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Neopterygii	DUPLICATION
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Mummichog	MODERN SPECIES	2361	kctd16b (ENSFHEG00000004839) #7	yipf5 (ENSFHEG00000004828) #8	NR3C1 (ENSFHEG00000004809) #9	ARHGAP26 (ENSFHEG00000004749) #10	fgf1b (ENSFHEG00000004722) #11	ENSFHEG00000004700 #12	spry4 (ENSFHEG00000004686) #13	ndfip1l (ENSFHEG00000004674) #14	endou2 (ENSFHEG00000004652) #15	rnf14 (ENSFHEG00000004644) #16	hspa4a (ENSFHEG00000004628) #17	zcchc10 (ENSFHEG00000004550) #18	AFF4 (ENSFHEG00000004526) #19	ENSFHEG00000004475 #20	SOWAHA (ENSFHEG00000004469) #21	septin8a (ENSFHEG00000004452) #22	CCNI2 (ENSFHEG00000004412) #23	ENSFHEG00000004398 #24	GABRG2 (ENSFHEG00000004369) #25	gabra1 (ENSFHEG00000004328) #26
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Platyfish	MODERN SPECIES	2	GRXCR2 (ENSXMAG00000001509)	kctd16b (ENSXMAG00000001512) #7	yipf5 (ENSXMAG00000001514) #8	NR3C1 (ENSXMAG00000001522) #9	ARHGAP26 (ENSXMAG00000001526) #10	ENSXMAG00000001555 #11	spry4 (ENSXMAG00000029964) #13	ndfip1l (ENSXMAG00000029155) #14	endou2 (ENSXMAG00000001569) #15	rnf14 (ENSXMAG00000001585) #16	hspa4a (ENSXMAG00000001608) #17	zcchc10 (ENSXMAG00000025729) #18	AFF4 (ENSXMAG00000001642) #19	ENSXMAG00000001683 #20	SOWAHA (ENSXMAG00000023309) #21	septin8a (ENSXMAG00000001689) #22	CCNI2 (ENSXMAG00000001709) #23	GABRG2 (ENSXMAG00000001711) #25	gabra1 (ENSXMAG00000012611) #26	GABRA6 (ENSXMAG00000012573)	GABRB2 (ENSXMAG00000012500)	SH3PXD2B (ENSXMAG00000026895)	stk10 (ENSXMAG00000012460)	ENSXMAG00000012459	STK32A (ENSXMAG00000022149)	dpysl3 (ENSXMAG00000012409)	JAKMIP2 (ENSXMAG00000000345)	ENSXMAG00000012320	p4ha2 (ENSXMAG00000012283)	pdlim4 (ENSXMAG00000021198)	SLC34A1 (ENSXMAG00000028651)
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.r #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.g.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00940000168656	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a	ENSGT00940000177067	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	58	GRXCR2 (ENSKMAG00000010041)	kctd16b (ENSKMAG00000010051) #7	yipf5 (ENSKMAG00000010061) #8	NR3C1 (ENSKMAG00000010085) #9	ARHGAP26 (ENSKMAG00000010140) #10	fgf1b (ENSKMAG00000010169) #11	spry4 (ENSKMAG00000010183) #13	ndfip1l (ENSKMAG00000010223) #14	endou2 (ENSKMAG00000010243) #15	rnf14 (ENSKMAG00000010260) #16	hspa4a (ENSKMAG00000010299) #17	ENSKMAG00000010417	AFF4 (ENSKMAG00000010443) #19	ENSKMAG00000010515 #20	ENSKMAG00000010558 #21	septin8a (ENSKMAG00000010785) #22	CCNI2 (ENSKMAG00000010841) #23	GABRG2 (ENSKMAG00000010884) #25	gabra1 (ENSKMAG00000010965) #26	GABRA6 (ENSKMAG00000011013)	GABRB2 (ENSKMAG00000011052)	ENSKMAG00000011122	SH3PXD2B (ENSKMAG00000011254)	stk10 (ENSKMAG00000011349)	ENSKMAG00000011444	STK32A (ENSKMAG00000011476)	dpysl3 (ENSKMAG00000011518)	JAKMIP2 (ENSKMAG00000011601)	ENSKMAG00000011713	p4ha2 (ENSKMAG00000011787)	pdlim4 (ENSKMAG00000011827)
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.r #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.g.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.r #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.g.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b
Indian medaka	MODERN SPECIES	4	GRXCR2 (ENSOMEG00000005551)	kctd16b (ENSOMEG00000005525) #7	yipf5 (ENSOMEG00000005512) #8	NR3C1 (ENSOMEG00000005484) #9	ARHGAP26 (ENSOMEG00000000119) #10	ENSOMEG00000005336 #11	spry4 (ENSOMEG00000005320) #13	ndfip1l (ENSOMEG00000005304) #14	endou2 (ENSOMEG00000005264) #15	rnf14 (ENSOMEG00000005243) #16	hspa4a (ENSOMEG00000005193) #17	zcchc10 (ENSOMEG00000005102) #18	AFF4 (ENSOMEG00000005078) #19	ENSOMEG00000005013 #20	ENSOMEG00000000109 #21	septin8a (ENSOMEG00000004959) #22	CCNI2 (ENSOMEG00000004930) #23	GABRG2 (ENSOMEG00000004910) #25	gabra1 (ENSOMEG00000004870) #26	GABRA6 (ENSOMEG00000004845)	GABRB2 (ENSOMEG00000004814)	ins (ENSOMEG00000004777)	SH3PXD2B (ENSOMEG00000004742)	stk10 (ENSOMEG00000004657)	STK32B (ENSOMEG00000004589)	dpysl3 (ENSOMEG00000004566)	JAKMIP2 (ENSOMEG00000004516)	ENSOMEG00000004405	p4ha2 (ENSOMEG00000004357)	pdlim4 (ENSOMEG00000004320)	ENSOMEG00000004294
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	5	yipf5 (ENSOJAG00000013710) #8	NR3C1 (ENSOJAG00000013765) #9	ARHGAP26 (ENSOJAG00000013998) #10	ENSOJAG00000014311 #11	spry4 (ENSOJAG00000014322) #13	ndfip1l (ENSOJAG00000014339) #14	endou2 (ENSOJAG00000014466) #15	rnf14 (ENSOJAG00000014491) #16	hspa4a (ENSOJAG00000014533) #17	ENSOJAG00000014970	AFF4 (ENSOJAG00000014976) #19	ENSOJAG00000014993	ENSOJAG00000014998	ENSOJAG00000015017 #20	SOWAHA (ENSOJAG00000015024) #21	septin8a (ENSOJAG00000015153) #22	CCNI2 (ENSOJAG00000001727) #23	GABRG2 (ENSOJAG00000001922) #25	gabra1 (ENSOJAG00000002418) #26	GABRA6 (ENSOJAG00000002476)	GABRB2 (ENSOJAG00000002595)	ENSOJAG00000002644	SH3PXD2B (ENSOJAG00000002664)	ENSOJAG00000002716	ENSOJAG00000002726	stk10 (ENSOJAG00000002818)	STK32A (ENSOJAG00000003261)	dpysl3 (ENSOJAG00000004186)	JAKMIP2 (ENSOJAG00000006912)	ENSOJAG00000008904	p4ha2 (ENSOJAG00000009268)
Chinese medaka	MODERN SPECIES	1086												ENSOSIG00000005809	AFF4 (ENSOSIG00000005815) #19	ENSOSIG00000005845 #20	SOWAHA (ENSOSIG00000005849) #21	septin8a (ENSOSIG00000005893) #22	CCNI2 (ENSOSIG00000009396) #23
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.r #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.g.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a	ENSGT00390000015484.j	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000177390	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.r #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.g.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a	ENSGT00990000208311	ENSGT00390000015484.j	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.r #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.g.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a	ENSGT00990000208311	ENSGT00390000015484.j	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.r #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.g.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a	ENSGT00990000208311	ENSGT00390000015484.j	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	675					nr3c1 (ENSHBUG00000022339) #9	ARHGAP26 (ENSHBUG00000022295) #10	fgf1b (ENSHBUG00000022171) #11	spry4 (ENSHBUG00000022165) #13	ndfip1l (ENSHBUG00000022149) #14	rnf14 (ENSHBUG00000022134) #16	hspa4a (ENSHBUG00000022116) #17	ENSHBUG00000021997	AFF4 (ENSHBUG00000021987) #19	ENSHBUG00000021962 #20	ENSHBUG00000021938 #21	septin8a (ENSHBUG00000021911) #22	CCNI2 (ENSHBUG00000021802) #23
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.r #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.g.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a	ENSGT00390000015484.j	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b
P. nyererei	MODERN SPECIES	321	GRXCR2 (ENSPNYG00000015199)	kctd16b (ENSPNYG00000015182) #7	yipf5 (ENSPNYG00000015166) #8	NR3C1 (ENSPNYG00000015102) #9	ARHGAP26 (ENSPNYG00000015053) #10	fgf1b (ENSPNYG00000015037) #11	spry4 (ENSPNYG00000015015) #13	ndfip1l (ENSPNYG00000015004) #14	endou2 (ENSPNYG00000014962) #15	rnf14 (ENSPNYG00000014948) #16	hspa4a (ENSPNYG00000014879) #17	ENSPNYG00000014848	AFF4 (ENSPNYG00000014804) #19	ENSPNYG00000014768 #20	ENSPNYG00000014745 #21	septin8a (ENSPNYG00000014720) #22	CCNI2 (ENSPNYG00000014693) #23	GABRG2 (ENSPNYG00000014341) #25	gabra1 (ENSPNYG00000013948) #26	GABRA6 (ENSPNYG00000013821)	GABRB2 (ENSPNYG00000013807)	ENSPNYG00000013786	SH3PXD2B (ENSPNYG00000013756)	stk10 (ENSPNYG00000013695)	STK32A (ENSPNYG00000013637)	dpysl3 (ENSPNYG00000013597)	JAKMIP2 (ENSPNYG00000013557)	ENSPNYG00000013521	p4ha2 (ENSPNYG00000013496)	pdlim4 (ENSPNYG00000013459)	ENSPNYG00000013427
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.r #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.g.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a	ENSGT00390000015484.j	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.b
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1092	GRXCR2 (ENSMZEG00005002759)	kctd16b (ENSMZEG00005002773) #7	yipf5 (ENSMZEG00005002809) #8	NR3C1 (ENSMZEG00005002837) #9	ARHGAP26 (ENSMZEG00005002884) #10	fgf1b (ENSMZEG00005002955) #11	spry4 (ENSMZEG00005002964) #13	ndfip1l (ENSMZEG00005002978) #14	endou2 (ENSMZEG00005002993) #15	rnf14 (ENSMZEG00005003001) #16	hspa4a (ENSMZEG00005003031) #17	ENSMZEG00005003199	AFF4 (ENSMZEG00005003218) #19	ENSMZEG00005003270 #20	ENSMZEG00005003293 #21	septin8a (ENSMZEG00005003308) #22	CCNI2 (ENSMZEG00005003334) #23	ENSMZEG00005003363	ENSMZEG00005003402	fnip1 (ENSMZEG00005003527)	ENSMZEG00005003831	ENSMZEG00005003844	IRF1 (ENSMZEG00005003899)	ENSMZEG00005003953	ENSMZEG00005003961	slc22a21 (ENSMZEG00005003976)	ENSMZEG00005004051	ENSMZEG00005007999	pdlim4 (ENSMZEG00005008187)	p4ha2 (ENSMZEG00005008207)	ENSMZEG00005008248
Eastern happy	MODERN SPECIES	1	GRXCR2 (ENSACLG00000011061)	kctd16b (ENSACLG00000011152) #7	yipf5 (ENSACLG00000011153) #8	NR3C1 (ENSACLG00000011372) #9	ARHGAP26 (ENSACLG00000011418) #10	ENSACLG00000011470 #11	spry4 (ENSACLG00000011478) #13	ndfip1l (ENSACLG00000011694) #14	endou2 (ENSACLG00000011700) #15	rnf14 (ENSACLG00000011718) #16	hspa4a (ENSACLG00000011771) #17	zcchc10 (ENSACLG00000011863) #18	AFF4 (ENSACLG00000011879) #19	ENSACLG00000011946 #20	ENSACLG00000011984 #21	septin8a (ENSACLG00000012018) #22	CCNI2 (ENSACLG00000012033) #23	GABRG2 (ENSACLG00000012156) #25	gabra1 (ENSACLG00000012229) #26	GABRA6 (ENSACLG00000012245)	GABRB2 (ENSACLG00000012305)	ENSACLG00000012388	ENSACLG00000012516	SH3PXD2B (ENSACLG00000012542)	stk10 (ENSACLG00000012570)	STK32A (ENSACLG00000012684)	dpysl3 (ENSACLG00000012804)	JAKMIP2 (ENSACLG00000012898)	ENSACLG00000012978	p4ha2 (ENSACLG00000012990)	pdlim4 (ENSACLG00000013036)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	297	kctd16b (ENSNBRG00000005936) #7	yipf5 (ENSNBRG00000005967) #8	NR3C1 (ENSNBRG00000005976) #9	ARHGAP26 (ENSNBRG00000006023) #10	fgf1b (ENSNBRG00000006086) #11	spry4 (ENSNBRG00000006099) #13	ndfip1l (ENSNBRG00000006121) #14	endou2 (ENSNBRG00000006137) #15	rnf14 (ENSNBRG00000006194) #16	hspa4a (ENSNBRG00000006219) #17	ENSNBRG00000006271	ENSNBRG00000006285 #19	AFF4 (ENSNBRG00000006303) #19	ENSNBRG00000006340 #20	SOWAHA (ENSNBRG00000006356) #21	septin8a (ENSNBRG00000006377) #22	CCNI2 (ENSNBRG00000006398) #23	GABRG2 (ENSNBRG00000006435) #25	gabra1 (ENSNBRG00000006481) #26	GABRA6 (ENSNBRG00000006521)	GABRB2 (ENSNBRG00000006558)	ENSNBRG00000006599	SH3PXD2B (ENSNBRG00000006631)	stk10 (ENSNBRG00000006673)	STK32A (ENSNBRG00000006740)	dpysl3 (ENSNBRG00000006779)	JAKMIP2 (ENSNBRG00000006814)	ENSNBRG00000006879	ENSNBRG00000006909	p4ha2 (ENSNBRG00000006929)	pdlim4 (ENSNBRG00000006992)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	1	GRXCR2 (ENSONIG00000008490)	kctd16b (ENSONIG00000008488) #7	yipf5 (ENSONIG00000008486) #8	NR3C1 (ENSONIG00000008483) #9	ARHGAP26 (ENSONIG00000008473) #10	fgf1 (ENSONIG00000034360) #11	spry4 (ENSONIG00000031453) #13	ndfip1l (ENSONIG00000008465) #14	endou2 (ENSONIG00000008463) #15	rnf14 (ENSONIG00000008460) #16	hspa4a (ENSONIG00000008454) #17	zcchc10 (ENSONIG00000034478) #18	AFF4 (ENSONIG00000008446) #19	ENSONIG00000038607 #20	ENSONIG00000028267 #21	septin8a (ENSONIG00000008438) #22	CCNI2 (ENSONIG00000008437) #23	GABRG2 (ENSONIG00000008436) #25	gabra1 (ENSONIG00000008432) #26	GABRA6 (ENSONIG00000008427)	GABRB2 (ENSONIG00000043045)	ENSONIG00000032765	ENSONIG00000040583	ENSONIG00000008420	SH3PXD2B (ENSONIG00000008417)	stk10 (ENSONIG00000008412)	ENSONIG00000008411	JAKMIP2 (ENSONIG00000008393)	ENSONIG00000008405	dpysl3 (ENSONIG00000008397)	ENSONIG00000008381
Midas cichlid	MODERN SPECIES	469	kctd16b (ENSACIG00000011116) #7	yipf5 (ENSACIG00000011102) #8	NR3C1 (ENSACIG00000010799) #9	ARHGAP26 (ENSACIG00000010729) #10	fgf1b (ENSACIG00000010719) #11	spry4 (ENSACIG00000010709) #13	NDFIP1 (ENSACIG00000010692) #14	endou2 (ENSACIG00000010671) #15	rnf14 (ENSACIG00000010648) #16	hspa4a (ENSACIG00000010612) #17	zcchc10 (ENSACIG00000010605) #18	ENSACIG00000010592 #19	AFF4 (ENSACIG00000010525) #19	ENSACIG00000010486 #20	ENSACIG00000010472 #21	septin8a (ENSACIG00000009699) #22	CCNI2 (ENSACIG00000009603) #23	GABRG2 (ENSACIG00000009566) #25	gabra1 (ENSACIG00000009534) #26	GABRA6 (ENSACIG00000009502)	GABRB2 (ENSACIG00000009473)	ENSACIG00000009466	ENSACIG00000009445	ENSACIG00000009437	ENSACIG00000009434	SH3PXD2B (ENSACIG00000009402)	stk10 (ENSACIG00000009345)	STK32A (ENSACIG00000009315)	dpysl3 (ENSACIG00000009276)	JAKMIP2 (ENSACIG00000009224)	p4ha2 (ENSACIG00000009196)
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.r #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.g.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a	ENSGT00940000177067	ENSGT00390000015484.j	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000177390	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	264				ARHGAP26 (ENSSPAG00000011902) #10	fgf1b (ENSSPAG00000012115) #11	spry4 (ENSSPAG00000012134) #13	ndfip1l (ENSSPAG00000012139) #14	endou2 (ENSSPAG00000012174) #15	rnf14 (ENSSPAG00000012229) #16	hspa4a (ENSSPAG00000012268) #17	zcchc10 (ENSSPAG00000012331) #18	ENSSPAG00000012349 #19	AFF4 (ENSSPAG00000012370) #19	ENSSPAG00000012399 #20	ENSSPAG00000012417 #21	septin8a (ENSSPAG00000012437) #22	CCNI2 (ENSSPAG00000012486) #23	GABRG2 (ENSSPAG00000012522) #25	gabra1 (ENSSPAG00000012551) #26	GABRA6 (ENSSPAG00000012576)	GABRB2 (ENSSPAG00000012598)	ENSSPAG00000012630	ENSSPAG00000012748	SH3PXD2B (ENSSPAG00000012775)	stk10 (ENSSPAG00000012876)	ENSSPAG00000012902	ENSSPAG00000012913	dpysl3 (ENSSPAG00000012942)
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.r #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.g.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00940000168656	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a	ENSGT00940000177067	ENSGT00390000015484.j	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000177390	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695
Spiny chromis	MODERN SPECIES	296					ARHGAP26 (ENSAPOG00000006376) #10	fgf1b (ENSAPOG00000006357) #11	spry4 (ENSAPOG00000006344) #13	ndfip1l (ENSAPOG00000006306) #14	endou2 (ENSAPOG00000006250) #15	rnf14 (ENSAPOG00000006225) #16	hspa4a (ENSAPOG00000006201) #17	ENSAPOG00000006138	AFF4 (ENSAPOG00000006096) #19	ENSAPOG00000006054 #20	SOWAHA (ENSAPOG00000006036) #21	septin8a (ENSAPOG00000006030) #22	CCNI2 (ENSAPOG00000006004) #23
Orange clownfish	MODERN SPECIES	6	GRXCR2 (ENSAPEG00000017834)	kctd16b (ENSAPEG00000017863) #7	yipf5 (ENSAPEG00000017896) #8	NR3C1 (ENSAPEG00000017923) #9	ARHGAP26 (ENSAPEG00000017953) #10	ENSAPEG00000018031 #11	spry4 (ENSAPEG00000018043) #13	ndfip1l (ENSAPEG00000018059) #14	endou2 (ENSAPEG00000018083) #15	rnf14 (ENSAPEG00000018135) #16	hspa4a (ENSAPEG00000018179) #17	ENSAPEG00000018258	AFF4 (ENSAPEG00000018275) #19	ENSAPEG00000018318 #20	SOWAHA (ENSAPEG00000018334) #21	septin8a (ENSAPEG00000018357) #22	CCNI2 (ENSAPEG00000018394) #23	GABRG2 (ENSAPEG00000018442) #25	gabra1 (ENSAPEG00000018467) #26	GABRA6 (ENSAPEG00000018522)	GABRB2 (ENSAPEG00000018559)	ENSAPEG00000018752	ENSAPEG00000018893	SH3PXD2B (ENSAPEG00000018943)	stk10 (ENSAPEG00000019012)	ENSAPEG00000019104	STK32A (ENSAPEG00000019118)	dpysl3 (ENSAPEG00000019184)	JAKMIP2 (ENSAPEG00000019267)	ENSAPEG00000019390	p4ha2 (ENSAPEG00000019437)
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.r #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.g.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a	ENSGT00390000015484.j	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000177390	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.r #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.g.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a.g #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.kb	ENSGT00940000154245.A.jb.a	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000163251.a.b.a.d.a.a.c.b
Tetraodon	MODERN SPECIES	22	PLAC8L1 (ENSTNIG00000018213)	GRXCR2 (ENSTNIG00000018212)	kctd16b (ENSTNIG00000018211) #7	yipf5 (ENSTNIG00000018210) #8	NR3C1 (ENSTNIG00000018209) #9	ARHGAP26 (ENSTNIG00000018208) #10	ENSTNIG00000018207 #11	spry4 (ENSTNIG00000018206) #13	ndfip1l (ENSTNIG00000018205) #14	endou2 (ENSTNIG00000018204) #15	rnf14 (ENSTNIG00000018203) #16	ENSTNIG00000018202 #17	AFF4 (ENSTNIG00000018201) #19	ENSTNIG00000018200 #20	ENSTNIG00000018199 #21	septin8a (ENSTNIG00000018198) #22	CCNI2 (ENSTNIG00000018197) #23	GABRG2 (ENSTNIG00000018196) #25	gabra1 (ENSTNIG00000018195) #26	GABRA6 (ENSTNIG00000018194)	ENSTNIG00000004179	GABRB2 (ENSTNIG00000019742)	SH3PXD2B (ENSTNIG00000014255)	stk10 (ENSTNIG00000014256)	ENSTNIG00000014257	p4ha2 (ENSTNIG00000014258)	pdlim4 (ENSTNIG00000014259)	ENSTNIG00000014260	ENSTNIG00000014261	ENSTNIG00000000481	slc22a21 (ENSTNIG00000014262)
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	112								ndfip1l (ENSLBEG00000018139) #14	endou2 (ENSLBEG00000018069) #15	RNF14 (ENSLBEG00000018040) #16	hspa4a (ENSLBEG00000017953) #17	ENSLBEG00000017901	AFF4 (ENSLBEG00000017778) #19	ENSLBEG00000017731 #20	SOWAHA (ENSLBEG00000017721) #21	septin8a (ENSLBEG00000017693) #22	CCNI2 (ENSLBEG00000017648) #23	GABRG2 (ENSLBEG00000017579) #25	gabra1 (ENSLBEG00000017525) #26	GABRA6 (ENSLBEG00000017476)	GABRB2 (ENSLBEG00000017428)	ENSLBEG00000017394	SH3PXD2B (ENSLBEG00000017207)	stk10 (ENSLBEG00000017102)	ENSLBEG00000017048	STK32A (ENSLBEG00000016980)	dpysl3 (ENSLBEG00000016888)	JAKMIP2 (ENSLBEG00000016726)	ENSLBEG00000016646	ENSLBEG00000016614	p4ha2 (ENSLBEG00000016497)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.r #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.g.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a	ENSGT00390000015484.j	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000177390	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.r #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.g.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a	ENSGT00390000015484.j	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.r #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.g.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a	ENSGT00940000182424	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.h
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	493	GRXCR2 (ENSLCRG00005012196)	kctd16b (ENSLCRG00005012198) #7	yipf5 (ENSLCRG00005012201) #8	NR3C1 (ENSLCRG00005012202) #9	ARHGAP26 (ENSLCRG00005012211) #10	fgf1b (ENSLCRG00005012521) #11	spry4 (ENSLCRG00005012523) #13	ndfip1l (ENSLCRG00005012534) #14	endou2 (ENSLCRG00005012696) #15	rnf14 (ENSLCRG00005012699) #16	hspa4a (ENSLCRG00005012711) #17	zcchc10 (ENSLCRG00005014402) #18	AFF4 (ENSLCRG00005014406) #19	ENSLCRG00005014418 #20	SOWAHA (ENSLCRG00005014420) #21	septin8a (ENSLCRG00005014422) #22	CCNI2 (ENSLCRG00005014424) #23	GABRG2 (ENSLCRG00005014438) #25	gabra1 (ENSLCRG00005015321) #26	GABRA6 (ENSLCRG00005015558)	GABRB2 (ENSLCRG00005015579)	ENSLCRG00005015660	ENSLCRG00005015663	SH3PXD2B (ENSLCRG00005015667)	stk10 (ENSLCRG00005015688)	ENSLCRG00005017552	STK32A (ENSLCRG00005017554)	dpysl3 (ENSLCRG00005017564)	JAKMIP2 (ENSLCRG00005017759)	p4ha2 (ENSLCRG00005017856)	pdlim4 (ENSLCRG00005019760)
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.r #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.g.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a	ENSGT00390000015484.j	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000177390	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.r #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.g.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000158657	ENSGT00500000044966	ENSGT00500000044950	ENSGT00390000012905.d
Lumpfish	MODERN SPECIES	5	LARS1 (ENSCLMG00005011773)	PLAC8L1 (ENSCLMG00005011763)	kctd16b (ENSCLMG00005011762) #7	yipf5 (ENSCLMG00005011761) #8	NR3C1 (ENSCLMG00005011759) #9	ARHGAP26 (ENSCLMG00005003832) #10	ENSCLMG00005003768 #11	ndfip1l (ENSCLMG00005003702) #14	endou2 (ENSCLMG00005003700) #15	rnf14 (ENSCLMG00005003698) #16	hspa4a (ENSCLMG00005001879) #17	zcchc10 (ENSCLMG00005001857) #18	AFF4 (ENSCLMG00005001838) #19	ENSCLMG00005001837 #20	ENSCLMG00005001836 #21	septin8a (ENSCLMG00005001528) #22	CCNI2 (ENSCLMG00005017579) #23	GABRG2 (ENSCLMG00005017457) #25	gabra1 (ENSCLMG00005017336) #26	GABRA6 (ENSCLMG00005017312)	GABRB2 (ENSCLMG00005017276)	SH3PXD2B (ENSCLMG00005017271)	stk10 (ENSCLMG00005016706)	ENSCLMG00005016699	STK32A (ENSCLMG00005016645)	dpysl3 (ENSCLMG00005016253)	JAKMIP2 (ENSCLMG00005016242)	ENSCLMG00005016225	slc37a2 (ENSCLMG00005015275)	ENSCLMG00005015259	psmg1 (ENSCLMG00005015258)
Stickleback	MODERN SPECIES	7	GRXCR2 (ENSGACG00000020722)	kctd16b (ENSGACG00000020723) #7	yipf5 (ENSGACG00000020724) #8	NR3C1 (ENSGACG00000020725) #9	ARHGAP26 (ENSGACG00000020726) #10	fgf1b (ENSGACG00000020727) #11	spry4 (ENSGACG00000020728) #13	ndfip1l (ENSGACG00000020729) #14	endou2 (ENSGACG00000020730) #15	rnf14 (ENSGACG00000020731) #16	hspa4a (ENSGACG00000020732) #17	zcchc10 (ENSGACG00000020733) #18	AFF4 (ENSGACG00000020734) #19	ENSGACG00000020735 #20	ENSGACG00000020736 #21	septin8a (ENSGACG00000020737) #22	CCNI2 (ENSGACG00000020738) #23	GABRG2 (ENSGACG00000020739) #25	gabra1 (ENSGACG00000020740) #26	ENSGACG00000020741	GABRA6 (ENSGACG00000020742)	GABRB2 (ENSGACG00000020743)	SH3PXD2B (ENSGACG00000020744)	stk10 (ENSGACG00000020745)	STK32A (ENSGACG00000020746)	dpysl3 (ENSGACG00000020747)	JAKMIP2 (ENSGACG00000020748)	ENSGACG00000020749	slc37a2 (ENSGACG00000020750)	ENSGACG00000020751	psmg1 (ENSGACG00000020752)
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.r #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.g.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a	ENSGT00390000015484.j	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000177390	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536
Climbing perch	MODERN SPECIES	5	GRXCR2 (ENSATEG00000010553)	kctd16b (ENSATEG00000010581) #7	yipf5 (ENSATEG00000010591) #8	NR3C1 (ENSATEG00000010600) #9	ARHGAP26 (ENSATEG00000010645) #10	ENSATEG00000010742 #11	SPRY4 (ENSATEG00000025572) #13	NDFIP1 (ENSATEG00000010763) #14	ENSATEG00000010793 #15	RNF14 (ENSATEG00000010831) #16	hspa4a (ENSATEG00000010850) #17	zcchc10 (ENSATEG00000010945) #18	AFF4 (ENSATEG00000010963) #19	ENSATEG00000010997 #20	ENSATEG00000029418 #21	septin8a (ENSATEG00000011056) #22	CCNI2 (ENSATEG00000011108) #23	GABRG2 (ENSATEG00000011122) #25	gabra1 (ENSATEG00000011169) #26	GABRA6 (ENSATEG00000011194)	GABRB2 (ENSATEG00000011255)	ENSATEG00000011293	ENSATEG00000028443	ENSATEG00000011321	ENSATEG00000011335	stk10 (ENSATEG00000011440)	ENSATEG00000011538	STK32A (ENSATEG00000011554)	dpysl3 (ENSATEG00000011595)	JAKMIP2 (ENSATEG00000011653)	p4ha2 (ENSATEG00000011722)
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	5	PLAC8L1 (ENSBSLG00000002418)	GRXCR2 (ENSBSLG00000002396)	kctd16b (ENSBSLG00000002377) #7	yipf5 (ENSBSLG00000002332) #8	NR3C1 (ENSBSLG00000025292) #9	ARHGAP26 (ENSBSLG00000025286) #10	spry4 (ENSBSLG00000025277) #13	ndfip1l (ENSBSLG00000025271) #14	endou2 (ENSBSLG00000025268) #15	rnf14 (ENSBSLG00000025265) #16	hspa4a (ENSBSLG00000025211) #17	zcchc10 (ENSBSLG00000025203) #18	AFF4 (ENSBSLG00000025201) #19	ENSBSLG00000025200 #20	ENSBSLG00000025199 #21	septin8a (ENSBSLG00000025151) #22	CCNI2 (ENSBSLG00000025141) #23	ENSBSLG00000025138	ENSBSLG00000025135	ENSBSLG00000025134	ENSBSLG00000025131	ENSBSLG00000025128	ENSBSLG00000025127	ENSBSLG00000025121	ENSBSLG00000025120	ENSBSLG00000025117	GABRG2 (ENSBSLG00000025008) #25	gabra1 (ENSBSLG00000024666) #26	GABRA6 (ENSBSLG00000024626)	GABRB2 (ENSBSLG00000024551)	ENSBSLG00000024500
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	5	kctd16b (ENSMAMG00000021397) #7	yipf5 (ENSMAMG00000024924) #8	NR3C1 (ENSMAMG00000021400) #9	ARHGAP26 (ENSMAMG00000021404) #10	ENSMAMG00000021411 #11	ENSMAMG00000008160	SPRY4 (ENSMAMG00000024910) #13	NDFIP1 (ENSMAMG00000027588) #14	ENSMAMG00000021425 #15	RNF14 (ENSMAMG00000021429) #16	hspa4a (ENSMAMG00000021436) #17	zcchc10 (ENSMAMG00000021448) #18	AFF4 (ENSMAMG00000021453) #19	ENSMAMG00000021459 #20	ENSMAMG00000021462 #21	septin8a (ENSMAMG00000021464) #22	CCNI2 (ENSMAMG00000021468) #23	ENSMAMG00000025987	GABRG2 (ENSMAMG00000021473) #25	gabra1 (ENSMAMG00000021477) #26	GABRA6 (ENSMAMG00000021483)	GABRB2 (ENSMAMG00000021487)	ENSMAMG00000024376	ENSMAMG00000024693	ENSMAMG00000021501	stk10 (ENSMAMG00000021508)	ENSMAMG00000028044	STK32A (ENSMAMG00000021514)	dpysl3 (ENSMAMG00000021522)	JAKMIP2 (ENSMAMG00000021536)	p4ha2 (ENSMAMG00000021549)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.r #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.g.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a	ENSGT00940000164327.a	ENSGT00390000015484.j	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000177390	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.r #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.g.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a	ENSGT00940000164327.a	ENSGT00390000015484.j	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000177390	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.r #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.g.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a	ENSGT00940000164327.a	ENSGT00390000015484.j	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000177390	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3182	GRXCR2 (ENSSLDG00000007195)	kctd16b (ENSSLDG00000007214) #7	yipf5 (ENSSLDG00000007233) #8	NR3C1 (ENSSLDG00000007270) #9	ARHGAP26 (ENSSLDG00000007338) #10	ENSSLDG00000007455 #11	spry4 (ENSSLDG00000007475) #13	ndfip1l (ENSSLDG00000007502) #14	endou2 (ENSSLDG00000007540) #15	rnf14 (ENSSLDG00000007562) #16	hspa4a (ENSSLDG00000007611) #17	zcchc10 (ENSSLDG00000007657) #18	AFF4 (ENSSLDG00000007683) #19	ENSSLDG00000007763 #20	SOWAHA (ENSSLDG00000007803) #21	septin8a (ENSSLDG00000007839) #22	CCNI2 (ENSSLDG00000007903) #23	GABRG2 (ENSSLDG00000007939) #25	gabra1 (ENSSLDG00000008029) #26	GABRA6 (ENSSLDG00000008075)	GABRB2 (ENSSLDG00000008129)	ins (ENSSLDG00000008164)	ENSSLDG00000008197	SH3PXD2B (ENSSLDG00000008255)	stk10 (ENSSLDG00000008328)	ENSSLDG00000008372	STK32A (ENSSLDG00000008385)	dpysl3 (ENSSLDG00000008413)	JAKMIP2 (ENSSLDG00000008489)	ENSSLDG00000008605	p4ha2 (ENSSLDG00000008672)
