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Tree shrew	MODERN SPECIES	4885																ACHE (ENSTBEG00000006472) #22	UFSP1 (ENSTBEG00000006421) #23	SRRT (ENSTBEG00000005212) #24	TRIP6 (ENSTBEG00000004974) #25	ENSTBEG00000004329 #26
Glires	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000161811	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013187	ENSGT00390000000592	ENSGT00940000157650	ENSGT00390000018426	ENSGT01030000234558.A.a.a.a	ENSGT01030000234582.f.b.g	ENSGT00390000017745	ENSGT00970000193372.a.b	ENSGT00940000160621	ENSGT00940000162489	ENSGT00940000154419.a.a	ENSGT00940000154419.a.b	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400	ENSGT00940000160057 #26	ENSGT00940000156850.a.a	ENSGT00390000017226	ENSGT00510000048483	ENSGT00940000159845	ENSGT01000000214413.b.b	ENSGT00940000160860	ENSGT01030000234598.a.a.b	ENSGT00940000162123	ENSGT00940000159264	ENSGT00390000017455
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000161811	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013187	ENSGT00390000000592	ENSGT00940000157650	ENSGT00390000018426	ENSGT01030000234558.A.a.a.a	ENSGT01030000234582.f.b.g	ENSGT00390000017745	ENSGT00970000193372.a.b	ENSGT00940000160621	ENSGT00940000162489	ENSGT00940000154419.a.a	ENSGT00940000154419.a.b	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400	ENSGT00940000160057 #26	ENSGT00940000156850.a.a	ENSGT00390000017226	ENSGT00510000048483	ENSGT00940000159845	ENSGT01000000214413.b.b	ENSGT00940000160860	ENSGT01030000234598.a.a.b	ENSGT00940000162123	ENSGT00940000159264	ENSGT00390000017455
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000161811	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013187	ENSGT00390000000592	ENSGT00940000157650	ENSGT00390000018426	ENSGT01030000234558.A.a.a.a	ENSGT01030000234582.f.b.g	ENSGT00390000017745	ENSGT00970000193372.a.b	ENSGT00940000160621	ENSGT00940000162489	ENSGT00940000154419.a.a	ENSGT00940000154419.a.b	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400	ENSGT00940000160057 #26	ENSGT00940000156850.a.a	ENSGT00390000017226	ENSGT00510000048483	ENSGT00940000159845	ENSGT01000000214413.b.b	ENSGT00940000160860	ENSGT01030000234598.a.a.b	ENSGT00940000162123	ENSGT00940000159264	ENSGT00390000017455
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000163742	ENSGT00940000161811	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013187	ENSGT00390000000592.n	ENSGT00940000157650	ENSGT00390000018426	ENSGT01030000234558.A.a.a.a	ENSGT01030000234582.f.b.g	ENSGT00390000017745	ENSGT00970000193372.a.b	ENSGT00940000160621	ENSGT00940000162489	ENSGT00940000154419.a.a	ENSGT00940000154419.a.b	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400	ENSGT00940000160057 #26	ENSGT00940000156850.a.a	ENSGT00390000017226	ENSGT00510000048483	ENSGT00940000159845	ENSGT01000000214413.b.b	ENSGT00940000160860	ENSGT01030000234598.a.a.b	ENSGT00940000162123	ENSGT00940000159264	ENSGT00390000017455
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000161811	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013187	ENSGT00390000000592.n	ENSGT00940000157650	ENSGT00390000018426	ENSGT01030000234558.A.a.a.a	ENSGT01030000234582.f.b.g	ENSGT00390000017745	ENSGT00970000193372.a.b	ENSGT00940000160621	ENSGT00940000162489	ENSGT00940000154419.a.a	ENSGT00940000154419.a.b	ENSGT00940000168691	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400	ENSGT00940000160057 #26	ENSGT00940000156850.a.a	ENSGT00390000017226	ENSGT00510000048483	ENSGT00940000159845	ENSGT01000000214413.b.b	ENSGT00940000160860	ENSGT01030000234598.a.a.b	ENSGT00940000162123	ENSGT00940000159264	ENSGT00390000017455
