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Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	60	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00900000143764	ENSGT00950000182848.d	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677 #16	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000177261	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459 #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #23	ENSGT00490000043329.a.b #24	ENSGT00390000002693	ENSGT00940000158032	ENSGT00390000016516	ENSGT00950000183117.b	ENSGT00940000153804.A	ENSGT00390000014654	ENSGT00490000043329.a.a.b ##24	ENSGT00940000153897.a ##21	ENSGT00940000159992	ENSGT00520000055578.a.a.d ##20	ENSGT00940000166855	ENSGT00940000159556	ENSGT00940000165742
Osteoglossocephalai	DUPLICATION
Osteoglossocephalai	DUPLICATION
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Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT00940000164671 #12	ENSGT00940000157459.b #13	ENSGT00940000156793 #14	ENSGT00390000016216 #15	ENSGT00940000156975.e.b	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000156484.b.e.a.a #17	ENSGT00940000178910 #18	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155724.q #25	ENSGT00940000156078.c #26	ENSGT00530000063503.a.b.g.b #27	ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b #28	ENSGT00940000159468 #29	ENSGT00940000164359.b #30	ENSGT00940000161652.b.b	ENSGT00940000154030.a.b #31	ENSGT00390000013670 #32	ENSGT00940000157701 #33	ENSGT00940000156464	ENSGT00940000156714.a	ENSGT01030000234564.a.a.a.a.b.a
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Cyprininae	DUPLICATION
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Golden-line barbel	MODERN SPECIES	188	plekhh1 (ENSSGRG00000035927) #7	tmem229b (ENSSGRG00000035924) #9	MTA1 (ENSSGRG00000034959) #10	crip2 (ENSSGRG00000034941) #11	crip1 (ENSSGRG00000034938) #12	ENSSGRG00000034928 #13	ptgr2 (ENSSGRG00000034756) #14	TMEM62 (ENSSGRG00000034754) #15	hadhab (ENSSGRG00000034752) #16	slc30a1b (ENSSGRG00000034750) #17	ENSSGRG00000034749 #18	kif3cb (ENSSGRG00000034748) #19	kif3cb (ENSSGRG00000034747) #19	ASXL2 (ENSSGRG00000034746) #20	dtnbb (ENSSGRG00000034708) #21	dnmt3ab (ENSSGRG00000034588) #22	dpysl5a (ENSSGRG00000034222) #23	mapre3a (ENSSGRG00000034213) #24	myo6b (ENSSGRG00000031310) #26	ENSSGRG00000031282 #27	HTR1B (ENSSGRG00000031281) #28	colec11 (ENSSGRG00000031280) #29	sox11a (ENSSGRG00000031279)
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Goldfish	MODERN SPECIES	8	plekhh1 (ENSCARG00000062727) #7	zfp36l1a (ENSCARG00000062720) #8	tmem229b (ENSCARG00000062716) #9	MTA1 (ENSCARG00000060844) #10	crip2 (ENSCARG00000060777) #11	crip1 (ENSCARG00000060728) #12	ENSCARG00000060693 #13	ptgr2 (ENSCARG00000060665) #14	TMEM62 (ENSCARG00000060601) #15	hadhab (ENSCARG00000056328) #16	slc30a1b (ENSCARG00000056146) #17	ENSCARG00000056126 #18	kif3cb (ENSCARG00000056090) #19	ENSCARG00000055965 #20	dtnbb (ENSCARG00000053334) #21	dnmt3ab (ENSCARG00000050968) #22	dpysl5a (ENSCARG00000050873) #23	mapre3a (ENSCARG00000050854) #24	ENSCARG00000050835 #25	myo6b (ENSCARG00000050475) #26	ENSCARG00000050407 #27	HTR1B (ENSCARG00000050392) #28	colec11 (ENSCARG00000050371) #29	ENSCARG00000050358 #30	ENSCARG00000050341 #31	rnf144aa (ENSCARG00000050309) #33	adam17a (ENSCARG00000037592) ##37	iah1 (ENSCARG00000037431)	itgb1bp1 (ENSCARG00000037420)	rsad2 (ENSCARG00000037380) #32	asap2a (ENSCARG00000037172)
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Goldfish	DUPLICATION
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Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	74	ENSGT00940000155076.a.d.b #8	ENSGT00390000010899.a.a.f #9	ENSGT01030000234573.B.c.a.t #10	ENSGT00940000158683.a.a.a.a.f #11	ENSGT00940000158683.a.b.b ##11	ENSGT00940000158683.a.a.a.a.e.a.b #11	ENSGT00940000164671 #12	ENSGT00940000157459.b.b #13	ENSGT00940000156793.m #14	ENSGT00390000016216.b #15	ENSGT00940000154677.b.a.c #16	ENSGT00940000156484.b.e.a.a.a #17	ENSGT00940000153739.a.b.t.c #19	ENSGT00520000055578.a.b.a #20	ENSGT00940000153897.b.a.b.a #21	ENSGT00940000155459.x.b.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.b #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.b #24	ENSGT00530000063503.a.b.g.b.b #27	ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b.c #28	ENSGT00940000159468.d #29	ENSGT00940000154030.a.b.b #31	ENSGT00390000013670.j #32	ENSGT00940000154030.a.b.a #31	ENSGT00940000157701.f.b.b #33	ENSGT00940000155443.c.b ##37	ENSGT00390000003990.r	ENSGT00940000155623.k	ENSGT00940000163467.b.a.b.d.a.a.b	ENSGT01030000234564.a.a.a.a.b.a.p	ENSGT00940000156714.a.a
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Zebrafish	MODERN SPECIES	8	zfp36l1a (ENSDARG00000016154) #8	tmem229b (ENSDARG00000060569) #9	MTA1 (ENSDARG00000007198) #10	crip2 (ENSDARG00000070670) #11	crip1 (ENSDARG00000053858) #12	ENSDARG00000096902	ENSDARG00000053864 #13	ptgr2 (ENSDARG00000070673) #14	TMEM62 (ENSDARG00000053890) #15	ENSDARG00000117189	hadhab (ENSDARG00000060594) #16	slc30a1b (ENSDARG00000053896) #17	kif3cb (ENSDARG00000079500) #19	ASXL2 (ENSDARG00000076501) #20	dtnbb (ENSDARG00000013020) #21	dnmt3ab (ENSDARG00000015566) #22	ENSDARG00000109649	dpysl5a (ENSDARG00000011141) #23	mapre3a (ENSDARG00000020231) #24	ENSDARG00000079992 #25	myo6b (ENSDARG00000042141) #26	ENSDARG00000074839 #27	htr1b (ENSDARG00000053987)	colec11 (ENSDARG00000013266) #29	ENSDARG00000103264 #30	sox11a (ENSDARG00000077811)	ENSDARG00000111789	CMPK2 (ENSDARG00000031359) #31	rsad2 (ENSDARG00000004952) #32	rnf144aa (ENSDARG00000020600) #33	adam17a (ENSDARG00000043213) ##37
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT00940000164671 #12	ENSGT00940000157459.b #13	ENSGT00940000156793 #14	ENSGT00390000016216 #15	ENSGT00940000156975.e.b	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT01080000259636	ENSGT00940000156484.b.e.a.a #17	ENSGT00940000178910 #18	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155724.q #25	ENSGT00940000156078.c #26	ENSGT00530000063503.a.b.g.b #27	ENSGT00940000154484.B.a.b	ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b #28	ENSGT00940000159468 #29	ENSGT00940000164359.b #30	ENSGT00940000161652.b.b	ENSGT00940000154030.a.b #31	ENSGT00390000013670 #32	ENSGT00940000157701.b #33	ENSGT00940000155443.c ##37	ENSGT00390000008069
Channel catfish	MODERN SPECIES	28	ZFP36L1 (ENSIPUG00000023681) #8	tmem229b (ENSIPUG00000023676) #9	mta1 (ENSIPUG00000023660) #10	crip2 (ENSIPUG00000023653) #11	crip1 (ENSIPUG00000023649) #12	elmsan1 (ENSIPUG00000023646) #13	ptgr2 (ENSIPUG00000023638) #14	tmem62 (ENSIPUG00000023636) #15	ENSIPUG00000023629	hadhab (ENSIPUG00000023622) #16	ENSIPUG00000023621	slc30a1b (ENSIPUG00000023619) #17	kif3cb (ENSIPUG00000023614) #19	asxl2 (ENSIPUG00000023610) #20	dtnb (ENSIPUG00000023593) #21	dnmt3ab (ENSIPUG00000023584) #22	dpysl5 (ENSIPUG00000023577) #23	mapre3a (ENSIPUG00000023574) #24	ENSIPUG00000023566 #25	myo6b (ENSIPUG00000023558) #26	HTR1B (ENSIPUG00000023556) #28	colec11 (ENSIPUG00000023552) #29	sox11 (ENSIPUG00000023551)	cmpk2 (ENSIPUG00000023548) #31	rsad2 (ENSIPUG00000023544) #32	rnf144aa (ENSIPUG00000023528) #33	adam17a (ENSIPUG00000023481) ##37	iah1 (ENSIPUG00000023477)	ITGB1BP1 (ENSIPUG00000023464)	asap2 (ENSIPUG00000023403)	mboat2 (ENSIPUG00000021660)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT00940000164671 #12	ENSGT00940000157459.b #13	ENSGT00940000156793 #14	ENSGT00390000016216 #15	ENSGT00940000156975.e.b	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT01080000259636	ENSGT00940000156484.b.e.a.a #17	ENSGT00940000178910 #18	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155724.q #25	ENSGT00940000156078.c #26	ENSGT00530000063503.a.b.g.b #27	ENSGT00940000154484.B.a.b	ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b #28	ENSGT00940000159468 #29	ENSGT00940000164359.b #30	ENSGT00940000161652.b.a	ENSGT00940000154030.a.b #31	ENSGT00390000013670 #32	ENSGT00940000155443.c ##37	ENSGT00390000008069	ENSGT00390000003990
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT00940000164671 #12	ENSGT00940000157459.b #13	ENSGT00940000156793 #14	ENSGT00390000016216 #15	ENSGT00940000156975.e.b	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT01080000259636	ENSGT00940000156484.b.e.a.a #17	ENSGT00940000178910 #18	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155724.q #25	ENSGT00940000156078.c #26	ENSGT00530000063503.a.b.g.b #27	ENSGT00940000154484.B.a.b	ENSGT00940000159468 #29	ENSGT00940000164359.b #30	ENSGT00940000159377	ENSGT00530000063877.b.a	ENSGT00940000161470.a.b.d	ENSGT00940000155952	ENSGT00880000138038	ENSGT00950000182982.A.a	ENSGT00950000182982.C.c.a
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	33	zfp36l1a (ENSPNAG00000015712) #8	tmem229b (ENSPNAG00000015730) #9	MTA1 (ENSPNAG00000015822) #10	crip2 (ENSPNAG00000015866) #11	crip1 (ENSPNAG00000015879) #12	ENSPNAG00000015910 #13	ptgr2 (ENSPNAG00000015939) #14	TMEM62 (ENSPNAG00000015959) #15	ENSPNAG00000015996	hadhab (ENSPNAG00000016106) #16	ENSPNAG00000016125	slc30a1b (ENSPNAG00000016132) #17	kif3cb (ENSPNAG00000016169) #19	ASXL2 (ENSPNAG00000016179) #20	dtnbb (ENSPNAG00000016352) #21	dnmt3ab (ENSPNAG00000016534) #22	dpysl5a (ENSPNAG00000016614) #23	mapre3a (ENSPNAG00000016644) #24	ENSPNAG00000016660 #25	myo6b (ENSPNAG00000016938) #26	ENSPNAG00000016997 #27	htr1b (ENSPNAG00000017017)	colec11 (ENSPNAG00000017024) #29	ENSPNAG00000017107 #30	ENSPNAG00000017132	ENSPNAG00000003468	CMPK2 (ENSPNAG00000017162) #31	rsad2 (ENSPNAG00000017210) #32	rnf144aa (ENSPNAG00000017242) #33	adam17a (ENSPNAG00000017353) ##37	iah1 (ENSPNAG00000017402)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	24	tmem229b (ENSAMXG00000041935) #9	MTA1 (ENSAMXG00000002214) #10	crip2 (ENSAMXG00000032936) #11	crip1 (ENSAMXG00000033153) #12	ENSAMXG00000016770 #13	ptgr2 (ENSAMXG00000016801) #14	TMEM62 (ENSAMXG00000016834) #15	ENSAMXG00000033253	hadhab (ENSAMXG00000016894) #16	slc30a1b (ENSAMXG00000033624) #17	ENSAMXG00000038010 #18	kif3cb (ENSAMXG00000016963) #19	ASXL2 (ENSAMXG00000040278) #20	dtnbb (ENSAMXG00000039786) #21	ENSAMXG00000034971	dnmt3ab (ENSAMXG00000030597) #22	dpysl5a (ENSAMXG00000017057) #23	mapre3a (ENSAMXG00000035032) #24	ENSAMXG00000031248 #25	myo6b (ENSAMXG00000017107) #26	ENSAMXG00000038125 #27	ENSAMXG00000035833	htr1b (ENSAMXG00000025153)	colec11 (ENSAMXG00000039363) #29	ENSAMXG00000037587	ENSAMXG00000035898	peli2 (ENSAMXG00000031432)	ktn1 (ENSAMXG00000001465)	MSH4 (ENSAMXG00000001485)	ATG2B (ENSAMXG00000001516)	gskip (ENSAMXG00000033856)
Electric eel	MODERN SPECIES	508											hadhab (ENSEEEG00000003245) #16	slc30a1b (ENSEEEG00000003208) #17	ENSEEEG00000003207 #19	ASXL2 (ENSEEEG00000003206) #20	dtnbb (ENSEEEG00000003204) #21	dnmt3ab (ENSEEEG00000002024) #22	dpysl5a (ENSEEEG00000001992) #23	mapre3a (ENSEEEG00000001988) #24	ENSEEEG00000001985 #25	myo6b (ENSEEEG00000001977) #26	HTR1B (ENSEEEG00000001967) #28	colec11 (ENSEEEG00000001964) #29
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	293	ENSGT00530000063408.A	ENSGT00940000156778.k	ENSGT00950000182906.b.a.i.a	ENSGT01030000234595.A.b.a.a	ENSGT00730000111123	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT00940000153467.a.a	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT00730000111244.a.a	ENSGT00940000158401.f	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000156484.b.e.a #17	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A
Atlantic herring	MODERN SPECIES	5	ENSCHAG00000010722	STXBP5 (ENSCHAG00000010273)	GRM1 (ENSCHAG00000009878)	SHPRH (ENSCHAG00000008680)	fbxo30a (ENSCHAG00000008643)	ENSCHAG00000008612	stx11a (ENSCHAG00000008606)	ENSCHAG00000008579	ZBTB2 (ENSCHAG00000008565)	rmnd1 (ENSCHAG00000008338)	slc30a1b (ENSCHAG00000008322) #17	kif3cb (ENSCHAG00000008255) #19	ENSCHAG00000008222 #20	dtnbb (ENSCHAG00000007033) #21	ENSCHAG00000006987	dnmt3ab (ENSCHAG00000001499) #22	dpysl5a (ENSCHAG00000000568) #23	mapre3a (ENSCHAG00000000501) #24	OTOF (ENSCHAG00000000406)	ENSCHAG00000018346	ENSCHAG00000018321	ENSCHAG00000018304	snapc1b (ENSCHAG00000018292)	SYT16 (ENSCHAG00000018284)	ENSCHAG00000018276	ENSCHAG00000018268	ENSCHAG00000018259 ##28	ENSCHAG00000018250	ENSCHAG00000017868	rpl13a (ENSCHAG00000017737)	atp5if1b (ENSCHAG00000017730)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00390000013931	ENSGT01030000234626.B	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000169194
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000169194	ENSGT00730000111244.a.a	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000169194	ENSGT00730000111244.a.a	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00940000176900.a	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000169194	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT01050000244948.c.b.b
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00940000176900.a	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00940000176900.a	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00940000176900.a	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000169194	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT00940000163723.B
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	59	crip2 (ENSKMAG00000013040) #11	MTA1 (ENSKMAG00000013082) #10	tmem229b (ENSKMAG00000013142) #9	zfp36l1a (ENSKMAG00000013156) #8	plekhh1 (ENSKMAG00000013171) #7	slc25a21 (ENSKMAG00000013224)	pax9 (ENSKMAG00000013301)	NKX2-8 (ENSKMAG00000013325)	nkx2.1 (ENSKMAG00000013335)	mbip (ENSKMAG00000013349)	RPS6KA5 (ENSKMAG00000013410)	hadhab (ENSKMAG00000013503) #16	kif3cb (ENSKMAG00000013602) #19	ASXL2 (ENSKMAG00000013630) #20	dtnbb (ENSKMAG00000013696) #21	dnmt3ab (ENSKMAG00000013869) #22	dpysl5a (ENSKMAG00000013999) #23	mapre3a (ENSKMAG00000014053) #24	OTOF (ENSKMAG00000014101)	ENSKMAG00000014180	hist2h3ca1 (ENSKMAG00000014201)	ENSKMAG00000014241	ahi1 (ENSKMAG00000014264)	slc18b1 (ENSKMAG00000014308)	TULP4 (ENSKMAG00000014370)	ENSKMAG00000014436	ENSKMAG00000014539	rmnd1 (ENSKMAG00000014835)	ENSKMAG00000014866	STX11 (ENSKMAG00000014884)	stx11a (ENSKMAG00000014913)
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Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00940000176900.a	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337
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Mummichog	MODERN SPECIES	2289	tmem229b (ENSFHEG00000001308) #9	zfp36l1a (ENSFHEG00000001313) #8	ENSFHEG00000001315	plekhh1 (ENSFHEG00000001326) #7	slc25a21 (ENSFHEG00000001336)	pax9 (ENSFHEG00000001342)	NKX2-8 (ENSFHEG00000001349)	nkx2.1 (ENSFHEG00000001358)	mbip (ENSFHEG00000001365)	RPS6KA5 (ENSFHEG00000001369)	hadhab (ENSFHEG00000001377) #16	kif3cb (ENSFHEG00000001386) #19	ASXL2 (ENSFHEG00000001398) #20	ENSFHEG00000001402	dtnbb (ENSFHEG00000001412) #21	dnmt3ab (ENSFHEG00000001427) #22	dpysl5a (ENSFHEG00000001439) #23	mapre3a (ENSFHEG00000001466) #24	OTOF (ENSFHEG00000001485)	ENSFHEG00000001496	ENSFHEG00000001505	ahi1 (ENSFHEG00000001512)	slc18b1 (ENSFHEG00000001532)	TULP4 (ENSFHEG00000001547)	ENSFHEG00000001552	ENSFHEG00000001583	ENSFHEG00000001606	ENSFHEG00000001640	rmnd1 (ENSFHEG00000001651)	ENSFHEG00000001657	STX11 (ENSFHEG00000001664)
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	686						slc25a21 (ENSCVAG00000000799)	pax9 (ENSCVAG00000002018)	NKX2-8 (ENSCVAG00000002013)	nkx2.1 (ENSCVAG00000002011)	mbip (ENSCVAG00000000652)	RPS6KA5 (ENSCVAG00000023268)	hadhab (ENSCVAG00000022521) #16	kif3cb (ENSCVAG00000022435) #19	ENSCVAG00000022430 #20	dtnbb (ENSCVAG00000022420) #21	dnmt3ab (ENSCVAG00000000575) #22	dpysl5a (ENSCVAG00000022335) #23	mapre3a (ENSCVAG00000022305) #24	ENSCVAG00000022273
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00940000176900.a	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00940000176900.a	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337
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Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000169194	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT01050000244948.c.b.b
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Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000161517.D.d.b.q.b.a.b	ENSGT01030000234589.g.b.kb.a.b.b	ENSGT00940000161517.D.d.b.q.b.a.a.a	ENSGT01030000234589.g.b.kb.a.b.a.b.b.b	ENSGT01080000257344.a.b.b.a.b	ENSGT01030000234589.g.b.jb	ENSGT00940000154954.ob	ENSGT00940000155528.t.d.b	ENSGT00940000164644	ENSGT01080000257344.a.b.a.a.b.a.a	ENSGT01030000234589.g.b.kb.b	ENSGT00940000161517.D.d.b.q.a	ENSGT00940000167061
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000161517.D.d.b.q.b.a.b	ENSGT01030000234589.g.b.kb.a.b.b	ENSGT01080000257344.a.b.a.a.b.a.b.c.a.a	ENSGT00940000154954.ob	ENSGT00940000155528.t.d.b	ENSGT00940000164644	ENSGT01080000257344.a.b.a.a.b.a.a.b.a.a	ENSGT01030000234589.g.b.kb.b	ENSGT00940000161517.D.d.b.q.a	ENSGT00940000167061	ENSGT00940000159915.b	ENSGT01100000263497.E.a.b	ENSGT00950000182964.a.b.b.b
