Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155050 #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237 ENSGT01010000222692 ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000164275 ENSGT00940000157360 ENSGT00940000169575 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000165649 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00910000148238 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237 ENSGT01010000222692 ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00940000164275 ENSGT00940000157360 ENSGT00940000169575 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00390000008846 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00910000148238 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237 ENSGT01010000222692 ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00940000164275 ENSGT00940000157360 ENSGT00940000169575 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00390000008846 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00910000148238 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237 ENSGT01010000222692 ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000164275 ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00910000148238 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237 ENSGT01010000222692 ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000164275 ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237 ENSGT01010000222692 ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 ENSGT00390000016769 ENSGT00390000017614 Theria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237 ENSGT01010000222692 ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00390000016769 ENSGT00390000017614.i ENSGT00390000017614.j Eutheria ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00910000148238 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00940000164524 ENSGT00940000155052.e.b.b ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00980000199886 ENSGT00940000155024 ENSGT00950000185579 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00940000164524 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00980000199886 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00980000199886 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 Glires ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00940000164524 ENSGT00940000155052.e.b.b ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00980000199886 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00940000164524 ENSGT00940000155052.e.b.b ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00980000199886 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00980000199886 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00980000199886 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00980000199886 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155755 ENSGT00390000007067 ENSGT00900000143257 ENSGT00390000013180 ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.b.a.a.c ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 ENSGT00530000063335.A Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155755 ENSGT00390000007067 ENSGT00900000143257 ENSGT00390000013180 ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.b.a.a.c ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00390000007081.b.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007067 ENSGT00660000097475 ENSGT00900000143257 ENSGT00390000013180 ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.b.a.a.c ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320.w ENSGT00940000164524 ENSGT00390000009320.x ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00390000007081.b.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00860000135847 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000007067 ENSGT00660000097475 ENSGT00900000143257 ENSGT00390000013180 ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.b.a.a.c ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320.w ENSGT00940000164524 ENSGT00390000009320.x ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00390000007081.b.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00860000135847 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007067 ENSGT00660000097475 ENSGT00900000143257 ENSGT00390000013180 ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.b.a.a.c ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320.w ENSGT00940000164524 ENSGT00390000009320.x.a ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00390000007081.b.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00860000135847 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 Mus_C ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000007067 ENSGT00660000097475 ENSGT00900000143257 ENSGT00390000013180 ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.b.a.a.c ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320.w ENSGT00940000164524 ENSGT00390000009320.x.a ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00390000007081.b.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00860000135847 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 Steppe mouse MODERN SPECIES 2179 ENSMSIG00000021964 #21 Ube3a (ENSMSIG00000021968) #22 spretus MODERN SPECIES 16 MGP_SPRETEiJ_G0030901 Svip (MGP_SPRETEiJ_G0030902) 1700015G11Rik (MGP_SPRETEiJ_G0030903) Luzp2 (MGP_SPRETEiJ_G0030904) Siglech (MGP_SPRETEiJ_G0030905) Tubgcp5 (MGP_SPRETEiJ_G0030906) Cyfip1 (MGP_SPRETEiJ_G0030907) MGP_SPRETEiJ_G0030908 Nipa1 (MGP_SPRETEiJ_G0030909) Herc2 (MGP_SPRETEiJ_G0030910) Oca2 (MGP_SPRETEiJ_G0030911) Gabrg3 (MGP_SPRETEiJ_G0030912) Gabra5 (MGP_SPRETEiJ_G0030913) Gabrb3 (MGP_SPRETEiJ_G0030914) Atp10a (MGP_SPRETEiJ_G0030915) Ube3a (MGP_SPRETEiJ_G0030916) #22 MGP_SPRETEiJ_G0030917 Snrpn (MGP_SPRETEiJ_G0030918) MGP_SPRETEiJ_G0030919 Ndn (MGP_SPRETEiJ_G0030920) Magel2 (MGP_SPRETEiJ_G0030921) Mkrn3 (MGP_SPRETEiJ_G0030922) Peg12 (MGP_SPRETEiJ_G0030923) Chrna7 (MGP_SPRETEiJ_G0030924) Otud7a (MGP_SPRETEiJ_G0030925) Klf13 (MGP_SPRETEiJ_G0030926) E030018B13Rik (MGP_SPRETEiJ_G0030927) Trpm1 (MGP_SPRETEiJ_G0030928) Mtmr10 (MGP_SPRETEiJ_G0030929) Fan1 (MGP_SPRETEiJ_G0030930) Mphosph10 (MGP_SPRETEiJ_G0030931) Mouse MODERN SPECIES 16 Gas2 (ENSMUSG00000030498) Svip (ENSMUSG00000074093) 1700015G11Rik (ENSMUSG00000094445) Luzp2 (ENSMUSG00000063297) Siglech (ENSMUSG00000051504) Tubgcp5 (ENSMUSG00000033790) Cyfip1 (ENSMUSG00000030447) Nipa2 (ENSMUSG00000030452) Nipa1 (ENSMUSG00000047037) Herc2 (ENSMUSG00000030451) Oca2 (ENSMUSG00000030450) Gabrg3 (ENSMUSG00000055026) Gabra5 (ENSMUSG00000055078) Gabrb3 (ENSMUSG00000033676) Atp10a (ENSMUSG00000025324) Ube3a (ENSMUSG00000025326) #22 Snrpn (ENSMUSG00000102252) Snurf (ENSMUSG00000102627) Ndn (ENSMUSG00000033585) Magel2 (ENSMUSG00000056972) Mkrn3 (ENSMUSG00000070527) Peg12 (ENSMUSG00000070526) Chrna7 (ENSMUSG00000030525) Otud7a (ENSMUSG00000033510) Klf13 (ENSMUSG00000052040) E030018B13Rik (ENSMUSG00000095061) Trpm1 (ENSMUSG00000030523) Mtmr10 (ENSMUSG00000030522) Fan1 (ENSMUSG00000033458) Mphosph10 (ENSMUSG00000030521) Mcee (ENSMUSG00000033429) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 16 Gas2 (MGP_CAROLIEiJ_G0029798) Svip (MGP_CAROLIEiJ_G0029799) 1700015G11Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0029800) Luzp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0029801) Siglech (MGP_CAROLIEiJ_G0029802) Tubgcp5 (MGP_CAROLIEiJ_G0029803) Cyfip1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029804) Nipa2 (MGP_CAROLIEiJ_G0029805) Nipa1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029806) Herc2 (MGP_CAROLIEiJ_G0029807) Oca2 (MGP_CAROLIEiJ_G0029808) Gabrg3 (MGP_CAROLIEiJ_G0029809) Gabra5 (MGP_CAROLIEiJ_G0029810) Gabrb3 (MGP_CAROLIEiJ_G0029811) Atp10a (MGP_CAROLIEiJ_G0029812) Ube3a (MGP_CAROLIEiJ_G0029813) #22 MGP_CAROLIEiJ_G0029814 Snrpn (MGP_CAROLIEiJ_G0029815) MGP_CAROLIEiJ_G0029816 Ndn (MGP_CAROLIEiJ_G0029817) Magel2 (MGP_CAROLIEiJ_G0029818) Mkrn3 (MGP_CAROLIEiJ_G0029819) Peg12 (MGP_CAROLIEiJ_G0029820) Chrna7 (MGP_CAROLIEiJ_G0029821) Otud7a (MGP_CAROLIEiJ_G0029822) Klf13 (MGP_CAROLIEiJ_G0029823) MGP_CAROLIEiJ_G0029824 Trpm1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029825) Mtmr10 (MGP_CAROLIEiJ_G0029826) Fan1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029827) Mphosph10 (MGP_CAROLIEiJ_G0029828) Shrew mouse MODERN SPECIES Gas2 (MGP_PahariEiJ_G0013023) Svip (MGP_PahariEiJ_G0013024) 1700015G11Rik (MGP_PahariEiJ_G0013025) Luzp2 (MGP_PahariEiJ_G0013026) Siglech (MGP_PahariEiJ_G0013027) Tubgcp5 (MGP_PahariEiJ_G0013028) Cyfip1 (MGP_PahariEiJ_G0013029) Nipa2 (MGP_PahariEiJ_G0013030) Nipa1 (MGP_PahariEiJ_G0013031) Herc2 (MGP_PahariEiJ_G0013032) Oca2 (MGP_PahariEiJ_G0013033) Gabrg3 (MGP_PahariEiJ_G0013034) Gabra5 (MGP_PahariEiJ_G0013035) Gabrb3 (MGP_PahariEiJ_G0013036) Atp10a (MGP_PahariEiJ_G0013037) Ube3a (MGP_PahariEiJ_G0013038) #22 MGP_PahariEiJ_G0013039 Snrpn (MGP_PahariEiJ_G0013040) Snurf (MGP_PahariEiJ_G0013041) Ndn (MGP_PahariEiJ_G0013042) Magel2 (MGP_PahariEiJ_G0013043) Mkrn3 (MGP_PahariEiJ_G0013044) Peg12 (MGP_PahariEiJ_G0013045) Chrna7 (MGP_PahariEiJ_G0013046) Otud7a (MGP_PahariEiJ_G0013047) Klf13 (MGP_PahariEiJ_G0013048) MGP_PahariEiJ_G0013049 Trpm1 (MGP_PahariEiJ_G0013050) Mtmr10 (MGP_PahariEiJ_G0013051) Fan1 (MGP_PahariEiJ_G0013052) Mphosph10 (MGP_PahariEiJ_G0013053) Rat MODERN SPECIES Luzp2 (ENSRNOG00000021507) ENSRNOG00000069456 Siglech (ENSRNOG00000021499) Rhoq-ps1 (ENSRNOG00000021484) Tubgcp5 (ENSRNOG00000011480) Cyfip1 (ENSRNOG00000011945) Nipa2 (ENSRNOG00000012690) Nipa1 (ENSRNOG00000042702) Herc2 (ENSRNOG00000013718) Oca2 (ENSRNOG00000014465) Gabrg3 (ENSRNOG00000014862) Gabra5 (ENSRNOG00000010803) Gabrb3 (ENSRNOG00000060599) ENSRNOG00000066632 Atp10a (ENSRNOG00000056228) Ube3a (ENSRNOG00000015734) #22 Snrpn (ENSRNOG00000054391) ENSRNOG00000069377 AC080157.1 (ENSRNOG00000058277) ENSRNOG00000063232 ENSRNOG00000069701 Ndn (ENSRNOG00000010146) Magel2 (ENSRNOG00000010158) Mkrn3 (ENSRNOG00000010172) Peg12 (ENSRNOG00000024429) ENSRNOG00000066862 LOC102548067 (ENSRNOG00000051782) Chrna7 (ENSRNOG00000010853) Otud7a (ENSRNOG00000015503) LOC120097335 (ENSRNOG00000065214) Klf13 (ENSRNOG00000015822) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00390000013180 ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.b.a.a.c ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00390000013180 ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.b.a.a.c ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 274 Siglech (ENSCGRG00001011364) Tubgcp5 (ENSCGRG00001016603) Cyfip1 (ENSCGRG00001009484) Nipa2 (ENSCGRG00001004391) Nipa1 (ENSCGRG00001003595) Herc2 (ENSCGRG00001021715) Oca2 (ENSCGRG00001012797) Gabrg3 (ENSCGRG00001009703) Gabra5 (ENSCGRG00001016341) Gabrb3 (ENSCGRG00001014154) ENSCGRG00001008003 ENSCGRG00001017313 ENSCGRG00001017022 Atp10a (ENSCGRG00001015628) ENSCGRG00001013331 Ube3a (ENSCGRG00001010781) #22 Golden Hamster MODERN SPECIES 748 Luzp2 (ENSMAUG00000016237) ENSMAUG00000019001 Siglech (ENSMAUG00000000362) Tubgcp5 (ENSMAUG00000018710) Cyfip1 (ENSMAUG00000012507) ENSMAUG00000020484 ENSMAUG00000009514 Herc2 (ENSMAUG00000013700) Oca2 (ENSMAUG00000015979) ENSMAUG00000019045 ENSMAUG00000020999 Gabra5 (ENSMAUG00000019162) Gabrb3 (ENSMAUG00000008422) ENSMAUG00000017204 Atp10a (ENSMAUG00000018254) Ube3a (ENSMAUG00000006627) #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 72 ENSGT00390000013180 ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.b.a.a.c ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES ENSPEMG00000028549 ENSPEMG00000019594 ENSPEMG00000028728 Luzp2 (ENSPEMG00000019695) Siglech (ENSPEMG00000016963) Tubgcp5 (ENSPEMG00000017749) Cyfip1 (ENSPEMG00000020064) Nipa2 (ENSPEMG00000028381) Nipa1 (ENSPEMG00000011557) Herc2 (ENSPEMG00000019120) Oca2 (ENSPEMG00000020098) Gabrg3 (ENSPEMG00000019431) Gabra5 (ENSPEMG00000019839) Gabrb3 (ENSPEMG00000023767) Atp10a (ENSPEMG00000020854) Ube3a (ENSPEMG00000021010) #22 ENSPEMG00000030721 ENSPEMG00000030863 Zdhhc13 (ENSPEMG00000002307) Csrp3 (ENSPEMG00000004949) E2f8 (ENSPEMG00000015259) ENSPEMG00000030771 Nav2 (ENSPEMG00000014632) Dbx1 (ENSPEMG00000005909) ENSPEMG00000010926 Htatip2 (ENSPEMG00000009365) Prmt3 (ENSPEMG00000008087) Slc6a5 (ENSPEMG00000020942) Nell1 (ENSPEMG00000009575) Ano5 (ENSPEMG00000011022) Slc17a6 (ENSPEMG00000012568) Prairie vole MODERN SPECIES 222 Atp10a (ENSMOCG00000002633) Ube3a (ENSMOCG00000000635) #22 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 851 Lct (ENSNGAG00000018139) Mcm6 (ENSNGAG00000014663) ENSNGAG00000010888 Cxcr4 (ENSNGAG00000002679) Thsd7b (ENSNGAG00000001511) Tubgcp5 (ENSNGAG00000017205) Cyfip1 (ENSNGAG00000002534) Nipa2 (ENSNGAG00000020274) Nipa1 (ENSNGAG00000018071) Herc2 (ENSNGAG00000013763) Oca2 (ENSNGAG00000006386) Gabrg3 (ENSNGAG00000010399) Gabra5 (ENSNGAG00000017019) Gabrb3 (ENSNGAG00000005760) Atp10a (ENSNGAG00000011847) Ube3a (ENSNGAG00000007229) #22 Kangaroo rat MODERN SPECIES 334 Fem1b (ENSDORG00000024760) Cln6 (ENSDORG00000002678) Calml4 (ENSDORG00000027895) Pias1 (ENSDORG00000002601) Nipa1 (ENSDORG00000025660) ENSDORG00000027046 Cyfip1 (ENSDORG00000012763) Tubgcp5 (ENSDORG00000011370) ENSDORG00000024211 Oca2 (ENSDORG00000002790) Herc2 (ENSDORG00000009116) ENSDORG00000024538 Gabra5 (ENSDORG00000027530) Gabrb3 (ENSDORG00000002704) Atp10a (ENSDORG00000002131) Ube3a (ENSDORG00000004100) #22 Snrpn (ENSDORG00000004527) Snurf (ENSDORG00000006871) Mkrn3 (ENSDORG00000027697) Chrna7 (ENSDORG00000010785) Otud7a (ENSDORG00000029796) ENSDORG00000023169 ENSDORG00000026264 ENSDORG00000014624 ENSDORG00000024136 ENSDORG00000014623 Mphosph10 (ENSDORG00000006007) Mcee (ENSDORG00000006006) Apba2 (ENSDORG00000004960) Nsmce3 (ENSDORG00000004984) ENSDORG00000014998 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000017791 ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000160833 ENSGT00390000008646 ENSGT00960000186669 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 ENSGT00530000063335.A Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00390000017791 ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000160833 ENSGT00390000008646 ENSGT00960000186669 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 ENSGT00530000063335.A Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000017791 ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000160833 ENSGT00390000008646 ENSGT00960000186669 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 ENSGT00530000063335.A Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00390000017791 ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000160833 ENSGT00390000008646 ENSGT00960000186669 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 240 BCL2A1 (ENSCLAG00000001913) ZFAND6 (ENSCLAG00000002003) FAH (ENSCLAG00000002458) CTXND1 (ENSCLAG00000017548) TUBGCP5 (ENSCLAG00000001370) CYFIP1 (ENSCLAG00000000901) NIPA2 (ENSCLAG00000001028) NIPA1 (ENSCLAG00000001173) HERC2 (ENSCLAG00000002190) OCA2 (ENSCLAG00000002580) GABRG3 (ENSCLAG00000003194) GABRA5 (ENSCLAG00000003390) GABRB3 (ENSCLAG00000005141) ATP10A (ENSCLAG00000006124) ENSCLAG00000006279 UBE3A (ENSCLAG00000006723) #22 Degu MODERN SPECIES 240 MTHFS (ENSODEG00000003916) BCL2A1 (ENSODEG00000003896) ENSODEG00000003846 FAH (ENSODEG00000003764) TUBGCP5 (ENSODEG00000003406) ENSODEG00000018957 CYFIP1 (ENSODEG00000005616) ENSODEG00000005458 NIPA1 (ENSODEG00000005406) HERC2 (ENSODEG00000004618) OCA2 (ENSODEG00000003387) ENSODEG00000003987 GABRA5 (ENSODEG00000003968) GABRB3 (ENSODEG00000003908) ATP10A (ENSODEG00000003751) UBE3A (ENSODEG00000003671) #22 Guinea pig MODERN SPECIES 151 GABRA5 (ENSCPOG00000004165) GABRB3 (ENSCPOG00000005728) ATP10A (ENSCPOG00000012360) UBE3A (ENSCPOG00000005951) #22 SNRPN (ENSCPOG00000020270) SNURF (ENSCPOG00000024892) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 6 FKBP9 (ENSHGLG00000034172) ENSHGLG00000009440 ENSHGLG00000009094 CYFIP1 (ENSHGLG00000008409) ENSHGLG00000008356 ENSHGLG00000008301 ENSHGLG00000008251 ENSHGLG00000013498 ENSHGLG00000012774 OCA2 (ENSHGLG00000012626) GABRG3 (ENSHGLG00000044980) GABRA5 (ENSHGLG00000011294) GABRB3 (ENSHGLG00000010843) ATP10A (ENSHGLG00000008914) ENSHGLG00000047979 UBE3A (ENSHGLG00000008569) #22 SNRPN (ENSHGLG00000011924) NDN (ENSHGLG00000048511) ENSHGLG00000020818 ENSHGLG00000012821 ENSHGLG00000041264 ENSHGLG00000034954 ENSHGLG00000007956 OTUD7A (ENSHGLG00000008007) KLF13 (ENSHGLG00000044507) ENSHGLG00000008099 ENSHGLG00000008430 FAN1 (ENSHGLG00000020643) ENSHGLG00000009125 MCEE (ENSHGLG00000009474) ENSHGLG00000010225 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00530000063851.a ENSGT00390000017791 ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000160833 ENSGT00390000008646 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 ENSGT00530000063335.A Marmotini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00530000063851.a ENSGT00390000017791 ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000160833 ENSGT00390000008646 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651.s.b ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00530000063851.a ENSGT00390000017791 ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000160833 ENSGT00390000008646 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651.s.b ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 272 GABRG3 (ENSUPAG00010011724) GABRA5 (ENSUPAG00010011734) GABRB3 (ENSUPAG00010011768) ENSUPAG00010011910 ATP10A (ENSUPAG00010011922) ENSUPAG00010011958 UBE3A (ENSUPAG00010011978) #22 Squirrel MODERN SPECIES 71 MINAR1 (ENSSTOG00000004728) MTHFS (ENSSTOG00000009124) BCL2A1 (ENSSTOG00000009135) ZFAND6 (ENSSTOG00000025147) FAH (ENSSTOG00000003980) TUBGCP5 (ENSSTOG00000000167) CYFIP1 (ENSSTOG00000022382) ENSSTOG00000004003 NIPA1 (ENSSTOG00000004008) HERC2 (ENSSTOG00000006805) OCA2 (ENSSTOG00000006767) GABRG3 (ENSSTOG00000000919) GABRA5 (ENSSTOG00000014502) GABRB3 (ENSSTOG00000014493) ATP10A (ENSSTOG00000002017) UBE3A (ENSSTOG00000001338) #22 Alpin marmot MODERN SPECIES 7 MTHFS (ENSMMMG00000000648) BCL2A1 (ENSMMMG00000000627) ZFAND6 (ENSMMMG00000000571) FAH (ENSMMMG00000000552) TUBGCP5 (ENSMMMG00000000426) CYFIP1 (ENSMMMG00000000146) NIPA2 (ENSMMMG00000000083) NIPA1 (ENSMMMG00000023282) HERC2 (ENSMMMG00000023161) OCA2 (ENSMMMG00000023142) GABRG3 (ENSMMMG00000023125) GABRA5 (ENSMMMG00000023104) GABRB3 (ENSMMMG00000023089) ENSMMMG00000023072 ATP10A (ENSMMMG00000023067) UBE3A (ENSMMMG00000023053) #22 ENSMMMG00000023041 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 11 FAH (ENSSVLG00005008412) TUBGCP5 (ENSSVLG00005008437) CYFIP1 (ENSSVLG00005008475) ENSSVLG00005008620 NIPA1 (ENSSVLG00005008682) ENSSVLG00005008701 HERC2 (ENSSVLG00005008754) OCA2 (ENSSVLG00005009249) ENSSVLG00005009420 GABRG3 (ENSSVLG00005009456) GABRA5 (ENSSVLG00005009605) GABRB3 (ENSSVLG00005009710) ATP10A (ENSSVLG00005010147) ENSSVLG00005011189 ENSSVLG00005011214 UBE3A (ENSSVLG00005011271) #22 ENSSVLG00005011480 ENSSVLG00005011544 ENSSVLG00005011656 SNRPN (ENSSVLG00005011766) SNURF (ENSSVLG00005011691) ENSSVLG00005011795 ENSSVLG00005011846 ENSSVLG00005000097 NDN (ENSSVLG00005000123) MAGEL2 (ENSSVLG00005000130) MKRN3 (ENSSVLG00005000160) ENSSVLG00005000172 ENSSVLG00005000184 ENSSVLG00005000200 ENSSVLG00005000226 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 84 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999.f ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 ENSGT00530000063335.A ENSGT00940000163627 ENSGT00940000155164 Rabbit MODERN SPECIES 8 ENSOCUG00000025960 DACT1 (ENSOCUG00000015140) TUBGCP5 (ENSOCUG00000010715) CYFIP1 (ENSOCUG00000010732) NIPA2 (ENSOCUG00000010746) NIPA1 (ENSOCUG00000010754) HERC2 (ENSOCUG00000006754) OCA2 (ENSOCUG00000003510) GABRG3 (ENSOCUG00000011584) ENSOCUG00000031543 GABRA5 (ENSOCUG00000012905) ENSOCUG00000029227 GABRB3 (ENSOCUG00000003638) ATP10A (ENSOCUG00000006386) ENSOCUG00000034404 UBE3A (ENSOCUG00000017465) #22 ENSOCUG00000039001 ENSOCUG00000030271 SNRPN (ENSOCUG00000003532) ENSOCUG00000022682 ENSOCUG00000029162 ENSOCUG00000030537 NDN (ENSOCUG00000003250) ENSOCUG00000032204 ENSOCUG00000024436 MKRN3 (ENSOCUG00000012822) ENSOCUG00000031359 CHRNA7 (ENSOCUG00000002580) ENSOCUG00000025900 OTUD7A (ENSOCUG00000013856) ENSOCUG00000035146 Pika MODERN SPECIES 351 ENSOPRG00000016113 #22 Tree shrew MODERN SPECIES 539 UBE3A (ENSTBEG00000017521) #22 Primates ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00940000164524 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00910000147744 ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00910000147744 ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.c.a #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00940000164524 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00910000147744 ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00940000158943 ENSGT00530000063335.A Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.c.a #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00390000004524.c.a.b ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000163338.b.a Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000163338.b.a ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00390000003791.h ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.c.a #22 ENSGT00940000164524 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00950000186460 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b Hominidae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000163338.b.a.d ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00390000003791.h ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.c.a #22 ENSGT00940000164524 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00950000186460 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000163338.b.a.c Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00390000003791.h ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.c.a #22 ENSGT00950000186460 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000163338.b.a.c ENSGT00940000159067 ENSGT00940000155651 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155962 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00390000003791.h ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.c.a #22 ENSGT00940000164524 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00950000186460 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000163338.b.a.c ENSGT00940000163338.b.a.d.c.b ENSGT00940000159067 ENSGT00940000155651 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155962 ENSGT01050000244871.a.a.c.a.b.a.a.b.a.b ENSGT00950000183013.e.a.c.a.a.b.a.a ENSGT00950000183013.e.a.c.a.a.b.b.b.a Pan ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00940000158943 ENSGT00530000063335.A ENSGT00940000163627 ENSGT00940000155164 ENSGT00950000182935.B.a.q.a.b ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00390000003791.h ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.c.a #22 ENSGT00940000164524 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00950000186460 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000163338.b.a.c ENSGT00940000159067 ENSGT00940000155651 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155962 ENSGT01050000244871.a.a.c.a.b.a.a.b.a.b ENSGT00950000183013.e.a.c.a.a.b.a.a ENSGT00950000183013.e.a.c.a.a.b.b.b.a Chimpanzee MODERN SPECIES 6 ENSPTRG00000049709 TJP1 (ENSPTRG00000006846) ENSPTRG00000033952 ENSPTRG00000041722 ENSPTRG00000043911 ENSPTRG00000030350 ENSPTRG00000006850 ENSPTRG00000046635 ENSPTRG00000050016 OCA2 (ENSPTRG00000006834) GABRG3 (ENSPTRG00000052476) GABRA5 (ENSPTRG00000006832) GABRB3 (ENSPTRG00000006831) ENSPTRG00000047058 ATP10A (ENSPTRG00000030356) UBE3A (ENSPTRG00000006829) #22 ENSPTRG00000046808 SNURF (ENSPTRG00000034046) SNRPN (ENSPTRG00000006826) ENSPTRG00000044022 NPAP1 (ENSPTRG00000030358) ENSPTRG00000042825 MAGEL2 (ENSPTRG00000032582) MKRN3 (ENSPTRG00000051959) ENSPTRG00000051938 ENSPTRG00000052123 ENSPTRG00000029928 NIPA1 (ENSPTRG00000051453) NIPA2 (ENSPTRG00000052089) CYFIP1 (ENSPTRG00000006818) TUBGCP5 (ENSPTRG00000006817) Bonobo MODERN SPECIES 6 APBA2 (ENSPPAG00000031729) NSMCE3 (ENSPPAG00000037064) ENTREP2 (ENSPPAG00000042380) ENSPPAG00000035869 TJP1 (ENSPPAG00000040608) ENSPPAG00000011211 ENSPPAG00000037540 ENSPPAG00000032441 HERC2 (ENSPPAG00000031770) OCA2 (ENSPPAG00000036995) GABRG3 (ENSPPAG00000036643) GABRA5 (ENSPPAG00000037305) GABRB3 (ENSPPAG00000039754) ENSPPAG00000037400 ATP10A (ENSPPAG00000007479) UBE3A (ENSPPAG00000037743) #22 ENSPPAG00000043325 ENSPPAG00000035186 SNURF (ENSPPAG00000030924) SNRPN (ENSPPAG00000027650) ENSPPAG00000027823 ENSPPAG00000010428 MAGEL2 (ENSPPAG00000036442) ENSPPAG00000033415 ENSPPAG00000037386 NIPA1 (ENSPPAG00000035632) NIPA2 (ENSPPAG00000031169) CYFIP1 (ENSPPAG00000027494) TUBGCP5 (ENSPPAG00000028817) Human MODERN SPECIES 6 NSMCE3 (ENSG00000185115) ENTREP2 (ENSG00000104059) APBA2 (ENSG00000034053) GOLGA6L7 (ENSG00000261649) GOLGA8M (ENSG00000188626) GOLGA6L25 (ENSG00000227717) GOLGA8G (ENSG00000183629) GOLGA8F (ENSG00000153684) GOLGA6L24 (ENSG00000237850) HERC2 (ENSG00000128731) OCA2 (ENSG00000104044) GABRG3 (ENSG00000182256) GABRA5 (ENSG00000186297) GABRB3 (ENSG00000166206) ATP10A (ENSG00000206190) UBE3A (ENSG00000114062) #22 SNURF (ENSG00000273173) SNRPN (ENSG00000128739) NPAP1 (ENSG00000185823) NDN (ENSG00000182636) MAGEL2 (ENSG00000254585) MKRN3 (ENSG00000179455) GOLGA6L2 (ENSG00000174450) GOLGA8S (ENSG00000261739) GOLGA6L26 (ENSG00000273756) GOLGA6L1 (ENSG00000273976) TUBGCP5 (ENSG00000275835) CYFIP1 (ENSG00000273749) NIPA2 (ENSG00000140157) NIPA1 (ENSG00000170113) GOLGA6L22 (ENSG00000277865) Gorilla MODERN SPECIES 6 CHRFAM7A (ENSGGOG00000028541) ENSGGOG00000041887 ENSGGOG00000022637 ENSGGOG00000012146 APBA2 (ENSGGOG00000005676) ENSGGOG00000027053 ENSGGOG00000026476 HERC2 (ENSGGOG00000012785) ENSGGOG00000039106 OCA2 (ENSGGOG00000005900) GABRG3 (ENSGGOG00000036478) GABRA5 (ENSGGOG00000036809) GABRB3 (ENSGGOG00000011207) ENSGGOG00000037903 ATP10A (ENSGGOG00000001775) UBE3A (ENSGGOG00000003955) #22 SNRPN (ENSGGOG00000003988) SNURF (ENSGGOG00000042638) ENSGGOG00000039674 NPAP1 (ENSGGOG00000023549) ENSGGOG00000041536 ENSGGOG00000024364 ENSGGOG00000043626 ENSGGOG00000025127 NIPA1 (ENSGGOG00000012394) NIPA2 (ENSGGOG00000002147) CYFIP1 (ENSGGOG00000002142) TUBGCP5 (ENSGGOG00000015241) ENSGGOG00000026858 ENSGGOG00000042770 ENSGGOG00000038570 Orangutan MODERN SPECIES 6 ENSPPYG00000038048 ENSPPYG00000038168 TUBGCP5 (ENSPPYG00000006257) CYFIP1 (ENSPPYG00000006258) NIPA2 (ENSPPYG00000006259) NIPA1 (ENSPPYG00000006260) ENSPPYG00000029470 ENSPPYG00000006261 HERC2 (ENSPPYG00000006279) OCA2 (ENSPPYG00000006278) GABRG3 (ENSPPYG00000006277) GABRA5 (ENSPPYG00000006276) GABRB3 (ENSPPYG00000006275) ATP10A (ENSPPYG00000006273) UBE3A (ENSPPYG00000006272) #22 ENSPPYG00000032699 SNURF (ENSPPYG00000006269) NPAP1 (ENSPPYG00000006268) NDN (ENSPPYG00000006267) MAGEL2 (ENSPPYG00000033115) ENSPPYG00000031637 ENSPPYG00000006284 ENSPPYG00000033109 ENSPPYG00000032068 ENSPPYG00000030048 ENSPPYG00000032030 ENSPPYG00000034029 ENSPPYG00000038719 TJP1 (ENSPPYG00000006283) ENTREP2 (ENSPPYG00000006281) Gibbon MODERN SPECIES 21 TRPM1 (ENSNLEG00000007538) MTMR10 (ENSNLEG00000007537) ENSNLEG00000030565 FAN1 (ENSNLEG00000007533) ENSNLEG00000012458 TJP1 (ENSNLEG00000012450) ENTREP2 (ENSNLEG00000012443) APBA2 (ENSNLEG00000012430) HERC2 (ENSNLEG00000010563) OCA2 (ENSNLEG00000010539) GABRG3 (ENSNLEG00000010534) GABRA5 (ENSNLEG00000032139) GABRB3 (ENSNLEG00000001628) ENSNLEG00000035717 ATP10A (ENSNLEG00000001532) UBE3A (ENSNLEG00000001407) #22 ENSNLEG00000001404 ENSNLEG00000032294 SNRPN (ENSNLEG00000001376) ENSNLEG00000001365 ENSNLEG00000028122 MAGEL2 (ENSNLEG00000018795) ENSNLEG00000027596 ENSNLEG00000036044 ENSNLEG00000031107 ENSNLEG00000026795 TUBGCP5 (ENSNLEG00000010987) CYFIP1 (ENSNLEG00000011085) NIPA2 (ENSNLEG00000035813) NIPA1 (ENSNLEG00000030666) ENSNLEG00000028832 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00390000011439.n ENSGT00390000003791.h ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.c.a #22 ENSGT00940000164524 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00390000004524.c.a.b ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000163338.b.a Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000163338.b.a.a ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00390000011439.n ENSGT00390000003791.h ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.c.a #22 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000163338.b.a.b Vervet Monkey MODERN SPECIES 18 CYP2E1 (ENSCSAG00000006614) SYCE1 (ENSCSAG00000006600) TUBGCP5 (ENSCSAG00000006573) CYFIP1 (ENSCSAG00000006559) NIPA2 (ENSCSAG00000006549) NIPA1 (ENSCSAG00000006544) ENSCSAG00000006535 HERC2 (ENSCSAG00000006517) OCA2 (ENSCSAG00000006478) ENSCSAG00000006459 ENSCSAG00000006454 GABRA5 (ENSCSAG00000006450) GABRB3 (ENSCSAG00000006440) ATP10A (ENSCSAG00000006422) ENSCSAG00000019760 UBE3A (ENSCSAG00000006415) #22 ENSCSAG00000006411 SNRPN (ENSCSAG00000006406) SNURF (ENSCSAG00000006401) NPAP1 (ENSCSAG00000018865) NDN (ENSCSAG00000018866) ENSCSAG00000018867 MKRN3 (ENSCSAG00000018868) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000163338.b.a.a ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00390000011439.n ENSGT00390000003791.h ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.c.a #22 ENSGT00910000147623 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000163338.b.b.a ENSGT00530000062932.c.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00910000147744 ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00910000146953 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00910000147908 ENSGT00390000018637 Macaca ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975.`b.b ENSGT00940000163338.b.a.a ENSGT00940000154975.`b.a ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00390000011439.n ENSGT00390000003791.h ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.c.a #22 ENSGT00910000147623 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000163338.b.a.b ENSGT00530000062932.c.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00910000147744 ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00910000146953 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00530000062932.c.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000164709.a.b.b.a.b.b.a.a.b.a.a.a.b.b.b.a.a.b ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975.`b.b ENSGT00940000163338.b.a.a ENSGT00940000154975.`b.a ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00390000011439.n ENSGT00390000003791.h ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.c.a #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000153253.b.a.h ENSGT00940000153104.e.b.a.b ENSGT00940000163084 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000163338.b.b.a ENSGT00530000062932.c.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00910000146953 ENSGT00980000199886 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 Rhesus MODERN SPECIES 17 ENSMMUG00000062900 ENSMMUG00000065234 CYFIP1 (ENSMMUG00000003890) NIPA2 (ENSMMUG00000003892) NIPA1 (ENSMMUG00000003013) ENSMMUG00000058216 HERC2 (ENSMMUG00000004370) ENSMMUG00000057676 OCA2 (ENSMMUG00000012027) GABRG3 (ENSMMUG00000023555) GABRA5 (ENSMMUG00000023554) GABRB3 (ENSMMUG00000051793) ENSMMUG00000064053 ENSMMUG00000052147 ATP10A (ENSMMUG00000054546) UBE3A (ENSMMUG00000000628) #22 SNRPN (ENSMMUG00000023139) SNURF (ENSMMUG00000041221) NPAP1 (ENSMMUG00000051503) ENSMMUG00000054594 ENSMMUG00000060745 NDN (ENSMMUG00000005161) ENSMMUG00000046479 ENSMMUG00000008530 ENSMMUG00000058972 ENSMMUG00000019483 ENSMMUG00000021656 ENSMMUG00000063268 ENSMMUG00000060334 ENSMMUG00000061747 ENSMMUG00000060774 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 17 CYFIP1 (ENSMFAG00000038397) NIPA2 (ENSMFAG00000000201) NIPA1 (ENSMFAG00000048936) ENSMFAG00000050049 ENSMFAG00000064393 HERC2 (ENSMFAG00000041087) ENSMFAG00000063611 OCA2 (ENSMFAG00000030481) ENSMFAG00000056497 GABRG3 (ENSMFAG00000046358) GABRA5 (ENSMFAG00000000781) GABRB3 (ENSMFAG00000033421) ENSMFAG00000043953 ENSMFAG00000036317 ATP10A (ENSMFAG00000041606) UBE3A (ENSMFAG00000037265) #22 ENSMFAG00000050509 ENSMFAG00000059350 SNURF (ENSMFAG00000051999) SNRPN (ENSMFAG00000042235) ENSMFAG00000013529 NPAP1 (ENSMFAG00000062702) ENSMFAG00000049938 ENSMFAG00000043430 ENSMFAG00000061526 ENSMFAG00000059685 ENSMFAG00000051242 ENSMFAG00000060699 ENSMFAG00000057119 ENSMFAG00000045338 ENSMFAG00000048954 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 276 ATP10A (ENSMNEG00000030347) UBE3A (ENSMNEG00000028458) #22 ENSMNEG00000028191 SNRPN (ENSMNEG00000031291) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000154617.B ENSGT00530000062932.c.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000163338.b.a.a ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00390000011439.n ENSGT00390000003791.h ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.c.a #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00940000164524 Olive baboon MODERN SPECIES 17 OTUD7A (ENSPANG00000019951) CHRNA7 (ENSPANG00000019953) TUBGCP5 (ENSPANG00000020044) CYFIP1 (ENSPANG00000020068) NIPA2 (ENSPANG00000020065) NIPA1 (ENSPANG00000020062) ENSPANG00000020047 HERC2 (ENSPANG00000048246) OCA2 (ENSPANG00000020154) GABRG3 (ENSPANG00000030112) ENSPANG00000020148 GABRB3 (ENSPANG00000020144) ENSPANG00000031108 ENSPANG00000033621 ATP10A (ENSPANG00000015694) UBE3A (ENSPANG00000018034) #22 ENSPANG00000047051 SNRPN (ENSPANG00000020142) NPAP1 (ENSPANG00000043553) ENSPANG00000046426 ENSPANG00000040529 ENSPANG00000029912 ENSPANG00000042362 ENSPANG00000020053 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 194 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000163338.b.a.a ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00390000011439.n ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.c.a #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00940000164524 Drill MODERN SPECIES 824 TUBGCP5 (ENSMLEG00000039560) CYFIP1 (ENSMLEG00000044448) NIPA2 (ENSMLEG00000029257) NIPA1 (ENSMLEG00000003228) ENSMLEG00000009643 HERC2 (ENSMLEG00000032055) OCA2 (ENSMLEG00000033698) GABRG3 (ENSMLEG00000038872) GABRA5 (ENSMLEG00000031703) GABRB3 (ENSMLEG00000031496) ENSMLEG00000038383 ATP10A (ENSMLEG00000043561) UBE3A (ENSMLEG00000041127) #22 ENSMLEG00000039041 Sooty mangabey MODERN SPECIES 197 TUBGCP5 (ENSCATG00000035916) CYFIP1 (ENSCATG00000040295) NIPA2 (ENSCATG00000029912) NIPA1 (ENSCATG00000044931) ENSCATG00000032536 HERC2 (ENSCATG00000041097) OCA2 (ENSCATG00000009099) GABRG3 (ENSCATG00000045054) GABRA5 (ENSCATG00000036066) GABRB3 (ENSCATG00000036325) ATP10A (ENSCATG00000037526) UBE3A (ENSCATG00000037110) #22 SNRPN (ENSCATG00000032518) ENSCATG00000044455 SNURF (ENSCATG00000040263) ENSCATG00000019216 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 359 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00390000011439.n ENSGT00390000003791.h ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.c.a #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 798 ENSRROG00000044915 ENSRROG00000030722 ATP10A (ENSRROG00000010879) UBE3A (ENSRROG00000039909) #22 SNRPN (ENSRROG00000035157) SNURF (ENSRROG00000045707) ENSRROG00000033668 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 704 ENSRBIG00000023690 OCA2 (ENSRBIG00000032016) GABRG3 (ENSRBIG00000024456) GABRA5 (ENSRBIG00000030679) GABRB3 (ENSRBIG00000021140) ENSRBIG00000036017 ENSRBIG00000031637 ATP10A (ENSRBIG00000033020) UBE3A (ENSRBIG00000040451) #22 SNURF (ENSRBIG00000027904) SNRPN (ENSRBIG00000041765) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000162722 ENSGT00940000161651 ENSGT00390000016499 ENSGT00390000000455.a ENSGT00910000147901 ENSGT00940000157964 ENSGT00390000006278 ENSGT00940000162103 ENSGT00390000014210 ENSGT00650000093475 ENSGT00940000154267.B ENSGT00940000161070 ENSGT00530000063946.a ENSGT00940000155551 ENSGT00940000156294 ENSGT00940000155050.c.b #22 ENSGT00940000162756.n ENSGT00730000111539 ENSGT00730000111511 ENSGT00550000076318 ENSGT00390000001157.A.a ENSGT00940000159077 ENSGT00940000162550 ENSGT00940000156253 ENSGT00940000158923 ENSGT00770000120675 ENSGT00550000074783 ENSGT00940000156013 ENSGT00390000007224.b ENSGT00390000016055 ENSGT00390000013073.a Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000161651 ENSGT00390000016499 ENSGT00390000000455.a ENSGT00910000147901 ENSGT00940000157964 ENSGT00390000006278 ENSGT00530000063927.a.a.n.b.b.b ENSGT00940000162103 ENSGT00390000014210 ENSGT00650000093475 ENSGT00940000154267.B ENSGT00940000161070 ENSGT00530000063946.a ENSGT00940000155551 ENSGT00940000156294 ENSGT00940000155050.c.b #22 ENSGT00940000162756.n ENSGT00730000111539 ENSGT00730000111511 ENSGT00550000076318 ENSGT00390000001157.A.a ENSGT00940000159077 ENSGT00940000162550 ENSGT00940000156253 ENSGT00940000158923 ENSGT00770000120675 ENSGT00550000074783 ENSGT00940000156013 ENSGT00390000007224.b ENSGT00390000016055 ENSGT00390000002365.x.d.c.b Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000000455.a ENSGT00910000147901 ENSGT00940000157964 ENSGT00390000006278 ENSGT00530000063927.a.a.n.b.b.b.b ENSGT00940000162103 ENSGT00390000014210 ENSGT00650000093475 ENSGT00940000154267.B ENSGT00940000161070 ENSGT00530000063946.a ENSGT00940000155551 ENSGT00940000155898.d ENSGT00390000009366.c.b ENSGT00940000156294 ENSGT00940000155050.c.b #22 ENSGT00940000162756.n ENSGT00730000111539 ENSGT00730000111511 ENSGT00550000076318 ENSGT00390000001157.A.a ENSGT00940000159077 ENSGT00940000162550 ENSGT00940000156253 ENSGT00940000158923 ENSGT00770000120675 ENSGT00550000074783 ENSGT00940000156013 ENSGT00390000007224.b ENSGT00390000016055 ENSGT00390000002365.x.d.c.b Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000000455.a ENSGT00910000147901 ENSGT00940000157964 ENSGT00390000006278 ENSGT00530000063927.a.a.n.b.b.b.b ENSGT00940000162103 ENSGT00390000014210 ENSGT00650000093475 ENSGT00940000154267.B ENSGT00940000161070 ENSGT00530000063946.a ENSGT00940000155551 ENSGT00940000155898.d ENSGT00390000009366.c.b ENSGT00940000156294 ENSGT00940000155050.c.b #22 ENSGT00940000162756.n.c ENSGT00730000111539 ENSGT00730000111511 ENSGT00550000076318 ENSGT00390000001157.A.a ENSGT00940000159077 ENSGT00940000162550 ENSGT00940000156253 ENSGT00940000158923 ENSGT00770000120675 ENSGT00550000074783 ENSGT00940000156013 ENSGT00390000007224.b ENSGT00390000016055 ENSGT00390000002365.x.d.c.b Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155050.c.b #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155050.c.b #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155050.c.b #22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 465 C21orf62 (ENSCATG00000043153) PAXBP1 (ENSCATG00000030287) ENSCATG00000016391 SYNJ1 (ENSCATG00000033891) CFAP298 (ENSCATG00000037049) TCP10L (ENSCATG00000010454) EVA1C (ENSCATG00000027012) URB1 (ENSCATG00000042630) MRAP (ENSCATG00000042418) MIS18A (ENSCATG00000034951) HUNK (ENSCATG00000028680) SCAF4 (ENSCATG00000030379) SOD1 (ENSCATG00000040821) ENSCATG00000040145 TIAM1 (ENSCATG00000015629) ENSCATG00000042584 #22 ENSCATG00000039770 KRTAP7-1 (ENSCATG00000011966) KRTAP21-1 (ENSCATG00000034414) KRTAP6-1 (ENSCATG00000045292) KRTAP6-2 (ENSCATG00000036799) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 70 ENSGT00940000161651 ENSGT00390000016499 ENSGT00390000000455.a ENSGT00940000157964 ENSGT00390000006278 ENSGT00530000063927.a.a.n.b.b.b.b ENSGT00940000162103 ENSGT00390000014210 ENSGT00650000093475 ENSGT00940000154267.B ENSGT00940000161070 ENSGT00530000063946.a