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000161811	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013187	ENSGT00390000000592.n	ENSGT00940000157650	ENSGT00390000018426	ENSGT01030000234558.A.a.a.a	ENSGT01030000234582.f.b.g	ENSGT00390000017745	ENSGT00970000193372.a.b	ENSGT00940000160621	ENSGT00940000162489	ENSGT00940000154419.a.a	ENSGT00940000154419.a.b	ENSGT00940000168691	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400	ENSGT00940000160057 #26	ENSGT00940000156850.a.a	ENSGT00390000017226	ENSGT00510000048483	ENSGT00940000159845	ENSGT01000000214413.b.b	ENSGT00940000160860	ENSGT01030000234598.a.a.b	ENSGT00940000162123	ENSGT00940000159264	ENSGT00390000017455
Squirrel	MODERN SPECIES	143	MYL10 (ENSSTOG00000028388)	COL26A1 (ENSSTOG00000020628)	IFT22 (ENSSTOG00000012125)	FIS1 (ENSSTOG00000024383)	CLDN15 (ENSSTOG00000000766)	ZNHIT1 (ENSSTOG00000000762)	PLOD3 (ENSSTOG00000022109)	MOGAT3 (ENSSTOG00000026724)	VGF (ENSSTOG00000000747)	AP1S1 (ENSSTOG00000000744)	SERPINE1 (ENSSTOG00000000741)	TRIM56 (ENSSTOG00000019886)	ENSSTOG00000031943	ENSSTOG00000019617	ENSSTOG00000031100	ACHE (ENSSTOG00000026914) #22	UFSP1 (ENSSTOG00000028717) #23	SRRT (ENSSTOG00000013776) #24	TRIP6 (ENSSTOG00000028136) #25	SLC12A9 (ENSSTOG00000013755)	EPHB4 (ENSSTOG00000013737) #26	EPO (ENSSTOG00000013659)	POP7 (ENSSTOG00000030883)	GIGYF1 (ENSSTOG00000024993)	GNB2 (ENSSTOG00000019633)	ACTL6B (ENSSTOG00000013646)	TFR2 (ENSSTOG00000013621)	MOSPD3 (ENSSTOG00000013615)	PCOLCE (ENSSTOG00000019417)	FBXO24 (ENSSTOG00000007715)	LRCH4 (ENSSTOG00000007678)
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Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	9	ENSSVLG00005019119	MYL10 (ENSSVLG00005018944)	COL26A1 (ENSSVLG00005018701)	IFT22 (ENSSVLG00005018611)	FIS1 (ENSSVLG00005018476)	CLDN15 (ENSSVLG00005018381)	ZNHIT1 (ENSSVLG00005018341)	PLOD3 (ENSSVLG00005018296)	ENSSVLG00005018185	MOGAT3 (ENSSVLG00005017967)	VGF (ENSSVLG00005017867)	AP1S1 (ENSSVLG00005017778)	SERPINE1 (ENSSVLG00005017728)	TRIM56 (ENSSVLG00005017696)	ENSSVLG00005017593	ACHE (ENSSVLG00005017422) #22	UFSP1 (ENSSVLG00005017391) #23	SRRT (ENSSVLG00005017306) #24	TRIP6 (ENSSVLG00005017267) #25	SLC12A9 (ENSSVLG00005017109)	EPHB4 (ENSSVLG00005025419) #26	ZAN (ENSSVLG00005025350)	EPO (ENSSVLG00005025319)	POP7 (ENSSVLG00005025314)	GIGYF1 (ENSSVLG00005025302)	GNB2 (ENSSVLG00005025281)	ACTL6B (ENSSVLG00005025256)	TFR2 (ENSSVLG00005025213)	MOSPD3 (ENSSVLG00005025176)	PCOLCE (ENSSVLG00005025143)	FBXO24 (ENSSVLG00005025042)
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000163742	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000161811	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013187	ENSGT00390000000592	ENSGT00940000157650	ENSGT00390000018426	ENSGT01030000234558.A.a.a.a	ENSGT00390000017745	ENSGT00970000193372.a.b	ENSGT00940000160621	ENSGT00940000162489	ENSGT00940000154419.a.a	ENSGT00940000154419.a.b	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400	ENSGT00940000160057 #26	ENSGT00940000156850.a.a	ENSGT00390000017226	ENSGT00510000048483	ENSGT00940000159845	ENSGT01000000214413.b.b	ENSGT00940000160860	ENSGT01030000234598.a.a.b	ENSGT00940000162123	ENSGT00940000159264	ENSGT00390000017455
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000163742	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000161811	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013187	ENSGT00390000000592	ENSGT00940000157650	ENSGT00390000018426	ENSGT01030000234558.A.a.a.a	ENSGT00390000017745	ENSGT00970000193372.a.b	ENSGT00940000160621	ENSGT00940000162489	ENSGT00940000154419.a.a	ENSGT00940000154419.a.b	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400	ENSGT00940000160057 #26	ENSGT00940000156850.a.a	ENSGT00390000017226	ENSGT00510000048483	ENSGT00940000159845	ENSGT01000000214413.b.b	ENSGT00940000160860	ENSGT01030000234598.a.a.b	ENSGT00940000162123	ENSGT00940000159264	ENSGT00390000017455
