Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000162504	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000161120	ENSGT00390000001374	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000018676	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000012703.a	ENSGT00940000157391	ENSGT00940000155656	ENSGT00940000154790.a.a.b #18	ENSGT00940000157082 #19	ENSGT00940000156874 #20	ENSGT00730000111187.b #21	ENSGT00940000156560 #22	ENSGT00940000153881.a #23	ENSGT00940000158456 #24	ENSGT00940000153433.B.a.b #25	ENSGT00940000154268.e.a	ENSGT00410000025698.a #26	ENSGT00390000011270	ENSGT00390000001960 #28	ENSGT00940000157390 #29	ENSGT00940000159171	ENSGT00940000159967	ENSGT00550000074815	ENSGT00940000157359	ENSGT00550000074910	ENSGT00390000005794	ENSGT00940000157560.e
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000161120	ENSGT00390000001374	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000018676	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000012703.a	ENSGT00940000157391	ENSGT00940000155656	ENSGT00940000154790.a.a.b #18	ENSGT00940000157082 #19	ENSGT00940000156874 #20	ENSGT00730000111187.b #21	ENSGT00900000143015.b	ENSGT00940000156560 #22	ENSGT00940000153881.a #23	ENSGT00940000158456 #24	ENSGT00940000153433.B.a.b #25	ENSGT00940000154268.e.a	ENSGT00410000025698.a #26	ENSGT00390000011270	ENSGT00390000001960 #28	ENSGT00940000157390 #29	ENSGT00940000159171	ENSGT00940000159967	ENSGT00550000074815	ENSGT00940000157359	ENSGT00550000074910	ENSGT00390000005794	ENSGT00940000157560.e
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	160											ENSGT00940000154790.a.a.b #18	ENSGT00940000157082 #19	ENSGT00940000156874 #20	ENSGT00730000111187.b #21	ENSGT00900000143015.b	ENSGT00940000156560 #22	ENSGT00940000153881.a #23	ENSGT00940000158456 #24	ENSGT00940000153433.B.a.b #25	ENSGT00410000025698.a #26	ENSGT00390000011270	ENSGT00390000001960 #28	ENSGT00940000157390 #29	ENSGT00940000159171	ENSGT00940000159967	ENSGT00550000074815	ENSGT00940000157359	ENSGT00550000074910	ENSGT00390000005794	ENSGT00940000157560.e	ENSGT00390000004585
Squirrel	MODERN SPECIES	228												PROX1 (ENSSTOG00000026238) #18	SMYD2 (ENSSTOG00000008142) #19	PTPN14 (ENSSTOG00000024270) #20	CENPF (ENSSTOG00000034538) #21	KCNK2 (ENSSTOG00000010156) #22	KCTD3 (ENSSTOG00000005730) #23	USH2A (ENSSTOG00000008983) #24	ESRRG (ENSSTOG00000009493) #25	GPATCH2 (ENSSTOG00000024959) #26	ENSSTOG00000001331 #27	RRP15 (ENSSTOG00000001244) #28	TGFB2 (ENSSTOG00000001250) #29
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	54													ENSUPAG00010008295 #20	CENPF (ENSUPAG00010009384) #21	ENSUPAG00010009433	KCNK2 (ENSUPAG00010009442) #22	KCTD3 (ENSUPAG00010009493) #23	USH2A (ENSUPAG00010009520) #24	ESRRG (ENSUPAG00010009597) #25	GPATCH2 (ENSUPAG00010009619) #26	SPATA17 (ENSUPAG00010009658)	RRP15 (ENSUPAG00010009681) #28	TGFB2 (ENSUPAG00010009688) #29	LYPLAL1 (ENSUPAG00010009729)	SLC30A10 (ENSUPAG00010009741)	EPRS1 (ENSUPAG00010009749)	BPNT1 (ENSUPAG00010009777)	IARS2 (ENSUPAG00010009798)	RAB3GAP2 (ENSUPAG00010009831)	MARK1 (ENSUPAG00010009891)	C1orf115 (ENSUPAG00010009923)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	12	ENSMMMG00000000435	BATF3 (ENSMMMG00000000419)	NSL1 (ENSMMMG00000000394)	TATDN3 (ENSMMMG00000000340)	ENSMMMG00000000314	FLVCR1 (ENSMMMG00000000275)	VASH2 (ENSMMMG00000000245)	ANGEL2 (ENSMMMG00000000181)	ENSMMMG00000000164	RPS6KC1 (ENSMMMG00000000125)	PROX1 (ENSMMMG00000024214) #18	ENSMMMG00000024213 #19	PTPN14 (ENSMMMG00000024212) #20	CENPF (ENSMMMG00000024211) #21	ENSMMMG00000024210	KCNK2 (ENSMMMG00000024209) #22	KCTD3 (ENSMMMG00000024208) #23	USH2A (ENSMMMG00000024206) #24	ESRRG (ENSMMMG00000024205) #25	ENSMMMG00000024203	GPATCH2 (ENSMMMG00000024202) #26	SPATA17 (ENSMMMG00000024201)	RRP15 (ENSMMMG00000024199) #28	TGFB2 (ENSMMMG00000024197) #29	LYPLAL1 (ENSMMMG00000024196)	SLC30A10 (ENSMMMG00000024195)	EPRS1 (ENSMMMG00000024193)	BPNT1 (ENSMMMG00000024192)	ENSMMMG00000024191	IARS2 (ENSMMMG00000024190)	RAB3GAP2 (ENSMMMG00000024188)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	3	BATF3 (ENSSVLG00005016663)	NSL1 (ENSSVLG00005016609)	ENSSVLG00005016573	TATDN3 (ENSSVLG00005016168)	SPATA45 (ENSSVLG00005016084)	ENSSVLG00005016057	FLVCR1 (ENSSVLG00005015972)	VASH2 (ENSSVLG00005015835)	ANGEL2 (ENSSVLG00005015787)	RPS6KC1 (ENSSVLG00005015251)	PROX1 (ENSSVLG00005015139) #18	SMYD2 (ENSSVLG00005014781) #19	PTPN14 (ENSSVLG00005014690) #20	CENPF (ENSSVLG00005014494) #21	ENSSVLG00005014446	KCNK2 (ENSSVLG00005014267) #22	KCTD3 (ENSSVLG00005014023) #23	ENSSVLG00005021878	USH2A (ENSSVLG00005020592) #24	ESRRG (ENSSVLG00005020291) #25	ENSSVLG00005020247	GPATCH2 (ENSSVLG00005020165) #26	SPATA17 (ENSSVLG00005020029)	ENSSVLG00005019966	RRP15 (ENSSVLG00005019888) #28	TGFB2 (ENSSVLG00005019711) #29	LYPLAL1 (ENSSVLG00005019579)	ENSSVLG00005019505	SLC30A10 (ENSSVLG00005019457)	EPRS1 (ENSSVLG00005019363)	BPNT1 (ENSSVLG00005019226)