 (ENSOKIG00005006280) hacd2 (ENSOKIG00005006738) stam2 (ENSOKIG00005006796) cacnb4a (ENSOKIG00005007018) ##22 arl5a (ENSOKIG00005007290) NEB (ENSOKIG00005007549) ENSOKIG00005012457 rif1 (ENSOKIG00005012486) tnfaip6 (ENSOKIG00005012539) itgb5 (ENSOKIG00005012644) etv5a (ENSOKIG00005013554) ENSOKIG00005013720 ENSOKIG00005014398 crygs3 (ENSOKIG00005014406) ENSOKIG00005014426 ENSOKIG00005014446 ENSOKIG00005014475 ENSOKIG00005014477 ENSOKIG00005014491 Rainbow trout MODERN SPECIES 14 ENSOMYG00000068681 eaf2 (ENSOMYG00000042087) ENSOMYG00000042092 slc15a2 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ENSSHAG00000022458 ENSSHAG00000017174 ENSSHAG00000014382 ENSSHAG00000013973 CCDC169 (ENSSHAG00000013972) SOHLH2 (ENSSHAG00000013234) DCLK1 (ENSSHAG00000010588) NBEA (ENSSHAG00000001274) MAB21L1 (ENSSHAG00000028852) RFC3 (ENSSHAG00000012696) Eutheria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 574 ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b Armadillo MODERN SPECIES 1440 STAM2 (ENSDNOG00000042259) ENSDNOG00000032947 CACNB4 (ENSDNOG00000015978) ##22 ARL5A (ENSDNOG00000013331) NEB (ENSDNOG00000011258) RIF1 (ENSDNOG00000011194) ENSDNOG00000004146 TNFAIP6 (ENSDNOG00000015784) NMI (ENSDNOG00000010133) RBM43 (ENSDNOG00000040175) Sloth MODERN SPECIES 6570 CACNB4 (ENSCHOG00000003080) ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Elephant MODERN SPECIES 301 ENSLAFG00000028549 ACVR1 (ENSLAFG00000006865) ACVR1C (ENSLAFG00000022543) CYTIP (ENSLAFG00000000259) ERMN (ENSLAFG00000006133) GALNT5 (ENSLAFG00000003531) GPD2 (ENSLAFG00000009569) NR4A2 (ENSLAFG00000018512) KCNJ3 (ENSLAFG00000022282) GALNT13 (ENSLAFG00000005947) RPRM (ENSLAFG00000001386) ARL6IP6 (ENSLAFG00000001616) PRPF40A (ENSLAFG00000001613) FMNL2 (ENSLAFG00000001605) STAM2 (ENSLAFG00000009848) CACNB4 (ENSLAFG00000009844) ##22 ARL5A (ENSLAFG00000032104) NEB (ENSLAFG00000009810) RIF1 (ENSLAFG00000009796) TNFAIP6 (ENSLAFG00000009790) NMI (ENSLAFG00000012842) RBM43 (ENSLAFG00000010512) RND3 (ENSLAFG00000010712) MMADHC (ENSLAFG00000016977) LYPD6 (ENSLAFG00000014710) LYPD6B (ENSLAFG00000007340) KIF5C (ENSLAFG00000005632) EPC2 (ENSLAFG00000014312) ENSLAFG00000001900 ENSLAFG00000030020 ORC4 (ENSLAFG00000002631) Hyrax MODERN SPECIES 4546 CACNB4 (ENSPCAG00000016598) ##22 ARL5A (ENSPCAG00000016566) Tenrec MODERN SPECIES 5352 CACNB4 (ENSETEG00000011985) ##22 ARL5A (ENSETEG00000011982) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00950000185140 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00950000185140 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a 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ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT01090000260806 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b.l ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT01090000260806 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 Suina ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT01090000260806 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Chacoan peccary MODERN SPECIES 130 STAM2 (ENSCWAG00000004723) CACNB4 (ENSCWAG00000005063) ##22 ARL5A (ENSCWAG00000015627) NEB (ENSCWAG00000015808) RIF1 (ENSCWAG00000017662) TNFAIP6 (ENSCWAG00000017746) ENSCWAG00000017775 NMI (ENSCWAG00000017794) RND3 (ENSCWAG00000017833) MMADHC (ENSCWAG00000017904) LYPD6 (ENSCWAG00000017934) LYPD6B (ENSCWAG00000017971) KIF5C (ENSCWAG00000018100) EPC2 (ENSCWAG00000018158) MBD5 (ENSCWAG00000018269) ORC4 (ENSCWAG00000018425) ACVR2A (ENSCWAG00000018473) Pig MODERN SPECIES 6 ENSSSCG00000043514 ENSSSCG00000032174 STAM2 (ENSSSCG00000016399) CACNB4 (ENSSSCG00000029073) ##22 ARL5A (ENSSSCG00000031541) NEB (ENSSSCG00000016397) RIF1 (ENSSSCG00000016395) TNFAIP6 (ENSSSCG00000023716) NMI (ENSSSCG00000022011) ENSSSCG00000060497 ENSSSCG00000047930 RND3 (ENSSSCG00000040445) ENSSSCG00000050050 MMADHC (ENSSSCG00000028646) LYPD6 (ENSSSCG00000023627) LYPD6B (ENSSSCG00000015677) KIF5C (ENSSSCG00000022919) EPC2 (ENSSSCG00000027211) MBD5 (ENSSSCG00000015667) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b.l ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b.k.a ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Arabian camel MODERN SPECIES 31 GALNT5 (ENSCDRG00005001377) GPD2 (ENSCDRG00005001281) NR4A2 (ENSCDRG00005001248) 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ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b.l ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Pecora ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00940000160209.e ENSGT00390000010523.c.b 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ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000171318 ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b.l ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541.c ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 11 UPP2 (ENSOARG00020021088) ACVR1 (ENSOARG00020021241) ACVR1C (ENSOARG00020021468) CYTIP (ENSOARG00020021649) ERMN (ENSOARG00020021747) GPD2 (ENSOARG00020021873) NR4A2 (ENSOARG00020022011) KCNJ3 (ENSOARG00020022128) ENSOARG00020022186 GALNT13 (ENSOARG00020022232) ARL6IP6 (ENSOARG00020022563) PRPF40A (ENSOARG00020022598) FMNL2 (ENSOARG00020023016) ENSOARG00020023393 STAM2 (ENSOARG00020023418) CACNB4 (ENSOARG00020023560) ##22 ARL5A (ENSOARG00020024180) NEB (ENSOARG00020024247) RIF1 (ENSOARG00020024396) TNFAIP6 (ENSOARG00020024645) NMI (ENSOARG00020024663) RBM43 (ENSOARG00020024693) ENSOARG00020024716 ENSOARG00020024723 RND3 (ENSOARG00020024731) MMADHC (ENSOARG00020024756) LYPD6 (ENSOARG00020024772) LYPD6B (ENSOARG00020024784) KIF5C (ENSOARG00020024809) EPC2 (ENSOARG00020024888) MBD5 (ENSOARG00020024911) Goat MODERN SPECIES 11 GALNT5 (ENSCHIG00000001864) GPD2 (ENSCHIG00000018054) NR4A2 (ENSCHIG00000012843) ENSCHIG00000009224 KCNJ3 (ENSCHIG00000018841) ENSCHIG00000017562 ENSCHIG00000024495 GALNT13 (ENSCHIG00000022466) RPRM (ENSCHIG00000005339) ARL6IP6 (ENSCHIG00000013866) PRPF40A (ENSCHIG00000011660) FMNL2 (ENSCHIG00000026934) ENSCHIG00000010047 STAM2 (ENSCHIG00000020598) ENSCHIG00000022060 CACNB4 (ENSCHIG00000013367) ##22 ARL5A (ENSCHIG00000025329) NEB (ENSCHIG00000014281) RIF1 (ENSCHIG00000020327) TNFAIP6 (ENSCHIG00000013151) NMI (ENSCHIG00000025341) RBM43 (ENSCHIG00000019526) RND3 (ENSCHIG00000022258) ENSCHIG00000010348 ENSCHIG00000020042 MMADHC (ENSCHIG00000026029) LYPD6 (ENSCHIG00000018947) ENSCHIG00000026876 LYPD6B (ENSCHIG00000014675) KIF5C (ENSCHIG00000012226) EPC2 (ENSCHIG00000024313) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00940000160209.e ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b.l ENSGT00390000018085.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT01100000264677 ENSGT00390000016542 Bos ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00940000155602.i.a ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00940000160209.e ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000007818.e.b.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b.l ENSGT00390000018085.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT01100000264677 ENSGT00390000016542 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00940000155602.i.a ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000007818.e.b.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b.l ENSGT00390000018085.