Chordata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154787 #22
Vertebrata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154787 #22
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	258												ENSGT00940000155945	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000166116
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	166				ENSGT00940000158795	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00530000064359	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000166116	ENSGT00940000172233	ENSGT00940000157194
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	71	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000158795	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00530000064359	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00940000164541	ENSGT00940000160293	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000172233	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	58	ENSGT00530000064359.b.a	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00940000164541	ENSGT00940000162975	ENSGT00390000008726.h.b	ENSGT00390000014107.a.b	ENSGT00940000160293	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000172233	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00940000164541	ENSGT00940000162975	ENSGT00390000008726.h.b	ENSGT00390000014107.a.b	ENSGT00940000160293	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000172233	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00940000164541	ENSGT00940000160293	ENSGT00390000002471	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000172233	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Theria	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00940000164541	ENSGT00940000160293	ENSGT00390000002471	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000160293	ENSGT00390000002471	ENSGT00940000163287	ENSGT00940000162450	ENSGT00530000064839	ENSGT00940000162484	ENSGT00940000160997	ENSGT00940000155371	ENSGT00940000154993	ENSGT00940000161821	ENSGT00940000154723.b	ENSGT00940000162353	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000165628	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000165628	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
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Glires	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000006922.m.b.b.a	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
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Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000155127	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.f	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000155127	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.f	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
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Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.b.b	ENSGT00390000006922.m.b.b.a	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00940000162230 #25	ENSGT00390000013040 #26	ENSGT00390000017030.b.a #27	ENSGT00950000183180.a.a #28	ENSGT00940000161076 #29	ENSGT00940000155670.c.a #30	ENSGT00940000155670.c.b #31	ENSGT00940000155434 #32	ENSGT00940000155178 #33	ENSGT00940000155591 #35	ENSGT01030000234614.B.a.a.a #36	ENSGT00390000000223	ENSGT00950000182858.B.a.d #37
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.b.b	ENSGT00390000006922.m.b.b.a	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00940000162230 #25	ENSGT00390000013040 #26	ENSGT00390000017030.b.a #27	ENSGT00950000183180.a.a #28	ENSGT00940000161076 #29	ENSGT00940000155670.c.a #30	ENSGT00940000155670.c.b #31	ENSGT00940000155434 #32	ENSGT00940000155178 #33	ENSGT00940000155591 #35	ENSGT01030000234614.B.a.a.a #36	ENSGT00390000000223	ENSGT00950000182858.B.a.d #37
Mus	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000155127	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.b.b	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00940000162230 #25	ENSGT00390000013040 #26	ENSGT00390000017030.b.a #27	ENSGT00950000183180.a.a #28	ENSGT00940000161076 #29	ENSGT00940000155670.c.a #30	ENSGT00940000155670.c.b #31	ENSGT00940000155434 #32	ENSGT00940000155178 #33	ENSGT00940000155591 #35	ENSGT01030000234614.B.a.a.a #36	ENSGT00950000182858.B.a.d #37	ENSGT00950000182858.B.b.b ##37
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155127	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.b.b	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00940000162230 #25	ENSGT00390000013040 #26	ENSGT00390000017030.b.a #27	ENSGT00950000183180.a.a #28	ENSGT00940000161076 #29	ENSGT00940000155670.c.a #30	ENSGT00940000155670.c.b #31	ENSGT00940000155434 #32	ENSGT00940000155178 #33	ENSGT00940000155591 #35	ENSGT01030000234614.B.a.a.a #36	ENSGT00950000182858.B.a.d #37	ENSGT00950000182858.B.b.b ##37
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000155127	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.b.b	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00940000162230 #25	ENSGT00390000013040 #26	ENSGT00390000017030.b.a #27	ENSGT00950000183180.a.a #28	ENSGT00940000161076 #29	ENSGT00940000155670.c.a #30	ENSGT00940000155670.c.b #31	ENSGT00940000155434 #32	ENSGT00940000155178 #33	ENSGT00940000155591 #35	ENSGT01030000234614.B.a.a.a #36	ENSGT00950000182858.B.a.d #37	ENSGT00950000182858.B.b.b ##37
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155127	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.b.b	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00940000162230 #25	ENSGT00390000013040 #26	ENSGT00390000017030.b.a #27	ENSGT00950000183180.a.a #28	ENSGT00940000161076 #29	ENSGT00940000155670.c.a #30	ENSGT00940000155670.c.b #31	ENSGT00940000155434 #32	ENSGT00940000155178 #33	ENSGT00940000155591 #35	ENSGT01030000234614.B.a.a.a #36	ENSGT00950000182858.B.a.d #37	ENSGT00950000182858.B.b.b ##37
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3128													ENSMSIG00000014679 #19	Mapkap1 (ENSMSIG00000014730) #20	Gapvd1 (ENSMSIG00000014925) #21	Hspa5 (ENSMSIG00000015271) #22	Rabepk (ENSMSIG00000015295) #23	Fbxw2 (ENSMSIG00000015324) #24	B3galt9 (ENSMSIG00000015410) #25	Psmd5 (ENSMSIG00000015420) #26	Cutal (ENSMSIG00000015443) #27	Phf19 (ENSMSIG00000015511) #28	Traf1 (ENSMSIG00000015545) #29	Hc (ENSMSIG00000015579) #30	AI182371 (ENSMSIG00000015637) #31	Cntrl (ENSMSIG00000015919) #32	Rab14 (ENSMSIG00000016182) #33	ENSMSIG00000016224 #34	Gsn (ENSMSIG00000016233) #35	Stom (ENSMSIG00000016319) #36	ENSMSIG00000016329 #37
spretus	MODERN SPECIES	11	Stxbp1 (MGP_SPRETEiJ_G0024369)	Niban2 (MGP_SPRETEiJ_G0024370)	Lrsam1 (MGP_SPRETEiJ_G0024371)	Rpl12 (MGP_SPRETEiJ_G0024372)	Slc2a8 (MGP_SPRETEiJ_G0024373)	Garnl3 (MGP_SPRETEiJ_G0024374)	Ralgps1 (MGP_SPRETEiJ_G0024375)	Angptl2 (MGP_SPRETEiJ_G0024376)	Zbtb34 (MGP_SPRETEiJ_G0024377)	Zbtb43 (MGP_SPRETEiJ_G0024378)	Lmx1b (MGP_SPRETEiJ_G0024379)	Mvb12b (MGP_SPRETEiJ_G0024380)	Pbx3 (MGP_SPRETEiJ_G0024381)	Mapkap1 (MGP_SPRETEiJ_G0024382) #20	Gapvd1 (MGP_SPRETEiJ_G0024383) #21	Hspa5 (MGP_SPRETEiJ_G0024384) #22	Rabepk (MGP_SPRETEiJ_G0024385) #23	Fbxw2 (MGP_SPRETEiJ_G0024386) #24	Psmd5 (MGP_SPRETEiJ_G0024387) #26	Cutal (MGP_SPRETEiJ_G0024388) #27	Phf19 (MGP_SPRETEiJ_G0024389) #28	Traf1 (MGP_SPRETEiJ_G0024390) #29	Hc (MGP_SPRETEiJ_G0024391) #30	AI182371 (MGP_SPRETEiJ_G0024392) #31	Cntrl (MGP_SPRETEiJ_G0024393) #32	Rab14 (MGP_SPRETEiJ_G0024394) #33	Gsn (MGP_SPRETEiJ_G0024395) #35	Stom (MGP_SPRETEiJ_G0024396) #36	4930568D16Rik (MGP_SPRETEiJ_G0024397) #37	4930402F06Rik (MGP_SPRETEiJ_G0024398) ##37	Ggta1 (MGP_SPRETEiJ_G0024399) ##37
Mouse	MODERN SPECIES	11	Stxbp1 (ENSMUSG00000026797)	Niban2 (ENSMUSG00000026796)	Lrsam1 (ENSMUSG00000026792)	Rpl12 (ENSMUSG00000038900)	Slc2a8 (ENSMUSG00000026791)	Garnl3 (ENSMUSG00000038860)	Ralgps1 (ENSMUSG00000038831)	Angptl2 (ENSMUSG00000004105)	Zbtb34 (ENSMUSG00000068966)	Zbtb43 (ENSMUSG00000026788)	Lmx1b (ENSMUSG00000038765)	Mvb12b (ENSMUSG00000038740)	Pbx3 (ENSMUSG00000038718)	Mapkap1 (ENSMUSG00000038696) #20	Gapvd1 (ENSMUSG00000026867) #21	Hspa5 (ENSMUSG00000026864) #22	Rabepk (ENSMUSG00000070953) #23	Fbxw2 (ENSMUSG00000035949) #24	B3galt9 (ENSMUSG00000107167) #25	Psmd5 (ENSMUSG00000026869) #26	Cutal (ENSMUSG00000026870) #27	Phf19 (ENSMUSG00000026873) #28	Traf1 (ENSMUSG00000026875) #29	Hc (ENSMUSG00000026874) #30	AI182371 (ENSMUSG00000035875) #31	Cntrl (ENSMUSG00000057110) #32	Rab14 (ENSMUSG00000026878) #33	Gsn (ENSMUSG00000026879) #35	Stom (ENSMUSG00000026880) #36	4930568D16Rik (ENSMUSG00000026882) #37	4930402F06Rik (ENSMUSG00000079421) ##37
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	11	MGP_CAROLIEiJ_G0023452	Niban2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023453)	Lrsam1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023454)	Rpl12 (MGP_CAROLIEiJ_G0023455)	Slc2a8 (MGP_CAROLIEiJ_G0023456)	Garnl3 (MGP_CAROLIEiJ_G0023457)	Ralgps1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023458)	Angptl2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023459)	Zbtb34 (MGP_CAROLIEiJ_G0023460)	Zbtb43 (MGP_CAROLIEiJ_G0023461)	Lmx1b (MGP_CAROLIEiJ_G0023462)	Mvb12b (MGP_CAROLIEiJ_G0023463)	Pbx3 (MGP_CAROLIEiJ_G0023464)	Mapkap1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023465) #20	Gapvd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023466) #21	Hspa5 (MGP_CAROLIEiJ_G0023467) #22	Rabepk (MGP_CAROLIEiJ_G0023468) #23	Fbxw2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023469) #24	Psmd5 (MGP_CAROLIEiJ_G0023470) #26	Cutal (MGP_CAROLIEiJ_G0023471) #27	Phf19 (MGP_CAROLIEiJ_G0023472) #28	MGP_CAROLIEiJ_G0023473	Hc (MGP_CAROLIEiJ_G0023474) #30	AI182371 (MGP_CAROLIEiJ_G0023475) #31	Cntrl (MGP_CAROLIEiJ_G0023476) #32	MGP_CAROLIEiJ_G0023477 #33	Gsn (MGP_CAROLIEiJ_G0023478) #35	Stom (MGP_CAROLIEiJ_G0023479) #36	4930568D16Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0023480) #37	4930402F06Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0023481) ##37	Ggta1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023482) ##37
Shrew mouse	MODERN SPECIES	16	Stxbp1 (MGP_PahariEiJ_G0024909)	Niban2 (MGP_PahariEiJ_G0024910)	Lrsam1 (MGP_PahariEiJ_G0024911)	MGP_PahariEiJ_G0024912	Slc2a8 (MGP_PahariEiJ_G0024913)	Garnl3 (MGP_PahariEiJ_G0024914)	Ralgps1 (MGP_PahariEiJ_G0024915)	Angptl2 (MGP_PahariEiJ_G0024916)	Zbtb34 (MGP_PahariEiJ_G0024917)	Zbtb43 (MGP_PahariEiJ_G0024918)	Lmx1b (MGP_PahariEiJ_G0024919)	Mvb12b (MGP_PahariEiJ_G0024920)	Pbx3 (MGP_PahariEiJ_G0024921)	Mapkap1 (MGP_PahariEiJ_G0024922) #20	Gapvd1 (MGP_PahariEiJ_G0024923) #21	Hspa5 (MGP_PahariEiJ_G0024924) #22	Rabepk (MGP_PahariEiJ_G0024925) #23	Fbxw2 (MGP_PahariEiJ_G0024926) #24	Psmd5 (MGP_PahariEiJ_G0024927) #26	Cutal (MGP_PahariEiJ_G0024928) #27	Phf19 (MGP_PahariEiJ_G0024929) #28	MGP_PahariEiJ_G0024930	Hc (MGP_PahariEiJ_G0024931) #30	AI182371 (MGP_PahariEiJ_G0024932) #31	Cntrl (MGP_PahariEiJ_G0024933) #32	Rab14 (MGP_PahariEiJ_G0024934) #33	Gsn (MGP_PahariEiJ_G0024935) #35	Stom (MGP_PahariEiJ_G0024936) #36	4930568D16Rik (MGP_PahariEiJ_G0024937) #37	4930402F06Rik (MGP_PahariEiJ_G0024938) ##37	Ggta1 (MGP_PahariEiJ_G0024939) ##37
Rat	MODERN SPECIES	13	Niban2 (ENSRNOG00000015845)	Lrsam1 (ENSRNOG00000022312)	Rpl12 (ENSRNOG00000016220)	Slc2a8 (ENSRNOG00000022274)	Garnl3 (ENSRNOG00000057044)	Ralgps1 (ENSRNOG00000016910)	Angptl2 (ENSRNOG00000016678)	Zbtb34 (ENSRNOG00000032700)	Zbtb43 (ENSRNOG00000017017)	Lmx1b (ENSRNOG00000017019)	LOC103695152 (ENSRNOG00000067028)	Mvb12b (ENSRNOG00000017172)	Pbx3 (ENSRNOG00000022162) #19	Mapkap1 (ENSRNOG00000017583) #20	Gapvd1 (ENSRNOG00000017925) #21	Hspa5 (ENSRNOG00000018294) #22	Rabepk (ENSRNOG00000018591) #23	Fbxw2 (ENSRNOG00000018687) #24	B3galt9 (ENSRNOG00000069270) #25	Psmd5 (ENSRNOG00000018809) #26	RGD1564854 (ENSRNOG00000018832) #27	Phf19 (ENSRNOG00000018874) #28	Traf1 (ENSRNOG00000048914) #29	C5 (ENSRNOG00000018899) #30	RGD1308742 (ENSRNOG00000022033) #31	Cntrl (ENSRNOG00000022015) #32	Rab14 (ENSRNOG00000018901) #33	Gsn (ENSRNOG00000018991) #35	Stom (ENSRNOG00000019147) #36	ENSRNOG00000066367	Ggta1l1 (ENSRNOG00000042373) #37
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000165628	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00940000162230 #25	ENSGT00390000013040 #26	ENSGT00390000017030.b.a #27	ENSGT00950000183180.a.a #28	ENSGT00940000161076 #29	ENSGT00940000155670.c.a #30	ENSGT00940000155670.c.b #31	ENSGT00940000155434 #32	ENSGT00940000155178 #33	ENSGT00940000155591 #35	ENSGT01030000234614.B.a.a.a #36	ENSGT00950000182858.B.a.d #37	ENSGT00950000182858.B.b.b ##37
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000155127	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00940000162230 #25	ENSGT00390000013040 #26	ENSGT00390000017030.b.a #27	ENSGT00950000183180.a.a #28	ENSGT00940000161076 #29	ENSGT00940000155670.c.a #30	ENSGT00940000155670.c.b #31	ENSGT00940000155434 #32	ENSGT00940000155178 #33	ENSGT00940000155591 #35	ENSGT01030000234614.B.a.a.a #36	ENSGT00950000182858.B.a.d #37	ENSGT00950000182858.B.b.b ##37
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	17	Stxbp1 (ENSPEMG00000017782)	Niban2 (ENSPEMG00000010275)	Lrsam1 (ENSPEMG00000009017)	ENSPEMG00000012646	Slc2a8 (ENSPEMG00000015906)	Garnl3 (ENSPEMG00000015218)	Angptl2 (ENSPEMG00000024229)	Ralgps1 (ENSPEMG00000022675)	Zbtb34 (ENSPEMG00000029809)	Zbtb43 (ENSPEMG00000030024)	Lmx1b (ENSPEMG00000029828)	Mvb12b (ENSPEMG00000018956)	Pbx3 (ENSPEMG00000021405)	Mapkap1 (ENSPEMG00000023004) #20	Gapvd1 (ENSPEMG00000002184) #21	Hspa5 (ENSPEMG00000021747) #22	Rabepk (ENSPEMG00000015873) #23	Fbxw2 (ENSPEMG00000018212) #24	B3galt9 (ENSPEMG00000028638) #25	Psmd5 (ENSPEMG00000023222) #26	Cutal (ENSPEMG00000007769) #27	Phf19 (ENSPEMG00000021731) #28	ENSPEMG00000005981	Traf1 (ENSPEMG00000021434) #29	Hc (ENSPEMG00000007298) #30	AI182371 (ENSPEMG00000023612) #31	Cntrl (ENSPEMG00000022435) #32	Rab14 (ENSPEMG00000031339) #33	Gsn (ENSPEMG00000022763) #35	Stom (ENSPEMG00000024133) #36	4930568D16Rik (ENSPEMG00000023360) #37
Prairie vole	MODERN SPECIES	12	Niban2 (ENSMOCG00000018534)	ENSMOCG00000022326	ENSMOCG00000020577	ENSMOCG00000019930	Garnl3 (ENSMOCG00000018573)	Angptl2 (ENSMOCG00000000727)	Ralgps1 (ENSMOCG00000001227)	Zbtb34 (ENSMOCG00000021068)	Zbtb43 (ENSMOCG00000020167)	Lmx1b (ENSMOCG00000017503)	ENSMOCG00000015977	Mvb12b (ENSMOCG00000004446)	Pbx3 (ENSMOCG00000016562)	Mapkap1 (ENSMOCG00000007657) #20	Gapvd1 (ENSMOCG00000004036) #21	Hspa5 (ENSMOCG00000000712) #22	Rabepk (ENSMOCG00000012677) #23	ENSMOCG00000002036 #24	Psmd5 (ENSMOCG00000006360) #26	Cutal (ENSMOCG00000004392) #27	Phf19 (ENSMOCG00000017903) #28	Traf1 (ENSMOCG00000022030) #29	Hc (ENSMOCG00000021554) #30	AI182371 (ENSMOCG00000013729) #31	Cntrl (ENSMOCG00000015441) #32	Rab14 (ENSMOCG00000003760) #33	Gsn (ENSMOCG00000016307) #35	Stom (ENSMOCG00000011437) #36	4930568D16Rik (ENSMOCG00000001085) #37	4930402F06Rik (ENSMOCG00000021961) ##37	Ggta1 (ENSMOCG00000019453) ##37
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	61									ENSGT00940000159944	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000165175	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00390000013040 #26	ENSGT00390000017030.b.a #27	ENSGT00950000183180.a.a #28	ENSGT00940000161076 #29	ENSGT00900000143249	ENSGT00940000155670.c.a #30
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	389											ENSCGRG00001012771	ENSCGRG00001005965	Pbx3 (ENSCGRG00001007618)	Mapkap1 (ENSCGRG00001009499) #20	Gapvd1 (ENSCGRG00001011304) #21	Hspa5 (ENSCGRG00001013777) #22
Golden Hamster	MODERN SPECIES	739										Zbtb34 (ENSMAUG00000016224)	Lmx1b (ENSMAUG00000021164)	Mvb12b (ENSMAUG00000012172)	ENSMAUG00000015241	Mapkap1 (ENSMAUG00000001416) #20	Gapvd1 (ENSMAUG00000000416) #21	Hspa5 (ENSMAUG00000016779) #22	Rabepk (ENSMAUG00000001453) #23	Fbxw2 (ENSMAUG00000010752) #24	Psmd5 (ENSMAUG00000008700) #26	Cutal (ENSMAUG00000012653) #27	Phf19 (ENSMAUG00000018644) #28	Traf1 (ENSMAUG00000018192) #29	Cwf19l2 (ENSMAUG00000013819)	Alkbh8 (ENSMAUG00000022157)	ENSMAUG00000011357	ENSMAUG00000022145	ENSMAUG00000021988	Ppp6c (ENSMAUG00000019280)	Scai (ENSMAUG00000016374)	Golga1 (ENSMAUG00000017375)	Arpc5l (ENSMAUG00000020262)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	513	Stxbp1 (ENSNGAG00000018185)	Niban2 (ENSNGAG00000018294)	ENSNGAG00000017220	ENSNGAG00000014820	Slc2a8 (ENSNGAG00000017563)	ENSNGAG00000018639	Angptl2 (ENSNGAG00000013329)	Ralgps1 (ENSNGAG00000011874)	Zbtb34 (ENSNGAG00000016663)	Zbtb43 (ENSNGAG00000009744)	Lmx1b (ENSNGAG00000013286)	Mvb12b (ENSNGAG00000012640)	Pbx3 (ENSNGAG00000020873)	Mapkap1 (ENSNGAG00000002676) #20	Gapvd1 (ENSNGAG00000016173) #21	Hspa5 (ENSNGAG00000016525) #22	Rabepk (ENSNGAG00000009850) #23	ENSNGAG00000000167	Scai (ENSNGAG00000009532)	Golga1 (ENSNGAG00000017928)	Arpc5l (ENSNGAG00000004816)	ENSNGAG00000012132	ENSNGAG00000016210	Olfml2a (ENSNGAG00000006763)	Nr6a1 (ENSNGAG00000019760)	Nr5a1 (ENSNGAG00000018329)	Psmb7 (ENSNGAG00000016549)	Nek6 (ENSNGAG00000017493)	Lhx2 (ENSNGAG00000013721)	ENSNGAG00000003822	ENSNGAG00000011495
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	94													ENSJJAG00000023751	Mapkap1 (ENSJJAG00000014299) #20	Gapvd1 (ENSJJAG00000010351) #21	Hspa5 (ENSJJAG00000023256) #22	Rabepk (ENSJJAG00000023084) #23	ENSJJAG00000011633	ENSJJAG00000000698	Scai (ENSJJAG00000020518)	Golga1 (ENSJJAG00000024183)	Arpc5l (ENSJJAG00000013733)	ENSJJAG00000014897	Wdr38 (ENSJJAG00000008331)	Olfml2a (ENSJJAG00000017354)	Nr6a1 (ENSJJAG00000016130)	Nr5a1 (ENSJJAG00000023318)	ENSJJAG00000020212	Nek6 (ENSJJAG00000015974)	Lhx2 (ENSJJAG00000015440)	ENSJJAG00000018640
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	374	Stxbp1 (ENSDORG00000013319)	Niban2 (ENSDORG00000014462)	ENSDORG00000008563	ENSDORG00000028244	Slc2a8 (ENSDORG00000005309)	Garnl3 (ENSDORG00000005302)	Angptl2 (ENSDORG00000005301)	Ralgps1 (ENSDORG00000005296)	Zbtb34 (ENSDORG00000010756)	Zbtb43 (ENSDORG00000028519)	Lmx1b (ENSDORG00000002371)	Mvb12b (ENSDORG00000027922)	ENSDORG00000024134	Mapkap1 (ENSDORG00000013292) #20	Gapvd1 (ENSDORG00000013673) #21	Hspa5 (ENSDORG00000014419) #22	Rabepk (ENSDORG00000014417) #23	ENSDORG00000028487	Scai (ENSDORG00000012138)	Golga1 (ENSDORG00000012132)	Arpc5l (ENSDORG00000027899)	ENSDORG00000012125	Wdr38 (ENSDORG00000012116)	Olfml2a (ENSDORG00000013607)	Nr6a1 (ENSDORG00000013606)	Nr5a1 (ENSDORG00000028222)	Psmb7 (ENSDORG00000014519)	Nek6 (ENSDORG00000014518)	ENSDORG00000025549	Lhx2 (ENSDORG00000025403)	Dennd1a (ENSDORG00000002817)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.f	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000155127	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.e.a	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000155127	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.e.a	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Guinea pig	DUPLICATION
Guinea pig	MODERN SPECIES	27	STXBP1 (ENSCPOG00000003635)	NIBAN2 (ENSCPOG00000021846)	LRSAM1 (ENSCPOG00000013773)	ENSCPOG00000013769	SLC2A8 (ENSCPOG00000012327)	GARNL3 (ENSCPOG00000012318)	RALGPS1 (ENSCPOG00000012308)	ANGPTL2 (ENSCPOG00000002360)	ZBTB34 (ENSCPOG00000003791)	ZBTB43 (ENSCPOG00000038507)	LMX1B (ENSCPOG00000023429)	MVB12B (ENSCPOG00000036809)	PBX3 (ENSCPOG00000004530)	MAPKAP1 (ENSCPOG00000004526) #20	GAPVD1 (ENSCPOG00000004285) #21	ENSCPOG00000012520 #22	RABEPK (ENSCPOG00000026070) #23	PPP6C (ENSCPOG00000004898)	SCAI (ENSCPOG00000001406)	GOLGA1 (ENSCPOG00000014706)	ARPC5L (ENSCPOG00000036902)	RPL35 (ENSCPOG00000022811)	OLFML2A (ENSCPOG00000003516)	NR6A1 (ENSCPOG00000005970)	NR5A1 (ENSCPOG00000022305)	ADGRD2 (ENSCPOG00000027184)	PSMB7 (ENSCPOG00000007839)	NEK6 (ENSCPOG00000007827)	LHX2 (ENSCPOG00000022927)	DENND1A (ENSCPOG00000014548)	CRB2 (ENSCPOG00000010074)
Guinea pig	MODERN SPECIES	10	SPRED1 (ENSCPOG00000036046)	TMCO5A (ENSCPOG00000008812)	MEIS2 (ENSCPOG00000015087)	CDIN1 (ENSCPOG00000031711)	DPH6 (ENSCPOG00000015532)	AQR (ENSCPOG00000000810)	ACTC1 (ENSCPOG00000039882)	GJD2 (ENSCPOG00000030355)	ENSCPOG00000002037	SCG5 (ENSCPOG00000034361)	GREM1 (ENSCPOG00000036070)	FMN1 (ENSCPOG00000002614)	ENSCPOG00000027291	RYR3 (ENSCPOG00000003120)	AVEN (ENSCPOG00000003146)	ENSCPOG00000040719 #22	CHRM5 (ENSCPOG00000003150)	EMC7 (ENSCPOG00000004178)	KATNBL1 (ENSCPOG00000011153)	EMC4 (ENSCPOG00000005287)	SLC12A6 (ENSCPOG00000007938)	NOP10 (ENSCPOG00000037400)	NUTM1 (ENSCPOG00000007954)	LPCAT4 (ENSCPOG00000023492)	ENSCPOG00000039959	ENSCPOG00000002710	ENSCPOG00000040152	OR4F15 (ENSCPOG00000030908)	ENSCPOG00000037540	ENSCPOG00000033366	ENSCPOG00000005786
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000155127	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.e.a	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b	ENSGT00940000154687.B.c
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	126	STXBP1 (ENSCLAG00000008818)	NIBAN2 (ENSCLAG00000011344)	LRSAM1 (ENSCLAG00000012918)	Rpl12 (ENSCLAG00000010912)	SLC2A8 (ENSCLAG00000013068)	GARNL3 (ENSCLAG00000014036)	RALGPS1 (ENSCLAG00000009365)	ANGPTL2 (ENSCLAG00000012007)	ZBTB34 (ENSCLAG00000012109)	ZBTB43 (ENSCLAG00000017099)	LMX1B (ENSCLAG00000012490)	MVB12B (ENSCLAG00000010176)	PBX3 (ENSCLAG00000009335)	MAPKAP1 (ENSCLAG00000011818) #20	GAPVD1 (ENSCLAG00000010577) #21	HSPA5 (ENSCLAG00000009815) #22	RABEPK (ENSCLAG00000011734) #23	PPP6C (ENSCLAG00000013734)	SCAI (ENSCLAG00000013682)	GOLGA1 (ENSCLAG00000011649)	ARPC5L (ENSCLAG00000009936)	RPL35 (ENSCLAG00000013142)	OLFML2A (ENSCLAG00000014121)	NR6A1 (ENSCLAG00000012774)	NR5A1 (ENSCLAG00000012090)	PSMB7 (ENSCLAG00000013548)	NEK6 (ENSCLAG00000009797)	LHX2 (ENSCLAG00000010277)	DENND1A (ENSCLAG00000010455)	CRB2 (ENSCLAG00000015580)	STRBP (ENSCLAG00000010826)
Degu	MODERN SPECIES	179	GARNL3 (ENSODEG00000004430)	RALGPS1 (ENSODEG00000004526)	ANGPTL2 (ENSODEG00000004652)	ZBTB34 (ENSODEG00000019126)	ZBTB43 (ENSODEG00000004660)	LMX1B (ENSODEG00000004681)	MVB12B (ENSODEG00000004709)	ENSODEG00000004733	ENSODEG00000019095	PBX3 (ENSODEG00000003566)	ENSODEG00000003600	ENSODEG00000019075	MAPKAP1 (ENSODEG00000003644) #20	ENSODEG00000018962	GAPVD1 (ENSODEG00000003684) #21	HSPA5 (ENSODEG00000003702) #22	RABEPK (ENSODEG00000003723) #23	ENSODEG00000003752	ENSODEG00000003771	SCAI (ENSODEG00000003843)	GOLGA1 (ENSODEG00000003980)	ENSODEG00000004095	ENSODEG00000004120	OLFML2A (ENSODEG00000004138)	NR6A1 (ENSODEG00000004183)	ENSODEG00000004234	NR5A1 (ENSODEG00000004244)	ENSODEG00000004257	ENSODEG00000019019	NEK6 (ENSODEG00000004126)	ENSODEG00000004179
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	3	ENSHGLG00000048469	SLC2A8 (ENSHGLG00000017706)	GARNL3 (ENSHGLG00000017737)	RALGPS1 (ENSHGLG00000017780)	ENSHGLG00000018019	ANGPTL2 (ENSHGLG00000042186)	ZBTB34 (ENSHGLG00000032761)	ZBTB43 (ENSHGLG00000044018)	LMX1B (ENSHGLG00000035542)	MVB12B (ENSHGLG00000011104)	ENSHGLG00000043708	PBX3 (ENSHGLG00000011457)	MAPKAP1 (ENSHGLG00000011921) #20	ENSHGLG00000012167	GAPVD1 (ENSHGLG00000012368) #21	HSPA5 (ENSHGLG00000045279) #22	RABEPK (ENSHGLG00000010878) #23	PPP6C (ENSHGLG00000037108)	SCAI (ENSHGLG00000011703)	GOLGA1 (ENSHGLG00000012081)	ARPC5L (ENSHGLG00000012246)	ENSHGLG00000035609	OLFML2A (ENSHGLG00000012516)	NR6A1 (ENSHGLG00000012869)	NR5A1 (ENSHGLG00000042870)	PSMB7 (ENSHGLG00000013424)	NEK6 (ENSHGLG00000013776)	LHX2 (ENSHGLG00000014024)	DENND1A (ENSHGLG00000014439)	CRB2 (ENSHGLG00000014737)	ENSHGLG00000014962
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.f	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990.j	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.f	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990.j	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Alpin marmot	MODERN SPECIES	47	LRSAM1 (ENSMMMG00000017387)	ENSMMMG00000017430	SLC2A8 (ENSMMMG00000017451)	GARNL3 (ENSMMMG00000017471)	RALGPS1 (ENSMMMG00000017558)	ANGPTL2 (ENSMMMG00000017697)	ZBTB34 (ENSMMMG00000017703)	ENSMMMG00000017708	LMX1B (ENSMMMG00000017718)	MVB12B (ENSMMMG00000017733)	PBX3 (ENSMMMG00000017764)	ENSMMMG00000017816	ENSMMMG00000017820	MAPKAP1 (ENSMMMG00000017830) #20	GAPVD1 (ENSMMMG00000017880) #21	HSPA5 (ENSMMMG00000017949) #22	ENSMMMG00000017965 #23	PPP6C (ENSMMMG00000017971)	SCAI (ENSMMMG00000017999)	ENSMMMG00000018021	GOLGA1 (ENSMMMG00000018029)	ARPC5L (ENSMMMG00000018071)	RPL35 (ENSMMMG00000018074)	WDR38 (ENSMMMG00000018077)	OLFML2A (ENSMMMG00000018107)	NR6A1 (ENSMMMG00000018148)	NR5A1 (ENSMMMG00000018155)	PSMB7 (ENSMMMG00000018175)	NEK6 (ENSMMMG00000018189)	ENSMMMG00000018209	DENND1A (ENSMMMG00000018266)
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.f	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990.j	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	44	NIBAN2 (ENSUPAG00010014186)	LRSAM1 (ENSUPAG00010014137)	ENSUPAG00010014127	ZNF79 (ENSUPAG00010014122)	SLC2A8 (ENSUPAG00010014111)	GARNL3 (ENSUPAG00010013986)	ANGPTL2 (ENSUPAG00010013967)	RALGPS1 (ENSUPAG00010013847)	ENSUPAG00010013834	ENSUPAG00010013827	LMX1B (ENSUPAG00010013815)	MVB12B (ENSUPAG00010013802)	PBX3 (ENSUPAG00010013778)	MAPKAP1 (ENSUPAG00010013693) #20	GAPVD1 (ENSUPAG00010013640) #21	HSPA5 (ENSUPAG00010013632) #22	RABEPK (ENSUPAG00010013628) #23	PPP6C (ENSUPAG00010013600)	SCAI (ENSUPAG00010013570)	GOLGA1 (ENSUPAG00010013479)	ARPC5L (ENSUPAG00010013460)	WDR38 (ENSUPAG00010013438)	RPL35 (ENSUPAG00010013420)	OLFML2A (ENSUPAG00010013389)	NR6A1 (ENSUPAG00010013329)	NR5A1 (ENSUPAG00010013310)	ADGRD2 (ENSUPAG00010013284)	PSMB7 (ENSUPAG00010013273)	NEK6 (ENSUPAG00010013255)	LHX2 (ENSUPAG00010013245)	DENND1A (ENSUPAG00010013123)
Squirrel	MODERN SPECIES	87	NIBAN2 (ENSSTOG00000028681)	ENSSTOG00000033174	LRSAM1 (ENSSTOG00000005417)	ENSSTOG00000027425	SLC2A8 (ENSSTOG00000005378)	GARNL3 (ENSSTOG00000005340)	ANGPTL2 (ENSSTOG00000028602)	RALGPS1 (ENSSTOG00000032069)	ZBTB34 (ENSSTOG00000009103)	ZBTB43 (ENSSTOG00000007435)	LMX1B (ENSSTOG00000026973)	MVB12B (ENSSTOG00000021458)	PBX3 (ENSSTOG00000013679)	MAPKAP1 (ENSSTOG00000011275) #20	GAPVD1 (ENSSTOG00000011260) #21	Hspa5 (ENSSTOG00000011243) #22	RABEPK (ENSSTOG00000011234) #23	PPP6C (ENSSTOG00000007971)	SCAI (ENSSTOG00000007948)	GOLGA1 (ENSSTOG00000007917)	ARPC5L (ENSSTOG00000007907)	RPL35 (ENSSTOG00000007901)	WDR38 (ENSSTOG00000007867)	OLFML2A (ENSSTOG00000007852)	NR6A1 (ENSSTOG00000022764)	NR5A1 (ENSSTOG00000000396)	PSMB7 (ENSSTOG00000013826)	NEK6 (ENSSTOG00000013817)	LHX2 (ENSSTOG00000000794)	DENND1A (ENSSTOG00000023765)	CRB2 (ENSSTOG00000021477)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	6	NIBAN2 (ENSSVLG00005012680)	LRSAM1 (ENSSVLG00005012605)	ENSSVLG00005012515	ZNF79 (ENSSVLG00005012484)	SLC2A8 (ENSSVLG00005012376)	GARNL3 (ENSSVLG00005011649)	ANGPTL2 (ENSSVLG00005011489)	RALGPS1 (ENSSVLG00005011169)	ZBTB34 (ENSSVLG00005011114)	ZBTB43 (ENSSVLG00005011093)	LMX1B (ENSSVLG00005010935)	MVB12B (ENSSVLG00005023376)	PBX3 (ENSSVLG00005023289)	MAPKAP1 (ENSSVLG00005022966) #20	GAPVD1 (ENSSVLG00005022773) #21	HSPA5 (ENSSVLG00005022700) #22	RABEPK (ENSSVLG00005022664) #23	ENSSVLG00005022620	ENSSVLG00005022574	ENSSVLG00005022544	SCAI (ENSSVLG00005022411)	GOLGA1 (ENSSVLG00005022372)	ARPC5L (ENSSVLG00005022345)	RPL35 (ENSSVLG00005022293)	WDR38 (ENSSVLG00005022161)	OLFML2A (ENSSVLG00005022068)	ENSSVLG00005022017	NR6A1 (ENSSVLG00005021745)	NR5A1 (ENSSVLG00005021643)	ADGRD2 (ENSSVLG00005021497)	PSMB7 (ENSSVLG00005021459)
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000155127	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.b.b	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Rabbit	MODERN SPECIES	432	STXBP1 (ENSOCUG00000016172)	NIBAN2 (ENSOCUG00000004918)	LRSAM1 (ENSOCUG00000033801)	RPL12 (ENSOCUG00000004902)	SLC2A8 (ENSOCUG00000008091)	GARNL3 (ENSOCUG00000008082)	RALGPS1 (ENSOCUG00000007683)	ANGPTL2 (ENSOCUG00000007685)	ZBTB34 (ENSOCUG00000025964)	ZBTB43 (ENSOCUG00000009799)	ENSOCUG00000023786	MVB12B (ENSOCUG00000014336)	PBX3 (ENSOCUG00000012302)	MAPKAP1 (ENSOCUG00000001574) #20	GAPVD1 (ENSOCUG00000003136) #21	HSPA5 (ENSOCUG00000011636) #22	RABEPK (ENSOCUG00000016229) #23	PPP6C (ENSOCUG00000009375)	SCAI (ENSOCUG00000012963)	GOLGA1 (ENSOCUG00000003976)	ARPC5L (ENSOCUG00000002997)	ENSOCUG00000002996	WDR38 (ENSOCUG00000002992)	OLFML2A (ENSOCUG00000002473)	ENSOCUG00000036292	NR6A1 (ENSOCUG00000007599)	NR5A1 (ENSOCUG00000007848)	ADGRD2 (ENSOCUG00000006271)	PSMB7 (ENSOCUG00000009114)	ENSOCUG00000009108	LHX2 (ENSOCUG00000007757)
Tree shrew	MODERN SPECIES	1739															GAPVD1 (ENSTBEG00000001388) #21	HSPA5 (ENSTBEG00000000973) #22	RABEPK (ENSTBEG00000000816) #23
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Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000167867
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Catarrhini	DUPLICATION
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Pan	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.h.b	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787.y #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00900000141073.s	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990
