Vertebrata	DUPLICATION
Vertebrata	ANCESTRAL SPECIES	1077																ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00390000017802
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	1702																ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	1397																ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155086.C #22
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	78	ENSGT00940000164041	ENSGT01030000234597.a.b.a	ENSGT00940000157269.a.a	ENSGT00940000158299	ENSGT00940000158614	ENSGT00510000049722	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00720000108839	ENSGT00940000158598	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158238	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000166976	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158299	ENSGT00940000158614	ENSGT00510000049722	ENSGT00390000007091	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00720000108839	ENSGT00940000158598	ENSGT00950000185082	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158238	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000177261	ENSGT00940000156975.t.b	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT00490000043329.a.b #15
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	52	ENSGT00940000161395	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459
Theria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Glires	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	170	Prr30 (ENSJJAG00000007138) #7	Preb (ENSJJAG00000001672) #8	Cgref1 (ENSJJAG00000000578) #9	Khk (ENSJJAG00000022427) #10	Emilin1 (ENSJJAG00000021862) #11	Ost4 (ENSJJAG00000020657) #12	Agbl5 (ENSJJAG00000018626) #13	Tmem214 (ENSJJAG00000016804) #14	Mapre3 (ENSJJAG00000016184) #15	Dpysl5 (ENSJJAG00000015628) #16	Cenpa (ENSJJAG00000015171) #17	Slc35f6 (ENSJJAG00000011894) #18	Kcnk3 (ENSJJAG00000011342) #19	Cib4 (ENSJJAG00000011140) #20	Fam166c (ENSJJAG00000010978) #21	Otof (ENSJJAG00000001877) #22	Drc1 (ENSJJAG00000021373) #23	ENSJJAG00000020368 #24
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00700000106164	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00700000106164	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	229	Abhd1 (ENSCGRG00001023993)	Cgref1 (ENSCGRG00001024267) #9	Khk (ENSCGRG00001000681) #10	Emilin1 (ENSCGRG00001019405) #11	Agbl5 (ENSCGRG00001000476) #13	Ost4 (ENSCGRG00001011578) #12	Tmem214 (ENSCGRG00001023263) #14	Mapre3 (ENSCGRG00001025011) #15	Dpysl5 (ENSCGRG00001020912) #16	CENPA (ENSCGRG00001016945) #17	ENSCGRG00001005366	Slc35f6 (ENSCGRG00001024274) #18	Kcnk3 (ENSCGRG00001020254) #19	Cib4 (ENSCGRG00001024923) #20	Fam166c (ENSCGRG00001025030) #21	Otof (ENSCGRG00001015298) #22	Drc1 (ENSCGRG00001017306) #23	Selenoi (ENSCGRG00001008322) #24	Adgrf3 (ENSCGRG00001006414)	Hadhb (ENSCGRG00001015973)	Hadha (ENSCGRG00001020547)	Garem2 (ENSCGRG00001015014)	Rab10 (ENSCGRG00001018289)	Kif3c (ENSCGRG00001019464)	Asxl2 (ENSCGRG00001024434)	Dtnb (ENSCGRG00001024414)	Dnmt3a (ENSCGRG00001020172)	Pomc (ENSCGRG00001023516)	Efr3b (ENSCGRG00001024941)	Dnajc27 (ENSCGRG00001023794)	Adcy3 (ENSCGRG00001010489)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	657	Preb (ENSMAUG00000013921) #8	Abhd1 (ENSMAUG00000011808)	Cgref1 (ENSMAUG00000011082) #9	Khk (ENSMAUG00000013515) #10	Emilin1 (ENSMAUG00000011391) #11	Ost4 (ENSMAUG00000009438) #12	Agbl5 (ENSMAUG00000012736) #13	Tmem214 (ENSMAUG00000009294) #14	Mapre3 (ENSMAUG00000020109) #15	Dpysl5 (ENSMAUG00000015389) #16	Cenpa (ENSMAUG00000014416) #17	Slc35f6 (ENSMAUG00000018629) #18	Kcnk3 (ENSMAUG00000016567) #19	Cib4 (ENSMAUG00000015795) #20	Fam166c (ENSMAUG00000017307) #21	Otof (ENSMAUG00000017448) #22	Drc1 (ENSMAUG00000015717) #23	Selenoi (ENSMAUG00000010172) #24	ENSMAUG00000009372	Hadhb (ENSMAUG00000007811)	Hadha (ENSMAUG00000004383)	Garem2 (ENSMAUG00000019987)	Mis18bp1 (ENSMAUG00000018267)	Fancm (ENSMAUG00000015450)	Fkbp3 (ENSMAUG00000014997)	Prpf39 (ENSMAUG00000003291)	Togaram1 (ENSMAUG00000019675)	Klhl28 (ENSMAUG00000013866)	Gm527 (ENSMAUG00000013479)	ENSMAUG00000018008	ENSMAUG00000012931
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	59	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541
Prairie vole	MODERN SPECIES	189	Preb (ENSMOCG00000012868) #8	Abhd1 (ENSMOCG00000019312)	Cgref1 (ENSMOCG00000016306) #9	Khk (ENSMOCG00000007949) #10	Emilin1 (ENSMOCG00000009798) #11	Ost4 (ENSMOCG00000018204) #12	Agbl5 (ENSMOCG00000017026) #13	Tmem214 (ENSMOCG00000021430) #14	Mapre3 (ENSMOCG00000015943) #15	Dpysl5 (ENSMOCG00000001644) #16	Cenpa (ENSMOCG00000000241) #17	Slc35f6 (ENSMOCG00000013863) #18	Kcnk3 (ENSMOCG00000000691) #19	Cib4 (ENSMOCG00000020643) #20	Fam166c (ENSMOCG00000021160) #21	Otof (ENSMOCG00000006641) #22	ENSMOCG00000013306	Drc1 (ENSMOCG00000022934) #23	ENSMOCG00000007677 #24	ENSMOCG00000011056 #24
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	14	Abhd1 (ENSPEMG00000014073)	Cgref1 (ENSPEMG00000018386) #9	Khk (ENSPEMG00000009381) #10	Emilin1 (ENSPEMG00000017228) #11	Ost4 (ENSPEMG00000010111) #12	Agbl5 (ENSPEMG00000018742) #13	Tmem214 (ENSPEMG00000017115) #14	Mapre3 (ENSPEMG00000001429) #15	ENSPEMG00000026813	Dpysl5 (ENSPEMG00000011531) #16	Cenpa (ENSPEMG00000017924) #17	Slc35f6 (ENSPEMG00000009443) #18	Kcnk3 (ENSPEMG00000027136) #19	Cib4 (ENSPEMG00000008395) #20	Fam166c (ENSPEMG00000011014) #21	Otof (ENSPEMG00000012774) #22	Drc1 (ENSPEMG00000018450) #23	Selenoi (ENSPEMG00000014398) #24	Adgrf3 (ENSPEMG00000019077)	Zfp512 (ENSPEMG00000012969)	Gpn1 (ENSPEMG00000003913)	Supt7l (ENSPEMG00000023284)	Slc4a1ap (ENSPEMG00000009955)	ENSPEMG00000030130	ENSPEMG00000030587	Rbks (ENSPEMG00000020650)	Babam2 (ENSPEMG00000022521)	Fosl2 (ENSPEMG00000030847)	Plb1 (ENSPEMG00000020757)	Ppp1cb (ENSPEMG00000024207)	Spdya (ENSPEMG00000024837)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00700000106164	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133
Mus	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00700000106164	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00700000106164	ENSGT00390000014786	ENSGT00390000000878	ENSGT00940000154205.h	ENSGT00860000136054	ENSGT00940000156321	ENSGT00940000160059.a.a	ENSGT00940000153458.A	ENSGT00390000007809.b
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00700000106164	ENSGT00390000014786	ENSGT00390000000878	ENSGT00940000154205.h	ENSGT00860000136054	ENSGT00940000156321	ENSGT00940000160059.a.a	ENSGT00940000153458.A	ENSGT00390000007809.b
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00700000106164	ENSGT00390000014786	ENSGT00390000000878	ENSGT00940000154205.h	ENSGT00860000136054	ENSGT00940000156321	ENSGT00940000160059.a.a	ENSGT00940000153458.A	ENSGT00390000007809.b
Steppe mouse	MODERN SPECIES	15										Dpysl5 (ENSMSIG00000013507) #16	Cenpa (ENSMSIG00000013495) #17	Slc35f6 (ENSMSIG00000013482) #18	Kcnk3 (ENSMSIG00000013471) #19	Cib4 (ENSMSIG00000013437) #20	Fam166c (ENSMSIG00000013389) #21	Otof (ENSMSIG00000013084) #22	ENSMSIG00000012983 #23	Selenoi (ENSMSIG00000012932) #24	Adgrf3 (ENSMSIG00000012893)	Hadhb (ENSMSIG00000012773)	Hadha (ENSMSIG00000012707)	Garem2 (ENSMSIG00000012700)	ENSMSIG00000012679	Tyms (ENSMSIG00000012655)	Il6 (ENSMSIG00000012630)	ENSMSIG00000012620	Rfk (ENSMSIG00000012617)	ENSMSIG00000012609	ENSMSIG00000012602	ENSMSIG00000012364	Ube3c (ENSMSIG00000012285)
spretus	MODERN SPECIES	14	Slc5a6 (MGP_SPRETEiJ_G0028068)	Tcf23 (MGP_SPRETEiJ_G0028067)	Preb (MGP_SPRETEiJ_G0028066) #8	Cgref1 (MGP_SPRETEiJ_G0028065) #9	Khk (MGP_SPRETEiJ_G0028064) #10	Emilin1 (MGP_SPRETEiJ_G0028063) #11	Ost4 (MGP_SPRETEiJ_G0028062) #12	Agbl5 (MGP_SPRETEiJ_G0028061) #13	Tmem214 (MGP_SPRETEiJ_G0028060) #14	Dpysl5 (MGP_SPRETEiJ_G0028059) #16	Cenpa (MGP_SPRETEiJ_G0028058) #17	Slc35f6 (MGP_SPRETEiJ_G0028057) #18	Kcnk3 (MGP_SPRETEiJ_G0028056) #19	Cib4 (MGP_SPRETEiJ_G0028055) #20	Fam166c (MGP_SPRETEiJ_G0028054) #21	Otof (MGP_SPRETEiJ_G0028053) #22	Drc1 (MGP_SPRETEiJ_G0028052) #23	Selenoi (MGP_SPRETEiJ_G0028051) #24	Adgrf3 (MGP_SPRETEiJ_G0028050)	Hadhb (MGP_SPRETEiJ_G0028049)	Hadha (MGP_SPRETEiJ_G0028048)	Garem2 (MGP_SPRETEiJ_G0028047)	MGP_SPRETEiJ_G0028046	MGP_SPRETEiJ_G0028045	Il6 (MGP_SPRETEiJ_G0028044)	MGP_SPRETEiJ_G0028043	MGP_SPRETEiJ_G0028042	MGP_SPRETEiJ_G0028041	Mnx1 (MGP_SPRETEiJ_G0028040)	MGP_SPRETEiJ_G0028039	Lmbr1 (MGP_SPRETEiJ_G0028038)
Mouse	MODERN SPECIES	14	Preb (ENSMUSG00000045302) #8	Abhd1 (ENSMUSG00000006638)	Cgref1 (ENSMUSG00000029161) #9	Khk (ENSMUSG00000029162) #10	Emilin1 (ENSMUSG00000029163) #11	Ost4 (ENSMUSG00000038803) #12	Agbl5 (ENSMUSG00000029165) #13	Tmem214 (ENSMUSG00000038828) #14	Mapre3 (ENSMUSG00000029166) #15	Dpysl5 (ENSMUSG00000029168) #16	Cenpa (ENSMUSG00000029177) #17	Slc35f6 (ENSMUSG00000029175) #18	Kcnk3 (ENSMUSG00000049265) #19	Cib4 (ENSMUSG00000053194) #20	Fam166c (ENSMUSG00000029182) #21	Otof (ENSMUSG00000062372) #22	Drc1 (ENSMUSG00000073102) #23	Selenoi (ENSMUSG00000075703) #24	Adgrf3 (ENSMUSG00000067642)	Hadhb (ENSMUSG00000059447)	Hadha (ENSMUSG00000025745)	Garem2 (ENSMUSG00000044576)	Tyms (ENSMUSG00000025747)	Il6 (ENSMUSG00000025746)	Dnajb6 (ENSMUSG00000029131)	Ube3c (ENSMUSG00000039000)	Mnx1 (ENSMUSG00000001566)	Nom1 (ENSMUSG00000001569)	Lmbr1 (ENSMUSG00000010721)	Rnf32 (ENSMUSG00000029130)	Shh (ENSMUSG00000002633)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	14	Tcf23 (MGP_CAROLIEiJ_G0027072)	Preb (MGP_CAROLIEiJ_G0027071) #8	Cgref1 (MGP_CAROLIEiJ_G0027070) #9	Khk (MGP_CAROLIEiJ_G0027069) #10	Emilin1 (MGP_CAROLIEiJ_G0027068) #11	Ost4 (MGP_CAROLIEiJ_G0027067) #12	Agbl5 (MGP_CAROLIEiJ_G0027066) #13	Tmem214 (MGP_CAROLIEiJ_G0027065) #14	Mapre3 (MGP_CAROLIEiJ_G0027064) #15	Dpysl5 (MGP_CAROLIEiJ_G0027063) #16	Cenpa (MGP_CAROLIEiJ_G0027062) #17	Slc35f6 (MGP_CAROLIEiJ_G0027061) #18	Kcnk3 (MGP_CAROLIEiJ_G0027060) #19	Cib4 (MGP_CAROLIEiJ_G0027059) #20	Fam166c (MGP_CAROLIEiJ_G0027058) #21	Otof (MGP_CAROLIEiJ_G0027057) #22	Drc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0027056) #23	MGP_CAROLIEiJ_G0027055 #24	Adgrf3 (MGP_CAROLIEiJ_G0027054)	Hadhb (MGP_CAROLIEiJ_G0027053)	Hadha (MGP_CAROLIEiJ_G0027052)	Garem2 (MGP_CAROLIEiJ_G0027051)	MGP_CAROLIEiJ_G0027050	MGP_CAROLIEiJ_G0027049	Il6 (MGP_CAROLIEiJ_G0027048)	MGP_CAROLIEiJ_G0027047	MGP_CAROLIEiJ_G0027046	Ube3c (MGP_CAROLIEiJ_G0027045)	Mnx1 (MGP_CAROLIEiJ_G0027044)	MGP_CAROLIEiJ_G0027043	Lmbr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0027042)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	20	Tcf23 (MGP_PahariEiJ_G0029309)	Preb (MGP_PahariEiJ_G0029310) #8	MGP_PahariEiJ_G0029311 #9	Khk (MGP_PahariEiJ_G0029312) #10	Emilin1 (MGP_PahariEiJ_G0029313) #11	Ost4 (MGP_PahariEiJ_G0029314) #12	Agbl5 (MGP_PahariEiJ_G0029315) #13	Tmem214 (MGP_PahariEiJ_G0029316) #14	Mapre3 (MGP_PahariEiJ_G0029317) #15	MGP_PahariEiJ_G0029318 #16	MGP_PahariEiJ_G0029319 #17	Slc35f6 (MGP_PahariEiJ_G0029320) #18	Kcnk3 (MGP_PahariEiJ_G0029321) #19	Cib4 (MGP_PahariEiJ_G0029322) #20	Fam166c (MGP_PahariEiJ_G0029323) #21	Otof (MGP_PahariEiJ_G0029324) #22	Drc1 (MGP_PahariEiJ_G0029325) #23	MGP_PahariEiJ_G0029326 #24	Adgrf3 (MGP_PahariEiJ_G0029327)	Hadhb (MGP_PahariEiJ_G0029328)	Hadha (MGP_PahariEiJ_G0029329)	Garem2 (MGP_PahariEiJ_G0029330)	MGP_PahariEiJ_G0029331	Rab10 (MGP_PahariEiJ_G0029332)	Kif3c (MGP_PahariEiJ_G0029333)	MGP_PahariEiJ_G0029335	Dnmt3a (MGP_PahariEiJ_G0029336)	Pomc (MGP_PahariEiJ_G0029337)	Efr3b (MGP_PahariEiJ_G0029338)	MGP_PahariEiJ_G0029339	MGP_PahariEiJ_G0029340
Rat	MODERN SPECIES	16	Prr30 (ENSRNOG00000025726) #7	Preb (ENSRNOG00000007141) #8	Abhd1 (ENSRNOG00000025689)	Cgref1 (ENSRNOG00000007923) #9	Emilin1 (ENSRNOG00000008246) #11	Khk (ENSRNOG00000008047) #10	Agbl5 (ENSRNOG00000008612) #13	Tmem214 (ENSRNOG00000008812) #14	Mapre3 (ENSRNOG00000008961) #15	Dpysl5 (ENSRNOG00000008996) #16	Cenpa (ENSRNOG00000032178) #17	Slc35f6 (ENSRNOG00000009459) #18	Kcnk3 (ENSRNOG00000009790) #19	Cib4 (ENSRNOG00000009898) #20	Fam166c (ENSRNOG00000009905) #21	Otof (ENSRNOG00000009967) #22	Drc1 (ENSRNOG00000024905) #23	Selenoi (ENSRNOG00000059295) #24	Adgrf3 (ENSRNOG00000024766)	Hadhb (ENSRNOG00000010800)	Hadha (ENSRNOG00000024629)	Garem2 (ENSRNOG00000048004)	3110082J24Rik (ENSRNOG00000046262)	ENSRNOG00000069124	Rab10 (ENSRNOG00000047088)	Kif3c (ENSRNOG00000011394)	Asxl2 (ENSRNOG00000011908)	ENSRNOG00000066562	Dtnb (ENSRNOG00000011914)	Dnmt3a (ENSRNOG00000026649)	Pomc (ENSRNOG00000012686)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	904	Preb (ENSNGAG00000015422) #8	Abhd1 (ENSNGAG00000014361)	Cgref1 (ENSNGAG00000013644) #9	Khk (ENSNGAG00000011724) #10	Emilin1 (ENSNGAG00000001013) #11	Ost4 (ENSNGAG00000000518) #12	Agbl5 (ENSNGAG00000020980) #13	Tmem214 (ENSNGAG00000018011) #14	Mapre3 (ENSNGAG00000016644) #15	Dpysl5 (ENSNGAG00000000173) #16	Cenpa (ENSNGAG00000018923) #17	Slc35f6 (ENSNGAG00000018757) #18	Kcnk3 (ENSNGAG00000018512) #19	Cib4 (ENSNGAG00000016496) #20	Fam166c (ENSNGAG00000015810) #21	Otof (ENSNGAG00000012602) #22	ENSNGAG00000020417	ENSNGAG00000019910	Drc1 (ENSNGAG00000012970) #23	ENSNGAG00000003438 #24	ENSNGAG00000018498 #24	ENSNGAG00000016715	Adgrf3 (ENSNGAG00000018193)	ENSNGAG00000014735	Hadha (ENSNGAG00000000257)	Garem2 (ENSNGAG00000019452)	Rab10 (ENSNGAG00000019140)	Kif3c (ENSNGAG00000017317)	Asxl2 (ENSNGAG00000017809)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	339	Preb (ENSDORG00000026431) #8	Abhd1 (ENSDORG00000001044)	Cgref1 (ENSDORG00000001043) #9	Khk (ENSDORG00000001042) #10	Emilin1 (ENSDORG00000023602) #11	Ost4 (ENSDORG00000027195) #12	Agbl5 (ENSDORG00000001040) #13	Tmem214 (ENSDORG00000001039) #14	Mapre3 (ENSDORG00000001038) #15	Dpysl5 (ENSDORG00000014064) #16	Cenpa (ENSDORG00000000750) #17	Slc35f6 (ENSDORG00000026032) #18	Kcnk3 (ENSDORG00000010916) #19	Cib4 (ENSDORG00000029788) #20	Fam166c (ENSDORG00000013129) #21	Otof (ENSDORG00000013123) #22	Drc1 (ENSDORG00000013116) #23	Selenoi (ENSDORG00000013109) #24	Adgrf3 (ENSDORG00000008293)	ENSDORG00000008292	Hadha (ENSDORG00000015032)	Garem2 (ENSDORG00000015031)	Rab10 (ENSDORG00000023416)	Kif3c (ENSDORG00000003700)	Asxl2 (ENSDORG00000013989)	Dtnb (ENSDORG00000005817)	Dnmt3a (ENSDORG00000010021)	Pomc (ENSDORG00000005577)	Efr3b (ENSDORG00000005575)	ENSDORG00000029715	Dnajc27 (ENSDORG00000015134)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT01000000214622	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	176	PREB (ENSCLAG00000010312) #8	ABHD1 (ENSCLAG00000011859)	CGREF1 (ENSCLAG00000008112) #9	KHK (ENSCLAG00000011682) #10	EMILIN1 (ENSCLAG00000011938) #11	OST4 (ENSCLAG00000011618) #12	AGBL5 (ENSCLAG00000012658) #13	TMEM214 (ENSCLAG00000017342) #14	MAPRE3 (ENSCLAG00000017298) #15	DPYSL5 (ENSCLAG00000011988) #16	CENPA (ENSCLAG00000008835) #17	SLC35F6 (ENSCLAG00000008346) #18	KCNK3 (ENSCLAG00000011049) #19	CIB4 (ENSCLAG00000008461) #20	FAM166C (ENSCLAG00000008355) #21	OTOF (ENSCLAG00000009174) #22	DRC1 (ENSCLAG00000016214) #23	SELENOI (ENSCLAG00000014310) #24	ENSCLAG00000011221	HADHB (ENSCLAG00000010359)	HADHA (ENSCLAG00000009530)	GAREM2 (ENSCLAG00000013430)	RAB10 (ENSCLAG00000010979)	KIF3C (ENSCLAG00000015470)	ASXL2 (ENSCLAG00000011428)	ENSCLAG00000009921	ENSCLAG00000008767	DNMT3A (ENSCLAG00000011272)	POMC (ENSCLAG00000010165)	EFR3B (ENSCLAG00000005527)	DNAJC27 (ENSCLAG00000008212)
Degu	MODERN SPECIES	60	SLC30A3 (ENSODEG00000007184)	CAD (ENSODEG00000006683)	SLC5A6 (ENSODEG00000008686)	ENSODEG00000007705	PREB (ENSODEG00000008608) #8	ABHD1 (ENSODEG00000007266)	KHK (ENSODEG00000008065) #10	EMILIN1 (ENSODEG00000007515) #11	AGBL5 (ENSODEG00000008715) #13	TMEM214 (ENSODEG00000008522) #14	MAPRE3 (ENSODEG00000006780) #15	DPYSL5 (ENSODEG00000007347) #16	SLC35F6 (ENSODEG00000007078) #18	KCNK3 (ENSODEG00000008235) #19	CIB4 (ENSODEG00000008531) #20	OTOF (ENSODEG00000007924) #22	DRC1 (ENSODEG00000011420) #23	SELENOI (ENSODEG00000007845) #24	HADHB (ENSODEG00000008596)	HADHA (ENSODEG00000009366)	GAREM2 (ENSODEG00000008492)	RAB10 (ENSODEG00000008075)	ENSODEG00000007394	KIF3C (ENSODEG00000008275)	ENSODEG00000009191	ASXL2 (ENSODEG00000009627)	ENSODEG00000012930	ENSODEG00000009839	POMC (ENSODEG00000010910)	EFR3B (ENSODEG00000007566)	DNAJC27 (ENSODEG00000007488)
Guinea pig	MODERN SPECIES	18	PREB (ENSCPOG00000039680) #8	ABHD1 (ENSCPOG00000030832)	CGREF1 (ENSCPOG00000000058) #9	KHK (ENSCPOG00000010959) #10	EMILIN1 (ENSCPOG00000008666) #11	OST4 (ENSCPOG00000036077) #12	AGBL5 (ENSCPOG00000011258) #13	TMEM214 (ENSCPOG00000005106) #14	MAPRE3 (ENSCPOG00000005103) #15	DPYSL5 (ENSCPOG00000008231) #16	CENPA (ENSCPOG00000038745) #17	SLC35F6 (ENSCPOG00000024555) #18	KCNK3 (ENSCPOG00000019590) #19	CIB4 (ENSCPOG00000003756) #20	FAM166C (ENSCPOG00000003754) #21	OTOF (ENSCPOG00000000331) #22	DRC1 (ENSCPOG00000000327) #23	SELENOI (ENSCPOG00000033910) #24	ADGRF3 (ENSCPOG00000000855)	HADHB (ENSCPOG00000005418)	HADHA (ENSCPOG00000005945)	GAREM2 (ENSCPOG00000033262)	RAB10 (ENSCPOG00000038345)	KIF3C (ENSCPOG00000037818)	ENSCPOG00000031398	ASXL2 (ENSCPOG00000007343)	ENSCPOG00000004733	DNMT3A (ENSCPOG00000020900)	POMC (ENSCPOG00000004474)	EFR3B (ENSCPOG00000013235)	DNAJC27 (ENSCPOG00000006843)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	23	PREB (ENSHGLG00000007142) #8	ABHD1 (ENSHGLG00000034110)	CGREF1 (ENSHGLG00000017028) #9	KHK (ENSHGLG00000016984) #10	EMILIN1 (ENSHGLG00000010116) #11	OST4 (ENSHGLG00000007691) #12	AGBL5 (ENSHGLG00000016490) #13	TMEM214 (ENSHGLG00000013324) #14	MAPRE3 (ENSHGLG00000018592) #15	DPYSL5 (ENSHGLG00000049058) #16	ENSHGLG00000007874 #17	SLC35F6 (ENSHGLG00000005351) #18	KCNK3 (ENSHGLG00000005243) #19	CIB4 (ENSHGLG00000017440) #20	ENSHGLG00000035789	OTOF (ENSHGLG00000007386) #22	DRC1 (ENSHGLG00000007441) #23	SELENOI (ENSHGLG00000011515) #24	ADGRF3 (ENSHGLG00000008001)	HADHB (ENSHGLG00000006268)	HADHA (ENSHGLG00000014003)	GAREM2 (ENSHGLG00000018233)	ENSHGLG00000044435	ENSHGLG00000047199	ENSHGLG00000035830	ENSHGLG00000033377	ASXL2 (ENSHGLG00000006048)	ENSHGLG00000019126	ENSHGLG00000020949	ENSHGLG00000033034	DNMT3A (ENSHGLG00000014901)
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Alpin marmot	MODERN SPECIES	6	PREB (ENSMMMG00000020983) #8	ABHD1 (ENSMMMG00000020995)	CGREF1 (ENSMMMG00000021004) #9	KHK (ENSMMMG00000021008) #10	EMILIN1 (ENSMMMG00000021026) #11	AGBL5 (ENSMMMG00000021041) #13	TMEM214 (ENSMMMG00000021073) #14	MAPRE3 (ENSMMMG00000021097) #15	ENSMMMG00000021119	DPYSL5 (ENSMMMG00000021125) #16	CENPA (ENSMMMG00000021149) #17	SLC35F6 (ENSMMMG00000021156) #18	KCNK3 (ENSMMMG00000021162) #19	CIB4 (ENSMMMG00000021175) #20	FAM166C (ENSMMMG00000021179) #21	OTOF (ENSMMMG00000021193) #22	DRC1 (ENSMMMG00000021257) #23	SELENOI (ENSMMMG00000021266) #24	ADGRF3 (ENSMMMG00000021278)	HADHB (ENSMMMG00000021287)	HADHA (ENSMMMG00000021297)	GAREM2 (ENSMMMG00000021301)	ENSMMMG00000021304	KIF3C (ENSMMMG00000021315)	ASXL2 (ENSMMMG00000021326)	ENSMMMG00000021345	ENSMMMG00000021366	DNMT3A (ENSMMMG00000021507)	ENSMMMG00000021550	EFR3B (ENSMMMG00000021552)	DNAJC27 (ENSMMMG00000021572)
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES		PREB (ENSUPAG00010007023) #8	ABHD1 (ENSUPAG00010007052)	CGREF1 (ENSUPAG00010007078) #9	KHK (ENSUPAG00010007086) #10	EMILIN1 (ENSUPAG00010007122) #11	OST4 (ENSUPAG00010007144) #12	AGBL5 (ENSUPAG00010007149) #13	TMEM214 (ENSUPAG00010007212) #14	MAPRE3 (ENSUPAG00010007328) #15	DPYSL5 (ENSUPAG00010007343) #16	CENPA (ENSUPAG00010007380) #17	SLC35F6 (ENSUPAG00010007387) #18	KCNK3 (ENSUPAG00010007399) #19	CIB4 (ENSUPAG00010007407) #20	FAM166C (ENSUPAG00010007420) #21	OTOF (ENSUPAG00010007436) #22	DRC1 (ENSUPAG00010007561) #23	SELENOI (ENSUPAG00010007592) #24	ADGRF3 (ENSUPAG00010007600)	HADHB (ENSUPAG00010007620)	ENSUPAG00010007631	GAREM2 (ENSUPAG00010007652)	RAB10 (ENSUPAG00010007668)	KIF3C (ENSUPAG00010007680)	ASXL2 (ENSUPAG00010007692)	ENSUPAG00010007737	DNMT3A (ENSUPAG00010008081)	POMC (ENSUPAG00010008168)	EFR3B (ENSUPAG00010008174)	DNAJC27 (ENSUPAG00010008208)	ADCY3 (ENSUPAG00010008224)
Squirrel	MODERN SPECIES	93	PREB (ENSSTOG00000012225) #8	ABHD1 (ENSSTOG00000020803)	CGREF1 (ENSSTOG00000015520) #9	KHK (ENSSTOG00000022057) #10	EMILIN1 (ENSSTOG00000025637) #11	AGBL5 (ENSSTOG00000015510) #13	OST4 (ENSSTOG00000025286) #12	TMEM214 (ENSSTOG00000015505) #14	MAPRE3 (ENSSTOG00000015500) #15	DPYSL5 (ENSSTOG00000009791) #16	CENPA (ENSSTOG00000025168) #17	SLC35F6 (ENSSTOG00000005833) #18	KCNK3 (ENSSTOG00000000037) #19	CIB4 (ENSSTOG00000002407) #20	FAM166C (ENSSTOG00000032726) #21	OTOF (ENSSTOG00000020549) #22	DRC1 (ENSSTOG00000001637) #23	SELENOI (ENSSTOG00000001622) #24	ADGRF3 (ENSSTOG00000001610)	HADHB (ENSSTOG00000001601)	HADHA (ENSSTOG00000001593)	GAREM2 (ENSSTOG00000022734)	RAB10 (ENSSTOG00000023160)	KIF3C (ENSSTOG00000013740)	ASXL2 (ENSSTOG00000013729)	ENSSTOG00000034335	ENSSTOG00000015511	DNMT3A (ENSSTOG00000022154)	POMC (ENSSTOG00000006150)	EFR3B (ENSSTOG00000023043)	DNAJC27 (ENSSTOG00000006080)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	5	ABHD1 (ENSSVLG00005016238)	CGREF1 (ENSSVLG00005016287) #9	KHK (ENSSVLG00005016355) #10	EMILIN1 (ENSSVLG00005016393) #11	OST4 (ENSSVLG00005016433) #12	AGBL5 (ENSSVLG00005016467) #13	ENSSVLG00005016589 #14	ENSSVLG00005016902	MAPRE3 (ENSSVLG00005016937) #15	DPYSL5 (ENSSVLG00005017026) #16	ENSSVLG00005017194 #17	SLC35F6 (ENSSVLG00005017344) #18	KCNK3 (ENSSVLG00005017388) #19	CIB4 (ENSSVLG00005017439) #20	FAM166C (ENSSVLG00005017545) #21	OTOF (ENSSVLG00005017767) #22	DRC1 (ENSSVLG00005019360) #23	SELENOI (ENSSVLG00005019494) #24	ENSSVLG00005019538	ADGRF3 (ENSSVLG00005019818)	HADHB (ENSSVLG00005020328)	HADHA (ENSSVLG00005020540)	GAREM2 (ENSSVLG00005020605)	RAB10 (ENSSVLG00005020645)	KIF3C (ENSSVLG00005020692)	ENSSVLG00005020731	ASXL2 (ENSSVLG00005020772)	ENSSVLG00005021051	DNMT3A (ENSSVLG00005021301)	POMC (ENSSVLG00005021550)	EFR3B (ENSSVLG00005021623)
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000005754 #7	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b
Pika	MODERN SPECIES	392														CIB4 (ENSOPRG00000004487) #20	ENSOPRG00000004478 #21	OTOF (ENSOPRG00000004379) #22
Rabbit	MODERN SPECIES	11	ENSOCUG00000008655	ENSOCUG00000006528	PREB (ENSOCUG00000006522) #8	ABHD1 (ENSOCUG00000006519)	ENSOCUG00000008657 #9	KHK (ENSOCUG00000008662) #10	EMILIN1 (ENSOCUG00000006872) #11	AGBL5 (ENSOCUG00000014887) #13	TMEM214 (ENSOCUG00000014868) #14	MAPRE3 (ENSOCUG00000014861) #15	DPYSL5 (ENSOCUG00000014846) #16	CENPA (ENSOCUG00000028221) #17	SLC35F6 (ENSOCUG00000022141) #18	KCNK3 (ENSOCUG00000025172) #19	CIB4 (ENSOCUG00000026765) #20	OTOF (ENSOCUG00000015585) #22	DRC1 (ENSOCUG00000015559) #23	SELENOI (ENSOCUG00000015554) #24	ADGRF3 (ENSOCUG00000012452)	ENSOCUG00000000012	HADHA (ENSOCUG00000009786)	GAREM2 (ENSOCUG00000009777)	RAB10 (ENSOCUG00000029308)	KIF3C (ENSOCUG00000015014)	ASXL2 (ENSOCUG00000017108)	ENSOCUG00000001249	NTSR2 (ENSOCUG00000021232)	LPIN1 (ENSOCUG00000003071)	ENSOCUG00000038693	ENSOCUG00000031382	TRIB2 (ENSOCUG00000003153)
Tree shrew	MODERN SPECIES	5728									TMEM214 (ENSTBEG00000013868) #14	MAPRE3 (ENSTBEG00000013617) #15	DPYSL5 (ENSTBEG00000013379) #16	SLC35F6 (ENSTBEG00000013291) #18	KCNK3 (ENSTBEG00000013101) #19	CIB4 (ENSTBEG00000013001) #20	FAM166C (ENSTBEG00000012845) #21	OTOF (ENSTBEG00000011633) #22	DRC1 (ENSTBEG00000010975) #23	SELENOI (ENSTBEG00000010575) #24	ADGRF3 (ENSTBEG00000009683)	HADHB (ENSTBEG00000017273)	HADHA (ENSTBEG00000017118)	ENSTBEG00000016837	RAB10 (ENSTBEG00000016698)
Primates	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b.o.b	ENSGT00940000154677.g.a	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541
Mas night monkey	MODERN SPECIES	790	KHK (ENSANAG00000034884) #10	EMILIN1 (ENSANAG00000033199) #11	AGBL5 (ENSANAG00000025922) #13	OST4 (ENSANAG00000007870) #12	ENSANAG00000009045	TMEM214 (ENSANAG00000017783) #14	MAPRE3 (ENSANAG00000027124) #15	DPYSL5 (ENSANAG00000036633) #16	ENSANAG00000036736	CENPA (ENSANAG00000021074) #17	SLC35F6 (ENSANAG00000034692) #18	KCNK3 (ENSANAG00000035067) #19	ENSANAG00000029975	CIB4 (ENSANAG00000022832) #20	FAM166C (ENSANAG00000024341) #21	OTOF (ENSANAG00000038071) #22	DRC1 (ENSANAG00000012032) #23	SELENOI (ENSANAG00000025838) #24	ADGRF3 (ENSANAG00000023259)
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541
Marmoset	MODERN SPECIES	5	PREB (ENSCJAG00000001207) #8	ABHD1 (ENSCJAG00000001229)	KHK (ENSCJAG00000001241) #10	EMILIN1 (ENSCJAG00000001258) #11	OST4 (ENSCJAG00000047403) #12	AGBL5 (ENSCJAG00000001279) #13	TMEM214 (ENSCJAG00000001317) #14	MAPRE3 (ENSCJAG00000001341) #15	DPYSL5 (ENSCJAG00000001352) #16	ENSCJAG00000075557	CENPA (ENSCJAG00000058840) #17	SLC35F6 (ENSCJAG00000071257) #18	KCNK3 (ENSCJAG00000052158) #19	CIB4 (ENSCJAG00000001393) #20	FAM166C (ENSCJAG00000001406) #21	OTOF (ENSCJAG00000001409) #22	DRC1 (ENSCJAG00000001461) #23	ENSCJAG00000086527	SELENOI (ENSCJAG00000001477) #24	ADGRF3 (ENSCJAG00000001491)	KIF3C (ENSCJAG00000008138)	RAB10 (ENSCJAG00000056072)	ENSCJAG00000070963	GAREM2 (ENSCJAG00000008091)	HADHA (ENSCJAG00000008008)	ENSCJAG00000007943	ENSCJAG00000078565	ENSCJAG00000072220	ASXL2 (ENSCJAG00000008396)	ENSCJAG00000008281	ENSCJAG00000084719
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541
Capuchin	MODERN SPECIES	180	ABHD1 (ENSCCAG00000025988)	CGREF1 (ENSCCAG00000036183) #9	KHK (ENSCCAG00000024077) #10	EMILIN1 (ENSCCAG00000037359) #11	OST4 (ENSCCAG00000019720) #12	AGBL5 (ENSCCAG00000028156) #13	TMEM214 (ENSCCAG00000037708) #14	MAPRE3 (ENSCCAG00000027647) #15	DPYSL5 (ENSCCAG00000035679) #16	CENPA (ENSCCAG00000033270) #17	SLC35F6 (ENSCCAG00000020489) #18	KCNK3 (ENSCCAG00000031756) #19	ENSCCAG00000031997	CIB4 (ENSCCAG00000027046) #20	FAM166C (ENSCCAG00000033094) #21	OTOF (ENSCCAG00000027886) #22	DRC1 (ENSCCAG00000021798) #23	SELENOI (ENSCCAG00000034229) #24	ADGRF3 (ENSCCAG00000037267)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	189	ABHD1 (ENSSBOG00000026059)	CGREF1 (ENSSBOG00000028458) #9	KHK (ENSSBOG00000015057) #10	EMILIN1 (ENSSBOG00000023122) #11	OST4 (ENSSBOG00000014116) #12	AGBL5 (ENSSBOG00000028423) #13	TMEM214 (ENSSBOG00000019654) #14	MAPRE3 (ENSSBOG00000027201) #15	ENSSBOG00000032666	DPYSL5 (ENSSBOG00000022166) #16	CENPA (ENSSBOG00000028059) #17	SLC35F6 (ENSSBOG00000028622) #18	KCNK3 (ENSSBOG00000013243) #19	CIB4 (ENSSBOG00000025726) #20	FAM166C (ENSSBOG00000027806) #21	OTOF (ENSSBOG00000028732) #22	DRC1 (ENSSBOG00000035949) #23	SELENOI (ENSSBOG00000035404) #24	ADGRF3 (ENSSBOG00000033827)	ENSSBOG00000031969
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b.o.b	ENSGT00940000154677.g.a	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00390000003860.h.b	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00940000154256.l.b	ENSGT01030000234542.b.a.a.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b.o.b	ENSGT00940000154677.g.a	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00390000003860.h.b	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00940000154256.l.b	ENSGT01030000234542.b.a.a.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00950000182802.A.b
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000018031.c #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b.o.b	ENSGT00940000154677.g.a	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00390000003860.h.b	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00940000154256.l.b	ENSGT01030000234542.b.a.a.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00950000182802.A.b
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	5	PREB (ENSCSAG00000009608) #8	ABHD1 (ENSCSAG00000009570)	CGREF1 (ENSCSAG00000009550) #9	KHK (ENSCSAG00000009540) #10	EMILIN1 (ENSCSAG00000009531) #11	AGBL5 (ENSCSAG00000009523) #13	OST4 (ENSCSAG00000009508) #12	TMEM214 (ENSCSAG00000009483) #14	MAPRE3 (ENSCSAG00000009421) #15	DPYSL5 (ENSCSAG00000009382) #16	CENPA (ENSCSAG00000009296) #17	SLC35F6 (ENSCSAG00000009283) #18	KCNK3 (ENSCSAG00000009271) #19	CIB4 (ENSCSAG00000009252) #20	FAM166C (ENSCSAG00000009234) #21	OTOF (ENSCSAG00000009067) #22	ENSCSAG00000008776 #23	ENSCSAG00000008771 #23	SELENOI (ENSCSAG00000008763) #24	HADHB (ENSCSAG00000008753)	HADHA (ENSCSAG00000008736)	GAREM2 (ENSCSAG00000008714)	RAB10 (ENSCSAG00000008695)	KIF3C (ENSCSAG00000008688)	ASXL2 (ENSCSAG00000008663)	DTNB (ENSCSAG00000008613)	ENSCSAG00000008593	DNMT3A (ENSCSAG00000008584)	POMC (ENSCSAG00000008563)	EFR3B (ENSCSAG00000008553)	DNAJC27 (ENSCSAG00000008536)
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000018031.c #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b.o.b	ENSGT00940000154677.g.a	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00390000003860.h.b.a.a	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00940000154256.l.b	ENSGT01030000234542.b.a.a.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00950000182802.A.b
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000018031.c #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b.o.b	ENSGT00940000154677.g.a	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00390000003860.h.b.a.a	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT01030000234542.b.a.a.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00950000182802.A.b	ENSGT00390000016811
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00390000018031.c #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b.o.b	ENSGT00940000154677.g.a	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00390000003860.h.b.a.a	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT01030000234542.b.a.a.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00950000182802.A.b	ENSGT00390000016811
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	542	ENSCATG00000037457 #8	ABHD1 (ENSCATG00000044616)	CGREF1 (ENSCATG00000006363) #9	KHK (ENSCATG00000040385) #10	EMILIN1 (ENSCATG00000044989) #11	OST4 (ENSCATG00000018592) #12	AGBL5 (ENSCATG00000035059) #13	TMEM214 (ENSCATG00000039251) #14	MAPRE3 (ENSCATG00000036386) #15	DPYSL5 (ENSCATG00000021528) #16	CENPA (ENSCATG00000037376) #17	SLC35F6 (ENSCATG00000044941) #18	KCNK3 (ENSCATG00000043870) #19	CIB4 (ENSCATG00000034446) #20	FAM166C (ENSCATG00000038758) #21	OTOF (ENSCATG00000043960) #22	DRC1 (ENSCATG00000042753) #23	SELENOI (ENSCATG00000019121) #24	ADGRF3 (ENSCATG00000036098)	HADHB (ENSCATG00000037244)	HADHA (ENSCATG00000030823)	GAREM2 (ENSCATG00000040150)	RAB10 (ENSCATG00000002631)	ENSCATG00000030449	KIF3C (ENSCATG00000029067)	ASXL2 (ENSCATG00000041653)	ENSCATG00000013048	ENSCATG00000031389	DNMT3A (ENSCATG00000003150)	ENSCATG00000019562	POMC (ENSCATG00000041120)
Drill	MODERN SPECIES	340	TCF23 (ENSMLEG00000031513)	ENSMLEG00000037804 #8	ABHD1 (ENSMLEG00000038178)	CGREF1 (ENSMLEG00000040404) #9	KHK (ENSMLEG00000021332) #10	EMILIN1 (ENSMLEG00000043063) #11	AGBL5 (ENSMLEG00000020977) #13	TMEM214 (ENSMLEG00000040419) #14	MAPRE3 (ENSMLEG00000032860) #15	DPYSL5 (ENSMLEG00000041344) #16	CENPA (ENSMLEG00000039231) #17	SLC35F6 (ENSMLEG00000044250) #18	KCNK3 (ENSMLEG00000038319) #19	CIB4 (ENSMLEG00000028464) #20	FAM166C (ENSMLEG00000036937) #21	OTOF (ENSMLEG00000027728) #22	DRC1 (ENSMLEG00000037987) #23	SELENOI (ENSMLEG00000041082) #24	ADGRF3 (ENSMLEG00000036680)	HADHB (ENSMLEG00000003668)	ENSMLEG00000038228	HADHA (ENSMLEG00000022425)	GAREM2 (ENSMLEG00000032967)	RAB10 (ENSMLEG00000039320)	KIF3C (ENSMLEG00000036529)	ASXL2 (ENSMLEG00000042828)	ENSMLEG00000043138	ENSMLEG00000035719	DNMT3A (ENSMLEG00000034751)	POMC (ENSMLEG00000009557)	EFR3B (ENSMLEG00000031167)
Olive baboon	MODERN SPECIES	5	ENSPANG00000016499	PREB (ENSPANG00000009016) #8	ABHD1 (ENSPANG00000016566)	CGREF1 (ENSPANG00000011257) #9	EMILIN1 (ENSPANG00000026150) #11	OST4 (ENSPANG00000011316) #12	AGBL5 (ENSPANG00000018762) #13	TMEM214 (ENSPANG00000009921) #14	MAPRE3 (ENSPANG00000014553) #15	DPYSL5 (ENSPANG00000000632) #16	CENPA (ENSPANG00000026487) #17	SLC35F6 (ENSPANG00000030429) #18	KCNK3 (ENSPANG00000009018) #19	CIB4 (ENSPANG00000014555) #20	FAM166C (ENSPANG00000007617) #21	OTOF (ENSPANG00000019226) #22	DRC1 (ENSPANG00000020443) #23	SELENOI (ENSPANG00000011258) #24	ADGRF3 (ENSPANG00000016225)	HADHB (ENSPANG00000018040)	HADHA (ENSPANG00000019056)	GAREM2 (ENSPANG00000026153)	RAB10 (ENSPANG00000009860)	ENSPANG00000049061	ENSPANG00000035790	KIF3C (ENSPANG00000000518)	ASXL2 (ENSPANG00000007355)	DTNB (ENSPANG00000017000)	DNMT3A (ENSPANG00000009987)	POMC (ENSPANG00000041108)	EFR3B (ENSPANG00000004979)
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000018031.c #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693.k #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b.o.b	ENSGT00940000154677.g.a	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00390000003860.h.b.a.a	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00940000154256.l.b	ENSGT01030000234542.b.a.a.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00950000185281	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT01100000263539.b.a.a.a.b.b.b.b.b	ENSGT00390000002693.k #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b.o.b	ENSGT00940000154677.g.a	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000164709.a.b.b.a.b.b.a.b.a.a.a.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00390000003860.h.b.a.a	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT01100000263493.a.b.a.a.a.b.a.a.b.b.b.b.c.b.a	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00940000161627.a.a.a.b.b.b.b.a.b.a.b.b	ENSGT00390000016811
Rhesus	MODERN SPECIES	4	PREB (ENSMMUG00000002390) #8	ABHD1 (ENSMMUG00000002388)	CGREF1 (ENSMMUG00000016050) #9	EMILIN1 (ENSMMUG00000016046) #11	OST4 (ENSMMUG00000045826) #12	AGBL5 (ENSMMUG00000016044) #13	ENSMMUG00000053603	TMEM214 (ENSMMUG00000019733) #14	MAPRE3 (ENSMMUG00000019732) #15	DPYSL5 (ENSMMUG00000019731) #16	CENPA (ENSMMUG00000015934) #17	SLC35F6 (ENSMMUG00000040310) #18	KCNK3 (ENSMMUG00000056208) #19	CIB4 (ENSMMUG00000014297) #20	FAM166C (ENSMMUG00000014296) #21	OTOF (ENSMMUG00000014292) #22	SELENOI (ENSMMUG00000014287) #23	ADGRF3 (ENSMMUG00000004383)	HADHB (ENSMMUG00000004381)	HADHA (ENSMMUG00000004380)	GAREM2 (ENSMMUG00000004378)	ENSMMUG00000059135	ENSMMUG00000052700	RAB10 (ENSMMUG00000039805)	KIF3C (ENSMMUG00000019293)	ENSMMUG00000062814	ASXL2 (ENSMMUG00000001377)	DTNB (ENSMMUG00000016587)	DNMT3A (ENSMMUG00000013565)	ENSMMUG00000050208	ENSMMUG00000056636