Greater amberjack	MODERN SPECIES	139					ARHGAP26 (ENSSDUG00000019202) #10	ENSSDUG00000019317 #11	spry4 (ENSSDUG00000019324) #13	ndfip1l (ENSSDUG00000019333) #14	endou2 (ENSSDUG00000019368) #15	rnf14 (ENSSDUG00000019373) #16	hspa4a (ENSSDUG00000019408) #17	zcchc10 (ENSSDUG00000019487) #18	AFF4 (ENSSDUG00000019498) #19	ENSSDUG00000019549 #20	SOWAHA (ENSSDUG00000019599) #21	septin8a (ENSSDUG00000019607) #22	CCNI2 (ENSSDUG00000019631) #23	GABRG2 (ENSSDUG00000019640) #25	gabra1 (ENSSDUG00000019654) #26	GABRA6 (ENSSDUG00000019671)	GABRB2 (ENSSDUG00000019683)	ins (ENSSDUG00000019701)	ENSSDUG00000019711	SH3PXD2B (ENSSDUG00000019717)	stk10 (ENSSDUG00000019762)	ENSSDUG00000019843	STK32A (ENSSDUG00000019864)	dpysl3 (ENSSDUG00000019910)	JAKMIP2 (ENSSDUG00000019999)	ENSSDUG00000020087	p4ha2 (ENSSDUG00000020111)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	94	GRXCR2 (ENSLCAG00010019890)	kctd16b (ENSLCAG00010019888) #7	yipf5 (ENSLCAG00010019885) #8	NR3C1 (ENSLCAG00010019875) #9	ARHGAP26 (ENSLCAG00010019798) #10	ENSLCAG00010019779 #11	spry4 (ENSLCAG00010019778) #13	ndfip1l (ENSLCAG00010019752) #14	endou2 (ENSLCAG00010019736) #15	rnf14 (ENSLCAG00010019733) #16	hspa4a (ENSLCAG00010018546) #17	zcchc10 (ENSLCAG00010018286) #18	AFF4 (ENSLCAG00010018272) #19	ENSLCAG00010018267 #20	ENSLCAG00010018262 #21	septin8a (ENSLCAG00010018253) #22	CCNI2 (ENSLCAG00010018242) #23	GABRG2 (ENSLCAG00010018198) #25	gabra1 (ENSLCAG00010018189) #26	GABRA6 (ENSLCAG00010018184)	GABRB2 (ENSLCAG00010018176)	ins (ENSLCAG00010018166)	ENSLCAG00010018163	ENSLCAG00010018160	SH3PXD2B (ENSLCAG00010018154)	stk10 (ENSLCAG00010018097)	ENSLCAG00010018059	STK32A (ENSLCAG00010018055)	dpysl3 (ENSLCAG00010017308)	JAKMIP2 (ENSLCAG00010017187)	ENSLCAG00010017150
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.r #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.g.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a	ENSGT00940000164327.a	ENSGT00390000015484.j	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000177390	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.q.a ##10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a.h ##14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.kb	ENSGT00390000015484.j	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000163251.a.b.a
Salmoninae	DUPLICATION
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Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00510000046929.b.d	ENSGT00390000012163.c	ENSGT00940000160864.a	ENSGT00940000156071.b.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a.d #8	ENSGT00940000156385.b.f #9	ENSGT00940000157254.q.b.a.a ##10	ENSGT00950000183055.b.b.e #13	ENSGT00390000012721.a.h.b ##14	ENSGT00530000063825.A.d.c #15	ENSGT00940000154507.s.e #16	ENSGT00940000156067.g.a.j #17	ENSGT00730000111200.ib #18	ENSGT00950000182974.a.a.b.m #19	ENSGT00940000160656.i #20	ENSGT00940000156068.i.a #22	ENSGT00940000162679.g #23	ENSGT00940000156685.w #25	ENSGT00940000159136.n #26	ENSGT00940000156722.a.c	ENSGT00940000154245.A.kb.c.a	ENSGT00550000074618.a.a.mb.a	ENSGT00940000156580.c	ENSGT00940000157177.b	ENSGT00940000158570.n	ENSGT00940000164397.b.c	ENSGT00950000182924.B.a.b.b	ENSGT00950000183068.a.b.c.c	ENSGT00390000013087	ENSGT00390000016589.d	ENSGT00520000055616.a.e
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Huchen	MODERN SPECIES	82						ENSHHUG00000028034 ##10	ENSHHUG00000028011 #11	spry4 (ENSHHUG00000027983) #13	ndfip1l (ENSHHUG00000027971) ##14	endou2 (ENSHHUG00000027922) #15	RNF14 (ENSHHUG00000027912) #16	hspa4a (ENSHHUG00000027635) #17	zcchc10 (ENSHHUG00000027629) #18	AFF4 (ENSHHUG00000027608) #19	ENSHHUG00000027600 #20	septin8a (ENSHHUG00000027329) #22	CCNI2 (ENSHHUG00000027319) #23	GABRG2 (ENSHHUG00000026936) #25	gabra1 (ENSHHUG00000026758) #26	GABRA6 (ENSHHUG00000026724)	GABRB2 (ENSHHUG00000026719)	ENSHHUG00000026709	SH3PXD2B (ENSHHUG00000026682)	stk10 (ENSHHUG00000026610)	STK32A (ENSHHUG00000026587)	dpysl3 (ENSHHUG00000025989)	JAKMIP2 (ENSHHUG00000025905)	p4ha2 (ENSHHUG00000025483)	pdlim4 (ENSHHUG00000025464)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b.a #7	ENSGT00940000153168.C.a.a.c #8	ENSGT00940000156385.b.e #9	ENSGT00940000157254.q.a ##10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b.f #13	ENSGT00390000012721.a.h.a ##14	ENSGT00530000063825.A.d.d #15	ENSGT00940000154507.s.f #16	ENSGT00940000156067.g.a.i #17	ENSGT00730000111200.hb #18	ENSGT00950000182974.a.a.b.n #19	ENSGT00940000160656.j #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i.b #22	ENSGT00940000162679.h #23	ENSGT00940000156685.x #25	ENSGT00940000159136.m #26	ENSGT00940000156722.a.d	ENSGT00940000154245.A.kb.c.b	ENSGT00940000158396.b	ENSGT00940000156818.`c.a	ENSGT00390000016221.yb	ENSGT00940000158185.h.a	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a.b	ENSGT00940000153713.B.d.k	ENSGT00940000157695.o.a	ENSGT00940000159536.a	ENSGT00940000163251.a.b.a	ENSGT00940000163251.a.a
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b.a #7	ENSGT00940000153168.C.a.a.c #8	ENSGT00940000156385.b.e #9	ENSGT00940000157254.q.a ##10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b.f #13	ENSGT00390000012721.a.h.a ##14	ENSGT00530000063825.A.d.d #15	ENSGT00940000154507.s.f #16	ENSGT00940000156067.g.a.i #17	ENSGT00730000111200.hb #18	ENSGT00950000182974.a.a.b.n #19	ENSGT00940000160656.j #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i.b #22	ENSGT00940000162679.h #23	ENSGT00940000156685.x #25	ENSGT00940000159136.m #26	ENSGT00940000156722.a.d	ENSGT00940000154245.A.kb.c.b	ENSGT00940000158396.b	ENSGT00940000156818.`c.a	ENSGT00390000016221.yb	ENSGT00940000158185.h.a	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a.b	ENSGT00940000153713.B.d.k	ENSGT00940000157695.o.a	ENSGT00940000159536.a	ENSGT00940000163251.a.b.a	ENSGT00940000163251.a.a
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b.a #7	ENSGT00940000153168.C.a.a.c #8	ENSGT00940000156385.b.e #9	ENSGT00940000157254.q.a ##10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b.f #13	ENSGT00390000012721.a.h.a ##14	ENSGT00530000063825.A.d.d #15	ENSGT00940000154507.s.f #16	ENSGT00940000156067.g.a.i #17	ENSGT00730000111200.hb #18	ENSGT00950000182974.a.a.b.n #19	ENSGT00940000160656.j #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i.b #22	ENSGT00940000162679.h #23	ENSGT00940000156685.x #25	ENSGT00940000159136.m #26	ENSGT00940000156722.a.d	ENSGT00940000154245.A.kb.c.b	ENSGT00940000158396.b	ENSGT00940000156818.`c.a	ENSGT00390000016221.yb	ENSGT00940000158185.h.a	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a.b	ENSGT00940000153713.B.d.k	ENSGT00940000157695.o.a	ENSGT00940000159536.a	ENSGT00940000163251.a.b.a	ENSGT00940000163251.a.a
Rainbow trout	MODERN SPECIES	1	NR3C1 (ENSOMYG00000031572) #9	ARHGAP26 (ENSOMYG00000031827) ##10	ENSOMYG00000031854 #11	ENSOMYG00000060773	ENSOMYG00000061901	SPRY4 (ENSOMYG00000031862) #13	nfip1 (ENSOMYG00000031901) ##14	ENSOMYG00000067761 #15	RNF14 (ENSOMYG00000031947) #16	hspa4a (ENSOMYG00000032117) #17	zcchc10 (ENSOMYG00000032505) #18	AFF4 (ENSOMYG00000032517) #19	ENSOMYG00000032527	ENSOMYG00000032528 #20	SOWAHA (ENSOMYG00000032535) #21	septin8a (ENSOMYG00000032597) #22	ENSOMYG00000032699 #23	ENSOMYG00000066971	GABRG2 (ENSOMYG00000032827) #25	ENSOMYG00000058530	gabra1 (ENSOMYG00000055306) #26	GABRA6 (ENSOMYG00000064866)	GABRB2 (ENSOMYG00000033545)	ENSOMYG00000059998	ENSOMYG00000033923	stk10 (ENSOMYG00000034063)	ENSOMYG00000034161	STK32A (ENSOMYG00000034172)	dpysl3 (ENSOMYG00000034680)	JAKMIP2 (ENSOMYG00000041188)	p4ha2 (ENSOMYG00000041283)
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b.a #7	ENSGT00940000153168.C.a.a.c #8	ENSGT00940000156385.b.e #9	ENSGT00940000157254.q.a ##10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b.f #13	ENSGT00390000012721.a.h.a ##14	ENSGT00530000063825.A.d.d #15	ENSGT00940000154507.s.f #16	ENSGT00940000156067.g.a.i #17	ENSGT00730000111200.hb #18	ENSGT00950000182974.a.a.b.n #19	ENSGT00940000160656.j #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i.b #22	ENSGT00940000162679.h #23	ENSGT00940000156685.x #25	ENSGT00940000159136.m #26	ENSGT00940000156722.a.d	ENSGT00940000154245.A.kb.c.b	ENSGT00940000158396.b	ENSGT00940000156818.`c.a	ENSGT00940000158185.h.a	ENSGT00390000016221.yb	ENSGT00940000158185.g	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a.b	ENSGT00940000153713.B.d.k	ENSGT00940000157695.o.a	ENSGT00940000159536.a	ENSGT00940000163251.a.b.a
Chinook salmon	MODERN SPECIES	23	spry4 (ENSOTSG00005003872) #13	ENSOTSG00005003874	RNF145 (ENSOTSG00005003879)	UBLCP1 (ENSOTSG00005004012)	ENSOTSG00005004014	ubtd2 (ENSOTSG00005004017)	adrb2b (ENSOTSG00005004018)	NDFIP1 (ENSOTSG00005004020) ##14	endou2 (ENSOTSG00005004263) #15	ENSOTSG00005004266 #16	hspa4a (ENSOTSG00005004283) #17	zcchc10 (ENSOTSG00005005069) #18	AFF4 (ENSOTSG00005005070) #19	ENSOTSG00005005072 #20	SOWAHA (ENSOTSG00005005073) #21	septin8a (ENSOTSG00005005081) #22	ENSOTSG00005007417 #23	GABRG2 (ENSOTSG00005007418) #25	gabra1 (ENSOTSG00005007419) #26	GABRA6 (ENSOTSG00005007420)	GABRB2 (ENSOTSG00005007421)	ENSOTSG00005007422	SH3PXD2B (ENSOTSG00005007427)	stk10 (ENSOTSG00005007860)	STK32A (ENSOTSG00005008643)	dpysl3 (ENSOTSG00005008657)	JAKMIP2 (ENSOTSG00005008901)	p4ha2 (ENSOTSG00005008934)	pdlim4 (ENSOTSG00005013551)	ENSOTSG00005013564	ENSOTSG00005020526
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b.a #7	ENSGT00940000153168.C.a.a.c #8	ENSGT00940000156385.b.e #9	ENSGT00940000157254.q.a ##10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b.f #13	ENSGT00390000012721.a.h.a ##14	ENSGT00530000063825.A.d.d #15	ENSGT00940000154507.s.f #16	ENSGT00940000156067.g.a.i #17	ENSGT00940000168656	ENSGT00950000182974.a.a.b.n #19	ENSGT00940000160656.j #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i.b #22	ENSGT00940000162679.h #23	ENSGT00940000156685.x #25	ENSGT00940000159136.m #26	ENSGT00940000156722.a.d	ENSGT00940000154245.A.kb.c.b	ENSGT00940000158396.b	ENSGT00940000156818.`c.a	ENSGT00390000016221.yb	ENSGT00940000158185.h.a	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a.b	ENSGT00940000153713.B.d.k	ENSGT00940000157695.o.a	ENSGT00940000159536.a	ENSGT00940000163251.a.b.a	ENSGT00940000163251.a.a
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	23	NR3C1 (ENSSSAG00000078999) #9	ARHGAP26 (ENSSSAG00000078318) ##10	FGF1 (ENSSSAG00000078271) #11	ENSSSAG00000110087	SPRY4 (ENSSSAG00000104116) #13	NDFIP1 (ENSSSAG00000078235) ##14	ENSSSAG00000078231 #15	RNF14 (ENSSSAG00000078228) #16	ENSSSAG00000078223	ENSSSAG00000078016 #17	ENSSSAG00000103528	ZCH10 (ENSSSAG00000077977)	ENSSSAG00000077858 #19	ENSSSAG00000077845 #20	SOWAHA (ENSSSAG00000077842) #21	sept8 (ENSSSAG00000076438) #22	ENSSSAG00000076407 #23	GABRG2 (ENSSSAG00000075824) #25	gabra1 (ENSSSAG00000075796) #26	GABRA6 (ENSSSAG00000075791)	GABRB2 (ENSSSAG00000045443)	ENSSSAG00000075758	stk10 (ENSSSAG00000083798)	ENSSSAG00000085788	STK32A (ENSSSAG00000075742)	dpysl3 (ENSSSAG00000055483)	JAKMIP2 (ENSSSAG00000072244)	ENSSSAG00000119675	p4ha2 (ENSSSAG00000068099)	pdli4 (ENSSSAG00000068047)	ENSSSAG00000068009
Northern pike	MODERN SPECIES	6	NR3C1 (ENSELUG00000023409) #9	ARHGAP26 (ENSELUG00000023519) #10	ARHGAP26 (ENSELUG00000029002) #10	fgf1b (ENSELUG00000023539) #11	spry4 (ENSELUG00000023554) #13	ndfip1l (ENSELUG00000033033) ##14	endou2 (ENSELUG00000023584) #15	rnf14 (ENSELUG00000023620) #16	hspa4a (ENSELUG00000023695) #17	zcchc10 (ENSELUG00000023728) #18	AFF4 (ENSELUG00000023871) #19	ENSELUG00000024882	ENSELUG00000028348	ENSELUG00000023915 #20	SOWAHA (ENSELUG00000023939) #21	septin8a (ENSELUG00000023981) #22	CCNI2 (ENSELUG00000024000) #23	GABRG2 (ENSELUG00000024074) #25	gabra1 (ENSELUG00000024116) #26	GABRA6 (ENSELUG00000024139)	GABRB2 (ENSELUG00000001023)	SH3PXD2B (ENSELUG00000024231)	stk10 (ENSELUG00000024266)	ENSELUG00000024280	STK32A (ENSELUG00000001337)	dpysl3 (ENSELUG00000024377)	JAKMIP2 (ENSELUG00000024543)	ENSELUG00000024575	ENSELUG00000005671	ENSELUG00000032923	nsrp1 (ENSELUG00000005731)
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.kb	ENSGT00390000015484.j	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000163251.a.b.a
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	137	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00390000001134.b.`b.b	ENSGT00940000158972	ENSGT00940000157904.b	ENSGT00940000158388.a.a	ENSGT00530000063000.a.b.a	ENSGT00940000160883.a	ENSGT00990000210151	ENSGT01060000248564.b.a.b.b.b.b	ENSGT00950000182962.a.b.b	ENSGT01050000244937.a.b.a.b
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	60	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00390000001134.b.`b.b	ENSGT00940000158972	ENSGT00940000157904.b	ENSGT00940000158388.a.a	ENSGT00530000063000.a.b.a	ENSGT00940000160883.a	ENSGT01060000248564.b.a.b.b.b.b	ENSGT00950000182962.a.b.b	ENSGT01050000244937.a.b.a.b	ENSGT00390000013075.a	ENSGT00940000158195	ENSGT00390000010397.a	ENSGT00390000007430	ENSGT00940000154783
Channel catfish	DUPLICATION
Channel catfish	MODERN SPECIES	9	grxcr2 (ENSIPUG00000010891)	kctd16 (ENSIPUG00000010898) #7	yipf5 (ENSIPUG00000010902) #8	nr3c1 (ENSIPUG00000010944) #9	ARHGAP26 (ENSIPUG00000010994) #10	Fgf1 (ENSIPUG00000011328) #11	spry4 (ENSIPUG00000011350) #13	NFI1L (ENSIPUG00000011367) #14	endou2 (ENSIPUG00000011459) #15	rnf14 (ENSIPUG00000011466) #16	HSPA4 (ENSIPUG00000011525) #17	Zcchc10 (ENSIPUG00000011660)	aff4 (ENSIPUG00000011689) #19	ENSIPUG00000011720 #20	ENSIPUG00000011754 #21	septin8a (ENSIPUG00000011782) #22	stk26 (ENSIPUG00000011923)	tmem185a (ENSIPUG00000011988)	HTR2C (ENSIPUG00000012032)	ENSIPUG00000012063	GPR12 (ENSIPUG00000012125)	ENSIPUG00000012132	gucy2f (ENSIPUG00000012144)	ENSIPUG00000012166	atg4a (ENSIPUG00000012181)	ANKRD46 (ENSIPUG00000012223)	ENSIPUG00000012244	rbm27 (ENSIPUG00000012280)	pou4f3 (ENSIPUG00000012516)	rad50 (ENSIPUG00000012572)	drd1b (ENSIPUG00000012849)
Channel catfish	MODERN SPECIES	3	nelfcd (ENSIPUG00000010728)	AAMP (ENSIPUG00000010704)	fam210b (ENSIPUG00000010690)	FBXL3 (ENSIPUG00000010676)	caskb (ENSIPUG00000010623)	abcc4 (ENSIPUG00000010571)	ENSIPUG00000010555	GPR180 (ENSIPUG00000010525)	TGDS (ENSIPUG00000010461)	SLC19A1 (ENSIPUG00000010418)	ENSIPUG00000010165	ddx3xb (ENSIPUG00000009936)	kdm6al (ENSIPUG00000005102)	prelid3b (ENSIPUG00000004788)	slc32a1 (ENSIPUG00000004778)	septin8a (ENSIPUG00000004772) #22	ENSIPUG00000004759	inha (ENSIPUG00000004751)	gjc4a.1 (ENSIPUG00000004675)	STK11IP (ENSIPUG00000004620)	igfbp2a (ENSIPUG00000004584)	IGFBP5 (ENSIPUG00000004559)	wbp4 (ENSIPUG00000004525)	ENSIPUG00000004507	ENSIPUG00000004500	Nufip1 (ENSIPUG00000004479)	ENSIPUG00000004466	ahcy-b (ENSIPUG00000004424)	nhej1 (ENSIPUG00000004365)	bin1b (ENSIPUG00000004347)	chmp4ba (ENSIPUG00000004312)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00390000001134.b.`b.b	ENSGT00940000158972	ENSGT00940000157904.b	ENSGT00940000158388.a.a	ENSGT00940000157094	ENSGT00940000164076.a.a	ENSGT00530000063000.a.b.a	ENSGT00940000160883.a	ENSGT01060000248564.b.a.b.b.b.b	ENSGT00950000182962.a.b.b	ENSGT01050000244937.a.b.a.b	ENSGT00390000013075.a	ENSGT00940000158195	ENSGT00390000010397.a
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.g.a.a #17	ENSGT00940000168656	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00390000001134.b.`b.b	ENSGT00940000158972	ENSGT00940000157904.b	ENSGT00940000158388.a.a	ENSGT00940000157094	ENSGT00940000164076.a.a	ENSGT00530000063000.a.b.a	ENSGT00940000160883.a	ENSGT01060000248564.b.a.b.b.b.b	ENSGT00950000182962.a.b.b	ENSGT01050000244937.a.b.a.b	ENSGT00390000013075.a	ENSGT00940000158195	ENSGT00390000010397.a
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	129				ENSAMXG00000040962 #10	fgf1b (ENSAMXG00000043639) #11	spry4 (ENSAMXG00000024962) #13	ndfip1l (ENSAMXG00000037274) #14	endou2 (ENSAMXG00000020081) #15	rnf14 (ENSAMXG00000020091) #16	hspa4a (ENSAMXG00000020109) #17	ENSAMXG00000020130	ENSAMXG00000029234	AFF4 (ENSAMXG00000020137) #19	ENSAMXG00000041446 #20	SOWAHA (ENSAMXG00000034243) #21	septin8a (ENSAMXG00000020162) #22	CCNI2 (ENSAMXG00000035660) #23	ENSAMXG00000032265	ENSAMXG00000020185	frmd7 (ENSAMXG00000020194)	stk26 (ENSAMXG00000036199)	tmem185 (ENSAMXG00000035538)	ANKRD46 (ENSAMXG00000042450)	atg4a (ENSAMXG00000020240)
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	73	GRXCR2 (ENSPNAG00000005035)	kctd16b (ENSPNAG00000026987) #7	yipf5 (ENSPNAG00000026975) #8	NR3C1 (ENSPNAG00000005159) #9	ARHGAP26 (ENSPNAG00000006266) #10	fgf1b (ENSPNAG00000026613) #11	spry4 (ENSPNAG00000026599) #13	ndfip1l (ENSPNAG00000026565) #14	endou2 (ENSPNAG00000026537) #15	rnf14 (ENSPNAG00000004066) #16	hspa4a (ENSPNAG00000004058) #17	ENSPNAG00000026350	AFF4 (ENSPNAG00000004777) #19	ENSPNAG00000026258 #20	SOWAHA (ENSPNAG00000005600) #21	septin8a (ENSPNAG00000005865) #22	CCNI2 (ENSPNAG00000006260) #23	frmd7 (ENSPNAG00000026085)	stk26 (ENSPNAG00000005204)	tmem185 (ENSPNAG00000025933)	ANKRD46 (ENSPNAG00000025887)	atg4a (ENSPNAG00000025863)	ENSPNAG00000003963	ENSPNAG00000025795	ENSPNAG00000005258	ENSPNAG00000025752	ENSPNAG00000025726	ENSPNAG00000025713	ENSPNAG00000025694	rnf121 (ENSPNAG00000025675)	kif4 (ENSPNAG00000003939)
Electric eel	MODERN SPECIES	13										ENSEEEG00000020886	ENSEEEG00000020885 #17	zcchc10 (ENSEEEG00000020884) #18	AFF4 (ENSEEEG00000020881) #19	ENSEEEG00000020879 #20	ENSEEEG00000020878 #21	septin8a (ENSEEEG00000020702) #22	CCNI2 (ENSEEEG00000020694) #23	stk26 (ENSEEEG00000020642)	tmem185 (ENSEEEG00000020638)	ANKRD46 (ENSEEEG00000020635)	atg4a (ENSEEEG00000020632)	ENSEEEG00000020629	ENSEEEG00000020626	ENSEEEG00000020623	ENSEEEG00000020622	ENSEEEG00000020620	ENSEEEG00000020615	rnf121 (ENSEEEG00000020609)	kif4 (ENSEEEG00000020603)	ammecr1 (ENSEEEG00000020596)	TMEM164 (ENSEEEG00000020594)
Cyprinoidei	DUPLICATION
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	136	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a.mb	ENSGT00390000012652.v.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499.k	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000158124	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c #21	ENSGT00940000156068.i.e #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00390000001134.b.`b.b	ENSGT00940000158972	ENSGT00940000157904.b	ENSGT00940000158388.a.a	ENSGT00530000063582.a	ENSGT00510000047092	ENSGT00940000159536	ENSGT00390000001803	ENSGT00940000155150.b.b	ENSGT00940000164078.a.b.a.a	ENSGT00940000166125	ENSGT00390000006178	ENSGT00940000153727.b	ENSGT00940000174470
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	434										ENSGT00940000158124.c.b	ENSGT00940000156067.g.a.c #17	ENSGT00940000168656.a	ENSGT00950000182974.a.a.b.l #19	ENSGT00940000160656.f #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c.c #21	ENSGT00940000156068.i.e.a #22	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c.d #21	ENSGT00940000156068.j.b ##22	ENSGT00940000156068.i.f #22	ENSGT00940000162679.f #23	ENSGT00940000157904.b.b	ENSGT00940000158388.a.a	ENSGT00940000157094.z	ENSGT00530000063000.a.b.a.b	ENSGT00940000160883.a	ENSGT00950000182963.b.b.p	ENSGT01060000248564.b.a.b.b.b.b	ENSGT00950000182962.a.b.b.b	ENSGT01050000244937.a.b.a.b.a	ENSGT00530000063582.a.c.a	ENSGT00510000047092.s
Common carp reference	MODERN SPECIES	45	ppp2cab (ENSCCRG00000014111)	skp1 (ENSCCRG00000055740)	tcf7 (ENSCCRG00000077815)	vdac1 (ENSCCRG00000010598)	ENSCCRG00000068138	ENSCCRG00000021343	FSTL4 (ENSCCRG00000024272)	ENSCCRG00000077873	ENSCCRG00000011098	hspa4a (ENSCCRG00000023164) #17	ENSCCRG00000067769	AFF4 (ENSCCRG00000071302) #19	ENSCCRG00000014775 #20	SOWAHA (ENSCCRG00000014778) #21	CCNI2 (ENSCCRG00000016133) #23	septin8a (ENSCCRG00000067962) #22	stk26 (ENSCCRG00000062358)	tmem185 (ENSCCRG00000014763)	ENSCCRG00000062306	atg4a (ENSCCRG00000030830)	ENSCCRG00000030790	ENSCCRG00000082297	ENSCCRG00000068798	ENSCCRG00000017051	ENSCCRG00000057779	ENSCCRG00000016962	dkc1 (ENSCCRG00000071908)	pdlim4 (ENSCCRG00000054086)	ENSCCRG00000034699	ENSCCRG00000059644	ENSCCRG00000073692
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	38													ENSSGRG00000040767 #19	ENSSGRG00000040769 #20	SOWAHA (ENSSGRG00000040770) #21	septin8a (ENSSGRG00000040772) #22	CCNI2 (ENSSGRG00000040823) #23	stk26 (ENSSGRG00000040827)	ENSSGRG00000040829	ANKRD46 (ENSSGRG00000040830)	ANKRD46 (ENSSGRG00000040831)	atg4a (ENSSGRG00000040837)	ENSSGRG00000041384	ENSSGRG00000041387	ENSSGRG00000041388	ENSSGRG00000041389	ENSSGRG00000041391	TMLHE (ENSSGRG00000041392)	dkc1 (ENSSGRG00000041445)	ENSSGRG00000041674	ENSSGRG00000041675
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	595			ENSGT00940000158570.k	ENSGT00940000156580.l	ENSGT00550000074618.a.a.mb.d	ENSGT00390000012652.v.b	ENSGT00940000159831.e	ENSGT00950000182869.e.a.b.c	ENSGT00440000037499.k	ENSGT00940000158076.c	ENSGT00940000158124.c.a	ENSGT00940000156067.g.a.d #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b.k #19	ENSGT00940000160656.e #20	ENSGT00940000156068.i.e.b #22	ENSGT00940000162679.e #23	ENSGT00940000158972.f	ENSGT00940000157904.b.a
Goldfish	MODERN SPECIES	40	CREBRF (ENSCARG00000036267)	ppp2r2bb (ENSCARG00000036318)	TCERG1 (ENSCARG00000036488)	CLINT1 (ENSCARG00000036681)	EBF1 (ENSCARG00000036745)	rnf145b (ENSCARG00000037460)	ENSCARG00000037589	map4k6 (ENSCARG00000037620)	ENSCARG00000037723	mtmr1b (ENSCARG00000037892)	hmgb3b (ENSCARG00000038532)	TRPC5 (ENSCARG00000038549)	mep1ba (ENSCARG00000038602)	ENSCARG00000038609 #20	SOWAHA (ENSCARG00000038612) #21	septin8a (ENSCARG00000038729) #22	CCNI2 (ENSCARG00000040736) #23	frmd7 (ENSCARG00000040753)	stk26 (ENSCARG00000040857)	tmem185 (ENSCARG00000041094)	ANKRD46 (ENSCARG00000041149)	atg4a (ENSCARG00000041176)	ENSCARG00000041374	ENSCARG00000041406	ENSCARG00000041444	ENSCARG00000041456	ENSCARG00000041505	TMLHE (ENSCARG00000041533)	dkc1 (ENSCARG00000044419)	pdlim4 (ENSCARG00000045421)	ENSCARG00000045440
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	83				ENSGT00940000158570.k	ENSGT00550000074618.a.a.mb.c.b	ENSGT00390000012652.v.a	ENSGT00940000159831.e	ENSGT00950000182869.e.a.b.c	ENSGT00440000037499.k	ENSGT00940000158076.c	ENSGT00940000158124.c.a	ENSGT00940000156067.g.a.d #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b.k #19	ENSGT00940000160656.e #20	ENSGT00940000156068.i.e.b #22	ENSGT00940000162679.e #23	ENSGT00940000158972.f	ENSGT00940000157904.b.a	ENSGT00940000158388.a.a.d	ENSGT00530000063000.a.b.a.a	ENSGT00940000160883.a.a	ENSGT01060000248564.b.a.b.b.b.b.a	ENSGT00950000182962.a.b.b.a	ENSGT01050000244937.a.b.a.b.b.a	ENSGT00530000063582.a.c.b	ENSGT00510000047092.t	ENSGT00940000159536.h.b	ENSGT00940000155150.b.b.f	ENSGT00940000164078.a.b.a.a	ENSGT00940000166125
Common carp reference	MODERN SPECIES	38	ENSCCRG00000053206	JADE2 (ENSCCRG00000073401)	ube2b (ENSCCRG00000015221)	ppp2cab (ENSCCRG00000039662)	skp1 (ENSCCRG00000064752)	ENSCCRG00000057535	tcf7 (ENSCCRG00000077972)	vdac1 (ENSCCRG00000024251)	C5orf15 (ENSCCRG00000024235)	FSTL4 (ENSCCRG00000006295)	ENSCCRG00000024417	hspa4a (ENSCCRG00000014659) #17	ENSCCRG00000075879	AFF4 (ENSCCRG00000080218) #19	ENSCCRG00000014620 #20	septin8a (ENSCCRG00000014799) #22	CCNI2 (ENSCCRG00000081331) #23	stk26 (ENSCCRG00000082508)	tmem185 (ENSCCRG00000075420)	ENSCCRG00000021305	atg4a (ENSCCRG00000021229)	ENSCCRG00000021219	ENSCCRG00000071453	ENSCCRG00000017062	ENSCCRG00000075723	ENSCCRG00000017040	dkc1 (ENSCCRG00000017005)	pdlim4 (ENSCCRG00000017001)	ENSCCRG00000016992	ENSCCRG00000016989	sra1 (ENSCCRG00000062578)
Zebrafish	MODERN SPECIES	13	ENSDARG00000101925	SH3PXD2B (ENSDARG00000103251)	stk10 (ENSDARG00000101894)	ENSDARG00000089216	STK32B (ENSDARG00000079499)	dpysl3 (ENSDARG00000002587)	JAKMIP2 (ENSDARG00000053547)	ENSDARG00000094609	p4ha2 (ENSDARG00000010085)	hspa4a (ENSDARG00000004754) #17	zcchc10 (ENSDARG00000091092) #18	AFF4 (ENSDARG00000001857) #19	ENSDARG00000114616	ENSDARG00000094181 #20	ENSDARG00000077861 #21	septin8a (ENSDARG00000032606) #22	CCNI2 (ENSDARG00000033046) #23	frmd7 (ENSDARG00000068958)	stk26 (ENSDARG00000060390)	tmem185 (ENSDARG00000044327)	ANKRD46 (ENSDARG00000044328)	atg4a (ENSDARG00000014531)	ENSDARG00000086551	ENSDARG00000090164	ENSDARG00000060400	ENSDARG00000023940	ENSDARG00000013210	ENSDARG00000090870	ENSDARG00000094392	ENSDARG00000116512	ENSDARG00000093353
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156068.i.f #22
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	434							ENSGT00940000158124.c.b	ENSGT00940000156067.g.a.c #17	ENSGT00940000168656.a	ENSGT00950000182974.a.a.b.l #19	ENSGT00940000160656.f #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c.c #21	ENSGT00940000156068.i.e.a #22	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c.d #21	ENSGT00940000156068.j.b ##22	ENSGT00940000156068.i.f #22	ENSGT00940000162679.f #23	ENSGT00940000157904.b.b	ENSGT00940000158388.a.a	ENSGT00940000157094.z	ENSGT00530000063000.a.b.a.b	ENSGT00940000160883.a	ENSGT00950000182963.b.b.p	ENSGT01060000248564.b.a.b.b.b.b	ENSGT00950000182962.a.b.b.b	ENSGT01050000244937.a.b.a.b.a	ENSGT00530000063582.a.c.a	ENSGT00510000047092.s	ENSGT00940000159536.g	ENSGT00390000012412	ENSGT00390000001803
Goldfish	MODERN SPECIES	13	ptch2 (ENSCARG00000032827)	kif2c (ENSCARG00000003742)	kiss1ra (ENSCARG00000003910)	atp6v0b (ENSCARG00000003990)	b4galt2 (ENSCARG00000004027)	zgc:113531 (ENSCARG00000004045)	ENSCARG00000004062	slc6a9 (ENSCARG00000004116)	ENSCARG00000004350	ENSCARG00000004642	hspa4a (ENSCARG00000009283) #17	ENSCARG00000010880	AFF4 (ENSCARG00000010888) #19	ENSCARG00000010929 #20	SOWAHA (ENSCARG00000010934) #21	SEPTIN8 (ENSCARG00000011011) #22	CCNI2 (ENSCARG00000013323) #23	stk26 (ENSCARG00000013330)	tmem185 (ENSCARG00000013346)	ANKRD46 (ENSCARG00000013354)	atg4a (ENSCARG00000013361)	ENSCARG00000013445	ENSCARG00000013450	ENSCARG00000013455	ENSCARG00000013467	TMLHE (ENSCARG00000013474)	dkc1 (ENSCARG00000013500)	pdlim4 (ENSCARG00000013561)	ENSCARG00000013565	sra1 (ENSCARG00000013570)	camk2a (ENSCARG00000013583)
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000165707	ENSGT00390000002823	ENSGT00950000183206.a.b.a.a.b.d	ENSGT00950000183206.a.b.a.a.b.c.a	ENSGT00940000159804	ENSGT00950000183206.a.a	ENSGT01020000230360.c.b.b	ENSGT01100000263474.a.b.b.p	ENSGT00940000164443.b.a.a	ENSGT00940000164443.b.a.b	ENSGT00940000157686	ENSGT00940000168656	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c.e #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.kb	ENSGT00390000015484.j	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000156818	ENSGT00940000164716.C.c	ENSGT00390000016221	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d	ENSGT00940000163827.a.a.a.b	ENSGT00940000157695
