Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000154518.a ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182808.a.a.a.b ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652 #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000156288 ENSGT00940000163251.a ENSGT00940000159536 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 79 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT01090000260575 ENSGT00950000182808.a.a.a.b ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652 #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000156288 ENSGT00940000163251.a ENSGT00940000154155 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000157695 ENSGT00390000018781 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652 #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000156288 ENSGT00940000154155 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000157695 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 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ENSGT00390000016270 ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000154155 ENSGT00940000156288 ENSGT00390000018781 ENSGT00390000013108 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156068 #35 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00390000016270 ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000154155 ENSGT00940000156288 ENSGT00390000016991 ENSGT00390000018781 ENSGT00390000013108 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00940000162679 #36 Theria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00390000016270 ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000154155 ENSGT00940000156288 ENSGT00390000016991 ENSGT00390000018781 ENSGT00390000003225 ENSGT00390000013108 ENSGT00940000156386 #37 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #28 ENSGT00390000013467 #30 ENSGT00390000004029 #31 ENSGT00940000159784 #32 ENSGT00940000160656 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00390000013108 ENSGT00390000003225 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 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#32 ENSGT00940000160656 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00390000013108 ENSGT00390000003225 Primates ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.ab.b #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #28 ENSGT00390000013467 #30 ENSGT00390000004029 #31 ENSGT00940000159784 #32 ENSGT00940000160656 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00390000013108 ENSGT00390000003225 Haplorrhini ANCESTRAL 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ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156386 #37 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a.i #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00940000153446.a.a.q.a.a.a.b ENSGT00940000155258.s.a.c ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #28 ENSGT00910000147122 #29 ENSGT00390000013467 #30 ENSGT00390000004029 #31 ENSGT00940000159784 #32 ENSGT00940000160656 #33 ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156386 #37 Capuchin MODERN SPECIES 76 TXNDC15 (ENSCCAG00000030665) #8 ENSCCAG00000033520 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ENSGGOG00000039492 ##22 HMGN5 (ENSGGOG00000016479) SH3BGRL (ENSGGOG00000009664) ENSGGOG00000025534 POU3F4 (ENSGGOG00000027353) CYLC1 (ENSGGOG00000001587) RPS6KA6 (ENSGGOG00000016474) HDX (ENSGGOG00000005551) ENSGGOG00000016329 SATL1 (ENSGGOG00000016333) ZNF711 (ENSGGOG00000006110) POF1B (ENSGGOG00000016908) CHM (ENSGGOG00000022912) ENSGGOG00000040803 DACH2 (ENSGGOG00000007231) KLHL4 (ENSGGOG00000002307) Gorilla MODERN SPECIES 523 DACH2 (ENSGGOG00000007231) ENSGGOG00000040803 CHM (ENSGGOG00000022912) POF1B (ENSGGOG00000016908) ZNF711 (ENSGGOG00000006110) SATL1 (ENSGGOG00000016333) ENSGGOG00000016329 HDX (ENSGGOG00000005551) RPS6KA6 (ENSGGOG00000016474) CYLC1 (ENSGGOG00000001587) POU3F4 (ENSGGOG00000027353) ENSGGOG00000025534 SH3BGRL (ENSGGOG00000009664) HMGN5 (ENSGGOG00000016479) ENSGGOG00000039492 ##22 ENSGGOG00000037044 ##22 ENSGGOG00000039837 BRWD3 (ENSGGOG00000004108) ENSGGOG00000015916 ENSGGOG00000043041 TBX22 (ENSGGOG00000008990) ITM2A (ENSGGOG00000026998) GPR174 (ENSGGOG00000024322) CYSLTR1 (ENSGGOG00000003276) TAF9B (ENSGGOG00000002470) PGK1 (ENSGGOG00000017111) ATP7A (ENSGGOG00000025640) COX7B (ENSGGOG00000023347) MAGT1 (ENSGGOG00000010342) ATRX (ENSGGOG00000024999) FGF16 (ENSGGOG00000002237) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.a ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 1126 ADGRG7 (ENSANAG00000033047) ENSANAG00000038428 TMEM45A (ENSANAG00000023330) LNP1 (ENSANAG00000031808) TOMM70 (ENSANAG00000020825) NIT2 (ENSANAG00000020458) TBC1D23 (ENSANAG00000024314) ENSANAG00000001502 CMSS1 (ENSANAG00000023565) FILIP1L (ENSANAG00000036993) COL8A1 (ENSANAG00000036463) ENSANAG00000019820 DCBLD2 (ENSANAG00000035766) ENSANAG00000035028 ST3GAL6 (ENSANAG00000026185) ENSANAG00000036882 ##22 CPOX (ENSANAG00000032840) CLDND1 (ENSANAG00000035467) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b ##22 Hominoidea DUPLICATION Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.a ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.a ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.a ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162070 ENSGT00390000003183.e.a ENSGT00390000003183.e.b ENSGT00940000160559 ENSGT00390000008621 ENSGT00940000160940 ENSGT00940000159479 ENSGT00940000162262 ENSGT00940000160459 ENSGT00940000153313.C.a ENSGT00940000153763.a ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000153097.A.f.b ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.a ##22 ENSGT00940000153097.A.f.a.b.b.c ENSGT00390000013859 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000162625 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00910000147473 ENSGT00940000159855 ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000153629.a.b ENSGT00940000158528 ENSGT00940000162529 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000155657.db.a.a ENSGT00940000154102.b Bonobo MODERN SPECIES 369 ENSPPAG00000027565 MAGED1 (ENSPPAG00000037605) CENPVL3 (ENSPPAG00000005217) EZHIP (ENSPPAG00000005586) ENSPPAG00000022094 BMP15 (ENSPPAG00000005038) SHROOM4 (ENSPPAG00000039023) DGKK (ENSPPAG00000034077) CCNB3 (ENSPPAG00000027314) AKAP4 (ENSPPAG00000034394) CLCN5 (ENSPPAG00000029912) USP27X (ENSPPAG00000012284) PAGE4 (ENSPPAG00000037679) PAGE1 (ENSPPAG00000030309) ENSPPAG00000035136 ENSPPAG00000043153 ##22 ENSPPAG00000027179 ENSPPAG00000027948 FOXP3 (ENSPPAG00000028117) CCDC22 (ENSPPAG00000039638) CACNA1F (ENSPPAG00000027619) SYP (ENSPPAG00000033248) PRICKLE3 (ENSPPAG00000040750) PLP2 (ENSPPAG00000040820) MAGIX (ENSPPAG00000037324) GPKOW (ENSPPAG00000040116) WDR45 (ENSPPAG00000042027) CCDC120 (ENSPPAG00000026576) TFE3 (ENSPPAG00000028832) GRIPAP1 (ENSPPAG00000040230) KCND1 (ENSPPAG00000035010) Chimpanzee MODERN SPECIES 972 ENSPTRG00000046536 ENSPTRG00000047771 CENPVL3 (ENSPTRG00000051936) ENSPTRG00000046232 ENSPTRG00000050633 ENSPTRG00000044134 BMP15 (ENSPTRG00000021908) SHROOM4 (ENSPTRG00000021905) DGKK (ENSPTRG00000048026) CCNB3 (ENSPTRG00000048758) AKAP4 (ENSPTRG00000049957) CLCN5 (ENSPTRG00000021899) PAGE4 (ENSPTRG00000021896) ENSPTRG00000021894 ENSPTRG00000045256 ENSPTRG00000048439 ##22 GAGE10 (ENSPTRG00000021892) PPP1R3F (ENSPTRG00000046513) FOXP3 (ENSPTRG00000021890) CCDC22 (ENSPTRG00000021889) ENSPTRG00000049813 CACNA1F (ENSPTRG00000021888) SYP (ENSPTRG00000021887) PRICKLE3 (ENSPTRG00000045748) PLP2 (ENSPTRG00000021885) MAGIX (ENSPTRG00000047576) GPKOW (ENSPTRG00000047603) WDR45 (ENSPTRG00000021882) CCDC120 (ENSPTRG00000021880) TFE3 (ENSPTRG00000021879) GRIPAP1 (ENSPTRG00000051549) Gibbon MODERN SPECIES 449 ENSNLEG00000008180 MAGED1 (ENSNLEG00000008178) ENSNLEG00000033915 NUDT11 (ENSNLEG00000008174) ENSNLEG00000029212 NUDT10 (ENSNLEG00000008173) BMP15 (ENSNLEG00000008172) SHROOM4 (ENSNLEG00000008164) ENSNLEG00000008157 CCNB3 (ENSNLEG00000008143) AKAP4 (ENSNLEG00000008132) CLCN5 (ENSNLEG00000008106) USP27X (ENSNLEG00000028156) PAGE4 (ENSNLEG00000008101) PAGE1 (ENSNLEG00000008094) ENSNLEG00000027542 ##22 ENSNLEG00000027762 ENSNLEG00000030515 ENSNLEG00000033633 PPP1R3F (ENSNLEG00000031049) FOXP3 (ENSNLEG00000008046) CCDC22 (ENSNLEG00000008043) CACNA1F (ENSNLEG00000008028) SYP (ENSNLEG00000008024) ENSNLEG00000008017 GPKOW (ENSNLEG00000007998) ENSNLEG00000007994 CCDC120 (ENSNLEG00000007975) TFE3 (ENSNLEG00000007963) GRIPAP1 (ENSNLEG00000007939) KCND1 (ENSNLEG00000007958) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 143 ENSGT00940000153889.e.a.a ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 137 ENSGT00940000153889.e.a.a ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00940000155206.d.b ENSGT00940000153889.e.a.a ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00940000158335.d Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00940000155206.d.b ENSGT00940000153889.e.a.a ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.b ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000183123.h.b ENSGT00940000161632.c ENSGT00940000158987 ENSGT00940000159060 ENSGT00940000159149 ENSGT00940000159092 ENSGT00480000042679.a ENSGT00940000159162 ENSGT00940000153239.B.i.a.b ENSGT00940000157822 ENSGT00940000163054 ENSGT00730000111097.e ENSGT00940000162927 ENSGT00940000155206.d.b ENSGT00940000153889.e.a.a ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00940000158335.c ENSGT00940000162668 ENSGT00940000154977.l.b.b ENSGT00940000165485 ENSGT00390000003732 ENSGT00950000183119.a.e.a.d.a.a ENSGT00940000159818 ENSGT00390000001134.b ENSGT00940000154911.v ENSGT00950000182994.A.n.a ENSGT00390000000141 ENSGT00940000159611 ENSGT00950000183121.b.b.b.a ENSGT00530000063666.a.m.a ENSGT00390000008591 Bonobo MODERN SPECIES 369 NOX1 (ENSPPAG00000021977) CSTF2 (ENSPPAG00000031804) SYTL4 (ENSPPAG00000026955) SRPX2 (ENSPPAG00000039226) TSPAN6 (ENSPPAG00000038316) TNMD (ENSPPAG00000035804) PCDH19 (ENSPPAG00000039228) ENSPPAG00000034644 DIAPH2 (ENSPPAG00000040909) ENSPPAG00000038822 FAM133A (ENSPPAG00000017635) NAP1L3 (ENSPPAG00000019923) ENSPPAG00000007354 ENSPPAG00000003031 ENSPPAG00000040878 ENSPPAG00000030962 ##22 ENSPPAG00000043443 PABPC5 (ENSPPAG00000007378) ENSPPAG00000041507 ENSPPAG00000038346 CPXCR1 (ENSPPAG00000016441) ENSPPAG00000026574 KLHL4 (ENSPPAG00000043431) ENSPPAG00000036042 ENSPPAG00000024013 CHM (ENSPPAG00000034301) ENSPPAG00000028498 POF1B (ENSPPAG00000033485) ZNF711 (ENSPPAG00000038129) ENSPPAG00000033891 APOOL (ENSPPAG00000037582) Gorilla MODERN SPECIES 523 CSTF2 (ENSGGOG00000022267) SYTL4 (ENSGGOG00000001159) SRPX2 (ENSGGOG00000010009) TSPAN6 (ENSGGOG00000010003) TNMD (ENSGGOG00000017007) PCDH19 (ENSGGOG00000001810) ENSGGOG00000027167 ENSGGOG00000038151 DIAPH2 (ENSGGOG00000002859) ENSGGOG00000038270 FAM133A (ENSGGOG00000043974) NAP1L3 (ENSGGOG00000016989) ENSGGOG00000025902 ENSGGOG00000039790 ENSGGOG00000025897 ENSGGOG00000042618 ##22 ENSGGOG00000008584 PABPC5 (ENSGGOG00000007622) ENSGGOG00000037634 ENSGGOG00000036979 CPXCR1 (ENSGGOG00000026865) RPSA (ENSGGOG00000036643) KLHL4 (ENSGGOG00000002307) DACH2 (ENSGGOG00000007231) ENSGGOG00000040803 CHM (ENSGGOG00000022912) POF1B (ENSGGOG00000016908) ZNF711 (ENSGGOG00000006110) SATL1 (ENSGGOG00000016333) ENSGGOG00000016329 HDX (ENSGGOG00000005551) Gibbon MODERN SPECIES 114 ENSNLEG00000027059 ENSNLEG00000002453 ##22 ENSNLEG00000015514 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 1031 RDH5 (ENSANAG00000022716) ITGA7 (ENSANAG00000035353) METTL7B (ENSANAG00000036477) OR2AP1 (ENSANAG00000005559) OR6C4 (ENSANAG00000005997) OR6C2 (ENSANAG00000020125) ENSANAG00000026469 OR6C3 (ENSANAG00000020167) OR6C6 (ENSANAG00000001856) OR6C74 (ENSANAG00000001962) OR9K2 (ENSANAG00000020116) ENSANAG00000023011 NEUROD4 (ENSANAG00000004700) TESPA1 (ENSANAG00000037498) MUCL1 (ENSANAG00000026232) ENSANAG00000030917 ##22 DCD (ENSANAG00000035073) LACRT (ENSANAG00000021062) PPP1R1A (ENSANAG00000036632) PDE1B (ENSANAG00000034831) NCKAP1L (ENSANAG00000025148) ENSANAG00000023191 GTSF1 (ENSANAG00000024529) ITGA5 (ENSANAG00000036479) ZNF385A (ENSANAG00000001893) GPR84 (ENSANAG00000004247) ENSANAG00000025073 COPZ1 (ENSANAG00000031944) NFE2 (ENSANAG00000025350) ENSANAG00000023645 CBX5 (ENSANAG00000023641) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b ##22 Capuchin MODERN SPECIES 285 OR6C2 (ENSCCAG00000019750) OR6C3 (ENSCCAG00000018653) OR10A7 (ENSCCAG00000008524) ENSCCAG00000029232 NEUROD4 (ENSCCAG00000015070) TESPA1 (ENSCCAG00000023429) ENSCCAG00000025420 ENSCCAG00000021932 ##22 DCD (ENSCCAG00000009193) LACRT (ENSCCAG00000020335) PPP1R1A (ENSCCAG00000027579) PDE1B (ENSCCAG00000034020) NCKAP1L (ENSCCAG00000032586) GTSF1 (ENSCCAG00000032808) ITGA5 (ENSCCAG00000021214) ZNF385A (ENSCCAG00000033332) ENSCCAG00000019051 COPZ1 (ENSCCAG00000013641) NFE2 (ENSCCAG00000027905) ENSCCAG00000033451 CBX5 (ENSCCAG00000024410) ENSCCAG00000035935 HOXC4 (ENSCCAG00000030761) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000182951.B ENSGT00950000182888.a.a.b ENSGT00940000153838.b ENSGT00950000183081.a.a.a ENSGT00390000005554 ENSGT01030000234614.B.b ENSGT00940000159902 ENSGT00940000159228 ENSGT00390000012166.o ENSGT00430000032886 ENSGT00390000012166.p ENSGT00940000155130 ENSGT00940000159504 ENSGT00940000157906 ENSGT00940000157458 ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b ##22 ENSGT00500000044895 ENSGT00390000013003 ENSGT00940000157639 ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b ENSGT00900000141021.a ENSGT00940000155601 ENSGT00940000163676 ENSGT00390000010047.a.a ENSGT00940000161715.jb ENSGT00940000161715.kb ENSGT00660000095605 ENSGT00940000161114 ENSGT00940000154304.B ENSGT00940000154304.A ENSGT00530000063604.B Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000153838.b ENSGT00910000147219 ENSGT00950000183081.a.a.a ENSGT00390000005554 ENSGT00950000183123.g.b.b.i.b ENSGT01030000234614.B.b ENSGT00940000159902 ENSGT00940000159228 ENSGT00390000012166.o ENSGT00430000032886 ENSGT00390000012166.p ENSGT00940000155130 ENSGT00940000159504 ENSGT00940000157906 ENSGT00940000157458 ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b ##22 ENSGT00500000044895 ENSGT00390000013003 ENSGT00940000157639 ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b ENSGT00900000141021.a ENSGT00940000155601 ENSGT00940000163676 ENSGT00390000010047.a.a ENSGT00390000010047.b ENSGT00940000161715.jb ENSGT00940000161715.kb ENSGT00660000095605 ENSGT00940000161114 ENSGT00940000154304.B ENSGT00940000154304.A Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000153838.b ENSGT00910000147219 ENSGT00950000183081.a.a.a ENSGT00390000005554 ENSGT00950000183123.g.b.b.i.b ENSGT01030000234614.B.b ENSGT00940000159902 ENSGT00940000159228 ENSGT00390000012166.o ENSGT00430000032886 ENSGT00390000012166.p ENSGT00940000155130 ENSGT00940000159504 ENSGT00940000157906 ENSGT00940000157458 ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b ##22 ENSGT00500000044895 ENSGT00390000013003 ENSGT00940000157639 ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b ENSGT00900000141021.a ENSGT00940000155601 ENSGT00940000163676 ENSGT00390000010047.a.a ENSGT00390000010047.b ENSGT00940000161715.jb ENSGT00940000161715.kb ENSGT00660000095605 ENSGT00940000161114 ENSGT00940000154304.B ENSGT00940000154304.A Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153838.b ENSGT00910000147219 ENSGT00950000183081.a.a.a ENSGT00390000005554 ENSGT00950000183123.g.b.b.i.b ENSGT01030000234614.B.b ENSGT00940000159902 ENSGT00940000159228 ENSGT00390000012166.o ENSGT00430000032886 ENSGT00390000012166.p ENSGT00940000155130 ENSGT00940000159504 ENSGT00940000157906 ENSGT00940000157458 ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b ##22 ENSGT00500000044895 ENSGT00390000013003 ENSGT00940000157639 ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b ENSGT00900000141021.a ENSGT00940000155601 ENSGT00940000163676 ENSGT00390000010047.a.a ENSGT00390000010047.b ENSGT00940000161715.jb ENSGT00940000161715.kb ENSGT00660000095605 ENSGT00940000161114 ENSGT00940000154304.B ENSGT00940000154304.A Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182951.B ENSGT00950000182888.a.a.b ENSGT00940000153838.b ENSGT00910000147219 ENSGT00950000183081.a.a.a ENSGT00390000005554 ENSGT00950000183123.g.b.b.i.b ENSGT01030000234614.B.b ENSGT00940000159902 ENSGT00940000159228 ENSGT00390000012166.o ENSGT00390000012166.p ENSGT00940000155130 ENSGT00940000159504 ENSGT00940000157906 ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b ##22 ENSGT00940000157458 ENSGT00500000044895 ENSGT00390000013003 ENSGT00940000157639 ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b ENSGT00900000141021.a ENSGT00940000155601 ENSGT00940000163676 ENSGT00390000015789.c.a.a ENSGT00390000010047.a.a ENSGT00390000010047.b.p ENSGT00940000161715.jb ENSGT00940000161715.kb ENSGT00660000095605 ENSGT00940000161114 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00950000182888.a.a.b ENSGT00940000153838.b ENSGT00910000147219 ENSGT00950000183081.a.a.a ENSGT00390000005554 ENSGT00950000183123.g.b.b.i.b ENSGT01030000234614.B.b ENSGT00940000159902 ENSGT00940000159228 ENSGT00390000012166.o ENSGT00390000012166.p ENSGT00940000155130 ENSGT00940000159504 ENSGT00940000157906 ENSGT00940000157458 ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b ##22 ENSGT00500000044895 ENSGT00390000013003 ENSGT00940000157639 ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b ENSGT00940000155601 ENSGT00390000015789.c.a.a ENSGT00390000010047.a.a ENSGT00940000161715.kb ENSGT00390000010047.b.p ENSGT00940000161715.jb ENSGT00660000095605 ENSGT00940000161114 ENSGT00940000154304.B ENSGT00940000154304.A ENSGT00530000063604.B Sooty mangabey MODERN SPECIES 110 RALGPS2 (ENSCATG00000037783) FAM20B (ENSCATG00000032604) TOR3A (ENSCATG00000041605) ABL2 (ENSCATG00000034934) ENSCATG00000001027 SOAT1 (ENSCATG00000029999) AXDND1 (ENSCATG00000032663) NPHS2 (ENSCATG00000036937) TDRD5 (ENSCATG00000042714) FAM163A (ENSCATG00000034127) TOR1AIP2 (ENSCATG00000044101) TOR1AIP1 (ENSCATG00000036271) CEP350 (ENSCATG00000000294) QSOX1 (ENSCATG00000014337) LHX4 (ENSCATG00000045236) ENSCATG00000031451 ##22 ACBD6 (ENSCATG00000015218) XPR1 (ENSCATG00000039536) KIAA1614 (ENSCATG00000029007) STX6 (ENSCATG00000045307) MR1 (ENSCATG00000042907) CACNA1E (ENSCATG00000035687) ENSCATG00000037086 ENSCATG00000014247 TEDDM1 (ENSCATG00000000091) RGSL1 (ENSCATG00000038774) RNASEL (ENSCATG00000038808) RGS16 (ENSCATG00000043024) RGS8 (ENSCATG00000009681) NPL (ENSCATG00000037634) DHX9 (ENSCATG00000027871) Drill MODERN SPECIES 1422 LHX4 (ENSMLEG00000038342) ACBD6 (ENSMLEG00000000612) ENSMLEG00000043837 ##22 XPR1 (ENSMLEG00000040363) KIAA1614 (ENSMLEG00000031704) STX6 (ENSMLEG00000037024) MR1 (ENSMLEG00000044129) ENSMLEG00000042627 CACNA1E (ENSMLEG00000033118) ENSMLEG00000003862 Olive baboon MODERN SPECIES FAM20B (ENSPANG00000013234) TOR3A (ENSPANG00000005484) ABL2 (ENSPANG00000015263) SOAT1 (ENSPANG00000022548) ENSPANG00000037477 AXDND1 (ENSPANG00000010748) NPHS2 (ENSPANG00000015051) TDRD5 (ENSPANG00000021218) FAM163A (ENSPANG00000039302) TOR1AIP2 (ENSPANG00000011377) TOR1AIP1 (ENSPANG00000010531) CEP350 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ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000182951.B ENSGT00950000182888.a.a.b ENSGT00940000153838.b ENSGT00950000183081.a.a.a ENSGT00390000005554 ENSGT01030000234614.B.b ENSGT00940000154793.C.ab.n ENSGT00940000159902 ENSGT00940000159228 ENSGT00390000012166.o ENSGT00390000012166.p ENSGT00940000155130 ENSGT00940000159504 ENSGT00940000157906 ENSGT00940000157458 ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b.a ##22 ENSGT00500000044895 ENSGT00390000013003 ENSGT00940000157639 ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b ENSGT00900000141021.a ENSGT00940000155601 ENSGT00940000163676 ENSGT00390000010047.a.a ENSGT00940000161715.kb ENSGT00660000095605 ENSGT00940000161114 ENSGT00940000154304.B ENSGT00940000154304.A ENSGT00530000063604.B ENSGT00940000155924.b.m Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000182951.B ENSGT00950000182888.a.a.b ENSGT00940000153838.b ENSGT00950000183081.a.a.a ENSGT00390000005554 ENSGT01030000234614.B.b ENSGT00940000154793.C.ab.n ENSGT00940000159902 ENSGT00940000159228 ENSGT00390000012166.o 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(ENSSBOG00000033154) ENSSBOG00000035266 ENSSBOG00000029761 ENSSBOG00000032961 ENSSBOG00000033034 ##22 BSX (ENSSBOG00000035292) JHY (ENSSBOG00000020543) ENSSBOG00000019647 CRTAM (ENSSBOG00000020006) UBASH3B (ENSSBOG00000026096) ENSSBOG00000032996 BLID (ENSSBOG00000028902) SORL1 (ENSSBOG00000027914) ENSSBOG00000015796 SC5D (ENSSBOG00000020424) TECTA (ENSSBOG00000019507) TBCEL (ENSSBOG00000028041) GRIK4 (ENSSBOG00000030277) ARHGEF12 (ENSSBOG00000020565) TLCD5 (ENSSBOG00000025172) Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.a ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.a ##22 Capuchin MODERN SPECIES 303 ENSCCAG00000034683 PCDH18 (ENSCCAG00000023413) SLC7A11 (ENSCCAG00000033426) ENSCCAG00000032478 ENSCCAG00000036211 ##22 NOCT (ENSCCAG00000022628) ELF2 (ENSCCAG00000025670) ENSCCAG00000028381 ENSCCAG00000037489 MGARP (ENSCCAG00000032552) ENSCCAG00000035857 NDUFC1 (ENSCCAG00000020974) NAA15 (ENSCCAG00000021709) RAB33B (ENSCCAG00000019859) SETD7 (ENSCCAG00000030675) ENSCCAG00000020807 MGST2 (ENSCCAG00000020498) ENSCCAG00000025062 Marmoset MODERN SPECIES 11 PHYKPL (ENSCJAG00000012215) COL23A1 (ENSCJAG00000012175) CLK4 (ENSCJAG00000012089) MSANTD5 (ENSCJAG00000065896) ENSCJAG00000052143 ZNF354A (ENSCJAG00000012077) ENSCJAG00000012069 PROP1 (ENSCJAG00000012060) FAF2 (ENSCJAG00000040255) RNF44 (ENSCJAG00000007338) CDHR2 (ENSCJAG00000007310) GPRIN1 (ENSCJAG00000007308) SNCB (ENSCJAG00000007301) EIF4E1B (ENSCJAG00000007291) TSPAN17 (ENSCJAG00000007278) ENSCJAG00000054332 ##22 UNC5A (ENSCJAG00000007237) HK3 (ENSCJAG00000007223) UIMC1 (ENSCJAG00000007106) ZNF346 (ENSCJAG00000007194) FGFR4 (ENSCJAG00000007147) NSD1 (ENSCJAG00000007009) RAB24 (ENSCJAG00000006969) ENSCJAG00000006953 MXD3 (ENSCJAG00000006943) ENSCJAG00000073973 LMAN2 (ENSCJAG00000006916) RGS14 (ENSCJAG00000006873) SLC34A1 (ENSCJAG00000006845) PFN3 (ENSCJAG00000006841) F12 (ENSCJAG00000006834) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT01100000263490.A.b.a.a.a ENSGT01090000260013.b.a.b.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000163719 ENSGT01100000263490.B.b.a ENSGT01100000263490.B.a.c.a.b.a ENSGT01090000259999.G.b ENSGT01090000259999.G.a.a ENSGT01100000263490.D.a.a ENSGT01090000259999.F.a ENSGT00910000146879 ENSGT00940000162047.g ENSGT00530000065242 ENSGT01100000263522.A.c.b.c.a.hb ENSGT00940000161515 ENSGT01090000260043.a.