Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00940000165253 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000005700 ENSGT00390000006223 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00940000160358 ENSGT00940000166395 ENSGT00940000156765 ENSGT00390000009795 ENSGT01100000263537.b.b.c.a.a ENSGT00940000153887.B ENSGT00940000157969 ENSGT00940000161850 ENSGT00530000064222.a ENSGT00390000003107.b ENSGT00940000161006 ENSGT00940000175873 ENSGT00940000159603 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00940000165253 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000005700 ENSGT00390000006223 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00940000160358 ENSGT00940000166395 ENSGT00940000160599 ENSGT00940000156765 ENSGT00390000009795 ENSGT01100000263537.b.b.c.a.a ENSGT00940000153887.B ENSGT00940000177245 ENSGT00530000064222.a ENSGT00390000003107.b ENSGT00940000161006 ENSGT00940000158785 ENSGT00950000182980.a.b.a.a.a Amniota ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00940000165253 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000005700 ENSGT00390000006223 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 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ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000162939 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01100000263540.A.b ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 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ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT01100000263540.A.b ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00990000207089 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 Rabbit MODERN SPECIES 12 BBOF1 (ENSOCUG00000017487) ALDH6A1 (ENSOCUG00000025121) LIN52 (ENSOCUG00000017491) VSX2 (ENSOCUG00000017496) ABCD4 (ENSOCUG00000003484) VRTN (ENSOCUG00000027081) SYNDIG1L (ENSOCUG00000015989) ENSOCUG00000035144 NPC2 (ENSOCUG00000014067) ISCA2 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(ENSOPRG00000011956) TMED10 (ENSOPRG00000011992) FOS (ENSOPRG00000012005) ENSOPRG00000012017 JDP2 (ENSOPRG00000012032) BATF (ENSOPRG00000012041) FLVCR2 (ENSOPRG00000012046) ERG28 (ENSOPRG00000012066) ENSOPRG00000012071 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000016292.g.a.b ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000162939 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000016292.g.a.b ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000162939 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00390000016292.g.a.b ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000162939 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000154427.A ENSGT00390000016292.g.a.b ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000162939 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT01100000263540.A.b ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 48 CCDC198 (ENSODEG00000015422) SLC35F4 (ENSODEG00000014001) ENSODEG00000014617 ENSODEG00000014244 ENSODEG00000014881 ENSODEG00000014309 ENSODEG00000014880 ENSODEG00000014925 DACT1 (ENSODEG00000014574) ENSODEG00000015435 DAAM1 (ENSODEG00000014128) L3HYPDH (ENSODEG00000015887) JKAMP (ENSODEG00000014669) ENSODEG00000014803 ENSODEG00000014970 ENSODEG00000020245 #22 ENSODEG00000020257 ENSODEG00000015513 ENSODEG00000014407 KTN1 (ENSODEG00000015972) ENSODEG00000020182 ENSODEG00000020193 TBPL2 (ENSODEG00000015283) ATG14 (ENSODEG00000014397) ENSODEG00000014741 ENSODEG00000014683 TTC9 (ENSODEG00000015092) ENSODEG00000020259 MAP3K9 (ENSODEG00000015307) PCNX1 (ENSODEG00000015239) SIPA1L1 (ENSODEG00000014862) Degu MODERN SPECIES 48 ENTPD5 (ENSODEG00000015910) ENSODEG00000015055 ALDH6A1 (ENSODEG00000015807) ENSODEG00000015046 VSX2 (ENSODEG00000015486) ABCD4 (ENSODEG00000015190) VRTN (ENSODEG00000015577) SYNDIG1L (ENSODEG00000015191) NPC2 (ENSODEG00000015454) ENSODEG00000015593 LTBP2 (ENSODEG00000015966) AREL1 (ENSODEG00000015900) ENSODEG00000015318 YLPM1 (ENSODEG00000015362) PROX2 (ENSODEG00000015273) ENSODEG00000016718 #22 RPS6KL1 (ENSODEG00000015734) #23 ENSODEG00000015442 ENSODEG00000015428 ENSODEG00000015487 ZC2HC1C (ENSODEG00000015376) NEK9 (ENSODEG00000015192) TMED10 (ENSODEG00000015608) FOS (ENSODEG00000015631) ENSODEG00000015265 JDP2 (ENSODEG00000015424) BATF (ENSODEG00000015516) Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 230 ENTPD5 (ENSCLAG00000003418) ENSCLAG00000003357 ALDH6A1 (ENSCLAG00000003304) LIN52 (ENSCLAG00000003236) VSX2 (ENSCLAG00000006640) ABCD4 (ENSCLAG00000006557) VRTN (ENSCLAG00000006514) SYNDIG1L (ENSCLAG00000006492) NPC2 (ENSCLAG00000006435) ISCA2 (ENSCLAG00000006410) LTBP2 (ENSCLAG00000005951) AREL1 (ENSCLAG00000005714) FCF1 (ENSCLAG00000005606) YLPM1 (ENSCLAG00000004848) PROX2 (ENSCLAG00000004620) DLST (ENSCLAG00000004328) #22 RPS6KL1 (ENSCLAG00000004091) #23 PGF (ENSCLAG00000003475) EIF2B2 (ENSCLAG00000003404) MLH3 (ENSCLAG00000003183) ENSCLAG00000003079 ZC2HC1C (ENSCLAG00000003052) NEK9 (ENSCLAG00000002894) ENSCLAG00000017571 ENSCLAG00000005287 FOS (ENSCLAG00000005234) JDP2 (ENSCLAG00000005213) BATF (ENSCLAG00000005182) Guinea pig DUPLICATION Guinea pig MODERN SPECIES 20 ENSCPOG00000015588 RNF113A (ENSCPOG00000038517) ALDH6A1 (ENSCPOG00000000015) LIN52 (ENSCPOG00000003170) VSX2 (ENSCPOG00000003172) 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(ENSHGLG00000013483) #23 ENSHGLG00000013243 ENSHGLG00000018678 ENSHGLG00000050804 EIF2B2 (ENSHGLG00000016520) MLH3 (ENSHGLG00000015005) ENSHGLG00000040406 ENSHGLG00000014222 ZC2HC1C (ENSHGLG00000012165) ENSHGLG00000011281 TMED10 (ENSHGLG00000009862) Fos (ENSHGLG00000009642) ENSHGLG00000012043 JDP2 (ENSHGLG00000046590) ENSHGLG00000034007 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402.f ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B.g ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000155747 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 11 ALDH6A1 (ENSSVLG00005005600) ENSSVLG00005005569 ENSSVLG00005005534 VSX2 (ENSSVLG00005005496) ABCD4 (ENSSVLG00005005450) VRTN (ENSSVLG00005005435) SYNDIG1L (ENSSVLG00005005404) NPC2 (ENSSVLG00005005374) ISCA2 (ENSSVLG00005005331) LTBP2 (ENSSVLG00005023777) ENSSVLG00005023700 AREL1 (ENSSVLG00005023654) FCF1 (ENSSVLG00005023579) YLPM1 (ENSSVLG00005023475) ENSSVLG00005023416 DLST (ENSSVLG00005023360) #22 RPS6KL1 (ENSSVLG00005023325) #23 PGF (ENSSVLG00005023268) EIF2B2 (ENSSVLG00005023236) MLH3 (ENSSVLG00005023158) ENSSVLG00005023086 ZC2HC1C (ENSSVLG00005023028) NEK9 (ENSSVLG00005022971) TMED10 (ENSSVLG00005022941) FOS (ENSSVLG00005022864) JDP2 (ENSSVLG00005022819) BATF (ENSSVLG00005022782) ERG28 (ENSSVLG00005022750) FLVCR2 (ENSSVLG00005022704) TTLL5 (ENSSVLG00005022638) TGFB3 (ENSSVLG00005022514) Marmotini ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402.f ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B.g ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000155747 Alpin marmot MODERN SPECIES 1 BBOF1 (ENSMMMG00000016213) ALDH6A1 (ENSMMMG00000016229) LIN52 (ENSMMMG00000016244) VSX2 (ENSMMMG00000016247) ABCD4 (ENSMMMG00000016264) VRTN (ENSMMMG00000016304) SYNDIG1L (ENSMMMG00000016305) NPC2 (ENSMMMG00000016316) ISCA2 (ENSMMMG00000016320) LTBP2 (ENSMMMG00000016333) AREL1 (ENSMMMG00000016543) FCF1 (ENSMMMG00000016553) YLPM1 (ENSMMMG00000016573) ENSMMMG00000018793 PROX2 (ENSMMMG00000018802) DLST (ENSMMMG00000018811) #22 RPS6KL1 (ENSMMMG00000018824) #23 ENSMMMG00000018834 EIF2B2 (ENSMMMG00000018871) MLH3 (ENSMMMG00000018877) ENSMMMG00000018919 ZC2HC1C (ENSMMMG00000018927) NEK9 (ENSMMMG00000018929) TMED10 (ENSMMMG00000018955) FOS (ENSMMMG00000018959) JDP2 (ENSMMMG00000018991) BATF (ENSMMMG00000018997) FLVCR2 (ENSMMMG00000019011) ERG28 (ENSMMMG00000019015) ENSMMMG00000019046 TGFB3 (ENSMMMG00000019151) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402.f ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B.g.a ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000155747 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 8 BBOF1 (ENSUPAG00010014608) ALDH6A1 (ENSUPAG00010014582) LIN52 (ENSUPAG00010014569) VSX2 (ENSUPAG00010014562) ABCD4 (ENSUPAG00010014503) VRTN (ENSUPAG00010014491) SYNDIG1L (ENSUPAG00010014486) NPC2 (ENSUPAG00010014477) ISCA2 (ENSUPAG00010014470) LTBP2 (ENSUPAG00010014320) ENSUPAG00010014316 AREL1 (ENSUPAG00010014265) ENSUPAG00010014237 YLPM1 (ENSUPAG00010014207) PROX2 (ENSUPAG00010014197) DLST (ENSUPAG00010014158) #22 RPS6KL1 (ENSUPAG00010014140) #23 PGF (ENSUPAG00010014126) EIF2B2 (ENSUPAG00010014118) MLH3 (ENSUPAG00010014100) ENSUPAG00010014073 ZC2HC1C (ENSUPAG00010014064) NEK9 (ENSUPAG00010014023) TMED10 (ENSUPAG00010014006) FOS (ENSUPAG00010013998) JDP2 (ENSUPAG00010013987) ENSUPAG00010013983 