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Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00400000022873	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00390000013802.u	ENSGT00530000063866.f.a	ENSGT00390000013802.v.a	ENSGT00530000063866.f.b	ENSGT00390000013802.v.b	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.b ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35
Glires	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00400000022873	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00390000013802.u	ENSGT00530000063866.f.a	ENSGT00390000013802.v.b	ENSGT00530000063866.f.b	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.b ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35	ENSGT00950000182990.a.a.b.b #36
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00390000013802.u	ENSGT00530000063866.f.a	ENSGT00390000013802.v.b	ENSGT00530000063866.f.b	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.b.p ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35	ENSGT00950000182990.a.a.b.b #36
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00400000022873	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.a #31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35	ENSGT00950000182990.a.a.b.b #36	ENSGT00520000061410	ENSGT00940000155807.a #37	ENSGT00390000010089.f	ENSGT00530000063626.a
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00400000022873	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.a #31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35	ENSGT00950000182990.a.a.b.b #36	ENSGT00520000061410	ENSGT00940000155807.a #37	ENSGT00390000010089.f	ENSGT00530000063626.a
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00400000022873	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.a #31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35	ENSGT00950000182990.a.a.b.b #36	ENSGT00520000061410	ENSGT00940000155807.a #37	ENSGT00390000010089.f	ENSGT00530000063626.a
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00400000022873	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00530000063866.f.a	ENSGT00390000013802.u	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.a #31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35	ENSGT00950000182990.a.a.b.b #36	ENSGT00520000061410	ENSGT00940000155807.a #37
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00400000022873	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00390000013802.u	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.a #31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35	ENSGT00950000182990.a.a.b.b #36	ENSGT00520000061410	ENSGT00940000155807.a #37	ENSGT00390000010089.f
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00400000022873	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.a #31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35	ENSGT00950000182990.a.a.b.b #36	ENSGT00940000155807.a #37	ENSGT00520000061410	ENSGT00390000010089.f	ENSGT00530000063626.a
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES		Ttc9c (ENSPEMG00000026108) #7	Hnrnpul2 (ENSPEMG00000015546) #8	Gng3 (ENSPEMG00000028724) #9	Bscl2 (ENSPEMG00000031381) #10	Lrrn4cl (ENSPEMG00000016106) #11	Ubxn1 (ENSPEMG00000015778) #12	Uqcc3 (ENSPEMG00000030804) #13	1810009A15Rik (ENSPEMG00000031275) #14	Ints5 (ENSPEMG00000004838) #15	Ganab (ENSPEMG00000003185) #16	B3gat3 (ENSPEMG00000009881) #17	Rom1 (ENSPEMG00000003110) #18	Eml3 (ENSPEMG00000008367) #19	Mta2 (ENSPEMG00000007490) #20	Tut1 (ENSPEMG00000018332) #21	Eef1g (ENSPEMG00000004247) #22	ENSPEMG00000019243 #23	ENSPEMG00000026154 #24	ENSPEMG00000024701 #25	Scgb1a1 (ENSPEMG00000009557) #26	Asrgl1 (ENSPEMG00000018019) #27	ENSPEMG00000028067 #28	Incenp (ENSPEMG00000008252) #29	ENSPEMG00000020638 #30	Fth1 (ENSPEMG00000017564) #31	ENSPEMG00000012703 #32	Rab3il1 (ENSPEMG00000011822) #33	Fads3 (ENSPEMG00000012107) #34	Fads2 (ENSPEMG00000015890) #35	Fads1 (ENSPEMG00000008265) #36	Fen1 (ENSPEMG00000009788) #37
Prairie vole	DUPLICATION
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Chinese hamster chok1gshd	DUPLICATION
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Golden Hamster	DUPLICATION
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Murinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00400000022873	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00530000063866.f.a.a.a	ENSGT00530000063866.f.a.b	ENSGT00390000013802.u	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.a #31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35	ENSGT00950000182990.a.a.b.b #36	ENSGT00940000155807.a #37
Mus	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00400000022873	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00390000013802.u	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.a #31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35	ENSGT00950000182990.a.a.b.b #36	ENSGT00940000155807.a #37	ENSGT00390000010089.f	ENSGT00530000063626.a
Shrew mouse	MODERN SPECIES		Zbtb3 (MGP_PahariEiJ_G0014149)	Ttc9c (MGP_PahariEiJ_G0014150) #7	Hnrnpul2 (MGP_PahariEiJ_G0014151) #8	Gng3 (MGP_PahariEiJ_G0014152) #9	Bscl2 (MGP_PahariEiJ_G0014153) #10	Lrrn4cl (MGP_PahariEiJ_G0014154) #11	Ubxn1 (MGP_PahariEiJ_G0014155) #12	Uqcc3 (MGP_PahariEiJ_G0014156) #13	Ints5 (MGP_PahariEiJ_G0014158) #15	Ganab (MGP_PahariEiJ_G0014159) #16	B3gat3 (MGP_PahariEiJ_G0014160) #17	Rom1 (MGP_PahariEiJ_G0014161) #18	Eml3 (MGP_PahariEiJ_G0014162) #19	Mta2 (MGP_PahariEiJ_G0014163) #20	Tut1 (MGP_PahariEiJ_G0014164) #21	Eef1g (MGP_PahariEiJ_G0014165) #22	MGP_PahariEiJ_G0014166 #24	Scgb1a1 (MGP_PahariEiJ_G0014167) #26	Asrgl1 (MGP_PahariEiJ_G0014168) #27	Incenp (MGP_PahariEiJ_G0014169) #29	Fth1 (MGP_PahariEiJ_G0014170) #31	Best1 (MGP_PahariEiJ_G0014171) #32	Rab3il1 (MGP_PahariEiJ_G0014172) #33	Fads3 (MGP_PahariEiJ_G0014173) #34	Fads2 (MGP_PahariEiJ_G0014174) #35	Fads1 (MGP_PahariEiJ_G0014175) #36	Fen1 (MGP_PahariEiJ_G0014176) #37	Tmem258 (MGP_PahariEiJ_G0014177)	Myrf (MGP_PahariEiJ_G0014178)	MGP_PahariEiJ_G0014179	Syt7 (MGP_PahariEiJ_G0014180)
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00400000022873	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00390000013802.u	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.a #31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35	ENSGT00950000182990.a.a.b.b #36	ENSGT00940000155807.a #37	ENSGT00390000010089.f	ENSGT00530000063626.a
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	10	Hnrnpul2 (MGP_CAROLIEiJ_G0022656) #8	Gng3 (MGP_CAROLIEiJ_G0022657) #9	Bscl2 (MGP_CAROLIEiJ_G0022658) #10	Lrrn4cl (MGP_CAROLIEiJ_G0022659) #11	Ubxn1 (MGP_CAROLIEiJ_G0022660) #12	Uqcc3 (MGP_CAROLIEiJ_G0022661) #13	MGP_CAROLIEiJ_G0022662	MGP_CAROLIEiJ_G0022663 #14	Ints5 (MGP_CAROLIEiJ_G0022664) #15	Ganab (MGP_CAROLIEiJ_G0022665) #16	B3gat3 (MGP_CAROLIEiJ_G0022666) #17	Rom1 (MGP_CAROLIEiJ_G0022667) #18	Eml3 (MGP_CAROLIEiJ_G0022668) #19	Mta2 (MGP_CAROLIEiJ_G0022669) #20	Tut1 (MGP_CAROLIEiJ_G0022670) #21	Eef1g (MGP_CAROLIEiJ_G0022671) #22	MGP_CAROLIEiJ_G0022672 #23	Scgb1a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0022673) #26	Asrgl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0022674) #27	Incenp (MGP_CAROLIEiJ_G0022675) #29	Fth1 (MGP_CAROLIEiJ_G0022676) #31	Best1 (MGP_CAROLIEiJ_G0022677) #32	Rab3il1 (MGP_CAROLIEiJ_G0022678) #33	Fads3 (MGP_CAROLIEiJ_G0022679) #34	Fads2 (MGP_CAROLIEiJ_G0022680) #35	Fads1 (MGP_CAROLIEiJ_G0022681) #36	Fen1 (MGP_CAROLIEiJ_G0022682) #37	Tmem258 (MGP_CAROLIEiJ_G0022683)	Myrf (MGP_CAROLIEiJ_G0022684)	Dagla (MGP_CAROLIEiJ_G0022685)	Syt7 (MGP_CAROLIEiJ_G0022686)
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00400000022873	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00390000013802.u.a	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.a #31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35	ENSGT00950000182990.a.a.b.b #36	ENSGT00940000155807.a #37	ENSGT00390000010089.f	ENSGT00530000063626.a
Mouse	MODERN SPECIES	10	Gng3 (ENSMUSG00000071658) #9	Bscl2 (ENSMUSG00000071657) #10	Lrrn4cl (ENSMUSG00000071656) #11	Ubxn1 (ENSMUSG00000071655) #12	Uqcc3 (ENSMUSG00000071654) #13	Lbhd1 (ENSMUSG00000096740)	1810009A15Rik (ENSMUSG00000071653) #14	Gm49416 (ENSMUSG00000116347)	Ints5 (ENSMUSG00000071652) #15	Ganab (ENSMUSG00000071650) #16	B3gat3 (ENSMUSG00000071649) #17	Rom1 (ENSMUSG00000071648) #18	Eml3 (ENSMUSG00000071647) #19	Mta2 (ENSMUSG00000071646) #20	Tut1 (ENSMUSG00000071645) #21	Eef1g (ENSMUSG00000071644) #22	Ahnak (ENSMUSG00000069833) #24	Scgb1a1 (ENSMUSG00000024653) #26	Asrgl1 (ENSMUSG00000024654) #27	Scgb2a2 (ENSMUSG00000096872)	Incenp (ENSMUSG00000024660) #29	Fth1 (ENSMUSG00000024661) #31	Best1 (ENSMUSG00000037418) #32	Rab3il1 (ENSMUSG00000024663) #33	Fads3 (ENSMUSG00000024664) #34	Fads2 (ENSMUSG00000024665) #35	Fads1 (ENSMUSG00000010663) #36	Fen1 (ENSMUSG00000024742) #37	Tmem258 (ENSMUSG00000036372)	Myrf (ENSMUSG00000036098)	Dagla (ENSMUSG00000035735)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00400000022873	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00390000013802.u.a	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.a #31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35	ENSGT00950000182990.a.a.b.b #36	ENSGT00940000155807.a #37	ENSGT00390000010089.f	ENSGT00530000063626.a
Steppe mouse	DUPLICATION
Steppe mouse	MODERN SPECIES	2399						Uqcc3 (ENSMSIG00000030087) #13	ENSMSIG00000030086	1810009A15Rik (ENSMSIG00000030082) #14	Ints5 (ENSMSIG00000030081) #15	Ganab (ENSMSIG00000030073) #16	B3gat3 (ENSMSIG00000030069) #17	Rom1 (ENSMSIG00000030067) #18	Eml3 (ENSMSIG00000030059) #19	Mta2 (ENSMSIG00000030052) #20	Tut1 (ENSMSIG00000030047) #21	ENSMSIG00000030044 #22	ENSMSIG00000030038 #24	ENSMSIG00000030024 #23	Scgb1a1 (ENSMSIG00000030022) #26	Asrgl1 (ENSMSIG00000030021) #27
Steppe mouse	MODERN SPECIES	38							Gfra1 (ENSMSIG00000028497)	Ccdc172 (ENSMSIG00000028482)	Pnlip (ENSMSIG00000028475)	Pnliprp1 (ENSMSIG00000028468)	Pnliprp2 (ENSMSIG00000028454)	1700019N19Rik (ENSMSIG00000028440)	Hspa12a (ENSMSIG00000028425)	Eno4 (ENSMSIG00000028394)	Shtn1 (ENSMSIG00000028359)	ENSMSIG00000028327 #22	Vax1 (ENSMSIG00000028320)	ENSMSIG00000028314	Kcnk18 (ENSMSIG00000028309)	Slc18a2 (ENSMSIG00000028291)	Pdzd8 (ENSMSIG00000028285)	Emx2 (ENSMSIG00000028276)	Rab11fip2 (ENSMSIG00000028250)	Fam204a (ENSMSIG00000028227)	Prlhr (ENSMSIG00000028226)	Cacul1 (ENSMSIG00000028208)	Nanos1 (ENSMSIG00000028205)	Eif3a (ENSMSIG00000028178)	ENSMSIG00000028172	Dennd10 (ENSMSIG00000028163)	Sfxn4 (ENSMSIG00000028157)
