Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Muroidea DUPLICATION Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22 Rat DUPLICATION Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 15 LOC108351043 (ENSRNOG00000054734) #7 E130218I03Rik (ENSRNOG00000065422) #8 Zfp593 (ENSRNOG00000016392) #9 Cnksr1 (ENSRNOG00000022838) #10 Catsper4 (ENSRNOG00000016312) #11 Umodl (ENSRNOG00000037191) #12 Cep85 (ENSRNOG00000016249) #13 Sh3bgrl3 (ENSRNOG00000015967) #14 Ubxn11 (ENSRNOG00000015476) #15 LOC100360087 (ENSRNOG00000064482) #16 Cd52 (ENSRNOG00000015403) #17 Crybg2 (ENSRNOG00000057957) #18 Zfp683 (ENSRNOG00000065788) #19 Lin28a (ENSRNOG00000069459) #20 Dhdds (ENSRNOG00000014665) #21 Hmgn2 (ENSRNOG00000051615) #22 LOC683456 (ENSRNOG00000070457) #23 Rps6ka1 (ENSRNOG00000042411) #24 LOC120103001 (ENSRNOG00000068341) #25 Arid1a (ENSRNOG00000006137) #26 Pigv (ENSRNOG00000000121) #27 Zdhhc18 (ENSRNOG00000058156) #28 Sfn (ENSRNOG00000033153) #29 Gpn2 (ENSRNOG00000007083) #30 Gpatch3 (ENSRNOG00000007097) #31 ENSRNOG00000066253 #32 Nr0b2 (ENSRNOG00000007229) #33 Nudc (ENSRNOG00000051720) #34 AC118963.1 (ENSRNOG00000049922) #35 Kdf1 (ENSRNOG00000055933) #36 ENSRNOG00000068236 #37 Rat MODERN SPECIES 7 Spock3 (ENSRNOG00000029903) Anxa10 (ENSRNOG00000014339) LOC120097562 (ENSRNOG00000056947) Palldl1 (ENSRNOG00000010107) Ddx60 (ENSRNOG00000059097) Cbr4 (ENSRNOG00000024411) Sh3rf1 (ENSRNOG00000010358) Nek1 (ENSRNOG00000010418) Clcn3 (ENSRNOG00000010682) Hpf1 (ENSRNOG00000011293) LOC100360260 (ENSRNOG00000060395) Ppia-ps13 (ENSRNOG00000062799) Mfap3l (ENSRNOG00000011775) Aadat (ENSRNOG00000011861) ENSRNOG00000063109 Hmgn2-ps4 (ENSRNOG00000066721) ##22 Galntl6 (ENSRNOG00000067282) Galnt7 (ENSRNOG00000012037) Hmgb2 (ENSRNOG00000013167) Sap30 (ENSRNOG00000013218) Scrg1 (ENSRNOG00000069516) ENSRNOG00000069425 Hand2 (ENSRNOG00000060448) LOC103694242 (ENSRNOG00000007402) Fbxo8 (ENSRNOG00000010502) ENSRNOG00000062690 Cep44 (ENSRNOG00000010566) Hpgd (ENSRNOG00000010610) Hmgb1 (ENSRNOG00000058908) Glra3 (ENSRNOG00000049792) ENSRNOG00000063491 Rat MODERN SPECIES 13 Bfsp1 (ENSRNOG00000005707) Pcsk2 (ENSRNOG00000005438) Otor (ENSRNOG00000028721) Snrpb2 (ENSRNOG00000004967) Kif16b (ENSRNOG00000004951) ENSRNOG00000062960 Flrt3 (ENSRNOG00000004874) Macrod2 (ENSRNOG00000050784) Sel1l2 (ENSRNOG00000004852) Ndufaf5 (ENSRNOG00000004784) Esf1 (ENSRNOG00000004777) Tasp1 (ENSRNOG00000004493) ENSRNOG00000068011 Ism1 (ENSRNOG00000063262) Sptlc3 (ENSRNOG00000004443) AABR07053884.1 (ENSRNOG00000030601) ##22 ENSRNOG00000066288 ENSRNOG00000067830 Btbd3 (ENSRNOG00000008088) Jag1 (ENSRNOG00000007443) Slx4ip (ENSRNOG00000007430) Gm56451 (ENSRNOG00000067094) Mkks (ENSRNOG00000006705) Snap25 (ENSRNOG00000006037) Ankef1 (ENSRNOG00000005792) AABR07053830.1 (ENSRNOG00000055829) Pak5 (ENSRNOG00000005509) Lamp5 (ENSRNOG00000005457) Plcb4 (ENSRNOG00000033119) Plcb1 (ENSRNOG00000004810) Tmx4 (ENSRNOG00000024852) Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 2 MGP_CAROLIEiJ_G0016274 Flt4 (MGP_CAROLIEiJ_G0016275) Scgb3a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016276) Cnot6 (MGP_CAROLIEiJ_G0016277) Gfpt2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016278) Mapk9 (MGP_CAROLIEiJ_G0016279) Rasgef1c (MGP_CAROLIEiJ_G0016280) Rnf130 (MGP_CAROLIEiJ_G0016281) Tbc1d9b (MGP_CAROLIEiJ_G0016282) Mrnip (MGP_CAROLIEiJ_G0016283) Sqstm1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016284) Mgat4b (MGP_CAROLIEiJ_G0016285) Ltc4s (MGP_CAROLIEiJ_G0016286) Maml1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016287) Canx (MGP_CAROLIEiJ_G0016288) MGP_CAROLIEiJ_G0016289 #22 MGP_CAROLIEiJ_G0016290 MGP_CAROLIEiJ_G0016291 Rufy1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016292) Adamts2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016293) Zfp354c (MGP_CAROLIEiJ_G0016294) Zfp879 (MGP_CAROLIEiJ_G0016295) Grm6 (MGP_CAROLIEiJ_G0016296) Zfp454 (MGP_CAROLIEiJ_G0016297) Zfp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016298) Zfp354b (MGP_CAROLIEiJ_G0016299) 4933414I15Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0016300) Prop1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016301) Or1ad6 (MGP_CAROLIEiJ_G0016302) MGP_CAROLIEiJ_G0016303 Or1ad8 (MGP_CAROLIEiJ_G0016304) Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22 Mouse MODERN SPECIES 17 Hmgxb4 (ENSMUSG00000034518) Isx (ENSMUSG00000031621) Large1 (ENSMUSG00000004383) F2rl3 (ENSMUSG00000050147) Sin3b (ENSMUSG00000031622) Nwd1 (ENSMUSG00000048148) Tmem38a (ENSMUSG00000031791) Smim7 (ENSMUSG00000044600) Med26 (ENSMUSG00000045248) Slc35e1 (ENSMUSG00000019731) Cherp (ENSMUSG00000052488) 1700030K09Rik (ENSMUSG00000052794) Calr3 (ENSMUSG00000019732) Eps15l1 (ENSMUSG00000006276) Klf2 (ENSMUSG00000055148) Hmgn2-ps (ENSMUSG00000070713) #22 Ap1m1 (ENSMUSG00000003033) Fam32a (ENSMUSG00000003039) Cib3 (ENSMUSG00000074240) Hsh2d (ENSMUSG00000062007) Rab8a (ENSMUSG00000003037) Tpm4 (ENSMUSG00000031799) Or1ab2 (ENSMUSG00000046881) Or2z9 (ENSMUSG00000061561) Or2z8 (ENSMUSG00000069998) Cyp4f18 (ENSMUSG00000003484) Zfp961 (ENSMUSG00000052446) Zfp617 (ENSMUSG00000066880) Zfp882 (ENSMUSG00000089857) Zfp709 (ENSMUSG00000056019) Fcho1 (ENSMUSG00000070000) Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i #22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3218 ENSMSIG00000027765 #22 ENSMSIG00000027776 ENSMSIG00000027793 Tenm4 (ENSMSIG00000027807) Nars2 (ENSMSIG00000027934) spretus MODERN SPECIES 8 Frs3 (MGP_SPRETEiJ_G0022622) MGP_SPRETEiJ_G0022621 MGP_SPRETEiJ_G0022620 Tomm6 (MGP_SPRETEiJ_G0022619) Usp49 (MGP_SPRETEiJ_G0022618) MGP_SPRETEiJ_G0022617 Med20 (MGP_SPRETEiJ_G0022616) Bysl (MGP_SPRETEiJ_G0022615) Ccnd3 (MGP_SPRETEiJ_G0022614) Taf8 (MGP_SPRETEiJ_G0022613) MGP_SPRETEiJ_G0022612 1700001C19Rik (MGP_SPRETEiJ_G0022611) Guca1a (MGP_SPRETEiJ_G0022610) Guca1b (MGP_SPRETEiJ_G0022609) Mrps10 (MGP_SPRETEiJ_G0022608) MGP_SPRETEiJ_G0022607 #22 Ubr2 (MGP_SPRETEiJ_G0022606) Prph2 (MGP_SPRETEiJ_G0022605) Tbcc (MGP_SPRETEiJ_G0022604) MGP_SPRETEiJ_G0022603 Bicral (MGP_SPRETEiJ_G0022602) Rpl7l1 (MGP_SPRETEiJ_G0022601) 2310039H08Rik (MGP_SPRETEiJ_G0022600) Ptcra (MGP_SPRETEiJ_G0022599) Cnpy3 (MGP_SPRETEiJ_G0022598) Gnmt (MGP_SPRETEiJ_G0022597) Pex6 (MGP_SPRETEiJ_G0022596) Ppp2r5d (MGP_SPRETEiJ_G0022595) Mea1 (MGP_SPRETEiJ_G0022594) Klhdc3 (MGP_SPRETEiJ_G0022593) Rrp36 (MGP_SPRETEiJ_G0022592) Cricetidae DUPLICATION Cricetidae DUPLICATION Cricetidae DUPLICATION Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.a.a #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.a.a #22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Hoxc4 (ENSCGRG00001013095) Smug1 (ENSCGRG00001016146) Cbx5 (ENSCGRG00001019018) Hnrnpa1 (ENSCGRG00001013129) Nfe2 (ENSCGRG00001022465) Copz1 (ENSCGRG00001013501) ENSCGRG00001009425 Zfp385a (ENSCGRG00001015539) Itga5 (ENSCGRG00001017691) Gtsf1 (ENSCGRG00001013814) Gtsf2 (ENSCGRG00001016136) Nckap1l (ENSCGRG00001014386) Pde1b (ENSCGRG00001017137) Ppp1r1a (ENSCGRG00001013456) Glycam1 (ENSCGRG00001016454) ENSCGRG00001009407 #22 Tpp2 (ENSCGRG00001014893) Mettl21c (ENSCGRG00001014510) Tex30 (ENSCGRG00001013834) Poglut2 (ENSCGRG00001016741) Bivm (ENSCGRG00001013666) Ercc5 (ENSCGRG00001015414) Mettl21e (ENSCGRG00001014330) ENSCGRG00001010198 ENSCGRG00001019242 Gulp1 (ENSCGRG00001015646) Col3a1 (ENSCGRG00001015480) Col5a2 (ENSCGRG00001013733) Wdr75 (ENSCGRG00001013929) ENSCGRG00001016157 Slc40a1 (ENSCGRG00001014664) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.a.a #22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 17 ENSPEMG00000027805 ENSPEMG00000029460 ENSPEMG00000024866 ENSPEMG00000029053 ENSPEMG00000028491 ENSPEMG00000029100 ENSPEMG00000025935 Zc3h15 (ENSPEMG00000013093) Itgav (ENSPEMG00000015518) Fam171b (ENSPEMG00000026590) Zswim2 (ENSPEMG00000014220) ENSPEMG00000027679 Or5t5 (ENSPEMG00000025077) Or8k3b (ENSPEMG00000024781) Or8k40 (ENSPEMG00000025465) ENSPEMG00000024333 #22 Or5t7 (ENSPEMG00000029283) Or8k39 (ENSPEMG00000025808) Or8k38 (ENSPEMG00000031089) ENSPEMG00000026528 Or8k32 (ENSPEMG00000027876) ENSPEMG00000024690 ENSPEMG00000026822 ENSPEMG00000025620 ENSPEMG00000030206 ENSPEMG00000027513 ENSPEMG00000026543 Or8k23 (ENSPEMG00000028666) Or8k53 (ENSPEMG00000028082) Or8k22 (ENSPEMG00000028101) ENSPEMG00000027677 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.a.b #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.a.b #22 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 175 Klf8 (ENSCGRG00001019035) Ubqln2 (ENSCGRG00001016085) Kctd12b (ENSCGRG00001004538) Nbdy (ENSCGRG00001003251) ENSCGRG00001005909 Spin2c (ENSCGRG00001004592) ENSCGRG00001018471 ENSCGRG00001000978 ENSCGRG00001023144 Mycs (ENSCGRG00001000792) ENSCGRG00001003982 ENSCGRG00001000208 ENSCGRG00001010729 ENSCGRG00001007007 ENSCGRG00001022547 ENSCGRG00001007687 #22 ENSCGRG00001008851 ENSCGRG00001009060 ENSCGRG00001001286 Bmp15 (ENSCGRG00001012329) Shroom4 (ENSCGRG00001016683) Dgkk (ENSCGRG00001005491) Ccnb3 (ENSCGRG00001016975) Akap4 (ENSCGRG00001022827) ENSCGRG00001000058 Clcn5 (ENSCGRG00001017810) ENSCGRG00001006356 Ppp1r3f (ENSCGRG00001022530) Foxp3 (ENSCGRG00001021426) Ccdc22 (ENSCGRG00001023162) Cacna1f (ENSCGRG00001013804) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 188 Ehmt1 (ENSCGRG00001002035) Cacna1b (ENSCGRG00001018788) Pax8 (ENSCGRG00001017508) Psd4 (ENSCGRG00001010714) Il1rn (ENSCGRG00001005108) Il1f10 (ENSCGRG00001003880) Il36rn (ENSCGRG00001010036) Il36b (ENSCGRG00001008679) ENSCGRG00001008839 Il36a (ENSCGRG00001005772) ENSCGRG00001015320 Tbpl2 (ENSCGRG00001015310) ENSCGRG00001009248 ENSCGRG00001001542 ENSCGRG00001024843 ENSCGRG00001008614 #22 Spopl (ENSCGRG00001010346) Nxph2 (ENSCGRG00001024840) ENSCGRG00001024491 ENSCGRG00001009004 ENSCGRG00001012428 Kynu (ENSCGRG00001005556) Arhgap15 (ENSCGRG00001011371) ENSCGRG00001008381 Gtdc1 (ENSCGRG00001014426) ENSCGRG00001006690 Zeb2 (ENSCGRG00001003812) ENSCGRG00001000890 Acvr2a (ENSCGRG00001024754) Orc4 (ENSCGRG00001001352) Mbd5 (ENSCGRG00001001266) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.a.b #22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 2 Nenf (ENSPEMG00000004190) Ppp2r5a (ENSPEMG00000007353) Dtl (ENSPEMG00000009566) Ints7 (ENSPEMG00000014500) Lpgat1 (ENSPEMG00000016230) Nek2 (ENSPEMG00000011480) ENSPEMG00000031137 Slc30a1 (ENSPEMG00000002874) Rd3 (ENSPEMG00000020626) Traf5 (ENSPEMG00000022373) Rcor3 (ENSPEMG00000007457) Kcnh1 (ENSPEMG00000010427) Hhat (ENSPEMG00000001916) Sertad4 (ENSPEMG00000010470) Syt14 (ENSPEMG00000000255) ENSPEMG00000029864 #22 Utp25 (ENSPEMG00000000712) Irf6 (ENSPEMG00000020332) A130010J15Rik (ENSPEMG00000022277) Traf3ip3 (ENSPEMG00000021211) Hsd11b1 (ENSPEMG00000009872) G0s2 (ENSPEMG00000029839) Lamb3 (ENSPEMG00000017689) Camk1g (ENSPEMG00000010373) Plxna2 (ENSPEMG00000019686) Cd34 (ENSPEMG00000020063) Cd46 (ENSPEMG00000013673) Cr1l (ENSPEMG00000019441) Cr2 (ENSPEMG00000007875) Cricetidae DUPLICATION Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.b.a #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.b.a #22 Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 475 Rps6ka6 (ENSPEMG00000015736) Cylc1 (ENSPEMG00000017301) Pou3f4 (ENSPEMG00000003663) ENSPEMG00000025843 Gm6377 (ENSPEMG00000023246) ENSPEMG00000024318 Sh3bgrl (ENSPEMG00000027781) Brwd3 (ENSPEMG00000022305) ENSPEMG00000031328 Wmp (ENSPEMG00000027638) Tent5d (ENSPEMG00000031184) Chmp1b2 (ENSPEMG00000022335) Tbx22 (ENSPEMG00000023383) Itm2a (ENSPEMG00000023946) Gpr174 (ENSPEMG00000005742) ENSPEMG00000004229 #22 P2ry10b (ENSPEMG00000024642) P2ry10 (ENSPEMG00000023462) Lpar4 (ENSPEMG00000030102) Cysltr1 (ENSPEMG00000023120) ENSPEMG00000026887 ENSPEMG00000021468 Taf9b (ENSPEMG00000022582) ENSPEMG00000012872 Atp7a (ENSPEMG00000006787) ENSPEMG00000012083 Magt1 (ENSPEMG00000021915) ENSPEMG00000016457 Atrx (ENSPEMG00000022358) Fgf16 (ENSPEMG00000021916) ENSPEMG00000030780 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 475 Fthl17a (ENSPEMG00000019530) Tab3 (ENSPEMG00000019664) Gk (ENSPEMG00000019899) Tasl (ENSPEMG00000020160) Nr0b1 (ENSPEMG00000020271) ##33 ENSPEMG00000028874 ENSPEMG00000025328 ENSPEMG00000028142 ENSPEMG00000031097 ENSPEMG00000028040 Il1rapl1 (ENSPEMG00000029607) ENSPEMG00000019379 Tmem47 (ENSPEMG00000029078) ENSPEMG00000026179 Mageb16 (ENSPEMG00000023768) ENSPEMG00000028268 #22 Cfap47 (ENSPEMG00000022325) Fam47c (ENSPEMG00000030109) Prrg1 (ENSPEMG00000030282) 4930480E11Rik (ENSPEMG00000028721) ENSPEMG00000030251 ENSPEMG00000023943 ENSPEMG00000024840 ENSPEMG00000015794 ENSPEMG00000027218 ENSPEMG00000023281 Pbsn (ENSPEMG00000012253) Prkx (ENSPEMG00000030408) ENSPEMG00000030079 Tbl1x (ENSPEMG00000017480) ENSPEMG00000029386 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 475 ENSPEMG00000027777 Usp11 (ENSPEMG00000023892) Cdk16 (ENSPEMG00000021751) Uba1 (ENSPEMG00000007224) Rbm10 (ENSPEMG00000012165) ENSPEMG00000023255 ENSPEMG00000029454 Rgn (ENSPEMG00000022597) Jade3 (ENSPEMG00000009000) Rp2 (ENSPEMG00000012699) Slc9a7 (ENSPEMG00000022733) Chst7 (ENSPEMG00000022504) ENSPEMG00000001616 ENSPEMG00000001590 ENSPEMG00000025989 ENSPEMG00000026731 #22 Dipk2b (ENSPEMG00000026275) Kdm6a (ENSPEMG00000011007) ENSPEMG00000028355 Slc38a5 (ENSPEMG00000012763) ENSPEMG00000015698 Porcn (ENSPEMG00000018381) Ebp (ENSPEMG00000019215) Tbc1d25 (ENSPEMG00000000481) Rbm3 (ENSPEMG00000012411) Wdr13 (ENSPEMG00000030841) Was (ENSPEMG00000017673) Suv39h1 (ENSPEMG00000012820) Glod5 (ENSPEMG00000014471) Gata1 (ENSPEMG00000010138) Hdac6 (ENSPEMG00000002814) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.b.a #22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 352 ENSCGRG00001018287 Tiparp (ENSCGRG00001011123) Ssr3 (ENSCGRG00001019723) Kcnab1 (ENSCGRG00001005457) ENSCGRG00001005615 ENSCGRG00001017013 Vmn2r1 (ENSCGRG00001023200) Gmps (ENSCGRG00001018772) Slc33a1 (ENSCGRG00001018761) E130311K13Rik (ENSCGRG00001024290) Plch1 (ENSCGRG00001000217) ENSCGRG00001021700 ENSCGRG00001022762 Mme (ENSCGRG00001000828) ENSCGRG00001008438 ENSCGRG00001007190 #22 Gpr149 (ENSCGRG00001013143) Dhx36 (ENSCGRG00001013722) Arhgef26 (ENSCGRG00001017827) Rap2b (ENSCGRG00001008789) P2ry1 (ENSCGRG00001004469) Mbnl1 (ENSCGRG00001007139) Sucnr1 (ENSCGRG00001017063) Aadac (ENSCGRG00001018575) Aadacl2 (ENSCGRG00001019320) Aadacl2fm1 (ENSCGRG00001013390) Aadacl2fm3 (ENSCGRG00001016631) Igsf10 (ENSCGRG00001011835) Med12l (ENSCGRG00001002841) P2ry12 (ENSCGRG00001004633) P2ry13 (ENSCGRG00001004523) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.b.b #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.b.b #22 Golden Hamster MODERN SPECIES 709 Gm30191 (ENSMAUG00000015307) #7 Zfp593 (ENSMAUG00000022183) #9 E130218I03Rik (ENSMAUG00000015371) #8 Cnksr1 (ENSMAUG00000015929) #10 Catsper4 (ENSMAUG00000022207) #11 Zpld2 (ENSMAUG00000018467) #12 ENSMAUG00000004093 #13 ENSMAUG00000009089 #13 Sh3bgrl3 (ENSMAUG00000015108) #14 Ubxn11 (ENSMAUG00000001021) #15 ENSMAUG00000020396 Crybg2 (ENSMAUG00000000813) #18 Zfp683 (ENSMAUG00000020451) #19 Lin28a (ENSMAUG00000018852) ##20 Dhdds (ENSMAUG00000004047) #21 Hmgn2-ps (ENSMAUG00000017301) #22 Rps6ka1 (ENSMAUG00000017784) #24 ENSMAUG00000004576 #26 ENSMAUG00000020343 #26 Pigv (ENSMAUG00000020277) #27 Zdhhc18 (ENSMAUG00000011253) #28 Sfn (ENSMAUG00000008489) #29 Gpn2 (ENSMAUG00000013057) #30 Gpatch3 (ENSMAUG00000002005) #31 Nr0b2 (ENSMAUG00000020860) #33 Nudc (ENSMAUG00000008166) #34 Kdf1 (ENSMAUG00000021929) #36 Trnp1 (ENSMAUG00000019939) Tent5b (ENSMAUG00000014675) ENSMAUG00000001078 Wdtc1 (ENSMAUG00000004693) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 76 ENSCGRG00001017566 ENSCGRG00001020873 ENSCGRG00001000908 ENSCGRG00001008846 ENSCGRG00001012210 Ugt2a3 (ENSCGRG00001006803) Ugt2a1 (ENSCGRG00001022953) Sult1b1 (ENSCGRG00001004112) Sult1d1 (ENSCGRG00001015275) Csn2 (ENSCGRG00001022086) Prr27 (ENSCGRG00001021889) Odam (ENSCGRG00001018569) Csn3 (ENSCGRG00001021623) ENSCGRG00001001669 #22 Cabs1 (ENSCGRG00001006155) ENSCGRG00001007525 Amtn (ENSCGRG00001013458) Ambn (ENSCGRG00001008007) Enam (ENSCGRG00001018697) Jchain (ENSCGRG00001011544) Utp3 (ENSCGRG00001001299) ENSCGRG00001018252 Rufy3 (ENSCGRG00001021194) ENSCGRG00001017575 Grsf1 (ENSCGRG00001019953) Mob1b (ENSCGRG00001008674) ENSCGRG00001015116 Slc4a4 (ENSCGRG00001024370) ENSCGRG00001024019 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.a.b.b #22 Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES Cep55 (ENSPEMG00000001787) Ffar4 (ENSPEMG00000030137) Rbp4 (ENSPEMG00000013876) Pde6c (ENSPEMG00000015785) Fra10ac1 (ENSPEMG00000016946) Lgi1 (ENSPEMG00000008179) Slc35g1 (ENSPEMG00000012559) Plce1 (ENSPEMG00000003369) Noc3l (ENSPEMG00000013021) Tbc1d12 (ENSPEMG00000030136) Hells (ENSPEMG00000017579) ENSPEMG00000028556 ENSPEMG00000020538 ENSPEMG00000020237 ENSPEMG00000012260 ENSPEMG00000029827 #22 Cyp2c55 (ENSPEMG00000006425) ENSPEMG00000012928 ENSPEMG00000028014 ENSPEMG00000005692 ENSPEMG00000016479 ENSPEMG00000025938 ENSPEMG00000020518 ENSPEMG00000024568 Pdlim1 (ENSPEMG00000022321) Sorbs1 (ENSPEMG00000002699) Aldh18a1 (ENSPEMG00000013055) Tctn3 (ENSPEMG00000003818) Entpd1 (ENSPEMG00000020787) Cc2d2b (ENSPEMG00000020898) Ccnj (ENSPEMG00000030735) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 10 Tmx3 (ENSPEMG00000011968) ENSPEMG00000030219 Dok6 (ENSPEMG00000019316) Cd226 (ENSPEMG00000029583) Rttn (ENSPEMG00000019864) ENSPEMG00000027089 Socs6 (ENSPEMG00000009086) ENSPEMG00000009228 ##15 ENSPEMG00000004621 ENSPEMG00000028176 Cbln2 (ENSPEMG00000024653) Neto1 (ENSPEMG00000021247) ENSPEMG00000026675 #22 ENSPEMG00000030444 ##25 Fbxo15 (ENSPEMG00000003160) Timm21 (ENSPEMG00000024475) Cyb5a (ENSPEMG00000020270) Gm17266 (ENSPEMG00000031219) Dipk1c (ENSPEMG00000019790) Cndp2 (ENSPEMG00000020038) Cndp1 (ENSPEMG00000017304) Zfp407 (ENSPEMG00000019754) Zadh2 (ENSPEMG00000028418) Tshz1 (ENSPEMG00000022838) Zfp516 (ENSPEMG00000024000) ENSPEMG00000024427 Zfp236 (ENSPEMG00000026320) Mbp (ENSPEMG00000021451) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.b #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.b #22 Prairie vole MODERN SPECIES 1 Pdik1l (ENSMOCG00000005467) Fam110d (ENSMOCG00000006661) Gm30191 (ENSMOCG00000016150) #7 Zfp593 (ENSMOCG00000013349) #9 E130218I03Rik (ENSMOCG00000013744) #8 Cnksr1 (ENSMOCG00000021432) #10 Catsper4 (ENSMOCG00000018811) #11 Zpld2 (ENSMOCG00000010562) #12 Cep85 (ENSMOCG00000013828) #13 Sh3bgrl3 (ENSMOCG00000001157) #14 Ubxn11 (ENSMOCG00000012381) #15 Crybg2 (ENSMOCG00000012028) #18 Zfp683 (ENSMOCG00000019164) #19 Lin28a (ENSMOCG00000007819) ##20 Dhdds (ENSMOCG00000018150) #21 ENSMOCG00000009477 #22 Rps6ka1 (ENSMOCG00000005121) #24 Arid1a (ENSMOCG00000015143) #26 Zdhhc18 (ENSMOCG00000014386) #28 Pigv (ENSMOCG00000021093) #27 Sfn (ENSMOCG00000007160) #29 Gpn2 (ENSMOCG00000016502) #30 Gpatch3 (ENSMOCG00000022375) #31 Nr0b2 (ENSMOCG00000022706) #33 ENSMOCG00000009769 #34 Kdf1 (ENSMOCG00000008803) #36 Trnp1 (ENSMOCG00000004450) Tent5b (ENSMOCG00000006029) Slc9a1 (ENSMOCG00000001951) Wdtc1 (ENSMOCG00000021708) Tmem222 (ENSMOCG00000001826) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.i.b #22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 2 Swt1 (ENSCGRG00001022955) Ivns1abp (ENSCGRG00001010161) Hmcn1 (ENSCGRG00001015387) Prg4 (ENSCGRG00001017987) Tpr (ENSCGRG00001022166) Odr4 (ENSCGRG00001012334) Pdc (ENSCGRG00001018609) Ptgs2 (ENSCGRG00001016942) Pla2g4a (ENSCGRG00001021132) ENSCGRG00001016441 ENSCGRG00001017155 Brinp3 (ENSCGRG00001019247) ENSCGRG00001020617 Rgs18 (ENSCGRG00001010249) Rgs21 (ENSCGRG00001010657) ENSCGRG00001004114 #22 Rgs1 (ENSCGRG00001011664) Rgs13 (ENSCGRG00001011756) Rgs2 (ENSCGRG00001015999) Uchl5 (ENSCGRG00001016538) Ro60 (ENSCGRG00001016925) ENSCGRG00001024711 Cdc73 (ENSCGRG00001023831) B3galt2 (ENSCGRG00001001870) ENSCGRG00001003032 Kcnt2 (ENSCGRG00001017430) ENSCGRG00001018310 ENSCGRG00001008325 F13b (ENSCGRG00001002944) Aspm (ENSCGRG00001014059) Zbtb41 (ENSCGRG00001015855) Muroidea DUPLICATION Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.a ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.a ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.a ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.a ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.a ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.a ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 1095 ENSMSIG00000003675 ##22 Shrew mouse MODERN SPECIES 9 Frs3 (MGP_PahariEiJ_G0020700) MGP_PahariEiJ_G0020699 MGP_PahariEiJ_G0020698 Tomm6 (MGP_PahariEiJ_G0020697) Usp49 (MGP_PahariEiJ_G0020696) MGP_PahariEiJ_G0020695 Med20 (MGP_PahariEiJ_G0020694) Bysl (MGP_PahariEiJ_G0020693) Ccnd3 (MGP_PahariEiJ_G0020692) Taf8 (MGP_PahariEiJ_G0020691) AI661453 (MGP_PahariEiJ_G0020690) MGP_PahariEiJ_G0020689 Guca1a (MGP_PahariEiJ_G0020688) MGP_PahariEiJ_G0020687 Mrps10 (MGP_PahariEiJ_G0020686) MGP_PahariEiJ_G0020685 ##22 Ubr2 (MGP_PahariEiJ_G0020684) Prph2 (MGP_PahariEiJ_G0020683) Tbcc (MGP_PahariEiJ_G0020682) MGP_PahariEiJ_G0020681 Rpl7l1 (MGP_PahariEiJ_G0020680) 2310039H08Rik (MGP_PahariEiJ_G0020679) Ptcra (MGP_PahariEiJ_G0020678) Cnpy3 (MGP_PahariEiJ_G0020677) Gnmt (MGP_PahariEiJ_G0020676) Pex6 (MGP_PahariEiJ_G0020675) Ppp2r5d (MGP_PahariEiJ_G0020674) Mea1 (MGP_PahariEiJ_G0020673) Klhdc3 (MGP_PahariEiJ_G0020672) Rrp36 (MGP_PahariEiJ_G0020671) Cul7 (MGP_PahariEiJ_G0020670) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.b ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.b ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.h.b ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 2708 Kcnd3 (ENSMSIG00000005944) Ddx20 (ENSMSIG00000005900) Inka2 (ENSMSIG00000005873) Rap1a (ENSMSIG00000005828) Adora3 (ENSMSIG00000005809) Tmigd3 (ENSMSIG00000005765) I830077J02Rik (ENSMSIG00000005744) ENSMSIG00000005701 Wdr77 (ENSMSIG00000005672) Ovgp1 (ENSMSIG00000005625) Pifo (ENSMSIG00000005553) Chil5 (ENSMSIG00000005504) ENSMSIG00000005488 ##22 Chia1 (ENSMSIG00000005457) Chil3 (ENSMSIG00000005424) Chil4 (ENSMSIG00000005364) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 702 Ppp1r14c (ENSNGAG00000014875) ENSNGAG00000016984 ##22 ENSNGAG00000017905 Lrp11 (ENSNGAG00000019568) Pcmt1 (ENSNGAG00000000477) Nup43 (ENSNGAG00000001085) Lats1 (ENSNGAG00000002110) ENSNGAG00000004438 Ginm1 (ENSNGAG00000006947) Ppil4 (ENSNGAG00000008801) Zc3h12d (ENSNGAG00000010502) Tab2 (ENSNGAG00000011601) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 12 TXNDC17 (ENSSVLG00005013668) ENSSVLG00005013558 KIAA0753 (ENSSVLG00005013510) PITPNM3 (ENSSVLG00005013384) PIMREG (ENSSVLG00005013051) AIPL1 (ENSSVLG00005012617) WSCD1 (ENSSVLG00005012425) NLRP1 (ENSSVLG00005011558) ENSSVLG00005011435 MIS12 (ENSSVLG00005011416) DERL2 (ENSSVLG00005011333) DHX33 (ENSSVLG00005011159) ENSSVLG00005011043 RPAIN (ENSSVLG00005010858) NUP88 (ENSSVLG00005010768) ENSSVLG00005010734 #22 RABEP1 (ENSSVLG00005013880) ENSSVLG00005013751 ENSSVLG00005013649 SCIMP (ENSSVLG00005013585) ENSSVLG00005013440 ENSSVLG00005013408 ZNF232 (ENSSVLG00005013374) ZFP3 (ENSSVLG00005013333) ENSSVLG00005013210 KIF1C (ENSSVLG00005013143) INCA1 (ENSSVLG00005013041) CAMTA2 (ENSSVLG00005012676) ENSSVLG00005012585 SPAG7 (ENSSVLG00005012361) ENO3 (ENSSVLG00005012264) Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Arctic ground squirrel DUPLICATION Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 376 ENSUPAG00010011754 ENSUPAG00010011764 #22 KIAA1143 (ENSUPAG00010011777) ENSUPAG00010011781 ZNF35 (ENSUPAG00010011784) ZNF197 (ENSUPAG00010011790) ZNF660 (ENSUPAG00010011799) ZKSCAN7 (ENSUPAG00010011801) ENSUPAG00010011824 ENSUPAG00010011836 TCAIM (ENSUPAG00010011866) TOPAZ1 (ENSUPAG00010011889) ABHD5 (ENSUPAG00010011940) ANO10 (ENSUPAG00010011968) SNRK (ENSUPAG00010012029) POMGNT2 (ENSUPAG00010012035) GASK1A (ENSUPAG00010012037) Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 241 EPB41L4A (ENSUPAG00010021876) APC (ENSUPAG00010021893) SRP19 (ENSUPAG00010021920) ENSUPAG00010021923 REEP5 (ENSUPAG00010021926) PKD2L2 (ENSUPAG00010021930) FAM13B (ENSUPAG00010021934) WNT8A (ENSUPAG00010021939) NME5 (ENSUPAG00010021941) ENSUPAG00010021946 #22 ENSUPAG00010021949 BRD8 (ENSUPAG00010021951) KIF20A (ENSUPAG00010021970) CDC23 (ENSUPAG00010021979) ENSUPAG00010021987 GFRA3 (ENSUPAG00010021988) CDC25C (ENSUPAG00010021991) ENSUPAG00010021998 FAM53C (ENSUPAG00010022019) KDM3B (ENSUPAG00010022021) EGR1 (ENSUPAG00010022030) ETF1 (ENSUPAG00010022032) HSPA9 (ENSUPAG00010022035) CTNNA1 (ENSUPAG00010022041) LRRTM2 (ENSUPAG00010022043) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 10 APPBP2 (ENSOCUG00000009419) ENSOCUG00000029614 BCAS3 (ENSOCUG00000010794) TBX2 (ENSOCUG00000023498) TBX4 (ENSOCUG00000010834) BRIP1 (ENSOCUG00000006683) INTS2 (ENSOCUG00000006693) MED13 (ENSOCUG00000006709) ENSOCUG00000021230 RPS6KB1 (ENSOCUG00000004600) TUBD1 (ENSOCUG00000013772) VMP1 (ENSOCUG00000004210) PTRH2 (ENSOCUG00000023345) CLTC (ENSOCUG00000016413) DHX40 (ENSOCUG00000038496) ENSOCUG00000031327 #22 ENSOCUG00000035846 YPEL2 (ENSOCUG00000020978) GDPD1 (ENSOCUG00000013113) SMG8 (ENSOCUG00000002350) PRR11 (ENSOCUG00000002337) ENSOCUG00000002334 TRIM37 (ENSOCUG00000002326) PPM1E (ENSOCUG00000026526) ENSOCUG00000002269 ENSOCUG00000025769 ##25 TEX14 (ENSOCUG00000009775) ENSOCUG00000009757 MTMR4 (ENSOCUG00000009743) HSF5 (ENSOCUG00000009733) RNF43 (ENSOCUG00000009729) Rabbit MODERN SPECIES 5 PFN2 (ENSOCUG00000006059) RNF13 (ENSOCUG00000006055) ENSOCUG00000026009 ANKUB1 (ENSOCUG00000002642) COMMD2 (ENSOCUG00000002638) WWTR1 (ENSOCUG00000013750) TM4SF4 (ENSOCUG00000013741) ENSOCUG00000022512 TM4SF1 (ENSOCUG00000027275) ENSOCUG00000003545 TM4SF18 (ENSOCUG00000003542) CP (ENSOCUG00000003535) HPS3 (ENSOCUG00000003526) HLTF (ENSOCUG00000003520) ENSOCUG00000003516 ENSOCUG00000007320 #22 CPA3 (ENSOCUG00000032097) CPB1 (ENSOCUG00000003084) AGTR1 (ENSOCUG00000025557) ENSOCUG00000026392 ENSOCUG00000021417 ZIC4 (ENSOCUG00000010959) ENSOCUG00000037397 PLSCR5 (ENSOCUG00000002500) ENSOCUG00000012892 ENSOCUG00000029550 ENSOCUG00000023944 PLSCR4 (ENSOCUG00000015564) PLOD2 (ENSOCUG00000001461) ENSOCUG00000038414 DIPK2A (ENSOCUG00000012616) Tree shrew DUPLICATION Tree shrew MODERN SPECIES 4470 CCR4 (ENSTBEG00000004629) ENSTBEG00000004866 ENSTBEG00000006455 #22 ENSTBEG00000006940 Tree shrew MODERN SPECIES 9542 ENSTBEG00000004358 #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Bushbaby MODERN SPECIES 158 SMAGP (ENSOGAG00000030770) DAZAP2 (ENSOGAG00000007977) POU6F1 (ENSOGAG00000007973) TFCP2 (ENSOGAG00000007969) CSRNP2 (ENSOGAG00000007966) LETMD1 (ENSOGAG00000007963) SLC11A2 (ENSOGAG00000000214) ENSOGAG00000000213 ENSOGAG00000009474 TMPRSS12 (ENSOGAG00000034766) ENSOGAG00000000212 ATF1 (ENSOGAG00000026029) DIP2B (ENSOGAG00000005189) LARP4 (ENSOGAG00000001415) ENSOGAG00000029433 ENSOGAG00000007391 #22 LIMA1 (ENSOGAG00000004671) CERS5 (ENSOGAG00000004668) COX14 (ENSOGAG00000004667) GPD1 (ENSOGAG00000004665) ENSOGAG00000004662 ASIC1 (ENSOGAG00000004661) ENSOGAG00000015732 LCP1 (ENSOGAG00000012043) CPB2 (ENSOGAG00000012039) ZC3H13 (ENSOGAG00000012032) SIAH3 (ENSOGAG00000033062) CBY2 (ENSOGAG00000029836) ENSOGAG00000016040 COG3 (ENSOGAG00000016033) SLC25A30 (ENSOGAG00000011571) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 213 ENSMNEG00000040231 ENSMNEG00000042414 ENSMNEG00000030462 ZNF91 (ENSMNEG00000012114) ENSMNEG00000037823 #22 ZNF681 (ENSMNEG00000030468) ENSMNEG00000010325 ENSMNEG00000010773 ENSMNEG00000027108 ZNF254 (ENSMNEG00000034353) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1170 ENSRBIG00000034522 ENSRBIG00000034838 #22 ZNF726 (ENSRBIG00000039359) ENSRBIG00000037060 ENSRBIG00000035070 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1 ENSRROG00000005953 #22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Odontoceti DUPLICATION Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.a #22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.a #22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000154277.a.b.b.n.k.b ENSGT00940000162643.b ENSGT00940000153313.C.a ENSGT00940000160459 ENSGT00940000162262 ENSGT00940000159479 ENSGT00510000048066 ENSGT00870000136506 ENSGT00940000160940 ENSGT00940000160559.f ENSGT00390000008621 ENSGT00940000160559.e ENSGT00940000163245 ENSGT00940000162070 ENSGT00940000162389 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.a #22 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162496 ENSGT00980000198762 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00940000159667 ENSGT00940000155614 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155170 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000157847 ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000160145.b ENSGT00390000012692 ENSGT00940000159438 ENSGT00940000155877 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000159438 ENSGT00390000012692 ENSGT00940000160145.b ENSGT00530000063168.a.a.b ENSGT00940000157847 ENSGT00940000156319 ENSGT00940000155170 ENSGT00390000010825.a ENSGT00940000155614 ENSGT00940000159667 ENSGT00940000161236.a.a ENSGT00980000198762 ENSGT00940000162496 ENSGT00890000139436.A.b ENSGT00940000162389 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.a #22 ENSGT00940000162070 ENSGT00940000163245 ENSGT00940000160559.e ENSGT00390000008621 ENSGT00940000160559.f ENSGT00940000160940 ENSGT00870000136506 ENSGT00510000048066 ENSGT00940000159479 ENSGT00940000162262 ENSGT00940000160459 ENSGT00940000153313.C.a ENSGT00940000162643.b ENSGT00940000154277.a.b.b.n.k.b ENSGT00940000153763.a Beluga whale MODERN SPECIES 114 HUWE1 (ENSDLEG00000010517) HSD17B10 (ENSDLEG00000009630) RIBC1 (ENSDLEG00000009583) SMC1A (ENSDLEG00000009492) IQSEC2 (ENSDLEG00000008870) KDM5C (ENSDLEG00000008448) TSPYL2 (ENSDLEG00000008358) GPR173 (ENSDLEG00000008337) ENSDLEG00000008319 #22 MAGED1 (ENSDLEG00000008255) GSPT2 (ENSDLEG00000008211) Narwhal MODERN SPECIES 309 FGD1 (ENSMMNG00015015565) TSR2 (ENSMMNG00015015553) WNK3 (ENSMMNG00015015519) FAM120C (ENSMMNG00015015477) PHF8 (ENSMMNG00015015410) HUWE1 (ENSMMNG00015015224) HSD17B10 (ENSMMNG00015015147) ENSMMNG00015015125 SMC1A (ENSMMNG00015015063) IQSEC2 (ENSMMNG00015014978) KDM5C (ENSMMNG00015014882) KANTR (ENSMMNG00015014864) TSPYL2 (ENSMMNG00015014852) GPR173 (ENSMMNG00015014842) ENSMMNG00015014814 ENSMMNG00015014800 #22 MAGED1 (ENSMMNG00015014774) GSPT2 (ENSMMNG00015014759) ENSMMNG00015014742 BMP15 (ENSMMNG00015014720) ENSMMNG00015014703 SHROOM4 (ENSMMNG00015014668) DGKK (ENSMMNG00015014617) ENSMMNG00015014590 AKAP4 (ENSMMNG00015014564) ENSMMNG00015014557 ENSMMNG00015014545 CLCN5 (ENSMMNG00015014509) USP27X (ENSMMNG00015014494) PAGE4 (ENSMMNG00015014484) PPP1R3F (ENSMMNG00015014470) Vaquita MODERN SPECIES 34 ENSPSNG00000013438 ENSPSNG00000013583 AKAP4 (ENSPSNG00000013674) CCNB3 (ENSPSNG00000013841) DGKK (ENSPSNG00000013923) SHROOM4 (ENSPSNG00000014309) ENSPSNG00000014387 BMP15 (ENSPSNG00000014443) ENSPSNG00000014492 ENSPSNG00000014522 ENSPSNG00000014613 ENSPSNG00000014642 GSPT2 (ENSPSNG00000014658) MAGED1 (ENSPSNG00000014702) ENSPSNG00000014799 ENSPSNG00000014914 #22 ENSPSNG00000014941 ENSPSNG00000015015 GPR173 (ENSPSNG00000015090) TSPYL2 (ENSPSNG00000015108) KDM5C (ENSPSNG00000015193) IQSEC2 (ENSPSNG00000015666) SMC1A (ENSPSNG00000016208) ENSPSNG00000016407 HSD17B10 (ENSPSNG00000016498) HUWE1 (ENSPSNG00000016681) PHF8 (ENSPSNG00000016986) FAM120C (ENSPSNG00000017250) WNK3 (ENSPSNG00000017347) TSR2 (ENSPSNG00000017417) FGD1 (ENSPSNG00000017466) Sperm whale MODERN SPECIES 536 ENSPCTG00005010766 #22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.b #22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.b #22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160543 ENSGT01030000234543.B.e.b ENSGT00940000158794 ENSGT00940000158210 ENSGT00390000000984 ENSGT00940000158394 ENSGT00390000014082.b ENSGT00530000063713.a ENSGT00940000157470 ENSGT00940000161078 ENSGT00390000004181 ENSGT00390000014794.b ENSGT00940000159995 ENSGT00940000153335.a.b ENSGT00940000154939 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.b #22 ENSGT00390000013594 ENSGT01100000266036 ENSGT00940000156416 ENSGT00900000143228 ENSGT00950000183033.a.a.d ENSGT00390000014563.a.b ENSGT00940000156276 ENSGT00940000157838 ENSGT00940000153062.A.a.a.b ENSGT00940000164892.a ENSGT00940000160822 ENSGT01050000244968.d ENSGT00940000158499 ENSGT00940000153195.B ENSGT00940000161962 Vaquita MODERN SPECIES 7 CTNNA3 (ENSPSNG00000015816) ENSPSNG00000015753 ENSPSNG00000015687 REEP3 (ENSPSNG00000015636) JMJD1C (ENSPSNG00000015259) NRBF2 (ENSPSNG00000015149) EGR2 (ENSPSNG00000015063) ADO (ENSPSNG00000015035) ZNF365 (ENSPSNG00000014971) RTKN2 (ENSPSNG00000014902) ARID5B (ENSPSNG00000014736) CABCOCO1 (ENSPSNG00000014615) TMEM26 (ENSPSNG00000014493) RHOBTB1 (ENSPSNG00000014292) CDK1 (ENSPSNG00000014155) ENSPSNG00000014083 #22 ANK3 (ENSPSNG00000012368) CCDC6 (ENSPSNG00000012111) SLC16A9 (ENSPSNG00000012014) ENSPSNG00000011967 FAM13C (ENSPSNG00000011038) PHYHIPL (ENSPSNG00000010830) BICC1 (ENSPSNG00000010653) HNRNPF (ENSPSNG00000010529) FXYD4 (ENSPSNG00000010413) ENSPSNG00000010387 RASGEF1A (ENSPSNG00000010125) CSGALNACT2 (ENSPSNG00000010027) RET (ENSPSNG00000009662) BMS1 (ENSPSNG00000020037) ENSPSNG00000020012 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160543 ENSGT01030000234543.B.e.b ENSGT00940000158794 ENSGT00940000158210 ENSGT00390000000984 ENSGT00940000158394 ENSGT00390000014082.b ENSGT00530000063713.a ENSGT00940000157470 ENSGT00940000161078 ENSGT00390000004181 ENSGT00390000014794.b ENSGT00940000159995 ENSGT00940000153335.a.b ENSGT00940000154939 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a.b #22 ENSGT00390000013594 ENSGT01100000266036 ENSGT00940000156416 ENSGT00950000183033.a.a.d ENSGT00390000014563.a.b ENSGT00940000156276 ENSGT00940000157251.gb.a.a ENSGT00940000157838 ENSGT00940000164892.a ENSGT00940000160822 ENSGT01050000244968.d ENSGT00940000158499 ENSGT00940000153195.B ENSGT00940000161962 ENSGT00940000153505.a.b.a.a Narwhal MODERN SPECIES 311 CTNNA3 (ENSMMNG00015016145) ENSMMNG00015016066 REEP3 (ENSMMNG00015016031) JMJD1C (ENSMMNG00015015904) NRBF2 (ENSMMNG00015015806) EGR2 (ENSMMNG00015015758) ADO (ENSMMNG00015015748) ZNF365 (ENSMMNG00015015720) RTKN2 (ENSMMNG00015015683) ARID5B (ENSMMNG00015015623) CABCOCO1 (ENSMMNG00015015573) TMEM26 (ENSMMNG00015015516) RHOBTB1 (ENSMMNG00015015499) CDK1 (ENSMMNG00015015475) ENSMMNG00015015458 ENSMMNG00015015447 #22 ANK3 (ENSMMNG00015015095) CCDC6 (ENSMMNG00015014903) ENSMMNG00015014890 SLC16A9 (ENSMMNG00015014872) FAM13C (ENSMMNG00015014829) PHYHIPL (ENSMMNG00015014782) ENSMMNG00015019259 BICC1 (ENSMMNG00015019163) ENSMMNG00015019131 HNRNPF (ENSMMNG00015019119) ENSMMNG00015019105 RASGEF1A (ENSMMNG00015019069) CSGALNACT2 (ENSMMNG00015019032) RET (ENSMMNG00015018914) BMS1 (ENSMMNG00015018851) Beluga whale MODERN SPECIES 56 REEP3 (ENSDLEG00000011032) JMJD1C (ENSDLEG00000011059) NRBF2 (ENSDLEG00000011181) EGR2 (ENSDLEG00000011204) ADO (ENSDLEG00000011209) ZNF365 (ENSDLEG00000011279) RTKN2 (ENSDLEG00000011317) ARID5B (ENSDLEG00000011338) CABCOCO1 (ENSDLEG00000011387) TMEM26 (ENSDLEG00000011417) ENSDLEG00000011441 RHOBTB1 (ENSDLEG00000011454) CDK1 (ENSDLEG00000011518) ANK3 (ENSDLEG00000011908) ENSDLEG00000017045 #22 CCDC6 (ENSDLEG00000017057) SLC16A9 (ENSDLEG00000017063) FAM13C (ENSDLEG00000006892) PHYHIPL (ENSDLEG00000006905) ENSDLEG00000006911 BICC1 (ENSDLEG00000006916) ENSDLEG00000006926 HNRNPF (ENSDLEG00000006928) SCN5A (ENSDLEG00000006948) SCN10A (ENSDLEG00000007074) SCN11A (ENSDLEG00000007273) WDR48 (ENSDLEG00000007687) GORASP1 (ENSDLEG00000007913) TTC21A (ENSDLEG00000008333) CSRNP1 (ENSDLEG00000009935) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 lion MODERN SPECIES 10 EHF (ENSPLOG00000006746) APIP (ENSPLOG00000006818) PDHX (ENSPLOG00000006867) CD44 (ENSPLOG00000007114) SLC1A2 (ENSPLOG00000007683) PAMR1 (ENSPLOG00000008067) FJX1 (ENSPLOG00000008243) TRIM44 (ENSPLOG00000008259) LDLRAD3 (ENSPLOG00000008283) COMMD9 (ENSPLOG00000008326) PRR5L (ENSPLOG00000008389) TRAF6 (ENSPLOG00000008425) RAG1 (ENSPLOG00000008443) RAG2 (ENSPLOG00000008456) ENSPLOG00000008466 ENSPLOG00000008507 #22 LRRC4C (ENSPLOG00000008513) API5 (ENSPLOG00000008595) TTC17 (ENSPLOG00000008790) HSD17B12 (ENSPLOG00000008903) ALKBH3 (ENSPLOG00000009033) C11orf96 (ENSPLOG00000009053) ACCSL (ENSPLOG00000009077) ACCS (ENSPLOG00000009169) EXT2 (ENSPLOG00000009265) ALX4 (ENSPLOG00000009372) CD82 (ENSPLOG00000009416) TSPAN18 (ENSPLOG00000009462) TP53I11 (ENSPLOG00000009507) PRDM11 (ENSPLOG00000009558) SYT13 (ENSPLOG00000009590) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 American mink MODERN SPECIES 168 OR5K4 (ENSNVIG00000016556) OR5K3 (ENSNVIG00000016563) ENSNVIG00000016574 CLDND1 (ENSNVIG00000016585) GPR15 (ENSNVIG00000016647) CPOX (ENSNVIG00000016650) ST3GAL6 (ENSNVIG00000016667) DCBLD2 (ENSNVIG00000016789) ENSNVIG00000016833 #22 COL8A1 (ENSNVIG00000016844) CC026 (ENSNVIG00000016879) FILIP1L (ENSNVIG00000016962) ENSNVIG00000017005 ENSNVIG00000017014 TBC1D23 (ENSNVIG00000017076) ENSNVIG00000017150 TOMM70 (ENSNVIG00000017175) LNP1 (ENSNVIG00000017190) TMEM45A (ENSNVIG00000017210) ENSNVIG00000017226 ADGRG7 (ENSNVIG00000017236) TFG (ENSNVIG00000017297) ENSNVIG00000017433 IMPG2 (ENSNVIG00000017469) Canidae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000154428.a ENSGT00940000154428.b ENSGT00940000158236 ENSGT00940000155393.d ENSGT00940000155683 ENSGT00530000063692.b ENSGT00950000183154.a ENSGT00390000011642 ENSGT00940000154481.a.b.bc ENSGT00940000158133 ENSGT00390000012924.a ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000013337 ENSGT00940000158401 ENSGT00730000111244 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 ENSGT00940000157477 ENSGT00940000157723 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c ENSGT00940000161275 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00390000004803 ENSGT00900000143690 ENSGT00940000157684 ENSGT00940000156638 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156283 ENSGT00940000161388 Red fox MODERN SPECIES 26 CNKSR3 (ENSVVUG00000007515) IPCEF1 (ENSVVUG00000007491) OPRM1 (ENSVVUG00000007466) RGS17 (ENSVVUG00000007424) FBXO5 (ENSVVUG00000007414) ENSVVUG00000007408 VIP (ENSVVUG00000007395) MYCT1 (ENSVVUG00000007392) ENSVVUG00000006984 ENSVVUG00000006396 ESR1 (ENSVVUG00000006190) CCDC170 (ENSVVUG00000006168) ARMT1 (ENSVVUG00000006134) RMND1 (ENSVVUG00000006114) ZBTB2 (ENSVVUG00000006110) ENSVVUG00000006108 #22 AKAP12 (ENSVVUG00000006099) ENSVVUG00000005367 ENSVVUG00000005287 PLEKHG1 (ENSVVUG00000005233) IYD (ENSVVUG00000005224) PPP1R14C (ENSVVUG00000005202) ENSVVUG00000005195 ENSVVUG00000005191 ENSVVUG00000005187 ENSVVUG00000005185 PCMT1 (ENSVVUG00000005178) NUP43 (ENSVVUG00000005168) LATS1 (ENSVVUG00000005155) KATNA1 (ENSVVUG00000005135) GINM1 (ENSVVUG00000005128) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154428.a ENSGT00940000154428.b ENSGT00940000158236 ENSGT00940000155393.d ENSGT00940000155683 ENSGT00530000063692.b ENSGT00950000183154.a ENSGT00390000011642 ENSGT00940000154481.a.b.bc ENSGT00940000158133 ENSGT00390000012924.a ENSGT00530000064023.b ENSGT00390000013337 ENSGT00940000158401 ENSGT00730000111244 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 ENSGT00940000157477 ENSGT00940000157723 ENSGT00390000004348 ENSGT00950000182985.b.a ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.d.b ENSGT00390000015489.q.a.f.a ENSGT01100000263517.b.d.m.a.a.a.a.c ENSGT00940000161275 ENSGT00950000183032.B.b.b ENSGT00390000004803 ENSGT00900000143690 ENSGT00940000157684 ENSGT00940000156638 ENSGT00390000008373 ENSGT00940000156283 Dog MODERN SPECIES 144 BMX (ENSCAFG00845029748) PIR (ENSCAFG00845029590) VEGFD (ENSCAFG00845029554) ASB11 (ENSCAFG00845029445) ASB9 (ENSCAFG00845029376) MOSPD2 (ENSCAFG00845029311) GLRA2 (ENSCAFG00845029193) FANCB (ENSCAFG00845029118) GSTP1 (ENSCAFG00845029100) GPM6B (ENSCAFG00845029037) ENSCAFG00845029012 OFD1 (ENSCAFG00845028661) TRAPPC2 (ENSCAFG00845028547) RAB9A (ENSCAFG00845028510) TCEANC (ENSCAFG00845028494) ENSCAFG00845028459 #22 EGFL6 (ENSCAFG00845028422) TLR8 (ENSCAFG00845028394) ENSCAFG00845028351 TLR7 (ENSCAFG00845028303) PRPS2 (ENSCAFG00845028237) ENSCAFG00845028207 FRMPD4 (ENSCAFG00845027637) ENSCAFG00845027491 MSL3 (ENSCAFG00845027243) ENSCAFG00845027078 ENSCAFG00845026844 ARHGAP6 (ENSCAFG00845026713) HCCS (ENSCAFG00845026624) MID1 (ENSCAFG00845026369) CLCN4 (ENSCAFG00845026001) Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 138 ANAPC4 (ENSCAFG00020027256) ENSCAFG00020027253 ENSCAFG00020027252 PI4K2B (ENSCAFG00020027250) SEPSECS (ENSCAFG00020027249) LGI2 (ENSCAFG00020027248) CCDC149 (ENSCAFG00020027247) SOD3 (ENSCAFG00020027246) DHX15 (ENSCAFG00020027245) ENSCAFG00020027244 PPARGC1A (ENSCAFG00020027242) GBA3 (ENSCAFG00020027241) ADGRA3 (ENSCAFG00020027238) KCNIP4 (ENSCAFG00020027237) PACRGL (ENSCAFG00020027236) ENSCAFG00020027235 #22 SLIT2 (ENSCAFG00020027191) ENSCAFG00020027105 ENSCAFG00020027097 NCAPG (ENSCAFG00020027090) ENSCAFG00020027087 DCAF16 (ENSCAFG00020027085) CTBP1 (ENSCAFG00020027072) SPON2 (ENSCAFG00020027066) ENSCAFG00020027065 ENSCAFG00020027063 ENSCAFG00020027061 FGFRL1 (ENSCAFG00020027059) SLC26A1 (ENSCAFG00020027054) IDUA (ENSCAFG00020027044) DGKQ (ENSCAFG00020027034) Dingo MODERN SPECIES 217 ENSCAFG00020003498 ASB11 (ENSCAFG00020003486) ASB9 (ENSCAFG00020003474) ENSCAFG00020003473 MOSPD2 (ENSCAFG00020003148) FANCB (ENSCAFG00020003123) GLRA2 (ENSCAFG00020003077) GEMIN8 (ENSCAFG00020003054) GPM6B (ENSCAFG00020003028) ENSCAFG00020003022 OFD1 (ENSCAFG00020002846) ENSCAFG00020002815 RAB9A (ENSCAFG00020002812) TCEANC (ENSCAFG00020002804) EGFL6 (ENSCAFG00020002796) ENSCAFG00020002790 #22 ENSCAFG00020002783 TLR8 (ENSCAFG00020002780) TLR7 (ENSCAFG00020002778) PRPS2 (ENSCAFG00020002638) ENSCAFG00020002627 FRMPD4 (ENSCAFG00020002590) ENSCAFG00020002578 MSL3 (ENSCAFG00020002360) ENSCAFG00020002352 AMELX (ENSCAFG00020002340) ARHGAP6 (ENSCAFG00020002309) HCCS (ENSCAFG00020002285) MID1 (ENSCAFG00020002249) CLCN4 (ENSCAFG00020002224) WWC3 (ENSCAFG00020002166) Dingo MODERN SPECIES 125 ENSCAFG00020014955 RGS17 (ENSCAFG00020014939) MTRF1L (ENSCAFG00020014937) FBXO5 (ENSCAFG00020014935) VIP (ENSCAFG00020014925) MYCT1 (ENSCAFG00020014923) ENSCAFG00020014881 ENSCAFG00020014804 ESR1 (ENSCAFG00020014707) CCDC170 (ENSCAFG00020014704) ENSCAFG00020014702 ENSCAFG00020014700 RMND1 (ENSCAFG00020014697) ZBTB2 (ENSCAFG00020014696) AKAP12 (ENSCAFG00020014695) ENSCAFG00020014694 #22 ENSCAFG00020014133 ENSCAFG00020014068 PLEKHG1 (ENSCAFG00020014055) IYD (ENSCAFG00020014043) PPP1R14C (ENSCAFG00020014021) ENSCAFG00020014013 ENSCAFG00020014007 LRP11 (ENSCAFG00020013981) PCMT1 (ENSCAFG00020013908) NUP43 (ENSCAFG00020013901) LATS1 (ENSCAFG00020013895) KATNA1 (ENSCAFG00020013829) GINM1 (ENSCAFG00020013825) PPIL4 (ENSCAFG00020013550) ENSCAFG00020013539 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Common shrew MODERN SPECIES 12192 ENSSARG00000010054 #22 Hedgehog MODERN SPECIES 1937 DHDDS (ENSEEUG00000008324) #21 ENSEEUG00000008466 #22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156529 ENSGT00940000158412 ENSGT00390000004173 #9 ENSGT00940000159599 #10 ENSGT00940000161879 #11 ENSGT00720000109135 #12 ENSGT00620000087993.a.b #13 ENSGT00940000157260 #14 ENSGT00520000055567.b #15 ENSGT00940000157740 #18 ENSGT00940000164781 #19 ENSGT00500000045882 ENSGT00940000163172 ENSGT00940000153295.a #20 ENSGT00390000007879 #21 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a #22 ENSGT00940000159314 #24 ENSGT00940000155194 #26 ENSGT00390000013174 #27 ENSGT00940000156585 #28 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #29 ENSGT00950000183172.B #30 ENSGT00390000004191 #31 ENSGT00390000015719.c #33 ENSGT00940000155361 #34 ENSGT00390000016565 #36 ENSGT00390000017418 ENSGT00940000160747 ENSGT00940000156338 ENSGT00950000182900.B ENSGT00390000007371 Tenrec DUPLICATION Tenrec MODERN SPECIES 9254 ENSETEG00000007052 #22 Tenrec MODERN SPECIES 1830 DHDDS (ENSETEG00000013567) #21 ENSETEG00000013571 #22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 1256 ZDHHC3 (ENSMLUG00000000717) ENSMLUG00000030287 KIF15 (ENSMLUG00000014202) KIAA1143 (ENSMLUG00000014199) ZNF35 (ENSMLUG00000011312) ENSMLUG00000010285 ENSMLUG00000011292 ENSMLUG00000011259 TCAIM (ENSMLUG00000001192) ENSMLUG00000001186 ABHD5 (ENSMLUG00000001034) ANO10 (ENSMLUG00000008366) SNRK (ENSMLUG00000001785) ENSMLUG00000028228 ##22 ITGA9 (ENSMLUG00000004256) ENSMLUG00000025938 CTDSPL (ENSMLUG00000010347) VILL (ENSMLUG00000010367) PLCD1 (ENSMLUG00000010403) Microbat MODERN SPECIES 1446 ENSMLUG00000012636 ENSMLUG00000030065 ##22 SHQ1 (ENSMLUG00000013539) Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000005534.b.b.d ENSGT00940000155789 ENSGT00940000158200 ENSGT01030000234598.a.b ENSGT00860000135711 ENSGT00940000153421.a.b ENSGT00950000183039.B.b.a ENSGT00730000111202 ENSGT00940000155531.b ENSGT00950000183039.B.a ENSGT00940000156335 ENSGT00390000013727.d ENSGT01000000214413.b.a.a ENSGT00940000156305 ENSGT00390000002837 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00390000009980 ENSGT00940000157401 ENSGT00910000147128 ENSGT00940000155931 ENSGT00390000013701 ENSGT00390000015010 ENSGT00940000172992 ENSGT00950000183189.a.b.a ENSGT00940000154384.h.a ENSGT00940000160614 ENSGT00940000164959 ENSGT00940000156162.C.k ENSGT00940000154552 ENSGT00940000156941 ENSGT00940000164015 leopard MODERN SPECIES 41 NAALADL2 (ENSPPRG00000008765) ENSPPRG00000008440 ENSPPRG00000008283 ENSPPRG00000014311 TBL1XR1 (ENSPPRG00000007211) KCNMB2 (ENSPPRG00000005379) ZMAT3 (ENSPPRG00000004407) PIK3CA (ENSPPRG00000003667) KCNMB3 (ENSPPRG00000003525) ZNF639 (ENSPPRG00000002569) MFN1 (ENSPPRG00000001517) GNB4 (ENSPPRG00000001295) ENSPPRG00000022425 ACTL6A (ENSPPRG00000000310) MRPL47 (ENSPPRG00000000050) ENSPPRG00000022339 ##22 NDUFB5 (ENSPPRG00000023717) USP13 (ENSPPRG00000023982) ENSPPRG00000022239 PEX5L (ENSPPRG00000012577) ENSPPRG00000006521 TTC14 (ENSPPRG00000006127) CCDC39 (ENSPPRG00000005599) ENSPPRG00000005376 FXR1 (ENSPPRG00000004943) DNAJC19 (ENSPPRG00000002612) SOX2 (ENSPPRG00000021752) ENSPPRG00000002170 ENSPPRG00000001643 ATP11B (ENSPPRG00000001539) DCUN1D1 (ENSPPRG00000000834) lion MODERN SPECIES 9 NLGN1 (ENSPLOG00000013747) ENSPLOG00000013820 NAALADL2 (ENSPLOG00000013868) ENSPLOG00000014025 TBL1XR1 (ENSPLOG00000014076) ENSPLOG00000014169 KCNMB2 (ENSPLOG00000014199) ZMAT3 (ENSPLOG00000014350) PIK3CA (ENSPLOG00000014416) KCNMB3 (ENSPLOG00000014563) ZNF639 (ENSPLOG00000014743) MFN1 (ENSPLOG00000014785) GNB4 (ENSPLOG00000014871) ACTL6A (ENSPLOG00000014922) MRPL47 (ENSPLOG00000015006) ENSPLOG00000015221 ##22 NDUFB5 (ENSPLOG00000015246) USP13 (ENSPLOG00000015359) PEX5L (ENSPLOG00000015604) TTC14 (ENSPLOG00000016608) CCDC39 (ENSPLOG00000016889) ENSPLOG00000017262 DNAJC19 (ENSPLOG00000017942) SOX2 (ENSPLOG00000018057) ENSPLOG00000018071 ATP11B (ENSPLOG00000018137) DCUN1D1 (ENSPLOG00000018397) MCCC1 (ENSPLOG00000018464) LAMP3 (ENSPLOG00000018830) MCF2L2 (ENSPLOG00000018925) B3GNT5 (ENSPLOG00000019335) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT01100000263498.b.a.a.d.a.a.a.b.b ENSGT01100000263498.b.a.a.d.b.a.b.a ENSGT01100000263498.b.a.a.d.a.a.b.a.e ENSGT01100000263498.b.a.a.d.b.b ENSGT01100000263498.b.a.a.d.a.a.a.a.b ENSGT01100000263498.b.a.a.d.a.a.a.a.a ENSGT01060000248581.A.a.a.a.k ENSGT01060000248581.A.a.b ENSGT01060000248581.A.a.a.a.l ENSGT00940000162899 ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.b.c.e ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.b.c.f ENSGT01100000263494.a.b.a.a.b ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a ENSGT01090000260045.C.e.a.a.a.b.a ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT01100000263498.a.a ENSGT00940000156045 ENSGT00560000078563 ENSGT00390000003751.a ENSGT00390000001774 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 Red fox DUPLICATION Red fox MODERN SPECIES 84 MYH9 (ENSVVUG00000023567) ENSVVUG00000023566 ENSVVUG00000023565 ENSVVUG00000023564 RBFOX2 (ENSVVUG00000023561) APOL5 (ENSVVUG00000023558) ENSVVUG00000023556 ENSVVUG00000023554 RASD2 (ENSVVUG00000023551) MCM5 (ENSVVUG00000023540) HMOX1 (ENSVVUG00000023539) TOM1 (ENSVVUG00000023536) HMGXB4 (ENSVVUG00000023533) ISX (ENSVVUG00000023529) LARGE1 (ENSVVUG00000023512) ENSVVUG00000023507 ##22 ENSVVUG00000023500 TIMP3 (ENSVVUG00000023494) ENSVVUG00000023491 FBXO7 (ENSVVUG00000023488) BPIFC (ENSVVUG00000023482) RTCB (ENSVVUG00000023408) ENSVVUG00000023398 PRDM4 (ENSVVUG00000023397) PWP1 (ENSVVUG00000023390) ABTB3 (ENSVVUG00000023211) CRY1 (ENSVVUG00000023184) MTERF2 (ENSVVUG00000023182) TMEM263 (ENSVVUG00000023180) RIC8B (ENSVVUG00000023164) RFX4 (ENSVVUG00000023150) Red fox MODERN SPECIES 37 PGM5 (ENSVVUG00000004340) TMEM252 (ENSVVUG00000004338) PIP5K1B (ENSVVUG00000004306) FXN (ENSVVUG00000004304) TJP2 (ENSVVUG00000004207) ENSVVUG00000004192 FAM189A2 (ENSVVUG00000004164) APBA1 (ENSVVUG00000004105) ENSVVUG00000004075 PTAR1 (ENSVVUG00000004054) CUNH9orf135 (ENSVVUG00000004036) MAMDC2 (ENSVVUG00000004006) SMC5 (ENSVVUG00000003940) KLF9 (ENSVVUG00000003932) TRPM3 (ENSVVUG00000003834) ENSVVUG00000003804 ##22 ENSVVUG00000003791 CEMIP2 (ENSVVUG00000003729) ABHD17B (ENSVVUG00000003713) CUNH9orf85 (ENSVVUG00000003703) ENSVVUG00000003697 GDA (ENSVVUG00000003650) ZFAND5 (ENSVVUG00000003622) TMC1 (ENSVVUG00000003266) ALDH1A1 (ENSVVUG00000003231) ANXA1 (ENSVVUG00000003204) ENSVVUG00000003184 ENSVVUG00000003173 RORB (ENSVVUG00000002470) TRPM6 (ENSVVUG00000002363) ENSVVUG00000002351 Red fox MODERN SPECIES 94 ENSVVUG00000017020 ENSVVUG00000017021 ENSVVUG00000017025 OR5B2 (ENSVVUG00000017032) ENSVVUG00000017034 ENSVVUG00000017036 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BICC1 (ENSVVUG00000008341) TFAM (ENSVVUG00000008325) UBE2D1 (ENSVVUG00000008320) ENSVVUG00000008280 IPMK (ENSVVUG00000008271) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01100000263498.b.a.a.d.a.a.a.b.b ENSGT01100000263498.b.a.a.d.b.a.b.a ENSGT01100000263498.b.a.a.d.a.a.b.a.e ENSGT01100000263498.b.a.a.d.b.b ENSGT01100000263498.b.a.a.d.a.a.a.a.b ENSGT01100000263498.b.a.a.d.a.a.a.a.a ENSGT01060000248581.A.a.a.a.k ENSGT01060000248581.A.a.b ENSGT01060000248581.A.a.a.a.l ENSGT00940000162899 ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.b.c.e ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.b.c.f ENSGT01100000263494.a.b.a.a.b ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a ENSGT01090000260045.C.e.a.a.a.b.a ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT01100000263498.a.a ENSGT00940000156045 ENSGT00560000078563 ENSGT00390000003751.a ENSGT00390000001774 ENSGT00940000156001 ENSGT00940000153668.B ENSGT00940000161443 ENSGT00940000159681 ENSGT00940000161981 ENSGT00940000162276 ENSGT00390000003068 ENSGT00940000153576.c.a ENSGT00940000158505 ENSGT00940000157622 Dog DUPLICATION Dog MODERN SPECIES 9 OR5B2B (ENSCAFG00845018583) OR5B2 (ENSCAFG00845018642) OR5B3 (ENSCAFG00845018668) OR5B31 (ENSCAFG00845018698) OR5B35 (ENSCAFG00845018730) OR5B33 (ENSCAFG00845018762) ENSCAFG00845018807 OR10W1 (ENSCAFG00845018824) ENSCAFG00845018843 ENSCAFG00845018886 ENSCAFG00845018915 OR9Q4 (ENSCAFG00845018938) ENSCAFG00845018963 OR9I1 (ENSCAFG00845018992) OR6Q1 (ENSCAFG00845019017) ENSCAFG00845019049 ##22 ENSCAFG00845019062 CTNND1 (ENSCAFG00845019357) BTBD18 (ENSCAFG00845020281) TMX2 (ENSCAFG00845020311) MED19 (ENSCAFG00845020361) ZDHHC5 (ENSCAFG00845020408) CLP1 (ENSCAFG00845020482) YPEL (ENSCAFG00845020539) SERPING1 (ENSCAFG00845020645) UBE2L6 (ENSCAFG00845020791) SMTNL1 (ENSCAFG00845020817) TIMM10 (ENSCAFG00845020870) SLC43A1 (ENSCAFG00845020974) RTN4RL2 (ENSCAFG00845021213) SLC43A3 (ENSCAFG00845021319) Dog MODERN SPECIES 32 ZNF365 (ENSCAFG00845003326) RTKN2 (ENSCAFG00845003274) ARID5B (ENSCAFG00845003220) CABCOCO1 (ENSCAFG00845003174) TMEM26 (ENSCAFG00845003132) ENSCAFG00845003111 RHOBTB1 (ENSCAFG00845003029) CDK1 (ENSCAFG00845002973) ANK3 (ENSCAFG00845002592) CCDC6 (ENSCAFG00845002409) ENSCAFG00845002372 SLC16A9 (ENSCAFG00845002335) FAM13C (ENSCAFG00845002255) PHYHIPL (ENSCAFG00845002117) ENSCAFG00845002085 ENSCAFG00845002063 ##22 BICC1 (ENSCAFG00845002009) TFAM (ENSCAFG00845001967) UBE2D1 (ENSCAFG00845001917) ENSCAFG00845001878 ENSCAFG00845001859 RHOU (ENSCAFG00845001719) ENSCAFG00845001681 RAB4A (ENSCAFG00845001626) CCSAP (ENSCAFG00845001564) NUP133 (ENSCAFG00845001518) ABCB10 (ENSCAFG00845001468) ENSCAFG00845001416 TAF5L (ENSCAFG00845001360) URB2 (ENSCAFG00845001297) GALNT2 (ENSCAFG00845001196) Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 307 ENSCAFG00020004527 ENSCAFG00020004537 RBFOX2 (ENSCAFG00020004541) ENSCAFG00020004550 ENSCAFG00020004553 ENSCAFG00020004556 MB (ENSCAFG00020004565) RASD2 (ENSCAFG00020004566) MCM5 (ENSCAFG00020004568) HMOX1 (ENSCAFG00020004569) TOM1 (ENSCAFG00020004581) HMGXB4 (ENSCAFG00020004587) ISX (ENSCAFG00020004651) ENSCAFG00020004691 LARGE1 (ENSCAFG00020004723) ENSCAFG00020004732 ##22 ENSCAFG00020004742 TIMP3 (ENSCAFG00020004747) ENSCAFG00020004756 FBXO7 (ENSCAFG00020004763) BPIFC (ENSCAFG00020004848) ENSCAFG00020004890 ASCL4 (ENSCAFG00020004911) PRDM4 (ENSCAFG00020004916) ENSCAFG00020004919 PWP1 (ENSCAFG00020004921) ABTB3 (ENSCAFG00020004942) CRY1 (ENSCAFG00020004979) MTERF2 (ENSCAFG00020004993) TMEM263 (ENSCAFG00020004996) RIC8B (ENSCAFG00020005022) Dingo MODERN SPECIES 69 LPXN (ENSCAFG00020001181) OR5B21 (ENSCAFG00020001173) OR5B12 (ENSCAFG00020001168) ENSCAFG00020001126 ENSCAFG00020001114 OR5B2 (ENSCAFG00020001108) OR5B3 (ENSCAFG00020001097) ENSCAFG00020001082 ENSCAFG00020001064 ENSCAFG00020001051 ENSCAFG00020001045 OR9Q2 (ENSCAFG00020001033) ENSCAFG00020001030 OR9I1 (ENSCAFG00020001023) OR6Q1 (ENSCAFG00020001013) ENSCAFG00020001008 ##22 CTNND1 (ENSCAFG00020000969) BTBD18 (ENSCAFG00020000960) TMX2 (ENSCAFG00020000934) MED19 (ENSCAFG00020000914) ZDHHC5 (ENSCAFG00020000906) CLP1 (ENSCAFG00020000903) YPEL4 (ENSCAFG00020000835) SERPING1 (ENSCAFG00020000809) UBE2L6 (ENSCAFG00020000807) SMTNL1 (ENSCAFG00020000753) TIMM10 (ENSCAFG00020000744) SLC43A1 (ENSCAFG00020000733) RTN4RL2 (ENSCAFG00020000714) SLC43A3 (ENSCAFG00020000707) ENSCAFG00020000701 Dingo MODERN SPECIES 324 ARID5B (ENSCAFG00020026682) CABCOCO1 (ENSCAFG00020026683) ENSCAFG00020026685 TMEM26 (ENSCAFG00020026691) RHOBTB1 (ENSCAFG00020026694) CDK1 (ENSCAFG00020026698) ENSCAFG00020026701 ENSCAFG00020026712 ENSCAFG00020026801 CCDC6 (ENSCAFG00020026872) SLC16A9 (ENSCAFG00020026878) FAM13C (ENSCAFG00020026881) PHYHIPL (ENSCAFG00020026885) ENSCAFG00020026886 BICC1 (ENSCAFG00020026888) ENSCAFG00020026889 ##22 TFAM (ENSCAFG00020026891) UBE2D1 (ENSCAFG00020026892) CISD1 (ENSCAFG00020026893) IPMK (ENSCAFG00020026894) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Ursus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Polar bear MODERN SPECIES 342 ENSUMAG00000000867 MASTL (ENSUMAG00000000892) ACBD5 (ENSUMAG00000000936) ABI1 (ENSUMAG00000000981) ENSUMAG00000001406 ENSUMAG00000001414 ENSUMAG00000001437 APBB1IP (ENSUMAG00000001466) ENSUMAG00000001490 GAD2 (ENSUMAG00000001504) MYO3A (ENSUMAG00000001650) ENSUMAG00000001802 ##22 GPR158 (ENSUMAG00000001813) American black bear MODERN SPECIES 5225 ENSUAMG00000018692 ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 American mink MODERN SPECIES 139 NOP14 (ENSNVIG00000001159) GRK4 (ENSNVIG00000001210) HTT (ENSNVIG00000001469) MSANTD1 (ENSNVIG00000005202) ENSNVIG00000005214 ENSNVIG00000005232 HGFAC (ENSNVIG00000005255) ENSNVIG00000005312 LRPAP1 (ENSNVIG00000005321) HMX1 (ENSNVIG00000005343) CPZ (ENSNVIG00000005357) TRMT44 (ENSNVIG00000005444) ACOX3 (ENSNVIG00000005462) HTRA3 (ENSNVIG00000005532) SH3TC1 (ENSNVIG00000005580) ENSNVIG00000005654 ##22 ABLIM2 (ENSNVIG00000005686) ENSNVIG00000006127 AFAP1 (ENSNVIG00000006148) SORCS2 (ENSNVIG00000006257) GRPEL1 (ENSNVIG00000006297) TADA2B (ENSNVIG00000006308) ENSNVIG00000006315 TBC1D14 (ENSNVIG00000006343) KIAA0232 (ENSNVIG00000006465) BLOC1S4 (ENSNVIG00000006492) ENSNVIG00000006498 S100P (ENSNVIG00000006501) ENSNVIG00000006512 ENSNVIG00000006515 ENSNVIG00000006525 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00530000067301 #7 ENSGT00390000004173 #9 ENSGT01070000253847 #8 ENSGT00940000159599 #10 ENSGT00940000161879 #11 ENSGT00620000087993.a.b #13 ENSGT00940000157260 #14 ENSGT00520000055567.b #15 ENSGT01090000260447 ENSGT00940000157740 #18 ENSGT00500000045882 ENSGT00940000163172 ENSGT00940000153295.a #20 ENSGT00390000007879 #21 ENSGT00950000182802.B.a.b ##22 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000159314 #24 ENSGT00940000155194 #26 ENSGT00390000013174 #27 ENSGT00940000156585 #28 ENSGT00950000183172.B #30 ENSGT00390000004191 #31 ENSGT00390000015719.c #33 ENSGT00940000155361 #34 ENSGT00390000016565 #36 ENSGT00940000160747 ENSGT00940000156338 ENSGT00950000182900.B ENSGT00390000007371 ENSGT00940000160932 ENSGT00940000159398 Arabian camel MODERN SPECIES 4 PDIK1L (ENSCDRG00005005581) FAM110D (ENSCDRG00005005595) C1orf232 (ENSCDRG00005005611) #7 ZNF593 (ENSCDRG00005005654) #9 ZNF593OS (ENSCDRG00005005667) #8 CNKSR1 (ENSCDRG00005005684) #10 CATSPER4 (ENSCDRG00005005716) #11 CEP85 (ENSCDRG00005005745) #13 SH3BGRL3 (ENSCDRG00005005804) #14 UBXN11 (ENSCDRG00005005817) #15 ENSCDRG00005005874 CRYBG2 (ENSCDRG00005005884) #18 ZNF683 (ENSCDRG00005005912) LIN28A (ENSCDRG00005005930) #20 DHDDS (ENSCDRG00005005975) #21 ENSCDRG00005006053 ##22 RPS6KA1 (ENSCDRG00005006116) #24 ARID1A (ENSCDRG00005006498) #26 PIGV (ENSCDRG00005006607) #27 ZDHHC18 (ENSCDRG00005006661) #28 GPN2 (ENSCDRG00005006791) #30 GPATCH3 (ENSCDRG00005006833) #31 NR0B2 (ENSCDRG00005006876) #33 NUDC (ENSCDRG00005006914) #34 KDF1 (ENSCDRG00005007013) #36 TENT5B (ENSCDRG00005007132) SLC9A1 (ENSCDRG00005007172) WDTC1 (ENSCDRG00005007230) ENSCDRG00005007278 SYTL1 (ENSCDRG00005007351) MAP3K6 (ENSCDRG00005007422) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Yarkand deer