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	4	ENSMFAG00000040163 #8	ABHD1 (ENSMFAG00000041476)	ENSMFAG00000031188	KHK (ENSMFAG00000032386) #10	EMILIN1 (ENSMFAG00000029007) #11	AGBL5 (ENSMFAG00000000522) #13	ENSMFAG00000050146	ENSMFAG00000045975 #14	MAPRE3 (ENSMFAG00000000279) #15	DPYSL5 (ENSMFAG00000029591) #16	SLC35F6 (ENSMFAG00000029510) #18	CENPA (ENSMFAG00000045875) #17	KCNK3 (ENSMFAG00000060076) #19	CIB4 (ENSMFAG00000036825) #20	FAM166C (ENSMFAG00000042764) #21	OTOF (ENSMFAG00000043966) #22	DRC1 (ENSMFAG00000043768) #23	ADGRF3 (ENSMFAG00000040027)	HADHB (ENSMFAG00000031252)	ENSMFAG00000053961	HADHA (ENSMFAG00000039817)	ENSMFAG00000060925	RAB10 (ENSMFAG00000001674)	ENSMFAG00000044444	KIF3C (ENSMFAG00000002881)	ENSMFAG00000049777	ASXL2 (ENSMFAG00000039252)	ENSMFAG00000053114	ENSMFAG00000038698	DNMT3A (ENSMFAG00000031180)	ENSMFAG00000048533
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	561	ENSMNEG00000041498 #8	ABHD1 (ENSMNEG00000031516)	CGREF1 (ENSMNEG00000006088) #9	KHK (ENSMNEG00000039942) #10	EMILIN1 (ENSMNEG00000036452) #11	AGBL5 (ENSMNEG00000038767) #13	OST4 (ENSMNEG00000007735) #12	ENSMNEG00000019129 #14	MAPRE3 (ENSMNEG00000034824) #15	DPYSL5 (ENSMNEG00000033753) #16	CENPA (ENSMNEG00000025072) #17	SLC35F6 (ENSMNEG00000038432) #18	KCNK3 (ENSMNEG00000044744) #19	CIB4 (ENSMNEG00000037140) #20	FAM166C (ENSMNEG00000001318) #21	OTOF (ENSMNEG00000040565) #22	DRC1 (ENSMNEG00000044674) #23	SELENOI (ENSMNEG00000010725) #24	ADGRF3 (ENSMNEG00000031948)	HADHB (ENSMNEG00000044887)	HADHA (ENSMNEG00000044721)	GAREM2 (ENSMNEG00000034057)	RAB10 (ENSMNEG00000028491)	ENSMNEG00000031146	KIF3C (ENSMNEG00000032633)	ASXL2 (ENSMNEG00000030154)	ENSMNEG00000044519	ENSMNEG00000041605	ENSMNEG00000032051	DNMT3A (ENSMNEG00000038454)	EFR3B (ENSMNEG00000033229)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B.o #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT00670000098076.i.a.b.g.b	ENSGT01030000234626.A.b.o.b	ENSGT00940000154677.g.a	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00390000003860.h.b	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT01030000234542.b.a.a.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00950000182802.A.b
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2393																OTOF (ENSRROG00000030813) #22	ENSRROG00000036843	DRC1 (ENSRROG00000045724) #23	SELENOI (ENSRROG00000030657) #24	ADGRF3 (ENSRROG00000037215)	ENSRROG00000036092	HADHB (ENSRROG00000025585)	HADHA (ENSRROG00000032860)	GAREM2 (ENSRROG00000034425)	RAB10 (ENSRROG00000028647)	KIF3C (ENSRROG00000045700)	ENSRROG00000000064	ASXL2 (ENSRROG00000034489)	ENSRROG00000041965	DNMT3A (ENSRROG00000033151)	ENSRROG00000002529
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	560	ABHD1 (ENSRBIG00000037116)	CGREF1 (ENSRBIG00000044061) #9	KHK (ENSRBIG00000037516) #10	EMILIN1 (ENSRBIG00000033823) #11	OST4 (ENSRBIG00000019455) #12	AGBL5 (ENSRBIG00000031536) #13	TMEM214 (ENSRBIG00000035746) #14	MAPRE3 (ENSRBIG00000044904) #15	ENSRBIG00000044902	DPYSL5 (ENSRBIG00000031460) #16	CENPA (ENSRBIG00000043662) #17	SLC35F6 (ENSRBIG00000039090) #18	KCNK3 (ENSRBIG00000039484) #19	CIB4 (ENSRBIG00000044606) #20	FAM166C (ENSRBIG00000041010) #21	OTOF (ENSRBIG00000027377) #22	DRC1 (ENSRBIG00000037025) #23	SELENOI (ENSRBIG00000026035) #24	ADGRF3 (ENSRBIG00000035232)	ENSRBIG00000010956	HADHB (ENSRBIG00000024676)	HADHA (ENSRBIG00000030017)	GAREM2 (ENSRBIG00000030250)	RAB10 (ENSRBIG00000044561)	ENSRBIG00000036827	KIF3C (ENSRBIG00000018579)	ENSRBIG00000038397	ENSRBIG00000036540	ASXL2 (ENSRBIG00000030906)	ENSRBIG00000033599	DNMT3A (ENSRBIG00000031793)
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT00940000157177.i.a	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b.o.b	ENSGT00940000154677.g.a	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00390000003860.h.b	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00940000154256.l.b	ENSGT01030000234542.b.a.a.a.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811
Gibbon	MODERN SPECIES	9	ENSNLEG00000002886 #9	KHK (ENSNLEG00000034395) #10	EMILIN1 (ENSNLEG00000002755) #11	OST4 (ENSNLEG00000027727) #12	AGBL5 (ENSNLEG00000002704) #13	TMEM214 (ENSNLEG00000002572) #14	MAPRE3 (ENSNLEG00000002567) #15	ENSNLEG00000029345	DPYSL5 (ENSNLEG00000002542) #16	ENSNLEG00000029245	CENPA (ENSNLEG00000034937) #17	SLC35F6 (ENSNLEG00000027135) #18	ENSNLEG00000019012 #19	CIB4 (ENSNLEG00000002462) #20	FAM166C (ENSNLEG00000002450) #21	OTOF (ENSNLEG00000002149) #22	DRC1 (ENSNLEG00000002135) #23	SELENOI (ENSNLEG00000029725) #24	ADGRF3 (ENSNLEG00000002076)	HADHB (ENSNLEG00000001754)	ENSNLEG00000001616	GAREM2 (ENSNLEG00000001585)	ENSNLEG00000032970	ENSNLEG00000033019	RAB10 (ENSNLEG00000001528)	ENSNLEG00000030085	KIF3C (ENSNLEG00000001471)	ENSNLEG00000027472	ENSNLEG00000035558	ASXL2 (ENSNLEG00000028738)	ENSNLEG00000001170
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT00940000157177.i.a	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b.o.b	ENSGT00940000154677.g.a	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00390000003860.h.b	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00940000154256.l.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b
Orangutan	MODERN SPECIES	14	ENSPPYG00000033262	PREB (ENSPPYG00000012562) #8	ENSPPYG00000036203	CGREF1 (ENSPPYG00000036041) #9	KHK (ENSPPYG00000012564) #10	EMILIN1 (ENSPPYG00000012565) #11	AGBL5 (ENSPPYG00000012566) #13	TMEM214 (ENSPPYG00000012567) #14	MAPRE3 (ENSPPYG00000012568) #15	DPYSL5 (ENSPPYG00000012570) #16	CENPA (ENSPPYG00000012572) #17	SLC35F6 (ENSPPYG00000012573) #18	KCNK3 (ENSPPYG00000037474) #19	CIB4 (ENSPPYG00000039437) #20	FAM166C (ENSPPYG00000032905) #21	OTOF (ENSPPYG00000012577) #22	DRC1 (ENSPPYG00000012578) #23	SELENOI (ENSPPYG00000032296) #24	ADGRF3 (ENSPPYG00000012581)	HADHB (ENSPPYG00000012582)	HADHA (ENSPPYG00000012583)	GAREM2 (ENSPPYG00000034864)	ENSPPYG00000040422	RAB10 (ENSPPYG00000012586)	ENSPPYG00000012587	KIF3C (ENSPPYG00000012588)	ASXL2 (ENSPPYG00000012589)	DTNB (ENSPPYG00000012590)	DNMT3A (ENSPPYG00000012591)	POMC (ENSPPYG00000012592)	ENSPPYG00000038894
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT00940000157177.i.a	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b.o.b	ENSGT00940000154677.g.a	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000168009	ENSGT00390000003860.h.b	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00940000154256.l.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811
Gorilla	MODERN SPECIES	14	ABHD1 (ENSGGOG00000002601)	ENSGGOG00000002597 #9	KHK (ENSGGOG00000002595) #10	EMILIN1 (ENSGGOG00000002590) #11	OST4 (ENSGGOG00000040607) #12	AGBL5 (ENSGGOG00000016929) #13	TMEM214 (ENSGGOG00000016917) #14	MAPRE3 (ENSGGOG00000016912) #15	DPYSL5 (ENSGGOG00000016697) #16	ENSGGOG00000013089	CENPA (ENSGGOG00000023861) #17	SLC35F6 (ENSGGOG00000039816) #18	ENSGGOG00000038547 #19	CIB4 (ENSGGOG00000010718) #20	FAM166C (ENSGGOG00000010712) #21	OTOF (ENSGGOG00000000008) #22	DRC1 (ENSGGOG00000000007) #23	SELENOI (ENSGGOG00000000006) #24	ADGRF3 (ENSGGOG00000011154)	HADHB (ENSGGOG00000025829)	HADHA (ENSGGOG00000004918)	GAREM2 (ENSGGOG00000004917)	ENSGGOG00000010466	ENSGGOG00000040507	RAB10 (ENSGGOG00000023707)	ENSGGOG00000025056	ENSGGOG00000010631	KIF3C (ENSGGOG00000008106)	ASXL2 (ENSGGOG00000011013)	ENSGGOG00000043565	ENSGGOG00000007679
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b.o.b	ENSGT00940000154677.g.a	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000168009	ENSGT00390000003860.h.b	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00940000154256.l.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811
Human	MODERN SPECIES	11	PREB (ENSG00000138073) #8	ABHD1 (ENSG00000143994)	CGREF1 (ENSG00000138028) #9	KHK (ENSG00000138030) #10	EMILIN1 (ENSG00000138080) #11	OST4 (ENSG00000228474) #12	AGBL5 (ENSG00000084693) #13	TMEM214 (ENSG00000119777) #14	MAPRE3 (ENSG00000084764) #15	DPYSL5 (ENSG00000157851) #16	CENPA (ENSG00000115163) #17	SLC35F6 (ENSG00000213699) #18	KCNK3 (ENSG00000171303) #19	CIB4 (ENSG00000157884) #20	FAM166C (ENSG00000173557) #21	OTOF (ENSG00000115155) #22	DRC1 (ENSG00000157856) #23	SELENOI (ENSG00000138018) #24	ADGRF3 (ENSG00000173567)	HADHB (ENSG00000138029)	HADHA (ENSG00000084754)	GAREM2 (ENSG00000157833)	RAB10 (ENSG00000084733)	KIF3C (ENSG00000084731)	ASXL2 (ENSG00000143970)	DTNB (ENSG00000138101)	DNMT3A (ENSG00000119772)	POMC (ENSG00000115138)	EFR3B (ENSG00000084710)	DNAJC27 (ENSG00000115137)	ADCY3 (ENSG00000138031)
Pan	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b.o.b	ENSGT00940000154677.g.a	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000164415	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000168009	ENSGT00390000003860.h.b	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00940000154256.l.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000155459
Chimpanzee	MODERN SPECIES	14	PREB (ENSPTRG00000011751) #8	ABHD1 (ENSPTRG00000011749)	CGREF1 (ENSPTRG00000011747) #9	KHK (ENSPTRG00000011746) #10	EMILIN1 (ENSPTRG00000011745) #11	OST4 (ENSPTRG00000045190) #12	AGBL5 (ENSPTRG00000011744) #13	TMEM214 (ENSPTRG00000011743) #14	MAPRE3 (ENSPTRG00000011742) #15	DPYSL5 (ENSPTRG00000011741) #16	CENPA (ENSPTRG00000011740) #17	SLC35F6 (ENSPTRG00000033946) #18	KCNK3 (ENSPTRG00000048881) #19	CIB4 (ENSPTRG00000011738) #20	C2AH2orf70 (ENSPTRG00000022566) #21	OTOF (ENSPTRG00000050060) #22	DRC1 (ENSPTRG00000023470) #23	SELENOI (ENSPTRG00000011735) #24	ADGRF3 (ENSPTRG00000011734)	HADHB (ENSPTRG00000011733)	HADHA (ENSPTRG00000011732)	GAREM2 (ENSPTRG00000011731)	ENSPTRG00000052059	RAB10 (ENSPTRG00000050373)	ENSPTRG00000040383	ENSPTRG00000052062	KIF3C (ENSPTRG00000011727)	ENSPTRG00000047905	ASXL2 (ENSPTRG00000011726)	DTNB (ENSPTRG00000011724)	DNMT3A (ENSPTRG00000011723)
Bonobo	MODERN SPECIES	14	ABHD1 (ENSPPAG00000028181)	ENSPPAG00000025050 #9	KHK (ENSPPAG00000039729) #10	EMILIN1 (ENSPPAG00000028099) #11	OST4 (ENSPPAG00000013188) #12	AGBL5 (ENSPPAG00000033862) #13	TMEM214 (ENSPPAG00000000878) #14	MAPRE3 (ENSPPAG00000035525) #15	ENSPPAG00000033183	DPYSL5 (ENSPPAG00000038863) #16	ENSPPAG00000030110 #17	SLC35F6 (ENSPPAG00000025353) #18	KCNK3 (ENSPPAG00000040420) #19	ENSPPAG00000039751 #20	FAM166C (ENSPPAG00000034582) #21	OTOF (ENSPPAG00000038766) #22	DRC1 (ENSPPAG00000030017) #23	SELENOI (ENSPPAG00000021435) #24	HADHB (ENSPPAG00000040869)	HADHA (ENSPPAG00000044082)	ENSPPAG00000041743	ENSPPAG00000041660	ENSPPAG00000040272	RAB10 (ENSPPAG00000031403)	ENSPPAG00000000073	ENSPPAG00000038147	KIF3C (ENSPPAG00000040221)	ASXL2 (ENSPPAG00000040962)	DTNB (ENSPPAG00000028095)	DNMT3A (ENSPPAG00000037925)	POMC (ENSPPAG00000038015)
Tarsier	MODERN SPECIES	1424														CIB4 (ENSTSYG00000013434) #20	CUNH2orf70 (ENSTSYG00000013418) #21	OTOF (ENSTSYG00000027647) #22	DRC1 (ENSTSYG00000014741) #23	SELENOI (ENSTSYG00000000400) #24	ENSTSYG00000031538	ADGRF3 (ENSTSYG00000008706)	ENSTSYG00000037184
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Mouse lemur	MODERN SPECIES	30	ABHD1 (ENSMICG00000017053)	CGREF1 (ENSMICG00000017044) #9	KHK (ENSMICG00000017040) #10	EMILIN1 (ENSMICG00000017031) #11	OST4 (ENSMICG00000043827) #12	AGBL5 (ENSMICG00000017022) #13	TMEM214 (ENSMICG00000017015) #14	MAPRE3 (ENSMICG00000016874) #15	DPYSL5 (ENSMICG00000017006) #16	CENPA (ENSMICG00000034107) #17	SLC35F6 (ENSMICG00000006854) #18	ENSMICG00000032231	KCNK3 (ENSMICG00000006852) #19	CIB4 (ENSMICG00000006843) #20	FAM166C (ENSMICG00000044017) #21	OTOF (ENSMICG00000006807) #22	DRC1 (ENSMICG00000006785) #23	SELENOI (ENSMICG00000006775) #24	ADGRF3 (ENSMICG00000006761)	HADHB (ENSMICG00000006750)	HADHA (ENSMICG00000014248)	GAREM2 (ENSMICG00000014228)	ENSMICG00000037941	KIF3C (ENSMICG00000029603)	ASXL2 (ENSMICG00000038141)	ENSMICG00000001238	ENSMICG00000004108	POMC (ENSMICG00000001616)	EFR3B (ENSMICG00000001606)	DNAJC27 (ENSMICG00000027424)	ADCY3 (ENSMICG00000001584)
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00940000172407	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	534	PREB (ENSPCOG00000003364) #8	ABHD1 (ENSPCOG00000014634)	CGREF1 (ENSPCOG00000028870) #9	KHK (ENSPCOG00000028868) #10	EMILIN1 (ENSPCOG00000023843) #11	OST4 (ENSPCOG00000026859) #12	AGBL5 (ENSPCOG00000024402) #13	TMEM214 (ENSPCOG00000022037) #14	MAPRE3 (ENSPCOG00000014462) #15	DPYSL5 (ENSPCOG00000015765) #16	CENPA (ENSPCOG00000026894) #17	SLC35F6 (ENSPCOG00000020315) #18	KCNK3 (ENSPCOG00000027571) #19	CIB4 (ENSPCOG00000005972) #20	FAM166C (ENSPCOG00000024050) #21	OTOF (ENSPCOG00000013923) #22	DRC1 (ENSPCOG00000014033) #23	ENSPCOG00000017322 #24	ADGRF3 (ENSPCOG00000019825)	HADHB (ENSPCOG00000013733)	HADHA (ENSPCOG00000021407)	GAREM2 (ENSPCOG00000017304)	RAB10 (ENSPCOG00000026753)	KIF3C (ENSPCOG00000026164)	ENSPCOG00000016865	ENSPCOG00000007714	ASXL2 (ENSPCOG00000027270)	ENSPCOG00000013999	DNMT3A (ENSPCOG00000025150)	POMC (ENSPCOG00000028772)	EFR3B (ENSPCOG00000014434)
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	4	PREB (ENSPSMG00000003913) #8	ABHD1 (ENSPSMG00000003959)	CGREF1 (ENSPSMG00000003980) #9	KHK (ENSPSMG00000004009) #10	EMILIN1 (ENSPSMG00000004045) #11	OST4 (ENSPSMG00000004053) #12	AGBL5 (ENSPSMG00000004104) #13	TMEM214 (ENSPSMG00000004206) #14	MAPRE3 (ENSPSMG00000004237) #15	DPYSL5 (ENSPSMG00000004304) #16	CENPA (ENSPSMG00000004325) #17	SLC35F6 (ENSPSMG00000004346) #18	KCNK3 (ENSPSMG00000004353) #19	CIB4 (ENSPSMG00000004366) #20	FAM166C (ENSPSMG00000004376) #21	OTOF (ENSPSMG00000004578) #22	DRC1 (ENSPSMG00000004646) #23	SELENOI (ENSPSMG00000004662) #24	ENSPSMG00000004670	ADGRF3 (ENSPSMG00000004677)	HADHB (ENSPSMG00000004850)	HADHA (ENSPSMG00000005094)	GAREM2 (ENSPSMG00000005141)	RAB10 (ENSPSMG00000005159)	KIF3C (ENSPSMG00000005196)	ENSPSMG00000005229	ASXL2 (ENSPSMG00000005276)	DTNB (ENSPSMG00000005314)	DNMT3A (ENSPSMG00000005403)	POMC (ENSPSMG00000005433)	EFR3B (ENSPSMG00000005442)
Bushbaby	MODERN SPECIES	137	PRR30 (ENSOGAG00000000521) #7	PREB (ENSOGAG00000000519) #8	ABHD1 (ENSOGAG00000000518)	CGREF1 (ENSOGAG00000029392) #9	KHK (ENSOGAG00000006516) #10	EMILIN1 (ENSOGAG00000027096) #11	AGBL5 (ENSOGAG00000006825) #13	TMEM214 (ENSOGAG00000006821) #14	MAPRE3 (ENSOGAG00000006818) #15	DPYSL5 (ENSOGAG00000006814) #16	CENPA (ENSOGAG00000024154) #17	SLC35F6 (ENSOGAG00000006810) #18	KCNK3 (ENSOGAG00000006808) #19	CIB4 (ENSOGAG00000006804) #20	FAM166C (ENSOGAG00000031193) #21	OTOF (ENSOGAG00000006798) #22	DRC1 (ENSOGAG00000005456) #23	SELENOI (ENSOGAG00000005453) #24	ADGRF3 (ENSOGAG00000005448)	ENSOGAG00000005444	ENSOGAG00000005440	ENSOGAG00000030869	ENSOGAG00000027816	RAB10 (ENSOGAG00000010403)	KIF3C (ENSOGAG00000026662)	ASXL2 (ENSOGAG00000002435)	ENSOGAG00000007002	DNMT3A (ENSOGAG00000015182)	POMC (ENSOGAG00000028112)	EFR3B (ENSOGAG00000015170)	DNAJC27 (ENSOGAG00000015168)
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Suina	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133
Pig	MODERN SPECIES	11	ABHD1 (ENSSSCG00000008554)	ENSSSCG00000008555 #9	KHK (ENSSSCG00000008556) #10	EMILIN1 (ENSSSCG00000008557) #11	OST4 (ENSSSCG00000056865) #12	AGBL5 (ENSSSCG00000008558) #13	TMEM214 (ENSSSCG00000008559) #14	MAPRE3 (ENSSSCG00000029185) #15	ENSSSCG00000033511	DPYSL5 (ENSSSCG00000008560) #16	CENPA (ENSSSCG00000038543) #17	SLC35F6 (ENSSSCG00000008562) #18	KCNK3 (ENSSSCG00000008563) #19	CIB4 (ENSSSCG00000008564) #20	FAM166C (ENSSSCG00000008565) #21	OTOF (ENSSSCG00000037751) #22	ENSSSCG00000022357	DRC1 (ENSSSCG00000008568) #23	SELENOI (ENSSSCG00000030643) #24	ADGRF3 (ENSSSCG00000008570)	HADHB (ENSSSCG00000008569)	ENSSSCG00000033644	HADHA (ENSSSCG00000008571)	GAREM2 (ENSSSCG00000008572)	RAB10 (ENSSSCG00000008573)	ENSSSCG00000058357	KIF3C (ENSSSCG00000008574)	ASXL2 (ENSSSCG00000008575)	ENSSSCG00000051169	ENSSSCG00000008576	DNMT3A (ENSSSCG00000029413)
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	776	ENSCWAG00000012811	PREB (ENSCWAG00000012720) #8	ENSCWAG00000012558	KHK (ENSCWAG00000012493) #10	EMILIN1 (ENSCWAG00000012460) #11	OST4 (ENSCWAG00000012449) #12	AGBL5 (ENSCWAG00000012406) #13	TMEM214 (ENSCWAG00000012344) #14	MAPRE3 (ENSCWAG00000012295) #15	DPYSL5 (ENSCWAG00000012185) #16	CENPA (ENSCWAG00000012096) #17	SLC35F6 (ENSCWAG00000012059) #18	KCNK3 (ENSCWAG00000012027) #19	CIB4 (ENSCWAG00000011940) #20	FAM166C (ENSCWAG00000011886) #21	OTOF (ENSCWAG00000010240) #22	DRC1 (ENSCWAG00000010039) #23	SELENOI (ENSCWAG00000009999) #24	ADGRF3 (ENSCWAG00000009293)	HADHB (ENSCWAG00000008886)	HADHA (ENSCWAG00000008770)	GAREM2 (ENSCWAG00000008629)	RAB10 (ENSCWAG00000008575)	KIF3C (ENSCWAG00000008496)	ASXL2 (ENSCWAG00000008355)	DTNB (ENSCWAG00000006032)	DNMT3A (ENSCWAG00000005845)	POMC (ENSCWAG00000005810)	EFR3B (ENSCWAG00000005505)	DNAJC27 (ENSCWAG00000005420)	ADCY3 (ENSCWAG00000005376)
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Beluga whale	MODERN SPECIES	37	TCF23 (ENSDLEG00000021778)	PRR30 (ENSDLEG00000021780) #7	PREB (ENSDLEG00000021782) #8	ENSDLEG00000021785	CGREF1 (ENSDLEG00000021789) #9	KHK (ENSDLEG00000021793) #10	EMILIN1 (ENSDLEG00000021798) #11	AGBL5 (ENSDLEG00000021803) #13	TMEM214 (ENSDLEG00000021807) #14	MAPRE3 (ENSDLEG00000021812) #15	DPYSL5 (ENSDLEG00000021816) #16	ENSDLEG00000000124 #17	SLC35F6 (ENSDLEG00000000163) #18	KCNK3 (ENSDLEG00000000236) #19	ENSDLEG00000000258 #20	OTOF (ENSDLEG00000000377) #22	DRC1 (ENSDLEG00000000706) #23	SELENOI (ENSDLEG00000000757) #24	HADHB (ENSDLEG00000000782)	HADHA (ENSDLEG00000000819)	ENSDLEG00000000841	GAREM2 (ENSDLEG00000000854)	RAB10 (ENSDLEG00000000876)	KIF3C (ENSDLEG00000000897)	ASXL2 (ENSDLEG00000000951)	DTNB (ENSDLEG00000001035)	DNMT3A (ENSDLEG00000001166)	POMC (ENSDLEG00000001217)	EFR3B (ENSDLEG00000001247)	DNAJC27 (ENSDLEG00000001321)	ADCY3 (ENSDLEG00000001361)
Vaquita	MODERN SPECIES	4	TCF23 (ENSPSNG00000004535)	ENSPSNG00000004519	PREB (ENSPSNG00000004487) #8	ENSPSNG00000004457	CGREF1 (ENSPSNG00000004439) #9	KHK (ENSPSNG00000004394) #10	EMILIN1 (ENSPSNG00000004344) #11	AGBL5 (ENSPSNG00000011301) #13	TMEM214 (ENSPSNG00000011216) #14	MAPRE3 (ENSPSNG00000011141) #15	DPYSL5 (ENSPSNG00000011087) #16	CENPA (ENSPSNG00000011049) #17	SLC35F6 (ENSPSNG00000011008) #18	KCNK3 (ENSPSNG00000010967) #19	CIB4 (ENSPSNG00000010868) #20	OTOF (ENSPSNG00000009430) #22	DRC1 (ENSPSNG00000009090) #23	SELENOI (ENSPSNG00000009045) #24	HADHB (ENSPSNG00000008833)	HADHA (ENSPSNG00000008638)	GAREM2 (ENSPSNG00000008565)	RAB10 (ENSPSNG00000008511)	KIF3C (ENSPSNG00000008462)	ENSPSNG00000008422	ENSPSNG00000008385	ENSPSNG00000008291	DNMT3A (ENSPSNG00000008093)	POMC (ENSPSNG00000008036)	EFR3B (ENSPSNG00000007711)	DNAJC27 (ENSPSNG00000007648)	CENPO (ENSPSNG00000007599)
Dolphin	MODERN SPECIES	2959											DPYSL5 (ENSTTRG00000010281) #16	CENPA (ENSTTRG00000010278) #17	SLC35F6 (ENSTTRG00000010274) #18	KCNK3 (ENSTTRG00000010273) #19	CIB4 (ENSTTRG00000010269) #20	OTOF (ENSTTRG00000010249) #22	DRC1 (ENSTTRG00000010239) #23	SELENOI (ENSTTRG00000010232) #24	HADHB (ENSTTRG00000010217)	HADHA (ENSTTRG00000010204)	GAREM2 (ENSTTRG00000010196)	RAB10 (ENSTTRG00000010192)
Sperm whale	MODERN SPECIES	3	CAD (ENSPCTG00005005772)	ATRAID (ENSPCTG00005005687)	SLC5A6 (ENSPCTG00005005591)	TCF23 (ENSPCTG00005005565)	ENSPCTG00005005552	PREB (ENSPCTG00005005509) #8	ABHD1 (ENSPCTG00005005279)	CGREF1 (ENSPCTG00005005198) #9	KHK (ENSPCTG00005005126) #10	AGBL5 (ENSPCTG00005005070) #13	TMEM214 (ENSPCTG00005004939) #14	MAPRE3 (ENSPCTG00005004904) #15	CENPA (ENSPCTG00005004881) #17	ENSPCTG00005004849 #16	ENSPCTG00005004838 #20	OTOF (ENSPCTG00005004362) #22	ENSPCTG00005004272	DRC1 (ENSPCTG00005004253) #23	SELENOI (ENSPCTG00005004235) #24	ENSPCTG00005004220	HADHB (ENSPCTG00005004125)	HADHA (ENSPCTG00005021814)	GAREM2 (ENSPCTG00005021751)	RAB10 (ENSPCTG00005021719)	ASXL2 (ENSPCTG00005021682)	DTNB (ENSPCTG00005021592)	DNMT3A (ENSPCTG00005021441)	POMC (ENSPCTG00005021388)	EFR3B (ENSPCTG00005021246)	DNAJC27 (ENSPCTG00005021182)	ADCY3 (ENSPCTG00005021158)
Blue whale	MODERN SPECIES	4	TCF23 (ENSBMSG00010010911)	ENSBMSG00010010933	PREB (ENSBMSG00010010962) #8	CGREF1 (ENSBMSG00010011017) #9	KHK (ENSBMSG00010011041) #10	EMILIN1 (ENSBMSG00010011069) #11	AGBL5 (ENSBMSG00010011101) #13	TMEM214 (ENSBMSG00010011131) #14	MAPRE3 (ENSBMSG00010011178) #15	DPYSL5 (ENSBMSG00010011203) #16	CENPA (ENSBMSG00010011244) #17	SLC35F6 (ENSBMSG00010011273) #18	KCNK3 (ENSBMSG00010011291) #19	CIB4 (ENSBMSG00010011318) #20	FAM166C (ENSBMSG00010011346) #21	OTOF (ENSBMSG00010011447) #22	DRC1 (ENSBMSG00010011621) #23	SELENOI (ENSBMSG00010011740) #24	ADGRF3 (ENSBMSG00010011811)	HADHB (ENSBMSG00010011872)	HADHA (ENSBMSG00010011954)	RAB10 (ENSBMSG00010012106)	KIF3C (ENSBMSG00010012120)	ASXL2 (ENSBMSG00010012153)	DTNB (ENSBMSG00010012231)	ENSBMSG00010012314	DNMT3A (ENSBMSG00010012344)	POMC (ENSBMSG00010012400)	EFR3B (ENSBMSG00010012424)	DNAJC27 (ENSBMSG00010012472)	ADCY3 (ENSBMSG00010012510)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B.m.a #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B.m.a #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B.m.a #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B.m.a #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b.bc #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Goat	MODERN SPECIES	2	TCF23 (ENSCHIG00000024261)	PRR30 (ENSCHIG00000003060) #7	ABHD1 (ENSCHIG00000026789)	PREB (ENSCHIG00000012510) #8	CGREF1 (ENSCHIG00000013120) #9	KHK (ENSCHIG00000024620) #10	EMILIN1 (ENSCHIG00000020225) #11	AGBL5 (ENSCHIG00000012376) #13	TMEM214 (ENSCHIG00000007752) #14	MAPRE3 (ENSCHIG00000022223) #15	DPYSL5 (ENSCHIG00000026005) #16	ENSCHIG00000010550 #17	SLC35F6 (ENSCHIG00000021255) #18	KCNK3 (ENSCHIG00000026730) #19	CIB4 (ENSCHIG00000016186) #20	OTOF (ENSCHIG00000018439) #22	FAM166C (ENSCHIG00000017427) #21	DRC1 (ENSCHIG00000001933) #23	ENSCHIG00000013868 #24	ENSCHIG00000023283	HADHB (ENSCHIG00000024735)	HADHA (ENSCHIG00000022677)	GAREM2 (ENSCHIG00000022994)	RAB10 (ENSCHIG00000007930)	KIF3C (ENSCHIG00000005084)	ENSCHIG00000009652	ASXL2 (ENSCHIG00000023616)	ENSCHIG00000010663	DNMT3A (ENSCHIG00000014247)	POMC (ENSCHIG00000024414)	EFR3B (ENSCHIG00000013224)
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	19	PREB (ENSOARG00020001389) #8	ABHD1 (ENSOARG00020001364)	CGREF1 (ENSOARG00020001343) #9	KHK (ENSOARG00020001333) #10	EMILIN1 (ENSOARG00020001316) #11	OST4 (ENSOARG00020001307) #12	AGBL5 (ENSOARG00020001275) #13	TMEM214 (ENSOARG00020001236) #14	MAPRE3 (ENSOARG00020001192) #15	DPYSL5 (ENSOARG00020001155) #16	CENPA (ENSOARG00020001123) #17	SLC35F6 (ENSOARG00020001108) #18	KCNK3 (ENSOARG00020001063) #19	CIB4 (ENSOARG00020001043) #20	FAM166C (ENSOARG00020001012) #21	OTOF (ENSOARG00020000652) #22	DRC1 (ENSOARG00020000494) #23	SELENOI (ENSOARG00020000449) #24	ADGRF3 (ENSOARG00020000413)	HADHB (ENSOARG00020000348)	HADHA (ENSOARG00020000289)	GAREM2 (ENSOARG00020000249)	RAB10 (ENSOARG00020000225)	ENSOARG00020000209	KIF3C (ENSOARG00020022724)	ASXL2 (ENSOARG00020022527)	ENSOARG00020022321	DNMT3A (ENSOARG00020022113)	POMC (ENSOARG00020022037)	EFR3B (ENSOARG00020021643)	DNAJC27 (ENSOARG00020021503)
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516.g #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B.m.a.a.b #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00960000190709	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133
Bos	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516.g #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b.b.a	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B.m.a.a.b #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT01100000263481.n.a.a.a.b.b.b.b.b.b.b.a	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00950000183198.c.b.b.d	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00960000190709	ENSGT00390000016811
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516.g #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b.b.a	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B.m.a.a.b #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT01100000263481.n.a.a.a.b.b.b.b.b.b.b.a	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00960000190709	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b
Wild yak	MODERN SPECIES	752	PREB (ENSBMUG00000008491) #8	ABHD1 (ENSBMUG00000008469)	CGREF1 (ENSBMUG00000008443) #9	KHK (ENSBMUG00000008430) #10	EMILIN1 (ENSBMUG00000008404) #11	ENSBMUG00000008365	AGBL5 (ENSBMUG00000008345) #13	TMEM214 (ENSBMUG00000008301) #14	MAPRE3 (ENSBMUG00000008220) #15	DPYSL5 (ENSBMUG00000008186) #16	ENSBMUG00000008176 #17	SLC35F6 (ENSBMUG00000008165) #18	KCNK3 (ENSBMUG00000008150) #19	CIB4 (ENSBMUG00000008137) #20	FAM166C (ENSBMUG00000008127) #21	OTOF (ENSBMUG00000007996) #22	DRC1 (ENSBMUG00000007424) #23	SELENOI (ENSBMUG00000007207) #24	ADGRF3 (ENSBMUG00000007181)	HADHB (ENSBMUG00000007151)	HADHA (ENSBMUG00000007070)	GAREM2 (ENSBMUG00000007039)	RAB10 (ENSBMUG00000007030)	KIF3C (ENSBMUG00000007015)	ENSBMUG00000007004	ASXL2 (ENSBMUG00000006985)	ENSBMUG00000006789	DNMT3A (ENSBMUG00000006671)	ENSBMUG00000006637	POMC (ENSBMUG00000006633)	EFR3B (ENSBMUG00000006619)
Domestic yak	MODERN SPECIES	28	PREB (ENSBGRG00000011384) #8	ABHD1 (ENSBGRG00000011727)	KHK (ENSBGRG00000011857) #10	EMILIN1 (ENSBGRG00000012069) #11	OST4 (ENSBGRG00000012154) #12	AGBL5 (ENSBGRG00000012181) #13	TMEM214 (ENSBGRG00000012267) #14	ENSBGRG00000012757	MAPRE3 (ENSBGRG00000012781) #15	DPYSL5 (ENSBGRG00000012850) #16	ENSBGRG00000010562 #17	SLC35F6 (ENSBGRG00000010740) #18	KCNK3 (ENSBGRG00000010821) #19	CIB4 (ENSBGRG00000010921) #20	FAM166C (ENSBGRG00000011044) #21	OTOF (ENSBGRG00000011136) #22	DRC1 (ENSBGRG00000011341) #23	SELENOI (ENSBGRG00000011521) #24	ADGRF3 (ENSBGRG00000011740)	HADHB (ENSBGRG00000011944)	HADHA (ENSBGRG00000012469)	ENSBGRG00000013436	GAREM2 (ENSBGRG00000013458)	RAB10 (ENSBGRG00000013498)	KIF3C (ENSBGRG00000013558)	ENSBGRG00000013690	ENSBGRG00000013699	ASXL2 (ENSBGRG00000013739)	DTNB (ENSBGRG00000014178)	DNMT3A (ENSBGRG00000015176)	ENSBGRG00000015691
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516.g #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b.b.a	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B.m.a.a.b #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT01100000263481.n.a.a.a.b.b.b.b.b.b.b.a	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00960000190709	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	2	ABHD1 (ENSBIXG00005028595)	ENSBIXG00005004928 #9	KHK (ENSBIXG00005028534) #10	EMILIN1 (ENSBIXG00005028510) #11	ENSBIXG00005004902 #12	AGBL5 (ENSBIXG00005028468) #13	TMEM214 (ENSBIXG00005028434) #14	ENSBIXG00005028373	MAPRE3 (ENSBIXG00005028362) #15	DPYSL5 (ENSBIXG00005028296) #16	ENSBIXG00005028248 #17	SLC35F6 (ENSBIXG00005007597) #18	KCNK3 (ENSBIXG00005028186) #19	CIB4 (ENSBIXG00005028164) #20	FAM166C (ENSBIXG00005028118) #21	OTOF (ENSBIXG00005028079) #22	DRC1 (ENSBIXG00005028017) #23	ASXL2 (ENSBIXG00005027961)	ENSBIXG00005027805	DNMT3A (ENSBIXG00005027616)	ENSBIXG00005027443	POMC (ENSBIXG00005027434)	EFR3B (ENSBIXG00005027378)	DNAJC27 (ENSBIXG00005027192)	ADCY3 (ENSBIXG00005027167)	CENPO (ENSBIXG00005027141)	PTRHD1 (ENSBIXG00005027086)	NCOA1 (ENSBIXG00005027050)	ENSBIXG00005026925	ENSBIXG00005004595	ITSN2 (ENSBIXG00005026878)
Cow	MODERN SPECIES	2	PREB (ENSBTAG00000007080) #8	ABHD1 (ENSBTAG00000007077)	CGREF1 (ENSBTAG00000051104) #9	KHK (ENSBTAG00000011325) #10	EMILIN1 (ENSBTAG00000011324) #11	AGBL5 (ENSBTAG00000013403) #13	TMEM214 (ENSBTAG00000017423) #14	ENSBTAG00000051160	MAPRE3 (ENSBTAG00000008884) #15	DPYSL5 (ENSBTAG00000018576) #16	CENPA (ENSBTAG00000023938) #17	SLC35F6 (ENSBTAG00000018761) #18	KCNK3 (ENSBTAG00000051102) #19	CIB4 (ENSBTAG00000005041) #20	FAM166C (ENSBTAG00000031150) #21	OTOF (ENSBTAG00000009650) #22	DRC1 (ENSBTAG00000009649) #23	SELENOI (ENSBTAG00000007837) #24	ENSBTAG00000017330	ADGRF3 (ENSBTAG00000005736)	HADHB (ENSBTAG00000010083)	HADHA (ENSBTAG00000015038)	ENSBTAG00000054613	GAREM2 (ENSBTAG00000015037)	RAB10 (ENSBTAG00000000985)	KIF3C (ENSBTAG00000019138)	ASXL2 (ENSBTAG00000019983)	DTNB (ENSBTAG00000021072)	DNMT3A (ENSBTAG00000021143)	ENSBTAG00000054828	POMC (ENSBTAG00000007897)
American bison	MODERN SPECIES	3068	PREB (ENSBBBG00000000720) #8	ABHD1 (ENSBBBG00000007660)	CGREF1 (ENSBBBG00000016748) #9	KHK (ENSBBBG00000016780) #10	EMILIN1 (ENSBBBG00000016821) #11	ENSBBBG00000016829 #12	AGBL5 (ENSBBBG00000016865) #13	TMEM214 (ENSBBBG00000016931) #14	MAPRE3 (ENSBBBG00000016965) #15	DPYSL5 (ENSBBBG00000017042) #16	ENSBBBG00000017068 #17	SLC35F6 (ENSBBBG00000017080) #18	KCNK3 (ENSBBBG00000004224) #19	CIB4 (ENSBBBG00000017106) #20	FAM166C (ENSBBBG00000017115) #21	OTOF (ENSBBBG00000004312) #22	ENSBBBG00000017459 #23	SELENOI (ENSBBBG00000017484) #24	ADGRF3 (ENSBBBG00000017500)	HADHB (ENSBBBG00000017631)	HADHA (ENSBBBG00000017750)	GAREM2 (ENSBBBG00000008382)	RAB10 (ENSBBBG00000017772)	KIF3C (ENSBBBG00000017822)	ENSBBBG00000017835	ASXL2 (ENSBBBG00000017858)	DTNB (ENSBBBG00000018305)	DNMT3A (ENSBBBG00000004490)	ENSBBBG00000018393	POMC (ENSBBBG00000006902)	EFR3B (ENSBBBG00000004527)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	240	ENSMMSG00000006338	PREB (ENSMMSG00000006300) #8	ABHD1 (ENSMMSG00000006241)	CGREF1 (ENSMMSG00000006230) #9	KHK (ENSMMSG00000006194) #10	EMILIN1 (ENSMMSG00000006157) #11	AGBL5 (ENSMMSG00000006037) #13	TMEM214 (ENSMMSG00000005960) #14	MAPRE3 (ENSMMSG00000005915) #15	DPYSL5 (ENSMMSG00000005856) #16	ENSMMSG00000005795 #17	SLC35F6 (ENSMMSG00000005749) #18	KCNK3 (ENSMMSG00000005730) #19	CIB4 (ENSMMSG00000005697) #20	FAM166C (ENSMMSG00000005676) #21	OTOF (ENSMMSG00000004848) #22	ENSMMSG00000004743 #23	ENSMMSG00000004719 #23	SELENOI (ENSMMSG00000004311) #24	ADGRF3 (ENSMMSG00000004296)	HADHB (ENSMMSG00000004251)	HADHA (ENSMMSG00000004193)	GAREM2 (ENSMMSG00000004177)	ENSMMSG00000004163	KIF3C (ENSMMSG00000004152)	ASXL2 (ENSMMSG00000004131)	ENSMMSG00000004026	DNMT3A (ENSMMSG00000003949)	ENSMMSG00000003931	POMC (ENSMMSG00000003919)	EFR3B (ENSMMSG00000003852)
Yarkand deer	MODERN SPECIES	2	PREB (ENSCHYG00000007810) #8	ABHD1 (ENSCHYG00000007873)	CGREF1 (ENSCHYG00000007950) #9	EMILIN1 (ENSCHYG00000007981) #11	OST4 (ENSCHYG00000008055) #12	AGBL5 (ENSCHYG00000008078) #13	ENSCHYG00000008138	TMEM214 (ENSCHYG00000008158) #14	MAPRE3 (ENSCHYG00000008266) #15	DPYSL5 (ENSCHYG00000008359) #16	ENSCHYG00000008434 #17	SLC35F6 (ENSCHYG00000008502) #18	KCNK3 (ENSCHYG00000008547) #19	CIB4 (ENSCHYG00000008562) #20	FAM166C (ENSCHYG00000008639) #21	OTOF (ENSCHYG00000008676) #22	DRC1 (ENSCHYG00000009228) #23	SELENOI (ENSCHYG00000009378) #24	ADGRF3 (ENSCHYG00000009487)	HADHB (ENSCHYG00000009640)	HADHA (ENSCHYG00000010003)	GAREM2 (ENSCHYG00000011311)	RAB10 (ENSCHYG00000011347)	KIF3C (ENSCHYG00000011405)	ASXL2 (ENSCHYG00000011494)	ENSCHYG00000011641	DNMT3A (ENSCHYG00000012556)	POMC (ENSCHYG00000013191)	EFR3B (ENSCHYG00000013292)	DNAJC27 (ENSCHYG00000013784)	ADCY3 (ENSCHYG00000013932)
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000005754 #7	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133
Arabian camel	MODERN SPECIES	6	PRR30 (ENSCDRG00005007555) #7	ABHD1 (ENSCDRG00005007438)	PREB (ENSCDRG00005007331) #8	KHK (ENSCDRG00005007139) #10	EMILIN1 (ENSCDRG00005007034) #11	OST4 (ENSCDRG00005007006) #12	AGBL5 (ENSCDRG00005006858) #13	TMEM214 (ENSCDRG00005006773) #14	MAPRE3 (ENSCDRG00005006682) #15	DPYSL5 (ENSCDRG00005013299) #16	CENPA (ENSCDRG00005013201) #17	SLC35F6 (ENSCDRG00005013158) #18	KCNK3 (ENSCDRG00005013127) #19	CIB4 (ENSCDRG00005013022) #20	FAM166C (ENSCDRG00005012972) #21	OTOF (ENSCDRG00005012657) #22	DRC1 (ENSCDRG00005012478) #23	SELENOI (ENSCDRG00005012423) #24	ENSCDRG00005012380	ADGRF3 (ENSCDRG00005012247)	HADHB (ENSCDRG00005011980)	HADHA (ENSCDRG00005011749)	GAREM2 (ENSCDRG00005011666)	RAB10 (ENSCDRG00005011600)	KIF3C (ENSCDRG00005011518)	ASXL2 (ENSCDRG00005011334)	ENSCDRG00005010397	DNMT3A (ENSCDRG00005010068)	ENSCDRG00005010039	EFR3B (ENSCDRG00005009818)	DNAJC27 (ENSCDRG00005009711)
Alpaca	MODERN SPECIES	3040															ENSVPAG00000002661 #20	ENSVPAG00000002656 #22	DRC1 (ENSVPAG00000002655) #23	SELENOI (ENSVPAG00000002651) #24	HADHB (ENSVPAG00000002646)	HADHA (ENSVPAG00000002645)	ENSVPAG00000002642	RAB10 (ENSVPAG00000002641)
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00390000007479.z	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133
American black bear	MODERN SPECIES	3500															FAM166C (ENSUAMG00000016525) #21	OTOF (ENSUAMG00000016532) #22	DRC1 (ENSUAMG00000016555) #23	SELENOI (ENSUAMG00000016620) #24
Polar bear	MODERN SPECIES	223	PREB (ENSUMAG00000021962) #8	ABHD1 (ENSUMAG00000021963)	CGREF1 (ENSUMAG00000021971) #9	KHK (ENSUMAG00000021972) #10	ENSUMAG00000021975 #11	OST4 (ENSUMAG00000021977) #12	AGBL5 (ENSUMAG00000021982) #13	TMEM214 (ENSUMAG00000021997) #14	MAPRE3 (ENSUMAG00000022068) #15	ENSUMAG00000022073	DPYSL5 (ENSUMAG00000022079) #16	CENPA (ENSUMAG00000022125) #17	SLC35F6 (ENSUMAG00000022128) #18	ENSUMAG00000022131 #20	FAM166C (ENSUMAG00000022134) #21	OTOF (ENSUMAG00000022140) #22	DRC1 (ENSUMAG00000022194) #23	SELENOI (ENSUMAG00000022269) #24	ENSUMAG00000022277	HADHB (ENSUMAG00000022281)	HADHA (ENSUMAG00000022289)	RAB10 (ENSUMAG00000022303)	KIF3C (ENSUMAG00000022313)	ENSUMAG00000022340	ASXL2 (ENSUMAG00000022345)	ENSUMAG00000022354	DNMT3A (ENSUMAG00000022397)	EFR3B (ENSUMAG00000022545)	DNAJC27 (ENSUMAG00000022558)	ADCY3 (ENSUMAG00000022574)	CENPO (ENSUMAG00000022621)