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	345	crip2 (ENSHBUG00000015959) #11	MTA1 (ENSHBUG00000016016) #10	tmem229b (ENSHBUG00000016038) #9	zfp36l1a (ENSHBUG00000016051) #8	plekhh1 (ENSHBUG00000016067) #7	slc25a21 (ENSHBUG00000016082)	pax9 (ENSHBUG00000016115)	NKX2-8 (ENSHBUG00000016142)	nkx2.1 (ENSHBUG00000016151)	mbip (ENSHBUG00000016161)	RPS6KA5 (ENSHBUG00000017050)	hadhab (ENSHBUG00000017179) #16	kif3cb (ENSHBUG00000017216) #19	ASXL2 (ENSHBUG00000017227) #20	dtnbb (ENSHBUG00000017324) #21	dnmt3ab (ENSHBUG00000017466) #22	dpysl5a (ENSHBUG00000017530) #23	mapre3a (ENSHBUG00000017552) #24
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000161517.D.d.b.q.b.a.b	ENSGT01030000234589.g.b.kb.a.b.b	ENSGT01080000257344.a.b.a.a.b.a.b.c.a.a	ENSGT00940000154954.ob	ENSGT00940000155528.t.d.b	ENSGT00940000164644	ENSGT01080000257344.a.b.a.a.b.a.a.b.a.a	ENSGT01030000234589.g.b.kb.b	ENSGT00940000161517.D.d.b.q.a	ENSGT00940000167061	ENSGT00940000159915.b	ENSGT01100000263497.E.a.b	ENSGT00950000182964.a.b.b.b
P. nyererei	MODERN SPECIES	365	crip2 (ENSPNYG00000005059) #11	MTA1 (ENSPNYG00000004995) #10	tmem229b (ENSPNYG00000004965) #9	zfp36l1a (ENSPNYG00000004953) #8	plekhh1 (ENSPNYG00000004898) #7	slc25a21 (ENSPNYG00000004880)	pax9 (ENSPNYG00000004863)	NKX2-8 (ENSPNYG00000004849)	nkx2.1 (ENSPNYG00000004833)	mbip (ENSPNYG00000004791)	RPS6KA5 (ENSPNYG00000004481)	hadhab (ENSPNYG00000004350) #16	kif3cb (ENSPNYG00000004221) #19	ASXL2 (ENSPNYG00000004178) #20	dtnbb (ENSPNYG00000004129) #21	dnmt3ab (ENSPNYG00000004039) #22	dpysl5a (ENSPNYG00000003990) #23	mapre3a (ENSPNYG00000003958) #24	ENSPNYG00000003927	ENSPNYG00000003904	ENSPNYG00000003849
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000161517.D.d.b.q.b.a.b	ENSGT01030000234589.g.b.kb.a.b.b	ENSGT01080000257344.a.b.a.a.b.a.b.c.a.a	ENSGT01030000234589.g.b.kb.a.b.a.a.c	ENSGT01080000257344.a.b.a.a.b.a.a.a.a.a.a	ENSGT00940000161517.D.d.b.q.b.b	ENSGT01080000257344.a.b.a.b.a	ENSGT01030000234589.g.b.kb.a.b.a.b.b.a	ENSGT01080000257344.a.b.a.a.b.a.b.d.b.a.b	ENSGT01080000257344.a.b.a.b.b.g	ENSGT00940000154954.ob	ENSGT00940000155528.t.d.b	ENSGT00940000164644
Eastern happy	MODERN SPECIES	10	MTA1 (ENSACLG00000007726) #10	tmem229b (ENSACLG00000007763) #9	zfp36l1a (ENSACLG00000007768) #8	plekhh1 (ENSACLG00000007780) #7	slc25a21 (ENSACLG00000007866)	pax9 (ENSACLG00000007915)	NKX2-8 (ENSACLG00000007928)	nkx2.1 (ENSACLG00000007931)	mbip (ENSACLG00000007940)	RPS6KA5 (ENSACLG00000007991)	hadhab (ENSACLG00000008298) #16	kif3cb (ENSACLG00000008328) #19	ASXL2 (ENSACLG00000008337) #20	dtnbb (ENSACLG00000008344) #21	ENSACLG00000008388	dnmt3ab (ENSACLG00000008392) #22	dpysl5a (ENSACLG00000008453) #23	mapre3a (ENSACLG00000008483) #24	ENSACLG00000008503	ENSACLG00000008514	ENSACLG00000008522	ENSACLG00000008526	ENSACLG00000009088	ENSACLG00000009115	ENSACLG00000009125	ENSACLG00000009142	ENSACLG00000009151	ENSACLG00000009171	ENSACLG00000009178	ENSACLG00000009196	ENSACLG00000009253
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1101	crip2 (ENSMZEG00005014639) #11	MTA1 (ENSMZEG00005014659) #10	tmem229b (ENSMZEG00005014671) #9	zfp36l1a (ENSMZEG00005014679) #8	plekhh1 (ENSMZEG00005014696) #7	slc25a21 (ENSMZEG00005014756)	pax9 (ENSMZEG00005014778)	NKX2-8 (ENSMZEG00005014809)	nkx2.1 (ENSMZEG00005014813)	mbip (ENSMZEG00005014817)	RPS6KA5 (ENSMZEG00005014911)	hadhab (ENSMZEG00005015078) #16	kif3cb (ENSMZEG00005015113) #19	ASXL2 (ENSMZEG00005015122) #20	dtnbb (ENSMZEG00005015132) #21	dnmt3ab (ENSMZEG00005015144) #22	dpysl5a (ENSMZEG00005015198) #23	dpysl5a (ENSMZEG00005015511) #23	mapre3a (ENSMZEG00005015624) #24	ENSMZEG00005015636	ENSMZEG00005015645	ENSMZEG00005015656	ENSMZEG00005015664	ENSMZEG00005015673	ENSMZEG00005015680	ENSMZEG00005015687	ENSMZEG00005015691	ENSMZEG00005015699	ENSMZEG00005015700	ENSMZEG00005015706	ENSMZEG00005015717
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	347	crip2 (ENSNBRG00000010619) #11	MTA1 (ENSNBRG00000010672) #10	tmem229b (ENSNBRG00000010815) #9	zfp36l1a (ENSNBRG00000010827) #8	plekhh1 (ENSNBRG00000010847) #7	slc25a21 (ENSNBRG00000010932)	pax9 (ENSNBRG00000010967)	NKX2-8 (ENSNBRG00000010982)	nkx2.1 (ENSNBRG00000011000)	mbip (ENSNBRG00000011056)	RPS6KA5 (ENSNBRG00000011129)	hadhab (ENSNBRG00000011308) #16	kif3cb (ENSNBRG00000011368) #19	ASXL2 (ENSNBRG00000011503) #20	dtnbb (ENSNBRG00000011589) #21	dnmt3ab (ENSNBRG00000012075) #22	ENSNBRG00000012552 #23	mapre3a (ENSNBRG00000012557) #24	ENSNBRG00000012581	ENSNBRG00000012618	ENSNBRG00000012634	ENSNBRG00000012658	ENSNBRG00000012665	ENSNBRG00000012671	ENSNBRG00000012676	ENSNBRG00000012695	ENSNBRG00000012724	ENSNBRG00000012733
Nile tilapia	MODERN SPECIES	10	crip2 (ENSONIG00000000955) #11	MTA1 (ENSONIG00000000969) #10	tmem229b (ENSONIG00000020737) #9	zfp36l1a (ENSONIG00000034848) #8	plekhh1 (ENSONIG00000000975) #7	slc25a21 (ENSONIG00000000985)	pax9 (ENSONIG00000000990)	NKX2-8 (ENSONIG00000000994)	nkx2.1 (ENSONIG00000039882)	mbip (ENSONIG00000000997)	RPS6KA5 (ENSONIG00000001001)	hadhab (ENSONIG00000001016) #16	kif3cb (ENSONIG00000001032) #19	ASXL2 (ENSONIG00000001036) #20	dtnbb (ENSONIG00000001041) #21	dnmt3ab (ENSONIG00000001050) #22	dpysl5a (ENSONIG00000001063) #23	mapre3a (ENSONIG00000029008) #24	ENSONIG00000034033	ENSONIG00000039518	ENSONIG00000029647	ENSONIG00000039201	ENSONIG00000038593	ENSONIG00000033195	ENSONIG00000036189	scarb2a (ENSONIG00000001079)	ENSONIG00000030161	ENSONIG00000031822	ENSONIG00000038381	ENSONIG00000039042	ENSONIG00000035500
Midas cichlid	MODERN SPECIES	362		MTA1 (ENSACIG00000016052) #10	tmem229b (ENSACIG00000016304) #9	zfp36l1a (ENSACIG00000016314) #8	plekhh1 (ENSACIG00000016325) #7	slc25a21 (ENSACIG00000016389)	pax9 (ENSACIG00000016451)	NKX2-8 (ENSACIG00000016461)	nkx2.1 (ENSACIG00000016474)	mbip (ENSACIG00000016547)	RPS6KA5 (ENSACIG00000016608)	hadhab (ENSACIG00000016806) #16	kif3cb (ENSACIG00000016854) #19	ENSACIG00000016887 #20	dtnbb (ENSACIG00000016910) #21	dnmt3ab (ENSACIG00000017005) #22	dpysl5a (ENSACIG00000017769) #23	mapre3a (ENSACIG00000017796) #24	OTOF (ENSACIG00000017805)	ENSACIG00000017829	ENSACIG00000017846	ahi1 (ENSACIG00000017883)	slc18b1 (ENSACIG00000017919)
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00940000176900.a	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	57	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00940000176900.a	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	83	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f.d	ENSGT01090000260070.D.b	ENSGT00940000155887.a	ENSGT00950000183031.A.a.b	ENSGT00940000156864.c
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	149	crip2 (ENSAOCG00000019339) #11	MTA1 (ENSAOCG00000001390) #10	tmem229b (ENSAOCG00000019255) #9	zfp36l1a (ENSAOCG00000019239) #8	plekhh1 (ENSAOCG00000001374) #7	slc25a21 (ENSAOCG00000019103)	pax9 (ENSAOCG00000019051)	NKX2-8 (ENSAOCG00000019043)	nkx2.1 (ENSAOCG00000019036)	mbip (ENSAOCG00000019025)	RPS6KA5 (ENSAOCG00000018926)	hadhab (ENSAOCG00000018498) #16	kif3cb (ENSAOCG00000018404) #19	ASXL2 (ENSAOCG00000018354) #20	dtnbb (ENSAOCG00000018315) #21	dnmt3ab (ENSAOCG00000018171) #22	dpysl5a (ENSAOCG00000018053) #23	ENSAOCG00000017927	ENSAOCG00000017910	ENSAOCG00000017880	ENSAOCG00000017861	ENSAOCG00000017852
Orange clownfish	MODERN SPECIES	9	tmem229b (ENSAPEG00000010264) #9	zfp36l1a (ENSAPEG00000010246) #8	plekhh1 (ENSAPEG00000010155) #7	slc25a21 (ENSAPEG00000010096)	pax9 (ENSAPEG00000010061)	NKX2-8 (ENSAPEG00000010047)	nkx2.1 (ENSAPEG00000010034)	mbip (ENSAPEG00000010022)	RPS6KA5 (ENSAPEG00000010002)	ENSAPEG00000009987	ENSAPEG00000009973	hadhab (ENSAPEG00000009876) #16	kif3cb (ENSAPEG00000009799) #19	ASXL2 (ENSAPEG00000009777) #20	dtnbb (ENSAPEG00000009720) #21	dnmt3ab (ENSAPEG00000009584) #22	dpysl5a (ENSAPEG00000009506) #23	mapre3a (ENSAPEG00000009470) #24	ENSAPEG00000009441	ENSAPEG00000009425	ahi1 (ENSAPEG00000009375)	slc18b1 (ENSAPEG00000009354)	TULP4 (ENSAPEG00000009289)	ENSAPEG00000009258	ENSAPEG00000009249	gja10a (ENSAPEG00000009234)	ENSAPEG00000009206	ENSAPEG00000009179	rragd (ENSAPEG00000009165)	ENSAPEG00000008970	ENSAPEG00000008945
Spiny chromis	MODERN SPECIES	1022										ENSAPOG00000018262	ENSAPOG00000018280	hadhab (ENSAPOG00000018376) #16	kif3cb (ENSAPOG00000018385) #19	ASXL2 (ENSAPOG00000018392) #20	dtnbb (ENSAPOG00000018483) #21	dnmt3ab (ENSAPOG00000018612) #22	dpysl5a (ENSAPOG00000018645) #23	mapre3a (ENSAPOG00000018695) #24
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	738																dnmt3ab (ENSSPAG00000014883) #22	dpysl5a (ENSSPAG00000014948) #23	mapre3a (ENSSPAG00000014976) #24	OTOF (ENSSPAG00000015005)	ENSSPAG00000015086	ENSSPAG00000015133	ahi1 (ENSSPAG00000015157)	slc18b1 (ENSSPAG00000015198)	TULP4 (ENSSPAG00000015235)	ENSSPAG00000015282	ENSSPAG00000015332	ENSSPAG00000015631	rmnd1 (ENSSPAG00000015686)	ENSSPAG00000015697	stx11a (ENSSPAG00000015702)	fbxo30a (ENSSPAG00000015738)
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT01030000234573.B.d ##10	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.d	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000169194	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT01050000244948.c.b.b
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.d	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000169194	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT01050000244948.c.b.b
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000177671	ENSGT00940000156509.m	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.d	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000169194	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT00950000183204.b.b.b
Fugu	MODERN SPECIES	11	MTA1 (ENSTRUG00000009012) #10	tmem229b (ENSTRUG00000009003) #9	zfp36l1a (ENSTRUG00000028662) #8	plekhh1 (ENSTRUG00000012147) #7	slc25a21 (ENSTRUG00000023029)	pax9 (ENSTRUG00000011965)	ENSTRUG00000030643	nkx2.9 (ENSTRUG00000011937)	nkx2.1 (ENSTRUG00000011900)	mbip (ENSTRUG00000011871)	RPS6KA5 (ENSTRUG00000011435)	hadhab (ENSTRUG00000010991) #16	ENSTRUG00000023146	ENSTRUG00000023287 #20	dtnbb (ENSTRUG00000010348) #21	dnmt3ab (ENSTRUG00000009738) #22	dpysl5a (ENSTRUG00000009449) #23	mapre3a (ENSTRUG00000009296) #24	ENSTRUG00000029071	ENSTRUG00000025849	ahi1 (ENSTRUG00000008309)	slc18b1 (ENSTRUG00000001854)	TULP4 (ENSTRUG00000007983)	ENSTRUG00000025910	rmnd1 (ENSTRUG00000006625)	ENSTRUG00000029368	STX11 (ENSTRUG00000006593)	fbxo30a (ENSTRUG00000001577)	SHPRH (ENSTRUG00000001674)	RAB32 (ENSTRUG00000024158)	GRM1 (ENSTRUG00000002341)
Tetraodon	MODERN SPECIES	1	psph (ENSTNIG00000019276)	phkg1a (ENSTNIG00000002064)	chchd2 (ENSTNIG00000019277)	im:7138535 (ENSTNIG00000019278)	ENSTNIG00000019279	UBE4A (ENSTNIG00000019280)	kmt2a (ENSTNIG00000019281)	plekhh1 (ENSTNIG00000019282) #7	slc25a21 (ENSTNIG00000019283)	pax9 (ENSTNIG00000019284)	RPS6KA5 (ENSTNIG00000019285)	hadhab (ENSTNIG00000019286) #16	kif3cb (ENSTNIG00000019287) #19	ENSTNIG00000019288 #20	dtnbb (ENSTNIG00000019289) #21	dnmt3ab (ENSTNIG00000019290) #22	dpysl5a (ENSTNIG00000019291) #23	mapre3a (ENSTNIG00000019292) #24	OTOF (ENSTNIG00000019293)	ENSTNIG00000019294	ahi1 (ENSTNIG00000019295)	slc18b1 (ENSTNIG00000019296)	TULP4 (ENSTNIG00000019297)	ENSTNIG00000019298	ENSTNIG00000019299	ENSTNIG00000019300	rmnd1 (ENSTNIG00000019301)	STX11 (ENSTNIG00000019302)	stx11a (ENSTNIG00000019303)	fbxo30a (ENSTNIG00000019304)	ENSTNIG00000019305
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.d	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000169194	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT01050000244948.c.b.b
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	19	crip2 (ENSLBEG00000008624) #11	MTA1 (ENSLBEG00000008236) #10	tmem229b (ENSLBEG00000008124) #9	zfp36l1a (ENSLBEG00000008102) #8	plekhh1 (ENSLBEG00000007962) #7	slc25a21 (ENSLBEG00000007921)	pax9 (ENSLBEG00000007878)	NKX2-8 (ENSLBEG00000007852)	nkx2.1 (ENSLBEG00000007839)	mbip (ENSLBEG00000007778)	RPS6KA5 (ENSLBEG00000007107)	hadhab (ENSLBEG00000006817) #16	kif3cb (ENSLBEG00000006751) #19	ENSLBEG00000006710 #20	dtnbb (ENSLBEG00000006630) #21	dnmt3ab (ENSLBEG00000006546) #22	dpysl5a (ENSLBEG00000006483) #23	mapre3a (ENSLBEG00000006445) #24	OTOF (ENSLBEG00000006321)	ENSLBEG00000006260	ENSLBEG00000006215	ahi1 (ENSLBEG00000006126)	slc18b1 (ENSLBEG00000006089)	TULP4 (ENSLBEG00000005982)	ENSLBEG00000005912	ENSLBEG00000005445	ENSLBEG00000005330	rmnd1 (ENSLBEG00000005300)	ENSLBEG00000005267	ENSLBEG00000005240	stx11a (ENSLBEG00000005213)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.d	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000169194	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT01050000244948.c.b.b
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000177671	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.d	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00730000111244.a.a	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00940000177261	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000177671	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.d	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00730000111244.a.a	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT00950000183204.b.b.b
Stickleback	MODERN SPECIES	15	crip2 (ENSGACG00000011235) #11	MTA1 (ENSGACG00000011264) #10	tmem229b (ENSGACG00000011269) #9	zfp36l1a (ENSGACG00000011271) #8	plekhh1 (ENSGACG00000011275) #7	slc25a21 (ENSGACG00000011289)	pax9 (ENSGACG00000011298)	NKX2-8 (ENSGACG00000011300)	nkx2.1 (ENSGACG00000011301)	mbip (ENSGACG00000011304)	RPS6KA5 (ENSGACG00000011310)	hadhab (ENSGACG00000011314) #16	kif3cb (ENSGACG00000011361) #19	ENSGACG00000011377 #20	dtnbb (ENSGACG00000011386) #21	dnmt3ab (ENSGACG00000011391) #22	dpysl5a (ENSGACG00000011401) #23	mapre3a (ENSGACG00000011419) #24	OTOF (ENSGACG00000011463)	ENSGACG00000011476	ahi1 (ENSGACG00000011481)	slc18b1 (ENSGACG00000011487)	TULP4 (ENSGACG00000011498)	ENSGACG00000011511	ENSGACG00000011565	rmnd1 (ENSGACG00000011566)	ENSGACG00000011575	stx11a (ENSGACG00000011576)	fbxo30a (ENSGACG00000011577)	SHPRH (ENSGACG00000011582)	GRM1 (ENSGACG00000011598)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000177671	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00390000013337	ENSGT00730000111244.a.a	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT00950000183204.b.b.b
Pike perch	MODERN SPECIES	24	crip2 (ENSSLUG00000016935) #11	MTA1 (ENSSLUG00000015681) #10	tmem229b (ENSSLUG00000015622) #9	zfp36l1a (ENSSLUG00000015616) #8	plekhh1 (ENSSLUG00000014985) #7	slc25a21 (ENSSLUG00000014952)	pax9 (ENSSLUG00000014936)	NKX2-8 (ENSSLUG00000014930)	nkx2.1 (ENSSLUG00000014925)	mbip (ENSSLUG00000014909)	RPS6KA5 (ENSSLUG00000014728)	hadhab (ENSSLUG00000012414) #16	kif3cb (ENSSLUG00000012288) #19	ASXL2 (ENSSLUG00000012282) #20	dtnbb (ENSSLUG00000011084) #21	dnmt3ab (ENSSLUG00000006723) #22	dpysl5a (ENSSLUG00000006346) #23	mapre3a (ENSSLUG00000006330) #24	OTOF (ENSSLUG00000006244)	ENSSLUG00000006217	ahi1 (ENSSLUG00000006194)	slc18b1 (ENSSLUG00000006148)	TULP4 (ENSSLUG00000006124)	ENSSLUG00000006118	rmnd1 (ENSSLUG00000005236)	ENSSLUG00000005192	ENSSLUG00000019049	stx11a (ENSSLUG00000019046)	fbxo30a (ENSSLUG00000019043)	SHPRH (ENSSLUG00000018810)	GRM1 (ENSSLUG00000018756)
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	14	crip2 (ENSCGOG00000023867) #11	MTA1 (ENSCGOG00000023462) #10	tmem229b (ENSCGOG00000023422) #9	zfp36l1a (ENSCGOG00000023421) #8	plekhh1 (ENSCGOG00000023407) #7	slc25a21 (ENSCGOG00000023396)	pax9 (ENSCGOG00000023394)	NKX2-8 (ENSCGOG00000023392)	nkx2.1 (ENSCGOG00000023391)	mbip (ENSCGOG00000023387)	RPS6KA5 (ENSCGOG00000023253)	hadhab (ENSCGOG00000022932) #16	kif3cb (ENSCGOG00000022910) #19	ENSCGOG00000022905 #20	dtnbb (ENSCGOG00000022062) #21	dnmt3ab (ENSCGOG00000021228) #22	dpysl5a (ENSCGOG00000021008) #23	mapre3a (ENSCGOG00000020998) #24	OTOF (ENSCGOG00000020965)	ENSCGOG00000020948	ENSCGOG00000020943	dact1 (ENSCGOG00000020934)	lgals3b (ENSCGOG00000020931)	jmjd7 (ENSCGOG00000020893)	tbpl2 (ENSCGOG00000020891)	atg14 (ENSCGOG00000020885)	ENSCGOG00000020884	ENSCGOG00000020864	ENSCGOG00000020860	ENSCGOG00000020858	tyro3 (ENSCGOG00000020834)
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.d	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000169194	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT01050000244948.c.b.b
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	7	MTA1 (ENSSAUG00010026898) #10	tmem229b (ENSSAUG00010027216) #9	zfp36l1a (ENSSAUG00010027218) #8	plekhh1 (ENSSAUG00010027228) #7	slc25a21 (ENSSAUG00010027240)	pax9 (ENSSAUG00010027247)	NKX2-8 (ENSSAUG00010027251)	nkx2.1 (ENSSAUG00010027253)	mbip (ENSSAUG00010027255)	RPS6KA5 (ENSSAUG00010027264)	hadhab (ENSSAUG00010027297) #16	kif3cb (ENSSAUG00010027366) #19	ENSSAUG00010027367	ASXL2 (ENSSAUG00010027369) #20	dtnbb (ENSSAUG00010027397) #21	dnmt3ab (ENSSAUG00010027489) #22	dpysl5a (ENSSAUG00010027540) #23	mapre3a (ENSSAUG00010027541) #24	OTOF (ENSSAUG00010027544)	ENSSAUG00010027551	ENSSAUG00010027563	ENSSAUG00010027566	ENSSAUG00010027567	ENSSAUG00010001620	ENSSAUG00010001628	ENSSAUG00010001643	ENSSAUG00010001650	ENSSAUG00010001659	ENSSAUG00010001666	ENSSAUG00010001673	ENSSAUG00010001678