BATF (ENSUPAG00010013971) FLVCR2 (ENSUPAG00010013953) ERG28 (ENSUPAG00010013948) ENSUPAG00010013566 Squirrel MODERN SPECIES 88 ENSSTOG00000008087 ALDH6A1 (ENSSTOG00000028534) LIN52 (ENSSTOG00000029773) VSX2 (ENSSTOG00000008114) ABCD4 (ENSSTOG00000009827) VRTN (ENSSTOG00000021434) SYNDIG1L (ENSSTOG00000007981) NPC2 (ENSSTOG00000007987) ISCA2 (ENSSTOG00000020219) LTBP2 (ENSSTOG00000007996) ENSSTOG00000034311 AREL1 (ENSSTOG00000008036) FCF1 (ENSSTOG00000008083) YLPM1 (ENSSTOG00000014581) PROX2 (ENSSTOG00000023253) DLST (ENSSTOG00000014603) #22 RPS6KL1 (ENSSTOG00000014613) #23 PGF (ENSSTOG00000023041) EIF2B2 (ENSSTOG00000007283) MLH3 (ENSSTOG00000027479) ENSSTOG00000007327 ZC2HC1C (ENSSTOG00000007331) NEK9 (ENSSTOG00000007339) ENSSTOG00000007392 FOS (ENSSTOG00000003005) JDP2 (ENSSTOG00000026831) BATF (ENSSTOG00000024626) FLVCR2 (ENSSTOG00000014389) ERG28 (ENSSTOG00000014394) TTLL5 (ENSSTOG00000014397) TGFB3 (ENSSTOG00000028492) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000016292.g.a.b ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000162939 Kangaroo rat MODERN SPECIES 321 ENSDORG00000001878 Rnf113a2 (ENSDORG00000027624) ENSDORG00000005218 Aldh6a1 (ENSDORG00000005224) Lin52 (ENSDORG00000025156) Vsx2 (ENSDORG00000010911) Abcd4 (ENSDORG00000010912) Vrtn (ENSDORG00000010914) Syndig1l (ENSDORG00000014474) Isca2 (ENSDORG00000027372) Ltbp2 (ENSDORG00000014858) Arel1 (ENSDORG00000027985) Fcf1 (ENSDORG00000009970) Ylpm1 (ENSDORG00000016716) Prox2 (ENSDORG00000027296) Dlst (ENSDORG00000002153) #22 Rps6kl1 (ENSDORG00000002155) #23 Pgf (ENSDORG00000029841) ENSDORG00000004893 Acyp1 (ENSDORG00000029459) Zc2hc1c (ENSDORG00000004895) Nek9 (ENSDORG00000004896) Tmed10 (ENSDORG00000012999) Fos (ENSDORG00000024479) Jdp2 (ENSDORG00000026956) Batf (ENSDORG00000026541) Flvcr2 (ENSDORG00000012890) Erg28 (ENSDORG00000012893) ENSDORG00000012894 Tgfb3 (ENSDORG00000012897) Ift43 (ENSDORG00000012899) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000016292.g.a.b ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000162939 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000016292.g.a.b ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000162939 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000016292.g.a.b ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000155747 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d.g.a ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000155747 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d.g.a ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000155747 Golden Hamster MODERN SPECIES 835 Bbof1 (ENSMAUG00000012362) Aldh6a1 (ENSMAUG00000016891) Lin52 (ENSMAUG00000011456) Vsx2 (ENSMAUG00000017695) Abcd4 (ENSMAUG00000011789) ENSMAUG00000017258 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ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000155747 Prairie vole MODERN SPECIES Entpd5 (ENSMOCG00000020144) Bbof1 (ENSMOCG00000001378) Aldh6a1 (ENSMOCG00000018307) Lin52 (ENSMOCG00000017855) Vsx2 (ENSMOCG00000020119) Abcd4 (ENSMOCG00000022046) Vrtn (ENSMOCG00000011795) Syndig1l (ENSMOCG00000013518) Npc2 (ENSMOCG00000013949) Isca2 (ENSMOCG00000000566) Ltbp2 (ENSMOCG00000007456) Arel1 (ENSMOCG00000014662) ENSMOCG00000001860 Ylpm1 (ENSMOCG00000022334) Prox2 (ENSMOCG00000019247) Dlst (ENSMOCG00000022960) #22 Rps6kl1 (ENSMOCG00000020851) #23 ENSMOCG00000002159 Pgf (ENSMOCG00000002312) Eif2b2 (ENSMOCG00000003698) ENSMOCG00000006235 Acyp1 (ENSMOCG00000013303) Zc2hc1c (ENSMOCG00000003376) Nek9 (ENSMOCG00000007711) Tmed10 (ENSMOCG00000022712) Fos (ENSMOCG00000000968) Jdp2 (ENSMOCG00000002176) Batf (ENSMOCG00000014949) Flvcr2 (ENSMOCG00000002645) Erg28 (ENSMOCG00000013099) ENSMOCG00000018205 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 5 Bbof1 (ENSPEMG00000020680) Aldh6a1 (ENSPEMG00000021209) Lin52 (ENSPEMG00000016158) Vsx2 (ENSPEMG00000014515) Abcd4 (ENSPEMG00000021386) Vrtn (ENSPEMG00000020660) Syndig1l (ENSPEMG00000030499) Npc2 (ENSPEMG00000030688) Isca2 (ENSPEMG00000028312) Ltbp2 (ENSPEMG00000015484) ENSPEMG00000029842 Arel1 (ENSPEMG00000020566) Fcf1 (ENSPEMG00000012596) Ylpm1 (ENSPEMG00000020843) Prox2 (ENSPEMG00000020502) Dlst (ENSPEMG00000009929) #22 Rps6kl1 (ENSPEMG00000011503) #23 Pgf (ENSPEMG00000017060) Eif2b2 (ENSPEMG00000007004) Mlh3 (ENSPEMG00000005719) Acyp1 (ENSPEMG00000010196) Zc2hc1c (ENSPEMG00000000113) Nek9 (ENSPEMG00000016848) ENSPEMG00000001102 Fos (ENSPEMG00000025669) Jdp2 (ENSPEMG00000027096) Batf (ENSPEMG00000026240) Flvcr2 (ENSPEMG00000021330) Erg28 (ENSPEMG00000022195) Ttll5 (ENSPEMG00000011267) Tgfb3 (ENSPEMG00000023520) Murinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000016292.g.a.b ENSGT00940000156110 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#23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000155747 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000016292.g.a.b ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000155747 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000016292.g.a.b ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000155747 Mouse MODERN SPECIES 3 Bbof1 (ENSMUSG00000057265) Rnf113a2 (ENSMUSG00000098134) Aldh6a1 (ENSMUSG00000021238) Lin52 (ENSMUSG00000085793) Vsx2 (ENSMUSG00000021239) Abcd4 (ENSMUSG00000021240) Vrtn (ENSMUSG00000071235) Syndig1l (ENSMUSG00000071234) Npc2 (ENSMUSG00000021242) Isca2 (ENSMUSG00000021241) Ltbp2 (ENSMUSG00000002020) Arel1 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ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000155747 Steppe mouse MODERN SPECIES 3303 Bbof1 (ENSMSIG00000003750) Aldh6a1 (ENSMSIG00000003829) ENSMSIG00000003864 Vsx2 (ENSMSIG00000003898) Abcd4 (ENSMSIG00000003952) Vrtn (ENSMSIG00000004123) ENSMSIG00000004137 Npc2 (ENSMSIG00000004195) Isca2 (ENSMSIG00000004207) Ltbp2 (ENSMSIG00000004256) ENSMSIG00000004608 Arel1 (ENSMSIG00000004619) ENSMSIG00000004690 Ylpm1 (ENSMSIG00000004817) Prox2 (ENSMSIG00000005003) Dlst (ENSMSIG00000005032) #22 Rps6kl1 (ENSMSIG00000005067) #23 Pgf (ENSMSIG00000005142) spretus MODERN SPECIES 3 Rnf113a2 (MGP_SPRETEiJ_G0018788) Aldh6a1 (MGP_SPRETEiJ_G0018789) MGP_SPRETEiJ_G0018790 Vsx2 (MGP_SPRETEiJ_G0018791) Abcd4 (MGP_SPRETEiJ_G0018792) Vrtn (MGP_SPRETEiJ_G0018793) Syndig1l (MGP_SPRETEiJ_G0018794) Npc2 (MGP_SPRETEiJ_G0018795) Isca2 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MGP_PahariEiJ_G0029712 MGP_PahariEiJ_G0029713 Fcf1 (MGP_PahariEiJ_G0029714) Ylpm1 (MGP_PahariEiJ_G0029715) Prox2 (MGP_PahariEiJ_G0029716) Dlst (MGP_PahariEiJ_G0029717) #22 Rps6kl1 (MGP_PahariEiJ_G0029718) #23 Pgf (MGP_PahariEiJ_G0029719) Eif2b2 (MGP_PahariEiJ_G0029720) Mlh3 (MGP_PahariEiJ_G0029721) Acyp1 (MGP_PahariEiJ_G0029722) Zc2hc1c (MGP_PahariEiJ_G0029723) Nek9 (MGP_PahariEiJ_G0029724) Tmed10 (MGP_PahariEiJ_G0029725) Fos (MGP_PahariEiJ_G0029726) Jdp2 (MGP_PahariEiJ_G0029727) Batf (MGP_PahariEiJ_G0029728) Flvcr2 (MGP_PahariEiJ_G0029729) Erg28 (MGP_PahariEiJ_G0029730) Ttll5 (MGP_PahariEiJ_G0029731) Tgfb3 (MGP_PahariEiJ_G0029732) Rat MODERN SPECIES 16 Rnf113a2 (ENSRNOG00000067995) Aldh6a1 (ENSRNOG00000011419) Lin52 (ENSRNOG00000043441) Vsx2 (ENSRNOG00000011918) Abcd4 (ENSRNOG00000011964) Vrtn (ENSRNOG00000048378) Syndig1l (ENSRNOG00000027645) Npc2 (ENSRNOG00000012062) Isca2 (ENSRNOG00000012085) Ltbp2 (ENSRNOG00000012094) Arel1 (ENSRNOG00000004382) Fcf1 (ENSRNOG00000004723) Ylpm1 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Rps6kl1 (ENSNGAG00000013728) #23 Pgf (ENSNGAG00000000539) Eif2b2 (ENSNGAG00000012270) Mlh3 (ENSNGAG00000014700) Acyp1 (ENSNGAG00000007984) Zc2hc1c (ENSNGAG00000019419) Nek9 (ENSNGAG00000017456) Tmed10 (ENSNGAG00000011251) Fos (ENSNGAG00000009761) Jdp2 (ENSNGAG00000001677) Batf (ENSNGAG00000020639) Flvcr2 (ENSNGAG00000016955) Erg28 (ENSNGAG00000011973) ENSNGAG00000000162 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 41 Bbof1 (ENSJJAG00000012977) Aldh6a1 (ENSJJAG00000005519) ENSJJAG00000015460 Vsx2 (ENSJJAG00000011877) Abcd4 (ENSJJAG00000014302) Vrtn (ENSJJAG00000008057) Syndig1l (ENSJJAG00000012505) Npc2 (ENSJJAG00000017648) Isca2 (ENSJJAG00000015802) Ltbp2 (ENSJJAG00000016908) ENSJJAG00000011505 Arel1 (ENSJJAG00000023937) Fcf1 (ENSJJAG00000015320) Ylpm1 (ENSJJAG00000017599) Prox2 (ENSJJAG00000017786) Dlst (ENSJJAG00000016242) #22 Rps6kl1 (ENSJJAG00000013675) #23 Pgf (ENSJJAG00000017768) Eif2b2 (ENSJJAG00000015912) ENSJJAG00000017233 Acyp1 (ENSJJAG00000011511) Zc2hc1c (ENSJJAG00000011295) Nek9 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(ENSMNEG00000040141) ISCA2 (ENSMNEG00000036042) LTBP2 (ENSMNEG00000036133) AREL1 (ENSMNEG00000031507) ENSMNEG00000033468 YLPM1 (ENSMNEG00000036638) PROX2 (ENSMNEG00000034494) ENSMNEG00000037226 