Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000013931.a.a.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B #16 ENSGT00940000157993 #17 ENSGT00390000004172 #18 ENSGT01090000260082.d.b #20 ENSGT00940000160610 #21 ENSGT00940000154531 #22 ENSGT00390000007183 #24 ENSGT00940000155913 #25 ENSGT00390000004028 ENSGT00390000003560 ENSGT00940000160715 ENSGT00940000156557 ENSGT00940000156483 ENSGT00390000008642 ENSGT00940000163242.b ENSGT00940000155634 ENSGT00940000160501 ENSGT00940000161252 ENSGT00950000183142.a.b.a.a ENSGT00940000157012 ENSGT00530000063946.b Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000013931.a.a.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B #16 ENSGT00940000157993 #17 ENSGT00390000004172 #18 ENSGT01090000260082.d.b #20 ENSGT00940000160610 #21 ENSGT00940000154531 #22 ENSGT00390000007183 #24 ENSGT00940000155913 #25 ENSGT00390000004028 ENSGT00390000003560 ENSGT00940000160715 ENSGT00940000156557 ENSGT00940000156483 ENSGT00390000008642 ENSGT00940000163242.b ENSGT00940000155634 ENSGT00940000160501 ENSGT00940000161252 ENSGT00950000183142.a.b.a.a ENSGT00940000157012 ENSGT00530000063946.b Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000013931.a.a.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B #16 ENSGT00940000157993 #17 ENSGT00390000004172 #18 ENSGT01090000260082.d.b #20 ENSGT00940000160610 #21 ENSGT00940000154531 #22 ENSGT00390000007183 #24 ENSGT00940000155913 #25 ENSGT00390000004028 ENSGT00390000003560 ENSGT00940000160715 ENSGT00940000156557 ENSGT00940000156483 ENSGT00390000008642 ENSGT00940000163242.b ENSGT00940000155634 ENSGT00940000160501 ENSGT00940000161252 ENSGT00950000183142.a.b.a.a ENSGT00940000157012 ENSGT00530000063946.b Cetacea DUPLICATION Cetacea DUPLICATION Cetacea ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00390000017281.j ENSGT00530000063558.B #16 ENSGT00940000157993 #17 ENSGT00390000004172 #18 ENSGT01090000260082.d.b #20 ENSGT00940000160610 #21 ENSGT00940000154531.k.b #22 ENSGT00390000007183 #24 ENSGT01010000229882 ENSGT00940000155913 #25 ENSGT00390000004028 ENSGT00390000003560 ENSGT00940000160715 ENSGT00940000156557 ENSGT00940000156483 ENSGT00390000008642 ENSGT00940000163242.b ENSGT00940000155634 ENSGT00940000160501 ENSGT00940000161252 ENSGT00950000183142.a.b.a.a ENSGT00940000157012 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00390000017281.j ENSGT00530000063558.B #16 ENSGT00940000157993 #17 ENSGT00390000004172 #18 ENSGT01090000260082.d.b #20 ENSGT00940000160610 #21 ENSGT00940000154531.k.b #22 ENSGT00390000007183 #24 ENSGT01010000229882 ENSGT00940000155913 #25 ENSGT00390000004028 ENSGT00390000003560 ENSGT00940000160715 ENSGT00940000156557 ENSGT00940000156483 ENSGT00390000008642 ENSGT00940000163242.b ENSGT00940000155634 ENSGT00940000160501 ENSGT00940000161252 ENSGT00950000183142.a.b.a.a ENSGT00940000157012 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00390000017281.j ENSGT00530000063558.B #16 ENSGT00940000157993 #17 ENSGT00390000004172 #18 ENSGT01090000260082.d.b #20 ENSGT00940000160610 #21 ENSGT00940000154531.k.b #22 ENSGT00390000007183 #24 ENSGT01010000229882 ENSGT00940000155913 #25 ENSGT00390000004028 ENSGT00390000003560 ENSGT00940000160715 ENSGT00940000156557 ENSGT00940000156483 ENSGT00390000008642 ENSGT00940000163242.b ENSGT00940000155634 ENSGT00940000160501 ENSGT00940000161252 ENSGT00950000183142.a.b.a.a.e ENSGT00940000157012 Dolphin MODERN SPECIES 253 FNDC1 (ENSTTRG00000011353) #16 TAGAP (ENSTTRG00000011352) #17 ENSTTRG00000011351 #18 ENSTTRG00000011350 #19 EZR (ENSTTRG00000011346) #20 SYTL3 (ENSTTRG00000011341) #21 DYNLT1 (ENSTTRG00000011340) #22 ENSTTRG00000011339 #23 TMEM181 (ENSTTRG00000011328) #24 TULP4 (ENSTTRG00000011314) #25 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00390000017281.j ENSGT00530000063558.B #16 ENSGT00940000157993 #17 ENSGT00390000004172 #18 ENSGT01090000260082.d.b #20 ENSGT00940000160610 #21 ENSGT00940000154531.k.b #22 ENSGT00390000007183 #24 ENSGT01010000229882 ENSGT00940000155913 #25 ENSGT00390000004028 ENSGT00390000003560 ENSGT00940000160715 ENSGT00940000156557 ENSGT00940000156483 ENSGT00390000008642 ENSGT00940000163242.b ENSGT00940000155634 ENSGT00940000160501 ENSGT00940000161252 ENSGT00950000183142.a.b.a.a.e ENSGT00940000157012 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00390000017281.j ENSGT00530000063558.B #16 ENSGT00940000157993 #17 ENSGT00390000004172 #18 ENSGT01090000260082.d.b #20 ENSGT00940000160610 #21 ENSGT00940000154531.k.b #22 ENSGT00390000007183 #24 ENSGT01010000229882 ENSGT00940000155913 #25 ENSGT00390000004028 ENSGT00390000003560 ENSGT00940000160715 ENSGT00940000156557 ENSGT00940000156483 ENSGT00390000008642 ENSGT00940000163242.b ENSGT00940000155634 ENSGT00940000160501 ENSGT00940000161252 ENSGT00950000183142.a.b.a.a.e ENSGT00940000157012 Beluga whale MODERN SPECIES 80 SLC22A1 (ENSDLEG00000013591) IGF2R (ENSDLEG00000013373) MAS1 (ENSDLEG00000013351) PNLDC1 (ENSDLEG00000013298) MRPL18 (ENSDLEG00000013282) TCP1 (ENSDLEG00000013249) ACAT2 (ENSDLEG00000013224) WTAP (ENSDLEG00000013205) SOD2 (ENSDLEG00000013188) ENSDLEG00000013163 ENSDLEG00000013131 #16 TAGAP (ENSDLEG00000013116) #17 RSPH3 (ENSDLEG00000013000) #18 EZR (ENSDLEG00000012951) #20 SYTL3 (ENSDLEG00000012934) #21 DYNLT1 (ENSDLEG00000012925) #22 TMEM181 (ENSDLEG00000012897) #24 TULP4 (ENSDLEG00000012862) #25 GTF2H5 (ENSDLEG00000012851) SERAC1 (ENSDLEG00000012822) SYNJ2 (ENSDLEG00000012744) SNX9 (ENSDLEG00000012695) ZDHHC14 (ENSDLEG00000012658) ENSDLEG00000012649 TMEM242 (ENSDLEG00000012634) ARID1B (ENSDLEG00000012513) NOX3 (ENSDLEG00000012479) CLDN20 (ENSDLEG00000012472) TFB1M (ENSDLEG00000012467) TIAM2 (ENSDLEG00000012451) SCAF8 (ENSDLEG00000012389) Narwhal MODERN SPECIES 301 SLC22A1 (ENSMMNG00015011429) IGF2R (ENSMMNG00015011406) MAS1 (ENSMMNG00015011391) PNLDC1 (ENSMMNG00015011367) MRPL18 (ENSMMNG00015011349) TCP1 (ENSMMNG00015011321) ACAT2 (ENSMMNG00015011293) WTAP (ENSMMNG00015011260) SOD2 (ENSMMNG00015011230) ENSMMNG00015011212 FNDC1 (ENSMMNG00015011181) #16 TAGAP (ENSMMNG00015011155) #17 RSPH3 (ENSMMNG00015011129) #18 EZR (ENSMMNG00015011090) #20 SYTL3 (ENSMMNG00015011069) #21 ENSMMNG00015011048 #22 TMEM181 (ENSMMNG00015011008) #24 ENSMMNG00015010987 TULP4 (ENSMMNG00015010941) #25 GTF2H5 (ENSMMNG00015010910) SERAC1 (ENSMMNG00015010803) SYNJ2 (ENSMMNG00015010674) ENSMMNG00015010636 SNX9 (ENSMMNG00015010588) ZDHHC14 (ENSMMNG00015010553) ENSMMNG00015010533 TMEM242 (ENSMMNG00015010509) ARID1B (ENSMMNG00015010328) NOX3 (ENSMMNG00015010259) CLDN20 (ENSMMNG00015010248) ENSMMNG00015010231 Vaquita MODERN SPECIES 3 ENSPSNG00000017517 IGF2R (ENSPSNG00000017592) MAS1 (ENSPSNG00000017797) PNLDC1 (ENSPSNG00000017839) MRPL18 (ENSPSNG00000018155) TCP1 (ENSPSNG00000018222) ACAT2 (ENSPSNG00000018304) WTAP (ENSPSNG00000018363) SOD2 (ENSPSNG00000018468) ENSPSNG00000018560 FNDC1 (ENSPSNG00000018682) #16 TAGAP (ENSPSNG00000018854) #17 RSPH3 (ENSPSNG00000019104) #18 EZR (ENSPSNG00000019386) #20 SYTL3 (ENSPSNG00000019533) #21 ENSPSNG00000019724 #22 TMEM181 (ENSPSNG00000019785) #24 TULP4 (ENSPSNG00000019944) #25 GTF2H5 (ENSPSNG00000020011) SERAC1 (ENSPSNG00000020095) SYNJ2 (ENSPSNG00000020311) ENSPSNG00000020609 SNX9 (ENSPSNG00000020632) ZDHHC14 (ENSPSNG00000020697) TMEM242 (ENSPSNG00000020809) ENSPSNG00000020849 ARID1B (ENSPSNG00000021058) NOX3 (ENSPSNG00000021516) ENSPSNG00000021564 CLDN20 (ENSPSNG00000021584) TIAM2 (ENSPSNG00000021646) Blue whale MODERN SPECIES 3 ENSBMSG00010010858 IGF2R (ENSBMSG00010010889) MAS1 (ENSBMSG00010010947) PNLDC1 (ENSBMSG00010010984) MRPL18 (ENSBMSG00010011042) TCP1 (ENSBMSG00010011064) ACAT2 (ENSBMSG00010011102) ENSBMSG00010011125 ENSBMSG00010011159 ENSBMSG00010011186 FNDC1 (ENSBMSG00010011227) #16 TAGAP (ENSBMSG00010011351) #17 RSPH3 (ENSBMSG00010011388) #18 EZR (ENSBMSG00010011421) #20 SYTL3 (ENSBMSG00010011475) #21 ENSBMSG00010011520 #22 TMEM181 (ENSBMSG00010011555) #24 ENSBMSG00010011592 TULP4 (ENSBMSG00010011601) #25 GTF2H5 (ENSBMSG00010011624) SERAC1 (ENSBMSG00010011654) SYNJ2 (ENSBMSG00010011701) ENSBMSG00010011748 SNX9 (ENSBMSG00010011766) ZDHHC14 (ENSBMSG00010011784) TMEM242 (ENSBMSG00010011795) ARID1B (ENSBMSG00010011869) NOX3 (ENSBMSG00010008478) TFB1M (ENSBMSG00010008513) CLDN20 (ENSBMSG00010008525) TIAM2 (ENSBMSG00010008560) Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154531.k.a ##22 Blue whale MODERN SPECIES 12 BHLHA9 (ENSBMSG00010017399) TRARG1 (ENSBMSG00010017380) GOSR1 (ENSBMSG00010017300) CPD (ENSBMSG00010017172) TMIGD1 (ENSBMSG00010017079) ENSBMSG00010017005 SLC6A4 (ENSBMSG00010016971) NSRP1 (ENSBMSG00010016930) EFCAB5 (ENSBMSG00010016863) SSH2 (ENSBMSG00010016655) CORO6 (ENSBMSG00010016595) ANKRD13B (ENSBMSG00010016542) GIT1 (ENSBMSG00010016292) TP53I13 (ENSBMSG00010016231) ABHD15 (ENSBMSG00010016208) ENSBMSG00010016195 ##22 TAOK1 (ENSBMSG00010016159) NUFIP2 (ENSBMSG00010016116) CRYBA1 (ENSBMSG00010015770) MYO18A (ENSBMSG00010014109) ENSBMSG00010020510 PIPOX (ENSBMSG00010020496) SEZ6 (ENSBMSG00010020370) PHF12 (ENSBMSG00010020310) DHRS13 (ENSBMSG00010020249) FLOT2 (ENSBMSG00010020206) ERAL1 (ENSBMSG00010020135) FAM222B (ENSBMSG00010020109) TRAF4 (ENSBMSG00010020091) NEK8 (ENSBMSG00010020063) TLCD1 (ENSBMSG00010020017) Odontoceti DUPLICATION Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154531.k.a.a ##22 Sperm whale DUPLICATION Sperm whale MODERN SPECIES 1249 ROGDI (ENSPCTG00005012199) SMIM22 (ENSPCTG00005012256) SEPTIN12 (ENSPCTG00005012376) ENSPCTG00005012772 ##22 ZNF500 (ENSPCTG00005012789) Sperm whale MODERN SPECIES 1 ENSPCTG00005002991 ENSPCTG00005003046 SLC22A3 (ENSPCTG00005003082) ENSPCTG00005003105 SLC22A2 (ENSPCTG00005003126) SLC22A1 (ENSPCTG00005003152) IGF2R (ENSPCTG00005003188) MAS1 (ENSPCTG00005003224) WTAP (ENSPCTG00005003235) SOD2 (ENSPCTG00005003274) FNDC1 (ENSPCTG00005003312) #16 ENSPCTG00005003361 #17 RSPH3 (ENSPCTG00005003392) #18 EZR (ENSPCTG00005003418) #20 SYTL3 (ENSPCTG00005003470) #21 DYNLT1 (ENSPCTG00005003532) ##22 TMEM181 (ENSPCTG00005003562) #24 ENSPCTG00005003602 #25 GTF2H5 (ENSPCTG00005003620) SERAC1 (ENSPCTG00005003673) ENSPCTG00005003749 ENSPCTG00005003781 ENSPCTG00005003788 SNX9 (ENSPCTG00005003806) ZDHHC14 (ENSPCTG00005003841) TMEM242 (ENSPCTG00005003855) ARID1B (ENSPCTG00005003954) NOX3 (ENSPCTG00005004723) TFB1M (ENSPCTG00005004760) CLDN20 (ENSPCTG00005004774) SCAF8 (ENSPCTG00005004842) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000008688 ENSGT00940000156919 