spretus	MODERN SPECIES	10	Hnrnpul2 (MGP_SPRETEiJ_G0023569) #8	Gng3 (MGP_SPRETEiJ_G0023570) #9	Bscl2 (MGP_SPRETEiJ_G0023571) #10	Lrrn4cl (MGP_SPRETEiJ_G0023572) #11	Ubxn1 (MGP_SPRETEiJ_G0023573) #12	Uqcc3 (MGP_SPRETEiJ_G0023574) #13	MGP_SPRETEiJ_G0023575	1810009A15Rik (MGP_SPRETEiJ_G0023576) #14	Ints5 (MGP_SPRETEiJ_G0023577) #15	Ganab (MGP_SPRETEiJ_G0023578) #16	B3gat3 (MGP_SPRETEiJ_G0023579) #17	Rom1 (MGP_SPRETEiJ_G0023580) #18	Eml3 (MGP_SPRETEiJ_G0023581) #19	Mta2 (MGP_SPRETEiJ_G0023582) #20	Tut1 (MGP_SPRETEiJ_G0023583) #21	Eef1g (MGP_SPRETEiJ_G0023584) #22	Ahnak (MGP_SPRETEiJ_G0023585) #24	Scgb1a1 (MGP_SPRETEiJ_G0023586) #26	Asrgl1 (MGP_SPRETEiJ_G0023587) #27	Scgb2a2 (MGP_SPRETEiJ_G0023588)	Incenp (MGP_SPRETEiJ_G0023589) #29	Fth1 (MGP_SPRETEiJ_G0023590) #31	Best1 (MGP_SPRETEiJ_G0023591) #32	Rab3il1 (MGP_SPRETEiJ_G0023592) #33	Fads3 (MGP_SPRETEiJ_G0023593) #34	Fads2 (MGP_SPRETEiJ_G0023594) #35	Fads1 (MGP_SPRETEiJ_G0023595) #36	Fen1 (MGP_SPRETEiJ_G0023596) #37	Tmem258 (MGP_SPRETEiJ_G0023597)	Myrf (MGP_SPRETEiJ_G0023598)	Dagla (MGP_SPRETEiJ_G0023599)
Rat	DUPLICATION
Rat	MODERN SPECIES		Polr2g (ENSRNOG00000019439)	Ttc9c (ENSRNOG00000019464) #7	Hnrnpul2 (ENSRNOG00000019507)	Gng3 (ENSRNOG00000019570) #9	Bscl2 (ENSRNOG00000052393) #10	Ubxn1 (ENSRNOG00000019666) #12	Uqcc3 (ENSRNOG00000045561) #13	Gm49403 (ENSRNOG00000064559)	C1h11orf98 (ENSRNOG00000019701) #14	Ints5 (ENSRNOG00000026005) #15	Ganab (ENSRNOG00000019724) #16	B3gat3 (ENSRNOG00000019873) #19	Rom1 (ENSRNOG00000019858) #18	Mta2 (ENSRNOG00000019913) #20	Tut1 (ENSRNOG00000020047) #21	Eef1g (ENSRNOG00000020075) #22	Ahnak (ENSRNOG00000057569) #24	Scgb1a1 (ENSRNOG00000020196) #26	Asrgl1 (ENSRNOG00000020202) #27	Scgb1d2 (ENSRNOG00000020294)	Scgb1d4 (ENSRNOG00000020301)	Scgb2a1 (ENSRNOG00000020305)	AABR07006242.1 (ENSRNOG00000028909)	Scgb2a1 (ENSRNOG00000023151)	ENSRNOG00000062718	Incenp (ENSRNOG00000032929) #29	Fth1 (ENSRNOG00000022619) #31	Best1 (ENSRNOG00000020346) #32	AABR07006255.1 (ENSRNOG00000036633)	Rab3il1 (ENSRNOG00000020349) #33	Fads3 (ENSRNOG00000020385) #34
Rat	DUPLICATION
Rat	MODERN SPECIES	4	Igsf8 (ENSRNOG00000007604)	Atp1a2 (ENSRNOG00000007290)	Atp1a4 (ENSRNOG00000032378)	Casq1 (ENSRNOG00000006930)	Pea15 (ENSRNOG00000046996)	Dcaf8 (ENSRNOG00000006785)	LOC102548286 (ENSRNOG00000057116)	Copa (ENSRNOG00000006247)	Ncstn (ENSRNOG00000005355)	Nhlh1 (ENSRNOG00000005166)	Vangl2 (ENSRNOG00000004889)	Slamf6 (ENSRNOG00000038286)	Cd84 (ENSRNOG00000022884)	Slamf1 (ENSRNOG00000059073)	Cd48 (ENSRNOG00000004737)	ENSRNOG00000062700 #22	Slamf7 (ENSRNOG00000023209)	Ly9 (ENSRNOG00000025069)	Cd244 (ENSRNOG00000064255)	Cd244 (ENSRNOG00000068754)	Itln1 (ENSRNOG00000004678)	LOC100359583 (ENSRNOG00000025731)	F11r (ENSRNOG00000004414)	ENSRNOG00000068856	Arhgap30 (ENSRNOG00000004192)	Tstd1 (ENSRNOG00000004255)	Nectin4 (ENSRNOG00000004029)	Klhdc9 (ENSRNOG00000004022)	Nit1 (ENSRNOG00000003881)	Dedd (ENSRNOG00000003779)	Pfdn2 (ENSRNOG00000066932)
Rat	MODERN SPECIES	15	Pusl1 (ENSRNOG00000022354)	Ints11 (ENSRNOG00000019712)	Cptp (ENSRNOG00000022455)	Tas1r3 (ENSRNOG00000019589)	Dvl1 (ENSRNOG00000019423)	Mxra8 (ENSRNOG00000019244)	Ccnl2 (ENSRNOG00000018691)	Mrpl20 (ENSRNOG00000018647)	Ankrd65 (ENSRNOG00000043331)	Tmem88b (ENSRNOG00000036869)	Vwa1 (ENSRNOG00000018338)	Atad3a (ENSRNOG00000018118)	Tmem240 (ENSRNOG00000066137)	Ssu72 (ENSRNOG00000017829)	LOC100364191 (ENSRNOG00000030447)	ENSRNOG00000065253 #22	Mib2 (ENSRNOG00000017564)	Mmp23 (ENSRNOG00000017477)	Cdk11b (ENSRNOG00000017213)	Slc35e2b (ENSRNOG00000017075)	Nadk (ENSRNOG00000016936)	Gnb1 (ENSRNOG00000016638)	Tmem52 (ENSRNOG00000016618)	Cfap74 (ENSRNOG00000023627)	Gabrd (ENSRNOG00000016385)	Prkcz (ENSRNOG00000015480)	Faap20 (ENSRNOG00000036876)	Ski (ENSRNOG00000055340)	Morn1 (ENSRNOG00000014642)	Rer1 (ENSRNOG00000014270)	Pex10 (ENSRNOG00000024012)
Upper Galilee mountains blind mole rat	DUPLICATION
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	993	Hnrnpul2 (ENSNGAG00000012005) #8	Gng3 (ENSNGAG00000017324) #9	Bscl2 (ENSNGAG00000001576) #10	Lrrn4cl (ENSNGAG00000019480) #11	Ubxn1 (ENSNGAG00000019771) #12	Uqcc3 (ENSNGAG00000012681) #13	ENSNGAG00000013023	1810009A15Rik (ENSNGAG00000016918) #14	Ints5 (ENSNGAG00000020876) #15	Ganab (ENSNGAG00000001471) #16	B3gat3 (ENSNGAG00000011046) #17	Rom1 (ENSNGAG00000011407) #18	Eml3 (ENSNGAG00000020054) #19	Mta2 (ENSNGAG00000001070) #20	Tut1 (ENSNGAG00000002988) #21	ENSNGAG00000019856 #22	Ahnak (ENSNGAG00000010664) #24	Scgb1a1 (ENSNGAG00000015223) #26	Asrgl1 (ENSNGAG00000017941) #27
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	832																ENSNGAG00000000678 #22	Tnrc6b (ENSNGAG00000021294)	Adsl (ENSNGAG00000016522)	Sgsm3 (ENSNGAG00000021377)	ENSNGAG00000019442	ENSNGAG00000012273
Lesser Egyptian jerboa	DUPLICATION
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	60	ENSJJAG00000008957 #7	Hnrnpul2 (ENSJJAG00000011206) #8	Gng3 (ENSJJAG00000015400) #9	ENSJJAG00000019301 #10	Ubxn1 (ENSJJAG00000012631) #12	Uqcc3 (ENSJJAG00000022865) #13	ENSJJAG00000011273	1810009A15Rik (ENSJJAG00000010598) #14	Ints5 (ENSJJAG00000013000) #15	Ganab (ENSJJAG00000024016) #16	B3gat3 (ENSJJAG00000023873) #17	Rom1 (ENSJJAG00000016209) #18	Eml3 (ENSJJAG00000001007) #19	Mta2 (ENSJJAG00000001163) #20	Tut1 (ENSJJAG00000022329) #21	Eef1g (ENSJJAG00000019511) #22	ENSJJAG00000015059 #24	Scgb1a1 (ENSJJAG00000013224) #26	Asrgl1 (ENSJJAG00000021275) #27
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	45	ENSJJAG00000022712	Gxylt2 (ENSJJAG00000013774)	Shq1 (ENSJJAG00000017611)	Rybp (ENSJJAG00000017045)	Prok2 (ENSJJAG00000021320)	Gpr27 (ENSJJAG00000011153)	Eif4e3 (ENSJJAG00000002638)	Foxp1 (ENSJJAG00000022621)	Mdfic2 (ENSJJAG00000012963)	Mitf (ENSJJAG00000018472)	Frmd4b (ENSJJAG00000023390)	Minar2 (ENSJJAG00000000279)	Adamts19 (ENSJJAG00000021431)	Isoc1 (ENSJJAG00000019157)	Slc27a6 (ENSJJAG00000020519)	ENSJJAG00000017710 #22	Fbn2 (ENSJJAG00000020592)	Slc12a2 (ENSJJAG00000019580)	ENSJJAG00000017426	Ctxn3 (ENSJJAG00000011014)	Prrc1 (ENSJJAG00000011454)	Crhbp (ENSJJAG00000010630)	S100z (ENSJJAG00000013195)	ENSJJAG00000018088	F2rl1 (ENSJJAG00000005361)	F2r (ENSJJAG00000021467)	Iqgap2 (ENSJJAG00000023927)	F2rl2 (ENSJJAG00000020545)	Sv2c (ENSJJAG00000012121)	Poc5 (ENSJJAG00000019666)	Ankdd1b (ENSJJAG00000013237)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	436	Zbtb3 (ENSDORG00000015697)	Ttc9c (ENSDORG00000028105) #7	Hnrnpul2 (ENSDORG00000008678) #8	Gng3 (ENSDORG00000025670) #9	ENSDORG00000024721	Ubxn1 (ENSDORG00000009406) #12	Uqcc3 (ENSDORG00000025423) #13	1810009A15Rik (ENSDORG00000025730) #14	Ints5 (ENSDORG00000025017) #15	Ganab (ENSDORG00000011363) #16	B3gat3 (ENSDORG00000004024) #17	Rom1 (ENSDORG00000004023) #18	Eml3 (ENSDORG00000004021) #19	Mta2 (ENSDORG00000004019) #20	Tut1 (ENSDORG00000004018) #21	Eef1g (ENSDORG00000004017) #22	ENSDORG00000026538 ##24	Asrgl1 (ENSDORG00000014041) #27	ENSDORG00000026990	Incenp (ENSDORG00000009799) #29	Fth1 (ENSDORG00000024132) #31	ENSDORG00000027094 #32	ENSDORG00000001649 #33	Fads3 (ENSDORG00000001648) #34	Fads2 (ENSDORG00000000340) #35	Fads1 (ENSDORG00000019737) #36	Fen1 (ENSDORG00000002039) #37	Tmem258 (ENSDORG00000002038)	Myrf (ENSDORG00000002029)	Dagla (ENSDORG00000002025)	Syt7 (ENSDORG00000006357)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00390000013802.u	ENSGT00530000063866.f.a	ENSGT00390000013802.v.b	ENSGT00530000063866.f.b	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.b.p ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35	ENSGT00950000182990.a.a.b.b #36
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00530000063866.f.a	ENSGT00390000013802.v.b	ENSGT00530000063866.f.b	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.a #31	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.b.o.b ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35	ENSGT00950000182990.a.a.b.b #36
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	2	BSCL2 (ENSSVLG00005005272) #10	GNG3 (ENSSVLG00005005306) #9	LRRN4CL (ENSSVLG00005005319) #11	UBXN1 (ENSSVLG00005005341) #12	UQCC3 (ENSSVLG00005005402) #13	CSKMT (ENSSVLG00005005417)	ENSSVLG00005005456 #14	ENSSVLG00005005515	INTS5 (ENSSVLG00005005530) #15	GANAB (ENSSVLG00005005602) #16	B3GAT3 (ENSSVLG00005005875) #17	ROM1 (ENSSVLG00005005903) #18	EML3 (ENSSVLG00005005947) #19	MTA2 (ENSSVLG00005006257) #20	TUT1 (ENSSVLG00005006406) #21	EEF1G (ENSSVLG00005006436) #22	AHNAK (ENSSVLG00005006485) #24	SCGB1A1 (ENSSVLG00005006566) #26	ASRGL1 (ENSSVLG00005006616) #27	ENSSVLG00005006645	ENSSVLG00005006675	ENSSVLG00005006740 ##31	BEST1 (ENSSVLG00005006784) #32	RAB3IL1 (ENSSVLG00005006928) #33	FADS3 (ENSSVLG00005007116) #34	FADS2 (ENSSVLG00005007178) #35	FADS1 (ENSSVLG00005007252) #36	ENSSVLG00005007308	FEN1 (ENSSVLG00005007324) #37	TMEM258 (ENSSVLG00005007336)	MYRF (ENSSVLG00005007408)
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00530000063866.f.a	ENSGT00390000013802.v.b.a	ENSGT00530000063866.f.b	ENSGT00390000013802.v.b.b	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.a #31	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.b.o.b ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00530000063866.f.a	ENSGT00390000013802.v.b.a	ENSGT00530000063866.f.b	ENSGT00390000013802.v.b.b	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.a #31	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.b.o.b ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	366	HNRNPUL2 (ENSUPAG00010005211) #8	GNG3 (ENSUPAG00010005209) #9	BSCL2 (ENSUPAG00010005172) #10	LRRN4CL (ENSUPAG00010005167) #11	UBXN1 (ENSUPAG00010005156) #12	UQCC3 (ENSUPAG00010005149) #13	CSKMT (ENSUPAG00010005145)	C11orf98 (ENSUPAG00010005135) #14	INTS5 (ENSUPAG00010005127) #15	GANAB (ENSUPAG00010005106) #16	B3GAT3 (ENSUPAG00010005100) #17	ROM1 (ENSUPAG00010005099) #18	EML3 (ENSUPAG00010005056) #19	MTA2 (ENSUPAG00010005038) #20	TUT1 (ENSUPAG00010005020) #21	EEF1G (ENSUPAG00010005012) #22	ENSUPAG00010004999 #24	ENSUPAG00010004996	ENSUPAG00010004986 #23	ASRGL1 (ENSUPAG00010004983) #27	ENSUPAG00010004973	ENSUPAG00010004955	ENSUPAG00010004946	ENSUPAG00010004941	INCENP (ENSUPAG00010004917) #29	ENSUPAG00010004905 #31	BEST1 (ENSUPAG00010004888) #32	ENSUPAG00010004814 #33	FADS2 (ENSUPAG00010004799) #35	FADS1 (ENSUPAG00010004789) #36	ENSUPAG00010004784
Squirrel	DUPLICATION
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Alpin marmot	DUPLICATION
Alpin marmot	MODERN SPECIES	3	TTC9C (ENSMMMG00000003362) #7	HNRNPUL2 (ENSMMMG00000002784) #8	GNG3 (ENSMMMG00000002755) #9	BSCL2 (ENSMMMG00000002687) #10	LRRN4CL (ENSMMMG00000002684) #11	UBXN1 (ENSMMMG00000002665) #12	UQCC3 (ENSMMMG00000002655) #13	CSKMT (ENSMMMG00000002643)	INTS5 (ENSMMMG00000002623) #15	GANAB (ENSMMMG00000002585) #16	B3GAT3 (ENSMMMG00000002571) #17	ROM1 (ENSMMMG00000002567) #18	EML3 (ENSMMMG00000002484) #19	MTA2 (ENSMMMG00000002461) #20	TUT1 (ENSMMMG00000002433) #21	ENSMMMG00000002424 #22	ENSMMMG00000002408 #24	ENSMMMG00000002397 #23	SCGB1A1 (ENSMMMG00000002393) #26	ASRGL1 (ENSMMMG00000002386) #27	ENSMMMG00000002372	ENSMMMG00000002360	ENSMMMG00000002256 ##31	BEST1 (ENSMMMG00000002191) #32	FADS3 (ENSMMMG00000002106) #34	FADS2 (ENSMMMG00000002075) #35	FADS1 (ENSMMMG00000002044) #36	ENSMMMG00000002036	FEN1 (ENSMMMG00000002027) #37	TMEM258 (ENSMMMG00000002020)	MYRF (ENSMMMG00000001773)