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b.a ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b ##22 ENSGT00910000144246 ENSGT00390000000214.a.a ENSGT00940000155158.i ENSGT00510000047299 ENSGT00550000074799 ENSGT00940000160721 ENSGT01030000234601.c.a.a ENSGT01030000234601.c.b.b ENSGT01060000248588.b ENSGT00390000004140.b.h ENSGT00390000013075.a.d ENSGT00390000004026 ENSGT00950000183078.b.a.a ENSGT00390000016789 ENSGT00940000161220 Sooty mangabey MODERN SPECIES 545 OR52A5 (ENSCATG00000010932) ENSCATG00000040874 ENSCATG00000044261 MMP26 (ENSCATG00000039857) OR51G1 (ENSCATG00000029826) OR51A7 (ENSCATG00000026903) OR51F2 (ENSCATG00000038466) OR51E2 (ENSCATG00000007724) ENSCATG00000010569 ENSCATG00000032822 ENSCATG00000018446 ENSCATG00000038847 OR52K1 (ENSCATG00000015044) TRIM21 (ENSCATG00000030899) OR52B4 (ENSCATG00000032503) ENSCATG00000035679 ##22 RRM1 (ENSCATG00000035182) STIM1 (ENSCATG00000013784) ENSCATG00000014698 PGAP2 (ENSCATG00000034622) NUP98 (ENSCATG00000033581) CHRNA10 (ENSCATG00000038975) ART1 (ENSCATG00000020846) ART5 (ENSCATG00000044955) ENSCATG00000043589 ENSCATG00000043505 RNF121 (ENSCATG00000039465) IL18BP (ENSCATG00000036233) NUMA1 (ENSCATG00000044445) LAMTOR1 (ENSCATG00000045256) TOMT (ENSCATG00000043251) Drill MODERN SPECIES 1114 ENSMLEG00000036708 ##22 RRM1 (ENSMLEG00000042859) STIM1 (ENSMLEG00000032366) ENSMLEG00000008168 PGAP2 (ENSMLEG00000038507) NUP98 (ENSMLEG00000043563) CHRNA10 (ENSMLEG00000019278) ART1 (ENSMLEG00000030716) ART5 (ENSMLEG00000008190) ENSMLEG00000034998 ENSMLEG00000039461 RNF121 (ENSMLEG00000043299) IL18BP (ENSMLEG00000032241) NUMA1 (ENSMLEG00000029680) LAMTOR1 (ENSMLEG00000037079) TOMT (ENSMLEG00000037107) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b ##22 Capuchin MODERN SPECIES 354 ENSCCAG00000021084 ENSCCAG00000027679 ADGRG7 (ENSCCAG00000029521) TMEM45A (ENSCCAG00000037862) LNP1 (ENSCCAG00000030879) TOMM70 (ENSCCAG00000032264) NIT2 (ENSCCAG00000029927) TBC1D23 (ENSCCAG00000022989) ENSCCAG00000024603 FILIP1L (ENSCCAG00000025103) CMSS1 (ENSCCAG00000034685) COL8A1 (ENSCCAG00000018156) DCBLD2 (ENSCCAG00000012943) ST3GAL6 (ENSCCAG00000033953) ENSCCAG00000003554 ENSCCAG00000022346 ##22 CPOX (ENSCCAG00000021341) ENSCCAG00000034984 OR5K4 (ENSCCAG00000033707) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.b ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000156451 ENSGT00940000155997 ENSGT00940000157572 ENSGT00940000158409 ENSGT00940000156127 ENSGT00390000016717.j.a ENSGT00940000157200 ENSGT00390000005378 ENSGT00950000182999.b.a.a ENSGT00390000006066 ENSGT00940000158804 ENSGT00390000003219 ENSGT00940000157941.k.b ENSGT00940000158155 ENSGT00950000182956.b.b.a.b ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.b ##22 ENSGT00940000158225 ENSGT00940000155867 ENSGT00440000033504.B ENSGT00940000156857 ENSGT00940000155180.b ENSGT00390000013224 ENSGT00940000160821 ENSGT00940000157821 ENSGT00390000010229 ENSGT00940000153414.A ENSGT00940000159401 ENSGT00940000162469 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a Cebidae ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000156451 ENSGT00940000155997 ENSGT00940000157572 ENSGT00940000158409 ENSGT00940000156127 ENSGT00390000016717.j.a ENSGT00940000157200 ENSGT00390000005378 ENSGT00950000182999.b.a.a ENSGT00390000006066 ENSGT00940000158804 ENSGT00390000003219 ENSGT00940000157941.k.b ENSGT00940000158155 ENSGT00950000182956.b.b.a.b ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.b ##22 ENSGT00940000158225 ENSGT00940000155867 ENSGT00440000033504.B ENSGT00940000156857 ENSGT00940000155180.b ENSGT00390000013224 ENSGT00940000160821 ENSGT00940000157821 ENSGT00390000010229 ENSGT00940000153414.A ENSGT00940000159401 ENSGT00940000162469 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 94 ENSGT00940000157200 ENSGT00390000005378 ENSGT00950000182999.b.a.a ENSGT00390000006066 ENSGT00940000158804 ENSGT00390000003219 ENSGT00940000157941.k.b ENSGT00940000158155 ENSGT00950000182956.b.b.a.b ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.b ##22 ENSGT00940000158225 ENSGT00940000155867 ENSGT00440000033504.B ENSGT00940000156857 ENSGT00940000155180.b ENSGT00390000013224 ENSGT00940000160821 ENSGT00940000157821 ENSGT00390000010229 ENSGT00940000153414.A ENSGT00940000159401 ENSGT00940000162469 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a Bolivian squirrel monkey DUPLICATION Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 197 FKBP4 (ENSSBOG00000030928) ITFG2 (ENSSBOG00000021331) NRIP2 (ENSSBOG00000021076) TEX52 (ENSSBOG00000026810) FOXM1 (ENSSBOG00000026585) TULP3 (ENSSBOG00000027404) TEAD4 (ENSSBOG00000025602) ENSSBOG00000019593 ##22 TSPAN9 (ENSSBOG00000000277) PRMT8 (ENSSBOG00000027867) CRACR2A (ENSSBOG00000024718) ENSSBOG00000031519 PARP11 (ENSSBOG00000032202) CCND2 (ENSSBOG00000022163) TIGAR (ENSSBOG00000035082) FGF23 (ENSSBOG00000027393) FGF6 (ENSSBOG00000024969) C12orf4 (ENSSBOG00000030014) RAD51AP1 (ENSSBOG00000031364) DYRK4 (ENSSBOG00000022376) ENSSBOG00000023354 KCNA6 (ENSSBOG00000012723) KCNA1 (ENSSBOG00000036388) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 123 THOC3 (ENSSBOG00000022663) SIMC1 (ENSSBOG00000025281) KIAA1191 (ENSSBOG00000026134) ARL10 (ENSSBOG00000031819) ENSSBOG00000022208 ENSSBOG00000025283 CLTB (ENSSBOG00000029379) ENSSBOG00000028310 FAF2 (ENSSBOG00000035526) RNF44 (ENSSBOG00000028138) CDHR2 (ENSSBOG00000028213) GPRIN1 (ENSSBOG00000004419) SNCB (ENSSBOG00000014341) EIF4E1B (ENSSBOG00000030710) TSPAN17 (ENSSBOG00000017848) ENSSBOG00000020696 ##22 UNC5A (ENSSBOG00000020718) HK3 (ENSSBOG00000033767) ENSSBOG00000028026 UIMC1 (ENSSBOG00000035332) ZNF346 (ENSSBOG00000034067) FGFR4 (ENSSBOG00000024525) ENSSBOG00000026004 NSD1 (ENSSBOG00000032022) RAB24 (ENSSBOG00000025992) ENSSBOG00000001085 MXD3 (ENSSBOG00000024598) LMAN2 (ENSSBOG00000023284) RGS14 (ENSSBOG00000032330) SLC34A1 (ENSSBOG00000033597) F12 (ENSSBOG00000023238) Mas night monkey MODERN SPECIES 349 ENSANAG00000034432 NUP160 (ENSANAG00000025545) PTPRJ (ENSANAG00000028493) OR4X2 (ENSANAG00000009838) OR4C3 (ENSANAG00000006729) ENSANAG00000018347 FKBP4 (ENSANAG00000032425) ITFG2 (ENSANAG00000035866) NRIP2 (ENSANAG00000033901) TEX52 (ENSANAG00000020158) FOXM1 (ENSANAG00000035342) RHNO1 (ENSANAG00000037023) ENSANAG00000028446 TULP3 (ENSANAG00000027783) TEAD4 (ENSANAG00000036426) ENSANAG00000035753 ##22 TSPAN9 (ENSANAG00000031807) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 Bonobo MODERN SPECIES 16 COLQ (ENSPPAG00000031635) EAF1 (ENSPPAG00000039271) METTL6 (ENSPPAG00000039377) SH3BP5 (ENSPPAG00000038360) CAPN7 (ENSPPAG00000032807) RBSN (ENSPPAG00000038220) MRPS25 (ENSPPAG00000039324) NR2C2 (ENSPPAG00000023138) ENSPPAG00000042214 FGD5 (ENSPPAG00000025764) C3orf20 (ENSPPAG00000041311) CCDC174 (ENSPPAG00000038422) ENSPPAG00000033481 GRIP2 (ENSPPAG00000041847) SLC6A6 (ENSPPAG00000042007) ENSPPAG00000036305 ##22 LSM3 (ENSPPAG00000034074) XPC (ENSPPAG00000043453) TMEM43 (ENSPPAG00000000804) CHCHD4 (ENSPPAG00000032925) WNT7A (ENSPPAG00000030187) FBLN2 (ENSPPAG00000015671) HDAC11 (ENSPPAG00000037567) NUP210 (ENSPPAG00000037715) ENSPPAG00000028546 IQSEC1 (ENSPPAG00000036448) RPL32 (ENSPPAG00000008188) CAND2 (ENSPPAG00000004317) ENSPPAG00000036413 TMEM40 (ENSPPAG00000019163) ENSPPAG00000024005 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 988 ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 ENSGT00940000163696.a.a Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 70 ENSRROG00000002298 ##22 CYP2C8 (ENSRROG00000041111) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2602 ENSRROG00000032766 ##22 Black snub-nosed monkey DUPLICATION Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1016 CYP2C9 (ENSRBIG00000030824) ENSRBIG00000028008 ##22 CYP2C8 (ENSRBIG00000038387) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 426 TLR4 (ENSRBIG00000026429) ENSRBIG00000029433 ENSRBIG00000000050 ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177.j #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.ab.b #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 ENSGT00440000037499.m #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000154875.k.b ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200.y #26 ENSGT00940000154268.f.l ENSGT00950000182974.a.a.b #28 ENSGT00390000013467 #30 ENSGT00390000004029 #31 ENSGT00940000159784 #32 ENSGT00940000160656 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156386 #37 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177.j #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.ab.b #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 ENSGT00440000037499.m #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000154875.k.b ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200.y #26 ENSGT00940000154268.f.l ENSGT00950000182974.a.a.b #28 ENSGT00390000013467 #30 ENSGT00390000004029 #31 ENSGT00940000159784 #32 ENSGT00940000160656 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156386 #37 Macaca ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177.j #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 ENSGT00440000037499.m #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000154875.k.b ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200.y #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #28 ENSGT00390000013467 #30 ENSGT00390000004029 #31 ENSGT00940000159784 #32 ENSGT00940000160656 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00390000013108 Pig-tailed macaque DUPLICATION Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 449 CYP2C8 (ENSMNEG00000011295) ENSMNEG00000028049 ##22 CYP2C93 (ENSMNEG00000000870) ENSMNEG00000004860 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 383 CATSPER3 (ENSMNEG00000025685) PCBD2 (ENSMNEG00000035154) #7 TXNDC15 (ENSMNEG00000035748) #8 C5orf24 (ENSMNEG00000041574) #9 DDX46 (ENSMNEG00000029903) #10 CAMLG (ENSMNEG00000038227) #11 SEC24A (ENSMNEG00000044861) #12 SAR1B (ENSMNEG00000045379) #13 JADE2 (ENSMNEG00000031371) #15 CDKN2AIPNL (ENSMNEG00000042298) #16 UBE2B (ENSMNEG00000034858) #17 CDKL3 (ENSMNEG00000032037) #18 PPP2CA (ENSMNEG00000043537) #19 ENSMNEG00000032488 ##20 TCF7 (ENSMNEG00000044025) #21 ENSMNEG00000016613 ##22 C5orf15 (ENSMNEG00000041375) #23 FSTL4 (ENSMNEG00000039940) #24 ENSMNEG00000042952 HSPA4 (ENSMNEG00000030298) #25 ZCCHC10 (ENSMNEG00000039054) #26 AFF4 (ENSMNEG00000033381) #28 LEAP2 (ENSMNEG00000031057) #30 UQCRQ (ENSMNEG00000041577) #31 GDF9 (ENSMNEG00000036613) #32 SHROOM1 (ENSMNEG00000038716) #33 SOWAHA (ENSMNEG00000006710) #34 SEPTIN8 (ENSMNEG00000043687) #35 CCNI2 (ENSMNEG00000041733) #36 KIF3A (ENSMNEG00000029565) #37 IL4 (ENSMNEG00000033953) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154518.a ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177.j #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00690000102286.a.b.k.b.d.a.a.a.a ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 ENSGT00440000037499.m #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200.y #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #28 ENSGT00390000013467 #30 ENSGT00390000004029 #31 ENSGT00940000159784 #32 ENSGT00940000160656 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00390000013108 ENSGT00390000003225 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 19 ENSMFAG00000018870 CEP55 (ENSMFAG00000041263) FFAR4 (ENSMFAG00000042176) RBP4 (ENSMFAG00000042546) PDE6C (ENSMFAG00000045757) FRA10AC1 (ENSMFAG00000045302) LGI1 (ENSMFAG00000037131) SLC35G1 (ENSMFAG00000039807) PLCE1 (ENSMFAG00000020572) NOC3L (ENSMFAG00000032429) HELLS (ENSMFAG00000044053) CYP2C18 (ENSMFAG00000058429) H2AZ1 (ENSMFAG00000001222) CYP2C9 (ENSMFAG00000005983) CYP2C8 (ENSMFAG00000034299) ENSMFAG00000041843 ##22 CYP2C93 (ENSMFAG00000032581) ENSMFAG00000055400 PDLIM1 (ENSMFAG00000030298) SORBS1 (ENSMFAG00000030641) ENSMFAG00000050945 ALDH18A1 (ENSMFAG00000001272) TCTN3 (ENSMFAG00000001575) CC2D2B (ENSMFAG00000038060) ENSMFAG00000045985 CCNJ (ENSMFAG00000037933) BLNK (ENSMFAG00000043139) DNTT (ENSMFAG00000034600) OPALIN (ENSMFAG00000043114) TLL2 (ENSMFAG00000002794) TM9SF3 (ENSMFAG00000002926) Rhesus DUPLICATION Rhesus MODERN SPECIES 16 PCBD2 (ENSMMUG00000058022) #7 TXNDC15 (ENSMMUG00000063014) #8 C6H5orf24 (ENSMMUG00000004013) #9 DDX46 (ENSMMUG00000012463) #10 CAMLG (ENSMMUG00000056880) #11 SEC24A (ENSMMUG00000004418) #12 SAR1B (ENSMMUG00000004417) #13 JADE2 (ENSMMUG00000000358) #15 CDKN2AIPNL (ENSMMUG00000058096) #16 ENSMMUG00000053384 UBE2B (ENSMMUG00000016641) #17 ENSMMUG00000052256 ENSMMUG00000052915 SKP1 (ENSMMUG00000013047) #19 TCF7 (ENSMMUG00000022788) #21 VDAC1 (ENSMMUG00000016235) ##22 C6H5orf15 (ENSMMUG00000042266) #23 FSTL4 (ENSMMUG00000003062) #24 ENSMMUG00000052685 HSPA4 (ENSMMUG00000009396) #25 ENSMMUG00000053208 ZCCHC10 (ENSMMUG00000056688) #26 AFF4 (ENSMMUG00000015640) #28 LEAP2 (ENSMMUG00000015638) #30 UQCRQ (ENSMMUG00000051941) #31 GDF9 (ENSMMUG00000060221) #32 SHROOM1 (ENSMMUG00000010312) #33 SOWAHA (ENSMMUG00000039781) #34 SEPTIN8 (ENSMMUG00000010309) #35 CCNI2 (ENSMMUG00000010308) #36 KIF3A (ENSMMUG00000010313) #37 Rhesus MODERN SPECIES 19 RBP4 (ENSMMUG00000014711) PDE6C (ENSMMUG00000014713) FRA10AC1 (ENSMMUG00000014715) LGI1 (ENSMMUG00000001825) ENSMMUG00000056291 SLC35G1 (ENSMMUG00000045531) PLCE1 (ENSMMUG00000001608) NOC3L (ENSMMUG00000001619) TBC1D12 (ENSMMUG00000055733) ENSMMUG00000040417 HELLS 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Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 Marmoset DUPLICATION Marmoset MODERN SPECIES 11 ZNF354C (ENSCJAG00000086065) ZNF879 (ENSCJAG00000018904) GRM6 (ENSCJAG00000018865) ZNF454 (ENSCJAG00000018857) ZNF354B (ENSCJAG00000018848) MGAT1 (ENSCJAG00000046208) ZFP62 (ENSCJAG00000018839) BTNL9 (ENSCJAG00000018803) RACK1 (ENSCJAG00000018752) TRIM41 (ENSCJAG00000018733) TRIM7 (ENSCJAG00000018704) ENSCJAG00000066969 PPP2CA (ENSCJAG00000045966) #19 ENSCJAG00000067181 #20 TCF7 (ENSCJAG00000013603) #21 ENSCJAG00000013556 ##22 C5orf15 (ENSCJAG00000013543) #23 FSTL4 (ENSCJAG00000013506) #24 HSPA4 (ENSCJAG00000013384) #25 ENSCJAG00000013378 ZCCHC10 (ENSCJAG00000047052) #26 AFF4 (ENSCJAG00000013322) #28 LEAP2 (ENSCJAG00000046560) #30 UQCRQ (ENSCJAG00000080204) #31 GDF9 (ENSCJAG00000013297) #32 SHROOM1 (ENSCJAG00000013275) #33 SOWAHA (ENSCJAG00000013269) #34 SEPTIN8 (ENSCJAG00000013225) #35 CCNI2 (ENSCJAG00000013222) #36 KIF3A (ENSCJAG00000013116) #37 IL4 (ENSCJAG00000013083) Marmoset MODERN SPECIES 2 SMCO4 (ENSCJAG00000045722) CEP295 (ENSCJAG00000003748) TAF1D (ENSCJAG00000003782) ENSCJAG00000084182 MED17 (ENSCJAG00000003839) VSTM5 (ENSCJAG00000003861) HEPHL1 (ENSCJAG00000003906) PANX1 (ENSCJAG00000003952) IZUMO1R (ENSCJAG00000003960) GPR83 (ENSCJAG00000003972) MRE11 (ENSCJAG00000003984) ANKRD49 (ENSCJAG00000083691) C11orf97 (ENSCJAG00000087393) FUT4 (ENSCJAG00000074794) PIWIL4 (ENSCJAG00000004075) ENSCJAG00000065220 ##22 ENSCJAG00000070716 AMOTL1 (ENSCJAG00000004124) CWC15 (ENSCJAG00000040352) KDM4D (ENSCJAG00000023319) ENSCJAG00000072491 ENDOD1 (ENSCJAG00000039825) ENSCJAG00000004220 FAM76B (ENSCJAG00000040122) CEP57 (ENSCJAG00000004281) MTMR2 (ENSCJAG00000004327) MAML2 (ENSCJAG00000004359) CCDC82 (ENSCJAG00000004365) JRKL (ENSCJAG00000043270) ENSCJAG00000069774 ENSCJAG00000074166 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 115 BTLA (ENSSBOG00000025065) ENSSBOG00000034078 CD200 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ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #28 ENSGT00390000013467 #30 ENSGT00390000004029 #31 ENSGT00940000159784 #32 ENSGT00940000160656 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00390000013108 ENSGT00390000003225 ENSGT00390000018781.hb Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 17 Lamp5 (ENSPEMG00000024012) Plcb4 (ENSPEMG00000021051) Plcb1 (ENSPEMG00000023485) Tmx4 (ENSPEMG00000013286) Hao1 (ENSPEMG00000023039) Bmp2 (ENSPEMG00000030188) Fermt1 (ENSPEMG00000021814) Lrrn4 (ENSPEMG00000022463) Crls1 (ENSPEMG00000022545) Mcm8 (ENSPEMG00000021929) Trmt6 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ENSJJAG00000005383 Fstl4 (ENSJJAG00000010445) #24 ENSJJAG00000013880 Hspa4 (ENSJJAG00000023896) #25 Aff4 (ENSJJAG00000000912) #28 Leap2 (ENSJJAG00000000464) #30 Uqcrq (ENSJJAG00000011956) #31 Gdf9 (ENSJJAG00000009480) #32 Shroom1 (ENSJJAG00000019891) #33 Septin8 (ENSJJAG00000022205) #35 Kif3a (ENSJJAG00000023717) #37 ENSJJAG00000012514 Il13 (ENSJJAG00000000582) ENSJJAG00000019622 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 48 ENSJJAG00000012290 Ccdc152 (ENSJJAG00000020346) Ghr (ENSJJAG00000018825) Fbxo4 (ENSJJAG00000021644) ENSJJAG00000021693 ENSJJAG00000004330 Plcxd3 (ENSJJAG00000023898) ENSJJAG00000020132 C6 (ENSJJAG00000008024) Mroh2b (ENSJJAG00000024133) Card6 (ENSJJAG00000023358) ENSJJAG00000014290 Prkaa1 (ENSJJAG00000021671) ENSJJAG00000007891 Ptger4 (ENSJJAG00000023417) ENSJJAG00000011581 #22 ENSJJAG00000018434 ENSJJAG00000000928 Fyb (ENSJJAG00000016416) Rictor (ENSJJAG00000014049) Osmr (ENSJJAG00000011588) Lifr (ENSJJAG00000018296) Egflam (ENSJJAG00000017564) Gdnf 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ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00390000011365.a ENSGT00940000162517 ENSGT00510000046787.e.b ENSGT00940000158507 ENSGT00940000156583 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00390000012652.ab.a.m ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #28 ENSGT00390000013467 #30 ENSGT00390000004029 #31 ENSGT00940000159784 #32 ENSGT00940000160656 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00390000013108 ENSGT00390000003225 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 22 ENSHGLG00000006028 ENSHGLG00000048389 STAT1 (ENSHGLG00000003617) STAT4 (ENSHGLG00000003160) MYO1B (ENSHGLG00000001644) NABP1 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Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 114 GABRR3 (ENSCLAG00000006076) RIOX2 (ENSCLAG00000006223) CRYBG3 (ENSCLAG00000007113) ARL6 (ENSCLAG00000011788) EPHA6 (ENSCLAG00000012297) ENSCLAG00000007975 #22 NSUN3 (ENSCLAG00000004168) STX19 (ENSCLAG00000005443) ARL13B (ENSCLAG00000006379) PROS1 (ENSCLAG00000006656) ENSCLAG00000007467 EPHA3 (ENSCLAG00000008216) C3orf38 (ENSCLAG00000008911) ZNF654 (ENSCLAG00000009137) ENSCLAG00000010225 HTR1F (ENSCLAG00000008847) POU1F1 (ENSCLAG00000008895) CHMP2B (ENSCLAG00000004251) VGLL3 (ENSCLAG00000004309) CADM2 (ENSCLAG00000004950) GBE1 (ENSCLAG00000005860) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000162238 ENSGT00940000159222 ENSGT00940000154735 ENSGT00550000074939 ENSGT00940000153203.A.a ENSGT00940000158603 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 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ENSSVLG00005023263 #26 AFF4 (ENSSVLG00005023168) #28 LEAP2 (ENSSVLG00005023101) #30 UQCRQ (ENSSVLG00005023071) #31 GDF9 (ENSSVLG00005023040) #32 SHROOM1 (ENSSVLG00005022874) #33 SOWAHA (ENSSVLG00005022829) #34 SEPTIN8 (ENSSVLG00005022761) #35 KIF3A (ENSSVLG00005022459) #37 ENSSVLG00005022296 IL13 (ENSSVLG00005022239) Marmotini ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000162238 ENSGT00940000159222 ENSGT00940000154735 ENSGT00550000074939.o ENSGT00940000153203.A.a ENSGT00940000158603 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154.i #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.ab.b #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #28 ENSGT00390000013467 #30 ENSGT00390000004029 #31 ENSGT00940000159784 #32 ENSGT00940000160656 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 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SPECIES 1057 ENSSARG00000008221 #22 C5orf15 (ENSSARG00000008200) #23 Hedgehog MODERN SPECIES 7267 VDAC1 (ENSEEUG00000005438) #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #28 ENSGT00390000013467 #30 ENSGT00390000004029 #31 ENSGT00940000159784 #32 ENSGT00940000160656 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00390000013108 ENSGT00390000003225 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161455 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#15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #28 ENSGT00390000013467 #30 ENSGT00390000004029 #31 ENSGT00940000159784 #32 ENSGT00940000160656 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00390000013108 ENSGT00390000003225 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 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ENSGT00940000160656 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00390000013108 ENSGT00390000003225 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #28 ENSGT00390000013467 #30 ENSGT00390000004029.k.a #31 ENSGT00940000159784 #32 ENSGT00940000160656 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00390000013108 ENSGT00390000003225 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #28 ENSGT00390000013467 #30 ENSGT00390000004029.k.a #31 ENSGT00940000159784 #32 ENSGT00940000160656 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00390000013108 ENSGT00390000003225 Dolphin MODERN SPECIES 3497 CATSPER3 (ENSTTRG00000016875) PCBD2 (ENSTTRG00000016874) #7 TXNDC15 (ENSTTRG00000016873) #8 C5orf24 (ENSTTRG00000016871) #9 DDX46 (ENSTTRG00000016869) #10 CAMLG (ENSTTRG00000016867) #11 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Narwhal MODERN SPECIES 298 CATSPER3 (ENSMMNG00015002813) PCBD2 (ENSMMNG00015002795) #7 TXNDC15 (ENSMMNG00015002779) #8 C5orf24 (ENSMMNG00015002768) #9 DDX46 (ENSMMNG00015002724) #10 CAMLG (ENSMMNG00015002694) #11 SEC24A (ENSMMNG00015002600) #12 SAR1B (ENSMMNG00015002534) #13 JADE2 (ENSMMNG00015002387) #15 CDKN2AIPNL (ENSMMNG00015002305) #16 ENSMMNG00015002289 #17 CDKL3 (ENSMMNG00015002257) #18 PPP2CA (ENSMMNG00015002212) #19 ENSMMNG00015002197 ##20 TCF7 (ENSMMNG00015002150) #21 ENSMMNG00015002104 #22 C5orf15 (ENSMMNG00015002074) #23 FSTL4 (ENSMMNG00015002051) #24 ENSMMNG00015002024 HSPA4 (ENSMMNG00015001979) #25 ZCCHC10 (ENSMMNG00015001916) #26 AFF4 (ENSMMNG00015001850) #28 LEAP2 (ENSMMNG00015001821) #30 ENSMMNG00015001806 #31 GDF9 (ENSMMNG00015001793) #32 SHROOM1 (ENSMMNG00015001762) #33 SOWAHA (ENSMMNG00015001733) #34 SEPTIN8 (ENSMMNG00015001582) #35 KIF3A (ENSMMNG00015001401) #37 IL4 (ENSMMNG00015001332) IL13 (ENSMMNG00015001279) Narwhal MODERN SPECIES 306 ADCY1 (ENSMMNG00015010742) 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ENSGT00940000156067.c #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #28 ENSGT00390000013467 #30 ENSGT00390000004029 #31 ENSGT00940000159784 #32 ENSGT00940000160656 #33 ENSGT00390000018299.cb ENSGT00940000159179 ENSGT00940000156470 ENSGT00390000010706 ENSGT00940000162150 ENSGT00940000155854 Goat MODERN SPECIES 26 PCBD2 (ENSCHIG00000023788) #7 TXNDC15 (ENSCHIG00000010236) #8 ENSCHIG00000016073 C5orf24 (ENSCHIG00000012125) #9 DDX46 (ENSCHIG00000026009) #10 CAMLG (ENSCHIG00000005820) #11 SEC24A (ENSCHIG00000024982) #12 SAR1B (ENSCHIG00000022509) #13 JADE2 (ENSCHIG00000012699) #15 CDKN2AIPNL (ENSCHIG00000027126) #16 UBE2B (ENSCHIG00000017701) #17 CDKL3 (ENSCHIG00000008858) #18 PPP2CA (ENSCHIG00000023636) #19 ENSCHIG00000015329 ##20 TCF7 (ENSCHIG00000027172) #21 VDAC1 (ENSCHIG00000024204) #22 C5orf15 (ENSCHIG00000020905) #23 FSTL4 (ENSCHIG00000023121) #24 ENSCHIG00000009256 #25 ZCCHC10 (ENSCHIG00000021529) #26 AFF4 (ENSCHIG00000015153) #28 LEAP2 (ENSCHIG00000006437) #30 UQCRQ 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ENSGT00390000010706 ENSGT00940000155854 Bos ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.oc #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #28 ENSGT00390000013467 #30 ENSGT00390000004029 #31 ENSGT00940000159784 #32 ENSGT00940000160656 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 ENSGT00940000159179 ENSGT00940000156470 ENSGT00940000162150 ENSGT00390000010706 ENSGT00940000155854 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 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ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00390000013108 ENSGT00390000003225 Equus ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT01100000263508.A.d.e.a.a.