DLST (ENSMNEG00000035472) #22 RPS6KL1 (ENSMNEG00000043637) #23 PGF (ENSMNEG00000030055) EIF2B2 (ENSMNEG00000034034) MLH3 (ENSMNEG00000032615) ENSMNEG00000041248 ZC2HC1C (ENSMNEG00000044895) NEK9 (ENSMNEG00000038107) TMED10 (ENSMNEG00000027961) FOS (ENSMNEG00000031655) JDP2 (ENSMNEG00000044862) ENSMNEG00000033927 BATF (ENSMNEG00000028812) ERG28 (ENSMNEG00000004663) FLVCR2 (ENSMNEG00000041899) ENSMNEG00000032194 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00390000017443.s.a.a ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700.a.b ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d.b ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00390000000227.g.a.d ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B.i ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954.bb ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000153883.a.a ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162939 Olive baboon MODERN SPECIES 17 ALDH6A1 (ENSPANG00000000641) LIN52 (ENSPANG00000000642) ENSPANG00000038524 VSX2 (ENSPANG00000012707) ENSPANG00000042755 ABCD4 (ENSPANG00000007033) VRTN (ENSPANG00000012341) SYNDIG1L (ENSPANG00000001022) NPC2 (ENSPANG00000013438) ISCA2 (ENSPANG00000006983) LTBP2 (ENSPANG00000012340) AREL1 (ENSPANG00000018774) FCF1 (ENSPANG00000013437) YLPM1 (ENSPANG00000006982) PROX2 (ENSPANG00000024084) DLST (ENSPANG00000024086) #22 RPS6KL1 (ENSPANG00000016739) #23 PGF (ENSPANG00000017556) EIF2B2 (ENSPANG00000006825) MLH3 (ENSPANG00000016738) ENSPANG00000006824 ZC2HC1C (ENSPANG00000045711) NEK9 (ENSPANG00000006981) TMED10 (ENSPANG00000019635) FOS (ENSPANG00000020551) JDP2 (ENSPANG00000019986) BATF (ENSPANG00000021772) ERG28 (ENSPANG00000022559) FLVCR2 (ENSPANG00000017555) ENSPANG00000030981 TTLL5 (ENSPANG00000021771) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00390000017443.s.a.a ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700.a.b ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d.b ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00390000000227.g.a.d ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B.i ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954.bb ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000153883.a.a ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162939 Sooty mangabey MODERN SPECIES 165 ALDH6A1 (ENSCATG00000020482) ENSCATG00000008507 LIN52 (ENSCATG00000030477) ENSCATG00000031234 VSX2 (ENSCATG00000042328) ABCD4 (ENSCATG00000044007) VRTN (ENSCATG00000016010) SYNDIG1L (ENSCATG00000034933) NPC2 (ENSCATG00000034248) ISCA2 (ENSCATG00000039296) LTBP2 (ENSCATG00000037020) AREL1 (ENSCATG00000024599) ENSCATG00000038174 YLPM1 (ENSCATG00000029765) PROX2 (ENSCATG00000005114) DLST (ENSCATG00000021002) #22 RPS6KL1 (ENSCATG00000030155) #23 PGF (ENSCATG00000021773) EIF2B2 (ENSCATG00000044945) MLH3 (ENSCATG00000037886) ENSCATG00000044270 ZC2HC1C (ENSCATG00000039242) NEK9 (ENSCATG00000037694) TMED10 (ENSCATG00000031220) FOS (ENSCATG00000044925) JDP2 (ENSCATG00000041724) ENSCATG00000031624 BATF (ENSCATG00000032310) FLVCR2 (ENSCATG00000001690) ERG28 (ENSCATG00000027251) TTLL5 (ENSCATG00000039057) Drill MODERN SPECIES 827 ENSMLEG00000040250 ALDH6A1 (ENSMLEG00000041110) LIN52 (ENSMLEG00000032006) VSX2 (ENSMLEG00000003115) ABCD4 (ENSMLEG00000041560) VRTN (ENSMLEG00000011469) SYNDIG1L (ENSMLEG00000034438) NPC2 (ENSMLEG00000043459) ISCA2 (ENSMLEG00000031882) LTBP2 (ENSMLEG00000036452) AREL1 (ENSMLEG00000017085) ENSMLEG00000043413 YLPM1 (ENSMLEG00000041226) PROX2 (ENSMLEG00000044172) ENSMLEG00000031552 DLST (ENSMLEG00000037511) #22 RPS6KL1 (ENSMLEG00000037049) #23 PGF (ENSMLEG00000028938) EIF2B2 (ENSMLEG00000041601) MLH3 (ENSMLEG00000009239) ENSMLEG00000033619 ZC2HC1C (ENSMLEG00000040598) NEK9 (ENSMLEG00000038474) TMED10 (ENSMLEG00000038447) FOS (ENSMLEG00000040559) JDP2 (ENSMLEG00000038051) ENSMLEG00000041625 BATF (ENSMLEG00000033193) FLVCR2 (ENSMLEG00000042003) ERG28 (ENSMLEG00000034213) TTLL5 (ENSMLEG00000033082) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT01100000263540.A.b ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700.a.b ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d.b ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B.i ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954.bb ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000153883.a.a ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162939 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2365 BBOF1 (ENSRROG00000039245) ALDH6A1 (ENSRROG00000035589) LIN52 (ENSRROG00000038659) VSX2 (ENSRROG00000035399) ABCD4 (ENSRROG00000036607) VRTN (ENSRROG00000010435) SYNDIG1L (ENSRROG00000041128) NPC2 (ENSRROG00000037959) ISCA2 (ENSRROG00000030258) LTBP2 (ENSRROG00000036111) ENSRROG00000045039 AREL1 (ENSRROG00000031099) ENSRROG00000037201 YLPM1 (ENSRROG00000039845) PROX2 (ENSRROG00000033966) DLST (ENSRROG00000045190) #22 RPS6KL1 (ENSRROG00000033229) #23 PGF (ENSRROG00000034324) EIF2B2 (ENSRROG00000042761) MLH3 (ENSRROG00000029699) ENSRROG00000037333 ZC2HC1C (ENSRROG00000045324) NEK9 (ENSRROG00000011665) TMED10 (ENSRROG00000034110) FOS (ENSRROG00000038425) JDP2 (ENSRROG00000000567) ENSRROG00000034062 BATF (ENSRROG00000041232) FLVCR2 (ENSRROG00000042695) ERG28 (ENSRROG00000043806) TTLL5 (ENSRROG00000038675) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 656 ENTPD5 (ENSRBIG00000032979) BBOF1 (ENSRBIG00000031361) ALDH6A1 (ENSRBIG00000034701) LIN52 (ENSRBIG00000040121) VSX2 (ENSRBIG00000030815) ABCD4 (ENSRBIG00000031434) VRTN (ENSRBIG00000024397) SYNDIG1L (ENSRBIG00000032309) NPC2 (ENSRBIG00000030802) ISCA2 (ENSRBIG00000038871) LTBP2 (ENSRBIG00000029959) AREL1 (ENSRBIG00000042880) ENSRBIG00000035012 YLPM1 (ENSRBIG00000042494) PROX2 (ENSRBIG00000034329) DLST (ENSRBIG00000044815) #22 RPS6KL1 (ENSRBIG00000040806) #23 PGF (ENSRBIG00000031738) EIF2B2 (ENSRBIG00000040243) MLH3 (ENSRBIG00000031546) ENSRBIG00000028316 ZC2HC1C (ENSRBIG00000029182) NEK9 (ENSRBIG00000032887) TMED10 (ENSRBIG00000042626) FOS (ENSRBIG00000036327) JDP2 (ENSRBIG00000030082) ENSRBIG00000036437 BATF (ENSRBIG00000038010) FLVCR2 (ENSRBIG00000038928) ERG28 (ENSRBIG00000029268) TTLL5 (ENSRBIG00000044481) Hominoidea DUPLICATION Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00930000151014.g #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00930000151014.g #22 Orangutan MODERN SPECIES GIPC2 (ENSPPYG00000001218) DNAJB4 (ENSPPYG00000001217) FUBP1 (ENSPPYG00000001219) NEXN (ENSPPYG00000001220) MIGA1 (ENSPPYG00000001221) USP33 (ENSPPYG00000001222) ZZZ3 (ENSPPYG00000001223) AK5 (ENSPPYG00000001224) PIGK (ENSPPYG00000001225) ST6GALNAC5 (ENSPPYG00000001226) ST6GALNAC3 (ENSPPYG00000030574) ASB17 (ENSPPYG00000001228) MSH4 (ENSPPYG00000032071) RABGGTB (ENSPPYG00000001230) ACADM (ENSPPYG00000001231) ENSPPYG00000033221 #22 SLC44A5 (ENSPPYG00000001232) LHX8 (ENSPPYG00000001233) TYW3 (ENSPPYG00000001234) CRYZ (ENSPPYG00000001235) ERICH3 (ENSPPYG00000001236) FPGT (ENSPPYG00000001237) LRRC53 (ENSPPYG00000001238) LRRIQ3 (ENSPPYG00000039895) NEGR1 (ENSPPYG00000001239) ZRANB2 (ENSPPYG00000001240) PTGER3 (ENSPPYG00000001241) ENSPPYG00000037732 CTH (ENSPPYG00000001242) ENSPPYG00000001243 ANKRD13C (ENSPPYG00000001244) Hominoidea DUPLICATION Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00940000160251.h ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700.a.b ENSGT00910000148032 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d.b ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014.h.a #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B.j ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954.bb ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162939 ENSGT00940000155747 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700.a.b ENSGT00910000148032 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Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000164709.a.b.b.a.a.b.b.b.a.a.a.b.b ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00940000160251.h ENSGT00390000005700.a.b ENSGT00910000148032 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d.b ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014.h.a #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00940000166472 ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954.bb ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT00390000000153.l.a.cb.i.b.a.a ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162939 Human MODERN SPECIES 5 ENTPD5 (ENSG00000187097) BBOF1 (ENSG00000119636) ALDH6A1 (ENSG00000119711) LIN52 (ENSG00000205659) VSX2 (ENSG00000119614) ABCD4 (ENSG00000119688) VRTN (ENSG00000133980) SYNDIG1L (ENSG00000183379) NPC2 (ENSG00000119655) ISCA2 