Alpin marmot	MODERN SPECIES		ENSMMMG00000007789	SLCO4C1 (ENSMMMG00000007769)	ST8SIA4 (ENSMMMG00000007750)	ENSMMMG00000007722	CHD1 (ENSMMMG00000007643)	ENSMMMG00000007613	ENSMMMG00000007586	ENSMMMG00000007554	RIOK2 (ENSMMMG00000007539)	LIX1 (ENSMMMG00000007525)	LNPEP (ENSMMMG00000007455)	ERAP2 (ENSMMMG00000006028)	ERAP1 (ENSMMMG00000005931)	CAST (ENSMMMG00000005793)	PCSK1 (ENSMMMG00000005758)	ENSMMMG00000005740 #22	ELL2 (ENSMMMG00000005714)	ENSMMMG00000005706	GLRX (ENSMMMG00000005701)	RHOBTB3 (ENSMMMG00000005684)	ENSMMMG00000005662	SPATA9 (ENSMMMG00000005647)	RFESD (ENSMMMG00000005634)	ENSMMMG00000005629	ARSK (ENSMMMG00000005570)	SKIC3 (ENSMMMG00000005439)	FAM81B (ENSMMMG00000005408)	MCTP1 (ENSMMMG00000005297)	SLF1 (ENSMMMG00000005222)	KIAA0825 (ENSMMMG00000005181)	ENSMMMG00000005155
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00530000063866.e	ENSGT00940000161089	ENSGT00950000183151.a.a.a	ENSGT00390000015415	ENSGT00950000183197.b.a	ENSGT00390000018587	ENSGT00940000153899.a.a	ENSGT00730000110905.a	ENSGT00390000001149	ENSGT00390000003127	ENSGT00940000155040.a	ENSGT00940000157180
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	14	ENSHGLG00000038212	HNRNPUL2 (ENSHGLG00000003285) #8	GNG3 (ENSHGLG00000038630) #9	BSCL2 (ENSHGLG00000002887) #10	ENSHGLG00000038756 #11	UBXN1 (ENSHGLG00000002960) #12	METTL12 (ENSHGLG00000044833)	ENSHGLG00000002601 #14	INTS5 (ENSHGLG00000039217) #15	ENSHGLG00000045807 #16	ENSHGLG00000045092 #16	B3GAT3 (ENSHGLG00000004546) #17	ROM1 (ENSHGLG00000003990) #18	MTA2 (ENSHGLG00000002877) #20	ENSHGLG00000037053 #21	EEF1G (ENSHGLG00000046941) #22	ENSHGLG00000034389 ##24	ENSHGLG00000037481 #24	ENSHGLG00000035437	ENSHGLG00000038948 #27	ENSHGLG00000029155	ENSHGLG00000046269	ENSHGLG00000033722	ENSHGLG00000002837	ENSHGLG00000046341	TKFC (ENSHGLG00000018883)	CYB561A3 (ENSHGLG00000013997)	ENSHGLG00000034372	ENSHGLG00000038968	ENSHGLG00000019090	ENSHGLG00000032097
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00940000161805 #7	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00390000013802.u	ENSGT00940000161089	ENSGT00950000183151.a.a.a	ENSGT00390000015415	ENSGT00950000183197.b.a	ENSGT00390000018587	ENSGT00940000153899.a.a	ENSGT00730000110905.a	ENSGT00390000001149	ENSGT00390000003127	ENSGT00940000155040.a	ENSGT00940000157180	ENSGT00940000161192
Guinea pig	MODERN SPECIES	44	ENSCPOG00000000739	GNG3 (ENSCPOG00000040497) #9	LRRN4CL (ENSCPOG00000036188) #11	BSCL2 (ENSCPOG00000021949) #10	UBXN1 (ENSCPOG00000004750) #12	UQCC3 (ENSCPOG00000035939) #13	CSKMT (ENSCPOG00000027504)	C11orf98 (ENSCPOG00000039535) #14	INTS5 (ENSCPOG00000003669) #15	GANAB (ENSCPOG00000003659) #16	B3GAT3 (ENSCPOG00000021841) #17	ROM1 (ENSCPOG00000020227) #18	EML3 (ENSCPOG00000014293) #19	MTA2 (ENSCPOG00000014290) #20	TUT1 (ENSCPOG00000014281) #21	EEF1G (ENSCPOG00000025703) #22	ENSCPOG00000032311 #23	ASRGL1 (ENSCPOG00000038025) #27	ENSCPOG00000030162
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	80	ENSGT00940000161805 #7	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00940000161089	ENSGT00950000183151.a.a.a	ENSGT00390000015415	ENSGT00950000183197.b.a	ENSGT00390000018587	ENSGT00940000153899.a.a	ENSGT00730000110905.a	ENSGT00390000001149	ENSGT00390000003127	ENSGT00940000155040.a	ENSGT00940000157180	ENSGT00940000161192	ENSGT00530000063626.a
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	306	HNRNPUL2 (ENSCLAG00000000417) #8	LRRN4CL (ENSCLAG00000000228) #11	GNG3 (ENSCLAG00000000268) #9	BSCL2 (ENSCLAG00000000105) #10	UQCC3 (ENSCLAG00000000136) #13	UBXN1 (ENSCLAG00000000144) #12	CSKMT (ENSCLAG00000000298)	C11orf98 (ENSCLAG00000000342) #14	INTS5 (ENSCLAG00000000384) #15	GANAB (ENSCLAG00000000345) #16	B3GAT3 (ENSCLAG00000001628) #17	ROM1 (ENSCLAG00000000479) #18	EML3 (ENSCLAG00000001662) #19	MTA2 (ENSCLAG00000000128) #20	TUT1 (ENSCLAG00000000215) #21	EEF1G (ENSCLAG00000000315) #22	ENSCLAG00000000347 #23
Degu	DUPLICATION
Degu	DUPLICATION
Degu	MODERN SPECIES	238	CADM4 (ENSODEG00000010861)	PLAUR (ENSODEG00000010245)	ENSODEG00000019696	IRGC (ENSODEG00000009791)	SMG9 (ENSODEG00000010484)	KCNN4 (ENSODEG00000008740)	LYPD5 (ENSODEG00000008374)	ENSODEG00000019532	ZNF45 (ENSODEG00000011301)	ZNF227 (ENSODEG00000008802)	ENSODEG00000008591	ENSODEG00000010507	ZNF235 (ENSODEG00000008851)	ZNF112 (ENSODEG00000009193)	ZNF180 (ENSODEG00000010071)	ENSODEG00000019539 #22	CEACAM19 (ENSODEG00000008206)	CEACAM16 (ENSODEG00000008673)	BCL3 (ENSODEG00000009380)	CBLC (ENSODEG00000008402)	BCAM (ENSODEG00000013187)	NECTIN2 (ENSODEG00000008200)	ENSODEG00000010615	APOE (ENSODEG00000008747)	ENSODEG00000010383	ENSODEG00000011088	APOC2 (ENSODEG00000008478)	CLPTM1 (ENSODEG00000008066)	RELB (ENSODEG00000008207)	CLASRP (ENSODEG00000008407)	ZNF296 (ENSODEG00000008238)
Degu	MODERN SPECIES	320	TAF6L (ENSODEG00000001781)	ENSODEG00000018748	ENSODEG00000002048	HNRNPUL2 (ENSODEG00000002142) #8	TTC9C (ENSODEG00000002308) #7	GNG3 (ENSODEG00000002315) #9	UBXN1 (ENSODEG00000002987) #12	UQCC3 (ENSODEG00000003020) #13	INTS5 (ENSODEG00000003038) #15	GANAB (ENSODEG00000003210) #16	B3GAT3 (ENSODEG00000003388) #17	ROM1 (ENSODEG00000003428) #18	EML3 (ENSODEG00000003455) #19	MTA2 (ENSODEG00000003595) #20	TUT1 (ENSODEG00000002204) #21	ENSODEG00000002254 #22	ENSODEG00000002275 #23	ENSODEG00000002297	ENSODEG00000002313 #27	ENSODEG00000002333 #27	VWCE (ENSODEG00000002356)	DDB1 (ENSODEG00000002419)	CYB561A3 (ENSODEG00000002516)	TKFC (ENSODEG00000002529)	TMEM138 (ENSODEG00000002548)	TMEM216 (ENSODEG00000002567)	CPSF7 (ENSODEG00000002610)	SDHAF2 (ENSODEG00000002638)	PPP1R32 (ENSODEG00000004127)	SYT7 (ENSODEG00000004157)	DAGLA (ENSODEG00000004222)
Degu	MODERN SPECIES	77	ENSODEG00000007521	ADAM7 (ENSODEG00000007547)	ADAMDEC1 (ENSODEG00000008034)	ADAM28 (ENSODEG00000007875)	STC1 (ENSODEG00000007382)	NKX2-6 (ENSODEG00000007413)	NKX3-1 (ENSODEG00000007004)	SLC25A37 (ENSODEG00000007363)	ENTPD4 (ENSODEG00000009788)	ENSODEG00000009404	LOXL2 (ENSODEG00000006938)	R3HCC1 (ENSODEG00000007529)	ENSODEG00000019474	ENSODEG00000007294	RHOBTB2 (ENSODEG00000007111)	ENSODEG00000008725 #22	EGR3 (ENSODEG00000007442)	BIN3 (ENSODEG00000006965)	CCAR2 (ENSODEG00000008466)	C8orf58 (ENSODEG00000006637)	PDLIM2 (ENSODEG00000006028)	SORBS3 (ENSODEG00000007179)	PPP3CC (ENSODEG00000006004)	SLC39A14 (ENSODEG00000006438)	ENSODEG00000019353	PIWIL2 (ENSODEG00000009752)	POLR3D (ENSODEG00000005884)	PHYHIP (ENSODEG00000006421)	BMP1 (ENSODEG00000007288)	SFTPC (ENSODEG00000007026)	LGI3 (ENSODEG00000006726)
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000007552.f #22
Pika	MODERN SPECIES	2658	POLR2G (ENSOPRG00000014769)	ENSOPRG00000014743	HNRNPUL2 (ENSOPRG00000014724) #8	GNG3 (ENSOPRG00000014720) #9	BSCL2 (ENSOPRG00000018314) #10	UBXN1 (ENSOPRG00000014688) #12	UQCC3 (ENSOPRG00000014686) #13	CSKMT (ENSOPRG00000018764)	LBHD1 (ENSOPRG00000014680)	INTS5 (ENSOPRG00000014673) #15	GANAB (ENSOPRG00000014645) #16	B3GAT3 (ENSOPRG00000014636) #17	ROM1 (ENSOPRG00000014631) #18	EML3 (ENSOPRG00000014597) #19	MTA2 (ENSOPRG00000014575) #20	EEF1G (ENSOPRG00000014563) #22
Rabbit	DUPLICATION
Rabbit	MODERN SPECIES	5	TSC22D2 (ENSOCUG00000016074)	SERP1 (ENSOCUG00000016085)	EIF2A (ENSOCUG00000016095)	SELENOT (ENSOCUG00000013866)	ERICH6 (ENSOCUG00000008304)	SIAH2 (ENSOCUG00000010373)	MINDY4B (ENSOCUG00000029551)	CLRN1 (ENSOCUG00000013347)	MED12L (ENSOCUG00000005851)	GPR171 (ENSOCUG00000005877)	P2RY14 (ENSOCUG00000005879)	IGSF10 (ENSOCUG00000005885)	P2RY13 (ENSOCUG00000000418)	ENSOCUG00000025667	ENSOCUG00000005140	ENSOCUG00000021109 #22	AADAC (ENSOCUG00000005368)	SUCNR1 (ENSOCUG00000014135)	ENSOCUG00000034635	MBNL1 (ENSOCUG00000007601)	ENSOCUG00000024369	P2RY1 (ENSOCUG00000010828)	RAP2B (ENSOCUG00000014398)	ENSOCUG00000027959	ENSOCUG00000036257	ARHGEF26 (ENSOCUG00000001179)	DHX36 (ENSOCUG00000001180)	ENSOCUG00000038376	MME (ENSOCUG00000017924)	ENSOCUG00000036761	ENSOCUG00000030899
Rabbit	MODERN SPECIES	511															ZMYND11 (ENSOCUG00000027497)	ENSOCUG00000024328 #22	DIP2C (ENSOCUG00000007803)	ENSOCUG00000004950	ENSOCUG00000016120
Tree shrew	MODERN SPECIES	4683										INTS5 (ENSTBEG00000014202) #15	GANAB (ENSTBEG00000013800) #16	B3GAT3 (ENSTBEG00000013714) #17	ROM1 (ENSTBEG00000013670) #18	EML3 (ENSTBEG00000013431) #19	TUT1 (ENSTBEG00000013123) #21	ENSTBEG00000012860 #22
Primates	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00400000022873	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00390000013802.v.b	ENSGT00530000063866	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.a #31	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.b ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35	ENSGT00950000182990.a.a.b.b #36	ENSGT00520000061410
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00400000022873	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00390000013802.v.b	ENSGT00530000063866	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.a #31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35	ENSGT00950000182990.a.a.b.b #36	ENSGT00520000061410	ENSGT00940000155807.a #37
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00400000022873	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00390000013802.v.b	ENSGT00530000063866	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.a #31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35	ENSGT00950000182990.a.a.b.b #36	ENSGT00520000061410	ENSGT00940000155807.a #37
Mouse lemur	MODERN SPECIES	27	TTC9C (ENSMICG00000042013) #7	HNRNPUL2 (ENSMICG00000009943) #8	GNG3 (ENSMICG00000028299) #9	ENSMICG00000033250 #10	UBXN1 (ENSMICG00000009925) #12	UQCC3 (ENSMICG00000026609) #13	CSKMT (ENSMICG00000038782)	LBHD1 (ENSMICG00000042954)	INTS5 (ENSMICG00000009907) #15	GANAB (ENSMICG00000009890) #16	B3GAT3 (ENSMICG00000009885) #17	ROM1 (ENSMICG00000041920) #18	EML3 (ENSMICG00000009866) #19	MTA2 (ENSMICG00000044141) #20	TUT1 (ENSMICG00000009841) #21	EEF1G (ENSMICG00000009834) #22	ENSMICG00000031530 #24	SCGB1A1 (ENSMICG00000041999) #26	ASRGL1 (ENSMICG00000047676) #27	SCGB2A1 (ENSMICG00000003206)	ENSMICG00000047195	INCENP (ENSMICG00000005864) #29	ENSMICG00000044535	ENSMICG00000031901	ENSMICG00000035165 #31	BEST1 (ENSMICG00000005843) #32	RAB3IL1 (ENSMICG00000005824) #33	FADS3 (ENSMICG00000032887) #34	FADS2 (ENSMICG00000004145) #35	FADS1 (ENSMICG00000013915) #36	ENSMICG00000029413
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00390000013802.v.b	ENSGT00530000063866	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.a #31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35	ENSGT00950000182990.a.a.b.b #36	ENSGT00520000061410	ENSGT00940000155807.a #37