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Domestic yak MODERN SPECIES 11 GALNT5 (ENSBGRG00000008625) ENSBGRG00000008596 GPD2 (ENSBGRG00000008160) NR4A2 (ENSBGRG00000007951) KCNJ3 (ENSBGRG00000007869) ENSBGRG00000007847 ENSBGRG00000007820 GALNT13 (ENSBGRG00000007349) RPRM (ENSBGRG00000007262) ENSBGRG00000007210 ENSBGRG00000016778 ARL6IP6 (ENSBGRG00000016671) PRPF40A (ENSBGRG00000015929) FMNL2 (ENSBGRG00000015350) STAM2 (ENSBGRG00000015223) CACNB4 (ENSBGRG00000008687) ##22 ARL5A (ENSBGRG00000008374) ENSBGRG00000008336 NEB (ENSBGRG00000006143) RIF1 (ENSBGRG00000005974) TNFAIP6 (ENSBGRG00000005909) ENSBGRG00000005896 NMI (ENSBGRG00000005853) ENSBGRG00000005845 RBM43 (ENSBGRG00000005796) FAM98B (ENSBGRG00000005761) RND3 (ENSBGRG00000005710) MMADHC (ENSBGRG00000005641) LYPD6 (ENSBGRG00000005614) LYPD6B (ENSBGRG00000005574) ENSBGRG00000005565 Wild yak MODERN SPECIES 679 ARL6IP6 (ENSBMUG00000021269) PRPF40A (ENSBMUG00000021241) ENSBMUG00000021149 FMNL2 (ENSBMUG00000021133) STAM2 (ENSBMUG00000021094) CACNB4 (ENSBMUG00000020173) ##22 ARL5A (ENSBMUG00000019151) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00940000155602.i.a ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00940000160209.e ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000007818.e.b.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b.l ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT01100000264677 ENSGT00390000016542 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 11 ERMN (ENSBIXG00005020022) GALNT5 (ENSBIXG00005019996) ENSBIXG00005019967 GPD2 (ENSBIXG00005019923) NR4A2 (ENSBIXG00005019759) KCNJ3 (ENSBIXG00005019661) ENSBIXG00005006035 ENSBIXG00005019614 GALNT13 (ENSBIXG00005019576) RPRM (ENSBIXG00005019467) ENSBIXG00005019449 ARL6IP6 (ENSBIXG00005003165) PRPF40A (ENSBIXG00005005862) FMNL2 (ENSBIXG00005019262) STAM2 (ENSBIXG00005019037) CACNB4 (ENSBIXG00005003080) ##22 ARL5A (ENSBIXG00005002986) NEB (ENSBIXG00005018305) RIF1 (ENSBIXG00005018091) TNFAIP6 (ENSBIXG00005017934) NMI (ENSBIXG00005017903) RBM43 (ENSBIXG00005017876) RND3 (ENSBIXG00005017847) MMADHC (ENSBIXG00005017782) LYPD6 (ENSBIXG00005017744) LYPD6B (ENSBIXG00005017688) KIF5C (ENSBIXG00005017619) EPC2 (ENSBIXG00005017562) MBD5 (ENSBIXG00005017469) ENSBIXG00005017400 ENSBIXG00005017396 Cow MODERN SPECIES 11 ERMN (ENSBTAG00000012912) GALNT5 (ENSBTAG00000017376) ENSBTAG00000054211 GPD2 (ENSBTAG00000009770) NR4A2 (ENSBTAG00000003650) KCNJ3 (ENSBTAG00000006159) GALNT13 (ENSBTAG00000005562) ENSBTAG00000054139 RPRM (ENSBTAG00000021526) ENSBTAG00000033143 ARL6IP6 (ENSBTAG00000001435) ENSBTAG00000047365 PRPF40A (ENSBTAG00000048151) FMNL2 (ENSBTAG00000026851) STAM2 (ENSBTAG00000001887) CACNB4 (ENSBTAG00000002297) ##22 ARL5A (ENSBTAG00000002293) NEB (ENSBTAG00000006907) RIF1 (ENSBTAG00000021020) TNFAIP6 (ENSBTAG00000007239) NMI (ENSBTAG00000032369) RBM43 (ENSBTAG00000016217) RND3 (ENSBTAG00000039731) MMADHC (ENSBTAG00000015962) LYPD6 (ENSBTAG00000047426) LYPD6B (ENSBTAG00000019683) KIF5C (ENSBTAG00000018125) EPC2 (ENSBTAG00000018581) MBD5 (ENSBTAG00000019592) PTMA (ENSBTAG00000051947) ORC4 (ENSBTAG00000015291) American bison MODERN SPECIES 3062 GALNT5 (ENSBBBG00000012983) GPD2 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CACNB4 (ENSBMSG00010003258) ##22 ARL5A (ENSBMSG00010002880) NEB (ENSBMSG00010002643) RIF1 (ENSBMSG00010002436) ENSBMSG00010002399 TNFAIP6 (ENSBMSG00010002386) NMI (ENSBMSG00010002366) RBM43 (ENSBMSG00010002353) RND3 (ENSBMSG00010002335) MMADHC (ENSBMSG00010002313) LYPD6 (ENSBMSG00010002294) ENSBMSG00010002277 EPC2 (ENSBMSG00010002250) MBD5 (ENSBMSG00010002215) ENSBMSG00010002178 ACVR2A (ENSBMSG00010002163) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00950000185140 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT01090000260806 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00950000185140 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT01090000260806 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00950000185140 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00950000185140 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00950000185140 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000008783.ab.b ENSGT00390000016542 Ursus ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT01030000235022 ENSGT00390000009987 ENSGT00950000185140 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b American black bear MODERN SPECIES 6182 CACNB4 (ENSUAMG00000002586) ##22 Polar bear MODERN SPECIES 142 ACVR1 (ENSUMAG00000005646) ACVR1C (ENSUMAG00000005629) CYTIP (ENSUMAG00000005620) ERMN (ENSUMAG00000005614) GALNT5 (ENSUMAG00000005567) GPD2 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ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Equus ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000153988.A ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Horse MODERN SPECIES 9 ERMN (ENSECAG00000017073) GALNT5 (ENSECAG00000012388) GPD2 (ENSECAG00000018290) NR4A2 (ENSECAG00000014232) ENSECAG00000058726 ENSECAG00000002256 ENSECAG00000046581 KCNJ3 (ENSECAG00000001276) GALNT13 (ENSECAG00000007821) RPRM (ENSECAG00000001246) ARL6IP6 (ENSECAG00000007580) PRPF40A (ENSECAG00000009113) ENSECAG00000001048 FMNL2 (ENSECAG00000011111) STAM2 (ENSECAG00000021355) CACNB4 (ENSECAG00000056636) ##22 ARL5A (ENSECAG00000023672) NEB (ENSECAG00000020638) RIF1 (ENSECAG00000012679) TNFAIP6 (ENSECAG00000012104) NMI (ENSECAG00000006801) RBM43 (ENSECAG00000000566) RND3 (ENSECAG00000021310) MMADHC (ENSECAG00000014503) LYPD6 (ENSECAG00000014321) LYPD6B (ENSECAG00000013932) KIF5C (ENSECAG00000013822) EPC2 (ENSECAG00000010930) ENSECAG00000008805 ENSECAG00000056446 ENSECAG00000055420 Donkey MODERN SPECIES 24 CCDC148 (ENSEASG00005023292) ACVR1 (ENSEASG00005023294) ACVR1C (ENSEASG00005023296) ENSEASG00005029587 ERMN (ENSEASG00005026686) GALNT5 (ENSEASG00005023306) GPD2 (ENSEASG00005023309) NR4A2 (ENSEASG00005023310) KCNJ3 (ENSEASG00005023313) GALNT13 (ENSEASG00005023315) RPRM (ENSEASG00005023316) ARL6IP6 (ENSEASG00005023320) PRPF40A (ENSEASG00005023328) FMNL2 (ENSEASG00005023341) STAM2 (ENSEASG00005023344) CACNB4 (ENSEASG00005023346) ##22 ARL5A (ENSEASG00005023347) ENSEASG00005023364 ENSEASG00005038507 RIF1 (ENSEASG00005023434) TNFAIP6 (ENSEASG00005023439) NMI (ENSEASG00005023440) RBM43 (ENSEASG00005033269) RND3 (ENSEASG00005038021) MMADHC (ENSEASG00005023444) LYPD6 (ENSEASG00005023445) LYPD6B (ENSEASG00005032417) KIF5C (ENSEASG00005023448) EPC2 (ENSEASG00005023449) MBD5 (ENSEASG00005023450) ORC4 (ENSEASG00005023452) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 26 UPP2 (ENSRFEG00010000790) ACVR1 (ENSRFEG00010000822) ACVR1C (ENSRFEG00010000861) CYTIP (ENSRFEG00010000916) ERMN (ENSRFEG00010000944) GALNT5 (ENSRFEG00010000968) GPD2 (ENSRFEG00010001004) NR4A2 (ENSRFEG00010001043) KCNJ3 (ENSRFEG00010001072) GALNT13 (ENSRFEG00010001100) RPRM (ENSRFEG00010001141) ARL6IP6 (ENSRFEG00010001173) PRPF40A (ENSRFEG00010001279) FMNL2 (ENSRFEG00010001562) STAM2 (ENSRFEG00010001637) CACNB4 (ENSRFEG00010001762) ##22 ARL5A (ENSRFEG00010001991) NEB (ENSRFEG00010003197) RIF1 (ENSRFEG00010004943) TNFAIP6 (ENSRFEG00010004979) NMI (ENSRFEG00010004983) RBM43 (ENSRFEG00010004990) RND3 (ENSRFEG00010005000) ENSRFEG00010005006 MMADHC (ENSRFEG00010005008) LYPD6 (ENSRFEG00010005018) ENSRFEG00010005025 LYPD6B (ENSRFEG00010005029) KIF5C (ENSRFEG00010005056) EPC2 (ENSRFEG00010005117) MBD5 (ENSRFEG00010005157) Microbat MODERN SPECIES 1026 CYTIP (ENSMLUG00000002426) ENSMLUG00000003547 GALNT5 (ENSMLUG00000003542) GPD2 (ENSMLUG00000001655) NR4A2 (ENSMLUG00000008683) ENSMLUG00000025509 ENSMLUG00000029954 KCNJ3 (ENSMLUG00000010559) GALNT13 (ENSMLUG00000015972) RPRM (ENSMLUG00000022854) ENSMLUG00000030388 ARL6IP6 (ENSMLUG00000023268) PRPF40A (ENSMLUG00000014881) FMNL2 (ENSMLUG00000014867) STAM2 (ENSMLUG00000003477) CACNB4 (ENSMLUG00000003465) ##22 ARL5A (ENSMLUG00000003458) Megabat MODERN SPECIES 1774 STAM2 (ENSPVAG00000014494) CACNB4 (ENSPVAG00000014493) ##22 ARL5A (ENSPVAG00000014492) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00950000185140 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Primates ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714.v ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718.j ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714.v ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000154530.r.b.