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00940000163742	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000161811	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013187	ENSGT00390000000592	ENSGT00940000157650	ENSGT00390000018426	ENSGT01030000234558.A.a.a.a	ENSGT00390000017745	ENSGT00970000193372.a.b	ENSGT00940000160621	ENSGT00940000162489	ENSGT00940000154419.a.a	ENSGT00940000154419.a.b	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400	ENSGT00940000160057 #26	ENSGT00940000156850.a.a	ENSGT00390000017226	ENSGT00510000048483	ENSGT00940000159845	ENSGT01000000214413.b.b	ENSGT00940000160860	ENSGT01030000234598.a.a.b	ENSGT00940000162123	ENSGT00940000159264	ENSGT00390000017455	ENSGT00940000161668
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	280															ENSCLAG00000003043	ACHE (ENSCLAG00000003264) #22	SRRT (ENSCLAG00000007568) #24	TRIP6 (ENSCLAG00000001804) #25	SLC12A9 (ENSCLAG00000001948)	EPHB4 (ENSCLAG00000002064) #26	ZAN (ENSCLAG00000001299)	EPO (ENSCLAG00000001391)	POP7 (ENSCLAG00000001541)	GIGYF1 (ENSCLAG00000001568)	GNB2 (ENSCLAG00000001809)	ACTL6B (ENSCLAG00000001889)	TFR2 (ENSCLAG00000001976)	MOSPD3 (ENSCLAG00000001074)	PCOLCE (ENSCLAG00000001234)	FBXO24 (ENSCLAG00000001324)	LRCH4 (ENSCLAG00000001389)
Degu	MODERN SPECIES	76	ENSODEG00000020369	MYL10 (ENSODEG00000016366)	COL26A1 (ENSODEG00000016006)	IFT22 (ENSODEG00000016441)	ENSODEG00000016143	CLDN15 (ENSODEG00000016334)	ZNHIT1 (ENSODEG00000015978)	PLOD3 (ENSODEG00000016528)	VGF (ENSODEG00000016534)	AP1S1 (ENSODEG00000015737)	SERPINE1 (ENSODEG00000016414)	TRIM56 (ENSODEG00000016293)	ENSODEG00000015770	ENSODEG00000015878	ENSODEG00000020377	ACHE (ENSODEG00000016532) #22	SRRT (ENSODEG00000016856) #24	TRIP6 (ENSODEG00000016732) #25	SLC12A9 (ENSODEG00000016182)	EPHB4 (ENSODEG00000016238) #26	EPO (ENSODEG00000016349)	POP7 (ENSODEG00000020363)	GIGYF1 (ENSODEG00000016368)	GNB2 (ENSODEG00000016384)	ACTL6B (ENSODEG00000016158)	TFR2 (ENSODEG00000016854)	PCOLCE (ENSODEG00000016650)	FBXO24 (ENSODEG00000016232)	LRCH4 (ENSODEG00000017054)	AGFG2 (ENSODEG00000016582)	NYAP1 (ENSODEG00000016669)
Guinea pig	MODERN SPECIES	30	SH2B2 (ENSCPOG00000007558)	CUX1 (ENSCPOG00000008564)	MYL10 (ENSCPOG00000022246)	COL26A1 (ENSCPOG00000032713)	IFT22 (ENSCPOG00000035118)	FIS1 (ENSCPOG00000021728)	CLDN15 (ENSCPOG00000026288)	ZNHIT1 (ENSCPOG00000032415)	PLOD3 (ENSCPOG00000002777)	VGF (ENSCPOG00000013537)	AP1S1 (ENSCPOG00000013536)	SERPINE1 (ENSCPOG00000000174)	TRIM56 (ENSCPOG00000034485)	ENSCPOG00000030234	ENSCPOG00000038634	ACHE (ENSCPOG00000001746) #22	SRRT (ENSCPOG00000001739) #24	UFSP1 (ENSCPOG00000001745) #23	TRIP6 (ENSCPOG00000001737) #25	SLC12A9 (ENSCPOG00000001735)	EPHB4 (ENSCPOG00000014491) #26	EPO (ENSCPOG00000021586)	POP7 (ENSCPOG00000005767)	GIGYF1 (ENSCPOG00000013604)	GNB2 (ENSCPOG00000019845)	ACTL6B (ENSCPOG00000005145)	TFR2 (ENSCPOG00000011162)	MOSPD3 (ENSCPOG00000006113)	PCOLCE (ENSCPOG00000025385)	FBXO24 (ENSCPOG00000006109)	LRCH4 (ENSCPOG00000006102)
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000163742	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000161811	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013187	ENSGT00390000000592	ENSGT00940000157650	ENSGT00390000018426	ENSGT01030000234558.A.a.a.a	ENSGT00390000017745	ENSGT00970000193372.a.b	ENSGT00940000160621	ENSGT00940000162489	ENSGT00940000154419.a.a	ENSGT00940000154419.a.b	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400	ENSGT00940000160057 #26	ENSGT00940000156850.a.a	ENSGT00390000017226	ENSGT00510000048483	ENSGT00940000159845	ENSGT01000000214413.b.b	ENSGT00940000160860	ENSGT01030000234598.a.a.b	ENSGT00940000162123	ENSGT00940000159264	ENSGT00390000017455
