Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	280															ENSGT01050000244902.a.a.a.b	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00530000063460.B ##24	ENSGT00940000164644	ENSGT00940000155528	ENSGT00940000154954	ENSGT00940000163793.B	ENSGT00940000163793.A.b	ENSGT00390000001338	ENSGT00390000002443	ENSGT00940000172895	ENSGT00940000154470.b	ENSGT00390000015600.c.a	ENSGT00940000158357
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	80											ENSGT00390000005254	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT01050000244902.a.a.a.b	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160020	ENSGT00940000154668	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000165146	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000154668	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00390000005254.i.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00390000005254.i.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Theria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.b	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Primates	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000009290	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00390000016655.a.a.b.f #20	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00620000089245	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00940000154314.k.a.b #33	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00390000001798.d	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000005569.x.a.a.a.a.a.b.a.a	ENSGT00390000010427.c
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00390000016655.a.a.b.f #20	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00620000089245	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00910000147779 #30	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00940000154314.k.a.b #33	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00390000001798.d	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000005569.x.a.a.a.a.a.b.a.a
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	442															ENSGT00390000016655.a.a.b.f #20	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00910000147779 #30	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1340														ENSRROG00000000948 #20	ENSRROG00000016353 #21	DAB2 (ENSRROG00000019221) #22	C9 (ENSRROG00000035079) #23	FYB1 (ENSRROG00000040150) #24	RICTOR (ENSRROG00000037489) #25	OSMR (ENSRROG00000044615) #26	ENSRROG00000038997 #27	LIFR (ENSRROG00000027679) #28	EGFLAM (ENSRROG00000029974) #29	ENSRROG00000045483 #30	GDNF (ENSRROG00000044233) #31	WDR70 (ENSRROG00000032989) #32	ENSRROG00000021089 #33	ENSRROG00000012369 #34	NUP155 (ENSRROG00000044836) #35
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1632															ENSRBIG00000028672 #20	DAB2 (ENSRBIG00000028025) #22	C9 (ENSRBIG00000034496) #23	FYB1 (ENSRBIG00000021231) #24	RICTOR (ENSRBIG00000039518) #25	ENSRBIG00000041860 #27	OSMR (ENSRBIG00000040445) #26	LIFR (ENSRBIG00000041802) #28	EGFLAM (ENSRBIG00000001132) #29	GDNF (ENSRBIG00000030195) #31	ENSRBIG00000044296 #33	ENSRBIG00000035882 #34	WDR70 (ENSRBIG00000036196) #32	NUP155 (ENSRBIG00000037862) #35
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00390000016655.a.a.b.f #20	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00620000089245	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00910000147779 #30	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00940000154314.k.a.b #33	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00390000001798.d	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00390000016655.a.a.b.f #20	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00620000089245	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00910000147779 #30	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00940000154314.k.a.b #33	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00390000001798.d	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00910000147779 #30	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00940000154314.k.a.b #33	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00940000165039	ENSGT00390000001798.d	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000009290.g.b	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.a.a.a	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.b	ENSGT00940000158865	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00910000147779 #30	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT01000000216185.c	ENSGT00940000164709.a.b.b.a.a.b.b.b.b.a.b.b.c.a.b.a	ENSGT00390000001798.d	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	16	ENSMFAG00000050413	FBXO4 (ENSMFAG00000043560)	RIMOC1 (ENSMFAG00000053017)	OXCT1 (ENSMFAG00000003998)	ENSMFAG00000065756	ENSMFAG00000049658	PLCXD3 (ENSMFAG00000040869)	C6 (ENSMFAG00000036931)	MROH2B (ENSMFAG00000045823)	C7 (ENSMFAG00000003261)	ENSMFAG00000040449	CARD6 (ENSMFAG00000036194)	ENSMFAG00000061843	PTGER4 (ENSMFAG00000040505)	PRKAA1 (ENSMFAG00000036296)	DAB2 (ENSMFAG00000000151) #22	ENSMFAG00000048428	FYB1 (ENSMFAG00000038840) #24	ENSMFAG00000048044	C9 (ENSMFAG00000039299) #23	RICTOR (ENSMFAG00000032530) #25	OSMR (ENSMFAG00000014306) #26	LIFR (ENSMFAG00000036647) #28	ENSMFAG00000034705 #30	EGFLAM (ENSMFAG00000001590) #29	GDNF (ENSMFAG00000047234) #31	ENSMFAG00000061244	ENSMFAG00000057345	WDR70 (ENSMFAG00000030910) #32	NUP155 (ENSMFAG00000040363) #35	ENSMFAG00000052450
Rhesus	MODERN SPECIES	16	CCDC152 (ENSMMUG00000030145)	ENSMMUG00000053009	GHR (ENSMMUG00000001336)	RIMOC1 (ENSMMUG00000042412)	OXCT1 (ENSMMUG00000011027)	ENSMMUG00000061337	C6 (ENSMMUG00000021034)	MROH2B (ENSMMUG00000004774)	ENSMMUG00000061318	C7 (ENSMMUG00000014171)	CARD6 (ENSMMUG00000023808)	ENSMMUG00000062350	PRKAA1 (ENSMMUG00000023806)	PTGER4 (ENSMMUG00000016167)	ENSMMUG00000060622	DAB2 (ENSMMUG00000019879) #22	C9 (ENSMMUG00000019878) #23	ENSMMUG00000063072	FYB1 (ENSMMUG00000021218) #24	RICTOR (ENSMMUG00000001611) #25	OSMR (ENSMMUG00000001609) #26	ENSMMUG00000051389	LIFR (ENSMMUG00000007386) #28	EGFLAM (ENSMMUG00000017163) #29	GDNF (ENSMMUG00000018963) #31	ENSMMUG00000052974	ENSMMUG00000052836	WDR70 (ENSMMUG00000006107) #32	NUP155 (ENSMMUG00000000704) #35	ENSMMUG00000058026	ENSMMUG00000061988
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	504															ENSMNEG00000041796 #20	DAB2 (ENSMNEG00000029168) #22	C9 (ENSMNEG00000036689) #23	FYB1 (ENSMNEG00000033176) #24	RICTOR (ENSMNEG00000035093) #25	ENSMNEG00000040659 #27	OSMR (ENSMNEG00000029404) #26	LIFR (ENSMNEG00000035771) #28	ENSMNEG00000024358 #30	EGFLAM (ENSMNEG00000032080) #29	GDNF (ENSMNEG00000035033) #31	ENSMNEG00000045383 #33	WDR70 (ENSMNEG00000029911) #32	NUP155 (ENSMNEG00000039083) #35	ENSMNEG00000042623	CPLANE1 (ENSMNEG00000029968)	NIPBL (ENSMNEG00000022277)
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000159987	ENSGT00910000147460	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00390000016655.a.a.b.f #20	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00620000089245	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00910000147779 #30	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00940000154314.k.a.b #33	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00390000001798.d	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c
Olive baboon	MODERN SPECIES	15	GHR (ENSPANG00000012118)	FBXO4 (ENSPANG00000011631)	RIMOC1 (ENSPANG00000003802)	OXCT1 (ENSPANG00000008222)	PLCXD3 (ENSPANG00000047585)	C6 (ENSPANG00000008845)	MROH2B (ENSPANG00000017936)	C7 (ENSPANG00000002426)	ENSPANG00000037388	CARD6 (ENSPANG00000007548)	ENSPANG00000048984	PTGER4 (ENSPANG00000017119)	PRKAA1 (ENSPANG00000014909)	ENSPANG00000042057	ENSPANG00000038926	DAB2 (ENSPANG00000005734) #22	C9 (ENSPANG00000006998) #23	FYB1 (ENSPANG00000019520) #24	ENSPANG00000044550	RICTOR (ENSPANG00000009353) #25	ENSPANG00000003026 #27	OSMR (ENSPANG00000003727) #26	ENSPANG00000040263	LIFR (ENSPANG00000017937) #28	EGFLAM (ENSPANG00000010086) #29	GDNF (ENSPANG00000010790) #31	WDR70 (ENSPANG00000018958) #32	NUP155 (ENSPANG00000004003) #35	ENSPANG00000042997	CPLANE1 (ENSPANG00000022779)	NIPBL (ENSPANG00000004378)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	83	ENSGT00940000159987	ENSGT00910000147460	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00390000016655.a.a.b.f #20	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00910000147779 #30	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00940000154314.k.a.b #33	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00940000165039	ENSGT00800000124150	ENSGT01040000241472	ENSGT00390000010427.c
Drill	MODERN SPECIES	244	ENSMLEG00000036440	GHR (ENSMLEG00000032587)	FBXO4 (ENSMLEG00000034484)	RIMOC1 (ENSMLEG00000039711)	OXCT1 (ENSMLEG00000042849)	PLCXD3 (ENSMLEG00000034402)	C6 (ENSMLEG00000038905)	MROH2B (ENSMLEG00000042724)	C7 (ENSMLEG00000034350)	CARD6 (ENSMLEG00000031801)	RPL37 (ENSMLEG00000041172)	PRKAA1 (ENSMLEG00000041369)	PTGER4 (ENSMLEG00000030658)	TTC33 (ENSMLEG00000030933)	ENSMLEG00000039893 #20	DAB2 (ENSMLEG00000042924) #22	C9 (ENSMLEG00000011885) #23	FYB1 (ENSMLEG00000036833) #24	RICTOR (ENSMLEG00000036263) #25	ENSMLEG00000009373 #27	OSMR (ENSMLEG00000023758) #26	LIFR (ENSMLEG00000037279) #28	ENSMLEG00000002410 #30	EGFLAM (ENSMLEG00000033485) #29	GDNF (ENSMLEG00000032363) #31
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	618	FBXO4 (ENSCATG00000038909)	RIMOC1 (ENSCATG00000041882)	OXCT1 (ENSCATG00000032314)	PLCXD3 (ENSCATG00000034754)	C6 (ENSCATG00000020115)	MROH2B (ENSCATG00000011334)	ENSCATG00000035426	C7 (ENSCATG00000020817)	CARD6 (ENSCATG00000038029)	RPL37 (ENSCATG00000031816)	PRKAA1 (ENSCATG00000039841)	PTGER4 (ENSCATG00000044142)	TTC33 (ENSCATG00000038033)	ENSCATG00000035134 #20	ENSCATG00000007387	DAB2 (ENSCATG00000025546) #22	C9 (ENSCATG00000037892) #23	FYB1 (ENSCATG00000036267) #24	RICTOR (ENSCATG00000043229) #25	ENSCATG00000037542 #27	OSMR (ENSCATG00000040888) #26	ENSCATG00000040214	LIFR (ENSCATG00000037247) #28	ENSCATG00000019362 #30	EGFLAM (ENSCATG00000031363) #29	GDNF (ENSCATG00000039360) #31	ENSCATG00000029476 #33	WDR70 (ENSCATG00000032326) #32	NUP155 (ENSCATG00000022656) #35	ENSCATG00000039836	ENSCATG00000039550
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	23	ENSCSAG00000016785	CCDC152 (ENSCSAG00000016788)	GHR (ENSCSAG00000016794)	FBXO4 (ENSCSAG00000016799)	RIMOC1 (ENSCSAG00000016803)	ENSCSAG00000016812	PLCXD3 (ENSCSAG00000016826)	C6 (ENSCSAG00000016831)	MROH2B (ENSCSAG00000016876)	C7 (ENSCSAG00000016904)	CARD6 (ENSCSAG00000016906)	ENSCSAG00000016909	PRKAA1 (ENSCSAG00000016919)	PTGER4 (ENSCSAG00000016922)	ENSCSAG00000018997	DAB2 (ENSCSAG00000016933) #22	C9 (ENSCSAG00000016939) #23	FYB1 (ENSCSAG00000016953) #24	ENSCSAG00000018996	ENSCSAG00000016963	RICTOR (ENSCSAG00000016972) #25	OSMR (ENSCSAG00000016980) #26	LIFR (ENSCSAG00000016984) #28	EGFLAM (ENSCSAG00000016988) #29	GDNF (ENSCSAG00000016991) #31	WDR70 (ENSCSAG00000016994) #32	NUP155 (ENSCSAG00000016999) #35	ENSCSAG00000018995	CPLANE1 (ENSCSAG00000017005)	NIPBL (ENSCSAG00000017012)	SLC1A3 (ENSCSAG00000017016)
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00390000016655.a.a.b.f #20	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00620000089245	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00940000154314.k.a.b #33	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00390000001798.d	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000005569.x.a.a.a.a.a.b.a.a	ENSGT00390000010427.c
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00390000016655.a.a.b.f #20	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00620000089245	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00390000001798.d	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000005569.x.a.a.a.a.a.b.a.a	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464
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Gorilla	MODERN SPECIES	8	ENSGGOG00000038169	CCDC152 (ENSGGOG00000012746)	GHR (ENSGGOG00000012636)	FBXO4 (ENSGGOG00000005501)	RIMOC1 (ENSGGOG00000009157)	OXCT1 (ENSGGOG00000025087)	PLCXD3 (ENSGGOG00000042825)	C6 (ENSGGOG00000008230)	MROH2B (ENSGGOG00000002203)	C7 (ENSGGOG00000002197)	CARD6 (ENSGGOG00000003251)	RPL37 (ENSGGOG00000003241)	PRKAA1 (ENSGGOG00000027961)	PTGER4 (ENSGGOG00000007632)	ENSGGOG00000040103 #20	DAB2 (ENSGGOG00000005856) #22	C9 (ENSGGOG00000015918) #23	FYB1 (ENSGGOG00000001364) #24	ENSGGOG00000025102	RICTOR (ENSGGOG00000014599) #25	OSMR (ENSGGOG00000014580) #26	LIFR (ENSGGOG00000015008) #28	EGFLAM (ENSGGOG00000005053) #29	GDNF (ENSGGOG00000039274) #31	WDR70 (ENSGGOG00000034954) #32	NUP155 (ENSGGOG00000013905) #35	CPLANE1 (ENSGGOG00000015352)	ENSGGOG00000041963	ENSGGOG00000038240	NIPBL (ENSGGOG00000026268)	SLC1A3 (ENSGGOG00000004661)
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00390000016655.a.a.b.f #20	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00620000089245	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00940000165039	ENSGT00390000005569.x.a.a.a.a.a.b.a.a	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464
Pan	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00390000016655.a.a.b.f #20	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00620000089245	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00940000165039	ENSGT00390000005569.x.a.a.a.a.a.b.a.a	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464
Chimpanzee	MODERN SPECIES	18	CCDC152 (ENSPTRG00000045287)	GHR (ENSPTRG00000016836)	FBXO4 (ENSPTRG00000016833)	RIMOC1 (ENSPTRG00000051599)	OXCT1 (ENSPTRG00000016829)	PLCXD3 (ENSPTRG00000016827)	C6 (ENSPTRG00000016826)	MROH2B (ENSPTRG00000016825)	C7 (ENSPTRG00000016824)	CARD6 (ENSPTRG00000016823)	RPL37 (ENSPTRG00000050195)	PRKAA1 (ENSPTRG00000016821)	TTC33 (ENSPTRG00000016820)	PTGER4 (ENSPTRG00000016819)	ENSPTRG00000052510 #20	DAB2 (ENSPTRG00000016817) #22	C9 (ENSPTRG00000016816) #23	FYB1 (ENSPTRG00000045930) #24	ENSPTRG00000042831	RICTOR (ENSPTRG00000016811) #25	OSMR (ENSPTRG00000016810) #26	LIFR (ENSPTRG00000016809) #28	EGFLAM (ENSPTRG00000016808) #29	GDNF (ENSPTRG00000016807) #31	WDR70 (ENSPTRG00000016806) #32	ENSPTRG00000049546 #33	NUP155 (ENSPTRG00000016804) #35	CPLANE1 (ENSPTRG00000023298)	ENSPTRG00000045502	NIPBL (ENSPTRG00000016801)	SLC1A3 (ENSPTRG00000016800)
Bonobo	MODERN SPECIES	18	GHR (ENSPPAG00000036371)	FBXO4 (ENSPPAG00000036877)	RIMOC1 (ENSPPAG00000027004)	OXCT1 (ENSPPAG00000000926)	PLCXD3 (ENSPPAG00000027307)	C6 (ENSPPAG00000035900)	ENSPPAG00000002482	ENSPPAG00000040649	C7 (ENSPPAG00000033591)	CARD6 (ENSPPAG00000031567)	RPL37 (ENSPPAG00000030179)	PRKAA1 (ENSPPAG00000035948)	TTC33 (ENSPPAG00000034323)	PTGER4 (ENSPPAG00000029600)	ENSPPAG00000028611 #20	DAB2 (ENSPPAG00000028886) #22	C9 (ENSPPAG00000037150) #23	ENSPPAG00000039798 #24	ENSPPAG00000024305	RICTOR (ENSPPAG00000039635) #25	OSMR (ENSPPAG00000033213) #26	LIFR (ENSPPAG00000040148) #28	EGFLAM (ENSPPAG00000034407) #29	GDNF (ENSPPAG00000012574) #31	ENSPPAG00000036064 #32	ENSPPAG00000030132 #33	ENSPPAG00000000687 #32	NUP155 (ENSPPAG00000043867) #35	CPLANE1 (ENSPPAG00000036782)	ENSPPAG00000032480	ENSPPAG00000039740
Human	MODERN SPECIES	17	SELENOP (ENSG00000250722)	CCDC152 (ENSG00000198865)	GHR (ENSG00000112964)	FBXO4 (ENSG00000151876)	RIMOC1 (ENSG00000205765)	OXCT1 (ENSG00000083720)	PLCXD3 (ENSG00000182836)	C6 (ENSG00000039537)	MROH2B (ENSG00000171495)	C7 (ENSG00000112936)	CARD6 (ENSG00000132357)	RPL37 (ENSG00000145592)	PRKAA1 (ENSG00000132356)	PTGER4 (ENSG00000171522)	TTC33 (ENSG00000113638)	DAB2 (ENSG00000153071) #22	C9 (ENSG00000113600) #23	FYB1 (ENSG00000082074) #24	RICTOR (ENSG00000164327) #25	OSMR (ENSG00000145623) #26	LIFR (ENSG00000113594) #28	EGFLAM (ENSG00000164318) #29	GDNF (ENSG00000168621) #31	WDR70 (ENSG00000082068) #32	NUP155 (ENSG00000113569) #35	CPLANE1 (ENSG00000197603)	NIPBL (ENSG00000164190)	SLC1A3 (ENSG00000079215)	RANBP3L (ENSG00000164188)	NADK2 (ENSG00000152620)	SKP2 (ENSG00000145604)
Orangutan	MODERN SPECIES	18	SELENOP (ENSPPYG00000025924)	CCDC152 (ENSPPYG00000015432)	GHR (ENSPPYG00000015431)	FBXO4 (ENSPPYG00000015430)	RIMOC1 (ENSPPYG00000030534)	OXCT1 (ENSPPYG00000015428)	PLCXD3 (ENSPPYG00000015427)	C6 (ENSPPYG00000015426)	MROH2B (ENSPPYG00000015425)	C7 (ENSPPYG00000015424)	CARD6 (ENSPPYG00000015423)	RPL37 (ENSPPYG00000040021)	PRKAA1 (ENSPPYG00000015421)	PTGER4 (ENSPPYG00000015419)	TTC33 (ENSPPYG00000015420)	DAB2 (ENSPPYG00000015417) #22	C9 (ENSPPYG00000015416) #23	FYB1 (ENSPPYG00000015415) #24	ENSPPYG00000031776	RICTOR (ENSPPYG00000015414) #25	OSMR (ENSPPYG00000015413) #26	LIFR (ENSPPYG00000015411) #28	EGFLAM (ENSPPYG00000015410) #29	GDNF (ENSPPYG00000034776) #31	ENSPPYG00000034921	WDR70 (ENSPPYG00000015408) #32	NUP155 (ENSPPYG00000015407) #35	ENSPPYG00000015406	CPLANE1 (ENSPPYG00000015405)	NIPBL (ENSPPYG00000015404)	SLC1A3 (ENSPPYG00000015403)
Gibbon	MODERN SPECIES	21	ENSNLEG00000031089	GHR (ENSNLEG00000016678)	FBXO4 (ENSNLEG00000016662)	RIMOC1 (ENSNLEG00000029700)	OXCT1 (ENSNLEG00000016656)	PLCXD3 (ENSNLEG00000030452)	C6 (ENSNLEG00000016610)	MROH2B (ENSNLEG00000016538)	C7 (ENSNLEG00000016515)	CARD6 (ENSNLEG00000016512)	RPL37 (ENSNLEG00000034217)	PRKAA1 (ENSNLEG00000016472)	PTGER4 (ENSNLEG00000016459)	TTC33 (ENSNLEG00000016461)	ENSNLEG00000016457 #20	DAB2 (ENSNLEG00000016439) #22	C9 (ENSNLEG00000016425) #23	FYB1 (ENSNLEG00000032915) #24	RICTOR (ENSNLEG00000016355) #25	OSMR (ENSNLEG00000016342) #26	LIFR (ENSNLEG00000028672) #28	EGFLAM (ENSNLEG00000016287) #29	ENSNLEG00000016286 #31	ENSNLEG00000032684 #33	WDR70 (ENSNLEG00000016270) #32	ENSNLEG00000035003	NUP155 (ENSNLEG00000016211) #35	ENSNLEG00000016210	CPLANE1 (ENSNLEG00000016160)	ENSNLEG00000032397	NIPBL (ENSNLEG00000016123)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462.o	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918.s.a
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462.o	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918.s.a
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000167563	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.a.a.b.a	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462.o	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918.s.a
Capuchin	MODERN SPECIES	344															ENSCCAG00000020632	DAB2 (ENSCCAG00000027379) #22	C9 (ENSCCAG00000000687) #23	FYB1 (ENSCCAG00000035405) #24	RICTOR (ENSCCAG00000028391) #25	OSMR (ENSCCAG00000028619) #26	LIFR (ENSCCAG00000026156) #28	EGFLAM (ENSCCAG00000000857) #29
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	57	FBXO4 (ENSSBOG00000031090)	RIMOC1 (ENSSBOG00000024152)	ENSSBOG00000007830	ENSSBOG00000017199	PLCXD3 (ENSSBOG00000024536)	ENSSBOG00000019421	C6 (ENSSBOG00000034860)	MROH2B (ENSSBOG00000023538)	C7 (ENSSBOG00000030097)	CARD6 (ENSSBOG00000020523)	RPL37 (ENSSBOG00000028031)	PRKAA1 (ENSSBOG00000021607)	TTC33 (ENSSBOG00000026154)	PTGER4 (ENSSBOG00000024324)	ENSSBOG00000032629	DAB2 (ENSSBOG00000035362) #22	C9 (ENSSBOG00000027417) #23	FYB1 (ENSSBOG00000036067) #24	RICTOR (ENSSBOG00000033799) #25	OSMR (ENSSBOG00000018501) #26	LIFR (ENSSBOG00000032569) #28	EGFLAM (ENSSBOG00000024254) #29	GDNF (ENSSBOG00000024539) #31	WDR70 (ENSSBOG00000026848) #32	ENSSBOG00000034407	ENSSBOG00000019791	NUP155 (ENSSBOG00000019052) #35	ENSSBOG00000034912	CPLANE1 (ENSSBOG00000035658)	NIPBL (ENSSBOG00000021705)	SLC1A3 (ENSSBOG00000022569)
Marmoset	MODERN SPECIES	11	ENSCJAG00000081636	FBXO4 (ENSCJAG00000001220)	RIMOC1 (ENSCJAG00000056589)	OXCT1 (ENSCJAG00000007199)	PLCXD3 (ENSCJAG00000007232)	ENSCJAG00000079370	C6 (ENSCJAG00000007234)	ENSCJAG00000069764	MROH2B (ENSCJAG00000007279)	C7 (ENSCJAG00000007321)	CARD6 (ENSCJAG00000007376)	ENSCJAG00000087109	PRKAA1 (ENSCJAG00000007341)	TTC33 (ENSCJAG00000047411)	PTGER4 (ENSCJAG00000007410)	DAB2 (ENSCJAG00000007426) #22	C9 (ENSCJAG00000007477) #23	FYB1 (ENSCJAG00000007485) #24	RICTOR (ENSCJAG00000007501) #25	OSMR (ENSCJAG00000007577) #26	ENSCJAG00000078983	ENSCJAG00000074673	LIFR (ENSCJAG00000007608) #28	EGFLAM (ENSCJAG00000007668) #29	GDNF (ENSCJAG00000007761) #31	WDR70 (ENSCJAG00000007784) #32	ENSCJAG00000070684	NUP155 (ENSCJAG00000017976) #35	ENSCJAG00000085546	ENSCJAG00000078551	CPLANE1 (ENSCJAG00000018003)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	576							C6 (ENSANAG00000029793)	MROH2B (ENSANAG00000027518)	C7 (ENSANAG00000023976)	CARD6 (ENSANAG00000029436)	RPL37 (ENSANAG00000031221)	PRKAA1 (ENSANAG00000032687)	ENSANAG00000024466	PTGER4 (ENSANAG00000037694)	ENSANAG00000022538	DAB2 (ENSANAG00000038111) #22	C9 (ENSANAG00000036485) #23	FYB1 (ENSANAG00000020505) #24	RICTOR (ENSANAG00000035097) #25	OSMR (ENSANAG00000036639) #26	LIFR (ENSANAG00000007846) #28	EGFLAM (ENSANAG00000036951) #29	GDNF (ENSANAG00000027668) #31	WDR70 (ENSANAG00000027079) #32	ENSANAG00000024058	NUP155 (ENSANAG00000022258) #35	ENSANAG00000024251	CPLANE1 (ENSANAG00000026997)	ENSANAG00000017913	NIPBL (ENSANAG00000023189)	SLC1A3 (ENSANAG00000022305)
Tarsier	MODERN SPECIES	5939														ENSTSYG00000027636	LRP4 (ENSTSYG00000010791)	DAB2 (ENSTSYG00000003683) #22	ENSTSYG00000036235	C9 (ENSTSYG00000009398) #23	FYB1 (ENSTSYG00000006519) #24
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	47		ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Mouse lemur	MODERN SPECIES	3	NNT (ENSMICG00000008207)	ENSMICG00000008198	CCDC152 (ENSMICG00000001272)	GHR (ENSMICG00000038266)	FBXO4 (ENSMICG00000006133)	OXCT1 (ENSMICG00000012578)	PLCXD3 (ENSMICG00000014443)	C6 (ENSMICG00000012415)	MROH2B (ENSMICG00000012385)	C7 (ENSMICG00000012365)	CARD6 (ENSMICG00000043072)	ENSMICG00000012351	PRKAA1 (ENSMICG00000036665)	PTGER4 (ENSMICG00000027186)	ENSMICG00000047886	DAB2 (ENSMICG00000006730) #22	ENSMICG00000026620	C9 (ENSMICG00000006710) #23	FYB1 (ENSMICG00000030963) #24	RICTOR (ENSMICG00000006675) #25	OSMR (ENSMICG00000006658) #26	LIFR (ENSMICG00000017232) #28	EGFLAM (ENSMICG00000017230) #29	GDNF (ENSMICG00000038777) #31	WDR70 (ENSMICG00000027615) #32	NUP155 (ENSMICG00000017202) #35	CPLANE1 (ENSMICG00000012526)	NIPBL (ENSMICG00000012468)	SLC1A3 (ENSMICG00000012786)	RANBP3L (ENSMICG00000017831)	NADK2 (ENSMICG00000031635)
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	131		ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	88				FBXO4 (ENSPCOG00000028830)	RIMOC1 (ENSPCOG00000028826)	OXCT1 (ENSPCOG00000028649)	PLCXD3 (ENSPCOG00000023951)	C6 (ENSPCOG00000026483)	MROH2B (ENSPCOG00000019914)	C7 (ENSPCOG00000019101)	CARD6 (ENSPCOG00000020080)	RPL37 (ENSPCOG00000025802)	PRKAA1 (ENSPCOG00000023955)	TTC33 (ENSPCOG00000024676)	PTGER4 (ENSPCOG00000022906)	DAB2 (ENSPCOG00000022554) #22	ENSPCOG00000004423 #23	FYB1 (ENSPCOG00000026925) #24	RICTOR (ENSPCOG00000027952) #25	ENSPCOG00000010776 #26	LIFR (ENSPCOG00000023656) #28	EGFLAM (ENSPCOG00000018965) #29	GDNF (ENSPCOG00000022994) #31	WDR70 (ENSPCOG00000022281) #32	NUP155 (ENSPCOG00000013228) #35	CPLANE1 (ENSPCOG00000021498)	NIPBL (ENSPCOG00000021900)	SLC1A3 (ENSPCOG00000003394)	RANBP3L (ENSPCOG00000018367)	NADK2 (ENSPCOG00000020255)	SKP2 (ENSPCOG00000025797)
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	547																DAB2 (ENSPSMG00000002035) #22	C9 (ENSPSMG00000002380) #23	FYB1 (ENSPSMG00000002386) #24	RICTOR (ENSPSMG00000002540) #25	ENSPSMG00000002662 #26	LIFR (ENSPSMG00000002683) #28	EGFLAM (ENSPSMG00000002763) #29	ENSPSMG00000002879	GDNF (ENSPSMG00000002888) #31	WDR70 (ENSPSMG00000002916) #32	NUP155 (ENSPSMG00000003091) #35	CPLANE1 (ENSPSMG00000003356)	NIPBL (ENSPSMG00000003534)	SLC1A3 (ENSPSMG00000003924)	RANBP3L (ENSPSMG00000004080)	NADK2 (ENSPSMG00000004172)