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #28 ENSGT00390000013467 #30 ENSGT00390000004029 #31 ENSGT00940000159784 #32 ENSGT00940000160656 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00390000013108 ENSGT00390000003225 Donkey MODERN SPECIES 3 ENSEASG00005026102 #7 TXNDC15 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Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT01090000260575 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.ab.b.u.b #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #28 ENSGT00390000013467 #30 ENSGT00390000004029 #31 ENSGT00940000159784 #32 ENSGT00940000160656 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00390000013108 ENSGT00390000003225 Microbat MODERN SPECIES 965 PITX1 (ENSMLUG00000012646) CATSPER3 (ENSMLUG00000012640) PCBD2 (ENSMLUG00000012638) #7 TXNDC15 (ENSMLUG00000012632) #8 C5orf24 (ENSMLUG00000012625) #9 DDX46 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AFF4 (ENSRFEG00010018556) #28 LEAP2 (ENSRFEG00010018515) #30 ENSRFEG00010018482 #31 GDF9 (ENSRFEG00010018441) #32 SHROOM1 (ENSRFEG00010018370) #33 SOWAHA (ENSRFEG00010018320) #34 SEPTIN8 (ENSRFEG00010018002) #35 KIF3A (ENSRFEG00010017681) #37 ENSRFEG00010017322 IL13 (ENSRFEG00010017200) RAD50 (ENSRFEG00010017143) IL5 (ENSRFEG00010017063) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00390000012652.ab.a ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #28 ENSGT00390000013467 #30 ENSGT00390000004029 #31 ENSGT00940000159784 #32 ENSGT00940000160656 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00390000013108 ENSGT00390000003225 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000154518.a ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT01090000260575 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #28 ENSGT00390000013467 #30 ENSGT00390000004029 #31 ENSGT00940000159784 #32 ENSGT00940000160656 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00940000156288 ENSGT00390000018781 Sloth MODERN SPECIES 1303 VDAC1 (ENSCHOG00000005631) #22 C5orf15 (ENSCHOG00000005627) #23 Armadillo MODERN SPECIES 3458 PITX1 (ENSDNOG00000034587) CATSPER3 (ENSDNOG00000012508) PCBD2 (ENSDNOG00000044959) #7 TXNDC15 (ENSDNOG00000017904) #8 C5orf24 (ENSDNOG00000034721) #9 DDX46 (ENSDNOG00000011448) #10 CAMLG (ENSDNOG00000017271) #11 ENSDNOG00000013795 SAR1B (ENSDNOG00000044440) #13 JADE2 (ENSDNOG00000045101) #15 CDKN2AIPNL (ENSDNOG00000044441) #16 UBE2B (ENSDNOG00000015719) #17 PPP2CA (ENSDNOG00000013011) #19 ENSDNOG00000012999 ##20 TCF7 (ENSDNOG00000012979) #21 VDAC1 (ENSDNOG00000045241) #22 ENSDNOG00000023901 #23 ENSDNOG00000035042 ENSDNOG00000017743 #24 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.ab.b #20 ENSGT00390000012652.ab.a ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 Tenrec MODERN SPECIES 1514 ENSETEG00000016337 #22 ENSETEG00000016335 #23 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00390000012652.ab.a ##20 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.ab.b #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 Hyrax MODERN SPECIES 7250 VDAC1 (ENSPCAG00000010064) #22 Elephant MODERN SPECIES 2 CATSPER3 (ENSLAFG00000008372) PCBD2 (ENSLAFG00000008369) #7 TXNDC15 (ENSLAFG00000008364) #8 C5orf24 (ENSLAFG00000010469) #9 DDX46 (ENSLAFG00000010465) #10 CAMLG (ENSLAFG00000005101) #11 SEC24A (ENSLAFG00000005093) #12 SAR1B (ENSLAFG00000001021) #13 JADE2 (ENSLAFG00000001018) #15 CDKN2AIPNL (ENSLAFG00000011476) #16 UBE2B (ENSLAFG00000021714) #17 CDKL3 (ENSLAFG00000011468) #18 PPP2CA (ENSLAFG00000016840) #19 ENSLAFG00000016832 #20 TCF7 (ENSLAFG00000016828) #21 VDAC1 (ENSLAFG00000028818) #22 C5orf15 (ENSLAFG00000015697) #23 KCNN2 (ENSLAFG00000010788) TRIM36 (ENSLAFG00000003749) PGGT1B (ENSLAFG00000003752) CCDC112 (ENSLAFG00000003761) FEM1C (ENSLAFG00000005712) TMED7 (ENSLAFG00000032184) CDO1 (ENSLAFG00000015304) ATG12 (ENSLAFG00000015307) ENSLAFG00000015311 LVRN (ENSLAFG00000002068) ARL14EPL (ENSLAFG00000032735) COMMD10 (ENSLAFG00000011885) ENSLAFG00000027553 SEMA6A (ENSLAFG00000004387) Marsupialia DUPLICATION Marsupialia DUPLICATION Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580.q.a #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00390000012652.ab.b #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.bd.a #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00390000016270 ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT01010000222666 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000154155 ENSGT00940000156288 ENSGT00390000016991 ENSGT00390000018781 ENSGT00390000003225 ENSGT00940000156386 #37 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580.q.a #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00390000012652.ab.b #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.bd.a #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00390000016270 ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT01010000222666 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000154155 ENSGT00940000156288 ENSGT00390000016991 ENSGT00390000018781 ENSGT00390000003225 ENSGT00940000156386 #37 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580.q.a #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.bd.a #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000154155 ENSGT00940000156288 ENSGT00390000016991 ENSGT00390000018781 ENSGT00390000003225 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00940000156068.a #35 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580.q.a #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.bd.a #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT00940000158652 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000154155 ENSGT00940000156288 ENSGT00390000016991 ENSGT00390000018781 ENSGT00390000003225 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00940000156068.a #35 koala MODERN SPECIES 41 TIFAB (ENSPCIG00000015898) ENSPCIG00000015900 PITX1 (ENSPCIG00000006623) CATSPER3 (ENSPCIG00000009633) TXNDC15 (ENSPCIG00000009213) #8 DDX46 (ENSPCIG00000009215) #10 CAMLG (ENSPCIG00000032820) #11 SEC24A 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SHQ1 (ENSVURG00010008402) ENSVURG00010008413 GXYLT2 (ENSVURG00010008424) PPP4R2 (ENSVURG00010008448) ENSVURG00010008462 PDZRN3 (ENSVURG00010008505) ENSVURG00010008548 CNTN3 (ENSVURG00010008586) CHL1 (ENSVURG00010008642) ENSVURG00010008727 CNTN6 (ENSVURG00010008756) ENSVURG00010008843 #22 ENSVURG00010008854 CNTN4 (ENSVURG00010008887) IL5RA (ENSVURG00010008982) TRNT1 (ENSVURG00010008997) CRBN (ENSVURG00010009020) LRRN1 (ENSVURG00010009042) ENSVURG00010009062 SUMF1 (ENSVURG00010009079) ITPR1 (ENSVURG00010009114) BHLHE40 (ENSVURG00010009249) ARL8B (ENSVURG00010009259) EDEM1 (ENSVURG00010009274) ENSVURG00010009302 ENSVURG00010009325 GRM7 (ENSVURG00010009382) Platypus MODERN SPECIES 84 ENSOANG00000039928 ENSOANG00000046337 #7 TXNDC15 (ENSOANG00000013063) #8 ENSOANG00000037036 #9 DDX46 (ENSOANG00000001842) #10 CAMLG (ENSOANG00000001840) #11 SEC24A (ENSOANG00000001838) #12 SAR1B (ENSOANG00000001245) #13 JADE2 (ENSOANG00000010024) #15 CDKN2AIPNL (ENSOANG00000037080) #16 UBE2B (ENSOANG00000050341) #17 CDKL3 (ENSOANG00000000233) #18 PPP2CA (ENSOANG00000037764) #19 SKP1 (ENSOANG00000048044) #20 ENSOANG00000040939 #21 VDAC1 (ENSOANG00000013490) #22 ENSOANG00000045927 #23 FSTL4 (ENSOANG00000013403) #24 RAPGEF6 (ENSOANG00000006961) FNIP1 (ENSOANG00000009212) ENSOANG00000030428 ENSOANG00000009215 P4HA2 (ENSOANG00000005598) PDLIM4 (ENSOANG00000040872) ENSOANG00000007236 ENSOANG00000007233 IRF1 (ENSOANG00000036485) ENSOANG00000040098 RAD50 (ENSOANG00000008019) KIF3A (ENSOANG00000007422) #37 ENSOANG00000007421 #36 Sauria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.ab.b #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00390000016270 ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000154155 ENSGT00940000156288 ENSGT00390000018781 ENSGT00390000013108 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156068 #35 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.ab.b #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00960000189568 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00390000016270 ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000154155 ENSGT00940000156288 ENSGT00390000018781 ENSGT00390000013108 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00940000162679 #36 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.ab.b #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00960000189568 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00390000016270 ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000154155 ENSGT00940000156288 ENSGT00390000018781 ENSGT00950000185731 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00940000162679 #36 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 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Duck MODERN SPECIES 5 NEUROG1 (ENSAPLG00000031251) MACROH2A1 (ENSAPLG00000005243) PITX1 (ENSAPLG00000028077) PCBD2 (ENSAPLG00000013164) #7 TXNDC15 (ENSAPLG00000017719) #8 C5orf24 (ENSAPLG00000001548) #9 DDX46 (ENSAPLG00000013208) #10 CAMLG (ENSAPLG00000013700) #11 ENSAPLG00000013847 SAR1B (ENSAPLG00000007369) #13 JADE2 (ENSAPLG00000014696) #15 UBE2B (ENSAPLG00000014846) #17 PPP2CA (ENSAPLG00000014864) #19 SKP1 (ENSAPLG00000015147) #20 TCF7 (ENSAPLG00000015177) #21 VDAC1 (ENSAPLG00000015267) #22 C5orf15 (ENSAPLG00000016800) #23 FSTL4 (ENSAPLG00000015488) #24 RAPGEF6 (ENSAPLG00000015846) FNIP1 (ENSAPLG00000002569) ENSAPLG00000002999 ENSAPLG00000024780 ENSAPLG00000023893 P4HA2 (ENSAPLG00000003370) PDLIM4 (ENSAPLG00000003185) ENSAPLG00000009155 ENSAPLG00000009189 ENSAPLG00000019991 RAD50 (ENSAPLG00000011856) ENSAPLG00000011854 KIF3A (ENSAPLG00000011529) #37 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT01070000257270 ENSGT00390000007221.a.a #7 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ground finch MODERN SPECIES 11 ENSGFOG00000002815 SLC25A48 (ENSGFOG00000002724) CXCL14 (ENSGFOG00000002706) MACROH2A1 (ENSGFOG00000002690) PCBD2 (ENSGFOG00000002646) #7 C5orf24 (ENSGFOG00000002637) #9 DDX46 (ENSGFOG00000002488) #10 CAMLG (ENSGFOG00000002451) #11 SEC24A (ENSGFOG00000002418) #12 SAR1B (ENSGFOG00000002405) #13 JADE2 (ENSGFOG00000002376) #15 UBE2B (ENSGFOG00000002352) #17 PPP2CA (ENSGFOG00000002331) #19 SKP1 (ENSGFOG00000002318) ##20 TCF7 (ENSGFOG00000002284) #21 VDAC1 (ENSGFOG00000002261) #22 C5orf15 (ENSGFOG00000002233) #23 FSTL4 (ENSGFOG00000002205) #24 RAPGEF6 (ENSGFOG00000002089) FNIP1 (ENSGFOG00000002025) ENSGFOG00000001484 ENSGFOG00000001415 P4HA2 (ENSGFOG00000001387) PDLIM4 (ENSGFOG00000001378) ENSGFOG00000001369 ENSGFOG00000001338 IRF1 (ENSGFOG00000001327) ENSGFOG00000001324 RAD50 (ENSGFOG00000001305) ENSGFOG00000001300 ENSGFOG00000001289 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a ENSGT00390000007221.a.a #7 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ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00390000016270 ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000154155 ENSGT00940000156288 ENSGT00390000018781 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 Argentine black and white tegu DUPLICATION Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 1 CATSPER3 (ENSSMRG00000017557) PCBD2 (ENSSMRG00000017579) #7 TXNDC15 (ENSSMRG00000017580) #8 C5orf24 (ENSSMRG00000017582) #9 DDX46 (ENSSMRG00000017584) #10 CAMLG (ENSSMRG00000017636) #11 SEC24A (ENSSMRG00000017637) #12 ENSSMRG00000017681 JADE2 (ENSSMRG00000017697) #15 CDKN2AIPNL (ENSSMRG00000017700) #16 UBE2B (ENSSMRG00000017701) #17 CDKL3 (ENSSMRG00000017704) #18 PPP2CA (ENSSMRG00000017705) #19 SKP1 (ENSSMRG00000017706) #20 TCF7 (ENSSMRG00000017715) #21 ENSSMRG00000017719 #22 C5orf15 (ENSSMRG00000017720) #23 FSTL4 (ENSSMRG00000017828) #24 RAPGEF6 (ENSSMRG00000017857) FNIP1 (ENSSMRG00000017871) ENSSMRG00000017872 P4HA2 (ENSSMRG00000017880) PDLIM4 (ENSSMRG00000017888) ENSSMRG00000017889 ENSSMRG00000017894 IRF1 (ENSSMRG00000017896) ENSSMRG00000017900 RAD50 (ENSSMRG00000017931) KIF3A (ENSSMRG00000017937) #37 CCNI2 (ENSSMRG00000017941) #36 SEPTIN8 (ENSSMRG00000017956) #35 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 3 RGS6 (ENSSMRG00000009910) DPF3 (ENSSMRG00000009927) ENSSMRG00000009934 ZFYVE1 (ENSSMRG00000009939) RBM25 (ENSSMRG00000009944) PSEN1 (ENSSMRG00000009951) PAPLN (ENSSMRG00000009970) NUMB (ENSSMRG00000009974) RIOX1 (ENSSMRG00000009976) ENSSMRG00000009978 ENSSMRG00000009990 ENSSMRG00000010006 DNAL1 (ENSSMRG00000010008) MIDEAS (ENSSMRG00000010009) PTGR2 (ENSSMRG00000010011) ENSSMRG00000010014 #22 TMEM62 (ENSSMRG00000010019) UBR1 (ENSSMRG00000010028) ENSSMRG00000010037 TTBK2 (ENSSMRG00000010040) ENSSMRG00000010043 ENSSMRG00000010047 ENSSMRG00000010050 ENSSMRG00000010058 HAUS2 (ENSSMRG00000010059) LRRC57 (ENSSMRG00000010060) SNAP23 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ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000154155 ENSGT00940000156288 ENSGT00390000018781 ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 ENSGT00940000160656 #33 Lizard MODERN SPECIES 1 ENSACAG00000037593 nabp1 (ENSACAG00000024010) CAVIN2 (ENSACAG00000006746) TMEFF2 (ENSACAG00000006747) ENSACAG00000043962 ENSACAG00000025255 ENSACAG00000040804 ENSACAG00000034575 ENSACAG00000035795 CDKN2AIPNL (ENSACAG00000039648) #16 UBE2B 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ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570.d #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00940000161317 #18 ENSGT00550000074618.a.a #19 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831.a #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000154155.vb.a ENSGT00940000154155.wb ENSGT00940000156288 ENSGT00390000018781.cb ENSGT00940000156386 #37 ENSGT00940000162679 #36 ENSGT00940000156068 #35 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #34 Eastern brown snake MODERN SPECIES 6 PCBD2 (ENSPTXG00000007506) #7 TXNDC15 (ENSPTXG00000007504) #8 C5orf24 (ENSPTXG00000007502) #9 DDX46 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SPECIES 24 asb12a (ENSCHAG00000023243) mtmr8 (ENSCHAG00000023277) shisa2a (ENSCHAG00000023350) zc4h2 (ENSCHAG00000023355) ZC3H12B (ENSCHAG00000023376) camlg (ENSCHAG00000023398) #11 SEC24A (ENSCHAG00000023429) #12 sar1b (ENSCHAG00000023826) JADE2 (ENSCHAG00000023829) #15 cdkn2aipnl (ENSCHAG00000023831) #16 ube2b (ENSCHAG00000023837) #17 CDKL3 (ENSCHAG00000023901) #18 ppp2cab (ENSCHAG00000023911) #19 SKP1 (ENSCHAG00000023916) #20 tcf7 (ENSCHAG00000023937) #21 vdac1 (ENSCHAG00000023980) #22 C5orf15 (ENSCHAG00000024136) #23 fstl4 (ENSCHAG00000024157) #24 ENSCHAG00000024712 RAPGEF6 (ENSCHAG00000024774) fnip1 (ENSCHAG00000025673) ENSCHAG00000025735 irf1b (ENSCHAG00000026167) ENSCHAG00000026170 slc22a21 (ENSCHAG00000026195) ENSCHAG00000026198 ENSCHAG00000026205 POLQ (ENSCHAG00000026216) birc2 (ENSCHAG00000026319) cfap300 (ENSCHAG00000026330) ANGPTL5 (ENSCHAG00000026333) Denticle herring MODERN SPECIES 16 mtmr8 (ENSDCDG00000032582) shisa2a (ENSDCDG00000032575) zc4h2 (ENSDCDG00000032573) 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(ENSOKIG00005020476) Rainbow trout MODERN SPECIES 1 CREBZF (ENSOMYG00000020478) ENSOMYG00000020463 ENSOMYG00000052358 picalma (ENSOMYG00000020200) SEC24A (ENSOMYG00000018809) #12 sar1a (ENSOMYG00000018675) ENSOMYG00000067482 JADE2 (ENSOMYG00000018630) #15 cdkn2aipnl (ENSOMYG00000047254) #16 ENSOMYG00000064076 ube2b (ENSOMYG00000047263) #17 CDKL3 (ENSOMYG00000074979) #18 ppp2cab (ENSOMYG00000047240) #19 skp1 (ENSOMYG00000047224) #20 tcf7 (ENSOMYG00000047216) #21 vdac1 (ENSOMYG00000047206) #22 ENSOMYG00000047201 #23 FSTL4 (ENSOMYG00000047192) #24 ENSOMYG00000046969 ENSOMYG00000064543 ENSOMYG00000043214 ENSOMYG00000046742 ENSOMYG00000042793 ENSOMYG00000042773 ENSOMYG00000042757 ENSOMYG00000042745 ENSOMYG00000042736 p4ha2 (ENSOMYG00000041283) JAKMIP2 (ENSOMYG00000041188) dpysl3 (ENSOMYG00000034680) STK32A (ENSOMYG00000034172) Salmo ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156765.a.b.a ENSGT00940000155156.b.e ENSGT00390000016589.c ENSGT00520000055616.a.f ENSGT00940000155843 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Atlantic salmon MODERN SPECIES 4 ENSSSAG00000079188 ENSSSAG00000115813 ENSSSAG00000109304 dlg2 (ENSSSAG00000109902) tmem126a (ENSSSAG00000073700) CREBZF (ENSSSAG00000073699) ccdc83 (ENSSSAG00000098038) picalma (ENSSSAG00000068138) SEC24A (ENSSSAG00000065831) #12 ENSSSAG00000082595 JADE2 (ENSSSAG00000065776) #15 ube2b (ENSSSAG00000090070) #17 ENSSSAG00000108779 ppp2cab (ENSSSAG00000065756) #19 tcf7 (ENSSSAG00000006857) #21 vdac1 (ENSSSAG00000064103) #22 kct2 (ENSSSAG00000064088) #23 ENSSSAG00000116382 FSTL4 (ENSSSAG00000063587) #24 ENSSSAG00000007307 ENSSSAG00000061035 ENSSSAG00000117983 irf-1 (ENSSSAG00000058121) ENSSSAG00000115748 ENSSSAG00000058114 ENSSSAG00000058083 PDLIM4 (ENSSSAG00000058065) p4ha2 (ENSSSAG00000057643) ENSSSAG00000057556 ENSSSAG00000056478 ENSSSAG00000056275 River trout MODERN SPECIES 6 dlg2 (ENSSTUG00000004572) tmem126a (ENSSTUG00000004503) CREBZF (ENSSTUG00000004497) ENSSTUG00000004470 picalma (ENSSTUG00000003808) SEC24A (ENSSTUG00000003280) #12 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MODERN SPECIES 33 ENSOTSG00005025321 dlg2 (ENSOTSG00005025392) tmem126a (ENSOTSG00005040520) CREBZF (ENSOTSG00005040522) ENSOTSG00005040524 picalma (ENSOTSG00005040531) SEC24A (ENSOTSG00005040541) #12 sar1b (ENSOTSG00005040563) JADE2 (ENSOTSG00005040566) #15 cdkn2aipnl (ENSOTSG00005040568) #16 ube2b (ENSOTSG00005040569) #17 ppp2cab (ENSOTSG00005040571) #19 skp1 (ENSOTSG00005040573) #20 tcf7 (ENSOTSG00005040577) #21 ENSOTSG00005040579 vdac1 (ENSOTSG00005040582) #22 ENSOTSG00005040586 #23 fstl4 (ENSOTSG00005040588) #24 ENSOTSG00005040825 fnip1 (ENSOTSG00005040889) ENSOTSG00005041459 irf1b (ENSOTSG00005046687) slc22a4 (ENSOTSG00005046691) pdlim4 (ENSOTSG00005046692) p4ha2 (ENSOTSG00005046693) ENSOTSG00005047178 ENSOTSG00005047180 JAKMIP2 (ENSOTSG00005047186) dpysl3 (ENSOTSG00005047194) STK32A (ENSOTSG00005047196) stk10 (ENSOTSG00005047197) Chinook salmon MODERN SPECIES 33 ENSOTSG00005036319 dlg2 (ENSOTSG00005036357) tmem126a (ENSOTSG00005044855) CREBZF (ENSOTSG00005044874) 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(ENSACIG00000013634) ENSACIG00000013646 JADE2 (ENSACIG00000013658) #15 ENSACIG00000013677 cdkn2aipnl (ENSACIG00000013686) #16 ube2b (ENSACIG00000013703) #17 PPP2CA (ENSACIG00000013721) #19 skp1 (ENSACIG00000013735) #20 tcf7 (ENSACIG00000013748) #21 vdac1 (ENSACIG00000013770) #22 C5orf15 (ENSACIG00000013787) #23 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b ENSGT01090000260029.a.a.b.a.a.b ENSGT00390000014889.b #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570.p #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00550000074618.a.a.lb.b #19 ENSGT00390000012652 #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b.d ENSGT01090000260029.a.a.b.a.a.b ENSGT00390000014889.b #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570.p #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00550000074618.a.a.lb.b #19 ENSGT00390000012652 #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b.d ENSGT00940000155191.a.a.c.a.a ENSGT00390000014725.r.b.b ENSGT00390000014889.b #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570.p #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00550000074618.a.a.lb.b #19 ENSGT00390000012652 #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 Orange clownfish MODERN SPECIES 6 txndc15 (ENSAPEG00000022478) #8 ENSAPEG00000022507 zgc:152891 (ENSAPEG00000022561) TRAPPC14 (ENSAPEG00000022603) zgc:77058 (ENSAPEG00000022629) #9 ddx46 (ENSAPEG00000022648) #10 camlg (ENSAPEG00000022701) #11 SEC24A (ENSAPEG00000022724) #12 sar1b (ENSAPEG00000022771) JADE2 (ENSAPEG00000022915) #15 cdkn2aipnl (ENSAPEG00000022936) #16 ube2b (ENSAPEG00000022952) #17 PPP2CA (ENSAPEG00000000315) #19 skp1 (ENSAPEG00000000369) #20 tcf7 (ENSAPEG00000000404) #21 vdac1 (ENSAPEG00000000481) #22 ENSAPEG00000000493 #23 fstl4 (ENSAPEG00000000505) #24 zgc:152891 (ENSAPEG00000000581) TRAPPC14 (ENSAPEG00000000677) ENSAPEG00000000730 cadm1a (ENSAPEG00000000786) ENSAPEG00000000825 ncam1a (ENSAPEG00000000870) zbtb16a (ENSAPEG00000000983) HTR3A (ENSAPEG00000001010) HTR3B (ENSAPEG00000001037) USP28 (ENSAPEG00000001094) rbm41 (ENSAPEG00000001223) klf8 (ENSAPEG00000001318) klf5l (ENSAPEG00000001364) Clown anemonefish MODERN SPECIES 642 tcf7 (ENSAOCG00000024730) #21 vdac1 (ENSAOCG00000002759) #22 ENSAOCG00000024748 #23 fstl4 (ENSAOCG00000024750) #24 Spiny chromis MODERN SPECIES 94 JADE2 (ENSAPOG00000000965) #15 cdkn2aipnl (ENSAPOG00000019535) #16 ube2b (ENSAPOG00000019564) #17 PPP2CA (ENSAPOG00000019529) #19 skp1 (ENSAPOG00000019503) #20 tcf7 (ENSAPOG00000019463) #21 vdac1 (ENSAPOG00000019381) #22 ENSAPOG00000019329 fstl4 (ENSAPOG00000019305) #24 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1006 tcf7 (ENSSPAG00000019350) #21 vdac1 (ENSSPAG00000019365) #22 C5orf15 (ENSSPAG00000019388) #23 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b ENSGT00390000014889.b #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000180246 ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00550000074618.a.a.lb.b #19 ENSGT00390000012652 #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000156288.a ENSGT00940000167667 ENSGT00940000163251.a.b.b ENSGT00940000163251.a.a ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h ENSGT00940000159536 ENSGT00940000157695 ENSGT00940000163827.a.a.a.b Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000165985 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b ENSGT00390000014889.b #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00550000074618.a.a.lb.b #19 ENSGT00390000012652 #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000156288.a ENSGT00940000167667 ENSGT00940000163251.a.b.b ENSGT00940000163251.a.a ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h ENSGT00940000159536 ENSGT00940000157695 ENSGT00940000163827.a.a.a.b Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000165985 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889.b #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00550000074618.a.a.lb.b #19 ENSGT00390000012652 #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000156288.a ENSGT00940000167667 ENSGT00940000163251.a.b.b ENSGT00940000163251.a.a ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a.d ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h ENSGT00940000163251.a.b.a.d.b ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a.c.b ENSGT00940000159536 ENSGT00940000157695 Fugu MODERN SPECIES 6 macroh2a1 (ENSTRUG00000009196) pitx1 (ENSTRUG00000009140) PCBD2 (ENSTRUG00000009098) #7 txndc15 (ENSTRUG00000009071) #8 zgc:77058 (ENSTRUG00000019776) #9 ddx46 (ENSTRUG00000008878) #10 camlg (ENSTRUG00000008826) #11 SEC24A (ENSTRUG00000008656) #12 sar1b (ENSTRUG00000007269) JADE2 (ENSTRUG00000008402) #15 cdkn2aipnl (ENSTRUG00000008396) #16 ube2b (ENSTRUG00000026138) #17 PPP2CA (ENSTRUG00000008018) #19 skp1 (ENSTRUG00000008007) #20 tcf7 (ENSTRUG00000007702) #21 vdac1 (ENSTRUG00000007625) #22 C5orf15 (ENSTRUG00000021434) #23 ENSTRUG00000021162 fstl4 (ENSTRUG00000007326) #24 ENSTRUG00000006132 fnip1 (ENSTRUG00000005664) irf1b (ENSTRUG00000004321) slc22a4 (ENSTRUG00000031026) ENSTRUG00000003362 slc22a21 (ENSTRUG00000001808) ENSTRUG00000001563 ENSTRUG00000023916 ENSTRUG00000027824 ENSTRUG00000000200 ENSTRUG00000031132 ENSTRUG00000000235 Tetraodon MODERN SPECIES 22 PCBD2 (ENSTNIG00000016103) #7 txndc15 (ENSTNIG00000016102) #8 zgc:77058 (ENSTNIG00000001939) #9 med21 (ENSTNIG00000016101) ddx46 (ENSTNIG00000016100) #10 camlg (ENSTNIG00000016099) #11 SEC24A (ENSTNIG00000016098) #12 sar1b (ENSTNIG00000016097) ENSTNIG00000000024 JADE2 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ENSGT00940000163827.a.a.a.b Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000165985 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 #15 ENSGT00940000157177 #16 ENSGT00940000156580 #17 ENSGT00550000074618.a.a.lb.b #19 ENSGT00390000012652 #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000156288.a ENSGT00940000167667 ENSGT00940000163251.a.b.b ENSGT00940000163251.a.a ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h ENSGT00940000159536 ENSGT00940000157695 ENSGT00940000163827.a.a.a.b European seabass MODERN SPECIES 4 ENSDLAG00005010760 PCBD2 (ENSDLAG00005010687) #7 txndc15 (ENSDLAG00005010675) #8 ENSDLAG00005029582 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TRIM37 (ENSCLMG00005014874) Stickleback MODERN SPECIES 7 ENSGACG00000020898 guca1d (ENSGACG00000020897) rhogb (ENSGACG00000020896) pgap2 (ENSGACG00000020895) ENSGACG00000020894 ENSGACG00000020893 zmat2 (ENSGACG00000020892) ENSGACG00000020891 ENSGACG00000020890 nhp2 (ENSGACG00000020889) ENSGACG00000020888 cdkn2aipnl (ENSGACG00000020887) #16 ENSGACG00000020886 PPP2CA (ENSGACG00000020885) #19 skp1 (ENSGACG00000020884) #20 vdac1 (ENSGACG00000020883) #22 ENSGACG00000020882 ENSGACG00000020881 fstl4 (ENSGACG00000020880) #24 ENSGACG00000020879 fnip1 (ENSGACG00000020878) ENSGACG00000020877 irf1b (ENSGACG00000020876) slc22a4 (ENSGACG00000020875) slc22a21 (ENSGACG00000020874) ENSGACG00000020873 ENSGACG00000020872 KCNJ15 (ENSGACG00000020871) SMG8 (ENSGACG00000020870) ppm1e (ENSGACG00000020869) ENSGACG00000020868 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b ENSGT00390000014889.b #9 ENSGT00940000157753 #10 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JAKMIP2 (ENSATEG00000011653) dpysl3 (ENSATEG00000011595) STK32A (ENSATEG00000011554) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 5 ENSBSLG00000010968 ddx46 (ENSBSLG00000011055) #10 zgc:77058 (ENSBSLG00000011549) #9 camlg (ENSBSLG00000011551) #11 SEC24A (ENSBSLG00000011851) #12 sar1b (ENSBSLG00000012790) JADE2 (ENSBSLG00000013068) #15 cdkn2aipnl (ENSBSLG00000013099) #16 ube2b (ENSBSLG00000013236) #17 PPP2CA (ENSBSLG00000013499) #19 skp1 (ENSBSLG00000013533) #20 tcf7 (ENSBSLG00000013637) #21 ENSBSLG00000014039 ENSBSLG00000014060 ENSBSLG00000014089 vdac1 (ENSBSLG00000014135) #22 C5orf15 (ENSBSLG00000014461) #23 fstl4 (ENSBSLG00000014690) #24 RAPGEF6 (ENSBSLG00000014892) fnip1 (ENSBSLG00000015835) ENSBSLG00000016076 IRF1 (ENSBSLG00000019407) slc22a4 (ENSBSLG00000019454) ENSBSLG00000019473 slc22a21 (ENSBSLG00000019542) ENSBSLG00000019614 ENSBSLG00000019824 ENSBSLG00000020078 ENSBSLG00000020083 pdlim4 (ENSBSLG00000020087) p4ha2 (ENSBSLG00000020993) Zig-zag eel MODERN SPECIES 5 macroh2a1 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(ENSNNAG00000003154) RTKN2 (ENSNNAG00000003167) ENSNNAG00000003188 ENSNNAG00000003212 VCL (ENSNNAG00000003234) AP3M1 (ENSNNAG00000003266) ADK (ENSNNAG00000003283) KAT6B (ENSNNAG00000003335) DUSP29 (ENSNNAG00000003367) DUSP13 (ENSNNAG00000003378) ENSNNAG00000003393 ENSNNAG00000003404 ENSNNAG00000003413 SAMD8 (ENSNNAG00000003418) VDAC2 (ENSNNAG00000003426) ##22 COMTD1 (ENSNNAG00000003439) ZNF503 (ENSNNAG00000003465) LRMDA (ENSNNAG00000003484) ENSNNAG00000003502 ENSNNAG00000003512 ENSNNAG00000003532 ENSNNAG00000003543 POLR3A (ENSNNAG00000004144) ENSNNAG00000004306 ZMIZ1 (ENSNNAG00000004412) PPIF (ENSNNAG00000004997) ZCCHC24 (ENSNNAG00000005155) ENSNNAG00000005178 ENSNNAG00000005312 ENSNNAG00000005334 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 