Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157037.a	ENSGT00940000159350	ENSGT00390000012901	ENSGT00390000003477	ENSGT00940000158750	ENSGT00390000000483.b	ENSGT00390000014853	ENSGT00940000161623	ENSGT00390000016221	ENSGT00940000160490	ENSGT00940000154127.A	ENSGT00940000154127.B	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.b	ENSGT00390000003220	ENSGT00940000153713.B.c	ENSGT00390000016928 #22	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.a.b #23	ENSGT01030000234638.b.a.b.q.a
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000013159	ENSGT00940000157887	ENSGT00900000140979.a.a.`b.b #7	ENSGT00520000060950 #8	ENSGT00530000063652.a.a #9	ENSGT00390000012139 #10	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.a.b #11	ENSGT00910000147694 #12	ENSGT00940000156306 #13	ENSGT00390000008787.a #15	ENSGT00940000158926 #16	ENSGT00940000158625 #17	ENSGT00390000001670 #18	ENSGT00940000153169.A.b.b.a.b ##19	ENSGT00940000156660 #20	ENSGT00390000016928 #22	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.a.b #23	ENSGT00390000004827 #24	ENSGT00940000160288 #25	ENSGT00950000183201.b.b.a #26	ENSGT00390000008828 #27	ENSGT00950000182915.a.a.b #28	ENSGT00940000161998	ENSGT00940000156589 #29	ENSGT00940000160382	ENSGT00940000157878 #30	ENSGT00940000156171 #32	ENSGT00390000017043 #33	ENSGT00390000016264 #34	ENSGT00940000157587 #35	ENSGT00940000158403 #36
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157887	ENSGT00900000140979.a.a.`b.b #7	ENSGT00520000060950 #8	ENSGT00530000063652.a.a #9	ENSGT00390000012139 #10	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.a.b #11	ENSGT00910000147694 #12	ENSGT00940000156306 #13	ENSGT00390000008787.a #15	ENSGT00940000158926 #16	ENSGT00940000158625 #17	ENSGT00390000001670 #18	ENSGT00940000153169.A.b.b.a.b ##19	ENSGT00940000153169.A.b.b.a.a.b #19	ENSGT00940000156660 #20	ENSGT00390000016928 #22	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.a.b #23	ENSGT00390000004827 #24	ENSGT00940000160288 #25	ENSGT00950000183201.b.b.a #26	ENSGT00390000008828 #27	ENSGT00950000182915.a.a.b #28	ENSGT00940000156589 #29	ENSGT00940000160382	ENSGT00940000157878 #30	ENSGT00940000156171 #32	ENSGT00390000017043 #33	ENSGT00390000016264 #34	ENSGT00940000157587 #35	ENSGT00940000158403 #36	ENSGT00940000156801 #37
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00390000013159	ENSGT00940000157887	ENSGT00900000140979.a.a.`b.b #7	ENSGT00520000060950 #8	ENSGT00530000063652.a.a #9	ENSGT00390000012139 #10	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.a.b #11	ENSGT00910000147694 #12	ENSGT00940000156306 #13	ENSGT00390000008787.a #15	ENSGT00940000158926 #16	ENSGT00940000158625 #17	ENSGT00390000001670 #18	ENSGT00940000153169.A.b.b.a.b ##19	ENSGT00940000156660 #20	ENSGT00390000016928 #22	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.a.b #23	ENSGT00390000004827 #24	ENSGT00940000160288 #25	ENSGT00950000183201.b.b.a #26	ENSGT00390000008828 #27	ENSGT00950000182915.a.a.b #28	ENSGT00940000156589 #29	ENSGT00940000157878 #30	ENSGT00940000156171 #32	ENSGT00390000017043 #33	ENSGT00390000016264 #34	ENSGT00940000157587 #35	ENSGT00940000158403 #36	ENSGT00940000156801 #37	ENSGT00940000156733