Bushbaby	MODERN SPECIES	178	CCDC152 (ENSOGAG00000012867)	GHR (ENSOGAG00000012855)	FBXO4 (ENSOGAG00000002038)	RIMOC1 (ENSOGAG00000002037)	OXCT1 (ENSOGAG00000009909)	PLCXD3 (ENSOGAG00000002604)	C6 (ENSOGAG00000015874)	MROH2B (ENSOGAG00000015864)	C7 (ENSOGAG00000015859)	CARD6 (ENSOGAG00000027415)	ENSOGAG00000034300	PRKAA1 (ENSOGAG00000011950)	TTC33 (ENSOGAG00000011946)	PTGER4 (ENSOGAG00000024975)	ENSOGAG00000029379	DAB2 (ENSOGAG00000015730) #22	C9 (ENSOGAG00000012072) #23	FYB1 (ENSOGAG00000009935) #24	RICTOR (ENSOGAG00000024700) #25	OSMR (ENSOGAG00000006678) #26	LIFR (ENSOGAG00000002071) #28	EGFLAM (ENSOGAG00000002067) #29	GDNF (ENSOGAG00000001397) #31	WDR70 (ENSOGAG00000006649) #32	NUP155 (ENSOGAG00000012413) #35	ENSOGAG00000012406	NIPBL (ENSOGAG00000006135)	SLC1A3 (ENSOGAG00000004888)	RANBP3L (ENSOGAG00000007246)	NADK2 (ENSOGAG00000007242)	ENSOGAG00000007236
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Glires	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	360	ENSDORG00000004794	Ccdc152 (ENSDORG00000004793)	Ghr (ENSDORG00000008027)	ENSDORG00000016321	Rimoc1 (ENSDORG00000016319)	ENSDORG00000016318	Plcxd3 (ENSDORG00000006478)	C6 (ENSDORG00000008629)	Mroh2b (ENSDORG00000008307)	C7 (ENSDORG00000008303)	ENSDORG00000008302	ENSDORG00000008300	Prkaa1 (ENSDORG00000014183)	Ttc33 (ENSDORG00000014182)	Ptger4 (ENSDORG00000005762)	ENSDORG00000006875 #22	Fyb (ENSDORG00000015775) #24	Rictor (ENSDORG00000010369) #25	Osmr (ENSDORG00000010368) #26	Lifr (ENSDORG00000016168) #28	Egflam (ENSDORG00000016165) #29	Gdnf (ENSDORG00000027984) #31	Wdr70 (ENSDORG00000008417) #32	Nup155 (ENSDORG00000009542) #35	Nipbl (ENSDORG00000002543)	Slc1a3 (ENSDORG00000016590)	ENSDORG00000029340	Nadk2 (ENSDORG00000013100)	Skp2 (ENSDORG00000013094)	Lmbrd2 (ENSDORG00000013092)	Capsl (ENSDORG00000009565)
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Lesser Egyptian jerboa	DUPLICATION
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	48	Ccdc152 (ENSJJAG00000020346)	Ghr (ENSJJAG00000018825)	Fbxo4 (ENSJJAG00000021644)	ENSJJAG00000021693	ENSJJAG00000004330	Plcxd3 (ENSJJAG00000023898)	ENSJJAG00000020132	C6 (ENSJJAG00000008024)	Mroh2b (ENSJJAG00000024133)	Card6 (ENSJJAG00000023358)	ENSJJAG00000014290	Prkaa1 (ENSJJAG00000021671)	ENSJJAG00000007891	Ptger4 (ENSJJAG00000023417)	ENSJJAG00000011581	ENSJJAG00000018434 #22	ENSJJAG00000000928 #23	Fyb (ENSJJAG00000016416) #24	Rictor (ENSJJAG00000014049) #25	Osmr (ENSJJAG00000011588) #26	Lifr (ENSJJAG00000018296) #28	Egflam (ENSJJAG00000017564) #29	Gdnf (ENSJJAG00000024134) #31	Wdr70 (ENSJJAG00000000410) #32	Nup155 (ENSJJAG00000020587) #35	Cplane1 (ENSJJAG00000021533)	Nipbl (ENSJJAG00000022683)	Slc1a3 (ENSJJAG00000011327)	ENSJJAG00000012664	ENSJJAG00000007978	Nadk2 (ENSJJAG00000023107)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	47	ENSJJAG00000012010	ENSJJAG00000023693	Bche (ENSJJAG00000024223)	ENSJJAG00000020586	Slitrk3 (ENSJJAG00000014567)	Sis (ENSJJAG00000013935)	ENSJJAG00000014060	ENSJJAG00000003270	ENSJJAG00000008203	Otol1 (ENSJJAG00000014583)	Sptssb (ENSJJAG00000002999)	Nmd3 (ENSJJAG00000019759)	B3galnt1 (ENSJJAG00000003796)	Ppm1l (ENSJJAG00000020436)	Kpna4 (ENSJJAG00000018083)	ENSJJAG00000014600 #22	Trim59 (ENSJJAG00000011810)	Smc4 (ENSJJAG00000010914)	Ift80 (ENSJJAG00000018399)	1110032F04Rik (ENSJJAG00000010657)	Il12a (ENSJJAG00000012071)	ENSJJAG00000019081	Iqcj (ENSJJAG00000011023)	Mfsd1 (ENSJJAG00000018648)	Rarres1 (ENSJJAG00000020808)	Gfm1 (ENSJJAG00000016447)	Lxn (ENSJJAG00000013889)	Mlf1 (ENSJJAG00000016680)	Rsrc1 (ENSJJAG00000013815)	ENSJJAG00000013277	Shox2 (ENSJJAG00000014041)
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1183	ENSNGAG00000019160	Fbxo4 (ENSNGAG00000000112)	Rimoc1 (ENSNGAG00000000034)	Oxct1 (ENSNGAG00000010264)	Plcxd3 (ENSNGAG00000020465)	C6 (ENSNGAG00000015691)	Mroh2b (ENSNGAG00000018783)	C7 (ENSNGAG00000014593)	ENSNGAG00000014031	Card6 (ENSNGAG00000001444)	ENSNGAG00000000693	Prkaa1 (ENSNGAG00000008327)	Ttc33 (ENSNGAG00000005682)	Ptger4 (ENSNGAG00000002797)	ENSNGAG00000017678	ENSNGAG00000018186 #22	C9 (ENSNGAG00000013631) #23	Fyb (ENSNGAG00000008827) #24	Rictor (ENSNGAG00000000546) #25	Osmr (ENSNGAG00000016413) #26	ENSNGAG00000009080	Lifr (ENSNGAG00000006273) #28	Egflam (ENSNGAG00000019890) #29	Gdnf (ENSNGAG00000017460) #31	Wdr70 (ENSNGAG00000013618) #32	Nup155 (ENSNGAG00000001345) #35	Cplane1 (ENSNGAG00000014748)	Nipbl (ENSNGAG00000018174)	Slc1a3 (ENSNGAG00000018048)	ENSNGAG00000016646	Nadk2 (ENSNGAG00000012720)
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00940000165146	ENSGT00390000005254.i.a.a.b	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	1	Rimoc1 (ENSCGRG00001020182)	Oxct1 (ENSCGRG00001022982)	Plcxd3 (ENSCGRG00001023897)	C6 (ENSCGRG00001024316)	ENSCGRG00001002969	Mroh2b (ENSCGRG00001004445)	C7 (ENSCGRG00001007548)	Card6 (ENSCGRG00001009142)	ENSCGRG00001012869	Prkaa1 (ENSCGRG00001001697)	Ttc33 (ENSCGRG00001019815)	Ptger4 (ENSCGRG00001020213)	ENSCGRG00001020504	ENSCGRG00001008646	ENSCGRG00001012741	Dab2 (ENSCGRG00001021141) #22	C9 (ENSCGRG00001021695) #23	Fyb (ENSCGRG00001022410) #24	Rictor (ENSCGRG00001009015) #25	Osmr (ENSCGRG00001017859) #26	Lifr (ENSCGRG00001003293) #28	Egflam (ENSCGRG00001023724) #29	ENSCGRG00001024378	ENSCGRG00001024626	Gdnf (ENSCGRG00001024149) #31	Wdr70 (ENSCGRG00001024618) #32	Nup155 (ENSCGRG00001023185) #35	Cplane1 (ENSCGRG00001023647)	Nipbl (ENSCGRG00001024039)	ENSCGRG00001008847	Slc1a3 (ENSCGRG00001011815)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	695						Pbsn (ENSMAUG00000012035)	Prkx (ENSMAUG00000016058)	ENSMAUG00000018492	ENSMAUG00000016228	Tbl1x (ENSMAUG00000006903)	Sat1 (ENSMAUG00000019369)	ENSMAUG00000008759	Prdx4 (ENSMAUG00000021607)	Ptchd1 (ENSMAUG00000002646)	Ptger4 (ENSMAUG00000014264)	ENSMAUG00000015397 #22	C9 (ENSMAUG00000018301) #23	Fyb (ENSMAUG00000001181) #24	Rictor (ENSMAUG00000013015) #25	Osmr (ENSMAUG00000019728) #26	Lifr (ENSMAUG00000015733) #28	Egflam (ENSMAUG00000015382) #29	Gdnf (ENSMAUG00000019401) #31	Wdr70 (ENSMAUG00000007958) #32	Nup155 (ENSMAUG00000003381) #35	Cplane1 (ENSMAUG00000001083)	Nipbl (ENSMAUG00000017640)	Slc1a3 (ENSMAUG00000009752)	ENSMAUG00000022209	Nadk2 (ENSMAUG00000022071)	Skp2 (ENSMAUG00000001989)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	6	ENSPEMG00000025781	Fbxo4 (ENSPEMG00000020075)	Rimoc1 (ENSPEMG00000010011)	Oxct1 (ENSPEMG00000011121)	Plcxd3 (ENSPEMG00000008571)	C6 (ENSPEMG00000011145)	Mroh2b (ENSPEMG00000011744)	C7 (ENSPEMG00000009708)	Card6 (ENSPEMG00000000513)	Rpl37 (ENSPEMG00000015291)	ENSPEMG00000029179	Prkaa1 (ENSPEMG00000000574)	Ttc33 (ENSPEMG00000026792)	Ptger4 (ENSPEMG00000028671)	ENSPEMG00000030159	Dab2 (ENSPEMG00000013156) #22	C9 (ENSPEMG00000008329) #23	Fyb (ENSPEMG00000001686) #24	ENSPEMG00000014848	Rictor (ENSPEMG00000000667) #25	Osmr (ENSPEMG00000008906) #26	ENSPEMG00000030395	Lifr (ENSPEMG00000004406) #28	Egflam (ENSPEMG00000017044) #29	Gdnf (ENSPEMG00000027275) #31	Wdr70 (ENSPEMG00000008794) #32	Nup155 (ENSPEMG00000019707) #35	Cplane1 (ENSPEMG00000019802)	Nipbl (ENSPEMG00000020126)	Slc1a3 (ENSPEMG00000000375)	Ranbp3l (ENSPEMG00000002400)
Prairie vole	MODERN SPECIES	6	Erap1 (ENSMOCG00000015368)	Fbxo4 (ENSMOCG00000019324)	Rimoc1 (ENSMOCG00000017689)	Oxct1 (ENSMOCG00000020647)	Plcxd3 (ENSMOCG00000003641)	C6 (ENSMOCG00000015087)	ENSMOCG00000008608	Mroh2b (ENSMOCG00000006405)	C7 (ENSMOCG00000020383)	Card6 (ENSMOCG00000000830)	Rpl37 (ENSMOCG00000003835)	Prkaa1 (ENSMOCG00000004966)	Ttc33 (ENSMOCG00000016527)	Ptger4 (ENSMOCG00000017627)	ENSMOCG00000000823	ENSMOCG00000022736 #22	C9 (ENSMOCG00000018405) #23	Fyb (ENSMOCG00000000549) #24	Rictor (ENSMOCG00000018257) #25	Osmr (ENSMOCG00000017794) #26	Lifr (ENSMOCG00000021812) #28	Egflam (ENSMOCG00000016024) #29	Gdnf (ENSMOCG00000016819) #31	Wdr70 (ENSMOCG00000000693) #32	Nup155 (ENSMOCG00000014018) #35	Cplane1 (ENSMOCG00000004713)	ENSMOCG00000018878	Nipbl (ENSMOCG00000000456)	Slc1a3 (ENSMOCG00000000262)	Ranbp3l (ENSMOCG00000018661)	Nadk2 (ENSMOCG00000019506)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Mus	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865.h	ENSGT00940000158865.g	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Mouse	MODERN SPECIES	6	Selenop (ENSMUSG00000064373)	Ccdc152 (ENSMUSG00000091119)	Ghr (ENSMUSG00000055737)	Fbxo4 (ENSMUSG00000022184)	Rimoc1 (ENSMUSG00000041935)	Oxct1 (ENSMUSG00000022186)	Plcxd3 (ENSMUSG00000049148)	C6 (ENSMUSG00000022181)	Mroh2b (ENSMUSG00000022155)	C7 (ENSMUSG00000079105)	Card6 (ENSMUSG00000041849)	Rpl37 (ENSMUSG00000041841)	Prkaa1 (ENSMUSG00000050697)	Ttc33 (ENSMUSG00000022151)	Ptger4 (ENSMUSG00000039942)	Dab2 (ENSMUSG00000022150) #22	C9 (ENSMUSG00000022149) #23	Fyb (ENSMUSG00000022148) #24	Rictor (ENSMUSG00000050310) #25	Osmr (ENSMUSG00000022146) #26	Lifr (ENSMUSG00000054263) #28	Egflam (ENSMUSG00000042961) #29	Gdnf (ENSMUSG00000022144) #31	Wdr70 (ENSMUSG00000039828) #32	Nup155 (ENSMUSG00000022142) #35	Cplane1 (ENSMUSG00000039801)	Nipbl (ENSMUSG00000022141)	Slc1a3 (ENSMUSG00000005360)	Ranbp3l (ENSMUSG00000048424)	Nadk2 (ENSMUSG00000022253)	Skp2 (ENSMUSG00000054115)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865.h	ENSGT00940000158865.g	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3107																Dab2 (ENSMSIG00000023466) #22	C9 (ENSMSIG00000024122) #23	Fyb (ENSMSIG00000024156) #24	Rictor (ENSMSIG00000024193) #25	Osmr (ENSMSIG00000024313) #26	Lifr (ENSMSIG00000024369) #28	Egflam (ENSMSIG00000024418) #29	Gdnf (ENSMSIG00000024493) #31	ENSMSIG00000024501 #32
spretus	MODERN SPECIES	6	MGP_SPRETEiJ_G0020521	Ccdc152 (MGP_SPRETEiJ_G0020522)	Ghr (MGP_SPRETEiJ_G0020523)	Fbxo4 (MGP_SPRETEiJ_G0020524)	Rimoc1 (MGP_SPRETEiJ_G0020525)	Oxct1 (MGP_SPRETEiJ_G0020526)	Plcxd3 (MGP_SPRETEiJ_G0020527)	C6 (MGP_SPRETEiJ_G0020528)	Mroh2b (MGP_SPRETEiJ_G0020529)	C7 (MGP_SPRETEiJ_G0020530)	Card6 (MGP_SPRETEiJ_G0020531)	Rpl37 (MGP_SPRETEiJ_G0020532)	MGP_SPRETEiJ_G0020533	Ttc33 (MGP_SPRETEiJ_G0020534)	Ptger4 (MGP_SPRETEiJ_G0020535)	Dab2 (MGP_SPRETEiJ_G0020536) #22	C9 (MGP_SPRETEiJ_G0020537) #23	Fyb (MGP_SPRETEiJ_G0020538) #24	Rictor (MGP_SPRETEiJ_G0020539) #25	Osmr (MGP_SPRETEiJ_G0020540) #26	Lifr (MGP_SPRETEiJ_G0020541) #28	Egflam (MGP_SPRETEiJ_G0020542) #29	Gdnf (MGP_SPRETEiJ_G0020543) #31	Wdr70 (MGP_SPRETEiJ_G0020544) #32	Nup155 (MGP_SPRETEiJ_G0020545) #35	Cplane1 (MGP_SPRETEiJ_G0020546)	Nipbl (MGP_SPRETEiJ_G0020547)	Slc1a3 (MGP_SPRETEiJ_G0020548)	Ranbp3l (MGP_SPRETEiJ_G0020549)	Nadk2 (MGP_SPRETEiJ_G0020550)	Skp2 (MGP_SPRETEiJ_G0020551)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	6	MGP_CAROLIEiJ_G0019624	Ccdc152 (MGP_CAROLIEiJ_G0019625)	Ghr (MGP_CAROLIEiJ_G0019626)	Fbxo4 (MGP_CAROLIEiJ_G0019627)	Rimoc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019628)	Oxct1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019629)	Plcxd3 (MGP_CAROLIEiJ_G0019630)	C6 (MGP_CAROLIEiJ_G0019631)	Mroh2b (MGP_CAROLIEiJ_G0019632)	C7 (MGP_CAROLIEiJ_G0019633)	Card6 (MGP_CAROLIEiJ_G0019634)	Rpl37 (MGP_CAROLIEiJ_G0019635)	Prkaa1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019636)	MGP_CAROLIEiJ_G0019637	Ptger4 (MGP_CAROLIEiJ_G0019638)	Dab2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019639) #22	C9 (MGP_CAROLIEiJ_G0019640) #23	Fyb (MGP_CAROLIEiJ_G0019641) #24	Rictor (MGP_CAROLIEiJ_G0019642) #25	Osmr (MGP_CAROLIEiJ_G0019643) #26	Lifr (MGP_CAROLIEiJ_G0019644) #28	Egflam (MGP_CAROLIEiJ_G0019645) #29	Gdnf (MGP_CAROLIEiJ_G0019646) #31	Wdr70 (MGP_CAROLIEiJ_G0019647) #32	Nup155 (MGP_CAROLIEiJ_G0019648) #35	Cplane1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019649)	Nipbl (MGP_CAROLIEiJ_G0019650)	Slc1a3 (MGP_CAROLIEiJ_G0019651)	MGP_CAROLIEiJ_G0019652	Nadk2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019653)	Skp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019654)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	2	MGP_PahariEiJ_G0016005	Ccdc152 (MGP_PahariEiJ_G0016006)	Ghr (MGP_PahariEiJ_G0016007)	Fbxo4 (MGP_PahariEiJ_G0016008)	Rimoc1 (MGP_PahariEiJ_G0016009)	Oxct1 (MGP_PahariEiJ_G0016010)	Plcxd3 (MGP_PahariEiJ_G0016011)	MGP_PahariEiJ_G0016012	Mroh2b (MGP_PahariEiJ_G0016013)	C7 (MGP_PahariEiJ_G0016014)	Card6 (MGP_PahariEiJ_G0016015)	Rpl37 (MGP_PahariEiJ_G0016016)	Prkaa1 (MGP_PahariEiJ_G0016017)	Ttc33 (MGP_PahariEiJ_G0016018)	Ptger4 (MGP_PahariEiJ_G0016019)	Dab2 (MGP_PahariEiJ_G0016020) #22	C9 (MGP_PahariEiJ_G0016021) #23	Fyb (MGP_PahariEiJ_G0016022) #24	Rictor (MGP_PahariEiJ_G0016023) #25	Osmr (MGP_PahariEiJ_G0016024) #26	Lifr (MGP_PahariEiJ_G0016025) #28	Egflam (MGP_PahariEiJ_G0016026) #29	Gdnf (MGP_PahariEiJ_G0016027) #31	Wdr70 (MGP_PahariEiJ_G0016028) #32	Nup155 (MGP_PahariEiJ_G0016029) #35	Cplane1 (MGP_PahariEiJ_G0016030)	Nipbl (MGP_PahariEiJ_G0016031)	Slc1a3 (MGP_PahariEiJ_G0016032)	MGP_PahariEiJ_G0016033	Nadk2 (MGP_PahariEiJ_G0016034)	Skp2 (MGP_PahariEiJ_G0016035)
Rat	MODERN SPECIES	11	Ghr (ENSRNOG00000015654)	Fbxo4 (ENSRNOG00000015622)	Rimoc1 (ENSRNOG00000052775)	Oxct1 (ENSRNOG00000043094)	ENSRNOG00000065139	Plcxd3 (ENSRNOG00000014550)	C6 (ENSRNOG00000024115)	Mroh2b (ENSRNOG00000042327)	Card6 (ENSRNOG00000001271)	Rpl37 (ENSRNOG00000064545)	Prkaa1 (ENSRNOG00000012799)	Ttc33 (ENSRNOG00000013217)	Ptger4 (ENSRNOG00000013240)	Rps15al4 (ENSRNOG00000052207)	ENSRNOG00000063101	Dab2 (ENSRNOG00000028930) #22	C9 (ENSRNOG00000013736) #23	Fyb1 (ENSRNOG00000013886) #24	Rictor (ENSRNOG00000011341) #25	Osmr (ENSRNOG00000033192) #26	Lifr (ENSRNOG00000011696) #28	Egflam (ENSRNOG00000012058) #29	Gdnf (ENSRNOG00000012819) #31	Wdr70 (ENSRNOG00000013336) #32	Nup155 (ENSRNOG00000013411) #35	Cplane1 (ENSRNOG00000042118)	Nipbl (ENSRNOG00000056907)	AABR07008421.1 (ENSRNOG00000030748)	Slc1a3 (ENSRNOG00000016163)	Ranbp3l (ENSRNOG00000052173)	ENSRNOG00000068920
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Hystricomorpha_a	DUPLICATION
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567.de #22	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918	ENSGT00390000018651
Guinea pig	DUPLICATION
Guinea pig	MODERN SPECIES	3	ENSCPOG00000021859	KYNU (ENSCPOG00000011220)	ARHGAP15 (ENSCPOG00000007467)	GTDC1 (ENSCPOG00000007030)	ENSCPOG00000035797	ZEB2 (ENSCPOG00000004182)	ACVR2A (ENSCPOG00000008575)	ORC4 (ENSCPOG00000008580)	MBD5 (ENSCPOG00000006236)	EPC2 (ENSCPOG00000008502)	KIF5C (ENSCPOG00000026278)	LYPD6B (ENSCPOG00000034526)	LYPD6 (ENSCPOG00000007686)	MMADHC (ENSCPOG00000007690)	RND3 (ENSCPOG00000035751)	ENSCPOG00000033292 #22	RBM43 (ENSCPOG00000037758)	NMI (ENSCPOG00000013053)	TNFAIP6 (ENSCPOG00000007974)	ENSCPOG00000038795	RIF1 (ENSCPOG00000037898)	NEB (ENSCPOG00000005161)	ARL5A (ENSCPOG00000005209)	CACNB4 (ENSCPOG00000026052)	STAM2 (ENSCPOG00000002847)	FMNL2 (ENSCPOG00000013482)	PRPF40A (ENSCPOG00000013494)	RPRM (ENSCPOG00000005597)	GALNT13 (ENSCPOG00000013115)	ENSCPOG00000005051	ENSCPOG00000034740
Guinea pig	MODERN SPECIES	29	ZNF131 (ENSCPOG00000033475)	ENSCPOG00000030497	CCDC152 (ENSCPOG00000002761)	GHR (ENSCPOG00000035401)	FBXO4 (ENSCPOG00000033716)	RIMOC1 (ENSCPOG00000031496)	OXCT1 (ENSCPOG00000012966)	PLCXD3 (ENSCPOG00000007095)	C6 (ENSCPOG00000030163)	MROH2B (ENSCPOG00000003334)	C7 (ENSCPOG00000015671)	RPL37 (ENSCPOG00000040164)	PRKAA1 (ENSCPOG00000005446)	TTC33 (ENSCPOG00000039296)	PTGER4 (ENSCPOG00000000716)	ENSCPOG00000008684 #22	FYB1 (ENSCPOG00000003694) #24	RICTOR (ENSCPOG00000039121) #25	OSMR (ENSCPOG00000015086) #26	LIFR (ENSCPOG00000000803) #28	EGFLAM (ENSCPOG00000002020) #29	GDNF (ENSCPOG00000034063) #31	WDR70 (ENSCPOG00000015400) #32	NUP155 (ENSCPOG00000008800) #35	ENSCPOG00000021336	NIPBL (ENSCPOG00000008170)	SLC1A3 (ENSCPOG00000007462)	RANBP3L (ENSCPOG00000014458)	NADK2 (ENSCPOG00000013309)	ENSCPOG00000013303	LMBRD2 (ENSCPOG00000038006)
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	60			ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567.de #22	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918	ENSGT00390000018651
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	133			ENSCLAG00000010107	CCDC152 (ENSCLAG00000008976)	GHR (ENSCLAG00000014878)	FBXO4 (ENSCLAG00000011352)	RIMOC1 (ENSCLAG00000009605)	OXCT1 (ENSCLAG00000008732)	PLCXD3 (ENSCLAG00000008935)	MROH2B (ENSCLAG00000008282)	RPL37 (ENSCLAG00000008803)	PRKAA1 (ENSCLAG00000009683)	TTC33 (ENSCLAG00000009002)	PTGER4 (ENSCLAG00000014156)	ENSCLAG00000007996	ENSCLAG00000015330 #22	FYB1 (ENSCLAG00000012441) #24	RICTOR (ENSCLAG00000007847) #25	OSMR (ENSCLAG00000008932) #26	LIFR (ENSCLAG00000008192) #28	EGFLAM (ENSCLAG00000011146) #29	GDNF (ENSCLAG00000013976) #31	WDR70 (ENSCLAG00000012915) #32	NUP155 (ENSCLAG00000010580) #35	CPLANE1 (ENSCLAG00000010572)	NIPBL (ENSCLAG00000009826)	SLC1A3 (ENSCLAG00000011675)	RANBP3L (ENSCLAG00000011000)	NADK2 (ENSCLAG00000007509)	SKP2 (ENSCLAG00000014622)	LMBRD2 (ENSCLAG00000011208)
Degu	MODERN SPECIES	43	PAK6 (ENSODEG00000017198)	BMF (ENSODEG00000017167)	EIF2AK4 (ENSODEG00000017099)	ENSODEG00000017096	ENSODEG00000017324	GPR176 (ENSODEG00000017131)	ENSODEG00000017258	THBS1 (ENSODEG00000017259)	ENSODEG00000017062	RASGRP1 (ENSODEG00000017423)	ENSODEG00000017000	SPRED1 (ENSODEG00000017489)	ENSODEG00000017175	TMCO5A (ENSODEG00000017946)	ENSODEG00000017255	ENSODEG00000017298 #22	FYB1 (ENSODEG00000017404) #24	RICTOR (ENSODEG00000017133) #25	OSMR (ENSODEG00000017295) #26	LIFR (ENSODEG00000017477) #28	EGFLAM (ENSODEG00000017406) #29	ENSODEG00000020500	GDNF (ENSODEG00000017491) #31	WDR70 (ENSODEG00000017279) #32	ENSODEG00000017505	NUP155 (ENSODEG00000017480) #35	CPLANE1 (ENSODEG00000017720)	NIPBL (ENSODEG00000017351)	SLC1A3 (ENSODEG00000017216)	ENSODEG00000017391	ENSODEG00000017427
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155567.ee #22
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155567.ee #22
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	77																ENSCLAG00000000166 #22
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	7	OXCT1 (ENSHGLG00000005620)	ENSHGLG00000000417	PLCXD3 (ENSHGLG00000005203)	C6 (ENSHGLG00000005314)	MROH2B (ENSHGLG00000006059)	ENSHGLG00000008189	C7 (ENSHGLG00000007774)	ENSHGLG00000038929	ENSHGLG00000009486	PRKAA1 (ENSHGLG00000010227)	ENSHGLG00000038071	ENSHGLG00000010606	ENSHGLG00000041880	PTGER4 (ENSHGLG00000002903)	ENSHGLG00000019934	DAB2 (ENSHGLG00000003257) #22	C9 (ENSHGLG00000003707) #23	ENSHGLG00000003910 #24	ENSHGLG00000049355	RICTOR (ENSHGLG00000004986) #25	ENSHGLG00000038546	OSMR (ENSHGLG00000002225) #26	LIFR (ENSHGLG00000002688) #28	EGFLAM (ENSHGLG00000003265) #29	ENSHGLG00000045283 #31	WDR70 (ENSHGLG00000007995) #32	ENSHGLG00000042227	NUP155 (ENSHGLG00000011918) #35	ENSHGLG00000007110	CPLANE1 (ENSHGLG00000008523)	NIPBL (ENSHGLG00000010862)
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	71	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b.g	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	102	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b.g	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	735																DAB2 (ENSUPAG00010016229) #22	C9 (ENSUPAG00010016395) #23
Squirrel	MODERN SPECIES	118	CCDC152 (ENSSTOG00000007216)	GHR (ENSSTOG00000007190)	FBXO4 (ENSSTOG00000021819)	RIMOC1 (ENSSTOG00000008291)	ENSSTOG00000008271	PLCXD3 (ENSSTOG00000008266)	C6 (ENSSTOG00000008232)	MROH2B (ENSSTOG00000008175)	C7 (ENSSTOG00000019606)	CARD6 (ENSSTOG00000027851)	ENSSTOG00000033844	PRKAA1 (ENSSTOG00000008118)	TTC33 (ENSSTOG00000025089)	PTGER4 (ENSSTOG00000024710)	ENSSTOG00000028948	DAB2 (ENSSTOG00000002461) #22	C9 (ENSSTOG00000002454) #23	ENSSTOG00000028890	RICTOR (ENSSTOG00000005716) #25	OSMR (ENSSTOG00000005685) #26	LIFR (ENSSTOG00000012582) #28	EGFLAM (ENSSTOG00000012561) #29	ENSSTOG00000032013	GDNF (ENSSTOG00000028754) #31	WDR70 (ENSSTOG00000005031) #32	NUP155 (ENSSTOG00000015151) #35	CPLANE1 (ENSSTOG00000015341)	NIPBL (ENSSTOG00000014981)	SLC1A3 (ENSSTOG00000015072)	RANBP3L (ENSSTOG00000002767)	NADK2 (ENSSTOG00000002754)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	44																DAB2 (ENSMMMG00000001159) #22	C9 (ENSMMMG00000001324) #23	FYB1 (ENSMMMG00000001335) #24	RICTOR (ENSMMMG00000001395) #25	OSMR (ENSMMMG00000001500) #26	LIFR (ENSMMMG00000001748) #28	EGFLAM (ENSMMMG00000001898) #29	GDNF (ENSMMMG00000001995) #31	WDR70 (ENSMMMG00000002008) #32	NUP155 (ENSMMMG00000002057) #35	CPLANE1 (ENSMMMG00000002202)	NIPBL (ENSMMMG00000002298)	SLC1A3 (ENSMMMG00000002366)	RANBP3L (ENSMMMG00000002394)	NADK2 (ENSMMMG00000002432)	SKP2 (ENSMMMG00000002584)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	15	GHR (ENSSVLG00005004362)	FBXO4 (ENSSVLG00005004500)	RIMOC1 (ENSSVLG00005004531)	OXCT1 (ENSSVLG00005004564)	PLCXD3 (ENSSVLG00005004611)	C6 (ENSSVLG00005004631)	MROH2B (ENSSVLG00005004687)	C7 (ENSSVLG00005004784)	CARD6 (ENSSVLG00005004836)	RPL37 (ENSSVLG00005004867)	PRKAA1 (ENSSVLG00005004929)	TTC33 (ENSSVLG00005005030)	PTGER4 (ENSSVLG00005005045)	ENSSVLG00005005058	ENSSVLG00005005082	DAB2 (ENSSVLG00005005129) #22	C9 (ENSSVLG00005005172) #23	ENSSVLG00005005217	FYB1 (ENSSVLG00005005277) #24	RICTOR (ENSSVLG00005005561) #25	ENSSVLG00005006015 #26	ENSSVLG00005006034 #26	LIFR (ENSSVLG00005006057) #28	EGFLAM (ENSSVLG00005006208) #29	GDNF (ENSSVLG00005006351) #31	WDR70 (ENSSVLG00005006404) #32	ENSSVLG00005006521	NUP155 (ENSSVLG00005006573) #35	CPLANE1 (ENSSVLG00005006661)	ENSSVLG00005006709	ENSSVLG00005006738
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000154668	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Rabbit	MODERN SPECIES	2	GHR (ENSOCUG00000008496)	ENSOCUG00000034980	ENSOCUG00000033828	FBXO4 (ENSOCUG00000009248)	RIMOC1 (ENSOCUG00000009242)	OXCT1 (ENSOCUG00000009231)	PLCXD3 (ENSOCUG00000002877)	C6 (ENSOCUG00000001929)	MROH2B (ENSOCUG00000014097)	ENSOCUG00000031207	CARD6 (ENSOCUG00000005374)	RPL37 (ENSOCUG00000029674)	PRKAA1 (ENSOCUG00000000897)	TTC33 (ENSOCUG00000000896)	PTGER4 (ENSOCUG00000000895)	DAB2 (ENSOCUG00000012721) #22	C9 (ENSOCUG00000012708) #23	FYB1 (ENSOCUG00000012699) #24	RICTOR (ENSOCUG00000012668) #25	OSMR (ENSOCUG00000012643) #26	LIFR (ENSOCUG00000003333) #28	ENSOCUG00000034940 #29	EGFLAM (ENSOCUG00000003322) #29	GDNF (ENSOCUG00000003033) #31	ENSOCUG00000038540	ENSOCUG00000000065	WDR70 (ENSOCUG00000006883) #32	NUP155 (ENSOCUG00000000170) #35	CPLANE1 (ENSOCUG00000025870)	NIPBL (ENSOCUG00000005888)	SLC1A3 (ENSOCUG00000021947)
Pika	MODERN SPECIES	6250																DAB2 (ENSOPRG00000011539) #22
Tree shrew	MODERN SPECIES	2609																DAB2 (ENSTBEG00000012465) #22
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01090000262500	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01090000262500	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00980000202544	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320
Suina	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01090000262500	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00980000202544	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320
Pig	MODERN SPECIES	7	FBXO4 (ENSSSCG00000016865)	RIMOC1 (ENSSSCG00000040855)	OXCT1 (ENSSSCG00000016863)	ENSSSCG00000031448	PLCXD3 (ENSSSCG00000033993)	ENSSSCG00000048052	C6 (ENSSSCG00000016861)	MROH2B (ENSSSCG00000021645)	C7 (ENSSSCG00000016859)	RPL37 (ENSSSCG00000033326)	PRKAA1 (ENSSSCG00000024598)	TTC33 (ENSSSCG00000034966)	PTGER4 (ENSSSCG00000024439)	ENSSSCG00000061479	ENSSSCG00000044033	DAB2 (ENSSSCG00000016857) #22	C9 (ENSSSCG00000016856) #23	FYB1 (ENSSSCG00000016855) #24	RICTOR (ENSSSCG00000016853) #25	OSMR (ENSSSCG00000016851) #26	LIFR (ENSSSCG00000016850) #28	EGFLAM (ENSSSCG00000016848) #29	ENSSSCG00000045434	GDNF (ENSSSCG00000038727) #31	WDR70 (ENSSSCG00000016846) #32	NUP155 (ENSSSCG00000016845) #35	CPLANE1 (ENSSSCG00000016843)	NIPBL (ENSSSCG00000016842)	SLC1A3 (ENSSSCG00000016841)	RANBP3L (ENSSSCG00000016838)	ENSSSCG00000016837
