Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000154518.a ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182808.a.a.a.b ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652 #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000156288 ENSGT00940000163251.a ENSGT00940000159536 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 79 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT01090000260575 ENSGT00950000182808.a.a.a.b ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652 #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000156288 ENSGT00940000163251.a ENSGT00940000154155 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000157695 ENSGT00390000018781 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652 #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000156288 ENSGT00940000154155 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000157695 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652 #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00940000154508.a.b Amniota ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00390000016270 ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000154155 ENSGT00940000156288 ENSGT00390000018781 ENSGT00390000013108 #36 ENSGT00940000156386 #35 ENSGT00940000162679 #34 ENSGT00940000156068 #33 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00390000016270 ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000154155 ENSGT00940000156288 ENSGT00390000016991 ENSGT00390000018781 ENSGT00390000013108 #36 ENSGT00940000156386 #35 ENSGT00940000162679 #34 Theria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00390000016270 ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000154155 ENSGT00940000156288 ENSGT00390000016991 ENSGT00390000018781 ENSGT00390000003225 #37 ENSGT00390000013108 #36 ENSGT00940000156386 #35 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #27 ENSGT00390000013467 #28 ENSGT00390000004029 #29 ENSGT00940000159784 #30 ENSGT00940000160656 #31 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #32 ENSGT00940000156068 #33 ENSGT00940000162679 #34 ENSGT00940000156386 #35 ENSGT00390000013108 #36 ENSGT00390000003225 #37 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #27 ENSGT00390000013467 #28 ENSGT00390000004029 #29 ENSGT00940000159784 #30 ENSGT00940000160656 #31 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #32 ENSGT00940000156068 #33 ENSGT00940000162679 #34 ENSGT00940000156386 #35 ENSGT00390000013108 #36 ENSGT00390000003225 #37 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.ab.b #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #27 ENSGT00390000013467 #28 ENSGT00390000004029 #29 ENSGT00940000159784 #30 ENSGT00940000160656 #31 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #32 ENSGT00940000156068 #33 ENSGT00940000162679 #34 ENSGT00940000156386 #35 ENSGT00390000013108 #36 ENSGT00390000003225 #37 Primates ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.ab.b #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #27 ENSGT00390000013467 #28 ENSGT00390000004029 #29 ENSGT00940000159784 #30 ENSGT00940000160656 #31 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #32 ENSGT00940000156068 #33 ENSGT00940000162679 #34 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ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.ab.b #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #27 ENSGT00910000147122 ENSGT00390000013467 #28 ENSGT00390000004029 #29 ENSGT00940000159784 #30 ENSGT00940000160656 #31 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #32 ENSGT00940000156068 #33 ENSGT00940000162679 #34 ENSGT00940000156386 #35 ENSGT00390000013108 #36 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 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ENSGT00940000156068 #33 ENSGT00940000162679 #34 ENSGT00940000156386 #35 Capuchin MODERN SPECIES 76 TXNDC15 (ENSCCAG00000030665) #8 ENSCCAG00000033520 C5orf24 (ENSCCAG00000025876) #9 DDX46 (ENSCCAG00000026721) #10 CAMLG (ENSCCAG00000034675) #11 SEC24A (ENSCCAG00000032334) #12 SAR1B (ENSCCAG00000037282) #13 ENSCCAG00000026527 JADE2 (ENSCCAG00000027715) #14 CDKN2AIPNL (ENSCCAG00000021921) #15 UBE2B (ENSCCAG00000026429) #16 CDKL3 (ENSCCAG00000024762) #17 ENSCCAG00000025572 #18 ENSCCAG00000031876 ##20 TCF7 (ENSCCAG00000026300) #21 VDAC1 (ENSCCAG00000028384) #22 C5orf15 (ENSCCAG00000024033) #23 FSTL4 (ENSCCAG00000027531) #24 HSPA4 (ENSCCAG00000036316) #25 ENSCCAG00000031545 ENSCCAG00000015918 ZCCHC10 (ENSCCAG00000024643) #26 ENSCCAG00000005532 AFF4 (ENSCCAG00000030353) #27 ENSCCAG00000034775 LEAP2 (ENSCCAG00000029916) #28 UQCRQ (ENSCCAG00000034496) #29 ENSCCAG00000031721 #30 SHROOM1 (ENSCCAG00000037692) #31 SEPTIN8 (ENSCCAG00000028922) #33 CCNI2 (ENSCCAG00000037558) #34 Bolivian squirrel 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(ENSGGOG00000008990) ENSGGOG00000043041 ENSGGOG00000015916 BRWD3 (ENSGGOG00000004108) ENSGGOG00000039837 ENSGGOG00000037044 ##22 ENSGGOG00000039492 ##22 HMGN5 (ENSGGOG00000016479) SH3BGRL (ENSGGOG00000009664) ENSGGOG00000025534 POU3F4 (ENSGGOG00000027353) CYLC1 (ENSGGOG00000001587) RPS6KA6 (ENSGGOG00000016474) HDX (ENSGGOG00000005551) ENSGGOG00000016329 SATL1 (ENSGGOG00000016333) ZNF711 (ENSGGOG00000006110) POF1B (ENSGGOG00000016908) CHM (ENSGGOG00000022912) ENSGGOG00000040803 DACH2 (ENSGGOG00000007231) KLHL4 (ENSGGOG00000002307) Gorilla MODERN SPECIES 523 DACH2 (ENSGGOG00000007231) ENSGGOG00000040803 CHM (ENSGGOG00000022912) POF1B (ENSGGOG00000016908) ZNF711 (ENSGGOG00000006110) SATL1 (ENSGGOG00000016333) ENSGGOG00000016329 HDX (ENSGGOG00000005551) RPS6KA6 (ENSGGOG00000016474) CYLC1 (ENSGGOG00000001587) POU3F4 (ENSGGOG00000027353) ENSGGOG00000025534 SH3BGRL (ENSGGOG00000009664) HMGN5 (ENSGGOG00000016479) ENSGGOG00000039492 ##22 ENSGGOG00000037044 ##22 ENSGGOG00000039837 BRWD3 (ENSGGOG00000004108) ENSGGOG00000015916 ENSGGOG00000043041 TBX22 (ENSGGOG00000008990) ITM2A (ENSGGOG00000026998) GPR174 (ENSGGOG00000024322) CYSLTR1 (ENSGGOG00000003276) TAF9B (ENSGGOG00000002470) PGK1 (ENSGGOG00000017111) ATP7A (ENSGGOG00000025640) COX7B (ENSGGOG00000023347) MAGT1 (ENSGGOG00000010342) ATRX (ENSGGOG00000024999) FGF16 (ENSGGOG00000002237) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.a ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 1126 ADGRG7 (ENSANAG00000033047) ENSANAG00000038428 TMEM45A (ENSANAG00000023330) LNP1 (ENSANAG00000031808) TOMM70 (ENSANAG00000020825) NIT2 (ENSANAG00000020458) TBC1D23 (ENSANAG00000024314) ENSANAG00000001502 CMSS1 (ENSANAG00000023565) FILIP1L (ENSANAG00000036993) COL8A1 (ENSANAG00000036463) ENSANAG00000019820 DCBLD2 (ENSANAG00000035766) ENSANAG00000035028 ST3GAL6 (ENSANAG00000026185) ENSANAG00000036882 ##22 CPOX (ENSANAG00000032840) CLDND1 (ENSANAG00000035467) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b ##22 Hominoidea DUPLICATION Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.a ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.a ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.a ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162070 ENSGT00390000003183.e.a ENSGT00390000003183.e.b ENSGT00940000160559 ENSGT00390000008621 ENSGT00940000160940 ENSGT00940000159479 ENSGT00940000162262 ENSGT00940000160459 ENSGT00940000153313.C.a ENSGT00940000153763.a ENSGT00940000162674 ENSGT00940000153097.C ENSGT00940000153097.A.f.b ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.a ##22 ENSGT00940000153097.A.f.a.b.b.c ENSGT00390000013859 ENSGT00940000161807 ENSGT00390000003809 ENSGT00940000162625 ENSGT00940000155882.a.a ENSGT00910000147473 ENSGT00940000159855 ENSGT01030000234637.b.c ENSGT00940000153629.a.b ENSGT00940000158528 ENSGT00940000162529 ENSGT00390000015154 ENSGT00940000155657.db.a.a ENSGT00940000154102.b Bonobo MODERN SPECIES 369 ENSPPAG00000027565 MAGED1 (ENSPPAG00000037605) CENPVL3 (ENSPPAG00000005217) EZHIP (ENSPPAG00000005586) ENSPPAG00000022094 BMP15 (ENSPPAG00000005038) SHROOM4 (ENSPPAG00000039023) DGKK (ENSPPAG00000034077) CCNB3 (ENSPPAG00000027314) AKAP4 (ENSPPAG00000034394) CLCN5 (ENSPPAG00000029912) USP27X (ENSPPAG00000012284) PAGE4 (ENSPPAG00000037679) PAGE1 (ENSPPAG00000030309) ENSPPAG00000035136 ENSPPAG00000043153 ##22 ENSPPAG00000027179 ENSPPAG00000027948 FOXP3 (ENSPPAG00000028117) CCDC22 (ENSPPAG00000039638) CACNA1F (ENSPPAG00000027619) SYP (ENSPPAG00000033248) PRICKLE3 (ENSPPAG00000040750) PLP2 (ENSPPAG00000040820) MAGIX (ENSPPAG00000037324) GPKOW (ENSPPAG00000040116) WDR45 (ENSPPAG00000042027) CCDC120 (ENSPPAG00000026576) TFE3 (ENSPPAG00000028832) GRIPAP1 (ENSPPAG00000040230) KCND1 (ENSPPAG00000035010) Chimpanzee MODERN SPECIES 972 ENSPTRG00000046536 ENSPTRG00000047771 CENPVL3 (ENSPTRG00000051936) ENSPTRG00000046232 ENSPTRG00000050633 ENSPTRG00000044134 BMP15 (ENSPTRG00000021908) SHROOM4 (ENSPTRG00000021905) DGKK (ENSPTRG00000048026) CCNB3 (ENSPTRG00000048758) AKAP4 (ENSPTRG00000049957) CLCN5 (ENSPTRG00000021899) PAGE4 (ENSPTRG00000021896) ENSPTRG00000021894 ENSPTRG00000045256 ENSPTRG00000048439 ##22 GAGE10 (ENSPTRG00000021892) PPP1R3F (ENSPTRG00000046513) FOXP3 (ENSPTRG00000021890) CCDC22 (ENSPTRG00000021889) ENSPTRG00000049813 CACNA1F (ENSPTRG00000021888) SYP (ENSPTRG00000021887) PRICKLE3 (ENSPTRG00000045748) PLP2 (ENSPTRG00000021885) MAGIX (ENSPTRG00000047576) GPKOW (ENSPTRG00000047603) WDR45 (ENSPTRG00000021882) CCDC120 (ENSPTRG00000021880) TFE3 (ENSPTRG00000021879) GRIPAP1 (ENSPTRG00000051549) Gibbon MODERN SPECIES 449 ENSNLEG00000008180 MAGED1 (ENSNLEG00000008178) ENSNLEG00000033915 NUDT11 (ENSNLEG00000008174) ENSNLEG00000029212 NUDT10 (ENSNLEG00000008173) BMP15 (ENSNLEG00000008172) SHROOM4 (ENSNLEG00000008164) ENSNLEG00000008157 CCNB3 (ENSNLEG00000008143) AKAP4 (ENSNLEG00000008132) CLCN5 (ENSNLEG00000008106) USP27X (ENSNLEG00000028156) PAGE4 (ENSNLEG00000008101) PAGE1 (ENSNLEG00000008094) ENSNLEG00000027542 ##22 ENSNLEG00000027762 ENSNLEG00000030515 ENSNLEG00000033633 PPP1R3F (ENSNLEG00000031049) FOXP3 (ENSNLEG00000008046) CCDC22 (ENSNLEG00000008043) CACNA1F (ENSNLEG00000008028) SYP (ENSNLEG00000008024) ENSNLEG00000008017 GPKOW (ENSNLEG00000007998) ENSNLEG00000007994 CCDC120 (ENSNLEG00000007975) TFE3 (ENSNLEG00000007963) GRIPAP1 (ENSNLEG00000007939) KCND1 (ENSNLEG00000007958) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 143 ENSGT00940000153889.e.a.a ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 137 ENSGT00940000153889.e.a.a ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00940000155206.d.b ENSGT00940000153889.e.a.a ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00940000158335.d Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00940000155206.d.b ENSGT00940000153889.e.a.a ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.b ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000183123.h.b ENSGT00940000161632.c ENSGT00940000158987 ENSGT00940000159060 ENSGT00940000159149 ENSGT00940000159092 ENSGT00480000042679.a ENSGT00940000159162 ENSGT00940000153239.B.i.a.b ENSGT00940000157822 ENSGT00940000163054 ENSGT00730000111097.e ENSGT00940000162927 ENSGT00940000155206.d.b ENSGT00940000153889.e.a.a ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00940000158335.c ENSGT00940000162668 ENSGT00940000154977.l.b.b ENSGT00940000165485 ENSGT00390000003732 ENSGT00950000183119.a.e.a.d.a.a ENSGT00940000159818 ENSGT00390000001134.b ENSGT00940000154911.v ENSGT00950000182994.A.n.a ENSGT00390000000141 ENSGT00940000159611 ENSGT00950000183121.b.b.b.a ENSGT00530000063666.a.m.a ENSGT00390000008591 Bonobo MODERN SPECIES 369 NOX1 (ENSPPAG00000021977) CSTF2 (ENSPPAG00000031804) SYTL4 (ENSPPAG00000026955) SRPX2 (ENSPPAG00000039226) TSPAN6 (ENSPPAG00000038316) TNMD (ENSPPAG00000035804) PCDH19 (ENSPPAG00000039228) ENSPPAG00000034644 DIAPH2 (ENSPPAG00000040909) ENSPPAG00000038822 FAM133A (ENSPPAG00000017635) NAP1L3 (ENSPPAG00000019923) ENSPPAG00000007354 ENSPPAG00000003031 ENSPPAG00000040878 ENSPPAG00000030962 ##22 ENSPPAG00000043443 PABPC5 (ENSPPAG00000007378) ENSPPAG00000041507 ENSPPAG00000038346 CPXCR1 (ENSPPAG00000016441) ENSPPAG00000026574 KLHL4 (ENSPPAG00000043431) ENSPPAG00000036042 ENSPPAG00000024013 CHM (ENSPPAG00000034301) ENSPPAG00000028498 POF1B (ENSPPAG00000033485) ZNF711 (ENSPPAG00000038129) ENSPPAG00000033891 APOOL (ENSPPAG00000037582) Gorilla MODERN SPECIES 523 CSTF2 (ENSGGOG00000022267) SYTL4 (ENSGGOG00000001159) SRPX2 (ENSGGOG00000010009) TSPAN6 (ENSGGOG00000010003) TNMD (ENSGGOG00000017007) PCDH19 (ENSGGOG00000001810) ENSGGOG00000027167 ENSGGOG00000038151 DIAPH2 (ENSGGOG00000002859) ENSGGOG00000038270 FAM133A (ENSGGOG00000043974) NAP1L3 (ENSGGOG00000016989) ENSGGOG00000025902 ENSGGOG00000039790 ENSGGOG00000025897 ENSGGOG00000042618 ##22 ENSGGOG00000008584 PABPC5 (ENSGGOG00000007622) ENSGGOG00000037634 ENSGGOG00000036979 CPXCR1 (ENSGGOG00000026865) RPSA (ENSGGOG00000036643) KLHL4 (ENSGGOG00000002307) DACH2 (ENSGGOG00000007231) ENSGGOG00000040803 CHM (ENSGGOG00000022912) POF1B (ENSGGOG00000016908) ZNF711 (ENSGGOG00000006110) SATL1 (ENSGGOG00000016333) ENSGGOG00000016329 HDX (ENSGGOG00000005551) Gibbon MODERN SPECIES 114 ENSNLEG00000027059 ENSNLEG00000002453 ##22 ENSNLEG00000015514 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 1031 RDH5 (ENSANAG00000022716) ITGA7 (ENSANAG00000035353) METTL7B (ENSANAG00000036477) OR2AP1 (ENSANAG00000005559) OR6C4 (ENSANAG00000005997) OR6C2 (ENSANAG00000020125) ENSANAG00000026469 OR6C3 (ENSANAG00000020167) OR6C6 (ENSANAG00000001856) OR6C74 (ENSANAG00000001962) OR9K2 (ENSANAG00000020116) ENSANAG00000023011 NEUROD4 (ENSANAG00000004700) TESPA1 (ENSANAG00000037498) MUCL1 (ENSANAG00000026232) ENSANAG00000030917 ##22 DCD (ENSANAG00000035073) LACRT (ENSANAG00000021062) PPP1R1A (ENSANAG00000036632) PDE1B (ENSANAG00000034831) NCKAP1L (ENSANAG00000025148) ENSANAG00000023191 GTSF1 (ENSANAG00000024529) ITGA5 (ENSANAG00000036479) ZNF385A (ENSANAG00000001893) GPR84 (ENSANAG00000004247) ENSANAG00000025073 COPZ1 (ENSANAG00000031944) NFE2 (ENSANAG00000025350) ENSANAG00000023645 CBX5 (ENSANAG00000023641) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.a.b ##22 Capuchin MODERN SPECIES 285 OR6C2 (ENSCCAG00000019750) OR6C3 (ENSCCAG00000018653) OR10A7 (ENSCCAG00000008524) ENSCCAG00000029232 NEUROD4 (ENSCCAG00000015070) TESPA1 (ENSCCAG00000023429) ENSCCAG00000025420 ENSCCAG00000021932 ##22 DCD (ENSCCAG00000009193) LACRT (ENSCCAG00000020335) PPP1R1A (ENSCCAG00000027579) PDE1B (ENSCCAG00000034020) NCKAP1L (ENSCCAG00000032586) GTSF1 (ENSCCAG00000032808) ITGA5 (ENSCCAG00000021214) ZNF385A (ENSCCAG00000033332) ENSCCAG00000019051 COPZ1 (ENSCCAG00000013641) NFE2 (ENSCCAG00000027905) ENSCCAG00000033451 CBX5 (ENSCCAG00000024410) ENSCCAG00000035935 HOXC4 (ENSCCAG00000030761) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000182951.B ENSGT00950000182888.a.a.b ENSGT00940000153838.b ENSGT00950000183081.a.a.a ENSGT00390000005554 ENSGT01030000234614.B.b ENSGT00940000159902 ENSGT00940000159228 ENSGT00390000012166.o ENSGT00430000032886 ENSGT00390000012166.p ENSGT00940000155130 ENSGT00940000159504 ENSGT00940000157906 ENSGT00940000157458 ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b ##22 ENSGT00500000044895 ENSGT00390000013003 ENSGT00940000157639 ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b ENSGT00900000141021.a ENSGT00940000155601 ENSGT00940000163676 ENSGT00390000010047.a.a ENSGT00940000161715.jb ENSGT00940000161715.kb ENSGT00660000095605 ENSGT00940000161114 ENSGT00940000154304.B ENSGT00940000154304.A ENSGT00530000063604.B Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000153838.b ENSGT00910000147219 ENSGT00950000183081.a.a.a ENSGT00390000005554 ENSGT00950000183123.g.b.b.i.b ENSGT01030000234614.B.b ENSGT00940000159902 ENSGT00940000159228 ENSGT00390000012166.o ENSGT00430000032886 ENSGT00390000012166.p ENSGT00940000155130 ENSGT00940000159504 ENSGT00940000157906 ENSGT00940000157458 ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b ##22 ENSGT00500000044895 ENSGT00390000013003 ENSGT00940000157639 ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b ENSGT00900000141021.a ENSGT00940000155601 ENSGT00940000163676 ENSGT00390000010047.a.a ENSGT00390000010047.b ENSGT00940000161715.jb ENSGT00940000161715.kb ENSGT00660000095605 ENSGT00940000161114 ENSGT00940000154304.B ENSGT00940000154304.A Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000153838.b ENSGT00910000147219 ENSGT00950000183081.a.a.a ENSGT00390000005554 ENSGT00950000183123.g.b.b.i.b ENSGT01030000234614.B.b ENSGT00940000159902 ENSGT00940000159228 ENSGT00390000012166.o ENSGT00430000032886 ENSGT00390000012166.p ENSGT00940000155130 ENSGT00940000159504 ENSGT00940000157906 ENSGT00940000157458 ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b ##22 ENSGT00500000044895 ENSGT00390000013003 ENSGT00940000157639 ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b ENSGT00900000141021.a ENSGT00940000155601 ENSGT00940000163676 ENSGT00390000010047.a.a ENSGT00390000010047.b ENSGT00940000161715.jb ENSGT00940000161715.kb ENSGT00660000095605 ENSGT00940000161114 ENSGT00940000154304.B ENSGT00940000154304.A Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153838.b ENSGT00910000147219 ENSGT00950000183081.a.a.a ENSGT00390000005554 ENSGT00950000183123.g.b.b.i.b ENSGT01030000234614.B.b ENSGT00940000159902 ENSGT00940000159228 ENSGT00390000012166.o ENSGT00430000032886 ENSGT00390000012166.p ENSGT00940000155130 ENSGT00940000159504 ENSGT00940000157906 ENSGT00940000157458 ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b ##22 ENSGT00500000044895 ENSGT00390000013003 ENSGT00940000157639 ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b ENSGT00900000141021.a ENSGT00940000155601 ENSGT00940000163676 ENSGT00390000010047.a.a ENSGT00390000010047.b ENSGT00940000161715.jb ENSGT00940000161715.kb ENSGT00660000095605 ENSGT00940000161114 ENSGT00940000154304.B ENSGT00940000154304.A Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182951.B ENSGT00950000182888.a.a.b ENSGT00940000153838.b ENSGT00910000147219 ENSGT00950000183081.a.a.a ENSGT00390000005554 ENSGT00950000183123.g.b.b.i.b ENSGT01030000234614.B.b ENSGT00940000159902 ENSGT00940000159228 ENSGT00390000012166.o ENSGT00390000012166.p ENSGT00940000155130 ENSGT00940000159504 ENSGT00940000157906 ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b ##22 ENSGT00940000157458 ENSGT00500000044895 ENSGT00390000013003 ENSGT00940000157639 ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b ENSGT00900000141021.a ENSGT00940000155601 ENSGT00940000163676 ENSGT00390000015789.c.a.a ENSGT00390000010047.a.a ENSGT00390000010047.b.p ENSGT00940000161715.jb ENSGT00940000161715.kb ENSGT00660000095605 ENSGT00940000161114 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00950000182888.a.a.b ENSGT00940000153838.b ENSGT00910000147219 ENSGT00950000183081.a.a.a ENSGT00390000005554 ENSGT00950000183123.g.b.b.i.b ENSGT01030000234614.B.b ENSGT00940000159902 ENSGT00940000159228 ENSGT00390000012166.o ENSGT00390000012166.p ENSGT00940000155130 ENSGT00940000159504 ENSGT00940000157906 ENSGT00940000157458 ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b ##22 ENSGT00500000044895 ENSGT00390000013003 ENSGT00940000157639 ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b ENSGT00940000155601 ENSGT00390000015789.c.a.a ENSGT00390000010047.a.a ENSGT00940000161715.kb ENSGT00390000010047.b.p ENSGT00940000161715.jb ENSGT00660000095605 ENSGT00940000161114 ENSGT00940000154304.B ENSGT00940000154304.A ENSGT00530000063604.B Sooty mangabey MODERN SPECIES 110 RALGPS2 (ENSCATG00000037783) FAM20B (ENSCATG00000032604) TOR3A (ENSCATG00000041605) ABL2 (ENSCATG00000034934) ENSCATG00000001027 SOAT1 (ENSCATG00000029999) AXDND1 (ENSCATG00000032663) NPHS2 (ENSCATG00000036937) TDRD5 (ENSCATG00000042714) FAM163A (ENSCATG00000034127) TOR1AIP2 (ENSCATG00000044101) TOR1AIP1 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(ENSPPAG00000043409) Gorilla MODERN SPECIES ANGPTL1 (ENSGGOG00000026690) FAM20B (ENSGGOG00000002484) TOR3A (ENSGGOG00000002627) ABL2 (ENSGGOG00000002631) SOAT1 (ENSGGOG00000013728) AXDND1 (ENSGGOG00000034867) NPHS2 (ENSGGOG00000015354) TDRD5 (ENSGGOG00000011310) FAM163A (ENSGGOG00000008032) TOR1AIP2 (ENSGGOG00000015785) TOR1AIP1 (ENSGGOG00000013837) CEP350 (ENSGGOG00000001794) QSOX1 (ENSGGOG00000009976) LHX4 (ENSGGOG00000013931) ACBD6 (ENSGGOG00000008735) ENSGGOG00000027576 ##22 XPR1 (ENSGGOG00000027512) KIAA1614 (ENSGGOG00000008498) STX6 (ENSGGOG00000000732) MR1 (ENSGGOG00000022903) IER5 (ENSGGOG00000012860) CACNA1E (ENSGGOG00000011090) ZNF648 (ENSGGOG00000037825) ENSGGOG00000026683 GLUL (ENSGGOG00000024712) RGSL1 (ENSGGOG00000039219) RNASEL (ENSGGOG00000023414) RGS16 (ENSGGOG00000002649) RGS8 (ENSGGOG00000037970) DHX9 (ENSGGOG00000013533) SHCBP1L (ENSGGOG00000003484) Gibbon MODERN SPECIES 2 FAM20B (ENSNLEG00000029048) TOR3A (ENSNLEG00000015587) ABL2 (ENSNLEG00000015604) SOAT1 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(ENSSBOG00000018587) TMEM225 (ENSSBOG00000005269) ZNF202 (ENSSBOG00000030152) SCN3B (ENSSBOG00000035992) GRAMD1B (ENSSBOG00000029940) CLMP (ENSSBOG00000033154) ENSSBOG00000035266 ENSSBOG00000029761 ENSSBOG00000032961 ENSSBOG00000033034 ##22 BSX (ENSSBOG00000035292) JHY (ENSSBOG00000020543) ENSSBOG00000019647 CRTAM (ENSSBOG00000020006) UBASH3B (ENSSBOG00000026096) ENSSBOG00000032996 BLID (ENSSBOG00000028902) SORL1 (ENSSBOG00000027914) ENSSBOG00000015796 SC5D (ENSSBOG00000020424) TECTA (ENSSBOG00000019507) TBCEL (ENSSBOG00000028041) GRIK4 (ENSSBOG00000030277) ARHGEF12 (ENSSBOG00000020565) TLCD5 (ENSSBOG00000025172) Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.a ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.a ##22 Capuchin MODERN SPECIES 303 ENSCCAG00000034683 PCDH18 (ENSCCAG00000023413) SLC7A11 (ENSCCAG00000033426) ENSCCAG00000032478 ENSCCAG00000036211 ##22 NOCT (ENSCCAG00000022628) ELF2 (ENSCCAG00000025670) ENSCCAG00000028381 ENSCCAG00000037489 MGARP (ENSCCAG00000032552) ENSCCAG00000035857 NDUFC1 (ENSCCAG00000020974) NAA15 (ENSCCAG00000021709) RAB33B (ENSCCAG00000019859) SETD7 (ENSCCAG00000030675) ENSCCAG00000020807 MGST2 (ENSCCAG00000020498) ENSCCAG00000025062 Marmoset MODERN SPECIES 11 PHYKPL (ENSCJAG00000012215) COL23A1 (ENSCJAG00000012175) CLK4 (ENSCJAG00000012089) MSANTD5 (ENSCJAG00000065896) ENSCJAG00000052143 ZNF354A (ENSCJAG00000012077) ENSCJAG00000012069 PROP1 (ENSCJAG00000012060) FAF2 (ENSCJAG00000040255) RNF44 (ENSCJAG00000007338) CDHR2 (ENSCJAG00000007310) GPRIN1 (ENSCJAG00000007308) SNCB (ENSCJAG00000007301) EIF4E1B (ENSCJAG00000007291) TSPAN17 (ENSCJAG00000007278) ENSCJAG00000054332 ##22 UNC5A (ENSCJAG00000007237) HK3 (ENSCJAG00000007223) UIMC1 (ENSCJAG00000007106) ZNF346 (ENSCJAG00000007194) FGFR4 (ENSCJAG00000007147) NSD1 (ENSCJAG00000007009) RAB24 (ENSCJAG00000006969) ENSCJAG00000006953 MXD3 (ENSCJAG00000006943) ENSCJAG00000073973 LMAN2 (ENSCJAG00000006916) RGS14 (ENSCJAG00000006873) SLC34A1 (ENSCJAG00000006845) PFN3 (ENSCJAG00000006841) F12 (ENSCJAG00000006834) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT01100000263490.A.b.a.a.a ENSGT01090000260013.b.a.b.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000163719 ENSGT01100000263490.B.b.a ENSGT01100000263490.B.a.c.a.b.a ENSGT01090000259999.G.b ENSGT01090000259999.G.a.a ENSGT01100000263490.D.a.a ENSGT01090000259999.F.a ENSGT00910000146879 ENSGT00940000162047.g ENSGT00530000065242 ENSGT01100000263522.A.c.b.c.a.hb ENSGT00940000161515 ENSGT01090000260043.a.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b.a ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b ##22 ENSGT00910000144246 ENSGT00390000000214.a.a ENSGT00940000155158.i ENSGT00510000047299 ENSGT00550000074799 ENSGT00940000160721 ENSGT01030000234601.c.a.a ENSGT01030000234601.c.b.b ENSGT01060000248588.b ENSGT00390000004140.b.h ENSGT00390000013075.a.d ENSGT00390000004026 ENSGT00950000183078.b.a.a ENSGT00390000016789 ENSGT00940000161220 Sooty mangabey MODERN SPECIES 545 OR52A5 (ENSCATG00000010932) ENSCATG00000040874 ENSCATG00000044261 MMP26 (ENSCATG00000039857) OR51G1 (ENSCATG00000029826) OR51A7 (ENSCATG00000026903) OR51F2 (ENSCATG00000038466) OR51E2 (ENSCATG00000007724) ENSCATG00000010569 ENSCATG00000032822 ENSCATG00000018446 ENSCATG00000038847 OR52K1 (ENSCATG00000015044) TRIM21 (ENSCATG00000030899) OR52B4 (ENSCATG00000032503) ENSCATG00000035679 ##22 RRM1 (ENSCATG00000035182) STIM1 (ENSCATG00000013784) ENSCATG00000014698 PGAP2 (ENSCATG00000034622) NUP98 (ENSCATG00000033581) CHRNA10 (ENSCATG00000038975) ART1 (ENSCATG00000020846) ART5 (ENSCATG00000044955) ENSCATG00000043589 ENSCATG00000043505 RNF121 (ENSCATG00000039465) IL18BP (ENSCATG00000036233) NUMA1 (ENSCATG00000044445) LAMTOR1 (ENSCATG00000045256) TOMT (ENSCATG00000043251) Drill MODERN SPECIES 1114 ENSMLEG00000036708 ##22 RRM1 (ENSMLEG00000042859) STIM1 (ENSMLEG00000032366) ENSMLEG00000008168 PGAP2 (ENSMLEG00000038507) NUP98 (ENSMLEG00000043563) CHRNA10 (ENSMLEG00000019278) ART1 (ENSMLEG00000030716) ART5 (ENSMLEG00000008190) ENSMLEG00000034998 ENSMLEG00000039461 RNF121 (ENSMLEG00000043299) IL18BP (ENSMLEG00000032241) NUMA1 (ENSMLEG00000029680) LAMTOR1 (ENSMLEG00000037079) TOMT (ENSMLEG00000037107) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.a.b ##22 Capuchin MODERN SPECIES 354 ENSCCAG00000021084 ENSCCAG00000027679 ADGRG7 (ENSCCAG00000029521) TMEM45A (ENSCCAG00000037862) LNP1 (ENSCCAG00000030879) TOMM70 (ENSCCAG00000032264) NIT2 (ENSCCAG00000029927) TBC1D23 (ENSCCAG00000022989) ENSCCAG00000024603 FILIP1L (ENSCCAG00000025103) CMSS1 (ENSCCAG00000034685) COL8A1 (ENSCCAG00000018156) DCBLD2 (ENSCCAG00000012943) ST3GAL6 (ENSCCAG00000033953) ENSCCAG00000003554 ENSCCAG00000022346 ##22 CPOX (ENSCCAG00000021341) ENSCCAG00000034984 OR5K4 (ENSCCAG00000033707) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.b ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000156451 ENSGT00940000155997 ENSGT00940000157572 ENSGT00940000158409 ENSGT00940000156127 ENSGT00390000016717.j.a ENSGT00940000157200 ENSGT00390000005378 ENSGT00950000182999.b.a.a ENSGT00390000006066 ENSGT00940000158804 ENSGT00390000003219 ENSGT00940000157941.k.b ENSGT00940000158155 ENSGT00950000182956.b.b.a.b ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.b ##22 ENSGT00940000158225 ENSGT00940000155867 ENSGT00440000033504.B ENSGT00940000156857 ENSGT00940000155180.b ENSGT00390000013224 ENSGT00940000160821 ENSGT00940000157821 ENSGT00390000010229 ENSGT00940000153414.A ENSGT00940000159401 ENSGT00940000162469 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a Cebidae ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000156451 ENSGT00940000155997 ENSGT00940000157572 ENSGT00940000158409 ENSGT00940000156127 ENSGT00390000016717.j.a ENSGT00940000157200 ENSGT00390000005378 ENSGT00950000182999.b.a.a ENSGT00390000006066 ENSGT00940000158804 ENSGT00390000003219 ENSGT00940000157941.k.b ENSGT00940000158155 ENSGT00950000182956.b.b.a.b ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.b ##22 ENSGT00940000158225 ENSGT00940000155867 ENSGT00440000033504.B ENSGT00940000156857 ENSGT00940000155180.b ENSGT00390000013224 ENSGT00940000160821 ENSGT00940000157821 ENSGT00390000010229 ENSGT00940000153414.A ENSGT00940000159401 ENSGT00940000162469 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 94 ENSGT00940000157200 ENSGT00390000005378 ENSGT00950000182999.b.a.a ENSGT00390000006066 ENSGT00940000158804 ENSGT00390000003219 ENSGT00940000157941.k.b ENSGT00940000158155 ENSGT00950000182956.b.b.a.b ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.b.b ##22 ENSGT00940000158225 ENSGT00940000155867 ENSGT00440000033504.B ENSGT00940000156857 ENSGT00940000155180.b ENSGT00390000013224 ENSGT00940000160821 ENSGT00940000157821 ENSGT00390000010229 ENSGT00940000153414.A ENSGT00940000159401 ENSGT00940000162469 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 ENSGT00390000007725.A.a Bolivian squirrel monkey DUPLICATION Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 197 FKBP4 (ENSSBOG00000030928) ITFG2 (ENSSBOG00000021331) NRIP2 (ENSSBOG00000021076) TEX52 (ENSSBOG00000026810) FOXM1 (ENSSBOG00000026585) TULP3 (ENSSBOG00000027404) TEAD4 (ENSSBOG00000025602) ENSSBOG00000019593 ##22 TSPAN9 (ENSSBOG00000000277) PRMT8 (ENSSBOG00000027867) CRACR2A (ENSSBOG00000024718) ENSSBOG00000031519 PARP11 (ENSSBOG00000032202) CCND2 (ENSSBOG00000022163) TIGAR (ENSSBOG00000035082) FGF23 (ENSSBOG00000027393) FGF6 (ENSSBOG00000024969) C12orf4 (ENSSBOG00000030014) RAD51AP1 (ENSSBOG00000031364) DYRK4 (ENSSBOG00000022376) ENSSBOG00000023354 KCNA6 (ENSSBOG00000012723) KCNA1 (ENSSBOG00000036388) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 123 THOC3 (ENSSBOG00000022663) SIMC1 (ENSSBOG00000025281) KIAA1191 (ENSSBOG00000026134) ARL10 (ENSSBOG00000031819) ENSSBOG00000022208 ENSSBOG00000025283 CLTB (ENSSBOG00000029379) ENSSBOG00000028310 FAF2 (ENSSBOG00000035526) RNF44 (ENSSBOG00000028138) CDHR2 (ENSSBOG00000028213) GPRIN1 (ENSSBOG00000004419) SNCB (ENSSBOG00000014341) EIF4E1B (ENSSBOG00000030710) TSPAN17 (ENSSBOG00000017848) ENSSBOG00000020696 ##22 UNC5A (ENSSBOG00000020718) HK3 (ENSSBOG00000033767) ENSSBOG00000028026 UIMC1 (ENSSBOG00000035332) ZNF346 (ENSSBOG00000034067) FGFR4 (ENSSBOG00000024525) ENSSBOG00000026004 NSD1 (ENSSBOG00000032022) RAB24 (ENSSBOG00000025992) ENSSBOG00000001085 MXD3 (ENSSBOG00000024598) LMAN2 (ENSSBOG00000023284) RGS14 (ENSSBOG00000032330) SLC34A1 (ENSSBOG00000033597) F12 (ENSSBOG00000023238) Mas night monkey MODERN SPECIES 349 ENSANAG00000034432 NUP160 (ENSANAG00000025545) PTPRJ (ENSANAG00000028493) OR4X2 (ENSANAG00000009838) OR4C3 (ENSANAG00000006729) ENSANAG00000018347 FKBP4 (ENSANAG00000032425) ITFG2 (ENSANAG00000035866) NRIP2 (ENSANAG00000033901) TEX52 (ENSANAG00000020158) FOXM1 (ENSANAG00000035342) RHNO1 (ENSANAG00000037023) ENSANAG00000028446 TULP3 (ENSANAG00000027783) TEAD4 (ENSANAG00000036426) ENSANAG00000035753 ##22 TSPAN9 (ENSANAG00000031807) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 Bonobo MODERN SPECIES 16 COLQ (ENSPPAG00000031635) EAF1 (ENSPPAG00000039271) METTL6 (ENSPPAG00000039377) SH3BP5 (ENSPPAG00000038360) CAPN7 (ENSPPAG00000032807) RBSN (ENSPPAG00000038220) MRPS25 (ENSPPAG00000039324) NR2C2 (ENSPPAG00000023138) ENSPPAG00000042214 FGD5 (ENSPPAG00000025764) C3orf20 (ENSPPAG00000041311) CCDC174 (ENSPPAG00000038422) ENSPPAG00000033481 GRIP2 (ENSPPAG00000041847) SLC6A6 (ENSPPAG00000042007) ENSPPAG00000036305 ##22 LSM3 (ENSPPAG00000034074) XPC (ENSPPAG00000043453) TMEM43 (ENSPPAG00000000804) CHCHD4 (ENSPPAG00000032925) WNT7A (ENSPPAG00000030187) FBLN2 (ENSPPAG00000015671) HDAC11 (ENSPPAG00000037567) NUP210 (ENSPPAG00000037715) ENSPPAG00000028546 IQSEC1 (ENSPPAG00000036448) RPL32 (ENSPPAG00000008188) CAND2 (ENSPPAG00000004317) ENSPPAG00000036413 TMEM40 (ENSPPAG00000019163) ENSPPAG00000024005 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 988 ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 ENSGT00940000163696.a.a Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 70 ENSRROG00000002298 ##22 CYP2C8 (ENSRROG00000041111) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2602 ENSRROG00000032766 ##22 Black snub-nosed monkey DUPLICATION Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1016 CYP2C9 (ENSRBIG00000030824) ENSRBIG00000028008 ##22 CYP2C8 (ENSRBIG00000038387) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 426 TLR4 (ENSRBIG00000026429) ENSRBIG00000029433 ENSRBIG00000000050 ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177.j #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.ab.b #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 ENSGT00440000037499.m #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000154875.k.b ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200.y #26 ENSGT00940000154268.f.l ENSGT00950000182974.a.a.b #27 ENSGT00390000013467 #28 ENSGT00390000004029 #29 ENSGT00940000159784 #30 ENSGT00940000160656 #31 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #32 ENSGT00940000156068 #33 ENSGT00940000162679 #34 ENSGT00940000156386 #35 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177.j #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.ab.b #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 ENSGT00440000037499.m #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000154875.k.b ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200.y #26 ENSGT00940000154268.f.l ENSGT00950000182974.a.a.b #27 ENSGT00390000013467 #28 ENSGT00390000004029 #29 ENSGT00940000159784 #30 ENSGT00940000160656 #31 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #32 ENSGT00940000156068 #33 ENSGT00940000162679 #34 ENSGT00940000156386 #35 Macaca ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177.j #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 ENSGT00440000037499.m #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000154875.k.b ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200.y #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #27 ENSGT00390000013467 #28 ENSGT00390000004029 #29 ENSGT00940000159784 #30 ENSGT00940000160656 #31 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #32 ENSGT00940000156068 #33 ENSGT00940000162679 #34 ENSGT00940000156386 #35 ENSGT00390000013108 #36 Pig-tailed macaque DUPLICATION Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 449 CYP2C8 (ENSMNEG00000011295) ENSMNEG00000028049 ##22 CYP2C93 (ENSMNEG00000000870) ENSMNEG00000004860 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 383 CATSPER3 (ENSMNEG00000025685) PCBD2 (ENSMNEG00000035154) #7 TXNDC15 (ENSMNEG00000035748) #8 C5orf24 (ENSMNEG00000041574) #9 DDX46 (ENSMNEG00000029903) #10 CAMLG (ENSMNEG00000038227) #11 SEC24A (ENSMNEG00000044861) #12 SAR1B (ENSMNEG00000045379) #13 JADE2 (ENSMNEG00000031371) #14 CDKN2AIPNL (ENSMNEG00000042298) #15 UBE2B (ENSMNEG00000034858) #16 CDKL3 (ENSMNEG00000032037) #17 PPP2CA (ENSMNEG00000043537) #18 ENSMNEG00000032488 ##20 TCF7 (ENSMNEG00000044025) #21 ENSMNEG00000016613 ##22 C5orf15 (ENSMNEG00000041375) #23 FSTL4 (ENSMNEG00000039940) #24 ENSMNEG00000042952 HSPA4 (ENSMNEG00000030298) #25 ZCCHC10 (ENSMNEG00000039054) #26 AFF4 (ENSMNEG00000033381) #27 LEAP2 (ENSMNEG00000031057) #28 UQCRQ (ENSMNEG00000041577) #29 GDF9 (ENSMNEG00000036613) #30 SHROOM1 (ENSMNEG00000038716) #31 SOWAHA (ENSMNEG00000006710) #32 SEPTIN8 (ENSMNEG00000043687) #33 CCNI2 (ENSMNEG00000041733) #34 KIF3A (ENSMNEG00000029565) #35 IL4 (ENSMNEG00000033953) #36 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154518.a ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177.j #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00690000102286.a.b.k.b.d.a.a.a.a ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 ENSGT00440000037499.m #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200.y #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #27 ENSGT00390000013467 #28 ENSGT00390000004029 #29 ENSGT00940000159784 #30 ENSGT00940000160656 #31 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #32 ENSGT00940000156068 #33 ENSGT00940000162679 #34 ENSGT00940000156386 #35 ENSGT00390000013108 #36 ENSGT00390000003225 #37 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 19 ENSMFAG00000018870 CEP55 (ENSMFAG00000041263) FFAR4 (ENSMFAG00000042176) RBP4 (ENSMFAG00000042546) PDE6C (ENSMFAG00000045757) FRA10AC1 (ENSMFAG00000045302) LGI1 (ENSMFAG00000037131) SLC35G1 (ENSMFAG00000039807) PLCE1 (ENSMFAG00000020572) NOC3L (ENSMFAG00000032429) HELLS (ENSMFAG00000044053) CYP2C18 (ENSMFAG00000058429) H2AZ1 (ENSMFAG00000001222) CYP2C9 (ENSMFAG00000005983) CYP2C8 (ENSMFAG00000034299) ENSMFAG00000041843 ##22 CYP2C93 (ENSMFAG00000032581) ENSMFAG00000055400 PDLIM1 (ENSMFAG00000030298) SORBS1 (ENSMFAG00000030641) ENSMFAG00000050945 ALDH18A1 (ENSMFAG00000001272) TCTN3 (ENSMFAG00000001575) CC2D2B (ENSMFAG00000038060) ENSMFAG00000045985 CCNJ (ENSMFAG00000037933) BLNK (ENSMFAG00000043139) DNTT (ENSMFAG00000034600) OPALIN (ENSMFAG00000043114) TLL2 (ENSMFAG00000002794) TM9SF3 (ENSMFAG00000002926) Rhesus DUPLICATION Rhesus MODERN SPECIES 16 PCBD2 (ENSMMUG00000058022) #7 TXNDC15 (ENSMMUG00000063014) #8 C6H5orf24 (ENSMMUG00000004013) #9 DDX46 (ENSMMUG00000012463) #10 CAMLG (ENSMMUG00000056880) #11 SEC24A (ENSMMUG00000004418) #12 SAR1B (ENSMMUG00000004417) #13 JADE2 (ENSMMUG00000000358) #14 CDKN2AIPNL (ENSMMUG00000058096) #15 ENSMMUG00000053384 UBE2B (ENSMMUG00000016641) #16 ENSMMUG00000052256 ENSMMUG00000052915 SKP1 (ENSMMUG00000013047) #18 TCF7 (ENSMMUG00000022788) #21 VDAC1 (ENSMMUG00000016235) ##22 C6H5orf15 (ENSMMUG00000042266) #23 FSTL4 (ENSMMUG00000003062) #24 ENSMMUG00000052685 HSPA4 (ENSMMUG00000009396) #25 ENSMMUG00000053208 ZCCHC10 (ENSMMUG00000056688) #26 AFF4 (ENSMMUG00000015640) #27 LEAP2 (ENSMMUG00000015638) #28 UQCRQ (ENSMMUG00000051941) #29 GDF9 (ENSMMUG00000060221) #30 SHROOM1 (ENSMMUG00000010312) #31 SOWAHA (ENSMMUG00000039781) #32 SEPTIN8 (ENSMMUG00000010309) #33 CCNI2 (ENSMMUG00000010308) #34 KIF3A (ENSMMUG00000010313) #35 Rhesus MODERN SPECIES 19 RBP4 (ENSMMUG00000014711) PDE6C (ENSMMUG00000014713) FRA10AC1 (ENSMMUG00000014715) LGI1 (ENSMMUG00000001825) ENSMMUG00000056291 SLC35G1 (ENSMMUG00000045531) PLCE1 (ENSMMUG00000001608) NOC3L (ENSMMUG00000001619) TBC1D12 (ENSMMUG00000055733) ENSMMUG00000040417 HELLS (ENSMMUG00000017255) ENSMMUG00000056966 CYP2C18 (ENSMMUG00000018330) CYP2C19 (ENSMMUG00000015542) CYP2C93 (ENSMMUG00000045340) ENSMMUG00000043867 ##22 ENSMMUG00000050068 CYP2C76 (ENSMMUG00000000124) PDLIM1 (ENSMMUG00000000454) SORBS1 (ENSMMUG00000004818) ALDH18A1 (ENSMMUG00000003102) TCTN3 (ENSMMUG00000003103) ENTPD1 (ENSMMUG00000022658) ENSMMUG00000050466 ENSMMUG00000059564 ENSMMUG00000030513 ENSMMUG00000016687 CCNJ (ENSMMUG00000016689) ZNF518A (ENSMMUG00000001518) BLNK (ENSMMUG00000008687) DNTT (ENSMMUG00000022496) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00510000047961 ENSGT01070000253744.a.a.a.a ENSGT00510000047107.A ENSGT00940000157825 ENSGT00390000017833 ENSGT00940000159793 ENSGT00940000153249.a ENSGT00940000157356 ENSGT00390000008540 ENSGT00930000151314 ENSGT00940000156410 ENSGT00740000115593 ENSGT00940000162913.f ENSGT00940000163209.a.a.a ENSGT00940000163696.a.b ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 ENSGT00940000163696.a.a ENSGT00940000163696.b ENSGT00940000162654.b.a ENSGT00940000155525.m ENSGT00940000158658 ENSGT00500000044903 ENSGT00570000079101.a.a ENSGT01100000263542.C ENSGT00940000156590 ENSGT00940000156981 ENSGT00940000162006 ENSGT00940000155715 ENSGT00940000158584 ENSGT00390000009395 ENSGT00940000160572 Olive baboon MODERN SPECIES 2 FFAR4 (ENSPANG00000021536) PDE6C (ENSPANG00000021540) FRA10AC1 (ENSPANG00000021541) LGI1 (ENSPANG00000021532) SLC35G1 (ENSPANG00000021516) PLCE1 (ENSPANG00000021518) NOC3L (ENSPANG00000021522) ENSPANG00000031350 TBC1D12 (ENSPANG00000021525) HELLS (ENSPANG00000033528) ENSPANG00000039619 ENSPANG00000037209 ENSPANG00000046687 ENSPANG00000021527 ENSPANG00000030497 CYP2C8 (ENSPANG00000021476) ##22 ENSPANG00000031836 CYP2C8 (ENSPANG00000016602) CYP2C76v2 (ENSPANG00000021950) PDLIM1 (ENSPANG00000021477) SORBS1 (ENSPANG00000021480) ALDH18A1 (ENSPANG00000021474) TCTN3 (ENSPANG00000021457) ENSPANG00000039768 ENTPD1 (ENSPANG00000021459) CC2D2B 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Sooty mangabey DUPLICATION Sooty mangabey MODERN SPECIES 485 ENSCATG00000031296 ##22 CYP2C8 (ENSCATG00000022282) CYP2C93 (ENSCATG00000033029) Sooty mangabey MODERN SPECIES 309 CATSPER3 (ENSCATG00000044756) PCBD2 (ENSCATG00000029213) #7 TXNDC15 (ENSCATG00000033445) #8 C5orf24 (ENSCATG00000025473) #9 DDX46 (ENSCATG00000040891) #10 CAMLG (ENSCATG00000044060) #11 SEC24A (ENSCATG00000039411) #12 SAR1B (ENSCATG00000022601) #13 JADE2 (ENSCATG00000032327) #14 CDKN2AIPNL (ENSCATG00000024426) #15 UBE2B (ENSCATG00000032151) #16 CDKL3 (ENSCATG00000039822) #17 PPP2CA (ENSCATG00000039567) #18 SKP1 (ENSCATG00000041858) #20 TCF7 (ENSCATG00000044135) #21 ENSCATG00000031466 ##22 C5orf15 (ENSCATG00000044895) #23 FSTL4 (ENSCATG00000044275) #24 ENSCATG00000031695 HSPA4 (ENSCATG00000042105) #25 ZCCHC10 (ENSCATG00000041405) #26 AFF4 (ENSCATG00000044510) #27 LEAP2 (ENSCATG00000042054) #28 UQCRQ (ENSCATG00000038607) #29 GDF9 (ENSCATG00000039023) #30 SHROOM1 (ENSCATG00000031031) #31 SEPTIN8 (ENSCATG00000032903) 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Monkey MODERN SPECIES 15 PITX1 (ENSCSAG00000013399) CATSPER3 (ENSCSAG00000013421) PCBD2 (ENSCSAG00000013439) #7 TXNDC15 (ENSCSAG00000013446) #8 ENSCSAG00000013451 #9 CAMLG (ENSCSAG00000013460) #11 SEC24A (ENSCSAG00000013554) #12 SAR1B (ENSCSAG00000013578) #13 JADE2 (ENSCSAG00000013584) #14 CDKN2AIPNL (ENSCSAG00000013589) #15 UBE2B (ENSCSAG00000013595) #16 CDKL3 (ENSCSAG00000013620) #17 PPP2CA (ENSCSAG00000013631) #18 ENSCSAG00000013640 ##20 TCF7 (ENSCSAG00000013646) #21 VDAC1 (ENSCSAG00000013649) ##22 C5orf15 (ENSCSAG00000013652) #23 FSTL4 (ENSCSAG00000013659) #24 HSPA4 (ENSCSAG00000013669) #25 ZCCHC10 (ENSCSAG00000013673) #26 AFF4 (ENSCSAG00000013682) #27 LEAP2 (ENSCSAG00000013689) #28 UQCRQ (ENSCSAG00000013694) #29 GDF9 (ENSCSAG00000013696) #30 SHROOM1 (ENSCSAG00000013700) #31 SOWAHA (ENSCSAG00000000503) #32 SEPTIN8 (ENSCSAG00000013705) #33 CCNI2 (ENSCSAG00000013715) #34 KIF3A (ENSCSAG00000013749) #35 IL4 (ENSCSAG00000013765) #36 IL13 (ENSCSAG00000013781) #37 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 Marmoset DUPLICATION Marmoset MODERN SPECIES 11 ZNF354C (ENSCJAG00000086065) ZNF879 (ENSCJAG00000018904) GRM6 (ENSCJAG00000018865) ZNF454 (ENSCJAG00000018857) ZNF354B (ENSCJAG00000018848) MGAT1 (ENSCJAG00000046208) ZFP62 (ENSCJAG00000018839) BTNL9 (ENSCJAG00000018803) RACK1 (ENSCJAG00000018752) TRIM41 (ENSCJAG00000018733) TRIM7 (ENSCJAG00000018704) ENSCJAG00000066969 PPP2CA (ENSCJAG00000045966) #18 ENSCJAG00000067181 #20 TCF7 (ENSCJAG00000013603) #21 ENSCJAG00000013556 ##22 C5orf15 (ENSCJAG00000013543) #23 FSTL4 (ENSCJAG00000013506) #24 HSPA4 (ENSCJAG00000013384) #25 ENSCJAG00000013378 ZCCHC10 (ENSCJAG00000047052) #26 AFF4 (ENSCJAG00000013322) #27 LEAP2 (ENSCJAG00000046560) #28 UQCRQ (ENSCJAG00000080204) #29 GDF9 (ENSCJAG00000013297) #30 SHROOM1 (ENSCJAG00000013275) #31 SOWAHA (ENSCJAG00000013269) #32 SEPTIN8 (ENSCJAG00000013225) #33 CCNI2 (ENSCJAG00000013222) #34 KIF3A (ENSCJAG00000013116) #35 IL4 (ENSCJAG00000013083) #36 Marmoset MODERN SPECIES 2 SMCO4 (ENSCJAG00000045722) CEP295 (ENSCJAG00000003748) TAF1D (ENSCJAG00000003782) ENSCJAG00000084182 MED17 (ENSCJAG00000003839) VSTM5 (ENSCJAG00000003861) HEPHL1 (ENSCJAG00000003906) PANX1 (ENSCJAG00000003952) IZUMO1R (ENSCJAG00000003960) GPR83 (ENSCJAG00000003972) MRE11 (ENSCJAG00000003984) ANKRD49 (ENSCJAG00000083691) C11orf97 (ENSCJAG00000087393) FUT4 (ENSCJAG00000074794) PIWIL4 (ENSCJAG00000004075) ENSCJAG00000065220 ##22 ENSCJAG00000070716 AMOTL1 (ENSCJAG00000004124) CWC15 (ENSCJAG00000040352) KDM4D (ENSCJAG00000023319) ENSCJAG00000072491 ENDOD1 (ENSCJAG00000039825) ENSCJAG00000004220 FAM76B (ENSCJAG00000040122) CEP57 (ENSCJAG00000004281) MTMR2 (ENSCJAG00000004327) MAML2 (ENSCJAG00000004359) CCDC82 (ENSCJAG00000004365) JRKL (ENSCJAG00000043270) ENSCJAG00000069774 ENSCJAG00000074166 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.tb ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 115 BTLA 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Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159222 ENSGT00940000154735 ENSGT00550000074939 ENSGT00940000153203.A.a ENSGT00940000158603 ENSGT00940000164277 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #27 ENSGT00390000013467 #28 ENSGT00390000004029 #29 ENSGT00940000159784 #30 ENSGT00940000160656 #31 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #32 ENSGT00940000156068 #33 ENSGT00940000156386 #35 ENSGT00390000013108 #36 ENSGT00390000003225 #37 ENSGT00390000018781.hb Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 17 Lamp5 (ENSPEMG00000024012) Plcb4 (ENSPEMG00000021051) Plcb1 (ENSPEMG00000023485) Tmx4 (ENSPEMG00000013286) Hao1 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#14 ENSJJAG00000010594 #16 ENSJJAG00000000547 #17 ENSJJAG00000007493 #18 ENSJJAG00000024213 ##20 Tcf7 (ENSJJAG00000000476) #21 Vdac1 (ENSJJAG00000018371) #22 ENSJJAG00000021209 #23 ENSJJAG00000005383 Fstl4 (ENSJJAG00000010445) #24 ENSJJAG00000013880 Hspa4 (ENSJJAG00000023896) #25 Aff4 (ENSJJAG00000000912) #27 Leap2 (ENSJJAG00000000464) #28 Uqcrq (ENSJJAG00000011956) #29 Gdf9 (ENSJJAG00000009480) #30 Shroom1 (ENSJJAG00000019891) #31 Septin8 (ENSJJAG00000022205) #33 Kif3a (ENSJJAG00000023717) #35 ENSJJAG00000012514 Il13 (ENSJJAG00000000582) #37 ENSJJAG00000019622 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 48 ENSJJAG00000012290 Ccdc152 (ENSJJAG00000020346) Ghr (ENSJJAG00000018825) Fbxo4 (ENSJJAG00000021644) ENSJJAG00000021693 ENSJJAG00000004330 Plcxd3 (ENSJJAG00000023898) ENSJJAG00000020132 C6 (ENSJJAG00000008024) Mroh2b (ENSJJAG00000024133) Card6 (ENSJJAG00000023358) ENSJJAG00000014290 Prkaa1 (ENSJJAG00000021671) ENSJJAG00000007891 Ptger4 (ENSJJAG00000023417) ENSJJAG00000011581 #22 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mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 22 ENSHGLG00000006028 ENSHGLG00000048389 STAT1 (ENSHGLG00000003617) STAT4 (ENSHGLG00000003160) MYO1B (ENSHGLG00000001644) NABP1 (ENSHGLG00000039589) ENSHGLG00000038831 TMEFF2 (ENSHGLG00000014352) ENSHGLG00000012392 ENSHGLG00000040475 ENSHGLG00000011282 ENSHGLG00000045287 DNAH7 (ENSHGLG00000002797) STK17B (ENSHGLG00000035702) ENSHGLG00000036485 ENSHGLG00000033429 #22 HECW2 (ENSHGLG00000003406) ENSHGLG00000043744 ENSHGLG00000003131 GTF3C3 (ENSHGLG00000002660) ENSHGLG00000045797 ENSHGLG00000039301 ENSHGLG00000044287 ITGAV (ENSHGLG00000019530) ENSHGLG00000013039 ENSHGLG00000018884 ENSHGLG00000032621 CALCRL (ENSHGLG00000037977) TFPI (ENSHGLG00000002403) ENSHGLG00000004085 ENSHGLG00000001839 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 23 ENSHGLG00000033423 ATOX1 (ENSHGLG00000015116) SPARC (ENSHGLG00000016693) ENSHGLG00000015818 ENSHGLG00000041388 ENSHGLG00000045552 ENSHGLG00000016500 #12 SAR1B (ENSHGLG00000047696) #13 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ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #27 ENSGT00390000013467 #28 ENSGT00390000004029.k.a #29 ENSGT00940000159784 #30 ENSGT00940000160656 #31 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #32 ENSGT00940000156068 #33 ENSGT00940000162679 #34 ENSGT00940000156386 #35 ENSGT00390000013108 #36 ENSGT00390000003225 #37 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 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(ENSBBBG00000019016) #25 ZCCHC10 (ENSBBBG00000018984) #26 AFF4 (ENSBBBG00000007509) #27 LEAP2 (ENSBBBG00000018954) #28 UQCRQ (ENSBBBG00000004808) #29 GDF9 (ENSBBBG00000018948) #30 SHROOM1 (ENSBBBG00000004801) #31 BTBD2 (ENSBBBG00000004795) CSNK1G2 (ENSBBBG00000018897) SCAMP4 (ENSBBBG00000018882) ADAT3 (ENSBBBG00000018851) ABHD17A (ENSBBBG00000018838) ENSBBBG00000004740 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.b.nc.b #22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 1 MANEA (ENSOARG00020013232) PCDH20 (ENSOARG00020013301) ENSOARG00020003059 TDRD3 (ENSOARG00020003168) DIAPH3 (ENSOARG00020003805) ENSOARG00020004829 ENSOARG00020004846 ENSOARG00020004852 ENSOARG00020004868 PCDH17 (ENSOARG00020004877) VDAC1 (ENSOARG00020004891) #22 ENSOARG00020004908 OLFM4 (ENSOARG00020004943) PCDH8 (ENSOARG00020004982) CNMD (ENSOARG00020005002) SUGT1 (ENSOARG00020005060) ELF1 (ENSOARG00020005153) ENSOARG00020005207 WBP4 (ENSOARG00020005228) KBTBD6 (ENSOARG00020005273) KBTBD7 (ENSOARG00020005282) MTRF1 (ENSOARG00020005295) NAA16 (ENSOARG00020005343) RGCC (ENSOARG00020005649) VWA8 (ENSOARG00020005673) DGKH (ENSOARG00020005790) Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.oc #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #27 ENSGT00390000013467 #28 ENSGT00390000004029 #29 ENSGT00940000159784 #30 ENSGT00940000160656 #31 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #32 ENSGT00940000159179 ENSGT00940000156470 ENSGT00940000162150 ENSGT00390000010706 ENSGT00940000155854 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.oc #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067.c #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #27 ENSGT00390000013467 #28 ENSGT00390000004029 #29 ENSGT00940000159784 #30 ENSGT00940000160656 #31 ENSGT00390000018299.cb ENSGT00940000159179 ENSGT00940000156470 ENSGT00390000010706 ENSGT00940000162150 ENSGT00940000155854 Goat MODERN SPECIES 26 PCBD2 (ENSCHIG00000023788) #7 TXNDC15 (ENSCHIG00000010236) #8 ENSCHIG00000016073 C5orf24 (ENSCHIG00000012125) #9 DDX46 (ENSCHIG00000026009) #10 CAMLG (ENSCHIG00000005820) #11 SEC24A (ENSCHIG00000024982) #12 SAR1B (ENSCHIG00000022509) #13 JADE2 (ENSCHIG00000012699) #14 CDKN2AIPNL (ENSCHIG00000027126) #15 UBE2B (ENSCHIG00000017701) #16 CDKL3 (ENSCHIG00000008858) #17 PPP2CA (ENSCHIG00000023636) #18 ENSCHIG00000015329 ##20 TCF7 (ENSCHIG00000027172) #21 VDAC1 (ENSCHIG00000024204) #22 C5orf15 (ENSCHIG00000020905) #23 FSTL4 (ENSCHIG00000023121) #24 ENSCHIG00000009256 #25 ZCCHC10 (ENSCHIG00000021529) #26 AFF4 (ENSCHIG00000015153) #27 LEAP2 (ENSCHIG00000006437) #28 UQCRQ (ENSCHIG00000017488) #29 GDF9 (ENSCHIG00000008167) #30 SHROOM1 (ENSCHIG00000018420) #31 ENSCHIG00000023876 ENSCHIG00000010758 BTBD2 (ENSCHIG00000025498) CSNK1G2 (ENSCHIG00000012053) SCAMP4 (ENSCHIG00000026658) ABHD17A (ENSCHIG00000017282) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.oc #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #27 ENSGT00390000013467 #28 ENSGT00390000004029 #29 ENSGT00940000159784 #30 ENSGT00940000160656 #31 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #32 ENSGT00940000159179 ENSGT00940000156470 ENSGT00940000162150 ENSGT00390000010706 ENSGT00940000155854 Bos ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.oc #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #27 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ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #32 ENSGT00940000156068 #33 ENSGT00940000162679 #34 ENSGT00940000156386 #35 ENSGT00390000013108 #36 ENSGT00390000003225 #37 Chacoan peccary MODERN SPECIES 204 PCBD2 (ENSCWAG00000001617) #7 TXNDC15 (ENSCWAG00000001604) #8 C5orf24 (ENSCWAG00000001594) #9 ENSCWAG00000001585 DDX46 (ENSCWAG00000001555) #10 CAMLG (ENSCWAG00000001526) #11 SEC24A (ENSCWAG00000001484) #12 SAR1B (ENSCWAG00000001466) #13 JADE2 (ENSCWAG00000001373) #14 CDKN2AIPNL (ENSCWAG00000001332) #15 UBE2B (ENSCWAG00000001325) #16 CDKL3 (ENSCWAG00000001280) #17 PPP2CA (ENSCWAG00000001252) #18 SKP1 (ENSCWAG00000001228) ##20 TCF7 (ENSCWAG00000000966) #21 VDAC1 (ENSCWAG00000000911) #22 C5orf15 (ENSCWAG00000000899) #23 ENSCWAG00000000888 FSTL4 (ENSCWAG00000000828) #24 HSPA4 (ENSCWAG00000000776) #25 ZCCHC10 (ENSCWAG00000000742) #26 AFF4 (ENSCWAG00000000699) #27 LEAP2 (ENSCWAG00000000679) #28 UQCRQ (ENSCWAG00000000670) #29 GDF9 (ENSCWAG00000000656) #30 SHROOM1 (ENSCWAG00000000622) #31 SOWAHA 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ENSGT00390000013108 #36 ENSGT00390000003225 #37 leopard MODERN SPECIES 89 CATSPER3 (ENSPPRG00000012747) PCBD2 (ENSPPRG00000012520) #7 TXNDC15 (ENSPPRG00000011247) #8 C5orf24 (ENSPPRG00000010838) #9 DDX46 (ENSPPRG00000010743) #10 CAMLG (ENSPPRG00000009315) #11 SEC24A (ENSPPRG00000009141) #12 SAR1B (ENSPPRG00000008356) #13 JADE2 (ENSPPRG00000008224) #14 CDKN2AIPNL (ENSPPRG00000006924) #15 UBE2B (ENSPPRG00000006222) #16 CDKL3 (ENSPPRG00000005837) #17 PPP2CA (ENSPPRG00000003724) #18 ENSPPRG00000003239 ##20 TCF7 (ENSPPRG00000002477) #21 VDAC1 (ENSPPRG00000001701) #22 C5orf15 (ENSPPRG00000001464) #23 FSTL4 (ENSPPRG00000001292) #24 HSPA4 (ENSPPRG00000000423) #25 ZCCHC10 (ENSPPRG00000017677) #26 AFF4 (ENSPPRG00000016213) #27 LEAP2 (ENSPPRG00000014622) #28 UQCRQ (ENSPPRG00000014061) #29 GDF9 (ENSPPRG00000013905) #30 SHROOM1 (ENSPPRG00000013762) #31 SEPTIN8 (ENSPPRG00000012732) #33 CCNI2 (ENSPPRG00000011839) #34 KIF3A (ENSPPRG00000011609) #35 ENSPPRG00000008759 #36 IL13 (ENSPPRG00000008703) #37 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ENSGT00390000012652.ab.b.u.b #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #27 ENSGT00390000013467 #28 ENSGT00390000004029 #29 ENSGT00940000159784 #30 ENSGT00940000160656 #31 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #32 ENSGT00940000156068 #33 ENSGT00940000162679 #34 ENSGT00940000156386 #35 ENSGT00390000013108 #36 ENSGT00390000003225 #37 Microbat MODERN SPECIES 965 PITX1 (ENSMLUG00000012646) CATSPER3 (ENSMLUG00000012640) PCBD2 (ENSMLUG00000012638) #7 TXNDC15 (ENSMLUG00000012632) #8 C5orf24 (ENSMLUG00000012625) #9 DDX46 (ENSMLUG00000012607) #10 SEC24A (ENSMLUG00000013536) #12 SAR1B (ENSMLUG00000016342) #13 JADE2 (ENSMLUG00000016330) #14 CDKN2AIPNL (ENSMLUG00000012917) #15 UBE2B (ENSMLUG00000012910) #16 CDKL3 (ENSMLUG00000012902) #17 PPP2CA (ENSMLUG00000016854) #18 ENSMLUG00000022919 #20 TCF7 (ENSMLUG00000006530) #21 VDAC1 (ENSMLUG00000012467) #22 C5orf15 (ENSMLUG00000012463) #23 ENSMLUG00000027411 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 16 PITX1 (ENSRFEG00010005915) CATSPER3 (ENSRFEG00010005873) TXNDC15 (ENSRFEG00010005814) #8 C5orf24 (ENSRFEG00010005786) #9 DDX46 (ENSRFEG00010019716) #10 CAMLG (ENSRFEG00010019647) #11 ENSRFEG00010019614 SAR1B (ENSRFEG00010019572) #13 JADE2 (ENSRFEG00010019310) #14 CDKN2AIPNL (ENSRFEG00010019255) #15 UBE2B (ENSRFEG00010019234) #16 CDKL3 (ENSRFEG00010019192) #17 PPP2CA (ENSRFEG00010019120) #18 ENSRFEG00010018983 #20 TCF7 (ENSRFEG00010018892) #21 VDAC1 (ENSRFEG00010018814) #22 FSTL4 (ENSRFEG00010018753) #24 HSPA4 (ENSRFEG00010018704) #25 ZCCHC10 (ENSRFEG00010018635) #26 AFF4 (ENSRFEG00010018556) #27 LEAP2 (ENSRFEG00010018515) #28 ENSRFEG00010018482 #29 GDF9 (ENSRFEG00010018441) #30 SHROOM1 (ENSRFEG00010018370) #31 SOWAHA (ENSRFEG00010018320) #32 SEPTIN8 (ENSRFEG00010018002) #33 KIF3A (ENSRFEG00010017681) #35 ENSRFEG00010017322 #36 IL13 (ENSRFEG00010017200) #37 RAD50 (ENSRFEG00010017143) IL5 (ENSRFEG00010017063) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00390000012652.ab.a ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #27 ENSGT00390000013467 #28 ENSGT00390000004029 #29 ENSGT00940000159784 #30 ENSGT00940000160656 #31 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #32 ENSGT00940000156068 #33 ENSGT00940000162679 #34 ENSGT00940000156386 #35 ENSGT00390000013108 #36 ENSGT00390000003225 #37 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000154518.a ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT01090000260575 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000156067 #25 ENSGT00730000111200 #26 ENSGT00950000182974.a.a.b #27 ENSGT00390000013467 #28 ENSGT00390000004029 #29 ENSGT00940000159784 #30 ENSGT00940000160656 #31 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #32 ENSGT00940000156068 #33 ENSGT00940000162679 #34 ENSGT00940000156386 #35 ENSGT00940000156288 ENSGT00390000018781 Sloth MODERN SPECIES 1303 VDAC1 (ENSCHOG00000005631) #22 C5orf15 (ENSCHOG00000005627) #23 Armadillo MODERN SPECIES 3458 PITX1 (ENSDNOG00000034587) CATSPER3 (ENSDNOG00000012508) PCBD2 (ENSDNOG00000044959) #7 TXNDC15 (ENSDNOG00000017904) #8 C5orf24 (ENSDNOG00000034721) #9 DDX46 (ENSDNOG00000011448) #10 CAMLG (ENSDNOG00000017271) #11 ENSDNOG00000013795 SAR1B (ENSDNOG00000044440) #13 JADE2 (ENSDNOG00000045101) #14 CDKN2AIPNL (ENSDNOG00000044441) #15 UBE2B (ENSDNOG00000015719) #16 PPP2CA (ENSDNOG00000013011) #18 ENSDNOG00000012999 ##20 TCF7 (ENSDNOG00000012979) #21 VDAC1 (ENSDNOG00000045241) #22 ENSDNOG00000023901 #23 ENSDNOG00000035042 ENSDNOG00000017743 #24 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.ab.b #20 ENSGT00390000012652.ab.a ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 Tenrec MODERN SPECIES 1514 ENSETEG00000016337 #22 ENSETEG00000016335 #23 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00390000012652.ab.a ##20 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.ab.b #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 Hyrax MODERN SPECIES 7250 VDAC1 (ENSPCAG00000010064) #22 Elephant MODERN SPECIES 2 CATSPER3 (ENSLAFG00000008372) PCBD2 (ENSLAFG00000008369) #7 TXNDC15 (ENSLAFG00000008364) #8 C5orf24 (ENSLAFG00000010469) #9 DDX46 (ENSLAFG00000010465) #10 CAMLG (ENSLAFG00000005101) #11 SEC24A (ENSLAFG00000005093) #12 SAR1B (ENSLAFG00000001021) #13 JADE2 (ENSLAFG00000001018) #14 CDKN2AIPNL (ENSLAFG00000011476) #15 UBE2B (ENSLAFG00000021714) #16 CDKL3 (ENSLAFG00000011468) #17 PPP2CA (ENSLAFG00000016840) #18 ENSLAFG00000016832 #20 TCF7 (ENSLAFG00000016828) #21 VDAC1 (ENSLAFG00000028818) #22 C5orf15 (ENSLAFG00000015697) #23 KCNN2 (ENSLAFG00000010788) TRIM36 (ENSLAFG00000003749) PGGT1B (ENSLAFG00000003752) CCDC112 (ENSLAFG00000003761) FEM1C (ENSLAFG00000005712) TMED7 (ENSLAFG00000032184) CDO1 (ENSLAFG00000015304) ATG12 (ENSLAFG00000015307) ENSLAFG00000015311 LVRN (ENSLAFG00000002068) ARL14EPL (ENSLAFG00000032735) COMMD10 (ENSLAFG00000011885) ENSLAFG00000027553 SEMA6A (ENSLAFG00000004387) Marsupialia DUPLICATION Marsupialia DUPLICATION Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580.q.a #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00390000012652.ab.b #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.bd.a #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00390000016270 ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT01010000222666 ENSGT00940000159536 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ENSGT00940000156580.q.a #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.bd.a #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT00940000158652 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000154155 ENSGT00940000156288 ENSGT00390000016991 ENSGT00390000018781 ENSGT00390000003225 #37 ENSGT00940000156386 #35 ENSGT00940000156068.a #33 koala MODERN SPECIES 41 TIFAB (ENSPCIG00000015898) ENSPCIG00000015900 PITX1 (ENSPCIG00000006623) CATSPER3 (ENSPCIG00000009633) TXNDC15 (ENSPCIG00000009213) #8 DDX46 (ENSPCIG00000009215) #10 CAMLG (ENSPCIG00000032820) #11 SEC24A (ENSPCIG00000014097) #12 SAR1B (ENSPCIG00000014092) #13 JADE2 (ENSPCIG00000014090) #14 CDKN2AIPNL (ENSPCIG00000034137) #15 ENSPCIG00000021861 #16 CDKL3 (ENSPCIG00000021862) #17 SKP1 (ENSPCIG00000021864) #20 ENSPCIG00000021868 #21 ENSPCIG00000027455 #22 C5orf15 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ENSGT00940000162679 #34 ENSGT00940000156068 #33 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.ab.b #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00960000189568 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00390000016270 ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000154155 ENSGT00940000156288 ENSGT00390000018781 ENSGT00390000013108 #36 ENSGT00940000156386 #35 ENSGT00940000162679 #34 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 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ENSPMJG00000014459 #36 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00390000016270 ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000154155 ENSGT00940000156288 ENSGT00390000018781 ENSGT00940000156386 #35 ENSGT00940000162679 #34 ENSGT00940000156068 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #32 tuatara MODERN SPECIES 1050 CATSPER3 (ENSSPUG00000008855) PCBD2 (ENSSPUG00000008886) #7 TXNDC15 (ENSSPUG00000008895) #8 C5orf24 (ENSSPUG00000008904) #9 DDX46 (ENSSPUG00000008985) #10 CAMLG (ENSSPUG00000009378) #11 SEC24A (ENSSPUG00000009401) #12 SAR1B (ENSSPUG00000009441) #13 JADE2 (ENSSPUG00000009471) #14 ENSSPUG00000009508 #15 UBE2B (ENSSPUG00000009524) #16 CDKL3 (ENSSPUG00000009556) #17 PPP2CA (ENSSPUG00000009588) #18 SKP1 (ENSSPUG00000009612) #20 TCF7 (ENSSPUG00000009678) #21 VDAC1 (ENSSPUG00000009700) #22 C5orf15 (ENSSPUG00000009711) #23 FSTL4 (ENSSPUG00000009735) #24 RAPGEF6 (ENSSPUG00000009821) FNIP1 (ENSSPUG00000009950) ENSSPUG00000009971 P4HA2 (ENSSPUG00000009999) PDLIM4 (ENSSPUG00000010030) ENSSPUG00000010053 ENSSPUG00000010078 IRF1 (ENSSPUG00000010109) RAD50 (ENSSPUG00000010141) Episquamata ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00390000016270 ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000154155 ENSGT00940000156288 ENSGT00390000018781 ENSGT00940000156386 #35 ENSGT00940000162679 #34 ENSGT00940000156068 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #32 Laterata ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00390000016270 ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000154155 ENSGT00940000156288 ENSGT00390000018781 ENSGT00940000156386 #35 ENSGT00940000162679 #34 ENSGT00940000156068 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #32 Argentine black and white tegu DUPLICATION Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 1 CATSPER3 (ENSSMRG00000017557) PCBD2 (ENSSMRG00000017579) #7 TXNDC15 (ENSSMRG00000017580) #8 C5orf24 (ENSSMRG00000017582) #9 DDX46 (ENSSMRG00000017584) #10 CAMLG (ENSSMRG00000017636) #11 SEC24A (ENSSMRG00000017637) #12 ENSSMRG00000017681 JADE2 (ENSSMRG00000017697) #14 CDKN2AIPNL (ENSSMRG00000017700) #15 UBE2B (ENSSMRG00000017701) #16 CDKL3 (ENSSMRG00000017704) #17 PPP2CA (ENSSMRG00000017705) #18 SKP1 (ENSSMRG00000017706) #20 TCF7 (ENSSMRG00000017715) #21 ENSSMRG00000017719 #22 C5orf15 (ENSSMRG00000017720) #23 FSTL4 (ENSSMRG00000017828) #24 RAPGEF6 (ENSSMRG00000017857) FNIP1 (ENSSMRG00000017871) ENSSMRG00000017872 P4HA2 (ENSSMRG00000017880) PDLIM4 (ENSSMRG00000017888) ENSSMRG00000017889 ENSSMRG00000017894 IRF1 (ENSSMRG00000017896) ENSSMRG00000017900 RAD50 (ENSSMRG00000017931) KIF3A (ENSSMRG00000017937) #35 CCNI2 (ENSSMRG00000017941) #34 SEPTIN8 (ENSSMRG00000017956) #33 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 3 RGS6 (ENSSMRG00000009910) DPF3 (ENSSMRG00000009927) ENSSMRG00000009934 ZFYVE1 (ENSSMRG00000009939) RBM25 (ENSSMRG00000009944) PSEN1 (ENSSMRG00000009951) PAPLN (ENSSMRG00000009970) NUMB (ENSSMRG00000009974) RIOX1 (ENSSMRG00000009976) ENSSMRG00000009978 ENSSMRG00000009990 ENSSMRG00000010006 DNAL1 (ENSSMRG00000010008) MIDEAS (ENSSMRG00000010009) PTGR2 (ENSSMRG00000010011) ENSSMRG00000010014 #22 TMEM62 (ENSSMRG00000010019) UBR1 (ENSSMRG00000010028) ENSSMRG00000010037 TTBK2 (ENSSMRG00000010040) ENSSMRG00000010043 ENSSMRG00000010047 ENSSMRG00000010050 ENSSMRG00000010058 HAUS2 (ENSSMRG00000010059) LRRC57 (ENSSMRG00000010060) SNAP23 (ENSSMRG00000010062) ZNF106 (ENSSMRG00000010063) ENSSMRG00000010068 ENSSMRG00000010071 ENSSMRG00000010072 Common wall lizard MODERN SPECIES 10 PCBD2 (ENSPMRG00000012115) #7 TXNDC15 (ENSPMRG00000012113) #8 C5orf24 (ENSPMRG00000012110) #9 DDX46 (ENSPMRG00000012038) #10 ENSPMRG00000012023 #11 SEC24A (ENSPMRG00000011870) #12 ENSPMRG00000011845 ENSPMRG00000011842 #14 ENSPMRG00000011840 #14 CDKN2AIPNL (ENSPMRG00000011837) #15 UBE2B (ENSPMRG00000011833) #16 CDKL3 (ENSPMRG00000011826) #17 PPP2CA (ENSPMRG00000011825) #18 ENSPMRG00000011819 ##20 TCF7 (ENSPMRG00000011809) #21 VDAC1 (ENSPMRG00000011804) #22 ENSPMRG00000011800 FSTL4 (ENSPMRG00000011789) #24 ENSPMRG00000011786 ENSPMRG00000011718 FNIP1 (ENSPMRG00000011671) ENSPMRG00000011627 ENSPMRG00000011609 ENSPMRG00000011608 P4HA2 (ENSPMRG00000011605) PDLIM4 (ENSPMRG00000011601) ENSPMRG00000011600 ENSPMRG00000011597 ENSPMRG00000011592 ENSPMRG00000011587 ENSPMRG00000011573 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000160154 #13 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000154155 ENSGT00940000156288 ENSGT00390000018781 ENSGT00940000156386 #35 ENSGT00940000162679 #34 ENSGT00940000156068 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #32 ENSGT00940000160656 #31 Lizard MODERN SPECIES 1 ENSACAG00000037593 nabp1 (ENSACAG00000024010) CAVIN2 (ENSACAG00000006746) TMEFF2 (ENSACAG00000006747) ENSACAG00000043962 ENSACAG00000025255 ENSACAG00000040804 ENSACAG00000034575 ENSACAG00000035795 CDKN2AIPNL (ENSACAG00000039648) #15 UBE2B (ENSACAG00000002551) #16 CDKL3 (ENSACAG00000002557) #17 PPP2CA (ENSACAG00000002653) #18 SKP1 (ENSACAG00000002723) ##20 TCF7 (ENSACAG00000002732) #21 VDAC1 (ENSACAG00000002795) #22 ENSACAG00000043938 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ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #32 ENSGT00940000160656 #31 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570.d #14 ENSGT00940000158570.c #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652.bb ##20 ENSGT00940000159831.a #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000157695 ENSGT00940000159536 ENSGT00940000154155.vb.a ENSGT00940000154155.wb ENSGT00940000156288 ENSGT00390000018781.cb ENSGT00940000156386 #35 ENSGT00940000162679 #34 ENSGT00940000156068 #33 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #32 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889 #9 ENSGT00940000157753 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#20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000156288.a ENSGT00940000167667 ENSGT00940000163251.a.a ENSGT00940000163251.a.b.a ENSGT00940000159536 ENSGT00940000157695 ENSGT00390000018781 ENSGT00940000156386 #35 ENSGT00940000160880 ENSGT00510000046929.b Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889.b #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a #18 ENSGT00390000012652 #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000156288.a ENSGT00940000167667 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#18 ENSGT00390000012652 #20 ENSGT00940000159831.c #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.b #22 ENSGT00440000037499.c.b #23 ENSGT00940000158076.b #24 ENSGT00940000158124.h ENSGT00940000156288.a.h ENSGT00940000163251.a.b.b P. kingsleyae MODERN SPECIES 173 ENSPKIG00000017020 ENSPKIG00000017031 cnot8 (ENSPKIG00000017056) SAP30L (ENSPKIG00000017077) LARP1 (ENSPKIG00000017153) ENSPKIG00000017256 #7 pitx1 (ENSPKIG00000017277) C5orf24 (ENSPKIG00000017304) #9 camlg (ENSPKIG00000017319) #11 sar1b (ENSPKIG00000017353) ENSPKIG00000017398 #14 JADE2 (ENSPKIG00000017427) #14 ppp2cab (ENSPKIG00000017467) #18 SKP1 (ENSPKIG00000017512) #20 TCF7 (ENSPKIG00000017560) #21 VDAC1 (ENSPKIG00000017617) #22 C5orf15 (ENSPKIG00000017660) #23 ENSPKIG00000017717 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889.b #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 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ENSGT00950000182974.a.a.b.k #27 ENSGT00940000160656.e #31 ENSGT00940000156068.i.e.b #33 ENSGT00940000162679.e #34 ENSGT00940000158972.f ENSGT00940000157904.b.a ENSGT00940000158388.a.a.d ENSGT00530000063000.a.b.a.a ENSGT00940000160883.a.a ENSGT01060000248564.b.a.b.b.b.b.a Common carp reference DUPLICATION Common carp reference MODERN SPECIES 38 ENSCCRG00000066284 stk10 (ENSCCRG00000003209) STK32A (ENSCCRG00000043759) dpysl3 (ENSCCRG00000045890) JAKMIP2 (ENSCCRG00000011879) p4ha2 (ENSCCRG00000043501) ENSCCRG00000002237 ENSCCRG00000035025 ENSCCRG00000053206 JADE2 (ENSCCRG00000073401) #14 ube2b (ENSCCRG00000015221) #16 ppp2cab (ENSCCRG00000039662) #18 skp1 (ENSCCRG00000064752) #20 ENSCCRG00000057535 tcf7 (ENSCCRG00000077972) #21 vdac1 (ENSCCRG00000024251) #22 C5orf15 (ENSCCRG00000024235) #23 FSTL4 (ENSCCRG00000006295) #24 ENSCCRG00000024417 hspa4a (ENSCCRG00000014659) #25 ENSCCRG00000075879 AFF4 (ENSCCRG00000080218) #27 ENSCCRG00000014620 #31 septin8a (ENSCCRG00000014799) #33 CCNI2 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(ENSSGRG00000043724) #24 ENSSGRG00000043728 RAPGEF6 (ENSSGRG00000043759) fnip1 (ENSSGRG00000044808) hspa4a (ENSSGRG00000044813) #25 ENSSGRG00000044816 #25 zcchc10 (ENSSGRG00000044818) #26 Zebrafish MODERN SPECIES 13 ENSDARG00000101021 irf1b (ENSDARG00000043249) ENSDARG00000099648 ENSDARG00000113657 fnip1 (ENSDARG00000102171) ENSDARG00000102926 ENSDARG00000105104 JADE2 (ENSDARG00000053389) #14 cdkn2aipnl (ENSDARG00000053395) #15 ube2b (ENSDARG00000026035) #16 ppp2cab (ENSDARG00000053404) #18 skp1 (ENSDARG00000003151) #20 tcf7 (ENSDARG00000038672) #21 ENSDARG00000086612 ENSDARG00000096305 vdac1 (ENSDARG00000045132) #22 ENSDARG00000090747 #23 RAPGEF6 (ENSDARG00000010945) fstl4 (ENSDARG00000044319) #24 rnf121 (ENSDARG00000060282) kif4 (ENSDARG00000005462) ammecr1 (ENSDARG00000012892) spry4 (ENSDARG00000068732) TMEM164 (ENSDARG00000113609) fundc2 (ENSDARG00000103740) cmc4 (ENSDARG00000100774) BRCC3 (ENSDARG00000098242) zgc:136410 (ENSDARG00000102241) ENSDARG00000090883 fgf1b (ENSDARG00000042811) ENSDARG00000019713 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00530000063529.B ENSGT00940000153902.b.a ENSGT00940000162717 ENSGT00940000159316 ENSGT00390000014785 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a.mb #18 ENSGT00390000012652 #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000156288.a ENSGT00940000167667 ENSGT00940000163251.a.b.b ENSGT00940000163251.a.a ENSGT00940000163251.a.b.a ENSGT00940000159536 ENSGT00940000157695 ENSGT00940000163827.a.a.a.b ENSGT00940000153713.B.d ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a Atlantic herring MODERN SPECIES 24 asb12a (ENSCHAG00000023243) mtmr8 (ENSCHAG00000023277) shisa2a (ENSCHAG00000023350) zc4h2 (ENSCHAG00000023355) ZC3H12B (ENSCHAG00000023376) camlg (ENSCHAG00000023398) #11 SEC24A (ENSCHAG00000023429) #12 sar1b (ENSCHAG00000023826) JADE2 (ENSCHAG00000023829) #14 cdkn2aipnl (ENSCHAG00000023831) #15 ube2b (ENSCHAG00000023837) #16 CDKL3 (ENSCHAG00000023901) #17 ppp2cab (ENSCHAG00000023911) #18 SKP1 (ENSCHAG00000023916) #20 tcf7 (ENSCHAG00000023937) #21 vdac1 (ENSCHAG00000023980) #22 C5orf15 (ENSCHAG00000024136) #23 fstl4 (ENSCHAG00000024157) #24 ENSCHAG00000024712 RAPGEF6 (ENSCHAG00000024774) fnip1 (ENSCHAG00000025673) ENSCHAG00000025735 irf1b (ENSCHAG00000026167) ENSCHAG00000026170 slc22a21 (ENSCHAG00000026195) ENSCHAG00000026198 ENSCHAG00000026205 POLQ (ENSCHAG00000026216) birc2 (ENSCHAG00000026319) cfap300 (ENSCHAG00000026330) ANGPTL5 (ENSCHAG00000026333) Denticle herring MODERN SPECIES 16 mtmr8 (ENSDCDG00000032582) shisa2a (ENSDCDG00000032575) zc4h2 (ENSDCDG00000032573) ZC3H12B (ENSDCDG00000032570) las1l (ENSDCDG00000032558) camlg (ENSDCDG00000032551) #11 psmb1 (ENSDCDG00000032550) SEC24A (ENSDCDG00000031648) #12 sar1b (ENSDCDG00000031601) JADE2 (ENSDCDG00000031595) #14 cdkn2aipnl (ENSDCDG00000031591) #15 ube2b (ENSDCDG00000031585) #16 ppp2cab (ENSDCDG00000031579) #18 skp1 (ENSDCDG00000031573) #20 tcf7 (ENSDCDG00000031561) #21 vdac1 (ENSDCDG00000031475) #22 C5orf15 (ENSDCDG00000031470) #23 fstl4 (ENSDCDG00000031127) #24 RAPGEF6 (ENSDCDG00000029508) ENSDCDG00000019947 irf1b (ENSDCDG00000019773) slc22a4 (ENSDCDG00000019767) ENSDCDG00000019764 slc22a21 (ENSDCDG00000019762) ENSDCDG00000019758 pdlim4 (ENSDCDG00000019753) p4ha2 (ENSDCDG00000019606) ENSDCDG00000019586 JAKMIP2 (ENSDCDG00000019515) dpysl3 (ENSDCDG00000014412) STK32A (ENSDCDG00000025036) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT00390000014889.b #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a.mb #18 ENSGT00550000074618.a.a.lb.b #18 ENSGT00390000012652 #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00980000202263 ENSGT00940000156288.a ENSGT00940000167667 ENSGT00940000163251.a.b.b ENSGT00940000163251.a.a ENSGT00940000163251.a.b.a ENSGT00940000159536 ENSGT00940000157695 ENSGT00940000163827.a.a.a.b ENSGT00940000153713.B.d Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00520000055616.a ENSGT00390000016589.d ENSGT00390000016589.c ENSGT00940000155843 ENSGT00390000013087 ENSGT00950000183068.a.b.c ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a.mb #18 ENSGT00390000012652 #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000156288.a ENSGT00940000167667.c ENSGT00940000163251.a.b.b ENSGT00940000163251.a.a ENSGT00940000163251.a.b.a ENSGT00940000159536 ENSGT00940000157695 ENSGT00940000163827.a.a.a.b ENSGT00940000153713.B.d ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000155156.b.e ENSGT01030000234954 ENSGT00520000055616.a.f ENSGT00390000016589.c ENSGT00940000155843 ENSGT00950000183068.a.b.c.d ENSGT00950000182924.B.a.b.a #12 ENSGT00940000164397.b.d ENSGT00940000158570.m #14 ENSGT00940000157177.a #15 ENSGT00940000156580.d #16 ENSGT00940000161317 #17 ENSGT00550000074618.a.a.mb.b #18 ENSGT00390000012652 #20 ENSGT00940000159831.h #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.e #22 ENSGT00440000037499.f #23 ENSGT00940000158076.e #24 ENSGT00940000158124.f ENSGT00390000009391.b.d ENSGT00940000154508.a.b.f ENSGT00940000156288.a.c ENSGT00940000167667.c.a ENSGT00940000163251.a.b.b ENSGT00940000163251.a.a ENSGT00940000163251.a.b.a ENSGT00940000159536.a 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ENSGT00940000164397.b.d.b ENSGT00940000158570.m #14 ENSGT00940000157177.a #15 ENSGT00940000156580.d #16 ENSGT00940000161317.b #17 ENSGT00550000074618.a.a.mb.b #18 ENSGT00390000012652 #20 ENSGT00940000159831.h #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.e #22 ENSGT00440000037499.f #23 ENSGT00940000158076.e #24 ENSGT00390000016567.m.b ENSGT00940000159201.j ENSGT00550000074815.l ENSGT00390000004254.g ENSGT00940000159280.d ENSGT00940000157706.o ENSGT00390000002768.a.d ENSGT00940000156417.g.a ENSGT00390000005572 ENSGT00940000155320 ENSGT00390000001612.d ENSGT00390000010130 ENSGT00390000005743.g Chinook salmon DUPLICATION Chinook salmon MODERN SPECIES 2926 VASP (ENSOTSG00005031988) dlg2 (ENSOTSG00005031941) ENSOTSG00005031933 CREBZF (ENSOTSG00005031932) ENSOTSG00005031931 picalma (ENSOTSG00005030757) SEC24A (ENSOTSG00005029871) #12 sar1b (ENSOTSG00005029862) JADE2 (ENSOTSG00005029859) #14 cdkn2aipnl (ENSOTSG00005029856) #15 ube2b (ENSOTSG00005029731) #16 CDKL3 (ENSOTSG00005029730) #17 ppp2cab 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picalma (ENSOMYG00000020200) SEC24A (ENSOMYG00000018809) #12 sar1a (ENSOMYG00000018675) ENSOMYG00000067482 JADE2 (ENSOMYG00000018630) #14 cdkn2aipnl (ENSOMYG00000047254) #15 ENSOMYG00000064076 ube2b (ENSOMYG00000047263) #16 CDKL3 (ENSOMYG00000074979) #17 ppp2cab (ENSOMYG00000047240) #18 skp1 (ENSOMYG00000047224) #20 tcf7 (ENSOMYG00000047216) #21 vdac1 (ENSOMYG00000047206) #22 ENSOMYG00000047201 #23 FSTL4 (ENSOMYG00000047192) #24 ENSOMYG00000046969 ENSOMYG00000064543 ENSOMYG00000043214 ENSOMYG00000046742 ENSOMYG00000042793 ENSOMYG00000042773 ENSOMYG00000042757 ENSOMYG00000042745 ENSOMYG00000042736 p4ha2 (ENSOMYG00000041283) JAKMIP2 (ENSOMYG00000041188) dpysl3 (ENSOMYG00000034680) STK32A (ENSOMYG00000034172) Salmo ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156765.a.b.a ENSGT00940000155156.b.e ENSGT00390000016589.c ENSGT00520000055616.a.f ENSGT00940000155843 ENSGT00950000183068.a.b.c.d ENSGT00950000182924.B.a.b.a #12 ENSGT00940000164397.b.d ENSGT00940000158570.m.a #14 ENSGT00940000157177.a #15 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Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01000000220481 ENSGT00940000159359.s.b ENSGT00940000156765.a.b.b ENSGT00940000155156.b.f ENSGT00520000055616.a.e ENSGT00390000016589.d ENSGT00390000013087 ENSGT00950000183068.a.b.c.c ENSGT00950000182924.B.a.b.b #12 ENSGT00940000164397.b.c ENSGT00940000158570.n #14 ENSGT00940000157177.b #15 ENSGT00940000156580.c #16 ENSGT00550000074618.a.a.mb.a #18 ENSGT00940000159831.g #21 ENSGT00950000182869.e.a.b.f #22 ENSGT00440000037499.e #23 ENSGT00940000158076.f #24 ENSGT00940000158124.e ENSGT00390000009391.b.c ENSGT00940000154508.a.b.e ENSGT00940000156288.a.d ENSGT00940000167667.c.b ENSGT00940000159536.b ENSGT00940000157695.o.b ENSGT00940000157695.p ENSGT00940000163827.a.a.a.b ENSGT00940000153713.B.d.l ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a.a ENSGT00940000158185.h.b ENSGT00940000156818.`c.b Chinook salmon DUPLICATION Chinook salmon MODERN SPECIES 33 ENSOTSG00005025321 dlg2 (ENSOTSG00005025392) tmem126a (ENSOTSG00005040520) CREBZF (ENSOTSG00005040522) 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#21 vdac1 (ENSACIG00000013770) #22 C5orf15 (ENSACIG00000013787) #23 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b ENSGT01090000260029.a.a.b.a.a.b ENSGT00390000014889.b #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570.p #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00550000074618.a.a.lb.b #18 ENSGT00390000012652 #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b.d ENSGT01090000260029.a.a.b.a.a.b ENSGT00390000014889.b #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570.p #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00550000074618.a.a.lb.b #18 ENSGT00390000012652 #20 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#24 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1006 tcf7 (ENSSPAG00000019350) #21 vdac1 (ENSSPAG00000019365) #22 C5orf15 (ENSSPAG00000019388) #23 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000007221.a.a #7 ENSGT00390000002845 #8 ENSGT01090000259997.a.d.b.b.b.b.b ENSGT00390000014889.b #9 ENSGT00940000157753 #10 ENSGT00390000015996 #11 ENSGT00950000182924.B.a.b #12 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000180246 ENSGT00940000158570 #14 ENSGT00940000157177 #15 ENSGT00940000156580 #16 ENSGT00550000074618.a.a.lb.b #18 ENSGT00390000012652 #20 ENSGT00940000159831 #21 ENSGT00950000182869.e.a.b #22 ENSGT00440000037499 #23 ENSGT00940000158076 #24 ENSGT00940000158124 ENSGT00390000009391.b ENSGT00940000154508.a.b ENSGT00940000156288.a ENSGT00940000167667 ENSGT00940000163251.a.b.b ENSGT00940000163251.a.a ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h ENSGT00940000159536 ENSGT00940000157695 ENSGT00940000163827.a.a.a.b Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 17 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ENSGT00940000159536 ENSGT00940000157695 ENSGT00940000153713.B.d ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a ENSGT00940000158185 Climbing perch MODERN SPECIES 5 ENSATEG00000013293 ENSATEG00000013139 ENSATEG00000013247 zgc:77058 (ENSATEG00000013098) #9 ddx46 (ENSATEG00000012998) #10 camlg (ENSATEG00000012973) #11 SEC24A (ENSATEG00000012932) #12 sar1b (ENSATEG00000012904) JADE2 (ENSATEG00000012891) #14 cdkn2aipnl (ENSATEG00000012877) #15 ube2b (ENSATEG00000012849) #16 PPP2CA (ENSATEG00000012817) #18 skp1 (ENSATEG00000012791) #20 SKP1 (ENSATEG00000012539) #20 tcf7 (ENSATEG00000012486) #21 vdac1 (ENSATEG00000012447) #22 C5orf15 (ENSATEG00000012441) #23 FSTL4 (ENSATEG00000012386) #24 ENSATEG00000012200 ENSATEG00000012162 ENSATEG00000012077 ENSATEG00000012034 ENSATEG00000011962 ENSATEG00000011923 ENSATEG00000011888 ENSATEG00000011816 ENSATEG00000011775 p4ha2 (ENSATEG00000011722) JAKMIP2 (ENSATEG00000011653) dpysl3 (ENSATEG00000011595) STK32A (ENSATEG00000011554) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 5 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#15 ENSCMIG00000006290 ppp2cab (ENSCMIG00000006272) #18 SKP1 (ENSCMIG00000006268) #20 ENSCMIG00000006266 #21 ENSCMIG00000006265 cyp2u1 (ENSCMIG00000006261) vdac1 (ENSCMIG00000006252) #22 ENSCMIG00000006248 #23 FSTL4 (ENSCMIG00000006230) #24 RAPGEF6 (ENSCMIG00000005650) ENSCMIG00000004631 ENSCMIG00000004338 ENSCMIG00000004323 pdlim4 (ENSCMIG00000004312) ubtd2 (ENSCMIG00000004309) ENSCMIG00000004306 STK10 (ENSCMIG00000003838) SH3PXD2B (ENSCMIG00000003689) neurl1b (ENSCMIG00000003684) Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 200 ENSGT00390000014666.b ENSGT00950000182937.A.a ENSGT00940000158930 ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00940000154418.a.b ENSGT00940000161685.A.b Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00390000011381 ENSGT00940000156697 ENSGT00940000158585 ENSGT00940000171460 ENSGT00390000014666.b ENSGT00950000182937.A.a ENSGT00940000164426 ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT01060000252496 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000165077 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153 ENSGT00930000151028 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000156697 ENSGT00940000158585 ENSGT00910000144159.A.b ENSGT00940000171460 ENSGT00390000014666.b ENSGT00950000182937.A.a ENSGT00940000164426 ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT01060000252496 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00390000011381 ENSGT00940000156697 ENSGT00940000158585 ENSGT00910000144159.A.b ENSGT00390000014666.b ENSGT00950000182937.A.a ENSGT00940000164426 ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT01060000252496 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000170983 ENSGT00600000084626 Amniota ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000166242 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 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ENSACCG00020012374 ENSACCG00020012399 ENSACCG00020012429 BMS1 (ENSACCG00020012450) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000166242.b ENSGT00940000166242.a ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT00940000164426 ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT01060000252496 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000170983 ENSGT00600000084626 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000166242.b ENSGT00940000166242.a ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT00940000164426 ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000170983 ENSGT00600000084626 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000153195.B Pink-footed goose MODERN SPECIES 143 CHCHD1 (ENSABRG00000016659) ENSABRG00000016633 ZSWIM8 (ENSABRG00000015082) NDST2 (ENSABRG00000013828) CAMK2G (ENSABRG00000011360) ENSABRG00000011105 VCL (ENSABRG00000011047) AP3M1 (ENSABRG00000010999) ADK (ENSABRG00000010252) KAT6B (ENSABRG00000010196) DUSP29 (ENSABRG00000010189) DUSP13 (ENSABRG00000010167) ENSABRG00000010156 ENSABRG00000010147 SAMD8 (ENSABRG00000010140) VDAC2 (ENSABRG00000010109) ##22 COMTD1 (ENSABRG00000010101) ZNF503 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ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000158879 ENSGT00940000156635 ENSGT00390000008798.d Turkey MODERN SPECIES 28 FUT11 (ENSMGAG00000006512) CHCHD1 (ENSMGAG00000021620) ENSMGAG00000006507 ZSWIM8 (ENSMGAG00000006483) NDST2 (ENSMGAG00000006432) CAMK2G (ENSMGAG00000006266) ENSMGAG00000006225 VCL (ENSMGAG00000006167) AP3M1 (ENSMGAG00000006136) ADK (ENSMGAG00000006115) KAT6B (ENSMGAG00000006095) DUSP29 (ENSMGAG00000006093) ENSMGAG00000016410 ENSMGAG00000006074 SAMD8 (ENSMGAG00000006065) VDAC2 (ENSMGAG00000006031) ##22 COMTD1 (ENSMGAG00000006025) LRMDA (ENSMGAG00000006023) KCNMA1 (ENSMGAG00000005789) DLG5 (ENSMGAG00000005774) POLR3A (ENSMGAG00000005713) ENSMGAG00000005697 ZMIZ1 (ENSMGAG00000005656) PPIF (ENSMGAG00000005640) ZCCHC24 (ENSMGAG00000021575) NUDT13 (ENSMGAG00000005611) P4HA1 (ENSMGAG00000005554) PLA2G12B (ENSMGAG00000005546) OIT3 (ENSMGAG00000005538) MCU (ENSMGAG00000005532) MICU1 (ENSMGAG00000005487) Chicken MODERN SPECIES 35 ZSWIM8 (ENSGALG00010021182) NDST2 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ENSCPRG00005010040 ANXA11 (ENSCPRG00005010045) Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000166242.b ENSGT00940000166242.a ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT00940000164426 ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000173294 ENSGT00940000165077 ENSGT00940000170983 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000166242.b ENSGT00940000166242.a ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT00940000164426 ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000173294 ENSGT00940000165077 ENSGT00940000170983 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000166242.b ENSGT00940000166242.a ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT00940000164426 ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000165077 ENSGT00940000170983 ENSGT00600000084626 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000000854.c.b ENSGT00390000003133 ENSGT00940000158394 ENSGT00390000014082.b ENSGT00530000063713.a ENSGT00940000157470 ENSGT00940000164426 ENSGT01030000234543.D.b ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372.f ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935.nb ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028.z ENSGT00390000000153.l.b.c.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000165077 ENSGT00940000170983 ENSGT00600000084626 Indian cobra MODERN SPECIES 3 ADO (ENSNNAG00000003138) ZNF365 (ENSNNAG00000003154) RTKN2 (ENSNNAG00000003167) ENSNNAG00000003188 ENSNNAG00000003212 VCL (ENSNNAG00000003234) AP3M1 (ENSNNAG00000003266) ADK (ENSNNAG00000003283) KAT6B (ENSNNAG00000003335) DUSP29 (ENSNNAG00000003367) DUSP13 (ENSNNAG00000003378) ENSNNAG00000003393 ENSNNAG00000003404 ENSNNAG00000003413 SAMD8 (ENSNNAG00000003418) VDAC2 (ENSNNAG00000003426) ##22 COMTD1 (ENSNNAG00000003439) ZNF503 (ENSNNAG00000003465) LRMDA (ENSNNAG00000003484) ENSNNAG00000003502 ENSNNAG00000003512 ENSNNAG00000003532 ENSNNAG00000003543 POLR3A (ENSNNAG00000004144) ENSNNAG00000004306 ZMIZ1 (ENSNNAG00000004412) PPIF (ENSNNAG00000004997) ZCCHC24 (ENSNNAG00000005155) ENSNNAG00000005178 ENSNNAG00000005312 ENSNNAG00000005334 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 141 ENSGT00390000000984 ENSGT00530000063713.a ENSGT00940000157470 ENSGT00940000164426 ENSGT01030000234543.D.b ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372.f ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 70 ENSGT01030000234633.C.a ENSGT00390000000854.c.b ENSGT00390000003133 ENSGT00390000000984 ENSGT00530000063713.a ENSGT00940000157470 ENSGT00940000164426 ENSGT01030000234543.D.b ENSGT00940000158184.l ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372.f ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 Eastern brown snake DUPLICATION Eastern brown snake MODERN SPECIES 427 ENSPTXG00000018095 ##22 ENSPTXG00000018094 Eastern brown snake MODERN SPECIES 426 ENSPTXG00000018093 ##22 ENSPTXG00000018092 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 60 NRBF2 (ENSNSUG00000020077) ZNF365 (ENSNSUG00000020076) ENSNSUG00000020075 ENSNSUG00000020074 VCL (ENSNSUG00000020072) AP3M1 (ENSNSUG00000020071) ADK (ENSNSUG00000020070) ENSNSUG00000020069 ENSNSUG00000020068 DUSP29 (ENSNSUG00000020066) ENSNSUG00000020065 ENSNSUG00000020064 ENSNSUG00000020063 ENSNSUG00000020062 SAMD8 (ENSNSUG00000020061) VDAC2 (ENSNSUG00000020060) ##22 ZNF503 (ENSNSUG00000020059) Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 8579 VDAC2 (ENSLLTG00000012226) ##22 Lizard MODERN SPECIES 810 NDST2 (ENSACAG00000009340) ENSACAG00000045222 CAMK2G (ENSACAG00000009061) ENSACAG00000009046 VCL (ENSACAG00000008935) ENSACAG00000045050 AP3M1 (ENSACAG00000008930) ADK (ENSACAG00000008837) KAT6B (ENSACAG00000008709) dupd1 (ENSACAG00000037610) DUSP13 (ENSACAG00000008666) ENSACAG00000038884 ENSACAG00000041941 ENSACAG00000041631 SAMD8 (ENSACAG00000035735) VDAC2 (ENSACAG00000008559) ##22 COMTD1 (ENSACAG00000045223) ENSACAG00000044090 ENSACAG00000044210 ZNF503 (ENSACAG00000040044) ENSACAG00000035103 ENSACAG00000042912 LRMDA (ENSACAG00000028568) ENSACAG00000039917 ENSACAG00000035654 ENSACAG00000039723 ENSACAG00000040958 ENSACAG00000043778 ENSACAG00000039320 ENSACAG00000036138 ENSACAG00000040803 Laterata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000166242.a ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT00940000164426 ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b.z ENSGT00940000162682.A.a.b.y.a ENSGT00940000162682.A.a.b.y.b ENSGT00940000155540.b.b.e ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000173294 ENSGT00600000084626 ENSGT00940000154537 ENSGT00390000016042.a Common wall lizard MODERN SPECIES 13 NDST2 (ENSPMRG00000001889) CAMK2G (ENSPMRG00000001904) ENSPMRG00000001921 ENSPMRG00000001927 VCL (ENSPMRG00000001955) AP3M1 (ENSPMRG00000002000) ADK (ENSPMRG00000002011) KAT6B (ENSPMRG00000002036) DUSP29 (ENSPMRG00000002065) DUSP13 (ENSPMRG00000002070) ENSPMRG00000002076 ENSPMRG00000002080 ENSPMRG00000002087 ENSPMRG00000002091 SAMD8 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(ENSSMRG00000006724) POLR3A (ENSSMRG00000006755) RPS24 (ENSSMRG00000006802) ENSSMRG00000006826 ZMIZ1 (ENSSMRG00000006858) PPIF (ENSSMRG00000006912) ZCCHC24 (ENSSMRG00000006925) ANXA11 (ENSSMRG00000006928) tuatara MODERN SPECIES 1933 SAMD8 (ENSSPUG00000006031) VDAC2 (ENSSPUG00000006024) ##22 COMTD1 (ENSSPUG00000005920) Mammalia ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT01060000252496 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00600000084626 Platypus MODERN SPECIES 14 ENSOANG00000010541 ##12 FUT11 (ENSOANG00000044777) ENSOANG00000047759 ZSWIM8 (ENSOANG00000047326) NDST2 (ENSOANG00000013314) CAMK2G (ENSOANG00000013313) ENSOANG00000003924 VCL (ENSOANG00000010411) AP3M1 (ENSOANG00000010412) ADK (ENSOANG00000010413) KAT6B (ENSOANG00000005908) DUSP29 (ENSOANG00000031368) ENSOANG00000005909 ENSOANG00000046388 SAMD8 (ENSOANG00000005910) VDAC2 (ENSOANG00000005911) ##22 COMTD1 (ENSOANG00000005912) ZNF503 (ENSOANG00000044200) LRMDA (ENSOANG00000045478) KCNMA1 (ENSOANG00000005169) ENSOANG00000048761 DLG5 (ENSOANG00000001726) POLR3A (ENSOANG00000007013) RPS24 (ENSOANG00000006329) ZMIZ1 (ENSOANG00000005178) PPIF (ENSOANG00000005176) ZCCHC24 (ENSOANG00000045766) ANXA11 (ENSOANG00000005992) ENSOANG00000040840 TMEM254 (ENSOANG00000019840) ENSOANG00000047618 Theria ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT01060000252496 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000165487 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT01060000252496 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Wild yak MODERN SPECIES 355 ENSBMUG00000009918 ENSBMUG00000009928 SLC6A2 (ENSBMUG00000010092) LPCAT2 (ENSBMUG00000010132) MMP2 (ENSBMUG00000010148) IRX6 (ENSBMUG00000010165) IRX5 (ENSBMUG00000010181) IRX3 (ENSBMUG00000010223) FTO (ENSBMUG00000010305) ENSBMUG00000010323 ##22 RPGRIP1L (ENSBMUG00000010431) ENSBMUG00000010496 AKTIP (ENSBMUG00000010517) RBL2 (ENSBMUG00000010579) CHD9 (ENSBMUG00000010701) CHD9NB (ENSBMUG00000010713) Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 Arabian camel MODERN SPECIES 24 CCDC25 (ENSCDRG00005019631) SCARA3 (ENSCDRG00005019603) CLU (ENSCDRG00005019585) ENSCDRG00005019569 EPHX2 (ENSCDRG00005019465) CHRNA2 (ENSCDRG00005019402) PTK2B (ENSCDRG00005019294) TRIM35 (ENSCDRG00005019253) STMN4 (ENSCDRG00005019200) ENSCDRG00005019174 ADRA1A (ENSCDRG00005019146) DPYSL2 (ENSCDRG00005018995) PNMA2 (ENSCDRG00005018959) BNIP3L (ENSCDRG00005018890) PPP2R2A (ENSCDRG00005018721) ENSCDRG00005018693 ##22 EBF2 (ENSCDRG00005018634) CDCA2 (ENSCDRG00005018503) KCTD9 (ENSCDRG00005018455) GNRH1 (ENSCDRG00005018431) DOCK5 (ENSCDRG00005018165) NEFL (ENSCDRG00005018138) ENSCDRG00005018075 ADAM7 (ENSCDRG00005017257) ADAM28 (ENSCDRG00005016471) STC1 (ENSCDRG00005016415) ENSCDRG00005016389 NKX3-1 (ENSCDRG00005016364) SLC25A37 (ENSCDRG00005016317) ENTPD4 (ENSCDRG00005016214) LOXL2 (ENSCDRG00005016177) Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 2239 ENSGT00950000182869.e.a.a.e.a ##22 ENSGT00390000004409 Hedgehog MODERN SPECIES 5990 VDAC2 (ENSEEUG00000008623) ##22 COMTD1 (ENSEEUG00000008657) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b ENSGT00940000154368.k ENSGT00940000156653 Alpaca MODERN SPECIES 2944 ENSVPAG00000010294 ##22 Arabian camel MODERN SPECIES 2 FUT11 (ENSCDRG00005015164) CHCHD1 (ENSCDRG00005015257) ZSWIM8 (ENSCDRG00005015347) NDST2 (ENSCDRG00005016902) CAMK2G (ENSCDRG00005017107) PLAU (ENSCDRG00005017463) VCL (ENSCDRG00005017643) ENSCDRG00005017824 ADK (ENSCDRG00005017927) KAT6B (ENSCDRG00005018083) DUSP29 (ENSCDRG00005018150) ENSCDRG00005018186 SAMD8 (ENSCDRG00005018320) ENSCDRG00005018348 ENSCDRG00005018370 ENSCDRG00005018385 ##22 COMTD1 (ENSCDRG00005018451) ZNF503 (ENSCDRG00005018488) LRMDA (ENSCDRG00005018525) KCNMA1 (ENSCDRG00005019550) DLG5 (ENSCDRG00005022253) ENSCDRG00005022255 ENSCDRG00005022257 RPS24 (ENSCDRG00005022258) PPIF (ENSCDRG00005006732) ZCCHC24 (ENSCDRG00005006751) ANXA11 (ENSCDRG00005006778) ENSCDRG00005006822 TMEM254 (ENSCDRG00005006878) SFTPD (ENSCDRG00005006926) ENSCDRG00005006976 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Wild yak MODERN SPECIES 590 NUAK1 (ENSBMUG00000003355) CKAP4 (ENSBMUG00000003414) TCP11L2 (ENSBMUG00000003454) POLR3B (ENSBMUG00000003546) RFX4 (ENSBMUG00000003646) RIC8B (ENSBMUG00000003725) TMEM263 (ENSBMUG00000003752) MTERF2 (ENSBMUG00000003775) CRY1 (ENSBMUG00000003802) ENSBMUG00000003817 ##22 ABTB3 (ENSBMUG00000003937) PWP1 (ENSBMUG00000004016) PRDM4 (ENSBMUG00000004032) ASCL4 (ENSBMUG00000004047) RTCB (ENSBMUG00000004067) BPIFC (ENSBMUG00000004131) FBXO7 (ENSBMUG00000004148) ENSBMUG00000004203 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 American mink MODERN SPECIES 109 VRK2 (ENSNVIG00000012761) ENSNVIG00000012747 FANCL (ENSNVIG00000012633) BCL11A (ENSNVIG00000012490) PAPOLG (ENSNVIG00000012455) REL (ENSNVIG00000012402) PUS10 (ENSNVIG00000012384) PEX13 (ENSNVIG00000012376) K1841 (ENSNVIG00000012252) C2orf74 (ENSNVIG00000012228) ENSNVIG00000012222 ENSNVIG00000012217 ##22 USP34 (ENSNVIG00000012085) XPO1 (ENSNVIG00000011993) F161A (ENSNVIG00000011983) CCT4 (ENSNVIG00000011941) COMMD1 (ENSNVIG00000011903) ENSNVIG00000011888 TMEM17 (ENSNVIG00000011866) EHBP1 (ENSNVIG00000011813) OTX1 (ENSNVIG00000011785) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 Chimpanzee DUPLICATION Chimpanzee MODERN SPECIES 1 FUT11 (ENSPTRG00000024232) CHCHD1 (ENSPTRG00000002638) ZSWIM8 (ENSPTRG00000034304) NDST2 (ENSPTRG00000002641) CAMK2G (ENSPTRG00000002643) PLAU (ENSPTRG00000002646) ENSPTRG00000041808 VCL (ENSPTRG00000002647) AP3M1 (ENSPTRG00000024118) ADK (ENSPTRG00000002649) ENSPTRG00000047234 KAT6B (ENSPTRG00000002652) DUSP29 (ENSPTRG00000002653) DUSP13 (ENSPTRG00000002655) SAMD8 (ENSPTRG00000002656) ENSPTRG00000050280 ##22 COMTD1 (ENSPTRG00000002658) ZNF503 (ENSPTRG00000029870) LRMDA (ENSPTRG00000002660) KCNMA1 (ENSPTRG00000046743) ENSPTRG00000045968 ENSPTRG00000048458 DLG5 (ENSPTRG00000002663) POLR3A (ENSPTRG00000002664) RPS24 (ENSPTRG00000002666) ZMIZ1 (ENSPTRG00000002668) PPIF (ENSPTRG00000002669) ENSPTRG00000052838 ZCCHC24 (ENSPTRG00000002670) ENSPTRG00000039342 ANXA11 (ENSPTRG00000002680) Chimpanzee MODERN SPECIES 18 TIMD4 (ENSPTRG00000017458) HAVCR1 (ENSPTRG00000017459) HAVCR2 (ENSPTRG00000017461) MED7 (ENSPTRG00000017462) GARIN3 (ENSPTRG00000017463) ITK (ENSPTRG00000017464) CYFIP2 (ENSPTRG00000017465) FNDC9 (ENSPTRG00000041848) NIPAL4 (ENSPTRG00000017469) ADAM19 (ENSPTRG00000017470) SOX30 (ENSPTRG00000017471) C5H5orf52 (ENSPTRG00000017472) THG1L (ENSPTRG00000017473) LSM11 (ENSPTRG00000017474) CLINT1 (ENSPTRG00000052146) ENSPTRG00000028515 ##22 ENSPTRG00000042059 EBF1 (ENSPTRG00000017477) RNF145 (ENSPTRG00000017479) UBLCP1 (ENSPTRG00000017480) IL12B (ENSPTRG00000017481) ADRA1B (ENSPTRG00000017482) TTC1 (ENSPTRG00000017484) PWWP2A (ENSPTRG00000017486) FABP6 (ENSPTRG00000017487) CCNJL (ENSPTRG00000017488) ENSPTRG00000046075 C1QTNF2 (ENSPTRG00000017489) FAM200C (ENSPTRG00000042098) SLU7 (ENSPTRG00000017491) PTTG1 (ENSPTRG00000017492) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT01060000252496 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000154537 ENSGT00940000155748.b Glires ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000165487 ENSGT00940000155748.b ENSGT00940000154368.k ENSGT00940000156653 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b.s Pika MODERN SPECIES 2438 KAT6B (ENSOPRG00000002310) DUSP29 (ENSOPRG00000002366) DUSP13 (ENSOPRG00000002376) SAMD8 (ENSOPRG00000002388) VDAC2 (ENSOPRG00000002415) ##22 COMTD1 (ENSOPRG00000002449) Rabbit MODERN SPECIES 9 CHCHD1 (ENSOCUG00000037036) ZSWIM8 (ENSOCUG00000020924) NDST2 (ENSOCUG00000012569) CAMK2G (ENSOCUG00000012578) ENSOCUG00000030476 PLAU (ENSOCUG00000003155) VCL (ENSOCUG00000003163) AP3M1 (ENSOCUG00000009946) ENSOCUG00000023858 ENSOCUG00000010613 ADK (ENSOCUG00000009950) KAT6B (ENSOCUG00000017344) DUSP29 (ENSOCUG00000026189) ENSOCUG00000009072 SAMD8 (ENSOCUG00000009076) VDAC2 (ENSOCUG00000009082) ##22 COMTD1 (ENSOCUG00000009095) ZNF503 (ENSOCUG00000000028) LRMDA (ENSOCUG00000008123) KCNMA1 (ENSOCUG00000009543) DLG5 (ENSOCUG00000002180) POLR3A (ENSOCUG00000012450) ENSOCUG00000012472 ENSOCUG00000023411 ENSOCUG00000024476 ENSOCUG00000009721 ANXA8 (ENSOCUG00000014189) NPY4R (ENSOCUG00000014188) GPRIN2 (ENSOCUG00000005728) ENSOCUG00000004393 SHLD2 (ENSOCUG00000004390) Rodentia DUPLICATION Rodentia DUPLICATION Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.a ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.a ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 80 ENSJJAG00000017411 Slit3 (ENSJJAG00000018676) Spdl1 (ENSJJAG00000012981) Insyn2b (ENSJJAG00000019989) Dock2 (ENSJJAG00000005958) Iqsec2 (ENSJJAG00000012417) Kdm5c (ENSJJAG00000013385) Tspyl2 (ENSJJAG00000021239) Gpr173 (ENSJJAG00000005573) Maged1 (ENSJJAG00000008793) ENSJJAG00000019689 Gspt2 (ENSJJAG00000000985) Zxdb (ENSJJAG00000014676) Spin4 (ENSJJAG00000008548) Arhgef9 (ENSJJAG00000009447) ENSJJAG00000023059 ##22 Asb12 (ENSJJAG00000024100) Zc4h2 (ENSJJAG00000023338) ENSJJAG00000011514 ENSJJAG00000011017 