141 ENSGT00390000000984 ENSGT00530000063713.a ENSGT00940000157470 ENSGT00940000164426 ENSGT01030000234543.D.b ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372.f ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 70 ENSGT01030000234633.C.a ENSGT00390000000854.c.b ENSGT00390000003133 ENSGT00390000000984 ENSGT00530000063713.a ENSGT00940000157470 ENSGT00940000164426 ENSGT01030000234543.D.b ENSGT00940000158184.l ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372.f ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 Eastern brown snake DUPLICATION Eastern brown snake MODERN SPECIES 427 ENSPTXG00000018095 ##22 ENSPTXG00000018094 Eastern brown snake MODERN SPECIES 426 ENSPTXG00000018093 ##22 ENSPTXG00000018092 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 60 NRBF2 (ENSNSUG00000020077) ZNF365 (ENSNSUG00000020076) ENSNSUG00000020075 ENSNSUG00000020074 VCL (ENSNSUG00000020072) AP3M1 (ENSNSUG00000020071) ADK (ENSNSUG00000020070) ENSNSUG00000020069 ENSNSUG00000020068 DUSP29 (ENSNSUG00000020066) ENSNSUG00000020065 ENSNSUG00000020064 ENSNSUG00000020063 ENSNSUG00000020062 SAMD8 (ENSNSUG00000020061) VDAC2 (ENSNSUG00000020060) ##22 ZNF503 (ENSNSUG00000020059) Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 8579 VDAC2 (ENSLLTG00000012226) ##22 Lizard MODERN SPECIES 810 NDST2 (ENSACAG00000009340) ENSACAG00000045222 CAMK2G (ENSACAG00000009061) ENSACAG00000009046 VCL (ENSACAG00000008935) ENSACAG00000045050 AP3M1 (ENSACAG00000008930) ADK (ENSACAG00000008837) KAT6B (ENSACAG00000008709) dupd1 (ENSACAG00000037610) DUSP13 (ENSACAG00000008666) ENSACAG00000038884 ENSACAG00000041941 ENSACAG00000041631 SAMD8 (ENSACAG00000035735) VDAC2 (ENSACAG00000008559) ##22 COMTD1 (ENSACAG00000045223) ENSACAG00000044090 ENSACAG00000044210 ZNF503 (ENSACAG00000040044) ENSACAG00000035103 ENSACAG00000042912 LRMDA (ENSACAG00000028568) ENSACAG00000039917 ENSACAG00000035654 ENSACAG00000039723 ENSACAG00000040958 ENSACAG00000043778 ENSACAG00000039320 ENSACAG00000036138 ENSACAG00000040803 Laterata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000166242.a ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT00940000164426 ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b.z ENSGT00940000162682.A.a.b.y.a ENSGT00940000162682.A.a.b.y.b ENSGT00940000155540.b.b.e ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000173294 ENSGT00600000084626 ENSGT00940000154537 ENSGT00390000016042.a Common wall lizard MODERN SPECIES 13 NDST2 (ENSPMRG00000001889) CAMK2G (ENSPMRG00000001904) ENSPMRG00000001921 ENSPMRG00000001927 VCL (ENSPMRG00000001955) AP3M1 (ENSPMRG00000002000) ADK (ENSPMRG00000002011) KAT6B (ENSPMRG00000002036) DUSP29 (ENSPMRG00000002065) DUSP13 (ENSPMRG00000002070) ENSPMRG00000002076 ENSPMRG00000002080 ENSPMRG00000002087 ENSPMRG00000002091 SAMD8 (ENSPMRG00000002095) VDAC2 (ENSPMRG00000002106) ##22 COMTD1 (ENSPMRG00000002115) ZNF503 (ENSPMRG00000002125) LRMDA (ENSPMRG00000002138) KCNMA1 (ENSPMRG00000002147) ENSPMRG00000002204 ENSPMRG00000002268 ENSPMRG00000002608 POLR3A (ENSPMRG00000002618) ENSPMRG00000002638 ZMIZ1 (ENSPMRG00000002657) ENSPMRG00000002684 PPIF (ENSPMRG00000002688) ZCCHC24 (ENSPMRG00000002697) ANXA11 (ENSPMRG00000002708) ENSPMRG00000002765 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 47 CAMK2G (ENSSMRG00000002031) ENSSMRG00000002149 VCL (ENSSMRG00000002170) ENSSMRG00000002205 AP3M1 (ENSSMRG00000002212) ADK (ENSSMRG00000002232) KAT6B (ENSSMRG00000002236) DUSP29 (ENSSMRG00000002240) DUSP13 (ENSSMRG00000002249) ENSSMRG00000002270 ENSSMRG00000002271 ENSSMRG00000002284 ENSSMRG00000002285 ENSSMRG00000002287 ENSSMRG00000002289 VDAC2 (ENSSMRG00000002293) ##22 COMTD1 (ENSSMRG00000002301) ZNF503 (ENSSMRG00000002314) ENSSMRG00000002338 LRMDA (ENSSMRG00000002390) ENSSMRG00000002439 ENSSMRG00000006686 ENSSMRG00000006708 DLG5 (ENSSMRG00000006724) POLR3A (ENSSMRG00000006755) RPS24 (ENSSMRG00000006802) ENSSMRG00000006826 ZMIZ1 (ENSSMRG00000006858) PPIF (ENSSMRG00000006912) ZCCHC24 (ENSSMRG00000006925) ANXA11 (ENSSMRG00000006928) tuatara MODERN SPECIES 1933 SAMD8 (ENSSPUG00000006031) VDAC2 (ENSSPUG00000006024) ##22 COMTD1 (ENSSPUG00000005920) Mammalia ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT01060000252496 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00600000084626 Platypus MODERN SPECIES 14 ENSOANG00000010541 ##12 FUT11 (ENSOANG00000044777) ENSOANG00000047759 ZSWIM8 (ENSOANG00000047326) NDST2 (ENSOANG00000013314) CAMK2G (ENSOANG00000013313) ENSOANG00000003924 VCL (ENSOANG00000010411) AP3M1 (ENSOANG00000010412) ADK (ENSOANG00000010413) KAT6B (ENSOANG00000005908) DUSP29 (ENSOANG00000031368) ENSOANG00000005909 ENSOANG00000046388 SAMD8 (ENSOANG00000005910) VDAC2 (ENSOANG00000005911) ##22 COMTD1 (ENSOANG00000005912) ZNF503 (ENSOANG00000044200) LRMDA (ENSOANG00000045478) KCNMA1 (ENSOANG00000005169) ENSOANG00000048761 DLG5 (ENSOANG00000001726) POLR3A (ENSOANG00000007013) RPS24 (ENSOANG00000006329) ZMIZ1 (ENSOANG00000005178) PPIF (ENSOANG00000005176) ZCCHC24 (ENSOANG00000045766) ANXA11 (ENSOANG00000005992) ENSOANG00000040840 TMEM254 (ENSOANG00000019840) ENSOANG00000047618 Theria ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT01060000252496 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000165487 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT01060000252496 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Wild yak MODERN SPECIES 355 ENSBMUG00000009918 ENSBMUG00000009928 SLC6A2 (ENSBMUG00000010092) LPCAT2 (ENSBMUG00000010132) MMP2 (ENSBMUG00000010148) IRX6 (ENSBMUG00000010165) IRX5 (ENSBMUG00000010181) IRX3 (ENSBMUG00000010223) FTO (ENSBMUG00000010305) ENSBMUG00000010323 ##22 RPGRIP1L (ENSBMUG00000010431) ENSBMUG00000010496 AKTIP (ENSBMUG00000010517) RBL2 (ENSBMUG00000010579) CHD9 (ENSBMUG00000010701) CHD9NB (ENSBMUG00000010713) Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Arabian camel MODERN SPECIES 24 CCDC25 (ENSCDRG00005019631) SCARA3 (ENSCDRG00005019603) CLU (ENSCDRG00005019585) ENSCDRG00005019569 EPHX2 (ENSCDRG00005019465) CHRNA2 (ENSCDRG00005019402) PTK2B (ENSCDRG00005019294) TRIM35 (ENSCDRG00005019253) STMN4 (ENSCDRG00005019200) ENSCDRG00005019174 ADRA1A (ENSCDRG00005019146) DPYSL2 (ENSCDRG00005018995) PNMA2 (ENSCDRG00005018959) BNIP3L (ENSCDRG00005018890) PPP2R2A (ENSCDRG00005018721) ENSCDRG00005018693 ##22 EBF2 (ENSCDRG00005018634) CDCA2 (ENSCDRG00005018503) KCTD9 (ENSCDRG00005018455) GNRH1 (ENSCDRG00005018431) DOCK5 (ENSCDRG00005018165) NEFL (ENSCDRG00005018138) ENSCDRG00005018075 ADAM7 (ENSCDRG00005017257) ADAM28 (ENSCDRG00005016471) STC1 (ENSCDRG00005016415) ENSCDRG00005016389 NKX3-1 (ENSCDRG00005016364) SLC25A37 (ENSCDRG00005016317) ENTPD4 (ENSCDRG00005016214) LOXL2 (ENSCDRG00005016177) Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 2239 ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 ENSGT00390000004409 Hedgehog MODERN SPECIES 5990 VDAC2 (ENSEEUG00000008623) ##22 COMTD1 (ENSEEUG00000008657) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b ENSGT00940000154368.k ENSGT00940000156653 Alpaca MODERN SPECIES 2944 ENSVPAG00000010294 ##22 Arabian camel MODERN SPECIES 2 FUT11 (ENSCDRG00005015164) CHCHD1 (ENSCDRG00005015257) ZSWIM8 (ENSCDRG00005015347) NDST2 (ENSCDRG00005016902) CAMK2G (ENSCDRG00005017107) PLAU (ENSCDRG00005017463) VCL (ENSCDRG00005017643) ENSCDRG00005017824 ADK (ENSCDRG00005017927) KAT6B (ENSCDRG00005018083) DUSP29 (ENSCDRG00005018150) ENSCDRG00005018186 SAMD8 (ENSCDRG00005018320) ENSCDRG00005018348 ENSCDRG00005018370 ENSCDRG00005018385 ##22 COMTD1 (ENSCDRG00005018451) ZNF503 (ENSCDRG00005018488) LRMDA (ENSCDRG00005018525) KCNMA1 (ENSCDRG00005019550) DLG5 (ENSCDRG00005022253) ENSCDRG00005022255 ENSCDRG00005022257 RPS24 (ENSCDRG00005022258) PPIF (ENSCDRG00005006732) ZCCHC24 (ENSCDRG00005006751) ANXA11 (ENSCDRG00005006778) ENSCDRG00005006822 TMEM254 (ENSCDRG00005006878) SFTPD (ENSCDRG00005006926) ENSCDRG00005006976 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Wild yak MODERN SPECIES 590 NUAK1 (ENSBMUG00000003355) CKAP4 (ENSBMUG00000003414) TCP11L2 (ENSBMUG00000003454) POLR3B (ENSBMUG00000003546) RFX4 (ENSBMUG00000003646) RIC8B (ENSBMUG00000003725) TMEM263 (ENSBMUG00000003752) MTERF2 (ENSBMUG00000003775) CRY1 (ENSBMUG00000003802) ENSBMUG00000003817 ##22 ABTB3 (ENSBMUG00000003937) PWP1 (ENSBMUG00000004016) PRDM4 (ENSBMUG00000004032) ASCL4 (ENSBMUG00000004047) RTCB (ENSBMUG00000004067) BPIFC (ENSBMUG00000004131) FBXO7 (ENSBMUG00000004148) ENSBMUG00000004203 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 American mink MODERN SPECIES 109 VRK2 (ENSNVIG00000012761) ENSNVIG00000012747 FANCL (ENSNVIG00000012633) BCL11A (ENSNVIG00000012490) PAPOLG (ENSNVIG00000012455) REL (ENSNVIG00000012402) PUS10 (ENSNVIG00000012384) PEX13 (ENSNVIG00000012376) K1841 (ENSNVIG00000012252) C2orf74 (ENSNVIG00000012228) ENSNVIG00000012222 ENSNVIG00000012217 ##22 USP34 (ENSNVIG00000012085) XPO1 (ENSNVIG00000011993) F161A (ENSNVIG00000011983) CCT4 (ENSNVIG00000011941) COMMD1 (ENSNVIG00000011903) ENSNVIG00000011888 TMEM17 (ENSNVIG00000011866) EHBP1 (ENSNVIG00000011813) OTX1 (ENSNVIG00000011785) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Chimpanzee DUPLICATION Chimpanzee MODERN SPECIES 1 FUT11 (ENSPTRG00000024232) CHCHD1 (ENSPTRG00000002638) ZSWIM8 (ENSPTRG00000034304) NDST2 (ENSPTRG00000002641) CAMK2G (ENSPTRG00000002643) PLAU (ENSPTRG00000002646) ENSPTRG00000041808 VCL (ENSPTRG00000002647) AP3M1 (ENSPTRG00000024118) ADK (ENSPTRG00000002649) ENSPTRG00000047234 KAT6B (ENSPTRG00000002652) DUSP29 (ENSPTRG00000002653) DUSP13 (ENSPTRG00000002655) SAMD8 (ENSPTRG00000002656) ENSPTRG00000050280 ##22 COMTD1 (ENSPTRG00000002658) ZNF503 (ENSPTRG00000029870) LRMDA (ENSPTRG00000002660) KCNMA1 (ENSPTRG00000046743) ENSPTRG00000045968 ENSPTRG00000048458 DLG5 (ENSPTRG00000002663) POLR3A (ENSPTRG00000002664) RPS24 (ENSPTRG00000002666) ZMIZ1 (ENSPTRG00000002668) PPIF (ENSPTRG00000002669) ENSPTRG00000052838 ZCCHC24 (ENSPTRG00000002670) ENSPTRG00000039342 ANXA11 (ENSPTRG00000002680) Chimpanzee MODERN SPECIES 18 TIMD4 (ENSPTRG00000017458) HAVCR1 (ENSPTRG00000017459) HAVCR2 (ENSPTRG00000017461) MED7 (ENSPTRG00000017462) GARIN3 (ENSPTRG00000017463) ITK (ENSPTRG00000017464) CYFIP2 (ENSPTRG00000017465) FNDC9 (ENSPTRG00000041848) NIPAL4 (ENSPTRG00000017469) ADAM19 (ENSPTRG00000017470) SOX30 (ENSPTRG00000017471) C5H5orf52 (ENSPTRG00000017472) THG1L (ENSPTRG00000017473) LSM11 (ENSPTRG00000017474) CLINT1 (ENSPTRG00000052146) ENSPTRG00000028515 ##22 ENSPTRG00000042059 EBF1 (ENSPTRG00000017477) RNF145 (ENSPTRG00000017479) UBLCP1 (ENSPTRG00000017480) IL12B (ENSPTRG00000017481) ADRA1B (ENSPTRG00000017482) TTC1 (ENSPTRG00000017484) PWWP2A (ENSPTRG00000017486) FABP6 (ENSPTRG00000017487) CCNJL (ENSPTRG00000017488) ENSPTRG00000046075 C1QTNF2 (ENSPTRG00000017489) FAM200C (ENSPTRG00000042098) SLU7 (ENSPTRG00000017491) PTTG1 (ENSPTRG00000017492) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT01060000252496 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000154537 ENSGT00940000155748.b Glires ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000165487 ENSGT00940000155748.b ENSGT00940000154368.k ENSGT00940000156653 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b.s Pika MODERN SPECIES 2438 KAT6B (ENSOPRG00000002310) DUSP29 (ENSOPRG00000002366) DUSP13 (ENSOPRG00000002376) SAMD8 (ENSOPRG00000002388) VDAC2 (ENSOPRG00000002415) ##22 COMTD1 (ENSOPRG00000002449) Rabbit MODERN SPECIES 9 CHCHD1 (ENSOCUG00000037036) ZSWIM8 (ENSOCUG00000020924) NDST2 (ENSOCUG00000012569) CAMK2G (ENSOCUG00000012578) ENSOCUG00000030476 PLAU (ENSOCUG00000003155) VCL (ENSOCUG00000003163) AP3M1 (ENSOCUG00000009946) ENSOCUG00000023858 ENSOCUG00000010613 ADK (ENSOCUG00000009950) KAT6B (ENSOCUG00000017344) DUSP29 (ENSOCUG00000026189) ENSOCUG00000009072 SAMD8 (ENSOCUG00000009076) VDAC2 (ENSOCUG00000009082) ##22 COMTD1 (ENSOCUG00000009095) ZNF503 (ENSOCUG00000000028) LRMDA (ENSOCUG00000008123) KCNMA1 (ENSOCUG00000009543) DLG5 (ENSOCUG00000002180) POLR3A (ENSOCUG00000012450) ENSOCUG00000012472 ENSOCUG00000023411 ENSOCUG00000024476 ENSOCUG00000009721 ANXA8 (ENSOCUG00000014189) NPY4R (ENSOCUG00000014188) GPRIN2 (ENSOCUG00000005728) ENSOCUG00000004393 SHLD2 (ENSOCUG00000004390) Rodentia DUPLICATION Rodentia DUPLICATION Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.a ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.a ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 80 ENSJJAG00000017411 Slit3 (ENSJJAG00000018676) Spdl1 (ENSJJAG00000012981) Insyn2b (ENSJJAG00000019989) Dock2 (ENSJJAG00000005958) Iqsec2 (ENSJJAG00000012417) Kdm5c (ENSJJAG00000013385) Tspyl2 (ENSJJAG00000021239) Gpr173 (ENSJJAG00000005573) Maged1 (ENSJJAG00000008793) ENSJJAG00000019689 Gspt2 (ENSJJAG00000000985) Zxdb (ENSJJAG00000014676) Spin4 (ENSJJAG00000008548) Arhgef9 (ENSJJAG00000009447) ENSJJAG00000023059 ##22 Asb12 (ENSJJAG00000024100) Zc4h2 (ENSJJAG00000023338) ENSJJAG00000011514 ENSJJAG00000011017 ENSJJAG00000014273 Zc3h12b (ENSJJAG00000015755) Las1l (ENSJJAG00000015634) ENSJJAG00000007483 ENSJJAG00000009736 Msn (ENSJJAG00000018702) Heph (ENSJJAG00000011624) Eda2r (ENSJJAG00000011031) ENSJJAG00000023290 ENSJJAG00000016187 ENSJJAG00000023447 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.a ##22 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 123 BTBD1 (ENSCLAG00000010092) TM6SF1 (ENSCLAG00000009743) HDGFL3 (ENSCLAG00000007952) BNC1 (ENSCLAG00000008723) SH3GL3 (ENSCLAG00000008885) ADAMTSL3 (ENSCLAG00000012719) SAXO2 (ENSCLAG00000009494) EFL1 (ENSCLAG00000010155) MEX3B (ENSCLAG00000009451) ENSCLAG00000008018 ENSCLAG00000009164 TMC3 (ENSCLAG00000015003) STARD5 (ENSCLAG00000014919) ENSCLAG00000010965 ENSCLAG00000009290 ENSCLAG00000013651 ##22 ENSCLAG00000012189 TLNRD1 (ENSCLAG00000018087) MESD (ENSCLAG00000010925) CEMIP (ENSCLAG00000009458) ABHD17C (ENSCLAG00000008301) ARNT2 (ENSCLAG00000015272) B2M (ENSCLAG00000010453) ENSCLAG00000007186 PATL2 (ENSCLAG00000014407) SPG11 (ENSCLAG00000016540) EIF3J (ENSCLAG00000017286) ENSCLAG00000013359 GOLM2 (ENSCLAG00000010634) FRMD5 (ENSCLAG00000013639) WDR76 (ENSCLAG00000010272) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.b ##22 Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 128 Zdhhc11 (ENSJJAG00000011440) Brd9 (ENSJJAG00000001706) Trip13 (ENSJJAG00000016963) Nkd2 (ENSJJAG00000022067) Slc12a7 (ENSJJAG00000013362) Slc6a19 (ENSJJAG00000013014) Slc6a18 (ENSJJAG00000013974) Tert (ENSJJAG00000015110) Clptm1l (ENSJJAG00000017514) Slc6a3 (ENSJJAG00000018113) Lpcat1 (ENSJJAG00000004764) Mrpl36 (ENSJJAG00000017543) Ndufs6 (ENSJJAG00000018200) Irx4 (ENSJJAG00000000181) Irx2 (ENSJJAG00000010684) ENSJJAG00000012959 ##22 Irx1 (ENSJJAG00000021563) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 88 ENSJJAG00000012384 Myl3 (ENSJJAG00000021882) Pth1r (ENSJJAG00000020640) Ccdc12 (ENSJJAG00000014918) Nbeal2 (ENSJJAG00000018112) Nradd (ENSJJAG00000008456) ENSJJAG00000000233 Setd2 (ENSJJAG00000022758) ENSJJAG00000014043 Kif9 (ENSJJAG00000004798) Klhl18 (ENSJJAG00000022221) Ngp (ENSJJAG00000019896) Ptpn23 (ENSJJAG00000023111) ENSJJAG00000012176 ENSJJAG00000011308 ENSJJAG00000018014 ##22 Cspg5 (ENSJJAG00000011976) ENSJJAG00000022882 ENSJJAG00000009892 ENSJJAG00000023311 ENSJJAG00000010648 ENSJJAG00000013858 Cdc25a (ENSJJAG00000005624) Camp (ENSJJAG00000020763) Nme6 (ENSJJAG00000014892) Plxnb1 (ENSJJAG00000002381) Ccdc51 (ENSJJAG00000020589) ENSJJAG00000019810 ENSJJAG00000018076 ENSJJAG00000019292 ENSJJAG00000014117 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.b ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.b ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.b ##22 Degu MODERN SPECIES 110 ADGRG2 (ENSODEG00000004624) ENSODEG00000004242 ENSODEG00000019043 PPEF1 (ENSODEG00000004173) RS1 (ENSODEG00000004135) ENSODEG00000004098 CDKL5 (ENSODEG00000004155) RAI2 (ENSODEG00000004137) NHS (ENSODEG00000003999) REPS2 (ENSODEG00000003800) RBBP7 (ENSODEG00000003570) ENSODEG00000003512 ENSODEG00000006406 S100G (ENSODEG00000006358) CTPS2 (ENSODEG00000006096) ENSODEG00000006049 ##22 ENSODEG00000006035 ENSODEG00000006009 ENSODEG00000005993 GRPR (ENSODEG00000005986) ENSODEG00000005335 ENSODEG00000005316 ZRSR2 (ENSODEG00000004944) CA5B (ENSODEG00000004810) CLTRN (ENSODEG00000004738) ACE2 (ENSODEG00000004540) BMX (ENSODEG00000004424) PIR (ENSODEG00000004376) VEGFD (ENSODEG00000003938) PIGA (ENSODEG00000003813) ASB11 (ENSODEG00000003719) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000165487 ENSGT00940000155748.b ENSGT00940000154368.k ENSGT00940000156653 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00520000058758 ENSGT00940000155748.b Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184.e ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b ENSGT00940000154368.k Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES DNTTIP2 (ENSSVLG00005000490) BCAR3 (ENSSVLG00005000445) ENSSVLG00005000405 FNBP1L (ENSSVLG00005000352) DR1 (ENSSVLG00005000282) CCDC18 (ENSSVLG00005000256) TMED5 (ENSSVLG00005000211) ENSSVLG00005000190 MTF2 (ENSSVLG00005000167) ENSSVLG00005000125 ENSSVLG00005000089 DIPK1A (ENSSVLG00005004374) ENSSVLG00005004298 EVI5 (ENSSVLG00005004175) GFI1 (ENSSVLG00005004132) ENSSVLG00005004104 ##22 RPAP2 (ENSSVLG00005004082) GLMN (ENSSVLG00005004063) C1orf146 (ENSSVLG00005004047) BTBD8 (ENSSVLG00005003975) EPHX4 (ENSSVLG00005003946) BRDT (ENSSVLG00005003821) TGFBR3 (ENSSVLG00005003738) CDC7 (ENSSVLG00005003704) ENSSVLG00005003691 ENSSVLG00005003666 ENSSVLG00005003646 ZNF644 (ENSSVLG00005003587) BARHL2 (ENSSVLG00005003545) ZNF326 (ENSSVLG00005003520) LRRC8D (ENSSVLG00005003504) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 11 PCNX1 (ENSSVLG00005009899) ENSSVLG00005009795 SIPA1L1 (ENSSVLG00005009679) ENSSVLG00005009607 RGS6 (ENSSVLG00005008662) DPF3 (ENSSVLG00005008293) ENSSVLG00005008049 ZFYVE1 (ENSSVLG00005007958) RBM25 (ENSSVLG00005007885) PSEN1 (ENSSVLG00005007728) PAPLN (ENSSVLG00005007348) NUMB (ENSSVLG00005007168) RIOX1 (ENSSVLG00005007089) ENSSVLG00005007042 ENSSVLG00005007000 ENSSVLG00005006975 ##22 ENSSVLG00005006698 ENSSVLG00005006583 ACOT4 (ENSSVLG00005006548) ENSSVLG00005006522 DNAL1 (ENSSVLG00005006438) PNMA1 (ENSSVLG00005006415) MIDEAS (ENSSVLG00005006379) PTGR2 (ENSSVLG00005006327) ZNF410 (ENSSVLG00005006231) FAM161B (ENSSVLG00005006140) COQ6 (ENSSVLG00005006026) ENTPD5 (ENSSVLG00005005845) BBOF1 (ENSSVLG00005005756) ALDH6A1 (ENSSVLG00005005600) ENSSVLG00005005569 Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 17 CHCHD10 (ENSSVLG00005006718) MMP11 (ENSSVLG00005006688) SMARCB1 (ENSSVLG00005006606) DERL3 (ENSSVLG00005006510) SLC2A11 (ENSSVLG00005006380) MIF (ENSSVLG00005006339) ENSSVLG00005006314 ENSSVLG00005006292 GSTT4 (ENSSVLG00005006254) ENSSVLG00005006229 ENSSVLG00005006193 ENSSVLG00005006177 ENSSVLG00005006131 CABIN1 (ENSSVLG00005006001) SUSD2 (ENSSVLG00005005881) ENSSVLG00005005852 ##22 GGT5 (ENSSVLG00005005644) ENSSVLG00005005413 LRRC75B (ENSSVLG00005005370) SNRPD3 (ENSSVLG00005005327) GUCD1 (ENSSVLG00005005243) UPB1 (ENSSVLG00005005173) ADORA2A (ENSSVLG00005005154) SPECC1L (ENSSVLG00005005084) ENSSVLG00005005044 BCR (ENSSVLG00005004988) RAB36 (ENSSVLG00005004911) GNAZ (ENSSVLG00005004858) RSPH14 (ENSSVLG00005004828) ENSSVLG00005004761 ENSSVLG00005004725 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 17 TBC1D10A (ENSSVLG00005007816) CASTOR1 (ENSSVLG00005007779) OSM (ENSSVLG00005007718) LIF (ENSSVLG00005007682) ENSSVLG00005007667 ENSSVLG00005007628 ENSSVLG00005007561 ENSSVLG00005007526 ENSSVLG00005007499 ENSSVLG00005007477 ENSSVLG00005007459 ENSSVLG00005007426 ENSSVLG00005018815 VOPP1 (ENSSVLG00005018733) LANCL2 (ENSSVLG00005018702) ENSSVLG00005018648 ##22 EGFR (ENSSVLG00005018390) ENSSVLG00005018307 VSTM2A (ENSSVLG00005018198) ENSSVLG00005018127 ENSSVLG00005017900 ENSSVLG00005017841 ENSSVLG00005017587 GRB10 (ENSSVLG00005016817) DDC (ENSSVLG00005016201) FIGNL1 (ENSSVLG00005016112) IKZF1 (ENSSVLG00005015695) ENSSVLG00005015574 SPATA48 (ENSSVLG00005015485) ZPBP (ENSSVLG00005015427) VWC2 (ENSSVLG00005015374) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 13 SYNPO2L (ENSSVLG00005014592) SEC24C (ENSSVLG00005014542) FUT11 (ENSSVLG00005014469) CHCHD1 (ENSSVLG00005014409) ZSWIM8 (ENSSVLG00005014326) NDST2 (ENSSVLG00005014248) CAMK2G (ENSSVLG00005013946) PLAU (ENSSVLG00005013500) VCL (ENSSVLG00005013208) AP3M1 (ENSSVLG00005012809) ENSSVLG00005012767 ENSSVLG00005011968 DUSP29 (ENSSVLG00005011302) DUSP13 (ENSSVLG00005011100) SAMD8 (ENSSVLG00005011005) ENSSVLG00005010821 ##22 COMTD1 (ENSSVLG00005010754) ZNF503 (ENSSVLG00005010698) LRMDA (ENSSVLG00005010576) KCNMA1 (ENSSVLG00005007882) ENSSVLG00005006853 ENSSVLG00005006820 ENSSVLG00005006809 ENSSVLG00005006795 DLG5 (ENSSVLG00005006751) POLR3A (ENSSVLG00005006708) ENSSVLG00005006601 ZMIZ1 (ENSSVLG00005006475) ENSSVLG00005006423 ZCCHC24 (ENSSVLG00005006394) ENSSVLG00005006356 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 11 MEF2A (ENSSVLG00005001742) ENSSVLG00005001869 ENSSVLG00005001915 TTC23 (ENSSVLG00005001983) SYNM (ENSSVLG00005002041) IGF1R (ENSSVLG00005002096) ENSSVLG00005002151 ENSSVLG00005002216 NR2F2 (ENSSVLG00005002243) ENSSVLG00005002275 RGMA (ENSSVLG00005002308) CHD2 (ENSSVLG00005002368) FAM174B (ENSSVLG00005002437) ST8SIA2 (ENSSVLG00005002459) SLCO3A1 (ENSSVLG00005002498) ENSSVLG00005002515 ##22 SV2B (ENSSVLG00005002536) ENSSVLG00005002572 ENSSVLG00005002584 AKAP13 (ENSSVLG00005002651) KLHL25 (ENSSVLG00005002784) AGBL1 (ENSSVLG00005002803) NTRK3 (ENSSVLG00005003033) MRPL46 (ENSSVLG00005003446) MRPS11 (ENSSVLG00005003465) DET1 (ENSSVLG00005003477) AEN (ENSSVLG00005003506) ISG20 (ENSSVLG00005003524) ACAN (ENSSVLG00005003652) ENSSVLG00005003827 ABHD2 (ENSSVLG00005003901) Marmotini ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184.e ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184.e ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 Arctic ground squirrel DUPLICATION Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 75 ENSUPAG00010010560 ##12 FUT11 (ENSUPAG00010010553) CHCHD1 (ENSUPAG00010010547) ZSWIM8 (ENSUPAG00010010484) NDST2 (ENSUPAG00010010466) CAMK2G (ENSUPAG00010010199) PLAU (ENSUPAG00010010185) ENSUPAG00010010171 VCL (ENSUPAG00010010108) AP3M1 (ENSUPAG00010010078) ADK (ENSUPAG00010010046) KAT6B (ENSUPAG00010009815) DUSP29 (ENSUPAG00010009810) ENSUPAG00010009693 SAMD8 (ENSUPAG00010009689) ENSUPAG00010009651 ##22 COMTD1 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SYNPO2L (ENSSTOG00000020507) ENSSTOG00000002375 ##12 FUT11 (ENSSTOG00000010435) CHCHD1 (ENSSTOG00000010448) ZSWIM8 (ENSSTOG00000023617) NDST2 (ENSSTOG00000002389) CAMK2G (ENSSTOG00000010452) PLAU (ENSSTOG00000010465) VCL (ENSSTOG00000012867) ENSSTOG00000012881 ADK (ENSSTOG00000011843) KAT6B (ENSSTOG00000011169) DUSP29 (ENSSTOG00000029009) DUSP13 (ENSSTOG00000005514) SAMD8 (ENSSTOG00000028532) VDAC2 (ENSSTOG00000011353) ##22 COMTD1 (ENSSTOG00000021669) ZNF503 (ENSSTOG00000004349) LRMDA (ENSSTOG00000010640) KCNMA1 (ENSSTOG00000009391) DLG5 (ENSSTOG00000022087) POLR3A (ENSSTOG00000012983) ENSSTOG00000013000 ZMIZ1 (ENSSTOG00000015815) PPIF (ENSSTOG00000003021) ZCCHC24 (ENSSTOG00000013873) ANXA11 (ENSSTOG00000011180) ENSSTOG00000011176 TMEM254 (ENSSTOG00000030373) Alpin marmot MODERN SPECIES 93 SYNPO2L (ENSMMMG00000023482) SEC24C (ENSMMMG00000023479) FUT11 (ENSMMMG00000023478) CHCHD1 (ENSMMMG00000023476) ZSWIM8 (ENSMMMG00000023458) NDST2 (ENSMMMG00000023450) CAMK2G (ENSMMMG00000023401) PLAU 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ENSGT00390000016042 ENSGT00940000156827 ENSGT01100000263524.B.a Guinea pig MODERN SPECIES 15 SYNPO2L (ENSCPOG00000022018) ENSCPOG00000003394 ##12 FUT11 (ENSCPOG00000003400) CHCHD1 (ENSCPOG00000030461) ZSWIM8 (ENSCPOG00000020625) NDST2 (ENSCPOG00000003403) CAMK2G (ENSCPOG00000000914) PLAU (ENSCPOG00000000920) VCL (ENSCPOG00000005058) AP3M1 (ENSCPOG00000005068) ADK (ENSCPOG00000004488) KAT6B (ENSCPOG00000006544) DUSP29 (ENSCPOG00000022980) DUSP13 (ENSCPOG00000006560) SAMD8 (ENSCPOG00000031357) VDAC2 (ENSCPOG00000002752) ##22 COMTD1 (ENSCPOG00000002758) ZNF503 (ENSCPOG00000010319) LRMDA (ENSCPOG00000008454) KCNMA1 (ENSCPOG00000011100) DLG5 (ENSCPOG00000005329) POLR3A (ENSCPOG00000022387) RPS24 (ENSCPOG00000020096) ZMIZ1 (ENSCPOG00000002268) PPIF (ENSCPOG00000013666) ZCCHC24 (ENSCPOG00000026826) ANXA11 (ENSCPOG00000023458) ENSCPOG00000034945 ENSCPOG00000037289 TMEM254 (ENSCPOG00000030137) PTCHD4 (ENSCPOG00000005747) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000156827 ENSGT01100000263524.B.a Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 144 CHCHD1 (ENSCLAG00000012183) ZSWIM8 (ENSCLAG00000011062) NDST2 (ENSCLAG00000010841) CAMK2G (ENSCLAG00000009687) PLAU (ENSCLAG00000010993) VCL (ENSCLAG00000009895) AP3M1 (ENSCLAG00000010102) ADK (ENSCLAG00000011462) KAT6B (ENSCLAG00000012921) DUSP29 (ENSCLAG00000010412) DUSP13 (ENSCLAG00000009900) 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ENSGT00940000156914 ENSGT00940000165487 ENSGT00940000155748.b ENSGT00940000154368.k ENSGT00940000156653 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 64 Fut11 (ENSJJAG00000014414) Chchd1 (ENSJJAG00000001170) Zswim8 (ENSJJAG00000002294) Ndst2 (ENSJJAG00000015732) Camk2g (ENSJJAG00000013441) Plau (ENSJJAG00000022417) Vcl (ENSJJAG00000017784) Ap3m1 (ENSJJAG00000021173) Adk (ENSJJAG00000000489) ENSJJAG00000010577 ENSJJAG00000019180 ENSJJAG00000016757 Dusp29 (ENSJJAG00000012771) Dusp13 (ENSJJAG00000021011) Samd8 (ENSJJAG00000019200) Vdac2 (ENSJJAG00000013813) ##22 Comtd1 (ENSJJAG00000023380) Zfp503 (ENSJJAG00000012451) Lrmda (ENSJJAG00000010771) Kcnma1 (ENSJJAG00000015287) ENSJJAG00000019119 ENSJJAG00000006291 ENSJJAG00000016217 ENSJJAG00000007712 Zmiz1 (ENSJJAG00000016307) Ppif (ENSJJAG00000011851) Zcchc24 (ENSJJAG00000010391) Anxa11 (ENSJJAG00000016249) ENSJJAG00000013392 Tmem254 (ENSJJAG00000024320) Duxbl1 (ENSJJAG00000021637) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00900000143356 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000154537 Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1504 Vcl (ENSNGAG00000004164) Ap3m1 (ENSNGAG00000022117) Adk (ENSNGAG00000008826) ENSNGAG00000000383 Dusp29 (ENSNGAG00000015948) Dusp13 (ENSNGAG00000010931) Samd8 (ENSNGAG00000009450) ENSNGAG00000019006 ##22 Comtd1 (ENSNGAG00000018108) Zfp503 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ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00520000058758 Murinae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00950000183054.b ENSGT01060000248649 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00900000143356 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00520000058758 Mus ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183054.b ENSGT01060000248649 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00520000058758 ENSGT00940000154537 Mus_A DUPLICATION Mus_A ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000183054.b ENSGT01060000248649 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372.m ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b.j ##22 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ENSGT00520000058758 Mus_C ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00950000183054.b ENSGT01060000248649 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372.m ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b.j ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00860000136364 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00520000058758 Steppe mouse MODERN SPECIES 3047 Sec24c (ENSMSIG00000008066) Fut11 (ENSMSIG00000008049) Chchd1 (ENSMSIG00000008020) Zswim8 (ENSMSIG00000007856) Ndst2 (ENSMSIG00000007806) Camk2g (ENSMSIG00000007318) Plau (ENSMSIG00000007288) Vcl (ENSMSIG00000007244) ENSMSIG00000007196 Adk 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MGP_CAROLIEiJ_G0019023 MGP_CAROLIEiJ_G0019024 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b.k ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b.k ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b.k ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3339 Nup54 (ENSMSIG00000019704) Cxcl10 (ENSMSIG00000019679) ENSMSIG00000019590 Cxcl9 (ENSMSIG00000019565) Sdad1 (ENSMSIG00000019448) Naaa (ENSMSIG00000019423) Ppef2 (ENSMSIG00000019374) ENSMSIG00000019344 Uso1 (ENSMSIG00000019049) G3bp2 (ENSMSIG00000018888) Cdkl2 (ENSMSIG00000018828) Odaph (ENSMSIG00000018812) ENSMSIG00000018661 Rchy1 (ENSMSIG00000018588) ENSMSIG00000018579 ENSMSIG00000018571 ##22 Parm1 (ENSMSIG00000018537) Btc (ENSMSIG00000018521) ENSMSIG00000018511 Areg (ENSMSIG00000018486) Ereg (ENSMSIG00000018453) Epgn (ENSMSIG00000018433) Mthfd2l (ENSMSIG00000018395) Cxcl2 (ENSMSIG00000018380) Cxcl1 (ENSMSIG00000018365) Cxcl15 (ENSMSIG00000018349) Cxcl3 (ENSMSIG00000018335) Pf4 (ENSMSIG00000018327) Ppbp (ENSMSIG00000018319) 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MGP_PahariEiJ_G0030038 Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 6 Synpo2l (ENSRNOG00000008949) Sec24c (ENSRNOG00000009042) Fut11 (ENSRNOG00000009274) Chchd1 (ENSRNOG00000009297) Zswim8 (ENSRNOG00000056617) Ndst2 (ENSRNOG00000057755) Camk2g (ENSRNOG00000009783) Plau (ENSRNOG00000010516) Vcl (ENSRNOG00000010765) Ap3m1 (ENSRNOG00000011461) Adk (ENSRNOG00000012325) Kat6b (ENSRNOG00000012850) Dusp29 (ENSRNOG00000013034) LOC108348213 (ENSRNOG00000060401) Samd8 (ENSRNOG00000064565) Vdac2 (ENSRNOG00000013505) ##22 Comtd1 (ENSRNOG00000013968) Zfp503 (ENSRNOG00000014237) ENSRNOG00000065677 Lrmda (ENSRNOG00000069198) ENSRNOG00000069647 Kcnma1 (ENSRNOG00000005985) Dlg5 (ENSRNOG00000005783) Rat MODERN SPECIES 13 Ns5atp4-ps3 (ENSRNOG00000027533) Lypd6b (ENSRNOG00000004614) Kif5c (ENSRNOG00000004680) Epc2 (ENSRNOG00000029447) Mbd5 (ENSRNOG00000027596) Orc4 (ENSRNOG00000005021) Acvr2a (ENSRNOG00000005334) ENSRNOG00000062624 ENSRNOG00000067798 Zeb2 (ENSRNOG00000004677) Gtdc1 (ENSRNOG00000031038) Arhgap15 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DUPLICATION Tree shrew MODERN SPECIES 3902 ENSTBEG00000002607 PHLDB1 (ENSTBEG00000002143) ARCN1 (ENSTBEG00000002080) ENSTBEG00000001946 ##22 Tree shrew MODERN SPECIES 4956 ENSTBEG00000008773 SAMD8 (ENSTBEG00000009083) ENSTBEG00000009198 ##22 COMTD1 (ENSTBEG00000000737) Primates ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT00390000017469 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00910000147651 ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b ENSGT00940000154368.k Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT00390000017469 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00910000147651 ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b ENSGT00940000154368.k Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT00390000017469 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00910000147651 ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B 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ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00910000146898 ENSGT00910000147360 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00910000147265 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 Orangutan MODERN SPECIES 1 ZSWIM8 (ENSPPYG00000002328) NDST2 (ENSPPYG00000002327) CAMK2G (ENSPPYG00000025863) ENSPPYG00000002325 PLAU (ENSPPYG00000002324) VCL (ENSPPYG00000002323) AP3M1 (ENSPPYG00000002322) ENSPPYG00000031666 ENSPPYG00000037496 ADK (ENSPPYG00000002319) ENSPPYG00000039462 ENSPPYG00000039682 DUSP29 (ENSPPYG00000002317) DUSP13 (ENSPPYG00000002316) ENSPPYG00000002315 VDAC2 (ENSPPYG00000037153) ##22 COMTD1 (ENSPPYG00000002314) ZNF503 (ENSPPYG00000002853) LRMDA (ENSPPYG00000002312) KCNMA1 (ENSPPYG00000002311) ENSPPYG00000002308 DLG5 (ENSPPYG00000002306) POLR3A (ENSPPYG00000002305) RPS24 (ENSPPYG00000002304) ZMIZ1 (ENSPPYG00000002302) PPIF (ENSPPYG00000002301) ZCCHC24 (ENSPPYG00000035309) ENSPPYG00000039923 ENSPPYG00000041507 ENSPPYG00000002295 ENSPPYG00000002294 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT00390000017469 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT01100000263897 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00910000146898 ENSGT00910000147360 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00910000147265 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 Gorilla MODERN SPECIES 1 FUT11 (ENSGGOG00000006179) CHCHD1 (ENSGGOG00000006184) ZSWIM8 (ENSGGOG00000006189) NDST2 (ENSGGOG00000006203) CAMK2G (ENSGGOG00000006223) ENSGGOG00000043479 PLAU (ENSGGOG00000015266) VCL (ENSGGOG00000011101) AP3M1 (ENSGGOG00000011120) ENSGGOG00000039536 ADK (ENSGGOG00000005390) KAT6B (ENSGGOG00000008756) DUSP29 (ENSGGOG00000011019) DUSP13 (ENSGGOG00000011021) SAMD8 (ENSGGOG00000011029) VDAC2 (ENSGGOG00000005861) ##22 COMTD1 (ENSGGOG00000005871) ZNF503 (ENSGGOG00000011284) LRMDA (ENSGGOG00000002566) ENSGGOG00000040791 ENSGGOG00000040389 KCNMA1 (ENSGGOG00000000507) ENSGGOG00000043656 ENSGGOG00000023246 ENSGGOG00000025920 DLG5 (ENSGGOG00000008140) POLR3A (ENSGGOG00000027729) ENSGGOG00000022357 ZMIZ1 (ENSGGOG00000005242) ENSGGOG00000043751 PPIF (ENSGGOG00000037486) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT00390000017469 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT01100000263897 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00910000146898 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00910000147265 ENSGT00390000008264 ENSGT00390000003738.a.a.b.y.b ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 Pan ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT00390000017469 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT01100000263897 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00910000146898 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000154156.d.n.b.b.a ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00910000147265 ENSGT00390000008264 ENSGT00390000003738.a.a.b.y.b ENSGT00940000156914 Bonobo MODERN SPECIES 1 FUT11 (ENSPPAG00000032820) CHCHD1 (ENSPPAG00000034801) ZSWIM8 (ENSPPAG00000043189) NDST2 (ENSPPAG00000028737) CAMK2G (ENSPPAG00000001211) PLAU (ENSPPAG00000035966) ENSPPAG00000033301 VCL (ENSPPAG00000042103) AP3M1 (ENSPPAG00000014891) ADK (ENSPPAG00000033166) ENSPPAG00000034472 KAT6B (ENSPPAG00000005711) DUSP29 (ENSPPAG00000029736) DUSP13 (ENSPPAG00000006978) SAMD8 (ENSPPAG00000034932) VDAC2 (ENSPPAG00000027456) ##22 COMTD1 (ENSPPAG00000029541) ZNF503 (ENSPPAG00000000057) LRMDA (ENSPPAG00000032754) KCNMA1 (ENSPPAG00000031977) ENSPPAG00000034645 ENSPPAG00000034656 DLG5 (ENSPPAG00000041668) ENSPPAG00000031986 ENSPPAG00000041726 ENSPPAG00000043469 ZMIZ1 (ENSPPAG00000037801) PPIF (ENSPPAG00000032388) ENSPPAG00000034843 ENSPPAG00000039528 ENSPPAG00000040556 Human MODERN SPECIES 1 AGAP5 (ENSG00000172650) SEC24C (ENSG00000176986) FUT11 (ENSG00000196968) CHCHD1 (ENSG00000172586) ZSWIM8 (ENSG00000214655) NDST2 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monkey MODERN SPECIES 1866 KAT6B (ENSRROG00000032050) DUSP29 (ENSRROG00000022077) DUSP13 (ENSRROG00000034082) SAMD8 (ENSRROG00000020803) VDAC2 (ENSRROG00000036244) ##22 COMTD1 (ENSRROG00000043081) ZNF503 (ENSRROG00000035090) ENSRROG00000008276 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT00390000017469 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT01100000263897 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00910000147265 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156653.o ENSGT00940000156653.n ENSGT00940000154368.k ENSGT00940000155748.b Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 14 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ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT00390000017469 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT01100000263897 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00910000147653 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00910000147319 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156653.o ENSGT00940000156653.n.a.a ENSGT00940000154368.k ENSGT00940000155748.b Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 353 CHCHD1 (ENSMNEG00000035760) ZSWIM8 (ENSMNEG00000043204) NDST2 (ENSMNEG00000031901) CAMK2G (ENSMNEG00000040671) ENSMNEG00000042120 PLAU (ENSMNEG00000037477) VCL (ENSMNEG00000034341) AP3M1 (ENSMNEG00000036623) ENSMNEG00000029844 ADK (ENSMNEG00000044445) KAT6B (ENSMNEG00000039563) DUSP29 (ENSMNEG00000014700) DUSP13 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SPECIES 19 CHCHD1 (ENSMMUG00000056125) ZSWIM8 (ENSMMUG00000004604) NDST2 (ENSMMUG00000022976) CAMK2G (ENSMMUG00000021393) PLAU (ENSMMUG00000009906) VCL (ENSMMUG00000020823) AP3M1 (ENSMMUG00000020825) ENSMMUG00000060115 ADK (ENSMMUG00000022237) ENSMMUG00000053916 ENSMMUG00000054526 KAT6B (ENSMMUG00000023488) DUSP29 (ENSMMUG00000020221) ENSMMUG00000009286 SAMD8 (ENSMMUG00000008690) VDAC2 (ENSMMUG00000008691) ##22 COMTD1 (ENSMMUG00000008694) ZNF503 (ENSMMUG00000006102) ENSMMUG00000050956 ENSMMUG00000057557 ENSMMUG00000059732 LRMDA (ENSMMUG00000023415) ENSMMUG00000050670 KCNMA1 (ENSMMUG00000018390) DLG5 (ENSMMUG00000009128) POLR3A (ENSMMUG00000005514) RPS24 (ENSMMUG00000030562) ZMIZ1 (ENSMMUG00000008790) PPIF (ENSMMUG00000003189) ZCCHC24 (ENSMMUG00000051972) ENSMMUG00000057196 Vervet Monkey MODERN SPECIES 28 FUT11 (ENSCSAG00000008916) CHCHD1 (ENSCSAG00000008922) ZSWIM8 (ENSCSAG00000008933) NDST2 (ENSCSAG00000008945) CAMK2G (ENSCSAG00000008967) ENSCSAG00000008976 PLAU (ENSCSAG00000008982) 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ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a.cb ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b ENSGT00940000154368.k Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 218 CHCHD1 (ENSPSMG00000014655) ZSWIM8 (ENSPSMG00000015172) NDST2 (ENSPSMG00000015772) CAMK2G (ENSPSMG00000017026) PLAU (ENSPSMG00000018622) VCL (ENSPSMG00000018782) ENSPSMG00000018966 AP3M1 (ENSPSMG00000018973) ADK (ENSPSMG00000019107) ENSPSMG00000019148 ENSPSMG00000019149 KAT6B (ENSPSMG00000019163) DUSP29 (ENSPSMG00000019167) DUSP13 (ENSPSMG00000019178) SAMD8 (ENSPSMG00000019189) VDAC2 (ENSPSMG00000019207) ##22 COMTD1 (ENSPSMG00000019215) ZNF503 (ENSPSMG00000019217) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 928 SYNPO2L (ENSPCOG00000017048) ENSPCOG00000024154 ##12 FUT11 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ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b ENSGT00940000154368.k Cetacea ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01060000248649 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182960.a.a.a.a.b.qb.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a 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PLAU (ENSPCTG00005019863) VCL (ENSPCTG00005020063) AP3M1 (ENSPCTG00005020425) ADK (ENSPCTG00005020477) ENSPCTG00005020588 KAT6B (ENSPCTG00005020615) DUSP29 (ENSPCTG00005020706) DUSP13 (ENSPCTG00005020729) SAMD8 (ENSPCTG00005020782) VDAC2 (ENSPCTG00005020809) ##22 COMTD1 (ENSPCTG00005020832) ENSPCTG00005020849 ENSPCTG00005004390 LRMDA (ENSPCTG00005004419) ENSPCTG00005004441 ENSPCTG00005004478 ENSPCTG00005004484 KCNMA1 (ENSPCTG00005004698) ENSPCTG00005005355 POLR3A (ENSPCTG00005005766) RPS24 (ENSPCTG00005005966) ZMIZ1 (ENSPCTG00005006080) ENSPCTG00005006100 ENSPCTG00005006115 TMEM254 (ENSPCTG00005006162) Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01060000248649 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000153524.b.a.b ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b Dolphin MODERN SPECIES 1231 KAT6B (ENSTTRG00000000365) DUSP29 (ENSTTRG00000000367) DUSP13 (ENSTTRG00000000368) SAMD8 (ENSTTRG00000000370) VDAC2 (ENSTTRG00000000371) ##22 COMTD1 (ENSTTRG00000000373) Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000183054.b ENSGT01060000248649 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000000916.f ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000153524.b.a.b ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 Vaquita DUPLICATION Vaquita MODERN SPECIES 7 SEC24C (ENSPSNG00000017183) FUT11 (ENSPSNG00000017287) ENSPSNG00000017371 ZSWIM8 (ENSPSNG00000017427) NDST2 (ENSPSNG00000017553) CAMK2G (ENSPSNG00000017680) PLAU (ENSPSNG00000017933) ENSPSNG00000018054 VCL (ENSPSNG00000018103) AP3M1 (ENSPSNG00000018186) ADK (ENSPSNG00000018276) KAT6B (ENSPSNG00000018544) DUSP29 (ENSPSNG00000018629) DUSP13 (ENSPSNG00000018715) SAMD8 (ENSPSNG00000018913) VDAC2 (ENSPSNG00000018978) ##22 COMTD1 (ENSPSNG00000019015) ENSPSNG00000019024 ZNF503 (ENSPSNG00000019055) LRMDA (ENSPSNG00000019120) ENSPSNG00000019239 KCNMA1 (ENSPSNG00000021619) DLG5 (ENSPSNG00000022596) POLR3A (ENSPSNG00000022598) ENSPSNG00000022599 ZMIZ1 (ENSPSNG00000022601) PPIF (ENSPSNG00000022602) ZCCHC24 (ENSPSNG00000022605) ENSPSNG00000022606 ANXA11 (ENSPSNG00000022607) PLAC9 (ENSPSNG00000022608) Vaquita MODERN SPECIES 12 TBX2 (ENSPSNG00000015990) BCAS3 (ENSPSNG00000016097) PPM1D (ENSPSNG00000016346) APPBP2 (ENSPSNG00000016424) CHCT1 (ENSPSNG00000016555) ENSPSNG00000016659 CA4 (ENSPSNG00000016964) MYO19 (ENSPSNG00000017087) PIGW (ENSPSNG00000017216) GGNBP2 (ENSPSNG00000017255) DHRS11 (ENSPSNG00000017327) MRM1 (ENSPSNG00000017377) LHX1 (ENSPSNG00000017410) AATF (ENSPSNG00000017487) ACACA (ENSPSNG00000017621) ENSPSNG00000018226 ##22 TADA2A (ENSPSNG00000018448) DUSP14 (ENSPSNG00000018531) SYNRG (ENSPSNG00000018625) DDX52 (ENSPSNG00000019073) HNF1B (ENSPSNG00000019157) HEATR6 (ENSPSNG00000019450) ENSPSNG00000019574 ENSPSNG00000019594 ENSPSNG00000019631 ENSPSNG00000019708 ENSPSNG00000019744 CCL14 (ENSPSNG00000019802) ENSPSNG00000019836 ENSPSNG00000019862 HEATR9 (ENSPSNG00000019966) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000183054.b ENSGT01060000248649 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000000916.f ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000153524.b.a.b ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 Narwhal MODERN SPECIES 311 SYNPO2L (ENSMMNG00015010901) SEC24C (ENSMMNG00015010919) FUT11 (ENSMMNG00015010939) CHCHD1 (ENSMMNG00015010957) ZSWIM8 (ENSMMNG00015010974) NDST2 (ENSMMNG00015010993) CAMK2G (ENSMMNG00015011060) PLAU (ENSMMNG00015011120) VCL (ENSMMNG00015011199) AP3M1 (ENSMMNG00015011241) ADK (ENSMMNG00015011303) KAT6B (ENSMMNG00015011393) DUSP29 (ENSMMNG00015011409) DUSP13 (ENSMMNG00015011440) SAMD8 (ENSMMNG00015011491) VDAC2 (ENSMMNG00015011504) ##22 COMTD1 (ENSMMNG00015011519) ENSMMNG00015011553 ENSMMNG00015011565 ZNF503 (ENSMMNG00015011576) LRMDA (ENSMMNG00015011597) KCNMA1 (ENSMMNG00015011966) DLG5 (ENSMMNG00015012641) POLR3A (ENSMMNG00015012741) ENSMMNG00015012806 ZMIZ1 (ENSMMNG00015012852) PPIF (ENSMMNG00015012885) ZCCHC24 (ENSMMNG00015012905) ENSMMNG00015012913 ANXA11 (ENSMMNG00015012925) ENSMMNG00015012941 Beluga whale MODERN SPECIES 65 SYNPO2L (ENSDLEG00000012344) SEC24C (ENSDLEG00000010630) FUT11 (ENSDLEG00000010504) CHCHD1 (ENSDLEG00000010487) ZSWIM8 (ENSDLEG00000010444) NDST2 (ENSDLEG00000010390) CAMK2G (ENSDLEG00000010121) PLAU (ENSDLEG00000010069) VCL (ENSDLEG00000009901) AP3M1 (ENSDLEG00000009868) ADK (ENSDLEG00000009807) KAT6B (ENSDLEG00000009762) DUSP29 (ENSDLEG00000009742) DUSP13 (ENSDLEG00000009704) SAMD8 (ENSDLEG00000009683) VDAC2 (ENSDLEG00000009647) ##22 COMTD1 (ENSDLEG00000009625) ENSDLEG00000009581 ENSDLEG00000009567 ZNF503 (ENSDLEG00000009559) LRMDA (ENSDLEG00000009546) ENSDLEG00000009527 ENSDLEG00000009522 KCNMA1 (ENSDLEG00000009375) ENSDLEG00000009359 DLG5 (ENSDLEG00000009115) POLR3A (ENSDLEG00000008899) RPS24 (ENSDLEG00000008847) ZMIZ1 (ENSDLEG00000008643) PPIF (ENSDLEG00000008590) ZCCHC24 (ENSDLEG00000008566) Pecora ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b.h.a ENSGT00940000155748.b.g Yarkand deer MODERN SPECIES 6 FUT11 (ENSCHYG00000024258) CHCHD1 (ENSCHYG00000024301) ZSWIM8 (ENSCHYG00000024329) NDST2 (ENSCHYG00000024458) CAMK2G (ENSCHYG00000024544) PLAU (ENSCHYG00000024660) VCL (ENSCHYG00000024709) ENSCHYG00000024815 AP3M1 (ENSCHYG00000024826) ADK (ENSCHYG00000024894) ENSCHYG00000025467 ENSCHYG00000025482 KAT6B (ENSCHYG00000004926) DUSP29 (ENSCHYG00000005048) ENSCHYG00000005091 ENSCHYG00000005291 ##22 ENSCHYG00000005450 COMTD1 (ENSCHYG00000005474) ZNF503 (ENSCHYG00000005491) LRMDA (ENSCHYG00000005527) ENSCHYG00000005620 KCNMA1 (ENSCHYG00000006117) DLG5 (ENSCHYG00000012083) POLR3A (ENSCHYG00000012420) ENSCHYG00000012766 ZMIZ1 (ENSCHYG00000012931) PPIF (ENSCHYG00000013395) ZCCHC24 (ENSCHYG00000013440) ANXA11 (ENSCHYG00000013542) PLAC9 (ENSCHYG00000013866) ENSCHYG00000014032 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b.h.a ENSGT00940000155748.b.g Siberian musk deer MODERN SPECIES 1227 SYNPO2L (ENSMMSG00000011327) SEC24C (ENSMMSG00000011364) FUT11 (ENSMMSG00000011509) ENSMMSG00000011549 ZSWIM8 (ENSMMSG00000011579) NDST2 (ENSMMSG00000011632) CAMK2G (ENSMMSG00000011688) PLAU (ENSMMSG00000012070) VCL (ENSMMSG00000012155) AP3M1 (ENSMMSG00000012284) ADK (ENSMMSG00000012338) KAT6B (ENSMMSG00000012486) DUSP29 (ENSMMSG00000012556) DUSP13 (ENSMMSG00000012590) SAMD8 (ENSMMSG00000012740) VDAC2 (ENSMMSG00000012764) ##22 COMTD1 (ENSMMSG00000012778) ZNF503 (ENSMMSG00000012799) LRMDA (ENSMMSG00000012829) KCNMA1 (ENSMMSG00000013398) ENSMMSG00000022915 DLG5 (ENSMMSG00000022925) POLR3A (ENSMMSG00000022968) ENSMMSG00000023003 ZMIZ1 (ENSMMSG00000023032) PPIF (ENSMMSG00000023077) ENSMMSG00000023087 ZCCHC24 (ENSMMSG00000023092) ANXA11 (ENSMMSG00000023104) PLAC9 (ENSMMSG00000023126) TMEM254 (ENSMMSG00000023136) Bovidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b.h.a.b ENSGT00940000155748.b.g Caprinae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00390000000076.o.a ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b.h.a.b.d ENSGT00940000155748.b.h.b Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 17 FUT11 (ENSOARG00020022377) CHCHD1 (ENSOARG00020022399) ZSWIM8 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(ENSCHIG00000000073) DUSP29 (ENSCHIG00000012654) DUSP13 (ENSCHIG00000024051) ENSCHIG00000017421 SAMD8 (ENSCHIG00000012189) ENSCHIG00000023236 VDAC2 (ENSCHIG00000013328) ##22 COMTD1 (ENSCHIG00000005405) ZNF503 (ENSCHIG00000020542) ENSCHIG00000016052 LRMDA (ENSCHIG00000011904) KCNMA1 (ENSCHIG00000025127) ENSCHIG00000016306 DLG5 (ENSCHIG00000000389) POLR3A (ENSCHIG00000000352) ENSCHIG00000000315 ZMIZ1 (ENSCHIG00000000282) PPIF (ENSCHIG00000000241) ZCCHC24 (ENSCHIG00000000203) ENSCHIG00000000166 ANXA11 (ENSCHIG00000000134) PLAC9 (ENSCHIG00000000102) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.k ENSGT00940000167697 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000005496.l ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b.h.a.b.a Bos ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT01060000248649 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D.j ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.k ENSGT00940000167697 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000005496.l ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b.h.a.b.a Bos_b ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT01060000248649 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D.j ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.k ENSGT00940000167697 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000005496.l ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b.h.a.b.a Cow DUPLICATION Cow MODERN SPECIES 24 CHST11 (ENSBTAG00000010644) SLC41A2 (ENSBTAG00000021875) NOPCHAP1 (ENSBTAG00000021196) ALDH1L2 (ENSBTAG00000006326) WASHC4 (ENSBTAG00000033735) APPL2 (ENSBTAG00000030784) NUAK1 (ENSBTAG00000010457) CKAP4 (ENSBTAG00000011913) TCP11L2 (ENSBTAG00000002127) POLR3B (ENSBTAG00000004781) RFX4 (ENSBTAG00000025837) RIC8B (ENSBTAG00000000147) TMEM263 (ENSBTAG00000053105) MTERF2 (ENSBTAG00000010144) CRY1 (ENSBTAG00000010149) ENSBTAG00000001858 ##22 BTBD11 (ENSBTAG00000027064) PWP1 (ENSBTAG00000004654) PRDM4 (ENSBTAG00000012999) ASCL4 (ENSBTAG00000046402) RTCB (ENSBTAG00000011070) BPIFC (ENSBTAG00000011071) FBXO7 (ENSBTAG00000020634) SYN3 (ENSBTAG00000020636) TIMP3 (ENSBTAG00000020638) ENSBTAG00000050644 ENSBTAG00000030683 MGC137211 (ENSBTAG00000018556) MGC137014 (ENSBTAG00000026666) LARGE1 (ENSBTAG00000021953) ENSBTAG00000053499 Cow MODERN SPECIES 20 SEC24C (ENSBTAG00000002791) FUT11 (ENSBTAG00000002792) CHCHD1 (ENSBTAG00000012654) ZSWIM8 (ENSBTAG00000012657) NDST2 (ENSBTAG00000012664) CAMK2G (ENSBTAG00000012667) PLAU (ENSBTAG00000005947) VCL (ENSBTAG00000021879) AP3M1 (ENSBTAG00000021883) ADK (ENSBTAG00000011072) ENSBTAG00000051166 KAT6B (ENSBTAG00000002920) DUSP29 (ENSBTAG00000002924) DUSP13 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Domestic yak MODERN SPECIES 12 BBS2 (ENSBGRG00000022168) MT3 (ENSBGRG00000022541) MT2A (ENSBGRG00000022584) ENSBGRG00000022635 ENSBGRG00000022662 ENSBGRG00000022677 ENSBGRG00000022766 ENSBGRG00000022847 SLC6A2 (ENSBGRG00000022943) LPCAT2 (ENSBGRG00000023829) MMP2 (ENSBGRG00000023889) IRX6 (ENSBGRG00000024080) IRX5 (ENSBGRG00000024137) IRX3 (ENSBGRG00000024169) FTO (ENSBGRG00000024270) ENSBGRG00000024677 ##22 RPGRIP1L (ENSBGRG00000024721) AKTIP (ENSBGRG00000024918) RBL2 (ENSBGRG00000024969) CHD9 (ENSBGRG00000025060) ENSBGRG00000025379 ENSBGRG00000025389 ENSBGRG00000025395 ENSBGRG00000025407 SALL1 (ENSBGRG00000025421) CYLD (ENSBGRG00000005642) NOD2 (ENSBGRG00000006201) SNX20 (ENSBGRG00000006807) NKD1 (ENSBGRG00000007093) ENSBGRG00000007550 BRD7 (ENSBGRG00000007865) Domestic yak MODERN SPECIES 19 FUT11 (ENSBGRG00000012236) CHCHD1 (ENSBGRG00000012311) ZSWIM8 (ENSBGRG00000012462) NDST2 (ENSBGRG00000014437) CAMK2G (ENSBGRG00000014580) PLAU (ENSBGRG00000018034) VCL (ENSBGRG00000018257) AP3M1 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ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b ENSGT00940000154368.k Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 7 SEC24C (ENSRFEG00010016998) FUT11 (ENSRFEG00010017076) CHCHD1 (ENSRFEG00010017138) ZSWIM8 (ENSRFEG00010017191) NDST2 (ENSRFEG00010017352) CAMK2G (ENSRFEG00010017694) PLAU (ENSRFEG00010018945) VCL (ENSRFEG00010019056) AP3M1 (ENSRFEG00010019100) ADK (ENSRFEG00010005375) ENSRFEG00010005466 KAT6B (ENSRFEG00010005507) DUSP29 (ENSRFEG00010005542) DUSP13 (ENSRFEG00010005601) SAMD8 (ENSRFEG00010005728) VDAC2 (ENSRFEG00010005777) ##22 COMTD1 (ENSRFEG00010005853) ZNF503 (ENSRFEG00010005883) LRMDA (ENSRFEG00010006056) KCNMA1 (ENSRFEG00010007791) DLG5 (ENSRFEG00010018952) POLR3A (ENSRFEG00010019028) ENSRFEG00010019078 ZMIZ1 (ENSRFEG00010019186) PPIF (ENSRFEG00010019256) ZCCHC24 (ENSRFEG00010019281) ANXA11 (ENSRFEG00010019316) PLAC9 (ENSRFEG00010019355) TMEM254 (ENSRFEG00010019393) SFTPD (ENSRFEG00010019424) ENSRFEG00010019463 Microbat MODERN SPECIES 1006 SEC24C (ENSMLUG00000012749) FUT11 (ENSMLUG00000012762) CHCHD1 (ENSMLUG00000024022) ZSWIM8 (ENSMLUG00000028244) NDST2 (ENSMLUG00000012766) CAMK2G (ENSMLUG00000012781) PLAU (ENSMLUG00000012801) VCL (ENSMLUG00000009809) AP3M1 (ENSMLUG00000003703) ADK (ENSMLUG00000003709) KAT6B (ENSMLUG00000007438) DUSP29 (ENSMLUG00000007469) DUSP13 (ENSMLUG00000007480) ENSMLUG00000028391 SAMD8 (ENSMLUG00000007486) VDAC2 (ENSMLUG00000007500) ##22 COMTD1 (ENSMLUG00000007523) ZNF503 (ENSMLUG00000012474) ENSMLUG00000003304 LRMDA (ENSMLUG00000009477) ENSMLUG00000022493 KCNMA1 (ENSMLUG00000005723) DLG5 (ENSMLUG00000011460) POLR3A (ENSMLUG00000011522) ENSMLUG00000024102 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT01060000252496 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 Felidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00950000182891.