Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160376 #7	ENSGT01100000263497.B #8	ENSGT00390000011639 #9	ENSGT00940000162696 #10	ENSGT00940000156457 #11	ENSGT00390000001930 #12	ENSGT00510000049875 #13	ENSGT00390000002615.o.a #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x #22	ENSGT00940000154902.bb.b ##23	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #24	ENSGT00950000183045.A.a.a #25	ENSGT00390000013802.v.a #26	ENSGT00940000153052.c.a.a.a	ENSGT00530000063866.c.b ##27	ENSGT00390000013802.v.b.c ##26	ENSGT00530000063866.c.a #27	ENSGT00390000013802.v.b.d #28	ENSGT00530000063866.d #29	ENSGT00730000111073 #30	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.a.b ##32	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a #32	ENSGT00940000158650 #33
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160376 #7	ENSGT01100000263497.B #8	ENSGT00390000011639 #9	ENSGT00940000162696 #10	ENSGT00940000156457 #11	ENSGT00390000001930 #12	ENSGT00510000049875 #13	ENSGT00390000002615.o.a #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x #22	ENSGT00940000154902.bb.b ##23	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #24	ENSGT00950000183045.A.a.a #25	ENSGT00940000153052.c.a.a.a	ENSGT00530000063866.c.b ##27	ENSGT00390000013802.v.b.c ##26	ENSGT00390000013802.v.a #26	ENSGT00530000063866.c.a #27	ENSGT00390000013802.v.b.d #28	ENSGT00530000063866.d #29	ENSGT00730000111073 #30	ENSGT00390000011666.x.a.e.a #31	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.a.b ##32	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a #32
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000160376 #7	ENSGT01100000263497.B #8	ENSGT00390000011639 #9	ENSGT00940000162696 #10	ENSGT00940000156457 #11	ENSGT00390000001930 #12	ENSGT00510000049875 #13	ENSGT00390000002615.o.a #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x #22	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #24	ENSGT00950000183045.A.a.a #25	ENSGT00940000153052.c.a.a.a	ENSGT00530000063866.c.b ##27	ENSGT00390000013802.v.b.c ##26	ENSGT00390000013802.v.a #26	ENSGT00530000063866.c.a #27	ENSGT00390000013802.v.b.d #28	ENSGT00530000063866.d #29	ENSGT00730000111073 #30	ENSGT00390000011666.x.a.e.a #31	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a #32	ENSGT00940000158650 #33	ENSGT00940000159102 #34
Olive baboon	MODERN SPECIES	3	HNRNPUL2 (ENSPANG00000023745) #7	GNG3 (ENSPANG00000042558) #8	BSCL2 (ENSPANG00000011406) #9	LRRN4CL (ENSPANG00000003479) #10	UBXN1 (ENSPANG00000005453) #11	UQCC3 (ENSPANG00000035430) #12	CSKMT (ENSPANG00000046328) #13	C11orf98 (ENSPANG00000007575) #14	ENSPANG00000040911 #15	GANAB (ENSPANG00000010909) #16	B3GAT3 (ENSPANG00000005376) #17	ROM1 (ENSPANG00000015653) #18	EML3 (ENSPANG00000012313) #19	MTA2 (ENSPANG00000005452) #20	TUT1 (ENSPANG00000010908) #21	EEF1G (ENSPANG00000003106) #22	ENSPANG00000037028 #23	SCGB1A1 (ENSPANG00000019204) #24	ASRGL1 (ENSPANG00000011234) #25	SCGB2A2 (ENSPANG00000032557) #26	SCGB1D2 (ENSPANG00000016130) #27	SCGB2A1 (ENSPANG00000046637) #28	SCGB1D1 (ENSPANG00000016660) #29	INCENP (ENSPANG00000016661) #30	ENSPANG00000032665 #31	FTH1 (ENSPANG00000016662) #32	BEST1 (ENSPANG00000016663) #33	RAB3IL1 (ENSPANG00000023599) #34	FADS3 (ENSPANG00000016422) #35	ENSPANG00000035579 #36	FADS2 (ENSPANG00000015652) #37
