Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000154860	ENSGT00940000157226 #7	ENSGT00390000016821 #8	ENSGT00940000162841 #9	ENSGT00940000161101 #10	ENSGT00940000156620 #11	ENSGT00940000159662 #12	ENSGT00940000158481 #14	ENSGT00940000157667 #15	ENSGT00390000017249 #16	ENSGT00940000159837 #17	ENSGT00940000160226 #18	ENSGT00940000161262 #19	ENSGT00390000013315 #20	ENSGT00940000159073 #21	ENSGT00940000157089.B #22	ENSGT00390000018235 #23	ENSGT00390000017790 #24	ENSGT00940000158758 #25	ENSGT00940000156124 #26	ENSGT00940000159848 #27	ENSGT00940000156152 #29	ENSGT00390000007640.b #30	ENSGT00940000160394.a #31	ENSGT00390000016223 #32	ENSGT00940000154348.c.b.a #33	ENSGT00390000007055 #34	ENSGT00940000160630 #35	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000154234.b #36	ENSGT00390000014757 #37
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	2	ALKBH3 (ENSSVLG00005018027) #7	C11orf96 (ENSSVLG00005018003) #8	ACCSL (ENSSVLG00005017862) #9	ACCS (ENSSVLG00005017673) #10	EXT2 (ENSSVLG00005017472) #11	ALX4 (ENSSVLG00005017428) #12	ENSSVLG00005017405 #13	CD82 (ENSSVLG00005017346) #14	TSPAN18 (ENSSVLG00005017248) #15	TP53I11 (ENSSVLG00005017174) #16	PRDM11 (ENSSVLG00005017126) #17	SYT13 (ENSSVLG00005017054) #18	CHST1 (ENSSVLG00005017036) #19	SLC35C1 (ENSSVLG00005016968) #20	CRY2 (ENSSVLG00005016727) #21	MAPK8IP1 (ENSSVLG00005016511) #22	FREY1 (ENSSVLG00005016461) #23	PEX16 (ENSSVLG00005016392) #24	LARGE2 (ENSSVLG00005016132) #25	PHF21A (ENSSVLG00005016012) #26	CREB3L1 (ENSSVLG00005015955) #27	ENSSVLG00005015926 #28	DGKZ (ENSSVLG00005015887) #29	MDK (ENSSVLG00005015782) #30	CHRM4 (ENSSVLG00005015740) #31	AMBRA1 (ENSSVLG00005015569) #32	HARBI1 (ENSSVLG00005015510) #33	ENSSVLG00005014869 #34	ARHGAP1 (ENSSVLG00005014685) #35	F2 (ENSSVLG00005014116) #36	CKAP5 (ENSSVLG00005013939) #37
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000154860	ENSGT00940000157226 #7	ENSGT00390000016821 #8	ENSGT00940000162841 #9	ENSGT00940000161101 #10	ENSGT00940000156620 #11	ENSGT00940000159662 #12	ENSGT00940000158481 #14	ENSGT00940000157667 #15	ENSGT00390000017249 #16	ENSGT00940000159837 #17	ENSGT00940000160226 #18	ENSGT00940000161262 #19	ENSGT00390000013315 #20	ENSGT00940000159073 #21	ENSGT00940000157089.B #22	ENSGT00390000018235 #23	ENSGT00390000017790 #24	ENSGT00940000158758 #25	ENSGT00940000156124 #26	ENSGT00940000159848 #27	ENSGT00940000156152 #29	ENSGT00390000007640.b #30	ENSGT00940000160394.a #31	ENSGT00390000016223 #32	ENSGT00940000154348.c.b.a #33	ENSGT00390000007055 #34	ENSGT00940000160630 #35	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000154234.b #36	ENSGT00390000014757 #37
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000154860	ENSGT00940000157226 #7	ENSGT00390000016821 #8	ENSGT00940000162841 #9	ENSGT00940000161101 #10	ENSGT00940000156620 #11	ENSGT00940000159662 #12	ENSGT00940000158481 #14	ENSGT00940000157667 #15	ENSGT00390000017249 #16	ENSGT00940000159837 #17	ENSGT00940000160226 #18	ENSGT00940000161262 #19	ENSGT00390000013315 #20	ENSGT00940000159073 #21	ENSGT00940000157089.B #22	ENSGT00390000018235 #23	ENSGT00390000017790 #24	ENSGT00940000158758 #25	ENSGT00940000156124 #26	ENSGT00940000159848 #27	ENSGT00940000156152 #29	ENSGT00390000007640.b #30	ENSGT00940000160394.a #31	ENSGT00390000016223 #32	ENSGT00940000154348.c.b.a #33	ENSGT00390000007055 #34	ENSGT00940000160630 #35	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000154234.b #36	ENSGT00390000014757 #37