Giant Panda	MODERN SPECIES	14	ENSAMEG00000028341	PREB (ENSAMEG00000001829) #8	ABHD1 (ENSAMEG00000001861)	CGREF1 (ENSAMEG00000001870) #9	EMILIN1 (ENSAMEG00000001899) #11	OST4 (ENSAMEG00000020108) #12	AGBL5 (ENSAMEG00000001915) #13	TMEM214 (ENSAMEG00000001938) #14	MAPRE3 (ENSAMEG00000001977) #15	DPYSL5 (ENSAMEG00000002012) #16	CENPA (ENSAMEG00000002112) #17	SLC35F6 (ENSAMEG00000002126) #18	KCNK3 (ENSAMEG00000002147) #19	CIB4 (ENSAMEG00000002150) #20	FAM166C (ENSAMEG00000002155) #21	OTOF (ENSAMEG00000002163) #22	DRC1 (ENSAMEG00000002238) #23	SELENOI (ENSAMEG00000002275) #24	ADGRF3 (ENSAMEG00000002279)	HADHB (ENSAMEG00000002288)	HADHA (ENSAMEG00000002313)	GAREM2 (ENSAMEG00000026829)	ENSAMEG00000002360	KIF3C (ENSAMEG00000002379)	ASXL2 (ENSAMEG00000002397)	ENSAMEG00000028157	ENSAMEG00000002424	DNMT3A (ENSAMEG00000002443)	POMC (ENSAMEG00000002511)	EFR3B (ENSAMEG00000002518)	DNAJC27 (ENSAMEG00000002554)
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	55											ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
American mink	MODERN SPECIES	7	MATN4 (ENSNVIG00000010816)	SLPI (ENSNVIG00000010853)	ENSNVIG00000010861	ENSNVIG00000010873	WFDC5 (ENSNVIG00000010883)	ELAF (ENSNVIG00000010904)	KCNS1 (ENSNVIG00000010907)	STK4 (ENSNVIG00000010914)	TOMM34 (ENSNVIG00000010955)	PABPC1L (ENSNVIG00000010962)	YWHAB (ENSNVIG00000011016)	RIMS4 (ENSNVIG00000011024)	KCNK3 (ENSNVIG00000011039) #19	CIB4 (ENSNVIG00000011050) #20	FAM166C (ENSNVIG00000011066) #21	OTOF (ENSNVIG00000011081) #22	CC164 (ENSNVIG00000011276) #23	SELENOI (ENSNVIG00000011344) #24	ADGRF3 (ENSNVIG00000011368)	HADHB (ENSNVIG00000011410)	HADHA (ENSNVIG00000011530)	GAREM2 (ENSNVIG00000011575)	RAB10 (ENSNVIG00000011586)	ENSNVIG00000011606	KIF3C (ENSNVIG00000011611)	ASXL2 (ENSNVIG00000011638)	ENSNVIG00000011664	ENSNVIG00000011667	ENSNVIG00000011719	ENSNVIG00000012087	DNMT3A (ENSNVIG00000012095)
Ferret	MODERN SPECIES	549										ENSMPUG00000008162	CENPA (ENSMPUG00000008165) #17	SLC35F6 (ENSMPUG00000008176) #18	KCNK3 (ENSMPUG00000008188) #19	CIB4 (ENSMPUG00000008218) #20	FAM166C (ENSMPUG00000008226) #21	OTOF (ENSMPUG00000008231) #22	DRC1 (ENSMPUG00000008490) #23	SELENOI (ENSMPUG00000008507) #24	ADGRF3 (ENSMPUG00000008520)	HADHB (ENSMPUG00000008535)	HADHA (ENSMPUG00000008546)	GAREM2 (ENSMPUG00000008563)	ENSMPUG00000008602
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00910000147123	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b.cb	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00990000213351	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000005754 #7	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b.cb	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00990000213351	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133
Dog	MODERN SPECIES	8	PREB (ENSCAFG00845006201) #8	ABHD1 (ENSCAFG00845006161)	CGREF1 (ENSCAFG00845006113) #9	KHK (ENSCAFG00845006046) #10	EMILIN1 (ENSCAFG00845005994) #11	AGBL5 (ENSCAFG00845005966) #13	TMEM214 (ENSCAFG00845005931) #14	SLC5A6 (ENSCAFG00845005860)	MAPRE3 (ENSCAFG00845005806) #15	DPYSL5 (ENSCAFG00845029023) #16	CENPA (ENSCAFG00845028982) #17	SLC35F6 (ENSCAFG00845028914) #18	KCNK3 (ENSCAFG00845028885) #19	OTOF (ENSCAFG00845028822) #20	FAM166C (ENSCAFG00845028780) #21	OTOF (ENSCAFG00845028326) #22	DRC1 (ENSCAFG00845028116) #23	SELENOI (ENSCAFG00845028041) #24	ADGRF3 (ENSCAFG00845027979)	ENSCAFG00845027719	HADHA (ENSCAFG00845027504)	GAREM2 (ENSCAFG00845027452)	RAB10 (ENSCAFG00845027419)	KIF3C (ENSCAFG00845027365)	ASXL2 (ENSCAFG00845027213)	DTNB (ENSCAFG00845026621)	DNMT3A (ENSCAFG00845026173)	POMC (ENSCAFG00845026092)	EFR3B (ENSCAFG00845025549)	DNAJC27 (ENSCAFG00845025362)	ADCY3 (ENSCAFG00845025117)
Dingo	MODERN SPECIES	223	PRR30 (ENSCAFG00020024698) #7	PREB (ENSCAFG00020024700) #8	ABHD1 (ENSCAFG00020024710)	CGREF1 (ENSCAFG00020024744) #9	KHK (ENSCAFG00020024746) #10	EMILIN1 (ENSCAFG00020024750) #11	AGBL5 (ENSCAFG00020024757) #13	TMEM214 (ENSCAFG00020024765) #14	MAPRE3 (ENSCAFG00020024770) #15	DPYSL5 (ENSCAFG00020024773) #16	CENPA (ENSCAFG00020024783) #17	SLC35F6 (ENSCAFG00020024784) #18	KCNK3 (ENSCAFG00020024787) #19	CIB4 (ENSCAFG00020024789) #20	FAM166C (ENSCAFG00020024794) #21	OTOF (ENSCAFG00020024797) #22	DRC1 (ENSCAFG00020024833) #23	SELENOI (ENSCAFG00020024863) #24	ADGRF3 (ENSCAFG00020024878)	ENSCAFG00020024883	HADHA (ENSCAFG00020024925)	GAREM2 (ENSCAFG00020025095)	RAB10 (ENSCAFG00020025098)	ENSCAFG00020025102	KIF3C (ENSCAFG00020025103)	ASXL2 (ENSCAFG00020025120)	ENSCAFG00020025160	DNMT3A (ENSCAFG00020025176)	POMC (ENSCAFG00020025221)	EFR3B (ENSCAFG00020025238)	DNAJC27 (ENSCAFG00020025277)
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Tiger	MODERN SPECIES	287	PREB (ENSPTIG00000019959) #8	ABHD1 (ENSPTIG00000020968)	CGREF1 (ENSPTIG00000006929) #9	KHK (ENSPTIG00000009090) #10	EMILIN1 (ENSPTIG00000010116) #11	OST4 (ENSPTIG00000007081) #12	AGBL5 (ENSPTIG00000011353) #13	TMEM214 (ENSPTIG00000012413) #14	ENSPTIG00000016113 ##15	DPYSL5 (ENSPTIG00000016404) #16	CENPA (ENSPTIG00000017121) #17	SLC35F6 (ENSPTIG00000017375) #18	ENSPTIG00000018187 #19	CIB4 (ENSPTIG00000018756) #20	FAM166C (ENSPTIG00000019670) #21	OTOF (ENSPTIG00000021218) #22	DRC1 (ENSPTIG00000020695) #23	SELENOI (ENSPTIG00000021799) #24	ADGRF3 (ENSPTIG00000002861)	HADHB (ENSPTIG00000009770)	HADHA (ENSPTIG00000014280)	RAB10 (ENSPTIG00000014861)	KIF3C (ENSPTIG00000015228)	DTNB (ENSPTIG00000019750)	DNMT3A (ENSPTIG00000017909)	ENSPTIG00000006949	EFR3B (ENSPTIG00000007845)	DNAJC27 (ENSPTIG00000013443)
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
leopard	MODERN SPECIES		PREB (ENSPPRG00000000755) #8	ABHD1 (ENSPPRG00000000739)	CGREF1 (ENSPPRG00000000715) #9	KHK (ENSPPRG00000000689) #10	EMILIN1 (ENSPPRG00000000674) #11	OST4 (ENSPPRG00000020132) #12	AGBL5 (ENSPPRG00000000663) #13	TMEM214 (ENSPPRG00000000634) #14	MAPRE3 (ENSPPRG00000000603) #15	DPYSL5 (ENSPPRG00000000590) #16	CENPA (ENSPPRG00000000575) #17	SLC35F6 (ENSPPRG00000000570) #18	KCNK3 (ENSPPRG00000000563) #19	CIB4 (ENSPPRG00000000556) #20	FAM166C (ENSPPRG00000000546) #21	OTOF (ENSPPRG00000000530) #22	DRC1 (ENSPPRG00000000495) #23	SELENOI (ENSPPRG00000000475) #24	ADGRF3 (ENSPPRG00000000445)	HADHB (ENSPPRG00000000393)	HADHA (ENSPPRG00000000312)	GAREM2 (ENSPPRG00000000295)	RAB10 (ENSPPRG00000000261)	KIF3C (ENSPPRG00000000256)	ASXL2 (ENSPPRG00000000239)	DTNB (ENSPPRG00000000149)	DNMT3A (ENSPPRG00000022803)	POMC (ENSPPRG00000022853)	EFR3B (ENSPPRG00000022872)	DNAJC27 (ENSPPRG00000022920)	ADCY3 (ENSPPRG00000022933)
lion	MODERN SPECIES	3	PREB (ENSPLOG00000003329) #8	ABHD1 (ENSPLOG00000003298)	ENSPLOG00000003283	KHK (ENSPLOG00000003266) #10	EMILIN1 (ENSPLOG00000003241) #11	OST4 (ENSPLOG00000003176) #12	AGBL5 (ENSPLOG00000003143) #13	TMEM214 (ENSPLOG00000003054) #14	MAPRE3 (ENSPLOG00000003024) #15	DPYSL5 (ENSPLOG00000003005) #16	CENPA (ENSPLOG00000002966) #17	SLC35F6 (ENSPLOG00000002941) #18	KCNK3 (ENSPLOG00000002929) #19	CIB4 (ENSPLOG00000002901) #20	FAM166C (ENSPLOG00000002878) #21	OTOF (ENSPLOG00000002573) #22	DRC1 (ENSPLOG00000002473) #23	SELENOI (ENSPLOG00000002450) #24	ADGRF3 (ENSPLOG00000002389)	ENSPLOG00000002341	ENSPLOG00000002330	ENSPLOG00000002151	HADHA (ENSPLOG00000001953)	GAREM2 (ENSPLOG00000001895)	RAB10 (ENSPLOG00000001873)	KIF3C (ENSPLOG00000001843)	ENSPLOG00000001827	ASXL2 (ENSPLOG00000001803)	ENSPLOG00000001685	DNMT3A (ENSPLOG00000001561)	POMC (ENSPLOG00000001533)
Cat	MODERN SPECIES	2	PREB (ENSFCAG00000005154) #8	ABHD1 (ENSFCAG00000005144)	CGREF1 (ENSFCAG00000009887) #9	KHK (ENSFCAG00000009886) #10	EMILIN1 (ENSFCAG00000028415) #11	OST4 (ENSFCAG00000046340) #12	AGBL5 (ENSFCAG00000009884) #13	TMEM214 (ENSFCAG00000009883) #14	MAPRE3 (ENSFCAG00000022268) #15	DPYSL5 (ENSFCAG00000001652) #16	CENPA (ENSFCAG00000019293) #17	SLC35F6 (ENSFCAG00000026864) #18	KCNK3 (ENSFCAG00000040829) #19	CIB4 (ENSFCAG00000000368) #20	CA3H2orf70 (ENSFCAG00000000036) #21	OTOF (ENSFCAG00000000035) #22	DRC1 (ENSFCAG00000000034) #23	SELENOI (ENSFCAG00000032898) #24	ADGRF3 (ENSFCAG00000009009)	ENSFCAG00000047852	ENSFCAG00000050388	HADHB (ENSFCAG00000014934)	HADHA (ENSFCAG00000014933)	GAREM2 (ENSFCAG00000023983)	RAB10 (ENSFCAG00000024401)	KIF3C (ENSFCAG00000015635)	ASXL2 (ENSFCAG00000003836)	ENSFCAG00000037234	DTNB (ENSFCAG00000000232)	DNMT3A (ENSFCAG00000003659)	POMC (ENSFCAG00000003658)
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Equus	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Donkey	MODERN SPECIES	26	ABHD1 (ENSEASG00005012594)	PREB (ENSEASG00005012580) #8	CGREF1 (ENSEASG00005032358) #9	KHK (ENSEASG00005012602) #10	EMILIN1 (ENSEASG00005012604) #11	OST4 (ENSEASG00005035113) #12	AGBL5 (ENSEASG00005012611) #13	TMEM214 (ENSEASG00005012620) #14	MAPRE3 (ENSEASG00005012624) #15	DPYSL5 (ENSEASG00005012628) #16	CENPA (ENSEASG00005012631) #17	SLC35F6 (ENSEASG00005012632) #18	KCNK3 (ENSEASG00005028893) #19	CIB4 (ENSEASG00005012635) #20	FAM166C (ENSEASG00005012638) #21	OTOF (ENSEASG00005012660) #22	DRC1 (ENSEASG00005012692) #23	SELENOI (ENSEASG00005012697) #24	ADGRF3 (ENSEASG00005022225)	ENSEASG00005022116	HADHA (ENSEASG00005011596)	GAREM2 (ENSEASG00005011592)	RAB10 (ENSEASG00005011588)	KIF3C (ENSEASG00005011585)	ASXL2 (ENSEASG00005011580)	DTNB (ENSEASG00005011562)	DNMT3A (ENSEASG00005010712)	POMC (ENSEASG00005010600)	EFR3B (ENSEASG00005010599)	DNAJC27 (ENSEASG00005010598)	ADCY3 (ENSEASG00005010572)
Horse	MODERN SPECIES	6	PRR30 (ENSECAG00000043429) #7	ENSECAG00000044393	PREB (ENSECAG00000021473) #8	ABHD1 (ENSECAG00000026975)	KHK (ENSECAG00000025017) #10	CGREF1 (ENSECAG00000054591) #9	EMILIN1 (ENSECAG00000025161) #11	AGBL5 (ENSECAG00000007490) #13	TMEM214 (ENSECAG00000010689) #14	ENSECAG00000016515 #15	DPYSL5 (ENSECAG00000024403) #16	CENPA (ENSECAG00000016271) #17	SLC35F6 (ENSECAG00000017703) #18	KCNK3 (ENSECAG00000038775) #19	CIB4 (ENSECAG00000020061) #20	OTOF (ENSECAG00000002692) #22	DRC1 (ENSECAG00000020710) #23	SELENOI (ENSECAG00000046166) #24	ADGRF3 (ENSECAG00000007460)	HADHB (ENSECAG00000054935)	HADHA (ENSECAG00000015725)	GAREM2 (ENSECAG00000023175)	RAB10 (ENSECAG00000032798)	KIF3C (ENSECAG00000000746)	ASXL2 (ENSECAG00000010885)	ENSECAG00000054333	DTNB (ENSECAG00000014987)	DNMT3A (ENSECAG00000025086)	POMC (ENSECAG00000016388)	EFR3B (ENSECAG00000016528)	DNAJC27 (ENSECAG00000024595)
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133
Megabat	MODERN SPECIES	830													KCNK3 (ENSPVAG00000001879) #19	CIB4 (ENSPVAG00000001878) #20	FAM166C (ENSPVAG00000001877) #21	OTOF (ENSPVAG00000001875) #22	DRC1 (ENSPVAG00000001872) #23	SELENOI (ENSPVAG00000001870) #24
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Microbat	MODERN SPECIES	1222	PREB (ENSMLUG00000001388) #8	ABHD1 (ENSMLUG00000001382)	ENSMLUG00000001376 #9	KHK (ENSMLUG00000001371) #10	EMILIN1 (ENSMLUG00000001361) #11	OST4 (ENSMLUG00000025707) #12	AGBL5 (ENSMLUG00000001348) #13	TMEM214 (ENSMLUG00000001330) #14	MAPRE3 (ENSMLUG00000001328) #15	DPYSL5 (ENSMLUG00000001313) #16	ENSMLUG00000027409	SLC35F6 (ENSMLUG00000001308) #18	KCNK3 (ENSMLUG00000001305) #19	CIB4 (ENSMLUG00000010269) #20	FAM166C (ENSMLUG00000010256) #21	OTOF (ENSMLUG00000010168) #22	DRC1 (ENSMLUG00000010104) #23	SELENOI (ENSMLUG00000010073) #24	ADGRF3 (ENSMLUG00000010022)	HADHB (ENSMLUG00000027296)	ENSMLUG00000009979
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	4	PREB (ENSRFEG00010013440) #8	ABHD1 (ENSRFEG00010013636)	CGREF1 (ENSRFEG00010013732) #9	KHK (ENSRFEG00010013776) #10	EMILIN1 (ENSRFEG00010013863) #11	OST4 (ENSRFEG00010013928) #12	AGBL5 (ENSRFEG00010013964) #13	TMEM214 (ENSRFEG00010014138) #14	MAPRE3 (ENSRFEG00010014677) #15	DPYSL5 (ENSRFEG00010014789) #16	CENPA (ENSRFEG00010014848) #17	SLC35F6 (ENSRFEG00010015042) #18	KCNK3 (ENSRFEG00010015096) #19	CIB4 (ENSRFEG00010015172) #20	FAM166C (ENSRFEG00010015294) #21	OTOF (ENSRFEG00010015369) #22	DRC1 (ENSRFEG00010015514) #23	SELENOI (ENSRFEG00010015540) #24	ADGRF3 (ENSRFEG00010015582)	HADHB (ENSRFEG00010015789)	HADHA (ENSRFEG00010015960)	GAREM2 (ENSRFEG00010016065)	RAB10 (ENSRFEG00010016112)	KIF3C (ENSRFEG00010016154)	ASXL2 (ENSRFEG00010016207)	ENSRFEG00010016277	ENSRFEG00010016372	DNMT3A (ENSRFEG00010016679)	POMC (ENSRFEG00010016944)	EFR3B (ENSRFEG00010016983)	DNAJC27 (ENSRFEG00010017106)
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES	1648																ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23
Common shrew	MODERN SPECIES	1150																ENSSARG00000001104 #22
Hedgehog	MODERN SPECIES	5150																ENSEEUG00000001814 #22	DRC1 (ENSEEUG00000001783) #23
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Hyrax	MODERN SPECIES	4242														CIB4 (ENSPCAG00000001073) #20	FAM166C (ENSPCAG00000001055) #21	OTOF (ENSPCAG00000000884) #22	DRC1 (ENSPCAG00000000799) #23
Elephant	MODERN SPECIES	197	PREB (ENSLAFG00000014583) #8	ABHD1 (ENSLAFG00000022268)	CGREF1 (ENSLAFG00000014581) #9	KHK (ENSLAFG00000014578) #10	EMILIN1 (ENSLAFG00000026301) #11	OST4 (ENSLAFG00000027285) #12	AGBL5 (ENSLAFG00000014564) #13	TMEM214 (ENSLAFG00000014558) #14	MAPRE3 (ENSLAFG00000014552) #15	DPYSL5 (ENSLAFG00000013765) #16	CENPA (ENSLAFG00000020873) #17	SLC35F6 (ENSLAFG00000006862) #18	KCNK3 (ENSLAFG00000012031) #19	CIB4 (ENSLAFG00000016389) #20	FAM166C (ENSLAFG00000016384) #21	OTOF (ENSLAFG00000012736) #22	DRC1 (ENSLAFG00000001893) #23	ENSLAFG00000020893 #24	ADGRF3 (ENSLAFG00000005262)	HADHB (ENSLAFG00000008375)	HADHA (ENSLAFG00000002731)	GAREM2 (ENSLAFG00000002730)	RAB10 (ENSLAFG00000027391)	ENSLAFG00000030378	KIF3C (ENSLAFG00000004381)	ASXL2 (ENSLAFG00000002035)	ENSLAFG00000013179	DNMT3A (ENSLAFG00000013263)	POMC (ENSLAFG00000031034)	EFR3B (ENSLAFG00000013258)	DNAJC27 (ENSLAFG00000002742)
Tenrec	MODERN SPECIES	1615																OTOF (ENSETEG00000005214) #22
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	648																ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u
Armadillo	MODERN SPECIES	392																OTOF (ENSDNOG00000037747) #22	DRC1 (ENSDNOG00000038749) #23	SELENOI (ENSDNOG00000007037) #24	ADGRF3 (ENSDNOG00000007015)	HADHB (ENSDNOG00000006999)	HADHA (ENSDNOG00000006972)	GAREM2 (ENSDNOG00000033219)	RAB10 (ENSDNOG00000045834)	ENSDNOG00000035629	NPY (ENSDNOG00000002909)	ENSDNOG00000048956	ENSDNOG00000038117	PALS2 (ENSDNOG00000007871)	GSDME (ENSDNOG00000007884)	OSBPL3 (ENSDNOG00000008460)	ENSDNOG00000047486
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000018031 #8	ENSGT00950000182902.a.d	ENSGT00940000154141.A #9	ENSGT00390000007458.i #10	ENSGT01030000234633.A #11	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT01100000263514.B #17	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a
Common wonbat	MODERN SPECIES	574	ENSVURG00010020896 #9	KHK (ENSVURG00010020900) #10	EMILIN1 (ENSVURG00010020912) #11	OST4 (ENSVURG00010020915) #12	AGBL5 (ENSVURG00010020922) #13	TMEM214 (ENSVURG00010020932) #14	MAPRE3 (ENSVURG00010020938) #15	DPYSL5 (ENSVURG00010020951) #16	CENPA (ENSVURG00010020960) #17	ENSVURG00010020964	SLC35F6 (ENSVURG00010020968) #18	ENSVURG00010020969	KCNK3 (ENSVURG00010020970) #19	ENSVURG00010000101 #20	FAM166C (ENSVURG00010000107) #21	OTOF (ENSVURG00010000174) #22	DRC1 (ENSVURG00010000415) #23	SELENOI (ENSVURG00010000464) #24	ENSVURG00010000497	HADHB (ENSVURG00010000535)	HADHA (ENSVURG00010000555)	GAREM2 (ENSVURG00010000581)	RAB10 (ENSVURG00010000601)	KIF3C (ENSVURG00010000616)	ENSVURG00010000654	ASXL2 (ENSVURG00010000667)	ENSVURG00010000697	ENSVURG00010000721	DNMT3A (ENSVURG00010000794)	ENSVURG00010000869	ENSVURG00010000874
koala	MODERN SPECIES	15	PREB (ENSPCIG00000012262) #8	ABHD1 (ENSPCIG00000012261)	ENSPCIG00000032908 #9	KHK (ENSPCIG00000012087) #10	EMILIN1 (ENSPCIG00000012082) #11	OST4 (ENSPCIG00000032420) #12	AGBL5 (ENSPCIG00000012079) #13	TMEM214 (ENSPCIG00000012073) #14	MAPRE3 (ENSPCIG00000012066) #15	DPYSL5 (ENSPCIG00000036730) #16	CENPA (ENSPCIG00000012054) #17	SLC35F6 (ENSPCIG00000012050) #18	KCNK3 (ENSPCIG00000024391) #19	CIB4 (ENSPCIG00000024392) #20	FAM166C (ENSPCIG00000024393) #21	OTOF (ENSPCIG00000024403) #22	DRC1 (ENSPCIG00000024414) #23	SELENOI (ENSPCIG00000024416) #24	ADGRF3 (ENSPCIG00000024418)	HADHB (ENSPCIG00000024419)	HADHA (ENSPCIG00000024420)	GAREM2 (ENSPCIG00000024425)	RAB10 (ENSPCIG00000024427)	KIF3C (ENSPCIG00000025229)	ASXL2 (ENSPCIG00000025232)	ENSPCIG00000025231	ENSPCIG00000025234	ENSPCIG00000025235	DNMT3A (ENSPCIG00000025236)	ENSPCIG00000025237	EFR3B (ENSPCIG00000025238)
Wallaby	MODERN SPECIES	2390																OTOF (ENSMEUG00000010765) #22
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	1	ENSSHAG00000029722 #7	PREB (ENSSHAG00000012390) #8	ABHD1 (ENSSHAG00000012331)	ENSSHAG00000023317 #9	KHK (ENSSHAG00000030031) #10	EMILIN1 (ENSSHAG00000027750) #11	AGBL5 (ENSSHAG00000012008) #13	TMEM214 (ENSSHAG00000011811) #14	MAPRE3 (ENSSHAG00000011741) #15	DPYSL5 (ENSSHAG00000010753) #16	CENPA (ENSSHAG00000010305) #17	SLC35F6 (ENSSHAG00000026267) #18	KCNK3 (ENSSHAG00000021709) #19	CIB4 (ENSSHAG00000021842) #20	ENSSHAG00000026839	OTOF (ENSSHAG00000004180) #22	DRC1 (ENSSHAG00000003011) #23	SELENOI (ENSSHAG00000024053) #24	ADGRF3 (ENSSHAG00000014566)	HADHB (ENSSHAG00000014373)	HADHA (ENSSHAG00000014112)	GAREM2 (ENSSHAG00000021473)	RAB10 (ENSSHAG00000032249)	ENSSHAG00000030526	KIF3C (ENSSHAG00000020830)	ASXL2 (ENSSHAG00000012066)	ENSSHAG00000009563	DNMT3A (ENSSHAG00000007509)	ENSSHAG00000024476	EFR3B (ENSSHAG00000002481)	DNAJC27 (ENSSHAG00000024931)
Opossum	MODERN SPECIES		PREB (ENSMODG00000015718) #8	ABHD1 (ENSMODG00000015722)	ENSMODG00000015725 #9	KHK (ENSMODG00000015726) #10	EMILIN1 (ENSMODG00000015730) #11	OST4 (ENSMODG00000038109) #12	AGBL5 (ENSMODG00000015738) #13	TMEM214 (ENSMODG00000015750) #14	MAPRE3 (ENSMODG00000015753) #15	DPYSL5 (ENSMODG00000015761) #16	CENPA (ENSMODG00000049956) #17	SLC35F6 (ENSMODG00000046989) #18	KCNK3 (ENSMODG00000015769) #19	CIB4 (ENSMODG00000015773) #20	FAM166C (ENSMODG00000015776) #21	OTOF (ENSMODG00000015788) #22	DRC1 (ENSMODG00000015797) #23	SELENOI (ENSMODG00000015800) #24	ADGRF3 (ENSMODG00000015803)	HADHB (ENSMODG00000015809)	HADHA (ENSMODG00000015815)	GAREM2 (ENSMODG00000015817)	RAB10 (ENSMODG00000015821)	KIF3C (ENSMODG00000015824)	ASXL2 (ENSMODG00000015832)	ENSMODG00000015846	DNMT3A (ENSMODG00000015850)	POMC (ENSMODG00000015853)	EFR3B (ENSMODG00000015857)	ENSMODG00000051458	DNAJC27 (ENSMODG00000015869)
Platypus	MODERN SPECIES	20	ENSOANG00000003937 #8	ENSOANG00000048809 #9	KHK (ENSOANG00000000509) #10	EMILIN1 (ENSOANG00000049714) #11	OST4 (ENSOANG00000044535) #12	AGBL5 (ENSOANG00000000511) #13	TMEM214 (ENSOANG00000022079) #14	MAPRE3 (ENSOANG00000040306) #15	DPYSL5 (ENSOANG00000000514) #16	ENSOANG00000045223 #17	SLC35F6 (ENSOANG00000003585) #18	KCNK3 (ENSOANG00000000517) #19	CIB4 (ENSOANG00000000518) #20	ENSOANG00000037767	FAM166C (ENSOANG00000000519) #21	OTOF (ENSOANG00000000520) #22	DRC1 (ENSOANG00000000522) #23	SELENOI (ENSOANG00000000523) #24	ADGRF3 (ENSOANG00000015827)	HADHB (ENSOANG00000015828)	HADHA (ENSOANG00000015830)	GAREM2 (ENSOANG00000015831)	RAB10 (ENSOANG00000015832)	KIF3C (ENSOANG00000015833)	ASXL2 (ENSOANG00000015834)	ENSOANG00000015835	DNMT3A (ENSOANG00000015836)	ENSOANG00000022083	NUGGC (ENSOANG00000015837)	SCARA5 (ENSOANG00000015838)	PBK (ENSOANG00000015839)
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158299	ENSGT00940000158614	ENSGT00510000049722	ENSGT00390000007091	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00720000108839	ENSGT00940000158598	ENSGT00950000185082	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158238	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000008161.b	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000177261	ENSGT00940000156975.t.b	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	153						ENSGT00720000108839	ENSGT00940000158598	ENSGT00950000185082	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158238	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000154677	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000161541	ENSGT00390000008161.b	ENSGT00720000108839	ENSGT00940000158598	ENSGT00950000185082	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158238	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00390000016811	ENSGT00940000164041	ENSGT01030000234597.a.b.a	ENSGT00940000160868	ENSGT00940000157269.a.a	ENSGT00940000158299	ENSGT00940000158614	ENSGT00510000049722	ENSGT00940000159021	ENSGT00940000156491.a	ENSGT00390000013141	ENSGT00950000183149.C
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000154677	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000161541	ENSGT00390000008161.b	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00720000108839	ENSGT00940000158598	ENSGT00990000211035	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158238	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00390000016811	ENSGT00940000164041	ENSGT01030000234597.a.b.a	ENSGT00940000160868	ENSGT00940000157269.a.a	ENSGT00940000158299	ENSGT00940000158614	ENSGT00510000049722	ENSGT00940000159021	ENSGT00940000156491.a	ENSGT00390000013141	ENSGT00950000183149.C
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	68	HADHA (ENSSMRG00000013060)	HADHB (ENSSMRG00000013061)	ADGRF3 (ENSSMRG00000013062)	ENSSMRG00000013063	SELENOI (ENSSMRG00000013064) #24	PBK (ENSSMRG00000013066)	ESCO2 (ENSSMRG00000013067)	CCDC25 (ENSSMRG00000013068)	SCARA3 (ENSSMRG00000013069)	CLU (ENSSMRG00000013070)	SLC35F6 (ENSSMRG00000013072) #18	KCNK3 (ENSSMRG00000013073) #19	ENSSMRG00000013074	ENSSMRG00000013077	FAM166C (ENSSMRG00000013078) #21	OTOF (ENSSMRG00000013079) #22	DRC1 (ENSSMRG00000013326) #23	SCARA5 (ENSSMRG00000013328)	NRBP1 (ENSSMRG00000013329)	PPM1G (ENSSMRG00000013330)	ENSSMRG00000013412	ZNF513 (ENSSMRG00000013414)	SNX17 (ENSSMRG00000013416)	EIF2B4 (ENSSMRG00000013419)	GTF3C2 (ENSSMRG00000013421)	SLC30A3 (ENSSMRG00000013422)	ENSSMRG00000013424	ENSSMRG00000013427	TRIM54 (ENSSMRG00000013569)	ENSSMRG00000013572	MPV17 (ENSSMRG00000013574)
Common wall lizard	MODERN SPECIES	11	HADHB (ENSPMRG00000000508)	ENSPMRG00000000492	ENSPMRG00000000477	ENSPMRG00000000442	SELENOI (ENSPMRG00000000396) #24	PBK (ENSPMRG00000000363)	ESCO2 (ENSPMRG00000000327)	ENSPMRG00000000305	CCDC25 (ENSPMRG00000000280)	SCARA3 (ENSPMRG00000000237)	CLU (ENSPMRG00000003336)	SLC35F6 (ENSPMRG00000003328) #18	KCNK3 (ENSPMRG00000003323) #19	CIB4 (ENSPMRG00000003309) #20	FAM166C (ENSPMRG00000003296) #21	OTOF (ENSPMRG00000003190) #22	DRC1 (ENSPMRG00000003155) #23	SCARA5 (ENSPMRG00000003140)	ENSPMRG00000003130	EFR3B (ENSPMRG00000002977)	POMC (ENSPMRG00000002939)	ENSPMRG00000002931	TRIM35 (ENSPMRG00000002924)	STMN4 (ENSPMRG00000002911)	PTK2B (ENSPMRG00000002828)	CHRNA2 (ENSPMRG00000002766)	EPHX2 (ENSPMRG00000002740)	ENSPMRG00000002723	FBXO16 (ENSPMRG00000002709)	FZD3 (ENSPMRG00000002701)	ELP3 (ENSPMRG00000002594)
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	36													ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00390000016811	ENSGT01030000234597.a.b.a	ENSGT00940000160868	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00940000158238	ENSGT00390000004380	ENSGT00950000185082	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000012138.a.a.e.a	ENSGT00940000157136	ENSGT01100000263521.a.a.a.b.a.b.a.c.b	ENSGT00940000162770.o	ENSGT00950000183149.C	ENSGT00390000013141	ENSGT00940000156491.a	ENSGT00940000159021	ENSGT00510000049722	ENSGT00940000158614	ENSGT00940000158299	ENSGT00940000157269.a.a	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00390000016811	ENSGT01030000234597.a.b.a	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00940000158238	ENSGT00390000004380	ENSGT00950000185082	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	59	ENSGT00390000012138.a.a.e.a	ENSGT00940000157136	ENSGT01100000263521.a.a.a.b.a.b.a.c.b	ENSGT00940000162770.o	ENSGT00950000183149.C	ENSGT00390000013141	ENSGT00940000156491.a	ENSGT00940000159021	ENSGT00510000049722	ENSGT00940000158614	ENSGT00940000158299	ENSGT00940000157269.a.a	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00390000002143.b	ENSGT01030000234597.a.b.a	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00940000158238	ENSGT00390000004380	ENSGT00990000211035	ENSGT00950000185082	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000012138.a.a.e.a	ENSGT00940000157136	ENSGT01100000263521.a.a.a.b.a.b.a.c.b	ENSGT00940000162770.o	ENSGT00950000183149.C	ENSGT00390000013141	ENSGT00940000156491.a	ENSGT00940000159021	ENSGT00510000049722	ENSGT00940000158614	ENSGT00940000158299	ENSGT00940000157269.a.a	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00390000002143.b	ENSGT01030000234597.a.b.a	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00940000158238	ENSGT00390000004380	ENSGT00950000185082	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	80	NCOA1 (ENSPTXG00000015051)	ENSPTXG00000015064	ZNF395 (ENSPTXG00000015067)	ENSPTXG00000015070	ENSPTXG00000015072	ELP3 (ENSPTXG00000015074)	FZD3 (ENSPTXG00000015075)	FBXO16 (ENSPTXG00000015076)	ENSPTXG00000015077	EPHX2 (ENSPTXG00000015079)	CHRNA2 (ENSPTXG00000015080)	PTK2B (ENSPTXG00000015131)	KCNK3 (ENSPTXG00000015137) #19	CIB4 (ENSPTXG00000015140) #20	FAM166C (ENSPTXG00000015142) #21	OTOF (ENSPTXG00000015144) #22	ENSPTXG00000015299	SCARA5 (ENSPTXG00000015301)	EFR3B (ENSPTXG00000015303)
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	38	ENSNSUG00000004932	ZNF395 (ENSNSUG00000004943)	ENSNSUG00000004945	ENSNSUG00000004946	ENSNSUG00000004947	ELP3 (ENSNSUG00000004953)	FZD3 (ENSNSUG00000004972)	FBXO16 (ENSNSUG00000004978)	ENSNSUG00000004979	EPHX2 (ENSNSUG00000004993)	CHRNA2 (ENSNSUG00000005137)	PTK2B (ENSNSUG00000005160)	KCNK3 (ENSNSUG00000005163) #19	CIB4 (ENSNSUG00000005164) #20	FAM166C (ENSNSUG00000005166) #21	OTOF (ENSNSUG00000005171) #22	DRC1 (ENSNSUG00000005215) #23	SCARA5 (ENSNSUG00000005259)	EFR3B (ENSNSUG00000005297)	POMC (ENSNSUG00000005300)	STMN4 (ENSNSUG00000005301)	ENSNSUG00000005315	SLC35F6 (ENSNSUG00000005316) #18	CLU (ENSNSUG00000005317)	SCARA3 (ENSNSUG00000005320)	CCDC25 (ENSNSUG00000005321)	ENSNSUG00000005331	ESCO2 (ENSNSUG00000005333)	PBK (ENSNSUG00000005340)	SELENOI (ENSNSUG00000005342) #24	HADHB (ENSNSUG00000005411)
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	2542																OTOF (ENSLLTG00000012434) #22	DRC1 (ENSLLTG00000012557) #23
Indian cobra	MODERN SPECIES		NCOA1 (ENSNNAG00000001015)	ENSNNAG00000000986	ENSNNAG00000000970	ZNF395 (ENSNNAG00000000935)	ENSNNAG00000000913	ELP3 (ENSNNAG00000000861)	FZD3 (ENSNNAG00000000829)	FBXO16 (ENSNNAG00000000819)	ENSNNAG00000000808	EPHX2 (ENSNNAG00000000770)	CHRNA2 (ENSNNAG00000000635)	PTK2B (ENSNNAG00000000522)	KCNK3 (ENSNNAG00000000490) #19	CIB4 (ENSNNAG00000000465) #20	FAM166C (ENSNNAG00000000454) #21	OTOF (ENSNNAG00000000403) #22	SCARA5 (ENSNNAG00000000358)	EFR3B (ENSNNAG00000000274)	ENSNNAG00000000253	STMN4 (ENSNNAG00000000248)	SLC35F6 (ENSNNAG00000000242) #18	CLU (ENSNNAG00000000239)	SCARA3 (ENSNNAG00000000236)	SELENOI (ENSNNAG00000000233) #24	HADHB (ENSNNAG00000000228)	HADHA (ENSNNAG00000000220)	GAREM2 (ENSNNAG00000000215)	RAB10 (ENSNNAG00000000210)	KIF3C (ENSNNAG00000000207)	ASXL2 (ENSNNAG00000000202)	ENSNNAG00000000188
Lizard	MODERN SPECIES	1536																ENSACAG00000014174 #22
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158299	ENSGT00940000158614	ENSGT00510000049722	ENSGT00390000007091	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00720000108839	ENSGT00940000158598	ENSGT00950000185082	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158238	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000008161.b	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000177261	ENSGT00940000156975.t.b	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01030000234597.a.b.a	ENSGT00940000160868	ENSGT00940000157269.a.a	ENSGT00940000158299	ENSGT00940000158614	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00720000108839	ENSGT00940000158598	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158238	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000008161.b	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00390000002693 #14
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT01030000234597.a.b.a	ENSGT00940000160868	ENSGT00940000157269.a.a	ENSGT00940000158299	ENSGT00940000158614	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00720000108839	ENSGT00940000158598	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158238	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000008161.b	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.d #16	ENSGT00490000043329.a.b.c #15	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00940000158032 #13
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	87						ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00720000108839	ENSGT00940000158598	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158238	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000008161.b	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00990000205100.E.a	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.d #16
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	196							PBK (ENSTMTG00000013736)	ESCO2 (ENSTMTG00000013722)	CCDC25 (ENSTMTG00000013716)	SCARA3 (ENSTMTG00000013711)	CLU (ENSTMTG00000013702)	SLC35F6 (ENSTMTG00000013695) #18	KCNK3 (ENSTMTG00000013674) #19	CIB4 (ENSTMTG00000013640) #20	FAM166C (ENSTMTG00000013627) #21	OTOF (ENSTMTG00000013357) #22
painted turtle	MODERN SPECIES	828					SCARA5 (ENSCPBG00000010593)	PBK (ENSCPBG00000010615)	ESCO2 (ENSCPBG00000010617)	CCDC25 (ENSCPBG00000010622)	CLU (ENSCPBG00000010630)	SLC35F6 (ENSCPBG00000010634) #18	ENSCPBG00000010636	KCNK3 (ENSCPBG00000010637) #19	ENSCPBG00000010639	CIB4 (ENSCPBG00000010641) #20	FAM166C (ENSCPBG00000010645) #21	OTOF (ENSCPBG00000010661) #22	DRC1 (ENSCPBG00000010693) #23	SELENOI (ENSCPBG00000010697) #24	ENSCPBG00000010703	ENSCPBG00000010704	ENSCPBG00000010711	ENSCPBG00000010715	HADHB (ENSCPBG00000010721)	HADHA (ENSCPBG00000010733)	GAREM2 (ENSCPBG00000010750)	RAB10 (ENSCPBG00000010768)	KIF3C (ENSCPBG00000010772)	ASXL2 (ENSCPBG00000010779)	ENSCPBG00000010791	ENSCPBG00000010794	ENSCPBG00000010813
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00940000160868	ENSGT00940000157269.a.a	ENSGT00940000158299	ENSGT00940000158614.d	ENSGT00940000158614.c	ENSGT00510000049722	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00720000108839	ENSGT00940000158598	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158238	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000154393.h	ENSGT00940000154393.g.a.n	ENSGT00940000161541	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.d #16	ENSGT00490000043329.a.b.c #15
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	2051										CCDC25 (ENSCABG00000021060)	SCARA3 (ENSCABG00000021066)	CLU (ENSCABG00000021069)	SLC35F6 (ENSCABG00000021074) #18	KCNK3 (ENSCABG00000021078) #19	FAM166C (ENSCABG00000021079) #21	OTOF (ENSCABG00000021084) #22	DRC1 (ENSCABG00000021101) #23	ENSCABG00000021131	ENSCABG00000021133 #24	ENSCABG00000021136	ENSCABG00000021139	ENSCABG00000021140	ENSCABG00000021142	ENSCABG00000021145	ENSCABG00000021146	ENSCABG00000021149	ENSCABG00000021151
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	17	TRIM35 (ENSGEVG00005009862)	PTK2B (ENSGEVG00005009625)	CHRNA2 (ENSGEVG00005009506)	ENSGEVG00005009424	ENSGEVG00005009312	ENSGEVG00005009192	SCARA5 (ENSGEVG00005008955)	PBK (ENSGEVG00005008894)	ESCO2 (ENSGEVG00005008858)	CCDC25 (ENSGEVG00005008803)	SCARA3 (ENSGEVG00005008756)	CLU (ENSGEVG00005008738)	SLC35F6 (ENSGEVG00005008714) #18	KCNK3 (ENSGEVG00005008695) #19	FAM166C (ENSGEVG00005008643) #21	OTOF (ENSGEVG00005008198) #22	DRC1 (ENSGEVG00005007884) #23	SELENOI (ENSGEVG00005007815) #24	ENSGEVG00005007798	ENSGEVG00005007778	ENSGEVG00005007753	ENSGEVG00005007728	ADGRF3 (ENSGEVG00005007643)	HADHB (ENSGEVG00005007566)	HADHA (ENSGEVG00005007454)	GAREM2 (ENSGEVG00005007252)	RAB10 (ENSGEVG00005007178)	KIF3C (ENSGEVG00005007123)	ASXL2 (ENSGEVG00005007100)	ENSGEVG00005007053	DNMT3A (ENSGEVG00005006987)
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000158299	ENSGT00940000158614	ENSGT00510000049722	ENSGT00390000007091	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00720000108839	ENSGT00940000158598	ENSGT00950000185082	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158238	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000161840 #20	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000008161.b	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000177261	ENSGT00940000156975.t.b	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT00490000043329.a.b #15
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	38	HADHA (ENSCPRG00005003283)	HADHB (ENSCPRG00005003272)	ENSCPRG00005003270	SELENOI (ENSCPRG00005003267) #24	PTK2B (ENSCPRG00005003239)	CHRNA2 (ENSCPRG00005003216)	EPHX2 (ENSCPRG00005003158)	ENSCPRG00005003140	CCDC25 (ENSCPRG00005003117)	SCARA3 (ENSCPRG00005003111)	CLU (ENSCPRG00005003108)	SLC35F6 (ENSCPRG00005003101) #18	KCNK3 (ENSCPRG00005003098) #19	CIB4 (ENSCPRG00005003088) #20	FAM166C (ENSCPRG00005003082) #21	OTOF (ENSCPRG00005002907) #22	DRC1 (ENSCPRG00005002888) #23	ENSCPRG00005002882	ENSCPRG00005002876	ENSCPRG00005002868	STMN4 (ENSCPRG00005002849)	POMC (ENSCPRG00005002840)	EFR3B (ENSCPRG00005002762)	DNAJC27 (ENSCPRG00005002735)	CENPO (ENSCPRG00005002732)	ADCY3 (ENSCPRG00005002712)	NCOA1 (ENSCPRG00005002688)	ENSCPRG00005002638	ELP3 (ENSCPRG00005002580)	FBXO16 (ENSCPRG00005002562)	FZD3 (ENSCPRG00005002557)
Aves	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00940000157269.a.a	ENSGT00940000158299	ENSGT00940000158614	ENSGT00510000049722	ENSGT00390000007091	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00720000108839	ENSGT00940000158598	ENSGT00950000185082	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158238	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00940000154393.h	ENSGT00940000154393.g.a	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000177261	ENSGT00940000156975.t.b	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16