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000013159	ENSGT00940000157887	ENSGT00900000140979.a.a.`b.b #7	ENSGT00520000060950 #8	ENSGT00530000063652.a.a #9	ENSGT00390000012139 #10	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.a.b #11	ENSGT00910000147694 #12	ENSGT00940000156306 #13	ENSGT00390000008787.a #15	ENSGT00940000158926 #16	ENSGT00940000158625 #17	ENSGT00390000001670 #18	ENSGT00940000153169.A.b.b.a.b ##19	ENSGT00940000156660 #20	ENSGT00390000016928 #22	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.a.b #23	ENSGT00390000004827 #24	ENSGT00940000160288 #25	ENSGT00950000183201.b.b.a #26	ENSGT00390000008828 #27	ENSGT00950000182915.a.a.b #28	ENSGT00940000156589 #29	ENSGT00940000157878 #30	ENSGT00940000156171 #32	ENSGT00390000017043 #33	ENSGT00390000016264 #34	ENSGT00940000157587 #35	ENSGT00940000158403 #36	ENSGT00940000156801 #37	ENSGT00940000156733
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000013159	ENSGT00940000157887	ENSGT00900000140979.a.a.`b.b #7	ENSGT00520000060950 #8	ENSGT00530000063652.a.a #9	ENSGT00390000012139 #10	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.a.b #11	ENSGT00910000147694 #12	ENSGT00940000156306 #13	ENSGT00390000008787.a #15	ENSGT00940000158926 #16	ENSGT00940000158625 #17	ENSGT00390000001670 #18	ENSGT00940000153169.A.b.b.a.b ##19	ENSGT00940000156660 #20	ENSGT00390000016928 #22	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.a.b #23	ENSGT00390000004827 #24	ENSGT00940000160288 #25	ENSGT00950000183201.b.b.a #26	ENSGT00390000008828 #27	ENSGT00950000182915.a.a.b #28	ENSGT00940000156589 #29	ENSGT00940000157878 #30	ENSGT00940000156171 #32	ENSGT00390000017043 #33	ENSGT00390000016264 #34	ENSGT00940000157587 #35	ENSGT00940000158403 #36	ENSGT00940000156801 #37	ENSGT00940000156733
Narwhal	MODERN SPECIES	307	ENSMMNG00015012367 #7	ENSMMNG00015012392 #8	DDIT4L (ENSMMNG00015012408) #9	EMCN (ENSMMNG00015012431) #10	ENSMMNG00015012507 #11	ENSMMNG00015012516 #12	PPP3CA (ENSMMNG00015012547) #13	ENSMMNG00015012617 #14	BANK1 (ENSMMNG00015012635) #15	SLC39A8 (ENSMMNG00015012676) #16	NFKB1 (ENSMMNG00015012707) #17	MANBA (ENSMMNG00015012754) #18	ENSMMNG00015012793 #19	CISD2 (ENSMMNG00015012855) #20	SLC9B1 (ENSMMNG00015012884) #21	WFS1 (ENSMMNG00015012919) #22	PPP2R2C (ENSMMNG00015012939) #23	SETD7 (ENSMMNG00015012957) #24	MGST2 (ENSMMNG00015013012) #25	MAML3 (ENSMMNG00015013033) #26	SCOC (ENSMMNG00015013055) #27	CLGN (ENSMMNG00015013069) #28	ELMOD2 (ENSMMNG00015013079) #29	TBC1D9 (ENSMMNG00015013089) #30	ENSMMNG00015013116 #31	RNF150 (ENSMMNG00015015631) #32	ZNF330 (ENSMMNG00015015654) #33	IL15 (ENSMMNG00015015698) #34	INPP4B (ENSMMNG00015015936) #35	USP38 (ENSMMNG00015016230) #36	GAB1 (ENSMMNG00015016325) #37
