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Mouse	DUPLICATION
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Steppe mouse	MODERN SPECIES	3211														Ezr (ENSMSIG00000014644) #26	Sytl3 (ENSMSIG00000014687) #25	ENSMSIG00000014712 #24	Tmem181a (ENSMSIG00000014774) #20	Tulp4 (ENSMSIG00000014861) #19	Gtf2h5 (ENSMSIG00000014886) #18	Serac1 (ENSMSIG00000014904) #17	Synj2 (ENSMSIG00000015028) #16	Snx9 (ENSMSIG00000015240) #15	Zdhhc14 (ENSMSIG00000015288) #14	ENSMSIG00000015308	Tmem242 (ENSMSIG00000015329) #12	Arid1b (ENSMSIG00000015417) #11	ENSMSIG00000015661	ENSMSIG00000015702
Ryukyu mouse	DUPLICATION
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	8	Mrgprh (MGP_CAROLIEiJ_G0021046)	Pnldc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021045)	Mrpl18 (MGP_CAROLIEiJ_G0021044)	Tcp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021043)	MGP_CAROLIEiJ_G0021042	MGP_CAROLIEiJ_G0021041	MGP_CAROLIEiJ_G0021040	Sod2 (MGP_CAROLIEiJ_G0021039)	Fndc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021038) #36	MGP_CAROLIEiJ_G0021037 #37	MGP_CAROLIEiJ_G0021036 #27	MGP_CAROLIEiJ_G0021035 #27	Ezr (MGP_CAROLIEiJ_G0021034) #26	Sytl3 (MGP_CAROLIEiJ_G0021033) #25	MGP_CAROLIEiJ_G0021032 #24	MGP_CAROLIEiJ_G0021031 #24	Tmem181a (MGP_CAROLIEiJ_G0021030) #20	Tulp4 (MGP_CAROLIEiJ_G0021029) #19	Gtf2h5 (MGP_CAROLIEiJ_G0021028) #18	Serac1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021027) #17	Synj2 (MGP_CAROLIEiJ_G0021026) #16	Snx9 (MGP_CAROLIEiJ_G0021025) #15	Zdhhc14 (MGP_CAROLIEiJ_G0021024) #14	Ldhal6b (MGP_CAROLIEiJ_G0021023) #13	Tmem242 (MGP_CAROLIEiJ_G0021022) #12	Arid1b (MGP_CAROLIEiJ_G0021021) #11	Nox3 (MGP_CAROLIEiJ_G0021020) #10	MGP_CAROLIEiJ_G0021019	Tfb1m (MGP_CAROLIEiJ_G0021018) #9	Tiam2 (MGP_CAROLIEiJ_G0021017) #8	Scaf8 (MGP_CAROLIEiJ_G0021016) #7
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	8	Mas1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021047)	Mrgprh (MGP_CAROLIEiJ_G0021046)	Pnldc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021045)	Mrpl18 (MGP_CAROLIEiJ_G0021044)	Tcp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021043)	MGP_CAROLIEiJ_G0021042	MGP_CAROLIEiJ_G0021041	MGP_CAROLIEiJ_G0021040	Sod2 (MGP_CAROLIEiJ_G0021039)	Fndc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021038) #36	MGP_CAROLIEiJ_G0021037 #37	MGP_CAROLIEiJ_G0021036 #27	MGP_CAROLIEiJ_G0021035 #27	Ezr (MGP_CAROLIEiJ_G0021034) #26	Sytl3 (MGP_CAROLIEiJ_G0021033) #25	MGP_CAROLIEiJ_G0021032 #24	MGP_CAROLIEiJ_G0021031 #24	Tmem181a (MGP_CAROLIEiJ_G0021030) #20	Tulp4 (MGP_CAROLIEiJ_G0021029) #19	Gtf2h5 (MGP_CAROLIEiJ_G0021028) #18	Serac1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021027) #17	Synj2 (MGP_CAROLIEiJ_G0021026) #16	Snx9 (MGP_CAROLIEiJ_G0021025) #15	Zdhhc14 (MGP_CAROLIEiJ_G0021024) #14	Ldhal6b (MGP_CAROLIEiJ_G0021023) #13	Tmem242 (MGP_CAROLIEiJ_G0021022) #12	Arid1b (MGP_CAROLIEiJ_G0021021) #11	Nox3 (MGP_CAROLIEiJ_G0021020) #10	MGP_CAROLIEiJ_G0021019	Tfb1m (MGP_CAROLIEiJ_G0021018) #9	Tiam2 (MGP_CAROLIEiJ_G0021017) #8