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.d	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000169194	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT01050000244948.c.b.b
European seabass	MODERN SPECIES	2	ENSDLAG00005011424 ##11	crip2 (ENSDLAG00005028716) #11	ENSDLAG00005011510 #10	tmem229b (ENSDLAG00005034642) #9	zfp36l1a (ENSDLAG00005013440) #8	plekhh1 (ENSDLAG00005013498) #7	slc25a21 (ENSDLAG00005014733)	pax9 (ENSDLAG00005014769)	NKX2-8 (ENSDLAG00005014816)	nkx2.1 (ENSDLAG00005030104)	mbip (ENSDLAG00005034945)	ENSDLAG00005014918	ENSDLAG00005015355 #16	ENSDLAG00005017635 #20	dtnbb (ENSDLAG00005017872) #21	dnmt3ab (ENSDLAG00005018806) #22	dpysl5a (ENSDLAG00005020641) #23	mapre3a (ENSDLAG00005020660) #24	ENSDLAG00005020695	ENSDLAG00005021018	ENSDLAG00005021032	ahi1 (ENSDLAG00005021046)	slc18b1 (ENSDLAG00005021061)	ENSDLAG00005021165	ENSDLAG00005021257	ENSDLAG00005021184	ENSDLAG00005023541	rmnd1 (ENSDLAG00005033321)	ENSDLAG00005023578	ENSDLAG00005023581	stx11a (ENSDLAG00005030078)
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	495	MTA1 (ENSLCRG00005001910) #10	tmem229b (ENSLCRG00005007404) #9	zfp36l1a (ENSLCRG00005007406) #8	plekhh1 (ENSLCRG00005007422) #7	slc25a21 (ENSLCRG00005007494)	pax9 (ENSLCRG00005007497)	NKX2-8 (ENSLCRG00005007498)	nkx2.1 (ENSLCRG00005007500)	mbip (ENSLCRG00005007502)	RPS6KA5 (ENSLCRG00005007544)	hadhab (ENSLCRG00005009284) #16	kif3cb (ENSLCRG00005012391) #19	ENSLCRG00005012392	ENSLCRG00005012395 #20	dtnbb (ENSLCRG00005012399) #21	dnmt3ab (ENSLCRG00005012433) #22	dpysl5a (ENSLCRG00005014646) #23	mapre3a (ENSLCRG00005014652) #24	OTOF (ENSLCRG00005014657)	ENSLCRG00005014661	ENSLCRG00005014662	ENSLCRG00005014663	ahi1 (ENSLCRG00005014664)	slc18b1 (ENSLCRG00005014670)	TULP4 (ENSLCRG00005014829)	ENSLCRG00005014854	ENSLCRG00005014947	rmnd1 (ENSLCRG00005014948)	ENSLCRG00005014957	ENSLCRG00005014962	stx11a (ENSLCRG00005014963)
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00940000177261	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000169194	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00940000177261	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000169194	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00940000177261	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000169194	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT00950000183204.b.b.b
Tongue sole	MODERN SPECIES		otomp (ENSCSEG00000005362)	hs6st1b (ENSCSEG00000005379)	uggt1 (ENSCSEG00000005390)	ENSCSEG00000005431	ola1 (ENSCSEG00000005434)	GRM1 (ENSCSEG00000005446)	SHPRH (ENSCSEG00000005452)	ENSCSEG00000005493	fbxo30a (ENSCSEG00000005500)	stx11a (ENSCSEG00000005503)	RPS6KA5 (ENSCSEG00000006322)	hadhab (ENSCSEG00000006477) #16	ENSCSEG00000006512 #20	ENSCSEG00000006518 #19	dtnbb (ENSCSEG00000006526) #21	dnmt3ab (ENSCSEG00000006540) #22	dpysl5a (ENSCSEG00000006551) #23	mapre3a (ENSCSEG00000006565) #24	OTOF (ENSCSEG00000006592)	ahi1 (ENSCSEG00000006633)	slc18b1 (ENSCSEG00000006659)	TULP4 (ENSCSEG00000006683)	ENSCSEG00000006723	ENSCSEG00000006735	ENSCSEG00000006792	SYNE1 (ENSCSEG00000006808)	rmnd1 (ENSCSEG00000006888)	ENSCSEG00000006899	ENSCSEG00000006904	mbip (ENSCSEG00000006916)	nkx2.1 (ENSCSEG00000006924)
Turbot	MODERN SPECIES	8	ENSSMAG00000012794 #10	tmem229b (ENSSMAG00000012814) #9	zfp36l1a (ENSSMAG00000031055) #8	plekhh1 (ENSSMAG00000012824) #7	slc25a21 (ENSSMAG00000012977)	pax9 (ENSSMAG00000013048)	NKX2-8 (ENSSMAG00000013053)	nkx2.1 (ENSSMAG00000013068)	mbip (ENSSMAG00000013076)	ENSSMAG00000013089	ENSSMAG00000013122 #16	kif3cb (ENSSMAG00000013180) #19	ENSSMAG00000013185	ENSSMAG00000013191 #20	dtnbb (ENSSMAG00000013199) #21	dnmt3ab (ENSSMAG00000013252) #22	dpysl5a (ENSSMAG00000013343) #23	mapre3a (ENSSMAG00000013407) #24	ENSSMAG00000013449	ENSSMAG00000013554	ahi1 (ENSSMAG00000013582)	slc18b1 (ENSSMAG00000013619)	ENSSMAG00000013654	ENSSMAG00000013685	CCDC170 (ENSSMAG00000013942)	rmnd1 (ENSSMAG00000013954)	ENSSMAG00000036493	stx11a (ENSSMAG00000013967)	fbxo30a (ENSSMAG00000013985)	SHPRH (ENSSMAG00000014003)	GRM1 (ENSSMAG00000014159)
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00940000154481.a.a.c.b	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000169194	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b
Barramundi perch	MODERN SPECIES	367																dnmt3ab (ENSLCAG00010018846) #22	dpysl5a (ENSLCAG00010019496) #23	mapre3a (ENSLCAG00010019515) #24	OTOF (ENSLCAG00010019550)	ENSLCAG00010019638	ENSLCAG00010019643	ahi1 (ENSLCAG00010019649)	slc18b1 (ENSLCAG00010019665)	TULP4 (ENSLCAG00010019671)	ENSLCAG00010019674	ENSLCAG00010019681	ENSLCAG00010019717	rmnd1 (ENSLCAG00010019723)	ENSLCAG00010019738	STX11 (ENSLCAG00010019742)	stx11a (ENSLCAG00010019747)
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000158683.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.c.a	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000169194	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT01050000244948.c.b.b
Greater amberjack	MODERN SPECIES	62	MTA1 (ENSSDUG00000009705) #10	tmem229b (ENSSDUG00000009690) #9	zfp36l1a (ENSSDUG00000009669) #8	plekhh1 (ENSSDUG00000009551) #7	slc25a21 (ENSSDUG00000009483)	pax9 (ENSSDUG00000009460)	NKX2-8 (ENSSDUG00000009451)	nkx2.1 (ENSSDUG00000009444)	mbip (ENSSDUG00000009420)	RPS6KA5 (ENSSDUG00000009386)	hadhab (ENSSDUG00000009305) #16	kif3cb (ENSSDUG00000009283) #19	ENSSDUG00000009262 #20	dtnbb (ENSSDUG00000009232) #21	ENSSDUG00000009225	dnmt3ab (ENSSDUG00000009066) #22	dpysl5a (ENSSDUG00000009017) #23	mapre3a (ENSSDUG00000008998) #24	OTOF (ENSSDUG00000008908)	ENSSDUG00000008844	ENSSDUG00000008815	ahi1 (ENSSDUG00000008760)	slc18b1 (ENSSDUG00000008721)	TULP4 (ENSSDUG00000008680)	ENSSDUG00000008669	ENSSDUG00000008552	ENSSDUG00000008466	ENSSDUG00000008403	ENSSDUG00000008386	rmnd1 (ENSSDUG00000008364)	ENSSDUG00000008336
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3199	MTA1 (ENSSLDG00000021311) #10	tmem229b (ENSSLDG00000021372) #9	zfp36l1a (ENSSLDG00000021382) #8	plekhh1 (ENSSLDG00000021411) #7	slc25a21 (ENSSLDG00000021531)	pax9 (ENSSLDG00000021552)	NKX2-8 (ENSSLDG00000021566)	nkx2.1 (ENSSLDG00000021573)	mbip (ENSSLDG00000021579)	ENSSLDG00000021592	RPS6KA5 (ENSSLDG00000021636)	hadhab (ENSSLDG00000021940) #16	kif3cb (ENSSLDG00000021995) #19	ENSSLDG00000022018 #20	dtnbb (ENSSLDG00000022040) #21	dnmt3ab (ENSSLDG00000022115) #22	dpysl5a (ENSSLDG00000022245) #23	mapre3a (ENSSLDG00000022291) #24	ENSSLDG00000022330	tspan37 (ENSSLDG00000022468)	ELAVL1 (ENSSLDG00000022499)	slc1a8b (ENSSLDG00000022518)	ENSSLDG00000022542	zgc:101744 (ENSSLDG00000022565)	diras1b (ENSSLDG00000022578)	gng7 (ENSSLDG00000022588)	ifi44c2 (ENSSLDG00000022597)	GADD45B (ENSSLDG00000022607)	ENSSLDG00000022619	CARTPT (ENSSLDG00000022635)	yju2 (ENSSLDG00000022641)
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00940000177261	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000169194	ENSGT00730000111244.a.a	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT01050000244948.c.b.b
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	14	crip2 (ENSMAMG00000000277) #11	ENSMAMG00000000276 #10	tmem229b (ENSMAMG00000000275) #9	zfp36l1a (ENSMAMG00000000274) #8	plekhh1 (ENSMAMG00000000272) #7	slc25a21 (ENSMAMG00000000271)	pax9 (ENSMAMG00000000270)	NKX2-8 (ENSMAMG00000000269)	nkx2.1 (ENSMAMG00000000268)	mbip (ENSMAMG00000000267)	ENSMAMG00000000266	ENSMAMG00000000265 #16	kif3cb (ENSMAMG00000000264) #19	ENSMAMG00000000263 #20	dtnbb (ENSMAMG00000000262) #21	dnmt3ab (ENSMAMG00000000261) #22	dpysl5a (ENSMAMG00000000260) #23	mapre3a (ENSMAMG00000000259) #24	ENSMAMG00000000258	ENSMAMG00000000257	ENSMAMG00000000256	ahi1 (ENSMAMG00000000255)	slc18b1 (ENSMAMG00000000254)	ENSMAMG00000000253	ENSMAMG00000000252	ENSMAMG00000024394	rmnd1 (ENSMAMG00000000246)	ENSMAMG00000000245	ENSMAMG00000000244	stx11a (ENSMAMG00000000243)	fbxo30a (ENSMAMG00000000242)
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT01030000234573.B.c.a #10	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00940000177261	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000177671	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000169194	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT00730000111123
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	12	MTA1 (ENSBSLG00000024830) #10	tmem229b (ENSBSLG00000025382) #9	zfp36l1a (ENSBSLG00000025392) #8	plekhh1 (ENSBSLG00000025489) #7	slc25a21 (ENSBSLG00000025690)	pax9 (ENSBSLG00000025706)	NKX2-8 (ENSBSLG00000025715)	nkx2.1 (ENSBSLG00000025719)	mbip (ENSBSLG00000025724)	RPS6KA5 (ENSBSLG00000025788)	hadhab (ENSBSLG00000026039) #16	kif3cb (ENSBSLG00000026213) #19	ENSBSLG00000026222	ASXL2 (ENSBSLG00000026228) #20	dtnbb (ENSBSLG00000026254) #21	dnmt3ab (ENSBSLG00000026316) #22	dpysl5a (ENSBSLG00000026409) #23	mapre3a (ENSBSLG00000026411) #24	OTOF (ENSBSLG00000026418)	ENSBSLG00000026433	ENSBSLG00000026440	ahi1 (ENSBSLG00000026441)	slc18b1 (ENSBSLG00000026452)	TULP4 (ENSBSLG00000026478)	ENSBSLG00000026480	rmnd1 (ENSBSLG00000026537)	ENSBSLG00000026539	stx11a (ENSBSLG00000026540)	fbxo30a (ENSBSLG00000026541)	SHPRH (ENSBSLG00000026543)	GRM1 (ENSBSLG00000026559)
Climbing perch	MODERN SPECIES	13	crip2 (ENSATEG00000004593) #11	ENSATEG00000004570 #10	tmem229b (ENSATEG00000004557) #9	zfp36l1a (ENSATEG00000004546) #8	plekhh1 (ENSATEG00000004373) #7	slc25a21 (ENSATEG00000004294)	pax9 (ENSATEG00000004252)	NKX2-8 (ENSATEG00000004236)	nkx2.1 (ENSATEG00000004137)	mbip (ENSATEG00000004129)	ENSATEG00000003636	ENSATEG00000003592 #16	kif3cb (ENSATEG00000003388) #19	ENSATEG00000003374 #20	dtnbb (ENSATEG00000003325) #21	dnmt3ab (ENSATEG00000003305) #22	dpysl5a (ENSATEG00000003213) #23	mapre3a (ENSATEG00000003194) #24	ENSATEG00000002991	ENSATEG00000029892	ENSATEG00000002965	ahi1 (ENSATEG00000002948)	slc18b1 (ENSATEG00000002932)	ENSATEG00000002836	ENSATEG00000002813	CCDC170 (ENSATEG00000002214)	rmnd1 (ENSATEG00000002208)	ENSATEG00000028434	stx11a (ENSATEG00000002167)	fbxo30a (ENSATEG00000002153)	ENSATEG00000002015
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	399	MTA1 (ENSHCOG00000013965) #10	tmem229b (ENSHCOG00000013939) #9	zfp36l1a (ENSHCOG00000013932) #8	plekhh1 (ENSHCOG00000013922) #7	slc25a21 (ENSHCOG00000013866)	pax9 (ENSHCOG00000013856)	NKX2-8 (ENSHCOG00000013838)	nkx2.1 (ENSHCOG00000013833)	mbip (ENSHCOG00000013822)	RPS6KA5 (ENSHCOG00000013747)	hadhab (ENSHCOG00000013042) #16	ENSHCOG00000013028 #19	ENSHCOG00000013012 #19	ENSHCOG00000012992 #20	dtnbb (ENSHCOG00000012966) #21	dnmt3ab (ENSHCOG00000012855) #22	dpysl5a (ENSHCOG00000011965) #23	mapre3a (ENSHCOG00000011949) #24	ENSHCOG00000011937	SLC39A8 (ENSHCOG00000011927)	manba (ENSHCOG00000011898)	ube2d3 (ENSHCOG00000011883)	ENSHCOG00000011857	ENSHCOG00000011849	CPXM1 (ENSHCOG00000011844)	wdr32 (ENSHCOG00000011821)	rmnd1 (ENSHCOG00000011799)	ENSHCOG00000011776	ENSHCOG00000011747	ENSHCOG00000011727	ENSHCOG00000011642
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	14	crip2 (ENSMMDG00005024716) #11	MTA1 (ENSMMDG00005024530) #10	tmem229b (ENSMMDG00005024498) #9	zfp36l1a (ENSMMDG00005024497) #8	plekhh1 (ENSMMDG00005024494) #7	slc25a21 (ENSMMDG00005024491)	pax9 (ENSMMDG00005024490)	NKX2-8 (ENSMMDG00005024489)	nkx2.1 (ENSMMDG00005024488)	mbip (ENSMMDG00005024485)	RPS6KA5 (ENSMMDG00005024442)	hadhab (ENSMMDG00005024249) #16	kif3cb (ENSMMDG00005024221) #19	ASXL2 (ENSMMDG00005024218) #20	dtnbb (ENSMMDG00005024212) #21	dnmt3ab (ENSMMDG00005023789) #22	dpysl5a (ENSMMDG00005023741) #23	mapre3a (ENSMMDG00005023738) #24	OTOF (ENSMMDG00005023720)	ENSMMDG00005023707	ENSMMDG00005023698	ENSMMDG00005023695	ahi1 (ENSMMDG00005023691)	slc18b1 (ENSMMDG00005023679)	TULP4 (ENSMMDG00005023675)	ENSMMDG00005023673	ENSMMDG00005023573	ENSMMDG00005023534	rmnd1 (ENSMMDG00005023488)	ENSMMDG00005023481	ENSMMDG00005023480
Cod	MODERN SPECIES	18	slc18b1 (ENSGMOG00000030233)	slc18b1 (ENSGMOG00000019410)	ENSGMOG00000019415	ENSGMOG00000023735	ENSGMOG00000019433	rmnd1 (ENSGMOG00000019502)	ENSGMOG00000033787	stx11a (ENSGMOG00000034568)	fbxo30a (ENSGMOG00000025323)	ENSGMOG00000026983	ENSGMOG00000016082	ENSGMOG00000034655	ENSGMOG00000031388	ENSGMOG00000023444	dtnbb (ENSGMOG00000019472) #21	dnmt3ab (ENSGMOG00000019477) #22	dpysl5a (ENSGMOG00000019487) #23	mapre3a (ENSGMOG00000019491) #24	zbtb24 (ENSGMOG00000027722)	ENSGMOG00000013904	ENSGMOG00000030876	ENSGMOG00000013777	ENSGMOG00000013757	pnn (ENSGMOG00000013746)	ENSGMOG00000025119	ENSGMOG00000009379	ENSGMOG00000009391	ENSGMOG00000004214	ENSGMOG00000031897	ENSGMOG00000023678	ENSGMOG00000026908
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000010899.a.a #9	ENSGT00940000155076.a.d #8	ENSGT00940000159456 #7	ENSGT00730000111119.c	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00940000156484.b.e.a #17	ENSGT00940000166633	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00940000153804.A	ENSGT00940000155086.B	ENSGT00530000063558.B.k	ENSGT00390000011877	ENSGT00390000013931	ENSGT01030000234626.B.ub	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949	ENSGT00550000074878	ENSGT00940000157723.q.a	ENSGT00390000012341	ENSGT00940000156693
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	257																ENSGT00940000155459.x.b.e #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.g #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.g #24	ENSGT00940000155086.A.c	ENSGT00390000013931.n	ENSGT00950000182941.a.a.a.b.d	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674.a	ENSGT00940000155913.c.d	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.a	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337.c	ENSGT00730000111244.a.a.d	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT01050000244948.c.b.b.k
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	64	ENSGT00940000158683.a.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a.q #10	ENSGT00390000010899.a.a.g #9	ENSGT00940000155076.a.d.c #8	ENSGT00940000159456.c #7	ENSGT00730000111119.c	ENSGT00940000159896.c	ENSGT00940000161610.c	ENSGT00940000161107.u	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D.h	ENSGT00940000154677.b.a.e #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b.g #20	ENSGT00940000153897.b.a.b.g.a #21	ENSGT00940000155459.x.b.e #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.g #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.g #24	ENSGT00940000155086.A.c	ENSGT00390000013931.n	ENSGT00950000182941.a.a.a.b.d	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674.a	ENSGT00940000155913.c.d	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.a	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337.c	ENSGT00730000111244.a.a.d	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT01050000244948.c.b.b.k
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158683.a.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a.q #10	ENSGT00390000010899.a.a.g #9	ENSGT00940000155076.a.d.c #8	ENSGT00940000159456.c #7	ENSGT00730000111119.c	ENSGT00940000159896.c	ENSGT00940000161610.c	ENSGT00940000161107.u	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D.h	ENSGT00940000154677.b.a.e #16	ENSGT00940000166633.a	ENSGT00520000055578.a.b.g #20	ENSGT00940000153897.b.a.b.g.a #21	ENSGT00940000155459.x.b.e #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.g #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.g #24	ENSGT00940000155086.A.c	ENSGT00390000013931.n	ENSGT00950000182941.a.a.a.b.d	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674.a	ENSGT00940000155913.c.d	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.a	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00390000013337.c	ENSGT00730000111244.a.a.d	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT01050000244948.c.b.b.k
Atlantic salmon	MODERN SPECIES		crip1 (ENSSSAG00000076605) ##11	crip2 (ENSSSAG00000091691) #11	mta1 (ENSSSAG00000076651) #10	tmem229b (ENSSSAG00000085684) #9	ENSSSAG00000108885	zfp36l1a (ENSSSAG00000109874) #8	plekhh1 (ENSSSAG00000076963) #7	slc25a21 (ENSSSAG00000077374)	pax9 (ENSSSAG00000077394)	nkx2-8 (ENSSSAG00000077395)	nkx2.1 (ENSSSAG00000120893)	mbip (ENSSSAG00000077406)	ENSSSAG00000077473	ENSSSAG00000078035 #16	dtnbb (ENSSSAG00000117898) #21	dnmt3ab (ENSSSAG00000042714) #22	dpysl5a (ENSSSAG00000043824) #23	mapre3a (ENSSSAG00000103255) #24	ENSSSAG00000044138	ENSSSAG00000045091	ENSSSAG00000045145	ahi1 (ENSSSAG00000045210)	slc18b1 (ENSSSAG00000045425)	ENSSSAG00000045797	myct1b (ENSSSAG00000045855)	ENSSSAG00000046366	ENSSSAG00000082734	rmnd1 (ENSSSAG00000050905)	ENSSSAG00000050920	ENSSSAG00000119559	stx11a (ENSSSAG00000050924)
