Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158594 ENSGT00940000161730 ENSGT00990000207858 ENSGT00940000157307 ENSGT00940000160998 ENSGT00940000155813 ENSGT00950000183122.C ENSGT00940000157282 ENSGT00950000182979.a.b.b.a ENSGT00940000154272.B ENSGT00920000149129 ENSGT00390000001347 ENSGT00940000163470 ENSGT00940000153657.A ENSGT00940000155618 ENSGT00940000155497 #22 ENSGT00940000153840.a.b ENSGT00940000154464.b ENSGT00440000039203 ENSGT00390000018542.a ENSGT00940000156578 ENSGT00940000154208.d ENSGT00390000018518 ENSGT00940000154892 ENSGT00390000004383 ENSGT00390000000022.b ENSGT00390000002918.a.b ENSGT00730000111100 ENSGT00940000153239.B ENSGT00550000074840.y.b ENSGT00900000141218 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158594 ENSGT00940000161730 ENSGT00990000207858 ENSGT00940000157307 ENSGT00940000160998 ENSGT00940000155813 ENSGT00950000183122.C ENSGT00940000157282 ENSGT00950000182979.a.b.b.a ENSGT00940000154272.B ENSGT00920000149129 ENSGT00390000001347 ENSGT00940000153657.A ENSGT00940000163470 ENSGT00940000155618 ENSGT00940000155497 #22 ENSGT00940000153840.a.b ENSGT00940000154464.b ENSGT00440000039203 ENSGT00390000018542.a ENSGT00940000156578 ENSGT00940000154208.d ENSGT00390000018518 ENSGT00940000154892 ENSGT00390000004383 ENSGT00390000000022.b ENSGT00390000002918.a.b ENSGT00730000111100 ENSGT00940000153239.B ENSGT00550000074840.y.b.b ENSGT00900000141218 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158594 ENSGT00940000161730 ENSGT00990000207858 ENSGT00940000157307 ENSGT00940000160998 ENSGT00940000155813 ENSGT00950000183122.C ENSGT00940000157282 ENSGT00950000182979.a.b.b.a ENSGT00940000154272.B ENSGT00920000149129 ENSGT00390000001347 ENSGT00940000153657.A ENSGT00940000163470 ENSGT00940000155618 ENSGT00940000155497 #22 ENSGT00940000153840.a.b ENSGT00940000154464.b ENSGT00440000039203 ENSGT00390000018542.a ENSGT00940000156578 ENSGT00940000154208.d ENSGT00390000018518 ENSGT00940000154892 ENSGT00390000004383 ENSGT00390000000022.b 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ENSGT00940000155813 ENSGT00950000183122.C ENSGT00940000157282 ENSGT00950000182979.a.b.b.a ENSGT00940000154272.B ENSGT00920000149129 ENSGT00390000001347 ENSGT00940000153657.A ENSGT00940000163470 ENSGT00940000155618 ENSGT00940000155497 #22 ENSGT00940000153840.a.b ENSGT00940000154464.b ENSGT00440000039203 ENSGT00390000018542.a ENSGT00940000156578 ENSGT00940000154208.d ENSGT00390000018518 ENSGT00940000154892 ENSGT00390000004383 ENSGT00390000000022.b ENSGT00390000002918.a.b ENSGT00730000111100 ENSGT00940000153239.B ENSGT00550000074840.y.b.b ENSGT00900000141218 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000016774 ENSGT00940000158594 ENSGT00940000161730 ENSGT00940000157307 ENSGT00940000160998 ENSGT00940000155813 ENSGT00950000183122.C ENSGT00940000157282 ENSGT00950000182979.a.b.b.a ENSGT00940000154272.B ENSGT00920000149129 ENSGT00390000001347 ENSGT00940000153657.A ENSGT00940000163470 ENSGT00940000155618 ENSGT00940000155497 #22 ENSGT00940000153840.a.b ENSGT00940000154464.b ENSGT00440000039203 ENSGT00390000018542.a ENSGT00940000156578 ENSGT00940000154208.d ENSGT00390000018518 ENSGT00940000154892 ENSGT00390000004383 ENSGT00390000000022.b ENSGT00390000002918.a.b ENSGT00730000111100 ENSGT00940000153239.B ENSGT00550000074840.y.b.b ENSGT00900000141218 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000016774 ENSGT00940000158594 ENSGT00940000161730 ENSGT00940000157307 ENSGT00940000160998 ENSGT00940000155813 ENSGT00950000183122.C ENSGT00940000157282 ENSGT00950000182979.a.b.b.a ENSGT00940000154272.B ENSGT00920000149129 ENSGT00390000001347 