Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000002905 #9	ENSGT00940000157434 #10	ENSGT00940000161288 #11	ENSGT00390000015195	ENSGT00950000182903.b.b #12	ENSGT00940000154943 #13	ENSGT00510000048581 #14	ENSGT00510000048628 #15	ENSGT00940000155479 #16	ENSGT00390000010003 #17	ENSGT00390000001053 #18	ENSGT00390000006602 #19	ENSGT00950000182913.A.a #20	ENSGT00390000002752.x #21	ENSGT00390000014690	ENSGT00940000155743 #22	ENSGT00940000161758 #23	ENSGT00940000162060 #24	ENSGT00940000155539.a.a #25	ENSGT00940000159163 #26	ENSGT00390000016427 #27	ENSGT00940000157670 #28	ENSGT00940000158478 #29	ENSGT00940000157705.l #30	ENSGT00940000154616.b #31	ENSGT00390000011708.a.k.b #32	ENSGT00390000007962	ENSGT00870000136493.d #33	ENSGT00390000009255 #34	ENSGT00950000182866.D.c.h #35	ENSGT00950000182866.D.c.g.d #36
Guinea pig	MODERN SPECIES	19	ALG9 (ENSCPOG00000013412) #7	FDXACB1 (ENSCPOG00000032584) #8	CFAP68 (ENSCPOG00000030692) #9	CRYAB (ENSCPOG00000038560) #10	HSPB2 (ENSCPOG00000034179) #11	DIXDC1 (ENSCPOG00000008568) #12	DLAT (ENSCPOG00000011723) #13	PIH1D2 (ENSCPOG00000027299) #14	NKAPD1 (ENSCPOG00000033651) #15	TIMM8B (ENSCPOG00000032635) #16	SDHD (ENSCPOG00000003178) #17	IL18 (ENSCPOG00000003179) #18	TEX12 (ENSCPOG00000009900) #19	BCO2 (ENSCPOG00000009905) #20	PTS (ENSCPOG00000034020) #21	NCAM1 (ENSCPOG00000004681) #22	TTC12 (ENSCPOG00000004685) #23	ANKK1 (ENSCPOG00000001170) #24	DRD2 (ENSCPOG00000009265) #25	ENSCPOG00000009863 #26	ZW10 (ENSCPOG00000005097) #27	USP28 (ENSCPOG00000001875) #28	HTR3B (ENSCPOG00000010829) #29	HTR3A (ENSCPOG00000010833) #30	ZBTB16 (ENSCPOG00000004151) #31	NNMT (ENSCPOG00000013034) #32	RBM7 (ENSCPOG00000034273) #33	REXO2 (ENSCPOG00000010548) #34	NXPE4 (ENSCPOG00000000299) #35	NXPE2 (ENSCPOG00000011786) #36	CADM1 (ENSCPOG00000005736) #37
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00390000002905 #9	ENSGT00940000157434 #10	ENSGT00940000161288 #11	ENSGT00390000015195	ENSGT00950000182903.b.b #12	ENSGT00940000154943 #13	ENSGT00510000048581 #14	ENSGT00510000048628 #15	ENSGT00940000155479 #16	ENSGT00390000010003 #17	ENSGT00390000001053 #18	ENSGT00390000006602 #19	ENSGT00950000182913.A.a #20	ENSGT00390000002752.x #21	ENSGT00390000014690	ENSGT00940000155743 #22	ENSGT00940000161758 #23	ENSGT00940000162060 #24	ENSGT00940000155539.a.a #25	ENSGT00940000159163 #26	ENSGT00390000016427 #27	ENSGT00940000157670 #28	ENSGT00940000158478 #29	ENSGT00940000157705.l #30	ENSGT00940000154616.b #31	ENSGT00390000011708.a.k.b #32	ENSGT00390000007962	ENSGT00870000136493.d #33	ENSGT00390000009255 #34	ENSGT00950000182866.D.c.h #35	ENSGT00950000182866.D.c.g.d #36
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	119	CFAP68 (ENSCLAG00000012754) #9	CRYAB (ENSCLAG00000013159) #10	HSPB2 (ENSCLAG00000016288) #11	C11orf52 (ENSCLAG00000016503)	DIXDC1 (ENSCLAG00000014623) #12	DLAT (ENSCLAG00000012017) #13	PIH1D2 (ENSCLAG00000015278) #14	NKAPD1 (ENSCLAG00000012317) #15	TIMM8B (ENSCLAG00000012638) #16	SDHD (ENSCLAG00000013294) #17	IL18 (ENSCLAG00000012063) #18	TEX12 (ENSCLAG00000014098) #19	BCO2 (ENSCLAG00000015493) #20	PTS (ENSCLAG00000014281) #21	ENSCLAG00000013183	NCAM1 (ENSCLAG00000013591) #22	TTC12 (ENSCLAG00000011783) #23	ANKK1 (ENSCLAG00000011795) #24	DRD2 (ENSCLAG00000016034) #25	TMPRSS5 (ENSCLAG00000016268) #26	ZW10 (ENSCLAG00000011976) #27	USP28 (ENSCLAG00000013072) #28	HTR3B (ENSCLAG00000016164) #29	HTR3A (ENSCLAG00000016559) #30	ZBTB16 (ENSCLAG00000014819) #31	NNMT (ENSCLAG00000014574) #32	C11orf71 (ENSCLAG00000014517)	RBM7 (ENSCLAG00000014875) #33	ENSCLAG00000017767	REXO2 (ENSCLAG00000011195) #34	NXPE4 (ENSCLAG00000011609) #35
Degu	MODERN SPECIES	307				ENSODEG00000000209	CRYAB (ENSODEG00000000243) #10	HSPB2 (ENSODEG00000000284) #11	DIXDC1 (ENSODEG00000000375) #12	ENSODEG00000000505 #13	ENSODEG00000000806 #16	ENSODEG00000000817	ENSODEG00000000833 #17	IL18 (ENSODEG00000000875) #18	TEX12 (ENSODEG00000000891) #19	BCO2 (ENSODEG00000000956) #20	PTS (ENSODEG00000000157) #21	NCAM1 (ENSODEG00000000397) #22	ENSODEG00000000622 #23	DRD2 (ENSODEG00000000703) #25	TMPRSS5 (ENSODEG00000000500) #26	AKAP10 (ENSODEG00000000586)	ULK2 (ENSODEG00000000757)