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000186316 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00520000058758 Cat MODERN SPECIES 242 SEC24C (ENSFCAG00000010952) FUT11 (ENSFCAG00000010958) CHCHD1 (ENSFCAG00000034312) ZSWIM8 (ENSFCAG00000018535) NDST2 (ENSFCAG00000010960) CAMK2G (ENSFCAG00000018407) PLAU (ENSFCAG00000015567) VCL (ENSFCAG00000015569) AP3M1 (ENSFCAG00000000775) ADK (ENSFCAG00000015570) ENSFCAG00000039301 KAT6B (ENSFCAG00000005552) DUSP29 (ENSFCAG00000005553) DUSP13 (ENSFCAG00000036709) SAMD8 (ENSFCAG00000026865) VDAC2 (ENSFCAG00000026943) ##22 COMTD1 (ENSFCAG00000005086) ENSFCAG00000026027 ZNF503 (ENSFCAG00000010035) LRMDA (ENSFCAG00000041676) ENSFCAG00000052289 KCNMA1 (ENSFCAG00000007701) DLG5 (ENSFCAG00000002056) POLR3A (ENSFCAG00000000843) ENSFCAG00000000849 ZMIZ1 (ENSFCAG00000011569) PPIF (ENSFCAG00000025543) ZCCHC24 (ENSFCAG00000040394) ANXA11 (ENSFCAG00000023518) ENSFCAG00000040701 TMEM254 (ENSFCAG00000046502) Panthera ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00950000182891.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000186316 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b.i ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b Tiger MODERN SPECIES 507 FUT11 (ENSPTIG00000010079) CHCHD1 (ENSPTIG00000009718) ZSWIM8 (ENSPTIG00000021580) NDST2 (ENSPTIG00000021359) CAMK2G (ENSPTIG00000017657) PLAU (ENSPTIG00000014553) VCL (ENSPTIG00000011317) AP3M1 (ENSPTIG00000010217) ENSPTIG00000005252 ADK (ENSPTIG00000006576) KAT6B (ENSPTIG00000020017) DUSP29 (ENSPTIG00000019868) DUSP13 (ENSPTIG00000018719) ENSPTIG00000018284 SAMD8 (ENSPTIG00000017445) VDAC2 (ENSPTIG00000016826) ##22 COMTD1 (ENSPTIG00000016356) LRMDA (ENSPTIG00000014508) KCNMA1 (ENSPTIG00000012047) DLG5 (ENSPTIG00000006163) POLR3A (ENSPTIG00000020916) ENSPTIG00000018226 ZMIZ1 (ENSPTIG00000014547) PPIF (ENSPTIG00000013743) ZCCHC24 (ENSPTIG00000013378) ANXA11 (ENSPTIG00000012716) ENSPTIG00000012313 TMEM254 (ENSPTIG00000010003) SFTPD (ENSPTIG00000009408) ENSPTIG00000008123 ENSPTIG00000006379 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00950000182891.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000186316 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b.i ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b leopard MODERN SPECIES 11 FUT11 (ENSPPRG00000011359) CHCHD1 (ENSPPRG00000010862) ZSWIM8 (ENSPPRG00000010252) NDST2 (ENSPPRG00000006645) CAMK2G (ENSPPRG00000006184) PLAU (ENSPPRG00000001217) VCL (ENSPPRG00000000447) AP3M1 (ENSPPRG00000022656) ADK (ENSPPRG00000022417) ENSPPRG00000015069 KAT6B (ENSPPRG00000013251) DUSP29 (ENSPPRG00000010401) DUSP13 (ENSPPRG00000010272) ENSPPRG00000009738 SAMD8 (ENSPPRG00000009450) VDAC2 (ENSPPRG00000008901) ##22 COMTD1 (ENSPPRG00000007978) ZNF503 (ENSPPRG00000007343) LRMDA (ENSPPRG00000007251) KCNMA1 (ENSPPRG00000006089) 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ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00520000058758 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 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SPECIES 84 ENSVVUG00000023065 ENSVVUG00000023074 ENSVVUG00000023081 NUAK1 (ENSVVUG00000023089) CKAP4 (ENSVVUG00000023094) TCP11L2 (ENSVVUG00000023095) POLR3B (ENSVVUG00000023101) RFX4 (ENSVVUG00000023150) RIC8B (ENSVVUG00000023164) TMEM263 (ENSVVUG00000023180) MTERF2 (ENSVVUG00000023182) CRY1 (ENSVVUG00000023184) ABTB3 (ENSVVUG00000023211) PWP1 (ENSVVUG00000023390) PRDM4 (ENSVVUG00000023397) ENSVVUG00000023398 ##22 RTCB (ENSVVUG00000023408) BPIFC (ENSVVUG00000023482) FBXO7 (ENSVVUG00000023488) ENSVVUG00000023491 TIMP3 (ENSVVUG00000023494) ENSVVUG00000023500 ENSVVUG00000023507 LARGE1 (ENSVVUG00000023512) ISX (ENSVVUG00000023529) HMGXB4 (ENSVVUG00000023533) TOM1 (ENSVVUG00000023536) HMOX1 (ENSVVUG00000023539) MCM5 (ENSVVUG00000023540) RASD2 (ENSVVUG00000023551) ENSVVUG00000023554 Red fox MODERN SPECIES 2 SEC24C (ENSVVUG00000023183) FUT11 (ENSVVUG00000023196) CHCHD1 (ENSVVUG00000023197) ZSWIM8 (ENSVVUG00000023201) NDST2 (ENSVVUG00000023221) CAMK2G (ENSVVUG00000023234) PLAU 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##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00950000186003 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000186316 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 Dog MODERN SPECIES 32 SEC24C (ENSCAFG00845007865) FUT11 (ENSCAFG00845008151) CHCHD1 (ENSCAFG00845008199) ZSWIM8 (ENSCAFG00845008328) NDST2 (ENSCAFG00845008593) CAMK2G (ENSCAFG00845008751) PLAU (ENSCAFG00845008986) VCL (ENSCAFG00845009183) ENSCAFG00845009485 AP3M1 (ENSCAFG00845009530) ADK (ENSCAFG00845009636) KAT6B (ENSCAFG00845009903) DUSP29 (ENSCAFG00845009993) DUSP13 (ENSCAFG00845010082) SAMD8 (ENSCAFG00845010171) VDAC2 (ENSCAFG00845010278) ##22 COMTD1 (ENSCAFG00845010345) LRMDA (ENSCAFG00845010464) ZNF503 (ENSCAFG00845010719) ENSCAFG00845010740 ENSCAFG00845010767 KCNMA1 (ENSCAFG00845011389) DLG5 (ENSCAFG00845013364) POLR3A (ENSCAFG00845013802) RPS24 (ENSCAFG00845014074) ZMIZ1 (ENSCAFG00845014304) PPIF (ENSCAFG00845014432) ZCCHC24 (ENSCAFG00845014540) ENSCAFG00845014646 ENSCAFG00845014704 TMEM254 (ENSCAFG00845014737) Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 324 CHCHD1 (ENSCAFG00020020732) ZSWIM8 (ENSCAFG00020018623) NDST2 (ENSCAFG00020016436) ENSCAFG00020016387 ENSCAFG00020016383 PLAU (ENSCAFG00020016293) VCL (ENSCAFG00020016286) ENSCAFG00020016285 AP3M1 (ENSCAFG00020016284) ADK (ENSCAFG00020016273) KAT6B (ENSCAFG00020016239) DUSP29 (ENSCAFG00020016226) DUSP13 (ENSCAFG00020016225) ENSCAFG00020016224 SAMD8 (ENSCAFG00020016213) ENSCAFG00020016208 ##22 COMTD1 (ENSCAFG00020016203) ZNF503 (ENSCAFG00020016201) ENSCAFG00020016194 LRMDA (ENSCAFG00020016191) ENSCAFG00020016190 ENSCAFG00020016188 KCNMA1 (ENSCAFG00020014954) DLG5 (ENSCAFG00020014784) POLR3A (ENSCAFG00020014711) RPS24 (ENSCAFG00020014698) ZMIZ1 (ENSCAFG00020014475) ENSCAFG00020014445 PPIF (ENSCAFG00020014441) ZCCHC24 (ENSCAFG00020014439) ANXA11 (ENSCAFG00020014434) Dingo MODERN SPECIES 307 ENSCAFG00020005182 ENSCAFG00020005179 ENSCAFG00020005124 NUAK1 (ENSCAFG00020005117) CKAP4 (ENSCAFG00020005091) ENSCAFG00020005089 TCP11L2 (ENSCAFG00020005088) POLR3B (ENSCAFG00020005062) RFX4 (ENSCAFG00020005027) RIC8B (ENSCAFG00020005022) TMEM263 (ENSCAFG00020004996) MTERF2 (ENSCAFG00020004993) CRY1 (ENSCAFG00020004979) ABTB3 (ENSCAFG00020004942) PWP1 (ENSCAFG00020004921) ENSCAFG00020004919 ##22 PRDM4 (ENSCAFG00020004916) ASCL4 (ENSCAFG00020004911) ENSCAFG00020004890 BPIFC (ENSCAFG00020004848) FBXO7 (ENSCAFG00020004763) ENSCAFG00020004756 TIMP3 (ENSCAFG00020004747) ENSCAFG00020004742 ENSCAFG00020004732 LARGE1 (ENSCAFG00020004723) ENSCAFG00020004691 ISX (ENSCAFG00020004651) HMGXB4 (ENSCAFG00020004587) TOM1 (ENSCAFG00020004581) HMOX1 (ENSCAFG00020004569) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 81 ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00520000058758 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 750 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a Sloth MODERN SPECIES 5329 VDAC2 (ENSCHOG00000009691) ##22 Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 3634 KAT6B (ENSDNOG00000006625) DUSP29 (ENSDNOG00000039114) ENSDNOG00000043527 SAMD8 (ENSDNOG00000042126) ENSDNOG00000045840 ##22 COMTD1 (ENSDNOG00000004911) ZNF503 (ENSDNOG00000045953) Armadillo MODERN SPECIES 2764 ENSDNOG00000041965 ENSDNOG00000005103 GLRX (ENSDNOG00000049647) RHOBTB3 (ENSDNOG00000006568) SPATA9 (ENSDNOG00000031930) RFESD (ENSDNOG00000031736) ARSK (ENSDNOG00000035393) SKIC3 (ENSDNOG00000019699) FAM81B (ENSDNOG00000019698) MCTP1 (ENSDNOG00000024619) SLF1 (ENSDNOG00000011705) KIAA0825 (ENSDNOG00000040421) ENSDNOG00000033821 ##22 FAM172A (ENSDNOG00000004689) NR2F1 (ENSDNOG00000043183) ENSDNOG00000008056 ##22 ENSDNOG00000047445 ENSDNOG00000039372 ENSDNOG00000031852 ENSDNOG00000047212 ARRDC3 (ENSDNOG00000007684) ENSDNOG00000038531 ENSDNOG00000041520 ENSDNOG00000007596 LYSMD3 (ENSDNOG00000034583) ENSDNOG00000004195 MBLAC2 (ENSDNOG00000036816) CETN3 (ENSDNOG00000039817) Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 2764 ENSDNOG00000036264 MEF2C (ENSDNOG00000000377) ENSDNOG00000047108 CETN3 (ENSDNOG00000039817) MBLAC2 (ENSDNOG00000036816) ENSDNOG00000004195 LYSMD3 (ENSDNOG00000034583) ENSDNOG00000007596 ENSDNOG00000041520 ENSDNOG00000038531 ARRDC3 (ENSDNOG00000007684) ENSDNOG00000047212 ENSDNOG00000031852 ENSDNOG00000039372 ENSDNOG00000047445 ENSDNOG00000008056 ##22 NR2F1 (ENSDNOG00000043183) FAM172A (ENSDNOG00000004689) ENSDNOG00000033821 ##22 KIAA0825 (ENSDNOG00000040421) SLF1 (ENSDNOG00000011705) MCTP1 (ENSDNOG00000024619) FAM81B (ENSDNOG00000019698) SKIC3 (ENSDNOG00000019699) ARSK (ENSDNOG00000035393) RFESD (ENSDNOG00000031736) SPATA9 (ENSDNOG00000031930) RHOBTB3 (ENSDNOG00000006568) GLRX (ENSDNOG00000049647) ENSDNOG00000005103 ENSDNOG00000041965 Armadillo MODERN SPECIES 4291 ITPKA (ENSDNOG00000036587) RPAP1 (ENSDNOG00000018324) TYRO3 (ENSDNOG00000032240) MGA (ENSDNOG00000032105) MAPKBP1 (ENSDNOG00000007644) PLA2G4B (ENSDNOG00000007402) SPTBN5 (ENSDNOG00000041279) EHD4 (ENSDNOG00000037551) ENSDNOG00000008133 PLA2G4F (ENSDNOG00000019135) VPS39 (ENSDNOG00000017274) TMEM87A (ENSDNOG00000039921) GANC (ENSDNOG00000017281) CAPN3 (ENSDNOG00000024011) ZNF106 (ENSDNOG00000006442) ENSDNOG00000047810 ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 Tenrec DUPLICATION Tenrec MODERN SPECIES 5802 ENSETEG00000010119 ##22 COMTD1 (ENSETEG00000010121) Tenrec MODERN SPECIES 11171 ENSETEG00000003004 ##22 Tenrec MODERN SPECIES 17463 ENSETEG00000000010 ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 Elephant MODERN SPECIES 3 SYNPO2L (ENSLAFG00000028703) ENSLAFG00000002364 ##12 FUT11 (ENSLAFG00000022417) CHCHD1 (ENSLAFG00000016311) ZSWIM8 (ENSLAFG00000020554) NDST2 (ENSLAFG00000008298) CAMK2G (ENSLAFG00000017644) PLAU (ENSLAFG00000016662) VCL (ENSLAFG00000022677) AP3M1 (ENSLAFG00000018700) ADK (ENSLAFG00000004737) KAT6B (ENSLAFG00000015357) DUSP29 (ENSLAFG00000021406) ENSLAFG00000026669 SAMD8 (ENSLAFG00000013269) VDAC2 (ENSLAFG00000009526) ##22 COMTD1 (ENSLAFG00000009529) ZNF503 (ENSLAFG00000031176) LRMDA (ENSLAFG00000004894) KCNMA1 (ENSLAFG00000003481) ENSLAFG00000029514 DLG5 (ENSLAFG00000004091) POLR3A (ENSLAFG00000016719) RPS24 (ENSLAFG00000027878) ZMIZ1 (ENSLAFG00000022250) PPIF (ENSLAFG00000000379) ZCCHC24 (ENSLAFG00000012854) ANXA11 (ENSLAFG00000023249) PLAC9 (ENSLAFG00000007184) ENSLAFG00000026006 ENSLAFG00000029465 Hyrax MODERN SPECIES 4913 VDAC2 (ENSPCAG00000017046) ##22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000165487 ENSGT00600000084626 ENSGT00390000016042 Opossum MODERN SPECIES ENSMODG00000000346 ##12 FUT11 (ENSMODG00000000355) CHCHD1 (ENSMODG00000000361) ZSWIM8 (ENSMODG00000000396) NDST2 (ENSMODG00000000427) CAMK2G (ENSMODG00000000536) PLAU (ENSMODG00000000564) VCL (ENSMODG00000000633) AP3M1 (ENSMODG00000010261) ADK (ENSMODG00000000687) KAT6B (ENSMODG00000000736) DUPD1 (ENSMODG00000042234) ENSMODG00000000762 ENSMODG00000000853 SAMD8 (ENSMODG00000000873) VDAC2 (ENSMODG00000000896) ##22 COMTD1 (ENSMODG00000000906) ZNF503 (ENSMODG00000048510) ENSMODG00000000919 ENSMODG00000050891 ENSMODG00000040056 ENSMODG00000038200 ENSMODG00000038411 DLG5 (ENSMODG00000001002) POLR3A (ENSMODG00000001036) RPS24 (ENSMODG00000025091) ZMIZ1 (ENSMODG00000001116) PPIF (ENSMODG00000001128) ZCCHC24 (ENSMODG00000001134) ENSMODG00000001145 ENSMODG00000025082 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000165487 ENSGT00600000084626 ENSGT00390000016042 Tasmanian devil DUPLICATION Tasmanian devil MODERN SPECIES 1 ENSSHAG00000030514 ##12 ENSSHAG00000020541 ZSWIM8 (ENSSHAG00000021505) NDST2 (ENSSHAG00000007678) CAMK2G (ENSSHAG00000007766) PLAU (ENSSHAG00000008764) VCL (ENSSHAG00000009417) AP3M1 (ENSSHAG00000009890) ADK (ENSSHAG00000003646) KAT6B (ENSSHAG00000009496) DUSP29 (ENSSHAG00000027020) ENSSHAG00000011319 ENSSHAG00000011402 ENSSHAG00000029396 SAMD8 (ENSSHAG00000011668) ENSSHAG00000012048 ##22 COMTD1 (ENSSHAG00000029495) ZNF503 (ENSSHAG00000013269) LRMDA (ENSSHAG00000026629) ENSSHAG00000029061 KCNMA1 (ENSSHAG00000017451) DLG5 (ENSSHAG00000005215) POLR3A (ENSSHAG00000007588) RPS24 (ENSSHAG00000008090) ZMIZ1 (ENSSHAG00000016743) PPIF (ENSSHAG00000030438) ENSSHAG00000029897 ENSSHAG00000023385 ENSSHAG00000002073 ENSSHAG00000005914 ENSSHAG00000029579 Tasmanian devil MODERN SPECIES ENSSHAG00000009575 CARMIL1 (ENSSHAG00000010466) ENSSHAG00000001939 RIPOR2 (ENSSHAG00000006862) ENSSHAG00000004417 GMNN (ENSSHAG00000004058) C6orf62 (ENSSHAG00000023714) ENSSHAG00000021442 ACOT13 (ENSSHAG00000025514) KIAA0319 (ENSSHAG00000004593) ALDH5A1 (ENSSHAG00000006033) GPLD1 (ENSSHAG00000006784) MRS2 (ENSSHAG00000007390) DCDC2 (ENSSHAG00000008058) NRSN1 (ENSSHAG00000003491) ENSSHAG00000008496 ##22 PRL (ENSSHAG00000003994) SOX4 (ENSSHAG00000027520) CDKAL1 (ENSSHAG00000013159) E2F3 (ENSSHAG00000023717) MBOAT1 (ENSSHAG00000016486) ID4 (ENSSHAG00000031770) RNF144B (ENSSHAG00000013434) DEK (ENSSHAG00000014678) KDM1B (ENSSHAG00000014810) TPMT (ENSSHAG00000030718) NHLRC1 (ENSSHAG00000015039) KIF13A (ENSSHAG00000015411) NUP153 (ENSSHAG00000031841) FAM8A1 (ENSSHAG00000031589) CAP2 (ENSSHAG00000016266) Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000165487 ENSGT00600000084626 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000153195.B Wallaby DUPLICATION Wallaby MODERN SPECIES 14717 ENSMEUG00000001698 ##22 Wallaby MODERN SPECIES 7223 ENSMEUG00000012995 ##22 COMTD1 (ENSMEUG00000013009) Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000165487 ENSGT00600000084626 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000153195.B Common wonbat MODERN SPECIES 39 FUT11 (ENSVURG00010013388) CHCHD1 (ENSVURG00010013402) ZSWIM8 (ENSVURG00010013410) NDST2 (ENSVURG00010013438) CAMK2G (ENSVURG00010013489) PLAU (ENSVURG00010013646) VCL (ENSVURG00010013662) AP3M1 (ENSVURG00010013688) ADK (ENSVURG00010013704) KAT6B (ENSVURG00010013732) DUSP29 (ENSVURG00010013750) ENSVURG00010013756 ENSVURG00010013777 ENSVURG00010013837 SAMD8 (ENSVURG00010013872) VDAC2 (ENSVURG00010013882) ##22 COMTD1 (ENSVURG00010013912) ZNF503 (ENSVURG00010013917) LRMDA (ENSVURG00010013934) KCNMA1 (ENSVURG00010013967) ENSVURG00010014006 DLG5 (ENSVURG00010014017) POLR3A (ENSVURG00010014062) ENSVURG00010014100 ENSVURG00010014156 ZMIZ1 (ENSVURG00010014184) PPIF (ENSVURG00010014243) ZCCHC24 (ENSVURG00010014255) ENSVURG00010014270 ENSVURG00010014280 ENSVURG00010014285 koala MODERN SPECIES 111 FUT11 (ENSPCIG00000028700) ZSWIM8 (ENSPCIG00000028702) NDST2 (ENSPCIG00000028703) CAMK2G (ENSPCIG00000028709) PLAU (ENSPCIG00000028718) VCL (ENSPCIG00000004878) AP3M1 (ENSPCIG00000004913) ADK (ENSPCIG00000024594) KAT6B (ENSPCIG00000024595) ENSPCIG00000024596 DUSP29 (ENSPCIG00000024597) DUSP13 (ENSPCIG00000024598) ENSPCIG00000024599 ENSPCIG00000031519 SAMD8 (ENSPCIG00000024601) VDAC2 (ENSPCIG00000024602) ##22 COMTD1 (ENSPCIG00000024603) ZNF503 (ENSPCIG00000003560) LRMDA (ENSPCIG00000034823) KCNMA1 (ENSPCIG00000030721) ENSPCIG00000013087 DLG5 (ENSPCIG00000015827) POLR3A (ENSPCIG00000015842) RPS24 (ENSPCIG00000015847) ZMIZ1 (ENSPCIG00000000008) PPIF (ENSPCIG00000000007) ZCCHC24 (ENSPCIG00000000006) ANXA11 (ENSPCIG00000000005) ENSPCIG00000032831 ENSPCIG00000000003 ENSPCIG00000000002 Anura ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000157609 ENSGT00390000001197 ENSGT00390000000483.a.b ENSGT00940000164982 ENSGT00390000011381 ENSGT00940000156697 ENSGT00940000158585 ENSGT00910000144159.A.b ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008.qb ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000170983 ENSGT00600000084626 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000154537 ENSGT00940000153195.B Leishan spiny toad MODERN SPECIES 9 ENSLLEG00000020183 CHUK (ENSLLEG00000019747) ENSLLEG00000019717 VCL (ENSLLEG00000018869) AP3M1 (ENSLLEG00000018441) ENSLLEG00000018188 KAT6B (ENSLLEG00000017949) DUSP29 (ENSLLEG00000017871) ENSLLEG00000017859 ENSLLEG00000017778 ENSLLEG00000017627 ENSLLEG00000017550 ENSLLEG00000017504 ENSLLEG00000017440 ENSLLEG00000017350 VDAC2 (ENSLLEG00000017009) ##22 ENSLLEG00000016923 ENSLLEG00000016888 ZNF503 (ENSLLEG00000016852) ENSLLEG00000016830 ENSLLEG00000016804 LRMDA (ENSLLEG00000016681) ENSLLEG00000016652 ENSLLEG00000015600 ENSLLEG00000015530 ENSLLEG00000015519 ENSLLEG00000015510 ENSLLEG00000015379 ENSLLEG00000015355 RASGEF1A (ENSLLEG00000015041) ENSLLEG00000029385 Frog MODERN SPECIES 7 ENSXETG00000049386 clstn1 (ENSXETG00000000775) ENSXETG00000043237 med19 (ENSXETG00000032150) tmx2 (ENSXETG00000026417) ENSXETG00000034423 ENSXETG00000044732 ENSXETG00000041918 ctnnd1 (ENSXETG00000007089) clp1 (ENSXETG00000007088) zdhhc5 (ENSXETG00000030941) vcl (ENSXETG00000007084) dusp29 (ENSXETG00000040556) dusp13 (ENSXETG00000041222) samd8 (ENSXETG00000009864) vdac2 (ENSXETG00000009865) ##22 ENSXETG00000043219 znf503 (ENSXETG00000009866) ENSXETG00000042633 ENSXETG00000045575 lrmda (ENSXETG00000009871) kcnma1 (ENSXETG00000018041) ENSXETG00000048193 dlg5 (ENSXETG00000018090) ENSXETG00000043646 polr3a (ENSXETG00000018101) rps24 (ENSXETG00000018137) ENSXETG00000041587 zmiz1 (ENSXETG00000018359) ppif (ENSXETG00000039032) zcchc24 (ENSXETG00000018372) Coelacanth MODERN SPECIES 1341 ZMIZ1 (ENSLACG00000011105) ENSLACG00000010756 comtd1 (ENSLACG00000010476) ENSLACG00000009566 VDAC2 (ENSLACG00000008660) ##22 ENSLACG00000008070 ENSLACG00000007444 ENSLACG00000006059 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00390000000483.a.b ENSGT00940000164982 ENSGT00390000011381 ENSGT00940000156697 ENSGT00940000158585 ENSGT00910000144159.A ENSGT00390000014666.b ENSGT00950000182937.A.a ENSGT00940000164426 ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT01060000252496 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000174594 ENSGT00940000158426 ENSGT00390000005448 Neopterygii DUPLICATION Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158585 ENSGT00910000144159.A ENSGT00390000014666.b ENSGT00950000182937.A.a ENSGT00940000164426 ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000160190 ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.r ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00390000014618.a ENSGT01060000252496 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153 ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00390000011412 Spotted gar MODERN SPECIES 671 tubgcp2 (ENSLOCG00000004354) adam8a (ENSLOCG00000004374) ENSLOCG00000004406 erlin1 (ENSLOCG00000004418) chuk (ENSLOCG00000004432) plaua (ENSLOCG00000004467) vcla (ENSLOCG00000004474) ENSLOCG00000004496 ap3m1 (ENSLOCG00000004509) ADK (ENSLOCG00000004521) KAT6B (ENSLOCG00000004535) ENSLOCG00000004551 DUSP13 (ENSLOCG00000004561) ENSLOCG00000004576 SAMD8 (ENSLOCG00000004590) vdac2 (ENSLOCG00000004602) ##22 ENSLOCG00000004642 ENSLOCG00000004660 ifit8 (ENSLOCG00000004672) comtd1 (ENSLOCG00000004687) znf503 (ENSLOCG00000004723) lrmda (ENSLOCG00000004734) kcnma1a (ENSLOCG00000004752) dlg5a (ENSLOCG00000004786) ENSLOCG00000004826 anxa11b (ENSLOCG00000004840) zcchc24 (ENSLOCG00000004863) ppifb (ENSLOCG00000004875) zmiz1a (ENSLOCG00000004888) rps24 (ENSLOCG00000004926) polr3a (ENSLOCG00000004942) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 838 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT01060000252496 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.d ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 138 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000155636.a ENSGT00940000175262 ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b ENSGT00940000154332 ENSGT00940000169918 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000155636.a ENSGT00940000175262 ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 6 ENSMMDG00005011050 papss2a (ENSMMDG00005011133) minpp1a (ENSMMDG00005014352) sgms1a (ENSMMDG00005014355) prkg1a (ENSMMDG00005014365) dkk1a (ENSMMDG00005014381) pcdh15a (ENSMMDG00005014451) plek (ENSMMDG00005016712) prokr1b (ENSMMDG00005016716) BFSP1 (ENSMMDG00005016722) pcsk2 (ENSMMDG00005016732) OTOR (ENSMMDG00005016736) GTPBP2 (ENSMMDG00005016741) polh (ENSMMDG00005016748) ENSMMDG00005016752 vdac2 (ENSMMDG00005016776) ##22 ENSMMDG00005017470 comtd1 (ENSMMDG00005017515) znf503 (ENSMMDG00005017518) lrmda (ENSMMDG00005017520) KCNMA1 (ENSMMDG00005017628) dlg5a (ENSMMDG00005021664) anxa11a (ENSMMDG00005022306) zcchc24 (ENSMMDG00005022450) ppifa (ENSMMDG00005022451) zmiz1a (ENSMMDG00005022454) rps24 (ENSMMDG00005022456) eif4ebp2 (ENSMMDG00005022457) ppa1b (ENSMMDG00005022458) sar1ab (ENSMMDG00005022461) tysnd1 (ENSMMDG00005022462) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158306 ENSGT00390000004632 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000175262 ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 103 ENSHCOG00000002572 vdac2 (ENSHCOG00000002590) ##22 comtd1 (ENSHCOG00000002598) znf503 (ENSHCOG00000002607) ENSHCOG00000002614 lrmda (ENSHCOG00000002627) KCNMA1 (ENSHCOG00000002653) dlg5a (ENSHCOG00000002682) ENSHCOG00000002701 zcchc24 (ENSHCOG00000002716) ppifa (ENSHCOG00000000076) zmiz1a (ENSHCOG00000002749) rps24 (ENSHCOG00000002765) eif4ebp2 (ENSHCOG00000000576) ppa1b (ENSHCOG00000002839) sar1ab (ENSHCOG00000002845) tysnd1 (ENSHCOG00000002848) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000176967 ENSGT00940000169918 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00940000176967 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ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000009613.a ENSGT00390000018409.h.m ENSGT00390000018409.h.n ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 ENSGT00940000157107.a.b Fugu MODERN SPECIES 16 GTPBP2 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(ENSTNIG00000008620) BFSP1 (ENSTNIG00000008621) pcsk2 (ENSTNIG00000008622) GTPBP2 (ENSTNIG00000008623) polh (ENSTNIG00000008624) ENSTNIG00000000638 vdac2 (ENSTNIG00000008625) ##22 comtd1 (ENSTNIG00000008626) znf503 (ENSTNIG00000008627) KCNMA1 (ENSTNIG00000008628) dlg5a (ENSTNIG00000008629) anxa11a (ENSTNIG00000008630) zcchc24 (ENSTNIG00000008631) ppifa (ENSTNIG00000008632) zmiz1a (ENSTNIG00000008633) rps24 (ENSTNIG00000000893) ppa1b (ENSTNIG00000008634) sar1ab (ENSTNIG00000008635) tysnd1 (ENSTNIG00000008636) SPOCK2 (ENSTNIG00000008637) ENSTNIG00000008638 dnajb12a (ENSTNIG00000008639) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000176967 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Ballan wrasse MODERN SPECIES 36 ENSLBEG00000003619 minpp1a (ENSLBEG00000003597) sgms1a (ENSLBEG00000003577) prkg1a (ENSLBEG00000003513) dkk1a (ENSLBEG00000003477) pcdh15a (ENSLBEG00000003097) plek (ENSLBEG00000002998) prokr1b (ENSLBEG00000002964) BFSP1 (ENSLBEG00000002865) pcsk2 (ENSLBEG00000002804) OTOR (ENSLBEG00000002783) ENSLBEG00000002749 polh (ENSLBEG00000002731) ENSLBEG00000002698 ENSLBEG00000002678 vdac2 (ENSLBEG00000002636) ##22 ENSLBEG00000002618 comtd1 (ENSLBEG00000002585) znf503 (ENSLBEG00000002559) ENSLBEG00000002549 lrmda (ENSLBEG00000002540) KCNMA1 (ENSLBEG00000002458) dlg5a (ENSLBEG00000002343) anxa11a (ENSLBEG00000002315) zcchc24 (ENSLBEG00000002286) ppifa (ENSLBEG00000001428) zmiz1a (ENSLBEG00000001255) rps24 (ENSLBEG00000001222) eif4ebp2 (ENSLBEG00000001180) ppa1b (ENSLBEG00000001141) sar1ab (ENSLBEG00000001114) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000176967 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000169918.