Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	49	ENSGT00940000154518.a	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182808.a.a.a.b	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000163251.a	ENSGT00940000159536
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	79	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT01090000260575	ENSGT00950000182808.a.a.a.b	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000163251.a	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000018781
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	108	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	110	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000013108	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156068
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000016991	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000013108	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000162679
Theria	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000016991	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000013108	ENSGT00940000156386
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Pecora	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000159179	ENSGT00940000156470	ENSGT00940000162150	ENSGT00390000010706	ENSGT00940000155854
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000159179	ENSGT00940000156470	ENSGT00940000162150	ENSGT00390000010706	ENSGT00940000155854
Bovidae	DUPLICATION
Bovidae	DUPLICATION
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.nc.b #22
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.nc.b #22
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	1						MANEA (ENSOARG00020013232) #12	PCDH20 (ENSOARG00020013301) #13	ENSOARG00020003059 #14	TDRD3 (ENSOARG00020003168) #15	DIAPH3 (ENSOARG00020003805) #16	ENSOARG00020004829 #17	ENSOARG00020004846 #18	ENSOARG00020004852 #19	ENSOARG00020004868 #20	PCDH17 (ENSOARG00020004877) #21	VDAC1 (ENSOARG00020004891) #22	ENSOARG00020004908 #23	OLFM4 (ENSOARG00020004943) #24	PCDH8 (ENSOARG00020004982) #25	CNMD (ENSOARG00020005002) #26	SUGT1 (ENSOARG00020005060) #27	ELF1 (ENSOARG00020005153) #28	ENSOARG00020005207 #29	WBP4 (ENSOARG00020005228) #30	KBTBD6 (ENSOARG00020005273) #31	KBTBD7 (ENSOARG00020005282) #32	MTRF1 (ENSOARG00020005295) #33	NAA16 (ENSOARG00020005343) #34	RGCC (ENSOARG00020005649) #35	VWA8 (ENSOARG00020005673) #36	DGKH (ENSOARG00020005790) #37
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.nc.b #22
American bison	MODERN SPECIES	3121	CATSPER3 (ENSBBBG00000005201)	PCBD2 (ENSBBBG00000008779)	TXNDC15 (ENSBBBG00000005147)	C5orf24 (ENSBBBG00000019397)	DDX46 (ENSBBBG00000008835)	CAMLG (ENSBBBG00000009173)	SEC24A (ENSBBBG00000019313)	SAR1B (ENSBBBG00000004990)	JADE2 (ENSBBBG00000004974)	CDKN2AIPNL (ENSBBBG00000019190)	ENSBBBG00000019187	CDKL3 (ENSBBBG00000009163)	PPP2CA (ENSBBBG00000004914)	SKP1 (ENSBBBG00000019111)	TCF7 (ENSBBBG00000019088)	VDAC1 (ENSBBBG00000004884) #22	C5orf15 (ENSBBBG00000004870)	FSTL4 (ENSBBBG00000019047)	HSPA4 (ENSBBBG00000019016)	ZCCHC10 (ENSBBBG00000018984)	AFF4 (ENSBBBG00000007509)	LEAP2 (ENSBBBG00000018954)	UQCRQ (ENSBBBG00000004808)	GDF9 (ENSBBBG00000018948)	SHROOM1 (ENSBBBG00000004801)	BTBD2 (ENSBBBG00000004795)	CSNK1G2 (ENSBBBG00000018897)	SCAMP4 (ENSBBBG00000018882)	ADAT3 (ENSBBBG00000018851)	ABHD17A (ENSBBBG00000018838)	ENSBBBG00000004740
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.nc.a ##22
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.nc.a ##22
Bos	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.nc.a ##22
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.nc.a ##22
Wild yak	MODERN SPECIES	320	CATSPER3 (ENSBMUG00000001351)	PCBD2 (ENSBMUG00000001362)	TXNDC15 (ENSBMUG00000001379)	C5orf24 (ENSBMUG00000001409)	DDX46 (ENSBMUG00000001553)	CAMLG (ENSBMUG00000001593)	SEC24A (ENSBMUG00000001651)	SAR1B (ENSBMUG00000001674)	JADE2 (ENSBMUG00000001907)	CDKN2AIPNL (ENSBMUG00000002007)	ENSBMUG00000002018	CDKL3 (ENSBMUG00000002116)	PPP2CA (ENSBMUG00000002156)	ENSBMUG00000002203	TCF7 (ENSBMUG00000002245)	VDAC1 (ENSBMUG00000002267) ##22	C5orf15 (ENSBMUG00000002280)	FSTL4 (ENSBMUG00000002338)	HSPA4 (ENSBMUG00000002377)	ZCCHC10 (ENSBMUG00000002404)	ENSBMUG00000002429
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.nc.a ##22
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	21	CATSPER3 (ENSOARG00020009232)	PCBD2 (ENSOARG00020009182)	TXNDC15 (ENSOARG00020009129)	C5orf24 (ENSOARG00020009076)	DDX46 (ENSOARG00020008824)	CAMLG (ENSOARG00020008740)	SEC24A (ENSOARG00020008223)	SAR1B (ENSOARG00020008125)	JADE2 (ENSOARG00020007407)	CDKN2AIPNL (ENSOARG00020007343)	UBE2B (ENSOARG00020022616)	CDKL3 (ENSOARG00020022325)	ENSOARG00020022273	ENSOARG00020022204	TCF7 (ENSOARG00020021919)	VDAC1 (ENSOARG00020021794) ##22	C5orf15 (ENSOARG00020021778)	FSTL4 (ENSOARG00020021517)	HSPA4 (ENSOARG00020021466)	ZCCHC10 (ENSOARG00020021393)	AFF4 (ENSOARG00020021183)	LEAP2 (ENSOARG00020021152)	UQCRQ (ENSOARG00020021124)	GDF9 (ENSOARG00020021050)	SHROOM1 (ENSOARG00020020980)	ENSOARG00020020953	BTBD2 (ENSOARG00020020888)	CSNK1G2 (ENSOARG00020020862)	ADAT3 (ENSOARG00020020822)	SCAMP4 (ENSOARG00020020721)	ABHD17A (ENSOARG00020020656)
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.oc ##22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000159179	ENSGT00940000156470	ENSGT00940000162150	ENSGT00390000010706	ENSGT00940000155854
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.oc ##22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067.c	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00390000018299.cb	ENSGT00940000159179	ENSGT00940000156470	ENSGT00390000010706	ENSGT00940000162150	ENSGT00940000155854
Goat	MODERN SPECIES	26	PCBD2 (ENSCHIG00000023788)	TXNDC15 (ENSCHIG00000010236)	ENSCHIG00000016073	C5orf24 (ENSCHIG00000012125)	DDX46 (ENSCHIG00000026009)	CAMLG (ENSCHIG00000005820)	SEC24A (ENSCHIG00000024982)	SAR1B (ENSCHIG00000022509)	JADE2 (ENSCHIG00000012699)	CDKN2AIPNL (ENSCHIG00000027126)	UBE2B (ENSCHIG00000017701)	CDKL3 (ENSCHIG00000008858)	PPP2CA (ENSCHIG00000023636)	ENSCHIG00000015329	TCF7 (ENSCHIG00000027172)	VDAC1 (ENSCHIG00000024204) ##22	C5orf15 (ENSCHIG00000020905)	FSTL4 (ENSCHIG00000023121)	ENSCHIG00000009256	ZCCHC10 (ENSCHIG00000021529)	AFF4 (ENSCHIG00000015153)	LEAP2 (ENSCHIG00000006437)	UQCRQ (ENSCHIG00000017488)	GDF9 (ENSCHIG00000008167)	SHROOM1 (ENSCHIG00000018420)	ENSCHIG00000023876	ENSCHIG00000010758	BTBD2 (ENSCHIG00000025498)	CSNK1G2 (ENSCHIG00000012053)	SCAMP4 (ENSCHIG00000026658)	ABHD17A (ENSCHIG00000017282)
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.oc ##22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000159179	ENSGT00940000156470	ENSGT00940000162150	ENSGT00390000010706	ENSGT00940000155854
Bos	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.oc ##22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000159179	ENSGT00940000156470	ENSGT00940000162150	ENSGT00390000010706	ENSGT00940000155854
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.oc ##22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000159179	ENSGT00940000156470	ENSGT00940000162150	ENSGT00940000155854	ENSGT00940000163280
Domestic yak	MODERN SPECIES	27	PCBD2 (ENSBGRG00000001957)	TXNDC15 (ENSBGRG00000001937)	C5orf24 (ENSBGRG00000001916)	DDX46 (ENSBGRG00000001771)	CAMLG (ENSBGRG00000001715)	SEC24A (ENSBGRG00000001631)	SAR1B (ENSBGRG00000001569)	JADE2 (ENSBGRG00000001448)	CDKN2AIPNL (ENSBGRG00000001401)	UBE2B (ENSBGRG00000001392)	CDKL3 (ENSBGRG00000001365)	PP2Acalpha (ENSBGRG00000001299)	ENSBGRG00000001287	TCF7 (ENSBGRG00000001126)	ENSBGRG00000001048	VDAC1 (ENSBGRG00000001004) ##22	C5orf15 (ENSBGRG00000000989)	ENSBGRG00000000981	ENSBGRG00000000974	FSTL4 (ENSBGRG00000000909)	HSPA4 (ENSBGRG00000000648)	ZCCHC10 (ENSBGRG00000000580)	AFF4 (ENSBGRG00000000504)	ENSBGRG00000000468	GDF9 (ENSBGRG00000000431)	SHROOM1 (ENSBGRG00000000396)	SOWAHA (ENSBGRG00000018725)	ENSBGRG00000018649	ENSBGRG00000018562	CSNK1G2 (ENSBGRG00000018491)	ENSBGRG00000018385
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.oc ##22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00940000159179	ENSGT00940000156470	ENSGT00940000162150	ENSGT00390000010706	ENSGT00940000155854	ENSGT00940000163280
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	26	DDX46 (ENSBIXG00005000976)	PITX1 (ENSBIXG00005000961)	CATSPER3 (ENSBIXG00005010842)	TXNDC15 (ENSBIXG00005010781)	C5orf24 (ENSBIXG00005000936)	CAMLG (ENSBIXG00005010728)	SEC24A (ENSBIXG00005000631)	SAR1B (ENSBIXG00005010665)	JADE2 (ENSBIXG00005000689)	CDKN2AIPNL (ENSBIXG00005010473)	UBE2B (ENSBIXG00005010452)	CDKL3 (ENSBIXG00005000877)	PPP2CA (ENSBIXG00005000838)	ENSBIXG00005000834	TCF7 (ENSBIXG00005010211)	VDAC1 (ENSBIXG00005010095) ##22	C5orf15 (ENSBIXG00005010062)	FSTL4 (ENSBIXG00005010006)	HSPA4 (ENSBIXG00005000684)	ZCCHC10 (ENSBIXG00005009861)	AFF4 (ENSBIXG00005009834)	LEAP2 (ENSBIXG00005000606)	UQCRQ (ENSBIXG00005000603)	ENSBIXG00005009763	SHROOM1 (ENSBIXG00005009751)	BTBD2 (ENSBIXG00005006410)	CSNK1G2 (ENSBIXG00005009637)	SCAMP4 (ENSBIXG00005009612)	ADAT3 (ENSBIXG00005009585)	ABHD17A (ENSBIXG00005000539)	KLF16 (ENSBIXG00005009542)
Cow	MODERN SPECIES	26	CATSPER3 (ENSBTAG00000014746)	PCBD2 (ENSBTAG00000050621)	TXNDC15 (ENSBTAG00000014744)	C7H5orf24 (ENSBTAG00000012762)	DDX46 (ENSBTAG00000021520)	CAMLG (ENSBTAG00000021519)	SEC24A (ENSBTAG00000018322)	SAR1B (ENSBTAG00000021226)	JADE2 (ENSBTAG00000021687)	CDKN2AIPNL (ENSBTAG00000010984)	UBE2B (ENSBTAG00000010982)	CDKL3 (ENSBTAG00000010979)	PPP2CA (ENSBTAG00000000469)	SKP1 (ENSBTAG00000025191)	TCF7 (ENSBTAG00000001002)	VDAC1 (ENSBTAG00000013113) ##22	C7H5orf15 (ENSBTAG00000013112)	FSTL4 (ENSBTAG00000017105)	HSPA4 (ENSBTAG00000015683)	ZCCHC10 (ENSBTAG00000030616)	AFF4 (ENSBTAG00000009482)	LEAP2 (ENSBTAG00000018926)	UQCRQ (ENSBTAG00000009479)	GDF9 (ENSBTAG00000009478)	SHROOM1 (ENSBTAG00000014676)	BTBD2 (ENSBTAG00000016108)	CSNK1G2 (ENSBTAG00000016797)	SCAMP4 (ENSBTAG00000045762)	ABHD17A (ENSBTAG00000025277)	KLF16 (ENSBTAG00000038055)	REXO1 (ENSBTAG00000020232)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	49	CATSPER3 (ENSMMSG00000013928)	PCBD2 (ENSMMSG00000013960)	TXNDC15 (ENSMMSG00000013982)	C5orf24 (ENSMMSG00000014006)	DDX46 (ENSMMSG00000014044)	CAMLG (ENSMMSG00000014100)	SEC24A (ENSMMSG00000014138)	SAR1B (ENSMMSG00000014243)	JADE2 (ENSMMSG00000014299)	CDKN2AIPNL (ENSMMSG00000014743)	ENSMMSG00000014776	CDKL3 (ENSMMSG00000014817)	ENSMMSG00000015075	ENSMMSG00000015092	TCF7 (ENSMMSG00000015169)	VDAC1 (ENSMMSG00000015383) #22	C5orf15 (ENSMMSG00000015405)	FSTL4 (ENSMMSG00000015424)	HSPA4 (ENSMMSG00000015537)	ZCCHC10 (ENSMMSG00000015618)	AFF4 (ENSMMSG00000015669)	LEAP2 (ENSMMSG00000015759)	UQCRQ (ENSMMSG00000015786)	GDF9 (ENSMMSG00000015798)	SHROOM1 (ENSMMSG00000015817)	ENSMMSG00000015926	BTBD2 (ENSMMSG00000015949)	CSNK1G2 (ENSMMSG00000015996)	SCAMP4 (ENSMMSG00000016040)	ABHD17A (ENSMMSG00000016084)	KLF16 (ENSMMSG00000016148)
Yarkand deer	DUPLICATION
Yarkand deer	MODERN SPECIES	32	PCBD2 (ENSCHYG00000018515)	TXNDC15 (ENSCHYG00000018453)	C5orf24 (ENSCHYG00000018373)	DDX46 (ENSCHYG00000017047)	CAMLG (ENSCHYG00000016873)	SEC24A (ENSCHYG00000016665)	SAR1B (ENSCHYG00000016568)	JADE2 (ENSCHYG00000016164)	ENSCHYG00000016035	CDKN2AIPNL (ENSCHYG00000015984)	UBE2B (ENSCHYG00000015868)	CDKL3 (ENSCHYG00000015697)	PPP2CA (ENSCHYG00000015535)	SKP1 (ENSCHYG00000015380)	TCF7 (ENSCHYG00000014370)	ENSCHYG00000014158 #22	C5orf15 (ENSCHYG00000014107)	FSTL4 (ENSCHYG00000013767)	HSPA4 (ENSCHYG00000013342)	ENSCHYG00000013195	AFF4 (ENSCHYG00000012961)	LEAP2 (ENSCHYG00000012912)	UQCRQ (ENSCHYG00000012886)	GDF9 (ENSCHYG00000012848)	SHROOM1 (ENSCHYG00000012543)	SOWAHA (ENSCHYG00000012503)	BTBD2 (ENSCHYG00000012402)	CSNK1G2 (ENSCHYG00000012240)	SCAMP4 (ENSCHYG00000012163)	ABHD17A (ENSCHYG00000012056)	ENSCHYG00000012027
Yarkand deer	MODERN SPECIES	14	TMEM263 (ENSCHYG00000006874)	RIC8B (ENSCHYG00000006732)	RFX4 (ENSCHYG00000006451)	POLR3B (ENSCHYG00000006222)	TCP11L2 (ENSCHYG00000006165)	CKAP4 (ENSCHYG00000006152)	NUAK1 (ENSCHYG00000006097)	C12orf75 (ENSCHYG00000006042)	APPL2 (ENSCHYG00000005990)	WASHC4 (ENSCHYG00000005953)	ALDH1L2 (ENSCHYG00000005846)	NOPCHAP1 (ENSCHYG00000005781)	SLC41A2 (ENSCHYG00000005646)	CHST11 (ENSCHYG00000005591)	TXNRD1 (ENSCHYG00000005515)	ENSCHYG00000005473 #22	NFYB (ENSCHYG00000005366)	HCFC2 (ENSCHYG00000005260)	GLT8D2 (ENSCHYG00000005230)	TDG (ENSCHYG00000005191)	UQCC6 (ENSCHYG00000005155)	HSP90B1 (ENSCHYG00000005129)	ENSCHYG00000005088	NT5DC3 (ENSCHYG00000026709)	STAB2 (ENSCHYG00000026488)	ASCL1 (ENSCHYG00000026408)	PAH (ENSCHYG00000026322)	IGF1 (ENSCHYG00000026263)	ENSCHYG00000026246	PMCH (ENSCHYG00000026232)	PARPBP (ENSCHYG00000026202)
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029.k.a	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029.k.a	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029.k.a	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Dolphin	MODERN SPECIES	3497	CATSPER3 (ENSTTRG00000016875)	PCBD2 (ENSTTRG00000016874)	TXNDC15 (ENSTTRG00000016873)	C5orf24 (ENSTTRG00000016871)	DDX46 (ENSTTRG00000016869)	CAMLG (ENSTTRG00000016867)	SEC24A (ENSTTRG00000016865)	SAR1B (ENSTTRG00000016864)	JADE2 (ENSTTRG00000016863)	CDKN2AIPNL (ENSTTRG00000016862)	UBE2B (ENSTTRG00000016861)	CDKL3 (ENSTTRG00000016860)	PPP2CA (ENSTTRG00000016859)	SKP1 (ENSTTRG00000016858)	TCF7 (ENSTTRG00000016857)	VDAC1 (ENSTTRG00000016856) #22	C5orf15 (ENSTTRG00000016855)
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029.k.a	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029.k.a	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Narwhal	DUPLICATION
Narwhal	MODERN SPECIES	298	CATSPER3 (ENSMMNG00015002813)	PCBD2 (ENSMMNG00015002795)	TXNDC15 (ENSMMNG00015002779)	C5orf24 (ENSMMNG00015002768)	DDX46 (ENSMMNG00015002724)	CAMLG (ENSMMNG00015002694)	SEC24A (ENSMMNG00015002600)	SAR1B (ENSMMNG00015002534)	JADE2 (ENSMMNG00015002387)	CDKN2AIPNL (ENSMMNG00015002305)	ENSMMNG00015002289	CDKL3 (ENSMMNG00015002257)	PPP2CA (ENSMMNG00015002212)	ENSMMNG00015002197	TCF7 (ENSMMNG00015002150)	ENSMMNG00015002104 #22	C5orf15 (ENSMMNG00015002074)	FSTL4 (ENSMMNG00015002051)	ENSMMNG00015002024	HSPA4 (ENSMMNG00015001979)	ZCCHC10 (ENSMMNG00015001916)	AFF4 (ENSMMNG00015001850)	LEAP2 (ENSMMNG00015001821)	ENSMMNG00015001806	GDF9 (ENSMMNG00015001793)	SHROOM1 (ENSMMNG00015001762)	SOWAHA (ENSMMNG00015001733)	SEPTIN8 (ENSMMNG00015001582)	KIF3A (ENSMMNG00015001401)	IL4 (ENSMMNG00015001332)	IL13 (ENSMMNG00015001279)
Narwhal	MODERN SPECIES	306	ADCY1 (ENSMMNG00015010742)	CCDC201 (ENSMMNG00015010720)	IGFBP1 (ENSMMNG00015010699)	IGFBP3 (ENSMMNG00015010669)	TNS3 (ENSMMNG00015010584)	ENSMMNG00015010539	URGCP (ENSMMNG00015010531)	DBNL (ENSMMNG00015010470)	PGAM2 (ENSMMNG00015010428)	VOPP1 (ENSMMNG00015010340)	LANCL2 (ENSMMNG00015010287)	EGFR (ENSMMNG00015010237)	ENSMMNG00015010184	VSTM2A (ENSMMNG00015010168)	ENSMMNG00015009346	ENSMMNG00015009341 #22	COBL (ENSMMNG00015009269)	ENSMMNG00015009222	DDC (ENSMMNG00015009141)	FIGNL1 (ENSMMNG00015009090)	IKZF1 (ENSMMNG00015009060)	SPATA48 (ENSMMNG00015009027)	ZPBP (ENSMMNG00015009014)	VWC2 (ENSMMNG00015009001)	UPP1 (ENSMMNG00015008987)	C7orf57 (ENSMMNG00015008959)	SUN3 (ENSMMNG00015008936)	HUS1 (ENSMMNG00015008919)
Narwhal	MODERN SPECIES	311	FRAT2 (ENSMMNG00015020149)	RRP12 (ENSMMNG00015020232)	PGAM1 (ENSMMNG00015020334)	EXOSC1 (ENSMMNG00015020372)	ZDHHC16 (ENSMMNG00015020473)	MMS19 (ENSMMNG00015020600)	UBTD1 (ENSMMNG00015020639)	ANKRD2 (ENSMMNG00015020671)	HOGA1 (ENSMMNG00015020756)	MORN4 (ENSMMNG00015020795)	PI4K2A (ENSMMNG00015020825)	AVPI1 (ENSMMNG00015020853)	MARVELD1 (ENSMMNG00015020866)	ZFYVE27 (ENSMMNG00015020926)	SFRP5 (ENSMMNG00015021053)	ENSMMNG00015021065 #22	GOLGA7B (ENSMMNG00015021091)	CRTAC1 (ENSMMNG00015021140)	R3HCC1L (ENSMMNG00015021199)	LOXL4 (ENSMMNG00015021234)	PYROXD2 (ENSMMNG00015021259)	HPS1 (ENSMMNG00015021292)	HPSE2 (ENSMMNG00015021406)	CNNM1 (ENSMMNG00015021551)	GOT1 (ENSMMNG00015021565)	ENSMMNG00015021579	NKX2-3 (ENSMMNG00015021590)	ENSMMNG00015021602	SLC25A28 (ENSMMNG00015021609)	ENTPD7 (ENSMMNG00015021616)	COX15 (ENSMMNG00015021631)
Beluga whale	DUPLICATION
Beluga whale	MODERN SPECIES	17	ADCY1 (ENSDLEG00000005087)	IGFBP1 (ENSDLEG00000005245)	IGFBP3 (ENSDLEG00000003238)	TNS3 (ENSDLEG00000003402)	MRPS24 (ENSDLEG00000004051)	URGCP (ENSDLEG00000004057)	ENSDLEG00000004063	DBNL (ENSDLEG00000004073)	PGAM2 (ENSDLEG00000004099)	VOPP1 (ENSDLEG00000004105)	LANCL2 (ENSDLEG00000004118)	EGFR (ENSDLEG00000004590)	ENSDLEG00000006999	VSTM2A (ENSDLEG00000007004)	ENSDLEG00000007010	ENSDLEG00000007019 #22	COBL (ENSDLEG00000007036)	ENSDLEG00000007069	DDC (ENSDLEG00000007076)	FIGNL1 (ENSDLEG00000007088)	IKZF1 (ENSDLEG00000007094)	ENSDLEG00000007117	ZPBP (ENSDLEG00000007123)	VWC2 (ENSDLEG00000007130)	UPP1 (ENSDLEG00000007148)	C7orf57 (ENSDLEG00000007168)	SUN3 (ENSDLEG00000007187)	HUS1 (ENSDLEG00000007202)
Beluga whale	MODERN SPECIES	34	CATSPER3 (ENSDLEG00000004249)	PCBD2 (ENSDLEG00000004235)	TXNDC15 (ENSDLEG00000004230)	CUNH5orf24 (ENSDLEG00000004224)	DDX46 (ENSDLEG00000004211)	CAMLG (ENSDLEG00000004203)	SEC24A (ENSDLEG00000004181)	SAR1B (ENSDLEG00000004168)	JADE2 (ENSDLEG00000004151)	CDKN2AIPNL (ENSDLEG00000004140)	UBE2B (ENSDLEG00000004135)	CDKL3 (ENSDLEG00000004128)	PPP2CA (ENSDLEG00000004119)	ENSDLEG00000004108	TCF7 (ENSDLEG00000004087)	ENSDLEG00000004058 #22	CUNH5orf15 (ENSDLEG00000004047)	FSTL4 (ENSDLEG00000002768)	HSPA4 (ENSDLEG00000002746)	ZCCHC10 (ENSDLEG00000002732)	AFF4 (ENSDLEG00000002716)	LEAP2 (ENSDLEG00000002714)	ENSDLEG00000002709	GDF9 (ENSDLEG00000002706)	SHROOM1 (ENSDLEG00000002694)	SOWAHA (ENSDLEG00000002687)	SEPT8 (ENSDLEG00000002669)	CCNI2 (ENSDLEG00000002654)	KIF3A (ENSDLEG00000002592)	IL4 (ENSDLEG00000002560)	IL13 (ENSDLEG00000002549)
Beluga whale	MODERN SPECIES	65	FRAT2 (ENSDLEG00000015766)	RRP12 (ENSDLEG00000015698)	PGAM1 (ENSDLEG00000015682)	EXOSC1 (ENSDLEG00000015668)	ZDHHC16 (ENSDLEG00000015638)	MMS19 (ENSDLEG00000015591)	UBTD1 (ENSDLEG00000015580)	ANKRD2 (ENSDLEG00000015568)	HOGA1 (ENSDLEG00000015555)	MORN4 (ENSDLEG00000015545)	PI4K2A (ENSDLEG00000015532)	AVPI1 (ENSDLEG00000015521)	MARVELD1 (ENSDLEG00000015515)	ZFYVE27 (ENSDLEG00000015495)	SFRP5 (ENSDLEG00000015488)	ENSDLEG00000015480 #22	GOLGA7B (ENSDLEG00000015445)	CRTAC1 (ENSDLEG00000015410)	R3HCC1L (ENSDLEG00000019396)	LOXL4 (ENSDLEG00000019384)	PYROXD2 (ENSDLEG00000019317)	HPS1 (ENSDLEG00000018728)	HPSE2 (ENSDLEG00000018666)	ENSDLEG00000018658	CNNM1 (ENSDLEG00000018642)	GOT1 (ENSDLEG00000018631)	ENSDLEG00000018627	NKX2-3 (ENSDLEG00000018624)	ENSDLEG00000018620	SLC25A28 (ENSDLEG00000018615)	ENTPD7 (ENSDLEG00000018599)
Vaquita	DUPLICATION
Vaquita	MODERN SPECIES	14	PCBD2 (ENSPSNG00000019393)	TXNDC15 (ENSPSNG00000019414)	C5orf24 (ENSPSNG00000019472)	DDX46 (ENSPSNG00000019517)	CAMLG (ENSPSNG00000019584)	SEC24A (ENSPSNG00000019616)	ENSPSNG00000019675	SAR1B (ENSPSNG00000019715)	JADE2 (ENSPSNG00000019780)	CDKN2AIPNL (ENSPSNG00000000056)	ENSPSNG00000000064	CDKL3 (ENSPSNG00000000099)	PPP2CA (ENSPSNG00000000125)	ENSPSNG00000000142	TCF7 (ENSPSNG00000000199)	ENSPSNG00000000298 #22	C5orf15 (ENSPSNG00000000328)	FSTL4 (ENSPSNG00000000371)	HSPA4 (ENSPSNG00000000446)	ZCCHC10 (ENSPSNG00000000491)	AFF4 (ENSPSNG00000000549)	LEAP2 (ENSPSNG00000000583)	ENSPSNG00000000601	GDF9 (ENSPSNG00000000623)	SHROOM1 (ENSPSNG00000000661)	SEPTIN8 (ENSPSNG00000000738)	KIF3A (ENSPSNG00000000863)	ENSPSNG00000000891	IL4 (ENSPSNG00000000916)	IL13 (ENSPSNG00000000949)	RAD50 (ENSPSNG00000001010)
Vaquita	MODERN SPECIES	7	ARID4B (ENSPSNG00000016188)	ENSPSNG00000016428	TBCE (ENSPSNG00000016546)	B3GALNT2 (ENSPSNG00000016831)	ENSPSNG00000016937	NID1 (ENSPSNG00000016998)	GPR137B (ENSPSNG00000017071)	ERO1B (ENSPSNG00000017108)	EDARADD (ENSPSNG00000017210)	LGALS8 (ENSPSNG00000017330)	HEATR1 (ENSPSNG00000017452)	ACTN2 (ENSPSNG00000017620)	MTR (ENSPSNG00000018069)	ENSPSNG00000018643	RYR2 (ENSPSNG00000018774)	ENSPSNG00000019599 #22	ZP4 (ENSPSNG00000019640)	CHRM3 (ENSPSNG00000019748)	ENSPSNG00000019778	ZNF37A (ENSPSNG00000019824)	ENSPSNG00000019878	ZNF25 (ENSPSNG00000019906)	ENSPSNG00000019949	ZNF248 (ENSPSNG00000019971)	ENSPSNG00000020012	BMS1 (ENSPSNG00000020037)	RET (ENSPSNG00000009662)	CSGALNACT2 (ENSPSNG00000010027)	RASGEF1A (ENSPSNG00000010125)	ENSPSNG00000010387	FXYD4 (ENSPSNG00000010413)
Sperm whale	DUPLICATION
Sperm whale	MODERN SPECIES	10	PIEZO2 (ENSPCTG00005021976)	NAPG (ENSPCTG00005022203)	VAPA (ENSPCTG00005022215)	ENSPCTG00005022222	RAB31 (ENSPCTG00005022229)	PPP4R1 (ENSPCTG00005022253)	ENSPCTG00005022290	RALBP1 (ENSPCTG00005022298)	TWSG1 (ENSPCTG00005022308)	ANKRD12 (ENSPCTG00005022318)	ENSPCTG00005022333	MTCL1 (ENSPCTG00005022346)	ENSPCTG00005009165	RAB12 (ENSPCTG00005009191)	PTPRM (ENSPCTG00005009359)	ENSPCTG00005010629 #22	LRRC30 (ENSPCTG00005010734)	LAMA1 (ENSPCTG00005010960)	ARHGAP28 (ENSPCTG00005012161)	L3MBTL4 (ENSPCTG00005012962)	TMEM200C (ENSPCTG00005013590)	EPB41L3 (ENSPCTG00005013615)	ZBTB14 (ENSPCTG00005013701)	ENSPCTG00005013791	AKAIN1 (ENSPCTG00005013812)	ENSPCTG00005013869	ENSPCTG00005013911	DLGAP1 (ENSPCTG00005014046)	TGIF1 (ENSPCTG00005015886)	MYL12A (ENSPCTG00005015983)	MYOM1 (ENSPCTG00005016147)
Sperm whale	MODERN SPECIES	19	CATSPER3 (ENSPCTG00005011602)	PCBD2 (ENSPCTG00005011566)	TXNDC15 (ENSPCTG00005011498)	C8H5orf24 (ENSPCTG00005011452)	DDX46 (ENSPCTG00005011383)	CAMLG (ENSPCTG00005011326)	SEC24A (ENSPCTG00005011267)	SAR1B (ENSPCTG00005011214)	JADE2 (ENSPCTG00005010764)	CDKN2AIPNL (ENSPCTG00005010729)	UBE2B (ENSPCTG00005010679)	CDKL3 (ENSPCTG00005010526)	PPP2CA (ENSPCTG00005010464)	SKP1 (ENSPCTG00005010295)	TCF7 (ENSPCTG00005010007)	VDAC1 (ENSPCTG00005009965) #22	C8H5orf15 (ENSPCTG00005009935)	FSTL4 (ENSPCTG00005009656)	HSPA4 (ENSPCTG00005009592)	ZCCHC10 (ENSPCTG00005009514)	LEAP2 (ENSPCTG00005009462)	ENSPCTG00005009418	GDF9 (ENSPCTG00005009233)	SHROOM1 (ENSPCTG00005009012)	SOWAHA (ENSPCTG00005008985)	SEPT8 (ENSPCTG00005008764)	CCNI2 (ENSPCTG00005008653)	ENSPCTG00005006404	KIF3A (ENSPCTG00005006335)	IL4 (ENSPCTG00005006270)	IL13 (ENSPCTG00005006232)
Blue whale	DUPLICATION
Blue whale	MODERN SPECIES	11	TP53BP1 (ENSBMSG00010003494)	TUBGCP4 (ENSBMSG00010003528)	ZSCAN29 (ENSBMSG00010003539)	ENSBMSG00010003548	ADAL (ENSBMSG00010003560)	ENSBMSG00010003570	TGM5 (ENSBMSG00010003578)	EPB42 (ENSBMSG00010003597)	CCNDBP1 (ENSBMSG00010003695)	TMEM62 (ENSBMSG00010003716)	UBR1 (ENSBMSG00010003745)	TTBK2 (ENSBMSG00010003774)	CDAN1 (ENSBMSG00010003812)	ENSBMSG00010003824	ENSBMSG00010003842	ENSBMSG00010003868 #22	HAUS2 (ENSBMSG00010003892)	LRRC57 (ENSBMSG00010003922)	ENSBMSG00010003946	ZNF106 (ENSBMSG00010003987)	CAPN3 (ENSBMSG00010004116)	GANC (ENSBMSG00010004785)	TMEM87A (ENSBMSG00010004823)	VPS39 (ENSBMSG00010004855)	PLA2G4F (ENSBMSG00010004869)	PLA2G4D (ENSBMSG00010004891)	PLA2G4E (ENSBMSG00010004908)	EHD4 (ENSBMSG00010004831)	PLA2G4B (ENSBMSG00010004852)	JMJD7 (ENSBMSG00010004872)	MAPKBP1 (ENSBMSG00010004924)
Blue whale	MODERN SPECIES	7	FRAT1 (ENSBMSG00010014808)	FRAT2 (ENSBMSG00010014789)	RRP12 (ENSBMSG00010014708)	PGAM4 (ENSBMSG00010014630)	EXOSC1 (ENSBMSG00010014544)	ZDHHC16 (ENSBMSG00010014246)	MMS19 (ENSBMSG00010014036)	UBTD1 (ENSBMSG00010021584)	ANKRD2 (ENSBMSG00010021528)	HOGA1 (ENSBMSG00010021510)	ENSBMSG00010021499	PI4K2A (ENSBMSG00010021477)	AVPI1 (ENSBMSG00010021470)	MARVELD1 (ENSBMSG00010021463)	SFRP5 (ENSBMSG00010021454)	ENSBMSG00010021433 #22	ZFYVE27 (ENSBMSG00010021315)	CRTAC1 (ENSBMSG00010021195)	R3HCC1L (ENSBMSG00010021112)	LOXL4 (ENSBMSG00010021080)	PYROXD2 (ENSBMSG00010021039)	HPS1 (ENSBMSG00010021004)	ENSBMSG00010020978	HPSE2 (ENSBMSG00010020945)	CNNM1 (ENSBMSG00010020911)	GOT1 (ENSBMSG00010020897)	NKX2-3 (ENSBMSG00010020878)	SLC25A28 (ENSBMSG00010020858)	ENTPD7 (ENSBMSG00010020812)	COX15 (ENSBMSG00010020776)	CUTC (ENSBMSG00010020742)
Blue whale	MODERN SPECIES	14	CATSPER3 (ENSBMSG00010001029)	PCBD2 (ENSBMSG00010001020)	TXNDC15 (ENSBMSG00010000989)	C5orf24 (ENSBMSG00010000970)	DDX46 (ENSBMSG00010000904)	CAMLG (ENSBMSG00010000870)	SEC24A (ENSBMSG00010000853)	SAR1B (ENSBMSG00010000823)	JADE2 (ENSBMSG00010000773)	CDKN2AIPNL (ENSBMSG00010000756)	ENSBMSG00010000743	CDKL3 (ENSBMSG00010000621)	PPP2CA (ENSBMSG00010000599)	ENSBMSG00010000571	TCF7 (ENSBMSG00010000497)	ENSBMSG00010000427 #22	C5orf15 (ENSBMSG00010000398)	FSTL4 (ENSBMSG00010000325)	HSPA4 (ENSBMSG00010000264)	ZCCHC10 (ENSBMSG00010000233)	AFF4 (ENSBMSG00010000194)	LEAP2 (ENSBMSG00010000170)	ENSBMSG00010000150	GDF9 (ENSBMSG00010000134)	SHROOM1 (ENSBMSG00010000056)	SOWAHA (ENSBMSG00010000033)	SEPTIN8 (ENSBMSG00010017726)	ENSBMSG00010017575	KIF3A (ENSBMSG00010017431)	IL4 (ENSBMSG00010017373)	IL13 (ENSBMSG00010017323)
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154.k	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029.n	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991
Alpaca	MODERN SPECIES	5436																VDAC1 (ENSVPAG00000010448) #22	C5orf15 (ENSVPAG00000010447)
Arabian camel	DUPLICATION
Arabian camel	MODERN SPECIES	22	CATSPER3 (ENSCDRG00005002372)	PCBD2 (ENSCDRG00005002391)	TXNDC15 (ENSCDRG00005002410)	C5orf24 (ENSCDRG00005002423)	DDX46 (ENSCDRG00005002451)	CAMLG (ENSCDRG00005002484)	SEC24A (ENSCDRG00005002533)	SAR1B (ENSCDRG00005002739)	JADE2 (ENSCDRG00005002781)	CDKN2AIPNL (ENSCDRG00005002906)	UBE2B (ENSCDRG00005002926)	CDKL3 (ENSCDRG00005002942)	PPP2CA (ENSCDRG00005003008)	ENSCDRG00005003041	TCF7 (ENSCDRG00005003054)	ENSCDRG00005003084 #22	C5orf15 (ENSCDRG00005003097)	FSTL4 (ENSCDRG00005003110)	HSPA4 (ENSCDRG00005003126)	ZCCHC10 (ENSCDRG00005003157)	AFF4 (ENSCDRG00005003176)	LEAP2 (ENSCDRG00005003219)	ENSCDRG00005003236	GDF9 (ENSCDRG00005003240)	SHROOM1 (ENSCDRG00005003247)	SEPTIN8 (ENSCDRG00005003268)	KIF3A (ENSCDRG00005003630)	IL4 (ENSCDRG00005003716)	IL13 (ENSCDRG00005003744)	RAD50 (ENSCDRG00005003769)	IL5 (ENSCDRG00005003838)
Arabian camel	MODERN SPECIES	7	ENSCDRG00005013844	ENSCDRG00005013757	CDRT4 (ENSCDRG00005013739)	TEKT3 (ENSCDRG00005013674)	PMP22 (ENSCDRG00005013586)	HS3ST3B1 (ENSCDRG00005013544)	COX10 (ENSCDRG00005013442)	ENSCDRG00005013405	HS3ST3A1 (ENSCDRG00005013366)	ELAC2 (ENSCDRG00005009659)	ENSCDRG00005009369	ENSCDRG00005009485	MYOCD (ENSCDRG00005009287)	MAP2K4 (ENSCDRG00005009003)	ZNF18 (ENSCDRG00005008936)	ENSCDRG00005008864 #22	ENSCDRG00005008806	ENSCDRG00005021832	ENSCDRG00005021831	PIRT (ENSCDRG00005021811)	TMEM238L (ENSCDRG00005021809)	ENSCDRG00005021805	ADPRM (ENSCDRG00005021801)	SCO1 (ENSCDRG00005021797)	MYH3 (ENSCDRG00005021793)	MYH2 (ENSCDRG00005021781)	ENSCDRG00005021776	ENSCDRG00005021772	MYH4 (ENSCDRG00005018178)	MYH8 (ENSCDRG00005017681)	ENSCDRG00005017428
Suina	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	204	PCBD2 (ENSCWAG00000001617)	TXNDC15 (ENSCWAG00000001604)	C5orf24 (ENSCWAG00000001594)	ENSCWAG00000001585	DDX46 (ENSCWAG00000001555)	CAMLG (ENSCWAG00000001526)	SEC24A (ENSCWAG00000001484)	SAR1B (ENSCWAG00000001466)	JADE2 (ENSCWAG00000001373)	CDKN2AIPNL (ENSCWAG00000001332)	UBE2B (ENSCWAG00000001325)	CDKL3 (ENSCWAG00000001280)	PPP2CA (ENSCWAG00000001252)	SKP1 (ENSCWAG00000001228)	TCF7 (ENSCWAG00000000966)	VDAC1 (ENSCWAG00000000911) #22	C5orf15 (ENSCWAG00000000899)	ENSCWAG00000000888	FSTL4 (ENSCWAG00000000828)	HSPA4 (ENSCWAG00000000776)	ZCCHC10 (ENSCWAG00000000742)	AFF4 (ENSCWAG00000000699)	LEAP2 (ENSCWAG00000000679)	UQCRQ (ENSCWAG00000000670)	GDF9 (ENSCWAG00000000656)	SHROOM1 (ENSCWAG00000000622)	SOWAHA (ENSCWAG00000000597)	SEPTIN8 (ENSCWAG00000000563)	KIF3A (ENSCWAG00000000413)	IL4 (ENSCWAG00000000368)	IL13 (ENSCWAG00000000347)
Pig	DUPLICATION
Pig	MODERN SPECIES	10	CATSPER3 (ENSSSCG00000028294)	ENSSSCG00000026229	TXNDC15 (ENSSSCG00000026106)	C5orf24 (ENSSSCG00000034954)	DDX46 (ENSSSCG00000026644)	CAMLG (ENSSSCG00000038955)	SEC24A (ENSSSCG00000014304)	SAR1B (ENSSSCG00000014305)	JADE2 (ENSSSCG00000014303)	CDKN2AIPNL (ENSSSCG00000037127)	UBE2B (ENSSSCG00000038953)	CDKL3 (ENSSSCG00000014302)	PPP2CA (ENSSSCG00000014298)	SKP1 (ENSSSCG00000038628)	TCF7 (ENSSSCG00000030680)	ENSSSCG00000014296 #22	C5orf15 (ENSSSCG00000032323)	FSTL4 (ENSSSCG00000014293)	HSPA4 (ENSSSCG00000014292)	ZCCHC10 (ENSSSCG00000056081)	ENSSSCG00000062388	AFF4 (ENSSSCG00000014291)	LEAP2 (ENSSSCG00000040998)	UQCRQ (ENSSSCG00000014289)	GDF9 (ENSSSCG00000014288)	SHROOM1 (ENSSSCG00000014287)	SOWAHA (ENSSSCG00000014286)	SEPTIN8 (ENSSSCG00000014285)	ENSSSCG00000014284	IL4 (ENSSSCG00000014282)	IL13 (ENSSSCG00000014281)
Pig	MODERN SPECIES	4	CXADR (ENSSSCG00000032702)	USP25 (ENSSSCG00000024623)	NRIP1 (ENSSSCG00000021038)	ENSSSCG00000063406	SAMSN1 (ENSSSCG00000038062)	HSPA13 (ENSSSCG00000012007)	ENSSSCG00000012006	RBM11 (ENSSSCG00000037517)	LIPI (ENSSSCG00000012004)	ROBO2 (ENSSSCG00000012002)	ROBO1 (ENSSSCG00000012001)	ENSSSCG00000050662	GBE1 (ENSSSCG00000012000)	ENSSSCG00000060930	ENSSSCG00000029127	ENSSSCG00000062632 #22	CADM2 (ENSSSCG00000011999)	VGLL3 (ENSSSCG00000032398)	CHMP2B (ENSSSCG00000011997)	POU1F1 (ENSSSCG00000011996)	HTR1F (ENSSSCG00000030227)	CGGBP1 (ENSSSCG00000032182)	ZNF654 (ENSSSCG00000036885)	C3orf38 (ENSSSCG00000034645)	ENSSSCG00000060301	EPHA3 (ENSSSCG00000026130)	PROS1 (ENSSSCG00000025463)	STX19 (ENSSSCG00000045484)	ARL13B (ENSSSCG00000027571)	NSUN3 (ENSSSCG00000027432)	EPHA6 (ENSSSCG00000033898)
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
leopard	MODERN SPECIES	89	CATSPER3 (ENSPPRG00000012747)	PCBD2 (ENSPPRG00000012520)	TXNDC15 (ENSPPRG00000011247)	C5orf24 (ENSPPRG00000010838)	DDX46 (ENSPPRG00000010743)	CAMLG (ENSPPRG00000009315)	SEC24A (ENSPPRG00000009141)	SAR1B (ENSPPRG00000008356)	JADE2 (ENSPPRG00000008224)	CDKN2AIPNL (ENSPPRG00000006924)	UBE2B (ENSPPRG00000006222)	CDKL3 (ENSPPRG00000005837)	PPP2CA (ENSPPRG00000003724)	ENSPPRG00000003239	TCF7 (ENSPPRG00000002477)	VDAC1 (ENSPPRG00000001701) #22	C5orf15 (ENSPPRG00000001464)	FSTL4 (ENSPPRG00000001292)	HSPA4 (ENSPPRG00000000423)	ZCCHC10 (ENSPPRG00000017677)	AFF4 (ENSPPRG00000016213)	LEAP2 (ENSPPRG00000014622)	UQCRQ (ENSPPRG00000014061)	GDF9 (ENSPPRG00000013905)	SHROOM1 (ENSPPRG00000013762)	SEPTIN8 (ENSPPRG00000012732)	CCNI2 (ENSPPRG00000011839)	KIF3A (ENSPPRG00000011609)	ENSPPRG00000008759	IL13 (ENSPPRG00000008703)	RAD50 (ENSPPRG00000008316)
lion	MODERN SPECIES		CATSPER3 (ENSPLOG00000000516)	PCBD2 (ENSPLOG00000000536)	TXNDC15 (ENSPLOG00000000551)	C5orf24 (ENSPLOG00000000632)	DDX46 (ENSPLOG00000000678)	CAMLG (ENSPLOG00000000745)	SEC24A (ENSPLOG00000000780)	SAR1B (ENSPLOG00000000835)	JADE2 (ENSPLOG00000000897)	CDKN2AIPNL (ENSPLOG00000000981)	UBE2B (ENSPLOG00000000999)	CDKL3 (ENSPLOG00000001036)	PPP2CA (ENSPLOG00000001057)	ENSPLOG00000001076	TCF7 (ENSPLOG00000001137)	VDAC1 (ENSPLOG00000001215) #22	C5orf15 (ENSPLOG00000001242)	FSTL4 (ENSPLOG00000001264)	HSPA4 (ENSPLOG00000001328)	ZCCHC10 (ENSPLOG00000001391)	AFF4 (ENSPLOG00000001411)	LEAP2 (ENSPLOG00000001435)	UQCRQ (ENSPLOG00000001445)	GDF9 (ENSPLOG00000001462)	SHROOM1 (ENSPLOG00000001489)	SOWAHA (ENSPLOG00000001548)	SEPTIN8 (ENSPLOG00000001577)	KIF3A (ENSPLOG00000001619)	ENSPLOG00000001651	IL13 (ENSPLOG00000001662)	ENSPLOG00000001678
Tiger	MODERN SPECIES	269	CATSPER3 (ENSPTIG00000008990)	PCBD2 (ENSPTIG00000009638)	TXNDC15 (ENSPTIG00000010021)	C5orf24 (ENSPTIG00000011447)	DDX46 (ENSPTIG00000012382)	CAMLG (ENSPTIG00000016836)	SEC24A (ENSPTIG00000017811)	SAR1B (ENSPTIG00000001052)	JADE2 (ENSPTIG00000007170)	CDKN2AIPNL (ENSPTIG00000016998)	UBE2B (ENSPTIG00000017564)	CDKL3 (ENSPTIG00000019406)	PPP2CA (ENSPTIG00000021959)	SKP1 (ENSPTIG00000022037)	TCF7 (ENSPTIG00000022096)	VDAC1 (ENSPTIG00000007829) #22	C5orf15 (ENSPTIG00000008679)	FSTL4 (ENSPTIG00000009803)	HSPA4 (ENSPTIG00000012242)	ZCCHC10 (ENSPTIG00000014392)	AFF4 (ENSPTIG00000016209)	LEAP2 (ENSPTIG00000019152)	UQCRQ (ENSPTIG00000019667)	GDF9 (ENSPTIG00000021103)	SEPTIN8 (ENSPTIG00000000022)	ENSPTIG00000008743	KIF3A (ENSPTIG00000009869)	ENSPTIG00000015647	IL13 (ENSPTIG00000016535)	RAD50 (ENSPTIG00000016988)	IL5 (ENSPTIG00000017805)
Cat	MODERN SPECIES		MACROH2A1 (ENSFCAG00000013924)	PITX1 (ENSFCAG00000044399)	CATSPER3 (ENSFCAG00000006832)	TXNDC15 (ENSFCAG00000025528)	DDX46 (ENSFCAG00000026229)	CAMLG (ENSFCAG00000026813)	SEC24A (ENSFCAG00000013980)	SAR1B (ENSFCAG00000000338)	JADE2 (ENSFCAG00000029905)	CDKN2AIPNL (ENSFCAG00000036907)	UBE2B (ENSFCAG00000039904)	CDKL3 (ENSFCAG00000024742)	PPP2CA (ENSFCAG00000033613)	ENSFCAG00000031140	TCF7 (ENSFCAG00000008424)	VDAC1 (ENSFCAG00000008421) #22	CA1H5orf15 (ENSFCAG00000022790)	FSTL4 (ENSFCAG00000014604)	HSPA4 (ENSFCAG00000012426)	ZCCHC10 (ENSFCAG00000029016)	AFF4 (ENSFCAG00000012425)	LEAP2 (ENSFCAG00000035850)	UQCRQ (ENSFCAG00000024071)	GDF9 (ENSFCAG00000012423)	SHROOM1 (ENSFCAG00000022651)	SOWAHA (ENSFCAG00000025559)	SEPTIN8 (ENSFCAG00000014043)	CCNI2 (ENSFCAG00000046088)	KIF3A (ENSFCAG00000014036)	IL4 (ENSFCAG00000002490)	IL13 (ENSFCAG00000032683)
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Red fox	MODERN SPECIES	17	CATSPER3 (ENSVVUG00000017514)	PCBD2 (ENSVVUG00000017522)	TXNDC15 (ENSVVUG00000017530)	CUNH5orf24 (ENSVVUG00000017545)	DDX46 (ENSVVUG00000017549)	CAMLG (ENSVVUG00000017569)	SEC24A (ENSVVUG00000017713)	SAR1B (ENSVVUG00000021294)	JADE2 (ENSVVUG00000021300)	CDKN2AIPNL (ENSVVUG00000021312)	UBE2B (ENSVVUG00000021319)	CDKL3 (ENSVVUG00000021356)	PPP2CA (ENSVVUG00000021365)	SKP1 (ENSVVUG00000021377)	TCF7 (ENSVVUG00000021387)	VDAC1 (ENSVVUG00000021410) #22	CUNH5orf15 (ENSVVUG00000021413)	ENSVVUG00000021414	FSTL4 (ENSVVUG00000021423)	ENSVVUG00000021429	ENSVVUG00000021578	ENSVVUG00000024517	ZCCHC10 (ENSVVUG00000024519)	AFF4 (ENSVVUG00000024524)	ENSVVUG00000024534	UQCRQ (ENSVVUG00000024537)	GDF9 (ENSVVUG00000024542)	SHROOM1 (ENSVVUG00000024544)	SEPTIN8 (ENSVVUG00000024548)	KIF3A (ENSVVUG00000024559)	IL4 (ENSVVUG00000024569)
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b.v	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Dingo	MODERN SPECIES	214	ENSCAFG00020008979	AASDHPPT (ENSCAFG00020008990)	KBTBD3 (ENSCAFG00020008995)	MSANTD4 (ENSCAFG00020009005)	GRIA4 (ENSCAFG00020009023)	ENSCAFG00020009148	ENSCAFG00020009158	CASP12 (ENSCAFG00020009167)	ENSCAFG00020009172	ENSCAFG00020009183	PDGFD (ENSCAFG00020009202)	DDI1 (ENSCAFG00020009203)	ENSCAFG00020009224	ENSCAFG00020009235	ENSCAFG00020009260	VDAC1 (ENSCAFG00020009285) #22	ENSCAFG00020009289	MMP13 (ENSCAFG00020009304)	MMP12 (ENSCAFG00020009354)	MMP3 (ENSCAFG00020009376)	MMP1 (ENSCAFG00020009380)	MMP8 (ENSCAFG00020009478)	MMP27 (ENSCAFG00020009747)	MMP20 (ENSCAFG00020009756)	ENSCAFG00020009766	BIRC2 (ENSCAFG00020009773)	BIRC3 (ENSCAFG00020009777)	YAP1 (ENSCAFG00020009787)	CFAP300 (ENSCAFG00020009803)	CEP126 (ENSCAFG00020009832)	ANGPTL5 (ENSCAFG00020009840)
Dog	DUPLICATION