African ostrich	MODERN SPECIES	358																ENSSCUG00000004413 #22	ENSSCUG00000004414	ENSSCUG00000004415	SOX11 (ENSSCUG00000004416)	ENSSCUG00000004418	RSAD2 (ENSSCUG00000004420)	RNF144A (ENSSCUG00000004421)
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158299	ENSGT00940000158614	ENSGT00510000049722	ENSGT00390000007091	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00720000108839	ENSGT00940000158598	ENSGT00950000185082	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158238	ENSGT01100000263560.b	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00940000154393.h	ENSGT00940000154393.g.a	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000177261	ENSGT00940000156975.t.b	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158614	ENSGT00510000049722	ENSGT00940000164057.a	ENSGT00940000164057.b	ENSGT00390000007091	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00720000108839	ENSGT00940000158598	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158238	ENSGT01100000263560.b.b	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00940000160868	ENSGT01030000234597.a.b.a	ENSGT00940000164041	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a	ENSGT00390000016702	ENSGT00500000044959	ENSGT00950000183021.b	ENSGT00940000157136	ENSGT00950000183149.C	ENSGT00940000166178	ENSGT00390000013141
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000158614	ENSGT00510000049722	ENSGT00940000164057.a	ENSGT00940000164057.b	ENSGT00390000007091	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00720000108839	ENSGT00940000158598	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158238	ENSGT01100000263560.b.b	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00940000160868	ENSGT01030000234597.a.b.a	ENSGT00940000164041	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a	ENSGT00390000016702	ENSGT00500000044959	ENSGT00950000183021.b	ENSGT00940000157136	ENSGT00950000183149.C	ENSGT00940000166178	ENSGT00390000013141
Japanese quail	MODERN SPECIES	21	SELENOI (ENSCJPG00005012971) #24	PTK2B (ENSCJPG00005012972)	CHRNA2 (ENSCJPG00005012973)	EPHX2 (ENSCJPG00005012975)	ENSCJPG00005012976	ENSCJPG00005012977	SCARA5 (ENSCJPG00005012978)	PBK (ENSCJPG00005012979)	ESCO2 (ENSCJPG00005012980)	CCDC25 (ENSCJPG00005012981)	SCARA3 (ENSCJPG00005012982)	ENSCJPG00005012983	CLU (ENSCJPG00005012984)	SLC35F6 (ENSCJPG00005012985) #18	KCNK3 (ENSCJPG00005012986) #19	OTOF (ENSCJPG00005012987) #22	DRC1 (ENSCJPG00005012988) #23	TRIM35 (ENSCJPG00005012989)	STMN4 (ENSCJPG00005012990)	POMC (ENSCJPG00005012992)	EFR3B (ENSCJPG00005012993)	DNAJC27 (ENSCJPG00005012994)	ADCY3 (ENSCJPG00005012995)	CENPO (ENSCJPG00005012996)	PTRHD1 (ENSCJPG00005012997)	NCOA1 (ENSCJPG00005012998)	ZNF395 (ENSCJPG00005013001)	ENSCJPG00005013002	ENSCJPG00005013003	ELP3 (ENSCJPG00005013004)	FBXO16 (ENSCJPG00005013006)
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000158614	ENSGT00510000049722	ENSGT00940000164057.a	ENSGT00940000164057.b	ENSGT00390000007091	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00720000108839	ENSGT00940000158598	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158238	ENSGT01100000263560.b.b	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00940000160868	ENSGT01030000234597.a.b.a	ENSGT00940000164041	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a	ENSGT00390000016702	ENSGT00500000044959	ENSGT00950000183021.b	ENSGT00940000157136	ENSGT00950000183149.C	ENSGT00940000166178	ENSGT00390000013141
Chicken	MODERN SPECIES	22	EPHX2 (ENSGALG00010010136)	ENSGALG00010011927	ENSGALG00010010153	NUGGC (ENSGALG00010010171)	SCARA5 (ENSGALG00010010206)	PBK (ENSGALG00010010218)	ESCO2 (ENSGALG00010010243)	CCDC25 (ENSGALG00010010284)	SCARA3 (ENSGALG00010010337)	ENSGALG00010010317	CLU (ENSGALG00010010366)	SLC35F6 (ENSGALG00010010379) #18	ENSGALG00010010387	KCNK3 (ENSGALG00010010390) #19	FAM166C (ENSGALG00010010400) #21	OTOF (ENSGALG00010010417) #22	DRC1 (ENSGALG00010010453) #23	TRIM35 (ENSGALG00010010473)	STMN4 (ENSGALG00010010517)	ENSGALG00010010537	POMC (ENSGALG00010010556)	EFR3B (ENSGALG00010010663)	DNAJC27 (ENSGALG00010010699)	ADCY3 (ENSGALG00010010724)	CENPO (ENSGALG00010010766)	PTRHD1 (ENSGALG00010010805)	ENSGALG00010010759	NCOA1 (ENSGALG00010010826)	ZNF395 (ENSGALG00010010843)	PNOC (ENSGALG00010010851)	ENSGALG00010010859
Turkey	MODERN SPECIES	11	PTK2B (ENSMGAG00000014100)	ENSMGAG00000014105	EPHX2 (ENSMGAG00000014107)	ENSMGAG00000014114	NUGGC (ENSMGAG00000020967)	SCARA5 (ENSMGAG00000014119)	PBK (ENSMGAG00000014121)	ESCO2 (ENSMGAG00000014122)	CCDC25 (ENSMGAG00000014123)	SCARA3 (ENSMGAG00000014125)	ENSMGAG00000022703	CLU (ENSMGAG00000014126)	SLC35F6 (ENSMGAG00000014128) #18	KCNK3 (ENSMGAG00000017098) #19	FAM166C (ENSMGAG00000020358) #21	OTOF (ENSMGAG00000014133) #22	ENSMGAG00000014136 #23	ENSMGAG00000014139	ENSMGAG00000017031	ENSMGAG00000014141	POMC (ENSMGAG00000014142)	EFR3B (ENSMGAG00000014143)	DNAJC27 (ENSMGAG00000014146)	ADCY3 (ENSMGAG00000014149)	CENPO (ENSMGAG00000014151)	ENSMGAG00000022096	NCOA1 (ENSMGAG00000014153)	ZNF395 (ENSMGAG00000014155)	ENSMGAG00000014158	ENSMGAG00000014159	ELP3 (ENSMGAG00000014178)
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES																ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000160868.b	ENSGT01030000234597.a.b.a	ENSGT00940000164041	ENSGT00390000016811	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157133	ENSGT00940000156549.a.a	ENSGT00390000016702	ENSGT00500000044959	ENSGT00950000183021.b	ENSGT00940000157136	ENSGT00950000183149.C	ENSGT00940000166178	ENSGT00390000013141	ENSGT00940000159021
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	343															ENSABRG00000018976 #21	OTOF (ENSABRG00000019033) #22	ENSABRG00000019345	TRIM35 (ENSABRG00000019350)	STMN4 (ENSABRG00000019352)	ENSABRG00000019356	POMC (ENSABRG00000019361)	EFR3B (ENSABRG00000019368)	DNAJC27 (ENSABRG00000019378)	ADCY3 (ENSABRG00000019381)	CENPO (ENSABRG00000019387)	PTRHD1 (ENSABRG00000019389)	NCOA1 (ENSABRG00000019391)
Duck	MODERN SPECIES	754																ENSAPLG00000027309 #22
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157269.a.a.d	ENSGT00940000158299	ENSGT00940000158614	ENSGT00510000049722	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00720000108839	ENSGT00940000158598	ENSGT00950000185082	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158238	ENSGT01100000263560.b	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000154393.h	ENSGT00940000154393.g.a	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00940000158032 #13
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	48															ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000154393.h	ENSGT00940000154393.g.a	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.t.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00390000002693 #14
Great tit	MODERN SPECIES	284															ENSPMJG00000001913	OTOF (ENSPMJG00000001477) #22
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	58															ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000154393.h.j.a	ENSGT00940000154393.g.a	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00940000156975.t.a	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.t.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b.p	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000164272
Flycatcher	MODERN SPECIES	294														ENSFALG00000028780 #19	ENSFALG00000026553	ENSFALG00000002626 #22
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	78																ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000154393.h.j.a	ENSGT00940000154393.g.a	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00940000156975.t.a	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.t.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b.p	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000164272
Medium ground finch	MODERN SPECIES	357													ENSGFOG00000002333	ENSGFOG00000002122	ENSGFOG00000001922	OTOF (ENSGFOG00000007568) #22
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	84																ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000154393.g.a	ENSGT00940000154393.h.j.a	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.t.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b.p	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000164272
Zebra finch	DUPLICATION
Zebra finch	MODERN SPECIES	23	ENSTGUG00000022181 #22	ENSTGUG00000028069	ENSTGUG00000014407 #24	ENSTGUG00000019652	ENSTGUG00000020253	ENSTGUG00000014477	ENSTGUG00000029360	ENSTGUG00000028224	ENSTGUG00000018963	ENSTGUG00000025070	ENSTGUG00000024576	ENSTGUG00000027137	ENSTGUG00000024393	ENSTGUG00000027496	ENSTGUG00000029004	ENSTGUG00000026856 #22	ENSTGUG00000021161	ENSTGUG00000015724	ENSTGUG00000019591 #24	ENSTGUG00000029279	ENSTGUG00000014433	ENSTGUG00000022620	ENSTGUG00000027186	ENSTGUG00000028646	ENSTGUG00000021481	ENSTGUG00000023276	ENSTGUG00000021185	ENSTGUG00000022206	ENSTGUG00000026716	DNMT3A (ENSTGUG00000020883)	DPYSL5 (ENSTGUG00000028796) #16
Zebra finch	MODERN SPECIES	23	ENSTGUG00000027945	ENSTGUG00000021787	DRC1 (ENSTGUG00000022350) #23	TRIM35 (ENSTGUG00000020309)	ENSTGUG00000026507	ENSTGUG00000028914	KCNK3 (ENSTGUG00000026168) #19	ENSTGUG00000023570	CLU (ENSTGUG00000028547)	ENSTGUG00000027492	ENSTGUG00000021901	ENSTGUG00000019284	SCARA5 (ENSTGUG00000022151)	ENSTGUG00000024251	ENSTGUG00000021006	ENSTGUG00000022181 #22	ENSTGUG00000028069	ENSTGUG00000014407 #24	ENSTGUG00000019652	ENSTGUG00000020253	ENSTGUG00000014477	ENSTGUG00000029360	ENSTGUG00000028224	ENSTGUG00000018963	ENSTGUG00000025070	ENSTGUG00000024576	ENSTGUG00000027137	ENSTGUG00000024393	ENSTGUG00000027496	ENSTGUG00000029004	ENSTGUG00000026856 #22
Common canary	MODERN SPECIES	110																OTOF (ENSSCAG00000012618) #22	ENSSCAG00000012592	ENSSCAG00000012589	ENSSCAG00000012587	SELENOI (ENSSCAG00000012581) #24	ENSSCAG00000012577
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157269.a.a.d	ENSGT00940000158299	ENSGT00940000158614	ENSGT00510000049722	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00720000108839	ENSGT00940000158598	ENSGT00950000185082	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158238	ENSGT01100000263560.b	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00390000018634 #21	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000154393.g.a	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000016516 #12	ENSGT01030000234633.A #11
Kakapo	MODERN SPECIES	23	PTK2B (ENSSHBG00005010925)	CHRNA2 (ENSSHBG00005011161)	EPHX2 (ENSSHBG00005011215)	ENSSHBG00005011243	SCARA5 (ENSSHBG00005011297)	PBK (ENSSHBG00005011416)	ENSSHBG00005011440	ENSSHBG00005011457	CCDC25 (ENSSHBG00005011479)	SCARA3 (ENSSHBG00005011496)	ENSSHBG00005011516	CLU (ENSSHBG00005011529)	SLC35F6 (ENSSHBG00005011551) #18	KCNK3 (ENSSHBG00005011570) #19	FAM166C (ENSSHBG00005011584) #21	OTOF (ENSSHBG00005011947) #22	SELENOI (ENSSHBG00005015151) #24	ENSSHBG00005015158	ENSSHBG00005015164	HADHB (ENSSHBG00005015179)	HADHA (ENSSHBG00005015191)	GAREM2 (ENSSHBG00005015219)	RAB10 (ENSSHBG00005015229)	KIF3C (ENSSHBG00005015239)	ASXL2 (ENSSHBG00005015259)	ENSSHBG00005015404	DNMT3A (ENSSHBG00005017508)	DPYSL5 (ENSSHBG00005017531) #16	MAPRE3 (ENSSHBG00005017542) #15	ATRAID (ENSSHBG00005017557)	PREB (ENSSHBG00005017570) #8
Golden eagle	MODERN SPECIES	6	DRC1 (ENSACCG00020006349) #23	PTK2B (ENSACCG00020006294)	CHRNA2 (ENSACCG00020006240)	EPHX2 (ENSACCG00020006227)	ENSACCG00020006171	SCARA5 (ENSACCG00020006154)	PBK (ENSACCG00020006136)	ESCO2 (ENSACCG00020006123)	CCDC25 (ENSACCG00020006104)	SCARA3 (ENSACCG00020006092)	ENSACCG00020006081	CLU (ENSACCG00020006066)	SLC35F6 (ENSACCG00020006053) #18	KCNK3 (ENSACCG00020006041) #19	FAM166C (ENSACCG00020006030) #21	OTOF (ENSACCG00020005945) #22	SELENOI (ENSACCG00020005836) #24	ENSACCG00020005815	HADHB (ENSACCG00020005793)	HADHA (ENSACCG00020005747)	GAREM2 (ENSACCG00020005641)	RAB10 (ENSACCG00020005616)	KIF3C (ENSACCG00020005593)	ENSACCG00020005579	ASXL2 (ENSACCG00020005555)	ENSACCG00020015332	DNMT3A (ENSACCG00020015155)	DPYSL5 (ENSACCG00020015004) #16	MAPRE3 (ENSACCG00020014992) #15	TMEM214 (ENSACCG00020014942) #14	AGBL5 (ENSACCG00020014917) #13
Anura	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000164041	ENSGT01030000234597.a.b.a	ENSGT00940000157269.a.a	ENSGT00940000158299	ENSGT00940000158614	ENSGT00510000049722.b	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00720000108839	ENSGT00940000158598	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158238	ENSGT00530000063668.B	ENSGT00390000017237 #18	ENSGT00940000158248.b #19	ENSGT00940000166976	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00940000155731	ENSGT00940000161395	ENSGT00940000161541.d	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.u	ENSGT00940000156975.t.b	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.a.a	ENSGT00940000155459	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT00490000043329.a.b #15
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	7	ENSLLEG00000006115	ENSLLEG00000006153	ENSLLEG00000006193	ENSLLEG00000006204	ENSLLEG00000006220	ENSLLEG00000006239	ENSLLEG00000006254	ENSLLEG00000006290	ENSLLEG00000006308	ENSLLEG00000006324	ENSLLEG00000006342	ENSLLEG00000006364	ENSLLEG00000006401	ENSLLEG00000006419	ENSLLEG00000006452	OTOF (ENSLLEG00000006615) #22	DRC1 (ENSLLEG00000007838) #23	ENSLLEG00000008056	SELENOI (ENSLLEG00000008071) #24	KCNK3 (ENSLLEG00000008124) #19	ENSLLEG00000008139	SLC35F6 (ENSLLEG00000008151) #18	CLU (ENSLLEG00000008205)	ENSLLEG00000008263	ENSLLEG00000008270	SCARA3 (ENSLLEG00000008296)	CCDC25 (ENSLLEG00000008355)	ENSLLEG00000008416	ENSLLEG00000008468	ENSLLEG00000008483	ENSLLEG00000008526
Frog	MODERN SPECIES	5	t2r2 (ENSXETG00000042194)	tas2r7 (ENSXETG00000002135)	t2r5 (ENSXETG00000032235)	t2r6 (ENSXETG00000042642)	t2r3 (ENSXETG00000044474)	t2r8 (ENSXETG00000038186)	ccdc25 (ENSXETG00000044260)	scara3 (ENSXETG00000002137)	clu (ENSXETG00000047328)	ENSXETG00000049074	KCNK3 (ENSXETG00000045842) #19	ENSXETG00000042709	slc35f6 (ENSXETG00000047893) #18	ENSXETG00000049429	fam166c (ENSXETG00000031621)	otof (ENSXETG00000003330) #22	drc1 (ENSXETG00000003329) #23	selenoi (ENSXETG00000043213) #24	ENSXETG00000003326	ENSXETG00000042094	ENSXETG00000049341	ENSXETG00000003327	ENSXETG00000041889	ENSXETG00000003325	ENSXETG00000044030	ENSXETG00000046682	ENSXETG00000044681	ENSXETG00000043959	ENSXETG00000045623	ENSXETG00000044042	ENSXETG00000046462
Coelacanth	MODERN SPECIES	868										ENSLACG00000002297	NTAQ1 (ENSLACG00000004043)	FBXO32 (ENSLACG00000004890)	KLHL38 (ENSLACG00000006507)	ANXA13 (ENSLACG00000007200)	FAM91A1 (ENSLACG00000008831)	ENSLACG00000009937 #22	FER1L6 (ENSLACG00000011449)	ENSLACG00000012916	TMEM65 (ENSLACG00000014352)
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	1168																ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	949																ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	1188																ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155086.C #22
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155086.C #22
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	59	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00390000000663	ENSGT00940000161401	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00940000156693	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000180091	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00940000178209	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000180091	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00940000178209	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000180091	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00940000178209	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000173939	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000180091	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00940000178209	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000173939	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000180091	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000173939	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00940000176160	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000180091	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000173939	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000180091	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000173939	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809
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Otophysi	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155086.C #22
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155086.C #22
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155086.C #22
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155086.C #22
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	14	id2b (ENSSGRG00000040814)	rnf144ab (ENSSGRG00000040813)	sox11b (ENSSGRG00000040812)	allc (ENSSGRG00000040688)	rnaseh1 (ENSSGRG00000040687)	myt1la (ENSSGRG00000040685)	cep43 (ENSSGRG00000040684)	acbd3 (ENSSGRG00000040680)	NHSL1 (ENSSGRG00000040679)	hebp2 (ENSSGRG00000040677)	acat2 (ENSSGRG00000040620)	wtap (ENSSGRG00000040595)	sod2 (ENSSGRG00000040469)	ENSSGRG00000040450	ENSSGRG00000040448	ENSSGRG00000040440 #22	pdia6 (ENSSGRG00000039707)	hpcal1 (ENSSGRG00000039674)	apobb.1 (ENSSGRG00000039671)	slc22a16 (ENSSGRG00000039670)	sash1a (ENSSGRG00000039664)	SAMD5 (ENSSGRG00000039656)	stxbp5a (ENSSGRG00000039621)	ENSSGRG00000039602	rab32a (ENSSGRG00000039598)	GRM1 (ENSSGRG00000039593)	cd164 (ENSSGRG00000039591)	cep57l1 (ENSSGRG00000039586)	sesn1 (ENSSGRG00000039550)	ARMC2 (ENSSGRG00000039535)	foxo3b (ENSSGRG00000039532)
Cyclostomata	DUPLICATION
Cyclostomata	DUPLICATION
Cyclostomata	ANCESTRAL SPECIES	1196																ENSGT00940000155086.C.c.a #22	ENSGT00390000017802
Hagfish	DUPLICATION
Hagfish	MODERN SPECIES	684										ENSEBUG00000015103	alkbh7 (ENSEBUG00000005766)	ENSEBUG00000006445	ENSEBUG00000012483	ENSEBUG00000008491	ENSEBUG00000002914 ##22	ENSEBUG00000003273 #22	ENSEBUG00000012089 #22	ENSEBUG00000012420	ENSEBUG00000008381	ENSEBUG00000015551 ##11	ENSEBUG00000013744	ENSEBUG00000016151	ENSEBUG00000007154	elocb (ENSEBUG00000012727)	ube2wb (ENSEBUG00000014991)	MRPL13 (ENSEBUG00000007958)	ENSEBUG00000008872	ENSEBUG00000009777	ENSEBUG00000005247	RAE1 (ENSEBUG00000006793)	ENSEBUG00000007028
Hagfish	MODERN SPECIES	684									ENSEBUG00000015103	alkbh7 (ENSEBUG00000005766)	ENSEBUG00000006445	ENSEBUG00000012483	ENSEBUG00000008491	ENSEBUG00000002914 ##22	ENSEBUG00000003273 #22	ENSEBUG00000012089 #22	ENSEBUG00000012420	ENSEBUG00000008381	ENSEBUG00000015551 ##11	ENSEBUG00000013744	ENSEBUG00000016151	ENSEBUG00000007154	elocb (ENSEBUG00000012727)	ube2wb (ENSEBUG00000014991)	MRPL13 (ENSEBUG00000007958)	ENSEBUG00000008872	ENSEBUG00000009777	ENSEBUG00000005247	RAE1 (ENSEBUG00000006793)	ENSEBUG00000007028	ENSEBUG00000003787
Lamprey	MODERN SPECIES	2641																OTOF (ENSPMAG00000001492) #22
Cyclostomata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155086.C.c.b #22
Lamprey	DUPLICATION
Lamprey	MODERN SPECIES	617																ENSPMAG00000008043 #22
Lamprey	MODERN SPECIES	1170																ENSPMAG00000003981 #22
Cyclostomata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155086.C.d #22
Hagfish	MODERN SPECIES	65	ENSEBUG00000005596	ENSEBUG00000007264	ENSEBUG00000009156	romo1 (ENSEBUG00000000426)	ENSEBUG00000010717	ENSEBUG00000009764	ENSEBUG00000007039	psmc3 (ENSEBUG00000006111)	ENSEBUG00000003355	ENSEBUG00000012633	colgalt1b (ENSEBUG00000004269)	prpf6 (ENSEBUG00000008835)	ENSEBUG00000008899	ENSEBUG00000006236	ENSEBUG00000006755	ENSEBUG00000014496 #22	rnf139 (ENSEBUG00000016119)	ENSEBUG00000016681	ENSEBUG00000003572	ENSEBUG00000015221	ENSEBUG00000003600	pex3 (ENSEBUG00000015554)	ENSEBUG00000011910	ENSEBUG00000010477	ENSEBUG00000000604	ENSEBUG00000012977	ENSEBUG00000004927	ENSEBUG00000007045	ENSEBUG00000012845
Vertebrata	DUPLICATION
Vertebrata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155086.A ##22
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	166																ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00940000158032 #13	ENSGT00390000002693 #14	ENSGT00490000043329.a.b #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #16	ENSGT00940000155459	ENSGT00940000153897.b.a	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b	ENSGT00940000156975	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000154677	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00390000008161.b
Elephant shark	MODERN SPECIES	1563	laptm4a (ENSCMIG00000004662)	matn3b (ENSCMIG00000004669)	wdr35 (ENSCMIG00000004723)	TTC32 (ENSCMIG00000004884)	ENSCMIG00000004891	ENSCMIG00000004895	kcns3a (ENSCMIG00000004899)	ENSCMIG00000004904	rdh14b (ENSCMIG00000004906)	ENSCMIG00000004909	ENSCMIG00000004913	osr1 (ENSCMIG00000004915)	ENSCMIG00000004918	ENSCMIG00000004922	ENSCMIG00000004924	OTOF (ENSCMIG00000004944) ##22	drc1 (ENSCMIG00000004992) #23	selenoi (ENSCMIG00000004999) #24	agbl5 (ENSCMIG00000005007) #13	tmem214 (ENSCMIG00000005089) #14	ENSCMIG00000005355 #15	dpysl5a (ENSCMIG00000005360) #16	dnmt3aa (ENSCMIG00000005462)	dtnbb (ENSCMIG00000005805)	ASXL2 (ENSCMIG00000006187)	KIF3C (ENSCMIG00000006191)	rab10 (ENSCMIG00000006196)	GAREM2 (ENSCMIG00000006209)	hadhab (ENSCMIG00000006307)	hadhb (ENSCMIG00000006698)	ENSCMIG00000006739
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a	ENSGT00940000156618	ENSGT01050000244824.B	ENSGT00940000159860	ENSGT00530000063834.e.a	ENSGT00940000166646	ENSGT00940000159556	ENSGT00940000166855	ENSGT00520000055578.a.a.d	ENSGT00940000159992	ENSGT00940000153897.a	ENSGT00490000043329.a.a.b ##15	ENSGT00940000166976	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00390000014654	ENSGT00940000163032	ENSGT00940000155633.D	ENSGT01050000244824.A	ENSGT00740000115534.a.b	ENSGT00940000154681.a	ENSGT00950000182863.B.a	ENSGT00940000163562	ENSGT00950000183032.A.a	ENSGT00940000159905	ENSGT00940000159969.a	ENSGT00390000015871	ENSGT00940000161936
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000153229.A.a.b	ENSGT00940000158138	ENSGT01100000263524.B.b.b	ENSGT00390000000568	ENSGT00950000182909.b.a.a	ENSGT00950000183111.b.a	ENSGT00530000063834.e.a	ENSGT00940000166646	ENSGT00940000159556	ENSGT00940000166855	ENSGT00520000055578.a.a.d	ENSGT00940000159992	ENSGT00940000153897.a	ENSGT00490000043329.a.a.b ##15	ENSGT00940000166976	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00390000014654	ENSGT00940000163032	ENSGT00940000155633.D	ENSGT01050000244824.A	ENSGT00740000115534.a.b	ENSGT00940000154681.a	ENSGT00950000182863.B.a	ENSGT00940000163562	ENSGT00950000183032.A.a	ENSGT00940000159905	ENSGT00940000159969.a	ENSGT00390000015871	ENSGT00940000161936
Coelacanth	MODERN SPECIES	304														ENSLACG00000017917	ENSLACG00000017832	OTOF (ENSLACG00000017144) ##22	DRC1 (ENSLACG00000016984) #23	AGBL5 (ENSLACG00000016671) #13	TMEM214 (ENSLACG00000016457) #14	ENSLACG00000016441	MAPRE3 (ENSLACG00000015913) #15	LAMA4 (ENSLACG00000015059)	TUBE1 (ENSLACG00000014820)	CCN6 (ENSLACG00000014733)	FYN (ENSLACG00000012800)	ENSLACG00000012499	ENSLACG00000011895	ENSLACG00000009876	ENSLACG00000008590	MFSD4B (ENSLACG00000008157)	SLC16A10 (ENSLACG00000006659)
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00950000182909.b.a.a.cb	ENSGT00950000182909.b.a.a.db	ENSGT00950000183111.b.a	ENSGT00940000156618	ENSGT01050000244824.B	ENSGT00940000159860	ENSGT00530000063834.e.a	ENSGT00940000166646	ENSGT00940000159556	ENSGT00940000166855	ENSGT00520000055578.a.a.d	ENSGT00940000159992	ENSGT00940000153897.a	ENSGT00490000043329.a.a.b ##15	ENSGT00940000166976	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00950000183117.b #24	ENSGT00390000014654	ENSGT00940000163032	ENSGT00940000155633.D	ENSGT01050000244824.A	ENSGT00740000115534.a.b	ENSGT00940000154681.a	ENSGT00950000182863.B.a	ENSGT00940000163562	ENSGT00950000183032.A.b.a	ENSGT00940000159905	ENSGT00940000159969.a	ENSGT00390000015871	ENSGT00940000161936
Reedfish	MODERN SPECIES	11	taf5l (ENSECRG00000003887)	urb2 (ENSECRG00000003894)	galnt2 (ENSECRG00000003902)	ENSECRG00000003911	ENSECRG00000003918	ENSECRG00000003922	ENSECRG00000004012	ENSECRG00000004645	ENSECRG00000004658	elp3 (ENSECRG00000004675)	pnocb (ENSECRG00000004687)	paqr8 (ENSECRG00000004701)	ENSECRG00000004707	slc35f6 (ENSECRG00000004715) #18	ENSECRG00000004724	OTOF (ENSECRG00000004771) ##22	drc1 (ENSECRG00000004920) #23	selenoi (ENSECRG00000004933) #24	ost4 (ENSECRG00000004939) #12	tmem214 (ENSECRG00000004956) #14	mapre3b (ENSECRG00000004993) #15	dpysl5a (ENSECRG00000005012) #16	eprs1 (ENSECRG00000000673)	ENSECRG00000000747	spdya (ENSECRG00000000770)	ENSECRG00000000789	wdr43 (ENSECRG00000000818)	agbl5 (ENSECRG00000000857) #13	zgc:112001 (ENSECRG00000000876)	ENSECRG00000000922	ENSECRG00000000962
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	88	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000159413	ENSGT00950000183215.c.a.a	ENSGT00940000164948	ENSGT00950000183163.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a	ENSGT00950000182985.b.a	ENSGT00390000004348	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.A ##22
Spotted gar	MODERN SPECIES	647	ahi1 (ENSLOCG00000016215)	PDE7B (ENSLOCG00000016213)	mtfr2 (ENSLOCG00000016211)	armc1l (ENSLOCG00000016210)	BCLAF1 (ENSLOCG00000016208)	ENSLOCG00000016206	MAP7 (ENSLOCG00000016205)	ppp1r14c (ENSLOCG00000016203)	iyd (ENSLOCG00000016202)	PLEKHG1 (ENSLOCG00000016199)	tcp1 (ENSLOCG00000016197)	acat2 (ENSLOCG00000016193)	wtap (ENSLOCG00000016191)	sod2 (ENSLOCG00000016188)	FNDC1 (ENSLOCG00000016185)	OTOF (ENSLOCG00000016183) ##22	drc1 (ENSLOCG00000016179) #23	selenoi (ENSLOCG00000016178) #24	ost4 (ENSLOCG00000017994) #12	agbl5 (ENSLOCG00000016175) #13	UTRN (ENSLOCG00000016162)	ENSLOCG00000016161	EPM2A (ENSLOCG00000016158)	fbxo30a (ENSLOCG00000016157)	ENSLOCG00000016156	SHPRH (ENSLOCG00000016153)	GRM1 (ENSLOCG00000016149)	rab32a (ENSLOCG00000016148)	ADGB (ENSLOCG00000016140)	stxbp5a (ENSLOCG00000016129)	SAMD5 (ENSLOCG00000016128)
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	402											ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000176900	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00940000153804.A #23
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	104	ENSGT00950000183204.b.b.a	ENSGT00390000010101	ENSGT00940000153467.a.a	ENSGT01050000244948.c.b.a.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.a	ENSGT00940000157477	ENSGT00730000111244.a.b	ENSGT00940000158401	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00960000191541	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156484.b.e.a	ENSGT01100000263861
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00730000111244.a.a	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000163723.B	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00730000111244.a.a	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000163723.B	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00730000111244.a.a	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	14	fbxo30a (ENSMMDG00005023474)	stx11a (ENSMMDG00005023475)	STX11 (ENSMMDG00005023478)	ENSMMDG00005023480	ENSMMDG00005023481	rmnd1 (ENSMMDG00005023488)	ENSMMDG00005023534	ENSMMDG00005023573	ENSMMDG00005023673	TULP4 (ENSMMDG00005023675)	slc18b1 (ENSMMDG00005023679)	ahi1 (ENSMMDG00005023691)	ENSMMDG00005023695	ENSMMDG00005023698	ENSMMDG00005023707	OTOF (ENSMMDG00005023720) ##22	mapre3a (ENSMMDG00005023738) #15	dpysl5a (ENSMMDG00005023741) #16	dnmt3ab (ENSMMDG00005023789)	dtnbb (ENSMMDG00005024212)	ASXL2 (ENSMMDG00005024218)	kif3cb (ENSMMDG00005024221)	hadhab (ENSMMDG00005024249)	RPS6KA5 (ENSMMDG00005024442)	mbip (ENSMMDG00005024485)	nkx2.1 (ENSMMDG00005024488)	NKX2-8 (ENSMMDG00005024489)	pax9 (ENSMMDG00005024490)	slc25a21 (ENSMMDG00005024491)	plekhh1 (ENSMMDG00005024494)	zfp36l1a (ENSMMDG00005024497)
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00730000111244.a.a	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000176900.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	399	ube2d3 (ENSHCOG00000011883)	ENSHCOG00000011857	ENSHCOG00000011849	CPXM1 (ENSHCOG00000011844)	wdr32 (ENSHCOG00000011821)	rmnd1 (ENSHCOG00000011799)	ENSHCOG00000011776	ENSHCOG00000011747	ENSHCOG00000011727	ENSHCOG00000011642	ENSHCOG00000011630	ENSHCOG00000011597	TULP4 (ENSHCOG00000011585)	slc18b1 (ENSHCOG00000011551)	ahi1 (ENSHCOG00000011539)	OTOF (ENSHCOG00000011514) ##22	DCTN1 (ENSHCOG00000011466)	NANOS1 (ENSHCOG00000011423)	si:dkey-33c12.3 (ENSHCOG00000011415)	mrps26 (ENSHCOG00000011405)	loxl3b (ENSHCOG00000011391)	pank2 (ENSHCOG00000011357)	ENSHCOG00000011330	ENSHCOG00000011319	ENSHCOG00000011316	ENSHCOG00000011306	emx1 (ENSHCOG00000011298)	noto (ENSHCOG00000011295)	ENSHCOG00000011279	ap5s1 (ENSHCOG00000011270)
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00730000111123	ENSGT00940000163723.B	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00730000111123	ENSGT00940000163723.B	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.d	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456	ENSGT00940000155076.a.d
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Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01030000234595.A.b.a.a	ENSGT00730000111123	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00730000111244.a.a	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000177261	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00510000048701.b	ENSGT00950000182906.b.a.i.a	ENSGT01030000234595.A.b.a.a	ENSGT00730000111123	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000177671	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000177261	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456
Climbing perch	MODERN SPECIES	13	ENSATEG00000001780	STXBP5 (ENSATEG00000001801)	GRM1 (ENSATEG00000001983)	ENSATEG00000002015	fbxo30a (ENSATEG00000002153)	stx11a (ENSATEG00000002167)	ENSATEG00000028434	rmnd1 (ENSATEG00000002208)	CCDC170 (ENSATEG00000002214)	ENSATEG00000002813	ENSATEG00000002836	slc18b1 (ENSATEG00000002932)	ahi1 (ENSATEG00000002948)	ENSATEG00000002965	ENSATEG00000029892	ENSATEG00000002991 ##22	mapre3a (ENSATEG00000003194) #15	dpysl5a (ENSATEG00000003213) #16	dnmt3ab (ENSATEG00000003305)	dtnbb (ENSATEG00000003325)	ENSATEG00000003374	kif3cb (ENSATEG00000003388)	ENSATEG00000003592	ENSATEG00000003636	mbip (ENSATEG00000004129)	nkx2.1 (ENSATEG00000004137)	NKX2-8 (ENSATEG00000004236)	pax9 (ENSATEG00000004252)	slc25a21 (ENSATEG00000004294)	plekhh1 (ENSATEG00000004373)	zfp36l1a (ENSATEG00000004546)
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	12	ENSBSLG00000026580	SAMD5 (ENSBSLG00000026579)	STXBP5 (ENSBSLG00000026567)	GRM1 (ENSBSLG00000026559)	SHPRH (ENSBSLG00000026543)	fbxo30a (ENSBSLG00000026541)	stx11a (ENSBSLG00000026540)	ENSBSLG00000026539	rmnd1 (ENSBSLG00000026537)	ENSBSLG00000026480	TULP4 (ENSBSLG00000026478)	slc18b1 (ENSBSLG00000026452)	ahi1 (ENSBSLG00000026441)	ENSBSLG00000026440	ENSBSLG00000026433	OTOF (ENSBSLG00000026418) ##22	mapre3a (ENSBSLG00000026411) #15	dpysl5a (ENSBSLG00000026409) #16	dnmt3ab (ENSBSLG00000026316)	dtnbb (ENSBSLG00000026254)	ASXL2 (ENSBSLG00000026228)	ENSBSLG00000026222	kif3cb (ENSBSLG00000026213)	hadhab (ENSBSLG00000026039)	RPS6KA5 (ENSBSLG00000025788)	mbip (ENSBSLG00000025724)	nkx2.1 (ENSBSLG00000025719)	NKX2-8 (ENSBSLG00000025715)	pax9 (ENSBSLG00000025706)	slc25a21 (ENSBSLG00000025690)	plekhh1 (ENSBSLG00000025489)
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	14	RAB32 (ENSMAMG00000000238)	GRM1 (ENSMAMG00000000239)	SHPRH (ENSMAMG00000000240)	fbxo30a (ENSMAMG00000000242)	stx11a (ENSMAMG00000000243)	ENSMAMG00000000244	ENSMAMG00000000245	rmnd1 (ENSMAMG00000000246)	ENSMAMG00000024394	ENSMAMG00000000252	ENSMAMG00000000253	slc18b1 (ENSMAMG00000000254)	ahi1 (ENSMAMG00000000255)	ENSMAMG00000000256	ENSMAMG00000000257	ENSMAMG00000000258 ##22	mapre3a (ENSMAMG00000000259) #15	dpysl5a (ENSMAMG00000000260) #16	dnmt3ab (ENSMAMG00000000261)	dtnbb (ENSMAMG00000000262)	ENSMAMG00000000263	kif3cb (ENSMAMG00000000264)	ENSMAMG00000000265	ENSMAMG00000000266	mbip (ENSMAMG00000000267)	nkx2.1 (ENSMAMG00000000268)	NKX2-8 (ENSMAMG00000000269)	pax9 (ENSMAMG00000000270)	slc25a21 (ENSMAMG00000000271)	plekhh1 (ENSMAMG00000000272)	zfp36l1a (ENSMAMG00000000274)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000163723.B	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000177261	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT01030000234595.A.b.a.a	ENSGT00730000111123	ENSGT00940000163723.B	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000177261	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456
Turbot	MODERN SPECIES	8	ddo (ENSSMAG00000014322)	ENSSMAG00000014292	ENSSMAG00000014182	GRM1 (ENSSMAG00000014159)	SHPRH (ENSSMAG00000014003)	fbxo30a (ENSSMAG00000013985)	stx11a (ENSSMAG00000013967)	ENSSMAG00000036493	rmnd1 (ENSSMAG00000013954)	CCDC170 (ENSSMAG00000013942)	ENSSMAG00000013685	ENSSMAG00000013654	slc18b1 (ENSSMAG00000013619)	ahi1 (ENSSMAG00000013582)	ENSSMAG00000013554	ENSSMAG00000013449 ##22	mapre3a (ENSSMAG00000013407) #15	dpysl5a (ENSSMAG00000013343) #16	dnmt3ab (ENSSMAG00000013252)	dtnbb (ENSSMAG00000013199)	ENSSMAG00000013191	ENSSMAG00000013185	kif3cb (ENSSMAG00000013180)	ENSSMAG00000013122	ENSSMAG00000013089	mbip (ENSSMAG00000013076)	nkx2.1 (ENSSMAG00000013068)	NKX2-8 (ENSSMAG00000013053)	pax9 (ENSSMAG00000013048)	slc25a21 (ENSSMAG00000012977)	plekhh1 (ENSSMAG00000012824)