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000160376 #7	ENSGT01100000263497.B #8	ENSGT00390000011639 #9	ENSGT00940000162696 #10	ENSGT00940000156457 #11	ENSGT00390000001930 #12	ENSGT00510000049875 #13	ENSGT00390000002615.o.a #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x #22	ENSGT00940000154902.bb.b ##23	ENSGT00940000155073.b #24	ENSGT00950000183045.A.a.a #25	ENSGT00940000153052.c.a.a.a	ENSGT00530000063866.c.b ##27	ENSGT00390000013802.v.b.c ##26	ENSGT00530000063866.c.a #27	ENSGT00390000013802.v.b.d #28	ENSGT00530000063866.d #29	ENSGT00730000111073 #30	ENSGT00390000011666.x.a.e.a #31	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.b.b.a #32	ENSGT00940000158650 #33	ENSGT00940000159102 #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #35
Drill	DUPLICATION
Drill	MODERN SPECIES	1111	TTC9C (ENSMLEG00000036250)	HNRNPUL2 (ENSMLEG00000033906) #7	GNG3 (ENSMLEG00000039091) #8	BSCL2 (ENSMLEG00000037535) #9	LRRN4CL (ENSMLEG00000006668) #10	UBXN1 (ENSMLEG00000027508) #11	UQCC3 (ENSMLEG00000042115) #12	CSKMT (ENSMLEG00000029829) #13	ENSMLEG00000024134 #14	INTS5 (ENSMLEG00000036338) #15	GANAB (ENSMLEG00000035204) #16	B3GAT3 (ENSMLEG00000032645) #17	ROM1 (ENSMLEG00000005548) #18	EML3 (ENSMLEG00000031847) #19	TUT1 (ENSMLEG00000040498) #21	EEF1G (ENSMLEG00000023252) #22	ENSMLEG00000027464 #23	SCGB1A1 (ENSMLEG00000043598) #24	ASRGL1 (ENSMLEG00000043526) #25	ENSMLEG00000039578	SCGB1D4 (ENSMLEG00000033831) ##27	ENSMLEG00000029127 ##26	SCGB1D2 (ENSMLEG00000035930) #27	SCGB2A1 (ENSMLEG00000035453) #28	SCGB1D1 (ENSMLEG00000042430) #29	INCENP (ENSMLEG00000043817) #30	ENSMLEG00000042552 ##32	BEST1 (ENSMLEG00000034408) #33	RAB3IL1 (ENSMLEG00000043733) #34	FADS3 (ENSMLEG00000043283) #35	ENSMLEG00000021942
Drill	MODERN SPECIES	129										HTR2C (ENSMLEG00000034297)	ENSMLEG00000038638	IL13RA2 (ENSMLEG00000033567)	LRCH2 (ENSMLEG00000003513)	LUZP4 (ENSMLEG00000030075)	PLS3 (ENSMLEG00000027953)	ENSMLEG00000007374 #22
Drill	MODERN SPECIES	959	RAPGEF3 (ENSMLEG00000041624)	SLC48A1 (ENSMLEG00000001439)	HDAC7 (ENSMLEG00000030810)	VDR (ENSMLEG00000039437)	TMEM106C (ENSMLEG00000040987)	COL2A1 (ENSMLEG00000040212)	SENP1 (ENSMLEG00000042606)	PFKM (ENSMLEG00000013288)	ASB8 (ENSMLEG00000035600)	CCDC184 (ENSMLEG00000004337)	ENSMLEG00000040313	ENSMLEG00000039549	ENSMLEG00000035066	ENSMLEG00000007600	ZNF641 (ENSMLEG00000044259)	ENSMLEG00000036523 #22	ENSMLEG00000030489	C12orf54 (ENSMLEG00000013602)	OR8S1 (ENSMLEG00000043967)	ENSMLEG00000033939	KANSL2 (ENSMLEG00000030435)	CCNT1 (ENSMLEG00000043751)	TEX49 (ENSMLEG00000031575)	ADCY6 (ENSMLEG00000043020)	CACNB3 (ENSMLEG00000021784)	DDX23 (ENSMLEG00000042846)	RND1 (ENSMLEG00000030008)	FKBP11 (ENSMLEG00000043157)	CCDC65 (ENSMLEG00000039143)	ENSMLEG00000018862	ARF3 (ENSMLEG00000028270)
Sooty mangabey	DUPLICATION
