Murinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22
Rat	DUPLICATION
Rat	DUPLICATION
Rat	MODERN SPECIES	15	LOC108351043 (ENSRNOG00000054734) #7	E130218I03Rik (ENSRNOG00000065422) #8	Zfp593 (ENSRNOG00000016392) #9	Cnksr1 (ENSRNOG00000022838) #10	Catsper4 (ENSRNOG00000016312) #11	Umodl (ENSRNOG00000037191) #12	Cep85 (ENSRNOG00000016249) #13	Sh3bgrl3 (ENSRNOG00000015967) #14	Ubxn11 (ENSRNOG00000015476) #15	LOC100360087 (ENSRNOG00000064482) #16	Cd52 (ENSRNOG00000015403) #17	Crybg2 (ENSRNOG00000057957) #18	Zfp683 (ENSRNOG00000065788) #19	Lin28a (ENSRNOG00000069459) #20	Dhdds (ENSRNOG00000014665) #21	Hmgn2 (ENSRNOG00000051615) #22	LOC683456 (ENSRNOG00000070457) #23	Rps6ka1 (ENSRNOG00000042411) #24	LOC120103001 (ENSRNOG00000068341) #25	Arid1a (ENSRNOG00000006137) #26	Pigv (ENSRNOG00000000121) #27	Zdhhc18 (ENSRNOG00000058156) #28	Sfn (ENSRNOG00000033153) #29	Gpn2 (ENSRNOG00000007083) #30	Gpatch3 (ENSRNOG00000007097) #31	ENSRNOG00000066253 #32	Nr0b2 (ENSRNOG00000007229) #33	Nudc (ENSRNOG00000051720) #34	AC118963.1 (ENSRNOG00000049922) #35	Kdf1 (ENSRNOG00000055933) #36	ENSRNOG00000068236 #37
Rat	MODERN SPECIES	7	Spock3 (ENSRNOG00000029903)	Anxa10 (ENSRNOG00000014339)	LOC120097562 (ENSRNOG00000056947)	Palldl1 (ENSRNOG00000010107)	Ddx60 (ENSRNOG00000059097)	Cbr4 (ENSRNOG00000024411)	Sh3rf1 (ENSRNOG00000010358)	Nek1 (ENSRNOG00000010418)	Clcn3 (ENSRNOG00000010682)	Hpf1 (ENSRNOG00000011293)	LOC100360260 (ENSRNOG00000060395)	Ppia-ps13 (ENSRNOG00000062799)	Mfap3l (ENSRNOG00000011775)	Aadat (ENSRNOG00000011861)	ENSRNOG00000063109	Hmgn2-ps4 (ENSRNOG00000066721) ##22	Galntl6 (ENSRNOG00000067282)	Galnt7 (ENSRNOG00000012037)	Hmgb2 (ENSRNOG00000013167)	Sap30 (ENSRNOG00000013218)	Scrg1 (ENSRNOG00000069516)	ENSRNOG00000069425	Hand2 (ENSRNOG00000060448)	LOC103694242 (ENSRNOG00000007402)	Fbxo8 (ENSRNOG00000010502)	ENSRNOG00000062690	Cep44 (ENSRNOG00000010566)	Hpgd (ENSRNOG00000010610)	Hmgb1 (ENSRNOG00000058908)	Glra3 (ENSRNOG00000049792)	ENSRNOG00000063491
Rat	MODERN SPECIES	13	Bfsp1 (ENSRNOG00000005707)	Pcsk2 (ENSRNOG00000005438)	Otor (ENSRNOG00000028721)	Snrpb2 (ENSRNOG00000004967)	Kif16b (ENSRNOG00000004951)	ENSRNOG00000062960	Flrt3 (ENSRNOG00000004874)	Macrod2 (ENSRNOG00000050784)	Sel1l2 (ENSRNOG00000004852)	Ndufaf5 (ENSRNOG00000004784)	Esf1 (ENSRNOG00000004777)	Tasp1 (ENSRNOG00000004493)	ENSRNOG00000068011	Ism1 (ENSRNOG00000063262)	Sptlc3 (ENSRNOG00000004443)	AABR07053884.1 (ENSRNOG00000030601) ##22	ENSRNOG00000066288	ENSRNOG00000067830	Btbd3 (ENSRNOG00000008088)	Jag1 (ENSRNOG00000007443)	Slx4ip (ENSRNOG00000007430)	Gm56451 (ENSRNOG00000067094)	Mkks (ENSRNOG00000006705)	Snap25 (ENSRNOG00000006037)	Ankef1 (ENSRNOG00000005792)	AABR07053830.1 (ENSRNOG00000055829)	Pak5 (ENSRNOG00000005509)	Lamp5 (ENSRNOG00000005457)	Plcb4 (ENSRNOG00000033119)	Plcb1 (ENSRNOG00000004810)	Tmx4 (ENSRNOG00000024852)