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Gorilla	MODERN SPECIES	22	LRSAM1 (ENSGGOG00000000649)	ENSGGOG00000000648	ZNF79 (ENSGGOG00000000647)	SLC2A8 (ENSGGOG00000022646)	GARNL3 (ENSGGOG00000012871)	ANGPTL2 (ENSGGOG00000005996)	RALGPS1 (ENSGGOG00000015706)	ZBTB34 (ENSGGOG00000039553)	ZBTB43 (ENSGGOG00000017180)	ENSGGOG00000003629	MVB12B (ENSGGOG00000015432)	ENSGGOG00000009025 #19	ENSGGOG00000025432	MAPKAP1 (ENSGGOG00000005950) #20	GAPVD1 (ENSGGOG00000001564) #21	HSPA5 (ENSGGOG00000026879) #22	RABEPK (ENSGGOG00000003250) #23	PPP6C (ENSGGOG00000028356)	SCAI (ENSGGOG00000034880)	ENSGGOG00000037553	GOLGA1 (ENSGGOG00000004117)	ARPC5L (ENSGGOG00000004115)	ENSGGOG00000004111	WDR38 (ENSGGOG00000004105)	OLFML2A (ENSGGOG00000004100)	NR6A1 (ENSGGOG00000009250)	NR5A1 (ENSGGOG00000008994)	ADGRD2 (ENSGGOG00000008978)	PSMB7 (ENSGGOG00000012164)	NEK6 (ENSGGOG00000012155)	LHX2 (ENSGGOG00000008475)
Orangutan	MODERN SPECIES	22	NIBAN2 (ENSPPYG00000019624)	LRSAM1 (ENSPPYG00000019623)	ENSPPYG00000012775	ZNF79 (ENSPPYG00000019621)	SLC2A8 (ENSPPYG00000019620)	GARNL3 (ENSPPYG00000019619)	ANGPTL2 (ENSPPYG00000019618)	RALGPS1 (ENSPPYG00000019617)	ZBTB34 (ENSPPYG00000019616)	ZBTB43 (ENSPPYG00000019615)	LMX1B (ENSPPYG00000035802)	MVB12B (ENSPPYG00000019613)	PBX3 (ENSPPYG00000019612)	MAPKAP1 (ENSPPYG00000019611) #20	GAPVD1 (ENSPPYG00000019610) #21	HSPA5 (ENSPPYG00000019609) #22	RABEPK (ENSPPYG00000019608) #23	PPP6C (ENSPPYG00000019607)	SCAI (ENSPPYG00000019606)	GOLGA1 (ENSPPYG00000019605)	ARPC5L (ENSPPYG00000019604)	RPL35 (ENSPPYG00000019603)	WDR38 (ENSPPYG00000019602)	OLFML2A (ENSPPYG00000019601)	NR6A1 (ENSPPYG00000019600)	NR5A1 (ENSPPYG00000019599)	ADGRD2 (ENSPPYG00000019598)	PSMB7 (ENSPPYG00000019596)	NEK6 (ENSPPYG00000019594)	LHX2 (ENSPPYG00000019593)	DENND1A (ENSPPYG00000019592)
Gibbon	MODERN SPECIES	23	LRSAM1 (ENSNLEG00000017448)	ENSNLEG00000032140	ZNF79 (ENSNLEG00000017444)	SLC2A8 (ENSNLEG00000017441)	GARNL3 (ENSNLEG00000017424)	ANGPTL2 (ENSNLEG00000030312)	RALGPS1 (ENSNLEG00000017416)	ZBTB34 (ENSNLEG00000018999)	LMX1B (ENSNLEG00000017412)	MVB12B (ENSNLEG00000017403)	ENSNLEG00000032471	PBX3 (ENSNLEG00000034849)	ENSNLEG00000035312	MAPKAP1 (ENSNLEG00000017378) #20	GAPVD1 (ENSNLEG00000017358) #21	HSPA5 (ENSNLEG00000017348) #22	RABEPK (ENSNLEG00000017333) #23	ENSNLEG00000035575	PPP6C (ENSNLEG00000017324)	ENSNLEG00000030118	SCAI (ENSNLEG00000017321)	GOLGA1 (ENSNLEG00000017311)	ARPC5L (ENSNLEG00000017306)	ENSNLEG00000031655	WDR38 (ENSNLEG00000017294)	OLFML2A (ENSNLEG00000017289)	ENSNLEG00000033577	ENSNLEG00000035190	NR6A1 (ENSNLEG00000017287)	NR5A1 (ENSNLEG00000017282)	ENSNLEG00000033335
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00910000147354	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00910000147509	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787.y #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00910000147354	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00910000147509	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787.y #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00910000147354	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00910000147509	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787.y #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000006922.m.b.a.c.b.d.b	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00910000147354	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787.y #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990
Olive baboon	MODERN SPECIES	4	ZNF79 (ENSPANG00000024822)	SLC2A8 (ENSPANG00000024823)	GARNL3 (ENSPANG00000024824)	ANGPTL2 (ENSPANG00000024826)	ENSPANG00000024827	ZBTB34 (ENSPANG00000024819)	RALGPS1 (ENSPANG00000024825)	ZBTB43 (ENSPANG00000000295)	LMX1B (ENSPANG00000024818)	MVB12B (ENSPANG00000049397)	ENSPANG00000050841	PBX3 (ENSPANG00000024812)	ENSPANG00000051227	MAPKAP1 (ENSPANG00000024814) #20	GAPVD1 (ENSPANG00000024816) #21	HSPA5 (ENSPANG00000024811) #22	ENSPANG00000024810 #23	PPP6C (ENSPANG00000024802)	SCAI (ENSPANG00000011266)	GOLGA1 (ENSPANG00000017415)	ARPC5L (ENSPANG00000044193)	RPL35 (ENSPANG00000032631)	WDR38 (ENSPANG00000007029)	OLFML2A (ENSPANG00000025860)	NR6A1 (ENSPANG00000025861)	NR5A1 (ENSPANG00000025862)	ADGRD2 (ENSPANG00000025863)	NEK6 (ENSPANG00000025854)	PSMB7 (ENSPANG00000025855)	LHX2 (ENSPANG00000025852)	DENND1A (ENSPANG00000025853)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	56	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.a.c.b.d.b	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00910000147354	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787.y #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990
Drill	MODERN SPECIES	986												MVB12B (ENSMLEG00000032595)	PBX3 (ENSMLEG00000041125)	MAPKAP1 (ENSMLEG00000043978) #20	GAPVD1 (ENSMLEG00000037587) #21	HSPA5 (ENSMLEG00000035604) #22	RABEPK (ENSMLEG00000035953) #23	ENSMLEG00000037267	PPP6C (ENSMLEG00000031102)	ENSMLEG00000010445	SCAI (ENSMLEG00000037841)	GOLGA1 (ENSMLEG00000040538)	ARPC5L (ENSMLEG00000032105)	RPL35 (ENSMLEG00000034655)	WDR38 (ENSMLEG00000044214)	OLFML2A (ENSMLEG00000042186)	NR6A1 (ENSMLEG00000033021)	NR5A1 (ENSMLEG00000030657)	ADGRD2 (ENSMLEG00000031066)	PSMB7 (ENSMLEG00000034459)	NEK6 (ENSMLEG00000034890)
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	489	ENSCATG00000044598	ZNF79 (ENSCATG00000021022)	SLC2A8 (ENSCATG00000044921)	GARNL3 (ENSCATG00000031241)	RALGPS1 (ENSCATG00000020584)	ANGPTL2 (ENSCATG00000013244)	ENSCATG00000040745	ENSCATG00000018402	ZBTB34 (ENSCATG00000018802)	LMX1B (ENSCATG00000026158)	MVB12B (ENSCATG00000012830)	ENSCATG00000044919	PBX3 (ENSCATG00000044996)	MAPKAP1 (ENSCATG00000001243) #20	GAPVD1 (ENSCATG00000029396) #21	HSPA5 (ENSCATG00000044680) #22	RABEPK (ENSCATG00000042136) #23	PPP6C (ENSCATG00000031273)	ENSCATG00000029331	SCAI (ENSCATG00000011189)	GOLGA1 (ENSCATG00000044682)	ENSCATG00000034300	ARPC5L (ENSCATG00000037319)	RPL35 (ENSCATG00000020241)	WDR38 (ENSCATG00000041965)	OLFML2A (ENSCATG00000026827)	NR6A1 (ENSCATG00000030436)	NR5A1 (ENSCATG00000032967)	ADGRD2 (ENSCATG00000044429)	PSMB7 (ENSCATG00000033885)	NEK6 (ENSCATG00000044368)
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000006922.m.b.a.c.a.b	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00390000014472.e.a	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787.y #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961.j	ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	317	NIBAN2 (ENSMNEG00000029856)	LRSAM1 (ENSMNEG00000029748)	ENSMNEG00000035377	ZNF79 (ENSMNEG00000042847)	SLC2A8 (ENSMNEG00000032403)	GARNL3 (ENSMNEG00000032351)	ANGPTL2 (ENSMNEG00000030521)	RALGPS1 (ENSMNEG00000028572)	ZBTB34 (ENSMNEG00000025553)	ZBTB43 (ENSMNEG00000014226)	LMX1B (ENSMNEG00000033189)	MVB12B (ENSMNEG00000044373)	PBX3 (ENSMNEG00000037976)	MAPKAP1 (ENSMNEG00000035440) #20	GAPVD1 (ENSMNEG00000030972) #21	HSPA5 (ENSMNEG00000023579) #22	RABEPK (ENSMNEG00000042468) #23	ENSMNEG00000044210	PPP6C (ENSMNEG00000035583)	ENSMNEG00000038470	SCAI (ENSMNEG00000039438)	ENSMNEG00000010083	GOLGA1 (ENSMNEG00000015755)	ARPC5L (ENSMNEG00000021442)	ENSMNEG00000044108	WDR38 (ENSMNEG00000036703)	OLFML2A (ENSMNEG00000013543)	NR6A1 (ENSMNEG00000032193)	NR5A1 (ENSMNEG00000037300)	ADGRD2 (ENSMNEG00000034810)	PSMB7 (ENSMNEG00000034519)
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00390000014472.e.a	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT01100000263539.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.b.b	ENSGT00910000147509	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787.y #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961.j	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000162358	ENSGT01100000263577.a.a.b.a.a.a.b.b.a.a	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	6	ENSMFAG00000047488	RALGPS1 (ENSMFAG00000035476)	ENSMFAG00000050198	ANGPTL2 (ENSMFAG00000038065)	NGRN (ENSMFAG00000045785)	ZBTB34 (ENSMFAG00000014178)	ZBTB43 (ENSMFAG00000030607)	LMX1B (ENSMFAG00000045773)	ENSMFAG00000061078	MVB12B (ENSMFAG00000034269)	ENSMFAG00000054813	PBX3 (ENSMFAG00000027078)	ENSMFAG00000050988	MAPKAP1 (ENSMFAG00000032616) #20	GAPVD1 (ENSMFAG00000003434) #21	HSPA5 (ENSMFAG00000039748) #22	RABEPK (ENSMFAG00000042018) #23	PPP6C (ENSMFAG00000030045)	SCAI (ENSMFAG00000002648)	ENSMFAG00000051574	ENSMFAG00000064534	ENSMFAG00000049005	GOLGA1 (ENSMFAG00000031129)	ARPC5L (ENSMFAG00000033396)	RPL35 (ENSMFAG00000044075)	WDR38 (ENSMFAG00000038461)	ENSMFAG00000062053	OLFML2A (ENSMFAG00000002383)	NR6A1 (ENSMFAG00000045408)	ENSMFAG00000059108	ENSMFAG00000055757
Rhesus	MODERN SPECIES	6	GARNL3 (ENSMMUG00000012163)	RALGPS1 (ENSMMUG00000023495)	ENSMMUG00000060450	ANGPTL2 (ENSMMUG00000012161)	ENSMMUG00000059888	ZBTB34 (ENSMMUG00000050175)	ZBTB43 (ENSMMUG00000052476)	LMX1B (ENSMMUG00000002236)	ENSMMUG00000053490	MVB12B (ENSMMUG00000000871)	PBX3 (ENSMMUG00000013763)	ENSMMUG00000049448	MAPKAP1 (ENSMMUG00000016826) #20	ENSMMUG00000053791	GAPVD1 (ENSMMUG00000003668) #21	HSPA5 (ENSMMUG00000005217) #22	RABEPK (ENSMMUG00000005215) #23	PPP6C (ENSMMUG00000020549)	SCAI (ENSMMUG00000020633)	ENSMMUG00000064277	GOLGA1 (ENSMMUG00000020631)	ARPC5L (ENSMMUG00000043892)	RPL35 (ENSMMUG00000005260)	WDR38 (ENSMMUG00000005259)	ENSMMUG00000061871	OLFML2A (ENSMMUG00000011183)	NR6A1 (ENSMMUG00000011185)	NR5A1 (ENSMMUG00000014111)	ADGRD2 (ENSMMUG00000014110)	PSMB7 (ENSMMUG00000060033)	NEK6 (ENSMMUG00000007354)
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	3	NIBAN2 (ENSCSAG00000013741)	LRSAM1 (ENSCSAG00000013739)	ENSCSAG00000013731	ZNF79 (ENSCSAG00000013717)	SLC2A8 (ENSCSAG00000013708)	GARNL3 (ENSCSAG00000013701)	RALGPS1 (ENSCSAG00000013693)	ANGPTL2 (ENSCSAG00000013686)	ZBTB34 (ENSCSAG00000013684)	ZBTB43 (ENSCSAG00000019711)	LMX1B (ENSCSAG00000013678)	MVB12B (ENSCSAG00000013660)	ENSCSAG00000013655	MAPKAP1 (ENSCSAG00000013650) #20	GAPVD1 (ENSCSAG00000013643) #21	HSPA5 (ENSCSAG00000013633) #22	RABEPK (ENSCSAG00000013629) #23	PPP6C (ENSCSAG00000013623)	SCAI (ENSCSAG00000013617)	GOLGA1 (ENSCSAG00000013605)	ARPC5L (ENSCSAG00000013596)	WDR38 (ENSCSAG00000013588)	OLFML2A (ENSCSAG00000013568)	NR6A1 (ENSCSAG00000013563)	NR5A1 (ENSCSAG00000013558)	ADGRD2 (ENSCSAG00000013549)	PSMB7 (ENSCSAG00000013536)	NEK6 (ENSCSAG00000013531)	LHX2 (ENSCSAG00000013520)	DENND1A (ENSCSAG00000013513)	CRB2 (ENSCSAG00000013494)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	140							ENSGT00910000147354	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00910000147509	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787.y #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00390000016384.f.i.a.b	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	491								ZBTB34 (ENSRBIG00000036908)	ZBTB43 (ENSRBIG00000023571)	LMX1B (ENSRBIG00000023660)	MVB12B (ENSRBIG00000033987)	ENSRBIG00000033076	PBX3 (ENSRBIG00000027497)	MAPKAP1 (ENSRBIG00000044095) #20	GAPVD1 (ENSRBIG00000042745) #21	HSPA5 (ENSRBIG00000044773) #22	RABEPK (ENSRBIG00000023800) #23	PPP6C (ENSRBIG00000044351)	ENSRBIG00000036429	SCAI (ENSRBIG00000026974)	GOLGA1 (ENSRBIG00000026783)	ARPC5L (ENSRBIG00000042947)	RPL35 (ENSRBIG00000036679)	WDR38 (ENSRBIG00000042146)	OLFML2A (ENSRBIG00000029375)	NR6A1 (ENSRBIG00000034563)	NR5A1 (ENSRBIG00000034857)	ADGRD2 (ENSRBIG00000002924)	PSMB7 (ENSRBIG00000024252)	NEK6 (ENSRBIG00000032831)	ENSRBIG00000042581
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1251					ANGPTL2 (ENSRROG00000030995)	ENSRROG00000043057	ENSRROG00000027090	ZBTB34 (ENSRROG00000014404)	ZBTB43 (ENSRROG00000024398)	LMX1B (ENSRROG00000035482)	MVB12B (ENSRROG00000027519)	PBX3 (ENSRROG00000045788)	MAPKAP1 (ENSRROG00000023703) #20	ENSRROG00000030764	GAPVD1 (ENSRROG00000032873) #21	HSPA5 (ENSRROG00000028741) #22	RABEPK (ENSRROG00000014112) #23	ENSRROG00000031506	ENSRROG00000032403	PPP6C (ENSRROG00000031327)	SCAI (ENSRROG00000042786)	GOLGA1 (ENSRROG00000029321)	ARPC5L (ENSRROG00000041093)	ENSRROG00000041830	WDR38 (ENSRROG00000036886)	OLFML2A (ENSRROG00000035091)	ENSRROG00000044077	NR6A1 (ENSRROG00000030167)	NR5A1 (ENSRROG00000044475)	ADGRD2 (ENSRROG00000034601)	PSMB7 (ENSRROG00000043335)
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00810000125524	ENSGT00940000158871	ENSGT00390000008551	ENSGT00390000011115	ENSGT00940000160752	ENSGT00390000016054.b	ENSGT00390000015364.b	ENSGT00570000079623	ENSGT00940000157291	ENSGT00940000156762	ENSGT00940000178211	ENSGT00530000063402.a.h.a	ENSGT00950000183028.a.b	ENSGT00390000005813	ENSGT00940000163458	ENSGT00940000154787.z #22	ENSGT00950000183031.A.a.a	ENSGT00390000017974	ENSGT00910000147413	ENSGT00940000165268	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00940000159442	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00390000002919	ENSGT00730000111729	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00860000135787	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000161351	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00910000147126
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00810000125524	ENSGT00940000158871	ENSGT00390000008551	ENSGT00390000011115	ENSGT00940000160752	ENSGT00940000157135.j	ENSGT00390000016054.b	ENSGT00390000015364.b	ENSGT00570000079623	ENSGT00940000157291	ENSGT00940000156762	ENSGT00530000063402.a.h.a	ENSGT00950000183028.a.b	ENSGT00390000005813	ENSGT00940000163458	ENSGT00940000154787.z #22	ENSGT00950000183031.A.a.a	ENSGT00390000017974	ENSGT00910000147413	ENSGT00940000165268	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00940000159442	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00390000002919	ENSGT00730000111729	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00940000155272	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00860000135787	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000161351
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00810000125524	ENSGT00940000158871	ENSGT00390000008551	ENSGT00390000011115	ENSGT00940000160752	ENSGT00940000157135.j	ENSGT00390000016054.b	ENSGT00390000015364.b	ENSGT00570000079623	ENSGT00940000157291	ENSGT00940000156762	ENSGT00530000063402.a.h.a	ENSGT00950000183028.a.b	ENSGT00390000005813	ENSGT00940000163458	ENSGT00940000154787.z #22	ENSGT00950000183031.A.a.a	ENSGT00390000017974.fb.a	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00940000159442	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00390000002919	ENSGT00730000111729	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00940000155272	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00860000135787	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000161351	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161166
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00810000125524	ENSGT00940000158871	ENSGT00390000008551	ENSGT00390000011115	ENSGT00940000160752	ENSGT00940000157135.j	ENSGT00390000016054.b	ENSGT00390000015364.b	ENSGT00570000079623	ENSGT00940000157291	ENSGT00940000156762	ENSGT00530000063402.a.h.a	ENSGT00950000183028.a.b	ENSGT00390000005813	ENSGT00940000163458	ENSGT00940000154787.z #22	ENSGT00950000183031.A.a.a	ENSGT00390000017974.fb.a	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00940000159442	ENSGT00940000158787.nb.b	ENSGT00940000158787.nb.a	ENSGT00390000002919	ENSGT00730000111729	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00940000155272.ec.b	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000155272.dc	ENSGT00860000135787	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000161351
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00810000125524	ENSGT00940000158871	ENSGT00390000008551	ENSGT00390000011115	ENSGT00940000160752	ENSGT00940000157135.j	ENSGT00390000016054.b	ENSGT00390000015364.b	ENSGT00570000079623	ENSGT00940000157291	ENSGT00940000156762	ENSGT00530000063402.a.h.a	ENSGT00950000183028.a.b	ENSGT00390000005813	ENSGT00940000163458	ENSGT00940000154787.z #22	ENSGT00950000183031.A.a.a	ENSGT00390000017974.fb.a	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00940000159442	ENSGT00940000158787.nb.a	ENSGT00390000002919	ENSGT00730000111729	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00940000155272.dc	ENSGT00860000135787	ENSGT00940000155272.ec.b	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000161351	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161166
Pan	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00810000125524	ENSGT00940000158871	ENSGT00390000008551	ENSGT00390000011115	ENSGT00940000160752	ENSGT00940000157135.j	ENSGT00390000016054.b	ENSGT00390000015364.b	ENSGT00940000165942	ENSGT00940000157291	ENSGT00940000156762	ENSGT00530000063402.a.h.a	ENSGT00950000183028.a.b	ENSGT00390000005813	ENSGT00940000163458	ENSGT00940000154787.z #22	ENSGT00950000183031.A.a.a	ENSGT00390000017974.gb	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00940000159442	ENSGT00940000158787.nb.b	ENSGT00940000158787.nb.a	ENSGT00390000002919	ENSGT00730000111729	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00940000155272.ec.b	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000155272.dc	ENSGT00860000135787	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000161351
Chimpanzee	MODERN SPECIES		GNL2 (ENSPTRG00000000549)	RSPO1 (ENSPTRG00000000550)	C1H1orf109 (ENSPTRG00000000551)	CDCA8 (ENSPTRG00000000552)	EPHA10 (ENSPTRG00000000553)	ENSPTRG00000042294	MANEAL (ENSPTRG00000000556)	YRDC (ENSPTRG00000000557)	ENSPTRG00000000558	MTF1 (ENSPTRG00000022932)	INPP5B (ENSPTRG00000030681)	SF3A3 (ENSPTRG00000000559)	FHL3 (ENSPTRG00000000560)	UTP11 (ENSPTRG00000000561)	POU3F1 (ENSPTRG00000030679)	ENSPTRG00000046426 #22	RRAGC (ENSPTRG00000000564)	MYCBP (ENSPTRG00000052820)	GJA9 (ENSPTRG00000034043)	RHBDL2 (ENSPTRG00000000566)	ENSPTRG00000052337	NDUFS5 (ENSPTRG00000000568)	MACF1 (ENSPTRG00000043118)	ENSPTRG00000000572	ENSPTRG00000049535	PABPC4 (ENSPTRG00000000573)	HEYL (ENSPTRG00000047504)	NT5C1A (ENSPTRG00000000575)	HPCAL4 (ENSPTRG00000000576)	ENSPTRG00000044983	PPIE (ENSPTRG00000000577)
Bonobo	MODERN SPECIES		DNALI1 (ENSPPAG00000032274)	GNL2 (ENSPPAG00000001559)	RSPO1 (ENSPPAG00000042330)	C1orf109 (ENSPPAG00000043440)	CDCA8 (ENSPPAG00000030888)	EPHA10 (ENSPPAG00000042080)	ENSPPAG00000035218	ENSPPAG00000033012	ENSPPAG00000039722	ENSPPAG00000029353	MTF1 (ENSPPAG00000033358)	INPP5B (ENSPPAG00000007165)	SF3A3 (ENSPPAG00000034066)	FHL3 (ENSPPAG00000038081)	UTP11 (ENSPPAG00000030136)	ENSPPAG00000027652 #22	RRAGC (ENSPPAG00000029918)	ENSPPAG00000032287	GJA9 (ENSPPAG00000021709)	RHBDL2 (ENSPPAG00000041735)	AKIRIN1 (ENSPPAG00000033039)	NDUFS5 (ENSPPAG00000030074)	MACF1 (ENSPPAG00000032133)	ENSPPAG00000037863	ENSPPAG00000030685	ENSPPAG00000039451	ENSPPAG00000017922	PABPC4 (ENSPPAG00000043625)	HEYL (ENSPPAG00000029785)	NT5C1A (ENSPPAG00000042148)	HPCAL4 (ENSPPAG00000030421)
Gorilla	MODERN SPECIES		DNALI1 (ENSGGOG00000007698)	GNL2 (ENSGGOG00000007704)	RSPO1 (ENSGGOG00000007712)	C1orf109 (ENSGGOG00000007715)	CDCA8 (ENSGGOG00000007719)	EPHA10 (ENSGGOG00000007724)	ENSGGOG00000022800	ENSGGOG00000007612	YRDC (ENSGGOG00000007619)	ENSGGOG00000028421	MTF1 (ENSGGOG00000007624)	INPP5B (ENSGGOG00000001150)	SF3A3 (ENSGGOG00000013928)	FHL3 (ENSGGOG00000002876)	UTP11 (ENSGGOG00000022705)	ENSGGOG00000027537 #22	RRAGC (ENSGGOG00000013382)	MYCBP (ENSGGOG00000005810)	GJA9 (ENSGGOG00000005807)	RHBDL2 (ENSGGOG00000009504)	AKIRIN1 (ENSGGOG00000006053)	MACF1 (ENSGGOG00000022652)	ENSGGOG00000039286	ENSGGOG00000039231	PABPC4 (ENSGGOG00000004002)	HEYL (ENSGGOG00000008268)	NT5C1A (ENSGGOG00000008274)	ENSGGOG00000039917	PPIE (ENSGGOG00000015783)	BMP8A (ENSGGOG00000015791)	TRIT1 (ENSGGOG00000010070)
Gibbon	MODERN SPECIES	2	DNALI1 (ENSNLEG00000011584)	GNL2 (ENSNLEG00000011599)	RSPO1 (ENSNLEG00000011628)	ENSNLEG00000031719	CDCA8 (ENSNLEG00000011630)	EPHA10 (ENSNLEG00000011640)	ENSNLEG00000031312	MANEAL (ENSNLEG00000011655)	YRDC (ENSNLEG00000011665)	ENSNLEG00000011653	MTF1 (ENSNLEG00000011682)	INPP5B (ENSNLEG00000011699)	SF3A3 (ENSNLEG00000011720)	FHL3 (ENSNLEG00000011730)	UTP11 (ENSNLEG00000033980)	ENSNLEG00000030739 #22	RRAGC (ENSNLEG00000011794)	ENSNLEG00000029170	ENSNLEG00000035297	GJA9 (ENSNLEG00000011831)	RHBDL2 (ENSNLEG00000011836)	ENSNLEG00000011848	AKIRIN1 (ENSNLEG00000035139)	ENSNLEG00000034249	MACF1 (ENSNLEG00000011857)	PABPC4 (ENSNLEG00000011928)	HEYL (ENSNLEG00000011965)	NT5C1A (ENSNLEG00000011971)	ENSNLEG00000028855	ENSNLEG00000028202	PPIE (ENSNLEG00000011979)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00810000125524	ENSGT00940000158871	ENSGT00390000008551	ENSGT00390000011115	ENSGT00940000160752	ENSGT00390000016054.b	ENSGT00390000015364.b	ENSGT00570000079623	ENSGT00940000157291	ENSGT00940000156762	ENSGT00940000178211	ENSGT00530000063402.a.h.a	ENSGT00950000183028.a.b	ENSGT00390000005813	ENSGT00940000163458	ENSGT00940000154787.z #22	ENSGT00950000183031.A.a.a	ENSGT00390000017974	ENSGT00910000147413	ENSGT00940000165268	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00940000159442	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000165766	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00940000155272.`c.b	ENSGT00730000111729	ENSGT00940000155272.ac	ENSGT00860000135787	ENSGT00940000154788
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00810000125524	ENSGT00940000158871	ENSGT00390000008551	ENSGT00390000011115	ENSGT00940000160752	ENSGT00390000016054.b	ENSGT00390000015364.b	ENSGT00570000079623	ENSGT00940000157291	ENSGT00940000156762	ENSGT00940000178211	ENSGT00530000063402.a.h.a	ENSGT00950000183028.a.b	ENSGT00390000005813	ENSGT00940000163458	ENSGT00940000154787.z #22	ENSGT00950000183031.A.a.a	ENSGT00390000017974.db	ENSGT00910000147413	ENSGT00940000165268	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00940000159442	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00390000002919.u	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00940000155272.`c.b	ENSGT00860000135787	ENSGT00940000155272.ac	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000161351
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00810000125524	ENSGT00940000158871	ENSGT00390000008551	ENSGT00390000011115	ENSGT00940000160752	ENSGT00390000016054.b	ENSGT00390000015364.b	ENSGT00570000079623	ENSGT00940000157291	ENSGT00940000156762	ENSGT00940000178211	ENSGT00530000063402.a.h.a	ENSGT00950000183028.a.b	ENSGT00390000005813	ENSGT00940000163458	ENSGT00940000154787.z #22	ENSGT00950000183031.A.a.a	ENSGT00390000017974.db	ENSGT00910000147413	ENSGT00940000165268	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00940000159442	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00390000002919.v.b.b	ENSGT00390000002919.u	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00940000155272.`c.b	ENSGT00860000135787	ENSGT00940000155272.ac	ENSGT00940000154788
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	169															ENSGT00940000153096.b.d.fb.b.a.b	ENSGT00940000154787.z #22
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	217	GNL2 (ENSMNEG00000043438)	RSPO1 (ENSMNEG00000034664)	C1orf109 (ENSMNEG00000039182)	CDCA8 (ENSMNEG00000042921)	EPHA10 (ENSMNEG00000032931)	MANEAL (ENSMNEG00000036440)	YRDC (ENSMNEG00000029348)	C1orf122 (ENSMNEG00000011544)	MTF1 (ENSMNEG00000038330)	INPP5B (ENSMNEG00000033845)	SF3A3 (ENSMNEG00000044291)	FHL3 (ENSMNEG00000010982)	UTP11 (ENSMNEG00000041655)	POU3F1 (ENSMNEG00000009418)	ENSMNEG00000041499	ENSMNEG00000043355 #22	RRAGC (ENSMNEG00000036698)	ENSMNEG00000006212	GJA9 (ENSMNEG00000012033)	RHBDL2 (ENSMNEG00000033107)	AKIRIN1 (ENSMNEG00000038763)	NDUFS5 (ENSMNEG00000027516)	MACF1 (ENSMNEG00000033514)	ENSMNEG00000035118	ENSMNEG00000038372	ENSMNEG00000043485	PABPC4 (ENSMNEG00000043054)	ENSMNEG00000043139	HEYL (ENSMNEG00000009070)	NT5C1A (ENSMNEG00000031973)	ENSMNEG00000002154
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000003012	ENSGT00810000125524	ENSGT00940000158871	ENSGT00390000008551	ENSGT00390000011115	ENSGT00940000160752	ENSGT00390000016054.b	ENSGT00390000015364.b	ENSGT00570000079623	ENSGT00940000157291	ENSGT00940000156762	ENSGT00530000063402.a.h.a	ENSGT00950000183028.a.b	ENSGT00390000005813	ENSGT00940000163458	ENSGT00940000154787.z #22	ENSGT00950000183031.A.a.a	ENSGT00910000147413	ENSGT00940000165268	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00940000159442	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00390000002919.v.b.b	ENSGT00390000002919.u	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00940000155272.`c.b	ENSGT00730000111729	ENSGT00940000155272.ac	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000161351	ENSGT00390000017767.b.b
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00810000125524	ENSGT00940000158871	ENSGT00390000008551	ENSGT00390000011115	ENSGT00910000147664	ENSGT00940000160752	ENSGT00390000016054.b	ENSGT00390000015364.b	ENSGT00570000079623	ENSGT00940000157291	ENSGT00940000156762	ENSGT00530000063402.a.h.a	ENSGT00950000183028.a.b	ENSGT00390000005813	ENSGT00940000163458	ENSGT00940000154787.z #22	ENSGT00950000183031.A.a.a	ENSGT00910000147413	ENSGT00940000165268	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00940000159442	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00390000002919.v.b.b	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00940000155272.ac	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000161351	ENSGT00910000147126	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161166
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	227	GNL2 (ENSCATG00000026503)	RSPO1 (ENSCATG00000037142)	C1orf109 (ENSCATG00000036421)	CDCA8 (ENSCATG00000038767)	ENSCATG00000038225	EPHA10 (ENSCATG00000032555)	MANEAL (ENSCATG00000035882)	YRDC (ENSCATG00000036928)	C1orf122 (ENSCATG00000035798)	MTF1 (ENSCATG00000037876)	INPP5B (ENSCATG00000037843)	SF3A3 (ENSCATG00000043496)	FHL3 (ENSCATG00000035550)	UTP11 (ENSCATG00000042680)	POU3F1 (ENSCATG00000006621)	ENSCATG00000043118 #22	RRAGC (ENSCATG00000036245)	ENSCATG00000002978	ENSCATG00000035175	GJA9 (ENSCATG00000002745)	RHBDL2 (ENSCATG00000036212)	AKIRIN1 (ENSCATG00000036878)	NDUFS5 (ENSCATG00000034399)	ENSCATG00000043856	MACF1 (ENSCATG00000039558)	ENSCATG00000033745	PABPC4 (ENSCATG00000042164)	ENSCATG00000002769	ENSCATG00000005536	HEYL (ENSCATG00000037907)	ENSCATG00000036036
Drill	MODERN SPECIES	672																ENSMLEG00000035324 #22	RRAGC (ENSMLEG00000041097)	ENSMLEG00000023695	ENSMLEG00000044124	GJA9 (ENSMLEG00000004074)	RHBDL2 (ENSMLEG00000010184)	AKIRIN1 (ENSMLEG00000044218)	ENSMLEG00000043083	ENSMLEG00000040128	MACF1 (ENSMLEG00000044445)	ENSMLEG00000006499	PABPC4 (ENSMLEG00000040716)	HEYL (ENSMLEG00000032705)	ENSMLEG00000032704	NT5C1A (ENSMLEG00000038970)	ENSMLEG00000040607
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	179	ENSGT00810000125524	ENSGT00940000158871	ENSGT00390000008551	ENSGT00390000011115	ENSGT00940000160752	ENSGT00390000016054.b	ENSGT00390000015364.b	ENSGT00570000079623	ENSGT01050000247123	ENSGT00940000157291	ENSGT00940000156762	ENSGT00530000063402.a.h.a	ENSGT00950000183028.a.b	ENSGT00390000005813	ENSGT00940000153096.b.d.fb.b.a.b	ENSGT00940000154787.z #22	ENSGT00950000183031.A.a.a	ENSGT00910000147413	ENSGT00940000165268	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00940000159442	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000165766	ENSGT00940000155824.C
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1838	TRIM63 (ENSRBIG00000033288)	SLC30A2 (ENSRBIG00000031643)	EXTL1 (ENSRBIG00000035630)	ENSRBIG00000044988	PAFAH2 (ENSRBIG00000043154)	STMN1 (ENSRBIG00000033291)	PAQR7 (ENSRBIG00000013869)	AUNIP (ENSRBIG00000042883)	MTFR1L (ENSRBIG00000033890)	SELENON (ENSRBIG00000031791)	MAN1C1 (ENSRBIG00000040110)	LDLRAP1 (ENSRBIG00000031475)	MACO1 (ENSRBIG00000040448)	ENSRBIG00000037336	TMEM50A (ENSRBIG00000031357)	ENSRBIG00000002054 #22	RRAGC (ENSRBIG00000019580)	ENSRBIG00000034270	GJA9 (ENSRBIG00000033240)	RHBDL2 (ENSRBIG00000042643)	AKIRIN1 (ENSRBIG00000044113)	ENSRBIG00000026158	ENSRBIG00000037418
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2761	DNALI1 (ENSRROG00000030462)	GNL2 (ENSRROG00000014347)	RSPO1 (ENSRROG00000041896)	C1orf109 (ENSRROG00000043592)	CDCA8 (ENSRROG00000029031)	EPHA10 (ENSRROG00000003477)	MANEAL (ENSRROG00000033600)	YRDC (ENSRROG00000039370)	ENSRROG00000038617	MTF1 (ENSRROG00000031591)	INPP5B (ENSRROG00000035588)	SF3A3 (ENSRROG00000033888)	FHL3 (ENSRROG00000045533)	UTP11 (ENSRROG00000011983)	ENSRROG00000037856	ENSRROG00000043761 #22	RRAGC (ENSRROG00000004713)	ENSRROG00000042967	ENSRROG00000041803	GJA9 (ENSRROG00000027410)	RHBDL2 (ENSRROG00000035713)	AKIRIN1 (ENSRROG00000015889)	NDUFS5 (ENSRROG00000019572)	ENSRROG00000035666	ENSRROG00000045142
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.h	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00910000147354	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763.n #23	ENSGT00940000158763.m #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.h	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00910000147354	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763.n #23	ENSGT00940000158763.m #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.i.a	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	68	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.h	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00950000183070.a.b.g.a	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00910000147354	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763.n #23	ENSGT00940000158763.m #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000005811.w.b	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990