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ENSGT00800000124176 ENSGT00940000166472 ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954.bb ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT00390000000153.l.a.cb.i.b.a.a ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162939 Chimpanzee MODERN SPECIES 5 ALDH6A1 (ENSPTRG00000006531) ENSPTRG00000041719 LIN52 (ENSPTRG00000030700) VSX2 (ENSPTRG00000006532) ABCD4 (ENSPTRG00000006533) VRTN (ENSPTRG00000030698) SYNDIG1L (ENSPTRG00000006534) NPC2 (ENSPTRG00000006535) ENSPTRG00000045441 ISCA2 (ENSPTRG00000006536) LTBP2 (ENSPTRG00000006538) AREL1 (ENSPTRG00000006539) FCF1 (ENSPTRG00000006540) YLPM1 (ENSPTRG00000006541) PROX2 (ENSPTRG00000006542) DLST (ENSPTRG00000006543) #22 RPS6KL1 (ENSPTRG00000024146) #23 PGF (ENSPTRG00000006545) EIF2B2 (ENSPTRG00000006547) MLH3 (ENSPTRG00000006548) ACYP1 (ENSPTRG00000006549) ZC2HC1C (ENSPTRG00000006550) ENSPTRG00000048259 NEK9 (ENSPTRG00000006551) TMED10 (ENSPTRG00000052822) FOS (ENSPTRG00000047703) JDP2 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monkey MODERN SPECIES 825 BBOF1 (ENSANAG00000023794) ALDH6A1 (ENSANAG00000027801) LIN52 (ENSANAG00000022775) VSX2 (ENSANAG00000023147) ENSANAG00000022365 SYNDIG1L (ENSANAG00000024522) ENSANAG00000021950 NPC2 (ENSANAG00000035008) ENSANAG00000028498 LTBP2 (ENSANAG00000036688) ENSANAG00000023213 AREL1 (ENSANAG00000027921) ENSANAG00000026765 YLPM1 (ENSANAG00000024403) PROX2 (ENSANAG00000038021) DLST (ENSANAG00000035966) #22 RPS6KL1 (ENSANAG00000030516) #23 PGF (ENSANAG00000032847) EIF2B2 (ENSANAG00000025345) MLH3 (ENSANAG00000022727) ENSANAG00000026223 ZC2HC1C (ENSANAG00000026717) NEK9 (ENSANAG00000016195) TMED10 (ENSANAG00000022267) ENSANAG00000019432 FOS (ENSANAG00000029534) JDP2 (ENSANAG00000034209) BATF (ENSANAG00000031689) ERG28 (ENSANAG00000032608) FLVCR2 (ENSANAG00000026869) TTLL5 (ENSANAG00000035139) Cebidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b.k ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00940000160251.h.a 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Caniformia ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.c.b ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.f ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000162939 Canidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223.q ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 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ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.f ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 Dingo MODERN SPECIES 161 ENTPD5 (ENSCAFG00020004058) BBOF1 (ENSCAFG00020004003) ALDH6A1 (ENSCAFG00020003666) LIN52 (ENSCAFG00020003644) VSX2 (ENSCAFG00020003629) ENSCAFG00020003625 ENSCAFG00020003619 VRTN (ENSCAFG00020003595) ENSCAFG00020003586 ISCA2 (ENSCAFG00020003579) LTBP2 (ENSCAFG00020003464) AREL1 (ENSCAFG00020003085) ENSCAFG00020003053 YLPM1 (ENSCAFG00020002557) PROX2 (ENSCAFG00020002501) DLST (ENSCAFG00020002488) #22 RPS6KL1 (ENSCAFG00020002467) #23 PGF (ENSCAFG00020002459) EIF2B2 (ENSCAFG00020002450) MLH3 (ENSCAFG00020002443) ENSCAFG00020002438 ZC2HC1C (ENSCAFG00020002433) NEK9 (ENSCAFG00020002125) TMED10 (ENSCAFG00020002100) ENSCAFG00020002090 FOS (ENSCAFG00020002082) JDP2 (ENSCAFG00020002072) BATF (ENSCAFG00020002062) ENSCAFG00020002058 FLVCR2 (ENSCAFG00020002054) ERG28 (ENSCAFG00020002048) Dog MODERN SPECIES 36 ALDH6A1 (ENSCAFG00845013992) LIN52 (ENSCAFG00845014059) VSX2 (ENSCAFG00845014112) ENSCAFG00845014165 ENSCAFG00845014218 ENSCAFG00845014241 ENSCAFG00845014257 NPC2 (ENSCAFG00845014286) ISCA2 (ENSCAFG00845014307) LTBP2 (ENSCAFG00845014362) AREL1 (ENSCAFG00845014520) FCF1 (ENSCAFG00845014562) YLPM1 (ENSCAFG00845014628) ENSCAFG00845014672 ENSCAFG00845014690 DLST (ENSCAFG00845014735) #22 RPS6KL1 (ENSCAFG00845014807) #23 ENSCAFG00845014841 EIF2B2 (ENSCAFG00845014894) MLH3 (ENSCAFG00845014944) ACYP1 (ENSCAFG00845015059) ZC2HC1C (ENSCAFG00845015123) NEK9 (ENSCAFG00845015171) TMED10 (ENSCAFG00845015221) ENSCAFG00845015259 FOS (ENSCAFG00845015304) JDP2 (ENSCAFG00845015414) BATF (ENSCAFG00845015458) FLVCR2 (ENSCAFG00845015506) ENSCAFG00845015573 TTLL5 (ENSCAFG00845015662) Red fox MODERN SPECIES 71 BBOF1 (ENSVVUG00000004994) ALDH6A1 (ENSVVUG00000005031) LIN52 (ENSVVUG00000005034) VSX2 (ENSVVUG00000005042) ABCD4 (ENSVVUG00000005058) VRTN (ENSVVUG00000005086) SYNDIG1L (ENSVVUG00000005089) NPC2 (ENSVVUG00000005100) ISCA2 (ENSVVUG00000005108) LTBP2 (ENSVVUG00000005123) ENSVVUG00000005169 AREL1 (ENSVVUG00000005173) YLPM1 (ENSVVUG00000005181) ENSVVUG00000005198 PROX2 (ENSVVUG00000005203) DLST (ENSVVUG00000005214) #22 RPS6KL1 (ENSVVUG00000005216) #23 PGF (ENSVVUG00000005220) ENSVVUG00000005229 MLH3 (ENSVVUG00000005236) ENSVVUG00000005257 ZC2HC1C (ENSVVUG00000005265) NEK9 (ENSVVUG00000005288) TMED10 (ENSVVUG00000005652) FOS (ENSVVUG00000005656) JDP2 (ENSVVUG00000005661) BATF (ENSVVUG00000005666) FLVCR2 (ENSVVUG00000005669) ENSVVUG00000005675 ERG28 (ENSVVUG00000005717) TTLL5 (ENSVVUG00000005760) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.c.b ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 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ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.f ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162939 ENSGT00940000155747 leopard MODERN SPECIES 109 BBOF1 (ENSPPRG00000018080) ALDH6A1 (ENSPPRG00000016252) LIN52 (ENSPPRG00000014701) VSX2 (ENSPPRG00000014452) ABCD4 (ENSPPRG00000014193) ENSPPRG00000020217 SYNDIG1L (ENSPPRG00000012500) NPC2 (ENSPPRG00000012026) ISCA2 (ENSPPRG00000011662) LTBP2 (ENSPPRG00000010146) AREL1 (ENSPPRG00000006846) ENSPPRG00000006398 YLPM1 (ENSPPRG00000005704) ENSPPRG00000004808 ENSPPRG00000004385 DLST (ENSPPRG00000004226) #22 RPS6KL1 (ENSPPRG00000003181) #23 PGF (ENSPPRG00000001100) EIF2B2 (ENSPPRG00000000321) MLH3 (ENSPPRG00000022709) ENSPPRG00000023976 ZC2HC1C (ENSPPRG00000024260) NEK9 (ENSPPRG00000022516) TMED10 (ENSPPRG00000019952) FOS (ENSPPRG00000019513) JDP2 (ENSPPRG00000018181) BATF (ENSPPRG00000016427) FLVCR2 (ENSPPRG00000015729) ERG28 (ENSPPRG00000012901) TTLL5 (ENSPPRG00000012572) TGFB3 (ENSPPRG00000008430) lion MODERN SPECIES 6 ALDH6A1 (ENSPLOG00000001208) LIN52 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(ENSPTIG00000016165) NPC2 (ENSPTIG00000016030) ISCA2 (ENSPTIG00000016002) ENSPTIG00000015991 AREL1 (ENSPTIG00000015968) ENSPTIG00000015948 YLPM1 (ENSPTIG00000015893) PROX2 (ENSPTIG00000015867) DLST (ENSPTIG00000015793) #22 RPS6KL1 (ENSPTIG00000015758) #23 PGF (ENSPTIG00000015737) EIF2B2 (ENSPTIG00000015724) MLH3 (ENSPTIG00000015702) ENSPTIG00000015684 ZC2HC1C (ENSPTIG00000015672) NEK9 (ENSPTIG00000015640) TMED10 (ENSPTIG00000015563) FOS (ENSPTIG00000015550) JDP2 (ENSPTIG00000015529) BATF (ENSPTIG00000015520) ERG28 (ENSPTIG00000015488) FLVCR2 (ENSPTIG00000015461) TTLL5 (ENSPTIG00000015299) TGFB3 (ENSPTIG00000015253) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00530000064848 ENSGT00940000153117.B.c.b ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.f ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162939 ENSGT00940000155747 Equus ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.f.b.b ENSGT01030000234625.B.d.e.b ENSGT01030000234625.B.d.f.a ENSGT00390000010925 Donkey MODERN SPECIES 27 BBOF1 (ENSEASG00005011653) ALDH6A1 (ENSEASG00005011664) LIN52 (ENSEASG00005031315) VSX2 (ENSEASG00005011673) ABCD4 (ENSEASG00005011677) VRTN (ENSEASG00005011680) SYNDIG1L (ENSEASG00005011683) NPC2 (ENSEASG00005023991) ISCA2 (ENSEASG00005032166) LTBP2 (ENSEASG00005011719) ENSEASG00005012000 AREL1 (ENSEASG00005012006) FCF1 (ENSEASG00005012011) YLPM1 (ENSEASG00005012016) ENSEASG00005032702 DLST (ENSEASG00005012025) #22 RPS6KL1 (ENSEASG00005012030) #23 PGF (ENSEASG00005012033) EIF2B2 (ENSEASG00005012035) MLH3 (ENSEASG00005012041) ENSEASG00005033366 ZC2HC1C (ENSEASG00005012049) NEK9 (ENSEASG00005012069) TMED10 (ENSEASG00005012384) FOS (ENSEASG00005012390) ENSEASG00005025547 BATF (ENSEASG00005037745) ENSEASG00005019748 ENSEASG00005037343 ENSEASG00005026680 ENSEASG00005028828 Horse MODERN SPECIES 16 ENSECAG00000057994 ALDH6A1 (ENSECAG00000009453) LIN52 (ENSECAG00000022953) ENSECAG00000048527 VSX2 (ENSECAG00000023780) ABCD4 (ENSECAG00000000282) VRTN (ENSECAG00000038256) SYNDIG1L (ENSECAG00000018296) NPC2 (ENSECAG00000018345) ISCA2 (ENSECAG00000018007) LTBP2 (ENSECAG00000018631) AREL1 (ENSECAG00000059545) FCF1 (ENSECAG00000008261) YLPM1 (ENSECAG00000016305) ENSECAG00000023529 DLST (ENSECAG00000000273) #22 RPS6KL1 (ENSECAG00000014056) #23 PGF (ENSECAG00000031273) EIF2B2 (ENSECAG00000000332) MLH3 (ENSECAG00000008011) ZC2HC1C (ENSECAG00000017661) NEK9 (ENSECAG00000018489) TMED10 (ENSECAG00000008831) FOS (ENSECAG00000014260) JDP2 (ENSECAG00000034290) ENSECAG00000017937 BATF (ENSECAG00000016422) ENSECAG00000055708 ENSECAG00000056517 ENSECAG00000055095 ENSECAG00000051647 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00530000064848 ENSGT00940000153117.B.c.b ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.f ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162939 ENSGT00940000155747 Megabat MODERN SPECIES 922 BBOF1 (ENSPVAG00000000644) ALDH6A1 (ENSPVAG00000000645) LIN52 (ENSPVAG00000000646) VSX2 (ENSPVAG00000000647) ABCD4 (ENSPVAG00000000648) VRTN (ENSPVAG00000000649) SYNDIG1L (ENSPVAG00000000650) NPC2 (ENSPVAG00000000651) ISCA2 (ENSPVAG00000000652) LTBP2 (ENSPVAG00000000653) AREL1 (ENSPVAG00000000655) ENSPVAG00000000656 FCF1 (ENSPVAG00000000657) YLPM1 (ENSPVAG00000000658) PROX2 (ENSPVAG00000000659) DLST (ENSPVAG00000000660) #22 RPS6KL1 (ENSPVAG00000000661) #23 PGF (ENSPVAG00000000662) EIF2B2 (ENSPVAG00000000663) MLH3 (ENSPVAG00000000664) ENSPVAG00000000666 NEK9 (ENSPVAG00000000667) TMED10 (ENSPVAG00000000670) FOS (ENSPVAG00000000671) JDP2 (ENSPVAG00000000672) BATF (ENSPVAG00000000674) FLVCR2 (ENSPVAG00000000675) ERG28 (ENSPVAG00000000677) TTLL5 (ENSPVAG00000000679) TGFB3 (ENSPVAG00000000681) IFT43 (ENSPVAG00000000683) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT01100000263540.A.b ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.f ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162939 ENSGT00940000155747 Microbat MODERN SPECIES 1172 VSX2 (ENSMLUG00000010090) ABCD4 (ENSMLUG00000004541) SYNDIG1L (ENSMLUG00000004551) NPC2 (ENSMLUG00000004558) ENSMLUG00000029419 ENSMLUG00000012381 ENSMLUG00000022193 YLPM1 (ENSMLUG00000004983) PROX2 (ENSMLUG00000005898) DLST (ENSMLUG00000005909) #22 RPS6KL1 (ENSMLUG00000005917) #23 ENSMLUG00000005931 ENSMLUG00000005942 MLH3 (ENSMLUG00000005949) ENSMLUG00000007742 ZC2HC1C (ENSMLUG00000010524) NEK9 (ENSMLUG00000010541) ENSMLUG00000017125 FOS (ENSMLUG00000003729) ENSMLUG00000002256 BATF (ENSMLUG00000013360) FLVCR2 (ENSMLUG00000013362) ERG28 (ENSMLUG00000013376) TTLL5 (ENSMLUG00000013381) TGFB3 (ENSMLUG00000013406) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 24 ENTPD5 (ENSRFEG00010002649) BBOF1 (ENSRFEG00010002580) ALDH6A1 (ENSRFEG00010002445) LIN52 (ENSRFEG00010002408) VSX2 (ENSRFEG00010002363) ABCD4 (ENSRFEG00010002301) VRTN (ENSRFEG00010002267) SYNDIG1L (ENSRFEG00010002259) NPC2 (ENSRFEG00010002250) ISCA2 (ENSRFEG00010002215) LTBP2 (ENSRFEG00010002042) AREL1 (ENSRFEG00010001938) ENSRFEG00010001893 YLPM1 (ENSRFEG00010001752) ENSRFEG00010001697 DLST (ENSRFEG00010001634) #22 RPS6KL1 (ENSRFEG00010001576) #23 PGF (ENSRFEG00010001542) EIF2B2 (ENSRFEG00010001498) MLH3 (ENSRFEG00010001317) ZC2HC1C (ENSRFEG00010001234) NEK9 (ENSRFEG00010001168) TMED10 (ENSRFEG00010001139) FOS (ENSRFEG00010001112) JDP2 (ENSRFEG00010001081) BATF (ENSRFEG00010001057) ERG28 (ENSRFEG00010001031) FLVCR2 (ENSRFEG00010000978) TTLL5 (ENSRFEG00010000797) TGFB3 (ENSRFEG00010000739) IFT43 (ENSRFEG00010000684) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00530000064848 ENSGT00940000153117.B.c.b ENSGT00940000153117.B.c.a ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00990000207089 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.f ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162939 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00530000064848 ENSGT00940000153117.B.c.b ENSGT00940000153117.B.c.a ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00990000207089 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.f ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162939 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.c.a ENSGT00530000064848 ENSGT00940000153117.B.c.b ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.f ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162939 ENSGT00940000155747 Arabian camel MODERN SPECIES 32 ENTPD5 (ENSCDRG00005008760) BBOF1 (ENSCDRG00005008989) ALDH6A1 (ENSCDRG00005000113) LIN52 (ENSCDRG00005000203) VSX2 (ENSCDRG00005000228) ABCD4 (ENSCDRG00005000282) VRTN (ENSCDRG00005000338) SYNDIG1L (ENSCDRG00005000359) NPC2 (ENSCDRG00005000375) ISCA2 (ENSCDRG00005000399) LTBP2 (ENSCDRG00005000468) AREL1 (ENSCDRG00005000590) FCF1 (ENSCDRG00005000630) YLPM1 (ENSCDRG00005000671) ENSCDRG00005000746 DLST 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ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00990000207089 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.f ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162939 Pecora ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.c.a ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.f ENSGT00390000010925.c.a ENSGT00940000162939 ENSGT00940000155747 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.c.a ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.f ENSGT00390000010925.c.a ENSGT00940000162939 ENSGT00940000155747 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00990000210987 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.c.a ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.f.e.a ENSGT00390000010925.d ENSGT00940000162939 ENSGT00940000155747 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00990000210987 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00390000010172.y ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.f.e.a ENSGT01030000234625.B.d.f.e.b ENSGT00390000010925.c.a Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 23 ALDH6A1 (ENSOARG00020014015) LIN52 (ENSOARG00020014138) VSX2 (ENSOARG00020014208) ABCD4 (ENSOARG00020014282) VRTN (ENSOARG00020014385) SYNDIG1L (ENSOARG00020014401) NPC2 (ENSOARG00020014455) ISCA2 (ENSOARG00020014514) LTBP2 (ENSOARG00020014686) ENSOARG00020015656 ENSOARG00020015685 AREL1 (ENSOARG00020015742) FCF1 (ENSOARG00020015954) YLPM1 (ENSOARG00020016026) ENSOARG00020016649 DLST (ENSOARG00020016709) #22 RPS6KL1 (ENSOARG00020016765) #23 PGF (ENSOARG00020016856) ENSOARG00020017002 EIF2B2 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ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00990000210987 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.c.a ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.f.e.a ENSGT01030000234625.B.d.e.a ENSGT00390000010925.c.b.a.a ENSGT00940000162939 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.c.a ENSGT00940000153117.B.c.b ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.f.e.a ENSGT01030000234625.B.d.f.e.b ENSGT00940000162939 ENSGT00390000010925.c.a Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 1 ALDH6A1 (ENSBIXG00005026295) LIN52 (ENSBIXG00005026222) VSX2 (ENSBIXG00005026200) ABCD4 (ENSBIXG00005026163) VRTN (ENSBIXG00005026108) SYNDIG1L (ENSBIXG00005026092) NPC2 (ENSBIXG00005026057) ENSBIXG00005026039 LTBP2 (ENSBIXG00005025977) ENSBIXG00005025782 AREL1 (ENSBIXG00005006183) ENSBIXG00005025743 ENSBIXG00005004386 YLPM1 (ENSBIXG00005025680) ENSBIXG00005025629 DLST (ENSBIXG00005007402) #22 RPS6KL1 (ENSBIXG00005025559) #23 PGF (ENSBIXG00005025480) EIF2B2 (ENSBIXG00005025394) MLH3 (ENSBIXG00005025342) ENSBIXG00005025275 ZC2HC1C (ENSBIXG00005025227) NEK9 (ENSBIXG00005025200) TMED10 (ENSBIXG00005025171) FOS (ENSBIXG00005025139) JDP2 (ENSBIXG00005025082) ENSBIXG00005025026 BATF (ENSBIXG00005025002) ENSBIXG00005024965 ENSBIXG00005024804 ENSBIXG00005024769 Cow MODERN SPECIES 1 ENSBTAG00000053938 ALDH6A1 (ENSBTAG00000018469) LIN52 (ENSBTAG00000030557) VSX2 (ENSBTAG00000014632) ABCD4 (ENSBTAG00000014633) VRTN (ENSBTAG00000005774) SYNDIG1L (ENSBTAG00000052950) NPC2 (ENSBTAG00000021955) ISCA2 (ENSBTAG00000021956) LTBP2 (ENSBTAG00000021957) ENSBTAG00000050205 AREL1 (ENSBTAG00000020379) FCF1 (ENSBTAG00000020381) YLPM1 (ENSBTAG00000008287) PROX2 (ENSBTAG00000015052) DLST (ENSBTAG00000006463) #22 RPS6KL1 (ENSBTAG00000006688) #23 PGF (ENSBTAG00000013688) EIF2B2 (ENSBTAG00000008664) MLH3 (ENSBTAG00000019279) ACYP1 (ENSBTAG00000013992) ZC2HC1C (ENSBTAG00000013983) NEK9 (ENSBTAG00000016612) TMED10 (ENSBTAG00000005694) FOS (ENSBTAG00000004322) JDP2 (ENSBTAG00000009451) BATF (ENSBTAG00000025405) FLVCR2 (ENSBTAG00000040078) ENSBTAG00000011985 ERG28 (ENSBTAG00000011987) TTLL5 (ENSBTAG00000025403) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00990000210987 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.e.a ENSGT00390000010925.c.b.a.a ENSGT00390000010925.c.a ENSGT00940000162939 Domestic yak MODERN SPECIES 2 LIN52 (ENSBGRG00000006226) VSX2 (ENSBGRG00000006307) ABCD4 (ENSBGRG00000006381) VRTN (ENSBGRG00000006578) SYNDIG1L (ENSBGRG00000006594) NPC2 (ENSBGRG00000006618) ISCA2 (ENSBGRG00000006642) LTBP2 (ENSBGRG00000006692) ENSBGRG00000006766 ENSBGRG00000006783 AREL1 (ENSBGRG00000006814) ENSBGRG00000006917 