Atlantic herring	MODERN SPECIES	24	ntm (ENSCHAG00000016060)	lim2.1 (ENSCHAG00000016036)	bsx (ENSCHAG00000016010)	jhy (ENSCHAG00000016004)	hspa8 (ENSCHAG00000015941)	ENSCHAG00000015929	ENSCHAG00000014950	h2ax1 (ENSCHAG00000014913)	hist2h2l (ENSCHAG00000014905)	ENSCHAG00000014863	hyou1 (ENSCHAG00000011186)	ENSCHAG00000011119	AFF4 (ENSCHAG00000010829) #19	ENSCHAG00000010809 #20	ENSCHAG00000010771 #21	septin8a (ENSCHAG00000006039) #22	CCNI2 (ENSCHAG00000005898) #23	GABRG2 (ENSCHAG00000005178) #25	gabra1 (ENSCHAG00000003379) #26	GABRA6 (ENSCHAG00000003186)	GABRB2 (ENSCHAG00000002959)	ENSCHAG00000002922	SH3PXD2B (ENSCHAG00000002742)	stk10 (ENSCHAG00000001193)	ENSCHAG00000000383	ENSCHAG00000000289	dpysl3 (ENSCHAG00000027730)	ENSCHAG00000027724	picalma (ENSCHAG00000027704)	CREBZF (ENSCHAG00000027702)	tmem126a (ENSCHAG00000027701)
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000156386.c	ENSGT00940000160880.d	ENSGT00510000046929.b.g	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b #7	ENSGT00940000156385.b #9	ENSGT00940000157254.p #10	ENSGT00950000183055.b.b.a #13	ENSGT00940000154507.s #16	ENSGT00940000156067.h ##17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b.i #19	ENSGT00940000160656.c #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.f #21	ENSGT00940000156068.i #22	ENSGT00940000162679.d #23	ENSGT00940000156685.y.b #25
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	19	kif3a (ENSSFOG00015000552)	POU4F3 (ENSSFOG00015000571)	ENSSFOG00015000620	GRXCR2 (ENSSFOG00015029720)	kctd16b (ENSSFOG00015000640) #7	NR3C1 (ENSSFOG00015000680) #9	ARHGAP26 (ENSSFOG00015000688) #10	spry4 (ENSSFOG00015029236) #13	ndfip1l (ENSSFOG00015031123) #14	rnf14 (ENSSFOG00015000731) #16	hspa4b (ENSSFOG00015000742) ##17	zcchc10 (ENSSFOG00015000832) #18	AFF4 (ENSSFOG00015000839) #19	ENSSFOG00015000893 #20	SOWAHA (ENSSFOG00015031119) #21	septin8a (ENSSFOG00015000919) #22	CCNI2 (ENSSFOG00015000927) #23	GABRG2 (ENSSFOG00015002914) #25	gabra1 (ENSSFOG00015000992) #26	GABRA6 (ENSSFOG00015001032)	gabrb2a (ENSSFOG00015001078)	ENSSFOG00015001114	SH3PXD2B (ENSSFOG00015001146)	stk10 (ENSSFOG00015001218)	ENSSFOG00015024473	STK32A (ENSSFOG00015032749)	dpysl3 (ENSSFOG00015001389)	JAKMIP2 (ENSSFOG00015001450)	SFXN1 (ENSSFOG00015029237)	ENSSFOG00015001574	ENSSFOG00015001579
Spotted gar	MODERN SPECIES	672	yipf5 (ENSLOCG00000010498) #8	nr3c1 (ENSLOCG00000010508) #9	ARHGAP26 (ENSLOCG00000010520) #10	FGF1 (ENSLOCG00000010543)	ndfip1l (ENSLOCG00000010551) #14	endou2 (ENSLOCG00000010565) #15	gnpda1 (ENSLOCG00000010571)	rnf14 (ENSLOCG00000010578) #16	hspa4b (ENSLOCG00000010589) #17	zcchc10 (ENSLOCG00000010604) #18	AFF4 (ENSLOCG00000010610) #19	uqcrq (ENSLOCG00000010627)	gdf9 (ENSLOCG00000010635)	ENSLOCG00000010639 #20	SOWAHA (ENSLOCG00000010647) #21	septin8a (ENSLOCG00000010651) #22	CCNI2 (ENSLOCG00000010667) #23	ccng1 (ENSLOCG00000010677)	nudcd2 (ENSLOCG00000010683)	GABRG2 (ENSLOCG00000010690) #25	gabra1 (ENSLOCG00000010698) #26	gabra6a (ENSLOCG00000010706)	gabrb2a (ENSLOCG00000010718)	ATP10B (ENSLOCG00000010731)	ENSLOCG00000010751	ENSLOCG00000010757	SH3PXD2B (ENSLOCG00000010766)	stk10 (ENSLOCG00000010779)	STK32A (ENSLOCG00000010793)	dpysl3 (ENSLOCG00000010797)	JAKMIP2 (ENSLOCG00000010819)
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156068.j ##22
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	291						ENSGT00940000156386	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a ##7	ENSGT00940000156385.a ##9	ENSGT00940000165035.a ##11	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000156067.g.b ##17	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d ##21	ENSGT00940000156068.j ##22	ENSGT00940000154726	ENSGT00940000172088	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491	ENSGT00940000159568
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	259												ENSGT00940000155027.c.a	ENSGT00390000014889.a	ENSGT00550000074618.a.a.lb.a	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b	ENSGT00940000156068.j ##22	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491	ENSGT00940000159568	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d ##21	ENSGT00940000159784	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000156067.g.b ##17	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000165035.a ##11	ENSGT00940000156385.a ##9	ENSGT00940000156071.a ##7
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	173	ENSGT00940000166166	ENSGT00940000155429.b	ENSGT00950000183054.a.a.b	ENSGT00390000006954	ENSGT00940000165034	ENSGT00510000046908.a.a.a	ENSGT00940000158770	ENSGT00940000164978.a	ENSGT00390000017153.b	ENSGT00940000158603	ENSGT00940000153203.A.a	ENSGT00940000155027.c.a	ENSGT00390000014889.a	ENSGT00550000074618.a.a.lb.a	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b	ENSGT00940000156068.j ##22	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491	ENSGT00940000159568	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d ##21	ENSGT00940000159784
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	86												ENSGT00530000063023.A.b	ENSGT00940000157751	ENSGT00390000014274	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b	ENSGT00940000156068.j ##22	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491	ENSGT00940000155756.p	ENSGT00940000159568	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d ##21	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000162460.s	ENSGT01060000248588.a.c.b.e	ENSGT00940000154108.a.d.f	ENSGT00940000154445.b	ENSGT00940000153169.B
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	32												ENSGT00530000063023.A.b	ENSGT00940000157751	ENSGT00390000014274	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b	ENSGT00940000156068.j ##22	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491	ENSGT00940000155756.p	ENSGT00940000159568	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d ##21	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000162460.s	ENSGT01060000248588.a.c.b.e	ENSGT00940000154108.a.d.f	ENSGT00940000154445.b	ENSGT00940000153169.B
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	102						ENSGT00390000012569.a	ENSGT00940000153511.a	ENSGT00940000165091.d.d	ENSGT00940000157432.A	ENSGT00390000017671.a.a	ENSGT00940000157045.b	ENSGT00530000063023.A.b	ENSGT00940000157751	ENSGT00390000014274	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b	ENSGT00940000156068.j ##22	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491	ENSGT00940000159568	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d ##21	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000162460.s	ENSGT01060000248588.a.c.b.e	ENSGT00940000154108.a.d.f	ENSGT00940000154445.b	ENSGT00940000153169.B	ENSGT00940000165110.b
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	188	ENSPNAG00000003733	ENSPNAG00000022739	ENSPNAG00000022750	ENSPNAG00000005585	dnajc8 (ENSPNAG00000022812)	hnrnpr (ENSPNAG00000022865)	atp5if1a (ENSPNAG00000022875)	ADGRB1 (ENSPNAG00000022990)	ENSPNAG00000023010	ENSPNAG00000023141	DPY19L4 (ENSPNAG00000023169)	ENSPNAG00000023185	KDM1B (ENSPNAG00000023207)	ENSPNAG00000023218	sfxn1 (ENSPNAG00000005338)	septin8b (ENSPNAG00000023257) ##22	ccng1 (ENSPNAG00000023264)	nudcd2 (ENSPNAG00000003765)	gabra6a (ENSPNAG00000023320)	gabrb2a (ENSPNAG00000023369)	ATP10B (ENSPNAG00000023541)	ENSPNAG00000023557	ENSPNAG00000023568	atp7a (ENSPNAG00000023658)	ENSPNAG00000023666 ##21	gdf9 (ENSPNAG00000023678)	ENSPNAG00000003782	trpc3 (ENSPNAG00000023873)	ENSPNAG00000023889
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	23	DPY19L4 (ENSAMXG00000005510)	SLC4A7 (ENSAMXG00000005426)	ENSAMXG00000035763	ENSAMXG00000040545	ENSAMXG00000037183	ENSAMXG00000029508	ENSAMXG00000042022	ADGRB1 (ENSAMXG00000020775)	hnrnpr (ENSAMXG00000020800)	dnajc8 (ENSAMXG00000029561)	ENSAMXG00000044077	ENSAMXG00000041961	KDM1B (ENSAMXG00000019002)	CFAP69 (ENSAMXG00000018988)	sfxn1 (ENSAMXG00000037681)	septin8b (ENSAMXG00000018970) ##22	ccng1 (ENSAMXG00000018968)	nudcd2 (ENSAMXG00000018964)	gabra6a (ENSAMXG00000018951)	gabrb2a (ENSAMXG00000036347)	ENSAMXG00000018935	ENSAMXG00000029216	atp7a (ENSAMXG00000018894)	ENSAMXG00000018882 ##21	gdf9 (ENSAMXG00000018879)	GSTP1 (ENSAMXG00000039650)	trpc3 (ENSAMXG00000018867)	ENSAMXG00000035215	ENSAMXG00000018864	zgc:92242 (ENSAMXG00000030327)	CXXC5 (ENSAMXG00000039163)
Channel catfish	MODERN SPECIES	5	gstp1 (ENSIPUG00000012349)	trpc7 (ENSIPUG00000012300)	ENSIPUG00000012284	zgc:92242 (ENSIPUG00000012274)	CXXC5 (ENSIPUG00000012253)	Cisd1 (ENSIPUG00000012234)	ube2d2 (ENSIPUG00000012146)	ppp3cb (ENSIPUG00000012028)	Tmem173 (ENSIPUG00000011996)	si:ch211-39i2.2 (ENSIPUG00000011973)	brd8 (ENSIPUG00000011835)	DPY19L4 (ENSIPUG00000011756)	KDM1B (ENSIPUG00000011710)	cfap69 (ENSIPUG00000011653)	sfxn1 (ENSIPUG00000011608)	SEPT8b (ENSIPUG00000011324) ##22	CCNG1 (ENSIPUG00000011238)	nudcd2 (ENSIPUG00000011272)	gabra6a (ENSIPUG00000011213)	gabrb2a (ENSIPUG00000011129)	ATP10B (ENSIPUG00000011091)	ENSIPUG00000011079	trappc11 (ENSIPUG00000010843)	hars (ENSIPUG00000010757)	dnd1 (ENSIPUG00000010743)	gfra3 (ENSIPUG00000010739)	ENSIPUG00000010715	STOX2 (ENSIPUG00000010694)	acsl1b (ENSIPUG00000010613)	ENSIPUG00000010567	ENSIPUG00000010512
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000166166	ENSGT00940000155429.b	ENSGT00950000183054.a.a.b	ENSGT00390000006954	ENSGT00940000165034	ENSGT00510000046908.a.a.a	ENSGT00940000158770	ENSGT00940000164978.a	ENSGT00390000017153.b	ENSGT00940000158603	ENSGT00940000153203.A.a	ENSGT00940000155027.c.a	ENSGT00390000014889.a	ENSGT00550000074618.a.a.lb.a	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b	ENSGT00940000156068.j.a ##22	ENSGT00940000156001.d	ENSGT00940000153668.B	ENSGT00940000155608	ENSGT00940000165332.A	ENSGT00390000008828.gb	ENSGT00940000156526.b	ENSGT00510000050125	ENSGT00940000159799	ENSGT00940000153451.a.a.b	ENSGT00940000158978.a.a	ENSGT00940000156647.a	ENSGT00940000158241	ENSGT00390000010773	ENSGT00940000154672	ENSGT00940000170113
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT01030000234543.A.b.e	ENSGT00940000160581.e	ENSGT00940000166166.e	ENSGT00940000155429.b.c	ENSGT00950000183054.a.a.b.a	ENSGT00390000006954.f	ENSGT00940000165034.a	ENSGT00510000046908.a.a.a.c	ENSGT00940000158770.a	ENSGT00940000158603.a	ENSGT00940000153203.A.a.b	ENSGT00940000155027.c.a.c	ENSGT00390000014889.a.c	ENSGT00550000074618.a.a.lb.a.a	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b.p	ENSGT00940000156068.j.a.a ##22	ENSGT00940000156001.d.f	ENSGT00940000153668.B.e	ENSGT00940000163832	ENSGT00940000155608.ib	ENSGT00940000165332.A.b	ENSGT00390000008828.gb.a	ENSGT00940000156526.b.c	ENSGT00510000050125.e	ENSGT00940000159799.n	ENSGT00940000153451.a.a.b.a	ENSGT00940000158978.a.a.d	ENSGT00940000156647.a.u.a	ENSGT00940000158241.f	ENSGT00390000010773.d	ENSGT00940000154672.ib
Goldfish	MODERN SPECIES	5	slc7a2 (ENSCARG00000045774)	cnot7 (ENSCARG00000045857)	zdhhc2 (ENSCARG00000046089)	MICU3 (ENSCARG00000047234)	fgf20b (ENSCARG00000047492)	dctn4 (ENSCARG00000047506)	gpx3 (ENSCARG00000047707)	tnip1 (ENSCARG00000047775)	anxa6 (ENSCARG00000048475)	N4BP3 (ENSCARG00000057623)	rmnd5b (ENSCARG00000057631)	ENSCARG00000057758	ppp2caa (ENSCARG00000058155)	si:ch1073-44g3.1 (ENSCARG00000058173)	sfxn1 (ENSCARG00000058193)	septin8b (ENSCARG00000058254) ##22	zdhhc5b (ENSCARG00000058449)	clp1 (ENSCARG00000058619)	ENSCARG00000058683	mif (ENSCARG00000058707)	ENSCARG00000058737	scocb (ENSCARG00000058765)	zgc:154054 (ENSCARG00000058827)	ENSCARG00000058890	ENSCARG00000058953	ENSCARG00000058972	cnot6b (ENSCARG00000058997)	ENSCARG00000059091	rxfp1 (ENSCARG00000059704)	etfdh (ENSCARG00000059915)	ppid (ENSCARG00000060825)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	72	ENSGT00940000160581.e	ENSGT00940000166166.e	ENSGT00940000155429.b.c	ENSGT00950000183054.a.a.b.a	ENSGT00390000006954.f	ENSGT00940000165034.a	ENSGT00510000046908.a.a.a.c	ENSGT00940000158770.a	ENSGT00390000017153.b.b	ENSGT00940000158603.a	ENSGT00940000153203.A.a.b	ENSGT00940000155027.c.a.c	ENSGT00390000014889.a.c	ENSGT00550000074618.a.a.lb.a.a	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b.p	ENSGT00940000156068.j.a.a ##22	ENSGT00940000156001.d.f	ENSGT00940000153668.B.e	ENSGT00940000163832	ENSGT00940000155608.ib	ENSGT00940000165332.A.b	ENSGT00390000008828.gb.a	ENSGT00940000156526.b.c	ENSGT00510000050125.e	ENSGT00940000159799.m.a	ENSGT00940000159799.n	ENSGT00940000153451.a.a.b.a	ENSGT00940000158978.a.a.d	ENSGT00940000156647.a.u.a	ENSGT00940000158241.f	ENSGT00390000010773.d
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Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	179	ENSGT00940000155429.b.d	ENSGT00950000183054.a.a.b.b	ENSGT00390000006954.e	ENSGT01060000253723	ENSGT00940000165034.b	ENSGT00510000046908.a.a.a.d	ENSGT00940000158770.b	ENSGT00940000164978.a	ENSGT00390000017153.b.a	ENSGT00940000158603.b	ENSGT00940000153203.A.a.a.a	ENSGT00940000155027.c.a.d	ENSGT00390000014889.a.d	ENSGT00550000074618.a.a.lb.a.b	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b.o	ENSGT00940000156068.j.a.b ##22	ENSGT00940000156001.d.e	ENSGT00940000153668.B.f	ENSGT00940000155608.hb	ENSGT00940000165332.A.a	ENSGT00390000008828.gb.b	ENSGT00940000156526.b.d	ENSGT00510000050125.f	ENSGT00940000176098.a	ENSGT00940000153451.a.a.b.b	ENSGT00940000158978.a.a.c	ENSGT00940000156647.a.u.b	ENSGT00940000158241.e	ENSGT00390000010773.c	ENSGT00940000154672.hb	ENSGT00940000170113
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	191	ENSSGRG00000048407	tspan17 (ENSSGRG00000048370)	SYNPO (ENSSGRG00000048369)	dctn4 (ENSSGRG00000048122)	gpx3 (ENSSGRG00000048058)	tnip1 (ENSSGRG00000048052)	anxa6 (ENSSGRG00000047041)	ENSSGRG00000047009	ENSSGRG00000047008	N4BP3 (ENSSGRG00000047007)	rmnd5b (ENSSGRG00000047000)	ENSSGRG00000046994	si:ch1073-44g3.1 (ENSSGRG00000046990)	ppp2caa (ENSSGRG00000046859)	sfxn1 (ENSSGRG00000046848)	septin8b (ENSSGRG00000045013) ##22	zdhhc5b (ENSSGRG00000044959)	clp1 (ENSSGRG00000044957)	ENSSGRG00000044956	mif (ENSSGRG00000044955)	ENSSGRG00000044954	zgc:154054 (ENSSGRG00000044844)	ENSSGRG00000044840	ENSSGRG00000044837	ENSSGRG00000044836	cnot6b (ENSSGRG00000044821)	ENSSGRG00000044729	rxfp1 (ENSSGRG00000044720)	etfdh (ENSSGRG00000044718)	ppid (ENSSGRG00000044704)	ENSSGRG00000044701
Zebrafish	MODERN SPECIES	5	FAM193B (ENSDARG00000102831)	ube2d2l (ENSDARG00000099749)	ENSDARG00000105261	tspan17 (ENSDARG00000114067)	ENSDARG00000106873	dctn4 (ENSDARG00000023988)	gpx3 (ENSDARG00000043342)	tnip1 (ENSDARG00000015653)	ENSDARG00000060007	anxa6 (ENSDARG00000013335)	rmnd5b (ENSDARG00000043359)	ENSDARG00000060016	si:ch1073-44g3.1 (ENSDARG00000060018)	ppp2caa (ENSDARG00000030224)	sfxn1 (ENSDARG00000019963)	septin8b (ENSDARG00000014233) ##22	zdhhc5b (ENSDARG00000087417)	clp1 (ENSDARG00000063663)	mif (ENSDARG00000071336)	ENSDARG00000086245	scocb (ENSDARG00000002217)	zgc:154054 (ENSDARG00000099923)	ENSDARG00000102956	ENSDARG00000098209	cnot6b (ENSDARG00000101072)	ENSDARG00000100772	ENSDARG00000115504	rxfp1 (ENSDARG00000090071)	etfdh (ENSDARG00000038834)	ppid (ENSDARG00000038835)	RAPGEF2 (ENSDARG00000005482)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156068.j.b ##22
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	434								ENSGT00940000158124.c.b	ENSGT00940000156067.g.a.c #17	ENSGT00940000168656.a	ENSGT00950000182974.a.a.b.l #19	ENSGT00940000160656.f #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c.c #21	ENSGT00940000156068.i.e.a #22	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c.d #21	ENSGT00940000156068.j.b ##22	ENSGT00940000156068.i.f #22	ENSGT00940000162679.f #23	ENSGT00940000157904.b.b	ENSGT00940000158388.a.a	ENSGT00940000157094.z	ENSGT00530000063000.a.b.a.b	ENSGT00940000160883.a	ENSGT00950000182963.b.b.p	ENSGT01060000248564.b.a.b.b.b.b	ENSGT00950000182962.a.b.b.b	ENSGT01050000244937.a.b.a.b.a	ENSGT00530000063582.a.c.a	ENSGT00510000047092.s	ENSGT00940000159536.g	ENSGT00390000012412
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	62								ENSGT00940000158124.c.b	ENSGT00940000156067.g.a.c #17	ENSGT00940000168656.a	ENSGT00950000182974.a.a.b.l #19	ENSGT00940000160656.f #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c.c #21	ENSGT00940000156068.i.e.a #22	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c.d #21	ENSGT00940000156068.j.b ##22	ENSGT00940000162679.f #23	ENSGT00940000157904.b.b	ENSGT00940000158388.a.a.c	ENSGT00940000157094.z	ENSGT00530000063000.a.b.a.b	ENSGT00940000160883.a.b	ENSGT01060000248564.b.a.b.b.b.b.b	ENSGT00950000182962.a.b.b.b	ENSGT01050000244937.a.b.a.b.a	ENSGT00530000063582.a.c.a	ENSGT00510000047092.s	ENSGT00940000159536.g	ENSGT00390000012412	ENSGT00390000001803	ENSGT00940000155150.b.b.e
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	3221															ENSSGRG00000005392 #21	ENSSGRG00000005393 ##22
Denticle herring	MODERN SPECIES	9	ENSDCDG00000005729	mrpl18 (ENSDCDG00000005660)	ENSDCDG00000005651	ENSDCDG00000005646	COPS6 (ENSDCDG00000031129)	ENSDCDG00000031128	mcm7 (ENSDCDG00000030464)	tcirg1b (ENSDCDG00000029916)	prpf19 (ENSDCDG00000029834)	ENSDCDG00000029831	rnf20 (ENSDCDG00000028950)	ENSDCDG00000027252	si:ch1073-44g3.1 (ENSDCDG00000027232)	ppp2caa (ENSDCDG00000027230)	sfxn1 (ENSDCDG00000027201)	septin8b (ENSDCDG00000026013) ##22	ccng1 (ENSDCDG00000025989)	nudcd2 (ENSDCDG00000025985)	gabra6a (ENSDCDG00000025980)	gabrb2a (ENSDCDG00000025943)	ATP10B (ENSDCDG00000025857)	ENSDCDG00000025781	atp7a (ENSDCDG00000023427)	ENSDCDG00000023407 #21	uqcrq (ENSDCDG00000023405)	hspa4b (ENSDCDG00000022882) ##17	gnpda1 (ENSDCDG00000022832)	fgf1a (ENSDCDG00000022828) ##11	nr3c1 (ENSDCDG00000022825) ##9	kctd16a (ENSDCDG00000022819) ##7	ENSDCDG00000022817
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a ##7	ENSGT00940000156385.a ##9	ENSGT00940000165035.a ##11	ENSGT00390000012721.a.g.b ##14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000156067.g.b ##17	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d ##21	ENSGT00940000156068.j ##22	ENSGT00940000154726	ENSGT00940000172088	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.kb	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491	ENSGT00940000159568	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b	ENSGT00550000074618.a.a.lb.a	ENSGT00390000015060	ENSGT00390000014889.a	ENSGT00940000155027.c.a	ENSGT00390000002292.b
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a ##7	ENSGT00940000156385.a ##9	ENSGT00940000165035.a ##11	ENSGT00390000012721.a.g.b ##14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000156067.g.b ##17	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d ##21	ENSGT00940000156068.j ##22	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491	ENSGT00940000159568	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b	ENSGT00550000074618.a.a.lb.a	ENSGT00390000015060	ENSGT00390000014889.a	ENSGT00940000155027.c.a	ENSGT00390000002292.b	ENSGT00940000159591	ENSGT00940000159349
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	1	abcb7 (ENSMMDG00005008126)	uprt (ENSMMDG00005009648)	zdhhc15b (ENSMMDG00005009664)	fgf16 (ENSMMDG00005009699)	atrx (ENSMMDG00005009742)	kif3a (ENSMMDG00005012985)	ENSMMDG00005013694	kctd16a (ENSMMDG00005013696) ##7	nr3c1 (ENSMMDG00005013698) ##9	fgf1a (ENSMMDG00005013782) ##11	NDFIP1 (ENSMMDG00005013785) ##14	gnpda1 (ENSMMDG00005013790)	hspa4b (ENSMMDG00005013815) ##17	gdf9 (ENSMMDG00005014599)	ENSMMDG00005014601 ##21	septin8b (ENSMMDG00005014605) ##22	ccng1 (ENSMMDG00005014612)	nudcd2 (ENSMMDG00005014614)	gabra6a (ENSMMDG00005014620)	gabrb2a (ENSMMDG00005014669)	ATP10B (ENSMMDG00005014682)	ENSMMDG00005014697	atp7a (ENSMMDG00005014714)	sfxn1 (ENSMMDG00005015666)	ppp2caa (ENSMMDG00005015670)	ATP5PO (ENSMMDG00005015677)	si:ch1073-44g3.1 (ENSMMDG00005015684)	ENSMMDG00005015689	slu7 (ENSMMDG00005015711)	C1QTNF2 (ENSMMDG00005015770)	ccnjl (ENSMMDG00005015801)
Cod	MODERN SPECIES	1	RLIM (ENSGMOG00000031968)	NEXMIF (ENSGMOG00000020192)	UPRT (ENSGMOG00000005875)	zdhhc15b (ENSGMOG00000005836)	ENSGMOG00000005751	kif3a (ENSGMOG00000005722)	ENSGMOG00000022664	kctd16a (ENSGMOG00000005691) ##7	nr3c1 (ENSGMOG00000005668) ##9	fgf1a (ENSGMOG00000005658) ##11	ENSGMOG00000024027 ##14	gnpda1 (ENSGMOG00000005643)	hspa4b (ENSGMOG00000005602) ##17	ENSGMOG00000032759	ENSGMOG00000030469 ##21	ENSGMOG00000005532 ##22	ENSGMOG00000005450	ENSGMOG00000020191	urp1 (ENSGMOG00000026552)	clic2 (ENSGMOG00000005434)	ENSGMOG00000005419	ocrl (ENSGMOG00000005366)	ENSGMOG00000023833	xpnpep2 (ENSGMOG00000005338)	SASH3 (ENSGMOG00000005306)	zdhhc9 (ENSGMOG00000005283)	SYTL4 (ENSGMOG00000005253)	ENSGMOG00000005238	tspan7 (ENSGMOG00000005225)	mid1ip1l (ENSGMOG00000028803)	cstf2 (ENSGMOG00000005145)
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	62	ENSGT00940000167495	ENSGT00940000159580	ENSGT00940000156123.a.b	ENSGT00940000178948	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a ##7	ENSGT00940000156385.a ##9	ENSGT00940000165035.a ##11	ENSGT00390000012721.a.g.b ##14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000156067.g.b ##17	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d ##21	ENSGT00940000156068.j ##22	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491	ENSGT00940000159568	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b	ENSGT00550000074618.a.a.lb.a	ENSGT00980000202612	ENSGT00940000161679.a	ENSGT00390000015060	ENSGT00390000014889.a	ENSGT00940000155027.c.a	ENSGT00390000002292.b
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	293						ENSGT00940000178948.b	ENSGT00940000156386.m	ENSGT00940000155875.s.a.a	ENSGT00940000156071.a.g ##7	ENSGT00940000156385.a.e ##9	ENSGT00390000012721.a.g.b.d ##14	ENSGT00390000014316.c.b.e.b	ENSGT00940000156067.g.b.e.a ##17	ENSGT00390000004029.d	ENSGT00940000159784.l	ENSGT00940000156068.j.e ##22	ENSGT00940000154726.rb.b	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b.c	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531.f	ENSGT00940000159491	ENSGT00940000159568.k.a	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b.q.b	ENSGT00550000074618.a.a.lb.a.d	ENSGT00390000014889.a.a	ENSGT00940000155027.c.a.f	ENSGT00390000002292.b	ENSGT00940000159349.e.a.b	ENSGT00940000158355.c	ENSGT00940000159747.b
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00940000158229.g	ENSGT00530000063872.A.c	ENSGT00940000158983	ENSGT00940000160481.h	ENSGT00390000006915.c.d.a.f.a	ENSGT00940000178948.b	ENSGT00940000156386.m	ENSGT00940000155875.s.a.a	ENSGT00940000156071.a.g ##7	ENSGT00940000156385.a.e ##9	ENSGT00390000012721.a.g.b.d ##14	ENSGT00390000014316.c.b.e.b	ENSGT00940000156067.g.b.e.a ##17	ENSGT00390000004029.d	ENSGT00940000159784.l	ENSGT00940000156068.j.e ##22	ENSGT00940000154726.rb.b	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b.c	ENSGT00940000154245.A.kb.d
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	83						ENSGT00940000156386.m	ENSGT00940000155875.s.a.a	ENSGT00940000156071.a.g ##7	ENSGT00940000156385.a.e ##9	ENSGT00390000012721.a.g.b.d ##14	ENSGT00390000014316.c.b.e.b	ENSGT00940000156067.g.b.e.a ##17	ENSGT00390000004029.d	ENSGT00940000159784.l	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d.n ##21	ENSGT00940000156068.j.e ##22	ENSGT00940000154726.rb.b	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b.c	ENSGT00940000154245.A.jb.b.d	ENSGT00940000159531.f	ENSGT00940000159491	ENSGT00940000159568.k.b	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b.q.a	ENSGT00550000074618.a.a.lb.a.c	ENSGT00390000014889.a.b	ENSGT00940000155027.c.a.e	ENSGT00940000159591	ENSGT00940000159349.e.a.a	ENSGT00940000158355.d	ENSGT00940000159747.a
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	28	itk (ENSSSAG00000041613)	ENSSSAG00000041995	ENSSSAG00000092242	ENSSSAG00000041820	gria1a (ENSSSAG00000106340)	13b2 (ENSSSAG00000068142)	ENSSSAG00000068150	ENSSSAG00000068195	kctd16a (ENSSSAG00000086914) ##7	nr3c1 (ENSSSAG00000121753) ##9	fgf1a (ENSSSAG00000037964) ##11	ENSSSAG00000038700 ##14	gnpda1 (ENSSSAG00000044271)	hspa4b (ENSSSAG00000039557) ##17	ENSSSAG00000044301	ENSSSAG00000042611 ##22	ENSSSAG00000053980 ##21	ccng1 (ENSSSAG00000102112)	NUDC2 (ENSSSAG00000053984)	gabra6a (ENSSSAG00000053996)	gabrb2a (ENSSSAG00000105666)	ENSSSAG00000054027	ENSSSAG00000054150	atp7a (ENSSSAG00000108486)	sfxn1 (ENSSSAG00000105560)	pp2aa (ENSSSAG00000054285)	si:ch1073-44g3.1 (ENSSSAG00000097474)	ENSSSAG00000086092	ENSSSAG00000094670	ENSSSAG00000054516	lman2 (ENSSSAG00000054557)
River trout	MODERN SPECIES	4	ENSSTUG00000008719	ENSSTUG00000009941	kif3a (ENSSTUG00000009981)	ENSSTUG00000011262	ENSSTUG00000011269	ENSSTUG00000011278	kctd16a (ENSSTUG00000011280) ##7	ENSSTUG00000011294	nr3c1 (ENSSTUG00000011302) ##9	NDFIP1 (ENSSTUG00000011346) ##14	ENSSTUG00000011381	gnpda1 (ENSSTUG00000011406)	hspa4b (ENSSTUG00000011561) ##17	uqcrq (ENSSTUG00000013319)	gdf9 (ENSSTUG00000013326)	septin8b (ENSSTUG00000013403) ##22	ccng1 (ENSSTUG00000015693)	nudcd2 (ENSSTUG00000015706)	gabra6a (ENSSTUG00000015727)	gabrb2a (ENSSTUG00000015821)	ATP10B (ENSSTUG00000015967)	ENSSTUG00000016085	atp7a (ENSSTUG00000016187)	sfxn1 (ENSSTUG00000019578)	ppp2caa (ENSSTUG00000019616)	si:ch1073-44g3.1 (ENSSTUG00000019646)	ENSSTUG00000019657	C1QTNF2 (ENSSTUG00000019799)	ENSSTUG00000019805	lman2 (ENSSTUG00000019838)	tmed9 (ENSSTUG00000020422)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000160481.h	ENSGT00390000006915.c.d.a.e	ENSGT00940000167495.d	ENSGT00940000159580.r.a	ENSGT00940000178948.b.b	ENSGT00940000156386.m	ENSGT00940000155875.s.a.a	ENSGT00940000156071.a.g ##7	ENSGT00940000156385.a.e ##9	ENSGT01030000237240	ENSGT00390000012721.a.g.b.d ##14	ENSGT00390000014316.c.b.e.b	ENSGT00940000156067.g.b.e.a ##17	ENSGT00390000004029.d	ENSGT00940000159784.l	ENSGT00940000156068.j.e ##22	ENSGT00940000154726.rb.b	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b.c	ENSGT00940000154245.A.jb.b.b	ENSGT00940000159531.f	ENSGT00940000159491.fb	ENSGT00940000159568.k.b	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b.q.a	ENSGT00550000074618.a.a.lb.a.c	ENSGT00390000015060.jb	ENSGT00390000014889.a.b	ENSGT00940000155027.c.a.e	ENSGT00940000159591	ENSGT00940000159349.e.a.a	ENSGT00940000158355.d
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000160481.h	ENSGT00390000006915.c.d.a.e	ENSGT00940000167495.d	ENSGT00940000159580.q	ENSGT00940000178948.b.b	ENSGT00940000156386.m	ENSGT00940000155875.s.a.a	ENSGT00940000156071.a.g ##7	ENSGT00940000156385.a.e ##9	ENSGT01030000237240	ENSGT00390000012721.a.g.b.d ##14	ENSGT00390000014316.c.b.e.b	ENSGT00940000156067.g.b.e.a ##17	ENSGT00390000004029.d	ENSGT00940000159784.l	ENSGT00940000156068.j.e ##22	ENSGT00940000154726.rb.b	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b.c	ENSGT00940000154245.A.jb.b.b	ENSGT00940000159531.f	ENSGT00940000159491.fb	ENSGT00940000159568.k.b	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b.q.a	ENSGT00940000168767	ENSGT00390000015060.jb	ENSGT00390000014889.a.b	ENSGT00940000155027.c.a.e	ENSGT00940000159591	ENSGT00940000159349.e.a.a	ENSGT00940000158355.d