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	7	CCDC152 (ENSCWAG00000003977)	GHR (ENSCWAG00000003810)	FBXO4 (ENSCWAG00000003760)	RIMOC1 (ENSCWAG00000003741)	OXCT1 (ENSCWAG00000003672)	PLCXD3 (ENSCWAG00000003655)	C6 (ENSCWAG00000003638)	MROH2B (ENSCWAG00000003569)	C7 (ENSCWAG00000003542)	CARD6 (ENSCWAG00000003528)	RPL37 (ENSCWAG00000003508)	PRKAA1 (ENSCWAG00000003485)	TTC33 (ENSCWAG00000003468)	ENSCWAG00000003465	PTGER4 (ENSCWAG00000003457)	DAB2 (ENSCWAG00000003433) #22	C9 (ENSCWAG00000003303) #23	FYB1 (ENSCWAG00000003152) #24	RICTOR (ENSCWAG00000002954) #25	OSMR (ENSCWAG00000002899) #26	LIFR (ENSCWAG00000002882) #28	EGFLAM (ENSCWAG00000002665) #29	ENSCWAG00000002634 #31	WDR70 (ENSCWAG00000002608) #32	NUP155 (ENSCWAG00000002550) #35	CPLANE1 (ENSCWAG00000002502)	NIPBL (ENSCWAG00000002371)	SLC1A3 (ENSCWAG00000002268)	RANBP3L (ENSCWAG00000002083)	NADK2 (ENSCWAG00000001928)	SKP2 (ENSCWAG00000001863)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00980000202544	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00980000202544	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000006707.r.g	ENSGT00390000011383	ENSGT00940000154721.vb.a	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00940000165146	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000153239.B.n	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT01010000228899	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000006707.r.g	ENSGT00390000011383	ENSGT00940000154721.vb.a	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00940000165146	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000153239.B.n	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT01010000228899	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387
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Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000006707.r.g	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.b.c	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000153239.B.n	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT01010000228899	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155725.c.b	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464
Narwhal	MODERN SPECIES	298	FBXO4 (ENSMMNG00015004176)	ENSMMNG00015004154	RIMOC1 (ENSMMNG00015004141)	OXCT1 (ENSMMNG00015004110)	ENSMMNG00015004093	PLCXD3 (ENSMMNG00015004082)	ENSMMNG00015004073	C6 (ENSMMNG00015004038)	MROH2B (ENSMMNG00015003995)	C7 (ENSMMNG00015003958)	ENSMMNG00015003941	RPL37 (ENSMMNG00015003911)	PRKAA1 (ENSMMNG00015003860)	TTC33 (ENSMMNG00015003825)	PTGER4 (ENSMMNG00015003808)	DAB2 (ENSMMNG00015003683) #22	C9 (ENSMMNG00015003592) #23	ENSMMNG00015003575	FYB1 (ENSMMNG00015003499) #24	ENSMMNG00015003438	RICTOR (ENSMMNG00015003392) #25	OSMR (ENSMMNG00015003314) #26	ENSMMNG00015003299	ENSMMNG00015003285	LIFR (ENSMMNG00015003256) #28	EGFLAM (ENSMMNG00015003099) #29	ENSMMNG00015003038	GDNF (ENSMMNG00015003016) #31	WDR70 (ENSMMNG00015002899) #32	NUP155 (ENSMMNG00015002811) #35	CPLANE1 (ENSMMNG00015002752)
Beluga whale	MODERN SPECIES	71	ENSDLEG00000011117	OXCT1 (ENSDLEG00000007932)	ENSDLEG00000007959	PLCXD3 (ENSDLEG00000007969)	ENSDLEG00000007976	C6 (ENSDLEG00000007985)	ENSDLEG00000008015	ENSDLEG00000008047	C7 (ENSDLEG00000008142)	ENSDLEG00000008182	ENSDLEG00000008197	ENSDLEG00000008233	PRKAA1 (ENSDLEG00000008270)	TTC33 (ENSDLEG00000008324)	PTGER4 (ENSDLEG00000008354)	DAB2 (ENSDLEG00000008396) #22	C9 (ENSDLEG00000008449) #23	ENSDLEG00000008481	ENSDLEG00000008494 #24	ENSDLEG00000008508	RICTOR (ENSDLEG00000008761) #25	OSMR (ENSDLEG00000011096) #26	ENSDLEG00000011140	LIFR (ENSDLEG00000011161) #28	EGFLAM (ENSDLEG00000011222) #29	GDNF (ENSDLEG00000011285) #31	WDR70 (ENSDLEG00000011311) #32	NUP155 (ENSDLEG00000011741) #35	CPLANE1 (ENSDLEG00000012250)	NIPBL (ENSDLEG00000012577)	SLC1A3 (ENSDLEG00000012807)
Vaquita	MODERN SPECIES	14	FBXO4 (ENSPSNG00000013298)	RIMOC1 (ENSPSNG00000013384)	ENSPSNG00000013420	OXCT1 (ENSPSNG00000013489)	PLCXD3 (ENSPSNG00000013744)	ENSPSNG00000013802	C6 (ENSPSNG00000003100)	ENSPSNG00000003137	ENSPSNG00000003175	C7 (ENSPSNG00000003232)	RPL37 (ENSPSNG00000003299)	PRKAA1 (ENSPSNG00000003371)	TTC33 (ENSPSNG00000003417)	PTGER4 (ENSPSNG00000003430)	ENSPSNG00000003449	DAB2 (ENSPSNG00000003484) #22	C9 (ENSPSNG00000003566) #23	FYB1 (ENSPSNG00000003635) #24	ENSPSNG00000003737	RICTOR (ENSPSNG00000003768) #25	OSMR (ENSPSNG00000003821) #26	ENSPSNG00000003851	ENSPSNG00000003863	LIFR (ENSPSNG00000003881) #28	EGFLAM (ENSPSNG00000003979) #29	GDNF (ENSPSNG00000004104) #31	WDR70 (ENSPSNG00000004131) #32	NUP155 (ENSPSNG00000004202) #35	CPLANE1 (ENSPSNG00000004315)	NIPBL (ENSPSNG00000004448)	SLC1A3 (ENSPSNG00000004628)
Dolphin	MODERN SPECIES	865																DAB2 (ENSTTRG00000011722) #22	C9 (ENSTTRG00000011709) #23	FYB1 (ENSTTRG00000011700) #24	RICTOR (ENSTTRG00000011681) #25	OSMR (ENSTTRG00000011662) #26
Sperm whale	MODERN SPECIES	19	FBXO4 (ENSPCTG00005019359)	C8H5orf51 (ENSPCTG00005019324)	ENSPCTG00005019287	OXCT1 (ENSPCTG00005019136)	PLCXD3 (ENSPCTG00005019106)	ENSPCTG00005019087	C7 (ENSPCTG00005018916)	ENSPCTG00005018695	ENSPCTG00005018427	C6 (ENSPCTG00005018209)	ENSPCTG00005018189	ENSPCTG00005018160	PRKAA1 (ENSPCTG00005018088)	TTC33 (ENSPCTG00005018058)	PTGER4 (ENSPCTG00005018041)	DAB2 (ENSPCTG00005017944) #22	C9 (ENSPCTG00005017803) #23	ENSPCTG00005017759	ENSPCTG00005017725 #24	RICTOR (ENSPCTG00005017549) #25	OSMR (ENSPCTG00005017459) #26	ENSPCTG00005017392	LIFR (ENSPCTG00005017295) #28	EGFLAM (ENSPCTG00005016321) #29	GDNF (ENSPCTG00005016211) #31	WDR70 (ENSPCTG00005016122) #32	NUP155 (ENSPCTG00005015912) #35	CPLANE1 (ENSPCTG00005015256)	NIPBL (ENSPCTG00005014793)	SLC1A3 (ENSPCTG00005014533)	RANBP3L (ENSPCTG00005013974)
Blue whale	MODERN SPECIES	14	GHR (ENSBMSG00010002362)	ENSBMSG00010002320	FBXO4 (ENSBMSG00010002261)	ENSBMSG00010002244	RIMOC1 (ENSBMSG00010002238)	ENSBMSG00010002229	OXCT1 (ENSBMSG00010002211)	PLCXD3 (ENSBMSG00010002197)	C6 (ENSBMSG00010002171)	MROH2B (ENSBMSG00010002084)	C7 (ENSBMSG00010002048)	RPL37 (ENSBMSG00010002005)	PRKAA1 (ENSBMSG00010001960)	TTC33 (ENSBMSG00010001948)	PTGER4 (ENSBMSG00010001942)	DAB2 (ENSBMSG00010001905) #22	C9 (ENSBMSG00010001883) #23	ENSBMSG00010001877	ENSBMSG00010001871 #24	ENSBMSG00010001865	RICTOR (ENSBMSG00010001806) #25	OSMR (ENSBMSG00010001765) #26	EGFLAM (ENSBMSG00010001547) #29	GDNF (ENSBMSG00010001506) #31	WDR70 (ENSBMSG00010001492) #32	NUP155 (ENSBMSG00010001449) #35	CPLANE1 (ENSBMSG00010001402)	NIPBL (ENSBMSG00010001354)	SLC1A3 (ENSBMSG00010001259)	RANBP3L (ENSBMSG00010001078)	NADK2 (ENSBMSG00010000976)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00980000202544	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320
Yarkand deer	MODERN SPECIES	17	ENSCHYG00000014378	GHR (ENSCHYG00000014476)	FBXO4 (ENSCHYG00000015127)	RIMOC1 (ENSCHYG00000015406)	OXCT1 (ENSCHYG00000015484)	PLCXD3 (ENSCHYG00000015980)	C6 (ENSCHYG00000016069)	MROH2B (ENSCHYG00000016365)	C7 (ENSCHYG00000017007)	CARD6 (ENSCHYG00000017300)	ENSCHYG00000017362	PRKAA1 (ENSCHYG00000017622)	TTC33 (ENSCHYG00000017689)	PTGER4 (ENSCHYG00000017728)	ENSCHYG00000017787	DAB2 (ENSCHYG00000017878) #22	C9 (ENSCHYG00000018644) #23	FYB1 (ENSCHYG00000018867) #24	RICTOR (ENSCHYG00000019087) #25	OSMR (ENSCHYG00000019839) #26	LIFR (ENSCHYG00000020189) #28	EGFLAM (ENSCHYG00000020383) #29	ENSCHYG00000021006	GDNF (ENSCHYG00000021089) #31	WDR70 (ENSCHYG00000021169) #32	NUP155 (ENSCHYG00000021563) #35	CPLANE1 (ENSCHYG00000022035)	NIPBL (ENSCHYG00000022479)	SLC1A3 (ENSCHYG00000022666)	RANBP3L (ENSCHYG00000022913)	NADK2 (ENSCHYG00000023009)
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00980000202544	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1235	CCDC152 (ENSMMSG00000021074)	GHR (ENSMMSG00000020908)	FBXO4 (ENSMMSG00000020820)	OXCT1 (ENSMMSG00000020705)	ENSMMSG00000020689	PLCXD3 (ENSMMSG00000020669)	C6 (ENSMMSG00000020604)	MROH2B (ENSMMSG00000020386)	C7 (ENSMMSG00000020330)	CARD6 (ENSMMSG00000020302)	ENSMMSG00000020242	PRKAA1 (ENSMMSG00000020136)	TTC33 (ENSMMSG00000020105)	PTGER4 (ENSMMSG00000020089)	ENSMMSG00000020059	DAB2 (ENSMMSG00000019922) #22	C9 (ENSMMSG00000019814) #23	FYB1 (ENSMMSG00000019572) #24	RICTOR (ENSMMSG00000019199) #25	OSMR (ENSMMSG00000019092) #26	LIFR (ENSMMSG00000019030) #28	EGFLAM (ENSMMSG00000018823) #29	ENSMMSG00000018725	ENSMMSG00000018703	GDNF (ENSMMSG00000018647) #31	WDR70 (ENSMMSG00000018497) #32	NUP155 (ENSMMSG00000018372) #35	CPLANE1 (ENSMMSG00000018124)	NIPBL (ENSMMSG00000017930)	SLC1A3 (ENSMMSG00000017722)	RANBP3L (ENSMMSG00000017537)
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00980000202544	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b.a	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231.g	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.b	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918.g.a.e
Goat	MODERN SPECIES	12	CCDC152 (ENSCHIG00000011450)	GHR (ENSCHIG00000018928)	FBXO4 (ENSCHIG00000021750)	RIMOC1 (ENSCHIG00000000538)	ENSCHIG00000012124	PLCXD3 (ENSCHIG00000016815)	C6 (ENSCHIG00000021210)	ENSCHIG00000002172	ENSCHIG00000012521	C7 (ENSCHIG00000016536)	CARD6 (ENSCHIG00000020994)	RPL37 (ENSCHIG00000014444)	PRKAA1 (ENSCHIG00000017495)	TTC33 (ENSCHIG00000020642)	PTGER4 (ENSCHIG00000023835)	DAB2 (ENSCHIG00000009529) #22	C9 (ENSCHIG00000014791) #23	FYB1 (ENSCHIG00000018413) #24	RICTOR (ENSCHIG00000022858) #25	OSMR (ENSCHIG00000009367) #26	LIFR (ENSCHIG00000014349) #28	EGFLAM (ENSCHIG00000019067) #29	GDNF (ENSCHIG00000023187) #31	WDR70 (ENSCHIG00000012219) #32	NUP155 (ENSCHIG00000016985) #35	CPLANE1 (ENSCHIG00000022182)	NIPBL (ENSCHIG00000011197)	SLC1A3 (ENSCHIG00000017045)	RANBP3L (ENSCHIG00000023865)	NADK2 (ENSCHIG00000012491)	ENSCHIG00000019384
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	7	ZNF131 (ENSOARG00020006056)	ENSOARG00020006096	CCDC152 (ENSOARG00020006118)	GHR (ENSOARG00020006196)	FBXO4 (ENSOARG00020006423)	ENSOARG00020006604	OXCT1 (ENSOARG00020006708)	PLCXD3 (ENSOARG00020006984)	C6 (ENSOARG00020007044)	ENSOARG00020007543	RPL37 (ENSOARG00020007993)	PRKAA1 (ENSOARG00020008087)	TTC33 (ENSOARG00020008406)	PTGER4 (ENSOARG00020008466)	ENSOARG00020008514	DAB2 (ENSOARG00020008646) #22	C9 (ENSOARG00020008908) #23	FYB1 (ENSOARG00020009055) #24	RICTOR (ENSOARG00020009257) #25	ENSOARG00020010918	LIFR (ENSOARG00020010940) #28	EGFLAM (ENSOARG00020011103) #29	GDNF (ENSOARG00020011807) #31	WDR70 (ENSOARG00020011861) #32	NUP155 (ENSOARG00020012252) #35	NIPBL (ENSOARG00020013253)	SLC1A3 (ENSOARG00020013733)	RANBP3L (ENSOARG00020014079)	NADK2 (ENSOARG00020014421)	ENSOARG00020014918	LMBRD2 (ENSOARG00020015223)
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00980000202544	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320
American bison	MODERN SPECIES	3245	USP27X (ENSBBBG00000012099)	PAGE4 (ENSBBBG00000012093)	FBXO4 (ENSBBBG00000012083)	RIMOC1 (ENSBBBG00000012071)	OXCT1 (ENSBBBG00000012068)	PLCXD3 (ENSBBBG00000025503)	C6 (ENSBBBG00000006743)	MROH2B (ENSBBBG00000006720)	C7 (ENSBBBG00000025233)	CARD6 (ENSBBBG00000025191)	RPL37 (ENSBBBG00000007752)	PRKAA1 (ENSBBBG00000006659)	TTC33 (ENSBBBG00000006615)	PTGER4 (ENSBBBG00000025021)	ENSBBBG00000006604	DAB2 (ENSBBBG00000024953) #22	C9 (ENSBBBG00000024759) #23	FYB1 (ENSBBBG00000024722) #24	RICTOR (ENSBBBG00000024605) #25	OSMR (ENSBBBG00000024414) #26	LIFR (ENSBBBG00000008997) #28	EGFLAM (ENSBBBG00000024243) #29	GDNF (ENSBBBG00000024032) #31	WDR70 (ENSBBBG00000024014) #32	NUP155 (ENSBBBG00000023976) #35	CPLANE1 (ENSBBBG00000023780)	NIPBL (ENSBBBG00000006181)	SLC1A3 (ENSBBBG00000023563)	RANBP3L (ENSBBBG00000023472)	NADK2 (ENSBBBG00000023410)	ENSBBBG00000023284
Bos	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00980000202544	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150.s	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00390000015784.h	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150.s	ENSGT00390000010427.c	ENSGT01100000263480.a.b.b.a.b.b.a.a.a.a.b.a	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	12	ENSBIXG00005000772	FBXO4 (ENSBIXG00005010018)	OXCT1 (ENSBIXG00005009957)	ENSBIXG00005000669	PLCXD3 (ENSBIXG00005009870)	C6 (ENSBIXG00005009838)	MROH2B (ENSBIXG00005005801)	C7 (ENSBIXG00005009426)	ENSBIXG00005009368	CARD6 (ENSBIXG00005009362)	ENSBIXG00005009352	RPL37 (ENSBIXG00005009336)	PRKAA1 (ENSBIXG00005009308)	TTC33 (ENSBIXG00005009287)	PTGER4 (ENSBIXG00005009279)	DAB2 (ENSBIXG00005009202) #22	C9 (ENSBIXG00005009100) #23	FYB1 (ENSBIXG00005009080) #24	RICTOR (ENSBIXG00005009018) #25	ENSBIXG00005008919	OSMR (ENSBIXG00005008909) #26	LIFR (ENSBIXG00005008844) #28	EGFLAM (ENSBIXG00005008798) #29	GDNF (ENSBIXG00005008679) #31	WDR70 (ENSBIXG00005008644) #32	NUP155 (ENSBIXG00005008569) #35	CPLANE1 (ENSBIXG00005008503)	NIPBL (ENSBIXG00005008477)	ENSBIXG00005000192	SLC1A3 (ENSBIXG00005000188)	RANBP3L (ENSBIXG00005008350)
Cow	MODERN SPECIES	12	CCDC152 (ENSBTAG00000033221)	GHR (ENSBTAG00000001335)	FBXO4 (ENSBTAG00000016981)	RIMOC1 (ENSBTAG00000004929)	OXCT1 (ENSBTAG00000033186)	ENSBTAG00000049771	PLCXD3 (ENSBTAG00000010822)	C6 (ENSBTAG00000014177)	MROH2B (ENSBTAG00000001997)	C7 (ENSBTAG00000011766)	CARD6 (ENSBTAG00000014374)	RPL37 (ENSBTAG00000005142)	PRKAA1 (ENSBTAG00000000013)	TTC33 (ENSBTAG00000000012)	PTGER4 (ENSBTAG00000014972)	DAB2 (ENSBTAG00000016152) #22	C9 (ENSBTAG00000016149) #23	FYB1 (ENSBTAG00000001492) #24	RICTOR (ENSBTAG00000006697) #25	OSMR (ENSBTAG00000033107) #26	LIFR (ENSBTAG00000010423) #28	EGFLAM (ENSBTAG00000019595) #29	GDNF (ENSBTAG00000005176) #31	WDR70 (ENSBTAG00000033095) #32	NUP155 (ENSBTAG00000002458) #35	CPLANE1 (ENSBTAG00000000586)	NIPBL (ENSBTAG00000000579)	ENSBTAG00000050782	SLC1A3 (ENSBTAG00000018245)	RANBP3L (ENSBTAG00000008430)	NADK2 (ENSBTAG00000011334)
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00980000202544	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150.s	ENSGT00800000124150.t	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387
Wild yak	MODERN SPECIES	263			GHR (ENSBMUG00000026271)	FBXO4 (ENSBMUG00000026264)	RIMOC1 (ENSBMUG00000026260)	OXCT1 (ENSBMUG00000026258)	PLCXD3 (ENSBMUG00000026253)	C6 (ENSBMUG00000026250)	MROH2B (ENSBMUG00000026248)	C7 (ENSBMUG00000026244)	CARD6 (ENSBMUG00000026242)	RPL37 (ENSBMUG00000026237)	PRKAA1 (ENSBMUG00000026232)	TTC33 (ENSBMUG00000026229)	PTGER4 (ENSBMUG00000026228)	DAB2 (ENSBMUG00000026225) #22
Domestic yak	MODERN SPECIES	15	CCDC152 (ENSBGRG00000025298)	GHR (ENSBGRG00000025165)	FBXO4 (ENSBGRG00000025120)	RIMOC1 (ENSBGRG00000025094)	OXCT1 (ENSBGRG00000025043)	PLCXD3 (ENSBGRG00000025032)	C6 (ENSBGRG00000024962)	MROH2B (ENSBGRG00000024835)	C7 (ENSBGRG00000024642)	ENSBGRG00000024609	ENSBGRG00000024600	RPL37 (ENSBGRG00000024490)	PRKAA1 (ENSBGRG00000024391)	TTC33 (ENSBGRG00000024337)	PTGER4 (ENSBGRG00000024291)	DAB2 (ENSBGRG00000024066) #22	C9 (ENSBGRG00000023994) #23	FYB1 (ENSBGRG00000023892) #24	ENSBGRG00000023878	RICTOR (ENSBGRG00000023459) #25	OSMR (ENSBGRG00000022920) #26	ENSBGRG00000022886	LIFR (ENSBGRG00000022759) #28	ENSBGRG00000022731	EGFLAM (ENSBGRG00000021685) #29	GDNF (ENSBGRG00000021590) #31	WDR70 (ENSBGRG00000021511) #32	NUP155 (ENSBGRG00000020642) #35	CPLANE1 (ENSBGRG00000020312)	ENSBGRG00000020280	NIPBL (ENSBGRG00000018858)
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Arabian camel	MODERN SPECIES	22	ENSCDRG00005015137	CCDC152 (ENSCDRG00005015162)	GHR (ENSCDRG00005015314)	FBXO4 (ENSCDRG00005015505)	RIMOC1 (ENSCDRG00005015687)	ENSCDRG00005015716	OXCT1 (ENSCDRG00005015763)	PLCXD3 (ENSCDRG00005015917)	C6 (ENSCDRG00005015939)	MROH2B (ENSCDRG00005015996)	C7 (ENSCDRG00005016414)	RPL37 (ENSCDRG00005016487)	PRKAA1 (ENSCDRG00005016610)	TTC33 (ENSCDRG00005016688)	PTGER4 (ENSCDRG00005016717)	DAB2 (ENSCDRG00005016789) #22	C9 (ENSCDRG00005017085) #23	FYB1 (ENSCDRG00005017167) #24	RICTOR (ENSCDRG00005017323) #25	OSMR (ENSCDRG00005017567) #26	LIFR (ENSCDRG00005017655) #28	EGFLAM (ENSCDRG00005017766) #29	GDNF (ENSCDRG00005018248) #31	WDR70 (ENSCDRG00005018283) #32	NUP155 (ENSCDRG00005018373) #35	CPLANE1 (ENSCDRG00005000143)	NIPBL (ENSCDRG00005000397)	SLC1A3 (ENSCDRG00005000503)	RANBP3L (ENSCDRG00005000572)	NADK2 (ENSCDRG00005000629)	SKP2 (ENSCDRG00005000709)
Alpaca	MODERN SPECIES	1580																DAB2 (ENSVPAG00000004398) #22	C9 (ENSVPAG00000004396) #23	FYB1 (ENSVPAG00000004395) #24	RICTOR (ENSVPAG00000004393) #25	OSMR (ENSVPAG00000004392) #26	LIFR (ENSVPAG00000004387) #28	EGFLAM (ENSVPAG00000004385) #29	GDNF (ENSVPAG00000004384) #31	WDR70 (ENSVPAG00000004382) #32	NUP155 (ENSVPAG00000004381) #35	ENSVPAG00000004380	ENSVPAG00000004376	NIPBL (ENSVPAG00000004375)	SLC1A3 (ENSVPAG00000004372)	RANBP3L (ENSVPAG00000004370)	ENSVPAG00000004368
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01090000262500	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00390000005569.x.a.a.a.a.b	ENSGT01100000264727	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Felidae	DUPLICATION
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Panthera	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00390000005569.x.a.a.a.a.b	ENSGT01100000264727	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567.fe #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00390000005569.x.a.a.a.a.b	ENSGT01100000264727	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567.fe #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
leopard	MODERN SPECIES	44	GHR (ENSPPRG00000013162)	FBXO4 (ENSPPRG00000015760)	RIMOC1 (ENSPPRG00000018326)	OXCT1 (ENSPPRG00000021023)	PLCXD3 (ENSPPRG00000000201)	ENSPPRG00000000919	ENSPPRG00000001119	C6 (ENSPPRG00000001975)	MROH2B (ENSPPRG00000004540)	C7 (ENSPPRG00000004856)	CARD6 (ENSPPRG00000005352)	RPL37 (ENSPPRG00000006766)	PRKAA1 (ENSPPRG00000007500)	PTGER4 (ENSPPRG00000007870)	TTC33 (ENSPPRG00000008311)	DAB2 (ENSPPRG00000009732) #22	C9 (ENSPPRG00000009952) #23	FYB1 (ENSPPRG00000012788) #24	RICTOR (ENSPPRG00000014413) #25	OSMR (ENSPPRG00000016563) #26	LIFR (ENSPPRG00000017604) #28	EGFLAM (ENSPPRG00000000225) #29	GDNF (ENSPPRG00000001414) #31	WDR70 (ENSPPRG00000004068) #32	NUP155 (ENSPPRG00000006328) #35	CPLANE1 (ENSPPRG00000009663)
lion	MODERN SPECIES		ENSPLOG00000000785	CCDC152 (ENSPLOG00000000749)	GHR (ENSPLOG00000000658)	FBXO4 (ENSPLOG00000000603)	RIMOC1 (ENSPLOG00000000577)	OXCT1 (ENSPLOG00000000537)	PLCXD3 (ENSPLOG00000000517)	C6 (ENSPLOG00000000495)	MROH2B (ENSPLOG00000000435)	C7 (ENSPLOG00000000381)	CARD6 (ENSPLOG00000000362)	RPL37 (ENSPLOG00000000332)	PRKAA1 (ENSPLOG00000000298)	TTC33 (ENSPLOG00000000278)	PTGER4 (ENSPLOG00000000266)	DAB2 (ENSPLOG00000000213) #22	C9 (ENSPLOG00000000162) #23	FYB1 (ENSPLOG00000000133) #24	RICTOR (ENSPLOG00000020472) #25	OSMR (ENSPLOG00000020349) #26	LIFR (ENSPLOG00000020239) #28	EGFLAM (ENSPLOG00000019854) #29	GDNF (ENSPLOG00000019755) #31	WDR70 (ENSPLOG00000019708) #32	NUP155 (ENSPLOG00000019604) #35	CPLANE1 (ENSPLOG00000019536)	NIPBL (ENSPLOG00000019421)	SLC1A3 (ENSPLOG00000019155)	ENSPLOG00000019112	RANBP3L (ENSPLOG00000018932)	NADK2 (ENSPLOG00000018841)
Tiger	MODERN SPECIES	497	GHR (ENSPTIG00000006741)	FBXO4 (ENSPTIG00000010823)	RIMOC1 (ENSPTIG00000011017)	OXCT1 (ENSPTIG00000011427)	ENSPTIG00000005297	PLCXD3 (ENSPTIG00000013242)	ENSPTIG00000013442	C6 (ENSPTIG00000013714)	MROH2B (ENSPTIG00000013970)	C7 (ENSPTIG00000014486)	CARD6 (ENSPTIG00000015544)	ENSPTIG00000015735	PRKAA1 (ENSPTIG00000016570)	TTC33 (ENSPTIG00000017527)	PTGER4 (ENSPTIG00000018762)	DAB2 (ENSPTIG00000018885) #22	C9 (ENSPTIG00000021299) #23	FYB1 (ENSPTIG00000001694) #24	RICTOR (ENSPTIG00000010050) #25	OSMR (ENSPTIG00000015925) #26	LIFR (ENSPTIG00000017603) #28	EGFLAM (ENSPTIG00000018864) #29	GDNF (ENSPTIG00000001499) #31	WDR70 (ENSPTIG00000003961) #32	NUP155 (ENSPTIG00000007172) #35	CPLANE1 (ENSPTIG00000010544)	NIPBL (ENSPTIG00000017937)	SLC1A3 (ENSPTIG00000006100)	ENSPTIG00000006207	RANBP3L (ENSPTIG00000012107)	NADK2 (ENSPTIG00000015649)
Cat	MODERN SPECIES		ENSFCAG00000038537	ENSFCAG00000041553	CCDC152 (ENSFCAG00000001690)	GHR (ENSFCAG00000026499)	FBXO4 (ENSFCAG00000047836)	OXCT1 (ENSFCAG00000005209)	PLCXD3 (ENSFCAG00000031562)	C6 (ENSFCAG00000014857)	MROH2B (ENSFCAG00000015522)	C7 (ENSFCAG00000031466)	CARD6 (ENSFCAG00000025436)	ENSFCAG00000035948	PRKAA1 (ENSFCAG00000023817)	TTC33 (ENSFCAG00000014572)	PTGER4 (ENSFCAG00000036856)	DAB2 (ENSFCAG00000013125) #22	C9 (ENSFCAG00000013123) #23	FYB1 (ENSFCAG00000008084) #24	RICTOR (ENSFCAG00000008083) #25	OSMR (ENSFCAG00000008082) #26	LIFR (ENSFCAG00000018250) #28	EGFLAM (ENSFCAG00000010468) #29	GDNF (ENSFCAG00000037326) #31	WDR70 (ENSFCAG00000010442) #32	NUP155 (ENSFCAG00000013875) #35	CPLANE1 (ENSFCAG00000013871)	NIPBL (ENSFCAG00000003873)	SLC1A3 (ENSFCAG00000005554)	ENSFCAG00000025957	RANBP3L (ENSFCAG00000001019)	NADK2 (ENSFCAG00000029498)
Felidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155567.ge #22
Cat	MODERN SPECIES	240	ENTPD3 (ENSFCAG00000001786)	EIF1B (ENSFCAG00000003255)	MYRIP (ENSFCAG00000001785)	ENSFCAG00000002739	ENSFCAG00000024410	SLC25A38 (ENSFCAG00000002738)	CCR8 (ENSFCAG00000002737)	CX3CR1 (ENSFCAG00000002736)	XIRP1 (ENSFCAG00000013533)	CSRNP1 (ENSFCAG00000022981)	TTC21A (ENSFCAG00000013530)	GORASP1 (ENSFCAG00000022655)	WDR48 (ENSFCAG00000025123)	SCN11A (ENSFCAG00000000236)	SCN10A (ENSFCAG00000003166)	ENSFCAG00000039897 #22	SCN5A (ENSFCAG00000003161)	EXOG (ENSFCAG00000003159)	ACVR2B (ENSFCAG00000003157)	XYLB (ENSFCAG00000008493)	SLC22A14 (ENSFCAG00000012402)	SLC22A13 (ENSFCAG00000012398)	OXSR1 (ENSFCAG00000012392)	MYD88 (ENSFCAG00000034951)	ACAA1 (ENSFCAG00000012872)	DLEC1 (ENSFCAG00000012866)	PLCD1 (ENSFCAG00000002286)	VILL (ENSFCAG00000002285)	CTDSPL (ENSFCAG00000002282)	ITGA9 (ENSFCAG00000002281)	GOLGA4 (ENSFCAG00000002280)
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00390000005569.x.a.a.a.a.b	ENSGT01100000264727	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00390000005569.x.a.a.a.a.b.d.b	ENSGT01100000264727	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000167563	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00390000005569.x.a.a.a.a.b.d.b	ENSGT01100000264727	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.b	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Polar bear	MODERN SPECIES	179	CCDC152 (ENSUMAG00000007202)	GHR (ENSUMAG00000007219)	FBXO4 (ENSUMAG00000007263)	RIMOC1 (ENSUMAG00000007277)	OXCT1 (ENSUMAG00000007281)	PLCXD3 (ENSUMAG00000007317)	ENSUMAG00000007319	C6 (ENSUMAG00000007323)	MROH2B (ENSUMAG00000007341)	C7 (ENSUMAG00000007413)	CARD6 (ENSUMAG00000007533)	ENSUMAG00000007537	PRKAA1 (ENSUMAG00000007543)	TTC33 (ENSUMAG00000007549)	PTGER4 (ENSUMAG00000007573)	DAB2 (ENSUMAG00000007591) #22	C9 (ENSUMAG00000007604) #23	FYB1 (ENSUMAG00000007612) #24	RICTOR (ENSUMAG00000007680) #25	OSMR (ENSUMAG00000008099) #26	LIFR (ENSUMAG00000008233) #28	EGFLAM (ENSUMAG00000008246) #29	GDNF (ENSUMAG00000008259) #31	WDR70 (ENSUMAG00000008288) #32	ENSUMAG00000008296	NUP155 (ENSUMAG00000008416) #35	CPLANE1 (ENSUMAG00000009281)	NIPBL (ENSUMAG00000009519)	SLC1A3 (ENSUMAG00000011705)	RANBP3L (ENSUMAG00000011732)	NADK2 (ENSUMAG00000011742)
American black bear	MODERN SPECIES	3096																DAB2 (ENSUAMG00000011060) #22
Giant Panda	MODERN SPECIES	13	ENSAMEG00000029954	CCDC152 (ENSAMEG00000003860)	GHR (ENSAMEG00000003826)	FBXO4 (ENSAMEG00000015862)	RIMOC1 (ENSAMEG00000015856)	OXCT1 (ENSAMEG00000015794)	PLCXD3 (ENSAMEG00000012336)	C6 (ENSAMEG00000015230)	MROH2B (ENSAMEG00000015313)	C7 (ENSAMEG00000015352)	CARD6 (ENSAMEG00000015421)	RPL37 (ENSAMEG00000015424)	PRKAA1 (ENSAMEG00000015425)	TTC33 (ENSAMEG00000015444)	PTGER4 (ENSAMEG00000015458)	DAB2 (ENSAMEG00000017080) #22	C9 (ENSAMEG00000017094) #23	FYB1 (ENSAMEG00000017105) #24	RICTOR (ENSAMEG00000017120) #25	OSMR (ENSAMEG00000017152) #26	ENSAMEG00000028531	LIFR (ENSAMEG00000006524) #28	EGFLAM (ENSAMEG00000006497) #29	GDNF (ENSAMEG00000015066) #31	WDR70 (ENSAMEG00000015068) #32	NUP155 (ENSAMEG00000009783) #35	CPLANE1 (ENSAMEG00000009903)	NIPBL (ENSAMEG00000012191)	SLC1A3 (ENSAMEG00000012282)	RANBP3L (ENSAMEG00000012308)	NADK2 (ENSAMEG00000012313)