ENSGT00940000155551 ENSGT00940000155898.d ENSGT00940000156294 ENSGT00940000155050.c.b #22 ENSGT01000000215755 ENSGT00950000183372 ENSGT00950000183416 ENSGT01100000263699 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 741 OLIG1 (ENSRBIG00000025302) OLIG2 (ENSRBIG00000044608) C21orf62 (ENSRBIG00000029872) PAXBP1 (ENSRBIG00000041633) SYNJ1 (ENSRBIG00000034477) CFAP298 (ENSRBIG00000026515) TCP10L (ENSRBIG00000033081) EVA1C (ENSRBIG00000034927) URB1 (ENSRBIG00000033122) MRAP (ENSRBIG00000040139) MIS18A (ENSRBIG00000038961) HUNK (ENSRBIG00000031500) SCAF4 (ENSRBIG00000040007) SOD1 (ENSRBIG00000029804) TIAM1 (ENSRBIG00000033361) ENSRBIG00000039717 #22 ENSRBIG00000014035 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155050.c.b #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155050.c.b #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000161651 ENSGT00390000016499 ENSGT00390000000455.a ENSGT00940000157964 ENSGT00390000006278 ENSGT00530000063927.a.a.n.b.b.b ENSGT00940000162103 ENSGT00390000014210 ENSGT00650000093475 ENSGT00940000154267.B ENSGT00940000161070 ENSGT00530000063946.a ENSGT00940000155551 ENSGT00390000009366.c.b ENSGT00940000156294 ENSGT00940000155050.c.b #22 ENSGT00950000183564 ENSGT00730000111463 ENSGT00390000015202 ENSGT00530000064274 ENSGT01090000260341 ENSGT00840000130947 ENSGT00550000076392 ENSGT01000000215755 ENSGT00950000183533 ENSGT00950000183372 ENSGT00860000134312 ENSGT00950000183416 ENSGT01100000263699 ENSGT00530000065184 ENSGT00950000183791 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000161651 ENSGT00390000016499 ENSGT00390000000455.a ENSGT00940000157964 ENSGT00390000006278 ENSGT00530000063927.a.a.n.b.b.b ENSGT00940000162103 ENSGT00390000014210 ENSGT00650000093475 ENSGT00940000154267.B ENSGT00940000161070 ENSGT00530000063946.a ENSGT00940000155551 ENSGT00390000009366.c.b ENSGT00940000156294 ENSGT00940000155050.c.b #22 ENSGT00950000183564 ENSGT00730000111463 ENSGT00390000015202 ENSGT00530000064274 ENSGT01090000260341 ENSGT00840000130947 ENSGT00550000076392 ENSGT00410000029383 ENSGT00950000186539 ENSGT01000000215755 ENSGT00950000183533 ENSGT00950000183372 ENSGT00860000134312 ENSGT00950000183416 ENSGT01100000263699 Pan ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000161651 ENSGT00390000016499 ENSGT00390000000455.a ENSGT00940000157964 ENSGT00390000006278 ENSGT00530000063927.a.a.n.b.b.b ENSGT00940000162103 ENSGT00390000014210 ENSGT00650000093475 ENSGT00940000154267.B ENSGT00940000161070 ENSGT00530000063946.a ENSGT00940000155551 ENSGT00390000009366.c.b ENSGT00940000156294 ENSGT00940000155050.c.b #22 ENSGT00950000183564 ENSGT00730000111463 ENSGT00390000015202 ENSGT00530000064274 ENSGT01090000260341 ENSGT00550000076392 ENSGT00410000029383 ENSGT00950000186539 ENSGT01000000215755 ENSGT00950000183533 ENSGT00950000183372 ENSGT00860000134312 ENSGT00950000183416 ENSGT01100000263699 ENSGT00530000065184 Chimpanzee MODERN SPECIES 12 ENSPTRG00000051983 ENSPTRG00000051353 C21H21orf62 (ENSPTRG00000013862) PAXBP1 (ENSPTRG00000013861) SYNJ1 (ENSPTRG00000023787) CFAP298 (ENSPTRG00000013857) TCP10L (ENSPTRG00000013856) EVA1C (ENSPTRG00000013854) URB1 (ENSPTRG00000013852) MRAP (ENSPTRG00000013851) MIS18A (ENSPTRG00000013850) HUNK (ENSPTRG00000013849) SCAF4 (ENSPTRG00000013848) SOD1 (ENSPTRG00000013847) TIAM1 (ENSPTRG00000013846) ENSPTRG00000044292 #22 KRTAP19-8 (ENSPTRG00000031445) KRTAP11-1 (ENSPTRG00000013844) KRTAP7-1 (ENSPTRG00000052397) KRTAP8-1 (ENSPTRG00000013843) KRTAP21-1 (ENSPTRG00000013842) KRTAP21-3 (ENSPTRG00000041998) KRTAP20-3 (ENSPTRG00000048081) KRTAP20-2 (ENSPTRG00000013841) KRTAP20-4 (ENSPTRG00000031449) KRTAP20-1 (ENSPTRG00000013840) KRTAP6-1 (ENSPTRG00000013839) KRTAP22-1 (ENSPTRG00000013838) KRTAP6-2 (ENSPTRG00000031450) KRTAP6-3 (ENSPTRG00000031451) KRTAP22-2 (ENSPTRG00000031452) Bonobo MODERN SPECIES 12 ENSPPAG00000034805 ENSPPAG00000034697 PAXBP1 (ENSPPAG00000034585) SYNJ1 (ENSPPAG00000026784) ENSPPAG00000009038 TCP10L (ENSPPAG00000007355) EVA1C (ENSPPAG00000005532) URB1 (ENSPPAG00000003423) MRAP (ENSPPAG00000002893) MIS18A (ENSPPAG00000001292) HUNK (ENSPPAG00000032225) SCAF4 (ENSPPAG00000028535) ENSPPAG00000027217 ENSPPAG00000026185 TIAM1 (ENSPPAG00000033381) ENSPPAG00000030797 #22 KRTAP19-8 (ENSPPAG00000032522) KRTAP11-1 (ENSPPAG00000032405) KRTAP7-1 (ENSPPAG00000032653) KRTAP8-1 (ENSPPAG00000032139) KRTAP21-1 (ENSPPAG00000030330) KRTAP6-1 (ENSPPAG00000032430) KRTAP22-1 (ENSPPAG00000032266) KRTAP6-2 (ENSPPAG00000032330) ENSPPAG00000030209 KRTAP22-2 (ENSPPAG00000030023) KRTAP19-5 (ENSPPAG00000032202) KRTAP19-3 (ENSPPAG00000032888) KRTAP13-1 (ENSPPAG00000032574) KRTAP27-1 (ENSPPAG00000032584) KRTAP26-1 (ENSPPAG00000032463) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000162722 ENSGT00940000161651 ENSGT00390000016499 ENSGT00390000000455.a.k ENSGT00910000147901 ENSGT00940000157964 ENSGT00390000006278 ENSGT00940000162103 ENSGT00390000014210 ENSGT00650000093475 ENSGT00940000154267.B ENSGT00940000161070.b ENSGT00530000063946.a ENSGT00940000155551 ENSGT00940000156294 ENSGT00940000155050.c.b #22 ENSGT00940000159077 ENSGT00530000064274 ENSGT00860000134312 ENSGT00530000065184 ENSGT00940000165160 ENSGT00940000162550 ENSGT00940000156253 ENSGT00940000158923 ENSGT00770000120675 ENSGT00550000074783 ENSGT00940000156013 ENSGT00390000007224.b ENSGT00390000016055 ENSGT00390000013073.a ENSGT00940000159090 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000161651 ENSGT00390000016499 ENSGT00390000000455.a.k ENSGT00910000147901 ENSGT00940000157964 ENSGT00390000006278 ENSGT00940000162103 ENSGT00390000014210 ENSGT00650000093475 ENSGT00940000154267.B ENSGT00940000161070.a ENSGT00940000161070.b ENSGT00530000063946.a ENSGT00940000155551 ENSGT00940000156294 ENSGT00940000155050.c.b #22 ENSGT00940000159077 ENSGT00940000156253 ENSGT00940000158923 ENSGT00770000120675 ENSGT00550000074783 ENSGT00940000156013 ENSGT00390000007224.b ENSGT00390000016055 ENSGT00390000013073.a ENSGT00940000159090 ENSGT00940000156815 ENSGT00500000044986 ENSGT00530000063252.a.b ENSGT00940000155799.f ENSGT00940000155799.e Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000162722 ENSGT00940000161651 ENSGT00390000016499 ENSGT00390000000455.a.k ENSGT00910000147901 ENSGT00940000157964 ENSGT00390000006278 ENSGT00940000162103 ENSGT00390000014210 ENSGT00650000093475 ENSGT00940000154267.B ENSGT00940000161070.b ENSGT00530000063946.a ENSGT00940000155551 ENSGT00940000156294 ENSGT00940000155050.c.b #22 ENSGT00940000162550 ENSGT00940000156253 ENSGT00940000158923 ENSGT00770000120675 ENSGT00550000074783 ENSGT00940000156013 ENSGT00390000007224.b ENSGT00390000016055 ENSGT00390000013073.a ENSGT00940000159090 ENSGT00940000156815 ENSGT00500000044986 ENSGT00530000063252.a.b ENSGT00940000155799.e ENSGT00390000008902 Capuchin MODERN SPECIES 619 SCAF4 (ENSCCAG00000033727) SOD1 (ENSCCAG00000034174) ENSCCAG00000029290 TIAM1 (ENSCCAG00000036707) ENSCCAG00000035782 #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 117 ENSGT00940000155050.d #22 ENSGT00910000148238 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.d #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00940000164524.c.b ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00940000158943 ENSGT00530000063335.A ENSGT00940000163627 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.d #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00940000158943 ENSGT00530000063335.A ENSGT00940000155164 ENSGT00940000159348 Marmoset MODERN SPECIES 18 TUBGCP5 (ENSCJAG00000005261) CYFIP1 (ENSCJAG00000005289) NIPA2 (ENSCJAG00000005448) NIPA1 (ENSCJAG00000084460) ENSCJAG00000038833 HERC2 (ENSCJAG00000011798) OCA2 (ENSCJAG00000011780) ENSCJAG00000078802 ENSCJAG00000073185 GABRG3 (ENSCJAG00000009977) GABRA5 (ENSCJAG00000001665) GABRB3 (ENSCJAG00000003857) ENSCJAG00000071099 ENSCJAG00000077228 ATP10A (ENSCJAG00000074536) UBE3A (ENSCJAG00000003764) #22 SNRPN (ENSCJAG00000003759) ENSCJAG00000003753 ENSCJAG00000048599 ENSCJAG00000076943 ENSCJAG00000069790 NDN (ENSCJAG00000003738) MAGEL2 (ENSCJAG00000085421) ENSCJAG00000045017 ENSCJAG00000076248 CHRNA7 (ENSCJAG00000021542) ENSCJAG00000070281 ENSCJAG00000069970 OTUD7A (ENSCJAG00000017621) KLF13 (ENSCJAG00000017617) TRPM1 (ENSCJAG00000017565) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 133 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.d #22 ENSGT00910000148238 Capuchin DUPLICATION Capuchin MODERN SPECIES 36 SEPTIN9 (ENSCCAG00000028621) ENSCCAG00000015305 SEC14L1 (ENSCCAG00000020866) MGAT5B (ENSCCAG00000027779) MFSD11 (ENSCCAG00000033114) SRSF2 (ENSCCAG00000037532) METTL23 (ENSCCAG00000033973) JMJD6 (ENSCCAG00000022260) ENSCCAG00000033820 KHDRBS2 (ENSCCAG00000037746) LGSN (ENSCCAG00000036955) SNRPD2 (ENSCCAG00000030191) PTP4A1 (ENSCCAG00000034348) ENSCCAG00000022679 ENSCCAG00000024127 ENSCCAG00000026544 #22 ENSCCAG00000021420 Capuchin MODERN SPECIES 154 NAP1L3 (ENSCCAG00000023985) ENSCCAG00000029000 ENSCCAG00000021902 #22 TEX9 (ENSCCAG00000026441) RFX7 (ENSCCAG00000021423) NEDD4 (ENSCCAG00000029823) PRTG (ENSCCAG00000023400) PYGO1 (ENSCCAG00000022604) DNAAF4 (ENSCCAG00000030726) C15orf65 (ENSCCAG00000037177) CCPG1 (ENSCCAG00000027606) PIGB (ENSCCAG00000015876) RAB27A (ENSCCAG00000032708) RSL24D1 (ENSCCAG00000029762) UNC13C (ENSCCAG00000022691) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 229 TUBGCP5 (ENSSBOG00000028320) CYFIP1 (ENSSBOG00000018005) NIPA2 (ENSSBOG00000027749) NIPA1 (ENSSBOG00000026682) ENSSBOG00000021693 HERC2 (ENSSBOG00000020147) OCA2 (ENSSBOG00000025178) GABRG3 (ENSSBOG00000018827) ENSSBOG00000020961 GABRA5 (ENSSBOG00000022560) GABRB3 (ENSSBOG00000031803) ENSSBOG00000035481 ATP10A (ENSSBOG00000022187) UBE3A (ENSSBOG00000023635) #22 Mas night monkey MODERN SPECIES 798 ENSANAG00000021669 TUBGCP5 (ENSANAG00000036155) ENSANAG00000022819 NIPA2 (ENSANAG00000034589) NIPA1 (ENSANAG00000030345) HERC2 (ENSANAG00000021521) ENSANAG00000035248 ENSANAG00000027347 OCA2 (ENSANAG00000024732) ENSANAG00000036971 GABRG3 (ENSANAG00000026561) ENSANAG00000030796 GABRA5 (ENSANAG00000031355) GABRB3 (ENSANAG00000020497) ATP10A (ENSANAG00000025549) UBE3A (ENSANAG00000034271) #22 SNRPN (ENSANAG00000034241) ENSANAG00000021829 SNURF (ENSANAG00000037403) NDN (ENSANAG00000015770) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155050.d #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155050.d #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155050.d #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183198.c.a.b.a.b.j ENSGT00940000157381 ENSGT00390000000089 ENSGT00940000157145 ENSGT00940000160271 ENSGT00390000007773 ENSGT00940000155421.b ENSGT00390000000111.b.b ENSGT00390000002393 ENSGT00440000038745.b ENSGT00730000111088 ENSGT00390000009628 ENSGT00390000016730.a.a ENSGT00390000001488 ENSGT00390000017443.s.a.b ENSGT00940000155050.d #22 ENSGT00540000072033 ENSGT00940000157803 ENSGT00390000005386 ENSGT00940000153167.A.b ENSGT00390000010137 ENSGT00910000146858 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b ENSGT00390000004394 ENSGT00910000147879 ENSGT00940000161478 ENSGT00390000008676 ENSGT00730000110975 ENSGT00940000154485.B ENSGT00390000002627 ENSGT00940000155582 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000000089 ENSGT00940000157145 ENSGT00940000160271 ENSGT00390000007773 ENSGT00940000155421.b ENSGT00390000000111.b.b ENSGT00390000002393 ENSGT00550000074698.k.b.b.nb.b ENSGT00440000038745.b ENSGT00730000111088.k ENSGT00730000111088.l ENSGT00390000009628 ENSGT00390000016730.a.a ENSGT00390000001488 ENSGT00390000017443.s.a.b ENSGT00940000155050.d #22 ENSGT00540000072033 ENSGT00940000157803 ENSGT00390000005386 ENSGT00940000153167.A.b ENSGT00390000010137 ENSGT00910000146858 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b ENSGT00390000004394 ENSGT00940000161478 ENSGT00390000008676 ENSGT00730000110975 ENSGT00940000154485.B ENSGT00390000002627 ENSGT00940000155582 ENSGT00440000038603 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000157381 ENSGT00390000000089 ENSGT00940000157145 ENSGT00940000160271 ENSGT00390000007773 ENSGT00940000155421.b ENSGT00390000000111.b.b ENSGT00390000002393 ENSGT00550000074698.k.b.b.nb.b ENSGT00440000038745.b ENSGT00730000111088.k ENSGT00390000009628 ENSGT00390000016730.a.a ENSGT00390000001488 ENSGT00390000017443.s.a.b ENSGT00940000155050.d #22 ENSGT00540000072033 ENSGT00940000157803 ENSGT00390000005386 ENSGT00940000153167.A.b ENSGT00390000010137 ENSGT00910000146858 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b ENSGT00390000004394 ENSGT00940000161478 ENSGT00390000008676 ENSGT00730000110975 ENSGT00940000154485.B ENSGT00390000002627 ENSGT00940000155582 ENSGT00440000038603 Sooty mangabey MODERN SPECIES 375 ENSCATG00000030713 ABCC6 (ENSCATG00000005326) ABCC1 (ENSCATG00000040758) CEP20 (ENSCATG00000040556) MYH11 (ENSCATG00000031651) NDE1 (ENSCATG00000009262) MARF1 (ENSCATG00000043323) BMERB1 (ENSCATG00000041158) PDXDC1 (ENSCATG00000031700) ENSCATG00000034647 RRN3 (ENSCATG00000038216) ENSCATG00000035541 ENSCATG00000031011 ENSCATG00000021882 #22 ENSCATG00000034179 PLA2G10 (ENSCATG00000037489) BFAR (ENSCATG00000040996) PARN (ENSCATG00000041368) ENSCATG00000030392 MRTFB (ENSCATG00000039198) ERCC4 (ENSCATG00000033864) SHISA9 (ENSCATG00000034629) CPPED1 (ENSCATG00000041340) SNX29 (ENSCATG00000043072) GSPT1 (ENSCATG00000025774) ENSCATG00000020644 RSL1D1 (ENSCATG00000031153) ZC3H7A (ENSCATG00000039664) ENSCATG00000024056 Macaca ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000157381 ENSGT00390000000089 ENSGT00940000157145 ENSGT00940000160271 ENSGT00390000007773 ENSGT00940000155421.b ENSGT00390000000111.b.b ENSGT00390000002393 ENSGT00440000038745.b ENSGT00730000111088.m.b ENSGT00730000111088.m.a ENSGT00390000009628 ENSGT00390000016730.a.a ENSGT00390000001488 ENSGT00390000017443.s.a.b ENSGT00940000155050.d #22 ENSGT00540000072033 ENSGT00940000157803 ENSGT00390000005386 ENSGT00940000153167.A.b ENSGT00390000010137 ENSGT00910000146858 ENSGT00950000182979.a.b.b.b.b ENSGT00390000004394 ENSGT00910000147879 ENSGT00940000161478 ENSGT00390000008676 ENSGT00730000110975 ENSGT00390000002627 ENSGT00940000154485.B ENSGT00940000155582 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 400 ENSMNEG00000038337 ABCC6 (ENSMNEG00000040358) ABCC1 (ENSMNEG00000033265) CEP20 (ENSMNEG00000016396) MYH11 (ENSMNEG00000039371) NDE1 (ENSMNEG00000041092) MARF1 (ENSMNEG00000045020) BMERB1 (ENSMNEG00000020708) ENSMNEG00000044381 ENSMNEG00000010183 PDXDC1 (ENSMNEG00000044575) NTAN1 (ENSMNEG00000035140) RRN3 (ENSMNEG00000031979) ENSMNEG00000036261 ENSMNEG00000031838 ENSMNEG00000042918 #22 ENSMNEG00000031946 PLA2G10 (ENSMNEG00000039283) BFAR (ENSMNEG00000043366) PARN (ENSMNEG00000045108) ENSMNEG00000036374 ENSMNEG00000040007 MRTFB (ENSMNEG00000039623) ERCC4 (ENSMNEG00000036211) ENSMNEG00000014276 SHISA9 (ENSMNEG00000043617) CPPED1 (ENSMNEG00000036188) SNX29 (ENSMNEG00000036610) TNFRSF17 (ENSMNEG00000030225) ENSMNEG00000045158 GSPT1 (ENSMNEG00000032993) Tarsier MODERN SPECIES 6357 UBE3A (ENSTSYG00000013589) #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000154712 ENSGT00940000162306 ENSGT00940000163050 ENSGT00940000164787 ENSGT00390000000306 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 Mouse lemur MODERN SPECIES 31 ENSMICG00000045619 ARRDC4 (ENSMICG00000037963) NR2F2 (ENSMICG00000035561) ENSMICG00000016758 RGMA (ENSMICG00000026641) CHD2 (ENSMICG00000000332) FAM174B (ENSMICG00000046366) ENSMICG00000044575 OCA2 (ENSMICG00000000034) ENSMICG00000027022 GABRG3 (ENSMICG00000000033) GABRA5 (ENSMICG00000000032) GABRB3 (ENSMICG00000027069) ATP10A (ENSMICG00000001113) ENSMICG00000037691 UBE3A (ENSMICG00000027572) #22 FAM135B (ENSMICG00000005212) COL22A1 (ENSMICG00000005224) KCNK9 (ENSMICG00000004397) ENSMICG00000037374 ENSMICG00000045662 TRAPPC9 (ENSMICG00000004399) CHRAC1 (ENSMICG00000042491) AGO2 (ENSMICG00000004427) PTK2 (ENSMICG00000004440) DENND3 (ENSMICG00000010407) SLC45A4 (ENSMICG00000010421) PTP4A3 (ENSMICG00000030190) MROH5 (ENSMICG00000028942) C8orf90 (ENSMICG00000047940) TSNARE1 (ENSMICG00000000568) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000154712 ENSGT00940000162306 ENSGT00940000163050 ENSGT00940000164787 ENSGT00390000000306 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 398 ENSPCOG00000015651 ENSPCOG00000021340 ZNF250 (ENSPCOG00000017191) ZNF16 (ENSPCOG00000024153) C8orf33 (ENSPCOG00000020794) TUBGCP5 (ENSPCOG00000023426) CYFIP1 (ENSPCOG00000014944) NIPA2 (ENSPCOG00000017066) NIPA1 (ENSPCOG00000016963) HERC2 (ENSPCOG00000014423) OCA2 (ENSPCOG00000024905) GABRG3 (ENSPCOG00000026126) GABRA5 (ENSPCOG00000028781) GABRB3 (ENSPCOG00000023664) ATP10A (ENSPCOG00000004623) UBE3A (ENSPCOG00000020517) #22 ENSPCOG00000024073 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1101 CYFIP1 (ENSPSMG00000006271) NIPA2 (ENSPSMG00000005989) NIPA1 (ENSPSMG00000005963) ENSPSMG00000005949 HERC2 (ENSPSMG00000005697) OCA2 (ENSPSMG00000005438) GABRG3 (ENSPSMG00000005427) GABRA5 (ENSPSMG00000005407) GABRB3 (ENSPSMG00000005228) ATP10A (ENSPSMG00000005097) UBE3A (ENSPSMG00000005061) #22 Bushbaby MODERN SPECIES 285 TUBGCP5 (ENSOGAG00000014141) CYFIP1 (ENSOGAG00000013728) NIPA2 (ENSOGAG00000013744) NIPA1 (ENSOGAG00000002200) HERC2 (ENSOGAG00000000178) OCA2 (ENSOGAG00000000074) ENSOGAG00000009173 ENSOGAG00000029540 GABRA5 (ENSOGAG00000000699) GABRB3 (ENSOGAG00000000698) ENSOGAG00000029052 ENSOGAG00000008588 ENSOGAG00000024833 UBE3A (ENSOGAG00000017107) #22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00950000185579 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 ENSGT00530000063335.A Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00940000164524 ENSGT00940000155052.e.b.b ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00950000185579 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00940000164524 ENSGT00940000155052.e.b.b ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00980000199886 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 Suina ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000156205 ENSGT00940000160583 ENSGT00940000158773 ENSGT01030000234515.a.b.a.b ENSGT00390000001790 ENSGT00940000158068 ENSGT00900000143686 ENSGT00940000158815 ENSGT00940000160363 ENSGT01050000244857.C.a.a ENSGT00390000015688 ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000185118 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 ENSGT00530000063335.A ENSGT00940000155164 Chacoan peccary MODERN SPECIES 160 MEF2A (ENSCWAG00000009911) LYSMD4 (ENSCWAG00000009871) ADAMTS17 (ENSCWAG00000009807) CERS3 (ENSCWAG00000009754) ENSCWAG00000009711 ASB7 (ENSCWAG00000009674) ALDH1A3 (ENSCWAG00000009539) LRRK1 (ENSCWAG00000009332) CHSY1 (ENSCWAG00000009271) SELENOS (ENSCWAG00000009194) GABRG3 (ENSCWAG00000009036) GABRA5 (ENSCWAG00000008932) GABRB3 (ENSCWAG00000008459) ATP10A (ENSCWAG00000008228) UBE3A (ENSCWAG00000008186) #22 Pig MODERN SPECIES ENSSSCG00000056799 CERS3 (ENSSSCG00000004819) LINS1 (ENSSSCG00000004820) ASB7 (ENSSSCG00000004821) ENSSSCG00000038358 ALDH1A3 (ENSSSCG00000004822) LRRK1 (ENSSSCG00000004823) CHSY1 (ENSSSCG00000004825) SELENOS (ENSSSCG00000004826) GABRG3 (ENSSSCG00000035584) GABRA5 (ENSSSCG00000004827) GABRB3 (ENSSSCG00000038547) ENSSSCG00000043519 ENSSSCG00000004830 ENSSSCG00000054906 UBE3A (ENSSSCG00000004832) #22 NDN (ENSSSCG00000004834) ENSSSCG00000004836 CHRNA7 (ENSSSCG00000004839) OTUD7A (ENSSSCG00000004840) KLF13 (ENSSSCG00000026006) TRPM1 (ENSSSCG00000004843) MTMR10 (ENSSSCG00000004844) FAN1 (ENSSSCG00000004845) MPHOSPH10 (ENSSSCG00000004847) MCEE (ENSSSCG00000035696) APBA2 (ENSSSCG00000004849) ENTREP2 (ENSSSCG00000004850) TJP1 (ENSSSCG00000004854) ENSSSCG00000033540 TARS3 (ENSSSCG00000005781) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00940000164524 ENSGT00940000155052.e.b.b ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00980000199886 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156205 ENSGT00940000160583 ENSGT00940000158773 ENSGT01030000234515.a.b.a.b ENSGT00390000001790 ENSGT00940000158068 ENSGT00900000143686 ENSGT00940000158815 ENSGT00940000160363 ENSGT01050000244857.C.a.a ENSGT00390000015688 ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00940000164524 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000159819 ENSGT00940000157737 ENSGT00940000160977 ENSGT00940000157327 ENSGT00950000182989.A ENSGT00940000160380 ENSGT00940000155707 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157771 ENSGT00940000156205 ENSGT00940000160583 ENSGT00940000158773 ENSGT01030000234515.a.b.a.b ENSGT00390000001790 ENSGT00940000158068 ENSGT00940000158815 ENSGT00940000160363 ENSGT01050000244857.C.a.a ENSGT00390000015688 ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f.a ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320.ab.a ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.a ENSGT00940000158999 ENSGT00940000159819 ENSGT00940000157737 ENSGT00940000160977 ENSGT00940000157327 ENSGT00950000182989.A ENSGT00940000160380 ENSGT00940000155707 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157771 ENSGT00940000156205 ENSGT00940000160583 ENSGT00940000158773 ENSGT01030000234515.a.b.a.b ENSGT00390000001790 ENSGT00940000158068 ENSGT00940000158815 ENSGT00940000160363 ENSGT01050000244857.C.a.a ENSGT00390000015688 ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f.a ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320.ab.a.a ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.a ENSGT00940000158999 ENSGT00940000159819 ENSGT00940000157737 ENSGT00940000160977 ENSGT00940000157327 ENSGT00950000182989.A ENSGT00940000160380 ENSGT00940000155707 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157771 ENSGT00940000156205 ENSGT00940000160583 ENSGT00940000158773 ENSGT01030000234515.a.b.a.b ENSGT00390000001790 ENSGT00940000158068 ENSGT00940000158815 ENSGT00940000160363 ENSGT01050000244857.C.a.a ENSGT00390000015688 ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f.a ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320.ab.a.a ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.a ENSGT00940000158999 ENSGT00940000159819 ENSGT00940000157737 ENSGT00940000160977 ENSGT00940000157327 ENSGT00950000182989.A ENSGT00940000160380 ENSGT00940000155707 Dolphin MODERN SPECIES 6515 UBE3A (ENSTTRG00000005991) #22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157771 ENSGT00940000156205 ENSGT00940000160583 ENSGT00940000158773 ENSGT01030000234515.a.b.a.b ENSGT00390000001790 ENSGT00940000158068 ENSGT00940000158815 ENSGT00940000160363 ENSGT01050000244857.C.a.a ENSGT00390000015688 ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f.a ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320.ab.a.a ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.a ENSGT00940000158999 ENSGT00940000159819 ENSGT00940000157737 ENSGT00940000160977 ENSGT00940000157327 ENSGT00950000182989.A ENSGT00940000160380 ENSGT00940000155707 Vaquita MODERN SPECIES 11 LRRC28 (ENSPSNG00000006850) MEF2A (ENSPSNG00000006923) LYSMD4 (ENSPSNG00000007014) ADAMTS17 (ENSPSNG00000007060) CERS3 (ENSPSNG00000007138) LINS1 (ENSPSNG00000007209) ASB7 (ENSPSNG00000007278) ALDH1A3 (ENSPSNG00000007352) LRRK1 (ENSPSNG00000007511) CHSY1 (ENSPSNG00000007562) SELENOS (ENSPSNG00000007584) GABRG3 (ENSPSNG00000007646) ENSPSNG00000007765 GABRB3 (ENSPSNG00000007853) ATP10A (ENSPSNG00000008042) UBE3A (ENSPSNG00000008097) #22 SNRPN (ENSPSNG00000008506) ENSPSNG00000008608 NDN (ENSPSNG00000008660) MAGEL2 (ENSPSNG00000008680) CHRNA7 (ENSPSNG00000008735) ENSPSNG00000000081 OTUD7A (ENSPSNG00000000112) ADAMTS7 (ENSPSNG00000000139) TBC1D2B (ENSPSNG00000000215) SH2D7 (ENSPSNG00000000331) CIB2 (ENSPSNG00000000462) IDH3A (ENSPSNG00000000494) ENSPSNG00000000531 ACSBG1 (ENSPSNG00000000557) DNAJA4 (ENSPSNG00000000584) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000157771 ENSGT00940000156205 ENSGT00940000160583 ENSGT00940000158773 ENSGT01030000234515.a.b.a.b ENSGT00390000001790 ENSGT00940000158068 ENSGT00940000158815 ENSGT00940000160363 ENSGT01050000244857.C.a.a ENSGT00390000015688 ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f.a ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320.ab.a.a Beluga whale MODERN SPECIES 52 LRRC28 (ENSDLEG00000006888) MEF2A (ENSDLEG00000006900) LYSMD4 (ENSDLEG00000006906) ADAMTS17 (ENSDLEG00000006922) CERS3 (ENSDLEG00000006971) LINS1 (ENSDLEG00000006980) ASB7 (ENSDLEG00000006990) ALDH1A3 (ENSDLEG00000006994) LRRK1 (ENSDLEG00000007002) CHSY1 (ENSDLEG00000007027) SELENOS (ENSDLEG00000007037) GABRG3 (ENSDLEG00000007042) GABRA5 (ENSDLEG00000007067) GABRB3 (ENSDLEG00000007078) ATP10A (ENSDLEG00000007092) UBE3A (ENSDLEG00000007113) #22 SNRPN (ENSDLEG00000014174) ENSDLEG00000014207 Narwhal MODERN SPECIES 308 MEF2A (ENSMMNG00015011012) LYSMD4 (ENSMMNG00015011058) ADAMTS17 (ENSMMNG00015011079) CERS3 (ENSMMNG00015011108) LINS1 (ENSMMNG00015011141) ASB7 (ENSMMNG00015011178) ALDH1A3 (ENSMMNG00015011205) LRRK1 (ENSMMNG00015011239) CHSY1 (ENSMMNG00015011277) SELENOS (ENSMMNG00015011300) GABRG3 (ENSMMNG00015011324) ENSMMNG00015011346 GABRB3 (ENSMMNG00015011375) ENSMMNG00015011410 ENSMMNG00015011428 UBE3A (ENSMMNG00015011456) #22 SNRPN (ENSMMNG00015011647) ENSMMNG00015011671 ENSMMNG00015011691 ENSMMNG00015011700 NDN (ENSMMNG00015011707) ENSMMNG00015011717 ENSMMNG00015011744 DMXL2 (ENSMMNG00015011788) SCG3 (ENSMMNG00015011814) LYSMD2 (ENSMMNG00015011833) TMOD2 (ENSMMNG00015011849) TMOD3 (ENSMMNG00015011880) ENSMMNG00015011900 LEO1 (ENSMMNG00015011924) ENSMMNG00015011949 Sperm whale MODERN SPECIES 2 MEF2A (ENSPCTG00005011471) LYSMD4 (ENSPCTG00005011348) ADAMTS17 (ENSPCTG00005011170) CERS3 (ENSPCTG00005011060) LINS1 (ENSPCTG00005010944) ASB7 (ENSPCTG00005010877) ALDH1A3 (ENSPCTG00005010651) LRRK1 (ENSPCTG00005010536) ENSPCTG00005010476 CHSY1 (ENSPCTG00005010429) SELENOS (ENSPCTG00005010343) GABRG3 (ENSPCTG00005010080) GABRA5 (ENSPCTG00005010049) GABRB3 (ENSPCTG00005009807) ATP10A (ENSPCTG00005009469) UBE3A (ENSPCTG00005009396) #22 SNRPN (ENSPCTG00005008845) SNURF (ENSPCTG00005008825) NDN (ENSPCTG00005008795) MAGEL2 (ENSPCTG00005008775) ENSPCTG00005008735 CHRNA7 (ENSPCTG00005008463) ENSPCTG00005020947 OTUD7A (ENSPCTG00005020891) ADAMTS7 (ENSPCTG00005020874) TBC1D2B (ENSPCTG00005020842) SH2D7 (ENSPCTG00005020794) CIB2 (ENSPCTG00005020750) IDH3A (ENSPCTG00005020703) ACSBG1 (ENSPCTG00005020568) DNAJA4 (ENSPCTG00005020540) Blue whale MODERN SPECIES 11 ADAMTS17 (ENSBMSG00010007680) CERS3 (ENSBMSG00010007841) LINS1 (ENSBMSG00010007852) ASB7 (ENSBMSG00010007863) ENSBMSG00010007868 ALDH1A3 (ENSBMSG00010007886) LRRK1 (ENSBMSG00010007999) CHSY1 (ENSBMSG00010008026) SELENOS (ENSBMSG00010008057) GABRG3 (ENSBMSG00010008082) ENSBMSG00010008110 GABRB3 (ENSBMSG00010008145) ENSBMSG00010008226 ENSBMSG00010008236 ATP10A (ENSBMSG00010008266) UBE3A (ENSBMSG00010008323) #22 SNRPN (ENSBMSG00010008520) NDN (ENSBMSG00010008546) MAGEL2 (ENSBMSG00010008554) ENSBMSG00010008562 CHRNA7 (ENSBMSG00010008603) ENSBMSG00010008876 ENSBMSG00010008883 OTUD7A (ENSBMSG00010013492) TBC1D2B (ENSBMSG00010013515) SH2D7 (ENSBMSG00010013535) CIB2 (ENSBMSG00010013559) IDH3A (ENSBMSG00010013586) ENSBMSG00010013604 ACSBG1 (ENSBMSG00010013627) DNAJA4 (ENSBMSG00010013663) Pecora ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158773 ENSGT01030000234515.a.b.a.b ENSGT00390000001790 ENSGT00940000158068 ENSGT00900000143686 ENSGT00940000158815 ENSGT00940000160363 ENSGT00390000018141.i.a.b.b.b.b ENSGT01100000263481.n.a.b.b ENSGT01050000244857.C.a.a ENSGT00390000015688 ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000164524 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b Yarkand deer MODERN SPECIES 4 CERS3 (ENSCHYG00000006461) LINS1 (ENSCHYG00000006425) ASB7 (ENSCHYG00000006398) ENSCHYG00000006386 ALDH1A3 (ENSCHYG00000006301) LRRK1 (ENSCHYG00000005930) CHSY1 (ENSCHYG00000005857) SELENOS (ENSCHYG00000005762) GABRG3 (ENSCHYG00000005703) GABRA5 (ENSCHYG00000005654) ENSCHYG00000005633 GABRB3 (ENSCHYG00000005619) ENSCHYG00000005608 ENSCHYG00000005590 ENSCHYG00000005530 UBE3A (ENSCHYG00000005478) #22 SNRPN (ENSCHYG00000005196) SNURF (ENSCHYG00000005159) NDN (ENSCHYG00000005128) MAGEL2 (ENSCHYG00000005117) MKRN3 (ENSCHYG00000005104) Percora_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158773 ENSGT01030000234515.a.b.a.b ENSGT00390000001790 ENSGT00940000158068 ENSGT00900000143686 ENSGT00940000158815 ENSGT00940000160363 ENSGT00390000018141.i.a.b.b.b.b ENSGT01100000263481.n.a.b.b ENSGT01050000244857.C.a.a ENSGT00390000015688 ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000164524 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b Bovidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158773 ENSGT01030000234515.a.b.a.b ENSGT00390000001790 ENSGT00940000158068 ENSGT00900000143686 ENSGT00940000158815 ENSGT00940000160363 ENSGT00390000018141.i.a.b.b.b.b ENSGT01100000263481.n.a.b.b ENSGT01050000244857.C.a.a ENSGT00390000015688 ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000164524 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320.y ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b Bovinae ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000160583 ENSGT00940000158773 ENSGT01030000234515.a.b.a.b ENSGT00390000001790 ENSGT00940000158068 ENSGT00900000143686 ENSGT00940000158815 ENSGT00940000160363 ENSGT01050000244857.C.a.a ENSGT00390000015688 ENSGT00390000009588.pb.a.a.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320.y ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b Bos ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000183841.a ENSGT01030000234515.a.b.a.b ENSGT00390000001790 ENSGT00940000158068 ENSGT00900000143686 ENSGT00940000158815 ENSGT00940000160363 ENSGT01100000263481.n.a.b.b.a.b.b.a.a.a.a.a ENSGT01050000244857.C.a.a ENSGT00390000015688 ENSGT00390000009588.pb.a.a.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320.y ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000185118 ENSGT00940000162296.`b.a.a ENSGT00940000161491.d.j ENSGT00940000166360 ENSGT00940000161491.d.i ENSGT00940000162793.j ENSGT00940000163076 ENSGT00940000161516 ENSGT00390000003866.a.b ENSGT00390000011474 ENSGT00940000162342 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 79 ENSGT01030000234515.a.b.a.b ENSGT00390000001790 ENSGT00940000158068 ENSGT00900000143686 ENSGT00940000158815 ENSGT00940000160363 ENSGT01050000244857.C.a.a ENSGT00390000015688 ENSGT00390000009588.pb.a.a.b.a ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.e.a ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000156234.e.b ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 Wild yak MODERN SPECIES 339 ENSBMUG00000025198 GABRB3 (ENSBMUG00000025193) ENSBMUG00000025185 ENSBMUG00000025181 ATP10A (ENSBMUG00000025051) UBE3A (ENSBMUG00000024523) #22 Domestic yak MODERN SPECIES 8 LINS1 (ENSBGRG00000004716) ASB7 (ENSBGRG00000004639) ENSBGRG00000004632 ALDH1A3 (ENSBGRG00000004521) LRRK1 (ENSBGRG00000004461) CHSY1 (ENSBGRG00000004426) SELENOS (ENSBGRG00000004321) ENSBGRG00000004294 ENSBGRG00000004250 GABRG3 (ENSBGRG00000004154) GABRA5 (ENSBGRG00000004069) ENSBGRG00000004040 GABRB3 (ENSBGRG00000003940) ENSBGRG00000003908 ATP10A (ENSBGRG00000003850) UBE3A (ENSBGRG00000003821) #22 SNRPN (ENSBGRG00000023848) SNURF (ENSBGRG00000023752) ENSBGRG00000023739 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00950000183841.a ENSGT01030000234515.a.b.a.b ENSGT00390000001790 ENSGT00940000158068 ENSGT00900000143686 ENSGT00940000158815 ENSGT00940000160363 ENSGT01100000263481.n.a.b.b.a.b.b.a.a.a.a.a ENSGT01050000244857.C.a.a ENSGT00390000015688 ENSGT00390000009588.pb.a.a.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320.y ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 13 LINS1 (ENSBIXG00005006486) ASB7 (ENSBIXG00005024255) ENSBIXG00005024290 ALDH1A3 (ENSBIXG00005024423) LRRK1 (ENSBIXG00005006062) ENSBIXG00005006488 CHSY1 (ENSBIXG00005024627) SELENOS (ENSBIXG00005024692) ENSBIXG00005024736 GABRG3 (ENSBIXG00005004245) GABRA5 (ENSBIXG00005024931) ENSBIXG00005024946 GABRB3 (ENSBIXG00005025037) ENSBIXG00005025106 ATP10A (ENSBIXG00005004289) UBE3A (ENSBIXG00005025325) #22 ENSBIXG00005004309 ENSBIXG00005025579 SNRPN (ENSBIXG00005025666) NDN (ENSBIXG00005025694) MAGEL2 (ENSBIXG00005025699) MKRN3 (ENSBIXG00005025714) ENSBIXG00005025731 ENSBIXG00005025915 Cow MODERN SPECIES 13 CERS3 (ENSBTAG00000006987) LINS1 (ENSBTAG00000016495) ASB7 (ENSBTAG00000010514) ENSBTAG00000048684 ALDH1A3 (ENSBTAG00000009125) LRRK1 (ENSBTAG00000001567) CHSY1 (ENSBTAG00000007357) SELENOS (ENSBTAG00000000640) ENSBTAG00000034398 GABRG3 (ENSBTAG00000052298) ENSBTAG00000035184 ENSBTAG00000051536 GABRA5 (ENSBTAG00000003392) GABRB3 (ENSBTAG00000013422) ATP10A (ENSBTAG00000027081) UBE3A (ENSBTAG00000002487) #22 SNRPN (ENSBTAG00000008251) NDN (ENSBTAG00000002186) MAGEL2 (ENSBTAG00000045998) MKRN3 (ENSBTAG00000053916) ENSBTAG00000053635 ENSBTAG00000050088 ENSBTAG00000054133 ENSBTAG00000048268 ENSBTAG00000051425 ENSBTAG00000046161 ENSBTAG00000051010 ENSBTAG00000024041 ENSBTAG00000053508 ENSBTAG00000048048 ENSBTAG00000054702 American bison MODERN SPECIES 2702 UBE3A (ENSBBBG00000000748) #22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000156205 ENSGT00940000160583 ENSGT00940000158773 ENSGT01030000234515.a.b.a.b ENSGT00390000001790 ENSGT00940000158068 ENSGT00900000143686 ENSGT00940000158815 ENSGT00940000160363 ENSGT01050000244857.C.a.a ENSGT00390000015688.a ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000164524 ENSGT00390000009320.y ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320.z ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b Goat MODERN SPECIES 13 CERS3 (ENSCHIG00000025546) LINS1 (ENSCHIG00000009033) ASB7 (ENSCHIG00000009823) ALDH1A3 (ENSCHIG00000020729) LRRK1 (ENSCHIG00000024029) CHSY1 (ENSCHIG00000026238) ENSCHIG00000023492 ENSCHIG00000023151 GABRG3 (ENSCHIG00000024578) ENSCHIG00000014564 GABRA5 (ENSCHIG00000023746) GABRB3 (ENSCHIG00000021468) ENSCHIG00000022386 ATP10A (ENSCHIG00000007182) ENSCHIG00000017789 UBE3A (ENSCHIG00000017576) #22 ENSCHIG00000008148 SNRPN (ENSCHIG00000017477) ENSCHIG00000022019 ENSCHIG00000009017 NDN (ENSCHIG00000008761) MAGEL2 (ENSCHIG00000007827) MKRN3 (ENSCHIG00000020847) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 9 ADAMTS17 (ENSOARG00020004620) CERS3 (ENSOARG00020004593) ASB7 (ENSOARG00020004526) ENSOARG00020004515 ALDH1A3 (ENSOARG00020004379) LRRK1 (ENSOARG00020003980) ENSOARG00020003929 ENSOARG00020003892 ENSOARG00020003880 GABRG3 (ENSOARG00020003804) GABRA5 (ENSOARG00020003769) GABRB3 (ENSOARG00020003644) ENSOARG00020003603 RPS25 (ENSOARG00020003579) ATP10A (ENSOARG00020003485) UBE3A (ENSOARG00020003405) #22 SNURF (ENSOARG00020008154) SNRPN (ENSOARG00020008056) NDN (ENSOARG00020008021) MAGEL2 (ENSOARG00020007998) Siberian musk deer MODERN SPECIES 1280 ENSMMSG00000014596 ENSMMSG00000014606 GABRG3 (ENSMMSG00000014628) GABRA5 (ENSMMSG00000014688) ENSMMSG00000014705 GABRB3 (ENSMMSG00000014731) ATP10A (ENSMMSG00000014958) UBE3A (ENSMMSG00000015412) #22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00980000199886 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 Arabian camel MODERN SPECIES 19 GABRG3 (ENSCDRG00005021707) GABRA5 (ENSCDRG00005021710) GABRB3 (ENSCDRG00005021715) UBE3A (ENSCDRG00005021739) #22 SNRPN (ENSCDRG00005003687) ENSCDRG00005003847 ENSCDRG00005003861 ENSCDRG00005003879 NDN (ENSCDRG00005003906) MAGEL2 (ENSCDRG00005003920) MKRN3 (ENSCDRG00005003937) CHRNA7 (ENSCDRG00005003957) OTUD7A (ENSCDRG00005004081) ENSCDRG00005004122 ENSCDRG00005004149 TRPM1 (ENSCDRG00005004213) MTMR10 (ENSCDRG00005004648) FAN1 (ENSCDRG00005004716) MPHOSPH10 (ENSCDRG00005004863) Alpaca MODERN SPECIES 3636 UBE3A (ENSVPAG00000008317) #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000164524 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00950000185579 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000013422 ENSGT00940000156738 ENSGT00390000014815 ENSGT00390000013049 ENSGT00940000155357 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000164524 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00950000185579 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a Caniformia ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000153731.a.b ENSGT00390000013422 ENSGT00940000156738 ENSGT00390000013049 ENSGT00940000155357 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000164524 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00950000185579 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156738 ENSGT00950000182922.a.a.a.b.b.a.b ENSGT00390000013049 ENSGT00940000155357 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.e.a ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000164524 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.e.a ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000164524 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320.gb ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000185118 ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 Ursus ANCESTRAL SPECIES 232 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.e.a ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000164524 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320.gb Polar bear MODERN SPECIES 287 CYFIP1 (ENSUMAG00000025644) NIPA2 (ENSUMAG00000025643) NIPA1 (ENSUMAG00000025642) ENSUMAG00000025641 HERC2 (ENSUMAG00000025640) OCA2 (ENSUMAG00000025620) ENSUMAG00000025618 GABRA5 (ENSUMAG00000025617) GABRB3 (ENSUMAG00000025615) ATP10A (ENSUMAG00000025614) UBE3A (ENSUMAG00000025613) #22 ENSUMAG00000025590 SNRPN (ENSUMAG00000025589) ENSUMAG00000025588 ENSUMAG00000025587 ADAM18 (ENSUMAG00000025586) ENSUMAG00000025585 ENSUMAG00000025584 IDO1 (ENSUMAG00000025583) IDO2 (ENSUMAG00000025582) TCIM (ENSUMAG00000025579) ZMAT4 (ENSUMAG00000025578) SFRP1 (ENSUMAG00000025577) GOLGA7 (ENSUMAG00000025576) GINS4 (ENSUMAG00000025575) GPAT4 (ENSUMAG00000025574) Giant Panda MODERN SPECIES 19 PSTPIP1 (ENSAMEG00000009684) RCN2 (ENSAMEG00000009670) SCAPER (ENSAMEG00000008276) ISL2 (ENSAMEG00000008253) ENSAMEG00000008226 ENSAMEG00000008212 ENSAMEG00000013758 ENSAMEG00000013824 ENSAMEG00000013833 ENSAMEG00000003194 OCA2 (ENSAMEG00000011064) GABRG3 (ENSAMEG00000008228) GABRA5 (ENSAMEG00000005642) GABRB3 (ENSAMEG00000029320) ATP10A (ENSAMEG00000005927) UBE3A (ENSAMEG00000007071) #22 ENSAMEG00000024500 SNRPN (ENSAMEG00000007034) ENSAMEG00000007033 NDN (ENSAMEG00000012513) ENSAMEG00000018975 ENSAMEG00000012505 ENSAMEG00000024276 ENSAMEG00000023575 ENSAMEG00000019852 ENSAMEG00000028113 ENSAMEG00000026159 OTUD7A (ENSAMEG00000015494) ENSAMEG00000019549 TRPM1 (ENSAMEG00000015437) ENSAMEG00000015406 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 273 ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 Ferret MODERN SPECIES 511 ENSMPUG00000018998 ATP10A (ENSMPUG00000002413) UBE3A (ENSMPUG00000002419) #22 American mink MODERN SPECIES 724 UBE3A (ENSNVIG00000001264) #22 Canidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00950000185579 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 ENSGT00530000063335.A ENSGT00940000155164 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000155962.n ENSGT00940000155962.m ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000153341.b.p.a.b.b ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320.eb.b ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00390000013931.a.a.a.a.a ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00950000185579 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 Dingo MODERN SPECIES 138 ENSCAFG00020024810 HERC2 (ENSCAFG00020024243) ENSCAFG00020024206 