ENSGT00940000163470 ENSGT00940000153657.A ENSGT00940000155618 ENSGT00940000155497 #22 ENSGT00940000153840.a.b ENSGT00940000154464.b ENSGT00440000039203 ENSGT00390000018542.a ENSGT00940000156578 ENSGT00940000154208.d ENSGT00390000018518 ENSGT00940000154892 ENSGT00390000004383 ENSGT00390000000022.b ENSGT00390000002918.a.b ENSGT00730000111100 ENSGT00940000153239.B ENSGT00550000074840.y.b.b ENSGT00900000141218 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000016774 ENSGT00940000158594 ENSGT00940000161730 ENSGT00940000157307 ENSGT00940000160998 ENSGT00940000155813 ENSGT00950000183122.C.c.a ENSGT00940000157282 ENSGT00950000182979.a.b.b.a ENSGT00940000154272.B ENSGT00920000149129 ENSGT00390000001347 ENSGT00940000163470 ENSGT00940000153657.A ENSGT00940000155618 ENSGT00940000155497 #22 ENSGT00940000153840.a.b ENSGT00940000154464.b ENSGT00440000039203 ENSGT00390000018542.a ENSGT00940000156578 ENSGT00940000154208.d ENSGT00390000018518 ENSGT00940000154892 ENSGT00390000004383 ENSGT00390000000022.b ENSGT00390000002918.a.b ENSGT00730000111100 ENSGT00940000153239.B ENSGT00550000074840.y.b.b ENSGT00900000141218 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000016774 ENSGT00940000158594 ENSGT00940000161730 ENSGT00940000157307 ENSGT00940000160998 ENSGT00940000155813 ENSGT00950000183122.C.c.a ENSGT00940000157282 ENSGT00950000182979.a.b.b.a ENSGT00940000154272.B ENSGT00920000149129 ENSGT00390000001347 ENSGT00940000163470 ENSGT00940000153657.A ENSGT00940000155618 ENSGT00940000155497 #22 ENSGT00940000153840.a.b ENSGT00940000154464.b ENSGT00440000039203 ENSGT00390000018542.a ENSGT00940000156578 ENSGT00940000154208.d ENSGT00390000018518 ENSGT00940000154892 ENSGT00390000004383 ENSGT00390000000022.b ENSGT00390000002918.a.b ENSGT00730000111100 ENSGT00940000153239.B ENSGT00550000074840.y.b.b ENSGT00900000141218 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 328 RPS19BP1 (ENSUPAG00010006690) CACNA1I (ENSUPAG00010006656) ENTHD1 (ENSUPAG00010006643) GRAP2 (ENSUPAG00010006631) FAM83F (ENSUPAG00010006625) TNRC6B (ENSUPAG00010006574) ENSUPAG00010006489 SGSM3 (ENSUPAG00010006439) MRTFA (ENSUPAG00010006297) MCHR1 (ENSUPAG00010006286) SLC25A17 (ENSUPAG00010006258) ST13 (ENSUPAG00010006238) DNAJB7 (ENSUPAG00010006227) XPNPEP3 (ENSUPAG00010006211) RBX1 (ENSUPAG00010006183) EP300 (ENSUPAG00010006142) #22 L3MBTL2 (ENSUPAG00010006102) CHADL (ENSUPAG00010006094) RANGAP1 (ENSUPAG00010006037) ZC3H7B (ENSUPAG00010006013) TEF (ENSUPAG00010005998) TOB2 (ENSUPAG00010005994) PHF5A (ENSUPAG00010005980) ACO2 (ENSUPAG00010005914) POLR3H (ENSUPAG00010005893) CSDC2 (ENSUPAG00010005885) PMM1 (ENSUPAG00010005870) DESI1 (ENSUPAG00010005863) XRCC6 (ENSUPAG00010005843) SNU13 (ENSUPAG00010005841) ENSUPAG00010005838 Squirrel MODERN SPECIES 92 ATF4 (ENSSTOG00000025355) RPS19BP1 (ENSSTOG00000008459) CACNA1I (ENSSTOG00000025056) ENTHD1 (ENSSTOG00000002219) GRAP2 (ENSSTOG00000002229) FAM83F (ENSSTOG00000023057) TNRC6B (ENSSTOG00000008927) ENSSTOG00000000979 SGSM3 (ENSSTOG00000002927) MRTFA (ENSSTOG00000002947) MCHR1 (ENSSTOG00000010032) SLC25A17 (ENSSTOG00000004370) ENSSTOG00000003165 XPNPEP3 (ENSSTOG00000003200) ENSSTOG00000015580 EP300 (ENSSTOG00000000722) #22 L3MBTL2 (ENSSTOG00000000242) CHADL (ENSSTOG00000026534) RANGAP1 (ENSSTOG00000016191) ZC3H7B (ENSSTOG00000016196) TEF (ENSSTOG00000019642) ENSSTOG00000016206 PHF5A (ENSSTOG00000016207) ACO2 (ENSSTOG00000016210) POLR3H (ENSSTOG00000016215) CSDC2 (ENSSTOG00000020429) PMM1 (ENSSTOG00000026025) DESI1 (ENSSTOG00000009480) XRCC6 (ENSSTOG00000009490) SNU13 (ENSSTOG00000009514) MEI1 (ENSSTOG00000012870) Alpin marmot MODERN