Coho salmon	MODERN SPECIES	6	ENSOKIG00005034878	nlgn3a (ENSOKIG00005034853)	ENSOKIG00005034842	ENSOKIG00005034639	ENSOKIG00005034615	ENSOKIG00005034608	ENSOKIG00005034586	kif3a (ENSOKIG00005033698)	ENSOKIG00005033602	kctd16a (ENSOKIG00005033589) ##7	nr3c1 (ENSOKIG00005033418) ##9	NDFIP1 (ENSOKIG00005033386) ##14	gnpda1 (ENSOKIG00005033314)	hspa4b (ENSOKIG00005031533) ##17	gdf9 (ENSOKIG00005031422)	SEPTIN8 (ENSOKIG00005030725) ##22	ccng1 (ENSOKIG00005030627)	nudcd2 (ENSOKIG00005030598)	gabra6a (ENSOKIG00005030584)	gabrb2a (ENSOKIG00005029890)	ENSOKIG00005029838	ENSOKIG00005029824	ENSOKIG00005029818	atp7a (ENSOKIG00005024424)	ENSOKIG00005024214	sfxn1 (ENSOKIG00005024192)	ppp2caa (ENSOKIG00005024148)	ENSOKIG00005024070	ENSOKIG00005024056	si:ch1073-44g3.1 (ENSOKIG00005024034)	ENSOKIG00005023014
Chinook salmon	MODERN SPECIES	22	NALF1 (ENSOTSG00005000532)	abhd13 (ENSOTSG00005000537)	ENSOTSG00005000541	ENSOTSG00005000545	jade1 (ENSOTSG00005000552)	nsd2 (ENSOTSG00005000633)	letm1 (ENSOTSG00005000653)	kctd16a (ENSOTSG00005000993) ##7	nr3c1 (ENSOTSG00005000998) ##9	ENSOTSG00005001040	NDFIP1 (ENSOTSG00005001050) ##14	gnpda1 (ENSOTSG00005001288)	hspa4b (ENSOTSG00005001398) ##17	uqcrq (ENSOTSG00005013553)	gdf9 (ENSOTSG00005013554)	septin8b (ENSOTSG00005013555) ##22	ccng1 (ENSOTSG00005013556)	nudcd2 (ENSOTSG00005013558)	gabra6a (ENSOTSG00005013559)	ENSOTSG00005013562	IRS2 (ENSOTSG00005013565)	ENSOTSG00005013566	ENSOTSG00005013569	ENSOTSG00005013573	rab20 (ENSOTSG00005013576)	naxd (ENSOTSG00005013577)	ENSOTSG00005013579	ing1 (ENSOTSG00005013580)	ube2al (ENSOTSG00005013581)	ankrd10b (ENSOTSG00005013582)	OTC (ENSOTSG00005013584)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	23	plp1a (ENSOMYG00000043374)	ENSOMYG00000043389	nlgn3a (ENSOMYG00000048600)	ENSOMYG00000072202	ENSOMYG00000042618	kif3a (ENSOMYG00000042606)	ENSOMYG00000042598	kctd16a (ENSOMYG00000042592) ##7	ENSOMYG00000042508	ENSOMYG00000042482 ##14	gnpda1 (ENSOMYG00000042464)	nr3c1 (ENSOMYG00000042542) ##9	ENSOMYG00000038105 ##17	ENSOMYG00000037400	ENSOMYG00000049190	ENSOMYG00000052219 ##22	ccng1 (ENSOMYG00000037382)	nudcd2 (ENSOMYG00000066428)	gabra6a (ENSOMYG00000058409)	gabrb2a (ENSOMYG00000048690)	ENSOMYG00000050877	ENSOMYG00000037031	atp7a (ENSOMYG00000036926)	ENSOMYG00000072484	sfxn1 (ENSOMYG00000074939)	ppp2caa (ENSOMYG00000036871)	ENSOMYG00000036797	si:ch1073-44g3.1 (ENSOMYG00000036774)	ENSOMYG00000036216	ENSOMYG00000036467	ENSOMYG00000056771
Huchen	MODERN SPECIES	2342															gdf9 (ENSHHUG00000050611)	septin8b (ENSHHUG00000050442) ##22	ccng1 (ENSHHUG00000050439)	nudcd2 (ENSHHUG00000050434)	gabra6a (ENSHHUG00000050431)	kcns3a (ENSHHUG00000050417)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	276	ENSGT00940000156123.a.b	ENSGT00940000178948.a	ENSGT00940000156386.n	ENSGT00940000155875.s.a.b	ENSGT00940000156071.a.h ##7	ENSGT00940000156385.a.f ##9	ENSGT00940000165035.a ##11	ENSGT00390000012721.a.g.b.c ##14	ENSGT00390000014316.c.b.e.a	ENSGT00940000156067.g.b.e.b ##17	ENSGT00390000004029.c.a.b	ENSGT00940000156067.g.b.f ##17	ENSGT00390000004029.c.b	ENSGT00940000159784.k	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d ##21	ENSGT00940000156068.j.f ##22	ENSGT00940000154726.rb.a	ENSGT00940000172088	ENSGT00940000156722.b.d	ENSGT00940000154245.A.kb.d
Huchen	MODERN SPECIES	2774								nr3c1 (ENSHHUG00000003278) ##9	fgf1a (ENSHHUG00000003306) ##11	NDFIP1 (ENSHHUG00000003319) ##14	gnpda1 (ENSHHUG00000003499)	hspa4b (ENSHHUG00000003517) ##17	uqcrq (ENSHHUG00000004865)	gdf9 (ENSHHUG00000004878)	ENSHHUG00000004888 ##21	septin8b (ENSHHUG00000004894) ##22	ccng1 (ENSHHUG00000004980)	ENSHHUG00000005023	ENSHHUG00000005036
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000156123.a.b	ENSGT00940000178948.a	ENSGT00940000156386.n	ENSGT00940000155875.s.a.b	ENSGT00940000156071.a.h ##7	ENSGT00940000156385.a.f ##9	ENSGT00940000165035.a ##11	ENSGT00390000012721.a.g.b.c ##14	ENSGT00390000014316.c.b.e.a	ENSGT00940000156067.g.b.e.b ##17	ENSGT00390000004029.c.a.b	ENSGT00940000156067.g.b.f ##17	ENSGT00390000004029.c.b	ENSGT00940000159784.k	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d ##21	ENSGT00940000156068.j.f ##22	ENSGT00940000154726.rb.a	ENSGT00940000172088	ENSGT00940000156722.b.d	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531.f	ENSGT00940000159491	ENSGT00940000159568.k.a	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b.q.b	ENSGT00550000074618.a.a.lb.a.d	ENSGT00390000014889.a.a	ENSGT00940000155027.c.a.f	ENSGT00390000002292.b	ENSGT00940000159349.e.a.b	ENSGT00940000158355.c	ENSGT00940000159747.b
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT00940000159580.r.b	ENSGT00940000156123.a.b	ENSGT00940000178948.a	ENSGT00940000156386.n	ENSGT00940000155875.s.a.b	ENSGT00940000156071.a.h ##7	ENSGT00940000156385.a.f ##9	ENSGT00940000165035.a ##11	ENSGT00390000012721.a.g.b.c ##14	ENSGT00390000014316.c.b.e.a	ENSGT00940000156067.g.b.e.b ##17	ENSGT00940000156067.g.b.f ##17	ENSGT00390000004029.c.b	ENSGT00940000159784.k	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d ##21	ENSGT00940000156068.j.f ##22	ENSGT00940000154726.rb.a	ENSGT00940000172088	ENSGT00940000156722.b.d	ENSGT00940000154245.A.jb.b.a	ENSGT00940000159491.gb	ENSGT00940000159568.k.a	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b.q.b	ENSGT00550000074618.a.a.lb.a.d	ENSGT00390000014889.a.a	ENSGT00940000155027.c.a.f	ENSGT00390000002292.b	ENSGT00940000159349.e.a.b	ENSGT00940000158355.c	ENSGT00940000159747.b	ENSGT00940000157712.f
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00940000159580.r.b	ENSGT00940000156123.a.b	ENSGT00940000178948.a	ENSGT00940000156386.n	ENSGT00940000155875.s.a.b	ENSGT00940000156071.a.h ##7	ENSGT00940000156385.a.f ##9	ENSGT00940000165035.a ##11	ENSGT00390000012721.a.g.b.c ##14	ENSGT00390000014316.c.b.e.a	ENSGT00940000156067.g.b.e.b ##17	ENSGT00940000156067.g.b.f.a ##17	ENSGT00390000004029.c.b	ENSGT00940000159784.k	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d ##21	ENSGT00940000156068.j.f ##22	ENSGT00940000154726.rb.a	ENSGT00940000172088	ENSGT00940000156722.b.d	ENSGT00940000154245.A.jb.b.a	ENSGT00940000159491.gb	ENSGT00940000159568.k.a	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b.q.b	ENSGT00550000074618.a.a.lb.a.d	ENSGT00390000014889.a.a	ENSGT00940000155027.c.a.f	ENSGT00390000002292.b	ENSGT00940000159349.e.a.b	ENSGT00940000158355.c	ENSGT00940000159747.b	ENSGT00940000157712.f
Coho salmon	MODERN SPECIES	10	ENSOKIG00005006270	ENSOKIG00005006298	ENSOKIG00005006367	ENSOKIG00005006387	kif3a (ENSOKIG00005006479)	ENSOKIG00005008430	kctd16a (ENSOKIG00005008439) ##7	ENSOKIG00005008447	nr3c1 (ENSOKIG00005008463) ##9	fgf1a (ENSOKIG00005008480) ##11	NDFIP1 (ENSOKIG00005008602) ##14	gnpda1 (ENSOKIG00005008508)	hspa4b (ENSOKIG00005008739) ##17	UQCRQ (ENSOKIG00005009683)	ENSOKIG00005009690	septin8b (ENSOKIG00005009718) ##22	ENSOKIG00005009966 ##21	ccng1 (ENSOKIG00005009983)	ENSOKIG00005010005	gabra6a (ENSOKIG00005010017)	gabrb2a (ENSOKIG00005010038)	ENSOKIG00005010250	atp7a (ENSOKIG00005010437)	sfxn1 (ENSOKIG00005012833)	ppp2caa (ENSOKIG00005012858)	si:ch1073-44g3.1 (ENSOKIG00005012887)	ENSOKIG00005012898	slu7 (ENSOKIG00005012947)	ENSOKIG00005013382	lman2 (ENSOKIG00005013403)	tmed9 (ENSOKIG00005013533)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	13	ENSOTSG00005002843	ENSOTSG00005002848	OGT (ENSOTSG00005002927)	ENSOTSG00005007428	ENSOTSG00005007429	kctd16a (ENSOTSG00005007430) ##7	nr3c1 (ENSOTSG00005007431) ##9	fgf1a (ENSOTSG00005007432) ##11	NDFIP1 (ENSOTSG00005007434) ##14	gnpda1 (ENSOTSG00005007439)	hspa4b (ENSOTSG00005007462) ##17	ENSOTSG00005014117	uqcrq (ENSOTSG00005014174)	gdf9 (ENSOTSG00005014177)	ENSOTSG00005014178 ##21	septin8b (ENSOTSG00005014180) ##22	ccng1 (ENSOTSG00005014248)	ENSOTSG00005014304	gabra6a (ENSOTSG00005014306)	ENSOTSG00005014307	ENSOTSG00005014310	ENSOTSG00005014311	atp7a (ENSOTSG00005014313)	sfxn1 (ENSOTSG00005014319)	ppp2caa (ENSOTSG00005014321)	si:ch1073-44g3.1 (ENSOTSG00005014322)	slu7 (ENSOTSG00005014326)	ENSOTSG00005014328	ENSOTSG00005014329	tiparp (ENSOTSG00005014330)	ENSOTSG00005014331
Rainbow trout	MODERN SPECIES	5	nlgn3a (ENSOMYG00000025033)	ENSOMYG00000050020	ENSOMYG00000043440	ENSOMYG00000021425	kif3a (ENSOMYG00000021663)	ENSOMYG00000022735	ENSOMYG00000050452	kctd16a (ENSOMYG00000022748) ##7	nr3c1 (ENSOMYG00000022763) ##9	n4wbp5 (ENSOMYG00000022835) ##14	gnpi (ENSOMYG00000022957)	hspa4b (ENSOMYG00000023264) ##17	ENSOMYG00000008327	ENSOMYG00000023920	ENSOMYG00000023932	ENSOMYG00000023955 ##22	ENSOMYG00000023976 ##21	ccng1 (ENSOMYG00000023986)	ENSOMYG00000023997	gabra6a (ENSOMYG00000024007)	gabrb2a (ENSOMYG00000024015)	ENSOMYG00000058132	atp7a (ENSOMYG00000024304)	sfxn1 (ENSOMYG00000025096)	ENSOMYG00000025082	ppp2caa (ENSOMYG00000025165)	si:ch1073-44g3.1 (ENSOMYG00000025192)	ENSOMYG00000025214	ENSOMYG00000056983	ENSOMYG00000025348	ENSOMYG00000030168
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000167495.c	ENSGT00940000159580.r.b	ENSGT00940000156123.a.a	ENSGT00940000178948.a	ENSGT00940000156386.n	ENSGT00940000155875.s.a.b	ENSGT00940000156071.a.h ##7	ENSGT00940000156385.a.f ##9	ENSGT00940000165035.a ##11	ENSGT00390000012721.a.g.b.c ##14	ENSGT00390000014316.c.b.e.a	ENSGT00940000156067.g.b.e.b ##17	ENSGT00390000004029.c.a.b	ENSGT00940000159784.k	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d.m ##21	ENSGT00940000156068.j.f ##22	ENSGT00940000154726.rb.a	ENSGT00940000172088	ENSGT00940000156722.b.d	ENSGT00940000154245.A.jb.b.c	ENSGT00940000159568.k.a	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b.q.b	ENSGT00550000074618.a.a.lb.a.d	ENSGT00390000014889.a.a	ENSGT00940000155027.c.a.f	ENSGT00390000002292.b	ENSGT00940000159349.e.a.b	ENSGT00940000158355.c	ENSGT00940000159747.b	ENSGT00940000157712.f	ENSGT01100000264172.a
River trout	MODERN SPECIES	22	ENSSTUG00000012893	ENSSTUG00000012860	ENSSTUG00000012827	kif3a (ENSSTUG00000012540)	ENSSTUG00000012485	kctd16a (ENSSTUG00000012472) ##7	ENSSTUG00000012457	nr3c1 (ENSSTUG00000012316) ##9	fgf1a (ENSSTUG00000012303) ##11	NDFIP1 (ENSSTUG00000012258) ##14	gnpda1 (ENSSTUG00000012209)	hspa4b (ENSSTUG00000004613) ##17	uqcrq (ENSSTUG00000004319)	gdf9 (ENSSTUG00000004307)	ENSSTUG00000004294 ##21	septin8b (ENSSTUG00000003576) ##22	ccng1 (ENSSTUG00000003509)	ENSSTUG00000003459	gabra6a (ENSSTUG00000003335)	gabrb2a (ENSSTUG00000003134)	sfxn1 (ENSSTUG00000003096)	ppp2caa (ENSSTUG00000003079)	si:ch1073-44g3.1 (ENSSTUG00000003074)	ENSSTUG00000002382	slu7 (ENSSTUG00000001922)	CCNJL (ENSSTUG00000001877)	lman2 (ENSSTUG00000001754)	tmed9 (ENSSTUG00000001712)	b4galt7 (ENSSTUG00000001689)	ENSSTUG00000001680	emx3 (ENSSTUG00000001674)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	24	ENSSSAG00000119562	ENSSSAG00000115877	ENSSSAG00000103923	ENSSSAG00000098977	ENSSSAG00000116463	kif3a (ENSSSAG00000062434)	ENSSSAG00000062323	kctd16a (ENSSSAG00000062280) ##7	ENSSSAG00000089870	nr3c1 (ENSSSAG00000062169) ##9	ENSSSAG00000061598 ##14	ENSSSAG00000042995 ##17	ENSSSAG00000109728	ENSSSAG00000095278	ENSSSAG00000042721 ##21	ENSSSAG00000044568 ##22	ccng1 (ENSSSAG00000109221)	ENSSSAG00000042485	gabra6a (ENSSSAG00000042446)	gabrb2a (ENSSSAG00000075781)	ENSSSAG00000041826	sfxn1 (ENSSSAG00000054175)	pp2aa (ENSSSAG00000042241)	si:ch1073-44g3.1 (ENSSSAG00000042224)	ENSSSAG00000119037	ENSSSAG00000040045	ENSSSAG00000085688	lman2 (ENSSSAG00000038386)	tmed9 (ENSSSAG00000088667)	b4galt7 (ENSSSAG00000037414)	ENSSSAG00000113604
Northern pike	MODERN SPECIES	3	ENSELUG00000024245	ENSELUG00000024214	ENSELUG00000024148	ENSELUG00000034359	ENSELUG00000024034	kif3a (ENSELUG00000024021)	ENSELUG00000023931	ENSELUG00000023896 ##9	kctd16a (ENSELUG00000023920) ##7	fgf1a (ENSELUG00000023891) ##11	NDFIP1 (ENSELUG00000023844) ##14	gnpda1 (ENSELUG00000023817)	hspa4b (ENSELUG00000023803) ##17	gdf9 (ENSELUG00000023686)	ENSELUG00000023342 ##21	septin8b (ENSELUG00000023338) ##22	ccng1 (ENSELUG00000030151)	nudcd2 (ENSELUG00000023272)	gabra6a (ENSELUG00000023227)	gabrb2a (ENSELUG00000023213)	ENSELUG00000023174	atp7a (ENSELUG00000023084)	sfxn1 (ENSELUG00000022974)	ppp2caa (ENSELUG00000022917)	ATP5PO (ENSELUG00000022874)	si:ch1073-44g3.1 (ENSELUG00000022674)	ENSELUG00000022638	slu7 (ENSELUG00000022607)	ENSELUG00000025901	C1QTNF2 (ENSELUG00000022594)	CCNJL (ENSELUG00000022574)
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000156071.a ##7	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385.a ##9	ENSGT00940000157254.o #10	ENSGT00940000165035.b #11	ENSGT00950000183055.b.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000156067.g.a #17	ENSGT00950000182974.a.a.b.j #19	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656.d #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.e #21	ENSGT00940000156068.j ##22	ENSGT00940000162679.c #23	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156685.y.a #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.hb	ENSGT00390000015484.j	ENSGT00940000158396	ENSGT00940000158185	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a	ENSGT00940000153713.B.d.g	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b.t	ENSGT00940000157695.h
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	4	kctd16a (ENSSFOG00015018302) ##7	yipf5 (ENSSFOG00015031270) #8	nr3c1 (ENSSFOG00015018348) ##9	ARHGAP26 (ENSSFOG00015018403) #10	ENSSFOG00015018500 #11	spry4 (ENSSFOG00015018544) #13	ndfip1 (ENSSFOG00015025334) #14	endou2 (ENSSFOG00015018551) #15	gnpda1 (ENSSFOG00015018565)	HSPA4 (ENSSFOG00015018589) ##17	AFF4 (ENSSFOG00015018646) #19	uqcrq (ENSSFOG00015027428)	gdf9 (ENSSFOG00015018741)	ENSSFOG00015018754 #20	ENSSFOG00015026126 #21	septin8b (ENSSFOG00015018786) ##22	CCNI2 (ENSSFOG00015018827) #23	ccng1 (ENSSFOG00015024879)	nudcd2 (ENSSFOG00015032834)	GABRG2 (ENSSFOG00015000943) #25	gabra1 (ENSSFOG00015000829) #26	gabra6a (ENSSFOG00015000780)	GABRB2 (ENSSFOG00015000744)	ATP10B (ENSSFOG00015000727)	ENSSFOG00015000713	ENSSFOG00015000584	ENSSFOG00015000560	ENSSFOG00015000523	ENSSFOG00015000514	atp7a (ENSSFOG00015000401)	JAKMIP2 (ENSSFOG00015000291)
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	442	kctd16a (ENSPKIG00000024111) ##7	yipf5 (ENSPKIG00000024119) #8	NR3C1 (ENSPKIG00000024131) ##9	ARHGAP26 (ENSPKIG00000024147) #10	fgf1b (ENSPKIG00000024173) #11	spry4 (ENSPKIG00000024184) #13	ndfip1l (ENSPKIG00000024194) #14	endou2 (ENSPKIG00000024238) #15	gnpda1 (ENSPKIG00000024252)	HSPA4 (ENSPKIG00000024274) #17	AFF4 (ENSPKIG00000024325) #19	uqcrq (ENSPKIG00000024365)	gdf9 (ENSPKIG00000024372)	ENSPKIG00000024384 #20	SOWAHA (ENSPKIG00000024393) #21	septin8b (ENSPKIG00000024403) ##22	CCNI2 (ENSPKIG00000024425) #23	ccng1 (ENSPKIG00000024439)	nudcd2 (ENSPKIG00000024450)
Reedfish	MODERN SPECIES	2	nr3c1 (ENSECRG00000008039) #9	ARHGAP26 (ENSECRG00000008023) #10	FGF1 (ENSECRG00000007992)	spry4 (ENSECRG00000007982) #13	ndfip1l (ENSECRG00000007968) #14	endou2 (ENSECRG00000007952) #15	gnpda1 (ENSECRG00000007935)	rnf14 (ENSECRG00000007922) #16	hspa4b (ENSECRG00000007900) #17	ZCCHC10 (ENSECRG00000007885) #18	AFF4 (ENSECRG00000007860) #19	uqcrq (ENSECRG00000007848)	gdf9 (ENSECRG00000007841)	ENSECRG00000007827 #20	SOWAHA (ENSECRG00000014563) #21	septin8a (ENSECRG00000014339) #22	CCNI2 (ENSECRG00000014209) #23	ccng1 (ENSECRG00000014190)	nudcd2 (ENSECRG00000014169)	GABRG2 (ENSECRG00000014086) #25	gabra1 (ENSECRG00000013884) #26	ENSECRG00000013748	gabrb2a (ENSECRG00000013694)	mgst3a (ENSECRG00000013670)	ATP10B (ENSECRG00000013627)	ENSECRG00000013610	SH3PXD2B (ENSECRG00000013596)	stk10 (ENSECRG00000013572)	STK32A (ENSECRG00000013551)	dpysl3 (ENSECRG00000013511)	JAKMIP2 (ENSECRG00000013354)
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00530000063825.A.d #15	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000018781
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124	ENSGT00940000158076	ENSGT00440000037499	ENSGT00950000182869.e.a.b
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124	ENSGT00940000158076	ENSGT00440000037499
Theria	ANCESTRAL SPECIES	18								ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124	ENSGT00940000158076
Marsupialia	DUPLICATION
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000004842	ENSGT00940000158752	ENSGT00940000155092.a	ENSGT00940000157058	ENSGT00950000183059.b.a.a	ENSGT00870000136707	ENSGT00940000163336	ENSGT00940000154186.b	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068.a #22	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT01010000222666	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124	ENSGT00940000158076	ENSGT00440000037499
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00390000015553.a.b	ENSGT00390000004842	ENSGT00940000158752	ENSGT00940000155092.a	ENSGT00940000157058	ENSGT00950000183059.b.a.a	ENSGT00940000163336	ENSGT00940000154186.b	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068.a #22	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT01010000222666	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124	ENSGT00940000158076	ENSGT00440000037499
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000155691.d	ENSGT00390000015553.a.b	ENSGT00390000004842	ENSGT00940000158752	ENSGT00940000155092.a	ENSGT00940000157058	ENSGT00950000183059.b.a.a	ENSGT00940000154186.b	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068.a #22	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124	ENSGT00940000158076	ENSGT00440000037499	ENSGT00950000182869.e.a.b.bd.a	ENSGT00940000159831
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000155691.d	ENSGT00390000015553.a.b	ENSGT00390000004842	ENSGT00940000158752	ENSGT00940000155092.a	ENSGT00940000157058	ENSGT00950000183059.b.a.a	ENSGT00940000154186.b	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068.a #22	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000158652	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124	ENSGT00940000158076	ENSGT00440000037499	ENSGT00950000182869.e.a.b.bd.a
Common wonbat	MODERN SPECIES	455	ENSVURG00010005353	ADSS1 (ENSVURG00010005386)	SIVA1 (ENSVURG00010005407)	AKT1 (ENSVURG00010005413)	ENSVURG00010005422	CEP170B (ENSVURG00010005438)	PLD4 (ENSVURG00010005479)	ENSVURG00010005508	HSPA4 (ENSVURG00010005522) #17	ZCCHC10 (ENSVURG00010005568) #18	AFF4 (ENSVURG00010005580) #19	LEAP2 (ENSVURG00010005589)	UQCRQ (ENSVURG00010005598)	GDF9 (ENSVURG00010005609)	SOWAHA (ENSVURG00010005648) #21	ENSVURG00010005660 #22	KIF3A (ENSVURG00010005711)	ENSVURG00010005777	RAD50 (ENSVURG00010005808)	IL5 (ENSVURG00010005850)	IRF1 (ENSVURG00010005871)	ENSVURG00010005882	ENSVURG00010005895	PDLIM4 (ENSVURG00010005944)	ENSVURG00010005959	P4HA2 (ENSVURG00010006006)	ENSVURG00010006181	FNIP1 (ENSVURG00010006887)	RAPGEF6 (ENSVURG00010006926)	FSTL4 (ENSVURG00010007022)	C5orf15 (ENSVURG00010007442)
koala	MODERN SPECIES	41								ENSPCIG00000018099	HSPA4 (ENSPCIG00000018100) #17	ZCCHC10 (ENSPCIG00000000173) #18	AFF4 (ENSPCIG00000000197) #19	ENSPCIG00000000228	ENSPCIG00000000300	GDF9 (ENSPCIG00000000319)	SOWAHA (ENSPCIG00000000331) #21	ENSPCIG00000000355 #22	KIF3A (ENSPCIG00000000389)	ENSPCIG00000000419	RAD50 (ENSPCIG00000000437)	IL5 (ENSPCIG00000000474)	IRF1 (ENSPCIG00000000595)	ENSPCIG00000000632	ENSPCIG00000000667	PDLIM4 (ENSPCIG00000000968)	ENSPCIG00000000988	ENSPCIG00000007200	P4HA2 (ENSPCIG00000001023)	ENSPCIG00000007531	ENSPCIG00000013616	ENSPCIG00000013467	ENSPCIG00000013466
Wallaby	MODERN SPECIES	7022																ENSMEUG00000005644 #22
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	1	ADSS1 (ENSSHAG00000010303)	SIVA1 (ENSSHAG00000010175)	AKT1 (ENSSHAG00000008957)	ENSSHAG00000030413	CEP170B (ENSSHAG00000006663)	PLD4 (ENSSHAG00000006062)	ENSSHAG00000031853	ENSSHAG00000001671	ENSSHAG00000013815 #17	ZCCHC10 (ENSSHAG00000027044) #18	AFF4 (ENSSHAG00000013198) #19	LEAP2 (ENSSHAG00000013151)	UQCRQ (ENSSHAG00000027678)	GDF9 (ENSSHAG00000012875)	SOWAHA (ENSSHAG00000025314) #21	ENSSHAG00000012403 #22	KIF3A (ENSSHAG00000011952)	ENSSHAG00000027514	ENSSHAG00000010792	ENSSHAG00000028225	ENSSHAG00000009209	ENSSHAG00000023817	ENSSHAG00000021482	PDLIM4 (ENSSHAG00000005332)	ENSSHAG00000027627	ENSSHAG00000029069	P4HA2 (ENSSHAG00000002885)	ENSSHAG00000024165	ENSSHAG00000007755	ENSSHAG00000006580	ENSSHAG00000003849
Opossum	MODERN SPECIES		SIVA1 (ENSMODG00000013672)	AKT1 (ENSMODG00000013693)	ENSMODG00000042982	CEP170B (ENSMODG00000013774)	PLD4 (ENSMODG00000013788)	ENSMODG00000042540	ENSMODG00000027908	HSPA4 (ENSMODG00000013823) #17	ZCCHC10 (ENSMODG00000013827) #18	LEAP2 (ENSMODG00000013847)	AFF4 (ENSMODG00000013842) #19	ENSMODG00000013849	GDF9 (ENSMODG00000048752)	SOWAHA (ENSMODG00000013874) #21	ENSMODG00000039421	ENSMODG00000013909 #22	KIF3A (ENSMODG00000013930)	RAD50 (ENSMODG00000013947)	IL5 (ENSMODG00000013956)	IRF1 (ENSMODG00000013963)	ENSMODG00000013976	ENSMODG00000013979	PDLIM4 (ENSMODG00000013984)	ENSMODG00000039876	ENSMODG00000027953	ENSMODG00000051448	ENSMODG00000037056	P4HA2 (ENSMODG00000014035)	ENSMODG00000014079	ENSMODG00000045591	ENSMODG00000027692
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156000	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00940000163116	ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a	ENSGT00390000010652.C	ENSGT00940000156111	ENSGT00940000158282	ENSGT00940000155716	ENSGT00940000153997.b.a.a	ENSGT00940000154371.b.i.b	ENSGT00940000154371.b.i.a	ENSGT00940000153912.A	ENSGT00940000156068.b #22	ENSGT00940000155910	ENSGT00530000064550.B	ENSGT00390000015768	ENSGT01100000263502.B.a.a	ENSGT00940000154877.C	ENSGT00940000156225	ENSGT01030000234633.C.a	ENSGT00950000183175.A	ENSGT00940000163402.b.a.a.a.a	ENSGT00950000182965.a.b.b.a.b	ENSGT01030000234534.B.a.b	ENSGT00940000159819	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156000	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00940000163116	ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a	ENSGT00390000010652.C	ENSGT00940000156111	ENSGT00940000158282.f	ENSGT00940000155716	ENSGT00940000153997.b.a.a	ENSGT00940000154371.b.i.b	ENSGT00940000154371.b.i.a	ENSGT00940000153912.A	ENSGT00940000156068.b #22	ENSGT00940000155910.g	ENSGT00390000015768	ENSGT00940000154612.l	ENSGT01100000263502.B.a.a	ENSGT00940000154877.C	ENSGT00940000156225	ENSGT01030000234633.C.a	ENSGT00950000183175.A	ENSGT00940000163402.b.a.a.a.a	ENSGT00950000182965.a.b.b.a.b	ENSGT01030000234534.B.a.b	ENSGT00940000159819	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00950000182937.A.a	ENSGT00390000005889.e	ENSGT00940000156000	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00940000163116	ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a	ENSGT00390000010652.C	ENSGT00940000156111	ENSGT00940000158282.f	ENSGT00940000155716	ENSGT00940000153997.b.a.a	ENSGT00940000153912.A	ENSGT00940000156068.b #22	ENSGT00940000155910.g	ENSGT00390000015768	ENSGT00940000154612.l	ENSGT01100000263502.B.a.a	ENSGT00940000154877.C	ENSGT00940000156225	ENSGT01030000234633.C.a	ENSGT00950000183175.A	ENSGT00940000163402.b.a.a.a.a
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000156000	ENSGT00940000157274	ENSGT00940000154908	ENSGT00940000160584	ENSGT00390000014666.b	ENSGT00940000163116	ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a	ENSGT00390000010652.C	ENSGT00940000156111	ENSGT00940000158282.f	ENSGT00940000155716	ENSGT00940000153997.b.a.a	ENSGT00940000154371.b.i.b.a.b	ENSGT00940000154371.b.i.b.b	ENSGT00940000153912.A	ENSGT00940000156068.b #22	ENSGT00940000155910.g	ENSGT00390000015768	ENSGT00940000154612.l	ENSGT01100000263502.B.a.a	ENSGT00940000154877.C	ENSGT00940000156225	ENSGT01030000234633.C.a	ENSGT00950000183175.A	ENSGT00940000163402.b.a.a.a.a
koala	MODERN SPECIES	57	PKD2L1 (ENSPCIG00000022688)	SCD (ENSPCIG00000011298)	WNT8B (ENSPCIG00000022682)	ERLIN1 (ENSPCIG00000022677)	ZNF774 (ENSPCIG00000022675)	IQGAP1 (ENSPCIG00000022670)	ENSPCIG00000031656	ALOX5 (ENSPCIG00000022662)	MARCHF8 (ENSPCIG00000022658)	ZFAND4 (ENSPCIG00000022651)	ENSPCIG00000022605	ENSPCIG00000036580	ENSPCIG00000020917	ENSPCIG00000020916	CCSER2 (ENSPCIG00000020913)	ENSPCIG00000020912 #22	GRID1 (ENSPCIG00000032856)	WAPL (ENSPCIG00000013332)	ENSPCIG00000017426	OPN4 (ENSPCIG00000000750)	LDB3 (ENSPCIG00000031216)	BMPR1A (ENSPCIG00000011599)	ENSPCIG00000024470	ENSPCIG00000024473
Common wonbat	MODERN SPECIES	1179	PKD2L1 (ENSVURG00010015561)	SCD (ENSVURG00010015579)	WNT8B (ENSVURG00010015593)	ERLIN1 (ENSVURG00010015622)	ZNF774 (ENSVURG00010015632)	IQGAP1 (ENSVURG00010015643)	CRTC3 (ENSVURG00010015687)	ALOX5 (ENSVURG00010015696)	MARCHF8 (ENSVURG00010015718)	ZFAND4 (ENSVURG00010015731)	ENSVURG00010015759	ENSVURG00010015818	ENSVURG00010015821	ENSVURG00010015823	CCSER2 (ENSVURG00010015832)	ENSVURG00010015860 #22	ENSVURG00010015877	ENSVURG00010015882	WAPL (ENSVURG00010015908)	ENSVURG00010015969	OPN4 (ENSVURG00010015982)	LDB3 (ENSVURG00010015994)	BMPR1A (ENSVURG00010016012)	ENSVURG00010016018	SNCG (ENSVURG00010016027)	ENSVURG00010016053
Wallaby	MODERN SPECIES	11149																ENSMEUG00000007024 #22
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	1	ENSSHAG00000008578	ENSSHAG00000007856	ENSSHAG00000006783	ENSSHAG00000027461	ENSSHAG00000029552	ENSSHAG00000000827	ENSSHAG00000027485	ENSSHAG00000024244	ENSSHAG00000027720	ENSSHAG00000022795	ENSSHAG00000002064	ENSSHAG00000023219	ENSSHAG00000029057	ENSSHAG00000015607	ENSSHAG00000028704	ENSSHAG00000029846 #22	ENSSHAG00000007904	ENSSHAG00000023967	WAPL (ENSSHAG00000009610)	ENSSHAG00000009404	OPN4 (ENSSHAG00000008435)	LDB3 (ENSSHAG00000007310)	BMPR1A (ENSSHAG00000005672)	ENSSHAG00000004694	ENSSHAG00000004383	ENSSHAG00000002530	ENSSHAG00000000967	ENSSHAG00000028319	ENSSHAG00000021979	ENSSHAG00000025673	ENSSHAG00000018484
Opossum	MODERN SPECIES		IQGAP1 (ENSMODG00000010739)	CRTC3 (ENSMODG00000010751)	ALOX5 (ENSMODG00000010770)	MARCHF8 (ENSMODG00000010754)	ZFAND4 (ENSMODG00000010862)	ENSMODG00000010910	ENSMODG00000025721	ENSMODG00000041128	ENSMODG00000025717	ENSMODG00000042938	ENSMODG00000045956	ENSMODG00000029353	ENSMODG00000028868	ENSMODG00000040275	CCSER2 (ENSMODG00000010952)	ENSMODG00000010954 #22	ENSMODG00000051387	ENSMODG00000029662	GRID1 (ENSMODG00000011030)	ENSMODG00000028223	WAPL (ENSMODG00000011102)	OPN4 (ENSMODG00000011114)	LDB3 (ENSMODG00000011146)	BMPR1A (ENSMODG00000011158)	ENSMODG00000011163	SNCG (ENSMODG00000046065)	ENSMODG00000011252	ENSMODG00000011489	ENSMODG00000011517	ENSMODG00000025367	ADAMTS7 (ENSMODG00000011540)
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000162308	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000154508.a.b
