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Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000170602	ENSGT00940000161716 #8	ENSGT00390000013187 #9	ENSGT00390000000592 #10	ENSGT00940000157650 #11	ENSGT00390000018426 #12	ENSGT01030000234558.A.a.a.a #13	ENSGT01030000234582.f.b.g #15	ENSGT00390000016398	ENSGT00390000017745 #16	ENSGT00970000193372.a.b #17	ENSGT00940000160621 #18	ENSGT00940000162489 #19	ENSGT00940000154419.a.a #20	ENSGT00940000154419.a.b #21	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400 #26	ENSGT00940000160057 #27	ENSGT00940000156850.a.a #28	ENSGT00390000017226 #29	ENSGT00510000048483 #30	ENSGT00940000159845 #31	ENSGT01000000214413.b.b #32	ENSGT00940000160860 #33	ENSGT01030000234598.a.a.b #34	ENSGT00940000162123 #35	ENSGT00940000159264 #36	ENSGT00390000017455 #37
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Glires	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000161811 #7	ENSGT00940000161716 #8	ENSGT00390000013187 #9	ENSGT00390000000592 #10	ENSGT00940000157650 #11	ENSGT00390000018426 #12	ENSGT01030000234558.A.a.a.a #13	ENSGT01030000234582.f.b.g #15	ENSGT00390000017745 #16	ENSGT00970000193372.a.b #17	ENSGT00940000160621 #18	ENSGT00940000162489 #19	ENSGT00940000154419.a.a #20	ENSGT00940000154419.a.b #21	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400 #26	ENSGT00940000160057 #27	ENSGT00940000156850.a.a #28	ENSGT00390000017226 #29	ENSGT00510000048483 #30	ENSGT00940000159845 #31	ENSGT01000000214413.b.b #32	ENSGT00940000160860 #33	ENSGT01030000234598.a.a.b #34	ENSGT00940000162123 #35	ENSGT00940000159264 #36	ENSGT00390000017455 #37
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000161811 #7	ENSGT00940000161716 #8	ENSGT00390000013187 #9	ENSGT00390000000592 #10	ENSGT00940000157650 #11	ENSGT00390000018426 #12	ENSGT01030000234558.A.a.a.a #13	ENSGT01030000234582.f.b.g #15	ENSGT00390000017745 #16	ENSGT00970000193372.a.b #17	ENSGT00940000160621 #18	ENSGT00940000162489 #19	ENSGT00940000154419.a.a #20	ENSGT00940000154419.a.b #21	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400 #26	ENSGT00940000160057 #27	ENSGT00940000156850.a.a #28	ENSGT00390000017226 #29	ENSGT00510000048483 #30	ENSGT00940000159845 #31	ENSGT01000000214413.b.b #32	ENSGT00940000160860 #33	ENSGT01030000234598.a.a.b #34	ENSGT00940000162123 #35	ENSGT00940000159264 #36	ENSGT00390000017455 #37
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000163742	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000161811 #7	ENSGT00940000161716 #8	ENSGT00390000013187 #9	ENSGT00390000000592 #10	ENSGT00940000157650 #11	ENSGT00390000018426 #12	ENSGT01030000234558.A.a.a.a #13	ENSGT00390000017745 #16	ENSGT00970000193372.a.b #17	ENSGT00940000160621 #18	ENSGT00940000162489 #19	ENSGT00940000154419.a.a #20	ENSGT00940000154419.a.b #21	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400 #26	ENSGT00940000160057 #27	ENSGT00940000156850.a.a #28	ENSGT00390000017226 #29	ENSGT00510000048483 #30	ENSGT00940000159845 #31	ENSGT01000000214413.b.b #32	ENSGT00940000160860 #33	ENSGT01030000234598.a.a.b #34	ENSGT00940000162123 #35	ENSGT00940000159264 #36	ENSGT00390000017455 #37
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Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	15	Myl10 (ENSPEMG00000017542) #7	Col26a1 (ENSPEMG00000015760) #8	Ift22 (ENSPEMG00000013590) #9	Fis1 (ENSPEMG00000011161) #10	Cldn15 (ENSPEMG00000029730) #11	Znhit1 (ENSPEMG00000002806) #12	Plod3 (ENSPEMG00000000016) #13	ENSPEMG00000026689 #14	ENSPEMG00000024566 #15	Vgf (ENSPEMG00000017554) #16	Ap1s1 (ENSPEMG00000016550) #17	Serpine1 (ENSPEMG00000015527) #18	Trim56 (ENSPEMG00000027942) #19	ENSPEMG00000014470 #20	Muc3a (ENSPEMG00000012889) #21	Ache (ENSPEMG00000012349) #22	Ufsp1 (ENSPEMG00000014023) #23	Srrt (ENSPEMG00000010834) #24	Trip6 (ENSPEMG00000009489) #25	Slc12a9 (ENSPEMG00000008133) #26	Ephb4 (ENSPEMG00000003881) #27	Zan (ENSPEMG00000016734) #28	Epo (ENSPEMG00000011939) #29	Pop7 (ENSPEMG00000011583) #30	Gigyf1 (ENSPEMG00000008611) #31	Gnb2 (ENSPEMG00000007981) #32	Actl6b (ENSPEMG00000006769) #33	Tfr2 (ENSPEMG00000001392) #34	Mospd3 (ENSPEMG00000000348) #35	Pcolce (ENSPEMG00000000057) #36	Fbxo24 (ENSPEMG00000017456) #37