SPECIES 76 GRAP2 (ENSMMMG00000004731) TNRC6B (ENSMMMG00000004583) ENSMMMG00000004472 SGSM3 (ENSMMMG00000004431) MRTFA (ENSMMMG00000004294) MCHR1 (ENSMMMG00000004286) ENSMMMG00000004275 ENSMMMG00000004266 ENSMMMG00000004251 SLC25A17 (ENSMMMG00000004230) ENSMMMG00000004215 ST13 (ENSMMMG00000004184) DNAJB7 (ENSMMMG00000004165) XPNPEP3 (ENSMMMG00000004122) RBX1 (ENSMMMG00000004102) EP300 (ENSMMMG00000004029) #22 L3MBTL2 (ENSMMMG00000003930) RANGAP1 (ENSMMMG00000003853) ZC3H7B (ENSMMMG00000003824) TEF (ENSMMMG00000003810) TOB2 (ENSMMMG00000003805) PHF5A (ENSMMMG00000003799) ACO2 (ENSMMMG00000003764) POLR3H (ENSMMMG00000003743) CSDC2 (ENSMMMG00000003735) PMM1 (ENSMMMG00000003696) DESI1 (ENSMMMG00000003682) ENSMMMG00000003671 SNU13 (ENSMMMG00000003647) ENSMMMG00000003627 MEI1 (ENSMMMG00000003545) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 14 CACNA1I (ENSSVLG00005016425) ENTHD1 (ENSSVLG00005017597) GRAP2 (ENSSVLG00005017680) FAM83F (ENSSVLG00005017783) TNRC6B (ENSSVLG00005017928) ENSSVLG00005018698 SGSM3 (ENSSVLG00005018784) MRTFA (ENSSVLG00005018986) ENSSVLG00005019466 MCHR1 (ENSSVLG00005019589) SLC25A17 (ENSSVLG00005019724) XPNPEP3 (ENSSVLG00005020124) DNAJB7 (ENSSVLG00005020233) RBX1 (ENSSVLG00005020266) ENSSVLG00005020321 EP300 (ENSSVLG00005020397) #22 L3MBTL2 (ENSSVLG00005020580) CHADL (ENSSVLG00005020628) ENSSVLG00005020695 ENSSVLG00005020791 ZC3H7B (ENSSVLG00005020817) TEF (ENSSVLG00005020887) TOB2 (ENSSVLG00005020946) PHF5A (ENSSVLG00005020965) ACO2 (ENSSVLG00005021008) POLR3H (ENSSVLG00005021062) CSDC2 (ENSSVLG00005021115) PMM1 (ENSSVLG00005021168) DESI1 (ENSSVLG00005021220) XRCC6 (ENSSVLG00005021287) ENSSVLG00005021427 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000016774 ENSGT00940000158594 ENSGT00940000161730 ENSGT00940000157307 ENSGT00940000160998 ENSGT00940000155813 ENSGT00950000183122.C ENSGT00940000157282 ENSGT00950000182979.a.b.b.a ENSGT00940000154272.B 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(ENSODEG00000014094) MRTFA (ENSODEG00000012960) MCHR1 (ENSODEG00000012909) SLC25A17 (ENSODEG00000013252) ENSODEG00000014217 XPNPEP3 (ENSODEG00000013851) ENSODEG00000013250 ENSODEG00000012932 #22 Guinea pig MODERN SPECIES 28 ATF4 (ENSCPOG00000022485) RPS19BP1 (ENSCPOG00000037075) CACNA1I (ENSCPOG00000011963) ENTHD1 (ENSCPOG00000014129) GRAP2 (ENSCPOG00000040713) FAM83F (ENSCPOG00000014133) TNRC6B (ENSCPOG00000005705) ADSL (ENSCPOG00000005715) SGSM3 (ENSCPOG00000009876) MRTFA (ENSCPOG00000009883) MCHR1 (ENSCPOG00000012166) SLC25A17 (ENSCPOG00000002289) ENSCPOG00000002290 XPNPEP3 (ENSCPOG00000002291) RBX1 (ENSCPOG00000035978) EP300 (ENSCPOG00000005438) #22 L3MBTL2 (ENSCPOG00000021063) CHADL (ENSCPOG00000026967) RANGAP1 (ENSCPOG00000004404) ZC3H7B (ENSCPOG00000004413) TEF (ENSCPOG00000020591) TOB2 (ENSCPOG00000031873) PHF5A (ENSCPOG00000033309) ACO2 (ENSCPOG00000012642) POLR3H (ENSCPOG00000012650) CSDC2 (ENSCPOG00000037976) PMM1 (ENSCPOG00000014618) DESI1 (ENSCPOG00000038083) XRCC6 (ENSCPOG00000003542) SNU13 (ENSCPOG00000040165) ENSCPOG00000010113 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 24 GRAP2 (ENSHGLG00000012328) ENSHGLG00000017812 ENSHGLG00000049183 ENSHGLG00000018482 ENSHGLG00000042810 ENSHGLG00000038998 ENSHGLG00000009306 ADSL (ENSHGLG00000016466) SGSM3 (ENSHGLG00000018585) MRTFA (ENSHGLG00000009723) MCHR1 (ENSHGLG00000005319) SLC25A17 (ENSHGLG00000013720) ENSHGLG00000013411 XPNPEP3 (ENSHGLG00000013429) RBX1 (ENSHGLG00000014822) EP300 (ENSHGLG00000015586) #22 L3MBTL2 (ENSHGLG00000018290) CHADL (ENSHGLG00000018119) RANGAP1 (ENSHGLG00000015526) ZC3H7B (ENSHGLG00000012263) TEF (ENSHGLG00000050605) TOB2 (ENSHGLG00000009302) PHF5A (ENSHGLG00000042397) ENSHGLG00000041589 Aco2 (ENSHGLG00000015463) POLR3H (ENSHGLG00000014795) CSDC2 (ENSHGLG00000016778) PMM1 (ENSHGLG00000016980) DESI1 (ENSHGLG00000039030) ENSHGLG00000018078 SNU13 (ENSHGLG00000018808) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000016774 ENSGT00940000158594 ENSGT00940000161730 ENSGT00940000157307 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ENSGT00390000003022.t ENSGT00730000111100 ENSGT00940000153239.B Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Rps19bp1 (ENSCGRG00001023983) Cacna1i (ENSCGRG00001022652) Enthd1 (ENSCGRG00001021361) Grap2 (ENSCGRG00001021712) Fam83f (ENSCGRG00001018899) Tnrc6b (ENSCGRG00001020166) Adsl (ENSCGRG00001017906) Sgsm3 (ENSCGRG00001018846) Mrtfa (ENSCGRG00001018160) Mchr1 (ENSCGRG00001017287) Slc25a17 (ENSCGRG00001017555) ENSCGRG00001019004 Xpnpep3 (ENSCGRG00001020209) Dnajb7 (ENSCGRG00001010409) Rbx1 (ENSCGRG00001022113) Ep300 (ENSCGRG00001020720) #22 L3mbtl2 (ENSCGRG00001021097) Chadl (ENSCGRG00001017198) Rangap1 (ENSCGRG00001017379) Zc3h7b (ENSCGRG00001022924) Tef (ENSCGRG00001005588) Tob2 (ENSCGRG00001010039) Phf5a (ENSCGRG00001017936) ENSCGRG00001023335 Polr3h (ENSCGRG00001023556) Csdc2 (ENSCGRG00001021123) Pmm1 (ENSCGRG00001021685) ENSCGRG00001018874 Ndufb11b (ENSCGRG00001009944) Desi1 (ENSCGRG00001018751) Xrcc6 (ENSCGRG00001019029) Golden Hamster MODERN SPECIES 626 Cacna1i (ENSMAUG00000008968) Enthd1 (ENSMAUG00000006247) Grap2 (ENSMAUG00000008300) Fam83f (ENSMAUG00000015744) ENSMAUG00000014912 Tnrc6b (ENSMAUG00000016123) Adsl (ENSMAUG00000001074) Sgsm3 (ENSMAUG00000008597) ENSMAUG00000022256 ENSMAUG00000012578 Mchr1 (ENSMAUG00000021927) Slc25a17 (ENSMAUG00000017231) ENSMAUG00000004356 Dnajb7 (ENSMAUG00000010726) ENSMAUG00000010852 Ep300 (ENSMAUG00000004380) #22 L3mbtl2 (ENSMAUG00000008519) Rangap1 (ENSMAUG00000013685) Zc3h7b (ENSMAUG00000007915) Tef (ENSMAUG00000011211) Tob2 (ENSMAUG00000007650) Phf5a (ENSMAUG00000017124) Aco2 (ENSMAUG00000007598) Polr3h (ENSMAUG00000022215) Csdc2 (ENSMAUG00000020821) ENSMAUG00000012267 Desi1 (ENSMAUG00000020204) Xrcc6 (ENSMAUG00000017340) Snu13 (ENSMAUG00000010871) 4930407I10Rik (ENSMAUG00000020761) ENSMAUG00000018190 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000016774 ENSGT00940000158594 ENSGT00940000161730 ENSGT00940000157307 ENSGT00940000160998 ENSGT00940000155813 ENSGT00950000183122.C ENSGT00940000157282 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Mouse MODERN SPECIES 6 Rps19bp1 (ENSMUSG00000051518) Cacna1i (ENSMUSG00000022416) Enthd1 (ENSMUSG00000050439) Grap2 (ENSMUSG00000042351) Fam83f (ENSMUSG00000022408) Tnrc6b (ENSMUSG00000047888) Adsl (ENSMUSG00000022407) Sgsm3 (ENSMUSG00000042303) Mrtfa (ENSMUSG00000042292) Mchr1 (ENSMUSG00000050164) Slc25a17 (ENSMUSG00000022404) St13 (ENSMUSG00000022403) Xpnpep3 (ENSMUSG00000022401) Dnajb7 (ENSMUSG00000047108) Rbx1 (ENSMUSG00000022400) Ep300 (ENSMUSG00000055024) #22 L3mbtl2 (ENSMUSG00000022394) Chadl (ENSMUSG00000063765) Rangap1 (ENSMUSG00000022391) Zc3h7b (ENSMUSG00000022390) Tef (ENSMUSG00000022389) Tob2 (ENSMUSG00000048546) Phf5a (ENSMUSG00000061360) Aco2 (ENSMUSG00000022477) Polr3h (ENSMUSG00000022476) Csdc2 (ENSMUSG00000042109) Pmm1 (ENSMUSG00000022474) Ndufb11b (ENSMUSG00000061633) Xrcc6 (ENSMUSG00000022471) Desi1 (ENSMUSG00000022472) Snu13 (ENSMUSG00000063480) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000016774 ENSGT00940000158594 ENSGT00940000161730 ENSGT00940000157307 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ENSGT00940000154464.b ENSGT00440000039203 ENSGT00390000018542.a