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718.i ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00390000015797.d ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00950000183077.a.a.a.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00620000089259 ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714.v ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000154530.r.b.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718.i ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00390000015797.d ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00950000183077.a.a.a.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00620000089259 ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714.v ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Marmoset MODERN SPECIES 18 ENSCJAG00000015452 NR4A2 (ENSCJAG00000015464) ENSCJAG00000078948 KCNJ3 (ENSCJAG00000015490) ENSCJAG00000046815 GALNT13 (ENSCJAG00000015503) ENSCJAG00000074891 RPRM (ENSCJAG00000046500) ARL6IP6 (ENSCJAG00000061546) PRPF40A (ENSCJAG00000015541) FMNL2 (ENSCJAG00000015629) ENSCJAG00000056419 ENSCJAG00000075153 ENSCJAG00000082252 STAM2 (ENSCJAG00000044417) CACNB4 (ENSCJAG00000003326) ##22 ENSCJAG00000040846 ENSCJAG00000086283 ENSCJAG00000075900 NEB (ENSCJAG00000003175) RIF1 (ENSCJAG00000003138) TNFAIP6 (ENSCJAG00000003134) NMI (ENSCJAG00000003127) RBM43 (ENSCJAG00000003125) ENSCJAG00000083510 RND3 (ENSCJAG00000045984) ENSCJAG00000071388 ENSCJAG00000075779 ENSCJAG00000070079 ENSCJAG00000003086 LYPD6 (ENSCJAG00000055489) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00940000154966.l ENSGT00390000001718.i ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00390000015797.d ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00950000183077.a.a.a.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00620000089259 ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714.v ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Capuchin MODERN SPECIES 27 KCNJ3 (ENSCCAG00000030138) ENSCCAG00000025266 GALNT13 (ENSCCAG00000024645) ENSCCAG00000019999 RPRM (ENSCCAG00000006984) ENSCCAG00000019893 ARL6IP6 (ENSCCAG00000024457) PRPF40A (ENSCCAG00000034856) FMNL2 (ENSCCAG00000028051) ENSCCAG00000020790 ENSCCAG00000007786 STAM2 (ENSCCAG00000030900) CACNB4 (ENSCCAG00000036673) ##22 ARL5A (ENSCCAG00000023321) NEB (ENSCCAG00000026566) RIF1 (ENSCCAG00000024760) TNFAIP6 (ENSCCAG00000022288) NMI (ENSCCAG00000022500) RBM43 (ENSCCAG00000020911) RND3 (ENSCCAG00000030386) MMADHC (ENSCCAG00000036477) LYPD6 (ENSCCAG00000028399) LYPD6B (ENSCCAG00000030062) KIF5C (ENSCCAG00000031241) EPC2 (ENSCCAG00000037425) MBD5 (ENSCCAG00000030324) ORC4 (ENSCCAG00000008932) ACVR2A (ENSCCAG00000034862) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 46 ERMN (ENSSBOG00000031955) GALNT5 (ENSSBOG00000020422) ENSSBOG00000023257 ENSSBOG00000027281 NR4A2 (ENSSBOG00000021402) KCNJ3 (ENSSBOG00000023474) ENSSBOG00000030750 GALNT13 (ENSSBOG00000024917) RPRM (ENSSBOG00000009917) ARL6IP6 (ENSSBOG00000029584) PRPF40A (ENSSBOG00000015435) FMNL2 (ENSSBOG00000027176) ENSSBOG00000023807 ENSSBOG00000027242 ENSSBOG00000023639 CACNB4 (ENSSBOG00000025206) ##22 ARL5A (ENSSBOG00000034323) NEB (ENSSBOG00000031622) RIF1 (ENSSBOG00000029530) TNFAIP6 (ENSSBOG00000034644) NMI (ENSSBOG00000035067) RBM43 (ENSSBOG00000022371) RND3 (ENSSBOG00000025108) ENSSBOG00000035889 LYPD6 (ENSSBOG00000019011) LYPD6B (ENSSBOG00000017701) KIF5C (ENSSBOG00000013675) EPC2 (ENSSBOG00000035940) MBD5 (ENSSBOG00000024663) ORC4 (ENSSBOG00000028104) ACVR2A (ENSSBOG00000025103) Mas night monkey MODERN SPECIES 1325 ENSANAG00000016076 ENSANAG00000031523 ARL6IP6 (ENSANAG00000034126) PRPF40A (ENSANAG00000023828) FMNL2 (ENSANAG00000029876) ENSANAG00000024796 ENSANAG00000026006 STAM2 (ENSANAG00000000022) CACNB4 (ENSANAG00000035973) ##22 ARL5A (ENSANAG00000027698) NEB (ENSANAG00000025115) RIF1 (ENSANAG00000024840) TNFAIP6 (ENSANAG00000024087) NMI (ENSANAG00000034417) RBM43 (ENSANAG00000032206) ENSANAG00000022645 RND3 (ENSANAG00000033420) MMADHC (ENSANAG00000038372) LYPD6 (ENSANAG00000032366) LYPD6B (ENSANAG00000034708) KIF5C (ENSANAG00000034068) ENSANAG00000027793 EPC2 (ENSANAG00000037383) MBD5 (ENSANAG00000033779) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00940000155179.c.b ENSGT00390000001718.j ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00620000089259 ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714.v ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00910000147393 ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000154530.r.b.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00910000146654 ENSGT00940000158526 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00940000155179.c.b ENSGT00390000001718.j ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00620000089259 ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714.v ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00910000147393 ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00940000153201.j.k.b ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00910000146654 ENSGT00940000158526 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00940000155179.c.b ENSGT00390000001718.j ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714.v ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00910000147393 ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00940000153201.j.k.a.a.b.a.b ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00910000146654 ENSGT00940000158526 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00940000155179.c.b ENSGT00390000001718.j ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT00940000154748.C.bb.a ENSGT00910000147369 ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714.v ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00910000147393 ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00940000153201.j.k.a.a.b.a.b ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00910000146654 ENSGT00940000158526 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00940000155179.c.b ENSGT00390000001718.j ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT00940000154748.C.bb.a ENSGT00910000147369 ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714.v ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00910000147393 ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00940000153201.j.k.a.a.b.a.b ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00910000146654 ENSGT00940000158526 Olive baboon MODERN SPECIES 1 ERMN (ENSPANG00000011571) GALNT5 (ENSPANG00000015847) ENSPANG00000045575 ENSPANG00000050199 GPD2 (ENSPANG00000022223) NR4A2 (ENSPANG00000017851) ENSPANG00000039703 ENSPANG00000021079 ENSPANG00000046537 GALNT13 (ENSPANG00000016223) RPRM (ENSPANG00000016888) ARL6IP6 (ENSPANG00000018067) PRPF40A (ENSPANG00000022095) FMNL2 (ENSPANG00000008524) STAM2 (ENSPANG00000025044) CACNB4 (ENSPANG00000008398) ##22 