Beluga whale	MODERN SPECIES	13	LAMTOR3 (ENSDLEG00000001284)	DNAJB14 (ENSDLEG00000001308)	ENSDLEG00000001318 ##7	ENSDLEG00000001338 #8	DDIT4L (ENSDLEG00000001345) #9	EMCN (ENSDLEG00000001362) #10	ENSDLEG00000001406 #11	PPP3CA (ENSDLEG00000001417) #13	ENSDLEG00000001444	BANK1 (ENSDLEG00000001450) #15	SLC39A8 (ENSDLEG00000001477) #16	NFKB1 (ENSDLEG00000001502) #17	MANBA (ENSDLEG00000001605) #18	ENSDLEG00000001738 ##19	CISD2 (ENSDLEG00000001852) #20	WFS1 (ENSDLEG00000001861) #22	PPP2R2C (ENSDLEG00000001869) #23	SETD7 (ENSDLEG00000001880) #24	MGST2 (ENSDLEG00000001895) #25	MAML3 (ENSDLEG00000001906) #26	SCOC (ENSDLEG00000001918) #27	CLGN (ENSDLEG00000001932) #28	ELMOD2 (ENSDLEG00000001956) #29	TBC1D9 (ENSDLEG00000001998) #30
Vaquita	MODERN SPECIES	16	DAPP1 (ENSPSNG00000018345)	LAMTOR3 (ENSPSNG00000018278)	DNAJB14 (ENSPSNG00000018219)	ENSPSNG00000018157 #7	ENSPSNG00000018108 #8	DDIT4L (ENSPSNG00000018061) #9	EMCN (ENSPSNG00000017732) #10	ENSPSNG00000017663 #11	PPP3CA (ENSPSNG00000017541) #13	BANK1 (ENSPSNG00000017240) #15	SLC39A8 (ENSPSNG00000017173) #16	NFKB1 (ENSPSNG00000016882) #17	MANBA (ENSPSNG00000016760) #18	ENSPSNG00000016573 ##19	CISD2 (ENSPSNG00000016497) #20	WFS1 (ENSPSNG00000016467) #22	PPP2R2C (ENSPSNG00000016392) #23	SETD7 (ENSPSNG00000016301) #24	ENSPSNG00000016177	ENSPSNG00000016125	MAML3 (ENSPSNG00000016048) #26	SCOC (ENSPSNG00000015865) #27	CLGN (ENSPSNG00000015754) #28	ELMOD2 (ENSPSNG00000015677) #29	TBC1D9 (ENSPSNG00000015613) #30	RNF150 (ENSPSNG00000015526) #32	ZNF330 (ENSPSNG00000015475) #33	IL15 (ENSPSNG00000015292) #34	INPP4B (ENSPSNG00000015200) #35	USP38 (ENSPSNG00000015085) #36	GAB1 (ENSPSNG00000014895) #37
Dolphin	MODERN SPECIES	3377															ENSTTRG00000016146 #18	WFS1 (ENSTTRG00000016153) #22	PPP2R2C (ENSTTRG00000016155) #23
Sperm whale	MODERN SPECIES	18	LAMTOR3 (ENSPCTG00005000312)	DNAJB14 (ENSPCTG00005000342)	ENSPCTG00005000362 #7	ENSPCTG00005000383 #8	DDIT4L (ENSPCTG00005000396) #9	EMCN (ENSPCTG00005000427) #10	ENSPCTG00005000476 #11	PPP3CA (ENSPCTG00005000512) #13	ENSPCTG00005000582 ##14	BANK1 (ENSPCTG00005000621) #15	SLC39A8 (ENSPCTG00005000697) #16	NFKB1 (ENSPCTG00005000726) #17	MANBA (ENSPCTG00005000794) #18	UBE2D3 (ENSPCTG00005000874) #19	CISD2 (ENSPCTG00005000912) #20	WFS1 (ENSPCTG00005000923) #22	PPP2R2C (ENSPCTG00005000935) #23	SETD7 (ENSPCTG00005000966) #24	ENSPCTG00005000987	ENSPCTG00005000996 #25	MAML3 (ENSPCTG00005001012) #26	ENSPCTG00005001027	ENSPCTG00005001047 #27	CLGN (ENSPCTG00005001074) #28	ELMOD2 (ENSPCTG00005001098) #29	ENSPCTG00005001118	TBC1D9 (ENSPCTG00005001153) #30	RNF150 (ENSPCTG00005001237) #32	ZNF330 (ENSPCTG00005001281) #33	IL15 (ENSPCTG00005001318) #34	INPP4B (ENSPCTG00005001389) #35