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000163742	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000161811	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013187	ENSGT00390000000592	ENSGT00940000157650	ENSGT00390000018426	ENSGT01030000234558.A.a.a.a	ENSGT00390000017745	ENSGT00970000193372.a.b	ENSGT00940000160621	ENSGT00940000162489	ENSGT00940000154419.a.a	ENSGT00940000154419.a.b	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400	ENSGT00940000160057 #26	ENSGT00940000156850.a.a	ENSGT00390000017226	ENSGT00510000048483	ENSGT00940000159845	ENSGT01000000214413.b.b	ENSGT00940000160860	ENSGT01030000234598.a.a.b	ENSGT00940000162123	ENSGT00940000159264	ENSGT00390000017455
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00940000163742	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000161811	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013187	ENSGT00390000000592	ENSGT00940000157650	ENSGT00390000018426	ENSGT01030000234558.A.a.a.a	ENSGT00390000017745	ENSGT00970000193372.a.b	ENSGT00940000160621	ENSGT00940000162489	ENSGT00940000154419.a.a	ENSGT00940000154419.a.b	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400	ENSGT00940000160057 #26	ENSGT00940000156850.a.a	ENSGT00390000017226	ENSGT00510000048483	ENSGT00940000159845	ENSGT01000000214413.b.b	ENSGT00940000160860	ENSGT01030000234598.a.a.b	ENSGT00940000162123	ENSGT00940000159264	ENSGT00390000017455
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00950000183191.a.b	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000161811	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013187	ENSGT00390000000592	ENSGT00940000157650	ENSGT00390000018426	ENSGT01030000234558.A.a.a.a	ENSGT00390000017745	ENSGT00970000193372.a.b	ENSGT00940000160621	ENSGT00940000162489	ENSGT00940000154419.a.a	ENSGT00940000154419.a.b	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400	ENSGT00940000160057 #26	ENSGT00940000156850.a.a	ENSGT00390000017226	ENSGT00510000048483	ENSGT00940000159845	ENSGT01000000214413.b.b	ENSGT00940000160860	ENSGT01030000234598.a.a.b	ENSGT00940000162123	ENSGT00940000159264	ENSGT00390000017455
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00950000183191.a.b	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000161811	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013187	ENSGT00390000000592	ENSGT00940000157650	ENSGT00390000018426	ENSGT01030000234558.A.a.a.a	ENSGT00390000017745	ENSGT00970000193372.a.b	ENSGT00940000160621	ENSGT00940000162489	ENSGT00940000154419.a.a	ENSGT00940000154419.a.b	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400	ENSGT00940000160057 #26	ENSGT00940000156850.a.a	ENSGT00390000017226	ENSGT00510000048483	ENSGT00940000159845	ENSGT01000000214413.b.b	ENSGT00940000160860	ENSGT01030000234598.a.a.b	ENSGT00940000162123	ENSGT00940000159264	ENSGT00390000017455
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000161811	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013187	ENSGT00390000000592	ENSGT00940000157650	ENSGT00390000018426	ENSGT01030000234558.A.a.a.a	ENSGT01030000234582.f.b.g	ENSGT00390000017745	ENSGT00970000193372.a.b	ENSGT00940000160621	ENSGT00940000162489	ENSGT00940000154419.a.a	ENSGT00940000154419.a.b	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400	ENSGT00940000160057 #26	ENSGT00940000156850.a.a	ENSGT00390000017226	ENSGT00510000048483	ENSGT00940000159845	ENSGT01000000214413.b.b	ENSGT00940000160860	ENSGT01030000234598.a.a.b	ENSGT00940000162123	ENSGT00940000159264	ENSGT00390000017455