Rat	MODERN SPECIES		Igf2r (ENSRNOG00000014997)	Mas1 (ENSRNOG00000014971)	Pnldc1 (ENSRNOG00000023140)	Mrpl18 (ENSRNOG00000014582)	Tcp1 (ENSRNOG00000014160)	ENSRNOG00000069754	Acat2l1 (ENSRNOG00000013975)	Acat2 (ENSRNOG00000019189)	Wtap (ENSRNOG00000019091)	Sod2 (ENSRNOG00000019048)	Fndc1 (ENSRNOG00000030210) #36	Tagap (ENSRNOG00000018915) #37	Rsph3 (ENSRNOG00000018762) #27	Ezr (ENSRNOG00000018524) #26	Sytl3 (ENSRNOG00000018321) #25	Dynlt1 (ENSRNOG00000018207) #24	Tmem181 (ENSRNOG00000018158) #20	Tulp4 (ENSRNOG00000018012) #19	Gtf2h5 (ENSRNOG00000018007) #18	Serac1 (ENSRNOG00000017889) #17	Synj2 (ENSRNOG00000017114) #16	Snx9 (ENSRNOG00000046874) #15	Zdhhc14 (ENSRNOG00000029049) #14	Tmem242 (ENSRNOG00000016973) #12	Ldhal6b (ENSRNOG00000062741) #13	Arid1b (ENSRNOG00000017030) #11	ENSRNOG00000064039	Nox3 (ENSRNOG00000016490) #10	Cldn20 (ENSRNOG00000023531)	Tfb1m (ENSRNOG00000056223) #9	Tiam2 (ENSRNOG00000016728) #8
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000155089	ENSGT00940000162065	ENSGT00390000013943	ENSGT01030000234639.A.a	ENSGT00940000153167.A.a	ENSGT00390000006394	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931.a.b.b	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B #36	ENSGT00940000157993 #37	ENSGT00390000004172 #27	ENSGT01090000260082.d.b #26	ENSGT00940000160610 #25	ENSGT00940000154531 #24	ENSGT00390000007183 #20	ENSGT00940000155913 #19	ENSGT00390000004028 #18	ENSGT00390000003560 #17	ENSGT00940000160715 #16	ENSGT00940000156557 #15	ENSGT00940000156483 #14	ENSGT00390000008642 #12	ENSGT00940000155634 #11	ENSGT00940000160501 #10	ENSGT00940000161252	ENSGT00950000183142.a.b.a.a #9	ENSGT00940000157012 #8	ENSGT00530000063946.b #7	ENSGT00940000154428.a
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Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	1	Slc22a1 (ENSCGRG00001023484)	Igf2r (ENSCGRG00001022921)	Mas1 (ENSCGRG00001007652)	ENSCGRG00001007470	Mrpl18 (ENSCGRG00001010667)	TCP1 (ENSCGRG00001007629)	ENSCGRG00001024850	ENSCGRG00001024790	Wtap (ENSCGRG00001003444)	Sod2 (ENSCGRG00001001155)	Fndc1 (ENSCGRG00001004306) #36	ENSCGRG00001002978 #37	ENSCGRG00001023672 #27	Ezr (ENSCGRG00001022444) #26	Sytl3 (ENSCGRG00001021896) #25	ENSCGRG00001024351 #24	Tmem181a (ENSCGRG00001020931) #20	Tulp4 (ENSCGRG00001020408) #19	ENSCGRG00001013373 #18	Serac1 (ENSCGRG00001012521) #17	ENSCGRG00001008515	Synj2 (ENSCGRG00001004257) #16	Snx9 (ENSCGRG00001001484) #15	Zdhhc14 (ENSCGRG00001000563) #14	Tmem242 (ENSCGRG00001024838) #12	Arid1b (ENSCGRG00001024894) #11	Nox3 (ENSCGRG00001023896) #10	ENSCGRG00001008208	Tfb1m (ENSCGRG00001022866) #9	Tiam2 (ENSCGRG00001023036) #8	Scaf8 (ENSCGRG00001020167) #7
Golden Hamster	DUPLICATION
