Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 466 ENSGT00390000017249.e ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000001802 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00940000178634 ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c ENSGT00390000004417.b ENSGT00940000155010.a ENSGT00940000156563.a ENSGT00940000166375 ENSGT00940000163421.a.d.a ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00390000001802 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00940000178634 ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c ENSGT00390000004417.b ENSGT00940000155010.a ENSGT00940000156563.a ENSGT00940000166375 ENSGT00940000163421.a.d.a ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00940000178634 ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c ENSGT00390000004417.b ENSGT00940000163421.a.d.a ENSGT00940000166375 ENSGT00940000156563.a ENSGT00940000155010.a ENSGT01030000235215 ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00940000155405 ENSGT00390000006347.a ENSGT00390000017790 #24 ENSGT00940000155568 ENSGT00940000163723.A.e ENSGT00940000163723.A.f.b ENSGT01050000244900.a.a.b.eb ENSGT00940000158565 ENSGT00940000153561.b.a.a.b Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00940000178634 ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c ENSGT00390000004417.b ENSGT00940000163421.a.d.a ENSGT00940000166375 ENSGT00940000156563.a ENSGT00940000155010.a ENSGT01030000235215 ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT01010000230193 ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00940000155405 ENSGT00390000006347.a ENSGT00940000174432 ENSGT00390000017790 #24 ENSGT00940000155568 ENSGT00940000163723.A.e ENSGT00940000163723.A.f.b ENSGT01050000244900.a.a.b.eb Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00940000178634 ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c ENSGT00390000004417.b ENSGT00940000163421.a.d.a ENSGT00940000166375 ENSGT00940000156563.a ENSGT00940000155010.a ENSGT01030000235215 ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a.h ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00940000155405 ENSGT00390000006347.a ENSGT00940000174432 ENSGT00390000017790 #24 ENSGT00940000155568 ENSGT00940000163723.A.e Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00940000178634 ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c ENSGT00390000004417.b ENSGT00940000163421.a.d.a ENSGT00940000166375 ENSGT00940000156563.a ENSGT00940000155010.a ENSGT01030000235215 ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a.h ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00940000155405 ENSGT00390000006347.a ENSGT00390000017790 #24 ENSGT00940000155568 ENSGT00940000163723.A.e ENSGT00940000163723.A.f.b Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159464 ENSGT00390000001802 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00940000178634 ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c ENSGT00390000004417.b ENSGT00940000163421.a.d.a ENSGT00940000161887 ENSGT00940000155010.a ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a.h ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00940000155405 ENSGT00390000006347.a ENSGT00390000017790 #24 ENSGT00940000155568 ENSGT00940000163723.A.e ENSGT00940000163723.A.f.a Tetraodon DUPLICATION Tetraodon MODERN SPECIES 26 ENSTNIG00000001868 #7 ENSTNIG00000001869 #8 ENSTNIG00000001870 #9 ENSTNIG00000001871 #10 ENSTNIG00000001872 #11 wdr55 (ENSTNIG00000001873) #12 ENSTNIG00000001874 #13 ENSTNIG00000001884 #14 ENSTNIG00000001885 #15 ENSTNIG00000000066 #16 dtd2 (ENSTNIG00000000437) #17 ENSTNIG00000002170 #18 fga (ENSTNIG00000001888) #19 lratb.2 (ENSTNIG00000001889) #20 LRAT (ENSTNIG00000001890) #21 TSPAN18 (ENSTNIG00000001891) #22 ENSTNIG00000001893 #23 pex16 (ENSTNIG00000001894) #24 ENSTNIG00000001895 #25 ulk3 (ENSTNIG00000011929) #26 vmp1 (ENSTNIG00000001897) #27 MMP14 (ENSTNIG00000001898) #28 ENSTNIG00000001899 #29 ENSTNIG00000000408 #30 lrrc59 (ENSTNIG00000000837) #31 ENSTNIG00000001900 #32 SOX9 (ENSTNIG00000001901) #33 ENSTNIG00000001902 #34 ENSTNIG00000001903 #35 ENSTNIG00000001904 #36 ENSTNIG00000001906 #37 Tetraodon MODERN SPECIES 20 ENSTNIG00000005023 csnk2a2a (ENSTNIG00000002964) MATCAP1 (ENSTNIG00000002963) zgc:194679 (ENSTNIG00000002962) ENSTNIG00000002961 ENSTNIG00000002960 NQO2 (ENSTNIG00000002280) ENSTNIG00000003443 rpl12 (ENSTNIG00000003442) pole3 (ENSTNIG00000003441) kmt5b (ENSTNIG00000003440) ube2g1a (ENSTNIG00000000903) cd82a (ENSTNIG00000003439) ube2g1a (ENSTNIG00000015331) cd82a (ENSTNIG00000003438) tspan18a (ENSTNIG00000003437) ##22 HERC1 (ENSTNIG00000003436) dapk2a (ENSTNIG00000003435) ENSTNIG00000003434 ENSTNIG00000004765 dis3l (ENSTNIG00000004764) tipin (ENSTNIG00000004763) lctla (ENSTNIG00000004762) crybgx (ENSTNIG00000004761) ccnb2 (ENSTNIG00000004760) cars1 (ENSTNIG00000004759) pex16 (ENSTNIG00000004758) ##24 arfgap2 (ENSTNIG00000004757) ENSTNIG00000004756 ENSTNIG00000004755 ENSTNIG00000004754 Fugu MODERN SPECIES 4 csnk2a2a (ENSTRUG00000012041) MATCAP1 (ENSTRUG00000011981) zgc:194679 (ENSTRUG00000024839) zgc:194679 (ENSTRUG00000028025) ENSTRUG00000021071 ENSTRUG00000011870 GABARAPL2 (ENSTRUG00000022747) ENSTRUG00000011767 rpl12 (ENSTRUG00000021921) pole3 (ENSTRUG00000032058) kmt5b (ENSTRUG00000022914) ccnb2 (ENSTRUG00000011147) ube2g1a (ENSTRUG00000011134) cd82a (ENSTRUG00000011027) ENSTRUG00000029380 tspan18a (ENSTRUG00000020577) #22 ENSTRUG00000029860 HERC1 (ENSTRUG00000029848) dapk2a (ENSTRUG00000010609) ENSTRUG00000024673 rab11a (ENSTRUG00000020792) ENSTRUG00000009956 