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00390000012652.ab.a	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000009391.b
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	73							ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000009391.b
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	72							ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000009391.b
Elephant	MODERN SPECIES	2	APC (ENSLAFG00000013596)	SRP19 (ENSLAFG00000002564)	REEP5 (ENSLAFG00000027602)	DCP2 (ENSLAFG00000013735)	MCC (ENSLAFG00000009872)	YTHDC2 (ENSLAFG00000003538)	FSTL4 (ENSLAFG00000014396)	HSPA4 (ENSLAFG00000010561) #17	ZCCHC10 (ENSLAFG00000010560) #18	AFF4 (ENSLAFG00000010555) #19	LEAP2 (ENSLAFG00000030564)	UQCRQ (ENSLAFG00000010551)	GDF9 (ENSLAFG00000010547)	SHROOM1 (ENSLAFG00000000024) #20	SOWAHA (ENSLAFG00000032130) #21	SEPTIN8 (ENSLAFG00000008567) #22	KIF3A (ENSLAFG00000009777)	ENSLAFG00000009773	IL13 (ENSLAFG00000008861)	RAD50 (ENSLAFG00000009764)	IL5 (ENSLAFG00000009763)	IRF1 (ENSLAFG00000007502)	SLC22A5 (ENSLAFG00000002666)	SLC22A4 (ENSLAFG00000014336)	PDLIM4 (ENSLAFG00000014331)	P4HA2 (ENSLAFG00000007412)	CSF2 (ENSLAFG00000017283)	ENSLAFG00000025619	ENSLAFG00000031213	ENSLAFG00000001106	FNIP1 (ENSLAFG00000020752)
Hyrax	MODERN SPECIES	1178																SEPTIN8 (ENSPCAG00000007178) #22	ENSPCAG00000007026 #23	KIF3A (ENSPCAG00000006958)	ENSPCAG00000006939
Tenrec	MODERN SPECIES	5648																ENSETEG00000015700 #22
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000156580	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991
Armadillo	MODERN SPECIES	1377						ENSDNOG00000046296	HSPA4 (ENSDNOG00000012202) #17	ZCCHC10 (ENSDNOG00000036052) #18	ENSDNOG00000041890	AFF4 (ENSDNOG00000016669) #19	LEAP2 (ENSDNOG00000016664)	ENSDNOG00000014819	GDF9 (ENSDNOG00000036127)	ENSDNOG00000016662 #20	SOWAHA (ENSDNOG00000039985) #21	SEPTIN8 (ENSDNOG00000001507) #22	ENSDNOG00000001502 #23	KIF3A (ENSDNOG00000010649)	ENSDNOG00000045299	IRF1 (ENSDNOG00000035479)	RAD50 (ENSDNOG00000002733)	SLC22A5 (ENSDNOG00000012104)
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Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000163251.a	ENSGT00940000166268	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425
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Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000166268	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00910000147122	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000166268	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00940000153446.a.a.q.a.a.a.b	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00910000147122	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00910000147709	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00940000153446.a.a.q.a.a.a.b	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00910000147122	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000166958	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Marmoset	MODERN SPECIES	11	PPP2CA (ENSCJAG00000045966)	ENSCJAG00000067181	TCF7 (ENSCJAG00000013603)	ENSCJAG00000013556	C5orf15 (ENSCJAG00000013543)	FSTL4 (ENSCJAG00000013506)	HSPA4 (ENSCJAG00000013384) #17	ENSCJAG00000013378	ZCCHC10 (ENSCJAG00000047052) #18	AFF4 (ENSCJAG00000013322) #19	LEAP2 (ENSCJAG00000046560)	UQCRQ (ENSCJAG00000080204)	GDF9 (ENSCJAG00000013297)	SHROOM1 (ENSCJAG00000013275) #20	SOWAHA (ENSCJAG00000013269) #21	SEPTIN8 (ENSCJAG00000013225) #22	CCNI2 (ENSCJAG00000013222) #23	KIF3A (ENSCJAG00000013116)	IL4 (ENSCJAG00000013083)	IL13 (ENSCJAG00000076117)	RAD50 (ENSCJAG00000033428)	IL5 (ENSCJAG00000013034)	IRF1 (ENSCJAG00000013013)	ENSCJAG00000013010	SLC22A5 (ENSCJAG00000012972)	ENSCJAG00000078935	SLC22A4 (ENSCJAG00000012966)	PDLIM4 (ENSCJAG00000012942)	P4HA2 (ENSCJAG00000012936)	CSF2 (ENSCJAG00000012924)	MA_m002_jsm762B1f (ENSCJAG00000012921)
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00940000153446.a.a.q.a.a.a.b	ENSGT00940000155258.s.a.c	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00910000147122	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000166958	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	43	ENSSBOG00000023243	ENSSBOG00000027260	ENSSBOG00000029368	TCF7 (ENSSBOG00000023988)	VDAC1 (ENSSBOG00000025732)	C5orf15 (ENSSBOG00000008071)	FSTL4 (ENSSBOG00000023542)	HSPA4 (ENSSBOG00000030378) #17	ENSSBOG00000023294	ENSSBOG00000035356 #18	AFF4 (ENSSBOG00000021562) #19	LEAP2 (ENSSBOG00000036208)	UQCRQ (ENSSBOG00000030933)	GDF9 (ENSSBOG00000021602)	SHROOM1 (ENSSBOG00000014463) #20	SEPTIN8 (ENSSBOG00000021236) #22	CCNI2 (ENSSBOG00000024313) #23	KIF3A (ENSSBOG00000025487)	IL4 (ENSSBOG00000018689)	IL13 (ENSSBOG00000025273)	RAD50 (ENSSBOG00000034930)	IL5 (ENSSBOG00000026418)	IRF1 (ENSSBOG00000029502)	ENSSBOG00000029687	SLC22A5 (ENSSBOG00000019993)	SLC22A4 (ENSSBOG00000023192)	PDLIM4 (ENSSBOG00000032614)	P4HA2 (ENSSBOG00000032486)	CSF2 (ENSSBOG00000018675)	IL3 (ENSSBOG00000020935)	ACSL6 (ENSSBOG00000006212)
Capuchin	MODERN SPECIES	76	TCF7 (ENSCCAG00000026300)	VDAC1 (ENSCCAG00000028384)	C5orf15 (ENSCCAG00000024033)	FSTL4 (ENSCCAG00000027531)	HSPA4 (ENSCCAG00000036316) #17	ENSCCAG00000031545	ENSCCAG00000015918	ZCCHC10 (ENSCCAG00000024643) #18	ENSCCAG00000005532	AFF4 (ENSCCAG00000030353) #19	ENSCCAG00000034775	LEAP2 (ENSCCAG00000029916)	UQCRQ (ENSCCAG00000034496)	ENSCCAG00000031721	SHROOM1 (ENSCCAG00000037692) #20	SEPTIN8 (ENSCCAG00000028922) #22	CCNI2 (ENSCCAG00000037558) #23	KIF3A (ENSCCAG00000035624)	IL4 (ENSCCAG00000023394)	IL13 (ENSCCAG00000033417)	RAD50 (ENSCCAG00000037418)	IL5 (ENSCCAG00000036340)	IRF1 (ENSCCAG00000037029)	ENSCCAG00000030612	SLC22A5 (ENSCCAG00000019101)	SLC22A4 (ENSCCAG00000034959)	PDLIM4 (ENSCCAG00000033552)	P4HA2 (ENSCCAG00000030663)	CSF2 (ENSCCAG00000034506)	IL3 (ENSCCAG00000032589)	ACSL6 (ENSCCAG00000036217)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	966	SKP1 (ENSANAG00000020252)	TCF7 (ENSANAG00000033911)	VDAC1 (ENSANAG00000033546)	ENSANAG00000032709	ENSANAG00000035584	FSTL4 (ENSANAG00000036865)	HSPA4 (ENSANAG00000036525) #17	ENSANAG00000035313	ENSANAG00000033751 #18	AFF4 (ENSANAG00000037761) #19	ENSANAG00000033618	LEAP2 (ENSANAG00000033692)	UQCRQ (ENSANAG00000036737)	GDF9 (ENSANAG00000035513)	SHROOM1 (ENSANAG00000034017) #20	SEPTIN8 (ENSANAG00000015484) #22	CCNI2 (ENSANAG00000035629) #23	KIF3A (ENSANAG00000037664)	IL4 (ENSANAG00000021885)	IL13 (ENSANAG00000036597)	RAD50 (ENSANAG00000011935)	IL5 (ENSANAG00000037582)	ENSANAG00000018353	IRF1 (ENSANAG00000036604)	ENSANAG00000037552	SLC22A5 (ENSANAG00000037852)	SLC22A4 (ENSANAG00000022508)	PDLIM4 (ENSANAG00000037746)	ENSANAG00000017464	P4HA2 (ENSANAG00000022840)	CSF2 (ENSANAG00000020243)
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00910000147122	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000166268	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00910000147122	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000166268	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00940000163817	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00910000147122	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000166268	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200.`b #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00910000147122	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000166268	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Gorilla	MODERN SPECIES	18	PPP2CA (ENSGGOG00000000338)	SKP1 (ENSGGOG00000022930)	ENSGGOG00000008257	VDAC1 (ENSGGOG00000010880)	C5orf15 (ENSGGOG00000021947)	FSTL4 (ENSGGOG00000011205)	HSPA4 (ENSGGOG00000009655) #17	ZCCHC10 (ENSGGOG00000043978) #18	ENSGGOG00000022261	AFF4 (ENSGGOG00000011786) #19	LEAP2 (ENSGGOG00000012326)	UQCRQ (ENSGGOG00000039037)	GDF9 (ENSGGOG00000012318)	SHROOM1 (ENSGGOG00000012307) #20	SOWAHA (ENSGGOG00000041415) #21	SEPTIN8 (ENSGGOG00000001010) #22	CCNI2 (ENSGGOG00000001009) #23	KIF3A (ENSGGOG00000008000)	IL4 (ENSGGOG00000005670)	IL13 (ENSGGOG00000004704)	RAD50 (ENSGGOG00000001053)	IL5 (ENSGGOG00000011581)	IRF1 (ENSGGOG00000013927)	ENSGGOG00000036218	SLC22A5 (ENSGGOG00000001040)	SLC22A4 (ENSGGOG00000010429)	PDLIM4 (ENSGGOG00000010415)	P4HA2 (ENSGGOG00000006366)	CSF2 (ENSGGOG00000001046)	IL3 (ENSGGOG00000001048)	ACSL6 (ENSGGOG00000016883)
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200.`b #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00910000147122	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000166268	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Pan	DUPLICATION
Pan	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200.`b #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00910000147122	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068.c #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000166268	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Chimpanzee	MODERN SPECIES	18	SKP1 (ENSPTRG00000045225)	TCF7 (ENSPTRG00000017236)	VDAC1 (ENSPTRG00000017235)	C5H5orf15 (ENSPTRG00000017234)	FSTL4 (ENSPTRG00000017231)	HSPA4 (ENSPTRG00000017230) #17	ZCCHC10 (ENSPTRG00000017229) #18	ENSPTRG00000044799	AFF4 (ENSPTRG00000017228) #19	ENSPTRG00000051105	LEAP2 (ENSPTRG00000017227)	ENSPTRG00000049854	GDF9 (ENSPTRG00000017225)	SHROOM1 (ENSPTRG00000017224) #20	ENSPTRG00000042715 #21	SEPTIN8 (ENSPTRG00000017222) #22	CCNI2 (ENSPTRG00000028617) #23	KIF3A (ENSPTRG00000017221)	IL4 (ENSPTRG00000017220)	IL13 (ENSPTRG00000017219)	RAD50 (ENSPTRG00000017218)	IL5 (ENSPTRG00000045848)	IRF1 (ENSPTRG00000017216)	ENSPTRG00000023704	SLC22A5 (ENSPTRG00000044897)	SLC22A4 (ENSPTRG00000017215)	PDLIM4 (ENSPTRG00000017214)	P4HA2 (ENSPTRG00000017213)	CSF2 (ENSPTRG00000017212)	IL3 (ENSPTRG00000017211)	ACSL6 (ENSPTRG00000017210)
Bonobo	MODERN SPECIES	18	PPP2CA (ENSPPAG00000029799)	SKP1 (ENSPPAG00000013599)	ENSPPAG00000034368	VDAC1 (ENSPPAG00000037303)	C5orf15 (ENSPPAG00000041430)	FSTL4 (ENSPPAG00000012227)	HSPA4 (ENSPPAG00000041576) #17	ZCCHC10 (ENSPPAG00000030765) #18	ENSPPAG00000035854	AFF4 (ENSPPAG00000043255) #19	LEAP2 (ENSPPAG00000037695)	UQCRQ (ENSPPAG00000028056)	GDF9 (ENSPPAG00000035552)	SHROOM1 (ENSPPAG00000024669) #20	SOWAHA (ENSPPAG00000027028) #21	SEPTIN8 (ENSPPAG00000018901) #22	CCNI2 (ENSPPAG00000033820) #23	KIF3A (ENSPPAG00000036580)	IL4 (ENSPPAG00000027527)	IL13 (ENSPPAG00000030757)	RAD50 (ENSPPAG00000029837)	IL5 (ENSPPAG00000043508)	IRF1 (ENSPPAG00000036300)	ENSPPAG00000036268	SLC22A5 (ENSPPAG00000042113)	SLC22A4 (ENSPPAG00000040702)	PDLIM4 (ENSPPAG00000028371)	P4HA2 (ENSPPAG00000028815)	CSF2 (ENSPPAG00000041208)	IL3 (ENSPPAG00000034624)	ACSL6 (ENSPPAG00000040311)
Pan	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156068.d #22
Chimpanzee	MODERN SPECIES	543									ENSPTRG00000046486 #19	ENSPTRG00000043008	ENSPTRG00000043208	ENSPTRG00000047175	ENSPTRG00000046389	ENSPTRG00000050491 #20	ENSPTRG00000048184 #21	ENSPTRG00000044122 #22	KIF3A (ENSPTRG00000048416)	IL4 (ENSPTRG00000044483)	IL13 (ENSPTRG00000052345)	ENSPTRG00000045876	IL5 (ENSPTRG00000017217)	ENSPTRG00000045681
Human	MODERN SPECIES	17	PPP2CA (ENSG00000113575)	ENSG00000272772	SKP1 (ENSG00000113558)	TCF7 (ENSG00000081059)	VDAC1 (ENSG00000213585)	C5orf15 (ENSG00000113583)	FSTL4 (ENSG00000053108)	HSPA4 (ENSG00000170606) #17	ZCCHC10 (ENSG00000155329) #18	AFF4 (ENSG00000072364) #19	LEAP2 (ENSG00000164406)	UQCRQ (ENSG00000164405)	GDF9 (ENSG00000164404)	SHROOM1 (ENSG00000164403) #20	SOWAHA (ENSG00000198944) #21	SEPTIN8 (ENSG00000164402) #22	CCNI2 (ENSG00000205089) #23	KIF3A (ENSG00000131437)	IL4 (ENSG00000113520)	IL13 (ENSG00000169194)	RAD50 (ENSG00000113522)	IL5 (ENSG00000113525)	IRF1 (ENSG00000125347)	ENSG00000283782	SLC22A5 (ENSG00000197375)	SLC22A4 (ENSG00000197208)	PDLIM4 (ENSG00000131435)	P4HA2 (ENSG00000072682)	CSF2 (ENSG00000164400)	IL3 (ENSG00000164399)	ACSL6 (ENSG00000164398)
Orangutan	MODERN SPECIES	18	SKP1 (ENSPPYG00000015783)	ENSPPYG00000015782	VDAC1 (ENSPPYG00000015781)	C5H5orf15 (ENSPPYG00000015780)	FSTL4 (ENSPPYG00000015778)	HSPA4 (ENSPPYG00000015777) #17	ENSPPYG00000015776 #18	ENSPPYG00000036231	AFF4 (ENSPPYG00000015775) #19	ENSPPYG00000033299	LEAP2 (ENSPPYG00000034587)	UQCRQ (ENSPPYG00000015773)	GDF9 (ENSPPYG00000015772)	SHROOM1 (ENSPPYG00000015771) #20	SOWAHA (ENSPPYG00000015770) #21	SEPTIN8 (ENSPPYG00000015769) #22	CCNI2 (ENSPPYG00000015768) #23	KIF3A (ENSPPYG00000015767)	IL4 (ENSPPYG00000015766)	ENSPPYG00000015765	RAD50 (ENSPPYG00000015764)	IL5 (ENSPPYG00000015763)	IRF1 (ENSPPYG00000034834)	SLC22A5 (ENSPPYG00000015760)	SLC22A4 (ENSPPYG00000015759)	PDLIM4 (ENSPPYG00000015756)	P4HA2 (ENSPPYG00000015755)	CSF2 (ENSPPYG00000015754)	IL3 (ENSPPYG00000015753)	ACSL6 (ENSPPYG00000015752)	MEIKIN (ENSPPYG00000038901)
Gibbon	MODERN SPECIES	11	CFDP1 (ENSNLEG00000013027)	BCAR1 (ENSNLEG00000013003)	ZFP1 (ENSNLEG00000013001)	ENSNLEG00000012995	ENSNLEG00000012991	WDR59 (ENSNLEG00000012952)	HSPA4 (ENSNLEG00000012898) #17	ZCCHC10 (ENSNLEG00000012894) #18	AFF4 (ENSNLEG00000012874) #19	ENSNLEG00000030060	LEAP2 (ENSNLEG00000012869)	UQCRQ (ENSNLEG00000012867)	GDF9 (ENSNLEG00000012865)	SHROOM1 (ENSNLEG00000012851) #20	SOWAHA (ENSNLEG00000027362) #21	SEPTIN8 (ENSNLEG00000008147) #22	CCNI2 (ENSNLEG00000012817) #23	KIF3A (ENSNLEG00000012790)	IL4 (ENSNLEG00000012783)	IL13 (ENSNLEG00000036144)	RAD50 (ENSNLEG00000012738)	IL5 (ENSNLEG00000012731)	IRF1 (ENSNLEG00000012720)	ENSNLEG00000012719	SLC22A5 (ENSNLEG00000012703)	SLC22A4 (ENSNLEG00000012690)	PDLIM4 (ENSNLEG00000012676)	P4HA2 (ENSNLEG00000012634)	CSF2 (ENSNLEG00000012626)	IL3 (ENSNLEG00000012611)	ACSL6 (ENSNLEG00000012574)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000154875.k.b	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200.y #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000166268	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.tb	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000154875.k.b	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200.y #18	ENSGT00940000154268.f.l	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000166268	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.tb	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000154875.k.b	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200.y #18	ENSGT00940000154268.f.l	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000166268	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.tb	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000154875.k.b	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200.y #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000166268	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	383	PPP2CA (ENSMNEG00000043537)	ENSMNEG00000032488	TCF7 (ENSMNEG00000044025)	ENSMNEG00000016613	C5orf15 (ENSMNEG00000041375)	FSTL4 (ENSMNEG00000039940)	ENSMNEG00000042952	HSPA4 (ENSMNEG00000030298) #17	ZCCHC10 (ENSMNEG00000039054) #18	AFF4 (ENSMNEG00000033381) #19	LEAP2 (ENSMNEG00000031057)	UQCRQ (ENSMNEG00000041577)	GDF9 (ENSMNEG00000036613)	SHROOM1 (ENSMNEG00000038716) #20	SOWAHA (ENSMNEG00000006710) #21	SEPTIN8 (ENSMNEG00000043687) #22	CCNI2 (ENSMNEG00000041733) #23	KIF3A (ENSMNEG00000029565)	IL4 (ENSMNEG00000033953)	IL13 (ENSMNEG00000020765)	RAD50 (ENSMNEG00000035431)	IL5 (ENSMNEG00000009020)	IRF1 (ENSMNEG00000032179)	ENSMNEG00000036896	SLC22A5 (ENSMNEG00000042840)	SLC22A4 (ENSMNEG00000041914)	PDLIM4 (ENSMNEG00000034904)	P4HA2 (ENSMNEG00000043295)	CSF2 (ENSMNEG00000037130)	IL3 (ENSMNEG00000042699)	ACSL6 (ENSMNEG00000037133)
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000156580	ENSGT00690000102286.a.b.k.b.d.a.a.a.a	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.tb	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200.y #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308	ENSGT00390000009391.b
Rhesus	MODERN SPECIES	16	SKP1 (ENSMMUG00000013047)	TCF7 (ENSMMUG00000022788)	VDAC1 (ENSMMUG00000016235)	C6H5orf15 (ENSMMUG00000042266)	FSTL4 (ENSMMUG00000003062)	ENSMMUG00000052685	HSPA4 (ENSMMUG00000009396) #17	ENSMMUG00000053208	ZCCHC10 (ENSMMUG00000056688) #18	AFF4 (ENSMMUG00000015640) #19	LEAP2 (ENSMMUG00000015638)	UQCRQ (ENSMMUG00000051941)	GDF9 (ENSMMUG00000060221)	SHROOM1 (ENSMMUG00000010312) #20	SOWAHA (ENSMMUG00000039781) #21	SEPTIN8 (ENSMMUG00000010309) #22	CCNI2 (ENSMMUG00000010308) #23	KIF3A (ENSMMUG00000010313)	IL4 (ENSMMUG00000003133)	IL13 (ENSMMUG00000003131)	IL5 (ENSMMUG00000051989)	IRF1 (ENSMMUG00000008100)	RAD50 (ENSMMUG00000003130)	SLC22A5 (ENSMMUG00000007087)	SLC22A4 (ENSMMUG00000009301)	PDLIM4 (ENSMMUG00000009298)	P4HA2 (ENSMMUG00000010858)	CSF2 (ENSMMUG00000016915)	IL3 (ENSMMUG00000016912)	ACSL6 (ENSMMUG00000016909)	ENSMMUG00000058082
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000154875.k.b	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200.y #18	ENSGT00940000154268.f.l	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000166958	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Olive baboon	MODERN SPECIES	15	TCF7 (ENSPANG00000025085)	VDAC1 (ENSPANG00000006997)	C5orf15 (ENSPANG00000006159)	ENSPANG00000047174	FSTL4 (ENSPANG00000003666)	ENSPANG00000042341	HSPA4 (ENSPANG00000020837) #17	ENSPANG00000050065	ZCCHC10 (ENSPANG00000003667) #18	AFF4 (ENSPANG00000007039) #19	LEAP2 (ENSPANG00000003279)	ENSPANG00000032662	GDF9 (ENSPANG00000004785)	SHROOM1 (ENSPANG00000010941) #20	SOWAHA (ENSPANG00000007085) #21	SEPTIN8 (ENSPANG00000010836) #22	CCNI2 (ENSPANG00000009548) #23	KIF3A (ENSPANG00000003996)	IL4 (ENSPANG00000004677)	IL13 (ENSPANG00000005704)	RAD50 (ENSPANG00000003668)	IL5 (ENSPANG00000018674)	IRF1 (ENSPANG00000014875)	SLC22A5 (ENSPANG00000010659)	SLC22A4 (ENSPANG00000024866)	PDLIM4 (ENSPANG00000011299)	P4HA2 (ENSPANG00000003024)	CSF2 (ENSPANG00000010837)	IL3 (ENSPANG00000011666)	ACSL6 (ENSPANG00000014592)	ENSPANG00000045567
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000154875.k.b	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200.y #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000166958	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	309	CDKL3 (ENSCATG00000039822)	PPP2CA (ENSCATG00000039567)	SKP1 (ENSCATG00000041858)	TCF7 (ENSCATG00000044135)	ENSCATG00000031466	C5orf15 (ENSCATG00000044895)	FSTL4 (ENSCATG00000044275)	ENSCATG00000031695	HSPA4 (ENSCATG00000042105) #17	ZCCHC10 (ENSCATG00000041405) #18	AFF4 (ENSCATG00000044510) #19	LEAP2 (ENSCATG00000042054)	UQCRQ (ENSCATG00000038607)	GDF9 (ENSCATG00000039023)	SHROOM1 (ENSCATG00000031031) #20	SEPTIN8 (ENSCATG00000032903) #22	CCNI2 (ENSCATG00000044370) #23	KIF3A (ENSCATG00000043006)	IL4 (ENSCATG00000042947)	IL13 (ENSCATG00000030939)	RAD50 (ENSCATG00000040968)	IL5 (ENSCATG00000032308)	IRF1 (ENSCATG00000036411)	ENSCATG00000032180	SLC22A5 (ENSCATG00000030925)	SLC22A4 (ENSCATG00000039145)	PDLIM4 (ENSCATG00000018873)	P4HA2 (ENSCATG00000037172)	CSF2 (ENSCATG00000042168)	IL3 (ENSCATG00000041084)	ACSL6 (ENSCATG00000013697)
Drill	MODERN SPECIES	1616	CDKL3 (ENSMLEG00000041033)	PPP2CA (ENSMLEG00000031466)	SKP1 (ENSMLEG00000028087)	TCF7 (ENSMLEG00000037766)	VDAC1 (ENSMLEG00000040918)	C5orf15 (ENSMLEG00000038327)	FSTL4 (ENSMLEG00000036739)	ENSMLEG00000028159	HSPA4 (ENSMLEG00000021000) #17	ZCCHC10 (ENSMLEG00000030449) #18	AFF4 (ENSMLEG00000028953) #19	LEAP2 (ENSMLEG00000042867)	UQCRQ (ENSMLEG00000039284)	GDF9 (ENSMLEG00000040252)	SHROOM1 (ENSMLEG00000035446) #20	SEPTIN8 (ENSMLEG00000044191) #22	CCNI2 (ENSMLEG00000010031) #23	KIF3A (ENSMLEG00000032746)	IL4 (ENSMLEG00000039248)	IL13 (ENSMLEG00000023325)	RAD50 (ENSMLEG00000043648)	IL5 (ENSMLEG00000029971)	IRF1 (ENSMLEG00000034761)	ENSMLEG00000038250	SLC22A5 (ENSMLEG00000040200)	SLC22A4 (ENSMLEG00000029881)	PDLIM4 (ENSMLEG00000031573)	P4HA2 (ENSMLEG00000039335)	CSF2 (ENSMLEG00000037348)	IL3 (ENSMLEG00000016086)	ACSL6 (ENSMLEG00000034115)
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	15	CDKL3 (ENSCSAG00000013620)	PPP2CA (ENSCSAG00000013631)	ENSCSAG00000013640	TCF7 (ENSCSAG00000013646)	VDAC1 (ENSCSAG00000013649)	C5orf15 (ENSCSAG00000013652)	FSTL4 (ENSCSAG00000013659)	HSPA4 (ENSCSAG00000013669) #17	ZCCHC10 (ENSCSAG00000013673) #18	AFF4 (ENSCSAG00000013682) #19	LEAP2 (ENSCSAG00000013689)	UQCRQ (ENSCSAG00000013694)	GDF9 (ENSCSAG00000013696)	SHROOM1 (ENSCSAG00000013700) #20	SOWAHA (ENSCSAG00000000503) #21	SEPTIN8 (ENSCSAG00000013705) #22	CCNI2 (ENSCSAG00000013715) #23	KIF3A (ENSCSAG00000013749)	IL4 (ENSCSAG00000013765)	IL13 (ENSCSAG00000013781)	RAD50 (ENSCSAG00000013792)	IL5 (ENSCSAG00000013804)	IRF1 (ENSCSAG00000013810)	ENSCSAG00000013815	SLC22A5 (ENSCSAG00000013822)	SLC22A4 (ENSCSAG00000013829)	PDLIM4 (ENSCSAG00000013834)	P4HA2 (ENSCSAG00000013842)	CSF2 (ENSCSAG00000013872)	IL3 (ENSCSAG00000013891)	ACSL6 (ENSCSAG00000013940)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	72	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.a	ENSGT00440000037499.m	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000154875.k.b	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200.y #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000166268	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	854	TCF7 (ENSRROG00000042564)	VDAC1 (ENSRROG00000025787)	C5orf15 (ENSRROG00000039514)	FSTL4 (ENSRROG00000042283)	ENSRROG00000030119	HSPA4 (ENSRROG00000038754) #17	ENSRROG00000022780	ENSRROG00000034804 #18	ENSRROG00000032317	AFF4 (ENSRROG00000033812) #19	LEAP2 (ENSRROG00000042130)	UQCRQ (ENSRROG00000035832)	GDF9 (ENSRROG00000034493)	SHROOM1 (ENSRROG00000029747) #20	SOWAHA (ENSRROG00000021650) #21	SEPTIN8 (ENSRROG00000032709) #22	CCNI2 (ENSRROG00000037110) #23	KIF3A (ENSRROG00000031372)	IL4 (ENSRROG00000042664)	IL13 (ENSRROG00000038522)	RAD50 (ENSRROG00000038469)	IL5 (ENSRROG00000025726)	IRF1 (ENSRROG00000041744)	ENSRROG00000030714	SLC22A5 (ENSRROG00000035793)	SLC22A4 (ENSRROG00000031572)	PDLIM4 (ENSRROG00000034780)	P4HA2 (ENSRROG00000041342)	CSF2 (ENSRROG00000042074)	IL3 (ENSRROG00000030385)	ACSL6 (ENSRROG00000023564)
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	395	CDKL3 (ENSRBIG00000044694)	PPP2CA (ENSRBIG00000044818)	ENSRBIG00000041901	TCF7 (ENSRBIG00000029278)	VDAC1 (ENSRBIG00000028673)	C5orf15 (ENSRBIG00000032919)	FSTL4 (ENSRBIG00000030754)	ENSRBIG00000036446	HSPA4 (ENSRBIG00000039851) #17	ZCCHC10 (ENSRBIG00000026308) #18	AFF4 (ENSRBIG00000029376) #19	LEAP2 (ENSRBIG00000029790)	UQCRQ (ENSRBIG00000039737)	GDF9 (ENSRBIG00000028937)	SHROOM1 (ENSRBIG00000043878) #20	SEPTIN8 (ENSRBIG00000043766) #22	CCNI2 (ENSRBIG00000030786) #23	KIF3A (ENSRBIG00000042000)	IL4 (ENSRBIG00000043499)	IL13 (ENSRBIG00000028591)	RAD50 (ENSRBIG00000033471)	IL5 (ENSRBIG00000044196)	IRF1 (ENSRBIG00000028233)	ENSRBIG00000043845	SLC22A5 (ENSRBIG00000038788)	SLC22A4 (ENSRBIG00000042281)	PDLIM4 (ENSRBIG00000031610)	P4HA2 (ENSRBIG00000043030)	PKNOX1 (ENSRBIG00000029842)	CBS (ENSRBIG00000027159)	ENSRBIG00000028845
Tarsier	MODERN SPECIES	4158												AFF4 (ENSTSYG00000014713) #19	LEAP2 (ENSTSYG00000014711)	UQCRQ (ENSTSYG00000036259)	GDF9 (ENSTSYG00000009625)	SEPT8 (ENSTSYG00000004315) #22	CCNI2 (ENSTSYG00000004254) #23	KIF3A (ENSTSYG00000009881)	IL4 (ENSTSYG00000009846)	IL13 (ENSTSYG00000001534)	RAD50 (ENSTSYG00000007636)	IL5 (ENSTSYG00000010509)	IRF1 (ENSTSYG00000001107)
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499.r	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029.q	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00910000147709	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000162308
Bushbaby	MODERN SPECIES	118	PPP2CA (ENSOGAG00000009695)	SKP1 (ENSOGAG00000028707)	TCF7 (ENSOGAG00000024343)	ENSOGAG00000030742	C5orf15 (ENSOGAG00000001273)	FSTL4 (ENSOGAG00000010492)	HSPA4 (ENSOGAG00000006501) #17	ZCCHC10 (ENSOGAG00000032171) #18	AFF4 (ENSOGAG00000028482) #19	LEAP2 (ENSOGAG00000009438)	UQCRQ (ENSOGAG00000009436)	GDF9 (ENSOGAG00000009434)	SHROOM1 (ENSOGAG00000015519) #20	SOWAHA (ENSOGAG00000024323) #21	ENSOGAG00000028706	SEPTIN8 (ENSOGAG00000015514) #22	ENSOGAG00000031380	KIF3A (ENSOGAG00000015508)	IL4 (ENSOGAG00000015507)	IL13 (ENSOGAG00000015504)	RAD50 (ENSOGAG00000015497)	IL5 (ENSOGAG00000015494)	IRF1 (ENSOGAG00000015489)	SLC22A5 (ENSOGAG00000015482)	SLC22A4 (ENSOGAG00000015480)	PDLIM4 (ENSOGAG00000015477)	ENSOGAG00000030323	P4HA2 (ENSOGAG00000015473)	CSF2 (ENSOGAG00000010462)	ACSL6 (ENSOGAG00000010449)	FNIP1 (ENSOGAG00000026556)
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499.r	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029.q	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00910000147709	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000162308
Mouse lemur	MODERN SPECIES	10	PPP2CA (ENSMICG00000045630)	SKP1 (ENSMICG00000030106)	TCF7 (ENSMICG00000017587)	VDAC1 (ENSMICG00000014715)	C5orf15 (ENSMICG00000047659)	ENSMICG00000033662	FSTL4 (ENSMICG00000007423)	HSPA4 (ENSMICG00000012231) #17	ENSMICG00000044154 #18	ENSMICG00000002753 #19	LEAP2 (ENSMICG00000028746)	UQCRQ (ENSMICG00000041653)	GDF9 (ENSMICG00000032249)	SHROOM1 (ENSMICG00000041567) #20	SOWAHA (ENSMICG00000030974) #21	SEPTIN8 (ENSMICG00000012498) #22	CCNI2 (ENSMICG00000045266) #23	KIF3A (ENSMICG00000012476)	IL4 (ENSMICG00000012471)	IL13 (ENSMICG00000030495)	RAD50 (ENSMICG00000012446)	IL5 (ENSMICG00000032694)	ENSMICG00000043814	IRF1 (ENSMICG00000008190)	SLC22A5 (ENSMICG00000002456)	PDLIM4 (ENSMICG00000013790)	P4HA2 (ENSMICG00000005666)	CSF2 (ENSMICG00000031976)	ACSL6 (ENSMICG00000013984)	ENSMICG00000030938	MEIKIN (ENSMICG00000034049)
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499.r	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029.q	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00910000147709	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000162308
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	496	CDKL3 (ENSPCOG00000024912)	PPP2CA (ENSPCOG00000024928)	SKP1 (ENSPCOG00000017179)	TCF7 (ENSPCOG00000028391)	ENSPCOG00000021763	C5orf15 (ENSPCOG00000018490)	FSTL4 (ENSPCOG00000018355)	HSPA4 (ENSPCOG00000028098) #17	ZCCHC10 (ENSPCOG00000020856) #18	AFF4 (ENSPCOG00000023876) #19	LEAP2 (ENSPCOG00000013787)	ENSPCOG00000021192	GDF9 (ENSPCOG00000020827)	SHROOM1 (ENSPCOG00000028398) #20	SOWAHA (ENSPCOG00000013631) #21	SEPTIN8 (ENSPCOG00000020927) #22	ENSPCOG00000021867 #23	KIF3A (ENSPCOG00000027391)	IL4 (ENSPCOG00000020620)	IL13 (ENSPCOG00000016239)	ENSPCOG00000011867