ENSPANG00000009772 NEB (ENSPANG00000005536) RIF1 (ENSPANG00000008525) TNFAIP6 (ENSPANG00000021874) NMI (ENSPANG00000006057) RBM43 (ENSPANG00000009533) ENSPANG00000047432 RND3 (ENSPANG00000015939) ENSPANG00000009096 MMADHC (ENSPANG00000019761) ENSPANG00000038761 ENSPANG00000048846 LYPD6 (ENSPANG00000019895) LYPD6B (ENSPANG00000022096) KIF5C (ENSPANG00000018689) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00940000155179.c.b ENSGT00390000001718.j ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT00940000154748.C.bb.a ENSGT00910000147369 ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714.v ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00910000147393 ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00940000153201.j.k.a.a.b.a.b ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b Drill MODERN SPECIES 965 ARL6IP6 (ENSMLEG00000019180) PRPF40A (ENSMLEG00000012078) FMNL2 (ENSMLEG00000039912) STAM2 (ENSMLEG00000038778) CACNB4 (ENSMLEG00000032404) ##22 ENSMLEG00000039596 NEB (ENSMLEG00000025619) RIF1 (ENSMLEG00000042945) TNFAIP6 (ENSMLEG00000039791) NMI (ENSMLEG00000033257) ENSMLEG00000033169 RBM43 (ENSMLEG00000032155) RND3 (ENSMLEG00000035844) MMADHC (ENSMLEG00000033230) Sooty mangabey MODERN SPECIES 480 ERMN (ENSCATG00000035512) GALNT5 (ENSCATG00000043386) ENSCATG00000041805 GPD2 (ENSCATG00000027595) NR4A2 (ENSCATG00000031198) ENSCATG00000039232 ENSCATG00000012230 KCNJ3 (ENSCATG00000015555) GALNT13 (ENSCATG00000041414) RPRM (ENSCATG00000009508) ARL6IP6 (ENSCATG00000037038) PRPF40A (ENSCATG00000043798) ENSCATG00000039643 FMNL2 (ENSCATG00000030795) STAM2 (ENSCATG00000045298) CACNB4 (ENSCATG00000035449) ##22 ARL5A (ENSCATG00000029667) NEB (ENSCATG00000031600) RIF1 (ENSCATG00000033353) TNFAIP6 (ENSCATG00000043098) NMI (ENSCATG00000045259) ENSCATG00000038471 RBM43 (ENSCATG00000029617) RND3 (ENSCATG00000042453) ENSCATG00000036472 MMADHC (ENSCATG00000043511) LYPD6 (ENSCATG00000030657) LYPD6B (ENSCATG00000033638) KIF5C (ENSCATG00000045100) EPC2 (ENSCATG00000045291) MBD5 (ENSCATG00000040834) Macaca ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00940000155179.d ENSGT00940000166727.b ENSGT00390000001718.j ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT00940000154748.C.bb.a ENSGT00910000147369 ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714.v ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00910000147393 ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00940000153201.j.k.a.a.b.a.b ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00390000010822.p ENSGT00940000158526 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 193 ENSMNEG00000034833 RPRM (ENSMNEG00000020933) ARL6IP6 (ENSMNEG00000041131) PRPF40A (ENSMNEG00000042025) FMNL2 (ENSMNEG00000042052) ENSMNEG00000031306 STAM2 (ENSMNEG00000026377) CACNB4 (ENSMNEG00000032652) ##22 ARL5A (ENSMNEG00000035230) NEB (ENSMNEG00000037586) RIF1 (ENSMNEG00000031616) TNFAIP6 (ENSMNEG00000005810) NMI (ENSMNEG00000036210) ENSMNEG00000043989 RBM43 (ENSMNEG00000030900) RND3 (ENSMNEG00000034976) ENSMNEG00000033300 MMADHC (ENSMNEG00000036865) LYPD6 (ENSMNEG00000014126) LYPD6B (ENSMNEG00000036224) KIF5C (ENSMNEG00000022981) EPC2 (ENSMNEG00000039186) MBD5 (ENSMNEG00000029374) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00940000155179.d ENSGT00390000001718.j ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT00940000153375.lb.qb.a.a.a.a ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT01100000263539.b.a.a.a.b.b.a.b.b.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714.v ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00390000010822.p ENSGT00940000158526 ENSGT00940000167556.b.b.a.b.a.a.a.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a.a.b.a.a.a ENSGT00530000064137.a.b Crab-eating macaque MODERN SPECIES 3 ERMN (ENSMFAG00000045944) GALNT5 (ENSMFAG00000036566) ENSMFAG00000059673 GPD2 (ENSMFAG00000031606) NR4A2 (ENSMFAG00000036654) ENSMFAG00000048164 ENSMFAG00000043008 ENSMFAG00000050325 GALNT13 (ENSMFAG00000043213) ENSMFAG00000065123 RPRM (ENSMFAG00000023756) ARL6IP6 (ENSMFAG00000046021) PRPF40A (ENSMFAG00000038480) FMNL2 (ENSMFAG00000000995) STAM2 (ENSMFAG00000039480) CACNB4 (ENSMFAG00000044631) ##22 ENSMFAG00000056377 NEB (ENSMFAG00000000188) RIF1 (ENSMFAG00000032233) TNFAIP6 (ENSMFAG00000000925) NMI (ENSMFAG00000045501) RBM43 (ENSMFAG00000031648) RND3 (ENSMFAG00000045221) ENSMFAG00000037633 ENSMFAG00000060272 MMADHC (ENSMFAG00000001801) LYPD6 (ENSMFAG00000002977) LYPD6B (ENSMFAG00000046204) KIF5C (ENSMFAG00000038774) ENSMFAG00000052887 EPC2 (ENSMFAG00000002751) Rhesus MODERN SPECIES 3 ERMN (ENSMMUG00000038413) GALNT5 (ENSMMUG00000017717) ENSMMUG00000017716 GPD2 (ENSMMUG00000004897) NR4A2 (ENSMMUG00000011607) ENSMMUG00000058984 KCNJ3 (ENSMMUG00000007096) ENSMMUG00000061400 GALNT13 (ENSMMUG00000055468) RPRM (ENSMMUG00000061390) ENSMMUG00000056430 ARL6IP6 (ENSMMUG00000062827) PRPF40A (ENSMMUG00000010812) FMNL2 (ENSMMUG00000031452) STAM2 (ENSMMUG00000010527) CACNB4 (ENSMMUG00000010526) ##22 ARL5A (ENSMMUG00000010521) RIF1 (ENSMMUG00000008611) TNFAIP6 (ENSMMUG00000010927) NMI (ENSMMUG00000017781) RBM43 (ENSMMUG00000044949) RND3 (ENSMMUG00000016040) ENSMMUG00000056410 ENSMMUG00000058846 ENSMMUG00000051118 MMADHC (ENSMMUG00000005633) LYPD6 (ENSMMUG00000038492) ENSMMUG00000056996 LYPD6B (ENSMMUG00000009475) KIF5C (ENSMMUG00000009268) ENSMMUG00000031468 Vervet Monkey MODERN SPECIES 1 ACVR1 (ENSCSAG00000015925) ACVR1C (ENSCSAG00000015930) CYTIP (ENSCSAG00000015933) ERMN (ENSCSAG00000015935) GALNT5 (ENSCSAG00000015950) GPD2 (ENSCSAG00000015958) NR4A2 (ENSCSAG00000015964) KCNJ3 (ENSCSAG00000015970) GALNT13 (ENSCSAG00000015977) RPRM (ENSCSAG00000018646) ENSCSAG00000015984 ARL6IP6 (ENSCSAG00000015990) PRPF40A (ENSCSAG00000016002) ENSCSAG00000016011 STAM2 (ENSCSAG00000016021) CACNB4 (ENSCSAG00000016028) ##22 NEB (ENSCSAG00000016065) RIF1 (ENSCSAG00000016089) TNFAIP6 (ENSCSAG00000016095) NMI (ENSCSAG00000016102) RBM43 (ENSCSAG00000016105) RND3 (ENSCSAG00000016117) ENSCSAG00000016123 MMADHC (ENSCSAG00000016144) LYPD6 (ENSCSAG00000016149) LYPD6B (ENSCSAG00000016151) KIF5C (ENSCSAG00000016159) ENSCSAG00000018645 EPC2 (ENSCSAG00000016167) MBD5 (ENSCSAG00000016175) ORC4 (ENSCSAG00000016183) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 381 ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00620000089259 ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714.v ENSGT00940000154533.b.d.j ENSGT00940000154533.b.d.k ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00910000147393 ENSGT00530000063686.a.b Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2867 ARL6IP6 (ENSRBIG00000038429) PRPF40A (ENSRBIG00000042261) FMNL2 (ENSRBIG00000036852) ENSRBIG00000035673 STAM2 (ENSRBIG00000031763) CACNB4 (ENSRBIG00000031798) ##22 ARL5A (ENSRBIG00000031831) NEB (ENSRBIG00000043974) RIF1 (ENSRBIG00000003704) TNFAIP6 (ENSRBIG00000041985) NMI (ENSRBIG00000035886) RBM43 (ENSRBIG00000035651) ENSRBIG00000020624 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1699 ARL6IP6 (ENSRROG00000043370) PRPF40A (ENSRROG00000032937) FMNL2 (ENSRROG00000023932) ENSRROG00000030157 ENSRROG00000015902 STAM2 (ENSRROG00000030925) CACNB4 (ENSRROG00000044165) ##22 ARL5A (ENSRROG00000040290) ENSRROG00000035506 ENSRROG00000023658 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00940000155179.c.b ENSGT00390000001718.j ENSGT00950000183038.a.b.b.b 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ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00910000147393 ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000154530.r.b.