Capuchin	MODERN SPECIES	216	SLC2A8 (ENSCCAG00000025993)	GARNL3 (ENSCCAG00000019419)	ENSCCAG00000033037	RALGPS1 (ENSCCAG00000033522)	ENSCCAG00000026743	ANGPTL2 (ENSCCAG00000033864)	ZBTB34 (ENSCCAG00000023663)	ENSCCAG00000023231	ZBTB43 (ENSCCAG00000018809)	LMX1B (ENSCCAG00000035283)	MVB12B (ENSCCAG00000036494)	PBX3 (ENSCCAG00000026276)	ENSCCAG00000020017	MAPKAP1 (ENSCCAG00000000053) #20	GAPVD1 (ENSCCAG00000020392) #21	HSPA5 (ENSCCAG00000029035) #22	RABEPK (ENSCCAG00000033815) #23	PPP6C (ENSCCAG00000028568)	ENSCCAG00000034667
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	172	SLC2A8 (ENSSBOG00000025945)	GARNL3 (ENSSBOG00000031507)	ENSSBOG00000020535	RALGPS1 (ENSSBOG00000018935)	ANGPTL2 (ENSSBOG00000036085)	ENSSBOG00000022078	ZBTB34 (ENSSBOG00000018797)	ZBTB43 (ENSSBOG00000019137)	LMX1B (ENSSBOG00000029735)	MVB12B (ENSSBOG00000024924)	PBX3 (ENSSBOG00000031379)	MAPKAP1 (ENSSBOG00000024685) #20	ENSSBOG00000020739	ENSSBOG00000021840	GAPVD1 (ENSSBOG00000027606) #21	HSPA5 (ENSSBOG00000022955) #22	RABEPK (ENSSBOG00000032682) #23	PPP6C (ENSSBOG00000018030)	SCAI (ENSSBOG00000029441)	ENSSBOG00000033641	GOLGA1 (ENSSBOG00000035730)	ARPC5L (ENSSBOG00000026457)	RPL35 (ENSSBOG00000030899)	WDR38 (ENSSBOG00000030562)	OLFML2A (ENSSBOG00000032661)	NR6A1 (ENSSBOG00000031223)	NR5A1 (ENSSBOG00000026963)	ADGRD2 (ENSSBOG00000025524)	PSMB7 (ENSSBOG00000028132)	NEK6 (ENSSBOG00000028368)	LHX2 (ENSSBOG00000012275)
Marmoset	MODERN SPECIES		LRSAM1 (ENSCJAG00000018088)	RPL12 (ENSCJAG00000018082)	ZNF79 (ENSCJAG00000018073)	SLC2A8 (ENSCJAG00000018048)	GARNL3 (ENSCJAG00000017982)	ANGPTL2 (ENSCJAG00000017978)	RALGPS1 (ENSCJAG00000017946)	ZBTB34 (ENSCJAG00000021856)	ZBTB43 (ENSCJAG00000046123)	LMX1B (ENSCJAG00000072150)	MVB12B (ENSCJAG00000042322)	ENSCJAG00000070779	PBX3 (ENSCJAG00000007020)	MAPKAP1 (ENSCJAG00000006963) #20	GAPVD1 (ENSCJAG00000006913) #21	HSPA5 (ENSCJAG00000006880) #22	ENSCJAG00000052894	RABEPK (ENSCJAG00000006849) #23	PPP6C (ENSCJAG00000006827)	ENSCJAG00000082314	ENSCJAG00000077976	SCAI (ENSCJAG00000006789)	GOLGA1 (ENSCJAG00000006745)	ENSCJAG00000006730	ENSCJAG00000006724	WDR38 (ENSCJAG00000006695)	ENSCJAG00000077082	OLFML2A (ENSCJAG00000006668)	ENSCJAG00000078726	NR6A1 (ENSCJAG00000006631)	NR5A1 (ENSCJAG00000006624)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	768	ENSANAG00000011753	ENSANAG00000030521	GARNL3 (ENSANAG00000029515)	ANGPTL2 (ENSANAG00000030911)	RALGPS1 (ENSANAG00000023735)	ENSANAG00000033431	ZBTB34 (ENSANAG00000037523)	ZBTB43 (ENSANAG00000038335)	LMX1B (ENSANAG00000037425)	MVB12B (ENSANAG00000021467)	PBX3 (ENSANAG00000026691)	MAPKAP1 (ENSANAG00000038007) #20	ENSANAG00000006107	GAPVD1 (ENSANAG00000026547) #21	ENSANAG00000002903	HSPA5 (ENSANAG00000038513) #22	ENSANAG00000029634 #23	ENSANAG00000002363	PPP6C (ENSANAG00000033545)	ENSANAG00000035375	ENSANAG00000005773	SCAI (ENSANAG00000024288)	GOLGA1 (ENSANAG00000020513)	ENSANAG00000021654	RPL35 (ENSANAG00000032849)	WDR38 (ENSANAG00000033407)	OLFML2A (ENSANAG00000028567)	NR6A1 (ENSANAG00000036986)	NR5A1 (ENSANAG00000027136)	ADGRD2 (ENSANAG00000036641)	PSMB7 (ENSANAG00000030640)
Tarsier	MODERN SPECIES	4820															GAPVD1 (ENSTSYG00000009254) #21	HSPA5 (ENSTSYG00000026880) #22	RABEPK (ENSTSYG00000002663) #23
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642.g.a #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT01030000234866	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642.g.a #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Mouse lemur	MODERN SPECIES	1	LRSAM1 (ENSMICG00000002341)	ENSMICG00000002326	ZNF79 (ENSMICG00000002323)	SLC2A8 (ENSMICG00000002319)	GARNL3 (ENSMICG00000002311)	ANGPTL2 (ENSMICG00000002303)	RALGPS1 (ENSMICG00000002291)	ZBTB34 (ENSMICG00000036866)	ZBTB43 (ENSMICG00000047892)	LMX1B (ENSMICG00000010287)	ENSMICG00000037534	MVB12B (ENSMICG00000010281)	PBX3 (ENSMICG00000036972)	MAPKAP1 (ENSMICG00000002956) #20	GAPVD1 (ENSMICG00000002953) #21	HSPA5 (ENSMICG00000002950) #22	RABEPK (ENSMICG00000029186) #23	PPP6C (ENSMICG00000030309)	SCAI (ENSMICG00000002936)	ENSMICG00000002934	GOLGA1 (ENSMICG00000002928)	ARPC5L (ENSMICG00000002925)	RPL35 (ENSMICG00000002922)	WDR38 (ENSMICG00000038127)	OLFML2A (ENSMICG00000002915)	NR6A1 (ENSMICG00000002911)	NR5A1 (ENSMICG00000002907)	ADGRD2 (ENSMICG00000046284)	PSMB7 (ENSMICG00000043101)	NEK6 (ENSMICG00000009990)	LHX2 (ENSMICG00000009968)
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT01030000234866	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642.g.a #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.i.b	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Coquerels sifaka	DUPLICATION
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	168	NIBAN2 (ENSPCOG00000001731)	LRSAM1 (ENSPCOG00000018251)	ENSPCOG00000026357	ZNF79 (ENSPCOG00000006104)	SLC2A8 (ENSPCOG00000016228)	GARNL3 (ENSPCOG00000020428)	RALGPS1 (ENSPCOG00000027079)	ANGPTL2 (ENSPCOG00000028374)	ZBTB34 (ENSPCOG00000010113)	ZBTB43 (ENSPCOG00000013176)	LMX1B (ENSPCOG00000016360)	MVB12B (ENSPCOG00000018046)	PBX3 (ENSPCOG00000023976)	MAPKAP1 (ENSPCOG00000022924) #20	GAPVD1 (ENSPCOG00000009430) #21	ENSPCOG00000025856 #22	RABEPK (ENSPCOG00000023004) #23	PPP6C (ENSPCOG00000025430)	SCAI (ENSPCOG00000002768)	GOLGA1 (ENSPCOG00000013519)	ARPC5L (ENSPCOG00000013587)	RPL35 (ENSPCOG00000026733)	WDR38 (ENSPCOG00000016069)	OLFML2A (ENSPCOG00000020707)	NR6A1 (ENSPCOG00000027156)	NR5A1 (ENSPCOG00000025859)	ADGRD2 (ENSPCOG00000021058)	ENSPCOG00000027275	NEK6 (ENSPCOG00000021556)
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	346					PLOD2 (ENSPCOG00000014444)	PLSCR4 (ENSPCOG00000025204)	ENSPCOG00000020032	ENSPCOG00000019592	PLSCR5 (ENSPCOG00000028578)	SCAND3 (ENSPCOG00000028692)	TRIM27 (ENSPCOG00000018155)	APELA (ENSPCOG00000017930)	SMIM31 (ENSPCOG00000016981)	ENSPCOG00000020782	ENSPCOG00000021363	ENSPCOG00000015982 #22	MARCHF1 (ENSPCOG00000014699)	TMA16 (ENSPCOG00000018500)	TKTL2 (ENSPCOG00000012803)	NPY5R (ENSPCOG00000026942)	NPY1R (ENSPCOG00000013845)
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	222				SLC2A8 (ENSPSMG00000024346)	GARNL3 (ENSPSMG00000024288)	ANGPTL2 (ENSPSMG00000024220)	RALGPS1 (ENSPSMG00000024207)	ZBTB34 (ENSPSMG00000024167)	ZBTB43 (ENSPSMG00000024161)	LMX1B (ENSPSMG00000024151)	ENSPSMG00000024126	MVB12B (ENSPSMG00000024123)	PBX3 (ENSPSMG00000024085)	MAPKAP1 (ENSPSMG00000023992) #20	GAPVD1 (ENSPSMG00000023857) #21	HSPA5 (ENSPSMG00000023796) #22	RABEPK (ENSPSMG00000023786) #23	PPP6C (ENSPSMG00000023766)
Bushbaby	MODERN SPECIES	129	LRSAM1 (ENSOGAG00000009522)	ENSOGAG00000000597	ZNF79 (ENSOGAG00000000595)	SLC2A8 (ENSOGAG00000000594)	GARNL3 (ENSOGAG00000000592)	ANGPTL2 (ENSOGAG00000003988)	RALGPS1 (ENSOGAG00000003986)	ZBTB34 (ENSOGAG00000007730)	ZBTB43 (ENSOGAG00000002029)	LMX1B (ENSOGAG00000001158)	MVB12B (ENSOGAG00000008766)	PBX3 (ENSOGAG00000031460)	MAPKAP1 (ENSOGAG00000008854) #20	ENSOGAG00000029276 #21	ENSOGAG00000008849 #21	HSPA5 (ENSOGAG00000006786) #22	RABEPK (ENSOGAG00000027730) #23	PPP6C (ENSOGAG00000025294)	SCAI (ENSOGAG00000008529)	GOLGA1 (ENSOGAG00000008519)	ARPC5L (ENSOGAG00000030099)	ENSOGAG00000008513	WDR38 (ENSOGAG00000008507)	OLFML2A (ENSOGAG00000008504)	NR6A1 (ENSOGAG00000030677)	NR5A1 (ENSOGAG00000017023)	ADGRD2 (ENSOGAG00000003517)	PSMB7 (ENSOGAG00000003513)	NEK6 (ENSOGAG00000003510)	LHX2 (ENSOGAG00000003505)	ENSOGAG00000024358
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000006922.m.b.b.a	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000165628	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.z	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000165628	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.z	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000165628	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Suina	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.z	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	887	ENSCWAG00000013714	ZNF79 (ENSCWAG00000013852)	SLC2A8 (ENSCWAG00000013917)	GARNL3 (ENSCWAG00000014137)	RALGPS1 (ENSCWAG00000014641)	ANGPTL2 (ENSCWAG00000014826)	ZBTB34 (ENSCWAG00000014869)	ZBTB43 (ENSCWAG00000014897)	LMX1B (ENSCWAG00000014916)	MVB12B (ENSCWAG00000015058)	ENSCWAG00000015098	PBX3 (ENSCWAG00000015147)	MAPKAP1 (ENSCWAG00000015226) #20	ENSCWAG00000015419	GAPVD1 (ENSCWAG00000015492) #21	HSPA5 (ENSCWAG00000015743) #22	RABEPK (ENSCWAG00000015788) #23	PPP6C (ENSCWAG00000015841)	SCAI (ENSCWAG00000015880)	GOLGA1 (ENSCWAG00000015995)	ARPC5L (ENSCWAG00000016051)	ENSCWAG00000016078	WDR38 (ENSCWAG00000016114)	OLFML2A (ENSCWAG00000016191)	NR6A1 (ENSCWAG00000016277)	NR5A1 (ENSCWAG00000016562)	ADGRD2 (ENSCWAG00000016668)	PSMB7 (ENSCWAG00000016793)	NEK6 (ENSCWAG00000016836)	LHX2 (ENSCWAG00000016921)	DENND1A (ENSCWAG00000016950)
Pig	MODERN SPECIES		LRSAM1 (ENSSSCG00000005613)	ENSSSCG00000033019	ZNF79 (ENSSSCG00000005611)	SLC2A8 (ENSSSCG00000005610)	GARNL3 (ENSSSCG00000005609)	ANGPTL2 (ENSSSCG00000005608)	RALGPS1 (ENSSSCG00000005607)	ZBTB34 (ENSSSCG00000031426)	ZBTB43 (ENSSSCG00000032752)	LMX1B (ENSSSCG00000035968)	MVB12B (ENSSSCG00000036926)	PBX3 (ENSSSCG00000005604)	ENSSSCG00000031440	MAPKAP1 (ENSSSCG00000029169) #20	GAPVD1 (ENSSSCG00000005602) #21	HSPA5 (ENSSSCG00000005601) #22	RABEPK (ENSSSCG00000005599) #23	PPP6C (ENSSSCG00000005600)	SCAI (ENSSSCG00000005598)	GOLGA1 (ENSSSCG00000005597)	ARPC5L (ENSSSCG00000005596)	RPL35 (ENSSSCG00000034227)	WDR38 (ENSSSCG00000005594)	OLFML2A (ENSSSCG00000005593)	ENSSSCG00000058119	NR6A1 (ENSSSCG00000005589)	NR5A1 (ENSSSCG00000005588)	ADGRD2 (ENSSSCG00000005591)	PSMB7 (ENSSSCG00000005590)	NEK6 (ENSSSCG00000005587)	LHX2 (ENSSSCG00000005586)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.z	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000165628	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.z	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Arabian camel	MODERN SPECIES	30	NIBAN2 (ENSCDRG00005014164)	LRSAM1 (ENSCDRG00005014315)	ENSCDRG00005014612	ZNF79 (ENSCDRG00005014726)	ENSCDRG00005014792	GARNL3 (ENSCDRG00005015033)	RALGPS1 (ENSCDRG00005015413)	ANGPTL2 (ENSCDRG00005015792)	ZBTB34 (ENSCDRG00005015829)	ZBTB43 (ENSCDRG00005015839)	LMX1B (ENSCDRG00005015852)	MVB12B (ENSCDRG00005015897)	PBX3 (ENSCDRG00005015941)	MAPKAP1 (ENSCDRG00005016030) #20	GAPVD1 (ENSCDRG00005016319) #21	HSPA5 (ENSCDRG00005016512) #22	RABEPK (ENSCDRG00005016565) #23	PPP6C (ENSCDRG00005016612)	SCAI (ENSCDRG00005016671)	GOLGA1 (ENSCDRG00005016743)	ARPC5L (ENSCDRG00005016882)	ENSCDRG00005016937	WDR38 (ENSCDRG00005016977)	OLFML2A (ENSCDRG00005017022)	NR6A1 (ENSCDRG00005017082)	NR5A1 (ENSCDRG00005006378)	ADGRD2 (ENSCDRG00005006465)	PSMB7 (ENSCDRG00005006562)	NEK6 (ENSCDRG00005006640)	ENSCDRG00005006859	DENND1A (ENSCDRG00005006927)
Alpaca	MODERN SPECIES	1048													PBX3 (ENSVPAG00000009274)	MAPKAP1 (ENSVPAG00000009272) #20	GAPVD1 (ENSVPAG00000009271) #21	HSPA5 (ENSVPAG00000009270) #22	RABEPK (ENSVPAG00000009269) #23	PPP6C (ENSVPAG00000009268)	SCAI (ENSVPAG00000009267)	GOLGA1 (ENSVPAG00000009265)	ENSVPAG00000009264	RPL35 (ENSVPAG00000009263)	ENSVPAG00000009262	NR6A1 (ENSVPAG00000009261)
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.z	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000165628	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.a	ENSGT00390000006922.m.b.b.b.b	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.a	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.a	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.a	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.a	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Beluga whale	MODERN SPECIES	19	NIBAN2 (ENSDLEG00000014438)	LRSAM1 (ENSDLEG00000014490)	ENSDLEG00000014595	ZNF79 (ENSDLEG00000014610)	SLC2A8 (ENSDLEG00000014631)	GARNL3 (ENSDLEG00000014690)	RALGPS1 (ENSDLEG00000015117)	ANGPTL2 (ENSDLEG00000015143)	ZBTB34 (ENSDLEG00000015149)	ZBTB43 (ENSDLEG00000015157)	LMX1B (ENSDLEG00000015166)	MVB12B (ENSDLEG00000015237)	ENSDLEG00000015268	MAPKAP1 (ENSDLEG00000015293) #20	GAPVD1 (ENSDLEG00000015347) #21	HSPA5 (ENSDLEG00000015433) #22	RABEPK (ENSDLEG00000015453) #23	PPP6C (ENSDLEG00000015466)	SCAI (ENSDLEG00000015503)	GOLGA1 (ENSDLEG00000015625)	ARPC5L (ENSDLEG00000015658)	RPL35 (ENSDLEG00000015667)	OLFML2A (ENSDLEG00000015685)	NR6A1 (ENSDLEG00000015711)	ENSDLEG00000015771	NR5A1 (ENSDLEG00000015804)	PSMB7 (ENSDLEG00000000050)	NEK6 (ENSDLEG00000000066)	LHX2 (ENSDLEG00000000097)	DENND1A (ENSDLEG00000000198)	ENSDLEG00000000331
Narwhal	MODERN SPECIES	312	NIBAN2 (ENSMMNG00015020746)	LRSAM1 (ENSMMNG00015020627)	ENSMMNG00015020561	ZNF79 (ENSMMNG00015020535)	SLC2A8 (ENSMMNG00015020510)	GARNL3 (ENSMMNG00015020351)	ANGPTL2 (ENSMMNG00015020310)	RALGPS1 (ENSMMNG00015020238)	ZBTB34 (ENSMMNG00015020186)	ZBTB43 (ENSMMNG00015020180)	LMX1B (ENSMMNG00015020144)	MVB12B (ENSMMNG00015020108)	PBX3 (ENSMMNG00015020008)	MAPKAP1 (ENSMMNG00015019888) #20	GAPVD1 (ENSMMNG00015019708) #21	HSPA5 (ENSMMNG00015019608) #22	RABEPK (ENSMMNG00015019570) #23	PPP6C (ENSMMNG00015019538)	SCAI (ENSMMNG00015019495)	GOLGA1 (ENSMMNG00015019440)	ARPC5L (ENSMMNG00015019410)	RPL35 (ENSMMNG00015019387)	OLFML2A (ENSMMNG00015019345)	NR6A1 (ENSMMNG00015019302)	NR5A1 (ENSMMNG00015019244)	ADGRD2 (ENSMMNG00015019194)	PSMB7 (ENSMMNG00015019159)	NEK6 (ENSMMNG00015019045)	ENSMMNG00015018990	ENSMMNG00015018977	ENSMMNG00015018954
Vaquita	MODERN SPECIES	17	NIBAN2 (ENSPSNG00000012186)	LRSAM1 (ENSPSNG00000012243)	ENSPSNG00000012353	ZNF79 (ENSPSNG00000012436)	SLC2A8 (ENSPSNG00000012508)	GARNL3 (ENSPSNG00000012629)	RALGPS1 (ENSPSNG00000013305)	ANGPTL2 (ENSPSNG00000013386)	ZBTB34 (ENSPSNG00000013448)	ZBTB43 (ENSPSNG00000013499)	LMX1B (ENSPSNG00000013539)	MVB12B (ENSPSNG00000013790)	PBX3 (ENSPSNG00000013926)	MAPKAP1 (ENSPSNG00000014088) #20	GAPVD1 (ENSPSNG00000014354) #21	HSPA5 (ENSPSNG00000014547) #22	RABEPK (ENSPSNG00000014628) #23	PPP6C (ENSPSNG00000014742)	SCAI (ENSPSNG00000014857)	GOLGA1 (ENSPSNG00000014918)	ARPC5L (ENSPSNG00000014993)	RPL35 (ENSPSNG00000015051)	OLFML2A (ENSPSNG00000015295)	NR6A1 (ENSPSNG00000015414)	ENSPSNG00000015665	NR5A1 (ENSPSNG00000015697)	PSMB7 (ENSPSNG00000015876)	NEK6 (ENSPSNG00000015982)	LHX2 (ENSPSNG00000016296)	DENND1A (ENSPSNG00000016381)	ENSPSNG00000016443
Dolphin	MODERN SPECIES	2198													PBX3 (ENSTTRG00000017402)	MAPKAP1 (ENSTTRG00000017401) #20	GAPVD1 (ENSTTRG00000017400) #21	HSPA5 (ENSTTRG00000017399) #22	RABEPK (ENSTTRG00000017398) #23	PPP6C (ENSTTRG00000017397)	SCAI (ENSTTRG00000017396)	GOLGA1 (ENSTTRG00000017395)	ARPC5L (ENSTTRG00000017394)	WDR38 (ENSTTRG00000017393)	OLFML2A (ENSTTRG00000017392)	NR6A1 (ENSTTRG00000017391)	NR5A1 (ENSTTRG00000017390)	ADGRD2 (ENSTTRG00000017389)
Sperm whale	MODERN SPECIES	20	PTRH1 (ENSPCTG00005009665)	ENSPCTG00005009715	FAM129B (ENSPCTG00005009737)	LRSAM1 (ENSPCTG00005009828)	RPL12 (ENSPCTG00005010082)	ZNF79 (ENSPCTG00005010241)	GARNL3 (ENSPCTG00005010308)	ENSPCTG00005010710	ANGPTL2 (ENSPCTG00005010742)	ZBTB34 (ENSPCTG00005010789)	ZBTB43 (ENSPCTG00005010816)	ENSPCTG00005010838	PBX3 (ENSPCTG00005010920)	MAPKAP1 (ENSPCTG00005011461) #20	GAPVD1 (ENSPCTG00005011724) #21	HSPA5 (ENSPCTG00005011897) #22	RABEPK (ENSPCTG00005011943) #23	PPP6C (ENSPCTG00005012010)	SCAI (ENSPCTG00005012153)	GOLGA1 (ENSPCTG00005012337)	ARPC5L (ENSPCTG00005012408)	RPL35 (ENSPCTG00005012446)	OLFML2A (ENSPCTG00005012507)	NR6A1 (ENSPCTG00005012676)	NR5A1 (ENSPCTG00005013087)	ENSPCTG00005013273	PSMB7 (ENSPCTG00005013513)	LHX2 (ENSPCTG00005013579)	DENND1A (ENSPCTG00005013710)	ENSPCTG00005014157	ENSPCTG00005014200
Blue whale	MODERN SPECIES	17	NIBAN2 (ENSBMSG00010003981)	LRSAM1 (ENSBMSG00010003941)	ENSBMSG00010003901	ZNF79 (ENSBMSG00010003870)	SLC2A8 (ENSBMSG00010003821)	GARNL3 (ENSBMSG00010003623)	ANGPTL2 (ENSBMSG00010003608)	RALGPS1 (ENSBMSG00010003350)	ZBTB34 (ENSBMSG00010003322)	ZBTB43 (ENSBMSG00010003316)	LMX1B (ENSBMSG00010003297)	MVB12B (ENSBMSG00010003247)	PBX3 (ENSBMSG00010003222)	MAPKAP1 (ENSBMSG00010003149) #20	GAPVD1 (ENSBMSG00010002952) #21	HSPA5 (ENSBMSG00010002905) #22	RABEPK (ENSBMSG00010002878) #23	PPP6C (ENSBMSG00010002860)	SCAI (ENSBMSG00010002823)	GOLGA1 (ENSBMSG00010002753)	ARPC5L (ENSBMSG00010002727)	RPL35 (ENSBMSG00010002712)	WDR38 (ENSBMSG00010002692)	OLFML2A (ENSBMSG00010002654)	NR6A1 (ENSBMSG00010002572)	NR5A1 (ENSBMSG00010002525)	PSMB7 (ENSBMSG00010002486)	NEK6 (ENSBMSG00010002464)	ENSBMSG00010002438	ENSBMSG00010002423	ENSBMSG00010002405
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.z	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000165628	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Yarkand deer	MODERN SPECIES	2	LRSAM1 (ENSCHYG00000016515)	ENSCHYG00000016315	ZNF79 (ENSCHYG00000016255)	SLC2A8 (ENSCHYG00000016051)	GARNL3 (ENSCHYG00000015453)	ANGPTL2 (ENSCHYG00000015207)	RALGPS1 (ENSCHYG00000014648)	ZBTB34 (ENSCHYG00000014591)	ZBTB43 (ENSCHYG00000014567)	LMX1B (ENSCHYG00000014482)	MVB12B (ENSCHYG00000014274)	ENSCHYG00000014212	PBX3 (ENSCHYG00000014035)	MAPKAP1 (ENSCHYG00000013578) #20	GAPVD1 (ENSCHYG00000013014) #21	HSPA5 (ENSCHYG00000012948) #22	RABEPK (ENSCHYG00000012887) #23	ENSCHYG00000012832	PPP6C (ENSCHYG00000012715)	SCAI (ENSCHYG00000012382)	GOLGA1 (ENSCHYG00000011987)	ARPC5L (ENSCHYG00000011918)	RPL35 (ENSCHYG00000011873)	WDR38 (ENSCHYG00000011690)	OLFML2A (ENSCHYG00000011623)	NR6A1 (ENSCHYG00000011423)	NR5A1 (ENSCHYG00000011305)	ADGRD2 (ENSCHYG00000011162)	PSMB7 (ENSCHYG00000011100)	NEK6 (ENSCHYG00000010901)	LHX2 (ENSCHYG00000010827)
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.z	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000165628	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1178	NIBAN2 (ENSMMSG00000020068)	LRSAM1 (ENSMMSG00000019944)	ENSMMSG00000019853	ZNF79 (ENSMMSG00000019820)	SLC2A8 (ENSMMSG00000019762)	GARNL3 (ENSMMSG00000019457)	ANGPTL2 (ENSMMSG00000019397)	RALGPS1 (ENSMMSG00000019341)	ZBTB34 (ENSMMSG00000019307)	ZBTB43 (ENSMMSG00000019296)	LMX1B (ENSMMSG00000019145)	MVB12B (ENSMMSG00000019104)	PBX3 (ENSMMSG00000019008)	MAPKAP1 (ENSMMSG00000018766) #20	GAPVD1 (ENSMMSG00000018535) #21	HSPA5 (ENSMMSG00000018479) #22	RABEPK (ENSMMSG00000018434) #23	PPP6C (ENSMMSG00000018370)	SCAI (ENSMMSG00000018254)	GOLGA1 (ENSMMSG00000018093)	ARPC5L (ENSMMSG00000018050)	ENSMMSG00000018016	WDR38 (ENSMMSG00000017949)	OLFML2A (ENSMMSG00000017889)	NR6A1 (ENSMMSG00000017835)	NR5A1 (ENSMMSG00000017732)	ADGRD2 (ENSMMSG00000017611)	PSMB7 (ENSMMSG00000017573)	NEK6 (ENSMMSG00000017451)	LHX2 (ENSMMSG00000017407)	DENND1A (ENSMMSG00000017330)
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000006922.m.b.b.b.b	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000165628	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.b.b	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000165628	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.a.b
Bos	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.b.b	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.a.b
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.b.b	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.a.b
Cow	MODERN SPECIES	2	NIBAN2 (ENSBTAG00000012847)	LRSAM1 (ENSBTAG00000012844)	RPL12 (ENSBTAG00000006963)	ZNF79 (ENSBTAG00000023885)	SLC2A8 (ENSBTAG00000006957)	GARNL3 (ENSBTAG00000006948)	ANGPTL2 (ENSBTAG00000011810)	RALGPS1 (ENSBTAG00000023843)	ZBTB34 (ENSBTAG00000039343)	ZBTB43 (ENSBTAG00000003438)	LMX1B (ENSBTAG00000049695)	MVB12B (ENSBTAG00000050426)	PBX3 (ENSBTAG00000013314)	MAPKAP1 (ENSBTAG00000010271) #20	GAPVD1 (ENSBTAG00000011544) #21	HSPA5 (ENSBTAG00000007662) #22	RABEPK (ENSBTAG00000015098) #23	PPP6C (ENSBTAG00000008033)	SCAI (ENSBTAG00000015553)	GOLGA1 (ENSBTAG00000015286)	ARPC5L (ENSBTAG00000015278)	RPL35 (ENSBTAG00000003205)	WDR38 (ENSBTAG00000039223)	OLFML2A (ENSBTAG00000004848)	NR6A1 (ENSBTAG00000040585)	NR5A1 (ENSBTAG00000009017)	ADGRD2 (ENSBTAG00000017576)	PSMB7 (ENSBTAG00000003067)	NEK6 (ENSBTAG00000019470)	LHX2 (ENSBTAG00000010990)	ENSBTAG00000023860
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	2	ENSBIXG00005016505	ZNF79 (ENSBIXG00005016530)	SLC2A8 (ENSBIXG00005016556)	GARNL3 (ENSBIXG00005016797)	ANGPTL2 (ENSBIXG00005002738)	ENSBIXG00005016879	RALGPS1 (ENSBIXG00005016915)	ZBTB34 (ENSBIXG00005016939)	ZBTB43 (ENSBIXG00005016956)	ENSBIXG00005002755	MVB12B (ENSBIXG00005017101)	PBX3 (ENSBIXG00005017186)	MAPKAP1 (ENSBIXG00005002821) #20	GAPVD1 (ENSBIXG00005002862) #21	ENSBIXG00005017629	HSPA5 (ENSBIXG00005017657) #22	RABEPK (ENSBIXG00005017715) #23	PPP6C (ENSBIXG00005002881)	SCAI (ENSBIXG00005017823)	GOLGA1 (ENSBIXG00005017888)	ARPC5L (ENSBIXG00005017925)	ENSBIXG00005017947	WDR38 (ENSBIXG00005017964)	OLFML2A (ENSBIXG00005017994)	ENSBIXG00005017999	NR6A1 (ENSBIXG00005018129)	NR5A1 (ENSBIXG00005007287)	ADGRD2 (ENSBIXG00005018218)	ENSBIXG00005018237	NEK6 (ENSBIXG00005018334)	LHX2 (ENSBIXG00005018376)
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.z	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000168001	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Wild yak	MODERN SPECIES	534													PBX3 (ENSBMUG00000019805)	MAPKAP1 (ENSBMUG00000019899) #20	GAPVD1 (ENSBMUG00000020198) #21	HSPA5 (ENSBMUG00000020273) #22	RABEPK (ENSBMUG00000020294) #23	PPP6C (ENSBMUG00000020319)	SCAI (ENSBMUG00000020339)	GOLGA1 (ENSBMUG00000020389)	ARPC5L (ENSBMUG00000020410)	RPL35 (ENSBMUG00000020431)	WDR38 (ENSBMUG00000020446)	OLFML2A (ENSBMUG00000020472)	NR6A1 (ENSBMUG00000020485)	NR5A1 (ENSBMUG00000020509)	PSMB7 (ENSBMUG00000020516)	NEK6 (ENSBMUG00000020547)	LHX2 (ENSBMUG00000020558)	DENND1A (ENSBMUG00000020652)	CRB2 (ENSBMUG00000020716)
Domestic yak	MODERN SPECIES	28	NIBAN2 (ENSBGRG00000005231)	LRSAM1 (ENSBGRG00000004897)	ENSBGRG00000004793	ZNF79 (ENSBGRG00000004744)	SLC2A8 (ENSBGRG00000004637)	GARNL3 (ENSBGRG00000004303)	ANGPTL2 (ENSBGRG00000004258)	RALGPS1 (ENSBGRG00000004130)	ZBTB34 (ENSBGRG00000004098)	ZBTB43 (ENSBGRG00000004090)	LMX1B (ENSBGRG00000004039)	MVB12B (ENSBGRG00000003751)	PBX3 (ENSBGRG00000003613)	MAPKAP1 (ENSBGRG00000003483) #20	GAPVD1 (ENSBGRG00000020149) #21	HSPA5 (ENSBGRG00000020026) #22	RABEPK (ENSBGRG00000019866) #23	PPP6C (ENSBGRG00000019741)	SCAI (ENSBGRG00000019665)	GOLGA1 (ENSBGRG00000019407)	ENSBGRG00000019352	ENSBGRG00000019299	ENSBGRG00000019233	WDR38 (ENSBGRG00000019089)	OLFML2A (ENSBGRG00000018998)	NR6A1 (ENSBGRG00000018410)	NR5A1 (ENSBGRG00000018297)	PSMB7 (ENSBGRG00000018037)	NEK6 (ENSBGRG00000017708)	LHX2 (ENSBGRG00000017595)	ENSBGRG00000017559
American bison	MODERN SPECIES	3112								ENSBBBG00000014647	ZBTB34 (ENSBBBG00000014658)	ZBTB43 (ENSBBBG00000014671)	LMX1B (ENSBBBG00000014694)	MVB12B (ENSBBBG00000003570)	PBX3 (ENSBBBG00000014751)	MAPKAP1 (ENSBBBG00000014882) #20	GAPVD1 (ENSBBBG00000000863) #21	HSPA5 (ENSBBBG00000000833) #22	RABEPK (ENSBBBG00000014930) #23	PPP6C (ENSBBBG00000003624)	SCAI (ENSBBBG00000014945)	GOLGA1 (ENSBBBG00000014965)	ARPC5L (ENSBBBG00000003705)	RPL35 (ENSBBBG00000014980)	WDR38 (ENSBBBG00000003711)	OLFML2A (ENSBBBG00000000806)	NR6A1 (ENSBBBG00000015024)	NR5A1 (ENSBBBG00000015038)	ADGRD2 (ENSBBBG00000015057)	PSMB7 (ENSBBBG00000015071)	NEK6 (ENSBBBG00000015078)	LHX2 (ENSBBBG00000003743)	ENSBBBG00000015098
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.z	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	19	NIBAN2 (ENSOARG00020018057)	LRSAM1 (ENSOARG00020018197)	ENSOARG00020018336	ZNF79 (ENSOARG00020005829)	SLC2A8 (ENSOARG00020005850)	GARNL3 (ENSOARG00020005922)	RALGPS1 (ENSOARG00020006212)	ANGPTL2 (ENSOARG00020006239)	ZBTB34 (ENSOARG00020006266)	ZBTB43 (ENSOARG00020006288)	LMX1B (ENSOARG00020006318)	MVB12B (ENSOARG00020006420)	PBX3 (ENSOARG00020006510)	MAPKAP1 (ENSOARG00020006895) #20	GAPVD1 (ENSOARG00020007060) #21	HSPA5 (ENSOARG00020007714) #22	RABEPK (ENSOARG00020007776) #23	PPP6C (ENSOARG00020007850)	SCAI (ENSOARG00020007930)	GOLGA1 (ENSOARG00020008027)	ARPC5L (ENSOARG00020008562)	RPL35 (ENSOARG00020008582)	WDR38 (ENSOARG00020008607)	OLFML2A (ENSOARG00020008739)	NR6A1 (ENSOARG00020008843)	NR5A1 (ENSOARG00020009154)	ADGRD2 (ENSOARG00020009282)	PSMB7 (ENSOARG00020009676)	NEK6 (ENSOARG00020009766)	ENSOARG00020010162	ENSOARG00020010288
Goat	MODERN SPECIES	2	ENSCHIG00000023017	ZNF79 (ENSCHIG00000016296)	SLC2A8 (ENSCHIG00000015906)	GARNL3 (ENSCHIG00000015896)	ANGPTL2 (ENSCHIG00000023162)	RALGPS1 (ENSCHIG00000019334)	ZBTB34 (ENSCHIG00000025301)	ZBTB43 (ENSCHIG00000008012)	LMX1B (ENSCHIG00000019164)	ENSCHIG00000006744	MVB12B (ENSCHIG00000013327)	PBX3 (ENSCHIG00000019810)	ENSCHIG00000024696	MAPKAP1 (ENSCHIG00000026766) #20	GAPVD1 (ENSCHIG00000007353) #21	HSPA5 (ENSCHIG00000025078) #22	RABEPK (ENSCHIG00000003281) #23	PPP6C (ENSCHIG00000002356)	SCAI (ENSCHIG00000016265)	GOLGA1 (ENSCHIG00000025077)	ARPC5L (ENSCHIG00000015054)	RPL35 (ENSCHIG00000012200)	WDR38 (ENSCHIG00000022520)	OLFML2A (ENSCHIG00000023813)	ENSCHIG00000016762	NR6A1 (ENSCHIG00000023004)	NR5A1 (ENSCHIG00000020020)	ADGRD2 (ENSCHIG00000015493)	PSMB7 (ENSCHIG00000016023)	NEK6 (ENSCHIG00000014014)	LHX2 (ENSCHIG00000024662)
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.z	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.z	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000155028.q.a	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.z	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000155028.q.a	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501.y	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.z	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000155028.q.a	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501.y	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Tiger	MODERN SPECIES	473	LRSAM1 (ENSPTIG00000018502)	ENSPTIG00000018300	ZNF79 (ENSPTIG00000018136)	SLC2A8 (ENSPTIG00000018073)	GARNL3 (ENSPTIG00000017483)	ANGPTL2 (ENSPTIG00000017403)	RALGPS1 (ENSPTIG00000015973)	ZBTB34 (ENSPTIG00000006352)	ZBTB43 (ENSPTIG00000006342)	LMX1B (ENSPTIG00000015206)	MVB12B (ENSPTIG00000014948)	PBX3 (ENSPTIG00000014417)	MAPKAP1 (ENSPTIG00000012826) #20	GAPVD1 (ENSPTIG00000010076) #21	ENSPTIG00000006297	HSPA5 (ENSPTIG00000009854) #22	RABEPK (ENSPTIG00000009569) #23	ENSPTIG00000009511	PPP6C (ENSPTIG00000007118)	SCAI (ENSPTIG00000006221)	GOLGA1 (ENSPTIG00000005468)	ENSPTIG00000004434	ENSPTIG00000003358	WDR38 (ENSPTIG00000001191)	OLFML2A (ENSPTIG00000000256)	NR6A1 (ENSPTIG00000019310)	NR5A1 (ENSPTIG00000018980)	ADGRD2 (ENSPTIG00000018740)	PSMB7 (ENSPTIG00000018529)	NEK6 (ENSPTIG00000018068)	LHX2 (ENSPTIG00000017789)
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.z	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000155028.q.a	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501.y	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
leopard	MODERN SPECIES	83	LRSAM1 (ENSPPRG00000000380)	ENSPPRG00000022389	ZNF79 (ENSPPRG00000020262)	SLC2A8 (ENSPPRG00000018279)	GARNL3 (ENSPPRG00000015297)	RALGPS1 (ENSPPRG00000012694)	ANGPTL2 (ENSPPRG00000010552)	ZBTB34 (ENSPPRG00000018596)	ZBTB43 (ENSPPRG00000018577)	LMX1B (ENSPPRG00000010155)	MVB12B (ENSPPRG00000009397)	PBX3 (ENSPPRG00000007791)	MAPKAP1 (ENSPPRG00000006466) #20	GAPVD1 (ENSPPRG00000003140) #21	ENSPPRG00000018138	HSPA5 (ENSPPRG00000022078) #22	RABEPK (ENSPPRG00000020336) #23	PPP6C (ENSPPRG00000016362)	SCAI (ENSPPRG00000013250)	GOLGA1 (ENSPPRG00000012551)	ENSPPRG00000011416	RPL35 (ENSPPRG00000009584)	WDR38 (ENSPPRG00000009371)	OLFML2A (ENSPPRG00000008528)	NR6A1 (ENSPPRG00000007044)	NR5A1 (ENSPPRG00000004846)	ADGRD2 (ENSPPRG00000003636)	PSMB7 (ENSPPRG00000002455)	NEK6 (ENSPPRG00000002216)	LHX2 (ENSPPRG00000024346)	DENND1A (ENSPPRG00000024434)
lion	MODERN SPECIES	13	LRSAM1 (ENSPLOG00000021277)	ENSPLOG00000021361	ZNF79 (ENSPLOG00000021492)	SLC2A8 (ENSPLOG00000011202)	GARNL3 (ENSPLOG00000011359)	RALGPS1 (ENSPLOG00000011877)	ANGPTL2 (ENSPLOG00000012007)	ZBTB34 (ENSPLOG00000012089)	ZBTB43 (ENSPLOG00000012121)	LMX1B (ENSPLOG00000012167)	MVB12B (ENSPLOG00000012399)	PBX3 (ENSPLOG00000012473)	MAPKAP1 (ENSPLOG00000012802) #20	GAPVD1 (ENSPLOG00000013218) #21	ENSPLOG00000013557	HSPA5 (ENSPLOG00000013582) #22	RABEPK (ENSPLOG00000013703) #23	PPP6C (ENSPLOG00000013892)	ENSPLOG00000014063	SCAI (ENSPLOG00000014157)	GOLGA1 (ENSPLOG00000014524)	ENSPLOG00000014601	RPL35 (ENSPLOG00000014664)	WDR38 (ENSPLOG00000014714)	OLFML2A (ENSPLOG00000014824)	NR6A1 (ENSPLOG00000014966)	NR5A1 (ENSPLOG00000015373)	ADGRD2 (ENSPLOG00000015510)	PSMB7 (ENSPLOG00000015690)	NEK6 (ENSPLOG00000015777)	LHX2 (ENSPLOG00000015889)
Cat	MODERN SPECIES	244	RPL12 (ENSFCAG00000010302)	ZNF79 (ENSFCAG00000036757)	SLC2A8 (ENSFCAG00000023972)	GARNL3 (ENSFCAG00000019243)	ANGPTL2 (ENSFCAG00000008697)	RALGPS1 (ENSFCAG00000008696)	ENSFCAG00000051360	ZBTB34 (ENSFCAG00000026253)	ZBTB43 (ENSFCAG00000031874)	LMX1B (ENSFCAG00000046069)	MVB12B (ENSFCAG00000005855)	PBX3 (ENSFCAG00000014463)	MAPKAP1 (ENSFCAG00000029143) #20	GAPVD1 (ENSFCAG00000019310) #21	ENSFCAG00000027674	HSPA5 (ENSFCAG00000011816) #22	RABEPK (ENSFCAG00000012303) #23	ENSFCAG00000035560	PPP6C (ENSFCAG00000037922)	SCAI (ENSFCAG00000003261)	GOLGA1 (ENSFCAG00000003260)	ENSFCAG00000028753	RPL35 (ENSFCAG00000030388)	WDR38 (ENSFCAG00000028099)	OLFML2A (ENSFCAG00000003257)	NR6A1 (ENSFCAG00000005507)	NR5A1 (ENSFCAG00000022552)	ADGRD2 (ENSFCAG00000052526)	PSMB7 (ENSFCAG00000014567)	NEK6 (ENSFCAG00000014563)	LHX2 (ENSFCAG00000006890)