tipin (ENSTRUG00000024319) lctla (ENSTRUG00000009494) crybgx (ENSTRUG00000009403) ccnb2 (ENSTRUG00000021973) cars1 (ENSTRUG00000008686) pex16 (ENSTRUG00000008505) #24 arfgap2 (ENSTRUG00000008070) ENSTRUG00000008059 ENSTRUG00000026832 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000159464 ENSGT00390000001802 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c ENSGT00390000004417.b ENSGT00940000163421.a.d.a ENSGT00940000166375 ENSGT00940000156563.a ENSGT00940000155010.a ENSGT01030000235215 ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a.g.a ENSGT00940000155333.A.a.h ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00940000155405 ENSGT00940000156431 ENSGT00390000006347.a ENSGT00390000017790 #24 ENSGT00940000155568 Ballan wrasse MODERN SPECIES 1138 ENSLBEG00000025334 cd82a (ENSLBEG00000025321) TSPAN18 (ENSLBEG00000025295) #22 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c ENSGT00390000004417.b ENSGT00940000163421.a.d.a ENSGT00940000166375 ENSGT00940000156563.a ENSGT00940000155010.a ENSGT01030000235215 ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000155405 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a.g.a ENSGT00940000155333.A.a.h ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00390000006347.a ENSGT00390000017790 #24 ENSGT00940000155568 ENSGT00940000163723.A.e ENSGT00940000163723.A.f.b Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c ENSGT00390000004417.b ENSGT00940000163421.a.d.a ENSGT00940000166375 ENSGT00940000156563.a ENSGT00940000155010.a ENSGT01030000235215 ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000155405 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a.g.a ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00390000006347.a ENSGT00390000017790 #24 ENSGT00940000155568 ENSGT00940000163723.A.e ENSGT00940000163723.A.f.a.d ENSGT00940000163723.A.f.b.h Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c ENSGT00390000004417.b ENSGT00940000163421.a.d.a ENSGT00940000166375 ENSGT00940000156563.a ENSGT00940000155010.a ENSGT01030000235215 ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000155405 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a.g.a ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00390000006347.a ENSGT00390000017790 #24 ENSGT00940000155568 ENSGT00940000163723.A.e ENSGT00940000163723.A.f.a.d ENSGT00940000163723.A.f.a.c ENSGT01050000244900.a.a.b.eb ENSGT00940000158565 European seabass MODERN SPECIES 18 ENSDLAG00005022415 ENSDLAG00005027886 ENSDLAG00005034364 ENSDLAG00005034465 zgc:194679 (ENSDLAG00005033847) ENSDLAG00005022437 ENSDLAG00005022501 ENSDLAG00005030498 ENSDLAG00005033959 ENSDLAG00005022504 ENSDLAG00005022516 ENSDLAG00005027740 ENSDLAG00005022538 ENSDLAG00005022562 ENSDLAG00005022573 ENSDLAG00005022575 #22 ENSDLAG00005031844 ENSDLAG00005022632 ENSDLAG00005032472 ENSDLAG00005030332 RAB11A (ENSDLAG00005030246) ENSDLAG00005023499 dis3l (ENSDLAG00005008734) tipin (ENSDLAG00005008836) lctla (ENSDLAG00005008857) crybgx (ENSDLAG00005009036) ENSDLAG00005009046 ENSDLAG00005009095 ENSDLAG00005010168 #24 ENSDLAG00005010356 ENSDLAG00005010448 Large yellow croaker MODERN SPECIES 480 glg1b (ENSLCRG00005002969) tnni2b.1 (ENSLCRG00005003007) aph1b (ENSLCRG00005003009) aph1b (ENSLCRG00005003014) OTOG (ENSLCRG00005003017) nqo1 (ENSLCRG00005003029) ENSLCRG00005003039 ENSLCRG00005003042 ENSLCRG00005003045 ENSLCRG00005003048 rpl12 (ENSLCRG00005003051) pole3 (ENSLCRG00005003071) kmt5b (ENSLCRG00005003072) ccnb2 (ENSLCRG00005003075) cd82a (ENSLCRG00005003078) tspan18a (ENSLCRG00005003082) #22 ENSLCRG00005003084 dapk2a (ENSLCRG00005003886) rab11a (ENSLCRG00005003890) tacr1b (ENSLCRG00005003894) SLC4A5 (ENSLCRG00005003912) ENSLCRG00005005760 SEZ6L (ENSLCRG00005005778) grk3 (ENSLCRG00005006651) cryba4 (ENSLCRG00005006673) crybb1 (ENSLCRG00005006674) acads (ENSLCRG00005006677) cldn5b (ENSLCRG00005006728) SEPTIN5 (ENSLCRG00005006734) MCTP1 (ENSLCRG00005007123) ENSLCRG00005008051 Gilthead seabream MODERN SPECIES 18 csnk2a2a (ENSSAUG00010018259) MATCAP1 (ENSSAUG00010018624) zgc:194679 (ENSSAUG00010018642) zgc:194679 (ENSSAUG00010018643) ENSSAUG00010018644 NQO2 (ENSSAUG00010018647) GABARAPL2 (ENSSAUG00010018669) ENSSAUG00010018675 ENSSAUG00010018679 ENSSAUG00010018681 rpl12 (ENSSAUG00010018685) pole3 (ENSSAUG00010018691) kmt5b (ENSSAUG00010018693) ccnb2 (ENSSAUG00010018695) cd82a (ENSSAUG00010018700) tspan18a (ENSSAUG00010018721) #22 HERC1 (ENSSAUG00010018739) dapk2a (ENSSAUG00010018803) ENSSAUG00010019086 rab11a (ENSSAUG00010019089) ENSSAUG00010019106 ENSSAUG00010019213 dis3l (ENSSAUG00010019226) tipin (ENSSAUG00010019272) lctla (ENSSAUG00010019278) crybgx (ENSSAUG00010019299) ENSSAUG00010019302 ccnb2 (ENSSAUG00010019305) cars1 (ENSSAUG00010019318) pex16 (ENSSAUG00010019614) #24 arfgap2 (ENSSAUG00010019616) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000159464 ENSGT00390000001802 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c ENSGT00390000004417.b ENSGT00940000163421.a.d.a ENSGT00940000166375 ENSGT00940000156563.a ENSGT00940000155010.a ENSGT01030000235215 ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a.h ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00940000155405 ENSGT00940000156431 ENSGT00390000006347.a ENSGT00390000017790 #24 ENSGT00940000155568 ENSGT00940000163723.A.e Cottioidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157667.d #22 Lumpfish MODERN SPECIES 18 tnni2b.1 (ENSCLMG00005003095) glg1b (ENSCLMG00005003173) pacsin3 (ENSCLMG00005003323) ero1a (ENSCLMG00005003328) SAMD4A (ENSCLMG00005003385) gch1 (ENSCLMG00005003387) wdhd1 (ENSCLMG00005003392) socs4 (ENSCLMG00005003403) ENSCLMG00005003404 ENSCLMG00005003406 ENSCLMG00005003408 ENSCLMG00005003410 ENSCLMG00005003411 ENSCLMG00005003412 ENSCLMG00005003428 TSPAN18 (ENSCLMG00005003451) #22 ENSCLMG00005003975 ENSCLMG00005003976 RASSF7 (ENSCLMG00005003977) ENSCLMG00005003978 ENSCLMG00005003980 ENSCLMG00005003986 CTTN (ENSCLMG00005004094) PPFIA1 (ENSCLMG00005004167) ENSCLMG00005009443 arfgap2 (ENSCLMG00005009444) pex16 (ENSCLMG00005009449) #24 cars1 (ENSCLMG00005009487) ENSCLMG00005012023 crybgx (ENSCLMG00005012024) lctla (ENSCLMG00005012029) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a.h ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00940000155405 ENSGT00940000156431 ENSGT00390000006347.a ENSGT00390000017790 #24 ENSGT00940000155568 ENSGT00940000163723.A.f.a.d Pike perch MODERN SPECIES 42 ZNF319 (ENSSLUG00000008957) csnk2a2a (ENSSLUG00000008968) MATCAP1 (ENSSLUG00000008988) zgc:194679 (ENSSLUG00000008992) ENSSLUG00000008994 nqo1 (ENSSLUG00000008999) GABARAPL2 (ENSSLUG00000009005) ENSSLUG00000009015 ENSSLUG00000009020 rpl12 (ENSSLUG00000009043) pole3 (ENSSLUG00000009195) kmt5b (ENSSLUG00000009197) kmt5b (ENSSLUG00000009202) ccnb2 (ENSSLUG00000009207) cd82a (ENSSLUG00000009215) TSPAN18 (ENSSLUG00000009223) #22 ENSSLUG00000009230 dapk2a (ENSSLUG00000009254) ENSSLUG00000009257 rab11a (ENSSLUG00000009263) ENSSLUG00000009292 dis3l (ENSSLUG00000009340) tipin (ENSSLUG00000009385) lctla (ENSSLUG00000009393) crybgx (ENSSLUG00000009402) ccnb2 (ENSSLUG00000009411) cars1 (ENSSLUG00000009586) pex16 (ENSSLUG00000014500) #24 arfgap2 (ENSSLUG00000014518) ENSSLUG00000014557 ppfia1 (ENSSLUG00000014829) Channel bull blenny MODERN SPECIES 17 csnk2a2a (ENSCGOG00000007895) MATCAP1 (ENSCGOG00000007863) zgc:194679 (ENSCGOG00000007862) ENSCGOG00000007860 ENSCGOG00000007776 GABARAPL2 (ENSCGOG00000007767) ENSCGOG00000007766 ENSCGOG00000007763 rpl12 (ENSCGOG00000007669) pole3 (ENSCGOG00000007661) kmt5b (ENSCGOG00000007635) ccnb2 (ENSCGOG00000007619) kmt5b (ENSCGOG00000007614) ccnb2 (ENSCGOG00000007613) cd82a (ENSCGOG00000007609) tspan18a (ENSCGOG00000007545) #22 ENSCGOG00000007543 HERC1 (ENSCGOG00000006815) dapk2a (ENSCGOG00000006770) ENSCGOG00000006769 rab11a (ENSCGOG00000006701) ENSCGOG00000005992 dis3l (ENSCGOG00000005362) tipin (ENSCGOG00000005347) lctla (ENSCGOG00000005318) crybgx (ENSCGOG00000005309) ccnb2 (ENSCGOG00000005301) cars1 (ENSCGOG00000003638) pex16 (ENSCGOG00000003590) #24 arfgap2 (ENSCGOG00000003096) ENSCGOG00000003070 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c ENSGT00390000004417.b ENSGT00940000163421.a.d.a ENSGT00940000166375 ENSGT00940000156563.a ENSGT00940000155010.a ENSGT01030000235215 ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000155405 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a.h ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00390000006347.a ENSGT00940000174432 ENSGT00390000017790 #24 ENSGT00940000155568.l ENSGT00940000163723.A.e ENSGT00940000163723.A.f.b Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000001802 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c ENSGT00390000004417.b ENSGT00940000163421.a.d.a ENSGT00940000166375 ENSGT00940000156563.a ENSGT00940000155010.a ENSGT01030000235215 ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a.h ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00940000155405 ENSGT00390000006347.a ENSGT00390000017790 #24 ENSGT00940000155568.l ENSGT00940000163723.A.e ENSGT00940000163723.A.f.b Zig-zag eel MODERN SPECIES 17 ENSMAMG00000017911 ENSMAMG00000017859 ENSMAMG00000025305 ENSMAMG00000017844 ENSMAMG00000017839 ENSMAMG00000017831 ENSMAMG00000017751 ENSMAMG00000028301 ENSMAMG00000025929 ENSMAMG00000017664 ENSMAMG00000025257 ENSMAMG00000024511 ENSMAMG00000027922 ENSMAMG00000017556 ENSMAMG00000024446 ENSMAMG00000017520 #22 ENSMAMG00000026774 ENSMAMG00000017358 ENSMAMG00000025603 ENSMAMG00000017337 RAB11A (ENSMAMG00000027414) ENSMAMG00000017293 dis3l (ENSMAMG00000017229) tipin (ENSMAMG00000017203) lctla (ENSMAMG00000017174) crybgx (ENSMAMG00000017150) ENSMAMG00000017121 ENSMAMG00000017073 ENSMAMG00000017043 #24 ENSMAMG00000017001 ENSMAMG00000016992 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c ENSGT00390000004417.b ENSGT00940000163421.a.d.a ENSGT00940000166375 ENSGT00940000161887 ENSGT00940000156563.a ENSGT00940000155010.a ENSGT01030000235215 ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a.h ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00940000155405 ENSGT00390000006347.a ENSGT00390000017790 #24 ENSGT00940000155568.l ENSGT00940000163723.A.e ENSGT00940000163723.A.f.b Climbing perch MODERN SPECIES 16 ENSATEG00000022839 ENSATEG00000022820 ENSATEG00000022807 ENSATEG00000022803 ENSATEG00000022791 ENSATEG00000025456 ENSATEG00000022749 ENSATEG00000022743 ENSATEG00000022729 ENSATEG00000022724 ENSATEG00000022706 ENSATEG00000026022 ENSATEG00000022688 ENSATEG00000022675 ENSATEG00000022662 ENSATEG00000022648 #22 ENSATEG00000022577 ENSATEG00000022559 ENSATEG00000022546 RAB11A (ENSATEG00000023730) ENSATEG00000022505 dis3l (ENSATEG00000022464) tipin (ENSATEG00000022453) lctla (ENSATEG00000022437) crybgx (ENSATEG00000022426) ENSATEG00000022355 ENSATEG00000022291 ENSATEG00000022262 #24 ENSATEG00000022248 ENSATEG00000022233 ENSATEG00000022204 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 14 ENSBSLG00000010307 ZNF319 (ENSBSLG00000010313) csnk2a2a (ENSBSLG00000010323) MATCAP1 (ENSBSLG00000010358) ENSBSLG00000010360 ENSBSLG00000010362 nqo1 (ENSBSLG00000010372) GABARAPL2 (ENSBSLG00000010373) ENSBSLG00000010375 ENSBSLG00000010380 ENSBSLG00000010384 rpl12 (ENSBSLG00000010386) pole3 (ENSBSLG00000010398) kmt5b (ENSBSLG00000010403) cd82a (ENSBSLG00000010422) tspan18a (ENSBSLG00000010424) #22 SEMA4B (ENSBSLG00000010459) ENSBSLG00000011103 ENSBSLG00000011106 ENSBSLG00000011113 gnrhr2 (ENSBSLG00000011122) SPPL2A (ENSBSLG00000011133) trpm7 (ENSBSLG00000011325) ENSBSLG00000014504 gnb5b (ENSBSLG00000014511) MYO5A (ENSBSLG00000014595) atosa (ENSBSLG00000016132) onecut1 (ENSBSLG00000016151) UNC13C (ENSBSLG00000016266) IGDCC4 (ENSBSLG00000019896) SCAMP5 (ENSBSLG00000019988) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c ENSGT00390000004417.b ENSGT00940000163421.a.d.a ENSGT00940000166375 ENSGT00940000156563.a ENSGT00940000155010.a ENSGT01030000235215 ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000155405 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a.h ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00390000006347.a ENSGT00940000174432 ENSGT00390000017790 #24 ENSGT00940000155568.l ENSGT00940000163723.A.e ENSGT00940000163723.A.f.b Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c ENSGT00390000004417.b ENSGT00940000163421.a.d.a ENSGT00940000166375 ENSGT00940000156563.a ENSGT00940000155010.a ENSGT01030000235215 ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000155405 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a.h ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 Seriola ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c ENSGT00390000004417.b ENSGT00940000163421.a.d.a ENSGT00940000166375 ENSGT00940000156563.a ENSGT00940000155010.a ENSGT01030000235215 ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000155405 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000171177 ENSGT00980000198667 ENSGT00390000006043 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000158689 ENSGT00940000155465.i ENSGT01030000234518.B.a.b.a.a ENSGT00940000159819 ENSGT00940000157859.a.a ENSGT00400000022240 ENSGT00940000154617.B.c ENSGT00390000005300 ENSGT01030000238233 ENSGT00390000008748.b.g.b Greater amberjack MODERN SPECIES 3 ENSSDUG00000019920 ZNF319 (ENSSDUG00000019932) csnk2a2a (ENSSDUG00000019939) MATCAP1 (ENSSDUG00000019964) zgc:194679 (ENSSDUG00000019991) ENSSDUG00000019995 ENSSDUG00000020005 GABARAPL2 (ENSSDUG00000020014) ENSSDUG00000020031 KCNG4 (ENSSDUG00000020040) rpl12 (ENSSDUG00000020052) pole3 (ENSSDUG00000020085) kmt5b (ENSSDUG00000020097) ccnb2 (ENSSDUG00000020128) cd82a (ENSSDUG00000020277) tspan18a (ENSSDUG00000020293) #22 HERC1 (ENSSDUG00000020323) glceb (ENSSDUG00000020455) anp32a (ENSSDUG00000020495) CORO2B (ENSSDUG00000000059) itga11a (ENSSDUG00000000114) ENSSDUG00000000131 ADAMTS7 (ENSSDUG00000000146) calml4a (ENSSDUG00000000158) ENSSDUG00000000170 chrna7a (ENSSDUG00000000208) trip4 (ENSSDUG00000000225) ENSSDUG00000000248 ENSSDUG00000000263 znf609b (ENSSDUG00000000271) GRAMD2A (ENSSDUG00000000304) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2787 ENSSLDG00000024300 ZNF319 (ENSSLDG00000024295) csnk2a2a (ENSSLDG00000024279) MATCAP1 (ENSSLDG00000024257) zgc:194679 (ENSSLDG00000024252) ENSSLDG00000024247 ENSSLDG00000024241 GABARAPL2 (ENSSLDG00000024233) ENSSLDG00000024230 KCNG4 (ENSSLDG00000024228) pole3 (ENSSLDG00000024205) rpl12 (ENSSLDG00000024199) kmt5b (ENSSLDG00000024174) ccnb2 (ENSSLDG00000024163) cd82a (ENSSLDG00000024159) tspan18a (ENSSLDG00000024143) #22 Barramundi perch MODERN SPECIES 100 tppp3 (ENSLCAG00010007080) ENSLCAG00010007075 ENSLCAG00010007051 trpm1a (ENSLCAG00010006810) galr1b (ENSLCAG00010006750) ENSLCAG00010006746 VPS13C (ENSLCAG00010005593) shcbp1 (ENSLCAG00010005362) mtfmt (ENSLCAG00010005345) celf1 (ENSLCAG00010005339) arfgap2 (ENSLCAG00010005307) pex16 (ENSLCAG00010005280) #24 cars1 (ENSLCAG00010004799) ccnb2 (ENSLCAG00010004723) cd82a (ENSLCAG00010004720) TSPAN18 (ENSLCAG00010004718) #22 ENSLCAG00010004716 dapk2a (ENSLCAG00010004706) ENSLCAG00010004701 rab11a (ENSLCAG00010004697) ENSLCAG00010004683 dis3l (ENSLCAG00010004501) tipin (ENSLCAG00010004459) lctla (ENSLCAG00010004446) crybgx (ENSLCAG00010004435) ccnb2 (ENSLCAG00010004421) kmt5b (ENSLCAG00010004407) pole3 (ENSLCAG00010004399) rpl12 (ENSLCAG00010004367) ENSLCAG00010004346 ENSLCAG00010004337 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01030000235215 ENSGT00940000155010.a ENSGT00940000156563.a ENSGT00940000166375 ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000160977.e.a ENSGT01060000249384 ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00940000155405 ENSGT00390000006347.a ENSGT00940000174432 ENSGT00390000017790 #24 ENSGT00940000155568 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000160522.c.b ENSGT00390000014572 ENSGT00940000157136.a ENSGT00940000159860.f ENSGT01030000234838 ENSGT00940000156618.c.b ENSGT01030000234597.a.b.a.a ENSGT00950000183172.C ENSGT01030000234633.A.a.a ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000155405 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000160977.e.a ENSGT01060000249384 ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00390000006347.a ENSGT00940000174432 ENSGT00390000017790 #24 ENSGT00940000155568 ENSGT00940000163723.A.e Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000014572 ENSGT00940000157136.a ENSGT00940000159860.f ENSGT01030000234838 ENSGT00940000156618.c.b ENSGT01030000234597.a.b.a.a ENSGT00950000183172.C ENSGT01030000234633.A.a.a ENSGT01030000235215 ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000155405 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000160977.e.a