ENSCAFG00020024204 ENSCAFG00020024203 OCA2 (ENSCAFG00020024200) GABRG3 (ENSCAFG00020024195) ENSCAFG00020024194 ENSCAFG00020024193 ENSCAFG00020024191 GABRA5 (ENSCAFG00020024190) GABRB3 (ENSCAFG00020024171) ENSCAFG00020024159 ATP10A (ENSCAFG00020024138) ENSCAFG00020024121 UBE3A (ENSCAFG00020024115) #22 ENSCAFG00020024089 SNRPN (ENSCAFG00020024075) ENSCAFG00020024072 ENSCAFG00020024067 NDN (ENSCAFG00020024065) MAGEL2 (ENSCAFG00020024064) MKRN3 (ENSCAFG00020024058) CHRNA7 (ENSCAFG00020024042) ENSCAFG00020024032 OTUD7A (ENSCAFG00020024024) KLF13 (ENSCAFG00020024015) ENSCAFG00020024010 ENSCAFG00020024007 TRPM1 (ENSCAFG00020023986) ENSCAFG00020023965 Dog MODERN SPECIES 22 ENSCAFG00845015830 ENSCAFG00845015855 CYFIP1 (ENSCAFG00845015950) NIPA2 (ENSCAFG00845016134) NIPA1 (ENSCAFG00845016196) ENSCAFG00845016369 ENSCAFG00845016648 OCA2 (ENSCAFG00845016997) GABRG3 (ENSCAFG00845017588) ENSCAFG00845017687 ENSCAFG00845017711 GABRA5 (ENSCAFG00845017763) GABRB3 (ENSCAFG00845018027) ENSCAFG00845018217 ATP10A (ENSCAFG00845018321) UBE3A (ENSCAFG00845018724) #22 ENSCAFG00845019038 SNRPN (ENSCAFG00845019483) NDN (ENSCAFG00845019721) MAGEL2 (ENSCAFG00845019742) ENSCAFG00845019755 ENSCAFG00845019775 CHRNA7 (ENSCAFG00845019829) ENSCAFG00845020142 OTUD7A (ENSCAFG00845020217) ENSCAFG00845020458 KLF13 (ENSCAFG00845020614) TRPM1 (ENSCAFG00845020749) MTMR10 (ENSCAFG00845021318) FAN1 (ENSCAFG00845021476) ENSCAFG00845021580 Red fox MODERN SPECIES 168 CYFIP1 (ENSVVUG00000003311) NIPA2 (ENSVVUG00000003342) ENSVVUG00000003349 ENSVVUG00000003371 HERC2 (ENSVVUG00000003553) ENSVVUG00000008538 OCA2 (ENSVVUG00000008559) GABRG3 (ENSVVUG00000008676) ENSVVUG00000008736 ENSVVUG00000008755 ENSVVUG00000008765 ENSVVUG00000008775 GABRA5 (ENSVVUG00000008787) GABRB3 (ENSVVUG00000008833) ATP10A (ENSVVUG00000008892) UBE3A (ENSVVUG00000009231) #22 Felidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000013422 ENSGT00940000156738 ENSGT00390000014815 ENSGT00390000013049 ENSGT00940000155357 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222.ib.a ENSGT00390000009320.bb ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 ENSGT00530000063335.A Panthera ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222.ib.a ENSGT00390000009320.bb ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 ENSGT00530000063335.A Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222.ib.a ENSGT00390000009320.bb ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359.c ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 ENSGT00530000063335.A leopard MODERN SPECIES 169 GABRB3 (ENSPPRG00000010864) UBE3A (ENSPPRG00000011347) #22 lion MODERN SPECIES 6 TSPAN3 (ENSPLOG00000001385) PSTPIP1 (ENSPLOG00000001330) RCN2 (ENSPLOG00000001296) SCAPER (ENSPLOG00000001194) ISL2 (ENSPLOG00000001152) ENSPLOG00000001139 ENSPLOG00000001117 NIPA1 (ENSPLOG00000001098) HERC2 (ENSPLOG00000000757) ENSPLOG00000000571 OCA2 (ENSPLOG00000000481) GABRG3 (ENSPLOG00000003969) GABRA5 (ENSPLOG00000003906) GABRB3 (ENSPLOG00000003854) ATP10A (ENSPLOG00000003795) UBE3A (ENSPLOG00000003739) #22 ENSPLOG00000003486 ENSPLOG00000003479 ENSPLOG00000003472 NDN (ENSPLOG00000003466) ENSPLOG00000003460 MKRN3 (ENSPLOG00000003450) CHRNA7 (ENSPLOG00000003375) OTUD7A (ENSPLOG00000003320) KLF13 (ENSPLOG00000003239) TRPM1 (ENSPLOG00000002947) MTMR10 (ENSPLOG00000002797) FAN1 (ENSPLOG00000002745) ENSPLOG00000002717 MCEE (ENSPLOG00000002632) APBA2 (ENSPLOG00000002596) Tiger MODERN SPECIES 595 TUBGCP5 (ENSPTIG00000013783) CYFIP1 (ENSPTIG00000014853) NIPA2 (ENSPTIG00000016097) NIPA1 (ENSPTIG00000016838) OCA2 (ENSPTIG00000005972) ENSPTIG00000003033 GABRG3 (ENSPTIG00000009186) ENSPTIG00000009355 GABRA5 (ENSPTIG00000009576) GABRB3 (ENSPTIG00000010776) ATP10A (ENSPTIG00000011203) UBE3A (ENSPTIG00000016119) #22 SNRPN (ENSPTIG00000004537) SNURF (ENSPTIG00000007167) NDN (ENSPTIG00000003866) ENSPTIG00000003893 Cat MODERN SPECIES 237 ETFA (ENSFCAG00000006109) TMEM266 (ENSFCAG00000014963) FBXO22 (ENSFCAG00000013095) UBE2Q2 (ENSFCAG00000023643) TUBGCP5 (ENSFCAG00000004965) CYFIP1 (ENSFCAG00000013166) NIPA2 (ENSFCAG00000037405) NIPA1 (ENSFCAG00000013033) HERC2 (ENSFCAG00000000154) ENSFCAG00000045123 OCA2 (ENSFCAG00000000153) GABRG3 (ENSFCAG00000023805) GABRA5 (ENSFCAG00000011946) GABRB3 (ENSFCAG00000027541) ATP10A (ENSFCAG00000031462) UBE3A (ENSFCAG00000027111) #22 ENSFCAG00000022298 SNURF (ENSFCAG00000022807) NDN (ENSFCAG00000010586) MAGEL2 (ENSFCAG00000025882) MKRN3 (ENSFCAG00000009688) CHRNA7 (ENSFCAG00000036300) OTUD7A (ENSFCAG00000011528) KLF13 (ENSFCAG00000028152) TRPM1 (ENSFCAG00000003436) MTMR10 (ENSFCAG00000003271) FAN1 (ENSFCAG00000005498) ENSFCAG00000052273 MPHOSPH10 (ENSFCAG00000026780) MCEE (ENSFCAG00000038444) APBA2 (ENSFCAG00000008067) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000164524 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000164524 ENSGT00940000158222 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 ENSGT00530000063335.A Megabat MODERN SPECIES 4753 UBE3A (ENSPVAG00000000826) #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000164524 ENSGT00940000158222 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00950000183077.a.a.a.b ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 ENSGT00530000063335.A Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 20 TUBGCP5 (ENSRFEG00010015024) CYFIP1 (ENSRFEG00010014901) NIPA2 (ENSRFEG00010014698) NIPA1 (ENSRFEG00010014670) HERC2 (ENSRFEG00010014426) OCA2 (ENSRFEG00010014378) GABRG3 (ENSRFEG00010014205) GABRA5 (ENSRFEG00010014136) GABRB3 (ENSRFEG00010013851) ATP10A (ENSRFEG00010013800) UBE3A (ENSRFEG00010013693) #22 ENSRFEG00010018728 SNRPN (ENSRFEG00010018624) NDN (ENSRFEG00010018594) MAGEL2 (ENSRFEG00010018582) MKRN3 (ENSRFEG00010018503) ENSRFEG00010018465 CHRNA7 (ENSRFEG00010018290) OTUD7A (ENSRFEG00010018255) KLF13 (ENSRFEG00010018216) TRPM1 (ENSRFEG00010017381) MTMR10 (ENSRFEG00010017311) FAN1 (ENSRFEG00010016986) MPHOSPH10 (ENSRFEG00010016930) MCEE (ENSRFEG00010016873) APBA2 (ENSRFEG00010016756) Microbat MODERN SPECIES 1901 UBE3A (ENSMLUG00000003428) #22 Equus ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000017791 ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000160833 ENSGT00390000008646 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b.s ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234.f ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158222 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163084 ENSGT00940000163006 ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000158999 ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359 ENSGT00940000153941.a.a ENSGT00940000158943 ENSGT00530000063335.A ENSGT00940000155164 Horse MODERN SPECIES FAH (ENSECAG00000000939) ENSECAG00000050880 ENSECAG00000030808 TUBGCP5 (ENSECAG00000005538) CYFIP1 (ENSECAG00000012143) NIPA2 (ENSECAG00000006379) NIPA1 (ENSECAG00000045195) ENSECAG00000056944 HERC2 (ENSECAG00000017677) OCA2 (ENSECAG00000009637) ENSECAG00000057600 GABRG3 (ENSECAG00000018053) GABRA5 (ENSECAG00000005559) GABRB3 (ENSECAG00000022463) ATP10A (ENSECAG00000014732) UBE3A (ENSECAG00000004792) #22 SNRPN (ENSECAG00000018148) SNURF (ENSECAG00000051267) NDN (ENSECAG00000001491) MAGEL2 (ENSECAG00000013555) ENSECAG00000001383 CHRNA7 (ENSECAG00000024757) OTUD7A (ENSECAG00000022071) ENSECAG00000028882 KLF13 (ENSECAG00000029677) TRPM1 (ENSECAG00000007539) MTMR10 (ENSECAG00000013765) FAN1 (ENSECAG00000010387) MPHOSPH10 (ENSECAG00000005944) MCEE (ENSECAG00000005917) APBA2 (ENSECAG00000015516) Donkey MODERN SPECIES 11 ZFAND6 (ENSEASG00005015479) ENSEASG00005015478 ENSEASG00005007587 ENSEASG00005029858 ENSEASG00005027255 ENSEASG00005037472 ENSEASG00005037357 ENSEASG00005020895 ENSEASG00005034104 ENSEASG00005020256 OCA2 (ENSEASG00005019895) GABRG3 (ENSEASG00005019878) GABRA5 (ENSEASG00005019875) GABRB3 (ENSEASG00005019874) ATP10A (ENSEASG00005019831) UBE3A (ENSEASG00005019815) #22 SNRPN (ENSEASG00005017871) SNURF (ENSEASG00005017866) ENSEASG00005023766 ENSEASG00005028965 ENSEASG00005024022 ENSEASG00005017852 OTUD7A (ENSEASG00005017841) KLF13 (ENSEASG00005017839) TRPM1 (ENSEASG00005017807) ENSEASG00005017788 ENSEASG00005017777 ENSEASG00005017746 ENSEASG00005017743 ENSEASG00005017737 ENSEASG00005017731 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155050 #22 Hedgehog MODERN SPECIES 1599 UBE3A (ENSEEUG00000002179) #22 Common shrew MODERN SPECIES 11221 UBE3A (ENSSARG00000006496) #22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 160 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.gb.b ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155050 #22 Sloth MODERN SPECIES 1339 UBE3A (ENSCHOG00000008012) #22 Armadillo MODERN SPECIES 352 UBE3A (ENSDNOG00000035914) #22 ENSDNOG00000031087 ENSDNOG00000048926 SNRPN (ENSDNOG00000037060) SNURF (ENSDNOG00000031630) Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 198 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.gb.b ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 197 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.gb.b ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 Elephant MODERN SPECIES 625 TUBGCP5 (ENSLAFG00000025550) CYFIP1 (ENSLAFG00000008868) NIPA2 (ENSLAFG00000008874) NIPA1 (ENSLAFG00000008877) HERC2 (ENSLAFG00000004263) OCA2 (ENSLAFG00000014303) GABRG3 (ENSLAFG00000008910) GABRA5 (ENSLAFG00000002547) GABRB3 (ENSLAFG00000001994) ATP10A (ENSLAFG00000013254) UBE3A (ENSLAFG00000012139) #22 Hyrax MODERN SPECIES 1219 UBE3A (ENSPCAG00000008958) #22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000157240.l ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237 ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00390000016769 ENSGT00390000017614.i ENSGT00390000017614.j ENSGT00390000015645 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000157240.l ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00950000182994.A.n.a.f ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.nb.a ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000164275.b ENSGT00940000164275.a ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00390000016769 ENSGT00390000017614.i Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000157240.l ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00950000182994.A.n.a.f ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.nb.a ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000164275.b ENSGT00940000164275.a ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00390000016769 ENSGT00390000017614.i Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000157240.l ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00950000182994.A.n.a.f ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.nb.a ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000164275.b ENSGT00940000164275.a ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00390000016769 ENSGT00390000017614.i Common wonbat MODERN SPECIES 730 HERC2 (ENSVURG00010009925) OCA2 (ENSVURG00010010056) GABRG3 (ENSVURG00010010096) GABRA5 (ENSVURG00010010106) GABRB3 (ENSVURG00010010127) ENSVURG00010010305 ATP10A (ENSVURG00010010318) UBE3A (ENSVURG00010010345) #22 CNGA3 (ENSVURG00010010358) ENSVURG00010010372 ENSVURG00010010382 ENSVURG00010010402 TMEM131 (ENSVURG00010010444) ENSVURG00010010506 ENSVURG00010010512 ENSVURG00010010522 INPP4A (ENSVURG00010010550) COA5 (ENSVURG00010010661) UNC50 (ENSVURG00010010666) MGAT4A (ENSVURG00010010693) ENSVURG00010010828 TSGA10 (ENSVURG00010010856) LIPT1 (ENSVURG00010010871) koala MODERN SPECIES 48 CYFIP1 (ENSPCIG00000016599) ENSPCIG00000016607 NIPA2 (ENSPCIG00000016610) NIPA1 (ENSPCIG00000016615) ENSPCIG00000016620 HERC2 (ENSPCIG00000016796) ENSPCIG00000017594 OCA2 (ENSPCIG00000017601) ENSPCIG00000017616 ENSPCIG00000003017 ENSPCIG00000036865 GABRA5 (ENSPCIG00000019209) GABRB3 (ENSPCIG00000015449) ENSPCIG00000025219 ATP10A (ENSPCIG00000025217) UBE3A (ENSPCIG00000006746) #22 CNGA3 (ENSPCIG00000006747) ENSPCIG00000006751 TMEM131 (ENSPCIG00000006758) ENSPCIG00000006766 INPP4A (ENSPCIG00000006811) COA5 (ENSPCIG00000010301) UNC50 (ENSPCIG00000010302) MGAT4A (ENSPCIG00000010309) ENSPCIG00000011545 TSGA10 (ENSPCIG00000011547) LIPT1 (ENSPCIG00000011551) MITD1 (ENSPCIG00000011552) MRPL30 (ENSPCIG00000036345) LYG2 (ENSPCIG00000011558) ENSPCIG00000011563 Wallaby MODERN SPECIES 2297 UBE3A (ENSMEUG00000001298) #22 Tasmanian devil MODERN SPECIES 2 ENSSHAG00000003617 CYFIP1 (ENSSHAG00000005782) ENSSHAG00000006651 NIPA2 (ENSSHAG00000007132) ENSSHAG00000007633 ENSSHAG00000027441 ENSSHAG00000009551 OCA2 (ENSSHAG00000028289) ENSSHAG00000029607 ENSSHAG00000003167 ENSSHAG00000004573 GABRA5 (ENSSHAG00000026082) GABRB3 (ENSSHAG00000026028) ENSSHAG00000010315 ENSSHAG00000005271 ENSSHAG00000009977 #22 ENSSHAG00000010730 ENSSHAG00000025674 ENSSHAG00000005377 ENSSHAG00000004774 ENSSHAG00000003652 ENSSHAG00000026344 ENSSHAG00000006648 ENSSHAG00000009215 ENSSHAG00000009275 ENSSHAG00000020964 TSGA10 (ENSSHAG00000007532) MRPL30 (ENSSHAG00000022702) LIPT1 (ENSSHAG00000008755) MITD1 (ENSSHAG00000008769) LYG2 (ENSSHAG00000020738) Opossum MODERN SPECIES 6 NIPA2 (ENSMODG00000000565) ENSMODG00000045145 NIPA1 (ENSMODG00000000581) ENSMODG00000029329 HERC2 (ENSMODG00000000682) OCA2 (ENSMODG00000000700) SMCO4 (ENSMODG00000024310) ENSMODG00000000805 ENSMODG00000047445 ENSMODG00000000812 GABRA5 (ENSMODG00000000840) ENSMODG00000041058 GABRB3 (ENSMODG00000046193) ENSMODG00000000904 ATP10A (ENSMODG00000000935) UBE3A (ENSMODG00000000974) #22 ENSMODG00000000978 CNGA3 (ENSMODG00000001004) ENSMODG00000001020 ENSMODG00000050268 ENSMODG00000046045 TMEM131 (ENSMODG00000001070) ENSMODG00000001080 INPP4A (ENSMODG00000001182) ENSMODG00000040358 COA5 (ENSMODG00000044911) UNC50 (ENSMODG00000001209) MGAT4A (ENSMODG00000001241) ENSMODG00000001246 ENSMODG00000048504 TSGA10 (ENSMODG00000001318) Platypus MODERN SPECIES 9 EMX1 (ENSOANG00000037932) SMYD5 (ENSOANG00000050059) ENSOANG00000044978 CCT7 (ENSOANG00000041775) FBXO41 (ENSOANG00000048874) NIPA2 (ENSOANG00000036039) NIPA1 (ENSOANG00000013091) HERC2 (ENSOANG00000014542) OCA2 (ENSOANG00000031582) ENSOANG00000005813 ENSOANG00000030619 GABRA5 (ENSOANG00000009524) GABRB3 (ENSOANG00000009525) ENSOANG00000009526 ENSOANG00000047821 UBE3A (ENSOANG00000007102) #22 ENSOANG00000008733 ENSOANG00000049950 ENSOANG00000007103 TMEM131 (ENSOANG00000007104) ENSOANG00000045768 ENSOANG00000007109 XK (ENSOANG00000007110) CYBB (ENSOANG00000007111) DYNLT3 (ENSOANG00000007112) SYTL5 (ENSOANG00000007114) SRPX (ENSOANG00000007116) ENSOANG00000007117 OTC (ENSOANG00000007118) TSPAN7 (ENSOANG00000005230) ENSOANG00000048021 Sauria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00910000148238 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a ENSGT00940000157237.b.b ENSGT01010000222692 ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000164275 ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00960000191142 ENSGT00390000008846 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00910000148238 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a ENSGT00940000157237.b.b ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000164275 ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00960000191142 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895.b ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a ENSGT00940000157237.b.b ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000164275 ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00960000191142 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 Laterata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895.a.a ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a ENSGT00940000157237.b.b ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000164275 ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00960000191142 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES RP2 (ENSSMRG00000022408) SLC9A7 (ENSSMRG00000022407) CHST7 (ENSSMRG00000022405) TUBGCP5 (ENSSMRG00000022401) ENSSMRG00000022399 CYFIP1 (ENSSMRG00000022398) NIPA2 (ENSSMRG00000022397) NIPA1 (ENSSMRG00000022396) HERC2 (ENSSMRG00000022131) OCA2 (ENSSMRG00000022129) ENSSMRG00000022127 ENSSMRG00000022125 GABRA5 (ENSSMRG00000022118) GABRB3 (ENSSMRG00000022117) ATP10A (ENSSMRG00000022113) UBE3A (ENSSMRG00000022112) #22 CNGA3 (ENSSMRG00000022111) ENSSMRG00000022110 ENSSMRG00000022108 ENSSMRG00000022107 TMEM131 (ENSSMRG00000021628) ENSSMRG00000021627 INPP4A (ENSSMRG00000021626) COA5 (ENSSMRG00000021625) UNC50 (ENSSMRG00000021623) MGAT4A (ENSSMRG00000021622) CRACDL (ENSSMRG00000021621) TSGA10 (ENSSMRG00000021620) LIPT1 (ENSSMRG00000021619) MITD1 (ENSSMRG00000021618) ENSSMRG00000021617 Common wall lizard MODERN SPECIES 12 SLC9A7 (ENSPMRG00000000526) CHST7 (ENSPMRG00000001182) TUBGCP5 (ENSPMRG00000001248) CYFIP1 (ENSPMRG00000001766) ENSPMRG00000002538 NIPA2 (ENSPMRG00000002550) NIPA1 (ENSPMRG00000002567) HERC2 (ENSPMRG00000003229) OCA2 (ENSPMRG00000005217) GABRG3 (ENSPMRG00000005356) GABRA5 (ENSPMRG00000005379) GABRB3 (ENSPMRG00000005399) ENSPMRG00000005414 ENSPMRG00000005420 ENSPMRG00000005430 UBE3A (ENSPMRG00000005438) #22 CNGA3 (ENSPMRG00000005449) ENSPMRG00000005454 ENSPMRG00000005459 ENSPMRG00000005465 ENSPMRG00000005469 TMEM131 (ENSPMRG00000005478) ENSPMRG00000005500 INPP4A (ENSPMRG00000005512) COA5 (ENSPMRG00000005538) UNC50 (ENSPMRG00000005543) MGAT4A (ENSPMRG00000005556) CRACDL (ENSPMRG00000005563) TSGA10 (ENSPMRG00000005576) ENSPMRG00000005634 LIPT1 (ENSPMRG00000005637) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000014995 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895.b ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000164275 ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 ENSGT00390000017614.k.b ENSGT00390000015645 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000014995 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895.b ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000164275 ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205.f ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 ENSGT00390000017614.k.b ENSGT00390000015645 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000014995 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895.b ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000164275 ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205.f ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 ENSGT00390000017614.k.b ENSGT00390000015645 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000014995 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895.b ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000164275 ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177.a ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205.f ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 ENSGT00390000017614.k.b ENSGT00390000015645 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 17 RP2 (ENSNSUG00000007266) SLC9A7 (ENSNSUG00000007263) CHST7 (ENSNSUG00000007244) ENSNSUG00000007241 ENSNSUG00000007235 CYFIP1 (ENSNSUG00000004828) NIPA2 (ENSNSUG00000004761) NIPA1 (ENSNSUG00000004759) HERC2 (ENSNSUG00000004737) OCA2 (ENSNSUG00000004716) GABRG3 (ENSNSUG00000004698) GABRA5 (ENSNSUG00000004656) ENSNSUG00000004651 GABRB3 (ENSNSUG00000004639) ATP10A (ENSNSUG00000003315) UBE3A (ENSNSUG00000003312) #22 CNGA3 (ENSNSUG00000003311) ENSNSUG00000003308 ENSNSUG00000003303 TMEM131 (ENSNSUG00000002589) ENSNSUG00000002586 INPP4A (ENSNSUG00000002576) COA5 (ENSNSUG00000002574) UNC50 (ENSNSUG00000002571) ENSNSUG00000002569 CRACDL (ENSNSUG00000002562) TSGA10 (ENSNSUG00000002560) LIPT1 (ENSNSUG00000002559) MITD1 (ENSNSUG00000002558) ENSNSUG00000002556 ENSNSUG00000002554 Eastern brown snake MODERN SPECIES 35 JADE3 (ENSPTXG00000001779) RP2 (ENSPTXG00000001781) SLC9A7 (ENSPTXG00000001783) CHST7 (ENSPTXG00000001787) TUBGCP5 (ENSPTXG00000001795) CYFIP1 (ENSPTXG00000001799) NIPA2 (ENSPTXG00000001802) NIPA1 (ENSPTXG00000001804) HERC2 (ENSPTXG00000001815) ENSPTXG00000001907 OCA2 (ENSPTXG00000001913) GABRG3 (ENSPTXG00000001924) GABRA5 (ENSPTXG00000002016) GABRB3 (ENSPTXG00000002021) ATP10A (ENSPTXG00000002047) UBE3A (ENSPTXG00000002050) #22 CNGA3 (ENSPTXG00000002053) ENSPTXG00000002056 ENSPTXG00000002058 ENSPTXG00000002064 ENSPTXG00000002082 ENSPTXG00000002084 ENSPTXG00000002085 INPP4A (ENSPTXG00000002086) COA5 (ENSPTXG00000002088) UNC50 (ENSPTXG00000002089) MGAT4A (ENSPTXG00000002090) CRACDL (ENSPTXG00000002094) ENSPTXG00000002098 ENSPTXG00000002101 LIPT1 (ENSPTXG00000002104) Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 1170 UBE3A (ENSLLTG00000011893) #22 Indian cobra MODERN SPECIES 5 RP2 (ENSNNAG00000013290) SLC9A7 (ENSNNAG00000013298) CHST7 (ENSNNAG00000013370) TUBGCP5 (ENSNNAG00000013410) ENSNNAG00000013452 ENSNNAG00000013462 ENSNNAG00000013479 NIPA2 (ENSNNAG00000013505) NIPA1 (ENSNNAG00000013528) HERC2 (ENSNNAG00000013786) OCA2 (ENSNNAG00000016797) GABRG3 (ENSNNAG00000016832) GABRA5 (ENSNNAG00000016844) GABRB3 (ENSNNAG00000016868) ATP10A (ENSNNAG00000016928) UBE3A (ENSNNAG00000016958) #22 CNGA3 (ENSNNAG00000016966) ENSNNAG00000016975 ENSNNAG00000016990 ENSNNAG00000017016 TMEM131 (ENSNNAG00000017031) INPP4A (ENSNNAG00000017118) COA5 (ENSNNAG00000017142) UNC50 (ENSNNAG00000017144) MGAT4A (ENSNNAG00000017148) CRACDL (ENSNNAG00000017169) TSGA10 (ENSNNAG00000017177) LIPT1 (ENSNNAG00000017210) MITD1 (ENSNNAG00000017212) ENSNNAG00000017218 ENSNNAG00000017222 Lizard MODERN SPECIES 2 ENSACAG00000034871 CYFIP1 (ENSACAG00000012406) NIPA2 (ENSACAG00000012667) NIPA1 (ENSACAG00000012713) HERC2 (ENSACAG00000005186) ENSACAG00000039822 ENSACAG00000023782 OCA2 (ENSACAG00000011098) ENSACAG00000011286 ENSACAG00000043808 ENSACAG00000042397 GABRA5 (ENSACAG00000011363) ENSACAG00000035603 GABRB3 (ENSACAG00000011617) ATP10A (ENSACAG00000011809) UBE3A (ENSACAG00000012036) #22 CNGA3 (ENSACAG00000012148) ENSACAG00000012250 ENSACAG00000039194 ENSACAG00000006018 ENSACAG00000040740 TMEM131 (ENSACAG00000012281) ENSACAG00000036115 INPP4A (ENSACAG00000012423) COA5 (ENSACAG00000042310) UNC50 (ENSACAG00000012664) MGAT4A (ENSACAG00000012692) ENSACAG00000029057 GPR45 (ENSACAG00000010329) TGFBRAP1 (ENSACAG00000010331) C2orf49 (ENSACAG00000045073) tuatara MODERN SPECIES 1206 ATP10A (ENSSPUG00000007591) UBE3A (ENSSPUG00000007559) #22 ENSSPUG00000007547 CNGA3 (ENSSPUG00000007531) ENSSPUG00000007497 ENSSPUG00000007482 ENSSPUG00000007474 ENSSPUG00000007469 TMEM131 (ENSSPUG00000007445) ENSSPUG00000007387 INPP4A (ENSSPUG00000007352) COA5 (ENSSPUG00000007313) UNC50 (ENSSPUG00000007299) MGAT4A (ENSSPUG00000007277) Archelosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a ENSGT00940000157237.b.b ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000164275 ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00960000191142 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a ENSGT00940000157237.b.b ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000164275 ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00960000191142 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a.c ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a.g.b ENSGT00940000157237.b.b ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000164275 ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00950000185362 ENSGT00960000191142 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 Emydidae ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a.c ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a.g.a ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000164275 ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00950000185362.a ENSGT00940000159205 ENSGT00960000191142 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 Three-toed box turtle DUPLICATION Three-toed box turtle MODERN SPECIES 6 ENSTMTG00000010653 ENSTMTG00000010526 ENSTMTG00000010505 ENSTMTG00000010426 ENSTMTG00000010403 ENSTMTG00000010276 ENSTMTG00000010258 ENSTMTG00000010189 ENSTMTG00000006794 ENSTMTG00000006386 ENSTMTG00000006279 ENSTMTG00000006245 ENSTMTG00000006139 ENSTMTG00000005979 ENSTMTG00000005364 ENSTMTG00000005307 #22 ENSTMTG00000005281 ENSTMTG00000005249 ENSTMTG00000005219 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 8 ENSTMTG00000005723 ENSTMTG00000005706 ENSTMTG00000005694 ENSTMTG00000005272 ENSTMTG00000005208 ENSTMTG00000005063 ENSTMTG00000005033 ENSTMTG00000004968 ENSTMTG00000002443 ENSTMTG00000002233 ENSTMTG00000002208 ENSTMTG00000002203 ENSTMTG00000002184 ENSTMTG00000002137 ENSTMTG00000001876 ENSTMTG00000001822 #22 ENSTMTG00000001811 ENSTMTG00000001801 ENSTMTG00000001782 painted turtle MODERN SPECIES 694 CNOT11 (ENSCPBG00000004780) ATP10A (ENSCPBG00000004793) UBE3A (ENSCPBG00000004820) #22 CNGA3 (ENSCPBG00000004839) VWA3B (ENSCPBG00000004860) TMEM131 (ENSCPBG00000004925) ENSCPBG00000004963 INPP4A (ENSCPBG00000005011) ENSCPBG00000005046 COA5 (ENSCPBG00000005055) UNC50 (ENSCPBG00000005066) MGAT4A (ENSCPBG00000005076) CRACDL (ENSCPBG00000005110) TSGA10 (ENSCPBG00000005139) ENSCPBG00000005200 ENSCPBG00000005206 LIPT1 (ENSCPBG00000005213) MITD1 (ENSCPBG00000005218) Testudinidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a.c ENSGT00940000153460.c.a.d ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a.g.b ENSGT00940000157237.b.b ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000164275 ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00950000185362 ENSGT00960000191142 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES JADE3 (ENSGEVG00005002441) RP2 (ENSGEVG00005002421) SLC9A7 (ENSGEVG00005002305) CHST7 (ENSGEVG00005002281) TUBGCP5 (ENSGEVG00005002244) ENSGEVG00005002215 CYFIP1 (ENSGEVG00005002166) NIPA2 (ENSGEVG00005002155) NIPA1 (ENSGEVG00005002127) OCA2 (ENSGEVG00005001636) ENSGEVG00005001503 ENSGEVG00005001435 GABRA5 (ENSGEVG00005001402) GABRB3 (ENSGEVG00005001339) ATP10A (ENSGEVG00005001165) UBE3A (ENSGEVG00005001094) #22 CNGA3 (ENSGEVG00005001066) ENSGEVG00005001042 ENSGEVG00005001030 ENSGEVG00005001004 TMEM131 (ENSGEVG00005000834) ENSGEVG00005000780 INPP4A (ENSGEVG00005000555) COA5 (ENSGEVG00005000466) UNC50 (ENSGEVG00005000453) MGAT4A (ENSGEVG00005000411) CRACDL (ENSGEVG00005000301) ENSGEVG00005000259 TSGA10 (ENSGEVG00005000197) LIPT1 (ENSGEVG00005000170) MITD1 (ENSGEVG00005000156) Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2327 ATP10A (ENSCABG00000004541) UBE3A (ENSCABG00000004531) #22 CNGA3 (ENSCABG00000004525) ENSCABG00000004521 ENSCABG00000004518 ENSCABG00000004471 TMEM131 (ENSCABG00000003187) ENSCABG00000003139 INPP4A (ENSCABG00000003130) COA5 (ENSCABG00000003126) UNC50 (ENSCABG00000003123) MGAT4A (ENSCABG00000003117) Chinese turtle MODERN SPECIES 2209 UBE3A (ENSPSIG00000016196) #22 CNGA3 (ENSPSIG00000016436) VWA3B (ENSPSIG00000016680) TMEM131 (ENSPSIG00000017321) ENSPSIG00000008787 INPP4A (ENSPSIG00000008822) COA5 (ENSPSIG00000008984) UNC50 (ENSPSIG00000008997) MGAT4A (ENSPSIG00000009403) CRACDL (ENSPSIG00000010861) TSGA10 (ENSPSIG00000010868) LIPT1 (ENSPSIG00000001039) MITD1 (ENSPSIG00000011553) ENSPSIG00000011557 ENSPSIG00000011579 ENSPSIG00000011650 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a ENSGT00940000157237.b.b ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 ENSGT00390000017614.k.b ENSGT00390000017614.k.a.a Aves ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a ENSGT00940000157237.b.b ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 ENSGT00390000016769 ENSGT00390000017614.k.b Neognathae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a ENSGT01010000222692 ENSGT00940000157237.b.b ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 ENSGT00390000017614.k.b Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b.m.a ENSGT00940000165545 ENSGT00500000044831.a.b.n ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 ENSGT00390000016769 ENSGT00390000017614.k.b ENSGT00390000017614.k.a.a Anatidae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b.m.b ENSGT00940000165545 ENSGT00500000044831.a.b.n ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 ENSGT00390000017614.k.b ENSGT00390000017614.k.a.a ENSGT00390000017614.l Pink-footed goose MODERN SPECIES 46 RP2 (ENSABRG00000017781) SLC9A7 (ENSABRG00000017708) CHST7 (ENSABRG00000017687) TUBGCP5 (ENSABRG00000017384) ENSABRG00000017368 CYFIP1 (ENSABRG00000015505) NIPA2 (ENSABRG00000015360) ENSABRG00000015357 ENSABRG00000015351 HERC2 (ENSABRG00000014064) OCA2 (ENSABRG00000013852) GABRG3 (ENSABRG00000013832) GABRA5 (ENSABRG00000013815) GABRB3 (ENSABRG00000013802) ATP10A (ENSABRG00000013767) UBE3A (ENSABRG00000013750) #22 CNGA3 (ENSABRG00000013738) VWA3B (ENSABRG00000013688) TMEM131 (ENSABRG00000013101) INPP4A (ENSABRG00000010938) COA5 (ENSABRG00000010800) UNC50 (ENSABRG00000010789) MGAT4A (ENSABRG00000010545) CRACDL (ENSABRG00000010505) TSGA10 (ENSABRG00000010450) LIPT1 (ENSABRG00000010430) MITD1 (ENSABRG00000010414) ENSABRG00000010405 ENSABRG00000010396 ENSABRG00000010384 ENSABRG00000010364 Duck MODERN SPECIES RP2 (ENSAPLG00000005687) SLC9A7 (ENSAPLG00000005702) CHST7 (ENSAPLG00000028678) TUBGCP5 (ENSAPLG00000005776) ENSAPLG00000026011 ENSAPLG00000020705 ENSAPLG00000000924 NIPA2 (ENSAPLG00000026293) NIPA1 (ENSAPLG00000005169) HERC2 (ENSAPLG00000003410) OCA2 (ENSAPLG00000002607) GABRG3 (ENSAPLG00000002598) GABRA5 (ENSAPLG00000015626) GABRB3 (ENSAPLG00000015446) ATP10A (ENSAPLG00000014775) UBE3A (ENSAPLG00000014628) #22 ENSAPLG00000020267 CNGA3 (ENSAPLG00000014458) VWA3B (ENSAPLG00000015715) TMEM131 (ENSAPLG00000015123) INPP4A (ENSAPLG00000006583) COA5 (ENSAPLG00000025469) UNC50 (ENSAPLG00000026135) MGAT4A (ENSAPLG00000014270) CRACDL (ENSAPLG00000014720) ENSAPLG00000014805 ENSAPLG00000023503 LIPT1 (ENSAPLG00000001991) MITD1 (ENSAPLG00000014881) ENSAPLG00000015164 ENSAPLG00000028621 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b.m.a ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 ENSGT00390000016769 ENSGT00390000017614.k.b ENSGT00390000017614.k.a.a Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b.m.a ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 ENSGT00390000017614.k.b ENSGT00390000017614.k.a.a ENSGT00390000017614.l Turkey MODERN SPECIES DHRSX (ENSMGAG00000014738) ENSMGAG00000015483 ENSMGAG00000014736 ENSMGAG00000021248 ENSMGAG00000014734 ENSMGAG00000014731 ENSMGAG00000014732 ENSMGAG00000021355 MXRA5 (ENSMGAG00000014730) ENSMGAG00000014729 ENSMGAG00000016583 ENSMGAG00000020779 GABRA5 (ENSMGAG00000014768) GABRB3 (ENSMGAG00000014769) ATP10A (ENSMGAG00000014771) UBE3A (ENSMGAG00000014772) #22 CNGA3 (ENSMGAG00000014773) ENSMGAG00000014775 TMEM131 (ENSMGAG00000014778) INPP4A (ENSMGAG00000014779) COA5 (ENSMGAG00000022502) UNC50 (ENSMGAG00000020765) MGAT4A (ENSMGAG00000014782) CRACDL (ENSMGAG00000014783) PDCL3 (ENSMGAG00000014798) TSGA10 (ENSMGAG00000014784) ENSMGAG00000021378 ENSMGAG00000015501 ENSMGAG00000015504 NPAS2 (ENSMGAG00000014799) ENSMGAG00000014800 Chicken MODERN SPECIES RP2 (ENSGALG00010002728) SLC9A7 (ENSGALG00010002753) CHST7 (ENSGALG00010002954) TUBGCP5 (ENSGALG00010002800) CYFIP1 (ENSGALG00010002835) ENSGALG00010002844 NIPA2 (ENSGALG00010002860) ENSGALG00010003280 ENSGALG00010002421 HERC2 (ENSGALG00010002886) OCA2 (ENSGALG00010002896) GABRG3 (ENSGALG00010002907) GABRA5 (ENSGALG00010002927) GABRB3 (ENSGALG00010002942) ATP10A (ENSGALG00010015992) UBE3A (ENSGALG00010015520) #22 CNGA3 (ENSGALG00010015542) VWA3B (ENSGALG00010015551) TMEM131 (ENSGALG00010015606) INPP4A (ENSGALG00010015669) COA5 (ENSGALG00010015693) UNC50 (ENSGALG00010015701) MGAT4A (ENSGALG00010015716) CRACDL (ENSGALG00010015738) TSGA10 (ENSGALG00010015772) ENSGALG00010015813 LIPT1 (ENSGALG00010015810) MITD1 (ENSGALG00010015816) ENSGALG00010015820 LYG2 (ENSGALG00010015831) ENSGALG00010015850 Japanese quail MODERN SPECIES JADE3 (ENSCJPG00005018270) RP2 (ENSCJPG00005018300) SLC9A7 (ENSCJPG00005018302) CHST7 (ENSCJPG00005018442) TUBGCP5 (ENSCJPG00005018443) CYFIP1 (ENSCJPG00005018725) ENSCJPG00005019414 NIPA2 (ENSCJPG00005019415) NIPA1 (ENSCJPG00005019424) HERC2 (ENSCJPG00005019456) OCA2 (ENSCJPG00005019660) GABRG3 (ENSCJPG00005019689) GABRA5 (ENSCJPG00005019690) GABRB3 (ENSCJPG00005019691) ATP10A (ENSCJPG00005019695) UBE3A (ENSCJPG00005019696) #22 ENSCJPG00005019699 VWA3B (ENSCJPG00005019700) TMEM131 (ENSCJPG00005019703) INPP4A (ENSCJPG00005019746) COA5 (ENSCJPG00005019748) UNC50 (ENSCJPG00005000046) MGAT4A (ENSCJPG00005000086) CRACDL (ENSCJPG00005000108) TSGA10 (ENSCJPG00005000126) LIPT1 (ENSCJPG00005000139) MITD1 (ENSCJPG00005000145) ENSCJPG00005000152 MRPL30 (ENSCJPG00005000160) ENSCJPG00005000181 ENSCJPG00005000381 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a ENSGT00940000157237.b.b ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 ENSGT00390000017614.k.b ENSGT00390000017614.k.a.a Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a ENSGT01010000222692 ENSGT00940000157237.b.b ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 ENSGT00390000017614.k.b Golden eagle MODERN SPECIES 15 CHST7 (ENSACCG00020016467) TUBGCP5 (ENSACCG00020016461) ENSACCG00020016449 CYFIP1 (ENSACCG00020016432) NIPA2 (ENSACCG00020016419) NIPA1 (ENSACCG00020016416) HERC2 (ENSACCG00020016329) ENSACCG00020016153 OCA2 (ENSACCG00020016025) GABRG3 (ENSACCG00020015807) GABRA5 (ENSACCG00020015771) GABRB3 (ENSACCG00020015759) ENSACCG00020015726 ENSACCG00020015680 ENSACCG00020015598 UBE3A (ENSACCG00020015473) #22 CNGA3 (ENSACCG00020015457) ENSACCG00020015439 ENSACCG00020015426 TMEM131 (ENSACCG00020015377) INPP4A (ENSACCG00020015303) COA5 (ENSACCG00020015258) UNC50 (ENSACCG00020015240) MGAT4A (ENSACCG00020015221) CRACDL (ENSACCG00020015203) ENSACCG00020015184 ENSACCG00020015176 LIPT1 (ENSACCG00020015167) MITD1 (ENSACCG00020015139) ENSACCG00020015102 ENSACCG00020015084 Kakapo MODERN SPECIES 11 RGN (ENSSHBG00005010975) JADE3 (ENSSHBG00005010994) RP2 (ENSSHBG00005011022) SLC9A7 (ENSSHBG00005011276) TUBGCP5 (ENSSHBG00005013566) CYFIP1 (ENSSHBG00005013598) ENSSHBG00005013639 NIPA2 (ENSSHBG00005013646) NIPA1 (ENSSHBG00005013671) HERC2 (ENSSHBG00005013706) OCA2 (ENSSHBG00005013816) GABRG3 (ENSSHBG00005013909) GABRA5 (ENSSHBG00005013949) GABRB3 (ENSSHBG00005013964) ATP10A (ENSSHBG00005014010) UBE3A (ENSSHBG00005014128) #22 CNGA3 (ENSSHBG00005014157) ENSSHBG00005014163 ENSSHBG00005014170 ENSSHBG00005014184 TMEM131 (ENSSHBG00005014195) INPP4A (ENSSHBG00005014212) COA5 (ENSSHBG00005014224) UNC50 (ENSSHBG00005014231) MGAT4A (ENSSHBG00005014247) CRACDL (ENSSHBG00005014264) ENSSHBG00005014324 LIPT1 (ENSSHBG00005014332) MITD1 (ENSSHBG00005014341) ENSSHBG00005014359 ENSSHBG00005014372 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a ENSGT00940000157237.b.b ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 ENSGT00390000017614.k.b ENSGT00390000017614.l ENSGT00390000015645 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a ENSGT01010000222692 ENSGT00940000157237.b.b ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 ENSGT00390000017614.k.b ENSGT00390000017614.l Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a ENSGT01010000222692 ENSGT00940000157237.b.b ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 ENSGT00390000017614.k.b ENSGT00390000017614.l Medium ground finch MODERN SPECIES 18 UBE3A (ENSGFOG00000009087) #22 CNGA3 (ENSGFOG00000009080) ENSGFOG00000009074 ENSGFOG00000009070 TMEM131 (ENSGFOG00000009049) INPP4A (ENSGFOG00000009014) COA5 (ENSGFOG00000009005) UNC50 (ENSGFOG00000009001) MGAT4A (ENSGFOG00000008991) ENSGFOG00000008984 CRACDL (ENSGFOG00000008964) LIPT1 (ENSGFOG00000008956) MITD1 (ENSGFOG00000008951) ENSGFOG00000008948 ENSGFOG00000008932 TXNDC9 (ENSGFOG00000008919) Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237.b.a ENSGT00940000157237.b.b ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00390000008846 ENSGT00390000010868 ENSGT00940000163829 ENSGT00390000017614.k.b ENSGT00390000017614.l ENSGT00390000015645 Zebra finch MODERN SPECIES RGN (ENSTGUG00000010624) JADE3 (ENSTGUG00000010614) SLC9A7 (ENSTGUG00000010570) CHST7 (ENSTGUG00000028672) TUBGCP5 (ENSTGUG00000010552) CYFIP1 (ENSTGUG00000010510) ENSTGUG00000010550 NIPA2 (ENSTGUG00000026864) NIPA1 (ENSTGUG00000024057) HERC2 (ENSTGUG00000010457) OCA2 (ENSTGUG00000010434) GABRG3 (ENSTGUG00000026960) GABRA5 (ENSTGUG00000010368) GABRB3 (ENSTGUG00000010346) ATP10A (ENSTGUG00000010310) UBE3A (ENSTGUG00000010281) #22 CNGA3 (ENSTGUG00000010272) VWA3B (ENSTGUG00000010260) TMEM131 (ENSTGUG00000010237) INPP4A (ENSTGUG00000010196) UNC50 (ENSTGUG00000010176) MGAT4A (ENSTGUG00000010155) CRACDL (ENSTGUG00000010153) MITD1 (ENSTGUG00000010137) ENSTGUG00000024074 ENSTGUG00000019096 ENSTGUG00000010130 TXNDC9 (ENSTGUG00000010125) EIF5B (ENSTGUG00000010099) REV1 (ENSTGUG00000010082) AFF3 (ENSTGUG00000010075) Common canary MODERN SPECIES 4 RGN (ENSSCAG00000016361) JADE3 (ENSSCAG00000016365) RP2 (ENSSCAG00000016367) SLC9A7 (ENSSCAG00000016409) TUBGCP5 (ENSSCAG00000016446) CYFIP1 (ENSSCAG00000016448) ENSSCAG00000016450 NIPA2 (ENSSCAG00000016451) NIPA1 (ENSSCAG00000016456) HERC2 (ENSSCAG00000016520) OCA2 (ENSSCAG00000016649) GABRG3 (ENSSCAG00000016667) GABRA5 (ENSSCAG00000016681) GABRB3 (ENSSCAG00000016695) ATP10A (ENSSCAG00000016722) UBE3A (ENSSCAG00000016746) #22 ENSSCAG00000016750 ENSSCAG00000016751 ENSSCAG00000016755 TMEM131 (ENSSCAG00000016760) INPP4A (ENSSCAG00000016767) ENSSCAG00000016769 UNC50 (ENSSCAG00000016772) MGAT4A (ENSSCAG00000016774) CRACDL (ENSSCAG00000016778) LIPT1 (ENSSCAG00000016780) MITD1 (ENSSCAG00000016783) ENSSCAG00000016786 ENSSCAG00000016788 ENSSCAG00000016789 TXNDC9 (ENSSCAG00000016791) Flycatcher MODERN SPECIES ENSFALG00000004123 JADE3 (ENSFALG00000004111) ENSFALG00000004100 SLC9A7 (ENSFALG00000004095) TUBGCP5 (ENSFALG00000004079) ENSFALG00000015006 CYFIP1 (ENSFALG00000004070) NIPA2 (ENSFALG00000023084) NIPA1 (ENSFALG00000004063) HERC2 (ENSFALG00000004056) OCA2 (ENSFALG00000004044) GABRG3 (ENSFALG00000004035) GABRA5 (ENSFALG00000004030) GABRB3 (ENSFALG00000026709) ATP10A (ENSFALG00000004021) UBE3A (ENSFALG00000004019) #22 CNGA3 (ENSFALG00000027942) ENSFALG00000004004 TMEM131 (ENSFALG00000003986) INPP4A (ENSFALG00000003979) COA5 (ENSFALG00000003977) UNC50 (ENSFALG00000003974) MGAT4A (ENSFALG00000003960) CRACDL (ENSFALG00000003947) LIPT1 (ENSFALG00000003944) MITD1 (ENSFALG00000023579) ENSFALG00000003937 ENSFALG00000003932 TXNDC9 (ENSFALG00000003927) ENSFALG00000003920 REV1 (ENSFALG00000003890) Great tit MODERN SPECIES RP2 (ENSPMJG00000016427) SLC9A7 (ENSPMJG00000016393) CHST7 (ENSPMJG00000016392) TUBGCP5 (ENSPMJG00000016391) ENSPMJG00000016390 CYFIP1 (ENSPMJG00000016389) NIPA2 (ENSPMJG00000016388) NIPA1 (ENSPMJG00000016387) HERC2 (ENSPMJG00000015438) OCA2 (ENSPMJG00000015257) GABRG3 (ENSPMJG00000015255) GABRA5 (ENSPMJG00000015254) GABRB3 (ENSPMJG00000015253) ATP10A (ENSPMJG00000015251) ENSPMJG00000015250 UBE3A (ENSPMJG00000015249) #22 CNGA3 (ENSPMJG00000015248) ENSPMJG00000015247 ENSPMJG00000015246 TMEM131 (ENSPMJG00000015243) INPP4A (ENSPMJG00000015242) COA5 (ENSPMJG00000015241) UNC50 (ENSPMJG00000015240) MGAT4A (ENSPMJG00000015239) CRACDL (ENSPMJG00000015238) LIPT1 (ENSPMJG00000015237) MITD1 (ENSPMJG00000015236) ENSPMJG00000015235 ENSPMJG00000015234 TXNDC9 (ENSPMJG00000015233) EIF5B (ENSPMJG00000015232) African ostrich MODERN SPECIES 318 ENSSCUG00000003407 RGN (ENSSCUG00000003404) RP2 (ENSSCUG00000003400) SLC9A7 (ENSSCUG00000003376) TUBGCP5 (ENSSCUG00000003363) ENSSCUG00000003361 CYFIP1 (ENSSCUG00000003360) NIPA2 (ENSSCUG00000003359) NIPA1 (ENSSCUG00000003358) HERC2 (ENSSCUG00000003278) OCA2 (ENSSCUG00000003232) GABRG3 (ENSSCUG00000003231) GABRA5 (ENSSCUG00000003230) GABRB3 (ENSSCUG00000003229) ATP10A (ENSSCUG00000003225) UBE3A (ENSSCUG00000003221) #22 CNGA3 (ENSSCUG00000003220) VWA3B (ENSSCUG00000003214) TMEM131 (ENSSCUG00000003203) INPP4A (ENSSCUG00000003197) UNC50 (ENSSCUG00000003192) MGAT4A (ENSSCUG00000003189) CRACDL (ENSSCUG00000003185) TSGA10 (ENSSCUG00000003181) MITD1 (ENSSCUG00000003174) ENSSCUG00000003173 ENSSCUG00000003171 ENSSCUG00000003168 ENSSCUG00000003167 TXNDC9 (ENSSCUG00000003165) ENSSCUG00000003121 Australian saltwater crocodile DUPLICATION Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 31 ENSCPRG00005008164 ENSCPRG00005008150 ENSCPRG00005008120 ENSCPRG00005008110 ENSCPRG00005008058 ENSCPRG00005008042 ENSCPRG00005008038 ENSCPRG00005008014 ENSCPRG00005007991 ENSCPRG00005007966 ENSCPRG00005007951 ENSCPRG00005007944 ENSCPRG00005007940 ENSCPRG00005007924 ENSCPRG00005007889 ENSCPRG00005006911 #22 ENSCPRG00005006738 ENSCPRG00005006733 ENSCPRG00005006717 ENSCPRG00005006707 ENSCPRG00005006705 ENSCPRG00005006693 ENSCPRG00005006686 ENSCPRG00005006579 ENSCPRG00005006566 ENSCPRG00005006482 ENSCPRG00005006458 ENSCPRG00005006451 ENSCPRG00005006449 ENSCPRG00005006446 ENSCPRG00005006440 Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 27 CHST7 (ENSCPRG00005007438) TUBGCP5 (ENSCPRG00005007566) CYFIP1 (ENSCPRG00005008391) ENSCPRG00005009856 NIPA2 (ENSCPRG00005009861) NIPA1 (ENSCPRG00005009914) HERC2 (ENSCPRG00005010056) OCA2 (ENSCPRG00005010998) ENSCPRG00005011031 ENSCPRG00005011070 ENSCPRG00005011141 GABRA5 (ENSCPRG00005011145) GABRB3 (ENSCPRG00005011173) ATP10A (ENSCPRG00005011250) ENSCPRG00005011606 UBE3A (ENSCPRG00005011691) #22 ENSCPRG00005011706 ENSCPRG00005011752 ENSCPRG00005011759 TMEM131 (ENSCPRG00005011822) INPP4A (ENSCPRG00005011885) COA5 (ENSCPRG00005011925) UNC50 (ENSCPRG00005011930) MGAT4A (ENSCPRG00005011963) CRACDL (ENSCPRG00005011973) TSGA10 (ENSCPRG00005011985) LIPT1 (ENSCPRG00005012004) MITD1 (ENSCPRG00005012006) ENSCPRG00005012023 ENSCPRG00005012029 ENSCPRG00005012068 Anura ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00940000165545 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237 ENSGT01010000222692 ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000164275.c.a ENSGT00940000157360 ENSGT00390000005548 ENSGT00390000018553 ENSGT00940000159177 ENSGT00940000161984 ENSGT00940000159205 ENSGT00390000008846 ENSGT00940000155470.a ENSGT00940000163829 ENSGT00390000010868 Frog MODERN SPECIES 2 ENSXETG00000037110 cyfip1 (ENSXETG00000004138) nipa2 (ENSXETG00000004144) nipa1 (ENSXETG00000034731) herc2 (ENSXETG00000004148) ENSXETG00000047078 ENSXETG00000043399 cela2a (ENSXETG00000004157) ENSXETG00000044349 gabrg3 (ENSXETG00000041217) gabra5 (ENSXETG00000027302) gabrb3 (ENSXETG00000024288) ENSXETG00000044133 atp10a (ENSXETG00000024302) ENSXETG00000046612 ube3a (ENSXETG00000024326) #22 cnga3 (ENSXETG00000024338) vwa3b (ENSXETG00000024348) ENSXETG00000047831 tmem131 (ENSXETG00000031570) XB5727514 [provisional] (ENSXETG00000019416) inpp4a (ENSXETG00000019407) coa5 (ENSXETG00000026562) unc50 (ENSXETG00000026564) mgat4a (ENSXETG00000019401) cracdl (ENSXETG00000039679) tsga10 (ENSXETG00000030526) lipt1 (ENSXETG00000019393) abcc12 (ENSXETG00000034322) mrpl30 (ENSXETG00000026571) mitd1 (ENSXETG00000019386) Leishan spiny toad MODERN SPECIES 5 ENSLLEG00000003830 CYFIP1 (ENSLLEG00000003758) NIPA2 (ENSLLEG00000003738) NIPA1 (ENSLLEG00000003728) HERC2 (ENSLLEG00000003393) ENSLLEG00000003320 OCA2 (ENSLLEG00000003260) ENSLLEG00000002936 ENSLLEG00000002883 GABRA5 (ENSLLEG00000002842) GABRB3 (ENSLLEG00000002817) ENSLLEG00000002803 ATP10A (ENSLLEG00000002740) ENSLLEG00000002717 ENSLLEG00000002703 UBE3A (ENSLLEG00000002514) #22 CNGA3 (ENSLLEG00000002325) ENSLLEG00000002251 ENSLLEG00000002238 ENSLLEG00000002230 ENSLLEG00000002214 TMEM131 (ENSLLEG00000002009) ENSLLEG00000001947 ENSLLEG00000001912 INPP4A (ENSLLEG00000001549) COA5 (ENSLLEG00000001426) UNC50 (ENSLLEG00000001403) MGAT4A (ENSLLEG00000001320) ENSLLEG00000001293 CRACDL (ENSLLEG00000001259) TSGA10 (ENSLLEG00000001181) Coelacanth MODERN SPECIES 503 ATP10A (ENSLACG00000015393) UBE3A (ENSLACG00000014094) #22 CNGA3 (ENSLACG00000013592) VWA3B (ENSLACG00000011560) TMEM131 (ENSLACG00000008648) si:ch211-201h21.5 (ENSLACG00000008376) ENSLACG00000008216 si:dkey-4e7.3 (ENSLACG00000005781) INPP4A (ENSLACG00000003362) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00910000148238 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237 ENSGT01010000222692 ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000163631 ENSGT00940000159229 ENSGT00940000156596 ENSGT00390000014623 ENSGT00940000157953 ENSGT00940000154035.b ENSGT00940000166849 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00910000148238 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237 ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C ENSGT00390000010760 ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ENSGT00940000157829 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607 ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000156074.b ENSGT00910000148238 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237 ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C ENSGT00390000010760.f ENSGT00510000047120.fb ENSGT00950000182900.C ENSGT00940000157829 ENSGT00950000183022.a.b Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 124 ENSGT00940000158262.e ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651.a ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.kc ENSGT00940000156234 ENSGT00940000154713.A.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050 #22 ENSGT00940000158737 ENSGT00940000157237 ENSGT00530000063614.a.a.eb ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT01030000234579.C.i ENSGT00390000010760.f.a ENSGT00510000047120.gb ENSGT00950000182900.C ENSGT00940000157829 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000182827.A ENSGT00940000164470.c Asian bonytongue MODERN SPECIES rgn (ENSSFOG00015004298) rp2 (ENSSFOG00015005995) slc9a7 (ENSSFOG00015006030) CHST7 (ENSSFOG00015006054) tubgcp5 (ENSSFOG00015006068) cyfip1 (ENSSFOG00015006151) nipa2 (ENSSFOG00015006285) nipa1 (ENSSFOG00015033279) nipa1 (ENSSFOG00015026378) HERC2 (ENSSFOG00015006364) OCA2 (ENSSFOG00015006599) GABRG3 (ENSSFOG00015006679) GABRA5 (ENSSFOG00015006720) GABRB3 (ENSSFOG00015006754) ATP10A (ENSSFOG00015006790) ube3a (ENSSFOG00015006861) #22 CNGA3 (ENSSFOG00015006893) ENSSFOG00015006964 ENSSFOG00015032039 TMEM131 (ENSSFOG00015007016) si:ch211-201h21.5 (ENSSFOG00015030276) BIVM (ENSSFOG00015026667) zgc:172121 (ENSSFOG00015007372) atp1b1b (ENSSFOG00015007427) dpt (ENSSFOG00015007450) MPC2 (ENSSFOG00015007472) dcaf6 (ENSSFOG00015007509) gpr161b (ENSSFOG00015030679) ENSSFOG00015007562 atg3 (ENSSFOG00015007610) slc35a5 (ENSSFOG00015024319) P. kingsleyae MODERN SPECIES 64 rgn (ENSPKIG00000022567) jade3 (ENSPKIG00000022601) rp2 (ENSPKIG00000022632) slc9a7 (ENSPKIG00000022662) CHST7 (ENSPKIG00000022718) tubgcp5 (ENSPKIG00000022759) cyfip1 (ENSPKIG00000022844) nipa2 (ENSPKIG00000022900) nipa1 (ENSPKIG00000022922) HERC2 (ENSPKIG00000022987) OCA2 (ENSPKIG00000023109) GABRG3 (ENSPKIG00000023170) GABRA5 (ENSPKIG00000023202) GABRB3 (ENSPKIG00000023229) ATP10A (ENSPKIG00000023262) ube3a (ENSPKIG00000023315) #22 CNGA3 (ENSPKIG00000023349) ENSPKIG00000023366 ENSPKIG00000023414 TMEM131 (ENSPKIG00000002555) si:ch211-201h21.5 (ENSPKIG00000002759) BIVM (ENSPKIG00000002784) zgc:172121 (ENSPKIG00000002811) atp1b1b (ENSPKIG00000002842) dpt (ENSPKIG00000002873) mpc2a (ENSPKIG00000002913) dcaf6 (ENSPKIG00000002944) gpr161b (ENSPKIG00000002988) SLC19A2 (ENSPKIG00000003038) atg3 (ENSPKIG00000003083) slc35a5 (ENSPKIG00000003144) Clupeocephala DUPLICATION Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 99 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000156074.b ENSGT00910000148238 ENSGT00940000158737.g ENSGT00940000157237 ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C ENSGT00390000010760.f ENSGT00950000186445 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 228 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00940000157237 ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.k ENSGT00390000010760.f ENSGT00950000186445 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000156234.b ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00940000158197.c ENSGT00950000182882.A.a.i.a ENSGT00390000002307.f.a ENSGT00940000159065.b ENSGT00940000155473.c.b ENSGT00940000163886.B.b.b ENSGT00940000153336.a.b ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.h ENSGT00940000163160.b ENSGT00940000159991.A.a ENSGT01050000244905.C ENSGT00500000045104 ENSGT01030000235281 ENSGT00940000164002.k.b Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00940000158197.c ENSGT00950000182882.A.a.i.a ENSGT00390000002307.f.a ENSGT00940000159065.b ENSGT00940000155473.c.b ENSGT00940000163886.B.b.b ENSGT00940000153336.a.b ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.h ENSGT00940000163160.b.f ENSGT01050000244905.C ENSGT00500000045104 ENSGT01030000235281 ENSGT00940000164002.k.b ENSGT00530000063603.A Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00940000158197.c ENSGT00950000182882.A.a.i.a ENSGT00390000002307.f.a ENSGT00940000159065.b ENSGT00940000155473.c.b ENSGT00940000163886.B.b.b ENSGT00940000153336.a.b ENSGT00940000163160.b.f ENSGT01050000244905.C ENSGT00500000045104 ENSGT01030000235281 ENSGT00940000164002.k.b ENSGT00530000063603.A ENSGT00390000006679.a.e Characoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00940000165545 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00940000158197.c ENSGT00950000182882.A.a.i.a ENSGT00390000002307.f.a ENSGT00940000159065.b ENSGT00940000155473.c.b ENSGT00940000163886.B.b.b ENSGT00940000153336.a.b ENSGT00940000163160.b.f ENSGT01050000244905.C ENSGT00500000045104 ENSGT01030000235281 ENSGT00940000164002.k.b ENSGT00530000063603.A ENSGT00390000006679.a.e Red-bellied piranha MODERN SPECIES 9 jade3 (ENSPNAG00000002125) rp2 (ENSPNAG00000002142) slc9a7 (ENSPNAG00000012243) CHST7 (ENSPNAG00000012249) tubgcp5 (ENSPNAG00000012334) ENSPNAG00000012350 cyfip1 (ENSPNAG00000012434) nipa2 (ENSPNAG00000004709) nipa1 (ENSPNAG00000012489) HERC2 (ENSPNAG00000012669) OCA2 (ENSPNAG00000012887) GABRG3 (ENSPNAG00000012942) GABRA5 (ENSPNAG00000012974) GABRB3 (ENSPNAG00000013009) ATP10A (ENSPNAG00000013054) ube3a (ENSPNAG00000013092) #22 CNGA3 (ENSPNAG00000002562) stk35l (ENSPNAG00000013127) bin2b (ENSPNAG00000013138) slc48a1b (ENSPNAG00000002595) ENSPNAG00000002603 vdrb (ENSPNAG00000002636) ENSPNAG00000002657 eif4bb (ENSPNAG00000013294) ENSPNAG00000002766 ZNF385A (ENSPNAG00000013499) gpr84 (ENSPNAG00000013506) stat2 (ENSPNAG00000002807) ENSPNAG00000002812 tac3b (ENSPNAG00000013554) ENSPNAG00000013564 Mexicana tetra MODERN SPECIES 4 rp2 (ENSAMXG00000012578) slc9a7 (ENSAMXG00000012597) CHST7 (ENSAMXG00000025645) tubgcp5 (ENSAMXG00000012630) ENSAMXG00000025646 cyfip1 (ENSAMXG00000012657) nipa2 (ENSAMXG00000033701) nipa1 (ENSAMXG00000012689) ENSAMXG00000039716 HERC2 (ENSAMXG00000012725) oca2 (ENSAMXG00000012753) GABRG3 (ENSAMXG00000040268) GABRA5 (ENSAMXG00000012810) GABRB3 (ENSAMXG00000012837) ATP10A (ENSAMXG00000012884) ube3a (ENSAMXG00000012931) #22 CNGA3 (ENSAMXG00000035630) stk35l (ENSAMXG00000034115) bin2b (ENSAMXG00000012969) slc48a1b (ENSAMXG00000012982) ENSAMXG00000012988 vdrb (ENSAMXG00000012991) ENSAMXG00000013003 eif4bb (ENSAMXG00000034236) ENSAMXG00000013020 gpr84 (ENSAMXG00000025647) stat2 (ENSAMXG00000013030) ENSAMXG00000025648 tac3b (ENSAMXG00000035575) ENSAMXG00000029418 os9 (ENSAMXG00000001387) Electric eel MODERN SPECIES 90 ENSEEEG00000017397 CHST7 (ENSEEEG00000017399) tubgcp5 (ENSEEEG00000017418) cyfip1 (ENSEEEG00000017891) ENSEEEG00000018004 nipa2 (ENSEEEG00000018005) nipa1 (ENSEEEG00000018006) HERC2 (ENSEEEG00000018027) OCA2 (ENSEEEG00000018509) GABRG3 (ENSEEEG00000018515) ENSEEEG00000018518 ENSEEEG00000018520 GABRA5 (ENSEEEG00000018521) GABRB3 (ENSEEEG00000018527) ATP10A (ENSEEEG00000018533) ube3a (ENSEEEG00000018565) #22 CNGA3 (ENSEEEG00000018671) stk35l (ENSEEEG00000018710) bin2b (ENSEEEG00000018712) slc48a1b (ENSEEEG00000018715) ENSEEEG00000018717 vdrb (ENSEEEG00000018719) ENSEEEG00000018747 NCAM2 (ENSEEEG00000018749) gart (ENSEEEG00000018757) n6amt1 (ENSEEEG00000018764) ENSEEEG00000018765 ADAMTS5 (ENSEEEG00000018766) ADAMTS1 (ENSEEEG00000018771) cyyr1 (ENSEEEG00000018820) APP (ENSEEEG00000018915) Channel catfish MODERN SPECIES 2 tubgcp5 (ENSIPUG00000022415) cyfip1 (ENSIPUG00000022348) nipa2 (ENSIPUG00000022332) nipa1 (ENSIPUG00000022326) HERC2 (ENSIPUG00000022191) ENSIPUG00000022170 ENSIPUG00000022159 ENSIPUG00000022147 OCA2 (ENSIPUG00000022131) ENSIPUG00000022120 GABRG3 (ENSIPUG00000022110) GABRA5 (ENSIPUG00000022090) gabrb3 (ENSIPUG00000022064) ENSIPUG00000022059 atp10a (ENSIPUG00000022026) ube3a (ENSIPUG00000021987) #22 ENSIPUG00000021967 STK35 (ENSIPUG00000021958) bin2b (ENSIPUG00000021942) slc48a1b (ENSIPUG00000021934) ENSIPUG00000021921 mettl7a.1 (ENSIPUG00000021914) CREB1 (ENSIPUG00000021884) atf1 (ENSIPUG00000021869) ENSIPUG00000021709 atf7b (ENSIPUG00000021679) ENSIPUG00000021659 pfdn5 (ENSIPUG00000021641) espl1 (ENSIPUG00000021575) ENSIPUG00000021565 ENSIPUG00000021556 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.b ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00940000158197.c ENSGT00950000182882.A.a.i.a ENSGT00390000002307.f.a ENSGT00940000159065.b ENSGT00940000155473.c.b ENSGT00940000163886.B.b.b ENSGT00940000153336.a.b ENSGT00940000163160.b.c.b ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.h.b ENSGT00940000161671 ENSGT01050000244905.C ENSGT00500000045104 ENSGT00530000063603.A ENSGT00390000006679.a.e Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 131 ENSGT00940000158722.v ENSGT00940000158262.n ENSGT00940000153460.c.a.f ENSGT00940000162231.e ENSGT00940000155962.w ENSGT00500000044831.a.b.j ENSGT00940000165545.f ENSGT00940000155651.j.a ENSGT00940000159067.o ENSGT00940000154975.a ENSGT01030000234550.b.h ENSGT00940000155607.mc.a.c ENSGT00940000156234.b.b ENSGT00940000154713.A.c.a.d ENSGT00940000157895.t.a ENSGT00940000155050.a.a #22 ENSGT00940000158737.g.a ENSGT00940000158197.c.g.a ENSGT00950000182882.A.a.i.a.d ENSGT00390000002307.f.a.d ENSGT00940000159065.b.e ENSGT00940000155473.c.b.d Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 1973 ube3a (ENSCARG00000033628) #22 CNGA3 (ENSCARG00000033581) stk35l (ENSCARG00000033566) Goldfish MODERN SPECIES 46 quo (ENSCARG00000026217) DLGAP4 (ENSCARG00000026289) ENSCARG00000026299 DLGAP4 (ENSCARG00000026301) ENSCARG00000026306 myl9b (ENSCARG00000026314) ENSCARG00000026328 ENSCARG00000026425 tpra1 (ENSCARG00000026440) chchd6b (ENSCARG00000026746) PLXNA1 (ENSCARG00000026874) txnrd3 (ENSCARG00000028520) ENSCARG00000028753 orc4 (ENSCARG00000028779) ENSCARG00000028913 ube3a (ENSCARG00000029227) #22 ENSCARG00000029788 ENSCARG00000029798 ENSCARG00000029816 ENSCARG00000029825 ENSCARG00000029840 zeb2b (ENSCARG00000029862) lgals2b (ENSCARG00000030117) ENSCARG00000030143 zgc:92360 (ENSCARG00000030164) ENSCARG00000030409 ENSCARG00000031314 ENSCARG00000031365 ENSCARG00000031488 ENSCARG00000031504 ENSCARG00000031509 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158722.v ENSGT00940000158262.n ENSGT00940000153460.c.a.f ENSGT00940000162231.e ENSGT00940000155962.w ENSGT00500000044831.a.b.j ENSGT00940000165545.f ENSGT00940000155651.j.a ENSGT00940000159067.o ENSGT00940000154975.a ENSGT01030000234550.b.h ENSGT00940000155607.mc.a.c ENSGT00940000156234.b.b ENSGT00940000154713.A.c.a.d ENSGT00940000157895.t.a ENSGT00940000155050.a.a #22 ENSGT00940000158737.g.a ENSGT00940000158197.c.g.a ENSGT00950000182882.A.a.i.a.d ENSGT00390000002307.f.a.d ENSGT00940000159065.b.e ENSGT00940000155473.c.b.d ENSGT00940000163886.B.b.b.a ENSGT00940000153336.a.b.d ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.h.b.b ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.h.b.a.b.a ENSGT00940000161671.nb.b ENSGT01050000244905.C.l ENSGT00500000045104 ENSGT01030000235281.a ENSGT00940000164651.a.b.d Common carp reference MODERN SPECIES 10 ENSCCRG00000079938 ENSCCRG00000025666 jade3 (ENSCCRG00000025568) slc9a7 (ENSCCRG00000044453) CHST7 (ENSCCRG00000074968) tubgcp5 (ENSCCRG00000000848) ENSCCRG00000052986 cyfip1 (ENSCCRG00000000877) nipa2 (ENSCCRG00000001030) HERC2 (ENSCCRG00000001668) OCA2 (ENSCCRG00000028322) GABRG3 (ENSCCRG00000027104) GABRA5 (ENSCCRG00000077611) GABRB3 (ENSCCRG00000035195) ATP10A (ENSCCRG00000031378) ube3a (ENSCCRG00000038085) #22 ENSCCRG00000076097 stk35l (ENSCCRG00000054812) bin2b (ENSCCRG00000038248) slc48a1b (ENSCCRG00000060348) ENSCCRG00000054895 vdrb (ENSCCRG00000054349) ENSCCRG00000008501 eif4bb (ENSCCRG00000008516) ENSCCRG00000039686 ENSCCRG00000069639 ENSCCRG00000057996 gpr84 (ENSCCRG00000035006) stat2 (ENSCCRG00000049842) ENSCCRG00000036610 tac3b (ENSCCRG00000070609) Golden-line barbel MODERN SPECIES 66 rp2 (ENSSGRG00000012642) ENSSGRG00000012641 slc9a7 (ENSSGRG00000012639) CHST7 (ENSSGRG00000012637) tubgcp5 (ENSSGRG00000012629) ENSSGRG00000012628 cyfip1 (ENSSGRG00000009080) nipa2 (ENSSGRG00000009052) nipa1 (ENSSGRG00000009051) HERC2 (ENSSGRG00000007529) OCA2 (ENSSGRG00000007481) GABRG3 (ENSSGRG00000007480) GABRA5 (ENSSGRG00000007479) GABRB3 (ENSSGRG00000007476) ENSSGRG00000007475 ube3a (ENSSGRG00000006327) #22 CNGA3 (ENSSGRG00000006288) stk35l (ENSSGRG00000006287) bin2b (ENSSGRG00000006199) slc48a1b (ENSSGRG00000006198) ENSSGRG00000006197 vdrb (ENSSGRG00000005505) ENSSGRG00000005469 eif4bb (ENSSGRG00000005334) ENSSGRG00000005324 ENSSGRG00000005320 ENSSGRG00000004749 gpr84 (ENSSGRG00000004736) stat2 (ENSSGRG00000001411) ENSSGRG00000001152 tac3b (ENSSGRG00000001142) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 515 ENSGT00940000159067.p ENSGT00940000154975.b ENSGT01030000234550.b.g ENSGT00940000155607.mc.a.d ENSGT00940000156234.b.a ENSGT00940000154713.A.c.a.c ENSGT00940000157895.t.b ENSGT00940000155050.a.b #22 ENSGT00940000158737.g.b ENSGT00940000158197.c.g.b ENSGT00950000182882.A.a.i.a.c ENSGT00390000002307.f.a.c ENSGT00940000159065.b.f ENSGT00940000155473.c.b.c ENSGT00940000163886.B.b.b.b ENSGT00940000153336.a.b.c ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.h.b.a.a ENSGT00940000163160.b.c.b ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.h.b.a.b.b ENSGT00940000161671.nb.a ENSGT01050000244905.C.k Goldfish MODERN SPECIES 24 H6PD (ENSCARG00000047425) epha2a (ENSCARG00000047562) rbm19 (ENSCARG00000047670) cntn4 (ENSCARG00000048270) ENSCARG00000056867 ENSCARG00000062000 ENSCARG00000064643 pdzrn3b (ENSCARG00000064823) ppp4r2b (ENSCARG00000017325) gxylt2 (ENSCARG00000017360) shq1 (ENSCARG00000017391) rybpb (ENSCARG00000017435) prok2 (ENSCARG00000017460) gpr27 (ENSCARG00000017466) ATP10A (ENSCARG00000017533) ube3a (ENSCARG00000018573) #22 ENSCARG00000018944 stk35l (ENSCARG00000018954) bin2b (ENSCARG00000018963) slc48a1b (ENSCARG00000018999) ENSCARG00000019005 vdrb (ENSCARG00000019030) eif4bb (ENSCARG00000019145) ENSCARG00000019359 gpr84 (ENSCARG00000019362) stat2 (ENSCARG00000019373) c1galt1lb (ENSCARG00000019411) os9 (ENSCARG00000019418) B4GALNT1 (ENSCARG00000019447) ENSCARG00000019473 krt4 (ENSCARG00000019622) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 427 ENSGT00940000159067.p ENSGT00940000154975.b ENSGT01030000234550.b.g ENSGT00940000155607.mc.a.d ENSGT00940000156234.b.a ENSGT00940000154713.A.c.a.c ENSGT00940000157895.t.b ENSGT00940000155050.a.b #22 ENSGT00940000158737.g.b ENSGT00940000158197.c.g.b ENSGT00950000182882.A.a.i.a.c ENSGT00390000002307.f.a.c ENSGT00940000159065.b.f ENSGT00940000155473.c.b.c ENSGT00940000163886.B.b.b.b ENSGT00940000153336.a.b.c ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.h.b.a.a ENSGT00940000163160.b.c.b ENSGT00940000163852.c.a.b.a.a.h.b.a.b.b ENSGT00940000161671.nb.a ENSGT01050000244905.C.k