Dog	MODERN SPECIES	2	CATSPER3 (ENSCAFG00845013828)	PCBD2 (ENSCAFG00845013812)	TXNDC15 (ENSCAFG00845013770)	C5orf24 (ENSCAFG00845013744)	DDX46 (ENSCAFG00845013658)	CAMLG (ENSCAFG00845013583)	SEC24A (ENSCAFG00845013374)	SAR1B (ENSCAFG00845013299)	JADE2 (ENSCAFG00845013059)	CDKN2AIPNL (ENSCAFG00845012929)	UBE2B (ENSCAFG00845012898)	CDKL3 (ENSCAFG00845012747)	PPP2CA (ENSCAFG00845012605)	SKP1 (ENSCAFG00845012532)	ENSCAFG00845012366	VDAC1 (ENSCAFG00845012203) #22	C5orf15 (ENSCAFG00845012164)	FSTL4 (ENSCAFG00845012044)	HSPA4 (ENSCAFG00845011851)	ZCCHC10 (ENSCAFG00845011767)	AFF4 (ENSCAFG00845011722)	LEAP2 (ENSCAFG00845011696)	UQCRQ (ENSCAFG00845011677)	GDF9 (ENSCAFG00845011626)	SHROOM1 (ENSCAFG00845011505)	SOWAHA (ENSCAFG00845011481)	CCNI2 (ENSCAFG00845011431)	SEPTIN8 (ENSCAFG00845011237)	KIF3A (ENSCAFG00845011039)	IL4 (ENSCAFG00845010991)	IL13 (ENSCAFG00845010953)
Dog	MODERN SPECIES	33	GUCY1A2 (ENSCAFG00845003912)	ENSCAFG00845003965	AASDHPPT (ENSCAFG00845004003)	KBTBD3 (ENSCAFG00845004053)	MSANTD4 (ENSCAFG00845000215)	GRIA4 (ENSCAFG00845000279)	ENSCAFG00845000322	CASP4 (ENSCAFG00845000375)	CASP12 (ENSCAFG00845000482)	ENSCAFG00845000587	ENSCAFG00845000601	PDGFD (ENSCAFG00845000627)	DDI1 (ENSCAFG00845000650)	ENSCAFG00845000669	ENSCAFG00845000695	ENSCAFG00845000714 #22	DCUN1D5 (ENSCAFG00845000732)	MMP13 (ENSCAFG00845000761)	MMP12 (ENSCAFG00845000798)	MMP3 (ENSCAFG00845000842)	MMP1 (ENSCAFG00845000871)	MMP8 (ENSCAFG00845000899)	MMP27 (ENSCAFG00845000933)	MMP20 (ENSCAFG00845000974)	MMP7 (ENSCAFG00845000992)	TMEM123 (ENSCAFG00845001013)	BIRC2 (ENSCAFG00845001046)	BIRC3 (ENSCAFG00845001106)	YAP1 (ENSCAFG00845001157)	CFAP300 (ENSCAFG00845001215)	ANGPTL5 (ENSCAFG00845001246)
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b.v	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781.pb
Polar bear	MODERN SPECIES	173	PITX1 (ENSUMAG00000017343)	CATSPER3 (ENSUMAG00000017351)	PCBD2 (ENSUMAG00000017358)	TXNDC15 (ENSUMAG00000017361)	C5orf24 (ENSUMAG00000017367)	DDX46 (ENSUMAG00000017446)	CAMLG (ENSUMAG00000017662)	SEC24A (ENSUMAG00000017669)	SAR1B (ENSUMAG00000017678)	JADE2 (ENSUMAG00000017684)	UBE2B (ENSUMAG00000017720)	CDKL3 (ENSUMAG00000017727)	PPP2CA (ENSUMAG00000017743)	SKP1 (ENSUMAG00000017784)	TCF7 (ENSUMAG00000017791)	VDAC1 (ENSUMAG00000017808) #22	C5orf15 (ENSUMAG00000017819)	FSTL4 (ENSUMAG00000017851)	HSPA4 (ENSUMAG00000017895)	ZCCHC10 (ENSUMAG00000017932)	AFF4 (ENSUMAG00000017952)	LEAP2 (ENSUMAG00000018071)	UQCRQ (ENSUMAG00000018082)	GDF9 (ENSUMAG00000018085)	SEPTIN8 (ENSUMAG00000018131)	KIF3A (ENSUMAG00000018260)	ENSUMAG00000018266	ENSUMAG00000018269	RAD50 (ENSUMAG00000018284)	IL5 (ENSUMAG00000018318)	IRF1 (ENSUMAG00000018324)
American black bear	MODERN SPECIES	3280														SKP1 (ENSUAMG00000006692)	TCF7 (ENSUAMG00000006682)	VDAC1 (ENSUAMG00000006672) #22	C5orf15 (ENSUAMG00000006659)
Giant Panda	DUPLICATION
Giant Panda	MODERN SPECIES	13	CATSPER3 (ENSAMEG00000017882)	PCBD2 (ENSAMEG00000024638)	TXNDC15 (ENSAMEG00000017879)	C5orf24 (ENSAMEG00000018842)	DDX46 (ENSAMEG00000017873)	CAMLG (ENSAMEG00000017871)	SEC24A (ENSAMEG00000017858)	SAR1B (ENSAMEG00000017849)	JADE2 (ENSAMEG00000017840)	CDKN2AIPNL (ENSAMEG00000017839)	UBE2B (ENSAMEG00000017829)	CDKL3 (ENSAMEG00000017820)	PPP2CA (ENSAMEG00000029106)	ENSAMEG00000017810	TCF7 (ENSAMEG00000017798)	VDAC1 (ENSAMEG00000017790) #22	C5orf15 (ENSAMEG00000017789)	ENSAMEG00000017788	FSTL4 (ENSAMEG00000017773)	HSPA4 (ENSAMEG00000017771)	ZCCHC10 (ENSAMEG00000028102)	AFF4 (ENSAMEG00000017764)	LEAP2 (ENSAMEG00000017763)	UQCRQ (ENSAMEG00000017762)	GDF9 (ENSAMEG00000017761)	SHROOM1 (ENSAMEG00000017757)	SOWAHA (ENSAMEG00000025558)	SEPTIN8 (ENSAMEG00000017750)	ENSAMEG00000017749	KIF3A (ENSAMEG00000017728)	IL4 (ENSAMEG00000017724)
Giant Panda	MODERN SPECIES	1881																ENSAMEG00000027479 #22
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781
Ferret	DUPLICATION
Ferret	MODERN SPECIES	175	MACROH2A1 (ENSMPUG00000010011)	PITX1 (ENSMPUG00000010019)	CATSPER3 (ENSMPUG00000010032)	TXNDC15 (ENSMPUG00000010036)	DDX46 (ENSMPUG00000010045)	CAMLG (ENSMPUG00000010061)	SEC24A (ENSMPUG00000010069)	SAR1B (ENSMPUG00000010087)	JADE2 (ENSMPUG00000010095)	CDKN2AIPNL (ENSMPUG00000010101)	UBE2B (ENSMPUG00000010112)	CDKL3 (ENSMPUG00000010119)	ENSMPUG00000019793	PPP2CA (ENSMPUG00000010169)	TCF7 (ENSMPUG00000010174)	ENSMPUG00000010220 #22	C5orf15 (ENSMPUG00000010282)	ENSMPUG00000010288	FSTL4 (ENSMPUG00000010293)	HSPA4 (ENSMPUG00000010303)	ZCCHC10 (ENSMPUG00000010310)	AFF4 (ENSMPUG00000010316)	UQCRQ (ENSMPUG00000010443)	GDF9 (ENSMPUG00000010451)	SHROOM1 (ENSMPUG00000010453)	SOWAHA (ENSMPUG00000019795)	SEPTIN8 (ENSMPUG00000010490)	KIF3A (ENSMPUG00000010496)	IL4 (ENSMPUG00000010501)	IL13 (ENSMPUG00000010507)	RAD50 (ENSMPUG00000010515)
Ferret	MODERN SPECIES	164	MDGA2 (ENSMPUG00000004928)	ENSMPUG00000004940	LRR1 (ENSMPUG00000004946)	MGAT2 (ENSMPUG00000019625)	POLE2 (ENSMPUG00000004950)	KLHDC1 (ENSMPUG00000004962)	KLHDC2 (ENSMPUG00000004970)	NEMF (ENSMPUG00000004978)	ARF6 (ENSMPUG00000019627)	VCPKMT (ENSMPUG00000004994)	SOS2 (ENSMPUG00000005022)	L2HGDH (ENSMPUG00000005038)	DMAC2L (ENSMPUG00000005052)	CDKL1 (ENSMPUG00000005078)	MAP4K5 (ENSMPUG00000005086)	ENSMPUG00000019630 #22	ATL1 (ENSMPUG00000005107)	SAV1 (ENSMPUG00000005119)	NIN (ENSMPUG00000005126)	ABHD12B (ENSMPUG00000005144)	PYGL (ENSMPUG00000005218)	TRIM9 (ENSMPUG00000005230)	TMX1 (ENSMPUG00000005236)	FRMD6 (ENSMPUG00000005241)	RTRAF (ENSMPUG00000005253)	NID2 (ENSMPUG00000005320)	PTGDR (ENSMPUG00000005334)	PTGER2 (ENSMPUG00000005341)	TXNDC16 (ENSMPUG00000005348)	GPR137C (ENSMPUG00000005376)	ERO1A (ENSMPUG00000005389)
American mink	DUPLICATION
American mink	MODERN SPECIES	21	PCBD2 (ENSNVIG00000016278)	TXNDC15 (ENSNVIG00000016289)	C5orf24 (ENSNVIG00000016304)	DDX46 (ENSNVIG00000016315)	CAMLG (ENSNVIG00000016384)	SEC24A (ENSNVIG00000016430)	ENSNVIG00000016531	SAR1B (ENSNVIG00000016537)	JADE2 (ENSNVIG00000016580)	CDKN2AIPNL (ENSNVIG00000016676)	UBE2B (ENSNVIG00000016690)	CDKL3 (ENSNVIG00000016706)	PPP2CA (ENSNVIG00000016768)	ENSNVIG00000016786	TCF7 (ENSNVIG00000016818)	ENSNVIG00000016919 #22	C5orf15 (ENSNVIG00000016948)	FSTL4 (ENSNVIG00000016969)	HSPA4 (ENSNVIG00000017054)	ZCCHC10 (ENSNVIG00000017298)	AFF4 (ENSNVIG00000017333)	ENSNVIG00000017358	LEAP2 (ENSNVIG00000017370)	ENSNVIG00000017379	GDF9 (ENSNVIG00000017386)	SHROOM1 (ENSNVIG00000017407)	SOWAHA (ENSNVIG00000017442)	SEPTIN8 (ENSNVIG00000017457)	KIF3A (ENSNVIG00000017484)	ENSNVIG00000017632	ENSNVIG00000017641
American mink	MODERN SPECIES	24	HDAC9 (ENSNVIG00000014244)	PRPS1L1 (ENSNVIG00000014716)	SNX13 (ENSNVIG00000014729)	AHR (ENSNVIG00000014868)	ENSNVIG00000014908	AGR2 (ENSNVIG00000014918)	TSN13 (ENSNVIG00000014934)	BZW2 (ENSNVIG00000014944)	ANKMY2 (ENSNVIG00000015020)	LRRC72 (ENSNVIG00000015048)	SOSD1 (ENSNVIG00000015076)	CRPPA (ENSNVIG00000015094)	ENSNVIG00000015138	MEOX2 (ENSNVIG00000015163)	AGMO (ENSNVIG00000015171)	ENSNVIG00000015224 #22	DGKB (ENSNVIG00000015286)	ETV1 (ENSNVIG00000015507)	ARL4A (ENSNVIG00000015601)	SCIN (ENSNVIG00000015608)	ENSNVIG00000015646	ENSNVIG00000015664	VWDE (ENSNVIG00000015671)	TMEM106B (ENSNVIG00000015754)
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Equus	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT01100000263508.A.d.e.a.a.a.a.a.b.b.a.a	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Donkey	MODERN SPECIES	3	ENSEASG00005026102	TXNDC15 (ENSEASG00005020470)	C5orf24 (ENSEASG00005035504)	DDX46 (ENSEASG00005020329)	CAMLG (ENSEASG00005027453)	SEC24A (ENSEASG00005018668)	SAR1B (ENSEASG00005018603)	JADE2 (ENSEASG00005018548)	ENSEASG00005031046	CDKN2AIPNL (ENSEASG00005026846)	UBE2B (ENSEASG00005030009)	CDKL3 (ENSEASG00005018501)	PPP2CA (ENSEASG00005037929)	SKP1 (ENSEASG00005037065)	TCF7 (ENSEASG00005018474)	VDAC1 (ENSEASG00005018462) #22	C5orf15 (ENSEASG00005018451)	FSTL4 (ENSEASG00005018409)	ENSEASG00005025760	HSPA4 (ENSEASG00005018382)	ZCCHC10 (ENSEASG00005037597)	AFF4 (ENSEASG00005018361)	LEAP2 (ENSEASG00005024445)	ENSEASG00005035424	GDF9 (ENSEASG00005024265)	SHROOM1 (ENSEASG00005018346)	SOWAHA (ENSEASG00005025428)	SEPTIN8 (ENSEASG00005018336)	ENSEASG00005027696	KIF3A (ENSEASG00005017941)	ENSEASG00005017875
Horse	MODERN SPECIES	5	ENSECAG00000049763	TXNDC15 (ENSECAG00000016199)	C14H5orf24 (ENSECAG00000039558)	DDX46 (ENSECAG00000018217)	CAMLG (ENSECAG00000001757)	SEC24A (ENSECAG00000002321)	SAR1B (ENSECAG00000012409)	JADE2 (ENSECAG00000013170)	ENSECAG00000048044	CDKN2AIPNL (ENSECAG00000016203)	UBE2B (ENSECAG00000032089)	CDKL3 (ENSECAG00000018013)	PPP2CA (ENSECAG00000052111)	SKP1 (ENSECAG00000050063)	TCF7 (ENSECAG00000008098)	VDAC1 (ENSECAG00000012365) #22	C14H5orf15 (ENSECAG00000017207)	FSTL4 (ENSECAG00000018066)	HSPA4 (ENSECAG00000020813)	ZCCHC10 (ENSECAG00000026852)	AFF4 (ENSECAG00000011969)	ENSECAG00000029282	GDF9 (ENSECAG00000021088)	SHROOM1 (ENSECAG00000021746)	SOWAHA (ENSECAG00000022339)	SEPTIN8 (ENSECAG00000022349)	CCNI2 (ENSECAG00000043163)	KIF3A (ENSECAG00000024644)	IL4 (ENSECAG00000008299)	IL13 (ENSECAG00000009732)	RAD50 (ENSECAG00000010922)
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Megabat	MODERN SPECIES	6								SAR1B (ENSPVAG00000012433)	JADE2 (ENSPVAG00000012432)	CDKN2AIPNL (ENSPVAG00000012431)	UBE2B (ENSPVAG00000012430)	CDKL3 (ENSPVAG00000012429)	PPP2CA (ENSPVAG00000012428)	SKP1 (ENSPVAG00000012427)	TCF7 (ENSPVAG00000012426)	VDAC1 (ENSPVAG00000012423) #22	C5orf15 (ENSPVAG00000012421)
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT01090000260575	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b.u.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Microbat	MODERN SPECIES	965	PITX1 (ENSMLUG00000012646)	CATSPER3 (ENSMLUG00000012640)	PCBD2 (ENSMLUG00000012638)	TXNDC15 (ENSMLUG00000012632)	C5orf24 (ENSMLUG00000012625)	DDX46 (ENSMLUG00000012607)	SEC24A (ENSMLUG00000013536)	SAR1B (ENSMLUG00000016342)	JADE2 (ENSMLUG00000016330)	CDKN2AIPNL (ENSMLUG00000012917)	UBE2B (ENSMLUG00000012910)	CDKL3 (ENSMLUG00000012902)	PPP2CA (ENSMLUG00000016854)	ENSMLUG00000022919	TCF7 (ENSMLUG00000006530)	VDAC1 (ENSMLUG00000012467) #22	C5orf15 (ENSMLUG00000012463)	ENSMLUG00000027411
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	16	PITX1 (ENSRFEG00010005915)	CATSPER3 (ENSRFEG00010005873)	TXNDC15 (ENSRFEG00010005814)	C5orf24 (ENSRFEG00010005786)	DDX46 (ENSRFEG00010019716)	CAMLG (ENSRFEG00010019647)	ENSRFEG00010019614	SAR1B (ENSRFEG00010019572)	JADE2 (ENSRFEG00010019310)	CDKN2AIPNL (ENSRFEG00010019255)	UBE2B (ENSRFEG00010019234)	CDKL3 (ENSRFEG00010019192)	PPP2CA (ENSRFEG00010019120)	ENSRFEG00010018983	TCF7 (ENSRFEG00010018892)	VDAC1 (ENSRFEG00010018814) #22	FSTL4 (ENSRFEG00010018753)	HSPA4 (ENSRFEG00010018704)	ZCCHC10 (ENSRFEG00010018635)	AFF4 (ENSRFEG00010018556)	LEAP2 (ENSRFEG00010018515)	ENSRFEG00010018482	GDF9 (ENSRFEG00010018441)	SHROOM1 (ENSRFEG00010018370)	SOWAHA (ENSRFEG00010018320)	SEPTIN8 (ENSRFEG00010018002)	KIF3A (ENSRFEG00010017681)	ENSRFEG00010017322	IL13 (ENSRFEG00010017200)	RAD50 (ENSRFEG00010017143)	IL5 (ENSRFEG00010017063)
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES	2120																ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499
Common shrew	MODERN SPECIES	1057																ENSSARG00000008221 #22	C5orf15 (ENSSARG00000008200)
Hedgehog	MODERN SPECIES	7267																VDAC1 (ENSEEUG00000005438) #22
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Tree shrew	MODERN SPECIES	7192																VDAC1 (ENSTBEG00000003852) #22	C5orf15 (ENSTBEG00000002997)
Glires	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000160656	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288
Pika	MODERN SPECIES	4693										ENSOPRG00000006676	UBE2B (ENSOPRG00000006668)	CDKL3 (ENSOPRG00000006658)	PPP2CA (ENSOPRG00000006645)	SKP1 (ENSOPRG00000006637)	TCF7 (ENSOPRG00000006619)	ENSOPRG00000006605 #22
Rabbit	DUPLICATION
Rabbit	MODERN SPECIES	14	CATSPER3 (ENSOCUG00000001703)	ENSOCUG00000012230	TXNDC15 (ENSOCUG00000012223)	C5orf24 (ENSOCUG00000012220)	DDX46 (ENSOCUG00000012206)	CAMLG (ENSOCUG00000008284)	SEC24A (ENSOCUG00000008254)	SAR1B (ENSOCUG00000008250)	JADE2 (ENSOCUG00000009800)	CDKN2AIPNL (ENSOCUG00000015783)	UBE2B (ENSOCUG00000015774)	CDKL3 (ENSOCUG00000015764)	ENSOCUG00000015961	SKP1 (ENSOCUG00000022505)	TCF7 (ENSOCUG00000015935)	ENSOCUG00000009369 #22	C5orf15 (ENSOCUG00000013705)	LDHAL6B (ENSOCUG00000023018)	FSTL4 (ENSOCUG00000008452)	HSPA4 (ENSOCUG00000008361)	ENSOCUG00000030883	AFF4 (ENSOCUG00000013635)	LEAP2 (ENSOCUG00000013632)	UQCRQ (ENSOCUG00000013627)	GDF9 (ENSOCUG00000013621)	ENSOCUG00000028133	CCNI2 (ENSOCUG00000011946)	KIF3A (ENSOCUG00000011761)	IL-4 (ENSOCUG00000011943)	IL13 (ENSOCUG00000000154)	ENSOCUG00000033511
Rabbit	MODERN SPECIES	19	SLAIN1 (ENSOCUG00000010325)	EDNRB (ENSOCUG00000017780)	ENSOCUG00000031143	POU4F1 (ENSOCUG00000006718)	OBI1 (ENSOCUG00000028116)	ENSOCUG00000036462	RBM26 (ENSOCUG00000008843)	NDFIP2 (ENSOCUG00000013470)	ENSOCUG00000016212	SPRY2 (ENSOCUG00000009608)	SLITRK1 (ENSOCUG00000013009)	ENSOCUG00000032923	ENSOCUG00000022273	SLITRK6 (ENSOCUG00000000670)	SLITRK5 (ENSOCUG00000009898)	ENSOCUG00000027015 #22	ENSOCUG00000037741	ENSOCUG00000022423	GPC5 (ENSOCUG00000012280)	PUDP (ENSOCUG00000022845)	ENSOCUG00000024687	ENSOCUG00000035476	GPC6 (ENSOCUG00000037248)	DCT (ENSOCUG00000000407)	TGDS (ENSOCUG00000010258)	GPR180 (ENSOCUG00000016276)	ABCC4 (ENSOCUG00000014610)	CLDN10 (ENSOCUG00000009438)	DZIP1 (ENSOCUG00000009441)	DNAJC3 (ENSOCUG00000017619)	UGGT2 (ENSOCUG00000017627)
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000162238	ENSGT00940000159222	ENSGT00940000154735	ENSGT00550000074939	ENSGT00940000153203.A.a	ENSGT00940000158603	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000162238	ENSGT00940000159222	ENSGT00940000154735	ENSGT00550000074939	ENSGT00940000153203.A.a	ENSGT00940000158603	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	454	Col23a1 (ENSDORG00000011025)	Phykpl (ENSDORG00000011023)	Hnrnpab (ENSDORG00000011015)	Nhp2 (ENSDORG00000003312)	Rmnd5b (ENSDORG00000003311)	N4bp3 (ENSDORG00000003310)	Sec24a (ENSDORG00000007130)	Sar1b (ENSDORG00000023516)	Jade2 (ENSDORG00000001777)	Cdkn2aipnl (ENSDORG00000023575)	Ube2b (ENSDORG00000002525)	ENSDORG00000002519	Ppp2ca (ENSDORG00000027439)	ENSDORG00000002912	Tcf7 (ENSDORG00000005128)	Vdac1 (ENSDORG00000000714) #22	9530068E07Rik (ENSDORG00000000713)	Fstl4 (ENSDORG00000013824)	Hspa4 (ENSDORG00000004972)	Zcchc10 (ENSDORG00000008115)	ENSDORG00000023279	Leap2 (ENSDORG00000029735)	Uqcrq (ENSDORG00000023927)	Gdf9 (ENSDORG00000007464)	Sowaha (ENSDORG00000028247)	Septin8 (ENSDORG00000005384)	Kif3a (ENSDORG00000005381)	Il13 (ENSDORG00000001196)
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000162238	ENSGT00940000159222	ENSGT00940000154735	ENSGT00550000074939	ENSGT00940000153203.A.a	ENSGT00940000158603	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000162238	ENSGT00940000159222	ENSGT00940000154735	ENSGT00550000074939	ENSGT00940000153203.A.a	ENSGT00940000158603	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	391		Nhp2 (ENSNGAG00000021818)	Rmnd5b (ENSNGAG00000009420)	N4bp3 (ENSNGAG00000006198)	ENSNGAG00000022281	Sec24a (ENSNGAG00000021238)	Sar1b (ENSNGAG00000016176)	ENSNGAG00000010128	ENSNGAG00000011201	Cdkn2aipnl (ENSNGAG00000009385)	ENSNGAG00000023363	Cdkl3 (ENSNGAG00000022413)	Ppp2ca (ENSNGAG00000020974)	Skp1 (ENSNGAG00000010933)	Tcf7 (ENSNGAG00000011077)	Vdac1 (ENSNGAG00000023655) #22	9530068E07Rik (ENSNGAG00000019257)
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000159222	ENSGT00940000154735	ENSGT00550000074939	ENSGT00940000153203.A.a	ENSGT00940000158603	ENSGT00940000164277	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159222	ENSGT00940000154735	ENSGT00550000074939	ENSGT00940000153203.A.a	ENSGT00940000158603	ENSGT00940000164277	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781
Mus	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000154735	ENSGT00550000074939	ENSGT00940000153203.A.a	ENSGT00940000158603	ENSGT00860000136323	ENSGT00940000164277	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00860000136059	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000154735	ENSGT00550000074939	ENSGT00940000153203.A.a	ENSGT00940000158603	ENSGT00860000136323	ENSGT00940000164277	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029.y	ENSGT00940000159784	ENSGT00970000195231	ENSGT00940000160656	ENSGT00860000136059	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00860000136161	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000156386
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000154735	ENSGT00550000074939	ENSGT00940000153203.A.a	ENSGT00940000158603	ENSGT00860000136323	ENSGT00940000164277	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029.y	ENSGT00940000159784	ENSGT00970000195231	ENSGT00940000160656	ENSGT00860000136059	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00860000136161	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000156386
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000154735	ENSGT00550000074939	ENSGT00940000153203.A.a	ENSGT00940000158603	ENSGT00860000136323	ENSGT00940000164277	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029.y	ENSGT00940000159784	ENSGT00970000195231	ENSGT00940000160656	ENSGT00860000136059	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00860000136161	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000156386
spretus	MODERN SPECIES	2	Hnrnpab (MGP_SPRETEiJ_G0017155)	Nhp2 (MGP_SPRETEiJ_G0017156)	Rmnd5b (MGP_SPRETEiJ_G0017157)	N4bp3 (MGP_SPRETEiJ_G0017158)	MGP_SPRETEiJ_G0017159	0610009B22Rik (MGP_SPRETEiJ_G0017160)	Sec24a (MGP_SPRETEiJ_G0017161)	Sar1b (MGP_SPRETEiJ_G0017162)	Jade2 (MGP_SPRETEiJ_G0017163)	Cdkn2aipnl (MGP_SPRETEiJ_G0017164)	Ube2b (MGP_SPRETEiJ_G0017165)	Cdkl3 (MGP_SPRETEiJ_G0017166)	Ppp2ca (MGP_SPRETEiJ_G0017167)	Skp1 (MGP_SPRETEiJ_G0017168)	MGP_SPRETEiJ_G0017169	Vdac1 (MGP_SPRETEiJ_G0017170) #22	9530068E07Rik (MGP_SPRETEiJ_G0017171)	Fstl4 (MGP_SPRETEiJ_G0017172)	Hspa4 (MGP_SPRETEiJ_G0017173)	Zcchc10 (MGP_SPRETEiJ_G0017174)	Aff4 (MGP_SPRETEiJ_G0017175)	Leap2 (MGP_SPRETEiJ_G0017176)	Uqcrq (MGP_SPRETEiJ_G0017177)	Gdf9 (MGP_SPRETEiJ_G0017178)	MGP_SPRETEiJ_G0017179	Shroom1 (MGP_SPRETEiJ_G0017180)	MGP_SPRETEiJ_G0017181	Sowaha (MGP_SPRETEiJ_G0017182)	MGP_SPRETEiJ_G0017183	Septin8 (MGP_SPRETEiJ_G0017184)	Kif3a (MGP_SPRETEiJ_G0017185)
Steppe mouse	MODERN SPECIES	2352														Skp1 (ENSMSIG00000011459)	ENSMSIG00000011386	Vdac1 (ENSMSIG00000011334) #22	ENSMSIG00000011325	9530068E07Rik (ENSMSIG00000011298)
Mouse	MODERN SPECIES	2	Nhp2 (ENSMUSG00000001056)	Rmnd5b (ENSMUSG00000001054)	N4bp3 (ENSMUSG00000001053)	0610009B22Rik (ENSMUSG00000007777)	Sec24a (ENSMUSG00000036391)	Sar1b (ENSMUSG00000020386)	Jade2 (ENSMUSG00000020387)	Cdkn2aipnl (ENSMUSG00000020392)	Ube2b (ENSMUSG00000020390)	Cdkl3 (ENSMUSG00000020389)	Ppp2ca (ENSMUSG00000020349)	Or2y8 (ENSMUSG00000062204)	Or2y6 (ENSMUSG00000060170)	Skp1 (ENSMUSG00000036309)	Tcf7 (ENSMUSG00000000782)	Vdac1 (ENSMUSG00000020402) #22	9530068E07Rik (ENSMUSG00000036275)	Fstl4 (ENSMUSG00000036264)	Hspa4 (ENSMUSG00000020361)	Zcchc10 (ENSMUSG00000018239)	Aff4 (ENSMUSG00000049470)	Leap2 (ENSMUSG00000036216)	Uqcrq (ENSMUSG00000044894)	Gdf9 (ENSMUSG00000018238)	Shroom1 (ENSMUSG00000018387)	Sowaha (ENSMUSG00000044352)	Septin8 (ENSMUSG00000018398)	Kif3a (ENSMUSG00000018395)	Il4 (ENSMUSG00000000869)	Il13 (ENSMUSG00000020383)	Rad50 (ENSMUSG00000020380)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	5	Phykpl (MGP_PahariEiJ_G0017445)	Hnrnpab (MGP_PahariEiJ_G0017446)	Nhp2 (MGP_PahariEiJ_G0017447)	Rmnd5b (MGP_PahariEiJ_G0017448)	N4bp3 (MGP_PahariEiJ_G0017449)	MGP_PahariEiJ_G0017450	0610009B22Rik (MGP_PahariEiJ_G0017451)	Sec24a (MGP_PahariEiJ_G0017452)	Sar1b (MGP_PahariEiJ_G0017453)	Jade2 (MGP_PahariEiJ_G0017454)	Ube2b (MGP_PahariEiJ_G0017456)	Cdkl3 (MGP_PahariEiJ_G0017457)	Ppp2ca (MGP_PahariEiJ_G0017458)	Skp1 (MGP_PahariEiJ_G0017459)	MGP_PahariEiJ_G0017460	Vdac1 (MGP_PahariEiJ_G0017461) #22	9530068E07Rik (MGP_PahariEiJ_G0017462)	Fstl4 (MGP_PahariEiJ_G0017463)	Hspa4 (MGP_PahariEiJ_G0017464)	Zcchc10 (MGP_PahariEiJ_G0017465)	Aff4 (MGP_PahariEiJ_G0017466)	Leap2 (MGP_PahariEiJ_G0017467)	Uqcrq (MGP_PahariEiJ_G0017468)	Gdf9 (MGP_PahariEiJ_G0017469)	Shroom1 (MGP_PahariEiJ_G0017470)	MGP_PahariEiJ_G0017471	Sowaha (MGP_PahariEiJ_G0017472)	MGP_PahariEiJ_G0017473	Septin8 (MGP_PahariEiJ_G0017474)	Kif3a (MGP_PahariEiJ_G0017475)	MGP_PahariEiJ_G0017476
Rat	DUPLICATION
Rat	MODERN SPECIES	4	ENSRNOG00000069305	Cntnap5b (ENSRNOG00000064462)	RGD1561440 (ENSRNOG00000066175)	ENSRNOG00000064561	LOC304725 (ENSRNOG00000066325)	LOC679594 (ENSRNOG00000069659)	ENSRNOG00000064688	AABR07020651.1 (ENSRNOG00000053423)	ENSRNOG00000064103	Cntnap5a (ENSRNOG00000070614)	ENSRNOG00000066965	LOC100910714 (ENSRNOG00000050463)	Hsp90aa1-ps16 (ENSRNOG00000062084)	LOC304725 (ENSRNOG00000029556)	ENSRNOG00000066881	ENSRNOG00000067316 #22	ENSRNOG00000066834	ENSRNOG00000065529	Dsel (ENSRNOG00000032307)
Rat	MODERN SPECIES	46	Vma21 (ENSRNOG00000048606)	Gpr50 (ENSRNOG00000011335)	Rpsa-ps4 (ENSRNOG00000022882)	Hmgb3 (ENSRNOG00000011096)	Tmem185a (ENSRNOG00000011047)	LOC120099181 (ENSRNOG00000050915)	Eola2 (ENSRNOG00000063254)	Ids (ENSRNOG00000001465)	LOC689600 (ENSRNOG00000064273)	LOC100360413 (ENSRNOG00000051885)	Aff2 (ENSRNOG00000052572)	LOC689600 (ENSRNOG00000067249)	Fmr1nb (ENSRNOG00000053397)	Fmr1 (ENSRNOG00000057464)	AABR07042418.1 (ENSRNOG00000051726)	ENSRNOG00000069396 #22	Fam9c (ENSRNOG00000069253)	LOC100912196 (ENSRNOG00000062315)	AABR07042293.1 (ENSRNOG00000037381)	ENSRNOG00000067514	LOC689396 (ENSRNOG00000032418)	Slitrk2 (ENSRNOG00000011562)	LOC120099343 (ENSRNOG00000066658)	AABR07042226.1 (ENSRNOG00000058521)	Ctag2 (ENSRNOG00000012560)	Slitrk4 (ENSRNOG00000062783)	Magea9 (ENSRNOG00000023016)	AABR07042071.1 (ENSRNOG00000046097)	ENSRNOG00000067343	ENSRNOG00000063631	AABR07041997.1 (ENSRNOG00000026227)
Rat	MODERN SPECIES	1	Hnrnpab (ENSRNOG00000003645)	Nhp2 (ENSRNOG00000063470)	Rmnd5b (ENSRNOG00000047396)	N4bp3 (ENSRNOG00000021731)	Trappc2b (ENSRNOG00000049062)	Sec24a (ENSRNOG00000004563)	Sar1b (ENSRNOG00000004820)	Jade2 (ENSRNOG00000004956)	Cdkn2aipnl (ENSRNOG00000005024)	Ube2b (ENSRNOG00000059348)	Cdkl3 (ENSRNOG00000059485)	Ppp2ca (ENSRNOG00000005389)	LOC120095320 (ENSRNOG00000005821)	Skp1 (ENSRNOG00000005828)	Tcf7 (ENSRNOG00000005872)	Vdac1 (ENSRNOG00000006375) #22	C10h5orf15 (ENSRNOG00000006148)	ENSRNOG00000067101	Rpl30l2 (ENSRNOG00000032825)	Fstl4 (ENSRNOG00000006565)	Hspa4 (ENSRNOG00000016596)	AABR07072108.1 (ENSRNOG00000006943)	Aff4 (ENSRNOG00000006965)	Leap2 (ENSRNOG00000007218)	Uqcrq (ENSRNOG00000067979)	Gdf9 (ENSRNOG00000007301)	Shroom1 (ENSRNOG00000007431)	ENSRNOG00000065856	Sowaha (ENSRNOG00000060061)	Septin8 (ENSRNOG00000007462)	Kif3a (ENSRNOG00000007515)
Rat	MODERN SPECIES	16	Pnn (ENSRNOG00000004061)	Mia2 (ENSRNOG00000005101)	Fbxo33 (ENSRNOG00000005285)	AABR07064502.1 (ENSRNOG00000051280)	ENSRNOG00000067360	Lrfn5 (ENSRNOG00000005550)	LOC108351365 (ENSRNOG00000049817)	RGD1307621 (ENSRNOG00000023230)	Klhl28 (ENSRNOG00000004218)	Togaram1 (ENSRNOG00000004415)	Prpf39 (ENSRNOG00000004521)	Fkbp3 (ENSRNOG00000004629)	Fancm (ENSRNOG00000056721)	Mis18bp1 (ENSRNOG00000023093)	Fau (ENSRNOG00000062652)	ENSRNOG00000069999 #22	ENSRNOG00000063060	LOC689408 (ENSRNOG00000038771)	Rpl10l (ENSRNOG00000067139)	Mdga2 (ENSRNOG00000000618)	ENSRNOG00000064159	Rpl11-ps10 (ENSRNOG00000004163)	RGD1559639 (ENSRNOG00000069595)	Tigar-ps1 (ENSRNOG00000046064)	Rps29 (ENSRNOG00000004196)	Lrr1 (ENSRNOG00000004216)	Mgat2 (ENSRNOG00000004234)	Dnaaf2 (ENSRNOG00000028155)	Pole2 (ENSRNOG00000004242)	Klhdc1 (ENSRNOG00000004425)	ENSRNOG00000066035
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159222	ENSGT00940000154735	ENSGT00550000074939	ENSGT00940000153203.A.a	ENSGT00940000158603	ENSGT00940000164277	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781.hb
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159222	ENSGT00940000154735	ENSGT00550000074939	ENSGT00940000153203.A.a	ENSGT00940000158603	ENSGT00940000164277	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781.hb
Northern American deer mouse	DUPLICATION
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	17	Lamp5 (ENSPEMG00000024012)	Plcb4 (ENSPEMG00000021051)	Plcb1 (ENSPEMG00000023485)	Tmx4 (ENSPEMG00000013286)	Hao1 (ENSPEMG00000023039)	Bmp2 (ENSPEMG00000030188)	Fermt1 (ENSPEMG00000021814)	Lrrn4 (ENSPEMG00000022463)	Crls1 (ENSPEMG00000022545)	Mcm8 (ENSPEMG00000021929)	Trmt6 (ENSPEMG00000023268)	Chgb (ENSPEMG00000021563)	Shld1 (ENSPEMG00000026957)	Gpcpd1 (ENSPEMG00000023089)	ENSPEMG00000029643	ENSPEMG00000030370 #22	Cds2 (ENSPEMG00000028822)	Pcna (ENSPEMG00000011751)	Tmem230 (ENSPEMG00000026972)	Slc23a2 (ENSPEMG00000024117)	Rassf2 (ENSPEMG00000030284)	Prnd (ENSPEMG00000025579)	Prnp (ENSPEMG00000028335)	Erv3 (ENSPEMG00000022580)	Adra1d (ENSPEMG00000024149)	Smox (ENSPEMG00000009534)	Rnf24 (ENSPEMG00000014355)	Pank2 (ENSPEMG00000005506)	Mavs (ENSPEMG00000011582)	Ap5s1 (ENSPEMG00000016394)	Cdc25b (ENSPEMG00000012973)
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	3	ENSPEMG00000029079	Filip1l (ENSPEMG00000014409)	Cmss1 (ENSPEMG00000016384)	Tmem30c (ENSPEMG00000017481)	ENSPEMG00000011118	Nit2 (ENSPEMG00000024205)	Tomm70a (ENSPEMG00000015283)	Tmem45a2 (ENSPEMG00000012966)	ENSPEMG00000024759	Lnp1 (ENSPEMG00000029284)	Tmem45a (ENSPEMG00000017975)	Adgrg7 (ENSPEMG00000015621)	Tfg (ENSPEMG00000004990)	Abi3bp (ENSPEMG00000013685)	Impg2 (ENSPEMG00000008671)	ENSPEMG00000008660 #22	Senp7 (ENSPEMG00000011146)	Trmt10c (ENSPEMG00000006986)	ENSPEMG00000017850	Zbtb11 (ENSPEMG00000013233)	ENSPEMG00000012043	ENSPEMG00000013262	Cep97 (ENSPEMG00000029940)	ENSPEMG00000030353	Nxpe3 (ENSPEMG00000011617)	Nfkbiz (ENSPEMG00000010338)	Zpld1 (ENSPEMG00000007091)	Alcam (ENSPEMG00000013478)	Cblb (ENSPEMG00000013659)	Ccdc54 (ENSPEMG00000027662)	Bbx (ENSPEMG00000007033)
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	21	Hnrnpab (ENSPEMG00000023987)	Nhp2 (ENSPEMG00000023567)	Rmnd5b (ENSPEMG00000022906)	N4bp3 (ENSPEMG00000022965)	0610009B22Rik (ENSPEMG00000021728)	Sec24a (ENSPEMG00000012656)	ENSPEMG00000027537	Sar1b (ENSPEMG00000023610)	Jade2 (ENSPEMG00000023008)	Cdkn2aipnl (ENSPEMG00000031257)	Ube2b (ENSPEMG00000028920)	Cdkl3 (ENSPEMG00000021980)	Ppp2ca (ENSPEMG00000012315)	Skp1 (ENSPEMG00000021644)	Tcf7 (ENSPEMG00000013127)	Vdac1 (ENSPEMG00000011874) #22	9530068E07Rik (ENSPEMG00000023278)	Fstl4 (ENSPEMG00000001327)	ENSPEMG00000020405	Hspa4 (ENSPEMG00000004397)	ENSPEMG00000009811	Aff4 (ENSPEMG00000007995)	Leap2 (ENSPEMG00000027955)	Uqcrq (ENSPEMG00000002846)	Gdf9 (ENSPEMG00000014428)	Shroom1 (ENSPEMG00000011526)	Sowaha (ENSPEMG00000004189)	Septin8 (ENSPEMG00000009781)	Kif3a (ENSPEMG00000004934)	Il4 (ENSPEMG00000011220)	Il13 (ENSPEMG00000003732)
Prairie vole	DUPLICATION
Prairie vole	MODERN SPECIES	360	ENSMOCG00000012929	Hprt (ENSMOCG00000020974)	Plac1 (ENSMOCG00000007691)	Fam122b (ENSMOCG00000012360)	Fam122c (ENSMOCG00000010809)	Mospd1 (ENSMOCG00000005632)	ENSMOCG00000000159	ENSMOCG00000003477	ENSMOCG00000014841	ENSMOCG00000021534	Ct55 (ENSMOCG00000006595)	ENSMOCG00000016141	Zfp449 (ENSMOCG00000021000)	Smim10l2a (ENSMOCG00000004382)	Ints6l (ENSMOCG00000011413)	ENSMOCG00000001487 #22	Gm648 (ENSMOCG00000022308)	Mmgt1 (ENSMOCG00000006713)	Slc9a6 (ENSMOCG00000017739)	Fhl1 (ENSMOCG00000019051)	Map7d3 (ENSMOCG00000010703)	ENSMOCG00000013515	ENSMOCG00000020722	Brs3 (ENSMOCG00000021756)	ENSMOCG00000023007	ENSMOCG00000021293	Cd40lg (ENSMOCG00000007638)	ENSMOCG00000012399	Rbmx (ENSMOCG00000018048)	Gpr101 (ENSMOCG00000019682)	Zic3 (ENSMOCG00000020544)
Prairie vole	MODERN SPECIES	15	Hnrnpab (ENSMOCG00000014470)	Nhp2 (ENSMOCG00000022171)	Rmnd5b (ENSMOCG00000020378)	N4bp3 (ENSMOCG00000020990)	0610009B22Rik (ENSMOCG00000020890)	Sec24a (ENSMOCG00000019735)	Sar1b (ENSMOCG00000015207)	Jade2 (ENSMOCG00000012448)	Cdkn2aipnl (ENSMOCG00000016659)	Ube2b (ENSMOCG00000014525)	ENSMOCG00000012243	Ppp2ca (ENSMOCG00000015769)	ENSMOCG00000018605	ENSMOCG00000016351	Tcf7 (ENSMOCG00000010539)	Vdac1 (ENSMOCG00000015495) #22	9530068E07Rik (ENSMOCG00000013154)	Fstl4 (ENSMOCG00000020693)	Hspa4 (ENSMOCG00000021842)	Zcchc10 (ENSMOCG00000021909)	Aff4 (ENSMOCG00000003884)	Leap2 (ENSMOCG00000022263)	Uqcrq (ENSMOCG00000019628)	Gdf9 (ENSMOCG00000017121)	Shroom1 (ENSMOCG00000014587)	Sowaha (ENSMOCG00000003126)	Septin8 (ENSMOCG00000022633)	Kif3a (ENSMOCG00000006798)	Il4 (ENSMOCG00000012049)	Il13 (ENSMOCG00000011299)	ENSMOCG00000018737
Cricetinae	DUPLICATION
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.z #22
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	352	D930020B18Rik (ENSCGRG00001017356)	Xpot (ENSCGRG00001016835)	Tbk1 (ENSCGRG00001010773)	Rassf3 (ENSCGRG00001022140)	Gns (ENSCGRG00001005812)	Tbc1d30 (ENSCGRG00001019436)	Wif1 (ENSCGRG00001017177)	Lemd3 (ENSCGRG00001000700)	Msrb3 (ENSCGRG00001023685)	Hmga2 (ENSCGRG00001000426)	Llph (ENSCGRG00001002067)	Tmbim4 (ENSCGRG00001017771)	Irak3 (ENSCGRG00001021664)	Helb (ENSCGRG00001019650)	Grip1 (ENSCGRG00001016989)	ENSCGRG00001011948 #22	Cand1 (ENSCGRG00001015650)	Dyrk2 (ENSCGRG00001024229)	Ifng (ENSCGRG00001006663)	ENSCGRG00001020398	Mdm1 (ENSCGRG00001009239)	Rap1b (ENSCGRG00001021755)	Nup107 (ENSCGRG00001022934)	Slc35e3 (ENSCGRG00001019300)	Mdm2 (ENSCGRG00001022261)	Cpm (ENSCGRG00001019527)	Cpsf6 (ENSCGRG00001018082)	ENSCGRG00001024355	ENSCGRG00001008365	ENSCGRG00001021558	ENSCGRG00001012838
Cricetinae	DUPLICATION
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.`b.a #22
Golden Hamster	MODERN SPECIES	707	Draxin (ENSMAUG00000020626)	Agtrap (ENSMAUG00000020679)	Mthfr (ENSMAUG00000009132)	Clcn6 (ENSMAUG00000018198)	Nppa (ENSMAUG00000010723)	Nppb (ENSMAUG00000020459)	2510039O18Rik (ENSMAUG00000021494)	Plod1 (ENSMAUG00000021152)	Mfn2 (ENSMAUG00000008664)	Miip (ENSMAUG00000020135)	Tnfrsf8 (ENSMAUG00000009810)	Tnfrsf1b (ENSMAUG00000009639)	Vps13d (ENSMAUG00000003081)	Dhrs3 (ENSMAUG00000014881)	ENSMAUG00000022203	ENSMAUG00000001063 #22	Aadacl4fm4 (ENSMAUG00000008456)	ENSMAUG00000011542	Aadacl4fm1 (ENSMAUG00000022135)	Aadacl3 (ENSMAUG00000008443)	Cfap107 (ENSMAUG00000002284)	Pramel13 (ENSMAUG00000006280)	Pramel15 (ENSMAUG00000011962)
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	352	Plk4 (ENSCGRG00001002050)	Mfsd8 (ENSCGRG00001012257)	Fundc2b (ENSCGRG00001000870)	Abhd18 (ENSCGRG00001016317)	ENSCGRG00001004660	ENSCGRG00001022282	Pgrmc2 (ENSCGRG00001020177)	Jade1 (ENSCGRG00001001195)	Sclt1 (ENSCGRG00001013488)	D3Ertd751e (ENSCGRG00001017685)	ENSCGRG00001024232	Pcdh10 (ENSCGRG00001013755)	Pabpc4l (ENSCGRG00001002070)	Pcdh18 (ENSCGRG00001021760)	Slc7a11 (ENSCGRG00001013535)	ENSCGRG00001017707 #22	ENSCGRG00001021385	Noct (ENSCGRG00001021050)	Elf2 (ENSCGRG00001017608)	Mgarp (ENSCGRG00001021913)	Ndufc1 (ENSCGRG00001021397)	ENSCGRG00001016024 ##34	Rab33b (ENSCGRG00001016897)	Setd7 (ENSCGRG00001021541)	Mgst2 (ENSCGRG00001023658)	ENSCGRG00001015206	Maml3 (ENSCGRG00001013876)	Foxo1 (ENSCGRG00001010126)	Cog6 (ENSCGRG00001023122)	Lhfp (ENSCGRG00001014062)	ENSCGRG00001012241
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159222	ENSGT00940000154735	ENSGT00550000074939	ENSGT00940000153203.A.a	ENSGT00940000158603	ENSGT00940000164277	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.`b.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781.hb
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	229	Phykpl (ENSCGRG00001023817)	Hnrnpab (ENSCGRG00001005044)	Nhp2 (ENSCGRG00001005326)	Rmnd5b (ENSCGRG00001007195)	N4bp3 (ENSCGRG00001013658)	0610009B22Rik (ENSCGRG00001006476)	Sec24a (ENSCGRG00001022065)	SAR1B (ENSCGRG00001016339)	Jade2 (ENSCGRG00001020286)	Cdkn2aipnl (ENSCGRG00001019440)	ENSCGRG00001021699	Cdkl3 (ENSCGRG00001024159)	ENSCGRG00001015140	Skp1 (ENSCGRG00001022352)	Tcf7 (ENSCGRG00001023805)	ENSCGRG00001008975 #22	9530068E07Rik (ENSCGRG00001018577)	Fstl4 (ENSCGRG00001022572)	Hspa4 (ENSCGRG00001024247)	Zcchc10 (ENSCGRG00001000861)	ENSCGRG00001008805	Aff4 (ENSCGRG00001016680)	Leap2 (ENSCGRG00001015918)	Uqcrq (ENSCGRG00001017522)	Gdf9 (ENSCGRG00001019031)	Shroom1 (ENSCGRG00001022525)	Sowaha (ENSCGRG00001011742)	Septin8 (ENSCGRG00001020621)	Kif3a (ENSCGRG00001022016)	Il4 (ENSCGRG00001018451)	Il13 (ENSCGRG00001019822)
Lesser Egyptian jerboa	DUPLICATION
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	133	Clk4 (ENSJJAG00000014522)	Col23a1 (ENSJJAG00000020773)	Phykpl (ENSJJAG00000014498)	Hnrnpab (ENSJJAG00000022240)	Nhp2 (ENSJJAG00000016469)	Rmnd5b (ENSJJAG00000017175)	N4bp3 (ENSJJAG00000023037)	Sec24a (ENSJJAG00000021996)	ENSJJAG00000000251	Jade2 (ENSJJAG00000014097)	ENSJJAG00000010594	ENSJJAG00000000547	ENSJJAG00000007493	ENSJJAG00000024213	Tcf7 (ENSJJAG00000000476)	Vdac1 (ENSJJAG00000018371) #22	ENSJJAG00000021209	ENSJJAG00000005383	Fstl4 (ENSJJAG00000010445)	ENSJJAG00000013880	Hspa4 (ENSJJAG00000023896)	Aff4 (ENSJJAG00000000912)	Leap2 (ENSJJAG00000000464)	Uqcrq (ENSJJAG00000011956)	Gdf9 (ENSJJAG00000009480)	Shroom1 (ENSJJAG00000019891)	Septin8 (ENSJJAG00000022205)	Kif3a (ENSJJAG00000023717)	ENSJJAG00000012514	Il13 (ENSJJAG00000000582)	ENSJJAG00000019622
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	48	ENSJJAG00000012290	Ccdc152 (ENSJJAG00000020346)	Ghr (ENSJJAG00000018825)	Fbxo4 (ENSJJAG00000021644)	ENSJJAG00000021693	ENSJJAG00000004330	Plcxd3 (ENSJJAG00000023898)	ENSJJAG00000020132	C6 (ENSJJAG00000008024)	Mroh2b (ENSJJAG00000024133)	Card6 (ENSJJAG00000023358)	ENSJJAG00000014290	Prkaa1 (ENSJJAG00000021671)	ENSJJAG00000007891	Ptger4 (ENSJJAG00000023417)	ENSJJAG00000011581 #22	ENSJJAG00000018434	ENSJJAG00000000928	Fyb (ENSJJAG00000016416)	Rictor (ENSJJAG00000014049)	Osmr (ENSJJAG00000011588)	Lifr (ENSJJAG00000018296)	Egflam (ENSJJAG00000017564)	Gdnf (ENSJJAG00000024134)	Wdr70 (ENSJJAG00000000410)	Nup155 (ENSJJAG00000020587)	Cplane1 (ENSJJAG00000021533)	Nipbl (ENSJJAG00000022683)	Slc1a3 (ENSJJAG00000011327)	ENSJJAG00000012664	ENSJJAG00000007978
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000162238	ENSGT00940000159222	ENSGT00940000154735	ENSGT00550000074939	ENSGT00940000153203.A.a	ENSGT00940000158603	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00390000011365.a	ENSGT00940000162517	ENSGT00510000046787.e.b	ENSGT00940000158507	ENSGT00940000156583	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00390000012652.ab.a.m	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Naked mole-rat female	DUPLICATION