Mus	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	2	MGP_CAROLIEiJ_G0016274	Flt4 (MGP_CAROLIEiJ_G0016275)	Scgb3a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016276)	Cnot6 (MGP_CAROLIEiJ_G0016277)	Gfpt2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016278)	Mapk9 (MGP_CAROLIEiJ_G0016279)	Rasgef1c (MGP_CAROLIEiJ_G0016280)	Rnf130 (MGP_CAROLIEiJ_G0016281)	Tbc1d9b (MGP_CAROLIEiJ_G0016282)	Mrnip (MGP_CAROLIEiJ_G0016283)	Sqstm1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016284)	Mgat4b (MGP_CAROLIEiJ_G0016285)	Ltc4s (MGP_CAROLIEiJ_G0016286)	Maml1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016287)	Canx (MGP_CAROLIEiJ_G0016288)	MGP_CAROLIEiJ_G0016289 #22	MGP_CAROLIEiJ_G0016290	MGP_CAROLIEiJ_G0016291	Rufy1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016292)	Adamts2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016293)	Zfp354c (MGP_CAROLIEiJ_G0016294)	Zfp879 (MGP_CAROLIEiJ_G0016295)	Grm6 (MGP_CAROLIEiJ_G0016296)	Zfp454 (MGP_CAROLIEiJ_G0016297)	Zfp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016298)	Zfp354b (MGP_CAROLIEiJ_G0016299)	4933414I15Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0016300)	Prop1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016301)	Or1ad6 (MGP_CAROLIEiJ_G0016302)	MGP_CAROLIEiJ_G0016303	Or1ad8 (MGP_CAROLIEiJ_G0016304)
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22
Mouse	MODERN SPECIES	17	Hmgxb4 (ENSMUSG00000034518)	Isx (ENSMUSG00000031621)	Large1 (ENSMUSG00000004383)	F2rl3 (ENSMUSG00000050147)	Sin3b (ENSMUSG00000031622)	Nwd1 (ENSMUSG00000048148)	Tmem38a (ENSMUSG00000031791)	Smim7 (ENSMUSG00000044600)	Med26 (ENSMUSG00000045248)	Slc35e1 (ENSMUSG00000019731)	Cherp (ENSMUSG00000052488)	1700030K09Rik (ENSMUSG00000052794)	Calr3 (ENSMUSG00000019732)	Eps15l1 (ENSMUSG00000006276)	Klf2 (ENSMUSG00000055148)	Hmgn2-ps (ENSMUSG00000070713) #22	Ap1m1 (ENSMUSG00000003033)	Fam32a (ENSMUSG00000003039)	Cib3 (ENSMUSG00000074240)	Hsh2d (ENSMUSG00000062007)	Rab8a (ENSMUSG00000003037)	Tpm4 (ENSMUSG00000031799)	Or1ab2 (ENSMUSG00000046881)	Or2z9 (ENSMUSG00000061561)	Or2z8 (ENSMUSG00000069998)	Cyp4f18 (ENSMUSG00000003484)	Zfp961 (ENSMUSG00000052446)	Zfp617 (ENSMUSG00000066880)	Zfp882 (ENSMUSG00000089857)	Zfp709 (ENSMUSG00000056019)	Fcho1 (ENSMUSG00000070000)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3218																ENSMSIG00000027765 #22	ENSMSIG00000027776	ENSMSIG00000027793	Tenm4 (ENSMSIG00000027807)	Nars2 (ENSMSIG00000027934)
spretus	MODERN SPECIES	8	Frs3 (MGP_SPRETEiJ_G0022622)	MGP_SPRETEiJ_G0022621	MGP_SPRETEiJ_G0022620	Tomm6 (MGP_SPRETEiJ_G0022619)	Usp49 (MGP_SPRETEiJ_G0022618)	MGP_SPRETEiJ_G0022617	Med20 (MGP_SPRETEiJ_G0022616)	Bysl (MGP_SPRETEiJ_G0022615)	Ccnd3 (MGP_SPRETEiJ_G0022614)	Taf8 (MGP_SPRETEiJ_G0022613)	MGP_SPRETEiJ_G0022612	1700001C19Rik (MGP_SPRETEiJ_G0022611)	Guca1a (MGP_SPRETEiJ_G0022610)	Guca1b (MGP_SPRETEiJ_G0022609)	Mrps10 (MGP_SPRETEiJ_G0022608)	MGP_SPRETEiJ_G0022607 #22	Ubr2 (MGP_SPRETEiJ_G0022606)	Prph2 (MGP_SPRETEiJ_G0022605)	Tbcc (MGP_SPRETEiJ_G0022604)	MGP_SPRETEiJ_G0022603	Bicral (MGP_SPRETEiJ_G0022602)	Rpl7l1 (MGP_SPRETEiJ_G0022601)	2310039H08Rik (MGP_SPRETEiJ_G0022600)	Ptcra (MGP_SPRETEiJ_G0022599)	Cnpy3 (MGP_SPRETEiJ_G0022598)	Gnmt (MGP_SPRETEiJ_G0022597)	Pex6 (MGP_SPRETEiJ_G0022596)	Ppp2r5d (MGP_SPRETEiJ_G0022595)	Mea1 (MGP_SPRETEiJ_G0022594)	Klhdc3 (MGP_SPRETEiJ_G0022593)	Rrp36 (MGP_SPRETEiJ_G0022592)