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	124	TTC9C (ENSPCOG00000017839) #7	HNRNPUL2 (ENSPCOG00000013502) #8	GNG3 (ENSPCOG00000017973) #9	BSCL2 (ENSPCOG00000015043) #10	UBXN1 (ENSPCOG00000019984) #12	UQCC3 (ENSPCOG00000019522) #13	CSKMT (ENSPCOG00000016342)	ENSPCOG00000014134 #14	INTS5 (ENSPCOG00000023497) #15	GANAB (ENSPCOG00000014717) #16	B3GAT3 (ENSPCOG00000008969) #17	ROM1 (ENSPCOG00000027824) #18	EML3 (ENSPCOG00000015725) #19	MTA2 (ENSPCOG00000022200) #20	TUT1 (ENSPCOG00000017464) #21	EEF1G (ENSPCOG00000015966) #22	ENSPCOG00000028630 #24	ENSPCOG00000028633 #23	SCGB1A1 (ENSPCOG00000028635) #26	ASRGL1 (ENSPCOG00000028628) #27	SCGB2A1 (ENSPCOG00000028625)
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	101	HNRNPUL2 (ENSPSMG00000022973) #8	GNG3 (ENSPSMG00000022948) #9	BSCL2 (ENSPSMG00000022881) #10	LRRN4CL (ENSPSMG00000022803) #11	UBXN1 (ENSPSMG00000022794) #12	UQCC3 (ENSPSMG00000022737) #13	CSKMT (ENSPSMG00000022734)	LBHD1 (ENSPSMG00000022723)	INTS5 (ENSPSMG00000022709) #15	GANAB (ENSPSMG00000022613) #16	B3GAT3 (ENSPSMG00000022369) #17	ROM1 (ENSPSMG00000022362) #18	EML3 (ENSPSMG00000022351) #19	MTA2 (ENSPSMG00000022318) #20	TUT1 (ENSPSMG00000022289) #21	EEF1G (ENSPSMG00000022280) #22	ENSPSMG00000022263 #23	SCGB1A1 (ENSPSMG00000022253) #26	ASRGL1 (ENSPSMG00000022249) #27	ENSPSMG00000022241	ENSPSMG00000022239	INCENP (ENSPSMG00000022199) #29	ENSPSMG00000022147 #31	BEST1 (ENSPSMG00000022118) #32	RAB3IL1 (ENSPSMG00000022098) #33	FADS3 (ENSPSMG00000021967) #34	FADS2 (ENSPSMG00000021745) #35	FADS1 (ENSPSMG00000021668) #36	ENSPSMG00000021638	ENSPSMG00000021632	FEN1 (ENSPSMG00000021625) #37
Bushbaby	MODERN SPECIES	255	GNG3 (ENSOGAG00000034224) #9	BSCL2 (ENSOGAG00000025056) #10	LRRN4CL (ENSOGAG00000031003) #11	UBXN1 (ENSOGAG00000011411) #12	UQCC3 (ENSOGAG00000028729) #13	LBHD1 (ENSOGAG00000025205)	CSKMT (ENSOGAG00000024258)	C11orf98 (ENSOGAG00000033103) #14	INTS5 (ENSOGAG00000032704) #15	GANAB (ENSOGAG00000011407) #16	B3GAT3 (ENSOGAG00000011405) #17	ROM1 (ENSOGAG00000032235) #18	EML3 (ENSOGAG00000000836) #19	MTA2 (ENSOGAG00000000833) #20	TUT1 (ENSOGAG00000000828) #21	EEF1G (ENSOGAG00000000827) #22	ENSOGAG00000031813 #24	ASRGL1 (ENSOGAG00000000405) #27	SCGB2A1 (ENSOGAG00000013831)	ENSOGAG00000030358	INCENP (ENSOGAG00000012974) #29	ENSOGAG00000025354 ##31	BEST1 (ENSOGAG00000026226) #32	RAB3IL1 (ENSOGAG00000004501) #33	FADS3 (ENSOGAG00000028613) #34	FADS2 (ENSOGAG00000004500) #35	FADS1 (ENSOGAG00000010794) #36	FEN1 (ENSOGAG00000024238) #37	TMEM258 (ENSOGAG00000010793)	MYRF (ENSOGAG00000010786)	DAGLA (ENSOGAG00000012574)
Haplorrhini	DUPLICATION
Haplorrhini	DUPLICATION
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000007552.f.w.a #22
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000007552.f.w.a #22
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000007552.f.w.a #22
Mas night monkey	MODERN SPECIES	925	CHRDL1 (ENSANAG00000021596)	PAK3 (ENSANAG00000037154)	CAPN6 (ENSANAG00000038219)	DCX (ENSANAG00000036270)	SERTM2 (ENSANAG00000001590)	ALG13 (ENSANAG00000027292)	TRPC5 (ENSANAG00000034028)	LHFPL1 (ENSANAG00000033553)	AMOT (ENSANAG00000020413)	ENSANAG00000038242	HTR2C (ENSANAG00000029302)	IL13RA2 (ENSANAG00000038042)	LRCH2 (ENSANAG00000032964)	ENSANAG00000025092	PLS3 (ENSANAG00000035343)	ENSANAG00000023051 #22	ENSANAG00000019875
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000007552.f.w.a #22
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	90	ENSGT00950000182988.a.b.b.b	ENSGT00940000156128.b	ENSGT00940000161570.a	ENSGT00950000183232	ENSGT00510000047120.f	ENSGT00940000159922.b	ENSGT01060000248594.e.a	ENSGT00990000203589.a.b.a.b	ENSGT00940000159055	ENSGT00940000158041.c.b	ENSGT01050000244937.a.b.a	ENSGT00940000159971	ENSGT00940000160039	ENSGT00990000204264	ENSGT00950000183097.a.a.a	ENSGT00390000007552.f.w.a #22
Capuchin	MODERN SPECIES	534										ENSCCAG00000024001	HTR2C (ENSCCAG00000033885)	IL13RA2 (ENSCCAG00000026227)	LRCH2 (ENSCCAG00000027902)	ENSCCAG00000026741	PLS3 (ENSCCAG00000025264)	ENSCCAG00000019627 #22
Tarsier	MODERN SPECIES	6571															PDCD6IP (ENSTSYG00000012850)	ENSTSYG00000037581 #22	CLASP2 (ENSTSYG00000009193)	ENSTSYG00000000705	FBXL2 (ENSTSYG00000000704)	SUSD5 (ENSTSYG00000009115)	GLB1 (ENSTSYG00000014019)	TRIM71 (ENSTSYG00000033433)
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000007552.f.w.b #22
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000007552.f.w.b #22
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000007552.f.w.b #22
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000007552.f.w.b #22
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000156449	ENSGT00390000008128.c.a.a	ENSGT00940000153534.A	ENSGT00940000154319.u.b	ENSGT00860000133854	ENSGT00940000158239.b	ENSGT00940000159606	ENSGT00940000155861.C	ENSGT00940000156444	ENSGT00390000005159	ENSGT00390000018209	ENSGT00940000155390	ENSGT00880000138031.j	ENSGT00940000158202	ENSGT00400000022323	ENSGT00390000007552.f.w.b #22	ENSGT00940000160319	ENSGT00940000160994	ENSGT00530000064199	ENSGT00390000010316.j.a	ENSGT00390000011295.a	ENSGT00390000015228	ENSGT00390000003590	ENSGT00940000153189.B	ENSGT00940000159722	ENSGT00390000012561.b	ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b	ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b	ENSGT00940000154107.b	ENSGT00530000064234.c	ENSGT00390000001138.b
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	56	NOP58 (ENSSBOG00000020494)	ENSSBOG00000030624	KIAA2012 (ENSSBOG00000034494)	FZD7 (ENSSBOG00000013896)	CDK15 (ENSSBOG00000023266)	ALS2 (ENSSBOG00000026070)	MPP4 (ENSSBOG00000032446)	TMEM237 (ENSSBOG00000028677)	C2CD6 (ENSSBOG00000024027)	ENSSBOG00000022018	STRADB (ENSSBOG00000028914)	TRAK2 (ENSSBOG00000027410)	ENSSBOG00000024387	FLACC1 (ENSSBOG00000032227)	CASP8 (ENSSBOG00000027346)	ENSSBOG00000021837 #22	CASP10 (ENSSBOG00000023212)	CFLAR (ENSSBOG00000020876)	NDUFB3 (ENSSBOG00000023814)	HYCC2 (ENSSBOG00000033197)	ENSSBOG00000025751	NIF3L1 (ENSSBOG00000034561)	ENSSBOG00000028593	CLK1 (ENSSBOG00000031614)	BZW1 (ENSSBOG00000020710)	ENSSBOG00000034034	AOX1 (ENSSBOG00000032424)	SGO2 (ENSSBOG00000035222)	KCTD18 (ENSSBOG00000031520)	SPATS2L (ENSSBOG00000031853)	MAIP1 (ENSSBOG00000033061)
Capuchin	MODERN SPECIES	178												C2CD6 (ENSCCAG00000028522)	STRADB (ENSCCAG00000020333)	TRAK2 (ENSCCAG00000020610)	FLACC1 (ENSCCAG00000026901)	ENSCCAG00000018015 #22	CASP8 (ENSCCAG00000028402)	CASP10 (ENSCCAG00000024459)	CFLAR (ENSCCAG00000033389)	NDUFB3 (ENSCCAG00000033888)	FAM126B (ENSCCAG00000029565)	ORC2 (ENSCCAG00000000270)	NIF3L1 (ENSCCAG00000020100)	PPIL3 (ENSCCAG00000019393)	CLK1 (ENSCCAG00000021387)	BZW1 (ENSCCAG00000012616)	ENSCCAG00000028426	AOX1 (ENSCCAG00000025414)	SGO2 (ENSCCAG00000032369)	KCTD18 (ENSCCAG00000023011)	SPATS2L (ENSCCAG00000033886)
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00400000022873	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00390000013802.v.a	ENSGT00390000013802.v.b	ENSGT00530000063866	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.a.a.a ##31	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.b ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35	ENSGT00950000182990.a.a.b.b #36
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00400000022873	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00390000013802.v.a	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00530000063866.c.b	ENSGT00390000013802.v.b.c	ENSGT00530000063866.c.a	ENSGT00390000013802.v.b.d	ENSGT00530000063866.d	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.a.a.a ##31	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00400000022873	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a.i #27	ENSGT00950000183045.A.a.a.j #27	ENSGT00530000063866.c.b	ENSGT00390000013802.v.a	ENSGT00530000063866.c.a	ENSGT00390000013802.v.b.d	ENSGT00530000063866.d	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.a.a.a.b.a.a.b ##31	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33
Mas night monkey	DUPLICATION
Mas night monkey	MODERN SPECIES	336	TTC9C (ENSANAG00000030687) #7	HNRNPUL2 (ENSANAG00000027153) #8	GNG3 (ENSANAG00000028934) #9	ENSANAG00000037042 #10	UBXN1 (ENSANAG00000027543) #12	UQCC3 (ENSANAG00000035176) #13	CSKMT (ENSANAG00000028032)	LBHD1 (ENSANAG00000036011)	INTS5 (ENSANAG00000028879) #15	GANAB (ENSANAG00000007532) #16	B3GAT3 (ENSANAG00000035998) #17	ROM1 (ENSANAG00000035173) #18	EML3 (ENSANAG00000024070) #19	MTA2 (ENSANAG00000021803) #20	TUT1 (ENSANAG00000029063) #21	ENSANAG00000024873 #22	ENSANAG00000034540 #24	SCGB1A1 (ENSANAG00000027981) #26	ENSANAG00000036672 #27	ENSANAG00000033173 #27	SCGB1D4 (ENSANAG00000035813)	ENSANAG00000032810	SCGB2A2 (ENSANAG00000030356)	SCGB1D2 (ENSANAG00000023403)	SCGB2A1 (ENSANAG00000023243)	SCGB1D1 (ENSANAG00000037619)	INCENP (ENSANAG00000035094) #29	ENSANAG00000032960 ##31	BEST1 (ENSANAG00000037419) #32	RAB3IL1 (ENSANAG00000035875) #33	FADS3 (ENSANAG00000022958) #34
Mas night monkey	MODERN SPECIES	522			ENSANAG00000027676	ENSANAG00000028737	PCYOX1 (ENSANAG00000023649)	TIA1 (ENSANAG00000026081)	C2orf42 (ENSANAG00000034166)	ENSANAG00000023938	ASPRV1 (ENSANAG00000035270)	MXD1 (ENSANAG00000026938)	ENSANAG00000036286	ENSANAG00000024344	ANXA4 (ENSANAG00000024621)	ENSANAG00000034087	ENSANAG00000026342	ENSANAG00000006625 #22	AAK1 (ENSANAG00000022992)	NFU1 (ENSANAG00000022679)	GFPT1 (ENSANAG00000022514)	ANTXR1 (ENSANAG00000027848)	GKN1 (ENSANAG00000022751)	GKN2 (ENSANAG00000033190)	BMP10 (ENSANAG00000029195)
Cebidae	DUPLICATION
Cebidae	DUPLICATION
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000007552.f.x.c.a #22
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00400000022873	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x.c.b #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00950000183045.A.a.a.i #27	ENSGT00390000007552.f.x.c.a #22	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00390000013802.v.b.c	ENSGT00530000063866.c.a	ENSGT00390000013802.v.b.d	ENSGT00530000063866.d	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.a.a.a.b.a.a.a.b ##31	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000183316	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35	ENSGT00950000182990.a.a.b.b #36
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	42	TTC9C (ENSSBOG00000023530) #7	HNRNPUL2 (ENSSBOG00000026780) #8	GNG3 (ENSSBOG00000015839) #9	BSCL2 (ENSSBOG00000017621) #10	ENSSBOG00000035227 #12	UQCC3 (ENSSBOG00000032621) #13	CSKMT (ENSSBOG00000030424)	LBHD1 (ENSSBOG00000022501)	INTS5 (ENSSBOG00000033783) #15	GANAB (ENSSBOG00000031512) #16	B3GAT3 (ENSSBOG00000034134) #17	ROM1 (ENSSBOG00000021679) #18	EML3 (ENSSBOG00000028020) #19	MTA2 (ENSSBOG00000020111) #20	TUT1 (ENSSBOG00000003827) #21	ENSSBOG00000029342 #22	ENSSBOG00000014296 #23	SCGB1A1 (ENSSBOG00000018756) #26	ASRGL1 (ENSSBOG00000014673) #27	ENSSBOG00000029423	SCGB1D4 (ENSSBOG00000025179)	ENSSBOG00000017764	SCGB2A2 (ENSSBOG00000028742)	SCGB1D2 (ENSSBOG00000010503)	SCGB2A1 (ENSSBOG00000013372)	SCGB1D1 (ENSSBOG00000029702)	INCENP (ENSSBOG00000013254) #29	ENSSBOG00000015673	FTH1 (ENSSBOG00000027832) ##31	BEST1 (ENSSBOG00000027813) #32	RAB3IL1 (ENSSBOG00000030643) #33