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	15	Myl10 (ENSPEMG00000017542)	Col26a1 (ENSPEMG00000015760)	Ift22 (ENSPEMG00000013590)	Fis1 (ENSPEMG00000011161)	Cldn15 (ENSPEMG00000029730)	Znhit1 (ENSPEMG00000002806)	Plod3 (ENSPEMG00000000016)	ENSPEMG00000026689	ENSPEMG00000024566	Vgf (ENSPEMG00000017554)	Ap1s1 (ENSPEMG00000016550)	Serpine1 (ENSPEMG00000015527)	Trim56 (ENSPEMG00000027942)	ENSPEMG00000014470	Muc3a (ENSPEMG00000012889)	Ache (ENSPEMG00000012349) #22	Ufsp1 (ENSPEMG00000014023) #23	Srrt (ENSPEMG00000010834) #24	Trip6 (ENSPEMG00000009489) #25	Slc12a9 (ENSPEMG00000008133)	Ephb4 (ENSPEMG00000003881) #26	Zan (ENSPEMG00000016734)	Epo (ENSPEMG00000011939)	Pop7 (ENSPEMG00000011583)	Gigyf1 (ENSPEMG00000008611)	Gnb2 (ENSPEMG00000007981)	Actl6b (ENSPEMG00000006769)	Tfr2 (ENSPEMG00000001392)	Mospd3 (ENSPEMG00000000348)	Pcolce (ENSPEMG00000000057)	Fbxo24 (ENSPEMG00000017456)
Prairie vole	MODERN SPECIES	192																Ache (ENSMOCG00000013374) #22	Ufsp1 (ENSMOCG00000019956) #23	Srrt (ENSMOCG00000001971) #24	Trip6 (ENSMOCG00000003473) #25	Slc12a9 (ENSMOCG00000014835)	Ephb4 (ENSMOCG00000009224) #26	Zan (ENSMOCG00000018444)	Epo (ENSMOCG00000011118)	Pop7 (ENSMOCG00000013694)	Gigyf1 (ENSMOCG00000002516)	Gnb2 (ENSMOCG00000018267)	Actl6b (ENSMOCG00000007386)	Tfr2 (ENSMOCG00000002423)	Mospd3 (ENSMOCG00000002893)	ENSMOCG00000017218	Fbxo24 (ENSMOCG00000015611)
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00390000005003	ENSGT00950000183191.a.b	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000161811	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013187	ENSGT00390000000592	ENSGT00940000157650	ENSGT00390000018426	ENSGT01030000234558.A.a.a.a	ENSGT00390000017745	ENSGT00970000193372.a.b	ENSGT00940000160621	ENSGT00940000162489	ENSGT00940000154419.a.a	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400	ENSGT00940000160057 #26	ENSGT00940000156850.a.a	ENSGT00390000017226	ENSGT00510000048483	ENSGT00940000159845	ENSGT01000000214413.b.b	ENSGT00940000160860	ENSGT01030000234598.a.a.b	ENSGT00940000162123	ENSGT00940000159264	ENSGT00390000017455
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	202	Orai2 (ENSCGRG00001016281)	Sh2b2 (ENSCGRG00001023493)	Cux1 (ENSCGRG00001022360)	Myl10 (ENSCGRG00001015932)	Col26a1 (ENSCGRG00001004901)	Ift22 (ENSCGRG00001021179)	Fis1 (ENSCGRG00001000122)	Cldn15 (ENSCGRG00001003882)	ENSCGRG00001018394	Plod3 (ENSCGRG00001017088)	ENSCGRG00001008089	Vgf (ENSCGRG00001004872)	Ap1s1 (ENSCGRG00001015982)	Serpine1 (ENSCGRG00001012996)	ENSCGRG00001023911	Ache (ENSCGRG00001000791) #22	Srrt (ENSCGRG00001001594) #24	Ufsp1 (ENSCGRG00001008098) #23	Trip6 (ENSCGRG00001019048) #25	Slc12a9 (ENSCGRG00001004531)	Ephb4 (ENSCGRG00001021237) #26	Zan (ENSCGRG00001000780)	Epo (ENSCGRG00001019638)	Pop7 (ENSCGRG00001010593)	Gigyf1 (ENSCGRG00001004356)	Gnb2 (ENSCGRG00001017627)	Actl6b (ENSCGRG00001023904)	Tfr2 (ENSCGRG00001018636)	Mospd3 (ENSCGRG00001015885)	Pcolce (ENSCGRG00001023242)	Fbxo24 (ENSCGRG00001013663)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	715	Lrwd1 (ENSMAUG00000009363)	Alkbh4 (ENSMAUG00000005177)	Orai2 (ENSMAUG00000008449)	Prkrip1 (ENSMAUG00000013686)	Sh2b2 (ENSMAUG00000014541)	Cux1 (ENSMAUG00000022066)	Col26a1 (ENSMAUG00000004879)	ENSMAUG00000009788	Cldn15 (ENSMAUG00000020094)	Znhit1 (ENSMAUG00000001325)	Plod3 (ENSMAUG00000014281)	Vgf (ENSMAUG00000016152)	Serpine1 (ENSMAUG00000002717)	Trim56 (ENSMAUG00000012814)	ENSMAUG00000018255	Ache (ENSMAUG00000021581) #22	Srrt (ENSMAUG00000011386) #24	Trip6 (ENSMAUG00000014707) #25	Slc12a9 (ENSMAUG00000021467)	Ephb4 (ENSMAUG00000001045) #26	Zan (ENSMAUG00000003221)	Epo (ENSMAUG00000021556)	Pop7 (ENSMAUG00000015820)	Gigyf1 (ENSMAUG00000017322)	Gnb2 (ENSMAUG00000010760)	Actl6b (ENSMAUG00000008451)	Tfr2 (ENSMAUG00000007323)	Mospd3 (ENSMAUG00000003865)	ENSMAUG00000013870	Fbxo24 (ENSMAUG00000013892)	Lrch4 (ENSMAUG00000011620)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00950000183191.a.b	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000161811	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013187	ENSGT00390000000592	ENSGT00940000157650	ENSGT00390000018426	ENSGT01030000234558.A.a.a.a	ENSGT00390000017745	ENSGT00970000193372.a.b	ENSGT00940000160621	ENSGT00940000162489	ENSGT00940000154419.a.a	ENSGT00940000154419.a.b	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400	ENSGT00940000160057 #26	ENSGT00940000156850.a.a	ENSGT00390000017226	ENSGT00510000048483	ENSGT00940000159845	ENSGT01000000214413.b.b	ENSGT00940000160860	ENSGT01030000234598.a.a.b	ENSGT00940000162123	ENSGT00940000159264	ENSGT00390000017455
Mus	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00950000183191.a.b	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000161811	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013187	ENSGT00390000000592	ENSGT00940000157650	ENSGT00390000018426	ENSGT01030000234558.A.a.a.a	ENSGT00390000017745	ENSGT00970000193372.a.b	ENSGT00940000160621	ENSGT00940000162489	ENSGT00940000154419.a.a	ENSGT00940000154419.a.b	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400	ENSGT00940000160057 #26	ENSGT00940000156850.a.a	ENSGT00390000017226	ENSGT00510000048483	ENSGT00940000159845	ENSGT01000000214413.b.b	ENSGT00940000160860	ENSGT01030000234598.a.a.b	ENSGT00940000162123	ENSGT00940000159264	ENSGT00390000017455
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00950000183191.a.b	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000161811	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013187	ENSGT00390000000592	ENSGT00940000157650	ENSGT00390000018426	ENSGT01030000234558.A.a.a.a	ENSGT00390000017745	ENSGT00970000193372.a.b	ENSGT00940000160621	ENSGT00940000162489	ENSGT00940000154419.a.a	ENSGT00940000154419.a.b	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400	ENSGT00940000160057 #26	ENSGT00940000156850.a.a	ENSGT00390000017226	ENSGT00510000048483	ENSGT00940000159845	ENSGT01000000214413.b.b	ENSGT00940000160860	ENSGT01030000234598.a.a.b	ENSGT00940000162123	ENSGT00940000159264	ENSGT00390000017455
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00950000183191.a.b	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000161811	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013187	ENSGT00390000000592	ENSGT00940000157650	ENSGT00390000018426	ENSGT01030000234558.A.a.a.a	ENSGT00390000017745	ENSGT00970000193372.a.b	ENSGT00940000160621	ENSGT00940000162489	ENSGT00940000154419.a.a	ENSGT00940000154419.a.b	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400	ENSGT00940000160057 #26	ENSGT00940000156850.a.a	ENSGT00390000017226	ENSGT00510000048483	ENSGT00940000159845	ENSGT01000000214413.b.b	ENSGT00940000160860	ENSGT01030000234598.a.a.b	ENSGT00940000162123	ENSGT00940000159264	ENSGT00390000017455
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00950000183191.a.b	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000161811	ENSGT00940000161716	ENSGT00390000013187	ENSGT00390000000592	ENSGT00940000157650	ENSGT00390000018426	ENSGT01030000234558.A.a.a.a	ENSGT00390000017745	ENSGT00970000193372.a.b	ENSGT00940000160621	ENSGT00940000162489	ENSGT00940000154419.a.a	ENSGT00940000154419.a.b	ENSGT00940000157637.b #22	ENSGT00940000162936 #23	ENSGT00390000005492 #24	ENSGT00940000154273.b #25	ENSGT00940000159400	ENSGT00940000160057 #26	ENSGT00940000156850.a.a	ENSGT00390000017226	ENSGT00510000048483	ENSGT00940000159845	ENSGT01000000214413.b.b	ENSGT00940000160860	ENSGT01030000234598.a.a.b	ENSGT00940000162123	ENSGT00940000159264	ENSGT00390000017455