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	518	HNRNPUL2 (ENSCATG00000034588) #7	BSCL2 (ENSCATG00000037983) #9	GNG3 (ENSCATG00000038843) #8	LRRN4CL (ENSCATG00000003551) #10	UBXN1 (ENSCATG00000036706) #11	UQCC3 (ENSCATG00000015726) #12	LBHD1 (ENSCATG00000037717)	CSKMT (ENSCATG00000035188) #13	INTS5 (ENSCATG00000032127) #15	GANAB (ENSCATG00000037474) #16	B3GAT3 (ENSCATG00000043834) #17	ROM1 (ENSCATG00000043968) #18	EML3 (ENSCATG00000043181) #19	MTA2 (ENSCATG00000037060) #20	TUT1 (ENSCATG00000036770) #21	EEF1G (ENSCATG00000038495) #22	AHNAK (ENSCATG00000038864) ##23	SCGB1A1 (ENSCATG00000038223) #24	ASRGL1 (ENSCATG00000038215) #25	ENSCATG00000036822	SCGB1D4 (ENSCATG00000037621) ##27	ENSCATG00000043571 ##26	SCGB1D2 (ENSCATG00000037575) #27	SCGB2A1 (ENSCATG00000043661) #28	SCGB1D1 (ENSCATG00000037601) #29	INCENP (ENSCATG00000037082) #30	ENSCATG00000037944 #31	FTH1 (ENSCATG00000043595) #32	BEST1 (ENSCATG00000037568) #33	RAB3IL1 (ENSCATG00000038420) #34	FADS3 (ENSCATG00000042722) #35
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	283	ENSCATG00000016881	ENSCATG00000039884	SERTM2 (ENSCATG00000013352)	ALG13 (ENSCATG00000032824)	TRPC5 (ENSCATG00000029734)	LHFPL1 (ENSCATG00000041033)	AMOT (ENSCATG00000035828)	ENSCATG00000028931	ENSCATG00000043275	ENSCATG00000038904	HTR2C (ENSCATG00000031908)	IL13RA2 (ENSCATG00000037283)	LRCH2 (ENSCATG00000037702)	LUZP4 (ENSCATG00000012199)	PLS3 (ENSCATG00000038506)	ENSCATG00000045172 #22	AGTR2 (ENSCATG00000020256)	SLC6A14 (ENSCATG00000038946)	CT83 (ENSCATG00000034454)	KLHL13 (ENSCATG00000040977)	WDR44 (ENSCATG00000044289)	DOCK11 (ENSCATG00000038401)	ENSCATG00000009670	ENSCATG00000040411	IL13RA1 (ENSCATG00000034378)	ZCCHC12 (ENSCATG00000006188)	LONRF3 (ENSCATG00000040361)	CT47C1 (ENSCATG00000038614)	KIAA1210 (ENSCATG00000015100)	ENSCATG00000040418	PGRMC1 (ENSCATG00000039960)
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	607	PLEKHG3 (ENSCATG00000034138)	PPP1R36 (ENSCATG00000030666)	HSPA2 (ENSCATG00000037872)	ZBTB1 (ENSCATG00000032601)	ZBTB25 (ENSCATG00000013685)	MTHFD1 (ENSCATG00000014701)	ESR2 (ENSCATG00000036474)	SYNE2 (ENSCATG00000028929)	SGPP1 (ENSCATG00000012153)	WDR89 (ENSCATG00000011714)	ENSCATG00000038493	ENSCATG00000035888	PPP2R5E (ENSCATG00000019906)	GPHB5 (ENSCATG00000045284)	RHOJ (ENSCATG00000035763)	ENSCATG00000030810 #22	KCNH5 (ENSCATG00000042607)	ZNF71 (ENSCATG00000034845)	ZNF470 (ENSCATG00000042389)	ZFP28 (ENSCATG00000044000)	ZNF471 (ENSCATG00000040262)	ZNF667 (ENSCATG00000030847)	ZNF583 (ENSCATG00000033066)	ZNF582 (ENSCATG00000036892)	ENSCATG00000034610	ENSCATG00000042409	ENSCATG00000039719	EDDM13 (ENSCATG00000037344)	ZSCAN5A (ENSCATG00000039708)	ZSCAN5C (ENSCATG00000040802)	ZSCAN5B (ENSCATG00000038324)
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160376 #7	ENSGT01100000263497.B #8	ENSGT00390000011639 #9	ENSGT00940000162696 #10	ENSGT00940000156457 #11	ENSGT00390000001930 #12	ENSGT00510000049875 #13	ENSGT00390000002615.o.a #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x #22	ENSGT00940000154902.bb.b ##23	ENSGT00940000154902.bb.a #23	ENSGT00940000155073.b #24	ENSGT00950000183045.A.a.a #25	ENSGT00940000153052.c.a.a.a	ENSGT00530000063866.c.b ##27	ENSGT00390000013802.v.b.c ##26	ENSGT00530000063866.c.a #27	ENSGT00390000013802.v.b.d #28	ENSGT00530000063866.d #29	ENSGT00730000111073 #30	ENSGT00390000011666.x.a.e.a #31	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.a.b ##32	ENSGT00940000158650 #33	ENSGT00940000159102 #34