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT01100000264727	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00940000168157.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
American mink	MODERN SPECIES	216	FBXO4 (ENSNVIG00000000312)	CE051 (ENSNVIG00000000336)	SCOT1 (ENSNVIG00000000344)	PLCXD3 (ENSNVIG00000000377)	ENSNVIG00000000392	C6 (ENSNVIG00000000403)	MROH2B (ENSNVIG00000000452)	ENSNVIG00000000512	C7 (ENSNVIG00000000517)	ENSNVIG00000000542	ENSNVIG00000000545	AAPK1 (ENSNVIG00000000565)	TTC33 (ENSNVIG00000000624)	PTGER4 (ENSNVIG00000000646)	ENSNVIG00000000654	DAB2 (ENSNVIG00000000675) #22	C9 (ENSNVIG00000000781) #23	FYB1 (ENSNVIG00000000827) #24	RICTOR (ENSNVIG00000000960) #25	OSMR (ENSNVIG00000001088) #26	LIFR (ENSNVIG00000001169) #28	EGFLAM (ENSNVIG00000001250) #29
Ferret	MODERN SPECIES	162	ENSMPUG00000014441	CCDC152 (ENSMPUG00000014443)	GHR (ENSMPUG00000014445)	ENSMPUG00000019322	FBXO4 (ENSMPUG00000014449)	RIMOC1 (ENSMPUG00000014467)	OXCT1 (ENSMPUG00000014471)	PLCXD3 (ENSMPUG00000014556)	C6 (ENSMPUG00000014559)	MROH2B (ENSMPUG00000014663)	C7 (ENSMPUG00000014744)	CARD6 (ENSMPUG00000014751)	PRKAA1 (ENSMPUG00000014752)	TTC33 (ENSMPUG00000014786)	PTGER4 (ENSMPUG00000014788)	DAB2 (ENSMPUG00000014789) #22	C9 (ENSMPUG00000014793) #23	FYB1 (ENSMPUG00000014799) #24	RICTOR (ENSMPUG00000014842) #25	OSMR (ENSMPUG00000014850) #26	ENSMPUG00000014855	LIFR (ENSMPUG00000014857) #28	EGFLAM (ENSMPUG00000014860) #29	ENSMPUG00000014884	GDNF (ENSMPUG00000014888) #31	WDR70 (ENSMPUG00000014890) #32	NUP155 (ENSMPUG00000014895) #35	ENSMPUG00000014900	NIPBL (ENSMPUG00000014922)	ENSMPUG00000019323	SLC1A3 (ENSMPUG00000015046)
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Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00950000185104.B	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Dog	MODERN SPECIES	32	CCDC152 (ENSCAFG00845001839)	GHR (ENSCAFG00845001941)	RIMOC1 (ENSCAFG00845002073)	FBXO4 (ENSCAFG00845002116)	OXCT1 (ENSCAFG00845002156)	PLCXD3 (ENSCAFG00845002190)	C6 (ENSCAFG00845002251)	MROH2B (ENSCAFG00845002393)	C7 (ENSCAFG00845002627)	CARD6 (ENSCAFG00845002664)	RPL37 (ENSCAFG00845002691)	PRKAA1 (ENSCAFG00845002768)	TTC33 (ENSCAFG00845002884)	PTGER4 (ENSCAFG00845002906)	ENSCAFG00845002938	DAB2 (ENSCAFG00845003005) #22	C9 (ENSCAFG00845003087) #23	FYB1 (ENSCAFG00845003156) #24	RICTOR (ENSCAFG00845003291) #25	ENSCAFG00845003399	OSMR (ENSCAFG00845003423) #26	LIFR (ENSCAFG00845003525) #28	EGFLAM (ENSCAFG00845003614) #29	GDNF (ENSCAFG00845003744) #31	WDR70 (ENSCAFG00845003770) #32	NUP155 (ENSCAFG00845003864) #35	CPLANE1 (ENSCAFG00845003926)	NIPBL (ENSCAFG00845004008)	SLC1A3 (ENSCAFG00845004230)	RANBP3L (ENSCAFG00845004270)	NADK2 (ENSCAFG00845004315)
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Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01090000262500	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Equus	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.b	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01090000262500	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Donkey	MODERN SPECIES	1	RIMOC1 (ENSEASG00005013553)	OXCT1 (ENSEASG00005013690)	PLCXD3 (ENSEASG00005013901)	C6 (ENSEASG00005013903)	ENSEASG00005028457	MROH2B (ENSEASG00005013910)	C7 (ENSEASG00005013918)	CARD6 (ENSEASG00005013922)	RPL37 (ENSEASG00005013925)	ENSEASG00005013928	ENSEASG00005034165	ENSEASG00005027374	TTC33 (ENSEASG00005013930)	ENSEASG00005038518	PTGER4 (ENSEASG00005013933)	DAB2 (ENSEASG00005013938) #22	C9 (ENSEASG00005013943) #23	FYB1 (ENSEASG00005013945) #24	RICTOR (ENSEASG00005013952) #25	OSMR (ENSEASG00005013962) #26	LIFR (ENSEASG00005013963) #28	EGFLAM (ENSEASG00005013967) #29	GDNF (ENSEASG00005028766) #31	WDR70 (ENSEASG00005013976) #32	NUP155 (ENSEASG00005014066) #35	CPLANE1 (ENSEASG00005014288)	NIPBL (ENSEASG00005014299)	SLC1A3 (ENSEASG00005014668)	RANBP3L (ENSEASG00005014674)	NADK2 (ENSEASG00005014681)	SKP2 (ENSEASG00005014686)
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Microbat	MODERN SPECIES	1005	RIMOC1 (ENSMLUG00000007915)	ENSMLUG00000009431	PLCXD3 (ENSMLUG00000016916)	C6 (ENSMLUG00000016910)	MROH2B (ENSMLUG00000007613)	C7 (ENSMLUG00000007586)	ENSMLUG00000007572	RPL37 (ENSMLUG00000001565)	PRKAA1 (ENSMLUG00000014242)	TTC33 (ENSMLUG00000012023)	PTGER4 (ENSMLUG00000010038)	ENSMLUG00000029265	ENSMLUG00000030031	ENSMLUG00000006820	ENSMLUG00000027508	DAB2 (ENSMLUG00000005444) #22	C9 (ENSMLUG00000005440) #23	FYB1 (ENSMLUG00000002937) #24	RICTOR (ENSMLUG00000005754) #25	OSMR (ENSMLUG00000005743) #26	LIFR (ENSMLUG00000015027) #28	EGFLAM (ENSMLUG00000012866) #29	GDNF (ENSMLUG00000005002) #31	WDR70 (ENSMLUG00000004998) #32	NUP155 (ENSMLUG00000014272) #35	ENSMLUG00000029621	ENSMLUG00000011746	NIPBL (ENSMLUG00000001724)	RANBP3L (ENSMLUG00000002697)	NADK2 (ENSMLUG00000002689)	SKP2 (ENSMLUG00000002682)
Megabat	MODERN SPECIES	8223																DAB2 (ENSPVAG00000001050) #22	C9 (ENSPVAG00000001055) #23	FYB1 (ENSPVAG00000001056) #24
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES	1522																ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23
Common shrew	MODERN SPECIES	1061																DAB2 (ENSSARG00000007402) #22	ENSSARG00000007354 #23
Hedgehog	MODERN SPECIES	4808																ENSEEUG00000005476 #22
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150.k.a	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	683																ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29
Armadillo	DUPLICATION
Armadillo	DUPLICATION
Armadillo	DUPLICATION
Armadillo	MODERN SPECIES	2966					THAP6 (ENSDNOG00000039501)	CDKL2 (ENSDNOG00000041749)	ENSDNOG00000047453	ENSDNOG00000034968	ENSDNOG00000045619	ENSDNOG00000046068	ENSDNOG00000010053	PPEF2 (ENSDNOG00000023606)	NAAA (ENSDNOG00000012944)	ENSDNOG00000039376	SDAD1 (ENSDNOG00000006304)	ENSDNOG00000043830 #22	CXCL9 (ENSDNOG00000044316)	CXCL10 (ENSDNOG00000035824)	CXCL11 (ENSDNOG00000048035)	ART3 (ENSDNOG00000049435)	NUP54 (ENSDNOG00000002132)	SCARB2 (ENSDNOG00000015857)	FAM47E (ENSDNOG00000032529)	STBD1 (ENSDNOG00000017677)	CCDC158 (ENSDNOG00000025208)	SHROOM3 (ENSDNOG00000042825)	SOWAHB (ENSDNOG00000044339)	SEPTIN11 (ENSDNOG00000003551)	CCNI (ENSDNOG00000003558)	CCNG2 (ENSDNOG00000041902)	ENSDNOG00000031857
Armadillo	MODERN SPECIES	2773											ENSDNOG00000042401	ENSDNOG00000047848	PSMB1 (ENSDNOG00000019502)	ENSDNOG00000048505	DLL1 (ENSDNOG00000013023)	ENSDNOG00000041726 #22	ERMARD (ENSDNOG00000046414)	DYNLT2 (ENSDNOG00000038689)	C6orf120 (ENSDNOG00000023658)	PHF10 (ENSDNOG00000049431)	WDR27 (ENSDNOG00000014676)
Armadillo	MODERN SPECIES	4128															SOX3 (ENSDNOG00000048002)	ENSDNOG00000041545 #22	ENSDNOG00000032043	ENSDNOG00000034651
Armadillo	DUPLICATION
Armadillo	MODERN SPECIES	1373										OXTR (ENSDNOG00000033285)	CAV3 (ENSDNOG00000031489)	SSUH2 (ENSDNOG00000000625)	LMCD1 (ENSDNOG00000000622)	ENSDNOG00000046600	GRM7 (ENSDNOG00000015428)	ENSDNOG00000045152 #22
Armadillo	MODERN SPECIES	670																ENSDNOG00000012892 #22	C9 (ENSDNOG00000012875) #23	FYB1 (ENSDNOG00000012843) #24	RICTOR (ENSDNOG00000012194) #25	OSMR (ENSDNOG00000012169) #26	ENSDNOG00000047550	LIFR (ENSDNOG00000007535) #28	EGFLAM (ENSDNOG00000012920) #29
Sloth	MODERN SPECIES	4276																DAB2 (ENSCHOG00000002692) #22
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.b	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150.k.a	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.a.a.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.i.a.a.b	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150.k.a	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Elephant	MODERN SPECIES	526	CCDC152 (ENSLAFG00000010324)	GHR (ENSLAFG00000025524)	FBXO4 (ENSLAFG00000000157)	RIMOC1 (ENSLAFG00000000155)	OXCT1 (ENSLAFG00000000153)	PLCXD3 (ENSLAFG00000022636)	C6 (ENSLAFG00000003388)	ENSLAFG00000003380	ENSLAFG00000027888	ENSLAFG00000003378	CARD6 (ENSLAFG00000003376)	RPL37 (ENSLAFG00000030052)	PRKAA1 (ENSLAFG00000017784)	TTC33 (ENSLAFG00000003139)	PTGER4 (ENSLAFG00000017781)	DAB2 (ENSLAFG00000014524) #22	C9 (ENSLAFG00000023078) #23	FYB1 (ENSLAFG00000017371) #24	RICTOR (ENSLAFG00000004289) #25	OSMR (ENSLAFG00000004288) #26	LIFR (ENSLAFG00000009058) #28	EGFLAM (ENSLAFG00000009049) #29	GDNF (ENSLAFG00000012711) #31	WDR70 (ENSLAFG00000012469) #32	NUP155 (ENSLAFG00000012454) #35	ENSLAFG00000020573	ENSLAFG00000029995	ENSLAFG00000007588	NIPBL (ENSLAFG00000013762)	SLC1A3 (ENSLAFG00000014149)	RANBP3L (ENSLAFG00000015810)
Hyrax	MODERN SPECIES	10664																DAB2 (ENSPCAG00000009874) #22
Tenrec	MODERN SPECIES	1517																DAB2 (ENSETEG00000002867) #22	ENSETEG00000002860 #23
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000172494	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000161231	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000162106	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000172494	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Common wonbat	MODERN SPECIES	1011	CCDC152 (ENSVURG00010000969)	GHR (ENSVURG00010001082)	FBXO4 (ENSVURG00010001116)	RIMOC1 (ENSVURG00010001150)	ENSVURG00010001169	PLCXD3 (ENSVURG00010001256)	C6 (ENSVURG00010001315)	MROH2B (ENSVURG00010001388)	C7 (ENSVURG00010001566)	ENSVURG00010001615	ENSVURG00010001625	ENSVURG00010001637	PRKAA1 (ENSVURG00010001645)	TTC33 (ENSVURG00010001701)	PTGER4 (ENSVURG00010001714)	DAB2 (ENSVURG00010001765) #22	C9 (ENSVURG00010001837) #23	ENSVURG00010001851	RICTOR (ENSVURG00010001908) #25	ENSVURG00010002082 #26	LIFR (ENSVURG00010002185) #28	EGFLAM (ENSVURG00010002217) #29	ENSVURG00010002273	GDNF (ENSVURG00010002302) #31	WDR70 (ENSVURG00010002327) #32	NUP155 (ENSVURG00010002353) #35	CPLANE1 (ENSVURG00010002432)	NIPBL (ENSVURG00010002474)	SLC1A3 (ENSVURG00010002538)
koala	MODERN SPECIES	3	GHR (ENSPCIG00000022195)	FBXO4 (ENSPCIG00000018213)	RIMOC1 (ENSPCIG00000018212)	ENSPCIG00000011416	ENSPCIG00000035297	ENSPCIG00000036902	PLCXD3 (ENSPCIG00000011409)	C6 (ENSPCIG00000028618)	MROH2B (ENSPCIG00000028633)	C7 (ENSPCIG00000028644)	ENSPCIG00000032846	ENSPCIG00000028650	PRKAA1 (ENSPCIG00000027626)	TTC33 (ENSPCIG00000032953)	PTGER4 (ENSPCIG00000027624)	DAB2 (ENSPCIG00000035421) #22	C9 (ENSPCIG00000023900) #23	ENSPCIG00000023902	RICTOR (ENSPCIG00000020043) #25	ENSPCIG00000020045 #26	LIFR (ENSPCIG00000013315) #28	EGFLAM (ENSPCIG00000016479) #29	GDNF (ENSPCIG00000030881) #31	WDR70 (ENSPCIG00000024967) #32	NUP155 (ENSPCIG00000024969) #35	CPLANE1 (ENSPCIG00000024977)	NIPBL (ENSPCIG00000021464)	SLC1A3 (ENSPCIG00000021466)	RANBP3L (ENSPCIG00000021468)	NADK2 (ENSPCIG00000021475)	SKP2 (ENSPCIG00000021477)
Wallaby	MODERN SPECIES	5895																ENSMEUG00000014691 #22
Tasmanian devil	MODERN SPECIES		CCDC152 (ENSSHAG00000012352)	FBXO4 (ENSSHAG00000005221)	RIMOC1 (ENSSHAG00000028222)	ENSSHAG00000006848	PLCXD3 (ENSSHAG00000020772)	C6 (ENSSHAG00000012157)	MROH2B (ENSSHAG00000012840)	C7 (ENSSHAG00000013465)	RPL37 (ENSSHAG00000013969)	ENSSHAG00000013910	ENSSHAG00000029156	ENSSHAG00000014498	PTGER4 (ENSSHAG00000028137)	ENSSHAG00000028478	ENSSHAG00000002243	DAB2 (ENSSHAG00000007913) #22	C9 (ENSSHAG00000008614) #23	FYB1 (ENSSHAG00000009968) #24	RICTOR (ENSSHAG00000011344) #25	ENSSHAG00000011872 #26	LIFR (ENSSHAG00000014197) #28	EGFLAM (ENSSHAG00000014505) #29	GDNF (ENSSHAG00000017134) #31	ENSSHAG00000029137 #32	NUP155 (ENSSHAG00000017643) #35	CPLANE1 (ENSSHAG00000017799)	NIPBL (ENSSHAG00000018047)	ENSSHAG00000018536	ENSSHAG00000003678	NADK2 (ENSSHAG00000002696)	SKP2 (ENSSHAG00000004377)
Opossum	MODERN SPECIES	2	FBXO4 (ENSMODG00000020286)	C5orf51 (ENSMODG00000039581)	ENSMODG00000020289	ENSMODG00000050297	PLCXD3 (ENSMODG00000020290)	C6 (ENSMODG00000020291)	MROH2B (ENSMODG00000020294)	C7 (ENSMODG00000020299)	ENSMODG00000020300	ENSMODG00000020301	PRKAA1 (ENSMODG00000020303)	TTC33 (ENSMODG00000049452)	PTGER4 (ENSMODG00000020306)	ENSMODG00000020307	ENSMODG00000050821	DAB2 (ENSMODG00000020308) #22	C9 (ENSMODG00000020310) #23	ENSMODG00000020311	FYB1 (ENSMODG00000020313) #24	RICTOR (ENSMODG00000020315) #25	ENSMODG00000020318 #26	ENSMODG00000050317	LIFR (ENSMODG00000020327) #28	EGFLAM (ENSMODG00000020329) #29	GDNF (ENSMODG00000020332) #31	WDR70 (ENSMODG00000020335) #32	ENSMODG00000039622	NUP155 (ENSMODG00000020340) #35	CPLANE1 (ENSMODG00000020345)	NIPBL (ENSMODG00000020351)	ENSMODG00000029719
Platypus	MODERN SPECIES	14	ATOH7 (ENSOANG00000047393)	ENSOANG00000040638	CCDC152 (ENSOANG00000029600)	GHR (ENSOANG00000015024)	FBXO4 (ENSOANG00000032980)	RIMOC1 (ENSOANG00000040123)	ENSOANG00000047971	PLCXD3 (ENSOANG00000002823)	C6 (ENSOANG00000042077)	MROH2B (ENSOANG00000002183)	C7 (ENSOANG00000030433)	PRKAA1 (ENSOANG00000004087)	RPL37 (ENSOANG00000004863)	TTC33 (ENSOANG00000047394)	PTGER4 (ENSOANG00000000341)	DAB2 (ENSOANG00000010205) #22	ENSOANG00000047702 #23	RICTOR (ENSOANG00000010208) #25	ENSOANG00000010210 #26	LIFR (ENSOANG00000011785) #28	EGFLAM (ENSOANG00000051348) #29	GDNF (ENSOANG00000005353) #31	WDR70 (ENSOANG00000044568) #32	NUP155 (ENSOANG00000011539) #35	CPLANE1 (ENSOANG00000009236)	NIPBL (ENSOANG00000009233)	SLC1A3 (ENSOANG00000028968)	ENSOANG00000005822	ENSOANG00000046229	ADIRF (ENSOANG00000022097)	ENSOANG00000021407
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000154668	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156814.k.b	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000154668	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156814.k.b	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000160020	ENSGT00940000154668	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000160020	ENSGT00940000154668	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00390000016597	ENSGT00940000157775	ENSGT00390000011517.a.b
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000160020	ENSGT00940000154668	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000172494	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00390000016597	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320
painted turtle	MODERN SPECIES	710					ENSCPBG00000003814	NUP155 (ENSCPBG00000004106) #35	CPLANE1 (ENSCPBG00000005940)	NIPBL (ENSCPBG00000006177)	GDNF (ENSCPBG00000006880) #31	C6 (ENSCPBG00000006942)	C7 (ENSCPBG00000007210)	RPL37 (ENSCPBG00000007225)	PRKAA1 (ENSCPBG00000007237)	TTC33 (ENSCPBG00000007242)	PTGER4 (ENSCPBG00000007245)	DAB2 (ENSCPBG00000007273) #22	C9 (ENSCPBG00000007304) #23	ENSCPBG00000007312	RICTOR (ENSCPBG00000007344) #25	OSMR (ENSCPBG00000007369) #26	LIFR (ENSCPBG00000007396) #28	EGFLAM (ENSCPBG00000007423) #29	ENSCPBG00000007443	PLCXD3 (ENSCPBG00000007448)	HSPB3 (ENSCPBG00000007456)	ARL15 (ENSCPBG00000007476)	NDUFS4 (ENSCPBG00000007496)	FST (ENSCPBG00000007504)	ENSCPBG00000007508	MOCS2 (ENSCPBG00000007514)	ITGA2 (ENSCPBG00000007523)
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	29	SELENOP (ENSTMTG00000002406)	CCDC152 (ENSTMTG00000002399)	GHR (ENSTMTG00000002390)	FBXO4 (ENSTMTG00000002385)	RIMOC1 (ENSTMTG00000002378)	ENSTMTG00000002283	PLCXD3 (ENSTMTG00000002259)	C6 (ENSTMTG00000002249)	C7 (ENSTMTG00000002240)	ENSTMTG00000002232	PRKAA1 (ENSTMTG00000002224)	TTC33 (ENSTMTG00000002216)	PTGER4 (ENSTMTG00000002211)	ENSTMTG00000002204	ENSTMTG00000002200	DAB2 (ENSTMTG00000002178) #22	C9 (ENSTMTG00000002167) #23	ENSTMTG00000002158	RICTOR (ENSTMTG00000002135) #25	OSMR (ENSTMTG00000002119) #26	LIFR (ENSTMTG00000002099) #28	EGFLAM (ENSTMTG00000001929) #29	GDNF (ENSTMTG00000001896) #31	WDR70 (ENSTMTG00000001880) #32	NUP155 (ENSTMTG00000001858) #35	CPLANE1 (ENSTMTG00000001844)	NIPBL (ENSTMTG00000001776)	SLC1A3 (ENSTMTG00000001735)	ENSTMTG00000001724	NADK2 (ENSTMTG00000001715)	SKP2 (ENSTMTG00000001703)
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000160020	ENSGT00940000154668	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00390000016597	ENSGT00940000157775	ENSGT00390000011517.a.b
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	20	NIM1K (ENSGEVG00005009599)	ZNF131 (ENSGEVG00005009646)	SELENOP (ENSGEVG00005009695)	CCDC152 (ENSGEVG00005009743)	GHR (ENSGEVG00005009815)	FBXO4 (ENSGEVG00005009963)	RIMOC1 (ENSGEVG00005009989)	ENSGEVG00005010024	PLCXD3 (ENSGEVG00005010069)	C6 (ENSGEVG00005010128)	C7 (ENSGEVG00005010389)	ENSGEVG00005010523	PRKAA1 (ENSGEVG00005010575)	TTC33 (ENSGEVG00005010612)	PTGER4 (ENSGEVG00005010640)	DAB2 (ENSGEVG00005010672) #22	C9 (ENSGEVG00005010735) #23	FYB1 (ENSGEVG00005010813) #24	RICTOR (ENSGEVG00005011267) #25	OSMR (ENSGEVG00005011395) #26	LIFR (ENSGEVG00005011535) #28	EGFLAM (ENSGEVG00005011766) #29	ENSGEVG00005012431	GDNF (ENSGEVG00005012538) #31	WDR70 (ENSGEVG00005012562) #32	NUP155 (ENSGEVG00005012627) #35	CPLANE1 (ENSGEVG00005012750)	NIPBL (ENSGEVG00005012976)	SLC1A3 (ENSGEVG00005013105)	RANBP3L (ENSGEVG00005013355)	NADK2 (ENSGEVG00005013393)
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	281																ENSCABG00000007146 #22	C9 (ENSCABG00000007098) #23	ENSCABG00000007097	RICTOR (ENSCABG00000007093) #25	ENSCABG00000007092	OSMR (ENSCABG00000007091) #26
Chinese turtle	MODERN SPECIES	2253	ENSPSIG00000001635	GHR (ENSPSIG00000018116)	ENSPSIG00000001630	FBXO4 (ENSPSIG00000018090)	RIMOC1 (ENSPSIG00000018000)	ENSPSIG00000017367	PLCXD3 (ENSPSIG00000017330)	ENSPSIG00000001617	C6 (ENSPSIG00000015938)	C7 (ENSPSIG00000014239)	RPL37 (ENSPSIG00000014221)	PRKAA1 (ENSPSIG00000013615)	TTC33 (ENSPSIG00000013178)	PTGER4 (ENSPSIG00000013137)	ENSPSIG00000001605	DAB2 (ENSPSIG00000013114) #22	C9 (ENSPSIG00000012749) #23	FYB1 (ENSPSIG00000012110) #24	RICTOR (ENSPSIG00000010439) #25	OSMR (ENSPSIG00000009990) #26	LIFR (ENSPSIG00000008188) #28	EGFLAM (ENSPSIG00000007491) #29	GDNF (ENSPSIG00000007480) #31	WDR70 (ENSPSIG00000007222) #32	NUP155 (ENSPSIG00000017393) #35	ENSPSIG00000016981	ENSPSIG00000016464	NIPBL (ENSPSIG00000012077)	ENSPSIG00000011609
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154668	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156814.k.b	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Aves	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000160020	ENSGT00940000154668	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160020	ENSGT00940000154668	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000160020	ENSGT00940000154668.ec.a	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865.a	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c.e.a	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000154668.ec.a	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00980000198930	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865.a	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c.e.a	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Great tit	MODERN SPECIES	642	ZNF131 (ENSPMJG00000015861)	SELENOP (ENSPMJG00000015860)	CCDC152 (ENSPMJG00000015859)	GHR (ENSPMJG00000015858)	FBXO4 (ENSPMJG00000015854)	RIMOC1 (ENSPMJG00000015853)	ENSPMJG00000015852	ENSPMJG00000015851	PLCXD3 (ENSPMJG00000015850)	C6 (ENSPMJG00000015849)	C7 (ENSPMJG00000015848)	RPL37 (ENSPMJG00000015847)	PRKAA1 (ENSPMJG00000015846)	TTC33 (ENSPMJG00000015845)	PTGER4 (ENSPMJG00000015844)	DAB2 (ENSPMJG00000015837) #22	C9 (ENSPMJG00000015833) #23	FYB1 (ENSPMJG00000015823) #24	RICTOR (ENSPMJG00000015818) #25	OSMR (ENSPMJG00000015817) #26	LIFR (ENSPMJG00000015814) #28	EGFLAM (ENSPMJG00000015813) #29	GDNF (ENSPMJG00000015812) #31	WDR70 (ENSPMJG00000015811) #32	NUP155 (ENSPMJG00000015810) #35	CPLANE1 (ENSPMJG00000015809)	NIPBL (ENSPMJG00000015808)	SLC1A3 (ENSPMJG00000015806)	RANBP3L (ENSPMJG00000015805)	NADK2 (ENSPMJG00000015804)	SKP2 (ENSPMJG00000015803)
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000154668.ec.a	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00980000198930	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865.a	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c.e.a	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000154668.ec.a	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00980000198930	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865.a	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c.e.a	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000154668.ec.a	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00980000198930	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865.a	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00950000186371	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c.e.a	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320
Common canary	MODERN SPECIES	35	EMB (ENSSCAG00000008601)	HCN1 (ENSSCAG00000008579)	GHR (ENSSCAG00000008569)	ENSSCAG00000008558	FBXO4 (ENSSCAG00000008556)	RIMOC1 (ENSSCAG00000008550)	ENSSCAG00000008527	ENSSCAG00000008525	PLCXD3 (ENSSCAG00000008518)	C6 (ENSSCAG00000008466)	C7 (ENSSCAG00000008418)	ENSSCAG00000008409	ENSSCAG00000008395	TTC33 (ENSSCAG00000008384)	PTGER4 (ENSSCAG00000008380)	DAB2 (ENSSCAG00000008373) #22	C9 (ENSSCAG00000008362) #23	ENSSCAG00000008354	RICTOR (ENSSCAG00000008344) #25	OSMR (ENSSCAG00000008316) #26	LIFR (ENSSCAG00000008283) #28	ENSSCAG00000008274	ENSSCAG00000008270	EGFLAM (ENSSCAG00000008254) #29	ENSSCAG00000008201	NUP155 (ENSSCAG00000008153) #35	CPLANE1 (ENSSCAG00000008128)	ENSSCAG00000008090	SLC1A3 (ENSSCAG00000007944)	RANBP3L (ENSSCAG00000007911)	NADK2 (ENSSCAG00000007906)
Zebra finch	MODERN SPECIES	104	ZNF131 (ENSTGUG00000002273)	SELENOP (ENSTGUG00000021379)	CCDC152 (ENSTGUG00000019272)	GHR (ENSTGUG00000002265)	FBXO4 (ENSTGUG00000002262)	RIMOC1 (ENSTGUG00000002256)	ENSTGUG00000002229	ENSTGUG00000026505	PLCXD3 (ENSTGUG00000002227)	C6 (ENSTGUG00000002207)	C7 (ENSTGUG00000002197)	ENSTGUG00000002186	PRKAA1 (ENSTGUG00000002173)	TTC33 (ENSTGUG00000026129)	PTGER4 (ENSTGUG00000002168)	DAB2 (ENSTGUG00000002156) #22	C9 (ENSTGUG00000002149) #23	FYB1 (ENSTGUG00000002137) #24	RICTOR (ENSTGUG00000002126) #25	OSMR (ENSTGUG00000002125) #26	LIFR (ENSTGUG00000002116) #28	ENSTGUG00000019842	ENSTGUG00000025487	EGFLAM (ENSTGUG00000002114) #29	GDNF (ENSTGUG00000019278) #31	WDR70 (ENSTGUG00000002097) #32	CPLANE1 (ENSTGUG00000002059)	ENSTGUG00000002053	NIPBL (ENSTGUG00000002047)	SLC1A3 (ENSTGUG00000002032)	RANBP3L (ENSTGUG00000002031)
Medium ground finch	MODERN SPECIES	104				FBXO4 (ENSGFOG00000010776)	RIMOC1 (ENSGFOG00000010766)	ENSGFOG00000009455	ENSGFOG00000009379	ENSGFOG00000009365	PLCXD3 (ENSGFOG00000009355)	C6 (ENSGFOG00000009333)	C7 (ENSGFOG00000009307)	ENSGFOG00000009300	ENSGFOG00000009264	TTC33 (ENSGFOG00000009250)	PTGER4 (ENSGFOG00000009248)	DAB2 (ENSGFOG00000009237) #22	C9 (ENSGFOG00000009218) #23	FYB1 (ENSGFOG00000009203) #24	RICTOR (ENSGFOG00000009180) #25	LIFR (ENSGFOG00000009171) #28	ENSGFOG00000009165	EGFLAM (ENSGFOG00000009089) #29	GDNF (ENSGFOG00000009075) #31	WDR70 (ENSGFOG00000009064) #32	NUP155 (ENSGFOG00000009045) #35	ENSGFOG00000008987	SLC1A3 (ENSGFOG00000008971)	RANBP3L (ENSGFOG00000008957)	NADK2 (ENSGFOG00000008947)	SKP2 (ENSGFOG00000008924)	LMBRD2 (ENSGFOG00000008909)