ENSGT01060000249384 ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00390000006347.a ENSGT00940000174432 ENSGT00390000017790 #24 ENSGT00940000155568 ENSGT00940000163723.A.e Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159860.f ENSGT01030000234838 ENSGT00940000156618.c.b ENSGT01030000234597.a.b.a.a ENSGT00950000183172.C ENSGT01030000234633.A.a.a ENSGT00940000166375 ENSGT00940000159150 ENSGT00940000155010.a ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000155405 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000160977.e.a ENSGT01060000249384 ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00390000006347.a ENSGT00940000174432 ENSGT00390000017790 #24 ENSGT00940000155568 ENSGT00940000163723.A.e Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT01060000249384 ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00980000198667 ENSGT00940000171177 ENSGT00940000169428 ENSGT00940000166375 ENSGT00940000159150 ENSGT00940000155010.a ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT01030000234633.A.a.a ENSGT00950000183172.C ENSGT01030000234597.a.b.a.a ENSGT00940000156618.c.b ENSGT01030000234838 ENSGT00940000157136.a ENSGT00390000014572 ENSGT00940000160522.c.b ENSGT00940000154257.b ENSGT00940000162283.b ENSGT00940000154022.a.a ENSGT00940000157918 ENSGT00940000155363.v.a ENSGT00940000158845 ENSGT00940000159190 Platyfish MODERN SPECIES 18 ENSXMAG00000025540 ENSXMAG00000030004 ENSXMAG00000028636 ENSXMAG00000023601 ENSXMAG00000021331 ENSXMAG00000026018 ENSXMAG00000022073 ENSXMAG00000022070 nqo1 (ENSXMAG00000023962) GABARAPL2 (ENSXMAG00000013475) KCNG4 (ENSXMAG00000013465) pole3 (ENSXMAG00000027215) rpl12 (ENSXMAG00000023218) kmt5b (ENSXMAG00000028852) cd82a (ENSXMAG00000009251) tspan18a (ENSXMAG00000022831) #22 ENSXMAG00000005420 gpn1 (ENSXMAG00000005436) il17a/f1 (ENSXMAG00000005471) stmn4l (ENSXMAG00000005464) ENSXMAG00000029789 znf395a (ENSXMAG00000000690) gtf2a2 (ENSXMAG00000027547) ENSXMAG00000025745 anxa2b (ENSXMAG00000013331) ENSXMAG00000026029 ENSXMAG00000013027 KIFC3 (ENSXMAG00000014566) ENSXMAG00000023281 ENSXMAG00000021833 ENSXMAG00000014523 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154914 ENSGT01060000249384 ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00980000198667 ENSGT00940000171177 ENSGT00940000169428 ENSGT00940000159150 ENSGT00940000155010.a ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT01030000234633.A.a.a ENSGT00950000183172.C ENSGT01030000234597.a.b.a.a ENSGT00940000156618.c.b ENSGT01030000234838 ENSGT00940000157136.a ENSGT00390000014572 ENSGT00940000160522.c.b ENSGT00940000154257.b ENSGT00940000162283.b ENSGT00940000154022.a.a ENSGT00940000157918 ENSGT00940000155363.v.a ENSGT00940000158845 ENSGT00940000159190 Guppy MODERN SPECIES 5 ENSPREG00000009539 ENSPREG00000009518 ENSPREG00000009498 ENSPREG00000009445 ENSPREG00000009422 ENSPREG00000009417 ENSPREG00000009407 ENSPREG00000009372 nqo1 (ENSPREG00000009341) GABARAPL2 (ENSPREG00000009321) KCNG4 (ENSPREG00000009312) rpl12 (ENSPREG00000009233) pole3 (ENSPREG00000009175) kmt5b (ENSPREG00000009144) cd82a (ENSPREG00000009127) tspan18a (ENSPREG00000009099) #22 EMILIN1 (ENSPREG00000009073) gpn1 (ENSPREG00000009028) stmn4l (ENSPREG00000009000) ENSPREG00000008990 ENSPREG00000008980 ENSPREG00000008942 gtf2a2 (ENSPREG00000008924) ENSPREG00000008898 anxa2b (ENSPREG00000008879) ENSPREG00000008849 KIFC3 (ENSPREG00000008745) katnb1 (ENSPREG00000008675) rab8b (ENSPREG00000008638) ENSPREG00000008588 slc9a5 (ENSPREG00000008510) NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 189 ENSGT00940000166375 ENSGT00940000159150 ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000155405 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000169428 ENSGT00940000171177 ENSGT00980000198667 ENSGT00940000177441 ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00390000006347.a ENSGT00390000017790 #24 Mummichog MODERN SPECIES 2450 kmt5b (ENSFHEG00000020073) ccnb2 (ENSFHEG00000020062) cd82a (ENSFHEG00000020049) TSPAN18 (ENSFHEG00000019916) #22 ENSFHEG00000019840 ENSFHEG00000019825 ENSFHEG00000019811 ENSFHEG00000019784 ENSFHEG00000019750 ENSFHEG00000019737 ENSFHEG00000019717 dapk2a (ENSFHEG00000019702) ENSFHEG00000019681 rab11a (ENSFHEG00000019668) ENSFHEG00000019649 ENSFHEG00000019580 nme6 (ENSFHEG00000019568) eif2b4 (ENSFHEG00000019524) atraid (ENSFHEG00000019507) Sheepshead minnow MODERN SPECIES 226 rhpn2 (ENSCVAG00000023287) cep89 (ENSCVAG00000023276) zgc:165481 (ENSCVAG00000023263) ABCC12 (ENSCVAG00000023256) ENSCVAG00000023155 ENSCVAG00000023122 ENSCVAG00000022997 SLCO3A1 (ENSCVAG00000022977) ENSCVAG00000022953 KCNG4 (ENSCVAG00000022911) rpl12 (ENSCVAG00000022902) pole3 (ENSCVAG00000022885) kmt5b (ENSCVAG00000022875) ccnb2 (ENSCVAG00000022861) cd82a (ENSCVAG00000022849) TSPAN18 (ENSCVAG00000022839) #22 ENSCVAG00000022762 ENSCVAG00000022749 ENSCVAG00000022723 ENSCVAG00000022703 ENSCVAG00000022696 ENSCVAG00000022679 ENSCVAG00000022665 dapk2a (ENSCVAG00000022652) Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 146 ENSGT00940000157462.C.c.a ENSGT00940000175971 ENSGT00940000165480.a ENSGT00730000111007.a.b ENSGT00940000153561.a ENSGT00940000153561.b.a.a.b ENSGT00940000158565 ENSGT01050000244900.a.a.b.eb ENSGT00940000166122 ENSGT00940000163723.A.f.b ENSGT00940000163723.A.e ENSGT00940000155568 ENSGT00390000017790 #24 ENSGT00940000155405 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT01010000230193 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1616 ANKRD11 (ENSNFUG00015017283) SPG7 (ENSNFUG00015014730) cdh15 (ENSNFUG00015014522) ENSNFUG00015014504 ENSNFUG00015014325 SHANK2 (ENSNFUG00015014285) CTTN (ENSNFUG00015014016) ppfia1 (ENSNFUG00015010516) ENSNFUG00015010316 ENSNFUG00015010302 ENSNFUG00015010288 arfgap2 (ENSNFUG00015010223) PEX16 (ENSNFUG00015010190) #24 CCNB2 (ENSNFUG00015009080) cd82a (ENSNFUG00015009058) tspan18a (ENSNFUG00015009010) #22 ENSNFUG00015006967 RASGRF1 (ENSNFUG00015006520) OLA.11922 (ENSNFUG00015006420) idh2 (ENSNFUG00015005613) ENSNFUG00015005475 ZNF710 (ENSNFUG00015005470) GPN1 (ENSNFUG00015005389) stmn4l (ENSNFUG00015005339) il17a/f1 (ENSNFUG00015005322) ENSNFUG00015005295 gtf2a2 (ENSNFUG00015005283) FOXB1 (ENSNFUG00015005277) anxa2b (ENSNFUG00015005270) ENSNFUG00015005257 ENSNFUG00015004680 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 751 TSPAN18 (ENSKMAG00000011706) #22 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000014572 ENSGT00940000157136.a ENSGT00940000159860.f ENSGT01030000234838 ENSGT00940000156618.c.b ENSGT01030000234597.a.b.a.a ENSGT00950000183172.C ENSGT00940000166375 ENSGT00940000156563.a ENSGT00940000155010.a ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00940000155405 ENSGT00390000006347.a ENSGT00940000174432 ENSGT00390000017790 #24 ENSGT00940000155568 ENSGT00940000163723.A.e Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 96 ENSGT00940000157136.a ENSGT00940000159860.f ENSGT01030000234838 ENSGT00940000156618.c.b ENSGT01030000234597.a.b.a.a ENSGT00950000183172.C ENSGT00940000166375 ENSGT00940000156563.a ENSGT00940000155010.a ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000158481.d ENSGT00500000044904.a.b.e.a.k.b.b.b.b ENSGT00940000157667.d #22 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 97 ENSGT00940000157136.a ENSGT00940000159860.f ENSGT01030000234838 ENSGT00940000156618.c.b ENSGT01030000234597.a.b.a.a ENSGT00950000183172.C ENSGT00940000161887 ENSGT00940000156563.a ENSGT00940000155010.a ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000158481.d ENSGT00500000044904.a.b.e.a.k.b.b.b.b ENSGT00940000157667.d #22 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 282 ENSGT00940000159150 ENSGT00940000155010.a ENSGT00940000156938.e.e ENSGT00390000006922 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000158481.d ENSGT00500000044904.a.b.e.a.k.b.b.b.b ENSGT00940000157667.d #22 Orange clownfish MODERN SPECIES PAQR8 (ENSAPEG00000000046) ENSAPEG00000000047 il17a/f1 (ENSAPEG00000000048) STMN4 (ENSAPEG00000000049) gpn1 (ENSAPEG00000000050) ENSAPEG00000000051 ENSAPEG00000000052 nqo1 (ENSAPEG00000000053) GABARAPL2 (ENSAPEG00000000054) KCNG4 (ENSAPEG00000000055) rpl12 (ENSAPEG00000000056) pole3 (ENSAPEG00000000059) kmt5b (ENSAPEG00000000060) cd82a (ENSAPEG00000000061) ENSAPEG00000000062 tspan18a (ENSAPEG00000000063) #22 ENSAPEG00000000064 il17a/f1 (ENSAPEG00000000065) STMN4 (ENSAPEG00000000066) gpn1 (ENSAPEG00000000067) ENSAPEG00000000068 ENSAPEG00000000069 egln3 (ENSAPEG00000000070) tipin (ENSAPEG00000000071) dis3l (ENSAPEG00000000072) ENSAPEG00000000073 ENSAPEG00000000074 rab11a (ENSAPEG00000000075) ENSAPEG00000000076 ENSAPEG00000000077 ENSAPEG00000000078 Clown anemonefish MODERN SPECIES 876 tspan18a (ENSAOCG00000016918) #22 Spiny chromis MODERN SPECIES 1643 ENSAPOG00000014298 ENSAPOG00000000389 GDF5 (ENSAPOG00000014327) ENSAPOG00000014339 oser1 (ENSAPOG00000014371) manf (ENSAPOG00000014381) rbm15b (ENSAPOG00000014432) tspan18a (ENSAPOG00000014557) #22 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 776 gtf2a2 (ENSSPAG00000015257) PAQR8 (ENSSPAG00000015318) ENSSPAG00000015665 il17a/f1 (ENSSPAG00000015677) STMN4 (ENSSPAG00000015681) gpn1 (ENSSPAG00000015690) ENSSPAG00000015705 ENSSPAG00000015718 gabarapl2 (ENSSPAG00000015763) KCNG4 (ENSSPAG00000015851) rpl12 (ENSSPAG00000015864) pole3 (ENSSPAG00000015915) kmt5b (ENSSPAG00000015934) cd82a (ENSSPAG00000015970) ENSSPAG00000015996 tspan18a (ENSSPAG00000016010) #22 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000164386 ENSGT00940000156431 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.a ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00940000155405 ENSGT00390000006347.a ENSGT00940000174432 ENSGT00390000017790 #24 ENSGT00940000155568 ENSGT00940000163723.A.e Midas cichlid MODERN SPECIES 844 lto1 (ENSACIG00000002375) ccnd1 (ENSACIG00000002470) vstm2b (ENSACIG00000002484) uqcrfs1 (ENSACIG00000002502) rasl12 (ENSACIG00000002516) KBTBD13 (ENSACIG00000002547) pdcd7 (ENSACIG00000002556) ENSACIG00000002605 cars1 (ENSACIG00000002614) crybgx (ENSACIG00000002669) lctla (ENSACIG00000002686) pole3 (ENSACIG00000002711) kmt5b (ENSACIG00000002725) ccnb2 (ENSACIG00000002751) cd82a (ENSACIG00000002769) tspan18a (ENSACIG00000002818) #22 HERC1 (ENSACIG00000002866) dapk2a (ENSACIG00000003048) ENSACIG00000003069 rab11a (ENSACIG00000003092) ENSACIG00000003103 dis3l (ENSACIG00000003161) tipin (ENSACIG00000003205) TMC3 (ENSACIG00000003243) ENSACIG00000003308 Tiger tail seahorse DUPLICATION Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 136 ZNF319 (ENSHCOG00000006286) csnk2a2a (ENSHCOG00000006280) MATCAP1 (ENSHCOG00000006239) zgc:194679 (ENSHCOG00000006231) ENSHCOG00000006226 ENSHCOG00000006213 GABARAPL2 (ENSHCOG00000006062) ENSHCOG00000006007 ENSHCOG00000005994 rpl12 (ENSHCOG00000005990) pole3 (ENSHCOG00000005972) kmt5b (ENSHCOG00000005960) nxpe3 (ENSHCOG00000005947) ccnb2 (ENSHCOG00000005943) cd82a (ENSHCOG00000005923) tspan18a (ENSHCOG00000005835) #22 HERC1 (ENSHCOG00000005794) dapk2a (ENSHCOG00000005672) ENSHCOG00000005661 rab11a (ENSHCOG00000005652) ENSHCOG00000005631 ENSHCOG00000005626 