ENSGT00940000156578 ENSGT00910000148068 ENSGT00390000018518 ENSGT00940000154892.f ENSGT00390000004383 ENSGT00390000000022.b ENSGT00390000002918.a.b ENSGT00730000111100.g ENSGT00940000153239.B.j.b ENSGT00550000074840.y.b.b ENSGT00900000141218 Bonobo MODERN SPECIES 13 FAM83F (ENSPPAG00000027631) ENSPPAG00000012346 TNRC6B (ENSPPAG00000028514) ADSL (ENSPPAG00000029448) SGSM3 (ENSPPAG00000031514) MRTFA (ENSPPAG00000020762) MCHR1 (ENSPPAG00000030244) SLC25A17 (ENSPPAG00000038151) ENSPPAG00000036400 ST13 (ENSPPAG00000003665) ENSPPAG00000034722 XPNPEP3 (ENSPPAG00000037292) DNAJB7 (ENSPPAG00000025760) RBX1 (ENSPPAG00000031663) ENSPPAG00000035289 EP300 (ENSPPAG00000032679) #22 L3MBTL2 (ENSPPAG00000040643) ENSPPAG00000040223 RANGAP1 (ENSPPAG00000037749) ZC3H7B (ENSPPAG00000034228) TEF (ENSPPAG00000035585) ENSPPAG00000032847 PHF5A (ENSPPAG00000008422) ACO2 (ENSPPAG00000019653) POLR3H (ENSPPAG00000031000) CSDC2 (ENSPPAG00000032112) 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(ENSNLEG00000015473) ENSNLEG00000015481 ACO2 (ENSNLEG00000015482) POLR3H (ENSNLEG00000015536) ENSNLEG00000015551 PMM1 (ENSNLEG00000015555) DESI1 (ENSNLEG00000015592) XRCC6 (ENSNLEG00000015610) SNU13 (ENSNLEG00000027284) ENSNLEG00000030585 MEI1 (ENSNLEG00000015634) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000157307 ENSGT00940000160998 ENSGT00940000155813 ENSGT00950000183122.C ENSGT00940000157282 ENSGT00950000182979.a.b.b.a ENSGT00940000154272.B ENSGT00920000149129.e ENSGT00390000001347.vb.a.a.b ENSGT00940000163470 ENSGT00390000015537.ab ENSGT00910000146844 ENSGT00390000001347.vb.a.a.a ENSGT00940000153657.A ENSGT00940000155618 ENSGT00940000155497 #22 ENSGT00940000153840.a.b ENSGT00940000154464.b ENSGT00440000039203 ENSGT00390000018542.a ENSGT00940000156578 ENSGT00940000154208.d ENSGT00390000018518 ENSGT00940000154892.f ENSGT00390000004383 ENSGT00390000000022.b ENSGT00390000002918.a.b ENSGT00730000111100 ENSGT00940000153239.B.j.b ENSGT00550000074840.y.b.b ENSGT00900000141218 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000157307 ENSGT00940000160998 ENSGT00940000155813 ENSGT00950000183122.C ENSGT00940000157282 ENSGT00950000182979.a.b.b.a ENSGT00940000154272.B ENSGT00920000149129.e ENSGT00390000001347.vb.a.a.b ENSGT00940000163470 ENSGT00390000015537.ab ENSGT00910000146844 ENSGT00390000001347.vb.a.a.a ENSGT00940000153657.A ENSGT00940000155618 ENSGT00940000155497 #22 ENSGT00940000154846.b.k.a.a ENSGT00940000153840.a.b ENSGT00940000154464.b ENSGT00440000039203 ENSGT00390000018542.a ENSGT00940000156578 ENSGT00940000154208.d ENSGT00390000018518 ENSGT00940000154892.f ENSGT00390000004383 ENSGT00390000000022.b ENSGT00390000002918.a.b ENSGT00730000111100 ENSGT00940000153239.B.j.b ENSGT00550000074840.y.b.b Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000160998 ENSGT00940000155813 ENSGT00950000183122.C ENSGT00940000157282 ENSGT00950000182979.a.b.b.a ENSGT00940000154272.B ENSGT00920000149129.e ENSGT00390000001347.vb.a.a.b ENSGT00940000163470 ENSGT00390000015537.ab 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XPNPEP3 (ENSMNEG00000028410) ENSMNEG00000038287 EP300 (ENSMNEG00000043056) #22 L3MBTL2 (ENSMNEG00000044141) CHADL (ENSMNEG00000036193) RANGAP1 (ENSMNEG00000036291) ZC3H7B (ENSMNEG00000036730) TEF (ENSMNEG00000020616) ENSMNEG00000006468 ENSMNEG00000010834 TOB2 (ENSMNEG00000020529) PHF5A (ENSMNEG00000045104) ACO2 (ENSMNEG00000044522) POLR3H (ENSMNEG00000022264) CSDC2 (ENSMNEG00000027703) PMM1 (ENSMNEG00000021815) DESI1 (ENSMNEG00000030194) XRCC6 (ENSMNEG00000035076) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000157307 ENSGT00940000160998 