Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Muroidea DUPLICATION Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22 Mouse MODERN SPECIES 17 Hmgxb4 (ENSMUSG00000034518) #7 Isx (ENSMUSG00000031621) #8 Large1 (ENSMUSG00000004383) #9 F2rl3 (ENSMUSG00000050147) #10 Sin3b (ENSMUSG00000031622) #11 Nwd1 (ENSMUSG00000048148) #12 Tmem38a (ENSMUSG00000031791) #13 Smim7 (ENSMUSG00000044600) #14 Med26 (ENSMUSG00000045248) #15 Slc35e1 (ENSMUSG00000019731) #16 Cherp (ENSMUSG00000052488) #17 1700030K09Rik (ENSMUSG00000052794) #18 Calr3 (ENSMUSG00000019732) #19 Eps15l1 (ENSMUSG00000006276) #20 Klf2 (ENSMUSG00000055148) #21 Hmgn2-ps (ENSMUSG00000070713) #22 Ap1m1 (ENSMUSG00000003033) #23 Fam32a (ENSMUSG00000003039) #24 Cib3 (ENSMUSG00000074240) #25 Hsh2d (ENSMUSG00000062007) #26 Rab8a (ENSMUSG00000003037) #27 Tpm4 (ENSMUSG00000031799) #28 Or1ab2 (ENSMUSG00000046881) #29 Or2z9 (ENSMUSG00000061561) #30 Or2z8 (ENSMUSG00000069998) #31 Cyp4f18 (ENSMUSG00000003484) #32 Zfp961 (ENSMUSG00000052446) #33 Zfp617 (ENSMUSG00000066880) #34 Zfp882 (ENSMUSG00000089857) #35 Zfp709 (ENSMUSG00000056019) #36 Fcho1 (ENSMUSG00000070000) #37 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3218 ENSMSIG00000027765 #22 ENSMSIG00000027776 ENSMSIG00000027793 Tenm4 (ENSMSIG00000027807) Nars2 (ENSMSIG00000027934) spretus MODERN SPECIES 8 Frs3 (MGP_SPRETEiJ_G0022622) MGP_SPRETEiJ_G0022621 MGP_SPRETEiJ_G0022620 Tomm6 (MGP_SPRETEiJ_G0022619) Usp49 (MGP_SPRETEiJ_G0022618) MGP_SPRETEiJ_G0022617 Med20 (MGP_SPRETEiJ_G0022616) Bysl (MGP_SPRETEiJ_G0022615) Ccnd3 (MGP_SPRETEiJ_G0022614) Taf8 (MGP_SPRETEiJ_G0022613) MGP_SPRETEiJ_G0022612 1700001C19Rik (MGP_SPRETEiJ_G0022611) Guca1a (MGP_SPRETEiJ_G0022610) Guca1b (MGP_SPRETEiJ_G0022609) Mrps10 (MGP_SPRETEiJ_G0022608) MGP_SPRETEiJ_G0022607 #22 Ubr2 (MGP_SPRETEiJ_G0022606) Prph2 (MGP_SPRETEiJ_G0022605) Tbcc (MGP_SPRETEiJ_G0022604) MGP_SPRETEiJ_G0022603 Bicral (MGP_SPRETEiJ_G0022602) Rpl7l1 (MGP_SPRETEiJ_G0022601) 2310039H08Rik (MGP_SPRETEiJ_G0022600) Ptcra (MGP_SPRETEiJ_G0022599) Cnpy3 (MGP_SPRETEiJ_G0022598) Gnmt (MGP_SPRETEiJ_G0022597) Pex6 (MGP_SPRETEiJ_G0022596) Ppp2r5d (MGP_SPRETEiJ_G0022595) Mea1 (MGP_SPRETEiJ_G0022594) Klhdc3 (MGP_SPRETEiJ_G0022593) Rrp36 (MGP_SPRETEiJ_G0022592) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 2 MGP_CAROLIEiJ_G0016274 Flt4 (MGP_CAROLIEiJ_G0016275) Scgb3a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016276) Cnot6 (MGP_CAROLIEiJ_G0016277) Gfpt2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016278) Mapk9 (MGP_CAROLIEiJ_G0016279) Rasgef1c (MGP_CAROLIEiJ_G0016280) Rnf130 (MGP_CAROLIEiJ_G0016281) Tbc1d9b (MGP_CAROLIEiJ_G0016282) Mrnip (MGP_CAROLIEiJ_G0016283) Sqstm1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016284) Mgat4b (MGP_CAROLIEiJ_G0016285) Ltc4s (MGP_CAROLIEiJ_G0016286) Maml1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016287) Canx (MGP_CAROLIEiJ_G0016288) ##19 MGP_CAROLIEiJ_G0016289 #22 MGP_CAROLIEiJ_G0016290 MGP_CAROLIEiJ_G0016291 Rufy1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016292) Adamts2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016293) Zfp354c (MGP_CAROLIEiJ_G0016294) Zfp879 (MGP_CAROLIEiJ_G0016295) Grm6 (MGP_CAROLIEiJ_G0016296) Zfp454 (MGP_CAROLIEiJ_G0016297) Zfp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016298) Zfp354b (MGP_CAROLIEiJ_G0016299) 4933414I15Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0016300) Prop1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016301) Or1ad6 (MGP_CAROLIEiJ_G0016302) MGP_CAROLIEiJ_G0016303 Or1ad8 (MGP_CAROLIEiJ_G0016304) Rat DUPLICATION Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 15 LOC108351043 (ENSRNOG00000054734) E130218I03Rik (ENSRNOG00000065422) Zfp593 (ENSRNOG00000016392) Cnksr1 (ENSRNOG00000022838) Catsper4 (ENSRNOG00000016312) Umodl (ENSRNOG00000037191) Cep85 (ENSRNOG00000016249) Sh3bgrl3 (ENSRNOG00000015967) Ubxn11 (ENSRNOG00000015476) LOC100360087 (ENSRNOG00000064482) Cd52 (ENSRNOG00000015403) Crybg2 (ENSRNOG00000057957) Zfp683 (ENSRNOG00000065788) Lin28a (ENSRNOG00000069459) Dhdds (ENSRNOG00000014665) Hmgn2 (ENSRNOG00000051615) #22 LOC683456 (ENSRNOG00000070457) Rps6ka1 (ENSRNOG00000042411) LOC120103001 (ENSRNOG00000068341) Arid1a (ENSRNOG00000006137) Pigv (ENSRNOG00000000121) Zdhhc18 (ENSRNOG00000058156) Sfn (ENSRNOG00000033153) Gpn2 (ENSRNOG00000007083) Gpatch3 (ENSRNOG00000007097) ENSRNOG00000066253 Nr0b2 (ENSRNOG00000007229) Nudc (ENSRNOG00000051720) AC118963.1 (ENSRNOG00000049922) Kdf1 (ENSRNOG00000055933) ENSRNOG00000068236 Rat MODERN SPECIES 7 Spock3 (ENSRNOG00000029903) Anxa10 (ENSRNOG00000014339) LOC120097562 (ENSRNOG00000056947) Palldl1 (ENSRNOG00000010107) Ddx60 (ENSRNOG00000059097) Cbr4 (ENSRNOG00000024411) Sh3rf1 (ENSRNOG00000010358) Nek1 (ENSRNOG00000010418) Clcn3 (ENSRNOG00000010682) Hpf1 (ENSRNOG00000011293) LOC100360260 (ENSRNOG00000060395) Ppia-ps13 (ENSRNOG00000062799) Mfap3l (ENSRNOG00000011775) Aadat (ENSRNOG00000011861) ENSRNOG00000063109 Hmgn2-ps4 (ENSRNOG00000066721) #22 Galntl6 (ENSRNOG00000067282) Galnt7 (ENSRNOG00000012037) Hmgb2 (ENSRNOG00000013167) Sap30 (ENSRNOG00000013218) Scrg1 (ENSRNOG00000069516) ENSRNOG00000069425 Hand2 (ENSRNOG00000060448) LOC103694242 (ENSRNOG00000007402) Fbxo8 (ENSRNOG00000010502) ENSRNOG00000062690 Cep44 (ENSRNOG00000010566) Hpgd (ENSRNOG00000010610) Hmgb1 (ENSRNOG00000058908) Glra3 (ENSRNOG00000049792) ENSRNOG00000063491 Rat