dis3l (ENSHCOG00000000183) tipin (ENSHCOG00000005560) lctla (ENSHCOG00000005554) crybgx (ENSHCOG00000005524) cars1 (ENSHCOG00000005493) pex16 (ENSHCOG00000005418) #24 arfgap2 (ENSHCOG00000005405) ppfia1 (ENSHCOG00000005363) ENSHCOG00000005335 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 489 ENSHCOG00000016343 PDE3A (ENSHCOG00000016380) AEBP2 (ENSHCOG00000016384) PLEKHA5 (ENSHCOG00000016483) PLCZ1 (ENSHCOG00000016511) ENSHCOG00000016533 ENSHCOG00000016540 ENSHCOG00000016545 ENSHCOG00000016566 ENSHCOG00000016595 ENSHCOG00000016643 ENSHCOG00000016669 LHFPL3 (ENSHCOG00000016678) tp53i11b (ENSHCOG00000016691) cd82b (ENSHCOG00000016698) ENSHCOG00000016702 #22 alx4b (ENSHCOG00000016723) caprin1b (ENSHCOG00000016760) nat10 (ENSHCOG00000016765) adal (ENSHCOG00000016803) CSK (ENSHCOG00000016828) edc3 (ENSHCOG00000016834) arid3b (ENSHCOG00000016855) cox5aa (ENSHCOG00000016866) ENSHCOG00000016883 ENSHCOG00000016892 ENSHCOG00000016913 pkmb (ENSHCOG00000016942) HCN4 (ENSHCOG00000000473) ENSHCOG00000016982 nptna (ENSHCOG00000016991) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 17 E2F4 (ENSMMDG00005013978) ENSMMDG00005013976 kif7 (ENSMMDG00005013975) rhcgl1 (ENSMMDG00005013963) fes (ENSMMDG00005013844) furina (ENSMMDG00005009916) ENSMMDG00005009843 cd82a (ENSMMDG00005009840) kmt5b (ENSMMDG00005009834) pole3 (ENSMMDG00005009828) rpl12 (ENSMMDG00005009806) KCNG4 (ENSMMDG00005009798) zgc:194679 (ENSMMDG00005009794) ENSMMDG00005009793 ENSMMDG00005009786 tspan18a (ENSMMDG00005009782) #22 ENSMMDG00005009777 HERC1 (ENSMMDG00005009551) dapk2a (ENSMMDG00005009532) ENSMMDG00005009531 zdhhc1 (ENSMMDG00005009529) hsd11b2 (ENSMMDG00005009527) ENSMMDG00005009526 CIB2 (ENSMMDG00005009525) idh3a (ENSMMDG00005008694) rab8b (ENSMMDG00005008680) tnni1b (ENSMMDG00005008667) WDR59 (ENSMMDG00005007780) NOB1 (ENSMMDG00005007768) cog8 (ENSMMDG00005007766) katnb1 (ENSMMDG00005007639) Cod MODERN SPECIES 5 ENSGMOG00000013397 ENSGMOG00000011343 ENSGMOG00000011350 ENSGMOG00000035611 TNNT3 (ENSGMOG00000011393) ENSGMOG00000028561 tnni2b.1 (ENSGMOG00000018981) ENSGMOG00000018961 ENSGMOG00000018911 ENSGMOG00000006402 ENSGMOG00000025002 ENSGMOG00000006378 ENSGMOG00000025333 ENSGMOG00000006346 ENSGMOG00000006331 ENSGMOG00000003209 #22 ENSGMOG00000003176 ENSGMOG00000003144 ENSGMOG00000002967 zfhx3b (ENSGMOG00000002909) dhx38 (ENSGMOG00000002840) ENSGMOG00000036674 zgc:162592 (ENSGMOG00000034405) ENSGMOG00000002766 rpl13 (ENSGMOG00000002752) gcshb (ENSGMOG00000002668) kars1 (ENSGMOG00000002633) ##15 ENSGMOG00000031278 ENSGMOG00000002456 bola3 (ENSGMOG00000002443) vat1l (ENSGMOG00000002421) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000153230.C ENSGT01030000234638.a ENSGT00940000159282 ENSGT00940000168688 ENSGT01030000234953 ENSGT00940000157850 ENSGT00390000003748 ENSGT00940000153424.a.a.c.b ENSGT00940000157737 ENSGT00940000172107 ENSGT00940000160977.e.b ENSGT00940000157327.o.a ENSGT00390000006479 ENSGT00390000017249.e ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000164936.b ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000157327.o.b ENSGT00950000182989.A.a ENSGT00940000155363.v.a ENSGT00940000155024.a.b.c.b ENSGT00940000160380 ENSGT00940000155707 ENSGT00940000159331.b ENSGT00940000158531 ENSGT00940000160522.c.a ENSGT00940000154257.a ENSGT00390000006883 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000001802 ENSGT00940000158707.a.a ENSGT00940000160309.e.b ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a.b.a.c.b ENSGT00390000004417.b ENSGT01010000223078 ENSGT00940000155010.a ENSGT00940000159150.ab ENSGT00940000163421.a.d.a.a ENSGT00940000156938.e ENSGT00390000002381.b.c ENSGT00390000006293.t ENSGT00940000156431.u ENSGT00390000017249.e ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000164936.b ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000157327.o.b ENSGT00950000182989.A.a.b ENSGT00950000182989.A.a.a ENSGT00940000155363.v.a ENSGT00940000155024.a.b.c.b.a.a ENSGT00940000164815.b ENSGT00940000158999.l ENSGT00390000014572 ENSGT00940000160522.c.b ENSGT00940000154257.b.c ENSGT00940000157387.l Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 177 ENSGT00390000002381.b.d.b ENSGT00390000006293.t.b ENSGT00940000156431.u ENSGT00390000017249.e ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d #22 ENSGT00940000164936.b ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000160977.e.a ENSGT00940000157327.o.b.c.a ENSGT00950000182989.A.a.a ENSGT00940000155363.v.a.a.a ENSGT00940000155024.a.b.c.b.b Salmo DUPLICATION Salmo ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000177059.a ENSGT00940000162871 ENSGT00390000018549.l ENSGT00940000157250.f ENSGT01100000263482.F ENSGT00940000155010.a ENSGT00940000159150.ab ENSGT00940000163421.a.d.a.a.f.b ENSGT00940000166375.h ENSGT00940000163421.a.d.a.a.f.a.a.b ENSGT00940000156938.e.g.b ENSGT00390000006293.t.b ENSGT00940000156431.u ENSGT00390000017249.e ENSGT00940000158481.d.i ENSGT00940000157667.d.c #22 ENSGT00940000162710.c.a.c.a ENSGT01030000234940.g.a ENSGT00940000154521.A ENSGT00940000157318.a ENSGT00390000005589.a.a.w ENSGT01030000234563.b.a.a.l.a ENSGT00950000183067.a.a.h ENSGT00950000182850.a.b.a.a.a.b ENSGT00390000012556.d ENSGT00940000168370 ENSGT00940000155475.h.j ENSGT00940000153395.a.j ENSGT00940000159954.b ENSGT00940000159769.a.a.w.a ENSGT00940000155279.C.a.a.m.a.b River trout MODERN SPECIES 21 csnk2a2a (ENSSTUG00000034328) MATCAP1 (ENSSTUG00000034251) ENSSTUG00000034239 ENSSTUG00000034226 GABARAPL2 (ENSSTUG00000034205) nqo1 (ENSSTUG00000034192) zgc:194679 (ENSSTUG00000034188) ENSSTUG00000034182 zgc:194679 (ENSSTUG00000034173) ENSSTUG00000034167 ENSSTUG00000034161 hsbp1b (ENSSTUG00000034151) KMT5B (ENSSTUG00000034145) tp53i11a (ENSSTUG00000034139) cd82a (ENSSTUG00000034124) tspan18a (ENSSTUG00000034113) #22 ENSSTUG00000034107 Atlantic salmon MODERN SPECIES 18 CCL13 (ENSSSAG00000099932) ENSSSAG00000084012 ENSSSAG00000118511 ENSSSAG00000113380 ENSSSAG00000088400 GBRL2 (ENSSSAG00000010013) ENSSSAG00000110983 ENSSSAG00000085508 nqo1 (ENSSSAG00000101047) ENSSSAG00000011352 ENSSSAG00000011427 ENSSSAG00000010152 ENSSSAG00000082927 ENSSSAG00000091074 ENSSSAG00000105524 ENSSSAG00000009806 #22 ENSSSAG00000106909 ENSSSAG00000096217 ENSSSAG00000006347 ENSSSAG00000115735 ENSSSAG00000100545 ENSSSAG00000085122 ENSSSAG00000092608 rab8b (ENSSSAG00000109151) ENSSSAG00000043704 ENSSSAG00000012627 ENSSSAG00000112080 ENSSSAG00000015583 ENSSSAG00000115886 gtf2a2 (ENSSSAG00000015777) ENSSSAG00000104640 Salmo ANCESTRAL SPECIES 255 ENSGT00940000158481.d.j ENSGT00940000157667.d.d #22 ENSGT00940000164936.b ENSGT00940000155907.b.b ENSGT00940000153424.a.a.c.a.b ENSGT00940000157327.o.b.c.a ENSGT00950000182989.A.a.a ENSGT00940000155363.v.a.a.a ENSGT00940000155024.a.b.c.a.a River trout MODERN SPECIES 3 GABARAPL2 (ENSSTUG00000001213) nqo1 (ENSSTUG00000001202) zgc:194679 (ENSSTUG00000001200) zgc:194679 (ENSSTUG00000000976) ENSSTUG00000000784 zgc:194679 (ENSSTUG00000026575) zgc:194679 (ENSSTUG00000026569) ENSSTUG00000026564 ENSSTUG00000026561 ENSSTUG00000026557 hsbp1b (ENSSTUG00000026554) ENSSTUG00000026548 KMT5B (ENSSTUG00000026542) tp53i11a (ENSSTUG00000026534) cd82a (ENSSTUG00000026523) tspan18a (ENSSTUG00000026513) #22 ENSSTUG00000026508 ENSSTUG00000026461 ENSSTUG00000026401 idh3a (ENSSTUG00000026037) CIB2 (ENSSTUG00000026017) ENSSTUG00000025982 ENSSTUG00000025952 ENSSTUG00000025950 dapk2a (ENSSTUG00000025906) ENSSTUG00000025886 ENSSTUG00000025879 dapk2a (ENSSTUG00000025857) ENSSTUG00000025841 CIB2 (ENSSTUG00000025828) idh3a (ENSSTUG00000025601) Atlantic salmon MODERN SPECIES 2 ENSSSAG00000013813 ENSSSAG00000095829 ENSSSAG00000040098 CTSD (ENSSSAG00000010227) ENSSSAG00000010218 ENSSSAG00000092045 ENSSSAG00000009832 ENSSSAG00000009794 ENSSSAG00000115358 ENSSSAG00000010306 ENSSSAG00000105958 csk22 (ENSSSAG00000076656) ENSSSAG00000111837 ENSSSAG00000085534 ENSSSAG00000088699 ENSSSAG00000100704 #22 ENSSSAG00000109322 ENSSSAG00000109639 ENSSSAG00000119946 ENSSSAG00000111489 ENSSSAG00000084348 ENSSSAG00000114608 ENSSSAG00000006371 ENSSSAG00000110291 ENSSSAG00000006390 IDH3A (ENSSSAG00000106641) rab8b (ENSSSAG00000116323) ENSSSAG00000006595 ENSSSAG00000112619 ENSSSAG00000089022 t2ag (ENSSSAG00000011770) Oncorhynchus DUPLICATION Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 354 ENSGT00940000157667.d.e #22 ENSGT00940000164936.b ENSGT00940000155907.b.b Rainbow trout MODERN SPECIES 27 ENSOMYG00000065456 ENSOMYG00000023569 nqo1 (ENSOMYG00000026613) ENSOMYG00000027779 ENSOMYG00000027790 ENSOMYG00000024976 ENSOMYG00000029503 zgc:194679 (ENSOMYG00000029489) ENSOMYG00000029441 ENSOMYG00000069550 ENSOMYG00000030174 ENSOMYG00000050770 tp53i11a (ENSOMYG00000063935) ENSOMYG00000053868 ENSOMYG00000053944 tspan18a (ENSOMYG00000051783) #22 ENSOMYG00000069963 ENSOMYG00000049245 ENSOMYG00000057409 dapk2a (ENSOMYG00000030794) ENSOMYG00000051272 ENSOMYG00000022157 IDH3A (ENSOMYG00000076963) rab8b (ENSOMYG00000068216) trpm1a (ENSOMYG00000067467) ENSOMYG00000059969 ENSOMYG00000030563 ENSOMYG00000066449 ENSOMYG00000061510 ENSOMYG00000030677 ENSOMYG00000059310 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157667.d.e #22 Coho salmon MODERN SPECIES 170 cd82a (ENSOKIG00005032170) TSPAN18 (ENSOKIG00005032176) #22 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 424 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d.f #22 Rainbow trout MODERN SPECIES 18 ENSOMYG00000060814 ENSOMYG00000052323 ENSOMYG00000050454 ENSOMYG00000051857 nqo1 (ENSOMYG00000023536) ENSOMYG00000029528 ENSOMYG00000050301 ENSOMYG00000051512 zgc:194679 (ENSOMYG00000053254) ENSOMYG00000065845 ENSOMYG00000069105 ENSOMYG00000050793 ENSOMYG00000075107 ENSOMYG00000063620 ENSOMYG00000073398 ENSOMYG00000072222 #22 ENSOMYG00000037444 ENSOMYG00000074364 ENSOMYG00000057070 ENSOMYG00000075070 ENSOMYG00000067560 ENSOMYG00000057665 dapk2a (ENSOMYG00000065478) ENSOMYG00000038661 ENSOMYG00000063389 ENSOMYG00000054717 IDH3A (ENSOMYG00000022101) rab8b (ENSOMYG00000054197) trpm1a (ENSOMYG00000022182) ENSOMYG00000060194 ENSOMYG00000058602 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 591 ENSGT00940000158481.d ENSGT00940000157667.d.f #22 Coho salmon MODERN SPECIES 42 CD82 (ENSOKIG00005049754) ENSOKIG00005049756 #22 ENSOKIG00005049763 ENSOKIG00005049764 ENSOKIG00005049935 Northern pike MODERN SPECIES 1 MATCAP1 (ENSELUG00000016221) ENSELUG00000024881 ENSELUG00000026993 GABARAPL2 (ENSELUG00000016235) nqo1 (ENSELUG00000016240) zgc:194679 (ENSELUG00000001623) ENSELUG00000025489 ENSELUG00000016260 zgc:194679 (ENSELUG00000016269) ENSELUG00000016278 ENSELUG00000016282 hsbp1b (ENSELUG00000016301) KMT5B (ENSELUG00000016341) tp53i11a (ENSELUG00000016358) cd82a (ENSELUG00000016388) tspan18a (ENSELUG00000016416) #22 ENSELUG00000016428 HERC1 (ENSELUG00000016561) dapk2a (ENSELUG00000016620) ENSELUG00000016710 ENSELUG00000025922 ENSELUG00000032986 CIB2 (ENSELUG00000016739) idh3a (ENSELUG00000016752) rab8b (ENSELUG00000016862) trpm1a (ENSELUG00000016944) klf13 (ENSELUG00000016962) OTUD7A (ENSELUG00000016992) gtf2a2 (ENSELUG00000017019) FOXB1 (ENSELUG00000017034) anxa2b (ENSELUG00000000639)