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	22	ENSHGLG00000006028	ENSHGLG00000048389	STAT1 (ENSHGLG00000003617)	STAT4 (ENSHGLG00000003160)	MYO1B (ENSHGLG00000001644)	NABP1 (ENSHGLG00000039589)	ENSHGLG00000038831	TMEFF2 (ENSHGLG00000014352)	ENSHGLG00000012392	ENSHGLG00000040475	ENSHGLG00000011282	ENSHGLG00000045287	DNAH7 (ENSHGLG00000002797)	STK17B (ENSHGLG00000035702)	ENSHGLG00000036485	ENSHGLG00000033429 #22	HECW2 (ENSHGLG00000003406)	ENSHGLG00000043744	ENSHGLG00000003131	GTF3C3 (ENSHGLG00000002660)	ENSHGLG00000045797	ENSHGLG00000039301	ENSHGLG00000044287	ITGAV (ENSHGLG00000019530)	ENSHGLG00000013039	ENSHGLG00000018884	ENSHGLG00000032621	CALCRL (ENSHGLG00000037977)	TFPI (ENSHGLG00000002403)	ENSHGLG00000004085	ENSHGLG00000001839
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	23	ENSHGLG00000033423	ATOX1 (ENSHGLG00000015116)	SPARC (ENSHGLG00000016693)	ENSHGLG00000015818	ENSHGLG00000041388	ENSHGLG00000045552	ENSHGLG00000016500	SAR1B (ENSHGLG00000047696)	ENSHGLG00000043843	CDKN2AIPNL (ENSHGLG00000015833)	UBE2B (ENSHGLG00000015894)	ENSHGLG00000018175	PPP2CA (ENSHGLG00000049249)	ENSHGLG00000046526	TCF7 (ENSHGLG00000047039)	ENSHGLG00000016961 #22	C5orf15 (ENSHGLG00000046112)	FSTL4 (ENSHGLG00000013297)	ENSHGLG00000034279	ENSHGLG00000047311	HSPA4 (ENSHGLG00000017017)	ENSHGLG00000050674	ENSHGLG00000001303	AFF4 (ENSHGLG00000006661)	LEAP2 (ENSHGLG00000039112)	UQCRQ (ENSHGLG00000040975)	GDF9 (ENSHGLG00000006174)	SHROOM1 (ENSHGLG00000008210)	SOWAHA (ENSHGLG00000049840)	SEPTIN8 (ENSHGLG00000007976)	CCNI2 (ENSHGLG00000050667)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	7	ENSHGLG00000040928	ENC1 (ENSHGLG00000000552)	Hexb (ENSHGLG00000000527)	GFM2 (ENSHGLG00000000419)	NSA2 (ENSHGLG00000000324)	ENSHGLG00000035328	ENSHGLG00000032803	ENSHGLG00000000294	ENSHGLG00000000270	ANKRD31 (ENSHGLG00000000230)	ENSHGLG00000043427	ENSHGLG00000040348	ENSHGLG00000000135	ENSHGLG00000034320	ENSHGLG00000002129	ENSHGLG00000036754 #22	ENSHGLG00000002239	ENSHGLG00000040666	ENSHGLG00000035363	ENSHGLG00000001390 #18	ENSHGLG00000001449	ENSHGLG00000041239	ENSHGLG00000049946	ENSHGLG00000045518	ENSHGLG00000001474	ENSHGLG00000050747	ENSHGLG00000020852	ENSHGLG00000000509	ENSHGLG00000000374	MARVELD2 (ENSHGLG00000000537)	OCLN (ENSHGLG00000003299)
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000159047	ENSGT00390000011365.a	ENSGT00940000162517	ENSGT00510000046787.e.b	ENSGT00940000158507	ENSGT00940000156583	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991
Guinea pig	DUPLICATION
Guinea pig	MODERN SPECIES	24	KLHL5 (ENSCPOG00000004478)	WDR19 (ENSCPOG00000004240)	RFC1 (ENSCPOG00000004248)	KLB (ENSCPOG00000004539)	ENSCPOG00000004543	LIAS (ENSCPOG00000004547)	UGDH (ENSCPOG00000004550)	ENSCPOG00000039840	UBE2K (ENSCPOG00000014798)	ENSCPOG00000023886	PDS5A (ENSCPOG00000011558)	N4BP2 (ENSCPOG00000022196)	RHOH (ENSCPOG00000030419)	CHRNA9 (ENSCPOG00000008344)	RBM47 (ENSCPOG00000014100)	ENSCPOG00000022129 #22	NSUN7 (ENSCPOG00000006682)	APBB2 (ENSCPOG00000006689)	UCHL1 (ENSCPOG00000001263)	LIMCH1 (ENSCPOG00000010471)	PHOX2B (ENSCPOG00000027349)	TMEM33 (ENSCPOG00000010051)	SLC30A9 (ENSCPOG00000000374)	BEND4 (ENSCPOG00000019773)	SHISA3 (ENSCPOG00000038797)	ATP8A1 (ENSCPOG00000014331)	GRXCR1 (ENSCPOG00000022895)	KCTD8 (ENSCPOG00000012356)	YIPF7 (ENSCPOG00000034301)	GUF1 (ENSCPOG00000014267)	GNPDA2 (ENSCPOG00000005643)
Guinea pig	MODERN SPECIES	81	ATOX1 (ENSCPOG00000034767)	SPARC (ENSCPOG00000025242)	FAT2 (ENSCPOG00000014431)	SLC36A1 (ENSCPOG00000014430)	ENSCPOG00000034856	ENSCPOG00000023450	SEC24A (ENSCPOG00000014716)	SAR1B (ENSCPOG00000038655)	JADE2 (ENSCPOG00000008323)	CDKN2AIPNL (ENSCPOG00000015544)	UBE2B (ENSCPOG00000030926)	ENSCPOG00000007474	PPP2CA (ENSCPOG00000039543)	SKP1 (ENSCPOG00000005164)	TCF7 (ENSCPOG00000020029)	ENSCPOG00000023840 #22	C5orf15 (ENSCPOG00000010300)	FSTL4 (ENSCPOG00000007594)	ENSCPOG00000040616	HSPA4 (ENSCPOG00000004085)	ZCCHC10 (ENSCPOG00000010824)	AFF4 (ENSCPOG00000001814)	LEAP2 (ENSCPOG00000026582)	UQCRQ (ENSCPOG00000022324)	GDF9 (ENSCPOG00000023775)	SHROOM1 (ENSCPOG00000020425)	SEPTIN8 (ENSCPOG00000007247)	KIF3A (ENSCPOG00000011249)	ENSCPOG00000031420	IL13 (ENSCPOG00000027078)	RAD50 (ENSCPOG00000002226)
Guinea pig	MODERN SPECIES	42	NPAS4 (ENSCPOG00000000685)	MRPL11 (ENSCPOG00000000687)	PELI3 (ENSCPOG00000000688)	DPP3 (ENSCPOG00000000690)	BBS1 (ENSCPOG00000022395)	ZDHHC24 (ENSCPOG00000025311)	ACTN3 (ENSCPOG00000003032)	CTSF (ENSCPOG00000032470)	CCDC87 (ENSCPOG00000013683)	CCS (ENSCPOG00000013196)	RBM14 (ENSCPOG00000008019)	RBM4 (ENSCPOG00000013194)	RBM4B (ENSCPOG00000013689)	SPTBN2 (ENSCPOG00000013691)	ENSCPOG00000022344	ENSCPOG00000022547 #22	RCE1 (ENSCPOG00000006320)	PC (ENSCPOG00000006323)	LRFN4 (ENSCPOG00000006338)	C11orf86 (ENSCPOG00000025117)	SYT12 (ENSCPOG00000022335)	RHOD (ENSCPOG00000024684)	KDM2A (ENSCPOG00000007134)	GRK2 (ENSCPOG00000015449)	ANKRD13D (ENSCPOG00000015451)	SSH3 (ENSCPOG00000008616)	POLD4 (ENSCPOG00000039935)	CLCF1 (ENSCPOG00000031948)	RAD9A (ENSCPOG00000033699)	PPP1CA (ENSCPOG00000032835)	TBC1D10C (ENSCPOG00000011171)
Guinea pig	MODERN SPECIES	56	ADAMTS4 (ENSCPOG00000014372)	B4GALT3 (ENSCPOG00000038979)	PPOX (ENSCPOG00000015323)	USP21 (ENSCPOG00000015322)	UFC1 (ENSCPOG00000026930)	DEDD (ENSCPOG00000015321)	NIT1 (ENSCPOG00000015320)	PFDN2 (ENSCPOG00000035159)	KLHDC9 (ENSCPOG00000005123)	NECTIN4 (ENSCPOG00000015318)	ARHGAP30 (ENSCPOG00000022193)	USF1 (ENSCPOG00000003957)	TSTD1 (ENSCPOG00000020739)	F11R (ENSCPOG00000023572)	ENSCPOG00000021022	ENSCPOG00000023863 #22	ENSCPOG00000030350	ENSCPOG00000037419	ENSCPOG00000038232	ENSCPOG00000036074	ENSCPOG00000002224	SLAMF7 (ENSCPOG00000036736)	CD48 (ENSCPOG00000038301)	SLAMF1 (ENSCPOG00000002925)	CD84 (ENSCPOG00000008701)	ENSCPOG00000006924	VANGL2 (ENSCPOG00000010224)	NHLH1 (ENSCPOG00000021596)	NCSTN (ENSCPOG00000014923)	COPA (ENSCPOG00000014917)	PEX19 (ENSCPOG00000014916)
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000159047	ENSGT00390000011365.a.dc	ENSGT00940000162517	ENSGT00510000046787.e.b	ENSGT00940000158507	ENSGT00940000156583	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000160656	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288
Degu	DUPLICATION
Degu	MODERN SPECIES	70	FAT2 (ENSODEG00000010366)	SLC36A1 (ENSODEG00000010341)	ENSODEG00000019626	SEC24A (ENSODEG00000008665)	SAR1B (ENSODEG00000009764)	JADE2 (ENSODEG00000009149)	ENSODEG00000019739	ENSODEG00000008488	UBE2B (ENSODEG00000009143)	CDKL3 (ENSODEG00000009715)	ENSODEG00000019628	ENSODEG00000008982	ENSODEG00000008861	ENSODEG00000008274	TCF7 (ENSODEG00000013097)	ENSODEG00000008308 #22	C5orf15 (ENSODEG00000010577)	FSTL4 (ENSODEG00000008162)	ENSODEG00000019458	HSPA4 (ENSODEG00000009493)	ZCCHC10 (ENSODEG00000008556)	AFF4 (ENSODEG00000008137)	LEAP2 (ENSODEG00000007774)	ENSODEG00000008424	SHROOM1 (ENSODEG00000008283)	SEPTIN8 (ENSODEG00000009083)	KIF3A (ENSODEG00000008904)	IL13 (ENSODEG00000010260)	RAD50 (ENSODEG00000007504)	IL5 (ENSODEG00000009022)	ENSODEG00000008045
Degu	DUPLICATION
Degu	MODERN SPECIES	186	ENKUR (ENSODEG00000003177)	ENSODEG00000004103	GPR158 (ENSODEG00000004004)	MYO3A (ENSODEG00000003447)	GAD2 (ENSODEG00000002488)	ENSODEG00000002425	ENSODEG00000002394	ENSODEG00000018879	ENSODEG00000002334	APBB1IP (ENSODEG00000002301)	PDSS1 (ENSODEG00000003307)	ABI1 (ENSODEG00000002843)	MASTL (ENSODEG00000002698)	YME1L1 (ENSODEG00000002663)	KLF6 (ENSODEG00000002443)	ENSODEG00000002426 #22	ENSODEG00000002407	ENSODEG00000002349	ENSODEG00000002322	AKR1E2 (ENSODEG00000002292)	ENSODEG00000002199	ENSODEG00000019206	ENSODEG00000005623
Degu	MODERN SPECIES	136	ENSODEG00000003423	CEP78 (ENSODEG00000003443)	GNAQ (ENSODEG00000003488)	ENSODEG00000003499	GNA14 (ENSODEG00000003528)	ENSODEG00000003546	VPS13A (ENSODEG00000003608)	FOXB2 (ENSODEG00000018997)	ENSODEG00000019009	ENSODEG00000018936	ENSODEG00000003738	ENSODEG00000003761	GCNT1 (ENSODEG00000018998)	RFK (ENSODEG00000003081)	ENSODEG00000003128	ENSODEG00000003169 #22	OSTF1 (ENSODEG00000003195)	NMRK1 (ENSODEG00000003218)	CARNMT1 (ENSODEG00000003242)	TRPM6 (ENSODEG00000003284)	RORB (ENSODEG00000003372)	ENSODEG00000003433	ALDH1A1 (ENSODEG00000003505)	ENSODEG00000003619
Degu	MODERN SPECIES	53	ATM (ENSODEG00000015667)	ENSODEG00000011472	C11orf65 (ENSODEG00000010746)	POGLUT3 (ENSODEG00000010261)	EXPH5 (ENSODEG00000012829)	ENSODEG00000012589	ENSODEG00000011294	C11orf87 (ENSODEG00000019863)	ZC3H12C (ENSODEG00000011026)	RDX (ENSODEG00000011001)	FDX1 (ENSODEG00000010396)	ARHGAP20 (ENSODEG00000011570)	ENSODEG00000010847	ENSODEG00000011527	ENSODEG00000019923	ENSODEG00000011838 #22	ENSODEG00000019857	POU2AF2 (ENSODEG00000011866)	POU2AF3 (ENSODEG00000012452)	POU2AF1 (ENSODEG00000013999)	ENSODEG00000014568	HOATZ (ENSODEG00000011858)	LAYN (ENSODEG00000010958)	ENSODEG00000010835	PPP2R1B (ENSODEG00000010197)	ALG9 (ENSODEG00000010112)	FDXACB1 (ENSODEG00000010360)	CFAP68 (ENSODEG00000011045)	ENSODEG00000014412	ENSODEG00000010416	ENSODEG00000010149
Long-tailed chinchilla	DUPLICATION
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	115	G3BP1 (ENSCLAG00000012636)	ATOX1 (ENSCLAG00000011704)	SPARC (ENSCLAG00000012628)	FAT2 (ENSCLAG00000015326)	SLC36A1 (ENSCLAG00000013787)	ENSCLAG00000017958	SEC24A (ENSCLAG00000013518)	ENSCLAG00000015791	JADE2 (ENSCLAG00000014619)	CDKN2AIPNL (ENSCLAG00000015651)	UBE2B (ENSCLAG00000015390)	CDKL3 (ENSCLAG00000013562)	PPP2CA (ENSCLAG00000015668)	ENSCLAG00000012399	TCF7 (ENSCLAG00000015886)	ENSCLAG00000011602 #22	C5orf15 (ENSCLAG00000015163)	FSTL4 (ENSCLAG00000013940)	HSPA4 (ENSCLAG00000013757)	ZCCHC10 (ENSCLAG00000012644)	AFF4 (ENSCLAG00000013850)	LEAP2 (ENSCLAG00000012483)	UQCRQ (ENSCLAG00000015359)	SEPTIN8 (ENSCLAG00000013502)	KIF3A (ENSCLAG00000015898)	ENSCLAG00000014960	ENSCLAG00000016355	RAD50 (ENSCLAG00000014508)	IL5 (ENSCLAG00000016772)	IRF1 (ENSCLAG00000011280)	SLC22A5 (ENSCLAG00000012924)
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	114											GABRR3 (ENSCLAG00000006076)	RIOX2 (ENSCLAG00000006223)	CRYBG3 (ENSCLAG00000007113)	ARL6 (ENSCLAG00000011788)	EPHA6 (ENSCLAG00000012297)	ENSCLAG00000007975 #22	NSUN3 (ENSCLAG00000004168)	STX19 (ENSCLAG00000005443)	ARL13B (ENSCLAG00000006379)	PROS1 (ENSCLAG00000006656)	ENSCLAG00000007467	EPHA3 (ENSCLAG00000008216)	C3orf38 (ENSCLAG00000008911)	ZNF654 (ENSCLAG00000009137)	ENSCLAG00000010225	HTR1F (ENSCLAG00000008847)	POU1F1 (ENSCLAG00000008895)	CHMP2B (ENSCLAG00000004251)	VGLL3 (ENSCLAG00000004309)	CADM2 (ENSCLAG00000004950)	GBE1 (ENSCLAG00000005860)
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000162238	ENSGT00940000159222	ENSGT00940000154735	ENSGT00550000074939	ENSGT00940000153203.A.a	ENSGT00940000158603	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	15	HNRNPAB (ENSSVLG00005003613)	NHP2 (ENSSVLG00005024567)	RMND5B (ENSSVLG00005024538)	N4BP3 (ENSSVLG00005024511)	SEC24A (ENSSVLG00005024458)	SAR1B (ENSSVLG00005024394)	JADE2 (ENSSVLG00005024244)	CDKN2AIPNL (ENSSVLG00005024197)	ENSSVLG00005024167	ENSSVLG00005024156	CDKL3 (ENSSVLG00005023993)	ENSSVLG00005023964	ENSSVLG00005023900	TCF7 (ENSSVLG00005023805)	ENSSVLG00005023773	VDAC1 (ENSSVLG00005023719) #22	C5orf15 (ENSSVLG00005023679)	FSTL4 (ENSSVLG00005023553)	ENSSVLG00005023364	ENSSVLG00005023332	ENSSVLG00005023263	AFF4 (ENSSVLG00005023168)	LEAP2 (ENSSVLG00005023101)	UQCRQ (ENSSVLG00005023071)	GDF9 (ENSSVLG00005023040)	SHROOM1 (ENSSVLG00005022874)	SOWAHA (ENSSVLG00005022829)	SEPTIN8 (ENSSVLG00005022761)	KIF3A (ENSSVLG00005022459)	ENSSVLG00005022296	IL13 (ENSSVLG00005022239)
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00940000162238	ENSGT00940000159222	ENSGT00940000154735	ENSGT00550000074939.o	ENSGT00940000153203.A.a	ENSGT00940000158603	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154.i	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	106	ENSGT00940000162238	ENSGT00940000159222	ENSGT00940000154735	ENSGT00550000074939.o	ENSGT00940000153203.A.a	ENSGT00940000158603	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154.i	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	222													PPP2CA (ENSUPAG00010015575)	SKP1 (ENSUPAG00010015583)	TCF7 (ENSUPAG00010015597)	VDAC1 (ENSUPAG00010015618) #22	ENSUPAG00010015646	C5orf15 (ENSUPAG00010015652)	FSTL4 (ENSUPAG00010015657)	HSPA4 (ENSUPAG00010015698)	ZCCHC10 (ENSUPAG00010015736)	AFF4 (ENSUPAG00010015741)	LEAP2 (ENSUPAG00010015797)	UQCRQ (ENSUPAG00010015802)	GDF9 (ENSUPAG00010015820)	SHROOM1 (ENSUPAG00010015829)	SEPTIN8 (ENSUPAG00010015852)	KIF3A (ENSUPAG00010015879)	IL4 (ENSUPAG00010016022)	IL13 (ENSUPAG00010016041)	RAD50 (ENSUPAG00010016063)
Squirrel	MODERN SPECIES	247	PHYKPL (ENSSTOG00000004904)	HNRNPAB (ENSSTOG00000024394)	NHP2 (ENSSTOG00000003235)	RMND5B (ENSSTOG00000003208)	N4BP3 (ENSSTOG00000020851)	SEC24A (ENSSTOG00000011330)	ENSSTOG00000011326	JADE2 (ENSSTOG00000011323)	ENSSTOG00000023113	CDKN2AIPNL (ENSSTOG00000007822)	UBE2B (ENSSTOG00000007815)	CDKL3 (ENSSTOG00000007777)	PPP2CA (ENSSTOG00000010560)	SKP1 (ENSSTOG00000030878)	TCF7 (ENSSTOG00000010550)	VDAC1 (ENSSTOG00000007764) #22	C5orf15 (ENSSTOG00000025060)	FSTL4 (ENSSTOG00000025824)	HSPA4 (ENSSTOG00000009217)	ZCCHC10 (ENSSTOG00000026648)	AFF4 (ENSSTOG00000026695)	LEAP2 (ENSSTOG00000028867)	UQCRQ (ENSSTOG00000020757)	GDF9 (ENSSTOG00000024725)	SHROOM1 (ENSSTOG00000028841)	SOWAHA (ENSSTOG00000014947)	SEPTIN8 (ENSSTOG00000025813)	CCNI2 (ENSSTOG00000001327)	KIF3A (ENSSTOG00000010159)	IL13 (ENSSTOG00000007967)	RAD50 (ENSSTOG00000009876)
Alpin marmot	DUPLICATION
Alpin marmot	DUPLICATION
Alpin marmot	MODERN SPECIES	31	PHYKPL (ENSMMMG00000000618)	HNRNPAB (ENSMMMG00000000589)	ENSMMMG00000000579	RMND5B (ENSMMMG00000000556)	N4BP3 (ENSMMMG00000000546)	SEC24A (ENSMMMG00000000446)	SAR1B (ENSMMMG00000000407)	JADE2 (ENSMMMG00000000350)	CDKN2AIPNL (ENSMMMG00000000328)	UBE2B (ENSMMMG00000000290)	CDKL3 (ENSMMMG00000000077)	ENSMMMG00000000059	PPP2CA (ENSMMMG00000000010)	ENSMMMG00000016436	TCF7 (ENSMMMG00000016427)	ENSMMMG00000016423 #22	C5orf15 (ENSMMMG00000016422)	FSTL4 (ENSMMMG00000016390)	ENSMMMG00000016381	HSPA4 (ENSMMMG00000016373)	ZCCHC10 (ENSMMMG00000016370)	ENSMMMG00000016368	LEAP2 (ENSMMMG00000016357)	UQCRQ (ENSMMMG00000016345)	GDF9 (ENSMMMG00000016341)	SHROOM1 (ENSMMMG00000016317)	SOWAHA (ENSMMMG00000016312)	SEPTIN8 (ENSMMMG00000016128)	KIF3A (ENSMMMG00000015943)	IL4 (ENSMMMG00000015914)	IL13 (ENSMMMG00000015896)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	12	SVIL (ENSMMMG00000018193)	ZNF438 (ENSMMMG00000018126)	ZEB1 (ENSMMMG00000018103)	ENSMMMG00000018069	ENSMMMG00000017828	KIF5B (ENSMMMG00000017793)	ENSMMMG00000017789	EPC1 (ENSMMMG00000017762)	ENSMMMG00000017719	ENSMMMG00000017700	ITGB1 (ENSMMMG00000017667)	NRP1 (ENSMMMG00000017644)	PARD3 (ENSMMMG00000016563)	CUL2 (ENSMMMG00000016521)	ENSMMMG00000016517	ENSMMMG00000016516 #22	CREM (ENSMMMG00000015477)	CCNY (ENSMMMG00000015447)	GJD4 (ENSMMMG00000015438)	ENSMMMG00000015430	ENSMMMG00000015411	ENSMMMG00000015385	ACBD7 (ENSMMMG00000015380)	ENSMMMG00000015376	ENSMMMG00000015374	NMT2 (ENSMMMG00000015331)	FAM171A1 (ENSMMMG00000015323)	ITGA8 (ENSMMMG00000015293)	MINDY3 (ENSMMMG00000015272)	PTER (ENSMMMG00000015254)	C1QL3 (ENSMMMG00000015248)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	28	HIRIP3 (ENSMMMG00000023737)	INO80E (ENSMMMG00000023736)	DOC2A (ENSMMMG00000023735)	C16orf92 (ENSMMMG00000023734)	TLCD3B (ENSMMMG00000023732)	ENSMMMG00000023731	ALDOA (ENSMMMG00000023729)	PPP4C (ENSMMMG00000023728)	TBX6 (ENSMMMG00000023727)	YPEL3 (ENSMMMG00000023726)	GDPD3 (ENSMMMG00000023725)	MAPK3 (ENSMMMG00000023724)	CORO1A (ENSMMMG00000023723)	ENSMMMG00000023722	ENSMMMG00000023720	ENSMMMG00000023719 #22	ENSMMMG00000023645	ENSMMMG00000023642	ENSMMMG00000023639	SGF29 (ENSMMMG00000023637)	NUPR1 (ENSMMMG00000023635)	IL27 (ENSMMMG00000023634)	APOBR (ENSMMMG00000023633)	CLN3 (ENSMMMG00000023629)	ENSMMMG00000023627	ATXN2L (ENSMMMG00000023618)	TUFM (ENSMMMG00000023617)	SH2B1 (ENSMMMG00000023615)	ATP2A1 (ENSMMMG00000023612)	RABEP2 (ENSMMMG00000023605)	CD19 (ENSMMMG00000023599)
Primates	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Tarsier	DUPLICATION
Tarsier	MODERN SPECIES	5832										UBE2B (ENSTSYG00000031443)	CDKL3 (ENSTSYG00000011146)	ENSTSYG00000036460	PPP2CA (ENSTSYG00000005035)	SKP1 (ENSTSYG00000010696)	TCF7 (ENSTSYG00000010484)	VDAC1 (ENSTSYG00000007346) #22	CUNH5orf15 (ENSTSYG00000033325)
Tarsier	MODERN SPECIES	3300															ENSTSYG00000031021	ENSTSYG00000034256 #22	ANKRD13A (ENSTSYG00000000487)	GIT2 (ENSTSYG00000000485)
Simiiformes	DUPLICATION
Simiiformes	DUPLICATION
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00910000147122	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177.j	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a #22	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00910000147122	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177.j	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a #22	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00910000147122	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108
Gibbon	MODERN SPECIES	11	CATSPER3 (ENSNLEG00000008209)	PCBD2 (ENSNLEG00000028354)	TXNDC15 (ENSNLEG00000008191)	ENSNLEG00000008189	DDX46 (ENSNLEG00000008167)	CAMLG (ENSNLEG00000008160)	SEC24A (ENSNLEG00000008135)	SAR1B (ENSNLEG00000008118)	ENSNLEG00000008110	CDKN2AIPNL (ENSNLEG00000030191)	UBE2B (ENSNLEG00000008093)	CDKL3 (ENSNLEG00000008065)	PPP2CA (ENSNLEG00000034485)	ENSNLEG00000008051	ENSNLEG00000008042	VDAC1 (ENSNLEG00000008023) #22	C5orf15 (ENSNLEG00000008019)	FSTL4 (ENSNLEG00000008014)	FA2H (ENSNLEG00000008010)	MLKL (ENSNLEG00000008006)	RFWD3 (ENSNLEG00000008003)	GLG1 (ENSNLEG00000007991)	PDPR (ENSNLEG00000007974)	ENSNLEG00000030977	ENSNLEG00000035597	ENSNLEG00000013877	ENSNLEG00000027423	DDX19B (ENSNLEG00000029325)	ENSNLEG00000034963	DDX19A (ENSNLEG00000016042)	ENSNLEG00000029991
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177.j	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a #22	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00940000163817	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00910000147122	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386
Orangutan	MODERN SPECIES	18	PCBD2 (ENSPPYG00000015795)	TXNDC15 (ENSPPYG00000015794)	ENSPPYG00000039359	C5H5orf24 (ENSPPYG00000015793)	DDX46 (ENSPPYG00000015792)	CAMLG (ENSPPYG00000015791)	SEC24A (ENSPPYG00000015790)	SAR1B (ENSPPYG00000015789)	JADE2 (ENSPPYG00000015788)	ENSPPYG00000035303	CDKN2AIPNL (ENSPPYG00000015787)	UBE2B (ENSPPYG00000015786)	ENSPPYG00000015785	SKP1 (ENSPPYG00000015783)	ENSPPYG00000015782	VDAC1 (ENSPPYG00000015781) #22	C5H5orf15 (ENSPPYG00000015780)	FSTL4 (ENSPPYG00000015778)	HSPA4 (ENSPPYG00000015777)	ENSPPYG00000015776	ENSPPYG00000036231	AFF4 (ENSPPYG00000015775)	ENSPPYG00000033299	LEAP2 (ENSPPYG00000034587)	UQCRQ (ENSPPYG00000015773)	GDF9 (ENSPPYG00000015772)	SHROOM1 (ENSPPYG00000015771)	SOWAHA (ENSPPYG00000015770)	SEPTIN8 (ENSPPYG00000015769)	CCNI2 (ENSPPYG00000015768)	KIF3A (ENSPPYG00000015767)
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177.j	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a #22	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200.`b	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00910000147122	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108
Gorilla	MODERN SPECIES	18	ENSGGOG00000004842	ENSGGOG00000025134	TXNDC15 (ENSGGOG00000004588)	ENSGGOG00000039515	DDX46 (ENSGGOG00000013843)	CAMLG (ENSGGOG00000010224)	SEC24A (ENSGGOG00000011050)	ENSGGOG00000016284	JADE2 (ENSGGOG00000016982)	CDKN2AIPNL (ENSGGOG00000004348)	ENSGGOG00000037490	CDKL3 (ENSGGOG00000002228)	PPP2CA (ENSGGOG00000000338)	SKP1 (ENSGGOG00000022930)	ENSGGOG00000008257	VDAC1 (ENSGGOG00000010880) #22	C5orf15 (ENSGGOG00000021947)	FSTL4 (ENSGGOG00000011205)	HSPA4 (ENSGGOG00000009655)	ZCCHC10 (ENSGGOG00000043978)	ENSGGOG00000022261	AFF4 (ENSGGOG00000011786)	LEAP2 (ENSGGOG00000012326)	UQCRQ (ENSGGOG00000039037)	GDF9 (ENSGGOG00000012318)	SHROOM1 (ENSGGOG00000012307)	SOWAHA (ENSGGOG00000041415)	SEPTIN8 (ENSGGOG00000001010)	CCNI2 (ENSGGOG00000001009)	KIF3A (ENSGGOG00000008000)	IL4 (ENSGGOG00000005670)
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177.j	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a #22	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200.`b	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00910000147122	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108
Human	MODERN SPECIES	17	PCBD2 (ENSG00000132570)	TXNDC15 (ENSG00000113621)	C5orf24 (ENSG00000181904)	DDX46 (ENSG00000145833)	CAMLG (ENSG00000164615)	SEC24A (ENSG00000113615)	SAR1B (ENSG00000152700)	JADE2 (ENSG00000043143)	CDKN2AIPNL (ENSG00000237190)	UBE2B (ENSG00000119048)	CDKL3 (ENSG00000006837)	PPP2CA (ENSG00000113575)	ENSG00000272772	SKP1 (ENSG00000113558)	TCF7 (ENSG00000081059)	VDAC1 (ENSG00000213585) #22	C5orf15 (ENSG00000113583)	FSTL4 (ENSG00000053108)	HSPA4 (ENSG00000170606)	ZCCHC10 (ENSG00000155329)	AFF4 (ENSG00000072364)	LEAP2 (ENSG00000164406)	UQCRQ (ENSG00000164405)	GDF9 (ENSG00000164404)	SHROOM1 (ENSG00000164403)	SOWAHA (ENSG00000198944)	SEPTIN8 (ENSG00000164402)	CCNI2 (ENSG00000205089)	KIF3A (ENSG00000131437)	IL4 (ENSG00000113520)	IL13 (ENSG00000169194)
Pan	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177.j	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a #22	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200.`b	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00910000147122	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068.c	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108
Chimpanzee	MODERN SPECIES	18	PCBD2 (ENSPTRG00000017252)	TXNDC15 (ENSPTRG00000017251)	C5H5orf24 (ENSPTRG00000044708)	DDX46 (ENSPTRG00000017248)	CAMLG (ENSPTRG00000017247)	SEC24A (ENSPTRG00000017246)	SAR1B (ENSPTRG00000017244)	ENSPTRG00000030400	JADE2 (ENSPTRG00000017242)	CDKN2AIPNL (ENSPTRG00000017241)	UBE2B (ENSPTRG00000017240)	CDKL3 (ENSPTRG00000017239)	PPP2CA (ENSPTRG00000052040)	SKP1 (ENSPTRG00000045225)	TCF7 (ENSPTRG00000017236)	VDAC1 (ENSPTRG00000017235) #22	C5H5orf15 (ENSPTRG00000017234)	FSTL4 (ENSPTRG00000017231)	HSPA4 (ENSPTRG00000017230)	ZCCHC10 (ENSPTRG00000017229)	ENSPTRG00000044799	AFF4 (ENSPTRG00000017228)	ENSPTRG00000051105	LEAP2 (ENSPTRG00000017227)	ENSPTRG00000049854	GDF9 (ENSPTRG00000017225)	SHROOM1 (ENSPTRG00000017224)	ENSPTRG00000042715	SEPTIN8 (ENSPTRG00000017222)	CCNI2 (ENSPTRG00000028617)	KIF3A (ENSPTRG00000017221)
Bonobo	MODERN SPECIES	18	CATSPER3 (ENSPPAG00000040666)	PCBD2 (ENSPPAG00000037234)	TXNDC15 (ENSPPAG00000034396)	ENSPPAG00000042795	DDX46 (ENSPPAG00000037804)	CAMLG (ENSPPAG00000042799)	SEC24A (ENSPPAG00000030247)	SAR1B (ENSPPAG00000033175)	JADE2 (ENSPPAG00000039071)	CDKN2AIPNL (ENSPPAG00000030689)	UBE2B (ENSPPAG00000038729)	CDKL3 (ENSPPAG00000034942)	PPP2CA (ENSPPAG00000029799)	SKP1 (ENSPPAG00000013599)	ENSPPAG00000034368	VDAC1 (ENSPPAG00000037303) #22	C5orf15 (ENSPPAG00000041430)	FSTL4 (ENSPPAG00000012227)	HSPA4 (ENSPPAG00000041576)	ZCCHC10 (ENSPPAG00000030765)	ENSPPAG00000035854	AFF4 (ENSPPAG00000043255)	LEAP2 (ENSPPAG00000037695)	UQCRQ (ENSPPAG00000028056)	GDF9 (ENSPPAG00000035552)	SHROOM1 (ENSPPAG00000024669)	SOWAHA (ENSPPAG00000027028)	SEPTIN8 (ENSPPAG00000018901)	CCNI2 (ENSPPAG00000033820)	KIF3A (ENSPPAG00000036580)	IL4 (ENSPPAG00000027527)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177.j	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a #22	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000154875.k.b	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200.y	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a #22
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a #22
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177.j	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a #22	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000154875.k.b	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200.y	ENSGT00940000154268.f.l	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177.j	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a #22	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000154875.k.b	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200.y	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Drill	MODERN SPECIES	1616	CATSPER3 (ENSMLEG00000029137)	PCBD2 (ENSMLEG00000036945)	TXNDC15 (ENSMLEG00000043371)	C5orf24 (ENSMLEG00000037446)	DDX46 (ENSMLEG00000033516)	CAMLG (ENSMLEG00000006327)	SEC24A (ENSMLEG00000037674)	SAR1B (ENSMLEG00000038596)	JADE2 (ENSMLEG00000043416)	ENSMLEG00000032485	UBE2B (ENSMLEG00000000715)	CDKL3 (ENSMLEG00000041033)	PPP2CA (ENSMLEG00000031466)	SKP1 (ENSMLEG00000028087)	TCF7 (ENSMLEG00000037766)	VDAC1 (ENSMLEG00000040918) #22	C5orf15 (ENSMLEG00000038327)	FSTL4 (ENSMLEG00000036739)	ENSMLEG00000028159	HSPA4 (ENSMLEG00000021000)	ZCCHC10 (ENSMLEG00000030449)	AFF4 (ENSMLEG00000028953)	LEAP2 (ENSMLEG00000042867)	UQCRQ (ENSMLEG00000039284)	GDF9 (ENSMLEG00000040252)	SHROOM1 (ENSMLEG00000035446)	SEPTIN8 (ENSMLEG00000044191)	CCNI2 (ENSMLEG00000010031)	KIF3A (ENSMLEG00000032746)	IL4 (ENSMLEG00000039248)	IL13 (ENSMLEG00000023325)
Olive baboon	MODERN SPECIES	15	C5orf24 (ENSPANG00000001914)	ENSPANG00000046730	DDX46 (ENSPANG00000025084)	CAMLG (ENSPANG00000010658)	SEC24A (ENSPANG00000002425)	SAR1B (ENSPANG00000005732)	ENSPANG00000041180	ENSPANG00000051335	JADE2 (ENSPANG00000003278)	CDKN2AIPNL (ENSPANG00000008879)	UBE2B (ENSPANG00000010163)	CDKL3 (ENSPANG00000010940)	PPP2CA (ENSPANG00000010835)	SKP1 (ENSPANG00000008618)	TCF7 (ENSPANG00000025085)	VDAC1 (ENSPANG00000006997) #22	C5orf15 (ENSPANG00000006159)	ENSPANG00000047174	FSTL4 (ENSPANG00000003666)	ENSPANG00000042341	HSPA4 (ENSPANG00000020837)	ENSPANG00000050065	ZCCHC10 (ENSPANG00000003667)	AFF4 (ENSPANG00000007039)	LEAP2 (ENSPANG00000003279)	ENSPANG00000032662	GDF9 (ENSPANG00000004785)	SHROOM1 (ENSPANG00000010941)	SOWAHA (ENSPANG00000007085)	SEPTIN8 (ENSPANG00000010836)	CCNI2 (ENSPANG00000009548)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	72	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177.j.d	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a #22	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000154875.k.b	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200.y	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	395	CATSPER3 (ENSRBIG00000034438)	PCBD2 (ENSRBIG00000023562)	TXNDC15 (ENSRBIG00000034542)	C5orf24 (ENSRBIG00000008483)	DDX46 (ENSRBIG00000041150)	CAMLG (ENSRBIG00000031162)	SEC24A (ENSRBIG00000043543)	SAR1B (ENSRBIG00000036918)	JADE2 (ENSRBIG00000011646)	ENSRBIG00000018523	UBE2B (ENSRBIG00000039608)	CDKL3 (ENSRBIG00000044694)	PPP2CA (ENSRBIG00000044818)	ENSRBIG00000041901	TCF7 (ENSRBIG00000029278)	VDAC1 (ENSRBIG00000028673) #22	C5orf15 (ENSRBIG00000032919)	FSTL4 (ENSRBIG00000030754)	ENSRBIG00000036446	HSPA4 (ENSRBIG00000039851)	ZCCHC10 (ENSRBIG00000026308)	AFF4 (ENSRBIG00000029376)	LEAP2 (ENSRBIG00000029790)	UQCRQ (ENSRBIG00000039737)	GDF9 (ENSRBIG00000028937)	SHROOM1 (ENSRBIG00000043878)	SEPTIN8 (ENSRBIG00000043766)	CCNI2 (ENSRBIG00000030786)	KIF3A (ENSRBIG00000042000)	IL4 (ENSRBIG00000043499)	IL13 (ENSRBIG00000028591)
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	854	CATSPER3 (ENSRROG00000035501)	PCBD2 (ENSRROG00000035070)	TXNDC15 (ENSRROG00000024591)	C5orf24 (ENSRROG00000030678)	DDX46 (ENSRROG00000029467)	CAMLG (ENSRROG00000019981)	SEC24A (ENSRROG00000045670)	SAR1B (ENSRROG00000028843)	JADE2 (ENSRROG00000032987)	ENSRROG00000012329	UBE2B (ENSRROG00000041544)	CDKL3 (ENSRROG00000036347)	PPP2CA (ENSRROG00000036242)	ENSRROG00000044330	TCF7 (ENSRROG00000042564)	VDAC1 (ENSRROG00000025787) #22	C5orf15 (ENSRROG00000039514)	FSTL4 (ENSRROG00000042283)	ENSRROG00000030119	HSPA4 (ENSRROG00000038754)	ENSRROG00000022780	ENSRROG00000034804	ENSRROG00000032317	AFF4 (ENSRROG00000033812)	LEAP2 (ENSRROG00000042130)	UQCRQ (ENSRROG00000035832)	GDF9 (ENSRROG00000034493)	SHROOM1 (ENSRROG00000029747)	SOWAHA (ENSRROG00000021650)	SEPTIN8 (ENSRROG00000032709)	CCNI2 (ENSRROG00000037110)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a.i	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00940000153446.a.a.q.a.a.a.b	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00910000147122	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a.i	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00940000153446.a.a.q.a.a.a.b	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00910000147122	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a.i	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00940000153446.a.a.q.a.a.a.b	ENSGT00940000155258.s.a.c	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00910000147122	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386
Capuchin	MODERN SPECIES	76	TXNDC15 (ENSCCAG00000030665)	ENSCCAG00000033520	C5orf24 (ENSCCAG00000025876)	DDX46 (ENSCCAG00000026721)	CAMLG (ENSCCAG00000034675)	SEC24A (ENSCCAG00000032334)	SAR1B (ENSCCAG00000037282)	ENSCCAG00000026527	JADE2 (ENSCCAG00000027715)	CDKN2AIPNL (ENSCCAG00000021921)	UBE2B (ENSCCAG00000026429)	CDKL3 (ENSCCAG00000024762)	ENSCCAG00000025572	ENSCCAG00000031876	TCF7 (ENSCCAG00000026300)	VDAC1 (ENSCCAG00000028384) #22	C5orf15 (ENSCCAG00000024033)	FSTL4 (ENSCCAG00000027531)	HSPA4 (ENSCCAG00000036316)	ENSCCAG00000031545	ENSCCAG00000015918	ZCCHC10 (ENSCCAG00000024643)	ENSCCAG00000005532	AFF4 (ENSCCAG00000030353)	ENSCCAG00000034775	LEAP2 (ENSCCAG00000029916)	UQCRQ (ENSCCAG00000034496)	ENSCCAG00000031721	SHROOM1 (ENSCCAG00000037692)	SEPTIN8 (ENSCCAG00000028922)	CCNI2 (ENSCCAG00000037558)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	43	TXNDC15 (ENSSBOG00000023331)	C5orf24 (ENSSBOG00000022311)	DDX46 (ENSSBOG00000027666)	CAMLG (ENSSBOG00000025639)	SEC24A (ENSSBOG00000024973)	SAR1B (ENSSBOG00000022930)	JADE2 (ENSSBOG00000035045)	ENSSBOG00000028786	CDKN2AIPNL (ENSSBOG00000011200)	UBE2B (ENSSBOG00000024350)	CDKL3 (ENSSBOG00000020404)	ENSSBOG00000023243	ENSSBOG00000027260	ENSSBOG00000029368	TCF7 (ENSSBOG00000023988)	VDAC1 (ENSSBOG00000025732) #22	C5orf15 (ENSSBOG00000008071)	FSTL4 (ENSSBOG00000023542)	HSPA4 (ENSSBOG00000030378)	ENSSBOG00000023294	ENSSBOG00000035356	AFF4 (ENSSBOG00000021562)	LEAP2 (ENSSBOG00000036208)	UQCRQ (ENSSBOG00000030933)	GDF9 (ENSSBOG00000021602)	SHROOM1 (ENSSBOG00000014463)	SEPTIN8 (ENSSBOG00000021236)	CCNI2 (ENSSBOG00000024313)	KIF3A (ENSSBOG00000025487)	IL4 (ENSSBOG00000018689)	IL13 (ENSSBOG00000025273)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	966	TXNDC15 (ENSANAG00000033906)	C5orf24 (ENSANAG00000030411)	DDX46 (ENSANAG00000032116)	ENSANAG00000028078	CAMLG (ENSANAG00000028441)	SEC24A (ENSANAG00000033845)	SAR1B (ENSANAG00000032734)	JADE2 (ENSANAG00000031699)	ENSANAG00000020456	ENSANAG00000026282	UBE2B (ENSANAG00000032856)	ENSANAG00000037931	ENSANAG00000033828	SKP1 (ENSANAG00000020252)	TCF7 (ENSANAG00000033911)	VDAC1 (ENSANAG00000033546) #22	ENSANAG00000032709	ENSANAG00000035584	FSTL4 (ENSANAG00000036865)	HSPA4 (ENSANAG00000036525)	ENSANAG00000035313	ENSANAG00000033751	AFF4 (ENSANAG00000037761)	ENSANAG00000033618	LEAP2 (ENSANAG00000033692)	UQCRQ (ENSANAG00000036737)	GDF9 (ENSANAG00000035513)	SHROOM1 (ENSANAG00000034017)	SEPTIN8 (ENSANAG00000015484)	CCNI2 (ENSANAG00000035629)	KIF3A (ENSANAG00000037664)
Simiiformes	DUPLICATION
Simiiformes	DUPLICATION
Simiiformes	DUPLICATION
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.a #22
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.a #22
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.a #22
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.a #22
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.a #22
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.a #22
Pan	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000159568	ENSGT00390000008820.e.b.b	ENSGT00390000008820.e.b.a.b	ENSGT00940000161697.f	ENSGT01100000263536.B.c.b	ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b	ENSGT01100000263536.A.a.a.b	ENSGT01030000234518.D	ENSGT00950000183115.b.b	ENSGT00940000161206	ENSGT00940000162488	ENSGT00940000162350.b.b	ENSGT00940000162350.b.a	ENSGT00950000182787.C.d	ENSGT00950000183107.a.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.a #22	ENSGT00730000111570	ENSGT00940000156017	ENSGT00940000153314.b	ENSGT00940000161429	ENSGT00730000111075.b	ENSGT00940000159242	ENSGT00390000008591	ENSGT00530000063666.a.m.a	ENSGT00950000183121.b.b.b.a	ENSGT00940000159611	ENSGT00390000000141	ENSGT00950000182994.A.n.a	ENSGT00940000154911.v	ENSGT00390000001134.b	ENSGT00940000159818
Chimpanzee	MODERN SPECIES	972	COX7B (ENSPTRG00000022049)	ATP7A (ENSPTRG00000022050)	PGK1 (ENSPTRG00000022052)	TAF9B (ENSPTRG00000022053)	CYSLTR1 (ENSPTRG00000022054)	LPAR4 (ENSPTRG00000022056)	P2RY10 (ENSPTRG00000050132)	GPR174 (ENSPTRG00000039454)	ITM2A (ENSPTRG00000022057)	TBX22 (ENSPTRG00000022058)	TENT5D (ENSPTRG00000049359)	ENSPTRG00000047256	ENSPTRG00000046735	ENSPTRG00000045129	BRWD3 (ENSPTRG00000022060)	ENSPTRG00000048534 #22	HMGN5 (ENSPTRG00000022527)	SH3BGRL (ENSPTRG00000022061)	ENSPTRG00000047666	POU3F4 (ENSPTRG00000040705)	CYLC1 (ENSPTRG00000022063)	RPS6KA6 (ENSPTRG00000022064)	HDX (ENSPTRG00000022065)	ENSPTRG00000048780	APOOL (ENSPTRG00000022067)	ENSPTRG00000043670	ENSPTRG00000022068	ZNF711 (ENSPTRG00000022069)	POF1B (ENSPTRG00000022070)	CHM (ENSPTRG00000022071)	ENSPTRG00000052049
Bonobo	MODERN SPECIES	369	ATRX (ENSPPAG00000043806)	MAGT1 (ENSPPAG00000037154)	COX7B (ENSPPAG00000038135)	ATP7A (ENSPPAG00000041943)	ENSPPAG00000039675	TAF9B (ENSPPAG00000042950)	CYSLTR1 (ENSPPAG00000008752)	GPR174 (ENSPPAG00000016269)	ITM2A (ENSPPAG00000031833)	TBX22 (ENSPPAG00000040549)	ENSPPAG00000042789	ENSPPAG00000019114	ENSPPAG00000038929	BRWD3 (ENSPPAG00000036225)	ENSPPAG00000037661	ENSPPAG00000037242 #22	SH3BGRL (ENSPPAG00000035293)	ENSPPAG00000037558	ENSPPAG00000040389	POU3F4 (ENSPPAG00000017170)	ENSPPAG00000043882	CYLC1 (ENSPPAG00000019947)	RPS6KA6 (ENSPPAG00000010461)	HDX (ENSPPAG00000031927)	APOOL (ENSPPAG00000037582)	ENSPPAG00000033891	ZNF711 (ENSPPAG00000038129)	POF1B (ENSPPAG00000033485)	ENSPPAG00000028498	CHM (ENSPPAG00000034301)	ENSPPAG00000024013
Gorilla	DUPLICATION
Gorilla	MODERN SPECIES	523	ATRX (ENSGGOG00000024999)	MAGT1 (ENSGGOG00000010342)	COX7B (ENSGGOG00000023347)	ATP7A (ENSGGOG00000025640)	PGK1 (ENSGGOG00000017111)	TAF9B (ENSGGOG00000002470)	CYSLTR1 (ENSGGOG00000003276)	GPR174 (ENSGGOG00000024322)	ITM2A (ENSGGOG00000026998)	TBX22 (ENSGGOG00000008990)	ENSGGOG00000043041	ENSGGOG00000015916	BRWD3 (ENSGGOG00000004108)	ENSGGOG00000039837	ENSGGOG00000037044 #22	ENSGGOG00000039492 #22	HMGN5 (ENSGGOG00000016479)	SH3BGRL (ENSGGOG00000009664)	ENSGGOG00000025534	POU3F4 (ENSGGOG00000027353)	CYLC1 (ENSGGOG00000001587)	RPS6KA6 (ENSGGOG00000016474)	HDX (ENSGGOG00000005551)	ENSGGOG00000016329	SATL1 (ENSGGOG00000016333)	ZNF711 (ENSGGOG00000006110)	POF1B (ENSGGOG00000016908)	CHM (ENSGGOG00000022912)	ENSGGOG00000040803	DACH2 (ENSGGOG00000007231)	KLHL4 (ENSGGOG00000002307)