Golden Hamster	MODERN SPECIES	621	Slc22a2 (ENSMAUG00000011397)	Slc22a1 (ENSMAUG00000011380)	Igf2r (ENSMAUG00000007863)	Mas1 (ENSMAUG00000007870)	Mrgprh (ENSMAUG00000009630)	Pnldc1 (ENSMAUG00000012298)	Mrpl18 (ENSMAUG00000007294)	ENSMAUG00000013742	Wtap (ENSMAUG00000020468)	Sod2 (ENSMAUG00000021246)	Fndc1 (ENSMAUG00000002546) #36	ENSMAUG00000019048 #37	ENSMAUG00000011046 #27	Ezr (ENSMAUG00000007375) #26	Sytl3 (ENSMAUG00000013851) #25	ENSMAUG00000021387 #24	ENSMAUG00000018890 #20	Tulp4 (ENSMAUG00000003623) #19	Gtf2h5 (ENSMAUG00000021477) #18	Serac1 (ENSMAUG00000004954) #17	Synj2 (ENSMAUG00000022212) #16	Snx9 (ENSMAUG00000010656) #15	Zdhhc14 (ENSMAUG00000018645) #14	Tmem242 (ENSMAUG00000006231) #12	Arid1b (ENSMAUG00000017697) #11	ENSMAUG00000015104	Nox3 (ENSMAUG00000013920) #10	ENSMAUG00000009291	Tfb1m (ENSMAUG00000006705) #9	Tiam2 (ENSMAUG00000016491) #8	Scaf8 (ENSMAUG00000009513) #7
Golden Hamster	MODERN SPECIES	684	Pex12 (ENSMAUG00000004768)	Ap2b1 (ENSMAUG00000021295)	Rasl10b (ENSMAUG00000011536)	Gas2l2 (ENSMAUG00000001264)	ENSMAUG00000018386	Heatr9 (ENSMAUG00000019408)	Ccl5 (ENSMAUG00000000781)	ENSMAUG00000021412	ENSMAUG00000015635	Ccl3 (ENSMAUG00000021167)	Ccl4 (ENSMAUG00000020742)	ENSMAUG00000009975	Wfdc21 (ENSMAUG00000018673)	Heatr6 (ENSMAUG00000009627)	Hnf1b (ENSMAUG00000009573)	ENSMAUG00000007943 #24	Ddx52 (ENSMAUG00000021084)	Synrg (ENSMAUG00000015507)	Dusp14 (ENSMAUG00000015817)	Tada2a (ENSMAUG00000009253)	Gm11437 (ENSMAUG00000013814)	Acaca (ENSMAUG00000017414)	Aatf (ENSMAUG00000004548)	Lhx1 (ENSMAUG00000003621)	Mrm1 (ENSMAUG00000020976)	Dhrs11 (ENSMAUG00000011459)	Ggnbp2 (ENSMAUG00000020953)	Pigw (ENSMAUG00000022126)	Myo19 (ENSMAUG00000008695)	Znhit3 (ENSMAUG00000015879)	Car4 (ENSMAUG00000008867)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000155089	ENSGT00940000162065	ENSGT00390000013943	ENSGT01030000234639.A.a	ENSGT00940000153167.A.a	ENSGT00390000006394	ENSGT00550000074878	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00390000013931.a.b.b	ENSGT00390000011877	ENSGT00530000063558.B #36	ENSGT00940000157993 #37	ENSGT00390000004172 #27	ENSGT01090000260082.d.b #26	ENSGT00940000160610 #25	ENSGT00940000154531 #24	ENSGT00390000007183 #20	ENSGT00940000155913 #19	ENSGT00390000004028 #18	ENSGT00390000003560 #17	ENSGT00940000160715 #16	ENSGT00940000156557 #15	ENSGT00940000156483 #14	ENSGT00390000008642 #12	ENSGT00940000155634 #11	ENSGT00940000160501 #10	ENSGT00950000183142.a.b.a.a #9	ENSGT00940000161252	ENSGT00940000157012 #8	ENSGT00530000063946.b #7	ENSGT00940000154428.a
Prairie vole	MODERN SPECIES	358	Slc22a2 (ENSMOCG00000000432)	Slc22a1 (ENSMOCG00000006138)	Igf2r (ENSMOCG00000016653)	Mas1 (ENSMOCG00000012154)	Pnldc1 (ENSMOCG00000014287)	Mrpl18 (ENSMOCG00000016680)	Tcp1 (ENSMOCG00000020265)	ENSMOCG00000000514	ENSMOCG00000016415	Wtap (ENSMOCG00000015976)	Sod2 (ENSMOCG00000021263)	Fndc1 (ENSMOCG00000009408) #36	ENSMOCG00000018649 #27	Ezr (ENSMOCG00000016414) #26	Sytl3 (ENSMOCG00000014797) #25	ENSMOCG00000011752 #24	ENSMOCG00000013123 #20	Tulp4 (ENSMOCG00000020984) #19	Gtf2h5 (ENSMOCG00000000992) #18	Serac1 (ENSMOCG00000006727) #17	Synj2 (ENSMOCG00000020054) #16	Snx9 (ENSMOCG00000021777) #15	Zdhhc14 (ENSMOCG00000010952) #14	Tmem242 (ENSMOCG00000011673) #12	Arid1b (ENSMOCG00000017619) #11	Nox3 (ENSMOCG00000002324) #10	Tfb1m (ENSMOCG00000013879) #9	ENSMOCG00000017009	Tiam2 (ENSMOCG00000019544) #8	Scaf8 (ENSMOCG00000014950) #7	Cnksr3 (ENSMOCG00000020668)