ENSGT00510000048311 ENSGT00390000001735 ENSGT00940000157855 ENSGT00940000154049.a ENSGT00940000154049.b ENSGT00940000157430 ENSGT00940000159328 ENSGT00950000182928.A.a.a ENSGT00940000159604 ENSGT00390000008202 ENSGT00950000182902.b.b.a ENSGT01030000235034 ENSGT00940000155796 ENSGT00940000154531.k.a.b ##22 ENSGT00440000038328 ENSGT00940000159685 ENSGT00940000155768.B ENSGT00390000011000 ENSGT00940000156995 ENSGT00940000155713 ENSGT00940000155599 ENSGT00560000077232.B ENSGT00390000013800 ENSGT00530000063811.A ENSGT00940000158628 ENSGT00940000159297 ENSGT01010000222313.B.a ENSGT00950000182901.a.a.b.b.a.b.a.b.a.a.b.a.a ENSGT00940000159645 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000008688 ENSGT00940000156919 ENSGT00510000048311 ENSGT00390000001735 ENSGT00940000157855 ENSGT00940000154049.a ENSGT00940000154049.b ENSGT00940000157430 ENSGT00940000159328 ENSGT00950000182928.A.a.a ENSGT00940000159604 ENSGT00390000008202 ENSGT00950000182902.b.b.a ENSGT01030000235034 ENSGT00940000155796 ENSGT00940000154531.k.a.b ##22 ENSGT00440000038328 ENSGT00940000159685 ENSGT00940000155768.B ENSGT00390000011000 ENSGT00940000156995 ENSGT00940000155713 ENSGT00940000155599 ENSGT00560000077232.B ENSGT00390000013800 ENSGT00530000063811.A ENSGT00940000158628 ENSGT00940000159297 ENSGT01010000222313.B.a ENSGT00950000182901.a.a.b.b.a.b.a.b.a.a.b.a.a ENSGT00940000159645 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000008688 ENSGT00940000156919 ENSGT00510000048311 ENSGT00390000001735 ENSGT00940000157855 ENSGT00940000154049.a ENSGT00940000154049.b ENSGT00940000157430 ENSGT00940000159328 ENSGT00950000182928.A.a.a ENSGT00940000159604 ENSGT00390000008202 ENSGT00950000182902.b.b.a ENSGT01030000235034 ENSGT00940000155796 ENSGT00940000154531.k.a.b ##22 ENSGT00440000038328 ENSGT00940000159685 ENSGT00940000155768.B ENSGT00390000011000 ENSGT00940000156995 ENSGT00940000155713 ENSGT00940000155599 ENSGT00560000077232.B ENSGT00390000013800 ENSGT00530000063811.A ENSGT00940000158628 ENSGT00940000159297 ENSGT01010000222313.B.a ENSGT00950000182901.a.a.b.b.a.b.a.b.a.a.b.a.a ENSGT00940000159645 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000160337 ENSGT00390000008688 ENSGT00940000156919 ENSGT00510000048311 ENSGT00390000001735 ENSGT00940000157855 ENSGT00940000154049.a ENSGT00940000154049.b ENSGT00940000157430 ENSGT00940000159328 ENSGT00950000182928.A.a.a ENSGT00940000159604 ENSGT00390000008202 ENSGT00950000182902.b.b.a ENSGT00940000155796 ENSGT00940000154531.k.a.b ##22 ENSGT00440000038328 ENSGT00940000159685 ENSGT00940000155768.B ENSGT00390000011000 ENSGT00940000156995 ENSGT00940000155713 ENSGT00940000155599 ENSGT00560000077232.B ENSGT00390000013800 ENSGT00530000063811.A ENSGT00940000158628 ENSGT00940000159297 ENSGT01010000222313.B.a ENSGT00950000182901.a.a.b.b.a.b.a.b.a.a.b.a.a ENSGT00940000159645 Beluga whale DUPLICATION Beluga whale MODERN SPECIES 43 ENSDLEG00000007490 TRARG1 (ENSDLEG00000007482) GOSR1 (ENSDLEG00000007474) CPD (ENSDLEG00000007444) TMIGD1 (ENSDLEG00000007433) BLMH (ENSDLEG00000007404) SLC6A4 (ENSDLEG00000007391) NSRP1 (ENSDLEG00000007376) EFCAB5 (ENSDLEG00000007361) SSH2 (ENSDLEG00000007331) CORO6 (ENSDLEG00000007308) ANKRD13B (ENSDLEG00000007262) GIT1 (ENSDLEG00000007196) ENSDLEG00000007165 ABHD15 (ENSDLEG00000007149) ENSDLEG00000007141 ##22 ENSDLEG00000007134 ##22 TAOK1 (ENSDLEG00000007084) NUFIP2 (ENSDLEG00000007051) CRYBA1 (ENSDLEG00000007018) MYO18A (ENSDLEG00000006896) SEZ6 (ENSDLEG00000006863) PIPOX (ENSDLEG00000006845) PHF12 (ENSDLEG00000006781) DHRS13 (ENSDLEG00000006768) FLOT2 (ENSDLEG00000006755) ERAL1 (ENSDLEG00000006733) FAM222B (ENSDLEG00000006727) TRAF4 (ENSDLEG00000006694) TLCD1 (ENSDLEG00000006681) RPL23A (ENSDLEG00000006667) Beluga whale MODERN SPECIES 43 TRARG1 (ENSDLEG00000007482) GOSR1 (ENSDLEG00000007474) CPD (ENSDLEG00000007444) TMIGD1 (ENSDLEG00000007433) BLMH (ENSDLEG00000007404) SLC6A4 (ENSDLEG00000007391) NSRP1 (ENSDLEG00000007376) EFCAB5 (ENSDLEG00000007361) SSH2 (ENSDLEG00000007331) CORO6 (ENSDLEG00000007308) ANKRD13B (ENSDLEG00000007262) GIT1 (ENSDLEG00000007196) ENSDLEG00000007165 ABHD15 (ENSDLEG00000007149) ENSDLEG00000007141 ##22 ENSDLEG00000007134 ##22 TAOK1 (ENSDLEG00000007084) NUFIP2 (ENSDLEG00000007051) CRYBA1 (ENSDLEG00000007018) MYO18A (ENSDLEG00000006896) SEZ6 (ENSDLEG00000006863) PIPOX (ENSDLEG00000006845) PHF12 (ENSDLEG00000006781) DHRS13 (ENSDLEG00000006768) FLOT2 (ENSDLEG00000006755) ERAL1 (ENSDLEG00000006733) FAM222B (ENSDLEG00000006727) TRAF4 (ENSDLEG00000006694) TLCD1 (ENSDLEG00000006681) RPL23A (ENSDLEG00000006667) RAB34 (ENSDLEG00000006639) Narwhal MODERN SPECIES 316 TRARG1 (ENSMMNG00015021641) GOSR1 (ENSMMNG00015021652) CPD (ENSMMNG00015021681) TMIGD1 (ENSMMNG00015021706) BLMH (ENSMMNG00015021724) SLC6A4 (ENSMMNG00015015795) NSRP1 (ENSMMNG00015015859) EFCAB5 (ENSMMNG00015015923) SSH2 (ENSMMNG00015016017) CORO6 (ENSMMNG00015016225) ANKRD13B (ENSMMNG00015016276) GIT1 (ENSMMNG00015016362) TP53I13 (ENSMMNG00015016436) ABHD15 (ENSMMNG00015016465) TAOK1 (ENSMMNG00015016503) ENSMMNG00015016560 ##22 NUFIP2 (ENSMMNG00015016583) CRYBA1 (ENSMMNG00015016618) MYO18A (ENSMMNG00015016717) PIPOX (ENSMMNG00015017049) SEZ6 (ENSMMNG00015017109) PHF12 (ENSMMNG00015017343) DHRS13 (ENSMMNG00015017428) FLOT2 (ENSMMNG00015017510) ERAL1 (ENSMMNG00015017664) FAM222B (ENSMMNG00015017713) TRAF4 (ENSMMNG00015017744) NEK8 (ENSMMNG00015017818) TLCD1 (ENSMMNG00015017862) ENSMMNG00015017898 RAB34 (ENSMMNG00015018033) Vaquita MODERN SPECIES 12 GOSR1 (ENSPSNG00000022335) CPD (ENSPSNG00000022352) TMIGD1 (ENSPSNG00000022377) BLMH (ENSPSNG00000022379) SLC6A4 (ENSPSNG00000022384) NSRP1 (ENSPSNG00000022390) EFCAB5 (ENSPSNG00000022405) SSH2 (ENSPSNG00000013352) CORO6 (ENSPSNG00000013564) ANKRD13B (ENSPSNG00000013650) GIT1 (ENSPSNG00000013740) TP53I13 (ENSPSNG00000013922) ABHD15 (ENSPSNG00000014014) ENSPSNG00000014062 TAOK1 (ENSPSNG00000014127) ENSPSNG00000014235 ##22 NUFIP2 (ENSPSNG00000014306) CRYBA1 (ENSPSNG00000014388) MYO18A (ENSPSNG00000014591) PIPOX (ENSPSNG00000015048) SEZ6 (ENSPSNG00000015182) PHF12 (ENSPSNG00000015819) DHRS13 (ENSPSNG00000015979) FLOT2 (ENSPSNG00000016100) ERAL1 (ENSPSNG00000016280) FAM222B (ENSPSNG00000016332) TRAF4 (ENSPSNG00000016406) NEK8 (ENSPSNG00000016500) TLCD1 (ENSPSNG00000016583) ENSPSNG00000016697 RAB34 (ENSPSNG00000016872) Sperm whale MODERN SPECIES 5 TIMM22 (ENSPCTG00005007258) ABR (ENSPCTG00005007316) BHLHA9 (ENSPCTG00005007536) TRARG1 (ENSPCTG00005007551) GOSR1 (ENSPCTG00005007581) CPD (ENSPCTG00005007651) TMIGD1 (ENSPCTG00005007791) BLMH (ENSPCTG00005007833) SLC6A4 (ENSPCTG00005007871) NSRP1 (ENSPCTG00005007913) SSH2 (ENSPCTG00005007991) CORO6 (ENSPCTG00005008092) ANKRD13B (ENSPCTG00005008122) ABHD15 (ENSPCTG00005008187) TAOK1 (ENSPCTG00005008207) ENSPCTG00005008270 ##22 NUFIP2 (ENSPCTG00005008302) CRYBA1 (ENSPCTG00005008325) ENSPCTG00005008427 PHF12 (ENSPCTG00005009244) FLOT2 (ENSPCTG00005009525) ERAL1 (ENSPCTG00005009863) FAM222B (ENSPCTG00005009934) SDF2 (ENSPCTG00005009994) ENSPCTG00005010025 ENSPCTG00005010044 FOXN1 (ENSPCTG00005010061) UNC119 (ENSPCTG00005010164) PIGS (ENSPCTG00005010321) ENSPCTG00005010383 TMEM199 (ENSPCTG00005010422) Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154531.l ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154531.l ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154531.l ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00510000048539 ENSGT00390000007560.p ENSGT00390000011615.B ENSGT00940000160685 ENSGT00940000163876 ENSGT00510000047003 ENSGT00390000008647 ENSGT01030000234566.e.a ENSGT00940000160832 ENSGT00940000153578.B ENSGT00940000158857 ENSGT00940000156435 ENSGT00390000007164 ENSGT00770000120884 ENSGT00940000158310 ENSGT00940000154531.l ##22 ENSGT00940000154740.a.b.b ENSGT00390000015381 ENSGT00940000156610 ENSGT00390000016224.j.b ENSGT00390000009925.a ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000157696 ENSGT00390000017673.a ENSGT00940000160872 ENSGT00940000155280 ENSGT00390000013102.e.a.d ENSGT00940000159318 ENSGT00940000156606 ENSGT00390000012037 ENSGT00940000158383 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000007560.p ENSGT00390000011615.B ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.k ENSGT00940000160685 ENSGT00940000163876 ENSGT00510000047003 ENSGT00390000008647 ENSGT01030000234566.e.a ENSGT00940000160832 ENSGT00940000153578.B ENSGT00940000158857 ENSGT00940000156435 ENSGT00390000007164 ENSGT00770000120884 ENSGT00940000158310 ENSGT00940000154531.l ##22 ENSGT00940000154740.a.b.b ENSGT00390000015381 ENSGT00940000156610 ENSGT00390000016224.j.b ENSGT00390000009925.a ENSGT00390000008825.a ENSGT00940000157696 ENSGT00390000017673.a ENSGT00940000160872 ENSGT00940000155280 ENSGT00390000013102.e.a.d ENSGT00940000159318 ENSGT00940000156606 ENSGT00390000012037 ENSGT00940000158383 Beluga whale MODERN SPECIES 48 TMEM114 (ENSDLEG00000015996) ENSDLEG00000015979 ENSDLEG00000015968 RBFOX1 (ENSDLEG00000015877) ENSDLEG00000015860 ENSDLEG00000015842 EEF2KMT (ENSDLEG00000015825) ALG1 (ENSDLEG00000015810) NAGPA (ENSDLEG00000015799) SEC14L5 (ENSDLEG00000015744) PPL (ENSDLEG00000015662) UBN1 (ENSDLEG00000015636) GLYR1 (ENSDLEG00000015608) ROGDI (ENSDLEG00000015583) SEPTIN12 (ENSDLEG00000015556) ENSDLEG00000015548 ##22 ZNF500 (ENSDLEG00000015538) ENSDLEG00000015530 ANKS3 (ENSDLEG00000015511) NUDT16L1 (ENSDLEG00000015504) MGRN1 (ENSDLEG00000015407) UBALD1 (ENSDLEG00000015378) CDIP1 (ENSDLEG00000015367) HMOX2 (ENSDLEG00000015355) NMRAL1 (ENSDLEG00000015344) DNAJA3 (ENSDLEG00000015292) ENSDLEG00000015275 VASN (ENSDLEG00000015267) CORO7 (ENSDLEG00000015185) PAM16 (ENSDLEG00000015139) GLIS2 (ENSDLEG00000015124) Narwhal MODERN SPECIES 299 ENSMMNG00015005035 TMEM114 (ENSMMNG00015005026) ENSMMNG00015005013 RBFOX1 (ENSMMNG00015004838) ENSMMNG00015004798 ENSMMNG00015004793 ENSMMNG00015004785 NAGPA (ENSMMNG00015004776) SEC14L5 (ENSMMNG00015004764) PPL (ENSMMNG00015004753) UBN1 (ENSMMNG00015004730) GLYR1 (ENSMMNG00015004666) ROGDI (ENSMMNG00015004646) SMIM22 (ENSMMNG00015004640) SEPTIN12 (ENSMMNG00015004634) ENSMMNG00015004624 ##22 ZNF500 (ENSMMNG00015004613) DNAAF8 (ENSMMNG00015004600) ANKS3 (ENSMMNG00015009183) NUDT16L1 (ENSMMNG00015009164) MGRN1 (ENSMMNG00015009053) UBALD1 (ENSMMNG00015008992) CDIP1 (ENSMMNG00015008973) HMOX2 (ENSMMNG00015008946) NMRAL1 (ENSMMNG00015008931) DNAJA3 (ENSMMNG00015008893) ENSMMNG00015008878 VASN (ENSMMNG00015008873) CORO7 (ENSMMNG00015008837) PAM16 (ENSMMNG00015008811) GLIS2 (ENSMMNG00015008801) Vaquita MODERN SPECIES 6 METTL22 (ENSPSNG00000010061) TMEM114 (ENSPSNG00000009880) ENSPSNG00000009828 RBFOX1 (ENSPSNG00000009035) ENSPSNG00000008540 ENSPSNG00000008216 ENSPSNG00000008101 NAGPA (ENSPSNG00000008041) SEC14L5 (ENSPSNG00000007927) PPL (ENSPSNG00000007678) UBN1 (ENSPSNG00000007508) GLYR1 (ENSPSNG00000007358) ROGDI (ENSPSNG00000007270) SMIM22 (ENSPSNG00000007204) SEPTIN12 (ENSPSNG00000007088) ENSPSNG00000007035 ##22 ZNF500 (ENSPSNG00000007011) ENSPSNG00000006940 ANKS3 (ENSPSNG00000006816) NUDT16L1 (ENSPSNG00000006720) MGRN1 (ENSPSNG00000006589) UBALD1 (ENSPSNG00000006498) CDIP1 (ENSPSNG00000006450) HMOX2 (ENSPSNG00000006393) NMRAL1 (ENSPSNG00000006343) DNAJA3 (ENSPSNG00000006246) ENSPSNG00000006205 VASN (ENSPSNG00000006188) CORO7 (ENSPSNG00000006145) PAM16 (ENSPSNG00000006075) GLIS2 (ENSPSNG00000006050) Pecora ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000013931.a.a.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B #16 ENSGT00940000157993 #17 ENSGT00390000004172 #18 ENSGT01090000260082.d.b #20 ENSGT00940000160610 #21 ENSGT00940000154531 #22 ENSGT00390000007183 #24 ENSGT00940000155913 #25 ENSGT00390000004028 ENSGT00390000003560 ENSGT00940000160715 ENSGT00940000156557 ENSGT00940000156483 ENSGT00390000008642 ENSGT00940000155634 ENSGT00940000160501 ENSGT00940000161252 ENSGT00950000183142.a.b.a.a ENSGT00940000157012 ENSGT00940000161394.m.a ENSGT00530000063946.b Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES 3 RPS6KL1 (ENSCHYG00000006336) ENSCHYG00000006497 EIF2B2 (ENSCHYG00000006598) MLH3 (ENSCHYG00000006695) ZC2HC1C (ENSCHYG00000006886) NEK9 (ENSCHYG00000006917) TMED10 (ENSCHYG00000007018) FOS (ENSCHYG00000007069) ENSCHYG00000007218 JDP2 (ENSCHYG00000007237) BATF (ENSCHYG00000007278) ENSCHYG00000007326 ENSCHYG00000007628 ENSCHYG00000007651 TTLL5 (ENSCHYG00000007731) ENSCHYG00000008222 #22 TGFB3 (ENSCHYG00000008241) ENSCHYG00000008279 GPATCH2L (ENSCHYG00000008381) ESRRB (ENSCHYG00000008507) VASH1 (ENSCHYG00000008609) ANGEL1 (ENSCHYG00000008773) LRRC74A (ENSCHYG00000008938) IRF2BPL (ENSCHYG00000009093) CIPC (ENSCHYG00000009112) ZDHHC22 (ENSCHYG00000009129) TMEM63C (ENSCHYG00000009168) NGB (ENSCHYG00000009323) POMT2 (ENSCHYG00000009382) ENSCHYG00000009566 TMED8 (ENSCHYG00000009895) Yarkand deer MODERN SPECIES 18 SLC22A1 (ENSCHYG00000025285) IGF2R (ENSCHYG00000023202) MAS1 (ENSCHYG00000022925) PNLDC1 (ENSCHYG00000022800) MRPL18 (ENSCHYG00000022773) TCP1 (ENSCHYG00000022554) ACAT2 (ENSCHYG00000022487) WTAP (ENSCHYG00000022403) ENSCHYG00000022090 FNDC1 (ENSCHYG00000021187) #16 ENSCHYG00000021069 TAGAP (ENSCHYG00000020890) #17 RSPH3 (ENSCHYG00000020694) #18 ENSCHYG00000020511 #20 SYTL3 (ENSCHYG00000020333) #21 ENSCHYG00000020272 #22 ENSCHYG00000020249 TMEM181 (ENSCHYG00000018947) #24 ENSCHYG00000018828 ENSCHYG00000018795 TULP4 (ENSCHYG00000018070) #25 GTF2H5 (ENSCHYG00000017957) SERAC1 (ENSCHYG00000017067) SYNJ2 (ENSCHYG00000016600) SNX9 (ENSCHYG00000016120) ZDHHC14 (ENSCHYG00000015803) TMEM242 (ENSCHYG00000015670) ARID1B (ENSCHYG00000014258) ENSCHYG00000014034 ENSCHYG00000013993 NOX3 (ENSCHYG00000026919) Percora_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000013931.a.a.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B #16 ENSGT00940000157993.k #17 ENSGT00390000004172 #18 ENSGT01090000260082.d.b #20 ENSGT00940000160610 #21 ENSGT00940000154531 #22 ENSGT00390000007183 #24 ENSGT00940000155913 #25 ENSGT00390000004028 ENSGT00390000003560 ENSGT00940000160715 ENSGT00940000156557 ENSGT00940000156483 ENSGT00390000008642 ENSGT00940000155634 ENSGT01010000224193 ENSGT00940000160501 ENSGT00940000161252 ENSGT00950000183142.a.b.a.a ENSGT00940000157012 ENSGT00940000161394.m.a Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer MODERN SPECIES 61 SLC22A1 (ENSMMSG00000002522) IGF2R (ENSMMSG00000002420) MAS1 (ENSMMSG00000002388) PNLDC1 (ENSMMSG00000002313) MRPL18 (ENSMMSG00000002291) TCP1 (ENSMMSG00000002241) ENSMMSG00000002220 WTAP (ENSMMSG00000002177) ENSMMSG00000002137 FNDC1 (ENSMMSG00000002110) #16 ENSMMSG00000002090 TAGAP (ENSMMSG00000002040) #17 RSPH3 (ENSMMSG00000002005) #18 EZR (ENSMMSG00000001963) #20 SYTL3 (ENSMMSG00000001907) #21 ENSMMSG00000001893 #22 TMEM181 (ENSMMSG00000001689) #24 TULP4 (ENSMMSG00000001543) #25 GTF2H5 (ENSMMSG00000001513) SERAC1 (ENSMMSG00000001280) SYNJ2 (ENSMMSG00000001120) SNX9 (ENSMMSG00000001061) ZDHHC14 (ENSMMSG00000001040) TMEM242 (ENSMMSG00000001018) ARID1B (ENSMMSG00000000496) ENSMMSG00000000372 NOX3 (ENSMMSG00000000351) CLDN20 (ENSMMSG00000000336) TFB1M (ENSMMSG00000000321) TIAM2 (ENSMMSG00000000284) Siberian musk deer MODERN SPECIES 114 CALCRL (ENSMMSG00000009333) ZSWIM2 (ENSMMSG00000009259) FAM171B (ENSMMSG00000009227) ITGAV (ENSMMSG00000009104) ZC3H15 (ENSMMSG00000009028) FSIP2 (ENSMMSG00000008943) ENSMMSG00000008905 ZNF804A (ENSMMSG00000008869) ENSMMSG00000008830 ENSMMSG00000008797 ENSMMSG00000008776 NUP35 (ENSMMSG00000008706) DUSP19 (ENSMMSG00000008668) NCKAP1 (ENSMMSG00000008302) FRZB (ENSMMSG00000008223) ENSMMSG00000008197 #22 DNAJC10 (ENSMMSG00000008076) ENSMMSG00000008046 PDE1A (ENSMMSG00000007901) PPP1R1C (ENSMMSG00000007819) ITPRID2 (ENSMMSG00000007531) NEUROD1 (ENSMMSG00000007482) CERKL (ENSMMSG00000007095) ITGA4 (ENSMMSG00000007012) ENSMMSG00000006930 ENSMMSG00000006900 CWC22 (ENSMMSG00000006828) ZNF385B (ENSMMSG00000006663) ENSMMSG00000006636 SESTD1 (ENSMMSG00000006557) CCDC141 (ENSMMSG00000006504) Bovidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000013931.a.a.