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	208						EXT2 (ENSUPAG00010008690) #11	ALX4 (ENSUPAG00010008717) #12	CD82 (ENSUPAG00010008728) #14	TSPAN18 (ENSUPAG00010008743) #15	TP53I11 (ENSUPAG00010008764) #16	ENSUPAG00010008787 #17	SYT13 (ENSUPAG00010008795) #18	CHST1 (ENSUPAG00010008807) #19	SLC35C1 (ENSUPAG00010008815) #20	CRY2 (ENSUPAG00010008829) #21	MAPK8IP1 (ENSUPAG00010008856) #22	FREY1 (ENSUPAG00010008915) #23	PEX16 (ENSUPAG00010008926) #24	LARGE2 (ENSUPAG00010008955) #25	PHF21A (ENSUPAG00010009105) #26	CREB3L1 (ENSUPAG00010010194) #27	DGKZ (ENSUPAG00010010211) #29	MDK (ENSUPAG00010010379) #30	CHRM4 (ENSUPAG00010010417) #31	AMBRA1 (ENSUPAG00010010430) #32	HARBI1 (ENSUPAG00010010611) #33	ATG13 (ENSUPAG00010010621) #34	ARHGAP1 (ENSUPAG00010010696) #35	ZNF408 (ENSUPAG00010010704)	F2 (ENSUPAG00010010714) #36	CKAP5 (ENSUPAG00010010730) #37
Squirrel	MODERN SPECIES	162	C11orf96 (ENSSTOG00000030620) #8	ACCSL (ENSSTOG00000001158) #9	ENSSTOG00000033284 #10	ENSSTOG00000004449 #10	EXT2 (ENSSTOG00000004480) #11	ALX4 (ENSSTOG00000029078) #12	ENSSTOG00000023731 #14	TSPAN18 (ENSSTOG00000012343) #15	TP53I11 (ENSSTOG00000025635) #16	PRDM11 (ENSSTOG00000021186) #17	SYT13 (ENSSTOG00000004017) #18	CHST1 (ENSSTOG00000016359) #19	SLC35C1 (ENSSTOG00000022825) #20	CRY2 (ENSSTOG00000011521) #21	FREY1 (ENSSTOG00000027622) #23	MAPK8IP1 (ENSSTOG00000027362) #22	PEX16 (ENSSTOG00000011534) #24	LARGE2 (ENSSTOG00000011545) #25	PHF21A (ENSSTOG00000011552) #26	CREB3L1 (ENSSTOG00000012697) #27	DGKZ (ENSSTOG00000012704) #29	MDK (ENSSTOG00000027636) #30	CHRM4 (ENSSTOG00000022455) #31	AMBRA1 (ENSSTOG00000019411) #32	HARBI1 (ENSSTOG00000005072) #33	ATG13 (ENSSTOG00000005077) #34	ARHGAP1 (ENSSTOG00000026557) #35	ZNF408 (ENSSTOG00000005114)	F2 (ENSSTOG00000005130) #36	CKAP5 (ENSSTOG00000005158) #37	LRP4 (ENSSTOG00000005236)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	3	ALKBH3 (ENSMMMG00000011630) #7	C11orf96 (ENSMMMG00000011645) #8	ACCSL (ENSMMMG00000011649) #9	ENSMMMG00000011721	ACCS (ENSMMMG00000011728) #10	EXT2 (ENSMMMG00000011786) #11	ALX4 (ENSMMMG00000011816) #12	ENSMMMG00000011823	TSPAN18 (ENSMMMG00000011835) #15	TP53I11 (ENSMMMG00000011860) #16	PRDM11 (ENSMMMG00000011883) #17	SYT13 (ENSMMMG00000011892) #18	CHST1 (ENSMMMG00000011917) #19	SLC35C1 (ENSMMMG00000011928) #20	CRY2 (ENSMMMG00000011931) #21	MAPK8IP1 (ENSMMMG00000011982) #22	FREY1 (ENSMMMG00000012302) #23	PEX16 (ENSMMMG00000012310) #24	LARGE2 (ENSMMMG00000012317) #25	PHF21A (ENSMMMG00000012404) #26	CREB3L1 (ENSMMMG00000013137) #27	DGKZ (ENSMMMG00000013155) #29	MDK (ENSMMMG00000013259) #30	CHRM4 (ENSMMMG00000013278) #31	AMBRA1 (ENSMMMG00000013284) #32	HARBI1 (ENSMMMG00000013860) #33	ATG13 (ENSMMMG00000013875) #34	ARHGAP1 (ENSMMMG00000013934) #35	ZNF408 (ENSMMMG00000013944)	F2 (ENSMMMG00000013961) #36	CKAP5 (ENSMMMG00000013993) #37