Northern American deer mouse	DUPLICATION
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	7	Slc22a1 (ENSPEMG00000013645)	Igf2r (ENSPEMG00000016189)	Mas1 (ENSPEMG00000014302)	Pnldc1 (ENSPEMG00000016301)	Mrpl18 (ENSPEMG00000016836)	Tcp1 (ENSPEMG00000012176)	ENSPEMG00000002107	ENSPEMG00000017398	Wtap (ENSPEMG00000013632)	Sod2 (ENSPEMG00000013472)	Fndc1 (ENSPEMG00000016047) #36	ENSPEMG00000010143 #37	ENSPEMG00000009961 #27	Ezr (ENSPEMG00000008621) #26	Sytl3 (ENSPEMG00000014143) #25	ENSPEMG00000018532 #24	Tmem181a (ENSPEMG00000000341) #20	Tulp4 (ENSPEMG00000018536) #19	Gtf2h5 (ENSPEMG00000031016) #18	Serac1 (ENSPEMG00000010226) #17	Synj2 (ENSPEMG00000006247) #16	Snx9 (ENSPEMG00000018518) #15	Zdhhc14 (ENSPEMG00000019121) #14	Tmem242 (ENSPEMG00000016796) #12	Arid1b (ENSPEMG00000008950) #11	ENSPEMG00000014483	Nox3 (ENSPEMG00000010502) #10	ENSPEMG00000030418	Tfb1m (ENSPEMG00000010410) #9	Tiam2 (ENSPEMG00000019186) #8	Scaf8 (ENSPEMG00000010531) #7
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Upper Galilee mountains blind mole rat	DUPLICATION
Upper Galilee mountains blind mole rat	DUPLICATION
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1204	Dynll2 (ENSNGAG00000003951)	ENSNGAG00000000438	ENSNGAG00000015128	ENSNGAG00000015171	ENSNGAG00000017359	Epx (ENSNGAG00000001342)	Mks1 (ENSNGAG00000014826)	Lpo (ENSNGAG00000020233)	Mpo (ENSNGAG00000016937)	Tspoap1 (ENSNGAG00000001773)	ENSNGAG00000015537	Rnf43 (ENSNGAG00000005341)	Hsf5 (ENSNGAG00000014434)	ENSNGAG00000019510	ENSNGAG00000000527	ENSNGAG00000015801 #24	Tex14 (ENSNGAG00000014872)	Rad51c (ENSNGAG00000001439)	Ppm1e (ENSNGAG00000019128)	Trim37 (ENSNGAG00000020537)	Ska2 (ENSNGAG00000016177)	Prr11 (ENSNGAG00000000634)	Smg8 (ENSNGAG00000021241)	Gdpd1 (ENSNGAG00000020744)	Ypel2 (ENSNGAG00000018925)	ENSNGAG00000013032	Dhx40 (ENSNGAG00000014507)	Cltc (ENSNGAG00000001753)	Ptrh2 (ENSNGAG00000011147)	Vmp1 (ENSNGAG00000001666)	Tubd1 (ENSNGAG00000017771)
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Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	442													ENSNGAG00000005290 #27	Ezr (ENSNGAG00000003841) #26	Sytl3 (ENSNGAG00000012991) #25	ENSNGAG00000012619 #24	Tmem181a (ENSNGAG00000012098) #20	Tulp4 (ENSNGAG00000011546) #19	Gtf2h5 (ENSNGAG00000010817) #18	Serac1 (ENSNGAG00000010541) #17	Synj2 (ENSNGAG00000014859) #16	Snx9 (ENSNGAG00000015159) #15	Zdhhc14 (ENSNGAG00000016263) #14	Tmem242 (ENSNGAG00000015815) #12	Arid1b (ENSNGAG00000008587) #11	Nox3 (ENSNGAG00000016148) #10	ENSNGAG00000015193	Tfb1m (ENSNGAG00000015154) #9	Tiam2 (ENSNGAG00000012569) #8