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	66								FSTL4 (ENSPSMG00000023603)	HSPA4 (ENSPSMG00000023588) #17	ZCCHC10 (ENSPSMG00000023571) #18	AFF4 (ENSPSMG00000023553) #19	LEAP2 (ENSPSMG00000023534)	UQCRQ (ENSPSMG00000023529)	GDF9 (ENSPSMG00000023516)	SHROOM1 (ENSPSMG00000023509) #20	SEPTIN8 (ENSPSMG00000023431) #22	KIF3A (ENSPSMG00000023239)	IL4 (ENSPSMG00000023134)	IL13 (ENSPSMG00000023129)	RAD50 (ENSPSMG00000023119)	IL5 (ENSPSMG00000023088)	IRF1 (ENSPSMG00000023063)	ENSPSMG00000022944	PDLIM4 (ENSPSMG00000022937)	P4HA2 (ENSPSMG00000022909)	ENSPSMG00000022832	CSF2 (ENSPSMG00000022830)	ACSL6 (ENSPSMG00000022799)	MEIKIN (ENSPSMG00000022585)	ENSPSMG00000022569	RAPGEF6 (ENSPSMG00000022413)
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000163251.a	ENSGT00940000166268	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425
Tree shrew	MODERN SPECIES	516														SHROOM1 (ENSTBEG00000002641) #20	ENSTBEG00000002452	SEPTIN8 (ENSTBEG00000002323) #22	ENSTBEG00000002203 #23	KIF3A (ENSTBEG00000002107)	IL4 (ENSTBEG00000001889)
Glires	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000163251.a	ENSGT00860000136008	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000163251.a	ENSGT00860000136008	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00860000136008	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000162308
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00390000012652.ab.a.m	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000162308	ENSGT00390000016270
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000162308	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124
Guinea pig	MODERN SPECIES	81	ENSCPOG00000007474	PPP2CA (ENSCPOG00000039543)	SKP1 (ENSCPOG00000005164)	TCF7 (ENSCPOG00000020029)	ENSCPOG00000023840	C5orf15 (ENSCPOG00000010300)	FSTL4 (ENSCPOG00000007594)	ENSCPOG00000040616	HSPA4 (ENSCPOG00000004085) #17	ZCCHC10 (ENSCPOG00000010824) #18	AFF4 (ENSCPOG00000001814) #19	LEAP2 (ENSCPOG00000026582)	UQCRQ (ENSCPOG00000022324)	GDF9 (ENSCPOG00000023775)	SHROOM1 (ENSCPOG00000020425) #20	SEPTIN8 (ENSCPOG00000007247) #22	KIF3A (ENSCPOG00000011249)	ENSCPOG00000031420	IL13 (ENSCPOG00000027078)	RAD50 (ENSCPOG00000002226)	IL5 (ENSCPOG00000004840)	IRF1 (ENSCPOG00000004848)	SLC22A5 (ENSCPOG00000005459)	SLC22A4 (ENSCPOG00000004913)	PDLIM4 (ENSCPOG00000027520)	P4HA2 (ENSCPOG00000008411)	CSF2 (ENSCPOG00000014074)	ACSL6 (ENSCPOG00000012748)	FNIP1 (ENSCPOG00000030775)	RAPGEF6 (ENSCPOG00000010242)	CDC42SE2 (ENSCPOG00000039035)
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000157177	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000162308	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124
Degu	MODERN SPECIES	70	ENSODEG00000019628	ENSODEG00000008982	ENSODEG00000008861	ENSODEG00000008274	TCF7 (ENSODEG00000013097)	ENSODEG00000008308	C5orf15 (ENSODEG00000010577)	FSTL4 (ENSODEG00000008162)	ENSODEG00000019458	HSPA4 (ENSODEG00000009493) #17	ZCCHC10 (ENSODEG00000008556) #18	AFF4 (ENSODEG00000008137) #19	LEAP2 (ENSODEG00000007774)	ENSODEG00000008424	SHROOM1 (ENSODEG00000008283) #20	SEPTIN8 (ENSODEG00000009083) #22	KIF3A (ENSODEG00000008904)	IL13 (ENSODEG00000010260)	RAD50 (ENSODEG00000007504)	IL5 (ENSODEG00000009022)	ENSODEG00000008045	SLC22A5 (ENSODEG00000008261)	SLC22A4 (ENSODEG00000008298)	PDLIM4 (ENSODEG00000007682)	P4HA2 (ENSODEG00000009419)	ENSODEG00000008289	ENSODEG00000007892	CSF2 (ENSODEG00000009473)	ACSL6 (ENSODEG00000007593)	FNIP1 (ENSODEG00000009693)	ENSODEG00000007824
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	115	JADE2 (ENSCLAG00000014619)	CDKN2AIPNL (ENSCLAG00000015651)	UBE2B (ENSCLAG00000015390)	CDKL3 (ENSCLAG00000013562)	PPP2CA (ENSCLAG00000015668)	ENSCLAG00000012399	TCF7 (ENSCLAG00000015886)	ENSCLAG00000011602	C5orf15 (ENSCLAG00000015163)	FSTL4 (ENSCLAG00000013940)	HSPA4 (ENSCLAG00000013757) #17	ZCCHC10 (ENSCLAG00000012644) #18	AFF4 (ENSCLAG00000013850) #19	LEAP2 (ENSCLAG00000012483)	UQCRQ (ENSCLAG00000015359)	SEPTIN8 (ENSCLAG00000013502) #22	KIF3A (ENSCLAG00000015898)	ENSCLAG00000014960	ENSCLAG00000016355	RAD50 (ENSCLAG00000014508)	IL5 (ENSCLAG00000016772)	IRF1 (ENSCLAG00000011280)	SLC22A5 (ENSCLAG00000012924)	SLC22A4 (ENSCLAG00000011046)	PDLIM4 (ENSCLAG00000015495)	P4HA2 (ENSCLAG00000013749)	CSF2 (ENSCLAG00000014543)	ACSL6 (ENSCLAG00000015484)	MEIKIN (ENSCLAG00000013946)	FNIP1 (ENSCLAG00000015635)	RAPGEF6 (ENSCLAG00000014812)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	23	TCF7 (ENSHGLG00000047039)	ENSHGLG00000016961	C5orf15 (ENSHGLG00000046112)	FSTL4 (ENSHGLG00000013297)	ENSHGLG00000034279	ENSHGLG00000047311	HSPA4 (ENSHGLG00000017017) #17	ENSHGLG00000050674 #18	ENSHGLG00000001303	AFF4 (ENSHGLG00000006661) #19	LEAP2 (ENSHGLG00000039112)	UQCRQ (ENSHGLG00000040975)	GDF9 (ENSHGLG00000006174)	SHROOM1 (ENSHGLG00000008210) #20	SOWAHA (ENSHGLG00000049840) #21	SEPTIN8 (ENSHGLG00000007976) #22	CCNI2 (ENSHGLG00000050667) #23	KIF3A (ENSHGLG00000017608)	ENSHGLG00000015884	IL13 (ENSHGLG00000047436)	ENSHGLG00000007532	ENSHGLG00000010827	RAD50 (ENSHGLG00000013263)	IL5 (ENSHGLG00000040092)	ENSHGLG00000010931	SLC22A5 (ENSHGLG00000017486)	SLC22A4 (ENSHGLG00000047238)	PDLIM4 (ENSHGLG00000015806)	P4HA2 (ENSHGLG00000013514)	ENSHGLG00000034432	CSF2 (ENSHGLG00000017379)
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00860000136008	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000162308	ENSGT00390000016270
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00860000136008	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000162308	ENSGT00390000009391.b
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	106	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000162308	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124
Squirrel	MODERN SPECIES	247	CDKL3 (ENSSTOG00000007777)	PPP2CA (ENSSTOG00000010560)	SKP1 (ENSSTOG00000030878)	TCF7 (ENSSTOG00000010550)	VDAC1 (ENSSTOG00000007764)	C5orf15 (ENSSTOG00000025060)	FSTL4 (ENSSTOG00000025824)	HSPA4 (ENSSTOG00000009217) #17	ZCCHC10 (ENSSTOG00000026648) #18	AFF4 (ENSSTOG00000026695) #19	LEAP2 (ENSSTOG00000028867)	UQCRQ (ENSSTOG00000020757)	GDF9 (ENSSTOG00000024725)	SHROOM1 (ENSSTOG00000028841) #20	SOWAHA (ENSSTOG00000014947) #21	SEPTIN8 (ENSSTOG00000025813) #22	CCNI2 (ENSSTOG00000001327) #23	KIF3A (ENSSTOG00000010159)	IL13 (ENSSTOG00000007967)	RAD50 (ENSSTOG00000009876)	IL5 (ENSSTOG00000009588)	IRF1 (ENSSTOG00000009857)	ENSSTOG00000032519	SLC22A5 (ENSSTOG00000007795)	SLC22A4 (ENSSTOG00000028560)	PDLIM4 (ENSSTOG00000023257)	P4HA2 (ENSSTOG00000007747)	CSF2 (ENSSTOG00000013989)	ACSL6 (ENSSTOG00000008353)	FNIP1 (ENSSTOG00000027033)	RAPGEF6 (ENSSTOG00000015798)
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	222		PPP2CA (ENSUPAG00010015575)	SKP1 (ENSUPAG00010015583)	TCF7 (ENSUPAG00010015597)	VDAC1 (ENSUPAG00010015618)	ENSUPAG00010015646	C5orf15 (ENSUPAG00010015652)	FSTL4 (ENSUPAG00010015657)	HSPA4 (ENSUPAG00010015698) #17	ZCCHC10 (ENSUPAG00010015736) #18	AFF4 (ENSUPAG00010015741) #19	LEAP2 (ENSUPAG00010015797)	UQCRQ (ENSUPAG00010015802)	GDF9 (ENSUPAG00010015820)	SHROOM1 (ENSUPAG00010015829) #20	SEPTIN8 (ENSUPAG00010015852) #22	KIF3A (ENSUPAG00010015879)	IL4 (ENSUPAG00010016022)	IL13 (ENSUPAG00010016041)	RAD50 (ENSUPAG00010016063)	IL5 (ENSUPAG00010016087)	IRF1 (ENSUPAG00010016094)	SLC22A5 (ENSUPAG00010016119)	SLC22A4 (ENSUPAG00010016130)	PDLIM4 (ENSUPAG00010016141)	P4HA2 (ENSUPAG00010016159)	CSF2 (ENSUPAG00010016220)	ACSL6 (ENSUPAG00010016234)	FNIP1 (ENSUPAG00010016809)	RAPGEF6 (ENSUPAG00010016857)	ENSUPAG00010017157
Alpin marmot	MODERN SPECIES	31	PPP2CA (ENSMMMG00000000010)	ENSMMMG00000016436	TCF7 (ENSMMMG00000016427)	ENSMMMG00000016423	C5orf15 (ENSMMMG00000016422)	FSTL4 (ENSMMMG00000016390)	ENSMMMG00000016381	HSPA4 (ENSMMMG00000016373) #17	ZCCHC10 (ENSMMMG00000016370) #18	ENSMMMG00000016368 #19	LEAP2 (ENSMMMG00000016357)	UQCRQ (ENSMMMG00000016345)	GDF9 (ENSMMMG00000016341)	SHROOM1 (ENSMMMG00000016317) #20	SOWAHA (ENSMMMG00000016312) #21	SEPTIN8 (ENSMMMG00000016128) #22	KIF3A (ENSMMMG00000015943)	IL4 (ENSMMMG00000015914)	IL13 (ENSMMMG00000015896)	RAD50 (ENSMMMG00000015870)	IL5 (ENSMMMG00000015863)	ENSMMMG00000015854	IRF1 (ENSMMMG00000015838)	SLC22A5 (ENSMMMG00000015823)	SLC22A4 (ENSMMMG00000015803)	PDLIM4 (ENSMMMG00000015767)	P4HA2 (ENSMMMG00000015686)	CSF2 (ENSMMMG00000015682)	ACSL6 (ENSMMMG00000014713)	FNIP1 (ENSMMMG00000014670)	RAPGEF6 (ENSMMMG00000014369)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	15	ENSSVLG00005023900	TCF7 (ENSSVLG00005023805)	ENSSVLG00005023773	VDAC1 (ENSSVLG00005023719)	C5orf15 (ENSSVLG00005023679)	FSTL4 (ENSSVLG00005023553)	ENSSVLG00005023364 #17	ENSSVLG00005023332	ENSSVLG00005023263 #18	AFF4 (ENSSVLG00005023168) #19	LEAP2 (ENSSVLG00005023101)	UQCRQ (ENSSVLG00005023071)	GDF9 (ENSSVLG00005023040)	SHROOM1 (ENSSVLG00005022874) #20	SOWAHA (ENSSVLG00005022829) #21	SEPTIN8 (ENSSVLG00005022761) #22	KIF3A (ENSSVLG00005022459)	ENSSVLG00005022296	IL13 (ENSSVLG00005022239)	RAD50 (ENSSVLG00005022195)	IL5 (ENSSVLG00005022138)	IRF1 (ENSSVLG00005022008)	SLC22A5 (ENSSVLG00005021778)	PDLIM4 (ENSSVLG00005021702)	P4HA2 (ENSSVLG00005021636)	ENSSVLG00005021571	ENSSVLG00005021521	CSF2 (ENSSVLG00005021473)	ACSL6 (ENSSVLG00005020449)	MEIKIN (ENSSVLG00005020030)	ENSSVLG00005019939
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Mouse	MODERN SPECIES	2	Or2y8 (ENSMUSG00000062204)	Or2y6 (ENSMUSG00000060170)	Skp1 (ENSMUSG00000036309)	Tcf7 (ENSMUSG00000000782)	Vdac1 (ENSMUSG00000020402)	9530068E07Rik (ENSMUSG00000036275)	Fstl4 (ENSMUSG00000036264)	Hspa4 (ENSMUSG00000020361) #17	Zcchc10 (ENSMUSG00000018239) #18	Aff4 (ENSMUSG00000049470) #19	Leap2 (ENSMUSG00000036216)	Uqcrq (ENSMUSG00000044894)	Gdf9 (ENSMUSG00000018238)	Shroom1 (ENSMUSG00000018387) #20	Sowaha (ENSMUSG00000044352) #21	Septin8 (ENSMUSG00000018398) #22	Kif3a (ENSMUSG00000018395)	Il4 (ENSMUSG00000000869)	Il13 (ENSMUSG00000020383)	Rad50 (ENSMUSG00000020380)	Il5 (ENSMUSG00000036117)	Irf1 (ENSMUSG00000018899)	Slc22a5 (ENSMUSG00000018900)	Slc22a21 (ENSMUSG00000063652)	Slc22a4 (ENSMUSG00000020334)	Pdlim4 (ENSMUSG00000020388)	P4ha2 (ENSMUSG00000018906)	Csf2 (ENSMUSG00000018916)	Il3 (ENSMUSG00000018914)	Acsl6 (ENSMUSG00000020333)	Meikin (ENSMUSG00000020332)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	2	Skp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016324)	Tcf7 (MGP_CAROLIEiJ_G0016325)	9530068E07Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0016327)	Fstl4 (MGP_CAROLIEiJ_G0016328)	Hspa4 (MGP_CAROLIEiJ_G0016329) #17	Zcchc10 (MGP_CAROLIEiJ_G0016330) #18	Aff4 (MGP_CAROLIEiJ_G0016331) #19	Leap2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016332)	Uqcrq (MGP_CAROLIEiJ_G0016333)	Gdf9 (MGP_CAROLIEiJ_G0016334)	MGP_CAROLIEiJ_G0016335	Shroom1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016336) #20	MGP_CAROLIEiJ_G0016337	Sowaha (MGP_CAROLIEiJ_G0016338) #21	MGP_CAROLIEiJ_G0016339	Septin8 (MGP_CAROLIEiJ_G0016340) #22	Kif3a (MGP_CAROLIEiJ_G0016341)	Il4 (MGP_CAROLIEiJ_G0016342)	Il13 (MGP_CAROLIEiJ_G0016343)	Rad50 (MGP_CAROLIEiJ_G0016344)	Il5 (MGP_CAROLIEiJ_G0016345)	Irf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016346)	MGP_CAROLIEiJ_G0016347	MGP_CAROLIEiJ_G0016348	Slc22a5 (MGP_CAROLIEiJ_G0016349)	Slc22a21 (MGP_CAROLIEiJ_G0016350)	Slc22a4 (MGP_CAROLIEiJ_G0016351)	Pdlim4 (MGP_CAROLIEiJ_G0016352)	P4ha2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016353)	Csf2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016354)	Il3 (MGP_CAROLIEiJ_G0016355)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	5	Skp1 (MGP_PahariEiJ_G0017459)	MGP_PahariEiJ_G0017460	Vdac1 (MGP_PahariEiJ_G0017461)	9530068E07Rik (MGP_PahariEiJ_G0017462)	Fstl4 (MGP_PahariEiJ_G0017463)	Hspa4 (MGP_PahariEiJ_G0017464) #17	Zcchc10 (MGP_PahariEiJ_G0017465) #18	Aff4 (MGP_PahariEiJ_G0017466) #19	Leap2 (MGP_PahariEiJ_G0017467)	Uqcrq (MGP_PahariEiJ_G0017468)	Gdf9 (MGP_PahariEiJ_G0017469)	Shroom1 (MGP_PahariEiJ_G0017470) #20	MGP_PahariEiJ_G0017471	Sowaha (MGP_PahariEiJ_G0017472) #21	MGP_PahariEiJ_G0017473	Septin8 (MGP_PahariEiJ_G0017474) #22	Kif3a (MGP_PahariEiJ_G0017475)	MGP_PahariEiJ_G0017476	Il13 (MGP_PahariEiJ_G0017477)	Rad50 (MGP_PahariEiJ_G0017478)	Il5 (MGP_PahariEiJ_G0017479)	Irf1 (MGP_PahariEiJ_G0017480)	MGP_PahariEiJ_G0017481	MGP_PahariEiJ_G0017482	MGP_PahariEiJ_G0017483	MGP_PahariEiJ_G0017484	MGP_PahariEiJ_G0017485	Slc22a4 (MGP_PahariEiJ_G0017486)	MGP_PahariEiJ_G0017487	P4ha2 (MGP_PahariEiJ_G0017488)	Csf2 (MGP_PahariEiJ_G0017489)
Rat	MODERN SPECIES	1	Tcf7 (ENSRNOG00000005872)	Vdac1 (ENSRNOG00000006375)	C10h5orf15 (ENSRNOG00000006148)	ENSRNOG00000067101	Rpl30l2 (ENSRNOG00000032825)	Fstl4 (ENSRNOG00000006565)	Hspa4 (ENSRNOG00000016596) #17	AABR07072108.1 (ENSRNOG00000006943) #18	Aff4 (ENSRNOG00000006965) #19	Leap2 (ENSRNOG00000007218)	Uqcrq (ENSRNOG00000067979)	Gdf9 (ENSRNOG00000007301)	Shroom1 (ENSRNOG00000007431) #20	ENSRNOG00000065856	Sowaha (ENSRNOG00000060061) #21	Septin8 (ENSRNOG00000007462) #22	Kif3a (ENSRNOG00000007515)	Il4 (ENSRNOG00000007624)	Il13 (ENSRNOG00000007652)	Rad50 (ENSRNOG00000033065)	Il5 (ENSRNOG00000008111)	Irf1 (ENSRNOG00000008144)	Slc22a5 (ENSRNOG00000008432)	Slc22a21 (ENSRNOG00000069239)	Slc22a4 (ENSRNOG00000046195)	Pdlim4 (ENSRNOG00000050794)	P4ha2 (ENSRNOG00000033663)	ENSRNOG00000068705	Csf2 (ENSRNOG00000026805)	Il3 (ENSRNOG00000026786)	Acsl6 (ENSRNOG00000026745)
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781.hb	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c.c	ENSGT00940000154155.c.d	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000162308	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b.`b.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781.hb	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c.c	ENSGT00940000154155.c.d	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000162308	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	229	ENSCGRG00001015140	Skp1 (ENSCGRG00001022352)	Tcf7 (ENSCGRG00001023805)	ENSCGRG00001008975	9530068E07Rik (ENSCGRG00001018577)	Fstl4 (ENSCGRG00001022572)	Hspa4 (ENSCGRG00001024247) #17	Zcchc10 (ENSCGRG00001000861) #18	ENSCGRG00001008805	Aff4 (ENSCGRG00001016680) #19	Leap2 (ENSCGRG00001015918)	Uqcrq (ENSCGRG00001017522)	Gdf9 (ENSCGRG00001019031)	Shroom1 (ENSCGRG00001022525) #20	Sowaha (ENSCGRG00001011742) #21	Septin8 (ENSCGRG00001020621) #22	Kif3a (ENSCGRG00001022016)	Il4 (ENSCGRG00001018451)	Il13 (ENSCGRG00001019822)	Rad50 (ENSCGRG00001003192)	Il5 (ENSCGRG00001023655)	Irf1 (ENSCGRG00001011970)	Slc22a5 (ENSCGRG00001014195)	Slc22a21 (ENSCGRG00001016062)	Slc22a4 (ENSCGRG00001017477)	Pdlim4 (ENSCGRG00001023177)	P4ha2 (ENSCGRG00001012916)	ENSCGRG00001023837	Acsl6 (ENSCGRG00001001566)	Meikin (ENSCGRG00001014860)	Fnip1 (ENSCGRG00001019044)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	627	Ube2b (ENSMAUG00000011254)	ENSMAUG00000010031	Ppp2ca (ENSMAUG00000009699)	ENSMAUG00000009406	Tcf7 (ENSMAUG00000012202)	Fstl4 (ENSMAUG00000011560)	Hspa4 (ENSMAUG00000009192) #17	Zcchc10 (ENSMAUG00000015151) #18	Aff4 (ENSMAUG00000013669) #19	Leap2 (ENSMAUG00000012145)	Uqcrq (ENSMAUG00000021198)	ENSMAUG00000008675	Gdf9 (ENSMAUG00000008310)	Shroom1 (ENSMAUG00000010730) #20	Sowaha (ENSMAUG00000001988) #21	Septin8 (ENSMAUG00000011945) #22	Kif3a (ENSMAUG00000014138)	Il4 (ENSMAUG00000009458)	Il13 (ENSMAUG00000008859)	Rad50 (ENSMAUG00000010684)	Il5 (ENSMAUG00000009715)	ENSMAUG00000009569	ENSMAUG00000005660	Slc22a5 (ENSMAUG00000004448)	Slc22a4 (ENSMAUG00000020291)	Pdlim4 (ENSMAUG00000019688)	P4ha2 (ENSMAUG00000007802)	Csf2 (ENSMAUG00000009251)	Acsl6 (ENSMAUG00000008698)	Meikin (ENSMAUG00000009150)	Fnip1 (ENSMAUG00000008472)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781.hb	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c.c	ENSGT00940000154155.c.d	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000162308	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	21	Ppp2ca (ENSPEMG00000012315)	Skp1 (ENSPEMG00000021644)	Tcf7 (ENSPEMG00000013127)	Vdac1 (ENSPEMG00000011874)	9530068E07Rik (ENSPEMG00000023278)	Fstl4 (ENSPEMG00000001327)	ENSPEMG00000020405	Hspa4 (ENSPEMG00000004397) #17	ENSPEMG00000009811 #18	Aff4 (ENSPEMG00000007995) #19	Leap2 (ENSPEMG00000027955)	Uqcrq (ENSPEMG00000002846)	Gdf9 (ENSPEMG00000014428)	Shroom1 (ENSPEMG00000011526) #20	Sowaha (ENSPEMG00000004189) #21	Septin8 (ENSPEMG00000009781) #22	Kif3a (ENSPEMG00000004934)	Il4 (ENSPEMG00000011220)	Il13 (ENSPEMG00000003732)	Rad50 (ENSPEMG00000026491)	Il5 (ENSPEMG00000008086)	Irf1 (ENSPEMG00000008408)	ENSPEMG00000029901	ENSPEMG00000003145	Slc22a5 (ENSPEMG00000024793)	Slc22a21 (ENSPEMG00000026600)	Slc22a4 (ENSPEMG00000009670)	Pdlim4 (ENSPEMG00000005793)	P4ha2 (ENSPEMG00000004967)	Csf2 (ENSPEMG00000020530)	Acsl6 (ENSPEMG00000021800)
Prairie vole	MODERN SPECIES	15	Ppp2ca (ENSMOCG00000015769)	ENSMOCG00000018605	ENSMOCG00000016351	Tcf7 (ENSMOCG00000010539)	Vdac1 (ENSMOCG00000015495)	9530068E07Rik (ENSMOCG00000013154)	Fstl4 (ENSMOCG00000020693)	Hspa4 (ENSMOCG00000021842) #17	Zcchc10 (ENSMOCG00000021909) #18	Aff4 (ENSMOCG00000003884) #19	Leap2 (ENSMOCG00000022263)	Uqcrq (ENSMOCG00000019628)	Gdf9 (ENSMOCG00000017121)	Shroom1 (ENSMOCG00000014587) #20	Sowaha (ENSMOCG00000003126) #21	Septin8 (ENSMOCG00000022633) #22	Kif3a (ENSMOCG00000006798)	Il4 (ENSMOCG00000012049)	Il13 (ENSMOCG00000011299)	ENSMOCG00000018737	ENSMOCG00000002076	Il5 (ENSMOCG00000019607)	ENSMOCG00000001407	ENSMOCG00000018842	Slc22a5 (ENSMOCG00000021856)	ENSMOCG00000004251	Slc22a4 (ENSMOCG00000020972)	Pdlim4 (ENSMOCG00000018761)	P4ha2 (ENSMOCG00000010121)	Csf2 (ENSMOCG00000018945)	Acsl6 (ENSMOCG00000016180)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1485						ENSNGAG00000015348	Fstl4 (ENSNGAG00000003923)	Hspa4 (ENSNGAG00000017000) #17	Zcchc10 (ENSNGAG00000013626) #18	Aff4 (ENSNGAG00000019867) #19	Leap2 (ENSNGAG00000017043)	Uqcrq (ENSNGAG00000016376)	Gdf9 (ENSNGAG00000015065)	Shroom1 (ENSNGAG00000022989) #20	Sowaha (ENSNGAG00000022197) #21	Septin8 (ENSNGAG00000022217) #22	Kif3a (ENSNGAG00000021395)	Il4 (ENSNGAG00000012029)	Il13 (ENSNGAG00000010419)	ENSNGAG00000000930	ENSNGAG00000024312	Il5 (ENSNGAG00000011328)	ENSNGAG00000001238	ENSNGAG00000022743	ENSNGAG00000016994	Slc22a4 (ENSNGAG00000007928)	Pdlim4 (ENSNGAG00000020757)	P4ha2 (ENSNGAG00000019060)	Csf2 (ENSNGAG00000017289)	Acsl6 (ENSNGAG00000017314)	Meikin (ENSNGAG00000019878)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	133	ENSJJAG00000000547	ENSJJAG00000007493	ENSJJAG00000024213	Tcf7 (ENSJJAG00000000476)	Vdac1 (ENSJJAG00000018371)	ENSJJAG00000021209	ENSJJAG00000005383	Fstl4 (ENSJJAG00000010445)	ENSJJAG00000013880	Hspa4 (ENSJJAG00000023896) #17	Aff4 (ENSJJAG00000000912) #19	Leap2 (ENSJJAG00000000464)	Uqcrq (ENSJJAG00000011956)	Gdf9 (ENSJJAG00000009480)	Shroom1 (ENSJJAG00000019891) #20	Septin8 (ENSJJAG00000022205) #22	Kif3a (ENSJJAG00000023717)	ENSJJAG00000012514	Il13 (ENSJJAG00000000582)	ENSJJAG00000019622	ENSJJAG00000008274	Il5 (ENSJJAG00000023833)	ENSJJAG00000018240	ENSJJAG00000019858	Slc22a4 (ENSJJAG00000021594)	Pdlim4 (ENSJJAG00000015965)	P4ha2 (ENSJJAG00000023004)	Csf2 (ENSJJAG00000019419)	Acsl6 (ENSJJAG00000011523)	ENSJJAG00000009096	Fnip1 (ENSJJAG00000023248)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	454	Ube2b (ENSDORG00000002525)	ENSDORG00000002519	Ppp2ca (ENSDORG00000027439)	ENSDORG00000002912	Tcf7 (ENSDORG00000005128)	Vdac1 (ENSDORG00000000714)	9530068E07Rik (ENSDORG00000000713)	Fstl4 (ENSDORG00000013824)	Hspa4 (ENSDORG00000004972) #17	Zcchc10 (ENSDORG00000008115) #18	ENSDORG00000023279 #19	Leap2 (ENSDORG00000029735)	Uqcrq (ENSDORG00000023927)	Gdf9 (ENSDORG00000007464)	Sowaha (ENSDORG00000028247) #21	Septin8 (ENSDORG00000005384) #22	Kif3a (ENSDORG00000005381)	Il13 (ENSDORG00000001196)
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00390000012652.ab.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00860000136008	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES	2151																ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23
Hedgehog	DUPLICATION
Hedgehog	MODERN SPECIES	13217																ENSEEUG00000015595 #22
Hedgehog	MODERN SPECIES	1558																ENSEEUG00000015177 #22	ENSEEUG00000015131 #23
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00860000136008	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000162308	ENSGT00390000016270
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b.v	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00980000202777	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000162308
Dingo	MODERN SPECIES	366	CDKN2AIPNL (ENSCAFG00020001424)	UBE2B (ENSCAFG00020001359)	CDKL3 (ENSCAFG00020001317)	PPP2CA (ENSCAFG00020001309)	SKP1 (ENSCAFG00020001272)	TCF7 (ENSCAFG00020001127)	C5orf15 (ENSCAFG00020001109)	FSTL4 (ENSCAFG00020001057)	HSPA4 (ENSCAFG00020001038) #17	AFF4 (ENSCAFG00020000956) #19	LEAP2 (ENSCAFG00020000946)	UQCRQ (ENSCAFG00020000932)	GDF9 (ENSCAFG00020000928)	SHROOM1 (ENSCAFG00020000878) #20	SOWAHA (ENSCAFG00020000863) #21	SEPTIN8 (ENSCAFG00020000854) #22	KIF3A (ENSCAFG00020000311)	ENSCAFG00020000203	IL13 (ENSCAFG00020014310)	RAD50 (ENSCAFG00020014301)	IL5 (ENSCAFG00020014298)	IRF1 (ENSCAFG00020014294)	SLC22A5 (ENSCAFG00020014285)	SLC22A4 (ENSCAFG00020014277)	PDLIM4 (ENSCAFG00020014271)	ENSCAFG00020014269	P4HA2 (ENSCAFG00020014266)	CSF2 (ENSCAFG00020014258)	ACSL6 (ENSCAFG00020013978)	MEIKIN (ENSCAFG00020013948)	ENSCAFG00020013933
Dog	MODERN SPECIES	2	PPP2CA (ENSCAFG00845012605)	SKP1 (ENSCAFG00845012532)	ENSCAFG00845012366	VDAC1 (ENSCAFG00845012203)	C5orf15 (ENSCAFG00845012164)	FSTL4 (ENSCAFG00845012044)	HSPA4 (ENSCAFG00845011851) #17	ZCCHC10 (ENSCAFG00845011767) #18	AFF4 (ENSCAFG00845011722) #19	LEAP2 (ENSCAFG00845011696)	UQCRQ (ENSCAFG00845011677)	GDF9 (ENSCAFG00845011626)	SHROOM1 (ENSCAFG00845011505) #20	SOWAHA (ENSCAFG00845011481) #21	CCNI2 (ENSCAFG00845011431) #23	SEPTIN8 (ENSCAFG00845011237) #22	KIF3A (ENSCAFG00845011039)	IL4 (ENSCAFG00845010991)	IL13 (ENSCAFG00845010953)	RAD50 (ENSCAFG00845010682)	IL5 (ENSCAFG00845010566)	IRF1 (ENSCAFG00845010474)	SLC22A5 (ENSCAFG00845010298)	PDLIM4 (ENSCAFG00845010145)	ENSCAFG00845010098	P4HA2 (ENSCAFG00845009961)	ENSCAFG00845009857	CSF2 (ENSCAFG00845009774)	ACSL6 (ENSCAFG00845009224)	MEIKIN (ENSCAFG00845008941)	ENSCAFG00845008901
Red fox	MODERN SPECIES	17	SKP1 (ENSVVUG00000021377)	TCF7 (ENSVVUG00000021387)	VDAC1 (ENSVVUG00000021410)	CUNH5orf15 (ENSVVUG00000021413)	ENSVVUG00000021414	FSTL4 (ENSVVUG00000021423)	ENSVVUG00000021429	ENSVVUG00000021578 #17	ENSVVUG00000024517	ZCCHC10 (ENSVVUG00000024519) #18	AFF4 (ENSVVUG00000024524) #19	ENSVVUG00000024534	UQCRQ (ENSVVUG00000024537)	GDF9 (ENSVVUG00000024542)	SHROOM1 (ENSVVUG00000024544) #20	SEPTIN8 (ENSVVUG00000024548) #22	KIF3A (ENSVVUG00000024559)	IL4 (ENSVVUG00000024569)	IL13 (ENSVVUG00000024578)	RAD50 (ENSVVUG00000024587)	ENSVVUG00000024602	IL5 (ENSVVUG00000024604)	IRF1 (ENSVVUG00000024606)	SLC22A5 (ENSVVUG00000024615)	SLC22A4 (ENSVVUG00000024619)	P4HA2 (ENSVVUG00000024626)	PDLIM4 (ENSVVUG00000024637)	CSF2 (ENSVVUG00000024639)	ACSL6 (ENSVVUG00000024815)	FNIP1 (ENSVVUG00000028633)	RAPGEF6 (ENSVVUG00000028832)
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b
American mink	MODERN SPECIES	21	PPP2CA (ENSNVIG00000016768)	ENSNVIG00000016786	TCF7 (ENSNVIG00000016818)	ENSNVIG00000016919	C5orf15 (ENSNVIG00000016948)	FSTL4 (ENSNVIG00000016969)	HSPA4 (ENSNVIG00000017054) #17	ZCCHC10 (ENSNVIG00000017298) #18	AFF4 (ENSNVIG00000017333) #19	ENSNVIG00000017358	LEAP2 (ENSNVIG00000017370)	ENSNVIG00000017379	GDF9 (ENSNVIG00000017386)	SHROOM1 (ENSNVIG00000017407) #20	SOWAHA (ENSNVIG00000017442) #21	SEPTIN8 (ENSNVIG00000017457) #22	KIF3A (ENSNVIG00000017484)	ENSNVIG00000017632	ENSNVIG00000017641	IL13 (ENSNVIG00000017686)	RAD50 (ENSNVIG00000017706)	ENSNVIG00000017878	IL5 (ENSNVIG00000017886)	IRF1 (ENSNVIG00000017899)	SLC22A5 (ENSNVIG00000017983)	SLC22A4 (ENSNVIG00000018011)	PDLI4 (ENSNVIG00000018031)	P4HA2 (ENSNVIG00000018082)	CSF2 (ENSNVIG00000018231)	ACSL6 (ENSNVIG00000018275)	MEIKIN (ENSNVIG00000018458)
Ferret	MODERN SPECIES	175	CDKL3 (ENSMPUG00000010119)	ENSMPUG00000019793	PPP2CA (ENSMPUG00000010169)	TCF7 (ENSMPUG00000010174)	ENSMPUG00000010220	C5orf15 (ENSMPUG00000010282)	ENSMPUG00000010288	FSTL4 (ENSMPUG00000010293)	HSPA4 (ENSMPUG00000010303) #17	ZCCHC10 (ENSMPUG00000010310) #18	AFF4 (ENSMPUG00000010316) #19	UQCRQ (ENSMPUG00000010443)	GDF9 (ENSMPUG00000010451)	SHROOM1 (ENSMPUG00000010453) #20	SOWAHA (ENSMPUG00000019795) #21	SEPTIN8 (ENSMPUG00000010490) #22	KIF3A (ENSMPUG00000010496)	IL4 (ENSMPUG00000010501)	IL13 (ENSMPUG00000010507)	RAD50 (ENSMPUG00000010515)	IRF1 (ENSMPUG00000010522)	ENSMPUG00000010531	SLC22A5 (ENSMPUG00000010534)	SLC22A4 (ENSMPUG00000010710)	PDLIM4 (ENSMPUG00000010714)	P4HA2 (ENSMPUG00000010718)
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781.pb	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695.a	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000162308	ENSGT00390000016270
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b.v	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781.pb	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695.a
American black bear	MODERN SPECIES	2054										AFF4 (ENSUAMG00000025984) #19	LEAP2 (ENSUAMG00000025985)	UQCRQ (ENSUAMG00000025986)	GDF9 (ENSUAMG00000025987)	SHROOM1 (ENSUAMG00000025988) #20	SOWAHA (ENSUAMG00000025990) #21	SEPTIN8 (ENSUAMG00000025992) #22	KIF3A (ENSUAMG00000026007)
Polar bear	MODERN SPECIES	173	JADE2 (ENSUMAG00000017684)	UBE2B (ENSUMAG00000017720)	CDKL3 (ENSUMAG00000017727)	PPP2CA (ENSUMAG00000017743)	SKP1 (ENSUMAG00000017784)	TCF7 (ENSUMAG00000017791)	VDAC1 (ENSUMAG00000017808)	C5orf15 (ENSUMAG00000017819)	FSTL4 (ENSUMAG00000017851)	HSPA4 (ENSUMAG00000017895) #17	ZCCHC10 (ENSUMAG00000017932) #18	AFF4 (ENSUMAG00000017952) #19	LEAP2 (ENSUMAG00000018071)	UQCRQ (ENSUMAG00000018082)	GDF9 (ENSUMAG00000018085)	SEPTIN8 (ENSUMAG00000018131) #22	KIF3A (ENSUMAG00000018260)	ENSUMAG00000018266	ENSUMAG00000018269	RAD50 (ENSUMAG00000018284)	IL5 (ENSUMAG00000018318)	IRF1 (ENSUMAG00000018324)	SLC22A5 (ENSUMAG00000018353)	SLC22A4 (ENSUMAG00000018542)	PDLIM4 (ENSUMAG00000018550)	P4HA2 (ENSUMAG00000018565)	ENSUMAG00000018570
Giant Panda	MODERN SPECIES	13	PPP2CA (ENSAMEG00000029106)	ENSAMEG00000017810	TCF7 (ENSAMEG00000017798)	VDAC1 (ENSAMEG00000017790)	C5orf15 (ENSAMEG00000017789)	ENSAMEG00000017788	FSTL4 (ENSAMEG00000017773)	HSPA4 (ENSAMEG00000017771) #17	ZCCHC10 (ENSAMEG00000028102) #18	AFF4 (ENSAMEG00000017764) #19	LEAP2 (ENSAMEG00000017763)	UQCRQ (ENSAMEG00000017762)	GDF9 (ENSAMEG00000017761)	SHROOM1 (ENSAMEG00000017757) #20	SOWAHA (ENSAMEG00000025558) #21	SEPTIN8 (ENSAMEG00000017750) #22	ENSAMEG00000017749 #23	KIF3A (ENSAMEG00000017728)	IL4 (ENSAMEG00000017724)	IL13 (ENSAMEG00000017722)	ENSAMEG00000017706	RAD50 (ENSAMEG00000017712)	IRF1 (ENSAMEG00000017694)	SLC22A5 (ENSAMEG00000017680)	SLC22A4 (ENSAMEG00000017678)	PDLIM4 (ENSAMEG00000017670)	P4HA2 (ENSAMEG00000017663)	ENSAMEG00000024015	CSF2 (ENSAMEG00000024418)	ACSL6 (ENSAMEG00000017615)	MEIKIN (ENSAMEG00000017611)