Marmoset	MODERN SPECIES	11	CATSPER3 (ENSCJAG00000005799)	PITX1 (ENSCJAG00000086657)	MACROH2A1 (ENSCJAG00000005818)	TIFAB (ENSCJAG00000043900)	CXCL14 (ENSCJAG00000005888)	SLC25A48 (ENSCJAG00000005904)	IL9 (ENSCJAG00000005916)	ENSCJAG00000041175	LECT2 (ENSCJAG00000043329)	TGFBI (ENSCJAG00000005930)	SMAD5 (ENSCJAG00000005968)	SMIM32 (ENSCJAG00000005981)	TRPC7 (ENSCJAG00000005983)	SPOCK1 (ENSCJAG00000006070)	KLHL3 (ENSCJAG00000006075)	ENSCJAG00000006131 #22	MYOT (ENSCJAG00000006134)	PKD2L2 (ENSCJAG00000006165)	FAM13B (ENSCJAG00000006206)	ENSCJAG00000006244	NME5 (ENSCJAG00000006262)	WNT8A (ENSCJAG00000006245)	BRD8 (ENSCJAG00000006280)	KIF20A (ENSCJAG00000006393)	CDC23 (ENSCJAG00000006418)	ENSCJAG00000073473	GFRA3 (ENSCJAG00000006454)	CDC25C (ENSCJAG00000082458)	ENSCJAG00000055933	FAM53C (ENSCJAG00000048646)	KDM3B (ENSCJAG00000006510)
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00400000022873	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x.c.b #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a.i #27	ENSGT00950000183045.A.a.a.j #27	ENSGT00530000063866.c.b	ENSGT00390000013802.v.a	ENSGT00530000063866.c.a	ENSGT00390000013802.v.b.d	ENSGT00530000063866.d	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.a.a.a.b.a.a.b ##31	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000161805 #7	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00400000022873	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x.c.b #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00950000183045.A.a.a.i #27	ENSGT00390000007552.f.x.c.a #22	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00390000013802.v.b.c	ENSGT00530000063866.c.a	ENSGT00390000013802.v.b.d	ENSGT00530000063866.d	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.a.a.a.b.a.a.a.b ##31	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34
Capuchin	MODERN SPECIES	316	ENSCCAG00000022329	HNRNPUL2 (ENSCCAG00000037674) #8	BSCL2 (ENSCCAG00000026340) #10	GNG3 (ENSCCAG00000030017) #9	UBXN1 (ENSCCAG00000020847) #12	UQCC3 (ENSCCAG00000030092) #13	LBHD1 (ENSCCAG00000025856)	ENSCCAG00000037825	INTS5 (ENSCCAG00000030851) #15	GANAB (ENSCCAG00000001747) #16	ENSCCAG00000037727 #17	ROM1 (ENSCCAG00000023216) #18	EML3 (ENSCCAG00000029421) #19	MTA2 (ENSCCAG00000026631) #20	TUT1 (ENSCCAG00000018819) #21	ENSCCAG00000033526 #22	AHNAK (ENSCCAG00000025745) #24	ASRGL1 (ENSCCAG00000024611) #27	ENSCCAG00000022311	SCGB1D2 (ENSCCAG00000033799)	SCGB2A1 (ENSCCAG00000030614)	SCGB1D1 (ENSCCAG00000032346)	INCENP (ENSCCAG00000018638) #29	ENSCCAG00000027979 ##31	BEST1 (ENSCCAG00000022350) #32	RAB3IL1 (ENSCCAG00000023993) #33	FADS3 (ENSCCAG00000036626) #34	FADS2 (ENSCCAG00000020221) #35	ENSCCAG00000036895	FADS1 (ENSCCAG00000034736) #36	FEN1 (ENSCCAG00000024050) #37
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	79	ENSSBOG00000020043	HHAT (ENSSBOG00000035340)	ENSSBOG00000020597	ENSSBOG00000026679	SERTAD4 (ENSSBOG00000035607)	ENSSBOG00000026801	SYT14 (ENSSBOG00000029111)	UTP25 (ENSSBOG00000022281)	IRF6 (ENSSBOG00000003627)	TRAF3IP3 (ENSSBOG00000021891)	ENSSBOG00000012130	HSD11B1 (ENSSBOG00000035190)	LAMB3 (ENSSBOG00000031511)	CAMK1G (ENSSBOG00000027000)	PLXNA2 (ENSSBOG00000033258)	ENSSBOG00000036095 #22	CD34 (ENSSBOG00000030347)	CD46 (ENSSBOG00000019001)	CR1L (ENSSBOG00000022625)	ENSSBOG00000018205	CR2 (ENSSBOG00000021258)	CD55 (ENSSBOG00000023177)	ENSSBOG00000013917	C4BPA (ENSSBOG00000030104)	C4BPB (ENSSBOG00000021724)	PFKFB2 (ENSSBOG00000027447)	YOD1 (ENSSBOG00000023276)	C1orf116 (ENSSBOG00000032059)	FCAMR (ENSSBOG00000019046)	PIGR (ENSSBOG00000035980)	FCMR (ENSSBOG00000022073)
Marmoset	MODERN SPECIES	2	GNG3 (ENSCJAG00000069907) #9	BSCL2 (ENSCJAG00000018730) #10	LRRN4CL (ENSCJAG00000047970) #11	UBXN1 (ENSCJAG00000018751) #12	UQCC3 (ENSCJAG00000082326) #13	CSKMT (ENSCJAG00000018816)	LBHD1 (ENSCJAG00000018789)	ENSCJAG00000075366	INTS5 (ENSCJAG00000018821) #15	GANAB (ENSCJAG00000018826) #16	B3GAT3 (ENSCJAG00000018860) #17	ROM1 (ENSCJAG00000044995) #18	EML3 (ENSCJAG00000018884) #19	MTA2 (ENSCJAG00000018928) #20	TUT1 (ENSCJAG00000033294) #21	ENSCJAG00000018949 #22	ENSCJAG00000072475 #23	SCGB1A1 (ENSCJAG00000019012) #26	ENSCJAG00000078407 #27	ENSCJAG00000055515 #27	SCGB1D4 (ENSCJAG00000019054)	SCGB2A2 (ENSCJAG00000019059)	SCGB1D2 (ENSCJAG00000058578)	SCGB2A1 (ENSCJAG00000019050)	SCGB1D1 (ENSCJAG00000019048)	INCENP (ENSCJAG00000019069) #29	ENSCJAG00000047003 ##31	BEST1 (ENSCJAG00000019095) #32	RAB3IL1 (ENSCJAG00000019137) #33	ENSCJAG00000046538	FADS2 (ENSCJAG00000019168) #35
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000007552.f.x.d #22
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000007552.f.x.d #22
Capuchin	DUPLICATION
Capuchin	MODERN SPECIES	46	FER (ENSCCAG00000029167)	PJA2 (ENSCCAG00000020652)	ENSCCAG00000036031	MAN2A1 (ENSCCAG00000019187)	ENSCCAG00000031412	TMEM232 (ENSCCAG00000002879)	SLC25A46 (ENSCCAG00000032689)	TSLP (ENSCCAG00000022617)	WDR36 (ENSCCAG00000035644)	CAMK4 (ENSCCAG00000029501)	STARD4 (ENSCCAG00000029489)	ENSCCAG00000030010	ENSCCAG00000035385	NREP (ENSCCAG00000002167)	EPB41L4A (ENSCCAG00000034780)	ENSCCAG00000033143 #22	ENSCCAG00000026026	APC (ENSCCAG00000032289)	SRP19 (ENSCCAG00000035651)	REEP5 (ENSCCAG00000033540)	DCP2 (ENSCCAG00000034353)	TSSK1B (ENSCCAG00000035371)	MCC (ENSCCAG00000036065)	YTHDC2 (ENSCCAG00000037613)
Capuchin	MODERN SPECIES	11	GPRC6A (ENSCCAG00000030003)	RFX6 (ENSCCAG00000019715)	VGLL2 (ENSCCAG00000028036)	ROS1 (ENSCCAG00000033956)	ENSCCAG00000027081	DCBLD1 (ENSCCAG00000025349)	ENSCCAG00000028924	ENSCCAG00000024292	NUS1 (ENSCCAG00000020694)	DYDC2 (ENSCCAG00000028493)	DYDC1 (ENSCCAG00000026278)	MAT1A (ENSCCAG00000021786)	ANXA11 (ENSCCAG00000037639)	PLAC9 (ENSCCAG00000026257)	TMEM254 (ENSCCAG00000021130)	ENSCCAG00000028226 #22	ENSCCAG00000021547	SFTPD (ENSCCAG00000025815)	ENSCCAG00000003281	ZCCHC24 (ENSCCAG00000031702)	PPIF (ENSCCAG00000023235)	ZMIZ1 (ENSCCAG00000028934)	ENSCCAG00000033731	POLR3A (ENSCCAG00000032995)	DLG5 (ENSCCAG00000023904)	ENSCCAG00000022279	ENSCCAG00000021193	KCNMA1 (ENSCCAG00000036045)	LRMDA (ENSCCAG00000019485)	ZNF503 (ENSCCAG00000036982)	ENSCCAG00000023847
Capuchin	MODERN SPECIES	19	WDR93 (ENSCCAG00000032328)	PEX11A (ENSCCAG00000036277)	PLIN1 (ENSCCAG00000035870)	KIF7 (ENSCCAG00000033647)	ENSCCAG00000025798	TICRR (ENSCCAG00000020179)	RHCG (ENSCCAG00000025755)	POLG (ENSCCAG00000007512)	FANCI (ENSCCAG00000025718)	RLBP1 (ENSCCAG00000005991)	ABHD2 (ENSCCAG00000025237)	ZNF774 (ENSCCAG00000019513)	ENSCCAG00000035117	VPS33B (ENSCCAG00000023465)	SV2B (ENSCCAG00000033612)	ENSCCAG00000037846 #22	SLCO3A1 (ENSCCAG00000033566)	ST8SIA2 (ENSCCAG00000028872)	FAM174B (ENSCCAG00000028052)	ENSCCAG00000027689	CHD2 (ENSCCAG00000035304)	RGMA (ENSCCAG00000002095)	MCTP2 (ENSCCAG00000025750)	ENSCCAG00000034983	NR2F2 (ENSCCAG00000023106)	ENSCCAG00000033723	ENSCCAG00000024021	ARRDC4 (ENSCCAG00000020954)	ENSCCAG00000037829	PGPEP1L (ENSCCAG00000025538)	IGF1R (ENSCCAG00000030475)
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00400000022873	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615 #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00940000153052.c.a.a	ENSGT00530000063866.c.b	ENSGT00390000013802.v.b.c	ENSGT00390000013802.v.a	ENSGT00530000063866.c.a	ENSGT00390000013802.v.b.d	ENSGT00530000063866.d	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00400000022873	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954.k.a #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00940000153052.c.a.a.c	ENSGT00530000063866.c.b	ENSGT00390000013802.v.a	ENSGT00530000063866.c.a	ENSGT00390000013802.v.b.d	ENSGT00530000063866.d	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000183316
Gibbon	DUPLICATION
Gibbon	MODERN SPECIES	19	HNRNPUL2 (ENSNLEG00000004077) #8	GNG3 (ENSNLEG00000004072) #9	BSCL2 (ENSNLEG00000004058) #10	LRRN4CL (ENSNLEG00000004054) #11	UBXN1 (ENSNLEG00000004041) #12	UQCC3 (ENSNLEG00000035136) #13	CSKMT (ENSNLEG00000004038)	LBHD1 (ENSNLEG00000004026)	INTS5 (ENSNLEG00000035490) #15	GANAB (ENSNLEG00000003980) #16	B3GAT3 (ENSNLEG00000003956) #17	ROM1 (ENSNLEG00000003950) #18	EML3 (ENSNLEG00000003879) #19	MTA2 (ENSNLEG00000003813) #20	TUT1 (ENSNLEG00000003780) #21	EEF1G (ENSNLEG00000003528) #22	ENSNLEG00000031821 #23	SCGB1A1 (ENSNLEG00000003507) #26	ASRGL1 (ENSNLEG00000003492) #27	ENSNLEG00000030364	ENSNLEG00000003484	SCGB1D2 (ENSNLEG00000003481)	SCGB2A1 (ENSNLEG00000003471)	ENSNLEG00000003463	ENSNLEG00000028720	INCENP (ENSNLEG00000003380) #29	ENSNLEG00000003321 ##31	BEST1 (ENSNLEG00000003280) #32	RAB3IL1 (ENSNLEG00000003273) #33	ENSNLEG00000003139 #34	ENSNLEG00000031350
Gibbon	MODERN SPECIES	22	FAT4 (ENSNLEG00000009479)	ENSNLEG00000008841	ENSNLEG00000031531	INTU (ENSNLEG00000013556)	SLC25A31 (ENSNLEG00000013592)	HSPA4L (ENSNLEG00000013603)	PLK4 (ENSNLEG00000013679)	MFSD8 (ENSNLEG00000013748)	ABHD18 (ENSNLEG00000013793)	ENSNLEG00000030732	LARP1B (ENSNLEG00000013819)	PGRMC2 (ENSNLEG00000013884)	JADE1 (ENSNLEG00000013898)	SCLT1 (ENSNLEG00000013945)	C4orf33 (ENSNLEG00000031979)	ENSNLEG00000028478 #22	ENSNLEG00000029937	ENSNLEG00000029766	PCDH10 (ENSNLEG00000013967)	PABPC4L (ENSNLEG00000019300)	ENSNLEG00000027749	ENSNLEG00000035962	ENSNLEG00000029177	PCDH18 (ENSNLEG00000013976)	SLC7A11 (ENSNLEG00000013991)	NOCT (ENSNLEG00000014018)	ELF2 (ENSNLEG00000014022)	MGARP (ENSNLEG00000033771)	NDUFC1 (ENSNLEG00000034036)	NAA15 (ENSNLEG00000014091)	SLC5A4 (ENSNLEG00000014174)
Gibbon	MODERN SPECIES	3	CADPS2 (ENSNLEG00000012024)	ENSNLEG00000030675	SLC13A1 (ENSNLEG00000012101)	IQUB (ENSNLEG00000012115)	NDUFA5 (ENSNLEG00000030214)	ASB15 (ENSNLEG00000012140)	LMOD2 (ENSNLEG00000012153)	WASL (ENSNLEG00000012159)	HYAL4 (ENSNLEG00000012182)	SPAM1 (ENSNLEG00000012189)	TMEM229A (ENSNLEG00000018603)	ENSNLEG00000031959	GPR37 (ENSNLEG00000012200)	ENSNLEG00000033858	POT1 (ENSNLEG00000012201)	ENSNLEG00000012225 #22	GRM8 (ENSNLEG00000012231)	ENSNLEG00000033122	ZNF800 (ENSNLEG00000012232)	GCC1 (ENSNLEG00000012234)	ENSNLEG00000030696	FSCN3 (ENSNLEG00000012245)	PAX4 (ENSNLEG00000012257)	SND1 (ENSNLEG00000012263)	LRRC4 (ENSNLEG00000035843)	LEP (ENSNLEG00000012302)	RBM28 (ENSNLEG00000012307)	PRRT4 (ENSNLEG00000012335)	ENSNLEG00000012341	HILPDA (ENSNLEG00000028127)	ENSNLEG00000012368
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00400000022873	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954.k.a #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00940000153052.c.a.a.c	ENSGT00530000063866.c.b	ENSGT00390000013802.v.a	ENSGT00530000063866.c.a	ENSGT00390000013802.v.b.d	ENSGT00530000063866.d	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.b ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000183316