Gorilla	MODERN SPECIES	523	DACH2 (ENSGGOG00000007231)	ENSGGOG00000040803	CHM (ENSGGOG00000022912)	POF1B (ENSGGOG00000016908)	ZNF711 (ENSGGOG00000006110)	SATL1 (ENSGGOG00000016333)	ENSGGOG00000016329	HDX (ENSGGOG00000005551)	RPS6KA6 (ENSGGOG00000016474)	CYLC1 (ENSGGOG00000001587)	POU3F4 (ENSGGOG00000027353)	ENSGGOG00000025534	SH3BGRL (ENSGGOG00000009664)	HMGN5 (ENSGGOG00000016479)	ENSGGOG00000039492 #22	ENSGGOG00000037044 #22	ENSGGOG00000039837	BRWD3 (ENSGGOG00000004108)	ENSGGOG00000015916	ENSGGOG00000043041	TBX22 (ENSGGOG00000008990)	ITM2A (ENSGGOG00000026998)	GPR174 (ENSGGOG00000024322)	CYSLTR1 (ENSGGOG00000003276)	TAF9B (ENSGGOG00000002470)	PGK1 (ENSGGOG00000017111)	ATP7A (ENSGGOG00000025640)	COX7B (ENSGGOG00000023347)	MAGT1 (ENSGGOG00000010342)	ATRX (ENSGGOG00000024999)	FGF16 (ENSGGOG00000002237)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.a #22
Mas night monkey	MODERN SPECIES	1126	ADGRG7 (ENSANAG00000033047)	ENSANAG00000038428	TMEM45A (ENSANAG00000023330)	LNP1 (ENSANAG00000031808)	TOMM70 (ENSANAG00000020825)	NIT2 (ENSANAG00000020458)	TBC1D23 (ENSANAG00000024314)	ENSANAG00000001502	CMSS1 (ENSANAG00000023565)	FILIP1L (ENSANAG00000036993)	COL8A1 (ENSANAG00000036463)	ENSANAG00000019820	DCBLD2 (ENSANAG00000035766)	ENSANAG00000035028	ST3GAL6 (ENSANAG00000026185)	ENSANAG00000036882 #22	CPOX (ENSANAG00000032840)	CLDND1 (ENSANAG00000035467)
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b #22
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b #22
Hominoidea	DUPLICATION
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.a #22
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.a #22
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.a #22
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.a #22
Pan	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00890000139436.A.b	ENSGT00940000162070	ENSGT00390000003183.e.a	ENSGT00390000003183.e.b	ENSGT00940000160559	ENSGT00390000008621	ENSGT00940000160940	ENSGT00940000159479	ENSGT00940000162262	ENSGT00940000160459	ENSGT00940000153313.C.a	ENSGT00940000153763.a	ENSGT00940000162674	ENSGT00940000153097.C	ENSGT00940000153097.A.f.b	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.a #22	ENSGT00940000153097.A.f.a.b.b.c	ENSGT00390000013859	ENSGT00940000161807	ENSGT00390000003809	ENSGT00940000162625	ENSGT00940000155882.a.a	ENSGT00910000147473	ENSGT00940000159855	ENSGT01030000234637.b.c	ENSGT00940000153629.a.b	ENSGT00940000158528	ENSGT00940000162529	ENSGT00390000015154	ENSGT00940000155657.db.a.a	ENSGT00940000154102.b
Bonobo	MODERN SPECIES	369	ENSPPAG00000027565	MAGED1 (ENSPPAG00000037605)	CENPVL3 (ENSPPAG00000005217)	EZHIP (ENSPPAG00000005586)	ENSPPAG00000022094	BMP15 (ENSPPAG00000005038)	SHROOM4 (ENSPPAG00000039023)	DGKK (ENSPPAG00000034077)	CCNB3 (ENSPPAG00000027314)	AKAP4 (ENSPPAG00000034394)	CLCN5 (ENSPPAG00000029912)	USP27X (ENSPPAG00000012284)	PAGE4 (ENSPPAG00000037679)	PAGE1 (ENSPPAG00000030309)	ENSPPAG00000035136	ENSPPAG00000043153 #22	ENSPPAG00000027179	ENSPPAG00000027948	FOXP3 (ENSPPAG00000028117)	CCDC22 (ENSPPAG00000039638)	CACNA1F (ENSPPAG00000027619)	SYP (ENSPPAG00000033248)	PRICKLE3 (ENSPPAG00000040750)	PLP2 (ENSPPAG00000040820)	MAGIX (ENSPPAG00000037324)	GPKOW (ENSPPAG00000040116)	WDR45 (ENSPPAG00000042027)	CCDC120 (ENSPPAG00000026576)	TFE3 (ENSPPAG00000028832)	GRIPAP1 (ENSPPAG00000040230)	KCND1 (ENSPPAG00000035010)
Chimpanzee	MODERN SPECIES	972	ENSPTRG00000046536	ENSPTRG00000047771	CENPVL3 (ENSPTRG00000051936)	ENSPTRG00000046232	ENSPTRG00000050633	ENSPTRG00000044134	BMP15 (ENSPTRG00000021908)	SHROOM4 (ENSPTRG00000021905)	DGKK (ENSPTRG00000048026)	CCNB3 (ENSPTRG00000048758)	AKAP4 (ENSPTRG00000049957)	CLCN5 (ENSPTRG00000021899)	PAGE4 (ENSPTRG00000021896)	ENSPTRG00000021894	ENSPTRG00000045256	ENSPTRG00000048439 #22	GAGE10 (ENSPTRG00000021892)	PPP1R3F (ENSPTRG00000046513)	FOXP3 (ENSPTRG00000021890)	CCDC22 (ENSPTRG00000021889)	ENSPTRG00000049813	CACNA1F (ENSPTRG00000021888)	SYP (ENSPTRG00000021887)	PRICKLE3 (ENSPTRG00000045748)	PLP2 (ENSPTRG00000021885)	MAGIX (ENSPTRG00000047576)	GPKOW (ENSPTRG00000047603)	WDR45 (ENSPTRG00000021882)	CCDC120 (ENSPTRG00000021880)	TFE3 (ENSPTRG00000021879)	GRIPAP1 (ENSPTRG00000051549)
Gibbon	MODERN SPECIES	449	ENSNLEG00000008180	MAGED1 (ENSNLEG00000008178)	ENSNLEG00000033915	NUDT11 (ENSNLEG00000008174)	ENSNLEG00000029212	NUDT10 (ENSNLEG00000008173)	BMP15 (ENSNLEG00000008172)	SHROOM4 (ENSNLEG00000008164)	ENSNLEG00000008157	CCNB3 (ENSNLEG00000008143)	AKAP4 (ENSNLEG00000008132)	CLCN5 (ENSNLEG00000008106)	USP27X (ENSNLEG00000028156)	PAGE4 (ENSNLEG00000008101)	PAGE1 (ENSNLEG00000008094)	ENSNLEG00000027542 #22	ENSNLEG00000027762	ENSNLEG00000030515	ENSNLEG00000033633	PPP1R3F (ENSNLEG00000031049)	FOXP3 (ENSNLEG00000008046)	CCDC22 (ENSNLEG00000008043)	CACNA1F (ENSNLEG00000008028)	SYP (ENSNLEG00000008024)	ENSNLEG00000008017	GPKOW (ENSNLEG00000007998)	ENSNLEG00000007994	CCDC120 (ENSNLEG00000007975)	TFE3 (ENSNLEG00000007963)	GRIPAP1 (ENSNLEG00000007939)	KCND1 (ENSNLEG00000007958)
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	143															ENSGT00940000153889.e.a.a	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.b #22
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	137															ENSGT00940000153889.e.a.a	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.b #22
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	57														ENSGT00940000155206.d.b	ENSGT00940000153889.e.a.a	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.b #22	ENSGT00940000158335.d
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	76														ENSGT00940000155206.d.b	ENSGT00940000153889.e.a.a	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.b #22
Pan	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00950000183123.h.b	ENSGT00940000161632.c	ENSGT00940000158987	ENSGT00940000159060	ENSGT00940000159149	ENSGT00940000159092	ENSGT00480000042679.a ##26	ENSGT00940000159162	ENSGT00940000153239.B.i.a.b	ENSGT00940000157822	ENSGT00940000163054	ENSGT00730000111097.e	ENSGT00940000162927	ENSGT00940000155206.d.b	ENSGT00940000153889.e.a.a	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.b #22	ENSGT00940000158335.c	ENSGT00940000162668	ENSGT00940000154977.l.b.b	ENSGT00940000165485	ENSGT00390000003732	ENSGT00950000183119.a.e.a.d.a.a	ENSGT00940000159818	ENSGT00390000001134.b	ENSGT00940000154911.v	ENSGT00950000182994.A.n.a	ENSGT00390000000141	ENSGT00940000159611	ENSGT00950000183121.b.b.b.a	ENSGT00530000063666.a.m.a	ENSGT00390000008591
Bonobo	MODERN SPECIES	369	NOX1 (ENSPPAG00000021977)	CSTF2 (ENSPPAG00000031804)	SYTL4 (ENSPPAG00000026955)	SRPX2 (ENSPPAG00000039226)	TSPAN6 (ENSPPAG00000038316)	TNMD (ENSPPAG00000035804) ##26	PCDH19 (ENSPPAG00000039228)	ENSPPAG00000034644	DIAPH2 (ENSPPAG00000040909)	ENSPPAG00000038822	FAM133A (ENSPPAG00000017635)	NAP1L3 (ENSPPAG00000019923)	ENSPPAG00000007354	ENSPPAG00000003031	ENSPPAG00000040878	ENSPPAG00000030962 #22	ENSPPAG00000043443	PABPC5 (ENSPPAG00000007378)	ENSPPAG00000041507	ENSPPAG00000038346	CPXCR1 (ENSPPAG00000016441)	ENSPPAG00000026574	KLHL4 (ENSPPAG00000043431)	ENSPPAG00000036042	ENSPPAG00000024013	CHM (ENSPPAG00000034301)	ENSPPAG00000028498	POF1B (ENSPPAG00000033485)	ZNF711 (ENSPPAG00000038129)	ENSPPAG00000033891	APOOL (ENSPPAG00000037582)
Gorilla	MODERN SPECIES	523	CSTF2 (ENSGGOG00000022267)	SYTL4 (ENSGGOG00000001159)	SRPX2 (ENSGGOG00000010009)	TSPAN6 (ENSGGOG00000010003)	TNMD (ENSGGOG00000017007) ##26	PCDH19 (ENSGGOG00000001810)	ENSGGOG00000027167	ENSGGOG00000038151	DIAPH2 (ENSGGOG00000002859)	ENSGGOG00000038270	FAM133A (ENSGGOG00000043974)	NAP1L3 (ENSGGOG00000016989)	ENSGGOG00000025902	ENSGGOG00000039790	ENSGGOG00000025897	ENSGGOG00000042618 #22	ENSGGOG00000008584	PABPC5 (ENSGGOG00000007622)	ENSGGOG00000037634	ENSGGOG00000036979	CPXCR1 (ENSGGOG00000026865)	RPSA (ENSGGOG00000036643)	KLHL4 (ENSGGOG00000002307)	DACH2 (ENSGGOG00000007231)	ENSGGOG00000040803	CHM (ENSGGOG00000022912)	POF1B (ENSGGOG00000016908)	ZNF711 (ENSGGOG00000006110)	SATL1 (ENSGGOG00000016333)	ENSGGOG00000016329	HDX (ENSGGOG00000005551)
Gibbon	MODERN SPECIES	114															ENSNLEG00000027059	ENSNLEG00000002453 #22	ENSNLEG00000015514
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b #22
Mas night monkey	MODERN SPECIES	1031	RDH5 (ENSANAG00000022716)	ITGA7 (ENSANAG00000035353)	METTL7B (ENSANAG00000036477)	OR2AP1 (ENSANAG00000005559)	OR6C4 (ENSANAG00000005997)	OR6C2 (ENSANAG00000020125)	ENSANAG00000026469	OR6C3 (ENSANAG00000020167)	OR6C6 (ENSANAG00000001856)	OR6C74 (ENSANAG00000001962)	OR9K2 (ENSANAG00000020116)	ENSANAG00000023011	NEUROD4 (ENSANAG00000004700)	TESPA1 (ENSANAG00000037498)	MUCL1 (ENSANAG00000026232)	ENSANAG00000030917 #22	DCD (ENSANAG00000035073)	LACRT (ENSANAG00000021062)	PPP1R1A (ENSANAG00000036632)	PDE1B (ENSANAG00000034831)	NCKAP1L (ENSANAG00000025148)	ENSANAG00000023191	GTSF1 (ENSANAG00000024529)	ITGA5 (ENSANAG00000036479)	ZNF385A (ENSANAG00000001893)	GPR84 (ENSANAG00000004247)	ENSANAG00000025073	COPZ1 (ENSANAG00000031944)	NFE2 (ENSANAG00000025350)	ENSANAG00000023645	CBX5 (ENSANAG00000023641)
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b #22
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b #22
Capuchin	MODERN SPECIES	285									OR6C2 (ENSCCAG00000019750)	OR6C3 (ENSCCAG00000018653)	OR10A7 (ENSCCAG00000008524)	ENSCCAG00000029232	NEUROD4 (ENSCCAG00000015070)	TESPA1 (ENSCCAG00000023429)	ENSCCAG00000025420	ENSCCAG00000021932 #22	DCD (ENSCCAG00000009193)	LACRT (ENSCCAG00000020335)	PPP1R1A (ENSCCAG00000027579)	PDE1B (ENSCCAG00000034020)	NCKAP1L (ENSCCAG00000032586)	GTSF1 (ENSCCAG00000032808)	ITGA5 (ENSCCAG00000021214)	ZNF385A (ENSCCAG00000033332)	ENSCCAG00000019051	COPZ1 (ENSCCAG00000013641)	NFE2 (ENSCCAG00000027905)	ENSCCAG00000033451	CBX5 (ENSCCAG00000024410)	ENSCCAG00000035935	HOXC4 (ENSCCAG00000030761)
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b #22
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00950000182951.B	ENSGT00950000182888.a.a.b	ENSGT00940000153838.b	ENSGT00950000183081.a.a.a	ENSGT00390000005554	ENSGT01030000234614.B.b	ENSGT00940000159902	ENSGT00940000159228	ENSGT00390000012166.o	ENSGT00430000032886	ENSGT00390000012166.p	ENSGT00940000155130	ENSGT00940000159504	ENSGT00940000157906	ENSGT00940000157458	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b #22	ENSGT00500000044895	ENSGT00390000013003	ENSGT00940000157639	ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b	ENSGT00900000141021.a	ENSGT00940000155601	ENSGT00940000163676	ENSGT00390000010047.a.a	ENSGT00940000161715.jb	ENSGT00940000161715.kb	ENSGT00660000095605	ENSGT00940000161114	ENSGT00940000154304.B	ENSGT00940000154304.A	ENSGT00530000063604.B
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000153838.b	ENSGT00910000147219	ENSGT00950000183081.a.a.a	ENSGT00390000005554	ENSGT00950000183123.g.b.b.i.b	ENSGT01030000234614.B.b	ENSGT00940000159902	ENSGT00940000159228	ENSGT00390000012166.o	ENSGT00430000032886	ENSGT00390000012166.p	ENSGT00940000155130	ENSGT00940000159504	ENSGT00940000157906	ENSGT00940000157458	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b #22	ENSGT00500000044895	ENSGT00390000013003	ENSGT00940000157639	ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b	ENSGT00900000141021.a	ENSGT00940000155601	ENSGT00940000163676	ENSGT00390000010047.a.a	ENSGT00390000010047.b	ENSGT00940000161715.jb	ENSGT00940000161715.kb	ENSGT00660000095605	ENSGT00940000161114	ENSGT00940000154304.B	ENSGT00940000154304.A
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000153838.b	ENSGT00910000147219	ENSGT00950000183081.a.a.a	ENSGT00390000005554	ENSGT00950000183123.g.b.b.i.b	ENSGT01030000234614.B.b	ENSGT00940000159902	ENSGT00940000159228	ENSGT00390000012166.o	ENSGT00430000032886	ENSGT00390000012166.p	ENSGT00940000155130	ENSGT00940000159504	ENSGT00940000157906	ENSGT00940000157458	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b #22	ENSGT00500000044895	ENSGT00390000013003	ENSGT00940000157639	ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b	ENSGT00900000141021.a	ENSGT00940000155601	ENSGT00940000163676	ENSGT00390000010047.a.a	ENSGT00390000010047.b	ENSGT00940000161715.jb	ENSGT00940000161715.kb	ENSGT00660000095605	ENSGT00940000161114	ENSGT00940000154304.B	ENSGT00940000154304.A
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153838.b	ENSGT00910000147219	ENSGT00950000183081.a.a.a	ENSGT00390000005554	ENSGT00950000183123.g.b.b.i.b	ENSGT01030000234614.B.b	ENSGT00940000159902	ENSGT00940000159228	ENSGT00390000012166.o	ENSGT00430000032886	ENSGT00390000012166.p	ENSGT00940000155130	ENSGT00940000159504	ENSGT00940000157906	ENSGT00940000157458	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b #22	ENSGT00500000044895	ENSGT00390000013003	ENSGT00940000157639	ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b	ENSGT00900000141021.a	ENSGT00940000155601	ENSGT00940000163676	ENSGT00390000010047.a.a	ENSGT00390000010047.b	ENSGT00940000161715.jb	ENSGT00940000161715.kb	ENSGT00660000095605	ENSGT00940000161114	ENSGT00940000154304.B	ENSGT00940000154304.A
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00950000182951.B	ENSGT00950000182888.a.a.b	ENSGT00940000153838.b	ENSGT00910000147219	ENSGT00950000183081.a.a.a	ENSGT00390000005554	ENSGT00950000183123.g.b.b.i.b	ENSGT01030000234614.B.b	ENSGT00940000159902	ENSGT00940000159228	ENSGT00390000012166.o	ENSGT00390000012166.p	ENSGT00940000155130	ENSGT00940000159504	ENSGT00940000157906	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b #22	ENSGT00940000157458	ENSGT00500000044895	ENSGT00390000013003	ENSGT00940000157639	ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b	ENSGT00900000141021.a	ENSGT00940000155601	ENSGT00940000163676	ENSGT00390000015789.c.a.a	ENSGT00390000010047.a.a	ENSGT00390000010047.b.p	ENSGT00940000161715.jb	ENSGT00940000161715.kb	ENSGT00660000095605	ENSGT00940000161114
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	71	ENSGT00950000182888.a.a.b	ENSGT00940000153838.b	ENSGT00910000147219	ENSGT00950000183081.a.a.a	ENSGT00390000005554	ENSGT00950000183123.g.b.b.i.b	ENSGT01030000234614.B.b	ENSGT00940000159902	ENSGT00940000159228	ENSGT00390000012166.o	ENSGT00390000012166.p	ENSGT00940000155130	ENSGT00940000159504	ENSGT00940000157906	ENSGT00940000157458	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b #22	ENSGT00500000044895	ENSGT00390000013003	ENSGT00940000157639	ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b	ENSGT00940000155601	ENSGT00390000015789.c.a.a	ENSGT00390000010047.a.a	ENSGT00940000161715.kb	ENSGT00390000010047.b.p	ENSGT00940000161715.jb	ENSGT00660000095605	ENSGT00940000161114	ENSGT00940000154304.B	ENSGT00940000154304.A	ENSGT00530000063604.B
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	110	RALGPS2 (ENSCATG00000037783)	FAM20B (ENSCATG00000032604)	TOR3A (ENSCATG00000041605)	ABL2 (ENSCATG00000034934)	ENSCATG00000001027	SOAT1 (ENSCATG00000029999)	AXDND1 (ENSCATG00000032663)	NPHS2 (ENSCATG00000036937)	TDRD5 (ENSCATG00000042714)	FAM163A (ENSCATG00000034127)	TOR1AIP2 (ENSCATG00000044101)	TOR1AIP1 (ENSCATG00000036271)	CEP350 (ENSCATG00000000294)	QSOX1 (ENSCATG00000014337)	LHX4 (ENSCATG00000045236)	ENSCATG00000031451 #22	ACBD6 (ENSCATG00000015218)	XPR1 (ENSCATG00000039536)	KIAA1614 (ENSCATG00000029007)	STX6 (ENSCATG00000045307)	MR1 (ENSCATG00000042907)	CACNA1E (ENSCATG00000035687)	ENSCATG00000037086	ENSCATG00000014247	TEDDM1 (ENSCATG00000000091)	RGSL1 (ENSCATG00000038774)	RNASEL (ENSCATG00000038808)	RGS16 (ENSCATG00000043024)	RGS8 (ENSCATG00000009681)	NPL (ENSCATG00000037634)	DHX9 (ENSCATG00000027871)
Drill	MODERN SPECIES	1422														LHX4 (ENSMLEG00000038342)	ACBD6 (ENSMLEG00000000612)	ENSMLEG00000043837 #22	XPR1 (ENSMLEG00000040363)	KIAA1614 (ENSMLEG00000031704)	STX6 (ENSMLEG00000037024)	MR1 (ENSMLEG00000044129)	ENSMLEG00000042627	CACNA1E (ENSMLEG00000033118)	ENSMLEG00000003862
Olive baboon	MODERN SPECIES		FAM20B (ENSPANG00000013234)	TOR3A (ENSPANG00000005484)	ABL2 (ENSPANG00000015263)	SOAT1 (ENSPANG00000022548)	ENSPANG00000037477	AXDND1 (ENSPANG00000010748)	NPHS2 (ENSPANG00000015051)	TDRD5 (ENSPANG00000021218)	FAM163A (ENSPANG00000039302)	TOR1AIP2 (ENSPANG00000011377)	TOR1AIP1 (ENSPANG00000010531)	CEP350 (ENSPANG00000010288)	QSOX1 (ENSPANG00000007125)	ENSPANG00000048144	LHX4 (ENSPANG00000011378)	ENSPANG00000018019 #22	ACBD6 (ENSPANG00000008916)	ENSPANG00000045482	ENSPANG00000042523	XPR1 (ENSPANG00000021906)	KIAA1614 (ENSPANG00000017312)	STX6 (ENSPANG00000004517)	MR1 (ENSPANG00000009258)	IER5 (ENSPANG00000026360)	CACNA1E (ENSPANG00000008917)	ZNF648 (ENSPANG00000047878)	ENSPANG00000036942	ENSPANG00000049090	GLUL (ENSPANG00000015340)	ENSPANG00000015417	TEDDM1 (ENSPANG00000046198)
Hominoidea	DUPLICATION
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00950000182888.a.a.b	ENSGT00940000153838.b	ENSGT00950000183081.a.a.a	ENSGT00390000005554	ENSGT01030000234614.B.b	ENSGT00940000154793.C.ab.n	ENSGT00940000159902	ENSGT00940000159228	ENSGT00390000012166.o	ENSGT00430000032886	ENSGT00390000012166.p	ENSGT00940000155130	ENSGT00940000159504	ENSGT00940000157906	ENSGT00940000157458	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b.a #22	ENSGT00500000044895	ENSGT00390000013003	ENSGT00940000157639	ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b	ENSGT00900000141021.a	ENSGT00940000155601	ENSGT00940000163676	ENSGT00390000010047.a.a	ENSGT00940000161715.jb	ENSGT00940000161715.kb	ENSGT00660000095605	ENSGT00940000161114	ENSGT00940000154304.B	ENSGT00940000154304.A	ENSGT00530000063604.B
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00950000182951.B	ENSGT00950000182888.a.a.b	ENSGT00940000153838.b	ENSGT00950000183081.a.a.a	ENSGT00390000005554	ENSGT01030000234614.B.b	ENSGT00940000154793.C.ab.n	ENSGT00940000159902	ENSGT00940000159228	ENSGT00390000012166.o	ENSGT00390000012166.p	ENSGT00940000155130	ENSGT00940000159504	ENSGT00940000157906	ENSGT00940000157458	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b.a #22	ENSGT00500000044895	ENSGT00390000013003	ENSGT00940000157639	ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b	ENSGT00900000141021.a	ENSGT00940000155601	ENSGT00940000163676	ENSGT00390000010047.a.a	ENSGT00940000161715.jb	ENSGT00940000161715.kb	ENSGT00660000095605	ENSGT00940000161114	ENSGT00940000154304.B	ENSGT00940000154304.A	ENSGT00530000063604.B
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00950000182951.B	ENSGT00950000182888.a.a.b	ENSGT00940000153838.b	ENSGT00950000183081.a.a.a	ENSGT00390000005554	ENSGT01030000234614.B.b	ENSGT00940000154793.C.ab.n	ENSGT00940000159902	ENSGT00940000159228	ENSGT00390000012166.o	ENSGT00390000012166.p	ENSGT00940000155130	ENSGT00940000159504	ENSGT00940000157906	ENSGT00940000157458	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b.a #22	ENSGT00500000044895	ENSGT00390000013003	ENSGT00940000157639	ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b	ENSGT00900000141021.a	ENSGT00940000155601	ENSGT00940000163676	ENSGT00390000010047.a.a	ENSGT00940000161715.kb	ENSGT00660000095605	ENSGT00940000161114	ENSGT00940000154304.B	ENSGT00940000154304.A	ENSGT00530000063604.B	ENSGT00940000155924.b.m
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00950000182951.B	ENSGT00950000182888.a.a.b	ENSGT00940000153838.b	ENSGT00950000183081.a.a.a	ENSGT00390000005554	ENSGT01030000234614.B.b	ENSGT00940000154793.C.ab.n	ENSGT00940000159902	ENSGT00940000159228	ENSGT00390000012166.o	ENSGT00390000012166.p	ENSGT00940000155130	ENSGT00940000159504	ENSGT00940000157906	ENSGT00940000157458	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b.a #22	ENSGT00500000044895	ENSGT00390000013003	ENSGT00940000157639	ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b	ENSGT00900000141021.a	ENSGT00940000155601	ENSGT00940000163676	ENSGT00390000010047.a.a	ENSGT00940000161715.kb	ENSGT00660000095605	ENSGT00940000161114	ENSGT00940000154304.B	ENSGT00940000154304.A	ENSGT00530000063604.B	ENSGT00940000155924.b.m
Pan	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000182951.B	ENSGT00950000182888.a.a.b	ENSGT00940000153838.b	ENSGT00950000183081.a.a.a	ENSGT00390000005554	ENSGT01030000234614.B.b	ENSGT00940000154793.C.ab.n	ENSGT00940000159902	ENSGT00940000159228	ENSGT00390000012166.o	ENSGT00390000012166.p	ENSGT00940000155130	ENSGT00940000159504	ENSGT00940000157906	ENSGT00940000157458	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b.a #22	ENSGT00500000044895	ENSGT00390000013003	ENSGT00990000205747	ENSGT00940000157639	ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b	ENSGT00900000141021.a	ENSGT00940000155601	ENSGT00940000163676	ENSGT00390000010047.a.a	ENSGT00940000161715.kb	ENSGT00660000095605	ENSGT00940000161114	ENSGT00940000154304.B	ENSGT00940000154304.A	ENSGT00530000063604.B
Chimpanzee	MODERN SPECIES		TOR3A (ENSPTRG00000001726)	ABL2 (ENSPTRG00000001727)	SOAT1 (ENSPTRG00000001728)	AXDND1 (ENSPTRG00000001729)	NPHS2 (ENSPTRG00000001731)	ENSPTRG00000043051	TDRD5 (ENSPTRG00000001732)	ENSPTRG00000049859	FAM163A (ENSPTRG00000041446)	TOR1AIP2 (ENSPTRG00000001734)	TOR1AIP1 (ENSPTRG00000001736)	CEP350 (ENSPTRG00000001738)	QSOX1 (ENSPTRG00000001739)	LHX4 (ENSPTRG00000001740)	ACBD6 (ENSPTRG00000001741)	ENSPTRG00000051293 #22	XPR1 (ENSPTRG00000001743)	KIAA1614 (ENSPTRG00000001744)	ENSPTRG00000048595	STX6 (ENSPTRG00000033764)	MR1 (ENSPTRG00000001746)	IER5 (ENSPTRG00000030269)	CACNA1E (ENSPTRG00000001749)	ZNF648 (ENSPTRG00000045785)	GLUL (ENSPTRG00000001751)	TEDDM1 (ENSPTRG00000030260)	RGSL1 (ENSPTRG00000047463)	RNASEL (ENSPTRG00000001755)	RGS16 (ENSPTRG00000001756)	RGS8 (ENSPTRG00000051859)	NPL (ENSPTRG00000001758)
Bonobo	MODERN SPECIES		TOR3A (ENSPPAG00000035693)	ABL2 (ENSPPAG00000043803)	SOAT1 (ENSPPAG00000038722)	AXDND1 (ENSPPAG00000029513)	NPHS2 (ENSPPAG00000029304)	ENSPPAG00000028865	TDRD5 (ENSPPAG00000034442)	FAM163A (ENSPPAG00000035329)	TOR1AIP2 (ENSPPAG00000039236)	TOR1AIP1 (ENSPPAG00000027535)	CEP350 (ENSPPAG00000035440)	QSOX1 (ENSPPAG00000030296)	ENSPPAG00000034618	LHX4 (ENSPPAG00000043845)	ACBD6 (ENSPPAG00000043016)	ENSPPAG00000036003 #22	XPR1 (ENSPPAG00000023632)	KIAA1614 (ENSPPAG00000041204)	ENSPPAG00000029107	STX6 (ENSPPAG00000042678)	MR1 (ENSPPAG00000019815)	ENSPPAG00000041463	CACNA1E (ENSPPAG00000027818)	ZNF648 (ENSPPAG00000008203)	GLUL (ENSPPAG00000042337)	TEDDM1 (ENSPPAG00000028837)	RGSL1 (ENSPPAG00000036401)	RNASEL (ENSPPAG00000029542)	RGS16 (ENSPPAG00000002479)	RGS8 (ENSPPAG00000031556)	NPL (ENSPPAG00000043409)
Gorilla	MODERN SPECIES		ANGPTL1 (ENSGGOG00000026690)	FAM20B (ENSGGOG00000002484)	TOR3A (ENSGGOG00000002627)	ABL2 (ENSGGOG00000002631)	SOAT1 (ENSGGOG00000013728)	AXDND1 (ENSGGOG00000034867)	NPHS2 (ENSGGOG00000015354)	TDRD5 (ENSGGOG00000011310)	FAM163A (ENSGGOG00000008032)	TOR1AIP2 (ENSGGOG00000015785)	TOR1AIP1 (ENSGGOG00000013837)	CEP350 (ENSGGOG00000001794)	QSOX1 (ENSGGOG00000009976)	LHX4 (ENSGGOG00000013931)	ACBD6 (ENSGGOG00000008735)	ENSGGOG00000027576 #22	XPR1 (ENSGGOG00000027512)	KIAA1614 (ENSGGOG00000008498)	STX6 (ENSGGOG00000000732)	MR1 (ENSGGOG00000022903)	IER5 (ENSGGOG00000012860)	CACNA1E (ENSGGOG00000011090)	ZNF648 (ENSGGOG00000037825)	ENSGGOG00000026683	GLUL (ENSGGOG00000024712)	RGSL1 (ENSGGOG00000039219)	RNASEL (ENSGGOG00000023414)	RGS16 (ENSGGOG00000002649)	RGS8 (ENSGGOG00000037970)	DHX9 (ENSGGOG00000013533)	SHCBP1L (ENSGGOG00000003484)
Gibbon	MODERN SPECIES	2	FAM20B (ENSNLEG00000029048)	TOR3A (ENSNLEG00000015587)	ABL2 (ENSNLEG00000015604)	SOAT1 (ENSNLEG00000015623)	AXDND1 (ENSNLEG00000015679)	NPHS2 (ENSNLEG00000015739)	ENSNLEG00000015748	TDRD5 (ENSNLEG00000015751)	FAM163A (ENSNLEG00000015804)	TOR1AIP2 (ENSNLEG00000015815)	ENSNLEG00000029703	TOR1AIP1 (ENSNLEG00000015827)	CEP350 (ENSNLEG00000015851)	QSOX1 (ENSNLEG00000015908)	ENSNLEG00000015953	ENSNLEG00000027446 #22	ACBD6 (ENSNLEG00000015957)	XPR1 (ENSNLEG00000015979)	ENSNLEG00000016007	STX6 (ENSNLEG00000016021)	ENSNLEG00000016013	BTF3L4 (ENSNLEG00000016041)	TXNDC12 (ENSNLEG00000034609)	RAB3B (ENSNLEG00000016065)	NRDC (ENSNLEG00000016067)	OSBPL9 (ENSNLEG00000016138)	ENSNLEG00000016192	TTC39A (ENSNLEG00000016232)	ENSNLEG00000033471	ENSNLEG00000029189	CDKN2C (ENSNLEG00000016259)
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b.b #22
Gibbon	MODERN SPECIES	1	ORMDL2 (ENSNLEG00000017596)	SARNP (ENSNLEG00000017599)	ENSNLEG00000017601	CD63 (ENSNLEG00000017604)	RDH5 (ENSNLEG00000017608)	ENSNLEG00000017610	METTL7B (ENSNLEG00000017612)	ENSNLEG00000029671	OR2AP1 (ENSNLEG00000029073)	OR6C4 (ENSNLEG00000031901)	OR6C1 (ENSNLEG00000019272)	OR9K2 (ENSNLEG00000019273)	NEUROD4 (ENSNLEG00000028480)	TESPA1 (ENSNLEG00000017620)	MUCL1 (ENSNLEG00000028255)	ENSNLEG00000032441 #22	ENSNLEG00000017623	ENSNLEG00000029310	PPP1R1A (ENSNLEG00000017625)	PDE1B (ENSNLEG00000017627)	NCKAP1L (ENSNLEG00000017630)	GTSF1 (ENSNLEG00000017635)	ITGA5 (ENSNLEG00000017637)	ZNF385A (ENSNLEG00000017645)	GPR84 (ENSNLEG00000017649)	COPZ1 (ENSNLEG00000035667)	NFE2 (ENSNLEG00000017657)	HNRNPA1 (ENSNLEG00000017659)	CBX5 (ENSNLEG00000017671)	SMUG1 (ENSNLEG00000017673)	HOXC4 (ENSNLEG00000017675)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b #22
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b #22
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b #22
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	50	TBRG1 (ENSSBOG00000029487)	PANX3 (ENSSBOG00000019600)	ENSSBOG00000025144	ENSSBOG00000019896	ENSSBOG00000032507	ENSSBOG00000019871	VWA5A (ENSSBOG00000018587)	TMEM225 (ENSSBOG00000005269)	ZNF202 (ENSSBOG00000030152)	SCN3B (ENSSBOG00000035992)	GRAMD1B (ENSSBOG00000029940)	CLMP (ENSSBOG00000033154)	ENSSBOG00000035266	ENSSBOG00000029761	ENSSBOG00000032961	ENSSBOG00000033034 #22	BSX (ENSSBOG00000035292)	JHY (ENSSBOG00000020543)	ENSSBOG00000019647	CRTAM (ENSSBOG00000020006)	UBASH3B (ENSSBOG00000026096)	ENSSBOG00000032996	BLID (ENSSBOG00000028902)	SORL1 (ENSSBOG00000027914)	ENSSBOG00000015796	SC5D (ENSSBOG00000020424)	TECTA (ENSSBOG00000019507)	TBCEL (ENSSBOG00000028041)	GRIK4 (ENSSBOG00000030277)	ARHGEF12 (ENSSBOG00000020565)	TLCD5 (ENSSBOG00000025172)
Simiiformes	DUPLICATION
Simiiformes	DUPLICATION
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.a #22
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.a #22
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.a #22
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.a #22
Capuchin	MODERN SPECIES	303												ENSCCAG00000034683	PCDH18 (ENSCCAG00000023413)	SLC7A11 (ENSCCAG00000033426)	ENSCCAG00000032478	ENSCCAG00000036211 #22	NOCT (ENSCCAG00000022628)	ELF2 (ENSCCAG00000025670)	ENSCCAG00000028381	ENSCCAG00000037489	MGARP (ENSCCAG00000032552)	ENSCCAG00000035857	NDUFC1 (ENSCCAG00000020974)	NAA15 (ENSCCAG00000021709) ##34	RAB33B (ENSCCAG00000019859)	SETD7 (ENSCCAG00000030675)	ENSCCAG00000020807	MGST2 (ENSCCAG00000020498)	ENSCCAG00000025062
Marmoset	MODERN SPECIES	11	PHYKPL (ENSCJAG00000012215)	COL23A1 (ENSCJAG00000012175)	CLK4 (ENSCJAG00000012089)	MSANTD5 (ENSCJAG00000065896)	ENSCJAG00000052143	ZNF354A (ENSCJAG00000012077)	ENSCJAG00000012069	PROP1 (ENSCJAG00000012060)	FAF2 (ENSCJAG00000040255)	RNF44 (ENSCJAG00000007338)	CDHR2 (ENSCJAG00000007310)	GPRIN1 (ENSCJAG00000007308)	SNCB (ENSCJAG00000007301)	EIF4E1B (ENSCJAG00000007291)	TSPAN17 (ENSCJAG00000007278)	ENSCJAG00000054332 #22	UNC5A (ENSCJAG00000007237)	HK3 (ENSCJAG00000007223)	UIMC1 (ENSCJAG00000007106)	ZNF346 (ENSCJAG00000007194)	FGFR4 (ENSCJAG00000007147)	NSD1 (ENSCJAG00000007009)	RAB24 (ENSCJAG00000006969)	ENSCJAG00000006953	MXD3 (ENSCJAG00000006943)	ENSCJAG00000073973	LMAN2 (ENSCJAG00000006916)	RGS14 (ENSCJAG00000006873)	SLC34A1 (ENSCJAG00000006845)	PFN3 (ENSCJAG00000006841)	F12 (ENSCJAG00000006834)
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b #22
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b #22
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b #22
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b #22
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b #22
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b #22
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT01100000263490.A.b.a.a.a	ENSGT01090000260013.b.a.b.a.b.a.b.a.b	ENSGT00940000163719	ENSGT01100000263490.B.b.a	ENSGT01100000263490.B.a.c.a.b.a	ENSGT01090000259999.G.b	ENSGT01090000259999.G.a.a	ENSGT01100000263490.D.a.a	ENSGT01090000259999.F.a	ENSGT00910000146879	ENSGT00940000162047.g	ENSGT00530000065242	ENSGT01100000263522.A.c.b.c.a.hb	ENSGT00940000161515	ENSGT01090000260043.a.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b.a	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b #22	ENSGT00910000144246	ENSGT00390000000214.a.a	ENSGT00940000155158.i	ENSGT00510000047299	ENSGT00550000074799	ENSGT00940000160721	ENSGT01030000234601.c.a.a	ENSGT01030000234601.c.b.b	ENSGT01060000248588.b	ENSGT00390000004140.b.h	ENSGT00390000013075.a.d	ENSGT00390000004026	ENSGT00950000183078.b.a.a	ENSGT00390000016789	ENSGT00940000161220
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	545	OR52A5 (ENSCATG00000010932)	ENSCATG00000040874	ENSCATG00000044261	MMP26 (ENSCATG00000039857)	OR51G1 (ENSCATG00000029826)	OR51A7 (ENSCATG00000026903)	OR51F2 (ENSCATG00000038466)	OR51E2 (ENSCATG00000007724)	ENSCATG00000010569	ENSCATG00000032822	ENSCATG00000018446	ENSCATG00000038847	OR52K1 (ENSCATG00000015044)	TRIM21 (ENSCATG00000030899)	OR52B4 (ENSCATG00000032503)	ENSCATG00000035679 #22	RRM1 (ENSCATG00000035182)	STIM1 (ENSCATG00000013784)	ENSCATG00000014698	PGAP2 (ENSCATG00000034622)	NUP98 (ENSCATG00000033581)	CHRNA10 (ENSCATG00000038975)	ART1 (ENSCATG00000020846)	ART5 (ENSCATG00000044955)	ENSCATG00000043589	ENSCATG00000043505	RNF121 (ENSCATG00000039465)	IL18BP (ENSCATG00000036233)	NUMA1 (ENSCATG00000044445)	LAMTOR1 (ENSCATG00000045256)	TOMT (ENSCATG00000043251)
Drill	MODERN SPECIES	1114																ENSMLEG00000036708 #22	RRM1 (ENSMLEG00000042859)	STIM1 (ENSMLEG00000032366)	ENSMLEG00000008168	PGAP2 (ENSMLEG00000038507)	NUP98 (ENSMLEG00000043563)	CHRNA10 (ENSMLEG00000019278)	ART1 (ENSMLEG00000030716)	ART5 (ENSMLEG00000008190)	ENSMLEG00000034998	ENSMLEG00000039461	RNF121 (ENSMLEG00000043299)	IL18BP (ENSMLEG00000032241)	NUMA1 (ENSMLEG00000029680)	LAMTOR1 (ENSMLEG00000037079)	TOMT (ENSMLEG00000037107)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b #22
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b #22
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b #22
Capuchin	MODERN SPECIES	354	ENSCCAG00000021084	ENSCCAG00000027679	ADGRG7 (ENSCCAG00000029521)	TMEM45A (ENSCCAG00000037862)	LNP1 (ENSCCAG00000030879)	TOMM70 (ENSCCAG00000032264)	NIT2 (ENSCCAG00000029927)	TBC1D23 (ENSCCAG00000022989)	ENSCCAG00000024603	FILIP1L (ENSCCAG00000025103)	CMSS1 (ENSCCAG00000034685)	COL8A1 (ENSCCAG00000018156)	DCBLD2 (ENSCCAG00000012943)	ST3GAL6 (ENSCCAG00000033953)	ENSCCAG00000003554	ENSCCAG00000022346 #22	CPOX (ENSCCAG00000021341)	ENSCCAG00000034984	OR5K4 (ENSCCAG00000033707)
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.b #22
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00940000156451	ENSGT00940000155997	ENSGT00940000157572	ENSGT00940000158409	ENSGT00940000156127	ENSGT00390000016717.j.a	ENSGT00940000157200	ENSGT00390000005378	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000006066	ENSGT00940000158804	ENSGT00390000003219	ENSGT00940000157941.k.b	ENSGT00940000158155	ENSGT00950000182956.b.b.a.b	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.b #22	ENSGT00940000158225	ENSGT00940000155867	ENSGT00440000033504.B	ENSGT00940000156857	ENSGT00940000155180.b	ENSGT00390000013224	ENSGT00940000160821	ENSGT00940000157821	ENSGT00390000010229	ENSGT00940000153414.A	ENSGT00940000159401	ENSGT00940000162469	ENSGT00940000158576	ENSGT00940000161860	ENSGT00390000007725.A.a
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00940000156451	ENSGT00940000155997	ENSGT00940000157572	ENSGT00940000158409	ENSGT00940000156127	ENSGT00390000016717.j.a	ENSGT00940000157200	ENSGT00390000005378	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000006066	ENSGT00940000158804	ENSGT00390000003219	ENSGT00940000157941.k.b	ENSGT00940000158155	ENSGT00950000182956.b.b.a.b	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.b #22	ENSGT00940000158225	ENSGT00940000155867	ENSGT00440000033504.B	ENSGT00940000156857	ENSGT00940000155180.b	ENSGT00390000013224	ENSGT00940000160821	ENSGT00940000157821	ENSGT00390000010229	ENSGT00940000153414.A	ENSGT00940000159401	ENSGT00940000162469	ENSGT00940000158576	ENSGT00940000161860	ENSGT00390000007725.A.a
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	94							ENSGT00940000157200	ENSGT00390000005378	ENSGT00950000182999.b.a.a	ENSGT00390000006066	ENSGT00940000158804	ENSGT00390000003219	ENSGT00940000157941.k.b	ENSGT00940000158155	ENSGT00950000182956.b.b.a.b	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.b #22	ENSGT00940000158225	ENSGT00940000155867	ENSGT00440000033504.B	ENSGT00940000156857	ENSGT00940000155180.b	ENSGT00390000013224	ENSGT00940000160821	ENSGT00940000157821	ENSGT00390000010229	ENSGT00940000153414.A	ENSGT00940000159401	ENSGT00940000162469	ENSGT00940000158576	ENSGT00940000161860	ENSGT00390000007725.A.a
Bolivian squirrel monkey	DUPLICATION
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	197									FKBP4 (ENSSBOG00000030928)	ITFG2 (ENSSBOG00000021331)	NRIP2 (ENSSBOG00000021076)	TEX52 (ENSSBOG00000026810)	FOXM1 (ENSSBOG00000026585)	TULP3 (ENSSBOG00000027404)	TEAD4 (ENSSBOG00000025602)	ENSSBOG00000019593 #22	TSPAN9 (ENSSBOG00000000277)	PRMT8 (ENSSBOG00000027867)	CRACR2A (ENSSBOG00000024718)	ENSSBOG00000031519	PARP11 (ENSSBOG00000032202)	CCND2 (ENSSBOG00000022163)	TIGAR (ENSSBOG00000035082)	FGF23 (ENSSBOG00000027393)	FGF6 (ENSSBOG00000024969)	C12orf4 (ENSSBOG00000030014)	RAD51AP1 (ENSSBOG00000031364)	DYRK4 (ENSSBOG00000022376)	ENSSBOG00000023354	KCNA6 (ENSSBOG00000012723)	KCNA1 (ENSSBOG00000036388)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	123	THOC3 (ENSSBOG00000022663)	SIMC1 (ENSSBOG00000025281)	KIAA1191 (ENSSBOG00000026134)	ARL10 (ENSSBOG00000031819)	ENSSBOG00000022208	ENSSBOG00000025283	CLTB (ENSSBOG00000029379)	ENSSBOG00000028310	FAF2 (ENSSBOG00000035526)	RNF44 (ENSSBOG00000028138)	CDHR2 (ENSSBOG00000028213)	GPRIN1 (ENSSBOG00000004419)	SNCB (ENSSBOG00000014341)	EIF4E1B (ENSSBOG00000030710)	TSPAN17 (ENSSBOG00000017848)	ENSSBOG00000020696 #22	UNC5A (ENSSBOG00000020718)	HK3 (ENSSBOG00000033767)	ENSSBOG00000028026	UIMC1 (ENSSBOG00000035332)	ZNF346 (ENSSBOG00000034067)	FGFR4 (ENSSBOG00000024525)	ENSSBOG00000026004	NSD1 (ENSSBOG00000032022)	RAB24 (ENSSBOG00000025992)	ENSSBOG00000001085	MXD3 (ENSSBOG00000024598)	LMAN2 (ENSSBOG00000023284)	RGS14 (ENSSBOG00000032330)	SLC34A1 (ENSSBOG00000033597)	F12 (ENSSBOG00000023238)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	349	ENSANAG00000034432	NUP160 (ENSANAG00000025545)	PTPRJ (ENSANAG00000028493)	OR4X2 (ENSANAG00000009838)	OR4C3 (ENSANAG00000006729)	ENSANAG00000018347	FKBP4 (ENSANAG00000032425)	ITFG2 (ENSANAG00000035866)	NRIP2 (ENSANAG00000033901)	TEX52 (ENSANAG00000020158)	FOXM1 (ENSANAG00000035342)	RHNO1 (ENSANAG00000037023)	ENSANAG00000028446	TULP3 (ENSANAG00000027783)	TEAD4 (ENSANAG00000036426)	ENSANAG00000035753 #22	TSPAN9 (ENSANAG00000031807)