Tongue sole	MODERN SPECIES		slc25a21 (ENSCSEG00000006956)	pax9 (ENSCSEG00000006934)	NKX2-8 (ENSCSEG00000006926)	nkx2.1 (ENSCSEG00000006924)	mbip (ENSCSEG00000006916)	ENSCSEG00000006904	ENSCSEG00000006899	rmnd1 (ENSCSEG00000006888)	SYNE1 (ENSCSEG00000006808)	ENSCSEG00000006792	ENSCSEG00000006735	ENSCSEG00000006723	TULP4 (ENSCSEG00000006683)	slc18b1 (ENSCSEG00000006659)	ahi1 (ENSCSEG00000006633)	OTOF (ENSCSEG00000006592) ##22	mapre3a (ENSCSEG00000006565) #15	dpysl5a (ENSCSEG00000006551) #16	dnmt3ab (ENSCSEG00000006540)	dtnbb (ENSCSEG00000006526)	ENSCSEG00000006518	ENSCSEG00000006512	hadhab (ENSCSEG00000006477)	RPS6KA5 (ENSCSEG00000006322)	stx11a (ENSCSEG00000005503)	fbxo30a (ENSCSEG00000005500)	ENSCSEG00000005493	SHPRH (ENSCSEG00000005452)	GRM1 (ENSCSEG00000005446)	ola1 (ENSCSEG00000005434)	ENSCSEG00000005431
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000163723.B	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456	ENSGT00940000155076.a.d
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00730000111123	ENSGT00940000163723.B	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456	ENSGT00940000155076.a.d
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3025	GRM1 (ENSSLDG00000001554)	SHPRH (ENSSLDG00000001424)	ENSSLDG00000001376	fbxo30a (ENSSLDG00000001360)	stx11a (ENSSLDG00000001322)	STX11 (ENSSLDG00000001288)	ENSSLDG00000001245	rmnd1 (ENSSLDG00000001227)	ENSSLDG00000001050	ENSSLDG00000000644	ENSSLDG00000000580	TULP4 (ENSSLDG00000000571)	slc18b1 (ENSSLDG00000000561)	ahi1 (ENSSLDG00000000492)	ENSSLDG00000000440	OTOF (ENSSLDG00000000261) ##22	ENSSLDG00000000238	ENSSLDG00000000229	ENSSLDG00000000197	ENSSLDG00000000182	ENSSLDG00000000168	ENSSLDG00000000146	ENSSLDG00000000078	pak2a (ENSSLDG00000024352)	ENSSLDG00000024346	HLTF (ENSSLDG00000024327)	gyg1a (ENSSLDG00000024264)	pls1 (ENSSLDG00000024235)	ENSSLDG00000024227	ATR (ENSSLDG00000024203)	ENSSLDG00000023972
Greater amberjack	MODERN SPECIES	62	fbxo30a (ENSSDUG00000008292)	stx11a (ENSSDUG00000008303)	STX11 (ENSSDUG00000008320)	ENSSDUG00000008336	rmnd1 (ENSSDUG00000008364)	ENSSDUG00000008386	ENSSDUG00000008403	ENSSDUG00000008466	ENSSDUG00000008552	ENSSDUG00000008669	TULP4 (ENSSDUG00000008680)	slc18b1 (ENSSDUG00000008721)	ahi1 (ENSSDUG00000008760)	ENSSDUG00000008815	ENSSDUG00000008844	OTOF (ENSSDUG00000008908) ##22	mapre3a (ENSSDUG00000008998) #15	dpysl5a (ENSSDUG00000009017) #16	dnmt3ab (ENSSDUG00000009066)	ENSSDUG00000009225	dtnbb (ENSSDUG00000009232)	ENSSDUG00000009262	kif3cb (ENSSDUG00000009283)	hadhab (ENSSDUG00000009305)	RPS6KA5 (ENSSDUG00000009386)	mbip (ENSSDUG00000009420)	nkx2.1 (ENSSDUG00000009444)	NKX2-8 (ENSSDUG00000009451)	pax9 (ENSSDUG00000009460)	slc25a21 (ENSSDUG00000009483)	plekhh1 (ENSSDUG00000009551)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	367	GRM1 (ENSLCAG00010019829)	SHPRH (ENSLCAG00010019772)	fbxo30a (ENSLCAG00010019750)	stx11a (ENSLCAG00010019747)	STX11 (ENSLCAG00010019742)	ENSLCAG00010019738	rmnd1 (ENSLCAG00010019723)	ENSLCAG00010019717	ENSLCAG00010019681	ENSLCAG00010019674	TULP4 (ENSLCAG00010019671)	slc18b1 (ENSLCAG00010019665)	ahi1 (ENSLCAG00010019649)	ENSLCAG00010019643	ENSLCAG00010019638	OTOF (ENSLCAG00010019550) ##22	mapre3a (ENSLCAG00010019515) #15	dpysl5a (ENSLCAG00010019496) #16	dnmt3ab (ENSLCAG00010018846)
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00730000111123	ENSGT00940000163723.B	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.d	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456	ENSGT00940000155076.a.d
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00730000111123	ENSGT00940000163723.B	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.d	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456	ENSGT00940000155076.a.d
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	19	SHPRH (ENSLBEG00000005117)	ENSLBEG00000005160	fbxo30a (ENSLBEG00000005183)	stx11a (ENSLBEG00000005213)	ENSLBEG00000005240	ENSLBEG00000005267	rmnd1 (ENSLBEG00000005300)	ENSLBEG00000005330	ENSLBEG00000005445	ENSLBEG00000005912	TULP4 (ENSLBEG00000005982)	slc18b1 (ENSLBEG00000006089)	ahi1 (ENSLBEG00000006126)	ENSLBEG00000006215	ENSLBEG00000006260	OTOF (ENSLBEG00000006321) ##22	mapre3a (ENSLBEG00000006445) #15	dpysl5a (ENSLBEG00000006483) #16	dnmt3ab (ENSLBEG00000006546)	dtnbb (ENSLBEG00000006630)	ENSLBEG00000006710	kif3cb (ENSLBEG00000006751)	hadhab (ENSLBEG00000006817)	RPS6KA5 (ENSLBEG00000007107)	mbip (ENSLBEG00000007778)	nkx2.1 (ENSLBEG00000007839)	NKX2-8 (ENSLBEG00000007852)	pax9 (ENSLBEG00000007878)	slc25a21 (ENSLBEG00000007921)	plekhh1 (ENSLBEG00000007962)	zfp36l1a (ENSLBEG00000008102)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00730000111123	ENSGT00940000163723.B	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.d	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456	ENSGT00940000155076.a.d
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00730000111123	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00730000111244.a.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.d	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000177671	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456	ENSGT00940000155076.a.d
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000162477.d	ENSGT01030000234595.A.b.a.a	ENSGT00730000111123	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT00730000111244.a.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.d	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000177671	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000177261	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456
Stickleback	MODERN SPECIES	15	SAMD5 (ENSGACG00000011624)	STXBP5 (ENSGACG00000011612)	RAB32 (ENSGACG00000011607)	GRM1 (ENSGACG00000011598)	SHPRH (ENSGACG00000011582)	fbxo30a (ENSGACG00000011577)	stx11a (ENSGACG00000011576)	ENSGACG00000011575	rmnd1 (ENSGACG00000011566)	ENSGACG00000011565	ENSGACG00000011511	TULP4 (ENSGACG00000011498)	slc18b1 (ENSGACG00000011487)	ahi1 (ENSGACG00000011481)	ENSGACG00000011476	OTOF (ENSGACG00000011463) ##22	mapre3a (ENSGACG00000011419) #15	dpysl5a (ENSGACG00000011401) #16	dnmt3ab (ENSGACG00000011391)	dtnbb (ENSGACG00000011386)	ENSGACG00000011377	kif3cb (ENSGACG00000011361)	hadhab (ENSGACG00000011314)	RPS6KA5 (ENSGACG00000011310)	mbip (ENSGACG00000011304)	nkx2.1 (ENSGACG00000011301)	NKX2-8 (ENSGACG00000011300)	pax9 (ENSGACG00000011298)	slc25a21 (ENSGACG00000011289)	plekhh1 (ENSGACG00000011275)	zfp36l1a (ENSGACG00000011271)
Lumpfish	MODERN SPECIES	14	ifi44c2 (ENSCLMG00005017280)	GADD45B (ENSCLMG00005017279)	gng7 (ENSCLMG00005017278)	diras1b (ENSCLMG00005017277)	zgc:101744 (ENSCLMG00005017275)	ENSCLMG00005017273	ENSCLMG00005017272	rmnd1 (ENSCLMG00005017168)	ENSCLMG00005017166	ENSCLMG00005017008	ENSCLMG00005017003	TULP4 (ENSCLMG00005017001)	slc18b1 (ENSCLMG00005016823)	ahi1 (ENSCLMG00005016819)	ENSCLMG00005016816	OTOF (ENSCLMG00005016815) ##22	mapre3a (ENSCLMG00005016809) #15	dpysl5a (ENSCLMG00005016807) #16	ENSCLMG00005015971	dtnbb (ENSCLMG00005015957)	ENSCLMG00005015955	ENSCLMG00005015953	kif3cb (ENSCLMG00005015933)	hadhab (ENSCLMG00005014913)	RPS6KA5 (ENSCLMG00005012485)	mbip (ENSCLMG00005012468)	nkx2.1 (ENSCLMG00005012467)	NKX2-8 (ENSCLMG00005012466)	pax9 (ENSCLMG00005012465)	slc25a21 (ENSCLMG00005012464)	plekhh1 (ENSCLMG00005011709)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000162477.d	ENSGT01030000234595.A.b.a.a	ENSGT00730000111123	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00730000111244.a.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000177671	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456	ENSGT00940000155076.a.d
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	14	MDGA2 (ENSCGOG00000020243)	slc3a2b (ENSCGOG00000020793)	lrrc57 (ENSCGOG00000020832)	tyro3 (ENSCGOG00000020834)	ENSCGOG00000020858	ENSCGOG00000020860	ENSCGOG00000020864	ENSCGOG00000020884	atg14 (ENSCGOG00000020885)	tbpl2 (ENSCGOG00000020891)	jmjd7 (ENSCGOG00000020893)	lgals3b (ENSCGOG00000020931)	dact1 (ENSCGOG00000020934)	ENSCGOG00000020943	ENSCGOG00000020948	OTOF (ENSCGOG00000020965) ##22	mapre3a (ENSCGOG00000020998) #15	dpysl5a (ENSCGOG00000021008) #16	dnmt3ab (ENSCGOG00000021228)	dtnbb (ENSCGOG00000022062)	ENSCGOG00000022905	kif3cb (ENSCGOG00000022910)	hadhab (ENSCGOG00000022932)	RPS6KA5 (ENSCGOG00000023253)	mbip (ENSCGOG00000023387)	nkx2.1 (ENSCGOG00000023391)	NKX2-8 (ENSCGOG00000023392)	pax9 (ENSCGOG00000023394)	slc25a21 (ENSCGOG00000023396)	plekhh1 (ENSCGOG00000023407)	zfp36l1a (ENSCGOG00000023421)
Pike perch	MODERN SPECIES	24	SASH1 (ENSSLUG00000017859)	STXBP5 (ENSSLUG00000017932)	RAB32 (ENSSLUG00000018749)	GRM1 (ENSSLUG00000018756)	SHPRH (ENSSLUG00000018810)	fbxo30a (ENSSLUG00000019043)	stx11a (ENSSLUG00000019046)	ENSSLUG00000019049	ENSSLUG00000005192	rmnd1 (ENSSLUG00000005236)	ENSSLUG00000006118	TULP4 (ENSSLUG00000006124)	slc18b1 (ENSSLUG00000006148)	ahi1 (ENSSLUG00000006194)	ENSSLUG00000006217	OTOF (ENSSLUG00000006244) ##22	mapre3a (ENSSLUG00000006330) #15	dpysl5a (ENSSLUG00000006346) #16	dnmt3ab (ENSSLUG00000006723)	dtnbb (ENSSLUG00000011084)	ASXL2 (ENSSLUG00000012282)	kif3cb (ENSSLUG00000012288)	hadhab (ENSSLUG00000012414)	RPS6KA5 (ENSSLUG00000014728)	mbip (ENSSLUG00000014909)	nkx2.1 (ENSSLUG00000014925)	NKX2-8 (ENSSLUG00000014930)	pax9 (ENSSLUG00000014936)	slc25a21 (ENSSLUG00000014952)	plekhh1 (ENSSLUG00000014985)	zfp36l1a (ENSSLUG00000015616)
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00730000111123	ENSGT00940000163723.B	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.d	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456	ENSGT00940000155076.a.d
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	7	ENSSAUG00010002213	ENSSAUG00010001859	atg9a (ENSSAUG00010001736)	ENSSAUG00010001678	ENSSAUG00010001673	ENSSAUG00010001666	ENSSAUG00010001659	ENSSAUG00010001650	ENSSAUG00010001643	ENSSAUG00010001628	ENSSAUG00010001620	ENSSAUG00010027567	ENSSAUG00010027566	ENSSAUG00010027563	ENSSAUG00010027551	OTOF (ENSSAUG00010027544) ##22	mapre3a (ENSSAUG00010027541) #15	dpysl5a (ENSSAUG00010027540) #16	dnmt3ab (ENSSAUG00010027489)	dtnbb (ENSSAUG00010027397)	ASXL2 (ENSSAUG00010027369)	ENSSAUG00010027367	kif3cb (ENSSAUG00010027366)	hadhab (ENSSAUG00010027297)	RPS6KA5 (ENSSAUG00010027264)	mbip (ENSSAUG00010027255)	nkx2.1 (ENSSAUG00010027253)	NKX2-8 (ENSSAUG00010027251)	pax9 (ENSSAUG00010027247)	slc25a21 (ENSSAUG00010027240)	plekhh1 (ENSSAUG00010027228)
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00730000111123	ENSGT00940000163723.B	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.d	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456	ENSGT00940000155076.a.d
European seabass	MODERN SPECIES	2	SHPRH (ENSDLAG00005023598)	ENSDLAG00005030518	fbxo30a (ENSDLAG00005023587)	stx11a (ENSDLAG00005030078)	ENSDLAG00005023581	ENSDLAG00005023578	rmnd1 (ENSDLAG00005033321)	ENSDLAG00005023541	ENSDLAG00005021184	ENSDLAG00005021257	ENSDLAG00005021165	slc18b1 (ENSDLAG00005021061)	ahi1 (ENSDLAG00005021046)	ENSDLAG00005021032	ENSDLAG00005021018	ENSDLAG00005020695 ##22	mapre3a (ENSDLAG00005020660) #15	dpysl5a (ENSDLAG00005020641) #16	dnmt3ab (ENSDLAG00005018806)	dtnbb (ENSDLAG00005017872)	ENSDLAG00005017635	ENSDLAG00005015355	ENSDLAG00005014918	mbip (ENSDLAG00005034945)	nkx2.1 (ENSDLAG00005030104)	NKX2-8 (ENSDLAG00005014816)	pax9 (ENSDLAG00005014769)	slc25a21 (ENSDLAG00005014733)	plekhh1 (ENSDLAG00005013498)	zfp36l1a (ENSDLAG00005013440)	tmem229b (ENSDLAG00005034642)
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	495	GRM1 (ENSLCRG00005014978)	SHPRH (ENSLCRG00005014966)	fbxo30a (ENSLCRG00005014964)	stx11a (ENSLCRG00005014963)	ENSLCRG00005014962	ENSLCRG00005014957	rmnd1 (ENSLCRG00005014948)	ENSLCRG00005014947	ENSLCRG00005014854	TULP4 (ENSLCRG00005014829)	slc18b1 (ENSLCRG00005014670)	ahi1 (ENSLCRG00005014664)	ENSLCRG00005014663	ENSLCRG00005014662	ENSLCRG00005014661	OTOF (ENSLCRG00005014657) ##22	mapre3a (ENSLCRG00005014652) #15	dpysl5a (ENSLCRG00005014646) #16	dnmt3ab (ENSLCRG00005012433)	dtnbb (ENSLCRG00005012399)	ENSLCRG00005012395	ENSLCRG00005012392	kif3cb (ENSLCRG00005012391)	hadhab (ENSLCRG00005009284)	RPS6KA5 (ENSLCRG00005007544)	mbip (ENSLCRG00005007502)	nkx2.1 (ENSLCRG00005007500)	NKX2-8 (ENSLCRG00005007498)	pax9 (ENSLCRG00005007497)	slc25a21 (ENSLCRG00005007494)	plekhh1 (ENSLCRG00005007422)
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT01030000234595.A.b.a.a	ENSGT00730000111123	ENSGT00940000163723.B	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000154481.a.a.d	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509.m	ENSGT00940000177671	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456	ENSGT00940000155076.a.d
Tetraodon	MODERN SPECIES	1	RAB32 (ENSTNIG00000019308)	GRM1 (ENSTNIG00000019307)	SHPRH (ENSTNIG00000019306)	ENSTNIG00000019305	fbxo30a (ENSTNIG00000019304)	stx11a (ENSTNIG00000019303)	STX11 (ENSTNIG00000019302)	rmnd1 (ENSTNIG00000019301)	ENSTNIG00000019300	ENSTNIG00000019299	ENSTNIG00000019298	TULP4 (ENSTNIG00000019297)	slc18b1 (ENSTNIG00000019296)	ahi1 (ENSTNIG00000019295)	ENSTNIG00000019294	OTOF (ENSTNIG00000019293) ##22	mapre3a (ENSTNIG00000019292) #15	dpysl5a (ENSTNIG00000019291) #16	dnmt3ab (ENSTNIG00000019290)	dtnbb (ENSTNIG00000019289)	ENSTNIG00000019288	kif3cb (ENSTNIG00000019287)	hadhab (ENSTNIG00000019286)	RPS6KA5 (ENSTNIG00000019285)	pax9 (ENSTNIG00000019284)	slc25a21 (ENSTNIG00000019283)	plekhh1 (ENSTNIG00000019282)	kmt2a (ENSTNIG00000019281)	UBE4A (ENSTNIG00000019280)	ENSTNIG00000019279	im:7138535 (ENSTNIG00000019278)
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000176900.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000176900.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456	ENSGT00940000155076.a.d
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00730000111123	ENSGT00940000163723.B	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456	ENSGT00940000155076.a.d
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000163723.B	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674.e	ENSGT00940000156674.f	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00950000182988.a.a.a	ENSGT00910000144305	ENSGT00940000154674.q.a	ENSGT00950000183097.a.b	ENSGT00940000155714	ENSGT00940000155667.b.b	ENSGT00940000153249.b.d.a	ENSGT00950000182972.a.a.a.b	ENSGT00940000157741	ENSGT00390000016814.b	ENSGT01070000253816.b.d	ENSGT00940000156699.j	ENSGT00940000154659.b	ENSGT00940000157005	ENSGT01100000263484.C.b.a.b
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000163723.B	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674.e	ENSGT00940000156674.f	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00950000182988.a.a.a	ENSGT00910000144305	ENSGT00940000154674.q.a	ENSGT00950000183097.a.b	ENSGT00940000155714	ENSGT00940000155667.b.b	ENSGT00940000153249.b.d.a	ENSGT00950000182972.a.a.a.b	ENSGT00940000157741	ENSGT00390000016814.b	ENSGT01070000253816.b.d	ENSGT00940000156699.j	ENSGT00940000154659.b	ENSGT00940000157005	ENSGT01100000263484.C.b.a.b
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000163723.B	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674.e	ENSGT00940000156674.f	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00950000182988.a.a.a	ENSGT00910000144305	ENSGT00940000154674.q.a	ENSGT00950000183097.a.b	ENSGT00940000155714	ENSGT00940000155667.b.b	ENSGT00940000153249.b.d.a	ENSGT00950000182972.a.a.a.b	ENSGT00940000157741	ENSGT00390000016814.b	ENSGT01070000253816.b.d	ENSGT00940000156699.j	ENSGT00940000154659.b	ENSGT00940000157005	ENSGT01100000263484.C.b.a.b
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000163723.B	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674.e	ENSGT00940000156674.f	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00950000182988.a.a.a	ENSGT00910000144305	ENSGT00940000154674.q.a	ENSGT00950000183097.a.b	ENSGT00940000155714	ENSGT00940000155667.b.b	ENSGT00940000153249.b.d.a	ENSGT00950000182972.a.a.a.b	ENSGT00940000157741	ENSGT00390000016814.b	ENSGT01070000253816.b.d	ENSGT00940000156699.j	ENSGT00940000154659.b	ENSGT00940000157005	ENSGT01100000263484.C.b.a.b
P. nyererei	MODERN SPECIES	365	SHPRH (ENSPNYG00000007961)	ENSPNYG00000007925	fbxo30a (ENSPNYG00000007917)	stx11a (ENSPNYG00000007898)	STX11 (ENSPNYG00000007873)	ENSPNYG00000007861	rmnd1 (ENSPNYG00000007846)	ENSPNYG00000007822	ENSPNYG00000007504	ENSPNYG00000007459	TULP4 (ENSPNYG00000007409)	slc18b1 (ENSPNYG00000007367)	slc18b1 (ENSPNYG00000007333)	ahi1 (ENSPNYG00000007279)	ENSPNYG00000007237	OTOF (ENSPNYG00000007145) ##22	pak2a (ENSPNYG00000007078)	HLTF (ENSPNYG00000007026)	gyg1a (ENSPNYG00000006995)	pls1 (ENSPNYG00000006960)	ATR (ENSPNYG00000006873)	ENSPNYG00000006762	ENSPNYG00000006732	STAG1 (ENSPNYG00000006642)	pccb (ENSPNYG00000006591)	MSL2 (ENSPNYG00000006581)	tnfsf10 (ENSPNYG00000006557)	nceh1a (ENSPNYG00000006555)	PPP2R3A (ENSPNYG00000006535)	fndc3ba (ENSPNYG00000006456)	ghsra (ENSPNYG00000006289)
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674.e	ENSGT00950000183016.D.b.c	ENSGT00940000156674.f	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00950000182988.a.a.a	ENSGT00910000144305	ENSGT00940000154674.q.a	ENSGT00950000183097.a.b	ENSGT00940000155714	ENSGT00940000155667.b.b	ENSGT00940000153249.b.d.a	ENSGT00950000182972.a.a.a.b	ENSGT00940000157741	ENSGT00390000016814.b	ENSGT01070000253816.b.d	ENSGT00940000156699.j	ENSGT00940000154659.b	ENSGT00940000157005	ENSGT01100000263484.C.b.a.b
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	301												slc18b1 (ENSMZEG00005002800)	ahi1 (ENSMZEG00005002805)	ENSMZEG00005002824	ENSMZEG00005002836	OTOF (ENSMZEG00005002855) ##22	pak2a (ENSMZEG00005002967)	HLTF (ENSMZEG00005003008)	gyg1a (ENSMZEG00005003039)	pls1 (ENSMZEG00005003068)	ATR (ENSMZEG00005003131)
Eastern happy	MODERN SPECIES	10	STX11 (ENSACLG00000004072)	stx11a (ENSACLG00000004097)	ENSACLG00000004104	rmnd1 (ENSACLG00000004111)	ENSACLG00000004125	ENSACLG00000004151	ENSACLG00000004503	ENSACLG00000004732	TULP4 (ENSACLG00000005166)	slc18b1 (ENSACLG00000005190)	ENSACLG00000005243	slc18b1 (ENSACLG00000005253)	ahi1 (ENSACLG00000005307)	ENSACLG00000005339	ENSACLG00000005355	OTOF (ENSACLG00000005391) ##22	pak2a (ENSACLG00000005452)	HLTF (ENSACLG00000005486)	gyg1a (ENSACLG00000005555)	pls1 (ENSACLG00000005562)	ATR (ENSACLG00000005624)	ENSACLG00000005717	ENSACLG00000005731	STAG1 (ENSACLG00000005739)	pccb (ENSACLG00000006092)	msl2b (ENSACLG00000006145)	tnfsf10 (ENSACLG00000006153)	nceh1a (ENSACLG00000006160)	PPP2R3A (ENSACLG00000006170)	fndc3ba (ENSACLG00000006238)	ghsra (ENSACLG00000006359)
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	345	SHPRH (ENSHBUG00000013180)	ENSHBUG00000013220	fbxo30a (ENSHBUG00000001110)	STX11 (ENSHBUG00000013278)	ENSHBUG00000013285	rmnd1 (ENSHBUG00000013305)	ENSHBUG00000013340	ENSHBUG00000013735	ENSHBUG00000013763	TULP4 (ENSHBUG00000013811)	slc18b1 (ENSHBUG00000013822)	slc18b1 (ENSHBUG00000013865)	ahi1 (ENSHBUG00000013903)	ENSHBUG00000013925	ENSHBUG00000013938	OTOF (ENSHBUG00000014042) ##22	pak2a (ENSHBUG00000014148)	HLTF (ENSHBUG00000014165)	gyg1a (ENSHBUG00000014361)	pls1 (ENSHBUG00000014404)	ATR (ENSHBUG00000014512)	ENSHBUG00000014542	ENSHBUG00000014550	STAG1 (ENSHBUG00000014711)	pccb (ENSHBUG00000000432)	MSL2 (ENSHBUG00000001149)	tnfsf10 (ENSHBUG00000001166)	nceh1a (ENSHBUG00000014795)	PPP2R3A (ENSHBUG00000014845)	fndc3ba (ENSHBUG00000014984)	ghsra (ENSHBUG00000015039)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	347	SHPRH (ENSNBRG00000007612)	ENSNBRG00000007691	fbxo30a (ENSNBRG00000007718)	stx11a (ENSNBRG00000007735)	STX11 (ENSNBRG00000007762)	ENSNBRG00000007800	rmnd1 (ENSNBRG00000007814)	ENSNBRG00000007903	ENSNBRG00000008053	ENSNBRG00000008146	ENSNBRG00000008341	TULP4 (ENSNBRG00000008365)	slc18b1 (ENSNBRG00000008427)	ahi1 (ENSNBRG00000008499)	ENSNBRG00000008546	OTOF (ENSNBRG00000008594) ##22	pak2a (ENSNBRG00000008701)	HLTF (ENSNBRG00000008743)	gyg1a (ENSNBRG00000008792)	pls1 (ENSNBRG00000008820)	ATR (ENSNBRG00000008884)	sh3glb1b (ENSNBRG00000009120)	ENSNBRG00000009171	STAG1 (ENSNBRG00000009191)	pccb (ENSNBRG00000009257)	msl2b (ENSNBRG00000009306)	tnfsf10 (ENSNBRG00000009317)	nceh1a (ENSNBRG00000009343)	PPP2R3A (ENSNBRG00000009358)	fndc3ba (ENSNBRG00000009385)	pld1a (ENSNBRG00000009444)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	10	GRM1 (ENSONIG00000000669)	SHPRH (ENSONIG00000000684)	fbxo30a (ENSONIG00000000687)	stx11a (ENSONIG00000020735)	STX11 (ENSONIG00000020736)	ENSONIG00000034281	rmnd1 (ENSONIG00000000690)	ENSONIG00000031204	ENSONIG00000000692	ENSONIG00000000702	TULP4 (ENSONIG00000000703)	slc18b1 (ENSONIG00000041114)	slc18b1 (ENSONIG00000000707)	ahi1 (ENSONIG00000000712)	ENSONIG00000028957	OTOF (ENSONIG00000000721) ##22	pak2a (ENSONIG00000000726)	ENSONIG00000037588	HLTF (ENSONIG00000000740)	gyg1a (ENSONIG00000000749)	ENSONIG00000000752	ENSONIG00000033889	ATR (ENSONIG00000000770)	ENSONIG00000000774	ENSONIG00000000779	STAG1 (ENSONIG00000000780)	pccb (ENSONIG00000000798)	MSL2 (ENSONIG00000000807)	tnfsf10 (ENSONIG00000000810)	nceh1a (ENSONIG00000027840)	PPP2R3A (ENSONIG00000000815)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	362												slc18b1 (ENSACIG00000017919)	ahi1 (ENSACIG00000017883)	ENSACIG00000017846	ENSACIG00000017829	OTOF (ENSACIG00000017805) ##22	mapre3a (ENSACIG00000017796) #15	dpysl5a (ENSACIG00000017769) #16	dnmt3ab (ENSACIG00000017005)	dtnbb (ENSACIG00000016910)	ENSACIG00000016887	kif3cb (ENSACIG00000016854)	hadhab (ENSACIG00000016806)	RPS6KA5 (ENSACIG00000016608)	mbip (ENSACIG00000016547)	nkx2.1 (ENSACIG00000016474)	NKX2-8 (ENSACIG00000016461)	pax9 (ENSACIG00000016451)	slc25a21 (ENSACIG00000016389)	plekhh1 (ENSACIG00000016325)	zfp36l1a (ENSACIG00000016314)
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000176900.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456	ENSGT00940000155076.a.d
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	57	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000176900.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456	ENSGT00940000155076.a.d
Spiny chromis	MODERN SPECIES	571		RAB32 (ENSAPOG00000011562)	GRM1 (ENSAPOG00000011528)	SHPRH (ENSAPOG00000011458)	fbxo30a (ENSAPOG00000011346)	stx11a (ENSAPOG00000011315)	STX11 (ENSAPOG00000011230)	ENSAPOG00000011189	rmnd1 (ENSAPOG00000011181)	ENSAPOG00000011151	ENSAPOG00000010614	TULP4 (ENSAPOG00000010588)	slc18b1 (ENSAPOG00000010524)	ahi1 (ENSAPOG00000010501)	ENSAPOG00000010479	OTOF (ENSAPOG00000010413) ##22	trnau1apb (ENSAPOG00000010086)	fitm1l (ENSAPOG00000010045)	ENSAPOG00000010038	ENSAPOG00000009969	ENSAPOG00000009950
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	83						ENSGT00940000156864.c	ENSGT00950000183031.A.a.b	ENSGT00940000155887.a	ENSGT01090000260070.D.b	ENSGT00390000011642.f.d	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456	ENSGT00940000155076.a.d
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	668							gabrr2a (ENSAOCG00000013041)	rragd (ENSAOCG00000013072)	gja10a (ENSAOCG00000013084)	ENSAOCG00000013096	TULP4 (ENSAOCG00000013118)	slc18b1 (ENSAOCG00000013136)	ahi1 (ENSAOCG00000013157)	ENSAOCG00000013174	ENSAOCG00000013203	OTOF (ENSAOCG00000013459) ##22
Orange clownfish	MODERN SPECIES	9	ENSAPEG00000008859	ENSAPEG00000008899	gabrr2a (ENSAPEG00000008909)	ENSAPEG00000008945	ENSAPEG00000008970	rragd (ENSAPEG00000009165)	ENSAPEG00000009179	ENSAPEG00000009206	gja10a (ENSAPEG00000009234)	ENSAPEG00000009249	ENSAPEG00000009258	TULP4 (ENSAPEG00000009289)	slc18b1 (ENSAPEG00000009354)	ahi1 (ENSAPEG00000009375)	ENSAPEG00000009425	ENSAPEG00000009441 ##22	mapre3a (ENSAPEG00000009470) #15	dpysl5a (ENSAPEG00000009506) #16	dnmt3ab (ENSAPEG00000009584)	dtnbb (ENSAPEG00000009720)	ASXL2 (ENSAPEG00000009777)	kif3cb (ENSAPEG00000009799)	hadhab (ENSAPEG00000009876)	ENSAPEG00000009973	ENSAPEG00000009987	RPS6KA5 (ENSAPEG00000010002)	mbip (ENSAPEG00000010022)	nkx2.1 (ENSAPEG00000010034)	NKX2-8 (ENSAPEG00000010047)	pax9 (ENSAPEG00000010061)	slc25a21 (ENSAPEG00000010096)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	738	GRM1 (ENSSPAG00000015933)	SHPRH (ENSSPAG00000015794)	ENSSPAG00000015751	fbxo30a (ENSSPAG00000015738)	stx11a (ENSSPAG00000015702)	ENSSPAG00000015697	rmnd1 (ENSSPAG00000015686)	ENSSPAG00000015631	ENSSPAG00000015332	ENSSPAG00000015282	TULP4 (ENSSPAG00000015235)	slc18b1 (ENSSPAG00000015198)	ahi1 (ENSSPAG00000015157)	ENSSPAG00000015133	ENSSPAG00000015086	OTOF (ENSSPAG00000015005) ##22	mapre3a (ENSSPAG00000014976) #15	dpysl5a (ENSSPAG00000014948) #16	dnmt3ab (ENSSPAG00000014883)
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000176900.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000176900.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00950000182906.b.a.i.a	ENSGT01030000234595.A.b.a.a	ENSGT00730000111123	ENSGT00940000163723.B	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456	ENSGT00940000155076.a.d
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	59	SHPRH (ENSKMAG00000014992)	ENSKMAG00000014944	fbxo30a (ENSKMAG00000014928)	stx11a (ENSKMAG00000014913)	STX11 (ENSKMAG00000014884)	ENSKMAG00000014866	rmnd1 (ENSKMAG00000014835)	ENSKMAG00000014539	ENSKMAG00000014436	TULP4 (ENSKMAG00000014370)	slc18b1 (ENSKMAG00000014308)	ahi1 (ENSKMAG00000014264)	ENSKMAG00000014241	hist2h3ca1 (ENSKMAG00000014201)	ENSKMAG00000014180	OTOF (ENSKMAG00000014101) ##22	mapre3a (ENSKMAG00000014053) #15	dpysl5a (ENSKMAG00000013999) #16	dnmt3ab (ENSKMAG00000013869)	dtnbb (ENSKMAG00000013696)	ASXL2 (ENSKMAG00000013630)	kif3cb (ENSKMAG00000013602)	hadhab (ENSKMAG00000013503)	RPS6KA5 (ENSKMAG00000013410)	mbip (ENSKMAG00000013349)	nkx2.1 (ENSKMAG00000013335)	NKX2-8 (ENSKMAG00000013325)	pax9 (ENSKMAG00000013301)	slc25a21 (ENSKMAG00000013224)	plekhh1 (ENSKMAG00000013171)	zfp36l1a (ENSKMAG00000013156)
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1625	ZBTB24 (ENSNFUG00015020703)	FOXO3A (ENSNFUG00015020706)	afg1la (ENSNFUG00015020713)	SCML4 (ENSNFUG00015020763)	ENSNFUG00015014043	VSNL1A (ENSNFUG00015014055)	ENSNFUG00015014063	ENSNFUG00015014083	ENSNFUG00015014090	ENSNFUG00015014112	SLC5A6 (ENSNFUG00015014149)	CENPO (ENSNFUG00015014339)	TP53I3 (ENSNFUG00015014348)	dnajc5gb (ENSNFUG00015014378)	COQ8A (ENSNFUG00015014514)	OTOF (ENSNFUG00015016695) ##22	mapre3a (ENSNFUG00015016988) #15	dpysl5a (ENSNFUG00015017015) #16	DNMT3AB (ENSNFUG00015017367)	dtnbb (ENSNFUG00015020004)	ENSNFUG00015020012	dtnbb (ENSNFUG00015020020)	ASXL2 (ENSNFUG00015020028)	ENSNFUG00015020030	KIF3CB (ENSNFUG00015020037)	HADHAB (ENSNFUG00015020050)	RPS6KA5 (ENSNFUG00015020356)	MBIP (ENSNFUG00015020574)	ENSNFUG00015020582	NKX2.1B (ENSNFUG00015020587)	NKX2-8 (ENSNFUG00015020590)
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000176900.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00940000154481.a.b.fb	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000176900.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D.d	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456
Sheepshead minnow	DUPLICATION
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	879	ENSCVAG00000007270	fbxo30a (ENSCVAG00000007238)	stx11a (ENSCVAG00000007221)	STX11 (ENSCVAG00000007196)	ENSCVAG00000007164	rmnd1 (ENSCVAG00000007156)	ENSCVAG00000007146	ENSCVAG00000007023	ENSCVAG00000007014	ENSCVAG00000006998	ENSCVAG00000006627	TULP4 (ENSCVAG00000006611)	slc18b1 (ENSCVAG00000006580)	ahi1 (ENSCVAG00000006570)	ENSCVAG00000006555	OTOF (ENSCVAG00000006538) ##22
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	686																ENSCVAG00000022273 ##22	mapre3a (ENSCVAG00000022305) #15	dpysl5a (ENSCVAG00000022335) #16	dnmt3ab (ENSCVAG00000000575)	dtnbb (ENSCVAG00000022420)	ENSCVAG00000022430	kif3cb (ENSCVAG00000022435)	hadhab (ENSCVAG00000022521)	RPS6KA5 (ENSCVAG00000023268)	mbip (ENSCVAG00000000652)	nkx2.1 (ENSCVAG00000002011)	NKX2-8 (ENSCVAG00000002013)	pax9 (ENSCVAG00000002018)	slc25a21 (ENSCVAG00000000799)
Mummichog	MODERN SPECIES	2289	ENSFHEG00000001677	fbxo30a (ENSFHEG00000001673)	stx11a (ENSFHEG00000001668)	STX11 (ENSFHEG00000001664)	ENSFHEG00000001657	rmnd1 (ENSFHEG00000001651)	ENSFHEG00000001640	ENSFHEG00000001606	ENSFHEG00000001583	ENSFHEG00000001552	TULP4 (ENSFHEG00000001547)	slc18b1 (ENSFHEG00000001532)	ahi1 (ENSFHEG00000001512)	ENSFHEG00000001505	ENSFHEG00000001496	OTOF (ENSFHEG00000001485) ##22	mapre3a (ENSFHEG00000001466) #15	dpysl5a (ENSFHEG00000001439) #16	dnmt3ab (ENSFHEG00000001427)	dtnbb (ENSFHEG00000001412)	ENSFHEG00000001402	ASXL2 (ENSFHEG00000001398)	kif3cb (ENSFHEG00000001386)	hadhab (ENSFHEG00000001377)	RPS6KA5 (ENSFHEG00000001369)	mbip (ENSFHEG00000001365)	nkx2.1 (ENSFHEG00000001358)	NKX2-8 (ENSFHEG00000001349)	pax9 (ENSFHEG00000001342)	slc25a21 (ENSFHEG00000001336)	plekhh1 (ENSFHEG00000001326)
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000176900.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456	ENSGT00940000155076.a.d
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000176900.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456	ENSGT00940000155076.a.d
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00940000169194	ENSGT00390000013337	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000176900.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b.c	ENSGT00940000155459.x.b.d	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456
Sailfin molly	MODERN SPECIES	1280								ENSPLAG00000019666	ENSPLAG00000019911	ENSPLAG00000019939	TULP4 (ENSPLAG00000020046)	slc18b1 (ENSPLAG00000020077)	ahi1 (ENSPLAG00000020088)	ENSPLAG00000020094	ENSPLAG00000020137	OTOF (ENSPLAG00000000447) ##22	mapre3a (ENSPLAG00000020238) #15	dpysl5a (ENSPLAG00000020293) #16	dnmt3ab (ENSPLAG00000020423)
Amazon molly	MODERN SPECIES	453								ENSPFOG00000018414	ENSPFOG00000018166	ENSPFOG00000023334	TULP4 (ENSPFOG00000018094)	slc18b1 (ENSPFOG00000018065)	ahi1 (ENSPFOG00000018010)	ENSPFOG00000023093	ENSPFOG00000017988	OTOF (ENSPFOG00000017977) ##22	mapre3a (ENSPFOG00000022497) #15	dpysl5a (ENSPFOG00000017924) #16	dnmt3ab (ENSPFOG00000024640)	dnmt3ab (ENSPFOG00000017798)	dtnbb (ENSPFOG00000023529)	dtnbb (ENSPFOG00000023471)	ENSPFOG00000017771	ENSPFOG00000017761	kif3cb (ENSPFOG00000017737)	hadhab (ENSPFOG00000017672)	RPS6KA5 (ENSPFOG00000017625)	mbip (ENSPFOG00000017579)	nkx2.1 (ENSPFOG00000017570)	NKX2-8 (ENSPFOG00000017563)	pax9 (ENSPFOG00000017550)
Guppy	MODERN SPECIES	453	fbxo30a (ENSPREG00000015829)	stx11a (ENSPREG00000015813)	ENSPREG00000015799	rmnd1 (ENSPREG00000015779)	ENSPREG00000015758	ENSPREG00000015739	ENSPREG00000015705	ENSPREG00000015687	ENSPREG00000015478	ENSPREG00000015419	TULP4 (ENSPREG00000015376)	slc18b1 (ENSPREG00000015335)	ahi1 (ENSPREG00000015306)	ENSPREG00000015287	ENSPREG00000015260	OTOF (ENSPREG00000015186) ##22	mapre3a (ENSPREG00000015151) #15	dpysl5a (ENSPREG00000015127) #16	dnmt3ab (ENSPREG00000014413)	dtnbb (ENSPREG00000014277)	ENSPREG00000014267	kif3cb (ENSPREG00000014256)	hadhab (ENSPREG00000014227)	RPS6KA5 (ENSPREG00000013798)	mbip (ENSPREG00000013664)	nkx2.1 (ENSPREG00000013637)	NKX2-8 (ENSPREG00000013623)	pax9 (ENSPREG00000013601)	slc25a21 (ENSPREG00000013570)	plekhh1 (ENSPREG00000013512)	zfp36l1a (ENSPREG00000013484)
Platyfish	MODERN SPECIES	10	stx11a (ENSXMAG00000020367)	STX11 (ENSXMAG00000028427)	ENSXMAG00000015381	rmnd1 (ENSXMAG00000015383)	ENSXMAG00000022706	ENSXMAG00000026171	ENSXMAG00000025037	ENSXMAG00000021294	ENSXMAG00000021462	ENSXMAG00000024565	TULP4 (ENSXMAG00000015466)	slc18b1 (ENSXMAG00000015487)	ahi1 (ENSXMAG00000015504)	ENSXMAG00000024124	ENSXMAG00000015524	OTOF (ENSXMAG00000015543) ##22	mapre3a (ENSXMAG00000015588) #15	dpysl5a (ENSXMAG00000015602) #16	ttc7b (ENSXMAG00000000604)	dnmt3ab (ENSXMAG00000021324)	dtnbb (ENSXMAG00000015641)	ASXL2 (ENSXMAG00000015679)	kif3cb (ENSXMAG00000015681)	hadhab (ENSXMAG00000015694)	RPS6KA5 (ENSXMAG00000015712)	ENSXMAG00000024100	mbip (ENSXMAG00000015742)	nkx2.1 (ENSXMAG00000029778)	NKX2-8 (ENSXMAG00000015760)	pax9 (ENSXMAG00000015762)	slc25a21 (ENSXMAG00000015763)
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000159826	ENSGT00390000013227.a.a	ENSGT00940000157463.a.a.b	ENSGT00940000156513.a.a	ENSGT00940000155731.b	ENSGT00390000016702	ENSGT00940000174968	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000176900.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT00530000069038.a.a	ENSGT00390000015784	ENSGT00390000002751	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00510000047092
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	109							ENSGT00940000155731.b	ENSGT00390000016702	ENSGT00940000174968	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT00530000069038.a.a	ENSGT00390000015784	ENSGT00390000002751	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00510000047092
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Chinese medaka	MODERN SPECIES	5048																ENSOSIG00000004833 ##22
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155086.A ##22
Indian medaka	MODERN SPECIES	792				ENSOMEG00000023561	ENSOMEG00000005268	ENSOMEG00000005278	ENSOMEG00000005288	ENSOMEG00000005301	ENSOMEG00000005325	ENSOMEG00000005332	ENSOMEG00000005365	ENSOMEG00000005398	TULP4 (ENSOMEG00000005426)	ENSOMEG00000005439	ENSOMEG00000005447	OTOF (ENSOMEG00000005490) ##22	MAPRE3 (ENSOMEG00000005548) #15	ENSOMEG00000005573	ENSOMEG00000005627	ENSOMEG00000005660	ENSOMEG00000005688	dtnbb (ENSOMEG00000005713)	dkc1 (ENSOMEG00000005786)	ENSOMEG00000005806	ENSOMEG00000005826	ENSOMEG00000005839	ENSOMEG00000005845
Cod	MODERN SPECIES	18	ENSGMOG00000016082	ENSGMOG00000026983	fbxo30a (ENSGMOG00000025323)	stx11a (ENSGMOG00000034568)	ENSGMOG00000033787	rmnd1 (ENSGMOG00000019502)	ENSGMOG00000019433	ENSGMOG00000023735	ENSGMOG00000019415	slc18b1 (ENSGMOG00000019410)	slc18b1 (ENSGMOG00000030233)	slc18b1 (ENSGMOG00000028735)	ahi1 (ENSGMOG00000019402)	ENSGMOG00000033270	ENSGMOG00000029632	ENSGMOG00000019382 ##22	ENSGMOG00000029480	ENSGMOG00000027382	ENSGMOG00000019348	ENSGMOG00000030873	ENSGMOG00000028769	ENSGMOG00000029140	ENSGMOG00000031697	ENSGMOG00000001776	ENSGMOG00000036440	ENSGMOG00000030418	ENSGMOG00000029715	gja10a (ENSGMOG00000002098)	ENSGMOG00000027948	ENSGMOG00000025618	ENSGMOG00000030463