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.z	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000155028.q.a	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.z	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000155028.q.a	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00390000005534.b.b.c.b.a.a.b.a.b	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.z	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000155028.q.a	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00390000005534.b.b.c.b.a.a.b.a.b	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540
Dingo	MODERN SPECIES	327	ENSCAFG00020015751	ZNF79 (ENSCAFG00020015748)	SLC2A8 (ENSCAFG00020015735)	GARNL3 (ENSCAFG00020015720)	ANGPTL2 (ENSCAFG00020015712)	RALGPS1 (ENSCAFG00020015705)	ZBTB34 (ENSCAFG00020015695)	ZBTB43 (ENSCAFG00020015693)	LMX1B (ENSCAFG00020015686)	MVB12B (ENSCAFG00020015680)	PBX3 (ENSCAFG00020015673)	ENSCAFG00020015672	MAPKAP1 (ENSCAFG00020015668) #20	GAPVD1 (ENSCAFG00020015663) #21	ENSCAFG00020015662	HSPA5 (ENSCAFG00020015658) #22	RABEPK (ENSCAFG00020015656) #23	ENSCAFG00020015654	PPP6C (ENSCAFG00020015642)	SCAI (ENSCAFG00020015613)	GOLGA1 (ENSCAFG00020015604)	ARPC5L (ENSCAFG00020015602)	ENSCAFG00020015596	WDR38 (ENSCAFG00020015590)	OLFML2A (ENSCAFG00020015588)	NR6A1 (ENSCAFG00020015583)	NR5A1 (ENSCAFG00020015577)	PSMB7 (ENSCAFG00020015572)	NEK6 (ENSCAFG00020015571)	LHX2 (ENSCAFG00020015565)	DENND1A (ENSCAFG00020015553)
Dog	MODERN SPECIES	37	LRSAM1 (ENSCAFG00845006132)	RPL12 (ENSCAFG00845006492)	ZNF79 (ENSCAFG00845006589)	SLC2A8 (ENSCAFG00845006645)	GARNL3 (ENSCAFG00845006878)	RALGPS1 (ENSCAFG00845007722)	ANGPTL2 (ENSCAFG00845008148)	ZBTB34 (ENSCAFG00845008213)	ZBTB43 (ENSCAFG00845008244)	LMX1B (ENSCAFG00845008290)	MVB12B (ENSCAFG00845008402)	PBX3 (ENSCAFG00845008541)	MAPKAP1 (ENSCAFG00845008783) #20	GAPVD1 (ENSCAFG00845009138) #21	ENSCAFG00845009489	HSPA5 (ENSCAFG00845009518) #22	RABEPK (ENSCAFG00845009620) #23	ENSCAFG00845009818	PPP6C (ENSCAFG00845009869)	SCAI (ENSCAFG00845009946)	GOLGA1 (ENSCAFG00845010046)	ARPC5L (ENSCAFG00845010220)	RPL35 (ENSCAFG00845010255)	WDR38 (ENSCAFG00845010303)	OLFML2A (ENSCAFG00845010401)	NR6A1 (ENSCAFG00845010445)	NR5A1 (ENSCAFG00845010545)	ENSCAFG00845010600	PSMB7 (ENSCAFG00845010709)	NEK6 (ENSCAFG00845010805)	LHX2 (ENSCAFG00845010906)
Red fox	MODERN SPECIES	77	SLC2A8 (ENSVVUG00000011243)	GARNL3 (ENSVVUG00000010701)	ANGPTL2 (ENSVVUG00000010654)	RALGPS1 (ENSVVUG00000010288)	ZBTB34 (ENSVVUG00000010253)	ZBTB43 (ENSVVUG00000010246)	LMX1B (ENSVVUG00000010228)	MVB12B (ENSVVUG00000010180)	ENSVVUG00000010154	ENSVVUG00000010148	ENSVVUG00000010144	ENSVVUG00000010140	MAPKAP1 (ENSVVUG00000010108) #20	GAPVD1 (ENSVVUG00000010075) #21	ENSVVUG00000010071	HSPA5 (ENSVVUG00000010069) #22	RABEPK (ENSVVUG00000010062) #23	ENSVVUG00000010058	PPP6C (ENSVVUG00000010053)	SCAI (ENSVVUG00000009995)	GOLGA1 (ENSVVUG00000009974)	ARPC5L (ENSVVUG00000009965)	RPL35 (ENSVVUG00000009948)	WDR38 (ENSVVUG00000009939)	OLFML2A (ENSVVUG00000009902)	NR6A1 (ENSVVUG00000009870)	NR5A1 (ENSVVUG00000009804)	PSMB7 (ENSVVUG00000009795)	NEK6 (ENSVVUG00000009771)	LHX2 (ENSVVUG00000009751)	DENND1A (ENSVVUG00000009688)
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.z	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000155028.q.a	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.z	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000155028.q.a	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
American mink	MODERN SPECIES	182	LRSAM1 (ENSNVIG00000008960)	ENSNVIG00000008765	ZNF79 (ENSNVIG00000008671)	SLC2A8 (ENSNVIG00000008575)	GARNL3 (ENSNVIG00000007970)	ANGPTL2 (ENSNVIG00000007835)	RALGPS1 (ENSNVIG00000007412)	ZBTB34 (ENSNVIG00000007361)	ZBT43 (ENSNVIG00000007330)	LMX1B (ENSNVIG00000007213)	MVB12B (ENSNVIG00000007087)	PBX3 (ENSNVIG00000006934)	MAPKAP1 (ENSNVIG00000006459) #20	GAPVD1 (ENSNVIG00000006048) #21	ENSNVIG00000006030	HSPA5 (ENSNVIG00000006019) #22	RABEPK (ENSNVIG00000005963) #23	PPP6C (ENSNVIG00000005944)	SCAI (ENSNVIG00000005835)	GOLGA1 (ENSNVIG00000005806)	ARP5L (ENSNVIG00000005786)	RPL35 (ENSNVIG00000005757)	WDR38 (ENSNVIG00000005737)	OLFML2A (ENSNVIG00000005683)	NR6A1 (ENSNVIG00000005633)	NR5A1 (ENSNVIG00000005527)	PSMB7 (ENSNVIG00000005110)	NEK6 (ENSNVIG00000005066)	LHX2 (ENSNVIG00000005036)	DENND1A (ENSNVIG00000004449)	CRB2 (ENSNVIG00000004241)
Ferret	MODERN SPECIES	218	ZNF79 (ENSMPUG00000013847)	SLC2A8 (ENSMPUG00000013848)	GARNL3 (ENSMPUG00000013851)	RALGPS1 (ENSMPUG00000013857)	ANGPTL2 (ENSMPUG00000013863)	ZBTB34 (ENSMPUG00000013866)	ENSMPUG00000013867	ZBTB43 (ENSMPUG00000019227)	LMX1B (ENSMPUG00000013868)	ENSMPUG00000013871	MVB12B (ENSMPUG00000013873)	PBX3 (ENSMPUG00000013876)	ENSMPUG00000019230	MAPKAP1 (ENSMPUG00000013878) #20	GAPVD1 (ENSMPUG00000013880) #21	HSPA5 (ENSMPUG00000013886) #22	RABEPK (ENSMPUG00000013889) #23	PPP6C (ENSMPUG00000013892)	SCAI (ENSMPUG00000013894)	GOLGA1 (ENSMPUG00000013917)	ARPC5L (ENSMPUG00000013924)	ENSMPUG00000013947	RPL35 (ENSMPUG00000013950)	WDR38 (ENSMPUG00000013960)	OLFML2A (ENSMPUG00000013962)	NR6A1 (ENSMPUG00000013965)	ENSMPUG00000013968	NR5A1 (ENSMPUG00000013973)	ADGRD2 (ENSMPUG00000013976)	PSMB7 (ENSMPUG00000013994)	NEK6 (ENSMPUG00000013997)
Ursidae	DUPLICATION
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154787.w #22
Giant Panda	MODERN SPECIES	490																ENSAMEG00000027217 #22
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.z	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945.f	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000155028.q.a	ENSGT00940000154787.x #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419.h	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.z	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795.c	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945.e	ENSGT00940000155945.f	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000155028.q.a	ENSGT00940000154787.x #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419.h	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Polar bear	MODERN SPECIES	214	NIBAN2 (ENSUMAG00000001007)	LRSAM1 (ENSUMAG00000001212)	ENSUMAG00000001711	ZNF79 (ENSUMAG00000001734)	ENSUMAG00000001742	GARNL3 (ENSUMAG00000001779)	RALGPS1 (ENSUMAG00000001933)	ANGPTL2 (ENSUMAG00000002003)	ZBTB34 (ENSUMAG00000002018)	ZBTB43 (ENSUMAG00000002027)	MVB12B (ENSUMAG00000002046)	PBX3 (ENSUMAG00000002081)	MAPKAP1 (ENSUMAG00000002142) #20	GAPVD1 (ENSUMAG00000002166) #21	ENSUMAG00000002202	HSPA5 (ENSUMAG00000002207) #22	RABEPK (ENSUMAG00000002218) #23	PPP6C (ENSUMAG00000002283)	SCAI (ENSUMAG00000002651)	GOLGA1 (ENSUMAG00000002704)	ENSUMAG00000002970	RPL35 (ENSUMAG00000002978)	WDR38 (ENSUMAG00000002982)	OLFML2A (ENSUMAG00000002991)	NR6A1 (ENSUMAG00000003006)	PSMB7 (ENSUMAG00000003020)	NEK6 (ENSUMAG00000003025)	LHX2 (ENSUMAG00000003040)	ENSUMAG00000003051	ENSUMAG00000003058	STRBP (ENSUMAG00000003090)
American black bear	MODERN SPECIES	191															GAPVD1 (ENSUAMG00000014455) #21	HSPA5 (ENSUAMG00000014452) #22	RABEPK (ENSUAMG00000014445) #23	PPP6C (ENSUAMG00000014443)	SCAI (ENSUAMG00000014427)
Giant Panda	MODERN SPECIES	17	LRSAM1 (ENSAMEG00000016718)	RPL12 (ENSAMEG00000016712)	ZNF79 (ENSAMEG00000016711)	SLC2A8 (ENSAMEG00000016684)	GARNL3 (ENSAMEG00000016676)	ANGPTL2 (ENSAMEG00000016668)	RALGPS1 (ENSAMEG00000016657)	ZBTB34 (ENSAMEG00000019669)	ZBTB43 (ENSAMEG00000019654)	LMX1B (ENSAMEG00000023595)	MVB12B (ENSAMEG00000016634)	PBX3 (ENSAMEG00000016625)	MAPKAP1 (ENSAMEG00000016622) #20	GAPVD1 (ENSAMEG00000016598) #21	ENSAMEG00000019675	HSPA5 (ENSAMEG00000016583) #22	RABEPK (ENSAMEG00000016577) #23	PPP6C (ENSAMEG00000016567)	SCAI (ENSAMEG00000026864)	GOLGA1 (ENSAMEG00000016553)	ENSAMEG00000016540	RPL35 (ENSAMEG00000016537)	WDR38 (ENSAMEG00000029862)	OLFML2A (ENSAMEG00000016521)	NR6A1 (ENSAMEG00000011212)	NR5A1 (ENSAMEG00000027142)	PSMB7 (ENSAMEG00000011136)	NEK6 (ENSAMEG00000011113)	LHX2 (ENSAMEG00000011089)	DENND1A (ENSAMEG00000011077)	CRB2 (ENSAMEG00000011056)
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.b.b	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.b.b	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a.z	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00620000088615	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	3	LRSAM1 (ENSRFEG00010014012)	RPL12 (ENSRFEG00010013892)	ZNF79 (ENSRFEG00010013807)	SLC2A8 (ENSRFEG00010013704)	GARNL3 (ENSRFEG00010013517)	ANGPTL2 (ENSRFEG00010013415)	RALGPS1 (ENSRFEG00010013214)	ZBTB34 (ENSRFEG00010013147)	ZBTB43 (ENSRFEG00010013135)	LMX1B (ENSRFEG00010012903)	MVB12B (ENSRFEG00010012808)	PBX3 (ENSRFEG00010012647)	ENSRFEG00010012590	MAPKAP1 (ENSRFEG00010012394) #20	GAPVD1 (ENSRFEG00010012121) #21	HSPA5 (ENSRFEG00010012022) #22	RABEPK (ENSRFEG00010011922) #23	PPP6C (ENSRFEG00010011691)	SCAI (ENSRFEG00010011538)	GOLGA1 (ENSRFEG00010011365)	ARPC5L (ENSRFEG00010011262)	RPL35 (ENSRFEG00010011212)	WDR38 (ENSRFEG00010010924)	OLFML2A (ENSRFEG00010010880)	NR6A1 (ENSRFEG00010010735)	NR5A1 (ENSRFEG00010010595)	PSMB7 (ENSRFEG00010010524)	NEK6 (ENSRFEG00010010318)	LHX2 (ENSRFEG00010020804)	DENND1A (ENSRFEG00010020653)	CRB2 (ENSRFEG00010020565)
Microbat	MODERN SPECIES	1110										MVB12B (ENSMLUG00000001140)	ENSMLUG00000008546	MAPKAP1 (ENSMLUG00000009614) #20	GAPVD1 (ENSMLUG00000009563) #21	ENSMLUG00000028960	PPP6C (ENSMLUG00000009516)	HSPA5 (ENSMLUG00000009546) #22	ENSMLUG00000009537 #23	SCAI (ENSMLUG00000015214)	GOLGA1 (ENSMLUG00000009442)	ARPC5L (ENSMLUG00000009429)	RPL35 (ENSMLUG00000029323)	WDR38 (ENSMLUG00000024073)	OLFML2A (ENSMLUG00000017669)	NR6A1 (ENSMLUG00000014714)	NR5A1 (ENSMLUG00000005775)	PSMB7 (ENSMLUG00000007496)	NEK6 (ENSMLUG00000007482)	LHX2 (ENSMLUG00000016917)	DENND1A (ENSMLUG00000016076)	CRB2 (ENSMLUG00000024466)	ENSMLUG00000024699
Megabat	MODERN SPECIES	764														MAPKAP1 (ENSPVAG00000008108) #20	GAPVD1 (ENSPVAG00000008103) #21	HSPA5 (ENSPVAG00000008100) #22	RABEPK (ENSPVAG00000008097) #23	PPP6C (ENSPVAG00000008096)	SCAI (ENSPVAG00000008093)	GOLGA1 (ENSPVAG00000008088)	ARPC5L (ENSPVAG00000008087)	RPL35 (ENSPVAG00000008086)	WDR38 (ENSPVAG00000008085)
Equus	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.b.b	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f.d	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Horse	MODERN SPECIES	17	ENSECAG00000010622	ENSECAG00000058158	ZNF79 (ENSECAG00000009109)	SLC2A8 (ENSECAG00000020011)	GARNL3 (ENSECAG00000049299)	ANGPTL2 (ENSECAG00000016234)	RALGPS1 (ENSECAG00000013574)	ZBTB34 (ENSECAG00000029669)	ZBTB43 (ENSECAG00000013239)	LMX1B (ENSECAG00000029610)	MVB12B (ENSECAG00000017566)	ENSECAG00000002719	PBX3 (ENSECAG00000016804)	MAPKAP1 (ENSECAG00000020453) #20	GAPVD1 (ENSECAG00000012787) #21	HSPA5 (ENSECAG00000024205) #22	RABEPK (ENSECAG00000021517) #23	PPP6C (ENSECAG00000015767)	SCAI (ENSECAG00000024008)	GOLGA1 (ENSECAG00000015124)	WDR38 (ENSECAG00000006383)	ENSECAG00000045439	OLFML2A (ENSECAG00000023908)	NR6A1 (ENSECAG00000021324)	NR5A1 (ENSECAG00000013752)	ADGRD2 (ENSECAG00000009351)	PSMB7 (ENSECAG00000023415)	NEK6 (ENSECAG00000009941)	LHX2 (ENSECAG00000009405)	ENSECAG00000055062	ENSECAG00000027494
Donkey	MODERN SPECIES	1	ENSEASG00005020491	ENSEASG00005036560	ZNF79 (ENSEASG00005030528)	ENSEASG00005030939	SLC2A8 (ENSEASG00005020518)	GARNL3 (ENSEASG00005020575)	RALGPS1 (ENSEASG00005020590)	ANGPTL2 (ENSEASG00005020595)	ZBTB34 (ENSEASG00005024007)	ZBTB43 (ENSEASG00005033930)	LMX1B (ENSEASG00005020607)	MVB12B (ENSEASG00005020611)	PBX3 (ENSEASG00005020621)	MAPKAP1 (ENSEASG00005020623) #20	GAPVD1 (ENSEASG00005020630) #21	HSPA5 (ENSEASG00005020644) #22	RABEPK (ENSEASG00005020648) #23	PPP6C (ENSEASG00005020651)	SCAI (ENSEASG00005020664)	GOLGA1 (ENSEASG00005020734)	ARPC5L (ENSEASG00005020744)	ENSEASG00005035844	WDR38 (ENSEASG00005020747)	OLFML2A (ENSEASG00005020762)	NR6A1 (ENSEASG00005020778)	NR5A1 (ENSEASG00005020785)	ADGRD2 (ENSEASG00005020796)	PSMB7 (ENSEASG00005020802)	NEK6 (ENSEASG00005020808)	LHX2 (ENSEASG00005020812)	DENND1A (ENSEASG00005020820)
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	12								ENSGT00940000168001	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155127	ENSGT00940000154149.a	ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.b.b.a	ENSGT00390000006922.m.a	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00930000151044	ENSGT00390000006922.m.a	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000165628	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Elephant	MODERN SPECIES	472	STXBP1 (ENSLAFG00000002046)	NIBAN2 (ENSLAFG00000017682)	LRSAM1 (ENSLAFG00000017672)	ENSLAFG00000017669	SLC2A8 (ENSLAFG00000017653)	GARNL3 (ENSLAFG00000017640)	ENSLAFG00000001003	ANGPTL2 (ENSLAFG00000001006)	ZBTB34 (ENSLAFG00000008146)	ZBTB43 (ENSLAFG00000011314)	LMX1B (ENSLAFG00000015481)	MVB12B (ENSLAFG00000004750)	PBX3 (ENSLAFG00000016898)	MAPKAP1 (ENSLAFG00000014506) #20	GAPVD1 (ENSLAFG00000016946) #21	HSPA5 (ENSLAFG00000010047) #22	RABEPK (ENSLAFG00000010044) #23	PPP6C (ENSLAFG00000010043)	SCAI (ENSLAFG00000010037)	GOLGA1 (ENSLAFG00000010035)	ARPC5L (ENSLAFG00000010034)	RPL35 (ENSLAFG00000010031)	WDR38 (ENSLAFG00000010023)	OLFML2A (ENSLAFG00000013500)	NR6A1 (ENSLAFG00000011676)	NR5A1 (ENSLAFG00000018557)	ENSLAFG00000018553	PSMB7 (ENSLAFG00000009265)	NEK6 (ENSLAFG00000021394)	LHX2 (ENSLAFG00000007827)	DENND1A (ENSLAFG00000011628)
Hyrax	MODERN SPECIES	2694																HSPA5 (ENSPCAG00000014311) #22	RABEPK (ENSPCAG00000014265) #23	PPP6C (ENSPCAG00000014214)	SCAI (ENSPCAG00000014089)	GOLGA1 (ENSPCAG00000013961)	ARPC5L (ENSPCAG00000013936)	RPL35 (ENSPCAG00000013906)	WDR38 (ENSPCAG00000013811)
Tenrec	MODERN SPECIES	1927															GAPVD1 (ENSETEG00000017878) #21	HSPA5 (ENSETEG00000017875) #22	PPP6C (ENSETEG00000017872)
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	90													ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000016384.f	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b	ENSGT00940000154687.B
Armadillo	MODERN SPECIES	2027													PBX3 (ENSDNOG00000043756)	MAPKAP1 (ENSDNOG00000038808) #20	GAPVD1 (ENSDNOG00000009683) #21	HSPA5 (ENSDNOG00000031601) #22	RABEPK (ENSDNOG00000015327) #23	PPP6C (ENSDNOG00000045474)	SCAI (ENSDNOG00000000007)	GOLGA1 (ENSDNOG00000000005)	ENSDNOG00000033968	WDR38 (ENSDNOG00000046480)	OLFML2A (ENSDNOG00000040474)	ENSDNOG00000033680	NR6A1 (ENSDNOG00000017832)	ENSDNOG00000032252	NR5A1 (ENSDNOG00000040922)	ADGRD2 (ENSDNOG00000015410)	PSMB7 (ENSDNOG00000015332)	NEK6 (ENSDNOG00000015320)	LHX2 (ENSDNOG00000000465)
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000164541	ENSGT00940000160293	ENSGT00390000002471	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261
Opossum	MODERN SPECIES		SLC2A8 (ENSMODG00000019809)	GARNL3 (ENSMODG00000019806)	ANGPTL2 (ENSMODG00000019796)	ENSMODG00000037361	ENSMODG00000038042	RALGPS1 (ENSMODG00000019794)	ENSMODG00000023571	ZBTB43 (ENSMODG00000019790)	LMX1B (ENSMODG00000019789)	MVB12B (ENSMODG00000019787)	ENSMODG00000039977	PBX3 (ENSMODG00000019785)	ENSMODG00000049965	MAPKAP1 (ENSMODG00000019775) #20	GAPVD1 (ENSMODG00000019772) #21	HSPA5 (ENSMODG00000019764) #22	RABEPK (ENSMODG00000019763) #23	PPP6C (ENSMODG00000039439)	ENSMODG00000029560	SCAI (ENSMODG00000019760)	GOLGA1 (ENSMODG00000019758)	ARPC5L (ENSMODG00000019755)	RPL35 (ENSMODG00000019753)	ENSMODG00000019752	OLFML2A (ENSMODG00000019750)	NR6A1 (ENSMODG00000019748)	NR5A1 (ENSMODG00000019746)	ENSMODG00000019744	PSMB7 (ENSMODG00000019742)	NEK6 (ENSMODG00000019741)	LHX2 (ENSMODG00000019739)
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000164541	ENSGT00940000160293	ENSGT00390000002471	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540.a	ENSGT00940000158540.b
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000154650.d.g.d.a	ENSGT00410000025802	ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540.a	ENSGT00940000158540.b	ENSGT00940000156261.d
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000163270	ENSGT00940000158795	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000164541	ENSGT00940000160293	ENSGT00390000002471	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501.g	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000162358	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540.a	ENSGT00940000156261.d	ENSGT00950000183101.a.b.b
Common wonbat	DUPLICATION
Common wonbat	MODERN SPECIES	1024	ENSVURG00010009905	ENSVURG00010009899	ENSVURG00010009885	ENSVURG00010009879	ENSVURG00010009826	ENSVURG00010009813	ENSVURG00010009792	ENSVURG00010009775	ENSVURG00010009773	ENSVURG00010009746	ENSVURG00010009720	ENSVURG00010009701	ENSVURG00010009693	ENSVURG00010009686 #20	ENSVURG00010009649 #21	ENSVURG00010009631 #22	ENSVURG00010009625 #23	ENSVURG00010009620	ENSVURG00010009604	ENSVURG00010009564	ENSVURG00010009559	ENSVURG00010009550	ENSVURG00010009523	ENSVURG00010009499	ENSVURG00010009439	ENSVURG00010009361	ENSVURG00010009332	ENSVURG00010009314	ENSVURG00010009299	ENSVURG00010009229	ENSVURG00010009185
Common wonbat	MODERN SPECIES	1024	ENSVURG00010017849	ENSVURG00010017834	ENSVURG00010017828	ENSVURG00010017823	ENSVURG00010017816	ENSVURG00010017781	ENSVURG00010017766	ENSVURG00010017746	ENSVURG00010017733	ENSVURG00010017731	ENSVURG00010017724	ENSVURG00010017706	PBX3 (ENSVURG00010017684)	ENSVURG00010017647 #20	ENSVURG00010017616 #21	ENSVURG00010017591 #22	ENSVURG00010017575 #23	ENSVURG00010017559	ENSVURG00010017537	ENSVURG00010017517	ENSVURG00010017501	ENSVURG00010017496	ENSVURG00010017466	ENSVURG00010017449	ENSVURG00010017416	ENSVURG00010017409	ENSVURG00010017394	ENSVURG00010017384	ENSVURG00010017362	ENSVURG00010017253	ENSVURG00010017196
koala	MODERN SPECIES	177												MVB12B (ENSPCIG00000001247)	PBX3 (ENSPCIG00000018264)	MAPKAP1 (ENSPCIG00000018266) #20	GAPVD1 (ENSPCIG00000018270) #21	HSPA5 (ENSPCIG00000018277) #22	RABEPK (ENSPCIG00000018279) #23	PPP6C (ENSPCIG00000018281)	SCAI (ENSPCIG00000028448)	GOLGA1 (ENSPCIG00000028441)	ENSPCIG00000020607	ENSPCIG00000020603	ENSPCIG00000020599	OLFML2A (ENSPCIG00000020590)	NR6A1 (ENSPCIG00000020572)	NR5A1 (ENSPCIG00000020567)	PSMB7 (ENSPCIG00000020558)	NEK6 (ENSPCIG00000020553)	ENSPCIG00000020547	LHX2 (ENSPCIG00000010082)	DENND1A (ENSPCIG00000035239)
Wallaby	MODERN SPECIES	14869																HSPA5 (ENSMEUG00000016702) #22
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	1	ENSSHAG00000031451	ENSSHAG00000022916	ENSSHAG00000004020	SLC2A8 (ENSSHAG00000015867)	GARNL3 (ENSSHAG00000015222)	ANGPTL2 (ENSSHAG00000013947)	RALGPS1 (ENSSHAG00000013101)	ENSSHAG00000031849	ZBTB43 (ENSSHAG00000030880)	ZBTB34 (ENSSHAG00000025162)	LMX1B (ENSSHAG00000009990)	MVB12B (ENSSHAG00000028126)	PBX3 (ENSSHAG00000023136)	MAPKAP1 (ENSSHAG00000005395) #20	GAPVD1 (ENSSHAG00000009639) #21	HSPA5 (ENSSHAG00000021738) #22	RABEPK (ENSSHAG00000008678) #23	PPP6C (ENSSHAG00000023513)	SCAI (ENSSHAG00000006233)	GOLGA1 (ENSSHAG00000005279)	ARPC5L (ENSSHAG00000031667)	RPL35 (ENSSHAG00000004756)	ENSSHAG00000004224	OLFML2A (ENSSHAG00000028473)	NR6A1 (ENSSHAG00000030299)	NR5A1 (ENSSHAG00000025642)	ENSSHAG00000023389	PSMB7 (ENSSHAG00000016059)	NEK6 (ENSSHAG00000015827)	ENSSHAG00000026980	LHX2 (ENSSHAG00000014985)
Platypus	MODERN SPECIES	15	ENSOANG00000030197	SNX16 (ENSOANG00000014703)	ENSOANG00000014702	FBXW2 (ENSOANG00000014701) #24	SLC2A8 (ENSOANG00000014700)	ANGPTL2 (ENSOANG00000011011)	GARNL3 (ENSOANG00000014699)	RALGPS1 (ENSOANG00000037776)	ZBTB34 (ENSOANG00000044657)	ZBTB43 (ENSOANG00000014742)	LMX1B (ENSOANG00000044492)	MVB12B (ENSOANG00000037606)	ENSOANG00000010436 #19	MAPKAP1 (ENSOANG00000040686) #20	GAPVD1 (ENSOANG00000013289) #21	HSPA5 (ENSOANG00000013291) #22	RABEPK (ENSOANG00000013292) #23	PPP6C (ENSOANG00000038056)	SCAI (ENSOANG00000013296)	GOLGA1 (ENSOANG00000013299)	ARPC5L (ENSOANG00000038645)	RPL35 (ENSOANG00000036932)	OLFML2A (ENSOANG00000013302)	NR6A1 (ENSOANG00000013303)	NR5A1 (ENSOANG00000012920)	ENSOANG00000012921	PSMB7 (ENSOANG00000048360)	NEK6 (ENSOANG00000000382)	LHX2 (ENSOANG00000043102)	DENND1A (ENSOANG00000045046)	ENSOANG00000020908
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00940000164541	ENSGT00940000162975	ENSGT00390000008726.h.b.e	ENSGT00390000014107.a.b	ENSGT00940000160293	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000158795	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00530000064359.b.b	ENSGT00530000064359.b.a	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000158795	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00530000064359.b.b	ENSGT00530000064359.b.a	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00950000182888.b	ENSGT00940000154842.a.a	ENSGT00530000063843.a	ENSGT01100000263542.B.a	ENSGT00390000000459	ENSGT00940000156763	ENSGT00390000013158	ENSGT00940000167223	ENSGT00960000188404
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000158795	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00530000064359.b.b	ENSGT00530000064359.b.a	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000168001	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384.c	ENSGT00950000182888.b	ENSGT00940000154842.a.a	ENSGT00530000063843.a	ENSGT01100000263542.B.a	ENSGT00390000000459	ENSGT00940000156763	ENSGT00390000013158	ENSGT00390000018644	ENSGT00940000167223
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	52	SLC2A8 (ENSSMRG00000008054)	FBXW2 (ENSSMRG00000008053) #24	ENSSMRG00000008052	ENSSMRG00000008051	ANGPTL2 (ENSSMRG00000008050)	ENSSMRG00000008049	ENSSMRG00000008048	RALGPS1 (ENSSMRG00000008046)	ZBTB43 (ENSSMRG00000008033)	LMX1B (ENSSMRG00000008025)	MVB12B (ENSSMRG00000008020)	ENSSMRG00000008009	ENSSMRG00000008008 #19	MAPKAP1 (ENSSMRG00000008002) #20	GAPVD1 (ENSSMRG00000007991) #21	HSPA5 (ENSSMRG00000007984) #22	RABEPK (ENSSMRG00000007979) #23	PPP6C (ENSSMRG00000007977)	ARPC5L (ENSSMRG00000007945)	GOLGA1 (ENSSMRG00000007928)	SCAI (ENSSMRG00000007916)	RPL35 (ENSSMRG00000007912)	TOR4A (ENSSMRG00000007911)	ENSSMRG00000007906	ENTPD8 (ENSSMRG00000007901)	NSMF (ENSSMRG00000007894)	PNPLA7 (ENSSMRG00000007886)	MRPL41 (ENSSMRG00000007884)	ENSSMRG00000007879	ENSSMRG00000007874	ZMYND19 (ENSSMRG00000007872)
Common wall lizard	MODERN SPECIES	419	GARNL3 (ENSPMRG00000023801)	SLC2A8 (ENSPMRG00000023802)	FBXW2 (ENSPMRG00000023803) #24	ENSPMRG00000023804	ENSPMRG00000023805	RALGPS1 (ENSPMRG00000023806)	ANGPTL2 (ENSPMRG00000023808)	ZBTB34 (ENSPMRG00000023811)	ZBTB43 (ENSPMRG00000023812)	LMX1B (ENSPMRG00000023813)	MVB12B (ENSPMRG00000023815)	ENSPMRG00000023816	ENSPMRG00000023817 #19	MAPKAP1 (ENSPMRG00000023818) #20	GAPVD1 (ENSPMRG00000023821) #21	HSPA5 (ENSPMRG00000023822) #22	RABEPK (ENSPMRG00000021483) #23	PPP6C (ENSPMRG00000021496)	ARPC5L (ENSPMRG00000021505)	GOLGA1 (ENSPMRG00000021521)	SCAI (ENSPMRG00000021564)	ENSPMRG00000021593	TOR4A (ENSPMRG00000021601)	ENSPMRG00000021605	ENSPMRG00000021613	ENSPMRG00000021616	NOXA1 (ENSPMRG00000021623)	ENTPD8 (ENSPMRG00000021631)	NSMF (ENSPMRG00000021637)	PNPLA7 (ENSPMRG00000021762)	MRPL41 (ENSPMRG00000022410)
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000158795	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00530000064359.b.b	ENSGT00530000064359.b.a	ENSGT00940000165628	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00950000182888.b	ENSGT00940000154842.a.a	ENSGT00530000063843.a	ENSGT01100000263542.B.a	ENSGT00390000000459	ENSGT00940000156763	ENSGT00390000013158	ENSGT00940000167223	ENSGT00960000188404
Lizard	MODERN SPECIES	245																ENSACAG00000004072 #22	ENSACAG00000004012 #23
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000160404	ENSGT00940000156207.a.b.b.b.a.a.b.a.b.a	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00390000008220	ENSGT00940000156207.a.b.b.b.a.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000165628	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642.d #20	ENSGT00940000156611.d #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00950000182888.b	ENSGT00940000154842.a.a	ENSGT00530000063843.a	ENSGT01100000263542.B.a	ENSGT00390000000459	ENSGT00940000156763	ENSGT00390000013158	ENSGT00940000167223	ENSGT00960000188404
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00390000018059.a	ENSGT00940000157147.i	ENSGT00950000183161.a.b	ENSGT00940000158049	ENSGT00940000165628	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642.c #20	ENSGT00940000156611.c #21	ENSGT00940000156611.d #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00950000182888.b	ENSGT00940000154842.a.a	ENSGT00530000063843.a	ENSGT01100000263542.B.a	ENSGT00390000000459	ENSGT00940000156763	ENSGT00390000013158	ENSGT00940000167223	ENSGT00960000188404
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000153253.b.b	ENSGT00390000018059.a	ENSGT00940000157147.i	ENSGT00950000183161.a.b	ENSGT00940000158049	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642.c #20	ENSGT00940000156611.c #21	ENSGT00940000156611.d #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00950000182888.b	ENSGT00940000154842.a.a	ENSGT00530000063843.a	ENSGT01100000263542.B.a	ENSGT00390000000459	ENSGT00940000156763	ENSGT00390000013158	ENSGT00940000167223	ENSGT00960000188404
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	305															GAPVD1 (ENSNSUG00000006146) #21	HSPA5 (ENSNSUG00000006382) #22	RABEPK (ENSNSUG00000006383) #23	PPP6C (ENSNSUG00000006384)	ARPC5L (ENSNSUG00000006435)	GOLGA1 (ENSNSUG00000006436)	SCAI (ENSNSUG00000006437)	RPL35 (ENSNSUG00000006441)	ENSNSUG00000006442	ENSNSUG00000006446	ENTPD8 (ENSNSUG00000006448)	NSMF (ENSNSUG00000006450)	PNPLA7 (ENSNSUG00000007863)	MRPL41 (ENSNSUG00000008089)	ENSNSUG00000008090	ZMYND19 (ENSNSUG00000008091)	ENSNSUG00000008092
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	54	ENSPTXG00000014292	FAM78A (ENSPTXG00000014294)	PLPP7 (ENSPTXG00000014296)	ENSPTXG00000014299	ENSPTXG00000014302	POMT1 (ENSPTXG00000014311)	RALGPS1 (ENSPTXG00000014318)	ANGPTL2 (ENSPTXG00000014319)	ZBTB34 (ENSPTXG00000014320)	ZBTB43 (ENSPTXG00000014321)	LMX1B (ENSPTXG00000014323)	MVB12B (ENSPTXG00000014326)	PBX3 (ENSPTXG00000014328)	MAPKAP1 (ENSPTXG00000014330) #20	GAPVD1 (ENSPTXG00000014333) #21	HSPA5 (ENSPTXG00000014338) #22	RABEPK (ENSPTXG00000014340) #23	PPP6C (ENSPTXG00000014343)	ARPC5L (ENSPTXG00000014347)	SCAI (ENSPTXG00000014360)	RPL35 (ENSPTXG00000014406)	TOR4A (ENSPTXG00000014407)	ENSPTXG00000014408	ENSPTXG00000014409	ENTPD8 (ENSPTXG00000014410)	NSMF (ENSPTXG00000014411)	PNPLA7 (ENSPTXG00000015022)	MRPL41 (ENSPTXG00000015028)	ENSPTXG00000015029	ENSPTXG00000015032	ZMYND19 (ENSPTXG00000015033)
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	6989															ENSLLTG00000013659 #21	HSPA5 (ENSLLTG00000013661) #22	RABEPK (ENSLLTG00000013666) #23	PPP6C (ENSLLTG00000013671)
Indian cobra	MODERN SPECIES	8	ENSNNAG00000007215	ENSNNAG00000007126	ENSNNAG00000007088	GPSM1 (ENSNNAG00000007076)	DNLZ (ENSNNAG00000007063)	ENSNNAG00000007047	ANGPTL2 (ENSNNAG00000007034)	RALGPS1 (ENSNNAG00000006975)	ZBTB34 (ENSNNAG00000006958)	ZBTB43 (ENSNNAG00000006950)	LMX1B (ENSNNAG00000006928)	MVB12B (ENSNNAG00000006891)	PBX3 (ENSNNAG00000006018)	MAPKAP1 (ENSNNAG00000005867) #20	GAPVD1 (ENSNNAG00000005692) #21	HSPA5 (ENSNNAG00000005648) #22	RABEPK (ENSNNAG00000005626) #23	PPP6C (ENSNNAG00000005608)	ARPC5L (ENSNNAG00000005591)	GOLGA1 (ENSNNAG00000005563)	RPL35 (ENSNNAG00000005546)	TOR4A (ENSNNAG00000005542)	ENSNNAG00000005440	ENSNNAG00000005422	ENTPD8 (ENSNNAG00000005398)	NSMF (ENSNNAG00000005375)	MRPL41 (ENSNNAG00000005369)	DPH7 (ENSNNAG00000005350)	ZMYND19 (ENSNNAG00000005332)	ENSNNAG00000005304	RPL12 (ENSNNAG00000005250)
tuatara	MODERN SPECIES	1584	GARNL3 (ENSSPUG00000018869)	ENSSPUG00000018887	SLC2A8 (ENSSPUG00000018892)	FBXW2 (ENSSPUG00000018902) #24	ENSSPUG00000018903	RALGPS1 (ENSSPUG00000018920)	ENSSPUG00000000045	ENSSPUG00000000069	ZBTB34 (ENSSPUG00000000090)	ZBTB43 (ENSSPUG00000000096)	LMX1B (ENSSPUG00000000105)	MVB12B (ENSSPUG00000000134)	ENSSPUG00000000150 #19	MAPKAP1 (ENSSPUG00000000219) #20	GAPVD1 (ENSSPUG00000000434) #21	HSPA5 (ENSSPUG00000000728) #22	RABEPK (ENSSPUG00000000743) #23	PPP6C (ENSSPUG00000000751)	ENSSPUG00000000777	GOLGA1 (ENSSPUG00000000796)	SCAI (ENSSPUG00000000807)	RPL35 (ENSSPUG00000000827)	OLFML2A (ENSSPUG00000000841)	NR6A1 (ENSSPUG00000000892)	NR5A1 (ENSSPUG00000001092)	ENSSPUG00000001139	NEK6 (ENSSPUG00000001201)	LHX2 (ENSSPUG00000001214)	ENSSPUG00000001235	ENSSPUG00000001269	STRBP (ENSSPUG00000001279)