ENSGT00940000155813 ENSGT00950000183122.C ENSGT00940000157282 ENSGT00950000182979.a.b.b.a ENSGT00940000154272.B ENSGT00920000149129.e ENSGT00390000001347.vb.a.a.b ENSGT00940000163470 ENSGT00390000015537.ab ENSGT00910000146844 ENSGT00390000001347.vb.a.a.a ENSGT00940000153657.A ENSGT00940000155618.cb.b ENSGT00940000155497 #22 ENSGT00940000153840.a.b ENSGT00940000154464.b ENSGT00440000039203 ENSGT00390000018542.a ENSGT00940000156578 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ENSGT00940000153657.A ENSGT00940000155618 ENSGT00940000155497 #22 ENSGT00940000153840.a.b ENSGT00940000154464.b ENSGT00440000039203 ENSGT00390000018542.a ENSGT00940000156578 ENSGT00940000154208.d ENSGT00390000018518 ENSGT00940000154892 ENSGT00390000004383 ENSGT00390000000022.b ENSGT00390000002918.a.b ENSGT00730000111100 ENSGT00940000153239.B ENSGT00550000074840.y.b.b ENSGT00390000002077 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 231 RPS19BP1 (ENSPSMG00000003768) CACNA1I (ENSPSMG00000003753) ENTHD1 (ENSPSMG00000003712) GRAP2 (ENSPSMG00000003705) FAM83F (ENSPSMG00000003697) TNRC6B (ENSPSMG00000003634) ADSL (ENSPSMG00000003312) SGSM3 (ENSPSMG00000002912) MRTFA (ENSPSMG00000002488) MCHR1 (ENSPSMG00000002312) SLC25A17 (ENSPSMG00000002228) ST13 (ENSPSMG00000002173) DNAJB7 (ENSPSMG00000002153) XPNPEP3 (ENSPSMG00000002127) RBX1 (ENSPSMG00000002112) EP300 (ENSPSMG00000001992) #22 L3MBTL2 (ENSPSMG00000001837) CHADL (ENSPSMG00000001766) RANGAP1 (ENSPSMG00000001639) ZC3H7B (ENSPSMG00000001526) TEF 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Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158594 ENSGT00940000161730 ENSGT00990000207858 ENSGT00940000157307 ENSGT00940000160998 ENSGT00940000155813 ENSGT00950000183122.C ENSGT00940000157282 ENSGT00950000182979.a.b.b.a ENSGT00940000154272.B ENSGT00920000149129 ENSGT00390000001347 ENSGT00940000163470 ENSGT00940000153657.A ENSGT00940000155618 ENSGT00940000155497 #22 ENSGT00940000153840.a.b ENSGT00940000154464.b ENSGT00440000039203 ENSGT00390000018542.a ENSGT00940000156578 ENSGT00940000154208.d ENSGT00390000018518 ENSGT00940000154892 ENSGT00390000004383 ENSGT00390000000022.b ENSGT00390000002918.a.b ENSGT00730000111100 ENSGT00940000153239.B ENSGT00550000074840.y.b ENSGT00900000141218 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155497 #22 Common shrew DUPLICATION Common shrew MODERN SPECIES 7028 ENSSARG00000010521 #22 Common shrew MODERN SPECIES 87 ENSSARG00000008613 #22 Hedgehog MODERN SPECIES 410 EP300 (ENSEEUG00000009364) #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158594 ENSGT00940000161730 ENSGT00990000207858 ENSGT00940000157307 ENSGT00940000160998 ENSGT00940000155813 ENSGT00950000183122.C ENSGT00940000157282 ENSGT00950000182979.a.b.b.a ENSGT00940000154272.B ENSGT00920000149129 ENSGT00390000001347.v ENSGT00940000163470 ENSGT00940000153657.A ENSGT00940000155618 ENSGT00940000155497 #22 ENSGT00940000153840.a.b ENSGT00940000154464.b ENSGT00440000039203 ENSGT00390000018542.a ENSGT00940000156578 ENSGT00940000154208.d ENSGT00390000018518 ENSGT00940000154892 ENSGT00390000004383 ENSGT00390000000022.b ENSGT00390000002918.a.b ENSGT00730000111100 ENSGT00940000153239.B ENSGT00550000074840.y.b ENSGT00900000141218 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000016774 ENSGT00940000158594 ENSGT00940000161730 ENSGT00940000157307 ENSGT00940000160998 ENSGT00940000155813 ENSGT00950000183122.C ENSGT00940000157282 ENSGT00950000182979.a.b.b.a ENSGT00940000154272.B ENSGT00920000149129 ENSGT00390000001347.v.n.b ENSGT00940000153657.A ENSGT00940000163470 ENSGT00940000155618 