River trout	MODERN SPECIES	26	crip2 (ENSSTUG00000050023) #11	MTA1 (ENSSTUG00000048986) #10	tmem229b (ENSSTUG00000048911) #9	zfp36l1a (ENSSTUG00000048908) #8	plekhh1 (ENSSTUG00000048423) #7	slc25a21 (ENSSTUG00000048352)	pax9 (ENSSTUG00000048336)	NKX2-8 (ENSSTUG00000048331)	nkx2.1 (ENSSTUG00000048327)	mbip (ENSSTUG00000048303)	RPS6KA5 (ENSSTUG00000048116)	hadhab (ENSSTUG00000047229) #16	ENSSTUG00000047187	ASXL2 (ENSSTUG00000047178) #20	dtnbb (ENSSTUG00000046525) #21	dnmt3ab (ENSSTUG00000044178) #22	dpysl5a (ENSSTUG00000044075) #23	mapre3a (ENSSTUG00000044069) #24	OTOF (ENSSTUG00000043921)	ENSSTUG00000043890	ENSSTUG00000043880	ahi1 (ENSSTUG00000043708)	TULP4 (ENSSTUG00000043193)	ENSSTUG00000043147	ENSSTUG00000037367	ENSSTUG00000037264	rmnd1 (ENSSTUG00000037123)	ENSSTUG00000037111	STX11 (ENSSTUG00000037105)	stx11a (ENSSTUG00000037095)	zbtb24 (ENSSTUG00000037026)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000158683.a.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a.q #10	ENSGT00390000010899.a.a.g #9	ENSGT00940000155076.a.d.c #8	ENSGT00940000159456.c #7	ENSGT00730000111119.c	ENSGT00940000159896.c	ENSGT00940000161610.c	ENSGT00940000161107.u	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D.h	ENSGT00940000154677.b.a.e #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b.g #20	ENSGT00940000153897.b.a.b.g.a #21	ENSGT00940000155459.x.b.e #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.g #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.g #24	ENSGT00940000155086.A.c	ENSGT00390000013931.n	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674.a	ENSGT00940000155913.c.d	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.a	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00730000111244.a.a.d	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT01050000244948.c.b.b.k	ENSGT00940000159373	ENSGT00940000156778.k.e
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158683.a.a.a.a.a #11	ENSGT01030000234573.B.c.a.q #10	ENSGT00390000010899.a.a.g #9	ENSGT00940000155076.a.d.c #8	ENSGT00940000159456.c #7	ENSGT00730000111119.c	ENSGT00940000159896.c	ENSGT00940000161610.c	ENSGT00940000161107.u	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D.h	ENSGT00940000154677.b.a.e #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b.g #20	ENSGT00940000153897.b.a.b.g.a #21	ENSGT00940000155459.x.b.e #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.g #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.g #24	ENSGT00940000155086.A.c	ENSGT00390000013931.n	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674.a	ENSGT00940000155913.c.d	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a.a	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00730000111244.a.a.d	ENSGT01050000244948.c.b.a.a.b	ENSGT01050000244948.c.b.b.k	ENSGT00940000159373	ENSGT00940000156778.k.e
Coho salmon	MODERN SPECIES	27	MTA1 (ENSOKIG00005015605) #10	tmem229b (ENSOKIG00005015391) #9	zfp36l1a (ENSOKIG00005015383) #8	plekhh1 (ENSOKIG00005014777) #7	slc25a21 (ENSOKIG00005014688)	pax9 (ENSOKIG00005014660)	NKX2-8 (ENSOKIG00005014647)	nkx2.1 (ENSOKIG00005014635)	mbip (ENSOKIG00005014610)	RPS6KA5 (ENSOKIG00005014376)	ENSOKIG00005014335	ENSOKIG00005013236 #16	kif3cb (ENSOKIG00005013172) #19	ASXL2 (ENSOKIG00005013158) #20	dtnbb (ENSOKIG00005011119) #21	dnmt3ab (ENSOKIG00005006268) #22	ENSOKIG00005005842	dpysl5a (ENSOKIG00005005758) #23	mapre3a (ENSOKIG00005005709) #24	OTOF (ENSOKIG00005005301)	ENSOKIG00005005221	ahi1 (ENSOKIG00005004947)	slc18b1 (ENSOKIG00005004817)	TULP4 (ENSOKIG00005004773)	ENSOKIG00005004755	ENSOKIG00005004442	ENSOKIG00005004305	ENSOKIG00005004267	STX11 (ENSOKIG00005004250)	stx11a (ENSOKIG00005004243)	zbtb24 (ENSOKIG00005004214)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	2	MTA1 (ENSOTSG00005042628) #10	tmem229b (ENSOTSG00005042625) #9	zfp36l1a (ENSOTSG00005042623) #8	plekhh1 (ENSOTSG00005041758) #7	ENSOTSG00005041742	slc25a21 (ENSOTSG00005041740)	pax9 (ENSOTSG00005041739)	NKX2-8 (ENSOTSG00005041737)	nkx2.1 (ENSOTSG00005041736)	mbip (ENSOTSG00005041730)	RPS6KA5 (ENSOTSG00005040719)	hadhab (ENSOTSG00005037633) #16	ENSOTSG00005037606	ASXL2 (ENSOTSG00005037602) #20	dtnbb (ENSOTSG00005031581) #21	dnmt3ab (ENSOTSG00005024756) #22	dpysl5a (ENSOTSG00005024721) #23	mapre3a (ENSOTSG00005024720) #24	ENSOTSG00005024715	ahi1 (ENSOTSG00005024558)	slc18b1 (ENSOTSG00005024541)	TULP4 (ENSOTSG00005024540)	ENSOTSG00005024539	ENSOTSG00005023479	ENSOTSG00005023448	ENSOTSG00005023446	STX11 (ENSOTSG00005023445)	stx11a (ENSOTSG00005023443)	ENSOTSG00005023442	zbtb24 (ENSOTSG00005023441)	ENSOTSG00005023437
Rainbow trout	MODERN SPECIES	10	zfp36l1a (ENSOMYG00000029127) #8	plekhh1 (ENSOMYG00000028605) #7	ENSOMYG00000075150	ENSOMYG00000062008	ENSOMYG00000034354	slc25a21 (ENSOMYG00000028200)	pax9 (ENSOMYG00000028255)	NKX2-8 (ENSOMYG00000028107)	nkx2.1 (ENSOMYG00000028088)	mbip (ENSOMYG00000028051)	ENSOMYG00000025734	HADHA (ENSOMYG00000021215) #16	kif3cb (ENSOMYG00000020893) #19	ASXL2 (ENSOMYG00000020880) #20	dtnbb (ENSOMYG00000016049) #21	dnmt3ab (ENSOMYG00000013163) #22	dpysl5a (ENSOMYG00000036188) #23	mapre3a (ENSOMYG00000036149) #24	ENSOMYG00000035865	ENSOMYG00000035712	ahi1 (ENSOMYG00000035270)	slc18b1 (ENSOMYG00000035160)	ENSOMYG00000035114	ENSOMYG00000035101	ENSOMYG00000033554	ENSOMYG00000033282	ENSOMYG00000033275	stx11a (ENSOMYG00000033267)	ENSOMYG00000033250	ENSOMYG00000033211	STXBP5 (ENSOMYG00000030593)
Huchen	MODERN SPECIES	202																dnmt3ab (ENSHHUG00000034760) #22	dpysl5a (ENSHHUG00000034911) #23	mapre3a (ENSHHUG00000034932) #24	OTOF (ENSHHUG00000034941)	ENSHHUG00000035018	ENSHHUG00000035062	ahi1 (ENSHHUG00000035107)	slc18b1 (ENSHHUG00000035215)	TULP4 (ENSHHUG00000035231)	ENSHHUG00000035232	ENSHHUG00000035236	ENSHHUG00000035240	ENSHHUG00000035247	ENSHHUG00000035255	ENSHHUG00000035516	rmnd1 (ENSHHUG00000035530)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	205	ENSGT01030000234573.B.d ##10	ENSGT01030000234573.B.c.a.r #10	ENSGT00390000010899.a.a.h #9	ENSGT00940000155076.a.d.d #8	ENSGT00940000159456.d #7	ENSGT00730000111119.d	ENSGT00940000159896.d	ENSGT00940000161610.d	ENSGT00940000161107.v	ENSGT00940000156886.D.g	ENSGT00940000156484.b.e.a #17	ENSGT00940000154677.b.a.f #16	ENSGT00940000166633.b	ENSGT00520000055578.a.b.h #20	ENSGT00940000153897.b.a.b.g.b #21	ENSGT00940000155459.x.b.f #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.h #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.h #24	ENSGT00940000155086.A.d	ENSGT00950000182941.a.a.a.b.c	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156674.b	ENSGT00940000155913.c.c
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT01030000234573.B.d ##10	ENSGT01030000234573.B.c.a.r #10	ENSGT00390000010899.a.a.h #9	ENSGT00940000155076.a.d.d #8	ENSGT00940000159456.d #7	ENSGT00730000111119.d	ENSGT00940000159896.d	ENSGT00940000161610.d	ENSGT00940000161107.v	ENSGT00940000156886.D.g	ENSGT00940000156484.b.e.a #17	ENSGT00940000154677.b.a.f #16	ENSGT00940000166633.b	ENSGT00520000055578.a.b.h #20	ENSGT00940000153897.b.a.b.g.b #21	ENSGT00940000155459.x.b.f #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.h #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.h #24	ENSGT00940000155086.A.d	ENSGT00950000182941.a.a.a.b.c	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156674.b	ENSGT00940000155913.c.c	ENSGT00940000154481.a.a.b	ENSGT00390000013337.d	ENSGT00730000111244.a.a.c	ENSGT01050000244948.c.b.b.l	ENSGT00390000018635.c	ENSGT00940000156778.k.f.a	ENSGT00510000048701.b	ENSGT00950000182906.b.a.i.a.g.a
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000158683.a.a.a.a.b #11	ENSGT01030000234573.B.c.a.r #10	ENSGT00390000010899.a.a.h #9	ENSGT00940000155076.a.d.d #8	ENSGT00940000159456.d #7	ENSGT00730000111119.d	ENSGT00940000159896.d	ENSGT00940000161610.d	ENSGT00940000161107.v	ENSGT00940000156886.D.g	ENSGT00940000156484.b.e.a #17	ENSGT00940000154677.b.a.f #16	ENSGT00940000166633.b	ENSGT00520000055578.a.b.h #20	ENSGT00940000153897.b.a.b.g.b #21	ENSGT00940000155459.x.b.f #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.h #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.h #24	ENSGT00940000155086.A.d	ENSGT00950000182941.a.a.a.b.c	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156674.b	ENSGT00940000155913.c.c	ENSGT00940000154481.a.a.b	ENSGT00390000013337.d	ENSGT00730000111244.a.a.c	ENSGT01050000244948.c.b.b.l	ENSGT00390000018635.c.g	ENSGT00940000156778.k.f.a	ENSGT00510000048701.b	ENSGT00950000182906.b.a.i.a.g.a
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	28	ENSSSAG00000063876 #10	tmem229b (ENSSSAG00000095394) #9	ENSSSAG00000115222	zfp36l1a (ENSSSAG00000093103) #8	plekhh1 (ENSSSAG00000063941) #7	ENSSSAG00000064377	pax9 (ENSSSAG00000117660)	ENSSSAG00000064399	nkx2.1 (ENSSSAG00000064404)	ENSSSAG00000064453	ENSSSAG00000066302 #16	ENSSSAG00000068367 #17	ENSSSAG00000068422 #20	dtnbb (ENSSSAG00000093448) #21	ENSSSAG00000093955	dnmt3ab (ENSSSAG00000068527) #22	dpyl5 (ENSSSAG00000069192) #23	mapre3a (ENSSSAG00000009963) #24	ENSSSAG00000069241	ENSSSAG00000069398	ENSSSAG00000069411	slc18b1 (ENSSSAG00000113603)	ENSSSAG00000069434	ENSSSAG00000070134	rmnd1 (ENSSSAG00000071238)	ENSSSAG00000071313	stx11a (ENSSSAG00000113883)	ddo (ENSSSAG00000071341)	ENSSSAG00000109618	ENSSSAG00000108807	ENSSSAG00000071394
River trout	MODERN SPECIES	17	crip2 (ENSSTUG00000019947) #11	MTA1 (ENSSTUG00000016073) #10	ENSSTUG00000015977	zfp36l1a (ENSSTUG00000015974) #8	plekhh1 (ENSSTUG00000015313) #7	slc25a21 (ENSSTUG00000015281)	pax9 (ENSSTUG00000015263)	NKX2-8 (ENSSTUG00000015255)	nkx2.1 (ENSSTUG00000015240)	ENSSTUG00000014643	slc30a1b (ENSSTUG00000014514) #17	hadhab (ENSSTUG00000013353) #16	ENSSTUG00000013322	ENSSTUG00000013306 #20	dtnbb (ENSSTUG00000011764) #21	dnmt3ab (ENSSTUG00000010296) #22	dpysl5a (ENSSTUG00000010182) #23	mapre3a (ENSSTUG00000010175) #24	OTOF (ENSSTUG00000009829)	ENSSTUG00000009800	slc18b1 (ENSSTUG00000009727)	TULP4 (ENSSTUG00000009697)	ENSSTUG00000005129	rmnd1 (ENSSTUG00000004950)	ENSSTUG00000004899	stx11a (ENSSTUG00000004826)	ddo (ENSSTUG00000004819)	SAMD5 (ENSSTUG00000004805)	SASH1 (ENSSTUG00000004774)	STXBP5 (ENSSTUG00000004510)	GRM1 (ENSSTUG00000003846)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT01030000234573.B.c.a.r #10	ENSGT00390000010899.a.a.h #9	ENSGT00940000155076.a.d.d #8	ENSGT00940000159456.d #7	ENSGT00730000111119.d	ENSGT00940000159896.d	ENSGT00940000161610.d	ENSGT00940000161107.v	ENSGT01000000220414	ENSGT00940000156886.D.g	ENSGT00940000156484.b.e.a #17	ENSGT00940000154677.b.a.f #16	ENSGT00940000166633.b	ENSGT00520000055578.a.b.h #20	ENSGT00940000153897.b.a.b.g.b #21	ENSGT00940000155459.x.b.f #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.h #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.h #24	ENSGT00940000155086.A.d	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156674.b	ENSGT00940000155913.c.c	ENSGT00940000154481.a.a.b	ENSGT00390000013337.d	ENSGT00730000111244.a.a.c	ENSGT01050000244948.c.b.b.l	ENSGT00390000018635.c	ENSGT00940000156778.k.f.a	ENSGT00510000048701.b	ENSGT00950000182906.b.a.i.a.g.a	ENSGT01030000234595.A.b.a.a.c
Rainbow trout	MODERN SPECIES	17	ENSOMYG00000045253	tmem229b (ENSOMYG00000037278) #9	zfp36l1a (ENSOMYG00000037283) #8	plekhh1 (ENSOMYG00000037325) #7	ENSOMYG00000064585	pax9 (ENSOMYG00000037381)	ENSOMYG00000074485	nkx2.1 (ENSOMYG00000073717)	ENSOMYG00000037410	ENSOMYG00000037419	ENSOMYG00000037431 #17	ENSOMYG00000037527 #16	ENSOMYG00000037633	ENSOMYG00000037643 #20	dtnbb (ENSOMYG00000037701) #21	dnmt3ab (ENSOMYG00000038364) #22	dpysl5a (ENSOMYG00000041717) #23	mapre3a (ENSOMYG00000041724) #24	ENSOMYG00000041751	ENSOMYG00000041814	slc18b1 (ENSOMYG00000041820)	ENSOMYG00000041842	ENSOMYG00000042603	ENSOMYG00000062881	rmnd1 (ENSOMYG00000043676)	ENSOMYG00000076892	ENSOMYG00000060722	stx11a (ENSOMYG00000043686)	ddo (ENSOMYG00000043688)	SASH1 (ENSOMYG00000057465)	ENSOMYG00000043697
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	60	ENSGT00940000158683.a.a.a.a.b #11	ENSGT01030000234573.B.d ##10	ENSGT01030000234573.B.c.a.r #10	ENSGT00390000010899.a.a.h #9	ENSGT00940000155076.a.d.d #8	ENSGT00940000159896.d	ENSGT00940000161610.d	ENSGT00940000161107.v	ENSGT01000000220414	ENSGT00940000156886.D.g	ENSGT00940000156484.b.e.a #17	ENSGT00940000154677.b.a.f #16	ENSGT00940000166633.b	ENSGT00520000055578.a.b.h #20	ENSGT00940000153897.b.a.b.g.b #21	ENSGT00940000155459.x.b.f #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.h #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.h #24	ENSGT00940000155086.A.d	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156674.b	ENSGT00940000155913.c.c	ENSGT00940000154481.a.a.b	ENSGT00390000013337.d	ENSGT00730000111244.a.a.c	ENSGT01050000244948.c.b.b.l	ENSGT00390000018635.c	ENSGT00940000156778.k.f.a	ENSGT00950000182906.b.a.i.a.g.a	ENSGT01030000234595.A.b.a.a.c	ENSGT00950000183204.b.b.b.d
Coho salmon	MODERN SPECIES	5	zfp36l1a (ENSOKIG00005048464) #8	ENSOKIG00005048461	plekhh1 (ENSOKIG00005048296) #7	slc25a21 (ENSOKIG00005048242)	ENSOKIG00005048236	pax9 (ENSOKIG00005048217)	NKX2-8 (ENSOKIG00005048212)	nkx2.1 (ENSOKIG00005048207)	ENSOKIG00005048203	ENSOKIG00005047400	slc30a1b (ENSOKIG00005047249) #17	hadhab (ENSOKIG00005047072) #16	ENSOKIG00005047031	ENSOKIG00005047024 #20	dtnbb (ENSOKIG00005046666) #21	dnmt3ab (ENSOKIG00005044965) #22	dpysl5a (ENSOKIG00005044657) #23	mapre3a (ENSOKIG00005044633) #24	OTOF (ENSOKIG00005044164)	ENSOKIG00005044070	slc18b1 (ENSOKIG00005044003)	TULP4 (ENSOKIG00005043960)	ENSOKIG00005031763	rmnd1 (ENSOKIG00005030139)	ENSOKIG00005030050	stx11a (ENSOKIG00005030036)	ENSOKIG00005030018	ENSOKIG00005030002	ddo (ENSOKIG00005029968)	STXBP5 (ENSOKIG00005025216)	GRM1 (ENSOKIG00005024470)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	32	ENSOTSG00005006911 #10	ENSOTSG00005006914	zfp36l1a (ENSOTSG00005006915) #8	ENSOTSG00005006917	scd (ENSOTSG00005006924)	SEC31B (ENSOTSG00005006930)	ENSOTSG00005007042	ENSOTSG00005007052	ENSOTSG00005007053	slc30a1b (ENSOTSG00005007056) #17	hadhab (ENSOTSG00005007086) #16	ENSOTSG00005007390	ENSOTSG00005007391 #20	ENSOTSG00005007402 #20	dtnbb (ENSOTSG00005007406) #21	dnmt3ab (ENSOTSG00005008875) #22	dpysl5a (ENSOTSG00005012629) #23	mapre3a (ENSOTSG00005012643) #24	OTOF (ENSOTSG00005012647)	ENSOTSG00005012656	slc18b1 (ENSOTSG00005012658)	TULP4 (ENSOTSG00005012663)	ENSOTSG00005012700	rmnd1 (ENSOTSG00005014460)	ENSOTSG00005014470	stx11a (ENSOTSG00005014498)	ddo (ENSOTSG00005014503)	ENSOTSG00005014517	STXBP5 (ENSOTSG00005014523)	GRM1 (ENSOTSG00005014615)	fbxo30a (ENSOTSG00005014619)
Huchen	MODERN SPECIES	2007																dnmt3ab (ENSHHUG00000017176) #22	dpysl5a (ENSHHUG00000017142) #23	mapre3a (ENSHHUG00000017127) #24	ENSHHUG00000017119	OTOF (ENSHHUG00000017061)	ENSHHUG00000017035	ENSHHUG00000017007	ENSHHUG00000016986	slc18b1 (ENSHHUG00000016966)	TULP4 (ENSHHUG00000016958)
Northern pike	MODERN SPECIES	14	tmem229b (ENSELUG00000021511) #9	zfp36l1a (ENSELUG00000021506) #8	plekhh1 (ENSELUG00000021484) #7	slc25a21 (ENSELUG00000021444)	pax9 (ENSELUG00000021362)	NKX2-8 (ENSELUG00000032728)	nkx2.1 (ENSELUG00000021339)	mbip (ENSELUG00000021316)	RPS6KA5 (ENSELUG00000021270)	ENSELUG00000021187	slc30a1b (ENSELUG00000021161) #17	hadhab (ENSELUG00000001109) #16	kif3cb (ENSELUG00000021061) #19	ASXL2 (ENSELUG00000021024) #20	dtnbb (ENSELUG00000020995) #21	dnmt3ab (ENSELUG00000020827) #22	dpysl5a (ENSELUG00000020654) #23	mapre3a (ENSELUG00000020621) #24	OTOF (ENSELUG00000020563)	ENSELUG00000020480	ENSELUG00000020462	ENSELUG00000020442	ahi1 (ENSELUG00000020418)	slc18b1 (ENSELUG00000020386)	TULP4 (ENSELUG00000020361)	ENSELUG00000020284	ENSELUG00000020147	CCDC170 (ENSELUG00000000825)	rmnd1 (ENSELUG00000019358)	ENSELUG00000019325	stx11a (ENSELUG00000019317)
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000007341.b	ENSGT00940000160421	ENSGT00940000174492	ENSGT00940000167312	ENSGT00940000161139	ENSGT00950000183093.C.h	ENSGT00940000159665	ENSGT00940000158248.a	ENSGT01090000260082.d.b.a	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528	ENSGT00940000156484.b.c #17	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000156975.d.a	ENSGT00940000153897.b.a.a.b ##21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.i #24	ENSGT00940000155086.A.g	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156248.oc.a	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000176900	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000154481.a.b.a	ENSGT00940000158133	ENSGT00390000012924.a	ENSGT00950000183204.b.b.b.a	ENSGT00940000163723.B	ENSGT00730000111123	ENSGT01030000234595.A.b.a.a
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	6	ENSSFOG00015026453	ENSSFOG00015029731	HHIPL2 (ENSSFOG00015015157)	ENSSFOG00015029683	ENSSFOG00015015141	ENSSFOG00015015092	ezra (ENSSFOG00015015054)	tagapa (ENSSFOG00015015035)	nenf (ENSSFOG00015028126)	pacc1 (ENSSFOG00015015014)	ENSSFOG00015030842	ENSSFOG00015031571 #17	hadhab (ENSSFOG00015014954) #16	rab10 (ENSSFOG00015014932)	ENSSFOG00015014919 ##21	dnmt3ab (ENSSFOG00015014853) #22	MAPRE3 (ENSSFOG00015014816) #24	OTOF (ENSSFOG00015014727)	orc3 (ENSSFOG00015014381)	akirin2 (ENSSFOG00015014031)	CNR1 (ENSSFOG00015013994)	GABRR1 (ENSSFOG00015013972)	gabrr2a (ENSSFOG00015013943)	rragd (ENSSFOG00015013913)	ANKRD6 (ENSSFOG00015013830)	gja10a (ENSSFOG00015031485)	BACH2 (ENSSFOG00015026786)	manea (ENSSFOG00015013714)	fhl5 (ENSSFOG00015013696)	col10a1a (ENSSFOG00015013673)	marcksb (ENSSFOG00015027980)