ENSJJAG00000014273 Zc3h12b (ENSJJAG00000015755) Las1l (ENSJJAG00000015634) ENSJJAG00000007483 ENSJJAG00000009736 Msn (ENSJJAG00000018702) Heph (ENSJJAG00000011624) Eda2r (ENSJJAG00000011031) ENSJJAG00000023290 ENSJJAG00000016187 ENSJJAG00000023447 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.a ##22 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 123 BTBD1 (ENSCLAG00000010092) TM6SF1 (ENSCLAG00000009743) HDGFL3 (ENSCLAG00000007952) BNC1 (ENSCLAG00000008723) SH3GL3 (ENSCLAG00000008885) ADAMTSL3 (ENSCLAG00000012719) SAXO2 (ENSCLAG00000009494) EFL1 (ENSCLAG00000010155) MEX3B (ENSCLAG00000009451) ENSCLAG00000008018 ENSCLAG00000009164 TMC3 (ENSCLAG00000015003) STARD5 (ENSCLAG00000014919) ENSCLAG00000010965 ENSCLAG00000009290 ENSCLAG00000013651 ##22 ENSCLAG00000012189 TLNRD1 (ENSCLAG00000018087) MESD (ENSCLAG00000010925) CEMIP (ENSCLAG00000009458) ABHD17C (ENSCLAG00000008301) ARNT2 (ENSCLAG00000015272) B2M (ENSCLAG00000010453) ENSCLAG00000007186 PATL2 (ENSCLAG00000014407) SPG11 (ENSCLAG00000016540) EIF3J (ENSCLAG00000017286) ENSCLAG00000013359 GOLM2 (ENSCLAG00000010634) FRMD5 (ENSCLAG00000013639) WDR76 (ENSCLAG00000010272) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.b ##22 Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 128 Zdhhc11 (ENSJJAG00000011440) Brd9 (ENSJJAG00000001706) Trip13 (ENSJJAG00000016963) Nkd2 (ENSJJAG00000022067) Slc12a7 (ENSJJAG00000013362) Slc6a19 (ENSJJAG00000013014) Slc6a18 (ENSJJAG00000013974) Tert (ENSJJAG00000015110) Clptm1l (ENSJJAG00000017514) Slc6a3 (ENSJJAG00000018113) Lpcat1 (ENSJJAG00000004764) Mrpl36 (ENSJJAG00000017543) Ndufs6 (ENSJJAG00000018200) Irx4 (ENSJJAG00000000181) Irx2 (ENSJJAG00000010684) ENSJJAG00000012959 ##22 Irx1 (ENSJJAG00000021563) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 88 ENSJJAG00000012384 Myl3 (ENSJJAG00000021882) Pth1r (ENSJJAG00000020640) Ccdc12 (ENSJJAG00000014918) Nbeal2 (ENSJJAG00000018112) Nradd (ENSJJAG00000008456) ENSJJAG00000000233 Setd2 (ENSJJAG00000022758) ENSJJAG00000014043 Kif9 (ENSJJAG00000004798) Klhl18 (ENSJJAG00000022221) Ngp (ENSJJAG00000019896) Ptpn23 (ENSJJAG00000023111) ENSJJAG00000012176 ENSJJAG00000011308 ENSJJAG00000018014 ##22 Cspg5 (ENSJJAG00000011976) ENSJJAG00000022882 ENSJJAG00000009892 ENSJJAG00000023311 ENSJJAG00000010648 ENSJJAG00000013858 Cdc25a (ENSJJAG00000005624) Camp (ENSJJAG00000020763) Nme6 (ENSJJAG00000014892) Plxnb1 (ENSJJAG00000002381) Ccdc51 (ENSJJAG00000020589) ENSJJAG00000019810 ENSJJAG00000018076 ENSJJAG00000019292 ENSJJAG00000014117 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.b ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.b ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.a.b ##22 Degu MODERN SPECIES 110 ADGRG2 (ENSODEG00000004624) ENSODEG00000004242 ENSODEG00000019043 PPEF1 (ENSODEG00000004173) RS1 (ENSODEG00000004135) ENSODEG00000004098 CDKL5 (ENSODEG00000004155) RAI2 (ENSODEG00000004137) NHS (ENSODEG00000003999) REPS2 (ENSODEG00000003800) RBBP7 (ENSODEG00000003570) ENSODEG00000003512 ENSODEG00000006406 S100G (ENSODEG00000006358) CTPS2 (ENSODEG00000006096) ENSODEG00000006049 ##22 ENSODEG00000006035 ENSODEG00000006009 ENSODEG00000005993 GRPR (ENSODEG00000005986) ENSODEG00000005335 ENSODEG00000005316 ZRSR2 (ENSODEG00000004944) CA5B (ENSODEG00000004810) CLTRN (ENSODEG00000004738) ACE2 (ENSODEG00000004540) BMX (ENSODEG00000004424) PIR (ENSODEG00000004376) VEGFD (ENSODEG00000003938) PIGA (ENSODEG00000003813) ASB11 (ENSODEG00000003719) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000165487 ENSGT00940000155748.b ENSGT00940000154368.k ENSGT00940000156653 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00520000058758 ENSGT00940000155748.b Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184.e ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b ENSGT00940000154368.k Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES DNTTIP2 (ENSSVLG00005000490) BCAR3 (ENSSVLG00005000445) ENSSVLG00005000405 FNBP1L (ENSSVLG00005000352) DR1 (ENSSVLG00005000282) CCDC18 (ENSSVLG00005000256) TMED5 (ENSSVLG00005000211) ENSSVLG00005000190 MTF2 (ENSSVLG00005000167) ENSSVLG00005000125 ENSSVLG00005000089 DIPK1A (ENSSVLG00005004374) ENSSVLG00005004298 EVI5 (ENSSVLG00005004175) GFI1 (ENSSVLG00005004132) ENSSVLG00005004104 ##22 RPAP2 (ENSSVLG00005004082) GLMN (ENSSVLG00005004063) C1orf146 (ENSSVLG00005004047) BTBD8 (ENSSVLG00005003975) EPHX4 (ENSSVLG00005003946) BRDT (ENSSVLG00005003821) TGFBR3 (ENSSVLG00005003738) CDC7 (ENSSVLG00005003704) ENSSVLG00005003691 ENSSVLG00005003666 ENSSVLG00005003646 ZNF644 (ENSSVLG00005003587) BARHL2 (ENSSVLG00005003545) ZNF326 (ENSSVLG00005003520) LRRC8D (ENSSVLG00005003504) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 11 PCNX1 (ENSSVLG00005009899) ENSSVLG00005009795 SIPA1L1 (ENSSVLG00005009679) ENSSVLG00005009607 RGS6 (ENSSVLG00005008662) DPF3 (ENSSVLG00005008293) ENSSVLG00005008049 ZFYVE1 (ENSSVLG00005007958) RBM25 (ENSSVLG00005007885) PSEN1 (ENSSVLG00005007728) PAPLN (ENSSVLG00005007348) NUMB (ENSSVLG00005007168) RIOX1 (ENSSVLG00005007089) ENSSVLG00005007042 ENSSVLG00005007000 ENSSVLG00005006975 ##22 ENSSVLG00005006698 ENSSVLG00005006583 ACOT4 (ENSSVLG00005006548) ENSSVLG00005006522 DNAL1 (ENSSVLG00005006438) PNMA1 (ENSSVLG00005006415) MIDEAS (ENSSVLG00005006379) PTGR2 (ENSSVLG00005006327) ZNF410 (ENSSVLG00005006231) FAM161B (ENSSVLG00005006140) COQ6 (ENSSVLG00005006026) ENTPD5 (ENSSVLG00005005845) BBOF1 (ENSSVLG00005005756) ALDH6A1 (ENSSVLG00005005600) ENSSVLG00005005569 Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 17 CHCHD10 (ENSSVLG00005006718) MMP11 (ENSSVLG00005006688) SMARCB1 (ENSSVLG00005006606) DERL3 (ENSSVLG00005006510) SLC2A11 (ENSSVLG00005006380) MIF (ENSSVLG00005006339) ENSSVLG00005006314 ENSSVLG00005006292 GSTT4 (ENSSVLG00005006254) ENSSVLG00005006229 ENSSVLG00005006193 ENSSVLG00005006177 ENSSVLG00005006131 CABIN1 (ENSSVLG00005006001) SUSD2 (ENSSVLG00005005881) ENSSVLG00005005852 ##22 GGT5 (ENSSVLG00005005644) ENSSVLG00005005413 LRRC75B (ENSSVLG00005005370) SNRPD3 (ENSSVLG00005005327) GUCD1 (ENSSVLG00005005243) UPB1 (ENSSVLG00005005173) ADORA2A (ENSSVLG00005005154) SPECC1L (ENSSVLG00005005084) ENSSVLG00005005044 BCR (ENSSVLG00005004988) RAB36 (ENSSVLG00005004911) GNAZ (ENSSVLG00005004858) RSPH14 (ENSSVLG00005004828) ENSSVLG00005004761 ENSSVLG00005004725 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 17 TBC1D10A (ENSSVLG00005007816) CASTOR1 (ENSSVLG00005007779) OSM (ENSSVLG00005007718) LIF (ENSSVLG00005007682) ENSSVLG00005007667 ENSSVLG00005007628 ENSSVLG00005007561 ENSSVLG00005007526 ENSSVLG00005007499 ENSSVLG00005007477 ENSSVLG00005007459 ENSSVLG00005007426 ENSSVLG00005018815 VOPP1 (ENSSVLG00005018733) LANCL2 (ENSSVLG00005018702) ENSSVLG00005018648 ##22 EGFR (ENSSVLG00005018390) ENSSVLG00005018307 VSTM2A (ENSSVLG00005018198) ENSSVLG00005018127 ENSSVLG00005017900 ENSSVLG00005017841 ENSSVLG00005017587 GRB10 (ENSSVLG00005016817) DDC (ENSSVLG00005016201) FIGNL1 (ENSSVLG00005016112) IKZF1 (ENSSVLG00005015695) ENSSVLG00005015574 SPATA48 (ENSSVLG00005015485) ZPBP (ENSSVLG00005015427) VWC2 (ENSSVLG00005015374) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 13 SYNPO2L (ENSSVLG00005014592) SEC24C (ENSSVLG00005014542) FUT11 (ENSSVLG00005014469) CHCHD1 (ENSSVLG00005014409) ZSWIM8 (ENSSVLG00005014326) NDST2 (ENSSVLG00005014248) CAMK2G (ENSSVLG00005013946) PLAU (ENSSVLG00005013500) VCL (ENSSVLG00005013208) AP3M1 (ENSSVLG00005012809) ENSSVLG00005012767 ENSSVLG00005011968 DUSP29 (ENSSVLG00005011302) DUSP13 (ENSSVLG00005011100) SAMD8 (ENSSVLG00005011005) ENSSVLG00005010821 ##22 COMTD1 (ENSSVLG00005010754) ZNF503 (ENSSVLG00005010698) LRMDA (ENSSVLG00005010576) KCNMA1 (ENSSVLG00005007882) ENSSVLG00005006853 ENSSVLG00005006820 ENSSVLG00005006809 ENSSVLG00005006795 DLG5 (ENSSVLG00005006751) POLR3A (ENSSVLG00005006708) ENSSVLG00005006601 ZMIZ1 (ENSSVLG00005006475) ENSSVLG00005006423 ZCCHC24 (ENSSVLG00005006394) ENSSVLG00005006356 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 11 MEF2A (ENSSVLG00005001742) ENSSVLG00005001869 ENSSVLG00005001915 TTC23 (ENSSVLG00005001983) SYNM (ENSSVLG00005002041) IGF1R (ENSSVLG00005002096) ENSSVLG00005002151 ENSSVLG00005002216 NR2F2 (ENSSVLG00005002243) ENSSVLG00005002275 RGMA (ENSSVLG00005002308) CHD2 (ENSSVLG00005002368) FAM174B (ENSSVLG00005002437) ST8SIA2 (ENSSVLG00005002459) SLCO3A1 (ENSSVLG00005002498) ENSSVLG00005002515 ##22 SV2B (ENSSVLG00005002536) ENSSVLG00005002572 ENSSVLG00005002584 AKAP13 (ENSSVLG00005002651) KLHL25 (ENSSVLG00005002784) AGBL1 (ENSSVLG00005002803) NTRK3 (ENSSVLG00005003033) MRPL46 (ENSSVLG00005003446) MRPS11 (ENSSVLG00005003465) DET1 (ENSSVLG00005003477) AEN (ENSSVLG00005003506) ISG20 (ENSSVLG00005003524) ACAN (ENSSVLG00005003652) ENSSVLG00005003827 ABHD2 (ENSSVLG00005003901) Marmotini ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184.e ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184.e ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 Arctic ground squirrel DUPLICATION Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 75 ENSUPAG00010010560 ##12 FUT11 (ENSUPAG00010010553) CHCHD1 (ENSUPAG00010010547) ZSWIM8 (ENSUPAG00010010484) NDST2 (ENSUPAG00010010466) CAMK2G (ENSUPAG00010010199) PLAU (ENSUPAG00010010185) ENSUPAG00010010171 VCL (ENSUPAG00010010108) AP3M1 (ENSUPAG00010010078) ADK (ENSUPAG00010010046) KAT6B (ENSUPAG00010009815) DUSP29 (ENSUPAG00010009810) ENSUPAG00010009693 SAMD8 (ENSUPAG00010009689) ENSUPAG00010009651 ##22 COMTD1 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ENSGT00390000016042 ENSGT00940000156827 ENSGT01100000263524.B.a Guinea pig MODERN SPECIES 15 SYNPO2L (ENSCPOG00000022018) ENSCPOG00000003394 ##12 FUT11 (ENSCPOG00000003400) CHCHD1 (ENSCPOG00000030461) ZSWIM8 (ENSCPOG00000020625) NDST2 (ENSCPOG00000003403) CAMK2G (ENSCPOG00000000914) PLAU (ENSCPOG00000000920) VCL (ENSCPOG00000005058) AP3M1 (ENSCPOG00000005068) ADK (ENSCPOG00000004488) KAT6B (ENSCPOG00000006544) DUSP29 (ENSCPOG00000022980) DUSP13 (ENSCPOG00000006560) SAMD8 (ENSCPOG00000031357) VDAC2 (ENSCPOG00000002752) ##22 COMTD1 (ENSCPOG00000002758) ZNF503 (ENSCPOG00000010319) LRMDA (ENSCPOG00000008454) KCNMA1 (ENSCPOG00000011100) DLG5 (ENSCPOG00000005329) POLR3A (ENSCPOG00000022387) RPS24 (ENSCPOG00000020096) ZMIZ1 (ENSCPOG00000002268) PPIF (ENSCPOG00000013666) ZCCHC24 (ENSCPOG00000026826) ANXA11 (ENSCPOG00000023458) ENSCPOG00000034945 ENSCPOG00000037289 TMEM254 (ENSCPOG00000030137) PTCHD4 (ENSCPOG00000005747) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000156827 ENSGT01100000263524.B.a Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 144 CHCHD1 (ENSCLAG00000012183) ZSWIM8 (ENSCLAG00000011062) NDST2 (ENSCLAG00000010841) CAMK2G (ENSCLAG00000009687) PLAU (ENSCLAG00000010993) VCL (ENSCLAG00000009895) AP3M1 (ENSCLAG00000010102) ADK (ENSCLAG00000011462) KAT6B (ENSCLAG00000012921) DUSP29 (ENSCLAG00000010412) DUSP13 (ENSCLAG00000009900) 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ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000165487 ENSGT00940000155748.b ENSGT00940000154368.k ENSGT00940000156653 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000165487 ENSGT00940000155748.b ENSGT00940000154368.k ENSGT00940000156653 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 64 Fut11 (ENSJJAG00000014414) Chchd1 (ENSJJAG00000001170) Zswim8 (ENSJJAG00000002294) Ndst2 (ENSJJAG00000015732) Camk2g (ENSJJAG00000013441) Plau (ENSJJAG00000022417) Vcl (ENSJJAG00000017784) Ap3m1 (ENSJJAG00000021173) Adk (ENSJJAG00000000489) ENSJJAG00000010577 ENSJJAG00000019180 ENSJJAG00000016757 Dusp29 (ENSJJAG00000012771) Dusp13 (ENSJJAG00000021011) Samd8 (ENSJJAG00000019200) Vdac2 (ENSJJAG00000013813) ##22 Comtd1 (ENSJJAG00000023380) Zfp503 (ENSJJAG00000012451) Lrmda (ENSJJAG00000010771) Kcnma1 (ENSJJAG00000015287) ENSJJAG00000019119 ENSJJAG00000006291 ENSJJAG00000016217 ENSJJAG00000007712 Zmiz1 (ENSJJAG00000016307) Ppif (ENSJJAG00000011851) Zcchc24 (ENSJJAG00000010391) Anxa11 (ENSJJAG00000016249) ENSJJAG00000013392 Tmem254 (ENSJJAG00000024320) Duxbl1 (ENSJJAG00000021637) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00900000143356 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000154537 Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1504 Vcl (ENSNGAG00000004164) Ap3m1 (ENSNGAG00000022117) Adk (ENSNGAG00000008826) ENSNGAG00000000383 Dusp29 (ENSNGAG00000015948) Dusp13 (ENSNGAG00000010931) Samd8 (ENSNGAG00000009450) ENSNGAG00000019006 ##22 Comtd1 (ENSNGAG00000018108) Zfp503 (ENSNGAG00000017468) Lrmda (ENSNGAG00000011225) ENSNGAG00000004000 Kcnma1 (ENSNGAG00000013295) ENSNGAG00000012930 Duxbl1 (ENSNGAG00000007173) Tmem254 (ENSNGAG00000003387) ENSNGAG00000020773 Anxa11 (ENSNGAG00000016721) Zcchc24 (ENSNGAG00000015277) Ppif (ENSNGAG00000010430) Zmiz1 (ENSNGAG00000014318) ENSNGAG00000002316 Rps24 (ENSNGAG00000016361) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1534 Dthd1 (ENSNGAG00000005474) Arap2 (ENSNGAG00000011009) ENSNGAG00000012628 ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01060000248649 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00900000143356 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00520000058758 Murinae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00950000183054.b ENSGT01060000248649 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00900000143356 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00520000058758 Mus ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183054.b ENSGT01060000248649 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 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ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00860000136364 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00520000058758 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000183054.b ENSGT01060000248649 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372.m ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b.j ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00860000136364 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00520000058758 Mus_C ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00950000183054.b ENSGT01060000248649 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372.m ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b.j ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00860000136364 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00520000058758 Steppe mouse MODERN SPECIES 3047 Sec24c (ENSMSIG00000008066) Fut11 (ENSMSIG00000008049) Chchd1 (ENSMSIG00000008020) Zswim8 (ENSMSIG00000007856) Ndst2 (ENSMSIG00000007806) Camk2g (ENSMSIG00000007318) Plau (ENSMSIG00000007288) Vcl (ENSMSIG00000007244) ENSMSIG00000007196 Adk 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MGP_CAROLIEiJ_G0019023 MGP_CAROLIEiJ_G0019024 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b.k ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b.k ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b.k ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3339 Nup54 (ENSMSIG00000019704) Cxcl10 (ENSMSIG00000019679) ENSMSIG00000019590 Cxcl9 (ENSMSIG00000019565) Sdad1 (ENSMSIG00000019448) Naaa (ENSMSIG00000019423) Ppef2 (ENSMSIG00000019374) ENSMSIG00000019344 Uso1 (ENSMSIG00000019049) G3bp2 (ENSMSIG00000018888) Cdkl2 (ENSMSIG00000018828) Odaph (ENSMSIG00000018812) ENSMSIG00000018661 Rchy1 (ENSMSIG00000018588) ENSMSIG00000018579 ENSMSIG00000018571 ##22 Parm1 (ENSMSIG00000018537) Btc (ENSMSIG00000018521) ENSMSIG00000018511 Areg (ENSMSIG00000018486) Ereg (ENSMSIG00000018453) Epgn (ENSMSIG00000018433) Mthfd2l (ENSMSIG00000018395) Cxcl2 (ENSMSIG00000018380) Cxcl1 (ENSMSIG00000018365) Cxcl15 (ENSMSIG00000018349) Cxcl3 (ENSMSIG00000018335) Pf4 (ENSMSIG00000018327) Ppbp (ENSMSIG00000018319) Cxcl5 (ENSMSIG00000018306) Rassf6 (ENSMSIG00000018101) Shrew mouse MODERN SPECIES 21 Synpo2l (MGP_PahariEiJ_G0030008) Sec24c (MGP_PahariEiJ_G0030009) Fut11 (MGP_PahariEiJ_G0030010) Chchd1 (MGP_PahariEiJ_G0030011) Zswim8 (MGP_PahariEiJ_G0030012) Ndst2 (MGP_PahariEiJ_G0030013) Camk2g (MGP_PahariEiJ_G0030014) Plau (MGP_PahariEiJ_G0030015) Vcl (MGP_PahariEiJ_G0030016) Ap3m1 (MGP_PahariEiJ_G0030017) Adk (MGP_PahariEiJ_G0030018) MGP_PahariEiJ_G0030019 Dusp29 (MGP_PahariEiJ_G0030020) Dusp13 (MGP_PahariEiJ_G0030021) Samd8 (MGP_PahariEiJ_G0030022) Vdac2 (MGP_PahariEiJ_G0030023) ##22 Comtd1 (MGP_PahariEiJ_G0030024) Zfp503 (MGP_PahariEiJ_G0030025) Lrmda (MGP_PahariEiJ_G0030026) Kcnma1 (MGP_PahariEiJ_G0030027) Dlg5 (MGP_PahariEiJ_G0030028) Polr3a (MGP_PahariEiJ_G0030029) Rps24 (MGP_PahariEiJ_G0030030) Zmiz1 (MGP_PahariEiJ_G0030031) Ppif (MGP_PahariEiJ_G0030032) Zcchc24 (MGP_PahariEiJ_G0030033) Anxa11 (MGP_PahariEiJ_G0030034) MGP_PahariEiJ_G0030035 MGP_PahariEiJ_G0030036 MGP_PahariEiJ_G0030037 MGP_PahariEiJ_G0030038 Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 6 Synpo2l (ENSRNOG00000008949) Sec24c (ENSRNOG00000009042) Fut11 (ENSRNOG00000009274) Chchd1 (ENSRNOG00000009297) Zswim8 (ENSRNOG00000056617) Ndst2 (ENSRNOG00000057755) Camk2g (ENSRNOG00000009783) Plau (ENSRNOG00000010516) Vcl (ENSRNOG00000010765) Ap3m1 (ENSRNOG00000011461) Adk (ENSRNOG00000012325) Kat6b (ENSRNOG00000012850) Dusp29 (ENSRNOG00000013034) LOC108348213 (ENSRNOG00000060401) Samd8 (ENSRNOG00000064565) Vdac2 (ENSRNOG00000013505) ##22 Comtd1 (ENSRNOG00000013968) Zfp503 (ENSRNOG00000014237) ENSRNOG00000065677 Lrmda (ENSRNOG00000069198) ENSRNOG00000069647 Kcnma1 (ENSRNOG00000005985) Dlg5 (ENSRNOG00000005783) Rat MODERN SPECIES 13 Ns5atp4-ps3 (ENSRNOG00000027533) Lypd6b (ENSRNOG00000004614) Kif5c (ENSRNOG00000004680) Epc2 (ENSRNOG00000029447) Mbd5 (ENSRNOG00000027596) Orc4 (ENSRNOG00000005021) Acvr2a (ENSRNOG00000005334) ENSRNOG00000062624 ENSRNOG00000067798 Zeb2 (ENSRNOG00000004677) Gtdc1 (ENSRNOG00000031038) Arhgap15 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DUPLICATION Tree shrew MODERN SPECIES 3902 ENSTBEG00000002607 PHLDB1 (ENSTBEG00000002143) ARCN1 (ENSTBEG00000002080) ENSTBEG00000001946 ##22 Tree shrew MODERN SPECIES 4956 ENSTBEG00000008773 SAMD8 (ENSTBEG00000009083) ENSTBEG00000009198 ##22 COMTD1 (ENSTBEG00000000737) Primates ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT00390000017469 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00910000147651 ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b ENSGT00940000154368.k Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT00390000017469 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00910000147651 ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b ENSGT00940000154368.k Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT00390000017469 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00910000147651 ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B 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ENSGT00390000003738.a.a.b.y.b ENSGT00940000156914 Bonobo MODERN SPECIES 1 FUT11 (ENSPPAG00000032820) CHCHD1 (ENSPPAG00000034801) ZSWIM8 (ENSPPAG00000043189) NDST2 (ENSPPAG00000028737) CAMK2G (ENSPPAG00000001211) PLAU (ENSPPAG00000035966) ENSPPAG00000033301 VCL (ENSPPAG00000042103) AP3M1 (ENSPPAG00000014891) ADK (ENSPPAG00000033166) ENSPPAG00000034472 KAT6B (ENSPPAG00000005711) DUSP29 (ENSPPAG00000029736) DUSP13 (ENSPPAG00000006978) SAMD8 (ENSPPAG00000034932) VDAC2 (ENSPPAG00000027456) ##22 COMTD1 (ENSPPAG00000029541) ZNF503 (ENSPPAG00000000057) LRMDA (ENSPPAG00000032754) KCNMA1 (ENSPPAG00000031977) ENSPPAG00000034645 ENSPPAG00000034656 DLG5 (ENSPPAG00000041668) ENSPPAG00000031986 ENSPPAG00000041726 ENSPPAG00000043469 ZMIZ1 (ENSPPAG00000037801) PPIF (ENSPPAG00000032388) ENSPPAG00000034843 ENSPPAG00000039528 ENSPPAG00000040556 Human MODERN SPECIES 1 AGAP5 (ENSG00000172650) SEC24C (ENSG00000176986) FUT11 (ENSG00000196968) CHCHD1 (ENSG00000172586) ZSWIM8 (ENSG00000214655) NDST2 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ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00910000147265 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156653 ENSGT00940000154368.k ENSGT00940000155748.b ENSGT00390000015405.t Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 606 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 393 ENSRBIG00000035185 ENSRBIG00000003677 KAT6B (ENSRBIG00000044374) DUSP29 (ENSRBIG00000035015) DUSP13 (ENSRBIG00000044120) SAMD8 (ENSRBIG00000037003) VDAC2 (ENSRBIG00000032702) ##22 COMTD1 (ENSRBIG00000040999) ZNF503 (ENSRBIG00000039739) ENSRBIG00000036159 LRMDA (ENSRBIG00000035291) ENSRBIG00000037197 CMA1 (ENSRBIG00000029974) CTSG (ENSRBIG00000037190) GZMH (ENSRBIG00000035361) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1866 KAT6B (ENSRROG00000032050) DUSP29 (ENSRROG00000022077) DUSP13 (ENSRROG00000034082) SAMD8 (ENSRROG00000020803) VDAC2 (ENSRROG00000036244) ##22 COMTD1 (ENSRROG00000043081) ZNF503 (ENSRROG00000035090) ENSRROG00000008276 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT00390000017469 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT01100000263897 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00910000147265 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156653.o ENSGT00940000156653.n ENSGT00940000154368.k ENSGT00940000155748.b Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT00390000017469 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT01100000263897 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00910000147653 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00910000147319 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00910000147265 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156653.o ENSGT00940000156653.n.b ENSGT00940000155748.b Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT00390000017469 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT01100000263897 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00910000147653 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00910000147319 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT00390000014818.g.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00910000147265 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156653.n.b ENSGT00940000155748.b Olive baboon MODERN SPECIES 2 ZSWIM8 (ENSPANG00000022454) NDST2 (ENSPANG00000022458) CAMK2G (ENSPANG00000022457) ENSPANG00000045731 ENSPANG00000039725 PLAU (ENSPANG00000022455) ENSPANG00000022456 VCL (ENSPANG00000022469) AP3M1 (ENSPANG00000022467) ADK (ENSPANG00000022465) ENSPANG00000046395 KAT6B (ENSPANG00000022464) DUSP29 (ENSPANG00000022463) DUSP13 (ENSPANG00000022470) SAMD8 (ENSPANG00000022471) VDAC2 (ENSPANG00000022478) ##22 ENSPANG00000022475 ENSPANG00000045677 ZNF503 (ENSPANG00000022473) LRMDA (ENSPANG00000022499) ENSPANG00000038390 KCNMA1 (ENSPANG00000022497) ENSPANG00000040260 DLG5 (ENSPANG00000022509) POLR3A (ENSPANG00000022508) ENSPANG00000022507 ENSPANG00000047646 ENSPANG00000048295 ZMIZ1 (ENSPANG00000022505) PPIF (ENSPANG00000022504) ZCCHC24 (ENSPANG00000022503) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT01100000263897 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00910000147653 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00910000147319 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT00390000014818.g.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00910000147265 ENSGT00390000008264 ENSGT00390000003057 ENSGT00940000154045.a.i Sooty mangabey MODERN SPECIES 260 ZSWIM8 (ENSCATG00000018884) NDST2 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ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT00390000017469 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT01100000263897 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00910000147653 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00910000147319 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156653.o ENSGT00940000156653.n.a.a ENSGT00940000154368.k ENSGT00940000155748.b Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 353 CHCHD1 (ENSMNEG00000035760) ZSWIM8 (ENSMNEG00000043204) NDST2 (ENSMNEG00000031901) CAMK2G (ENSMNEG00000040671) ENSMNEG00000042120 PLAU (ENSMNEG00000037477) VCL (ENSMNEG00000034341) AP3M1 (ENSMNEG00000036623) ENSMNEG00000029844 ADK (ENSMNEG00000044445) KAT6B (ENSMNEG00000039563) DUSP29 (ENSMNEG00000014700) DUSP13 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SPECIES 19 CHCHD1 (ENSMMUG00000056125) ZSWIM8 (ENSMMUG00000004604) NDST2 (ENSMMUG00000022976) CAMK2G (ENSMMUG00000021393) PLAU (ENSMMUG00000009906) VCL (ENSMMUG00000020823) AP3M1 (ENSMMUG00000020825) ENSMMUG00000060115 ADK (ENSMMUG00000022237) ENSMMUG00000053916 ENSMMUG00000054526 KAT6B (ENSMMUG00000023488) DUSP29 (ENSMMUG00000020221) ENSMMUG00000009286 SAMD8 (ENSMMUG00000008690) VDAC2 (ENSMMUG00000008691) ##22 COMTD1 (ENSMMUG00000008694) ZNF503 (ENSMMUG00000006102) ENSMMUG00000050956 ENSMMUG00000057557 ENSMMUG00000059732 LRMDA (ENSMMUG00000023415) ENSMMUG00000050670 KCNMA1 (ENSMMUG00000018390) DLG5 (ENSMMUG00000009128) POLR3A (ENSMMUG00000005514) RPS24 (ENSMMUG00000030562) ZMIZ1 (ENSMMUG00000008790) PPIF (ENSMMUG00000003189) ZCCHC24 (ENSMMUG00000051972) ENSMMUG00000057196 Vervet Monkey MODERN SPECIES 28 FUT11 (ENSCSAG00000008916) CHCHD1 (ENSCSAG00000008922) ZSWIM8 (ENSCSAG00000008933) NDST2 (ENSCSAG00000008945) CAMK2G (ENSCSAG00000008967) ENSCSAG00000008976 PLAU (ENSCSAG00000008982) 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ENSGT00940000155748.b ENSGT00390000016042 Marmoset MODERN SPECIES 3 CHCHD1 (ENSCJAG00000001512) ZSWIM8 (ENSCJAG00000001500) NDST2 (ENSCJAG00000001456) CAMK2G (ENSCJAG00000001401) ENSCJAG00000046716 PLAU (ENSCJAG00000001364) ENSCJAG00000086250 VCL (ENSCJAG00000001337) AP3M1 (ENSCJAG00000001319) ADK (ENSCJAG00000001291) ENSCJAG00000069989 KAT6B (ENSCJAG00000001227) DUSP29 (ENSCJAG00000001221) ENSCJAG00000001195 SAMD8 (ENSCJAG00000001186) VDAC2 (ENSCJAG00000001145) ##22 COMTD1 (ENSCJAG00000001135) ZNF503 (ENSCJAG00000064189) ENSCJAG00000077967 LRMDA (ENSCJAG00000001111) KCNMA1 (ENSCJAG00000001073) POLR3A (ENSCJAG00000001015) ENSCJAG00000012512 ZMIZ1 (ENSCJAG00000000976) PPIF (ENSCJAG00000000973) ZCCHC24 (ENSCJAG00000040780) ENSCJAG00000086928 ENSCJAG00000038466 ENSCJAG00000018197 ENSCJAG00000086814 ENSCJAG00000081880 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 79 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 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ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a.cb ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b ENSGT00940000154368.k Bushbaby MODERN SPECIES 123 FUT11 (ENSOGAG00000026154) CHCHD1 (ENSOGAG00000017206) ZSWIM8 (ENSOGAG00000028969) NDST2 (ENSOGAG00000017207) CAMK2G (ENSOGAG00000017208) PLAU (ENSOGAG00000017210) VCL (ENSOGAG00000016697) AP3M1 (ENSOGAG00000016705) ADK (ENSOGAG00000016708) ENSOGAG00000029400 KAT6B (ENSOGAG00000015423) DUSP29 (ENSOGAG00000015432) DUSP13 (ENSOGAG00000008347) ENSOGAG00000029002 SAMD8 (ENSOGAG00000009026) VDAC2 (ENSOGAG00000030039) ##22 COMTD1 (ENSOGAG00000003820) ENSOGAG00000029180 ENSOGAG00000031665 ZNF503 (ENSOGAG00000014304) ENSOGAG00000026163 LRMDA (ENSOGAG00000015046) KCNMA1 (ENSOGAG00000007370) ENSOGAG00000027548 DLG5 (ENSOGAG00000016435) 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ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01060000248649 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b ENSGT00940000154368.k Alpaca MODERN SPECIES 1293 SAMD8 (ENSVPAG00000008052) ENSVPAG00000008068 ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D 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(ENSBMSG00010022498) PLAC9 (ENSBMSG00010022496) TMEM254 (ENSBMSG00010022495) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT01060000248649 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182960.a.a.a.a.b.qb.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000153524.b.a.b ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 Sperm whale MODERN SPECIES 12 SEC24C (ENSPCTG00005019137) ##12 FUT11 (ENSPCTG00005019182) CHCHD1 (ENSPCTG00005019254) ZSWIM8 (ENSPCTG00005019308) NDST2 (ENSPCTG00005019402) CAMK2G (ENSPCTG00005019488) PLAU (ENSPCTG00005019863) VCL (ENSPCTG00005020063) AP3M1 (ENSPCTG00005020425) ADK (ENSPCTG00005020477) ENSPCTG00005020588 KAT6B (ENSPCTG00005020615) DUSP29 (ENSPCTG00005020706) DUSP13 (ENSPCTG00005020729) SAMD8 (ENSPCTG00005020782) VDAC2 (ENSPCTG00005020809) ##22 COMTD1 (ENSPCTG00005020832) ENSPCTG00005020849 ENSPCTG00005004390 LRMDA (ENSPCTG00005004419) ENSPCTG00005004441 ENSPCTG00005004478 ENSPCTG00005004484 KCNMA1 (ENSPCTG00005004698) ENSPCTG00005005355 POLR3A (ENSPCTG00005005766) RPS24 (ENSPCTG00005005966) ZMIZ1 (ENSPCTG00005006080) ENSPCTG00005006100 ENSPCTG00005006115 TMEM254 (ENSPCTG00005006162) Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01060000248649 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000153524.b.a.b ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b Dolphin MODERN SPECIES 1231 KAT6B (ENSTTRG00000000365) DUSP29 (ENSTTRG00000000367) DUSP13 (ENSTTRG00000000368) SAMD8 (ENSTTRG00000000370) VDAC2 (ENSTTRG00000000371) ##22 COMTD1 (ENSTTRG00000000373) Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000183054.b ENSGT01060000248649 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000000916.f ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000153524.b.a.b ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 Vaquita DUPLICATION Vaquita MODERN SPECIES 7 SEC24C (ENSPSNG00000017183) FUT11 (ENSPSNG00000017287) ENSPSNG00000017371 ZSWIM8 (ENSPSNG00000017427) NDST2 (ENSPSNG00000017553) CAMK2G (ENSPSNG00000017680) PLAU (ENSPSNG00000017933) ENSPSNG00000018054 VCL (ENSPSNG00000018103) AP3M1 (ENSPSNG00000018186) ADK (ENSPSNG00000018276) KAT6B (ENSPSNG00000018544) DUSP29 (ENSPSNG00000018629) DUSP13 (ENSPSNG00000018715) SAMD8 (ENSPSNG00000018913) VDAC2 (ENSPSNG00000018978) ##22 COMTD1 (ENSPSNG00000019015) ENSPSNG00000019024 ZNF503 (ENSPSNG00000019055) LRMDA (ENSPSNG00000019120) ENSPSNG00000019239 KCNMA1 (ENSPSNG00000021619) DLG5 (ENSPSNG00000022596) POLR3A (ENSPSNG00000022598) ENSPSNG00000022599 ZMIZ1 (ENSPSNG00000022601) PPIF (ENSPSNG00000022602) ZCCHC24 (ENSPSNG00000022605) ENSPSNG00000022606 ANXA11 (ENSPSNG00000022607) PLAC9 (ENSPSNG00000022608) Vaquita MODERN SPECIES 12 TBX2 (ENSPSNG00000015990) BCAS3 (ENSPSNG00000016097) PPM1D (ENSPSNG00000016346) APPBP2 (ENSPSNG00000016424) CHCT1 (ENSPSNG00000016555) ENSPSNG00000016659 CA4 (ENSPSNG00000016964) MYO19 (ENSPSNG00000017087) PIGW (ENSPSNG00000017216) GGNBP2 (ENSPSNG00000017255) DHRS11 (ENSPSNG00000017327) MRM1 (ENSPSNG00000017377) LHX1 (ENSPSNG00000017410) AATF (ENSPSNG00000017487) ACACA (ENSPSNG00000017621) ENSPSNG00000018226 ##22 TADA2A (ENSPSNG00000018448) DUSP14 (ENSPSNG00000018531) SYNRG (ENSPSNG00000018625) DDX52 (ENSPSNG00000019073) HNF1B (ENSPSNG00000019157) HEATR6 (ENSPSNG00000019450) ENSPSNG00000019574 ENSPSNG00000019594 ENSPSNG00000019631 ENSPSNG00000019708 ENSPSNG00000019744 CCL14 (ENSPSNG00000019802) ENSPSNG00000019836 ENSPSNG00000019862 HEATR9 (ENSPSNG00000019966) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000183054.b ENSGT01060000248649 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000000916.f ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000153524.b.a.b ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 Narwhal MODERN SPECIES 311 SYNPO2L (ENSMMNG00015010901) SEC24C (ENSMMNG00015010919) FUT11 (ENSMMNG00015010939) CHCHD1 (ENSMMNG00015010957) ZSWIM8 (ENSMMNG00015010974) NDST2 (ENSMMNG00015010993) CAMK2G (ENSMMNG00015011060) PLAU (ENSMMNG00015011120) VCL (ENSMMNG00015011199) AP3M1 (ENSMMNG00015011241) ADK (ENSMMNG00015011303) KAT6B (ENSMMNG00015011393) DUSP29 (ENSMMNG00015011409) DUSP13 (ENSMMNG00015011440) SAMD8 (ENSMMNG00015011491) VDAC2 (ENSMMNG00015011504) ##22 COMTD1 (ENSMMNG00015011519) ENSMMNG00015011553 ENSMMNG00015011565 ZNF503 (ENSMMNG00015011576) LRMDA (ENSMMNG00015011597) KCNMA1 (ENSMMNG00015011966) DLG5 (ENSMMNG00015012641) POLR3A (ENSMMNG00015012741) ENSMMNG00015012806 ZMIZ1 (ENSMMNG00015012852) PPIF (ENSMMNG00015012885) ZCCHC24 (ENSMMNG00015012905) ENSMMNG00015012913 ANXA11 (ENSMMNG00015012925) ENSMMNG00015012941 Beluga whale MODERN SPECIES 65 SYNPO2L (ENSDLEG00000012344) SEC24C (ENSDLEG00000010630) FUT11 (ENSDLEG00000010504) CHCHD1 (ENSDLEG00000010487) ZSWIM8 (ENSDLEG00000010444) NDST2 (ENSDLEG00000010390) CAMK2G (ENSDLEG00000010121) PLAU (ENSDLEG00000010069) VCL (ENSDLEG00000009901) AP3M1 (ENSDLEG00000009868) ADK (ENSDLEG00000009807) KAT6B (ENSDLEG00000009762) DUSP29 (ENSDLEG00000009742) DUSP13 (ENSDLEG00000009704) SAMD8 (ENSDLEG00000009683) VDAC2 (ENSDLEG00000009647) ##22 COMTD1 (ENSDLEG00000009625) ENSDLEG00000009581 ENSDLEG00000009567 ZNF503 (ENSDLEG00000009559) LRMDA (ENSDLEG00000009546) ENSDLEG00000009527 ENSDLEG00000009522 KCNMA1 (ENSDLEG00000009375) ENSDLEG00000009359 DLG5 (ENSDLEG00000009115) POLR3A (ENSDLEG00000008899) RPS24 (ENSDLEG00000008847) ZMIZ1 (ENSDLEG00000008643) PPIF (ENSDLEG00000008590) ZCCHC24 (ENSDLEG00000008566) Pecora ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b.h.a ENSGT00940000155748.b.g Yarkand deer MODERN SPECIES 6 FUT11 (ENSCHYG00000024258) CHCHD1 (ENSCHYG00000024301) ZSWIM8 (ENSCHYG00000024329) NDST2 (ENSCHYG00000024458) CAMK2G (ENSCHYG00000024544) PLAU (ENSCHYG00000024660) VCL (ENSCHYG00000024709) ENSCHYG00000024815 AP3M1 (ENSCHYG00000024826) ADK (ENSCHYG00000024894) ENSCHYG00000025467 ENSCHYG00000025482 KAT6B (ENSCHYG00000004926) DUSP29 (ENSCHYG00000005048) ENSCHYG00000005091 ENSCHYG00000005291 ##22 ENSCHYG00000005450 COMTD1 (ENSCHYG00000005474) ZNF503 (ENSCHYG00000005491) LRMDA (ENSCHYG00000005527) ENSCHYG00000005620 KCNMA1 (ENSCHYG00000006117) DLG5 (ENSCHYG00000012083) POLR3A (ENSCHYG00000012420) ENSCHYG00000012766 ZMIZ1 (ENSCHYG00000012931) PPIF (ENSCHYG00000013395) ZCCHC24 (ENSCHYG00000013440) ANXA11 (ENSCHYG00000013542) PLAC9 (ENSCHYG00000013866) ENSCHYG00000014032 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b.h.a ENSGT00940000155748.b.g Siberian musk deer MODERN SPECIES 1227 SYNPO2L (ENSMMSG00000011327) SEC24C (ENSMMSG00000011364) FUT11 (ENSMMSG00000011509) ENSMMSG00000011549 ZSWIM8 (ENSMMSG00000011579) NDST2 (ENSMMSG00000011632) CAMK2G (ENSMMSG00000011688) PLAU (ENSMMSG00000012070) VCL (ENSMMSG00000012155) AP3M1 (ENSMMSG00000012284) ADK (ENSMMSG00000012338) KAT6B (ENSMMSG00000012486) DUSP29 (ENSMMSG00000012556) DUSP13 (ENSMMSG00000012590) SAMD8 (ENSMMSG00000012740) VDAC2 (ENSMMSG00000012764) ##22 COMTD1 (ENSMMSG00000012778) ZNF503 (ENSMMSG00000012799) LRMDA (ENSMMSG00000012829) KCNMA1 (ENSMMSG00000013398) ENSMMSG00000022915 DLG5 (ENSMMSG00000022925) POLR3A (ENSMMSG00000022968) ENSMMSG00000023003 ZMIZ1 (ENSMMSG00000023032) PPIF (ENSMMSG00000023077) ENSMMSG00000023087 ZCCHC24 (ENSMMSG00000023092) ANXA11 (ENSMMSG00000023104) PLAC9 (ENSMMSG00000023126) TMEM254 (ENSMMSG00000023136) Bovidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b.h.a.b ENSGT00940000155748.b.g Caprinae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00390000000076.o.a ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b.h.a.b.d ENSGT00940000155748.b.h.b Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 17 FUT11 (ENSOARG00020022377) CHCHD1 (ENSOARG00020022399) ZSWIM8 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(ENSCHIG00000000073) DUSP29 (ENSCHIG00000012654) DUSP13 (ENSCHIG00000024051) ENSCHIG00000017421 SAMD8 (ENSCHIG00000012189) ENSCHIG00000023236 VDAC2 (ENSCHIG00000013328) ##22 COMTD1 (ENSCHIG00000005405) ZNF503 (ENSCHIG00000020542) ENSCHIG00000016052 LRMDA (ENSCHIG00000011904) KCNMA1 (ENSCHIG00000025127) ENSCHIG00000016306 DLG5 (ENSCHIG00000000389) POLR3A (ENSCHIG00000000352) ENSCHIG00000000315 ZMIZ1 (ENSCHIG00000000282) PPIF (ENSCHIG00000000241) ZCCHC24 (ENSCHIG00000000203) ENSCHIG00000000166 ANXA11 (ENSCHIG00000000134) PLAC9 (ENSCHIG00000000102) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.k ENSGT00940000167697 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000005496.l ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b.h.a.b.a Bos ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT01060000248649 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D.j ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.k ENSGT00940000167697 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000005496.l ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b.h.a.b.a Bos_b ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT01060000248649 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D.j ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.k ENSGT00940000167697 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000005496.l ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000155748.b.h.a.b.a Cow DUPLICATION Cow MODERN SPECIES 24 CHST11 (ENSBTAG00000010644) SLC41A2 (ENSBTAG00000021875) NOPCHAP1 (ENSBTAG00000021196) ALDH1L2 (ENSBTAG00000006326) WASHC4 (ENSBTAG00000033735) APPL2 (ENSBTAG00000030784) NUAK1 (ENSBTAG00000010457) CKAP4 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ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000186316 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00520000058758 Cat MODERN SPECIES 242 SEC24C (ENSFCAG00000010952) FUT11 (ENSFCAG00000010958) CHCHD1 (ENSFCAG00000034312) ZSWIM8 (ENSFCAG00000018535) NDST2 (ENSFCAG00000010960) CAMK2G (ENSFCAG00000018407) PLAU (ENSFCAG00000015567) VCL (ENSFCAG00000015569) AP3M1 (ENSFCAG00000000775) ADK (ENSFCAG00000015570) ENSFCAG00000039301 KAT6B (ENSFCAG00000005552) DUSP29 (ENSFCAG00000005553) DUSP13 (ENSFCAG00000036709) SAMD8 (ENSFCAG00000026865) VDAC2 (ENSFCAG00000026943) ##22 COMTD1 (ENSFCAG00000005086) ENSFCAG00000026027 ZNF503 (ENSFCAG00000010035) LRMDA (ENSFCAG00000041676) ENSFCAG00000052289 KCNMA1 (ENSFCAG00000007701) DLG5 (ENSFCAG00000002056) POLR3A (ENSFCAG00000000843) ENSFCAG00000000849 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SPECIES 84 ENSVVUG00000023065 ENSVVUG00000023074 ENSVVUG00000023081 NUAK1 (ENSVVUG00000023089) CKAP4 (ENSVVUG00000023094) TCP11L2 (ENSVVUG00000023095) POLR3B (ENSVVUG00000023101) RFX4 (ENSVVUG00000023150) RIC8B (ENSVVUG00000023164) TMEM263 (ENSVVUG00000023180) MTERF2 (ENSVVUG00000023182) CRY1 (ENSVVUG00000023184) ABTB3 (ENSVVUG00000023211) PWP1 (ENSVVUG00000023390) PRDM4 (ENSVVUG00000023397) ENSVVUG00000023398 ##22 RTCB (ENSVVUG00000023408) BPIFC (ENSVVUG00000023482) FBXO7 (ENSVVUG00000023488) ENSVVUG00000023491 TIMP3 (ENSVVUG00000023494) ENSVVUG00000023500 ENSVVUG00000023507 LARGE1 (ENSVVUG00000023512) ISX (ENSVVUG00000023529) HMGXB4 (ENSVVUG00000023533) TOM1 (ENSVVUG00000023536) HMOX1 (ENSVVUG00000023539) MCM5 (ENSVVUG00000023540) RASD2 (ENSVVUG00000023551) ENSVVUG00000023554 Red fox MODERN SPECIES 2 SEC24C (ENSVVUG00000023183) FUT11 (ENSVVUG00000023196) CHCHD1 (ENSVVUG00000023197) ZSWIM8 (ENSVVUG00000023201) NDST2 (ENSVVUG00000023221) CAMK2G (ENSVVUG00000023234) PLAU (ENSVVUG00000023250) VCL (ENSVVUG00000023258) AP3M1 (ENSVVUG00000023266) ADK (ENSVVUG00000023279) KAT6B (ENSVVUG00000023402) DUSP29 (ENSVVUG00000023450) DUSP13 (ENSVVUG00000023453) SAMD8 (ENSVVUG00000023455) ENSVVUG00000023459 ENSVVUG00000023462 ##22 ENSVVUG00000023470 ZNF503 (ENSVVUG00000023475) ENSVVUG00000023479 LRMDA (ENSVVUG00000023484) ENSVVUG00000023498 ENSVVUG00000023502 KCNMA1 (ENSVVUG00000023686) DLG5 (ENSVVUG00000025517) POLR3A (ENSVVUG00000025523) RPS24 (ENSVVUG00000025527) ZMIZ1 (ENSVVUG00000025540) PPIF (ENSVVUG00000025544) ENSVVUG00000025546 ZCCHC24 (ENSVVUG00000025548) ANXA11 (ENSVVUG00000025550) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00980000203402 ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.f ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00950000186003 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000186316 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 Dog MODERN SPECIES 32 SEC24C (ENSCAFG00845007865) FUT11 (ENSCAFG00845008151) CHCHD1 (ENSCAFG00845008199) ZSWIM8 (ENSCAFG00845008328) NDST2 (ENSCAFG00845008593) CAMK2G (ENSCAFG00845008751) PLAU (ENSCAFG00845008986) VCL (ENSCAFG00845009183) ENSCAFG00845009485 AP3M1 (ENSCAFG00845009530) ADK (ENSCAFG00845009636) KAT6B (ENSCAFG00845009903) DUSP29 (ENSCAFG00845009993) DUSP13 (ENSCAFG00845010082) SAMD8 (ENSCAFG00845010171) VDAC2 (ENSCAFG00845010278) ##22 COMTD1 (ENSCAFG00845010345) LRMDA (ENSCAFG00845010464) ZNF503 (ENSCAFG00845010719) ENSCAFG00845010740 ENSCAFG00845010767 KCNMA1 (ENSCAFG00845011389) DLG5 (ENSCAFG00845013364) POLR3A (ENSCAFG00845013802) RPS24 (ENSCAFG00845014074) ZMIZ1 (ENSCAFG00845014304) PPIF (ENSCAFG00845014432) ZCCHC24 (ENSCAFG00845014540) ENSCAFG00845014646 ENSCAFG00845014704 TMEM254 (ENSCAFG00845014737) Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 324 CHCHD1 (ENSCAFG00020020732) ZSWIM8 (ENSCAFG00020018623) NDST2 (ENSCAFG00020016436) ENSCAFG00020016387 ENSCAFG00020016383 PLAU (ENSCAFG00020016293) VCL (ENSCAFG00020016286) ENSCAFG00020016285 AP3M1 (ENSCAFG00020016284) ADK (ENSCAFG00020016273) KAT6B (ENSCAFG00020016239) DUSP29 (ENSCAFG00020016226) DUSP13 (ENSCAFG00020016225) ENSCAFG00020016224 SAMD8 (ENSCAFG00020016213) ENSCAFG00020016208 ##22 COMTD1 (ENSCAFG00020016203) ZNF503 (ENSCAFG00020016201) ENSCAFG00020016194 LRMDA (ENSCAFG00020016191) ENSCAFG00020016190 ENSCAFG00020016188 KCNMA1 (ENSCAFG00020014954) DLG5 (ENSCAFG00020014784) POLR3A (ENSCAFG00020014711) RPS24 (ENSCAFG00020014698) ZMIZ1 (ENSCAFG00020014475) ENSCAFG00020014445 PPIF (ENSCAFG00020014441) ZCCHC24 (ENSCAFG00020014439) ANXA11 (ENSCAFG00020014434) Dingo MODERN SPECIES 307 ENSCAFG00020005182 ENSCAFG00020005179 ENSCAFG00020005124 NUAK1 (ENSCAFG00020005117) CKAP4 (ENSCAFG00020005091) ENSCAFG00020005089 TCP11L2 (ENSCAFG00020005088) POLR3B (ENSCAFG00020005062) RFX4 (ENSCAFG00020005027) RIC8B (ENSCAFG00020005022) TMEM263 (ENSCAFG00020004996) MTERF2 (ENSCAFG00020004993) CRY1 (ENSCAFG00020004979) ABTB3 (ENSCAFG00020004942) PWP1 (ENSCAFG00020004921) ENSCAFG00020004919 ##22 PRDM4 (ENSCAFG00020004916) ASCL4 (ENSCAFG00020004911) ENSCAFG00020004890 BPIFC (ENSCAFG00020004848) FBXO7 (ENSCAFG00020004763) ENSCAFG00020004756 TIMP3 (ENSCAFG00020004747) ENSCAFG00020004742 ENSCAFG00020004732 LARGE1 (ENSCAFG00020004723) ENSCAFG00020004691 ISX (ENSCAFG00020004651) HMGXB4 (ENSCAFG00020004587) TOM1 (ENSCAFG00020004581) HMOX1 (ENSCAFG00020004569) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 81 ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00520000058758 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 750 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a Sloth MODERN SPECIES 5329 VDAC2 (ENSCHOG00000009691) ##22 Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 3634 KAT6B (ENSDNOG00000006625) DUSP29 (ENSDNOG00000039114) ENSDNOG00000043527 SAMD8 (ENSDNOG00000042126) ENSDNOG00000045840 ##22 COMTD1 (ENSDNOG00000004911) ZNF503 (ENSDNOG00000045953) Armadillo MODERN SPECIES 2764 ENSDNOG00000041965 ENSDNOG00000005103 GLRX (ENSDNOG00000049647) RHOBTB3 (ENSDNOG00000006568) SPATA9 (ENSDNOG00000031930) RFESD (ENSDNOG00000031736) ARSK (ENSDNOG00000035393) SKIC3 (ENSDNOG00000019699) FAM81B (ENSDNOG00000019698) MCTP1 (ENSDNOG00000024619) SLF1 (ENSDNOG00000011705) KIAA0825 (ENSDNOG00000040421) ENSDNOG00000033821 ##22 FAM172A (ENSDNOG00000004689) NR2F1 (ENSDNOG00000043183) ENSDNOG00000008056 ##22 ENSDNOG00000047445 ENSDNOG00000039372 ENSDNOG00000031852 ENSDNOG00000047212 ARRDC3 (ENSDNOG00000007684) ENSDNOG00000038531 ENSDNOG00000041520 ENSDNOG00000007596 LYSMD3 (ENSDNOG00000034583) ENSDNOG00000004195 MBLAC2 (ENSDNOG00000036816) CETN3 (ENSDNOG00000039817) Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 2764 ENSDNOG00000036264 MEF2C (ENSDNOG00000000377) ENSDNOG00000047108 CETN3 (ENSDNOG00000039817) MBLAC2 (ENSDNOG00000036816) ENSDNOG00000004195 LYSMD3 (ENSDNOG00000034583) ENSDNOG00000007596 ENSDNOG00000041520 ENSDNOG00000038531 ARRDC3 (ENSDNOG00000007684) ENSDNOG00000047212 ENSDNOG00000031852 ENSDNOG00000039372 ENSDNOG00000047445 ENSDNOG00000008056 ##22 NR2F1 (ENSDNOG00000043183) FAM172A (ENSDNOG00000004689) ENSDNOG00000033821 ##22 KIAA0825 (ENSDNOG00000040421) SLF1 (ENSDNOG00000011705) MCTP1 (ENSDNOG00000024619) FAM81B (ENSDNOG00000019698) SKIC3 (ENSDNOG00000019699) ARSK (ENSDNOG00000035393) RFESD (ENSDNOG00000031736) SPATA9 (ENSDNOG00000031930) RHOBTB3 (ENSDNOG00000006568) GLRX (ENSDNOG00000049647) ENSDNOG00000005103 ENSDNOG00000041965 Armadillo MODERN SPECIES 4291 ITPKA (ENSDNOG00000036587) RPAP1 (ENSDNOG00000018324) TYRO3 (ENSDNOG00000032240) MGA (ENSDNOG00000032105) MAPKBP1 (ENSDNOG00000007644) PLA2G4B (ENSDNOG00000007402) SPTBN5 (ENSDNOG00000041279) EHD4 (ENSDNOG00000037551) ENSDNOG00000008133 PLA2G4F (ENSDNOG00000019135) VPS39 (ENSDNOG00000017274) TMEM87A (ENSDNOG00000039921) GANC (ENSDNOG00000017281) CAPN3 (ENSDNOG00000024011) ZNF106 (ENSDNOG00000006442) ENSDNOG00000047810 ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 Tenrec DUPLICATION Tenrec MODERN SPECIES 5802 ENSETEG00000010119 ##22 COMTD1 (ENSETEG00000010121) Tenrec MODERN SPECIES 11171 ENSETEG00000003004 ##22 Tenrec MODERN SPECIES 17463 ENSETEG00000000010 ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 Elephant MODERN SPECIES 3 SYNPO2L (ENSLAFG00000028703) ENSLAFG00000002364 ##12 FUT11 (ENSLAFG00000022417) CHCHD1 (ENSLAFG00000016311) ZSWIM8 (ENSLAFG00000020554) NDST2 (ENSLAFG00000008298) CAMK2G (ENSLAFG00000017644) PLAU (ENSLAFG00000016662) VCL (ENSLAFG00000022677) AP3M1 (ENSLAFG00000018700) ADK (ENSLAFG00000004737) KAT6B (ENSLAFG00000015357) DUSP29 (ENSLAFG00000021406) ENSLAFG00000026669 SAMD8 (ENSLAFG00000013269) VDAC2 (ENSLAFG00000009526) ##22 COMTD1 (ENSLAFG00000009529) ZNF503 (ENSLAFG00000031176) LRMDA (ENSLAFG00000004894) KCNMA1 (ENSLAFG00000003481) ENSLAFG00000029514 DLG5 (ENSLAFG00000004091) POLR3A (ENSLAFG00000016719) RPS24 (ENSLAFG00000027878) ZMIZ1 (ENSLAFG00000022250) PPIF (ENSLAFG00000000379) ZCCHC24 (ENSLAFG00000012854) ANXA11 (ENSLAFG00000023249) PLAC9 (ENSLAFG00000007184) ENSLAFG00000026006 ENSLAFG00000029465 Hyrax MODERN SPECIES 4913 VDAC2 (ENSPCAG00000017046) ##22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000165487 ENSGT00600000084626 ENSGT00390000016042 Opossum MODERN SPECIES ENSMODG00000000346 ##12 FUT11 (ENSMODG00000000355) CHCHD1 (ENSMODG00000000361) ZSWIM8 (ENSMODG00000000396) NDST2 (ENSMODG00000000427) CAMK2G (ENSMODG00000000536) PLAU (ENSMODG00000000564) VCL (ENSMODG00000000633) AP3M1 (ENSMODG00000010261) ADK (ENSMODG00000000687) KAT6B (ENSMODG00000000736) DUPD1 (ENSMODG00000042234) ENSMODG00000000762 ENSMODG00000000853 SAMD8 (ENSMODG00000000873) VDAC2 (ENSMODG00000000896) ##22 COMTD1 (ENSMODG00000000906) ZNF503 (ENSMODG00000048510) ENSMODG00000000919 ENSMODG00000050891 ENSMODG00000040056 ENSMODG00000038200 ENSMODG00000038411 DLG5 (ENSMODG00000001002) POLR3A (ENSMODG00000001036) RPS24 (ENSMODG00000025091) ZMIZ1 (ENSMODG00000001116) PPIF (ENSMODG00000001128) ZCCHC24 (ENSMODG00000001134) ENSMODG00000001145 ENSMODG00000025082 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000165487 ENSGT00600000084626 ENSGT00390000016042 Tasmanian devil DUPLICATION Tasmanian devil MODERN SPECIES 1 ENSSHAG00000030514 ##12 ENSSHAG00000020541 ZSWIM8 (ENSSHAG00000021505) NDST2 (ENSSHAG00000007678) CAMK2G (ENSSHAG00000007766) PLAU (ENSSHAG00000008764) VCL (ENSSHAG00000009417) AP3M1 (ENSSHAG00000009890) ADK (ENSSHAG00000003646) KAT6B (ENSSHAG00000009496) DUSP29 (ENSSHAG00000027020) ENSSHAG00000011319 ENSSHAG00000011402 ENSSHAG00000029396 SAMD8 (ENSSHAG00000011668) ENSSHAG00000012048 ##22 COMTD1 (ENSSHAG00000029495) ZNF503 (ENSSHAG00000013269) LRMDA (ENSSHAG00000026629) ENSSHAG00000029061 KCNMA1 (ENSSHAG00000017451) DLG5 (ENSSHAG00000005215) POLR3A (ENSSHAG00000007588) RPS24 (ENSSHAG00000008090) ZMIZ1 (ENSSHAG00000016743) PPIF (ENSSHAG00000030438) ENSSHAG00000029897 ENSSHAG00000023385 ENSSHAG00000002073 ENSSHAG00000005914 ENSSHAG00000029579 Tasmanian devil MODERN SPECIES ENSSHAG00000009575 CARMIL1 (ENSSHAG00000010466) ENSSHAG00000001939 RIPOR2 (ENSSHAG00000006862) ENSSHAG00000004417 GMNN (ENSSHAG00000004058) C6orf62 (ENSSHAG00000023714) ENSSHAG00000021442 ACOT13 (ENSSHAG00000025514) KIAA0319 (ENSSHAG00000004593) ALDH5A1 (ENSSHAG00000006033) GPLD1 (ENSSHAG00000006784) MRS2 (ENSSHAG00000007390) DCDC2 (ENSSHAG00000008058) NRSN1 (ENSSHAG00000003491) ENSSHAG00000008496 ##22 PRL (ENSSHAG00000003994) SOX4 (ENSSHAG00000027520) CDKAL1 (ENSSHAG00000013159) E2F3 (ENSSHAG00000023717) MBOAT1 (ENSSHAG00000016486) ID4 (ENSSHAG00000031770) RNF144B (ENSSHAG00000013434) DEK (ENSSHAG00000014678) KDM1B (ENSSHAG00000014810) TPMT (ENSSHAG00000030718) NHLRC1 (ENSSHAG00000015039) KIF13A (ENSSHAG00000015411) NUP153 (ENSSHAG00000031841) FAM8A1 (ENSSHAG00000031589) CAP2 (ENSSHAG00000016266) Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000165487 ENSGT00600000084626 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000153195.B Wallaby DUPLICATION Wallaby MODERN SPECIES 14717 ENSMEUG00000001698 ##22 Wallaby MODERN SPECIES 7223 ENSMEUG00000012995 ##22 COMTD1 (ENSMEUG00000013009) Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##12 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156481 ENSGT01050000244971.C.d ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000165487 ENSGT00600000084626 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000153195.B Common wonbat MODERN SPECIES 39 FUT11 (ENSVURG00010013388) CHCHD1 (ENSVURG00010013402) ZSWIM8 (ENSVURG00010013410) NDST2 (ENSVURG00010013438) CAMK2G (ENSVURG00010013489) PLAU (ENSVURG00010013646) VCL (ENSVURG00010013662) AP3M1 (ENSVURG00010013688) ADK (ENSVURG00010013704) KAT6B (ENSVURG00010013732) DUSP29 (ENSVURG00010013750) ENSVURG00010013756 ENSVURG00010013777 ENSVURG00010013837 SAMD8 (ENSVURG00010013872) VDAC2 (ENSVURG00010013882) ##22 COMTD1 (ENSVURG00010013912) ZNF503 (ENSVURG00010013917) LRMDA (ENSVURG00010013934) KCNMA1 (ENSVURG00010013967) ENSVURG00010014006 DLG5 (ENSVURG00010014017) POLR3A (ENSVURG00010014062) ENSVURG00010014100 ENSVURG00010014156 ZMIZ1 (ENSVURG00010014184) PPIF (ENSVURG00010014243) ZCCHC24 (ENSVURG00010014255) ENSVURG00010014270 ENSVURG00010014280 ENSVURG00010014285 koala MODERN SPECIES 111 FUT11 (ENSPCIG00000028700) ZSWIM8 (ENSPCIG00000028702) NDST2 (ENSPCIG00000028703) CAMK2G (ENSPCIG00000028709) PLAU (ENSPCIG00000028718) VCL (ENSPCIG00000004878) AP3M1 (ENSPCIG00000004913) ADK (ENSPCIG00000024594) KAT6B (ENSPCIG00000024595) ENSPCIG00000024596 DUSP29 (ENSPCIG00000024597) DUSP13 (ENSPCIG00000024598) ENSPCIG00000024599 ENSPCIG00000031519 SAMD8 (ENSPCIG00000024601) VDAC2 (ENSPCIG00000024602) ##22 COMTD1 (ENSPCIG00000024603) ZNF503 (ENSPCIG00000003560) LRMDA (ENSPCIG00000034823) KCNMA1 (ENSPCIG00000030721) ENSPCIG00000013087 DLG5 (ENSPCIG00000015827) POLR3A (ENSPCIG00000015842) RPS24 (ENSPCIG00000015847) ZMIZ1 (ENSPCIG00000000008) PPIF (ENSPCIG00000000007) ZCCHC24 (ENSPCIG00000000006) ANXA11 (ENSPCIG00000000005) ENSPCIG00000032831 ENSPCIG00000000003 ENSPCIG00000000002 Anura ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000157609 ENSGT00390000001197 ENSGT00390000000483.a.b ENSGT00940000164982 ENSGT00390000011381 ENSGT00940000156697 ENSGT00940000158585 ENSGT00910000144159.A.b ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000162682.A.a.