Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Muroidea DUPLICATION Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22 Mouse MODERN SPECIES 17 Hmgxb4 (ENSMUSG00000034518) #7 Isx (ENSMUSG00000031621) #8 Large1 (ENSMUSG00000004383) #9 F2rl3 (ENSMUSG00000050147) #10 Sin3b (ENSMUSG00000031622) #11 Nwd1 (ENSMUSG00000048148) #12 Tmem38a (ENSMUSG00000031791) #13 Smim7 (ENSMUSG00000044600) #14 Med26 (ENSMUSG00000045248) #15 Slc35e1 (ENSMUSG00000019731) #16 Cherp (ENSMUSG00000052488) #17 1700030K09Rik (ENSMUSG00000052794) #18 Calr3 (ENSMUSG00000019732) #19 Eps15l1 (ENSMUSG00000006276) #20 Klf2 (ENSMUSG00000055148) #21 Hmgn2-ps (ENSMUSG00000070713) #22 Ap1m1 (ENSMUSG00000003033) #23 Fam32a (ENSMUSG00000003039) #24 Cib3 (ENSMUSG00000074240) #25 Hsh2d (ENSMUSG00000062007) #26 Rab8a (ENSMUSG00000003037) #27 Tpm4 (ENSMUSG00000031799) #28 Or1ab2 (ENSMUSG00000046881) #29 Or2z9 (ENSMUSG00000061561) #30 Or2z8 (ENSMUSG00000069998) #31 Cyp4f18 (ENSMUSG00000003484) #32 Zfp961 (ENSMUSG00000052446) #33 Zfp617 (ENSMUSG00000066880) #34 Zfp882 (ENSMUSG00000089857) #35 Zfp709 (ENSMUSG00000056019) #36 Fcho1 (ENSMUSG00000070000) #37 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3218 ENSMSIG00000027765 #22 ENSMSIG00000027776 ENSMSIG00000027793 Tenm4 (ENSMSIG00000027807) Nars2 (ENSMSIG00000027934) spretus MODERN SPECIES 8 Frs3 (MGP_SPRETEiJ_G0022622) MGP_SPRETEiJ_G0022621 MGP_SPRETEiJ_G0022620 Tomm6 (MGP_SPRETEiJ_G0022619) Usp49 (MGP_SPRETEiJ_G0022618) MGP_SPRETEiJ_G0022617 Med20 (MGP_SPRETEiJ_G0022616) Bysl (MGP_SPRETEiJ_G0022615) Ccnd3 (MGP_SPRETEiJ_G0022614) Taf8 (MGP_SPRETEiJ_G0022613) MGP_SPRETEiJ_G0022612 1700001C19Rik (MGP_SPRETEiJ_G0022611) Guca1a (MGP_SPRETEiJ_G0022610) Guca1b (MGP_SPRETEiJ_G0022609) Mrps10 (MGP_SPRETEiJ_G0022608) MGP_SPRETEiJ_G0022607 #22 Ubr2 (MGP_SPRETEiJ_G0022606) Prph2 (MGP_SPRETEiJ_G0022605) Tbcc (MGP_SPRETEiJ_G0022604) MGP_SPRETEiJ_G0022603 Bicral (MGP_SPRETEiJ_G0022602) Rpl7l1 (MGP_SPRETEiJ_G0022601) 2310039H08Rik (MGP_SPRETEiJ_G0022600) Ptcra (MGP_SPRETEiJ_G0022599) Cnpy3 (MGP_SPRETEiJ_G0022598) Gnmt (MGP_SPRETEiJ_G0022597) Pex6 (MGP_SPRETEiJ_G0022596) Ppp2r5d (MGP_SPRETEiJ_G0022595) Mea1 (MGP_SPRETEiJ_G0022594) Klhdc3 (MGP_SPRETEiJ_G0022593) Rrp36 (MGP_SPRETEiJ_G0022592) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 2 MGP_CAROLIEiJ_G0016274 Flt4 (MGP_CAROLIEiJ_G0016275) Scgb3a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016276) Cnot6 (MGP_CAROLIEiJ_G0016277) Gfpt2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016278) Mapk9 (MGP_CAROLIEiJ_G0016279) Rasgef1c (MGP_CAROLIEiJ_G0016280) Rnf130 (MGP_CAROLIEiJ_G0016281) Tbc1d9b (MGP_CAROLIEiJ_G0016282) Mrnip (MGP_CAROLIEiJ_G0016283) Sqstm1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016284) Mgat4b (MGP_CAROLIEiJ_G0016285) Ltc4s (MGP_CAROLIEiJ_G0016286) Maml1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016287) Canx (MGP_CAROLIEiJ_G0016288) ##19 MGP_CAROLIEiJ_G0016289 #22 MGP_CAROLIEiJ_G0016290 MGP_CAROLIEiJ_G0016291 