Flycatcher	MODERN SPECIES	561	ZNF131 (ENSFALG00000025012)	SELENOP (ENSFALG00000025062)	CCDC152 (ENSFALG00000011107)	GHR (ENSFALG00000029017)	ENSFALG00000029033	FBXO4 (ENSFALG00000001919)	ENSFALG00000001931	ENSFALG00000024258	PLCXD3 (ENSFALG00000001951)	C6 (ENSFALG00000001961)	C7 (ENSFALG00000001988)	RPL37 (ENSFALG00000002006)	PRKAA1 (ENSFALG00000002013)	TTC33 (ENSFALG00000002015)	PTGER4 (ENSFALG00000002017)	DAB2 (ENSFALG00000002020) #22	C9 (ENSFALG00000002022) #23	FYB1 (ENSFALG00000002027) #24	RICTOR (ENSFALG00000002034) #25	OSMR (ENSFALG00000002039) #26	LIFR (ENSFALG00000002041) #28	EGFLAM (ENSFALG00000002044) #29	ENSFALG00000025627	GDNF (ENSFALG00000002046) #31	WDR70 (ENSFALG00000002047) #32	NUP155 (ENSFALG00000002048) #35	ENSFALG00000002055	ENSFALG00000026945	NIPBL (ENSFALG00000002058)	SLC1A3 (ENSFALG00000002060)	RANBP3L (ENSFALG00000028032)
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160020	ENSGT00940000154668.ec.a	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865.a	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c.e.a	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Kakapo	MODERN SPECIES	19	ENSSHBG00005004509	HMGCS1 (ENSSHBG00005004513)	NIM1K (ENSSHBG00005004524)	ENSSHBG00005004542	SELENOP (ENSSHBG00005004547)	GHR (ENSSHBG00005004562)	FBXO4 (ENSSHBG00005004572)	ENSSHBG00005004582	PLCXD3 (ENSSHBG00005004588)	C6 (ENSSHBG00005004594)	C7 (ENSSHBG00005004638)	RPL37 (ENSSHBG00005004778)	ENSSHBG00005004786	TTC33 (ENSSHBG00005004791)	PTGER4 (ENSSHBG00005004794)	DAB2 (ENSSHBG00005004798) #22	C9 (ENSSHBG00005004807) #23	FYB1 (ENSSHBG00005004815) #24	RICTOR (ENSSHBG00005004989) #25	ENSSHBG00005009009 #26	LIFR (ENSSHBG00005009016) #28	EGFLAM (ENSSHBG00005009055) #29	GDNF (ENSSHBG00005009214) #31	WDR70 (ENSSHBG00005009223) #32	NUP155 (ENSSHBG00005009278) #35	CPLANE1 (ENSSHBG00005009463)	ENSSHBG00005009517	ENSSHBG00005009561	SLC1A3 (ENSSHBG00005009612)	RANBP3L (ENSSHBG00005000453)	NADK2 (ENSSHBG00005000456)
Golden eagle	MODERN SPECIES	91	ZNF131 (ENSACCG00020013746)	SELENOP (ENSACCG00020013755)	CCDC152 (ENSACCG00020013770)	GHR (ENSACCG00020013799)	FBXO4 (ENSACCG00020013861)	RIMOC1 (ENSACCG00020013834)	ENSACCG00020013903	PLCXD3 (ENSACCG00020013932)	C6 (ENSACCG00020013957)	C7 (ENSACCG00020013988)	RPL37 (ENSACCG00020014013)	PRKAA1 (ENSACCG00020014041)	ENSACCG00020014065	TTC33 (ENSACCG00020014076)	PTGER4 (ENSACCG00020014091)	DAB2 (ENSACCG00020014117) #22	FYB1 (ENSACCG00020014242) #24	RICTOR (ENSACCG00020014567) #25	OSMR (ENSACCG00020014918) #26	LIFR (ENSACCG00020014953) #28	EGFLAM (ENSACCG00020014991) #29	GDNF (ENSACCG00020015016) #31	WDR70 (ENSACCG00020015041) #32	NUP155 (ENSACCG00020015100) #35	CPLANE1 (ENSACCG00020015149)	NIPBL (ENSACCG00020015233)	SLC1A3 (ENSACCG00020015296)	RANBP3L (ENSACCG00020015318)	NADK2 (ENSACCG00020015342)	SKP2 (ENSACCG00020015380)	LMBRD2 (ENSACCG00020015420)
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000160020	ENSGT00940000154668	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000160020	ENSGT00940000154668	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Duck	MODERN SPECIES	4281	LOXHD1 (ENSAPLG00000010718)	ENSAPLG00000018736	RNF165 (ENSAPLG00000006619)	C18orf25 (ENSAPLG00000017723)	HAUS1 (ENSAPLG00000011232)	ATP5F1A (ENSAPLG00000011512)	PSTPIP2 (ENSAPLG00000011930)	EPG5 (ENSAPLG00000011964)	ENSAPLG00000024300	ENSAPLG00000024359	ENSAPLG00000012208	SETBP1 (ENSAPLG00000017129)	SYT4 (ENSAPLG00000011860)	RIT2 (ENSAPLG00000027064)	PIK3C3 (ENSAPLG00000012759)	DAB2 (ENSAPLG00000009262) #22	C9 (ENSAPLG00000008988) #23	FYB1 (ENSAPLG00000008903) #24	RICTOR (ENSAPLG00000008632) #25	OSMR (ENSAPLG00000008272) #26	LIFR (ENSAPLG00000007351) #28	EGFLAM (ENSAPLG00000010255) #29	GDNF (ENSAPLG00000020330) #31	WDR70 (ENSAPLG00000010164) #32	NUP155 (ENSAPLG00000008857) #35	CPLANE1 (ENSAPLG00000008819)	NIPBL (ENSAPLG00000008108)	SLC1A3 (ENSAPLG00000007513)	RANBP3L (ENSAPLG00000008111)	NADK2 (ENSAPLG00000007886)	SKP2 (ENSAPLG00000007705)
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Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000006096.a.b	ENSGT00940000160020	ENSGT00940000154668	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987.a	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865.c	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851.d #26	ENSGT00940000160851.c.a #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c.g.a	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Chicken	MODERN SPECIES	131	HMGCS1 (ENSGALG00010014334)	NIM1K (ENSGALG00010014292)	ZNF131 (ENSGALG00010014263)	SELENOP1 (ENSGALG00010014658)	CCDC152 (ENSGALG00010014634)	GHR (ENSGALG00010014614)	FBXO4 (ENSGALG00010012536)	OXCT1 (ENSGALG00010012511)	PLCXD3 (ENSGALG00010012497)	C6 (ENSGALG00010012485)	C7 (ENSGALG00010012427)	RPL37 (ENSGALG00010013438)	PRKAA1 (ENSGALG00010014397)	TTC33 (ENSGALG00010014371)	PTGER4 (ENSGALG00010014350)	DAB2 (ENSGALG00010013409) #22	FYB1 (ENSGALG00010013396) #24	RICTOR (ENSGALG00010013357) #25	OSMR (ENSGALG00010013344) #26	LIFR (ENSGALG00010013329) #28	EGFLAM (ENSGALG00010012913) #29	GDNF (ENSGALG00010012878) #31	WDR70 (ENSGALG00010012861) #32	NUP155 (ENSGALG00010012803) #35	CPLANE1 (ENSGALG00010013777)	ENSGALG00010013746	SLC1A3 (ENSGALG00010013632)	RANBP3L (ENSGALG00010013580)	NADK2 (ENSGALG00010015616)	SKP2 (ENSGALG00010013533)	LMBRD2 (ENSGALG00010013514)
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African ostrich	MODERN SPECIES	811									PLCXD3 (ENSSCUG00000013524)	C6 (ENSSCUG00000013520)	C7 (ENSSCUG00000013517)	RPL37 (ENSSCUG00000013514)	PRKAA1 (ENSSCUG00000013512)	TTC33 (ENSSCUG00000013508)	PTGER4 (ENSSCUG00000013504)	DAB2 (ENSSCUG00000013492) #22	C9 (ENSSCUG00000013485) #23	ENSSCUG00000013479	FYB1 (ENSSCUG00000013473) #24	RICTOR (ENSSCUG00000013466) #25	OSMR (ENSSCUG00000013454) #26	LIFR (ENSSCUG00000013446) #28	EGFLAM (ENSSCUG00000013437) #29	GDNF (ENSSCUG00000013433) #31	WDR70 (ENSSCUG00000013431) #32	NUP155 (ENSSCUG00000013381) #35	CPLANE1 (ENSSCUG00000013340)	NIPBL (ENSSCUG00000013323)	SLC1A3 (ENSSCUG00000013319)	RANBP3L (ENSSCUG00000013314)	NADK2 (ENSSCUG00000013309)
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	29	NIM1K (ENSCPRG00005016179)	ZNF131 (ENSCPRG00005016172)	SELENOP (ENSCPRG00005016168)	GHR (ENSCPRG00005016164)	FBXO4 (ENSCPRG00005016162)	RIMOC1 (ENSCPRG00005016159)	ENSCPRG00005016023	PLCXD3 (ENSCPRG00005015986)	ENSCPRG00005015979	ENSCPRG00005015955	C7 (ENSCPRG00005015950)	RPL37 (ENSCPRG00005015947)	PRKAA1 (ENSCPRG00005015945)	ENSCPRG00005015942	PTGER4 (ENSCPRG00005015941)	DAB2 (ENSCPRG00005015933) #22	C9 (ENSCPRG00005015929) #23	ENSCPRG00005015928	RICTOR (ENSCPRG00005015925) #25	OSMR (ENSCPRG00005015920) #26	LIFR (ENSCPRG00005015912) #28	EGFLAM (ENSCPRG00005015907) #29	ENSCPRG00005015904 #31	ENSCPRG00005015903 #31	WDR70 (ENSCPRG00005015897) #32	NUP155 (ENSCPRG00005015889) #35	CPLANE1 (ENSCPRG00005015879)	NIPBL (ENSCPRG00005015833)	SLC1A3 (ENSCPRG00005015823)	ENSCPRG00005015819	NADK2 (ENSCPRG00005015799)
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154668	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156814.k.b	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000154668	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156814.k.b	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000154668	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156814.k.b	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918	ENSGT00390000018651
Common wall lizard	MODERN SPECIES	2	GHR (ENSPMRG00000016713)	ENSPMRG00000016706	RIMOC1 (ENSPMRG00000016705)	ENSPMRG00000016704	ENSPMRG00000016702	ENSPMRG00000016697	PLCXD3 (ENSPMRG00000016694)	ENSPMRG00000016669	ENSPMRG00000016654	C7 (ENSPMRG00000016643)	ENSPMRG00000016636	PRKAA1 (ENSPMRG00000016630)	TTC33 (ENSPMRG00000016627)	PTGER4 (ENSPMRG00000016625)	ENSPMRG00000016621	DAB2 (ENSPMRG00000016609) #22	C9 (ENSPMRG00000016600) #23	FYB1 (ENSPMRG00000016583) #24	RICTOR (ENSPMRG00000016267) #25	ENSPMRG00000016217	LIFR (ENSPMRG00000016207) #28	EGFLAM (ENSPMRG00000016146) #29	GDNF (ENSPMRG00000016124) #31	WDR70 (ENSPMRG00000016116) #32	NUP155 (ENSPMRG00000016099) #35	NIPBL (ENSPMRG00000011413)	ENSPMRG00000011401	ENSPMRG00000011399	SLC1A3 (ENSPMRG00000011395)	RANBP3L (ENSPMRG00000011380)	NADK2 (ENSPMRG00000011370)
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	10	ZNF131 (ENSSMRG00000018888)	SELENOP (ENSSMRG00000018887)	GHR (ENSSMRG00000018886)	FBXO4 (ENSSMRG00000018884)	RIMOC1 (ENSSMRG00000018883)	ENSSMRG00000018882	PLCXD3 (ENSSMRG00000018881)	C6 (ENSSMRG00000018880)	C7 (ENSSMRG00000018879)	ENSSMRG00000018878	PRKAA1 (ENSSMRG00000018877)	TTC33 (ENSSMRG00000018876)	PTGER4 (ENSSMRG00000018875)	ENSSMRG00000018872	ENSSMRG00000018871	DAB2 (ENSSMRG00000018870) #22	C9 (ENSSMRG00000018869) #23	FYB1 (ENSSMRG00000018868) #24	RICTOR (ENSSMRG00000018866) #25	LIFR (ENSSMRG00000018864) #28	ENSSMRG00000018863	EGFLAM (ENSSMRG00000018862) #29	GDNF (ENSSMRG00000018861) #31	WDR70 (ENSSMRG00000018860) #32	ENSSMRG00000018859	NUP155 (ENSSMRG00000018858) #35	CPLANE1 (ENSSMRG00000018857)	NIPBL (ENSSMRG00000017641)	ENSSMRG00000017638	ENSSMRG00000017634	SLC1A3 (ENSSMRG00000017633)
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000154668	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156814.k.b	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156814.k.b	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462.s.a	ENSGT00390000017462.s.b	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777.g #23	ENSGT00940000159777.h #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c.l	ENSGT00390000010427.c.k	ENSGT00940000155464	ENSGT00390000006320
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156814.k.b	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462.s.a	ENSGT00390000017462.s.b	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777.g #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.c.l	ENSGT00390000010427.c.k	ENSGT00940000155464	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000011383	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814.k.a	ENSGT00940000156814.k.b	ENSGT00940000156804	ENSGT00390000005254.j	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462.s.a	ENSGT00390000017462.s.b	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00640000091610.g	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777.g #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00390000010427.c.k	ENSGT00940000155464	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918	ENSGT00390000018651	ENSGT00940000156466
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	2	SELENOP (ENSPTXG00000008979)	CCDC152 (ENSPTXG00000008978)	GHR (ENSPTXG00000008976)	FBXO4 (ENSPTXG00000008975)	RIMOC1 (ENSPTXG00000008974)	ENSPTXG00000008973	PLCXD3 (ENSPTXG00000008972)	ENSPTXG00000008951	ENSPTXG00000008921	C7 (ENSPTXG00000008920)	ENSPTXG00000008918	PRKAA1 (ENSPTXG00000008917)	TTC33 (ENSPTXG00000008916)	PTGER4 (ENSPTXG00000008915)	ENSPTXG00000008914	DAB2 (ENSPTXG00000008913) #22	ENSPTXG00000008912 #23	ENSPTXG00000008911 #23	ENSPTXG00000008910	FYB1 (ENSPTXG00000008908) #24	RICTOR (ENSPTXG00000007824) #25	ENSPTXG00000007808 #26	LIFR (ENSPTXG00000007804) #28	EGFLAM (ENSPTXG00000007796) #29	GDNF (ENSPTXG00000007789) #31	WDR70 (ENSPTXG00000007785) #32	NUP155 (ENSPTXG00000007774) #35	NIPBL (ENSPTXG00000007747)	SLC1A3 (ENSPTXG00000007729)	NADK2 (ENSPTXG00000007656)	SKP2 (ENSPTXG00000007653)
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	15	SELENOP (ENSNSUG00000017070)	GHR (ENSNSUG00000017068)	FBXO4 (ENSNSUG00000017066)	RIMOC1 (ENSNSUG00000017065)	ENSNSUG00000017062	PLCXD3 (ENSNSUG00000017058)	ENSNSUG00000016788	ENSNSUG00000016787	C7 (ENSNSUG00000016786)	RPL37 (ENSNSUG00000016784)	PRKAA1 (ENSNSUG00000016695)	ENSNSUG00000016692	ENSNSUG00000016691	PTGER4 (ENSNSUG00000016689)	ENSNSUG00000016688	ENSNSUG00000016687 #22	C9 (ENSNSUG00000016686) #23	FYB1 (ENSNSUG00000016685) #24	RICTOR (ENSNSUG00000016683) #25	LIFR (ENSNSUG00000016680) #28	EGFLAM (ENSNSUG00000016679) #29	GDNF (ENSNSUG00000016677) #31	WDR70 (ENSNSUG00000016469) #32	NUP155 (ENSNSUG00000015920) #35	NIPBL (ENSNSUG00000015145)	SLC1A3 (ENSNSUG00000015143)	NADK2 (ENSNSUG00000015137)	SKP2 (ENSNSUG00000015136)	LMBRD2 (ENSNSUG00000015135)	CAPSL (ENSNSUG00000015134)	IL7R (ENSNSUG00000015133)
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	9930																DAB2 (ENSLLTG00000013690) #22
Indian cobra	MODERN SPECIES	1	ENSNNAG00000006401	ENSNNAG00000006415	SELENOP (ENSNNAG00000006431)	GHR (ENSNNAG00000006471)	FBXO4 (ENSNNAG00000006570)	RIMOC1 (ENSNNAG00000006619)	ENSNNAG00000006806	PLCXD3 (ENSNNAG00000009078)	ENSNNAG00000009102	ENSNNAG00000009187	C7 (ENSNNAG00000009375)	ENSNNAG00000009488	PRKAA1 (ENSNNAG00000009513)	TTC33 (ENSNNAG00000009535)	PTGER4 (ENSNNAG00000009560)	DAB2 (ENSNNAG00000009585) #22	ENSNNAG00000009786 #23	ENSNNAG00000010001 #23	FYB1 (ENSNNAG00000010872) #24	RICTOR (ENSNNAG00000010929) #25	LIFR (ENSNNAG00000011134) #28	EGFLAM (ENSNNAG00000011232) #29	GDNF (ENSNNAG00000011597) #31	WDR70 (ENSNNAG00000011614) #32	NUP155 (ENSNNAG00000011706) #35	NIPBL (ENSNNAG00000012019)	SLC1A3 (ENSNNAG00000012211)	NADK2 (ENSNNAG00000012252)	ENSNNAG00000012310	SKP2 (ENSNNAG00000012337)	LMBRD2 (ENSNNAG00000012402)
Lizard	MODERN SPECIES	1	ZNF131 (ENSACAG00000010702)	SELENOP (ENSACAG00000026650)	GHR (ENSACAG00000045331)	ENSACAG00000043221	ENSACAG00000037677	FBXO4 (ENSACAG00000010612)	RIMOC1 (ENSACAG00000010599)	ENSACAG00000010461	PLCXD3 (ENSACAG00000010454)	ENSACAG00000010314	ENSACAG00000022087	C7 (ENSACAG00000010303)	RPL37 (ENSACAG00000035464)	PRKAA1 (ENSACAG00000010236)	PTGER4 (ENSACAG00000010213)	DAB2 (ENSACAG00000010173) #22	ENSACAG00000010148 #23	ENSACAG00000037160 #23	FYB1 (ENSACAG00000026231) #24	IPO11 (ENSACAG00000008472)	DIMT1 (ENSACAG00000008504)	KIF2A (ENSACAG00000008507)	ZSWIM6 (ENSACAG00000008772)	ENSACAG00000008871	NDUFAF2 (ENSACAG00000008879)	ERCC8 (ENSACAG00000044507)	ELOVL7 (ENSACAG00000008996)	DEPDC1B (ENSACAG00000009000)	ENSACAG00000037617	ENSACAG00000037826	PDE4D (ENSACAG00000009088)
tuatara	MODERN SPECIES	1665																DAB2 (ENSSPUG00000007413) #22	C9 (ENSSPUG00000007256) #23	ENSSPUG00000007217	ENSSPUG00000007202 #24	RICTOR (ENSSPUG00000007143) #25	LIFR (ENSSPUG00000007112) #28	EGFLAM (ENSSPUG00000007043) #29	GDNF (ENSSPUG00000007019) #31	WDR70 (ENSSPUG00000007003) #32	NUP155 (ENSSPUG00000006857) #35	ENSSPUG00000006821	ENSSPUG00000006806	ENSSPUG00000006779	ENSSPUG00000006768	ENSSPUG00000006697
Anura	ANCESTRAL SPECIES	65	ENSGT00390000006096.a.b	ENSGT00940000160020	ENSGT00940000154668	ENSGT00510000049326.b.b	ENSGT00390000010075	ENSGT00940000159987	ENSGT00390000014416	ENSGT00390000009130.b	ENSGT00940000158747	ENSGT00940000156814	ENSGT00940000156804	ENSGT00940000165146	ENSGT00940000158865	ENSGT00390000017462	ENSGT01050000244902.a.a.a.a	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00530000063460.A.b #24	ENSGT00390000002096 #25	ENSGT00940000160851 #26	ENSGT00940000155776 #28	ENSGT00940000158504 #29	ENSGT00950000182993.A.b #31	ENSGT00390000015433 #32	ENSGT00390000016532 #35	ENSGT00800000124150	ENSGT00390000010427.d.b.a	ENSGT00940000155464	ENSGT00940000161387	ENSGT00390000006320	ENSGT00390000007918
Frog	MODERN SPECIES		znf131 (ENSXETG00000032207)	selenop1 (ENSXETG00000031045)	ccdc152 (ENSXETG00000048344)	ghr (ENSXETG00000037965)	fbxo4 (ENSXETG00000005569)	oxct1 (ENSXETG00000033345)	plcxd3 (ENSXETG00000003537)	c6.1 (ENSXETG00000003532)	c7 (ENSXETG00000033440)	ENSXETG00000048088	rpl37 (ENSXETG00000027024)	prkaa1 (ENSXETG00000007026)	ttc33 (ENSXETG00000007029)	ptger4 (ENSXETG00000007030)	ENSXETG00000043140	dab2 (ENSXETG00000006761) #22	c9 (ENSXETG00000006766) #23	ENSXETG00000035736	ENSXETG00000036492	ENSXETG00000039357	fyb1 (ENSXETG00000040396) #24	rictor (ENSXETG00000013215) #25	osmr (ENSXETG00000042029) #28	lifr (ENSXETG00000013223) #28	egflam (ENSXETG00000013228) #29	gdnf (ENSXETG00000004782) #31	ENSXETG00000048195	emx2 (ENSXETG00000004784) #32	ENSXETG00000047309	nup155 (ENSXETG00000004785) #35	cplane1 (ENSXETG00000043699)
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES		FBXO4 (ENSLLEG00000002826)	ENSLLEG00000002664	ENSLLEG00000002617	PLCXD3 (ENSLLEG00000002577)	ENSLLEG00000002558	C6 (ENSLLEG00000002530)	C7 (ENSLLEG00000002491)	ENSLLEG00000002474	ENSLLEG00000002463	ENSLLEG00000002444	PRKAA1 (ENSLLEG00000002421)	TTC33 (ENSLLEG00000002378)	ENSLLEG00000002364	ENSLLEG00000002357	ENSLLEG00000002347	DAB2 (ENSLLEG00000002254) #22	ENSLLEG00000001996 #23	ENSLLEG00000001740 #23	FYB1 (ENSLLEG00000001548) #24	ENSLLEG00000001509	RICTOR (ENSLLEG00000001324) #25	ENSLLEG00000001272 #26	ENSLLEG00000001253	ENSLLEG00000001190	ENSLLEG00000001161	LIFR (ENSLLEG00000001109) #28	EGFLAM (ENSLLEG00000000879) #29	GDNF (ENSLLEG00000000815) #31	WDR70 (ENSLLEG00000000716) #32	ENSLLEG00000000633 #35	ENSLLEG00000000614
Coelacanth	DUPLICATION
Coelacanth	MODERN SPECIES	274	CHERP (ENSLACG00000018221)	SLC35E1 (ENSLACG00000018186)	MED26 (ENSLACG00000018158)	TMEM38A (ENSLACG00000018131)	ENSLACG00000018126	NWD1 (ENSLACG00000018112)	SAFB (ENSLACG00000018090)	ENSLACG00000018046	ENSLACG00000018035	LPL (ENSLACG00000018014)	RAB8A (ENSLACG00000017882)	CIB3 (ENSLACG00000017857)	TAX1BP3 (ENSLACG00000017846)	CTNS (ENSLACG00000017816)	ENSLACG00000017800	ENSLACG00000017745 #22	ENSLACG00000017673 ##24	slc1a8b (ENSLACG00000017647)	ELAVL1 (ENSLACG00000017607)	tspan37 (ENSLACG00000017588)	ENSLACG00000017484	POLE4 (ENSLACG00000017480)	pnhd (ENSLACG00000017449)	admp (ENSLACG00000017430)	ENSLACG00000017420	ENSLACG00000017317	ENSLACG00000017294	NDUFA7 (ENSLACG00000017258)	kank3 (ENSLACG00000017209)	ENSLACG00000017186	ANGPTL4 (ENSLACG00000017018)
Coelacanth	MODERN SPECIES	825																DAB2 (ENSLACG00000013028) #22	C9 (ENSLACG00000012497) #23	FYB1 (ENSLACG00000009953) #24	RICTOR (ENSLACG00000005665) #25	ENSLACG00000004305 #26
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	347									ENSGT00940000161635	ENSGT00940000165051	ENSGT00390000018845.f	ENSGT00390000014626	ENSGT00390000000259	ENSGT00940000159007	ENSGT01050000244902.a.a.a.b	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00530000063460.B ##24	ENSGT00940000164644	ENSGT00940000155528
Reedfish	DUPLICATION
Reedfish	MODERN SPECIES	13	ENSECRG00000005185	ENSECRG00000005238	FOXB2 (ENSECRG00000005249)	nup155 (ENSECRG00000005269) #35	WDR70 (ENSECRG00000005313) #32	ENSECRG00000005366	gdnfa (ENSECRG00000005378) #31	EGFLAM (ENSECRG00000005431) #29	LIFR (ENSECRG00000005603) #28	ENSECRG00000005623 #25	ENSECRG00000005635	ENSECRG00000005641	ENSECRG00000005648	C9 (ENSECRG00000005656) #23	ENSECRG00000005671 #22	DAB2 (ENSECRG00000005682) #22	ptger4a (ENSECRG00000005690)	prkaa1 (ENSECRG00000005701)	ENSECRG00000005712	rpl37 (ENSECRG00000005718)	st8sia5 (ENSECRG00000005737)	LOXHD1 (ENSECRG00000005754)	RNF165 (ENSECRG00000005780)	isca1 (ENSECRG00000005793)	ENSECRG00000005802	ENSECRG00000005816	ENSECRG00000005833	GOLM1 (ENSECRG00000005850)	naa35 (ENSECRG00000005875)	agtpbp1 (ENSECRG00000005910)	ENSECRG00000005937
Reedfish	MODERN SPECIES	13	GCNT1 (ENSECRG00000005155)	ENSECRG00000005185	ENSECRG00000005238	FOXB2 (ENSECRG00000005249)	nup155 (ENSECRG00000005269) #35	WDR70 (ENSECRG00000005313) #32	ENSECRG00000005366	gdnfa (ENSECRG00000005378) #31	EGFLAM (ENSECRG00000005431) #29	LIFR (ENSECRG00000005603) #28	ENSECRG00000005623 #25	ENSECRG00000005635	ENSECRG00000005641	ENSECRG00000005648	C9 (ENSECRG00000005656) #23	ENSECRG00000005671 #22	DAB2 (ENSECRG00000005682) #22	ptger4a (ENSECRG00000005690)	prkaa1 (ENSECRG00000005701)	ENSECRG00000005712	rpl37 (ENSECRG00000005718)	st8sia5 (ENSECRG00000005737)	LOXHD1 (ENSECRG00000005754)	RNF165 (ENSECRG00000005780)	isca1 (ENSECRG00000005793)	ENSECRG00000005802	ENSECRG00000005816	ENSECRG00000005833	GOLM1 (ENSECRG00000005850)	naa35 (ENSECRG00000005875)	agtpbp1 (ENSECRG00000005910)
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	594															ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00530000063460.B ##24
Spotted gar	DUPLICATION
Spotted gar	MODERN SPECIES	657	ENSLOCG00000001315	dohh (ENSLOCG00000001335)	ENSLOCG00000001357	fzr1a (ENSLOCG00000001367)	comp (ENSLOCG00000001385)	CRTC1 (ENSLOCG00000001421)	klhl26 (ENSLOCG00000001457)	ENSLOCG00000001470	ENSLOCG00000001487	ENSLOCG00000001498	pik3r2 (ENSLOCG00000001519)	tmem38a (ENSLOCG00000001550)	MED26 (ENSLOCG00000001566)	slc35e1 (ENSLOCG00000001576)	ENSLOCG00000001580	ENSLOCG00000001592 #22	ENSLOCG00000001605 ##24	ENSLOCG00000001644	ENSLOCG00000001661	efna2a (ENSLOCG00000001681)	fam174c (ENSLOCG00000001689)	ptbp1b (ENSLOCG00000001702)	ENSLOCG00000001725	ENSLOCG00000001737	ENSLOCG00000017627	palm1b (ENSLOCG00000001753)	plppr3a (ENSLOCG00000001776)	ENSLOCG00000001788	med16 (ENSLOCG00000001808)	TMEM259 (ENSLOCG00000001828)	GRIN3B (ENSLOCG00000001847)
Spotted gar	MODERN SPECIES	658	adamts3 (ENSLOCG00000011512)	smarca2 (ENSLOCG00000011499)	dmrt2a (ENSLOCG00000011487)	dmrt3a (ENSLOCG00000011480)	dmrt1 (ENSLOCG00000011472)	KANK1 (ENSLOCG00000011458)	fbp1b (ENSLOCG00000011449)	fbp2 (ENSLOCG00000011443)	ctsla (ENSLOCG00000011433)	dapk1 (ENSLOCG00000011423)	gas1a (ENSLOCG00000017545)	tars1 (ENSLOCG00000011402)	ENSLOCG00000011395	TMEM8B (ENSLOCG00000011389)	c9 (ENSLOCG00000011377) #23	dab2 (ENSLOCG00000011371) #22	ENSLOCG00000011364	mccc2 (ENSLOCG00000011352)	hspb11 (ENSLOCG00000011348)	smn1 (ENSLOCG00000011339)	ENSLOCG00000011330	slc20a2 (ENSLOCG00000011322)	kcmf1 (ENSLOCG00000011313)	lipg (ENSLOCG00000011301)	acaa2 (ENSLOCG00000011285)	GAK (ENSLOCG00000011267)	cdc37l1 (ENSLOCG00000011249)	ak3 (ENSLOCG00000011239)	ptger4a (ENSLOCG00000011237)	prkaa1 (ENSLOCG00000011222)	rpl37 (ENSLOCG00000011220)
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000154821.b	ENSGT00940000156282.a.a	ENSGT00940000160420	ENSGT00940000156489	ENSGT00940000154886.a.a	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000015513.a.a.b	ENSGT00940000153321.b.b	ENSGT00940000153424.a.b	ENSGT00390000001195.a.a	ENSGT00940000154969.b	ENSGT00940000161883	ENSGT00940000157861	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000155949	ENSGT00940000166675	ENSGT00950000182964.a.b.b.a.a	ENSGT00940000153352.A	ENSGT00940000158491.a	ENSGT00940000166263	ENSGT00940000164944	ENSGT00940000166272	ENSGT00940000167385	ENSGT00940000157242.a.b	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00670000099470	ENSGT00390000014845
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	169	ENSGT00390000000113.B	ENSGT01070000253744.b.b.e	ENSGT00940000156085	ENSGT00940000154821.b	ENSGT00940000156282.a.a.g	ENSGT00940000160420.c	ENSGT00940000154886.a.a.g.b	ENSGT00390000015513.a.b.b.e	ENSGT00390000015513.a.a.b	ENSGT00940000153424.a.b.a	ENSGT00390000001195.a.a.a	ENSGT00940000154969.b	ENSGT00940000161883	ENSGT00940000157861	ENSGT01050000244902.a.a.a.b	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000155949	ENSGT00940000166675	ENSGT00940000153352.A	ENSGT00940000158491.a.a	ENSGT00940000181170	ENSGT00940000166263.b	ENSGT00940000164944.m	ENSGT00530000067979	ENSGT00940000157242.a.a	ENSGT00390000018619	ENSGT00940000158982	ENSGT00390000016407	ENSGT00390000004985.a	ENSGT00940000156031.e.a
Asian bonytongue	DUPLICATION
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Asian bonytongue	MODERN SPECIES	21	ENSSFOG00015019206	RUFY3 (ENSSFOG00015019217)	mob1ba (ENSSFOG00015019281)	SLC4A4 (ENSSFOG00015019317)	NPFFR2 (ENSSFOG00015019405)	ENSSFOG00015019506	DMRT2 (ENSSFOG00015019541)	DMRT3 (ENSSFOG00015019574)	dmrt1 (ENSSFOG00015032337)	ENSSFOG00015019609	ENSSFOG00015019665	si:dkey-26g8.5 (ENSSFOG00015019688)	dapk1 (ENSSFOG00015019739)	gas1b (ENSSFOG00015024998)	c9 (ENSSFOG00015019837) #23	dab2 (ENSSFOG00015028048) #22	ENSSFOG00015019884	rtkna (ENSSFOG00015019916)	ENSSFOG00015019932	ENSSFOG00015019950	rhobtb4 (ENSSFOG00015026928)	wdr54 (ENSSFOG00015020034)	ENSSFOG00015030433	aqp3b (ENSSFOG00015020054)	UNC5D (ENSSFOG00015020067)	tnfrsfa (ENSSFOG00015020094)	ENSSFOG00015031602	cyb561a3a (ENSSFOG00015020102)	zgc:193801 (ENSSFOG00015020110)	mzt2b (ENSSFOG00015020132)	lhx5 (ENSSFOG00015020148)