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000161401	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00940000156693	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000157723.q.a	ENSGT00550000074878	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT01030000234626.B.ub	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B.k	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000166633	ENSGT00940000156484.b.e.a	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119.c
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	257	ENSGT00950000182906.b.a.i.a.g.b	ENSGT00940000156778.k.e	ENSGT00940000159373	ENSGT01050000244948.c.b.b.k	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00730000111244.a.a.d	ENSGT00390000013337.c	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c.d	ENSGT00940000156674.a	ENSGT00940000156509	ENSGT00950000182941.a.a.a.b.d	ENSGT00390000013931.n	ENSGT00940000155086.A.c ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.g #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.g #16	ENSGT00940000155459.x.b.e
Huchen	MODERN SPECIES	202	zbtb24 (ENSHHUG00000035562)	stx11a (ENSHHUG00000035559)	STX11 (ENSHHUG00000035552)	rmnd1 (ENSHHUG00000035530)	ENSHHUG00000035516	ENSHHUG00000035255	ENSHHUG00000035247	ENSHHUG00000035240	ENSHHUG00000035236	ENSHHUG00000035232	TULP4 (ENSHHUG00000035231)	slc18b1 (ENSHHUG00000035215)	ahi1 (ENSHHUG00000035107)	ENSHHUG00000035062	ENSHHUG00000035018	OTOF (ENSHHUG00000034941) ##22	mapre3a (ENSHHUG00000034932) #15	dpysl5a (ENSHHUG00000034911) #16	dnmt3ab (ENSHHUG00000034760)
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	64	ENSGT00950000182906.b.a.i.a.g.b	ENSGT00940000156778.k.e	ENSGT00940000159373	ENSGT01050000244948.c.b.b.k	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00730000111244.a.a.d	ENSGT00390000013337.c	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c.d	ENSGT00940000156674.a	ENSGT00940000156509	ENSGT00950000182941.a.a.a.b.d	ENSGT00390000013931.n	ENSGT00940000155086.A.c ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.g #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.g #16	ENSGT00940000155459.x.b.e	ENSGT00940000153897.b.a.b.g.a	ENSGT00520000055578.a.b.g	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a.e	ENSGT00940000156886.D.h	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107.u	ENSGT00940000161610.c	ENSGT00940000159896.c	ENSGT00730000111119.c	ENSGT00940000159456.c	ENSGT00940000155076.a.d.c
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000162477.d	ENSGT00440000035378.d.l	ENSGT00950000182906.b.a.i.a.g.b	ENSGT00940000156778.k.e	ENSGT00940000159373	ENSGT01050000244948.c.b.b.k	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00730000111244.a.a.d	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c.d	ENSGT00940000156674.a	ENSGT00940000156509	ENSGT00390000013931.n	ENSGT00940000155086.A.c ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.g #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.g #16	ENSGT00940000155459.x.b.e	ENSGT00940000153897.b.a.b.g.a	ENSGT00520000055578.a.b.g	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a.e	ENSGT00940000156886.D.h	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107.u	ENSGT00940000161610.c	ENSGT00940000159896.c	ENSGT00730000111119.c	ENSGT00940000159456.c	ENSGT00940000155076.a.d.c
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000162477.d	ENSGT00440000035378.d.l	ENSGT00950000182906.b.a.i.a.g.b	ENSGT00940000156778.k.e	ENSGT00940000159373	ENSGT01050000244948.c.b.b.k	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00730000111244.a.a.d	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c.d	ENSGT00940000156674.a	ENSGT00940000156509	ENSGT00390000013931.n	ENSGT00940000155086.A.c ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.g #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.g #16	ENSGT00940000155459.x.b.e	ENSGT00940000153897.b.a.b.g.a	ENSGT00520000055578.a.b.g	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a.e	ENSGT00940000156886.D.h	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107.u	ENSGT00940000161610.c	ENSGT00940000159896.c	ENSGT00730000111119.c	ENSGT00940000159456.c	ENSGT00940000155076.a.d.c
Coho salmon	MODERN SPECIES	27	RAB32 (ENSOKIG00005003247)	FUCA2 (ENSOKIG00005003253)	STXBP5 (ENSOKIG00005003369)	ENSOKIG00005004162	zbtb24 (ENSOKIG00005004214)	stx11a (ENSOKIG00005004243)	STX11 (ENSOKIG00005004250)	ENSOKIG00005004267	ENSOKIG00005004305	ENSOKIG00005004442	ENSOKIG00005004755	TULP4 (ENSOKIG00005004773)	slc18b1 (ENSOKIG00005004817)	ahi1 (ENSOKIG00005004947)	ENSOKIG00005005221	OTOF (ENSOKIG00005005301) ##22	mapre3a (ENSOKIG00005005709) #15	dpysl5a (ENSOKIG00005005758) #16	ENSOKIG00005005842	dnmt3ab (ENSOKIG00005006268)	dtnbb (ENSOKIG00005011119)	ASXL2 (ENSOKIG00005013158)	kif3cb (ENSOKIG00005013172)	ENSOKIG00005013236	ENSOKIG00005014335	RPS6KA5 (ENSOKIG00005014376)	mbip (ENSOKIG00005014610)	nkx2.1 (ENSOKIG00005014635)	NKX2-8 (ENSOKIG00005014647)	pax9 (ENSOKIG00005014660)	slc25a21 (ENSOKIG00005014688)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	10	SHPRH (ENSOMYG00000027891)	GRM1 (ENSOMYG00000029298)	RAB32 (ENSOMYG00000029727)	STXBP5 (ENSOMYG00000030593)	ENSOMYG00000033211	ENSOMYG00000033250	stx11a (ENSOMYG00000033267)	ENSOMYG00000033275	ENSOMYG00000033282	ENSOMYG00000033554	ENSOMYG00000035101	ENSOMYG00000035114	slc18b1 (ENSOMYG00000035160)	ahi1 (ENSOMYG00000035270)	ENSOMYG00000035712	ENSOMYG00000035865 ##22	mapre3a (ENSOMYG00000036149) #15	dpysl5a (ENSOMYG00000036188) #16	dnmt3ab (ENSOMYG00000013163)	dtnbb (ENSOMYG00000016049)	ASXL2 (ENSOMYG00000020880)	kif3cb (ENSOMYG00000020893)	HADHA (ENSOMYG00000021215)	ENSOMYG00000025734	mbip (ENSOMYG00000028051)	nkx2.1 (ENSOMYG00000028088)	NKX2-8 (ENSOMYG00000028107)	pax9 (ENSOMYG00000028255)	slc25a21 (ENSOMYG00000028200)	ENSOMYG00000034354	ENSOMYG00000062008
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000156778.k.e	ENSGT00390000018635.c.h	ENSGT00940000159373	ENSGT01050000244948.c.b.b.k	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT00730000111244.a.a.d	ENSGT00390000013337.c	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000154481.a.a.a	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000155913.c.d	ENSGT00940000156674.a	ENSGT00940000156509	ENSGT00950000182941.a.a.a.b.d	ENSGT00390000013931.n	ENSGT00940000155086.A.c ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.g #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.g #16	ENSGT00940000155459.x.b.e	ENSGT00940000153897.b.a.b.g.a	ENSGT00520000055578.a.b.g	ENSGT00940000166633.a	ENSGT00940000154677.b.a.e	ENSGT00940000156886.D.h	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107.u	ENSGT00940000161610.c	ENSGT00940000159896.c	ENSGT00730000111119.c	ENSGT00940000159456.c	ENSGT00940000155076.a.d.c
Atlantic salmon	MODERN SPECIES		ENSSSAG00000050948	ENSSSAG00000091107	zbtb24 (ENSSSAG00000050932)	stx11a (ENSSSAG00000050924)	ENSSSAG00000119559	ENSSSAG00000050920	rmnd1 (ENSSSAG00000050905)	ENSSSAG00000082734	ENSSSAG00000046366	myct1b (ENSSSAG00000045855)	ENSSSAG00000045797	slc18b1 (ENSSSAG00000045425)	ahi1 (ENSSSAG00000045210)	ENSSSAG00000045145	ENSSSAG00000045091	ENSSSAG00000044138 ##22	mapre3a (ENSSSAG00000103255) #15	dpysl5a (ENSSSAG00000043824) #16	dnmt3ab (ENSSSAG00000042714)	dtnbb (ENSSSAG00000117898)	ENSSSAG00000078035	ENSSSAG00000077473	mbip (ENSSSAG00000077406)	nkx2.1 (ENSSSAG00000120893)	nkx2-8 (ENSSSAG00000077395)	pax9 (ENSSSAG00000077394)	slc25a21 (ENSSSAG00000077374)	plekhh1 (ENSSSAG00000076963)	zfp36l1a (ENSSSAG00000109874)	ENSSSAG00000108885	tmem229b (ENSSSAG00000085684)
River trout	MODERN SPECIES	26	STXBP5 (ENSSTUG00000034313)	ENSSTUG00000035028	ddo (ENSSTUG00000036979)	zbtb24 (ENSSTUG00000037026)	stx11a (ENSSTUG00000037095)	STX11 (ENSSTUG00000037105)	ENSSTUG00000037111	rmnd1 (ENSSTUG00000037123)	ENSSTUG00000037264	ENSSTUG00000037367	ENSSTUG00000043147	TULP4 (ENSSTUG00000043193)	ahi1 (ENSSTUG00000043708)	ENSSTUG00000043880	ENSSTUG00000043890	OTOF (ENSSTUG00000043921) ##22	mapre3a (ENSSTUG00000044069) #15	dpysl5a (ENSSTUG00000044075) #16	dnmt3ab (ENSSTUG00000044178)	dtnbb (ENSSTUG00000046525)	ASXL2 (ENSSTUG00000047178)	ENSSTUG00000047187	hadhab (ENSSTUG00000047229)	RPS6KA5 (ENSSTUG00000048116)	mbip (ENSSTUG00000048303)	nkx2.1 (ENSSTUG00000048327)	NKX2-8 (ENSSTUG00000048331)	pax9 (ENSSTUG00000048336)	slc25a21 (ENSSTUG00000048352)	plekhh1 (ENSSTUG00000048423)	zfp36l1a (ENSSTUG00000048908)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	205												ENSGT00940000155913.c.c	ENSGT00940000156674.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b.c	ENSGT00940000155086.A.d ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.h #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.h #16	ENSGT00940000155459.x.b.f	ENSGT00940000153897.b.a.b.g.b	ENSGT00520000055578.a.b.h	ENSGT00940000166633.b	ENSGT00940000154677.b.a.f	ENSGT00940000156484.b.e.a	ENSGT00940000156886.D.g	ENSGT00940000161107.v	ENSGT00940000161610.d	ENSGT00940000159896.d	ENSGT00730000111119.d	ENSGT00940000159456.d	ENSGT00940000155076.a.d.d
Huchen	DUPLICATION
Huchen	MODERN SPECIES	2007										TULP4 (ENSHHUG00000016958)	slc18b1 (ENSHHUG00000016966)	ENSHHUG00000016986	ENSHHUG00000017007	ENSHHUG00000017035	OTOF (ENSHHUG00000017061) ##22	ENSHHUG00000017119 ##22	mapre3a (ENSHHUG00000017127) #15	dpysl5a (ENSHHUG00000017142) #16	dnmt3ab (ENSHHUG00000017176)
Huchen	MODERN SPECIES	2007											TULP4 (ENSHHUG00000016958)	slc18b1 (ENSHHUG00000016966)	ENSHHUG00000016986	ENSHHUG00000017007	ENSHHUG00000017035	OTOF (ENSHHUG00000017061) ##22	ENSHHUG00000017119 ##22	mapre3a (ENSHHUG00000017127) #15	dpysl5a (ENSHHUG00000017142) #16	dnmt3ab (ENSHHUG00000017176)
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000159826	ENSGT00950000183204.b.b.b.d	ENSGT01030000234595.A.b.a.a.c	ENSGT00950000182906.b.a.i.a.g.a	ENSGT00510000048701.b	ENSGT00940000156778.k.f.a	ENSGT00390000018635.c	ENSGT01050000244948.c.b.b.l	ENSGT00730000111244.a.a.c	ENSGT00390000013337.d	ENSGT00940000154481.a.a.b	ENSGT00940000155913.c.c	ENSGT00940000156674.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b.c	ENSGT00940000155086.A.d ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.h #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.h #16	ENSGT00940000155459.x.b.f	ENSGT00940000153897.b.a.b.g.b	ENSGT00520000055578.a.b.h	ENSGT00940000166633.b	ENSGT00940000154677.b.a.f	ENSGT00940000156484.b.e.a	ENSGT00940000156886.D.g	ENSGT00940000161107.v	ENSGT00940000161610.d	ENSGT00940000159896.d	ENSGT00730000111119.d	ENSGT00940000159456.d	ENSGT00940000155076.a.d.d
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000159826	ENSGT00950000183204.b.b.b.d	ENSGT01030000234595.A.b.a.a.c	ENSGT00950000182906.b.a.i.a.g.a	ENSGT00510000048701.b	ENSGT00940000156778.k.f.a	ENSGT00390000018635.c.g	ENSGT01050000244948.c.b.b.l	ENSGT00730000111244.a.a.c	ENSGT00390000013337.d	ENSGT00940000154481.a.a.b	ENSGT00940000155913.c.c	ENSGT00940000156674.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b.c	ENSGT00940000155086.A.d ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.h #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.h #16	ENSGT00940000155459.x.b.f	ENSGT00940000153897.b.a.b.g.b	ENSGT00520000055578.a.b.h	ENSGT00940000166633.b	ENSGT00940000154677.b.a.f	ENSGT00940000156484.b.e.a	ENSGT00940000156886.D.g	ENSGT00940000161107.v	ENSGT00940000161610.d	ENSGT00940000159896.d	ENSGT00730000111119.d	ENSGT00940000159456.d	ENSGT00940000155076.a.d.d
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	28	ENSSSAG00000073667	ENSSSAG00000073665	ENSSSAG00000073553	ENSSSAG00000071394	ENSSSAG00000108807	ENSSSAG00000109618	ddo (ENSSSAG00000071341)	stx11a (ENSSSAG00000113883)	ENSSSAG00000071313	rmnd1 (ENSSSAG00000071238)	ENSSSAG00000070134	ENSSSAG00000069434	slc18b1 (ENSSSAG00000113603)	ENSSSAG00000069411	ENSSSAG00000069398	ENSSSAG00000069241 ##22	mapre3a (ENSSSAG00000009963) #15	dpyl5 (ENSSSAG00000069192) #16	dnmt3ab (ENSSSAG00000068527)	ENSSSAG00000093955	dtnbb (ENSSSAG00000093448)	ENSSSAG00000068422	ENSSSAG00000068367	ENSSSAG00000066302	ENSSSAG00000064453	nkx2.1 (ENSSSAG00000064404)	ENSSSAG00000064399	pax9 (ENSSSAG00000117660)	ENSSSAG00000064377	plekhh1 (ENSSSAG00000063941)	zfp36l1a (ENSSSAG00000093103)
River trout	MODERN SPECIES	17	FOXO3 (ENSSTUG00000023554)	ENSSTUG00000023557	fbxo30a (ENSSTUG00000003254)	GRM1 (ENSSTUG00000003846)	STXBP5 (ENSSTUG00000004510)	SASH1 (ENSSTUG00000004774)	SAMD5 (ENSSTUG00000004805)	ddo (ENSSTUG00000004819)	stx11a (ENSSTUG00000004826)	ENSSTUG00000004899	rmnd1 (ENSSTUG00000004950)	ENSSTUG00000005129	TULP4 (ENSSTUG00000009697)	slc18b1 (ENSSTUG00000009727)	ENSSTUG00000009800	OTOF (ENSSTUG00000009829) ##22	mapre3a (ENSSTUG00000010175) #15	dpysl5a (ENSSTUG00000010182) #16	dnmt3ab (ENSSTUG00000010296)	dtnbb (ENSSTUG00000011764)	ENSSTUG00000013306	ENSSTUG00000013322	hadhab (ENSSTUG00000013353)	slc30a1b (ENSSTUG00000014514)	ENSSTUG00000014643	nkx2.1 (ENSSTUG00000015240)	NKX2-8 (ENSSTUG00000015255)	pax9 (ENSSTUG00000015263)	slc25a21 (ENSSTUG00000015281)	plekhh1 (ENSSTUG00000015313)	zfp36l1a (ENSSTUG00000015974)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT00940000157463.a.d	ENSGT00940000161401.n.b	ENSGT00950000183204.b.b.b.d	ENSGT01030000234595.A.b.a.a.c	ENSGT00950000182906.b.a.i.a.g.a	ENSGT00510000048701.b	ENSGT00940000156778.k.f.a	ENSGT00390000018635.c	ENSGT01050000244948.c.b.b.l	ENSGT00730000111244.a.a.c	ENSGT00390000013337.d	ENSGT00940000154481.a.a.b	ENSGT00940000155913.c.c	ENSGT00940000156674.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000155086.A.d ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.h #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.h #16	ENSGT00940000155459.x.b.f	ENSGT00940000153897.b.a.b.g.b	ENSGT00520000055578.a.b.h	ENSGT00940000166633.b	ENSGT00940000154677.b.a.f	ENSGT00940000156484.b.e.a	ENSGT00940000156886.D.g	ENSGT01000000220414	ENSGT00940000161107.v	ENSGT00940000161610.d	ENSGT00940000159896.d	ENSGT00730000111119.d	ENSGT00940000159456.d
Rainbow trout	MODERN SPECIES	17	ENSOMYG00000074222	ENSOMYG00000045511	STXBP5 (ENSOMYG00000044027)	ENSOMYG00000043697	SASH1 (ENSOMYG00000057465)	ddo (ENSOMYG00000043688)	stx11a (ENSOMYG00000043686)	ENSOMYG00000060722	ENSOMYG00000076892	rmnd1 (ENSOMYG00000043676)	ENSOMYG00000062881	ENSOMYG00000042603	ENSOMYG00000041842	slc18b1 (ENSOMYG00000041820)	ENSOMYG00000041814	ENSOMYG00000041751 ##22	mapre3a (ENSOMYG00000041724) #15	dpysl5a (ENSOMYG00000041717) #16	dnmt3ab (ENSOMYG00000038364)	dtnbb (ENSOMYG00000037701)	ENSOMYG00000037643	ENSOMYG00000037633	ENSOMYG00000037527	ENSOMYG00000037431	ENSOMYG00000037419	ENSOMYG00000037410	nkx2.1 (ENSOMYG00000073717)	ENSOMYG00000074485	pax9 (ENSOMYG00000037381)	ENSOMYG00000064585	plekhh1 (ENSOMYG00000037325)
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	60	ENSGT00940000156513.a.a.j	ENSGT00940000157463.a.d	ENSGT00940000161401.n.b	ENSGT00950000183204.b.b.b.d	ENSGT01030000234595.A.b.a.a.c	ENSGT00950000182906.b.a.i.a.g.a	ENSGT00940000156778.k.f.a	ENSGT00390000018635.c	ENSGT01050000244948.c.b.b.l	ENSGT00730000111244.a.a.c	ENSGT00390000013337.d	ENSGT00940000154481.a.a.b	ENSGT00940000155913.c.c	ENSGT00940000156674.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000155086.A.d ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.h #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.h #16	ENSGT00940000155459.x.b.f	ENSGT00940000153897.b.a.b.g.b	ENSGT00520000055578.a.b.h	ENSGT00940000166633.b	ENSGT00940000154677.b.a.f	ENSGT00940000156484.b.e.a	ENSGT00940000156886.D.g	ENSGT01000000220414	ENSGT00940000161107.v	ENSGT00940000161610.d	ENSGT00940000159896.d	ENSGT00940000155076.a.d.d	ENSGT00390000010899.a.a.h
Chinook salmon	MODERN SPECIES	32	ENSOTSG00005025612	ENSOTSG00005025610	foxo3a (ENSOTSG00005025573)	fbxo30a (ENSOTSG00005014619)	GRM1 (ENSOTSG00005014615)	STXBP5 (ENSOTSG00005014523)	ENSOTSG00005014517	ddo (ENSOTSG00005014503)	stx11a (ENSOTSG00005014498)	ENSOTSG00005014470	rmnd1 (ENSOTSG00005014460)	ENSOTSG00005012700	TULP4 (ENSOTSG00005012663)	slc18b1 (ENSOTSG00005012658)	ENSOTSG00005012656	OTOF (ENSOTSG00005012647) ##22	mapre3a (ENSOTSG00005012643) #15	dpysl5a (ENSOTSG00005012629) #16	dnmt3ab (ENSOTSG00005008875)	dtnbb (ENSOTSG00005007406)	ENSOTSG00005007402	ENSOTSG00005007391	ENSOTSG00005007390	hadhab (ENSOTSG00005007086)	slc30a1b (ENSOTSG00005007056)	ENSOTSG00005007053	ENSOTSG00005007052	ENSOTSG00005007042	SEC31B (ENSOTSG00005006930)	scd (ENSOTSG00005006924)	ENSOTSG00005006917
Coho salmon	MODERN SPECIES	5	SCML4 (ENSOKIG00005024420)	ENSOKIG00005024433	FBXO30 (ENSOKIG00005024440)	GRM1 (ENSOKIG00005024470)	STXBP5 (ENSOKIG00005025216)	ddo (ENSOKIG00005029968)	ENSOKIG00005030002	ENSOKIG00005030018	stx11a (ENSOKIG00005030036)	ENSOKIG00005030050	rmnd1 (ENSOKIG00005030139)	ENSOKIG00005031763	TULP4 (ENSOKIG00005043960)	slc18b1 (ENSOKIG00005044003)	ENSOKIG00005044070	OTOF (ENSOKIG00005044164) ##22	mapre3a (ENSOKIG00005044633) #15	dpysl5a (ENSOKIG00005044657) #16	dnmt3ab (ENSOKIG00005044965)	dtnbb (ENSOKIG00005046666)	ENSOKIG00005047024	ENSOKIG00005047031	hadhab (ENSOKIG00005047072)	slc30a1b (ENSOKIG00005047249)	ENSOKIG00005047400	ENSOKIG00005048203	nkx2.1 (ENSOKIG00005048207)	NKX2-8 (ENSOKIG00005048212)	pax9 (ENSOKIG00005048217)	ENSOKIG00005048236	slc25a21 (ENSOKIG00005048242)
Northern pike	MODERN SPECIES	14	ENSELUG00000019278	ddo (ENSELUG00000024792)	zbtb24 (ENSELUG00000019305)	stx11a (ENSELUG00000019317)	ENSELUG00000019325	rmnd1 (ENSELUG00000019358)	CCDC170 (ENSELUG00000000825)	ENSELUG00000020147	ENSELUG00000020284	TULP4 (ENSELUG00000020361)	slc18b1 (ENSELUG00000020386)	ahi1 (ENSELUG00000020418)	ENSELUG00000020442	ENSELUG00000020462	ENSELUG00000020480	OTOF (ENSELUG00000020563) ##22	mapre3a (ENSELUG00000020621) #15	dpysl5a (ENSELUG00000020654) #16	dnmt3ab (ENSELUG00000020827)	dtnbb (ENSELUG00000020995)	ASXL2 (ENSELUG00000021024)	kif3cb (ENSELUG00000021061)	hadhab (ENSELUG00000001109)	slc30a1b (ENSELUG00000021161)	ENSELUG00000021187	RPS6KA5 (ENSELUG00000021270)	mbip (ENSELUG00000021316)	nkx2.1 (ENSELUG00000021339)	NKX2-8 (ENSELUG00000032728)	pax9 (ENSELUG00000021362)	slc25a21 (ENSELUG00000021444)
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	272																ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000156484.b.e.a	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156975.e.b	ENSGT00970000197437	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	293																ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000156484.b.e.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000158401.f	ENSGT00730000111244.a.a	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT00940000153467.a.a	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT00730000111123	ENSGT01030000234595.A.b.a.a
Denticle herring	MODERN SPECIES		jkamp (ENSDCDG00000015442)	GPR135 (ENSDCDG00000015441)	ENSDCDG00000015440	ENSDCDG00000015434	sdsl (ENSDCDG00000015433)	ENSDCDG00000015432	ENSDCDG00000015431	ENSDCDG00000015424	plaat1l (ENSDCDG00000015418)	ENSDCDG00000015417	PTK2B (ENSDCDG00000015072)	GJE1 (ENSDCDG00000015050)	txlnbb (ENSDCDG00000015046)	DCTN1 (ENSDCDG00000004926)	ENSDCDG00000004744	OTOF (ENSDCDG00000004576) ##22	metap1 (ENSDCDG00000004459)	adh8a (ENSDCDG00000004391)	elavl2 (ENSDCDG00000004298)	SHPRH (ENSDCDG00000004007)	CAAP1 (ENSDCDG00000003981)	ENSDCDG00000003979	PTPRD (ENSDCDG00000034628)	TYRP1 (ENSDCDG00000034559)	LURAP1L (ENSDCDG00000034558)	MPDZ (ENSDCDG00000034214)	ENSDCDG00000031518	ENSDCDG00000031443	ENSDCDG00000031441	ENSDCDG00000031359	SLC24A2 (ENSDCDG00000031308)
Atlantic herring	MODERN SPECIES	5	zmpste24 (ENSCHAG00000017558)	ENSCHAG00000017664	ENSCHAG00000017697	atp5if1b (ENSCHAG00000017730)	rpl13a (ENSCHAG00000017737)	ENSCHAG00000017868	ENSCHAG00000018250	ENSCHAG00000018259	ENSCHAG00000018268	ENSCHAG00000018276	SYT16 (ENSCHAG00000018284)	snapc1b (ENSCHAG00000018292)	ENSCHAG00000018304	ENSCHAG00000018321	ENSCHAG00000018346	OTOF (ENSCHAG00000000406) ##22	mapre3a (ENSCHAG00000000501) #15	dpysl5a (ENSCHAG00000000568) #16	dnmt3ab (ENSCHAG00000001499)	ENSCHAG00000006987	dtnbb (ENSCHAG00000007033)	ENSCHAG00000008222	kif3cb (ENSCHAG00000008255)	slc30a1b (ENSCHAG00000008322)	rmnd1 (ENSCHAG00000008338)	ZBTB2 (ENSCHAG00000008565)	ENSCHAG00000008579	stx11a (ENSCHAG00000008606)	ENSCHAG00000008612	fbxo30a (ENSCHAG00000008643)	SHPRH (ENSCHAG00000008680)
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	113	ENSGT00940000159462.a.a	ENSGT00390000001830	ENSGT00940000158591.g.b	ENSGT00390000003365.b	ENSGT00440000037341.b.a	ENSGT00940000159180	ENSGT00940000155643.c.b.a	ENSGT00390000018465	ENSGT00420000029820	ENSGT00940000156668	ENSGT00940000154710.a.b.b.n.b.b	ENSGT00940000156499.b	ENSGT00390000013444.a.a.w	ENSGT00940000156065.a	ENSGT00940000159502	ENSGT00940000155086.A ##22
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00940000158591.g.b	ENSGT00390000003365.b	ENSGT00440000037341.b.a	ENSGT00940000159180	ENSGT00940000155643.d	ENSGT00390000018465	ENSGT00420000029820	ENSGT00940000156668	ENSGT00940000154710.a.b.b.n.b.b	ENSGT00940000154710.a.b.b.n.a.a	ENSGT01090000260005.a.b.a.b.a.b	ENSGT00940000156499.a.a	ENSGT00390000013444.a.a.w	ENSGT00940000156065.a	ENSGT00940000159502	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00950000182856.a.b.a	ENSGT00940000153511.b.q	ENSGT00390000012242	ENSGT00950000183034.C.a.b	ENSGT00390000011376	ENSGT00940000156096.e.a	ENSGT00940000155613	ENSGT00390000014113	ENSGT00940000156147.d	ENSGT01100000263537.b.b.c.a.b	ENSGT01030000234534.A.c.a	ENSGT01030000234534.A.c.b.b.a	ENSGT01030000234534.A.c.b.a	ENSGT00700000106116.a.b	ENSGT00390000013762.b.a.a.b
Channel catfish	MODERN SPECIES	28	serpina10 (ENSIPUG00000006996)	atxn3 (ENSIPUG00000006959)	ENSIPUG00000006915	fam98b (ENSIPUG00000006869)	SPRED1 (ENSIPUG00000006833)	meis2 (ENSIPUG00000006749)	c9h15orf41 (ENSIPUG00000006704)	dph6 (ENSIPUG00000006675)	aqr (ENSIPUG00000006431)	actc2 (ENSIPUG00000006384)	GJD2 (ENSIPUG00000006372)	stxbp6 (ENSIPUG00000006331)	fermt2 (ENSIPUG00000006242)	DDHD1 (ENSIPUG00000006149)	bmp4 (ENSIPUG00000006124)	OTOF (ENSIPUG00000006030) ##22	snx14 (ENSIPUG00000005792)	syncripl (ENSIPUG00000005704)	cga (ENSIPUG00000005682)	znf292 (ENSIPUG00000005601)	ORC3 (ENSIPUG00000005513)	AKIRIN2 (ENSIPUG00000005484)	ptpn21 (ENSIPUG00000005279)	spata7 (ENSIPUG00000005205)	kcnk10b (ENSIPUG00000005180)	Bdkrb2 (ENSIPUG00000005169)	BDKRB2 (ENSIPUG00000005138)	C14orf132 (ENSIPUG00000005128)	TMEM151B (ENSIPUG00000005106)	sntg2 (ENSIPUG00000005059)	TPO (ENSIPUG00000005018)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00550000074847	ENSGT00940000159462.a.a	ENSGT00390000001830	ENSGT00940000158591.g.b	ENSGT00390000003365.b	ENSGT00440000037341.b.a	ENSGT00940000159180	ENSGT00940000155643.d	ENSGT00390000018465	ENSGT00420000029820	ENSGT00940000156668	ENSGT00940000156499.b	ENSGT00390000013444.a.a.w	ENSGT00940000156065.a	ENSGT00940000159502	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00950000182856.a.b.a	ENSGT00940000153511.b.q	ENSGT00390000012242	ENSGT00950000183034.C.a.b	ENSGT00390000011376	ENSGT00940000156096.e.a	ENSGT00940000155613	ENSGT00390000014113	ENSGT00940000156147.d	ENSGT01100000263537.b.b.c.a.b	ENSGT01030000234534.A.c.a	ENSGT01030000234534.A.c.b.b.a	ENSGT01030000234534.A.c.b.a	ENSGT00700000106116.a.b	ENSGT00390000013762.b.a.a.b
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00550000074847	ENSGT00940000159462.a.a	ENSGT00390000001830	ENSGT00940000158591.g.b	ENSGT00390000003365.b	ENSGT00440000037341.b.a	ENSGT00940000159180	ENSGT00940000155643.d	ENSGT00390000018465	ENSGT00420000029820	ENSGT00940000156668	ENSGT00940000156499.b	ENSGT00390000013444.a.a.w	ENSGT00940000156065.a	ENSGT00940000159502	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00950000182856.a.b.a	ENSGT00940000153511.b.q	ENSGT00390000012242	ENSGT00950000183034.C.a.b	ENSGT00390000011376	ENSGT00940000156096.e.a	ENSGT00940000155613	ENSGT00390000014113	ENSGT00940000156147.d	ENSGT01100000263537.b.b.c.a.b	ENSGT01030000234534.A.c.a	ENSGT01030000234534.A.c.b.b.a	ENSGT01030000234534.A.c.b.a	ENSGT00700000106116.a.b	ENSGT00390000013762.b.a.a.b
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	16	SERPINA10 (ENSPNAG00000001266)	atxn3 (ENSPNAG00000008945)	GABRR1 (ENSPNAG00000008919)	PM20D2 (ENSPNAG00000001236)	fam98b (ENSPNAG00000008893)	spred1 (ENSPNAG00000008822)	MEIS2 (ENSPNAG00000008803)	cdin1 (ENSPNAG00000008771)	dph6 (ENSPNAG00000008737)	aqr (ENSPNAG00000001173)	ENSPNAG00000001149	stxbp6 (ENSPNAG00000001143)	fermt2 (ENSPNAG00000008641)	DDHD1 (ENSPNAG00000008579)	bmp4 (ENSPNAG00000008552)	OTOF (ENSPNAG00000008540) ##22	SNX14 (ENSPNAG00000008484)	syncripl (ENSPNAG00000000907)	cga (ENSPNAG00000008318)	znf292a (ENSPNAG00000000883)	orc3 (ENSPNAG00000008303)	AKIRIN2 (ENSPNAG00000008291)	PTPN21 (ENSPNAG00000000852)	ENSPNAG00000000811	kcnk10b (ENSPNAG00000000794)	ENSPNAG00000000787	bdkrb1 (ENSPNAG00000008218)	BDKRB2 (ENSPNAG00000000780)	C14orf132 (ENSPNAG00000000777)	TMEM151B (ENSPNAG00000008200)	sntg2 (ENSPNAG00000000765)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	24	DDX24 (ENSAMXG00000014635)	SERPINA10 (ENSAMXG00000036511)	atxn3 (ENSAMXG00000035805)	GABRR1 (ENSAMXG00000014673)	PM20D2 (ENSAMXG00000043881)	fam98b (ENSAMXG00000014694)	spred1 (ENSAMXG00000030050)	MEIS2 (ENSAMXG00000014706)	cdin1 (ENSAMXG00000014715)	dph6 (ENSAMXG00000014741)	aqr (ENSAMXG00000014751)	ENSAMXG00000038077	STXBP6 (ENSAMXG00000014763)	fermt2 (ENSAMXG00000042847)	DDHD1 (ENSAMXG00000014813)	OTOF (ENSAMXG00000014833) ##22	bmp4 (ENSAMXG00000038238)	SNX14 (ENSAMXG00000014858)	syncripl (ENSAMXG00000030806)	cga (ENSAMXG00000043908)	znf292a (ENSAMXG00000030465)	orc3 (ENSAMXG00000014871)	AKIRIN2 (ENSAMXG00000040898)	PTPN21 (ENSAMXG00000014876)	ENSAMXG00000014879	kcnk10b (ENSAMXG00000014880)	GPR65 (ENSAMXG00000026332)	ENSAMXG00000039290	ENSAMXG00000043348	ENSAMXG00000032555	bdkrb1 (ENSAMXG00000026333)
Electric eel	MODERN SPECIES	60										aqr (ENSEEEG00000008519)	gjd2b (ENSEEEG00000009209)	stxbp6 (ENSEEEG00000009211)	fermt2 (ENSEEEG00000009216)	DDHD1 (ENSEEEG00000009406)	bmp4 (ENSEEEG00000009409)	OTOF (ENSEEEG00000009419) ##22	SNX14 (ENSEEEG00000009426)	ENSEEEG00000009427	syncripl (ENSEEEG00000009429)	cga (ENSEEEG00000009452)	ENSEEEG00000009488	znf292a (ENSEEEG00000009490)	orc3 (ENSEEEG00000009493)	akirin2 (ENSEEEG00000009498)	PTPN21 (ENSEEEG00000009499)	ENSEEEG00000009501	kcnk10b (ENSEEEG00000009504)	GPR65 (ENSEEEG00000009514)	bdkrb1 (ENSEEEG00000009516)	BDKRB2 (ENSEEEG00000009522)	C14orf132 (ENSEEEG00000009523)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	118	ENSGT00940000164908	ENSGT00940000157666	ENSGT00940000155671.y.a	ENSGT00730000111137	ENSGT00390000002448	ENSGT00390000008195	ENSGT00940000158751	ENSGT00770000120838.B.c	ENSGT00940000156891.a.a	ENSGT00940000156668	ENSGT00390000013444.a.a.w	ENSGT00940000156499.a.a	ENSGT00390000013444.a.a.x	ENSGT00940000156065.a	ENSGT00940000159502	ENSGT00940000155086.A ##22
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	352	ENSGT00940000155671.y.a.h	ENSGT00730000111137.h	ENSGT00390000002448.e.a	ENSGT00390000008195	ENSGT00940000158751	ENSGT00940000156891.a.a	ENSGT00940000156668	ENSGT01090000260005.a.b.a.b.a.b.i.b	ENSGT01090000260005.a.b.a.b.a.b.i.a	ENSGT00940000156499.a.a	ENSGT00390000013444.a.a.x	ENSGT00390000013444.a.a.w	ENSGT00940000156065.a	ENSGT00940000159502.d	ENSGT00940000155086.A.f ##22	ENSGT00940000155086.A.e.a ##22	ENSGT00940000153511.b.q.a	ENSGT00940000160947	ENSGT00390000011103.B	ENSGT00940000164930.a	ENSGT00940000155693.a.b	ENSGT01030000234625.B.d.c.a.b	ENSGT00390000010925	ENSGT00940000162910	ENSGT00940000155747.g.a.d	ENSGT00390000012060	ENSGT00940000153433.A.e.a.b	ENSGT00940000154790.b.a.b.f	ENSGT00930000151014.q.h	ENSGT00940000159057.j	ENSGT00390000012703.b
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	369					ENSGT00940000165425.a.b.b.b.a	ENSGT00940000156668	ENSGT01090000260005.a.b.a.b.a.b.i.a	ENSGT00940000156499.a.a	ENSGT00390000013444.a.a.x	ENSGT00390000013444.a.a.w	ENSGT00940000156065.a	ENSGT00940000159502.d	ENSGT00940000155086.A.e.b ##22	ENSGT00940000153511.b.q.b	ENSGT00900000143321	ENSGT00940000155086.A.e.a ##22	ENSGT00940000153511.b.q.a	ENSGT00940000160947	ENSGT00390000011103.B	ENSGT00940000164930.a.d	ENSGT00940000155693.a.b	ENSGT01030000234625.B.d.c.a.b	ENSGT00390000010925	ENSGT00940000162910	ENSGT00940000155747.g.a.d	ENSGT00390000012060	ENSGT00940000153433.A.e.a.b	ENSGT00940000154790.b.a.b.f	ENSGT00930000151014.q.h	ENSGT00940000159057.j	ENSGT00390000012703.b
Common carp reference	MODERN SPECIES	30	PXDN (ENSCCRG00000053432)	MYT1L (ENSCCRG00000028930)	eipr1 (ENSCCRG00000031934)	trappc12 (ENSCCRG00000025338)	adi1 (ENSCCRG00000025334)	psen1 (ENSCCRG00000075467)	ENSCCRG00000051900	ENSCCRG00000074153	ENSCCRG00000012861	aqr (ENSCCRG00000034110)	ENSCCRG00000066002	stxbp6 (ENSCCRG00000015301)	ENSCCRG00000064589	ENSCCRG00000082438	ENSCCRG00000037086	ENSCCRG00000075948 ##22	syncripl (ENSCCRG00000041944)	ENSCCRG00000078494	ENSCCRG00000053187	ENSCCRG00000059288	JDP2 (ENSCCRG00000061353)	FLVCR2 (ENSCCRG00000038972)	ERG28 (ENSCCRG00000038975)	ENSCCRG00000038024	tgfb3 (ENSCCRG00000002876)	ENSCCRG00000079793	IFT43 (ENSCCRG00000076096)	esrrb (ENSCCRG00000072814)	prox2 (ENSCCRG00000081041)	dlst (ENSCCRG00000070142)	ENSCCRG00000081462
Goldfish	MODERN SPECIES	8	zgc:113142 (ENSCARG00000007079)	PXDN (ENSCARG00000006354)	ENSCARG00000006248	eipr1 (ENSCARG00000006219)	ENSCARG00000006208	trappc12 (ENSCARG00000004849)	adi1 (ENSCARG00000004773)	psen1 (ENSCARG00000004748)	ENSCARG00000004741	PAPLN (ENSCARG00000004677)	aqr (ENSCARG00000003972)	ENSCARG00000003736	FERMT2 (ENSCARG00000003543)	DDHD1 (ENSCARG00000003493)	bmp4 (ENSCARG00000003482)	OTOF (ENSCARG00000003230) ##22	syncripl (ENSCARG00000003079)	ENSCARG00000003052	ENSCARG00000003051	ENSCARG00000003046	JDP2 (ENSCARG00000003043)	ENSCARG00000003042	FLVCR2 (ENSCARG00000003002)	ERG28 (ENSCARG00000002977)	ENSCARG00000002968	ENSCARG00000002959	tgfb3 (ENSCARG00000002952)	IFT43 (ENSCARG00000002944)	ENSCARG00000002940	esrrb (ENSCARG00000002898)	prox2 (ENSCARG00000002885)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	1104															ENSGT00940000159502.c	ENSGT00940000155086.A.e.b ##22	ENSGT00940000153511.b.q.b	ENSGT00900000143321
Goldfish	MODERN SPECIES	36	ENSCARG00000069739	spred1 (ENSCARG00000069750)	fam98b (ENSCARG00000017727)	GABRR1 (ENSCARG00000017769)	atxn3 (ENSCARG00000018176)	ENSCARG00000018503	ENSCARG00000018505	DDX24 (ENSCARG00000018522)	asb2b (ENSCARG00000018564)	exd1 (ENSCARG00000018576)	stxbp6 (ENSCARG00000018592)	fermt2 (ENSCARG00000018618)	DDHD1 (ENSCARG00000018788)	ENSCARG00000019798	bmp4 (ENSCARG00000019799)	OTOF (ENSCARG00000019825) ##22	syncripl (ENSCARG00000020068)	ENSCARG00000020266	ENSCARG00000020273	JDP2 (ENSCARG00000020278)	ENSCARG00000020286	ENSCARG00000020298	tgfb3 (ENSCARG00000020480)	esrrb (ENSCARG00000020490)	prox2 (ENSCARG00000020521)	dlst (ENSCARG00000020544)	RPS6KL1 (ENSCARG00000021487)	ENSCARG00000021500	ENSCARG00000021512	ENSCARG00000021522	ENSCARG00000021535
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	369								ENSGT00940000165425.a.b.b.b.a	ENSGT00940000156668	ENSGT01090000260005.a.b.a.b.a.b.i.a	ENSGT00940000156499.a.a	ENSGT00390000013444.a.a.x	ENSGT00390000013444.a.a.w	ENSGT00940000156065.a	ENSGT00940000159502.d	ENSGT00940000155086.A.e.b ##22	ENSGT00940000153511.b.q.b	ENSGT00900000143321	ENSGT00940000155086.A.e.a ##22	ENSGT00940000153511.b.q.a	ENSGT00940000160947	ENSGT00390000011103.B	ENSGT00940000164930.a.d	ENSGT00940000155693.a.b	ENSGT01030000234625.B.d.c.a.b	ENSGT00390000010925	ENSGT00940000162910	ENSGT00940000155747.g.a.d	ENSGT00390000012060	ENSGT00940000153433.A.e.a.b	ENSGT00940000154790.b.a.b.f
Common carp reference	MODERN SPECIES	4	ENSCCRG00000056311	ENSCCRG00000059450	zgc:113142 (ENSCCRG00000024349)	PXDN (ENSCCRG00000073385)	MYT1L (ENSCCRG00000068437)	ENSCCRG00000069368	eipr1 (ENSCCRG00000042196)	trappc12 (ENSCCRG00000019751)	psen1 (ENSCCRG00000019623)	ENSCCRG00000074885	ENSCCRG00000028247	ENSCCRG00000073360	FERMT2 (ENSCCRG00000046391)	ENSCCRG00000047748	BMP4 (ENSCCRG00000027803)	ENSCCRG00000063553 ##22	syncripl (ENSCCRG00000045720)	ENSCCRG00000039881	ENSCCRG00000057155	ENSCCRG00000080537	ENSCCRG00000058481	ENSCCRG00000050688	tgfb3 (ENSCCRG00000055181)	esrrb (ENSCCRG00000004324)	prox2 (ENSCCRG00000030011)	dlst (ENSCCRG00000030002)	RPS6KL1 (ENSCCRG00000058925)	ENSCCRG00000018057	ENSCCRG00000059612	ENSCCRG00000046666	ENSCCRG00000046921
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	352	ENSGT00940000157666.c	ENSGT00940000155671.y.a.h	ENSGT00730000111137.h	ENSGT00390000002448.e.a	ENSGT00390000008195	ENSGT00940000158751	ENSGT00940000156891.a.a	ENSGT00940000156668	ENSGT01090000260005.a.b.a.b.a.b.i.b	ENSGT01090000260005.a.b.a.b.a.b.i.a	ENSGT00940000156499.a.a	ENSGT00390000013444.a.a.x	ENSGT00390000013444.a.a.w	ENSGT00940000156065.a	ENSGT00940000159502.d	ENSGT00940000155086.A.f ##22	ENSGT00940000155086.A.e.a ##22	ENSGT00940000153511.b.q.a	ENSGT00940000160947	ENSGT00390000011103.B	ENSGT00940000164930.a	ENSGT00940000155693.a.b	ENSGT01030000234625.B.d.c.a.b	ENSGT00390000010925	ENSGT00940000162910	ENSGT00940000155747.g.a.d	ENSGT00390000012060	ENSGT00940000153433.A.e.a.b	ENSGT00940000154790.b.a.b.f	ENSGT00930000151014.q.h	ENSGT00940000159057.j
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155086.A.f ##22
Golden-line barbel	DUPLICATION