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.tb #22
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.tb #22
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.tb #22
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.tb #22
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.tb #22
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.tb #22
Pan	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.tb #22
Bonobo	MODERN SPECIES	16	COLQ (ENSPPAG00000031635)	EAF1 (ENSPPAG00000039271)	METTL6 (ENSPPAG00000039377)	SH3BP5 (ENSPPAG00000038360)	CAPN7 (ENSPPAG00000032807)	RBSN (ENSPPAG00000038220)	MRPS25 (ENSPPAG00000039324)	NR2C2 (ENSPPAG00000023138)	ENSPPAG00000042214	FGD5 (ENSPPAG00000025764)	C3orf20 (ENSPPAG00000041311)	CCDC174 (ENSPPAG00000038422)	ENSPPAG00000033481	GRIP2 (ENSPPAG00000041847)	SLC6A6 (ENSPPAG00000042007)	ENSPPAG00000036305 #22	LSM3 (ENSPPAG00000034074)	XPC (ENSPPAG00000043453)	TMEM43 (ENSPPAG00000000804)	CHCHD4 (ENSPPAG00000032925)	WNT7A (ENSPPAG00000030187)	FBLN2 (ENSPPAG00000015671)	HDAC11 (ENSPPAG00000037567)	NUP210 (ENSPPAG00000037715)	ENSPPAG00000028546	IQSEC1 (ENSPPAG00000036448)	RPL32 (ENSPPAG00000008188)	CAND2 (ENSPPAG00000004317)	ENSPPAG00000036413	TMEM40 (ENSPPAG00000019163)	ENSPPAG00000024005
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.tb #22
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	988																ENSGT00950000182869.e.a.b.tb #22	ENSGT00940000163696.a.a
Golden snub-nosed monkey	DUPLICATION
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	70																ENSRROG00000002298 #22	CYP2C8 (ENSRROG00000041111)
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2602																ENSRROG00000032766 #22
Black snub-nosed monkey	DUPLICATION
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1016															CYP2C9 (ENSRBIG00000030824)	ENSRBIG00000028008 #22	CYP2C8 (ENSRBIG00000038387)
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	426														TLR4 (ENSRBIG00000026429)	ENSRBIG00000029433	ENSRBIG00000000050 #22
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177.j	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.tb #22	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000154875.k.b	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200.y	ENSGT00940000154268.f.l	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177.j	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.tb #22	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000154875.k.b	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200.y	ENSGT00940000154268.f.l	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177.j	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.tb #22	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000154875.k.b	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200.y	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108
Pig-tailed macaque	DUPLICATION
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	449															CYP2C8 (ENSMNEG00000011295)	ENSMNEG00000028049 #22	CYP2C93 (ENSMNEG00000000870)	ENSMNEG00000004860
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	383	CATSPER3 (ENSMNEG00000025685)	PCBD2 (ENSMNEG00000035154)	TXNDC15 (ENSMNEG00000035748)	C5orf24 (ENSMNEG00000041574)	DDX46 (ENSMNEG00000029903)	CAMLG (ENSMNEG00000038227)	SEC24A (ENSMNEG00000044861)	SAR1B (ENSMNEG00000045379)	JADE2 (ENSMNEG00000031371)	CDKN2AIPNL (ENSMNEG00000042298)	UBE2B (ENSMNEG00000034858)	CDKL3 (ENSMNEG00000032037)	PPP2CA (ENSMNEG00000043537)	ENSMNEG00000032488	TCF7 (ENSMNEG00000044025)	ENSMNEG00000016613 #22	C5orf15 (ENSMNEG00000041375)	FSTL4 (ENSMNEG00000039940)	ENSMNEG00000042952	HSPA4 (ENSMNEG00000030298)	ZCCHC10 (ENSMNEG00000039054)	AFF4 (ENSMNEG00000033381)	LEAP2 (ENSMNEG00000031057)	UQCRQ (ENSMNEG00000041577)	GDF9 (ENSMNEG00000036613)	SHROOM1 (ENSMNEG00000038716)	SOWAHA (ENSMNEG00000006710)	SEPTIN8 (ENSMNEG00000043687)	CCNI2 (ENSMNEG00000041733)	KIF3A (ENSMNEG00000029565)	IL4 (ENSMNEG00000033953)
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000154518.a	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177.j	ENSGT00940000156580	ENSGT00690000102286.a.b.k.b.d.a.a.a.a	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.tb #22	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200.y	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	19	ENSMFAG00000018870	CEP55 (ENSMFAG00000041263)	FFAR4 (ENSMFAG00000042176)	RBP4 (ENSMFAG00000042546)	PDE6C (ENSMFAG00000045757)	FRA10AC1 (ENSMFAG00000045302)	LGI1 (ENSMFAG00000037131)	SLC35G1 (ENSMFAG00000039807)	PLCE1 (ENSMFAG00000020572)	NOC3L (ENSMFAG00000032429)	HELLS (ENSMFAG00000044053)	CYP2C18 (ENSMFAG00000058429)	H2AZ1 (ENSMFAG00000001222)	CYP2C9 (ENSMFAG00000005983)	CYP2C8 (ENSMFAG00000034299)	ENSMFAG00000041843 #22	CYP2C93 (ENSMFAG00000032581)	ENSMFAG00000055400	PDLIM1 (ENSMFAG00000030298)	SORBS1 (ENSMFAG00000030641)	ENSMFAG00000050945	ALDH18A1 (ENSMFAG00000001272)	TCTN3 (ENSMFAG00000001575)	CC2D2B (ENSMFAG00000038060)	ENSMFAG00000045985	CCNJ (ENSMFAG00000037933)	BLNK (ENSMFAG00000043139)	DNTT (ENSMFAG00000034600)	OPALIN (ENSMFAG00000043114)	TLL2 (ENSMFAG00000002794)	TM9SF3 (ENSMFAG00000002926)
Rhesus	DUPLICATION
Rhesus	MODERN SPECIES	16	PCBD2 (ENSMMUG00000058022)	TXNDC15 (ENSMMUG00000063014)	C6H5orf24 (ENSMMUG00000004013)	DDX46 (ENSMMUG00000012463)	CAMLG (ENSMMUG00000056880)	SEC24A (ENSMMUG00000004418)	SAR1B (ENSMMUG00000004417)	JADE2 (ENSMMUG00000000358)	CDKN2AIPNL (ENSMMUG00000058096)	ENSMMUG00000053384	UBE2B (ENSMMUG00000016641)	ENSMMUG00000052256	ENSMMUG00000052915	SKP1 (ENSMMUG00000013047)	TCF7 (ENSMMUG00000022788)	VDAC1 (ENSMMUG00000016235) #22	C6H5orf15 (ENSMMUG00000042266)	FSTL4 (ENSMMUG00000003062)	ENSMMUG00000052685	HSPA4 (ENSMMUG00000009396)	ENSMMUG00000053208	ZCCHC10 (ENSMMUG00000056688)	AFF4 (ENSMMUG00000015640)	LEAP2 (ENSMMUG00000015638)	UQCRQ (ENSMMUG00000051941)	GDF9 (ENSMMUG00000060221)	SHROOM1 (ENSMMUG00000010312)	SOWAHA (ENSMMUG00000039781)	SEPTIN8 (ENSMMUG00000010309)	CCNI2 (ENSMMUG00000010308)	KIF3A (ENSMMUG00000010313)
Rhesus	MODERN SPECIES	19	RBP4 (ENSMMUG00000014711)	PDE6C (ENSMMUG00000014713)	FRA10AC1 (ENSMMUG00000014715)	LGI1 (ENSMMUG00000001825)	ENSMMUG00000056291	SLC35G1 (ENSMMUG00000045531)	PLCE1 (ENSMMUG00000001608)	NOC3L (ENSMMUG00000001619)	TBC1D12 (ENSMMUG00000055733)	ENSMMUG00000040417	HELLS (ENSMMUG00000017255)	ENSMMUG00000056966	CYP2C18 (ENSMMUG00000018330)	CYP2C19 (ENSMMUG00000015542)	CYP2C93 (ENSMMUG00000045340)	ENSMMUG00000043867 #22	ENSMMUG00000050068	CYP2C76 (ENSMMUG00000000124)	PDLIM1 (ENSMMUG00000000454)	SORBS1 (ENSMMUG00000004818)	ALDH18A1 (ENSMMUG00000003102)	TCTN3 (ENSMMUG00000003103)	ENTPD1 (ENSMMUG00000022658)	ENSMMUG00000050466	ENSMMUG00000059564	ENSMMUG00000030513	ENSMMUG00000016687	CCNJ (ENSMMUG00000016689)	ZNF518A (ENSMMUG00000001518)	BLNK (ENSMMUG00000008687)	DNTT (ENSMMUG00000022496)
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00510000047961	ENSGT01070000253744.a.a.a.a	ENSGT00510000047107.A	ENSGT00940000157825	ENSGT00390000017833	ENSGT00940000159793	ENSGT00940000153249.a	ENSGT00940000157356	ENSGT00390000008540	ENSGT00930000151314	ENSGT00940000156410	ENSGT00740000115593	ENSGT00940000162913.f	ENSGT00940000163209.a.a.a	ENSGT00940000163696.a.b	ENSGT00950000182869.e.a.b.tb #22	ENSGT00940000163696.a.a	ENSGT00940000163696.b	ENSGT00940000162654.b.a	ENSGT00940000155525.m	ENSGT00940000158658	ENSGT00500000044903	ENSGT00570000079101.a.a	ENSGT01100000263542.C	ENSGT00940000156590	ENSGT00940000156981	ENSGT00940000162006	ENSGT00940000155715	ENSGT00940000158584	ENSGT00390000009395	ENSGT00940000160572
Olive baboon	MODERN SPECIES	2	FFAR4 (ENSPANG00000021536)	PDE6C (ENSPANG00000021540)	FRA10AC1 (ENSPANG00000021541)	LGI1 (ENSPANG00000021532)	SLC35G1 (ENSPANG00000021516)	PLCE1 (ENSPANG00000021518)	NOC3L (ENSPANG00000021522)	ENSPANG00000031350	TBC1D12 (ENSPANG00000021525)	HELLS (ENSPANG00000033528)	ENSPANG00000039619	ENSPANG00000037209	ENSPANG00000046687	ENSPANG00000021527	ENSPANG00000030497	CYP2C8 (ENSPANG00000021476) #22	ENSPANG00000031836	CYP2C8 (ENSPANG00000016602)	CYP2C76v2 (ENSPANG00000021950)	PDLIM1 (ENSPANG00000021477)	SORBS1 (ENSPANG00000021480)	ALDH18A1 (ENSPANG00000021474)	TCTN3 (ENSPANG00000021457)	ENSPANG00000039768	ENTPD1 (ENSPANG00000021459)	CC2D2B (ENSPANG00000021446)	CCNJ (ENSPANG00000021449)	ENSPANG00000043364	ZNF518A (ENSPANG00000021450)	BLNK (ENSPANG00000021417)	DNTT (ENSPANG00000021421)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	57																ENSGT00950000182869.e.a.b.tb #22	ENSGT00940000163696.a.a	ENSGT00940000163696.b	ENSGT00940000162654.b.a	ENSGT00940000155525.m	ENSGT00940000158658	ENSGT00500000044903	ENSGT00570000079101.a.a	ENSGT01100000263542.C	ENSGT00940000156590	ENSGT00940000156981	ENSGT00940000162006	ENSGT00940000155715	ENSGT00940000158584	ENSGT00390000009395	ENSGT00940000160572
Drill	MODERN SPECIES	226															CYP2C8 (ENSMLEG00000038189)	ENSMLEG00000042053 #22	CYP2C93 (ENSMLEG00000038282)	ENSMLEG00000040880	ENSMLEG00000043966	ENSMLEG00000024585	PDLIM1 (ENSMLEG00000039026)	SORBS1 (ENSMLEG00000036005)	ALDH18A1 (ENSMLEG00000040804)	TCTN3 (ENSMLEG00000032599)	ENTPD1 (ENSMLEG00000032678)	ENSMLEG00000031797	CC2D2B (ENSMLEG00000041340)	CCNJ (ENSMLEG00000021833)	ZNF518A (ENSMLEG00000020642)	BLNK (ENSMLEG00000037312)	DNTT (ENSMLEG00000041343)
Sooty mangabey	DUPLICATION
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	485																ENSCATG00000031296 #22	CYP2C8 (ENSCATG00000022282)	CYP2C93 (ENSCATG00000033029)
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	309	CATSPER3 (ENSCATG00000044756)	PCBD2 (ENSCATG00000029213)	TXNDC15 (ENSCATG00000033445)	C5orf24 (ENSCATG00000025473)	DDX46 (ENSCATG00000040891)	CAMLG (ENSCATG00000044060)	SEC24A (ENSCATG00000039411)	SAR1B (ENSCATG00000022601)	JADE2 (ENSCATG00000032327)	CDKN2AIPNL (ENSCATG00000024426)	UBE2B (ENSCATG00000032151)	CDKL3 (ENSCATG00000039822)	PPP2CA (ENSCATG00000039567)	SKP1 (ENSCATG00000041858)	TCF7 (ENSCATG00000044135)	ENSCATG00000031466 #22	C5orf15 (ENSCATG00000044895)	FSTL4 (ENSCATG00000044275)	ENSCATG00000031695	HSPA4 (ENSCATG00000042105)	ZCCHC10 (ENSCATG00000041405)	AFF4 (ENSCATG00000044510)	LEAP2 (ENSCATG00000042054)	UQCRQ (ENSCATG00000038607)	GDF9 (ENSCATG00000039023)	SHROOM1 (ENSCATG00000031031)	SEPTIN8 (ENSCATG00000032903)	CCNI2 (ENSCATG00000044370)	KIF3A (ENSCATG00000043006)	IL4 (ENSCATG00000042947)	IL13 (ENSCATG00000030939)
Vervet Monkey	DUPLICATION
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	17	GARIN4 (ENSCSAG00000000263)	BATF3 (ENSCSAG00000015412)	NSL1 (ENSCSAG00000015419)	TATDN3 (ENSCSAG00000015424)	ENSCSAG00000015430	FLVCR1 (ENSCSAG00000015440)	VASH2 (ENSCSAG00000015494)	ANGEL2 (ENSCSAG00000015513)	RPS6KC1 (ENSCSAG00000015524)	PROX1 (ENSCSAG00000015530)	SMYD2 (ENSCSAG00000015537)	PTPN14 (ENSCSAG00000015544)	CENPF (ENSCSAG00000015553)	KCNK2 (ENSCSAG00000015559)	ENSCSAG00000000264	ENSCSAG00000015567 #22	KCTD3 (ENSCSAG00000015574)	USH2A (ENSCSAG00000015644)	ESRRG (ENSCSAG00000015679)	ENSCSAG00000015701	ENSCSAG00000015704	SPATA17 (ENSCSAG00000015709)	RRP15 (ENSCSAG00000015713)	TGFB2 (ENSCSAG00000015715)	ENSCSAG00000015738	LYPLAL1 (ENSCSAG00000015750)	SLC30A10 (ENSCSAG00000015760)	EPRS1 (ENSCSAG00000015776)	BPNT1 (ENSCSAG00000015787)	IARS2 (ENSCSAG00000015833)	RAB3GAP2 (ENSCSAG00000015853)
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	15	PITX1 (ENSCSAG00000013399)	CATSPER3 (ENSCSAG00000013421)	PCBD2 (ENSCSAG00000013439)	TXNDC15 (ENSCSAG00000013446)	ENSCSAG00000013451	CAMLG (ENSCSAG00000013460)	SEC24A (ENSCSAG00000013554)	SAR1B (ENSCSAG00000013578)	JADE2 (ENSCSAG00000013584)	CDKN2AIPNL (ENSCSAG00000013589)	UBE2B (ENSCSAG00000013595)	CDKL3 (ENSCSAG00000013620)	PPP2CA (ENSCSAG00000013631)	ENSCSAG00000013640	TCF7 (ENSCSAG00000013646)	VDAC1 (ENSCSAG00000013649) #22	C5orf15 (ENSCSAG00000013652)	FSTL4 (ENSCSAG00000013659)	HSPA4 (ENSCSAG00000013669)	ZCCHC10 (ENSCSAG00000013673)	AFF4 (ENSCSAG00000013682)	LEAP2 (ENSCSAG00000013689)	UQCRQ (ENSCSAG00000013694)	GDF9 (ENSCSAG00000013696)	SHROOM1 (ENSCSAG00000013700)	SOWAHA (ENSCSAG00000000503)	SEPTIN8 (ENSCSAG00000013705)	CCNI2 (ENSCSAG00000013715)	KIF3A (ENSCSAG00000013749)	IL4 (ENSCSAG00000013765)	IL13 (ENSCSAG00000013781)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.tb #22
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.tb #22
Marmoset	DUPLICATION
Marmoset	MODERN SPECIES	11	ZNF354C (ENSCJAG00000086065)	ZNF879 (ENSCJAG00000018904)	GRM6 (ENSCJAG00000018865)	ZNF454 (ENSCJAG00000018857)	ZNF354B (ENSCJAG00000018848)	MGAT1 (ENSCJAG00000046208)	ZFP62 (ENSCJAG00000018839)	BTNL9 (ENSCJAG00000018803)	RACK1 (ENSCJAG00000018752)	TRIM41 (ENSCJAG00000018733)	TRIM7 (ENSCJAG00000018704)	ENSCJAG00000066969	PPP2CA (ENSCJAG00000045966)	ENSCJAG00000067181	TCF7 (ENSCJAG00000013603)	ENSCJAG00000013556 #22	C5orf15 (ENSCJAG00000013543)	FSTL4 (ENSCJAG00000013506)	HSPA4 (ENSCJAG00000013384)	ENSCJAG00000013378	ZCCHC10 (ENSCJAG00000047052)	AFF4 (ENSCJAG00000013322)	LEAP2 (ENSCJAG00000046560)	UQCRQ (ENSCJAG00000080204)	GDF9 (ENSCJAG00000013297)	SHROOM1 (ENSCJAG00000013275)	SOWAHA (ENSCJAG00000013269)	SEPTIN8 (ENSCJAG00000013225)	CCNI2 (ENSCJAG00000013222)	KIF3A (ENSCJAG00000013116)	IL4 (ENSCJAG00000013083)
Marmoset	MODERN SPECIES	2	SMCO4 (ENSCJAG00000045722)	CEP295 (ENSCJAG00000003748)	TAF1D (ENSCJAG00000003782)	ENSCJAG00000084182	MED17 (ENSCJAG00000003839)	VSTM5 (ENSCJAG00000003861)	HEPHL1 (ENSCJAG00000003906)	PANX1 (ENSCJAG00000003952)	IZUMO1R (ENSCJAG00000003960)	GPR83 (ENSCJAG00000003972)	MRE11 (ENSCJAG00000003984)	ANKRD49 (ENSCJAG00000083691)	C11orf97 (ENSCJAG00000087393)	FUT4 (ENSCJAG00000074794)	PIWIL4 (ENSCJAG00000004075)	ENSCJAG00000065220 #22	ENSCJAG00000070716	AMOTL1 (ENSCJAG00000004124)	CWC15 (ENSCJAG00000040352)	KDM4D (ENSCJAG00000023319)	ENSCJAG00000072491	ENDOD1 (ENSCJAG00000039825)	ENSCJAG00000004220	FAM76B (ENSCJAG00000040122)	CEP57 (ENSCJAG00000004281)	MTMR2 (ENSCJAG00000004327)	MAML2 (ENSCJAG00000004359)	CCDC82 (ENSCJAG00000004365)	JRKL (ENSCJAG00000043270)	ENSCJAG00000069774	ENSCJAG00000074166
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.tb #22
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	115	BTLA (ENSSBOG00000025065)	ENSSBOG00000034078	CD200 (ENSSBOG00000027816)	SLC9C1 (ENSSBOG00000011995)	GCSAM (ENSSBOG00000023001)	ENSSBOG00000028628	TMPRSS7 (ENSSBOG00000033131)	TAGLN3 (ENSSBOG00000029984)	ABHD10 (ENSSBOG00000009312)	PHLDB2 (ENSSBOG00000015415)	CD96 (ENSSBOG00000026911)	NECTIN3 (ENSSBOG00000019099)	ENSSBOG00000029122	ENSSBOG00000029864	ENSSBOG00000020150	ENSSBOG00000023328 #22	ENSSBOG00000018559
Capuchin	MODERN SPECIES	478				SIMC1 (ENSCCAG00000029674)	KIAA1191 (ENSCCAG00000036363)	ARL10 (ENSCCAG00000032554)	ENSCCAG00000020691	ENSCCAG00000031161	CLTB (ENSCCAG00000036858)	FAF2 (ENSCCAG00000035052)	RNF44 (ENSCCAG00000024456)	CDHR2 (ENSCCAG00000033098)	SNCB (ENSCCAG00000021013)	EIF4E1B (ENSCCAG00000008488)	TSPAN17 (ENSCCAG00000028954)	ENSCCAG00000024114 #22	UNC5A (ENSCCAG00000036150)	HK3 (ENSCCAG00000027550)	UIMC1 (ENSCCAG00000030824)	ENSCCAG00000023454	ZNF346 (ENSCCAG00000025324)	FGFR4 (ENSCCAG00000026258)	NSD1 (ENSCCAG00000031074)	ENSCCAG00000028199	ENSCCAG00000036708	RAB24 (ENSCCAG00000032754)	PRELID1 (ENSCCAG00000017920)	MXD3 (ENSCCAG00000026342)	LMAN2 (ENSCCAG00000032831)	RGS14 (ENSCCAG00000031951)	SLC34A1 (ENSCCAG00000030954)
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996.f	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499.r	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029.q	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Bushbaby	DUPLICATION
Bushbaby	MODERN SPECIES	118	ENSOGAG00000034689	DPYSL3 (ENSOGAG00000013863)	STK32A (ENSOGAG00000013862)	PPP2R2B (ENSOGAG00000010873)	GPR151 (ENSOGAG00000009575)	TCERG1 (ENSOGAG00000025674)	POU4F3 (ENSOGAG00000026756)	RBM27 (ENSOGAG00000008758)	LARS1 (ENSOGAG00000008750)	SH3RF2 (ENSOGAG00000010029)	GRXCR2 (ENSOGAG00000010027)	PRELID2 (ENSOGAG00000010025)	KCTD16 (ENSOGAG00000001547)	ENSOGAG00000002243	YIPF5 (ENSOGAG00000001543)	ENSOGAG00000025196 #22	NR3C1 (ENSOGAG00000003356)	ENSOGAG00000011397	ENSOGAG00000024728	FGF1 (ENSOGAG00000005081)	SPRY4 (ENSOGAG00000005080)	NDFIP1 (ENSOGAG00000015910)	GNPDA1 (ENSOGAG00000007303)	RNF14 (ENSOGAG00000003535)	PCDH12 (ENSOGAG00000029106)	DELE1 (ENSOGAG00000003528)	PCDH1 (ENSOGAG00000032935)	ARAP3 (ENSOGAG00000030775)	FCHSD1 (ENSOGAG00000032557)	RELL2 (ENSOGAG00000000607)	HDAC3 (ENSOGAG00000000605)
Bushbaby	MODERN SPECIES	118	ENSOGAG00000028757	PITX1 (ENSOGAG00000033052)	TXNDC15 (ENSOGAG00000011697)	C5orf24 (ENSOGAG00000011696)	ENSOGAG00000011690	CAMLG (ENSOGAG00000003580)	SEC24A (ENSOGAG00000013354)	SAR1B (ENSOGAG00000013347)	JADE2 (ENSOGAG00000016300)	ENSOGAG00000024120	UBE2B (ENSOGAG00000016291)	CDKL3 (ENSOGAG00000016285)	PPP2CA (ENSOGAG00000009695)	SKP1 (ENSOGAG00000028707)	TCF7 (ENSOGAG00000024343)	ENSOGAG00000030742 #22	C5orf15 (ENSOGAG00000001273)	FSTL4 (ENSOGAG00000010492)	HSPA4 (ENSOGAG00000006501)	ZCCHC10 (ENSOGAG00000032171)	AFF4 (ENSOGAG00000028482)	LEAP2 (ENSOGAG00000009438)	UQCRQ (ENSOGAG00000009436)	GDF9 (ENSOGAG00000009434)	SHROOM1 (ENSOGAG00000015519)	SOWAHA (ENSOGAG00000024323)	ENSOGAG00000028706	SEPTIN8 (ENSOGAG00000015514)	ENSOGAG00000031380 #18	KIF3A (ENSOGAG00000015508)	IL4 (ENSOGAG00000015507)
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996.f	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499.r	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029.q	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Mouse lemur	MODERN SPECIES	10	PCBD2 (ENSMICG00000041651)	TXNDC15 (ENSMICG00000043867)	C5orf24 (ENSMICG00000046739)	ENSMICG00000036509	DDX46 (ENSMICG00000028626)	CAMLG (ENSMICG00000011682)	SEC24A (ENSMICG00000011650)	SAR1B (ENSMICG00000011638)	JADE2 (ENSMICG00000032137)	ENSMICG00000028986	UBE2B (ENSMICG00000047998)	CDKL3 (ENSMICG00000004579)	PPP2CA (ENSMICG00000045630)	SKP1 (ENSMICG00000030106)	TCF7 (ENSMICG00000017587)	VDAC1 (ENSMICG00000014715) #22	C5orf15 (ENSMICG00000047659)	ENSMICG00000033662	FSTL4 (ENSMICG00000007423)	HSPA4 (ENSMICG00000012231)	ENSMICG00000044154	ENSMICG00000002753	LEAP2 (ENSMICG00000028746)	UQCRQ (ENSMICG00000041653)	GDF9 (ENSMICG00000032249)	SHROOM1 (ENSMICG00000041567)	SOWAHA (ENSMICG00000030974)	SEPTIN8 (ENSMICG00000012498)	CCNI2 (ENSMICG00000045266)	KIF3A (ENSMICG00000012476)	IL4 (ENSMICG00000012471)
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996.f	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499.r	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029.q	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	725	CATSPER3 (ENSPSMG00000021100)	PCBD2 (ENSPSMG00000021087)	TXNDC15 (ENSPSMG00000021083)	C5orf24 (ENSPSMG00000021080)	DDX46 (ENSPSMG00000021031)	CAMLG (ENSPSMG00000020923)	SEC24A (ENSPSMG00000020890)	SAR1B (ENSPSMG00000020738)	JADE2 (ENSPSMG00000020658)	CDKN2AIPNL (ENSPSMG00000020559)	ENSPSMG00000020551	CDKL3 (ENSPSMG00000020528)	ENSPSMG00000020480	SKP1 (ENSPSMG00000020450)	TCF7 (ENSPSMG00000020435)	VDAC1 (ENSPSMG00000020419) #22	C5orf15 (ENSPSMG00000020399)
Coquerels sifaka	DUPLICATION
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	496	CATSPER3 (ENSPCOG00000025032)	PCBD2 (ENSPCOG00000021501)	TXNDC15 (ENSPCOG00000021382)	C5orf24 (ENSPCOG00000024715)	DDX46 (ENSPCOG00000018969)	ENSPCOG00000015224	ENSPCOG00000026348	ENSPCOG00000013207	JADE2 (ENSPCOG00000018172)	CDKN2AIPNL (ENSPCOG00000023139)	UBE2B (ENSPCOG00000022801)	CDKL3 (ENSPCOG00000024912)	PPP2CA (ENSPCOG00000024928)	SKP1 (ENSPCOG00000017179)	TCF7 (ENSPCOG00000028391)	ENSPCOG00000021763 #22	C5orf15 (ENSPCOG00000018490)	FSTL4 (ENSPCOG00000018355)	HSPA4 (ENSPCOG00000028098)	ZCCHC10 (ENSPCOG00000020856)	AFF4 (ENSPCOG00000023876)	LEAP2 (ENSPCOG00000013787)	ENSPCOG00000021192	GDF9 (ENSPCOG00000020827)	SHROOM1 (ENSPCOG00000028398)	SOWAHA (ENSPCOG00000013631)	SEPTIN8 (ENSPCOG00000020927)	ENSPCOG00000021867	KIF3A (ENSPCOG00000027391)	IL4 (ENSPCOG00000020620)	IL13 (ENSPCOG00000016239)
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	989															CLNK (ENSPCOG00000023334)	ENSPCOG00000014601 #22	ENSPCOG00000018039	WDR1 (ENSPCOG00000025097)	ENSPCOG00000028835	SH3RF3 (ENSPCOG00000013390)	EDAR (ENSPCOG00000022448)	CCDC138 (ENSPCOG00000007075)	RANBP2 (ENSPCOG00000008879)	ENSPCOG00000021714	ENSPCOG00000027638	GCC2 (ENSPCOG00000025181)	SULT1C4 (ENSPCOG00000017230)	SULT1C3 (ENSPCOG00000025335)	SLC5A7 (ENSPCOG00000008283)	ST6GAL2 (ENSPCOG00000018654)	UXS1 (ENSPCOG00000007831)
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00390000012652.ab.a	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000154518.a	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT01090000260575	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156068	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000018781
Sloth	MODERN SPECIES	1303																VDAC1 (ENSCHOG00000005631) #22	C5orf15 (ENSCHOG00000005627)
Armadillo	MODERN SPECIES	3458	PITX1 (ENSDNOG00000034587)	CATSPER3 (ENSDNOG00000012508)	PCBD2 (ENSDNOG00000044959)	TXNDC15 (ENSDNOG00000017904)	C5orf24 (ENSDNOG00000034721)	DDX46 (ENSDNOG00000011448)	CAMLG (ENSDNOG00000017271)	ENSDNOG00000013795	SAR1B (ENSDNOG00000044440)	JADE2 (ENSDNOG00000045101)	CDKN2AIPNL (ENSDNOG00000044441)	UBE2B (ENSDNOG00000015719)	PPP2CA (ENSDNOG00000013011)	ENSDNOG00000012999	TCF7 (ENSDNOG00000012979)	VDAC1 (ENSDNOG00000045241) #22	ENSDNOG00000023901	ENSDNOG00000035042	ENSDNOG00000017743
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00390000012652.ab.a	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499
Tenrec	MODERN SPECIES	1514																ENSETEG00000016337 #22	ENSETEG00000016335
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00390000012652.ab.a	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499
Hyrax	MODERN SPECIES	7250																VDAC1 (ENSPCAG00000010064) #22
Elephant	MODERN SPECIES	2	CATSPER3 (ENSLAFG00000008372)	PCBD2 (ENSLAFG00000008369)	TXNDC15 (ENSLAFG00000008364)	C5orf24 (ENSLAFG00000010469)	DDX46 (ENSLAFG00000010465)	CAMLG (ENSLAFG00000005101)	SEC24A (ENSLAFG00000005093)	SAR1B (ENSLAFG00000001021)	JADE2 (ENSLAFG00000001018)	CDKN2AIPNL (ENSLAFG00000011476)	UBE2B (ENSLAFG00000021714)	CDKL3 (ENSLAFG00000011468)	PPP2CA (ENSLAFG00000016840)	ENSLAFG00000016832	TCF7 (ENSLAFG00000016828)	VDAC1 (ENSLAFG00000028818) #22	C5orf15 (ENSLAFG00000015697)	KCNN2 (ENSLAFG00000010788)	TRIM36 (ENSLAFG00000003749)	PGGT1B (ENSLAFG00000003752)	CCDC112 (ENSLAFG00000003761)	FEM1C (ENSLAFG00000005712)	TMED7 (ENSLAFG00000032184)	CDO1 (ENSLAFG00000015304)	ATG12 (ENSLAFG00000015307)	ENSLAFG00000015311	LVRN (ENSLAFG00000002068)	ARL14EPL (ENSLAFG00000032735)	COMMD10 (ENSLAFG00000011885)	ENSLAFG00000027553	SEMA6A (ENSLAFG00000004387)
Marsupialia	DUPLICATION
Marsupialia	DUPLICATION
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580.q.a	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.bd.a #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT01010000222666	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000016991	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000003225	ENSGT00940000156386
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580.q.a	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.bd.a #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT01010000222666	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000016991	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000003225	ENSGT00940000156386
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580.q.a	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.bd.a #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000016991	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000003225	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000156068.a	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580.q.a	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.bd.a #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000158652	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000016991	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000003225	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000156068.a
koala	MODERN SPECIES	41	TIFAB (ENSPCIG00000015898)	ENSPCIG00000015900	PITX1 (ENSPCIG00000006623)	CATSPER3 (ENSPCIG00000009633)	TXNDC15 (ENSPCIG00000009213)	DDX46 (ENSPCIG00000009215)	CAMLG (ENSPCIG00000032820)	SEC24A (ENSPCIG00000014097)	SAR1B (ENSPCIG00000014092)	JADE2 (ENSPCIG00000014090)	CDKN2AIPNL (ENSPCIG00000034137)	ENSPCIG00000021861	CDKL3 (ENSPCIG00000021862)	SKP1 (ENSPCIG00000021864)	ENSPCIG00000021868	ENSPCIG00000027455 #22	C5orf15 (ENSPCIG00000021870)	FSTL4 (ENSPCIG00000000975)	RAPGEF6 (ENSPCIG00000001038)	FNIP1 (ENSPCIG00000013462)	ENSPCIG00000013466	ENSPCIG00000013467	ENSPCIG00000013616	ENSPCIG00000007531	P4HA2 (ENSPCIG00000001023)	ENSPCIG00000007200	ENSPCIG00000000988	PDLIM4 (ENSPCIG00000000968)	ENSPCIG00000000667	ENSPCIG00000000632	IRF1 (ENSPCIG00000000595)
Opossum	MODERN SPECIES		MACROH2A1 (ENSMODG00000014397)	PITX1 (ENSMODG00000048877)	PCBD2 (ENSMODG00000038053)	TXNDC15 (ENSMODG00000047885)	C5orf24 (ENSMODG00000014344)	DDX46 (ENSMODG00000014331)	CAMLG (ENSMODG00000036964)	SEC24A (ENSMODG00000014243)	SAR1B (ENSMODG00000014227)	JADE2 (ENSMODG00000014214)	ENSMODG00000050873	UBE2B (ENSMODG00000014209)	CDKL3 (ENSMODG00000014201)	PPP2CA (ENSMODG00000014168)	TCF7 (ENSMODG00000014163)	VDAC1 (ENSMODG00000014157) #22	ENSMODG00000039397	FSTL4 (ENSMODG00000014139)	RAPGEF6 (ENSMODG00000014131)	ENSMODG00000044825	FNIP1 (ENSMODG00000014112)	ENSMODG00000027692	ENSMODG00000045591	ENSMODG00000014079	P4HA2 (ENSMODG00000014035)	ENSMODG00000037056	ENSMODG00000051448	ENSMODG00000027953	ENSMODG00000039876	PDLIM4 (ENSMODG00000013984)	ENSMODG00000013979
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.bd.b #22
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.bd.b #22
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.bd.b #22
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.bd.b #22
Common wonbat	MODERN SPECIES	455	CATSPER3 (ENSVURG00010007695)	PCBD2 (ENSVURG00010007681)	TXNDC15 (ENSVURG00010007674)	C5orf24 (ENSVURG00010007665)	DDX46 (ENSVURG00010007646)	CAMLG (ENSVURG00010007616)	SEC24A (ENSVURG00010007591)	SAR1B (ENSVURG00010007582)	JADE2 (ENSVURG00010007533)	CDKN2AIPNL (ENSVURG00010007514)	ENSVURG00010007506	CDKL3 (ENSVURG00010007497)	PPP2CA (ENSVURG00010007475)	SKP1 (ENSVURG00010007470)	TCF7 (ENSVURG00010007461)	ENSVURG00010007449 #22	C5orf15 (ENSVURG00010007442)	FSTL4 (ENSVURG00010007022)	RAPGEF6 (ENSVURG00010006926)	FNIP1 (ENSVURG00010006887)	ENSVURG00010006181	P4HA2 (ENSVURG00010006006)	ENSVURG00010005959	PDLIM4 (ENSVURG00010005944)	ENSVURG00010005895	ENSVURG00010005882	IRF1 (ENSVURG00010005871)	IL5 (ENSVURG00010005850)	RAD50 (ENSVURG00010005808)	ENSVURG00010005777	KIF3A (ENSVURG00010005711)
koala	MODERN SPECIES	335														ENSPCIG00000014150	ENSPCIG00000009978	ENSPCIG00000012418 #22	ENSPCIG00000001930	ENSPCIG00000024696	ENSPCIG00000009307	ENSPCIG00000005393	ENSPCIG00000010134
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.cd #22
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.cd #22
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	1	MACROH2A1 (ENSSHAG00000009340)	PITX1 (ENSSHAG00000013488)	CATSPER3 (ENSSHAG00000024193)	ENSSHAG00000025610	ENSSHAG00000014172	DDX46 (ENSSHAG00000014408)	CAMLG (ENSSHAG00000014673)	SEC24A (ENSSHAG00000014775)	SAR1B (ENSSHAG00000014991)	JADE2 (ENSSHAG00000020756)	ENSSHAG00000023696	CDKL3 (ENSSHAG00000016286)	PPP2CA (ENSSHAG00000016632)	SKP1 (ENSSHAG00000027320)	ENSSHAG00000016841	VDAC1 (ENSSHAG00000017502) #22	C5orf15 (ENSSHAG00000023664)	ENSSHAG00000025310	ENSSHAG00000018710	ENSSHAG00000006253	ENSSHAG00000003849	ENSSHAG00000006580	ENSSHAG00000007755	ENSSHAG00000024165	P4HA2 (ENSSHAG00000002885)	ENSSHAG00000029069	ENSSHAG00000027627	PDLIM4 (ENSSHAG00000005332)	ENSSHAG00000021482	ENSSHAG00000023817	ENSSHAG00000009209
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.cd #22
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182869.e.a.b.cd #22
Common wonbat	MODERN SPECIES	1012	ENSVURG00010008289	ENSVURG00010008299	PROK2 (ENSVURG00010008305)	RYBP (ENSVURG00010008342)	SHQ1 (ENSVURG00010008402)	ENSVURG00010008413	GXYLT2 (ENSVURG00010008424)	PPP4R2 (ENSVURG00010008448)	ENSVURG00010008462	PDZRN3 (ENSVURG00010008505)	ENSVURG00010008548	CNTN3 (ENSVURG00010008586)	CHL1 (ENSVURG00010008642)	ENSVURG00010008727	CNTN6 (ENSVURG00010008756)	ENSVURG00010008843 #22	ENSVURG00010008854	CNTN4 (ENSVURG00010008887)	IL5RA (ENSVURG00010008982)	TRNT1 (ENSVURG00010008997)	CRBN (ENSVURG00010009020)	LRRN1 (ENSVURG00010009042)	ENSVURG00010009062	SUMF1 (ENSVURG00010009079)	ITPR1 (ENSVURG00010009114)	BHLHE40 (ENSVURG00010009249)	ARL8B (ENSVURG00010009259)	EDEM1 (ENSVURG00010009274)	ENSVURG00010009302	ENSVURG00010009325	GRM7 (ENSVURG00010009382)
Platypus	MODERN SPECIES	84	ENSOANG00000039928	ENSOANG00000046337	TXNDC15 (ENSOANG00000013063)	ENSOANG00000037036	DDX46 (ENSOANG00000001842)	CAMLG (ENSOANG00000001840)	SEC24A (ENSOANG00000001838)	SAR1B (ENSOANG00000001245)	JADE2 (ENSOANG00000010024)	CDKN2AIPNL (ENSOANG00000037080)	UBE2B (ENSOANG00000050341)	CDKL3 (ENSOANG00000000233)	PPP2CA (ENSOANG00000037764)	SKP1 (ENSOANG00000048044)	ENSOANG00000040939	VDAC1 (ENSOANG00000013490) #22	ENSOANG00000045927	FSTL4 (ENSOANG00000013403)	RAPGEF6 (ENSOANG00000006961)	FNIP1 (ENSOANG00000009212)	ENSOANG00000030428	ENSOANG00000009215	P4HA2 (ENSOANG00000005598)	PDLIM4 (ENSOANG00000040872)	ENSOANG00000007236	ENSOANG00000007233	IRF1 (ENSOANG00000036485)	ENSOANG00000040098	RAD50 (ENSOANG00000008019)	KIF3A (ENSOANG00000007422)	ENSOANG00000007421
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000013108	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156068
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00960000189568	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000013108	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000162679
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00960000189568	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000018781	ENSGT00950000185731	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000162679
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00960000189568	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000018781	ENSGT00950000185731	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156068
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155.lb.a	ENSGT00940000154155.mb	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000018781	ENSGT00950000185731	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156068
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	306	PITX1 (ENSTMTG00000021296)	PCBD2 (ENSTMTG00000021293)	TXNDC15 (ENSTMTG00000021288)	C5orf24 (ENSTMTG00000021283)	DDX46 (ENSTMTG00000021134)	CAMLG (ENSTMTG00000021110)	SEC24A (ENSTMTG00000021102)	SAR1B (ENSTMTG00000021093)	JADE2 (ENSTMTG00000021073)	CDKN2AIPNL (ENSTMTG00000021068)	UBE2B (ENSTMTG00000021063)	CDKL3 (ENSTMTG00000021054)	PPP2CA (ENSTMTG00000021047)	SKP1 (ENSTMTG00000021043)	TCF7 (ENSTMTG00000021039)	VDAC1 (ENSTMTG00000021034) #22	C5orf15 (ENSTMTG00000021029)	FSTL4 (ENSTMTG00000020998)	RAPGEF6 (ENSTMTG00000018189)	FNIP1 (ENSTMTG00000017988)	ENSTMTG00000017044	P4HA2 (ENSTMTG00000016163)	PDLIM4 (ENSTMTG00000016084)	ENSTMTG00000016007	ENSTMTG00000015908	IRF1 (ENSTMTG00000015881)	RAD50 (ENSTMTG00000014874)	KIF3A (ENSTMTG00000014795)	CCNI2 (ENSTMTG00000014786)	SEPTIN8 (ENSTMTG00000014763)	SOWAHA (ENSTMTG00000014745)
painted turtle	MODERN SPECIES	2383	MAGI1 (ENSCPBG00000026871)	ENSCPBG00000026862	ENSCPBG00000026851	PRICKLE2 (ENSCPBG00000026844)	PSMD6 (ENSCPBG00000026839)	ATXN7 (ENSCPBG00000026836)	ENSCPBG00000026835	THOC7 (ENSCPBG00000026834)	SNTN (ENSCPBG00000026833)	SYNPR (ENSCPBG00000026830)	ENSCPBG00000025971	FEZF2 (ENSCPBG00000025918)	C3orf14 (ENSCPBG00000025917)	PTPRG (ENSCPBG00000025269)	ENSCPBG00000025159	VDAC1 (ENSCPBG00000025152) #22	C5orf15 (ENSCPBG00000025151)	FSTL4 (ENSCPBG00000025147)	RAPGEF6 (ENSCPBG00000025142)	FNIP1 (ENSCPBG00000025137)	ENSCPBG00000025128	P4HA2 (ENSCPBG00000025117)
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00960000189568	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000018781	ENSGT00950000185731	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156068
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	22	PITX1 (ENSGEVG00005006852)	CATSPER3 (ENSGEVG00005006893)	TXNDC15 (ENSGEVG00005006986)	C5orf24 (ENSGEVG00005007023)	DDX46 (ENSGEVG00005007169)	CAMLG (ENSGEVG00005007877)	SEC24A (ENSGEVG00005007906)	SAR1B (ENSGEVG00005007964)	JADE2 (ENSGEVG00005007986)	CDKN2AIPNL (ENSGEVG00005008010)	UBE2B (ENSGEVG00005008019)	CDKL3 (ENSGEVG00005008046)	PPP2CA (ENSGEVG00005008076)	SKP1 (ENSGEVG00005008099)	TCF7 (ENSGEVG00005008118)	VDAC1 (ENSGEVG00005008146) #22	C5orf15 (ENSGEVG00005008167)	FSTL4 (ENSGEVG00005008216)	ENSGEVG00005008336	RAPGEF6 (ENSGEVG00005008382)	FNIP1 (ENSGEVG00005008570)	ENSGEVG00005008614	P4HA2 (ENSGEVG00005008755)	PDLIM4 (ENSGEVG00005009408)	ENSGEVG00005009511	IRF1 (ENSGEVG00005009584)	RAD50 (ENSGEVG00005009615)	KIF3A (ENSGEVG00005009678)	CCNI2 (ENSGEVG00005009749)	SEPTIN8 (ENSGEVG00005009791)	SOWAHA (ENSGEVG00005009935)
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	953					DDX46 (ENSCABG00000006511)	CAMLG (ENSCABG00000006503)	SEC24A (ENSCABG00000004683)	SAR1B (ENSCABG00000004640)	JADE2 (ENSCABG00000004632)	CDKN2AIPNL (ENSCABG00000004630)	UBE2B (ENSCABG00000004629)	CDKL3 (ENSCABG00000004624)	PPP2CA (ENSCABG00000004622)	SKP1 (ENSCABG00000004621)	TCF7 (ENSCABG00000004619)	VDAC1 (ENSCABG00000004611) #22	C5orf15 (ENSCABG00000004608)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	525	CATSPER3 (ENSPSIG00000004301)	PCBD2 (ENSPSIG00000004411)	TXNDC15 (ENSPSIG00000004419)	C5orf24 (ENSPSIG00000004507)	DDX46 (ENSPSIG00000004522)	CAMLG (ENSPSIG00000004577)	SEC24A (ENSPSIG00000004594)	SAR1B (ENSPSIG00000004800)	JADE2 (ENSPSIG00000004841)	CDKN2AIPNL (ENSPSIG00000004956)	UBE2B (ENSPSIG00000004966)	CDKL3 (ENSPSIG00000004969)	PPP2CA (ENSPSIG00000004984)	SKP1 (ENSPSIG00000004991)	TCF7 (ENSPSIG00000004998)	VDAC1 (ENSPSIG00000005127) #22	C5orf15 (ENSPSIG00000005135)	ENSPSIG00000000038	FSTL4 (ENSPSIG00000005140)	ENSPSIG00000000039	RAPGEF6 (ENSPSIG00000005204)	FNIP1 (ENSPSIG00000005471)	ENSPSIG00000005641	ENSPSIG00000005667