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00910000146654 ENSGT00940000158526 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00940000155179.c.b ENSGT00390000001718.j ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00620000089259 ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714.v.f ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00910000147393 ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00940000155179.c.b ENSGT00390000001718.j ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00620000089259 ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714.v.f ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00910000147393 ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 Pan ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00530000063734.a ENSGT00730000111097.f.a.b.b.b ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00940000155179.c.b ENSGT00390000001718.j ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00620000089259 ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714.v.f ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00910000147393 ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00960000190927 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b Chimpanzee MODERN SPECIES 15 CYTIP (ENSPTRG00000012553) ENSPTRG00000050997 ERMN (ENSPTRG00000012551) GALNT5 (ENSPTRG00000012550) ENSPTRG00000043600 GPD2 (ENSPTRG00000012549) NR4A2 (ENSPTRG00000012548) KCNJ3 (ENSPTRG00000012547) GALNT13 (ENSPTRG00000012546) RPRM (ENSPTRG00000012545) ARL6IP6 (ENSPTRG00000012544) PRPF40A (ENSPTRG00000012543) ENSPTRG00000048776 FMNL2 (ENSPTRG00000012541) STAM2 (ENSPTRG00000012540) CACNB4 (ENSPTRG00000047916) ##22 ARL5A (ENSPTRG00000012538) ENSPTRG00000039444 NEB (ENSPTRG00000012536) RIF1 (ENSPTRG00000012534) TNFAIP6 (ENSPTRG00000012533) NMI (ENSPTRG00000012531) RBM43 (ENSPTRG00000046668) RND3 (ENSPTRG00000012527) MMADHC (ENSPTRG00000012525) LYPD6 (ENSPTRG00000012524) LYPD6B (ENSPTRG00000012523) KIF5C (ENSPTRG00000012521) ENSPTRG00000051205 EPC2 (ENSPTRG00000012518) MBD5 (ENSPTRG00000029184) Bonobo MODERN SPECIES 15 CYTIP (ENSPPAG00000032175) ENSPPAG00000038520 ERMN (ENSPPAG00000032661) GALNT5 (ENSPPAG00000041176) ENSPPAG00000039863 GPD2 (ENSPPAG00000030269) NR4A2 (ENSPPAG00000031796) ENSPPAG00000014453 GALNT13 (ENSPPAG00000035152) RPRM (ENSPPAG00000002667) ARL6IP6 (ENSPPAG00000026309) PRPF40A (ENSPPAG00000040033) ENSPPAG00000009946 FMNL2 (ENSPPAG00000038903) STAM2 (ENSPPAG00000037568) CACNB4 (ENSPPAG00000028311) ##22 ARL5A (ENSPPAG00000033494) ENSPPAG00000043206 RIF1 (ENSPPAG00000023754) TNFAIP6 (ENSPPAG00000029874) NMI (ENSPPAG00000034174) ENSPPAG00000028605 RBM43 (ENSPPAG00000035042) RND3 (ENSPPAG00000042575) MMADHC (ENSPPAG00000029746) LYPD6 (ENSPPAG00000043249) LYPD6B (ENSPPAG00000039900) KIF5C (ENSPPAG00000031052) ENSPPAG00000001157 EPC2 (ENSPPAG00000040114) MBD5 (ENSPPAG00000037170) Human MODERN SPECIES 11 UPP2 (ENSG00000007001) ACVR1 (ENSG00000115170) ACVR1C (ENSG00000123612) CYTIP (ENSG00000115165) ERMN (ENSG00000136541) GALNT5 (ENSG00000136542) GPD2 (ENSG00000115159) NR4A2 (ENSG00000153234) KCNJ3 (ENSG00000162989) GALNT13 (ENSG00000144278) RPRM (ENSG00000177519) ARL6IP6 (ENSG00000177917) PRPF40A (ENSG00000196504) FMNL2 (ENSG00000157827) STAM2 (ENSG00000115145) CACNB4 (ENSG00000182389) ##22 ARL5A (ENSG00000162980) NEB (ENSG00000183091) RIF1 (ENSG00000080345) TNFAIP6 (ENSG00000123610) NMI (ENSG00000123609) RBM43 (ENSG00000184898) RND3 (ENSG00000115963) MMADHC (ENSG00000168288) LYPD6 (ENSG00000187123) LYPD6B (ENSG00000150556) KIF5C (ENSG00000168280) EPC2 (ENSG00000135999) MBD5 (ENSG00000204406) ORC4 (ENSG00000115947) ACVR2A (ENSG00000121989) Gorilla MODERN SPECIES 15 ACVR1C (ENSGGOG00000039092) CYTIP (ENSGGOG00000006478) ERMN (ENSGGOG00000009944) GALNT5 (ENSGGOG00000002475) ENSGGOG00000027932 GPD2 (ENSGGOG00000022735) NR4A2 (ENSGGOG00000011182) KCNJ3 (ENSGGOG00000022873) GALNT13 (ENSGGOG00000034959) RPRM (ENSGGOG00000002162) ARL6IP6 (ENSGGOG00000015604) PRPF40A (ENSGGOG00000015592) ENSGGOG00000028462 FMNL2 (ENSGGOG00000008600) STAM2 (ENSGGOG00000011441) CACNB4 (ENSGGOG00000038672) ##22 ENSGGOG00000002066 NEB (ENSGGOG00000016489) RIF1 (ENSGGOG00000040178) TNFAIP6 (ENSGGOG00000022498) NMI (ENSGGOG00000013518) RBM43 (ENSGGOG00000041294) RND3 (ENSGGOG00000036127) MMADHC (ENSGGOG00000027348) LYPD6 (ENSGGOG00000007400) LYPD6B (ENSGGOG00000000801) KIF5C (ENSGGOG00000016596) EPC2 (ENSGGOG00000011299) MBD5 (ENSGGOG00000003833) ORC4 (ENSGGOG00000022258) ACVR2A (ENSGGOG00000015713) Orangutan MODERN SPECIES 15 ACVR1C (ENSPPYG00000038725) CYTIP (ENSPPYG00000037528) ERMN (ENSPPYG00000012862) GALNT5 (ENSPPYG00000012861) GPD2 (ENSPPYG00000041025) NR4A2 (ENSPPYG00000012859) ENSPPYG00000032817 ENSPPYG00000033294 GALNT13 (ENSPPYG00000012857) RPRM (ENSPPYG00000012856) ARL6IP6 (ENSPPYG00000012855) PRPF40A (ENSPPYG00000012854) ENSPPYG00000012852 FMNL2 (ENSPPYG00000012851) STAM2 (ENSPPYG00000012850) CACNB4 (ENSPPYG00000012849) ##22 ARL5A (ENSPPYG00000012848) ENSPPYG00000032033 NEB (ENSPPYG00000012847) RIF1 (ENSPPYG00000012846) TNFAIP6 (ENSPPYG00000012845) ENSPPYG00000012844 RBM43 (ENSPPYG00000037248) ENSPPYG00000036365 RND3 (ENSPPYG00000012842) MMADHC (ENSPPYG00000012840) LYPD6 (ENSPPYG00000012839) ENSPPYG00000029593 KIF5C (ENSPPYG00000012838) ENSPPYG00000032644 EPC2 (ENSPPYG00000012837) Gibbon MODERN SPECIES 7 ERMN (ENSNLEG00000027710) ENSNLEG00000028994 GALNT5 (ENSNLEG00000000734) ENSNLEG00000000733 GPD2 (ENSNLEG00000000655) NR4A2 (ENSNLEG00000000629) KCNJ3 (ENSNLEG00000011437) GALNT13 (ENSNLEG00000011400) RPRM (ENSNLEG00000019197) ARL6IP6 (ENSNLEG00000011387) PRPF40A (ENSNLEG00000011324) FMNL2 (ENSNLEG00000026694) ENSNLEG00000019196 ENSNLEG00000029701 STAM2 (ENSNLEG00000011293) CACNB4 (ENSNLEG00000029444) ##22 ENSNLEG00000030371 ARL5A (ENSNLEG00000011191) NEB (ENSNLEG00000011170) RIF1 (ENSNLEG00000010955) TNFAIP6 (ENSNLEG00000010934) NMI (ENSNLEG00000010893) RBM43 (ENSNLEG00000010889) RND3 (ENSNLEG00000010846) ENSNLEG00000035632 MMADHC (ENSNLEG00000010795) IQCE (ENSNLEG00000010709) BRAT1 (ENSNLEG00000010655) AMZ1 (ENSNLEG00000010620) GNA12 (ENSNLEG00000033618) CARD11 (ENSNLEG00000010543) Tarsier MODERN SPECIES 6739 ARL6IP6 (ENSTSYG00000032686) PRPF40A (ENSTSYG00000012362) FMNL2 (ENSTSYG00000026977) STAM2 (ENSTSYG00000014533) CACNB4 (ENSTSYG00000011905) ##22 ARL5A (ENSTSYG00000035041) NEB (ENSTSYG00000005011) RIF1 (ENSTSYG00000008861) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 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ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Mouse lemur MODERN SPECIES 30 UPP2 (ENSMICG00000004835) ACVR1 (ENSMICG00000042942) ACVR1C (ENSMICG00000008579) CYTIP (ENSMICG00000033074) ERMN (ENSMICG00000043032) GALNT5 (ENSMICG00000008562) GPD2 (ENSMICG00000002816) NR4A2 (ENSMICG00000012076) KCNJ3 (ENSMICG00000005207) GALNT13 (ENSMICG00000013917) RPRM (ENSMICG00000038767) ARL6IP6 (ENSMICG00000042407) PRPF40A (ENSMICG00000017146) FMNL2 (ENSMICG00000017132) STAM2 (ENSMICG00000009382) CACNB4 (ENSMICG00000005867) ##22 ENSMICG00000015788 NEB (ENSMICG00000007063) RIF1 (ENSMICG00000046127) TNFAIP6 (ENSMICG00000045439) NMI (ENSMICG00000046560) RBM43 (ENSMICG00000002078) ENSMICG00000033304 RND3 (ENSMICG00000035694) MMADHC (ENSMICG00000005952) LYPD6 (ENSMICG00000041550) LYPD6B (ENSMICG00000016688) KIF5C (ENSMICG00000016670) EPC2 (ENSMICG00000016659) MBD5 (ENSMICG00000017046) ORC4 (ENSMICG00000004578) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 81 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00620000089259 ENSGT00390000008673.c.