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	34	sox11a (ENSPKIG00000020439)	ENSPKIG00000020425	ENSPKIG00000020407	colec11 (ENSPKIG00000020364) #29	myo6b (ENSPKIG00000020283) #26	ENSPKIG00000020228 #27	HTR1B (ENSPKIG00000020198) #28	SNX14 (ENSPKIG00000020125)	SYNCRIP (ENSPKIG00000020066)	ezra (ENSPKIG00000020002)	tagapa (ENSPKIG00000019949)	nenf (ENSPKIG00000019926)	pacc1 (ENSPKIG00000019895)	hadhab (ENSPKIG00000019822) #16	RAB10 (ENSPKIG00000019774)	dnmt3ab (ENSPKIG00000019638) #22	mapre3a (ENSPKIG00000019457) #24	OTOF (ENSPKIG00000019389)	ahi1 (ENSPKIG00000019324)	myb (ENSPKIG00000019287)	slc18b1 (ENSPKIG00000019233)	TULP4 (ENSPKIG00000019154)	ENSPKIG00000018887	ENSPKIG00000018696	ENSPKIG00000018656	ENSPKIG00000018556	esr1 (ENSPKIG00000018298)	zbtb2a (ENSPKIG00000018172)	stx11a (ENSPKIG00000018148)	ENSPKIG00000018135	ENSPKIG00000018096
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	60	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00900000143764	ENSGT00950000182848.d	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000177261	ENSGT00940000154677.b.a #16	ENSGT00940000153739.a.b.t #19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT00940000153897.b.a.a.b ##21	ENSGT00940000155459.x.b #22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a #24	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00940000158032	ENSGT00390000016516	ENSGT00950000183117.b	ENSGT00490000043329.a.a.b ##24	ENSGT00940000153897.a ##21	ENSGT00940000168786	ENSGT00940000159556
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	96	ENSGT00390000002089.a.a.a	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00900000143764	ENSGT00950000182848.d	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.c	ENSGT00940000177261	ENSGT00940000156975.d.b	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00520000055578.a.b #20	ENSGT00940000153897.b.a.b #21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b #23	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.j #24	ENSGT00390000002693	ENSGT00940000158032	ENSGT00390000016516	ENSGT00950000183117.b	ENSGT00490000043329.a.a.b ##24	ENSGT00940000153897.a ##21
Asian bonytongue	MODERN SPECIES		slc30a1a (ENSSFOG00015027996) #17	rd3 (ENSSFOG00015027647)	rhag (ENSSFOG00015006691)	ENSSFOG00015006673	tfap2b (ENSSFOG00015006654)	ENSSFOG00015027405	tfap2d (ENSSFOG00015006620)	hadhb (ENSSFOG00015006603)	hadhaa (ENSSFOG00015006508) ##16	GAREM2 (ENSSFOG00015006462)	rab10 (ENSSFOG00015027492)	KIF3C (ENSSFOG00015006428) ##19	ASXL2 (ENSSFOG00015006380) #20	hspb9l (ENSSFOG00015006397)	dtnbb (ENSSFOG00015006252) #21	DNMT3A (ENSSFOG00015006003) ##22	dpysl5a (ENSSFOG00015005937) #23	mapre3a (ENSSFOG00015005918) #24	tmem214 (ENSSFOG00015005891)	agbl5 (ENSSFOG00015005857)	ost4 (ENSSFOG00015005884)	selenoi (ENSSFOG00015005791)	fez2b (ENSSFOG00015005747)	wdr26b (ENSSFOG00015005730)	ADCY3 (ENSSFOG00015005680)	tgfb2 (ENSSFOG00015005654)	NAGA (ENSSFOG00015005645)	vegfab (ENSSFOG00015032179)	mrps18a (ENSSFOG00015005628)	rsph9 (ENSSFOG00015005596)	tmem63a (ENSSFOG00015005575)
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	223						hadhb (ENSPKIG00000014396)	hadhaa (ENSPKIG00000014316) ##16	GAREM2 (ENSPKIG00000014263)	ENSPKIG00000014241	ENSPKIG00000014226	KIF3C (ENSPKIG00000014189) ##19	ASXL2 (ENSPKIG00000014149) #20	dtnbb (ENSPKIG00000013896) #21	ENSPKIG00000013792	ENSPKIG00000013776	DNMT3A (ENSPKIG00000013521) ##22	dpysl5a (ENSPKIG00000013412) #23	MAPRE3 (ENSPKIG00000013345) #24	tmem214 (ENSPKIG00000013296)	ost4 (ENSPKIG00000013283)	agbl5 (ENSPKIG00000013187)	selenoi (ENSPKIG00000013107)	fez2b (ENSPKIG00000013046)	wdr26b (ENSPKIG00000012991)	ADCY3 (ENSPKIG00000012947)	tgfb2 (ENSPKIG00000012907)	NAGA (ENSPKIG00000012875)	vegfab (ENSPKIG00000012831)	mrps18a (ENSPKIG00000012807)	rsph9 (ENSPKIG00000012795)	tmem63a (ENSPKIG00000012769)
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	140								ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00940000158032	ENSGT00390000016516	ENSGT00950000183117.b	ENSGT00940000164803	ENSGT00940000155566	ENSGT00390000012588	ENSGT00530000065281	ENSGT00950000183107.a.a	ENSGT01040000240523	ENSGT00560000077266.a	ENSGT00940000159157	ENSGT00940000165353
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	165	ENSGT00940000178209	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT01070000253766.A.a.a.b.a.b	ENSGT00940000154798.a.d.b	ENSGT00530000063426.b.b	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.e.a	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00940000158032	ENSGT00390000016516
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	235	ENSGT00940000178209	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT01070000253766.A.a.a.b.a.b	ENSGT00940000154798.a.d.b	ENSGT00530000063426.b.b	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.e.a	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693
Denticle herring	DUPLICATION
Denticle herring	MODERN SPECIES	62																dnmt3aa (ENSDCDG00000019824) ##22	dpysl5b (ENSDCDG00000019809) ##23	mapre3b (ENSDCDG00000019805) ##24	tmem214 (ENSDCDG00000019740)
Denticle herring	MODERN SPECIES	5	ENSDCDG00000004222	prep (ENSDCDG00000004295)	lin28b (ENSDCDG00000004581)	ENSDCDG00000004598	acadl (ENSDCDG00000004602)	acadl (ENSDCDG00000004606)	tfap2b (ENSDCDG00000004613)	ENSDCDG00000004622	tfap2d (ENSDCDG00000004624)	hadhb (ENSDCDG00000004689)	hadhaa (ENSDCDG00000005346) ##16	GAREM2 (ENSDCDG00000005491)	rab10 (ENSDCDG00000005493)	KIF3C (ENSDCDG00000005497) ##19	dtnba (ENSDCDG00000005514) ##21	dnmt3aa (ENSDCDG00000009632) ##22	dpysl5b (ENSDCDG00000014792) ##23	mapre3b (ENSDCDG00000014825) ##24	tmem214 (ENSDCDG00000014867)	tram2 (ENSDCDG00000016300)	efhc1 (ENSDCDG00000016326)	ENSDCDG00000016329	mrpl19 (ENSDCDG00000016333)	itsn2a (ENSDCDG00000016359)	GNPAT (ENSDCDG00000016416)	LPIN1 (ENSDCDG00000016421)	si:ch73-21k16.4 (ENSDCDG00000016426)	ENSDCDG00000016431	kidins220b (ENSDCDG00000016437)	spint1b (ENSDCDG00000016500)	KIF1A (ENSDCDG00000016697)
Atlantic herring	MODERN SPECIES	6	efhc1 (ENSCHAG00000025291)	tram2 (ENSCHAG00000025217)	xkr5a (ENSCHAG00000025213)	ENSCHAG00000025209	prep (ENSCHAG00000025117)	lin28b (ENSCHAG00000025081)	tfap2b (ENSCHAG00000025062)	tfap2d (ENSCHAG00000025039)	hadhb (ENSCHAG00000024547)	hadhaa (ENSCHAG00000023963) ##16	GAREM2 (ENSCHAG00000023933)	rab10 (ENSCHAG00000023924)	ENSCHAG00000023917	KIF3C (ENSCHAG00000023912) ##19	dtnba (ENSCHAG00000023843) ##21	dnmt3aa (ENSCHAG00000022822) ##22	dpysl5b (ENSCHAG00000022720) ##23	mapre3b (ENSCHAG00000022700) ##24	METTL24 (ENSCHAG00000022690)	cdc40 (ENSCHAG00000022664)	ENSCHAG00000022652	WASF1 (ENSCHAG00000022646)	GPR6 (ENSCHAG00000022643)	FIG4 (ENSCHAG00000022495)	AK9 (ENSCHAG00000022439)	ENSCHAG00000022426	ENSCHAG00000022419	MPEG1 (ENSCHAG00000022414)	HTR3A (ENSCHAG00000022392)	ENSCHAG00000022383	ENSCHAG00000022375
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	55	ENSGT00390000009415	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT01070000253766.A.a.a.b.a.b	ENSGT00940000154798.a.d.b	ENSGT00530000063426.b.b	ENSGT00980000202516	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.e.a	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT00520000055570.B.l	ENSGT00940000157219.e	ENSGT00410000025698.a	ENSGT00940000153433.B.a.a	ENSGT00940000165654	ENSGT00390000017627.a.a.a	ENSGT00940000153634.b.b	ENSGT00940000156549.a.b	ENSGT00940000159745	ENSGT00940000155693.a.a	ENSGT00940000164930.b	ENSGT00940000159276	ENSGT00550000074954	ENSGT00550000074908	ENSGT00440000038430
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	167	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT01070000253766.A.a.a.b.a.b	ENSGT00530000063426.b.b	ENSGT00980000202516	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.f	ENSGT00940000177261	ENSGT00940000156975.e.a	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT00520000055570.B.l	ENSGT00940000157219.e	ENSGT00410000025698.a	ENSGT00940000153433.B.a.a
Channel catfish	MODERN SPECIES	11	xkr5 (ENSIPUG00000013477)	tram2 (ENSIPUG00000013446)	efhc1 (ENSIPUG00000013427)	ENSIPUG00000013406	mrpl19 (ENSIPUG00000013395)	ENSIPUG00000013382	ENSIPUG00000013369	ENSIPUG00000013363	ENSIPUG00000013349	ENSIPUG00000013341	ENSIPUG00000013333	ENSIPUG00000013319	ENSIPUG00000013315	ENSIPUG00000013278	dtnba (ENSIPUG00000013166) ##21	dnmt3a (ENSIPUG00000012999) ##22	ENSIPUG00000012966	ENSIPUG00000012882	si:ch73-21k16.4 (ENSIPUG00000012840)	esrrgb (ENSIPUG00000012120)	ENSIPUG00000012052	ENSIPUG00000012030	ENSIPUG00000011957	ENSIPUG00000011941	ENSIPUG00000011909	ENSIPUG00000011884	amd1 (ENSIPUG00000011800)	Cdk19 (ENSIPUG00000011750)	tab2 (ENSIPUG00000011691)	ENSIPUG00000011663	scara5 (ENSIPUG00000011649)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	175	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT01070000253766.A.a.a.b.a.b	ENSGT00530000063426.b.b	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.f	ENSGT00940000177261	ENSGT00940000156975.e.a	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT00520000055570.B.l	ENSGT00940000157219.e	ENSGT00410000025698.a	ENSGT00940000153433.B.a.a
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	206	ENSGT00940000154096.b.b.a	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT01070000253766.A.a.a.b.a.b	ENSGT00530000063426.b.b	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.f	ENSGT00940000177261	ENSGT00940000156975.e.a	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT00520000055570.B.l	ENSGT00940000157219.e	ENSGT00410000025698.a	ENSGT00940000153433.B.a.a
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	1323																dnmt3aa (ENSPNAG00000000155) ##22	GNPAT (ENSPNAG00000000156)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	18	ENSAMXG00000041061	efhc1 (ENSAMXG00000001941)	tram2 (ENSAMXG00000042373)	xkr5a (ENSAMXG00000001910)	prep (ENSAMXG00000001896)	lin28b (ENSAMXG00000001888)	tfap2b (ENSAMXG00000034876)	tfap2d (ENSAMXG00000001854)	hadhb (ENSAMXG00000001836)	hadhaa (ENSAMXG00000001804) ##16	GAREM2 (ENSAMXG00000001775)	RAB10 (ENSAMXG00000034090)	ENSAMXG00000032714	KIF3C (ENSAMXG00000035039) ##19	dtnba (ENSAMXG00000001714) ##21	dnmt3aa (ENSAMXG00000001678) ##22	GNPAT (ENSAMXG00000001670)	LPIN1 (ENSAMXG00000032749)	si:ch73-21k16.4 (ENSAMXG00000001662)	esrrgb (ENSAMXG00000001660)	csrnp1b (ENSAMXG00000034148)	LIMD2 (ENSAMXG00000002170)	slc22a13b (ENSAMXG00000002238)	oxsr1b (ENSAMXG00000002341)	ENSAMXG00000030738	myd88 (ENSAMXG00000033434)	cry-dash (ENSAMXG00000002370)	map3k22 (ENSAMXG00000018527)	acaa1 (ENSAMXG00000002390)	DLEC1 (ENSAMXG00000002508)	plcd1a (ENSAMXG00000002736)
Electric eel	MODERN SPECIES	1338																dnmt3aa (ENSEEEG00000013509) ##22	ENSEEEG00000013514	ENSEEEG00000013518
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	100	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00510000046470.a.b	ENSGT01070000253766.A.a.a.b.a.b	ENSGT00940000154798.a.d.b	ENSGT00530000063426.b.b	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00980000202516	ENSGT00940000153295.b	ENSGT00940000156975.e.a	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT00520000055570.B.l	ENSGT00940000157219.e	ENSGT00410000025698.a	ENSGT00940000153433.B.a.a	ENSGT00940000165654	ENSGT00390000017627.a.a.a	ENSGT00940000153634.b.b	ENSGT00940000156549.a.b	ENSGT00940000159745	ENSGT00940000155693.a.a	ENSGT00940000164930.b	ENSGT00940000159276	ENSGT00550000074954	ENSGT00550000074908	ENSGT00440000038430
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	314	ENSGT00530000063347.A.b.g.b	ENSGT00940000154096.b.b.a.h.b.b	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00510000046470.a.b.j	ENSGT00940000154798.a.d.b.b.b	ENSGT00530000063426.b.b.e	ENSGT00530000063834.e.b.c	ENSGT00940000154677.b.b.c ##16	ENSGT01030000234626.A.b.d	ENSGT00950000182848.d.b	ENSGT00950000182848.c.b.b.b.c	ENSGT00940000153295.b.l	ENSGT00940000156975.e.a.d	ENSGT00940000153739.a.b.s.c ##19	ENSGT00940000153897.b.b.f ##21	ENSGT00940000155459.x.a.c ##22	ENSGT00520000055570.B.l.d	ENSGT00940000157219.e.l	ENSGT00410000025698.a.f	ENSGT00940000153433.B.a.a.a	ENSGT00390000017627.a.a.a.b	ENSGT00940000153634.b.b.d	ENSGT00940000156549.a.b.b	ENSGT00940000159745.b.a	ENSGT00940000155693.a.a.b
Goldfish	MODERN SPECIES	645	ENSCARG00000025976	efhc1 (ENSCARG00000025950)	tram2 (ENSCARG00000025886)	ENSCARG00000025869	prep (ENSCARG00000025628)	GAREM2 (ENSCARG00000025515)	hadhaa (ENSCARG00000025436) ##16	hadhb (ENSCARG00000025176)	ENSCARG00000025113	tfap2d (ENSCARG00000025057)	tfap2b (ENSCARG00000025023)	lin28b (ENSCARG00000025002)	rab10 (ENSCARG00000024986)	KIF3C (ENSCARG00000024977) ##19	dtnba (ENSCARG00000024814) ##21	dnmt3aa (ENSCARG00000024559) ##22	ENSCARG00000024497	ENSCARG00000024422	si:ch73-21k16.4 (ENSCARG00000024384)	esrrgb (ENSCARG00000024358)	fez2b (ENSCARG00000024333)	wdr26b (ENSCARG00000024156)	ENSCARG00000024124	batf (ENSCARG00000024033)	jdp2b (ENSCARG00000069561)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	297	ENSGT00530000063347.A.b.g.b	ENSGT00940000154096.b.b.a.h.b.b	ENSGT00530000063528.A.a	ENSGT00510000046470.a.b.j	ENSGT00940000154798.a.d.b.a	ENSGT00530000063426.b.b.e	ENSGT00530000063834.e.b.c	ENSGT00940000154677.b.b.c ##16	ENSGT01030000234626.A.b.d	ENSGT00950000182848.d.b	ENSGT00950000182848.c.b.b.b.c	ENSGT00940000153295.b.l	ENSGT00940000156975.e.a.d	ENSGT00940000153739.a.b.s.c ##19	ENSGT00940000153897.b.b.f ##21	ENSGT00940000155459.x.a.c ##22	ENSGT00520000055570.B.l.d	ENSGT00940000157219.e.l	ENSGT00410000025698.a.f	ENSGT00940000153433.B.a.a.a	ENSGT00390000017627.a.a.a.b	ENSGT00940000153634.b.b.d	ENSGT00940000156549.a.b.b	ENSGT00940000159745.b.a	ENSGT00940000155693.a.a.b	ENSGT00940000164930.b.b	ENSGT00940000159276.l	ENSGT00550000074954.c	ENSGT00550000074908.m	ENSGT00440000038430.r	ENSGT00950000182992.a.b.a.b.g
Common carp reference	MODERN SPECIES	28	ENSCCRG00000008668	ENSCCRG00000065663	efhc1 (ENSCCRG00000028193)	tram2 (ENSCCRG00000028190)	prep (ENSCCRG00000010847)	ENSCCRG00000010851	GAREM2 (ENSCCRG00000010843)	hadhaa (ENSCCRG00000074806) ##16	hadhb (ENSCCRG00000010774)	tfap2d (ENSCCRG00000025627)	tfap2b (ENSCCRG00000078327)	lin28b (ENSCCRG00000063422)	RAB10 (ENSCCRG00000082614)	KIF3C (ENSCCRG00000043861) ##19	dtnba (ENSCCRG00000074769) ##21	dnmt3aa (ENSCCRG00000012465) ##22	ENSCCRG00000012420	ENSCCRG00000012411	si:ch73-21k16.4 (ENSCCRG00000080993)	esrrgb (ENSCCRG00000012875)	fez2b (ENSCCRG00000013917)	wdr26b (ENSCCRG00000045952)	ENSCCRG00000033462	batf (ENSCCRG00000077530)	jdp2b (ENSCCRG00000060927)	fosab (ENSCCRG00000072619)	ENSCCRG00000024792	tmed10 (ENSCCRG00000024655)	eif2b2 (ENSCCRG00000024669)	zc3h14 (ENSCCRG00000068113)	rmdn3 (ENSCCRG00000056920)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	396				ENSSGRG00000041849	ENSSGRG00000041853	prep (ENSSGRG00000041858)	GAREM2 (ENSSGRG00000041875)	hadhaa (ENSSGRG00000041894) ##16	hadhb (ENSSGRG00000042205)	tfap2d (ENSSGRG00000042501)	tfap2b (ENSSGRG00000042505)	lin28b (ENSSGRG00000042506)	rab10 (ENSSGRG00000042507)	KIF3C (ENSSGRG00000042512) ##19	dtnba (ENSSGRG00000042521) ##21	dnmt3aa (ENSSGRG00000043238) ##22	ENSSGRG00000044366	si:ch73-21k16.4 (ENSSGRG00000044564)	esrrgb (ENSSGRG00000044565)	fez2b (ENSSGRG00000044568)	wdr26b (ENSSGRG00000044569)	batf (ENSSGRG00000044571)	jdp2b (ENSSGRG00000044572)	ENSSGRG00000044574	fosab (ENSSGRG00000044575)	tmed10 (ENSSGRG00000044579)	eif2b2 (ENSSGRG00000044625)	zc3h14 (ENSSGRG00000044781)	rmdn3 (ENSSGRG00000044782)	RAD51 (ENSSGRG00000044783)	bmf2 (ENSSGRG00000044787)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	198									ENSGT00950000182848.d.a	ENSGT00950000182848.c.b.b.b.d	ENSGT00980000202516	ENSGT00940000153295.b.k	ENSGT00940000156975.e.a.c	ENSGT00940000153739.a.b.s.d ##19	ENSGT00940000153897.b.b.e ##21	ENSGT00940000155459.x.a.d ##22	ENSGT00520000055570.B.l.c	ENSGT00940000157219.e.k	ENSGT00410000025698.a.e	ENSGT00940000153433.B.a.a.b	ENSGT00390000017627.a.a.a.a	ENSGT00940000153634.b.b.c	ENSGT00940000156549.a.b.a	ENSGT00940000159745.b.b	ENSGT00940000155693.a.a.a	ENSGT00940000164930.b	ENSGT00940000159276.k	ENSGT00550000074954.d	ENSGT00550000074908.n	ENSGT00440000038430.q	ENSGT00950000182992.a.b.a.b.h