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00960000189568	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000013108	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000162679
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	34	CATSPER3 (ENSCPRG00005010812)	PCBD2 (ENSCPRG00005010811)	TXNDC15 (ENSCPRG00005010809)	C5orf24 (ENSCPRG00005010806)	DDX46 (ENSCPRG00005010752)	CAMLG (ENSCPRG00005010742)	SEC24A (ENSCPRG00005010507)	ENSCPRG00005010444	JADE2 (ENSCPRG00005010436)	CDKN2AIPNL (ENSCPRG00005010431)	UBE2B (ENSCPRG00005010425)	CDKL3 (ENSCPRG00005010415)	PPP2CA (ENSCPRG00005010409)	SKP1 (ENSCPRG00005010404)	TCF7 (ENSCPRG00005010397)	VDAC1 (ENSCPRG00005010381) #22	FSTL4 (ENSCPRG00005010357)	RAPGEF6 (ENSCPRG00005010295)	FNIP1 (ENSCPRG00005010267)	ENSCPRG00005010222	P4HA2 (ENSCPRG00005009472)	PDLIM4 (ENSCPRG00005009404)	ENSCPRG00005009387	IRF1 (ENSCPRG00005009375)	ENSCPRG00005009369	RAD50 (ENSCPRG00005008628)	ENSCPRG00005008547	KIF3A (ENSCPRG00005008523)	CCNI2 (ENSCPRG00005008513)	SEPTIN8 (ENSCPRG00005008502)	ENSCPRG00005008491
Aves	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000154518.a	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00960000189568	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT01030000235545	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT01030000235516	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000013108
African ostrich	MODERN SPECIES	182										JADE2 (ENSSCUG00000002659)	UBE2B (ENSSCUG00000002654)	CDKL3 (ENSSCUG00000002652)	PPP2CA (ENSSCUG00000002646)	SKP1 (ENSSCUG00000002644)	ENSSCUG00000002641	VDAC1 (ENSSCUG00000002638) #22	C5orf15 (ENSSCUG00000002634)	FSTL4 (ENSSCUG00000002618)	RAPGEF6 (ENSSCUG00000002405)	FNIP1 (ENSSCUG00000002340)	ENSSCUG00000002339	ENSSCUG00000002337	ENSSCUG00000002333	P4HA2 (ENSSCUG00000002331)	PDLIM4 (ENSSCUG00000002328)	ENSSCUG00000002326	ENSSCUG00000002318	IRF1 (ENSSCUG00000002314)	ENSSCUG00000002306	RAD50 (ENSSCUG00000002300)	ENSSCUG00000002296
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000159541	ENSGT00940000154518.a	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00960000189568	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00610000087493	ENSGT01030000235545	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT01030000235516	ENSGT00390000018781
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000162170	ENSGT00940000159541	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00610000087493	ENSGT01030000235545	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT01030000235516	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000013108.b
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000159541	ENSGT00940000154518.a	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00610000087493	ENSGT01030000235545	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT01030000235516	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000013108.b	ENSGT00940000169911
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	9	CXCL14 (ENSABRG00000005107)	MACROH2A1 (ENSABRG00000005120)	ENSABRG00000005145	PCBD2 (ENSABRG00000005148)	TXNDC15 (ENSABRG00000005150)	C5orf24 (ENSABRG00000005158)	DDX46 (ENSABRG00000005167)	CAMLG (ENSABRG00000005194)	SEC24A (ENSABRG00000005396)	SAR1B (ENSABRG00000011759)	JADE2 (ENSABRG00000011766)	UBE2B (ENSABRG00000011776)	PPP2CA (ENSABRG00000011781)	SKP1 (ENSABRG00000011783)	TCF7 (ENSABRG00000011798)	VDAC1 (ENSABRG00000011834) #22	C5orf15 (ENSABRG00000011842)	FSTL4 (ENSABRG00000011873)	RAPGEF6 (ENSABRG00000012009)	FNIP1 (ENSABRG00000012140)	ENSABRG00000013109	ENSABRG00000016183	ENSABRG00000016190	P4HA2 (ENSABRG00000016204)	PDLIM4 (ENSABRG00000016232)	ENSABRG00000016241	ENSABRG00000016247	IRF1 (ENSABRG00000016253)	ENSABRG00000016256	RAD50 (ENSABRG00000016258)	ENSABRG00000016274
Duck	MODERN SPECIES	5	NEUROG1 (ENSAPLG00000031251)	MACROH2A1 (ENSAPLG00000005243)	PITX1 (ENSAPLG00000028077)	PCBD2 (ENSAPLG00000013164)	TXNDC15 (ENSAPLG00000017719)	C5orf24 (ENSAPLG00000001548)	DDX46 (ENSAPLG00000013208)	CAMLG (ENSAPLG00000013700)	ENSAPLG00000013847	SAR1B (ENSAPLG00000007369)	JADE2 (ENSAPLG00000014696)	UBE2B (ENSAPLG00000014846)	PPP2CA (ENSAPLG00000014864)	SKP1 (ENSAPLG00000015147)	TCF7 (ENSAPLG00000015177)	VDAC1 (ENSAPLG00000015267) #22	C5orf15 (ENSAPLG00000016800)	FSTL4 (ENSAPLG00000015488)	RAPGEF6 (ENSAPLG00000015846)	FNIP1 (ENSAPLG00000002569)	ENSAPLG00000002999	ENSAPLG00000024780	ENSAPLG00000023893	P4HA2 (ENSAPLG00000003370)	PDLIM4 (ENSAPLG00000003185)	ENSAPLG00000009155	ENSAPLG00000009189	ENSAPLG00000019991	RAD50 (ENSAPLG00000011856)	ENSAPLG00000011854	KIF3A (ENSAPLG00000011529)
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000162170	ENSGT00940000159541	ENSGT01070000257270	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499.v	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00610000087492	ENSGT00610000087493	ENSGT01030000235545	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT01030000235516	ENSGT00390000018781
Japanese quail	MODERN SPECIES	4	NEUROG1 (ENSCJPG00005005172)	MACROH2A1 (ENSCJPG00005005171)	PITX1 (ENSCJPG00005005163)	PCBD2 (ENSCJPG00005005162)	TXNDC15 (ENSCJPG00005005159)	C5orf24 (ENSCJPG00005005156)	DDX46 (ENSCJPG00005005147)	CAMLG (ENSCJPG00005005143)	SEC24A (ENSCJPG00005005137)	SAR1B (ENSCJPG00005005136)	JADE2 (ENSCJPG00005005135)	UBE2B (ENSCJPG00005005133)	PPP2CA (ENSCJPG00005005132)	SKP1 (ENSCJPG00005005131)	TCF7 (ENSCJPG00005005130)	VDAC1 (ENSCJPG00005005127) #22	C5orf15 (ENSCJPG00005005126)	ENSCJPG00005005125	FSTL4 (ENSCJPG00005005120)	RAPGEF6 (ENSCJPG00005001231)	FNIP1 (ENSCJPG00005021191)	ENSCJPG00005020994	ENSCJPG00005020989	ENSCJPG00005020988	ENSCJPG00005020987	P4HA2 (ENSCJPG00005020986)	PDLIM4 (ENSCJPG00005020985)	ENSCJPG00005020984	ENSCJPG00005020983	IRF1 (ENSCJPG00005020982)	ENSCJPG00005020981
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000162170	ENSGT00940000159541	ENSGT01070000257270	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499.v	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00610000087492	ENSGT00610000087493	ENSGT01030000235545	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT01030000235516	ENSGT00390000018781
Chicken	MODERN SPECIES	4	PITX1 (ENSGALG00010012790)	PCBD2 (ENSGALG00010013121)	TXNDC15 (ENSGALG00010013133)	C5orf24 (ENSGALG00010013180)	DDX46 (ENSGALG00010013186)	CAMLG (ENSGALG00010013198)	SEC24A (ENSGALG00010013241)	SAR1B (ENSGALG00010013254)	JADE2 (ENSGALG00010013261)	ENSGALG00010012800	UBE2B (ENSGALG00010015848)	PPP2CA (ENSGALG00010015861)	SKP1 (ENSGALG00010015876)	TCF7 (ENSGALG00010015893)	ENSGALG00010015897	VDAC1 (ENSGALG00010017393) #22	C5orf15 (ENSGALG00010015910)	FSTL4 (ENSGALG00010015972)	RAPGEF6 (ENSGALG00010016017)	FNIP1 (ENSGALG00010016097)	MEIKIN (ENSGALG00010016117)	ENSGALG00010016127	CSF2 (ENSGALG00010016145)	IL3 (ENSGALG00010016157)	KK34 (ENSGALG00010016165)	P4HA2 (ENSGALG00010016225)	PDLIM4 (ENSGALG00010016266)	SLC22A4 (ENSGALG00010016281)	SLC22A5 (ENSGALG00010017398)	IRF1 (ENSGALG00010016289)	IL5 (ENSGALG00010016298)
Turkey	DUPLICATION
Turkey	MODERN SPECIES	6	ENSMGAG00000009019	KIF3A (ENSMGAG00000009022)	ENSMGAG00000008970	IRF1 (ENSMGAG00000008932)	ENSMGAG00000019134	ENSMGAG00000008873	ENSMGAG00000008855	ENSMGAG00000008781	ENSMGAG00000008782	ENSMGAG00000008785	ENSMGAG00000008789	ENSMGAG00000008698	ENSMGAG00000008646	ENSMGAG00000008561	ENSMGAG00000008511	ENSMGAG00000008470 #22	ENSMGAG00000021583 #22	ENSMGAG00000008458	ENSMGAG00000008392	ENSMGAG00000008416	ENSMGAG00000008406	ENSMGAG00000008372	ENSMGAG00000008340	ENSMGAG00000008295	ENSMGAG00000008283	ENSMGAG00000008226	ENSMGAG00000015456	ENSMGAG00000008211	ENSMGAG00000008370
Turkey	MODERN SPECIES	6	KIF3A (ENSMGAG00000009022)	ENSMGAG00000008970	IRF1 (ENSMGAG00000008932)	ENSMGAG00000019134	ENSMGAG00000008873	ENSMGAG00000008855	ENSMGAG00000008781	ENSMGAG00000008782	ENSMGAG00000008785	ENSMGAG00000008789	ENSMGAG00000008698	ENSMGAG00000008646	ENSMGAG00000008561	ENSMGAG00000008511	ENSMGAG00000008470 #22	ENSMGAG00000021583 #22	ENSMGAG00000008458	ENSMGAG00000008392	ENSMGAG00000008416	ENSMGAG00000008406	ENSMGAG00000008372	ENSMGAG00000008340	ENSMGAG00000008295	ENSMGAG00000008283	ENSMGAG00000008226	ENSMGAG00000015456	ENSMGAG00000008211	ENSMGAG00000008370
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000159541	ENSGT00940000154518.a	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00960000189568	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00610000087493	ENSGT01030000235545	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT01030000235516	ENSGT00390000018781
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000159541	ENSGT00940000154518.a	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00610000087493	ENSGT01030000235545	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT01030000235516	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000013108.b	ENSGT00940000169911
Kakapo	MODERN SPECIES	6	NEUROG1 (ENSSHBG00005007501)	MACROH2A1 (ENSSHBG00005007476)	PITX1 (ENSSHBG00005007456)	PCBD2 (ENSSHBG00005007449)	TXNDC15 (ENSSHBG00005007436)	C5orf24 (ENSSHBG00005007424)	DDX46 (ENSSHBG00005007082)	CAMLG (ENSSHBG00005007012)	SEC24A (ENSSHBG00005006963)	SAR1B (ENSSHBG00005006933)	JADE2 (ENSSHBG00005006895)	UBE2B (ENSSHBG00005006853)	PPP2CA (ENSSHBG00005006833)	SKP1 (ENSSHBG00005006814)	TCF7 (ENSSHBG00005006790)	VDAC1 (ENSSHBG00005006771) #22	C5orf15 (ENSSHBG00005006759)	FSTL4 (ENSSHBG00005006742)	RAPGEF6 (ENSSHBG00005006630)	FNIP1 (ENSSHBG00005005952)	ENSSHBG00005005846	ENSSHBG00005005830	P4HA2 (ENSSHBG00005005790)	PDLIM4 (ENSSHBG00005005762)	ENSSHBG00005005737	ENSSHBG00005005709	IRF1 (ENSSHBG00005005671)	RAD50 (ENSSHBG00005005627)	ENSSHBG00005005600	ENSSHBG00005005583	KIF3A (ENSSHBG00005005551)
Golden eagle	MODERN SPECIES	14	MACROH2A1 (ENSACCG00020016171)	PITX1 (ENSACCG00020009463)	CATSPER3 (ENSACCG00020009481)	PCBD2 (ENSACCG00020009501)	TXNDC15 (ENSACCG00020009510)	C5orf24 (ENSACCG00020009527)	DDX46 (ENSACCG00020009551)	CAMLG (ENSACCG00020009579)	ENSACCG00020009593	SAR1B (ENSACCG00020009625)	JADE2 (ENSACCG00020009669)	UBE2B (ENSACCG00020009706)	PPP2CA (ENSACCG00020009725)	SKP1 (ENSACCG00020009740)	TCF7 (ENSACCG00020009771)	VDAC1 (ENSACCG00020009806) #22	C5orf15 (ENSACCG00020009818)	FSTL4 (ENSACCG00020009842)	RAPGEF6 (ENSACCG00020009916)	FNIP1 (ENSACCG00020010141)	ENSACCG00020011493	ENSACCG00020013414	ENSACCG00020013427	P4HA2 (ENSACCG00020013454)	PDLIM4 (ENSACCG00020013485)	ENSACCG00020013514	ENSACCG00020013529	IRF1 (ENSACCG00020013556)	ENSACCG00020013574	RAD50 (ENSACCG00020013607)	ENSACCG00020013651
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000162170	ENSGT00940000159541	ENSGT00940000154518.a	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00960000189568	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00610000087493	ENSGT01030000235545	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT01030000235516	ENSGT00390000018781
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000162170	ENSGT00940000159541	ENSGT00940000154518.a	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00960000189568	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00610000087493	ENSGT01030000235545	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT01030000235516	ENSGT00390000018781
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000162170	ENSGT00940000159541	ENSGT00940000154518.a	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00960000189568	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00610000087493	ENSGT01030000235545	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT01030000235516	ENSGT00390000018781
Medium ground finch	MODERN SPECIES	11	ENSGFOG00000002815	SLC25A48 (ENSGFOG00000002724)	CXCL14 (ENSGFOG00000002706)	MACROH2A1 (ENSGFOG00000002690)	PCBD2 (ENSGFOG00000002646)	C5orf24 (ENSGFOG00000002637)	DDX46 (ENSGFOG00000002488)	CAMLG (ENSGFOG00000002451)	SEC24A (ENSGFOG00000002418)	SAR1B (ENSGFOG00000002405)	JADE2 (ENSGFOG00000002376)	UBE2B (ENSGFOG00000002352)	PPP2CA (ENSGFOG00000002331)	SKP1 (ENSGFOG00000002318)	TCF7 (ENSGFOG00000002284)	VDAC1 (ENSGFOG00000002261) #22	C5orf15 (ENSGFOG00000002233)	FSTL4 (ENSGFOG00000002205)	RAPGEF6 (ENSGFOG00000002089)	FNIP1 (ENSGFOG00000002025)	ENSGFOG00000001484	ENSGFOG00000001415	P4HA2 (ENSGFOG00000001387)	PDLIM4 (ENSGFOG00000001378)	ENSGFOG00000001369	ENSGFOG00000001338	IRF1 (ENSGFOG00000001327)	ENSGFOG00000001324	RAD50 (ENSGFOG00000001305)	ENSGFOG00000001300	ENSGFOG00000001289
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000162170	ENSGT00940000159541	ENSGT00940000154518.a	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00960000189568	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00610000087493	ENSGT01030000235545	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT01030000235516	ENSGT00390000018781
Zebra finch	MODERN SPECIES	4	NEUROG1 (ENSTGUG00000001245)	MACROH2A1 (ENSTGUG00000001246)	PITX1 (ENSTGUG00000001251)	PCBD2 (ENSTGUG00000019159)	TXNDC15 (ENSTGUG00000027749)	C5orf24 (ENSTGUG00000028499)	DDX46 (ENSTGUG00000001260)	CAMLG (ENSTGUG00000001268)	SEC24A (ENSTGUG00000001269)	SAR1B (ENSTGUG00000027303)	JADE2 (ENSTGUG00000001284)	UBE2B (ENSTGUG00000022464)	PPP2CA (ENSTGUG00000001287)	SKP1 (ENSTGUG00000001291)	TCF7 (ENSTGUG00000001295)	VDAC1 (ENSTGUG00000001300) #22	C5orf15 (ENSTGUG00000001302)	FSTL4 (ENSTGUG00000001305)	ENSTGUG00000020111	RAPGEF6 (ENSTGUG00000001310)	FNIP1 (ENSTGUG00000001315)	ENSTGUG00000001321	ENSTGUG00000001326	ENSTGUG00000001346	P4HA2 (ENSTGUG00000001347)	ENSTGUG00000001369	PDLIM4 (ENSTGUG00000001365)	ENSTGUG00000027381	ARAP3 (ENSTGUG00000015074)	ENSTGUG00000015072	FCHSD1 (ENSTGUG00000015068)
Common canary	MODERN SPECIES	16	CXCL14 (ENSSCAG00000010960)	MACROH2A1 (ENSSCAG00000010954)	PITX1 (ENSSCAG00000010951)	PCBD2 (ENSSCAG00000010942)	TXNDC15 (ENSSCAG00000010936)	C5orf24 (ENSSCAG00000010932)	DDX46 (ENSSCAG00000010927)	CAMLG (ENSSCAG00000010922)	SEC24A (ENSSCAG00000010912)	SAR1B (ENSSCAG00000010903)	JADE2 (ENSSCAG00000010894)	UBE2B (ENSSCAG00000010887)	PPP2CA (ENSSCAG00000010878)	SKP1 (ENSSCAG00000010873)	TCF7 (ENSSCAG00000010869)	VDAC1 (ENSSCAG00000010861) #22	C5orf15 (ENSSCAG00000010858)	FSTL4 (ENSSCAG00000010845)	RAPGEF6 (ENSSCAG00000010822)	FNIP1 (ENSSCAG00000010809)	MEIKIN (ENSSCAG00000010796)	ENSSCAG00000010785	ENSSCAG00000010781	ENSSCAG00000010779	P4HA2 (ENSSCAG00000010774)	PDLIM4 (ENSSCAG00000010770)	ENSSCAG00000010765	ENSSCAG00000010763	IRF1 (ENSSCAG00000010761)	ENSSCAG00000010758	RAD50 (ENSSCAG00000010752)
Flycatcher	MODERN SPECIES	4	CXCL14 (ENSFALG00000007978)	MACROH2A1 (ENSFALG00000007972)	PITX1 (ENSFALG00000026628)	PCBD2 (ENSFALG00000024599)	TXNDC15 (ENSFALG00000007957)	C5orf24 (ENSFALG00000027320)	DDX46 (ENSFALG00000007947)	CAMLG (ENSFALG00000007942)	SEC24A (ENSFALG00000007938)	SAR1B (ENSFALG00000007931)	JADE2 (ENSFALG00000024209)	UBE2B (ENSFALG00000026103)	PPP2CA (ENSFALG00000024680)	SKP1 (ENSFALG00000007917)	TCF7 (ENSFALG00000023633)	VDAC1 (ENSFALG00000007902) #22	C5orf15 (ENSFALG00000028754)	FSTL4 (ENSFALG00000001023)	ENSFALG00000028787	RAPGEF6 (ENSFALG00000001033)	ENSFALG00000001039	ENSFALG00000001062	ENSFALG00000015042	P4HA2 (ENSFALG00000001103)	APBB3 (ENSFALG00000009289)	ENSFALG00000028095	SRA1 (ENSFALG00000009306)	ANKHD1 (ENSFALG00000009315)	HBEGF (ENSFALG00000009396)	PFDN1 (ENSFALG00000027730)	ENSFALG00000009420
Great tit	MODERN SPECIES	4	MACROH2A1 (ENSPMJG00000009625)	ENSPMJG00000009628	PCBD2 (ENSPMJG00000009629)	TXNDC15 (ENSPMJG00000009630)	C5orf24 (ENSPMJG00000009631)	DDX46 (ENSPMJG00000009632)	CAMLG (ENSPMJG00000009633)	SEC24A (ENSPMJG00000009634)	SAR1B (ENSPMJG00000009641)	JADE2 (ENSPMJG00000009659)	UBE2B (ENSPMJG00000009661)	PPP2CA (ENSPMJG00000009662)	SKP1 (ENSPMJG00000009663)	TCF7 (ENSPMJG00000009664)	ENSPMJG00000009665	VDAC1 (ENSPMJG00000009676) #22	C5orf15 (ENSPMJG00000009680)	FSTL4 (ENSPMJG00000009687)	RAPGEF6 (ENSPMJG00000009725)	FNIP1 (ENSPMJG00000009750)	ENSPMJG00000009782	ENSPMJG00000014447	P4HA2 (ENSPMJG00000014449)	PDLIM4 (ENSPMJG00000014450)	ENSPMJG00000014452	ENSPMJG00000014453	IRF1 (ENSPMJG00000014454)	ENSPMJG00000014455	ENSPMJG00000014457	RAD50 (ENSPMJG00000014458)	ENSPMJG00000014459
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156068	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b
tuatara	MODERN SPECIES	1050	CATSPER3 (ENSSPUG00000008855)	PCBD2 (ENSSPUG00000008886)	TXNDC15 (ENSSPUG00000008895)	C5orf24 (ENSSPUG00000008904)	DDX46 (ENSSPUG00000008985)	CAMLG (ENSSPUG00000009378)	SEC24A (ENSSPUG00000009401)	SAR1B (ENSSPUG00000009441)	JADE2 (ENSSPUG00000009471)	ENSSPUG00000009508	UBE2B (ENSSPUG00000009524)	CDKL3 (ENSSPUG00000009556)	PPP2CA (ENSSPUG00000009588)	SKP1 (ENSSPUG00000009612)	TCF7 (ENSSPUG00000009678)	VDAC1 (ENSSPUG00000009700) #22	C5orf15 (ENSSPUG00000009711)	FSTL4 (ENSSPUG00000009735)	RAPGEF6 (ENSSPUG00000009821)	FNIP1 (ENSSPUG00000009950)	ENSSPUG00000009971	P4HA2 (ENSSPUG00000009999)	PDLIM4 (ENSSPUG00000010030)	ENSSPUG00000010053	ENSSPUG00000010078	IRF1 (ENSSPUG00000010109)	RAD50 (ENSSPUG00000010141)
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156068	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156068	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b
Argentine black and white tegu	DUPLICATION
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	1	CATSPER3 (ENSSMRG00000017557)	PCBD2 (ENSSMRG00000017579)	TXNDC15 (ENSSMRG00000017580)	C5orf24 (ENSSMRG00000017582)	DDX46 (ENSSMRG00000017584)	CAMLG (ENSSMRG00000017636)	SEC24A (ENSSMRG00000017637)	ENSSMRG00000017681	JADE2 (ENSSMRG00000017697)	CDKN2AIPNL (ENSSMRG00000017700)	UBE2B (ENSSMRG00000017701)	CDKL3 (ENSSMRG00000017704)	PPP2CA (ENSSMRG00000017705)	SKP1 (ENSSMRG00000017706)	TCF7 (ENSSMRG00000017715)	ENSSMRG00000017719 #22	C5orf15 (ENSSMRG00000017720)	FSTL4 (ENSSMRG00000017828)	RAPGEF6 (ENSSMRG00000017857)	FNIP1 (ENSSMRG00000017871)	ENSSMRG00000017872	P4HA2 (ENSSMRG00000017880)	PDLIM4 (ENSSMRG00000017888)	ENSSMRG00000017889	ENSSMRG00000017894	IRF1 (ENSSMRG00000017896)	ENSSMRG00000017900	RAD50 (ENSSMRG00000017931)	KIF3A (ENSSMRG00000017937)	CCNI2 (ENSSMRG00000017941)	SEPTIN8 (ENSSMRG00000017956)
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	3	RGS6 (ENSSMRG00000009910)	DPF3 (ENSSMRG00000009927)	ENSSMRG00000009934	ZFYVE1 (ENSSMRG00000009939)	RBM25 (ENSSMRG00000009944)	PSEN1 (ENSSMRG00000009951)	PAPLN (ENSSMRG00000009970)	NUMB (ENSSMRG00000009974)	RIOX1 (ENSSMRG00000009976)	ENSSMRG00000009978	ENSSMRG00000009990	ENSSMRG00000010006	DNAL1 (ENSSMRG00000010008)	MIDEAS (ENSSMRG00000010009)	PTGR2 (ENSSMRG00000010011)	ENSSMRG00000010014 #22	TMEM62 (ENSSMRG00000010019)	UBR1 (ENSSMRG00000010028)	ENSSMRG00000010037	TTBK2 (ENSSMRG00000010040)	ENSSMRG00000010043	ENSSMRG00000010047	ENSSMRG00000010050	ENSSMRG00000010058	HAUS2 (ENSSMRG00000010059)	LRRC57 (ENSSMRG00000010060)	SNAP23 (ENSSMRG00000010062)	ZNF106 (ENSSMRG00000010063)	ENSSMRG00000010068	ENSSMRG00000010071	ENSSMRG00000010072
Common wall lizard	MODERN SPECIES	10	PCBD2 (ENSPMRG00000012115)	TXNDC15 (ENSPMRG00000012113)	C5orf24 (ENSPMRG00000012110)	DDX46 (ENSPMRG00000012038)	ENSPMRG00000012023	SEC24A (ENSPMRG00000011870)	ENSPMRG00000011845	ENSPMRG00000011842	ENSPMRG00000011840	CDKN2AIPNL (ENSPMRG00000011837)	UBE2B (ENSPMRG00000011833)	CDKL3 (ENSPMRG00000011826)	PPP2CA (ENSPMRG00000011825)	ENSPMRG00000011819	TCF7 (ENSPMRG00000011809)	VDAC1 (ENSPMRG00000011804) #22	ENSPMRG00000011800	FSTL4 (ENSPMRG00000011789)	ENSPMRG00000011786	ENSPMRG00000011718	FNIP1 (ENSPMRG00000011671)	ENSPMRG00000011627	ENSPMRG00000011609	ENSPMRG00000011608	P4HA2 (ENSPMRG00000011605)	PDLIM4 (ENSPMRG00000011601)	ENSPMRG00000011600	ENSPMRG00000011597	ENSPMRG00000011592	ENSPMRG00000011587	ENSPMRG00000011573
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156068	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000160656
Lizard	MODERN SPECIES	1	ENSACAG00000037593	nabp1 (ENSACAG00000024010)	CAVIN2 (ENSACAG00000006746)	TMEFF2 (ENSACAG00000006747)	ENSACAG00000043962	ENSACAG00000025255	ENSACAG00000040804	ENSACAG00000034575	ENSACAG00000035795	CDKN2AIPNL (ENSACAG00000039648)	UBE2B (ENSACAG00000002551)	CDKL3 (ENSACAG00000002557)	PPP2CA (ENSACAG00000002653)	SKP1 (ENSACAG00000002723)	TCF7 (ENSACAG00000002732)	VDAC1 (ENSACAG00000002795) #22	ENSACAG00000043938	ENSACAG00000045343	ENSACAG00000024897	ENSACAG00000017827	ENSACAG00000042986	ENSACAG00000035659	ENSACAG00000041828	ENSACAG00000011477	ENSACAG00000035040	ENSACAG00000036111	ENSACAG00000037233	ENSACAG00000042271	ENSACAG00000036664	ENSACAG00000043062	ENSACAG00000035752
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831.a	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000018781.cb	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156068	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b	ENSGT00940000160656
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570.d	ENSGT00940000158570.c	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831.a	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155.vb.a	ENSGT00940000154155.wb	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000018781.cb	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156068	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570.d	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831.a	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000154155.vb.a	ENSGT00940000154155.wb	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000018781.cb	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156068	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	6	PCBD2 (ENSPTXG00000007506)	TXNDC15 (ENSPTXG00000007504)	C5orf24 (ENSPTXG00000007502)	DDX46 (ENSPTXG00000007500)	CAMLG (ENSPTXG00000007498)	SEC24A (ENSPTXG00000007493)	ENSPTXG00000007491	JADE2 (ENSPTXG00000007487)	CDKN2AIPNL (ENSPTXG00000007485)	UBE2B (ENSPTXG00000007484)	CDKL3 (ENSPTXG00000007480)	PPP2CA (ENSPTXG00000007479)	SKP1 (ENSPTXG00000007477)	ENSPTXG00000007476	ENSPTXG00000007475	VDAC1 (ENSPTXG00000007473) #22	C5orf15 (ENSPTXG00000007471)	FSTL4 (ENSPTXG00000007436)	RAPGEF6 (ENSPTXG00000003836)	FNIP1 (ENSPTXG00000003793)	ENSPTXG00000003572	P4HA2 (ENSPTXG00000003562)	PDLIM4 (ENSPTXG00000003561)	ENSPTXG00000003558	ENSPTXG00000003555	IRF1 (ENSPTXG00000003549)	RAD50 (ENSPTXG00000001442)	KIF3A (ENSPTXG00000001378)	CCNI2 (ENSPTXG00000001375)	SEPTIN8 (ENSPTXG00000001367)	ENSPTXG00000001363
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	4	CATSPER3 (ENSNSUG00000003236)	PCBD2 (ENSNSUG00000003269)	TXNDC15 (ENSNSUG00000003272)	C5orf24 (ENSNSUG00000003273)	DDX46 (ENSNSUG00000003281)	CAMLG (ENSNSUG00000004455)	SEC24A (ENSNSUG00000004456)	ENSNSUG00000004463	JADE2 (ENSNSUG00000004469)	CDKN2AIPNL (ENSNSUG00000004477)	UBE2B (ENSNSUG00000004480)	CDKL3 (ENSNSUG00000004483)	PPP2CA (ENSNSUG00000004490)	SKP1 (ENSNSUG00000004491)	TCF7 (ENSNSUG00000004495)	VDAC1 (ENSNSUG00000004501) #22	C5orf15 (ENSNSUG00000004508)	FSTL4 (ENSNSUG00000004519)	ENSNSUG00000004560	RAPGEF6 (ENSNSUG00000004562)	FNIP1 (ENSNSUG00000004609)	ENSNSUG00000004614	P4HA2 (ENSNSUG00000004623)	PDLIM4 (ENSNSUG00000004626)	ENSNSUG00000004629	ENSNSUG00000004635	IRF1 (ENSNSUG00000004638)	RAD50 (ENSNSUG00000004660)	KIF3A (ENSNSUG00000006210)	CCNI2 (ENSNSUG00000006302)	SEPTIN8 (ENSNSUG00000006326)
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	9456																VDAC1 (ENSLLTG00000015121) #22	ENSLLTG00000015118
Indian cobra	MODERN SPECIES	1	CATSPER3 (ENSNNAG00000002694)	PCBD2 (ENSNNAG00000002727)	TXNDC15 (ENSNNAG00000002732)	C5orf24 (ENSNNAG00000002736)	DDX46 (ENSNNAG00000002747)	ENSNNAG00000002763	SEC24A (ENSNNAG00000002983)	ENSNNAG00000006501	JADE2 (ENSNNAG00000006519)	CDKN2AIPNL (ENSNNAG00000006543)	UBE2B (ENSNNAG00000006559)	CDKL3 (ENSNNAG00000006597)	PPP2CA (ENSNNAG00000006645)	SKP1 (ENSNNAG00000006670)	TCF7 (ENSNNAG00000006715)	VDAC1 (ENSNNAG00000006771) #22	C5orf15 (ENSNNAG00000006795)	FSTL4 (ENSNNAG00000006849)	RAPGEF6 (ENSNNAG00000007133)	FNIP1 (ENSNNAG00000007313)	ENSNNAG00000009610	P4HA2 (ENSNNAG00000011265)	PDLIM4 (ENSNNAG00000011307)	ENSNNAG00000011330	ENSNNAG00000011415	IRF1 (ENSNNAG00000011474)	KIF3A (ENSNNAG00000011793)	ENSNNAG00000011880	ENSNNAG00000011893	SEPTIN8 (ENSNNAG00000011922)	ENSNNAG00000012277
Anura	ANCESTRAL SPECIES	157	ENSGT00940000154518.a	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000160154	ENSGT00940000158570	ENSGT00390000008582	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158124
Leishan spiny toad	DUPLICATION
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	6	ENSLLEG00000018339	FNIP1 (ENSLLEG00000017687)	ENSLLEG00000017584	ENSLLEG00000017560	ENSLLEG00000017534	ENSLLEG00000016934	IRF1 (ENSLLEG00000016781)	ENSLLEG00000015303	UBE2B (ENSLLEG00000015052)	ENSLLEG00000015011	ENSLLEG00000014984	PPP2CA (ENSLLEG00000014914)	SKP1 (ENSLLEG00000014777)	TCF7 (ENSLLEG00000014526)	ENSLLEG00000014482	ENSLLEG00000014391 #22	ENSLLEG00000029183	RAPGEF6 (ENSLLEG00000028983)	ENSLLEG00000028916	ENSLLEG00000028909	PFDN1 (ENSLLEG00000028867)	ENSLLEG00000028845	ENSLLEG00000028831	HBEGF (ENSLLEG00000028811)	RUFY1 (ENSLLEG00000028704)	ENSLLEG00000028668	ENSLLEG00000028600	ENSLLEG00000028581	ENSLLEG00000028499	ENSLLEG00000028473	ENSLLEG00000028289
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	5	ENSLLEG00000001118	ENSLLEG00000001113	HNRNPR (ENSLLEG00000001012)	ENSLLEG00000000945	SDC3 (ENSLLEG00000000913)	ENSLLEG00000000884	ENSLLEG00000000877	ENSLLEG00000000869	LAPTM5 (ENSLLEG00000000825)	MATN1 (ENSLLEG00000000789)	ENSLLEG00000000782	PTPRU (ENSLLEG00000000485)	ENSLLEG00000000458	MECR (ENSLLEG00000000444)	SRSF4 (ENSLLEG00000000436)	ENSLLEG00000000428 #22	ENSLLEG00000000412	ENSLLEG00000000292	TMEM200B (ENSLLEG00000003289)	EPB41 (ENSLLEG00000003123)	ENSLLEG00000003087	ENSLLEG00000003077	ENSLLEG00000003059	MED18 (ENSLLEG00000003040)	ENSLLEG00000003030	ENSLLEG00000003020	PHACTR4 (ENSLLEG00000002972)	ENSLLEG00000002962	ENSLLEG00000002940	GMEB1 (ENSLLEG00000002920)	YTHDF2 (ENSLLEG00000002900)
Frog	MODERN SPECIES	3	ENSXETG00000048092	ENSXETG00000042332	ENSXETG00000043515	ENSXETG00000036978	ndnfl1.1 (ENSXETG00000015829)	gpx3 (ENSXETG00000038391)	eif3c (ENSXETG00000015831)	anxa6 (ENSXETG00000015832)	slc7a2.2 (ENSXETG00000015899)	raf1 (ENSXETG00000015911)	sqstm1 (ENSXETG00000015913)	tbc1d9b (ENSXETG00000015920)	rnf130 (ENSXETG00000015941)	ENSXETG00000043040	fstl4 (ENSXETG00000015944)	vdac1 (ENSXETG00000015952) #22	anapc13.2 (ENSXETG00000039062)	ndufa2 (ENSXETG00000031397)	ik (ENSXETG00000036715)	WDR55 (ENSXETG00000016509)	ugdhl (ENSXETG00000016526)	tmco6 (ENSXETG00000032759)	slc35a4 (ENSXETG00000048089)	ENSXETG00000044465	apbb3 (ENSXETG00000033970)	ENSXETG00000048821	slu7 (ENSXETG00000016536)	c1qtnf2 (ENSXETG00000049392)	sra1 (ENSXETG00000032326)	atp10b (ENSXETG00000030587)	ENSXETG00000040716
Coelacanth	MODERN SPECIES	263	WNT8A (ENSLACG00000014940)	NME5 (ENSLACG00000015079)	RACK1 (ENSLACG00000015141)	HNRNPAB (ENSLACG00000015227)	PHYKPL (ENSLACG00000015279)	JADE2 (ENSLACG00000015512)	CDKN2AIPNL (ENSLACG00000016166)	UBE2B (ENSLACG00000016195)	CDKL3 (ENSLACG00000016283)	PPP2CA (ENSLACG00000016504)	SKP1 (ENSLACG00000016599)	TCF7 (ENSLACG00000016627)	ENSLACG00000017178	ENSLACG00000017185	ENSLACG00000017228	VDAC1 (ENSLACG00000017279) #22	C5orf15 (ENSLACG00000017336)	FSTL4 (ENSLACG00000018088)	RAPGEF6 (ENSLACG00000018286)
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT01090000260575	ENSGT00950000182808.a.a.a.b	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000163251.a	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00940000161455	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a
Osteoglossiformes	DUPLICATION
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000154359.w	ENSGT00940000162696.d	ENSGT01100000263491.a.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000160285.`b	ENSGT00940000158847.d.c	ENSGT00940000161776.b	ENSGT00940000155070.a.b.b	ENSGT00940000162301.a	ENSGT01030000234532.A.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160644.a	ENSGT00940000162391.j	ENSGT00940000159375.c.a	ENSGT00940000159921.c	ENSGT00940000167701.b	ENSGT00940000159831.d	ENSGT00950000182869.e.a.b.a #22	ENSGT00440000037499.d	ENSGT00940000158076.a	ENSGT00940000158124.g	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a.g	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695.g.b	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b.s	ENSGT00940000153713.B.d.h	ENSGT00940000159568	ENSGT00440000039314.b
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	19	LTBP3 (ENSSFOG00015002755)	SPTBN2 (ENSSFOG00015002579)	cdc42ep2 (ENSSFOG00015002548)	dpf2 (ENSSFOG00015002492)	CHRM1 (ENSSFOG00015029971)	ENSSFOG00015002431	SIPA1 (ENSSFOG00015002393)	ENSSFOG00015002376	FLRT1 (ENSSFOG00015002369)	rom1a (ENSSFOG00015002344)	ENSSFOG00015002334	ube2b (ENSSFOG00015031211)	ppp2cab (ENSSFOG00015002249)	SKP1 (ENSSFOG00015002226)	tcf7 (ENSSFOG00015030688)	vdac1 (ENSSFOG00015002081) #22	ENSSFOG00015002055	fstl4 (ENSSFOG00015001997)	ENSSFOG00015028792	ENSSFOG00015001976	ENSSFOG00015001853	ENSSFOG00015001817	slc22a4 (ENSSFOG00015001730)	slc22a21 (ENSSFOG00015001673)	ENSSFOG00015027237	pdlim4 (ENSSFOG00015001663)	p4ha2 (ENSSFOG00015001608)	ENSSFOG00015001579	ENSSFOG00015001574	SFXN1 (ENSSFOG00015029237)	JAKMIP2 (ENSSFOG00015001450)
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	71	LTBP3 (ENSPKIG00000005539)	SPTBN2 (ENSPKIG00000005153)	cdc42ep2 (ENSPKIG00000005041)	dpf2 (ENSPKIG00000004967)	CHRM1 (ENSPKIG00000004905)	ENSPKIG00000004846	SIPA1 (ENSPKIG00000004807)	ENSPKIG00000004793	FLRT1 (ENSPKIG00000004787)	rom1a (ENSPKIG00000004771)	ube2b (ENSPKIG00000004732)	ppp2cab (ENSPKIG00000004706)	skp1 (ENSPKIG00000004682)	tcf7 (ENSPKIG00000004591)	ENSPKIG00000004534	vdac1 (ENSPKIG00000004438) #22	C5orf15 (ENSPKIG00000004390)	fstl4 (ENSPKIG00000004293)	ENSPKIG00000004226	fnip1 (ENSPKIG00000004108)	ENSPKIG00000003921	ENSPKIG00000003880	slc22a4 (ENSPKIG00000003839)	slc22a21 (ENSPKIG00000003712)	pdlim4 (ENSPKIG00000003686)	p4ha2 (ENSPKIG00000003533)	ENSPKIG00000003449	sfxn1 (ENSPKIG00000003404)	JAKMIP2 (ENSPKIG00000003324)	dpysl3 (ENSPKIG00000003238)	STK32A (ENSPKIG00000003173)
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	319					ENSGT00390000006633.a.h	ENSGT00940000159577.b	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000014889.b.a	ENSGT00390000015996	ENSGT00940000164397.b.g.a	ENSGT00940000158570.i	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831.c	ENSGT00950000182869.e.a.b.b #22	ENSGT00440000037499.c.b	ENSGT00940000158076.b	ENSGT00940000158124.h	ENSGT00940000156288.a.h	ENSGT00940000163251.a.b.b
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	173	ENSPKIG00000017020	ENSPKIG00000017031	cnot8 (ENSPKIG00000017056)	SAP30L (ENSPKIG00000017077)	LARP1 (ENSPKIG00000017153)	ENSPKIG00000017256	pitx1 (ENSPKIG00000017277)	C5orf24 (ENSPKIG00000017304)	camlg (ENSPKIG00000017319)	sar1b (ENSPKIG00000017353)	ENSPKIG00000017398	JADE2 (ENSPKIG00000017427)	ppp2cab (ENSPKIG00000017467)	SKP1 (ENSPKIG00000017512)	TCF7 (ENSPKIG00000017560)	VDAC1 (ENSPKIG00000017617) #22	C5orf15 (ENSPKIG00000017660)	ENSPKIG00000017717
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a.mb	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00980000202263	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a.mb	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00980000202263	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	75				ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.mb	ENSGT00390000012652.v.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00980000202263	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	169								ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.mb	ENSGT00390000012652.v.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00980000202263	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	176								ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.mb	ENSGT00390000012652.v.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	239								ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.mb	ENSGT00390000012652.v.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.b.a
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	109	chm (ENSPNAG00000014315)	wdr55 (ENSPNAG00000014340)	dpysl3 (ENSPNAG00000014385)	JAKMIP2 (ENSPNAG00000014515)	p4ha2 (ENSPNAG00000014592)	pdlim4 (ENSPNAG00000014621)	slc22a21 (ENSPNAG00000014638)	SEC24A (ENSPNAG00000014660)	sar1b (ENSPNAG00000014683)	JADE2 (ENSPNAG00000014732)	cdkn2aipnl (ENSPNAG00000014740)	ube2b (ENSPNAG00000014763)	ppp2cab (ENSPNAG00000014786)	skp1 (ENSPNAG00000014816)	tcf7 (ENSPNAG00000003297)	vdac1 (ENSPNAG00000003314) #22	C5orf15 (ENSPNAG00000014901)	fstl4 (ENSPNAG00000014962)	RAPGEF6 (ENSPNAG00000015267)	ENSPNAG00000015329	fnip1 (ENSPNAG00000015447)	ENSPNAG00000015591	irf1b (ENSPNAG00000015637)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	5								SEC24A (ENSAMXG00000018129)	sar1b (ENSAMXG00000018108)	JADE2 (ENSAMXG00000018096)	cdkn2aipnl (ENSAMXG00000043967)	ube2b (ENSAMXG00000015642)	ppp2cab (ENSAMXG00000042034)	skp1 (ENSAMXG00000032670)	tcf7 (ENSAMXG00000015861)	vdac1 (ENSAMXG00000039880) #22	C5orf15 (ENSAMXG00000041218)	fstl4 (ENSAMXG00000040670)	ENSAMXG00000031449	sdad1 (ENSAMXG00000015491)	klhl8 (ENSAMXG00000015545)	ENSAMXG00000036712	ENSAMXG00000015641	gsdf (ENSAMXG00000039161)	PPEF2 (ENSAMXG00000015666)	NUP54 (ENSAMXG00000035922)	bxdc2 (ENSAMXG00000043121)	fech (ENSAMXG00000041094)	ONECUT2 (ENSAMXG00000031267)	st8sia3 (ENSAMXG00000015782)	WDR7 (ENSAMXG00000015805)
Electric eel	MODERN SPECIES	162												ube2b (ENSEEEG00000022109)	ppp2cab (ENSEEEG00000022112)	skp1 (ENSEEEG00000022141)	tcf7 (ENSEEEG00000022150)	vdac1 (ENSEEEG00000022153) #22	C5orf15 (ENSEEEG00000022165)	fstl4 (ENSEEEG00000022176)	RAPGEF6 (ENSEEEG00000022225)	fnip1 (ENSEEEG00000022613)	ENSEEEG00000022673	irf1b (ENSEEEG00000023472)	ENSEEEG00000023483	slc22a21 (ENSEEEG00000023490)	ENSEEEG00000023495	pdlim4 (ENSEEEG00000023496)	p4ha2 (ENSEEEG00000023584)	ENSEEEG00000023825	JAKMIP2 (ENSEEEG00000023827)	dpysl3 (ENSEEEG00000023854)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	136										ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.mb	ENSGT00390000012652.v.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499.k	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000156067.g.a	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c	ENSGT00940000156068.i.e	ENSGT00940000162679	ENSGT00390000001134.b.`b.b	ENSGT00940000158972	ENSGT00940000157904.b	ENSGT00940000158388.a.a