Orangutan	MODERN SPECIES	2	HNRNPUL2 (ENSPPYG00000029773) #8	GNG3 (ENSPPYG00000003150) #9	BSCL2 (ENSPPYG00000038932) #10	LRRN4CL (ENSPPYG00000003152) #11	UBXN1 (ENSPPYG00000003153) #12	ENSPPYG00000003154 #13	LBHD1 (ENSPPYG00000003155)	CSKMT (ENSPPYG00000003156)	INTS5 (ENSPPYG00000003157) #15	GANAB (ENSPPYG00000003158) #16	B3GAT3 (ENSPPYG00000025907) #17	ROM1 (ENSPPYG00000003159) #18	EML3 (ENSPPYG00000003160) #19	MTA2 (ENSPPYG00000003161) #20	TUT1 (ENSPPYG00000003162) #21	EEF1G (ENSPPYG00000029434) #22	ENSPPYG00000035391 #23	SCGB1A1 (ENSPPYG00000003165) #26	ASRGL1 (ENSPPYG00000003166) #27	ENSPPYG00000034057	ENSPPYG00000038729	ENSPPYG00000003168	SCGB1D2 (ENSPPYG00000003169)	SCGB2A1 (ENSPPYG00000003170)	SCGB1D1 (ENSPPYG00000025908)	INCENP (ENSPPYG00000003171) #29	FTH1 (ENSPPYG00000003173) ##31	BEST1 (ENSPPYG00000003174) #32	ENSPPYG00000003175 #33	FADS3 (ENSPPYG00000003176) #34	FADS2 (ENSPPYG00000003177) #35
Homo/Pan/Gorilla group	DUPLICATION
Homo/Pan/Gorilla group	DUPLICATION
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00400000022873	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139.e #16	ENSGT00940000156954.k.a #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x.h.a #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00940000153052.c.a.a.c	ENSGT00530000063866.c.b	ENSGT00390000013802.v.a	ENSGT00530000063866.c.a	ENSGT00390000013802.v.b.d	ENSGT00530000063866.d	ENSGT01030000235462	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.b ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00400000022873	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139.e #16	ENSGT00940000156954.k.a #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x.h.a #22	ENSGT00390000007552.f.x.i #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00940000153052.c.a.a.c	ENSGT00530000063866.c.b	ENSGT00390000013802.v.a	ENSGT00530000063866.c.a	ENSGT00390000013802.v.b.d	ENSGT00530000063866.d	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34
Pan	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00400000022873	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139.e #16	ENSGT00940000156954.k.a #17	ENSGT00940000159139.f #16	ENSGT00940000156954.l #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x.h.a #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00940000153052.c.a.a.c	ENSGT00530000063866.c.b	ENSGT00390000013802.v.a	ENSGT00530000063866.c.a	ENSGT00390000013802.v.b.d	ENSGT00530000063866.d	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.b ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000183316
Chimpanzee	MODERN SPECIES	2	TTC9C (ENSPTRG00000023824) #7	HNRNPUL2 (ENSPTRG00000034359) #8	GNG3 (ENSPTRG00000003783) #9	BSCL2 (ENSPTRG00000003784) #10	UBXN1 (ENSPTRG00000003780) #12	UQCC3 (ENSPTRG00000028607) #13	CSKMT (ENSPTRG00000034411)	LBHD1 (ENSPTRG00000049492)	INTS5 (ENSPTRG00000003777) #15	GANAB (ENSPTRG00000003776) #16	B3GAT3 (ENSPTRG00000039665) #17	ROM1 (ENSPTRG00000003773) #18	ENSPTRG00000003772 #19	MTA2 (ENSPTRG00000003771) #20	TUT1 (ENSPTRG00000003770) #21	EEF1G (ENSPTRG00000003768) #22	AHNAK (ENSPTRG00000003766) #24	SCGB1A1 (ENSPTRG00000003765) #26	ASRGL1 (ENSPTRG00000003764) #27	ENSPTRG00000047416	SCGB1D4 (ENSPTRG00000050005)	SCGB2A2 (ENSPTRG00000003763)	SCGB1D2 (ENSPTRG00000023215)	SCGB2A1 (ENSPTRG00000003762)	SCGB1D1 (ENSPTRG00000003761)	ENSPTRG00000046039	INCENP (ENSPTRG00000003760) #29	ENSPTRG00000050975 ##31	BEST1 (ENSPTRG00000003756) #32	RAB3IL1 (ENSPTRG00000003755) #33	FADS3 (ENSPTRG00000003754) #34
Bonobo	MODERN SPECIES	2	ZBTB3 (ENSPPAG00000031673)	TTC9C (ENSPPAG00000030010) #7	ENSPPAG00000041471	GNG3 (ENSPPAG00000032105) #9	BSCL2 (ENSPPAG00000042902) #10	UBXN1 (ENSPPAG00000036691) #12	ENSPPAG00000012147 #13	CSKMT (ENSPPAG00000029192)	LBHD1 (ENSPPAG00000031864)	INTS5 (ENSPPAG00000028305) #15	GANAB (ENSPPAG00000043210) #16	B3GAT3 (ENSPPAG00000016802) #17	ROM1 (ENSPPAG00000035434) #18	EML3 (ENSPPAG00000031717) #19	TUT1 (ENSPPAG00000037200) #21	ENSPPAG00000043560 #22	ENSPPAG00000044021 #24	SCGB1A1 (ENSPPAG00000037115) #26	ASRGL1 (ENSPPAG00000037527) #27	ENSPPAG00000043065	SCGB1D4 (ENSPPAG00000020935)	SCGB2A2 (ENSPPAG00000039013)	SCGB1D2 (ENSPPAG00000011860)	SCGB2A1 (ENSPPAG00000040636)	SCGB1D1 (ENSPPAG00000038178)	INCENP (ENSPPAG00000020765) #29	ENSPPAG00000029826 ##31	BEST1 (ENSPPAG00000028859) #32	RAB3IL1 (ENSPPAG00000042430) #33	FADS3 (ENSPPAG00000027798) #34	ENSPPAG00000041561
Gorilla	MODERN SPECIES	2	ZBTB3 (ENSGGOG00000011735)	TTC9C (ENSGGOG00000011733) #7	HNRNPUL2 (ENSGGOG00000011722) #8	GNG3 (ENSGGOG00000003199) #9	BSCL2 (ENSGGOG00000003195) #10	UBXN1 (ENSGGOG00000005047) #12	ENSGGOG00000027467 #13	CSKMT (ENSGGOG00000027342)	LBHD1 (ENSGGOG00000005043)	INTS5 (ENSGGOG00000026126) #15	GANAB (ENSGGOG00000013611) #16	EML3 (ENSGGOG00000013581) #19	ROM1 (ENSGGOG00000013599) #18	MTA2 (ENSGGOG00000013570) #20	TUT1 (ENSGGOG00000013564) #21	ENSGGOG00000013557 #22	ENSGGOG00000026177 #24	SCGB1A1 (ENSGGOG00000001795) #26	ENSGGOG00000023746	SCGB1D4 (ENSGGOG00000000819)	SCGB2A2 (ENSGGOG00000006347)	SCGB1D2 (ENSGGOG00000026258)	SCGB2A1 (ENSGGOG00000022202)	SCGB1D1 (ENSGGOG00000015681)	ENSGGOG00000041256	INCENP (ENSGGOG00000014193) #29	ENSGGOG00000027722 ##31	BEST1 (ENSGGOG00000011404) #32	ENSGGOG00000012399 #33	FADS3 (ENSGGOG00000012388) #34	ENSGGOG00000037580
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000017181	ENSGT00390000001566	ENSGT00390000013192	ENSGT00390000014089	ENSGT00940000154507.g.a	ENSGT00940000160916	ENSGT00940000153901.a.a	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000164182.a.b	ENSGT00940000154773.o	ENSGT00940000153272.a.b.o.a	ENSGT00390000002915	ENSGT00940000157992	ENSGT00390000001439	ENSGT00390000000903.a.f.a	ENSGT00390000007552.f.x.h.b #22	ENSGT00390000000903.a.f.b.b	ENSGT01050000244850.B	ENSGT00390000005809.m.b	ENSGT00950000183014.f.a.g.b.a.a	ENSGT00730000111314	ENSGT00390000001702	ENSGT00940000163415	ENSGT00390000009822	ENSGT00390000016313.a.a	ENSGT00510000047602.q.a.a	ENSGT00390000002222	ENSGT00940000158082.b	ENSGT00940000161666	ENSGT00940000161774	ENSGT00940000160121
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Pan	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000000068	ENSGT00390000017181	ENSGT00390000001566	ENSGT00390000013192	ENSGT00390000014089	ENSGT00940000154507.g.a	ENSGT00940000160916	ENSGT00940000153901.a.a	ENSGT00950000182926.a	ENSGT00940000164182.a.b	ENSGT00940000154773.o	ENSGT00940000153272.a.b.o.a	ENSGT00390000002915	ENSGT00940000157992	ENSGT00390000001439	ENSGT00390000007552.f.x.h.b #22	ENSGT00390000000903.a.f.b.b	ENSGT01050000244850.B	ENSGT00390000005809.m.b	ENSGT00950000183014.f.a.g.b.a.a	ENSGT00730000111314	ENSGT00390000001702	ENSGT00940000154668.`b	ENSGT00940000163415	ENSGT00390000009822	ENSGT00390000016313.a.a	ENSGT00510000047602.q.a.a	ENSGT00390000002222	ENSGT00940000158082.b	ENSGT00940000161666	ENSGT00940000161774
Bonobo	MODERN SPECIES	20	STRA8 (ENSPPAG00000019246)	WDR91 (ENSPPAG00000043535)	ENSPPAG00000041815	TMEM140 (ENSPPAG00000009309)	ENSPPAG00000039575	ENSPPAG00000042375	CALD1 (ENSPPAG00000033595)	BPGM (ENSPPAG00000028646)	AKR1B15 (ENSPPAG00000027085)	AKR1B10 (ENSPPAG00000032122)	ENSPPAG00000010783	SLC35B4 (ENSPPAG00000036396)	LRGUK (ENSPPAG00000026937)	EXOC4 (ENSPPAG00000035477)	ENSPPAG00000035760	ENSPPAG00000007374 #22	ENSPPAG00000019389	ENSPPAG00000033968	ENSPPAG00000039044	ENSPPAG00000041347	ENSPPAG00000025319	PODXL (ENSPPAG00000033899)	MKLN1 (ENSPPAG00000024879)	ENSPPAG00000041979	TSGA13 (ENSPPAG00000032619)	COPG2 (ENSPPAG00000033454)	MEST (ENSPPAG00000042166)	CEP41 (ENSPPAG00000027998)	CPA1 (ENSPPAG00000038156)	CPA5 (ENSPPAG00000028093)	CPA4 (ENSPPAG00000024844)
Chimpanzee	MODERN SPECIES	20	CNOT4 (ENSPTRG00000019727)	STRA8 (ENSPTRG00000019726)	WDR91 (ENSPTRG00000019725)	CYREN (ENSPTRG00000019724)	TMEM140 (ENSPTRG00000046203)	ENSPTRG00000043525	AGBL3 (ENSPTRG00000019722)	CALD1 (ENSPTRG00000019721)	BPGM (ENSPTRG00000019720)	AKR1B15 (ENSPTRG00000041803)	AKR1B10 (ENSPTRG00000019718)	AKR1B1 (ENSPTRG00000019716)	SLC35B4 (ENSPTRG00000028390)	LRGUK (ENSPTRG00000019715)	EXOC4 (ENSPTRG00000019712)	ENSPTRG00000039432 #22	CHCHD3 (ENSPTRG00000019711)	PLXNA4 (ENSPTRG00000041884)	ENSPTRG00000045758	ENSPTRG00000043790	PODXL (ENSPTRG00000019705)	MKLN1 (ENSPTRG00000022979)	ENSPTRG00000044862	KLF14 (ENSPTRG00000019701)	TSGA13 (ENSPTRG00000033729)	COPG2 (ENSPTRG00000022792)	MEST (ENSPTRG00000019698)	CEP41 (ENSPTRG00000052638)	CPA1 (ENSPTRG00000019696)	CPA5 (ENSPTRG00000019695)	CPA4 (ENSPTRG00000019694)
Gorilla	MODERN SPECIES	20	STRA8 (ENSGGOG00000012953)	WDR91 (ENSGGOG00000000897)	CYREN (ENSGGOG00000000896)	TMEM140 (ENSGGOG00000039750)	ENSGGOG00000025238	AGBL3 (ENSGGOG00000024585)	CALD1 (ENSGGOG00000009728)	BPGM (ENSGGOG00000007525)	ENSGGOG00000012293	AKR1B10 (ENSGGOG00000026172)	AKR1B1 (ENSGGOG00000011731)	SLC35B4 (ENSGGOG00000001736)	LRGUK (ENSGGOG00000022273)	EXOC4 (ENSGGOG00000003951)	ENSGGOG00000041288	ENSGGOG00000042744 #22	ENSGGOG00000037349	PLXNA4 (ENSGGOG00000007146)	ENSGGOG00000042691	ENSGGOG00000025653	PODXL (ENSGGOG00000000858)	MKLN1 (ENSGGOG00000026878)	ENSGGOG00000043449	KLF14 (ENSGGOG00000006845)	TSGA13 (ENSGGOG00000008987)	ENSGGOG00000008981	MEST (ENSGGOG00000000592)	CEP41 (ENSGGOG00000002423)	CPA1 (ENSGGOG00000002419)	CPA5 (ENSGGOG00000002414)	CPA4 (ENSGGOG00000040989)
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000007552.f.x.i #22
Gorilla	MODERN SPECIES	523	CAPN6 (ENSGGOG00000007851)	DCX (ENSGGOG00000038714)	SERTM2 (ENSGGOG00000036792)	ENSGGOG00000037011	ALG13 (ENSGGOG00000010402)	TRPC5 (ENSGGOG00000015892)	TRPC5OS (ENSGGOG00000040904)	LHFPL1 (ENSGGOG00000010356)	AMOT (ENSGGOG00000011142)	HTR2C (ENSGGOG00000043401)	IL13RA2 (ENSGGOG00000012153)	LRCH2 (ENSGGOG00000001918)	RBMXL3 (ENSGGOG00000027260)	ENSGGOG00000028364	PLS3 (ENSGGOG00000008810)	ENSGGOG00000043307 #22	ENSGGOG00000026147	ENSGGOG00000039348	AGTR2 (ENSGGOG00000041235)	SLC6A14 (ENSGGOG00000010824)	CT83 (ENSGGOG00000027593)	ENSGGOG00000043839	KLHL13 (ENSGGOG00000025384)	WDR44 (ENSGGOG00000003190)	DOCK11 (ENSGGOG00000014811)	ENSGGOG00000037465	IL13RA1 (ENSGGOG00000014651)	ZCCHC12 (ENSGGOG00000044194)	ENSGGOG00000000535	LONRF3 (ENSGGOG00000013667)	CT47C1 (ENSGGOG00000016359)
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Human	MODERN SPECIES	2	BSCL2 (ENSG00000168000) #10	LRRN4CL (ENSG00000177363) #11	UBXN1 (ENSG00000162191) #12	UQCC3 (ENSG00000204922) #13	CSKMT (ENSG00000214756)	LBHD1 (ENSG00000162194)	C11orf98 (ENSG00000278615) #14	ENSG00000255432	INTS5 (ENSG00000185085) #15	GANAB (ENSG00000089597) #16	B3GAT3 (ENSG00000149541) #17	ROM1 (ENSG00000149489) #18	EML3 (ENSG00000149499) #19	MTA2 (ENSG00000149480) #20	TUT1 (ENSG00000149016) #21	EEF1G (ENSG00000254772) #22	AHNAK (ENSG00000124942) #24	SCGB1A1 (ENSG00000149021) #26	ASRGL1 (ENSG00000162174) #27	SCGB1D4 (ENSG00000197745)	SCGB2A2 (ENSG00000110484)	SCGB1D2 (ENSG00000124935)	SCGB2A1 (ENSG00000124939)	SCGB1D1 (ENSG00000168515)	INCENP (ENSG00000149503) #29	FTH1 (ENSG00000167996) ##31	BEST1 (ENSG00000167995) #32	RAB3IL1 (ENSG00000167994) #33	FADS3 (ENSG00000221968) #34	FADS1 (ENSG00000149485) #36	FADS2 (ENSG00000134824) #35