Blue whale	MODERN SPECIES	16	ENSBMSG00010001368 #7	ENSBMSG00010001383 #8	DDIT4L (ENSBMSG00010001397) #9	ENSBMSG00010001417 #10	ENSBMSG00010001432 #11	ENSBMSG00010001448	PPP3CA (ENSBMSG00010001488) #13	BANK1 (ENSBMSG00010001543) #15	ENSBMSG00010001588	SLC39A8 (ENSBMSG00010001600) #16	NFKB1 (ENSBMSG00010001621) #17	MANBA (ENSBMSG00010001654) #18	ENSBMSG00010001687 ##19	CISD2 (ENSBMSG00010001715) #20	SLC9B1 (ENSBMSG00010001740) #21	WFS1 (ENSBMSG00010001770) #22	PPP2R2C (ENSBMSG00010001796) #23	SETD7 (ENSBMSG00010001824) #24	MGST2 (ENSBMSG00010001835) #25	MAML3 (ENSBMSG00010001847) #26	ENSBMSG00010001855	SCOC (ENSBMSG00010001913) #27	CLGN (ENSBMSG00010001947) #28	MGAT4D (ENSBMSG00010001980)	ELMOD2 (ENSBMSG00010002040) #29	TBC1D9 (ENSBMSG00010002068) #30	RNF150 (ENSBMSG00010002115) #32	ZNF330 (ENSBMSG00010002166) #33	ENSBMSG00010002175	IL15 (ENSBMSG00010002198) #34	INPP4B (ENSBMSG00010002249) #35
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157037.a	ENSGT00940000159350	ENSGT00390000012901	ENSGT00390000003477	ENSGT00940000158750	ENSGT00390000000483.b	ENSGT00390000014853	ENSGT00940000161623	ENSGT00390000016221	ENSGT00940000160490	ENSGT00940000154127.A	ENSGT00940000154127.B	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.b	ENSGT00390000003220	ENSGT00940000153713.B.c	ENSGT00390000016928 #22	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.a.b #23	ENSGT01030000234638.b.a.b.q.a.b	ENSGT01030000234638.b.a.b.q.a.a	ENSGT00730000111375	ENSGT00730000111489	ENSGT00510000046787.e.a	ENSGT00390000017405	ENSGT00940000160856	ENSGT00940000161743	ENSGT00940000157583	ENSGT00950000182974.a.b	ENSGT00390000015549	ENSGT00950000182808.a.a.a.a.b	ENSGT00940000155133.b	ENSGT00940000153692.A
Yarkand deer	MODERN SPECIES	29	OTOP1 (ENSCHYG00000020927)	TMEM128 (ENSCHYG00000020873)	LYAR (ENSCHYG00000020808)	ZBTB49 (ENSCHYG00000020730)	ENSCHYG00000020601	ENSCHYG00000020468	MSX1 (ENSCHYG00000020422)	CYTL1 (ENSCHYG00000020364)	STK32B (ENSCHYG00000020103)	EVC2 (ENSCHYG00000019186)	EVC (ENSCHYG00000019037)	CRMP1 (ENSCHYG00000018819)	ENSCHYG00000018775	JAKMIP1 (ENSCHYG00000018225)	ENSCHYG00000018159	WFS1 (ENSCHYG00000018113) #22	PPP2R2C (ENSCHYG00000017967) #23	ENSCHYG00000017283	ENSCHYG00000016162	DMP1 (ENSCHYG00000015748)	ENSCHYG00000015331	SPARCL1 (ENSCHYG00000015173)	ENSCHYG00000014882	ENSCHYG00000014859	HSD17B11 (ENSCHYG00000014635)	HSD17B13 (ENSCHYG00000014556)	KLHL8 (ENSCHYG00000014019)	AFF1 (ENSCHYG00000013429)	C4orf36 (ENSCHYG00000013363)	SLC10A6 (ENSCHYG00000013255)	PTPN13 (ENSCHYG00000011843)