Goldfish	MODERN SPECIES	12	unc93a (ENSCARG00000010132)	TRIB2 (ENSCARG00000010125)	IPO13 (ENSCARG00000009286)	ENSCARG00000009235	mgst3a (ENSCARG00000009226)	prep (ENSCARG00000009153)	GAREM2 (ENSCARG00000009137)	hadhb (ENSCARG00000006895)	tfap2d (ENSCARG00000006815)	ENSCARG00000006804	tfap2b (ENSCARG00000006748)	lin28b (ENSCARG00000006722)	rab10 (ENSCARG00000006707)	KIF3C (ENSCARG00000006701) ##19	dtnba (ENSCARG00000006540) ##21	dnmt3aa (ENSCARG00000005107) ##22	GNPAT (ENSCARG00000004999)	ENSCARG00000004961	si:ch73-21k16.4 (ENSCARG00000004938)	esrrgb (ENSCARG00000004925)	fez2b (ENSCARG00000004904)	wdr26b (ENSCARG00000004633)	ENSCARG00000004465	batf (ENSCARG00000004443)	jdp2b (ENSCARG00000004431)	fosab (ENSCARG00000004417)	tmed10 (ENSCARG00000004358)	eif2b2 (ENSCARG00000004220)	zc3h14 (ENSCARG00000004185)	rmdn3 (ENSCARG00000004160)	rad51 (ENSCARG00000004144)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	130	ENSGT00940000154096.b.b.a.g	ENSGT00940000154096.b.b.a.h.b.a	ENSGT00510000046470.a.b.i	ENSGT01070000253766.A.a.a.b.a.b	ENSGT00940000154798.a.d.b.b.a	ENSGT00530000063426.b.b.f	ENSGT00530000063834.e.b.d	ENSGT00940000154677.b.b.d ##16	ENSGT01030000234626.A.b.c	ENSGT00950000182848.d.a	ENSGT00950000182848.c.b.b.b.d	ENSGT00940000153295.b.k	ENSGT00940000156975.e.a.c	ENSGT00940000153739.a.b.s.d ##19	ENSGT00940000153897.b.b.e ##21	ENSGT00940000155459.x.a.d ##22	ENSGT00520000055570.B.l.c	ENSGT00940000157219.e.k	ENSGT00410000025698.a.e	ENSGT00940000153433.B.a.a.b	ENSGT00390000017627.a.a.a.a	ENSGT00940000153634.b.b.c	ENSGT00940000156549.a.b.a	ENSGT00940000159745.b.b	ENSGT00940000155693.a.a.a	ENSGT00940000164930.b.a	ENSGT00940000159276.k	ENSGT00550000074954.d	ENSGT00550000074908.n	ENSGT00440000038430.q	ENSGT00950000182992.a.b.a.b.h
Common carp reference	MODERN SPECIES	34	ENSCCRG00000028238	ENSCCRG00000076012	tram2 (ENSCCRG00000004112)	xkr5a (ENSCCRG00000010765)	prep (ENSCCRG00000010038)	ENSCCRG00000023759	GAREM2 (ENSCCRG00000010023)	hadhaa (ENSCCRG00000010021) ##16	hadhb (ENSCCRG00000055821)	tfap2d (ENSCCRG00000003096)	tfap2b (ENSCCRG00000003128)	rab10 (ENSCCRG00000043765)	lin28b (ENSCCRG00000043756)	ENSCCRG00000079344 ##19	dtnba (ENSCCRG00000058037) ##21	dnmt3aa (ENSCCRG00000058953) ##22	ENSCCRG00000013654	ENSCCRG00000012939	si:ch73-21k16.4 (ENSCCRG00000012895)	esrrgb (ENSCCRG00000053761)	fez2b (ENSCCRG00000045991)	wdr26b (ENSCCRG00000013666)	ENSCCRG00000033792	ENSCCRG00000033794	jdp2b (ENSCCRG00000033796)	ENSCCRG00000033798	fosab (ENSCCRG00000033799)	tmed10 (ENSCCRG00000077997)	zc3h14 (ENSCCRG00000063233)	eif2b2 (ENSCCRG00000033800)	rmdn3 (ENSCCRG00000057388)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	167	ENSSGRG00000054758	efhc1 (ENSSGRG00000054756)	xkr5a (ENSSGRG00000054722)	ENSSGRG00000054719	prep (ENSSGRG00000054676)	GAREM2 (ENSSGRG00000054673)	hadhaa (ENSSGRG00000054647) ##16	hadhb (ENSSGRG00000054555)	tfap2d (ENSSGRG00000054518)	tfap2b (ENSSGRG00000054508)	lin28b (ENSSGRG00000054505)	rab10 (ENSSGRG00000054493)	KIF3C (ENSSGRG00000054489) ##19	ENSSGRG00000054487	dtnba (ENSSGRG00000053980) ##21	dnmt3aa (ENSSGRG00000053690) ##22	GNPAT (ENSSGRG00000053661)	ENSSGRG00000053549	si:ch73-21k16.4 (ENSSGRG00000053536)	esrrgb (ENSSGRG00000053535)	fez2b (ENSSGRG00000053533)	wdr26b (ENSSGRG00000053410)	ENSSGRG00000053384	batf (ENSSGRG00000053373)	jdp2b (ENSSGRG00000053372)	ENSSGRG00000053370	fosab (ENSSGRG00000053368)	tmed10 (ENSSGRG00000053359)	eif2b2 (ENSSGRG00000053355)	rmdn3 (ENSSGRG00000053350)	rad51 (ENSSGRG00000053343)
Zebrafish	MODERN SPECIES	12	prep (ENSDARG00000057151)	GAREM2 (ENSDARG00000073933)	hadhaa (ENSDARG00000057128) ##16	hadhb (ENSDARG00000102055)	tfap2d (ENSDARG00000023272)	tfap2b (ENSDARG00000012667)	ENSDARG00000116759	lin28b (ENSDARG00000052511)	rab10 (ENSDARG00000046106)	KIF3C (ENSDARG00000017162) ##19	dtnba (ENSDARG00000077694) ##21	ENSDARG00000096708	ENSDARG00000091243	ENSDARG00000096715	ENSDARG00000089158	dnmt3aa (ENSDARG00000005394) ##22	GNPAT (ENSDARG00000078770)	ENSDARG00000103380	GPATCH2 (ENSDARG00000101260)	esrrgb (ENSDARG00000011696)	ENSDARG00000041375	fez2b (ENSDARG00000022260)	ENSDARG00000093354	wdr26b (ENSDARG00000006812)	ENSDARG00000017437	ENSDARG00000111953	jdp2b (ENSDARG00000020133)	batf (ENSDARG00000011818)	fosab (ENSDARG00000031683)	ENSDARG00000068428	tmed10 (ENSDARG00000041391)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	92								ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00940000158032	ENSGT00390000016516	ENSGT00950000183117.b	ENSGT00940000164803	ENSGT00940000155566	ENSGT00390000012588	ENSGT00530000065281	ENSGT00950000183107.a.a	ENSGT01040000240523	ENSGT00940000160562	ENSGT00940000156406.b	ENSGT00940000166083
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	219			ENSGT00940000157684	ENSGT00390000004803	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00940000165711	ENSGT00940000159155	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01060000248685	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022	ENSGT00940000154071.B	ENSGT00390000015936	ENSGT00390000003585	ENSGT00940000153370.a.b
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410	ENSGT00940000163960.b	ENSGT01100000263671	ENSGT00940000177326	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022	ENSGT00940000154071.B
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.a.a	ENSGT00940000165711.a.b	ENSGT00940000165711.b	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410	ENSGT00940000163960.b	ENSGT01100000263671	ENSGT00940000177235	ENSGT00940000177326	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.a.a	ENSGT00940000165711.a.b	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410	ENSGT00940000163960.b	ENSGT01100000263671	ENSGT00940000177235	ENSGT00940000177326	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.a.a	ENSGT00940000165711.a.b	ENSGT00940000165711.b	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410	ENSGT00940000163960.b	ENSGT01100000263671	ENSGT00940000177235	ENSGT00940000177326	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.a.a	ENSGT00940000165711.a.b	ENSGT00940000165711.b	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410	ENSGT00940000163960.b	ENSGT01100000263671	ENSGT00940000177235	ENSGT00940000177326	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00510000047967	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.a.a	ENSGT00940000165711.a.b	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000163960.b	ENSGT01100000263671	ENSGT00940000177235	ENSGT00940000177326	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022	ENSGT00940000154071.B
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Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2936	GAREM2 (ENSSLDG00000020659)	fhit (ENSSLDG00000020653)	hadhb (ENSSLDG00000020610)	tfap2d (ENSSLDG00000020577)	tfap2b (ENSSLDG00000020559)	map3k5 (ENSSLDG00000020493)	lrp11 (ENSSLDG00000020480)	ENSSLDG00000020473	pcmt (ENSSLDG00000020446)	nup43 (ENSSLDG00000020406)	lats1 (ENSSLDG00000020377)	rab10 (ENSSLDG00000020361)	KIF3C (ENSSLDG00000020350) ##19	ENSSLDG00000020328	ENSSLDG00000020301 ##21	dnmt3aa (ENSSLDG00000020176) ##22	dpysl5b (ENSSLDG00000020131) ##23	mapre3b (ENSSLDG00000020081) ##24	tmem214 (ENSSLDG00000020045)	stmn4 (ENSSLDG00000020032)	il17a/f3 (ENSSLDG00000020022)	mcm3 (ENSSLDG00000019971)	paqr8 (ENSSLDG00000019955)	znf395b (ENSSLDG00000019938)	pnocb (ENSSLDG00000019931)	si:ch211-63o20.7 (ENSSLDG00000019915)	elp3 (ENSSLDG00000019877)	ENSSLDG00000019861	KIF13B (ENSSLDG00000019810)	HMBOX1 (ENSSLDG00000019781)	disp1 (ENSSLDG00000019770)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	317	fhit (ENSLCAG00010012729)	hadhb (ENSLCAG00010012538)	tfap2d (ENSLCAG00010012461)	ENSLCAG00010012453	tfap2b (ENSLCAG00010012440)	map3k5 (ENSLCAG00010012094)	lrp11 (ENSLCAG00010011988)	ENSLCAG00010011987	pcmt (ENSLCAG00010011980)	nup43 (ENSLCAG00010011975)	lats1 (ENSLCAG00010011966)	rab10 (ENSLCAG00010011953)	KIF3C (ENSLCAG00010011929) ##19	ENSLCAG00010011916	dtnba (ENSLCAG00010011903) ##21	dnmt3aa (ENSLCAG00010011402) ##22	dpysl5b (ENSLCAG00010011282) ##23	mapre3b (ENSLCAG00010011273) ##24	tmem214 (ENSLCAG00010011167)	ccdc25 (ENSLCAG00010011148)	esco2 (ENSLCAG00010011142)
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00510000047967	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.b	ENSGT00940000165711.a.a	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410	ENSGT00940000163960.b	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022	ENSGT00940000154071.B	ENSGT00390000015936	ENSGT00390000003585	ENSGT00940000153370.a.b
Turbot	MODERN SPECIES	12	ENSSMAG00000003120	ENSSMAG00000003151	hadhb (ENSSMAG00000003155)	tfap2d (ENSSMAG00000003201)	tfap2b (ENSSMAG00000003234)	ENSSMAG00000003239	ENSSMAG00000003253	ENSSMAG00000026387	PCMT1 (ENSSMAG00000003401)	nup43 (ENSSMAG00000003424)	LATS1 (ENSSMAG00000034320)	rab10 (ENSSMAG00000034648)	KIF3C (ENSSMAG00000003483) ##19	ENSSMAG00000003516	dtnba (ENSSMAG00000003535) ##21	dnmt3aa (ENSSMAG00000003540) ##22	dpysl5b (ENSSMAG00000003581) ##23	ENSSMAG00000003610 ##24	tmem214 (ENSSMAG00000003636)	ccdc25 (ENSSMAG00000003651)	ESCO2 (ENSSMAG00000003673)	pbk (ENSSMAG00000021670)	SCARA5 (ENSSMAG00000003736)	ENSSMAG00000029556	ENSSMAG00000003769	GNPAT (ENSSMAG00000003810)	zgc:194224 (ENSSMAG00000003818)	TRIM67 (ENSSMAG00000003826)	exoc8 (ENSSMAG00000003840)	sprtn (ENSSMAG00000003862)	FAM89A (ENSSMAG00000003900)
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Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT01060000248685	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.a.a	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410	ENSGT01080000257477.B	ENSGT00940000177235	ENSGT00940000177326	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022	ENSGT00940000154071.B
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	16	ENSMAMG00000024983	ENSMAMG00000001303	hadhb (ENSMAMG00000001232)	tfap2d (ENSMAMG00000001191)	ENSMAMG00000025165	tfap2b (ENSMAMG00000001154)	ENSMAMG00000001009	lrp11 (ENSMAMG00000000977)	PCMT1 (ENSMAMG00000000917)	nup43 (ENSMAMG00000000858)	LATS1 (ENSMAMG00000000819)	rab10 (ENSMAMG00000000782)	KIF3C (ENSMAMG00000000705) ##19	ENSMAMG00000024445	dtnba (ENSMAMG00000000593) ##21	dnmt3aa (ENSMAMG00000000518) ##22	dpysl5b (ENSMAMG00000000436) ##23	ENSMAMG00000000408 ##24	tmem214 (ENSMAMG00000000376)	ccdc25 (ENSMAMG00000000355)	ESCO2 (ENSMAMG00000000348)	pbk (ENSMAMG00000000338)	SCARA5 (ENSMAMG00000000321)	ENSMAMG00000026781	ENSMAMG00000028358	ENSMAMG00000000315	ENSMAMG00000021292	ENSMAMG00000021291	ENSMAMG00000021289	GNPAT (ENSMAMG00000021279)	zgc:194224 (ENSMAMG00000021275)
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT01060000248685	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.a.a	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410	ENSGT00940000163960.b	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022	ENSGT00940000154071.B	ENSGT00390000015936	ENSGT00390000003585	ENSGT00940000153370.a.b
Climbing perch	MODERN SPECIES	15	ENSATEG00000021040	ENSATEG00000021012	hadhb (ENSATEG00000020947)	tfap2d (ENSATEG00000020916)	tfap2b (ENSATEG00000020889)	ENSATEG00000030070	ENSATEG00000020817	lrp11 (ENSATEG00000020789)	PCMT1 (ENSATEG00000020772)	nup43 (ENSATEG00000020726)	LATS1 (ENSATEG00000020702)	rab10 (ENSATEG00000020686)	KIF3C (ENSATEG00000020596) ##19	ENSATEG00000020537	dtnba (ENSATEG00000020468) ##21	dnmt3aa (ENSATEG00000020419) ##22	dpysl5b (ENSATEG00000020376) ##23	ENSATEG00000020361 ##24	tmem214 (ENSATEG00000020343)	ccdc25 (ENSATEG00000026569)	ESCO2 (ENSATEG00000020300)	pbk (ENSATEG00000020271)	SCARA5 (ENSATEG00000020242)	ENSATEG00000020231	ENSATEG00000026590	ENSATEG00000026234	ENSATEG00000020190	ENSATEG00000028954	ENSATEG00000020184	ENSATEG00000019831	GNPAT (ENSATEG00000019802)
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	13	ENSBSLG00000016821	GAREM2 (ENSBSLG00000022699)	hadhb (ENSBSLG00000021981)	tfap2d (ENSBSLG00000021890)	tfap2b (ENSBSLG00000021793)	ENSBSLG00000021775	map3k5 (ENSBSLG00000021275)	lrp11 (ENSBSLG00000020946)	pcmt (ENSBSLG00000020040)	nup43 (ENSBSLG00000019995)	lats1 (ENSBSLG00000019976)	rab10 (ENSBSLG00000019960)	KIF3C (ENSBSLG00000019951) ##19	ENSBSLG00000019946	dtnba (ENSBSLG00000019807) ##21	dnmt3aa (ENSBSLG00000019122) ##22	dpysl5b (ENSBSLG00000019013) ##23	mapre3b (ENSBSLG00000018993) ##24	tmem214 (ENSBSLG00000018049)	ccdc25 (ENSBSLG00000018011)	esco2 (ENSBSLG00000017989)	pbk (ENSBSLG00000017980)	SCARA5 (ENSBSLG00000017964)	ENSBSLG00000017946	ENSBSLG00000017939	ENSBSLG00000017927	ENSBSLG00000017408	GNPAT (ENSBSLG00000016787)	zgc:194224 (ENSBSLG00000016601)	TRIM67 (ENSBSLG00000015933)	exoc8 (ENSBSLG00000015923)
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.a.a	ENSGT00940000165711.a.b	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410	ENSGT01100000263988	ENSGT00940000177235	ENSGT00940000177326	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022	ENSGT00940000154071.B
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.a.a	ENSGT00940000165711.a.b	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410	ENSGT01100000263988	ENSGT00940000177235	ENSGT00940000177326	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022	ENSGT00940000154071.B
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	138	ENSLBEG00000016538	GAREM2 (ENSLBEG00000016558)	hadhaa (ENSLBEG00000016662) ##16	hadhb (ENSLBEG00000016901)	tfap2d (ENSLBEG00000016981)	tfap2b (ENSLBEG00000017035)	map3k5 (ENSLBEG00000017084)	lrp11 (ENSLBEG00000017146)	pcmt (ENSLBEG00000017170)	nup43 (ENSLBEG00000017200)	lats1 (ENSLBEG00000017235)	rab10 (ENSLBEG00000017280)	KIF3C (ENSLBEG00000017299) ##19	ENSLBEG00000017322	dtnba (ENSLBEG00000017416) ##21	dnmt3aa (ENSLBEG00000017607) ##22	dpysl5b (ENSLBEG00000017678) ##23	ENSLBEG00000017739 ##24	tmem214 (ENSLBEG00000017793)	ccdc25 (ENSLBEG00000017845)	esco2 (ENSLBEG00000017871)	pbk (ENSLBEG00000017910)	scara5 (ENSLBEG00000017937)	ENSLBEG00000017973
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.a.a	ENSGT00940000165711.a.b	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410	ENSGT01100000263988	ENSGT00940000177235	ENSGT00940000177326	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022	ENSGT00940000154071.B
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT01060000248685	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.a.a	ENSGT00940000165711.a.b	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410	ENSGT01100000263988	ENSGT00940000177235	ENSGT00940000177326	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022	ENSGT00940000154071.B
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000154656.ob.b	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.a.a	ENSGT00940000165711.a.b	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410	ENSGT00940000177235.i	ENSGT00940000177326	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022	ENSGT00940000154071.B	ENSGT00390000015936
European seabass	MODERN SPECIES	7	ENSDLAG00005030584	ENSDLAG00005001693	hadhb (ENSDLAG00005001480)	tfap2d (ENSDLAG00005034048)	tfap2b (ENSDLAG00005001349)	ENSDLAG00005001123	ENSDLAG00005001096	ENSDLAG00005001093	PCMT1 (ENSDLAG00005001077)	nup43 (ENSDLAG00005001065)	LATS1 (ENSDLAG00005001055)	rab10 (ENSDLAG00005027287)	KIF3C (ENSDLAG00005001041) ##19	ENSDLAG00005001039	dtnba (ENSDLAG00005000781) ##21	dnmt3aa (ENSDLAG00005000339) ##22	dpysl5b (ENSDLAG00005000252) ##23	ENSDLAG00005000225 ##24	tmem214 (ENSDLAG00005000178)	ENSDLAG00005019404	hebp2 (ENSDLAG00005019396)	ENSDLAG00005033327	acbd3 (ENSDLAG00005019380)	mixl1 (ENSDLAG00005019378)	lin9 (ENSDLAG00005019351)	ENSDLAG00005019347	parp1 (ENSDLAG00005016955)	ENSDLAG00005016701	ENSDLAG00005014876	ENSDLAG00005014915	PTPN14 (ENSDLAG00005014848)
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	482	ENSLCRG00005021325	ENSLCRG00005021326	GAREM2 (ENSLCRG00005021332)	hadhb (ENSLCRG00005021353)	tfap2d (ENSLCRG00005021555)	tfap2b (ENSLCRG00005021570)	map3k5 (ENSLCRG00005021692)	lrp11 (ENSLCRG00005021927)	pcmt (ENSLCRG00005021933)	nup43 (ENSLCRG00005021949)	lats1 (ENSLCRG00005021960)	rab10 (ENSLCRG00005021968)	KIF3C (ENSLCRG00005021975) ##19	ENSLCRG00005021978	dtnba (ENSLCRG00005022039) ##21	dnmt3aa (ENSLCRG00005022244) ##22	dpysl5b (ENSLCRG00005022480) ##23	ENSLCRG00005022509 ##24	tmem214 (ENSLCRG00005022518)	ccdc25 (ENSLCRG00005022536)	esco2 (ENSLCRG00005022538)	pbk (ENSLCRG00005022540)	scara5 (ENSLCRG00005022545)	arv1 (ENSLCRG00005022548)	FAM89A (ENSLCRG00005002521)	sprtn (ENSLCRG00005002525)	exoc8 (ENSLCRG00005002640)	CAPN3 (ENSLCRG00005002667)	ENSLCRG00005002948	churc1 (ENSLCRG00005002955)	ttbk2b (ENSLCRG00005002957)
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	14	esr2a (ENSSAUG00010012071)	ENSSAUG00010012070	atp5mj (ENSSAUG00010012064)	GAREM2 (ENSSAUG00010012062)	hadhb (ENSSAUG00010010935)	tfap2d (ENSSAUG00010010926)	tfap2b (ENSSAUG00010010916)	map3k5 (ENSSAUG00010010318)	lrp11 (ENSSAUG00010010307)	pcmt (ENSSAUG00010010301)	lats1 (ENSSAUG00010010298)	rab10 (ENSSAUG00010010294)	KIF3C (ENSSAUG00010010278) ##19	ENSSAUG00010010271	dtnba (ENSSAUG00010008826) ##21	dnmt3aa (ENSSAUG00010003393) ##22	dpysl5b (ENSSAUG00010003360) ##23	ENSSAUG00010003358	mapre3b (ENSSAUG00010003357) ##24	tmem214 (ENSSAUG00010002876)	ENSSAUG00010012253	ENSSAUG00010012250	ENSSAUG00010012249	ENSSAUG00010012248	ENSSAUG00010012246	ENSSAUG00010012244	ENSSAUG00010012242	ccdc25 (ENSSAUG00010012235)	ESCO2 (ENSSAUG00010012234)	pbk (ENSSAUG00010012231)	scara5 (ENSSAUG00010012213)
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.a.a	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000163960.b	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022	ENSGT00940000154071.B	ENSGT00390000015936	ENSGT00390000003585	ENSGT00940000153370.a.b