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000162308	ENSGT00390000016270
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Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.ab.b.u.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308	ENSGT00390000016270
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Microbat	MODERN SPECIES	1237								FSTL4 (ENSMLUG00000012445)	HSPA4 (ENSMLUG00000003658) #17	ENSMLUG00000011366 #18	AFF4 (ENSMLUG00000015081) #19	LEAP2 (ENSMLUG00000015078)	UQCRQ (ENSMLUG00000007686)	GDF9 (ENSMLUG00000015073)	SHROOM1 (ENSMLUG00000015066) #20	SEPTIN8 (ENSMLUG00000015061) #22	CCNI2 (ENSMLUG00000028586) #23	KIF3A (ENSMLUG00000016582)	IL4 (ENSMLUG00000016579)	IL13 (ENSMLUG00000016573)	RAD50 (ENSMLUG00000016559)	IL5 (ENSMLUG00000016555)	IRF1 (ENSMLUG00000016545)	SLC22A5 (ENSMLUG00000016164)	PDLIM4 (ENSMLUG00000016139)	P4HA2 (ENSMLUG00000001634)	CSF2 (ENSMLUG00000015052)	ENSMLUG00000030462	ACSL6 (ENSMLUG00000015039)	MEIKIN (ENSMLUG00000024903)	FNIP1 (ENSMLUG00000023359)
Megabat	MODERN SPECIES	4093								HSPA4 (ENSPVAG00000015208) #17	ZCCHC10 (ENSPVAG00000015207) #18	AFF4 (ENSPVAG00000015204) #19	LEAP2 (ENSPVAG00000015202)	UQCRQ (ENSPVAG00000015201)	GDF9 (ENSPVAG00000015199)	SHROOM1 (ENSPVAG00000015196) #20	SOWAHA (ENSPVAG00000015194) #21	SEPTIN8 (ENSPVAG00000015189) #22	CCNI2 (ENSPVAG00000015184) #23	KIF3A (ENSPVAG00000015178)	IL4 (ENSPVAG00000015176)	IL13 (ENSPVAG00000015174)	RAD50 (ENSPVAG00000015171)	IL5 (ENSPVAG00000015170)
Equus	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695.d	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000162308	ENSGT00390000016270
Donkey	MODERN SPECIES	3	PPP2CA (ENSEASG00005037929)	SKP1 (ENSEASG00005037065)	TCF7 (ENSEASG00005018474)	VDAC1 (ENSEASG00005018462)	C5orf15 (ENSEASG00005018451)	FSTL4 (ENSEASG00005018409)	ENSEASG00005025760	HSPA4 (ENSEASG00005018382) #17	ZCCHC10 (ENSEASG00005037597) #18	AFF4 (ENSEASG00005018361) #19	LEAP2 (ENSEASG00005024445)	ENSEASG00005035424	GDF9 (ENSEASG00005024265)	SHROOM1 (ENSEASG00005018346) #20	SOWAHA (ENSEASG00005025428) #21	SEPTIN8 (ENSEASG00005018336) #22	ENSEASG00005027696 #23	KIF3A (ENSEASG00005017941)	ENSEASG00005017875	IL13 (ENSEASG00005026317)	RAD50 (ENSEASG00005016481)	IL5 (ENSEASG00005017855)	IRF1 (ENSEASG00005017842)	ENSEASG00005029409	SLC22A5 (ENSEASG00005016298)	SLC22A4 (ENSEASG00005028444)	PDLIM4 (ENSEASG00005016293)	P4HA2 (ENSEASG00005016292)	ENSEASG00005037108	ENSEASG00005031697	CSF2 (ENSEASG00005028210)
Horse	MODERN SPECIES	5	UBE2B (ENSECAG00000032089)	CDKL3 (ENSECAG00000018013)	PPP2CA (ENSECAG00000052111)	SKP1 (ENSECAG00000050063)	TCF7 (ENSECAG00000008098)	VDAC1 (ENSECAG00000012365)	C14H5orf15 (ENSECAG00000017207)	FSTL4 (ENSECAG00000018066)	HSPA4 (ENSECAG00000020813) #17	ZCCHC10 (ENSECAG00000026852) #18	AFF4 (ENSECAG00000011969) #19	ENSECAG00000029282	GDF9 (ENSECAG00000021088)	SHROOM1 (ENSECAG00000021746) #20	SOWAHA (ENSECAG00000022339) #21	SEPTIN8 (ENSECAG00000022349) #22	CCNI2 (ENSECAG00000043163) #23	KIF3A (ENSECAG00000024644)	IL4 (ENSECAG00000008299)	IL13 (ENSECAG00000009732)	RAD50 (ENSECAG00000010922)	IL5 (ENSECAG00000016648)	IRF1 (ENSECAG00000017794)	ENSECAG00000058597	SLC22A5 (ENSECAG00000021721)	SLC22A4 (ENSECAG00000050879)	PDLIM4 (ENSECAG00000024273)	P4HA2 (ENSECAG00000024817)	ENSECAG00000048852	CSF2 (ENSECAG00000009678)	ACSL6 (ENSECAG00000010126)
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00860000136008	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393
Suina	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000162308	ENSGT00390000016270
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	204	PPP2CA (ENSCWAG00000001252)	SKP1 (ENSCWAG00000001228)	TCF7 (ENSCWAG00000000966)	VDAC1 (ENSCWAG00000000911)	C5orf15 (ENSCWAG00000000899)	ENSCWAG00000000888	FSTL4 (ENSCWAG00000000828)	HSPA4 (ENSCWAG00000000776) #17	ZCCHC10 (ENSCWAG00000000742) #18	AFF4 (ENSCWAG00000000699) #19	LEAP2 (ENSCWAG00000000679)	UQCRQ (ENSCWAG00000000670)	GDF9 (ENSCWAG00000000656)	SHROOM1 (ENSCWAG00000000622) #20	SOWAHA (ENSCWAG00000000597) #21	SEPTIN8 (ENSCWAG00000000563) #22	KIF3A (ENSCWAG00000000413)	IL4 (ENSCWAG00000000368)	IL13 (ENSCWAG00000000347)	RAD50 (ENSCWAG00000000310)	IL5 (ENSCWAG00000000297)	IRF1 (ENSCWAG00000000270)	SLC22A5 (ENSCWAG00000000222)	SLC22A4 (ENSCWAG00000000183)	PDLIM4 (ENSCWAG00000000153)	P4HA2 (ENSCWAG00000000092)	ENSCWAG00000006229	CSF2 (ENSCWAG00000006204)	ACSL6 (ENSCWAG00000004924)	MEIKIN (ENSCWAG00000004716)	FNIP1 (ENSCWAG00000004582)
Pig	MODERN SPECIES	10	PPP2CA (ENSSSCG00000014298)	SKP1 (ENSSSCG00000038628)	TCF7 (ENSSSCG00000030680)	ENSSSCG00000014296	C5orf15 (ENSSSCG00000032323)	FSTL4 (ENSSSCG00000014293)	HSPA4 (ENSSSCG00000014292) #17	ZCCHC10 (ENSSSCG00000056081) #18	ENSSSCG00000062388	AFF4 (ENSSSCG00000014291) #19	LEAP2 (ENSSSCG00000040998)	UQCRQ (ENSSSCG00000014289)	GDF9 (ENSSSCG00000014288)	SHROOM1 (ENSSSCG00000014287) #20	SOWAHA (ENSSSCG00000014286) #21	SEPTIN8 (ENSSSCG00000014285) #22	ENSSSCG00000014284 #23	IL4 (ENSSSCG00000014282)	IL13 (ENSSSCG00000014281)	KIF3A (ENSSSCG00000014283)	IL5 (ENSSSCG00000014278)	IRF1 (ENSSSCG00000014277)	RAD50 (ENSSSCG00000014280)	SLC22A5 (ENSSSCG00000061383)	SLC22A4 (ENSSSCG00000014275)	PDLIM4 (ENSSSCG00000014274)	P4HA2 (ENSSSCG00000020915)	ENSSSCG00000055451	CSF2 (ENSSSCG00000023737)	ACSL6 (ENSSSCG00000014272)	MEIKIN (ENSSSCG00000014271)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00860000136008	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000156580	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029.n	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000162308	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124
Arabian camel	MODERN SPECIES	22	UBE2B (ENSCDRG00005002926)	CDKL3 (ENSCDRG00005002942)	PPP2CA (ENSCDRG00005003008)	ENSCDRG00005003041	TCF7 (ENSCDRG00005003054)	ENSCDRG00005003084	C5orf15 (ENSCDRG00005003097)	FSTL4 (ENSCDRG00005003110)	HSPA4 (ENSCDRG00005003126) #17	ZCCHC10 (ENSCDRG00005003157) #18	AFF4 (ENSCDRG00005003176) #19	LEAP2 (ENSCDRG00005003219)	ENSCDRG00005003236	GDF9 (ENSCDRG00005003240)	SHROOM1 (ENSCDRG00005003247) #20	SEPTIN8 (ENSCDRG00005003268) #22	KIF3A (ENSCDRG00005003630)	IL4 (ENSCDRG00005003716)	IL13 (ENSCDRG00005003744)	RAD50 (ENSCDRG00005003769)	IL5 (ENSCDRG00005003838)	IRF1 (ENSCDRG00005003873)	SLC22A5 (ENSCDRG00005003925)	PDLIM4 (ENSCDRG00005004076)	P4HA2 (ENSCDRG00005000116)	CSF2 (ENSCDRG00005000185)	ACSL6 (ENSCDRG00005000277)	MEIKIN (ENSCDRG00005001063)	FNIP1 (ENSCDRG00005001151)	RAPGEF6 (ENSCDRG00005001347)	CDC42SE2 (ENSCDRG00005002638)
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00860000136008	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029.k.a	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029.k.a	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308	ENSGT00390000016270
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029.k.a	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308	ENSGT00390000016270
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029.k.a	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000162308	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000161317	ENSGT00550000074618.a.a	ENSGT00390000012652.bb	ENSGT00940000159831	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00440000037499	ENSGT00940000158076	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029.k.a	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000162308	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b
Narwhal	MODERN SPECIES	298	PPP2CA (ENSMMNG00015002212)	ENSMMNG00015002197	TCF7 (ENSMMNG00015002150)	ENSMMNG00015002104	C5orf15 (ENSMMNG00015002074)	FSTL4 (ENSMMNG00015002051)	ENSMMNG00015002024	HSPA4 (ENSMMNG00015001979) #17	ZCCHC10 (ENSMMNG00015001916) #18	AFF4 (ENSMMNG00015001850) #19	LEAP2 (ENSMMNG00015001821)	ENSMMNG00015001806	GDF9 (ENSMMNG00015001793)	SHROOM1 (ENSMMNG00015001762) #20	SOWAHA (ENSMMNG00015001733) #21	SEPTIN8 (ENSMMNG00015001582) #22	KIF3A (ENSMMNG00015001401)	IL4 (ENSMMNG00015001332)	IL13 (ENSMMNG00015001279)	IL5 (ENSMMNG00015001244)	IRF1 (ENSMMNG00015001204)	RAD50 (ENSMMNG00015001057)	SLC22A5 (ENSMMNG00015000945)	PDLIM4 (ENSMMNG00015000756)	P4HA2 (ENSMMNG00015000684)	CSF2 (ENSMMNG00015000645)	ACSL6 (ENSMMNG00015000476)	MEIKIN (ENSMMNG00015000287)	FNIP1 (ENSMMNG00015000141)	RAPGEF6 (ENSMMNG00015003948)	CDC42SE2 (ENSMMNG00015003871)
Beluga whale	MODERN SPECIES	34	CDKL3 (ENSDLEG00000004128)	PPP2CA (ENSDLEG00000004119)	ENSDLEG00000004108	TCF7 (ENSDLEG00000004087)	ENSDLEG00000004058	CUNH5orf15 (ENSDLEG00000004047)	FSTL4 (ENSDLEG00000002768)	HSPA4 (ENSDLEG00000002746) #17	ZCCHC10 (ENSDLEG00000002732) #18	AFF4 (ENSDLEG00000002716) #19	LEAP2 (ENSDLEG00000002714)	ENSDLEG00000002709	GDF9 (ENSDLEG00000002706)	SHROOM1 (ENSDLEG00000002694) #20	SOWAHA (ENSDLEG00000002687) #21	SEPT8 (ENSDLEG00000002669) #22	CCNI2 (ENSDLEG00000002654) #23	KIF3A (ENSDLEG00000002592)	IL4 (ENSDLEG00000002560)	IL13 (ENSDLEG00000002549)	IL5 (ENSDLEG00000002536)	IRF1 (ENSDLEG00000002517)	RAD50 (ENSDLEG00000002453)	SLC22A5 (ENSDLEG00000002429)	ENSDLEG00000002425	PDLIM4 (ENSDLEG00000002414)	P4HA2 (ENSDLEG00000002352)	CSF2 (ENSDLEG00000002339)	ACSL6 (ENSDLEG00000002257)	ENSDLEG00000002237	FNIP1 (ENSDLEG00000002195)
Vaquita	MODERN SPECIES	14	ENSPSNG00000000064	CDKL3 (ENSPSNG00000000099)	PPP2CA (ENSPSNG00000000125)	ENSPSNG00000000142	TCF7 (ENSPSNG00000000199)	ENSPSNG00000000298	C5orf15 (ENSPSNG00000000328)	FSTL4 (ENSPSNG00000000371)	HSPA4 (ENSPSNG00000000446) #17	ZCCHC10 (ENSPSNG00000000491) #18	AFF4 (ENSPSNG00000000549) #19	LEAP2 (ENSPSNG00000000583)	ENSPSNG00000000601	GDF9 (ENSPSNG00000000623)	SHROOM1 (ENSPSNG00000000661) #20	SEPTIN8 (ENSPSNG00000000738) #22	KIF3A (ENSPSNG00000000863)	ENSPSNG00000000891	IL4 (ENSPSNG00000000916)	IL13 (ENSPSNG00000000949)	RAD50 (ENSPSNG00000001010)	ENSPSNG00000001084	IL5 (ENSPSNG00000001105)	IRF1 (ENSPSNG00000001129)	SLC22A5 (ENSPSNG00000001173)	SLC22A4 (ENSPSNG00000001211)	PDLIM4 (ENSPSNG00000001255)	P4HA2 (ENSPSNG00000001404)	CSF2 (ENSPSNG00000001500)	ACSL6 (ENSPSNG00000001595)	MEIKIN (ENSPSNG00000001746)
Dolphin	MODERN SPECIES	2583																SEPTIN8 (ENSTTRG00000002608) #22	CCNI2 (ENSTTRG00000002606) #23	KIF3A (ENSTTRG00000002604)	IL4 (ENSTTRG00000002602)	IL13 (ENSTTRG00000002601)	RAD50 (ENSTTRG00000002599)	IL5 (ENSTTRG00000002598)	IRF1 (ENSTTRG00000002597)	SLC22A5 (ENSTTRG00000002595)
Sperm whale	MODERN SPECIES	19	UBE2B (ENSPCTG00005010679)	CDKL3 (ENSPCTG00005010526)	PPP2CA (ENSPCTG00005010464)	SKP1 (ENSPCTG00005010295)	TCF7 (ENSPCTG00005010007)	VDAC1 (ENSPCTG00005009965)	C8H5orf15 (ENSPCTG00005009935)	FSTL4 (ENSPCTG00005009656)	HSPA4 (ENSPCTG00005009592) #17	ZCCHC10 (ENSPCTG00005009514) #18	LEAP2 (ENSPCTG00005009462)	ENSPCTG00005009418	GDF9 (ENSPCTG00005009233) #19	SHROOM1 (ENSPCTG00005009012) #20	SOWAHA (ENSPCTG00005008985) #21	SEPT8 (ENSPCTG00005008764) #22	CCNI2 (ENSPCTG00005008653) #23	ENSPCTG00005006404	KIF3A (ENSPCTG00005006335)	IL4 (ENSPCTG00005006270)	IL13 (ENSPCTG00005006232)	RAD50 (ENSPCTG00005005979)	IL5 (ENSPCTG00005005933)	IRF1 (ENSPCTG00005005916)	SLC22A5 (ENSPCTG00005005818)	SLC22A4 (ENSPCTG00005005790)	PDLIM4 (ENSPCTG00005005755)	P4HA2 (ENSPCTG00005005698)	CSF2 (ENSPCTG00005005667)	ENSPCTG00005005597	ACSL6 (ENSPCTG00005004726)
Blue whale	MODERN SPECIES	14	CDKL3 (ENSBMSG00010000621)	PPP2CA (ENSBMSG00010000599)	ENSBMSG00010000571	TCF7 (ENSBMSG00010000497)	ENSBMSG00010000427	C5orf15 (ENSBMSG00010000398)	FSTL4 (ENSBMSG00010000325)	HSPA4 (ENSBMSG00010000264) #17	ZCCHC10 (ENSBMSG00010000233) #18	AFF4 (ENSBMSG00010000194) #19	LEAP2 (ENSBMSG00010000170)	ENSBMSG00010000150	GDF9 (ENSBMSG00010000134)	SHROOM1 (ENSBMSG00010000056) #20	SOWAHA (ENSBMSG00010000033) #21	SEPTIN8 (ENSBMSG00010017726) #22	ENSBMSG00010017575	KIF3A (ENSBMSG00010017431)	IL4 (ENSBMSG00010017373)	IL13 (ENSBMSG00010017323)	RAD50 (ENSBMSG00010017284)	IRF1 (ENSBMSG00010017200)	SLC22A5 (ENSBMSG00010017125)	SLC22A4 (ENSBMSG00010017062)	PDLIM4 (ENSBMSG00010017023)	P4HA2 (ENSBMSG00010016924)	ENSBMSG00010016848	CSF2 (ENSBMSG00010016824)	ACSL6 (ENSBMSG00010015881)	MEIKIN (ENSBMSG00010015587)	FNIP1 (ENSBMSG00010015476)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158753	ENSGT00950000186377	ENSGT00510000047872	ENSGT00940000162661	ENSGT00940000163597	ENSGT00940000159808	ENSGT00390000013515	ENSGT00390000005235	ENSGT00720000108823	ENSGT00390000006337	ENSGT00390000012911	ENSGT00550000075067	ENSGT00390000015418	ENSGT01050000244898.a.a.a.a	ENSGT00940000154587.a.b	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00860000136008	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393
Yarkand deer	MODERN SPECIES	32	LMNB2 (ENSCHYG00000004498)	TIMM13 (ENSCHYG00000000344)	TMPRSS9 (ENSCHYG00000000368)	LSM7 (ENSCHYG00000000423)	PEAK3 (ENSCHYG00000000445)	OAZ1 (ENSCHYG00000000472)	DOT1L (ENSCHYG00000000575)	PLEKHJ1 (ENSCHYG00000000867)	SF3A2 (ENSCHYG00000000893)	AMH (ENSCHYG00000000909)	JSRP1 (ENSCHYG00000000925)	AP3D1 (ENSCHYG00000000957)	ENSCHYG00000001063	MOB3A (ENSCHYG00000001112)	MKNK2 (ENSCHYG00000001205)	SEPTIN8 (ENSCHYG00000001401) #22	KIF3A (ENSCHYG00000001582)	IL4 (ENSCHYG00000001642)	ENSCHYG00000001665	RAD50 (ENSCHYG00000001711)	IL5 (ENSCHYG00000001775)	IRF1 (ENSCHYG00000001795)	SLC22A5 (ENSCHYG00000001886)	ENSCHYG00000001972	ENSCHYG00000001987	ENSCHYG00000001999	PDLIM4 (ENSCHYG00000002022)	P4HA2 (ENSCHYG00000002114)	ENSCHYG00000002268	ENSCHYG00000002295	CSF2 (ENSCHYG00000002315)
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158753	ENSGT00950000186377	ENSGT00510000047872	ENSGT00940000162661	ENSGT00940000163597	ENSGT00940000159808	ENSGT00390000013515	ENSGT00390000005235	ENSGT00720000108823	ENSGT00390000006337	ENSGT00390000012911	ENSGT00550000075067	ENSGT00390000015418	ENSGT01050000244898.a.a.a.a	ENSGT00940000154587.a.b	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00860000136008	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	99	SPPL2B (ENSMMSG00000001402)	LSM7 (ENSMMSG00000001427)	LINGO3 (ENSMMSG00000001452)	PEAK3 (ENSMMSG00000001459)	OAZ1 (ENSMMSG00000001472)	DOT1L (ENSMMSG00000001501)	PLEKHJ1 (ENSMMSG00000001573)	SF3A2 (ENSMMSG00000001597)	AMH (ENSMMSG00000001611)	JSRP1 (ENSMMSG00000001625)	AP3D1 (ENSMMSG00000001647)	IZUMO4 (ENSMMSG00000001699)	MOB3A (ENSMMSG00000001750)	ENSMMSG00000001769	MKNK2 (ENSMMSG00000001783)	SEPTIN8 (ENSMMSG00000001824) #22	KIF3A (ENSMMSG00000001930)	IL4 (ENSMMSG00000001956)	IL13 (ENSMMSG00000001976)	RAD50 (ENSMMSG00000001998)	ENSMMSG00000002018	IL5 (ENSMMSG00000002022)	IRF1 (ENSMMSG00000002032)	SLC22A5 (ENSMMSG00000002067)	SLC22A4 (ENSMMSG00000002092)	PDLIM4 (ENSMMSG00000002108)	P4HA2 (ENSMMSG00000002135)
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158753	ENSGT00950000186377	ENSGT00510000047872	ENSGT00940000162661	ENSGT00940000163597	ENSGT00940000159808	ENSGT00390000013515	ENSGT00390000005235	ENSGT00720000108823	ENSGT00390000006337	ENSGT00390000012911	ENSGT00550000075067	ENSGT00390000015418	ENSGT01050000244898.a.a.a.a	ENSGT00940000154587.a.b	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00860000136008	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000159993	ENSGT00940000158753	ENSGT00510000047872	ENSGT00940000162661	ENSGT00940000163597	ENSGT00940000159808	ENSGT00390000013515	ENSGT00390000005235	ENSGT00720000108823	ENSGT00390000006337	ENSGT00390000012911	ENSGT00550000075067	ENSGT00390000015418	ENSGT01050000244898.a.a.a.a	ENSGT00940000154587.a.b	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425	ENSGT00940000163393	ENSGT00940000162308
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	21	SPPL2B (ENSOARG00020022087)	LSM7 (ENSOARG00020022153)	LINGO3 (ENSOARG00020022211)	PEAK3 (ENSOARG00020022229)	OAZ1 (ENSOARG00020022261)	DOT1L (ENSOARG00020022357)	PLEKHJ1 (ENSOARG00020022506)	SF3A2 (ENSOARG00020022551)	AMH (ENSOARG00020022582)	JSRP1 (ENSOARG00020022642)	AP3D1 (ENSOARG00020022696)	IZUMO4 (ENSOARG00020023112)	MOB3A (ENSOARG00020023197)	MKNK2 (ENSOARG00020023226)	KIF3A (ENSOARG00020023396)	SEPTIN8 (ENSOARG00020023569) #22	CCNI2 (ENSOARG00020023740) #23	ENSOARG00020000137	IL4 (ENSOARG00020000164)	IL13 (ENSOARG00020000182)	RAD50 (ENSOARG00020000231)	IL5 (ENSOARG00020000299)	IRF1 (ENSOARG00020000320)	SLC22A5 (ENSOARG00020000369)	PDLIM4 (ENSOARG00020000472)	P4HA2 (ENSOARG00020000510)	CSF2 (ENSOARG00020000571)	IL3 (ENSOARG00020000584)	ACSL6 (ENSOARG00020000681)	MEIKIN (ENSOARG00020000943)	FNIP1 (ENSOARG00020001049)
Goat	MODERN SPECIES	26	TMPRSS9 (ENSCHIG00000017597)	SPPL2B (ENSCHIG00000018686)	LSM7 (ENSCHIG00000023663)	LINGO3 (ENSCHIG00000010793)	PEAK3 (ENSCHIG00000015985)	OAZ1 (ENSCHIG00000000810)	DOT1L (ENSCHIG00000015437)	PLEKHJ1 (ENSCHIG00000010795)	SF3A2 (ENSCHIG00000018323)	AMH (ENSCHIG00000024227)	JSRP1 (ENSCHIG00000011843)	AP3D1 (ENSCHIG00000024186)	IZUMO4 (ENSCHIG00000012130)	MOB3A (ENSCHIG00000014339)	MKNK2 (ENSCHIG00000026760)	SEPTIN8 (ENSCHIG00000014012) #22	KIF3A (ENSCHIG00000027262)	IL4 (ENSCHIG00000019142)	IL13 (ENSCHIG00000020082)	RAD50 (ENSCHIG00000006955)	IL5 (ENSCHIG00000001692)	ENSCHIG00000015548	IRF1 (ENSCHIG00000019913)	SLC22A5 (ENSCHIG00000023337)	SLC22A4 (ENSCHIG00000021571)	PDLIM4 (ENSCHIG00000011646)	P4HA2 (ENSCHIG00000021007)	ENSCHIG00000020172	CSF2 (ENSCHIG00000027268)	ENSCHIG00000017795	ACSL6 (ENSCHIG00000007360)
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158753	ENSGT00950000186377	ENSGT00510000047872	ENSGT00940000162661	ENSGT00940000163597	ENSGT00940000159808	ENSGT00390000013515	ENSGT00390000005235	ENSGT00720000108823	ENSGT00390000006337	ENSGT00390000012911	ENSGT00550000075067	ENSGT00390000015418	ENSGT01050000244898.a.a.a.a	ENSGT00940000154587.a.b	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00860000136008	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000005569.x.a.b.b.a.b.a.g	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425
American bison	MODERN SPECIES	3349	LMNB2 (ENSBBBG00000023963)	TIMM13 (ENSBBBG00000023974)	TMPRSS9 (ENSBBBG00000008875)	SPPL2B (ENSBBBG00000008884)	LSM7 (ENSBBBG00000024293)	LINGO3 (ENSBBBG00000024314)	OAZ1 (ENSBBBG00000024367)	DOT1L (ENSBBBG00000006363)	PLEKHJ1 (ENSBBBG00000024440)	SF3A2 (ENSBBBG00000024453)	JSRP1 (ENSBBBG00000024475)	AP3D1 (ENSBBBG00000008196)	IZUMO4 (ENSBBBG00000006444)	MOB3A (ENSBBBG00000024665)	MKNK2 (ENSBBBG00000024717)	SEPTIN8 (ENSBBBG00000024826) #22	ENSBBBG00000024868	KIF3A (ENSBBBG00000025147)	IL4 (ENSBBBG00000025345)	IL13 (ENSBBBG00000025394)	RAD50 (ENSBBBG00000006746)	IL5 (ENSBBBG00000025482)	IRF1 (ENSBBBG00000012548)	SLC22A5 (ENSBBBG00000002405)	SLC22A4 (ENSBBBG00000001857)	PDLIM4 (ENSBBBG00000012595)	P4HA2 (ENSBBBG00000012706)	ENSBBBG00000012721	ENSBBBG00000012726	CSF2 (ENSBBBG00000012729)	ENSBBBG00000012738
Bos	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000158753	ENSGT00950000186377	ENSGT00510000047872	ENSGT00940000162661	ENSGT00940000163597	ENSGT00940000159808	ENSGT00390000013515	ENSGT00390000005235	ENSGT00720000108823	ENSGT00390000006337	ENSGT00390000012911	ENSGT00550000075067	ENSGT00390000015418	ENSGT01050000244898.a.a.a.a	ENSGT00940000154587.a.b	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00860000136008	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000005569.x.a.b.b.a.b.a.g	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000186377	ENSGT00510000047872	ENSGT00940000162661	ENSGT00940000163597	ENSGT00940000159808	ENSGT00390000013515	ENSGT00390000005235	ENSGT00960000190456	ENSGT00720000108823	ENSGT00390000006337	ENSGT00390000012911	ENSGT00550000075067	ENSGT00390000015418	ENSGT01050000244898.a.a.a.a	ENSGT00940000154587.a.b	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000153169.A.b.b.a.b	ENSGT01100000263480.a.a.a.a.b.b.b.a.a.b	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000005569.x.a.b.b.a.b.a.g	ENSGT00910000148765
Wild yak	MODERN SPECIES	144	SPPL2B (ENSBMUG00000013515)	ENSBMUG00000013528	ENSBMUG00000013546	PEAK3 (ENSBMUG00000013617)	OAZ1 (ENSBMUG00000013624)	DOT1L (ENSBMUG00000013662)	ENSBMUG00000013714	SF3A2 (ENSBMUG00000013735)	AMH (ENSBMUG00000013753)	JSRP1 (ENSBMUG00000013809)	AP3D1 (ENSBMUG00000013895)	IZUMO4 (ENSBMUG00000013950)	MOB3A (ENSBMUG00000013970)	MKNK2 (ENSBMUG00000014007)	ENSBMUG00000014038	SEPTIN8 (ENSBMUG00000014064) #22	CCNI2 (ENSBMUG00000014089) #23	KIF3A (ENSBMUG00000014235)	ENSBMUG00000014367	IL4 (ENSBMUG00000014428)	IL13 (ENSBMUG00000014514)	RAD50 (ENSBMUG00000014543)	IL5 (ENSBMUG00000014557)	IRF1 (ENSBMUG00000014575)	SLC22A5 (ENSBMUG00000014593)	SLC22A4 (ENSBMUG00000014610)	PDLIM4 (ENSBMUG00000014643)	P4HA2 (ENSBMUG00000014738)	ENSBMUG00000014754	ENSBMUG00000014788	CSF2 (ENSBMUG00000014799)
Domestic yak	MODERN SPECIES	27	TMPRSS9 (ENSBGRG00000001387)	SPPL2B (ENSBGRG00000001417)	LSM7 (ENSBGRG00000001523)	LINGO3 (ENSBGRG00000001543)	PEAK3 (ENSBGRG00000001551)	ENSBGRG00000001574	DOT1L (ENSBGRG00000001615)	PLEKHJ1 (ENSBGRG00000001668)	JSRP1 (ENSBGRG00000001703)	ENSBGRG00000001773	AP3D1 (ENSBGRG00000001819)	IZUMO4 (ENSBGRG00000001910)	MOB3A (ENSBGRG00000001980)	MKNK2 (ENSBGRG00000002024)	ENSBGRG00000002174	SEPTIN8 (ENSBGRG00000002241) #22	CCNI2 (ENSBGRG00000002530) #23	KIF3A (ENSBGRG00000002563)	ENSBGRG00000002631	ENSBGRG00000002650	IL4 (ENSBGRG00000002658)	IL13 (ENSBGRG00000002683)	RAD50 (ENSBGRG00000002771)	IL5 (ENSBGRG00000003095)	IRF1 (ENSBGRG00000003116)	SLC22A5 (ENSBGRG00000003191)	PDLIM4 (ENSBGRG00000003303)	P4HA2 (ENSBGRG00000003333)	ENSBGRG00000003349	ENSBGRG00000003354	ENSBGRG00000003376
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000159993	ENSGT00940000158753	ENSGT00510000047872	ENSGT00940000162661	ENSGT00940000163597	ENSGT00940000159808	ENSGT00390000013515	ENSGT00390000005235	ENSGT00720000108823	ENSGT00390000006337	ENSGT00390000012911	ENSGT00550000075067	ENSGT00390000015418	ENSGT01050000244898.a.a.a.a	ENSGT00940000154587.a.b	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000003225	ENSGT00390000018781	ENSGT00390000016991	ENSGT00940000156288	ENSGT00860000136008	ENSGT00940000154155.c	ENSGT00940000154155.d	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00390000005569.x.a.b.b.a.b.a.g	ENSGT00910000148765	ENSGT00390000013425
Cow	MODERN SPECIES	26	SPPL2B (ENSBTAG00000004524)	LSM7 (ENSBTAG00000004521)	LINGO3 (ENSBTAG00000016478)	PEAK3 (ENSBTAG00000016477)	OAZ1 (ENSBTAG00000018522)	DOT1L (ENSBTAG00000009996)	PLEKHJ1 (ENSBTAG00000001647)	SF3A2 (ENSBTAG00000025452)	AMH (ENSBTAG00000014955)	JSRP1 (ENSBTAG00000014956)	AP3D1 (ENSBTAG00000009034)	IZUMO4 (ENSBTAG00000025448)	MOB3A (ENSBTAG00000014526)	MKNK2 (ENSBTAG00000018049)	ENSBTAG00000025445	SEPTIN8 (ENSBTAG00000008609) #22	CCNI2 (ENSBTAG00000031246) #23	KIF3A (ENSBTAG00000025477)	IL4 (ENSBTAG00000015957)	IL13 (ENSBTAG00000015953)	RAD50 (ENSBTAG00000011252)	IL5 (ENSBTAG00000031235)	IRF1 (ENSBTAG00000031231)	SLC22A5 (ENSBTAG00000000668)	SLC22A4 (ENSBTAG00000031209)	PDLIM4 (ENSBTAG00000015426)	P4HA2 (ENSBTAG00000001116)	ENSBTAG00000031205	ENSBTAG00000050573	CSF2 (ENSBTAG00000001570)	IL3 (ENSBTAG00000002140)
Platypus	MODERN SPECIES	84	NR3C1 (ENSOANG00000005745) #9	ARHGAP26 (ENSOANG00000046105) #10	SPRY4 (ENSOANG00000050843) #13	NDFIP1 (ENSOANG00000044026) #14	ENSOANG00000038385	RNF14 (ENSOANG00000007432) #16	HSPA4 (ENSOANG00000007430) #17	ENSOANG00000007429	AFF4 (ENSOANG00000007428) #19	ENSOANG00000048396	LEAP2 (ENSOANG00000048336)	UQCRQ (ENSOANG00000042160)	GDF9 (ENSOANG00000044501)	ENSOANG00000049290 #20	SOWAHA (ENSOANG00000036102) #21	SEPTIN8 (ENSOANG00000007424) #22	ENSOANG00000007421 #23	KIF3A (ENSOANG00000007422)	RAD50 (ENSOANG00000008019)	ENSOANG00000040098	IRF1 (ENSOANG00000036485)	ENSOANG00000007233	ENSOANG00000007236	PDLIM4 (ENSOANG00000040872)	P4HA2 (ENSOANG00000005598)	ENSOANG00000009215	ENSOANG00000030428	FNIP1 (ENSOANG00000009212)	RAPGEF6 (ENSOANG00000006961)	FSTL4 (ENSOANG00000013403)	ENSOANG00000045927
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124	ENSGT00940000158076	ENSGT00440000037499	ENSGT00950000182869.e.a.b
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124	ENSGT00940000158076	ENSGT00440000037499	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00940000159831
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124	ENSGT00940000158076	ENSGT00440000037499	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00940000159831
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124	ENSGT00940000158076	ENSGT00440000037499	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00940000159831
Common wall lizard	MODERN SPECIES	10	ARHGAP26 (ENSPMRG00000011404) #10	FGF1 (ENSPMRG00000011436)	ENSPMRG00000011440	SPRY4 (ENSPMRG00000011441) #13	NDFIP1 (ENSPMRG00000011446) #14	ENSPMRG00000011453	RNF14 (ENSPMRG00000011457) #16	HSPA4 (ENSPMRG00000011460) #17	ZCCHC10 (ENSPMRG00000011467) #18	AFF4 (ENSPMRG00000011471) #19	ENSPMRG00000011489	LEAP2 (ENSPMRG00000011494)	GDF9 (ENSPMRG00000011503)	ENSPMRG00000011507 #20	SOWAHA (ENSPMRG00000011515) #21	SEPTIN8 (ENSPMRG00000011522) #22	CCNI2 (ENSPMRG00000011536) #23	KIF3A (ENSPMRG00000011547)	RAD50 (ENSPMRG00000011558)	ENSPMRG00000011573	ENSPMRG00000011587	ENSPMRG00000011592	ENSPMRG00000011597	ENSPMRG00000011600	PDLIM4 (ENSPMRG00000011601)	P4HA2 (ENSPMRG00000011605)	ENSPMRG00000011608	ENSPMRG00000011609	ENSPMRG00000011627	FNIP1 (ENSPMRG00000011671)	ENSPMRG00000011718
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	1	ARHGAP26 (ENSSMRG00000017990) #10	FGF1 (ENSSMRG00000017987)	SPRY4 (ENSSMRG00000017986) #13	NDFIP1 (ENSSMRG00000017985) #14	GNPDA1 (ENSSMRG00000017984)	RNF14 (ENSSMRG00000017983) #16	HSPA4 (ENSSMRG00000017982) #17	ZCCHC10 (ENSSMRG00000017981) #18	AFF4 (ENSSMRG00000017975) #19	LEAP2 (ENSSMRG00000017974)	ENSSMRG00000017973	ENSSMRG00000017971	GDF9 (ENSSMRG00000017969)	ENSSMRG00000017965 #20	ENSSMRG00000017962 #21	SEPTIN8 (ENSSMRG00000017956) #22	CCNI2 (ENSSMRG00000017941) #23	KIF3A (ENSSMRG00000017937)	RAD50 (ENSSMRG00000017931)	ENSSMRG00000017900	IRF1 (ENSSMRG00000017896)	ENSSMRG00000017894	ENSSMRG00000017889	PDLIM4 (ENSSMRG00000017888)	P4HA2 (ENSSMRG00000017880)	ENSSMRG00000017872	FNIP1 (ENSSMRG00000017871)	RAPGEF6 (ENSSMRG00000017857)	FSTL4 (ENSSMRG00000017828)	C5orf15 (ENSSMRG00000017720)	ENSSMRG00000017719
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254.d #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124	ENSGT00940000158076	ENSGT00440000037499	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00940000159831	ENSGT00390000012652.bb
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254.d #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000018781.cb	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124	ENSGT00940000158076	ENSGT00440000037499	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00940000159831.a	ENSGT00390000012652.bb