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	8	NPFFR2 (ENSSFOG00015029921)	adamts3 (ENSSFOG00015014846)	SMARCA2 (ENSSFOG00015014870)	dmrt2a (ENSSFOG00015014922)	dmrt3a (ENSSFOG00015014937)	ENSSFOG00015014968	ENSSFOG00015015007	fbp2 (ENSSFOG00015015025)	ctsla (ENSSFOG00015015031)	dapk1 (ENSSFOG00015015059)	gas1a (ENSSFOG00015027640)	tars1 (ENSSFOG00015015118)	ENSSFOG00015015181	ENSSFOG00015025706	TMEM8B (ENSSFOG00015015208)	DAB2 (ENSSFOG00015015237) #22	ENSSFOG00015015341	mccc2 (ENSSFOG00015015370)	hspb11 (ENSSFOG00015032493)	smn1 (ENSSFOG00015015507)	rtkna (ENSSFOG00015015698)	ENSSFOG00015015747	ENSSFOG00015015763	rhobtb4 (ENSSFOG00015015822)	ENSSFOG00015015878	ENSSFOG00015016019	aqp3a (ENSSFOG00015016026)	nol6 (ENSSFOG00015016052)	arsk (ENSSFOG00015016097)	SKIC3 (ENSSFOG00015016172)	ENSSFOG00015016212
P. kingsleyae	DUPLICATION
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	4	jund (ENSPKIG00000006193)	rab3aa (ENSPKIG00000006212)	ENSPKIG00000006292	ifi30 (ENSPKIG00000006449)	PIK3R2 (ENSPKIG00000006516)	MAST3 (ENSPKIG00000006629)	ENSPKIG00000006674	ENSPKIG00000006717 #28	CRTC1 (ENSPKIG00000006807)	comp (ENSPKIG00000006912)	tmem38a (ENSPKIG00000006981)	smim7 (ENSPKIG00000007017)	MED26 (ENSPKIG00000007041)	slc35e1 (ENSPKIG00000007059)	ENSPKIG00000007079	ENSPKIG00000007103 #22	ENSPKIG00000007130 ##24	pex11g (ENSPKIG00000007147)	APBA3 (ENSPKIG00000007178)	ENSPKIG00000007219	ABCA7 (ENSPKIG00000007281)	r3hdm4 (ENSPKIG00000007421)	ENSPKIG00000007465	ENSPKIG00000007510	ENSPKIG00000007557	ENSPKIG00000007576	ndufs7 (ENSPKIG00000007604)	gamt (ENSPKIG00000007631)	dazap1 (ENSPKIG00000007696)	rps15 (ENSPKIG00000007804)	dpp9 (ENSPKIG00000007874)
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	163						ENSPKIG00000003039	DMRT2 (ENSPKIG00000003092)	dmrt3a (ENSPKIG00000003109)	ENSPKIG00000003133	ENSPKIG00000003169	fbp1b (ENSPKIG00000003215)	ctsla (ENSPKIG00000003259)	dapk1 (ENSPKIG00000003300)	gas1a (ENSPKIG00000003338)	c9 (ENSPKIG00000003353) #23	dab2 (ENSPKIG00000003408) #22	ENSPKIG00000003484	rtkna (ENSPKIG00000003583)	ENSPKIG00000003676	ENSPKIG00000003740	rhobtb4 (ENSPKIG00000003871)	wdr54 (ENSPKIG00000003958)	ENSPKIG00000003992	aqp3b (ENSPKIG00000004013)	ENSPKIG00000004033	unc5da (ENSPKIG00000004126)	tnfrsfa (ENSPKIG00000004160)	zgc:193801 (ENSPKIG00000004193)	mzt2b (ENSPKIG00000004249)	ENSPKIG00000004297	ENSPKIG00000004329
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	166													tars1 (ENSPKIG00000010725)	ENSPKIG00000010795	TMEM8B (ENSPKIG00000010830)	DAB2 (ENSPKIG00000010926) #22	ENSPKIG00000010951	mccc2 (ENSPKIG00000010994)	hspb11 (ENSPKIG00000011052)	smn1 (ENSPKIG00000011096)	ENSPKIG00000011203	rtkna (ENSPKIG00000011223)	ENSPKIG00000011239	rhobtb4 (ENSPKIG00000011298)	ENSPKIG00000011371	aqp3a (ENSPKIG00000011389)	nol6 (ENSPKIG00000011418)	arsk (ENSPKIG00000011476)	SKIC3 (ENSPKIG00000011621)	ENSPKIG00000011858	MCTP1 (ENSPKIG00000011924)
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	239	ENSGT00940000156035	ENSGT00940000165677	ENSGT00940000156290.a	ENSGT00390000000113.B	ENSGT01070000253744.b.b.e	ENSGT00940000156085	ENSGT00940000154821.b	ENSGT00940000156282.a.a	ENSGT00940000160420	ENSGT00940000156489	ENSGT00940000153424.a.b	ENSGT00390000001195.a.a	ENSGT00940000154969.b	ENSGT00940000161883	ENSGT00940000157861	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000155949	ENSGT00940000166675	ENSGT00940000153352.A	ENSGT00940000158491.a	ENSGT00940000166263	ENSGT00940000164944	ENSGT00940000166272	ENSGT00940000167385
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT01050000244898.b.b.e.a	ENSGT00940000156290.a	ENSGT00390000000113.B	ENSGT01070000253744.b.b.e	ENSGT00940000156085	ENSGT00940000154821.b	ENSGT00940000156282.a.a	ENSGT00940000160420	ENSGT00940000156489	ENSGT00940000154886.a.a.e	ENSGT00940000153424.a.b	ENSGT00390000001195.a.a	ENSGT00940000154969.b	ENSGT00940000161883	ENSGT00940000157861	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762.v	ENSGT00940000155949	ENSGT00940000166675	ENSGT00940000153352.A	ENSGT00940000158491.a	ENSGT00940000166263	ENSGT00940000164944	ENSGT00940000166272	ENSGT00940000167385	ENSGT00530000067979	ENSGT00940000157242.a.a	ENSGT00390000018619	ENSGT00940000158982	ENSGT00390000016407	ENSGT00390000004985.a
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	129	ENSGT00940000157648	ENSGT00940000163293.c.b	ENSGT00940000155449	ENSGT00500000044984	ENSGT00940000153849.a.a.b	ENSGT00940000155570.t	ENSGT00940000155496.b	ENSGT01050000244838.H.c.b	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000155674.tc	ENSGT00940000157368.n	ENSGT00940000158739.d	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762.u	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00940000157242.a.b	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00670000099470	ENSGT00390000014845	ENSGT00940000166328	ENSGT00510000048902.a.f	ENSGT00940000159721.h	ENSGT00940000155305.b.b	ENSGT00940000155123.b.b	ENSGT00950000182940.b.b.f	ENSGT01050000244840.A.b.b.b	ENSGT01050000244840.A.a.a.h.a
Atlantic herring	DUPLICATION
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Atlantic herring	MODERN SPECIES	23	NPFFR2 (ENSCHAG00000009148)	adamts3 (ENSCHAG00000003933)	smarca2 (ENSCHAG00000001539)	dmrt2a (ENSCHAG00000001301)	dmrt3a (ENSCHAG00000001256)	dmrt1 (ENSCHAG00000001231)	ENSCHAG00000001123	fbp2 (ENSCHAG00000000965)	ctsla (ENSCHAG00000027488)	dapk1 (ENSCHAG00000027445)	gas1a (ENSCHAG00000027396)	tars1 (ENSCHAG00000026904)	ENSCHAG00000026831	ENSCHAG00000026822	TMEM8B (ENSCHAG00000026814)	DAB2 (ENSCHAG00000026804) #22	zcchc8 (ENSCHAG00000026801)	elovl7a (ENSCHAG00000026800)	PDE4D (ENSCHAG00000026756)	rab3c (ENSCHAG00000026746)	si:dkey-190g11.3 (ENSCHAG00000026738)	plk2b (ENSCHAG00000026726)	mier3b (ENSCHAG00000026693)	mrps36 (ENSCHAG00000026678)	cenph (ENSCHAG00000026675)	dimt1l (ENSCHAG00000026650)	kif2a (ENSCHAG00000026560)	ENSCHAG00000026539	unc45b (ENSCHAG00000026166)	pip5k1bb (ENSCHAG00000026085)	fxn (ENSCHAG00000026075)
Denticle herring	DUPLICATION
Denticle herring	MODERN SPECIES	13	sbno1 (ENSDCDG00000001375)	CDK2AP1 (ENSDCDG00000001305)	MPHOSPH9 (ENSDCDG00000001303)	PITPNM2 (ENSDCDG00000001216)	KIF2A (ENSDCDG00000000873)	ZSWIM6 (ENSDCDG00000000784)	ELOVL7 (ENSDCDG00000000756)	DEPDC1B (ENSDCDG00000000749)	PDE4D (ENSDCDG00000000665)	RAB3C (ENSDCDG00000000615)	PLK2 (ENSDCDG00000000583)	fbp1b (ENSDCDG00000000563)	si:dkey-26g8.5 (ENSDCDG00000000375)	gas1b (ENSDCDG00000029994)	c9 (ENSDCDG00000029988) #23	dab2 (ENSDCDG00000029983) #22	ENSDCDG00000029969	ENSDCDG00000029964	aqp3b (ENSDCDG00000029961)	unc5da (ENSDCDG00000028972)	tnfrsfa (ENSDCDG00000028939)	zgc:193801 (ENSDCDG00000028935)	mzt2b (ENSDCDG00000028932)	lhx5 (ENSDCDG00000028930)	FAM169A (ENSDCDG00000028929)	GCNT4 (ENSDCDG00000028927)	hmgcrb (ENSDCDG00000027394)	CERT1 (ENSDCDG00000027303)	SV2C (ENSDCDG00000027291)	F2RL2 (ENSDCDG00000027288)	f2rl1.1 (ENSDCDG00000027287)
Denticle herring	MODERN SPECIES	2	sv2ca (ENSDCDG00000021684)	F2RL2 (ENSDCDG00000021673)	iqgap2 (ENSDCDG00000007179)	f2r (ENSDCDG00000005542)	fbp1a (ENSDCDG00000005541)	fbp2 (ENSDCDG00000005540)	ctsla (ENSDCDG00000005536)	dapk1 (ENSDCDG00000005122)	gas1a (ENSDCDG00000005053)	tars1 (ENSDCDG00000005042)	tars1 (ENSDCDG00000005031)	tars1 (ENSDCDG00000005012)	tars1 (ENSDCDG00000003540)	ENSDCDG00000003270	TMEM8B (ENSDCDG00000003254)	DAB2 (ENSDCDG00000003235) #22	CLIP1 (ENSDCDG00000003198)	ammecr1 (ENSDCDG00000003121)	dnaaf11 (ENSDCDG00000003084)	dnaaf11 (ENSDCDG00000003033)	zcchc8 (ENSDCDG00000002992)	rsrc2 (ENSDCDG00000002949)	ercc8 (ENSDCDG00000029391)	elovl7a (ENSDCDG00000029385)	PDE4D (ENSDCDG00000029029)	rab3c (ENSDCDG00000028997)	si:dkey-190g11.3 (ENSDCDG00000028995)	plk2b (ENSDCDG00000028597)	ENSDCDG00000028569	pold2 (ENSDCDG00000028553)	star (ENSDCDG00000028548)
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	78	ENSGT01070000253744.b.b.e	ENSGT00940000156085	ENSGT00940000154821.b	ENSGT00940000156282.a.a	ENSGT00940000160420	ENSGT00940000156489	ENSGT00940000154886.a.a.e	ENSGT00390000015513.a.b.a	ENSGT00390000015513.a.a.b	ENSGT00940000153321.b.b	ENSGT00940000153424.a.b	ENSGT00390000001195.a.a	ENSGT00940000154969.b	ENSGT00940000161883	ENSGT00940000157861	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762.v	ENSGT00940000155949	ENSGT00940000166675	ENSGT00940000153352.A	ENSGT00940000158491.a	ENSGT00940000166263	ENSGT00940000164944	ENSGT00940000166272	ENSGT00530000067979	ENSGT00940000157242.a.a
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	142	ENSGT00940000155151.a.a.b	ENSGT00940000164386	ENSGT00390000006922	ENSGT00930000151044	ENSGT00530000064286	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a	ENSGT00390000011500	ENSGT00900000141021.b.a.d	ENSGT00390000008371.b	ENSGT00930000151050	ENSGT00940000160451	ENSGT00940000154645.B	ENSGT00930000151016	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762.v	ENSGT00940000155882.a.b.b	ENSGT00940000164626.b.b.c.a
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000155151.a.a.b	ENSGT00940000164386	ENSGT00390000006922	ENSGT00930000151044	ENSGT00530000064286	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a	ENSGT00390000011500	ENSGT00900000141021.b.a.d	ENSGT00390000008371.b	ENSGT00930000151050	ENSGT00940000160451	ENSGT00940000154645.B	ENSGT00930000151016	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000155882.a.b.b	ENSGT00940000164626.b.b.c.a	ENSGT00940000155735.r	ENSGT00420000029890	ENSGT00940000155845.t	ENSGT00940000159368.a	ENSGT00390000009869	ENSGT00940000158501.d.a	ENSGT00390000009566	ENSGT00550000074961.b	ENSGT00940000156430.b	ENSGT00940000156133.a.b	ENSGT00940000156488.a.a	ENSGT00390000017134
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	69	ENSGT00940000155151.a.a.b	ENSGT00940000164386	ENSGT00390000006922	ENSGT00930000151044	ENSGT00530000064286	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a	ENSGT00390000011500	ENSGT00900000141021.b.a.d	ENSGT00390000008371.b	ENSGT00930000151050	ENSGT00940000160451	ENSGT00940000154645.B	ENSGT00930000151016	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00940000155882.a.b.b
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	39	dmrt3a (ENSPNAG00000014527)	dmrt1 (ENSPNAG00000014524)	ENSPNAG00000014507	fbp1a (ENSPNAG00000014457)	fbp2 (ENSPNAG00000014425)	ctsla (ENSPNAG00000014392)	dapk1 (ENSPNAG00000014365)	gas1a (ENSPNAG00000014302)	tars1 (ENSPNAG00000014293)	ENSPNAG00000014238	TMEM8B (ENSPNAG00000014213)	ENSPNAG00000014161	ENSPNAG00000014151	ENSPNAG00000003035	ENSPNAG00000014140	DAB2 (ENSPNAG00000014124) #22	mccc2 (ENSPNAG00000014077)	hspb11 (ENSPNAG00000014017)	smn1 (ENSPNAG00000014007)	rtkna (ENSPNAG00000002969)	ENSPNAG00000013772	rhobtb4 (ENSPNAG00000013715)	wdr54 (ENSPNAG00000002878)	ENSPNAG00000013661	aqp3a (ENSPNAG00000013653)	POLK (ENSPNAG00000013620)	ANKDD1B (ENSPNAG00000005016)	ENSPNAG00000002821	sv2ca (ENSPNAG00000013551)	iqgap2 (ENSPNAG00000002783)	F2RL2 (ENSPNAG00000013416)
Mexicana tetra	DUPLICATION
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	137												ncs1a (ENSAMXG00000039140)	fbxw2 (ENSAMXG00000012941)	gas1b (ENSAMXG00000025652)	c9 (ENSAMXG00000012950) #23	dab2 (ENSAMXG00000012966) #22	hspb15 (ENSAMXG00000038921)	ENSAMXG00000036270	ENSAMXG00000012977	ENSAMXG00000038540	ENSAMXG00000038006	ENSAMXG00000039007	CABP7 (ENSAMXG00000006990)	zmat5 (ENSAMXG00000006979)	arpc5lb (ENSAMXG00000006965)	SCAI (ENSAMXG00000006940)	ppp6c (ENSAMXG00000030281)	tmem119b (ENSAMXG00000025747)	ENSAMXG00000006888	SSH1 (ENSAMXG00000006864)	MYO1H (ENSAMXG00000006824)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	26												tars1 (ENSAMXG00000014068)	ENSAMXG00000014047	TMEM8B (ENSAMXG00000040975)	ENSAMXG00000033885	DAB2 (ENSAMXG00000013962) #22	oxgr1a.2 (ENSAMXG00000025446)	ENSAMXG00000013953	hspb11 (ENSAMXG00000036011)	mccc2 (ENSAMXG00000013897)	smn1 (ENSAMXG00000013884)	rtkna (ENSAMXG00000031391)	ENSAMXG00000013848	rhobtb4 (ENSAMXG00000013839)	wdr54 (ENSAMXG00000030513)	ENSAMXG00000039267	aqp3a (ENSAMXG00000042262)	POLK (ENSAMXG00000013760)	ANKDD1B (ENSAMXG00000031396)	ENSAMXG00000036512	sv2ca (ENSAMXG00000013674)
Electric eel	DUPLICATION
Electric eel	MODERN SPECIES	352							ENSEEEG00000018577	ENSEEEG00000018579	FIS1 (ENSEEEG00000018580)	ENSEEEG00000018583	rangrf (ENSEEEG00000018585)	slc25a35 (ENSEEEG00000018586)	fbxw2 (ENSEEEG00000018589)	gas1b (ENSEEEG00000018591)	c9 (ENSEEEG00000018607) #23	dab2 (ENSEEEG00000018677) #22	hspb15 (ENSEEEG00000018679)	ENSEEEG00000018681	ENSEEEG00000018684	ENSEEEG00000018687	ENSEEEG00000018688	m17 (ENSEEEG00000018690)	tescb (ENSEEEG00000018691)	CABP7 (ENSEEEG00000018692)	zmat5 (ENSEEEG00000018693)	arpc5lb (ENSEEEG00000018696)	SCAI (ENSEEEG00000018705)	ppp6c (ENSEEEG00000018707)	MYO1H (ENSEEEG00000018711)	UNG (ENSEEEG00000018737)	SSH1 (ENSEEEG00000018775)
Electric eel	MODERN SPECIES	486																DAB2 (ENSEEEG00000015732) #22	mccc2 (ENSEEEG00000015725)	hspb11 (ENSEEEG00000015723)	smn1 (ENSEEEG00000015722)	tfap2b (ENSEEEG00000015718)	tfap2d (ENSEEEG00000015715)	CLMN (ENSEEEG00000015713)	dicer1 (ENSEEEG00000015686)	gsc (ENSEEEG00000015682)
Channel catfish	DUPLICATION
Channel catfish	MODERN SPECIES	20	rpl12 (ENSIPUG00000007575)	Lrsam1 (ENSIPUG00000007487)	ENSIPUG00000007367	crat (ENSIPUG00000007250)	ptpa (ENSIPUG00000007164)	ier5l (ENSIPUG00000007148)	ntmt1 (ENSIPUG00000007083)	ENSIPUG00000007066	ndor1 (ENSIPUG00000006992)	gpr107 (ENSIPUG00000006957)	ncs1 (ENSIPUG00000006898)	ENSIPUG00000006858	fbxw2 (ENSIPUG00000006792)	GAS1 (ENSIPUG00000006779)	c9 (ENSIPUG00000006737) #23	dab2 (ENSIPUG00000006718) #22	hspb15 (ENSIPUG00000006686)	ENSIPUG00000006653	cabp7 (ENSIPUG00000006642)	zmat5 (ENSIPUG00000006633)	ENSIPUG00000006620	kin (ENSIPUG00000006609)	arpc5lb (ENSIPUG00000006552)	ENSIPUG00000006545	ENSIPUG00000006522	scai (ENSIPUG00000006457)	ENSIPUG00000006443	ENSIPUG00000006416	mcc (ENSIPUG00000006341)	ENSIPUG00000006314	c28h9orf172 (ENSIPUG00000006304)
Channel catfish	MODERN SPECIES	14	npffr2 (ENSIPUG00000010900)	adamts3 (ENSIPUG00000010920)	smarca2 (ENSIPUG00000011060)	dmrt2a (ENSIPUG00000011295)	dmrt3 (ENSIPUG00000011306)	dmrt1 (ENSIPUG00000011312)	kank1 (ENSIPUG00000011334)	fbp1a (ENSIPUG00000011530)	fbp2 (ENSIPUG00000011685)	ctsla (ENSIPUG00000011719)	dapk1 (ENSIPUG00000011874)	Gas1 (ENSIPUG00000012093)	tars1 (ENSIPUG00000012104)	ggt6 (ENSIPUG00000012153)	tmem8b (ENSIPUG00000012178)	dab2 (ENSIPUG00000012221) #22	ENSIPUG00000012377	Mccc2 (ENSIPUG00000012419)	hspb11 (ENSIPUG00000012526)	smn1 (ENSIPUG00000012580)	rtkn (ENSIPUG00000012641)	ENSIPUG00000012707	rhobtb4 (ENSIPUG00000012733)	wdr54 (ENSIPUG00000012842)	ENSIPUG00000012892	aqp3a (ENSIPUG00000012906)	polk (ENSIPUG00000012942)	Ankdd1b (ENSIPUG00000012979)	poc5 (ENSIPUG00000013008)	sv2c (ENSIPUG00000013042)	iqgap2 (ENSIPUG00000013096)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT01070000253744.b.b.e.a	ENSGT00940000156085	ENSGT00940000154821.b	ENSGT00940000156282.a.a	ENSGT00940000160420	ENSGT00940000156489	ENSGT00940000154886.a.a.e	ENSGT00390000015513.a.b.a	ENSGT00390000015513.a.a.b	ENSGT00940000153321.b.b	ENSGT00940000153424.a.b	ENSGT00390000001195.a.a	ENSGT00940000154969.b	ENSGT00940000161883	ENSGT00940000157861	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762.v	ENSGT00940000155949	ENSGT00940000166675	ENSGT00940000153352.A	ENSGT00940000159752.j	ENSGT00940000158491.a	ENSGT00940000166263	ENSGT00940000164944	ENSGT00940000166272	ENSGT00530000067979	ENSGT00940000157242.a.a	ENSGT01050000244898.b.b.e.a	ENSGT00940000165677	ENSGT00940000156035	ENSGT01080000257489
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154394.b.a.a.b.b.c.b	ENSGT00940000164907.b.b.b.b	ENSGT00940000155151.a.a.b.a	ENSGT00940000164386.f	ENSGT00390000006922.d	ENSGT00930000151044.a	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.c	ENSGT00390000011500.f	ENSGT00900000141021.b.a.d.c	ENSGT00390000008371.b.c	ENSGT00930000151050.b	ENSGT00940000160451.b	ENSGT00940000154645.B.i.b	ENSGT00930000151016.y	ENSGT00390000001195.a.b.a	ENSGT00940000155567.w.a #22	ENSGT00940000155882.a.b.b.e	ENSGT00940000164626.b.b.c.a.f	ENSGT00940000155735.r.fb	ENSGT00420000029890.b	ENSGT00940000155845.t.a	ENSGT00940000159368.a.e	ENSGT00390000009869.b	ENSGT00940000158501.d.a.b	ENSGT00390000009566.e	ENSGT00550000074961.b.a	ENSGT00940000156430.b.a	ENSGT00940000155403.b.a	ENSGT00940000156133.a.b.a.b	ENSGT00940000156488.a.a.b	ENSGT00390000017134.c
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Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154394.b.a.a.b.b.c.a	ENSGT00940000164907.b.b.b.b	ENSGT00940000155151.a.a.b.a	ENSGT00940000164386.f	ENSGT00390000006922.d	ENSGT00930000151044.a	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.c	ENSGT00390000011500.f	ENSGT00900000141021.b.a.d.c	ENSGT00390000008371.b.c	ENSGT00930000151050.b	ENSGT00940000160451.b	ENSGT00940000163010.u.b	ENSGT00930000151016.y	ENSGT00390000001195.a.b.a	ENSGT00940000155567.w.a #22	ENSGT00940000155882.a.b.b.e	ENSGT00940000164626.b.b.c.a.f	ENSGT00940000155735.r.fb	ENSGT00420000029890.b	ENSGT00940000155845.t.a	ENSGT00940000159368.a.e	ENSGT00390000009869.b	ENSGT00940000158501.d.a.b	ENSGT00390000009566.e	ENSGT00550000074961.b.a	ENSGT00940000156430.b.a	ENSGT00940000155403.b.a	ENSGT00940000156133.a.b.a.b	ENSGT00940000156488.a.a.b	ENSGT00390000017134.c
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Cyprininae	DUPLICATION
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Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01070000253744.b.b.e.a.a.a	ENSGT00940000156085.s	ENSGT00940000154821.b.fb	ENSGT00940000156282.a.a.b	ENSGT00940000160420.f	ENSGT00940000156489.b	ENSGT00940000154886.a.a.e.a	ENSGT00390000015513.a.b.a.c	ENSGT00390000015513.a.a.b.b	ENSGT00940000153321.b.b.v.a	ENSGT00940000153424.a.b.c	ENSGT00390000001195.a.a.e	ENSGT00940000154969.b.d	ENSGT00940000161883	ENSGT00940000157861.m.b	ENSGT00940000155567.x.a #22	ENSGT00390000012762.v.a	ENSGT00940000155949.e	ENSGT00940000159752.j	ENSGT00940000158491.a.c	ENSGT00940000166263.g.a	ENSGT00940000164944.e	ENSGT00940000166272.b	ENSGT00940000157242.a.a.j	ENSGT01050000244898.b.b.e.a.a	ENSGT00940000165677.g.b	ENSGT00940000156035.w	ENSGT01080000257489.c.b	ENSGT01030000234997.i	ENSGT00940000161751.d.a.a	ENSGT00940000161751.d.b.b.b
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Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	53	ENSGT00390000000113.B.g	ENSGT01070000253744.b.b.e.a.a.b	ENSGT00940000156085.t	ENSGT00940000154821.b.gb	ENSGT00940000156282.a.a.a	ENSGT00940000160420.e	ENSGT00940000156489.a	ENSGT00940000154886.a.a.e.b	ENSGT00390000015513.a.b.a.d	ENSGT00390000015513.a.a.b.a	ENSGT00940000153321.b.b.v.b	ENSGT00940000153424.a.b.d	ENSGT00390000001195.a.a.f	ENSGT00940000154969.b.c	ENSGT00940000157861.m.a	ENSGT00940000155567.x.b #22	ENSGT00390000012762.v.b	ENSGT00940000155949.f	ENSGT00940000166675	ENSGT00940000153352.A	ENSGT00940000158491.a.d	ENSGT00940000166263.g.b	ENSGT00940000164944.f	ENSGT00940000166272.a	ENSGT00530000067979.d	ENSGT00940000157242.a.a.i	ENSGT01050000244898.b.b.e.a.b	ENSGT00940000165677.g.a	ENSGT00940000156035.x	ENSGT01080000257489.c.a	ENSGT01030000234997.j
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Golden-line barbel	MODERN SPECIES	781													ENSSGRG00000032065	DSCAM (ENSSGRG00000032072)	ENSSGRG00000032391	DAB2 (ENSSGRG00000032393) #22	ENSSGRG00000032395
Goldfish	MODERN SPECIES	23	ENSCARG00000018903	NPFFR2 (ENSCARG00000018894)	adamts3 (ENSCARG00000015706)	smarca2 (ENSCARG00000015308)	dmrt2a (ENSCARG00000015272)	dmrt3a (ENSCARG00000015270)	dmrt1 (ENSCARG00000015111)	ENSCARG00000015018	fbp1a (ENSCARG00000014995)	fbp2 (ENSCARG00000014970)	ctsla (ENSCARG00000014920)	dapk1 (ENSCARG00000014658)	gas1a (ENSCARG00000014625)	tars1 (ENSCARG00000009832)	TMEM8B (ENSCARG00000009588)	DAB2 (ENSCARG00000009548) #22	ENSCARG00000009493	mccc2 (ENSCARG00000009178)	hspb11 (ENSCARG00000009149)	smn1 (ENSCARG00000009135)	rtkna (ENSCARG00000008184)	ENSCARG00000008119	rhobtb4 (ENSCARG00000008033)	wdr54 (ENSCARG00000008008)	ENSCARG00000008005	aqp3a (ENSCARG00000007992)	mob1ba (ENSCARG00000007963)	grsf1 (ENSCARG00000007955)	rufy3 (ENSCARG00000007893)	ENSCARG00000007870	cxcl11.1 (ENSCARG00000007862)
Zebrafish	DUPLICATION
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Zebrafish	MODERN SPECIES	20	smarca2 (ENSDARG00000008904)	dmrt2a (ENSDARG00000015072)	dmrt3a (ENSDARG00000035290)	dmrt1 (ENSDARG00000007349)	ENSDARG00000060102	fbp1a (ENSDARG00000021366)	fbp2 (ENSDARG00000012366)	ctsla (ENSDARG00000007836)	dapk1 (ENSDARG00000060093)	gas1a (ENSDARG00000077298)	tars1 (ENSDARG00000013250)	ENSDARG00000094268	ENSDARG00000094625	TMEM8B (ENSDARG00000075126)	zgc:112966 (ENSDARG00000095369)	DAB2 (ENSDARG00000053091) #22	ENSDARG00000102375	mccc2 (ENSDARG00000017571)	hspb11 (ENSDARG00000067777)	smn1 (ENSDARG00000018494)	nos2a (ENSDARG00000026925)	rtkna (ENSDARG00000031345)	ENSDARG00000032482	rhobtb4 (ENSDARG00000016868)	wdr54 (ENSDARG00000010248)	ENSDARG00000103167	aqp3a (ENSDARG00000003808)	mob1ba (ENSDARG00000009169)	grsf1 (ENSDARG00000053021)	rufy3 (ENSDARG00000029692)	cxcl20 (ENSDARG00000075163)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	53													ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000171993	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00940000157242.a.b	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00950000183197.b.a.b	ENSGT00670000099470	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.tb	ENSGT00730000110872.a.sb
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00940000157242.a.b	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00950000183197.b.a.b	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.tb	ENSGT00730000110872.a.sb	ENSGT00940000167247	ENSGT00940000156399
Cod	MODERN SPECIES	17	ankra2 (ENSGMOG00000000317)	btf3 (ENSGMOG00000000326)	foxd1 (ENSGMOG00000000330)	TMEM174 (ENSGMOG00000023180)	fcho2 (ENSGMOG00000000337)	TNPO1 (ENSGMOG00000000347)	mob1bb (ENSGMOG00000008133)	DCK (ENSGMOG00000008130)	SLC4A4 (ENSGMOG00000008121)	NPFFR2 (ENSGMOG00000008118)	ENSGMOG00000008117	ENSGMOG00000030708	ENSGMOG00000025772	ENSGMOG00000008106	ENSGMOG00000008102 #23	ENSGMOG00000008092 #22	ENSGMOG00000029973	ENSGMOG00000008082	arid6 (ENSGMOG00000026215)	ENSGMOG00000022806	ENSGMOG00000032812	ENSGMOG00000027430	ENSGMOG00000001879	ENSGMOG00000028072	aqp3b (ENSGMOG00000008057)	ENSGMOG00000016604	tnfrsfa (ENSGMOG00000032599)	trappc13 (ENSGMOG00000017820)	sgtb (ENSGMOG00000017840)	nln (ENSGMOG00000017855)	ENSGMOG00000033108
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00940000157242.a.b	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00950000183197.b.a.b	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.tb	ENSGT00730000110872.a.sb	ENSGT00940000167247	ENSGT00940000156399
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00940000157242.a.b	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00950000183197.b.a.b	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.tb	ENSGT00730000110872.a.sb	ENSGT00940000167247	ENSGT00940000156399
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	414	ENSHCOG00000003147	ENSHCOG00000003137	si:ch73-234b20.5 (ENSHCOG00000003113)	hnrnpd (ENSHCOG00000000087)	enoph1 (ENSHCOG00000002977)	sec31a (ENSHCOG00000002960)	lin54 (ENSHCOG00000002894)	cops4 (ENSHCOG00000002860)	plac8.1 (ENSHCOG00000002835)	ADAMTS6 (ENSHCOG00000002822)	cwc27 (ENSHCOG00000002796)	ppwd1 (ENSHCOG00000002786)	trim23 (ENSHCOG00000002759)	fbp1b (ENSHCOG00000002735)	c9 (ENSHCOG00000002725) #23	dab2 (ENSHCOG00000002714) #22	PIP5KL1 (ENSHCOG00000002692)	sh3glb2b (ENSHCOG00000002670)	zer1 (ENSHCOG00000002632)	TBC1D13 (ENSHCOG00000002617)	thnsl2 (ENSHCOG00000002586)	DQX1 (ENSHCOG00000002562)	ENSHCOG00000002550	ENSHCOG00000002545	SPR (ENSHCOG00000002537)	slc1a3b (ENSHCOG00000002533)	nadk2 (ENSHCOG00000002523)	skp2 (ENSHCOG00000002516)	fpgs (ENSHCOG00000002500)	cdk9 (ENSHCOG00000002494)	ENSHCOG00000002484