MODERN SPECIES 19 SYT4 (ENSCHYG00000023253) PIK3C3 (ENSCHYG00000022452) CELF4 (ENSCHYG00000022121) ENSCHYG00000022088 ENSCHYG00000022059 KIAA1328 (ENSCHYG00000021992) TPGS2 (ENSCHYG00000021806) FHOD3 (ENSCHYG00000020663) MOCOS (ENSCHYG00000020478) ELP2 (ENSCHYG00000019094) SLC39A6 (ENSCHYG00000018931) RPRD1A (ENSCHYG00000018735) ENSCHYG00000018675 C18orf21 (ENSCHYG00000018586) ENSCHYG00000018558 ENSCHYG00000018508 ##22 GALNT1 (ENSCHYG00000018348) INO80C (ENSCHYG00000018185) ZNF24 (ENSCHYG00000018141) ENSCHYG00000018124 ZNF397 (ENSCHYG00000018037) ZSCAN30 (ENSCHYG00000017887) ENSCHYG00000017843 MAPRE2 (ENSCHYG00000017572) ENSCHYG00000017502 DTNA (ENSCHYG00000016221) NOL4 (ENSCHYG00000015738) ASXL3 (ENSCHYG00000015573) CCDC178 (ENSCHYG00000014402) KLHL14 (ENSCHYG00000014241) GAREM1 (ENSCHYG00000014077) Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 146 ENSMMSG00000011714 ENSMMSG00000011695 CELF4 (ENSMMSG00000011061) KIAA1328 (ENSMMSG00000010948) TPGS2 (ENSMMSG00000010880) ENSMMSG00000010863 FHOD3 (ENSMMSG00000010024) MOCOS (ENSMMSG00000009861) ELP2 (ENSMMSG00000009636) SLC39A6 (ENSMMSG00000009577) RPRD1A (ENSMMSG00000009522) C18orf21 (ENSMMSG00000009486) ENSMMSG00000009461 ENSMMSG00000009427 ##22 ENSMMSG00000009375 INO80C (ENSMMSG00000009323) ZNF24 (ENSMMSG00000009299) ENSMMSG00000009283 ZSCAN30 (ENSMMSG00000009228) ZNF397 (ENSMMSG00000009171) ENSMMSG00000009145 MAPRE2 (ENSMMSG00000009070) DTNA (ENSMMSG00000009262) NOL4 (ENSMMSG00000008980) ASXL3 (ENSMMSG00000008903) ENSMMSG00000008871 CCDC178 (ENSMMSG00000007704) KLHL14 (ENSMMSG00000007588) GAREM1 (ENSMMSG00000007550) Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00950000183198.c.b.b.d ENSGT00940000159026 ENSGT00390000009168.v.a ENSGT00940000156943 ENSGT00940000158673 ENSGT01100000263480.a.a.b.a.a.a.b.a.a.a.b.b.b.b.a.b.a.b.b.a.b ENSGT00390000011152 ENSGT00940000164615 ENSGT00390000018344.l ENSGT00940000154807.b ENSGT00940000157051 ENSGT00390000000916 ENSGT00940000156387 ENSGT00950000183094.b.b ENSGT00390000013383 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000154732 ENSGT00390000014303 ENSGT00940000161396 ENSGT00940000162162 ENSGT00940000162441 ENSGT00940000153299.c.b.a.a ENSGT00490000043329.a.a.b ENSGT00940000153897.a ENSGT00940000159992 ENSGT00520000055578.a.a.d ENSGT00390000012215 ENSGT00940000159556 ENSGT00530000063834.e.a ENSGT00950000183111.b.a ENSGT00950000182909.b.a.a.r.b.b Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 16 ENSBIXG00005021310 SYT4 (ENSBIXG00005021298) ENSBIXG00005021256 PIK3C3 (ENSBIXG00005021196) ENSBIXG00005003533 CELF4 (ENSBIXG00005020844) KIAA1328 (ENSBIXG00005020555) ENSBIXG00005020493 TPGS2 (ENSBIXG00005020487) FHOD3 (ENSBIXG00005020362) MOCOS (ENSBIXG00005020142) ELP2 (ENSBIXG00005020049) SLC39A6 (ENSBIXG00005003260) RPRD1A (ENSBIXG00005019871) C18orf21 (ENSBIXG00005019818) ENSBIXG00005019757 ##22 ENSBIXG00005019700 ENSBIXG00005019666 INO80C (ENSBIXG00005003210) ZNF24 (ENSBIXG00005019624) ENSBIXG00005006651 ZSCAN30 (ENSBIXG00005019492) ENSBIXG00005005522 MAPRE2 (ENSBIXG00005019431) DTNA (ENSBIXG00005019266) ENSBIXG00005018632 ENSBIXG00005018626 NOL4 (ENSBIXG00005018563) ASXL3 (ENSBIXG00005018458) CCDC178 (ENSBIXG00005018353) KLHL14 (ENSBIXG00005017797) Cow MODERN SPECIES 16 ENSBTAG00000045568 PIK3C3 (ENSBTAG00000026290) ENSBTAG00000053048 #25 ENSBTAG00000049926 ENSBTAG00000011094 CELF4 (ENSBTAG00000004940) ENSBTAG00000044087 ENSBTAG00000048612 TPGS2 (ENSBTAG00000021583) FHOD3 (ENSBTAG00000021581) MOCOS (ENSBTAG00000012252) ELP2 (ENSBTAG00000018954) SLC39A6 (ENSBTAG00000000998) RPRD1A (ENSBTAG00000005497) C24H18orf21 (ENSBTAG00000011622) ENSBTAG00000052576 ##22 GALNT1 (ENSBTAG00000011206) INO80C (ENSBTAG00000012426) ZNF24 (ENSBTAG00000010255) ZNF397 (ENSBTAG00000010252) ZSCAN30 (ENSBTAG00000054149) ENSBTAG00000015315 MAPRE2 (ENSBTAG00000007520) DTNA (ENSBTAG00000012307) NOL4 (ENSBTAG00000010299) ASXL3 (ENSBTAG00000047003) CCDC178 (ENSBTAG00000000138) KLHL14 (ENSBTAG00000020003) GAREM1 (ENSBTAG00000020286) MEP1B (ENSBTAG00000020391) RNF138 (ENSBTAG00000020160) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT01030000235049 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b ENSGT00510000049102 ENSGT00940000160532 ENSGT00970000198317 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000183087.A.a.a.a.a.b ENSGT00940000153568.B ENSGT00390000011515 ENSGT01040000241150 ENSGT00940000154817.b.b.b ENSGT00940000159158 ENSGT00940000159213 ENSGT00940000159862 ENSGT00940000155984 ENSGT00940000163000 ENSGT00940000156332 ENSGT00940000157211 ENSGT00390000010354 ENSGT00390000006925 ENSGT00940000160618 Goat MODERN SPECIES 11 ENSCHIG00000023149 ENSCHIG00000009122 TMEFF2 (ENSCHIG00000024847) CAVIN2 (ENSCHIG00000019774) NABP1 (ENSCHIG00000025573) MYO1B (ENSCHIG00000013498) STAT4 (ENSCHIG00000020943) STAT1 (ENSCHIG00000009728) GLS (ENSCHIG00000008500) ENSCHIG00000026149 ENSCHIG00000021291 ENSCHIG00000020984 ENSCHIG00000014237 CNTNAP5 (ENSCHIG00000009353) ENSCHIG00000026511 ENSCHIG00000012076 ##22 ENSCHIG00000020518 TSN (ENSCHIG00000010715) NIFK (ENSCHIG00000010512) CLASP1 (ENSCHIG00000022334) ENSCHIG00000010032 TFCP2L1 (ENSCHIG00000014608) GLI2 (ENSCHIG00000017600) INHBB (ENSCHIG00000024398) RALB (ENSCHIG00000019125) TMEM185B (ENSCHIG00000012850) ENSCHIG00000009337 ENSCHIG00000014138 ENSCHIG00000018796 PTPN4 (ENSCHIG00000012348) ENSCHIG00000021745 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 11 HECW2 (ENSOARG00020008825) STK17B (ENSOARG00020008783) ENSOARG00020008748 DNAH7 (ENSOARG00020008105) SLC39A10 (ENSOARG00020008005) ENSOARG00020007907 ENSOARG00020007893 TMEFF2 (ENSOARG00020007844) CAVIN2 (ENSOARG00020007809) ENSOARG00020007703 MYO1B (ENSOARG00020007023) ENSOARG00020006933 CNTNAP5 (ENSOARG00020006735) ENSOARG00020006673 ENSOARG00020006612 ENSOARG00020006595 ##22 ENSOARG00020006557 ENSOARG00020006534 ENSOARG00020024099 ENSOARG00020024083 TSN (ENSOARG00020024047) NIFK (ENSOARG00020024037) ENSOARG00020024020 CLASP1 (ENSOARG00020023927) ENSOARG00020023891 TFCP2L1 (ENSOARG00020023824) GLI2 (ENSOARG00020023763) INHBB (ENSOARG00020023725) RALB (ENSOARG00020023701) TMEM185B (ENSOARG00020023687) EPB41L5 (ENSOARG00020023616) Cetacea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000008727.a.b ENSGT00390000012816 ENSGT00910000144250 ENSGT00550000074912 ENSGT00940000156159 ENSGT00390000011698.c.b ENSGT00940000160102 ENSGT00390000012397 ENSGT00950000183181.B.a ENSGT00940000156452 ENSGT00950000182998.A ENSGT00390000002032 ENSGT00390000018097 ENSGT00390000001277 ENSGT00940000155077.f ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000158583 ENSGT00940000156899 ENSGT00940000155226 ENSGT00940000154832 ENSGT00390000010439 ENSGT00940000160091 ENSGT00940000156487 ENSGT00940000160820 ENSGT00390000002319 ENSGT00940000153304.B ENSGT00940000156982 ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00940000158220 ENSGT00940000156774 ENSGT00390000018691 Blue whale MODERN SPECIES 11 SLC35F4 (ENSBMSG00010006486) ARMH4 (ENSBMSG00010006512) ACTR10 (ENSBMSG00010006532) PSMA3 (ENSBMSG00010006547) ARID4A (ENSBMSG00010006597) TOMM20L (ENSBMSG00010006639) TIMM9 (ENSBMSG00010006673) KIAA0586 (ENSBMSG00010006894) DACT1 (ENSBMSG00010007147) DAAM1 (ENSBMSG00010007204) GPR135 (ENSBMSG00010007228) L3HYPDH (ENSBMSG00010007243) JKAMP (ENSBMSG00010007274) CCDC175 (ENSBMSG00010007322) RTN1 (ENSBMSG00010007376) ENSBMSG00010007407 ##22 LRRC9 (ENSBMSG00010007533) PCNX4 (ENSBMSG00010007679) DHRS7 (ENSBMSG00010007688) PPM1A (ENSBMSG00010007693) C14orf39 (ENSBMSG00010007715) SIX6 (ENSBMSG00010007733) SIX1 (ENSBMSG00010007741) SIX4 (ENSBMSG00010007749) MNAT1 (ENSBMSG00010007760) TRMT5 (ENSBMSG00010007803) SLC38A6 (ENSBMSG00010007835) ENSBMSG00010007847 PRKCH (ENSBMSG00010007864) HIF1A (ENSBMSG00010008000) SNAPC1 (ENSBMSG00010008427) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000008727.a.b ENSGT00390000012816 ENSGT00910000144250 ENSGT00550000074912 ENSGT00940000156159 ENSGT00390000011698.c.b ENSGT00940000160102 ENSGT00390000012397 ENSGT00950000183181.B.a ENSGT00940000156452 ENSGT00950000182998.A ENSGT00390000002032 ENSGT00390000018097 ENSGT00390000001277 ENSGT00940000155077.f ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000158583 ENSGT00940000156899 ENSGT00940000155226 ENSGT00940000154832 ENSGT00390000010439 ENSGT00940000160091 ENSGT00940000156487 ENSGT00940000160820 ENSGT00390000002319 ENSGT00940000153304.B ENSGT00940000156982 ENSGT00940000162029.a ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00940000158220 ENSGT00940000156774 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000154550.a.e.b ENSGT00990000213840 ENSGT00940000158277 ENSGT00910000144227.s.b ENSGT00940000163344.a ENSGT00950000182956.b.b.a.a.c.a.l.b ENSGT00390000004417.a.c.a ENSGT01000000216059 ENSGT00940000156295 ENSGT00940000160324 ENSGT00940000155249 ENSGT00940000154953 ENSGT00440000037338 ENSGT00390000002565.y.a ENSGT00950000183174.B.a ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157090 ENSGT00940000155541.C.db.b.a ENSGT00390000006790.b ENSGT00390000018549 ENSGT00940000157250.p ENSGT00940000154521.A ENSGT00940000157318 ENSGT00390000005589.a.a ENSGT01030000234563.b.a.a ENSGT00950000183067.a.a ENSGT00950000182850.a.b.a.a ENSGT00530000063812.A ENSGT00940000159570 ENSGT00940000159423 ENSGT00390000000645 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000006284 ENSGT00940000154550.a.e.b ENSGT00990000213840 ENSGT00940000158277 ENSGT00910000144227.s.b ENSGT00940000163344.a ENSGT00390000004417.a.c.a ENSGT01000000216059 ENSGT00940000156295 ENSGT00940000160324 ENSGT00940000155249 ENSGT00940000154953 ENSGT00440000037338 ENSGT00390000002565.y.a ENSGT00950000183174.B.a ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157090 ENSGT00940000155541.C.db.b.a ENSGT00390000006790.b ENSGT00390000018549 ENSGT00940000157250.p ENSGT00940000154521.A ENSGT00940000157318 ENSGT00390000005589.a.a ENSGT01030000234563.b.a.a ENSGT00950000183067.a.a ENSGT00950000182850.a.b.a.a ENSGT00530000063812.A ENSGT00940000159570 ENSGT00940000159423 ENSGT00390000000645 Beluga whale MODERN SPECIES 77 ENSDLEG00000018927 PCDH10 (ENSDLEG00000018930) ENSDLEG00000018933 PABPC4L (ENSDLEG00000018935) ENSDLEG00000018941 ENSDLEG00000018951 PCDH18 (ENSDLEG00000018963) SLC7A11 (ENSDLEG00000018967) ENSDLEG00000018982 ENSDLEG00000018987 NOCT (ENSDLEG00000018993) ELF2 (ENSDLEG00000019002) MGARP (ENSDLEG00000019030) ENSDLEG00000019031 NAA15 (ENSDLEG00000019037) ENSDLEG00000019063 ##22 RAB33B (ENSDLEG00000019066) ENSDLEG00000019068 BLOC1S4 (ENSDLEG00000019071) KIAA0232 (ENSDLEG00000019074) TBC1D14 (ENSDLEG00000019083) CCDC96 (ENSDLEG00000019112) TADA2B (ENSDLEG00000019117) GRPEL1 (ENSDLEG00000019119) SORCS2 (ENSDLEG00000019131) AFAP1 (ENSDLEG00000019189) ABLIM2 (ENSDLEG00000019228) SH3TC1 (ENSDLEG00000019312) HTRA3 (ENSDLEG00000019321) ACOX3 (ENSDLEG00000019342) TRMT44 (ENSDLEG00000019402) Vaquita MODERN SPECIES 16 PABPC4L (ENSPSNG00000002851) ENSPSNG00000002838 ENSPSNG00000002823 ENSPSNG00000002803 PCDH18 (ENSPSNG00000002759) ENSPSNG00000002737 ENSPSNG00000002718 ENSPSNG00000002711 ENSPSNG00000002696 SLC7A11 (ENSPSNG00000002665) NOCT (ENSPSNG00000002626) ELF2 (ENSPSNG00000002585) MGARP (ENSPSNG00000002547) ENSPSNG00000002536 NAA15 (ENSPSNG00000002515) ENSPSNG00000002493 ##22 RAB33B (ENSPSNG00000002479) ENSPSNG00000002467 BLOC1S4 (ENSPSNG00000002460) KIAA0232 (ENSPSNG00000002420) TBC1D14 (ENSPSNG00000002281) CCDC96 (ENSPSNG00000002230) TADA2B (ENSPSNG00000002208) GRPEL1 (ENSPSNG00000002191) SORCS2 (ENSPSNG00000002142) AFAP1 (ENSPSNG00000002106) ABLIM2 (ENSPSNG00000001662) SH3TC1 (ENSPSNG00000001295) HTRA3 (ENSPSNG00000001248) ACOX3 (ENSPSNG00000001193) TRMT44 (ENSPSNG00000001139) Sperm whale DUPLICATION Sperm whale MODERN SPECIES CYYR1 (ENSPCTG00005001364) APP (ENSPCTG00005000709) GABPA (ENSPCTG00005000558) ATP5PF (ENSPCTG00005000538) #32 JAM2 (ENSPCTG00005000503) MRPL39 (ENSPCTG00005000471) ENSPCTG00005000440 ENSPCTG00005000423 NCAM2 (ENSPCTG00005000381) ENSPCTG00005000328 ENSPCTG00005000315 TMPRSS15 (ENSPCTG00005000270) CHODL (ENSPCTG00005021207) C21orf91 (ENSPCTG00005021184) BTG3 (ENSPCTG00005021168) ENSPCTG00005021160 ##22 ENSPCTG00005021142 ##22 CXADR (ENSPCTG00005021100) ENSPCTG00005021061 USP25 (ENSPCTG00005020926) ENSPCTG00005020890 NRIP1 (ENSPCTG00005020884) SAMSN1 (ENSPCTG00005020754) HSPA13 (ENSPCTG00005020678) ENSPCTG00005020352 RBM11 (ENSPCTG00005020241) LIPI (ENSPCTG00005020089) ENSPCTG00005019983 ROBO2 (ENSPCTG00005019510) ROBO1 (ENSPCTG00005018380) GBE1 (ENSPCTG00005018274) Sperm whale MODERN SPECIES 2 NAA30 (ENSPCTG00005022750) CCDC198 (ENSPCTG00005022752) SLC35F4 (ENSPCTG00005022755) ARMH4 (ENSPCTG00005022756) ACTR10 (ENSPCTG00005022758) ENSPCTG00005005585 ARID4A (ENSPCTG00005005643) TIMM9 (ENSPCTG00005005709) KIAA0586 (ENSPCTG00005005784) DACT1 (ENSPCTG00005005972) DAAM1 (ENSPCTG00005006033) L3HYPDH (ENSPCTG00005006127) JKAMP (ENSPCTG00005006188) CCDC175 (ENSPCTG00005006268) RTN1 (ENSPCTG00005006386) ENSPCTG00005006692 ##22 LRRC9 (ENSPCTG00005006731) PCNX4 (ENSPCTG00005006953) DHRS7 (ENSPCTG00005007007) PPM1A (ENSPCTG00005007048) C14orf39 (ENSPCTG00005007109) SIX6 (ENSPCTG00005007177) SIX1 (ENSPCTG00005007198) MNAT1 (ENSPCTG00005007267) TRMT5 (ENSPCTG00005007560) ENSPCTG00005007592 TMEM30B (ENSPCTG00005007608) PRKCH (ENSPCTG00005007622) HIF1A (ENSPCTG00005007669) SNAPC1 (ENSPCTG00005007861) SYT16 (ENSPCTG00005007917) Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Common shrew MODERN SPECIES 8482 ENSSARG00000013570 ##22 Hedgehog MODERN SPECIES 8896 ENSEEUG00000014374 ##22 AKAP11 (ENSEEUG00000014266) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000158412 ENSGT00950000183056.A.a ENSGT00530000067301 #7 ENSGT00390000004173 #9 ENSGT01070000253847 #8 ENSGT00940000159599 #10 ENSGT00940000161879 #11 ENSGT00620000087993.a.b #13 ENSGT00940000157260 #14 ENSGT00520000055567.b #15 ENSGT00940000157740 #18 ENSGT00940000163172 ENSGT00940000153295.a.m.a #20 ENSGT00390000007879 #21 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.i.b ##22 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000159314 #24 ENSGT00940000155194 #26 ENSGT00390000013174 #27 ENSGT00940000156585 #28 ENSGT00950000183172.B #30 ENSGT00390000004191 #31 ENSGT00390000015719.c #33 ENSGT00940000155361 #34 ENSGT00390000016565 #36 ENSGT00940000160747 ENSGT00940000156338 ENSGT00950000182900.B ENSGT00390000007371 ENSGT00940000160932 ENSGT00940000159398 Rabbit MODERN SPECIES 4 TRIM63 (ENSOCUG00000013564) PDIK1L (ENSOCUG00000010956) FAM110D (ENSOCUG00000039461) ENSOCUG00000033604 #7 ZNF593 (ENSOCUG00000013999) #9 ZNF593OS (ENSOCUG00000038218) #8 CNKSR1 (ENSOCUG00000023717) #10 CATSPER4 (ENSOCUG00000002929) #11 CEP85 (ENSOCUG00000016916) #13 SH3BGRL3 (ENSOCUG00000016927) #14 UBXN11 (ENSOCUG00000016938) #15 CRYBG2 (ENSOCUG00000016959) #18 ZNF683 (ENSOCUG00000016978) ENSOCUG00000000299 #20 DHDDS (ENSOCUG00000016993) #21 ENSOCUG00000032486 ##22 RPS6KA1 (ENSOCUG00000010887) #24 ARID1A (ENSOCUG00000005314) #26 PIGV (ENSOCUG00000017959) #27 ZDHHC18 (ENSOCUG00000006400) #28 ENSOCUG00000006407 #30 GPATCH3 (ENSOCUG00000006411) #31 NR0B2 (ENSOCUG00000006416) #33 NUDC (ENSOCUG00000006418) #34 KDF1 (ENSOCUG00000006421) #36 ENSOCUG00000006426 SLC9A1 (ENSOCUG00000023061) WDTC1 (ENSOCUG00000016358) TMEM222 (ENSOCUG00000007371) SYTL1 (ENSOCUG00000002371) MAP3K6 (ENSOCUG00000002379) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 2 ENSHGLG00000040800 ENSHGLG00000005241 BORA (ENSHGLG00000013729) DIS3 (ENSHGLG00000013785) PIBF1 (ENSHGLG00000007841) ENSHGLG00000004652 KLF5 (ENSHGLG00000005790) ENSHGLG00000004170 ENSHGLG00000005058 ENSHGLG00000006079 ENSHGLG00000003893 COMMD6 (ENSHGLG00000042434) ENSHGLG00000005038 LMO7 (ENSHGLG00000003836) ENSHGLG00000032347 ENSHGLG00000047148 ##22 KCTD12 (ENSHGLG00000044311) ENSHGLG00000020812 ACOD1 (ENSHGLG00000045158) ENSHGLG00000006432 CLN5 (ENSHGLG00000005042) FBXL3 (ENSHGLG00000004245) ENSHGLG00000048947 MYCBP2 (ENSHGLG00000006408) SCEL (ENSHGLG00000010544) ENSHGLG00000037008 SLAIN1 (ENSHGLG00000008516) EDNRB (ENSHGLG00000010112) POU4F1 (ENSHGLG00000007136) OBI1 (ENSHGLG00000006081) ENSHGLG00000003995 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 168 GNPAT (ENSODEG00000004666) C1orf131 (ENSODEG00000005944) TRIM67 (ENSODEG00000005770) FAM89A (ENSODEG00000005427) ARV1 (ENSODEG00000006367) TTC13 (ENSODEG00000004797) C1orf198 (ENSODEG00000004510) CAPN9 (ENSODEG00000004920) AGT (ENSODEG00000004670) ENSODEG00000005060 PGBD5 (ENSODEG00000005019) ENSODEG00000019102 GALNT2 (ENSODEG00000005632) ENSODEG00000004795 ENSODEG00000005199 ENSODEG00000019162 ##22 ENSODEG00000005978 URB2 (ENSODEG00000005593) TAF5L (ENSODEG00000005431) ENSODEG00000005015 ABCB10 (ENSODEG00000004723) NUP133 (ENSODEG00000007703) ACTA1 (ENSODEG00000007499) CCSAP (ENSODEG00000004790) ENSODEG00000004796 RHOU (ENSODEG00000004343) Degu MODERN SPECIES 241 PDXDC1 (ENSODEG00000002216) MPV17L (ENSODEG00000002011) BMERB1 (ENSODEG00000001930) MARF1 (ENSODEG00000001725) ENSODEG00000001648 ENSODEG00000001633 MYH11 (ENSODEG00000003053) CEP20 (ENSODEG00000002999) ABCC1 (ENSODEG00000002850) ABCC6 (ENSODEG00000002667) ENSODEG00000002624 XYLT1 (ENSODEG00000002470) ENSODEG00000018884 RPS15A (ENSODEG00000002412) ENSODEG00000002384 ENSODEG00000018866 ##22 SMG1 (ENSODEG00000002351) ENSODEG00000002304 ENSODEG00000002291 SYT17 (ENSODEG00000002266) ITPRIPL2 (ENSODEG00000018844) COQ7 (ENSODEG00000004450) TMC7 (ENSODEG00000004388) TMC5 (ENSODEG00000004251) GDE1 (ENSODEG00000004207) ENSODEG00000004188 ENSODEG00000019040 ENSODEG00000019050 Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 255 CERS4 (ENSODEG00000012322) CD320 (ENSODEG00000011308) NDUFA7 (ENSODEG00000011906) RPS28 (ENSODEG00000012169) ENSODEG00000013962 ANGPTL4 (ENSODEG00000011879) RAB11B (ENSODEG00000011371) ENSODEG00000019849 ENSODEG00000010763 ENSODEG00000010314 ZNF414 (ENSODEG00000010741) ENSODEG00000019782 MYO1F (ENSODEG00000010712) ADAMTS10 (ENSODEG00000010286) OR2Z1 (ENSODEG00000019889) ENSODEG00000019765 ##22 ENSODEG00000010124 ZNF558 (ENSODEG00000010485) ENSODEG00000010460 Degu MODERN SPECIES 157 TSTD1 (ENSODEG00000010923) ENSODEG00000008881 F11R (ENSODEG00000007564) ENSODEG00000008250 ENSODEG00000007329 ENSODEG00000007561 ENSODEG00000007745 ENSODEG00000008083 ENSODEG00000009437 ENSODEG00000008141 ENSODEG00000009874 ENSODEG00000008491 SLAMF1 (ENSODEG00000009203) CD84 (ENSODEG00000007652) ENSODEG00000019654 ENSODEG00000019372 ##22 VANGL2 (ENSODEG00000007301) NHLH1 (ENSODEG00000007624) NCSTN (ENSODEG00000007729) COPA (ENSODEG00000007358) ENSODEG00000019505 PEX19 (ENSODEG00000008129) DCAF8 (ENSODEG00000008873) ENSODEG00000008689 PEA15 (ENSODEG00000008919) CASQ1 (ENSODEG00000007881) ATP1A4 (ENSODEG00000009334) ATP1A2 (ENSODEG00000009923) IGSF8 (ENSODEG00000011607) KCNJ9 (ENSODEG00000009424) KCNJ10 (ENSODEG00000008231) Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 102 MYO6 (ENSODEG00000004585) IMPG1 (ENSODEG00000004752) ENSODEG00000019128 HTR1B (ENSODEG00000004895) MEI4 (ENSODEG00000004184) ENSODEG00000004202 IRAK1BP1 (ENSODEG00000004218) ENSODEG00000004247 ENSODEG00000004261 LCA5 (ENSODEG00000004406) ENSODEG00000019022 ENSODEG00000004441 ENSODEG00000004582 ELOVL4 (ENSODEG00000004597) ENSODEG00000004627 ENSODEG00000019046 ##22 ENSODEG00000004648 KCNQ5 (ENSODEG00000004476) ENSODEG00000004685 ENSODEG00000004801 ENSODEG00000019070 ENSODEG00000004821 B3GAT2 (ENSODEG00000004838) SMAP1 (ENSODEG00000004883) SDHAF4 (ENSODEG00000004921) FAM135A (ENSODEG00000004939) ENSODEG00000005617 COL19A1 (ENSODEG00000005899) ENSODEG00000004181 LMBRD1 (ENSODEG00000004262) ENSODEG00000004325 Degu MODERN SPECIES 45 ENSODEG00000019965 C12orf75 (ENSODEG00000012089) APPL2 (ENSODEG00000011483) WASHC4 (ENSODEG00000014832) ALDH1L2 (ENSODEG00000012884) SLC41A2 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Degu MODERN SPECIES 204 PDIK1L (ENSODEG00000003711) FAM110D (ENSODEG00000019104) C1orf232 (ENSODEG00000003718) #7 ZNF593 (ENSODEG00000003869) #9 ZNF593OS (ENSODEG00000003889) #8 CNKSR1 (ENSODEG00000004045) #10 ENSODEG00000019012 CEP85 (ENSODEG00000004089) #13 ENSODEG00000004141 #14 UBXN11 (ENSODEG00000004163) #15 ENSODEG00000004203 #18 ENSODEG00000004272 ENSODEG00000004283 ##20 DHDDS (ENSODEG00000004324) #21 ENSODEG00000004366 ##22 ENSODEG00000019074 RPS6KA1 (ENSODEG00000005545) #24 ENSODEG00000005573 ARID1A (ENSODEG00000005639) #26 PIGV (ENSODEG00000005864) #27 ZDHHC18 (ENSODEG00000003193) #28 ENSODEG00000018988 #29 GPN2 (ENSODEG00000003267) #30 GPATCH3 (ENSODEG00000003292) #31 NR0B2 (ENSODEG00000003311) #33 ENSODEG00000003339 #34 ENSODEG00000003581 #36 TRNP1 (ENSODEG00000003604) TENT5B (ENSODEG00000003616) SLC9A1 (ENSODEG00000003659) Degu MODERN SPECIES 60 CEP135 (ENSODEG00000010808) EXOC1 (ENSODEG00000010280) EXOC1L (ENSODEG00000011413) NMU (ENSODEG00000010066) PDCL2 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(ENSODEG00000007604) ECT2L (ENSODEG00000011163) ENSODEG00000009856 ##22 ENSODEG00000009581 ENSODEG00000009059 ENSODEG00000007997 NHSL1 (ENSODEG00000008039) HEBP2 (ENSODEG00000007586) ENSODEG00000009708 ARFGEF3 (ENSODEG00000008382) ENSODEG00000008459 TNFAIP3 (ENSODEG00000008925) ENSODEG00000019565 OLIG3 (ENSODEG00000019534) ENSODEG00000019506 ENSODEG00000008408 IL22RA2 (ENSODEG00000007775) IL20RA (ENSODEG00000006756) Degu MODERN SPECIES 117 DDX54 (ENSODEG00000014863) CFAP73 (ENSODEG00000012352) RASAL1 (ENSODEG00000012525) DTX1 (ENSODEG00000013450) OAS2 (ENSODEG00000013276) OAS3 (ENSODEG00000013221) OAS1 (ENSODEG00000011899) RPH3A (ENSODEG00000012496) ENSODEG00000019909 ENSODEG00000011453 PTPN11 (ENSODEG00000012557) ENSODEG00000011835 HECTD4 (ENSODEG00000012009) NAA25 (ENSODEG00000010753) MAPKAPK5 (ENSODEG00000011587) ENSODEG00000019875 ##22 ALDH2 (ENSODEG00000010888) ENSODEG00000012368 ENSODEG00000012065 BRAP (ENSODEG00000011525) ATXN2 (ENSODEG00000010798) SH2B3 (ENSODEG00000012542) CUX2 (ENSODEG00000013686) ENSODEG00000010703 MYL2 (ENSODEG00000012393) ENSODEG00000010371 HVCN1 (ENSODEG00000010422) PPTC7 (ENSODEG00000010585) ENSODEG00000010285 GPN3 (ENSODEG00000011445) ##30 ENSODEG00000010625 Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 66 ENSODEG00000019563 ENSODEG00000008411 ENSODEG00000008135 ENSODEG00000011138 AOX1 (ENSODEG00000012914) ENSODEG00000009211 SPATS2L (ENSODEG00000009851) MAIP1 (ENSODEG00000008914) TYW5 (ENSODEG00000009836) C2orf69 (ENSODEG00000008700) SATB2 (ENSODEG00000008383) PLCL1 (ENSODEG00000008918) BOLL (ENSODEG00000008471) RFTN2 (ENSODEG00000008704) MOB4 (ENSODEG00000009609) ENSODEG00000019874 ##22 ENSODEG00000011397 ENSODEG00000009026 COQ10B (ENSODEG00000008396) ENSODEG00000011153 ENSODEG00000019820 ENSODEG00000008898 ENSODEG00000008698 ENSODEG00000009525 PGAP1 (ENSODEG00000009932) ENSODEG00000009843 CCDC150 (ENSODEG00000009669) ENSODEG00000009135 STK17B (ENSODEG00000009479) ENSODEG00000010152 ENSODEG00000009266 Degu MODERN SPECIES 66 ENSODEG00000019563 CLK1 (ENSODEG00000009021) PPIL3 (ENSODEG00000007592) NIF3L1 (ENSODEG00000008894) ORC2 (ENSODEG00000008853) ENSODEG00000007860 HYCC2 (ENSODEG00000008316) NDUFB3 (ENSODEG00000010233) CFLAR (ENSODEG00000009559) CASP8 (ENSODEG00000009065) TRAK2 (ENSODEG00000007402) STRADB (ENSODEG00000010540) TMEM237 (ENSODEG00000009685) MPP4 (ENSODEG00000009252) ALS2 (ENSODEG00000007275) ENSODEG00000008122 ##22 ENSODEG00000019906 ENSODEG00000010587 Degu MODERN SPECIES 132 XKR9 (ENSODEG00000003655) LACTB2 (ENSODEG00000003774) TRAM1 (ENSODEG00000003735) ENSODEG00000018956 NCOA2 (ENSODEG00000003435) PRDM14 (ENSODEG00000003245) ENSODEG00000018928 SLCO5A1 (ENSODEG00000005815) SULF1 (ENSODEG00000005337) ENSODEG00000004397 ENSODEG00000004347 ENSODEG00000004297 C8orf34 (ENSODEG00000004237) PREX2 (ENSODEG00000004186) CPA6 (ENSODEG00000003792) ENSODEG00000019000 ##22 ARFGEF1 (ENSODEG00000003588) ENSODEG00000003449 ENSODEG00000003399 ENSODEG00000003385 PPP1R42 (ENSODEG00000003329) TCF24 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(ENSCLAG00000015299) FSTL1 (ENSCLAG00000009617) ENSCLAG00000013373 LRRC58 (ENSCLAG00000013874) GPR156 (ENSCLAG00000011487) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 11 KCNK13 (ENSSVLG00005013326) TDP1 (ENSSVLG00005013476) EFCAB11 (ENSSVLG00005013546) ENSSVLG00005013662 TTC8 (ENSSVLG00005013985) EML5 (ENSSVLG00005014344) ZC3H14 (ENSSVLG00005015308) ENSSVLG00005015828 SPATA7 (ENSSVLG00005016315) KCNK10 (ENSSVLG00005016390) ENSSVLG00005016574 GPR65 (ENSSVLG00005016587) ENSSVLG00005016652 ENSSVLG00005017268 ENSSVLG00005017290 ENSSVLG00005017314 ##22 ENSSVLG00005017341 ENSSVLG00005017401 ENSSVLG00005017469 FLRT2 (ENSSVLG00005017482) SEL1L (ENSSVLG00005017527) STON2 (ENSSVLG00005017877) ENSSVLG00005018099 TSHR (ENSSVLG00005018291) CEP128 (ENSSVLG00005018595) ENSSVLG00005018940 ENSSVLG00005018988 NRXN3 (ENSSVLG00005019225) ENSSVLG00005019637 ENSSVLG00005019673 ENSSVLG00005019707 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 8 ENSSVLG00005022799 ENSSVLG00005022847 CMTR2 (ENSSVLG00005022862) CALB2 (ENSSVLG00005022894) TLE7 (ENSSVLG00005023018) ENSSVLG00005023073 CHST4 (ENSSVLG00005023084) TAT (ENSSVLG00005023106) ENSSVLG00005023175 PHLPP2 (ENSSVLG00005023221) AP1G1 (ENSSVLG00005023353) ATXN1L (ENSSVLG00005023433) ZNF821 (ENSSVLG00005023459) IST1 (ENSSVLG00005023547) ENSSVLG00005023582 ENSSVLG00005023609 ##22 DHODH (ENSSVLG00005023635) ENSSVLG00005023691 TXNL4B (ENSSVLG00005023768) DHX38 (ENSSVLG00005023788) PMFBP1 (ENSSVLG00005023835) ZFHX3 (ENSSVLG00005023938) ENSSVLG00005024001 WWP2 (ENSSVLG00005024025) NOB1 (ENSSVLG00005024070) NQO1 (ENSSVLG00005024117) ENSSVLG00005024219 NFAT5 (ENSSVLG00005024247) ENSSVLG00005024409 ENSSVLG00005024430 ENSSVLG00005024443 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 13 EEF1AKMT1 (ENSSVLG00005015915) IL17D (ENSSVLG00005015879) ENSSVLG00005015855 IFT88 (ENSSVLG00005015641) CRYL1 (ENSSVLG00005015539) ENSSVLG00005015520 GJB6 (ENSSVLG00005015504) GJB2 (ENSSVLG00005015488) ZMYM2 (ENSSVLG00005015358) ENSSVLG00005015259 ENSSVLG00005015231 PSPC1 (ENSSVLG00005015195) MPHOSPH8 (ENSSVLG00005015164) PARP4 (ENSSVLG00005014213) CENPJ (ENSSVLG00005013981) ENSSVLG00005013873 ##22 RNF17 (ENSSVLG00005013672) ENSSVLG00005013196 ENSSVLG00005013113 TIMM29 (ENSSVLG00005012441) ENSSVLG00005012415 ENSSVLG00005012358 ENSSVLG00005012315 ENSSVLG00005012267 ENSSVLG00005012242 ENSSVLG00005012223 ENSSVLG00005012165 ENSSVLG00005012090 ENSSVLG00005012043 ENSSVLG00005011984 ENSSVLG00005011941 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 27 BMP4 (ENSUPAG00010003585) CDKN3 (ENSUPAG00010003565) CNIH1 (ENSUPAG00010003545) GMFB (ENSUPAG00010003533) CGRRF1 (ENSUPAG00010003511) SAMD4A (ENSUPAG00010003229) GCH1 (ENSUPAG00010003221) WDHD1 (ENSUPAG00010003149) SOCS4 (ENSUPAG00010003145) MAPK1IP1L (ENSUPAG00010003130) LGALS3 (ENSUPAG00010003112) ENSUPAG00010003095 FBXO34 (ENSUPAG00010003083) ATG14 (ENSUPAG00010003072) TBPL2 (ENSUPAG00010003064) ENSUPAG00010003052 ##22 KTN1 (ENSUPAG00010001418) ENSUPAG00010001410 PELI2 (ENSUPAG00010001379) TMEM260 (ENSUPAG00010001276) OTX2 (ENSUPAG00010001231) EXOC5 (ENSUPAG00010001129) AP5M1 (ENSUPAG00010001100) NAA30 (ENSUPAG00010001083) CCDC198 (ENSUPAG00010001074) SLC35F4 (ENSUPAG00010001052) ARMH4 (ENSUPAG00010000968) ACTR10 (ENSUPAG00010000951) PSMA3 (ENSUPAG00010000924) ARID4A (ENSUPAG00010000903) TOMM20L (ENSUPAG00010000888) Squirrel MODERN SPECIES 166 MCF2L2 (ENSSTOG00000010382) ENSSTOG00000029916 B3GNT5 (ENSSTOG00000010399) ENSSTOG00000010372 MCCC1 (ENSSTOG00000010361) DCUN1D1 (ENSSTOG00000016465) ATP11B (ENSSTOG00000016462) SOX2 (ENSSTOG00000011011) ENSSTOG00000011508 FXR1 (ENSSTOG00000010612) ENSSTOG00000011392 ##22 ENSSTOG00000003847 TTC14 (ENSSTOG00000003827) PEX5L (ENSSTOG00000002383) USP13 (ENSSTOG00000002367) NDUFB5 (ENSSTOG00000010557) MRPL47 (ENSSTOG00000032487) ACTL6A (ENSSTOG00000010540) ENSSTOG00000033903 GNB4 (ENSSTOG00000005210) MFN1 (ENSSTOG00000005167) ZNF639 (ENSSTOG00000001442) KCNMB3 (ENSSTOG00000013715) PIK3CA (ENSSTOG00000012906) ZMAT3 (ENSSTOG00000028436) KCNMB2 (ENSSTOG00000002726) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 66 Enho (ENSJJAG00000004696) Cntfr (ENSJJAG00000011937) Rpp25l (ENSJJAG00000008971) Dctn3 (ENSJJAG00000003095) Arid3c (ENSJJAG00000022167) Sigmar1 (ENSJJAG00000014555) Galt (ENSJJAG00000023869) ENSJJAG00000021304 ENSJJAG00000014932 ENSJJAG00000013492 Ccl19 (ENSJJAG00000017038) ENSJJAG00000023174 ENSJJAG00000019575 ENSJJAG00000013137 ENSJJAG00000014996 ENSJJAG00000008982 ##22 Phf24 (ENSJJAG00000020569) Dnajb5 (ENSJJAG00000017881) 1700022I11Rik (ENSJJAG00000017366) Vcp (ENSJJAG00000011279) Fancg (ENSJJAG00000001037) Pigo (ENSJJAG00000013319) Stoml2 (ENSJJAG00000000653) ENSJJAG00000004248 ENSJJAG00000020741 ENSJJAG00000019777 Atp8b5 (ENSJJAG00000014837) ENSJJAG00000002181 ENSJJAG00000020184 Tesk1 (ENSJJAG00000016533) Cd72 (ENSJJAG00000013979) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 11 Brix1 (ENSRNOG00000018021) Dnajc21 (ENSRNOG00000017876) Agxt2 (ENSRNOG00000017821) Prlr (ENSRNOG00000057557) ENSRNOG00000065396 Spef2 (ENSRNOG00000058275) Il7r (ENSRNOG00000065741) Capsl (ENSRNOG00000054277) Ugt3a2 (ENSRNOG00000059568) Lmbrd2 (ENSRNOG00000054751) Skp2 (ENSRNOG00000059059) Nadk2 (ENSRNOG00000054157) ENSRNOG00000068920 Ranbp3l (ENSRNOG00000052173) Slc1a3 (ENSRNOG00000016163) AABR07008421.1 (ENSRNOG00000030748) ##22 Nipbl (ENSRNOG00000056907) Cplane1 (ENSRNOG00000042118) Nup155 (ENSRNOG00000013411) Wdr70 (ENSRNOG00000013336) Gdnf (ENSRNOG00000012819) Egflam (ENSRNOG00000012058) Lifr (ENSRNOG00000011696) Osmr (ENSRNOG00000033192) Rictor (ENSRNOG00000011341) Fyb1 (ENSRNOG00000013886) C9 (ENSRNOG00000013736) Dab2 (ENSRNOG00000028930) ENSRNOG00000063101 Rps15al4 (ENSRNOG00000052207) Ptger4 (ENSRNOG00000013240) Rat MODERN SPECIES 17 Deptor (ENSRNOG00000004328) ENSRNOG00000069733 LOC100359421 (ENSRNOG00000032401) Dscc1 (ENSRNOG00000026502) Taf2 (ENSRNOG00000034022) Enpp2 (ENSRNOG00000004089) Ccn3 (ENSRNOG00000008697) Mal2 (ENSRNOG00000008615) Colec10 (ENSRNOG00000008591) Tnfrsf11b (ENSRNOG00000008336) LOC120093654 (ENSRNOG00000013191) Samd12 (ENSRNOG00000043390) Ext1 (ENSRNOG00000024886) Med30 (ENSRNOG00000004844) Slc30a8 (ENSRNOG00000004747) AABR07057877.1 (ENSRNOG00000028988) ##22 ENSRNOG00000067469 Aard (ENSRNOG00000004708) Rad21 (ENSRNOG00000004420) Utp23 (ENSRNOG00000063314) Eif3h (ENSRNOG00000004252) Trps1 (ENSRNOG00000024998) ENSRNOG00000069033 Csmd3 (ENSRNOG00000004937) ENSRNOG00000065523 ENSRNOG00000063900 Kcnv1 (ENSRNOG00000004117) Smg5l1 (ENSRNOG00000024507) Sybu (ENSRNOG00000004200) Ebag9 (ENSRNOG00000004220) Pkhd1l1 (ENSRNOG00000004398) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 6 Hapln1 (ENSMOCG00000018799) Edil3 (ENSMOCG00000001973) ENSMOCG00000016800 Cox7c (ENSMOCG00000017709) Rasa1 (ENSMOCG00000020205) Ccnh (ENSMOCG00000005334) Tmem161b (ENSMOCG00000017125) Mef2c (ENSMOCG00000010324) Cetn3 (ENSMOCG00000009624) Mblac2 (ENSMOCG00000011064) Polr3g (ENSMOCG00000014935) Lysmd3 (ENSMOCG00000020333) ENSMOCG00000013307 ENSMOCG00000018170 Arrdc3 (ENSMOCG00000006099) ENSMOCG00000015077 ##22 ENSMOCG00000020099 ENSMOCG00000011944 Nr2f1 (ENSMOCG00000013379) Fam172a (ENSMOCG00000003613) Pou5f2 (ENSMOCG00000012326) 2210408I21Rik (ENSMOCG00000000720) Slf1 (ENSMOCG00000022249) Mctp1 (ENSMOCG00000015853) ENSMOCG00000009313 Fam81b (ENSMOCG00000000570) Skic3 (ENSMOCG00000009822) Arsk (ENSMOCG00000019368) ENSMOCG00000006789 Rfesd (ENSMOCG00000001203) Spata9 (ENSMOCG00000010443) Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 18 Spin1 (ENSPEMG00000025203) ENSPEMG00000010408 ENSPEMG00000029172 Fbxw17 (ENSPEMG00000023428) Gm47429 (ENSPEMG00000025972) Nutm2 (ENSPEMG00000016872) ENSPEMG00000030685 Iars (ENSPEMG00000012867) Nol8 (ENSPEMG00000012756) Ogn (ENSPEMG00000024075) Omd (ENSPEMG00000024055) Aspn (ENSPEMG00000008598) Ecm2 (ENSPEMG00000017291) Cenpp (ENSPEMG00000011858) Ippk (ENSPEMG00000011435) ENSPEMG00000029579 ##22 Bicd2 (ENSPEMG00000014865) Fgd3 (ENSPEMG00000001715) Susd3 (ENSPEMG00000014029) Card19 (ENSPEMG00000017110) Ninj1 (ENSPEMG00000011812) Wnk2 (ENSPEMG00000001161) Fam120a (ENSPEMG00000014076) Phf2 (ENSPEMG00000005796) Barx1 (ENSPEMG00000017288) ENSPEMG00000031327 Ptpdc1 (ENSPEMG00000013276) Zfp169 (ENSPEMG00000000674) Id4 (ENSPEMG00000026044) Rnf144b (ENSPEMG00000026855) ENSPEMG00000011094 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 16 Arhgdib (ENSPEMG00000009813) Erp27 (ENSPEMG00000011430) Mgp (ENSPEMG00000029708) Art4 (ENSPEMG00000009970) BC049715 (ENSPEMG00000012035) Smco3 (ENSPEMG00000013256) Wbp11 (ENSPEMG00000004271) H2aj (ENSPEMG00000007976) ENSPEMG00000029950 Gucy2c (ENSPEMG00000009132) Plbd1 (ENSPEMG00000010747) Atf7ip (ENSPEMG00000015683) ENSPEMG00000026063 Grin2b (ENSPEMG00000003659) Emp1 (ENSPEMG00000026152) ENSPEMG00000030854 ##22 Pbp2 (ENSPEMG00000014713) Gsg1 (ENSPEMG00000018268) Fam234b (ENSPEMG00000008999) Hebp1 (ENSPEMG00000018770) Gprc5d (ENSPEMG00000017478) Gprc5a (ENSPEMG00000010508) Ddx47 (ENSPEMG00000009746) Apold1 (ENSPEMG00000026954) Cdkn1b (ENSPEMG00000028795) Gpr19 (ENSPEMG00000020863) Crebl2 (ENSPEMG00000018315) Dusp16 (ENSPEMG00000000055) Borcs5 (ENSPEMG00000028166) Mansc1 (ENSPEMG00000012536) Lrp6 (ENSPEMG00000006474) Tree shrew DUPLICATION Tree shrew DUPLICATION Tree shrew DUPLICATION Tree shrew MODERN SPECIES 2466 EEF1AKMT1 (ENSTBEG00000010417) ENSTBEG00000010387 ##22 Tree shrew MODERN SPECIES 10417 ENSTBEG00000013054 ##22 Tree shrew MODERN SPECIES 8589 ENSTBEG00000000665 ##22 Tree shrew DUPLICATION Tree shrew MODERN SPECIES 8300 ENSTBEG00000012869 ##22 Tree shrew MODERN SPECIES 7582 ENSTBEG00000006378 ##22 Tree shrew MODERN SPECIES 9302 ENSTBEG00000011419 ##22 Tree shrew MODERN SPECIES 6734 ENSTBEG00000014596 ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.b ##22 Vervet Monkey MODERN SPECIES 13 ENSCSAG00000015152 ENSCSAG00000015163 AMPH (ENSCSAG00000015175) ENSCSAG00000019602 VPS41 (ENSCSAG00000015187) POU6F2 (ENSCSAG00000015201) ENSCSAG00000019601 YAE1 (ENSCSAG00000015211) RALA (ENSCSAG00000015217) CDK13 (ENSCSAG00000015259) MPLKIP (ENSCSAG00000015281) SUGCT (ENSCSAG00000015289) ENSCSAG00000019600 INHBA (ENSCSAG00000015294) GLI3 (ENSCSAG00000015361) ENSCSAG00000019599 ##22 ENSCSAG00000015385 C7orf25 (ENSCSAG00000015390) PSMA2 (ENSCSAG00000015394) ENSCSAG00000015403 HECW1 (ENSCSAG00000015421) STK17A (ENSCSAG00000015428) COA1 (ENSCSAG00000015432) BLVRA (ENSCSAG00000015441) MRPS24 (ENSCSAG00000015447) URGCP (ENSCSAG00000015454) UBE2D4 (ENSCSAG00000015467) DBNL (ENSCSAG00000015475) PGAM2 (ENSCSAG00000015481) POLM (ENSCSAG00000015486) AEBP1 (ENSCSAG00000015516) Tarsier MODERN SPECIES 4675 ENSTSYG00000007754 CLCA4 (ENSTSYG00000013100) ENSTSYG00000037225 ENSTSYG00000032122 ##22