Indian cobra	MODERN SPECIES	1	YIPF5 (ENSNNAG00000012686) #8	NR3C1 (ENSNNAG00000012655) #9	ARHGAP26 (ENSNNAG00000012582) #10	ENSNNAG00000012564 #10	FGF1 (ENSNNAG00000012539)	SPRY4 (ENSNNAG00000012525) #13	NDFIP1 (ENSNNAG00000012504) #14	GNPDA1 (ENSNNAG00000012487)	RNF14 (ENSNNAG00000012441) #16	HSPA4 (ENSNNAG00000012415) #17	ENSNNAG00000012396 #18	AFF4 (ENSNNAG00000012346) #19	ENSNNAG00000012331	GDF9 (ENSNNAG00000012305)	ENSNNAG00000012277 #21	SEPTIN8 (ENSNNAG00000011922) #22	ENSNNAG00000011893	ENSNNAG00000011880	KIF3A (ENSNNAG00000011793)	IRF1 (ENSNNAG00000011474)	ENSNNAG00000011415	ENSNNAG00000011330	PDLIM4 (ENSNNAG00000011307)	P4HA2 (ENSNNAG00000011265)	ENSNNAG00000009610	FNIP1 (ENSNNAG00000007313)	RAPGEF6 (ENSNNAG00000007133)	FSTL4 (ENSNNAG00000006849)	C5orf15 (ENSNNAG00000006795)	VDAC1 (ENSNNAG00000006771)	TCF7 (ENSNNAG00000006715)
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254.d #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000018781.cb	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.wb	ENSGT00940000154155.vb.a	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124	ENSGT00940000158076	ENSGT00440000037499	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00940000159831.a
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000153168.C.a.a #8	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254.d #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000018781.cb	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.wb	ENSGT00940000154155.vb.a	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124	ENSGT00940000158076	ENSGT00440000037499	ENSGT00950000182869.e.a.b	ENSGT00940000159831.a
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	4	YIPF5 (ENSNSUG00000010279) #8	NR3C1 (ENSNSUG00000010278) #9	ARHGAP26 (ENSNSUG00000010267) #10	FGF1 (ENSNSUG00000010265)	SPRY4 (ENSNSUG00000010261) #13	NDFIP1 (ENSNSUG00000010260) #14	GNPDA1 (ENSNSUG00000010259)	ENSNSUG00000010258 #16	HSPA4 (ENSNSUG00000008345) #17	ZCCHC10 (ENSNSUG00000008341) #18	AFF4 (ENSNSUG00000008322) #19	ENSNSUG00000008319	GDF9 (ENSNSUG00000008317)	ENSNSUG00000008315 #20	ENSNSUG00000008314 #21	SEPTIN8 (ENSNSUG00000006326) #22	CCNI2 (ENSNSUG00000006302) #23	KIF3A (ENSNSUG00000006210)	RAD50 (ENSNSUG00000004660)	IRF1 (ENSNSUG00000004638)	ENSNSUG00000004635	ENSNSUG00000004629	PDLIM4 (ENSNSUG00000004626)	P4HA2 (ENSNSUG00000004623)	ENSNSUG00000004614	FNIP1 (ENSNSUG00000004609)	RAPGEF6 (ENSNSUG00000004562)	ENSNSUG00000004560	FSTL4 (ENSNSUG00000004519)	C5orf15 (ENSNSUG00000004508)	VDAC1 (ENSNSUG00000004501)
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	6	YIPF5 (ENSPTXG00000001213) #8	NR3C1 (ENSPTXG00000001219) #9	ARHGAP26 (ENSPTXG00000001239) #10	FGF1 (ENSPTXG00000001324)	SPRY4 (ENSPTXG00000001326) #13	NDFIP1 (ENSPTXG00000001327) #14	GNPDA1 (ENSPTXG00000001329)	RNF14 (ENSPTXG00000001333) #16	HSPA4 (ENSPTXG00000001337) #17	ZCCHC10 (ENSPTXG00000001340) #18	AFF4 (ENSPTXG00000001343) #19	LEAP2 (ENSPTXG00000001346)	GDF9 (ENSPTXG00000001348)	ENSPTXG00000001359 #20	ENSPTXG00000001363 #21	SEPTIN8 (ENSPTXG00000001367) #22	CCNI2 (ENSPTXG00000001375) #23	KIF3A (ENSPTXG00000001378)	RAD50 (ENSPTXG00000001442)	IRF1 (ENSPTXG00000003549)	ENSPTXG00000003555	ENSPTXG00000003558	PDLIM4 (ENSPTXG00000003561)	P4HA2 (ENSPTXG00000003562)	ENSPTXG00000003572	FNIP1 (ENSPTXG00000003793)	RAPGEF6 (ENSPTXG00000003836)	FSTL4 (ENSPTXG00000007436)	C5orf15 (ENSPTXG00000007471)	VDAC1 (ENSPTXG00000007473)	ENSPTXG00000007475
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	801																SEPTIN8 (ENSLLTG00000012334) #22	ENSLLTG00000012347 #23
Lizard	MODERN SPECIES	1	FOSL2 (ENSACAG00000009506)	ENSACAG00000009454	NR3C1 (ENSACAG00000013668) #9	ARHGAP26 (ENSACAG00000013456) #10	FGF1 (ENSACAG00000043127)	SPRY4 (ENSACAG00000013420) #13	NDFIP1 (ENSACAG00000013413) #14	GNPDA1 (ENSACAG00000013374)	RNF14 (ENSACAG00000013340) #16	HSPA4 (ENSACAG00000013092) #17	ENSACAG00000040566	ENSACAG00000013070 #18	AFF4 (ENSACAG00000022605) #19	ENSACAG00000013046	ENSACAG00000041958 #20	SEPTIN8 (ENSACAG00000012880) #22	ENSACAG00000035847	CCNI2 (ENSACAG00000029045) #23	KIF3A (ENSACAG00000012793)	RAD50 (ENSACAG00000012723)	IRF1 (ENSACAG00000012699)	ENSACAG00000012596	ENSACAG00000042535	ENSACAG00000025303	PDLIM4 (ENSACAG00000027479)	ENSACAG00000039701	P4HA2 (ENSACAG00000012415)	ENSACAG00000035374	ENSACAG00000039370	ENSACAG00000012268	ENSACAG00000044200
tuatara	MODERN SPECIES	1296			NR3C1 (ENSSPUG00000012418) #9	ARHGAP26 (ENSSPUG00000012383) #10	FGF1 (ENSSPUG00000012364)	SPRY4 (ENSSPUG00000012353) #13	NDFIP1 (ENSSPUG00000012343) #14	GNPDA1 (ENSSPUG00000012336)	RNF14 (ENSSPUG00000012319) #16	HSPA4 (ENSSPUG00000012262) #17	ZCCHC10 (ENSSPUG00000012246) #18	AFF4 (ENSSPUG00000012215) #19	LEAP2 (ENSSPUG00000012201)	UQCRQ (ENSSPUG00000012191)	GDF9 (ENSSPUG00000012186)	SEPTIN8 (ENSSPUG00000012170) #22	CCNI2 (ENSSPUG00000012158) #23	KIF3A (ENSSPUG00000012135)
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124	ENSGT00960000189568	ENSGT00940000158076	ENSGT00440000037499
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00950000185731	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124	ENSGT00960000189568	ENSGT00940000158076	ENSGT00440000037499
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00950000185731	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124	ENSGT00960000189568	ENSGT00940000158076	ENSGT00440000037499	ENSGT00950000182869.e.a.b
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00950000185731	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155.mb	ENSGT00940000154155.lb.a	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124	ENSGT00940000158076	ENSGT00440000037499	ENSGT00950000182869.e.a.b
painted turtle	MODERN SPECIES	761	NR3C1 (ENSCPBG00000016629) #9	ARHGAP26 (ENSCPBG00000016598) #10	FGF1 (ENSCPBG00000016580)	SPRY4 (ENSCPBG00000016578) #13	NDFIP1 (ENSCPBG00000016575) #14	GNPDA1 (ENSCPBG00000016567)	RNF14 (ENSCPBG00000016562) #16	HSPA4 (ENSCPBG00000016557) #17	ZCCHC10 (ENSCPBG00000016553) #18	ENSCPBG00000016549 #19	ENSCPBG00000016541 #19	LEAP2 (ENSCPBG00000016520)	UQCRQ (ENSCPBG00000016516)	GDF9 (ENSCPBG00000016514)	ENSCPBG00000016512 #20	SEPTIN8 (ENSCPBG00000016503) #22	CCNI2 (ENSCPBG00000016497) #23	KIF3A (ENSCPBG00000016491)	ENSCPBG00000016486	RAD50 (ENSCPBG00000013815)	ENSCPBG00000013765
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	306	NR3C1 (ENSTMTG00000017032) #9	ARHGAP26 (ENSTMTG00000017093) #10	FGF1 (ENSTMTG00000017562)	SPRY4 (ENSTMTG00000017587) #13	NDFIP1 (ENSTMTG00000017594) #14	GNPDA1 (ENSTMTG00000017607)	RNF14 (ENSTMTG00000017619) #16	HSPA4 (ENSTMTG00000017638) #17	ENSTMTG00000017685	AFF4 (ENSTMTG00000017703) #19	LEAP2 (ENSTMTG00000017743)	UQCRQ (ENSTMTG00000014720)	GDF9 (ENSTMTG00000014729)	ENSTMTG00000014735 #20	SOWAHA (ENSTMTG00000014745) #21	SEPTIN8 (ENSTMTG00000014763) #22	CCNI2 (ENSTMTG00000014786) #23	KIF3A (ENSTMTG00000014795)	RAD50 (ENSTMTG00000014874)	IRF1 (ENSTMTG00000015881)	ENSTMTG00000015908	ENSTMTG00000016007	PDLIM4 (ENSTMTG00000016084)	P4HA2 (ENSTMTG00000016163)	ENSTMTG00000017044	FNIP1 (ENSTMTG00000017988)	RAPGEF6 (ENSTMTG00000018189)	FSTL4 (ENSTMTG00000020998)	C5orf15 (ENSTMTG00000021029)	VDAC1 (ENSTMTG00000021034)	TCF7 (ENSTMTG00000021039)
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00950000185731	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124	ENSGT00960000189568	ENSGT00940000158076	ENSGT00440000037499	ENSGT00950000182869.e.a.b
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	22	NR3C1 (ENSGEVG00005011630) #9	ARHGAP26 (ENSGEVG00005010458) #10	FGF1 (ENSGEVG00005010339)	SPRY4 (ENSGEVG00005010321) #13	NDFIP1 (ENSGEVG00005010296) #14	GNPDA1 (ENSGEVG00005010284)	RNF14 (ENSGEVG00005010252) #16	HSPA4 (ENSGEVG00005010204) #17	ZCCHC10 (ENSGEVG00005010176) #18	AFF4 (ENSGEVG00005010126) #19	LEAP2 (ENSGEVG00005010095)	UQCRQ (ENSGEVG00005010077)	GDF9 (ENSGEVG00005010023)	ENSGEVG00005009956 #20	SOWAHA (ENSGEVG00005009935) #21	SEPTIN8 (ENSGEVG00005009791) #22	CCNI2 (ENSGEVG00005009749) #23	KIF3A (ENSGEVG00005009678)	RAD50 (ENSGEVG00005009615)	IRF1 (ENSGEVG00005009584)	ENSGEVG00005009511	PDLIM4 (ENSGEVG00005009408)	P4HA2 (ENSGEVG00005008755)	ENSGEVG00005008614	FNIP1 (ENSGEVG00005008570)	RAPGEF6 (ENSGEVG00005008382)	ENSGEVG00005008336	FSTL4 (ENSGEVG00005008216)	C5orf15 (ENSGEVG00005008167)	VDAC1 (ENSGEVG00005008146)	TCF7 (ENSGEVG00005008118)
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	2691	NR3C1 (ENSCABG00000010099) #9	ARHGAP26 (ENSCABG00000010102) #10	FGF1 (ENSCABG00000010142)	SPRY4 (ENSCABG00000010144) #13	NDFIP1 (ENSCABG00000010145) #14	GNPDA1 (ENSCABG00000010146)	RNF14 (ENSCABG00000010151) #16	HSPA4 (ENSCABG00000010166) #17	ZCCHC10 (ENSCABG00000010169) #18	AFF4 (ENSCABG00000010174) #19	LEAP2 (ENSCABG00000010227)	UQCRQ (ENSCABG00000010228)	GDF9 (ENSCABG00000010229)	ENSCABG00000010230 #20	ENSCABG00000010231 #21	SEPTIN8 (ENSCABG00000010233) #22	CCNI2 (ENSCABG00000010270) #23	KIF3A (ENSCABG00000010275)	ENSCABG00000010373	RAD50 (ENSCABG00000010414)	IRF1 (ENSCABG00000012044)	ENSCABG00000012045	ENSCABG00000012046	PDLIM4 (ENSCABG00000012047)	P4HA2 (ENSCABG00000012049)	ENSCABG00000012058	FNIP1 (ENSCABG00000012065)	RAPGEF6 (ENSCABG00000012084)	ENSCABG00000012085	FSTL4 (ENSCABG00000012086)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	1469	YIPF5 (ENSPSIG00000015511) #8	NR3C1 (ENSPSIG00000015245) #9	ARHGAP26 (ENSPSIG00000014722) #10	ENSPSIG00000002032	FGF1 (ENSPSIG00000014555)	SPRY4 (ENSPSIG00000014328) #13	NDFIP1 (ENSPSIG00000014277) #14	GNPDA1 (ENSPSIG00000014040)	RNF14 (ENSPSIG00000013973) #16	HSPA4 (ENSPSIG00000013077) #17	ZCCHC10 (ENSPSIG00000013016) #18	AFF4 (ENSPSIG00000013003) #19	UQCRQ (ENSPSIG00000012883)	GDF9 (ENSPSIG00000012848)	ENSPSIG00000012735 #20	SEPTIN8 (ENSPSIG00000012411) #22	CCNI2 (ENSPSIG00000012295) #23	KIF3A (ENSPSIG00000011075)	RAD50 (ENSPSIG00000010890)	IRF1 (ENSPSIG00000010399)	ENSPSIG00000010222
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124	ENSGT00960000189568	ENSGT00940000158076	ENSGT00440000037499
Aves	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000169911	ENSGT00950000185731	ENSGT00390000013108	ENSGT00390000018781	ENSGT01030000235516	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT01030000235545	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108.a	ENSGT00940000169911	ENSGT00390000013108.b	ENSGT00390000018781	ENSGT01030000235516	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT01030000235545	ENSGT00610000087493	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000016270
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108.a	ENSGT00940000169911	ENSGT00390000013108.b	ENSGT00390000018781	ENSGT01030000235516	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT01030000235545	ENSGT00610000087493	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000016270
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108.a	ENSGT00390000013108.b	ENSGT00390000018781	ENSGT01030000235516	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT01030000235545	ENSGT00610000087493	ENSGT00610000087492	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000016270
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000160557.a	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00390000013108.a	ENSGT00390000013108.b	ENSGT00390000018781	ENSGT01030000235516	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT01030000235545	ENSGT00610000087493	ENSGT00610000087492	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000016270
Chicken	MODERN SPECIES	4	NR3C1 (ENSGALG00010016758) #9	ARHGAP26 (ENSGALG00010016732) #10	FGF1 (ENSGALG00010013399)	SPRY4 (ENSGALG00010013372) #13	NDFIP1 (ENSGALG00010013353) #14	GNPDA1 (ENSGALG00010013300)	RNF14 (ENSGALG00010013286) #16	HSPA4 (ENSGALG00010013805) #17	ZCCHC10 (ENSGALG00010013787) #18	AFF4 (ENSGALG00010013737) #19	LEAP2 (ENSGALG00010013704)	UQCRQ (ENSGALG00010013686)	GDF9 (ENSGALG00010013676)	ENSGALG00010013672 #20	SOWAHA (ENSGALG00010013667) #21	SEPTIN8 (ENSGALG00010016402) #22	CCNI2 (ENSGALG00010016375) #23	KIF3A (ENSGALG00010016366)	IL4 (ENSGALG00010016327)	IL13 (ENSGALG00010016321)	RAD50 (ENSGALG00010016307)	IL5 (ENSGALG00010016298)	IRF1 (ENSGALG00010016289)	SLC22A5 (ENSGALG00010017398)	SLC22A4 (ENSGALG00010016281)	PDLIM4 (ENSGALG00010016266)	P4HA2 (ENSGALG00010016225)	KK34 (ENSGALG00010016165)	IL3 (ENSGALG00010016157)	CSF2 (ENSGALG00010016145)	ENSGALG00010016127
Turkey	MODERN SPECIES	6	ENSMGAG00000008646	ENSMGAG00000008698	ENSMGAG00000008789	ENSMGAG00000008785	ENSMGAG00000008782	ENSMGAG00000008781	ENSMGAG00000008855	ENSMGAG00000008873	ENSMGAG00000019134	IRF1 (ENSMGAG00000008932)	ENSMGAG00000008970	KIF3A (ENSMGAG00000009022)	ENSMGAG00000009019	ENSMGAG00000009008	ENSMGAG00000008972	ENSMGAG00000009086 #22	ENSMGAG00000009075 #23	ENSMGAG00000009138	UQCRQ (ENSMGAG00000009135)	ENSMGAG00000009121	ENSMGAG00000008958 #20	ENSMGAG00000020532 #21	ENSMGAG00000009184 #17	ENSMGAG00000009266	ENSMGAG00000009253 #16	NDFIP1 (ENSMGAG00000009275) #14	ENSMGAG00000009144 #19	ENSMGAG00000020424	ENSMGAG00000015458	ENSMGAG00000021682 #10	ENSMGAG00000009299 #10
Japanese quail	MODERN SPECIES	4	SH3RF2 (ENSCJPG00005020888)	GRXCR2 (ENSCJPG00005020889)	KCTD16 (ENSCJPG00005020892) #7	YIPF5 (ENSCJPG00005020893) #8	NR3C1 (ENSCJPG00005020895) #9	ARHGAP26 (ENSCJPG00005020896) #10	FGF1 (ENSCJPG00005020897)	SPRY4 (ENSCJPG00005020899) #13	NDFIP1 (ENSCJPG00005020900) #14	GNPDA1 (ENSCJPG00005020901)	RNF14 (ENSCJPG00005020902) #16	HSPA4 (ENSCJPG00005020903) #17	ZCCHC10 (ENSCJPG00005020904) #18	ENSCJPG00005020905 #20	SOWAHA (ENSCJPG00005020906) #21	SEPTIN8 (ENSCJPG00005020911) #22	CCNI2 (ENSCJPG00005020976) #23	KIF3A (ENSCJPG00005020977)	IL4 (ENSCJPG00005020978)	ENSCJPG00005020979	RAD50 (ENSCJPG00005020980)	ENSCJPG00005020981	IRF1 (ENSCJPG00005020982)	ENSCJPG00005020983	ENSCJPG00005020984	PDLIM4 (ENSCJPG00005020985)	P4HA2 (ENSCJPG00005020986)	ENSCJPG00005020987	ENSCJPG00005020988	ENSCJPG00005020989	ENSCJPG00005020994
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000169911	ENSGT00390000013108.b	ENSGT00390000018781	ENSGT01030000235516	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT01030000235545	ENSGT00610000087493	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124
Pink-footed goose	DUPLICATION
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Pink-footed goose	MODERN SPECIES	9	ARHGAP26 (ENSABRG00000016387) #10	FGF1 (ENSABRG00000016381)	SPRY4 (ENSABRG00000016376) #13	NDFIP1 (ENSABRG00000016372) #14	GNPDA1 (ENSABRG00000016368)	RNF14 (ENSABRG00000016367) #16	HSPA4 (ENSABRG00000016359) #17	ENSABRG00000016355	AFF4 (ENSABRG00000016343) #19	LEAP2 (ENSABRG00000016336)	UQCRQ (ENSABRG00000016335)	GDF9 (ENSABRG00000016331)	ENSABRG00000016326 #20	SOWAHA (ENSABRG00000016319) #21	ENSABRG00000016309 #22	ENSABRG00000016303 #22	CCNI2 (ENSABRG00000016299) #23	KIF3A (ENSABRG00000016291)	ENSABRG00000016288	ENSABRG00000016274	RAD50 (ENSABRG00000016258)	ENSABRG00000016256	IRF1 (ENSABRG00000016253)	ENSABRG00000016247	ENSABRG00000016241	PDLIM4 (ENSABRG00000016232)	P4HA2 (ENSABRG00000016204)	ENSABRG00000016190	ENSABRG00000016183	ENSABRG00000013109	FNIP1 (ENSABRG00000012140)
Duck	MODERN SPECIES	5	YIPF5 (ENSAPLG00000007623) #8	NR3C1 (ENSAPLG00000007318) #9	ARHGAP26 (ENSAPLG00000006831) #10	FGF1 (ENSAPLG00000006784)	SPRY4 (ENSAPLG00000001658) #13	NDFIP1 (ENSAPLG00000004156) #14	GNPDA1 (ENSAPLG00000004003)	RNF14 (ENSAPLG00000003900) #16	HSPA4 (ENSAPLG00000002687) #17	ZCCHC10 (ENSAPLG00000002623) #18	LEAP2 (ENSAPLG00000011235)	AFF4 (ENSAPLG00000011166) #19	GDF9 (ENSAPLG00000011242)	ENSAPLG00000018974 #20	SOWAHA (ENSAPLG00000021650) #21	SEPTIN8 (ENSAPLG00000011252) #22	CCNI2 (ENSAPLG00000011517) #23	KIF3A (ENSAPLG00000011529)	ENSAPLG00000011854	RAD50 (ENSAPLG00000011856)	ENSAPLG00000019991	ENSAPLG00000009189	ENSAPLG00000009155	PDLIM4 (ENSAPLG00000003185)	P4HA2 (ENSAPLG00000003370)	ENSAPLG00000023893	ENSAPLG00000024780	ENSAPLG00000002999	FNIP1 (ENSAPLG00000002569)	RAPGEF6 (ENSAPLG00000015846)	FSTL4 (ENSAPLG00000015488)
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000169911	ENSGT00390000013108.b	ENSGT00390000018781	ENSGT01030000235516	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT01030000235545	ENSGT00610000087493	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b
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Flycatcher	MODERN SPECIES	4	RARS1 (ENSFALG00000009700)	WWC1 (ENSFALG00000009702)	TENM2 (ENSFALG00000009707)	MAT2B (ENSFALG00000013556)	HMMR (ENSFALG00000013551)	NUDCD2 (ENSFALG00000027578)	CCNG1 (ENSFALG00000013546)	GABRG2 (ENSFALG00000013543) #25	GABRA1 (ENSFALG00000013536) #26	GABRA6 (ENSFALG00000013521)	GABRB2 (ENSFALG00000013511)	ATP10B (ENSFALG00000013488)	ENSFALG00000013477	ENSFALG00000013473	ENSFALG00000028676 #20	SEPTIN8 (ENSFALG00000013468) #22	ENSFALG00000013465 #23	KIF3A (ENSFALG00000013462)	ENSFALG00000014138	ENSFALG00000013458	RAD50 (ENSFALG00000013456)	ENSFALG00000025112	IRF1 (ENSFALG00000028567)	ENSFALG00000014137	ENSFALG00000023998	ENSFALG00000028868	PCDHGC4 (ENSFALG00000002847)	ENSFALG00000015011	ENSFALG00000002835	PCDHGC5 (ENSFALG00000023289)	HDAC3 (ENSFALG00000002877)
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00410000025556.a.a.a.a	ENSGT01030000234566.e.b.a.b	ENSGT00390000006721	ENSGT00390000007135	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000154726	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722	ENSGT00940000154245.A	ENSGT00940000159531	ENSGT00390000009693	ENSGT00390000002292.b.g.a	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000169911	ENSGT00390000013108.b	ENSGT00390000018781	ENSGT01030000235516	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT01030000235545	ENSGT00610000087493	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00410000025556.a.a.a.a	ENSGT01030000234566.e.b.a.b	ENSGT00390000006721	ENSGT00390000007135	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000154726	ENSGT00940000156685 #25	ENSGT00940000159136 #26	ENSGT00940000156722	ENSGT00940000154245.A	ENSGT00940000159531	ENSGT00390000009693	ENSGT00390000002292.b.g.a	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000169911	ENSGT00390000013108.b	ENSGT00390000018781	ENSGT01030000235516	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT01030000235545	ENSGT00610000087493	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000016270	ENSGT00390000009391.b
Zebra finch	MODERN SPECIES	4	TENM2 (ENSTGUG00000001484)	ENSTGUG00000019787	MAT2B (ENSTGUG00000001479)	HMMR (ENSTGUG00000001476)	NUDCD2 (ENSTGUG00000001473)	CCNG1 (ENSTGUG00000021615)	GABRG2 (ENSTGUG00000001461) #25	GABRA1 (ENSTGUG00000001457) #26	GABRA6 (ENSTGUG00000001440)	GABRB2 (ENSTGUG00000020690)	ATP10B (ENSTGUG00000001419)	ENSTGUG00000001417	ENSTGUG00000001410	ENSTGUG00000029606 #20	SOWAHA (ENSTGUG00000025210) #21	SEPTIN8 (ENSTGUG00000001394) #22	CCNI2 (ENSTGUG00000015614) #23	KIF3A (ENSTGUG00000001386)	ENSTGUG00000001385	ENSTGUG00000001384	RAD50 (ENSTGUG00000001377)	ENSTGUG00000005051	IRF1 (ENSTGUG00000001375)	ENSTGUG00000021785	ENSTGUG00000022538	ENSTGUG00000024570	PCDH1 (ENSTGUG00000014668)	ENSTGUG00000019649	PCDH12 (ENSTGUG00000025129)	ENSTGUG00000019198	ECSCR (ENSTGUG00000028793)
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Medium ground finch	MODERN SPECIES	11			MAT2B (ENSGFOG00000000915)	HMMR (ENSGFOG00000000940)	NUDCD2 (ENSGFOG00000000952)	CCNG1 (ENSGFOG00000000959)	GABRG2 (ENSGFOG00000000970) #25	GABRA1 (ENSGFOG00000000991) #26	GABRA6 (ENSGFOG00000000997)	GABRB2 (ENSGFOG00000001007)	ENSGFOG00000001055	ATP10B (ENSGFOG00000001069)	ENSGFOG00000001135	SLU7 (ENSGFOG00000001147)	ENSGFOG00000001222 #20	SEPTIN8 (ENSGFOG00000001239) #22	CCNI2 (ENSGFOG00000001266) #23	KIF3A (ENSGFOG00000001277)	ENSGFOG00000001289	ENSGFOG00000001300	RAD50 (ENSGFOG00000001305)	ENSGFOG00000001324	IRF1 (ENSGFOG00000001327)	ENSGFOG00000001338	ENSGFOG00000001369	PDLIM4 (ENSGFOG00000001378)	P4HA2 (ENSGFOG00000001387)	ENSGFOG00000001415	ENSGFOG00000001484	FNIP1 (ENSGFOG00000002025)	RAPGEF6 (ENSGFOG00000002089)
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000156385 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23	ENSGT00940000156386	ENSGT00940000169911	ENSGT00390000013108.b	ENSGT00390000018781	ENSGT01030000235516	ENSGT00940000156288	ENSGT00940000154155	ENSGT00940000159536	ENSGT00940000157695	ENSGT01030000235545	ENSGT00610000087493	ENSGT00940000154508.a.b	ENSGT00390000009391.b	ENSGT00940000158124
Kakapo	MODERN SPECIES	6	ARHGAP26 (ENSSHBG00005016872) #10	FGF1 (ENSSHBG00005016881)	SPRY4 (ENSSHBG00005016889) #13	NDFIP1 (ENSSHBG00005016895) #14	GNPDA1 (ENSSHBG00005016903)	RNF14 (ENSSHBG00005016911) #16	HSPA4 (ENSSHBG00005016917) #17	ZCCHC10 (ENSSHBG00005005326) #18	ENSSHBG00005005338 #19	ENSSHBG00005005356 #19	UQCRQ (ENSSHBG00005005393)	LEAP2 (ENSSHBG00005005414)	GDF9 (ENSSHBG00005005427)	ENSSHBG00005005441 #20	SOWAHA (ENSSHBG00005005463) #21	SEPTIN8 (ENSSHBG00005005487) #22	CCNI2 (ENSSHBG00005005523) #23	KIF3A (ENSSHBG00005005551)	ENSSHBG00005005583	ENSSHBG00005005600	RAD50 (ENSSHBG00005005627)	IRF1 (ENSSHBG00005005671)	ENSSHBG00005005709	ENSSHBG00005005737	PDLIM4 (ENSSHBG00005005762)	P4HA2 (ENSSHBG00005005790)	ENSSHBG00005005830	ENSSHBG00005005846	FNIP1 (ENSSHBG00005005952)	RAPGEF6 (ENSSHBG00005006630)	FSTL4 (ENSSHBG00005006742)
Golden eagle	MODERN SPECIES	14	YIPF5 (ENSACCG00020014229) #8	NR3C1 (ENSACCG00020014204) #9	ARHGAP26 (ENSACCG00020014129) #10	FGF1 (ENSACCG00020014084)	SPRY4 (ENSACCG00020014075) #13	NDFIP1 (ENSACCG00020014064) #14	GNPDA1 (ENSACCG00020014051)	RNF14 (ENSACCG00020014027) #16	HSPA4 (ENSACCG00020013986) #17	ZCCHC10 (ENSACCG00020013952) #18	AFF4 (ENSACCG00020013926) #19	LEAP2 (ENSACCG00020013901)	UQCRQ (ENSACCG00020013890)	GDF9 (ENSACCG00020013877)	ENSACCG00020013860 #20	SEPTIN8 (ENSACCG00020013837) #22	CCNI2 (ENSACCG00020013805) #23	KIF3A (ENSACCG00020013769)	ENSACCG00020013670	ENSACCG00020013651	RAD50 (ENSACCG00020013607)	ENSACCG00020013574	IRF1 (ENSACCG00020013556)	ENSACCG00020013529	ENSACCG00020013514	PDLIM4 (ENSACCG00020013485)	P4HA2 (ENSACCG00020013454)	ENSACCG00020013427	ENSACCG00020013414	ENSACCG00020011493	FNIP1 (ENSACCG00020010141)
African ostrich	MODERN SPECIES	182	GRXCR2 (ENSSCUG00000002193)	KCTD16 (ENSSCUG00000002200) #7	YIPF5 (ENSSCUG00000002202) #8	NR3C1 (ENSSCUG00000002211) #9	ARHGAP26 (ENSSCUG00000002219) #10	ENSSCUG00000002235	NDFIP1 (ENSSCUG00000002238) #14	GNPDA1 (ENSSCUG00000002243)	RNF14 (ENSSCUG00000002246) #16	HSPA4 (ENSSCUG00000002258) #17	ZCCHC10 (ENSSCUG00000002270) #18	AFF4 (ENSSCUG00000002271) #19	LEAP2 (ENSSCUG00000002274)	GDF9 (ENSSCUG00000002275)	ENSSCUG00000002276 #20	SEPTIN8 (ENSSCUG00000002282) #22	CCNI2 (ENSSCUG00000002286) #23	KIF3A (ENSSCUG00000002290)	ENSSCUG00000002294	ENSSCUG00000002296	RAD50 (ENSSCUG00000002300)	ENSSCUG00000002306	IRF1 (ENSSCUG00000002314)	ENSSCUG00000002318	ENSSCUG00000002326	PDLIM4 (ENSSCUG00000002328)	P4HA2 (ENSSCUG00000002331)	ENSSCUG00000002333	ENSSCUG00000002337	ENSSCUG00000002339	FNIP1 (ENSSCUG00000002340)
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	34	YIPF5 (ENSCPRG00005008278) #8	NR3C1 (ENSCPRG00005008298) #9	ARHGAP26 (ENSCPRG00005008337) #10	FGF1 (ENSCPRG00005008365)	SPRY4 (ENSCPRG00005008382) #13	NDFIP1 (ENSCPRG00005008386) #14	GNPDA1 (ENSCPRG00005008400)	RNF14 (ENSCPRG00005008410) #16	HSPA4 (ENSCPRG00005008425) #17	ZCCHC10 (ENSCPRG00005008454) #18	AFF4 (ENSCPRG00005008462) #19	LEAP2 (ENSCPRG00005008479)	ENSCPRG00005008482	GDF9 (ENSCPRG00005008485)	ENSCPRG00005008491 #20	SEPTIN8 (ENSCPRG00005008502) #22	CCNI2 (ENSCPRG00005008513) #23	KIF3A (ENSCPRG00005008523)	ENSCPRG00005008547	RAD50 (ENSCPRG00005008628)	ENSCPRG00005009369	IRF1 (ENSCPRG00005009375)	ENSCPRG00005009387	PDLIM4 (ENSCPRG00005009404)	P4HA2 (ENSCPRG00005009472)	ENSCPRG00005010222	FNIP1 (ENSCPRG00005010267)	RAPGEF6 (ENSCPRG00005010295)	FSTL4 (ENSCPRG00005010357)	VDAC1 (ENSCPRG00005010381)	TCF7 (ENSCPRG00005010397)
Anura	ANCESTRAL SPECIES	198		ENSGT00940000160557	ENSGT00950000183055.b.b #13	ENSGT00390000012721.a #14	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00940000154507 #16	ENSGT00940000156067 #17	ENSGT00940000168656	ENSGT00730000111200 #18	ENSGT00950000182974.a.a.b #19	ENSGT00390000013467	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784	ENSGT00940000160656 #20	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #21	ENSGT00940000156068 #22	ENSGT00940000162679 #23
Frog	MODERN SPECIES	3	ENSXETG00000040540 #16	ENSXETG00000034756 #16	rnf14.4 (ENSXETG00000027144) #16	gnpda1 (ENSXETG00000004172)	hspa4 (ENSXETG00000027138) #17	zcchc10 (ENSXETG00000004171)	aff4 (ENSXETG00000004169) #19	leap2 (ENSXETG00000030080)	ENSXETG00000048896	uqcrq (ENSXETG00000027128)	gdf9 (ENSXETG00000004168)	ENSXETG00000049106	sowaha (ENSXETG00000004166) #21	shroom1 (ENSXETG00000004167) #20	ENSXETG00000046198	septin8 (ENSXETG00000030617) #22	ccni2 (ENSXETG00000034722) #23	kif3a (ENSXETG00000004164)	il4 (ENSXETG00000032602)	arhgap26 (ENSXETG00000001880) #10	ENSXETG00000047964	ENSXETG00000041993	ENSXETG00000047801	nr3c1 (ENSXETG00000042129) #9	yipf5 (ENSXETG00000005469) #8	kctd16 (ENSXETG00000030030) #7	ENSXETG00000047589	ENSXETG00000046225	prelid2 (ENSXETG00000027124)	ENSXETG00000043029	grxcr2 (ENSXETG00000032005)
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	6	ENSLLEG00000026476	SPRY4 (ENSLLEG00000026447) #13	ENSLLEG00000026406	NDFIP1 (ENSLLEG00000026180) #14	ENSLLEG00000026010	ENSLLEG00000025992	ENSLLEG00000025971	ENSLLEG00000025952	ENSLLEG00000025470 #16	ENSLLEG00000025349 #16	ENSLLEG00000024876 #16	HSPA4 (ENSLLEG00000024564) #17	GDF9 (ENSLLEG00000024479)	ENSLLEG00000024367 #20	SOWAHA (ENSLLEG00000024323) #21	SEPTIN8 (ENSLLEG00000023850) #22	CCNI2 (ENSLLEG00000023745) #23	ENSLLEG00000023483	ENSLLEG00000023452	ENSLLEG00000023424	ENSLLEG00000023401	ENSLLEG00000022610	ENSLLEG00000022515	PDLIM4 (ENSLLEG00000022384)	ENSLLEG00000022359	ENSLLEG00000022333	ENSLLEG00000022191	RARS1 (ENSLLEG00000022073)	WWC1 (ENSLLEG00000021732)	TENM2 (ENSLLEG00000019738)	ENSLLEG00000019586
Coelacanth	MODERN SPECIES	1120		FGF1 (ENSLACG00000013294)	SPRY4 (ENSLACG00000012427) #13	NDFIP1 (ENSLACG00000011391) #14	endou2 (ENSLACG00000011188) #15	gnpda1 (ENSLACG00000010995)	RNF14 (ENSLACG00000010710) #16	HSPA4 (ENSLACG00000010299) #17	ZCCHC10 (ENSLACG00000009762) #18	ENSLACG00000009069	AFF4 (ENSLACG00000008849) #19	UQCRQ (ENSLACG00000008524)	GDF9 (ENSLACG00000008346)	ENSLACG00000007532 #20	SOWAHA (ENSLACG00000007318) #21	SEPTIN8 (ENSLACG00000005880) #22	CCNI2 (ENSLACG00000005697) #23	KIF3A (ENSLACG00000004822)