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000158795	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00530000064359.b.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00940000164541	ENSGT00940000160293	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	25		ENSGT00940000159362	ENSGT00940000158795	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00530000064359.b.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Aves	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000158795	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00530000064359.b.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00940000164541	ENSGT00960000189464	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000158795	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00530000064359.b.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00940000164541	ENSGT00960000189464	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000158795	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00530000064359.b.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00940000164541	ENSGT00960000189464	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000159362	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00530000064359.b.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00940000164541	ENSGT00960000189464	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Great tit	MODERN SPECIES	7	ENSPMJG00000019141	ENSPMJG00000019142	GARNL3 (ENSPMJG00000019144)	FBXW2 (ENSPMJG00000019145) #24	ENSPMJG00000019146	RALGPS1 (ENSPMJG00000019147)	ANGPTL2 (ENSPMJG00000019148)	ZBTB34 (ENSPMJG00000019149)	ZBTB43 (ENSPMJG00000019150)	LMX1B (ENSPMJG00000019151)	MVB12B (ENSPMJG00000019152)	ENSPMJG00000019159 #19	MAPKAP1 (ENSPMJG00000019160) #20	ENSPMJG00000019161	GAPVD1 (ENSPMJG00000019162) #21	HSPA5 (ENSPMJG00000019163) #22	RABEPK (ENSPMJG00000019164) #23	PPP6C (ENSPMJG00000019165)	ARPC5L (ENSPMJG00000019166)	GOLGA1 (ENSPMJG00000019167)	SCAI (ENSPMJG00000019168)	RPL35 (ENSPMJG00000019169)	OLFML2A (ENSPMJG00000019170)	NR6A1 (ENSPMJG00000019171)	NR5A1 (ENSPMJG00000019173)	ADGRD2 (ENSPMJG00000019174)	PSMB7 (ENSPMJG00000019175)	NEK6 (ENSPMJG00000019176)	LHX2 (ENSPMJG00000019177)	DENND1A (ENSPMJG00000000071)	CRB2 (ENSPMJG00000000171)
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Flycatcher	MODERN SPECIES	7	ENSFALG00000002225	FBXW2 (ENSFALG00000025720) #24	ANGPTL2 (ENSFALG00000002223)	RALGPS1 (ENSFALG00000002222)	ZBTB34 (ENSFALG00000014348)	ENSFALG00000023922	ENSFALG00000024520	LMX1B (ENSFALG00000002218)	ENSFALG00000025301	MVB12B (ENSFALG00000026898)	ENSFALG00000026683	ENSFALG00000026270	ENSFALG00000027110	MAPKAP1 (ENSFALG00000002187) #20	GAPVD1 (ENSFALG00000002186) #21	HSPA5 (ENSFALG00000002179) #22	RABEPK (ENSFALG00000002185) #23	PPP6C (ENSFALG00000002174)	ARPC5L (ENSFALG00000002171)	ENSFALG00000002170	SCAI (ENSFALG00000002169)	RPL35 (ENSFALG00000002168)	OLFML2A (ENSFALG00000002145)	NR6A1 (ENSFALG00000002133)	NR5A1 (ENSFALG00000002130)	ADGRD2 (ENSFALG00000002127)	PSMB7 (ENSFALG00000002108)	NEK6 (ENSFALG00000002081)	LHX2 (ENSFALG00000023364)	DENND1A (ENSFALG00000002050)	CRB2 (ENSFALG00000002040)
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000159362	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00530000064359.b.b	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00940000164541	ENSGT00960000189464	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Medium ground finch	MODERN SPECIES	32				GARNL3 (ENSGFOG00000001984)	FBXW2 (ENSGFOG00000002169) #24	ENSGFOG00000002179	RALGPS1 (ENSGFOG00000002187)	ANGPTL2 (ENSGFOG00000002199)	ZBTB34 (ENSGFOG00000002204)	ENSGFOG00000002208	ENSGFOG00000002214	MVB12B (ENSGFOG00000002222)	PBX3 (ENSGFOG00000002240)	MAPKAP1 (ENSGFOG00000002317) #20	GAPVD1 (ENSGFOG00000002401) #21	HSPA5 (ENSGFOG00000002477) #22	PPP6C (ENSGFOG00000002540)	ARPC5L (ENSGFOG00000002550)	GOLGA1 (ENSGFOG00000002568)	SCAI (ENSGFOG00000002633)	RPL35 (ENSGFOG00000003076)	OLFML2A (ENSGFOG00000003090)	NR5A1 (ENSGFOG00000003120)	NR6A1 (ENSGFOG00000003136)	ENSGFOG00000003161	ADGRD2 (ENSGFOG00000003184)	PSMB7 (ENSGFOG00000003237)	NEK6 (ENSGFOG00000003257)	LHX2 (ENSGFOG00000003318)	DENND1A (ENSGFOG00000003357)	CRB2 (ENSGFOG00000003494)
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	21		ENSGT00940000159362	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00530000064359.b.b	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000164541	ENSGT00960000189464	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Zebra finch	MODERN SPECIES	8					GARNL3 (ENSTGUG00000007497)	FBXW2 (ENSTGUG00000007484) #24	ANGPTL2 (ENSTGUG00000007478)	ENSTGUG00000007428	ZBTB34 (ENSTGUG00000007424)	ZBTB43 (ENSTGUG00000019980)	LMX1B (ENSTGUG00000007409)	MVB12B (ENSTGUG00000026555)	ENSTGUG00000007364 #19	MAPKAP1 (ENSTGUG00000007326) #20	GAPVD1 (ENSTGUG00000007305) #21	HSPA5 (ENSTGUG00000007279) #22	RABEPK (ENSTGUG00000007274) #23	PPP6C (ENSTGUG00000007259)	ARPC5L (ENSTGUG00000026340)	GOLGA1 (ENSTGUG00000007238)	SCAI (ENSTGUG00000007202)	RPL35 (ENSTGUG00000007196)	OLFML2A (ENSTGUG00000007193)	NR6A1 (ENSTGUG00000020793)	NR5A1 (ENSTGUG00000007170)	ADGRD2 (ENSTGUG00000007153)	PSMB7 (ENSTGUG00000007119)	NEK6 (ENSTGUG00000007095)	LHX2 (ENSTGUG00000028408)	DENND1A (ENSTGUG00000007024)	CRB2 (ENSTGUG00000007009)
Common canary	MODERN SPECIES	22			GARNL3 (ENSSCAG00000015938)	FBXW2 (ENSSCAG00000015943) #24	ENSSCAG00000015945	RALGPS1 (ENSSCAG00000015948)	ANGPTL2 (ENSSCAG00000015955)	ZBTB34 (ENSSCAG00000015957)	ZBTB43 (ENSSCAG00000015958)	LMX1B (ENSSCAG00000015960)	MVB12B (ENSSCAG00000015964)	ENSSCAG00000015967	ENSSCAG00000015970	MAPKAP1 (ENSSCAG00000015971) #20	GAPVD1 (ENSSCAG00000016008) #21	HSPA5 (ENSSCAG00000016115) #22	PPP6C (ENSSCAG00000016119)	RABEPK (ENSSCAG00000016120) #23	ARPC5L (ENSSCAG00000016122)	GOLGA1 (ENSSCAG00000016125)	SCAI (ENSSCAG00000016132)	RPL35 (ENSSCAG00000016137)	OLFML2A (ENSSCAG00000016141)	NR6A1 (ENSSCAG00000016146)	NR5A1 (ENSSCAG00000016149)	ADGRD2 (ENSSCAG00000016150)	PSMB7 (ENSSCAG00000016152)	NEK6 (ENSSCAG00000016156)	LHX2 (ENSSCAG00000016158)	DENND1A (ENSSCAG00000016165)	CRB2 (ENSSCAG00000016174)
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	25			ENSGT00940000159362	ENSGT00940000158795	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00530000064359.b.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Kakapo	MODERN SPECIES	9	GFI1B (ENSSHBG00005014198)	GARNL3 (ENSSHBG00005014166)	SLC2A8 (ENSSHBG00005014129)	FBXW2 (ENSSHBG00005014071) #24	ENSSHBG00005014060	ENSSHBG00005014052	ANGPTL2 (ENSSHBG00005014043)	RALGPS1 (ENSSHBG00005014025)	ZBTB34 (ENSSHBG00005013999)	ZBTB43 (ENSSHBG00005013981)	LMX1B (ENSSHBG00005013967)	MVB12B (ENSSHBG00005013946)	ENSSHBG00005013923 #19	MAPKAP1 (ENSSHBG00005013878) #20	GAPVD1 (ENSSHBG00005013815) #21	HSPA5 (ENSSHBG00005013782) #22	RABEPK (ENSSHBG00005013762) #23	PPP6C (ENSSHBG00005013749)	ARPC5L (ENSSHBG00005013738)	GOLGA1 (ENSSHBG00005013725)	SCAI (ENSSHBG00005013683)	RPL35 (ENSSHBG00005013653)	OLFML2A (ENSSHBG00005013635)	NR6A1 (ENSSHBG00005013599)	NR5A1 (ENSSHBG00005013567)	ADGRD2 (ENSSHBG00005013538)	PSMB7 (ENSSHBG00005013508)	NEK6 (ENSSHBG00005013489)	LHX2 (ENSSHBG00005013472)	ENSSHBG00005013441	ENSSHBG00005013419
Golden eagle	MODERN SPECIES	16			GARNL3 (ENSACCG00020011136)	SLC2A8 (ENSACCG00020016657)	FBXW2 (ENSACCG00020016653) #24	ENSACCG00020016649	ANGPTL2 (ENSACCG00020016645)	RALGPS1 (ENSACCG00020016635)	ZBTB34 (ENSACCG00020016626)	ZBTB43 (ENSACCG00020016621)	LMX1B (ENSACCG00020016620)	MVB12B (ENSACCG00020016611)	ENSACCG00020016602 #19	MAPKAP1 (ENSACCG00020016596) #20	GAPVD1 (ENSACCG00020016504) #21	HSPA5 (ENSACCG00020016447) #22	RABEPK (ENSACCG00020016384) #23	PPP6C (ENSACCG00020016300)	ARPC5L (ENSACCG00020016251)	GOLGA1 (ENSACCG00020015908)	SCAI (ENSACCG00020015805)	RPL35 (ENSACCG00020015720)	OLFML2A (ENSACCG00020015705)	NR6A1 (ENSACCG00020015466)	NR5A1 (ENSACCG00020015352)	ADGRD2 (ENSACCG00020015309)	PSMB7 (ENSACCG00020015286)	NEK6 (ENSACCG00020015262)	LHX2 (ENSACCG00020015247)	DENND1A (ENSACCG00020015213)	CRB2 (ENSACCG00020015097)
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000158795	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00530000064359.b.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00940000164541	ENSGT00960000189464	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	13			ENSGT00940000159362	ENSGT00940000158795	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00530000064359.b.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Duck	MODERN SPECIES	8					SLC2A8 (ENSAPLG00000012226)	FBXW2 (ENSAPLG00000012104) #24	ANGPTL2 (ENSAPLG00000012077)	RALGPS1 (ENSAPLG00000011266)	ZBTB34 (ENSAPLG00000021289)	ZBTB43 (ENSAPLG00000001308)	ENSAPLG00000011082	MVB12B (ENSAPLG00000002612)	ENSAPLG00000002733	MAPKAP1 (ENSAPLG00000002845) #20	GAPVD1 (ENSAPLG00000003016) #21	HSPA5 (ENSAPLG00000003208) #22	RABEPK (ENSAPLG00000003608) #23	PPP6C (ENSAPLG00000031249)	GOLGA1 (ENSAPLG00000003658)	SCAI (ENSAPLG00000003982)	NR6A1 (ENSAPLG00000026220)	NR5A1 (ENSAPLG00000018502)	ENSAPLG00000004790	PSMB7 (ENSAPLG00000004904)	NEK6 (ENSAPLG00000005036)	LHX2 (ENSAPLG00000005909)	DENND1A (ENSAPLG00000005294)	CRB2 (ENSAPLG00000006162)	STRBP (ENSAPLG00000006350)	RABGAP1 (ENSAPLG00000006937)	ZBTB26 (ENSAPLG00000001864)
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	8	GARNL3 (ENSABRG00000000396)	ENSABRG00000000354	FBXW2 (ENSABRG00000022448) #24	ENSABRG00000022447	ENSABRG00000022446	ANGPTL2 (ENSABRG00000022444)	RALGPS1 (ENSABRG00000022438)	ZBTB34 (ENSABRG00000022436)	ZBTB43 (ENSABRG00000022434)	LMX1B (ENSABRG00000022430)	MVB12B (ENSABRG00000022417)	ENSABRG00000022413	PBX3 (ENSABRG00000022401)	MAPKAP1 (ENSABRG00000022393) #20	GAPVD1 (ENSABRG00000022390) #21	HSPA5 (ENSABRG00000022376) #22	RABEPK (ENSABRG00000022375) #23	PPP6C (ENSABRG00000022374)	ARPC5L (ENSABRG00000022373)	GOLGA1 (ENSABRG00000022369)	SCAI (ENSABRG00000022367)	RPL35 (ENSABRG00000022365)	OLFML2A (ENSABRG00000022363)	NR6A1 (ENSABRG00000022362)	NR5A1 (ENSABRG00000022360)	ADGRD2 (ENSABRG00000022355)	PSMB7 (ENSABRG00000022352)	ENSABRG00000022351	NEK6 (ENSABRG00000022347)	LHX2 (ENSABRG00000022343)	DENND1A (ENSABRG00000022342)
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000158795	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00530000064359.b.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00940000164541	ENSGT00960000189464	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Japanese quail	MODERN SPECIES	8				GARNL3 (ENSCJPG00005011091)	SLC2A8 (ENSCJPG00005011090)	FBXW2 (ENSCJPG00005011089) #24	ANGPTL2 (ENSCJPG00005011088)	RALGPS1 (ENSCJPG00005011086)	ZBTB34 (ENSCJPG00005011085)	ZBTB43 (ENSCJPG00005011084)	LMX1B (ENSCJPG00005011083)	MVB12B (ENSCJPG00005011076)	PBX3 (ENSCJPG00005011074)	MAPKAP1 (ENSCJPG00005011073) #20	GAPVD1 (ENSCJPG00005011072) #21	HSPA5 (ENSCJPG00005011068) #22	RABEPK (ENSCJPG00005011067) #23	ARPC5L (ENSCJPG00005011066)	GOLGA1 (ENSCJPG00005010935)	SCAI (ENSCJPG00005010894)	RPL35 (ENSCJPG00005010891)	OLFML2A (ENSCJPG00005010890)	NR6A1 (ENSCJPG00005010887)	ENSCJPG00005010886	NR5A1 (ENSCJPG00005010885)	ADGRD2 (ENSCJPG00005010881)	PSMB7 (ENSCJPG00005010878)	NEK6 (ENSCJPG00005010876)	LHX2 (ENSCJPG00005010873)	DENND1A (ENSCJPG00005010867)	CRB2 (ENSCJPG00005010866)
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000159362	ENSGT00940000158795	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00530000064359.b.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000164541	ENSGT00960000189464	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Chicken	MODERN SPECIES	8			GARNL3 (ENSGALG00010028739)	SLC2A8 (ENSGALG00010028726)	FBXW2 (ENSGALG00010028712) #24	ANGPTL2 (ENSGALG00010028700)	RALGPS1 (ENSGALG00010028692)	ZBTB43 (ENSGALG00010028675)	ZBTB34 (ENSGALG00010028669)	LMX1B (ENSGALG00010028911)	ENSGALG00010028910	MVB12B (ENSGALG00010027775)	PBX3 (ENSGALG00010027414) #19	MAPKAP1 (ENSGALG00010027399) #20	GAPVD1 (ENSGALG00010027973) #21	HSPA5 (ENSGALG00010027969) #22	RABEPK (ENSGALG00010027964) #23	PPP6C (ENSGALG00010027960)	ARPC5L (ENSGALG00010028106)	GOLGA1 (ENSGALG00010028104)	SCAI (ENSGALG00010027752)	RPL35 (ENSGALG00010027733)	OLFML2A (ENSGALG00010027731)	NR6A1 (ENSGALG00010028917)	NR5A1 (ENSGALG00010028916)	ADGRD2 (ENSGALG00010028915)	PSMB7 (ENSGALG00010028440)	NEK6 (ENSGALG00010029146)	LHX2 (ENSGALG00010028411)	DENND1A (ENSGALG00010028346)	CRB2 (ENSGALG00010028326)
Turkey	MODERN SPECIES	10	ENSMGAG00000008765	ENSMGAG00000008730	ENSMGAG00000008714 #24	ENSMGAG00000008708	ENSMGAG00000018416	ANGPTL2 (ENSMGAG00000008700)	RALGPS1 (ENSMGAG00000008636)	ZBTB34 (ENSMGAG00000015784)	ZBTB43 (ENSMGAG00000008586)	ENSMGAG00000008601	MVB12B (ENSMGAG00000008589)	ENSMGAG00000008578	ENSMGAG00000019543	MAPKAP1 (ENSMGAG00000008552) #20	GAPVD1 (ENSMGAG00000008525) #21	HSPA5 (ENSMGAG00000008510) #22	RABEPK (ENSMGAG00000008507) #23	PPP6C (ENSMGAG00000008483)	ARPC5L (ENSMGAG00000008479)	ENSMGAG00000008417	SCAI (ENSMGAG00000008380)	RPL35 (ENSMGAG00000008366)	OLFML2A (ENSMGAG00000008339)	NR6A1 (ENSMGAG00000019523)	NR5A1 (ENSMGAG00000008342)	ADGRD2 (ENSMGAG00000008260)	PSMB7 (ENSMGAG00000008256)	NEK6 (ENSMGAG00000008220)	LHX2 (ENSMGAG00000008202)	DENND1A (ENSMGAG00000008024)	CRB2 (ENSMGAG00000008169)
African ostrich	MODERN SPECIES	705									ENSSCUG00000015630	MVB12B (ENSSCUG00000015624)	ENSSCUG00000015620	ENSSCUG00000015613	ENSSCUG00000015612	MAPKAP1 (ENSSCUG00000015609) #20	GAPVD1 (ENSSCUG00000015598) #21	HSPA5 (ENSSCUG00000015593) #22	PPP6C (ENSSCUG00000015588)	ARPC5L (ENSSCUG00000015585)	GOLGA1 (ENSSCUG00000015579)	SCAI (ENSSCUG00000015575)	RPL35 (ENSSCUG00000015573)	ENSSCUG00000015571	NR6A1 (ENSSCUG00000015566)
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	44		GARNL3 (ENSCPRG00005010959)	SLC2A8 (ENSCPRG00005010936)	FBXW2 (ENSCPRG00005010933) #24	ENSCPRG00005010928	ENSCPRG00005010926	ANGPTL2 (ENSCPRG00005010924)	RALGPS1 (ENSCPRG00005010911)	ZBTB34 (ENSCPRG00005010908)	ZBTB43 (ENSCPRG00005010904)	LMX1B (ENSCPRG00005010898)	MVB12B (ENSCPRG00005010892)	ENSCPRG00005010889 #19	MAPKAP1 (ENSCPRG00005010883) #20	GAPVD1 (ENSCPRG00005010870) #21	HSPA5 (ENSCPRG00005010864) #22	RABEPK (ENSCPRG00005010858) #23	PPP6C (ENSCPRG00005010855)	ARPC5L (ENSCPRG00005010854)	GOLGA1 (ENSCPRG00005010842)	SCAI (ENSCPRG00005010819)	RPL35 (ENSCPRG00005010810)	ENSCPRG00005010804	OLFML2A (ENSCPRG00005010769)	NR6A1 (ENSCPRG00005010754)	NR5A1 (ENSCPRG00005010753)	ADGRD2 (ENSCPRG00005010747)	PSMB7 (ENSCPRG00005010746)	NEK6 (ENSCPRG00005010741)	LHX2 (ENSCPRG00005010736)	DENND1A (ENSCPRG00005010705)
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000158795	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00530000064359.b.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00940000164541	ENSGT00940000160293	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000158795	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00530000064359.b.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00940000164541	ENSGT00940000160293	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763.s #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	29		ENSGT00940000159362	ENSGT00940000158795	ENSGT00930000151016 #24	ENSGT00530000064359.b.b	ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000163762.b #19	ENSGT00940000164541	ENSGT00940000160293	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763.s #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	113		ENSTMTG00000016857	GARNL3 (ENSTMTG00000016707)	SLC2A8 (ENSTMTG00000016674)	FBXW2 (ENSTMTG00000016659) #24	ENSTMTG00000016645	ANGPTL2 (ENSTMTG00000016622)	RALGPS1 (ENSTMTG00000016587)	ZBTB43 (ENSTMTG00000016578)	LMX1B (ENSTMTG00000016552)	MVB12B (ENSTMTG00000016531)	ENSTMTG00000016513	ENSTMTG00000016522	MAPKAP1 (ENSTMTG00000016484) #20	GAPVD1 (ENSTMTG00000016435) #21	HSPA5 (ENSTMTG00000016414) #22	ENSTMTG00000016384 #23	PPP6C (ENSTMTG00000016358)	ARPC5L (ENSTMTG00000016343)	GOLGA1 (ENSTMTG00000016257)	SCAI (ENSTMTG00000016173)	RPL35 (ENSTMTG00000016153)	OLFML2A (ENSTMTG00000016138)	NR6A1 (ENSTMTG00000016050)	NR5A1 (ENSTMTG00000016018)	ADGRD2 (ENSTMTG00000015979)	PSMB7 (ENSTMTG00000015950)	NEK6 (ENSTMTG00000015931)	LHX2 (ENSTMTG00000015920)	DENND1A (ENSTMTG00000015853)	CRB2 (ENSTMTG00000015799)
painted turtle	MODERN SPECIES	795						GARNL3 (ENSCPBG00000000314)	FBXW2 (ENSCPBG00000000281) #24	ANGPTL2 (ENSCPBG00000000267)	SLC2A8 (ENSCPBG00000000178)	ZBTB43 (ENSCPBG00000028198)	LMX1B (ENSCPBG00000028196)	MVB12B (ENSCPBG00000028192)	ENSCPBG00000028190 #19	MAPKAP1 (ENSCPBG00000028189) #20	GAPVD1 (ENSCPBG00000028164) #21	HSPA5 (ENSCPBG00000028151) #22	RABEPK (ENSCPBG00000028149) #23	PPP6C (ENSCPBG00000028147)	ARPC5L (ENSCPBG00000028146)	GOLGA1 (ENSCPBG00000028142)	SCAI (ENSCPBG00000028138)	RPL35 (ENSCPBG00000028135)	OLFML2A (ENSCPBG00000028134)	NR6A1 (ENSCPBG00000028130)	NR5A1 (ENSCPBG00000028128)	ADGRD2 (ENSCPBG00000028123)	ENSCPBG00000028118	PSMB7 (ENSCPBG00000028116)	NEK6 (ENSCPBG00000028115)	LHX2 (ENSCPBG00000028111)
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	29							ENSGT00940000155946	ENSGT00940000154079.b	ENSGT00940000159944	ENSGT00940000160616	ENSGT00940000157955	ENSGT00940000155945	ENSGT00940000154374.a	ENSGT00390000000642 #20	ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763.s #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00940000158501	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00390000009566	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261	ENSGT00950000183101.a.b.b
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	2600														ENSCABG00000000325 #20	GAPVD1 (ENSCABG00000000349) #21	HSPA5 (ENSCABG00000000399) #22	RABEPK (ENSCABG00000000406) #23	PPP6C (ENSCABG00000000418)	ARPC5L (ENSCABG00000000431)	GOLGA1 (ENSCABG00000000473)	SCAI (ENSCABG00000000867)	RPL35 (ENSCABG00000000871)	OLFML2A (ENSCABG00000000874)	NR6A1 (ENSCABG00000000881)	NR5A1 (ENSCABG00000000895)	ADGRD2 (ENSCABG00000000904)	PSMB7 (ENSCABG00000000915)	NEK6 (ENSCABG00000000924)	LHX2 (ENSCABG00000000963)	DENND1A (ENSCABG00000001004)	CRB2 (ENSCABG00000001608)
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	7		ENSGEVG00005007194	FBXW2 (ENSGEVG00005007185) #24	SLC2A8 (ENSGEVG00005007151)	GARNL3 (ENSGEVG00005006931)	ENSGEVG00005006879	ANGPTL2 (ENSGEVG00005006839)	RALGPS1 (ENSGEVG00005006800)	ZBTB34 (ENSGEVG00005006778)	ZBTB43 (ENSGEVG00005006768)	LMX1B (ENSGEVG00005006741)	MVB12B (ENSGEVG00005006718)	PBX3 (ENSGEVG00005006698)	MAPKAP1 (ENSGEVG00005006657) #20	GAPVD1 (ENSGEVG00005006592) #21	HSPA5 (ENSGEVG00005006550) #22	RABEPK (ENSGEVG00005006525) #23	PPP6C (ENSGEVG00005006512)	ARPC5L (ENSGEVG00005006487)	GOLGA1 (ENSGEVG00005006470)	SCAI (ENSGEVG00005006414)	RPL35 (ENSGEVG00005006381)	OLFML2A (ENSGEVG00005006363)	NR6A1 (ENSGEVG00005006341)	NR5A1 (ENSGEVG00005006277)	ADGRD2 (ENSGEVG00005006212)	PSMB7 (ENSGEVG00005006184)	NEK6 (ENSGEVG00005006167)	LHX2 (ENSGEVG00005006137)	DENND1A (ENSGEVG00005006000)	CRB2 (ENSGEVG00005005877)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	402															GAPVD1 (ENSPSIG00000005277) #21	HSPA5 (ENSPSIG00000005450) #22	RABEPK (ENSPSIG00000006852) #23	PPP6C (ENSPSIG00000006980)	ARPC5L (ENSPSIG00000007105)	GOLGA1 (ENSPSIG00000007344)	SCAI (ENSPSIG00000007803)	RPL35 (ENSPSIG00000008208)	OLFML2A (ENSPSIG00000008227)
Anura	ANCESTRAL SPECIES	127															ENSGT00940000156611 #21	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540	ENSGT00940000156261.a	ENSGT00950000183101.a.b.b
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	12	ENSLLEG00000022841	ENSLLEG00000022892	ENSLLEG00000022957	ENSLLEG00000023082	ENSLLEG00000023106	ENSLLEG00000023128	ENSLLEG00000023140	ENSLLEG00000023191	ENSLLEG00000023238	MAPKAP1 (ENSLLEG00000023285) #20	ENSLLEG00000023628	MVB12B (ENSLLEG00000023667)	ENSLLEG00000023896	GAPVD1 (ENSLLEG00000023990) #21	ENSLLEG00000024453	HSPA5 (ENSLLEG00000024531) #22	RABEPK (ENSLLEG00000025333) #23	SCAI (ENSLLEG00000025446)	ENSLLEG00000025593	ENSLLEG00000026111	ENSLLEG00000026171	ENSLLEG00000026185	ENSLLEG00000026207	RPL35 (ENSLLEG00000026232)	ARHGAP4 (ENSLLEG00000026304)	CAV3 (ENSLLEG00000026712)	ENSLLEG00000026754	AVPR2 (ENSLLEG00000026789)	L1CAM (ENSLLEG00000026877)	ENSLLEG00000027672	PDZD4 (ENSLLEG00000027705)
Frog	MODERN SPECIES	8	ENSXETG00000045758	ssr4 (ENSXETG00000000730)	idh3g (ENSXETG00000000731)	ENSXETG00000044761	srpk2 (ENSXETG00000000735)	ENSXETG00000041507	lmx1b.1 (ENSXETG00000000742)	cdc42ep4 (ENSXETG00000000745)	pbx3 (ENSXETG00000000502)	mapkap1 (ENSXETG00000000505) #20	ENSXETG00000049090	ENSXETG00000043470	gapvd1 (ENSXETG00000005493) #21	scai (ENSXETG00000016827)	ppp6c (ENSXETG00000016831)	hspa5 (ENSXETG00000016838) #22	rabepk (ENSXETG00000016839) #23	golga1 (ENSXETG00000016840)	arpc5l (ENSXETG00000044845)	rpl35 (ENSXETG00000016843)	wdr38 (ENSXETG00000016844)	olfml2a (ENSXETG00000008581)	nr6a1 (ENSXETG00000008578)	ENSXETG00000044240	nr5a1 (ENSXETG00000011456)	ENSXETG00000042998	adgrd2 (ENSXETG00000011460)	kif14l (ENSXETG00000011461)	psmb7 (ENSXETG00000042236)	ereg (ENSXETG00000011464)	lhx2 (ENSXETG00000020776)
Coelacanth	MODERN SPECIES	233	ENSLACG00000008495	SSR3 (ENSLACG00000010812)	TIPARP (ENSLACG00000011215)	LEKR1 (ENSLACG00000012224)	CCNL1 (ENSLACG00000013133)	VEPH1 (ENSLACG00000013468)	ANGPTL2 (ENSLACG00000014379)	ZBTB34 (ENSLACG00000015537)	ZBTB43 (ENSLACG00000015621)	LMX1B (ENSLACG00000016220)	MVB12B (ENSLACG00000016934)	ENSLACG00000017783	ENSLACG00000017961	MAPKAP1 (ENSLACG00000017973) #20	GAPVD1 (ENSLACG00000018166) #21	HSPA5 (ENSLACG00000018251) #22	RABEPK (ENSLACG00000018266) #23	PPP6C (ENSLACG00000018277)	SCAI (ENSLACG00000018318)	ENSLACG00000018347	GOLGA1 (ENSLACG00000018351)	ARPC5L (ENSLACG00000018386)	RPL35 (ENSLACG00000018394)	ENSLACG00000018402	olfml2a (ENSLACG00000018514)	NR6A1 (ENSLACG00000018630)	NR5A1 (ENSLACG00000018683)	ADGRD2 (ENSLACG00000018696)	ENSLACG00000018734	PSMB7 (ENSLACG00000018747)	NEK6 (ENSLACG00000018764)
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	267											ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000014634	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000166116	ENSGT00940000172233	ENSGT00940000157194
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	180										ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084	ENSGT00970000198035	ENSGT00940000155214	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000014634	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00550000074961	ENSGT00390000009566	ENSGT00940000153772.B	ENSGT00940000158501	ENSGT00390000016384	ENSGT00940000166116	ENSGT00940000172233	ENSGT00940000157194	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000153391.c.b.a	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000157419	ENSGT00940000159990	ENSGT00940000158540
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	153	ENSGT00940000153838.a	ENSGT00940000153596.B	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.l	ENSGT00390000013502.a.b	ENSGT00970000198035	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000014634	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.d	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT01010000222537	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00960000189961	ENSGT00940000159734
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00390000000223	ENSGT00940000155591.i.j #35	ENSGT00940000155178.b.b #33	ENSGT00940000153838.a.k	ENSGT00940000153596.B	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123.e.b	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a.y	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000014634	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.d	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a.g	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B.w	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b.a	ENSGT00940000158084.i	ENSGT01010000222537.a	ENSGT00940000158325.a	ENSGT00940000154667.a.b	ENSGT00940000160316.h	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000153253.b.b
P. kingsleyae	DUPLICATION
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Asian bonytongue	DUPLICATION
Asian bonytongue	DUPLICATION
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Asian bonytongue	MODERN SPECIES	8	ENSSFOG00015012899	gsnb (ENSSFOG00015012814) #35	rab14 (ENSSFOG00015012785) #33	ENSSFOG00015012729 #32	ENSSFOG00015012700 #32	ENSSFOG00015012633 #31	ENSSFOG00015025154 #31	ENSSFOG00015027654	ABL1 (ENSSFOG00015012538)	prdm12b (ENSSFOG00015012512)	FUBP3 (ENSSFOG00015012455)	surf4 (ENSSFOG00015012422)	ciz1b (ENSSFOG00015031556)	DNM1 (ENSSFOG00015031887)	ENSSFOG00015029187	hspa5 (ENSSFOG00015026251) #22	RGS3 (ENSSFOG00015012245)	ZNF618 (ENSSFOG00015025054)	pappab (ENSSFOG00015012182)	ASTN2 (ENSSFOG00015012129)	MYL4 (ENSSFOG00015012111)	BRINP1 (ENSSFOG00015012094)	ENSSFOG00015030010	ENSSFOG00015012063	AK1 (ENSSFOG00015012009)	gpsm1b (ENSSFOG00015011934)	QSOX2 (ENSSFOG00015032781)	LHX3 (ENSSFOG00015031865)	TMEM250 (ENSSFOG00015011708)	NACC2 (ENSSFOG00015011694)	ENSSFOG00015011543
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Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00550000075100	ENSGT00940000155178 #33	ENSGT00940000155434 #32	ENSGT00940000153838.a	ENSGT00940000153596.B	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123.g	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000014634	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00940000160949	ENSGT00390000003140.B	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Atlantic herring	DUPLICATION
Atlantic herring	MODERN SPECIES	3	MAP1B (ENSCHAG00000010761)	ptcd2 (ENSCHAG00000010756)	TNPO1 (ENSCHAG00000010519)	fcho2 (ENSCHAG00000008505)	TMEM174 (ENSCHAG00000008427)	foxd1 (ENSCHAG00000008410)	btf3 (ENSCHAG00000008388)	ankra2 (ENSCHAG00000008294)	ENSCHAG00000008245	ENC1 (ENSCHAG00000008231)	bbln (ENSCHAG00000008217)	ENSCHAG00000008202	dnm1a (ENSCHAG00000007239)	golga2 (ENSCHAG00000006912)	HSPA5 (ENSCHAG00000006720) #22	hspa5 (ENSCHAG00000006471) #22	rabepk (ENSCHAG00000006430) #23	ENSCHAG00000006417	rgs3a (ENSCHAG00000006335)	znf618 (ENSCHAG00000006313)	pappaa (ENSCHAG00000006243)	trim32 (ENSCHAG00000006233)	ENSCHAG00000006165	ENSCHAG00000006139	ASTN2 (ENSCHAG00000005594)	MYL4 (ENSCHAG00000005544)	brinp1 (ENSCHAG00000005514)	ENSCHAG00000005491	ak1 (ENSCHAG00000005454)	gpsm1b (ENSCHAG00000004790)	LHX3 (ENSCHAG00000004705)
Atlantic herring	MODERN SPECIES	3	ptger4b (ENSCHAG00000010791)	MAP1B (ENSCHAG00000010761)	ptcd2 (ENSCHAG00000010756)	TNPO1 (ENSCHAG00000010519)	fcho2 (ENSCHAG00000008505)	TMEM174 (ENSCHAG00000008427)	foxd1 (ENSCHAG00000008410)	btf3 (ENSCHAG00000008388)	ankra2 (ENSCHAG00000008294)	ENSCHAG00000008245	ENC1 (ENSCHAG00000008231)	bbln (ENSCHAG00000008217)	ENSCHAG00000008202	dnm1a (ENSCHAG00000007239)	golga2 (ENSCHAG00000006912)	HSPA5 (ENSCHAG00000006720) #22	hspa5 (ENSCHAG00000006471) #22	rabepk (ENSCHAG00000006430) #23	ENSCHAG00000006417	rgs3a (ENSCHAG00000006335)	znf618 (ENSCHAG00000006313)	pappaa (ENSCHAG00000006243)	trim32 (ENSCHAG00000006233)	ENSCHAG00000006165	ENSCHAG00000006139	ASTN2 (ENSCHAG00000005594)	MYL4 (ENSCHAG00000005544)	brinp1 (ENSCHAG00000005514)	ENSCHAG00000005491	ak1 (ENSCHAG00000005454)	gpsm1b (ENSCHAG00000004790)
Denticle herring	MODERN SPECIES	13	tbx5a (ENSDCDG00000004659)	ddx54 (ENSDCDG00000003941)	ENSDCDG00000003902 #33	ABL1 (ENSDCDG00000003881)	exosc2 (ENSDCDG00000003865)	PRDM12 (ENSDCDG00000003860)	fubp3 (ENSDCDG00000003578)	ASS1 (ENSDCDG00000003503)	surf4 (ENSDCDG00000003364)	surf2 (ENSDCDG00000003328)	bbln (ENSDCDG00000003323)	ENSDCDG00000003313	dnm1a (ENSDCDG00000001817)	golga2 (ENSDCDG00000001706)	haus4 (ENSDCDG00000001699)	hspa5 (ENSDCDG00000001153) #22	rabepk (ENSDCDG00000001065) #23	rgs3a (ENSDCDG00000001054)	znf618 (ENSDCDG00000001027)	pappaa (ENSDCDG00000000960)	trim32 (ENSDCDG00000000923)	ASTN2 (ENSDCDG00000000599)	MYL4 (ENSDCDG00000000495)	brinp1 (ENSDCDG00000000485)	ENSDCDG00000000477	ENSDCDG00000000465	ak1 (ENSDCDG00000000446)	gpsm1b (ENSDCDG00000000426)	LHX3 (ENSDCDG00000000402)	TMEM250 (ENSDCDG00000000394)	NACC2 (ENSDCDG00000000387)
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000155826	ENSGT00390000004511.c.a.d	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123.g	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000014634	ENSGT00940000169304	ENSGT00390000017193	ENSGT00970000195658	ENSGT00940000154078.b.a	ENSGT01030000234607.A.a.b.b	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	61	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123.g	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000014634	ENSGT00940000169304	ENSGT00390000017193	ENSGT00970000195658	ENSGT00940000154078.b.a	ENSGT01030000234607.A.a.b.b	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT01010000222537	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	78	ENSGT00390000004511.c.a.d	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123.g	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000014634	ENSGT00940000169304	ENSGT00390000017193	ENSGT00970000195658	ENSGT00940000154078.b.a	ENSGT01030000234607.A.a.b.b	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00940000163149.b.c.b.a	ENSGT01010000222537	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	265				ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123.g	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00390000014634	ENSGT00940000169304	ENSGT00940000154078.b.a	ENSGT01030000234607.A.a.b.b	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	249													ENSAMXG00000030457	ENSAMXG00000008582	YTHDC2 (ENSAMXG00000008735)	hspa5 (ENSAMXG00000009012) #22	rabepk (ENSAMXG00000035559) #23	ENSAMXG00000040695	ENSAMXG00000043170	ENSAMXG00000033207	rgs3a (ENSAMXG00000009082)