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT01060000248685	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.a.a	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000159678	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000163960.b	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022	ENSGT00940000154071.B	ENSGT00390000015936	ENSGT00390000003585	ENSGT00940000153370.a.b	ENSGT00390000002675
Lumpfish	MODERN SPECIES	16	atp5mj (ENSCLMG00005022622)	GAREM2 (ENSCLMG00005022620)	hadhb (ENSCLMG00005022567)	tfap2d (ENSCLMG00005022563)	tfap2b (ENSCLMG00005022560)	ENSCLMG00005022558	map3k5 (ENSCLMG00005022543)	lrp11 (ENSCLMG00005022540)	pcmt (ENSCLMG00005022539)	nup43 (ENSCLMG00005022538)	lats1 (ENSCLMG00005022537)	rab10 (ENSCLMG00005022536)	KIF3C (ENSCLMG00005022533) ##19	ENSCLMG00005022531	dtnba (ENSCLMG00005022513) ##21	dnmt3aa (ENSCLMG00005022191) ##22	dpysl5b (ENSCLMG00005022181) ##23	mapre3b (ENSCLMG00005022180) ##24	tmem214 (ENSCLMG00005022179)	ccdc25 (ENSCLMG00005022176)	esco2 (ENSCLMG00005022175)	pbk (ENSCLMG00005022173)	scara5 (ENSCLMG00005022172)	ENSCLMG00005022171	ENSCLMG00005022170	ENSCLMG00005022169	ENSCLMG00005022168	ENSCLMG00005022167	ENSCLMG00005022137	GNPAT (ENSCLMG00005022013)	zgc:194224 (ENSCLMG00005022002)
Stickleback	MODERN SPECIES	18	ENSGACG00000007463	GAREM2 (ENSGACG00000007459)	hadhb (ENSGACG00000007328)	tfap2d (ENSGACG00000007319)	tfap2b (ENSGACG00000007277)	map3k5 (ENSGACG00000007264)	lrp11 (ENSGACG00000007258)	pcmt (ENSGACG00000007215)	nup43 (ENSGACG00000007209)	lats1 (ENSGACG00000007187)	rab10 (ENSGACG00000007169)	KIF3C (ENSGACG00000007156) ##19	ENSGACG00000007154	ENSGACG00000007147	dtnba (ENSGACG00000007107) ##21	dnmt3aa (ENSGACG00000007097) ##22	dpysl5b (ENSGACG00000007021) ##23	mapre3b (ENSGACG00000007011) ##24	tmem214 (ENSGACG00000006995)	ccdc25 (ENSGACG00000006958)	esco2 (ENSGACG00000006940)	pbk (ENSGACG00000006932)	scara5 (ENSGACG00000006924)	ENSGACG00000006916	GNPAT (ENSGACG00000006891)	ENSGACG00000006888	ENSGACG00000006885	ENSGACG00000006882	exoc8 (ENSGACG00000006877)	sprtn (ENSGACG00000006873)	FAM89A (ENSGACG00000006868)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.a.a	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT01080000257477.B	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022	ENSGT00940000154071.B	ENSGT00390000015936	ENSGT00390000003585	ENSGT00940000153370.a.b
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Pike perch	MODERN SPECIES	4	GAREM2 (ENSSLUG00000000858)	hadhaa (ENSSLUG00000000834) ##16	hadhb (ENSSLUG00000000705)	tfap2d (ENSSLUG00000000640)	tfap2b (ENSSLUG00000000633)	ENSSLUG00000000628	map3k5 (ENSSLUG00000000392)	lrp11 (ENSSLUG00000000297)	pcmt (ENSSLUG00000000285)	nup43 (ENSSLUG00000000258)	lats1 (ENSSLUG00000000228)	rab10 (ENSSLUG00000000210)	KIF3C (ENSSLUG00000000179) ##19	ENSSLUG00000000169	dtnba (ENSSLUG00000000111) ##21	dnmt3aa (ENSSLUG00000012065) ##22	dpysl5b (ENSSLUG00000011961) ##23	mapre3b (ENSSLUG00000011889) ##24	mapre3b (ENSSLUG00000011871) ##24	tmem214 (ENSSLUG00000011508)	ccdc25 (ENSSLUG00000011476)	esco2 (ENSSLUG00000011470)	pbk (ENSSLUG00000011466)	scara5 (ENSSLUG00000011445)	ENSSLUG00000011435	ENSSLUG00000011431	ENSSLUG00000010663	GNPAT (ENSSLUG00000010113)	zgc:194224 (ENSSLUG00000010081)	TRIM67 (ENSSLUG00000010037)	exoc8 (ENSSLUG00000010019)
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Fugu	MODERN SPECIES	7	tfap2b (ENSTRUG00000001332)	ENSTRUG00000031830	map3k5 (ENSTRUG00000001070)	ENSTRUG00000001331	ENSTRUG00000021200	pcmt (ENSTRUG00000024022)	nup43 (ENSTRUG00000001466)	lats1 (ENSTRUG00000001479)	rab10 (ENSTRUG00000001680)	ENSTRUG00000030265	ENSTRUG00000026009	KIF3C (ENSTRUG00000001953) ##19	ENSTRUG00000023527	ENSTRUG00000002345	dtnba (ENSTRUG00000002471) ##21	dnmt3aa (ENSTRUG00000003838) ##22	dpysl5b (ENSTRUG00000004660) ##23	mapre3b (ENSTRUG00000005510) ##24	mapre3b (ENSTRUG00000005250) ##24	unc93a (ENSTRUG00000006505)	ENSTRUG00000006619	ptrhd1 (ENSTRUG00000007201)	FAM184A (ENSTRUG00000007214)	MAN1A1 (ENSTRUG00000027937)	tbc1d32 (ENSTRUG00000031753)	ENSTRUG00000027432	hsdl1 (ENSTRUG00000003140)	gja11 (ENSTRUG00000028727)	gja11 (ENSTRUG00000031909)	gja12.1 (ENSTRUG00000021311)	si:ch73-111k22.2 (ENSTRUG00000026859)
Tetraodon	MODERN SPECIES	5	reps1 (ENSTNIG00000012206)	jag2b (ENSTNIG00000004242)	esr2a (ENSTNIG00000003064)	ENSTNIG00000003063	GAREM2 (ENSTNIG00000013290)	hadhb (ENSTNIG00000013291)	map3k5 (ENSTNIG00000019125)	lrp11 (ENSTNIG00000019126)	pcmt (ENSTNIG00000019127)	nup43 (ENSTNIG00000019128)	lats1 (ENSTNIG00000019129)	rab10 (ENSTNIG00000019130)	KIF3C (ENSTNIG00000019131) ##19	ENSTNIG00000019132	dtnba (ENSTNIG00000019133) ##21	dnmt3aa (ENSTNIG00000019134) ##22	dpysl5b (ENSTNIG00000019135) ##23	MAPRE3 (ENSTNIG00000019136) ##24	mapre3b (ENSTNIG00000019137) ##24	tmem214 (ENSTNIG00000019138)	ENSTNIG00000019139	ENSTNIG00000005240	ENSTNIG00000004032	ENSTNIG00000000625	AFDN (ENSTNIG00000019140)	unc93a (ENSTNIG00000019141)	ENSTNIG00000019142	ptrhd1 (ENSTNIG00000019143)	FAM184A (ENSTNIG00000019144)	ENSTNIG00000019145	MAN1A1 (ENSTNIG00000000331)
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.b	ENSGT01060000248856	ENSGT01030000236465	ENSGT00940000156521.b	ENSGT00940000155691.c.b	ENSGT00940000165711.a.a	ENSGT00940000165711.a.b	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410	ENSGT01100000263671	ENSGT00940000177235	ENSGT00940000177326	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022	ENSGT00940000154071.B
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Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.b	ENSGT01060000248856	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT00940000165084	ENSGT00940000165540	ENSGT00390000004923.B	ENSGT01020000230346.A.d	ENSGT00390000004542
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT01100000263794	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000164472.a.b.c.a.a.a	ENSGT00940000165711.b	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000160610	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT00940000165084	ENSGT00940000165540	ENSGT00390000004923.B	ENSGT01020000230346.A.d
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	3418	GAREM2 (ENSAOCG00000022689)	hadhaa (ENSAOCG00000022641) ##16	hadhb (ENSAOCG00000022509)	tfap2d (ENSAOCG00000022463)	tfap2b (ENSAOCG00000022433)	map3k5 (ENSAOCG00000022391)	ENSAOCG00000022299	lrp11 (ENSAOCG00000022286)	pcmt (ENSAOCG00000002467)	nup43 (ENSAOCG00000022255)	lats1 (ENSAOCG00000022237)	rab10 (ENSAOCG00000022208)	KIF3C (ENSAOCG00000022180) ##19	dtnba (ENSAOCG00000022134) ##21	ENSAOCG00000022006	dnmt3aa (ENSAOCG00000021991) ##22	dpysl5b (ENSAOCG00000021925) ##23	mapre3b (ENSAOCG00000021865) ##24	tmem214 (ENSAOCG00000021837)	slc35f6 (ENSAOCG00000001957)	kcnk3a (ENSAOCG00000021785)	enpp1 (ENSAOCG00000021765)	ENSAOCG00000002688
Orange clownfish	MODERN SPECIES	2	GAREM2 (ENSAPEG00000006332)	hadhaa (ENSAPEG00000006281) ##16	hadhb (ENSAPEG00000006210)	tfap2d (ENSAPEG00000006165)	tfap2b (ENSAPEG00000006137)	map3k5 (ENSAPEG00000006044)	ENSAPEG00000006025	lrp11 (ENSAPEG00000006012)	pcmt (ENSAPEG00000005991)	nup43 (ENSAPEG00000005959)	lats1 (ENSAPEG00000005925)	rab10 (ENSAPEG00000005895)	KIF3C (ENSAPEG00000005875) ##19	dtnba (ENSAPEG00000005713) ##21	ENSAPEG00000005524	dnmt3aa (ENSAPEG00000005497) ##22	dpysl5b (ENSAPEG00000005446) ##23	mapre3b (ENSAPEG00000005411) ##24	tmem214 (ENSAPEG00000005390)	slc35f6 (ENSAPEG00000005371)	kcnk3a (ENSAPEG00000005293)	enpp1 (ENSAPEG00000005267)	ENSAPEG00000005249	ENSAPEG00000005235	ezrb (ENSAPEG00000005158)	rsph3 (ENSAPEG00000005139)	tagapb (ENSAPEG00000005128)	ENSAPEG00000005110	ENSAPEG00000005094	ENSAPEG00000005040	FNDC4 (ENSAPEG00000005014)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	384						map3k5 (ENSAPOG00000013200)	ENSAPOG00000013052	ENSAPOG00000013022	pcmt (ENSAPOG00000013007)	nup43 (ENSAPOG00000012958)	lats1 (ENSAPOG00000012905)	rab10 (ENSAPOG00000012826)	KIF3C (ENSAPOG00000012783) ##19	ENSAPOG00000000343	dtnba (ENSAPOG00000012673) ##21	dnmt3aa (ENSAPOG00000012525) ##22	dpysl5b (ENSAPOG00000012476) ##23	mapre3b (ENSAPOG00000012402) ##24	tmem214 (ENSAPOG00000012360)	slc35f6 (ENSAPOG00000012347)	kcnk3a (ENSAPOG00000012307)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	378	GAREM2 (ENSSPAG00000016759)	hadhaa (ENSSPAG00000016716) ##16	hadhb (ENSSPAG00000016668)	tfap2d (ENSSPAG00000016633)	tfap2b (ENSSPAG00000016614)	map3k5 (ENSSPAG00000016490)	ENSSPAG00000016472	ENSSPAG00000016462	pcmt (ENSSPAG00000016434)	nup43 (ENSSPAG00000016389)	lats1 (ENSSPAG00000016362)	rab10 (ENSSPAG00000016339)	KIF3C (ENSSPAG00000016323) ##19	ENSSPAG00000016314	dtnba (ENSSPAG00000016121) ##21	dnmt3aa (ENSSPAG00000015957) ##22	dpysl5b (ENSSPAG00000015889) ##23	mapre3b (ENSSPAG00000015835) ##24	tmem214 (ENSSPAG00000015806)	ccdc25 (ENSSPAG00000015787)	esco2 (ENSSPAG00000015762)
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.a.a	ENSGT00940000165711.a.b	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000164854.b.a	ENSGT01100000263671	ENSGT00940000177235	ENSGT00940000177326	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022	ENSGT00940000154071.B
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.a.a	ENSGT00940000165711.a.b	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000178466	ENSGT01100000263671	ENSGT00940000177235	ENSGT00940000177326	ENSGT00940000178984	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.a.a	ENSGT00940000165711.a.b	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000159678	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00940000154390.E	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410	ENSGT00940000178466	ENSGT01100000263671	ENSGT00940000177235	ENSGT00940000177326	ENSGT00940000178984	ENSGT00940000155321.e
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.a.a	ENSGT00940000165711.a.b	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000159678	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00940000154390.E	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410	ENSGT00940000178466	ENSGT01100000263671	ENSGT00940000177235.a	ENSGT00940000179320	ENSGT00940000177235.b	ENSGT00940000177326
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.a.a.f.a	ENSGT00940000165711.a.b	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000159678	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00940000154390.E	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410	ENSGT00940000178466	ENSGT01100000263671	ENSGT00940000177235.a	ENSGT00940000179320	ENSGT00940000177235.b	ENSGT00940000177326
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000154677.b.b ##16	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.a.a.f.a	ENSGT00940000165711.a.b	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000159678	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00940000154390.E	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000164854.b.a	ENSGT00940000177410	ENSGT00940000178466	ENSGT01100000263671	ENSGT00940000179320	ENSGT00940000177235.b	ENSGT00940000177326
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1097	hadhaa (ENSMZEG00005004774) ##16	hadhb (ENSMZEG00005004793)	tfap2d (ENSMZEG00005004802)	tfap2b (ENSMZEG00005004825)	ENSMZEG00005004842	map3k5 (ENSMZEG00005004868)	ENSMZEG00005004945	ENSMZEG00005004955	pcmt (ENSMZEG00005004971)	nup43 (ENSMZEG00005004999)	lats1 (ENSMZEG00005005028)	rab10 (ENSMZEG00005005043)	KIF3C (ENSMZEG00005005122) ##19	ENSMZEG00005005140	dtnba (ENSMZEG00005005170) ##21	dnmt3aa (ENSMZEG00005005225) ##22	dpysl5b (ENSMZEG00005005296) ##23	mapre3b (ENSMZEG00005005343) ##24	tmem214 (ENSMZEG00005005380)	ENSMZEG00005005393	ccdc25 (ENSMZEG00005005405)	esco2 (ENSMZEG00005005429)	pbk (ENSMZEG00005005475)	scara5 (ENSMZEG00005005502)	ENSMZEG00005005517	ENSMZEG00005005578	ENSMZEG00005005585	ENSMZEG00005005590	ENSMZEG00005005593	ENSMZEG00005005599	ENSMZEG00005005607
Eastern happy	MODERN SPECIES	6	tfap2d (ENSACLG00000027212)	tfap2b (ENSACLG00000027222)	ENSACLG00000027229	map3k5 (ENSACLG00000027238)	ENSACLG00000027285	ENSACLG00000027288	ENSACLG00000027292	pcmt (ENSACLG00000027300)	nup43 (ENSACLG00000027309)	lats1 (ENSACLG00000027320)	ENSACLG00000027325	rab10 (ENSACLG00000027326)	KIF3C (ENSACLG00000027331) ##19	ENSACLG00000027339	dtnba (ENSACLG00000027349) ##21	dnmt3aa (ENSACLG00000027364) ##22	ENSACLG00000027381	dpysl5b (ENSACLG00000027387) ##23	dpysl5b (ENSACLG00000027406) ##23	mapre3b (ENSACLG00000027432) ##24	tmem214 (ENSACLG00000027442)	ENSACLG00000027446	ENSACLG00000027449	ccdc25 (ENSACLG00000027451)	esco2 (ENSACLG00000027454)	pbk (ENSACLG00000027459)	scara5 (ENSACLG00000027470)	ENSACLG00000027480	ENSACLG00000027483	ENSACLG00000027488	ENSACLG00000027490
P. nyererei	MODERN SPECIES	369	hadhb (ENSPNYG00000001173)	tfap2d (ENSPNYG00000001125)	tfap2b (ENSPNYG00000001101)	ENSPNYG00000001091	map3k5 (ENSPNYG00000000969)	ENSPNYG00000000948	ENSPNYG00000000921	pcmt (ENSPNYG00000000882)	nup43 (ENSPNYG00000000835)	lats1 (ENSPNYG00000000828)	rab10 (ENSPNYG00000000820)	KIF3C (ENSPNYG00000000722) ##19	ENSPNYG00000000695	dtnba (ENSPNYG00000022207) ##21	ENSPNYG00000022195	dnmt3aa (ENSPNYG00000022177) ##22	dpysl5b (ENSPNYG00000022155) ##23	mapre3b (ENSPNYG00000022130) ##24	tmem214 (ENSPNYG00000022092)	ENSPNYG00000022082	ccdc25 (ENSPNYG00000022074)	esco2 (ENSPNYG00000022065)	pbk (ENSPNYG00000022056)	SCARA5 (ENSPNYG00000022044)	ENSPNYG00000022039	ENSPNYG00000022036	ENSPNYG00000022031	ENSPNYG00000022022	ENSPNYG00000022017	ENSPNYG00000022014	ENSPNYG00000021957
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	843																dnmt3aa (ENSHBUG00000014470) ##22	dpysl5b (ENSHBUG00000014288) ##23	mapre3b (ENSHBUG00000014210) ##24	tmem214 (ENSHBUG00000014171)	ccdc25 (ENSHBUG00000014157)	esco2 (ENSHBUG00000014126)	pbk (ENSHBUG00000014113)	scara5 (ENSHBUG00000014090)	ENSHBUG00000014058
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	314	GAREM2 (ENSNBRG00000002514)	hadhaa (ENSNBRG00000002547) ##16	hadhb (ENSNBRG00000002804)	tfap2d (ENSNBRG00000002857)	tfap2b (ENSNBRG00000002887)	map3k5 (ENSNBRG00000002912)	ENSNBRG00000003008	ENSNBRG00000003018	pcmt (ENSNBRG00000003034)	nup43 (ENSNBRG00000003075)	lats1 (ENSNBRG00000003131)	rab10 (ENSNBRG00000003165)	KIF3C (ENSNBRG00000003196) ##19	ENSNBRG00000003232	dtnba (ENSNBRG00000003263) ##21	dnmt3aa (ENSNBRG00000003312) ##22	dpysl5b (ENSNBRG00000003386) ##23	mapre3b (ENSNBRG00000003445) ##24	tmem214 (ENSNBRG00000003477)	ENSNBRG00000003523	ccdc25 (ENSNBRG00000003550)	esco2 (ENSNBRG00000003574)	pbk (ENSNBRG00000003621)	scara5 (ENSNBRG00000003646)	ENSNBRG00000003680
Nile tilapia	MODERN SPECIES	6	GAREM2 (ENSONIG00000005617)	hadhaa (ENSONIG00000005605) ##16	hadhb (ENSONIG00000005593)	tfap2d (ENSONIG00000005592)	tfap2b (ENSONIG00000005583)	map3k5 (ENSONIG00000005579)	ENSONIG00000029607	lrp11 (ENSONIG00000005575)	pcmt (ENSONIG00000005572)	nup43 (ENSONIG00000005570)	lats1 (ENSONIG00000005566)	rab10 (ENSONIG00000028151)	KIF3C (ENSONIG00000005560) ##19	ENSONIG00000005558	dtnba (ENSONIG00000005550) ##21	dnmt3aa (ENSONIG00000005542) ##22	dpysl5b (ENSONIG00000005535) ##23	mapre3b (ENSONIG00000005534) ##24	tmem214 (ENSONIG00000005531)	ENSONIG00000028740	ENSONIG00000028874	ENSONIG00000005530	ENSONIG00000018299	ENSONIG00000038417	ENSONIG00000038526	TP5 (ENSONIG00000031739)	ENSONIG00000032999	ENSONIG00000018302	ENSONIG00000018303	ENSONIG00000035130	ENSONIG00000041740
Midas cichlid	MODERN SPECIES	96	hadhb (ENSACIG00000023487)	tfap2d (ENSACIG00000023523)	tfap2b (ENSACIG00000023602)	ENSACIG00000023743	ENSACIG00000023746	map3k5 (ENSACIG00000023750)	ENSACIG00000023755	ENSACIG00000023757	pcmt (ENSACIG00000023767)	nup43 (ENSACIG00000023771)	lats1 (ENSACIG00000023776)	rab10 (ENSACIG00000023777)	KIF3C (ENSACIG00000023781) ##19	ENSACIG00000023799	dtnba (ENSACIG00000023804) ##21	dnmt3aa (ENSACIG00000023812) ##22	dpysl5b (ENSACIG00000023831) ##23
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.b	ENSGT01060000248856	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410	ENSGT01100000263671	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022	ENSGT00940000154071.B	ENSGT00390000015936	ENSGT00390000003585
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.b	ENSGT01060000248856	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410	ENSGT01100000263671.a.a	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022	ENSGT00940000154071.B	ENSGT00390000015936	ENSGT00390000003585
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.b	ENSGT01060000248856	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410	ENSGT01100000263671.a.a	ENSGT01100000263671.a.b	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022	ENSGT00940000154071.B	ENSGT00390000015936