Rufy1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016292) Adamts2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016293) Zfp354c (MGP_CAROLIEiJ_G0016294) Zfp879 (MGP_CAROLIEiJ_G0016295) Grm6 (MGP_CAROLIEiJ_G0016296) Zfp454 (MGP_CAROLIEiJ_G0016297) Zfp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016298) Zfp354b (MGP_CAROLIEiJ_G0016299) 4933414I15Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0016300) Prop1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016301) Or1ad6 (MGP_CAROLIEiJ_G0016302) MGP_CAROLIEiJ_G0016303 Or1ad8 (MGP_CAROLIEiJ_G0016304) Rat DUPLICATION Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 15 LOC108351043 (ENSRNOG00000054734) E130218I03Rik (ENSRNOG00000065422) Zfp593 (ENSRNOG00000016392) Cnksr1 (ENSRNOG00000022838) Catsper4 (ENSRNOG00000016312) Umodl (ENSRNOG00000037191) Cep85 (ENSRNOG00000016249) Sh3bgrl3 (ENSRNOG00000015967) Ubxn11 (ENSRNOG00000015476) LOC100360087 (ENSRNOG00000064482) Cd52 (ENSRNOG00000015403) Crybg2 (ENSRNOG00000057957) Zfp683 (ENSRNOG00000065788) Lin28a (ENSRNOG00000069459) Dhdds (ENSRNOG00000014665) Hmgn2 (ENSRNOG00000051615) #22 LOC683456 (ENSRNOG00000070457) Rps6ka1 (ENSRNOG00000042411) LOC120103001 (ENSRNOG00000068341) Arid1a (ENSRNOG00000006137) Pigv (ENSRNOG00000000121) Zdhhc18 (ENSRNOG00000058156) Sfn (ENSRNOG00000033153) Gpn2 (ENSRNOG00000007083) Gpatch3 (ENSRNOG00000007097) ENSRNOG00000066253 Nr0b2 (ENSRNOG00000007229) Nudc (ENSRNOG00000051720) AC118963.1 (ENSRNOG00000049922) Kdf1 (ENSRNOG00000055933) ENSRNOG00000068236 Rat MODERN SPECIES 7 Spock3 (ENSRNOG00000029903) Anxa10 (ENSRNOG00000014339) LOC120097562 (ENSRNOG00000056947) Palldl1 (ENSRNOG00000010107) Ddx60 (ENSRNOG00000059097) Cbr4 (ENSRNOG00000024411) Sh3rf1 (ENSRNOG00000010358) Nek1 (ENSRNOG00000010418) Clcn3 (ENSRNOG00000010682) Hpf1 (ENSRNOG00000011293) LOC100360260 (ENSRNOG00000060395) Ppia-ps13 (ENSRNOG00000062799) Mfap3l (ENSRNOG00000011775) Aadat (ENSRNOG00000011861) ENSRNOG00000063109 Hmgn2-ps4 (ENSRNOG00000066721) #22 Galntl6 (ENSRNOG00000067282) Galnt7 (ENSRNOG00000012037) Hmgb2 (ENSRNOG00000013167) Sap30 (ENSRNOG00000013218) Scrg1 (ENSRNOG00000069516) ENSRNOG00000069425 Hand2 (ENSRNOG00000060448) LOC103694242 (ENSRNOG00000007402) Fbxo8 (ENSRNOG00000010502) ENSRNOG00000062690 Cep44 (ENSRNOG00000010566) Hpgd (ENSRNOG00000010610) Hmgb1 (ENSRNOG00000058908) Glra3 (ENSRNOG00000049792) ENSRNOG00000063491 Rat MODERN SPECIES 13 Bfsp1 (ENSRNOG00000005707) Pcsk2 (ENSRNOG00000005438) Otor (ENSRNOG00000028721) Snrpb2 (ENSRNOG00000004967) Kif16b (ENSRNOG00000004951) ENSRNOG00000062960 Flrt3 (ENSRNOG00000004874) Macrod2 (ENSRNOG00000050784) Sel1l2 (ENSRNOG00000004852) Ndufaf5 (ENSRNOG00000004784) Esf1 (ENSRNOG00000004777) Tasp1 (ENSRNOG00000004493) ENSRNOG00000068011 Ism1 (ENSRNOG00000063262) Sptlc3 (ENSRNOG00000004443) AABR07053884.1 (ENSRNOG00000030601) #22 ENSRNOG00000066288 ENSRNOG00000067830 Btbd3 (ENSRNOG00000008088) Jag1 (ENSRNOG00000007443) Slx4ip (ENSRNOG00000007430) Gm56451 (ENSRNOG00000067094) Mkks (ENSRNOG00000006705) Snap25 (ENSRNOG00000006037) Ankef1 (ENSRNOG00000005792) AABR07053830.1 (ENSRNOG00000055829) Pak5 (ENSRNOG00000005509) Lamp5 (ENSRNOG00000005457) Plcb4 (ENSRNOG00000033119) Plcb1 (ENSRNOG00000004810) Tmx4 (ENSRNOG00000024852) Cricetidae DUPLICATION Cricetidae DUPLICATION Cricetidae DUPLICATION Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.a.a #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.a.a #22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Hoxc4 (ENSCGRG00001013095) Smug1 (ENSCGRG00001016146) Cbx5 (ENSCGRG00001019018) Hnrnpa1 (ENSCGRG00001013129) Nfe2 (ENSCGRG00001022465) Copz1 (ENSCGRG00001013501) ENSCGRG00001009425 Zfp385a (ENSCGRG00001015539) Itga5 (ENSCGRG00001017691) Gtsf1 (ENSCGRG00001013814) Gtsf2 (ENSCGRG00001016136) Nckap1l (ENSCGRG00001014386) Pde1b (ENSCGRG00001017137) Ppp1r1a (ENSCGRG00001013456) Glycam1 (ENSCGRG00001016454) ENSCGRG00001009407 #22 Tpp2 (ENSCGRG00001014893) Mettl21c (ENSCGRG00001014510) Tex30 (ENSCGRG00001013834) Poglut2 (ENSCGRG00001016741) Bivm (ENSCGRG00001013666) Ercc5 (ENSCGRG00001015414) Mettl21e (ENSCGRG00001014330) ENSCGRG00001010198 ENSCGRG00001019242 Gulp1 (ENSCGRG00001015646) Col3a1 (ENSCGRG00001015480) Col5a2 (ENSCGRG00001013733) Wdr75 (ENSCGRG00001013929) ENSCGRG00001016157 Slc40a1 (ENSCGRG00001014664) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.a.a #22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 17 ENSPEMG00000027805 ENSPEMG00000029460 ENSPEMG00000024866 ENSPEMG00000029053 ENSPEMG00000028491 ENSPEMG00000029100 ENSPEMG00000025935 Zc3h15 (ENSPEMG00000013093) Itgav (ENSPEMG00000015518) Fam171b (ENSPEMG00000026590) Zswim2 (ENSPEMG00000014220) ENSPEMG00000027679 Or5t5 (ENSPEMG00000025077) Or8k3b (ENSPEMG00000024781) Or8k40 (ENSPEMG00000025465) ENSPEMG00000024333 #22 Or5t7 (ENSPEMG00000029283) Or8k39 (ENSPEMG00000025808) Or8k38 (ENSPEMG00000031089) ENSPEMG00000026528 Or8k32 (ENSPEMG00000027876) ENSPEMG00000024690 ENSPEMG00000026822 ENSPEMG00000025620 ENSPEMG00000030206 ENSPEMG00000027513 ENSPEMG00000026543 Or8k23 (ENSPEMG00000028666) Or8k53 (ENSPEMG00000028082) Or8k22 (ENSPEMG00000028101) ENSPEMG00000027677 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.a.b #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.a.b #22 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 175 Klf8 (ENSCGRG00001019035) Ubqln2 (ENSCGRG00001016085) Kctd12b (ENSCGRG00001004538) Nbdy (ENSCGRG00001003251) ENSCGRG00001005909 Spin2c (ENSCGRG00001004592) ENSCGRG00001018471 ENSCGRG00001000978 ENSCGRG00001023144 Mycs (ENSCGRG00001000792) ENSCGRG00001003982 ENSCGRG00001000208 ENSCGRG00001010729 ENSCGRG00001007007 ENSCGRG00001022547 ENSCGRG00001007687 #22 ENSCGRG00001008851 ENSCGRG00001009060 ENSCGRG00001001286 Bmp15 (ENSCGRG00001012329) Shroom4 (ENSCGRG00001016683) Dgkk (ENSCGRG00001005491) Ccnb3 (ENSCGRG00001016975) Akap4 (ENSCGRG00001022827) ENSCGRG00001000058 Clcn5 (ENSCGRG00001017810) ENSCGRG00001006356 Ppp1r3f (ENSCGRG00001022530) Foxp3 (ENSCGRG00001021426) Ccdc22 (ENSCGRG00001023162) Cacna1f (ENSCGRG00001013804) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 188 Ehmt1 (ENSCGRG00001002035) Cacna1b (ENSCGRG00001018788) Pax8 (ENSCGRG00001017508) Psd4 (ENSCGRG00001010714) Il1rn (ENSCGRG00001005108) Il1f10 (ENSCGRG00001003880) Il36rn (ENSCGRG00001010036) Il36b (ENSCGRG00001008679) ENSCGRG00001008839 Il36a (ENSCGRG00001005772) ENSCGRG00001015320 Tbpl2 (ENSCGRG00001015310) ENSCGRG00001009248 ENSCGRG00001001542 ENSCGRG00001024843 ENSCGRG00001008614 #22 Spopl (ENSCGRG00001010346) Nxph2 (ENSCGRG00001024840) ENSCGRG00001024491 ENSCGRG00001009004 ENSCGRG00001012428 Kynu (ENSCGRG00001005556) Arhgap15 (ENSCGRG00001011371) ENSCGRG00001008381 Gtdc1 (ENSCGRG00001014426) ENSCGRG00001006690 Zeb2 (ENSCGRG00001003812) ENSCGRG00001000890 Acvr2a (ENSCGRG00001024754) Orc4 (ENSCGRG00001001352) Mbd5 (ENSCGRG00001001266) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.a.b #22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 2 Nenf (ENSPEMG00000004190) Ppp2r5a (ENSPEMG00000007353) Dtl (ENSPEMG00000009566) Ints7 (ENSPEMG00000014500) Lpgat1 (ENSPEMG00000016230) Nek2 (ENSPEMG00000011480) ENSPEMG00000031137 Slc30a1 (ENSPEMG00000002874) Rd3 (ENSPEMG00000020626) Traf5 (ENSPEMG00000022373) Rcor3 (ENSPEMG00000007457) Kcnh1 (ENSPEMG00000010427) Hhat (ENSPEMG00000001916) Sertad4 (ENSPEMG00000010470) Syt14 (ENSPEMG00000000255) ENSPEMG00000029864 #22 Utp25 (ENSPEMG00000000712) Irf6 (ENSPEMG00000020332) A130010J15Rik (ENSPEMG00000022277) Traf3ip3 (ENSPEMG00000021211) Hsd11b1 (ENSPEMG00000009872) G0s2 (ENSPEMG00000029839) Lamb3 (ENSPEMG00000017689) Camk1g (ENSPEMG00000010373) Plxna2 (ENSPEMG00000019686) Cd34 (ENSPEMG00000020063) Cd46 (ENSPEMG00000013673) Cr1l (ENSPEMG00000019441) Cr2 (ENSPEMG00000007875) Cricetidae DUPLICATION Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.b.a #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.b.a #22 Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 475 Rps6ka6 (ENSPEMG00000015736) Cylc1 (ENSPEMG00000017301) Pou3f4 (ENSPEMG00000003663) ENSPEMG00000025843 Gm6377 (ENSPEMG00000023246) ENSPEMG00000024318 Sh3bgrl (ENSPEMG00000027781) Brwd3 (ENSPEMG00000022305) ENSPEMG00000031328 Wmp (ENSPEMG00000027638) Tent5d (ENSPEMG00000031184) Chmp1b2 (ENSPEMG00000022335) Tbx22 (ENSPEMG00000023383) Itm2a (ENSPEMG00000023946) Gpr174 (ENSPEMG00000005742) ENSPEMG00000004229 #22 P2ry10b (ENSPEMG00000024642) P2ry10 (ENSPEMG00000023462) Lpar4 (ENSPEMG00000030102) Cysltr1 (ENSPEMG00000023120) ENSPEMG00000026887 ENSPEMG00000021468 Taf9b (ENSPEMG00000022582) ENSPEMG00000012872 Atp7a (ENSPEMG00000006787) ENSPEMG00000012083 Magt1 (ENSPEMG00000021915) ENSPEMG00000016457 Atrx (ENSPEMG00000022358) Fgf16 (ENSPEMG00000021916) ENSPEMG00000030780 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 475 Fthl17a (ENSPEMG00000019530) Tab3 (ENSPEMG00000019664) Gk (ENSPEMG00000019899) Tasl (ENSPEMG00000020160) Nr0b1 (ENSPEMG00000020271) ENSPEMG00000028874 ENSPEMG00000025328 ENSPEMG00000028142 ENSPEMG00000031097 ENSPEMG00000028040 Il1rapl1 (ENSPEMG00000029607) ENSPEMG00000019379 Tmem47 (ENSPEMG00000029078) ENSPEMG00000026179 Mageb16 (ENSPEMG00000023768) ENSPEMG00000028268 #22 Cfap47 (ENSPEMG00000022325) Fam47c (ENSPEMG00000030109) Prrg1 (ENSPEMG00000030282) 4930480E11Rik (ENSPEMG00000028721) ENSPEMG00000030251 ENSPEMG00000023943 ENSPEMG00000024840 ENSPEMG00000015794 ENSPEMG00000027218 ENSPEMG00000023281 #15 Pbsn (ENSPEMG00000012253) Prkx (ENSPEMG00000030408) ENSPEMG00000030079 Tbl1x (ENSPEMG00000017480) ENSPEMG00000029386 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 475 ENSPEMG00000027777 Usp11 (ENSPEMG00000023892) Cdk16 (ENSPEMG00000021751) Uba1 (ENSPEMG00000007224) Rbm10 (ENSPEMG00000012165) ENSPEMG00000023255 ENSPEMG00000029454 Rgn (ENSPEMG00000022597) Jade3 (ENSPEMG00000009000) Rp2 (ENSPEMG00000012699) Slc9a7 (ENSPEMG00000022733) Chst7 (ENSPEMG00000022504) ENSPEMG00000001616 ENSPEMG00000001590 ENSPEMG00000025989 ENSPEMG00000026731 #22 Dipk2b (ENSPEMG00000026275) Kdm6a (ENSPEMG00000011007) ENSPEMG00000028355 Slc38a5 (ENSPEMG00000012763) ENSPEMG00000015698 Porcn (ENSPEMG00000018381) Ebp (ENSPEMG00000019215) Tbc1d25 (ENSPEMG00000000481) Rbm3 (ENSPEMG00000012411) Wdr13 (ENSPEMG00000030841) Was (ENSPEMG00000017673) Suv39h1 (ENSPEMG00000012820) Glod5 (ENSPEMG00000014471) Gata1 (ENSPEMG00000010138) Hdac6 (ENSPEMG00000002814) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.b.a #22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 352 ENSCGRG00001018287 Tiparp (ENSCGRG00001011123) Ssr3 (ENSCGRG00001019723) Kcnab1 (ENSCGRG00001005457) ENSCGRG00001005615 ENSCGRG00001017013 Vmn2r1 (ENSCGRG00001023200) Gmps (ENSCGRG00001018772) Slc33a1 (ENSCGRG00001018761) E130311K13Rik (ENSCGRG00001024290) Plch1 (ENSCGRG00001000217) ENSCGRG00001021700 ENSCGRG00001022762 Mme (ENSCGRG00001000828) ENSCGRG00001008438 ENSCGRG00001007190 #22 Gpr149 (ENSCGRG00001013143) Dhx36 (ENSCGRG00001013722) Arhgef26 (ENSCGRG00001017827) Rap2b (ENSCGRG00001008789) P2ry1 (ENSCGRG00001004469) Mbnl1 (ENSCGRG00001007139) Sucnr1 (ENSCGRG00001017063) Aadac (ENSCGRG00001018575) Aadacl2 (ENSCGRG00001019320) Aadacl2fm1 (ENSCGRG00001013390) Aadacl2fm3 (ENSCGRG00001016631) Igsf10 (ENSCGRG00001011835) Med12l (ENSCGRG00001002841) P2ry12 (ENSCGRG00001004633) P2ry13 (ENSCGRG00001004523) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.b.b #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.b.b #22 Golden Hamster MODERN SPECIES 709 Gm30191 (ENSMAUG00000015307) Zfp593 (ENSMAUG00000022183) E130218I03Rik (ENSMAUG00000015371) Cnksr1 (ENSMAUG00000015929) Catsper4 (ENSMAUG00000022207) Zpld2 (ENSMAUG00000018467) ENSMAUG00000004093 ENSMAUG00000009089 Sh3bgrl3 (ENSMAUG00000015108) Ubxn11 (ENSMAUG00000001021) ENSMAUG00000020396 Crybg2 (ENSMAUG00000000813) Zfp683 (ENSMAUG00000020451) Lin28a (ENSMAUG00000018852) Dhdds (ENSMAUG00000004047) Hmgn2-ps (ENSMAUG00000017301) #22 Rps6ka1 (ENSMAUG00000017784) ENSMAUG00000004576 ENSMAUG00000020343 Pigv (ENSMAUG00000020277) Zdhhc18 (ENSMAUG00000011253) Sfn (ENSMAUG00000008489) Gpn2 (ENSMAUG00000013057) Gpatch3 (ENSMAUG00000002005) Nr0b2 (ENSMAUG00000020860) Nudc (ENSMAUG00000008166) Kdf1 (ENSMAUG00000021929) Trnp1 (ENSMAUG00000019939) Tent5b (ENSMAUG00000014675) ENSMAUG00000001078 Wdtc1 (ENSMAUG00000004693) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 76 ENSCGRG00001017566 ENSCGRG00001020873 ENSCGRG00001000908 ENSCGRG00001008846 ENSCGRG00001012210 Ugt2a3 (ENSCGRG00001006803) Ugt2a1 (ENSCGRG00001022953) Sult1b1 (ENSCGRG00001004112) Sult1d1 (ENSCGRG00001015275) Csn2 (ENSCGRG00001022086) Prr27 (ENSCGRG00001021889) Odam (ENSCGRG00001018569) Csn3 (ENSCGRG00001021623) ENSCGRG00001001669 #22 Cabs1 (ENSCGRG00001006155) ENSCGRG00001007525 Amtn (ENSCGRG00001013458) Ambn (ENSCGRG00001008007) Enam (ENSCGRG00001018697) Jchain (ENSCGRG00001011544) Utp3 (ENSCGRG00001001299) ENSCGRG00001018252 Rufy3 (ENSCGRG00001021194) ENSCGRG00001017575 Grsf1 (ENSCGRG00001019953) Mob1b (ENSCGRG00001008674) ENSCGRG00001015116 Slc4a4 (ENSCGRG00001024370) ENSCGRG00001024019 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.b.b #22 Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES Cep55 (ENSPEMG00000001787) Ffar4 (ENSPEMG00000030137) Rbp4 (ENSPEMG00000013876) Pde6c (ENSPEMG00000015785) Fra10ac1 (ENSPEMG00000016946) Lgi1 (ENSPEMG00000008179) Slc35g1 (ENSPEMG00000012559) Plce1 (ENSPEMG00000003369) Noc3l (ENSPEMG00000013021) Tbc1d12 (ENSPEMG00000030136) Hells (ENSPEMG00000017579) ENSPEMG00000028556 ENSPEMG00000020538 ENSPEMG00000020237 ENSPEMG00000012260 ENSPEMG00000029827 #22 Cyp2c55 (ENSPEMG00000006425) ENSPEMG00000012928 ENSPEMG00000028014 ENSPEMG00000005692 ENSPEMG00000016479 ENSPEMG00000025938 ENSPEMG00000020518 ENSPEMG00000024568 Pdlim1 (ENSPEMG00000022321) Sorbs1 (ENSPEMG00000002699) Aldh18a1 (ENSPEMG00000013055) Tctn3 (ENSPEMG00000003818) Entpd1 (ENSPEMG00000020787) Cc2d2b (ENSPEMG00000020898) Ccnj (ENSPEMG00000030735) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 10 Tmx3 (ENSPEMG00000011968) ENSPEMG00000030219 Dok6 (ENSPEMG00000019316) Cd226 (ENSPEMG00000029583) Rttn (ENSPEMG00000019864) ENSPEMG00000027089 Socs6 (ENSPEMG00000009086) ENSPEMG00000009228 ENSPEMG00000004621 ENSPEMG00000028176 Cbln2 (ENSPEMG00000024653) Neto1 (ENSPEMG00000021247) ENSPEMG00000026675 #22 ENSPEMG00000030444 Fbxo15 (ENSPEMG00000003160) Timm21 (ENSPEMG00000024475) Cyb5a (ENSPEMG00000020270) Gm17266 (ENSPEMG00000031219) Dipk1c (ENSPEMG00000019790) Cndp2 (ENSPEMG00000020038) Cndp1 (ENSPEMG00000017304) Zfp407 (ENSPEMG00000019754) Zadh2 (ENSPEMG00000028418) Tshz1 (ENSPEMG00000022838) Zfp516 (ENSPEMG00000024000) ENSPEMG00000024427 Zfp236 (ENSPEMG00000026320) Mbp (ENSPEMG00000021451) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.b #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.b #22 Prairie vole MODERN SPECIES 1 Pdik1l (ENSMOCG00000005467) Fam110d (ENSMOCG00000006661) Gm30191 (ENSMOCG00000016150) Zfp593 (ENSMOCG00000013349) E130218I03Rik (ENSMOCG00000013744) Cnksr1 (ENSMOCG00000021432) Catsper4 (ENSMOCG00000018811) Zpld2 (ENSMOCG00000010562) Cep85 (ENSMOCG00000013828) Sh3bgrl3 (ENSMOCG00000001157) Ubxn11 (ENSMOCG00000012381) Crybg2 (ENSMOCG00000012028) Zfp683 (ENSMOCG00000019164) Lin28a (ENSMOCG00000007819) Dhdds (ENSMOCG00000018150) ENSMOCG00000009477 #22 Rps6ka1 (ENSMOCG00000005121) Arid1a (ENSMOCG00000015143) Zdhhc18 (ENSMOCG00000014386) Pigv (ENSMOCG00000021093) Sfn (ENSMOCG00000007160) Gpn2 (ENSMOCG00000016502) Gpatch3 (ENSMOCG00000022375) Nr0b2 (ENSMOCG00000022706) ENSMOCG00000009769 Kdf1 (ENSMOCG00000008803) Trnp1 (ENSMOCG00000004450) Tent5b (ENSMOCG00000006029) Slc9a1 (ENSMOCG00000001951) Wdtc1 (ENSMOCG00000021708) Tmem222 (ENSMOCG00000001826) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.b #22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 2 Swt1 (ENSCGRG00001022955) Ivns1abp (ENSCGRG00001010161) Hmcn1 (ENSCGRG00001015387) Prg4 (ENSCGRG00001017987) Tpr (ENSCGRG00001022166) Odr4 (ENSCGRG00001012334) Pdc (ENSCGRG00001018609) Ptgs2 (ENSCGRG00001016942) Pla2g4a (ENSCGRG00001021132) ENSCGRG00001016441 ENSCGRG00001017155 Brinp3 (ENSCGRG00001019247) ENSCGRG00001020617 Rgs18 (ENSCGRG00001010249) Rgs21 (ENSCGRG00001010657) ENSCGRG00001004114 #22 Rgs1 (ENSCGRG00001011664) Rgs13 (ENSCGRG00001011756) Rgs2 (ENSCGRG00001015999) Uchl5 (ENSCGRG00001016538) Ro60 (ENSCGRG00001016925) ENSCGRG00001024711 Cdc73 (ENSCGRG00001023831) B3galt2 (ENSCGRG00001001870) ENSCGRG00001003032 Kcnt2 (ENSCGRG00001017430) ENSCGRG00001018310 ENSCGRG00001008325 F13b (ENSCGRG00001002944) Aspm (ENSCGRG00001014059) Zbtb41 (ENSCGRG00001015855) Muroidea DUPLICATION Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.a ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.a ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.a ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.a ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.a ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.a ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 1095 ENSMSIG00000003675 ##22 Shrew mouse MODERN SPECIES 9 Frs3 (MGP_PahariEiJ_G0020700) MGP_PahariEiJ_G0020699 MGP_PahariEiJ_G0020698 Tomm6 (MGP_PahariEiJ_G0020697) Usp49 (MGP_PahariEiJ_G0020696) MGP_PahariEiJ_G0020695 Med20 (MGP_PahariEiJ_G0020694) Bysl (MGP_PahariEiJ_G0020693) Ccnd3 (MGP_PahariEiJ_G0020692) Taf8 (MGP_PahariEiJ_G0020691) AI661453 (MGP_PahariEiJ_G0020690) MGP_PahariEiJ_G0020689 Guca1a (MGP_PahariEiJ_G0020688) MGP_PahariEiJ_G0020687 Mrps10 (MGP_PahariEiJ_G0020686) MGP_PahariEiJ_G0020685 ##22 Ubr2 (MGP_PahariEiJ_G0020684) Prph2 (MGP_PahariEiJ_G0020683) Tbcc (MGP_PahariEiJ_G0020682) MGP_PahariEiJ_G0020681 Rpl7l1 (MGP_PahariEiJ_G0020680) 2310039H08Rik (MGP_PahariEiJ_G0020679) Ptcra (MGP_PahariEiJ_G0020678) Cnpy3 (MGP_PahariEiJ_G0020677) Gnmt (MGP_PahariEiJ_G0020676) Pex6 (MGP_PahariEiJ_G0020675) Ppp2r5d (MGP_PahariEiJ_G0020674) Mea1 (MGP_PahariEiJ_G0020673) Klhdc3 (MGP_PahariEiJ_G0020672) Rrp36 (MGP_PahariEiJ_G0020671) Cul7 (MGP_PahariEiJ_G0020670) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.b ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.b ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.b ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 2708 Kcnd3 (ENSMSIG00000005944) Ddx20 (ENSMSIG00000005900) Inka2 (ENSMSIG00000005873) Rap1a (ENSMSIG00000005828) Adora3 (ENSMSIG00000005809) Tmigd3 (ENSMSIG00000005765) I830077J02Rik (ENSMSIG00000005744) ENSMSIG00000005701 Wdr77 (ENSMSIG00000005672) Ovgp1 (ENSMSIG00000005625) Pifo (ENSMSIG00000005553) Chil5 (ENSMSIG00000005504) ENSMSIG00000005488 ##22 Chia1 (ENSMSIG00000005457) Chil3 (ENSMSIG00000005424) Chil4 (ENSMSIG00000005364) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 702 Ppp1r14c (ENSNGAG00000014875) ENSNGAG00000016984 ##22 ENSNGAG00000017905 Lrp11 (ENSNGAG00000019568) Pcmt1 (ENSNGAG00000000477) Nup43 (ENSNGAG00000001085) Lats1 (ENSNGAG00000002110) ENSNGAG00000004438 Ginm1 (ENSNGAG00000006947) Ppil4 (ENSNGAG00000008801) Zc3h12d (ENSNGAG00000010502) Tab2 (ENSNGAG00000011601) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 12 TXNDC17 (ENSSVLG00005013668) ENSSVLG00005013558 KIAA0753 (ENSSVLG00005013510) PITPNM3 (ENSSVLG00005013384) PIMREG (ENSSVLG00005013051) AIPL1 (ENSSVLG00005012617) WSCD1 (ENSSVLG00005012425) NLRP1 (ENSSVLG00005011558) ENSSVLG00005011435 MIS12 (ENSSVLG00005011416) DERL2 (ENSSVLG00005011333) DHX33 (ENSSVLG00005011159) ENSSVLG00005011043 RPAIN (ENSSVLG00005010858) NUP88 (ENSSVLG00005010768) ENSSVLG00005010734 #22 RABEP1 (ENSSVLG00005013880) ENSSVLG00005013751 ENSSVLG00005013649 SCIMP (ENSSVLG00005013585) ENSSVLG00005013440 ENSSVLG00005013408 ZNF232 (ENSSVLG00005013374) ZFP3 (ENSSVLG00005013333) ENSSVLG00005013210 KIF1C (ENSSVLG00005013143) INCA1 (ENSSVLG00005013041) CAMTA2 (ENSSVLG00005012676) ENSSVLG00005012585 SPAG7 (ENSSVLG00005012361) ENO3 (ENSSVLG00005012264) Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Arctic ground squirrel DUPLICATION Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 376 ENSUPAG00010011754 ENSUPAG00010011764 #22 KIAA1143 (ENSUPAG00010011777) ENSUPAG00010011781 ZNF35 (ENSUPAG00010011784) ZNF197 (ENSUPAG00010011790) ZNF660 (ENSUPAG00010011799) ZKSCAN7 (ENSUPAG00010011801) ENSUPAG00010011824 ENSUPAG00010011836 TCAIM (ENSUPAG00010011866) TOPAZ1 (ENSUPAG00010011889) ABHD5 (ENSUPAG00010011940) ANO10 (ENSUPAG00010011968) SNRK (ENSUPAG00010012029) POMGNT2 (ENSUPAG00010012035) GASK1A (ENSUPAG00010012037) Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 241 EPB41L4A (ENSUPAG00010021876) APC (ENSUPAG00010021893) SRP19 (ENSUPAG00010021920) ENSUPAG00010021923 REEP5 (ENSUPAG00010021926) PKD2L2 (ENSUPAG00010021930) FAM13B (ENSUPAG00010021934) WNT8A (ENSUPAG00010021939) NME5 (ENSUPAG00010021941) ENSUPAG00010021946 #22 ENSUPAG00010021949 BRD8 (ENSUPAG00010021951) KIF20A (ENSUPAG00010021970) CDC23 (ENSUPAG00010021979) ENSUPAG00010021987 GFRA3 (ENSUPAG00010021988) CDC25C (ENSUPAG00010021991) ENSUPAG00010021998 FAM53C (ENSUPAG00010022019) KDM3B (ENSUPAG00010022021) EGR1 (ENSUPAG00010022030) ETF1 (ENSUPAG00010022032) HSPA9 (ENSUPAG00010022035) CTNNA1 (ENSUPAG00010022041) LRRTM2 (ENSUPAG00010022043)