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	595											ENSGT00940000158570.k	ENSGT00940000156580.l	ENSGT00550000074618.a.a.mb.d	ENSGT00390000012652.v.b	ENSGT00940000159831.e	ENSGT00950000182869.e.a.b.c #22	ENSGT00440000037499.k	ENSGT00940000158076.c	ENSGT00940000158124.c.a	ENSGT00940000156067.g.a.d	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b.k	ENSGT00940000160656.e	ENSGT00940000156068.i.e.b	ENSGT00940000162679.e	ENSGT00940000158972.f	ENSGT00940000157904.b.a
Goldfish	MODERN SPECIES	13	EBF1 (ENSCARG00000013117)	CLINT1 (ENSCARG00000013940)	ENSCARG00000013950	TCERG1 (ENSCARG00000013998)	ENSCARG00000014632	ENSCARG00000014636	PCYOX1L (ENSCARG00000014644)	CREBRF (ENSCARG00000014657)	ENSCARG00000014678	ENSCARG00000014778	irf1b (ENSCARG00000016132)	ENSCARG00000016141	sar1b (ENSCARG00000016149)	camlg (ENSCARG00000016166)	ENSCARG00000016169	vdac1 (ENSCARG00000016185) #22	ENSCARG00000016301	ENSCARG00000016316	ENSCARG00000016323	fstl4 (ENSCARG00000016427)	ENSCARG00000018769	ENSCARG00000018771	GALNT10 (ENSCARG00000018811)	SAP30L (ENSCARG00000019421)	ddx46 (ENSCARG00000019444)	zgc:77058 (ENSCARG00000020071)	txndc15 (ENSCARG00000020076)	PCBD2 (ENSCARG00000020085)	pitx1 (ENSCARG00000020093)	macroh2a1 (ENSCARG00000020107)	faxdc2 (ENSCARG00000020113)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	83												ENSGT00940000158570.k	ENSGT00550000074618.a.a.mb.c.b	ENSGT00390000012652.v.a	ENSGT00940000159831.e	ENSGT00950000182869.e.a.b.c #22	ENSGT00440000037499.k	ENSGT00940000158076.c	ENSGT00940000158124.c.a	ENSGT00940000156067.g.a.d	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b.k	ENSGT00940000160656.e	ENSGT00940000156068.i.e.b	ENSGT00940000162679.e	ENSGT00940000158972.f	ENSGT00940000157904.b.a	ENSGT00940000158388.a.a.d	ENSGT00530000063000.a.b.a.a	ENSGT00940000160883.a.a	ENSGT01060000248564.b.a.b.b.b.b.a
Common carp reference	DUPLICATION
Common carp reference	MODERN SPECIES	38	ENSCCRG00000066284	stk10 (ENSCCRG00000003209)	STK32A (ENSCCRG00000043759)	dpysl3 (ENSCCRG00000045890)	JAKMIP2 (ENSCCRG00000011879)	p4ha2 (ENSCCRG00000043501)	ENSCCRG00000002237	ENSCCRG00000035025	ENSCCRG00000053206	JADE2 (ENSCCRG00000073401)	ube2b (ENSCCRG00000015221)	ppp2cab (ENSCCRG00000039662)	skp1 (ENSCCRG00000064752)	ENSCCRG00000057535	tcf7 (ENSCCRG00000077972)	vdac1 (ENSCCRG00000024251) #22	C5orf15 (ENSCCRG00000024235)	FSTL4 (ENSCCRG00000006295)	ENSCCRG00000024417	hspa4a (ENSCCRG00000014659)	ENSCCRG00000075879	AFF4 (ENSCCRG00000080218)	ENSCCRG00000014620	septin8a (ENSCCRG00000014799)	CCNI2 (ENSCCRG00000081331)	stk26 (ENSCCRG00000082508)	tmem185 (ENSCCRG00000075420)	ENSCCRG00000021305	atg4a (ENSCCRG00000021229)	ENSCCRG00000021219	ENSCCRG00000071453
Common carp reference	MODERN SPECIES	45	dpysl3 (ENSCCRG00000062558)	JAKMIP2 (ENSCCRG00000045840)	ENSCCRG00000042898	ENSCCRG00000074037	ENSCCRG00000076306	p4ha2 (ENSCCRG00000070813)	ENSCCRG00000070672	ENSCCRG00000067663	JADE2 (ENSCCRG00000050732)	cdkn2aipnl (ENSCCRG00000014069)	ENSCCRG00000058168	ube2b (ENSCCRG00000078645)	ppp2cab (ENSCCRG00000014111)	skp1 (ENSCCRG00000055740)	tcf7 (ENSCCRG00000077815)	vdac1 (ENSCCRG00000010598) #22	ENSCCRG00000068138	ENSCCRG00000021343	FSTL4 (ENSCCRG00000024272)	ENSCCRG00000077873	ENSCCRG00000011098	hspa4a (ENSCCRG00000023164)	ENSCCRG00000067769	AFF4 (ENSCCRG00000071302)	ENSCCRG00000014775	SOWAHA (ENSCCRG00000014778)	CCNI2 (ENSCCRG00000016133)	septin8a (ENSCCRG00000067962)	stk26 (ENSCCRG00000062358)	tmem185 (ENSCCRG00000014763)	ENSCCRG00000062306
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	596															tcf7 (ENSSGRG00000040289)	vdac1 (ENSSGRG00000040338) #22	C5orf15 (ENSSGRG00000040429)	stk38l (ENSSGRG00000040438)	ENSSGRG00000040618	ccdc146 (ENSSGRG00000040619)	fgl2a (ENSSGRG00000040621)	sinup (ENSSGRG00000040622)	lrrc17 (ENSSGRG00000040623)	CEP83 (ENSSGRG00000040625)	fam3c (ENSSGRG00000040629)	ppp6r2a (ENSSGRG00000040649)	dennd6b (ENSSGRG00000040979)	gcc1 (ENSSGRG00000041614)	lamtor4 (ENSSGRG00000041616)	atp6v1f (ENSSGRG00000041618)	ENSSGRG00000041624
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	411	ENSGT00940000156818.lb.a	ENSGT00940000158185.f	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a.c	ENSGT00940000153713.B.d.n.a	ENSGT00940000157695.w.b	ENSGT00940000165810	ENSGT00940000174470.a	ENSGT00940000175762	ENSGT00940000153727.b	ENSGT00940000158570.l	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580.k.a	ENSGT00550000074618.a.a.mb.c.a	ENSGT00390000012652.w	ENSGT00940000159831.f	ENSGT00950000182869.e.a.b.d #22	ENSGT00940000158076.d	ENSGT01100000263541.a.a.a.b.a.b.a.c.b.a.b.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158124.d	ENSGT00390000009391.b
Goldfish	MODERN SPECIES	40	SH3PXD2B (ENSCARG00000015561)	stk10 (ENSCARG00000015594)	STK32A (ENSCARG00000015798)	dpysl3 (ENSCARG00000016836)	JAKMIP2 (ENSCARG00000017909)	p4ha2 (ENSCARG00000018143)	ENSCARG00000018210	ENSCARG00000018215	ENSCARG00000018220	ENSCARG00000018256	JADE2 (ENSCARG00000018277)	ube2b (ENSCARG00000018634)	ppp2cab (ENSCARG00000018651)	skp1 (ENSCARG00000018664)	tcf7 (ENSCARG00000018705)	vdac1 (ENSCARG00000018754) #22	C5orf15 (ENSCARG00000018774)	fstl4 (ENSCARG00000018867)	ENSCARG00000021875	hspa4a (ENSCARG00000022508)	ENSCARG00000023622	AFF4 (ENSCARG00000023630)	tcf25 (ENSCARG00000023664)	ENSCARG00000023830	ENSCARG00000023836	camk2a (ENSCARG00000023912)	cdx1b (ENSCARG00000023982)	ENSCARG00000023993	ndufa2 (ENSCARG00000024001)	ENSCARG00000024011	ammecr1 (ENSCARG00000024019)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	396	ENSGT00940000156818.lb.a	ENSGT00940000158185.f	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a.c	ENSGT00940000153713.B.d.n.a	ENSGT00940000157695.w.b	ENSGT00940000165810	ENSGT00940000174470.a	ENSGT00940000175762	ENSGT00940000153727.b	ENSGT00940000158570.l	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580.k.a	ENSGT00550000074618.a.a.mb.c.a	ENSGT00390000012652.w	ENSGT00940000159831.f	ENSGT00950000182869.e.a.b.d #22	ENSGT00940000158076.d	ENSGT01100000263541.a.a.a.b.a.b.a.c.b.a.b.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158124.d	ENSGT00390000009391.b
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	342	STK32A (ENSSGRG00000042588)	dpysl3 (ENSSGRG00000042622)	JAKMIP2 (ENSSGRG00000043258)	ENSSGRG00000043280	p4ha2 (ENSSGRG00000043503)	ENSSGRG00000043562	ENSSGRG00000043572	JADE2 (ENSSGRG00000043577)	ENSSGRG00000043588	ENSSGRG00000043589	cdkn2aipnl (ENSSGRG00000043590)	ube2b (ENSSGRG00000043592)	ppp2cab (ENSSGRG00000043593)	skp1 (ENSSGRG00000043707)	tcf7 (ENSSGRG00000043714)	vdac1 (ENSSGRG00000043717) #22	fstl4 (ENSSGRG00000043724)	ENSSGRG00000043728	RAPGEF6 (ENSSGRG00000043759)	fnip1 (ENSSGRG00000044808)	hspa4a (ENSSGRG00000044813)	ENSSGRG00000044816	zcchc10 (ENSSGRG00000044818)
Zebrafish	MODERN SPECIES	13	ENSDARG00000101021	irf1b (ENSDARG00000043249)	ENSDARG00000099648	ENSDARG00000113657	fnip1 (ENSDARG00000102171)	ENSDARG00000102926	ENSDARG00000105104	JADE2 (ENSDARG00000053389)	cdkn2aipnl (ENSDARG00000053395)	ube2b (ENSDARG00000026035)	ppp2cab (ENSDARG00000053404)	skp1 (ENSDARG00000003151)	tcf7 (ENSDARG00000038672)	ENSDARG00000086612	ENSDARG00000096305	vdac1 (ENSDARG00000045132) #22	ENSDARG00000090747	RAPGEF6 (ENSDARG00000010945)	fstl4 (ENSDARG00000044319)	rnf121 (ENSDARG00000060282)	kif4 (ENSDARG00000005462)	ammecr1 (ENSDARG00000012892)	spry4 (ENSDARG00000068732)	TMEM164 (ENSDARG00000113609)	fundc2 (ENSDARG00000103740)	cmc4 (ENSDARG00000100774)	BRCC3 (ENSDARG00000098242)	zgc:136410 (ENSDARG00000102241)	ENSDARG00000090883	fgf1b (ENSDARG00000042811)	ENSDARG00000019713
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00530000063529.B	ENSGT00940000153902.b.a	ENSGT00940000162717	ENSGT00940000159316	ENSGT00390000014785	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a.mb	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a
Atlantic herring	MODERN SPECIES	24	asb12a (ENSCHAG00000023243)	mtmr8 (ENSCHAG00000023277)	shisa2a (ENSCHAG00000023350)	zc4h2 (ENSCHAG00000023355)	ZC3H12B (ENSCHAG00000023376)	camlg (ENSCHAG00000023398)	SEC24A (ENSCHAG00000023429)	sar1b (ENSCHAG00000023826)	JADE2 (ENSCHAG00000023829)	cdkn2aipnl (ENSCHAG00000023831)	ube2b (ENSCHAG00000023837)	CDKL3 (ENSCHAG00000023901)	ppp2cab (ENSCHAG00000023911)	SKP1 (ENSCHAG00000023916)	tcf7 (ENSCHAG00000023937)	vdac1 (ENSCHAG00000023980) #22	C5orf15 (ENSCHAG00000024136)	fstl4 (ENSCHAG00000024157)	ENSCHAG00000024712	RAPGEF6 (ENSCHAG00000024774)	fnip1 (ENSCHAG00000025673)	ENSCHAG00000025735	irf1b (ENSCHAG00000026167)	ENSCHAG00000026170	slc22a21 (ENSCHAG00000026195)	ENSCHAG00000026198	ENSCHAG00000026205	POLQ (ENSCHAG00000026216)	birc2 (ENSCHAG00000026319)	cfap300 (ENSCHAG00000026330)	ANGPTL5 (ENSCHAG00000026333)
Denticle herring	MODERN SPECIES	16	mtmr8 (ENSDCDG00000032582)	shisa2a (ENSDCDG00000032575)	zc4h2 (ENSDCDG00000032573)	ZC3H12B (ENSDCDG00000032570)	las1l (ENSDCDG00000032558)	camlg (ENSDCDG00000032551)	psmb1 (ENSDCDG00000032550)	SEC24A (ENSDCDG00000031648)	sar1b (ENSDCDG00000031601)	JADE2 (ENSDCDG00000031595)	cdkn2aipnl (ENSDCDG00000031591)	ube2b (ENSDCDG00000031585)	ppp2cab (ENSDCDG00000031579)	skp1 (ENSDCDG00000031573)	tcf7 (ENSDCDG00000031561)	vdac1 (ENSDCDG00000031475) #22	C5orf15 (ENSDCDG00000031470)	fstl4 (ENSDCDG00000031127)	RAPGEF6 (ENSDCDG00000029508)	ENSDCDG00000019947	irf1b (ENSDCDG00000019773)	slc22a4 (ENSDCDG00000019767)	ENSDCDG00000019764	slc22a21 (ENSDCDG00000019762)	ENSDCDG00000019758	pdlim4 (ENSDCDG00000019753)	p4ha2 (ENSDCDG00000019606)	ENSDCDG00000019586	JAKMIP2 (ENSDCDG00000019515)	dpysl3 (ENSDCDG00000014412)	STK32A (ENSDCDG00000025036)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a.mb	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00980000202263	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00520000055616.a	ENSGT00390000016589.d	ENSGT00390000016589.c	ENSGT00940000155843	ENSGT00390000013087	ENSGT00950000183068.a.b.c	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a.mb	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667.c	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000155156.b.e	ENSGT01030000234954	ENSGT00520000055616.a.f	ENSGT00390000016589.c	ENSGT00940000155843	ENSGT00950000183068.a.b.c.d	ENSGT00950000182924.B.a.b.a	ENSGT00940000164397.b.d	ENSGT00940000158570.m	ENSGT00940000157177.a	ENSGT00940000156580.d	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a.mb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831.h	ENSGT00950000182869.e.a.b.e #22	ENSGT00440000037499.f	ENSGT00940000158076.e	ENSGT00940000158124.f	ENSGT00390000009391.b.d	ENSGT00940000154508.a.b.f	ENSGT00940000156288.a.c	ENSGT00940000167667.c.a	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a	ENSGT00940000159536.a	ENSGT00940000157695.o.a	ENSGT00940000153713.B.d.k	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a.b	ENSGT00940000158185.h.a
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00940000156765.a.b.a	ENSGT00940000155156.b.e	ENSGT00390000016589.c	ENSGT00520000055616.a.f	ENSGT00940000155843	ENSGT00950000183068.a.b.c.d	ENSGT00950000182924.B.a.b.a	ENSGT00940000164397.b.d	ENSGT00940000158570.m	ENSGT00940000157177.a	ENSGT00940000156580.d	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a.mb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831.h	ENSGT00950000182869.e.a.b.e #22	ENSGT00440000037499.f	ENSGT00940000158076.e	ENSGT00940000158124.f	ENSGT00390000009391.b.d	ENSGT00940000154508.a.b.f	ENSGT00940000156288.a.c	ENSGT00940000167667.c.a	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a	ENSGT00940000159536.a	ENSGT00940000157695.o.a	ENSGT00940000153713.B.d.k	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a.b	ENSGT00940000158185.h.a
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00940000156765.a.b.a	ENSGT00940000155156.b.e	ENSGT00390000016589.c	ENSGT00940000155843	ENSGT00950000183068.a.b.c.d	ENSGT00950000182924.B.a.b.a	ENSGT00940000164397.b.d.a	ENSGT00940000164397.b.d.b	ENSGT00940000158570.m	ENSGT00940000157177.a	ENSGT00940000156580.d	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a.mb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831.h	ENSGT00950000182869.e.a.b.e #22	ENSGT00440000037499.f	ENSGT00940000158076.e	ENSGT00940000158124.f	ENSGT00390000009391.b.d	ENSGT00940000154508.a.b.f	ENSGT00940000156288.a.c	ENSGT00940000167667.c.a	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a	ENSGT00940000159536.a	ENSGT00940000157695.o.a	ENSGT00940000153713.B.d.k	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a.b	ENSGT00940000158185.h.a
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00530000063596.A.j	ENSGT00940000155095.i.a.c	ENSGT01000000221078	ENSGT00390000016589.c	ENSGT00940000155843	ENSGT00950000183068.a.b.c.d	ENSGT00950000182924.B.a.b.a	ENSGT00940000164397.b.d.b	ENSGT00940000158570.m	ENSGT00940000157177.a	ENSGT00940000156580.d	ENSGT00940000161317.b	ENSGT00550000074618.a.a.mb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831.h	ENSGT00950000182869.e.a.b.e #22	ENSGT00440000037499.f	ENSGT00940000158076.e	ENSGT00390000016567.m.b	ENSGT00940000159201.j	ENSGT00550000074815.l	ENSGT00390000004254.g	ENSGT00940000159280.d	ENSGT00940000157706.o	ENSGT00390000002768.a.d	ENSGT00940000156417.g.a	ENSGT00390000005572	ENSGT00940000155320	ENSGT00390000001612.d	ENSGT00390000010130	ENSGT00390000005743.g
Chinook salmon	DUPLICATION
Chinook salmon	MODERN SPECIES	2926	VASP (ENSOTSG00005031988)	dlg2 (ENSOTSG00005031941)	ENSOTSG00005031933	CREBZF (ENSOTSG00005031932)	ENSOTSG00005031931	picalma (ENSOTSG00005030757)	SEC24A (ENSOTSG00005029871)	sar1b (ENSOTSG00005029862)	JADE2 (ENSOTSG00005029859)	cdkn2aipnl (ENSOTSG00005029856)	ube2b (ENSOTSG00005029731)	CDKL3 (ENSOTSG00005029730)	ppp2cab (ENSOTSG00005029728)	SKP1 (ENSOTSG00005029727)	tcf7 (ENSOTSG00005029726)	vdac1 (ENSOTSG00005029712) #22	C5orf15 (ENSOTSG00005029711)	fstl4 (ENSOTSG00005027338)	ZNF516 (ENSOTSG00005027333)	TSHZ1 (ENSOTSG00005027332)	PTGR3 (ENSOTSG00005027331)	ENSOTSG00005027329	ENSOTSG00005027328	nr0b2a (ENSOTSG00005027327)	KDF1 (ENSOTSG00005027326)	tpbgl (ENSOTSG00005027324)	tmem222a (ENSOTSG00005027323)	wdtc1 (ENSOTSG00005027278)	CEP85 (ENSOTSG00005027276)	cops7a (ENSOTSG00005027273)	cldc1 (ENSOTSG00005027271)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	23	VASP (ENSOTSG00005012879)	dlg2 (ENSOTSG00005008275)	ENSOTSG00005008249	CREBZF (ENSOTSG00005008247)	ENSOTSG00005008246	picalma (ENSOTSG00005008088)	SEC24A (ENSOTSG00005007193)	sar1b (ENSOTSG00005007190)	JADE2 (ENSOTSG00005007189)	cdkn2aipnl (ENSOTSG00005007185)	ube2b (ENSOTSG00005007007)	CDKL3 (ENSOTSG00005006999)	ppp2cab (ENSOTSG00005006997)	SKP1 (ENSOTSG00005006990)	tcf7 (ENSOTSG00005006981)	vdac1 (ENSOTSG00005006952) #22	C5orf15 (ENSOTSG00005006951)	fstl4 (ENSOTSG00005003132)
Coho salmon	MODERN SPECIES	20	ENSOKIG00005034767	ENSOKIG00005034784	CREBZF (ENSOKIG00005034985)	ENSOKIG00005035036	picalma (ENSOKIG00005035124)	SEC24A (ENSOKIG00005035431)	ENSOKIG00005036526	JADE2 (ENSOKIG00005036563)	ENSOKIG00005036587	cdkn2aipnl (ENSOKIG00005036638)	ube2b (ENSOKIG00005036669)	CDKL3 (ENSOKIG00005036767)	ppp2cab (ENSOKIG00005036804)	SKP1 (ENSOKIG00005036843)	tcf7 (ENSOKIG00005036882)	vdac1 (ENSOKIG00005037050) #22	ENSOKIG00005037200	FSTL4 (ENSOKIG00005037350)	ENSOKIG00005039310	ENSOKIG00005039315	ENSOKIG00005039678	ENSOKIG00005044877	FNIP1 (ENSOKIG00005044926)	ENSOKIG00005045948	irf1b (ENSOKIG00005020326)	ENSOKIG00005020350	slc22a4 (ENSOKIG00005020368)	ENSOKIG00005020395	slc22a21 (ENSOKIG00005020436)	ENSOKIG00005020469	PDLIM4 (ENSOKIG00005020476)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	1	CREBZF (ENSOMYG00000020478)	ENSOMYG00000020463	ENSOMYG00000052358	picalma (ENSOMYG00000020200)	SEC24A (ENSOMYG00000018809)	sar1a (ENSOMYG00000018675)	ENSOMYG00000067482	JADE2 (ENSOMYG00000018630)	cdkn2aipnl (ENSOMYG00000047254)	ENSOMYG00000064076	ube2b (ENSOMYG00000047263)	CDKL3 (ENSOMYG00000074979)	ppp2cab (ENSOMYG00000047240)	skp1 (ENSOMYG00000047224)	tcf7 (ENSOMYG00000047216)	vdac1 (ENSOMYG00000047206) #22	ENSOMYG00000047201	FSTL4 (ENSOMYG00000047192)	ENSOMYG00000046969	ENSOMYG00000064543	ENSOMYG00000043214	ENSOMYG00000046742	ENSOMYG00000042793	ENSOMYG00000042773	ENSOMYG00000042757	ENSOMYG00000042745	ENSOMYG00000042736	p4ha2 (ENSOMYG00000041283)	JAKMIP2 (ENSOMYG00000041188)	dpysl3 (ENSOMYG00000034680)	STK32A (ENSOMYG00000034172)
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000156765.a.b.a	ENSGT00940000155156.b.e	ENSGT00390000016589.c	ENSGT00520000055616.a.f	ENSGT00940000155843	ENSGT00950000183068.a.b.c.d	ENSGT00950000182924.B.a.b.a	ENSGT00940000164397.b.d	ENSGT00940000158570.m.a	ENSGT00940000157177.a	ENSGT00940000156580.d	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a.mb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831.h	ENSGT00950000182869.e.a.b.e #22	ENSGT00440000037499.f	ENSGT00940000158076.e	ENSGT00940000158124.f	ENSGT00390000009391.b.d	ENSGT00940000154508.a.b.f	ENSGT00940000156288.a.c	ENSGT00940000167667.c.a	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a	ENSGT00940000159536.a	ENSGT00940000157695.o.a	ENSGT00940000153713.B.d.k	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a.b	ENSGT00940000158185.h.a
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	23	ENSSSAG00000085412	ENSSSAG00000114114	CREBZF (ENSSSAG00000103873)	tmem126a (ENSSSAG00000071256)	ENSSSAG00000005211	ENSSSAG00000005304	SEC24A (ENSSSAG00000005541)	sar1a (ENSSSAG00000006705)	JADE2 (ENSSSAG00000095083)	cdkn2aipnl (ENSSSAG00000006740)	ube2b (ENSSSAG00000006757)	CDKL3 (ENSSSAG00000006804)	ppp2cab (ENSSSAG00000006809)	skp1 (ENSSSAG00000006816)	tcf7 (ENSSSAG00000064204)	VDAC1 (ENSSSAG00000006928) #22	ENSSSAG00000006977	ENSSSAG00000104019	FSTL4 (ENSSSAG00000007051)	ENSSSAG00000009418	ENSSSAG00000083739	ENSSSAG00000112091	ENSSSAG00000111128	irf1-2 (ENSSSAG00000067957)	ENSSSAG00000105017	ENSSSAG00000067999	ENSSSAG00000102941	ENSSSAG00000100867	ENSSSAG00000068009	pdli4 (ENSSSAG00000068047)	p4ha2 (ENSSSAG00000068099)
River trout	MODERN SPECIES	10	tmem126a (ENSSTUG00000032224)	CREBZF (ENSSTUG00000026767)	ENSSTUG00000026726	picalma (ENSSTUG00000026201)	ENSSTUG00000026148	SEC24A (ENSSTUG00000024365)	sar1b (ENSSTUG00000024315)	JADE2 (ENSSTUG00000024289)	ENSSTUG00000024281	cdkn2aipnl (ENSSTUG00000024274)	ube2b (ENSSTUG00000024053)	CDKL3 (ENSSTUG00000024033)	ppp2cab (ENSSTUG00000024015)	SKP1 (ENSSTUG00000023998)	tcf7 (ENSSTUG00000023812)	vdac1 (ENSSTUG00000023698) #22	ENSSTUG00000023684	fstl4 (ENSSTUG00000022788)	ENSSTUG00000022747	ENSSTUG00000022331	fnip1 (ENSSTUG00000021481)	ENSSTUG00000015813	irf1b (ENSSTUG00000015583)	ENSSTUG00000015578	slc22a4 (ENSSTUG00000015554)	ENSSTUG00000015461	slc22a21 (ENSSTUG00000015450)	ENSSTUG00000015388	pdlim4 (ENSSTUG00000015372)	p4ha2 (ENSSTUG00000015021)	ENSSTUG00000014996
Huchen	MODERN SPECIES	3205																vdac1 (ENSHHUG00000016123) #22	ENSHHUG00000016645
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	395	ENSGT01030000234517.F.d	ENSGT00940000159359.s	ENSGT00940000156765.a.b.b	ENSGT00940000155156.b.f	ENSGT00520000055616.a.e	ENSGT00390000016589.d	ENSGT00390000013087	ENSGT00950000183068.a.b.c.c	ENSGT00950000182924.B.a.b.b	ENSGT00940000164397.b.c	ENSGT00940000158570.n	ENSGT00940000157177.b	ENSGT00940000156580.c	ENSGT00550000074618.a.a.mb.a	ENSGT00940000159831.g	ENSGT00950000182869.e.a.b.f #22	ENSGT00440000037499.e	ENSGT00940000158076.f	ENSGT00940000158124.e	ENSGT00390000009391.b.c	ENSGT00940000154508.a.b.e	ENSGT00940000156288.a.d	ENSGT00940000167667.c.b
Huchen	MODERN SPECIES	1329										JADE2 (ENSHHUG00000017098)	cdkn2aipnl (ENSHHUG00000017118)	ube2b (ENSHHUG00000017157)	ppp2cab (ENSHHUG00000017199)	skp1 (ENSHHUG00000017299)	tcf7 (ENSHHUG00000017341)	vdac1 (ENSHHUG00000017359) #22	ENSHHUG00000017721
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000159359.s.a	ENSGT00940000156765.a.b.b	ENSGT00940000155156.b.f	ENSGT01040000240375.D	ENSGT00520000055616.a.e	ENSGT00390000016589.d	ENSGT00390000013087	ENSGT00950000183068.a.b.c.c	ENSGT00950000182924.B.a.b.b	ENSGT00940000164397.b.c	ENSGT00940000158570.n	ENSGT00940000157177.b	ENSGT00940000156580.c	ENSGT00550000074618.a.a.mb.a	ENSGT00940000159831.g	ENSGT00950000182869.e.a.b.f #22	ENSGT00440000037499.e	ENSGT00940000158076.f	ENSGT00940000158124.e	ENSGT00390000009391.b.c	ENSGT00940000154508.a.b.e	ENSGT00940000156288.a.d	ENSGT00940000167667.c.b	ENSGT00940000159536.b	ENSGT00940000157695.o.b	ENSGT00940000157695.p	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d.l	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a.a	ENSGT00940000158185.h.b	ENSGT00940000156818.`c.b
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00940000156765.a.b.b	ENSGT00940000155156.b.f	ENSGT01040000240375.D.s.a.a.b.b.b.a.a.a.a	ENSGT00520000055616.a.e	ENSGT00390000016589.d	ENSGT00390000013087	ENSGT00950000183068.a.b.c.c	ENSGT00950000182924.B.a.b.b	ENSGT00940000164397.b.c	ENSGT00940000158570.n	ENSGT00940000158570.m.b	ENSGT00940000157177.b	ENSGT00940000156580.c	ENSGT00550000074618.a.a.mb.a	ENSGT00940000159831.g	ENSGT00950000182869.e.a.b.f #22	ENSGT00440000037499.e	ENSGT00940000158076.f	ENSGT00940000158124.e	ENSGT00390000009391.b.c	ENSGT00940000154508.a.b.e	ENSGT00940000156288.a.d	ENSGT00940000167667.d	ENSGT00940000167667.c.b	ENSGT00940000159536.b	ENSGT00940000157695.o.b	ENSGT00940000157695.p	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d.l	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a.a	ENSGT00940000158185.h.b
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	4	ENSSSAG00000079188	ENSSSAG00000115813	ENSSSAG00000109304	dlg2 (ENSSSAG00000109902)	tmem126a (ENSSSAG00000073700)	CREBZF (ENSSSAG00000073699)	ccdc83 (ENSSSAG00000098038)	picalma (ENSSSAG00000068138)	SEC24A (ENSSSAG00000065831)	ENSSSAG00000082595	JADE2 (ENSSSAG00000065776)	ube2b (ENSSSAG00000090070)	ENSSSAG00000108779	ppp2cab (ENSSSAG00000065756)	tcf7 (ENSSSAG00000006857)	vdac1 (ENSSSAG00000064103) #22	kct2 (ENSSSAG00000064088)	ENSSSAG00000116382	FSTL4 (ENSSSAG00000063587)	ENSSSAG00000007307	ENSSSAG00000061035	ENSSSAG00000117983	irf-1 (ENSSSAG00000058121)	ENSSSAG00000115748	ENSSSAG00000058114	ENSSSAG00000058083	PDLIM4 (ENSSSAG00000058065)	p4ha2 (ENSSSAG00000057643)	ENSSSAG00000057556	ENSSSAG00000056478	ENSSSAG00000056275
River trout	MODERN SPECIES	6	dlg2 (ENSSTUG00000004572)	tmem126a (ENSSTUG00000004503)	CREBZF (ENSSTUG00000004497)	ENSSTUG00000004470	picalma (ENSSTUG00000003808)	SEC24A (ENSSTUG00000003280)	ENSSTUG00000003267	sar1b (ENSSTUG00000003243)	JADE2 (ENSSTUG00000003225)	cdkn2aipnl (ENSSTUG00000003213)	ube2b (ENSSTUG00000003141)	ppp2cab (ENSSTUG00000003114)	ENSSTUG00000003107	skp1 (ENSSTUG00000003086)	ENSSTUG00000002790	vdac1 (ENSSTUG00000002616) #22	ENSSTUG00000045429	fstl4 (ENSSTUG00000044904)	ENSSTUG00000039214	fnip1 (ENSSTUG00000038864)	ENSSTUG00000029115	irf1b (ENSSTUG00000028958)	slc22a4 (ENSSTUG00000028884)	slc22a4 (ENSSTUG00000028855)	pdlim4 (ENSSTUG00000028842)	p4ha2 (ENSSTUG00000025124)	ENSSTUG00000024864	ENSSTUG00000024854	JAKMIP2 (ENSSTUG00000024656)	dpysl3 (ENSSTUG00000021956)	STK32A (ENSSTUG00000021870)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	122															ENSGT00940000159831.g	ENSGT00950000182869.e.a.b.f #22	ENSGT00440000037499.e	ENSGT00940000158076.f	ENSGT00940000158124.e	ENSGT00390000009391.b.c	ENSGT00940000154508.a.b.e	ENSGT00940000156288.a.d	ENSGT00940000167667.c.b	ENSGT00940000159536.b	ENSGT00940000157695.o.b	ENSGT00940000157695.p	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d.l	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a.a	ENSGT00940000158185.h.b	ENSGT00940000156818.`c.b
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT01000000220481	ENSGT00940000159359.s.b	ENSGT00940000156765.a.b.b	ENSGT00940000155156.b.f	ENSGT00520000055616.a.e	ENSGT00390000016589.d	ENSGT00390000013087	ENSGT00950000183068.a.b.c.c	ENSGT00950000182924.B.a.b.b	ENSGT00940000164397.b.c	ENSGT00940000158570.n	ENSGT00940000157177.b	ENSGT00940000156580.c	ENSGT00550000074618.a.a.mb.a	ENSGT00940000159831.g	ENSGT00950000182869.e.a.b.f #22	ENSGT00440000037499.e	ENSGT00940000158076.f	ENSGT00940000158124.e	ENSGT00390000009391.b.c	ENSGT00940000154508.a.b.e	ENSGT00940000156288.a.d	ENSGT00940000167667.c.b	ENSGT00940000159536.b	ENSGT00940000157695.o.b	ENSGT00940000157695.p	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d.l	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a.a	ENSGT00940000158185.h.b	ENSGT00940000156818.`c.b
Chinook salmon	DUPLICATION
Chinook salmon	MODERN SPECIES	33	ENSOTSG00005025321	dlg2 (ENSOTSG00005025392)	tmem126a (ENSOTSG00005040520)	CREBZF (ENSOTSG00005040522)	ENSOTSG00005040524	picalma (ENSOTSG00005040531)	SEC24A (ENSOTSG00005040541)	sar1b (ENSOTSG00005040563)	JADE2 (ENSOTSG00005040566)	cdkn2aipnl (ENSOTSG00005040568)	ube2b (ENSOTSG00005040569)	ppp2cab (ENSOTSG00005040571)	skp1 (ENSOTSG00005040573)	tcf7 (ENSOTSG00005040577)	ENSOTSG00005040579	vdac1 (ENSOTSG00005040582) #22	ENSOTSG00005040586	fstl4 (ENSOTSG00005040588)	ENSOTSG00005040825	fnip1 (ENSOTSG00005040889)	ENSOTSG00005041459	irf1b (ENSOTSG00005046687)	slc22a4 (ENSOTSG00005046691)	pdlim4 (ENSOTSG00005046692)	p4ha2 (ENSOTSG00005046693)	ENSOTSG00005047178	ENSOTSG00005047180	JAKMIP2 (ENSOTSG00005047186)	dpysl3 (ENSOTSG00005047194)	STK32A (ENSOTSG00005047196)	stk10 (ENSOTSG00005047197)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	33	ENSOTSG00005036319	dlg2 (ENSOTSG00005036357)	tmem126a (ENSOTSG00005044855)	CREBZF (ENSOTSG00005044874)	ENSOTSG00005044906	picalma (ENSOTSG00005044908)	SEC24A (ENSOTSG00005045089)	sar1b (ENSOTSG00005045090)	JADE2 (ENSOTSG00005045091)	cdkn2aipnl (ENSOTSG00005045092)	ube2b (ENSOTSG00005045093)	ppp2cab (ENSOTSG00005045094)	ENSOTSG00005045095	tcf7 (ENSOTSG00005045096)	ENSOTSG00005045097	vdac1 (ENSOTSG00005045098) #22	ENSOTSG00005045101	fstl4 (ENSOTSG00005045106)	ENSOTSG00005045189	fnip1 (ENSOTSG00005045258)	ENSOTSG00005045333	irf1b (ENSOTSG00005047216)	slc22a4 (ENSOTSG00005047217)	pdlim4 (ENSOTSG00005047218)	p4ha2 (ENSOTSG00005047225)	ENSOTSG00005047241	ENSOTSG00005047243	JAKMIP2 (ENSOTSG00005047247)	dpysl3 (ENSOTSG00005047261)	STK32A (ENSOTSG00005047262)	stk10 (ENSOTSG00005047263)
Coho salmon	MODERN SPECIES	26	vaspa (ENSOKIG00005031338)	dlg2 (ENSOKIG00005031461)	tmem126a (ENSOKIG00005032452)	CREBZF (ENSOKIG00005032472)	ccdc83 (ENSOKIG00005032480)	picalma (ENSOKIG00005032510)	SEC24A (ENSOKIG00005032693)	sar1b (ENSOKIG00005033569)	JADE2 (ENSOKIG00005033619)	cdkn2aipnl (ENSOKIG00005033657)	ube2b (ENSOKIG00005033676)	ppp2cab (ENSOKIG00005033701)	ENSOKIG00005033719	skp1 (ENSOKIG00005033741)	tcf7 (ENSOKIG00005033777)	vdac1 (ENSOKIG00005033920) #22	ENSOKIG00005034005	fstl4 (ENSOKIG00005034045)	ENSOKIG00005034788	ENSOKIG00005041350	ENSOKIG00005041911	IRF1 (ENSOKIG00005048421)	ENSOKIG00005048441	pdlim4 (ENSOKIG00005048481)	p4ha2 (ENSOKIG00005048507)	ENSOKIG00005048673	ENSOKIG00005048726	JAKMIP2 (ENSOKIG00005048983)	dpysl3 (ENSOKIG00005049066)	STK32A (ENSOKIG00005049115)	stk10 (ENSOKIG00005049173)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	3	ENSOMYG00000075574	tmem126a (ENSOMYG00000019702)	CREBZF (ENSOMYG00000019707)	ENSOMYG00000019725	picalma (ENSOMYG00000019800)	ENSOMYG00000065853	SEC24A (ENSOMYG00000019934)	ENSOMYG00000019992	JADE2 (ENSOMYG00000056539)	cdkn2aipnl (ENSOMYG00000019997)	ube2b (ENSOMYG00000020002)	ENSOMYG00000074855	ppp2cab (ENSOMYG00000020013)	SKP1 (ENSOMYG00000020162)	tcf7 (ENSOMYG00000020060)	vdac1 (ENSOMYG00000020183) #22	ENSOMYG00000062916	ENSOMYG00000020196	FSTL4 (ENSOMYG00000020205)	ENSOMYG00000077187	ENSOMYG00000020374	ENSOMYG00000066816	ENSOMYG00000058821	ENSOMYG00000023077	irf1b (ENSOMYG00000038460)	ENSOMYG00000038527	ENSOMYG00000038557	PDLIM4 (ENSOMYG00000038574)	ENSOMYG00000075312	p4ha2 (ENSOMYG00000039356)	ENSOMYG00000041970
Northern pike	MODERN SPECIES	6	tmem126a (ENSELUG00000029889)	CREBZF (ENSELUG00000000907)	ENSELUG00000020635	ccdc83 (ENSELUG00000020685)	picalma (ENSELUG00000020842)	SEC24A (ENSELUG00000020869)	sar1b (ENSELUG00000020912)	JADE2 (ENSELUG00000020933)	cdkn2aipnl (ENSELUG00000020947)	ube2b (ENSELUG00000027640)	ppp2cab (ENSELUG00000021047)	skp1 (ENSELUG00000021058)	tcf7 (ENSELUG00000021126)	ENSELUG00000032539	ENSELUG00000027845	vdac1 (ENSELUG00000021150) #22	C5orf15 (ENSELUG00000021174)	fstl4 (ENSELUG00000021289)	ENSELUG00000029576	RAPGEF6 (ENSELUG00000021317)	fnip1 (ENSELUG00000021369)	ENSELUG00000021463	irf1b (ENSELUG00000021494)	slc22a4 (ENSELUG00000021505)	ENSELUG00000000942	slc22a21 (ENSELUG00000021564)	ENSELUG00000021544	pdlim4 (ENSELUG00000021604)	p4ha2 (ENSELUG00000021666)	ENSELUG00000027358	GALNT10 (ENSELUG00000021702)
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000159541	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00980000202263	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d
Cod	MODERN SPECIES	20	ENSGMOG00000009384	ENSGMOG00000034792	txndc15 (ENSGMOG00000011673)	zgc:77058 (ENSGMOG00000026008)	ddx46 (ENSGMOG00000007990)	camlg (ENSGMOG00000022625)	SEC24A (ENSGMOG00000008009)	sar1b (ENSGMOG00000008023)	JADE2 (ENSGMOG00000027196)	ENSGMOG00000027175	cdkn2aipnl (ENSGMOG00000016312)	ube2b (ENSGMOG00000023967)	PPP2CA (ENSGMOG00000016279)	skp1 (ENSGMOG00000016212)	tcf7 (ENSGMOG00000028701)	vdac1 (ENSGMOG00000009517) #22	ENSGMOG00000009503	ENSGMOG00000025045	ENSGMOG00000002057	ENSGMOG00000025345	ENSGMOG00000035963	ENSGMOG00000030926	MAPRE1 (ENSGMOG00000014917)	dnmt3bb.2 (ENSGMOG00000023632)	dnmt3bb.1 (ENSGMOG00000015045)	commd7 (ENSGMOG00000010171)	ENSGMOG00000024658	nol4lb (ENSGMOG00000008544)	ENSGMOG00000008553	ptk6b (ENSGMOG00000008563)	ENSGMOG00000015156
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000159541	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000159541	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	174				rpl23a (ENSHCOG00000007950)	ddx52 (ENSHCOG00000007966)	heatr6 (ENSHCOG00000007986)	ENSHCOG00000007999	ENSHCOG00000008016	ENSHCOG00000008025	JADE2 (ENSHCOG00000008043)	cdkn2aipnl (ENSHCOG00000008057)	ube2b (ENSHCOG00000008080)	PPP2CA (ENSHCOG00000008110)	skp1 (ENSHCOG00000008118)	tcf7 (ENSHCOG00000008182)	vdac1 (ENSHCOG00000008206) #22	C5orf15 (ENSHCOG00000008211)	fstl4 (ENSHCOG00000008240)	RAPGEF6 (ENSHCOG00000000277)	fnip1 (ENSHCOG00000008457)	ENSHCOG00000008511	ENSHCOG00000008546	slc22a4 (ENSHCOG00000008577)	ENSHCOG00000008616	slc22a21 (ENSHCOG00000008624)	ENSHCOG00000008636	ENSHCOG00000008834	ufm1 (ENSHCOG00000008846)	ENSHCOG00000008870	rfxap (ENSHCOG00000008879)	dclk1a (ENSHCOG00000008938)
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000180246	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000180246	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000159541	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000159541	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	35					ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	50	ENSKMAG00000019381	ENSKMAG00000019392	tbl2 (ENSKMAG00000019419)	ENSKMAG00000019446	zgc:77058 (ENSKMAG00000019468)	ddx46 (ENSKMAG00000019510)	camlg (ENSKMAG00000019591)	SEC24A (ENSKMAG00000019623)	sar1b (ENSKMAG00000019693)	JADE2 (ENSKMAG00000019719)	cdkn2aipnl (ENSKMAG00000019734)	ube2b (ENSKMAG00000019748)	PPP2CA (ENSKMAG00000019776)	skp1 (ENSKMAG00000019805)	tcf7 (ENSKMAG00000019834)	vdac1 (ENSKMAG00000019891) #22	C5orf15 (ENSKMAG00000019914)	fstl4 (ENSKMAG00000019941)	ENSKMAG00000020042	fnip1 (ENSKMAG00000020304)	ENSKMAG00000020407	irf1b (ENSKMAG00000020469)	slc22a4 (ENSKMAG00000020499)	ENSKMAG00000020536	slc22a21 (ENSKMAG00000020594)
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1620	ABHD15 (ENSNFUG00015005757)	TAOK1 (ENSNFUG00015005611)	SMG6 (ENSNFUG00015005550)	txndc15 (ENSNFUG00015005527)	zgc:77058 (ENSNFUG00015005520)	ddx46 (ENSNFUG00015005444)	CAMLG (ENSNFUG00015005406)	SEC24A (ENSNFUG00015004921)	SAR1B (ENSNFUG00015004825)	PHF15 (ENSNFUG00015004802)	cdkn2aipnl (ENSNFUG00015004788)	ube2b (ENSNFUG00015004726)	PPP2CA (ENSNFUG00015004706)	SKP1 (ENSNFUG00015024952)	tcf7 (ENSNFUG00015024940)	VDAC1 (ENSNFUG00015024928) #22	ENSNFUG00015024922	ENSNFUG00015024920	FSTL4 (ENSNFUG00015024842)	ENSNFUG00015024827	RAPGEF6 (ENSNFUG00015024790)	ACSL6 (ENSNFUG00015022809)	IRF1B (ENSNFUG00015022599)	casp9 (ENSNFUG00015022582)	SLC22A5 (ENSNFUG00015022503)	Nfu_g_1_022289 (ENSNFUG00015022496)	ENSNFUG00015022493	ENSNFUG00015022259	PDLIM4 (ENSNFUG00015022238)	P4HA2 (ENSNFUG00015019968)	JAKMIP2 (ENSNFUG00015019543)
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000159541	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667.f	ENSGT00940000167667.e	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a.e	ENSGT00940000163251.a.a.f	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000159541	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667.f	ENSGT00940000167667.e	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a.e	ENSGT00940000163251.a.a.f	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00940000179165	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695
Mummichog	MODERN SPECIES	2469	pitx1 (ENSFHEG00000020116)	PCBD2 (ENSFHEG00000020103)	txndc15 (ENSFHEG00000020088)	zgc:77058 (ENSFHEG00000020078)	ddx46 (ENSFHEG00000020055)	camlg (ENSFHEG00000019952)	ENSFHEG00000019918	SEC24A (ENSFHEG00000019896)	sar1b (ENSFHEG00000019865)	JADE2 (ENSFHEG00000019839)	cdkn2aipnl (ENSFHEG00000019829)	ube2b (ENSFHEG00000019816)	PPP2CA (ENSFHEG00000019771)	skp1 (ENSFHEG00000019726)	tcf7 (ENSFHEG00000019703)	vdac1 (ENSFHEG00000019662) #22	ENSFHEG00000019634
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	248													PPP2CA (ENSCVAG00000013639)	skp1 (ENSCVAG00000013583)	tcf7 (ENSCVAG00000013560)	vdac1 (ENSCVAG00000013466) #22	C5orf15 (ENSCVAG00000013434)	fstl4 (ENSCVAG00000013427)	ENSCVAG00000013382	ENSCVAG00000013367	ENSCVAG00000013337	ENSCVAG00000013001	ENSCVAG00000012993	thop1 (ENSCVAG00000012981)	ENSCVAG00000012942	ENSCVAG00000012934	ENSCVAG00000012920	ENSCVAG00000000336	ENSCVAG00000012831	ENSCVAG00000012782	tm2d1 (ENSCVAG00000012715)
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000159541	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831.j	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076.l	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667.f	ENSGT00940000167667.e	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a.e	ENSGT00940000163251.a.a.f	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536.d	ENSGT00940000157695
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159541	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831.j	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076.l	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667.f	ENSGT00940000167667.e	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a.e	ENSGT00940000163251.a.a.f	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536.d	ENSGT00940000157695
NAME_6	DUPLICATION