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	119	odc1 (ENSSGRG00000043158)	nol10 (ENSSGRG00000043161)	ATP6V1C2 (ENSSGRG00000043166)	CCR6 (ENSSGRG00000043170)	zgc:113142 (ENSSGRG00000043171)	PXDN (ENSSGRG00000043175)	MYT1L (ENSSGRG00000043184)	eipr1 (ENSSGRG00000043195)	trappc12 (ENSSGRG00000043239)	psen1 (ENSSGRG00000043391)	ENSSGRG00000043395	stxbp6 (ENSSGRG00000043397)	fermt2 (ENSSGRG00000043420)	DDHD1 (ENSSGRG00000045041)	bmp4 (ENSSGRG00000045055)	OTOF (ENSSGRG00000045056) ##22	syncripl (ENSSGRG00000045057)	ENSSGRG00000045058	ENSSGRG00000045059	ENSSGRG00000045060	ENSSGRG00000045061	JDP2 (ENSSGRG00000045062)	FLVCR2 (ENSSGRG00000045064)	ENSSGRG00000045071	TGFB3 (ENSSGRG00000045073)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	971									ENSSGRG00000040302	nr1d4b (ENSSGRG00000040300)	FAIM2 (ENSSGRG00000040296)	ENSSGRG00000039860	ENSSGRG00000039856	ENSSGRG00000039855	bmp4 (ENSSGRG00000039849)	OTOF (ENSSGRG00000039844) ##22	syncripl (ENSSGRG00000038717)
Zebrafish	MODERN SPECIES	8	ENSDARG00000027867	aqr (ENSDARG00000016775)	ENSDARG00000067999	stxbp6 (ENSDARG00000088862)	fermt2 (ENSDARG00000020242)	DDHD1 (ENSDARG00000086808)	bmp4 (ENSDARG00000019995)	ENSDARG00000115992	ENSDARG00000053165	ENSDARG00000097685	ENSDARG00000097839	ENSDARG00000088298	ENSDARG00000100587	ENSDARG00000093378	ENSDARG00000088507	OTOF (ENSDARG00000020581) ##22	ENSDARG00000087251	syncripl (ENSDARG00000026723)	ENSDARG00000070526	acyp1 (ENSDARG00000060126)	ENSDARG00000040135	JDP2 (ENSDARG00000040137)	GALNT16 (ENSDARG00000053190)	vps39 (ENSDARG00000074471)	ENSDARG00000108812	ENSDARG00000115096	ENSDARG00000077712	ENSDARG00000116570	zgc:100951 (ENSDARG00000111442)	ENSDARG00000114211	ENSDARG00000109703
Osteoglossiformes	DUPLICATION
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00510000048701.b	ENSGT00950000182906.b.a.i.a	ENSGT01030000234595.A.b.a.a	ENSGT00730000111123	ENSGT00940000163723.B	ENSGT00950000183204.b.b.b.a	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00940000158133	ENSGT00940000154481.a.b.a	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000176900	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000156248.oc.a	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000155086.A.g ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.i #15	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.a.b	ENSGT00940000156975.d.a	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156484.b.c	ENSGT00390000017528	ENSGT00940000162504	ENSGT01090000260082.d.b.a	ENSGT00940000158248.a ##19	ENSGT00940000159665	ENSGT00950000183093.C.h	ENSGT00940000161139	ENSGT00940000167312	ENSGT00940000174492
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P. kingsleyae	MODERN SPECIES	34	ENSPKIG00000018051	fbxo30a (ENSPKIG00000018074)	ENSPKIG00000018096	ENSPKIG00000018135	stx11a (ENSPKIG00000018148)	zbtb2a (ENSPKIG00000018172)	esr1 (ENSPKIG00000018298)	ENSPKIG00000018556	ENSPKIG00000018656	ENSPKIG00000018696	ENSPKIG00000018887	TULP4 (ENSPKIG00000019154)	slc18b1 (ENSPKIG00000019233)	myb (ENSPKIG00000019287)	ahi1 (ENSPKIG00000019324)	OTOF (ENSPKIG00000019389) ##22	mapre3a (ENSPKIG00000019457) #15	dnmt3ab (ENSPKIG00000019638)	RAB10 (ENSPKIG00000019774)	hadhab (ENSPKIG00000019822)	pacc1 (ENSPKIG00000019895)	nenf (ENSPKIG00000019926)	tagapa (ENSPKIG00000019949)	ezra (ENSPKIG00000020002)	SYNCRIP (ENSPKIG00000020066)	SNX14 (ENSPKIG00000020125)	HTR1B (ENSPKIG00000020198)	ENSPKIG00000020228	myo6b (ENSPKIG00000020283)	colec11 (ENSPKIG00000020364)	ENSPKIG00000020407
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000156274	ENSGT00940000156248.oc.b	ENSGT00940000159413	ENSGT00950000183215.c.a.a	ENSGT00940000164948	ENSGT00950000183163.a.b	ENSGT00950000182941.a.a.a.a	ENSGT00950000182985.b.a	ENSGT00390000004348	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.A.h ##22	ENSGT00940000153804.A #23
Asian bonytongue	MODERN SPECIES		hbs1l (ENSSFOG00015017544)	MYB (ENSSFOG00015017613)	mtfr2 (ENSSFOG00015017810)	armc1l (ENSSFOG00015017825)	BCLAF1 (ENSSFOG00015017853)	MAP7 (ENSSFOG00015017910)	ENSSFOG00015018022	ppp1r14c (ENSSFOG00015018031)	iyd (ENSSFOG00015018043)	PLEKHG1 (ENSSFOG00015024237)	ENSSFOG00015018085	tcp1 (ENSSFOG00015018108)	acat2 (ENSSFOG00015018150)	wtap (ENSSFOG00015032191)	sod2 (ENSSFOG00015018195)	OTOF (ENSSFOG00015018253) ##22	drc1 (ENSSFOG00015018560) #23	foxi2 (ENSSFOG00015026749)	zfyve28 (ENSSFOG00015027771)	EIF2AK3 (ENSSFOG00015018609)	SLC4A11 (ENSSFOG00015018690)	ENSSFOG00015018852	dnaaf9 (ENSSFOG00015018879)	ATRN (ENSSFOG00015018905)	gfra4a (ENSSFOG00015018969)	cactin (ENSSFOG00015018985)	CDC25B (ENSSFOG00015019012)	ENSSFOG00015019027	ENSSFOG00015031121	smyd5 (ENSSFOG00015019050)	noto (ENSSFOG00015019115)
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	82	PDE7B (ENSPKIG00000023116)	mtfr2 (ENSPKIG00000023105)	armc1l (ENSPKIG00000023085)	ENSPKIG00000023071	BCLAF1 (ENSPKIG00000023059)	MAP7 (ENSPKIG00000022970)	ppp1r14c (ENSPKIG00000022914)	iyd (ENSPKIG00000022903)	PLEKHG1 (ENSPKIG00000022866)	tcp1 (ENSPKIG00000022823)	acat2 (ENSPKIG00000022793)	wtap (ENSPKIG00000022767)	wtap (ENSPKIG00000022748)	sod2 (ENSPKIG00000022722)	FNDC1 (ENSPKIG00000022686)	OTOF (ENSPKIG00000022619) ##22	fzd3a (ENSPKIG00000022575)	ENSPKIG00000022561	cdc42bpab (ENSPKIG00000022461)	lft1 (ENSPKIG00000022403)	ENSPKIG00000022375	hnrnpub (ENSPKIG00000022332)	KIF26B (ENSPKIG00000022242)	cnstb (ENSPKIG00000022184)	snap25a (ENSPKIG00000022134)	ankef1a (ENSPKIG00000022097)	EMILIN1 (ENSPKIG00000022077) #11	stmn4 (ENSPKIG00000022059)	il17a/f3 (ENSPKIG00000022047)	mcm3 (ENSPKIG00000021999)	paqr8 (ENSPKIG00000021982)
Vertebrata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155086.B ##22
Cyclostomata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155086.B ##22
Hagfish	MODERN SPECIES	684											ENSEBUG00000015103	alkbh7 (ENSEBUG00000005766)	ENSEBUG00000006445	ENSEBUG00000012483	ENSEBUG00000008491	ENSEBUG00000002914 ##22	ENSEBUG00000003273 #22	ENSEBUG00000012089 #22	ENSEBUG00000012420	ENSEBUG00000008381	ENSEBUG00000015551 ##11	ENSEBUG00000013744	ENSEBUG00000016151	ENSEBUG00000007154	elocb (ENSEBUG00000012727)	ube2wb (ENSEBUG00000014991)	MRPL13 (ENSEBUG00000007958)	ENSEBUG00000008872	ENSEBUG00000009777	ENSEBUG00000005247	RAE1 (ENSEBUG00000006793)
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	1702															ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	1397															ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	1168															ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	949															ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	1188															ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	140	ENSGT00650000094590	ENSGT00940000156248	ENSGT00940000159413	ENSGT00950000183215.c.a.a	ENSGT00940000164948	ENSGT00950000182941.a.a.a.a	ENSGT00950000182985.b.a	ENSGT00390000004348	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000166976	ENSGT00940000155086.B ##22
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	162													ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000166976	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000155646.n	ENSGT00940000154645.A	ENSGT00590000083139.d.b	ENSGT00940000158912.i	ENSGT00940000156528.d	ENSGT00940000167286	ENSGT00940000157766.b.b	ENSGT00940000159694.b	ENSGT00940000154482.b.b.a.d	ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.a	ENSGT01020000230401.a.a.b.a.a	ENSGT01020000230401.a.a.b.a.b	ENSGT00390000007686.b.c.a.d	ENSGT00390000007341.a	ENSGT00940000161931
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	130										ENSGT00940000162166	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000166976	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000155646.n	ENSGT00940000154645.A	ENSGT00590000083139.d.b	ENSGT00940000158912.i	ENSGT00940000156528.d	ENSGT00940000167286	ENSGT00940000157766.b.b	ENSGT00940000159694.b	ENSGT00940000154482.b.b.a.d	ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.a	ENSGT01020000230401.a.a.b.a.a	ENSGT00390000007686.b.c.a.d	ENSGT00390000007341.a	ENSGT00940000161931	ENSGT00940000155369.A.d.b
Denticle herring	DUPLICATION
Denticle herring	MODERN SPECIES	5	lin9 (ENSDCDG00000034335)	mixl1 (ENSDCDG00000034346)	acbd3 (ENSDCDG00000034347)	NHSL1 (ENSDCDG00000034352)	KIF25 (ENSDCDG00000034359)	acat2 (ENSDCDG00000034366)	wtap (ENSDCDG00000034379)	sod2 (ENSDCDG00000034388)	FNDC1 (ENSDCDG00000034402)	ENSDCDG00000020126	ENSDCDG00000020134	ENSDCDG00000020138	ENSDCDG00000020140	ENSDCDG00000020158	ENSDCDG00000020161	otofa (ENSDCDG00000020229) ##22	pdia6 (ENSDCDG00000020444)	hpcal1 (ENSDCDG00000020491)	ENSDCDG00000020506	ENSDCDG00000020508	pak6b (ENSDCDG00000020509)	myh6 (ENSDCDG00000020510)	ENSDCDG00000020511	slc25a29 (ENSDCDG00000020513)	ENSDCDG00000020514	DIO3 (ENSDCDG00000020515)	ppp2r5cb (ENSDCDG00000020612)	ENSDCDG00000026005	hsp90aa1.2 (ENSDCDG00000026024)	WDR20 (ENSDCDG00000026499)	mgat2 (ENSDCDG00000026503)
Denticle herring	MODERN SPECIES	77												ENSDCDG00000017500	ENSDCDG00000017507	ENSDCDG00000024708	ENSDCDG00000024715	otofa (ENSDCDG00000024741) ##22
Atlantic herring	MODERN SPECIES	6	PLCB1 (ENSCHAG00000024398)	PLCB4 (ENSCHAG00000024198)	ENSCHAG00000024181	LAMP5 (ENSCHAG00000024174)	pak5 (ENSCHAG00000024155)	ENSCHAG00000024146	ENSCHAG00000024122	ENSCHAG00000024110	ENSCHAG00000024106	wtap (ENSCHAG00000024098)	sod2 (ENSCHAG00000024076)	ENSCHAG00000024071	GOLT1B (ENSCHAG00000024066)	FNDC1 (ENSCHAG00000023976)	ENSCHAG00000023973	otofa (ENSCHAG00000023495) ##22	pdia6 (ENSCHAG00000022895)	hpcal1 (ENSCHAG00000022860)	ENSCHAG00000022735	ENSCHAG00000022706	ENSCHAG00000022619	ENSCHAG00000022570	MDGA2 (ENSCHAG00000022235)	ENSCHAG00000022209	mgat2 (ENSCHAG00000022193)	WDR20 (ENSCHAG00000022188)	hsp90aa1.2 (ENSCHAG00000018997)	ENSCHAG00000021898	ENSCHAG00000018964	ENSCHAG00000018958	slc25a47a (ENSCHAG00000018918)
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	151													ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000166976	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000155646.n	ENSGT00940000154645.A	ENSGT00590000083139.d.b.fb	ENSGT00940000158912.i	ENSGT00940000156528.d	ENSGT00940000167286	ENSGT00940000157766.b.b	ENSGT00940000159694.b	ENSGT00940000154482.b.b.a.d	ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.a	ENSGT01020000230401.a.a.b.a.a	ENSGT01020000230401.a.a.b.a.b	ENSGT00390000007686.b.c.a.d	ENSGT00390000007341.a	ENSGT00940000161931
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	118									ENSGT00940000160412.a	ENSGT00940000162166	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000166976	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000155646.n	ENSGT00940000154645.A	ENSGT00590000083139.d.b.fb	ENSGT00940000158912.i	ENSGT00940000156528.d	ENSGT00940000167286	ENSGT00940000157766.b.b	ENSGT00940000154482.b.b.a.d	ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.a	ENSGT01020000230401.a.a.b.a.a	ENSGT01020000230401.a.a.b.a.b	ENSGT00390000007341.a	ENSGT00940000161931	ENSGT00940000155369.A.d.b	ENSGT00940000154514
Channel catfish	MODERN SPECIES	17	allc (ENSIPUG00000023088)	rps7 (ENSIPUG00000023071)	rnaseh1 (ENSIPUG00000023060)	myt1la (ENSIPUG00000023048)	fgfr1op (ENSIPUG00000023022)	ccr6a (ENSIPUG00000023019)	acbd3 (ENSIPUG00000023014)	nhsl1 (ENSIPUG00000022998)	hebp2 (ENSIPUG00000022989)	kif25 (ENSIPUG00000022979)	acat2 (ENSIPUG00000022947)	wtap (ENSIPUG00000022938)	SOD2 (ENSIPUG00000022934)	fndc1 (ENSIPUG00000022909)	c25h2orf70 (ENSIPUG00000022903)	otofa (ENSIPUG00000022878) ##22	pdia6 (ENSIPUG00000022856)	HPCAL1 (ENSIPUG00000022844)	apobb.1 (ENSIPUG00000022832)	ENSIPUG00000022824	pak6b (ENSIPUG00000022810)	myh6 (ENSIPUG00000022744)	slc25a29 (ENSIPUG00000022736)	DIO3 (ENSIPUG00000022732)	ppp2r5cb (ENSIPUG00000022710)	hsp90a.1 (ENSIPUG00000022238)	hsp90aa1.1 (ENSIPUG00000022194)	ENSIPUG00000022175	ENSIPUG00000022166	ENSIPUG00000022161	mgat2 (ENSIPUG00000022156)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157701.b	ENSGT00940000161652.b.b	ENSGT00390000001793	ENSGT00390000014122	ENSGT00390000003466	ENSGT00940000155671.y.b	ENSGT00390000007441	ENSGT01030000234667.b.f.a	ENSGT00940000160412.a	ENSGT00940000162166	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000166976	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000155646.n	ENSGT00940000154645.A	ENSGT00590000083139.d.b.fb	ENSGT00940000158912.i	ENSGT00940000156528.d	ENSGT00940000167286	ENSGT00940000157766.b.b	ENSGT00940000154482.b.b.a.d	ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.a	ENSGT01020000230401.a.a.b.a.a	ENSGT01020000230401.a.a.b.a.b	ENSGT00390000007341.a	ENSGT00940000161931	ENSGT00940000155369.A.d.b	ENSGT00940000154514
Electric eel	MODERN SPECIES	32	rps7 (ENSEEEG00000009739)	rnaseh1 (ENSEEEG00000009735)	cep43 (ENSEEEG00000009727)	ccr6a (ENSEEEG00000009725)	KBTBD11 (ENSEEEG00000009724)	acbd3 (ENSEEEG00000009692)	NHSL1 (ENSEEEG00000009690)	hebp2 (ENSEEEG00000009687)	ENSEEEG00000009686	acat2 (ENSEEEG00000009685)	wtap (ENSEEEG00000009684)	sod2 (ENSEEEG00000009496)	FNDC1 (ENSEEEG00000009480)	ENSEEEG00000009477	ENSEEEG00000009474	otofa (ENSEEEG00000009415) ##22	pdia6 (ENSEEEG00000009160)	hpcal1 (ENSEEEG00000009153)	apobb.1 (ENSEEEG00000009150)	ENSEEEG00000009147	pak6b (ENSEEEG00000009146)	ENSEEEG00000009145	slc25a29 (ENSEEEG00000009123)	ENSEEEG00000009122	ENSEEEG00000009121
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	130									ENSGT00940000160412.a	ENSGT00940000162166	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000166976	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000155646.n	ENSGT00590000083139.d.b.fb	ENSGT00940000158912.i	ENSGT00940000156528.d	ENSGT00940000167286	ENSGT00940000157766.b.b	ENSGT00940000154482.b.b.a.d	ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.a	ENSGT01020000230401.a.a.b.a.a	ENSGT01020000230401.a.a.b.a.b	ENSGT00390000007341.a	ENSGT00940000161931	ENSGT00940000155369.A.d.b	ENSGT00940000154514	ENSGT00390000007479
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	11	allc (ENSPNAG00000022422)	rps7 (ENSPNAG00000022404)	rnaseh1 (ENSPNAG00000022344)	myt1la (ENSPNAG00000022305)	cep43 (ENSPNAG00000003705)	ccr6a (ENSPNAG00000021944)	acbd3 (ENSPNAG00000021929)	NHSL1 (ENSPNAG00000021901)	hebp2 (ENSPNAG00000021771)	KIF25 (ENSPNAG00000021740)	acat2 (ENSPNAG00000021694)	wtap (ENSPNAG00000006471)	sod2 (ENSPNAG00000021603)	ENSPNAG00000021561	ENSPNAG00000021542	otofa (ENSPNAG00000021496) ##22	pdia6 (ENSPNAG00000021334)	hpcal1 (ENSPNAG00000021252)	apobb.1 (ENSPNAG00000021212)	ENSPNAG00000020829	pak6b (ENSPNAG00000020809)	myh6 (ENSPNAG00000020778)	slc25a29 (ENSPNAG00000020765)	ENSPNAG00000020754	ENSPNAG00000020743	ppp2r5cb (ENSPNAG00000020720)	hsp90aa1.2 (ENSPNAG00000020617)	hsp90aa1.1 (ENSPNAG00000020599)	mgat2 (ENSPNAG00000020516)	ENSPNAG00000020504	MDGA2 (ENSPNAG00000020408)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	18	ENSAMXG00000039837	myt1la (ENSAMXG00000001873)	cep43 (ENSAMXG00000002000)	ccr6a (ENSAMXG00000041469)	ENSAMXG00000043932	acbd3 (ENSAMXG00000002091)	NHSL1 (ENSAMXG00000002111)	hebp2 (ENSAMXG00000034618)	ENSAMXG00000002134	acat2 (ENSAMXG00000002149)	wtap (ENSAMXG00000030347)	sod2 (ENSAMXG00000040232)	FNDC1 (ENSAMXG00000002223)	ENSAMXG00000002234	ENSAMXG00000037436	otofa (ENSAMXG00000002401) ##22	pdia6 (ENSAMXG00000034339)	hpcal1 (ENSAMXG00000031838)	apobb.1 (ENSAMXG00000012267)	ENSAMXG00000012234	pak6b (ENSAMXG00000012204)	ENSAMXG00000029153	myh6 (ENSAMXG00000025295)	slc25a29 (ENSAMXG00000032847)	ENSAMXG00000029912	ENSAMXG00000025292	ppp2r5cb (ENSAMXG00000020584)	hsp90aa1.2 (ENSAMXG00000020572)	mgat2 (ENSAMXG00000025291)	ENSAMXG00000020569	ENSAMXG00000039635
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000153433.B.a.b	ENSGT00390000011270	ENSGT00390000008041.A	ENSGT00940000157219.f	ENSGT00940000164632.b.b.b	ENSGT00390000017067	ENSGT00940000155936.a.a	ENSGT00950000182963.a.a	ENSGT00940000160412.a	ENSGT00940000162166	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000166976	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000155646.n	ENSGT00940000154645.A	ENSGT00590000083139.d.b.fb	ENSGT00940000160723	ENSGT00530000063408.A	ENSGT00940000156778.l	ENSGT00510000048701.a	ENSGT00950000182906.b.a.i.b	ENSGT00390000014904	ENSGT00940000162477.c	ENSGT01030000234595.A.b.a.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00390000000663
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	271				ENSGT00940000155671.y.b.a	ENSGT00390000007441.f	ENSGT01030000234667.b.f.a.c	ENSGT00530000063651.a.o.b	ENSGT00950000182963.a.a.k.b	ENSGT00940000160412.a.a	ENSGT00940000162166.g.a	ENSGT01030000234626.B.qb	ENSGT00390000013931.e	ENSGT00390000011877.b	ENSGT00530000063558.B.e	ENSGT00940000166976	ENSGT00940000155086.B.c ##22	ENSGT00940000155646.n.a	ENSGT00940000154645.A.i	ENSGT00590000083139.d.b.fb.a	ENSGT00940000160723.j	ENSGT00530000063408.A.l.a	ENSGT00940000156778.l.c	ENSGT00510000048701.a.d	ENSGT00950000182906.b.a.i.b.d	ENSGT00390000014904.e	ENSGT00940000162477.c.g.a	ENSGT01030000234595.A.b.a.b.c	ENSGT00530000063929.a.b.g.b	ENSGT00530000063695.b.j	ENSGT00950000183168.B.b.c	ENSGT00390000000663.y
Goldfish	MODERN SPECIES	12	fam102bb (ENSCARG00000030428)	olfml2ba (ENSCARG00000030419)	atf6 (ENSCARG00000030397)	myt1la (ENSCARG00000030291)	ENSCARG00000030285	cep43 (ENSCARG00000030166)	ccr6a (ENSCARG00000030132)	acbd3 (ENSCARG00000030113)	NHSL1 (ENSCARG00000030063)	hebp2 (ENSCARG00000030029)	KIF25 (ENSCARG00000030013)	acat2 (ENSCARG00000029884)	wtap (ENSCARG00000029872)	sod2 (ENSCARG00000029851)	ENSCARG00000029838	otofa (ENSCARG00000029670) ##22	pdia6 (ENSCARG00000029220)	hpcal1 (ENSCARG00000029173)	apobb.1 (ENSCARG00000028946)	slc22a16 (ENSCARG00000028907)	usta (ENSCARG00000028867)	sash1a (ENSCARG00000028744)	stxbp5a (ENSCARG00000027250)	ADGB (ENSCARG00000027197)	rab32a (ENSCARG00000027172)	GRM1 (ENSCARG00000027150)	cd164 (ENSCARG00000027140)	cep57l1 (ENSCARG00000027130)	sesn1 (ENSCARG00000027028)	ARMC2 (ENSCARG00000026998)	foxo3b (ENSCARG00000026977)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	127	ENSGT00390000001793.c	ENSGT00390000003466.n	ENSGT00940000155671.y.b.a	ENSGT00390000007441.f	ENSGT01030000234667.b.f.a.c	ENSGT00530000063651.a.o.b	ENSGT00950000182963.a.a.k.b	ENSGT00940000160412.a.a	ENSGT00940000162166.h	ENSGT00940000162166.g.a	ENSGT01030000234626.B.qb	ENSGT00390000013931.e	ENSGT00390000011877.b	ENSGT00530000063558.B.e	ENSGT00940000166976	ENSGT00940000155086.B.c ##22	ENSGT00940000155646.n.a	ENSGT00940000154645.A.i	ENSGT00590000083139.d.b.fb.a	ENSGT00940000160723.j	ENSGT00530000063408.A.l.a	ENSGT00940000156778.l.c	ENSGT00510000048701.a.d	ENSGT00950000182906.b.a.i.b.d	ENSGT00390000014904.e	ENSGT00940000162477.c.g.a	ENSGT00940000162477.c.h	ENSGT01030000234595.A.b.a.b.c	ENSGT00530000063929.a.b.g.b	ENSGT00530000063695.b.j	ENSGT00950000183168.B.b.c
Common carp reference	MODERN SPECIES	34	ENSCCRG00000070367	rps7 (ENSCCRG00000012830)	ENSCCRG00000061716	rnaseh1 (ENSCCRG00000012828)	myt1la (ENSCCRG00000004110)	cep43 (ENSCCRG00000004734)	ccr6a (ENSCCRG00000079596)	acbd3 (ENSCCRG00000030468)	ENSCCRG00000079447	ENSCCRG00000036974	acat2 (ENSCCRG00000072282)	wtap (ENSCCRG00000061771)	sod2 (ENSCCRG00000079233)	FNDC1 (ENSCCRG00000036913)	ENSCCRG00000072273	otofa (ENSCCRG00000036895) ##22	pdia6 (ENSCCRG00000081509)	hpcal1 (ENSCCRG00000075624)	apobb.1 (ENSCCRG00000036877)	slc22a16 (ENSCCRG00000035150)	usta (ENSCCRG00000078488)	sash1a (ENSCCRG00000076668)	SAMD5 (ENSCCRG00000075853)	stxbp5a (ENSCCRG00000016687)	ADGB (ENSCCRG00000067547)	ENSCCRG00000032833	rab32a (ENSCCRG00000039767)	GRM1 (ENSCCRG00000048312)	cd164 (ENSCCRG00000033662)	cep57l1 (ENSCCRG00000020823)	sesn1 (ENSCCRG00000047614)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	361	allc (ENSSGRG00000028980)	rps7 (ENSSGRG00000028981)	rnaseh1 (ENSSGRG00000028989)	myt1la (ENSSGRG00000028996)	cep43 (ENSSGRG00000029019)	ccr6a (ENSSGRG00000029020)	acbd3 (ENSSGRG00000029022)	NHSL1 (ENSSGRG00000029030)	hebp2 (ENSSGRG00000029033)	KIF25 (ENSSGRG00000029034)	acat2 (ENSSGRG00000029036)	wtap (ENSSGRG00000029204)	sod2 (ENSSGRG00000029276)	FNDC1 (ENSSGRG00000029278)	ENSSGRG00000029279	otofa (ENSSGRG00000029285) ##22	pdia6 (ENSSGRG00000029433)	hpcal1 (ENSSGRG00000029484)	apobb.1 (ENSSGRG00000029494)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	420	ENSGT00940000161652.b.b.b.b.a	ENSGT00390000001793.d	ENSGT00390000014122.g	ENSGT00390000003466.m	ENSGT00940000155671.y.b.b	ENSGT00390000007441.e	ENSGT01030000234667.b.f.a.d	ENSGT00530000063651.a.o.a	ENSGT00950000182963.a.a.k.a	ENSGT00940000160412.a.b	ENSGT00940000162166.g.b	ENSGT01030000234626.B.pb	ENSGT00390000013931.f	ENSGT00390000011877.a	ENSGT00530000063558.B.f	ENSGT00940000155086.B.d ##22	ENSGT00940000155646.n.b	ENSGT00940000154645.A.j	ENSGT00590000083139.d.b.fb.b	ENSGT00940000160723.i	ENSGT00530000063408.A.l.b	ENSGT00940000156778.l.d
Goldfish	MODERN SPECIES	39	ptchd4 (ENSCARG00000028704)	ENSCARG00000028701	CNIH3 (ENSCARG00000028696)	lbr (ENSCARG00000028667)	enah (ENSCARG00000028652)	srp9 (ENSCARG00000028640)	ephx1 (ENSCARG00000028593)	slc5a6a (ENSCARG00000028559)	rpl7l1 (ENSCARG00000028530)	NCOA1 (ENSCARG00000028526)	ptrhd1 (ENSCARG00000028504)	slc25a27 (ENSCARG00000028491)	abracl (ENSCARG00000028484)	heca (ENSCARG00000028478)	TXLNB (ENSCARG00000028473)	otofa (ENSCARG00000027509) ##22	pdia6 (ENSCARG00000027241)	hpcal1 (ENSCARG00000027221)	apobb.1 (ENSCARG00000026897)	usta (ENSCARG00000026839)	sash1a (ENSCARG00000026673)	scyl3 (ENSCARG00000026640)	si:dkey-97o5.1 (ENSCARG00000026582)	zp3a.1 (ENSCARG00000026572)	si:dkey-51e6.1 (ENSCARG00000026563)	sele (ENSCARG00000026427)	ENSCARG00000026403	ENSCARG00000026377	rxrgb (ENSCARG00000026321)	THBS1 (ENSCARG00000025844)	gpr176 (ENSCARG00000025804)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155086.B.d ##22
Common carp reference	MODERN SPECIES	28	sox11b (ENSCCRG00000064255)	allc (ENSCCRG00000012846)	rps7 (ENSCCRG00000014352)	rnaseh1 (ENSCCRG00000014420)	myt1la (ENSCCRG00000064746)	cep43 (ENSCCRG00000074485)	ccr6a (ENSCCRG00000053257)	acbd3 (ENSCCRG00000036992)	ENSCCRG00000054161	ENSCCRG00000064494	acat2 (ENSCCRG00000076853)	wtap (ENSCCRG00000036927)	sod2 (ENSCCRG00000053850)	FNDC1 (ENSCCRG00000061407)	ENSCCRG00000009675	otofa (ENSCCRG00000036721) ##22	hpcal1 (ENSCCRG00000072721)	pdia6 (ENSCCRG00000035441)	apobb.1 (ENSCCRG00000036664)	slc22a16 (ENSCCRG00000033251)	usta (ENSCCRG00000074877)	sash1a (ENSCCRG00000035123)	SAMD5 (ENSCCRG00000071091)	stxbp5a (ENSCCRG00000015647)	rab32a (ENSCCRG00000053320)	GRM1 (ENSCCRG00000039754)	cd164 (ENSCCRG00000061578)	cep57l1 (ENSCCRG00000039740)	sesn1 (ENSCCRG00000022171)	ARMC2 (ENSCCRG00000047604)	foxo3b (ENSCCRG00000058998)
Zebrafish	MODERN SPECIES	12	allc (ENSDARG00000042562)	rps7 (ENSDARG00000042566)	rnaseh1 (ENSDARG00000042571)	myt1la (ENSDARG00000008209)	cep43 (ENSDARG00000003058)	ccr6a (ENSDARG00000087474)	acbd3 (ENSDARG00000042623)	NHSL1 (ENSDARG00000042627)	hebp2 (ENSDARG00000042630)	KIF25 (ENSDARG00000017532)	acat2 (ENSDARG00000007127)	wtap (ENSDARG00000042642)	sod2 (ENSDARG00000042644)	FNDC1 (ENSDARG00000002847)	ENSDARG00000089110	otofa (ENSDARG00000030832) ##22	pdia6 (ENSDARG00000009001)	hpcal1 (ENSDARG00000022763)	apobb.1 (ENSDARG00000022767)	slc22a16 (ENSDARG00000015869)	usta (ENSDARG00000006044)	sash1a (ENSDARG00000007179)	stxbp5a (ENSDARG00000002656)	ADGB (ENSDARG00000005595)	ENSDARG00000110912	rab32a (ENSDARG00000029036)	GRM1 (ENSDARG00000026796)	cd164 (ENSDARG00000013628)	cep57l1 (ENSDARG00000002826)	sesn1 (ENSDARG00000020693)	si:ch211-51a19.5 (ENSDARG00000094668)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	214													ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000166976	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000163305.b	ENSGT00940000178209	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00940000180091	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT01070000253766.A.a.a.b.a.b	ENSGT00940000154798.a.d.b	ENSGT00530000063426.b.b	ENSGT00940000155610.o.a
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00390000000663	ENSGT00940000161401	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00940000156693	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000157723.q.a	ENSGT00550000074878	ENSGT00940000167949	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT01030000234626.B.ub	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B.k	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00940000155086.A ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #15	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #16	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000166633	ENSGT00940000156484.b.e.a	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	144														ENSGT00530000063558.B.l	ENSGT00940000166976	ENSGT00940000155086.B.e ##22	ENSGT01100000263524.D.d.f	ENSGT01100000263524.C	ENSGT00390000011892.g.b	ENSGT00940000153311.a.b.b.f	ENSGT00390000001660.n	ENSGT00390000005318.b.b.a.j	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b.n	ENSGT00940000158824.h	ENSGT00950000182986.a.b.a.g.b	ENSGT00870000136554.dc.b	ENSGT00390000005826.a.b.h.b.b	ENSGT00440000033970.j	ENSGT00390000008327.n	ENSGT00390000013444.a.b.a.d
Huchen	MODERN SPECIES	1928															ENSHHUG00000011107	otofa (ENSHHUG00000011059) ##22	opn8a (ENSHHUG00000011015)
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000159634	ENSGT00530000063929.a.b.d	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00950000183168.B.b.a	ENSGT00940000161401.m.a.a.a	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000153609.b.db	ENSGT00940000156693.e	ENSGT00390000012341.c	ENSGT00940000157723.q.a	ENSGT00550000074878.ib.b	ENSGT01030000234626.B.ub	ENSGT00390000013931.m.b	ENSGT00530000063558.B.l	ENSGT00940000166976	ENSGT00940000155086.B.e ##22	ENSGT01100000263524.D.d.f	ENSGT01100000263524.C	ENSGT00390000011892.g.b	ENSGT00940000153311.a.b.b.f	ENSGT00390000001660.n	ENSGT00390000005318.b.b.a.j	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b.n	ENSGT00940000158824.h	ENSGT00950000182986.a.b.a.g.b	ENSGT00940000174827	ENSGT00390000005826.a.b.h.b.b	ENSGT00440000033970.j	ENSGT00390000008327.n	ENSGT00390000013444.a.b.a.d
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000159634	ENSGT00530000063929.a.b.d	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00950000183168.B.b.a	ENSGT00940000161401.m.a.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000153609.b.db	ENSGT00940000156693.e	ENSGT00390000012341.c	ENSGT00940000157723.q.a	ENSGT00550000074878.ib.b	ENSGT01030000234626.B.ub	ENSGT00390000013931.m.b	ENSGT00530000063558.B.l	ENSGT00940000166976	ENSGT00940000155086.B.e ##22	ENSGT01100000263524.D.d.f	ENSGT01100000263524.C	ENSGT00390000011892.g.b	ENSGT00940000153311.a.b.b.f	ENSGT00390000001660.n	ENSGT00390000005318.b.b.a.j	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b.n	ENSGT00940000158824.h	ENSGT00950000182986.a.b.a.g.b	ENSGT00940000174827	ENSGT00390000005826.a.b.h.b.b	ENSGT00440000033970.j	ENSGT00390000008327.n	ENSGT00390000013444.a.b.a.d
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	25	cep57l1 (ENSSSAG00000008398)	sesn1 (ENSSSAG00000008383)	foxo3b (ENSSSAG00000092355)	ENSSSAG00000109266	lace1 (ENSSSAG00000008348)	snx3 (ENSSSAG00000110792)	nr2e1 (ENSSSAG00000090271)	ENSSSAG00000114269	ostm1 (ENSSSAG00000008297)	plekhg1 (ENSSSAG00000008287)	TCPA (ENSSSAG00000008240)	acat2 (ENSSSAG00000096175)	wtap (ENSSSAG00000095056)	FNDC1 (ENSSSAG00000008223)	ENSSSAG00000091891	otofa (ENSSSAG00000061721) ##22	opn8a (ENSSSAG00000062094)	opn8b (ENSSSAG00000101895)	mmut (ENSSSAG00000062142)	fkbp1b (ENSSSAG00000097867)	cssa06h2orf44 (ENSSSAG00000062468)	mfsd2b (ENSSSAG00000062498)	ubxn2a (ENSSSAG00000084988)	ENSSSAG00000118824	atad2b (ENSSSAG00000062770)	KLHL29 (ENSSSAG00000066276)	ENSSSAG00000120004	ENSSSAG00000101039	ENSSSAG00000066632	gpcpd1 (ENSSSAG00000066803)	trmt6 (ENSSSAG00000067770)
River trout	MODERN SPECIES		ENSSTUG00000010407	ppil6 (ENSSTUG00000010282)	cep57l1 (ENSSTUG00000010265)	sesn1 (ENSSTUG00000010232)	foxo3b (ENSSTUG00000010224)	afg1lb (ENSSTUG00000010153)	snx3 (ENSSTUG00000010136)	nr2e1 (ENSSTUG00000010113)	OSTM1 (ENSSTUG00000010090)	PLEKHG1 (ENSSTUG00000010046)	tcp1 (ENSSTUG00000009987)	wtap (ENSSTUG00000009957)	ENSSTUG00000009949	ENSSTUG00000009942	ENSSTUG00000009933	otofa (ENSSTUG00000009472) ##22	opn8a (ENSSTUG00000009409)	opn8b (ENSSTUG00000009391)	fkbp1b (ENSSTUG00000009384)	wdcp (ENSSTUG00000009376)	mfsd2b (ENSSTUG00000009325)	UBXN2A (ENSSTUG00000009297)	ATAD2B (ENSSTUG00000007738)	KLHL29 (ENSSTUG00000007394)	TRIB2 (ENSSTUG00000007379)	ENSSTUG00000007366	ENSSTUG00000007202	gpcpd1 (ENSSTUG00000007087)	ENSSTUG00000007071	trmt6 (ENSSTUG00000007042)	ENSSTUG00000006892
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000159634	ENSGT00530000063929.a.b.d	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00950000183168.B.b.a	ENSGT00940000161401.m.a.a.a	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000153609.b.db	ENSGT00940000156693.e	ENSGT00390000012341.c	ENSGT00940000157723.q.a	ENSGT00550000074878.ib.b	ENSGT01030000234626.B.ub	ENSGT00390000013931.m.b	ENSGT00530000063558.B.l	ENSGT00940000166976	ENSGT00940000155086.B.e ##22	ENSGT01100000263524.D.d.f	ENSGT01100000263524.C	ENSGT00940000153311.a.b.b.f	ENSGT00390000001660.n	ENSGT00390000005318.b.b.a.j	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b.n	ENSGT00940000158824.h	ENSGT00950000182986.a.b.a.g.b	ENSGT00390000005826.a.b.h.b.b	ENSGT00440000033970.j	ENSGT00390000013444.a.b.a.d	ENSGT00940000155666.c.h	ENSGT00940000155428.a.k.b.a	ENSGT00940000156426.g.b
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000159634	ENSGT00530000063929.a.b.d	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00950000183168.B.b.a	ENSGT00940000161401.m.a.a.a	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000153609.b.db	ENSGT00940000156693.e	ENSGT00390000012341.c	ENSGT00940000157723.q.a	ENSGT00550000074878.ib.b	ENSGT01030000234626.B.ub	ENSGT00390000013931.m.b	ENSGT00530000063558.B.l	ENSGT00940000166976	ENSGT00940000155086.B.e ##22	ENSGT01100000263524.D.d.f	ENSGT01100000263524.C	ENSGT00940000153311.a.b.b.f	ENSGT00390000001660.n	ENSGT00390000005318.b.b.a.j	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b.n	ENSGT00940000158824.h	ENSGT00950000182986.a.b.a.g.b	ENSGT00390000005826.a.b.h.b.b	ENSGT00440000033970.j	ENSGT00390000013444.a.b.a.d	ENSGT00940000155666.c.h	ENSGT00940000155428.a.k.b.a	ENSGT00940000156426.g.b
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Chinook salmon	DUPLICATION
Chinook salmon	DUPLICATION
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Coho salmon	MODERN SPECIES	3	GRM1 (ENSOKIG00005021546)	ENSOKIG00005019438	ENSOKIG00005019359	ENSOKIG00005019289	ENSOKIG00005019255	ENSOKIG00005019242	PROX1 (ENSOKIG00005019222)	ENSOKIG00005019220	LIN9 (ENSOKIG00005019147)	ENSOKIG00005019123	ACBD3 (ENSOKIG00005019111)	sod2 (ENSOKIG00005019088)	WTAP (ENSOKIG00005019063)	ENSOKIG00005019053	ENSOKIG00005018674	otofa (ENSOKIG00005018306) ##22	drc1 (ENSOKIG00005018160) #23	opn8a (ENSOKIG00005018141)	mmut (ENSOKIG00005017867)	fkbp1b (ENSOKIG00005017818)	wdcp (ENSOKIG00005017807)	mfsd2b (ENSOKIG00005017661)	ATAD2B (ENSOKIG00005017483)	KLHL29 (ENSOKIG00005017421)	TRIB2 (ENSOKIG00005017406)	ENSOKIG00005017391	GZF1 (ENSOKIG00005017384)	NAPB (ENSOKIG00005037074)	gpcpd1 (ENSOKIG00005037034)	trmt6 (ENSOKIG00005036940)	ENSOKIG00005035863
Rainbow trout	MODERN SPECIES	29	ENSOMYG00000001665	ENSOMYG00000001328	ENSOMYG00000001313	ENSOMYG00000025173	ENSOMYG00000025048	ENSOMYG00000025006	ENSOMYG00000024977	ENSOMYG00000024937	ENSOMYG00000024864	ENSOMYG00000059774	ENSOMYG00000024771	wtap (ENSOMYG00000024720)	sod2 (ENSOMYG00000024260)	ENSOMYG00000053153	FNDC1 (ENSOMYG00000023817)	otofa (ENSOMYG00000022197) ##22	ENSOMYG00000021893 #23	opn8a (ENSOMYG00000057946)	mmut (ENSOMYG00000020771)	fkbp1b (ENSOMYG00000020645)	wdcp (ENSOMYG00000020639)	mfsd2b (ENSOMYG00000020521)	ENSOMYG00000065207	ATAD2B (ENSOMYG00000020455)	KLHL29 (ENSOMYG00000020417)	ENSOMYG00000020400	ENSOMYG00000020390	ENSOMYG00000020285	gpcpd1 (ENSOMYG00000020190)	trmt6 (ENSOMYG00000020149)	ENSOMYG00000019340
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00390000014904	ENSGT00940000162477.c.e.b	ENSGT01030000234595.A.b.a.b.a	ENSGT00940000153467.a.a.j	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.a.i	ENSGT00730000111244.a.b.d	ENSGT00940000158133.e	ENSGT00940000165510.c	ENSGT00940000154790.a.a.b.f	ENSGT00990000210479	ENSGT00390000003188.i	ENSGT00530000063651.a.c	ENSGT00390000013931.m.a	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B.k	ENSGT00940000155086.B.f ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT01100000263524.D.d.e	ENSGT00390000011892.g.a	ENSGT00940000153311.a.b.b.e	ENSGT00390000001660.m	ENSGT00390000005318.b.b.a.i	ENSGT00550000074694.b.m	ENSGT00940000158824.g	ENSGT00950000182986.a.b.a.g.a	ENSGT00870000136554.ec	ENSGT00390000005826.a.b.h.b.a	ENSGT00440000033970.i	ENSGT00390000008327.m	ENSGT00390000013444.a.b.a.c	ENSGT00940000155666.c.g