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000018409.h ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000169918.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Pike perch MODERN SPECIES 10 minpp1a (ENSSLUG00000017375) ENSSLUG00000017372 sgms1a (ENSSLUG00000017366) prkg1a (ENSSLUG00000017313) dkk1a (ENSSLUG00000017283) pcdh15a (ENSSLUG00000016837) plek (ENSSLUG00000016774) prokr1b (ENSSLUG00000016766) BFSP1 (ENSSLUG00000016759) pcsk2 (ENSSLUG00000016377) OTOR (ENSSLUG00000016362) GTPBP2 (ENSSLUG00000016352) polh (ENSSLUG00000016337) ENSSLUG00000016308 ENSSLUG00000016290 vdac2 (ENSSLUG00000015705) ##22 ENSSLUG00000015630 comtd1 (ENSSLUG00000015613) znf503 (ENSSLUG00000015608) lrmda (ENSSLUG00000015595) KCNMA1 (ENSSLUG00000007982) dlg5a (ENSSLUG00000007145) anxa11a (ENSSLUG00000006377) zcchc24 (ENSSLUG00000006351) ppifa (ENSSLUG00000006341) zmiz1a (ENSSLUG00000005428) rps24 (ENSSLUG00000005249) eif4ebp2 (ENSSLUG00000005239) ppa1b (ENSSLUG00000005196) sar1ab (ENSSLUG00000005174) tysnd1 (ENSSLUG00000005169) Channel bull blenny MODERN SPECIES 6 dkk1a (ENSCGOG00000012885) pcdh15a (ENSCGOG00000010072) plek (ENSCGOG00000009657) prokr1b (ENSCGOG00000009646) BFSP1 (ENSCGOG00000009643) pcsk2 (ENSCGOG00000009016) OTOR (ENSCGOG00000009006) GTPBP2 (ENSCGOG00000008794) polh (ENSCGOG00000008731) ENSCGOG00000008720 ENSCGOG00000008712 ENSCGOG00000008710 ENSCGOG00000008709 ENSCGOG00000008694 ENSCGOG00000008690 vdac2 (ENSCGOG00000008567) ##22 ENSCGOG00000008522 comtd1 (ENSCGOG00000008511) znf503 (ENSCGOG00000008501) lrmda (ENSCGOG00000008499) KCNMA1 (ENSCGOG00000004266) dlg5a (ENSCGOG00000003269) anxa11a (ENSCGOG00000002293) zcchc24 (ENSCGOG00000002271) ppifa (ENSCGOG00000002268) zmiz1a (ENSCGOG00000002137) rps24 (ENSCGOG00000002084) eif4ebp2 (ENSCGOG00000002080) ppa1b (ENSCGOG00000001959) sar1ab (ENSCGOG00000001902) tysnd1 (ENSCGOG00000001898) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000009613.a ENSGT00390000018409.h ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 ENSGT00940000157107.a.b Stickleback MODERN SPECIES 6 papss2a (ENSGACG00000009195) minpp1a (ENSGACG00000009178) sgms1a (ENSGACG00000009168) prkg1a (ENSGACG00000009151) dkk1a (ENSGACG00000009143) ENSGACG00000009141 pcdh15a (ENSGACG00000009135) plek (ENSGACG00000009115) prokr1b (ENSGACG00000009110) BFSP1 (ENSGACG00000009101) pcsk2 (ENSGACG00000009043) OTOR (ENSGACG00000009024) GTPBP2 (ENSGACG00000009007) polh (ENSGACG00000008990) ENSGACG00000008985 vdac2 (ENSGACG00000008932) ##22 comtd1 (ENSGACG00000008912) znf503 (ENSGACG00000008890) KCNMA1 (ENSGACG00000008829) dlg5a (ENSGACG00000008811) anxa11a (ENSGACG00000008793) zcchc24 (ENSGACG00000008791) ppifa (ENSGACG00000008764) zmiz1a (ENSGACG00000008751) rps24 (ENSGACG00000008736) eif4ebp2 (ENSGACG00000008729) ppa1b (ENSGACG00000008644) sar1ab (ENSGACG00000008616) tysnd1 (ENSGACG00000008609) SPOCK2 (ENSGACG00000008600) DDIT4 (ENSGACG00000008596) Lumpfish MODERN SPECIES 6 minpp1a (ENSCLMG00005012860) ENSCLMG00005012861 sgms1a (ENSCLMG00005012887) prkg1a (ENSCLMG00005012894) dkk1a (ENSCLMG00005012906) pcdh15a (ENSCLMG00005012915) plek (ENSCLMG00005013154) prokr1b (ENSCLMG00005013155) BFSP1 (ENSCLMG00005013156) pcsk2 (ENSCLMG00005013162) OTOR (ENSCLMG00005013164) ENSCLMG00005013165 polh (ENSCLMG00005013196) ENSCLMG00005013205 ENSCLMG00005013208 vdac2 (ENSCLMG00005013218) ##22 comtd1 (ENSCLMG00005013834) znf503 (ENSCLMG00005013835) lrmda (ENSCLMG00005013837) KCNMA1 (ENSCLMG00005013851) dlg5a (ENSCLMG00005016656) ENSCLMG00005016844 zcchc24 (ENSCLMG00005016846) ppifa (ENSCLMG00005016847) zmiz1a (ENSCLMG00005016863) rps24 (ENSCLMG00005018188) eif4ebp2 (ENSCLMG00005018190) ENSCLMG00005018191 THBS2 (ENSCLMG00005018195) ENSCLMG00005018196 ENSCLMG00005018200 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000018409.h ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000176967 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Gilthead seabream MODERN SPECIES 6 ENSSAUG00010018551 sgms1a (ENSSAUG00010018552) prkg1a (ENSSAUG00010018558) dkk1a (ENSSAUG00010018568) pcdh15a (ENSSAUG00010018569) plek (ENSSAUG00010018664) prokr1b (ENSSAUG00010018668) BFSP1 (ENSSAUG00010018670) pcsk2 (ENSSAUG00010018686) OTOR (ENSSAUG00010018723) GTPBP2 (ENSSAUG00010018726) polh (ENSSAUG00010018736) ENSSAUG00010018741 ENSSAUG00010018744 ENSSAUG00010018751 vdac2 (ENSSAUG00010018755) ##22 ENSSAUG00010018764 comtd1 (ENSSAUG00010018765) znf503 (ENSSAUG00010018767) lrmda (ENSSAUG00010018770) KCNMA1 (ENSSAUG00010018785) ENSSAUG00010019320 dlg5a (ENSSAUG00010019346) anxa11a (ENSSAUG00010020969) zcchc24 (ENSSAUG00010021835) ppifa (ENSSAUG00010021836) zmiz1a (ENSSAUG00010021857) rps24 (ENSSAUG00010022528) eif4ebp2 (ENSSAUG00010022529) ppa1b (ENSSAUG00010022531) sar1ab (ENSSAUG00010022545) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000018409.h ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000176967 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Large yellow croaker MODERN SPECIES 2 sgms1a (ENSLCRG00005006157) prkg1a (ENSLCRG00005006132) dkk1a (ENSLCRG00005006130) pcdh15a (ENSLCRG00005005945) plek (ENSLCRG00005005620) prokr1b (ENSLCRG00005005615) BFSP1 (ENSLCRG00005005614) pcsk2 (ENSLCRG00005005611) OTOR (ENSLCRG00005005606) GTPBP2 (ENSLCRG00005005599) polh (ENSLCRG00005005598) ENSLCRG00005005591 ENSLCRG00005005590 ENSLCRG00005005587 ENSLCRG00005005584 vdac2 (ENSLCRG00005005557) ##22 ENSLCRG00005005554 comtd1 (ENSLCRG00005005552) znf503 (ENSLCRG00005005548) lrmda (ENSLCRG00005005545) KCNMA1 (ENSLCRG00005001270) dlg5a (ENSLCRG00005000315) anxa11a (ENSLCRG00005017885) zcchc24 (ENSLCRG00005017867) ppifa (ENSLCRG00005017866) zmiz1a (ENSLCRG00005017601) rps24 (ENSLCRG00005017585) eif4ebp2 (ENSLCRG00005017583) ppa1b (ENSLCRG00005017577) sar1ab (ENSLCRG00005017576) tysnd1 (ENSLCRG00005017574) European seabass MODERN SPECIES 1 sgms1a (ENSDLAG00005018197) prkg1a (ENSDLAG00005017988) ENSDLAG00005017975 pcdh15a (ENSDLAG00005015554) plek (ENSDLAG00005015357) prokr1b (ENSDLAG00005030155) BFSP1 (ENSDLAG00005015335) pcsk2 (ENSDLAG00005015139) OTOR (ENSDLAG00005015108) ENSDLAG00005015067 ENSDLAG00005014960 ENSDLAG00005014935 ENSDLAG00005014907 ENSDLAG00005027772 ENSDLAG00005014911 vdac2 (ENSDLAG00005014704) ##22 ENSDLAG00005014673 comtd1 (ENSDLAG00005014652) znf503 (ENSDLAG00005014641) lrmda (ENSDLAG00005014626) KCNMA1 (ENSDLAG00005011420) dlg5a (ENSDLAG00005009954) anxa11a (ENSDLAG00005009497) ENSDLAG00005009464 zcchc24 (ENSDLAG00005030060) ppifa (ENSDLAG00005009453) zmiz1a (ENSDLAG00005009214) rps24 (ENSDLAG00005032750) eif4ebp2 (ENSDLAG00005029603) ppa1b (ENSDLAG00005008988) sar1ab (ENSDLAG00005008968) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000009613.a ENSGT00390000018409.h ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00940000176967 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000018409.h ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b 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ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Seriola ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b.q.b ENSGT00940000154332 ENSGT00950000182977.B.b.b.b.q.a.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b.q.a.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3131 prkg1a (ENSSLDG00000025436) dkk1a (ENSSLDG00000025445) pcdh15a (ENSSLDG00000025464) plek 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(ENSSDUG00000011500) ENSSDUG00000011487 ENSSDUG00000011473 ENSSDUG00000011464 ENSSDUG00000011452 ENSSDUG00000011430 vdac2 (ENSSDUG00000011407) ##22 ENSSDUG00000011402 comtd1 (ENSSDUG00000011339) znf503 (ENSSDUG00000011322) lrmda (ENSSDUG00000011237) KCNMA1 (ENSSDUG00000011189) dlg5a (ENSSDUG00000011056) anxa11a (ENSSDUG00000011017) zcchc24 (ENSSDUG00000011008) ppifa (ENSSDUG00000010985) zmiz1a (ENSSDUG00000010866) rps24 (ENSSDUG00000010831) eif4ebp2 (ENSSDUG00000010817) ppa1b (ENSSDUG00000010797) sar1ab (ENSSDUG00000010773) tysnd1 (ENSSDUG00000010765) Barramundi perch MODERN SPECIES 211 plek (ENSLCAG00010011443) prokr1b (ENSLCAG00010011441) BFSP1 (ENSLCAG00010011436) pcsk2 (ENSLCAG00010011341) OTOR (ENSLCAG00010011307) GTPBP2 (ENSLCAG00010011302) polh (ENSLCAG00010011296) ENSLCAG00010011294 ENSLCAG00010011287 ENSLCAG00010011283 ENSLCAG00010011276 vdac2 (ENSLCAG00010011270) ##22 ENSLCAG00010011266 comtd1 (ENSLCAG00010011261) znf503 (ENSLCAG00010011258) lrmda (ENSLCAG00010011253) KCNMA1 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ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Tongue sole MODERN SPECIES 3 ENSCSEG00000001568 ENSCSEG00000001495 macroh2a2 (ENSCSEG00000001483) ENSCSEG00000001453 GBF1 (ENSCSEG00000001430) CCDC88A (ENSCSEG00000001262) ugp2b (ENSCSEG00000001237) MDH1 (ENSCSEG00000001022) WDPCP (ENSCSEG00000001003) otx1 (ENSCSEG00000000992) EHBP1 (ENSCSEG00000000951) GTPBP2 (ENSCSEG00000000936) polh (ENSCSEG00000000930) ENSCSEG00000000924 comtd1 (ENSCSEG00000000915) vdac2 (ENSCSEG00000000908) ##22 ENSCSEG00000000901 pcgf6 (ENSCSEG00000000895) sertad2b (ENSCSEG00000000893) slc1a4 (ENSCSEG00000000884) ENSCSEG00000000875 ENSCSEG00000000869 OGFRL1 (ENSCSEG00000000866) ENSCSEG00000000856 ENSCSEG00000000852 cfap36 (ENSCSEG00000000835) ppp4r3b (ENSCSEG00000000830) PNPT1 (ENSCSEG00000000809) ENSCSEG00000000795 ENSCSEG00000000786 papolg (ENSCSEG00000000771) Turbot MODERN SPECIES 6 MINPP1 (ENSSMAG00000020410) ENSSMAG00000020414 sgms1a (ENSSMAG00000020417) prkg1a (ENSSMAG00000020419) ENSSMAG00000020425 pcdh15a (ENSSMAG00000020429) plek (ENSSMAG00000020641) prokr1b (ENSSMAG00000020647) BFSP1 (ENSSMAG00000020649) pcsk2 (ENSSMAG00000020650) OTOR (ENSSMAG00000034993) ENSSMAG00000020653 ENSSMAG00000020655 ENSSMAG00000020656 ENSSMAG00000020658 vdac2 (ENSSMAG00000020662) ##22 ENSSMAG00000020664 comtd1 (ENSSMAG00000020676) znf503 (ENSSMAG00000036362) lrmda (ENSSMAG00000020681) ENSSMAG00000020684 KCNMA1 (ENSSMAG00000020686) dlg5a (ENSSMAG00000020691) ENSSMAG00000020716 zcchc24 (ENSSMAG00000020721) ppifa (ENSSMAG00000020729) zmiz1a (ENSSMAG00000020731) rps24 (ENSSMAG00000020751) eif4ebp2 (ENSSMAG00000030557) ppa1b (ENSSMAG00000020755) sar1ab (ENSSMAG00000020758) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000018409.h ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 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ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Climbing perch MODERN SPECIES 6 sgms1a (ENSATEG00000005569) prkg1a (ENSATEG00000005482) ENSATEG00000005467 pcdh15a (ENSATEG00000004779) plek (ENSATEG00000004719) prokr1b (ENSATEG00000027943) BFSP1 (ENSATEG00000004650) pcsk2 (ENSATEG00000004440) OTOR (ENSATEG00000004429) ENSATEG00000004370 ENSATEG00000004318 ENSATEG00000004303 ENSATEG00000025406 ENSATEG00000004274 ENSATEG00000004255 vdac2 (ENSATEG00000004219) ##22 ENSATEG00000004190 comtd1 (ENSATEG00000026402) znf503 (ENSATEG00000004114) lrmda (ENSATEG00000004079) KCNMA1 (ENSATEG00000003963) dlg5a (ENSATEG00000003830) ENSATEG00000003799 anxa11a (ENSATEG00000003738) zcchc24 (ENSATEG00000028680) ppifa (ENSATEG00000003699) zmiz1a (ENSATEG00000003581) rps24 (ENSATEG00000003561) eif4ebp2 (ENSATEG00000003554) ppa1b (ENSATEG00000003490) sar1ab (ENSATEG00000003466) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 6 plek (ENSBSLG00000021761) prokr1b (ENSBSLG00000021695) BFSP1 (ENSBSLG00000021648) pcsk2 (ENSBSLG00000021443) OTOR (ENSBSLG00000021406) GTPBP2 (ENSBSLG00000021281) ENSBSLG00000021245 polh (ENSBSLG00000021178) ENSBSLG00000021151 ENSBSLG00000021117 ENSBSLG00000021100 ENSBSLG00000021064 ENSBSLG00000021026 ENSBSLG00000020845 ENSBSLG00000020844 vdac2 (ENSBSLG00000020830) ##22 ENSBSLG00000020806 znf503 (ENSBSLG00000020798) lrmda (ENSBSLG00000020791) ENSBSLG00000020789 KCNMA1 (ENSBSLG00000017294) dlg5a (ENSBSLG00000015284) zcchc24 (ENSBSLG00000015157) ppifa (ENSBSLG00000014622) zmiz1a (ENSBSLG00000014134) rps24 (ENSBSLG00000013645) eif4ebp2 (ENSBSLG00000013629) ppa1b (ENSBSLG00000013522) sar1ab (ENSBSLG00000013471) tysnd1 (ENSBSLG00000013456) SPOCK2 (ENSBSLG00000013436) Zig-zag eel MODERN SPECIES 6 papss2a (ENSMAMG00000021044) ENSMAMG00000021071 sgms1a (ENSMAMG00000021075) prkg1a (ENSMAMG00000021083) ENSMAMG00000027893 pcdh15a (ENSMAMG00000021121) plek (ENSMAMG00000021143) prokr1b (ENSMAMG00000021149) BFSP1 (ENSMAMG00000021151) pcsk2 (ENSMAMG00000021164) OTOR (ENSMAMG00000021175) ENSMAMG00000021180 ENSMAMG00000021195 ENSMAMG00000021198 ENSMAMG00000021205 vdac2 (ENSMAMG00000021208) ##22 ENSMAMG00000026123 comtd1 (ENSMAMG00000021228) znf503 (ENSMAMG00000021237) lrmda (ENSMAMG00000021238) KCNMA1 (ENSMAMG00000021248) dlg5a (ENSMAMG00000021260) ENSMAMG00000021283 zcchc24 (ENSMAMG00000021293) ppifa (ENSMAMG00000021290) zmiz1a (ENSMAMG00000021297) rps24 (ENSMAMG00000024622) eif4ebp2 (ENSMAMG00000025969) ppa1b (ENSMAMG00000021312) sar1ab (ENSMAMG00000021314) tysnd1 (ENSMAMG00000021316) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000176967 ENSGT00940000169918 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000004632 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00940000176967 ENSGT00940000169918 ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000004632 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00940000176967 ENSGT00940000169918 ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000018409.h.y ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00940000176967 ENSGT00940000169918 ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 3 sgms1a (ENSKMAG00000019544) prkg1a (ENSKMAG00000019480) dkk1a (ENSKMAG00000019456) pcdh15a (ENSKMAG00000019219) plek (ENSKMAG00000019135) prokr1b (ENSKMAG00000019117) BFSP1 (ENSKMAG00000019099) pcsk2 (ENSKMAG00000019075) OTOR (ENSKMAG00000019055) GTPBP2 (ENSKMAG00000019007) polh (ENSKMAG00000018975) ENSKMAG00000018959 ENSKMAG00000018942 ENSKMAG00000018922 ENSKMAG00000018903 vdac2 (ENSKMAG00000018870) ##22 comtd1 (ENSKMAG00000018851) ENSKMAG00000018796 ENSKMAG00000018771 znf503 (ENSKMAG00000018758) lrmda (ENSKMAG00000018743) KCNMA1 (ENSKMAG00000018677) dlg5a (ENSKMAG00000018480) ENSKMAG00000018391 zcchc24 (ENSKMAG00000018357) ppifa (ENSKMAG00000018348) zmiz1a (ENSKMAG00000018182) rps24 (ENSKMAG00000018121) eif4ebp2 (ENSKMAG00000018101) ppa1b (ENSKMAG00000018054) sar1ab (ENSKMAG00000018006) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1612 AFTPHA (ENSNFUG00015024338) ENSNFUG00015024333 lgalslb (ENSNFUG00015024326) ENSNFUG00015024317 PELI1B (ENSNFUG00015024315) ugp2b (ENSNFUG00015024190) mdh1aa (ENSNFUG00015024144) ENSNFUG00015024137 WDPCP (ENSNFUG00015024135) OTX1B (ENSNFUG00015024133) ENSNFUG00015024132 EHBP1 (ENSNFUG00015024071) B3GNT2B (ENSNFUG00015024061) ENSNFUG00015024060 ENSNFUG00015024057 VDAC2 (ENSNFUG00015023972) ##22 ENSNFUG00015023949 comtd1 (ENSNFUG00015023943) ENSNFUG00015023938 OPRD1B (ENSNFUG00015023936) tcea3 (ENSNFUG00015023905) lrmda (ENSNFUG00015023874) KCNMA1 (ENSNFUG00015023512) ENSNFUG00015023481 DLG5A (ENSNFUG00015022897) anxa11a (ENSNFUG00015022573) ZCCHC24 (ENSNFUG00015022554) ppifa (ENSNFUG00015022549) FAS (ENSNFUG00015022539) Nfu_g_1_002795 (ENSNFUG00015022516) PAPSS2 (ENSNFUG00015022029) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158306 ENSGT00390000004632 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00940000169918 ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c 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ENSPREG00000015294 ENSPREG00000015311 vdac2 (ENSPREG00000015321) ##22 ENSPREG00000015348 comtd1 (ENSPREG00000015368) znf503 (ENSPREG00000015386) lrmda (ENSPREG00000015411) KCNMA1 (ENSPREG00000015442) dlg5a (ENSPREG00000015514) ENSPREG00000015723 zcchc24 (ENSPREG00000015920) ppifa (ENSPREG00000015930) zmiz1a (ENSPREG00000015962) rps24 (ENSPREG00000016003) eif4ebp2 (ENSPREG00000016033) ppa1b (ENSPREG00000016060) sar1ab (ENSPREG00000016098) tysnd1 (ENSPREG00000016119) Platyfish MODERN SPECIES 14 ENSXMAG00000021079 ENSXMAG00000012957 papss2a (ENSXMAG00000012962) minpp1a (ENSXMAG00000012975) sgms1a (ENSXMAG00000028907) prkg1a (ENSXMAG00000010661) ENSXMAG00000025380 pcdh15a (ENSXMAG00000010653) plek (ENSXMAG00000010640) BFSP1 (ENSXMAG00000028704) pcsk2 (ENSXMAG00000010620) OTOR (ENSXMAG00000028311) GTPBP2 (ENSXMAG00000010601) polh (ENSXMAG00000010580) ENSXMAG00000010577 vdac2 (ENSXMAG00000010569) ##22 ENSXMAG00000010559 comtd1 (ENSXMAG00000021617) znf503 (ENSXMAG00000010546) lrmda 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ENSGT00940000165723.b ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00940000169918 ENSGT00940000176967 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 ENSGT00940000157107.a.b Indian medaka MODERN SPECIES 27 papss2a (ENSOMEG00000006234) minpp1a (ENSOMEG00000006206) sgms1a (ENSOMEG00000006190) ENSOMEG00000000989 prkg1a (ENSOMEG00000006154) ENSOMEG00000006102 pcdh15a (ENSOMEG00000006053) plek (ENSOMEG00000005838) prokr1b (ENSOMEG00000005788) BFSP1 (ENSOMEG00000005772) pcsk2 (ENSOMEG00000005740) OTOR (ENSOMEG00000005674) GTPBP2 (ENSOMEG00000005661) polh (ENSOMEG00000005622) ENSOMEG00000005596 vdac2 (ENSOMEG00000005547) ##22 ENSOMEG00000005489 znf503 (ENSOMEG00000005479) lrmda (ENSOMEG00000005461) ENSOMEG00000005436 ENSOMEG00000005402 dlg5a (ENSOMEG00000005357) anxa11a (ENSOMEG00000005187) zcchc24 (ENSOMEG00000005155) ppifa (ENSOMEG00000005136) zmiz1a (ENSOMEG00000005111) rps24 (ENSOMEG00000005046) eif4ebp2 (ENSOMEG00000005016) ppa1b (ENSOMEG00000004996) sar1ab (ENSOMEG00000004948) tysnd1 (ENSOMEG00000004942) Javanese ricefish MODERN SPECIES 6 ENSOJAG00000018846 papss2a (ENSOJAG00000018936) minpp1a (ENSOJAG00000019373) sgms1a (ENSOJAG00000019381) prkg1a (ENSOJAG00000019452) ENSOJAG00000019796 pcdh15a (ENSOJAG00000020054) plek (ENSOJAG00000021739) ENSOJAG00000021751 prokr1b (ENSOJAG00000021753) BFSP1 (ENSOJAG00000021760) pcsk2 (ENSOJAG00000021835) OTOR (ENSOJAG00000021983) GTPBP2 (ENSOJAG00000022002) ENSOJAG00000022040 vdac2 (ENSOJAG00000022042) ##22 ENSOJAG00000022051 znf503 (ENSOJAG00000022069) lrmda (ENSOJAG00000022072) KCNMA1 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ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 ENSGT00940000157107.a.b Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 6 papss2a (ENSORLG00000006251) minpp1a (ENSORLG00000006259) sgms1a (ENSORLG00000006277) prkg1 (ENSORLG00000006327) ENSORLG00000026993 dkk1a (ENSORLG00000006345) pcdh15a (ENSORLG00000023071) plek (ENSORLG00000006378) prokr1b (ENSORLG00000006384) BFSP1 (ENSORLG00000006395) pcsk2 (ENSORLG00000006472) OTOR (ENSORLG00000023881) ENSORLG00000006506 polh (ENSORLG00000006526) ENSORLG00000022482 vdac2 (ENSORLG00000006552) ##22 ENSORLG00000022435 ENSORLG00000024726 znf503 (ENSORLG00000006570) lrmda (ENSORLG00000006576) KCNMA1 (ENSORLG00000006622) dlg5a (ENSORLG00000006667) anxa11a (ENSORLG00000006673) zcchc24 (ENSORLG00000021845) ppifa (ENSORLG00000006690) zmiz1a (ENSORLG00000006719) rps24 (ENSORLG00000006739) eif4ebp2 (ENSORLG00000022491) ppa1b (ENSORLG00000006765) sar1ab (ENSORLG00000006779) tysnd1 (ENSORLG00000006784) Chinese medaka MODERN SPECIES 557 ENSOSIG00000010675 ENSOSIG00000010676 papss2a (ENSOSIG00000010713) minpp1a (ENSOSIG00000014016) sgms1a (ENSOSIG00000014019) prkg1a (ENSOSIG00000014035) dkk1a (ENSOSIG00000014247) pcdh15a (ENSOSIG00000014258) prokr1b (ENSOSIG00000016099) BFSP1 (ENSOSIG00000016100) pcsk2 (ENSOSIG00000016107) OTOR (ENSOSIG00000016381) GTPBP2 (ENSOSIG00000016382) ENSOSIG00000016383 ENSOSIG00000016386 vdac2 (ENSOSIG00000016393) ##22 ENSOSIG00000016782 znf503 (ENSOSIG00000016786) lrmda (ENSOSIG00000016790) KCNMA1 (ENSOSIG00000016957) dlg5a (ENSOSIG00000020835) ENSOSIG00000020936 anxa11a (ENSOSIG00000021055) zcchc24 (ENSOSIG00000022217) ppifa (ENSOSIG00000022222) zmiz1a (ENSOSIG00000022264) rps24 (ENSOSIG00000022315) ENSOSIG00000022318 sar1ab (ENSOSIG00000022321) tysnd1 (ENSOSIG00000022322) SPOCK2 (ENSOSIG00000022333) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000176967 ENSGT00940000169918 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00940000176967 ENSGT00940000169918 ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000176967 ENSGT00940000169918 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b 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(ENSSPAG00000008186) prokr1b (ENSSPAG00000008175) BFSP1 (ENSSPAG00000008143) pcsk2 (ENSSPAG00000008093) OTOR (ENSSPAG00000008082) GTPBP2 (ENSSPAG00000008019) polh (ENSSPAG00000007999) ENSSPAG00000007985 ENSSPAG00000007952 ENSSPAG00000007931 vdac2 (ENSSPAG00000007893) ##22 ENSSPAG00000007877 comtd1 (ENSSPAG00000007847) znf503 (ENSSPAG00000007834) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00940000176967.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000176967.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.b.i.b.a ENSGT00940000176967.a.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b.j ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.b.i.b.a ENSGT00940000176967.a.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b.j ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT00940000164656.b.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00940000176967.a.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b.i.b.b ENSGT00940000176967.a.b.b ENSGT00940000176967.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT00940000164656.b.