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000014618.a ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153.l.a ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008.qb ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000170983 ENSGT00600000084626 ENSGT00390000016042 ENSGT00940000154537 ENSGT00940000153195.B Leishan spiny toad MODERN SPECIES 9 ENSLLEG00000020183 CHUK (ENSLLEG00000019747) ENSLLEG00000019717 VCL (ENSLLEG00000018869) AP3M1 (ENSLLEG00000018441) ENSLLEG00000018188 KAT6B (ENSLLEG00000017949) DUSP29 (ENSLLEG00000017871) ENSLLEG00000017859 ENSLLEG00000017778 ENSLLEG00000017627 ENSLLEG00000017550 ENSLLEG00000017504 ENSLLEG00000017440 ENSLLEG00000017350 VDAC2 (ENSLLEG00000017009) ##22 ENSLLEG00000016923 ENSLLEG00000016888 ZNF503 (ENSLLEG00000016852) ENSLLEG00000016830 ENSLLEG00000016804 LRMDA (ENSLLEG00000016681) ENSLLEG00000016652 ENSLLEG00000015600 ENSLLEG00000015530 ENSLLEG00000015519 ENSLLEG00000015510 ENSLLEG00000015379 ENSLLEG00000015355 RASGEF1A (ENSLLEG00000015041) ENSLLEG00000029385 Frog MODERN SPECIES 7 ENSXETG00000049386 clstn1 (ENSXETG00000000775) ENSXETG00000043237 med19 (ENSXETG00000032150) tmx2 (ENSXETG00000026417) ENSXETG00000034423 ENSXETG00000044732 ENSXETG00000041918 ctnnd1 (ENSXETG00000007089) clp1 (ENSXETG00000007088) zdhhc5 (ENSXETG00000030941) vcl (ENSXETG00000007084) dusp29 (ENSXETG00000040556) dusp13 (ENSXETG00000041222) samd8 (ENSXETG00000009864) vdac2 (ENSXETG00000009865) ##22 ENSXETG00000043219 znf503 (ENSXETG00000009866) ENSXETG00000042633 ENSXETG00000045575 lrmda (ENSXETG00000009871) kcnma1 (ENSXETG00000018041) ENSXETG00000048193 dlg5 (ENSXETG00000018090) ENSXETG00000043646 polr3a (ENSXETG00000018101) rps24 (ENSXETG00000018137) ENSXETG00000041587 zmiz1 (ENSXETG00000018359) ppif (ENSXETG00000039032) zcchc24 (ENSXETG00000018372) Coelacanth MODERN SPECIES 1341 ZMIZ1 (ENSLACG00000011105) ENSLACG00000010756 comtd1 (ENSLACG00000010476) ENSLACG00000009566 VDAC2 (ENSLACG00000008660) ##22 ENSLACG00000008070 ENSLACG00000007444 ENSLACG00000006059 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00390000000483.a.b ENSGT00940000164982 ENSGT00390000011381 ENSGT00940000156697 ENSGT00940000158585 ENSGT00910000144159.A ENSGT00390000014666.b ENSGT00950000182937.A.a ENSGT00940000164426 ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190 ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a ENSGT01060000252496 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000174594 ENSGT00940000158426 ENSGT00390000005448 Neopterygii DUPLICATION Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158585 ENSGT00910000144159.A ENSGT00390000014666.b ENSGT00950000182937.A.a ENSGT00940000164426 ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000160190 ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.r ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00390000014618.a ENSGT01060000252496 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153 ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00390000011412 Spotted gar MODERN SPECIES 671 tubgcp2 (ENSLOCG00000004354) adam8a (ENSLOCG00000004374) ENSLOCG00000004406 erlin1 (ENSLOCG00000004418) chuk (ENSLOCG00000004432) plaua (ENSLOCG00000004467) vcla (ENSLOCG00000004474) ENSLOCG00000004496 ap3m1 (ENSLOCG00000004509) ADK (ENSLOCG00000004521) KAT6B (ENSLOCG00000004535) ENSLOCG00000004551 DUSP13 (ENSLOCG00000004561) ENSLOCG00000004576 SAMD8 (ENSLOCG00000004590) vdac2 (ENSLOCG00000004602) ##22 ENSLOCG00000004642 ENSLOCG00000004660 ifit8 (ENSLOCG00000004672) comtd1 (ENSLOCG00000004687) znf503 (ENSLOCG00000004723) lrmda (ENSLOCG00000004734) kcnma1a (ENSLOCG00000004752) dlg5a (ENSLOCG00000004786) ENSLOCG00000004826 anxa11b (ENSLOCG00000004840) zcchc24 (ENSLOCG00000004863) ppifb (ENSLOCG00000004875) zmiz1a (ENSLOCG00000004888) rps24 (ENSLOCG00000004926) polr3a (ENSLOCG00000004942) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 838 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT01060000252496 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.d ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 138 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000155636.a ENSGT00940000175262 ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b ENSGT00940000154332 ENSGT00940000169918 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000155636.a ENSGT00940000175262 ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 6 ENSMMDG00005011050 papss2a (ENSMMDG00005011133) minpp1a (ENSMMDG00005014352) sgms1a (ENSMMDG00005014355) prkg1a (ENSMMDG00005014365) dkk1a (ENSMMDG00005014381) pcdh15a (ENSMMDG00005014451) plek (ENSMMDG00005016712) prokr1b (ENSMMDG00005016716) BFSP1 (ENSMMDG00005016722) pcsk2 (ENSMMDG00005016732) OTOR (ENSMMDG00005016736) GTPBP2 (ENSMMDG00005016741) polh (ENSMMDG00005016748) ENSMMDG00005016752 vdac2 (ENSMMDG00005016776) ##22 ENSMMDG00005017470 comtd1 (ENSMMDG00005017515) znf503 (ENSMMDG00005017518) lrmda (ENSMMDG00005017520) KCNMA1 (ENSMMDG00005017628) dlg5a (ENSMMDG00005021664) anxa11a (ENSMMDG00005022306) zcchc24 (ENSMMDG00005022450) ppifa (ENSMMDG00005022451) zmiz1a (ENSMMDG00005022454) rps24 (ENSMMDG00005022456) eif4ebp2 (ENSMMDG00005022457) ppa1b (ENSMMDG00005022458) sar1ab (ENSMMDG00005022461) tysnd1 (ENSMMDG00005022462) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158306 ENSGT00390000004632 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000175262 ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 103 ENSHCOG00000002572 vdac2 (ENSHCOG00000002590) ##22 comtd1 (ENSHCOG00000002598) znf503 (ENSHCOG00000002607) ENSHCOG00000002614 lrmda (ENSHCOG00000002627) KCNMA1 (ENSHCOG00000002653) dlg5a (ENSHCOG00000002682) ENSHCOG00000002701 zcchc24 (ENSHCOG00000002716) ppifa (ENSHCOG00000000076) zmiz1a (ENSHCOG00000002749) rps24 (ENSHCOG00000002765) eif4ebp2 (ENSHCOG00000000576) ppa1b (ENSHCOG00000002839) sar1ab (ENSHCOG00000002845) tysnd1 (ENSHCOG00000002848) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000176967 ENSGT00940000169918 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00940000176967 ENSGT00940000169918.b ENSGT00940000169918.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000176967 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000009613.a ENSGT00390000018409.h.m ENSGT00390000018409.h.n ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 ENSGT00940000157107.a.b Fugu MODERN SPECIES 16 GTPBP2 (ENSTRUG00000011961) polh (ENSTRUG00000012126) ENSTRUG00000027302 ENSTRUG00000029587 ENSTRUG00000033261 ENSTRUG00000026491 ENSTRUG00000027769 ENSTRUG00000024965 ENSTRUG00000030266 ENSTRUG00000022595 ENSTRUG00000033488 ENSTRUG00000029315 ENSTRUG00000029127 ENSTRUG00000028960 ENSTRUG00000031758 vdac2 (ENSTRUG00000025053) ##22 comtd1 (ENSTRUG00000023652) znf503 (ENSTRUG00000003530) lrmda (ENSTRUG00000024928) dlg5a (ENSTRUG00000026783) anxa11a (ENSTRUG00000005504) zcchc24 (ENSTRUG00000005936) ppifa (ENSTRUG00000026292) zmiz1a (ENSTRUG00000006313) rps24 (ENSTRUG00000006773) eif4ebp2 (ENSTRUG00000006895) SPOCK2 (ENSTRUG00000007547) ENSTRUG00000007914 dnajb12a (ENSTRUG00000007929) trmt2b (ENSTRUG00000008166) scdb (ENSTRUG00000024315) Tetraodon MODERN SPECIES 9 ENSTNIG00000013318 papss2a (ENSTNIG00000013317) ENSTNIG00000008613 ENSTNIG00000008614 sgms1a (ENSTNIG00000008615) prkg1a (ENSTNIG00000008616) dkk1a (ENSTNIG00000008617) pcdh15a (ENSTNIG00000008618) plek (ENSTNIG00000008619) prokr1b (ENSTNIG00000008620) BFSP1 (ENSTNIG00000008621) pcsk2 (ENSTNIG00000008622) GTPBP2 (ENSTNIG00000008623) polh (ENSTNIG00000008624) ENSTNIG00000000638 vdac2 (ENSTNIG00000008625) ##22 comtd1 (ENSTNIG00000008626) znf503 (ENSTNIG00000008627) KCNMA1 (ENSTNIG00000008628) dlg5a (ENSTNIG00000008629) anxa11a (ENSTNIG00000008630) zcchc24 (ENSTNIG00000008631) ppifa (ENSTNIG00000008632) zmiz1a (ENSTNIG00000008633) rps24 (ENSTNIG00000000893) ppa1b (ENSTNIG00000008634) sar1ab (ENSTNIG00000008635) tysnd1 (ENSTNIG00000008636) SPOCK2 (ENSTNIG00000008637) ENSTNIG00000008638 dnajb12a (ENSTNIG00000008639) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000176967 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Ballan wrasse MODERN SPECIES 36 ENSLBEG00000003619 minpp1a (ENSLBEG00000003597) sgms1a (ENSLBEG00000003577) prkg1a (ENSLBEG00000003513) dkk1a (ENSLBEG00000003477) pcdh15a (ENSLBEG00000003097) plek (ENSLBEG00000002998) prokr1b (ENSLBEG00000002964) BFSP1 (ENSLBEG00000002865) pcsk2 (ENSLBEG00000002804) OTOR (ENSLBEG00000002783) ENSLBEG00000002749 polh (ENSLBEG00000002731) ENSLBEG00000002698 ENSLBEG00000002678 vdac2 (ENSLBEG00000002636) ##22 ENSLBEG00000002618 comtd1 (ENSLBEG00000002585) znf503 (ENSLBEG00000002559) ENSLBEG00000002549 lrmda (ENSLBEG00000002540) KCNMA1 (ENSLBEG00000002458) dlg5a (ENSLBEG00000002343) anxa11a (ENSLBEG00000002315) zcchc24 (ENSLBEG00000002286) ppifa (ENSLBEG00000001428) zmiz1a (ENSLBEG00000001255) rps24 (ENSLBEG00000001222) eif4ebp2 (ENSLBEG00000001180) ppa1b (ENSLBEG00000001141) sar1ab (ENSLBEG00000001114) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000176967 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000169918.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000018409.h ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000169918.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Pike perch MODERN SPECIES 10 minpp1a (ENSSLUG00000017375) ENSSLUG00000017372 sgms1a (ENSSLUG00000017366) prkg1a (ENSSLUG00000017313) dkk1a (ENSSLUG00000017283) pcdh15a (ENSSLUG00000016837) plek (ENSSLUG00000016774) prokr1b (ENSSLUG00000016766) BFSP1 (ENSSLUG00000016759) pcsk2 (ENSSLUG00000016377) OTOR (ENSSLUG00000016362) GTPBP2 (ENSSLUG00000016352) polh (ENSSLUG00000016337) ENSSLUG00000016308 ENSSLUG00000016290 vdac2 (ENSSLUG00000015705) ##22 ENSSLUG00000015630 comtd1 (ENSSLUG00000015613) znf503 (ENSSLUG00000015608) lrmda (ENSSLUG00000015595) KCNMA1 (ENSSLUG00000007982) dlg5a (ENSSLUG00000007145) anxa11a (ENSSLUG00000006377) zcchc24 (ENSSLUG00000006351) ppifa (ENSSLUG00000006341) zmiz1a (ENSSLUG00000005428) rps24 (ENSSLUG00000005249) eif4ebp2 (ENSSLUG00000005239) ppa1b (ENSSLUG00000005196) sar1ab (ENSSLUG00000005174) tysnd1 (ENSSLUG00000005169) Channel bull blenny MODERN SPECIES 6 dkk1a (ENSCGOG00000012885) pcdh15a (ENSCGOG00000010072) plek (ENSCGOG00000009657) prokr1b (ENSCGOG00000009646) BFSP1 (ENSCGOG00000009643) pcsk2 (ENSCGOG00000009016) OTOR (ENSCGOG00000009006) GTPBP2 (ENSCGOG00000008794) polh (ENSCGOG00000008731) ENSCGOG00000008720 ENSCGOG00000008712 ENSCGOG00000008710 ENSCGOG00000008709 ENSCGOG00000008694 ENSCGOG00000008690 vdac2 (ENSCGOG00000008567) ##22 ENSCGOG00000008522 comtd1 (ENSCGOG00000008511) znf503 (ENSCGOG00000008501) lrmda (ENSCGOG00000008499) KCNMA1 (ENSCGOG00000004266) dlg5a (ENSCGOG00000003269) anxa11a (ENSCGOG00000002293) zcchc24 (ENSCGOG00000002271) ppifa (ENSCGOG00000002268) zmiz1a (ENSCGOG00000002137) rps24 (ENSCGOG00000002084) eif4ebp2 (ENSCGOG00000002080) ppa1b (ENSCGOG00000001959) sar1ab (ENSCGOG00000001902) tysnd1 (ENSCGOG00000001898) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000009613.a ENSGT00390000018409.h ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 ENSGT00940000157107.a.b Stickleback MODERN SPECIES 6 papss2a (ENSGACG00000009195) minpp1a (ENSGACG00000009178) sgms1a (ENSGACG00000009168) prkg1a (ENSGACG00000009151) dkk1a (ENSGACG00000009143) ENSGACG00000009141 pcdh15a (ENSGACG00000009135) plek (ENSGACG00000009115) prokr1b (ENSGACG00000009110) BFSP1 (ENSGACG00000009101) pcsk2 (ENSGACG00000009043) OTOR (ENSGACG00000009024) GTPBP2 (ENSGACG00000009007) polh (ENSGACG00000008990) ENSGACG00000008985 vdac2 (ENSGACG00000008932) ##22 comtd1 (ENSGACG00000008912) znf503 (ENSGACG00000008890) KCNMA1 (ENSGACG00000008829) dlg5a (ENSGACG00000008811) anxa11a (ENSGACG00000008793) zcchc24 (ENSGACG00000008791) ppifa (ENSGACG00000008764) zmiz1a (ENSGACG00000008751) rps24 (ENSGACG00000008736) eif4ebp2 (ENSGACG00000008729) ppa1b (ENSGACG00000008644) sar1ab (ENSGACG00000008616) tysnd1 (ENSGACG00000008609) SPOCK2 (ENSGACG00000008600) DDIT4 (ENSGACG00000008596) Lumpfish MODERN SPECIES 6 minpp1a (ENSCLMG00005012860) ENSCLMG00005012861 sgms1a (ENSCLMG00005012887) prkg1a (ENSCLMG00005012894) dkk1a (ENSCLMG00005012906) pcdh15a (ENSCLMG00005012915) plek (ENSCLMG00005013154) prokr1b (ENSCLMG00005013155) BFSP1 (ENSCLMG00005013156) pcsk2 (ENSCLMG00005013162) OTOR (ENSCLMG00005013164) ENSCLMG00005013165 polh (ENSCLMG00005013196) ENSCLMG00005013205 ENSCLMG00005013208 vdac2 (ENSCLMG00005013218) ##22 comtd1 (ENSCLMG00005013834) znf503 (ENSCLMG00005013835) lrmda (ENSCLMG00005013837) KCNMA1 (ENSCLMG00005013851) dlg5a (ENSCLMG00005016656) ENSCLMG00005016844 zcchc24 (ENSCLMG00005016846) ppifa (ENSCLMG00005016847) zmiz1a (ENSCLMG00005016863) rps24 (ENSCLMG00005018188) eif4ebp2 (ENSCLMG00005018190) ENSCLMG00005018191 THBS2 (ENSCLMG00005018195) ENSCLMG00005018196 ENSCLMG00005018200 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000018409.h ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000176967 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Gilthead seabream MODERN SPECIES 6 ENSSAUG00010018551 sgms1a (ENSSAUG00010018552) prkg1a (ENSSAUG00010018558) dkk1a (ENSSAUG00010018568) pcdh15a (ENSSAUG00010018569) plek (ENSSAUG00010018664) prokr1b (ENSSAUG00010018668) BFSP1 (ENSSAUG00010018670) pcsk2 (ENSSAUG00010018686) OTOR (ENSSAUG00010018723) GTPBP2 (ENSSAUG00010018726) polh (ENSSAUG00010018736) ENSSAUG00010018741 ENSSAUG00010018744 ENSSAUG00010018751 vdac2 (ENSSAUG00010018755) ##22 ENSSAUG00010018764 comtd1 (ENSSAUG00010018765) znf503 (ENSSAUG00010018767) lrmda (ENSSAUG00010018770) KCNMA1 (ENSSAUG00010018785) ENSSAUG00010019320 dlg5a (ENSSAUG00010019346) anxa11a (ENSSAUG00010020969) zcchc24 (ENSSAUG00010021835) ppifa (ENSSAUG00010021836) zmiz1a (ENSSAUG00010021857) rps24 (ENSSAUG00010022528) eif4ebp2 (ENSSAUG00010022529) ppa1b (ENSSAUG00010022531) sar1ab (ENSSAUG00010022545) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000018409.h ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000176967 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Large yellow croaker MODERN SPECIES 2 sgms1a (ENSLCRG00005006157) prkg1a (ENSLCRG00005006132) dkk1a (ENSLCRG00005006130) pcdh15a (ENSLCRG00005005945) plek (ENSLCRG00005005620) prokr1b (ENSLCRG00005005615) BFSP1 (ENSLCRG00005005614) pcsk2 (ENSLCRG00005005611) OTOR (ENSLCRG00005005606) GTPBP2 (ENSLCRG00005005599) polh (ENSLCRG00005005598) ENSLCRG00005005591 ENSLCRG00005005590 ENSLCRG00005005587 ENSLCRG00005005584 vdac2 (ENSLCRG00005005557) ##22 ENSLCRG00005005554 comtd1 (ENSLCRG00005005552) znf503 (ENSLCRG00005005548) lrmda (ENSLCRG00005005545) KCNMA1 (ENSLCRG00005001270) dlg5a (ENSLCRG00005000315) anxa11a (ENSLCRG00005017885) zcchc24 (ENSLCRG00005017867) ppifa (ENSLCRG00005017866) zmiz1a (ENSLCRG00005017601) rps24 (ENSLCRG00005017585) eif4ebp2 (ENSLCRG00005017583) ppa1b (ENSLCRG00005017577) sar1ab (ENSLCRG00005017576) tysnd1 (ENSLCRG00005017574) European seabass MODERN SPECIES 1 sgms1a (ENSDLAG00005018197) prkg1a (ENSDLAG00005017988) ENSDLAG00005017975 pcdh15a (ENSDLAG00005015554) plek (ENSDLAG00005015357) prokr1b (ENSDLAG00005030155) BFSP1 (ENSDLAG00005015335) pcsk2 (ENSDLAG00005015139) OTOR (ENSDLAG00005015108) ENSDLAG00005015067 ENSDLAG00005014960 ENSDLAG00005014935 ENSDLAG00005014907 ENSDLAG00005027772 ENSDLAG00005014911 vdac2 (ENSDLAG00005014704) ##22 ENSDLAG00005014673 comtd1 (ENSDLAG00005014652) znf503 (ENSDLAG00005014641) lrmda (ENSDLAG00005014626) KCNMA1 (ENSDLAG00005011420) dlg5a (ENSDLAG00005009954) anxa11a (ENSDLAG00005009497) ENSDLAG00005009464 zcchc24 (ENSDLAG00005030060) ppifa (ENSDLAG00005009453) zmiz1a (ENSDLAG00005009214) rps24 (ENSDLAG00005032750) eif4ebp2 (ENSDLAG00005029603) ppa1b (ENSDLAG00005008988) sar1ab (ENSDLAG00005008968) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000009613.a ENSGT00390000018409.h ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00940000176967 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000018409.h ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000009613.a ENSGT00390000018409.h ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Seriola ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b.q.b ENSGT00940000154332 ENSGT00950000182977.B.b.b.b.q.a.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b.q.a.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3131 prkg1a (ENSSLDG00000025436) dkk1a (ENSSLDG00000025445) pcdh15a (ENSSLDG00000025464) plek (ENSSLDG00000025531) prokr1b (ENSSLDG00000025532) BFSP1 (ENSSLDG00000025533) pcsk2 (ENSSLDG00000025534) OTOR (ENSSLDG00000025535) ENSSLDG00000025536 polh (ENSSLDG00000025537) ENSSLDG00000025538 ENSSLDG00000025539 ENSSLDG00000025540 ENSSLDG00000025541 ENSSLDG00000025542 vdac2 (ENSSLDG00000025543) ##22 ENSSLDG00000025544 comtd1 (ENSSLDG00000025545) znf503 (ENSSLDG00000025546) lrmda (ENSSLDG00000025547) KCNMA1 (ENSSLDG00000025548) dlg5a (ENSSLDG00000025549) anxa11a (ENSSLDG00000025550) zcchc24 (ENSSLDG00000025551) ppifa (ENSSLDG00000025552) zmiz1a (ENSSLDG00000025553) rps24 (ENSSLDG00000025555) eif4ebp2 (ENSSLDG00000025556) ppa1b (ENSSLDG00000025557) sar1ab (ENSSLDG00000025558) tysnd1 (ENSSLDG00000025559) Greater amberjack MODERN SPECIES 147 ENSSDUG00000013239 pcdh15a (ENSSDUG00000011835) plek (ENSSDUG00000011738) ENSSDUG00000011726 prokr1b (ENSSDUG00000011720) BFSP1 (ENSSDUG00000011650) pcsk2 (ENSSDUG00000011595) OTOR (ENSSDUG00000011579) GTPBP2 (ENSSDUG00000011533) polh (ENSSDUG00000011500) ENSSDUG00000011487 ENSSDUG00000011473 ENSSDUG00000011464 ENSSDUG00000011452 ENSSDUG00000011430 vdac2 (ENSSDUG00000011407) ##22 ENSSDUG00000011402 comtd1 (ENSSDUG00000011339) znf503 (ENSSDUG00000011322) lrmda (ENSSDUG00000011237) KCNMA1 (ENSSDUG00000011189) dlg5a (ENSSDUG00000011056) anxa11a (ENSSDUG00000011017) zcchc24 (ENSSDUG00000011008) ppifa (ENSSDUG00000010985) zmiz1a (ENSSDUG00000010866) rps24 (ENSSDUG00000010831) eif4ebp2 (ENSSDUG00000010817) ppa1b (ENSSDUG00000010797) sar1ab (ENSSDUG00000010773) tysnd1 (ENSSDUG00000010765) Barramundi perch MODERN SPECIES 211 plek (ENSLCAG00010011443) prokr1b (ENSLCAG00010011441) BFSP1 (ENSLCAG00010011436) pcsk2 (ENSLCAG00010011341) OTOR (ENSLCAG00010011307) GTPBP2 (ENSLCAG00010011302) polh (ENSLCAG00010011296) ENSLCAG00010011294 ENSLCAG00010011287 ENSLCAG00010011283 ENSLCAG00010011276 vdac2 (ENSLCAG00010011270) ##22 ENSLCAG00010011266 comtd1 (ENSLCAG00010011261) znf503 (ENSLCAG00010011258) lrmda (ENSLCAG00010011253) KCNMA1 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ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Tongue sole MODERN SPECIES 3 ENSCSEG00000001568 ENSCSEG00000001495 macroh2a2 (ENSCSEG00000001483) ENSCSEG00000001453 GBF1 (ENSCSEG00000001430) CCDC88A (ENSCSEG00000001262) ugp2b (ENSCSEG00000001237) MDH1 (ENSCSEG00000001022) WDPCP (ENSCSEG00000001003) otx1 (ENSCSEG00000000992) EHBP1 (ENSCSEG00000000951) GTPBP2 (ENSCSEG00000000936) polh (ENSCSEG00000000930) ENSCSEG00000000924 comtd1 (ENSCSEG00000000915) vdac2 (ENSCSEG00000000908) ##22 ENSCSEG00000000901 pcgf6 (ENSCSEG00000000895) sertad2b (ENSCSEG00000000893) slc1a4 (ENSCSEG00000000884) ENSCSEG00000000875 ENSCSEG00000000869 OGFRL1 (ENSCSEG00000000866) ENSCSEG00000000856 ENSCSEG00000000852 cfap36 (ENSCSEG00000000835) ppp4r3b (ENSCSEG00000000830) PNPT1 (ENSCSEG00000000809) ENSCSEG00000000795 ENSCSEG00000000786 papolg (ENSCSEG00000000771) Turbot MODERN SPECIES 6 MINPP1 (ENSSMAG00000020410) ENSSMAG00000020414 sgms1a (ENSSMAG00000020417) prkg1a (ENSSMAG00000020419) ENSSMAG00000020425 pcdh15a (ENSSMAG00000020429) plek (ENSSMAG00000020641) prokr1b (ENSSMAG00000020647) BFSP1 (ENSSMAG00000020649) pcsk2 (ENSSMAG00000020650) OTOR (ENSSMAG00000034993) ENSSMAG00000020653 ENSSMAG00000020655 ENSSMAG00000020656 ENSSMAG00000020658 vdac2 (ENSSMAG00000020662) ##22 ENSSMAG00000020664 comtd1 (ENSSMAG00000020676) znf503 (ENSSMAG00000036362) lrmda (ENSSMAG00000020681) ENSSMAG00000020684 KCNMA1 (ENSSMAG00000020686) dlg5a (ENSSMAG00000020691) ENSSMAG00000020716 zcchc24 (ENSSMAG00000020721) ppifa (ENSSMAG00000020729) zmiz1a (ENSSMAG00000020731) rps24 (ENSSMAG00000020751) eif4ebp2 (ENSSMAG00000030557) ppa1b (ENSSMAG00000020755) sar1ab (ENSSMAG00000020758) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000018409.h ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000176967 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000018409.h ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000176967 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Climbing perch MODERN SPECIES 6 sgms1a (ENSATEG00000005569) prkg1a (ENSATEG00000005482) ENSATEG00000005467 pcdh15a (ENSATEG00000004779) plek (ENSATEG00000004719) prokr1b (ENSATEG00000027943) BFSP1 (ENSATEG00000004650) pcsk2 (ENSATEG00000004440) OTOR (ENSATEG00000004429) ENSATEG00000004370 ENSATEG00000004318 ENSATEG00000004303 ENSATEG00000025406 ENSATEG00000004274 ENSATEG00000004255 vdac2 (ENSATEG00000004219) ##22 ENSATEG00000004190 comtd1 (ENSATEG00000026402) znf503 (ENSATEG00000004114) lrmda (ENSATEG00000004079) KCNMA1 (ENSATEG00000003963) dlg5a (ENSATEG00000003830) ENSATEG00000003799 anxa11a (ENSATEG00000003738) zcchc24 (ENSATEG00000028680) ppifa (ENSATEG00000003699) zmiz1a (ENSATEG00000003581) rps24 (ENSATEG00000003561) eif4ebp2 (ENSATEG00000003554) ppa1b (ENSATEG00000003490) sar1ab (ENSATEG00000003466) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 6 plek (ENSBSLG00000021761) prokr1b (ENSBSLG00000021695) BFSP1 (ENSBSLG00000021648) pcsk2 (ENSBSLG00000021443) OTOR (ENSBSLG00000021406) GTPBP2 (ENSBSLG00000021281) ENSBSLG00000021245 polh (ENSBSLG00000021178) ENSBSLG00000021151 ENSBSLG00000021117 ENSBSLG00000021100 ENSBSLG00000021064 ENSBSLG00000021026 ENSBSLG00000020845 ENSBSLG00000020844 vdac2 (ENSBSLG00000020830) ##22 ENSBSLG00000020806 znf503 (ENSBSLG00000020798) lrmda (ENSBSLG00000020791) ENSBSLG00000020789 KCNMA1 (ENSBSLG00000017294) dlg5a (ENSBSLG00000015284) zcchc24 (ENSBSLG00000015157) ppifa (ENSBSLG00000014622) zmiz1a (ENSBSLG00000014134) rps24 (ENSBSLG00000013645) eif4ebp2 (ENSBSLG00000013629) ppa1b (ENSBSLG00000013522) sar1ab (ENSBSLG00000013471) tysnd1 (ENSBSLG00000013456) SPOCK2 (ENSBSLG00000013436) Zig-zag eel MODERN SPECIES 6 papss2a (ENSMAMG00000021044) ENSMAMG00000021071 sgms1a (ENSMAMG00000021075) prkg1a (ENSMAMG00000021083) ENSMAMG00000027893 pcdh15a (ENSMAMG00000021121) plek (ENSMAMG00000021143) prokr1b (ENSMAMG00000021149) BFSP1 (ENSMAMG00000021151) pcsk2 (ENSMAMG00000021164) OTOR (ENSMAMG00000021175) ENSMAMG00000021180 ENSMAMG00000021195 ENSMAMG00000021198 ENSMAMG00000021205 vdac2 (ENSMAMG00000021208) ##22 ENSMAMG00000026123 comtd1 (ENSMAMG00000021228) znf503 (ENSMAMG00000021237) lrmda (ENSMAMG00000021238) KCNMA1 (ENSMAMG00000021248) dlg5a (ENSMAMG00000021260) ENSMAMG00000021283 zcchc24 (ENSMAMG00000021293) ppifa (ENSMAMG00000021290) zmiz1a (ENSMAMG00000021297) rps24 (ENSMAMG00000024622) eif4ebp2 (ENSMAMG00000025969) ppa1b (ENSMAMG00000021312) sar1ab (ENSMAMG00000021314) tysnd1 (ENSMAMG00000021316) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000176967 ENSGT00940000169918 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000004632 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00940000176967 ENSGT00940000169918 ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000004632 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00940000176967 ENSGT00940000169918 ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000018409.h.y ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00940000176967 ENSGT00940000169918 ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 3 sgms1a (ENSKMAG00000019544) prkg1a (ENSKMAG00000019480) dkk1a (ENSKMAG00000019456) pcdh15a (ENSKMAG00000019219) plek (ENSKMAG00000019135) prokr1b (ENSKMAG00000019117) BFSP1 (ENSKMAG00000019099) pcsk2 (ENSKMAG00000019075) OTOR (ENSKMAG00000019055) GTPBP2 (ENSKMAG00000019007) polh (ENSKMAG00000018975) ENSKMAG00000018959 ENSKMAG00000018942 ENSKMAG00000018922 ENSKMAG00000018903 vdac2 (ENSKMAG00000018870) ##22 comtd1 (ENSKMAG00000018851) ENSKMAG00000018796 ENSKMAG00000018771 znf503 (ENSKMAG00000018758) lrmda (ENSKMAG00000018743) KCNMA1 (ENSKMAG00000018677) dlg5a (ENSKMAG00000018480) ENSKMAG00000018391 zcchc24 (ENSKMAG00000018357) ppifa (ENSKMAG00000018348) zmiz1a (ENSKMAG00000018182) rps24 (ENSKMAG00000018121) eif4ebp2 (ENSKMAG00000018101) ppa1b (ENSKMAG00000018054) sar1ab (ENSKMAG00000018006) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1612 AFTPHA (ENSNFUG00015024338) ENSNFUG00015024333 lgalslb (ENSNFUG00015024326) ENSNFUG00015024317 PELI1B (ENSNFUG00015024315) ugp2b (ENSNFUG00015024190) mdh1aa (ENSNFUG00015024144) ENSNFUG00015024137 WDPCP (ENSNFUG00015024135) OTX1B (ENSNFUG00015024133) ENSNFUG00015024132 EHBP1 (ENSNFUG00015024071) B3GNT2B (ENSNFUG00015024061) ENSNFUG00015024060 ENSNFUG00015024057 VDAC2 (ENSNFUG00015023972) ##22 ENSNFUG00015023949 comtd1 (ENSNFUG00015023943) ENSNFUG00015023938 OPRD1B (ENSNFUG00015023936) tcea3 (ENSNFUG00015023905) lrmda (ENSNFUG00015023874) KCNMA1 (ENSNFUG00015023512) ENSNFUG00015023481 DLG5A (ENSNFUG00015022897) anxa11a (ENSNFUG00015022573) ZCCHC24 (ENSNFUG00015022554) ppifa (ENSNFUG00015022549) FAS (ENSNFUG00015022539) Nfu_g_1_002795 (ENSNFUG00015022516) PAPSS2 (ENSNFUG00015022029) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158306 ENSGT00390000004632 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00940000169918 ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c 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ENSPREG00000015294 ENSPREG00000015311 vdac2 (ENSPREG00000015321) ##22 ENSPREG00000015348 comtd1 (ENSPREG00000015368) znf503 (ENSPREG00000015386) lrmda (ENSPREG00000015411) KCNMA1 (ENSPREG00000015442) dlg5a (ENSPREG00000015514) ENSPREG00000015723 zcchc24 (ENSPREG00000015920) ppifa (ENSPREG00000015930) zmiz1a (ENSPREG00000015962) rps24 (ENSPREG00000016003) eif4ebp2 (ENSPREG00000016033) ppa1b (ENSPREG00000016060) sar1ab (ENSPREG00000016098) tysnd1 (ENSPREG00000016119) Platyfish MODERN SPECIES 14 ENSXMAG00000021079 ENSXMAG00000012957 papss2a (ENSXMAG00000012962) minpp1a (ENSXMAG00000012975) sgms1a (ENSXMAG00000028907) prkg1a (ENSXMAG00000010661) ENSXMAG00000025380 pcdh15a (ENSXMAG00000010653) plek (ENSXMAG00000010640) BFSP1 (ENSXMAG00000028704) pcsk2 (ENSXMAG00000010620) OTOR (ENSXMAG00000028311) GTPBP2 (ENSXMAG00000010601) polh (ENSXMAG00000010580) ENSXMAG00000010577 vdac2 (ENSXMAG00000010569) ##22 ENSXMAG00000010559 comtd1 (ENSXMAG00000021617) znf503 (ENSXMAG00000010546) lrmda 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ENSGT00940000165723.b ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00940000169918 ENSGT00940000176967 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 ENSGT00940000157107.a.b Indian medaka MODERN SPECIES 27 papss2a (ENSOMEG00000006234) minpp1a (ENSOMEG00000006206) sgms1a (ENSOMEG00000006190) ENSOMEG00000000989 prkg1a (ENSOMEG00000006154) ENSOMEG00000006102 pcdh15a (ENSOMEG00000006053) plek (ENSOMEG00000005838) prokr1b (ENSOMEG00000005788) BFSP1 (ENSOMEG00000005772) pcsk2 (ENSOMEG00000005740) OTOR (ENSOMEG00000005674) GTPBP2 (ENSOMEG00000005661) polh (ENSOMEG00000005622) ENSOMEG00000005596 vdac2 (ENSOMEG00000005547) ##22 ENSOMEG00000005489 znf503 (ENSOMEG00000005479) lrmda (ENSOMEG00000005461) ENSOMEG00000005436 ENSOMEG00000005402 dlg5a (ENSOMEG00000005357) anxa11a (ENSOMEG00000005187) zcchc24 (ENSOMEG00000005155) ppifa (ENSOMEG00000005136) zmiz1a (ENSOMEG00000005111) rps24 (ENSOMEG00000005046) eif4ebp2 (ENSOMEG00000005016) ppa1b (ENSOMEG00000004996) sar1ab (ENSOMEG00000004948) tysnd1 (ENSOMEG00000004942) Javanese ricefish MODERN SPECIES 6 ENSOJAG00000018846 papss2a (ENSOJAG00000018936) minpp1a (ENSOJAG00000019373) sgms1a (ENSOJAG00000019381) prkg1a (ENSOJAG00000019452) ENSOJAG00000019796 pcdh15a (ENSOJAG00000020054) plek (ENSOJAG00000021739) ENSOJAG00000021751 prokr1b (ENSOJAG00000021753) BFSP1 (ENSOJAG00000021760) pcsk2 (ENSOJAG00000021835) OTOR (ENSOJAG00000021983) GTPBP2 (ENSOJAG00000022002) ENSOJAG00000022040 vdac2 (ENSOJAG00000022042) ##22 ENSOJAG00000022051 znf503 (ENSOJAG00000022069) lrmda (ENSOJAG00000022072) KCNMA1 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ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 ENSGT00940000157107.a.b Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 6 papss2a (ENSORLG00000006251) minpp1a (ENSORLG00000006259) sgms1a (ENSORLG00000006277) prkg1 (ENSORLG00000006327) ENSORLG00000026993 dkk1a (ENSORLG00000006345) pcdh15a (ENSORLG00000023071) plek (ENSORLG00000006378) prokr1b (ENSORLG00000006384) BFSP1 (ENSORLG00000006395) pcsk2 (ENSORLG00000006472) OTOR (ENSORLG00000023881) ENSORLG00000006506 polh (ENSORLG00000006526) ENSORLG00000022482 vdac2 (ENSORLG00000006552) ##22 ENSORLG00000022435 ENSORLG00000024726 znf503 (ENSORLG00000006570) lrmda (ENSORLG00000006576) KCNMA1 (ENSORLG00000006622) dlg5a (ENSORLG00000006667) anxa11a (ENSORLG00000006673) zcchc24 (ENSORLG00000021845) ppifa (ENSORLG00000006690) zmiz1a (ENSORLG00000006719) rps24 (ENSORLG00000006739) eif4ebp2 (ENSORLG00000022491) ppa1b (ENSORLG00000006765) sar1ab (ENSORLG00000006779) tysnd1 (ENSORLG00000006784) Chinese medaka MODERN SPECIES 557 ENSOSIG00000010675 ENSOSIG00000010676 papss2a (ENSOSIG00000010713) minpp1a (ENSOSIG00000014016) sgms1a (ENSOSIG00000014019) prkg1a (ENSOSIG00000014035) dkk1a (ENSOSIG00000014247) pcdh15a (ENSOSIG00000014258) prokr1b (ENSOSIG00000016099) BFSP1 (ENSOSIG00000016100) pcsk2 (ENSOSIG00000016107) OTOR (ENSOSIG00000016381) GTPBP2 (ENSOSIG00000016382) ENSOSIG00000016383 ENSOSIG00000016386 vdac2 (ENSOSIG00000016393) ##22 ENSOSIG00000016782 znf503 (ENSOSIG00000016786) lrmda (ENSOSIG00000016790) KCNMA1 (ENSOSIG00000016957) dlg5a (ENSOSIG00000020835) ENSOSIG00000020936 anxa11a (ENSOSIG00000021055) zcchc24 (ENSOSIG00000022217) ppifa (ENSOSIG00000022222) zmiz1a (ENSOSIG00000022264) rps24 (ENSOSIG00000022315) ENSOSIG00000022318 sar1ab (ENSOSIG00000022321) tysnd1 (ENSOSIG00000022322) SPOCK2 (ENSOSIG00000022333) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000176967 ENSGT00940000169918 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00940000176967 ENSGT00940000169918 ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000176967 ENSGT00940000169918 ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b 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(ENSSPAG00000008186) prokr1b (ENSSPAG00000008175) BFSP1 (ENSSPAG00000008143) pcsk2 (ENSSPAG00000008093) OTOR (ENSSPAG00000008082) GTPBP2 (ENSSPAG00000008019) polh (ENSSPAG00000007999) ENSSPAG00000007985 ENSSPAG00000007952 ENSSPAG00000007931 vdac2 (ENSSPAG00000007893) ##22 ENSSPAG00000007877 comtd1 (ENSSPAG00000007847) znf503 (ENSSPAG00000007834) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00940000176967.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b ENSGT00940000176967.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.b.i.b.a ENSGT00940000176967.a.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b.j ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a ENSGT00390000014627 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000158306 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00950000182977.B.b.b.b.i.b.a ENSGT00940000176967.a.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b.j ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT00940000164656.b.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00440000038232 ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000157885 ENSGT00940000166657 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000156965 ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00940000157048 ENSGT00940000176967.a.b.a ENSGT00950000182977.B.b.b.b.i.b.b ENSGT00940000176967.a.b.b ENSGT00940000176967.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00940000154935.c.a.b ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000166790 ENSGT00940000164656.b.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234539.b.b.b.a.b ENSGT00390000000153 ENSGT00940000155342 ENSGT00390000017004.a.b.`b ENSGT00940000165770.a Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 275 sgms1a (ENSHBUG00000018569) prkg1a (ENSHBUG00000018705) dkk1a (ENSHBUG00000018709) pcdh15a (ENSHBUG00000019877) plek (ENSHBUG00000019951) prokr1b (ENSHBUG00000019964) BFSP1 (ENSHBUG00000019976) pcsk2 (ENSHBUG00000019983) OTOR (ENSHBUG00000019990) GTPBP2 (ENSHBUG00000020061) polh (ENSHBUG00000020105) ENSHBUG00000020115 ENSHBUG00000020140 ENSHBUG00000020150 ENSHBUG00000020158 vdac2 (ENSHBUG00000020188) ##22 ENSHBUG00000020207 comtd1 (ENSHBUG00000000747) znf503 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MODERN SPECIES 4 pcdh15a (ENSACLG00000015076) plek (ENSACLG00000014995) prokr1b (ENSACLG00000014942) BFSP1 (ENSACLG00000014928) pcsk2 (ENSACLG00000014907) OTOR (ENSACLG00000014897) GTPBP2 (ENSACLG00000014839) polh (ENSACLG00000014800) ENSACLG00000014766 ENSACLG00000014732 ENSACLG00000014720 ENSACLG00000014699 ENSACLG00000014680 ENSACLG00000014662 ENSACLG00000014644 vdac2 (ENSACLG00000014596) ##22 ENSACLG00000014551 comtd1 (ENSACLG00000014532) ENSACLG00000014439 znf503 (ENSACLG00000014431) lrmda (ENSACLG00000014379) KCNMA1 (ENSACLG00000013694) dlg5a (ENSACLG00000013617) anxa11a (ENSACLG00000013566) zcchc24 (ENSACLG00000013545) ppifa (ENSACLG00000013099) ENSACLG00000013091 zmiz1a (ENSACLG00000013079) rps24 (ENSACLG00000013068) eif4ebp2 (ENSACLG00000013067) ppa1b (ENSACLG00000013062) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1095 pcdh15a (ENSMZEG00005027576) plek (ENSMZEG00005027577) prokr1b (ENSMZEG00005027578) BFSP1 (ENSMZEG00005027579) pcsk2 (ENSMZEG00005027580) OTOR (ENSMZEG00005027581) GTPBP2 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EIF4EBP2 (ENSOKIG00005025302) ppa1b (ENSOKIG00005025337) sar1ab (ENSOKIG00005025381) tysnd1 (ENSOKIG00005025413) SPOCK2 (ENSOKIG00005025428) ENSOKIG00005025441 scdb (ENSOKIG00005025450) WNT8B (ENSOKIG00005025465) hif1an (ENSOKIG00005025509) PLCE1 (ENSOKIG00005025598) mrpl57 (ENSOKIG00005025747) KCNH1 (ENSOKIG00005025773) ENSOKIG00005025875 ENSOKIG00005025937 VDAC2 (ENSOKIG00005025997) ##22 ENSOKIG00005026187 comtd1 (ENSOKIG00005026195) ENSOKIG00005026213 comtd1 (ENSOKIG00005026226) ENSOKIG00005026247 znf503 (ENSOKIG00005026264) lrmda (ENSOKIG00005026287) ENSOKIG00005026302 KCNMA1 (ENSOKIG00005026716) ENSOKIG00005038655 dlg5a (ENSOKIG00005038715) anxa11a (ENSOKIG00005039615) ENSOKIG00005041833 ZFAND4 (ENSOKIG00005041845) marchf8 (ENSOKIG00005041891) Rainbow trout MODERN SPECIES ENSOMYG00000047476 ENSOMYG00000047486 ENSOMYG00000068550 ENSOMYG00000047487 scdb (ENSOMYG00000058460) ENSOMYG00000047495 ENSOMYG00000052803 fih1 (ENSOMYG00000047500) ENSOMYG00000047539 ENSOMYG00000054195 ENSOMYG00000047564 ENSOMYG00000025742 ENSOMYG00000061088 ENSOMYG00000025830 ENSOMYG00000025885 vdac2 (ENSOMYG00000025946) ##22 ENSOMYG00000067627 comtd1 (ENSOMYG00000026039) ENSOMYG00000026093 ENSOMYG00000051624 ENSOMYG00000061708 ENSOMYG00000026115 ENSOMYG00000060285 ENSOMYG00000073926 ENSOMYG00000026000 ENSOMYG00000075025 znf503 (ENSOMYG00000026129) lrmda (ENSOMYG00000026150) ENSOMYG00000058026 KCNMA1 (ENSOMYG00000028680) ENSOMYG00000073138 Huchen MODERN SPECIES 574 EIF4EBP2 (ENSHHUG00000005556) ppa1b (ENSHHUG00000005516) sar1ab (ENSHHUG00000005483) tysnd1 (ENSHHUG00000005434) SPOCK2 (ENSHHUG00000005428) ENSHHUG00000005419 scdb (ENSHHUG00000005369) wnt8b (ENSHHUG00000005332) hif1an (ENSHHUG00000005254) PLCE1 (ENSHHUG00000005190) mrpl57 (ENSHHUG00000005184) kcnh1a (ENSHHUG00000005103) ENSHHUG00000005096 ENSHHUG00000004947 vdac2 (ENSHHUG00000004763) ##22 ENSHHUG00000004757 ENSHHUG00000004755 ENSHHUG00000004748 ENSHHUG00000004656 comtd1 (ENSHHUG00000004639) Northern pike MODERN SPECIES 5 sar1ab (ENSELUG00000024279) tysnd1 (ENSELUG00000024236) SPOCK2 (ENSELUG00000024218) ENSELUG00000024146 dnajb12a (ENSELUG00000024163) trmt2b (ENSELUG00000024144) scdb (ENSELUG00000024135) wnt8b (ENSELUG00000024097) hif1an (ENSELUG00000024069) PLCE1 (ENSELUG00000024002) mrpl57 (ENSELUG00000023731) KCNH1 (ENSELUG00000023726) hhat (ENSELUG00000023687) CRIP3 (ENSELUG00000023677) ENSELUG00000023425 vdac2 (ENSELUG00000023357) ##22 ENSELUG00000023308 ifit8 (ENSELUG00000023296) ENSELUG00000023291 ENSELUG00000027155 ENSELUG00000023283 comtd1 (ENSELUG00000023265) ENSELUG00000034245 znf503 (ENSELUG00000023250) lrmda (ENSELUG00000023237) KCNMA1 (ENSELUG00000023215) dlg5a (ENSELUG00000023155) anxa11a (ENSELUG00000023085) ENSELUG00000023002 zfand4 (ENSELUG00000022926) ENSELUG00000026905 Otomorpha DUPLICATION Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000164426.c ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.A.a.a.a 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ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00940000154935.c.b.a.a ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000173647 ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 136 ENSGT00940000160638.n ENSGT00390000017548.b.b ENSGT00950000182990.b ENSGT00940000161116.w.b ENSGT00390000004428.a.b ENSGT00390000003595 ENSGT00940000164426.c ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q.c ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000165077 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000173647 ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b 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tetra MODERN SPECIES 116 fam53b (ENSAMXG00000037052) lhpp (ENSAMXG00000001319) oat (ENSAMXG00000033395) CHST15 (ENSAMXG00000030259) tvp23b (ENSAMXG00000040559) exoc7 (ENSAMXG00000035608) ENSAMXG00000034862 vclb (ENSAMXG00000042904) adkb (ENSAMXG00000013461) ENSAMXG00000030866 ENSAMXG00000041055 DUSP13 (ENSAMXG00000006707) ENSAMXG00000034948 ENSAMXG00000030855 SAMD8 (ENSAMXG00000006691) VDAC2 (ENSAMXG00000035617) ##22 COMTD1 (ENSAMXG00000039488) ZNF503 (ENSAMXG00000031112) ENSAMXG00000030320 ENSAMXG00000039222 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1517 VDAC2 (ENSPNAG00000016221) ##22 COMTD1 (ENSPNAG00000016259) ZNF503 (ENSPNAG00000016268) Electric eel MODERN SPECIES 120 UBE2B (ENSEEEG00000024310) #16 cdkn2aipnl (ENSEEEG00000024309) #15 JADE2 (ENSEEEG00000024308) #14 sar1b (ENSEEEG00000024306) THRA (ENSEEEG00000024269) ENSEEEG00000024239 ENSEEEG00000024236 mrpl27 (ENSEEEG00000024235) EME1 (ENSEEEG00000024234) ca10a (ENSEEEG00000024233) DUSP13 (ENSEEEG00000024232) ENSEEEG00000024231 SAMD8 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ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 ENSGT00390000005448.e ENSGT00940000165641 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 606 ENSGT00940000166490.a.e ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q.c ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a.f ENSGT00940000154935.c.b.a.a.b ENSGT00940000156914.o.a.c ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008.f ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b.ub ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645.a ENSGT00940000158426.c Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 366 ENSGT00390000003070.b.c.a ENSGT00390000017548.b.b.d ENSGT00950000182990.b.e ENSGT00940000161116.w.b.a ENSGT00390000004428.a.b.d ENSGT00390000003595.i.b ENSGT00940000164426.c ENSGT01030000234543.D.n.g ENSGT00390000014320.c.a.e.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000155540.b.b.j ENSGT00940000166490.a.f ENSGT00940000155540.b.b.i ENSGT00950000182869.e.a.a.q.c ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a.f ENSGT00940000154935.c.b.a.a.b ENSGT00940000155303.k.d ENSGT00940000156914.o.a.c ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008.f ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b.ub ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645.a ENSGT00940000158426.c Common carp reference DUPLICATION Common carp reference MODERN SPECIES 44 ENSCCRG00000066038 hid1b (ENSCCRG00000011205) ENSCCRG00000019079 ENSCCRG00000019072 ENSCCRG00000019069 ENSCCRG00000070412 trim16 (ENSCCRG00000056501) tvp23b (ENSCCRG00000070572) exoc7 (ENSCCRG00000077506) ENSCCRG00000066328 vclb (ENSCCRG00000067790) adkb (ENSCCRG00000025883) DUSP13 (ENSCCRG00000071582) SAMD8 (ENSCCRG00000019230) ENSCCRG00000019171 VDAC2 (ENSCCRG00000057254) ##22 COMTD1 (ENSCCRG00000053993) ZNF503 (ENSCCRG00000070035) KCNMA1 (ENSCCRG00000036155) DLG5 (ENSCCRG00000024709) anxa11b (ENSCCRG00000007433) ZCCHC24 (ENSCCRG00000073191) ppifb (ENSCCRG00000077588) ZMIZ1 (ENSCCRG00000003862) polr3a 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Golden-line barbel DUPLICATION Golden-line barbel MODERN SPECIES 235 ENSSGRG00000019678 ENSSGRG00000019680 ENSSGRG00000019681 hid1b (ENSSGRG00000019684) USH1G (ENSSGRG00000019993) FADS6 (ENSSGRG00000019995) trim16 (ENSSGRG00000019998) tvp23b (ENSSGRG00000019999) exoc7 (ENSSGRG00000020056) ENSSGRG00000022421 vclb (ENSSGRG00000022450) ADK (ENSSGRG00000023760) ENSSGRG00000023795 ENSSGRG00000023802 SAMD8 (ENSSGRG00000023804) ENSSGRG00000023805 ##22 COMTD1 (ENSSGRG00000023807) ZNF503 (ENSSGRG00000023809) KCNMA1 (ENSSGRG00000023960) DLG5 (ENSSGRG00000030372) anxa11b (ENSSGRG00000030395) ZCCHC24 (ENSSGRG00000031568) ppifb (ENSSGRG00000031569) ZMIZ1 (ENSSGRG00000031594) ENSSGRG00000031673 ENSSGRG00000031678 ADAMTS14 (ENSSGRG00000031747) pald1a (ENSSGRG00000031753) ENSSGRG00000032016 lrrc20 (ENSSGRG00000032018) ENSSGRG00000032019 Golden-line barbel MODERN SPECIES 197 ENSSGRG00000038758 hid1b (ENSSGRG00000038757) USH1G (ENSSGRG00000038755) FADS6 (ENSSGRG00000038754) trim16 (ENSSGRG00000038752) 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(ENSDCDG00000003322) Denticle herring MODERN SPECIES 11 itga3b (ENSDCDG00000002157) dlx3b (ENSDCDG00000002164) dlx4b (ENSDCDG00000002167) ENSDCDG00000002168 kat7b (ENSDCDG00000002177) ptges3l (ENSDCDG00000002205) g6pc1a.1 (ENSDCDG00000002209) g6pc1a.2 (ENSDCDG00000002231) aarsd1 (ENSDCDG00000002244) adkb (ENSDCDG00000002266) KAT6B (ENSDCDG00000002290) ENSDCDG00000002294 DUSP13 (ENSDCDG00000002297) ENSDCDG00000002298 SAMD8 (ENSDCDG00000000134) VDAC2 (ENSDCDG00000000160) ##22 COMTD1 (ENSDCDG00000000256) ZNF503 (ENSDCDG00000000297) KCNMA1 (ENSDCDG00000000531) DLG5 (ENSDCDG00000000929) adkb (ENSDCDG00000000964) KAT6B (ENSDCDG00000000970) ENSDCDG00000000978 DUSP13 (ENSDCDG00000000986) ENSDCDG00000000989 SAMD8 (ENSDCDG00000000998) VDAC2 (ENSDCDG00000001032) ##22 COMTD1 (ENSDCDG00000001112) ZNF503 (ENSDCDG00000001117) KCNMA1 (ENSDCDG00000001213) DLG5 (ENSDCDG00000001713) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183185.c.a.b.a.a ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000154395.a.a.a.b 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alox5a (ENSPNAG00000027136) ENSPNAG00000006862 zfand4 (ENSPNAG00000007097) marchf8 (ENSPNAG00000027410) vdac2 (ENSPNAG00000005273) ##22 ENSPNAG00000027469 ifit8 (ENSPNAG00000027476) comtd1 (ENSPNAG00000027732) znf503 (ENSPNAG00000027759) lrmda (ENSPNAG00000004261) kcnma1a (ENSPNAG00000027930) ENSPNAG00000027955 dlg5a (ENSPNAG00000028221) anxa11a (ENSPNAG00000028657) MOCOS (ENSPNAG00000028740) zgc:110045 (ENSPNAG00000004501) ENSPNAG00000006838 vwc2 (ENSPNAG00000029192) SPATA48 (ENSPNAG00000004535) ikzf1 (ENSPNAG00000004566) Mexicana tetra MODERN SPECIES 17 ENSAMXG00000039931 ENSAMXG00000040191 si:ch211-198a12.6 (ENSAMXG00000026056) stox1 (ENSAMXG00000001371) ccar1 (ENSAMXG00000001383) zgc:110319 (ENSAMXG00000033105) si:dkey-228d14.5 (ENSAMXG00000001412) eif4e1c (ENSAMXG00000029997) TET1 (ENSAMXG00000001451) ENSAMXG00000029609 slc25a16 (ENSAMXG00000031377) alox5a (ENSAMXG00000001474) ENSAMXG00000001490 zfand4 (ENSAMXG00000040329) marchf8 (ENSAMXG00000040189) vdac2 (ENSAMXG00000001543) ##22 ENSAMXG00000040989 ifit8 (ENSAMXG00000032260) comtd1 (ENSAMXG00000001561) ENSAMXG00000036643 znf503 (ENSAMXG00000042362) ENSAMXG00000040919 lrmda (ENSAMXG00000038778) kcnma1a (ENSAMXG00000001588) ENSAMXG00000035070 dlg5a (ENSAMXG00000001625) anxa11a (ENSAMXG00000033610) MOCOS (ENSAMXG00000001739) ENSAMXG00000001760 vwc2 (ENSAMXG00000033541) SPATA48 (ENSAMXG00000001803) Electric eel MODERN SPECIES 1 ENSEEEG00000008670 slc25a16 (ENSEEEG00000008667) alox5a (ENSEEEG00000008660) ENSEEEG00000008655 zfand4 (ENSEEEG00000008654) marchf8 (ENSEEEG00000008650) vdac2 (ENSEEEG00000008142) ##22 ENSEEEG00000008123 ifit8 (ENSEEEG00000008121) znf503 (ENSEEEG00000008119) lrmda (ENSEEEG00000008116) kcnma1a (ENSEEEG00000006264) dlg5a (ENSEEEG00000006191) ENSEEEG00000005282 MOCOS (ENSEEEG00000005202) ENSEEEG00000005191 vwc2 (ENSEEEG00000005186) ikzf1 (ENSEEEG00000005094) fignl1 (ENSEEEG00000005088) ttl (ENSEEEG00000005087) klc1a (ENSEEEG00000004989) coa8 (ENSEEEG00000004958) Channel catfish MODERN SPECIES 22 ENSIPUG00000005349 ENSIPUG00000005336 STOX1 (ENSIPUG00000005320) ccar1 (ENSIPUG00000005123) si:dkey-228d14.5 (ENSIPUG00000005094) eif4e1c (ENSIPUG00000005027) tet1 (ENSIPUG00000005004) Slc25a16 (ENSIPUG00000004964) ALOX5 (ENSIPUG00000004930) Fam21 (ENSIPUG00000004769) zfand4 (ENSIPUG00000004728) marchf8 (ENSIPUG00000004619) ENSIPUG00000004606 ENSIPUG00000004596 ckba (ENSIPUG00000004569) vdac2 (ENSIPUG00000004553) ##22 ENSIPUG00000004549 ifit8 (ENSIPUG00000004546) comtd1 (ENSIPUG00000004535) znf503 (ENSIPUG00000004515) CJ011 (ENSIPUG00000004493) kcnma1a (ENSIPUG00000004383) dlg5 (ENSIPUG00000004020) anxa11a (ENSIPUG00000003965) mocos (ENSIPUG00000003946) zgc:110045 (ENSIPUG00000003932) ENSIPUG00000003914 vwc2 (ENSIPUG00000003893) c3h7orf72 (ENSIPUG00000003880) ikzf1 (ENSIPUG00000003841) fignl1 (ENSIPUG00000003825) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01100000263516.a.b.b.b.