River trout	MODERN SPECIES	28	ENSSTUG00000013571	ENSSTUG00000013735	ENSSTUG00000014829	ENSSTUG00000014834	ENSSTUG00000014838	ENSSTUG00000014847	ENSSTUG00000014895	ENSSTUG00000014919	prox1a (ENSSTUG00000014925)	ENSSTUG00000014946	lin9 (ENSSTUG00000015004)	acbd3 (ENSSTUG00000016082)	wtap (ENSSTUG00000016092)	sod2 (ENSSTUG00000016111)	FNDC1 (ENSSTUG00000016260)	otofa (ENSSTUG00000016416) ##22	drc1 (ENSSTUG00000017081) #23	opn8a (ENSSTUG00000017153)	mmut (ENSSTUG00000017215)	fkbp1b (ENSSTUG00000017668)	wdcp (ENSSTUG00000017700)	mfsd2b (ENSSTUG00000017708)	ATAD2B (ENSSTUG00000017837)	KLHL29 (ENSSTUG00000019640)	TRIB2 (ENSSTUG00000019773)	GZF1 (ENSSTUG00000019776)	NAPB (ENSSTUG00000019797)	gpcpd1 (ENSSTUG00000019934)	trmt6 (ENSSTUG00000020111)	FERMT1 (ENSSTUG00000020187)	bmp2b (ENSSTUG00000020285)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	6	rab32a (ENSSSAG00000045918)	GRM1 (ENSSSAG00000045907)	ENSSSAG00000040169	ENSSSAG00000009650	ENSSSAG00000040053	ENSSSAG00000039839	ENSSSAG00000039737	ENSSSAG00000039664	ENSSSAG00000039610	ENSSSAG00000112855	ENSSSAG00000074661	ENSSSAG00000121592	wtap (ENSSSAG00000074636)	sod2 (ENSSSAG00000074606)	FNDC1 (ENSSSAG00000074589)	otofa (ENSSSAG00000074129) ##22	ENSSSAG00000074076 #23	ENSSSAG00000074073	mut (ENSSSAG00000073058)	wdcp (ENSSSAG00000073030)	mfsd2b (ENSSSAG00000072986)	ATAD2B (ENSSSAG00000072937)	KLHL29 (ENSSSAG00000072906)	ENSSSAG00000072904	ENSSSAG00000100739	ENSSSAG00000072825	gpcpd1 (ENSSSAG00000072758)	trmt6 (ENSSSAG00000096467)	FERMT1 (ENSSSAG00000072632)	bmp2b (ENSSSAG00000072612)	PLCB1 (ENSSSAG00000067988)
Huchen	MODERN SPECIES	266	STX11 (ENSHHUG00000004669)	akap12b (ENSHHUG00000004667)	zbtb2b (ENSHHUG00000004663)	ENSHHUG00000004603	esr1 (ENSHHUG00000004593)	prox1a (ENSHHUG00000004587)	ENSHHUG00000004559	ENSHHUG00000004551	ENSHHUG00000004557	lin9 (ENSHHUG00000004446)	acbd3 (ENSHHUG00000004442)	ENSHHUG00000004437	wtap (ENSHHUG00000004388)	sod2 (ENSHHUG00000004257)	FNDC1 (ENSHHUG00000004155)	otofa (ENSHHUG00000003900) ##22	drc1 (ENSHHUG00000003880) #23	opn8a (ENSHHUG00000003839)	mmut (ENSHHUG00000003789)	fkbp1b (ENSHHUG00000003777)	wdcp (ENSHHUG00000003774)	mfsd2b (ENSHHUG00000003617)	ENSHHUG00000003606	ENSHHUG00000003603
Northern pike	MODERN SPECIES	17	ADGB (ENSELUG00000016140)	rab32a (ENSELUG00000025173)	GRM1 (ENSELUG00000016044)	fbxo30b (ENSELUG00000016030)	ENSELUG00000016008	ENSELUG00000015901	EPM2A (ENSELUG00000025496)	UTRN (ENSELUG00000015837)	ENSELUG00000025739	wtap (ENSELUG00000015594)	sod2 (ENSELUG00000015514)	ENSELUG00000015477	ENSELUG00000031230	FNDC1 (ENSELUG00000015456)	ENSELUG00000015390	otofa (ENSELUG00000000557) ##22	ENSELUG00000014921	drc1 (ENSELUG00000018332) #23	ENSELUG00000033218	ENSELUG00000014888	tmem18 (ENSELUG00000014882)	alkal2a (ENSELUG00000000544)	acp1 (ENSELUG00000014797)	FAM110C (ENSELUG00000014630)	fbxo25 (ENSELUG00000014599)	ENSELUG00000014558	ENSELUG00000014548	SNX9 (ENSELUG00000014518)	ENSELUG00000031935	ENSELUG00000002357	ENSELUG00000005628
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	59	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00390000000663	ENSGT00940000161401	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00940000156693	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23
Cod	MODERN SPECIES	13	ENSGMOG00000022278	sesn1 (ENSGMOG00000005675)	ARMC2 (ENSGMOG00000005690)	foxo3b (ENSGMOG00000035821)	ENSGMOG00000024666	afg1lb (ENSGMOG00000016004)	snx3 (ENSGMOG00000016029)	nr2e1 (ENSGMOG00000016036)	OSTM1 (ENSGMOG00000016051)	ENSGMOG00000022936	TCP1 (ENSGMOG00000001647)	acat2 (ENSGMOG00000001630)	wtap (ENSGMOG00000001613)	sod2 (ENSGMOG00000001602)	FNDC1 (ENSGMOG00000001515)	otofa (ENSGMOG00000001446) ##22	drc1 (ENSGMOG00000001177) #23	paplnb (ENSGMOG00000001137)	ENSGMOG00000001125	smek1 (ENSGMOG00000001099)	mycn (ENSGMOG00000025424)	ENSGMOG00000013706	ENSGMOG00000026789	efhc1 (ENSGMOG00000013731)	ENSGMOG00000013745	ENSGMOG00000013767	ENSGMOG00000007002	ENSGMOG00000006986	ENSGMOG00000031013	zpax1 (ENSGMOG00000006955)	matn3a (ENSGMOG00000006942)
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000180091	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00940000178209	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	16	tram2 (ENSMMDG00005022412)	efhc1 (ENSMMDG00005022444)	ENSMMDG00005022446	ENSMMDG00005022447	mrpl19 (ENSMMDG00005022448)	mycn (ENSMMDG00005022449)	smek1 (ENSMMDG00005022460)	ENSMMDG00005022836	paplnb (ENSMMDG00005022838)	PLEKHG1 (ENSMMDG00005022840)	tcp1 (ENSMMDG00005022846)	acat2 (ENSMMDG00005022853)	wtap (ENSMMDG00005022860)	sod2 (ENSMMDG00005022866)	FNDC1 (ENSMMDG00005022994)	otofa (ENSMMDG00005023012) ##22	drc1 (ENSMMDG00005023125) #23	OSTM1 (ENSMMDG00005023128)	nr2e1 (ENSMMDG00005023129)	snx3 (ENSMMDG00005002559)	afg1lb (ENSMMDG00005002572)	foxo3b (ENSMMDG00005002624)	ENSMMDG00005002632	ARMC2 (ENSMMDG00005002639)	sesn1 (ENSMMDG00005002663)	cep57l1 (ENSMMDG00005002680)	cd164 (ENSMMDG00005002696)	ppil6 (ENSMMDG00005002718)	ENSMMDG00005002750	msgn1 (ENSMMDG00005002764)	si:ch211-51e12.7 (ENSMMDG00005002788)
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000180091	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00940000178209	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	123	si:ch73-111k22.2 (ENSHCOG00000002273)	ENSHCOG00000002280	ttc13 (ENSHCOG00000002318)	dpf3 (ENSHCOG00000002342)	wdr21 (ENSHCOG00000002355)	ZFYVE1 (ENSHCOG00000002367)	pigh (ENSHCOG00000002377)	rhov (ENSHCOG00000002381)	vps18 (ENSHCOG00000002395)	ino80 (ENSHCOG00000002445)	chac1 (ENSHCOG00000002454)	dll4 (ENSHCOG00000002495)	syndig1l (ENSHCOG00000002512)	vrtn (ENSHCOG00000002517)	ENSHCOG00000002693	otofa (ENSHCOG00000002805) ##22
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00940000178209	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000173939	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00940000178209	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000173939	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000180091	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000173939	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00940000176160	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000180091	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000173939	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT01070000253766.A.a.a.b.a.b	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	20	xkr5a (ENSKMAG00000016226)	tram2 (ENSKMAG00000016177)	efhc1 (ENSKMAG00000016043)	ENSKMAG00000015994	mrpl19 (ENSKMAG00000015967)	mycn (ENSKMAG00000015950)	smek1 (ENSKMAG00000015917)	ERH (ENSKMAG00000015901)	paplnb (ENSKMAG00000015873)	PLEKHG1 (ENSKMAG00000015816)	tcp1 (ENSKMAG00000015727)	acat2 (ENSKMAG00000015691)	wtap (ENSKMAG00000015655)	sod2 (ENSKMAG00000015554)	FNDC1 (ENSKMAG00000015455)	otofa (ENSKMAG00000015305) ##22	ENSKMAG00000015262 #23
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1613	ENSNFUG00015011982	EVA1A (ENSNFUG00015011976)	efhc1 (ENSNFUG00015011969)	MRPL19 (ENSNFUG00015011964)	mycn (ENSNFUG00015011955)	ENSNFUG00015011949	SMEK1 (ENSNFUG00015011795)	OLA.1317 (ENSNFUG00015011759)	paplnb (ENSNFUG00015011727)	PLEKHG1 (ENSNFUG00015011706)	TCP1 (ENSNFUG00015011663)	WTAP (ENSNFUG00015011580)	SOD2 (ENSNFUG00015011560)	FNDC1 (ENSNFUG00015011516)	ENSNFUG00015011506	otofa (ENSNFUG00015010570) ##22	METTL24 (ENSNFUG00015010495)	CDC40 (ENSNFUG00015010408)	WASF1 (ENSNFUG00015010380)	CCDC167 (ENSNFUG00015010371)	GPR6 (ENSNFUG00015010365)	FIG4 (ENSNFUG00015009885)	ENSNFUG00015009830	ENSNFUG00015009793	TMEM18 (ENSNFUG00015009756)	ENSNFUG00015009748	ACP1 (ENSNFUG00015009710)	ENSNFUG00015009703	ENSNFUG00015009696	FAM110C (ENSNFUG00015009681)	FBXO25 (ENSNFUG00015009603)
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000180091	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000173939	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809	ENSGT00390000009045
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.C #22	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000155913.d
Mummichog	MODERN SPECIES	2240	tram2 (ENSFHEG00000022697)	efhc1 (ENSFHEG00000022840)	ENSFHEG00000022847	mrpl19 (ENSFHEG00000022887)	mycn (ENSFHEG00000022918)	smek1 (ENSFHEG00000022980)	ERH (ENSFHEG00000022994)	paplnb (ENSFHEG00000023004)	PLEKHG1 (ENSFHEG00000023038)	tcp1 (ENSFHEG00000023109)	acat2 (ENSFHEG00000023174)	wtap (ENSFHEG00000023365)	sod2 (ENSFHEG00000023363)	FNDC1 (ENSFHEG00000023360)	ENSFHEG00000023354 #22	ENSFHEG00000023352 ##22	OSTM1 (ENSFHEG00000023349)	nr2e1 (ENSFHEG00000023345)	snx3 (ENSFHEG00000023342)	afg1lb (ENSFHEG00000023340)	foxo3b (ENSFHEG00000023338)	ARMC2 (ENSFHEG00000023335)	sesn1 (ENSFHEG00000023330)	cep57l1 (ENSFHEG00000023326)	cd164 (ENSFHEG00000023325)	ppil6 (ENSFHEG00000023323)	ENSFHEG00000023320	ENSFHEG00000023319	msgn1 (ENSFHEG00000023318)	si:ch211-51e12.7 (ENSFHEG00000023316)	mrps10 (ENSFHEG00000023314)
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Chinese medaka	MODERN SPECIES	676	prep (ENSOSIG00000010859)	ENSOSIG00000010856	xkr5a (ENSOSIG00000010855)	tram2 (ENSOSIG00000010193)	ENSOSIG00000010174	mrpl19 (ENSOSIG00000010172)	mycn (ENSOSIG00000010146)	smek1 (ENSOSIG00000010125)	ERH (ENSOSIG00000010121)	paplnb (ENSOSIG00000010119)	PLEKHG1 (ENSOSIG00000010105)	tcp1 (ENSOSIG00000010100)	wtap (ENSOSIG00000010092)	sod2 (ENSOSIG00000010013)	FNDC1 (ENSOSIG00000010001)	otofa (ENSOSIG00000009904) ##22	OSTM1 (ENSOSIG00000009900)	nr2e1 (ENSOSIG00000009896)	snx3 (ENSOSIG00000009893)	afg1lb (ENSOSIG00000009890)	foxo3b (ENSOSIG00000009889)	ENSOSIG00000009887	ARMC2 (ENSOSIG00000009885)	sesn1 (ENSOSIG00000009546)	EFR3B (ENSOSIG00000009515)	ENSOSIG00000009514	ENSOSIG00000009511	parp1 (ENSOSIG00000008608)	lin9 (ENSOSIG00000007379)	mixl1 (ENSOSIG00000007374)	acbd3 (ENSOSIG00000007373)
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT01070000253766.A.a.a.b.a.b	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b.e	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000176160	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00390000002143.b.a	ENSGT00940000167206	ENSGT01030000234555.a.b.f.a	ENSGT00940000156058	ENSGT00390000003188	ENSGT00940000162190	ENSGT00530000063651.a
Indian medaka	MODERN SPECIES	22	tram2 (ENSOMEG00000006582)	efhc1 (ENSOMEG00000006600)	ENSOMEG00000006632	mrpl19 (ENSOMEG00000006661)	mycn (ENSOMEG00000000785)	smek1 (ENSOMEG00000006704)	ERH (ENSOMEG00000006713)	ENSOMEG00000006737	paplnb (ENSOMEG00000006760)	PLEKHG1 (ENSOMEG00000006809)	tcp1 (ENSOMEG00000006853)	acat2 (ENSOMEG00000006874)	wtap (ENSOMEG00000006907)	sod2 (ENSOMEG00000006930)	FNDC1 (ENSOMEG00000007225)	otofa (ENSOMEG00000007326) ##22	ENSOMEG00000007358	OSTM1 (ENSOMEG00000007371)	nr2e1 (ENSOMEG00000007396)	snx3 (ENSOMEG00000007412)	afg1lb (ENSOMEG00000007445)	foxo3b (ENSOMEG00000007462)	ENSOMEG00000007473	sesn1 (ENSOMEG00000007536)	EFR3B (ENSOMEG00000007711)	ENSOMEG00000007768	ENSOMEG00000007777	ENSOMEG00000007791	parp1 (ENSOMEG00000007822)	mixl1 (ENSOMEG00000007845)	lin9 (ENSOMEG00000007903)
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	16	tram2 (ENSOJAG00000023245)	efhc1 (ENSOJAG00000023264)	ENSOJAG00000023270	mrpl19 (ENSOJAG00000023277)	mycn (ENSOJAG00000023283)	smek1 (ENSOJAG00000023298)	ERH (ENSOJAG00000023329)	paplnb (ENSOJAG00000023337)	PLEKHG1 (ENSOJAG00000023344)	ENSOJAG00000015416	tcp1 (ENSOJAG00000015426)	acat2 (ENSOJAG00000015488)	wtap (ENSOJAG00000015544)	sod2 (ENSOJAG00000015572)	ENSOJAG00000015626	otofa (ENSOJAG00000015846) ##22	ENSOJAG00000016316	OSTM1 (ENSOJAG00000016324)	nr2e1 (ENSOJAG00000016346)	snx3 (ENSOJAG00000016432)	afg1lb (ENSOJAG00000016467)	foxo3b (ENSOJAG00000016575)	ARMC2 (ENSOJAG00000016586)	sesn1 (ENSOJAG00000016607)	ENSOJAG00000016707	EFR3B (ENSOJAG00000016735)	ENSOJAG00000017068	parp1 (ENSOJAG00000017082)	ENSOJAG00000017191	lin9 (ENSOJAG00000017273)	mixl1 (ENSOJAG00000017579)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00940000178209	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00940000178209	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT01070000253766.A.a.a.b.a.b	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT01070000253766.A.a.a.b.a.b	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01070000253766.A.a.a.b.a.b	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT01070000253766.A.a.a.b.a.b	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809
P. nyererei	MODERN SPECIES	336	efhc1 (ENSPNYG00000022525)	ENSPNYG00000022518	mrpl19 (ENSPNYG00000022512)	mycn (ENSPNYG00000022509)	smek1 (ENSPNYG00000022476)	ENSPNYG00000022461	paplnb (ENSPNYG00000022451)	ENSPNYG00000022442	ENSPNYG00000022434	tcp1 (ENSPNYG00000022378)	acat2 (ENSPNYG00000022364)	wtap (ENSPNYG00000022353)	sod2 (ENSPNYG00000022342)	ENSPNYG00000022334	ENSPNYG00000022331	otofa (ENSPNYG00000022307) ##22	drc1 (ENSPNYG00000022285) #23	OSTM1 (ENSPNYG00000022269)	nr2e1 (ENSPNYG00000022258)	snx3 (ENSPNYG00000022249)	afg1lb (ENSPNYG00000022230)	foxo3b (ENSPNYG00000022219)	ENSPNYG00000022211	ARMC2 (ENSPNYG00000022190)	sesn1 (ENSPNYG00000022168)	cep57l1 (ENSPNYG00000022144)	cd164 (ENSPNYG00000022135)	ppil6 (ENSPNYG00000022116)	ENSPNYG00000022108	ENSPNYG00000022097	msgn1 (ENSPNYG00000022089)
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT01100000263664.b.b	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT01030000234809	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000155913.d
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1097	tram2 (ENSMZEG00005018161)	efhc1 (ENSMZEG00005018159)	ENSMZEG00005018157	mrpl19 (ENSMZEG00005018154)	mycn (ENSMZEG00005018153)	smek1 (ENSMZEG00005018149)	ENSMZEG00005018146	paplnb (ENSMZEG00005018145)	PLEKHG1 (ENSMZEG00005018138)	tcp1 (ENSMZEG00005018125)	acat2 (ENSMZEG00005018127)	wtap (ENSMZEG00005018121)	sod2 (ENSMZEG00005018119)	ENSMZEG00005018117	FNDC1 (ENSMZEG00005018113)	otofa (ENSMZEG00005018102) ##22	ENSMZEG00005018096 #23	OSTM1 (ENSMZEG00005018095)	nr2e1 (ENSMZEG00005018093)	snx3 (ENSMZEG00005018091)	afg1lb (ENSMZEG00005018089)	foxo3b (ENSMZEG00005018088)	ENSMZEG00005018086	ENSMZEG00005018083	ARMC2 (ENSMZEG00005018080)	sesn1 (ENSMZEG00005018077)	cep57l1 (ENSMZEG00005018069)	cd164 (ENSMZEG00005018066)	ppil6 (ENSMZEG00005018062)	ENSMZEG00005018061	si:ch211-51e12.7 (ENSMZEG00005018058)
Eastern happy	MODERN SPECIES	6	efhc1 (ENSACLG00000021421)	ENSACLG00000021389	mrpl19 (ENSACLG00000021351)	mycn (ENSACLG00000021336)	smek1 (ENSACLG00000021261)	ENSACLG00000021247	paplnb (ENSACLG00000021209)	PLEKHG1 (ENSACLG00000021076)	tcp1 (ENSACLG00000020965)	acat2 (ENSACLG00000020918)	wtap (ENSACLG00000020899)	sod2 (ENSACLG00000020876)	ENSACLG00000020862	ENSACLG00000020851	FNDC1 (ENSACLG00000020762)	otofa (ENSACLG00000020643) ##22	ENSACLG00000020606 #23	OSTM1 (ENSACLG00000020598)	nr2e1 (ENSACLG00000020548)	snx3 (ENSACLG00000020523)	afg1lb (ENSACLG00000020466)	foxo3b (ENSACLG00000020458)	ARMC2 (ENSACLG00000020440)	sesn1 (ENSACLG00000020406)	cep57l1 (ENSACLG00000020390)	cd164 (ENSACLG00000020330)	ppil6 (ENSACLG00000020307)	ENSACLG00000020249	ENSACLG00000020219	mrps10 (ENSACLG00000020200)	tulp4a (ENSACLG00000020125)
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	312	tram2 (ENSHBUG00000014095)	efhc1 (ENSHBUG00000014062)	ENSHBUG00000014054	mrpl19 (ENSHBUG00000014044)	mycn (ENSHBUG00000014040)	smek1 (ENSHBUG00000014012)	ENSHBUG00000013942	paplnb (ENSHBUG00000013931)	PLEKHG1 (ENSHBUG00000013918)	tcp1 (ENSHBUG00000013899)	acat2 (ENSHBUG00000013808)	wtap (ENSHBUG00000001138)	sod2 (ENSHBUG00000013750)	FNDC1 (ENSHBUG00000013724)	ENSHBUG00000013701	otofa (ENSHBUG00000013680) ##22	drc1 (ENSHBUG00000013557) #23	OSTM1 (ENSHBUG00000013547)	nr2e1 (ENSHBUG00000013534)	snx3 (ENSHBUG00000013497)	afg1lb (ENSHBUG00000013479)	foxo3b (ENSHBUG00000000399)	ARMC2 (ENSHBUG00000000398)	sesn1 (ENSHBUG00000013443)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	314	efhc1 (ENSNBRG00000019997)	ENSNBRG00000019983	mrpl19 (ENSNBRG00000019970)	mycn (ENSNBRG00000019959)	smek1 (ENSNBRG00000019921)	ENSNBRG00000019894	paplnb (ENSNBRG00000019859)	ENSNBRG00000019846	tcp1 (ENSNBRG00000019787)	acat2 (ENSNBRG00000019737)	wtap (ENSNBRG00000019705)	sod2 (ENSNBRG00000019677)	ENSNBRG00000019660	ENSNBRG00000019648	ENSNBRG00000019637	otofa (ENSNBRG00000019524) ##22	ENSNBRG00000019483 #23	OSTM1 (ENSNBRG00000019471)	nr2e1 (ENSNBRG00000019443)	snx3 (ENSNBRG00000019406)	afg1lb (ENSNBRG00000019375)	foxo3b (ENSNBRG00000019364)	ARMC2 (ENSNBRG00000019334)	sesn1 (ENSNBRG00000019292)	cep57l1 (ENSNBRG00000019258)	cd164 (ENSNBRG00000019247)	ppil6 (ENSNBRG00000019209)	ENSNBRG00000019181	ENSNBRG00000019151	msgn1 (ENSNBRG00000019141)	ENSNBRG00000019116
Nile tilapia	MODERN SPECIES	6	xkr5a (ENSONIG00000014716)	tram2 (ENSONIG00000014718)	efhc1 (ENSONIG00000014725)	ENSONIG00000014730	mrpl19 (ENSONIG00000014731)	mycn (ENSONIG00000014735)	smek1 (ENSONIG00000014737)	ENSONIG00000027132	paplnb (ENSONIG00000014740)	PLEKHG1 (ENSONIG00000013238)	tcp1 (ENSONIG00000013244)	acat2 (ENSONIG00000013255)	wtap (ENSONIG00000013259)	sod2 (ENSONIG00000013263)	FNDC1 (ENSONIG00000013266)	otofa (ENSONIG00000013269) ##22	ENSONIG00000013276 #23	OSTM1 (ENSONIG00000013278)	nr2e1 (ENSONIG00000013281)	snx3 (ENSONIG00000013287)	afg1lb (ENSONIG00000013289)	foxo3b (ENSONIG00000013292)	ARMC2 (ENSONIG00000013293)	sesn1 (ENSONIG00000013301)	cep57l1 (ENSONIG00000013303)	cd164 (ENSONIG00000028394)	ENSONIG00000035914	ppil6 (ENSONIG00000013308)	ENSONIG00000013310	msgn1 (ENSONIG00000013311)	mrps10 (ENSONIG00000030627)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	271	tram2 (ENSACIG00000009677)	efhc1 (ENSACIG00000009608)	ENSACIG00000009591	ENSACIG00000009580	mrpl19 (ENSACIG00000009562)	mycn (ENSACIG00000009541)	smek1 (ENSACIG00000009497)	ENSACIG00000009424	paplnb (ENSACIG00000009378)	ENSACIG00000009358	tcp1 (ENSACIG00000009317)	acat2 (ENSACIG00000009288)	wtap (ENSACIG00000009155)	sod2 (ENSACIG00000009132)	FNDC1 (ENSACIG00000008997)	otofa (ENSACIG00000008893) ##22	ENSACIG00000008830	OSTM1 (ENSACIG00000008805)	nr2e1 (ENSACIG00000008784)	snx3 (ENSACIG00000008723)	afg1lb (ENSACIG00000008668)	foxo3b (ENSACIG00000008588)	ARMC2 (ENSACIG00000008500)	sesn1 (ENSACIG00000008468)	cep57l1 (ENSACIG00000008438)	cd164 (ENSACIG00000008424)	ppil6 (ENSACIG00000008390)	ENSACIG00000008370	ENSACIG00000008354	msgn1 (ENSACIG00000008345)	si:ch211-51e12.7 (ENSACIG00000008332)
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00940000178209	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00940000178209	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00390000016097.c	ENSGT00390000011890	ENSGT00940000157624.a	ENSGT00940000153635.B	ENSGT00900000141110	ENSGT00390000003855.b.e.b	ENSGT00940000167177	ENSGT00950000183147.A.a.g.b	ENSGT00390000007874	ENSGT01060000248799	ENSGT00940000157766.b.b	ENSGT00940000159694.b	ENSGT00940000154482.b.b.a.d	ENSGT00940000181419	ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.a
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	55	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00940000178209	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00390000016097.c	ENSGT00390000011890	ENSGT00940000157624.a	ENSGT00940000153635.B	ENSGT00900000141110	ENSGT00390000003855.b.e.b	ENSGT00940000167177	ENSGT00950000183147.A.a.g.b	ENSGT00390000007874	ENSGT01060000248799	ENSGT00940000157766.b.b	ENSGT00940000159694.b	ENSGT00940000154482.b.b.a.d	ENSGT00940000181419	ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.a
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1408							smek1 (ENSAOCG00000011257)	ERH (ENSAOCG00000011284)	paplnb (ENSAOCG00000011325)	ENSAOCG00000011356	tcp1 (ENSAOCG00000011419)	acat2 (ENSAOCG00000011461)	wtap (ENSAOCG00000011495)	sod2 (ENSAOCG00000011525)	FNDC1 (ENSAOCG00000011580)	otofa (ENSAOCG00000011718) ##22	ZFYVE1 (ENSAOCG00000011802)	pigh (ENSAOCG00000011836)
Orange clownfish	MODERN SPECIES	2	tram2 (ENSAPEG00000022143)	efhc1 (ENSAPEG00000022192)	ENSAPEG00000022427	ENSAPEG00000022432	mrpl19 (ENSAPEG00000022446)	mycn (ENSAPEG00000022477)	smek1 (ENSAPEG00000022492)	ERH (ENSAPEG00000022577)	paplnb (ENSAPEG00000022586)	ENSAPEG00000022606	tcp1 (ENSAPEG00000022617)	acat2 (ENSAPEG00000022680)	wtap (ENSAPEG00000022698)	sod2 (ENSAPEG00000022721)	ENSAPEG00000022735	otofa (ENSAPEG00000022763) ##22	ZFYVE1 (ENSAPEG00000022833)	pigh (ENSAPEG00000022860)	rhov (ENSAPEG00000022872)	vps18 (ENSAPEG00000022883)	ino80 (ENSAPEG00000022911)	chac1 (ENSAPEG00000022979)	dll4 (ENSAPEG00000023015)	syndig1l (ENSAPEG00000023081)	vrtn (ENSAPEG00000023134)	ENSAPEG00000023138	slc25a29 (ENSAPEG00000023144)	slc25a47a (ENSAPEG00000023150)	DIO3 (ENSAPEG00000023156)	ENSAPEG00000023162	ppp2r5cb (ENSAPEG00000023180)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	529																otofa (ENSAPOG00000012321) ##22	ZFYVE1 (ENSAPOG00000012367)	pigh (ENSAPOG00000012398)	rhov (ENSAPOG00000012419)	vps18 (ENSAPOG00000012470)	ino80 (ENSAPOG00000012586)	ENSAPOG00000012639	chac1 (ENSAPOG00000012676)	dll4 (ENSAPOG00000012832)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	1325										PLEKHG1 (ENSSPAG00000011477)	tcp1 (ENSSPAG00000011506)	acat2 (ENSSPAG00000011575)	wtap (ENSSPAG00000011600)	sod2 (ENSSPAG00000011621)	FNDC1 (ENSSPAG00000011652)	otofa (ENSSPAG00000011816) ##22
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00940000178209	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000173939	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT01070000253766.A.a.a.b.a.b	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809	ENSGT00390000009045
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT01070000253766.A.a.a.b.a.b	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809	ENSGT00390000009045
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01070000253766.A.a.a.b.a.b	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809	ENSGT00390000009045
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000180577	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809	ENSGT00390000009045.a
Greater amberjack	MODERN SPECIES	10	tram2 (ENSSDUG00000000462)	efhc1 (ENSSDUG00000000447)	mrpl19 (ENSSDUG00000000420)	mycn (ENSSDUG00000000413)	ENSSDUG00000000392	smek1 (ENSSDUG00000000333)	ENSSDUG00000000320	paplnb (ENSSDUG00000000272)	ENSSDUG00000000256	PLEKHG1 (ENSSDUG00000000241)	tcp1 (ENSSDUG00000000173)	acat2 (ENSSDUG00000000092)	wtap (ENSSDUG00000020070)	sod2 (ENSSDUG00000020057)	FNDC1 (ENSSDUG00000019950)	otofa (ENSSDUG00000019875) ##22	drc1 (ENSSDUG00000019839) #23	OSTM1 (ENSSDUG00000019798)	nr2e1 (ENSSDUG00000019776)	snx3 (ENSSDUG00000019760)	afg1lb (ENSSDUG00000019727)	foxo3b (ENSSDUG00000019718)	ARMC2 (ENSSDUG00000019699)	sesn1 (ENSSDUG00000019665)	cep57l1 (ENSSDUG00000019647)	cd164 (ENSSDUG00000019642)	ppil6 (ENSSDUG00000019625)	ENSSDUG00000019614	ENSSDUG00000019601	msgn1 (ENSSDUG00000019597)	si:ch211-51e12.7 (ENSSDUG00000019585)
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2858																otofa (ENSSLDG00000019608) ##22	ENSSLDG00000019663	OSTM1 (ENSSLDG00000019678)	nr2e1 (ENSSLDG00000019691)	snx3 (ENSSLDG00000019713)	afg1lb (ENSSLDG00000019730)	foxo3b (ENSSLDG00000019757)	ARMC2 (ENSSLDG00000019808)	sesn1 (ENSSLDG00000019836)	cep57l1 (ENSSLDG00000019878)	cd164 (ENSSLDG00000019912)	ppil6 (ENSSLDG00000019930)	ENSSLDG00000019952	msgn1 (ENSSLDG00000019975)	si:ch211-51e12.7 (ENSSLDG00000019984)	mrps10 (ENSSLDG00000019993)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	66	tram2 (ENSLCAG00010018539)	efhc1 (ENSLCAG00010018596)	ENSLCAG00010018604	mrpl19 (ENSLCAG00010018614)	ENSLCAG00010018617	ENSLCAG00010018621	smek1 (ENSLCAG00010018636)	ENSLCAG00010018662	paplnb (ENSLCAG00010018672)	PLEKHG1 (ENSLCAG00010018681)	tcp1 (ENSLCAG00010018702)	acat2 (ENSLCAG00010018750)	wtap (ENSLCAG00010018762)	sod2 (ENSLCAG00010018771)	FNDC1 (ENSLCAG00010018791)	otofa (ENSLCAG00010018817) ##22	ENSLCAG00010018863	drc1 (ENSLCAG00010018869) #23
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT01070000253766.A.a.a.b.a.b	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT00530000063528.A.a.k	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809	ENSGT00390000009045
Turbot	MODERN SPECIES	12	prep (ENSSMAG00000017534)	ENSSMAG00000017518	xkr5a (ENSSMAG00000017512)	tram2 (ENSSMAG00000017472)	ENSSMAG00000017458	ENSSMAG00000017419	ENSSMAG00000017409	mycn (ENSSMAG00000017400)	ENSSMAG00000017349	paplnb (ENSSMAG00000017290)	ENSSMAG00000017272	TCP1 (ENSSMAG00000017148)	wtap (ENSSMAG00000017133)	sod2 (ENSSMAG00000017117)	FNDC1 (ENSSMAG00000017056)	otofa (ENSSMAG00000016888) ##22	ENSSMAG00000016874 #23	OSTM1 (ENSSMAG00000016855)	nr2e1 (ENSSMAG00000016849)	snx3 (ENSSMAG00000024559)	afg1lb (ENSSMAG00000016829)	foxo3b (ENSSMAG00000016818)	ARMC2 (ENSSMAG00000016776)	sesn1 (ENSSMAG00000016729)	cep57l1 (ENSSMAG00000016719)	cd164 (ENSSMAG00000016703)	PPIL6 (ENSSMAG00000016607)	ENSSMAG00000016588	msgn1 (ENSSMAG00000016578)	si:ch211-51e12.7 (ENSSMAG00000016566)	mrps10 (ENSSMAG00000016563)
Tongue sole	MODERN SPECIES	17	prep (ENSCSEG00000000307)	lin28b (ENSCSEG00000000312)	paplnb (ENSCSEG00000000314)	ENSCSEG00000000321	smek1 (ENSCSEG00000000332)	mycn (ENSCSEG00000000346)	mrpl19 (ENSCSEG00000000349)	ENSCSEG00000000354	efhc1 (ENSCSEG00000000362)	efhc1 (ENSCSEG00000000379)	tcp1 (ENSCSEG00000000387)	acat2 (ENSCSEG00000000403)	wtap (ENSCSEG00000000408)	sod2 (ENSCSEG00000000427)	ENSCSEG00000000434	otofa (ENSCSEG00000000441) ##22	ENSCSEG00000000466 #23	chac1 (ENSCSEG00000000472)	dll4 (ENSCSEG00000000474)	ENSCSEG00000000478	vrtn (ENSCSEG00000000482)	slc25a29 (ENSCSEG00000000487)	slc25a47a (ENSCSEG00000000494)	DIO3 (ENSCSEG00000000497)	ppp2r5cb (ENSCSEG00000000502)	hsp90aa1.2 (ENSCSEG00000000515)	hsp90aa1.1 (ENSCSEG00000000594)	WDR20 (ENSCSEG00000001812)	mgat2 (ENSCSEG00000001816)	rps29 (ENSCSEG00000001818)	MDGA2 (ENSCSEG00000001820)
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT01070000253766.A.a.a.b.a.b	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809	ENSGT00390000009045
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	16	xkr5a (ENSMAMG00000006796)	tram2 (ENSMAMG00000024315)	efhc1 (ENSMAMG00000006869)	ENSMAMG00000006878	ENSMAMG00000006902	mycn (ENSMAMG00000006908)	ENSMAMG00000006925	ENSMAMG00000006967	paplnb (ENSMAMG00000007053)	ENSMAMG00000007068	TCP1 (ENSMAMG00000007085)	acat2 (ENSMAMG00000007108)	wtap (ENSMAMG00000027304)	sod2 (ENSMAMG00000007154)	FNDC1 (ENSMAMG00000007183)	otofa (ENSMAMG00000007209) ##22	ENSMAMG00000007292 #23	OSTM1 (ENSMAMG00000007316)	nr2e1 (ENSMAMG00000007321)	snx3 (ENSMAMG00000007349)	afg1lb (ENSMAMG00000025589)	foxo3b (ENSMAMG00000007377)	ARMC2 (ENSMAMG00000007384)	sesn1 (ENSMAMG00000007399)	cep57l1 (ENSMAMG00000007432)	cd164 (ENSMAMG00000007441)	PPIL6 (ENSMAMG00000007446)	ENSMAMG00000007461	msgn1 (ENSMAMG00000007470)	mrps10 (ENSMAMG00000007501)	tulp4a (ENSMAMG00000007526)
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT01070000253766.A.a.a.b.a.b	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809	ENSGT00390000009045
Climbing perch	MODERN SPECIES	15	xkr5a (ENSATEG00000014004)	tram2 (ENSATEG00000013975)	ENSATEG00000013913	ENSATEG00000027883	ENSATEG00000013886	mycn (ENSATEG00000029948)	ENSATEG00000013845	ENSATEG00000026335	paplnb (ENSATEG00000013766)	ENSATEG00000013758	TCP1 (ENSATEG00000013715)	acat2 (ENSATEG00000013681)	wtap (ENSATEG00000013657)	sod2 (ENSATEG00000013630)	FNDC1 (ENSATEG00000025404)	otofa (ENSATEG00000013468) ##22	ENSATEG00000013422 #23	OSTM1 (ENSATEG00000013366)	nr2e1 (ENSATEG00000013336)	snx3 (ENSATEG00000028012)	afg1lb (ENSATEG00000013291)	foxo3b (ENSATEG00000013282)	ARMC2 (ENSATEG00000013216)	sesn1 (ENSATEG00000013150)	cep57l1 (ENSATEG00000013115)	cd164 (ENSATEG00000013091)	PPIL6 (ENSATEG00000013027)	msgn1 (ENSATEG00000012980)	mrps10 (ENSATEG00000029736)	tulp4a (ENSATEG00000012950)	tmem181 (ENSATEG00000012888)
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00940000178209	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000173939	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00940000178209	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000173939	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	52									PLEKHG1 (ENSLBEG00000013520)	tcp1 (ENSLBEG00000013564)	ENSLBEG00000013623	acat2 (ENSLBEG00000013733)	wtap (ENSLBEG00000013802)	sod2 (ENSLBEG00000013851)	ENSLBEG00000013873	otofa (ENSLBEG00000014067) ##22	ENSLBEG00000014359 #23	OSTM1 (ENSLBEG00000014388)	nr2e1 (ENSLBEG00000014424)	snx3 (ENSLBEG00000014465)	afg1lb (ENSLBEG00000014493)	foxo3b (ENSLBEG00000014513)	ARMC2 (ENSLBEG00000014525)	ENSLBEG00000014553	sesn1 (ENSLBEG00000014585)	cep57l1 (ENSLBEG00000014613)	cd164 (ENSLBEG00000014634)	ppil6 (ENSLBEG00000014644)	ENSLBEG00000014667	ENSLBEG00000014695	msgn1 (ENSLBEG00000014718)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00940000178209	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000173939	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00940000178209	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000173939	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00940000178209	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000173939	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00940000178331	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000155913.d
Stickleback	MODERN SPECIES	18	tram2 (ENSGACG00000009285)	efhc1 (ENSGACG00000009276)	ENSGACG00000009272	mrpl19 (ENSGACG00000009248)	mycn (ENSGACG00000009241)	smek1 (ENSGACG00000009228)	ERH (ENSGACG00000009220)	paplnb (ENSGACG00000009212)	ENSGACG00000009211	PLEKHG1 (ENSGACG00000009204)	tcp1 (ENSGACG00000009066)	acat2 (ENSGACG00000009052)	wtap (ENSGACG00000009045)	sod2 (ENSGACG00000009000)	FNDC1 (ENSGACG00000008978)	otofa (ENSGACG00000008956) ##22	ENSGACG00000008950	nr2e1 (ENSGACG00000008934)	snx3 (ENSGACG00000008921)	afg1lb (ENSGACG00000008916)	foxo3b (ENSGACG00000008910)	ARMC2 (ENSGACG00000008903)	sesn1 (ENSGACG00000008895)	cep57l1 (ENSGACG00000008882)	cd164 (ENSGACG00000008876)	ppil6 (ENSGACG00000008871)	GEN1 (ENSGACG00000008868)	msgn1 (ENSGACG00000008865)	msgn1 (ENSGACG00000008864)	mrps10 (ENSGACG00000008859)	tulp4a (ENSGACG00000008851)
Lumpfish	MODERN SPECIES	16	efhc1 (ENSCLMG00005016685)	ENSCLMG00005016683	ENSCLMG00005016681	mrpl19 (ENSCLMG00005016679)	mycn (ENSCLMG00005016668)	smek1 (ENSCLMG00005016666)	ENSCLMG00005016660	paplnb (ENSCLMG00005016654)	PLEKHG1 (ENSCLMG00005016652)	ENSCLMG00005016650	tcp1 (ENSCLMG00005016643)	acat2 (ENSCLMG00005016642)	wtap (ENSCLMG00005016640)	sod2 (ENSCLMG00005016631)	FNDC1 (ENSCLMG00005016626)	otofa (ENSCLMG00005016621) ##22	OSTM1 (ENSCLMG00005016616)	nr2e1 (ENSCLMG00005016608)	snx3 (ENSCLMG00005016599)	afg1lb (ENSCLMG00005016596)	foxo3b (ENSCLMG00005016594)	ENSCLMG00005016591	ARMC2 (ENSCLMG00005016590)	sesn1 (ENSCLMG00005016589)	cep57l1 (ENSCLMG00005016585)	cd164 (ENSCLMG00005016582)	ppil6 (ENSCLMG00005016579)	ENSCLMG00005016576	ENSCLMG00005016575	msgn1 (ENSCLMG00005016574)	mrps10 (ENSCLMG00005016571)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT01070000253766.A.a.a.b.a.b	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000156891.a.b	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT01030000234809	ENSGT00390000009045
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Gilthead seabream	MODERN SPECIES	14	xkr5a (ENSSAUG00010015857)	tram2 (ENSSAUG00010015861)	efhc1 (ENSSAUG00010015930)	ENSSAUG00010015932	mrpl19 (ENSSAUG00010015939)	mycn (ENSSAUG00010015944)	smek1 (ENSSAUG00010015958)	ERH (ENSSAUG00010016632)	paplnb (ENSSAUG00010016633)	PLEKHG1 (ENSSAUG00010016638)	tcp1 (ENSSAUG00010008729)	acat2 (ENSSAUG00010008737)	wtap (ENSSAUG00010009317)	sod2 (ENSSAUG00010009320)	FNDC1 (ENSSAUG00010009326)	otofa (ENSSAUG00010009331) ##22	drc1 (ENSSAUG00010009552) #23	OSTM1 (ENSSAUG00010009560)	nr2e1 (ENSSAUG00010009563)	snx3 (ENSSAUG00010009568)	afg1lb (ENSSAUG00010009573)	foxo3b (ENSSAUG00010009595)	ARMC2 (ENSSAUG00010009600)	sesn1 (ENSSAUG00010009605)	cep57l1 (ENSSAUG00010009608)	cd164 (ENSSAUG00010009609)	ppil6 (ENSSAUG00010009611)	ENSSAUG00010009615	msgn1 (ENSSAUG00010009621)	si:ch211-51e12.7 (ENSSAUG00010009624)	mrps10 (ENSSAUG00010009627)
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT01070000253766.A.a.a.b.a.b	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00390000009415	ENSGT00940000158432	ENSGT00990000211308	ENSGT00390000018199.a	ENSGT00390000003316.c.a	ENSGT00940000157723	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B	ENSGT00940000155086.B ##22	ENSGT00940000153804.A #23	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693	ENSGT00940000153609.b	ENSGT00390000013227.a.b	ENSGT00940000161401	ENSGT00390000000663	ENSGT00950000183168.B.b	ENSGT00530000063695.b	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159634	ENSGT00390000002032	ENSGT00940000159266	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00390000009045
Fugu	MODERN SPECIES	7	prep (ENSTRUG00000008072)	ENSTRUG00000007847	xrg5 (ENSTRUG00000007765)	tram2 (ENSTRUG00000007487)	efhc1 (ENSTRUG00000007418)	ENSTRUG00000023346	mrpl19 (ENSTRUG00000007313)	mycn (ENSTRUG00000026111)	smek1 (ENSTRUG00000006781)	ERH (ENSTRUG00000024367)	PLEKHG1 (ENSTRUG00000006405)	tcp1 (ENSTRUG00000005967)	wtap (ENSTRUG00000005409)	sod2 (ENSTRUG00000005242)	FNDC1 (ENSTRUG00000004949)	otofa (ENSTRUG00000003831) ##22	ENSTRUG00000002802 #23	OSTM1 (ENSTRUG00000002434)	NR2E1 (ENSTRUG00000001893)	snx3 (ENSTRUG00000023871)	afg1lb (ENSTRUG00000032686)	foxo3b (ENSTRUG00000001458)	ARMC2 (ENSTRUG00000001327)	sesn1 (ENSTRUG00000001205)	cep57l1 (ENSTRUG00000009028)	cd164 (ENSTRUG00000031789)	ppil6 (ENSTRUG00000008896)	L3HYPDH (ENSTRUG00000024179)	ENSTRUG00000029745	msgn1 (ENSTRUG00000008888)	mrps10 (ENSTRUG00000008832)
Tetraodon	MODERN SPECIES	5	xkr5a (ENSTNIG00000012299)	tram2 (ENSTNIG00000012298)	efhc1 (ENSTNIG00000012297)	ENSTNIG00000012296	mrpl19 (ENSTNIG00000012295)	mycn (ENSTNIG00000012294)	ENSTNIG00000012293	ENSTNIG00000012292	PLEKHG1 (ENSTNIG00000012291)	tcp1 (ENSTNIG00000012290)	acat2 (ENSTNIG00000012289)	wtap (ENSTNIG00000012288)	sod2 (ENSTNIG00000012287)	ENSTNIG00000012286	ENSTNIG00000012285	otofa (ENSTNIG00000012284) ##22	ENSTNIG00000012283 #23	nr2e1 (ENSTNIG00000012282)	snx3 (ENSTNIG00000012281)	afg1lb (ENSTNIG00000012280)	ENSTNIG00000012279	ARMC2 (ENSTNIG00000012278)	sesn1 (ENSTNIG00000012277)	cep57l1 (ENSTNIG00000012276)	cd164 (ENSTNIG00000012275)	ppil6 (ENSTNIG00000012274)	L3HYPDH (ENSTNIG00000012273)	ENSTNIG00000012272	msgn1 (ENSTNIG00000001511)	mrps10 (ENSTNIG00000012271)	tulp4a (ENSTNIG00000012270)