Steppe mouse	MODERN SPECIES	149	ENSMSIG00000010739	ENSMSIG00000010699	Col26a1 (ENSMSIG00000010652)	Ift22 (ENSMSIG00000010604)	ENSMSIG00000010540	Cldn15 (ENSMSIG00000010515)	Znhit1 (ENSMSIG00000010378)	Plod3 (ENSMSIG00000010309)	Vgf (ENSMSIG00000010286)	ENSMSIG00000010253	Serpine1 (ENSMSIG00000010236)	Trim56 (ENSMSIG00000010233)	ENSMSIG00000010208	ENSMSIG00000010154	ENSMSIG00000010135	Ache (ENSMSIG00000010105) #22	Ufsp1 (ENSMSIG00000010096) #23	Srrt (ENSMSIG00000010003) #24	Trip6 (ENSMSIG00000009968) #25	Slc12a9 (ENSMSIG00000009900)	Ephb4 (ENSMSIG00000009713) #26	Zan (ENSMSIG00000008617)	Epo (ENSMSIG00000008562)	Pop7 (ENSMSIG00000008543)	Gigyf1 (ENSMSIG00000008422)	Gnb2 (ENSMSIG00000008390)	Actl6b (ENSMSIG00000008340)	Tfr2 (ENSMSIG00000008240)	ENSMSIG00000008208	ENSMSIG00000008182	Pcolce (ENSMSIG00000008123)
spretus	MODERN SPECIES	14	Sh2b2 (MGP_SPRETEiJ_G0028858)	Cux1 (MGP_SPRETEiJ_G0028859)	Myl10 (MGP_SPRETEiJ_G0028860)	Col26a1 (MGP_SPRETEiJ_G0028861)	Ift22 (MGP_SPRETEiJ_G0028862)	Fis1 (MGP_SPRETEiJ_G0028863)	Cldn15 (MGP_SPRETEiJ_G0028864)	Znhit1 (MGP_SPRETEiJ_G0028865)	Plod3 (MGP_SPRETEiJ_G0028866)	Vgf (MGP_SPRETEiJ_G0028867)	Ap1s1 (MGP_SPRETEiJ_G0028868)	Serpine1 (MGP_SPRETEiJ_G0028869)	Trim56 (MGP_SPRETEiJ_G0028870)	MGP_SPRETEiJ_G0028871	Muc3a (MGP_SPRETEiJ_G0028872)	Ache (MGP_SPRETEiJ_G0028873) #22	Ufsp1 (MGP_SPRETEiJ_G0028874) #23	Srrt (MGP_SPRETEiJ_G0028875) #24	Trip6 (MGP_SPRETEiJ_G0028876) #25	Slc12a9 (MGP_SPRETEiJ_G0028877)	Ephb4 (MGP_SPRETEiJ_G0028878) #26	Zan (MGP_SPRETEiJ_G0028879)	Epo (MGP_SPRETEiJ_G0028880)	Pop7 (MGP_SPRETEiJ_G0028881)	MGP_SPRETEiJ_G0028882	Gnb2 (MGP_SPRETEiJ_G0028883)	Actl6b (MGP_SPRETEiJ_G0028884)	Tfr2 (MGP_SPRETEiJ_G0028885)	Mospd3 (MGP_SPRETEiJ_G0028886)	Pcolce (MGP_SPRETEiJ_G0028887)	Fbxo24 (MGP_SPRETEiJ_G0028888)
Mouse	MODERN SPECIES	14	Cux1 (ENSMUSG00000029705)	Myl10 (ENSMUSG00000005474)	Col26a1 (ENSMUSG00000004415)	Ift22 (ENSMUSG00000007987)	Fis1 (ENSMUSG00000019054)	Cldn15 (ENSMUSG00000001739)	Znhit1 (ENSMUSG00000059518)	Plod3 (ENSMUSG00000004846)	Vgf (ENSMUSG00000037428)	Ap1s1 (ENSMUSG00000004849)	Serpine1 (ENSMUSG00000037411)	Trim56 (ENSMUSG00000043279)	Muc3 (ENSMUSG00000037390)	Gm31160 (ENSMUSG00000118522)	Muc3a (ENSMUSG00000094840)	Ache (ENSMUSG00000023328) #22	Ufsp1 (ENSMUSG00000051502) #23	Srrt (ENSMUSG00000037364) #24	Trip6 (ENSMUSG00000023348) #25	Slc12a9 (ENSMUSG00000037344)	Ephb4 (ENSMUSG00000029710) #26	Zan (ENSMUSG00000079173)	Epo (ENSMUSG00000029711)	Pop7 (ENSMUSG00000029715)	Gigyf1 (ENSMUSG00000029714)	Gnb2 (ENSMUSG00000029713)	Actl6b (ENSMUSG00000029712)	Tfr2 (ENSMUSG00000029716)	Mospd3 (ENSMUSG00000037221)	Pcolce (ENSMUSG00000029718)	Fbxo24 (ENSMUSG00000089984)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	14	Alkbh4 (MGP_CAROLIEiJ_G0027853)	MGP_CAROLIEiJ_G0027854	MGP_CAROLIEiJ_G0027855	Sh2b2 (MGP_CAROLIEiJ_G0027856)	MGP_CAROLIEiJ_G0027857	MGP_CAROLIEiJ_G0027858	MGP_CAROLIEiJ_G0027859	MGP_CAROLIEiJ_G0027860	Fis1 (MGP_CAROLIEiJ_G0027861)	MGP_CAROLIEiJ_G0027862	Plod3 (MGP_CAROLIEiJ_G0027863)	Vgf (MGP_CAROLIEiJ_G0027864)	MGP_CAROLIEiJ_G0027865	Trim56 (MGP_CAROLIEiJ_G0027866)	MGP_CAROLIEiJ_G0027867	Ache (MGP_CAROLIEiJ_G0027868) #22	Ufsp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0027869) #23	Srrt (MGP_CAROLIEiJ_G0027870) #24	Trip6 (MGP_CAROLIEiJ_G0027871) #25	Slc12a9 (MGP_CAROLIEiJ_G0027872)	Ephb4 (MGP_CAROLIEiJ_G0027873) #26	Zan (MGP_CAROLIEiJ_G0027874)	Epo (MGP_CAROLIEiJ_G0027875)	Pop7 (MGP_CAROLIEiJ_G0027876)	MGP_CAROLIEiJ_G0027877	Gnb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0027878)	Actl6b (MGP_CAROLIEiJ_G0027879)	Tfr2 (MGP_CAROLIEiJ_G0027880)	