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	347																ENSGT00950000182869.e.a.b.g #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076.k	ENSGT00940000158076.l	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667.f	ENSGT00940000167667.e	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a.e
Sailfin molly	MODERN SPECIES	2478																vdac1 (ENSPLAG00000008313) #22	ENSPLAG00000008298
Amazon molly	MODERN SPECIES	554																vdac1 (ENSPFOG00000002459) #22	C5orf15 (ENSPFOG00000022941)	ENSPFOG00000024376	fstl4 (ENSPFOG00000002566)	ENSPFOG00000003060	fnip1 (ENSPFOG00000003944)	ENSPFOG00000004541	ENSPFOG00000005268	slc22a4 (ENSPFOG00000023550)	ENSPFOG00000005456	slc22a21 (ENSPFOG00000005758)	slc22a21 (ENSPFOG00000024663)
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	343					ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831.j	ENSGT00950000182869.e.a.b.h #22
Sailfin molly	MODERN SPECIES	2249															tcf7 (ENSPLAG00000021331)	vdac1 (ENSPLAG00000021325) #22
Amazon molly	MODERN SPECIES	696		ENSPFOG00000023006	zgc:77058 (ENSPFOG00000020034)	ddx46 (ENSPFOG00000004966)	camlg (ENSPFOG00000021767)	ENSPFOG00000005205	camlg (ENSPFOG00000005220)	SEC24A (ENSPFOG00000005299)	sar1b (ENSPFOG00000005666)	JADE2 (ENSPFOG00000005729)	cdkn2aipnl (ENSPFOG00000005930)	ube2b (ENSPFOG00000023925)	PPP2CA (ENSPFOG00000005944)	skp1 (ENSPFOG00000006019)	tcf7 (ENSPFOG00000006026)	vdac1 (ENSPFOG00000006166) #22
Guppy	MODERN SPECIES	444																vdac1 (ENSPREG00000003307) #22	C5orf15 (ENSPREG00000003344)	fstl4 (ENSPREG00000003369)	ENSPREG00000003465	ENSPREG00000003515	fnip1 (ENSPREG00000003737)	ENSPREG00000003850	IRF1 (ENSPREG00000003901)	slc22a4 (ENSPREG00000003941)	slc22a4 (ENSPREG00000003990)	ENSPREG00000004014	slc22a21 (ENSPREG00000004027)	ENSPREG00000004047	ENSPREG00000004095	pdlim4 (ENSPREG00000004329)	FBXO40 (ENSPREG00000004335)
Platyfish	MODERN SPECIES	2	ENSXMAG00000027395	pitx1 (ENSXMAG00000008331)	PCBD2 (ENSXMAG00000029182)	txndc15 (ENSXMAG00000008328)	zgc:77058 (ENSXMAG00000025956)	ddx46 (ENSXMAG00000008312)	camlg (ENSXMAG00000021634)	SEC24A (ENSXMAG00000008298)	sar1b (ENSXMAG00000008294)	JADE2 (ENSXMAG00000028835)	cdkn2aipnl (ENSXMAG00000008286)	ube2b (ENSXMAG00000027189)	PPP2CA (ENSXMAG00000008278)	skp1 (ENSXMAG00000008273)	tcf7 (ENSXMAG00000029064)	vdac1 (ENSXMAG00000007418) #22	C5orf15 (ENSXMAG00000021893)	ENSXMAG00000023109	fstl4 (ENSXMAG00000008251)	ENSXMAG00000027515	RAPGEF6 (ENSXMAG00000008227)	fnip1 (ENSXMAG00000011993)	ENSXMAG00000012038	ENSXMAG00000011087	slc22a4 (ENSXMAG00000012072)	ENSXMAG00000026371	slc22a4 (ENSXMAG00000021251)	ENSXMAG00000012087	slc22a21 (ENSXMAG00000012103)	ENSXMAG00000012140	ENSXMAG00000012217
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000260029.a.a.b.a.a.b.c.a.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000260029.a.a.b.a.a.b.c.a.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d
Indian medaka	MODERN SPECIES	4	pitx1 (ENSOMEG00000003208)	PCBD2 (ENSOMEG00000003217)	txndc15 (ENSOMEG00000003249)	ENSOMEG00000003266	zgc:77058 (ENSOMEG00000003277)	ddx46 (ENSOMEG00000003338)	camlg (ENSOMEG00000003357)	SEC24A (ENSOMEG00000003429)	sar1b (ENSOMEG00000001052)	JADE2 (ENSOMEG00000003495)	cdkn2aipnl (ENSOMEG00000003517)	ube2b (ENSOMEG00000003529)	PPP2CA (ENSOMEG00000003551)	skp1 (ENSOMEG00000000076)	tcf7 (ENSOMEG00000003637)	vdac1 (ENSOMEG00000003682) #22	C5orf15 (ENSOMEG00000003693)	fstl4 (ENSOMEG00000003722)	ENSOMEG00000003924	fnip1 (ENSOMEG00000004038)	ENSOMEG00000004091	ENSOMEG00000000094	slc22a4 (ENSOMEG00000004218)	ENSOMEG00000004234	slc22a21 (ENSOMEG00000004259)	ENSOMEG00000004273	ENSOMEG00000004289	ENSOMEG00000004294	pdlim4 (ENSOMEG00000004320)	p4ha2 (ENSOMEG00000004357)	ENSOMEG00000004405
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	5	clk4b (ENSOJAG00000017760)	GPR119 (ENSOJAG00000017726)	slc25a14 (ENSOJAG00000017682)	btg4 (ENSOJAG00000017667)	HNRNPAB (ENSOJAG00000017658)	ponzr2 (ENSOJAG00000017647)	ENSOJAG00000017638	HAND1 (ENSOJAG00000017631)	sap30l (ENSOJAG00000017612)	JADE2 (ENSOJAG00000017573)	cdkn2aipnl (ENSOJAG00000017568)	ube2b (ENSOJAG00000017539)	PPP2CA (ENSOJAG00000017513)	skp1 (ENSOJAG00000017491)	tcf7 (ENSOJAG00000017469)	vdac1 (ENSOJAG00000017172) #22	C5orf15 (ENSOJAG00000017128)	ENSOJAG00000017123	fstl4 (ENSOJAG00000016443)	ENSOJAG00000016280	fnip1 (ENSOJAG00000016221)	ENSOJAG00000016075	ENSOJAG00000010932	slc22a4 (ENSOJAG00000010344)	ENSOJAG00000010294	slc22a21 (ENSOJAG00000010050)	ENSOJAG00000010005	ENSOJAG00000009989	pdlim4 (ENSOJAG00000009978)	p4ha2 (ENSOJAG00000009268)	ENSOJAG00000008904
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000260029.a.a.b.a.a.b.c.a.a	ENSGT01090000260029.a.a.b.a.a.b.c.a.b.a	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a
Chinese medaka	MODERN SPECIES	133	macroh2a1 (ENSOSIG00000004900)	pitx1 (ENSOSIG00000004954)	PCBD2 (ENSOSIG00000005253)	txndc15 (ENSOSIG00000005255)	ENSOSIG00000005256	zgc:77058 (ENSOSIG00000005258)	ddx46 (ENSOSIG00000005275)	camlg (ENSOSIG00000006627)	SEC24A (ENSOSIG00000006640)	sar1b (ENSOSIG00000007826)	JADE2 (ENSOSIG00000007857)	ube2b (ENSOSIG00000007860)	PPP2CA (ENSOSIG00000007865)	skp1 (ENSOSIG00000007867)	tcf7 (ENSOSIG00000007874)	vdac1 (ENSOSIG00000007907) #22	C5orf15 (ENSOSIG00000008575)	ENSOSIG00000008576	fstl4 (ENSOSIG00000008585)	ENSOSIG00000008722	ENSOSIG00000017668	ENSOSIG00000021862	ENSOSIG00000021866	ENSOSIG00000021882	slc22a21 (ENSOSIG00000021902)
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	5	ENSORLG00000027221	ENSORLG00000024044	ENSORLG00000024309	zgc:77058 (ENSORLG00000000878)	ddx46 (ENSORLG00000000903)	camlg (ENSORLG00000000912)	SEC24A (ENSORLG00000000920)	sar1b (ENSORLG00000000932)	JADE2 (ENSORLG00000000940)	ENSORLG00000028068	cdkn2aipnl (ENSORLG00000000947)	ube2b (ENSORLG00000000951)	tcf7 (ENSORLG00000000976)	PPP2CA (ENSORLG00000000957)	skp1 (ENSORLG00000000961)	vdac1 (ENSORLG00000000991) #22	C5orf15 (ENSORLG00000028417)	ENSORLG00000026781	fstl4 (ENSORLG00000001025)	ENSORLG00000001061	fnip1 (ENSORLG00000025326)	ENSORLG00000001111	IRF1 (ENSORLG00000001131)	slc22a4 (ENSORLG00000001145)	ENSORLG00000001185	slc22a21 (ENSORLG00000001226)	ENSORLG00000001237	ENSORLG00000025466	ENSORLG00000023443	ENSORLG00000025790	ENSORLG00000022215
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000180246	ENSGT00940000158570.p	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000180246	ENSGT00940000158570.p	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b.a	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570.p	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b.a.b.a.a	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b.a.a.a	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570.p	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570.p	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570.p	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b.a.b.a.a	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b.a.a.a	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570.p	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d
Eastern happy	MODERN SPECIES	1	ENSACLG00000015029	ENSACLG00000015016	ENSACLG00000014990	ENSACLG00000014986	zgc:77058 (ENSACLG00000014963)	ddx46 (ENSACLG00000014804)	camlg (ENSACLG00000014782)	SEC24A (ENSACLG00000014725)	sar1b (ENSACLG00000014649)	JADE2 (ENSACLG00000014614)	cdkn2aipnl (ENSACLG00000014554)	ube2b (ENSACLG00000014526)	PPP2CA (ENSACLG00000014499)	skp1 (ENSACLG00000014479)	tcf7 (ENSACLG00000014129)	vdac1 (ENSACLG00000014054) #22	C5orf15 (ENSACLG00000014042)	fstl4 (ENSACLG00000013901)	ENSACLG00000013489	ENSACLG00000013483	fnip1 (ENSACLG00000013456)	ENSACLG00000013419	ENSACLG00000013240	slc22a4 (ENSACLG00000013227)	ENSACLG00000013202	slc22a21 (ENSACLG00000013189)	ENSACLG00000013183	ENSACLG00000013163	ENSACLG00000013050	pdlim4 (ENSACLG00000013036)	p4ha2 (ENSACLG00000012990)
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1092	pitx1 (ENSMZEG00005009256)	PCBD2 (ENSMZEG00005009250)	txndc15 (ENSMZEG00005009245)	ENSMZEG00005009216	zgc:77058 (ENSMZEG00005009064)	ddx46 (ENSMZEG00005008989)	camlg (ENSMZEG00005008975)	SEC24A (ENSMZEG00005008954)	sar1b (ENSMZEG00005008942)	JADE2 (ENSMZEG00005008915)	cdkn2aipnl (ENSMZEG00005008875)	ube2b (ENSMZEG00005008860)	PPP2CA (ENSMZEG00005008851)	skp1 (ENSMZEG00005008842)	tcf7 (ENSMZEG00005008781)	vdac1 (ENSMZEG00005008735) #22	C5orf15 (ENSMZEG00005008723)	ENSMZEG00005008712	fstl4 (ENSMZEG00005008612)	GABRG2 (ENSMZEG00005008559)	gabra1 (ENSMZEG00005008540)	GABRA6 (ENSMZEG00005008523)	GABRB2 (ENSMZEG00005008510)	SH3PXD2B (ENSMZEG00005008481)	stk10 (ENSMZEG00005008421)	STK32A (ENSMZEG00005008389)	dpysl3 (ENSMZEG00005008356)	JAKMIP2 (ENSMZEG00005008289)	ENSMZEG00005008260	ENSMZEG00005008248	p4ha2 (ENSMZEG00005008207)
P. nyererei	MODERN SPECIES	321					zgc:77058 (ENSPNYG00000012301)	ddx46 (ENSPNYG00000012327)	camlg (ENSPNYG00000012380)	SEC24A (ENSPNYG00000012398)	sar1b (ENSPNYG00000012440)	JADE2 (ENSPNYG00000012483)	cdkn2aipnl (ENSPNYG00000012513)	ube2b (ENSPNYG00000012538)	PPP2CA (ENSPNYG00000012567)	skp1 (ENSPNYG00000012588)	tcf7 (ENSPNYG00000012618)	vdac1 (ENSPNYG00000012683) #22	C5orf15 (ENSPNYG00000012716)	fstl4 (ENSPNYG00000012730)	ENSPNYG00000012809	fnip1 (ENSPNYG00000012967)	ENSPNYG00000013043	IRF1 (ENSPNYG00000013147)	slc22a4 (ENSPNYG00000013176)	ENSPNYG00000013256	slc22a21 (ENSPNYG00000013387)	ENSPNYG00000013413	ENSPNYG00000013427	pdlim4 (ENSPNYG00000013459)	p4ha2 (ENSPNYG00000013496)	ENSPNYG00000013521	JAKMIP2 (ENSPNYG00000013557)
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	323	txndc15 (ENSHBUG00000020874)	ENSHBUG00000020896	ENSHBUG00000020915	ENSHBUG00000020933	zgc:77058 (ENSHBUG00000020946)	ddx46 (ENSHBUG00000021074)	camlg (ENSHBUG00000021085)	SEC24A (ENSHBUG00000021098)	sar1b (ENSHBUG00000000915)	JADE2 (ENSHBUG00000021160)	cdkn2aipnl (ENSHBUG00000021169)	ube2b (ENSHBUG00000021192)	PPP2CA (ENSHBUG00000021230)	skp1 (ENSHBUG00000021246)	tcf7 (ENSHBUG00000021278)	vdac1 (ENSHBUG00000021329) #22	C5orf15 (ENSHBUG00000021347)	ENSHBUG00000021360	fstl4 (ENSHBUG00000021437)	RAPGEF6 (ENSHBUG00000021498)	fnip1 (ENSHBUG00000021675)	ENSHBUG00000021801	ENSHBUG00000021875	slc22a4 (ENSHBUG00000021894)	ENSHBUG00000021908	slc22a21 (ENSHBUG00000021922)	ENSHBUG00000022233	ENSHBUG00000022248
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	297	ENSNBRG00000008355	ENSNBRG00000008342	ENSNBRG00000008323	ENSNBRG00000008299	zgc:77058 (ENSNBRG00000008276)	ddx46 (ENSNBRG00000008155)	camlg (ENSNBRG00000008070)	SEC24A (ENSNBRG00000008051)	sar1b (ENSNBRG00000008013)	JADE2 (ENSNBRG00000007939)	cdkn2aipnl (ENSNBRG00000007913)	UBE2B (ENSNBRG00000007879)	PPP2CA (ENSNBRG00000007844)	skp1 (ENSNBRG00000007808)	tcf7 (ENSNBRG00000007776)	vdac1 (ENSNBRG00000007715) #22	C5orf15 (ENSNBRG00000007701)	fstl4 (ENSNBRG00000007658)	RAPGEF6 (ENSNBRG00000007599)	fnip1 (ENSNBRG00000007564)	ENSNBRG00000007503	ENSNBRG00000007476	slc22a4 (ENSNBRG00000007402)	ENSNBRG00000007366	slc22a21 (ENSNBRG00000007341)	ENSNBRG00000007161	ENSNBRG00000007017	pdlim4 (ENSNBRG00000006992)	p4ha2 (ENSNBRG00000006929)	ENSNBRG00000006909	ENSNBRG00000006879
Nile tilapia	MODERN SPECIES	1	ENSONIG00000029341	ENSONIG00000041073	ENSONIG00000041481	ENSONIG00000038970	ddx46 (ENSONIG00000017282)	camlg (ENSONIG00000017281)	SEC24A (ENSONIG00000017279)	sar1b (ENSONIG00000017278)	JADE2 (ENSONIG00000017275)	cdkn2aipnl (ENSONIG00000017274)	ENSONIG00000028528	ube2b (ENSONIG00000039958)	ppp2ca (ENSONIG00000017267)	skp1 (ENSONIG00000017266)	tcf7 (ENSONIG00000017259)	vdac1 (ENSONIG00000017252) #22	C5orf15 (ENSONIG00000017251)	ENSONIG00000030562	ENSONIG00000042996	fstl4 (ENSONIG00000038503)	ENSONIG00000017241	fnip1 (ENSONIG00000017235)	ENSONIG00000030646	ENSONIG00000017218	ENSONIG00000017217	slc22a4 (ENSONIG00000017215)	ENSONIG00000031271	slc22a21 (ENSONIG00000017207)	ENSONIG00000017201	ENSONIG00000040445	ENSONIG00000027735
Midas cichlid	MODERN SPECIES	1214	ENSACIG00000013190	ENSACIG00000013200	zgc:77058 (ENSACIG00000013224)	ddx46 (ENSACIG00000013235)	camlg (ENSACIG00000013275)	SEC24A (ENSACIG00000013324)	sar1b (ENSACIG00000013634)	ENSACIG00000013646	JADE2 (ENSACIG00000013658)	ENSACIG00000013677	cdkn2aipnl (ENSACIG00000013686)	ube2b (ENSACIG00000013703)	PPP2CA (ENSACIG00000013721)	skp1 (ENSACIG00000013735)	tcf7 (ENSACIG00000013748)	vdac1 (ENSACIG00000013770) #22	C5orf15 (ENSACIG00000013787)
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	57	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b	ENSGT01090000260029.a.a.b.a.a.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570.p	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	85	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b.d	ENSGT01090000260029.a.a.b.a.a.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570.p	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b.d	ENSGT00940000155191.a.a.c.a.a	ENSGT00390000014725.r.b.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570.p	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076
Orange clownfish	MODERN SPECIES	6	txndc15 (ENSAPEG00000022478)	ENSAPEG00000022507	zgc:152891 (ENSAPEG00000022561)	TRAPPC14 (ENSAPEG00000022603)	zgc:77058 (ENSAPEG00000022629)	ddx46 (ENSAPEG00000022648)	camlg (ENSAPEG00000022701)	SEC24A (ENSAPEG00000022724)	sar1b (ENSAPEG00000022771)	JADE2 (ENSAPEG00000022915)	cdkn2aipnl (ENSAPEG00000022936)	ube2b (ENSAPEG00000022952)	PPP2CA (ENSAPEG00000000315)	skp1 (ENSAPEG00000000369)	tcf7 (ENSAPEG00000000404)	vdac1 (ENSAPEG00000000481) #22	ENSAPEG00000000493	fstl4 (ENSAPEG00000000505)	zgc:152891 (ENSAPEG00000000581)	TRAPPC14 (ENSAPEG00000000677)	ENSAPEG00000000730	cadm1a (ENSAPEG00000000786)	ENSAPEG00000000825	ncam1a (ENSAPEG00000000870)	zbtb16a (ENSAPEG00000000983)	HTR3A (ENSAPEG00000001010)	HTR3B (ENSAPEG00000001037)	USP28 (ENSAPEG00000001094)	rbm41 (ENSAPEG00000001223)	klf8 (ENSAPEG00000001318)	klf5l (ENSAPEG00000001364)
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	642															tcf7 (ENSAOCG00000024730)	vdac1 (ENSAOCG00000002759) #22	ENSAOCG00000024748	fstl4 (ENSAOCG00000024750)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	94										JADE2 (ENSAPOG00000000965)	cdkn2aipnl (ENSAPOG00000019535)	ube2b (ENSAPOG00000019564)	PPP2CA (ENSAPOG00000019529)	skp1 (ENSAPOG00000019503)	tcf7 (ENSAPOG00000019463)	vdac1 (ENSAPOG00000019381) #22	ENSAPOG00000019329	fstl4 (ENSAPOG00000019305)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	1006															tcf7 (ENSSPAG00000019350)	vdac1 (ENSSPAG00000019365) #22	C5orf15 (ENSSPAG00000019388)
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000180246	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000159541	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a.d	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.b	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a.c.b	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695
Fugu	MODERN SPECIES	6	macroh2a1 (ENSTRUG00000009196)	pitx1 (ENSTRUG00000009140)	PCBD2 (ENSTRUG00000009098)	txndc15 (ENSTRUG00000009071)	zgc:77058 (ENSTRUG00000019776)	ddx46 (ENSTRUG00000008878)	camlg (ENSTRUG00000008826)	SEC24A (ENSTRUG00000008656)	sar1b (ENSTRUG00000007269)	JADE2 (ENSTRUG00000008402)	cdkn2aipnl (ENSTRUG00000008396)	ube2b (ENSTRUG00000026138)	PPP2CA (ENSTRUG00000008018)	skp1 (ENSTRUG00000008007)	tcf7 (ENSTRUG00000007702)	vdac1 (ENSTRUG00000007625) #22	C5orf15 (ENSTRUG00000021434)	ENSTRUG00000021162	fstl4 (ENSTRUG00000007326)	ENSTRUG00000006132	fnip1 (ENSTRUG00000005664)	irf1b (ENSTRUG00000004321)	slc22a4 (ENSTRUG00000031026)	ENSTRUG00000003362	slc22a21 (ENSTRUG00000001808)	ENSTRUG00000001563	ENSTRUG00000023916	ENSTRUG00000027824	ENSTRUG00000000200	ENSTRUG00000031132	ENSTRUG00000000235
Tetraodon	MODERN SPECIES	22	PCBD2 (ENSTNIG00000016103)	txndc15 (ENSTNIG00000016102)	zgc:77058 (ENSTNIG00000001939)	med21 (ENSTNIG00000016101)	ddx46 (ENSTNIG00000016100)	camlg (ENSTNIG00000016099)	SEC24A (ENSTNIG00000016098)	sar1b (ENSTNIG00000016097)	ENSTNIG00000000024	JADE2 (ENSTNIG00000016096)	cdkn2aipnl (ENSTNIG00000016095)	ube2b (ENSTNIG00000016094)	PPP2CA (ENSTNIG00000016093)	skp1 (ENSTNIG00000016092)	tcf7 (ENSTNIG00000016091)	vdac1 (ENSTNIG00000016090) #22	fstl4 (ENSTNIG00000016089)	RAPGEF6 (ENSTNIG00000016088)	fnip1 (ENSTNIG00000016087)	ENSTNIG00000016086	ENSTNIG00000019636	ENSTNIG00000014263	slc22a21 (ENSTNIG00000014262)	ENSTNIG00000000481	ENSTNIG00000014261	ENSTNIG00000014260	pdlim4 (ENSTNIG00000014259)	p4ha2 (ENSTNIG00000014258)	ENSTNIG00000014257	stk10 (ENSTNIG00000014256)	SH3PXD2B (ENSTNIG00000014255)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	79	macroh2a1 (ENSLBEG00000027329)	pitx1 (ENSLBEG00000027356)	PCBD2 (ENSLBEG00000027371)	txndc15 (ENSLBEG00000027382)	ENSLBEG00000027395	ddx46 (ENSLBEG00000027425)	camlg (ENSLBEG00000027483)	SEC24A (ENSLBEG00000027512)	sar1b (ENSLBEG00000027550)	JADE2 (ENSLBEG00000027567)	cdkn2aipnl (ENSLBEG00000027623)	ube2b (ENSLBEG00000027601)	PPP2CA (ENSLBEG00000027632)	skp1 (ENSLBEG00000027646)	tcf7 (ENSLBEG00000027662)	vdac1 (ENSLBEG00000027674) #22	ENSLBEG00000027687	coro6 (ENSLBEG00000027703)	ssh2b (ENSLBEG00000027733)	nsrp1 (ENSLBEG00000027763)	ENSLBEG00000027783	ENSLBEG00000027795	ENSLBEG00000027819	supt6h (ENSLBEG00000027907)	sdf2 (ENSLBEG00000027956)	ENSLBEG00000027966	nf2b (ENSLBEG00000027985)	mettl27 (ENSLBEG00000028005)	mettl27 (ENSLBEG00000028015)	ENSLBEG00000028030	cldnd (ENSLBEG00000028043)
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	3347																vdac1 (ENSLBEG00000003281) #22	ENSLBEG00000003308
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000159541	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b
European seabass	MODERN SPECIES	4	ENSDLAG00005010760	PCBD2 (ENSDLAG00005010687)	txndc15 (ENSDLAG00005010675)	ENSDLAG00005029582	ENSDLAG00005029578	ddx46 (ENSDLAG00005009957)	camlg (ENSDLAG00005009939)	SEC24A (ENSDLAG00005008731)	sar1b (ENSDLAG00005027244)	JADE2 (ENSDLAG00005008656)	cdkn2aipnl (ENSDLAG00005008651)	ube2b (ENSDLAG00005008633)	PPP2CA (ENSDLAG00005008619)	skp1 (ENSDLAG00005033334)	tcf7 (ENSDLAG00005008406)	vdac1 (ENSDLAG00005008153) #22	C5orf15 (ENSDLAG00005026541)	ENSDLAG00005008136	FSTL4 (ENSDLAG00005007719)	ENSDLAG00005034389	ENSDLAG00005005038	ENSDLAG00005004782	ENSDLAG00005004772	ENSDLAG00005004700	ENSDLAG00005004597	ENSDLAG00005004425	ENSDLAG00005004227	ENSDLAG00005021348	ENSDLAG00005021333	ENSDLAG00005021324	ENSDLAG00005006176
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	493	macroh2a1 (ENSLCRG00005021953)	pitx1 (ENSLCRG00005021942)	PCBD2 (ENSLCRG00005021931)	txndc15 (ENSLCRG00005021929)	ENSLCRG00005021928	ddx46 (ENSLCRG00005021468)	camlg (ENSLCRG00005021465)	SEC24A (ENSLCRG00005021324)	sar1b (ENSLCRG00005021323)	JADE2 (ENSLCRG00005021322)	cdkn2aipnl (ENSLCRG00005021321)	ube2b (ENSLCRG00005021295)	PPP2CA (ENSLCRG00005021282)	skp1 (ENSLCRG00005021279)	tcf7 (ENSLCRG00005021197)	vdac1 (ENSLCRG00005020979) #22	C5orf15 (ENSLCRG00005020973)	ENSLCRG00005020972	fstl4 (ENSLCRG00005020539)	ENSLCRG00005020515	ENSLCRG00005020213	fnip1 (ENSLCRG00005020190)	ENSLCRG00005019802	irf1b (ENSLCRG00005019784)	ENSLCRG00005019783	ENSLCRG00005019779	ENSLCRG00005019773	ENSLCRG00005019767	SLC34A1 (ENSLCRG00005019763)	ENSLCRG00005019762	pdlim4 (ENSLCRG00005019760)
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	4	ENSSAUG00010023624	ENSSAUG00010023623	ENSSAUG00010023622	ENSSAUG00010023621	zgc:77058 (ENSSAUG00010023620)	ddx46 (ENSSAUG00010023583)	camlg (ENSSAUG00010023572)	SEC24A (ENSSAUG00010023024)	sar1b (ENSSAUG00010023010)	JADE2 (ENSSAUG00010023005)	cdkn2aipnl (ENSSAUG00010022998)	ube2b (ENSSAUG00010022982)	PPP2CA (ENSSAUG00010022977)	skp1 (ENSSAUG00010022975)	tcf7 (ENSSAUG00010022625)	vdac1 (ENSSAUG00010022598) #22	C5orf15 (ENSSAUG00010022596)	fstl4 (ENSSAUG00010022544)	RAPGEF6 (ENSSAUG00010017207)	ENSSAUG00010016233	IRF-1 (ENSSAUG00010016214)	slc22a4 (ENSSAUG00010016187)	ENSSAUG00010016182	ENSSAUG00010016179	slc22a21 (ENSSAUG00010016177)	ENSSAUG00010015959	mks1 (ENSSAUG00010015714)	ap2b1 (ENSSAUG00010015453)	styxl1 (ENSSAUG00010015442)	tmem120aa (ENSSAUG00010014087)	HEPACAM (ENSSAUG00010013974)
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b
Pike perch	MODERN SPECIES	22	PCBD2 (ENSSLUG00000017269)	txndc15 (ENSSLUG00000017262)	ENSSLUG00000017258	ENSSLUG00000017256	zgc:77058 (ENSSLUG00000017252)	ddx46 (ENSSLUG00000016913)	camlg (ENSSLUG00000016886)	SEC24A (ENSSLUG00000016258)	sar1b (ENSSLUG00000016222)	JADE2 (ENSSLUG00000016211)	cdkn2aipnl (ENSSLUG00000016203)	ube2b (ENSSLUG00000016044)	PPP2CA (ENSSLUG00000016014)	skp1 (ENSSLUG00000016001)	tcf7 (ENSSLUG00000015906)	vdac1 (ENSSLUG00000015783) #22	C5orf15 (ENSSLUG00000015754)	ENSSLUG00000015745	ENSSLUG00000015733	fstl4 (ENSSLUG00000015597)	ENSSLUG00000015569	ENSSLUG00000014100	ENSSLUG00000004913	ENSSLUG00000004372	ENSSLUG00000004356	ENSSLUG00000004346	ENSSLUG00000004234	ENSSLUG00000004207	slc22a21 (ENSSLUG00000004102)	ENSSLUG00000003961
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	5	ENSCGOG00000024242	ENSCGOG00000024243	ENSCGOG00000024248	ENSCGOG00000001585	ENSCGOG00000001651	ddx46 (ENSCGOG00000001693)	camlg (ENSCGOG00000002076)	SEC24A (ENSCGOG00000002185)	sar1b (ENSCGOG00000004801)	JADE2 (ENSCGOG00000004912)	cdkn2aipnl (ENSCGOG00000004960)	ube2b (ENSCGOG00000004932)	PPP2CA (ENSCGOG00000004965)	skp1 (ENSCGOG00000005119)	tcf7 (ENSCGOG00000005140)	vdac1 (ENSCGOG00000005208) #22	C5orf15 (ENSCGOG00000006195)	fstl4 (ENSCGOG00000006202)	fnip1 (ENSCGOG00000006236)	ENSCGOG00000006426	IRF1 (ENSCGOG00000013625)	slc22a4 (ENSCGOG00000013636)	ENSCGOG00000013684	slc22a21 (ENSCGOG00000013950)	ENSCGOG00000013954	ENSCGOG00000013956	ENSCGOG00000013963	ENSCGOG00000013968	ENSCGOG00000013973	ENSCGOG00000013978	SLC34A1 (ENSCGOG00000013993)
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	84										ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.b
Lumpfish	MODERN SPECIES	5	rhogb (ENSCLMG00005018619)	ncf1 (ENSCLMG00005018501)	st6gal1 (ENSCLMG00005018498)	HNRNPAB (ENSCLMG00005018497)	btg4 (ENSCLMG00005018487)	slc25a14 (ENSCLMG00005018483)	GPR119 (ENSCLMG00005018481)	ENSCLMG00005018480	ENSCLMG00005018479	JADE2 (ENSCLMG00005018478)	cdkn2aipnl (ENSCLMG00005018477)	ube2b (ENSCLMG00005018471)	PPP2CA (ENSCLMG00005018469)	skp1 (ENSCLMG00005018468)	tcf7 (ENSCLMG00005018467)	vdac1 (ENSCLMG00005018465) #22	ENSCLMG00005018464	ENSCLMG00005018463	ENSCLMG00005018461	fstl4 (ENSCLMG00005018458)	ENSCLMG00005018037	fnip1 (ENSCLMG00005016249)	ENSCLMG00005015350	irf1b (ENSCLMG00005015340)	ENSCLMG00005015310	ENSCLMG00005015300	slc22a21 (ENSCLMG00005015272)	ENSCLMG00005015125	ENSCLMG00005015119	ppm1e (ENSCLMG00005015116)	TRIM37 (ENSCLMG00005014874)
Stickleback	MODERN SPECIES	7	ENSGACG00000020898	guca1d (ENSGACG00000020897)	rhogb (ENSGACG00000020896)	pgap2 (ENSGACG00000020895)	ENSGACG00000020894	ENSGACG00000020893	zmat2 (ENSGACG00000020892)	ENSGACG00000020891	ENSGACG00000020890	nhp2 (ENSGACG00000020889)	ENSGACG00000020888	cdkn2aipnl (ENSGACG00000020887)	ENSGACG00000020886	PPP2CA (ENSGACG00000020885)	skp1 (ENSGACG00000020884)	vdac1 (ENSGACG00000020883) #22	ENSGACG00000020882	ENSGACG00000020881	fstl4 (ENSGACG00000020880)	ENSGACG00000020879	fnip1 (ENSGACG00000020878)	ENSGACG00000020877	irf1b (ENSGACG00000020876)	slc22a4 (ENSGACG00000020875)	slc22a21 (ENSGACG00000020874)	ENSGACG00000020873	ENSGACG00000020872	KCNJ15 (ENSGACG00000020871)	SMG8 (ENSGACG00000020870)	ppm1e (ENSGACG00000020869)	ENSGACG00000020868
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000180246	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000159541	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831.l	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000158185
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00940000154593.a.a.h	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831.l	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000158185
Climbing perch	MODERN SPECIES	5	ENSATEG00000013293	ENSATEG00000013139	ENSATEG00000013247	zgc:77058 (ENSATEG00000013098)	ddx46 (ENSATEG00000012998)	camlg (ENSATEG00000012973)	SEC24A (ENSATEG00000012932)	sar1b (ENSATEG00000012904)	JADE2 (ENSATEG00000012891)	cdkn2aipnl (ENSATEG00000012877)	ube2b (ENSATEG00000012849)	PPP2CA (ENSATEG00000012817)	skp1 (ENSATEG00000012791)	SKP1 (ENSATEG00000012539)	tcf7 (ENSATEG00000012486)	vdac1 (ENSATEG00000012447) #22	C5orf15 (ENSATEG00000012441)	FSTL4 (ENSATEG00000012386)	ENSATEG00000012200	ENSATEG00000012162	ENSATEG00000012077	ENSATEG00000012034	ENSATEG00000011962	ENSATEG00000011923	ENSATEG00000011888	ENSATEG00000011816	ENSATEG00000011775	p4ha2 (ENSATEG00000011722)	JAKMIP2 (ENSATEG00000011653)	dpysl3 (ENSATEG00000011595)	STK32A (ENSATEG00000011554)
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	5	ENSBSLG00000010968	ddx46 (ENSBSLG00000011055)	zgc:77058 (ENSBSLG00000011549)	camlg (ENSBSLG00000011551)	SEC24A (ENSBSLG00000011851)	sar1b (ENSBSLG00000012790)	JADE2 (ENSBSLG00000013068)	cdkn2aipnl (ENSBSLG00000013099)	ube2b (ENSBSLG00000013236)	PPP2CA (ENSBSLG00000013499)	skp1 (ENSBSLG00000013533)	tcf7 (ENSBSLG00000013637)	ENSBSLG00000014039	ENSBSLG00000014060	ENSBSLG00000014089	vdac1 (ENSBSLG00000014135) #22	C5orf15 (ENSBSLG00000014461)	fstl4 (ENSBSLG00000014690)	RAPGEF6 (ENSBSLG00000014892)	fnip1 (ENSBSLG00000015835)	ENSBSLG00000016076	IRF1 (ENSBSLG00000019407)	slc22a4 (ENSBSLG00000019454)	ENSBSLG00000019473	slc22a21 (ENSBSLG00000019542)	ENSBSLG00000019614	ENSBSLG00000019824	ENSBSLG00000020078	ENSBSLG00000020083	pdlim4 (ENSBSLG00000020087)	p4ha2 (ENSBSLG00000020993)
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	5	macroh2a1 (ENSMAMG00000021779)	ENSMAMG00000021775	PCBD2 (ENSMAMG00000021772)	txndc15 (ENSMAMG00000021770)	zgc:77058 (ENSMAMG00000021768)	ddx46 (ENSMAMG00000021755)	camlg (ENSMAMG00000026070)	SEC24A (ENSMAMG00000021736)	sar1b (ENSMAMG00000021732)	JADE2 (ENSMAMG00000021722)	cdkn2aipnl (ENSMAMG00000021716)	ube2b (ENSMAMG00000026516)	PPP2CA (ENSMAMG00000021702)	skp1 (ENSMAMG00000021700)	tcf7 (ENSMAMG00000021685)	vdac1 (ENSMAMG00000021673) #22	C5orf15 (ENSMAMG00000021669)	FSTL4 (ENSMAMG00000021664)	ENSMAMG00000021626	ENSMAMG00000021613	ENSMAMG00000021601	ENSMAMG00000021596	ENSMAMG00000021590	ENSMAMG00000021588	ENSMAMG00000021586	ENSMAMG00000025143	ENSMAMG00000021579	ENSMAMG00000021569	p4ha2 (ENSMAMG00000021549)	JAKMIP2 (ENSMAMG00000021536)	dpysl3 (ENSMAMG00000021522)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000180246	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000260059.a.b.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000180246	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652.f	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT01090000260059.a.b.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000180246	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652.f	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b
Greater amberjack	MODERN SPECIES	139	txndc15 (ENSSDUG00000021053)	ENSSDUG00000021043	ENSSDUG00000021038	ENSSDUG00000021022	zgc:77058 (ENSSDUG00000021016)	ddx46 (ENSSDUG00000020991)	camlg (ENSSDUG00000020985)	SEC24A (ENSSDUG00000020943)	sar1b (ENSSDUG00000020926)	JADE2 (ENSSDUG00000020877)	cdkn2aipnl (ENSSDUG00000020866)	ube2b (ENSSDUG00000020850)	PPP2CA (ENSSDUG00000020830)	skp1 (ENSSDUG00000020818)	tcf7 (ENSSDUG00000020751)	vdac1 (ENSSDUG00000020705) #22	C5orf15 (ENSSDUG00000020696)	fstl4 (ENSSDUG00000020639)	RAPGEF6 (ENSSDUG00000020526)	fnip1 (ENSSDUG00000020463)	ENSSDUG00000020429	ENSSDUG00000020396	slc22a4 (ENSSDUG00000020374)	ENSSDUG00000020357	slc22a21 (ENSSDUG00000020334)	ENSSDUG00000020197	ENSSDUG00000020176	SLC34A1 (ENSSDUG00000020152)	pdlim4 (ENSSDUG00000020137)	p4ha2 (ENSSDUG00000020111)	ENSSDUG00000020087
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2907	ENSSLDG00000016736	ENSSLDG00000016749	ENSSLDG00000016784	zgc:77058 (ENSSLDG00000016823)	ddx46 (ENSSLDG00000016854)	camlg (ENSSLDG00000016962)	ENSSLDG00000016984	sar1b (ENSSLDG00000017052)	ENSSLDG00000017123	JADE2 (ENSSLDG00000017143)	cdkn2aipnl (ENSSLDG00000017164)	ube2b (ENSSLDG00000017184)	PPP2CA (ENSSLDG00000017206)	skp1 (ENSSLDG00000017230)	tcf7 (ENSSLDG00000017257)	vdac1 (ENSSLDG00000017318) #22	C5orf15 (ENSSLDG00000017353)	fstl4 (ENSSLDG00000017368)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	94	PCBD2 (ENSLCAG00010012441)	txndc15 (ENSLCAG00010012446)	ENSLCAG00010012459	ENSLCAG00010012464	zgc:77058 (ENSLCAG00010012468)	ddx46 (ENSLCAG00010012508)	camlg (ENSLCAG00010012604)	sar1b (ENSLCAG00010012616)	SEC24A (ENSLCAG00010012767)	JADE2 (ENSLCAG00010013265)	cdkn2aipnl (ENSLCAG00010013311)	ube2b (ENSLCAG00010013327)	PPP2CA (ENSLCAG00010013378)	skp1 (ENSLCAG00010013403)	tcf7 (ENSLCAG00010013414)	vdac1 (ENSLCAG00010013420) #22	C5orf15 (ENSLCAG00010013430)	fstl4 (ENSLCAG00010013483)	ENSLCAG00010013681	fnip1 (ENSLCAG00010013774)	ENSLCAG00010014045	IRF1 (ENSLCAG00010015878)	slc22a4 (ENSLCAG00010015884)	ENSLCAG00010015887	slc22a21 (ENSLCAG00010015894)	ENSLCAG00010015907	ENSLCAG00010015963	SLC34A1 (ENSLCAG00010015973)	pdlim4 (ENSLCAG00010015997)	p4ha2 (ENSLCAG00010016263)	ENSLCAG00010017150
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000159541	ENSGT00940000165985	ENSGT00390000007221.a.a	ENSGT00390000002845	ENSGT00390000014889.b	ENSGT00940000157753	ENSGT00390000015996	ENSGT00950000182924.B.a.b	ENSGT00940000164397.b	ENSGT00940000158570	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.lb.b	ENSGT00390000012652	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b #22	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00940000156288.a	ENSGT00940000167667	ENSGT00940000163251.a.b.b	ENSGT00940000163251.a.a	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000153713.B.d
Turbot	MODERN SPECIES	16	macroh2a1 (ENSSMAG00000007415)	ENSSMAG00000024358	PCBD2 (ENSSMAG00000007303)	txndc15 (ENSSMAG00000007365)	zgc:77058 (ENSSMAG00000007295)	ddx46 (ENSSMAG00000007229)	camlg (ENSSMAG00000007219)	SEC24A (ENSSMAG00000007126)	sar1b (ENSSMAG00000007106)	JADE2 (ENSSMAG00000007087)	cdkn2aipnl (ENSSMAG00000024456)	ube2b (ENSSMAG00000007040)	PPP2CA (ENSSMAG00000007016)	skp1 (ENSSMAG00000007007)	tcf7 (ENSSMAG00000006917)	vdac1 (ENSSMAG00000006897) #22	C5orf15 (ENSSMAG00000006879)	FSTL4 (ENSSMAG00000006785)	ENSSMAG00000006774	ENSSMAG00000006491	ENSSMAG00000026937	ENSSMAG00000006329	ENSSMAG00000006178	ENSSMAG00000006165	ENSSMAG00000006158	ENSSMAG00000006010	ENSSMAG00000005984	ENSSMAG00000005969	ENSSMAG00000005964	p4ha2 (ENSSMAG00000005843)	ENSSMAG00000005767
Tongue sole	MODERN SPECIES	10	vps51 (ENSCSEG00000015406)	tm7sf2 (ENSCSEG00000015386)	cnih2 (ENSCSEG00000015369)	slc8a4a (ENSCSEG00000015359)	ENSCSEG00000015350	ENSCSEG00000015339	fhl1b (ENSCSEG00000015268)	SEC24A (ENSCSEG00000015247)	sar1b (ENSCSEG00000015238)	JADE2 (ENSCSEG00000015226)	cdkn2aipnl (ENSCSEG00000015222)	ube2b (ENSCSEG00000015219)	PPP2CA (ENSCSEG00000015211)	skp1 (ENSCSEG00000015204)	tcf7 (ENSCSEG00000015189)	vdac1 (ENSCSEG00000015156) #22	C5orf15 (ENSCSEG00000015151)	ENSCSEG00000015139	fstl4 (ENSCSEG00000015093)	NR3C1 (ENSCSEG00000015073)	yipf5 (ENSCSEG00000015061)	kctd16b (ENSCSEG00000015057)	GRXCR2 (ENSCSEG00000015051)	PLAC8L1 (ENSCSEG00000015044)	LARS1 (ENSCSEG00000014984)	RBM27 (ENSCSEG00000014910)	pou4f3 (ENSCSEG00000014894)	RAD50 (ENSCSEG00000014793)	drd1b (ENSCSEG00000014779)	msx2b (ENSCSEG00000014773)	nsg2 (ENSCSEG00000014763)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	5	macroh2a1 (ENSMMDG00005019997)	pitx1 (ENSMMDG00005020065)	PCBD2 (ENSMMDG00005020150)	txndc15 (ENSMMDG00005020169)	zgc:77058 (ENSMMDG00005020189)	ddx46 (ENSMMDG00005020541)	camlg (ENSMMDG00005021588)	SEC24A (ENSMMDG00005022416)	sar1b (ENSMMDG00005024216)	JADE2 (ENSMMDG00005024238)	cdkn2aipnl (ENSMMDG00005024257)	ube2b (ENSMMDG00005024278)	PPP2CA (ENSMMDG00005024322)	skp1 (ENSMMDG00005024352)	tcf7 (ENSMMDG00005024389)	vdac1 (ENSMMDG00005024484) #22	ENSMMDG00005024556	ENSMMDG00005024560	ENSMMDG00005024580	fstl4 (ENSMMDG00005024588)	RAPGEF6 (ENSMMDG00005024641)	fnip1 (ENSMMDG00005024715)	ENSMMDG00005024760	IRF1 (ENSMMDG00005025063)	IRF1 (ENSMMDG00005025064)	slc22a4 (ENSMMDG00005025065)	ENSMMDG00005025066	slc22a21 (ENSMMDG00005025067)	ENSMMDG00005025068	SLC34A1 (ENSMMDG00005025069)	pdlim4 (ENSMMDG00005025070)
Spotted gar	MODERN SPECIES	672	pitx1 (ENSLOCG00000010144)	CATSPER3 (ENSLOCG00000010152)	txndc15 (ENSLOCG00000010163)	zgc:77058 (ENSLOCG00000018304)	ddx46 (ENSLOCG00000010169)	ENSLOCG00000010178	SEC24A (ENSLOCG00000010187)	sar1b (ENSLOCG00000010197)	JADE2 (ENSLOCG00000010206)	cdkn2aipnl (ENSLOCG00000010215)	ube2b (ENSLOCG00000010219)	CDKL3 (ENSLOCG00000010226)	ppp2cab (ENSLOCG00000010230)	skp1 (ENSLOCG00000010241)	tcf7 (ENSLOCG00000010252)	vdac1 (ENSLOCG00000010266) #22	C5orf15 (ENSLOCG00000010282)	fstl4 (ENSLOCG00000010287)	RAPGEF6 (ENSLOCG00000010294)	fnip1 (ENSLOCG00000010308)	ENSLOCG00000010317	irf1b (ENSLOCG00000010331)	slc22a4 (ENSLOCG00000010336)	slc22a21 (ENSLOCG00000010344)	ENSLOCG00000010358	pdlim4 (ENSLOCG00000010368)	p4ha2 (ENSLOCG00000010375)	RAD50 (ENSLOCG00000010392)	kif3a (ENSLOCG00000010399)	pou4f3 (ENSLOCG00000010420)	RBM27 (ENSLOCG00000010426)
Reedfish	MODERN SPECIES	2	ENSECRG00000009090	SEC24A (ENSECRG00000009037)	sar1b (ENSECRG00000009016)	sar1b (ENSECRG00000009002)	JADE2 (ENSECRG00000008979)	ENSECRG00000008955	cdkn2aipnl (ENSECRG00000008947)	ENSECRG00000008937	ube2b (ENSECRG00000008908)	ENSECRG00000008886	ppp2cab (ENSECRG00000008872)	skp1 (ENSECRG00000008858)	ENSECRG00000008851	ENSECRG00000008838	tcf7 (ENSECRG00000008795)	vdac1 (ENSECRG00000008770) #22	C5orf15 (ENSECRG00000008760)	fstl4 (ENSECRG00000008746)	RAPGEF6 (ENSECRG00000008624)	fnip1 (ENSECRG00000008561)	ENSECRG00000008537	IRF1 (ENSECRG00000008518)	ENSECRG00000008504	ENSECRG00000008494	SLC22A4 (ENSECRG00000008484)	pdlim4 (ENSECRG00000008471)	ENSECRG00000008465	p4ha2 (ENSECRG00000008428)	ENSECRG00000008399	RAD50 (ENSECRG00000008371)	kif3a (ENSECRG00000008309)
Elephant shark	MODERN SPECIES	1572	ENSCMIG00000006456	ddx46 (ENSCMIG00000006420)	ENSCMIG00000006397	camlg (ENSCMIG00000006390)	ENSCMIG00000006382	SEC24A (ENSCMIG00000006357)	sar1b (ENSCMIG00000006330)	JADE2 (ENSCMIG00000006326)	cdkn2aipnl (ENSCMIG00000006324)	ENSCMIG00000006290	ppp2cab (ENSCMIG00000006272)	SKP1 (ENSCMIG00000006268)	ENSCMIG00000006266	ENSCMIG00000006265	cyp2u1 (ENSCMIG00000006261)	vdac1 (ENSCMIG00000006252) #22	ENSCMIG00000006248	FSTL4 (ENSCMIG00000006230)	RAPGEF6 (ENSCMIG00000005650)	ENSCMIG00000004631	ENSCMIG00000004338	ENSCMIG00000004323	pdlim4 (ENSCMIG00000004312)	ubtd2 (ENSCMIG00000004309)	ENSCMIG00000004306	STK10 (ENSCMIG00000003838)	SH3PXD2B (ENSCMIG00000003689)	neurl1b (ENSCMIG00000003684)