Pan	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00950000183232	ENSGT00940000153336.e.a.a.a.a.f.b	ENSGT00390000015797.d.m.a	ENSGT00940000159922.b	ENSGT01060000248594.e.a	ENSGT00390000018248	ENSGT00940000163925	ENSGT00990000203589.a.b.a.b	ENSGT00940000159055	ENSGT01050000244937.a.b.a	ENSGT00940000159971	ENSGT00940000160039	ENSGT00940000162929.l	ENSGT00950000183340	ENSGT00950000183097.a.a.a	ENSGT00390000007552.f.x.i #22	ENSGT00390000010991.f.a	ENSGT01050000244888.b.a.c.a	ENSGT00390000018873.c	ENSGT00390000018873.d	ENSGT00940000154359.f	ENSGT00940000157557.a	ENSGT00940000155658.bb.a	ENSGT00940000160896	ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.f	ENSGT00940000164191.b	ENSGT00440000033329.b.a.b	ENSGT00390000002253.a	ENSGT00940000163031.b.a	ENSGT00940000160619	ENSGT00530000064130.c.a.b
Bonobo	MODERN SPECIES	369	ENSPPAG00000023545	SERTM2 (ENSPPAG00000018021)	ENSPPAG00000043040	ALG13 (ENSPPAG00000043832)	TRPC5 (ENSPPAG00000034841)	ENSPPAG00000033141	LHFPL1 (ENSPPAG00000034666)	AMOT (ENSPPAG00000037944)	ENSPPAG00000042106	HTR2C (ENSPPAG00000041995)	IL13RA2 (ENSPPAG00000037271)	LRCH2 (ENSPPAG00000038304)	ENSPPAG00000030663	LUZP4 (ENSPPAG00000038050)	PLS3 (ENSPPAG00000027382)	ENSPPAG00000029376 #22	ENSPPAG00000040740	AGTR2 (ENSPPAG00000025632)	SLC6A14 (ENSPPAG00000028185)	CT83 (ENSPPAG00000028565)	ENSPPAG00000032254	ENSPPAG00000039439	KLHL13 (ENSPPAG00000041656)	WDR44 (ENSPPAG00000034699)	DOCK11 (ENSPPAG00000027285)	IL13RA1 (ENSPPAG00000030651)	ZCCHC12 (ENSPPAG00000023706)	ENSPPAG00000033537	LONRF3 (ENSPPAG00000019392)	CT47C1 (ENSPPAG00000004677)	KIAA1210 (ENSPPAG00000033897)
Chimpanzee	MODERN SPECIES	972	TRPC5 (ENSPTRG00000022192)	TRPC5OS (ENSPTRG00000045594)	ENSPTRG00000050241	RTL4 (ENSPTRG00000052718)	LHFPL1 (ENSPTRG00000022195)	AMOT (ENSPTRG00000022197)	ENSPTRG00000049885	HTR2C (ENSPTRG00000022199)	ENSPTRG00000052825	IL13RA2 (ENSPTRG00000022200)	LRCH2 (ENSPTRG00000022201)	RBMXL3 (ENSPTRG00000028217)	ENSPTRG00000044154	ENSPTRG00000049789	PLS3 (ENSPTRG00000022205)	ENSPTRG00000043395 #22	ENSPTRG00000040819	ENSPTRG00000043128	AGTR2 (ENSPTRG00000052314)	SLC6A14 (ENSPTRG00000022208)	CT83 (ENSPTRG00000028214)	ENSPTRG00000051003	ENSPTRG00000017238	KLHL13 (ENSPTRG00000044070)	ENSPTRG00000052513	DOCK11 (ENSPTRG00000022212)	IL13RA1 (ENSPTRG00000022214)	ZCCHC12 (ENSPTRG00000022215)	ENSPTRG00000000263	LONRF3 (ENSPTRG00000022217)	CT47C1 (ENSPTRG00000040870)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615.o.a #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00390000013802.v.a	ENSGT00940000153052.c.a.a.a	ENSGT00530000063866.c.b	ENSGT00390000013802.v.b.c	ENSGT00530000063866.c.a	ENSGT00390000013802.v.b.d	ENSGT00530000063866.d	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615.o.a #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00390000013802.v.a	ENSGT00940000153052.c.a.a.a	ENSGT00530000063866.c.b	ENSGT00390000013802.v.b.c	ENSGT00530000063866.c.a	ENSGT00390000013802.v.b.d	ENSGT00530000063866.d	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.a.b ##31	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a ##31	ENSGT00940000158650 #32
Vervet Monkey	MODERN SPECIES		TTC9C (ENSCSAG00000006708) #7	HNRNPUL2 (ENSCSAG00000006701) #8	GNG3 (ENSCSAG00000006696) #9	BSCL2 (ENSCSAG00000006684) #10	LRRN4CL (ENSCSAG00000019176) #11	UBXN1 (ENSCSAG00000006659) #12	UQCC3 (ENSCSAG00000006653) #13	CSKMT (ENSCSAG00000006647)	INTS5 (ENSCSAG00000006644) #15	GANAB (ENSCSAG00000006636) #16	B3GAT3 (ENSCSAG00000006625) #17	ROM1 (ENSCSAG00000006620) #18	EML3 (ENSCSAG00000006615) #19	MTA2 (ENSCSAG00000006593) #20	TUT1 (ENSCSAG00000006566) #21	EEF1G (ENSCSAG00000006560) #22	AHNAK (ENSCSAG00000006556) #24	SCGB1A1 (ENSCSAG00000006546) #26	ASRGL1 (ENSCSAG00000006542) #27	SCGB1D4 (ENSCSAG00000006534)	ENSCSAG00000006528	SCGB1D2 (ENSCSAG00000006525)	SCGB2A1 (ENSCSAG00000006522)	SCGB1D1 (ENSCSAG00000006515)	INCENP (ENSCSAG00000006508) #29	BEST1 (ENSCSAG00000006498) #32	ENSCSAG00000006491 ##31	RAB3IL1 (ENSCSAG00000006483) #33	FADS3 (ENSCSAG00000006479) #34	FADS2 (ENSCSAG00000006475) #35	FADS1 (ENSCSAG00000006469) #36
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615.o.a #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00940000153052.c.a.a.a	ENSGT00530000063866.c.b	ENSGT00390000013802.v.b.c	ENSGT00390000013802.v.a	ENSGT00530000063866.c.a	ENSGT00390000013802.v.b.d	ENSGT00530000063866.d	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00390000011666.x.a.e.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.a.b ##31	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a ##31
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615.o.a #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00940000153052.c.a.a.a	ENSGT00530000063866.c.b	ENSGT00390000013802.v.b.c	ENSGT00530000063866.c.a	ENSGT00390000013802.v.b.d	ENSGT00530000063866.d	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00390000011666.x.a.e.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.a.b ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00940000161627.a.a.a.a.b.a.a.a.b.c.a.a.b.b	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615.o.a #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00530000063866.c.b	ENSGT00530000063866.c.a	ENSGT00390000013802.v.b.d	ENSGT00530000063866.d	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT01100000263493.a.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.a.b ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #35	ENSGT00950000183316
Rhesus	DUPLICATION
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Rhesus	MODERN SPECIES	17	SOS2 (ENSMMUG00000007464)	VCPKMT (ENSMMUG00000007460)	ARF6 (ENSMMUG00000041889)	ENSMMUG00000049787	NEMF (ENSMMUG00000008214)	KLHDC2 (ENSMMUG00000029366)	KLHDC1 (ENSMMUG00000003914)	ENSMMUG00000057868	POLE2 (ENSMMUG00000003913)	DNAAF2 (ENSMMUG00000008284)	MGAT2 (ENSMMUG00000008285)	RPL36AL (ENSMMUG00000008286)	LRR1 (ENSMMUG00000037526)	RPS29 (ENSMMUG00000029367)	ENSMMUG00000058168	ENSMMUG00000016009 #22	ENSMMUG00000062305	MDGA2 (ENSMMUG00000015110)	RPL10L (ENSMMUG00000058343)	ENSMMUG00000053288	ENSMMUG00000053931	MIS18BP1 (ENSMMUG00000016515)	FANCM (ENSMMUG00000016513)	FKBP3 (ENSMMUG00000016512)	PRPF39 (ENSMMUG00000010862)	TOGARAM1 (ENSMMUG00000010860)	KLHL28 (ENSMMUG00000017678)	C7H14orf28 (ENSMMUG00000017677)	ENSMMUG00000052465	ENSMMUG00000049994	ENSMMUG00000063179
Crab-eating macaque	DUPLICATION
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	5	ENSMFAG00000039354 #9	BSCL2 (ENSMFAG00000031001) #10	LRRN4CL (ENSMFAG00000049892) #11	UBXN1 (ENSMFAG00000045415) #12	ENSMFAG00000051023	ENSMFAG00000061333	CSKMT (ENSMFAG00000032323)	C11orf98 (ENSMFAG00000003562) #14	INTS5 (ENSMFAG00000031212) #15	GANAB (ENSMFAG00000045211) #16	B3GAT3 (ENSMFAG00000037575) #17	ROM1 (ENSMFAG00000002310) #18	EML3 (ENSMFAG00000037614) #19	MTA2 (ENSMFAG00000041694) #20	TUT1 (ENSMFAG00000000912) #21	ENSMFAG00000007224 #22	ENSMFAG00000037659 #23	SCGB1A1 (ENSMFAG00000043963) #26	ASRGL1 (ENSMFAG00000036351) #27	ENSMFAG00000060551	SCGB1D4 (ENSMFAG00000000615)	SCGB1D2 (ENSMFAG00000032089)	SCGB2A1 (ENSMFAG00000002274)	SCGB1D1 (ENSMFAG00000032054)	INCENP (ENSMFAG00000031558) #29	ENSMFAG00000047451	ENSMFAG00000007415 ##31	BEST1 (ENSMFAG00000033154) #32	RAB3IL1 (ENSMFAG00000045583) #33	FADS3 (ENSMFAG00000040762) #34	ENSMFAG00000062962
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	17	DMAC2L (ENSMFAG00000042085)	L2HGDH (ENSMFAG00000044149)	SOS2 (ENSMFAG00000000174)	VCPKMT (ENSMFAG00000033945)	ARF6 (ENSMFAG00000001534)	NEMF (ENSMFAG00000005357)	KLHDC2 (ENSMFAG00000035256)	KLHDC1 (ENSMFAG00000003879)	ENSMFAG00000047329	POLE2 (ENSMFAG00000002595)	DNAAF2 (ENSMFAG00000045239)	MGAT2 (ENSMFAG00000043906)	ENSMFAG00000057803	LRR1 (ENSMFAG00000036709)	ENSMFAG00000045980	ENSMFAG00000034295 #22	ENSMFAG00000007818	MDGA2 (ENSMFAG00000032319)	RPL10L (ENSMFAG00000053210)	ENSMFAG00000064548	ENSMFAG00000055183	ENSMFAG00000055972	MIS18BP1 (ENSMFAG00000043146)	FANCM (ENSMFAG00000000383)	ENSMFAG00000000044	TOGARAM1 (ENSMFAG00000041007)	KLHL28 (ENSMFAG00000033166)	C14orf28 (ENSMFAG00000032623)	ENSMFAG00000054302	ENSMFAG00000057564	ENSMFAG00000053324
Pig-tailed macaque	DUPLICATION
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	433	HNRNPUL2 (ENSMNEG00000036955) #8	GNG3 (ENSMNEG00000041074) #9	BSCL2 (ENSMNEG00000027955) #10	LRRN4CL (ENSMNEG00000008801) #11	UBXN1 (ENSMNEG00000023355) #12	UQCC3 (ENSMNEG00000009079) #13	CSKMT (ENSMNEG00000032750)	ENSMNEG00000031419 #14	INTS5 (ENSMNEG00000009187) #15	GANAB (ENSMNEG00000044710) #16	B3GAT3 (ENSMNEG00000018264) #17	ROM1 (ENSMNEG00000040388) #18	EML3 (ENSMNEG00000035836) #19	MTA2 (ENSMNEG00000041381) #20	TUT1 (ENSMNEG00000029841) #21	ENSMNEG00000044626 #22	ENSMNEG00000039903 #24	ENSMNEG00000043224 #23	SCGB1A1 (ENSMNEG00000030793) #26	ASRGL1 (ENSMNEG00000044187) #27	ENSMNEG00000017421	SCGB1D4 (ENSMNEG00000029024)	ENSMNEG00000039066	SCGB1D2 (ENSMNEG00000038358)	SCGB2A1 (ENSMNEG00000036574)	SCGB1D1 (ENSMNEG00000031707)	INCENP (ENSMNEG00000034022) #29	ENSMNEG00000034175	ENSMNEG00000035801 ##31	BEST1 (ENSMNEG00000032288) #32	RAB3IL1 (ENSMNEG00000041630) #33
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	577	DMAC2L (ENSMNEG00000029226)	L2HGDH (ENSMNEG00000036800)	ENSMNEG00000028934	SOS2 (ENSMNEG00000027545)	VCPKMT (ENSMNEG00000042287)	ENSMNEG00000031593	ARF6 (ENSMNEG00000035341)	NEMF (ENSMNEG00000039343)	KLHDC2 (ENSMNEG00000041846)	KLHDC1 (ENSMNEG00000036986)	POLE2 (ENSMNEG00000022601)	DNAAF2 (ENSMNEG00000034164)	ENSMNEG00000028277	LRR1 (ENSMNEG00000040687)	ENSMNEG00000031083	ENSMNEG00000004495 #22	ENSMNEG00000016649	ENSMNEG00000033141	MDGA2 (ENSMNEG00000007673)	ENSMNEG00000032166	MIS18BP1 (ENSMNEG00000010715)	FANCM (ENSMNEG00000038659)	FKBP3 (ENSMNEG00000026591)	PRPF39 (ENSMNEG00000045131)	TOGARAM1 (ENSMNEG00000043052)	KLHL28 (ENSMNEG00000039812)	FSCB (ENSMNEG00000039959)	LRFN5 (ENSMNEG00000039668)
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	95	FEZF1 (ENSMNEG00000017416)	ENSMNEG00000037281	CADPS2 (ENSMNEG00000009908)	SLC13A1 (ENSMNEG00000035147)	IQUB (ENSMNEG00000032100)	NDUFA5 (ENSMNEG00000039718)	ASB15 (ENSMNEG00000041583)	LMOD2 (ENSMNEG00000031393)	WASL (ENSMNEG00000035595)	HYAL4 (ENSMNEG00000036511)	SPAM1 (ENSMNEG00000034544)	TMEM229A (ENSMNEG00000038128)	GPR37 (ENSMNEG00000037150)	ENSMNEG00000043524	POT1 (ENSMNEG00000029873)	ENSMNEG00000034791 #22	ENSMNEG00000010937	GRM8 (ENSMNEG00000039046)	ENSMNEG00000003199	ZNF800 (ENSMNEG00000041752)	GCC1 (ENSMNEG00000043499)	ARF5 (ENSMNEG00000040893)	FSCN3 (ENSMNEG00000042501)	PAX4 (ENSMNEG00000043809)	LRRC4 (ENSMNEG00000037000)	SND1 (ENSMNEG00000039808)	LEP (ENSMNEG00000034814)	RBM28 (ENSMNEG00000036970)	PRRT4 (ENSMNEG00000031115)	IMPDH1 (ENSMNEG00000031042)	GARIN1A (ENSMNEG00000028708)