MODERN SPECIES 13 Bfsp1 (ENSRNOG00000005707) Pcsk2 (ENSRNOG00000005438) Otor (ENSRNOG00000028721) Snrpb2 (ENSRNOG00000004967) Kif16b (ENSRNOG00000004951) ENSRNOG00000062960 Flrt3 (ENSRNOG00000004874) Macrod2 (ENSRNOG00000050784) Sel1l2 (ENSRNOG00000004852) Ndufaf5 (ENSRNOG00000004784) Esf1 (ENSRNOG00000004777) Tasp1 (ENSRNOG00000004493) ENSRNOG00000068011 Ism1 (ENSRNOG00000063262) Sptlc3 (ENSRNOG00000004443) AABR07053884.1 (ENSRNOG00000030601) #22 ENSRNOG00000066288 ENSRNOG00000067830 Btbd3 (ENSRNOG00000008088) Jag1 (ENSRNOG00000007443) Slx4ip (ENSRNOG00000007430) Gm56451 (ENSRNOG00000067094) Mkks (ENSRNOG00000006705) Snap25 (ENSRNOG00000006037) Ankef1 (ENSRNOG00000005792) AABR07053830.1 (ENSRNOG00000055829) Pak5 (ENSRNOG00000005509) Lamp5 (ENSRNOG00000005457) Plcb4 (ENSRNOG00000033119) Plcb1 (ENSRNOG00000004810) Tmx4 (ENSRNOG00000024852) Cricetidae DUPLICATION Cricetidae DUPLICATION Cricetidae DUPLICATION Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.a.a #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.a.a #22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Hoxc4 (ENSCGRG00001013095) Smug1 (ENSCGRG00001016146) Cbx5 (ENSCGRG00001019018) Hnrnpa1 (ENSCGRG00001013129) Nfe2 (ENSCGRG00001022465) Copz1 (ENSCGRG00001013501) ENSCGRG00001009425 Zfp385a (ENSCGRG00001015539) Itga5 (ENSCGRG00001017691) Gtsf1 (ENSCGRG00001013814) Gtsf2 (ENSCGRG00001016136) Nckap1l (ENSCGRG00001014386) Pde1b (ENSCGRG00001017137) Ppp1r1a (ENSCGRG00001013456) Glycam1 (ENSCGRG00001016454) ENSCGRG00001009407 #22 Tpp2 (ENSCGRG00001014893) Mettl21c (ENSCGRG00001014510) Tex30 (ENSCGRG00001013834) Poglut2 (ENSCGRG00001016741) Bivm (ENSCGRG00001013666) Ercc5 (ENSCGRG00001015414) Mettl21e (ENSCGRG00001014330) ENSCGRG00001010198 ENSCGRG00001019242 Gulp1 (ENSCGRG00001015646) Col3a1 (ENSCGRG00001015480) Col5a2 (ENSCGRG00001013733) Wdr75 (ENSCGRG00001013929) ENSCGRG00001016157 Slc40a1 (ENSCGRG00001014664) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.a.a #22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 17 ENSPEMG00000027805 ENSPEMG00000029460 ENSPEMG00000024866 ENSPEMG00000029053 ENSPEMG00000028491 ENSPEMG00000029100 ENSPEMG00000025935 Zc3h15 (ENSPEMG00000013093) Itgav (ENSPEMG00000015518) Fam171b (ENSPEMG00000026590) Zswim2 (ENSPEMG00000014220) ENSPEMG00000027679 Or5t5 (ENSPEMG00000025077) Or8k3b (ENSPEMG00000024781) Or8k40 (ENSPEMG00000025465) ENSPEMG00000024333 #22 Or5t7 (ENSPEMG00000029283) Or8k39 (ENSPEMG00000025808) Or8k38 (ENSPEMG00000031089) ENSPEMG00000026528 Or8k32 (ENSPEMG00000027876) ENSPEMG00000024690 ENSPEMG00000026822 ENSPEMG00000025620 ENSPEMG00000030206 ENSPEMG00000027513 ENSPEMG00000026543 Or8k23 (ENSPEMG00000028666) Or8k53 (ENSPEMG00000028082) Or8k22 (ENSPEMG00000028101) ENSPEMG00000027677 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.a.b #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.a.b #22 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 175 Klf8 (ENSCGRG00001019035) Ubqln2 (ENSCGRG00001016085) Kctd12b (ENSCGRG00001004538) Nbdy (ENSCGRG00001003251) ENSCGRG00001005909 Spin2c (ENSCGRG00001004592) ENSCGRG00001018471 ENSCGRG00001000978 ENSCGRG00001023144 Mycs (ENSCGRG00001000792) ENSCGRG00001003982 ENSCGRG00001000208 ENSCGRG00001010729 ENSCGRG00001007007 ENSCGRG00001022547 ENSCGRG00001007687 #22 ENSCGRG00001008851 ENSCGRG00001009060 ENSCGRG00001001286 Bmp15 (ENSCGRG00001012329) Shroom4 (ENSCGRG00001016683) Dgkk (ENSCGRG00001005491) Ccnb3 (ENSCGRG00001016975) Akap4 (ENSCGRG00001022827) ENSCGRG00001000058 Clcn5 (ENSCGRG00001017810) ENSCGRG00001006356 Ppp1r3f (ENSCGRG00001022530) Foxp3 (ENSCGRG00001021426) Ccdc22 (ENSCGRG00001023162) Cacna1f (ENSCGRG00001013804) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 188 Ehmt1 (ENSCGRG00001002035) Cacna1b (ENSCGRG00001018788) Pax8 (ENSCGRG00001017508) Psd4 (ENSCGRG00001010714) Il1rn (ENSCGRG00001005108) Il1f10 (ENSCGRG00001003880) Il36rn (ENSCGRG00001010036) Il36b (ENSCGRG00001008679) ENSCGRG00001008839 Il36a (ENSCGRG00001005772) ENSCGRG00001015320 Tbpl2 (ENSCGRG00001015310) ENSCGRG00001009248 ENSCGRG00001001542 ENSCGRG00001024843 ENSCGRG00001008614 #22 Spopl (ENSCGRG00001010346) Nxph2 (ENSCGRG00001024840) ENSCGRG00001024491 ENSCGRG00001009004 ENSCGRG00001012428 Kynu (ENSCGRG00001005556) Arhgap15 (ENSCGRG00001011371) ENSCGRG00001008381 Gtdc1 (ENSCGRG00001014426) ENSCGRG00001006690 Zeb2 (ENSCGRG00001003812) ENSCGRG00001000890 Acvr2a (ENSCGRG00001024754) Orc4 (ENSCGRG00001001352) Mbd5 (ENSCGRG00001001266) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.a.b #22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 2 Nenf (ENSPEMG00000004190) Ppp2r5a (ENSPEMG00000007353) Dtl (ENSPEMG00000009566) Ints7 (ENSPEMG00000014500) Lpgat1 (ENSPEMG00000016230) Nek2 (ENSPEMG00000011480) ENSPEMG00000031137 Slc30a1 (ENSPEMG00000002874) Rd3 (ENSPEMG00000020626) Traf5 (ENSPEMG00000022373) Rcor3 (ENSPEMG00000007457) Kcnh1 (ENSPEMG00000010427) Hhat (ENSPEMG00000001916) Sertad4 (ENSPEMG00000010470) Syt14 (ENSPEMG00000000255) ENSPEMG00000029864 #22 Utp25 (ENSPEMG00000000712) Irf6 (ENSPEMG00000020332) A130010J15Rik (ENSPEMG00000022277) Traf3ip3 (ENSPEMG00000021211) Hsd11b1 (ENSPEMG00000009872) G0s2 (ENSPEMG00000029839) Lamb3 (ENSPEMG00000017689) Camk1g (ENSPEMG00000010373) Plxna2 (ENSPEMG00000019686) Cd34 (ENSPEMG00000020063) Cd46 (ENSPEMG00000013673) Cr1l (ENSPEMG00000019441) Cr2 (ENSPEMG00000007875) Cricetidae