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 275 sgms1a (ENSHBUG00000018569) prkg1a (ENSHBUG00000018705) dkk1a (ENSHBUG00000018709) pcdh15a (ENSHBUG00000019877) plek (ENSHBUG00000019951) prokr1b (ENSHBUG00000019964) BFSP1 (ENSHBUG00000019976) pcsk2 (ENSHBUG00000019983) OTOR (ENSHBUG00000019990) GTPBP2 (ENSHBUG00000020061) polh (ENSHBUG00000020105) ENSHBUG00000020115 ENSHBUG00000020140 ENSHBUG00000020150 ENSHBUG00000020158 vdac2 (ENSHBUG00000020188) ##22 ENSHBUG00000020207 comtd1 (ENSHBUG00000000747) znf503 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MODERN SPECIES 4 pcdh15a (ENSACLG00000015076) plek (ENSACLG00000014995) prokr1b (ENSACLG00000014942) BFSP1 (ENSACLG00000014928) pcsk2 (ENSACLG00000014907) OTOR (ENSACLG00000014897) GTPBP2 (ENSACLG00000014839) polh (ENSACLG00000014800) ENSACLG00000014766 ENSACLG00000014732 ENSACLG00000014720 ENSACLG00000014699 ENSACLG00000014680 ENSACLG00000014662 ENSACLG00000014644 vdac2 (ENSACLG00000014596) ##22 ENSACLG00000014551 comtd1 (ENSACLG00000014532) ENSACLG00000014439 znf503 (ENSACLG00000014431) lrmda (ENSACLG00000014379) KCNMA1 (ENSACLG00000013694) dlg5a (ENSACLG00000013617) anxa11a (ENSACLG00000013566) zcchc24 (ENSACLG00000013545) ppifa (ENSACLG00000013099) ENSACLG00000013091 zmiz1a (ENSACLG00000013079) rps24 (ENSACLG00000013068) eif4ebp2 (ENSACLG00000013067) ppa1b (ENSACLG00000013062) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1095 pcdh15a (ENSMZEG00005027576) plek (ENSMZEG00005027577) prokr1b (ENSMZEG00005027578) BFSP1 (ENSMZEG00005027579) pcsk2 (ENSMZEG00005027580) OTOR (ENSMZEG00005027581) GTPBP2 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EIF4EBP2 (ENSOKIG00005025302) ppa1b (ENSOKIG00005025337) sar1ab (ENSOKIG00005025381) tysnd1 (ENSOKIG00005025413) SPOCK2 (ENSOKIG00005025428) ENSOKIG00005025441 scdb (ENSOKIG00005025450) WNT8B (ENSOKIG00005025465) hif1an (ENSOKIG00005025509) PLCE1 (ENSOKIG00005025598) mrpl57 (ENSOKIG00005025747) KCNH1 (ENSOKIG00005025773) ENSOKIG00005025875 ENSOKIG00005025937 VDAC2 (ENSOKIG00005025997) ##22 ENSOKIG00005026187 comtd1 (ENSOKIG00005026195) ENSOKIG00005026213 comtd1 (ENSOKIG00005026226) ENSOKIG00005026247 znf503 (ENSOKIG00005026264) lrmda (ENSOKIG00005026287) ENSOKIG00005026302 KCNMA1 (ENSOKIG00005026716) ENSOKIG00005038655 dlg5a (ENSOKIG00005038715) anxa11a (ENSOKIG00005039615) ENSOKIG00005041833 ZFAND4 (ENSOKIG00005041845) marchf8 (ENSOKIG00005041891) Rainbow trout MODERN SPECIES ENSOMYG00000047476 ENSOMYG00000047486 ENSOMYG00000068550 ENSOMYG00000047487 scdb (ENSOMYG00000058460) ENSOMYG00000047495 ENSOMYG00000052803 fih1 (ENSOMYG00000047500) ENSOMYG00000047539 ENSOMYG00000054195 ENSOMYG00000047564 ENSOMYG00000025742 ENSOMYG00000061088 ENSOMYG00000025830 ENSOMYG00000025885 vdac2 (ENSOMYG00000025946) ##22 ENSOMYG00000067627 comtd1 (ENSOMYG00000026039) ENSOMYG00000026093 ENSOMYG00000051624 ENSOMYG00000061708 ENSOMYG00000026115 ENSOMYG00000060285 ENSOMYG00000073926 ENSOMYG00000026000 ENSOMYG00000075025 znf503 (ENSOMYG00000026129) lrmda (ENSOMYG00000026150) ENSOMYG00000058026 KCNMA1 (ENSOMYG00000028680) ENSOMYG00000073138 Huchen MODERN SPECIES 574 EIF4EBP2 (ENSHHUG00000005556) ppa1b (ENSHHUG00000005516) sar1ab (ENSHHUG00000005483) tysnd1 (ENSHHUG00000005434) SPOCK2 (ENSHHUG00000005428) ENSHHUG00000005419 scdb (ENSHHUG00000005369) wnt8b (ENSHHUG00000005332) hif1an (ENSHHUG00000005254) PLCE1 (ENSHHUG00000005190) mrpl57 (ENSHHUG00000005184) kcnh1a (ENSHHUG00000005103) ENSHHUG00000005096 ENSHHUG00000004947 vdac2 (ENSHHUG00000004763) ##22 ENSHHUG00000004757 ENSHHUG00000004755 ENSHHUG00000004748 ENSHHUG00000004656 comtd1 (ENSHHUG00000004639) Northern pike MODERN SPECIES 5 sar1ab (ENSELUG00000024279) tysnd1 (ENSELUG00000024236) SPOCK2 (ENSELUG00000024218) ENSELUG00000024146 dnajb12a (ENSELUG00000024163) trmt2b (ENSELUG00000024144) scdb (ENSELUG00000024135) wnt8b (ENSELUG00000024097) hif1an (ENSELUG00000024069) PLCE1 (ENSELUG00000024002) mrpl57 (ENSELUG00000023731) KCNH1 (ENSELUG00000023726) hhat (ENSELUG00000023687) CRIP3 (ENSELUG00000023677) ENSELUG00000023425 vdac2 (ENSELUG00000023357) ##22 ENSELUG00000023308 ifit8 (ENSELUG00000023296) ENSELUG00000023291 ENSELUG00000027155 ENSELUG00000023283 comtd1 (ENSELUG00000023265) ENSELUG00000034245 znf503 (ENSELUG00000023250) lrmda (ENSELUG00000023237) KCNMA1 (ENSELUG00000023215) dlg5a (ENSELUG00000023155) anxa11a (ENSELUG00000023085) ENSELUG00000023002 zfand4 (ENSELUG00000022926) ENSELUG00000026905 Otomorpha DUPLICATION Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000164426.c ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.A.a.a.a 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ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00940000154935.c.b.a.a ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000173647 ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 136 ENSGT00940000160638.n ENSGT00390000017548.b.b ENSGT00950000182990.b ENSGT00940000161116.w.b ENSGT00390000004428.a.b ENSGT00390000003595 ENSGT00940000164426.c ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q.c ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000165077 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000173647 ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b 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tetra MODERN SPECIES 116 fam53b (ENSAMXG00000037052) lhpp (ENSAMXG00000001319) oat (ENSAMXG00000033395) CHST15 (ENSAMXG00000030259) tvp23b (ENSAMXG00000040559) exoc7 (ENSAMXG00000035608) ENSAMXG00000034862 vclb (ENSAMXG00000042904) adkb (ENSAMXG00000013461) ENSAMXG00000030866 ENSAMXG00000041055 DUSP13 (ENSAMXG00000006707) ENSAMXG00000034948 ENSAMXG00000030855 SAMD8 (ENSAMXG00000006691) VDAC2 (ENSAMXG00000035617) ##22 COMTD1 (ENSAMXG00000039488) ZNF503 (ENSAMXG00000031112) ENSAMXG00000030320 ENSAMXG00000039222 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1517 VDAC2 (ENSPNAG00000016221) ##22 COMTD1 (ENSPNAG00000016259) ZNF503 (ENSPNAG00000016268) Electric eel MODERN SPECIES 120 UBE2B (ENSEEEG00000024310) #17 cdkn2aipnl (ENSEEEG00000024309) #16 JADE2 (ENSEEEG00000024308) #15 sar1b (ENSEEEG00000024306) THRA (ENSEEEG00000024269) ENSEEEG00000024239 ENSEEEG00000024236 mrpl27 (ENSEEEG00000024235) EME1 (ENSEEEG00000024234) ca10a (ENSEEEG00000024233) DUSP13 (ENSEEEG00000024232) ENSEEEG00000024231 SAMD8 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ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 ENSGT00390000005448.e ENSGT00940000165641 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 606 ENSGT00940000166490.a.e ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q.c ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a.f ENSGT00940000154935.c.b.a.a.b ENSGT00940000156914.o.a.c ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008.f ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b.ub ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645.a ENSGT00940000158426.c Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 366 ENSGT00390000003070.b.c.a ENSGT00390000017548.b.b.d ENSGT00950000182990.b.e ENSGT00940000161116.w.b.a ENSGT00390000004428.a.b.d ENSGT00390000003595.i.b ENSGT00940000164426.c ENSGT01030000234543.D.n.g ENSGT00390000014320.c.a.e.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b.j ENSGT00940000166490.a.f ENSGT00940000155540.b.b.i ENSGT00950000182869.e.a.a.q.c ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a.f ENSGT00940000154935.c.b.a.a.b ENSGT00940000155303.k.d ENSGT00940000156914.o.a.c ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008.f ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b.ub ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645.a ENSGT00940000158426.c Common carp reference DUPLICATION Common carp reference MODERN SPECIES 44 ENSCCRG00000066038 hid1b (ENSCCRG00000011205) ENSCCRG00000019079 ENSCCRG00000019072 ENSCCRG00000019069 ENSCCRG00000070412 trim16 (ENSCCRG00000056501) tvp23b (ENSCCRG00000070572) exoc7 (ENSCCRG00000077506) ENSCCRG00000066328 vclb (ENSCCRG00000067790) adkb (ENSCCRG00000025883) DUSP13 (ENSCCRG00000071582) SAMD8 (ENSCCRG00000019230) ENSCCRG00000019171 VDAC2 (ENSCCRG00000057254) ##22 COMTD1 (ENSCCRG00000053993) ZNF503 (ENSCCRG00000070035) KCNMA1 (ENSCCRG00000036155) DLG5 (ENSCCRG00000024709) anxa11b (ENSCCRG00000007433) ZCCHC24 (ENSCCRG00000073191) ppifb (ENSCCRG00000077588) ZMIZ1 (ENSCCRG00000003862) polr3a 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Golden-line barbel DUPLICATION Golden-line barbel MODERN SPECIES 235 ENSSGRG00000019678 ENSSGRG00000019680 ENSSGRG00000019681 hid1b (ENSSGRG00000019684) USH1G (ENSSGRG00000019993) FADS6 (ENSSGRG00000019995) trim16 (ENSSGRG00000019998) tvp23b (ENSSGRG00000019999) exoc7 (ENSSGRG00000020056) ENSSGRG00000022421 vclb (ENSSGRG00000022450) ADK (ENSSGRG00000023760) ENSSGRG00000023795 ENSSGRG00000023802 SAMD8 (ENSSGRG00000023804) ENSSGRG00000023805 ##22 COMTD1 (ENSSGRG00000023807) ZNF503 (ENSSGRG00000023809) KCNMA1 (ENSSGRG00000023960) DLG5 (ENSSGRG00000030372) anxa11b (ENSSGRG00000030395) ZCCHC24 (ENSSGRG00000031568) ppifb (ENSSGRG00000031569) ZMIZ1 (ENSSGRG00000031594) ENSSGRG00000031673 ENSSGRG00000031678 ADAMTS14 (ENSSGRG00000031747) pald1a (ENSSGRG00000031753) ENSSGRG00000032016 lrrc20 (ENSSGRG00000032018) ENSSGRG00000032019 Golden-line barbel MODERN SPECIES 197 ENSSGRG00000038758 hid1b (ENSSGRG00000038757) USH1G (ENSSGRG00000038755) FADS6 (ENSSGRG00000038754) trim16 (ENSSGRG00000038752) 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(ENSDCDG00000003322) Denticle herring MODERN SPECIES 11 itga3b (ENSDCDG00000002157) dlx3b (ENSDCDG00000002164) dlx4b (ENSDCDG00000002167) ENSDCDG00000002168 kat7b (ENSDCDG00000002177) ptges3l (ENSDCDG00000002205) g6pc1a.1 (ENSDCDG00000002209) g6pc1a.2 (ENSDCDG00000002231) aarsd1 (ENSDCDG00000002244) adkb (ENSDCDG00000002266) KAT6B (ENSDCDG00000002290) ENSDCDG00000002294 DUSP13 (ENSDCDG00000002297) ENSDCDG00000002298 SAMD8 (ENSDCDG00000000134) VDAC2 (ENSDCDG00000000160) ##22 COMTD1 (ENSDCDG00000000256) ZNF503 (ENSDCDG00000000297) KCNMA1 (ENSDCDG00000000531) DLG5 (ENSDCDG00000000929) adkb (ENSDCDG00000000964) KAT6B (ENSDCDG00000000970) ENSDCDG00000000978 DUSP13 (ENSDCDG00000000986) ENSDCDG00000000989 SAMD8 (ENSDCDG00000000998) VDAC2 (ENSDCDG00000001032) ##22 COMTD1 (ENSDCDG00000001112) ZNF503 (ENSDCDG00000001117) KCNMA1 (ENSDCDG00000001213) DLG5 (ENSDCDG00000001713) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183185.c.a.b.a.a ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000154395.a.a.a.b 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alox5a (ENSPNAG00000027136) ENSPNAG00000006862 zfand4 (ENSPNAG00000007097) marchf8 (ENSPNAG00000027410) vdac2 (ENSPNAG00000005273) ##22 ENSPNAG00000027469 ifit8 (ENSPNAG00000027476) comtd1 (ENSPNAG00000027732) znf503 (ENSPNAG00000027759) lrmda (ENSPNAG00000004261) kcnma1a (ENSPNAG00000027930) ENSPNAG00000027955 dlg5a (ENSPNAG00000028221) anxa11a (ENSPNAG00000028657) MOCOS (ENSPNAG00000028740) zgc:110045 (ENSPNAG00000004501) ENSPNAG00000006838 vwc2 (ENSPNAG00000029192) SPATA48 (ENSPNAG00000004535) ikzf1 (ENSPNAG00000004566) Mexicana tetra MODERN SPECIES 17 ENSAMXG00000039931 ENSAMXG00000040191 si:ch211-198a12.6 (ENSAMXG00000026056) stox1 (ENSAMXG00000001371) ccar1 (ENSAMXG00000001383) zgc:110319 (ENSAMXG00000033105) si:dkey-228d14.5 (ENSAMXG00000001412) eif4e1c (ENSAMXG00000029997) TET1 (ENSAMXG00000001451) ENSAMXG00000029609 slc25a16 (ENSAMXG00000031377) alox5a (ENSAMXG00000001474) ENSAMXG00000001490 zfand4 (ENSAMXG00000040329) marchf8 (ENSAMXG00000040189) vdac2 (ENSAMXG00000001543) ##22 ENSAMXG00000040989 ifit8 (ENSAMXG00000032260) comtd1 (ENSAMXG00000001561) ENSAMXG00000036643 znf503 (ENSAMXG00000042362) ENSAMXG00000040919 lrmda (ENSAMXG00000038778) kcnma1a (ENSAMXG00000001588) ENSAMXG00000035070 dlg5a (ENSAMXG00000001625) anxa11a (ENSAMXG00000033610) MOCOS (ENSAMXG00000001739) ENSAMXG00000001760 vwc2 (ENSAMXG00000033541) SPATA48 (ENSAMXG00000001803) Electric eel MODERN SPECIES 1 ENSEEEG00000008670 slc25a16 (ENSEEEG00000008667) alox5a (ENSEEEG00000008660) ENSEEEG00000008655 zfand4 (ENSEEEG00000008654) marchf8 (ENSEEEG00000008650) vdac2 (ENSEEEG00000008142) ##22 ENSEEEG00000008123 ifit8 (ENSEEEG00000008121) znf503 (ENSEEEG00000008119) lrmda (ENSEEEG00000008116) kcnma1a (ENSEEEG00000006264) dlg5a (ENSEEEG00000006191) ENSEEEG00000005282 MOCOS (ENSEEEG00000005202) ENSEEEG00000005191 vwc2 (ENSEEEG00000005186) ikzf1 (ENSEEEG00000005094) fignl1 (ENSEEEG00000005088) ttl (ENSEEEG00000005087) klc1a (ENSEEEG00000004989) coa8 (ENSEEEG00000004958) Channel catfish MODERN SPECIES 22 ENSIPUG00000005349 ENSIPUG00000005336 STOX1 (ENSIPUG00000005320) ccar1 (ENSIPUG00000005123) si:dkey-228d14.5 (ENSIPUG00000005094) eif4e1c (ENSIPUG00000005027) tet1 (ENSIPUG00000005004) Slc25a16 (ENSIPUG00000004964) ALOX5 (ENSIPUG00000004930) Fam21 (ENSIPUG00000004769) zfand4 (ENSIPUG00000004728) marchf8 (ENSIPUG00000004619) ENSIPUG00000004606 ENSIPUG00000004596 ckba (ENSIPUG00000004569) vdac2 (ENSIPUG00000004553) ##22 ENSIPUG00000004549 ifit8 (ENSIPUG00000004546) comtd1 (ENSIPUG00000004535) znf503 (ENSIPUG00000004515) CJ011 (ENSIPUG00000004493) kcnma1a (ENSIPUG00000004383) dlg5 (ENSIPUG00000004020) anxa11a (ENSIPUG00000003965) mocos (ENSIPUG00000003946) zgc:110045 (ENSIPUG00000003932) ENSIPUG00000003914 vwc2 (ENSIPUG00000003893) c3h7orf72 (ENSIPUG00000003880) ikzf1 (ENSIPUG00000003841) fignl1 (ENSIPUG00000003825) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01100000263516.a.b.b.b.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000156323.d.c.a ENSGT00940000156323.d.c.b ENSGT00950000183169.C ENSGT00520000055589.c.g ENSGT00530000063672.a ENSGT00940000166680 ENSGT01030000234578.A.b.a.b ENSGT00940000166192 ENSGT00940000158935 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000156111.d ENSGT00940000153997.b.b ENSGT00940000155716 ENSGT00940000158282 ENSGT00950000182869.e.a.a.q.d ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935.d ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00940000157051 ENSGT00940000162185 ENSGT00940000162768.A ENSGT00720000108792.A ENSGT00940000175717 ENSGT00940000162844 ENSGT00940000156782.c Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 87 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.b.d ENSGT01100000263516.a.b.b.b.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000156323.d.c.a.b ENSGT00940000156323.d.c.b.b.a ENSGT00520000055589.c.g.b ENSGT00530000063672.a.s ENSGT00940000166680.b ENSGT01030000234578.A.b.a.b.c ENSGT00940000166192.c.b ENSGT00940000158935.b ENSGT00940000157520.c ENSGT00940000156111.d.b ENSGT00940000153997.b.b.b ENSGT00940000155716.r ENSGT00940000158282.d.a.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q.d.a ##22 ENSGT00940000161685.A.b.b ENSGT00950000182946.lb.b.e.a ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b.b ENSGT00940000153289.a.a.a.b ENSGT00940000154935.d.c.b ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935.d.c.a ENSGT00940000155303.l.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000157051.c ENSGT00940000162185 ENSGT00720000108792.A.f ENSGT00940000156782.c.f ENSGT00940000161552.d Goldfish MODERN SPECIES 31 tlr4bb (ENSCARG00000026423) ENSCARG00000026433 ENSCARG00000026447 ENSCARG00000026461 stox1 (ENSCARG00000026473) ccar1 (ENSCARG00000026508) zgc:110319 (ENSCARG00000026798) si:dkey-228d14.5 (ENSCARG00000026803) eif4e1c (ENSCARG00000026813) TET1 (ENSCARG00000026935) slc25a16 (ENSCARG00000026948) alox5a (ENSCARG00000027009) ENSCARG00000027747 zfand4 (ENSCARG00000027775) marchf8 (ENSCARG00000027821) vdac2 (ENSCARG00000027913) ##22 ENSCARG00000029201 ifit8 (ENSCARG00000029209) comtd1 (ENSCARG00000029223) znf503 (ENSCARG00000029284) ENSCARG00000029290 lrmda (ENSCARG00000029301) ENSCARG00000029306 kcnma1a (ENSCARG00000029529) dlg5a (ENSCARG00000037005) anxa11a (ENSCARG00000044215) MOCOS (ENSCARG00000044885) ENSCARG00000045010 vwc2 (ENSCARG00000045082) ikzf1 (ENSCARG00000045160) fignl1 (ENSCARG00000045590) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT01100000263516.a.b.b.b.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000156323.d.c.a.b ENSGT00940000156323.d.c.b.b.a ENSGT00950000183169.C.h ENSGT00520000055589.c.g.b ENSGT00530000063672.a.s ENSGT00940000166680.b ENSGT01030000234578.A.b.a.b.c ENSGT00940000166192.c.b ENSGT00940000158935.b ENSGT00940000157520.c ENSGT00940000156111.d.b ENSGT00940000153997.b.b.b ENSGT00940000155716.r ENSGT00940000158282.d.a.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q.d.a ##22 ENSGT00940000161685.A.b.a ENSGT00950000182946.lb.b.e.a ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b.b ENSGT01020000230338.a.b.b.a.a.a.b.a.b.a.a.d.b.a ENSGT00940000153289.a.a.a.b ENSGT00940000154935.d.c.b 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(ENSCCRG00000059292) Golden-line barbel MODERN SPECIES 44 selenou1a (ENSSGRG00000048071) mat1a (ENSSGRG00000048068) zgc:154058 (ENSSGRG00000048065) ENSSGRG00000048063 si:ch211-198a12.6 (ENSSGRG00000048059) stox1 (ENSSGRG00000048057) ccar1 (ENSSGRG00000048054) zgc:110319 (ENSSGRG00000048053) si:dkey-228d14.5 (ENSSGRG00000048051) eif4e1c (ENSSGRG00000048035) ENSSGRG00000048033 alox5a (ENSSGRG00000047929) ENSSGRG00000047927 zfand4 (ENSSGRG00000047926) marchf8 (ENSSGRG00000047925) vdac2 (ENSSGRG00000045875) ##22 ENSSGRG00000045819 ifit8 (ENSSGRG00000045818) comtd1 (ENSSGRG00000045817) znf503 (ENSSGRG00000045816) ENSSGRG00000045814 lrmda (ENSSGRG00000045813) kcnma1a (ENSSGRG00000043159) dlg5a (ENSSGRG00000043037) ENSSGRG00000041822 MOCOS (ENSSGRG00000041645) zgc:110045 (ENSSGRG00000041643) vwc2 (ENSSGRG00000041642) ikzf1 (ENSSGRG00000041641) fignl1 (ENSSGRG00000041640) ttl (ENSSGRG00000041639) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 96 ENSGT00940000156323.d.c.a.a ENSGT00940000156323.d.c.b.b.b 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(ENSSGRG00000020170) Zebrafish MODERN SPECIES 4 tlr4al (ENSDARG00000075671) tlr4ba (ENSDARG00000019742) si:ch211-198a12.6 (ENSDARG00000074624) stox1 (ENSDARG00000062593) ccar1 (ENSDARG00000074759) si:dkey-228d14.5 (ENSDARG00000057440) zgc:110319 (ENSDARG00000021404) eif4e1c (ENSDARG00000012274) TET1 (ENSDARG00000075230) slc25a16 (ENSDARG00000057287) alox5a (ENSDARG00000057273) ENSDARG00000062532 zfand4 (ENSDARG00000076703) ENSDARG00000110724 marchf8 (ENSDARG00000062489) vdac2 (ENSDARG00000013623) ##22 ENSDARG00000003146 ifit8 (ENSDARG00000057173) comtd1 (ENSDARG00000078918) znf503 (ENSDARG00000018492) lrmda (ENSDARG00000057166) kcnma1a (ENSDARG00000079840) dlg5a (ENSDARG00000074059) anxa11a (ENSDARG00000077383) zgc:110045 (ENSDARG00000057141) ENSDARG00000110961 vwc2 (ENSDARG00000076495) SPATA48 (ENSDARG00000109818) ikzf1 (ENSDARG00000013539) fignl1 (ENSDARG00000016427) ttl (ENSDARG00000062418) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000182936.a.b.a ENSGT00940000158288 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ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000164426.c ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.A.a.b ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000162682.A.a.b.a ENSGT00940000162682.A.a.a ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490 ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.r ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a.b ENSGT01060000252496 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 73 ENSGT00940000164426.c ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00940000162682.A.a.a ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490.a 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ENSGT00940000154935.d ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000165077 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000173647 ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00550000075078 ENSGT00940000163949.a ENSGT00940000178056 ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000162682.A.a.a ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.r ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000165077 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000173647 ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 ENSGT00390000005448 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000163949.a ENSGT00940000178056 ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00940000162682.A.a.a ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.r ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000165077 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 ENSGT00390000005448 ENSGT00940000165641 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00550000075078 ENSGT00940000163949.a ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n.d ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.r ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000165077 ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 ENSGT00390000005448 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155642 ENSGT00550000075078 ENSGT00940000163949.a ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n.d ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.r ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000165077 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 ENSGT00390000005448 ENSGT00940000165641 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 4 coasy (ENSKMAG00000016770) ENSKMAG00000016742 ENSKMAG00000016722 pus3 (ENSKMAG00000016715) dcakd (ENSKMAG00000016706) C1QL1 (ENSKMAG00000016696) vclb (ENSKMAG00000016618) ADK (ENSKMAG00000016538) KAT6B (ENSKMAG00000016455) DUSP29 (ENSKMAG00000016416) ENSKMAG00000016406 DUSP13 (ENSKMAG00000016386) ENSKMAG00000016373 SAMD8 (ENSKMAG00000016342) ENSKMAG00000016315 VDAC2 (ENSKMAG00000016282) ##22 COMTD1 (ENSKMAG00000016259) ZNF503 (ENSKMAG00000016253) KCNMA1 (ENSKMAG00000015959) DLG5 (ENSKMAG00000015734) ENSKMAG00000015651 ZCCHC24 (ENSKMAG00000015632) ppifb (ENSKMAG00000015611) ZMIZ1 (ENSKMAG00000015547) polr3a (ENSKMAG00000015290) QRFPR (ENSKMAG00000015221) ENSKMAG00000015191 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ENSGT00550000075078 ENSGT00940000163949.a ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n.d ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.r ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 ENSGT00390000005448 ENSGT00940000165641 ENSGT00730000111199 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 100 ENSGT00550000075078 ENSGT00940000163949.a ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n.d ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000162682.A.a.a ENSGT00940000154628.A.a.a.b 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Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00550000075078 ENSGT00940000163949.a ENSGT00940000178056 ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000162682.A.a.a ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.r ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b.a ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000165077 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000173647 ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 ENSGT00390000005448 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00550000075078 ENSGT00940000163949.a ENSGT00940000178056 ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000162682.A.a.a 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Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00550000075078 ENSGT00940000163949.a ENSGT00940000178056 ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000162682.A.a.a ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.r ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000165077 ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 ENSGT00390000005448 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 9 zdhhc6 (ENSBSLG00000026301) coasy (ENSBSLG00000026305) ENSBSLG00000026307 ENSBSLG00000026309 pus3 (ENSBSLG00000026310) dcakd (ENSBSLG00000026311) C1QL1 (ENSBSLG00000026312) vclb (ENSBSLG00000026334) ADK 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ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000155642 ENSGT00550000075078 ENSGT00940000163949.a ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000162682.A.a.a ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.r ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000165077 ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 ENSGT00390000005448 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000155642 ENSGT00550000075078 ENSGT00940000163949.a ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000162682.A.a.a 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Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000155642 ENSGT00550000075078 ENSGT00940000163949.a ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000162682.A.a.a ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.r ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000165077 ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 ENSGT00390000005448 Gilthead seabream MODERN SPECIES 12 coasy (ENSSAUG00010025571) ENSSAUG00010025573 ENSSAUG00010025575 pus3 (ENSSAUG00010025577) dcakd (ENSSAUG00010025578) C1QL1 (ENSSAUG00010025579) vclb (ENSSAUG00010025582) ADK (ENSSAUG00010025591) KAT6B 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SPECIES 1 tvp23b (ENSSTUG00000024827) trim16 (ENSSTUG00000024862) FADS6 (ENSSTUG00000024877) USH1G (ENSSTUG00000024887) ENSSTUG00000024912 HID1 (ENSSTUG00000024935) ENSSTUG00000025151 vclb (ENSSTUG00000025207) ENSSTUG00000025527 adkb (ENSSTUG00000025543) ENSSTUG00000025785 KAT6B (ENSSTUG00000025793) ENSSTUG00000025882 ENSSTUG00000025895 SAMD8 (ENSSTUG00000025918) VDAC2 (ENSSTUG00000026006) ##22 COMTD1 (ENSSTUG00000026629) ZNF503 (ENSSTUG00000026686) KCNMA1 (ENSSTUG00000027222) ENSSTUG00000047704 anxa11b (ENSSTUG00000047721) rrbp1a (ENSSTUG00000048555) snx5 (ENSSTUG00000048581) mgme1 (ENSSTUG00000048643) ENSSTUG00000048648 EPHX1 (ENSSTUG00000048657) ENSSTUG00000048791 ENSSTUG00000048805 ENSSTUG00000048809 flrt3 (ENSSTUG00000048815) ENSSTUG00000048819 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT01060000248846.a.a.a.a ENSGT01030000234586.B.a.a.a.g ENSGT01080000257365.a.d.j ENSGT00390000004428.a.b.e ENSGT00940000161116.w.b.e ENSGT00950000182990.b.a.b ENSGT00390000017548.b.b.b 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ENSOKIG00005038581 ENSOKIG00005038596 FLRT3 (ENSOKIG00005038623) Rainbow trout MODERN SPECIES 12 trim16 (ENSOMYG00000044839) ENSOMYG00000063762 USH1G (ENSOMYG00000044849) ENSOMYG00000050128 ENSOMYG00000044851 HID1 (ENSOMYG00000044857) ENSOMYG00000044870 ENSOMYG00000044963 ENSOMYG00000073946 ENSOMYG00000066262 KAT6B (ENSOMYG00000011685) ENSOMYG00000071306 ENSOMYG00000059206 ENSOMYG00000011753 SAMD8 (ENSOMYG00000011768) VDAC2 (ENSOMYG00000011846) ##22 comtd1 (ENSOMYG00000012211) ZNF503 (ENSOMYG00000012272) ENSOMYG00000048665 KCNMA1 (ENSOMYG00000012448) ENSOMYG00000017506 rrbp1a (ENSOMYG00000017898) snx5 (ENSOMYG00000017574) mgme1 (ENSOMYG00000017590) ENSOMYG00000017637 ENSOMYG00000017689 ENSOMYG00000017755 ENSOMYG00000054536 ENSOMYG00000017812 ENSOMYG00000017868 ENSOMYG00000068995 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 283 ENSGT01080000257365.a.d.i ENSGT01090000260051.a.hd ENSGT00390000003595.v ENSGT00390000004428.a.b.f ENSGT00940000161116.w.b.f ENSGT00950000182990.b.a.a ENSGT00390000017548.b.b.a 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