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000156323.d.c.a ENSGT00940000156323.d.c.b ENSGT00950000183169.C ENSGT00520000055589.c.g ENSGT00530000063672.a ENSGT00940000166680 ENSGT01030000234578.A.b.a.b ENSGT00940000166192 ENSGT00940000158935 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000156111.d ENSGT00940000153997.b.b ENSGT00940000155716 ENSGT00940000158282 ENSGT00950000182869.e.a.a.q.d ##22 ENSGT00940000161685.A.b ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935.d ENSGT00940000155303.l ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00940000157051 ENSGT00940000162185 ENSGT00940000162768.A ENSGT00720000108792.A ENSGT00940000175717 ENSGT00940000162844 ENSGT00940000156782.c Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 87 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a.a.b.d ENSGT01100000263516.a.b.b.b.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000156323.d.c.a.b ENSGT00940000156323.d.c.b.b.a ENSGT00520000055589.c.g.b ENSGT00530000063672.a.s ENSGT00940000166680.b ENSGT01030000234578.A.b.a.b.c ENSGT00940000166192.c.b ENSGT00940000158935.b ENSGT00940000157520.c ENSGT00940000156111.d.b ENSGT00940000153997.b.b.b ENSGT00940000155716.r ENSGT00940000158282.d.a.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q.d.a ##22 ENSGT00940000161685.A.b.b ENSGT00950000182946.lb.b.e.a ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b.b ENSGT00940000153289.a.a.a.b ENSGT00940000154935.d.c.b ENSGT00950000184268 ENSGT00940000154935.d.c.a ENSGT00940000155303.l.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000157051.c ENSGT00940000162185 ENSGT00720000108792.A.f ENSGT00940000156782.c.f ENSGT00940000161552.d Goldfish MODERN SPECIES 31 tlr4bb (ENSCARG00000026423) ENSCARG00000026433 ENSCARG00000026447 ENSCARG00000026461 stox1 (ENSCARG00000026473) ccar1 (ENSCARG00000026508) zgc:110319 (ENSCARG00000026798) si:dkey-228d14.5 (ENSCARG00000026803) eif4e1c (ENSCARG00000026813) TET1 (ENSCARG00000026935) slc25a16 (ENSCARG00000026948) alox5a (ENSCARG00000027009) ENSCARG00000027747 zfand4 (ENSCARG00000027775) marchf8 (ENSCARG00000027821) vdac2 (ENSCARG00000027913) ##22 ENSCARG00000029201 ifit8 (ENSCARG00000029209) comtd1 (ENSCARG00000029223) znf503 (ENSCARG00000029284) ENSCARG00000029290 lrmda (ENSCARG00000029301) ENSCARG00000029306 kcnma1a (ENSCARG00000029529) dlg5a (ENSCARG00000037005) anxa11a (ENSCARG00000044215) MOCOS (ENSCARG00000044885) ENSCARG00000045010 vwc2 (ENSCARG00000045082) ikzf1 (ENSCARG00000045160) fignl1 (ENSCARG00000045590) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT01100000263516.a.b.b.b.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000156323.d.c.a.b ENSGT00940000156323.d.c.b.b.a ENSGT00950000183169.C.h ENSGT00520000055589.c.g.b ENSGT00530000063672.a.s ENSGT00940000166680.b ENSGT01030000234578.A.b.a.b.c ENSGT00940000166192.c.b ENSGT00940000158935.b ENSGT00940000157520.c ENSGT00940000156111.d.b ENSGT00940000153997.b.b.b ENSGT00940000155716.r ENSGT00940000158282.d.a.b ENSGT00950000182869.e.a.a.q.d.a ##22 ENSGT00940000161685.A.b.a ENSGT00950000182946.lb.b.e.a ENSGT00390000004409.a.b ENSGT00390000014618.a.b.b ENSGT01020000230338.a.b.b.a.a.a.b.a.b.a.a.d.b.a ENSGT00940000153289.a.a.a.b ENSGT00940000154935.d.c.b 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(ENSCCRG00000059292) Golden-line barbel MODERN SPECIES 44 selenou1a (ENSSGRG00000048071) mat1a (ENSSGRG00000048068) zgc:154058 (ENSSGRG00000048065) ENSSGRG00000048063 si:ch211-198a12.6 (ENSSGRG00000048059) stox1 (ENSSGRG00000048057) ccar1 (ENSSGRG00000048054) zgc:110319 (ENSSGRG00000048053) si:dkey-228d14.5 (ENSSGRG00000048051) eif4e1c (ENSSGRG00000048035) ENSSGRG00000048033 alox5a (ENSSGRG00000047929) ENSSGRG00000047927 zfand4 (ENSSGRG00000047926) marchf8 (ENSSGRG00000047925) vdac2 (ENSSGRG00000045875) ##22 ENSSGRG00000045819 ifit8 (ENSSGRG00000045818) comtd1 (ENSSGRG00000045817) znf503 (ENSSGRG00000045816) ENSSGRG00000045814 lrmda (ENSSGRG00000045813) kcnma1a (ENSSGRG00000043159) dlg5a (ENSSGRG00000043037) ENSSGRG00000041822 MOCOS (ENSSGRG00000041645) zgc:110045 (ENSSGRG00000041643) vwc2 (ENSSGRG00000041642) ikzf1 (ENSSGRG00000041641) fignl1 (ENSSGRG00000041640) ttl (ENSSGRG00000041639) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 96 ENSGT00940000156323.d.c.a.a ENSGT00940000156323.d.c.b.b.b 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(ENSSGRG00000020170) Zebrafish MODERN SPECIES 4 tlr4al (ENSDARG00000075671) tlr4ba (ENSDARG00000019742) si:ch211-198a12.6 (ENSDARG00000074624) stox1 (ENSDARG00000062593) ccar1 (ENSDARG00000074759) si:dkey-228d14.5 (ENSDARG00000057440) zgc:110319 (ENSDARG00000021404) eif4e1c (ENSDARG00000012274) TET1 (ENSDARG00000075230) slc25a16 (ENSDARG00000057287) alox5a (ENSDARG00000057273) ENSDARG00000062532 zfand4 (ENSDARG00000076703) ENSDARG00000110724 marchf8 (ENSDARG00000062489) vdac2 (ENSDARG00000013623) ##22 ENSDARG00000003146 ifit8 (ENSDARG00000057173) comtd1 (ENSDARG00000078918) znf503 (ENSDARG00000018492) lrmda (ENSDARG00000057166) kcnma1a (ENSDARG00000079840) dlg5a (ENSDARG00000074059) anxa11a (ENSDARG00000077383) zgc:110045 (ENSDARG00000057141) ENSDARG00000110961 vwc2 (ENSDARG00000076495) SPATA48 (ENSDARG00000109818) ikzf1 (ENSDARG00000013539) fignl1 (ENSDARG00000016427) ttl (ENSDARG00000062418) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000182936.a.b.a ENSGT00940000158288 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ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000164426.c ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.A.a.b ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000162682.A.a.b.a ENSGT00940000162682.A.a.a ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490 ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.r ##22 ENSGT00390000004409 ENSGT00390000014618.a.b ENSGT01060000252496 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 73 ENSGT00940000164426.c ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00940000162682.A.a.a ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490.a 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ENSGT00940000154935.d ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000165077 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000173647 ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00550000075078 ENSGT00940000163949.a ENSGT00940000178056 ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000162682.A.a.a ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.r ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000165077 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000173647 ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 ENSGT00390000005448 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000163949.a ENSGT00940000178056 ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00940000162682.A.a.a ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.r ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000165077 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 ENSGT00390000005448 ENSGT00940000165641 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00550000075078 ENSGT00940000163949.a ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n.d ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.r ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000165077 ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 ENSGT00390000005448 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155642 ENSGT00550000075078 ENSGT00940000163949.a ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n.d ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.r ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000165077 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 ENSGT00390000005448 ENSGT00940000165641 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 4 coasy (ENSKMAG00000016770) ENSKMAG00000016742 ENSKMAG00000016722 pus3 (ENSKMAG00000016715) dcakd (ENSKMAG00000016706) C1QL1 (ENSKMAG00000016696) vclb (ENSKMAG00000016618) ADK (ENSKMAG00000016538) KAT6B (ENSKMAG00000016455) DUSP29 (ENSKMAG00000016416) ENSKMAG00000016406 DUSP13 (ENSKMAG00000016386) ENSKMAG00000016373 SAMD8 (ENSKMAG00000016342) ENSKMAG00000016315 VDAC2 (ENSKMAG00000016282) ##22 COMTD1 (ENSKMAG00000016259) ZNF503 (ENSKMAG00000016253) KCNMA1 (ENSKMAG00000015959) DLG5 (ENSKMAG00000015734) ENSKMAG00000015651 ZCCHC24 (ENSKMAG00000015632) ppifb (ENSKMAG00000015611) ZMIZ1 (ENSKMAG00000015547) polr3a (ENSKMAG00000015290) QRFPR (ENSKMAG00000015221) ENSKMAG00000015191 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ENSGT00550000075078 ENSGT00940000163949.a ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n.d ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.r ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 ENSGT00390000005448 ENSGT00940000165641 ENSGT00730000111199 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 100 ENSGT00550000075078 ENSGT00940000163949.a ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n.d ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000162682.A.a.a ENSGT00940000154628.A.a.a.b 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Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00550000075078 ENSGT00940000163949.a ENSGT00940000178056 ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000162682.A.a.a ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.r ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b.a ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000165077 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000173647 ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 ENSGT00390000005448 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00550000075078 ENSGT00940000163949.a ENSGT00940000178056 ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000162682.A.a.a 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Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00550000075078 ENSGT00940000163949.a ENSGT00940000178056 ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000162682.A.a.a ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.r ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000165077 ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 ENSGT00390000005448 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 9 zdhhc6 (ENSBSLG00000026301) coasy (ENSBSLG00000026305) ENSBSLG00000026307 ENSBSLG00000026309 pus3 (ENSBSLG00000026310) dcakd (ENSBSLG00000026311) C1QL1 (ENSBSLG00000026312) vclb (ENSBSLG00000026334) ADK 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ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000155642 ENSGT00550000075078 ENSGT00940000163949.a ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000162682.A.a.a ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.r ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000165077 ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 ENSGT00390000005448 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000155642 ENSGT00550000075078 ENSGT00940000163949.a ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000162682.A.a.a 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Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000155642 ENSGT00550000075078 ENSGT00940000163949.a ENSGT00950000183160.A ENSGT00550000075038 ENSGT00940000162478 ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000157372 ENSGT00940000162682.A.a.a ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00950000182869.e.a.a.r ##22 ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000165077 ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00930000151028 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00510000048896 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000158426 ENSGT00390000005448 Gilthead seabream MODERN SPECIES 12 coasy (ENSSAUG00010025571) ENSSAUG00010025573 ENSSAUG00010025575 pus3 (ENSSAUG00010025577) dcakd (ENSSAUG00010025578) C1QL1 (ENSSAUG00010025579) vclb (ENSSAUG00010025582) ADK (ENSSAUG00010025591) KAT6B 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SPECIES 1 tvp23b (ENSSTUG00000024827) trim16 (ENSSTUG00000024862) FADS6 (ENSSTUG00000024877) USH1G (ENSSTUG00000024887) ENSSTUG00000024912 HID1 (ENSSTUG00000024935) ENSSTUG00000025151 vclb (ENSSTUG00000025207) ENSSTUG00000025527 adkb (ENSSTUG00000025543) ENSSTUG00000025785 KAT6B (ENSSTUG00000025793) ENSSTUG00000025882 ENSSTUG00000025895 SAMD8 (ENSSTUG00000025918) VDAC2 (ENSSTUG00000026006) ##22 COMTD1 (ENSSTUG00000026629) ZNF503 (ENSSTUG00000026686) KCNMA1 (ENSSTUG00000027222) ENSSTUG00000047704 anxa11b (ENSSTUG00000047721) rrbp1a (ENSSTUG00000048555) snx5 (ENSSTUG00000048581) mgme1 (ENSSTUG00000048643) ENSSTUG00000048648 EPHX1 (ENSSTUG00000048657) ENSSTUG00000048791 ENSSTUG00000048805 ENSSTUG00000048809 flrt3 (ENSSTUG00000048815) ENSSTUG00000048819 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT01060000248846.a.a.a.a ENSGT01030000234586.B.a.a.a.g ENSGT01080000257365.a.d.j ENSGT00390000004428.a.b.e ENSGT00940000161116.w.b.e ENSGT00950000182990.b.a.b ENSGT00390000017548.b.b.b 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ENSOKIG00005038581 ENSOKIG00005038596 FLRT3 (ENSOKIG00005038623) Rainbow trout MODERN SPECIES 12 trim16 (ENSOMYG00000044839) ENSOMYG00000063762 USH1G (ENSOMYG00000044849) ENSOMYG00000050128 ENSOMYG00000044851 HID1 (ENSOMYG00000044857) ENSOMYG00000044870 ENSOMYG00000044963 ENSOMYG00000073946 ENSOMYG00000066262 KAT6B (ENSOMYG00000011685) ENSOMYG00000071306 ENSOMYG00000059206 ENSOMYG00000011753 SAMD8 (ENSOMYG00000011768) VDAC2 (ENSOMYG00000011846) ##22 comtd1 (ENSOMYG00000012211) ZNF503 (ENSOMYG00000012272) ENSOMYG00000048665 KCNMA1 (ENSOMYG00000012448) ENSOMYG00000017506 rrbp1a (ENSOMYG00000017898) snx5 (ENSOMYG00000017574) mgme1 (ENSOMYG00000017590) ENSOMYG00000017637 ENSOMYG00000017689 ENSOMYG00000017755 ENSOMYG00000054536 ENSOMYG00000017812 ENSOMYG00000017868 ENSOMYG00000068995 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 283 ENSGT01080000257365.a.d.i ENSGT01090000260051.a.hd ENSGT00390000003595.v ENSGT00390000004428.a.b.f ENSGT00940000161116.w.b.f ENSGT00950000182990.b.a.a ENSGT00390000017548.b.b.a 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ENSGT00940000158877 ENSGT00390000004965 ENSGT00950000182953.C.c ENSGT00940000158546 ENSGT00940000173670 ENSGT00940000156918 ENSGT00940000153866.B ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000168975 Coelacanth MODERN SPECIES 683 ENSLACG00000015438 ENSLACG00000015410 ENSLACG00000015177 ENKD1 (ENSLACG00000015037) POLB (ENSLACG00000014637) DKK4 (ENSLACG00000014455) VDAC3 (ENSLACG00000014148) ##22 ENSLACG00000012780 ENSLACG00000011794 MYO1D (ENSLACG00000011465) CDK5R1 (ENSLACG00000010746) PSMD11 (ENSLACG00000010294) ENSLACG00000009882 NSF (ENSLACG00000008120) WNT3 (ENSLACG00000007767) WNT9B (ENSLACG00000005608) ENSLACG00000022344 GOSR2 (ENSLACG00000003069) Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 177 ENSGT00940000173670 ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000156962 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ENSLLEG00000029326 NSD3 (ENSLLEG00000029373) ENSLLEG00000014026 LETM2 (ENSLLEG00000014086) FGFR1 (ENSLLEG00000014330) Amniota ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000156918 ENSGT00940000173670 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000168975 ENSGT00940000160545 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000155648.A.a ENSGT00390000003246 ENSGT00390000000134.b ENSGT00940000159875 ENSGT00940000175215 ENSGT00940000156888 ENSGT00390000003458 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000175215 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT00940000155648.A.a ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000168975 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00940000156591 ENSGT00940000157178 Theria ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000175215 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT00940000155648.A.a ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000168975 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00940000156591 ENSGT00940000157178 Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000003458 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ENSGT00680000101436 ENSGT00940000156591 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 Hedgehog MODERN SPECIES 8633 VDAC3 (ENSEEUG00000009678) ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000168975 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00680000101436 ENSGT00940000156591 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000168975 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00680000101436 ENSGT00940000156591 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000168975 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00680000101436 ENSGT00940000156591 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 80 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00680000101436 ENSGT00940000156591 Ferret MODERN SPECIES 383 IKBKB (ENSMPUG00000012701) POLB (ENSMPUG00000012708) DKK4 (ENSMPUG00000012714) VDAC3 (ENSMPUG00000012717) ##22 SLC20A2 (ENSMPUG00000012734) CHRNB3 (ENSMPUG00000012739) CHRNA6 (ENSMPUG00000012780) THAP1 (ENSMPUG00000012784) HOOK3 (ENSMPUG00000012800) FNTA (ENSMPUG00000012809) POMK (ENSMPUG00000012813) HGSNAT (ENSMPUG00000012819) INTS10 (ENSMPUG00000012827) CSGALNACT1 (ENSMPUG00000012847) SH2D4A (ENSMPUG00000012863) ENSMPUG00000012879 PSD3 (ENSMPUG00000012884) ENSMPUG00000019474 ENSMPUG00000012893 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000168975 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000162741.j.i.b ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00680000101436 Ursus ANCESTRAL SPECIES 186 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000168975 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 Polar bear MODERN SPECIES 287 TCIM (ENSUMAG00000025579) ZMAT4 (ENSUMAG00000025578) SFRP1 (ENSUMAG00000025577) GOLGA7 (ENSUMAG00000025576) GINS4 (ENSUMAG00000025575) GPAT4 (ENSUMAG00000025574) NKX6-3 (ENSUMAG00000025573) ENSUMAG00000025572 ANK1 (ENSUMAG00000025571) KAT6A (ENSUMAG00000025569) AP3M2 (ENSUMAG00000025568) PLAT (ENSUMAG00000025567) IKBKB (ENSUMAG00000025565) POLB (ENSUMAG00000025564) DKK4 (ENSUMAG00000025563) VDAC3 (ENSUMAG00000025562) ##22 SLC20A2 (ENSUMAG00000025561) SMIM19 (ENSUMAG00000025559) CHRNA6 (ENSUMAG00000025558) ENSUMAG00000025557 ENSUMAG00000025556 THAP1 (ENSUMAG00000025555) RNF170 (ENSUMAG00000025554) HOOK3 (ENSUMAG00000025553) FNTA (ENSUMAG00000025551) POMK (ENSUMAG00000025550) HGSNAT (ENSUMAG00000025549) INTS10 (ENSUMAG00000025536) ENSUMAG00000025535 CSGALNACT1 (ENSUMAG00000025534) SH2D4A (ENSUMAG00000025533) American black bear MODERN SPECIES 2545 IKBKB (ENSUAMG00000015677) ENSUAMG00000016181 ENSUAMG00000016182 DKK4 (ENSUAMG00000016183) VDAC3 (ENSUAMG00000016189) ##22 SLC20A2 (ENSUAMG00000016204) SMIM19 (ENSUAMG00000016207) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00680000101436 ENSGT00940000156591 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00940000156591 ENSGT00390000012054.b Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT00950000183005.b.c.a ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00940000156591 ENSGT00390000012054.b Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 22 TCIM (ENSRFEG00010000429) ZMAT4 (ENSRFEG00010000395) SFRP1 (ENSRFEG00010000348) GOLGA7 (ENSRFEG00010000282) ENSRFEG00010000256 MBD3L1 (ENSRFEG00010016322) GPAT4 (ENSRFEG00010016245) NKX6-3 (ENSRFEG00010016191) ANK1 (ENSRFEG00010015808) KAT6A (ENSRFEG00010015666) AP3M2 (ENSRFEG00010015592) PLAT (ENSRFEG00010015336) IKBKB (ENSRFEG00010014796) POLB (ENSRFEG00010014661) DKK4 (ENSRFEG00010014566) VDAC3 (ENSRFEG00010014475) ##22 SLC20A2 (ENSRFEG00010014423) SMIM19 (ENSRFEG00010014370) CHRNB3 (ENSRFEG00010014271) CHRNA6 (ENSRFEG00010014061) THAP1 (ENSRFEG00010013983) RNF170 (ENSRFEG00010013874) HOOK3 (ENSRFEG00010013720) POMK (ENSRFEG00010013639) HGSNAT (ENSRFEG00010013532) INTS10 (ENSRFEG00010013213) CSGALNACT1 (ENSRFEG00010013136) SH2D4A (ENSRFEG00010013083) PSD3 (ENSRFEG00010012730) ENSRFEG00010012671 CHAMP1 (ENSRFEG00010012653) Megabat MODERN SPECIES 3482 KAT6A (ENSPVAG00000014808) AP3M2 (ENSPVAG00000014810) PLAT (ENSPVAG00000014812) IKBKB (ENSPVAG00000014813) POLB (ENSPVAG00000014815) DKK4 (ENSPVAG00000014820) VDAC3 (ENSPVAG00000014822) ##22 SLC20A2 (ENSPVAG00000014825) SMIM19 (ENSPVAG00000014829) Equus ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962.s ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945.k ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00680000101436 ENSGT00940000156591 Donkey MODERN SPECIES 9 ENSEASG00005027197 ENSEASG00005036226 ZMAT4 (ENSEASG00005010447) SFRP1 (ENSEASG00005035468) GOLGA7 (ENSEASG00005010453) GINS4 (ENSEASG00005025199) GPAT4 (ENSEASG00005024389) NKX6-3 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DKK4 (ENSECAG00000026855) VDAC3 (ENSECAG00000000438) ##22 SLC20A2 (ENSECAG00000000096) SMIM19 (ENSECAG00000000412) CHRNB3 (ENSECAG00000000043) CHRNA6 (ENSECAG00000000024) THAP1 (ENSECAG00000000020) RNF170 (ENSECAG00000000004) HOOK3 (ENSECAG00000020276) POMK (ENSECAG00000003017) ENSECAG00000059262 HGSNAT (ENSECAG00000019625) INTS10 (ENSECAG00000018090) CSGALNACT1 (ENSECAG00000017912) SH2D4A (ENSECAG00000017779) PSD3 (ENSECAG00000017483) ENSECAG00000002652 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000168975 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 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ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155067.a ENSGT00940000158254 ENSGT00950000183117.a.a ENSGT00390000000062.x.a ENSGT00390000006747 ENSGT01030000234578.B.a ENSGT00390000014084.`b ENSGT00390000010777 ENSGT00940000161020.b ENSGT00390000006088 ENSGT00390000004984 ENSGT00940000159081 ENSGT00950000182885.B ENSGT00940000162483 ENSGT00390000015477 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00940000156566 ENSGT00940000158637 ENSGT01020000230401.b.a ENSGT00390000007685.g ENSGT00390000000987.i ENSGT00940000158078 ENSGT00940000160733 ENSGT00940000154917 ENSGT00940000160180 ENSGT00940000159167 ENSGT00390000018299.eb.b ENSGT00950000183042.a.b ENSGT00390000000376.b ENSGT00940000158018 ENSGT00390000002524 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155067.a ENSGT00940000158254 ENSGT00950000183117.a.a ENSGT00390000000062.x.a ENSGT00390000006747 ENSGT01030000234578.B.a ENSGT00390000014084.ab.a 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ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00960000191534 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935.y ENSGT00390000004945.i ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00680000101436 ENSGT00940000156591 Yarkand deer MODERN SPECIES 25 ZMAT4 (ENSCHYG00000025481) ENSCHYG00000025524 SFRP1 (ENSCHYG00000025546) GOLGA7 (ENSCHYG00000025574) GINS4 (ENSCHYG00000025621) GPAT4 (ENSCHYG00000025722) NKX6-3 (ENSCHYG00000025744) ANK1 (ENSCHYG00000025825) ENSCHYG00000026404 ENSCHYG00000026414 ENSCHYG00000026437 AP3M2 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(ENSBBBG00000012414) PLAT (ENSBBBG00000002352) IKBKB (ENSBBBG00000001923) POLB (ENSBBBG00000012253) DKK4 (ENSBBBG00000012236) VDAC3 (ENSBBBG00000002302) ##22 SLC20A2 (ENSBBBG00000012210) SMIM19 (ENSBBBG00000012190) CHRNB3 (ENSBBBG00000008104) CHRNA6 (ENSBBBG00000012164) THAP1 (ENSBBBG00000012152) RNF170 (ENSBBBG00000012146) HOOK3 (ENSBBBG00000002276) ENSBBBG00000012087 ENSBBBG00000002268 HGSNAT (ENSBBBG00000002264) INTS10 (ENSBBBG00000012057) CSGALNACT1 (ENSBBBG00000007882) SH2D4A (ENSBBBG00000012021) PSD3 (ENSBBBG00000002247) ENSBBBG00000002228 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000161410 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935.y.a ENSGT00390000004945.i ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00940000156591 ENSGT00390000012054.b Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 18 IDO1 (ENSOARG00020024595) IDO2 (ENSOARG00020024709) TCIM (ENSOARG00020024760) ZMAT4 (ENSOARG00020024771) SFRP1 (ENSOARG00020024807) GOLGA7 (ENSOARG00020024819) GINS4 (ENSOARG00020024828) GPAT4 (ENSOARG00020024847) NKX6-3 (ENSOARG00020024881) ANK1 (ENSOARG00020024995) KAT6A (ENSOARG00020025591) AP3M2 (ENSOARG00020025613) PLAT (ENSOARG00020025622) IKBKB (ENSOARG00020025633) POLB (ENSOARG00020025652) VDAC3 (ENSOARG00020025662) ##22 SLC20A2 (ENSOARG00020025665) SMIM19 (ENSOARG00020025670) CHRNB3 (ENSOARG00020025678) CHRNA6 (ENSOARG00020025686) THAP1 (ENSOARG00020025693) RNF170 (ENSOARG00020025696) HOOK3 (ENSOARG00020025699) FNTA (ENSOARG00020025711) POMK (ENSOARG00020025715) HGSNAT (ENSOARG00020025720) INTS10 (ENSOARG00020025726) CSGALNACT1 (ENSOARG00020025733) ENSOARG00020025759 PSD3 (ENSOARG00020015217) ENSOARG00020016997 Goat MODERN SPECIES 19 ZMAT4 (ENSCHIG00000022017) ENSCHIG00000016476 SFRP1 (ENSCHIG00000014291) GOLGA7 (ENSCHIG00000000610) GINS4 (ENSCHIG00000016339) GPAT4 (ENSCHIG00000021145) NKX6-3 (ENSCHIG00000003467) ANK1 (ENSCHIG00000007347) KAT6A (ENSCHIG00000000530) AP3M2 (ENSCHIG00000000394) PLAT (ENSCHIG00000000147) ENSCHIG00000000115 IKBKB (ENSCHIG00000014206) ENSCHIG00000018571 POLB (ENSCHIG00000002303) VDAC3 (ENSCHIG00000020881) ##22 SLC20A2 (ENSCHIG00000023382) SMIM19 (ENSCHIG00000010434) CHRNB3 (ENSCHIG00000025049) CHRNA6 (ENSCHIG00000024125) THAP1 (ENSCHIG00000012480) RNF170 (ENSCHIG00000017142) ENSCHIG00000018508 HOOK3 (ENSCHIG00000016259) ENSCHIG00000011734 POMK (ENSCHIG00000011543) HGSNAT (ENSCHIG00000000180) INTS10 (ENSCHIG00000000076) CSGALNACT1 (ENSCHIG00000024893) SH2D4A (ENSCHIG00000018803) PSD3 (ENSCHIG00000022134) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000168975 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a Primates ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 3734 POLB (ENSTSYG00000007891) DKK4 (ENSTSYG00000011895) VDAC3 (ENSTSYG00000007112) ##22 SLC20A2 (ENSTSYG00000003465) SMIM19 (ENSTSYG00000001347) CHRNB3 (ENSTSYG00000001503) CHRNA6 (ENSTSYG00000001518) Tarsier MODERN SPECIES 2426 ENSTSYG00000025571 ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935.u ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00910000147457 ENSGT00940000154351.k.b.a.b.a ENSGT00940000156298.t ENSGT00520000055567.a.a.a.e.b ENSGT00390000014654 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00910000147814 ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935.u ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00910000147457 ENSGT00940000154351.k.b.a.b.a ENSGT00940000156298.t ENSGT00520000055567.a.a.a.e.b Rhinopithecus DUPLICATION Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.a.c ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1385 DYNLL1 (ENSRROG00000003458) SRSF9 (ENSRROG00000041980) GATC (ENSRROG00000042802) TRIAP1 (ENSRROG00000027066) COX6A1 (ENSRROG00000029847) MSI1 (ENSRROG00000041076) PLA2G1B (ENSRROG00000045047) SIRT4 (ENSRROG00000029265) PXN (ENSRROG00000010876) RPLP0 (ENSRROG00000042588) GCN1 (ENSRROG00000039548) RAB35 (ENSRROG00000033446) BICDL1 (ENSRROG00000041540) CIT (ENSRROG00000032144) PRKAB1 (ENSRROG00000041677) ENSRROG00000044518 ##22 TMEM233 (ENSRROG00000026936) CCDC60 (ENSRROG00000037609) HSPB8 (ENSRROG00000027750) SRRM4 (ENSRROG00000035868) SUDS3 (ENSRROG00000041748) TAOK3 (ENSRROG00000040962) ENSRROG00000028119 VSIG10 (ENSRROG00000000420) WSB2 (ENSRROG00000003358) RFC5 (ENSRROG00000040185) KSR2 (ENSRROG00000040123) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 507 ENSGT00390000013931.a.a ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a.d ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00910000147814 ENSGT00390000000436 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 992 ENSRBIG00000016010 ENSRBIG00000015759 AP3M2 (ENSRBIG00000043559) PLAT (ENSRBIG00000037212) IKBKB (ENSRBIG00000037778) POLB (ENSRBIG00000040757) DKK4 (ENSRBIG00000035528) VDAC3 (ENSRBIG00000038122) ##22 SLC20A2 (ENSRBIG00000042050) SMIM19 (ENSRBIG00000028658) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1372 IKBKB (ENSRROG00000036326) POLB (ENSRROG00000031043) DKK4 (ENSRROG00000016601) VDAC3 (ENSRROG00000043950) ##22 SLC20A2 (ENSRROG00000037706) ENSRROG00000042504 SMIM19 (ENSRROG00000012662) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00910000147814 ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935.u ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00910000147457 ENSGT00940000154351.k.b.a.b.a ENSGT00940000156298.t ENSGT00520000055567.a.a.a.e.b Vervet Monkey MODERN SPECIES 27 IDO2 (ENSCSAG00000015113) TCIM (ENSCSAG00000018537) ZMAT4 (ENSCSAG00000015108) SFRP1 (ENSCSAG00000015099) GOLGA7 (ENSCSAG00000015096) GINS4 (ENSCSAG00000015091) GPAT4 (ENSCSAG00000015087) NKX6-3 (ENSCSAG00000015081) ANK1 (ENSCSAG00000015073) KAT6A (ENSCSAG00000015058) AP3M2 (ENSCSAG00000015054) PLAT (ENSCSAG00000015050) IKBKB (ENSCSAG00000015039) POLB (ENSCSAG00000015034) DKK4 (ENSCSAG00000015030) VDAC3 (ENSCSAG00000015024) ##22 SLC20A2 (ENSCSAG00000015019) SMIM19 (ENSCSAG00000015011) CHRNB3 (ENSCSAG00000015002) CHRNA6 (ENSCSAG00000014981) THAP1 (ENSCSAG00000014961) RNF170 (ENSCSAG00000014957) HOOK3 (ENSCSAG00000014951) FNTA (ENSCSAG00000014932) POMK (ENSCSAG00000014900) HGSNAT (ENSCSAG00000014893) SPIDR (ENSCSAG00000014882) PRKDC (ENSCSAG00000014860) MCM4 (ENSCSAG00000014816) ENSCSAG00000014799 CLXN (ENSCSAG00000014792) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00910000147814 ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935.u ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00910000147457 ENSGT00940000154351.k.b.a.b.a ENSGT00940000156298.t ENSGT00520000055567.a.a.a.e.b Macaca ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00910000147814 ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935.u ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00940000156298.t ENSGT00520000055567.a.a.a.e.b ENSGT00390000014654 ENSGT00940000163032 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT01100000263539.b.b.b.b.a.a.b.b.a.a.b ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00390000001491.a ENSGT00940000156298.t ENSGT00390000014654 ENSGT00940000155633.D ENSGT01050000244824.A ENSGT00740000115534.a.b.f.a.a ENSGT00940000159968 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 18 TCIM (ENSMFAG00000007134) ZMAT4 (ENSMFAG00000043475) ENSMFAG00000059759 SFRP1 (ENSMFAG00000035564) ENSMFAG00000032651 GINS4 (ENSMFAG00000002972) GPAT4 (ENSMFAG00000003498) NKX6-3 (ENSMFAG00000039180) ANK1 (ENSMFAG00000045115) KAT6A (ENSMFAG00000040843) AP3M2 (ENSMFAG00000045662) PLAT (ENSMFAG00000041986) IKBKB (ENSMFAG00000039739) POLB (ENSMFAG00000030793) DKK4 (ENSMFAG00000034088) VDAC3 (ENSMFAG00000041877) ##22 SLC20A2 (ENSMFAG00000000865) SMIM19 (ENSMFAG00000002359) 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(ENSPANG00000020590) NKX6-3 (ENSPANG00000014739) ANK1 (ENSPANG00000007577) KAT6A (ENSPANG00000021919) AP3M2 (ENSPANG00000016689) PLAT (ENSPANG00000006697) ENSPANG00000040523 IKBKB (ENSPANG00000013874) POLB (ENSPANG00000011021) DKK4 (ENSPANG00000012834) VDAC3 (ENSPANG00000023234) ##22 SLC20A2 (ENSPANG00000015058) SMIM19 (ENSPANG00000018972) CHRNA6 (ENSPANG00000008755) THAP1 (ENSPANG00000007346) RNF170 (ENSPANG00000018297) HOOK3 (ENSPANG00000010034) FNTA (ENSPANG00000016458) POMK (ENSPANG00000021584) HGSNAT (ENSPANG00000019010) ENSPANG00000040360 ENSPANG00000049209 ENSPANG00000020494 ENSPANG00000034365 SPIDR (ENSPANG00000010031) CEBPD (ENSPANG00000024953) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 169 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b 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SLC20A2 (ENSCATG00000029328) ENSCATG00000036254 SMIM19 (ENSCATG00000038240) CHRNB3 (ENSCATG00000019895) CHRNA6 (ENSCATG00000014399) THAP1 (ENSCATG00000017301) RNF170 (ENSCATG00000037123) HOOK3 (ENSCATG00000044162) FNTA (ENSCATG00000008576) POMK (ENSCATG00000005754) HGSNAT (ENSCATG00000015192) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935.u ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00910000147457 ENSGT00940000154351.k.b.a.b.a ENSGT00940000156298.t ENSGT00520000055567.a.a.a.e.b ENSGT00390000014654 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935.u ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00910000147457 ENSGT00940000154351.k.b.a.b.a ENSGT00940000156298.t ENSGT00520000055567.a.a.a.e.b ENSGT00390000014654 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b.kb ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935.u ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00910000147457 ENSGT00940000164614 ENSGT00390000001994.v ENSGT00390000015738 ENSGT00940000154351.k.b.a.b.a Gorilla MODERN SPECIES 21 IDO2 (ENSGGOG00000040816) TCIM (ENSGGOG00000038998) ZMAT4 (ENSGGOG00000006633) SFRP1 (ENSGGOG00000037132) GOLGA7 (ENSGGOG00000001532) GINS4 (ENSGGOG00000001536) GPAT4 (ENSGGOG00000016036) NKX6-3 (ENSGGOG00000016047) ANK1 (ENSGGOG00000011729) KAT6A (ENSGGOG00000004681) AP3M2 (ENSGGOG00000002072) PLAT (ENSGGOG00000025616) IKBKB (ENSGGOG00000006769) POLB (ENSGGOG00000009239) DKK4 (ENSGGOG00000015784) VDAC3 (ENSGGOG00000001932) ##22 SLC20A2 (ENSGGOG00000014798) SMIM19 (ENSGGOG00000042840) CHRNB3 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ENSGT00940000154351.k.b.a.b.a Human MODERN SPECIES 20 IDO2 (ENSG00000188676) TCIM (ENSG00000176907) ZMAT4 (ENSG00000165061) SFRP1 (ENSG00000104332) GOLGA7 (ENSG00000147533) GINS4 (ENSG00000147536) GPAT4 (ENSG00000158669) NKX6-3 (ENSG00000165066) ANK1 (ENSG00000029534) KAT6A (ENSG00000083168) AP3M2 (ENSG00000070718) PLAT (ENSG00000104368) IKBKB (ENSG00000104365) POLB (ENSG00000070501) DKK4 (ENSG00000104371) VDAC3 (ENSG00000078668) ##22 SLC20A2 (ENSG00000168575) SMIM19 (ENSG00000176209) CHRNB3 (ENSG00000147432) CHRNA6 (ENSG00000147434) THAP1 (ENSG00000131931) RNF170 (ENSG00000120925) HOOK3 (ENSG00000168172) FNTA (ENSG00000168522) POMK (ENSG00000185900) HGSNAT (ENSG00000165102) POTEA (ENSG00000188877) SPIDR (ENSG00000164808) CEBPD (ENSG00000221869) PRKDC (ENSG00000253729) MCM4 (ENSG00000104738) Pan ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b.kb ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935.u ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00910000147457 ENSGT00940000164614 ENSGT00390000001994.v ENSGT00390000015738.b ENSGT00940000154351.k.b.a.b.a Chimpanzee MODERN SPECIES 21 TCIM (ENSPTRG00000044702) ZMAT4 (ENSPTRG00000020191) SFRP1 (ENSPTRG00000020192) ENSPTRG00000042268 GOLGA7 (ENSPTRG00000020193) GINS4 (ENSPTRG00000020195) GPAT4 (ENSPTRG00000020196) NKX6-3 (ENSPTRG00000020197) ANK1 (ENSPTRG00000020198) KAT6A (ENSPTRG00000020199) AP3M2 (ENSPTRG00000020200) PLAT (ENSPTRG00000020201) IKBKB (ENSPTRG00000020202) POLB (ENSPTRG00000020203) DKK4 (ENSPTRG00000020204) VDAC3 (ENSPTRG00000020205) ##22 SLC20A2 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(ENSPPAG00000038995) FNTA (ENSPPAG00000041427) POMK (ENSPPAG00000036365) ENSPPAG00000042111 ENSPPAG00000028046 ENSPPAG00000042909 ENSPPAG00000042955 ENSPPAG00000042687 ENSPPAG00000037642 Orangutan MODERN SPECIES 21 IDO2 (ENSPPYG00000018538) TCIM (ENSPPYG00000018539) ZMAT4 (ENSPPYG00000018540) SFRP1 (ENSPPYG00000018541) GOLGA7 (ENSPPYG00000018542) GINS4 (ENSPPYG00000018543) GPAT4 (ENSPPYG00000018544) NKX6-3 (ENSPPYG00000018545) ANK1 (ENSPPYG00000018546) KAT6A (ENSPPYG00000018547) AP3M2 (ENSPPYG00000018548) PLAT (ENSPPYG00000018549) IKBKB (ENSPPYG00000018550) POLB (ENSPPYG00000018551) DKK4 (ENSPPYG00000018553) VDAC3 (ENSPPYG00000018554) ##22 SLC20A2 (ENSPPYG00000018555) SMIM19 (ENSPPYG00000018556) CHRNB3 (ENSPPYG00000018558) CHRNA6 (ENSPPYG00000018559) THAP1 (ENSPPYG00000034807) RNF170 (ENSPPYG00000031898) ENSPPYG00000018562 POMK (ENSPPYG00000018564) HGSNAT (ENSPPYG00000018565) ENSPPYG00000037871 ENSPPYG00000018567 ENSPPYG00000041060 ENSPPYG00000038516 SPIDR (ENSPPYG00000018571) CEBPD (ENSPPYG00000018572) Gibbon MODERN SPECIES 23 IDO2 (ENSNLEG00000012542) TCIM (ENSNLEG00000028164) ZMAT4 (ENSNLEG00000012564) SFRP1 (ENSNLEG00000012571) GOLGA7 (ENSNLEG00000012577) GINS4 (ENSNLEG00000012593) GPAT4 (ENSNLEG00000012602) NKX6-3 (ENSNLEG00000034620) ANK1 (ENSNLEG00000012608) KAT6A (ENSNLEG00000012750) AP3M2 (ENSNLEG00000012765) PLAT (ENSNLEG00000012779) IKBKB (ENSNLEG00000012842) POLB (ENSNLEG00000012862) DKK4 (ENSNLEG00000012886) VDAC3 (ENSNLEG00000012890) ##22 SLC20A2 (ENSNLEG00000012920) SMIM19 (ENSNLEG00000027333) CHRNB3 (ENSNLEG00000012932) CHRNA6 (ENSNLEG00000012940) THAP1 (ENSNLEG00000012946) RNF170 (ENSNLEG00000012949) HOOK3 (ENSNLEG00000012953) ENSNLEG00000012979 POMK (ENSNLEG00000012982) HGSNAT (ENSNLEG00000029760) ENSNLEG00000013005 ENSNLEG00000031617 ENSNLEG00000013008 DUSP22 (ENSNLEG00000010621) IRF4 (ENSNLEG00000010631) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b.g ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383.i ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075.m ENSGT00940000158075.n ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a.s Mas night monkey MODERN SPECIES 866 IDO2 (ENSANAG00000036163) TCIM (ENSANAG00000016944) ZMAT4 (ENSANAG00000027926) SFRP1 (ENSANAG00000021708) GOLGA7 (ENSANAG00000034573) GINS4 (ENSANAG00000033482) GPAT4 (ENSANAG00000028194) NKX6-3 (ENSANAG00000027678) ANK1 (ENSANAG00000037182) KAT6A (ENSANAG00000034349) AP3M2 (ENSANAG00000031998) PLAT (ENSANAG00000034979) IKBKB (ENSANAG00000030869) POLB (ENSANAG00000025608) DKK4 (ENSANAG00000025941) VDAC3 (ENSANAG00000032578) ##22 SLC20A2 (ENSANAG00000037424) SMIM19 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ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000168975 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00900000143342 ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 25 ENSHGLG00000003246 SFRP1 (ENSHGLG00000048334) ENSHGLG00000002990 GOLGA7 (ENSHGLG00000035035) GINS4 (ENSHGLG00000038877) AGPAT6 (ENSHGLG00000049078) NKX6-3 (ENSHGLG00000009779) ANK1 (ENSHGLG00000003086) KAT6A (ENSHGLG00000003976) ENSHGLG00000046201 AP3M2 (ENSHGLG00000003868) PLAT (ENSHGLG00000003529) IKBKB (ENSHGLG00000002996) Polb (ENSHGLG00000033147) DKK4 (ENSHGLG00000018668) VDAC3 (ENSHGLG00000018734) ##22 ENSHGLG00000034139 SLC20A2 (ENSHGLG00000019122) ENSHGLG00000035600 ENSHGLG00000020593 CHRNB3 (ENSHGLG00000017680) ENSHGLG00000003713 ENSHGLG00000020007 ENSHGLG00000040189 ENSHGLG00000003116 ENSHGLG00000040563 ENSHGLG00000037811 THAP1 (ENSHGLG00000036606) ENSHGLG00000038726 FNTA (ENSHGLG00000000048) SGK196 (ENSHGLG00000000861) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000168975 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00900000143342 ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 Guinea pig MODERN SPECIES 80 TCIM (ENSCPOG00000013411) ZMAT4 (ENSCPOG00000015224) SFRP1 (ENSCPOG00000039437) GOLGA7 (ENSCPOG00000037269) GINS4 (ENSCPOG00000009211) GPAT4 (ENSCPOG00000008006) NKX6-3 (ENSCPOG00000027500) ANK1 (ENSCPOG00000007390) KAT6A (ENSCPOG00000011695) AP3M2 (ENSCPOG00000002362) PLAT (ENSCPOG00000026062) IKBKB (ENSCPOG00000010558) ENSCPOG00000039839 POLB (ENSCPOG00000010567) DKK4 (ENSCPOG00000021700) VDAC3 (ENSCPOG00000010512) ##22 SLC20A2 (ENSCPOG00000008610) SMIM19 (ENSCPOG00000032325) CHRNB3 (ENSCPOG00000011765) CHRNA6 (ENSCPOG00000009697) ENSCPOG00000026860 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000168975 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00900000143342 ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 243 IDO1 (ENSCLAG00000001109) IDO2 (ENSCLAG00000003005) TCIM (ENSCLAG00000017544) ZMAT4 (ENSCLAG00000000923) SFRP1 (ENSCLAG00000000712) GOLGA7 (ENSCLAG00000000695) GINS4 (ENSCLAG00000000658) GPAT4 (ENSCLAG00000002589) NKX6-3 (ENSCLAG00000002327) ANK1 (ENSCLAG00000001439) KAT6A (ENSCLAG00000001559) AP3M2 (ENSCLAG00000000733) PLAT (ENSCLAG00000000644) IKBKB (ENSCLAG00000001149) POLB (ENSCLAG00000000919) VDAC3 (ENSCLAG00000000866) ##22 SLC20A2 (ENSCLAG00000000798) SMIM19 (ENSCLAG00000002469) CHRNB3 (ENSCLAG00000001883) CHRNA6 (ENSCLAG00000000775) Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 216 ENSODEG00000002756 ##22 ENSODEG00000002722 ENSODEG00000002633 PCDH9 (ENSODEG00000002576) ENSODEG00000018812 Degu MODERN SPECIES 92 ENSODEG00000007450 GINS4 (ENSODEG00000006226) GPAT4 (ENSODEG00000006252) NKX6-3 (ENSODEG00000005528) ENSODEG00000005411 ANK1 (ENSODEG00000006246) KAT6A (ENSODEG00000005122) ENSODEG00000005192 AP3M2 (ENSODEG00000005127) PLAT (ENSODEG00000005190) ENSODEG00000019108 ENSODEG00000004860 ENSODEG00000006104 POLB (ENSODEG00000006475) DKK4 (ENSODEG00000006319) ENSODEG00000006790 ##22 SLC20A2 (ENSODEG00000006256) SMIM19 (ENSODEG00000005591) CHRNB3 (ENSODEG00000005084) CHRNA6 (ENSODEG00000006080) VPS37A (ENSODEG00000005371) ENSODEG00000006498 ZDHHC2 (ENSODEG00000006012) ENSODEG00000005731 MICU3 (ENSODEG00000005330) FGF20 (ENSODEG00000004701) ENSODEG00000005389 ENSODEG00000005777 ENSODEG00000005349 MSR1 (ENSODEG00000004852) ENSODEG00000005030 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00900000143342 ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00900000143342 ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 165 Sfrp1 (ENSJJAG00000013805) ENSJJAG00000013991 Gins4 (ENSJJAG00000015028) Gpat4 (ENSJJAG00000012123) Nkx6-3 (ENSJJAG00000012233) ENSJJAG00000012904 Ank1 (ENSJJAG00000013390) ENSJJAG00000014398 ENSJJAG00000015060 Ap3m2 (ENSJJAG00000016071) Plat (ENSJJAG00000016962) ENSJJAG00000000210 ENSJJAG00000003998 Polb (ENSJJAG00000012865) Dkk4 (ENSJJAG00000014214) Vdac3 (ENSJJAG00000010473) ##22 Slc20a2 (ENSJJAG00000011000) Smim19 (ENSJJAG00000012675) Kcnj12 (ENSJJAG00000013092) Map2k3 (ENSJJAG00000015272) Natd1 (ENSJJAG00000019217) Tmem11 (ENSJJAG00000020023) Dhrs7b (ENSJJAG00000012592) Shmt1 (ENSJJAG00000015407) Smcr8 (ENSJJAG00000018061) ENSJJAG00000018489 Mief2 (ENSJJAG00000000391) Flii (ENSJJAG00000004390) Llgl1 (ENSJJAG00000012950) ENSJJAG00000021812 Myo15a (ENSJJAG00000011764) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00390000010017 ENSGT00730000110966 ENSGT00940000154335.a ENSGT00390000013335 ENSGT00390000017209 ENSGT00530000063691.b ENSGT00940000159738 ENSGT00940000160136 ENSGT00550000075118 ENSGT00940000155749.d ENSGT00940000153137.a.b.b.b Murinae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00390000010017 ENSGT00730000110966 ENSGT00940000154335.a ENSGT00390000013335 ENSGT00390000017209 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ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00390000010017 ENSGT00730000110966 ENSGT00940000154335.a ENSGT00390000013335 ENSGT00390000017209 ENSGT00530000063691.b ENSGT00940000159738 ENSGT00940000160136 ENSGT00550000075118 ENSGT00940000155749.d ENSGT00940000153137.a.b.b.b ENSGT00910000144208.d ENSGT00940000165558.b Mus_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00390000010017 ENSGT00730000110966 ENSGT00940000154335.a 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ENSGT00940000153137.a.b.b.b ENSGT00390000013953 ENSGT00390000002317 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00390000010017 ENSGT00730000110966 ENSGT00940000154335.a ENSGT00390000013335 ENSGT00390000017209 ENSGT00530000063691.b ENSGT00940000159738 ENSGT00940000160136 ENSGT00550000075118 ENSGT00940000155749.d ENSGT00940000153137.a.b.b.b ENSGT00390000013953 ENSGT00390000002317 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 8 Tcim (ENSPEMG00000003228) ENSPEMG00000018163 Zmat4 (ENSPEMG00000024509) Sfrp1 (ENSPEMG00000029396) Golga7 (ENSPEMG00000028120) Gins4 (ENSPEMG00000012800) Gpat4 (ENSPEMG00000028560) Nkx6-3 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(ENSMOCG00000020257) ENSMOCG00000006839 Vdac3 (ENSMOCG00000020594) ##22 Slc20a2 (ENSMOCG00000003842) Smim19 (ENSMOCG00000007629) Mrps31 (ENSMOCG00000004060) Slc25a15 (ENSMOCG00000003963) Thsd1 (ENSMOCG00000022554) ENSMOCG00000011199 Ckap2 (ENSMOCG00000019720) Nek3 (ENSMOCG00000012736) Nek5 (ENSMOCG00000008304) Alg11 (ENSMOCG00000020409) Atp7b (ENSMOCG00000017676) Ccdc70 (ENSMOCG00000003362) Defb13 (ENSMOCG00000018263) ENSMOCG00000011154 ENSMOCG00000014814 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00390000010017 ENSGT00730000110966 ENSGT00940000154335.a ENSGT00390000013335 ENSGT00390000017209 ENSGT00530000063691.b ENSGT00940000159738 ENSGT00940000160136 ENSGT00550000075118 ENSGT00940000155749.d ENSGT00940000153137.a.b.b.b ENSGT00390000013953 ENSGT00390000002317 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Ido2 (ENSCGRG00001014756) Tcim (ENSCGRG00001003871) Zmat4 (ENSCGRG00001016583) Sfrp1 (ENSCGRG00001017613) ENSCGRG00001020215 Gins4 (ENSCGRG00001016717) Gpat4 (ENSCGRG00001017830) Nkx6-3 (ENSCGRG00001018532) Ank1 (ENSCGRG00001021732) Kat6a (ENSCGRG00001019602) Ap3m2 (ENSCGRG00001020086) Plat (ENSCGRG00001021037) Ikbkb (ENSCGRG00001017718) Polb (ENSCGRG00001018504) Dkk4 (ENSCGRG00001018975) ENSCGRG00001019651 ##22 Slc20a2 (ENSCGRG00001007297) ENSCGRG00001008544 Smim19 (ENSCGRG00001013840) Mrps31 (ENSCGRG00001014160) ENSCGRG00001004965 ENSCGRG00001015230 Tpte (ENSCGRG00001016028) Thsd1 (ENSCGRG00001021322) Vps36 (ENSCGRG00001022167) Ckap2 (ENSCGRG00001023062) Nek3 (ENSCGRG00001004635) Nek5 (ENSCGRG00001024708) ENSCGRG00001023830 Atp7b (ENSCGRG00001019712) Ccdc70 (ENSCGRG00001005698) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 353 ENSCGRG00001013570 ENSCGRG00001010165 ENSCGRG00001008802 Bicd1 (ENSCGRG00001012616) Resf1 (ENSCGRG00001019529) Amn1 (ENSCGRG00001019322) Etfbkmt (ENSCGRG00001018178) ENSCGRG00001016214 ##22 Dennd5b (ENSCGRG00001012484) Sinhcaf (ENSCGRG00001000073) ENSCGRG00001017236 Caprin2 (ENSCGRG00001002901) Ipo8 (ENSCGRG00001014551) ENSCGRG00001012868 ENSCGRG00001012844 Tmtc1 (ENSCGRG00001012731) Ergic2 (ENSCGRG00001006657) Far2 (ENSCGRG00001000230) Golden Hamster DUPLICATION Golden Hamster MODERN SPECIES 624 ENSMAUG00000004169 Sfrp1 (ENSMAUG00000020015) Golga7 (ENSMAUG00000015212) ENSMAUG00000001580 Gins4 (ENSMAUG00000004678) Gpat4 (ENSMAUG00000019450) Nkx6-3 (ENSMAUG00000015260) Ank1 (ENSMAUG00000000761) ENSMAUG00000014837 ENSMAUG00000014493 Ap3m2 (ENSMAUG00000010210) Plat (ENSMAUG00000015957) Ikbkb (ENSMAUG00000015014) Polb (ENSMAUG00000002032) Dkk4 (ENSMAUG00000014089) ENSMAUG00000010048 ##22 Slc20a2 (ENSMAUG00000007412) Smim19 (ENSMAUG00000013864) Golden Hamster MODERN SPECIES 623 Spin1 (ENSMAUG00000014373) Nxnl2 (ENSMAUG00000014236) S1pr3 (ENSMAUG00000013844) Shc3 (ENSMAUG00000010478) Cks2 (ENSMAUG00000010312) Secisbp2 (ENSMAUG00000008659) ENSMAUG00000008086 Sema4d (ENSMAUG00000018331) Gadd45g (ENSMAUG00000020102) Diras2 (ENSMAUG00000019617) Syk (ENSMAUG00000019080) Auh (ENSMAUG00000009561) Nfil3 (ENSMAUG00000008018) Ror2 (ENSMAUG00000002294) Sptlc1 (ENSMAUG00000014497) ENSMAUG00000012346 ##22 Msx2 (ENSMAUG00000011757) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00940000156591 ENSGT00390000012054.b Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 Sloth DUPLICATION Sloth MODERN SPECIES 7931 ENSCHOG00000007369 ##22 Sloth MODERN SPECIES 13117 ENSCHOG00000006947 ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000161410 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00940000156591 ENSGT00390000012054.b Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000161410 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00940000156591 ENSGT00390000012054.b Elephant MODERN SPECIES 225 IDO1 (ENSLAFG00000002672) TCIM (ENSLAFG00000016270) ZMAT4 (ENSLAFG00000014753) SFRP1 (ENSLAFG00000017424) GOLGA7 (ENSLAFG00000009146) GINS4 (ENSLAFG00000016236) GPAT4 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ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 Armadillo MODERN SPECIES 4309 IKBKB (ENSDNOG00000007108) POLB (ENSDNOG00000007128) DKK4 (ENSDNOG00000007141) ENSDNOG00000013885 ##22 SLC20A2 (ENSDNOG00000013893) SMIM19 (ENSDNOG00000034740) Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 Tenrec MODERN SPECIES 5790 ENSETEG00000002644 DKK4 (ENSETEG00000002649) ENSETEG00000002652 ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 Mouse lemur MODERN SPECIES 12 CSMD1 (ENSMICG00000003389) MYOM2 (ENSMICG00000013602) KBTBD11 (ENSMICG00000013577) ARHGEF10 (ENSMICG00000013765) CLN8 (ENSMICG00000038560) DLGAP2 (ENSMICG00000016450) ENSMICG00000016447 TDRP (ENSMICG00000016699) ENSMICG00000007250 KAT6A (ENSMICG00000006961) AP3M2 (ENSMICG00000009218) PLAT (ENSMICG00000009222) IKBKB (ENSMICG00000006581) POLB (ENSMICG00000006594) DKK4 (ENSMICG00000045615) ENSMICG00000010235 ##22 CHRNA6 (ENSMICG00000010715) CHRNB3 (ENSMICG00000010710) SMIM19 (ENSMICG00000015429) SLC20A2 (ENSMICG00000033847) THAP1 (ENSMICG00000041721) RNF170 (ENSMICG00000031451) HOOK3 (ENSMICG00000001083) ENSMICG00000014757 POMK (ENSMICG00000046380) HGSNAT (ENSMICG00000006908) PLCG2 (ENSMICG00000015143) WFDC1 (ENSMICG00000012406) ATP2C2 (ENSMICG00000004563) MEAK7 (ENSMICG00000004583) COTL1 (ENSMICG00000045006) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 Tarsier MODERN SPECIES 6330 DDX19A (ENSTSYG00000025817) ENSTSYG00000033742 ##22 ENSTSYG00000029081 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00620000087966.a ENSGT00390000009517 ENSGT00390000015102.b ENSGT00940000154598 ENSGT00940000155554 ENSGT00390000003520 ENSGT00390000012366 ENSGT00910000147032 ENSGT00940000161060 ENSGT00940000153577.B ENSGT00940000156384 ENSGT00940000159071 ENSGT00940000162083 ENSGT00940000156927 ENSGT00940000153887.A.y ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00940000157826 ENSGT00390000013448.a.b ENSGT00940000154763 ENSGT00940000157766 ENSGT00940000159694 ENSGT00940000153724.B ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000161760 ENSGT00940000154225.b ENSGT00520000062039 ENSGT00910000147708 ENSGT00390000002641 ENSGT00530000068548 ENSGT00950000183173.O ENSGT00940000154482.b.b.a Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00620000087966.a ENSGT00390000009517 ENSGT00390000015102.b ENSGT00940000154598 ENSGT00940000155554 ENSGT00390000003520 ENSGT00390000012366 ENSGT00910000147032 ENSGT00940000161060 ENSGT00940000153577.B ENSGT00940000156384 ENSGT00940000159071 ENSGT00940000162083 ENSGT00940000156927 ENSGT00940000153887.A.y ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00940000157826 ENSGT00390000013448.a.b ENSGT00940000154763 ENSGT00940000157766 ENSGT00940000159694 ENSGT00940000153724.B ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000161760 ENSGT00940000154225.b ENSGT00520000062039 ENSGT00910000147708 ENSGT00390000002641 ENSGT00530000068548 ENSGT00950000183173.O ENSGT00940000153783.b.b.c.a.a.a.e.b Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00620000087966.a ENSGT00390000009517 ENSGT00390000015102.b ENSGT00940000154598 ENSGT00940000155554 ENSGT00390000003520 ENSGT00390000012366 ENSGT00910000147032 ENSGT00940000161060 ENSGT00940000153577.B ENSGT00940000156384 ENSGT00940000159071 ENSGT00940000162083 ENSGT00940000156927 ENSGT00940000153887.A.y ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00940000157826 ENSGT00390000013448.a.b ENSGT00940000154763 ENSGT00940000157766 ENSGT00940000159694 ENSGT00940000153724.B ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000161760 ENSGT00940000154225.b ENSGT00520000062039 ENSGT00910000147708 ENSGT00390000002641 ENSGT00530000068548 ENSGT00950000183173.O ENSGT00940000153783.b.b.c.a.a.a.e.b Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1079 CYP46A1 (ENSRBIG00000039410) EML1 (ENSRBIG00000035638) ENSRBIG00000042647 ##22 EVL (ENSRBIG00000041264) DEGS2 (ENSRBIG00000043113) ENSRBIG00000030861 SLC25A29 (ENSRBIG00000029125) SLC25A47 (ENSRBIG00000037776) WARS1 (ENSRBIG00000041632) WDR25 (ENSRBIG00000028405) BEGAIN (ENSRBIG00000038905) DLK1 (ENSRBIG00000026844) ENSRBIG00000026615 ENSRBIG00000026579 ENSRBIG00000027768 RTL1 (ENSRBIG00000029816) ENSRBIG00000039177 PPP2R5C (ENSRBIG00000043322) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2871 GSKIP (ENSRROG00000027899) AK7 (ENSRROG00000045086) PAPOLA (ENSRROG00000025545) VRK1 (ENSRROG00000033083) ENSRROG00000034494 ENSRROG00000008074 ENSRROG00000037006 ENSRROG00000040326 BCL11B (ENSRROG00000030930) SETD3 (ENSRROG00000042713) ENSRROG00000030431 CCNK (ENSRROG00000030282) HHIPL1 (ENSRROG00000044914) CYP46A1 (ENSRROG00000026022) EML1 (ENSRROG00000028922) ENSRROG00000040790 ##22 EVL (ENSRROG00000042601) DEGS2 (ENSRROG00000036009) ENSRROG00000042513 SLC25A29 (ENSRROG00000038750) SLC25A47 (ENSRROG00000034731) WARS1 (ENSRROG00000021348) WDR25 (ENSRROG00000039290) BEGAIN (ENSRROG00000030486) DLK1 (ENSRROG00000036823) ENSRROG00000039778 ENSRROG00000026506 ENSRROG00000042025 ENSRROG00000007395 RTL1 (ENSRROG00000011485) ENSRROG00000044881 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00620000087966.a ENSGT00390000009517 ENSGT00390000015102.b ENSGT00940000154598 ENSGT00940000155554 ENSGT00390000003520 ENSGT00390000012366 ENSGT00910000147032 ENSGT00940000161060 ENSGT00940000153577.B ENSGT00940000156384 ENSGT00940000159071 ENSGT00940000162083 ENSGT00940000156927 ENSGT00940000153887.A.y ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00940000157826 ENSGT00390000013448.a.b ENSGT00940000154763 ENSGT00940000157766 ENSGT00940000159694 ENSGT00940000153724.B ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000161760 ENSGT00940000154225.b ENSGT00520000062039 ENSGT00910000147708 ENSGT00530000068548 ENSGT00950000183173.O ENSGT00940000153783.b.b.c.a.a.a.e.b ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b.k Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000009517 ENSGT00390000015102.b ENSGT00940000154598 ENSGT00940000155554 ENSGT00390000003520 ENSGT00910000147472.b ENSGT00390000012366 ENSGT00910000147032 ENSGT00940000161060 ENSGT00940000153577.B ENSGT00940000156384 ENSGT00940000159071 ENSGT00940000162083 ENSGT00940000156927 ENSGT00940000153887.A.y ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00940000157826 ENSGT00390000013448.a.b ENSGT00940000154763 ENSGT00940000157766 ENSGT00940000159694 ENSGT00940000153724.B ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000161760 ENSGT00940000154225.b ENSGT00520000062039 ENSGT00910000147708 ENSGT00530000068548 ENSGT00950000183173.O ENSGT00390000010239.i.b ENSGT00940000153783.b.b.c.a.a.a.e.b Macaca ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000009517 ENSGT00390000015102.b ENSGT00940000154598 ENSGT00940000155554 ENSGT00390000003520 ENSGT00910000147472.b ENSGT00390000012366 ENSGT00910000147032 ENSGT00940000161060 ENSGT00940000153577.B ENSGT00940000156384 ENSGT00940000159071 ENSGT00940000162083 ENSGT00940000156927 ENSGT00940000153887.A.y ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00940000157826 ENSGT00390000013448.a.b ENSGT00940000154763 ENSGT00940000157766 ENSGT00940000159694 ENSGT00940000153724.B ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000161760 ENSGT00940000154225.b ENSGT00520000062039 ENSGT00910000147708 ENSGT00530000068548 ENSGT00950000183173.O ENSGT00390000010239.i.b ENSGT00940000153783.b.b.c.a.a.a.e.b Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 Rhesus MODERN SPECIES 18 ZMAT4 (ENSMMUG00000000776) SFRP1 (ENSMMUG00000019082) GOLGA7 (ENSMMUG00000016120) GINS4 (ENSMMUG00000009123) GPAT4 (ENSMMUG00000014721) NKX6-3 (ENSMMUG00000054451) ENSMMUG00000014725 ANK1 (ENSMMUG00000014726) KAT6A (ENSMMUG00000010891) AP3M2 (ENSMMUG00000014431) PLAT (ENSMMUG00000014432) IKBKB (ENSMMUG00000008351) POLB (ENSMMUG00000065244) ENSMMUG00000050370 DKK4 (ENSMMUG00000020794) VDAC3 (ENSMMUG00000020185) ##22 SLC20A2 (ENSMMUG00000020186) SMIM19 (ENSMMUG00000053488) CHRNB3 (ENSMMUG00000063923) ENSMMUG00000057030 CHRNA6 (ENSMMUG00000000163) ENSMMUG00000049973 THAP1 (ENSMMUG00000064084) RNF170 (ENSMMUG00000028999) HOOK3 (ENSMMUG00000019866) HGSNAT (ENSMMUG00000047028) ENSMMUG00000004229 ENSMMUG00000049337 SPIDR (ENSMMUG00000013149) ENSMMUG00000054991 CEBPD (ENSMMUG00000013151) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 393 GSKIP (ENSMNEG00000045172) AK7 (ENSMNEG00000034244) PAPOLA (ENSMNEG00000043747) VRK1 (ENSMNEG00000023345) ENSMNEG00000044943 ENSMNEG00000024440 ENSMNEG00000035369 ENSMNEG00000029995 BCL11B (ENSMNEG00000039540) SETD3 (ENSMNEG00000037141) CCNK (ENSMNEG00000042123) CCDC85C (ENSMNEG00000042565) HHIPL1 (ENSMNEG00000033661) CYP46A1 (ENSMNEG00000006524) EML1 (ENSMNEG00000019800) ENSMNEG00000032950 ##22 EVL (ENSMNEG00000034496) DEGS2 (ENSMNEG00000028076) ENSMNEG00000039286 SLC25A29 (ENSMNEG00000042810) SLC25A47 (ENSMNEG00000040592) WARS1 (ENSMNEG00000039856) WDR25 (ENSMNEG00000040432) BEGAIN (ENSMNEG00000033590) DLK1 (ENSMNEG00000040291) ENSMNEG00000019424 ENSMNEG00000009870 ENSMNEG00000031677 RTL1 (ENSMNEG00000026863) ENSMNEG00000040492 ENSMNEG00000044822 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000009517 ENSGT00390000015102.b ENSGT00940000154598 ENSGT00940000155554 ENSGT00390000003520 ENSGT00910000147472.b ENSGT00390000012366 ENSGT00910000147032 ENSGT00940000161060 ENSGT00940000153577.B ENSGT00940000156384 ENSGT00940000159071 ENSGT00940000162083 ENSGT00940000156927 ENSGT00940000153887.A.y ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00940000157826 ENSGT00390000013448.a.b ENSGT00940000154763 ENSGT00940000157766 ENSGT00940000159694 ENSGT00940000153724.B ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000161760 ENSGT00940000154225.b ENSGT00520000062039 ENSGT00530000068548 ENSGT00950000183173.O ENSGT00390000010239.i.b ENSGT00940000153783.b.b.c.a.a.a.e.b ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b.k Olive baboon MODERN SPECIES 17 AK7 (ENSPANG00000015911) PAPOLA (ENSPANG00000025582) ENSPANG00000048916 ENSPANG00000050213 VRK1 (ENSPANG00000026052) ENSPANG00000030091 ENSPANG00000013435 ENSPANG00000042513 BCL11B (ENSPANG00000004313) SETD3 (ENSPANG00000021767) CCNK (ENSPANG00000016348) ENSPANG00000034712 ENSPANG00000013434 CYP46A1 (ENSPANG00000015187) EML1 (ENSPANG00000024110) ENSPANG00000051190 ##22 EVL (ENSPANG00000019983) DEGS2 (ENSPANG00000012701) YY1 (ENSPANG00000009274) SLC25A29 (ENSPANG00000022750) SLC25A47 (ENSPANG00000012700) WARS1 (ENSPANG00000004815) WDR25 (ENSPANG00000015760) BEGAIN (ENSPANG00000009273) DLK1 (ENSPANG00000019235) ENSPANG00000023193 ENSPANG00000046994 ENSPANG00000033706 RTL1 (ENSPANG00000004236) ENSPANG00000006422 DYNC1H1 (ENSPANG00000036030) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000015102.b ENSGT00940000154598 ENSGT00390000008196.g.b.b ENSGT00940000155554 ENSGT00390000003520 ENSGT00910000147472.b ENSGT00390000012366 ENSGT00910000147032 ENSGT00940000161060 ENSGT00940000153577.B ENSGT00940000156384 ENSGT00940000159071 ENSGT00940000162083 ENSGT00940000156927 ENSGT00940000153887.A.y ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00940000157826 ENSGT00390000013448.a.b ENSGT00940000154763 ENSGT00940000157766 ENSGT00940000159694 ENSGT00940000153724.B ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000161760 ENSGT00940000154225.b ENSGT00520000062039 ENSGT00530000068548 ENSGT00950000183173.O ENSGT00390000010239.i.b ENSGT00940000153783.b.b.c.a.a.a.e.b ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b.k Sooty mangabey MODERN SPECIES 249 AK7 (ENSCATG00000042813) PAPOLA (ENSCATG00000018815) ENSCATG00000015145 VRK1 (ENSCATG00000037353) ENSCATG00000042865 ENSCATG00000017537 ENSCATG00000044476 BCL11B (ENSCATG00000041505) ENSCATG00000032943 SETD3 (ENSCATG00000032268) CCNK (ENSCATG00000038978) CCDC85C (ENSCATG00000038460) HHIPL1 (ENSCATG00000036604) CYP46A1 (ENSCATG00000011974) EML1 (ENSCATG00000034190) ENSCATG00000024268 ##22 EVL (ENSCATG00000036977) DEGS2 (ENSCATG00000044747) YY1 (ENSCATG00000041049) SLC25A29 (ENSCATG00000014876) SLC25A47 (ENSCATG00000037022) WARS1 (ENSCATG00000026382) ENSCATG00000031424 WDR25 (ENSCATG00000000642) BEGAIN (ENSCATG00000010614) DLK1 (ENSCATG00000003062) ENSCATG00000041632 ENSCATG00000041413 RTL1 (ENSCATG00000019857) ENSCATG00000032833 PPP2R5C (ENSCATG00000031494) Drill MODERN SPECIES 1071 GSKIP (ENSMLEG00000038618) AK7 (ENSMLEG00000027876) PAPOLA (ENSMLEG00000032066) ENSMLEG00000027823 VRK1 (ENSMLEG00000026137) ENSMLEG00000038361 ENSMLEG00000017040 ENSMLEG00000044245 ENSMLEG00000042118 SETD3 (ENSMLEG00000039987) ENSMLEG00000011573 CCNK (ENSMLEG00000042546) HHIPL1 (ENSMLEG00000031697) CYP46A1 (ENSMLEG00000038339) EML1 (ENSMLEG00000040176) ENSMLEG00000042567 ##22 EVL (ENSMLEG00000027796) DEGS2 (ENSMLEG00000034010) ENSMLEG00000034014 SLC25A29 (ENSMLEG00000028706) SLC25A47 (ENSMLEG00000034866) WARS1 (ENSMLEG00000034858) WDR25 (ENSMLEG00000011681) BEGAIN (ENSMLEG00000033047) DLK1 (ENSMLEG00000041076) ENSMLEG00000040231 ENSMLEG00000044223 RTL1 (ENSMLEG00000024634) ENSMLEG00000009022 ENSMLEG00000043964 PPP2R5C (ENSMLEG00000023078) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00550000076508 ENSGT00620000087966.a ENSGT00390000009517 ENSGT00390000015102.b ENSGT00940000154598 ENSGT00940000155554 ENSGT00390000003520 ENSGT00390000012366 ENSGT00940000161060 ENSGT00940000153577.B ENSGT00940000156384 ENSGT00940000159071 ENSGT00940000162083 ENSGT00940000156927 ENSGT00940000153887.A.y ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00940000157826 ENSGT00390000013448.a.b ENSGT00940000154763 ENSGT00940000157766 ENSGT00940000159694 ENSGT00940000153724.B ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000161760 ENSGT00940000154225.b ENSGT00520000062039 ENSGT00910000147708 ENSGT00390000002641 ENSGT00530000068548 ENSGT00950000183173.O ENSGT00940000154482.b.b.a Gibbon MODERN SPECIES 14 ENSNLEG00000018681 ENSNLEG00000000509 ATG2B (ENSNLEG00000000510) GSKIP (ENSNLEG00000000589) AK7 (ENSNLEG00000000597) PAPOLA (ENSNLEG00000000625) VRK1 (ENSNLEG00000000646) ENSNLEG00000035105 BCL11B (ENSNLEG00000000711) SETD3 (ENSNLEG00000000715) CCNK (ENSNLEG00000000753) CCDC85C (ENSNLEG00000000785) HHIPL1 (ENSNLEG00000000793) CYP46A1 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ENSGT00520000062039 ENSGT00530000068548 ENSGT00950000183173.O ENSGT00940000154482.b.b.a ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b.k ENSGT00940000156103 Orangutan MODERN SPECIES 5 ENSPPYG00000006124 ATG2B (ENSPPYG00000006125) GSKIP (ENSPPYG00000006126) AK7 (ENSPPYG00000006127) PAPOLA (ENSPPYG00000006128) VRK1 (ENSPPYG00000029830) ENSPPYG00000037039 BCL11B (ENSPPYG00000039840) SETD3 (ENSPPYG00000006132) CCNK (ENSPPYG00000029469) CCDC85C (ENSPPYG00000006133) HHIPL1 (ENSPPYG00000006134) CYP46A1 (ENSPPYG00000006136) ENSPPYG00000030717 EML1 (ENSPPYG00000006137) ENSPPYG00000036858 ##22 EVL (ENSPPYG00000006138) DEGS2 (ENSPPYG00000006139) YY1 (ENSPPYG00000025949) SLC25A29 (ENSPPYG00000033344) SLC25A47 (ENSPPYG00000006141) WARS1 (ENSPPYG00000006142) ENSPPYG00000006143 WDR25 (ENSPPYG00000029436) ENSPPYG00000006144 DLK1 (ENSPPYG00000006146) ENSPPYG00000006147 ENSPPYG00000035418 ENSPPYG00000040298 RTL1 (ENSPPYG00000006149) PPP2R5C (ENSPPYG00000006152) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 12 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ENSGT00530000068548 ENSGT00950000183173.O ENSGT00910000148454 ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b.k ENSGT00940000156103 Chimpanzee MODERN SPECIES 5 ATG2B (ENSPTRG00000006700) ENSPTRG00000052170 GSKIP (ENSPTRG00000006701) AK7 (ENSPTRG00000006703) PAPOLA (ENSPTRG00000006704) VRK1 (ENSPTRG00000006705) ENSPTRG00000024389 LINC02914 (ENSPTRG00000006706) BCL11B (ENSPTRG00000006707) SETD3 (ENSPTRG00000006708) CCNK (ENSPTRG00000006709) CCDC85C (ENSPTRG00000006711) HHIPL1 (ENSPTRG00000006712) CYP46A1 (ENSPTRG00000006713) EML1 (ENSPTRG00000006714) ENSPTRG00000046202 ##22 EVL (ENSPTRG00000006715) DEGS2 (ENSPTRG00000006716) YY1 (ENSPTRG00000006717) SLC25A29 (ENSPTRG00000006718) SLC25A47 (ENSPTRG00000006719) WARS1 (ENSPTRG00000006720) WDR25 (ENSPTRG00000006722) ENSPTRG00000006725 DLK1 (ENSPTRG00000051401) ENSPTRG00000050628 ENSPTRG00000043636 RTL1 (ENSPTRG00000006731) ENSPTRG00000047029 PPP2R5C (ENSPTRG00000006734) DYNC1H1 (ENSPTRG00000006735) Bonobo MODERN SPECIES 5 ENSPPAG00000042752 ATG2B 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ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935.k ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a.w Marmotini ANCESTRAL SPECIES 102 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 Alpin marmot MODERN SPECIES 116 IDO1 (ENSMMMG00000004171) IDO2 (ENSMMMG00000004208) TCIM (ENSMMMG00000004221) SFRP1 (ENSMMMG00000004226) ENSMMMG00000004245 GINS4 (ENSMMMG00000004261) GPAT4 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ENSUPAG00010022726 AP3M2 (ENSUPAG00010022725) PLAT (ENSUPAG00010022724) IKBKB (ENSUPAG00010022720) ENSUPAG00010022716 DKK4 (ENSUPAG00010022713) ENSUPAG00010022712 ##22 SLC20A2 (ENSUPAG00010022709) Squirrel MODERN SPECIES 385 SFRP1 (ENSSTOG00000024513) GOLGA7 (ENSSTOG00000004024) GINS4 (ENSSTOG00000026490) GPAT4 (ENSSTOG00000012719) NKX6-3 (ENSSTOG00000012730) ANK1 (ENSSTOG00000012734) KAT6A (ENSSTOG00000024970) ENSSTOG00000029457 AP3M2 (ENSSTOG00000009669) PLAT (ENSSTOG00000009680) IKBKB (ENSSTOG00000005808) POLB (ENSSTOG00000005845) DKK4 (ENSSTOG00000005875) ENSSTOG00000005888 ##22 SLC20A2 (ENSSTOG00000025918) SMIM19 (ENSSTOG00000002086) ENSSTOG00000028032 CHRNB3 (ENSSTOG00000002091) CHRNA6 (ENSSTOG00000002095) Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 1 PLXNB1 (ENSSVLG00005014328) CCDC51 (ENSSVLG00005014375) ENSSVLG00005014448 ATRIP (ENSSVLG00005014509) TREX1 (ENSSVLG00005014697) SHISA5 (ENSSVLG00005014756) PFKFB4 (ENSSVLG00005014865) UCN2 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ENSODEG00000005464 ISOC1 (ENSODEG00000007132) SLC27A6 (ENSODEG00000007619) FBN2 (ENSODEG00000007349) SLC12A2 (ENSODEG00000007287) ENSODEG00000008666 ENSODEG00000005778 ENSODEG00000006652 ##22 PRRC1 (ENSODEG00000006350) MEGF10 (ENSODEG00000005872) C5orf63 (ENSODEG00000007167) MARCHF3 (ENSODEG00000006696) LMNB1 (ENSODEG00000006242) TEX43 (ENSODEG00000006869) PHAX (ENSODEG00000006349) ENSODEG00000009578 ALDH7A1 (ENSODEG00000006140) GRAMD2B (ENSODEG00000006633) ZNF608 (ENSODEG00000006507) ENSODEG00000006728 ENSODEG00000008631 ENSODEG00000007055 CSNK1G3 (ENSODEG00000007615) Degu MODERN SPECIES 60 ENSODEG00000011811 PDGFRA (ENSODEG00000009544) GSX2 (ENSODEG00000009015) CHIC2 (ENSODEG00000009727) ENSODEG00000019624 ENSODEG00000009055 ENSODEG00000008952 ENSODEG00000008823 LNX1 (ENSODEG00000010836) ENSODEG00000009001 ENSODEG00000019669 ENSODEG00000008819 SCFD2 (ENSODEG00000010104) RASL11B (ENSODEG00000010294) USP46 (ENSODEG00000009787) ENSODEG00000008705 ##22 ENSODEG00000019795 ENSODEG00000009441 ENSODEG00000009977 SGCB (ENSODEG00000009784) ENSODEG00000009044 ENSODEG00000009096 CWH43 (ENSODEG00000009451) OCIAD2 (ENSODEG00000010340) ENSODEG00000010537 OCIAD1 (ENSODEG00000009198) FRYL (ENSODEG00000009331) ENSODEG00000008772 SLC10A4 (ENSODEG00000010331) ENSODEG00000008159 VSNL1 (ENSODEG00000008555) Degu MODERN SPECIES 49 SLC6A3 (ENSODEG00000018337) CLPTM1L (ENSODEG00000018435) TERT (ENSODEG00000018274) SLC6A18 (ENSODEG00000018351) SLC6A19 (ENSODEG00000018254) SLC12A7 (ENSODEG00000018252) NKD2 (ENSODEG00000018297) TRIP13 (ENSODEG00000018401) ENSODEG00000018289 ENSODEG00000018341 TPPP (ENSODEG00000018262) CEP72 (ENSODEG00000018348) SLC9A3 (ENSODEG00000018282) EXOC3 (ENSODEG00000018394) AHRR (ENSODEG00000018258) ENSODEG00000018234 ##22 PDCD6 (ENSODEG00000018264) SDHA (ENSODEG00000018317) CCDC127 (ENSODEG00000018314) LRRC14B (ENSODEG00000018256) GLYCTK (ENSODEG00000018246) WDR82 (ENSODEG00000018304) PPM1M (ENSODEG00000018248) TWF2 (ENSODEG00000018443) TLR9 (ENSODEG00000018236) ALAS1 (ENSODEG00000018438) ENSODEG00000018273 POC1A (ENSODEG00000018290) DUSP7 (ENSODEG00000018426) ENSODEG00000018318 ACY1 (ENSODEG00000018276) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 Kangaroo rat MODERN SPECIES 323 Zmat4 (ENSDORG00000009300) Sfrp1 (ENSDORG00000029616) Golga7 (ENSDORG00000027067) Gins4 (ENSDORG00000014928) Gpat4 (ENSDORG00000014044) Nkx6-3 (ENSDORG00000023956) ENSDORG00000028648 ENSDORG00000027400 ENSDORG00000024601 ENSDORG00000013658 Ap3m2 (ENSDORG00000011915) Plat (ENSDORG00000011916) Ikbkb (ENSDORG00000012732) Polb (ENSDORG00000002424) Dkk4 (ENSDORG00000002426) ENSDORG00000002427 ##22 Slc20a2 (ENSDORG00000002428) Smim19 (ENSDORG00000030229) Chrnb3 (ENSDORG00000006299) Chrna6 (ENSDORG00000008288) Thap1 (ENSDORG00000028182) Rnf170 (ENSDORG00000024809) Hook3 (ENSDORG00000001526) ENSDORG00000016106 ENSDORG00000023626 ENSDORG00000010015 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 44 ENSJJAG00000019626 ENSJJAG00000014496 ##22 Rag1 (ENSJJAG00000003473) Zup1 (ENSJJAG00000016597) Rfx6 (ENSJJAG00000020654) Vgll2 (ENSJJAG00000015020) Ros1 (ENSJJAG00000022739) Dcbld1 (ENSJJAG00000011489) Gopc (ENSJJAG00000013218) Nepn (ENSJJAG00000011885) Nus1 (ENSJJAG00000016913) Slc35f1 (ENSJJAG00000016095) ENSJJAG00000013262 ENSJJAG00000021447 Pln (ENSJJAG00000003066) Cep85l (ENSJJAG00000016233) Asf1a (ENSJJAG00000009705) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1861 Ikbkb (ENSNGAG00000012334) Polb (ENSNGAG00000010634) Dkk4 (ENSNGAG00000000367) ENSNGAG00000018843 ##22 ENSNGAG00000012230 ENSNGAG00000005779 Smim19 (ENSNGAG00000002360) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1065 Ubc (ENSNGAG00000020585) Scarb1 (ENSNGAG00000022213) Ncor2 (ENSNGAG00000023665) Rflna (ENSNGAG00000005526) Zfp664 (ENSNGAG00000010695) ENSNGAG00000012211 Ccdc92 (ENSNGAG00000006915) Dnah10 (ENSNGAG00000016515) Atp6v0a2 (ENSNGAG00000003702) Gtf2h3 (ENSNGAG00000019658) Eif2b1 (ENSNGAG00000002340) Ddx55 (ENSNGAG00000020564) Tmed2 (ENSNGAG00000022831) Rilpl1 (ENSNGAG00000001524) Snrnp35 (ENSNGAG00000010711) ENSNGAG00000014715 ##22 Rilpl2 (ENSNGAG00000022595) Kmt5a (ENSNGAG00000001408) Sbno1 (ENSNGAG00000012620) ENSNGAG00000010002 Mtrfr (ENSNGAG00000010625) Mphosph9 (ENSNGAG00000014036) ENSNGAG00000023046 ENSNGAG00000023216 Arl6ip4 (ENSNGAG00000023492) Ogfod2 (ENSNGAG00000023848) Abcb9 (ENSNGAG00000017758) Vps37b (ENSNGAG00000007096) Hip1r (ENSNGAG00000016649) Ccdc62 (ENSNGAG00000006948) Denr (ENSNGAG00000013775) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 Rat MODERN SPECIES 11 Wls (ENSRNOG00000036816) Rpe65 (ENSRNOG00000009582) Depdc1 (ENSRNOG00000009503) Lrrc7 (ENSRNOG00000011980) Lrrc40 (ENSRNOG00000011555) Srsf11 (ENSRNOG00000029592) Ankrd13c (ENSRNOG00000011340) Cth (ENSRNOG00000010658) AABR07013931.2 (ENSRNOG00000053997) AABR07048397.1 (ENSRNOG00000038905) ENSRNOG00000063023 ##22 Ptger3 (ENSRNOG00000010325) Zranb2 (ENSRNOG00000009990) Negr1 (ENSRNOG00000021410) Lrriq3 (ENSRNOG00000009555) Fpgt (ENSRNOG00000009548) Lrrc53 (ENSRNOG00000068038) Tnni3k (ENSRNOG00000028225) Erich3 (ENSRNOG00000009533) Cryz (ENSRNOG00000028319) Tyw3 (ENSRNOG00000028328) Lhx8 (ENSRNOG00000028348) Slc44a5 (ENSRNOG00000042332) Acadm (ENSRNOG00000009845) Rabggtb (ENSRNOG00000009992) Msh4 (ENSRNOG00000010431) Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000017848 ENSGT00390000016042 ENSGT00520000058758 ENSGT00940000154537 ENSGT00940000157660 ENSGT00390000008294.e.a.w.b ENSGT00390000005529.a ENSGT00940000156297 ENSGT00940000157205 ENSGT00940000154280 ENSGT00940000156550 ENSGT00940000156624 ENSGT00940000156780 ENSGT00940000156669.b ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00940000158385 ENSGT00530000063735.a ENSGT00390000012411 ENSGT00650000093320.a.b ENSGT00940000158894 ENSGT00940000155766.a ENSGT00940000158933 ENSGT00390000016119 ENSGT00390000001763 ENSGT00940000161145 ENSGT00530000063260 ENSGT00940000154839.C ENSGT00940000158818 ENSGT00940000155552 ENSGT00940000155327 spretus MODERN SPECIES 5 MGP_SPRETEiJ_G0019906 MGP_SPRETEiJ_G0019907 MGP_SPRETEiJ_G0019908 MGP_SPRETEiJ_G0019910 MGP_SPRETEiJ_G0019909 Slmap (MGP_SPRETEiJ_G0019912) MGP_SPRETEiJ_G0019913 Dennd6a (MGP_SPRETEiJ_G0019914) Arf4 (MGP_SPRETEiJ_G0019915) Pde12 (MGP_SPRETEiJ_G0019916) MGP_SPRETEiJ_G0019917 Asb14 (MGP_SPRETEiJ_G0019918) Appl1 (MGP_SPRETEiJ_G0019919) Hesx1 (MGP_SPRETEiJ_G0019920) Il17rd (MGP_SPRETEiJ_G0019921) MGP_SPRETEiJ_G0019922 ##22 Arhgef3 (MGP_SPRETEiJ_G0019923) Tasor (MGP_SPRETEiJ_G0019924) Ccdc66 (MGP_SPRETEiJ_G0019925) Erc2 (MGP_SPRETEiJ_G0019926) Wnt5a (MGP_SPRETEiJ_G0019927) Cacna2d3 (MGP_SPRETEiJ_G0019928) Lrtm1 (MGP_SPRETEiJ_G0019929) Selenok (MGP_SPRETEiJ_G0019930) Actr8 (MGP_SPRETEiJ_G0019931) Il17rb (MGP_SPRETEiJ_G0019932) Chdh (MGP_SPRETEiJ_G0019933) Cacna1d (MGP_SPRETEiJ_G0019934) Dcp1a (MGP_SPRETEiJ_G0019935) MGP_SPRETEiJ_G0019936 Prkcd (MGP_SPRETEiJ_G0019937) Steppe mouse MODERN SPECIES 275 Cphx1 (ENSMSIG00000026692) Duxbl1 (ENSMSIG00000026714) ENSMSIG00000026746 Slmap (ENSMSIG00000026772) ENSMSIG00000027380 Dennd6a (ENSMSIG00000027390) Arf4 (ENSMSIG00000027424) Pde12 (ENSMSIG00000027439) Dnah12 (ENSMSIG00000027454) Asb14 (ENSMSIG00000027841) Appl1 (ENSMSIG00000027855) Hesx1 (ENSMSIG00000027875) Il17rd (ENSMSIG00000027878) Arhgef3 (ENSMSIG00000027892) ENSMSIG00000027917 ENSMSIG00000027919 ##22 Tasor (ENSMSIG00000027932) Ccdc66 (ENSMSIG00000027991) Erc2 (ENSMSIG00000028031) Wnt5a (ENSMSIG00000028229) Cacna2d3 (ENSMSIG00000028244) ENSMSIG00000028356 ENSMSIG00000028374 Selenok (ENSMSIG00000028379) Actr8 (ENSMSIG00000028385) Il17rb (ENSMSIG00000028390) Chdh (ENSMSIG00000028402) Cacna1d (ENSMSIG00000028408) Dcp1a (ENSMSIG00000028662) Tkt (ENSMSIG00000028678) Prkcd (ENSMSIG00000028700) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a Rabbit MODERN SPECIES 439 ZMAT4 (ENSOCUG00000000977) ENSOCUG00000026917 ENSOCUG00000033787 GOLGA7 (ENSOCUG00000007546) GINS4 (ENSOCUG00000006154) GPAT4 (ENSOCUG00000002071) NKX6-3 (ENSOCUG00000025759) ENSOCUG00000030778 ANK1 (ENSOCUG00000011683) ENSOCUG00000038938 ENSOCUG00000000731 AP3M2 (ENSOCUG00000009960) PLAT (ENSOCUG00000009967) IKBKB (ENSOCUG00000007141) POLB (ENSOCUG00000001295) ENSOCUG00000024318 ##22 SLC20A2 (ENSOCUG00000015421) ENSOCUG00000003675 CHRNB3 (ENSOCUG00000005123) CHRNA6 (ENSOCUG00000009516) THAP1 (ENSOCUG00000001391) RNF170 (ENSOCUG00000001392) HOOK3 (ENSOCUG00000001402) POMK (ENSOCUG00000007725) HGSNAT (ENSOCUG00000008094) ENSOCUG00000039099 ENSOCUG00000029268 ENSOCUG00000038796 Pika MODERN SPECIES 5443 IKBKB (ENSOPRG00000012153) POLB (ENSOPRG00000012173) DKK4 (ENSOPRG00000012196) ENSOPRG00000012208 ##22 ENSOPRG00000012219 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 Common shrew MODERN SPECIES 396 IKBKB (ENSSARG00000008798) POLB (ENSSARG00000008811) DKK4 (ENSSARG00000008827) ENSSARG00000008835 ##22 SLC20A2 (ENSSARG00000008839) ENSSARG00000008851 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 Microbat MODERN SPECIES 1131 ENSMLUG00000016461 GOLGA7 (ENSMLUG00000014516) GINS4 (ENSMLUG00000017409) MBD3L1 (ENSMLUG00000027189) GPAT4 (ENSMLUG00000005245) ENSMLUG00000005260 ANK1 (ENSMLUG00000005262) KAT6A (ENSMLUG00000017445) AP3M2 (ENSMLUG00000002005) PLAT (ENSMLUG00000002013) ENSMLUG00000010048 ENSMLUG00000026380 POLB (ENSMLUG00000022469) METTL21C (ENSMLUG00000016774) ENSMLUG00000016777 ENSMLUG00000011159 ##22 SLC20A2 (ENSMLUG00000011172) SMIM19 (ENSMLUG00000011197) ENSMLUG00000027337 CHRNB3 (ENSMLUG00000027322) CHRNA6 (ENSMLUG00000005231) THAP1 (ENSMLUG00000003837) RNF170 (ENSMLUG00000011513) HOOK3 (ENSMLUG00000011455) FNTA (ENSMLUG00000002921) POMK 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ENSMPUG00000001261 ENSMPUG00000001262 ##22 GPX6 (ENSMPUG00000001266) ENSMPUG00000001273 ZSCAN12 (ENSMPUG00000001275) ZSCAN31 (ENSMPUG00000001277) PGBD1 (ENSMPUG00000001279) ZSCAN26 (ENSMPUG00000001288) ENSMPUG00000001293 ZKSCAN4 (ENSMPUG00000001306) ZKSCAN8 (ENSMPUG00000001308) ZSCAN16 (ENSMPUG00000001309) ENSMPUG00000001313 ZNF165 (ENSMPUG00000001314) ENSMPUG00000019301 ENSMPUG00000019303 ENSMPUG00000019304 American mink DUPLICATION American mink MODERN SPECIES 86 CH004 (ENSNVIG00000009822) ENSNVIG00000009769 ZMAT4 (ENSNVIG00000009733) SFRP1 (ENSNVIG00000009728) GOLGA7 (ENSNVIG00000009712) GINS4 (ENSNVIG00000009700) GPAT4 (ENSNVIG00000009642) NKX6-3 (ENSNVIG00000009629) ANK1 (ENSNVIG00000009294) KAT6A (ENSNVIG00000009232) AP3M2 (ENSNVIG00000009178) PLAT (ENSNVIG00000009037) IKBKB (ENSNVIG00000008793) DPOLB (ENSNVIG00000008734) DKK4 (ENSNVIG00000008723) ENSNVIG00000008690 ##22 SLC20A2 (ENSNVIG00000008669) SMIM19 (ENSNVIG00000008645) CHRNB3 (ENSNVIG00000008622) CHRNA6 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##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00680000101436 Suina ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000168975 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00940000156591 ENSGT00390000012054.b.tb Pig MODERN SPECIES 8 ZMAT4 (ENSSSCG00000007010) SFRP1 (ENSSSCG00000025822) GOLGA7 (ENSSSCG00000020715) GINS4 (ENSSSCG00000037513) GPAT4 (ENSSSCG00000007019) NKX6-3 (ENSSSCG00000033505) ENSSSCG00000031608 ANK1 (ENSSSCG00000007022) ENSSSCG00000059771 ENSSSCG00000007023 AP3M2 (ENSSSCG00000007033) PLAT (ENSSSCG00000007032) IKBKB (ENSSSCG00000007030) POLB (ENSSSCG00000007031) DKK4 (ENSSSCG00000007029) ENSSSCG00000007026 ##22 SLC20A2 (ENSSSCG00000007027) SMIM19 (ENSSSCG00000031857) CHRNB3 (ENSSSCG00000026363) CHRNA6 (ENSSSCG00000023338) THAP1 (ENSSSCG00000039969) RNF170 (ENSSSCG00000036001) HOOK3 (ENSSSCG00000024486) FNTA (ENSSSCG00000063303) POMK (ENSSSCG00000031510) ENSSSCG00000038960 ENSSSCG00000007004 ENSSSCG00000049489 CSGALNACT1 (ENSSSCG00000035371) ENSSSCG00000033750 PSD3 (ENSSSCG00000007034) Chacoan peccary MODERN SPECIES 781 IDO2 (ENSCWAG00000013189) TCIM (ENSCWAG00000013167) ZMAT4 (ENSCWAG00000013045) SFRP1 (ENSCWAG00000012985) GOLGA7 (ENSCWAG00000012944) GINS4 (ENSCWAG00000012781) GPAT4 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ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00680000101436 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383.l.a ENSGT00940000159383.l.b ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00680000101436 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b.o ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383.l.a ENSGT00940000159383.k ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00680000101436 Sperm whale DUPLICATION Sperm whale MODERN SPECIES 12 IDO1 (ENSPCTG00005011780) IDO2 (ENSPCTG00005011649) TCIM (ENSPCTG00005011627) ZMAT4 (ENSPCTG00005011467) SFRP1 (ENSPCTG00005011403) GOLGA7 (ENSPCTG00005011352) GINS4 (ENSPCTG00005011324) GPAT4 (ENSPCTG00005011287) NKX6-3 (ENSPCTG00005011248) ANK1 (ENSPCTG00005009711) ENSPCTG00005009617 ENSPCTG00005009569 ENSPCTG00005009532 POLB (ENSPCTG00005009483) DKK4 (ENSPCTG00005009421) VDAC3 (ENSPCTG00005009269) ##22 SLC20A2 (ENSPCTG00005009197) SMIM19 (ENSPCTG00005009155) CHRNB3 (ENSPCTG00005009052) CHRNA6 (ENSPCTG00005008927) ENSPCTG00005020643 ENSPCTG00005020608 RNF170 (ENSPCTG00005020524) HOOK3 (ENSPCTG00005020485) FNTA (ENSPCTG00005020435) POMK (ENSPCTG00005020417) HGSNAT (ENSPCTG00005020293) INTS10 (ENSPCTG00005020222) CSGALNACT1 (ENSPCTG00005020153) SH2D4A (ENSPCTG00005020126) PSD3 (ENSPCTG00005020026) Sperm whale MODERN SPECIES 2 HDGFL3 (ENSPCTG00005021855) BNC1 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ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383.l.a ENSGT00940000159383.k ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00680000101436 Dolphin MODERN SPECIES 1545 POLB (ENSTTRG00000009632) ENSTTRG00000009666 VDAC3 (ENSTTRG00000009681) ##22 SLC20A2 (ENSTTRG00000009698) SMIM19 (ENSTTRG00000009720) Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b.p.a ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383.l.a ENSGT00940000159383.k ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075.o ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00680000101436 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000161813 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000156888 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b.p.a ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00390000014879.c.b ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383.l.a ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075.o ENSGT00550000074935 ENSGT00390000004945 ENSGT00950000182878.b.b.k.b ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00680000101436 Beluga whale MODERN SPECIES 30 IDO2 (ENSDLEG00000007277) TCIM (ENSDLEG00000007290) ZMAT4 (ENSDLEG00000007292) SFRP1 (ENSDLEG00000007298) ENSDLEG00000007303 GINS4 (ENSDLEG00000007321) GPAT4 (ENSDLEG00000007332) NKX6-3 (ENSDLEG00000007337) ANK1 (ENSDLEG00000007966) KAT6A (ENSDLEG00000021358) AP3M2 (ENSDLEG00000021367) PLAT (ENSDLEG00000021369) IKBKB (ENSDLEG00000021376) POLB (ENSDLEG00000021389) DKK4 (ENSDLEG00000021396) ENSDLEG00000021398 ##22 SLC20A2 (ENSDLEG00000021401) SMIM19 (ENSDLEG00000021404) CHRNB3 (ENSDLEG00000021409) CHRNA6 (ENSDLEG00000021416) RNF170 (ENSDLEG00000021419) HOOK3 (ENSDLEG00000021425) FNTA (ENSDLEG00000021430) POMK (ENSDLEG00000021432) ENSDLEG00000021433 HGSNAT (ENSDLEG00000021434) INTS10 (ENSDLEG00000021442) CSGALNACT1 (ENSDLEG00000021463) SH2D4A (ENSDLEG00000021466) PSD3 (ENSDLEG00000021471) Narwhal DUPLICATION Narwhal MODERN SPECIES 308 FGF7 (ENSMMNG00015012274) GALK2 (ENSMMNG00015012300) COPS2 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SEMA6D (ENSPSNG00000002044) ENSPSNG00000002100 ##22 ENSPSNG00000002115 SQOR (ENSPSNG00000002134) BLOC1S6 (ENSPSNG00000002166) SLC30A4 (ENSPSNG00000002193) C15orf48 (ENSPSNG00000002224) SPATA5L1 (ENSPSNG00000002248) GATM (ENSPSNG00000002284) SLC28A2 (ENSPSNG00000002310) SHF (ENSPSNG00000002356) DUOXA1 (ENSPSNG00000002438) DUOXA2 (ENSPSNG00000002471) DUOX2 (ENSPSNG00000002511) SORD (ENSPSNG00000002602) TERB2 (ENSPSNG00000002623) TRIM69 (ENSPSNG00000002669) Vaquita MODERN SPECIES 13 IDO2 (ENSPSNG00000016133) TCIM (ENSPSNG00000016318) ZMAT4 (ENSPSNG00000016380) SFRP1 (ENSPSNG00000016536) ENSPSNG00000016584 GINS4 (ENSPSNG00000016625) GPAT4 (ENSPSNG00000016669) NKX6-3 (ENSPSNG00000016700) ANK1 (ENSPSNG00000016886) ENSPSNG00000018240 ENSPSNG00000018259 AP3M2 (ENSPSNG00000018308) PLAT (ENSPSNG00000018352) IKBKB (ENSPSNG00000018463) POLB (ENSPSNG00000018721) ENSPSNG00000018850 ##22 SLC20A2 (ENSPSNG00000018979) SMIM19 (ENSPSNG00000019059) CHRNB3 (ENSPSNG00000019107) CHRNA6 (ENSPSNG00000019174) THAP1 (ENSPSNG00000019257) RNF170 (ENSPSNG00000019305) ENSPSNG00000019430 ENSPSNG00000019363 FNTA (ENSPSNG00000019481) POMK (ENSPSNG00000019530) HGSNAT (ENSPSNG00000019558) INTS10 (ENSPSNG00000019615) CSGALNACT1 (ENSPSNG00000019674) SH2D4A (ENSPSNG00000019701) PSD3 (ENSPSNG00000019769) Vaquita MODERN SPECIES 17 ACO1 (ENSPSNG00000002130) ENSPSNG00000002105 ENSPSNG00000002077 ENSPSNG00000002047 LINGO2 (ENSPSNG00000002038) C9orf72 (ENSPSNG00000002018) IFNK (ENSPSNG00000002003) MOB3B (ENSPSNG00000001987) ENSPSNG00000001974 TEK (ENSPSNG00000001842) LRRC19 (ENSPSNG00000001725) IFT74 (ENSPSNG00000001698) PLAA (ENSPSNG00000001649) CAAP1 (ENSPSNG00000001609) TUSC1 (ENSPSNG00000001586) ENSPSNG00000001579 ##22 IZUMO3 (ENSPSNG00000001537) ELAVL2 (ENSPSNG00000001471) ENSPSNG00000001438 DMRTA1 (ENSPSNG00000001426) ENSPSNG00000001333 CDKN2B (ENSPSNG00000001319) CDKN2A (ENSPSNG00000001297) MTAP (ENSPSNG00000001269) ENSPSNG00000001246 IFNE (ENSPSNG00000001235) ENSPSNG00000001205 ENSPSNG00000001196 ENSPSNG00000001176 ENSPSNG00000001161 ENSPSNG00000001145 Blue whale DUPLICATION Blue whale MODERN SPECIES 13 STAR (ENSBMSG00010019246) ASH2L (ENSBMSG00010019289) SFRP1 (ENSBMSG00010019335) GOLGA7 (ENSBMSG00010019359) ENSBMSG00010019385 GPAT4 (ENSBMSG00010019416) NKX6-3 (ENSBMSG00010019452) ANK1 (ENSBMSG00010019640) ENSBMSG00010020304 ENSBMSG00010020319 AP3M2 (ENSBMSG00010020358) PLAT (ENSBMSG00010020399) IKBKB (ENSBMSG00010020465) POLB (ENSBMSG00010020604) DKK4 (ENSBMSG00010020658) ENSBMSG00010020678 ##22 SLC20A2 (ENSBMSG00010020717) ENSBMSG00010020752 ENSBMSG00010020796 PSD3 (ENSBMSG00010020863) ENSBMSG00010021154 SH2D4A (ENSBMSG00010021162) ENSBMSG00010013834 CSGALNACT1 (ENSBMSG00010013884) INTS10 (ENSBMSG00010013924) ENSBMSG00010013953 HGSNAT (ENSBMSG00010013991) POMK (ENSBMSG00010014060) FNTA (ENSBMSG00010014105) HOOK3 (ENSBMSG00010014193) RNF170 (ENSBMSG00010014360) Blue whale MODERN SPECIES 13 ENSBMSG00010020960 ENSBMSG00010020972 ENSBMSG00010020980 ENSBMSG00010015423 ENSBMSG00010015455 ENSBMSG00010015486 ENSBMSG00010015510 ENSBMSG00010015540 ENSBMSG00010015563 ENSBMSG00010015582 ENSBMSG00010015654 XKR5 (ENSBMSG00010015687) AGPAT5 (ENSBMSG00010015721) MCPH1 (ENSBMSG00010015797) ANGPT2 (ENSBMSG00010015936) ENSBMSG00010016118 ##22 CSMD1 (ENSBMSG00010016497) MYOM2 (ENSBMSG00010019539) KBTBD11 (ENSBMSG00010019757) ARHGEF10 (ENSBMSG00010019800) ENSBMSG00010019918 CLN8 (ENSBMSG00010019945) DLGAP2 (ENSBMSG00010019985) ERICH1 (ENSBMSG00010020348) TDRP (ENSBMSG00010020369) FBXO25 (ENSBMSG00010020424) ZNF596 (ENSBMSG00010020519) WWC2 (ENSBMSG00010020554) ENSBMSG00010020629 CDKN2AIP (ENSBMSG00010020641) ING2 (ENSBMSG00010020653) Blue whale MODERN SPECIES 1 CHPT1 (ENSBMSG00010006840) SYCP3 (ENSBMSG00010006857) GNPTAB (ENSBMSG00010006890) ENSBMSG00010006977 ENSBMSG00010007004 ENSBMSG00010007014 ENSBMSG00010007029 ENSBMSG00010007037 NUP37 (ENSBMSG00010007053) PARPBP (ENSBMSG00010007079) PMCH (ENSBMSG00010007116) IGF1 (ENSBMSG00010007135) PAH (ENSBMSG00010007171) ASCL1 (ENSBMSG00010007196) ENSBMSG00010007206 ENSBMSG00010007218 ##22 STAB2 (ENSBMSG00010007242) NT5DC3 (ENSBMSG00010007305) HSP90B1 (ENSBMSG00010007331) UQCC6 (ENSBMSG00010007373) TDG (ENSBMSG00010007381) GLT8D2 (ENSBMSG00010007404) HCFC2 (ENSBMSG00010007426) NFYB (ENSBMSG00010007437) ENSBMSG00010007446 TXNRD1 (ENSBMSG00010007469) ENSBMSG00010007543 ENSBMSG00010007559 SLC41A2 (ENSBMSG00010007567) ENSBMSG00010007578 NOPCHAP1 (ENSBMSG00010007590) Pecora ANCESTRAL SPECIES 212 ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00390000014084.y.a Yarkand deer MODERN SPECIES 3 PPP1R3E (ENSCHYG00000014529) PABPN1 (ENSCHYG00000014202) SLC22A17 (ENSCHYG00000013916) EFS (ENSCHYG00000013648) IL25 (ENSCHYG00000013553) ENSCHYG00000013291 ENSCHYG00000013203 MYH7 (ENSCHYG00000012682) NGDN (ENSCHYG00000012516) ZFHX2 (ENSCHYG00000012435) THTPA (ENSCHYG00000012365) AP1G2 (ENSCHYG00000012260) JPH4 (ENSCHYG00000012168) ENSCHYG00000012150 ENSCHYG00000012105 ENSCHYG00000012084 ##22 ENSCHYG00000012053 ENSCHYG00000012023 ENSCHYG00000011583 CARMIL3 (ENSCHYG00000011429) CPNE6 (ENSCHYG00000011191) NRL (ENSCHYG00000011152) PCK2 (ENSCHYG00000010885) DCAF11 (ENSCHYG00000010574) FITM1 (ENSCHYG00000010518) PSME1 (ENSCHYG00000010154) EMC9 (ENSCHYG00000010055) ENSCHYG00000009594 RNF31 (ENSCHYG00000009118) REC8 (ENSCHYG00000008911) IPO4 (ENSCHYG00000008496) Percora_a ANCESTRAL SPECIES 210 ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00390000014084.y.a Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer MODERN SPECIES 70 ENSMMSG00000001439 ENSMMSG00000001428 ##22 ENSMMSG00000001411 ENSMMSG00000001242 CARMIL3 (ENSMMSG00000001109) CPNE6 (ENSMMSG00000001051) NRL (ENSMMSG00000001028) PCK2 (ENSMMSG00000000916) DCAF11 (ENSMMSG00000000775) FITM1 (ENSMMSG00000000752) PSME1 (ENSMMSG00000000601) EMC9 (ENSMMSG00000000563) PSME2 (ENSMMSG00000000469) RNF31 (ENSMMSG00000000363) IRF9 (ENSMMSG00000000329) REC8 (ENSMMSG00000000291) IPO4 (ENSMMSG00000000208) Siberian musk deer MODERN SPECIES 1204 OR5M9 (ENSMMSG00000022159) ENSMMSG00000022192 ENSMMSG00000022197 ENSMMSG00000022202 ENSMMSG00000022211 OR9G1 (ENSMMSG00000022225) ENSMMSG00000022230 ENSMMSG00000022249 ENSMMSG00000022293 ENSMMSG00000022301 ENSMMSG00000004833 ENSMMSG00000004866 ENSMMSG00000004920 ENSMMSG00000004958 ENSMMSG00000005007 ENSMMSG00000005049 ##22 ENSMMSG00000005060 ENSMMSG00000005090 ENSMMSG00000005124 ENSMMSG00000005140 ENSMMSG00000005149 ENSMMSG00000005175 ENSMMSG00000005227 ENSMMSG00000005240 ENSMMSG00000005257 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00390000005448 ENSGT00530000063725 ENSGT00940000158426 ENSGT00510000048896 ENSGT00390000000046 ENSGT00390000007221.a.b ##7 ENSGT00950000182815.a.a.a.b ENSGT00950000182898.a.a.b ENSGT00940000155245 ENSGT00490000043902 ENSGT00940000163256 ENSGT00940000156695.f ENSGT00940000161045 ENSGT00940000157107 ENSGT00390000018119 ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00390000018109 ENSGT00530000063652.b ENSGT00940000155590 ENSGT00950000183079.B ENSGT00940000157528 ENSGT00940000157851 ENSGT00390000008798.d ENSGT00940000156635 ENSGT00950000182922.a.a.a.a.w.a ENSGT00940000158879 ENSGT00390000015361 ENSGT00530000063727.A ENSGT00390000014549 ENSGT00390000014309.bb ENSGT00390000013319 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00390000005448 ENSGT00530000063725 ENSGT00940000158426 ENSGT00510000048896 ENSGT00390000000046 ENSGT00390000007221.a.b ##7 ENSGT00950000182815.a.a.a.b ENSGT00950000182898.a.a.b ENSGT00490000043902 ENSGT00940000163256 ENSGT00940000155245 ENSGT00940000156695.f ENSGT00940000161045 ENSGT00940000157107 ENSGT00390000018119 ENSGT00950000182869.e.b.b ##22 ENSGT00390000018109 ENSGT00530000063652.b ENSGT00940000155590 ENSGT00950000183079.B ENSGT00940000157528 ENSGT00940000157851 ENSGT00390000008798.d ENSGT00940000156635 ENSGT00950000182922.a.a.a.a.w.a ENSGT00940000158879 ENSGT00390000015361 ENSGT00530000063727.A ENSGT00390000014549.h ENSGT00390000014309.bb ENSGT00390000013319 American bison MODERN SPECIES 3223 PALD1 (ENSBBBG00000021700) PRF1 (ENSBBBG00000007332) ADAMTS14 (ENSBBBG00000021657) TBATA (ENSBBBG00000021619) SGPL1 (ENSBBBG00000005744) PCBD1 (ENSBBBG00000021581) ##7 UNC5B (ENSBBBG00000021557) SLC29A3 (ENSBBBG00000021493) CDH23 (ENSBBBG00000021448) C10orf105 (ENSBBBG00000021078) ENSBBBG00000021057 PSAP (ENSBBBG00000020979) ENSBBBG00000020934 SPOCK2 (ENSBBBG00000020922) ASCC1 (ENSBBBG00000020879) ENSBBBG00000020798 ##22 ANAPC16 (ENSBBBG00000020795) DDIT4 (ENSBBBG00000020781) DNAJB12 (ENSBBBG00000020768) MICU1 (ENSBBBG00000020721) MCU (ENSBBBG00000020628) OIT3 (ENSBBBG00000020546) PLA2G12B (ENSBBBG00000020516) P4HA1 (ENSBBBG00000020492) NUDT13 (ENSBBBG00000000580) ECD (ENSBBBG00000000638) FAM149B1 (ENSBBBG00000005518) DNAJC9 (ENSBBBG00000020392) ENSBBBG00000020379 CFAP70 (ENSBBBG00000020361) ANXA7 (ENSBBBG00000005032) Bos DUPLICATION Bos DUPLICATION Bos ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00960000191014 ENSGT00960000191534 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00950000182869.e.b.b.db.