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B #16 ENSGT00940000157993.l #17 ENSGT00940000157993.k #17 ENSGT00390000004172 #18 ENSGT01090000260082.d.b #20 ENSGT00940000160610 #21 ENSGT00940000154531 #22 ENSGT00390000007183 #24 ENSGT00940000155913 #25 ENSGT00390000004028 ENSGT00390000003560 ENSGT00940000160715 ENSGT01030000234597.a.a.i.a.d ENSGT00940000156557 ENSGT00940000156483 ENSGT00390000008642 ENSGT00940000155634 ENSGT01010000224193 ENSGT00940000160501 ENSGT00940000161252 ENSGT00950000183142.a.b.a.a ENSGT00940000157012 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000013931.a.a.b ENSGT00390000011877 ENSGT00390000006208.a.f ENSGT01040000241176 ENSGT00530000063558.B #16 ENSGT00940000157993.l #17 ENSGT00940000157993.k #17 ENSGT00390000004172 #18 ENSGT01090000260082.d.b #20 ENSGT00940000160610 #21 ENSGT00940000154531 #22 ENSGT00390000007183 #24 ENSGT00940000155913 #25 ENSGT00390000004028 ENSGT00390000003560 ENSGT00940000160715 ENSGT01030000234597.a.a.i.a.d ENSGT00940000156557 ENSGT00940000156483 ENSGT00390000008642 ENSGT00940000155634 ENSGT00940000160501 ENSGT00940000161252 ENSGT00950000183142.a.b.a.a ENSGT00940000157012 ENSGT00940000161394.m.a American bison MODERN SPECIES 3071 MAS1 (ENSBBBG00000011119) PNLDC1 (ENSBBBG00000011161) MRPL18 (ENSBBBG00000011166) TCP1 (ENSBBBG00000002025) ENSBBBG00000011209 ENSBBBG00000011243 SOD2 (ENSBBBG00000011253) ENSBBBG00000011260 ENSBBBG00000011265 FNDC1 (ENSBBBG00000002055) #16 ENSBBBG00000011303 #17 ENSBBBG00000002057 #17 RSPH3 (ENSBBBG00000011334) #18 EZR (ENSBBBG00000002067) #20 SYTL3 (ENSBBBG00000011406) #21 DYNLT1 (ENSBBBG00000011420) #22 TMEM181 (ENSBBBG00000011458) #24 TULP4 (ENSBBBG00000011517) #25 GTF2H5 (ENSBBBG00000011523) SERAC1 (ENSBBBG00000011692) SYNJ2 (ENSBBBG00000008492) ENSBBBG00000011725 SNX9 (ENSBBBG00000011740) ZDHHC14 (ENSBBBG00000011752) TMEM242 (ENSBBBG00000011763) ENSBBBG00000002188 ARID1B (ENSBBBG00000011875) ENSBBBG00000011886 NOX3 (ENSBBBG00000011894) CLDN20 (ENSBBBG00000011901) TFB1M (ENSBBBG00000011905) Bos DUPLICATION Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154531.i #22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154531.i #22 Cow MODERN SPECIES 69 ENSBTAG00000048752 #22 Bos ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000013931.a.a.b ENSGT00390000011877 ENSGT00390000006208.a.f ENSGT01040000241176 ENSGT00530000063558.B #16 ENSGT00940000157993.l #17 ENSGT00940000157993.k #17 ENSGT00390000004172 #18 ENSGT01090000260082.d.b #20 ENSGT00940000160610 #21 ENSGT00940000154531.j #22 ENSGT00390000007183 #24 ENSGT00940000155913 #25 ENSGT00390000004028 ENSGT00390000003560 ENSGT00940000160715 ENSGT01030000234597.a.a.i.a.d ENSGT00940000156557 ENSGT00940000156483 ENSGT00390000008642 ENSGT00940000155634 ENSGT00940000160501 ENSGT00940000161252 ENSGT00950000183142.a.b.a.a ENSGT00940000157012 ENSGT00940000161394.m.a Bos_a ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000013931.a.a.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B #16 ENSGT00940000157993.l #17 ENSGT00940000157993.k #17 ENSGT00390000004172 #18 ENSGT01090000260082.d.b #20 ENSGT00940000160610 #21 ENSGT00940000154531.j #22 ENSGT00390000007183 #24 ENSGT00940000155913 #25 ENSGT00390000004028 ENSGT00390000003560 ENSGT00940000160715 ENSGT01030000234597.a.a.i.a.d ENSGT00940000156557 ENSGT01030000235099 ENSGT00940000156483 ENSGT00390000008642 ENSGT00940000155634 ENSGT00940000153147.m.a.a.a.a.b ENSGT00940000160501 ENSGT00940000161252 ENSGT00950000183142.a.b.a.a Domestic yak MODERN SPECIES 1 IGF2R (ENSBGRG00000021970) ENSBGRG00000026486 MAS1 (ENSBGRG00000026489) PNLDC1 (ENSBGRG00000026494) MRPL18 (ENSBGRG00000026525) TCP1 (ENSBGRG00000026527) ENSBGRG00000026550 ENSBGRG00000026557 ENSBGRG00000026563 ENSBGRG00000026571 FNDC1 (ENSBGRG00000026585) #16 TAGAP (ENSBGRG00000026597) #17 RSPH3 (ENSBGRG00000026600) #18 EZR (ENSBGRG00000026603) #20 SYTL3 (ENSBGRG00000026617) #21 DYNLT1 (ENSBGRG00000026623) #22 TMEM181 (ENSBGRG00000026630) #24 TULP4 (ENSBGRG00000026640) #25 ENSBGRG00000026645 SERAC1 (ENSBGRG00000026663) SYNJ2 (ENSBGRG00000026679) SNX9 (ENSBGRG00000026688) ENSBGRG00000026695 ZDHHC14 (ENSBGRG00000026696) ENSBGRG00000026701 ENSBGRG00000026710 ARID1B (ENSBGRG00000026715) ENSBGRG00000026720 ENSBGRG00000026721 ENSBGRG00000026722 NOX3 (ENSBGRG00000026724) Wild yak MODERN SPECIES 1168 MAS1 (ENSBMUG00000002956) PNLDC1 (ENSBMUG00000002939) MRPL18 (ENSBMUG00000002874) TCP1 (ENSBMUG00000002835) ACAT2 (ENSBMUG00000002762) ENSBMUG00000002743 SOD2 (ENSBMUG00000002696) ENSBMUG00000002680 ENSBMUG00000002677 FNDC1 (ENSBMUG00000002609) #16 ENSBMUG00000002323 #17 ENSBMUG00000002298 #17 RSPH3 (ENSBMUG00000002272) #18 EZR (ENSBMUG00000002231) #20 SYTL3 (ENSBMUG00000002194) #21 ENSBMUG00000002110 #22 TMEM181 (ENSBMUG00000002081) #24 ENSBMUG00000002042 #25 GTF2H5 (ENSBMUG00000002023) SERAC1 (ENSBMUG00000001963) SYNJ2 (ENSBMUG00000001791) ENSBMUG00000001758 SNX9 (ENSBMUG00000001734) ENSBMUG00000001704 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00390000006208.a.f ENSGT01040000241176 ENSGT00530000063558.B #16 ENSGT00940000157993.k #17 ENSGT00390000004172 #18 ENSGT01090000260082.d.b #20 ENSGT00940000160610 #21 ENSGT00940000154531.j #22 ENSGT00390000007183 #24 ENSGT00940000155913 #25 ENSGT00390000004028 ENSGT00390000003560 ENSGT00940000160715 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.b.b.