Mospd3 (MGP_CAROLIEiJ_G0027881)	Pcolce (MGP_CAROLIEiJ_G0027882)	Fbxo24 (MGP_CAROLIEiJ_G0027883)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	15	MGP_PahariEiJ_G0024439	Cux1 (MGP_PahariEiJ_G0024440)	Myl10 (MGP_PahariEiJ_G0024441)	Col26a1 (MGP_PahariEiJ_G0024442)	Ift22 (MGP_PahariEiJ_G0024443)	Fis1 (MGP_PahariEiJ_G0024444)	Cldn15 (MGP_PahariEiJ_G0024445)	Znhit1 (MGP_PahariEiJ_G0024446)	Plod3 (MGP_PahariEiJ_G0024447)	Vgf (MGP_PahariEiJ_G0024448)	MGP_PahariEiJ_G0024449	Serpine1 (MGP_PahariEiJ_G0024450)	Trim56 (MGP_PahariEiJ_G0024451)	MGP_PahariEiJ_G0024452	Muc3a (MGP_PahariEiJ_G0024453)	Ache (MGP_PahariEiJ_G0024454) #22	Ufsp1 (MGP_PahariEiJ_G0024455) #23	Srrt (MGP_PahariEiJ_G0024456) #24	Trip6 (MGP_PahariEiJ_G0024457) #25	Slc12a9 (MGP_PahariEiJ_G0024458)	Ephb4 (MGP_PahariEiJ_G0024459) #26	Epo (MGP_PahariEiJ_G0024461)	Pop7 (MGP_PahariEiJ_G0024462)	MGP_PahariEiJ_G0024463	Gnb2 (MGP_PahariEiJ_G0024464)	MGP_PahariEiJ_G0024465	MGP_PahariEiJ_G0024467	MGP_PahariEiJ_G0024468	Nyap1 (MGP_PahariEiJ_G0024469)	MGP_PahariEiJ_G0024470	MGP_PahariEiJ_G0024471
Rat	MODERN SPECIES	3	Cux1 (ENSRNOG00000001424)	Myl10 (ENSRNOG00000028981)	Col26a1 (ENSRNOG00000001422)	Ift22 (ENSRNOG00000031346)	Fis1 (ENSRNOG00000001420)	Cldn15 (ENSRNOG00000001419)	Znhit1 (ENSRNOG00000001418)	Plod3 (ENSRNOG00000001417)	Mogat3 (ENSRNOG00000029211)	Vgf (ENSRNOG00000001416)	Ap1s1 (ENSRNOG00000001415)	Serpine1 (ENSRNOG00000001414)	Trim56 (ENSRNOG00000071001)	ENSRNOG00000070500	Muc3a (ENSRNOG00000068186)	Ache (ENSRNOG00000050841) #22	Srrt (ENSRNOG00000048277) #24	Trip6 (ENSRNOG00000048580) #25	Slc12a9 (ENSRNOG00000048487)	Ephb4 (ENSRNOG00000045952) #26	Zan (ENSRNOG00000067638)	Epo (ENSRNOG00000001412)	Pop7 (ENSRNOG00000025310)	Gigyf1 (ENSRNOG00000001410)	Gnb2 (ENSRNOG00000001409)	Actl6b (ENSRNOG00000001408)	Tfr2 (ENSRNOG00000001407)	Mospd3 (ENSRNOG00000001396)	Pcolce (ENSRNOG00000025001)	Fbxo24 (ENSRNOG00000024922)	Lrch4 (ENSRNOG00000001402)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	779	ENSNGAG00000018777	ENSNGAG00000021445	ENSNGAG00000023111	Myl10 (ENSNGAG00000023559)	Col26a1 (ENSNGAG00000006906)	Ift22 (ENSNGAG00000023459)	Cldn15 (ENSNGAG00000003494)	Znhit1 (ENSNGAG00000023520)	Plod3 (ENSNGAG00000018568)	Vgf (ENSNGAG00000013648)	ENSNGAG00000004650	Serpine1 (ENSNGAG00000013020)	Trim56 (ENSNGAG00000013564)	ENSNGAG00000003056	ENSNGAG00000011323	Ache (ENSNGAG00000007886) #22	Srrt (ENSNGAG00000023715) #24	Trip6 (ENSNGAG00000021180) #25	Slc12a9 (ENSNGAG00000010253)	Ephb4 (ENSNGAG00000018259) #26	ENSNGAG00000010261	Epo (ENSNGAG00000019436)	Pop7 (ENSNGAG00000021630)	Gigyf1 (ENSNGAG00000015108)	Gnb2 (ENSNGAG00000021433)	Actl6b (ENSNGAG00000022489)	Tfr2 (ENSNGAG00000011356)	ENSNGAG00000014033	ENSNGAG00000015360	Fbxo24 (ENSNGAG00000023515)	Lrch4 (ENSNGAG00000002133)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	462	Prkrip1 (ENSDORG00000005929)	Sh2b2 (ENSDORG00000005927)	Cux1 (ENSDORG00000005924)	Myl10 (ENSDORG00000008118)	Col26a1 (ENSDORG00000004325)	Ift22 (ENSDORG00000008294)	Fis1 (ENSDORG00000001827)	Cldn15 (ENSDORG00000001824)	Znhit1 (ENSDORG00000001823)	Plod3 (ENSDORG00000001814)	Vgf (ENSDORG00000011809)	Ap1s1 (ENSDORG00000011811)	Serpine1 (ENSDORG00000010755)	Trim56 (ENSDORG00000016641)	ENSDORG00000024204	Ache (ENSDORG00000005591) #22	Srrt (ENSDORG00000005584) #24	Trip6 (ENSDORG00000005582) #25	Slc12a9 (ENSDORG00000005580)	Ephb4 (ENSDORG00000007887) #26	Epo (ENSDORG00000014792)	Pop7 (ENSDORG00000012512)	Gigyf1 (ENSDORG00000016513)	Gnb2 (ENSDORG00000028163)	Actl6b (ENSDORG00000002281)	Tfr2 (ENSDORG00000002261)	ENSDORG00000029885	Pcolce (ENSDORG00000000850)	Fbxo24 (ENSDORG00000000848)	Lrch4 (ENSDORG00000000846)	Agfg2 (ENSDORG00000000836)