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b.n ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935.y ENSGT00390000004945.i ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00680000101436 ENSGT00940000156591 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00960000191534 ENSGT00940000159875 ENSGT00390000000134.b ENSGT00390000003246 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000160545 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000158930.d ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b.m ENSGT00950000182869.e.b.b.db.a ##22 ENSGT00390000014879.c.b.n ENSGT00390000000436 ENSGT00940000156892 ENSGT00940000158062 ENSGT00940000159383 ENSGT00390000017123.b ENSGT00940000158075 ENSGT00550000074935.y ENSGT00390000004945.i ENSGT00390000001491.a ENSGT00390000010950 ENSGT01050000244968.c ENSGT00940000157357 ENSGT00940000156591 ENSGT00390000012054.b Domestic yak MODERN SPECIES 20 ENSBGRG00000011884 ZMAT4 (ENSBGRG00000011635) SFRP1 (ENSBGRG00000011484) GOLGA7 (ENSBGRG00000011361) GINS4 (ENSBGRG00000011269) NKX6-3 (ENSBGRG00000011190) GPAT4 (ENSBGRG00000010926) ANK1 (ENSBGRG00000009277) ENSBGRG00000009141 KAT6A (ENSBGRG00000009022) AP3M2 (ENSBGRG00000008906) PLAT (ENSBGRG00000008639) IKBKB (ENSBGRG00000008023) POLB (ENSBGRG00000007383) DKK4 (ENSBGRG00000007257) ENSBGRG00000007025 ##22 ENSBGRG00000016098 SLC20A2 (ENSBGRG00000015933) ENSBGRG00000015834 CHRNB3 (ENSBGRG00000015713) CHRNA6 (ENSBGRG00000015518) THAP1 (ENSBGRG00000015491) RNF170 (ENSBGRG00000015130) ENSBGRG00000015025 HOOK3 (ENSBGRG00000014655) ENSBGRG00000014526 ENSBGRG00000014480 HGSNAT (ENSBGRG00000014114) INTS10 (ENSBGRG00000013819) ENSBGRG00000013807 CSGALNACT1 (ENSBGRG00000013600) Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b.db.a ##22 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 19 ENSBIXG00005008127 ZMAT4 (ENSBIXG00005008092) SFRP1 (ENSBIXG00005008069) GOLGA7 (ENSBIXG00005008055) GINS4 (ENSBIXG00005008027) GPAT4 (ENSBIXG00005008002) NKX6-3 (ENSBIXG00005007981) ANK1 (ENSBIXG00005007939) KAT6A (ENSBIXG00005001946) ENSBIXG00005002004 AP3M2 (ENSBIXG00005029047) PLAT (ENSBIXG00005002068) IKBKB (ENSBIXG00005005046) ENSBIXG00005028701 DKK4 (ENSBIXG00005002403) ENSBIXG00005028614 ##22 SLC20A2 (ENSBIXG00005004922) ENSBIXG00005004905 CHRNB3 (ENSBIXG00005028459) CHRNA6 (ENSBIXG00005028438) THAP1 (ENSBIXG00005028395) RNF170 (ENSBIXG00005028376) HOOK3 (ENSBIXG00005028313) ENSBIXG00005004861 POMK (ENSBIXG00005028237) HGSNAT (ENSBIXG00005028212) INTS10 (ENSBIXG00005028161) CSGALNACT1 (ENSBIXG00005006969) SH2D4A (ENSBIXG00005028053) PSD3 (ENSBIXG00005004804) ENSBIXG00005027609 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b.db.b ##22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b.db.b ##22 Domestic yak MODERN SPECIES 2 ENSBGRG00000007033 SLC22A17 (ENSBGRG00000007218) EFS (ENSBGRG00000007431) IL25 (ENSBGRG00000007635) CMTM5 (ENSBGRG00000007702) MYH6 (ENSBGRG00000007922) ENSBGRG00000008201 MYH7 (ENSBGRG00000008351) NGDN (ENSBGRG00000010123) THTPA (ENSBGRG00000010786) ENSBGRG00000010937 ENSBGRG00000010978 AP1G2 (ENSBGRG00000011012) JPH4 (ENSBGRG00000011238) ENSBGRG00000011335 ENSBGRG00000011394 ##22 ENSBGRG00000011499 CARMIL3 (ENSBGRG00000011932) CPNE6 (ENSBGRG00000014176) NRL (ENSBGRG00000014631) PCK2 (ENSBGRG00000014685) DCAF11 (ENSBGRG00000014920) FITM1 (ENSBGRG00000015307) PSME1 (ENSBGRG00000015346) EMC9 (ENSBGRG00000015628) PSME2 (ENSBGRG00000015782) RNF31 (ENSBGRG00000016448) IRF9 (ENSBGRG00000016917) REC8 (ENSBGRG00000017034) IPO4 (ENSBGRG00000017165) TM9SF1 (ENSBGRG00000017728) Bos ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00530000063725 ENSGT00940000158426 ENSGT00510000048896 ENSGT00390000000046 ENSGT01100000263481.n.a.a.a.b.a.b.b.a ENSGT00390000007221.a.b ##7 ENSGT00950000182815.a.a.a.b ENSGT00950000182898.a.a.b ENSGT00940000155245 ENSGT00490000043902 ENSGT00940000163256 ENSGT00940000156695.f ENSGT00940000161045 ENSGT00940000157107 ENSGT00390000018119 ENSGT00950000182869.e.b.b.eb ##22 ENSGT00390000018109 ENSGT00530000063652.b ENSGT00940000155590 ENSGT00950000183079.B ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.b.b.a.a.a.b.b.a.b.a ENSGT00940000157528 ENSGT00940000157851 ENSGT00390000008798.d ENSGT00940000156635 ENSGT00950000182922.a.a.a.a.w.a ENSGT00940000158879 ENSGT00390000015361 ENSGT00530000063727.A ENSGT00390000014549.h ENSGT00390000014309.bb Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b.eb ##22 Wild yak MODERN SPECIES 175 C10orf105 (ENSBMUG00000018064) VSIR (ENSBMUG00000018055) CDH23 (ENSBMUG00000017888) PSAP (ENSBMUG00000017525) ENSBMUG00000017503 SPOCK2 (ENSBMUG00000017481) ENSBMUG00000017443 ##22 ENSBMUG00000017433 ASCC1 (ENSBMUG00000017422) ANAPC16 (ENSBMUG00000017410) DDIT4 (ENSBMUG00000017398) DNAJB12 (ENSBMUG00000017389) MICU1 (ENSBMUG00000017369) MCU (ENSBMUG00000017296) OIT3 (ENSBMUG00000017273) PLA2G12B (ENSBMUG00000017237) ENSBMUG00000017226 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00530000063725 ENSGT00940000158426 ENSGT00510000048896 ENSGT00390000000046 ENSGT01100000263481.n.a.a.a.b.a.b.b.a ENSGT00390000007221.a.b ##7 ENSGT00950000182815.a.a.a.b ENSGT00950000182898.a.a.b ENSGT00940000155245 ENSGT00490000043902 ENSGT00940000163256 ENSGT00940000156695.f ENSGT00940000161045 ENSGT00940000157107 ENSGT00390000018119 ENSGT00950000182869.e.b.b.eb ##22 ENSGT00390000018109 ENSGT00530000063652.b ENSGT00940000155590 ENSGT00950000183079.B ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.b.b.a.a.a.b.b.a.b.a ENSGT00940000157528 ENSGT00940000157851 ENSGT00390000008798.d ENSGT00940000156635 ENSGT00950000182922.a.a.a.a.w.a ENSGT00940000158879 ENSGT00390000015361 ENSGT00530000063727.A ENSGT00390000014549.g ENSGT00390000014309.bb Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 20 PALD1 (ENSBIXG00005016834) PRF1 (ENSBIXG00005002706) ADAMTS14 (ENSBIXG00005016702) TBATA (ENSBIXG00005016677) SGPL1 (ENSBIXG00005016659) PCBD1 (ENSBIXG00005016622) ##7 UNC5B (ENSBIXG00005016596) SLC29A3 (ENSBIXG00005016509) CDH23 (ENSBIXG00005016462) C10orf105 (ENSBIXG00005007031) VSIR (ENSBIXG00005002601) PSAP (ENSBIXG00005000092) CHST3 (ENSBIXG00005002591) SPOCK2 (ENSBIXG00005016258) ASCC1 (ENSBIXG00005016184) ENSBIXG00005002565 ##22 ANAPC16 (ENSBIXG00005016119) DDIT4 (ENSBIXG00005016099) DNAJB12 (ENSBIXG00005016077) MICU1 (ENSBIXG00005016017) ENSBIXG00005015987 MCU (ENSBIXG00005006751) OIT3 (ENSBIXG00005015959) PLA2G12B (ENSBIXG00005015930) P4HA1 (ENSBIXG00005015899) ENSBIXG00005015836 NUDT13 (ENSBIXG00005015818) ECD (ENSBIXG00005000200) FAM149B1 (ENSBIXG00005015684) DNAJC9 (ENSBIXG00005015661) CFAP70 (ENSBIXG00005015609) Cow MODERN SPECIES 20 PRF1 (ENSBTAG00000001008) ADAMTS14 (ENSBTAG00000021177) TBATA (ENSBTAG00000021180) SGPL1 (ENSBTAG00000009984) ENSBTAG00000054819 PCBD1 (ENSBTAG00000011866) ##7 UNC5B (ENSBTAG00000014270) SLC29A3 (ENSBTAG00000046357) CDH23 (ENSBTAG00000021497) C28H10orf105 (ENSBTAG00000045826) VSIR (ENSBTAG00000010888) PSAP (ENSBTAG00000021499) CHST3 (ENSBTAG00000011014) SPOCK2 (ENSBTAG00000008827) ASCC1 (ENSBTAG00000000392) ENSBTAG00000052269 ##22 ANAPC16 (ENSBTAG00000000162) DDIT4 (ENSBTAG00000000163) DNAJB12 (ENSBTAG00000013651) MICU1 (ENSBTAG00000005807) MCU (ENSBTAG00000003876) ENSBTAG00000054039 OIT3 (ENSBTAG00000009348) PLA2G12B (ENSBTAG00000009350) ENSBTAG00000055209 P4HA1 (ENSBTAG00000032996) NUDT13 (ENSBTAG00000000313) ECD (ENSBTAG00000000315) FAM149B1 (ENSBTAG00000019130) DNAJC9 (ENSBTAG00000000949) MRPS16 (ENSBTAG00000000950) Caprinae DUPLICATION Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b.fb ##22 Goat MODERN SPECIES 24 ENSCHIG00000027065 LGR5 (ENSCHIG00000018190) ZFC3H1 (ENSCHIG00000020097) THAP2 (ENSCHIG00000022445) TMEM19 (ENSCHIG00000022743) RAB21 (ENSCHIG00000004520) TBC1D15 (ENSCHIG00000026394) TPH2 (ENSCHIG00000002616) TRHDE (ENSCHIG00000012040) ENSCHIG00000012666 ##22 ENSCHIG00000009502 ATXN7L3B (ENSCHIG00000009745) ENSCHIG00000018503 ENSCHIG00000011941 CAPS2 (ENSCHIG00000023572) ENSCHIG00000017904 ENSCHIG00000010162 GLIPR1 (ENSCHIG00000024224) KRR1 (ENSCHIG00000018496) PHLDA1 (ENSCHIG00000005054) BBS10 (ENSCHIG00000016567) OSBPL8 (ENSCHIG00000010416) ZDHHC17 (ENSCHIG00000009471) CSRP2 (ENSCHIG00000025767) E2F7 (ENSCHIG00000023455) Caprinae DUPLICATION Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.b.gb.a ##22 Goat DUPLICATION Goat MODERN SPECIES 26 FAM13B (ENSCHIG00000016813) WNT8A (ENSCHIG00000000853) NME5 (ENSCHIG00000014752) BRD8 (ENSCHIG00000021350) KIF20A (ENSCHIG00000023432) CDC23 (ENSCHIG00000025087) GFRA3 (ENSCHIG00000010268) CDC25C (ENSCHIG00000024676) ENSCHIG00000015489 FAM53C (ENSCHIG00000021049) KDM3B (ENSCHIG00000025592) REEP2 (ENSCHIG00000016870) EGR1 (ENSCHIG00000022705) ENSCHIG00000009685 HSPA9 (ENSCHIG00000019832) ENSCHIG00000018343 ##22 LRRTM2 (ENSCHIG00000025714) CTNNA1 (ENSCHIG00000005836) ENSCHIG00000021268 SIL1 (ENSCHIG00000009767) MATR3 (ENSCHIG00000025746) PAIP2 (ENSCHIG00000004383) SLC23A1 (ENSCHIG00000011571) MZB1 (ENSCHIG00000023416) PROB1 (ENSCHIG00000010812) SPATA24 (ENSCHIG00000016759) DNAJC18 (ENSCHIG00000022675) ENSCHIG00000005666 STING1 (ENSCHIG00000010381) UBE2D2 (ENSCHIG00000024215) CXXC5 (ENSCHIG00000017875) Goat MODERN SPECIES 8 RASAL1 (ENSCHIG00000010017) DTX1 (ENSCHIG00000018624) PLBD2 (ENSCHIG00000025113) SDS (ENSCHIG00000021911) SDSL (ENSCHIG00000012156) LHX5 (ENSCHIG00000022961) RBM19 (ENSCHIG00000014917) TBX5 (ENSCHIG00000023939) TBX3 (ENSCHIG00000012328) MED13L (ENSCHIG00000017300) SPRING1 (ENSCHIG00000017588) RNFT2 (ENSCHIG00000022406) HRK (ENSCHIG00000008647) FBXW8 (ENSCHIG00000020348) TESC (ENSCHIG00000026339) ENSCHIG00000019388 ##22 FBXO21 (ENSCHIG00000013377) NOS1 (ENSCHIG00000025391) KSR2 (ENSCHIG00000023716) RFC5 (ENSCHIG00000016947) WSB2 (ENSCHIG00000011456) VSIG10 (ENSCHIG00000017491) ENSCHIG00000005694 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devil MODERN SPECIES 1 TCIM (ENSSHAG00000024315) ZMAT4 (ENSSHAG00000011847) ENSSHAG00000026872 SFRP1 (ENSSHAG00000015287) GOLGA7 (ENSSHAG00000016094) GINS4 (ENSSHAG00000030144) GPAT4 (ENSSHAG00000016396) NKX6-3 (ENSSHAG00000030724) ANK1 (ENSSHAG00000016518) KAT6A (ENSSHAG00000017256) AP3M2 (ENSSHAG00000017596) PLAT (ENSSHAG00000017639) IKBKB (ENSSHAG00000017794) POLB (ENSSHAG00000017892) DKK4 (ENSSHAG00000030792) VDAC3 (ENSSHAG00000017953) ##22 SLC20A2 (ENSSHAG00000018024) CHRNB3 (ENSSHAG00000018307) CHRNA6 (ENSSHAG00000018349) THAP1 (ENSSHAG00000026179) ENSSHAG00000025708 HOOK3 (ENSSHAG00000018503) FNTA (ENSSHAG00000021493) POMK (ENSSHAG00000018626) ENSSHAG00000018649 ENSSHAG00000018679 CSGALNACT1 (ENSSHAG00000018816) SH2D4A (ENSSHAG00000018885) ENSSHAG00000018917 ENSSHAG00000030296 ENSSHAG00000002224 Opossum MODERN SPECIES GINS4 (ENSMODG00000010469) ENSMODG00000041679 GPAT4 (ENSMODG00000010457) NKX6-3 (ENSMODG00000010439) ENSMODG00000048465 ANK1 (ENSMODG00000010432) KAT6A (ENSMODG00000010328) ENSMODG00000039166 ENSMODG00000049847 ENSMODG00000042969 AP3M2 (ENSMODG00000045620) PLAT (ENSMODG00000010225) IKBKB (ENSMODG00000010216) POLB (ENSMODG00000010196) DKK4 (ENSMODG00000010183) ENSMODG00000015526 ##22 ENSMODG00000045014 SLC20A2 (ENSMODG00000010176) SMIM19 (ENSMODG00000010128) CHRNB3 (ENSMODG00000010082) CHRNA6 (ENSMODG00000010120) THAP1 (ENSMODG00000010093) ENSMODG00000010090 ENSMODG00000010062 ENSMODG00000049393 FNTA (ENSMODG00000010003) POMK (ENSMODG00000009985) HGSNAT (ENSMODG00000009981) INTS10 (ENSMODG00000009962) CSGALNACT1 (ENSMODG00000009932) SH2D4A (ENSMODG00000009920) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.d ##22 Opossum MODERN SPECIES GATA5 (ENSMODG00000016774) ENSMODG00000023265 CABLES2 (ENSMODG00000023264) ENSMODG00000016769 LAMA5 (ENSMODG00000016753) ADRM1 (ENSMODG00000016715) OSBPL2 (ENSMODG00000016709) HRH3 (ENSMODG00000016705) MTG2 (ENSMODG00000016699) SS18L1 (ENSMODG00000016697) ENSMODG00000016692 LSM14B (ENSMODG00000016690) ENSMODG00000045678 ENSMODG00000016684 CDH4 (ENSMODG00000016675) ENSMODG00000043435 ##22 ENSMODG00000045124 ENSMODG00000041278 ENSMODG00000016629 ENSMODG00000027400 ENSMODG00000044206 FAM217B (ENSMODG00000045143) PPP1R3D (ENSMODG00000023260) ENSMODG00000016617 PHACTR3 (ENSMODG00000016615) ENSMODG00000016611 ENSMODG00000047827 ENSMODG00000050414 ENSMODG00000016608 ENSMODG00000016605 TUBB1 (ENSMODG00000016603) Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.d ##22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.d ##22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.d ##22 Common wonbat MODERN SPECIES 1009 CDC37L1 (ENSVURG00010006832) AK3 (ENSVURG00010006826) RCL1 (ENSVURG00010006818) JAK2 (ENSVURG00010006805) PLGRKT (ENSVURG00010006799) CD274 (ENSVURG00010006794) RIC1 (ENSVURG00010006750) ERMP1 (ENSVURG00010006720) MLANA (ENSVURG00010006707) KIAA2026 (ENSVURG00010006687) UHRF2 (ENSVURG00010006652) GLDC (ENSVURG00010005739) KDM4C (ENSVURG00010005641) ENSVURG00010005615 PTPRD (ENSVURG00010005527) ENSVURG00010005463 ##22 TYRP1 (ENSVURG00010005433) LURAP1L (ENSVURG00010005429) MPDZ (ENSVURG00010005019) NFIB (ENSVURG00010004715) ZDHHC21 (ENSVURG00010004573) ENSVURG00010004561 FREM1 (ENSVURG00010004450) ENSVURG00010004353 SNAPC3 (ENSVURG00010004305) PSIP1 (ENSVURG00010004263) CCDC171 (ENSVURG00010004058) BNC2 (ENSVURG00010003913) ENSVURG00010003793 ENSVURG00010003708 ADAMTSL1 (ENSVURG00010003657) Platypus MODERN SPECIES 16 IDO2 (ENSOANG00000047088) ZMAT4 (ENSOANG00000022431) SFRP1 (ENSOANG00000041091) GOLGA7 (ENSOANG00000048104) GINS4 (ENSOANG00000006555) GPAT4 (ENSOANG00000043332) NKX6-3 (ENSOANG00000000717) ANK1 (ENSOANG00000000720) KAT6A (ENSOANG00000000718) AP3M2 (ENSOANG00000000715) PLAT (ENSOANG00000000713) IKBKB (ENSOANG00000000711) ENSOANG00000045568 ENSOANG00000000697 DKK4 (ENSOANG00000019742) VDAC3 (ENSOANG00000000709) ##22 SLC20A2 (ENSOANG00000000705) SMIM19 (ENSOANG00000000704) CHRNB3 (ENSOANG00000000702) CHRNA6 (ENSOANG00000000701) THAP1 (ENSOANG00000036803) RNF170 (ENSOANG00000000698) HOOK3 (ENSOANG00000000693) ENSOANG00000036155 POMK (ENSOANG00000008922) HGSNAT (ENSOANG00000006825) INTS10 (ENSOANG00000000688) CSGALNACT1 (ENSOANG00000005364) SH2D4A (ENSOANG00000005363) ENSOANG00000005362 PSD3 (ENSOANG00000014422) Sauria ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000156918 ENSGT00940000173670 ENSGT00940000161614 ENSGT00950000182869.e.b ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000160545 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000167325 ENSGT00390000003246 ENSGT00390000000134.b ENSGT00940000159875 ENSGT00940000175215 ENSGT00940000156888 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000164380.a Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00950000182869.e.b ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000179153 ENSGT00940000158930 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000160545 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000167325 ENSGT00390000003246 ENSGT00390000000134.b ENSGT00940000159875 ENSGT00940000156888 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000164380.a Episquamata ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000161102 ENSGT00940000175342 ENSGT00940000160547 ENSGT00940000159885 ENSGT00530000064017.b ENSGT00390000011010.b ENSGT00940000161587 ENSGT00390000009948.d ENSGT00940000164226 ENSGT00950000183162.a.b ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00940000158490 ENSGT00940000165439 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183185.c.a.a ENSGT00950000182869.e.b ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000179153 ENSGT00940000158930 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000160545 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000167325 ENSGT00390000003246 ENSGT00390000000134.b ENSGT00940000159875 ENSGT00940000156888 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000164380.a Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000000483.b ENSGT00940000158750 ENSGT00390000003477 ENSGT00390000012901 ENSGT00940000159350 ENSGT00940000157037.a ENSGT00940000159192 ENSGT00390000009416 ENSGT00940000161833 ENSGT00940000161843 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000160449 ENSGT00940000158490 ENSGT00940000165439 ENSGT00950000183185.c.a.a ENSGT00950000182869.e.b ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000179153 ENSGT00940000158930 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000160545 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000167325 ENSGT00390000003246 ENSGT00390000000134.b ENSGT00940000159875 ENSGT00940000156888 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000164380.a Elapidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156317.k ENSGT00940000161102 ENSGT00940000175342 ENSGT00940000160547 ENSGT00940000159885 ENSGT00390000011010.b ENSGT00940000161587 ENSGT00390000009948.d ENSGT00940000164226 ENSGT00950000183162.a.b ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00940000160449 ENSGT00940000158490 ENSGT00940000165439 ENSGT00950000183185.c.a.a ENSGT00950000182869.e.b ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000179153 ENSGT00940000158930 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000160545 ENSGT01030000234574.B.c.b.b Indian cobra MODERN SPECIES 7 CNNM3 (ENSNNAG00000005095) ENSNNAG00000005066 ANKRD39 (ENSNNAG00000005053) SEMA4C (ENSNNAG00000005021) COX5B (ENSNNAG00000005003) ACTR1B (ENSNNAG00000004970) ENSNNAG00000004934 ENSNNAG00000004923 PURB (ENSNNAG00000004912) H2AZ2 (ENSNNAG00000004899) ENSNNAG00000004886 ENSNNAG00000004873 ENSNNAG00000004853 ENSNNAG00000004806 MAT2A (ENSNNAG00000004787) VDAC3 (ENSNNAG00000004768) ##22 IKBKB (ENSNNAG00000004683) ENSNNAG00000004661 PLAT (ENSNNAG00000004638) AP3M2 (ENSNNAG00000004604) KAT6A (ENSNNAG00000004542) ENSNNAG00000004518 ENSNNAG00000004511 ENSNNAG00000004446 ENSNNAG00000004417 GPAT4 (ENSNNAG00000004385) ENSNNAG00000004369 ENSNNAG00000004282 ENSNNAG00000004239 ENSNNAG00000004168 ENSNNAG00000004145 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 93 ENSGT00940000156317.k ENSGT00940000161102 ENSGT00940000175342 ENSGT00940000160547 ENSGT00940000159885 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ENSPMJG00000017980 ENSPMJG00000017979 POLB (ENSPMJG00000017978) VDAC3 (ENSPMJG00000017977) ##22 IKBKB (ENSPMJG00000017976) PLAT (ENSPMJG00000017975) AP3M2 (ENSPMJG00000017974) KAT6A (ENSPMJG00000017973) ANK1 (ENSPMJG00000017971) NKX6-3 (ENSPMJG00000017970) GPAT4 (ENSPMJG00000017969) GINS4 (ENSPMJG00000017968) GOLGA7 (ENSPMJG00000017967) SFRP1 (ENSPMJG00000017966) ZMAT4 (ENSPMJG00000017965) TCIM (ENSPMJG00000017963) ENSPMJG00000017962 ADAM32 (ENSPMJG00000017961) ADAM9 (ENSPMJG00000017960) Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000156918 ENSGT00950000182869.e.b ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000160545 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000167325 ENSGT00390000003246 ENSGT00390000000134.b ENSGT00940000159875 ENSGT00940000156888 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000164380.a ENSGT00940000161015.a.a Golden eagle MODERN SPECIES 4 ERMARD (ENSACCG00020005325) DYNLT2 (ENSACCG00020005347) PHF10 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PPP2R2A (ENSSHBG00005007294) BNIP3L (ENSSHBG00005007265) DPYSL2 (ENSSHBG00005007213) ADRA1A (ENSSHBG00005007111) POLB (ENSSHBG00005007095) VDAC3 (ENSSHBG00005007059) ##22 IKBKB (ENSSHBG00005006488) PLAT (ENSSHBG00005006275) AP3M2 (ENSSHBG00005006241) KAT6A (ENSSHBG00005006175) ANK1 (ENSSHBG00005005769) ENSSHBG00005000758 NKX6-3 (ENSSHBG00005000754) GPAT4 (ENSSHBG00005000748) ENSSHBG00005012035 GOLGA7 (ENSSHBG00005012011) SFRP1 (ENSSHBG00005011999) ZMAT4 (ENSSHBG00005011986) TCIM (ENSSHBG00005011977) ENSSHBG00005009809 ENSSHBG00005009698 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000156918 ENSGT00950000182869.e.b ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000160545 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000167325 ENSGT00390000003246 ENSGT00390000000134.b ENSGT00940000159875 ENSGT00940000156888 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000164380.a ENSGT00940000161015.a.a Anatidae ANCESTRAL SPECIES 90 ENSGT00940000156918 ENSGT00950000182869.e.b ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000160545 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000167325 ENSGT00390000003246 ENSGT00390000000134.b ENSGT00940000159875 ENSGT00940000156888 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000164380.a ENSGT00940000161015.a.a Duck MODERN SPECIES 14 ENSAPLG00000006545 VDAC3 (ENSAPLG00000006503) ##22 IKBKB (ENSAPLG00000006379) PLAT (ENSAPLG00000006336) AP3M2 (ENSAPLG00000006314) KAT6A (ENSAPLG00000006273) ANK1 (ENSAPLG00000006189) ENSAPLG00000024040 NKX6-3 (ENSAPLG00000026367) GPAT4 (ENSAPLG00000006157) GINS4 (ENSAPLG00000018162) GOLGA7 (ENSAPLG00000028662) SFRP1 (ENSAPLG00000006111) ZMAT4 (ENSAPLG00000006106) TCIM (ENSAPLG00000001262) ENSAPLG00000006102 ENSAPLG00000006066 Pink-footed goose MODERN SPECIES 312 POLB (ENSABRG00000001307) VDAC3 (ENSABRG00000001340) ##22 IKBKB (ENSABRG00000001364) PLAT (ENSABRG00000001476) KAT6A (ENSABRG00000001510) ANK1 (ENSABRG00000001591) NKX6-3 (ENSABRG00000002031) GPAT4 (ENSABRG00000002056) ENSABRG00000002089 GINS4 (ENSABRG00000002105) GOLGA7 (ENSABRG00000002109) SFRP1 (ENSABRG00000002129) ZMAT4 (ENSABRG00000002161) TCIM (ENSABRG00000002234) ENSABRG00000002249 ENSABRG00000002280 ENSABRG00000002313 Phasianidae DUPLICATION Phasianidae DUPLICATION Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000156439.r.b ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000162510.k ENSGT00940000162510.l ENSGT00390000005599 ENSGT00390000011892 ENSGT01100000263524.D ENSGT00940000161979.B ENSGT00550000074922 ENSGT00390000010738 ENSGT00940000160171 ENSGT00940000156406.b ENSGT00940000158831 ENSGT00940000159767 ENSGT00940000153141.A ENSGT00950000182869.e.b.e.a ##22 ENSGT00940000159049 ENSGT00390000005233.b ENSGT00550000075090 ENSGT00610000086772 ENSGT01100000263477.F.a ENSGT00950000183111.a.a ENSGT00940000154603.B ENSGT00940000156212 ENSGT00940000157566 ENSGT00940000162401 ENSGT01100000263524.B.a ENSGT00940000156827 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ENSCJPG00005002749 ##22 ENSCJPG00005002752 PLA2G7 (ENSCJPG00005002760) IMP3 (ENSCJPG00005002767) ANKRD66 (ENSCJPG00005002770) ENSCJPG00005002772 ENSCJPG00005002775 ENSCJPG00005002779 TNFRSF21 (ENSCJPG00005002782) CD2AP (ENSCJPG00005002786) ENSCJPG00005002798 OPN5 (ENSCJPG00005002822) PTCHD4 (ENSCJPG00005002825) EVA1A (ENSCJPG00005002833) MRPL19 (ENSCJPG00005002842) GCFC2 (ENSCJPG00005002848) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.e.b ##22 Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.e.b ##22 Chicken MODERN SPECIES ENSGALG00010001709 GRPR (ENSGALG00010001488) AP1S2 (ENSGALG00010001510) ZRSR2 (ENSGALG00010001513) TMEM27 (ENSGALG00010001516) ACE2 (ENSGALG00010001524) BMX (ENSGALG00010001484) VEGFD (ENSGALG00010001454) PIGA (ENSGALG00010001606) ASB11 (ENSGALG00010001427) ASB9 (ENSGALG00010001461) ENSGALG00010002949 MOSPD2 (ENSGALG00010001620) FANCB (ENSGALG00010001632) GLRA2 (ENSGALG00010001656) ENSGALG00010002363 ##22 GEMIN8 (ENSGALG00010002369) GPM6B (ENSGALG00010002393) OFD1 (ENSGALG00010002408) TRAPPC2 (ENSGALG00010002418) RAB9A (ENSGALG00010002448) TCEANC (ENSGALG00010002501) EGFL6 (ENSGALG00010002554) TMSB4X (ENSGALG00010002566) TLR7 (ENSGALG00010001897) PRPS2 (ENSGALG00010001901) FRMPD4 (ENSGALG00010001925) MSL3 (ENSGALG00010001952) ENSGALG00010002951 ARHGAP6 (ENSGALG00010001966) ENSGALG00010003266 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000156918 ENSGT00950000182869.e.b.f ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000160545 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000167325 ENSGT00390000003246 ENSGT00390000000134.b ENSGT00940000159875 ENSGT00940000156888 ENSGT00390000003458 ENSGT00940000164380.a ENSGT00940000161015.a.a Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000156918 ENSGT00950000182869.e.b.f ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000156962 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000160545 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(ENSCJPG00005015298) ANK1 (ENSCJPG00005015227) NKX6-3 (ENSCJPG00005015226) GPAT4 (ENSCJPG00005015225) ENSCJPG00005015224 GINS4 (ENSCJPG00005015223) GOLGA7 (ENSCJPG00005015222) SFRP1 (ENSCJPG00005015221) ZMAT4 (ENSCJPG00005015220) TCIM (ENSCJPG00005015219) ENSCJPG00005015218 ENSCJPG00005015217 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 144 ENSGT00940000161614 ENSGT00940000156918 ENSGT00940000153866.B ENSGT00950000182869.e.b ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00940000157991 ENSGT00940000156962 ENSGT00530000064017.b ENSGT00940000159885 ENSGT00940000161102 ENSGT00940000156317 ENSGT00940000155596 ENSGT00940000175450 ENSGT00940000155061.b ENSGT00950000182943 ENSGT00530000063691.a ENSGT00950000183162.a.b ENSGT00900000140979.a.b Reedfish MODERN SPECIES pak4 (ENSECRG00000000145) CCDC9 (ENSECRG00000000146) sae1 (ENSECRG00000000147) ZC3H4 (ENSECRG00000000148) ppp1r14ab (ENSECRG00000000150) spint2 (ENSECRG00000000151) ENSECRG00000000152 ENSECRG00000000153 supt5h (ENSECRG00000000154) 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ENSGT00950000182843.a.b.l.b ENSGT00940000158664.g ENSGT00950000182843.a.b.k ENSGT00550000074798.a.b.j ENSGT01100000263484.B.b.a Common carp reference DUPLICATION Common carp reference MODERN SPECIES 23 ENSCCRG00000055699 sh3glb2a (ENSCCRG00000065904) ENSCCRG00000034374 EEIG1 (ENSCCRG00000056154) naif1 (ENSCCRG00000017159) slc25a25a (ENSCCRG00000017155) seta (ENSCCRG00000041850) si:ch211-51h9.7 (ENSCCRG00000055915) gle1 (ENSCCRG00000013719) si:ch211-51h9.6 (ENSCCRG00000013717) mrpl40 (ENSCCRG00000060930) rpl6 (ENSCCRG00000022244) ENSCCRG00000056221 dynll1 (ENSCCRG00000054117) polb (ENSCCRG00000058760) vdac3 (ENSCCRG00000010673) ##22 ikbkb (ENSCCRG00000043515) PLAT (ENSCCRG00000043504) ENSCCRG00000030763 ENSCCRG00000038659 ENSCCRG00000055779 ENSCCRG00000028693 snap29 (ENSCCRG00000073907) serpind1 (ENSCCRG00000028695) ENSCCRG00000072944 ENSCCRG00000025946 ENSCCRG00000058770 ENSCCRG00000014877 dgcr6 (ENSCCRG00000014887) efna5b (ENSCCRG00000022283) ENSCCRG00000061046 Common carp reference 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(ENSSGRG00000042589) gle1 (ENSSGRG00000042580) si:ch211-51h9.6 (ENSSGRG00000042579) mrpl40 (ENSSGRG00000042578) rpl6 (ENSSGRG00000042577) dynll1 (ENSSGRG00000042558) ENSSGRG00000042556 enkd1 (ENSSGRG00000042552) vdac3 (ENSSGRG00000040392) ##22 ENSSGRG00000040331 PLAT (ENSSGRG00000040328) ENSSGRG00000040322 ENSSGRG00000040316 ENSSGRG00000040314 snap29 (ENSSGRG00000040313) serpind1 (ENSSGRG00000040311) ENSSGRG00000040280 ENSSGRG00000040264 ENSSGRG00000040259 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 109 ENSGT00940000156811.a.a ENSGT00450000040324.b.j.a ENSGT00940000157207.a.b.b ENSGT00530000065225 ENSGT00390000012903.d ENSGT00390000002511 ENSGT00390000010239.n ENSGT01030000234626.D ENSGT00390000003682.a.a ENSGT00390000003682.a.b ENSGT00390000001618 ENSGT00390000000378.d.b ENSGT00940000173670 ENSGT01030000236969.a ENSGT00940000156918.c ENSGT00950000182869.e.b.g.a.b ##22 ENSGT00950000182937.A.b.e ENSGT00940000158930.n.b ENSGT00940000155715.tb.a ENSGT00950000183166.a.b.d ENSGT00550000074856.c.b.a 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CIT (ENSCARG00000021154) mtmr3 (ENSCARG00000016858) ENSCARG00000016714 polb (ENSCARG00000016275) enkd1 (ENSCARG00000016257) vdac3 (ENSCARG00000016220) ##22 ENSCARG00000016215 ikbkb (ENSCARG00000014823) PLAT (ENSCARG00000014564) ENSCARG00000014534 ENSCARG00000014530 ENSCARG00000014524 sema6a (ENSCARG00000013399) ENSCARG00000013364 ENSCARG00000013353 dhx37 (ENSCARG00000013342) gp1bb (ENSCARG00000013340) septin5a (ENSCARG00000013207) zgc:63587 (ENSCARG00000012956) cldn5a (ENSCARG00000012934) cdc45 (ENSCARG00000012896) Zebrafish MODERN SPECIES 23 EEIG1 (ENSDARG00000102566) naif1 (ENSDARG00000062753) slc25a25a (ENSDARG00000010572) zdhhc12a (ENSDARG00000076632) seta (ENSDARG00000031495) si:ch211-51h9.7 (ENSDARG00000074720) gle1 (ENSDARG00000043559) si:ch211-51h9.6 (ENSDARG00000092360) mrpl40 (ENSDARG00000043554) acaa2 (ENSDARG00000038881) rpl6 (ENSDARG00000058451) dynll1 (ENSDARG00000058454) ENSDARG00000092379 polb (ENSDARG00000003749) enkd1 (ENSDARG00000043550) vdac3 (ENSDARG00000003695) ##22 ikbkb (ENSDARG00000079123) PLAT (ENSDARG00000062707) ENSDARG00000095437 ENSDARG00000076419 ENSDARG00000090607 ENSDARG00000091618 SLC25A1 (ENSDARG00000080000) ENSDARG00000058658 snap29 (ENSDARG00000038518) serpind1 (ENSDARG00000021208) pi4kab (ENSDARG00000062823) ENSDARG00000114976 ENSDARG00000116796 ENSDARG00000041515 dgcr6 (ENSDARG00000005500) Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000155841.c.a ENSGT00990000204366 ENSGT00940000156811.a ENSGT00450000040324.b ENSGT00940000157207.a.b ENSGT00940000156902.a ENSGT00940000153877.a.a.a ENSGT00530000065225 ENSGT00390000012903 ENSGT00390000002511 ENSGT00390000010239 ENSGT01030000234626.D ENSGT00390000003682 ENSGT00940000156918 ENSGT00940000153866.B ENSGT00950000182869.e.b.g.a ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00950000183166.a.b ENSGT00550000074856.c.b ENSGT00390000008325.a ENSGT00950000182843.a.b ENSGT00550000074798.a.b ENSGT00940000158664 ENSGT00940000160943 ENSGT00940000158715.e ENSGT00390000017663 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 210 ENSGT00940000156918 ENSGT00940000153866.B ENSGT00950000182869.e.b.g.a ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00950000183166.a.b ENSGT00550000074856.c.b ENSGT00390000008325.a ENSGT00950000182843.a.b ENSGT00550000074798.a.b ENSGT00940000158664 ENSGT00940000160943 ENSGT00940000158715.e ENSGT00390000017663 Electric eel MODERN SPECIES 412 polb (ENSEEEG00000002528) enkd1 (ENSEEEG00000002537) vdac3 (ENSEEEG00000002561) ##22 ikbkb (ENSEEEG00000002650) PLAT (ENSEEEG00000002691) ENSEEEG00000002958 SLC25A1 (ENSEEEG00000005176) ENSEEEG00000005209 snap29 (ENSEEEG00000005211) pi4kab (ENSEEEG00000005214) serpind1 (ENSEEEG00000005229) ENSEEEG00000005235 DTX1 (ENSEEEG00000005236) RASAL1 (ENSEEEG00000005253) dgcr6 (ENSEEEG00000005266) Characoidei ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00940000156811.a ENSGT00450000040324.b ENSGT00940000157207.a.b ENSGT00940000156902.a ENSGT00940000153877.a.a.a ENSGT00530000065225 ENSGT00390000012903 ENSGT00390000002511 ENSGT00390000010239 ENSGT01030000234626.D ENSGT00390000003682 ENSGT00390000000378.d.b ENSGT00390000001618 ENSGT00940000156918 ENSGT00940000153866.B ENSGT00950000182869.e.b.g.a ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00950000183166.a.b ENSGT00550000074856.c.b ENSGT00390000008325.a ENSGT00950000182843.a.b Red-bellied piranha MODERN SPECIES 86 sh3glb2a (ENSPNAG00000007607) ENSPNAG00000007598 EEIG1 (ENSPNAG00000007595) naif1 (ENSPNAG00000000324) slc25a25a (ENSPNAG00000000320) seta (ENSPNAG00000007583) si:ch211-51h9.7 (ENSPNAG00000000315) gle1 (ENSPNAG00000007573) si:ch211-51h9.6 (ENSPNAG00000007569) mrpl40 (ENSPNAG00000000310) acaa2 (ENSPNAG00000000308) rpl6 (ENSPNAG00000007557) dynll1 (ENSPNAG00000007553) polb (ENSPNAG00000007551) enkd1 (ENSPNAG00000007545) vdac3 (ENSPNAG00000000281) ##22 ikbkb (ENSPNAG00000000274) PLAT (ENSPNAG00000007521) DTX1 (ENSPNAG00000000261) RASAL1 (ENSPNAG00000007511) dgcr6 (ENSPNAG00000000247) ENSPNAG00000000243 Mexicana tetra MODERN SPECIES 21 EEIG1 (ENSAMXG00000012124) naif1 (ENSAMXG00000039603) slc25a25a (ENSAMXG00000042479) zdhhc12a (ENSAMXG00000012374) seta (ENSAMXG00000010484) si:ch211-51h9.7 (ENSAMXG00000012480) gle1 (ENSAMXG00000012542) mrpl40 (ENSAMXG00000029691) si:ch211-51h9.6 (ENSAMXG00000033396) acaa2 (ENSAMXG00000035892) rpl6 (ENSAMXG00000012854) dynll1 (ENSAMXG00000034358) ENSAMXG00000024374 polb (ENSAMXG00000012972) enkd1 (ENSAMXG00000013036) vdac3 (ENSAMXG00000013051) ##22 ikbkb (ENSAMXG00000013072) PLAT (ENSAMXG00000013113) ENSAMXG00000031840 ENSAMXG00000033070 ENSAMXG00000013138 ENSAMXG00000036289 SLC25A1 (ENSAMXG00000015817) ENSAMXG00000039755 snap29 (ENSAMXG00000029405) serpind1 (ENSAMXG00000015691) pi4kab (ENSAMXG00000015625) ENSAMXG00000031493 ppp1r3c2b (ENSAMXG00000032138) gins4 (ENSAMXG00000005381) COX5B (ENSAMXG00000034935) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 177 ENSGT00530000064244.b ENSGT00940000159913.a.a ENSGT00940000164668 ENSGT00940000161769.b.a ENSGT00390000009662 ENSGT00390000002408 ENSGT00390000002511 ENSGT00390000010239 ENSGT01030000234626.D ENSGT00390000003682 ENSGT00390000001618 ENSGT00390000000378.d.b ENSGT00940000173670 ENSGT00940000156918 ENSGT00940000153866.B ENSGT00950000182869.e.b.g.a ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183166.a.b ENSGT00550000074856.c.b ENSGT00390000008325.a ENSGT00950000182843.a.b ENSGT00550000074798.a.b ENSGT00940000158664 ENSGT00940000159978 ENSGT00390000012630.B ENSGT00390000004228 ENSGT00940000155831.bb ENSGT00940000155776.b Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT00530000064244.b ENSGT00940000159913.a.a ENSGT00940000164668 ENSGT00940000161769.b.a ENSGT00390000009662 ENSGT00390000002408 ENSGT00390000002511 ENSGT00390000010239 ENSGT01030000234626.D ENSGT00390000003682 ENSGT01100000263793 ENSGT00390000001618.s ENSGT00390000000378.d.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000153866.B ENSGT00950000182869.e.b.g.a ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183166.a.b ENSGT00550000074856.c.b ENSGT00940000164012.B ENSGT00950000183049.E ENSGT00510000050125.b.b ENSGT01050000244840.A.a.b.e ENSGT01050000244840.A.b.b.a ENSGT00950000183076.a.b.a ENSGT00950000182940.b.b.e ENSGT00940000164571 ENSGT00940000154170.A ENSGT00940000156667 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000159772.n ENSGT00530000064244.b.f ENSGT00940000159913.a.a.k.b.b ENSGT00940000177458 ENSGT00940000159913.a.a.k.b.a.a ENSGT00940000164668.i ENSGT00940000161769.b.a.x.b ENSGT00390000009662.h ENSGT00390000002408.s ENSGT00390000002511 ENSGT00990000213100 ENSGT01030000234626.D.c ENSGT00390000003682.e ENSGT00390000000378.d.b.vb ENSGT00940000156918.i ENSGT00950000182869.e.b.g.a.e ##22 ENSGT00950000182937.A.b.h ENSGT00940000158930.e ENSGT00940000155715.nb.b ENSGT00950000183166.a.b.e ENSGT00550000074856.c.b.f.a ENSGT00550000074856.c.b.f.b.a ENSGT00950000183049.E.d ENSGT00950000183167.a.b.b.a.g.a ENSGT00530000064873.b.j ENSGT00730000113582 ENSGT00940000158546.k ENSGT00950000182953.C.c.e ENSGT00940000158782.d.a.e ENSGT00390000004965.a.b ENSGT00530000063255.C.h Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00510000050125.b.b.a ENSGT00530000063113.A.r ENSGT00940000155355.`b ENSGT00940000159772.n ENSGT00530000064244.b.f ENSGT00940000159913.a.a.k.b.a.a ENSGT00940000164668.i ENSGT00940000161769.b.a.x.b ENSGT00390000009662.h ENSGT00390000002408.s ENSGT00390000002511 ENSGT01030000234626.D.c ENSGT00390000003682.e ENSGT00390000000378.d.b.vb ENSGT00940000156918.i ENSGT00950000182869.e.b.g.a.e ##22 ENSGT00950000182937.A.b.h ENSGT00940000158930.e ENSGT00940000155715.nb.b ENSGT00950000183166.a.b.e ENSGT00550000074856.c.b.f.a ENSGT00950000183049.E.d ENSGT00940000181029 ENSGT00950000183167.a.b.b.a.g.a ENSGT00530000064873.b.j ENSGT00730000113582.b ENSGT00940000158546.k ENSGT00950000182953.C.c.e ENSGT00940000158782.d.a.e ENSGT00390000004965.a.b ENSGT00530000063255.C.h Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT00510000050125.b.b.a ENSGT00530000063113.A.r ENSGT00940000155355.`b ENSGT00940000159772.n ENSGT00530000064244.b.f ENSGT00940000159913.a.a.k.b.b ENSGT00940000164668.i ENSGT00940000161769.b.a.x.b ENSGT00390000009662.h ENSGT00390000002408.s ENSGT00390000002511 ENSGT01030000234626.D.c ENSGT00390000003682.e ENSGT00390000000378.d.b.vb ENSGT00940000156918.i ENSGT00950000182869.e.b.g.a.e ##22 ENSGT00950000182937.A.b.h ENSGT00940000158930.e ENSGT00940000155715.nb.b ENSGT00950000183166.a.b.e ENSGT00550000074856.c.b.f.a ENSGT00950000183049.E.d ENSGT00940000181029 ENSGT00950000183167.a.b.b.a.g.a ENSGT00530000064873.b.j ENSGT00730000113582.b ENSGT00940000158546.k ENSGT00950000182953.C.c.e ENSGT00940000158782.d.a.e ENSGT00390000004965.a.b ENSGT00530000063255.C.h Atlantic salmon MODERN SPECIES 16 ENSSSAG00000053931 ENSSSAG00000118354 ppc1a (ENSSSAG00000053818) ENSSSAG00000118248 gp1bb (ENSSSAG00000053815) septin5a (ENSSSAG00000108161) zgc:63587 (ENSSSAG00000047646) cldn5a (ENSSSAG00000110113) cdc45 (ENSSSAG00000047454) ufd1l 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(ENSSTUG00000037975) ENSSTUG00000037957 ENSSTUG00000037716 SLC25A1 (ENSSTUG00000037225) ssbp2a (ENSSTUG00000035787) ENSSTUG00000035709 LETM2 (ENSSTUG00000035700) prnprs3 (ENSSTUG00000035692) ENSSTUG00000035689 rassf2a (ENSSTUG00000034925) SLC23A2 (ENSSTUG00000034813) KCNIP3 (ENSSTUG00000034725) PCNA (ENSSTUG00000034708) zgc:152830 (ENSSTUG00000034574) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00510000050125.b.b.a ENSGT00530000063113.A.r ENSGT00940000155355.`b ENSGT00940000159772.n ENSGT00530000064244.b.f ENSGT00940000159913.a.a.k.b.a.a ENSGT00940000164668.i ENSGT00940000161769.b.a.x.b ENSGT00390000009662.h ENSGT00390000002408.s ENSGT00390000002511 ENSGT01030000234626.D.c ENSGT00390000003682.e ENSGT00390000000378.d.b.vb ENSGT00940000156918.i ENSGT00950000182869.e.b.g.a.e ##22 ENSGT00940000158930.e ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183166.a.b.e ENSGT00550000074856.c.b.f.a ENSGT00950000183049.E.d ENSGT00940000181029 ENSGT00950000183167.a.b.b.a.g.a ENSGT00530000064873.b.j ENSGT00730000113582.b 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ENSGT00530000064244.b.e ENSGT00940000159913.a.a.k.a ENSGT00940000164668.j ENSGT00940000161769.b.a.x.a ENSGT00390000009662.g ENSGT00390000002408.t ENSGT00390000010239 ENSGT01030000234626.D.d ENSGT00390000003682.f ENSGT00390000001618.s ENSGT00390000000378.d.b.wb ENSGT00940000156918.j ENSGT00940000153866.B ENSGT00950000182869.e.b.g.a.f ##22 ENSGT00950000182937.A.b.h ENSGT00950000182937.A.b.g ENSGT00940000158930.f ENSGT00940000159038.a.a.d ENSGT00950000183166.a.b.f ENSGT00550000074856.c.b.e ENSGT00940000164012.B ENSGT00950000183049.E.c ENSGT00510000050125.b.b.b ENSGT01050000244840.A.a.b.e ENSGT00950000183076.a.b.a.d ENSGT01050000244840.A.b.b.a.d ENSGT00950000182940.b.b.e.d ENSGT00940000154170.A.c ENSGT00940000156667.o.a Chinook salmon MODERN SPECIES 3 ENSOTSG00005006590 dhx37 (ENSOTSG00005009966) gp1bb (ENSOTSG00005009971) septin5a (ENSOTSG00005009975) ENSOTSG00005010435 cldn5a (ENSOTSG00005010436) cdc45 (ENSOTSG00005010438) ufd1l (ENSOTSG00005010461) mrpl40 (ENSOTSG00005011128) ACAA2 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Turquoise killifish MODERN SPECIES 1627 PPAPDC1B (ENSNFUG00015016741) CDC45 (ENSNFUG00015016758) cldn5a (ENSNFUG00015016893) zgc:63587 (ENSNFUG00015014125) SEPT5A (ENSNFUG00015014443) ENSNFUG00015014995 UFD1L (ENSNFUG00015015193) si:ch211-51h9.6 (ENSNFUG00015015257) MRPL40 (ENSNFUG00015015276) ACAA2 (ENSNFUG00015015302) RPL6 (ENSNFUG00015015428) DYNLL1 (ENSNFUG00015015440) ENSNFUG00015015455 POLB (ENSNFUG00015015473) ENSNFUG00015015559 VDAC3 (ENSNFUG00015015582) ##22 ikbkb (ENSNFUG00015015755) PLAT (ENSNFUG00015016559) ENSNFUG00015016594 SLC25A1 (ENSNFUG00015016764) ENSNFUG00015016808 snap29 (ENSNFUG00015016817) pi4kab (ENSNFUG00015016838) serpind1 (ENSNFUG00015016997) ENSNFUG00015017007 BTF3 (ENSNFUG00015017060) UTP15 (ENSNFUG00015017071) ENSNFUG00015017100 ENSNFUG00015017115 YKT6 (ENSNFUG00015017130) ENSNFUG00015017141 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000009662 ENSGT00940000161769.b.a ENSGT00940000164668 ENSGT00940000159913.a.a ENSGT00530000064244.b ENSGT00550000074985 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ENSGT00390000002511 ENSGT00390000010239 ENSGT01030000234626.D ENSGT00390000003682 ENSGT00390000001618 ENSGT00390000000378.d.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000153866.B ENSGT00950000182869.e.b.g.a ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00950000183166.a.b ENSGT00550000074856.c.b ENSGT00390000008325.a ENSGT00950000182843.a.b ENSGT00550000074798.a.b ENSGT00940000158664 ENSGT00940000159978 ENSGT00390000009837 ENSGT00390000012630.B ENSGT00390000004228 ENSGT00940000155831.bb ENSGT00940000155776.b ENSGT00390000015164 Climbing perch MODERN SPECIES 22 cdc45 (ENSATEG00000020433) cldn5a (ENSATEG00000020491) zgc:63587 (ENSATEG00000020519) septin5a (ENSATEG00000020583) gp1bb (ENSATEG00000028591) dhx37 (ENSATEG00000020638) ENSATEG00000020712 si:ch211-51h9.6 (ENSATEG00000029168) mrpl40 (ENSATEG00000020753) acaa2 (ENSATEG00000020766) rpl6 (ENSATEG00000025793) ENSATEG00000027310 dynll1 (ENSATEG00000029579) polb (ENSATEG00000020803) enkd1 (ENSATEG00000020824) vdac3 (ENSATEG00000025440) ##22 ikbkb (ENSATEG00000020886) ENSATEG00000020915 ENSATEG00000020929 ENSATEG00000020957 ENSATEG00000021046 ENSATEG00000029495 snap29 (ENSATEG00000021079) pi4kab (ENSATEG00000021117) serpind1 (ENSATEG00000021178) ENSATEG00000021233 ENSATEG00000021240 ENSATEG00000021246 ENSATEG00000026260 ENSATEG00000021278 ENSATEG00000028531 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 20 NSD3 (ENSBSLG00000008531) plpp5 (ENSBSLG00000010262) cldn5a (ENSBSLG00000010582) zgc:63587 (ENSBSLG00000010761) septin5a (ENSBSLG00000011215) gp1bb (ENSBSLG00000011427) dhx37 (ENSBSLG00000011431) ufd1l (ENSBSLG00000011489) si:ch211-51h9.6 (ENSBSLG00000011539) mrpl40 (ENSBSLG00000011548) acaa2 (ENSBSLG00000011561) rpl6 (ENSBSLG00000012069) dynll1 (ENSBSLG00000012103) polb (ENSBSLG00000012161) enkd1 (ENSBSLG00000012120) vdac3 (ENSBSLG00000012194) ##22 ikbkb (ENSBSLG00000012342) PLAT (ENSBSLG00000012684) ENSBSLG00000012705 CLTCL1 (ENSBSLG00000012713) SLC25A1 (ENSBSLG00000013686) ENSBSLG00000013875 snap29 (ENSBSLG00000013879) pi4kab (ENSBSLG00000013900) serpind1 (ENSBSLG00000014355) hic1l (ENSBSLG00000014367) ENSBSLG00000014375 ENSBSLG00000014400 utp15 (ENSBSLG00000014429) ENSBSLG00000014471 ENSBSLG00000001705 Zig-zag eel MODERN SPECIES 23 cdc45 (ENSMAMG00000014559) cldn5a (ENSMAMG00000026747) zgc:63587 (ENSMAMG00000014467) septin5a (ENSMAMG00000014426) gp1bb (ENSMAMG00000014408) dhx37 (ENSMAMG00000014318) ENSMAMG00000014272 si:ch211-51h9.6 (ENSMAMG00000014259) mrpl40 (ENSMAMG00000014249) acaa2 (ENSMAMG00000014229) rpl6 (ENSMAMG00000014219) dynll1 (ENSMAMG00000026728) ENSMAMG00000025919 polb (ENSMAMG00000014133) enkd1 (ENSMAMG00000014116) vdac3 (ENSMAMG00000014082) ##22 ikbkb (ENSMAMG00000014045) ENSMAMG00000014017 ENSMAMG00000013857 ENSMAMG00000013831 ENSMAMG00000013809 snap29 (ENSMAMG00000013707) serpind1 (ENSMAMG00000013633) pi4kab (ENSMAMG00000013495) ENSMAMG00000013476 PRADC1 (ENSMAMG00000024659) ENSMAMG00000013398 ENSMAMG00000027147 ENSMAMG00000013321 ENSMAMG00000013241 YKT6 (ENSMAMG00000013181) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161769.b.a ENSGT00940000164668 ENSGT00940000159913.a.a ENSGT00530000064244.b ENSGT00550000074985 ENSGT00390000002408 ENSGT00390000002511 ENSGT00390000010239 ENSGT01030000234626.D ENSGT00390000003682 ENSGT01100000263793 ENSGT00390000000378.d.b ENSGT00390000001618 ENSGT00940000156918 ENSGT00940000153866.B ENSGT00950000182869.e.b.g.a ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183166.a.b ENSGT00550000074856.c.b ENSGT00390000008325.a ENSGT00950000182843.a.b ENSGT00940000158664 ENSGT00550000074798.a.b ENSGT00940000159978 ENSGT00390000009837 ENSGT00390000012630.B ENSGT00390000004228 ENSGT00940000155831.bb ENSGT00940000155776.b Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000009662 ENSGT00940000161769.b.a ENSGT00940000164668 ENSGT00940000159913.a.a ENSGT00530000064244.b ENSGT00550000074985 ENSGT00390000002408 ENSGT00390000002511 ENSGT00390000010239 ENSGT01030000234626.D ENSGT00390000003682.h 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ENSSDUG00000023059 ENSSDUG00000023050 aacs (ENSSDUG00000023028) AP3S1 (ENSSDUG00000023019) cdo1 (ENSSDUG00000023015) ENSSDUG00000023006 ENSSDUG00000023001 si:ch211-51h9.6 (ENSSDUG00000022999) mrpl40 (ENSSDUG00000022994) acaa2 (ENSSDUG00000022985) dynll1 (ENSSDUG00000022983) ENSSDUG00000022980 rpl6 (ENSSDUG00000022976) polb (ENSSDUG00000022962) enkd1 (ENSSDUG00000022958) vdac3 (ENSSDUG00000022952) ##22 ikbkb (ENSSDUG00000022942) PLAT (ENSSDUG00000022935) ENSSDUG00000022925 CLTCL1 (ENSSDUG00000022890) SLC25A1 (ENSSDUG00000022882) ENSSDUG00000022876 snap29 (ENSSDUG00000022863) serpind1 (ENSSDUG00000022851) pi4kab (ENSSDUG00000022824) hic1l (ENSSDUG00000022819) PRADC1 (ENSSDUG00000022817) ENSSDUG00000022800 ENSSDUG00000022797 utp15 (ENSSDUG00000022792) ENSSDUG00000022780 Barramundi perch MODERN SPECIES 9 plpp5 (ENSLCAG00010003491) cdc45 (ENSLCAG00010003255) cldn5a (ENSLCAG00010003207) zgc:63587 (ENSLCAG00010003198) septin5a (ENSLCAG00010003150) gp1bb (ENSLCAG00010003139) dhx37 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ENSGT00950000182869.e.b.g.a ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00950000183166.a.b.g ENSGT00950000183166.a.b.h ENSGT00550000074856.c.b ENSGT00390000008325.a ENSGT00950000182843.a.b ENSGT00940000158664 ENSGT00550000074798.a.b ENSGT00940000159978 ENSGT00390000009837 ENSGT00390000012630.B ENSGT00940000153288.b ENSGT00390000004228 ENSGT00940000155831.bb Tongue sole MODERN SPECIES 398 cldn5a (ENSCSEG00000019622) zgc:63587 (ENSCSEG00000019626) septin5a (ENSCSEG00000019641) gp1bb (ENSCSEG00000019724) dhx37 (ENSCSEG00000019728) tspan7 (ENSCSEG00000019743) ufd1l (ENSCSEG00000019744) si:ch211-51h9.6 (ENSCSEG00000019749) mrpl40 (ENSCSEG00000019750) ACAA2 (ENSCSEG00000019758) rpl6 (ENSCSEG00000019765) ENSCSEG00000019768 dynll1 (ENSCSEG00000019770) polb (ENSCSEG00000019776) enkd1 (ENSCSEG00000019787) vdac3 (ENSCSEG00000019795) ##22 ikbkb (ENSCSEG00000019800) PLAT (ENSCSEG00000019822) CLTCL1 (ENSCSEG00000019849) ENSCSEG00000019856 SLC25A1 (ENSCSEG00000019860) ENSCSEG00000019872 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SPECIES 5 ENSGT00940000161769.b.a ENSGT00940000164668 ENSGT00940000159913.a.a ENSGT00530000064244.b ENSGT00550000074985 ENSGT00390000002408 ENSGT00390000002511 ENSGT00390000010239 ENSGT01030000234626.D ENSGT00390000003682 ENSGT01100000263793 ENSGT00390000000378.d.b ENSGT00390000001618 ENSGT00940000156918 ENSGT00940000153866.B ENSGT00950000182869.e.b.g.a ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00950000183166.a.b ENSGT00550000074856.c.b ENSGT00390000008325.a ENSGT00950000182843.a.b ENSGT00550000074798.a.b ENSGT00940000158664 ENSGT00390000004228 ENSGT00940000155831.bb ENSGT00940000155776.b ENSGT00390000015164 ENSGT00950000182787.E.d.e.b ENSGT00940000161682 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.b Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155355 ENSGT00940000159772 ENSGT00390000009662 ENSGT00940000161769.b.a ENSGT00940000164668 ENSGT00940000159913.a.a ENSGT00550000074985 ENSGT00390000002408 ENSGT00390000002511 ENSGT00390000010239 ENSGT01030000234626.D ENSGT00390000003682 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ENSTNIG00000015908 TPCN1 (ENSTNIG00000015907) SLC8B1 (ENSTNIG00000001107) ENSTNIG00000015906 morc2 (ENSTNIG00000015905) plbd2 (ENSTNIG00000015904) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161769.b.a ENSGT00940000164668 ENSGT00940000159913.a.a ENSGT00530000064244.b ENSGT00550000074985 ENSGT00390000002408 ENSGT00390000002511 ENSGT00390000010239 ENSGT01030000234626.D ENSGT00390000003682 ENSGT01100000263793 ENSGT00390000000378.d.b ENSGT00390000001618 ENSGT00940000156918 ENSGT00940000153866.B ENSGT00950000182869.e.b.g.a ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00950000183166.a.b ENSGT00550000074856.c.b ENSGT00390000008325.a ENSGT00950000182843.a.b ENSGT01030000235069 ENSGT00940000158664 ENSGT00550000074798.a.b ENSGT00940000159978 ENSGT00390000009837 ENSGT00390000012630.B ENSGT00940000153288.b ENSGT00390000004228 ENSGT00940000155831.bb Ballan wrasse MODERN SPECIES 207 cdc45 (ENSLBEG00000025547) ENSLBEG00000025509 zgc:63587 (ENSLBEG00000025452) septin5a (ENSLBEG00000025389) 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ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00950000183166.a.b ENSGT00550000074856.c.b ENSGT00390000008325.a ENSGT00950000182843.a.b ENSGT00940000158664 ENSGT00550000074798.a.b ENSGT00940000159978 ENSGT00390000009837 ENSGT00390000012630.B ENSGT00390000004228 ENSGT00940000155831.bb ENSGT00940000155776.b ENSGT00390000015164 Lumpfish MODERN SPECIES 24 cdc45 (ENSCLMG00005016855) cldn5a (ENSCLMG00005016848) zgc:63587 (ENSCLMG00005016516) septin5a (ENSCLMG00005016049) gp1bb (ENSCLMG00005016039) dhx37 (ENSCLMG00005015998) ufd1l (ENSCLMG00005015867) si:ch211-51h9.6 (ENSCLMG00005015854) mrpl40 (ENSCLMG00005015851) acaa2 (ENSCLMG00005015620) rpl6 (ENSCLMG00005015618) dynll1 (ENSCLMG00005015617) ENSCLMG00005015615 polb (ENSCLMG00005015613) ENSCLMG00005015612 vdac3 (ENSCLMG00005015089) ##22 ikbkb (ENSCLMG00005012066) PLAT (ENSCLMG00005012039) CLTCL1 (ENSCLMG00005009416) SLC25A1 (ENSCLMG00005009402) ENSCLMG00005009401 snap29 (ENSCLMG00005009399) serpind1 (ENSCLMG00005009398) pi4kab (ENSCLMG00005008279) hic1l (ENSCLMG00005008268) PRADC1 (ENSCLMG00005008267) ENSCLMG00005008253 ENSCLMG00005008249 utp15 (ENSCLMG00005008242) ENSCLMG00005008234 ykt6 (ENSCLMG00005008231) Stickleback MODERN SPECIES 12 ENSGACG00000003878 golph3a (ENSGACG00000003881) ENSGACG00000003892 ENSGACG00000003894 npr3 (ENSGACG00000003906) sub1b (ENSGACG00000003912) dhx37 (ENSGACG00000003927) ufd1l (ENSGACG00000003940) si:ch211-51h9.6 (ENSGACG00000003986) ENSGACG00000003987 acaa2 (ENSGACG00000003989) rpl6 (ENSGACG00000004055) dynll1 (ENSGACG00000004060) polb (ENSGACG00000004070) enkd1 (ENSGACG00000004114) vdac3 (ENSGACG00000004119) ##22 ikbkb (ENSGACG00000004136) PLAT (ENSGACG00000004146) ENSGACG00000004156 ENSGACG00000004160 CLTCL1 (ENSGACG00000004169) SLC25A1 (ENSGACG00000004212) ENSGACG00000004218 snap29 (ENSGACG00000004226) pi4kab (ENSGACG00000004240) serpind1 (ENSGACG00000004263) hic1l (ENSGACG00000004268) PRADC1 (ENSGACG00000004269) ENSGACG00000004289 ENSGACG00000004293 utp15 (ENSGACG00000004300) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000009662 ENSGT00940000161769.b.a ENSGT00940000164668 ENSGT00940000159913.a.a ENSGT00530000064244.b ENSGT00550000074985 ENSGT00390000002408 ENSGT00390000002511 ENSGT00390000010239 ENSGT01030000234626.D ENSGT00390000003682 ENSGT00390000001618 ENSGT00390000000378.d.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000153866.B ENSGT00950000182869.e.b.g.a ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00950000183166.a.b ENSGT00550000074856.c.b ENSGT00390000008325.a ENSGT00950000182843.a.b ENSGT00940000158664 ENSGT00550000074798.a.b ENSGT00390000010435.A ENSGT00390000012630.B ENSGT00940000153288.b ENSGT00390000004228 ENSGT00940000155831.bb ENSGT00940000155776.b ENSGT00390000015164 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000009662 ENSGT00940000161769.b.a ENSGT00940000164668 ENSGT00940000159913.a.a ENSGT00940000177458 ENSGT00550000074985 ENSGT00390000002408 ENSGT00390000002511 ENSGT00390000010239 ENSGT01030000234626.D ENSGT00390000003682 ENSGT00390000001618 ENSGT00390000000378.d.b ENSGT00940000156918 ENSGT00940000153866.B ENSGT00950000182869.e.b.g.a ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00950000183166.a.b ENSGT00550000074856.c.b ENSGT00390000008325.a ENSGT00950000182843.a.b ENSGT00550000074798.a.b ENSGT00940000158664 ENSGT00390000010435.A ENSGT00390000012630.B ENSGT00940000153288.b ENSGT00390000004228 ENSGT00940000155831.bb ENSGT00940000155776.b ENSGT00390000015164 European seabass MODERN SPECIES 13 ENSDLAG00005024791 plpp5 (ENSDLAG00005026492) CDC45 (ENSDLAG00005024889) zgc:63587 (ENSDLAG00005004837) cldn5a (ENSDLAG00005004809) septin5a (ENSDLAG00005005774) dhx37 (ENSDLAG00005006009) ENSDLAG00005006145 mrpl40 (ENSDLAG00005033180) acaa2 (ENSDLAG00005006405) rpl6 (ENSDLAG00005006917) dynll1 (ENSDLAG00005031507) ENSDLAG00005006941 polb (ENSDLAG00005006964) enkd1 (ENSDLAG00005007034) vdac3 (ENSDLAG00005007063) ##22 ikbkb (ENSDLAG00005007449) ENSDLAG00005009550 ENSDLAG00005027575 ENSDLAG00005009688 ENSDLAG00005011016 ENSDLAG00005011102 snap29 (ENSDLAG00005011114) pi4kab (ENSDLAG00005011163) serpind1 (ENSDLAG00005012478) ENSDLAG00005032387 ENSDLAG00005028735 ENSDLAG00005027524 ENSDLAG00005012509 ENSDLAG00005012524 ENSDLAG00005012546 Large yellow croaker MODERN SPECIES 2 cdc45 (ENSLCRG00005015044) cldn5a (ENSLCRG00005015240) zgc:63587 (ENSLCRG00005015249) septin5a (ENSLCRG00005015282) ENSLCRG00005015334 dhx37 (ENSLCRG00005015338) ufd1l (ENSLCRG00005015551) si:ch211-51h9.6 (ENSLCRG00005015563) mrpl40 (ENSLCRG00005000093) acaa2 (ENSLCRG00005000116) rpl6 (ENSLCRG00005000140) ENSLCRG00005000148 dynll1 (ENSLCRG00005000153) polb (ENSLCRG00005000177) enkd1 (ENSLCRG00005000199) vdac3 (ENSLCRG00005000274) ##22 ikbkb (ENSLCRG00005000532) PLAT (ENSLCRG00005000800) CLTCL1 (ENSLCRG00005000916) SLC25A1 (ENSLCRG00005001220) ENSLCRG00005002170 snap29 (ENSLCRG00005002174) pi4kab (ENSLCRG00005002223) serpind1 (ENSLCRG00005003113) HIC2 (ENSLCRG00005003115) PRADC1 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Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 82 ENSGT00940000156812 ENSGT00950000183191.b ENSGT00940000166026 ENSGT00940000154842.a.a ENSGT00940000169174 ENSGT00950000182888.b ENSGT00940000166999.A ENSGT00910000144273 ENSGT00940000159527 ENSGT01030000234626.D ENSGT00390000000378.d.b ENSGT00390000003682 ENSGT00390000001618 ENSGT00940000156918 ENSGT00940000153866.B ENSGT00950000182869.e.b.g.a ##22 ENSGT00950000182937.A.b ENSGT00940000158930 ENSGT00950000183166.a.b ENSGT00550000074856.f ENSGT01030000235069 Asian bonytongue MODERN SPECIES 13 bri3bp (ENSSFOG00015028317) ppil2 (ENSSFOG00015014547) ypel1 (ENSSFOG00015014572) mapk1 (ENSSFOG00015030447) ppm1f (ENSSFOG00015015158) TOP3B (ENSSFOG00015015188) ENSSFOG00015015252 ydjc (ENSSFOG00015015281) ENSSFOG00015015292 HIC2 (ENSSFOG00015015304) PI4KA (ENSSFOG00015015366) serpind1 (ENSSFOG00015015477) snap29 (ENSSFOG00015015492) polb (ENSSFOG00015015567) enkd1 (ENSSFOG00015015654) vdac3 (ENSSFOG00015015682) ##22 ikbkb (ENSSFOG00015015783) PLAT 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SPECIES 53 ENSGT00390000012355.A.a.a.b ENSGT00940000155679.d ENSGT00940000180245 ENSGT00950000182772.B.a.a ENSGT00390000001362.a ENSGT00550000074798.a.a ENSGT01030000235069 ENSGT00550000074856.c.a ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 ENSGT00950000182888.b ENSGT00500000044909 ENSGT00950000183174.A ENSGT00940000155101.e ENSGT00970000197628 ENSGT00940000165179.a ENSGT00940000157468.b ENSGT00940000163301.c.a.a.b ENSGT00940000157468.a.a.b ENSGT00940000153876.B ENSGT00940000155143 ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853 ENSGT00390000002172.B ENSGT00940000178249 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000167350 ENSGT00950000183162.a.b.i.b ENSGT00940000161102 ENSGT00940000156317.w.a ENSGT00940000167011 ENSGT00940000154290.b ENSGT00940000165322 ENSGT00950000182772.B.a.a.g ENSGT00940000180245 ENSGT00940000155679.d ENSGT00390000012355.A.a.a.b ENSGT00730000110989.c.a ENSGT00940000155771.c ENSGT00550000074798.a.a ENSGT00550000074856.c.a ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 ENSGT00950000182888.b 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ENSGT00940000178249 ENSGT00940000155122.