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	167	DCX (ENSMNEG00000030015)	SERTM2 (ENSMNEG00000007178)	ALG13 (ENSMNEG00000035215)	ENSMNEG00000037987	TRPC5 (ENSMNEG00000027667)	LHFPL1 (ENSMNEG00000045486)	AMOT (ENSMNEG00000036435)	ENSMNEG00000038831	HTR2C (ENSMNEG00000031075)	ENSMNEG00000038629	IL13RA2 (ENSMNEG00000041297)	LRCH2 (ENSMNEG00000036629)	ENSMNEG00000026102	LUZP4 (ENSMNEG00000043768)	PLS3 (ENSMNEG00000034620)	ENSMNEG00000038885 #22
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	196									ENSMNEG00000028103	PFKM (ENSMNEG00000036534)	ENSMNEG00000039461	ASB8 (ENSMNEG00000036379)	CCDC184 (ENSMNEG00000000953)	ENSMNEG00000045356	ZNF641 (ENSMNEG00000044922)	ENSMNEG00000028722 #22	ENSMNEG00000032933	C12orf54 (ENSMNEG00000038960)	OR8S1 (ENSMNEG00000032997)	LALBA (ENSMNEG00000034387)	KANSL2 (ENSMNEG00000039608)	CCNT1 (ENSMNEG00000042465)	TEX49 (ENSMNEG00000028091)	ADCY6 (ENSMNEG00000043535)	CACNB3 (ENSMNEG00000029365)	DDX23 (ENSMNEG00000040016)	RND1 (ENSMNEG00000038480)	FKBP11 (ENSMNEG00000030125)	CCDC65 (ENSMNEG00000043967)	ARF3 (ENSMNEG00000032173)	WNT10B (ENSMNEG00000022399)
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615.o.a #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x #22	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00940000153052.c.a.a.a	ENSGT00530000063866.c.b	ENSGT00390000013802.v.b.c	ENSGT00390000013802.v.a	ENSGT00530000063866.c.a	ENSGT00390000013802.v.b.d	ENSGT00530000063866.d	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00390000011666.x.a.e.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33
Olive baboon	MODERN SPECIES	3	HNRNPUL2 (ENSPANG00000023745) #8	GNG3 (ENSPANG00000042558) #9	BSCL2 (ENSPANG00000011406) #10	LRRN4CL (ENSPANG00000003479) #11	UBXN1 (ENSPANG00000005453) #12	UQCC3 (ENSPANG00000035430) #13	CSKMT (ENSPANG00000046328)	C11orf98 (ENSPANG00000007575) #14	ENSPANG00000040911 #15	GANAB (ENSPANG00000010909) #16	B3GAT3 (ENSPANG00000005376) #17	ROM1 (ENSPANG00000015653) #18	EML3 (ENSPANG00000012313) #19	MTA2 (ENSPANG00000005452) #20	TUT1 (ENSPANG00000010908) #21	EEF1G (ENSPANG00000003106) #22	ENSPANG00000037028 #23	SCGB1A1 (ENSPANG00000019204) #26	ASRGL1 (ENSPANG00000011234) #27	SCGB2A2 (ENSPANG00000032557)	SCGB1D2 (ENSPANG00000016130)	SCGB2A1 (ENSPANG00000046637)	SCGB1D1 (ENSPANG00000016660)	INCENP (ENSPANG00000016661) #29	ENSPANG00000032665	FTH1 (ENSPANG00000016662) ##31	BEST1 (ENSPANG00000016663) #32	RAB3IL1 (ENSPANG00000023599) #33	FADS3 (ENSPANG00000016422) #34	ENSPANG00000035579	FADS2 (ENSPANG00000015652) #35
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000162696 #11	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615.o.a #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT00940000155073.b #26	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00940000153052.c.a.a.a	ENSGT00530000063866.c.b	ENSGT00390000013802.v.b.c	ENSGT00530000063866.c.a	ENSGT00390000013802.v.b.d	ENSGT00530000063866.d	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00390000011666.x.a.e.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #34
Drill	DUPLICATION
Drill	MODERN SPECIES	1111	TTC9C (ENSMLEG00000036250) #7	HNRNPUL2 (ENSMLEG00000033906) #8	GNG3 (ENSMLEG00000039091) #9	BSCL2 (ENSMLEG00000037535) #10	LRRN4CL (ENSMLEG00000006668) #11	UBXN1 (ENSMLEG00000027508) #12	UQCC3 (ENSMLEG00000042115) #13	CSKMT (ENSMLEG00000029829)	ENSMLEG00000024134 #14	INTS5 (ENSMLEG00000036338) #15	GANAB (ENSMLEG00000035204) #16	B3GAT3 (ENSMLEG00000032645) #17	ROM1 (ENSMLEG00000005548) #18	EML3 (ENSMLEG00000031847) #19	TUT1 (ENSMLEG00000040498) #21	EEF1G (ENSMLEG00000023252) #22	ENSMLEG00000027464 #23	SCGB1A1 (ENSMLEG00000043598) #26	ASRGL1 (ENSMLEG00000043526) #27	ENSMLEG00000039578	SCGB1D4 (ENSMLEG00000033831)	ENSMLEG00000029127	SCGB1D2 (ENSMLEG00000035930)	SCGB2A1 (ENSMLEG00000035453)	SCGB1D1 (ENSMLEG00000042430)	INCENP (ENSMLEG00000043817) #29	ENSMLEG00000042552 ##31	BEST1 (ENSMLEG00000034408) #32	RAB3IL1 (ENSMLEG00000043733) #33	FADS3 (ENSMLEG00000043283) #34	ENSMLEG00000021942
Drill	MODERN SPECIES	129										HTR2C (ENSMLEG00000034297)	ENSMLEG00000038638	IL13RA2 (ENSMLEG00000033567)	LRCH2 (ENSMLEG00000003513)	LUZP4 (ENSMLEG00000030075)	PLS3 (ENSMLEG00000027953)	ENSMLEG00000007374 #22
Drill	MODERN SPECIES	959	RAPGEF3 (ENSMLEG00000041624)	SLC48A1 (ENSMLEG00000001439)	HDAC7 (ENSMLEG00000030810)	VDR (ENSMLEG00000039437)	TMEM106C (ENSMLEG00000040987)	COL2A1 (ENSMLEG00000040212)	SENP1 (ENSMLEG00000042606)	PFKM (ENSMLEG00000013288)	ASB8 (ENSMLEG00000035600)	CCDC184 (ENSMLEG00000004337)	ENSMLEG00000040313	ENSMLEG00000039549	ENSMLEG00000035066	ENSMLEG00000007600	ZNF641 (ENSMLEG00000044259)	ENSMLEG00000036523 #22	ENSMLEG00000030489	C12orf54 (ENSMLEG00000013602)	OR8S1 (ENSMLEG00000043967)	ENSMLEG00000033939	KANSL2 (ENSMLEG00000030435)	CCNT1 (ENSMLEG00000043751)	TEX49 (ENSMLEG00000031575)	ADCY6 (ENSMLEG00000043020)	CACNB3 (ENSMLEG00000021784)	DDX23 (ENSMLEG00000042846)	RND1 (ENSMLEG00000030008)	FKBP11 (ENSMLEG00000043157)	CCDC65 (ENSMLEG00000039143)	ENSMLEG00000018862	ARF3 (ENSMLEG00000028270)
Sooty mangabey	DUPLICATION
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Sooty mangabey	MODERN SPECIES	283	ENSCATG00000016881	ENSCATG00000039884	SERTM2 (ENSCATG00000013352)	ALG13 (ENSCATG00000032824)	TRPC5 (ENSCATG00000029734)	LHFPL1 (ENSCATG00000041033)	AMOT (ENSCATG00000035828)	ENSCATG00000028931	ENSCATG00000043275	ENSCATG00000038904	HTR2C (ENSCATG00000031908)	IL13RA2 (ENSCATG00000037283)	LRCH2 (ENSCATG00000037702)	LUZP4 (ENSCATG00000012199)	PLS3 (ENSCATG00000038506)	ENSCATG00000045172 #22	AGTR2 (ENSCATG00000020256)	SLC6A14 (ENSCATG00000038946)	CT83 (ENSCATG00000034454)	KLHL13 (ENSCATG00000040977)	WDR44 (ENSCATG00000044289)	DOCK11 (ENSCATG00000038401)	ENSCATG00000009670	ENSCATG00000040411	IL13RA1 (ENSCATG00000034378)	ZCCHC12 (ENSCATG00000006188)	LONRF3 (ENSCATG00000040361)	CT47C1 (ENSCATG00000038614)	KIAA1210 (ENSCATG00000015100)	ENSCATG00000040418	PGRMC1 (ENSCATG00000039960)
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Rhinopithecus	DUPLICATION
Rhinopithecus	DUPLICATION
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B.e.b #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615.o.a #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x.y.b #22	ENSGT00390000007552.f.x.y.a #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT01090000263362	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00940000153052.c.a.a.a	ENSGT00530000063866.c.b	ENSGT00390000013802.v.b.c	ENSGT00530000063866.c.a	ENSGT00390000013802.v.b.d	ENSGT00530000063866.d	ENSGT00950000183014.f.b.a.a.t.g.a.b	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.a.b ##31	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a ##31	ENSGT00940000158650 #32	ENSGT00940000159102 #33
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2511	TTC9C (ENSRROG00000035353) #7	HNRNPUL2 (ENSRROG00000036561) #8	BSCL2 (ENSRROG00000036969) #10	GNG3 (ENSRROG00000037172) #9	UBXN1 (ENSRROG00000040915) #12	UQCC3 (ENSRROG00000007192) #13	CSKMT (ENSRROG00000027675)	ENSRROG00000044930 #14	INTS5 (ENSRROG00000042424) #15	GANAB (ENSRROG00000037256) #16	B3GAT3 (ENSRROG00000029771) #17	ROM1 (ENSRROG00000033061) #18	EML3 (ENSRROG00000043037) #19	MTA2 (ENSRROG00000044052) #20	TUT1 (ENSRROG00000043315) #21	ENSRROG00000042836 #22	AHNAK (ENSRROG00000044889) #24	ENSRROG00000045117	ASRGL1 (ENSRROG00000031523) #27	SCGB1D4 (ENSRROG00000039995)	ENSRROG00000044482	SCGB1D2 (ENSRROG00000031331)	SCGB2A1 (ENSRROG00000044015)	SCGB1D1 (ENSRROG00000036655)	ENSRROG00000036187	ENSRROG00000023884	INCENP (ENSRROG00000030466) #29	ENSRROG00000030005 ##31	BEST1 (ENSRROG00000034577) #32	RAB3IL1 (ENSRROG00000013229) #33	FADS3 (ENSRROG00000037612) #34
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000161805 #7	ENSGT00940000160376 #8	ENSGT01100000263497.B.e.b #9	ENSGT00390000011639 #10	ENSGT00940000156457 #12	ENSGT00390000001930 #13	ENSGT00510000049875	ENSGT00390000002615.o.a #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x.y.b #22	ENSGT00390000007552.f.x.y.a #22	ENSGT00940000154902.bb.b #24	ENSGT01090000263362	ENSGT00950000183045.A.a.a #27	ENSGT00940000153052.c.a.a.a	ENSGT00530000063866.c.b	ENSGT00390000013802.v.b.c	ENSGT00530000063866.c.a	ENSGT00390000013802.v.b.d	ENSGT00530000063866.d	ENSGT00950000183014.f.b.a.a.t.g.a.b	ENSGT00730000111073 #29	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.a.b ##31	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a ##31	ENSGT00940000158650 #32
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	3136													ENSRROG00000037228	SLC5A9 (ENSRROG00000044270)	ENSRROG00000039977	ENSRROG00000036867 #22	TRABD2B (ENSRROG00000044560)	ENSRROG00000026568	ENSRROG00000010148	CMPK1 (ENSRROG00000031992)	STIL (ENSRROG00000030013)	TAL1 (ENSRROG00000039099)	PDZK1IP1 (ENSRROG00000033498)
Black snub-nosed monkey	DUPLICATION
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	600	TTC9C (ENSRBIG00000044503) #7	HNRNPUL2 (ENSRBIG00000037820) #8	BSCL2 (ENSRBIG00000040625) #10	ENSRBIG00000036927 #9	UBXN1 (ENSRBIG00000028404) #12	UQCC3 (ENSRBIG00000038515) #13	CSKMT (ENSRBIG00000037785)	ENSRBIG00000030851 #14	INTS5 (ENSRBIG00000045006) #15	GANAB (ENSRBIG00000040636) #16	B3GAT3 (ENSRBIG00000012660) #17	ROM1 (ENSRBIG00000033282) #18	EML3 (ENSRBIG00000029464) #19	MTA2 (ENSRBIG00000038336) #20	TUT1 (ENSRBIG00000021240) #21	ENSRBIG00000042208 #22	ENSRBIG00000032801 #24	ENSRBIG00000037491	ASRGL1 (ENSRBIG00000008615) #27	ENSRBIG00000027474	ENSRBIG00000026802	SCGB1D4 (ENSRBIG00000044615)	ENSRBIG00000039690	SCGB1D2 (ENSRBIG00000032475)	SCGB2A1 (ENSRBIG00000041379)	SCGB1D1 (ENSRBIG00000034273)	ENSRBIG00000038214	INCENP (ENSRBIG00000040656) #29	FTH1 (ENSRBIG00000044604) ##31	BEST1 (ENSRBIG00000027850) #32	RAB3IL1 (ENSRBIG00000013414) #33
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	220										AGBL4 (ENSRBIG00000036871)	BEND5 (ENSRBIG00000036850)	SPATA6 (ENSRBIG00000038558)	SLC5A9 (ENSRBIG00000010075)	ENSRBIG00000040410	ENSRBIG00000040965	ENSRBIG00000044514 #22
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Golden snub-nosed monkey	DUPLICATION
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Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2905	RAPGEF3 (ENSRROG00000031521)	SLC48A1 (ENSRROG00000036870)	HDAC7 (ENSRROG00000006265)	VDR (ENSRROG00000038196)	TMEM106C (ENSRROG00000021591)	COL2A1 (ENSRROG00000020874)	SENP1 (ENSRROG00000041591)	ENSRROG00000033054	PFKM (ENSRROG00000035567)	ASB8 (ENSRROG00000033794)	ENSRROG00000037143	CCDC184 (ENSRROG00000000771)	ENSRROG00000035893	OR10AD1 (ENSRROG00000036758)	ZNF641 (ENSRROG00000028995)	ENSRROG00000045033 #22	C12orf54 (ENSRROG00000040880)	OR8S1 (ENSRROG00000042102)	LALBA (ENSRROG00000030100)	KANSL2 (ENSRROG00000028358)	CCNT1 (ENSRROG00000044470)	TEX49 (ENSRROG00000040354)
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Black snub-nosed monkey	DUPLICATION
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Tarsier	DUPLICATION
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Tarsier	DUPLICATION
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