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00940000157242.a.b	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00950000183197.b.a.b	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.tb	ENSGT00730000110872.a.sb	ENSGT00940000167247	ENSGT00940000156399
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00940000157242.a.b	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00950000183197.b.a.b	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.tb	ENSGT00730000110872.a.sb	ENSGT00940000167247	ENSGT00940000156399
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00940000157242.a.b	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00950000183197.b.a.b	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.tb	ENSGT00730000110872.a.sb	ENSGT00940000167247	ENSGT00940000156399
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00940000157242.a.b	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00950000183197.b.a.b	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.tb	ENSGT00730000110872.a.sb	ENSGT00940000167247	ENSGT00940000156399
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00940000157242.a.b	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00950000183197.b.a.b	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.tb	ENSGT00730000110872.a.sb	ENSGT00940000167247	ENSGT00940000156399
Barramundi perch	DUPLICATION
Barramundi perch	MODERN SPECIES	43	B3GNT3 (ENSLCAG00010005846)	ENSLCAG00010005845	ndufa7 (ENSLCAG00010005835)	MAST3 (ENSLCAG00010005828)	ENSLCAG00010005814	klhl26 (ENSLCAG00010005810)	CRTC1 (ENSLCAG00010005796)	comp (ENSLCAG00010005363)	tmem38a (ENSLCAG00010005277)	smim7 (ENSLCAG00010005272)	ENSLCAG00010005270	ENSLCAG00010005263	MED26 (ENSLCAG00010005259)	slc35e1 (ENSLCAG00010005253)	ENSLCAG00010005248	ENSLCAG00010005247 #22	ENSLCAG00010005243	ENSLCAG00010005240	ENSLCAG00010005233	ENSLCAG00010005227	foxg1a (ENSLCAG00010005224)	PRKD1 (ENSLCAG00010005162)	ENSLCAG00010005141	ENSLCAG00010005136	eapp (ENSLCAG00010005134)	sptssa (ENSLCAG00010005131)	egln3 (ENSLCAG00010005126)	ENSLCAG00010005121	ENSLCAG00010005118	ENSLCAG00010005098	ENSLCAG00010005088
Barramundi perch	MODERN SPECIES	469																ENSLCAG00010010164 #22	ENSLCAG00010010160 ##24	pex11g (ENSLCAG00010010158)	APBA3 (ENSLCAG00010010156)	ENSLCAG00010010103	r3hdm4 (ENSLCAG00010010085)	ENSLCAG00010010081	ENSLCAG00010010075	ENSLCAG00010010068	ndufs7 (ENSLCAG00010010059)	gamt (ENSLCAG00010010052)	dazap1 (ENSLCAG00010009993)	dpp9 (ENSLCAG00010009600)	ENSLCAG00010009489	kank3 (ENSLCAG00010009480)	ENSLCAG00010009457
Barramundi perch	MODERN SPECIES		ankra2 (ENSLCAG00010021015)	btf3 (ENSLCAG00010021025)	foxd1 (ENSLCAG00010021037)	TMEM174 (ENSLCAG00010021040)	fcho2 (ENSLCAG00010021128)	TNPO1 (ENSLCAG00010021272)	mob1bb (ENSLCAG00010021563)	dck (ENSLCAG00010021576)	SLC4A4 (ENSLCAG00010021674)	NPFFR2 (ENSLCAG00010022165)	ENSLCAG00010022172	ENSLCAG00010022179	fbp1b (ENSLCAG00010022190)	gas1b (ENSLCAG00010022199)	c9 (ENSLCAG00010022204) #23	dab2 (ENSLCAG00010022206) #22	ENSLCAG00010022211	rtknb (ENSLCAG00010022215)	PAN2 (ENSLCAG00010022228)	ENSLCAG00010022243	ormdl2 (ENSLCAG00010022248)	nemp1 (ENSLCAG00010022257)	cd63 (ENSLCAG00010022267)	letmd1 (ENSLCAG00010022279)	ENSLCAG00010022292	nr4a1 (ENSLCAG00010022294)	tamalin (ENSLCAG00010022298)	dgkaa (ENSLCAG00010022486)	rnf41 (ENSLCAG00010022965)	ankrd52a (ENSLCAG00010023015)	COQ10A (ENSLCAG00010023064)
Seriola	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000166579	ENSGT00940000159134.r.b	ENSGT00940000164521.e	ENSGT00940000165170	ENSGT00390000006553	ENSGT00940000157166.c	ENSGT00940000169112	ENSGT00940000159238	ENSGT00390000010652.D.a.a	ENSGT00940000166148	ENSGT00390000018845.f	ENSGT00390000014626	ENSGT00390000000259.k.b	ENSGT00940000159007	ENSGT01050000244902.a.a.a.b	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00530000063460.B ##24	ENSGT00390000000427	ENSGT00940000160384	ENSGT00940000161439	ENSGT00390000015467	ENSGT00940000160899	ENSGT01040000240503.A.a.b	ENSGT00390000002390.a	ENSGT00390000006565.b	ENSGT00390000018061	ENSGT00940000156757	ENSGT00940000158174.a	ENSGT00940000159478.f	ENSGT00940000154886.a.a	ENSGT00390000013481.c.b.b.c
Yellowtail amberjack	DUPLICATION
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3129	slc5a5 (ENSSLDG00000025146)	ENSSLDG00000025156	B3GNT3 (ENSSLDG00000025162)	ENSSLDG00000025164	ENSSLDG00000025167	ndufa7 (ENSSLDG00000025173)	MAST3 (ENSSLDG00000025177)	klhl26 (ENSSLDG00000025185)	CRTC1 (ENSSLDG00000025191)	comp (ENSSLDG00000025202)	tmem38a (ENSSLDG00000025217)	smim7 (ENSSLDG00000025224)	MED26 (ENSSLDG00000025229)	slc35e1 (ENSSLDG00000025232)	ENSSLDG00000025239	ENSSLDG00000025254 #22	ENSSLDG00000025255 ##24	pex11g (ENSSLDG00000025259)	APBA3 (ENSSLDG00000025261)	ENSSLDG00000025270	r3hdm4 (ENSSLDG00000025328)	ENSSLDG00000025330	ENSSLDG00000025333	ENSSLDG00000025336	ndufs7 (ENSSLDG00000025337)	gamt (ENSSLDG00000025338)	dazap1 (ENSSLDG00000025339)	dpp9 (ENSSLDG00000025341)	ENSSLDG00000025347
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3042	egfl7 (ENSSLDG00000015176)	agpat2 (ENSSLDG00000015225)	FNBP1 (ENSSLDG00000015269)	COL5A1 (ENSSLDG00000015379)	olfm1a (ENSSLDG00000015461)	mrps2 (ENSSLDG00000015489)	mob1bb (ENSSLDG00000015512)	dck (ENSSLDG00000015520)	SLC4A4 (ENSSLDG00000015570)	NPFFR2 (ENSSLDG00000015760)	ENSSLDG00000015787	ENSSLDG00000015805	fbp1b (ENSSLDG00000015834)	gas1b (ENSSLDG00000015854)	c9 (ENSSLDG00000015864) #23	dab2 (ENSSLDG00000015916) #22	hnrnpd (ENSSLDG00000015962)	si:ch73-234b20.5 (ENSSLDG00000015994)	mat2al (ENSSLDG00000016008)	ahr2 (ENSSLDG00000016033)	ZSWIM6 (ENSSLDG00000016063)	pik3r1 (ENSSLDG00000016135)	ENSSLDG00000016213	ENSSLDG00000016285	erbin (ENSSLDG00000016321)	nln (ENSSLDG00000016400)	sgtb (ENSSLDG00000016416)	trappc13 (ENSSLDG00000016461)	ENSSLDG00000016520	tnfrsfa (ENSSLDG00000016532)
Greater amberjack	DUPLICATION
Greater amberjack	MODERN SPECIES		B3GNT3 (ENSSDUG00000008024)	ENSSDUG00000008031	ENSSDUG00000008037	ndufa7 (ENSSDUG00000008053)	MAST3 (ENSSDUG00000008058)	ENSSDUG00000008068	ENSSDUG00000008086	klhl26 (ENSSDUG00000008115)	CRTC1 (ENSSDUG00000008132)	comp (ENSSDUG00000008144)	tmem38a (ENSSDUG00000008193)	smim7 (ENSSDUG00000008230)	MED26 (ENSSDUG00000008231)	slc35e1 (ENSSDUG00000008236)	ENSSDUG00000008250	ENSSDUG00000008285 #22	ENSSDUG00000008295 ##24	pex11g (ENSSDUG00000008318)	APBA3 (ENSSDUG00000008330)	ENSSDUG00000008368	r3hdm4 (ENSSDUG00000008488)	ENSSDUG00000008498	ENSSDUG00000008517	ENSSDUG00000008551	ndufs7 (ENSSDUG00000008562)	gamt (ENSSDUG00000008591)	dazap1 (ENSSDUG00000008609)	dpp9 (ENSSDUG00000008662)	ENSSDUG00000008717	kank3 (ENSSDUG00000008728)	ENSSDUG00000008756
Greater amberjack	MODERN SPECIES	357										NPFFR2 (ENSSDUG00000002250)	ENSSDUG00000002319	ENSSDUG00000002328	fbp1b (ENSSDUG00000002339)	gas1b (ENSSDUG00000002361)	c9 (ENSSDUG00000002372) #23	dab2 (ENSSDUG00000002415) #22
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000155831.cb	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT01040000244713	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000181170	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00940000157242.a.b	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00950000183197.b.a.b	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.tb	ENSGT00730000110872.a.sb	ENSGT00940000167247
Turbot	MODERN SPECIES	7	rpz6 (ENSSMAG00000035282)	rpz5 (ENSSMAG00000012752)	rpz4 (ENSSMAG00000012747)	ENSSMAG00000012741	ENSSMAG00000012727	ENSSMAG00000012624	ENSSMAG00000012614	DCK (ENSSMAG00000012596)	ENSSMAG00000012477	NPFFR2 (ENSSMAG00000012462)	ENSSMAG00000012451	ENSSMAG00000030823	ENSSMAG00000012328	gas1b (ENSSMAG00000012318)	ENSSMAG00000012284 #23	dab2 (ENSSMAG00000012179) #22	ENSSMAG00000012116	ENSSMAG00000012094	ENSSMAG00000012072	unc5da (ENSSMAG00000011998)	ENSSMAG00000011980	ENSSMAG00000011974	trappc13 (ENSSMAG00000011945)	sgtb (ENSSMAG00000011927)	nln (ENSSMAG00000011874)	erbin (ENSSMAG00000011831)	SREK1 (ENSSMAG00000011808)	ENSSMAG00000022871	ENSSMAG00000033485	MAST4 (ENSSMAG00000011729)	PIK3R1 (ENSSMAG00000011646)
Tongue sole	DUPLICATION
Tongue sole	MODERN SPECIES	11	klhl26 (ENSCSEG00000018611)	ENSCSEG00000018603	MAST3 (ENSCSEG00000018539)	ndufa7 (ENSCSEG00000018529)	ENSCSEG00000018524	ENSCSEG00000018520	ENSCSEG00000018518	ENSCSEG00000018514	B3GNT3 (ENSCSEG00000018484)	ENSCSEG00000018459	slc5a5 (ENSCSEG00000018396)	cluap1 (ENSCSEG00000018376)	ENSCSEG00000018373	slc35e1 (ENSCSEG00000018350)	ENSCSEG00000018327	ENSCSEG00000018319 #22	ENSCSEG00000018315	pex11g (ENSCSEG00000018312)	APBA3 (ENSCSEG00000018302)	ABCA7 (ENSCSEG00000018225)	r3hdm4 (ENSCSEG00000018211)	ENSCSEG00000018194	ENSCSEG00000018184	ndufs7 (ENSCSEG00000018178)	gamt (ENSCSEG00000018172)	dazap1 (ENSCSEG00000018162)	dpp9 (ENSCSEG00000018127)	ANGPTL4 (ENSCSEG00000018112)	ENSCSEG00000018091	angptl3 (ENSCSEG00000018084)	ENSCSEG00000018001
Tongue sole	MODERN SPECIES	5	bhmt (ENSCSEG00000013233)	DMGDH (ENSCSEG00000013250)	ARSB (ENSCSEG00000013290)	ARSB (ENSCSEG00000013306)	ARSB (ENSCSEG00000013315)	ARSB (ENSCSEG00000013331)	lhfpl2a (ENSCSEG00000013349)	scamp1 (ENSCSEG00000013358)	AP3B1 (ENSCSEG00000013388)	tbca (ENSCSEG00000013428)	otpa (ENSCSEG00000013434)	wdr41 (ENSCSEG00000013442)	PDE8B (ENSCSEG00000013472)	crhbp (ENSCSEG00000013525)	ENSCSEG00000013544 #23	dab2 (ENSCSEG00000013563) #22	ENSCSEG00000013623	ENSCSEG00000013677	aqp3b (ENSCSEG00000013694)	unc5da (ENSCSEG00000013713)	tnfrsfa (ENSCSEG00000013782)	trappc13 (ENSCSEG00000013793)	sgtb (ENSCSEG00000013826)	pik3r1 (ENSCSEG00000013846)	MAST4 (ENSCSEG00000013887)	ENSCSEG00000013895	ENSCSEG00000013906	ENSCSEG00000013913	ENSCSEG00000013925	ENSCSEG00000013934	erbin (ENSCSEG00000013960)
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.tb	ENSGT00730000110872.a.sb	ENSGT00940000167247	ENSGT00940000156399	ENSGT00940000155553.e.a	ENSGT00940000155188.B.a
Zig-zag eel	DUPLICATION
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Siamese fighting fish	DUPLICATION
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Tetraodon	MODERN SPECIES	19	tnfrsfa (ENSTNIG00000000226)	unc5da (ENSTNIG00000013458)	ENSTNIG00000013457	rtknb (ENSTNIG00000013456)	zgc:162472 (ENSTNIG00000013455)	dipk1b (ENSTNIG00000013454)	ttll11 (ENSTNIG00000013453)	dab2ipb (ENSTNIG00000013452)	zgc:63972 (ENSTNIG00000013451)	fibcd1b (ENSTNIG00000013450)	ENSTNIG00000013449	ENSTNIG00000001408	fbp1b (ENSTNIG00000013448)	gas1b (ENSTNIG00000013447)	c9 (ENSTNIG00000013446) #23	dab2 (ENSTNIG00000013445) #22	mrps2 (ENSTNIG00000013444)	COL5A1 (ENSTNIG00000013443)	FNBP1 (ENSTNIG00000013442)	egfl7 (ENSTNIG00000013441)	tor1 (ENSTNIG00000013440)	nsa2 (ENSTNIG00000013439)	gfm2 (ENSTNIG00000013438)	hexb (ENSTNIG00000013437)	ENSTNIG00000013436	ankra2 (ENSTNIG00000013435)	btf3 (ENSTNIG00000013434)	foxd1 (ENSTNIG00000013433)	fcho2 (ENSTNIG00000006689)	TNPO1 (ENSTNIG00000007483)	mob1bb (ENSTNIG00000007484)
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Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00940000157242.a.b	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00950000183197.b.a.b	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.sb	ENSGT00940000167247	ENSGT00940000156399	ENSGT00940000155553.e.a
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT01040000244713	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00940000157242.a.b	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00950000183197.b.a.b	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.sb	ENSGT00940000167247	ENSGT00940000156399	ENSGT00940000155553.e.a
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00950000182983.B.a.b.e	ENSGT00940000155831.cb	ENSGT00940000159526	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000158321	ENSGT00390000015280	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00940000157242.a.b	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00950000183197.b.a.b	ENSGT00940000155389	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157156
Stickleback	MODERN SPECIES	13	gfm2 (ENSGACG00000015889)	hexb (ENSGACG00000015887)	ENC1 (ENSGACG00000015886)	erbin (ENSGACG00000015884)	nln (ENSGACG00000015881)	sgtb (ENSGACG00000015874)	trappc13 (ENSGACG00000015870)	mob1bb (ENSGACG00000015867)	dck (ENSGACG00000015866)	SLC4A4 (ENSGACG00000015864)	NPFFR2 (ENSGACG00000015862)	ENSGACG00000015860	ENSGACG00000015859	fbp1b (ENSGACG00000015857)	c9 (ENSGACG00000015856) #23	dab2 (ENSGACG00000015854) #22	zgc:162472 (ENSGACG00000015852)	ENSGACG00000015851	ENSGACG00000015849	ENSGACG00000015848	RTKN (ENSGACG00000015847)	ENSGACG00000015846	unc5da (ENSGACG00000015844)	tnfrsfa (ENSGACG00000015843)	CYB561A3 (ENSGACG00000015842)	TNPO1 (ENSGACG00000015841)	fcho2 (ENSGACG00000015839)	ENSGACG00000015837	foxd1 (ENSGACG00000015836)	btf3 (ENSGACG00000015834)	ankra2 (ENSGACG00000015828)
Lumpfish	MODERN SPECIES	3	ENSCLMG00005013937	ENC1 (ENSCLMG00005013939)	ARHGEF28 (ENSCLMG00005013941)	nln (ENSCLMG00005013946)	sgtb (ENSCLMG00005014432)	trappc13 (ENSCLMG00005014437)	mob1bb (ENSCLMG00005014457)	dck (ENSCLMG00005014459)	SLC4A4 (ENSCLMG00005014467)	NPFFR2 (ENSCLMG00005015541)	ENSCLMG00005015542	ENSCLMG00005015547	fbp1b (ENSCLMG00005015558)	gas1b (ENSCLMG00005015560)	ENSCLMG00005015561 #23	dab2 (ENSCLMG00005015621) #22	ENSCLMG00005015622	zgc:162472 (ENSCLMG00005015624)	HIP1R (ENSCLMG00005015629)	ENSCLMG00005015636	denr (ENSCLMG00005015637)	ENSCLMG00005015641	ENSCLMG00005015642	bcl7a (ENSCLMG00005015649)	eif2b1 (ENSCLMG00005015650)	ddx55 (ENSCLMG00005015676)	tmed2 (ENSCLMG00005015692)	ptpn11a (ENSCLMG00005015696)	ENSCLMG00005016284	ENSCLMG00005016286	pla2g3 (ENSCLMG00005016287)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT01040000244713	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00940000157242.a.b	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00950000183197.b.a.b	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.sb	ENSGT00940000167247	ENSGT00940000156399	ENSGT00940000155553.e.a
Pike perch	DUPLICATION
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Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00940000157242.a.b	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00950000183197.b.a.b	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.sb	ENSGT00940000167247	ENSGT00940000156399	ENSGT00940000155553.e.a
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00940000157242.a.b	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00950000183197.b.a.b	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.sb	ENSGT00940000167247	ENSGT00940000156399	ENSGT00940000155553.e.a
Large yellow croaker	DUPLICATION
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European seabass	DUPLICATION
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Gilthead seabream	DUPLICATION
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Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	13	ENSLBEG00000002520	B3GNT3 (ENSLBEG00000002505)	ENSLBEG00000002494	ENSLBEG00000002476	ndufa7 (ENSLBEG00000002461)	MAST3 (ENSLBEG00000002380)	ENSLBEG00000002352	klhl26 (ENSLBEG00000002337)	CRTC1 (ENSLBEG00000002299)	comp (ENSLBEG00000002042)	tmem38a (ENSLBEG00000001973)	smim7 (ENSLBEG00000001934)	MED26 (ENSLBEG00000001906)	slc35e1 (ENSLBEG00000001865)	ENSLBEG00000001119	ENSLBEG00000001023 #22	pex11g (ENSLBEG00000001015)	APBA3 (ENSLBEG00000000999)	ENSLBEG00000000748	r3hdm4 (ENSLBEG00000000730)	ENSLBEG00000000686	ENSLBEG00000000637	ENSLBEG00000000628	ndufs7 (ENSLBEG00000000621)	gamt (ENSLBEG00000000587)	dazap1 (ENSLBEG00000000569)	dpp9 (ENSLBEG00000000450)	ANGPTL4 (ENSLBEG00000000358)	kank3 (ENSLBEG00000000346)	ENSLBEG00000000265	ENSLBEG00000000224
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	563									ENSLBEG00000017062	ENSLBEG00000016989	ENSLBEG00000016966	ENSLBEG00000016939	fbp1b (ENSLBEG00000016889)	gas1b (ENSLBEG00000016864)	c9 (ENSLBEG00000016836) #23	dab2 (ENSLBEG00000016811) #22	zgc:162472 (ENSLBEG00000016770)	ENSLBEG00000016740	arid6 (ENSLBEG00000016717)	aqp3b (ENSLBEG00000016690)
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00940000157242.a.b	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00950000183197.b.a.b	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.tb	ENSGT00730000110872.a.sb	ENSGT00940000167247	ENSGT00940000156399
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00950000183197.b.a.b	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.tb	ENSGT00730000110872.a.sb	ENSGT00940000167247	ENSGT00940000156399	ENSGT00940000155553.e.a
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.tb	ENSGT00730000110872.a.sb	ENSGT00940000167247	ENSGT00940000156399	ENSGT00940000155553.e.a	ENSGT00940000155188.B.a
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157156.o	ENSGT00940000153288.a.b.b.a	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.tb	ENSGT00940000156399	ENSGT00940000155553.e.a	ENSGT00940000155188.B.a	ENSGT00940000156621.e.b	ENSGT00940000156980.a
Mangrove rivulus	DUPLICATION
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Turquoise killifish	DUPLICATION
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Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000153288.a.b.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000163467.a.a.b.f.a.b.b	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00940000168653.b	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.tb	ENSGT00730000110872.a.sb	ENSGT00940000167247	ENSGT00940000155535.qb.b	ENSGT00940000156399
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Mummichog	DUPLICATION
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Javanese ricefish	DUPLICATION
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Midas cichlid	DUPLICATION
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Nile tilapia	DUPLICATION
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Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.a.b.a.b	ENSGT00940000153288.a.b.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.tb	ENSGT00730000110872.a.sb	ENSGT00940000167247	ENSGT00940000156399	ENSGT00940000155553.e.a	ENSGT00940000155188.B.a
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Burton s mouthbrooder	DUPLICATION
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Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	380						TNPO1 (ENSHBUG00000008068)	mob1bb (ENSHBUG00000007993)	dck (ENSHBUG00000007962)	SLC4A4 (ENSHBUG00000007927)	NPFFR2 (ENSHBUG00000007717)	ENSHBUG00000007632	ENSHBUG00000007615	fbp1b (ENSHBUG00000007589)	gas1b (ENSHBUG00000007555)	c9 (ENSHBUG00000007545) #23	dab2 (ENSHBUG00000007523) #22	ENSHBUG00000007511	ENSHBUG00000007484	arid6 (ENSHBUG00000007457)	unc5da (ENSHBUG00000007420)	tnfrsfa (ENSHBUG00000007366)	trappc13 (ENSHBUG00000007340)	sgtb (ENSHBUG00000007279)	nln (ENSHBUG00000007267)	erbin (ENSHBUG00000007199)	ENSHBUG00000007082	srek1 (ENSHBUG00000007057)	ENSHBUG00000007026	ENSHBUG00000006976	ENSHBUG00000006963	ENSHBUG00000006912
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P. nyererei	DUPLICATION
P. nyererei	MODERN SPECIES	331	ENSPNYG00000019188	ENSPNYG00000018966	B3GNT3 (ENSPNYG00000018917)	B3GNT3 (ENSPNYG00000018910)	ENSPNYG00000018895	ndufa7 (ENSPNYG00000018885)	MAST3 (ENSPNYG00000018811)	ENSPNYG00000018762	klhl26 (ENSPNYG00000018747)	ENSPNYG00000018734	comp (ENSPNYG00000018718)	tmem38a (ENSPNYG00000018695)	MED26 (ENSPNYG00000018687)	slc35e1 (ENSPNYG00000018668)	ENSPNYG00000018514	ENSPNYG00000018476 #22	ENSPNYG00000018462	ENSPNYG00000018444	APBA3 (ENSPNYG00000018436)	ABCA7 (ENSPNYG00000017647)	r3hdm4 (ENSPNYG00000017489)	ENSPNYG00000017435	ndufs7 (ENSPNYG00000017396)	gamt (ENSPNYG00000017366)	dazap1 (ENSPNYG00000017318)	dpp9 (ENSPNYG00000017246)	kank3 (ENSPNYG00000017230)	PIK3R2 (ENSPNYG00000017179)	ENSPNYG00000017142	ENSPNYG00000017124	ENSPNYG00000017013
P. nyererei	MODERN SPECIES	297	ENSPNYG00000001882	ankra2 (ENSPNYG00000001843)	btf3 (ENSPNYG00000001828)	foxd1 (ENSPNYG00000001818)	fcho2 (ENSPNYG00000001628)	TNPO1 (ENSPNYG00000001522)	mob1bb (ENSPNYG00000001509)	dck (ENSPNYG00000001253)	SLC4A4 (ENSPNYG00000001164)	NPFFR2 (ENSPNYG00000001069)	ENSPNYG00000000984	ENSPNYG00000000952	fbp1b (ENSPNYG00000000923)	gas1b (ENSPNYG00000000902)	c9 (ENSPNYG00000000896) #23	dab2 (ENSPNYG00000000886) #22	ENSPNYG00000000877	ENSPNYG00000000839	arid6 (ENSPNYG00000000826)	unc5da (ENSPNYG00000000772)	tnfrsfa (ENSPNYG00000000765)	trappc13 (ENSPNYG00000000720)	sgtb (ENSPNYG00000000689)	nln (ENSPNYG00000000653)	erbin (ENSPNYG00000007226)	ENSPNYG00000007178	srek1 (ENSPNYG00000007160)	ENSPNYG00000007150	ENSPNYG00000007101	MAST4 (ENSPNYG00000007081)	pik3r1 (ENSPNYG00000007028)
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Eastern happy	DUPLICATION
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Zebra mbuna	DUPLICATION
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Lyretail cichlid	DUPLICATION
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	312	ENSNBRG00000003213	B3GNT3 (ENSNBRG00000003524)	ENSNBRG00000003549	ndufa7 (ENSNBRG00000003568)	MAST3 (ENSNBRG00000003586)	ENSNBRG00000003667	ENSNBRG00000003684	klhl26 (ENSNBRG00000003726)	CRTC1 (ENSNBRG00000003737)	comp (ENSNBRG00000003785)	tmem38a (ENSNBRG00000003849)	smim7 (ENSNBRG00000003893)	MED26 (ENSNBRG00000003916)	slc35e1 (ENSNBRG00000003930)	ENSNBRG00000003963	ENSNBRG00000004112 #22	ENSNBRG00000004128	pex11g (ENSNBRG00000004138)	APBA3 (ENSNBRG00000004151)	ABCA7 (ENSNBRG00000004223)	r3hdm4 (ENSNBRG00000004438)	ENSNBRG00000004449	ENSNBRG00000004465	ENSNBRG00000004487	ENSNBRG00000004514	ndufs7 (ENSNBRG00000004562)	gamt (ENSNBRG00000004579)	dazap1 (ENSNBRG00000004605)	dpp9 (ENSNBRG00000004649)	ENSNBRG00000004818
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Bicolor damselfish	DUPLICATION
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	393	ENSSPAG00000004024	B3GNT3 (ENSSPAG00000004003)	ENSSPAG00000003997	ndufa7 (ENSSPAG00000003986)	MAST3 (ENSSPAG00000003526)	ENSSPAG00000003470	klhl26 (ENSSPAG00000003451)	ENSSPAG00000003444	CRTC1 (ENSSPAG00000003400)	comp (ENSSPAG00000003332)	tmem38a (ENSSPAG00000003321)	smim7 (ENSSPAG00000003311)	MED26 (ENSSPAG00000003302)	slc35e1 (ENSSPAG00000003274)	ENSSPAG00000003260	ENSSPAG00000003255 #22	ENSSPAG00000003242	pex11g (ENSSPAG00000003220)	APBA3 (ENSSPAG00000003169)	ABCA7 (ENSSPAG00000002631)	r3hdm4 (ENSSPAG00000002562)	ENSSPAG00000002527	ENSSPAG00000002509	ENSSPAG00000002503	ndufs7 (ENSSPAG00000002496)	gamt (ENSSPAG00000002470)	dazap1 (ENSSPAG00000002402)	dpp9 (ENSSPAG00000002342)	ANGPTL4 (ENSSPAG00000002327)	ENSSPAG00000002318	kank3 (ENSSPAG00000002295)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	302	ankra2 (ENSSPAG00000000508)	btf3 (ENSSPAG00000000473)	foxd1 (ENSSPAG00000000463)	TMEM174 (ENSSPAG00000000453)	fcho2 (ENSSPAG00000000340)	TNPO1 (ENSSPAG00000000258)	mob1bb (ENSSPAG00000000247)	dck (ENSSPAG00000000235)	SLC4A4 (ENSSPAG00000000164)	NPFFR2 (ENSSPAG00000000138)	ENSSPAG00000022545	ENSSPAG00000022534	fbp1b (ENSSPAG00000022524)	gas1b (ENSSPAG00000022517)	c9 (ENSSPAG00000022506) #23	dab2 (ENSSPAG00000022490) #22	ENSSPAG00000022464	rtknb (ENSSPAG00000022450)	arid6 (ENSSPAG00000022443)	aqp3b (ENSSPAG00000022438)	unc5da (ENSSPAG00000022427)	tnfrsfa (ENSSPAG00000022412)	CYB561A3 (ENSSPAG00000022379)	trappc13 (ENSSPAG00000022361)	sgtb (ENSSPAG00000022347)	nln (ENSSPAG00000022332)	erbin (ENSSPAG00000022319)	ENSSPAG00000022310	srek1 (ENSSPAG00000022298)	ENSSPAG00000022284	ENSSPAG00000022283