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000157037.a	ENSGT00940000159350	ENSGT00390000012901	ENSGT00390000003477.i	ENSGT00940000158750	ENSGT00390000000483.b	ENSGT00390000014853	ENSGT00940000161623	ENSGT00390000016221	ENSGT00940000160490	ENSGT00940000154127.A	ENSGT00940000154127.B	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.b	ENSGT00390000003220	ENSGT00940000153713.B.c	ENSGT00390000016928 #22	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.a.b #23	ENSGT01030000234638.b.a.b.q.a.b	ENSGT01030000234638.b.a.b.q.a.a	ENSGT00730000111375	ENSGT00730000111489	ENSGT00510000046787.e.a	ENSGT00390000017405	ENSGT00940000160856	ENSGT00940000161743	ENSGT00940000157583	ENSGT00950000182974.a.b	ENSGT00390000015549	ENSGT00950000182808.a.a.a.a.b	ENSGT00940000155133.b	ENSGT00940000153692.A
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000157037.a	ENSGT00940000159350	ENSGT00390000012901	ENSGT00390000003477.i	ENSGT00940000158750	ENSGT00390000000483.b	ENSGT00390000014853	ENSGT00940000161623	ENSGT00390000016221	ENSGT00940000160490	ENSGT00940000154127.A	ENSGT00940000154127.B	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.b	ENSGT00390000003220	ENSGT00940000153713.B.c	ENSGT00390000016928 #22	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.a.b #23	ENSGT01030000234638.b.a.b.q.a.b	ENSGT01030000234638.b.a.b.q.a.a	ENSGT00730000111375	ENSGT00730000111489	ENSGT00510000046787.e.a	ENSGT00390000017405	ENSGT00940000160856	ENSGT00940000161743	ENSGT00940000157583	ENSGT00950000182974.a.b	ENSGT00390000015549	ENSGT00950000182808.a.a.a.a.b	ENSGT00940000155133.b	ENSGT00390000006247.e.a
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157037.a	ENSGT00940000159350	ENSGT00390000012901	ENSGT00390000003477.i	ENSGT00940000158750	ENSGT00390000000483.b	ENSGT00390000014853	ENSGT00940000161623	ENSGT00390000016221	ENSGT00940000160490	ENSGT00940000154127.A	ENSGT00940000154127.B	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.b	ENSGT00390000003220	ENSGT00940000153713.B.c	ENSGT00390000016928 #22	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.a.b #23	ENSGT01030000234638.b.a.b.q.a.b	ENSGT01030000234638.b.a.b.q.a.a	ENSGT00730000111375	ENSGT00730000111489	ENSGT00510000046787.e.a	ENSGT00390000017405	ENSGT00940000160856	ENSGT00940000161743	ENSGT00940000157583	ENSGT00950000182974.a.b	ENSGT00390000015549	ENSGT00950000182808.a.a.a.a.b	ENSGT00940000155133.b	ENSGT00390000006247.e.a
Bos	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000159350	ENSGT00390000012901	ENSGT00390000003477.i	ENSGT00940000158750	ENSGT00390000000483.b	ENSGT00390000014853	ENSGT00940000161623	ENSGT00390000016221	ENSGT00940000160490	ENSGT00940000154127.A	ENSGT00940000154127.B	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.b	ENSGT00390000003220	ENSGT00940000153713.B.c	ENSGT00940000158464.k	ENSGT00390000016928 #22	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.a.b #23	ENSGT01030000234638.b.a.b.q.a.b	ENSGT01030000234638.b.a.b.q.a.a	ENSGT00730000111375	ENSGT00730000111489	ENSGT00510000046787.e.a	ENSGT00390000017405	ENSGT01100000263481.n.a.b.a.b.b.a.a.a.b.a.a.a.b.b	ENSGT00940000160856	ENSGT00940000161743	ENSGT00940000157583	ENSGT00950000182974.a.b	ENSGT00390000015549	ENSGT00950000182808.a.a.a.a.b	ENSGT00940000155133.b.n