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	385											DDRGK1 (ENSPNAG00000026849)	ENSPNAG00000026863	LZTS3 (ENSPNAG00000004140)	FASTKD5 (ENSPNAG00000006011)	ENSPNAG00000004143	hspa5 (ENSPNAG00000006665) #22	rabepk (ENSPNAG00000026966) #23	RGS3 (ENSPNAG00000004780)
Electric eel	MODERN SPECIES	18				TMEM132C (ENSEEEG00000017567)	HIRA (ENSEEEG00000017233)	ENSEEEG00000017227	ENSEEEG00000017226	bbln (ENSEEEG00000017225)	surf2 (ENSEEEG00000017224)	surf4 (ENSEEEG00000017198)	ASS1 (ENSEEEG00000017178)	fubp3 (ENSEEEG00000017174)	PRDM12 (ENSEEEG00000017171)	ENSEEEG00000017170	YTHDC2 (ENSEEEG00000017008)	hspa5 (ENSEEEG00000015869) #22	rabepk (ENSEEEG00000015828) #23	ENSEEEG00000015827	ENSEEEG00000015825	ENSEEEG00000015824	znf618 (ENSEEEG00000015823)	ENSEEEG00000015822	pappaa (ENSEEEG00000015819)	trim32 (ENSEEEG00000015816)	ENSEEEG00000015697	ASTN2 (ENSEEEG00000015673)	MYL4 (ENSEEEG00000015670)	ENSEEEG00000015669	brinp1 (ENSEEEG00000015668)	ENSEEEG00000015651	ENSEEEG00000015650
Channel catfish	MODERN SPECIES	20	LZTS3 (ENSIPUG00000018867)	DDRGK1 (ENSIPUG00000018878)	haus4 (ENSIPUG00000018895)	golga2 (ENSIPUG00000018908)	dnm1 (ENSIPUG00000019107)	ciz1 (ENSIPUG00000019231)	c28h9orf16 (ENSIPUG00000019253)	surf2 (ENSIPUG00000019263)	surf4 (ENSIPUG00000019273)	ass1 (ENSIPUG00000019295)	FUBP3 (ENSIPUG00000019400)	PRDM12 (ENSIPUG00000019544)	ENSIPUG00000019646	ythdc2 (ENSIPUG00000019561)	ENSIPUG00000019662	HSPA5 (ENSIPUG00000019695) #22	rabepk (ENSIPUG00000019667) #23	ENSIPUG00000019710	ENSIPUG00000019725	znf618 (ENSIPUG00000019742)	pappaa (ENSIPUG00000019768)	astn2 (ENSIPUG00000020051)	trim32 (ENSIPUG00000020093)	ENSIPUG00000020104	BRINP1 (ENSIPUG00000020123)	ENSIPUG00000020148	ENSIPUG00000020160	ak1 (ENSIPUG00000020187)	gpsm1b (ENSIPUG00000020211)	lhx3 (ENSIPUG00000020359)	c28h9orf69 (ENSIPUG00000020382)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	16																ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT01100000263525.a.a	ENSGT00940000158557.l	ENSGT01030000234517.E.c	ENSGT00940000157272.h	ENSGT00940000155578.e.a.a.a.a	ENSGT00940000153472.a.b	ENSGT00530000063974.b	ENSGT00530000063404.a.m	ENSGT01030000234606.a.b.p	ENSGT00390000017839	ENSGT00940000156747	ENSGT00940000167280	ENSGT00940000157044	ENSGT00390000001752
Zebrafish	MODERN SPECIES	20	MYO19 (ENSDARG00000073761)	znhit3 (ENSDARG00000023950)	c1qbp (ENSDARG00000039887)	rpain (ENSDARG00000063021)	ENSDARG00000104054	ENSDARG00000089107	ENSDARG00000110111	ENSDARG00000096920	hspb1 (ENSDARG00000041065)	ywhag1 (ENSDARG00000067626)	ENSDARG00000103792	supt4h1 (ENSDARG00000113969)	hsf5 (ENSDARG00000104686)	hpda (ENSDARG00000018351)	LZTS3 (ENSDARG00000098751)	hspa5 (ENSDARG00000103846) #22	rabepk (ENSDARG00000112165) #23	gng10 (ENSDARG00000104043)	RAB35 (ENSDARG00000102078)	CIT (ENSDARG00000089856)	ca4a (ENSDARG00000043589)	GUSB (ENSDARG00000063126)	vkorc1l1 (ENSDARG00000043644)	nupr1a (ENSDARG00000094300)	ENSDARG00000110675	dhx33 (ENSDARG00000051785)	rplp0 (ENSDARG00000051783)	ENSDARG00000045982	si:ch73-55i23.1 (ENSDARG00000042090)	zgc:101699 (ENSDARG00000033355)	rcl1 (ENSDARG00000038312)
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	695							ENSGT00530000064123.g.a.b	ENSGT01100000263529.a.a.a.a.a.a.a.b.b.b.a.a.b	ENSGT00440000039084.a.b.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000165527.b.a.a.a.a.b	ENSGT00390000017193	ENSGT00970000195658.b	ENSGT00940000154078.b.a.b	ENSGT00940000154787.g #22	ENSGT01030000234607.A.a.b.b	ENSGT00940000154787.h.b #22
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	526						ENSGT00390000004524.u	ENSGT00530000064123.g.a.b	ENSGT01100000263529.a.a.a.a.a.a.a.b.b.b.a.a.b	ENSGT00440000039084.a.b.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932.s.a	ENSGT00940000165527.b.a.a.a.a.b	ENSGT00390000017193	ENSGT00970000195658.b	ENSGT00940000154078.b.a.b	ENSGT00940000154787.g #22	ENSGT01030000234607.A.a.b.b	ENSGT00940000154787.h.b #22
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	2175													ENSSGRG00000012386	ENSSGRG00000012388	LZTS3 (ENSSGRG00000012389)	HSPA5 (ENSSGRG00000012390) #22
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00600000084860.B.j	ENSGT00940000162536	ENSGT00940000155826	ENSGT00940000161616.c.j.a.a	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524.v	ENSGT00530000064123.g.a.a	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b.a	ENSGT00940000155214.l.a.a	ENSGT00390000014634	ENSGT00940000169304	ENSGT00970000195658.a	ENSGT00940000154078.b.a.a	ENSGT00940000154787.h.a #22	ENSGT00940000158763.a #23	ENSGT01100000263525.a.a	ENSGT00940000158557.l.a	ENSGT01030000234517.E.c.a	ENSGT00940000157272.h	ENSGT00940000155578.e.a.a.a.a	ENSGT00940000153472.a.b	ENSGT00530000063974.b.a	ENSGT00530000063404.a.m.b	ENSGT00530000063974.b.b	ENSGT00530000063404.a.m.a.a	ENSGT01030000234606.a.b.p.a.b	ENSGT01030000234606.a.b.p.a.a.b	ENSGT00390000017839.l.b	ENSGT00940000156747
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	271	ENSGT00940000162536	ENSGT00940000155826	ENSGT00990000210947	ENSGT00940000161616.c.j.a.b	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524.v	ENSGT00530000064123.g.a.a	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b.a	ENSGT00940000155214.l.a.a	ENSGT00530000062932.t	ENSGT00390000014634	ENSGT00970000195658.a	ENSGT00940000154078.b.a.a	ENSGT00940000154787.h.a #22	ENSGT00940000158763.a #23	ENSGT00940000158763.b #23	ENSGT01100000263525.a.a	ENSGT00940000158557.l.a	ENSGT01030000234517.E.c.a	ENSGT00940000157272.h	ENSGT00940000155578.e.a.a.a.a.b	ENSGT00940000153472.a.b.o.a
Golden-line barbel	DUPLICATION
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	1197													golga2 (ENSSGRG00000016632)	ENSSGRG00000016634	LZTS3 (ENSSGRG00000016635)	hspa5 (ENSSGRG00000016643) #22	rabepk (ENSSGRG00000017083) #23	gng10 (ENSSGRG00000017084)	RAB35 (ENSSGRG00000017085)	CIT (ENSSGRG00000017095)	ENSSGRG00000017153	PPP1CA (ENSSGRG00000017161)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	1745															hspa5 (ENSSGRG00000019975) #22	hspa5 (ENSSGRG00000019648) #22	RAB35 (ENSSGRG00000019647)
Common carp reference	MODERN SPECIES	15	dnm1a (ENSCCRG00000079054)	golga2 (ENSCCRG00000029918)	ENSCCRG00000059415	ENSCCRG00000042984	ENSCCRG00000058476	ENSCCRG00000063358	ENSCCRG00000070814	ENSCCRG00000018677	ENSCCRG00000057976	ENSCCRG00000031022	ENSCCRG00000030808	ENSCCRG00000055742	haus4 (ENSCCRG00000033910)	ENSCCRG00000063367	ENSCCRG00000077589	hspa5 (ENSCCRG00000028672) #22	rabepk (ENSCCRG00000067219) #23	ENSCCRG00000062949	ENSCCRG00000056305	ENSCCRG00000056485	ENSCCRG00000006694	ENSCCRG00000068702	ENSCCRG00000014755	ENSCCRG00000035270	ENSCCRG00000080600	rcl1 (ENSCCRG00000002448)	ENSCCRG00000057831	ENSCCRG00000054361	ENSCCRG00000047594	ENSCCRG00000069080	ENSCCRG00000051286
Goldfish	DUPLICATION
Goldfish	MODERN SPECIES	235												haus4 (ENSCARG00000058194)	ddrgk1 (ENSCARG00000058208)	ENSCARG00000058216	LZTS3 (ENSCARG00000058219)	hspa5 (ENSCARG00000058227) #22	rabepk (ENSCARG00000058258) #23	gng10 (ENSCARG00000058273)	RAB35 (ENSCARG00000058283)	CIT (ENSCARG00000058310)	ENSCARG00000058400	ENSCARG00000058460	MYL2 (ENSCARG00000058478)	PPP1CA (ENSCARG00000058511)	MCC (ENSCARG00000023823)	ENSCARG00000024030	rcl1 (ENSCARG00000024058)	ENSCARG00000024327	ENSCARG00000024343	ENSCARG00000024355	ENSCARG00000024367
Goldfish	MODERN SPECIES	44	ZNRF3 (ENSCARG00000005245)	coq5 (ENSCARG00000005229)	kremen1 (ENSCARG00000005209)	SUSD2 (ENSCARG00000005104)	slc39a14 (ENSCARG00000005086)	piwil2 (ENSCARG00000004805)	ENSCARG00000004763	atad1a (ENSCARG00000004751)	ENSCARG00000004745	GALNT9 (ENSCARG00000004702)	DDRGK1 (ENSCARG00000004683)	ENSCARG00000004676	LZTS3 (ENSCARG00000004670)	FASTKD5 (ENSCARG00000004666)	hspa5 (ENSCARG00000004554) #22	hspa5 (ENSCARG00000004497) #22	gng10 (ENSCARG00000004488)	RAB35 (ENSCARG00000004476)	ENSCARG00000004473	surf4 (ENSCARG00000004403)	ENSCARG00000004373	ENSCARG00000004353	golga2 (ENSCARG00000004258)	ENSCARG00000004226	DDRGK1 (ENSCARG00000004208)	ENSCARG00000004196	LZTS3 (ENSCARG00000004187)	FASTKD5 (ENSCARG00000004178)	DNM1 (ENSCARG00000002998)	gng10 (ENSCARG00000002907)	RAB35 (ENSCARG00000002901)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	695					ENSGT00530000064123.g.a.b	ENSGT01100000263529.a.a.a.a.a.a.a.b.b.b.a.a.b	ENSGT00440000039084.a.b.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000165527.b.a.a.a.a.b	ENSGT00390000017193	ENSGT00970000195658.b	ENSGT00940000154078.b.a.b	ENSGT00940000154787.g #22	ENSGT01030000234607.A.a.b.b	ENSGT00940000154787.h.b #22
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	526				ENSGT00390000004524.u	ENSGT00530000064123.g.a.b	ENSGT01100000263529.a.a.a.a.a.a.a.b.b.b.a.a.b	ENSGT00440000039084.a.b.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932.s.a	ENSGT00940000165527.b.a.a.a.a.b	ENSGT00390000017193	ENSGT00970000195658.b	ENSGT00940000154078.b.a.b	ENSGT00940000154787.g #22	ENSGT01030000234607.A.a.b.b	ENSGT00940000154787.h.b #22
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	1745																hspa5 (ENSSGRG00000019975) #22	hspa5 (ENSSGRG00000019648) #22	RAB35 (ENSSGRG00000019647)
Common carp reference	MODERN SPECIES	7	ENSCCRG00000075164	ENSCCRG00000043734	PRDM12 (ENSCCRG00000069926)	ENSCCRG00000010926	ASS1 (ENSCCRG00000067520)	surf4 (ENSCCRG00000059365)	ENSCCRG00000035953	ENSCCRG00000035952	dnm1a (ENSCCRG00000029922)	golga2 (ENSCCRG00000076185)	ENSCCRG00000059492	ENSCCRG00000068021	DDRGK1 (ENSCCRG00000034045)	ENSCCRG00000034074	FASTKD5 (ENSCCRG00000034083)	hspa5 (ENSCCRG00000066202) #22	ENSCCRG00000063224	ENSCCRG00000018867	ENSCCRG00000035278	ENSCCRG00000035275	ENSCCRG00000034587	ENSCCRG00000049629	ENSCCRG00000047453	ENSCCRG00000046504	ENSCCRG00000047580	ENSCCRG00000067724	ENSCCRG00000067386	rcl1 (ENSCCRG00000049422)	ENSCCRG00000057799	ENSCCRG00000057854	ENSCCRG00000063057
Goldfish	MODERN SPECIES	44	ENSCARG00000005269	ZNRF3 (ENSCARG00000005245)	coq5 (ENSCARG00000005229)	kremen1 (ENSCARG00000005209)	SUSD2 (ENSCARG00000005104)	slc39a14 (ENSCARG00000005086)	piwil2 (ENSCARG00000004805)	ENSCARG00000004763	atad1a (ENSCARG00000004751)	ENSCARG00000004745	GALNT9 (ENSCARG00000004702)	DDRGK1 (ENSCARG00000004683)	ENSCARG00000004676	LZTS3 (ENSCARG00000004670)	FASTKD5 (ENSCARG00000004666)	hspa5 (ENSCARG00000004554) #22	hspa5 (ENSCARG00000004497) #22	gng10 (ENSCARG00000004488)	RAB35 (ENSCARG00000004476)	ENSCARG00000004473	surf4 (ENSCARG00000004403)	ENSCARG00000004373	ENSCARG00000004353	golga2 (ENSCARG00000004258)	ENSCARG00000004226	DDRGK1 (ENSCARG00000004208)	ENSCARG00000004196	LZTS3 (ENSCARG00000004187)	FASTKD5 (ENSCARG00000004178)	DNM1 (ENSCARG00000002998)	gng10 (ENSCARG00000002907)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	57	ENSGT00940000155178 #33	ENSGT00940000153838.a	ENSGT00940000153596.B	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.l.a.a	ENSGT00970000198035	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00390000014634	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.d	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000155434 #32	ENSGT00940000153838.a	ENSGT00940000153596.B	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123.i	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00970000198035	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932.w.b	ENSGT00530000062932.w.a	ENSGT00390000014634	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00690000103350	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00940000160949	ENSGT00390000003140.B	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	84	ENSGT00940000158066.p.i	ENSGT00940000156506.b.e	ENSGT00550000075100.b	ENSGT00940000155178.be.b #33	ENSGT00940000153838.a.p	ENSGT00940000153596.B.a	ENSGT00940000161616.c.q.b	ENSGT00940000156744.p.h	ENSGT00390000004524.`b.a	ENSGT00530000064123.i.b	ENSGT00940000165981.d	ENSGT00390000001761.k	ENSGT00440000039084.a.b.c	ENSGT00940000155214.k.a.b	ENSGT00530000062932.w.b	ENSGT00940000154787.i #22	ENSGT00940000158763.g #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a.nb.b	ENSGT00940000153306.A.a.f	ENSGT00940000156654.d	ENSGT00390000003140.B.bb	ENSGT00940000160949.c
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000158066.p.i	ENSGT00940000156506.b.e	ENSGT00550000075100.b	ENSGT00940000155178.be.b #33	ENSGT00940000153838.a.p	ENSGT00940000153596.B.a	ENSGT00940000161616.c.q.b	ENSGT00940000156744.p.h	ENSGT00390000004524.`b.a	ENSGT00530000064123.i.b	ENSGT00940000165981.d	ENSGT00390000001761.k	ENSGT00440000039084.a.b.c	ENSGT00940000155214.k.a.b	ENSGT00530000062932.w.b	ENSGT00940000154787.i #22	ENSGT00940000158763.g #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a.ob	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a.nb.b	ENSGT00940000153306.A.a.f	ENSGT00940000156654.d	ENSGT00940000160949.c	ENSGT00390000003140.B.bb	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b.c	ENSGT00940000158084.g	ENSGT00530000063861.b.a.b	ENSGT00940000158325.f	ENSGT00940000154667.a.c	ENSGT00940000160316.e	ENSGT00560000078707.d	ENSGT00940000159244.b.c
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158066.p.i	ENSGT00940000156506.b.e	ENSGT00550000075100.b	ENSGT00940000155178.be.b #33	ENSGT00940000153838.a.p	ENSGT00940000153596.B.a	ENSGT00940000161616.c.q.b	ENSGT00940000156744.p.h	ENSGT00390000004524.`b.a	ENSGT00530000064123.i.b	ENSGT00940000165981.d	ENSGT00390000001761.k	ENSGT00440000039084.a.b.c	ENSGT00940000155214.k.a.b	ENSGT00530000062932.w.b	ENSGT00940000154787.i #22	ENSGT00940000158763.g #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a.nb.b	ENSGT00940000153306.A.a.f	ENSGT00940000156654.d	ENSGT00390000003140.B.bb	ENSGT00940000160949.c	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b.c	ENSGT00940000158084.g	ENSGT00530000063861.b.a.b	ENSGT00940000158325.f	ENSGT00940000154667.a.c	ENSGT00940000160316.e	ENSGT00560000078707.d	ENSGT00940000159244.b.c	ENSGT00940000153253.b.b.b
River trout	MODERN SPECIES	3	tbx5a (ENSSTUG00000016397)	ddx54 (ENSSTUG00000016460)	ENSSTUG00000018496 #33	ABL1 (ENSSTUG00000018521)	exosc2 (ENSSTUG00000018647)	ENSSTUG00000018691	prdm12b (ENSSTUG00000018697)	fubp3 (ENSSTUG00000018711)	ASS1 (ENSSTUG00000018795)	surf4 (ENSSTUG00000018933)	surf2 (ENSSTUG00000019170)	bbln (ENSSTUG00000019193)	ENSSTUG00000019203	dnm1a (ENSSTUG00000019236)	golga2 (ENSSTUG00000019387)	hspa5 (ENSSTUG00000019508) #22	rabepk (ENSSTUG00000019542) #23	RGS3 (ENSSTUG00000019557)	ENSSTUG00000019584	znf618 (ENSSTUG00000019593)	pappaa (ENSSTUG00000019629)	ASTN2 (ENSSTUG00000019722)	trim32 (ENSSTUG00000019859)	ENSSTUG00000019865	ENSSTUG00000019870	MYL4 (ENSSTUG00000019875)	brinp1 (ENSSTUG00000019882)	ENSSTUG00000019900	ak1 (ENSSTUG00000019918)	gpsm1b (ENSSTUG00000019957)	LHX3 (ENSSTUG00000020318)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	2	ddx54 (ENSSSAG00000051599)	ENSSSAG00000090542	ENSSSAG00000113831 #33	ABL1 (ENSSSAG00000052199)	exos2 (ENSSSAG00000053553)	PRDM12 (ENSSSAG00000053567)	FUBP3 (ENSSSAG00000053592)	ass1 (ENSSSAG00000053906)	bbln (ENSSSAG00000092999)	surf4 (ENSSSAG00000054039)	ciz1 (ENSSSAG00000054368)	dnm1a (ENSSSAG00000054415)	golga2 (ENSSSAG00000054568)	ENSSSAG00000054646	ENSSSAG00000089515 #23	ENSSSAG00000054661 #22	ENSSSAG00000098457	ENSSSAG00000054690	ENSSSAG00000094398	znf618 (ENSSSAG00000054699)	ENSSSAG00000084557	pappaa (ENSSSAG00000054735)	ASTN2 (ENSSSAG00000055525)	TRIM32 (ENSSSAG00000111255)	brinp1 (ENSSSAG00000055594)	ENSSSAG00000112754	ENSSSAG00000055620	ak1 (ENSSSAG00000055636)	gpsm1b (ENSSSAG00000055784)	LHX3 (ENSSSAG00000118789)	TMEM250 (ENSSSAG00000102839)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000158066.p.i	ENSGT00940000156506.b.e	ENSGT00550000075100.b	ENSGT00940000155178.be.b #33	ENSGT00940000153838.a.p	ENSGT00940000153596.B.a	ENSGT00940000161616.c.q.b	ENSGT00940000156744.p.h	ENSGT00390000004524.`b.a	ENSGT00530000064123.i.b	ENSGT00940000165981.d	ENSGT00390000001761.k	ENSGT00440000039084.a.b.c	ENSGT00940000155214.k.a.b	ENSGT00530000062932.w.b.a	ENSGT00940000154787.i #22	ENSGT00940000158763.g #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a.ob	ENSGT00940000155135.x.a.a	ENSGT00940000156114.c.b	ENSGT00440000033609.w	ENSGT00940000154078.b.a.d	ENSGT01030000234607.A.a.b.b	ENSGT00390000004511.c.a.b.a	ENSGT00940000155826.c	ENSGT00530000063974.b.d	ENSGT00940000169460.i	ENSGT00940000165582.c	ENSGT00940000159652.i.a	ENSGT00940000164732.C	ENSGT00390000002738.a.p
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000158066.p.i	ENSGT00940000156506.b.e	ENSGT00550000075100.b	ENSGT00940000155178.be.b #33	ENSGT00940000153838.a.p	ENSGT00940000153596.B.a	ENSGT00940000161616.c.q.b	ENSGT00940000156744.p.h	ENSGT00390000004524.`b.a	ENSGT00530000064123.i.b	ENSGT00940000165981.d	ENSGT00390000001761.k	ENSGT00440000039084.a.b.c	ENSGT00940000155214.k.a.b	ENSGT00530000062932.w.b.a	ENSGT00940000154787.i #22	ENSGT00940000158763.g #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a.ob	ENSGT00940000155135.x.a.a	ENSGT00940000156114.c.b	ENSGT00440000033609.w	ENSGT00940000154078.b.a.d	ENSGT01030000234607.A.a.b.b	ENSGT00390000004511.c.a.b.a	ENSGT00940000155826.c	ENSGT00530000063974.b.d	ENSGT00940000169460.i	ENSGT00940000165582.c	ENSGT00940000159652.i.a	ENSGT00940000164732.C	ENSGT00390000002738.a.p
Chinook salmon	DUPLICATION
Chinook salmon	MODERN SPECIES	47													ENSOTSG00005034460	golga2 (ENSOTSG00005034459)	ENSOTSG00005034458	hspa5 (ENSOTSG00005034457) #22	rabepk (ENSOTSG00005034456) #23	ENSOTSG00005034453	ENSOTSG00005034452	znf618 (ENSOTSG00005034451)	pappaa (ENSOTSG00005034391)	trim32 (ENSOTSG00005034386)	ENSOTSG00005034384	ASTN2 (ENSOTSG00005034377)	MYL4 (ENSOTSG00005034376)	brinp1 (ENSOTSG00005034375)	ENSOTSG00005034374	ak1 (ENSOTSG00005034372)	gpsm1b (ENSOTSG00005034338)	LHX3 (ENSOTSG00005034336)	TMEM250 (ENSOTSG00005034334)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	26	MED13L (ENSOTSG00005014835)	tbx5a (ENSOTSG00005016939)	ddx54 (ENSOTSG00005016975)	ENSOTSG00005021606 #33	ABL1 (ENSOTSG00005021616)	exosc2 (ENSOTSG00005022293)	prdm12b (ENSOTSG00005022294)	fubp3 (ENSOTSG00005022296)	ASS1 (ENSOTSG00005022548)	surf4 (ENSOTSG00005022774)	surf2 (ENSOTSG00005022777)	bbln (ENSOTSG00005022778)	ENSOTSG00005022779	dnm1a (ENSOTSG00005022781)	golga2 (ENSOTSG00005022784)	hspa5 (ENSOTSG00005022795) #22	rabepk (ENSOTSG00005022797) #23	ENSOTSG00005022799	ENSOTSG00005022801	znf618 (ENSOTSG00005022804)	pappaa (ENSOTSG00005022808)	ASTN2 (ENSOTSG00005022898)	trim32 (ENSOTSG00005023012)	ENSOTSG00005023015	MYL4 (ENSOTSG00005023018)	brinp1 (ENSOTSG00005023020)	ENSOTSG00005023025	ak1 (ENSOTSG00005023028)	gpsm1b (ENSOTSG00005023034)	LHX3 (ENSOTSG00005023082)	TMEM250 (ENSOTSG00005023084)
Coho salmon	MODERN SPECIES	21	tbx3a (ENSOKIG00005028148)	tbx5a (ENSOKIG00005028169)	ddx54 (ENSOKIG00005028229)	ENSOKIG00005029288 #33	ABL1 (ENSOKIG00005029339)	exosc2 (ENSOKIG00005029559)	PRDM12 (ENSOKIG00005029614)	FUBP3 (ENSOKIG00005029639)	ASS1 (ENSOKIG00005029918)	surf4 (ENSOKIG00005031106)	surf2 (ENSOKIG00005031210)	bbln (ENSOKIG00005031230)	ENSOKIG00005031240	dnm1a (ENSOKIG00005031310)	golga2 (ENSOKIG00005031579)	hspa5 (ENSOKIG00005031789) #22	rabepk (ENSOKIG00005031808) #23	ENSOKIG00005031914	ENSOKIG00005031948	ENSOKIG00005031972	znf618 (ENSOKIG00005031976)	pappaa (ENSOKIG00005032004)	ASTN2 (ENSOKIG00005032112)	ENSOKIG00005032222	trim32 (ENSOKIG00005032230)	MYL4 (ENSOKIG00005032237)	brinp1 (ENSOKIG00005032241)	ENSOKIG00005032278	ak1 (ENSOKIG00005032289)	gpsm1b (ENSOKIG00005032350)	LHX3 (ENSOKIG00005032578)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	364	tbx5a (ENSOMYG00000036825)	ddx54 (ENSOMYG00000037010)	ENSOMYG00000038917 #33	ABL1 (ENSOMYG00000039096)	exosc2 (ENSOMYG00000039850)	PRDM12 (ENSOMYG00000039879)	FUBP3 (ENSOMYG00000039912)	ASS1 (ENSOMYG00000040078)	surf4 (ENSOMYG00000040699)	surf2 (ENSOMYG00000040840)	bbln (ENSOMYG00000040844)	ENSOMYG00000040847	dnm1a (ENSOMYG00000040884)	ENSOMYG00000040907	golga2 (ENSOMYG00000040912)	ENSOMYG00000040939 #22	ENSOMYG00000040947 #23	ENSOMYG00000040957	ENSOMYG00000040955	ENSOMYG00000061232	znf618 (ENSOMYG00000040959)	pappaa (ENSOMYG00000041002)	ASTN2 (ENSOMYG00000041202)	TRIM32 (ENSOMYG00000041251)	ENSOMYG00000069048	ENSOMYG00000041255	brinp1 (ENSOMYG00000041259)	ENSOMYG00000041263	ak1 (ENSOMYG00000041267)	gpsm1b (ENSOMYG00000041274)	ENSOMYG00000061528
Huchen	MODERN SPECIES	164	ENSHHUG00000011285 #33	ABL1 (ENSHHUG00000011163)	exosc2 (ENSHHUG00000011111)	prdm12b (ENSHHUG00000011103)	fubp3 (ENSHHUG00000010885)	ASS1 (ENSHHUG00000010806)	surf4 (ENSHHUG00000010544)	surf2 (ENSHHUG00000010481)	bbln (ENSHHUG00000010474)	ENSHHUG00000010466	dnm1a (ENSHHUG00000010209)	ENSHHUG00000010175	ENSHHUG00000010152	ENSHHUG00000010145	ENSHHUG00000010137	hspa5 (ENSHHUG00000010093) #22	rabepk (ENSHHUG00000010080) #23	ENSHHUG00000010068	ENSHHUG00000010062	ENSHHUG00000010040	ENSHHUG00000010034
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	79	ENSGT00550000075100.a	ENSGT00940000155178.be.a #33	ENSGT00940000153838.a.o	ENSGT00940000153596.B.b	ENSGT00940000161616.c.q.a	ENSGT00940000156744.p.g	ENSGT00390000004524.`b.b	ENSGT00530000064123.i.a	ENSGT00940000165981.c	ENSGT00390000001761.l	ENSGT00440000039084.a.b.d	ENSGT00970000198035	ENSGT00940000155214.k.a.a	ENSGT00530000062932.w.a	ENSGT00390000014634	ENSGT00940000154787.j #22	ENSGT00940000158763.h #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a.nb.a	ENSGT00940000153306.A.a.e	ENSGT00940000156654.c	ENSGT00940000160949.d	ENSGT00390000003140.B.cb	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b.d	ENSGT00940000158084.h	ENSGT00530000063861.b.a.a	ENSGT00940000158325.e	ENSGT00940000154667.a.d	ENSGT00940000160316.f	ENSGT00560000078707.c	ENSGT00940000159244.b.d	ENSGT00940000153253.b.b.a
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000156506.b.f	ENSGT00550000075100.a	ENSGT00940000155178.be.a #33	ENSGT00940000153838.a.o	ENSGT00940000153596.B.b	ENSGT00940000161616.c.q.a	ENSGT00940000156744.p.g	ENSGT00390000004524.`b.b	ENSGT00530000064123.i.a	ENSGT00940000165981.c	ENSGT00390000001761.l	ENSGT00440000039084.a.b.d	ENSGT00940000155214.k.a.a	ENSGT00530000062932.w.a	ENSGT00390000014634	ENSGT00940000154787.j #22	ENSGT00940000158763.h #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a.nb.a	ENSGT00940000153306.A.a.e	ENSGT00940000156654.c	ENSGT00940000160949.d	ENSGT00390000003140.B.cb	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b.d	ENSGT00940000158084.h	ENSGT00530000063861.b.a.a	ENSGT00940000158325.e	ENSGT00940000154667.a.d	ENSGT00940000160316.f	ENSGT00560000078707.c	ENSGT00940000159244.b.d	ENSGT00940000153253.b.b.a
Salmo	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156506.b.f	ENSGT00550000075100.a	ENSGT00940000155178.be.a #33	ENSGT00940000153838.a.o	ENSGT00940000153596.B.b	ENSGT00940000161616.c.q.a	ENSGT00940000156744.p.g	ENSGT00390000004524.`b.b	ENSGT00530000064123.i.a	ENSGT00940000165981.c	ENSGT00990000211885	ENSGT00440000039084.a.b.d	ENSGT00940000155214.k.a.a	ENSGT00530000062932.w.a	ENSGT00390000014634.c	ENSGT00940000154787.j #22	ENSGT00940000158763.h #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a.nb.a	ENSGT00940000153306.A.a.e	ENSGT00940000156654.c	ENSGT00940000160949.d	ENSGT00390000003140.B.cb	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b.d	ENSGT00940000158084.h	ENSGT00530000063861.b.a.a	ENSGT00940000158325.e	ENSGT00940000154667.a.d	ENSGT00940000160316.f	ENSGT00560000078707.c	ENSGT00940000159244.b.d	ENSGT00940000153253.b.b.a
Atlantic salmon	MODERN SPECIES		tbx5a (ENSSSAG00000098747)	RAB14 (ENSSSAG00000044909) #33	ABL1 (ENSSSAG00000044669)	exosc2 (ENSSSAG00000044601)	PRDM12 (ENSSSAG00000044522)	FUBP3 (ENSSSAG00000044217)	ENSSSAG00000104543	ENSSSAG00000044036	surf4 (ENSSSAG00000043718)	surf2 (ENSSSAG00000043669)	ENSSSAG00000043657	ENSSSAG00000043645	dnm1a (ENSSSAG00000042952)	golga2 (ENSSSAG00000042813)	ENSSSAG00000101792	ENSSSAG00000042766 #22	ENSSSAG00000042732 #23	ENSSSAG00000042591	pappaa (ENSSSAG00000040300)	TRIM32 (ENSSSAG00000040244)	ASTN2 (ENSSSAG00000035123)	ENSSSAG00000034549	brinp1 (ENSSSAG00000034408)	ENSSSAG00000103907	ENSSSAG00000070029	KAD (ENSSSAG00000070025)	gpsm1b (ENSSSAG00000069045)	LHX3 (ENSSSAG00000069016)	ENSSSAG00000091553	ENSSSAG00000086492	ENSSSAG00000069012
River trout	MODERN SPECIES	15	tbx5a (ENSSTUG00000008782)	ddx54 (ENSSTUG00000008778)	ENSSTUG00000008762 #33	ABL1 (ENSSTUG00000008699)	exosc2 (ENSSTUG00000008679)	prdm12b (ENSSTUG00000008671)	fubp3 (ENSSTUG00000007715)	ASS1 (ENSSTUG00000007486)	surf4 (ENSSTUG00000007353)	surf2 (ENSSTUG00000007334)	ENSSTUG00000007308	ENSSTUG00000007291	dnm1a (ENSSTUG00000006910)	golga2 (ENSSTUG00000006666)	haus4 (ENSSTUG00000006642)	hspa5 (ENSSTUG00000006628) #22	ENSSTUG00000006538	znf618 (ENSSTUG00000006495)	pappaa (ENSSTUG00000006415)	trim32 (ENSSTUG00000006404)	ASTN2 (ENSSTUG00000005688)	ENSSTUG00000005652	MYL4 (ENSSTUG00000005645)	brinp1 (ENSSTUG00000005630)	ENSSTUG00000005603	ak1 (ENSSTUG00000005573)	gpsm1b (ENSSTUG00000004947)	LHX3 (ENSSTUG00000004917)	ENSSTUG00000004909	TMEM250 (ENSSTUG00000004893)	NACC2 (ENSSTUG00000004888)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000156506.b.f	ENSGT00550000075100.a	ENSGT00940000155178.be.a #33	ENSGT00940000153838.a.o	ENSGT00940000153596.B.b	ENSGT00940000161616.c.q.a	ENSGT00940000156744.p.g	ENSGT00390000004524.`b.b	ENSGT00530000064123.i.a	ENSGT00940000165981.c	ENSGT00390000001761.l	ENSGT00440000039084.a.b.d	ENSGT00940000155214.k.a.a	ENSGT00530000062932.w.a	ENSGT00390000014634	ENSGT00940000154787.j #22	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a.nb.a	ENSGT00940000153306.A.a.e	ENSGT00940000156654.c	ENSGT00940000160949.d	ENSGT00390000003140.B.cb	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b.d	ENSGT00940000158084.h	ENSGT00530000063861.b.a.a	ENSGT00940000158325.e	ENSGT00940000154667.a.d	ENSGT00940000160316.f	ENSGT00560000078707.c	ENSGT00940000159244.b.d	ENSGT00940000165854	ENSGT00940000153253.b.b.a
Rainbow trout	MODERN SPECIES	26	ENSOMYG00000061663 #33	ENSOMYG00000054603	ABL1 (ENSOMYG00000027335)	ENSOMYG00000061507	exosc2 (ENSOMYG00000027435)	PRDM12 (ENSOMYG00000027478)	FUBP3 (ENSOMYG00000027630)	ENSOMYG00000028364	surf4 (ENSOMYG00000028434)	surf2 (ENSOMYG00000069864)	ENSOMYG00000029139	ENSOMYG00000029150	dnm1a (ENSOMYG00000029184)	golga2 (ENSOMYG00000028939)	ENSOMYG00000029395	ENSOMYG00000029430 #22	ENSOMYG00000072157	ENSOMYG00000029526	ENSOMYG00000002167	ENSOMYG00000000571	znf618 (ENSOMYG00000029757)	pappaa (ENSOMYG00000029847)	ASTN2 (ENSOMYG00000030000)	TRIM32 (ENSOMYG00000069773)	ENSOMYG00000030103	brinp1 (ENSOMYG00000030111)	ENSOMYG00000030144	ENSOMYG00000048199	ENSOMYG00000053282	ak1 (ENSOMYG00000030166)	LHX3 (ENSOMYG00000030573)
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000156506.b.f	ENSGT00550000075100.a	ENSGT00940000155178.be.a #33	ENSGT00940000153838.a.o	ENSGT00940000153596.B.b	ENSGT00940000161616.c.q.a	ENSGT00940000156744.p.g	ENSGT00390000004524.`b.b	ENSGT00530000064123.i.a	ENSGT00940000165981.c	ENSGT00390000001761.l	ENSGT00440000039084.a.b.d	ENSGT00940000155214.k.a.a	ENSGT00530000062932.w.a	ENSGT00390000014634	ENSGT00940000154787.j #22	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a.nb.a	ENSGT00940000153306.A.a.e	ENSGT00940000156654.c	ENSGT00940000160949.d	ENSGT00390000003140.B.cb	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b.d	ENSGT00940000158084.h	ENSGT00530000063861.b.a.a	ENSGT00940000158325.e	ENSGT00940000154667.a.d	ENSGT00940000160316.f	ENSGT00560000078707.c	ENSGT00940000159244.b.d	ENSGT00940000165854	ENSGT00390000018059.a.d
Chinook salmon	MODERN SPECIES	12	wbp1 (ENSOTSG00005010693)	ENSOTSG00005010694	MTFP1 (ENSOTSG00005010696)	ABL1 (ENSOTSG00005010698)	exosc2 (ENSOTSG00005010763)	prdm12b (ENSOTSG00005010783)	fubp3 (ENSOTSG00005010789)	ASS1 (ENSOTSG00005011537)	surf4 (ENSOTSG00005011538)	surf2 (ENSOTSG00005011611)	bbln (ENSOTSG00005011613)	ENSOTSG00005011615	dnm1a (ENSOTSG00005011620)	golga2 (ENSOTSG00005011814)	haus4 (ENSOTSG00005011818)	hspa5 (ENSOTSG00005011819) #22	ENSOTSG00005011820	ENSOTSG00005011826	znf618 (ENSOTSG00005011831)	pappaa (ENSOTSG00005011843)	ASTN2 (ENSOTSG00005011936)	trim32 (ENSOTSG00005011993)	MYL4 (ENSOTSG00005011994)	ENSOTSG00005011995	brinp1 (ENSOTSG00005011997)	ENSOTSG00005011998	ak1 (ENSOTSG00005011999)	gpsm1b (ENSOTSG00005012002)	LHX3 (ENSOTSG00005012010)	TMEM250 (ENSOTSG00005012014)	NACC2 (ENSOTSG00005012016)