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 116 ENSPCOG00000017835 RPRM (ENSPCOG00000011465) ARL6IP6 (ENSPCOG00000026472) PRPF40A (ENSPCOG00000021456) FMNL2 (ENSPCOG00000028832) ENSPCOG00000017905 STAM2 (ENSPCOG00000015690) CACNB4 (ENSPCOG00000024069) ##22 ARL5A (ENSPCOG00000016563) NEB (ENSPCOG00000014125) RIF1 (ENSPCOG00000027888) TNFAIP6 (ENSPCOG00000017912) NMI (ENSPCOG00000028467) RBM43 (ENSPCOG00000024727) RND3 (ENSPCOG00000025763) ENSPCOG00000028209 ENSPCOG00000015253 LYPD6 (ENSPCOG00000024054) LYPD6B (ENSPCOG00000024216) KIF5C (ENSPCOG00000024550) EPC2 (ENSPCOG00000016814) MBD5 (ENSPCOG00000007503) ORC4 (ENSPCOG00000005005) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 151 ENSPSMG00000024019 NR4A2 (ENSPSMG00000024042) ENSPSMG00000024051 GALNT13 (ENSPSMG00000024068) RPRM (ENSPSMG00000024079) ARL6IP6 (ENSPSMG00000024093) PRPF40A (ENSPSMG00000024134) FMNL2 (ENSPSMG00000024197) ENSPSMG00000024224 ENSPSMG00000024228 ENSPSMG00000024232 STAM2 (ENSPSMG00000024260) CACNB4 (ENSPSMG00000024421) ##22 ENSPSMG00000024472 NEB (ENSPSMG00000024578) RIF1 (ENSPSMG00000024723) TNFAIP6 (ENSPSMG00000024750) NMI (ENSPSMG00000024757) RBM43 (ENSPSMG00000024766) ENSPSMG00000024770 RND3 (ENSPSMG00000024777) Bushbaby MODERN SPECIES 179 STAM2 (ENSOGAG00000016811) CACNB4 (ENSOGAG00000011426) ##22 ARL5A (ENSOGAG00000011424) NEB (ENSOGAG00000006154) RIF1 (ENSOGAG00000006141) TNFAIP6 (ENSOGAG00000011099) NMI (ENSOGAG00000002762) RBM43 (ENSOGAG00000002761) RND3 (ENSOGAG00000006980) MMADHC (ENSOGAG00000034385) LYPD6 (ENSOGAG00000009025) LYPD6B (ENSOGAG00000009022) KIF5C (ENSOGAG00000009021) ENSOGAG00000027538 EPC2 (ENSOGAG00000009018) MBD5 (ENSOGAG00000005182) ENSOGAG00000007606 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00950000185140 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Tree shrew MODERN SPECIES 3049 STAM2 (ENSTBEG00000011785) CACNB4 (ENSTBEG00000011607) ##22 ARL5A (ENSTBEG00000011511) Glires ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00950000185140 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00950000185140 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Pika MODERN SPECIES 4038 STAM2 (ENSOPRG00000010491) CACNB4 (ENSOPRG00000010462) ##22 ARL5A (ENSOPRG00000010455) Rabbit MODERN SPECIES 18 ERMN (ENSOCUG00000009198) GALNT5 (ENSOCUG00000009185) ENSOCUG00000021063 GPD2 (ENSOCUG00000009764) NR4A2 (ENSOCUG00000000784) ENSOCUG00000013788 KCNJ3 (ENSOCUG00000024206) GALNT13 (ENSOCUG00000017645) RPRM (ENSOCUG00000001688) ARL6IP6 (ENSOCUG00000013257) ENSOCUG00000030282 ENSOCUG00000013239 ENSOCUG00000037766 ENSOCUG00000013216 STAM2 (ENSOCUG00000000344) ENSOCUG00000000144 ##22 ARL5A (ENSOCUG00000035346) NEB (ENSOCUG00000017458) ENSOCUG00000035924 RIF1 (ENSOCUG00000017435) TNFAIP6 (ENSOCUG00000013688) ENSOCUG00000038635 NMI (ENSOCUG00000001001) RBM43 (ENSOCUG00000026185) ENSOCUG00000025786 ENSOCUG00000036417 RND3 (ENSOCUG00000001751) MMADHC (ENSOCUG00000008124) LYPD6 (ENSOCUG00000008118) ENSOCUG00000030777 LYPD6B (ENSOCUG00000008346) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b 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ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 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ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 188 Upp2 (ENSCGRG00001011463) Acvr1 (ENSCGRG00001023684) Acvr1c (ENSCGRG00001023713) Cytip (ENSCGRG00001024713) Ermn (ENSCGRG00001016956) Galnt5 (ENSCGRG00001004718) Gpd2 (ENSCGRG00001024452) 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SPECIES 1 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT01100000263477.B.d.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 Mus ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160160 ENSGT00860000136335 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b 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SPECIES 22 ENSHGLG00000001958 ##22 ENSHGLG00000009340 NEB (ENSHGLG00000002368) ENSHGLG00000031797 ENSHGLG00000044961 ENSHGLG00000034699 ENSHGLG00000003683 ENSHGLG00000000472 ENSHGLG00000001738 ENSHGLG00000039688 ENSHGLG00000015922 LYPD1 (ENSHGLG00000033205) NCKAP5 (ENSHGLG00000008645) MGAT5 (ENSHGLG00000005155) ENSHGLG00000045914 ACMSD (ENSHGLG00000009833) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714.fb.a ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00490000043329.a.a.a.k.a ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526.c.b ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 12 ACVR1C (ENSSVLG00005008270) CYTIP (ENSSVLG00005008173) ERMN (ENSSVLG00005008084) ENSSVLG00005008042 GPD2 (ENSSVLG00005007886) NR4A2 (ENSSVLG00005007787) KCNJ3 (ENSSVLG00005007729) ENSSVLG00005007594 RPRM (ENSSVLG00005007559) ENSSVLG00005007524 PRPF40A (ENSSVLG00005007429) ENSSVLG00005007428 FMNL2 (ENSSVLG00005007277) STAM2 (ENSSVLG00005007197) ENSSVLG00005007179 CACNB4 (ENSSVLG00005005336) ##22 ENSSVLG00005004741 ENSSVLG00005004729 NEB (ENSSVLG00005004118) RIF1 (ENSSVLG00005003716) TNFAIP6 (ENSSVLG00005003640) ENSSVLG00005003622 ENSSVLG00005003611 RBM43 (ENSSVLG00005003593) ENSSVLG00005003570 RND3 (ENSSVLG00005003560) ENSSVLG00005003548 MMADHC (ENSSVLG00005003507) LYPD6 (ENSSVLG00005003472) LYPD6B (ENSSVLG00005003456) KIF5C (ENSSVLG00005003411) Marmotini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714.fb.a ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00490000043329.a.a.a.k.a ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526.c.b ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714.fb.a ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00490000043329.a.a.a.k.a ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526.c.b ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 3 ARL6IP6 (ENSUPAG00010000239) PRPF40A (ENSUPAG00010000254) FMNL2 (ENSUPAG00010000658) STAM2 (ENSUPAG00010001468) ENSUPAG00010001568 CACNB4 (ENSUPAG00010001584) ##22 ENSUPAG00010001737 NEB (ENSUPAG00010001764) RIF1 (ENSUPAG00010002377) TNFAIP6 (ENSUPAG00010004346) NMI (ENSUPAG00010004358) RBM43 (ENSUPAG00010004382) ENSUPAG00010004388 ENSUPAG00010004396 RND3 (ENSUPAG00010004413) MMADHC (ENSUPAG00010004432) LYPD6 (ENSUPAG00010004464) LYPD6B (ENSUPAG00010004479) KIF5C (ENSUPAG00010004496) EPC2 (ENSUPAG00010004529) ENSUPAG00010004532 Squirrel MODERN SPECIES 69 UPP2 (ENSSTOG00000030477) ACVR1 (ENSSTOG00000004704) ACVR1C (ENSSTOG00000009159) CYTIP (ENSSTOG00000009143) ERMN (ENSSTOG00000006613) ENSSTOG00000021734 GPD2 (ENSSTOG00000005221) NR4A2 (ENSSTOG00000002966) KCNJ3 (ENSSTOG00000014395) GALNT13 (ENSSTOG00000011628) RPRM (ENSSTOG00000026311) ARL6IP6 (ENSSTOG00000001658) PRPF40A (ENSSTOG00000001642) FMNL2 (ENSSTOG00000001614) STAM2 (ENSSTOG00000025023) CACNB4 (ENSSTOG00000016328) ##22 ARL5A (ENSSTOG00000016326) NEB (ENSSTOG00000016315) RIF1 (ENSSTOG00000020712) TNFAIP6 (ENSSTOG00000016314) NMI (ENSSTOG00000028659) RBM43 (ENSSTOG00000016311) ENSSTOG00000021862 RND3 (ENSSTOG00000009798) MMADHC (ENSSTOG00000021576) LYPD6 (ENSSTOG00000029572) LYPD6B (ENSSTOG00000021300) KIF5C (ENSSTOG00000008408) EPC2 (ENSSTOG00000010468) MBD5 (ENSSTOG00000024028) ORC4 (ENSSTOG00000026092) Alpin marmot DUPLICATION Alpin marmot MODERN SPECIES 5 ERMN (ENSMMMG00000022432) ENSMMMG00000022427 ENSMMMG00000022423 GPD2 (ENSMMMG00000022395) NR4A2 (ENSMMMG00000022388) KCNJ3 (ENSMMMG00000022368) ENSMMMG00000022354 ENSMMMG00000022342 ENSMMMG00000022338 ENSMMMG00000022335 ARL6IP6 (ENSMMMG00000022320) PRPF40A (ENSMMMG00000022291) FMNL2 (ENSMMMG00000022132) ENSMMMG00000022120 STAM2 (ENSMMMG00000022104) CACNB4 (ENSMMMG00000022074) ##22 ENSMMMG00000022061 NEB (ENSMMMG00000021921) RIF1 (ENSMMMG00000021851) TNFAIP6 (ENSMMMG00000021834) ENSMMMG00000021827 NMI (ENSMMMG00000021825) RBM43 (ENSMMMG00000021824) ENSMMMG00000021801 ENSMMMG00000021776 ENSMMMG00000021771 ENSMMMG00000021752 RND3 (ENSMMMG00000021746) MMADHC (ENSMMMG00000021733) LYPD6 (ENSMMMG00000021723) LYPD6B (ENSMMMG00000021702) Alpin marmot MODERN SPECIES 4 TRAPPC10 (ENSMMMG00000011441) PWP2 (ENSMMMG00000011468) GATD3 (ENSMMMG00000012356) ICOSLG (ENSMMMG00000012361) ENSMMMG00000012363 AIRE (ENSMMMG00000012367) ENSMMMG00000012488 CFAP410 (ENSMMMG00000012554) TRPM2 (ENSMMMG00000012573) LRRC3 (ENSMMMG00000012614) TSPEAR (ENSMMMG00000012623) ENSMMMG00000012640 ENSMMMG00000012650 ENSMMMG00000012657 UBE2G2 (ENSMMMG00000012664) ENSMMMG00000012676 ##22 SUMO3 (ENSMMMG00000012686) ENSMMMG00000012708 ITGB2 (ENSMMMG00000012709) SLX9 (ENSMMMG00000012725) ADARB1 (ENSMMMG00000012767) POFUT2 (ENSMMMG00000012809) ENSMMMG00000012904 SLC19A1 (ENSMMMG00000012919) PCBP3 (ENSMMMG00000012976) ENSMMMG00000013027 COL6A2 (ENSMMMG00000013048) ENSMMMG00000013067 FTCD (ENSMMMG00000013068) SPATC1L (ENSMMMG00000013131) LSS (ENSMMMG00000013141) Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT01000000220430 ENSGT00390000016542 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT01000000220430 ENSGT00390000016542 tuatara MODERN SPECIES 1553 ARL6IP6 (ENSSPUG00000003844) PRPF40A (ENSSPUG00000003801) ENSSPUG00000003783 ENSSPUG00000003778 STAM2 (ENSSPUG00000003757) CACNB4 (ENSSPUG00000003723) ##22 ARL5A (ENSSPUG00000003682) ENSSPUG00000003645 RIF1 (ENSSPUG00000003062) TNFAIP6 (ENSSPUG00000002940) NMI (ENSSPUG00000002923) RBM43 (ENSSPUG00000002915) RND3 (ENSSPUG00000002907) Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Laterata ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Common wall lizard MODERN SPECIES CYTIP (ENSPMRG00000008589) ERMN (ENSPMRG00000008582) GALNT5 (ENSPMRG00000008562) GPD2 (ENSPMRG00000008548) NR4A2 (ENSPMRG00000008539) ENSPMRG00000008534 KCNJ3 (ENSPMRG00000008530) ENSPMRG00000008525 ENSPMRG00000008519 RPRM (ENSPMRG00000008513) ENSPMRG00000008510 ARL6IP6 (ENSPMRG00000008504) PRPF40A (ENSPMRG00000007825) FMNL2 (ENSPMRG00000007265) STAM2 (ENSPMRG00000007098) CACNB4 (ENSPMRG00000007056) ##22 ARL5A (ENSPMRG00000007032) NEB (ENSPMRG00000002804) RIF1 (ENSPMRG00000001812) TNFAIP6 (ENSPMRG00000001751) NMI (ENSPMRG00000001742) RBM43 (ENSPMRG00000001735) RND3 (ENSPMRG00000001723) ENSPMRG00000001719 ENSPMRG00000001715 ENSPMRG00000001698 MMADHC (ENSPMRG00000001693) LYPD6 (ENSPMRG00000001684) LYPD6B (ENSPMRG00000001678) ENSPMRG00000001673 KIF5C (ENSPMRG00000000646) Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 20 ACVR1 (ENSSMRG00000023293) ACVR1C (ENSSMRG00000023294) ENSSMRG00000023295 GALNT5 (ENSSMRG00000023296) GPD2 (ENSSMRG00000023297) NR4A2 (ENSSMRG00000023298) KCNJ3 (ENSSMRG00000023300) GALNT13 (ENSSMRG00000023302) ENSSMRG00000023303 ENSSMRG00000023304 RPRM (ENSSMRG00000023307) ARL6IP6 (ENSSMRG00000023309) PRPF40A (ENSSMRG00000023310) FMNL2 (ENSSMRG00000023312) STAM2 (ENSSMRG00000023314) CACNB4 (ENSSMRG00000023315) ##22 ARL5A (ENSSMRG00000023317) NEB (ENSSMRG00000023318) RIF1 (ENSSMRG00000023454) TNFAIP6 (ENSSMRG00000023455) ENSSMRG00000023456 RBM43 (ENSSMRG00000023457) RND3 (ENSSMRG00000023459) MMADHC (ENSSMRG00000023460) LYPD6 (ENSSMRG00000023461) LYPD6B (ENSSMRG00000023462) ENSSMRG00000023463 KIF5C (ENSSMRG00000023464) EPC2 (ENSSMRG00000023465) MBD5 (ENSSMRG00000023466) ORC4 (ENSSMRG00000023467) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d.q ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Lizard MODERN SPECIES 910 ENSACAG00000035380 ENSACAG00000012401 ENSACAG00000040784 GALNT13 (ENSACAG00000012427) RPRM (ENSACAG00000043654) ENSACAG00000039227 ENSACAG00000042967 ARL6IP6 (ENSACAG00000028911) PRPF40A (ENSACAG00000012897) FMNL2 (ENSACAG00000012719) STAM2 (ENSACAG00000012530) ENSACAG00000035922 cacnb4 (ENSACAG00000012454) ##22 ARL5A (ENSACAG00000012408) Elapidae DUPLICATION Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153988.A ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT00940000159241.n ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904.t ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.g ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d.q ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00940000157541 ENSGT00940000164219.a.a.a.c.b ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Indian cobra MODERN SPECIES ACVR1 (ENSNNAG00000018290) ACVR1C (ENSNNAG00000018291) CYTIP (ENSNNAG00000018295) ENSNNAG00000018296 GPD2 (ENSNNAG00000018298) NR4A2 (ENSNNAG00000018303) KCNJ3 (ENSNNAG00000018307) GALNT13 (ENSNNAG00000018312) ENSNNAG00000018322 ENSNNAG00000018324 ENSNNAG00000018325 ENSNNAG00000018328 ARL6IP6 (ENSNNAG00000018331) FMNL2 (ENSNNAG00000018336) STAM2 (ENSNNAG00000018344) CACNB4 (ENSNNAG00000018360) ##22 ARL5A (ENSNNAG00000018385) NEB (ENSNNAG00000018647) TNFAIP6 (ENSNNAG00000019067) NMI (ENSNNAG00000019069) RND3 (ENSNNAG00000019074) ENSNNAG00000019076 MMADHC (ENSNNAG00000019078) LYPD6 (ENSNNAG00000006713) LYPD6B (ENSNNAG00000006750) ENSNNAG00000006910 KIF5C (ENSNNAG00000007202) EPC2 (ENSNNAG00000012958) MBD5 (ENSNNAG00000013008) ORC4 (ENSNNAG00000013093) ACVR2A (ENSNNAG00000013129) Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000153988.A ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT00940000159241.n ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904.t ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.g ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d.q ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00940000157541 ENSGT00940000164219.a.a.a.c.b ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542.f ENSGT00940000157233 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000153988.A ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT00940000159241.n ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904.t ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b.g ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d.q ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00940000157541 ENSGT00940000164219.a.a.a.c.b ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542.f ENSGT00940000157233 Mainland tiger snake DUPLICATION Mainland tiger snake MODERN SPECIES 124 ENSNSUG00000007544 ENSNSUG00000007426 ENSNSUG00000007424 ENSNSUG00000007423 ARL6IP6 (ENSNSUG00000007422) ENSNSUG00000007421 ENSNSUG00000007412 ENSNSUG00000007393 ENSNSUG00000007040 ##22 ENSNSUG00000007038 ENSNSUG00000007037 ENSNSUG00000007030 ENSNSUG00000007012 ENSNSUG00000007000 ENSNSUG00000006997 ENSNSUG00000006996 ENSNSUG00000006995 ENSNSUG00000006993 ENSNSUG00000006991 ENSNSUG00000006990 ENSNSUG00000006987 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 125 ENSNSUG00000008520 ENSNSUG00000008519 ENSNSUG00000008496 ENSNSUG00000008495 ENSNSUG00000008494 PRPF40A (ENSNSUG00000008493) ENSNSUG00000008491 ENSNSUG00000008487 ENSNSUG00000007603 ##22 ENSNSUG00000007601 ENSNSUG00000007578 ENSNSUG00000007567 ENSNSUG00000007562 ENSNSUG00000007557 ENSNSUG00000007556 ENSNSUG00000007555 ENSNSUG00000007554 ENSNSUG00000007548 Eastern brown snake MODERN SPECIES 7 ACVR1 (ENSPTXG00000010471) ACVR1C (ENSPTXG00000005857) CYTIP (ENSPTXG00000006616) GALNT5 (ENSPTXG00000006617) GPD2 (ENSPTXG00000006621) NR4A2 (ENSPTXG00000006713) ENSPTXG00000006714 ENSPTXG00000006715 