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000159350	ENSGT00390000012901	ENSGT00390000003477.i	ENSGT00940000158750	ENSGT00390000000483.b	ENSGT00390000014853	ENSGT00940000161623	ENSGT00390000016221	ENSGT00940000160490	ENSGT00940000154127.A	ENSGT00940000154127.B	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.b	ENSGT00390000003220	ENSGT00940000153713.B.c	ENSGT00940000158464.k	ENSGT00390000016928 #22	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.a.b #23	ENSGT01030000234638.b.a.b.q.a.b	ENSGT01030000234638.b.a.b.q.a.a	ENSGT00730000111375	ENSGT00730000111489	ENSGT00510000046787.e.a	ENSGT00390000017405	ENSGT01100000263481.n.a.b.a.b.b.a.a.a.b.a.a.a.b.b	ENSGT00940000160856	ENSGT00940000161743	ENSGT00940000157583	ENSGT00950000182974.a.b	ENSGT00390000015549	ENSGT00950000182808.a.a.a.a.b	ENSGT00940000155133.b.n
Domestic yak	MODERN SPECIES	25	LYAR (ENSBGRG00000009901)	ENSBGRG00000010035	ZBTB49 (ENSBGRG00000010047)	NSG1 (ENSBGRG00000010087)	STX18 (ENSBGRG00000010223)	MSX1 (ENSBGRG00000010388)	CYTL1 (ENSBGRG00000010429)	STK32B (ENSBGRG00000010525)	EVC2 (ENSBGRG00000010733)	EVC (ENSBGRG00000011517)	ENSBGRG00000012265	CRMP1 (ENSBGRG00000012288)	C4orf50 (ENSBGRG00000012490)	JAKMIP1 (ENSBGRG00000012631)	ENSBGRG00000013050	WFS1 (ENSBGRG00000013121) #22	PPP2R2C (ENSBGRG00000013226) #23	ENSBGRG00000013414	ENSBGRG00000013725	DMP1 (ENSBGRG00000014603)	ENSBGRG00000014783	SPARCL1 (ENSBGRG00000014840)	NUDT9 (ENSBGRG00000014966)	HSD17B11 (ENSBGRG00000015134)	ENSBGRG00000015430	KLHL8 (ENSBGRG00000015486)	AFF1 (ENSBGRG00000015861)	C4orf36 (ENSBGRG00000016444)	SLC10A6 (ENSBGRG00000016493)	PTPN13 (ENSBGRG00000016575)	ENSBGRG00000016870
Wild yak	MODERN SPECIES	1632													CRMP1 (ENSBMUG00000020375)	ENSBMUG00000020327	JAKMIP1 (ENSBMUG00000020292)	WFS1 (ENSBMUG00000020171) #22	PPP2R2C (ENSBMUG00000020159) #23	ENSBMUG00000020143
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000159350	ENSGT00390000012901	ENSGT00390000003477.i	ENSGT00940000158750	ENSGT00390000000483.b	ENSGT00390000014853	ENSGT00940000161623	ENSGT00390000016221	ENSGT00940000160490	ENSGT00940000154127.A	ENSGT00940000154127.B	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.b	ENSGT00390000003220	ENSGT00940000153713.B.c	ENSGT00940000158464.k	ENSGT00390000016928 #22	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.a.b #23	ENSGT01030000234638.b.a.b.q.a.b	ENSGT01030000234638.b.a.b.q.a.a	ENSGT00730000111375	ENSGT00730000111489	ENSGT00510000046787.e.a	ENSGT00390000017405	ENSGT01100000263481.n.a.b.a.b.b.a.a.a.b.a.a.a.b.b	ENSGT00940000160856	ENSGT00940000161743	ENSGT00940000157583	ENSGT00950000182974.a.b	ENSGT00390000015549	ENSGT00950000182808.a.a.a.a.b	ENSGT00940000155133.b.n.a