DUPLICATION Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.b.a #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.b.a #22 Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 475 Rps6ka6 (ENSPEMG00000015736) Cylc1 (ENSPEMG00000017301) Pou3f4 (ENSPEMG00000003663) ENSPEMG00000025843 Gm6377 (ENSPEMG00000023246) ENSPEMG00000024318 Sh3bgrl (ENSPEMG00000027781) Brwd3 (ENSPEMG00000022305) ENSPEMG00000031328 Wmp (ENSPEMG00000027638) Tent5d (ENSPEMG00000031184) Chmp1b2 (ENSPEMG00000022335) Tbx22 (ENSPEMG00000023383) Itm2a (ENSPEMG00000023946) Gpr174 (ENSPEMG00000005742) ENSPEMG00000004229 #22 P2ry10b (ENSPEMG00000024642) P2ry10 (ENSPEMG00000023462) Lpar4 (ENSPEMG00000030102) Cysltr1 (ENSPEMG00000023120) ENSPEMG00000026887 ENSPEMG00000021468 Taf9b (ENSPEMG00000022582) ENSPEMG00000012872 Atp7a (ENSPEMG00000006787) ENSPEMG00000012083 Magt1 (ENSPEMG00000021915) ENSPEMG00000016457 Atrx (ENSPEMG00000022358) Fgf16 (ENSPEMG00000021916) ENSPEMG00000030780 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 475 Fthl17a (ENSPEMG00000019530) Tab3 (ENSPEMG00000019664) Gk (ENSPEMG00000019899) Tasl (ENSPEMG00000020160) Nr0b1 (ENSPEMG00000020271) ENSPEMG00000028874 ENSPEMG00000025328 ENSPEMG00000028142 ENSPEMG00000031097 ENSPEMG00000028040 Il1rapl1 (ENSPEMG00000029607) ENSPEMG00000019379 Tmem47 (ENSPEMG00000029078) ENSPEMG00000026179 Mageb16 (ENSPEMG00000023768) ENSPEMG00000028268 #22 Cfap47 (ENSPEMG00000022325) Fam47c (ENSPEMG00000030109) Prrg1 (ENSPEMG00000030282) 4930480E11Rik (ENSPEMG00000028721) ENSPEMG00000030251 ENSPEMG00000023943 ENSPEMG00000024840 ENSPEMG00000015794 ENSPEMG00000027218 ENSPEMG00000023281 #15 Pbsn (ENSPEMG00000012253) Prkx (ENSPEMG00000030408) ENSPEMG00000030079 Tbl1x (ENSPEMG00000017480) ENSPEMG00000029386 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 475 ENSPEMG00000027777 Usp11 (ENSPEMG00000023892) Cdk16 (ENSPEMG00000021751) Uba1 (ENSPEMG00000007224) Rbm10 (ENSPEMG00000012165) ENSPEMG00000023255 ENSPEMG00000029454 Rgn (ENSPEMG00000022597) Jade3 (ENSPEMG00000009000) Rp2 (ENSPEMG00000012699) Slc9a7 (ENSPEMG00000022733) Chst7 (ENSPEMG00000022504) ENSPEMG00000001616 ENSPEMG00000001590 ENSPEMG00000025989 ENSPEMG00000026731 #22 Dipk2b (ENSPEMG00000026275) Kdm6a (ENSPEMG00000011007) ENSPEMG00000028355 Slc38a5 (ENSPEMG00000012763) ENSPEMG00000015698 Porcn (ENSPEMG00000018381) Ebp (ENSPEMG00000019215) Tbc1d25 (ENSPEMG00000000481) Rbm3 (ENSPEMG00000012411) Wdr13 (ENSPEMG00000030841) Was (ENSPEMG00000017673) Suv39h1 (ENSPEMG00000012820) Glod5 (ENSPEMG00000014471) Gata1 (ENSPEMG00000010138) Hdac6 (ENSPEMG00000002814) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.b.a #22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 352 ENSCGRG00001018287 Tiparp (ENSCGRG00001011123) Ssr3 (ENSCGRG00001019723) Kcnab1 (ENSCGRG00001005457) ENSCGRG00001005615 ENSCGRG00001017013 Vmn2r1 (ENSCGRG00001023200) Gmps (ENSCGRG00001018772) Slc33a1 (ENSCGRG00001018761) E130311K13Rik (ENSCGRG00001024290) Plch1 (ENSCGRG00001000217) ENSCGRG00001021700 ENSCGRG00001022762 Mme (ENSCGRG00001000828) ENSCGRG00001008438 ENSCGRG00001007190 #22 Gpr149 (ENSCGRG00001013143) Dhx36 (ENSCGRG00001013722) Arhgef26 (ENSCGRG00001017827) Rap2b (ENSCGRG00001008789) P2ry1 (ENSCGRG00001004469) Mbnl1 (ENSCGRG00001007139) Sucnr1 (ENSCGRG00001017063) Aadac (ENSCGRG00001018575) Aadacl2 (ENSCGRG00001019320) Aadacl2fm1 (ENSCGRG00001013390) Aadacl2fm3 (ENSCGRG00001016631) Igsf10 (ENSCGRG00001011835) Med12l (ENSCGRG00001002841) P2ry12 (ENSCGRG00001004633) P2ry13 (ENSCGRG00001004523) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.b.b #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.b.b #22 Golden Hamster MODERN SPECIES 709 Gm30191 (ENSMAUG00000015307) Zfp593 (ENSMAUG00000022183) E130218I03Rik (ENSMAUG00000015371) Cnksr1 (ENSMAUG00000015929) Catsper4 (ENSMAUG00000022207) Zpld2 (ENSMAUG00000018467) ENSMAUG00000004093 ENSMAUG00000009089 Sh3bgrl3 (ENSMAUG00000015108) Ubxn11 (ENSMAUG00000001021) ENSMAUG00000020396 Crybg2 (ENSMAUG00000000813) Zfp683 (ENSMAUG00000020451) Lin28a (ENSMAUG00000018852) Dhdds (ENSMAUG00000004047) Hmgn2-ps (ENSMAUG00000017301) #22 Rps6ka1 (ENSMAUG00000017784) ENSMAUG00000004576 ENSMAUG00000020343 Pigv (ENSMAUG00000020277) Zdhhc18 (ENSMAUG00000011253) Sfn (ENSMAUG00000008489) Gpn2 (ENSMAUG00000013057) Gpatch3 (ENSMAUG00000002005) Nr0b2 (ENSMAUG00000020860) Nudc (ENSMAUG00000008166) Kdf1 (ENSMAUG00000021929) Trnp1 (ENSMAUG00000019939) Tent5b (ENSMAUG00000014675) ENSMAUG00000001078 Wdtc1 (ENSMAUG00000004693) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 76 ENSCGRG00001017566 ENSCGRG00001020873 ENSCGRG00001000908 ENSCGRG00001008846 ENSCGRG00001012210 Ugt2a3 (ENSCGRG00001006803) Ugt2a1 (ENSCGRG00001022953) Sult1b1 (ENSCGRG00001004112) Sult1d1 (ENSCGRG00001015275) Csn2 (ENSCGRG00001022086) Prr27 (ENSCGRG00001021889) Odam (ENSCGRG00001018569) Csn3 (ENSCGRG00001021623) ENSCGRG00001001669 #22 Cabs1 (ENSCGRG00001006155) ENSCGRG00001007525 Amtn (ENSCGRG00001013458) Ambn (ENSCGRG00001008007) Enam (ENSCGRG00001018697) Jchain (ENSCGRG00001011544) Utp3 (ENSCGRG00001001299) ENSCGRG00001018252 Rufy3 (ENSCGRG00001021194) ENSCGRG00001017575 Grsf1 (ENSCGRG00001019953) Mob1b (ENSCGRG00001008674) ENSCGRG00001015116 Slc4a4 (ENSCGRG00001024370) ENSCGRG00001024019 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.b.b #22 Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES Cep55 (ENSPEMG00000001787) Ffar4 (ENSPEMG00000030137) Rbp4 (ENSPEMG00000013876) Pde6c (ENSPEMG00000015785) Fra10ac1 (ENSPEMG00000016946) Lgi1 (ENSPEMG00000008179) Slc35g1 (ENSPEMG00000012559) Plce1 (ENSPEMG00000003369) Noc3l (ENSPEMG00000013021) Tbc1d12 (ENSPEMG00000030136) Hells (ENSPEMG00000017579) ENSPEMG00000028556 ENSPEMG00000020538 ENSPEMG00000020237 ENSPEMG00000012260 ENSPEMG00000029827 #22 Cyp2c55 (ENSPEMG00000006425) ENSPEMG00000012928 ENSPEMG00000028014 ENSPEMG00000005692 ENSPEMG00000016479 ENSPEMG00000025938 ENSPEMG00000020518 ENSPEMG00000024568 Pdlim1 (ENSPEMG00000022321) Sorbs1 (ENSPEMG00000002699) Aldh18a1 (ENSPEMG00000013055) Tctn3 (ENSPEMG00000003818) Entpd1 (ENSPEMG00000020787) Cc2d2b (ENSPEMG00000020898) Ccnj (ENSPEMG00000030735) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 10 Tmx3 (ENSPEMG00000011968) ENSPEMG00000030219 Dok6 (ENSPEMG00000019316) Cd226 (ENSPEMG00000029583) Rttn (ENSPEMG00000019864) ENSPEMG00000027089 Socs6 (ENSPEMG00000009086) ENSPEMG00000009228 ENSPEMG00000004621 ENSPEMG00000028176 Cbln2 (ENSPEMG00000024653) Neto1 (ENSPEMG00000021247) ENSPEMG00000026675 #22 ENSPEMG00000030444 Fbxo15 (ENSPEMG00000003160) Timm21 (ENSPEMG00000024475) Cyb5a (ENSPEMG00000020270) Gm17266 (ENSPEMG00000031219) Dipk1c (ENSPEMG00000019790) Cndp2 (ENSPEMG00000020038) Cndp1 (ENSPEMG00000017304) Zfp407 (ENSPEMG00000019754) Zadh2 (ENSPEMG00000028418) Tshz1 (ENSPEMG00000022838) Zfp516 (ENSPEMG00000024000) ENSPEMG00000024427 Zfp236 (ENSPEMG00000026320) Mbp (ENSPEMG00000021451) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.b #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.b #22 Prairie vole MODERN SPECIES 1 Pdik1l (ENSMOCG00000005467) Fam110d (ENSMOCG00000006661) Gm30191 (ENSMOCG00000016150) Zfp593 (ENSMOCG00000013349) E130218I03Rik (ENSMOCG00000013744) Cnksr1 (ENSMOCG00000021432) Catsper4 (ENSMOCG00000018811) Zpld2 (ENSMOCG00000010562) Cep85 (ENSMOCG00000013828) Sh3bgrl3 (ENSMOCG00000001157) Ubxn11 (ENSMOCG00000012381) Crybg2 (ENSMOCG00000012028) Zfp683 (ENSMOCG00000019164) Lin28a (ENSMOCG00000007819) Dhdds (ENSMOCG00000018150) ENSMOCG00000009477 #22 Rps6ka1 (ENSMOCG00000005121) Arid1a (ENSMOCG00000015143) Zdhhc18 (ENSMOCG00000014386) Pigv (ENSMOCG00000021093) Sfn (ENSMOCG00000007160) Gpn2 (ENSMOCG00000016502) Gpatch3 (ENSMOCG00000022375) Nr0b2 (ENSMOCG00000022706) ENSMOCG00000009769 Kdf1 (ENSMOCG00000008803) Trnp1 (ENSMOCG00000004450) Tent5b (ENSMOCG00000006029) Slc9a1 (ENSMOCG00000001951) Wdtc1 (ENSMOCG00000021708) Tmem222 (ENSMOCG00000001826) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.b #22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 2 Swt1 (ENSCGRG00001022955) Ivns1abp (ENSCGRG00001010161) Hmcn1 (ENSCGRG00001015387) Prg4 (ENSCGRG00001017987) Tpr (ENSCGRG00001022166) Odr4 (ENSCGRG00001012334) Pdc (ENSCGRG00001018609) Ptgs2 (ENSCGRG00001016942) Pla2g4a (ENSCGRG00001021132) ENSCGRG00001016441 ENSCGRG00001017155 Brinp3 (ENSCGRG00001019247) ENSCGRG00001020617 Rgs18 (ENSCGRG00001010249) Rgs21 (ENSCGRG00001010657) ENSCGRG00001004114 #22 Rgs1 (ENSCGRG00001011664) Rgs13 (ENSCGRG00001011756) Rgs2 (ENSCGRG00001015999) Uchl5 (ENSCGRG00001016538) Ro60 (ENSCGRG00001016925) ENSCGRG00001024711 Cdc73 (ENSCGRG00001023831) B3galt2 (ENSCGRG00001001870) ENSCGRG00001003032 Kcnt2 (ENSCGRG00001017430) ENSCGRG00001018310 ENSCGRG00001008325 F13b (ENSCGRG00001002944) Aspm (ENSCGRG00001014059) Zbtb41 (ENSCGRG00001015855) Muroidea DUPLICATION Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.a ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.a ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.a ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.a ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.a ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.a ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 1095 ENSMSIG00000003675 ##22 Shrew mouse MODERN SPECIES 9 Frs3 (MGP_PahariEiJ_G0020700) MGP_PahariEiJ_G0020699 MGP_PahariEiJ_G0020698 Tomm6 (MGP_PahariEiJ_G0020697) Usp49 (MGP_PahariEiJ_G0020696) MGP_PahariEiJ_G0020695 Med20 (MGP_PahariEiJ_G0020694) Bysl (MGP_PahariEiJ_G0020693) Ccnd3 (MGP_PahariEiJ_G0020692) Taf8 (MGP_PahariEiJ_G0020691) AI661453 (MGP_PahariEiJ_G0020690) MGP_PahariEiJ_G0020689 Guca1a (MGP_PahariEiJ_G0020688) MGP_PahariEiJ_G0020687 Mrps10 (MGP_PahariEiJ_G0020686) MGP_PahariEiJ_G0020685 ##22 Ubr2 (MGP_PahariEiJ_G0020684) Prph2 (MGP_PahariEiJ_G0020683) Tbcc (MGP_PahariEiJ_G0020682) MGP_PahariEiJ_G0020681 Rpl7l1 (MGP_PahariEiJ_G0020680) 2310039H08Rik (MGP_PahariEiJ_G0020679) Ptcra (MGP_PahariEiJ_G0020678) Cnpy3 (MGP_PahariEiJ_G0020677) Gnmt (MGP_PahariEiJ_G0020676) Pex6 (MGP_PahariEiJ_G0020675) Ppp2r5d (MGP_PahariEiJ_G0020674) Mea1 (MGP_PahariEiJ_G0020673) Klhdc3 (MGP_PahariEiJ_G0020672) Rrp36 (MGP_PahariEiJ_G0020671) Cul7 (MGP_PahariEiJ_G0020670) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.b ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.b ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.b ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 2708 Kcnd3 (ENSMSIG00000005944) Ddx20 (ENSMSIG00000005900) Inka2 (ENSMSIG00000005873) Rap1a (ENSMSIG00000005828) Adora3 (ENSMSIG00000005809) Tmigd3 (ENSMSIG00000005765) I830077J02Rik (ENSMSIG00000005744) ENSMSIG00000005701 Wdr77 (ENSMSIG00000005672) Ovgp1 (ENSMSIG00000005625) Pifo (ENSMSIG00000005553) Chil5 (ENSMSIG00000005504) ENSMSIG00000005488 ##22 Chia1 (ENSMSIG00000005457) Chil3 (ENSMSIG00000005424) Chil4 (ENSMSIG00000005364) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 702 Ppp1r14c (ENSNGAG00000014875) ENSNGAG00000016984 ##22 ENSNGAG00000017905 Lrp11 (ENSNGAG00000019568) Pcmt1 (ENSNGAG00000000477) Nup43 (ENSNGAG00000001085) Lats1 (ENSNGAG00000002110) ENSNGAG00000004438 Ginm1 (ENSNGAG00000006947) Ppil4 (ENSNGAG00000008801) Zc3h12d (ENSNGAG00000010502) Tab2 (ENSNGAG00000011601) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 12 TXNDC17 (ENSSVLG00005013668) ENSSVLG00005013558 KIAA0753 (ENSSVLG00005013510) PITPNM3 (ENSSVLG00005013384) PIMREG (ENSSVLG00005013051) AIPL1 (ENSSVLG00005012617) WSCD1 (ENSSVLG00005012425) NLRP1 (ENSSVLG00005011558) ENSSVLG00005011435 MIS12 (ENSSVLG00005011416) DERL2 (ENSSVLG00005011333) DHX33 (ENSSVLG00005011159) ENSSVLG00005011043 RPAIN (ENSSVLG00005010858) NUP88 (ENSSVLG00005010768) ENSSVLG00005010734 #22 RABEP1 (ENSSVLG00005013880) ENSSVLG00005013751 ENSSVLG00005013649 SCIMP (ENSSVLG00005013585) ENSSVLG00005013440 ENSSVLG00005013408 ZNF232 (ENSSVLG00005013374) ZFP3 (ENSSVLG00005013333) ENSSVLG00005013210 KIF1C (ENSSVLG00005013143) INCA1 (ENSSVLG00005013041) CAMTA2 (ENSSVLG00005012676) ENSSVLG00005012585 SPAG7 (ENSSVLG00005012361) ENO3 (ENSSVLG00005012264) Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Arctic ground squirrel DUPLICATION Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 376 ENSUPAG00010011754 ENSUPAG00010011764 #22 KIAA1143 (ENSUPAG00010011777) ENSUPAG00010011781 ZNF35 (ENSUPAG00010011784) ZNF197 (ENSUPAG00010011790) ZNF660 (ENSUPAG00010011799) ZKSCAN7 (ENSUPAG00010011801) ENSUPAG00010011824 ENSUPAG00010011836 TCAIM (ENSUPAG00010011866) TOPAZ1 (ENSUPAG00010011889) ABHD5 (ENSUPAG00010011940) ANO10 (ENSUPAG00010011968) SNRK (ENSUPAG00010012029) POMGNT2 (ENSUPAG00010012035) GASK1A (ENSUPAG00010012037) Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 241 EPB41L4A (ENSUPAG00010021876) APC (ENSUPAG00010021893) SRP19 (ENSUPAG00010021920) ENSUPAG00010021923 REEP5 (ENSUPAG00010021926) PKD2L2 (ENSUPAG00010021930) FAM13B (ENSUPAG00010021934) WNT8A (ENSUPAG00010021939) NME5 (ENSUPAG00010021941) ENSUPAG00010021946 #22 ENSUPAG00010021949 BRD8 (ENSUPAG00010021951) KIF20A (ENSUPAG00010021970) CDC23 (ENSUPAG00010021979) ENSUPAG00010021987 GFRA3 (ENSUPAG00010021988) CDC25C (ENSUPAG00010021991) ENSUPAG00010021998 FAM53C (ENSUPAG00010022019) KDM3B (ENSUPAG00010022021) EGR1 (ENSUPAG00010022030) ETF1 (ENSUPAG00010022032) HSPA9 (ENSUPAG00010022035) CTNNA1 (ENSUPAG00010022041) LRRTM2 (ENSUPAG00010022043) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 10 APPBP2 (ENSOCUG00000009419) ENSOCUG00000029614 BCAS3 (ENSOCUG00000010794) TBX2 (ENSOCUG00000023498) TBX4 (ENSOCUG00000010834) BRIP1 (ENSOCUG00000006683) INTS2 (ENSOCUG00000006693) MED13 (ENSOCUG00000006709) ENSOCUG00000021230 RPS6KB1 (ENSOCUG00000004600) TUBD1 (ENSOCUG00000013772) VMP1 (ENSOCUG00000004210) PTRH2 (ENSOCUG00000023345) CLTC (ENSOCUG00000016413) DHX40 (ENSOCUG00000038496) ENSOCUG00000031327 #22 ENSOCUG00000035846 YPEL2 (ENSOCUG00000020978) GDPD1 (ENSOCUG00000013113) SMG8 (ENSOCUG00000002350) PRR11 (ENSOCUG00000002337) ENSOCUG00000002334 TRIM37 (ENSOCUG00000002326) PPM1E (ENSOCUG00000026526) ENSOCUG00000002269 ENSOCUG00000025769 TEX14 (ENSOCUG00000009775) ENSOCUG00000009757 MTMR4 (ENSOCUG00000009743) HSF5 (ENSOCUG00000009733) RNF43 (ENSOCUG00000009729) Rabbit MODERN SPECIES 5 PFN2 (ENSOCUG00000006059) RNF13 (ENSOCUG00000006055) ENSOCUG00000026009 ANKUB1 (ENSOCUG00000002642) COMMD2 (ENSOCUG00000002638) WWTR1 (ENSOCUG00000013750) TM4SF4 (ENSOCUG00000013741) ENSOCUG00000022512 TM4SF1 (ENSOCUG00000027275) ENSOCUG00000003545 TM4SF18 (ENSOCUG00000003542) CP (ENSOCUG00000003535) HPS3 (ENSOCUG00000003526) HLTF (ENSOCUG00000003520) ENSOCUG00000003516 ENSOCUG00000007320 #22 CPA3 (ENSOCUG00000032097) CPB1 (ENSOCUG00000003084) AGTR1 (ENSOCUG00000025557) ENSOCUG00000026392 ENSOCUG00000021417 ZIC4 (ENSOCUG00000010959) ENSOCUG00000037397 PLSCR5 (ENSOCUG00000002500) ENSOCUG00000012892 ENSOCUG00000029550 ENSOCUG00000023944 PLSCR4 (ENSOCUG00000015564) PLOD2 (ENSOCUG00000001461) ENSOCUG00000038414 DIPK2A (ENSOCUG00000012616) Tree shrew DUPLICATION Tree shrew MODERN SPECIES 4470 CCR4 (ENSTBEG00000004629) ENSTBEG00000004866 ENSTBEG00000006455 #22 ENSTBEG00000006940 Tree shrew MODERN SPECIES 9542 ENSTBEG00000004358 #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Bushbaby MODERN SPECIES 158 SMAGP (ENSOGAG00000030770) DAZAP2 (ENSOGAG00000007977) POU6F1 (ENSOGAG00000007973) TFCP2 (ENSOGAG00000007969) CSRNP2 (ENSOGAG00000007966) LETMD1 (ENSOGAG00000007963) SLC11A2 (ENSOGAG00000000214) ENSOGAG00000000213 ENSOGAG00000009474 TMPRSS12 (ENSOGAG00000034766) ENSOGAG00000000212 ATF1 (ENSOGAG00000026029) DIP2B (ENSOGAG00000005189) LARP4 (ENSOGAG00000001415) ENSOGAG00000029433 ENSOGAG00000007391 #22 LIMA1 (ENSOGAG00000004671) CERS5 (ENSOGAG00000004668) COX14 (ENSOGAG00000004667) GPD1 (ENSOGAG00000004665) ENSOGAG00000004662 ASIC1 (ENSOGAG00000004661) ENSOGAG00000015732 LCP1 (ENSOGAG00000012043) CPB2 (ENSOGAG00000012039) ZC3H13 (ENSOGAG00000012032) SIAH3 (ENSOGAG00000033062) CBY2 (ENSOGAG00000029836) ENSOGAG00000016040 COG3 (ENSOGAG00000016033) SLC25A30 (ENSOGAG00000011571) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 213 ENSMNEG00000040231 ENSMNEG00000042414 ENSMNEG00000030462 ZNF91 (ENSMNEG00000012114) ENSMNEG00000037823 #22 ZNF681 (ENSMNEG00000030468) ENSMNEG00000010325 ENSMNEG00000010773 ENSMNEG00000027108 ZNF254 (ENSMNEG00000034353) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1170 ENSRBIG00000034522 ENSRBIG00000034838 #22 ZNF726 (ENSRBIG00000039359) ENSRBIG00000037060 ENSRBIG00000035070 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1 ENSRROG00000005953 #22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Odontoceti DUPLICATION Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.a #22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.a #22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000154277.a.b.b.n.k.b ENSGT00940000162643.b ENSGT00940000153313.C.a ENSGT00940000160459 ENSGT00940000162262 ENSGT00940000159479 ENSGT00510000048066 ENSGT00870000136506 ENSGT00940000160940 ENSGT00940000160559.f ENSGT00390000008621 ENSGT00940000160559.e ENSGT00940000163245 ENSGT00940000162070 ENSGT00940000162389 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.a #22 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000159438 ENSGT00390000012692 ENSGT00940000160145.b ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000157847 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000155170 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155614 ENSGT00940000159667 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00980000198762 ENSGT00940000162496 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162389 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.a #22 ENSGT00940000162070 ENSGT00940000163245 ENSGT00940000160559.e ENSGT00390000008621 ENSGT00940000160559.f ENSGT00940000160940 ENSGT00870000136506 ENSGT00510000048066 ENSGT00940000159479 ENSGT00940000162262 ENSGT00940000160459 ENSGT00940000153313.C.a ENSGT00940000162643.b ENSGT00940000154277.a.b.b.n.k.b ENSGT00940000153763.a Beluga whale MODERN SPECIES 114 HUWE1 (ENSDLEG00000010517) HSD17B10 (ENSDLEG00000009630) RIBC1 (ENSDLEG00000009583) SMC1A (ENSDLEG00000009492) IQSEC2 (ENSDLEG00000008870) KDM5C (ENSDLEG00000008448) TSPYL2 (ENSDLEG00000008358) GPR173 (ENSDLEG00000008337) ENSDLEG00000008319 #22 MAGED1 (ENSDLEG00000008255) GSPT2 (ENSDLEG00000008211) Narwhal MODERN SPECIES 309 FGD1 (ENSMMNG00015015565) TSR2 (ENSMMNG00015015553) WNK3 (ENSMMNG00015015519) FAM120C (ENSMMNG00015015477) PHF8 (ENSMMNG00015015410) HUWE1 (ENSMMNG00015015224) HSD17B10 (ENSMMNG00015015147) ENSMMNG00015015125 SMC1A (ENSMMNG00015015063) IQSEC2 (ENSMMNG00015014978) KDM5C (ENSMMNG00015014882) KANTR (ENSMMNG00015014864) TSPYL2 (ENSMMNG00015014852) GPR173 (ENSMMNG00015014842) ENSMMNG00015014814 ENSMMNG00015014800 #22 MAGED1 (ENSMMNG00015014774) GSPT2 (ENSMMNG00015014759) ENSMMNG00015014742 BMP15 (ENSMMNG00015014720) ENSMMNG00015014703 SHROOM4 (ENSMMNG00015014668) DGKK (ENSMMNG00015014617) ENSMMNG00015014590 AKAP4 (ENSMMNG00015014564) ENSMMNG00015014557 ENSMMNG00015014545 CLCN5 (ENSMMNG00015014509) USP27X (ENSMMNG00015014494) PAGE4 (ENSMMNG00015014484) PPP1R3F (ENSMMNG00015014470) Vaquita MODERN SPECIES 34 ENSPSNG00000013438 ENSPSNG00000013583 AKAP4 (ENSPSNG00000013674) CCNB3 (ENSPSNG00000013841) DGKK (ENSPSNG00000013923) SHROOM4 (ENSPSNG00000014309) ENSPSNG00000014387 BMP15 (ENSPSNG00000014443) ENSPSNG00000014492 ENSPSNG00000014522 ENSPSNG00000014613 ENSPSNG00000014642 GSPT2 (ENSPSNG00000014658) MAGED1 (ENSPSNG00000014702) ENSPSNG00000014799 ENSPSNG00000014914 #22 ENSPSNG00000014941 ENSPSNG00000015015 GPR173 (ENSPSNG00000015090) TSPYL2 (ENSPSNG00000015108) KDM5C (ENSPSNG00000015193) IQSEC2 (ENSPSNG00000015666) SMC1A (ENSPSNG00000016208) ENSPSNG00000016407 HSD17B10 (ENSPSNG00000016498) HUWE1 (ENSPSNG00000016681) PHF8 (ENSPSNG00000016986) FAM120C (ENSPSNG00000017250) WNK3 (ENSPSNG00000017347) TSR2 (ENSPSNG00000017417) FGD1 (ENSPSNG00000017466) Sperm whale MODERN SPECIES 536 ENSPCTG00005010766 #22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.b #22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.b #22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160543 ENSGT01030000234543.B.e.b ENSGT00940000158794 ENSGT00940000158210 ENSGT00390000000984 ENSGT00940000158394 ENSGT00390000014082.b ENSGT00530000063713.a ENSGT00940000157470 ENSGT00940000161078 ENSGT00390000004181 ENSGT00390000014794.b ENSGT00940000159995 ENSGT00940000153335.a.b ENSGT00940000154939 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.b #22 ENSGT00390000013594 ENSGT01100000266036 ENSGT00940000156416 ENSGT00900000143228 ENSGT00950000183033.a.a.d ENSGT00390000014563.a.b ENSGT00940000156276 ENSGT00940000157838 ENSGT00940000153062.A.a.a.b ENSGT00940000164892.a ENSGT00940000160822 ENSGT01050000244968.d ENSGT00940000158499 ENSGT00940000153195.B ENSGT00940000161962 Vaquita MODERN SPECIES 7 CTNNA3 (ENSPSNG00000015816) ENSPSNG00000015753 ENSPSNG00000015687 REEP3 (ENSPSNG00000015636) JMJD1C (ENSPSNG00000015259) NRBF2 (ENSPSNG00000015149) EGR2 (ENSPSNG00000015063) ADO (ENSPSNG00000015035) ZNF365 (ENSPSNG00000014971) RTKN2 (ENSPSNG00000014902) ARID5B (ENSPSNG00000014736) CABCOCO1 (ENSPSNG00000014615) TMEM26 (ENSPSNG00000014493) RHOBTB1 (ENSPSNG00000014292) CDK1 (ENSPSNG00000014155) ENSPSNG00000014083 #22 ANK3 (ENSPSNG00000012368) CCDC6 (ENSPSNG00000012111) SLC16A9 (ENSPSNG00000012014) ENSPSNG00000011967 FAM13C (ENSPSNG00000011038) PHYHIPL (ENSPSNG00000010830) BICC1 (ENSPSNG00000010653) HNRNPF (ENSPSNG00000010529) FXYD4 (ENSPSNG00000010413) ENSPSNG00000010387 RASGEF1A (ENSPSNG00000010125) CSGALNACT2 (ENSPSNG00000010027) RET (ENSPSNG00000009662) BMS1 (ENSPSNG00000020037) ENSPSNG00000020012 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160543 ENSGT01030000234543.B.e.b ENSGT00940000158794 ENSGT00940000158210 ENSGT00390000000984 ENSGT00940000158394 ENSGT00390000014082.b ENSGT00530000063713.a ENSGT00940000157470 ENSGT00940000161078 ENSGT00390000004181 ENSGT00390000014794.b ENSGT00940000159995 ENSGT00940000153335.a.b ENSGT00940000154939 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.b #22 ENSGT00390000013594 ENSGT01100000266036 ENSGT00940000156416 ENSGT00950000183033.a.a.d ENSGT00390000014563.a.b ENSGT00940000156276 ENSGT00940000157251.gb.a.a ENSGT00940000157838 ENSGT00940000164892.a ENSGT00940000160822 ENSGT01050000244968.d ENSGT00940000158499 ENSGT00940000153195.B ENSGT00940000161962 ENSGT00940000153505.a.b.a.a Narwhal MODERN SPECIES 311 CTNNA3 (ENSMMNG00015016145) ENSMMNG00015016066 REEP3 (ENSMMNG00015016031) JMJD1C (ENSMMNG00015015904) NRBF2 (ENSMMNG00015015806) EGR2 (ENSMMNG00015015758) ADO (ENSMMNG00015015748) ZNF365 (ENSMMNG00015015720) RTKN2 (ENSMMNG00015015683) ARID5B (ENSMMNG00015015623) CABCOCO1 (ENSMMNG00015015573) TMEM26 (ENSMMNG00015015516) RHOBTB1 (ENSMMNG00015015499) CDK1 (ENSMMNG00015015475) ENSMMNG00015015458 ENSMMNG00015015447 #22 ANK3 (ENSMMNG00015015095) CCDC6 (ENSMMNG00015014903) ENSMMNG00015014890 SLC16A9 (ENSMMNG00015014872) FAM13C (ENSMMNG00015014829) PHYHIPL (ENSMMNG00015014782) ENSMMNG00015019259 BICC1 (ENSMMNG00015019163) ENSMMNG00015019131 HNRNPF (ENSMMNG00015019119) ENSMMNG00015019105 RASGEF1A (ENSMMNG00015019069) CSGALNACT2 (ENSMMNG00015019032) RET (ENSMMNG00015018914) BMS1 (ENSMMNG00015018851) Beluga whale MODERN SPECIES 56 REEP3 (ENSDLEG00000011032) JMJD1C (ENSDLEG00000011059) NRBF2 (ENSDLEG00000011181) EGR2 (ENSDLEG00000011204) ADO (ENSDLEG00000011209) ZNF365 (ENSDLEG00000011279) RTKN2 (ENSDLEG00000011317) ARID5B (ENSDLEG00000011338) CABCOCO1 (ENSDLEG00000011387) TMEM26 (ENSDLEG00000011417) ENSDLEG00000011441 RHOBTB1 (ENSDLEG00000011454) CDK1 (ENSDLEG00000011518) ANK3 (ENSDLEG00000011908) ENSDLEG00000017045 #22 CCDC6 (ENSDLEG00000017057) SLC16A9 (ENSDLEG00000017063) FAM13C (ENSDLEG00000006892) PHYHIPL (ENSDLEG00000006905) ENSDLEG00000006911 BICC1 (ENSDLEG00000006916) ENSDLEG00000006926 HNRNPF (ENSDLEG00000006928) SCN5A (ENSDLEG00000006948) SCN10A (ENSDLEG00000007074) SCN11A (ENSDLEG00000007273) WDR48 (ENSDLEG00000007687) GORASP1 (ENSDLEG00000007913) TTC21A (ENSDLEG00000008333) CSRNP1 (ENSDLEG00000009935) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 lion MODERN SPECIES 10 EHF (ENSPLOG00000006746) APIP (ENSPLOG00000006818) PDHX (ENSPLOG00000006867) CD44 (ENSPLOG00000007114) SLC1A2 (ENSPLOG00000007683) PAMR1 (ENSPLOG00000008067) FJX1 (ENSPLOG00000008243) TRIM44 (ENSPLOG00000008259) LDLRAD3 (ENSPLOG00000008283) COMMD9 (ENSPLOG00000008326) PRR5L (ENSPLOG00000008389) TRAF6 (ENSPLOG00000008425) RAG1 (ENSPLOG00000008443) RAG2 (ENSPLOG00000008456) ENSPLOG00000008466 ENSPLOG00000008507 #22 LRRC4C (ENSPLOG00000008513) API5 (ENSPLOG00000008595) TTC17 (ENSPLOG00000008790) HSD17B12 (ENSPLOG00000008903) ALKBH3 (ENSPLOG00000009033) C11orf96 (ENSPLOG00000009053) ACCSL (ENSPLOG00000009077) ACCS (ENSPLOG00000009169) EXT2 (ENSPLOG00000009265) ALX4 (ENSPLOG00000009372) CD82 (ENSPLOG00000009416) TSPAN18 (ENSPLOG00000009462) TP53I11 (ENSPLOG00000009507) PRDM11 (ENSPLOG00000009558) SYT13 (ENSPLOG00000009590) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 American mink MODERN SPECIES 168 OR5K4 (ENSNVIG00000016556) OR5K3 (ENSNVIG00000016563) ENSNVIG00000016574 CLDND1 (ENSNVIG00000016585) GPR15 (ENSNVIG00000016647) CPOX (ENSNVIG00000016650) ST3GAL6 (ENSNVIG00000016667) DCBLD2 (ENSNVIG00000016789) ENSNVIG00000016833 #22 COL8A1 (ENSNVIG00000016844) CC026 (ENSNVIG00000016879) FILIP1L (ENSNVIG00000016962) ENSNVIG00000017005 ENSNVIG00000017014 TBC1D23 (ENSNVIG00000017076) ENSNVIG00000017150 TOMM70 (ENSNVIG00000017175) LNP1 (ENSNVIG00000017190) TMEM45A (ENSNVIG00000017210) ENSNVIG00000017226 ADGRG7 (ENSNVIG00000017236) TFG (ENSNVIG00000017297) ENSNVIG00000017433 IMPG2 (ENSNVIG00000017469) Canidae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000154428.a ENSGT00940000154428.b ENSGT00940000158236 ENSGT00940000155393.d ENSGT00940000155683 ENSGT00530000063692.b ENSGT00950000183154.a ENSGT00390000011642 ENSGT00940000154481.a.b.bc ENSGT00940000158133 ENSGT00390000012924.a ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000013337 ENSGT00940000158401 ENSGT00730000111244 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 ENSGT00940000157477 ENSGT00940000157723 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c ENSGT00940000161275 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00390000004803 ENSGT00900000143690 ENSGT00940000157684 ENSGT00940000156638 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156283 ENSGT00940000161388 Red fox MODERN SPECIES 26 CNKSR3 (ENSVVUG00000007515) IPCEF1 (ENSVVUG00000007491) OPRM1 (ENSVVUG00000007466) RGS17 (ENSVVUG00000007424) FBXO5 (ENSVVUG00000007414) ENSVVUG00000007408 VIP (ENSVVUG00000007395) MYCT1 (ENSVVUG00000007392) ENSVVUG00000006984 ENSVVUG00000006396 ESR1 (ENSVVUG00000006190) CCDC170 (ENSVVUG00000006168) ARMT1 (ENSVVUG00000006134) RMND1 (ENSVVUG00000006114) ZBTB2 (ENSVVUG00000006110) ENSVVUG00000006108 #22 AKAP12 (ENSVVUG00000006099) ENSVVUG00000005367 ENSVVUG00000005287 PLEKHG1 (ENSVVUG00000005233) IYD (ENSVVUG00000005224) PPP1R14C (ENSVVUG00000005202) ENSVVUG00000005195 ENSVVUG00000005191 ENSVVUG00000005187 ENSVVUG00000005185 PCMT1 (ENSVVUG00000005178) NUP43 (ENSVVUG00000005168) LATS1 (ENSVVUG00000005155) KATNA1 (ENSVVUG00000005135) GINM1 (ENSVVUG00000005128) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154428.a ENSGT00940000154428.b ENSGT00940000158236 ENSGT00940000155393.d ENSGT00940000155683 ENSGT00530000063692.b ENSGT00950000183154.a ENSGT00390000011642 ENSGT00940000154481.a.b.bc ENSGT00940000158133 ENSGT00390000012924.a ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000013337 ENSGT00940000158401 ENSGT00730000111244 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 ENSGT00940000157477 ENSGT00940000157723 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b ENSGT00390000015489.q.a.f.a ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c ENSGT00940000161275 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00390000004803 ENSGT00900000143690 ENSGT00940000157684 ENSGT00940000156638 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156283 Dog MODERN SPECIES 144 BMX (ENSCAFG00845029748) PIR (ENSCAFG00845029590) VEGFD (ENSCAFG00845029554) ASB11 (ENSCAFG00845029445) ASB9 (ENSCAFG00845029376) MOSPD2 (ENSCAFG00845029311) GLRA2 (ENSCAFG00845029193) FANCB (ENSCAFG00845029118) GSTP1 (ENSCAFG00845029100) GPM6B (ENSCAFG00845029037) ENSCAFG00845029012 OFD1 (ENSCAFG00845028661) TRAPPC2 (ENSCAFG00845028547) RAB9A (ENSCAFG00845028510) TCEANC (ENSCAFG00845028494) ENSCAFG00845028459 #22 EGFL6 (ENSCAFG00845028422) TLR8 (ENSCAFG00845028394) ENSCAFG00845028351 TLR7 (ENSCAFG00845028303) PRPS2 (ENSCAFG00845028237) ENSCAFG00845028207 FRMPD4 (ENSCAFG00845027637) ENSCAFG00845027491 MSL3 (ENSCAFG00845027243) ENSCAFG00845027078 ENSCAFG00845026844 ARHGAP6 (ENSCAFG00845026713) HCCS (ENSCAFG00845026624) MID1 (ENSCAFG00845026369) CLCN4 (ENSCAFG00845026001) Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 138 ANAPC4 (ENSCAFG00020027256) ENSCAFG00020027253 ENSCAFG00020027252 PI4K2B (ENSCAFG00020027250) SEPSECS (ENSCAFG00020027249) LGI2 (ENSCAFG00020027248) CCDC149 (ENSCAFG00020027247) SOD3 (ENSCAFG00020027246) DHX15 (ENSCAFG00020027245) ENSCAFG00020027244 PPARGC1A (ENSCAFG00020027242) GBA3 (ENSCAFG00020027241) ADGRA3 (ENSCAFG00020027238) KCNIP4 (ENSCAFG00020027237) PACRGL (ENSCAFG00020027236) ENSCAFG00020027235 #22 SLIT2 (ENSCAFG00020027191) ENSCAFG00020027105 ENSCAFG00020027097 NCAPG (ENSCAFG00020027090) ENSCAFG00020027087 DCAF16 (ENSCAFG00020027085) CTBP1 (ENSCAFG00020027072) SPON2 (ENSCAFG00020027066) ENSCAFG00020027065 ENSCAFG00020027063 ENSCAFG00020027061 FGFRL1 (ENSCAFG00020027059) SLC26A1 (ENSCAFG00020027054) IDUA (ENSCAFG00020027044) DGKQ (ENSCAFG00020027034) Dingo MODERN SPECIES 217 ENSCAFG00020003498 ASB11 (ENSCAFG00020003486) ASB9 (ENSCAFG00020003474) ENSCAFG00020003473 MOSPD2 (ENSCAFG00020003148) FANCB (ENSCAFG00020003123) GLRA2 (ENSCAFG00020003077) GEMIN8 (ENSCAFG00020003054) GPM6B (ENSCAFG00020003028) ENSCAFG00020003022 OFD1 (ENSCAFG00020002846) ENSCAFG00020002815 RAB9A (ENSCAFG00020002812) TCEANC (ENSCAFG00020002804) EGFL6 (ENSCAFG00020002796) ENSCAFG00020002790 #22 ENSCAFG00020002783 TLR8 (ENSCAFG00020002780) TLR7 (ENSCAFG00020002778) PRPS2 (ENSCAFG00020002638) ENSCAFG00020002627 FRMPD4 (ENSCAFG00020002590) ENSCAFG00020002578 MSL3 (ENSCAFG00020002360) ENSCAFG00020002352 AMELX (ENSCAFG00020002340) ARHGAP6 (ENSCAFG00020002309) HCCS (ENSCAFG00020002285) MID1 (ENSCAFG00020002249) CLCN4 (ENSCAFG00020002224) WWC3 (ENSCAFG00020002166) Dingo MODERN SPECIES 125 ENSCAFG00020014955 RGS17 (ENSCAFG00020014939) MTRF1L (ENSCAFG00020014937) FBXO5 (ENSCAFG00020014935) VIP (ENSCAFG00020014925) MYCT1 (ENSCAFG00020014923) ENSCAFG00020014881 ENSCAFG00020014804 ESR1 (ENSCAFG00020014707) CCDC170 (ENSCAFG00020014704) ENSCAFG00020014702 ENSCAFG00020014700 RMND1 (ENSCAFG00020014697) ZBTB2 (ENSCAFG00020014696) AKAP12 (ENSCAFG00020014695) ENSCAFG00020014694 #22 ENSCAFG00020014133 ENSCAFG00020014068 PLEKHG1 (ENSCAFG00020014055) IYD (ENSCAFG00020014043) PPP1R14C (ENSCAFG00020014021) ENSCAFG00020014013 ENSCAFG00020014007 LRP11 (ENSCAFG00020013981) PCMT1 (ENSCAFG00020013908) NUP43 (ENSCAFG00020013901) LATS1 (ENSCAFG00020013895) KATNA1 (ENSCAFG00020013829) GINM1 (ENSCAFG00020013825) PPIL4 (ENSCAFG00020013550) ENSCAFG00020013539 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Common shrew MODERN SPECIES 12192 ENSSARG00000010054 #22 Hedgehog MODERN SPECIES 1937 DHDDS (ENSEEUG00000008324) ENSEEUG00000008466 #22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156529 ENSGT00940000158412 ENSGT00390000004173 ENSGT00940000159599 ENSGT00940000161879 ENSGT00720000109135 ENSGT00620000087993.a.b ENSGT00940000157260 ENSGT00520000055567.b ENSGT00940000157740 ENSGT00940000164781 ENSGT00500000045882 ENSGT00940000163172 ENSGT00940000153295.a ENSGT00390000007879 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 ENSGT00940000159314 ENSGT00940000155194 ENSGT00390000013174 ENSGT00940000156585 ENSGT01090000260040.b.b.b.a ENSGT00950000183172.B ENSGT00390000004191 ENSGT00390000015719.c ENSGT00940000155361 ENSGT00390000016565 ENSGT00390000017418 ENSGT00940000160747 ENSGT00940000156338 ENSGT00950000182900.B ENSGT00390000007371 Tenrec DUPLICATION Tenrec MODERN SPECIES 9254 ENSETEG00000007052 #22 Tenrec MODERN SPECIES 1830 DHDDS (ENSETEG00000013567) ENSETEG00000013571 #22