Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00530000063851.a	ENSGT00390000017791 #7	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #8	ENSGT00940000160833 #9	ENSGT00390000008646 #10	ENSGT00940000155962 #11	ENSGT00500000044831.a.b #12	ENSGT00940000155651 #13	ENSGT00940000159067 #14	ENSGT00940000154975 #15	ENSGT01030000234550.b #16	ENSGT00940000155607 #17	ENSGT00940000156234 #18	ENSGT00940000154713.A #19	ENSGT00940000157895 #21	ENSGT00940000155050 #22	ENSGT00940000158222	ENSGT00390000009320	ENSGT00940000163084	ENSGT00940000163006	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000156900	ENSGT00390000018637	ENSGT00390000011359	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00940000158943	ENSGT00530000063335.A
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00530000063851.a	ENSGT00390000017791 #7	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #8	ENSGT00940000160833 #9	ENSGT00390000008646 #10	ENSGT00940000155962 #11	ENSGT00500000044831.a.b #12	ENSGT00940000155651.s.b #13	ENSGT00940000159067 #14	ENSGT00940000154975 #15	ENSGT01030000234550.b #16	ENSGT00940000155607 #17	ENSGT00940000156234 #18	ENSGT00940000154713.A #19	ENSGT00940000157895 #21	ENSGT00940000155050 #22
Alpin marmot	MODERN SPECIES	7	MTHFS (ENSMMMG00000000648) #7	BCL2A1 (ENSMMMG00000000627) #8	ZFAND6 (ENSMMMG00000000571) #9	FAH (ENSMMMG00000000552) #10	TUBGCP5 (ENSMMMG00000000426) #11	CYFIP1 (ENSMMMG00000000146) #12	NIPA2 (ENSMMMG00000000083) #13	NIPA1 (ENSMMMG00000023282) #14	HERC2 (ENSMMMG00000023161) #15	OCA2 (ENSMMMG00000023142) #16	GABRG3 (ENSMMMG00000023125) #17	GABRA5 (ENSMMMG00000023104) #18	GABRB3 (ENSMMMG00000023089) #19	ENSMMMG00000023072 #20	ATP10A (ENSMMMG00000023067) #21	UBE3A (ENSMMMG00000023053) #22	ENSMMMG00000023041 #23
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00530000063851.a	ENSGT00390000017791 #7	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #8	ENSGT00940000160833 #9	ENSGT00390000008646 #10	ENSGT00940000155962 #11	ENSGT00500000044831.a.b #12	ENSGT00940000155651.s.b #13	ENSGT00940000159067 #14	ENSGT00940000154975 #15	ENSGT01030000234550.b #16	ENSGT00940000155607 #17	ENSGT00940000156234 #18	ENSGT00940000154713.A #19	ENSGT00940000157895 #21	ENSGT00940000155050 #22
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	272										GABRG3 (ENSUPAG00010011724) #17	GABRA5 (ENSUPAG00010011734) #18	GABRB3 (ENSUPAG00010011768) #19	ENSUPAG00010011910	ATP10A (ENSUPAG00010011922) #21	ENSUPAG00010011958 #20	UBE3A (ENSUPAG00010011978) #22
Squirrel	MODERN SPECIES	71	MINAR1 (ENSSTOG00000004728)	MTHFS (ENSSTOG00000009124) #7	BCL2A1 (ENSSTOG00000009135) #8	ZFAND6 (ENSSTOG00000025147) #9	FAH (ENSSTOG00000003980) #10	TUBGCP5 (ENSSTOG00000000167) #11	CYFIP1 (ENSSTOG00000022382) #12	ENSSTOG00000004003 #13	NIPA1 (ENSSTOG00000004008) #14	HERC2 (ENSSTOG00000006805) #15	OCA2 (ENSSTOG00000006767) #16	GABRG3 (ENSSTOG00000000919) #17	GABRA5 (ENSSTOG00000014502) #18	GABRB3 (ENSSTOG00000014493) #19	ATP10A (ENSSTOG00000002017) #21	UBE3A (ENSSTOG00000001338) #22
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	11	FAH (ENSSVLG00005008412) #10	TUBGCP5 (ENSSVLG00005008437) #11	CYFIP1 (ENSSVLG00005008475) #12	ENSSVLG00005008620 #13	NIPA1 (ENSSVLG00005008682) #14	ENSSVLG00005008701	HERC2 (ENSSVLG00005008754) #15	OCA2 (ENSSVLG00005009249) #16	ENSSVLG00005009420	GABRG3 (ENSSVLG00005009456) #17	GABRA5 (ENSSVLG00005009605) #18	GABRB3 (ENSSVLG00005009710) #19	ATP10A (ENSSVLG00005010147) #21	ENSSVLG00005011189	ENSSVLG00005011214	UBE3A (ENSSVLG00005011271) #22	ENSSVLG00005011480	ENSSVLG00005011544	ENSSVLG00005011656	SNRPN (ENSSVLG00005011766)	SNURF (ENSSVLG00005011691)	ENSSVLG00005011795	ENSSVLG00005011846	ENSSVLG00005000097	NDN (ENSSVLG00005000123)	MAGEL2 (ENSSVLG00005000130)	MKRN3 (ENSSVLG00005000160)	ENSSVLG00005000172	ENSSVLG00005000184	ENSSVLG00005000200	ENSSVLG00005000226