Coho salmon	MODERN SPECIES	15	tbx3a (ENSOKIG00005017594)	tbx5a (ENSOKIG00005017576)	ENSOKIG00005017522 #33	ABL1 (ENSOKIG00005017372)	exosc2 (ENSOKIG00005017346)	PRDM12 (ENSOKIG00005017338)	fubp3 (ENSOKIG00005016569)	ASS1 (ENSOKIG00005016442)	surf4 (ENSOKIG00005016412)	surf2 (ENSOKIG00005016402)	bbln (ENSOKIG00005016378)	ENSOKIG00005016365	dnm1a (ENSOKIG00005011964)	golga2 (ENSOKIG00005011523)	ENSOKIG00005011463	HSPA5 (ENSOKIG00005011438) #22	RGS3 (ENSOKIG00005011386)	znf618 (ENSOKIG00005011349)	pappaa (ENSOKIG00005011282)	ASTN2 (ENSOKIG00005011063)	MYL4 (ENSOKIG00005011044)	brinp1 (ENSOKIG00005011031)	ENSOKIG00005011021	ak1 (ENSOKIG00005011003)	gpsm1b (ENSOKIG00005010941)	LHX3 (ENSOKIG00005010906)	TMEM250 (ENSOKIG00005010901)	NACC2 (ENSOKIG00005010894)	fam78ab (ENSOKIG00005010890)	ENSOKIG00005010619	PRRC2B (ENSOKIG00005010542)
Huchen	MODERN SPECIES	128	ddx54 (ENSHHUG00000002778)	ENSHHUG00000003123 #33	ABL1 (ENSHHUG00000003184)	exosc2 (ENSHHUG00000003239)	prdm12b (ENSHHUG00000003269)	fubp3 (ENSHHUG00000003292)	ASS1 (ENSHHUG00000003324)	surf4 (ENSHHUG00000003378)	surf2 (ENSHHUG00000003482)	bbln (ENSHHUG00000003511)	ENSHHUG00000003515	ENSHHUG00000003521	dnm1a (ENSHHUG00000003533)	golga2 (ENSHHUG00000003612)	haus4 (ENSHHUG00000003654)	hspa5 (ENSHHUG00000003661) #22	rabepk (ENSHHUG00000003802) #23
Northern pike	MODERN SPECIES	13	ddx54 (ENSELUG00000013533)	ENSELUG00000013571 #33	ABL1 (ENSELUG00000013603)	exosc2 (ENSELUG00000013641)	prdm12b (ENSELUG00000013674)	fubp3 (ENSELUG00000013808)	ASS1 (ENSELUG00000013912)	surf4 (ENSELUG00000013950)	ENSELUG00000030214	surf2 (ENSELUG00000013966)	bbln (ENSELUG00000013980)	ENSELUG00000014004	dnm1a (ENSELUG00000014271)	golga2 (ENSELUG00000014460)	haus4 (ENSELUG00000014514)	hspa5 (ENSELUG00000014551) #22	rabepk (ENSELUG00000014591) #23	RGS3 (ENSELUG00000014769)	znf618 (ENSELUG00000014885)	pappaa (ENSELUG00000014958)	ASTN2 (ENSELUG00000015081)	trim32 (ENSELUG00000014976)	ENSELUG00000030040	MYL4 (ENSELUG00000015112)	brinp1 (ENSELUG00000015183)	ENSELUG00000015212	ak1 (ENSELUG00000015251)	gpsm1b (ENSELUG00000000551)	LHX3 (ENSELUG00000015306)	TMEM250 (ENSELUG00000015315)	NACC2 (ENSELUG00000015344)
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000158066.p	ENSGT00940000156506.b	ENSGT00550000075100	ENSGT00940000155178 #33	ENSGT00940000153838.a	ENSGT00940000153596.B	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000155976.b.b	ENSGT00940000154416.C.d	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.a	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT01010000222537	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a
Cod	MODERN SPECIES	10	hnrnpd (ENSGMOG00000018481)	enoph1 (ENSGMOG00000018492)	TMEM150C (ENSGMOG00000018512)	sec31a (ENSGMOG00000018568)	LIN54 (ENSGMOG00000018604)	ENSGMOG00000018624	ENSGMOG00000018638	ENSGMOG00000018645	ENSGMOG00000018678	ENSGMOG00000018702	ENSGMOG00000018717	bbln (ENSGMOG00000018731)	ENSGMOG00000018734	dnm1a (ENSGMOG00000002525)	golga2 (ENSGMOG00000002465)	ENSGMOG00000002437 #22	ENSGMOG00000002413 #23	ENSGMOG00000002347	ENSGMOG00000024018	znf618 (ENSGMOG00000029250)	pappaa (ENSGMOG00000002191)	TRIM32 (ENSGMOG00000033212)	ENSGMOG00000002118	brinp1 (ENSGMOG00000012869)	ENSGMOG00000036355	ENSGMOG00000022530	ENSGMOG00000003995	fam78ab (ENSGMOG00000031284)	ENSGMOG00000032741	ENSGMOG00000003848	ENSGMOG00000003815
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000158066.p	ENSGT00940000156506.b	ENSGT00550000075100	ENSGT00940000155178 #33	ENSGT00940000153838.a	ENSGT00940000153596.B	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.d	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.a	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707
Pinecone sodierfish	DUPLICATION
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	3	tbx5a (ENSMMDG00005012460)	ddx54 (ENSMMDG00005012485)	rab14 (ENSMMDG00005013704) #33	ABL1 (ENSMMDG00005013709)	exosc2 (ENSMMDG00005013919)	prdm12b (ENSMMDG00005013922)	ASS1 (ENSMMDG00005013928)	surf4 (ENSMMDG00005013937)	surf2 (ENSMMDG00005013953)	bbln (ENSMMDG00005013954)	ENSMMDG00005013958	dnm1a (ENSMMDG00005013986)	golga2 (ENSMMDG00005016681)	hspa5 (ENSMMDG00005016686) #22	rabepk (ENSMMDG00005016701) #23	hspa5 (ENSMMDG00005016707) #22	ENSMMDG00005001171	ENSMMDG00005001187	znf618 (ENSMMDG00005001210)	pappaa (ENSMMDG00005001262)	ASTN2 (ENSMMDG00005001375)	trim32 (ENSMMDG00005002110)	MYL4 (ENSMMDG00005002113)	brinp1 (ENSMMDG00005002115)	ENSMMDG00005002121	ak1 (ENSMMDG00005002124)	gpsm1b (ENSMMDG00005002156)	btc (ENSMMDG00005002350)	slc45a2 (ENSMMDG00005002352)	amacr (ENSMMDG00005002354)	ENSMMDG00005002356
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	3	MED13L (ENSMMDG00005012448)	tbx3a (ENSMMDG00005012452)	tbx5a (ENSMMDG00005012460)	ddx54 (ENSMMDG00005012485)	rab14 (ENSMMDG00005013704) #33	ABL1 (ENSMMDG00005013709)	exosc2 (ENSMMDG00005013919)	prdm12b (ENSMMDG00005013922)	ASS1 (ENSMMDG00005013928)	surf4 (ENSMMDG00005013937)	surf2 (ENSMMDG00005013953)	bbln (ENSMMDG00005013954)	ENSMMDG00005013958	dnm1a (ENSMMDG00005013986)	golga2 (ENSMMDG00005016681)	hspa5 (ENSMMDG00005016686) #22	rabepk (ENSMMDG00005016701) #23	hspa5 (ENSMMDG00005016707) #22	ENSMMDG00005001171	ENSMMDG00005001187	znf618 (ENSMMDG00005001210)	pappaa (ENSMMDG00005001262)	ASTN2 (ENSMMDG00005001375)	trim32 (ENSMMDG00005002110)	MYL4 (ENSMMDG00005002113)	brinp1 (ENSMMDG00005002115)	ENSMMDG00005002121	ak1 (ENSMMDG00005002124)	gpsm1b (ENSMMDG00005002156)	btc (ENSMMDG00005002350)	slc45a2 (ENSMMDG00005002352)
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00940000176908	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	281	ENSHCOG00000002699	ENSHCOG00000002708	ENSHCOG00000002722	ENSHCOG00000002733	ENSHCOG00000002757	ENSHCOG00000002801	zgc:113984 (ENSHCOG00000002850)	ENSHCOG00000002892	surf2 (ENSHCOG00000002899)	bbln (ENSHCOG00000002909)	ENSHCOG00000002919	dnm1a (ENSHCOG00000002942)	ENSHCOG00000002950	ENSHCOG00000002963	ENSHCOG00000002970	hspa5 (ENSHCOG00000002983) #22	rabepk (ENSHCOG00000002992) #23	rgs3a (ENSHCOG00000002999)	znf618 (ENSHCOG00000003019)	pappaa (ENSHCOG00000003050)
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT01010000222537	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00940000160949	ENSGT00390000003140.B	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT01010000222537	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00940000176908	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00940000160949	ENSGT00390000003140.B	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT01010000222537	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Indian medaka	MODERN SPECIES	30	zmynd19 (ENSOMEG00000003996)	bspry (ENSOMEG00000004022)	coq4 (ENSOMEG00000004042)	ENSOMEG00000004081	ENSOMEG00000004101	fbxw5 (ENSOMEG00000004115)	prdm12b (ENSOMEG00000004134)	fubp3 (ENSOMEG00000004190)	ENSOMEG00000004205	surf4 (ENSOMEG00000000097)	surf2 (ENSOMEG00000004238)	bbln (ENSOMEG00000004252)	ENSOMEG00000004322	dnm1a (ENSOMEG00000004475)	golga2 (ENSOMEG00000004569)	hspa5 (ENSOMEG00000004620) #22	rabepk (ENSOMEG00000004670) #23	ENSOMEG00000004737	znf618 (ENSOMEG00000004781)	pappaa (ENSOMEG00000004852)	trim32 (ENSOMEG00000004877)	ASTN2 (ENSOMEG00000004936)	MYL4 (ENSOMEG00000004952)	brinp1 (ENSOMEG00000004973)	ENSOMEG00000005019	ak1 (ENSOMEG00000000964)	gpsm1b (ENSOMEG00000005082)	LHX3 (ENSOMEG00000005115)	TMEM250 (ENSOMEG00000005124)	NACC2 (ENSOMEG00000005153)	ENSOMEG00000005250
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	3	zmynd19 (ENSOJAG00000009661)	bspry (ENSOJAG00000009678)	coq4 (ENSOJAG00000009686)	ENSOJAG00000009702	fbxw5 (ENSOJAG00000009766)	ENSOJAG00000009798	ENSOJAG00000009819	fubp3 (ENSOJAG00000009843)	ASS1 (ENSOJAG00000009991)	surf4 (ENSOJAG00000010394)	surf2 (ENSOJAG00000010520)	bbln (ENSOJAG00000010527)	ENSOJAG00000010544	dnm1a (ENSOJAG00000010946)	golga2 (ENSOJAG00000015292)	hspa5 (ENSOJAG00000015448) #22	rabepk (ENSOJAG00000015559) #23	rgs3a (ENSOJAG00000015607)	znf618 (ENSOJAG00000015634)	pappaa (ENSOJAG00000015720)	ASTN2 (ENSOJAG00000015886)	trim32 (ENSOJAG00000016301)	ENSOJAG00000016312	brinp1 (ENSOJAG00000016318)	ENSOJAG00000016335	ak1 (ENSOJAG00000016355)	gpsm1b (ENSOJAG00000016399)	LHX3 (ENSOJAG00000016611)	TMEM250 (ENSOJAG00000016666)	NACC2 (ENSOJAG00000016678)	ENSOJAG00000016838
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT01030000235357.b.b.a.b	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00940000160949	ENSGT00390000003140.B	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT01010000222537	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	3	coq4 (ENSORLG00000007173)	ENSORLG00000007166	fbxw5 (ENSORLG00000007130)	ENSORLG00000027265	prdm12b (ENSORLG00000007114)	fubp3 (ENSORLG00000007103)	ENSORLG00000023111	ASS1 (ENSORLG00000007080)	surf4 (ENSORLG00000007042)	surf2 (ENSORLG00000007033)	bbln (ENSORLG00000007027)	ENSORLG00000007023	dnm1a (ENSORLG00000007019)	ENSORLG00000030164	golga2 (ENSORLG00000006984)	hspa5 (ENSORLG00000006886) #22	rabepk (ENSORLG00000006859) #23	ENSORLG00000008461	ENSORLG00000022485	rgs3a (ENSORLG00000026253)	znf618 (ENSORLG00000006801)	pappaa (ENSORLG00000006791)	trim32 (ENSORLG00000025643)	ASTN2 (ENSORLG00000006763)	ENSORLG00000006733	brinp1 (ENSORLG00000006730)	ENSORLG00000028040	ak1 (ENSORLG00000006708)	ENSORLG00000026699	gpsm1b (ENSORLG00000006683)	lhx3 (ENSORLG00000006699)
Chinese medaka	MODERN SPECIES	489	tmem141 (ENSOSIG00000016428)	zmynd19 (ENSOSIG00000016426)	bspry (ENSOSIG00000016424)	ENSOSIG00000016421	fbxw5 (ENSOSIG00000016418)	prdm12b (ENSOSIG00000016416)	fubp3 (ENSOSIG00000016185)	ASS1 (ENSOSIG00000016127)	surf4 (ENSOSIG00000016116)	surf4 (ENSOSIG00000016115)	surf2 (ENSOSIG00000016114)	bbln (ENSOSIG00000016113)	ENSOSIG00000016111	dnm1a (ENSOSIG00000015761)	golga2 (ENSOSIG00000015742)	hspa5 (ENSOSIG00000015696) #22	rabepk (ENSOSIG00000015682) #23	ENSOSIG00000015680	ENSOSIG00000015675	ENSOSIG00000015673	znf618 (ENSOSIG00000015670)	pappaa (ENSOSIG00000015389)	trim32 (ENSOSIG00000015377)	ASTN2 (ENSOSIG00000012757)
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT01010000222537	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT01010000222537	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00940000160949	ENSGT00390000003140.B	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT01010000222537	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000153253.b.b
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	135	zmynd19 (ENSCVAG00000016943)	bspry (ENSCVAG00000016957)	coq4 (ENSCVAG00000017012)	ENSCVAG00000017029	ENSCVAG00000017048	fbxw5 (ENSCVAG00000017139)	prdm12b (ENSCVAG00000017166)	fubp3 (ENSCVAG00000017181)	ASS1 (ENSCVAG00000017263)	surf4 (ENSCVAG00000017276)	surf2 (ENSCVAG00000017286)	bbln (ENSCVAG00000017293)	ENSCVAG00000017316	dnm1a (ENSCVAG00000017589)	golga2 (ENSCVAG00000017680)	hspa5 (ENSCVAG00000017727) #22	rabepk (ENSCVAG00000017740) #23	ENSCVAG00000017761	ENSCVAG00000017797	znf618 (ENSCVAG00000017820)	pappaa (ENSCVAG00000017894)	trim32 (ENSCVAG00000017898)	ASTN2 (ENSCVAG00000017985)	ENSCVAG00000018005	brinp1 (ENSCVAG00000018046)	ENSCVAG00000018058	ak1 (ENSCVAG00000000473)	gpsm1b (ENSCVAG00000018102)	LHX3 (ENSCVAG00000018141)	TMEM250 (ENSCVAG00000018150)	NACC2 (ENSCVAG00000018166)
Mummichog	MODERN SPECIES	2333	bspry (ENSFHEG00000003842)	coq4 (ENSFHEG00000003854)	ENSFHEG00000003872	fbxw5 (ENSFHEG00000003917)	ENSFHEG00000003930	prdm12b (ENSFHEG00000003944)	fubp3 (ENSFHEG00000003957)	ASS1 (ENSFHEG00000003993)	surf4 (ENSFHEG00000004007)	surf2 (ENSFHEG00000004043)	bbln (ENSFHEG00000004050)	ENSFHEG00000004069	dnm1a (ENSFHEG00000004114)	ENSFHEG00000004126	golga2 (ENSFHEG00000004233)	hspa5 (ENSFHEG00000004267) #22	rabepk (ENSFHEG00000004292) #23	ENSFHEG00000004337	ENSFHEG00000004358	znf618 (ENSFHEG00000004396)	pappaa (ENSFHEG00000004457)	trim32 (ENSFHEG00000004468)	ASTN2 (ENSFHEG00000004533)	ENSFHEG00000004558
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854	ENSGT00940000153253.b.b
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT01010000222537	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854	ENSGT00940000153253.b.b
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084
Sailfin molly	MODERN SPECIES	661													DNM1 (ENSPLAG00000002482)	ENSPLAG00000002461	golga2 (ENSPLAG00000002455)	hspa5 (ENSPLAG00000002434) #22	rabepk (ENSPLAG00000002406) #23	ENSPLAG00000002392	ENSPLAG00000002380	pcdh10b (ENSPLAG00000023813)
Amazon molly	MODERN SPECIES	258	tmem141 (ENSPFOG00000019835)	zmynd19 (ENSPFOG00000019836)	bspry (ENSPFOG00000019837)	coq4 (ENSPFOG00000019838)	ENSPFOG00000019839	fbxw5 (ENSPFOG00000019840)	prdm12b (ENSPFOG00000019841)	fubp3 (ENSPFOG00000019842)	ASS1 (ENSPFOG00000019843)	surf4 (ENSPFOG00000019844)	surf2 (ENSPFOG00000019845)	bbln (ENSPFOG00000019846)	ENSPFOG00000019847	dnm1a (ENSPFOG00000019848)	golga2 (ENSPFOG00000019849)	hspa5 (ENSPFOG00000019850) #22	rabepk (ENSPFOG00000019851) #23	RGS3 (ENSPFOG00000019852)	znf618 (ENSPFOG00000019853)	pappaa (ENSPFOG00000019854)	ASTN2 (ENSPFOG00000019855)	trim32 (ENSPFOG00000019956)	MYL4 (ENSPFOG00000019958)	brinp1 (ENSPFOG00000019856)
Guppy	MODERN SPECIES	442	zmynd19 (ENSPREG00000014965)	bspry (ENSPREG00000014977)	coq4 (ENSPREG00000014990)	ENSPREG00000015006	fbxw5 (ENSPREG00000015033)	ENSPREG00000015060	prdm12b (ENSPREG00000015073)	fubp3 (ENSPREG00000015101)	ASS1 (ENSPREG00000015161)	surf4 (ENSPREG00000015229)	surf2 (ENSPREG00000015360)	ENSPREG00000015385	bbln (ENSPREG00000015410)	dnm1a (ENSPREG00000015500)	golga2 (ENSPREG00000015832)	hspa5 (ENSPREG00000015941) #22	rabepk (ENSPREG00000015988) #23	ENSPREG00000016039	znf618 (ENSPREG00000016147)	pappaa (ENSPREG00000016205)	ASTN2 (ENSPREG00000016294)	trim32 (ENSPREG00000016376)	ENSPREG00000016389	brinp1 (ENSPREG00000016405)	ENSPREG00000016434	ak1 (ENSPREG00000016472)	gpsm1b (ENSPREG00000016502)	LHX3 (ENSPREG00000016521)	TMEM250 (ENSPREG00000016544)	NACC2 (ENSPREG00000016554)	ENSPREG00000016577
Platyfish	MODERN SPECIES	22	ENSXMAG00000020905	fbxw5 (ENSXMAG00000005523)	ENSXMAG00000021921	prdm12b (ENSXMAG00000005537)	fubp3 (ENSXMAG00000005541)	ASS1 (ENSXMAG00000005558)	surf4 (ENSXMAG00000021269)	surf2 (ENSXMAG00000005594)	ENSXMAG00000023613	bbln (ENSXMAG00000005599)	dnm1a (ENSXMAG00000005602)	ENSXMAG00000025673	ENSXMAG00000027588	golga2 (ENSXMAG00000005654)	rabepk (ENSXMAG00000027947) #23	hspa5 (ENSXMAG00000005672) #22	ENSXMAG00000026805	znf618 (ENSXMAG00000023810)	pappaa (ENSXMAG00000005728)	ASTN2 (ENSXMAG00000005754)	trim32 (ENSXMAG00000005801)	ENSXMAG00000026027	MYL4 (ENSXMAG00000019800)	brinp1 (ENSXMAG00000011281)	ENSXMAG00000025101	ak1 (ENSXMAG00000011293)	gpsm1b (ENSXMAG00000011298)	LHX3 (ENSXMAG00000011308)	TMEM250 (ENSXMAG00000019658)	NACC2 (ENSXMAG00000011321)	ENSXMAG00000011331
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT01010000222537	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1611	bspry (ENSNFUG00015019678)	COQ4 (ENSNFUG00015019693)	TRAF2B (ENSNFUG00015019722)	FBXW5 (ENSNFUG00015019737)	ENSNFUG00015019747	prdm12b (ENSNFUG00015019752)	FUBP3 (ENSNFUG00015019813)	ASS1 (ENSNFUG00015020918)	SURF4 (ENSNFUG00015020925)	rnf213a (ENSNFUG00015020954)	SURF2 (ENSNFUG00015020969)	C9ORF16 (ENSNFUG00015020971)	ENSNFUG00015020975	dnm1a (ENSNFUG00015020984)	golga2 (ENSNFUG00015021013)	hspa5 (ENSNFUG00015021050) #22	RABEPK (ENSNFUG00015021149) #23	rgs3a (ENSNFUG00015021154)	ENSNFUG00015021158	znf618 (ENSNFUG00015021162)	pappaa (ENSNFUG00015021209)	ASTN2 (ENSNFUG00015021831)	ENSNFUG00015021939	trim32 (ENSNFUG00015021942)	ENSNFUG00015021944	MYL4 (ENSNFUG00015021947)	ENSNFUG00015021949	ENSNFUG00015021950	DBC1 (ENSNFUG00015021952)	ENSNFUG00015021957	Nfu_g_1_006350 (ENSNFUG00015000243)
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	9	zmynd19 (ENSKMAG00000017039)	bspry (ENSKMAG00000017015)	coq4 (ENSKMAG00000017001)	ENSKMAG00000016968	fbxw5 (ENSKMAG00000016939)	prdm12b (ENSKMAG00000016921)	fubp3 (ENSKMAG00000016886)	ASS1 (ENSKMAG00000016836)	surf4 (ENSKMAG00000016807)	surf2 (ENSKMAG00000016793)	bbln (ENSKMAG00000016786)	ENSKMAG00000016778	ENSKMAG00000016761	dnm1a (ENSKMAG00000016496)	golga2 (ENSKMAG00000016273)	hspa5 (ENSKMAG00000016210) #22	rabepk (ENSKMAG00000016174) #23	rgs3a (ENSKMAG00000016131)	znf618 (ENSKMAG00000016099)	pappaa (ENSKMAG00000016013)	trim32 (ENSKMAG00000015984)	ASTN2 (ENSKMAG00000015878)	ENSKMAG00000015836	brinp1 (ENSKMAG00000015805)	ENSKMAG00000015764	ak1 (ENSKMAG00000015726)	gpsm1b (ENSKMAG00000015670)	LHX3 (ENSKMAG00000015643)	TMEM250 (ENSKMAG00000015629)	NACC2 (ENSKMAG00000015604)	NUP214 (ENSKMAG00000015549)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Midas cichlid	MODERN SPECIES	75	tmem141 (ENSACIG00000019464)	zmynd19 (ENSACIG00000019495)	bspry (ENSACIG00000019511)	coq4 (ENSACIG00000019527)	ENSACIG00000019540	ENSACIG00000019560	ENSACIG00000019572	prdm12b (ENSACIG00000019578)	fubp3 (ENSACIG00000019595)	ASS1 (ENSACIG00000019637)	surf4 (ENSACIG00000019661)	surf2 (ENSACIG00000019681)	bbln (ENSACIG00000019739)	dnm1a (ENSACIG00000019754)	ENSACIG00000019825	hspa5 (ENSACIG00000019853) #22	rabepk (ENSACIG00000019875) #23	ENSACIG00000019933	ENSACIG00000019944	znf618 (ENSACIG00000019967)	pappaa (ENSACIG00000019993)	ASTN2 (ENSACIG00000020031)	trim32 (ENSACIG00000020078)	MYL4 (ENSACIG00000020084)
Pseudocrenilabrinae	DUPLICATION
Pseudocrenilabrinae	DUPLICATION
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787.m.a #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787.m.a #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	304	tmem141 (ENSNBRG00000006502)	zmynd19 (ENSNBRG00000006551)	bspry (ENSNBRG00000006579)	coq4 (ENSNBRG00000006617)	ENSNBRG00000006630	fbxw5 (ENSNBRG00000006664)	ENSNBRG00000006712	prdm12b (ENSNBRG00000006727)	fubp3 (ENSNBRG00000006751)	ASS1 (ENSNBRG00000006802)	surf4 (ENSNBRG00000006863)	surf2 (ENSNBRG00000006881)	bbln (ENSNBRG00000006884)	dnm1a (ENSNBRG00000006903)	golga2 (ENSNBRG00000007147)	hspa5 (ENSNBRG00000007293) #22	ENSNBRG00000007323	rabepk (ENSNBRG00000007333) #23	ENSNBRG00000007353 #22	ENSNBRG00000007378	rgs3a (ENSNBRG00000007426)	znf618 (ENSNBRG00000007434)	pappaa (ENSNBRG00000007479)	ASTN2 (ENSNBRG00000007542)	trim32 (ENSNBRG00000007621)	ENSNBRG00000007630	brinp1 (ENSNBRG00000007641)	ENSNBRG00000007664	ak1 (ENSNBRG00000007689)	gpsm1b (ENSNBRG00000007717)	LHX3 (ENSNBRG00000007742)
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787.m.a #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	383	zmynd19 (ENSHBUG00000023004)	bspry (ENSHBUG00000022987)	coq4 (ENSHBUG00000022977)	ENSHBUG00000022970	fbxw5 (ENSHBUG00000022935)	ENSHBUG00000022889	prdm12b (ENSHBUG00000022878)	fubp3 (ENSHBUG00000022849)	ASS1 (ENSHBUG00000022751)	surf4 (ENSHBUG00000022701)	surf2 (ENSHBUG00000022663)	bbln (ENSHBUG00000022643)	ENSHBUG00000022629	dnm1a (ENSHBUG00000022608)	golga2 (ENSHBUG00000022368)	hspa5 (ENSHBUG00000022256) #22	rabepk (ENSHBUG00000022265) #23	rgs3a (ENSHBUG00000022214)	znf618 (ENSHBUG00000022197)	pappaa (ENSHBUG00000022175)	ASTN2 (ENSHBUG00000022124)	trim32 (ENSHBUG00000022016)	ENSHBUG00000022008
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787.m.a #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00940000160949	ENSGT00390000003140.B	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Haplochromini_B	DUPLICATION
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787.m.a.a #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT00940000158431.a.a.a.a.a.b.b.c.a.c.a.a	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b
Eastern happy	DUPLICATION
Eastern happy	MODERN SPECIES	19	ENSACLG00000012032	ENSACLG00000012014	ENSACLG00000011998	fbxw5 (ENSACLG00000011907)	prdm12b (ENSACLG00000011876)	fubp3 (ENSACLG00000011819)	ASS1 (ENSACLG00000011726)	surf4 (ENSACLG00000011354)	surf2 (ENSACLG00000011352)	bbln (ENSACLG00000011347)	ENSACLG00000011341	dnm1a (ENSACLG00000011279)	golga2 (ENSACLG00000011018)	hspa5 (ENSACLG00000010993) #22	ENSACLG00000010959 #23	hspa5 (ENSACLG00000010903) #22	rabepk (ENSACLG00000010841) #23	ENSACLG00000010837	ENSACLG00000010817	ENSACLG00000010795	znf618 (ENSACLG00000010543)	ENSACLG00000010529	pappaa (ENSACLG00000010446)	trim32 (ENSACLG00000010049)	ASTN2 (ENSACLG00000009953)	ENSACLG00000009610	ENSACLG00000009608	ENSACLG00000009605	ENSACLG00000009592	ENSACLG00000009590	ENSACLG00000009589
Eastern happy	MODERN SPECIES	19	bspry (ENSACLG00000012152)	coq4 (ENSACLG00000012074)	ENSACLG00000012032	ENSACLG00000012014	ENSACLG00000011998	fbxw5 (ENSACLG00000011907)	prdm12b (ENSACLG00000011876)	fubp3 (ENSACLG00000011819)	ASS1 (ENSACLG00000011726)	surf4 (ENSACLG00000011354)	surf2 (ENSACLG00000011352)	bbln (ENSACLG00000011347)	ENSACLG00000011341	dnm1a (ENSACLG00000011279)	golga2 (ENSACLG00000011018)	hspa5 (ENSACLG00000010993) #22	ENSACLG00000010959 #23	hspa5 (ENSACLG00000010903) #22	rabepk (ENSACLG00000010841) #23	ENSACLG00000010837	ENSACLG00000010817	ENSACLG00000010795	znf618 (ENSACLG00000010543)	ENSACLG00000010529	pappaa (ENSACLG00000010446)	trim32 (ENSACLG00000010049)	ASTN2 (ENSACLG00000009953)	ENSACLG00000009610	ENSACLG00000009608	ENSACLG00000009605	ENSACLG00000009592
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1110	ENSMZEG00005018908	PAX8 (ENSMZEG00005018918)	ARL3 (ENSMZEG00005018934)	wbp1 (ENSMZEG00005019216)	lman2la (ENSMZEG00005019224)	ENSMZEG00005019229	ASS1 (ENSMZEG00005019245)	surf4 (ENSMZEG00005019249)	surf2 (ENSMZEG00005019255)	bbln (ENSMZEG00005019259)	ENSMZEG00005019261	dnm1a (ENSMZEG00005019282)	golga2 (ENSMZEG00005019354)	hspa5 (ENSMZEG00005019431) #22	rabepk (ENSMZEG00005019435) #23	hspa5 (ENSMZEG00005019440) #22	ENSMZEG00005019479	ENSMZEG00005019489	znf618 (ENSMZEG00005019490)	pappaa (ENSMZEG00005019502)	ASTN2 (ENSMZEG00005019509)	trim32 (ENSMZEG00005019516)	ENSMZEG00005019528	ENSMZEG00005019533	ENSMZEG00005019535	brinp1 (ENSMZEG00005019539)	ENSMZEG00005019543	ak1 (ENSMZEG00005019548)	gpsm1b (ENSMZEG00005019553)	LHX3 (ENSMZEG00005019555)	TMEM250 (ENSMZEG00005019558)
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154787.m.a.b #22
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1110	ENSMZEG00005018899	ENSMZEG00005018902	ENSMZEG00005018908	PAX8 (ENSMZEG00005018918)	ARL3 (ENSMZEG00005018934)	wbp1 (ENSMZEG00005019216)	lman2la (ENSMZEG00005019224)	ENSMZEG00005019229	ASS1 (ENSMZEG00005019245)	surf4 (ENSMZEG00005019249)	surf2 (ENSMZEG00005019255)	bbln (ENSMZEG00005019259)	ENSMZEG00005019261	dnm1a (ENSMZEG00005019282)	golga2 (ENSMZEG00005019354)	hspa5 (ENSMZEG00005019431) #22	rabepk (ENSMZEG00005019435) #23	hspa5 (ENSMZEG00005019440) #22	ENSMZEG00005019479	ENSMZEG00005019489	znf618 (ENSMZEG00005019490)	pappaa (ENSMZEG00005019502)	ASTN2 (ENSMZEG00005019509)	trim32 (ENSMZEG00005019516)	ENSMZEG00005019528	ENSMZEG00005019533	ENSMZEG00005019535	brinp1 (ENSMZEG00005019539)	ENSMZEG00005019543	ak1 (ENSMZEG00005019548)	gpsm1b (ENSMZEG00005019553)
P. nyererei	DUPLICATION
P. nyererei	MODERN SPECIES	99																hspa5 (ENSPNYG00000024227) #22
P. nyererei	MODERN SPECIES	297	zmynd19 (ENSPNYG00000009727)	bspry (ENSPNYG00000009715)	coq4 (ENSPNYG00000009707)	ENSPNYG00000009680	ENSPNYG00000009661	fbxw5 (ENSPNYG00000009625)	prdm12b (ENSPNYG00000009607)	fubp3 (ENSPNYG00000009567)	ASS1 (ENSPNYG00000009531)	surf4 (ENSPNYG00000009510)	surf2 (ENSPNYG00000009505)	bbln (ENSPNYG00000009498)	ENSPNYG00000009489	dnm1a (ENSPNYG00000009429)	golga2 (ENSPNYG00000009327)	ENSPNYG00000009288 #22	rabepk (ENSPNYG00000009267) #23	ENSPNYG00000009230	ENSPNYG00000009217	znf618 (ENSPNYG00000009190)	pappaa (ENSPNYG00000009132)	trim32 (ENSPNYG00000009122)	ASTN2 (ENSPNYG00000009059)	ENSPNYG00000009043	ENSPNYG00000008996	ENSPNYG00000008977	brinp1 (ENSPNYG00000008957)	ENSPNYG00000008931	ak1 (ENSPNYG00000008907)	gpsm1b (ENSPNYG00000008882)	LHX3 (ENSPNYG00000008852)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	19	bspry (ENSONIG00000000222)	ENSONIG00000030868	coq4 (ENSONIG00000002878)	ENSONIG00000002876	fbxw5 (ENSONIG00000002875)	ENSONIG00000034621	prdm12b (ENSONIG00000002871)	fubp3 (ENSONIG00000002861)	ASS1 (ENSONIG00000002858)	SURF4 (ENSONIG00000033846)	surf2 (ENSONIG00000002852)	bbln (ENSONIG00000040945)	ENSONIG00000002850	dnm1a (ENSONIG00000002836)	golga2 (ENSONIG00000002830)	hspa5 (ENSONIG00000039112) #22	rabepk (ENSONIG00000037252) #23	ENSONIG00000015006	znf618 (ENSONIG00000015003)	pappaa (ENSONIG00000015000)	trim32 (ENSONIG00000020998)	ASTN2 (ENSONIG00000014991)	ENSONIG00000020997	brinp1 (ENSONIG00000014989)	ENSONIG00000027713	ak1 (ENSONIG00000014988)	gpsm1b (ENSONIG00000014985)	LHX3 (ENSONIG00000014981)	TMEM250 (ENSONIG00000031991)	NACC2 (ENSONIG00000014979)	ENSONIG00000014974
Pseudocrenilabrinae	DUPLICATION
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154787.m.b.a #22
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154787.m.b.a #22
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154787.m.b.a #22
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154787.m.b.a #22
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154787.m.b.a #22
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	196													hspa5 (ENSMZEG00005025386) #22	ENSMZEG00005026142	ENSMZEG00005026143	hspa5 (ENSMZEG00005026154) #22	ENSMZEG00005026567	ENSMZEG00005026568	tfr2 (ENSMZEG00005026570)
Eastern happy	MODERN SPECIES	15	ENSACLG00000022996	ENSACLG00000023233	ENSACLG00000023236	ENSACLG00000023249	ENSACLG00000023261	ENSACLG00000023313	ENSACLG00000023384	ENSACLG00000023412	ENSACLG00000023435	ENSACLG00000023452	ENSACLG00000023465	ENSACLG00000023514	ENSACLG00000023524	ENSACLG00000023533	ENSACLG00000023554	hspa5 (ENSACLG00000023833) #22	ENSACLG00000027127	ENSACLG00000027130	ENSACLG00000027137	ENSACLG00000027144	ENSACLG00000027151	tfr2 (ENSACLG00000027157)	ENSACLG00000027188	tfr2 (ENSACLG00000027194)	ENSACLG00000027204	ENSACLG00000027221	ENSACLG00000027226	ENSACLG00000027258	ENSACLG00000027318	ENSACLG00000027843	ENSACLG00000027844
Nile tilapia	MODERN SPECIES	15	ENSONIG00000030375	ENSONIG00000012505	ENSONIG00000036861	ENSONIG00000001646	ENSONIG00000039884	ENSONIG00000038525	ENSONIG00000001647	ENSONIG00000043236	ENSONIG00000031086	ENSONIG00000038914	ENSONIG00000012428	ENSONIG00000036129	hspa5 (ENSONIG00000038508) #22	ENSONIG00000033777	ENSONIG00000012441	hspa5 (ENSONIG00000033493) #22	ENSONIG00000034667	ENSONIG00000028937	ENSONIG00000027829	ENSONIG00000029024	ENSONIG00000028795	ENSONIG00000038663	ENSONIG00000041441	ENSONIG00000030652	ENSONIG00000039059	hspa5 (ENSONIG00000030303) #22	ENSONIG00000032731	hspa5 (ENSONIG00000042812) #22	ENSONIG00000037969	ENSONIG00000040574	ENSONIG00000008338
Pseudocrenilabrinae	DUPLICATION
Pseudocrenilabrinae	DUPLICATION
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154787.m.b.b.a.a #22
Nile tilapia	MODERN SPECIES	15	ENSONIG00000042450	ENSONIG00000008003	ENSONIG00000039526	ENSONIG00000030375	ENSONIG00000012505	ENSONIG00000036861	ENSONIG00000001646	ENSONIG00000039884	ENSONIG00000038525	ENSONIG00000001647	ENSONIG00000043236	ENSONIG00000031086	ENSONIG00000038914	ENSONIG00000012428	ENSONIG00000036129	hspa5 (ENSONIG00000038508) #22	ENSONIG00000033777	ENSONIG00000012441	hspa5 (ENSONIG00000033493) #22	ENSONIG00000034667	ENSONIG00000028937	ENSONIG00000027829	ENSONIG00000029024	ENSONIG00000028795	ENSONIG00000038663	ENSONIG00000041441	ENSONIG00000030652	ENSONIG00000039059	hspa5 (ENSONIG00000030303) #22	ENSONIG00000032731	hspa5 (ENSONIG00000042812) #22
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154787.m.b.b.a.a #22
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154787.m.b.b.a.a #22
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154787.m.b.b.a.a #22
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154787.m.b.b.a.a #22
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	196																hspa5 (ENSMZEG00005025386) #22	ENSMZEG00005026142	ENSMZEG00005026143	hspa5 (ENSMZEG00005026154) #22	ENSMZEG00005026567	ENSMZEG00005026568	tfr2 (ENSMZEG00005026570)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	536												ENSNBRG00000019061	ENSNBRG00000019008	ENSNBRG00000018946	ENSNBRG00000018903	hspa5 (ENSNBRG00000018814) #22	ENSNBRG00000017492	ENSNBRG00000016928	ENSNBRG00000015866
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154787.m.b.b.a.b #22
Nile tilapia	MODERN SPECIES	15	ENSONIG00000003614	ENSONIG00000032960	tfr2 (ENSONIG00000019005)	ENSONIG00000028226	ENSONIG00000019001	ENSONIG00000036285	ENSONIG00000007445	ENSONIG00000032985	ENSONIG00000028371	ENSONIG00000036365	ENSONIG00000008338	ENSONIG00000040574	ENSONIG00000037969	hspa5 (ENSONIG00000042812) #22	ENSONIG00000032731	hspa5 (ENSONIG00000030303) #22	ENSONIG00000039059	ENSONIG00000030652	ENSONIG00000041441	ENSONIG00000038663	ENSONIG00000028795	ENSONIG00000029024	ENSONIG00000027829	ENSONIG00000028937	ENSONIG00000034667	hspa5 (ENSONIG00000033493) #22	ENSONIG00000012441	ENSONIG00000033777	hspa5 (ENSONIG00000038508) #22	ENSONIG00000036129	ENSONIG00000012428
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154787.m.b.b.b #22
Nile tilapia	MODERN SPECIES	15	hspa5 (ENSONIG00000038508) #22	ENSONIG00000033777	ENSONIG00000012441	hspa5 (ENSONIG00000033493) #22	ENSONIG00000034667	ENSONIG00000028937	ENSONIG00000027829	ENSONIG00000029024	ENSONIG00000028795	ENSONIG00000038663	ENSONIG00000041441	ENSONIG00000030652	ENSONIG00000039059	hspa5 (ENSONIG00000030303) #22	ENSONIG00000032731	hspa5 (ENSONIG00000042812) #22	ENSONIG00000037969	ENSONIG00000040574	ENSONIG00000008338	ENSONIG00000036365	ENSONIG00000028371	ENSONIG00000032985	ENSONIG00000007445	ENSONIG00000036285	ENSONIG00000019001	ENSONIG00000028226	tfr2 (ENSONIG00000019005)	ENSONIG00000032960	ENSONIG00000003614	ENSONIG00000028695	ENSONIG00000037234