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SYNGR1 (ENSPCTG00005009002) Blue whale MODERN SPECIES 1 RPS19BP1 (ENSBMSG00010010238) CACNA1I (ENSBMSG00010010289) ENTHD1 (ENSBMSG00010010382) GRAP2 (ENSBMSG00010010395) FAM83F (ENSBMSG00010010409) TNRC6B (ENSBMSG00010010473) ENSBMSG00010010564 ADSL (ENSBMSG00010010596) SGSM3 (ENSBMSG00010010739) MRTFA (ENSBMSG00010010792) MCHR1 (ENSBMSG00010010832) SLC25A17 (ENSBMSG00010010859) ST13 (ENSBMSG00010010885) ENSBMSG00010010899 ENSBMSG00010010940 EP300 (ENSBMSG00010010998) #22 L3MBTL2 (ENSBMSG00010011148) CHADL (ENSBMSG00010011175) RANGAP1 (ENSBMSG00010011194) ZC3H7B (ENSBMSG00010011209) ENSBMSG00010011228 TOB2 (ENSBMSG00010013844) ENSBMSG00010013857 ACO2 (ENSBMSG00010013926) POLR3H (ENSBMSG00010014040) ENSBMSG00010014114 CSDC2 (ENSBMSG00010014140) PMM1 (ENSBMSG00010014166) DESI1 (ENSBMSG00010014206) ENSBMSG00010014265 ENSBMSG00010014449 Pecora ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158594 ENSGT00940000161730 ENSGT00940000157307 ENSGT00940000160998 ENSGT00940000155813 ENSGT00950000183122.C 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ENSGT00390000018542.a ENSGT00940000156578 ENSGT00940000154208.d ENSGT00390000018518 ENSGT00940000154892 ENSGT00390000004383 ENSGT00390000000022.b ENSGT00390000002918.a.b ENSGT00730000111100 ENSGT00940000153239.B ENSGT00550000074840.y.b ENSGT00900000141218 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158594 ENSGT00940000161730 ENSGT00940000157307 ENSGT00940000160998 ENSGT00940000155813 ENSGT00950000183122.C ENSGT00940000157282 ENSGT00950000182979.a.b.b.a ENSGT00940000154272.B ENSGT00920000149129 ENSGT00390000001347.v.n.a ENSGT00940000163470 ENSGT00390000001347.u.b ENSGT00940000153657.A ENSGT00940000155618 ENSGT00940000155497 #22 ENSGT00940000153840.a.b ENSGT00940000154464.b ENSGT00440000039203 ENSGT00390000018542.a ENSGT00940000156578 ENSGT00940000154208.d ENSGT00390000018518 ENSGT00940000154892 ENSGT00390000004383 ENSGT00390000000022.b ENSGT00390000002918.a.b ENSGT00730000111100 ENSGT00940000153239.B ENSGT00550000074840.y.b ENSGT00900000141218 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016774 ENSGT00940000158594 ENSGT00940000161730 ENSGT00940000157307 ENSGT00940000160998 ENSGT00940000155813 ENSGT00950000183122.C ENSGT00940000157282 ENSGT00950000182979.a.b.b.a ENSGT00940000154272.B ENSGT00920000149129 ENSGT00390000001347.v.n.a ENSGT00940000163470 ENSGT00940000153657.A ENSGT00940000155618 ENSGT00940000155497 #22 ENSGT00940000153840.a.b ENSGT00940000154464.b ENSGT00440000039203 ENSGT00390000018542.a ENSGT00940000156578 ENSGT00940000154208.d ENSGT00390000018518 ENSGT00940000154892 ENSGT00390000004383 ENSGT00390000000022.b ENSGT00390000002918.a.b ENSGT00730000111100 ENSGT00940000153239.B ENSGT00550000074840.y.b ENSGT00900000141218 Goat MODERN SPECIES 24 RPS19BP1 (ENSCHIG00000020651) CACNA1I (ENSCHIG00000021978) ENTHD1 (ENSCHIG00000019751) GRAP2 (ENSCHIG00000015296) FAM83F (ENSCHIG00000026060) TNRC6B (ENSCHIG00000003491) ENSCHIG00000016369 SGSM3 (ENSCHIG00000018086) MRTFA (ENSCHIG00000016119) MCHR1 (ENSCHIG00000022709) SLC25A17 (ENSCHIG00000026918) ENSCHIG00000017681 XPNPEP3 (ENSCHIG00000016070) DNAJB7 (ENSCHIG00000012831) ENSCHIG00000025708 EP300 (ENSCHIG00000017767) #22 L3MBTL2 (ENSCHIG00000021479) CHADL (ENSCHIG00000025971) RANGAP1 (ENSCHIG00000026389) ZC3H7B (ENSCHIG00000020469) TEF (ENSCHIG00000016008) TOB2 (ENSCHIG00000003528) PHF5A (ENSCHIG00000015826) ACO2 (ENSCHIG00000007877) POLR3H (ENSCHIG00000013984) CSDC2 (ENSCHIG00000021658) PMM1 (ENSCHIG00000006787) DESI1 (ENSCHIG00000017498) XRCC6 (ENSCHIG00000012853) ENSCHIG00000015834 ENSCHIG00000017103 