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160376 #7	ENSGT01100000263497.B #8	ENSGT00390000011639 #9	ENSGT00940000162696 #10	ENSGT00940000156457 #11	ENSGT00940000161627.a.a.a.a.b.a.a.a.b.c.a.a.b.b	ENSGT00510000049875 #13	ENSGT00390000002615.o.a #14	ENSGT00390000008374 #15	ENSGT00940000159139 #16	ENSGT00940000156954 #17	ENSGT00940000159921 #18	ENSGT00940000159589 #19	ENSGT01030000234573.B.c.b.b #20	ENSGT00940000159914 #21	ENSGT00390000007552.f.x #22	ENSGT00940000154902.bb.b ##23	ENSGT00940000155073.b #24	ENSGT00950000183045.A.a.a #25	ENSGT00530000063866.c.b ##27	ENSGT00530000063866.c.a #27	ENSGT00390000013802.v.b.d #28	ENSGT00530000063866.d #29	ENSGT00730000111073 #30	ENSGT01100000263493.a.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b.a	ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.a.b ##32	ENSGT00940000158650 #33	ENSGT00940000159102 #34	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.b #35	ENSGT00950000182990.a.a.a.b.u.a #37	ENSGT00950000183316 #36
Rhesus	DUPLICATION
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Crab-eating macaque	DUPLICATION
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Pig-tailed macaque	DUPLICATION
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Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	196									ENSMNEG00000028103	PFKM (ENSMNEG00000036534)	ENSMNEG00000039461	ASB8 (ENSMNEG00000036379)	CCDC184 (ENSMNEG00000000953)	ENSMNEG00000045356	ZNF641 (ENSMNEG00000044922)	ENSMNEG00000028722 #22	ENSMNEG00000032933	C12orf54 (ENSMNEG00000038960)	OR8S1 (ENSMNEG00000032997)	LALBA (ENSMNEG00000034387)	KANSL2 (ENSMNEG00000039608)	CCNT1 (ENSMNEG00000042465)	TEX49 (ENSMNEG00000028091)	ADCY6 (ENSMNEG00000043535)	CACNB3 (ENSMNEG00000029365)	DDX23 (ENSMNEG00000040016)	RND1 (ENSMNEG00000038480)	FKBP11 (ENSMNEG00000030125)	CCDC65 (ENSMNEG00000043967)	ARF3 (ENSMNEG00000032173)	WNT10B (ENSMNEG00000022399)
Vervet Monkey	MODERN SPECIES		TTC9C (ENSCSAG00000006708)	HNRNPUL2 (ENSCSAG00000006701) #7	GNG3 (ENSCSAG00000006696) #8	BSCL2 (ENSCSAG00000006684) #9	LRRN4CL (ENSCSAG00000019176) #10	UBXN1 (ENSCSAG00000006659) #11	UQCC3 (ENSCSAG00000006653) #12	CSKMT (ENSCSAG00000006647) #13	INTS5 (ENSCSAG00000006644) #15	GANAB (ENSCSAG00000006636) #16	B3GAT3 (ENSCSAG00000006625) #17	ROM1 (ENSCSAG00000006620) #18	EML3 (ENSCSAG00000006615) #19	MTA2 (ENSCSAG00000006593) #20	TUT1 (ENSCSAG00000006566) #21	EEF1G (ENSCSAG00000006560) #22	AHNAK (ENSCSAG00000006556) ##23	SCGB1A1 (ENSCSAG00000006546) #24	ASRGL1 (ENSCSAG00000006542) #25	SCGB1D4 (ENSCSAG00000006534) ##27	ENSCSAG00000006528 ##26	SCGB1D2 (ENSCSAG00000006525) #27	SCGB2A1 (ENSCSAG00000006522) #28	SCGB1D1 (ENSCSAG00000006515) #29	INCENP (ENSCSAG00000006508) #30	BEST1 (ENSCSAG00000006498) #33	ENSCSAG00000006491 ##32	RAB3IL1 (ENSCSAG00000006483) #34	FADS3 (ENSCSAG00000006479) #35	FADS2 (ENSCSAG00000006475) #37	FADS1 (ENSCSAG00000006469) ##35