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154787.n #22
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154787.n #22
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	304	coq4 (ENSNBRG00000006617)	ENSNBRG00000006630	fbxw5 (ENSNBRG00000006664)	ENSNBRG00000006712	prdm12b (ENSNBRG00000006727)	fubp3 (ENSNBRG00000006751)	ASS1 (ENSNBRG00000006802)	surf4 (ENSNBRG00000006863)	surf2 (ENSNBRG00000006881)	bbln (ENSNBRG00000006884)	dnm1a (ENSNBRG00000006903)	golga2 (ENSNBRG00000007147)	hspa5 (ENSNBRG00000007293) #22	ENSNBRG00000007323	rabepk (ENSNBRG00000007333) #23	ENSNBRG00000007353 #22	ENSNBRG00000007378	rgs3a (ENSNBRG00000007426)	znf618 (ENSNBRG00000007434)	pappaa (ENSNBRG00000007479)	ASTN2 (ENSNBRG00000007542)	trim32 (ENSNBRG00000007621)	ENSNBRG00000007630	brinp1 (ENSNBRG00000007641)	ENSNBRG00000007664	ak1 (ENSNBRG00000007689)	gpsm1b (ENSNBRG00000007717)	LHX3 (ENSNBRG00000007742)	TMEM250 (ENSNBRG00000007770)	NACC2 (ENSNBRG00000007781)	NUP214 (ENSNBRG00000007835)
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154787.n #22
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	1302																ENSHBUG00000000978 #22	ENSHBUG00000021587
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00940000160949	ENSGT00390000003140.B	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000153253.b.b
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	1888										ENSSPAG00000016724	dnm1a (ENSSPAG00000016689)	ENSSPAG00000016681	golga2 (ENSSPAG00000016623)	ENSSPAG00000016610	rabepk (ENSSPAG00000016601) #23	hspa5 (ENSSPAG00000016545) #22
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B.y.a	ENSGT00390000003140.B.y.b	ENSGT00940000160949	ENSGT00390000003140.B.z	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276.c	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B.y.a	ENSGT00390000003140.B.y.b	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000182116	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1864															golga2 (ENSAOCG00000015050)	hspa5 (ENSAOCG00000014905) #22	rabepk (ENSAOCG00000014888) #23	rgs3a (ENSAOCG00000014858)	znf618 (ENSAOCG00000014814)	pappaa (ENSAOCG00000014767)
Orange clownfish	DUPLICATION
Orange clownfish	MODERN SPECIES	7	coq4 (ENSAPEG00000014905)	ENSAPEG00000014928	fbxw5 (ENSAPEG00000015014)	ENSAPEG00000015074	prdm12b (ENSAPEG00000015092)	fubp3 (ENSAPEG00000015125)	ASS1 (ENSAPEG00000015205)	surf4 (ENSAPEG00000015261)	surf2 (ENSAPEG00000015320)	bbln (ENSAPEG00000015330)	ENSAPEG00000015342	dnm1a (ENSAPEG00000015367)	golga2 (ENSAPEG00000015484)	rabepk (ENSAPEG00000015681) #23	hspa5 (ENSAPEG00000015641) #22	HSPA5 (ENSAPEG00000015695) #22	ENSAPEG00000015721	ENSAPEG00000015749	znf618 (ENSAPEG00000015770)	pappaa (ENSAPEG00000015801)	ASTN2 (ENSAPEG00000015932)	trim32 (ENSAPEG00000016012)	MYL4 (ENSAPEG00000016034)	ENSAPEG00000016050	brinp1 (ENSAPEG00000016081)	ENSAPEG00000016115	ak1 (ENSAPEG00000016123)	gpsm1b (ENSAPEG00000016148)	LHX3 (ENSAPEG00000016182)	NACC2 (ENSAPEG00000016216)	NUP214 (ENSAPEG00000016262)
Orange clownfish	MODERN SPECIES	7	bspry (ENSAPEG00000014861)	coq4 (ENSAPEG00000014905)	ENSAPEG00000014928	fbxw5 (ENSAPEG00000015014)	ENSAPEG00000015074	prdm12b (ENSAPEG00000015092)	fubp3 (ENSAPEG00000015125)	ASS1 (ENSAPEG00000015205)	surf4 (ENSAPEG00000015261)	surf2 (ENSAPEG00000015320)	bbln (ENSAPEG00000015330)	ENSAPEG00000015342	dnm1a (ENSAPEG00000015367)	golga2 (ENSAPEG00000015484)	rabepk (ENSAPEG00000015681) #23	hspa5 (ENSAPEG00000015641) #22	HSPA5 (ENSAPEG00000015695) #22	ENSAPEG00000015721	ENSAPEG00000015749	znf618 (ENSAPEG00000015770)	pappaa (ENSAPEG00000015801)	ASTN2 (ENSAPEG00000015932)	trim32 (ENSAPEG00000016012)	MYL4 (ENSAPEG00000016034)	ENSAPEG00000016050	brinp1 (ENSAPEG00000016081)	ENSAPEG00000016115	ak1 (ENSAPEG00000016123)	gpsm1b (ENSAPEG00000016148)	LHX3 (ENSAPEG00000016182)	NACC2 (ENSAPEG00000016216)
Spiny chromis	DUPLICATION
Spiny chromis	DUPLICATION
Spiny chromis	MODERN SPECIES	310	bspry (ENSAPOG00000015899)	coq4 (ENSAPOG00000015932)	ENSAPOG00000015993	ENSAPOG00000016009	fbxw5 (ENSAPOG00000016024)	prdm12b (ENSAPOG00000016051)	fubp3 (ENSAPOG00000016135)	ASS1 (ENSAPOG00000016183)	surf4 (ENSAPOG00000016200)	surf2 (ENSAPOG00000016206)	bbln (ENSAPOG00000016220)	ENSAPOG00000016241	dnm1a (ENSAPOG00000016281)	golga2 (ENSAPOG00000016337)	hspa5 (ENSAPOG00000016377) #22	ENSAPOG00000016402 #22	rabepk (ENSAPOG00000016414) #23	ENSAPOG00000016429 #22	ENSAPOG00000016517
Spiny chromis	MODERN SPECIES	310	zmynd19 (ENSAPOG00000015845)	bspry (ENSAPOG00000015899)	coq4 (ENSAPOG00000015932)	ENSAPOG00000015993	ENSAPOG00000016009	fbxw5 (ENSAPOG00000016024)	prdm12b (ENSAPOG00000016051)	fubp3 (ENSAPOG00000016135)	ASS1 (ENSAPOG00000016183)	surf4 (ENSAPOG00000016200)	surf2 (ENSAPOG00000016206)	bbln (ENSAPOG00000016220)	ENSAPOG00000016241	dnm1a (ENSAPOG00000016281)	golga2 (ENSAPOG00000016337)	hspa5 (ENSAPOG00000016377) #22	ENSAPOG00000016402 #22	rabepk (ENSAPOG00000016414) #23	ENSAPOG00000016429 #22	ENSAPOG00000016517
Spiny chromis	DUPLICATION
Spiny chromis	DUPLICATION
Spiny chromis	MODERN SPECIES	4514																ENSAPOG00000020874 #22
Spiny chromis	MODERN SPECIES	4524																ENSAPOG00000020752 #22
Spiny chromis	MODERN SPECIES	310	ENSAPOG00000015993	ENSAPOG00000016009	fbxw5 (ENSAPOG00000016024)	prdm12b (ENSAPOG00000016051)	fubp3 (ENSAPOG00000016135)	ASS1 (ENSAPOG00000016183)	surf4 (ENSAPOG00000016200)	surf2 (ENSAPOG00000016206)	bbln (ENSAPOG00000016220)	ENSAPOG00000016241	dnm1a (ENSAPOG00000016281)	golga2 (ENSAPOG00000016337)	hspa5 (ENSAPOG00000016377) #22	ENSAPOG00000016402 #22	rabepk (ENSAPOG00000016414) #23	ENSAPOG00000016429 #22	ENSAPOG00000016517
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	3	zmynd19 (ENSMAMG00000025065)	bspry (ENSMAMG00000013084)	COQ4 (ENSMAMG00000027953)	ENSMAMG00000013138	fbxw5 (ENSMAMG00000013169)	ENSMAMG00000013194	PRDM12 (ENSMAMG00000013212)	ENSMAMG00000013259	ASS1 (ENSMAMG00000013331)	surf4 (ENSMAMG00000028137)	surf2 (ENSMAMG00000013394)	bbln (ENSMAMG00000013421)	ENSMAMG00000013408	dnm1a (ENSMAMG00000013431)	golga2 (ENSMAMG00000013501)	ENSMAMG00000013572 #22	ENSMAMG00000028244 #23	ENSMAMG00000013613	znf618 (ENSMAMG00000013660)	pappaa (ENSMAMG00000013720)	ENSMAMG00000013788	TRIM32 (ENSMAMG00000024727)	ENSMAMG00000025927	ENSMAMG00000026585	brinp1 (ENSMAMG00000013874)	ENSMAMG00000013906	AK1 (ENSMAMG00000027308)	gpsm1b (ENSMAMG00000013932)	LHX3 (ENSMAMG00000014008)	TMEM250 (ENSMAMG00000014023)	NACC2 (ENSMAMG00000014038)
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000153116.D	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Climbing perch	MODERN SPECIES	3	tmem141 (ENSATEG00000029937)	zmynd19 (ENSATEG00000027841)	bspry (ENSATEG00000018141)	coq4 (ENSATEG00000018127)	ENSATEG00000018082	fbxw5 (ENSATEG00000018044)	PRDM12 (ENSATEG00000029530)	ENSATEG00000018030	ASS1 (ENSATEG00000017991)	surf4 (ENSATEG00000017980)	surf2 (ENSATEG00000017959)	C9orf16 (ENSATEG00000025511)	ENSATEG00000017923	dnm1a (ENSATEG00000017880)	golga2 (ENSATEG00000017779)	ENSATEG00000017748 #22	ENSATEG00000017715 #23	ENSATEG00000017666	znf618 (ENSATEG00000017624)	pappaa (ENSATEG00000017511)	TRIM32 (ENSATEG00000017502)	ASTN2 (ENSATEG00000017425)	ENSATEG00000029037	brinp1 (ENSATEG00000030167)	ENSATEG00000029129	ENSATEG00000017362	ak1 (ENSATEG00000017339)	gpsm1b (ENSATEG00000017299)	LHX3 (ENSATEG00000017273)	TMEM250 (ENSATEG00000017269)	NACC2 (ENSATEG00000017233)
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	3	tmem141 (ENSBSLG00000014987)	zmynd19 (ENSBSLG00000015147)	bspry (ENSBSLG00000015185)	coq4 (ENSBSLG00000015207)	ENSBSLG00000015231	fbxw5 (ENSBSLG00000015349)	prdm12b (ENSBSLG00000015415)	fubp3 (ENSBSLG00000015474)	ASS1 (ENSBSLG00000016773)	surf4 (ENSBSLG00000017160)	surf2 (ENSBSLG00000017298)	bbln (ENSBSLG00000017308)	ENSBSLG00000017322	dnm1a (ENSBSLG00000017424)	golga2 (ENSBSLG00000018970)	hspa5 (ENSBSLG00000019214) #22	rabepk (ENSBSLG00000019324) #23	ENSBSLG00000019415	znf618 (ENSBSLG00000019471)	pappaa (ENSBSLG00000019800)	ASTN2 (ENSBSLG00000020045)	trim32 (ENSBSLG00000020330)	MYL4 (ENSBSLG00000020334)	brinp1 (ENSBSLG00000020338)	ENSBSLG00000020342	ak1 (ENSBSLG00000020346)	gpsm1b (ENSBSLG00000020362)	LHX3 (ENSBSLG00000020542)	TMEM250 (ENSBSLG00000020551)	NACC2 (ENSBSLG00000020553)	ENSBSLG00000020557
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT01010000222537	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00940000160949	ENSGT00390000003140.B	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT01010000222537	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b
Barramundi perch	MODERN SPECIES	329	zmynd19 (ENSLCAG00010007833)	bspry (ENSLCAG00010007844)	coq4 (ENSLCAG00010007852)	ENSLCAG00010007860	fbxw5 (ENSLCAG00010007873)	ENSLCAG00010007889	prdm12b (ENSLCAG00010007892)	fubp3 (ENSLCAG00010007907)	ASS1 (ENSLCAG00010007957)	surf4 (ENSLCAG00010008047)	surf2 (ENSLCAG00010008078)	bbln (ENSLCAG00010008082)	ENSLCAG00010008084	dnm1a (ENSLCAG00010008116)	golga2 (ENSLCAG00010008151)	hspa5 (ENSLCAG00010008175) #22	rabepk (ENSLCAG00010008244) #23	rgs3a (ENSLCAG00010008251)	znf618 (ENSLCAG00010008283)	pappaa (ENSLCAG00010008312)
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00940000176908	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2993	tmem141 (ENSSLDG00000009782)	zmynd19 (ENSSLDG00000009755)	bspry (ENSSLDG00000009739)	coq4 (ENSSLDG00000009715)	ENSSLDG00000009677	ENSSLDG00000009654	fbxw5 (ENSSLDG00000009600)	prdm12b (ENSSLDG00000009557)	fubp3 (ENSSLDG00000009455)	ASS1 (ENSSLDG00000009327)	surf2 (ENSSLDG00000009296)	bbln (ENSSLDG00000009275)	ENSSLDG00000009246	dnm1a (ENSSLDG00000008896)	golga2 (ENSSLDG00000008687)	hspa5 (ENSSLDG00000008640) #22	rabepk (ENSSLDG00000008624) #23	ENSSLDG00000008573	znf618 (ENSSLDG00000008525)	pappaa (ENSSLDG00000008407)	trim32 (ENSSLDG00000008373)	ASTN2 (ENSSLDG00000008315)	ENSSLDG00000008294	brinp1 (ENSSLDG00000008271)	ENSSLDG00000008248	ak1 (ENSSLDG00000008196)	gpsm1b (ENSSLDG00000008113)	LHX3 (ENSSLDG00000008060)	TMEM250 (ENSSLDG00000008041)	NACC2 (ENSSLDG00000007987)	NUP214 (ENSSLDG00000007931)
Greater amberjack	MODERN SPECIES	296					ENSSDUG00000023501	fbxw5 (ENSSDUG00000023500)	prdm12b (ENSSDUG00000023498)	fubp3 (ENSSDUG00000023495)	ASS1 (ENSSDUG00000023489)	surf4 (ENSSDUG00000023487)	surf2 (ENSSDUG00000023486)	bbln (ENSSDUG00000023485)	ENSSDUG00000023483	dnm1a (ENSSDUG00000023479)	golga2 (ENSSDUG00000023470)	hspa5 (ENSSDUG00000023465) #22	rabepk (ENSSDUG00000023462) #23	ENSSDUG00000023460	ENSSDUG00000023458	znf618 (ENSSDUG00000023449)	pappaa (ENSSDUG00000023445)
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000153116.D	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT01010000222537	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Tongue sole	MODERN SPECIES	5	zmynd19 (ENSCSEG00000018480)	bspry (ENSCSEG00000018475)	coq4 (ENSCSEG00000018468)	ENSCSEG00000018446	fbxw5 (ENSCSEG00000018408)	prdm12b (ENSCSEG00000017877)	fubp3 (ENSCSEG00000017815)	ASS1 (ENSCSEG00000017796)	surf4 (ENSCSEG00000017790)	surf2 (ENSCSEG00000017777)	bbln (ENSCSEG00000017771)	ENSCSEG00000017763	dnm1a (ENSCSEG00000017677)	golga2 (ENSCSEG00000017643)	rabepk (ENSCSEG00000017627) #23	hspa5 (ENSCSEG00000017610) #22	ENSCSEG00000017576	rgs3a (ENSCSEG00000017543)	znf618 (ENSCSEG00000017506)	RAD23B (ENSCSEG00000017491)	ZNF462 (ENSCSEG00000017479)	TMEM38B (ENSCSEG00000017467)	PRAG1 (ENSCSEG00000017462)	edf1 (ENSCSEG00000017450)	PRRC2B (ENSCSEG00000017429)	PLPP7 (ENSCSEG00000017426)	fam78ab (ENSCSEG00000017421)	ENSCSEG00000017366	NACC2 (ENSCSEG00000017316)	LHX3 (ENSCSEG00000017295)	ENSCSEG00000017292
Turbot	MODERN SPECIES	7	bspry (ENSSMAG00000030034)	zmynd19 (ENSSMAG00000003656)	coq4 (ENSSMAG00000003693)	TRAF2 (ENSSMAG00000003707)	fbxw5 (ENSSMAG00000003725)	ENSSMAG00000029428	PRDM12 (ENSSMAG00000003754)	ENSSMAG00000003793	ASS1 (ENSSMAG00000003884)	surf4 (ENSSMAG00000028722)	surf2 (ENSSMAG00000003923)	bbln (ENSSMAG00000003931)	ENSSMAG00000003942	dnm1a (ENSSMAG00000003999)	golga2 (ENSSMAG00000004193)	ENSSMAG00000004412 #22	ENSSMAG00000004433 #23	ENSSMAG00000004459	znf618 (ENSSMAG00000004591)	pappaa (ENSSMAG00000004665)	ASTN2 (ENSSMAG00000004767)	TRIM32 (ENSSMAG00000025791)	ENSSMAG00000004829	brinp1 (ENSSMAG00000004917)	ENSSMAG00000004939	AK1 (ENSSMAG00000004960)	gpsm1b (ENSSMAG00000004990)	LHX3 (ENSSMAG00000005007)	TMEM250 (ENSSMAG00000005026)	NACC2 (ENSSMAG00000005034)	ENSSMAG00000005051
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000159718	ENSGT00940000153385.a	ENSGT00940000154143.c.b	ENSGT00940000159789	ENSGT00940000154909.a.b	ENSGT00940000159475.d	ENSGT00940000154885.A.e.a	ENSGT00940000155307.a.b.b	ENSGT00940000156466	ENSGT00510000049239.b.a	ENSGT00940000155402.a.b	ENSGT00950000183234	ENSGT00500000044904.a.b.e.b.a.a.a	ENSGT00390000018651.a	ENSGT00940000159475.c	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT01010000222537	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00390000018059.a
Fugu	MODERN SPECIES	18	rxraa (ENSTRUG00000006349)	LRRTM4 (ENSTRUG00000016274)	ENSTRUG00000002446	PLA2G1B (ENSTRUG00000002472)	prkab1a (ENSTRUG00000032651)	capslb (ENSTRUG00000003629)	ENSTRUG00000026338	ENSTRUG00000025169	myo5b (ENSTRUG00000003810)	ENSTRUG00000005212	ENSTRUG00000002174	ENSTRUG00000022324	lmbrd2b (ENSTRUG00000002365)	ENSTRUG00000026770	ppp1r3b (ENSTRUG00000027498)	hspa5 (ENSTRUG00000003346) #22	rabepk (ENSTRUG00000019746) #23	ENSTRUG00000004100	znf618 (ENSTRUG00000004978)	pappaa (ENSTRUG00000005279)	ASTN2 (ENSTRUG00000005783)	trim32 (ENSTRUG00000019757)	ENSTRUG00000027442	MYL4 (ENSTRUG00000006569)	ENSTRUG00000031274	brinp1 (ENSTRUG00000006631)	ENSTRUG00000023800	ak1 (ENSTRUG00000006830)	gpsm1b (ENSTRUG00000006995)	LHX3 (ENSTRUG00000007321)	TMEM250 (ENSTRUG00000021862)
Tetraodon	MODERN SPECIES	19	ENSTNIG00000017821	LRRTM4 (ENSTNIG00000017822)	VAV2 (ENSTNIG00000017823)	ENSTNIG00000003823	wdr5 (ENSTNIG00000003824)	RXRA (ENSTNIG00000006350)	LRRTM4 (ENSTNIG00000010383)	PLA2G1B (ENSTNIG00000010382)	prkab1a (ENSTNIG00000010381)	capslb (ENSTNIG00000010380)	ENSTNIG00000001792	myo5b (ENSTNIG00000010379)	ENSTNIG00000006523	lmbrd2b (ENSTNIG00000018749)	ppp1r3b (ENSTNIG00000018748)	hspa5 (ENSTNIG00000018747) #22	rabepk (ENSTNIG00000018746) #23	ENSTNIG00000018745	ENSTNIG00000018744	znf618 (ENSTNIG00000018743)	pappaa (ENSTNIG00000018742)	trim32 (ENSTNIG00000018740)	ASTN2 (ENSTNIG00000018741)	MYL4 (ENSTNIG00000018739)	brinp1 (ENSTNIG00000018738)	ak1 (ENSTNIG00000018737)	gpsm1b (ENSTNIG00000018736)	LHX3 (ENSTNIG00000018735)	PLPP7 (ENSTNIG00000018734)	ENSTNIG00000000362	PRRC2B (ENSTNIG00000018733)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00940000160949	ENSGT00390000003140.B	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828.c.a	ENSGT00390000003828.c.b	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00940000160949	ENSGT00390000003140.B	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828.c.a	ENSGT00390000003828.c.b	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00940000160949	ENSGT00390000003140.B	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Pike perch	MODERN SPECIES	48	zmynd19 (ENSSLUG00000012862)	bspry (ENSSLUG00000012855)	coq4 (ENSSLUG00000012847)	ENSSLUG00000012839	ENSSLUG00000012829	fbxw5 (ENSSLUG00000012811)	prdm12b (ENSSLUG00000012800)	fubp3 (ENSSLUG00000012696)	ASS1 (ENSSLUG00000012653)	surf4 (ENSSLUG00000012626)	surf2 (ENSSLUG00000012623)	bbln (ENSSLUG00000012620)	ENSSLUG00000012611	dnm1a (ENSSLUG00000012206)	golga2 (ENSSLUG00000012170)	hspa5 (ENSSLUG00000011768) #22	rabepk (ENSSLUG00000011735) #23	ENSSLUG00000011726	rgs3a (ENSSLUG00000011715)	ENSSLUG00000011711	znf618 (ENSSLUG00000011696)	pappaa (ENSSLUG00000011633)
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	3	zmynd19 (ENSCGOG00000005330)	bspry (ENSCGOG00000005328)	coq4 (ENSCGOG00000005305)	ENSCGOG00000005300	fbxw5 (ENSCGOG00000005294)	ENSCGOG00000005292	prdm12b (ENSCGOG00000005285)	fubp3 (ENSCGOG00000005239)	ASS1 (ENSCGOG00000004254)	surf4 (ENSCGOG00000004111)	surf2 (ENSCGOG00000004082)	bbln (ENSCGOG00000004066)	ENSCGOG00000023952	dnm1a (ENSCGOG00000023935)	golga2 (ENSCGOG00000023925)	hspa5 (ENSCGOG00000021559) #22	rabepk (ENSCGOG00000021471) #23	RGS3 (ENSCGOG00000021463)	znf618 (ENSCGOG00000021459)	pappaa (ENSCGOG00000021444)	trim32 (ENSCGOG00000021442)	ENSCGOG00000021441	ASTN2 (ENSCGOG00000021426)	MYL4 (ENSCGOG00000021424)	brinp1 (ENSCGOG00000021409)	ENSCGOG00000021405	ak1 (ENSCGOG00000021381)	gpsm1b (ENSCGOG00000020895)	LHX3 (ENSCGOG00000020868)	TMEM250 (ENSCGOG00000020867)	NACC2 (ENSCGOG00000020866)
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000003828.c.a	ENSGT00390000003828.d	ENSGT00390000003828.c.b	ENSGT00940000166276	ENSGT00940000176908	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Lumpfish	MODERN SPECIES	3	bspry (ENSCLMG00005012821)	ENSCLMG00005012820	coq4 (ENSCLMG00005012818)	ENSCLMG00005012808	ENSCLMG00005012805	fbxw5 (ENSCLMG00005012799)	prdm12b (ENSCLMG00005012797)	FUBP3 (ENSCLMG00005012607)	ASS1 (ENSCLMG00005012564)	surf4 (ENSCLMG00005012538)	surf2 (ENSCLMG00005012537)	bbln (ENSCLMG00005012536)	ENSCLMG00005012535	dnm1a (ENSCLMG00005012169)	golga2 (ENSCLMG00005012164)	hspa5 (ENSCLMG00005011436) #22	rabepk (ENSCLMG00005011413) #23	ENSCLMG00005011410	ENSCLMG00005011408	znf618 (ENSCLMG00005011404)	pappaa (ENSCLMG00005011317)	trim32 (ENSCLMG00005011310)	ENSCLMG00005011307	ASTN2 (ENSCLMG00005011219)	MYL4 (ENSCLMG00005011210)	brinp1 (ENSCLMG00005011209)	ENSCLMG00005011206	ak1 (ENSCLMG00005011203)	gpsm1b (ENSCLMG00005010916)	LHX3 (ENSCLMG00005010909)	TMEM250 (ENSCLMG00005010907)
Stickleback	MODERN SPECIES	13	SAPCD2 (ENSGACG00000016739)	zmynd19 (ENSGACG00000016735)	bspry (ENSGACG00000016732)	coq4 (ENSGACG00000016728)	ENSGACG00000016724	fbxw5 (ENSGACG00000016714)	prdm12b (ENSGACG00000016713)	fubp3 (ENSGACG00000016704)	ASS1 (ENSGACG00000016668)	surf4 (ENSGACG00000016660)	surf2 (ENSGACG00000016655)	bbln (ENSGACG00000016653)	ENSGACG00000016651	dnm1a (ENSGACG00000016647)	golga2 (ENSGACG00000016644)	hspa5 (ENSGACG00000016633) #22	rabepk (ENSGACG00000016628) #23	RGS3 (ENSGACG00000016619)	znf618 (ENSGACG00000016617)	pappaa (ENSGACG00000016615)	trim32 (ENSGACG00000016614)	ASTN2 (ENSGACG00000016611)	MYL4 (ENSGACG00000016608)	brinp1 (ENSGACG00000016603)	ENSGACG00000016601	ak1 (ENSGACG00000016598)	gpsm1b (ENSGACG00000016596)	LHX3 (ENSGACG00000016592)	TMEM250 (ENSGACG00000016591)	NACC2 (ENSGACG00000016588)	ENSGACG00000016574
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000176908	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a.f	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000165854
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	3	zmynd19 (ENSSAUG00010026139)	bspry (ENSSAUG00010026140)	coq4 (ENSSAUG00010026142)	ENSSAUG00010026144	fbxw5 (ENSSAUG00010026148)	ENSSAUG00010026150	prdm12b (ENSSAUG00010026152)	fubp3 (ENSSAUG00010026166)	ASS1 (ENSSAUG00010026280)	surf4 (ENSSAUG00010026309)	surf2 (ENSSAUG00010026312)	bbln (ENSSAUG00010008757)	ENSSAUG00010008761	dnm1a (ENSSAUG00010008778)	golga2 (ENSSAUG00010008870)	hspa5 (ENSSAUG00010008911) #22	rabepk (ENSSAUG00010008931) #23	RGS3 (ENSSAUG00010008934)	znf618 (ENSSAUG00010008945)	pappaa (ENSSAUG00010008975)	ASTN2 (ENSSAUG00010010022)	trim32 (ENSSAUG00010010155)	MYL4 (ENSSAUG00010010156)	brinp1 (ENSSAUG00010010157)	ENSSAUG00010010158	ak1 (ENSSAUG00010010160)	gpsm1b (ENSSAUG00010010163)	LHX3 (ENSSAUG00010010167)	TMEM250 (ENSSAUG00010010168)	NACC2 (ENSSAUG00010010169)	ENSSAUG00010010187
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000153820.b.a	ENSGT00940000165151.a	ENSGT00390000003828	ENSGT00940000166276	ENSGT00940000176908	ENSGT00730000111276	ENSGT00940000161616.c	ENSGT00940000156744.p	ENSGT00390000004524	ENSGT00530000064123	ENSGT00940000165981	ENSGT00390000001761	ENSGT00440000039084.a.b	ENSGT00940000155214.k.a.f	ENSGT00530000062932	ENSGT00940000154787 #22	ENSGT00940000158763 #23	ENSGT00940000154416.C.c.a.a.a	ENSGT00940000153306.A.a	ENSGT00940000156654	ENSGT00390000003140.B	ENSGT00940000160949	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a.d.b	ENSGT00940000158084	ENSGT00530000063861.b.a	ENSGT00940000158325	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00940000160316	ENSGT00560000078707	ENSGT00940000159244.b	ENSGT00940000153253.b.b
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	4	tmem141 (ENSLCRG00005013859)	zmynd19 (ENSLCRG00005013862)	bspry (ENSLCRG00005013864)	fbxw5 (ENSLCRG00005013868)	ENSLCRG00005013874	ENSLCRG00005013883	prdm12b (ENSLCRG00005013884)	fubp3 (ENSLCRG00005013901)	ASS1 (ENSLCRG00005014767)	surf4 (ENSLCRG00005014773)	surf2 (ENSLCRG00005014840)	bbln (ENSLCRG00005014841)	ENSLCRG00005014842	dnm1a (ENSLCRG00005014862)	golga2 (ENSLCRG00005016198)	hspa5 (ENSLCRG00005016224) #22	rabepk (ENSLCRG00005016505) #23	ENSLCRG00005000249	znf618 (ENSLCRG00005000308)	pappaa (ENSLCRG00005000369)	ASTN2 (ENSLCRG00005000893)	trim32 (ENSLCRG00005001857)	MYL4 (ENSLCRG00005001861)	brinp1 (ENSLCRG00005001868)	ENSLCRG00005001877	ak1 (ENSLCRG00005001891)	gpsm1b (ENSLCRG00005001928)	LHX3 (ENSLCRG00005002254)	TMEM250 (ENSLCRG00005002261)	NACC2 (ENSLCRG00005002265)	NUP214 (ENSLCRG00005002285)
European seabass	MODERN SPECIES	9	coq4 (ENSDLAG00005002266)	ENSDLAG00005028376	ENSDLAG00005002242	fbxw5 (ENSDLAG00005032850)	PRDM12 (ENSDLAG00005002235)	ENSDLAG00005001821	ASS1 (ENSDLAG00005001692)	surf4 (ENSDLAG00005001562)	surf2 (ENSDLAG00005001537)	bbln (ENSDLAG00005032034)	ENSDLAG00005001505	ENSDLAG00005016480	ENSDLAG00005001490	dnm1a (ENSDLAG00005001202)	golga2 (ENSDLAG00005001135)	ENSDLAG00005001005 #22	ENSDLAG00005000981 #23	rgs3a (ENSDLAG00005000959)	znf618 (ENSDLAG00005000948)	pappaa (ENSDLAG00005000923)	TRIM32 (ENSDLAG00005030662)	ASTN2 (ENSDLAG00005000790)	ENSDLAG00005028553	brinp1 (ENSDLAG00005034270)	ENSDLAG00005000768	ak1 (ENSDLAG00005000761)	gpsm1b (ENSDLAG00005000644)	LHX3 (ENSDLAG00005000609)	TMEM250 (ENSDLAG00005000602)	NACC2 (ENSDLAG00005000599)	fam78ab (ENSDLAG00005027480)
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	1900													ENSLBEG00000004485 #23	hspa5 (ENSLBEG00000004453) #22	ENSLBEG00000004431 #23	hspa5 (ENSLBEG00000004394) #22
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	1846												rabepk (ENSLBEG00000000629) #23	hspa5 (ENSLBEG00000000574) #22	ENSLBEG00000000556	ENSLBEG00000000528 #23	hspa5 (ENSLBEG00000000467) #22
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	2901																hspa5 (ENSLBEG00000021303) #22	ENSLBEG00000021289	rabepk (ENSLBEG00000021221) #23	hspa5 (ENSLBEG00000021157) #22
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	1010																hspa5 (ENSLBEG00000027280) #22	hspa5 (ENSLBEG00000027264) #22	ENSLBEG00000027251 #23	hspa5 (ENSLBEG00000027236) #22	rabepk (ENSLBEG00000027195) #23
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	4838																hspa5 (ENSLBEG00000009402) #22
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	1900															ENSLBEG00000004485 #23	hspa5 (ENSLBEG00000004453) #22	ENSLBEG00000004431 #23	hspa5 (ENSLBEG00000004394) #22
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	1010															hspa5 (ENSLBEG00000027280) #22	hspa5 (ENSLBEG00000027264) #22	ENSLBEG00000027251 #23	hspa5 (ENSLBEG00000027236) #22	rabepk (ENSLBEG00000027195) #23
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	1010													hspa5 (ENSLBEG00000027280) #22	hspa5 (ENSLBEG00000027264) #22	ENSLBEG00000027251 #23	hspa5 (ENSLBEG00000027236) #22	rabepk (ENSLBEG00000027195) #23
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	4515																hspa5 (ENSLBEG00000028957) #22	ENSLBEG00000028956
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	2901													hspa5 (ENSLBEG00000021303) #22	ENSLBEG00000021289	rabepk (ENSLBEG00000021221) #23	hspa5 (ENSLBEG00000021157) #22
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Ballan wrasse	MODERN SPECIES	2401																hspa5 (ENSLBEG00000004262) #22	rabepk (ENSLBEG00000004308) #23
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	4735																ENSLBEG00000005809 #22
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	4874																ENSLBEG00000011234 #22
Spotted gar	MODERN SPECIES	660	ASTN2 (ENSLOCG00000004717)	trim32 (ENSLOCG00000017344)	pappaa (ENSLOCG00000004730)	znf618 (ENSLOCG00000004746)	RGS3 (ENSLOCG00000004760)	ENSLOCG00000017345	ENSLOCG00000004778	TNFSF15 (ENSLOCG00000004793)	edf1 (ENSLOCG00000004805)	bbln (ENSLOCG00000004822)	ENSLOCG00000004835	ENSLOCG00000004878	dnm1a (ENSLOCG00000004893)	golga2 (ENSLOCG00000004929)	haus4 (ENSLOCG00000004964)	hspa5 (ENSLOCG00000004979) #22	rabepk (ENSLOCG00000004994) #23	ppp6c (ENSLOCG00000005012)	SCAI (ENSLOCG00000005027)	golga1 (ENSLOCG00000005040)	arpc5lb (ENSLOCG00000005063)	rpl35 (ENSLOCG00000005076)	ENSLOCG00000005093	olfml2a (ENSLOCG00000005109)	nr6a1a (ENSLOCG00000005138)	nr5a1a (ENSLOCG00000005158)	ADGRD2 (ENSLOCG00000005172)	ENSLOCG00000005193	psmb7 (ENSLOCG00000005208)	NEK6 (ENSLOCG00000005235)	lhx2b (ENSLOCG00000005257)
Reedfish	MODERN SPECIES	17	NACC2 (ENSECRG00000016256)	TMEM250 (ENSECRG00000016281)	LHX3 (ENSECRG00000016289)	QSOX2 (ENSECRG00000016332)	gpsm1b (ENSECRG00000016372)	ak5l (ENSECRG00000016424)	ak1 (ENSECRG00000016484)	ENSECRG00000016529	fpgs (ENSECRG00000016577)	cdk9 (ENSECRG00000016644)	bbln (ENSECRG00000016676)	CIZ1 (ENSECRG00000016716)	dnm1a (ENSECRG00000016785)	golga2 (ENSECRG00000016818)	ENSECRG00000016878	hspa5 (ENSECRG00000016910) #22	rabepk (ENSECRG00000016942) #23	ppp6c (ENSECRG00000016970)	SCAI (ENSECRG00000017006)	GOLGA1 (ENSECRG00000017091)	arpc5la (ENSECRG00000017203)	rpl35 (ENSECRG00000017234)	ENSECRG00000017275	olfml2a (ENSECRG00000017308)	nr6a1a (ENSECRG00000017370)	nr5a1a (ENSECRG00000017692)	ENSECRG00000019751	ENSECRG00000019778	psmb7 (ENSECRG00000019818)	NEK6 (ENSECRG00000019855)	ENSECRG00000019923
Elephant shark	MODERN SPECIES	1743													ENSCMIG00000004052 #19	MAPKAP1 (ENSCMIG00000004105) #20	gapvd1 (ENSCMIG00000004169) #21	hspa5 (ENSCMIG00000004288) #22	rabepk (ENSCMIG00000004525) #23	ppp6c (ENSCMIG00000004532)	SCAI (ENSCMIG00000004571)	golga1 (ENSCMIG00000004610)	arpc5la (ENSCMIG00000004634)	rpl35 (ENSCMIG00000004672)	ENSCMIG00000004693
Cyclostomata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154787 #22
Lamprey	MODERN SPECIES	2680																hspa5 (ENSPMAG00000004620) #22
Hagfish	MODERN SPECIES	1503												ENSEBUG00000001232	ENSEBUG00000007872	ENSEBUG00000015520	ENSEBUG00000013679	hspa5 (ENSEBUG00000003771) #22	ENSEBUG00000004007	ENSEBUG00000002269	ENSEBUG00000005293	ENSEBUG00000014569	ENSEBUG00000001840	slc27a4 (ENSEBUG00000008705)	ENSEBUG00000011981	ENSEBUG00000000632
Ciona	DUPLICATION
Ciona	ANCESTRAL SPECIES	35											ENSGT00390000013112	ENSGT00390000016384	ENSGT00390000015229	ENSGT00940000173561	ENSGT00940000153116.C.b	ENSGT00940000154787.db #22	ENSGT00950000182815	ENSGT00940000156625	ENSGT00530000066503
Ciona savignyi	MODERN SPECIES	56	ENSCSAVG00000007723	ENSCSAVG00000007722	ENSCSAVG00000007720	ENSCSAVG00000007718	ENSCSAVG00000007700	ENSCSAVG00000007520	ENSCSAVG00000007485	ENSCSAVG00000007484	ENSCSAVG00000007378	ENSCSAVG00000007374	ENSCSAVG00000007361	ENSCSAVG00000007330	ENSCSAVG00000007328	ENSCSAVG00000007325	ENSCSAVG00000007323	ENSCSAVG00000006429 #22	ENSCSAVG00000006425	ENSCSAVG00000006417	ENSCSAVG00000006411	ENSCSAVG00000006408	ENSCSAVG00000006402	ENSCSAVG00000006398	ENSCSAVG00000006375	ENSCSAVG00000006370	ENSCSAVG00000006368	ENSCSAVG00000006362	ENSCSAVG00000006360	ENSCSAVG00000006258	ENSCSAVG00000006241	ENSCSAVG00000006221	ENSCSAVG00000006180
Ciona intestinalis	MODERN SPECIES	13	ENSCING00000022998	ENSCING00000012962	ENSCING00000022319	ENSCING00000020944	ENSCING00000022040	ENSCING00000009432 #21	ENSCING00000012965	ENSCING00000020292	ENSCING00000015683	ENSCING00000008155	ENSCING00000012953	ENSCING00000021062	ENSCING00000012954	ENSCING00000012955	ENSCING00000020680	ENSCING00000009590 #22	ENSCING00000012956	ENSCING00000021545	bco (ENSCING00000009589)	ENSCING00000018955	ENSCING00000012957	ENSCING00000009588	ENSCING00000024683	ENSCING00000009586	ENSCING00000009585	ENSCING00000012958	ENSCING00000019192	ENSCING00000012951	ENSCING00000022803	ENSCING00000009591	ENSCING00000012952
Ciona	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000154787.eb #22
Ciona intestinalis	MODERN SPECIES	13	ENSCING00000009433	ENSCING00000012966	ENSCING00000009440	ENSCING00000012969	ENSCING00000021370	ENSCING00000009439	ENSCING00000012968	ENSCING00000022068	ENSCING00000021075	ENSCING00000022178	ENSCING00000018932	ENSCING00000020364	ENSCING00000012967	ENSCING00000024370	ENSCING00000021488	ENSCING00000009445 #22	ENSCING00000022239	ENSCING00000023522	ENSCING00000009444	ENSCING00000009443	ENSCING00000009442	ENSCING00000009441	ENSCING00000018163	ENSCING00000012971	ENSCING00000012970	ENSCING00000023555	n (ENSCING00000003521)	ENSCING00000003502	ENSCING00000019829	ENSCING00000003482	ENSCING00000022846