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	25	ZBTB49 (ENSBIXG00005014310)	NSG1 (ENSBIXG00005014389)	STX18 (ENSBIXG00005005974)	MSX1 (ENSBIXG00005014501)	CYTL1 (ENSBIXG00005006226)	ENSBIXG00005002014	STK32B (ENSBIXG00005002027)	ENSBIXG00005014592	EVC2 (ENSBIXG00005014669)	ENSBIXG00005014684	EVC (ENSBIXG00005014829)	CRMP1 (ENSBIXG00005002160)	ENSBIXG00005014962	JAKMIP1 (ENSBIXG00005015199)	ENSBIXG00005015285	WFS1 (ENSBIXG00005015314) #22	PPP2R2C (ENSBIXG00005015372) #23	ENSBIXG00005015774	ENSBIXG00005016537	DMP1 (ENSBIXG00005016673)	ENSBIXG00005016723	SPARCL1 (ENSBIXG00005007329)	NUDT9 (ENSBIXG00005016830)	ENSBIXG00005016839	HSD17B11 (ENSBIXG00005005731)	ENSBIXG00005016946	KLHL8 (ENSBIXG00005017118)	AFF1 (ENSBIXG00005017161)	C4orf36 (ENSBIXG00005017196)	ENSBIXG00005017214	ENSBIXG00005002799
Cow	MODERN SPECIES	25	TMEM128 (ENSBTAG00000003652)	LYAR (ENSBTAG00000003653)	ZBTB49 (ENSBTAG00000014680)	NSG1 (ENSBTAG00000005711)	ENSBTAG00000050796	STX18 (ENSBTAG00000005712)	MSX1 (ENSBTAG00000010875)	CYTL1 (ENSBTAG00000011163)	STK32B (ENSBTAG00000015409)	EVC2 (ENSBTAG00000004277)	EVC (ENSBTAG00000004287)	CRMP1 (ENSBTAG00000004292)	ENSBTAG00000021729	JAKMIP1 (ENSBTAG00000011170)	ENSBTAG00000054994	WFS1 (ENSBTAG00000046671) #22	PPP2R2C (ENSBTAG00000020598) #23	ENSBTAG00000006508	ENSBTAG00000017829	DMP1 (ENSBTAG00000019132)	DSPP (ENSBTAG00000045714)	SPARCL1 (ENSBTAG00000004094)	NUDT9 (ENSBTAG00000011354)	ENSBTAG00000052418	HSD17B11 (ENSBTAG00000006307)	HSD17B13 (ENSBTAG00000031679)	ENSBTAG00000047432	KLHL8 (ENSBTAG00000002455)	AFF1 (ENSBTAG00000018488)	C4orf36 (ENSBTAG00000051915)	ENSBTAG00000050963
American bison	MODERN SPECIES	3171		DRD5 (ENSBBBG00000018138)	OTOP1 (ENSBBBG00000018133)	TMEM128 (ENSBBBG00000018119)	ENSBBBG00000018099	ZBTB49 (ENSBBBG00000018051)	NSG1 (ENSBBBG00000018037)	STX18 (ENSBBBG00000017995)	MSX1 (ENSBBBG00000017970)	CYTL1 (ENSBBBG00000017963)	STK32B (ENSBBBG00000017951)	EVC2 (ENSBBBG00000017891)	EVC (ENSBBBG00000017842)	CRMP1 (ENSBBBG00000017804)	JAKMIP1 (ENSBBBG00000017761)	WFS1 (ENSBBBG00000004354) #22	PPP2R2C (ENSBBBG00000017550) #23	ENSBBBG00000017388	ENSBBBG00000017182	DMP1 (ENSBBBG00000008928)
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157037.a	ENSGT00940000159350	ENSGT00390000012901	ENSGT00390000003477.i	ENSGT00940000158750	ENSGT00390000000483.b	ENSGT00390000014853	ENSGT00940000161623	ENSGT00390000016221	ENSGT00940000160490	ENSGT00940000154127.A	ENSGT00940000154127.B	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.b	ENSGT00390000003220	ENSGT00940000153713.B.c	ENSGT00390000016928 #22	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.a.b #23	ENSGT01030000234638.b.a.b.q.a.b.a	ENSGT00730000111375	ENSGT00730000111489	ENSGT00510000046787.e.a	ENSGT00390000017405	ENSGT00940000160856	ENSGT00940000161743	ENSGT00940000157583	ENSGT00950000182974.a.b	ENSGT00390000015549	ENSGT00950000182808.a.a.a.a.b	ENSGT00940000155133.b	ENSGT00390000006247.e.a	ENSGT00940000153692.A