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 19 CACNA1I (ENSOARG00020013637) ENTHD1 (ENSOARG00020023243) GRAP2 (ENSOARG00020023284) FAM83F (ENSOARG00020023308) TNRC6B (ENSOARG00020023375) ADSL (ENSOARG00020023696) ENSOARG00020023873 ENSOARG00020023916 MRTFA (ENSOARG00020023983) MCHR1 (ENSOARG00020024030) SLC25A17 (ENSOARG00020024071) ST13 (ENSOARG00020024111) XPNPEP3 (ENSOARG00020024132) DNAJB7 (ENSOARG00020024159) RBX1 (ENSOARG00020024169) EP300 (ENSOARG00020024211) #22 L3MBTL2 (ENSOARG00020024288) CHADL (ENSOARG00020024330) RANGAP1 (ENSOARG00020024343) ZC3H7B (ENSOARG00020024392) TEF (ENSOARG00020024430) TOB2 (ENSOARG00020024450) PHF5A (ENSOARG00020024461) ACO2 (ENSOARG00020024476) POLR3H (ENSOARG00020024546) CSDC2 (ENSOARG00020024566) PMM1 (ENSOARG00020024579) DESI1 (ENSOARG00020024591) ENSOARG00020024613 ENSOARG00020024631 ENSOARG00020024666 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158594 ENSGT00940000161730 ENSGT00940000157307 ENSGT00940000160998 ENSGT00940000155813 ENSGT00950000183122.C ENSGT00940000157282 ENSGT00950000182979.a.b.b.a ENSGT00940000154272.B ENSGT00920000149129 ENSGT00390000001347.v.n.a ENSGT00940000163470 ENSGT00390000001347.u.b ENSGT00940000153657.A ENSGT00940000155618 ENSGT00940000155497 #22 ENSGT00940000153840.a.b ENSGT00940000154464.b ENSGT00440000039203 ENSGT00390000018542.a ENSGT00940000156578 ENSGT00940000154208.d ENSGT00390000018518 ENSGT00940000154892 ENSGT00390000004383 ENSGT00390000000022.b ENSGT00390000002918.a.b ENSGT00730000111100.d ENSGT00940000153239.B ENSGT00550000074840.y.b ENSGT00900000141218 Bos ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161730 ENSGT00940000157307 ENSGT00940000160998 ENSGT00940000155813 ENSGT00950000183122.C ENSGT00940000157282 ENSGT00950000182979.a.b.b.a ENSGT00940000154272.B ENSGT00920000149129 ENSGT00950000182891.a.a.b.b ENSGT00390000001347.v.n.a ENSGT00940000163470 ENSGT00390000001347.u.b ENSGT00940000153657.A ENSGT00940000155618 ENSGT00940000155497 #22 ENSGT00940000153840.a.b ENSGT00940000154464.b ENSGT00440000039203 ENSGT00390000018542.a ENSGT00940000156578 ENSGT00940000154208.d ENSGT00390000018518 ENSGT00940000154892 ENSGT00390000004383 ENSGT00390000000022.b ENSGT00390000002918.a.b ENSGT00730000111100.d ENSGT00940000153239.B ENSGT00550000074840.y.b ENSGT00900000141218 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000158594 ENSGT00940000161730 ENSGT00940000157307 ENSGT00940000160998 ENSGT00940000155813 ENSGT00950000183122.C ENSGT00940000157282 ENSGT00950000182979.a.b.b.a ENSGT00940000154272.B ENSGT00920000149129 ENSGT00950000182891.a.a.b.b ENSGT00390000001347.v.n.a ENSGT00940000153657.A ENSGT00940000163470 ENSGT00940000168153 ENSGT00940000155497 #22 ENSGT00940000153840.a.b ENSGT00940000154464.b ENSGT00440000039203 ENSGT00390000018542.a ENSGT00940000156578 ENSGT00940000154208.d ENSGT00390000018518 ENSGT00940000154892 ENSGT00390000004383 ENSGT00390000000022.b ENSGT00390000002918.a.b ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.b.a.a.b.a.b.a.a.a.b ENSGT00730000111100.d ENSGT00940000153239.B ENSGT00550000074840.y.b Domestic yak MODERN SPECIES 24 CACNA1I (ENSBGRG00000003629) ENTHD1 (ENSBGRG00000006865) GRAP2 (ENSBGRG00000006892) FAM83F (ENSBGRG00000006932) TNRC6B (ENSBGRG00000007053) ADSL (ENSBGRG00000008001) SGSM3 (ENSBGRG00000008503) MRTFA (ENSBGRG00000008675) MCHR1 (ENSBGRG00000009343) SLC25A17 (ENSBGRG00000006056) ENSBGRG00000006125 ST13 (ENSBGRG00000006165) XPNPEP3 (ENSBGRG00000006217) DNAJB7 (ENSBGRG00000006284) ENSBGRG00000006304 EP300 (ENSBGRG00000006401) #22 L3MBTL2 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