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000167011 ENSGT00940000154290.b ENSGT00940000153654.ve.b ENSGT00940000180245 ENSGT00940000165322 ENSGT00950000182772.B.a.a.g ENSGT00940000155679.d ENSGT00390000012355.A.a.a.b ENSGT00730000110989.c.a ENSGT00940000155771.c ENSGT00390000012630.B ENSGT00390000009837 ENSGT00940000159978 ENSGT00550000074798.a.a ENSGT00550000074856.c.a ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 ENSGT00950000182888.b ENSGT00500000044909 ENSGT00950000183174.A ENSGT00940000155101.e ENSGT00940000165179.a ENSGT00940000157468.b ENSGT00940000153876.B ENSGT00940000155143 ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853 ENSGT00390000002172.B ENSGT00940000178249 ENSGT00940000155122.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00390000014349 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 485 ved (ENSHCOG00000005201) polm (ENSHCOG00000005191) PURB (ENSHCOG00000005185) CNNM3 (ENSHCOG00000005178) CNNM4 (ENSHCOG00000005167) ENSHCOG00000005141 ENSHCOG00000005134 ENSHCOG00000005125 ckmt2a (ENSHCOG00000005105) ENSHCOG00000005085 oclna (ENSHCOG00000005062) MARVELD2 (ENSHCOG00000005055) pi4kaa (ENSHCOG00000005042) ENSHCOG00000005017 SLC25A1 (ENSHCOG00000005007) zgc:56235 (ENSHCOG00000004980) ##22 tor4aa (ENSHCOG00000004966) brap (ENSHCOG00000004954) NAA25 (ENSHCOG00000000876) pitpnb (ENSHCOG00000004846) pitpnb (ENSHCOG00000004815) ENSHCOG00000004806 ENSHCOG00000004799 ENSHCOG00000004786 ENSHCOG00000004776 ptpn11a (ENSHCOG00000004751) tmed2 (ENSHCOG00000004728) ENSHCOG00000004716 ddx55 (ENSHCOG00000004710) eif2b1 (ENSHCOG00000004679) ENSHCOG00000004660 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000180156 ENSGT00940000154290.b ENSGT00940000153654.ve.b ENSGT00940000180245 ENSGT00940000165322 ENSGT00950000182772.B.a.a.g ENSGT00940000155679.d ENSGT00390000012355.A.a.a.b ENSGT00730000110989.c.a ENSGT00940000155771.c ENSGT00390000012630.B ENSGT00390000009837 ENSGT00940000159978 ENSGT00550000074798.a.a ENSGT00550000074856.c.a ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 ENSGT00950000182888.b ENSGT00500000044909 ENSGT00950000183174.A ENSGT00940000155101.e ENSGT00940000165179.a ENSGT00940000157468.b ENSGT00940000153876.B ENSGT00940000155143 ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853 ENSGT00390000002172.B ENSGT00940000155122.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00390000014349 ENSGT00940000167301 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156317.w.a ENSGT00940000167011 ENSGT00940000180156 ENSGT00940000154290.b ENSGT00940000153654.ve.b ENSGT00940000180245 ENSGT00940000165322 ENSGT00950000182772.B.a.a.g ENSGT00940000155679.d ENSGT00390000012355.A.a.a.b ENSGT00730000110989.c.a ENSGT00940000155771.c ENSGT00550000074798.a.a ENSGT01030000235069 ENSGT00550000074856.c.a ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 ENSGT00950000182888.b ENSGT00500000044909 ENSGT00950000183174.A ENSGT00940000155101.e ENSGT00580000081898.b ENSGT00940000165179.a ENSGT00940000157468.b ENSGT00940000153876.B ENSGT00940000155143 ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853 ENSGT00390000002172.B ENSGT00940000155122.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00390000014349 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000161102 ENSGT00950000182944.A.b.c.e.a ENSGT00940000156317.w.a ENSGT00940000167011 ENSGT00940000154290.b ENSGT00940000153654.ve.b ENSGT00940000180245 ENSGT00950000182772.B.a.a.g ENSGT00940000155679.d ENSGT00390000012355.A.a.a.b ENSGT00730000110989.c.a ENSGT00940000155771.c ENSGT00550000074798.a.a ENSGT01030000235069 ENSGT00550000074856.c.a ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 ENSGT00950000182888.b ENSGT00500000044909 ENSGT00950000183174.A ENSGT00940000155101.e ENSGT00580000081898.b ENSGT00940000165179.a ENSGT00940000157468.b ENSGT00940000153876.B ENSGT00940000155143 ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853 ENSGT00390000002172.B ENSGT00940000155122.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00390000014349 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183162.a.b.i.b ENSGT00940000170783 ENSGT00940000161102 ENSGT00950000182944.A.b.c.e.a ENSGT00940000156317.w.a ENSGT00940000167011 ENSGT00940000154290.b ENSGT00940000153654.ve.b ENSGT00950000182772.B.a.a.g ENSGT00940000155679.d ENSGT00390000012355.A.a.a.b ENSGT00730000110989.c.a ENSGT00940000155771.c ENSGT00550000074798.a.a ENSGT00550000074856.c.a ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 ENSGT00950000182888.b ENSGT00500000044909 ENSGT00950000183174.A ENSGT00940000155101.e ENSGT00940000165179.a ENSGT00940000157468.b ENSGT00940000153876.B ENSGT00940000155143 ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853 ENSGT00390000002172.B ENSGT00940000155122.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00390000014349 ENSGT00940000167301 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 183 ENSGT00550000074856.c.a ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 ENSGT00950000182888.b ENSGT00500000044909 ENSGT00950000183174.A ENSGT00940000155101.e ENSGT00940000165179.a ENSGT00940000157468.b ENSGT00940000153876.B ENSGT00940000155143 ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853 ENSGT00390000002172.B ENSGT00940000178249 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1611 PURB (ENSNFUG00015010894) ved (ENSNFUG00015010913) polm (ENSNFUG00015011030) gnsb (ENSNFUG00015011217) MRPS24 (ENSNFUG00015012040) NUDCD3 (ENSNFUG00015012047) ENSNFUG00015012297 ENSNFUG00015017190 ENSNFUG00015017530 ENSNFUG00015017537 ENSNFUG00015017542 PPIAB (ENSNFUG00015017555) DUSP26 (ENSNFUG00015017564) ddx56 (ENSNFUG00015017600) SLC25A1B (ENSNFUG00015017942) zgc:56235 (ENSNFUG00015017999) ##22 C9ORF167 (ENSNFUG00015018006) brap (ENSNFUG00015018022) pitpnb (ENSNFUG00015005946) pla2g3 (ENSNFUG00015006114) ENSNFUG00015006134 ptpn11a (ENSNFUG00015006236) TMED2 (ENSNFUG00015006460) ddx55 (ENSNFUG00015006476) eif2b1 (ENSNFUG00015006499) bcl7a (ENSNFUG00015006515) stom (ENSNFUG00015006553) gsna (ENSNFUG00015006648) ENSNFUG00015007820 ENSNFUG00015007824 PPP2R2A (ENSNFUG00015007904) Mangrove rivulus MODERN SPECIES 254 ENSKMAG00000015663 SLC25A1 (ENSKMAG00000015636) NAA25 (ENSKMAG00000015517) brap (ENSKMAG00000015449) tor4aa (ENSKMAG00000015436) ENSKMAG00000015392 ##22 pitpnb (ENSKMAG00000015360) pla2g3 (ENSKMAG00000015337) ptpn11a (ENSKMAG00000015291) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000012355.A.a.a.b ENSGT00730000110989.c.a ENSGT00940000155771.c ENSGT00550000074798.a.a ENSGT00550000074856.c.a ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 ENSGT00950000182888.b ENSGT00500000044909 ENSGT00950000183174.A ENSGT00940000155101.e ENSGT00580000081898.b ENSGT00940000165179.a ENSGT00940000157468.b.f ENSGT00940000153876.B ENSGT00940000155143 ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853 ENSGT00390000002172.B ENSGT00940000155122.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00390000014349 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012355.A.a.a.b ENSGT00730000110989.c.a ENSGT00940000155771.c ENSGT00550000074798.a.a ENSGT00550000074856.c.a ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 ENSGT00950000182888.b ENSGT00500000044909 ENSGT00950000183174.A ENSGT00940000155101.e ENSGT00940000156428 ENSGT00940000165179.a ENSGT00940000157468.b.f ENSGT00940000153876.B ENSGT00940000155143 ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853 ENSGT00390000002172.B ENSGT00940000155122.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00390000014349 Mummichog MODERN SPECIES 473 ENSFHEG00000019963 ANKRD34B (ENSFHEG00000019985) oclna (ENSFHEG00000000897) oclna (ENSFHEG00000020029) ENSFHEG00000020090 pi4kaa (ENSFHEG00000020280) SLC25A1 (ENSFHEG00000020295) VDAC3 (ENSFHEG00000020335) ##22 tor4aa (ENSFHEG00000020344) brap (ENSFHEG00000020426) ENSFHEG00000020453 NAA25 (ENSFHEG00000020589) pitpnb (ENSFHEG00000020641) ENSFHEG00000020743 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 254 MARVELD2 (ENSCVAG00000005815) pi4kaa (ENSCVAG00000005937) ENSCVAG00000005950 SLC25A1 (ENSCVAG00000005971) zgc:56235 (ENSCVAG00000006002) ##22 tor4aa (ENSCVAG00000006009) brap (ENSCVAG00000006044) NAA25 (ENSCVAG00000006108) pitpnb (ENSCVAG00000006356) ENSCVAG00000006373 ENSCVAG00000006399 pla2g3 (ENSCVAG00000006412) ENSCVAG00000006505 ptpn11a (ENSCVAG00000006513) tmed2 (ENSCVAG00000006539) ENSCVAG00000006579 ddx55 (ENSCVAG00000006635) eif2b1 (ENSCVAG00000006658) bcl7a (ENSCVAG00000006665) ENSCVAG00000006679 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161102 ENSGT00950000182944.A.b.c.e.a ENSGT00940000156317.w.a ENSGT00940000167011 ENSGT00940000154290.b ENSGT00940000153654.ve.b ENSGT00940000180245 ENSGT00950000182772.B.a.a.g ENSGT00940000155679.d ENSGT00390000012355.A.a.a.b ENSGT00730000110989.c.a ENSGT00940000155771.c ENSGT00550000074798.a.a ENSGT01030000235069 ENSGT00550000074856.c.a ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 ENSGT00950000182888.b ENSGT00500000044909 ENSGT00950000183174.A ENSGT00940000155101.e ENSGT00940000155143 ENSGT00940000153876.B ENSGT00940000157468.b ENSGT00940000165179.a ENSGT00580000081898.b ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853 ENSGT00390000002172.B ENSGT00940000156102.r ENSGT00940000166544.a ENSGT00950000183041.C Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161102 ENSGT00950000182944.A.b.c.e.a ENSGT00940000156317.w.a ENSGT00940000167011 ENSGT00940000154290.b ENSGT00940000153654.ve.b ENSGT00940000180245 ENSGT00950000182772.B.a.a.g ENSGT00940000155679.d ENSGT00390000012355.A.a.a.b ENSGT00730000110989.c.a ENSGT00940000155771.c ENSGT00550000074798.a.a ENSGT01030000235069 ENSGT00550000074856.c.a ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 ENSGT00950000182888.b ENSGT00500000044909 ENSGT00950000183174.A ENSGT00940000155101.e ENSGT00940000155143 ENSGT00940000153876.B ENSGT00940000157468.b ENSGT00940000165179.a ENSGT00580000081898.b ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853 ENSGT00390000002172.B ENSGT00940000156102.r.g.a ENSGT00940000156102.r.g.b ENSGT00940000166544.a Indian medaka MODERN SPECIES 30 ENSOMEG00000023108 CNNM4 (ENSOMEG00000023126) ENSOMEG00000023165 ENSOMEG00000023202 UBE2L5 (ENSOMEG00000023226) ENSOMEG00000023229 ckmt2a (ENSOMEG00000023240) RASGRF2 (ENSOMEG00000023256) ENSOMEG00000000814 oclna (ENSOMEG00000023280) MARVELD2 (ENSOMEG00000000815) ENSOMEG00000023307 ENSOMEG00000023313 ENSOMEG00000023317 SLC25A1 (ENSOMEG00000023335) VDAC3 (ENSOMEG00000023354) ##22 tor4aa (ENSOMEG00000023366) ENSOMEG00000023373 brap (ENSOMEG00000023384) NAA25 (ENSOMEG00000023413) ENSOMEG00000023421 tmed2 (ENSOMEG00000023436) ptpn11a (ENSOMEG00000023451) ENSOMEG00000023483 ENSOMEG00000023494 ENSOMEG00000023510 ENSOMEG00000023523 pla2g3 (ENSOMEG00000023535) ENSOMEG00000023550 ENSOMEG00000023590 ddx55 (ENSOMEG00000023619) Javanese ricefish MODERN SPECIES 3 ENSOJAG00000018697 ENSOJAG00000001664 NEU3 (ENSOJAG00000001701) CNNM4 (ENSOJAG00000001764) ENSOJAG00000001854 UBE2L5 (ENSOJAG00000002232) ckmt2a (ENSOJAG00000002248) RASGRF2 (ENSOJAG00000002297) ENSOJAG00000002439 ENSOJAG00000002450 ENSOJAG00000002454 oclna (ENSOJAG00000002475) ENSOJAG00000002491 MARVELD2 (ENSOJAG00000002502) SLC25A1 (ENSOJAG00000003504) zgc:56235 (ENSOJAG00000003581) ##22 tor4aa (ENSOJAG00000004020) brap (ENSOJAG00000004054) ENSOJAG00000004792 tmed2 (ENSOJAG00000004834) ptpn11a (ENSOJAG00000004911) pla2g3 (ENSOJAG00000005515) eif2b1 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Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000170783 ENSGT00940000161102 ENSGT00950000182944.A.b.c.e ENSGT00940000156317.w.a ENSGT00940000167011 ENSGT00940000154290.b ENSGT00940000153654.ve.b ENSGT00950000182772.B.a.a.g ENSGT00940000155679.d ENSGT00390000012355.A.a.a.b ENSGT00730000110989.c.a ENSGT00940000155771.c ENSGT00550000074798.a.a ENSGT01030000235069 ENSGT00550000074856.c.a ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 ENSGT00950000182888.b ENSGT00500000044909 ENSGT00940000179402 ENSGT00950000183174.A ENSGT00940000155101.e ENSGT00580000081898.b ENSGT00940000165179.a ENSGT00940000157468.b ENSGT00940000153876.B ENSGT00940000155143 ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853 ENSGT00390000002172.B ENSGT00940000155122.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000161102 ENSGT00950000182944.A.b.c.e ENSGT00940000156317.w.a ENSGT00940000167011 ENSGT00940000154290.b ENSGT00940000153654.ve.b ENSGT00950000182772.B.a.a.g ENSGT00940000155679.d 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ENSGT00940000155101.e ENSGT00940000156428 ENSGT00940000165179.a ENSGT00940000157468.b ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853 ENSGT00390000002172.B ENSGT00940000155122.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00390000014349 ENSGT00940000167301 ENSGT00940000153594.c.e.b Tetraodon MODERN SPECIES 19 ENSTNIG00000013543 xylb (ENSTNIG00000013542) ENSTNIG00000013541 galnt11 (ENSTNIG00000013540) ENSTNIG00000000143 ENSTNIG00000013539 ENSTNIG00000013538 ckmt2a (ENSTNIG00000013536) RASGRF2 (ENSTNIG00000013535) ENSTNIG00000013534 oclna (ENSTNIG00000013533) MARVELD2 (ENSTNIG00000013532) pi4kaa (ENSTNIG00000013531) SLC25A1 (ENSTNIG00000013530) cluap1 (ENSTNIG00000013529) zgc:56235 (ENSTNIG00000013528) ##22 tor4aa (ENSTNIG00000013527) brap (ENSTNIG00000013526) NAA25 (ENSTNIG00000013525) pitpnb (ENSTNIG00000013524) ENSTNIG00000013523 ENSTNIG00000013522 ENSTNIG00000011225 ENSTNIG00000013521 lama1 (ENSTNIG00000013519) tmed2 (ENSTNIG00000013520) zgc:162895 (ENSTNIG00000013518) tubb6 (ENSTNIG00000013517) dipk1c (ENSTNIG00000005803) ddx55 (ENSTNIG00000013515) eif2b1 (ENSTNIG00000013514) Fugu MODERN SPECIES 18 ved (ENSTRUG00000018582) PURB (ENSTRUG00000018581) ENSTRUG00000018580 CNNM4 (ENSTRUG00000018576) ENSTRUG00000018575 ENSTRUG00000020228 ENSTRUG00000020733 ckmt2a (ENSTRUG00000018572) RASGRF2 (ENSTRUG00000018567) ANKRD34B (ENSTRUG00000022958) oclna (ENSTRUG00000018564) MARVELD2 (ENSTRUG00000018563) pi4kaa (ENSTRUG00000026573) ENSTRUG00000024634 SLC25A1 (ENSTRUG00000018555) zgc:56235 (ENSTRUG00000018554) ##22 tor4aa (ENSTRUG00000029108) brap (ENSTRUG00000018551) ENSTRUG00000030820 pitpnb (ENSTRUG00000018546) ENSTRUG00000026481 pla2g3 (ENSTRUG00000018542) ENSTRUG00000018535 ddx55 (ENSTRUG00000018525) eif2b1 (ENSTRUG00000018520) ENSTRUG00000024096 ENSTRUG00000018511 denr (ENSTRUG00000020621) ccdc62 (ENSTRUG00000022161) RILPL1 (ENSTRUG00000018499) kmt5aa (ENSTRUG00000018497) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000183162.a.b.i.b ENSGT00940000170783 ENSGT00940000161102 ENSGT00940000156317.w.a ENSGT00940000167011 ENSGT00940000154290.b ENSGT00940000153654.ve.b ENSGT00950000182772.B.a.a.g ENSGT00940000180245 ENSGT00940000155679.d ENSGT00390000012355.A.a.a.b ENSGT00730000110989.c.a ENSGT00940000155771.c ENSGT00550000074798.a.a ENSGT00550000074856.c.a ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 ENSGT00950000182888.b ENSGT00500000044909 ENSGT00950000183174.A ENSGT00940000155101.e ENSGT00940000165179.a ENSGT00940000157468.b ENSGT00940000153876.B ENSGT00940000155143 ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853 ENSGT00390000002172.B ENSGT00940000155122.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00390000014349 ENSGT00940000167301 Ballan wrasse MODERN SPECIES 466 HIC2 (ENSLBEG00000013821) pi4kaa (ENSLBEG00000013899) SLC25A1 (ENSLBEG00000014028) VDAC3 (ENSLBEG00000014092) ##22 tor4aa (ENSLBEG00000014125) brap (ENSLBEG00000014141) NAA25 (ENSLBEG00000014259) pitpnb (ENSLBEG00000014351) ENSLBEG00000014393 ENSLBEG00000014448 pla2g3 (ENSLBEG00000014467) ENSLBEG00000014507 ptpn11a (ENSLBEG00000014581) tmed2 (ENSLBEG00000014610) ENSLBEG00000014640 ENSLBEG00000014660 ENSLBEG00000014678 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000161102 ENSGT00940000156317.w.a ENSGT00940000167011 ENSGT00940000154290.b ENSGT00940000153654.ve.b ENSGT00950000182772.B.a.a.g ENSGT00940000180245 ENSGT00940000155679.d ENSGT00390000012355.A.a.a.b ENSGT00730000110989.c.a ENSGT00940000155771.c ENSGT00390000009837 ENSGT00940000159978 ENSGT00550000074798.a.a ENSGT00550000074856.c.a ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 ENSGT00950000182888.b ENSGT00500000044909 ENSGT00950000183174.A ENSGT00940000155101.e ENSGT00940000165179.a ENSGT00940000157468.b ENSGT00940000153876.B ENSGT00940000155143 ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853 ENSGT00390000002172.B ENSGT00940000155122.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00390000014349 ENSGT00940000167301 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000167350 ENSGT00950000183162.a.b.i.b ENSGT00940000170783 ENSGT00940000161102 ENSGT00940000156317.w.a ENSGT00940000167011 ENSGT00940000154290.b ENSGT00940000153654.ve.b ENSGT00950000182772.B.a.a.g ENSGT00940000155679.d ENSGT00390000012355.A.a.a.b ENSGT00730000110989.c.a ENSGT00940000155771.c ENSGT00550000074798.a.a ENSGT00550000074856.c.a ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 ENSGT00950000182888.b ENSGT00500000044909 ENSGT00950000183174.A ENSGT00940000155101.e ENSGT00940000165179.a ENSGT00940000157468.b ENSGT00940000153876.B ENSGT00940000155143 ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853 ENSGT00390000002172.B ENSGT00940000155122.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00390000014349 ENSGT00940000167301 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000167350 ENSGT00950000183162.a.b.i.b ENSGT00940000170783 ENSGT00940000161102 ENSGT00940000156317.w.a ENSGT00940000167011 ENSGT00940000154290.b ENSGT00940000153654.ve.b ENSGT00950000182772.B.a.a.g ENSGT00940000155679.d ENSGT00390000012355.A.a.a.b ENSGT00730000110989.c.a ENSGT00940000155771.c ENSGT00550000074798.a.a ENSGT00550000074856.c.a ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 ENSGT00950000182888.b ENSGT00500000044909 ENSGT00950000183174.A ENSGT00940000155101.e ENSGT00940000165179.a ENSGT00940000157468.b ENSGT00940000153876.B ENSGT00940000155143 ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853 ENSGT00390000002172.B ENSGT00940000155122.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00390000014349 ENSGT00940000167301 Lumpfish MODERN SPECIES 3 ENSCLMG00005018158 ENSCLMG00005017995 ENSCLMG00005017993 CNNM4 (ENSCLMG00005017964) CNNM3 (ENSCLMG00005017863) ENSCLMG00005017862 PURB (ENSCLMG00005017861) ved (ENSCLMG00005017860) RASGRF2 (ENSCLMG00005017859) ANKRD34B (ENSCLMG00005017858) oclna (ENSCLMG00005017857) MARVELD2 (ENSCLMG00005017856) pi4kaa (ENSCLMG00005017621) ENSCLMG00005017620 SLC25A1 (ENSCLMG00005017619) zgc:56235 (ENSCLMG00005017610) ##22 tor4aa (ENSCLMG00005017608) brap (ENSCLMG00005017555) NAA25 (ENSCLMG00005016309) pitpnb (ENSCLMG00005016293) pla2g3 (ENSCLMG00005016287) ENSCLMG00005016286 ENSCLMG00005016284 ptpn11a (ENSCLMG00005015696) tmed2 (ENSCLMG00005015692) ddx55 (ENSCLMG00005015676) eif2b1 (ENSCLMG00005015650) bcl7a (ENSCLMG00005015649) ENSCLMG00005015642 ENSCLMG00005015641 denr (ENSCLMG00005015637) Stickleback MODERN SPECIES 185 ENSGACG00000000407 ENSGACG00000000392 ckmt2a (ENSGACG00000000372) RASGRF2 (ENSGACG00000000366) ENSGACG00000000365 oclna (ENSGACG00000000363) ENSGACG00000000361 pi4kaa (ENSGACG00000000354) SLC25A1 (ENSGACG00000000351) zgc:56235 (ENSGACG00000000342) ##22 tor4aa (ENSGACG00000000341) brap (ENSGACG00000000338) NAA25 (ENSGACG00000000334) ENSGACG00000000321 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000167350 ENSGT00950000183162.a.b.i.b ENSGT00940000170783 ENSGT00940000161102 ENSGT00940000156317.w.a ENSGT00940000167011 ENSGT00940000154290.b ENSGT00940000153654.ve.b ENSGT00950000182772.B.a.a.g ENSGT00940000155679.d ENSGT00390000012355.A.a.a.b ENSGT00730000110989.c.a ENSGT00940000155771.c ENSGT00550000074798.a.a ENSGT00550000074856.c.a ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 ENSGT00950000182888.b ENSGT00500000044909 ENSGT00950000183174.A ENSGT00940000155101.e ENSGT00940000156428 ENSGT00940000165179.a ENSGT00940000157468.b ENSGT00940000153876.B ENSGT00940000155143 ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853 ENSGT00390000002172.B ENSGT00940000155122.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00390000014349 Channel bull blenny MODERN SPECIES 3 polm (ENSCGOG00000023361) ved (ENSCGOG00000023364) CNNM3 (ENSCGOG00000023366) purba (ENSCGOG00000023376) CNNM4 (ENSCGOG00000023377) ENSCGOG00000023379 ENSCGOG00000023404 ENSCGOG00000023484 ckmt2a (ENSCGOG00000023499) RASGRF2 (ENSCGOG00000023595) oclna (ENSCGOG00000023826) ANKRD34B (ENSCGOG00000023828) MARVELD2 (ENSCGOG00000023830) pi4kaa (ENSCGOG00000023836) SLC25A1 (ENSCGOG00000023870) zgc:56235 (ENSCGOG00000023914) ##22 tor4aa (ENSCGOG00000023989) brap (ENSCGOG00000023993) NAA25 (ENSCGOG00000024082) pitpnb (ENSCGOG00000024192) ENSCGOG00000024198 pla2g3 (ENSCGOG00000024208) ENSCGOG00000024217 ptpn11a (ENSCGOG00000024247) tmed2 (ENSCGOG00000024293) ddx55 (ENSCGOG00000024302) eif2b1 (ENSCGOG00000024319) bcl7a (ENSCGOG00000004076) ENSCGOG00000004094 ENSCGOG00000004105 denr (ENSCGOG00000004119) Pike perch MODERN SPECIES 165 ENSSLUG00000011317 ENSSLUG00000011322 ENSSLUG00000011324 ENSSLUG00000011330 ckmt2a (ENSSLUG00000011377) RASGRF2 (ENSSLUG00000012688) ENSSLUG00000014535 ANKRD34B (ENSSLUG00000014541) oclna (ENSSLUG00000014548) MARVELD2 (ENSSLUG00000014562) pi4kaa (ENSSLUG00000014652) SLC25A1 (ENSSLUG00000015243) ENSSLUG00000015894 ##22 tor4aa (ENSSLUG00000016005) brap (ENSSLUG00000016051) NAA25 (ENSSLUG00000016374) pitpnb (ENSSLUG00000016411) ENSSLUG00000016625 pla2g3 (ENSSLUG00000016878) ENSSLUG00000016891 ENSSLUG00000016898 ENSSLUG00000016905 ptpn11a (ENSSLUG00000016964) tmed2 (ENSSLUG00000018019) ddx55 (ENSSLUG00000018047) eif2b1 (ENSSLUG00000018094) bcl7a (ENSSLUG00000018262) ENSSLUG00000018266 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161102 ENSGT00940000156317.w.a ENSGT00940000167011 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tmed2 (ENSDLAG00005026328) ddx55 (ENSDLAG00005011433) EIF2B1 (ENSDLAG00005011652) ENSDLAG00005012192 ENSDLAG00005012197 ENSDLAG00005012230 Large yellow croaker MODERN SPECIES 4 PURB (ENSLCRG00005007682) ENSLCRG00005007680 CNNM3 (ENSLCRG00005007677) CNNM4 (ENSLCRG00005007667) ENSLCRG00005007382 ENSLCRG00005007072 ENSLCRG00005007068 ckmt2a (ENSLCRG00005006852) RASGRF2 (ENSLCRG00005002162) ANKRD34B (ENSLCRG00005002108) oclna (ENSLCRG00005002103) MARVELD2 (ENSLCRG00005002094) SLC25A1 (ENSLCRG00005001379) pi4kaa (ENSLCRG00005000472) HIC2 (ENSLCRG00005000462) zgc:56235 (ENSLCRG00005000246) ##22 tor4aa (ENSLCRG00005000164) brap (ENSLCRG00005022652) NAA25 (ENSLCRG00005022647) pitpnb (ENSLCRG00005022620) ENSLCRG00005022607 pla2g3 (ENSLCRG00005022602) ENSLCRG00005022598 ptpn11a (ENSLCRG00005022497) tmed2 (ENSLCRG00005022495) ddx55 (ENSLCRG00005022488) eif2b1 (ENSLCRG00005022477) bcl7a (ENSLCRG00005022475) ENSLCRG00005022474 ENSLCRG00005022471 denr (ENSLCRG00005022469) Gilthead seabream MODERN SPECIES 3 ved (ENSSAUG00010001588) PURB (ENSSAUG00010001595) ENSSAUG00010001602 CNNM3 (ENSSAUG00010001644) CNNM4 (ENSSAUG00010001710) ENSSAUG00010001716 ENSSAUG00010001761 UBE2L5 (ENSSAUG00010001897) ckmt2a (ENSSAUG00010001906) RASGRF2 (ENSSAUG00010001968) ENSSAUG00010002071 oclna (ENSSAUG00010002073) MARVELD2 (ENSSAUG00010002078) pi4kaa (ENSSAUG00010002122) SLC25A1 (ENSSAUG00010002365) zgc:56235 (ENSSAUG00010002564) ##22 tor4aa (ENSSAUG00010003396) brap (ENSSAUG00010003407) NAA25 (ENSSAUG00010003489) ENSSAUG00010006450 ENSSAUG00010006477 ENSSAUG00010006478 pla2g3 (ENSSAUG00010006480) ENSSAUG00010006488 ptpn11a (ENSSAUG00010006644) tmed2 (ENSSAUG00010007143) ddx55 (ENSSAUG00010007148) eif2b1 (ENSSAUG00010007162) ENSSAUG00010007169 ENSSAUG00010007170 ENSSAUG00010007171 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156317.w.a ENSGT00940000167011 ENSGT00940000180156 ENSGT00940000154290.b ENSGT00940000153654.ve.b ENSGT00940000180245 ENSGT00940000165322 ENSGT00950000182772.B.a.a.g 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Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183162.a.b.i.b ENSGT00940000170783 ENSGT00940000161102 ENSGT00940000156317.w.a ENSGT00940000167011 ENSGT00940000154290.b ENSGT00940000153654.ve.b ENSGT00940000180245 ENSGT00950000182772.B.a.a.g ENSGT00940000155679.d ENSGT00390000012355.A.a.a.b ENSGT00730000110989.c.a ENSGT00940000155771.c ENSGT00550000074798.a.a ENSGT00550000074856.c.a ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 ENSGT00950000182888.b ENSGT00500000044909 ENSGT00950000183174.A ENSGT00940000155101.e ENSGT00580000081898.b ENSGT00940000165179.a ENSGT00940000157468.b ENSGT00940000153876.B ENSGT00940000155143 ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853 ENSGT00390000002172.B ENSGT00940000155122.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00390000014349 Climbing perch MODERN SPECIES 3 ENSATEG00000001836 ENSATEG00000001871 ENSATEG00000001933 ENSATEG00000001946 ckmt2a (ENSATEG00000001981) ENSATEG00000002019 ENSATEG00000002136 ENSATEG00000002142 ENSATEG00000002176 ENSATEG00000029355 ENSATEG00000002181 ENSATEG00000027747 ENSATEG00000026011 pi4kaa (ENSATEG00000003318) ENSATEG00000026557 ENSATEG00000003509 ##22 tor4aa (ENSATEG00000003557) ENSATEG00000003563 ENSATEG00000003633 pitpnb (ENSATEG00000003751) ENSATEG00000003788 ENSATEG00000003804 pla2g3 (ENSATEG00000003868) ENSATEG00000003895 ptpn11a (ENSATEG00000003929) tmed2 (ENSATEG00000004001) ddx55 (ENSATEG00000004029) EIF2B1 (ENSATEG00000004100) ENSATEG00000026352 ENSATEG00000004144 ENSATEG00000004167 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 3 ved (ENSBSLG00000006280) PURB (ENSBSLG00000006318) il1b (ENSBSLG00000006363) CNNM3 (ENSBSLG00000006460) CNNM4 (ENSBSLG00000006739) ENSBSLG00000007162 ENSBSLG00000007941 ENSBSLG00000008843 ENSBSLG00000008859 ckmt2a (ENSBSLG00000008866) RASGRF2 (ENSBSLG00000009270) ENSBSLG00000009539 oclna (ENSBSLG00000009543) MARVELD2 (ENSBSLG00000009559) SLC25A1 (ENSBSLG00000010106) zgc:56235 (ENSBSLG00000010344) ##22 tor4aa (ENSBSLG00000010451) brap (ENSBSLG00000010462) NAA25 (ENSBSLG00000010928) pitpnb 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ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853 ENSGT00390000002172.B ENSGT00940000155122.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b ENSGT00390000014349 Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 23 pgap2 (ENSLCAG00010012056) ENSLCAG00010012048 timd4 (ENSLCAG00010012036) ENSLCAG00010012032 ENSLCAG00010012029 CNNM4 (ENSLCAG00010011999) ENSLCAG00010011842 ENSLCAG00010011780 ENSLCAG00010011750 RASGRF2 (ENSLCAG00010011634) ANKRD34B (ENSLCAG00010011581) oclna (ENSLCAG00010011575) MARVELD2 (ENSLCAG00010011570) pi4kaa (ENSLCAG00010011459) SLC25A1 (ENSLCAG00010011375) zgc:56235 (ENSLCAG00010011357) ##22 tor4aa (ENSLCAG00010011353) brap (ENSLCAG00010011309) NAA25 (ENSLCAG00010011285) tnfsf14 (ENSLCAG00010011277) pitpnb (ENSLCAG00010011260) ENSLCAG00010011181 ENSLCAG00010011160 ENSLCAG00010011065 ptpn11a (ENSLCAG00010010974) tmed2 (ENSLCAG00010010947) ddx55 (ENSLCAG00010010778) ENSLCAG00010010735 eif2b1 (ENSLCAG00010010681) ENSLCAG00010010651 ENSLCAG00010010635 Barramundi perch MODERN SPECIES 1638 SLC25A1 (ENSLCAG00010005045) VDAC3 (ENSLCAG00010005015) ##22 Seriola ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000161102 ENSGT00940000156317.w.a ENSGT00940000167011 ENSGT00940000180156 ENSGT00940000154290.b ENSGT00940000153654.ve.b ENSGT00950000182772.B.a.a.g ENSGT00940000155679.d ENSGT00390000012355.A.a.a.b ENSGT00730000110989.c.a ENSGT00940000155771.c ENSGT00550000074798.a.a ENSGT01030000235069 ENSGT00550000074856.c.a ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 ENSGT00950000182888.b ENSGT00500000044909 ENSGT00950000183174.A ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.f.p ENSGT00940000155101.e ENSGT00580000081898.b ENSGT00940000165179.a ENSGT00940000157468.b ENSGT00940000153876.B ENSGT00940000155143 ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853 ENSGT00390000002172.B ENSGT00940000155122.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3031 ENSSLDG00000010126 CNNM4 (ENSSLDG00000010177) ENSSLDG00000010231 ENSSLDG00000010400 UBE2L5 (ENSSLDG00000010498) ckmt2a (ENSSLDG00000010522) RASGRF2 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ENSGT00500000044909.d ENSGT00950000183174.A.d ENSGT00940000155101.e.i ENSGT00970000197628 ENSGT00940000165179.a ENSGT00940000157468.b.p ENSGT00940000157468.a.a.b ENSGT00940000153876.B.f ENSGT00940000155143.l.b ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853.d ENSGT00390000002172.B.a.b ENSGT00940000155122.b.bc.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b.j Huchen MODERN SPECIES 1290 pbdc1 (ENSHHUG00000044068) xpo7 (ENSHHUG00000043838) RASGRF2 (ENSHHUG00000043798) ckmt2a (ENSHHUG00000043788) ube2l3a (ENSHHUG00000043765) HIC2 (ENSHHUG00000043760) PI4KA (ENSHHUG00000043721) SLC25A1 (ENSHHUG00000043708) zgc:56235 (ENSHHUG00000043639) ##22 TOR4A (ENSHHUG00000043636) brap (ENSHHUG00000043626) NAA25 (ENSHHUG00000043621) PITPNB (ENSHHUG00000043586) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000157438.d.d ENSGT00390000015757.y ENSGT00940000155460.n.a ENSGT00390000002216.c.a ENSGT00400000024390.d ENSGT00940000154115.d.c ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b.h ENSGT00390000016333.j ENSGT00940000153139.B.a.d 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ENSGT00950000182869.e.b.g.b.c ##22 ENSGT00950000182888.b.e.b ENSGT00500000044909.d ENSGT00950000183174.A.d ENSGT00940000155101.e.i ENSGT00940000165179.a ENSGT00940000157468.b.p ENSGT00940000153876.B.f ENSGT00940000155143.l.b ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853.d ENSGT00390000002172.B.a.b ENSGT00940000155122.b.bc.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b.j ENSGT00390000014349.a ENSGT00940000157897.a.h Rainbow trout MODERN SPECIES 3 spp1 (ENSOMYG00000021668) ENSOMYG00000073848 ENSOMYG00000021617 dmtn (ENSOMYG00000069825) ENSOMYG00000021586 xpo7 (ENSOMYG00000021515) ENSOMYG00000019617 ENSOMYG00000019051 ENSOMYG00000019023 ENSOMYG00000019004 ENSOMYG00000054995 pi4kaa (ENSOMYG00000018843) ENSOMYG00000042313 ENSOMYG00000018770 ENSOMYG00000070169 ENSOMYG00000018757 ##22 tor4aa (ENSOMYG00000018751) ENSOMYG00000018738 ENSOMYG00000018459 pitpnb (ENSOMYG00000018388) ENSOMYG00000035441 ENSOMYG00000018115 ENSOMYG00000076972 ENSOMYG00000018094 ENSOMYG00000018084 ENSOMYG00000077170 ptpn11a (ENSOMYG00000018059) tmed2 (ENSOMYG00000018038) ddx55 (ENSOMYG00000017955) EIF2B1 (ENSOMYG00000017734) ENSOMYG00000017701 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000157438.d.d ENSGT00940000155460.n.a ENSGT00390000002216.c.a ENSGT00400000024390.d ENSGT00940000154115.d.c ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b.h ENSGT00390000016333.j ENSGT00940000153139.B.a.d ENSGT00940000155679.d.f ENSGT00940000155679.d.e.b ENSGT00950000182772.B.a.a.j.a ENSGT00940000153654.`f.a.a ENSGT00940000159978.s.b ENSGT00550000074798.a.a.q.b.b ENSGT00550000074856.c.a.d ENSGT00950000182869.e.b.g.b.c ##22 ENSGT00950000182888.b.e.b ENSGT00500000044909.d ENSGT00950000183174.A.d ENSGT00940000155101.e.i ENSGT00940000165179.a ENSGT00940000157468.b.p ENSGT00940000153876.B.f ENSGT00940000155143.l.b ENSGT00550000074969 ENSGT00550000074853.d ENSGT00390000002172.B.a.b ENSGT00940000155122.b.bc.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.b.j ENSGT00390000014349.a ENSGT00940000157897.a.h Chinook salmon MODERN SPECIES 33 ENSOTSG00005046709 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ENSELUG00000002632 ENSELUG00000028935 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 94 ENSGT00390000015164 ENSGT00550000074946 ENSGT00530000063672.b ENSGT00730000110989.c.a ENSGT00940000155771.c ENSGT00940000154290.b ENSGT00390000012355.A.a.a.b ENSGT00940000155679.d ENSGT00940000180245 ENSGT00950000182772.B.a.a ENSGT00940000153654 ENSGT00940000159978 ENSGT00550000074798.a.a ENSGT01030000235069 ENSGT00550000074856.d ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 ENSGT00950000182888.b ENSGT00500000044909 ENSGT00550000074969 ENSGT00940000155143.b ENSGT00940000153876.B ENSGT00940000157468.b ENSGT00940000165179.a ENSGT00940000156428 ENSGT00940000155101.e ENSGT00390000001777 ENSGT00940000164527.a ENSGT00390000003209 ENSGT00940000164635 ENSGT00940000156240 ENSGT00940000154089.b Otophysi ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000015164 ENSGT00550000074946 ENSGT00530000063672.b ENSGT00730000110989.c.a ENSGT00940000155771.c ENSGT00940000154290.b ENSGT00390000012355.A.a.a.b ENSGT00940000155679.d ENSGT00940000180245 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ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 ENSGT00950000182888.b ENSGT00500000044909 ENSGT00950000183174.A ENSGT00550000074969 ENSGT00940000155143.b ENSGT00940000153876.B ENSGT00940000157468.b ENSGT00940000165179.a ENSGT00940000156428 ENSGT00940000155101.e ENSGT00390000001777 ENSGT00940000158739.d ENSGT00940000157368.n ENSGT00940000155674.tc ENSGT00950000182976.b.b Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 174 ENSGT00940000180245 ENSGT00950000182772.B.a.a.u.a ENSGT00940000155679.d.g ENSGT00950000182772.B.a.a.u.b ENSGT00940000153654.bf.a.b ENSGT00940000159978.q.a ENSGT00550000074798.a.a.f ENSGT00940000159978.q.b ENSGT00550000074798.a.a.e ENSGT00550000074856.d ENSGT00950000182869.e.b.g.b.f ##22 ENSGT00950000182888.b.k.b ENSGT00500000044909.a ENSGT00950000183174.A.a ENSGT00550000074969.a ENSGT00950000182869.e.b.g.b.e ##22 ENSGT00950000182888.b.k.a ENSGT00500000044909.b ENSGT00950000183174.A.b ENSGT00550000074969.b ENSGT00940000155143.b ENSGT00940000153876.B.g ENSGT00940000157468.b.q ENSGT00940000165179.a.a ENSGT00940000156428.dd ENSGT00940000155101.e.c ENSGT00390000001777.e.b ENSGT00940000158739.d.b ENSGT00940000157368.n.b ENSGT00940000155674.tc.a ENSGT00950000182976.b.b.a Goldfish DUPLICATION Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 1824 zgc:56235 (ENSCARG00000049778) ##22 tor4aa (ENSCARG00000049817) Goldfish MODERN SPECIES 1044 zgc:56235 (ENSCARG00000066696) ##22 tor4aa (ENSCARG00000066714) brap (ENSCARG00000066732) NAA25 (ENSCARG00000067193) ddx55 (ENSCARG00000067387) tmed2 (ENSCARG00000067501) Goldfish MODERN SPECIES 794 slc25a1b (ENSCARG00000023412) zgc:56235 (ENSCARG00000023384) ##22 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 294 ENSGT01030000234573.A.b.b.b.l.a ENSGT00940000164321.d.b ENSGT00390000010474.d ENSGT00550000074946 ENSGT00530000063672.b.h ENSGT00940000164699.a.a ENSGT00730000110989.c.a.b ENSGT00940000155771.c.b ENSGT00940000154290.b.b ENSGT00390000012355.A.a.a.b.a ENSGT00940000155679.d.h ENSGT00940000180245 ENSGT00950000182772.B.a.a.u.a ENSGT00940000159978.q.a ENSGT00550000074798.a.a.f ENSGT00950000182869.e.b.g.b.e ##22 ENSGT00950000182888.b.k.a ENSGT00500000044909.b ENSGT00950000183174.A.b ENSGT00550000074969.b Common carp reference MODERN SPECIES 32 grk5 (ENSCCRG00000081589) ash2l (ENSCCRG00000051361) ENSCCRG00000040656 ENSCCRG00000010433 ENSCCRG00000040641 ENSCCRG00000031471 oclna (ENSCCRG00000075127) ENSCCRG00000005595 ENSCCRG00000005711 ENSCCRG00000055270 ENSCCRG00000025388 ckmt2a (ENSCCRG00000016808) ENSCCRG00000066521 hic2 (ENSCCRG00000055412) pi4kaa (ENSCCRG00000079867) zgc:56235 (ENSCCRG00000080198) ##22 tor4aa (ENSCCRG00000063616) brap (ENSCCRG00000018510) ENSCCRG00000019201 ddx55 (ENSCCRG00000019303) ENSCCRG00000059126 tmed2 (ENSCCRG00000008628) ptpn11a (ENSCCRG00000019379) ENSCCRG00000019721 pla2g3 (ENSCCRG00000058692) TTC28 (ENSCCRG00000070435) pitpnb (ENSCCRG00000042165) MN1 (ENSCCRG00000009732) PLK2 (ENSCCRG00000037784) ENSCCRG00000026459 RAB3C (ENSCCRG00000045994) Golden-line barbel MODERN SPECIES 1922 zgc:56235 (ENSSGRG00000007182) ##22 tor4aa (ENSSGRG00000007179) brap (ENSSGRG00000007048) NAA25 (ENSSGRG00000007042) ddx55 (ENSSGRG00000007039) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 174 ENSGT00730000110989.c.a.b ENSGT00940000155771.c.b ENSGT00940000154290.b.b ENSGT00390000012355.A.a.a.b ENSGT00940000155679.d.h ENSGT00940000180245 ENSGT00950000182772.B.a.a.u.a ENSGT00940000155679.d.g ENSGT00950000182772.B.a.a.u.b ENSGT00940000153654.bf.a.b ENSGT00940000159978.q.a ENSGT00550000074798.a.a.f ENSGT00940000159978.q.b ENSGT00550000074798.a.a.e ENSGT00550000074856.d ENSGT00950000182869.e.b.g.b.f ##22 ENSGT00950000182888.b.k.b ENSGT00500000044909.a ENSGT00950000183174.A.a ENSGT00550000074969.a ENSGT00950000182869.e.b.g.b.e ##22 ENSGT00950000182888.b.k.a ENSGT00500000044909.b ENSGT00950000183174.A.b ENSGT00550000074969.b ENSGT00940000155143.b ENSGT00940000153876.B.g ENSGT00940000157468.b.q ENSGT00940000165179.a.a ENSGT00940000156428.dd ENSGT00940000155101.e.c Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 396 pi4kaa (ENSCARG00000027801) slc25a1b (ENSCARG00000028164) zgc:56235 (ENSCARG00000028301) ##22 tor4aa (ENSCARG00000030958) brap (ENSCARG00000031018) NAA25 (ENSCARG00000032217) tmed2 (ENSCARG00000032585) ptpn11a (ENSCARG00000032640) Goldfish MODERN SPECIES 1 ash2l (ENSCARG00000003024) pnx (ENSCARG00000003377) aebp1a (ENSCARG00000003390) ENSCARG00000003429 ENSCARG00000003437 ERAP1 (ENSCARG00000003511) oclna (ENSCARG00000005457) MARVELD2 (ENSCARG00000005470) ENSCARG00000005515 ENSCARG00000006393 ckmt2a (ENSCARG00000006398) ENSCARG00000006430 hic2 (ENSCARG00000006455) pi4kaa (ENSCARG00000006476) slc25a1b (ENSCARG00000006735) zgc:56235 (ENSCARG00000006765) ##22 tor4aa (ENSCARG00000006796) brap (ENSCARG00000006813) NAA25 (ENSCARG00000007233) tmed2 (ENSCARG00000007299) ptpn11a (ENSCARG00000007329) ENSCARG00000007663 TTC28 (ENSCARG00000008011) pitpnb (ENSCARG00000008155) MN1 (ENSCARG00000008194) RAB3C (ENSCARG00000008204) PLK2 (ENSCARG00000008256) PDE4D (ENSCARG00000008572) ENSCARG00000010658 DEPDC1B (ENSCARG00000010667) ELOVL7 (ENSCARG00000010731) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00940000166967 ENSGT00940000158323.g ENSGT00390000015164.eb ENSGT00530000063672.b.g ENSGT00940000159086.p ENSGT00730000110989.c.a.a ENSGT00940000155771.c.a ENSGT00940000154290.b.a ENSGT00390000012355.A.a.a.b.b ENSGT00940000155679.d.g ENSGT00950000182772.B.a.a.u.b ENSGT00940000153654.bf.a.b ENSGT00940000159978.q.b ENSGT00550000074798.a.a.e ENSGT00550000074856.d ENSGT00950000182869.e.b.g.b.f ##22 ENSGT00950000182888.b.k.b ENSGT00500000044909.a ENSGT00950000183174.A.a ENSGT00550000074969.a ENSGT00940000155143.b ENSGT00940000153876.B.g ENSGT00940000157468.b.q ENSGT00940000165179.a.a ENSGT00940000156428.dd ENSGT00940000155101.e.c ENSGT00390000001777.e.b ENSGT00940000158739.d.b ENSGT00390000014771.b.b.i.b ENSGT00940000157368.n.b ENSGT00940000155674.tc.a Common carp reference MODERN SPECIES 24 pnx (ENSCCRG00000055746) aebp1a (ENSCCRG00000040679) ykt6 (ENSCCRG00000057784) ENSCCRG00000010441 ENSCCRG00000040619 oclna (ENSCCRG00000005581) ENSCCRG00000082673 ENSCCRG00000047314 ENSCCRG00000078808 ENSCCRG00000013155 ckmt2a (ENSCCRG00000013146) ENSCCRG00000013141 hic2 (ENSCCRG00000064601) pi4kaa (ENSCCRG00000068596) slc25a1b (ENSCCRG00000052291) zgc:56235 (ENSCCRG00000015764) ##22 tor4aa (ENSCCRG00000067562) brap (ENSCCRG00000079383) ENSCCRG00000041649 ddx55 (ENSCCRG00000041874) ptpn11a (ENSCCRG00000008592) ENSCCRG00000059018 pla2g3 (ENSCCRG00000008621) TTC28 (ENSCCRG00000070663) pitpnb (ENSCCRG00000077431) MN1 (ENSCCRG00000061033) ENSCCRG00000077958 PLK2 (ENSCCRG00000071967) ENSCCRG00000045987 RAB3C (ENSCCRG00000077386) PDE4D (ENSCCRG00000073113) Golden-line barbel MODERN SPECIES 321 ENSSGRG00000049751 ykt6 (ENSSGRG00000049752) ENSSGRG00000049788 ERAP1 (ENSSGRG00000049796) oclna (ENSSGRG00000050060) MARVELD2 (ENSSGRG00000050067) ENSSGRG00000050071 ANKRD34B (ENSSGRG00000050121) RASGRF2 (ENSSGRG00000050132) ckmt2a (ENSSGRG00000050176) ube2l3a (ENSSGRG00000050233) hic2 (ENSSGRG00000050237) pi4kaa (ENSSGRG00000050249) slc25a1b (ENSSGRG00000050530) zgc:56235 (ENSSGRG00000050531) ##22 brap (ENSSGRG00000050543) NAA25 (ENSSGRG00000050553) ddx55 (ENSSGRG00000051006) tmed2 (ENSSGRG00000051019) ptpn11a (ENSSGRG00000051039) ENSSGRG00000051182 pla2g3 (ENSSGRG00000051199) TTC28 (ENSSGRG00000051202) pitpnb (ENSSGRG00000051225) MN1 (ENSSGRG00000051246) PLK2 (ENSSGRG00000051261) ENSSGRG00000051434 RAB3C (ENSSGRG00000051435) PDE4D (ENSSGRG00000051437) ENSSGRG00000051463 Zebrafish MODERN SPECIES 1 aebp1a (ENSDARG00000091726) ykt6 (ENSDARG00000038308) ddx56 (ENSDARG00000020913) ENSDARG00000038302 ERAP1 (ENSDARG00000013024) oclna (ENSDARG00000005108) MARVELD2 (ENSDARG00000025076) ENSDARG00000075747 ANKRD34B (ENSDARG00000077086) RASGRF2 (ENSDARG00000075054) ckmt2a (ENSDARG00000069615) ube2l3a (ENSDARG00000112087) hic2 (ENSDARG00000100497) pi4kaa (ENSDARG00000076724) slc25a1b (ENSDARG00000076381) zgc:56235 (ENSDARG00000116680) ##22 tor4aa (ENSDARG00000010145) brap (ENSDARG00000008560) NAA25 (ENSDARG00000075446) ddx55 (ENSDARG00000009864) tmed2 (ENSDARG00000026908) ptpn11a (ENSDARG00000020334) ENSDARG00000063436 pla2g3 (ENSDARG00000008948) TTC28 (ENSDARG00000114920) pitpnb (ENSDARG00000036005) MN1 (ENSDARG00000076529) PLPPR1 (ENSDARG00000100642) ENSDARG00000075802 ENSDARG00000010729 PLK2 (ENSDARG00000090752) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000154702.b ENSGT00940000156044 ENSGT00390000002024 ENSGT00940000153189.A ENSGT00940000161453 ENSGT00940000156771 ENSGT00940000158884 ENSGT00990000204357 ENSGT00940000156516 ENSGT00940000160018 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654 ENSGT00940000159978 ENSGT00550000074798.a.a ENSGT00550000074856.d ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 ENSGT00950000182888.b ENSGT00500000044909 Denticle herring MODERN SPECIES 15 aebp1a (ENSDCDG00000000721) ykt6 (ENSDCDG00000000687) ddx56 (ENSDCDG00000000682) ENSDCDG00000000659 ERAP1 (ENSDCDG00000000612) oclna (ENSDCDG00000000589) MARVELD2 (ENSDCDG00000000584) ENSDCDG00000000406 ANKRD34B (ENSDCDG00000025160) RASGRF2 (ENSDCDG00000024986) ckmt2a (ENSDCDG00000024960) ube2l3a (ENSDCDG00000024955) hic2 (ENSDCDG00000024951) pi4kaa (ENSDCDG00000024634) slc25a1b (ENSDCDG00000024619) zgc:56235 (ENSDCDG00000024578) ##22 tor4aa (ENSDCDG00000024574) brap (ENSDCDG00000024397) ENSDCDG00000024367 ENSDCDG00000024119 poglut1 (ENSDCDG00000024106) timmdc1 (ENSDCDG00000024099) ENSDCDG00000024024 DIS3 (ENSDCDG00000023923) bora (ENSDCDG00000023918) mzt1 (ENSDCDG00000023916) dachc (ENSDCDG00000023911) gpr183b (ENSDCDG00000023910) ubac2 (ENSDCDG00000023907) tm9sf2 (ENSDCDG00000023211) zic2b (ENSDCDG00000023192) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 209 ENSGT00940000162972 ENSGT00390000017655.k ENSGT00940000163130 ENSGT00390000009387 ENSGT00390000014107.a.a ENSGT00940000159434.p ENSGT01020000230438.C.f.b ENSGT00390000015813.b.b ENSGT00390000017134.b ENSGT00990000203805 ENSGT01030000234989 ENSGT00940000156488.a.a.g ENSGT00940000156133.a.b ENSGT01050000244879.a.a.b ENSGT00940000156896 ENSGT00950000182869.e.b.g.b ##22 P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae MODERN SPECIES 271 ENSPKIG00000001042 ENSPKIG00000001081 zgc:158343 (ENSPKIG00000001153) tor4ab (ENSPKIG00000001168) ENSPKIG00000001180 wdr31 (ENSPKIG00000001204) GAK (ENSPKIG00000001261) acaa2 (ENSPKIG00000001360) dynll1 (ENSPKIG00000001421) rpl6 (ENSPKIG00000001407) ENSPKIG00000001435 polb (ENSPKIG00000001456) enkd1 (ENSPKIG00000001481) ENSPKIG00000001500 ##22 ikbkb (ENSPKIG00000001536) PLAT (ENSPKIG00000001615) ENSPKIG00000001659 ENSPKIG00000001730 SLC25A1 (ENSPKIG00000001918) ENSPKIG00000001980 snap29 (ENSPKIG00000002004) PI4KA (ENSPKIG00000002055) serpind1 (ENSPKIG00000002156) HIC2 (ENSPKIG00000002187) tmem135 (ENSPKIG00000002203) RAB38 (ENSPKIG00000002225) grm5a (ENSPKIG00000002262) TYR (ENSPKIG00000002320) kpna7 (ENSPKIG00000002347) P. kingsleyae MODERN SPECIES 9 dgcr2 (ENSPKIG00000017103) ess2 (ENSPKIG00000017140) ENSPKIG00000017186 rnf185 (ENSPKIG00000017239) wscd2 (ENSPKIG00000017279) CMKLR1 (ENSPKIG00000017305) iscub (ENSPKIG00000017322) tmem119b (ENSPKIG00000017340) ENSPKIG00000017354 ENSPKIG00000017407 SSH1 (ENSPKIG00000017517) UNG (ENSPKIG00000017575) FOXN4 (ENSPKIG00000017607) rfx3 (ENSPKIG00000017641) glis3 (ENSPKIG00000017730) zgc:56235 (ENSPKIG00000017776) ##22 SLC25A1 (ENSPKIG00000017818) ENSPKIG00000017835 pi4kaa (ENSPKIG00000017878) hic2 (ENSPKIG00000017929) ube2l3b (ENSPKIG00000017942) sdf2l1 (ENSPKIG00000017963) sppl3 (ENSPKIG00000018000) GNAZ (ENSPKIG00000018034) ENSPKIG00000018049 adam9 (ENSPKIG00000018077) dmtn (ENSPKIG00000018115) pbdc1 (ENSPKIG00000018127) xpo7 (ENSPKIG00000018175) ENSPKIG00000018292 GFRA2 (ENSPKIG00000018311) Asian bonytongue MODERN SPECIES 21 TSSK1B (ENSSFOG00015015442) ess2 (ENSSFOG00015015525) PIK3IP1 (ENSSFOG00015015561) rnf185 (ENSSFOG00015015627) wscd2 (ENSSFOG00015015648) CMKLR1 (ENSSFOG00015015689) iscub (ENSSFOG00015026978) ENSSFOG00015026039 ENSSFOG00015015743 ENSSFOG00015015764 SSH1 (ENSSFOG00015015810) ENSSFOG00015015832 FOXN4 (ENSSFOG00015015852) rfx3 (ENSSFOG00015029856) glis3 (ENSSFOG00015015922) zgc:56235 (ENSSFOG00015015933) ##22 SLC25A1 (ENSSFOG00015015942) pi4kaa (ENSSFOG00015015982) hic2 (ENSSFOG00015016070) UBE2L5 (ENSSFOG00015016080) sdf2l1 (ENSSFOG00015032321) sppl3 (ENSSFOG00015031011) GNAZ (ENSSFOG00015028594) rab36 (ENSSFOG00015016156) DEPDC5 (ENSSFOG00015016202) ywhah (ENSSFOG00015016274) slc5a1 (ENSSFOG00015016283) RNF208 (ENSSFOG00015028895) nt5c2l1 (ENSSFOG00015016324) slc2a11l (ENSSFOG00015016375) drg1 (ENSSFOG00015016405) Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.h ##22 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.h ##22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.h ##22 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.h ##22 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.h ##22 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.h ##22 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.h ##22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.h ##22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.h ##22 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.h ##22 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.h ##22 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.h ##22 Seriola ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.h ##22 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 52 ENSSLDG00000000759 ##22 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.h ##22 Otophysi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.h ##22 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.e.b.h ##22 Channel catfish MODERN SPECIES 24 map3k12 (ENSIPUG00000024813) pcbp2 (ENSIPUG00000024819) Kif5a (ENSIPUG00000024824) stac3 (ENSIPUG00000024832) cd63 (ENSIPUG00000024837) ENSIPUG00000024840 actr5 (ENSIPUG00000024841) slc32a1 (ENSIPUG00000024855) ENSIPUG00000024859 ENSIPUG00000024861 ENSIPUG00000024868 ENSIPUG00000024871 polb (ENSIPUG00000024873) ENSIPUG00000024881 tfdp1b (ENSIPUG00000024887) ENSIPUG00000024894 ##22 ENSIPUG00000024904 ikbkb (ENSIPUG00000024905) plat (ENSIPUG00000024913) ENSIPUG00000024924 ENSIPUG00000024926 ERC2 (ENSIPUG00000024934) DOCK3 (ENSIPUG00000024955) DAG1 (ENSIPUG00000024964) dcaf1 (ENSIPUG00000024966) RAD54L2 (ENSIPUG00000024973) BSN (ENSIPUG00000024975) slc25a27 (ENSIPUG00000024976) ENSIPUG00000024980 Apeh (ENSIPUG00000024983) tlr9 (ENSIPUG00000024990) Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.f ##22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.f ##22 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.f ##22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.f ##22 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.f ##22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.f ##22 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.f ##22 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.f ##22 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.f ##22 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.f ##22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.f ##22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.f ##22 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.f ##22 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.f ##22 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.f ##22 Seriola ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182869.f ##22 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 1505 ENSSLDG00000001485 ##22