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b ENSGT01030000234597.a.a.i.a.d ENSGT00940000156557 ENSGT00940000156483 ENSGT00390000008642 ENSGT00940000155634 ENSGT00940000160501 ENSGT00940000161252 ENSGT00950000183142.a.b.a.a ENSGT00940000157012 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 28 IGF2R (ENSBIXG00005015279) MAS1 (ENSBIXG00005015332) PNLDC1 (ENSBIXG00005015403) MRPL18 (ENSBIXG00005015451) TCP1 (ENSBIXG00005015526) ENSBIXG00005006136 ENSBIXG00005015570 WTAP (ENSBIXG00005015616) ENSBIXG00005005505 ENSBIXG00005006566 FNDC1 (ENSBIXG00005002485) #16 TAGAP (ENSBIXG00005015864) #17 RSPH3 (ENSBIXG00005002509) #18 EZR (ENSBIXG00005002517) #20 SYTL3 (ENSBIXG00005015982) #21 DYNLT1 (ENSBIXG00005002539) #22 TMEM181 (ENSBIXG00005016376) #24 TULP4 (ENSBIXG00005016689) #25 ENSBIXG00005016735 ENSBIXG00005016761 SERAC1 (ENSBIXG00005017174) ENSBIXG00005017210 SYNJ2 (ENSBIXG00005017312) ENSBIXG00005017343 ENSBIXG00005017357 SNX9 (ENSBIXG00005017441) ZDHHC14 (ENSBIXG00005017525) TMEM242 (ENSBIXG00005017618) ENSBIXG00005017632 ARID1B (ENSBIXG00005018627) NOX3 (ENSBIXG00005018801) Cow DUPLICATION Cow MODERN SPECIES ANAPC13 (ENSBTAG00000014461) AMOTL2 (ENSBTAG00000000742) ENSBTAG00000049951 RYK (ENSBTAG00000016999) ENSBTAG00000048733 SLCO2A1 (ENSBTAG00000001324) RAB6B (ENSBTAG00000000905) SRPRB (ENSBTAG00000044075) TF (ENSBTAG00000007273) INHCA (ENSBTAG00000023411) TOPBP1 (ENSBTAG00000000526) CDV3 (ENSBTAG00000035556) BFSP2 (ENSBTAG00000017659) TMEM108 (ENSBTAG00000018508) ENSBTAG00000049758 ENSBTAG00000049044 #22 NPHP3 (ENSBTAG00000005769) UBA5 (ENSBTAG00000004495) ACAD11 (ENSBTAG00000031010) ACKR4 (ENSBTAG00000019577) DNAJC13 (ENSBTAG00000002966) ACP3 (ENSBTAG00000011634) ENSBTAG00000054801 ENSBTAG00000049430 ENSBTAG00000054913 ENSBTAG00000054550 CPNE4 (ENSBTAG00000010448) ENSBTAG00000053358 MRPL3 (ENSBTAG00000030942) NUDT16 (ENSBTAG00000018749) NEK11 (ENSBTAG00000009258) Cow MODERN SPECIES 28 IGF2R (ENSBTAG00000002402) MAS1 (ENSBTAG00000031724) PNLDC1 (ENSBTAG00000015166) MRPL18 (ENSBTAG00000001289) TCP1 (ENSBTAG00000002829) ACAT2 (ENSBTAG00000002827) WTAP (ENSBTAG00000007974) SOD2 (ENSBTAG00000006523) ENSBTAG00000052316 ENSBTAG00000048338 FNDC1 (ENSBTAG00000003938) #16 TAGAP (ENSBTAG00000031701) #17 RSPH3 (ENSBTAG00000005955) #18 EZR (ENSBTAG00000010347) #20 SYTL3 (ENSBTAG00000010334) #21 ENSBTAG00000004472 #22 TMEM181 (ENSBTAG00000010838) #24 ENSBTAG00000045898 TULP4 (ENSBTAG00000005083) #25 GTF2H5 (ENSBTAG00000008543) SERAC1 (ENSBTAG00000011509) SYNJ2 (ENSBTAG00000000817) ENSBTAG00000048573 ENSBTAG00000052926 SNX9 (ENSBTAG00000006323) ZDHHC14 (ENSBTAG00000018464) TMEM242 (ENSBTAG00000007201) ENSBTAG00000045772 ARID1B (ENSBTAG00000002728) NOX3 (ENSBTAG00000013551) CLDN20 (ENSBTAG00000046726) Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b.d ENSGT00390000011877 ENSGT00390000006208.a.f ENSGT00390000013558.z ENSGT00530000063558.B #16 ENSGT00940000157993.l #17 ENSGT00390000004172 #18 ENSGT01090000260082.d.b #20 ENSGT00940000160610 #21 ENSGT00940000154531 #22 ENSGT00390000007183 #24 ENSGT00940000155913 #25 ENSGT00390000004028 ENSGT00390000003560 ENSGT00940000160715 ENSGT01030000234597.a.a.i.a.d ENSGT00940000156557 ENSGT00940000156483 ENSGT00390000008642 ENSGT00940000155634 ENSGT01010000224193 ENSGT00940000160501 ENSGT00940000161252 ENSGT00950000183142.a.b.a.a ENSGT00940000157012 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 24 SLC22A1 (ENSOARG00020025899) IGF2R (ENSOARG00020007810) MAS1 (ENSOARG00020006641) PNLDC1 (ENSOARG00020006365) MRPL18 (ENSOARG00020006305) TCP1 (ENSOARG00020006218) ENSOARG00020006176 WTAP (ENSOARG00020006133) SOD2 (ENSOARG00020006059) ENSOARG00020006017 ENSOARG00020005992 TAGAP (ENSOARG00020005923) #17 RSPH3 (ENSOARG00020005842) #18 ENSOARG00020005804 #20 SYTL3 (ENSOARG00020005678) #21 DYNLT1 (ENSOARG00020005652) #22 TMEM181 (ENSOARG00020005095) #24 TULP4 (ENSOARG00020004840) #25 GTF2H5 (ENSOARG00020004781) SERAC1 (ENSOARG00020004385) SYNJ2 (ENSOARG00020004254) RPS25 (ENSOARG00020004228) SNX9 (ENSOARG00020003963) ZDHHC14 (ENSOARG00020003801) TMEM242 (ENSOARG00020003775) ARID1B (ENSOARG00020003186) ENSOARG00020003115 NOX3 (ENSOARG00020003085) CLDN20 (ENSOARG00020025258) TFB1M (ENSOARG00020025200) TIAM2 (ENSOARG00020025148) Goat MODERN SPECIES 28 IGF2R (ENSCHIG00000010830) MAS1 (ENSCHIG00000012964) PNLDC1 (ENSCHIG00000003141) ENSCHIG00000023286 TCP1 (ENSCHIG00000016503) ENSCHIG00000017426 ENSCHIG00000026430 SOD2 (ENSCHIG00000009947) ENSCHIG00000010882 ENSCHIG00000020625 FNDC1 (ENSCHIG00000023614) #16 TAGAP (ENSCHIG00000008817) #17 RSPH3 (ENSCHIG00000018819) #18 EZR (ENSCHIG00000017900) #20 SYTL3 (ENSCHIG00000016283) #21 DYNLT1 (ENSCHIG00000026680) #22 TMEM181 (ENSCHIG00000023369) #24 TULP4 (ENSCHIG00000003373) #25 GTF2H5 (ENSCHIG00000000966) SERAC1 (ENSCHIG00000013202) SYNJ2 (ENSCHIG00000011077) ENSCHIG00000010027 SNX9 (ENSCHIG00000013873) ZDHHC14 (ENSCHIG00000022143) ENSCHIG00000009951 ARID1B (ENSCHIG00000020135) ENSCHIG00000007828 NOX3 (ENSCHIG00000014008) CLDN20 (ENSCHIG00000004190) TFB1M (ENSCHIG00000017013) TIAM2 (ENSCHIG00000016626) Camelidae ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B #16 ENSGT00940000157993 #17 ENSGT00390000004172 #18 ENSGT01090000260082.d.b #20 ENSGT00940000160610 #21 ENSGT00940000154531 #22 ENSGT00390000007183 #24 ENSGT00940000155913 #25 ENSGT00390000004028 ENSGT00390000003560 ENSGT00940000160715 ENSGT00940000156557 ENSGT00940000156483 ENSGT00390000008642 ENSGT00940000155634 ENSGT00940000160501 ENSGT00950000183142.a.b.a.a ENSGT00940000161252 ENSGT00940000157012 ENSGT00530000063946.b ENSGT00940000154428.a Arabian camel DUPLICATION Arabian camel MODERN SPECIES 34 SLC22A2 (ENSCDRG00005014141) SLC22A1 (ENSCDRG00005014227) IGF2R (ENSCDRG00005014304) MAS1 (ENSCDRG00005014532) PNLDC1 (ENSCDRG00005014558) MRPL18 (ENSCDRG00005014810) TCP1 (ENSCDRG00005014875) ACAT2 (ENSCDRG00005015012) WTAP (ENSCDRG00005015081) MnSOD (ENSCDRG00005015180) FNDC1 (ENSCDRG00005015292) #16 TAGAP (ENSCDRG00005015381) #17 RSPH3 (ENSCDRG00005015431) #18 ENSCDRG00005015561 #20 SYTL3 (ENSCDRG00005015709) #21 ENSCDRG00005015822 #22 TMEM181 (ENSCDRG00005015875) #24 ENSCDRG00005016299 #25 GTF2H5 (ENSCDRG00005016408) SERAC1 (ENSCDRG00005016470) SYNJ2 (ENSCDRG00005016839) SNX9 (ENSCDRG00005017884) ZDHHC14 (ENSCDRG00005018018) TMEM242 (ENSCDRG00005018146) ARID1B (ENSCDRG00005018236) NOX3 (ENSCDRG00005018725) TFB1M (ENSCDRG00005018794) CLDN20 (ENSCDRG00005018827) TIAM2 (ENSCDRG00005018842) SCAF8 (ENSCDRG00005018900) CNKSR3 (ENSCDRG00005019125) Arabian camel MODERN SPECIES 34 CALHM5 (ENSCDRG00005003006) TRAPPC3L (ENSCDRG00005002989) CALHM4 (ENSCDRG00005002979) RWDD1 (ENSCDRG00005002965) ENSCDRG00005002955 RSPH4A (ENSCDRG00005002922) ZUP1 (ENSCDRG00005002876) KPNA5 (ENSCDRG00005002825) FAM162B (ENSCDRG00005002796) GPRC6A (ENSCDRG00005002744) RFX6 (ENSCDRG00005002698) ENSCDRG00005002682 ROS1 (ENSCDRG00005002608) DCBLD1 (ENSCDRG00005002557) GOPC (ENSCDRG00005002474) ENSCDRG00005002449 #22 ENSCDRG00005002434 NUS1 (ENSCDRG00005002419) SLC35F1 (ENSCDRG00005002366) PLN (ENSCDRG00005002352) CEP85L (ENSCDRG00005002324) ASF1A (ENSCDRG00005002302) MCM9 (ENSCDRG00005002280) FAM184A (ENSCDRG00005002168) MAN1A1 (ENSCDRG00005002122) TBC1D32 (ENSCDRG00005002001) GJA1 (ENSCDRG00005001981) HSF2 (ENSCDRG00005001943) SERINC1 (ENSCDRG00005001918) PKIB (ENSCDRG00005001894) FABP7 (ENSCDRG00005001881) Alpaca MODERN SPECIES 142 TAGAP (ENSVPAG00000005174) #17 RSPH3 (ENSVPAG00000005173) #18 SYTL3 (ENSVPAG00000005172) #21 DYNLT1 (ENSVPAG00000005171) #22 ENSVPAG00000005169 #24 ENSVPAG00000005168 #25 GTF2H5 (ENSVPAG00000005167) SERAC1 (ENSVPAG00000005165) Suina ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B #16 ENSGT00940000157993 #17 ENSGT00390000004172 #18 ENSGT01090000260082.d.b #20 ENSGT00940000160610 #21 ENSGT00940000154531 #22 ENSGT00390000007183 #24 ENSGT00940000155913 #25 ENSGT00390000004028 ENSGT00390000003560 ENSGT00940000160715 ENSGT00940000156557 ENSGT00940000156483 ENSGT00390000008642 ENSGT00940000155634 ENSGT00940000160501 ENSGT00950000183142.a.b.a.a ENSGT00940000161252 ENSGT00940000157012 ENSGT00530000063946.b ENSGT00940000154428.a Chacoan peccary MODERN SPECIES 58 SLC22A1 (ENSCWAG00000002901) IGF2R (ENSCWAG00000002925) MAS1 (ENSCWAG00000002975) ENSCWAG00000002985 PNLDC1 (ENSCWAG00000003002) MRPL18 (ENSCWAG00000003059) TCP1 (ENSCWAG00000003074) ACAT2 (ENSCWAG00000003116) WTAP (ENSCWAG00000003142) SOD2 (ENSCWAG00000003162) FNDC1 (ENSCWAG00000003188) #16 ENSCWAG00000003211 #17 RSPH3 (ENSCWAG00000003227) #18 EZR (ENSCWAG00000003256) #20 SYTL3 (ENSCWAG00000003293) #21 DYNLT1 (ENSCWAG00000003343) #22 TMEM181 (ENSCWAG00000003377) #24 TULP4 (ENSCWAG00000003534) #25 GTF2H5 (ENSCWAG00000003578) SERAC1 (ENSCWAG00000003601) SYNJ2 (ENSCWAG00000003712) SNX9 (ENSCWAG00000003804) ZDHHC14 (ENSCWAG00000003840) TMEM242 (ENSCWAG00000003899) ARID1B (ENSCWAG00000004015) NOX3 (ENSCWAG00000004615) TFB1M (ENSCWAG00000004677) CLDN20 (ENSCWAG00000004706) TIAM2 (ENSCWAG00000004753) ENSCWAG00000005054 SCAF8 (ENSCWAG00000005122) Pig MODERN SPECIES SLC22A2 (ENSSSCG00000004040) SLC22A1 (ENSSSCG00000004041) IGF2R (ENSSSCG00000004044) MAS1 (ENSSSCG00000059431) PNLDC1 (ENSSSCG00000004046) MRPL18 (ENSSSCG00000004047) TCP1 (ENSSSCG00000004048) ACAT2 (ENSSSCG00000004049) WTAP (ENSSSCG00000004050) SOD2 (ENSSSCG00000040317) FNDC1 (ENSSSCG00000004052) #16 TAGAP (ENSSSCG00000004053) #17 RSPH3 (ENSSSCG00000004055) #18 EZR (ENSSSCG00000004058) #20 SYTL3 (ENSSSCG00000004057) #21 DYNLT1 (ENSSSCG00000033107) #22 TMEM181 (ENSSSCG00000024876) #24 ENSSSCG00000031776 #25 GTF2H5 (ENSSSCG00000024019) SERAC1 (ENSSSCG00000012314) SYNJ2 (ENSSSCG00000012315) SNX9 (ENSSSCG00000030535) ZDHHC14 (ENSSSCG00000035027) ENSSSCG00000038527 TMEM242 (ENSSSCG00000060508) ARID1B (ENSSSCG00000004064) ENSSSCG00000051789 NOX3 (ENSSSCG00000004068) TFB1M (ENSSSCG00000024361) CLDN20 (ENSSSCG00000063189) TIAM2 (ENSSSCG00000004065)