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00940000157242.a.b	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00950000183197.b.a.b	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.tb	ENSGT00730000110872.a.sb.f	ENSGT00940000167247	ENSGT00940000156399
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157156	ENSGT00940000153288.b	ENSGT00940000157140.b.a.b.b	ENSGT00390000004161	ENSGT00940000157105	ENSGT00940000155389	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000157321	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000158491.b	ENSGT00940000163584.a	ENSGT00940000157242.a.b	ENSGT00950000182815.a.a.b.g	ENSGT00940000165531.b.b	ENSGT00950000183197.b.a.b	ENSGT00390000015280	ENSGT00940000158321	ENSGT00950000183171.A.b.a.a	ENSGT00940000159526	ENSGT00730000110872.a.tb	ENSGT00730000110872.a.sb.f	ENSGT00940000167247	ENSGT00940000156399
Clown anemonefish	DUPLICATION
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	2522											tmem38a (ENSAOCG00000007000)	smim7 (ENSAOCG00000006981)	MED26 (ENSAOCG00000006967)	slc35e1 (ENSAOCG00000006954)	ENSAOCG00000006922	ENSAOCG00000006892 #22	ENSAOCG00000006873	pex11g (ENSAOCG00000006857)	APBA3 (ENSAOCG00000006849)	ABCA7 (ENSAOCG00000006698)
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	587	ankra2 (ENSAOCG00000007921)	btf3 (ENSAOCG00000002477)	foxd1 (ENSAOCG00000007950)	TMEM174 (ENSAOCG00000007953)	fcho2 (ENSAOCG00000008050)	TNPO1 (ENSAOCG00000008154)	mob1bb (ENSAOCG00000008183)	dck (ENSAOCG00000008197)	SLC4A4 (ENSAOCG00000008279)	NPFFR2 (ENSAOCG00000008303)	ENSAOCG00000008313	ENSAOCG00000008324	fbp1b (ENSAOCG00000008349)	gas1b (ENSAOCG00000002385)	c9 (ENSAOCG00000008363) #23	dab2 (ENSAOCG00000008396) #22	ENSAOCG00000008426	rtknb (ENSAOCG00000008456)	arid6 (ENSAOCG00000000495)
Orange clownfish	DUPLICATION
Orange clownfish	MODERN SPECIES	11	ENSAPEG00000004334	B3GNT3 (ENSAPEG00000004424)	ENSAPEG00000004435	ndufa7 (ENSAPEG00000004457)	MAST3 (ENSAPEG00000004491)	ENSAPEG00000004599	klhl26 (ENSAPEG00000004647)	ENSAPEG00000004662	CRTC1 (ENSAPEG00000004686)	comp (ENSAPEG00000004739)	tmem38a (ENSAPEG00000004795)	smim7 (ENSAPEG00000004824)	MED26 (ENSAPEG00000004847)	slc35e1 (ENSAPEG00000004856)	ENSAPEG00000004882	ENSAPEG00000004951 #22	ENSAPEG00000004970	pex11g (ENSAPEG00000004987)	APBA3 (ENSAPEG00000004999)	ABCA7 (ENSAPEG00000005033)	r3hdm4 (ENSAPEG00000005089)	ARID3A (ENSAPEG00000005100)	ENSAPEG00000005166	ndufs7 (ENSAPEG00000005186)	gamt (ENSAPEG00000005240)	dazap1 (ENSAPEG00000005289)	dpp9 (ENSAPEG00000005322)	ANGPTL4 (ENSAPEG00000005393)	ENSAPEG00000005408	kank3 (ENSAPEG00000005457)	ENSAPEG00000005475
Orange clownfish	MODERN SPECIES	7	btf3 (ENSAPEG00000000915)	foxd1 (ENSAPEG00000000936)	ENSAPEG00000000952	TMEM174 (ENSAPEG00000000954)	fcho2 (ENSAPEG00000000982)	TNPO1 (ENSAPEG00000001112)	mob1bb (ENSAPEG00000001183)	dck (ENSAPEG00000001210)	SLC4A4 (ENSAPEG00000001234)	NPFFR2 (ENSAPEG00000001373)	ENSAPEG00000001459	ENSAPEG00000001466	fbp1b (ENSAPEG00000001478)	gas1b (ENSAPEG00000001511)	c9 (ENSAPEG00000001520) #23	dab2 (ENSAPEG00000001533) #22	ENSAPEG00000001544	rtknb (ENSAPEG00000001552)	arid6 (ENSAPEG00000001595)	aqp3b (ENSAPEG00000001661)	unc5da (ENSAPEG00000001741)	tnfrsfa (ENSAPEG00000001812)	ENSAPEG00000001853	trappc13 (ENSAPEG00000001893)	sgtb (ENSAPEG00000001969)	nln (ENSAPEG00000002016)	erbin (ENSAPEG00000002081)	ENSAPEG00000002218	ENSAPEG00000002239	ENSAPEG00000002262	ENSAPEG00000002277
Spiny chromis	DUPLICATION
Spiny chromis	MODERN SPECIES	134	ENSAPOG00000023824	pth2 (ENSAPOG00000023791)	dnal1 (ENSAPOG00000023774)	ENSAPOG00000023736	PALS1 (ENSAPOG00000023551)	ENSAPOG00000023351	ENSAPOG00000023310	klhl26 (ENSAPOG00000023285)	CRTC1 (ENSAPOG00000023262)	comp (ENSAPOG00000023189)	tmem38a (ENSAPOG00000023140)	smim7 (ENSAPOG00000023100)	MED26 (ENSAPOG00000023070)	slc35e1 (ENSAPOG00000023056)	ENSAPOG00000023029	ENSAPOG00000022999 #22	ENSAPOG00000022984 ##24	pex11g (ENSAPOG00000022944)	APBA3 (ENSAPOG00000022934)	ABCA7 (ENSAPOG00000022818)	r3hdm4 (ENSAPOG00000022081)	ARID3A (ENSAPOG00000022063)	ENSAPOG00000022053	ENSAPOG00000022041	ndufs7 (ENSAPOG00000022032)	gamt (ENSAPOG00000022019)	dazap1 (ENSAPOG00000021971)	dpp9 (ENSAPOG00000021934)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	109				fcho2 (ENSAPOG00000003579)	TNPO1 (ENSAPOG00000003453)	mob1bb (ENSAPOG00000003391)	dck (ENSAPOG00000003386)	SLC4A4 (ENSAPOG00000003350)	NPFFR2 (ENSAPOG00000003236)	ENSAPOG00000003210	ENSAPOG00000003198	ENSAPOG00000003181	fbp1b (ENSAPOG00000003160)	gas1b (ENSAPOG00000003119)	c9 (ENSAPOG00000003104) #23	dab2 (ENSAPOG00000003052) #22	ENSAPOG00000003020	rtknb (ENSAPOG00000002957)	ENSAPOG00000002930	aqp3b (ENSAPOG00000002912)	unc5da (ENSAPOG00000002879)	tnfrsfa (ENSAPOG00000002817)	ENSAPOG00000024173	trappc13 (ENSAPOG00000024099)	sgtb (ENSAPOG00000024028)	nln (ENSAPOG00000023943)	erbin (ENSAPOG00000023809)	srek1 (ENSAPOG00000023618)
Pinecone sodierfish	DUPLICATION
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Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	3	ankra2 (ENSMMDG00005021427)	btf3 (ENSMMDG00005021420)	foxd1 (ENSMMDG00005021419)	fcho2 (ENSMMDG00005021184)	TNPO1 (ENSMMDG00005020843)	mob1bb (ENSMMDG00005020817)	dck (ENSMMDG00005020811)	SLC4A4 (ENSMMDG00005016559)	NPFFR2 (ENSMMDG00005016435)	ENSMMDG00005016419	ENSMMDG00005016417	ENSMMDG00005016416	fbp1b (ENSMMDG00005016413)	gas1b (ENSMMDG00005016412)	ENSMMDG00005016069 #23	dab2 (ENSMMDG00005016030) #22	ENSMMDG00005016025	rtknb (ENSMMDG00005016021)	arid6 (ENSMMDG00005016017)	aqp3b (ENSMMDG00005016016)	ENSMMDG00005016015	unc5da (ENSMMDG00005016009)	tnfrsfa (ENSMMDG00005016000)	trappc13 (ENSMMDG00005015997)	sgtb (ENSMMDG00005015991)	nln (ENSMMDG00005012294)	erbin (ENSMMDG00005006885)	ENSMMDG00005006822	srek1 (ENSMMDG00005006820)	MAST4 (ENSMMDG00005006491)	pik3r1 (ENSMMDG00005006298)
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00940000155181.c.b	ENSGT00960000193246	ENSGT00940000153434.c.b	ENSGT00940000161347.a.a	ENSGT00940000161347.a.b	ENSGT00940000154422.d	ENSGT00940000155770.b.b	ENSGT01100000263865	ENSGT00390000013415.b	ENSGT00940000155227.a	ENSGT00390000015513.a.b.b	ENSGT00940000153321.b.b.bb.b	ENSGT00940000153321.b.b.bb.a	ENSGT00390000001195.a.b	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567 #22	ENSGT00390000012762	ENSGT00940000159623	ENSGT00530000063749.c.b	ENSGT00390000004950.a.a	ENSGT00390000004950.a.b	ENSGT01100000263564.b	ENSGT00940000160228	ENSGT00940000163895	ENSGT00940000166301	ENSGT00940000156081.j	ENSGT00940000168229	ENSGT00950000182925.B	ENSGT00940000161260	ENSGT01050000244968.c.c	ENSGT00940000156730.b
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	364										ENSGT01100000263865.a	ENSGT00390000013415.b.d.a.a	ENSGT00940000155227.a.c	ENSGT00390000015513.a.b.b.a	ENSGT00940000153321.b.b.bb.a	ENSGT00390000001195.a.b.c	ENSGT00940000155567.vd.a #22	ENSGT00390000012762.s	ENSGT00940000159623.m	ENSGT00530000063749.c.b.m	ENSGT00390000004950.a.a.a.a	ENSGT00940000160228.g	ENSGT00940000166301.f	ENSGT00940000156081.j.i	ENSGT00950000182925.B.e	ENSGT00940000161260.g	ENSGT01050000244968.c.c.a	ENSGT00940000156730.b.d.a	ENSGT00940000156183.i.b	ENSGT00940000157286.h	ENSGT00940000158788.f	ENSGT00390000008802.a.b
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000153662.B.e	ENSGT00940000160006.l	ENSGT00510000047171.y.a	ENSGT00940000155181.c.b.i	ENSGT00940000153434.c.b	ENSGT00940000161347.a.a.b	ENSGT00940000161347.a.b.d.b	ENSGT00940000154422.d.h	ENSGT00940000155770.b.b	ENSGT01100000263865.a	ENSGT00390000013415.b.d.a.a	ENSGT00940000155227.a.c	ENSGT00390000015513.a.b.b.a	ENSGT00940000153321.b.b.bb.a.c	ENSGT00390000001195.a.b.c	ENSGT00940000155567.vd.a #22	ENSGT00390000012762.s	ENSGT00940000159623.m	ENSGT00530000063749.c.b.m	ENSGT00390000004950.a.a.b	ENSGT00390000004950.a.a.a.a	ENSGT00940000160228.g	ENSGT00940000166301.f	ENSGT00940000156081.j.i	ENSGT00950000182925.B.e	ENSGT00940000161260.g	ENSGT01050000244968.c.c.a	ENSGT00940000156730.b.d.a	ENSGT00940000156730.b.c.a	ENSGT00940000156183.i.b	ENSGT00940000157286.h
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT00510000047171.y.a	ENSGT00940000155181.c.b.i	ENSGT00940000153434.c.b	ENSGT00940000161347.a.a.a	ENSGT00940000162569.a.d	ENSGT00940000161347.a.b.d.b	ENSGT00940000154422.d.h	ENSGT00940000155770.b.b	ENSGT01100000263865.a	ENSGT00390000013415.b.d.b	ENSGT00940000155227.a.c	ENSGT00390000015513.a.b.b.a	ENSGT00940000153321.b.b.bb.a.c.a.b	ENSGT00940000153321.b.b.bb.a.c.b	ENSGT00390000001195.a.b.c	ENSGT00940000155567.vd.a #22	ENSGT00390000012762.s	ENSGT00940000159623.m	ENSGT00530000063749.c.b.m	ENSGT00390000004950.a.a.a.a	ENSGT00940000160228.g	ENSGT00940000166301.f	ENSGT00940000156081.j.i	ENSGT00940000161260.g	ENSGT01050000244968.c.c.a	ENSGT00940000156730.b.c.a	ENSGT00940000156183.i.b	ENSGT00940000157286.h	ENSGT00940000158788.f	ENSGT00940000166509.d.a	ENSGT00390000007153.a.a.b.a
River trout	MODERN SPECIES	15	camk4 (ENSSTUG00000003451)	kcmf1 (ENSSTUG00000003388)	ntrk2b (ENSSTUG00000003327)	hnrpkl (ENSSTUG00000003200)	ENSSTUG00000022191	gna14 (ENSSTUG00000022180)	prune2 (ENSSTUG00000022148)	ENSSTUG00000021558	ENSSTUG00000021527	zgc:73226 (ENSSTUG00000021507)	thbs4b (ENSSTUG00000020235)	fbp1b (ENSSTUG00000020147)	ctsla (ENSSTUG00000020049)	ctsla (ENSSTUG00000019899)	gas1b (ENSSTUG00000019877)	dab2 (ENSSTUG00000019851) #22	ENSSTUG00000019712	epb41l4a (ENSSTUG00000019554)	apc (ENSSTUG00000019403)	srp19 (ENSSTUG00000019375)	ENSSTUG00000014752	tdgf1 (ENSSTUG00000014537)	ENSSTUG00000014457	nxnl2 (ENSSTUG00000014449)	CSGALNACT1 (ENSSTUG00000014444)	PLPP1 (ENSSTUG00000014362)	mtrex (ENSSTUG00000014080)	ENSSTUG00000014044	ENSSTUG00000014037	PSTPIP2 (ENSSTUG00000013970)	ENSSTUG00000013953
Atlantic salmon	MODERN SPECIES		ntrk2b (ENSSSAG00000066722)	HNRPK (ENSSSAG00000066640)	ENSSSAG00000066621	gna14 (ENSSSAG00000066616)	bmcc1 (ENSSSAG00000075176)	ENSSSAG00000066035	ENSSSAG00000091085	ENSSSAG00000065996	ENSSSAG00000056442	ENSSSAG00000056305	ENSSSAG00000056206	ENSSSAG00000096256	ENSSSAG00000097868	ENSSSAG00000101536	ENSSSAG00000056287	ENSSSAG00000056184 #22	ENSSSAG00000056162	epb41l4a (ENSSSAG00000056138)	ENSSSAG00000054828	srp19 (ENSSSAG00000054790)	ENSSSAG00000089074	ENSSSAG00000049935	ENSSSAG00000109983	ENSSSAG00000121162	ENSSSAG00000089158	ENSSSAG00000105333	ENSSSAG00000044446	ENSSSAG00000107374	ENSSSAG00000044262	LPP1 (ENSSSAG00000044187)	mtrex (ENSSSAG00000041696)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000162090.c	ENSGT00390000003175.a.b.j	ENSGT00940000155881.i	ENSGT00940000153510.b.m	ENSGT00940000157329.i	ENSGT00940000156571.ab.b	ENSGT00940000155967.e	ENSGT00510000047710	ENSGT00940000155770.b.b	ENSGT01100000263865.a	ENSGT00390000013415.b.d.a.a	ENSGT00940000155227.a.c	ENSGT00390000015513.a.b.b.a	ENSGT00940000153321.b.b.bb.a.c	ENSGT00390000001195.a.b.c	ENSGT00940000155567.vd.a #22	ENSGT00390000012762.s	ENSGT00940000159623.m	ENSGT00530000063749.c.b.m	ENSGT00390000004950.a.a.b	ENSGT01060000253613	ENSGT00940000160228.g	ENSGT00940000166301.f	ENSGT00940000156081.j.i	ENSGT00950000182925.B.e	ENSGT00940000161260.g	ENSGT01050000244968.c.c.a	ENSGT00940000156730.b.d.a	ENSGT00940000156183.i.b	ENSGT00940000157286.h	ENSGT00940000158788.f
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Huchen	MODERN SPECIES	51												ctsla (ENSHHUG00000026221)	ctsla (ENSHHUG00000026223)	gas1b (ENSHHUG00000026327)	ENSHHUG00000026330	dab2 (ENSHHUG00000026331) #22	ENSHHUG00000026343	epb41l4a (ENSHHUG00000026349)	apc (ENSHHUG00000026358)	srp19 (ENSHHUG00000026361)	ENSHHUG00000026388	ENSHHUG00000026562	ENSHHUG00000026583	nxnl2 (ENSHHUG00000026613)	CSGALNACT1 (ENSHHUG00000026618)	PLPP1 (ENSHHUG00000026621)	mtrex (ENSHHUG00000026637)	ENSHHUG00000026812	ENSHHUG00000026832	PSTPIP2 (ENSHHUG00000026836)	sub1a (ENSHHUG00000026847)
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Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	57	ENSGT00940000153662.B.f	ENSGT00940000160006.k	ENSGT00510000047171.y.b	ENSGT00940000155181.c.b.j	ENSGT00960000193246	ENSGT00940000161347.a.a.a	ENSGT00940000154422.d.g	ENSGT01100000263865.b	ENSGT00390000013415.b.c	ENSGT00940000155227.a.d	ENSGT00390000015513.a.b.b.b	ENSGT00940000153321.b.b.bb.b	ENSGT01100000263491.a.b.b.c.b.k.a.a.a	ENSGT00390000001195.a.b.d	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567.vd.b #22	ENSGT00390000012762.t	ENSGT00940000159623.n	ENSGT00530000063749.c.b.n	ENSGT00390000004950.a.b	ENSGT01100000263564.b.i	ENSGT01100000263564.b.j.a	ENSGT00940000160228.h	ENSGT00940000166301.e	ENSGT00940000156081.j.j	ENSGT00940000168229	ENSGT00950000182925.B.f	ENSGT00940000161260.h	ENSGT01050000244968.c.c.b	ENSGT00940000156730.b.c.b	ENSGT00940000156183.i.a
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000015874.w	ENSGT00940000153662.B.f	ENSGT00940000160006.k	ENSGT00510000047171.y.b	ENSGT00940000155181.c.b.j	ENSGT00940000161347.a.b.d.a	ENSGT00940000154422.d.g	ENSGT01100000263865.b	ENSGT00390000013415.b.c	ENSGT00940000155227.a.d	ENSGT00390000015513.a.b.b.b	ENSGT00940000153321.b.b.bb.b	ENSGT01100000263491.a.b.b.c.b.k.a.a.a	ENSGT00390000001195.a.b.d	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567.vd.b #22	ENSGT00390000012762.t	ENSGT00940000159623.n	ENSGT00530000063749.c.b.n	ENSGT00390000004950.a.b	ENSGT01100000263564.b.i	ENSGT01100000263564.b.j.b	ENSGT01100000263564.b.j.a	ENSGT00940000160228.h	ENSGT00940000166301.e	ENSGT00940000156081.j.j	ENSGT00940000168229	ENSGT00950000182925.B.f	ENSGT00940000161260.h	ENSGT01050000244968.c.c.b	ENSGT00940000156730.b.c.b
River trout	MODERN SPECIES	6	ENSSTUG00000031088	ntrk2b (ENSSTUG00000031090)	HNRNPK (ENSSTUG00000031123)	gna14 (ENSSTUG00000031312)	prune2 (ENSSTUG00000031397)	ENSSTUG00000031459	ENSSTUG00000031477	zgc:73226 (ENSSTUG00000031492)	thbs4b (ENSSTUG00000031623)	fbp1b (ENSSTUG00000036010)	ctsla (ENSSTUG00000036046)	ENSSTUG00000036089	ENSSTUG00000036104	gas1b (ENSSTUG00000036132)	c9 (ENSSTUG00000036144) #23	dab2 (ENSSTUG00000036316) #22	ENSSTUG00000036389	epb41l4a (ENSSTUG00000036424)	apc (ENSSTUG00000036593)	srp19 (ENSSTUG00000036949)	ENSSTUG00000037117	ENSSTUG00000037133	C3AR1 (ENSSTUG00000037165)	ENSSTUG00000037310	tdgf1 (ENSSTUG00000001849)	ENSSTUG00000002086	ENSSTUG00000002612	nxnl2 (ENSSTUG00000002655)	CSGALNACT1 (ENSSTUG00000002666)	PLPP1 (ENSSTUG00000002685)	mtrex (ENSSTUG00000002747)
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Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00940000161347.a.b.d.b	ENSGT00940000154422.d.h	ENSGT00940000161347.a.b.c	ENSGT00940000162569.a.d	ENSGT00940000161347.a.b.d.a	ENSGT00940000154422.d.g	ENSGT01100000263865.b	ENSGT00390000013415.b.c	ENSGT00940000155227.a.d	ENSGT00390000015513.a.b.b.b	ENSGT00940000153321.b.b.bb.b	ENSGT01100000263491.a.b.b.c.b.k.a.a.b.a.a	ENSGT01100000263491.a.b.b.c.b.k.a.a.a	ENSGT00390000001195.a.b.d	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567.vd.b #22	ENSGT00940000159623.n	ENSGT00530000063749.c.b.n	ENSGT00390000004950.a.b	ENSGT01100000263564.b.i	ENSGT01100000263564.b.j.a	ENSGT00940000160228.h	ENSGT00940000166301.e	ENSGT00940000156081.j.j	ENSGT00940000168229	ENSGT00950000182925.B.f	ENSGT00940000161260.h	ENSGT01050000244968.c.c.b	ENSGT00940000156730.b.c.b	ENSGT00940000156183.i.a	ENSGT00940000157286.g
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	48	ENSGT00940000160006.k	ENSGT00510000047171.y.b	ENSGT00940000155181.c.b.j	ENSGT00960000193246	ENSGT00940000161347.a.a.a	ENSGT00940000154422.d.g	ENSGT01100000263865.b	ENSGT00390000013415.b.c	ENSGT00940000155227.a.d	ENSGT00390000015513.a.b.b.b	ENSGT00940000153321.b.b.bb.b	ENSGT01100000263491.a.b.b.c.b.k.a.a.b.a.a	ENSGT01100000263491.a.b.b.c.b.k.a.a.a	ENSGT00390000001195.a.b.d	ENSGT00940000159777 #23	ENSGT00940000155567.vd.b #22	ENSGT00940000159623.n	ENSGT00530000063749.c.b.n	ENSGT00390000004950.a.b	ENSGT01100000263564.b.i	ENSGT01100000263564.b.j.a	ENSGT00940000160228.h	ENSGT00940000166301.e	ENSGT00940000156081.j.j	ENSGT00940000168229	ENSGT00950000182925.B.f	ENSGT00940000161260.h	ENSGT01050000244968.c.c.b	ENSGT00940000156730.b.c.b	ENSGT00940000156183.i.a	ENSGT00940000157286.g
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Coho salmon	MODERN SPECIES	26	camk4 (ENSOKIG00005008303)	kcmf1 (ENSOKIG00005008236)	ntrk2b (ENSOKIG00005008221)	HNRNPK (ENSOKIG00005008081)	ENSOKIG00005007977	ENSOKIG00005007919	zgc:73226 (ENSOKIG00005007887)	thbs4b (ENSOKIG00005003779)	ENSOKIG00005003595	ctsla (ENSOKIG00005003560)	ENSOKIG00005003551	ENSOKIG00005003540	gas1b (ENSOKIG00005003524)	ENSOKIG00005003518	c9 (ENSOKIG00005003468) #23	dab2 (ENSOKIG00005003439) #22	epb41l4a (ENSOKIG00005003337)	apc (ENSOKIG00005003218)	SRP19 (ENSOKIG00005003167)	C3AR1 (ENSOKIG00005003163)	ENSOKIG00005003157	ENSOKIG00005003155	ENSOKIG00005003151	ENSOKIG00005003147	ENSOKIG00005001810	tdgf1 (ENSOKIG00005001661)	MFSD14B (ENSOKIG00005001548)	ENSOKIG00005001510	ENSOKIG00005001501	nxnl2 (ENSOKIG00005001492)	CSGALNACT1 (ENSOKIG00005001484)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	3	ENSOMYG00000034245	ENSOMYG00000033938	ctsla (ENSOMYG00000033910)	ENSOMYG00000033884	ENSOMYG00000061092	ENSOMYG00000052625	ENSOMYG00000061047	ENSOMYG00000058473	ENSOMYG00000067262	ENSOMYG00000033903	ENSOMYG00000057730	ENSOMYG00000076518	gas1b (ENSOMYG00000033869)	ENSOMYG00000075240	c9 (ENSOMYG00000033783) #23	dab2 (ENSOMYG00000033746) #22	ENSOMYG00000053133	epb41l4a (ENSOMYG00000033729)	ENSOMYG00000033647	c3ar1 (ENSOMYG00000033575)	ENSOMYG00000033569	ENSOMYG00000028125	ENSOMYG00000074887	ENSOMYG00000027017	ENSOMYG00000069519	ENSOMYG00000026964	ENSOMYG00000026921	ENSOMYG00000026894	nxnl2 (ENSOMYG00000026852)	ENSOMYG00000026841	PLPP1 (ENSOMYG00000026817)
Huchen	MODERN SPECIES	2872														gas1b (ENSHHUG00000024804)	c9 (ENSHHUG00000024808) #23	dab2 (ENSHHUG00000024907) #22	ENSHHUG00000024933	epb41l4a (ENSHHUG00000024955)
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Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000162806.b.b.e	ENSGT00940000158959.a.a.b.b	ENSGT00940000164492.a.b.f	ENSGT00940000164804.b.h	ENSGT00940000157050.i.b.b	ENSGT00940000157166.c.f	ENSGT01030000235156.d	ENSGT00940000159238.n	ENSGT00390000010652.D.a.a.a	ENSGT00940000166148.d	ENSGT00390000018845.f.g	ENSGT00390000014626.n	ENSGT00390000000259.k.b.a	ENSGT00940000159007.l	ENSGT01050000244902.a.a.a.b.a	ENSGT00940000155567.wd #22	ENSGT00530000063460.B.b ##24	ENSGT00940000160384.f	ENSGT01020000231482	ENSGT00940000160899.m	ENSGT01040000240503.A.a.b.b	ENSGT00940000161989.b	ENSGT00390000006565.b.d	ENSGT00390000018061.q	ENSGT00940000156757.f	ENSGT00940000158174.a.b	ENSGT00940000154886.a.a.c	ENSGT00940000175596.b	ENSGT00940000165170.c.a	ENSGT00940000159134.n	ENSGT00390000012482.g
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000162806.b.b.e	ENSGT00940000158959.a.a.b.b	ENSGT00940000164492.a.b.f	ENSGT00940000164804.b.h	ENSGT00940000157050.i.b.b	ENSGT00940000157166.c.f	ENSGT01030000235156.d	ENSGT00940000159238.n	ENSGT00390000010652.D.a.a.a	ENSGT00940000166148.d	ENSGT00390000018845.f.g	ENSGT00390000014626.n	ENSGT00390000000259.k.b.a	ENSGT00940000159007.l	ENSGT01050000244902.a.a.a.b.a	ENSGT00940000155567.wd #22	ENSGT00530000063460.B.b ##24	ENSGT00940000160384.f	ENSGT01020000231482	ENSGT00940000160899.m	ENSGT01040000240503.A.a.b.b	ENSGT00390000006565.b.d	ENSGT00940000161989.b	ENSGT00390000006565.a.a	ENSGT00390000018061.q	ENSGT00940000156757.f	ENSGT00940000158174.a.b	ENSGT00940000154886.a.a.c	ENSGT00940000175596.b	ENSGT00940000165170.c.a	ENSGT01010000228826
River trout	MODERN SPECIES	14	JUND (ENSSTUG00000007468)	RAB3A (ENSSTUG00000007473)	ENSSTUG00000007503	ENSSTUG00000007764	PIK3R2 (ENSSTUG00000007799)	MAST3 (ENSSTUG00000007859)	ENSSTUG00000008631	klhl26 (ENSSTUG00000008659)	ENSSTUG00000008670	comp (ENSSTUG00000008752)	tmem38a (ENSSTUG00000010346)	smim7 (ENSSTUG00000010364)	MED26 (ENSSTUG00000010379)	slc35e1 (ENSSTUG00000010394)	ENSSTUG00000010431	ENSSTUG00000010444 #22	ENSSTUG00000010460 ##24	APBA3 (ENSSTUG00000010497)	ENSSTUG00000010614	ENSSTUG00000010631	ENSSTUG00000010648	ndufs7 (ENSSTUG00000010657)	gamt (ENSSTUG00000010691)	dazap1 (ENSSTUG00000010720)	kank3 (ENSSTUG00000011296)	ENSSTUG00000011306	ENSSTUG00000011324	ENSSTUG00000011352	B3GNT3 (ENSSTUG00000011362)	ccdc124 (ENSSTUG00000011372)	KCNN1 (ENSSTUG00000011398)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	1	ENSSSAG00000095803	ENSSSAG00000050237	ENSSSAG00000118394	ENSSSAG00000057741	PIK3R2 (ENSSSAG00000057788)	ENSSSAG00000089110	ENSSSAG00000059199	ENSSSAG00000061284	klhl26 (ENSSSAG00000061318)	ENSSSAG00000065266	comp (ENSSSAG00000061720)	TMEM38A (ENSSSAG00000064623)	ENSSSAG00000122198	SLC35E1 (ENSSSAG00000064632)	ENSSSAG00000106725	ENSSSAG00000064646 #22	ENSSSAG00000118346	ENSSSAG00000064657 ##24	ENSSSAG00000064673	ENSSSAG00000064756	ENSSSAG00000064766	CTDS2 (ENSSSAG00000064784)	ENSSSAG00000064822	NDUFS7 (ENSSSAG00000064839)	gamt (ENSSSAG00000064919)	DAZP1 (ENSSSAG00000064945)	ENSSSAG00000084666	ENSSSAG00000065142	ENSSSAG00000089451	ENSSSAG00000103468	ENSSSAG00000065183
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000162806.b.b.e	ENSGT00940000158959.a.a.b.b	ENSGT00940000164492.a.b.f	ENSGT00940000164804.b.h	ENSGT00940000157050.i.b.b	ENSGT00940000157166.c.f	ENSGT01030000235156.d	ENSGT00940000159238.n	ENSGT00390000010652.D.a.a.a	ENSGT00940000166148.d	ENSGT00390000018845.f.g	ENSGT00390000014626.n.a	ENSGT00390000000259.k.b.a	ENSGT00940000159007.l	ENSGT01050000244902.a.a.a.b.a	ENSGT00940000155567.wd #22	ENSGT00530000063460.B.b ##24	ENSGT00940000160384.f	ENSGT01020000231482	ENSGT00940000160899.m	ENSGT01040000240503.A.a.b.b	ENSGT00940000161989.b	ENSGT00390000006565.b.d	ENSGT00390000018061.q	ENSGT00940000156757.f	ENSGT00940000158174.a.b	ENSGT00940000154886.a.a.c	ENSGT00940000175596.b	ENSGT00390000006553	ENSGT00940000165170.c.a	ENSGT00940000159134.n
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000162806.b.b.e	ENSGT00940000158959.a.a.b.b	ENSGT00940000164492.a.b.f	ENSGT00940000164804.b.h	ENSGT00940000157050.i.b.b	ENSGT00940000157166.c.f	ENSGT01030000235156.d	ENSGT00940000159238.n	ENSGT00390000010652.D.a.a.a	ENSGT00940000166148.d	ENSGT00390000018845.f.g	ENSGT00390000014626.n.a	ENSGT00390000000259.k.b.a	ENSGT00940000159007.l	ENSGT01050000244902.a.a.a.b.a	ENSGT00940000155567.wd #22	ENSGT00530000063460.B.b ##24	ENSGT00940000160384.f	ENSGT01020000231482	ENSGT00940000160899.m	ENSGT01040000240503.A.a.b.b	ENSGT00940000161989.b	ENSGT00390000006565.b.d	ENSGT00390000018061.q	ENSGT00940000156757.f	ENSGT00940000158174.a.b	ENSGT00940000154886.a.a.c	ENSGT00390000006553	ENSGT00940000165170.c.a	ENSGT00940000159134.n	ENSGT00390000012482.g
Chinook salmon	MODERN SPECIES	29	JUND (ENSOTSG00005025720)	RAB3A (ENSOTSG00005025721)	ENSOTSG00005025742	ENSOTSG00005026025	PIK3R2 (ENSOTSG00005026031)	MAST3 (ENSOTSG00005026034)	ENSOTSG00005026046	klhl26 (ENSOTSG00005026047)	ENSOTSG00005026048	comp (ENSOTSG00005026049)	tmem38a (ENSOTSG00005026153)	smim7 (ENSOTSG00005026154)	MED26 (ENSOTSG00005026155)	slc35e1 (ENSOTSG00005026156)	ENSOTSG00005026157	ENSOTSG00005026160 #22	ENSOTSG00005026164 ##24	APBA3 (ENSOTSG00005026168)	ENSOTSG00005026172	ARID3A (ENSOTSG00005026175)	ENSOTSG00005026178	ENSOTSG00005026179	ndufs7 (ENSOTSG00005026180)	gamt (ENSOTSG00005026181)	dazap1 (ENSOTSG00005026182)	dpp9 (ENSOTSG00005027181)	kank3 (ENSOTSG00005027183)	ENSOTSG00005027188	ENSOTSG00005027192	B3GNT3 (ENSOTSG00005027197)	ccdc124 (ENSOTSG00005027198)
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Northern pike	DUPLICATION
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