YLPM1 (ENSBGRG00000007101) ENSBGRG00000007592 ENSBGRG00000007645 DLST (ENSBGRG00000007671) #22 RPS6KL1 (ENSBGRG00000007964) #23 PGF (ENSBGRG00000008113) EIF2B2 (ENSBGRG00000008344) MLH3 (ENSBGRG00000008456) ENSBGRG00000008858 ZC2HC1C (ENSBGRG00000008922) NEK9 (ENSBGRG00000008973) TMED10 (ENSBGRG00000009052) FOS (ENSBGRG00000009096) JDP2 (ENSBGRG00000009251) ENSBGRG00000009350 ENSBGRG00000009398 ENSBGRG00000009425 ERG28 (ENSBGRG00000009468) TTLL5 (ENSBGRG00000009576) Wild yak MODERN SPECIES 1230 VSX2 (ENSBMUG00000007282) ABCD4 (ENSBMUG00000007298) SYNDIG1L (ENSBMUG00000007323) NPC2 (ENSBMUG00000007338) ISCA2 (ENSBMUG00000007353) LTBP2 (ENSBMUG00000007454) ENSBMUG00000007472 AREL1 (ENSBMUG00000007478) ENSBMUG00000007493 YLPM1 (ENSBMUG00000007507) ENSBMUG00000007517 DLST (ENSBMUG00000007522) #22 RPS6KL1 (ENSBMUG00000007535) #23 PGF (ENSBMUG00000007539) EIF2B2 (ENSBMUG00000007544) MLH3 (ENSBMUG00000007555) ENSBMUG00000007560 ZC2HC1C (ENSBMUG00000007566) NEK9 (ENSBMUG00000007574) TMED10 (ENSBMUG00000007579) FOS (ENSBMUG00000007590) JDP2 (ENSBMUG00000007601) BATF (ENSBMUG00000007615) American bison MODERN SPECIES 3282 BBOF1 (ENSBBBG00000003080) ALDH6A1 (ENSBBBG00000003099) LIN52 (ENSBBBG00000003104) VSX2 (ENSBBBG00000014020) ABCD4 (ENSBBBG00000003123) VRTN (ENSBBBG00000003129) SYNDIG1L (ENSBBBG00000014055) NPC2 (ENSBBBG00000014061) ISCA2 (ENSBBBG00000014070) LTBP2 (ENSBBBG00000003189) AREL1 (ENSBBBG00000003202) ENSBBBG00000014171 YLPM1 (ENSBBBG00000014199) PROX2 (ENSBBBG00000002886) ENSBBBG00000014217 DLST (ENSBBBG00000003225) #22 PGF (ENSBBBG00000014283) EIF2B2 (ENSBBBG00000003247) MLH3 (ENSBBBG00000014333) ENSBBBG00000014347 ZC2HC1C (ENSBBBG00000014352) NEK9 (ENSBBBG00000014365) TMED10 (ENSBBBG00000014371) FOS (ENSBBBG00000014386) JDP2 (ENSBBBG00000001407) BATF (ENSBBBG00000014403) ENSBBBG00000014424 ENSBBBG00000014438 Siberian musk deer MODERN SPECIES 260 BBOF1 (ENSMMSG00000021217) ALDH6A1 (ENSMMSG00000021323) LIN52 (ENSMMSG00000021369) VSX2 (ENSMMSG00000021411) ABCD4 (ENSMMSG00000021448) VRTN (ENSMMSG00000021493) 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(ENSCHYG00000005805) PROX2 (ENSCHYG00000006125) DLST (ENSCHYG00000006173) #22 RPS6KL1 (ENSCHYG00000006336) #23 ENSCHYG00000006497 EIF2B2 (ENSCHYG00000006598) MLH3 (ENSCHYG00000006695) ZC2HC1C (ENSCHYG00000006886) NEK9 (ENSCHYG00000006917) TMED10 (ENSCHYG00000007018) FOS (ENSCHYG00000007069) ENSCHYG00000007218 JDP2 (ENSCHYG00000007237) BATF (ENSCHYG00000007278) ENSCHYG00000007326 ENSCHYG00000007628 ENSCHYG00000007651 TTLL5 (ENSCHYG00000007731) Cetacea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223.p ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00910000147973 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000158980.b ENSGT00940000159276 ENSGT00990000207089 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.f ENSGT00390000010925 Blue whale MODERN SPECIES 11 ENTPD5 (ENSBMSG00010006501) BBOF1 (ENSBMSG00010006525) ENSBMSG00010006546 LIN52 (ENSBMSG00010006623) VSX2 (ENSBMSG00010006660) ABCD4 (ENSBMSG00010006684) SYNDIG1L (ENSBMSG00010006725) ENSBMSG00010006750 ISCA2 (ENSBMSG00010006777) LTBP2 (ENSBMSG00010006856) AREL1 (ENSBMSG00010006958) ENSBMSG00010006980 ENSBMSG00010006988 YLPM1 (ENSBMSG00010007012) ENSBMSG00010007040 DLST (ENSBMSG00010007068) #22 RPS6KL1 (ENSBMSG00010007119) #23 PGF (ENSBMSG00010007155) EIF2B2 (ENSBMSG00010007177) MLH3 (ENSBMSG00010007225) ENSBMSG00010007280 ZC2HC1C (ENSBMSG00010007296) NEK9 (ENSBMSG00010007311) TMED10 (ENSBMSG00010007334) ENSBMSG00010007349 FOS (ENSBMSG00010007361) JDP2 (ENSBMSG00010007385) FLVCR2 (ENSBMSG00010007550) ENSBMSG00010007570 ERG28 (ENSBMSG00010007579) TTLL5 (ENSBMSG00010007632) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000008092.a.k.b ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223.p ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00910000147973 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000158980.b ENSGT00940000159276 ENSGT00990000207089 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.f ENSGT00390000010925 Sperm whale MODERN SPECIES 2 ENSPCTG00005022468 ALDH6A1 (ENSPCTG00005022500) LIN52 (ENSPCTG00005022555) VSX2 (ENSPCTG00005022587) ABCD4 (ENSPCTG00005022592) VRTN (ENSPCTG00005022596) SYNDIG1L (ENSPCTG00005022606) NPC2 (ENSPCTG00005022616) ISCA2 (ENSPCTG00005022629) LTBP2 (ENSPCTG00005022652) ENSPCTG00005022671 AREL1 (ENSPCTG00005022673) FCF1 (ENSPCTG00005022674) YLPM1 (ENSPCTG00005022679) ENSPCTG00005022683 DLST (ENSPCTG00005022685) #22 ENSPCTG00005022692 #23 PGF (ENSPCTG00005022697) EIF2B2 (ENSPCTG00005022702) ACYP1 (ENSPCTG00005022706) ZC2HC1C (ENSPCTG00005022709) TMED10 (ENSPCTG00005022711) ENSPCTG00005022712 BATF (ENSPCTG00005022713) FLVCR2 (ENSPCTG00005022714) ERG28 (ENSPCTG00005022716) TTLL5 (ENSPCTG00005022718) ENSPCTG00005022725 GPATCH2L (ENSPCTG00005022727) IFT43 (ENSPCTG00005022728) ENSPCTG00005022729 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000008092.a.k.b ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223.p ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00910000147973 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000158980.b ENSGT00940000159276 ENSGT00990000207089 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.f ENSGT00390000010925 Dolphin MODERN SPECIES 25 YLPM1 (ENSTTRG00000001907) PROX2 (ENSTTRG00000001912) DLST (ENSTTRG00000001915) #22 RPS6KL1 (ENSTTRG00000001917) #23 PGF (ENSTTRG00000001918) EIF2B2 (ENSTTRG00000001921) MLH3 (ENSTTRG00000001923) ACYP1 (ENSTTRG00000001925) ZC2HC1C (ENSTTRG00000001926) NEK9 (ENSTTRG00000001928) Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000008092.a.k.b ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223.p ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00910000147973 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000158980.b ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.f ENSGT00940000157848.e.b ENSGT00390000010925 Vaquita MODERN SPECIES 11 ENSPSNG00000017159 ALDH6A1 (ENSPSNG00000017217) LIN52 (ENSPSNG00000017321) VSX2 (ENSPSNG00000017375) ABCD4 (ENSPSNG00000017443) VRTN (ENSPSNG00000017561) SYNDIG1L (ENSPSNG00000017585) ENSPSNG00000017639 ENSPSNG00000017665 LTBP2 (ENSPSNG00000017786) ENSPSNG00000017877 AREL1 (ENSPSNG00000017910) FCF1 (ENSPSNG00000017954) YLPM1 (ENSPSNG00000009718) ENSPSNG00000009885 DLST (ENSPSNG00000009959) #22 RPS6KL1 (ENSPSNG00000010039) #23 PGF (ENSPSNG00000010102) EIF2B2 (ENSPSNG00000010274) MLH3 (ENSPSNG00000010427) ENSPSNG00000010828 ZC2HC1C (ENSPSNG00000010910) NEK9 (ENSPSNG00000010998) TMED10 (ENSPSNG00000011085) ENSPSNG00000011136 FOS (ENSPSNG00000011265) JDP2 (ENSPSNG00000011391) BATF (ENSPSNG00000011426) FLVCR2 (ENSPSNG00000011492) ENSPSNG00000011652 ENSPSNG00000011740 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223.p ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00390000013771.d ENSGT00910000147973 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000158980.b ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.f ENSGT00940000157848.e.b ENSGT00390000010925 Narwhal MODERN SPECIES 308 ALDH6A1 (ENSMMNG00015015950) LIN52 (ENSMMNG00015015990) VSX2 (ENSMMNG00015016032) ABCD4 (ENSMMNG00015016106) VRTN (ENSMMNG00015016199) SYNDIG1L (ENSMMNG00015016210) ENSMMNG00015016236 ISCA2 (ENSMMNG00015016275) LTBP2 (ENSMMNG00015016409) ENSMMNG00015016679 AREL1 (ENSMMNG00015016706) FCF1 (ENSMMNG00015016775) ENSMMNG00015016846 YLPM1 (ENSMMNG00015016889) ENSMMNG00015016949 DLST (ENSMMNG00015016974) #22 RPS6KL1 (ENSMMNG00015017009) #23 PGF (ENSMMNG00015017047) EIF2B2 (ENSMMNG00015017142) MLH3 (ENSMMNG00015017206) ENSMMNG00015017395 ZC2HC1C (ENSMMNG00015017432) NEK9 (ENSMMNG00015017473) TMED10 (ENSMMNG00015017595) ENSMMNG00015017621 FOS (ENSMMNG00015017653) JDP2 (ENSMMNG00015017702) BATF (ENSMMNG00015017732) FLVCR2 (ENSMMNG00015017770) ENSMMNG00015017843 ERG28 (ENSMMNG00015017871) Beluga whale MODERN SPECIES 24 ENSDLEG00000004670 VSX2 (ENSDLEG00000004663) ABCD4 (ENSDLEG00000004639) VRTN (ENSDLEG00000004633) SYNDIG1L (ENSDLEG00000004630) NPC2 (ENSDLEG00000004626) ISCA2 (ENSDLEG00000004621) ENSDLEG00000004618 ENSDLEG00000004617 ENSDLEG00000004614 ENSDLEG00000004609 AREL1 (ENSDLEG00000004596) FCF1 (ENSDLEG00000004582) YLPM1 (ENSDLEG00000004568) PROX2 (ENSDLEG00000004556) DLST (ENSDLEG00000004541) #22 RPS6KL1 (ENSDLEG00000004528) #23 PGF (ENSDLEG00000004519) EIF2B2 (ENSDLEG00000004507) MLH3 (ENSDLEG00000004489) ACYP1 (ENSDLEG00000004481) ZC2HC1C (ENSDLEG00000004476) NEK9 (ENSDLEG00000004467) TMED10 (ENSDLEG00000004453) FOS (ENSDLEG00000004446) JDP2 (ENSDLEG00000004438) BATF (ENSDLEG00000004433) ENSDLEG00000004427 FLVCR2 (ENSDLEG00000004419) ENSDLEG00000004414 TTLL5 (ENSDLEG00000004346) Suina ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00900000143158 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.c.a ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.f ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162939 ENSGT00940000155747 Chacoan peccary MODERN SPECIES 885 BBOF1 (ENSCWAG00000020575) ALDH6A1 (ENSCWAG00000020593) LIN52 (ENSCWAG00000020608) VSX2 (ENSCWAG00000020616) ABCD4 (ENSCWAG00000020632) VRTN (ENSCWAG00000020682) SYNDIG1L (ENSCWAG00000020686) NPC2 (ENSCWAG00000020691) ENSCWAG00000020697 LTBP2 (ENSCWAG00000020735) ENSCWAG00000020814 AREL1 (ENSCWAG00000020824) FCF1 (ENSCWAG00000020846) YLPM1 (ENSCWAG00000020891) ENSCWAG00000020923 DLST (ENSCWAG00000020938) #22 RPS6KL1 (ENSCWAG00000020956) #23 PGF (ENSCWAG00000020978) EIF2B2 (ENSCWAG00000021011) MLH3 (ENSCWAG00000021039) ENSCWAG00000021059 ENSCWAG00000021069 NEK9 (ENSCWAG00000021083) TMED10 (ENSCWAG00000021099) FOS (ENSCWAG00000021112) JDP2 (ENSCWAG00000021133) BATF (ENSCWAG00000021146) FLVCR2 (ENSCWAG00000021161) ERG28 (ENSCWAG00000021179) TTLL5 (ENSCWAG00000021198) TGFB3 (ENSCWAG00000021233) Pig MODERN SPECIES 15 BBOF1 (ENSSSCG00000002356) ALDH6A1 (ENSSSCG00000002357) LIN52 (ENSSSCG00000055314) VSX2 (ENSSSCG00000002363) ABCD4 (ENSSSCG00000038231) VRTN (ENSSSCG00000002361) SYNDIG1L (ENSSSCG00000025000) NPC2 (ENSSSCG00000002366) ISCA2 (ENSSSCG00000002367) LTBP2 (ENSSSCG00000002368) ENSSSCG00000031305 AREL1 (ENSSSCG00000002370) FCF1 (ENSSSCG00000039202) YLPM1 (ENSSSCG00000002372) PROX2 (ENSSSCG00000002373) DLST (ENSSSCG00000002374) #22 RPS6KL1 (ENSSSCG00000002375) #23 PGF (ENSSSCG00000050616) EIF2B2 (ENSSSCG00000002377) ENSSSCG00000051291 MLH3 (ENSSSCG00000002378) ENSSSCG00000002379 ZC2HC1C (ENSSSCG00000002380) NEK9 (ENSSSCG00000002381) TMED10 (ENSSSCG00000035684) FOS (ENSSSCG00000002383) JDP2 (ENSSSCG00000035895) BATF (ENSSSCG00000055470) FLVCR2 (ENSSSCG00000021606) ERG28 (ENSSSCG00000036494) TTLL5 (ENSSSCG00000025984) Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00930000151014 #22 Hedgehog MODERN SPECIES 2051 DLST (ENSEEUG00000005769) #22 Common shrew MODERN SPECIES 1455 DLST (ENSSARG00000004980) #22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01100000263540.A.b ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000155747 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01100000263540.A.b ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000155747 Tenrec MODERN SPECIES 1947 AREL1 (ENSETEG00000009057) FCF1 (ENSETEG00000009062) YLPM1 (ENSETEG00000009066) DLST (ENSETEG00000009071) #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01100000263540.A.b ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B.d ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000155747 Elephant MODERN SPECIES 602 ENTPD5 (ENSLAFG00000010902) BBOF1 (ENSLAFG00000002530) ALDH6A1 (ENSLAFG00000002533) LIN52 (ENSLAFG00000002534) VSX2 (ENSLAFG00000002863) ABCD4 (ENSLAFG00000002865) VRTN (ENSLAFG00000026239) SYNDIG1L (ENSLAFG00000004416) NPC2 (ENSLAFG00000002876) ISCA2 (ENSLAFG00000001607) LTBP2 (ENSLAFG00000001609) AREL1 (ENSLAFG00000002793) ENSLAFG00000000724 YLPM1 (ENSLAFG00000012536) PROX2 (ENSLAFG00000012545) DLST (ENSLAFG00000012552) #22 RPS6KL1 (ENSLAFG00000032632) #23 PGF (ENSLAFG00000016611) EIF2B2 (ENSLAFG00000016616) MLH3 (ENSLAFG00000022310) ENSLAFG00000016628 ZC2HC1C (ENSLAFG00000023104) NEK9 (ENSLAFG00000013150) TMED10 (ENSLAFG00000022769) FOS (ENSLAFG00000029435) JDP2 (ENSLAFG00000025757) BATF (ENSLAFG00000011315) FLVCR2 (ENSLAFG00000014461) ERG28 (ENSLAFG00000004755) TTLL5 (ENSLAFG00000007694) TGFB3 (ENSLAFG00000022584) Hyrax MODERN SPECIES 1571 YLPM1 (ENSPCAG00000006232) PROX2 (ENSPCAG00000006424) DLST (ENSPCAG00000006509) #22 ENSPCAG00000006580 #23 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000015152 ENSGT01100000263540.A.b ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00530000064848 ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000155747 Sloth MODERN SPECIES 1768 ENSCHOG00000007501 #22 Armadillo MODERN SPECIES 1229 COQ6 (ENSDNOG00000015448) ENTPD5 (ENSDNOG00000039070) BBOF1 (ENSDNOG00000024781) ALDH6A1 (ENSDNOG00000024213) LIN52 (ENSDNOG00000038226) VSX2 (ENSDNOG00000005036) ENSDNOG00000032858 ABCD4 (ENSDNOG00000008122) SYNDIG1L (ENSDNOG00000032053) ENSDNOG00000016210 ISCA2 (ENSDNOG00000034125) LTBP2 (ENSDNOG00000016211) AREL1 (ENSDNOG00000003340) YLPM1 (ENSDNOG00000039154) PROX2 (ENSDNOG00000005528) DLST (ENSDNOG00000033083) #22 RPS6KL1 (ENSDNOG00000045055) #23 PGF (ENSDNOG00000042336) EIF2B2 (ENSDNOG00000032838) MLH3 (ENSDNOG00000048962) ENSDNOG00000047029 ZC2HC1C (ENSDNOG00000046626) NEK9 (ENSDNOG00000001965) TMED10 (ENSDNOG00000019851) FOS (ENSDNOG00000031516) ENSDNOG00000038922 JDP2 (ENSDNOG00000033141) BATF (ENSDNOG00000047121) FLVCR2 (ENSDNOG00000034014) ERG28 (ENSDNOG00000017697) ENSDNOG00000004904 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01040000244584 ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000155747 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01040000244584 ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000155747 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01040000244584 ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000006223 ENSGT00390000005700 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000155070 ENSGT00940000162651 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008992.b ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a 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ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00940000165253 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000005700 ENSGT00390000006223 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000155747 Aves ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00940000165253 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000005700 ENSGT00390000006223 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b 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ISCA2 (ENSPMJG00000016700) NPC2 (ENSPMJG00000016701) LTBP2 (ENSPMJG00000016702) AREL1 (ENSPMJG00000016703) FCF1 (ENSPMJG00000016704) YLPM1 (ENSPMJG00000016705) ENSPMJG00000016727 PROX2 (ENSPMJG00000016728) DLST (ENSPMJG00000016729) #22 RPS6KL1 (ENSPMJG00000016730) #23 PGF (ENSPMJG00000016731) EIF2B2 (ENSPMJG00000016732) MLH3 (ENSPMJG00000016733) ENSPMJG00000016734 ENSPMJG00000016735 NEK9 (ENSPMJG00000016739) TMED10 (ENSPMJG00000016820) FOS (ENSPMJG00000016821) JDP2 (ENSPMJG00000016823) BATF (ENSPMJG00000016824) ENSPMJG00000016825 ENSPMJG00000016826 ERG28 (ENSPMJG00000016827) ENSPMJG00000016828 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01100000263540.A.b ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00940000165253 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000005700 ENSGT00390000006223 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.j ENSGT01030000234625.B.d.i ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 Flycatcher MODERN SPECIES 24 ALDH6A1 (ENSFALG00000024159) LIN52 (ENSFALG00000028779) VSX2 (ENSFALG00000006274) ENSFALG00000006277 ABCD4 (ENSFALG00000006280) VRTN (ENSFALG00000015230) SYNDIG1L (ENSFALG00000006284) ENSFALG00000028034 ENSFALG00000006290 LTBP2 (ENSFALG00000006295) ENSFALG00000026806 AREL1 (ENSFALG00000006298) FCF1 (ENSFALG00000006301) YLPM1 (ENSFALG00000006304) PROX2 (ENSFALG00000006312) DLST (ENSFALG00000006316) #22 RPS6KL1 (ENSFALG00000006331) #23 PGF (ENSFALG00000028486) EIF2B2 (ENSFALG00000006338) MLH3 (ENSFALG00000006344) ENSFALG00000006347 ENSFALG00000006348 NEK9 (ENSFALG00000006350) TMED10 (ENSFALG00000025099) FOS (ENSFALG00000024693) JDP2 (ENSFALG00000006358) BATF (ENSFALG00000025671) FLVCR2 (ENSFALG00000023021) ERG28 (ENSFALG00000006377) ENSFALG00000006387 TGFB3 (ENSFALG00000006413) Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263540.A.b ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00940000165253 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000005700 ENSGT00390000006223 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.j ENSGT01030000234625.B.d.i ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01100000263540.A.b ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00940000165253 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000005700 ENSGT00390000006223 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d.j ENSGT01030000234625.B.d.i ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 Zebra finch MODERN SPECIES 27 COQ6 (ENSTGUG00000012085) ENTPD5 (ENSTGUG00000023657) ALDH6A1 (ENSTGUG00000014114) LIN52 (ENSTGUG00000023527) VSX2 (ENSTGUG00000012109) ABCD4 (ENSTGUG00000012116) VRTN (ENSTGUG00000012125) SYNDIG1L (ENSTGUG00000022036) ISCA2 (ENSTGUG00000016281) NPC2 (ENSTGUG00000016271) LTBP2 (ENSTGUG00000012131) AREL1 (ENSTGUG00000012150) FCF1 (ENSTGUG00000020479) YLPM1 (ENSTGUG00000012165) PROX2 (ENSTGUG00000012170) DLST (ENSTGUG00000012171) #22 RPS6KL1 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(ENSSCAG00000009723) TMED10 (ENSSCAG00000009702) FOS (ENSSCAG00000009700) JDP2 (ENSSCAG00000009696) BATF (ENSSCAG00000009693) FLVCR2 (ENSSCAG00000009666) ERG28 (ENSSCAG00000009658) ENSSCAG00000009627 TGFB3 (ENSSCAG00000009618) Medium ground finch MODERN SPECIES 4 FAM161B (ENSGFOG00000003198) COQ6 (ENSGFOG00000002978) ENTPD5 (ENSGFOG00000002920) ALDH6A1 (ENSGFOG00000002901) VSX2 (ENSGFOG00000002875) ENSGFOG00000002748 ABCD4 (ENSGFOG00000002710) VRTN (ENSGFOG00000002699) SYNDIG1L (ENSGFOG00000002688) ISCA2 (ENSGFOG00000002678) NPC2 (ENSGFOG00000002662) AREL1 (ENSGFOG00000002509) FCF1 (ENSGFOG00000002486) YLPM1 (ENSGFOG00000002443) PROX2 (ENSGFOG00000002426) DLST (ENSGFOG00000002394) #22 RPS6KL1 (ENSGFOG00000002379) #23 PGF (ENSGFOG00000002365) EIF2B2 (ENSGFOG00000002313) MLH3 (ENSGFOG00000002274) ENSGFOG00000002259 ZC2HC1C (ENSGFOG00000002249) NEK9 (ENSGFOG00000002105) TMED10 (ENSGFOG00000002078) JDP2 (ENSGFOG00000002072) BATF (ENSGFOG00000002062) FLVCR2 (ENSGFOG00000001853) ERG28 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ENSGT00390000006223 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000155747 Japanese quail MODERN SPECIES 23 ENSCJPG00005019186 ALDH6A1 (ENSCJPG00005019187) LIN52 (ENSCJPG00005019214) VSX2 (ENSCJPG00005019215) ENSCJPG00005019216 ABCD4 (ENSCJPG00005019217) VRTN (ENSCJPG00005019218) SYNDIG1L (ENSCJPG00005019220) ISCA2 (ENSCJPG00005019221) NPC2 (ENSCJPG00005019222) LTBP2 (ENSCJPG00005019223) AREL1 (ENSCJPG00005019225) FCF1 (ENSCJPG00005019226) YLPM1 (ENSCJPG00005019228) PROX2 (ENSCJPG00005019240) DLST (ENSCJPG00005019241) #22 RPS6KL1 (ENSCJPG00005019242) #23 PGF (ENSCJPG00005019243) EIF2B2 (ENSCJPG00005019244) 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MODERN SPECIES 34 ENTPD5 (ENSGALG00010006568) ALDH6A1 (ENSGALG00010006580) LIN52 (ENSGALG00010006619) VSX2 (ENSGALG00010006231) ENSGALG00010006291 ABCD4 (ENSGALG00010006311) VRTN (ENSGALG00010006280) SYNDIG1L (ENSGALG00010006328) ISCA2 (ENSGALG00010004380) NPC2 (ENSGALG00010004307) LTBP2 (ENSGALG00010004325) AREL1 (ENSGALG00010005981) FCF1 (ENSGALG00010005989) YLPM1 (ENSGALG00010005998) PROX2 (ENSGALG00010005943) DLST (ENSGALG00010006085) #22 RPS6KL1 (ENSGALG00010006100) #23 PGF (ENSGALG00010006107) EIF2B2 (ENSGALG00010006113) MLH3 (ENSGALG00010006123) ACYP1 (ENSGALG00010006128) ZC2HC1C (ENSGALG00010006135) NEK9 (ENSGALG00010006177) TMED10 (ENSGALG00010006188) FOS (ENSGALG00010006212) JDP2 (ENSGALG00010004473) BATF (ENSGALG00010004553) FLVCR2 (ENSGALG00010005057) C5H14orf1 (ENSGALG00010005077) TTLL5 (ENSGALG00010005107) TGFB3 (ENSGALG00010005146) Turkey MODERN SPECIES 25 BBOF1 (ENSMGAG00000012627) ALDH6A1 (ENSMGAG00000012632) LIN52 (ENSMGAG00000012638) VSX2 (ENSMGAG00000012646) 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ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000155747 Pink-footed goose MODERN SPECIES 23 ENTPD5 (ENSABRG00000008136) BBOF1 (ENSABRG00000008070) ALDH6A1 (ENSABRG00000007631) LIN52 (ENSABRG00000007580) VSX2 (ENSABRG00000007568) ABCD4 (ENSABRG00000007564) VRTN (ENSABRG00000007556) SYNDIG1L (ENSABRG00000007553) ISCA2 (ENSABRG00000007546) NPC2 (ENSABRG00000007540) LTBP2 (ENSABRG00000006674) AREL1 (ENSABRG00000006312) FCF1 (ENSABRG00000006245) YLPM1 (ENSABRG00000006121) PROX2 (ENSABRG00000006090) DLST (ENSABRG00000006045) #22 RPS6KL1 (ENSABRG00000006027) #23 PGF (ENSABRG00000006020) EIF2B2 (ENSABRG00000005958) MLH3 (ENSABRG00000005858) ENSABRG00000005837 ZC2HC1C 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ENSGT00940000162910 ENSGT00940000162939 Emydidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00940000165253 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a ENSGT00390000005700 ENSGT00390000006223 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00550000074954 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00900000143573 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 40 LIN52 (ENSTMTG00000011525) VSX2 (ENSTMTG00000011538) ENSTMTG00000011595 ABCD4 (ENSTMTG00000011713) VRTN (ENSTMTG00000011752) SYNDIG1L (ENSTMTG00000011761) ENSTMTG00000011800 ENSTMTG00000011818 ISCA2 (ENSTMTG00000011837) NPC2 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ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000162939 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 18 ALDH6A1 (ENSGEVG00005002696) LIN52 (ENSGEVG00005002674) VSX2 (ENSGEVG00005002657) ENSGEVG00005002626 ABCD4 (ENSGEVG00005002587) VRTN (ENSGEVG00005002571) SYNDIG1L (ENSGEVG00005002558) ISCA2 (ENSGEVG00005002545) NPC2 (ENSGEVG00005002529) LTBP2 (ENSGEVG00005002485) AREL1 (ENSGEVG00005002458) FCF1 (ENSGEVG00005002437) YLPM1 (ENSGEVG00005002397) ENSGEVG00005002378 PROX2 (ENSGEVG00005002365) DLST (ENSGEVG00005002330) #22 RPS6KL1 (ENSGEVG00005002304) #23 PGF (ENSGEVG00005002282) EIF2B2 (ENSGEVG00005002271) MLH3 (ENSGEVG00005002234) ENSGEVG00005002208 ZC2HC1C (ENSGEVG00005002199) NEK9 (ENSGEVG00005002164) TMED10 (ENSGEVG00005002145) FOS (ENSGEVG00005002133) JDP2 (ENSGEVG00005002120) BATF (ENSGEVG00005002108) FLVCR2 (ENSGEVG00005002085) ERG28 (ENSGEVG00005002067) ENSGEVG00005001531 TGFB3 (ENSGEVG00005001201) Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2201 VSX2 (ENSCABG00000022693) ENSCABG00000022694 ENSCABG00000022695 ENSCABG00000022697 ENSCABG00000022698 VRTN (ENSCABG00000022701) SYNDIG1L (ENSCABG00000022702) ENSCABG00000022705 ISCA2 (ENSCABG00000022706) NPC2 (ENSCABG00000022707) LTBP2 (ENSCABG00000022709) AREL1 (ENSCABG00000022711) FCF1 (ENSCABG00000022715) YLPM1 (ENSCABG00000022719) PROX2 (ENSCABG00000022729) DLST (ENSCABG00000022730) #22 RPS6KL1 (ENSCABG00000022731) #23 PGF (ENSCABG00000022732) EIF2B2 (ENSCABG00000022733) MLH3 (ENSCABG00000022738) ENSCABG00000022746 ENSCABG00000022749 NEK9 (ENSCABG00000022754) TMED10 (ENSCABG00000022757) FOS (ENSCABG00000022762) JDP2 (ENSCABG00000022764) BATF (ENSCABG00000022766) ENSCABG00000022767 ENSCABG00000022769 ERG28 (ENSCABG00000022770) ENSCABG00000022772 Chinese turtle MODERN SPECIES 666 BBOF1 (ENSPSIG00000015556) ALDH6A1 (ENSPSIG00000015581) LIN52 (ENSPSIG00000015591) VSX2 (ENSPSIG00000015600) ENSPSIG00000015706 ABCD4 (ENSPSIG00000016190) VRTN 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ENSGT00940000162910 ENSGT00940000162939 Laterata ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154427.A ENSGT00940000156110 ENSGT00390000008402 ENSGT00940000157776 ENSGT00940000165253 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00390000007874 ENSGT00950000183147.A.a.f ENSGT00390000005700 ENSGT00390000006223 ENSGT00940000160884 ENSGT00940000156723 ENSGT00940000153117.B ENSGT00440000039837 ENSGT00940000154790.b ENSGT00930000151014 #22 ENSGT00940000159815 #23 ENSGT00940000160164 ENSGT00550000074908 ENSGT00800000124176 ENSGT00390000011103.B ENSGT00940000160947 ENSGT00940000156145 ENSGT00940000159276 ENSGT00940000155693 ENSGT00940000159745 ENSGT01030000234625.B.d ENSGT00390000010925 ENSGT00940000162910 ENSGT00940000155747 ENSGT00390000012060 Common wall lizard MODERN SPECIES LIN52 (ENSPMRG00000008577) VSX2 (ENSPMRG00000008567) ENSPMRG00000008552 ABCD4 (ENSPMRG00000008533) ENSPMRG00000008526 ENSPMRG00000008522 SYNDIG1L (ENSPMRG00000008514) ENSPMRG00000008501 ISCA2 (ENSPMRG00000008488) NPC2 (ENSPMRG00000008478) LTBP2 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Eastern brown snake MODERN SPECIES 1 BBOF1 (ENSPTXG00000004390) ALDH6A1 (ENSPTXG00000004391) LIN52 (ENSPTXG00000004392) VSX2 (ENSPTXG00000004393) ENSPTXG00000004394 ABCD4 (ENSPTXG00000004395) VRTN (ENSPTXG00000004398) SYNDIG1L (ENSPTXG00000004399) ISCA2 (ENSPTXG00000004401) NPC2 (ENSPTXG00000004402) LTBP2 (ENSPTXG00000004404) AREL1 (ENSPTXG00000004408) FCF1 (ENSPTXG00000004410) YLPM1 (ENSPTXG00000004411) PROX2 (ENSPTXG00000004414) DLST (ENSPTXG00000004417) #22 RPS6KL1 (ENSPTXG00000004436) #23 ENSPTXG00000004462 PGF (ENSPTXG00000004465) EIF2B2 (ENSPTXG00000004467) ENSPTXG00000004470 ENSPTXG00000004472 ENSPTXG00000004474 ZC2HC1C (ENSPTXG00000004475) NEK9 (ENSPTXG00000004480) TMED10 (ENSPTXG00000004528) FOS (ENSPTXG00000004529) JDP2 (ENSPTXG00000004530) BATF (ENSPTXG00000004531) FLVCR2 (ENSPTXG00000004532) ERG28 (ENSPTXG00000004533) Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 7144 PROX2 (ENSLLTG00000005602) DLST (ENSLLTG00000005584) #22 Indian cobra MODERN SPECIES VSX2 (ENSNNAG00000010585) 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