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	20	GAREM2 (ENSKMAG00000022189)	hadhb (ENSKMAG00000022192)	ENSKMAG00000022194	tfap2d (ENSKMAG00000022196)	tfap2b (ENSKMAG00000022197)	ENSKMAG00000022199	map3k5 (ENSKMAG00000022202)	lrp11 (ENSKMAG00000022206)	pcmt (ENSKMAG00000022208)	nup43 (ENSKMAG00000022209)	lats1 (ENSKMAG00000022210)	rab10 (ENSKMAG00000022212)	KIF3C (ENSKMAG00000022214) ##19	ENSKMAG00000022215	dtnba (ENSKMAG00000022216) ##21	dnmt3aa (ENSKMAG00000022221) ##22	dpysl5b (ENSKMAG00000022225) ##23	mapre3b (ENSKMAG00000022229) ##24	tmem214 (ENSKMAG00000022232)
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1613	TFAP2D (ENSNFUG00015000914)	TFAP2B (ENSNFUG00015000900)	ENSNFUG00015000894	ENSNFUG00015000891	map3k5 (ENSNFUG00015000396)	ENSNFUG00015000064	ENSNFUG00015000060	pcmt (ENSNFUG00015005708)	NUP43 (ENSNFUG00015005692)	lats1 (ENSNFUG00015005664)	RAB10 (ENSNFUG00015005646)	ENSNFUG00015005601	KIF3C (ENSNFUG00015005555) ##19	ENSNFUG00015005529	DTNB (ENSNFUG00015004216) ##21	dnmt3aa (ENSNFUG00015003738) ##22	dpysl5b (ENSNFUG00015003617) ##23	MAPRE3 (ENSNFUG00015003605) ##24	tmem214 (ENSNFUG00015003543)	CCDC25 (ENSNFUG00015003530)	esco2 (ENSNFUG00015003523)	pbk (ENSNFUG00015003511)	SCARA5 (ENSNFUG00015003495)	ENSNFUG00015003493	ENSNFUG00015003491	ENSNFUG00015003488	ENSNFUG00015003483	ENSNFUG00015003479	ENSNFUG00015003473	ENSNFUG00015003432	GNPAT (ENSNFUG00015003361)
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.b	ENSGT01060000248856	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022	ENSGT00940000154071.B	ENSGT00390000015936	ENSGT00390000003585	ENSGT00940000153370.a.b
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.b	ENSGT01060000248856	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022	ENSGT00940000154071.B	ENSGT00390000015936	ENSGT00390000003585	ENSGT00940000153370.a.b	ENSGT00390000002675
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.b	ENSGT01060000248856	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410	ENSGT00940000155321.e	ENSGT00520000055570.B.k	ENSGT00390000017022	ENSGT00940000154071.B	ENSGT00390000015936	ENSGT00390000003585	ENSGT00940000153370.a.b
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000154656.ob.b.y	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000177318	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.b	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00390000004380	ENSGT00940000158598	ENSGT00720000108839	ENSGT00950000183074.B.a.a	ENSGT00940000177410
Amazon molly	MODERN SPECIES	253	ENSPFOG00000015957	GAREM2 (ENSPFOG00000015932)	hadhb (ENSPFOG00000015886)	ENSPFOG00000015882	tfap2d (ENSPFOG00000015857)	tfap2b (ENSPFOG00000015812)	map3k5 (ENSPFOG00000015511)	lrp11 (ENSPFOG00000015406)	pcmt (ENSPFOG00000015367)	nup43 (ENSPFOG00000023118)	lats1 (ENSPFOG00000015291)	rab10 (ENSPFOG00000015245)	KIF3C (ENSPFOG00000015190) ##19	ENSPFOG00000020606	dtnba (ENSPFOG00000014988) ##21	dnmt3aa (ENSPFOG00000014869) ##22	dpysl5b (ENSPFOG00000014704) ##23	mapre3b (ENSPFOG00000024031) ##24	tmem214 (ENSPFOG00000014631)	ccdc25 (ENSPFOG00000014567)	esco2 (ENSPFOG00000014531)	pbk (ENSPFOG00000014510)	scara5 (ENSPFOG00000014464)	ENSPFOG00000014455
Sailfin molly	MODERN SPECIES	134												rab10 (ENSPLAG00000004910)	KIF3C (ENSPLAG00000004923) ##19	ENSPLAG00000004946	dtnba (ENSPLAG00000005000) ##21	dnmt3aa (ENSPLAG00000005113) ##22	dpysl5b (ENSPLAG00000005156) ##23	mapre3b (ENSPLAG00000005167) ##24	tmem214 (ENSPLAG00000005180)	ccdc25 (ENSPLAG00000005200)	esco2 (ENSPLAG00000005208)	pbk (ENSPLAG00000005224)	scara5 (ENSPLAG00000005261)	ENSPLAG00000005279	agmo (ENSPLAG00000005316)
Guppy	MODERN SPECIES	452	GAREM2 (ENSPREG00000015750)	hadhb (ENSPREG00000015797)	tfap2d (ENSPREG00000015826)	tfap2b (ENSPREG00000015846)	ENSPREG00000015861	map3k5 (ENSPREG00000015885)	ENSPREG00000015933	ENSPREG00000015950	pcmt (ENSPREG00000015965)	nup43 (ENSPREG00000015983)	lats1 (ENSPREG00000016002)	rab10 (ENSPREG00000016055)	KIF3C (ENSPREG00000016235) ##19	ENSPREG00000016325	dtnba (ENSPREG00000016330) ##21	dnmt3aa (ENSPREG00000016371) ##22	dpysl5b (ENSPREG00000016401) ##23	mapre3b (ENSPREG00000016432) ##24	tmem214 (ENSPREG00000016453)	ccdc25 (ENSPREG00000016488)	esco2 (ENSPREG00000016517)	pbk (ENSPREG00000016541)	scara5 (ENSPREG00000016566)	ENSPREG00000016640	ENSPREG00000016938	ENSPREG00000016944	ENSPREG00000016952	ENSPREG00000016975	ENSPREG00000016998	ENSPREG00000017015	TRIM67 (ENSPREG00000017070)
Platyfish	MODERN SPECIES	6	ENSXMAG00000006145	ENSXMAG00000006155	ENSXMAG00000028960	hadhb (ENSXMAG00000006169)	tfap2d (ENSXMAG00000021464)	tfap2b (ENSXMAG00000029265)	map3k5 (ENSXMAG00000016278)	lrp11 (ENSXMAG00000021431)	pcmt (ENSXMAG00000006249)	nup43 (ENSXMAG00000006262)	lats1 (ENSXMAG00000006278)	rab10 (ENSXMAG00000023858)	KIF3C (ENSXMAG00000006298) ##19	ENSXMAG00000006310	dtnba (ENSXMAG00000006317) ##21	dnmt3aa (ENSXMAG00000015620) ##22	dpysl5b (ENSXMAG00000013095) ##23	mapre3b (ENSXMAG00000013109) ##24	tmem214 (ENSXMAG00000013122)	ccdc25 (ENSXMAG00000010835)	esco2 (ENSXMAG00000010833)	pbk (ENSXMAG00000006345)	scara5 (ENSXMAG00000006351)	ENSXMAG00000006354	ENSXMAG00000022093	ENSXMAG00000029762	ENSXMAG00000025316	ENSXMAG00000029386	ENSXMAG00000027830	ENSXMAG00000026948	GNPAT (ENSXMAG00000006356)
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Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	176			ENSCVAG00000021085	hadhb (ENSCVAG00000021297)	tfap2d (ENSCVAG00000021356)	tfap2b (ENSCVAG00000021386)	map3k5 (ENSCVAG00000021465)	lrp11 (ENSCVAG00000021482)	pcmt (ENSCVAG00000021517)	nup43 (ENSCVAG00000021546)	lats1 (ENSCVAG00000021576)	rab10 (ENSCVAG00000021597)	KIF3C (ENSCVAG00000021603) ##19	ENSCVAG00000021605	dtnba (ENSCVAG00000021632) ##21	dnmt3aa (ENSCVAG00000021660) ##22	dpysl5b (ENSCVAG00000021693) ##23	mapre3b (ENSCVAG00000000554) ##24	tmem214 (ENSCVAG00000021738)	ENSCVAG00000021747	ccdc25 (ENSCVAG00000021759)	esco2 (ENSCVAG00000021780)	pbk (ENSCVAG00000021831)	scara5 (ENSCVAG00000000777)	ENSCVAG00000021864	ENSCVAG00000021871	ENSCVAG00000021881	ENSCVAG00000021905	ENSCVAG00000021921	ENSCVAG00000021935	ENSCVAG00000021942
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	50	ENSGT00940000154656.ob.b	ENSGT01060000248685	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00950000182848.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00940000159155	ENSGT00940000165711.b	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00940000158188
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00950000183186.A	ENSGT00390000018361	ENSGT01050000244864.A.a.b.a.a.a	ENSGT01050000244864.A.a.b.a.b.c	ENSGT01050000244864.A.a.a	ENSGT00940000160053	ENSGT00940000153528.a.b.a.b	ENSGT01060000248856	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00940000158188
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	16	ENSORLG00000022810	gja12.1 (ENSORLG00000017606)	gja11 (ENSORLG00000017610)	hsdl1 (ENSORLG00000017614)	tbc1d32 (ENSORLG00000017620)	ENSORLG00000025702	ENSORLG00000029297	pcmt (ENSORLG00000017625)	nup43 (ENSORLG00000017628)	lats1 (ENSORLG00000017630)	rab10 (ENSORLG00000017635)	ENSORLG00000017637 ##19	ENSORLG00000017639	ENSORLG00000028198	dtnba (ENSORLG00000017644) ##21	dnmt3aa (ENSORLG00000017648) ##22	ENSORLG00000028694	dpysl5b (ENSORLG00000017657) ##23	mapre3b (ENSORLG00000017672) ##24	tmem214 (ENSORLG00000017680)	ENSORLG00000017683	dcp2 (ENSORLG00000019046)	ENSORLG00000024078	ENSORLG00000023245	YTHDC2 (ENSORLG00000019098)	prrc1 (ENSORLG00000022750)	ENSORLG00000027956	ENSORLG00000029363	lrp11 (ENSORLG00000017688)	map3k5 (ENSORLG00000017694)	ENSORLG00000025213
Chinese medaka	MODERN SPECIES	62	ENSOSIG00000018952	si:ch73-111k22.2 (ENSOSIG00000018953)	gja12.1 (ENSOSIG00000018955)	ENSOSIG00000018957	gja11 (ENSOSIG00000018959)	hsdl1 (ENSOSIG00000018961)	tbc1d32 (ENSOSIG00000018962)	ENSOSIG00000018965	pcmt (ENSOSIG00000018966)	nup43 (ENSOSIG00000018980)	lats1 (ENSOSIG00000019016)	rab10 (ENSOSIG00000019020)	KIF3C (ENSOSIG00000019027) ##19	ENSOSIG00000019030	dtnba (ENSOSIG00000019146) ##21	dnmt3aa (ENSOSIG00000020921) ##22	dpysl5b (ENSOSIG00000021441) ##23	mapre3b (ENSOSIG00000021451) ##24	tmem214 (ENSOSIG00000021453)	MAN1A1 (ENSOSIG00000021480)
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	109								ENSGT00940000165711.b	ENSGT00950000183032.B.b.b	ENSGT00390000004803	ENSGT00940000157684	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000162464.r	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00940000158188
Indian medaka	MODERN SPECIES	22	ENSOMEG00000021630	vsx2 (ENSOMEG00000021724)	eif2b2 (ENSOMEG00000021791)	FILIP1 (ENSOMEG00000021826)	COX7A2 (ENSOMEG00000021844)	NT5E (ENSOMEG00000021931)	lrp11 (ENSOMEG00000021973)	pcmt (ENSOMEG00000021999)	nup43 (ENSOMEG00000022035)	lats1 (ENSOMEG00000022074)	rab10 (ENSOMEG00000022106)	KIF3C (ENSOMEG00000022156) ##19	ENSOMEG00000022173	ENSOMEG00000022190	dtnba (ENSOMEG00000022344) ##21	dnmt3aa (ENSOMEG00000022438) ##22	dpysl5b (ENSOMEG00000022472) ##23	mapre3b (ENSOMEG00000000769) ##24	tmem214 (ENSOMEG00000000596)	MAN1A1 (ENSOMEG00000022544)	ENSOMEG00000022550	ENSOMEG00000022554	ENSOMEG00000022566	cdc42bpb (ENSOMEG00000022627)	ENSOMEG00000022641	vipas39 (ENSOMEG00000022673)	ENSOMEG00000022689	btbd6b (ENSOMEG00000022696)	ENSOMEG00000022720	brf1b (ENSOMEG00000022742)	xrcc3 (ENSOMEG00000022775)
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	404	hadhaa (ENSHCOG00000010233) ##16	hadhb (ENSHCOG00000010250)	tfap2d (ENSHCOG00000010271)	tfap2b (ENSHCOG00000010301)	ENSHCOG00000010312	map3k5 (ENSHCOG00000010382)	lrp11 (ENSHCOG00000010396)	pcmt (ENSHCOG00000010431)	nup43 (ENSHCOG00000010466)	lats1 (ENSHCOG00000000325)	rab10 (ENSHCOG00000010514)	KIF3C (ENSHCOG00000010641) ##19	ENSHCOG00000010657	dtnba (ENSHCOG00000010711) ##21	ENSHCOG00000010737	dnmt3aa (ENSHCOG00000010776) ##22	dpysl5b (ENSHCOG00000010906) ##23	mapre3b (ENSHCOG00000010940) ##24	tmem214 (ENSHCOG00000010965)	snw1 (ENSHCOG00000011007)	sptlc2b (ENSHCOG00000011048)	ism2b (ENSHCOG00000011074)	ENSHCOG00000011106	TP53 (ENSHCOG00000011113)	nrxn3b (ENSHCOG00000011157)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	16	GAREM2 (ENSMMDG00005020145)	hadhaa (ENSMMDG00005020004) ##16	ENSMMDG00005019999	hadhb (ENSMMDG00005018017)	tfap2d (ENSMMDG00005017956)	tfap2b (ENSMMDG00005017943)	map3k5 (ENSMMDG00005017836)	lrp11 (ENSMMDG00005017821)	pcmt (ENSMMDG00005017804)	nup43 (ENSMMDG00005017802)	lats1 (ENSMMDG00005017801)	rab10 (ENSMMDG00005017800)	KIF3C (ENSMMDG00005017774) ##19	ENSMMDG00005017772	dtnba (ENSMMDG00005017699) ##21	dnmt3aa (ENSMMDG00005017623) ##22	dpysl5b (ENSMMDG00005017618) ##23	mapre3b (ENSMMDG00005017613) ##24	tmem214 (ENSMMDG00005016934)	ccdc25 (ENSMMDG00005016926)	esco2 (ENSMMDG00005016925)	pbk (ENSMMDG00005016923)	scara5 (ENSMMDG00005016921)	ENSMMDG00005016920	ENSMMDG00005016721	ENSMMDG00005016713	fabp7b (ENSMMDG00005016700)	smpdl3a (ENSMMDG00005016696)	clvs2 (ENSMMDG00005016692)	ENSMMDG00005016690	ENSMMDG00005016689
Cod	MODERN SPECIES	13	ENSGMOG00000034841	ENSGMOG00000030403	LATS1 (ENSGMOG00000017653)	nup43 (ENSGMOG00000017672)	PCMT1 (ENSGMOG00000017692)	lrp11 (ENSGMOG00000017710)	ENSGMOG00000017733	tfap2b (ENSGMOG00000017800)	tfap2d (ENSGMOG00000030903)	hadhb (ENSGMOG00000017832)	ENSGMOG00000034882	GAREM2 (ENSGMOG00000022304)	rab10 (ENSGMOG00000018515)	KIF3C (ENSGMOG00000028919) ##19	dtnba (ENSGMOG00000018464) ##21	dnmt3aa (ENSGMOG00000018426) ##22	dpysl5b (ENSGMOG00000018400) ##23	ENSGMOG00000018388 ##24	tmem214 (ENSGMOG00000018357)	ENSGMOG00000001376	ENSGMOG00000035136	ENSGMOG00000001432	SCG5 (ENSGMOG00000001443)	GREM1 (ENSGMOG00000019960)	ENSGMOG00000028233	RYR3 (ENSGMOG00000014933)	aven (ENSGMOG00000014913)	chrm5b (ENSGMOG00000032574)	emc7b (ENSGMOG00000014883)	katnbl1 (ENSGMOG00000014849)	ENSGMOG00000014699
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	92										ENSGT00950000182848.d	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s ##19	ENSGT00940000153897.b.b ##21	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.b ##23	ENSGT00490000043329.a.b.g.b ##24	ENSGT00390000002693	ENSGT00940000158032	ENSGT00390000016516	ENSGT00950000183117.b	ENSGT00940000164803.a	ENSGT00940000155566	ENSGT00390000012588	ENSGT00530000065281	ENSGT00950000183107.a.a	ENSGT01040000240523	ENSGT00940000160562	ENSGT00940000156406.b	ENSGT00940000156598.d
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	886											ENSGT00950000182848.d	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s.g ##19	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.b.m ##24
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	68															ENSGT00940000153739.a.b.s.g ##19	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.b.m ##24	ENSGT00950000183117.b	ENSGT00940000155566.w	ENSGT00950000183107.a.a	ENSGT01040000240523	ENSGT00940000166083.e.a	ENSGT00940000155936.a.b	ENSGT00940000161165.i	ENSGT00950000182985.b.a.h	ENSGT00950000182941.a.a.a.a	ENSGT00940000164948	ENSGT00940000156248.e.b.b	ENSGT00940000156274.p	ENSGT00940000155726.qb	ENSGT00940000160174.f
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	52															ENSGT00940000153739.a.b.s.g ##19	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.b.m ##24	ENSGT00950000183117.b	ENSGT00940000155566.w	ENSGT00950000183107.a.a	ENSGT01040000240523	ENSGT00940000166083.e.a	ENSGT00940000155936.a.b	ENSGT00940000161165.i	ENSGT00950000182985.b.a.h	ENSGT00950000182941.a.a.a.a	ENSGT00940000164948	ENSGT00940000156248.e.b.b	ENSGT00940000156274.p	ENSGT00940000160174.f	ENSGT00940000171557
River trout	MODERN SPECIES	62										tfap2d (ENSSTUG00000024189)	ENSSTUG00000024181	ENSSTUG00000024171	ENSSTUG00000024160	rab10 (ENSSTUG00000024138)	KIF3C (ENSSTUG00000024120) ##19	dnmt3aa (ENSSTUG00000021092) ##22	mapre3b (ENSSTUG00000021022) ##24	ost4 (ENSSTUG00000021015)	ENSSTUG00000021004	selenoi (ENSSTUG00000020990)	ENSSTUG00000020972	ppp1r14c (ENSSTUG00000020966)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	6	dapk1 (ENSSSAG00000108825)	ENSSSAG00000108551	fbp1a (ENSSSAG00000095867)	ENSSSAG00000114358	ENSSSAG00000118786	dmrt3a (ENSSSAG00000047601)	dmrt2a (ENSSSAG00000089152)	ENSSSAG00000031294	ENSSSAG00000043060	ENSSSAG00000014321	SMARCA2 (ENSSSAG00000045598)	adamts3 (ENSSSAG00000047659)	ENSSSAG00000104997	tfap2d (ENSSSAG00000083685)	ENSSSAG00000085616	ENSSSAG00000122164 ##22	KIF3C (ENSSSAG00000120471) ##19	ENSSSAG00000112119	ENSSSAG00000081879 ##24	selenoi (ENSSSAG00000059365)	tbx18 (ENSSSAG00000107202)	ENSSSAG00000054711	ENSSSAG00000097427	ENSSSAG00000097093	hmgn3 (ENSSSAG00000099936)	ENSSSAG00000117369	ENSSSAG00000111511	ENSSSAG00000002148	ENSSSAG00000048091	ENSSSAG00000111755	ENSSSAG00000085875
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	55													ENSGT00950000182848.d.f	ENSGT00940000156975.n.b	ENSGT00940000153739.a.b.s.g ##19	ENSGT00940000155459.x.a ##22	ENSGT00490000043329.a.b.g.b.m ##24	ENSGT00390000016516.f.a	ENSGT00950000183117.b	ENSGT00940000155566.w	ENSGT00950000183107.a.a	ENSGT01040000240523	ENSGT00940000166083.e.a	ENSGT00940000155936.a.b	ENSGT00940000161165.i	ENSGT00950000182985.b.a.h	ENSGT00950000182941.a.a.a.a	ENSGT00940000164948	ENSGT00940000156248.e.b.b	ENSGT00940000156274.p	ENSGT00940000155726.qb
Rainbow trout	MODERN SPECIES	29	ENSOMYG00000073456	ENSOMYG00000008680	ENSOMYG00000074949	ENSOMYG00000008712	ENSOMYG00000050703	rps12 (ENSOMYG00000001300)	ENSOMYG00000001320	ENSOMYG00000001347	ENSOMYG00000074883	ENSOMYG00000055531	ENSOMYG00000028884	ENSOMYG00000053991	KIF3C (ENSOMYG00000025146) ##19	ENSOMYG00000063999	ENSOMYG00000060536	DNMT3A (ENSOMYG00000008370) ##22	ENSOMYG00000067532	ENSOMYG00000063049 ##24	ENSOMYG00000055202	ENSOMYG00000008519	ENSOMYG00000008565	ENSOMYG00000062251	ENSOMYG00000070205	ENSOMYG00000001421	ENSOMYG00000054045	ENSOMYG00000019693	ENSOMYG00000060391	ENSOMYG00000068643	ENSOMYG00000077823	ENSOMYG00000064844	ENSOMYG00000027370
Northern pike	MODERN SPECIES	17	ENSELUG00000008786	ENSELUG00000008760	si:ch211-63o20.7 (ENSELUG00000027051)	elp3 (ENSELUG00000008716)	KIF13B (ENSELUG00000008682)	HMBOX1 (ENSELUG00000008628)	abcd4 (ENSELUG00000008610)	ENSELUG00000008557	vsx2 (ENSELUG00000008538)	tfap2d (ENSELUG00000008515)	hadhb (ENSELUG00000008448)	GAREM2 (ENSELUG00000024865)	rab10 (ENSELUG00000008334)	KIF3C (ENSELUG00000008250) ##19	dtnba (ENSELUG00000008203) ##21	dnmt3aa (ENSELUG00000008170) ##22	dpysl5b (ENSELUG00000008137) ##23	mapre3b (ENSELUG00000008103) ##24	tmem214 (ENSELUG00000008066)	agbl5 (ENSELUG00000008027)	ost4 (ENSELUG00000007999)	selenoi (ENSELUG00000007979)	ENSELUG00000007959	tbx18 (ENSELUG00000007946)	irak1bp1 (ENSELUG00000007939)	ENSELUG00000007912	ENSELUG00000007929	ENSELUG00000007890	PHIP (ENSELUG00000007846)	ENSELUG00000033400	enpp5 (ENSELUG00000007776)
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155459.w ##22
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155459.w ##22
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155459.w ##22
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155459.w ##22
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155459.w ##22
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