ENSPTXG00000006716 GALNT13 (ENSPTXG00000006717) RPRM (ENSPTXG00000006718) ARL6IP6 (ENSPTXG00000006719) PRPF40A (ENSPTXG00000006720) FMNL2 (ENSPTXG00000006737) STAM2 (ENSPTXG00000009936) CACNB4 (ENSPTXG00000009947) ##22 ARL5A (ENSPTXG00000012173) NEB (ENSPTXG00000012187) RIF1 (ENSPTXG00000012982) TNFAIP6 (ENSPTXG00000012986) NMI (ENSPTXG00000012988) RND3 (ENSPTXG00000012993) ENSPTXG00000012996 MMADHC (ENSPTXG00000012998) LYPD6 (ENSPTXG00000013003) LYPD6B (ENSPTXG00000013021) KIF5C (ENSPTXG00000013024) EPC2 (ENSPTXG00000013031) MBD5 (ENSPTXG00000013034) ORC4 (ENSPTXG00000013039) ACVR2A (ENSPTXG00000013042) Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 10499 ENSLLTG00000008990 ##22 Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.b.h ##22 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182837.b.b.h ##22 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 3970 ENSLLTG00000002500 ##22 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT01010000223933 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT01010000223933 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT01010000223933 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542.j ENSGT00940000157233 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT01010000223933 ENSGT00530000063734.a ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542.j ENSGT00940000157233 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 2 ACVR1 (ENSGEVG00005019831) ACVR1C (ENSGEVG00005019840) CYTIP (ENSGEVG00005019851) ENSGEVG00005019858 ENSGEVG00005019865 GPD2 (ENSGEVG00005019873) ENSGEVG00005019886 ENSGEVG00005019893 KCNJ3 (ENSGEVG00005019903) GALNT13 (ENSGEVG00005019923) RPRM (ENSGEVG00005019943) ARL6IP6 (ENSGEVG00005019950) PRPF40A (ENSGEVG00005019971) FMNL2 (ENSGEVG00005020309) STAM2 (ENSGEVG00005020687) CACNB4 (ENSGEVG00005020734) ##22 ARL5A (ENSGEVG00005020782) NEB (ENSGEVG00005020817) RIF1 (ENSGEVG00005020864) 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ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542.j ENSGT00940000157233 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 25 CCDC148 (ENSTMTG00000022579) UPP2 (ENSTMTG00000022576) ACVR1 (ENSTMTG00000022573) ACVR1C (ENSTMTG00000022567) ENSTMTG00000022564 GALNT5 (ENSTMTG00000022562) GPD2 (ENSTMTG00000022557) NR4A2 (ENSTMTG00000022554) KCNJ3 (ENSTMTG00000022553) GALNT13 (ENSTMTG00000022547) RPRM (ENSTMTG00000022542) ARL6IP6 (ENSTMTG00000022540) PRPF40A (ENSTMTG00000022533) FMNL2 (ENSTMTG00000022518) STAM2 (ENSTMTG00000022506) CACNB4 (ENSTMTG00000022421) ##22 ARL5A (ENSTMTG00000022372) NEB (ENSTMTG00000016118) RIF1 (ENSTMTG00000013981) NMI (ENSTMTG00000013868) RBM43 (ENSTMTG00000013865) RND3 (ENSTMTG00000013856) MMADHC (ENSTMTG00000013842) LYPD6 (ENSTMTG00000013835) LYPD6B (ENSTMTG00000013809) KIF5C (ENSTMTG00000013757) EPC2 (ENSTMTG00000013718) MBD5 (ENSTMTG00000013709) ORC4 (ENSTMTG00000013683) ACVR2A (ENSTMTG00000013661) ENSTMTG00000013650 painted turtle MODERN SPECIES 766 RPRM (ENSCPBG00000000230) ARL6IP6 (ENSCPBG00000000213) PRPF40A (ENSCPBG00000000174) FMNL2 (ENSCPBG00000026424) STAM2 (ENSCPBG00000026351) CACNB4 (ENSCPBG00000026340) ##22 ARL5A (ENSCPBG00000026331) NEB (ENSCPBG00000026030) RIF1 (ENSCPBG00000025885) TNFAIP6 (ENSCPBG00000025850) NMI (ENSCPBG00000025846) RBM43 (ENSCPBG00000025841) RND3 (ENSCPBG00000025828) MMADHC (ENSCPBG00000025822) LYPD6 (ENSCPBG00000025812) LYPD6B (ENSCPBG00000025808) KIF5C (ENSCPBG00000025802) EPC2 (ENSCPBG00000025795) MBD5 (ENSCPBG00000025788) ORC4 (ENSCPBG00000025785) ACVR2A (ENSCPBG00000025780) Chinese turtle MODERN SPECIES 1244 ACVR1C (ENSPSIG00000009445) CYTIP (ENSPSIG00000008417) ERMN (ENSPSIG00000008413) GALNT5 (ENSPSIG00000008270) ENSPSIG00000001829 GPD2 (ENSPSIG00000008060) NR4A2 (ENSPSIG00000008054) KCNJ3 (ENSPSIG00000007874) GALNT13 (ENSPSIG00000007606) ENSPSIG00000001823 RPRM (ENSPSIG00000001821) ENSPSIG00000007594 PRPF40A (ENSPSIG00000007197) FMNL2 (ENSPSIG00000006880) STAM2 (ENSPSIG00000017391) CACNB4 (ENSPSIG00000016120) ##22 ENSPSIG00000016101 ARL5A (ENSPSIG00000016095) NEB (ENSPSIG00000012844) RIF1 (ENSPSIG00000012517) TNFAIP6 (ENSPSIG00000011601) NMI (ENSPSIG00000011462) RBM43 (ENSPSIG00000011378) ENSPSIG00000001819 RND3 (ENSPSIG00000010783) MMADHC (ENSPSIG00000009795) LYPD6 (ENSPSIG00000009279) LYPD6B (ENSPSIG00000009271) GPR20 (ENSPSIG00000001817) ENSPSIG00000008605 PTP4A3 (ENSPSIG00000008204) Archosauria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT01010000223933 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b 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MBD5 (ENSCPRG00005007665) ORC4 (ENSCPRG00005007654) Aves ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT01010000223933 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 African ostrich MODERN SPECIES 319 ACVR1 (ENSSCUG00000003298) ACVR1C (ENSSCUG00000003297) CYTIP (ENSSCUG00000003296) ENSSCUG00000003294 ENSSCUG00000003292 GPD2 (ENSSCUG00000003285) ENSSCUG00000003282 ENSSCUG00000003280 KCNJ3 (ENSSCUG00000003749) GALNT13 (ENSSCUG00000003741) ENSSCUG00000003735 ENSSCUG00000003733 PRPF40A (ENSSCUG00000003728) FMNL2 (ENSSCUG00000003723) STAM2 (ENSSCUG00000003717) CACNB4 (ENSSCUG00000003713) ##22 ARL5A (ENSSCUG00000003706) NEB (ENSSCUG00000003691) RIF1 (ENSSCUG00000003638) TNFAIP6 (ENSSCUG00000003603) NMI (ENSSCUG00000003597) RBM43 (ENSSCUG00000003594) RND3 (ENSSCUG00000003588) MMADHC (ENSSCUG00000003584) LYPD6 (ENSSCUG00000003581) LYPD6B (ENSSCUG00000003580) KIF5C (ENSSCUG00000003575) EPC2 (ENSSCUG00000003574) MBD5 (ENSSCUG00000003568) Neognathae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT01010000223933 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000153988.A ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000153988.A ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT00960000191069 ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b.f ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d.s ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Duck MODERN SPECIES 25 MAP3K19 (ENSAPLG00000029463) RAB3GAP1 (ENSAPLG00000014149) ZRANB3 (ENSAPLG00000014815) R3HDM1 (ENSAPLG00000015231) ENSAPLG00000026872 ENSAPLG00000030618 LCT (ENSAPLG00000016089) MCM6 (ENSAPLG00000016365) DARS1 (ENSAPLG00000001845) CXCR4 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(ENSABRG00000008400) ACVR2A (ENSABRG00000008383) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000153988.A ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Japanese quail MODERN SPECIES 25 KYNU (ENSCJPG00005020492) ACVR1 (ENSCJPG00005020493) ACVR1C (ENSCJPG00005020494) CYTIP (ENSCJPG00005020495) ENSCJPG00005020496 ENSCJPG00005020497 ENSCJPG00005020498 GPD2 (ENSCJPG00005020499) 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ENSGT00950000182837.b.b ##22 ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 Chicken MODERN SPECIES 36 UPP2 (ENSGALG00010010778) ATVR1 (ENSGALG00010010745) ACVR1C (ENSGALG00010010638) CYTIP (ENSGALG00010010586) ERMN (ENSGALG00010010567) ENSGALG00010010544 ENSGALG00010011007 GPD2 (ENSGALG00010010528) NR4A2 (ENSGALG00010010499) KCNJ3 (ENSGALG00010010471) GALNT13 (ENSGALG00010010448) RPRM (ENSGALG00010011002) PRPF40A (ENSGALG00010010386) FMNL2 (ENSGALG00010010336) STAM2 (ENSGALG00010010287) CACNB4 (ENSGALG00010010255) ##22 ARL5A (ENSGALG00010010205) ENSGALG00010010195 ENSGALG00010010115 RIF1 (ENSGALG00010009850) TNFAIP6 (ENSGALG00010009793) NMI (ENSGALG00010009731) RBM43 (ENSGALG00010009690) ENSGALG00010009641 RND3 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