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	22	DRD5 (ENSOARG00020024384)	OTOP1 (ENSOARG00020024371)	TMEM128 (ENSOARG00020024364)	LYAR (ENSOARG00020024350)	ZBTB49 (ENSOARG00020024332)	NSG1 (ENSOARG00020024305)	MSX1 (ENSOARG00020024231)	CYTL1 (ENSOARG00020024206)	STK32B (ENSOARG00020024051)	EVC2 (ENSOARG00020024014)	EVC (ENSOARG00020023672)	CRMP1 (ENSOARG00020023499)	ENSOARG00020023479	ENSOARG00020023467	JAKMIP1 (ENSOARG00020023163)	WFS1 (ENSOARG00020023129) #22	PPP2R2C (ENSOARG00020023090) #23	ENSOARG00020022932	ENSOARG00020022892	DMP1 (ENSOARG00020022854)	DSPP (ENSOARG00020022784)	SPARCL1 (ENSOARG00020022579)	NUDT9 (ENSOARG00020022482)	ENSOARG00020022244	ENSOARG00020021968	AFF1 (ENSOARG00020021386)	C4orf36 (ENSOARG00020021226)	SLC10A6 (ENSOARG00020021292)	PTPN13 (ENSOARG00020019325)	ENSOARG00020019244	MAPK10 (ENSOARG00020018223)
Goat	MODERN SPECIES	25	OTOP1 (ENSCHIG00000019597)	TMEM128 (ENSCHIG00000011114)	LYAR (ENSCHIG00000020398)	ZBTB49 (ENSCHIG00000015069)	NSG1 (ENSCHIG00000008294)	STX18 (ENSCHIG00000020439)	MSX1 (ENSCHIG00000014094)	CYTL1 (ENSCHIG00000001722)	STK32B (ENSCHIG00000021477)	EVC2 (ENSCHIG00000014543)	EVC (ENSCHIG00000024455)	CRMP1 (ENSCHIG00000017354)	ENSCHIG00000008410	JAKMIP1 (ENSCHIG00000022605)	ENSCHIG00000014433	WFS1 (ENSCHIG00000025731) #22	PPP2R2C (ENSCHIG00000016344) #23	DMP1 (ENSCHIG00000024137)	DSPP (ENSCHIG00000016631)	SPARCL1 (ENSCHIG00000007139)	NUDT9 (ENSCHIG00000020346)	HSD17B11 (ENSCHIG00000011780)	HSD17B13 (ENSCHIG00000020775)	KLHL8 (ENSCHIG00000015495)	AFF1 (ENSCHIG00000008450)	C4orf36 (ENSCHIG00000020322)	SLC10A6 (ENSCHIG00000014126)	ENSCHIG00000001076	PTPN13 (ENSCHIG00000021006)	ENSCHIG00000013818	ENSCHIG00000003527
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1273	DRD5 (ENSMMSG00000022201)	OTOP1 (ENSMMSG00000022207)	TMEM128 (ENSMMSG00000022229)	ENSMMSG00000022248	ZBTB49 (ENSMMSG00000022265)	NSG1 (ENSMMSG00000022287)	STX18 (ENSMMSG00000022315)	MSX1 (ENSMMSG00000022332)	CYTL1 (ENSMMSG00000022341)	STK32B (ENSMMSG00000022366)	EVC2 (ENSMMSG00000014469)	EVC (ENSMMSG00000014574)	CRMP1 (ENSMMSG00000014696)	ENSMMSG00000014897	JAKMIP1 (ENSMMSG00000014962)	WFS1 (ENSMMSG00000015467) #22	PPP2R2C (ENSMMSG00000015500) #23	ENSMMSG00000015548	DMP1 (ENSMMSG00000015722)	ENSMMSG00000015791	SPARCL1 (ENSMMSG00000015840)	NUDT9 (ENSMMSG00000015898)	HSD17B11 (ENSMMSG00000015946)	HSD17B13 (ENSMMSG00000016012)	KLHL8 (ENSMMSG00000016116)	AFF1 (ENSMMSG00000016294)	C4orf36 (ENSMMSG00000016405)	SLC10A6 (ENSMMSG00000016456)	PTPN13 (ENSMMSG00000016540)	MAPK10 (ENSMMSG00000016767)	ARHGAP24 (ENSMMSG00000017490)