Common carp reference MODERN SPECIES 16 slc9a7 (ENSCCRG00000058499) CHST7 (ENSCCRG00000027625) tubgcp5 (ENSCCRG00000045823) cyfip1 (ENSCCRG00000000971) ENSCCRG00000064095 nipa2 (ENSCCRG00000075202) nipa1 (ENSCCRG00000001039) HERC2 (ENSCCRG00000001082) OCA2 (ENSCCRG00000002053) GABRG3 (ENSCCRG00000080958) GABRA5 (ENSCCRG00000035226) GABRB3 (ENSCCRG00000063713) ENSCCRG00000072178 ENSCCRG00000066514 ATP10A (ENSCCRG00000035271) ube3a (ENSCCRG00000037977) #22 ENSCCRG00000003356 stk35l (ENSCCRG00000082287) bin2b (ENSCCRG00000072295) slc48a1b (ENSCCRG00000038273) ENSCCRG00000038279 vdrb (ENSCCRG00000038292) ENSCCRG00000055328 eif4bb (ENSCCRG00000039040) ENSCCRG00000079910 ENSCCRG00000062273 gpr84 (ENSCCRG00000056452) stat2 (ENSCCRG00000073657) tac3b (ENSCCRG00000036608) c1galt1lb (ENSCCRG00000040429) os9 (ENSCCRG00000036546) Golden-line barbel MODERN SPECIES 46 jade3 (ENSSGRG00000039295) rp2 (ENSSGRG00000039294) slc9a7 (ENSSGRG00000039293) CHST7 (ENSSGRG00000039292) tubgcp5 (ENSSGRG00000039215) cyfip1 (ENSSGRG00000036665) nipa2 (ENSSGRG00000036611) nipa1 (ENSSGRG00000036610) HERC2 (ENSSGRG00000036561) ENSSGRG00000036536 OCA2 (ENSSGRG00000036533) GABRG3 (ENSSGRG00000036507) GABRA5 (ENSSGRG00000036505) GABRB3 (ENSSGRG00000036179) ATP10A (ENSSGRG00000035935) ube3a (ENSSGRG00000035877) #22 CNGA3 (ENSSGRG00000035849) ENSSGRG00000035847 bin2b (ENSSGRG00000035845) slc48a1b (ENSSGRG00000035843) ENSSGRG00000035839 vdrb (ENSSGRG00000035428) ENSSGRG00000035421 eif4bb (ENSSGRG00000035358) ENSSGRG00000035355 ENSSGRG00000035354 ENSSGRG00000035279 ENSSGRG00000035148 gpr84 (ENSSGRG00000035145) stat2 (ENSSGRG00000032765) ENSSGRG00000032732 Zebrafish MODERN SPECIES 21 ENSDARG00000091465 ENSDARG00000088798 jade3 (ENSDARG00000019614) rp2 (ENSDARG00000044339) slc9a7 (ENSDARG00000076754) CHST7 (ENSDARG00000044341) tubgcp5 (ENSDARG00000077442) cyfip1 (ENSDARG00000044345) nipa2 (ENSDARG00000055912) nipa1 (ENSDARG00000055917) HERC2 (ENSDARG00000073841) OCA2 (ENSDARG00000061303) GABRA5 (ENSDARG00000070730) GABRB3 (ENSDARG00000023771) ATP10A (ENSDARG00000061039) ube3a (ENSDARG00000055737) #22 CNGA3 (ENSDARG00000070726) stk35l (ENSDARG00000057497) bin2b (ENSDARG00000010255) slc48a1b (ENSDARG00000026109) ENSDARG00000073850 vdrb (ENSDARG00000070721) ENSDARG00000068397 eif4bb (ENSDARG00000010194) prss60.1 (ENSDARG00000070713) prss60.2 (ENSDARG00000055644) ENSDARG00000070710 gpr84 (ENSDARG00000077308) stat2 (ENSDARG00000031647) ENSDARG00000090980 tac3b (ENSDARG00000097596) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 221 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00940000165545 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.b.k ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00940000157237 ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES 126 ATP10A (ENSDCDG00000007301) ube3a (ENSDCDG00000006635) #22 CNGA3 (ENSDCDG00000006184) ENSDCDG00000006032 si:ch211-201h21.5 (ENSDCDG00000005968) ENSDCDG00000005925 Denticle herring MODERN SPECIES 4 rp2 (ENSDCDG00000024063) slc9a7 (ENSDCDG00000022037) CHST7 (ENSDCDG00000021934) tubgcp5 (ENSDCDG00000020847) ENSDCDG00000020820 cyfip1 (ENSDCDG00000019074) nipa2 (ENSDCDG00000027509) nipa1 (ENSDCDG00000027506) HERC2 (ENSDCDG00000026466) OCA2 (ENSDCDG00000025645) ENSDCDG00000025588 GABRG3 (ENSDCDG00000025034) GABRA5 (ENSDCDG00000024945) GABRB3 (ENSDCDG00000024632) ATP10A (ENSDCDG00000024618) ube3a (ENSDCDG00000024573) #22 CNGA3 (ENSDCDG00000024560) ENSDCDG00000024558 si:ch211-201h21.5 (ENSDCDG00000024550) ENSDCDG00000024523 si:ch211-201h21.5 (ENSDCDG00000024514) lsg1 (ENSDCDG00000024355) fam43a (ENSDCDG00000024324) ENSDCDG00000024316 XXYLT1 (ENSDCDG00000024307) ENSDCDG00000024284 impact (ENSDCDG00000024275) OSBPL1A (ENSDCDG00000021174) ttc39c (ENSDCDG00000021003) ENSDCDG00000020958 ankrd29 (ENSDCDG00000020934) Atlantic herring MODERN SPECIES 1 jade3 (ENSCHAG00000019597) rp2 (ENSCHAG00000019589) slc9a7 (ENSCHAG00000018651) CHST7 (ENSCHAG00000018614) tubgcp5 (ENSCHAG00000017991) ENSCHAG00000017971 cyfip1 (ENSCHAG00000015400) nipa2 (ENSCHAG00000015262) nipa1 (ENSCHAG00000015133) HERC2 (ENSCHAG00000010365) OCA2 (ENSCHAG00000009166) GABRG3 (ENSCHAG00000008396) GABRA5 (ENSCHAG00000007911) GABRB3 (ENSCHAG00000007780) ATP10A (ENSCHAG00000005587) ube3a (ENSCHAG00000005340) #22 CNGA3 (ENSCHAG00000005109) ENSCHAG00000005077 TMEM131 (ENSCHAG00000002010) si:ch211-201h21.5 (ENSCHAG00000001924) nexn (ENSCHAG00000001761) ENSCHAG00000001708 alkal1 (ENSCHAG00000001686) zgc:153738 (ENSCHAG00000001607) ENSCHAG00000001579 ENSCHAG00000001552 dmap1 (ENSCHAG00000001402) RNF220 (ENSCHAG00000001377) ENSCHAG00000001353 guk1b (ENSCHAG00000001313) guk1b (ENSCHAG00000001054) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000156074.b ENSGT00910000148238 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C ENSGT00390000010760.f ENSGT00950000186445 ENSGT00900000141090.s.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000156074.b ENSGT00910000148238 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000156074.b ENSGT00910000148238 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000156074.b ENSGT00910000148238 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.d ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00910000148238 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.d ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00910000148238 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00910000148238 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158262.h ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262.h ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262.h ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a Orange clownfish MODERN SPECIES 11 jade3 (ENSAPEG00000018014) rp2 (ENSAPEG00000018076) slc9a7 (ENSAPEG00000018111) CHST7 (ENSAPEG00000018180) tubgcp5 (ENSAPEG00000018201) cyfip1 (ENSAPEG00000018329) ENSAPEG00000018428 nipa2 (ENSAPEG00000018436) nipa1 (ENSAPEG00000018468) HERC2 (ENSAPEG00000018488) OCA2 (ENSAPEG00000018748) GABRG3 (ENSAPEG00000019002) GABRA5 (ENSAPEG00000019071) GABRB3 (ENSAPEG00000019394) ATP10A (ENSAPEG00000019418) ube3a (ENSAPEG00000019470) #22 CNGA3 (ENSAPEG00000019486) TMEM131 (ENSAPEG00000019535) si:ch211-201h21.5 (ENSAPEG00000020059) BIVM (ENSAPEG00000020084) zgc:172121 (ENSAPEG00000020113) nme7 (ENSAPEG00000020138) ATP1B1 (ENSAPEG00000020152) dpt (ENSAPEG00000020176) ENSAPEG00000020191 tp63 (ENSAPEG00000020207) tprg1 (ENSAPEG00000020253) lpp (ENSAPEG00000020353) bcl6aa (ENSAPEG00000020369) smx5 (ENSAPEG00000020375) INPP5D (ENSAPEG00000020416) Clown anemonefish MODERN SPECIES 2010 GABRA5 (ENSAOCG00000012122) GABRB3 (ENSAOCG00000012186) ATP10A (ENSAOCG00000012299) ube3a (ENSAOCG00000012341) #22 CNGA3 (ENSAOCG00000012372) TMEM131 (ENSAOCG00000012495) Spiny chromis MODERN SPECIES 470 ENSAPOG00000002807 nipa2 (ENSAPOG00000002781) ENSAPOG00000002750 HERC2 (ENSAPOG00000002726) OCA2 (ENSAPOG00000002545) GABRG3 (ENSAPOG00000002403) GABRA5 (ENSAPOG00000002390) GABRB3 (ENSAPOG00000002369) ATP10A (ENSAPOG00000002349) ube3a (ENSAPOG00000002314) #22 CNGA3 (ENSAPOG00000002306) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1107 ube3a (ENSSPAG00000013079) #22 CNGA3 (ENSSPAG00000013056) TMEM131 (ENSSPAG00000012836) si:ch211-201h21.5 (ENSSPAG00000012802) BIVM (ENSSPAG00000012774) zgc:172121 (ENSSPAG00000012760) nme7 (ENSSPAG00000012718) ATP1B1 (ENSSPAG00000012706) dpt (ENSSPAG00000012688) ENSSPAG00000012670 tp63 (ENSSPAG00000012597) ENSSPAG00000012586 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00910000148238 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000002629 ENSGT00950000182925.C.a.b ENSGT00940000162161.A ENSGT00910000144271.A.c.b.a.a.f.b.b ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000002629 ENSGT00950000182925.C.a.b ENSGT00940000162161.A ENSGT00910000144271.A.c.b.a.a.f.b.b.d.a ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000182925.C.a.b ENSGT00940000162161.A.o ENSGT00910000144271.A.c.b.a.a.f.b.b.c ENSGT00910000144271.A.c.b.a.a.f.b.b.d.a ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 301 cyfip1 (ENSHBUG00000015536) ENSHBUG00000000448 nipa2 (ENSHBUG00000015440) nipa1 (ENSHBUG00000015413) HERC2 (ENSHBUG00000015333) OCA2 (ENSHBUG00000015094) GABRG3 (ENSHBUG00000015077) GABRA5 (ENSHBUG00000015029) GABRB3 (ENSHBUG00000014943) ATP10A (ENSHBUG00000014907) ube3a (ENSHBUG00000014796) #22 CNGA3 (ENSHBUG00000014779) TMEM131 (ENSHBUG00000014737) si:ch211-201h21.5 (ENSHBUG00000013789) BIVM (ENSHBUG00000013770) zgc:172121 (ENSHBUG00000001071) nme7 (ENSHBUG00000013730) ATP1B1 (ENSHBUG00000013688) dpt (ENSHBUG00000000779) zbtb11 (ENSHBUG00000013524) tp63 (ENSHBUG00000013508) tprg1 (ENSHBUG00000013459) lpp (ENSHBUG00000013448) bcl6aa (ENSHBUG00000013427) smx5 (ENSHBUG00000000394) INPP5D (ENSHBUG00000013397) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000162161.A.o ENSGT00910000144271.A.c.b.a.a.f.b.b.c ENSGT00940000162161.A.p ENSGT00910000144271.A.c.b.a.a.f.b.b.d.a ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000162161.A.o ENSGT00910000144271.A.c.b.a.a.f.b.b.c ENSGT00940000162161.A.p ENSGT00910000144271.A.c.b.a.a.f.b.b.d.a ENSGT00500000044831.a.b.d ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a Eastern happy MODERN SPECIES 14 micos13 (ENSACLG00000023787) ENSACLG00000023799 ENSACLG00000023815 ENSACLG00000023853 cyfip1 (ENSACLG00000023873) ENSACLG00000023946 nipa2 (ENSACLG00000023955) nipa1 (ENSACLG00000024035) HERC2 (ENSACLG00000024080) OCA2 (ENSACLG00000024190) GABRG3 (ENSACLG00000024228) GABRA5 (ENSACLG00000024232) GABRB3 (ENSACLG00000024236) ENSACLG00000024240 ATP10A (ENSACLG00000024242) ube3a (ENSACLG00000024258) #22 CNGA3 (ENSACLG00000024274) TMEM131 (ENSACLG00000024288) si:ch211-201h21.5 (ENSACLG00000024313) BIVM (ENSACLG00000024318) zgc:172121 (ENSACLG00000024325) nme7 (ENSACLG00000024393) atp1b1b (ENSACLG00000024438) dpt (ENSACLG00000024467) zbtb11 (ENSACLG00000024481) tp63 (ENSACLG00000024498) ENSACLG00000024556 ENSACLG00000024560 tprg1 (ENSACLG00000024576) lpp (ENSACLG00000024600) bcl6aa (ENSACLG00000024631) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1105 micos13 (ENSMZEG00005007321) ENSMZEG00005007324 ENSMZEG00005007355 ENSMZEG00005007409 cyfip1 (ENSMZEG00005007432) ENSMZEG00005007480 nipa2 (ENSMZEG00005007498) nipa1 (ENSMZEG00005007547) ENSMZEG00005007589 HERC2 (ENSMZEG00005007614) OCA2 (ENSMZEG00005007757) GABRG3 (ENSMZEG00005007851) GABRA5 (ENSMZEG00005007892) GABRB3 (ENSMZEG00005007922) ATP10A (ENSMZEG00005007941) ube3a (ENSMZEG00005007977) #22 CNGA3 (ENSMZEG00005008008) TMEM131 (ENSMZEG00005008057) si:ch211-201h21.5 (ENSMZEG00005008334) BIVM (ENSMZEG00005008383) zgc:172121 (ENSMZEG00005008403) nme7 (ENSMZEG00005008419) ATP1B1 (ENSMZEG00005008447) dpt (ENSMZEG00005008462) ENSMZEG00005008484 ENSMZEG00005008492 ENSMZEG00005008500 tp63 (ENSMZEG00005008516) tp63 (ENSMZEG00005008535) tprg1 (ENSMZEG00005008561) lpp (ENSMZEG00005008596) P. nyererei MODERN SPECIES 318 micos13 (ENSPNYG00000017550) ENSPNYG00000017558 ENSPNYG00000017575 ENSPNYG00000017596 cyfip1 (ENSPNYG00000017634) ENSPNYG00000017705 nipa2 (ENSPNYG00000017719) nipa1 (ENSPNYG00000017735) ENSPNYG00000017744 HERC2 (ENSPNYG00000017776) OCA2 (ENSPNYG00000017981) GABRG3 (ENSPNYG00000018192) GABRA5 (ENSPNYG00000018217) GABRB3 (ENSPNYG00000018243) ATP10A (ENSPNYG00000018279) ube3a (ENSPNYG00000018338) #22 CNGA3 (ENSPNYG00000018402) TMEM131 (ENSPNYG00000018471) si:ch211-201h21.5 (ENSPNYG00000018878) BIVM (ENSPNYG00000018896) zgc:172121 (ENSPNYG00000018926) nme7 (ENSPNYG00000018965) ATP1B1 (ENSPNYG00000019105) dpt (ENSPNYG00000019116) ENSPNYG00000019136 ENSPNYG00000019146 tp63 (ENSPNYG00000019171) tprg1 (ENSPNYG00000019230) lpp (ENSPNYG00000019245) bcl6aa (ENSPNYG00000019267) smx5 (ENSPNYG00000019298) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 307 hsd11b1la (ENSNBRG00000011488) micos13 (ENSNBRG00000011498) ENSNBRG00000011512 ENSNBRG00000011574 cyfip1 (ENSNBRG00000011634) ENSNBRG00000011722 nipa2 (ENSNBRG00000011743) nipa1 (ENSNBRG00000011798) ENSNBRG00000011839 HERC2 (ENSNBRG00000011878) OCA2 (ENSNBRG00000012100) GABRG3 (ENSNBRG00000012277) GABRA5 (ENSNBRG00000012332) ENSNBRG00000012355 ATP10A (ENSNBRG00000012378) ube3a (ENSNBRG00000012434) #22 CNGA3 (ENSNBRG00000012465) TMEM131 (ENSNBRG00000012482) si:ch211-201h21.5 (ENSNBRG00000012500) ENSNBRG00000012521 zgc:172121 (ENSNBRG00000012573) nme7 (ENSNBRG00000012586) ATP1B1 (ENSNBRG00000012617) dpt (ENSNBRG00000012642) ENSNBRG00000012666 ENSNBRG00000012678 tp63 (ENSNBRG00000012703) tprg1 (ENSNBRG00000012761) lpp (ENSNBRG00000012846) bcl6aa (ENSNBRG00000012880) smx5 (ENSNBRG00000012904) Nile tilapia MODERN SPECIES 14 ENSONIG00000039748 ENSONIG00000004875 ENSONIG00000002393 ENSONIG00000038968 ENSONIG00000002396 ENSONIG00000032470 cyfip1 (ENSONIG00000004878) nipa2 (ENSONIG00000004884) nipa1 (ENSONIG00000004886) HERC2 (ENSONIG00000004888) OCA2 (ENSONIG00000004896) GABRG3 (ENSONIG00000004903) GABRA5 (ENSONIG00000019352) GABRB3 (ENSONIG00000019350) ATP10A (ENSONIG00000019347) ube3a (ENSONIG00000019346) #22 CNGA3 (ENSONIG00000019344) TMEM131 (ENSONIG00000019341) si:ch211-201h21.5 (ENSONIG00000019338) BIVM (ENSONIG00000019337) zgc:172121 (ENSONIG00000019336) ATP1B1 (ENSONIG00000019331) nme7 (ENSONIG00000019333) zbtb11 (ENSONIG00000019328) tp63 (ENSONIG00000019325) tprg1 (ENSONIG00000019324) lpp (ENSONIG00000019323) bcl6aa (ENSONIG00000019322) smx5 (ENSONIG00000019321) INPP5D (ENSONIG00000019319) GPR17 (ENSONIG00000021192) Midas cichlid MODERN SPECIES 182 ATP10A (ENSACIG00000009063) ube3a (ENSACIG00000009036) #22 ENSACIG00000009023 CNGA3 (ENSACIG00000009001) EFNA2 (ENSACIG00000008985) Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.d.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000179813 ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000179813 ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 71 rp2 (ENSKMAG00000016316) slc9a7 (ENSKMAG00000016266) CHST7 (ENSKMAG00000016251) tubgcp5 (ENSKMAG00000016160) ENSKMAG00000016135 cyfip1 (ENSKMAG00000016064) nipa2 (ENSKMAG00000016044) nipa1 (ENSKMAG00000016035) ENSKMAG00000016023 HERC2 (ENSKMAG00000015883) OCA2 (ENSKMAG00000015767) GABRG3 (ENSKMAG00000015710) GABRA5 (ENSKMAG00000015685) GABRB3 (ENSKMAG00000015618) ATP10A (ENSKMAG00000015579) ube3a (ENSKMAG00000015531) #22 CNGA3 (ENSKMAG00000015496) TMEM131 (ENSKMAG00000015433) ENSKMAG00000015395 si:ch211-201h21.5 (ENSKMAG00000015377) BIVM (ENSKMAG00000015343) zgc:172121 (ENSKMAG00000015312) nme7 (ENSKMAG00000015255) ATP1B1 (ENSKMAG00000015208) dpt (ENSKMAG00000015183) ENSKMAG00000015169 tp63 (ENSKMAG00000015083) tprg1 (ENSKMAG00000015046) lpp (ENSKMAG00000015006) bcl6aa (ENSKMAG00000014942) smx5 (ENSKMAG00000014909) Turquoise killifish MODERN SPECIES 96 ATP10A (ENSNFUG00015016898) ube3a (ENSNFUG00015016749) #22 CNGA3 (ENSNFUG00015016631) TMEM131 (ENSNFUG00015016567) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000179813 ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a ENSGT01100000263537.b.a.a.b.a Poecilia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00940000165545 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00940000165545 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m.h ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a Sailfin molly MODERN SPECIES 7 slc9a7 (ENSPLAG00000015631) CHST7 (ENSPLAG00000015639) tubgcp5 (ENSPLAG00000015687) ENSPLAG00000015712 cyfip1 (ENSPLAG00000015768) nipa2 (ENSPLAG00000015797) nipa1 (ENSPLAG00000015813) ENSPLAG00000015823 HERC2 (ENSPLAG00000016017) OCA2 (ENSPLAG00000016071) GABRG3 (ENSPLAG00000016110) GABRA5 (ENSPLAG00000016137) GABRB3 (ENSPLAG00000016158) ENSPLAG00000016169 ATP10A (ENSPLAG00000016210) ube3a (ENSPLAG00000016233) #22 CNGA3 (ENSPLAG00000016246) TMEM131 (ENSPLAG00000016326) si:ch211-201h21.5 (ENSPLAG00000016348) BIVM (ENSPLAG00000016371) Amazon molly MODERN SPECIES 529 ube3a (ENSPFOG00000000124) #22 CNGA3 (ENSPFOG00000000150) TMEM131 (ENSPFOG00000000186) si:ch211-201h21.5 (ENSPFOG00000000336) BIVM (ENSPFOG00000000352) zgc:172121 (ENSPFOG00000000396) nme7 (ENSPFOG00000000431) ATP1B1 (ENSPFOG00000000553) dpt (ENSPFOG00000000620) ENSPFOG00000000687 tp63 (ENSPFOG00000000910) tprg1 (ENSPFOG00000001285) lpp (ENSPFOG00000001466) bcl6aa (ENSPFOG00000001561) smx5 (ENSPFOG00000001621) INPP5D (ENSPFOG00000021881) Guppy MODERN SPECIES 456 rp2 (ENSPREG00000017573) slc9a7 (ENSPREG00000017526) CHST7 (ENSPREG00000017516) tubgcp5 (ENSPREG00000017469) ENSPREG00000017454 cyfip1 (ENSPREG00000017400) nipa2 (ENSPREG00000017373) nipa1 (ENSPREG00000017336) ENSPREG00000017320 ENSPREG00000017229 OCA2 (ENSPREG00000017194) GABRG3 (ENSPREG00000017169) GABRA5 (ENSPREG00000017152) GABRB3 (ENSPREG00000017132) ATP10A (ENSPREG00000017091) ube3a (ENSPREG00000017057) #22 CNGA3 (ENSPREG00000017037) TMEM131 (ENSPREG00000016983) si:ch211-201h21.5 (ENSPREG00000016966) BIVM (ENSPREG00000016951) zgc:172121 (ENSPREG00000016924) nme7 (ENSPREG00000016758) ATP1B1 (ENSPREG00000016726) dpt (ENSPREG00000016712) ENSPREG00000016663 tp63 (ENSPREG00000016639) tprg1 (ENSPREG00000016606) lpp (ENSPREG00000016583) bcl6aa (ENSPREG00000016542) smx5 (ENSPREG00000016534) INPP5D (ENSPREG00000016395) Platyfish MODERN SPECIES 23 jade3 (ENSXMAG00000015987) rp2 (ENSXMAG00000015995) slc9a7 (ENSXMAG00000015998) CHST7 (ENSXMAG00000019936) tubgcp5 (ENSXMAG00000016055) cyfip1 (ENSXMAG00000016084) ENSXMAG00000021011 nipa2 (ENSXMAG00000016124) nipa1 (ENSXMAG00000016132) HERC2 (ENSXMAG00000016133) OCA2 (ENSXMAG00000016171) GABRG3 (ENSXMAG00000010347) GABRA5 (ENSXMAG00000016186) GABRB3 (ENSXMAG00000027240) ATP10A (ENSXMAG00000016224) ube3a (ENSXMAG00000016297) #22 CNGA3 (ENSXMAG00000016327) TMEM131 (ENSXMAG00000016339) si:ch211-201h21.5 (ENSXMAG00000016370) BIVM (ENSXMAG00000016378) zgc:172121 (ENSXMAG00000016387) nme7 (ENSXMAG00000016394) ENSXMAG00000022152 dpt (ENSXMAG00000016415) zbtb11 (ENSXMAG00000016418) tp63 (ENSXMAG00000016425) tprg1 (ENSXMAG00000024347) lpp (ENSXMAG00000026661) bcl6aa (ENSXMAG00000016456) smx5 (ENSXMAG00000028018) INPP5D (ENSXMAG00000016471) NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000179813 ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 Mummichog MODERN SPECIES 2185 jade3 (ENSFHEG00000011945) rp2 (ENSFHEG00000011914) slc9a7 (ENSFHEG00000011876) CHST7 (ENSFHEG00000011826) tubgcp5 (ENSFHEG00000011813) cyfip1 (ENSFHEG00000011718) ENSFHEG00000011520 nipa2 (ENSFHEG00000011505) nipa1 (ENSFHEG00000011451) HERC2 (ENSFHEG00000011436) OCA2 (ENSFHEG00000011165) GABRG3 (ENSFHEG00000000243) GABRA5 (ENSFHEG00000010673) GABRB3 (ENSFHEG00000010670) ATP10A (ENSFHEG00000010635) ube3a (ENSFHEG00000010525) #22 CNGA3 (ENSFHEG00000010460) TMEM131 (ENSFHEG00000010417) si:ch211-201h21.5 (ENSFHEG00000010272) BIVM (ENSFHEG00000010250) zgc:172121 (ENSFHEG00000010218) nme7 (ENSFHEG00000010170) ATP1B1 (ENSFHEG00000010122) dpt (ENSFHEG00000009930) ENSFHEG00000009909 tp63 (ENSFHEG00000009856) tprg1 (ENSFHEG00000009756) lpp (ENSFHEG00000009724) bcl6aa (ENSFHEG00000009639) smx5 (ENSFHEG00000009619) INPP5D (ENSFHEG00000009590) Sheepshead minnow MODERN SPECIES 796 ndnf (ENSCVAG00000002096) ATP10A (ENSCVAG00000002090) ube3a (ENSCVAG00000002071) #22 CNGA3 (ENSCVAG00000002062) TMEM131 (ENSCVAG00000002057) ENSCVAG00000002040 si:ch211-201h21.5 (ENSCVAG00000002036) BIVM (ENSCVAG00000002031) zgc:172121 (ENSCVAG00000002025) nme7 (ENSCVAG00000002023) ATP1B1 (ENSCVAG00000002015) dpt (ENSCVAG00000002002) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.d.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a ENSGT01100000263537.b.a.a.b.a Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a ENSGT01100000263537.b.a.a.b.a Indian medaka MODERN SPECIES 13 jade3 (ENSOMEG00000004406) rp2 (ENSOMEG00000004324) slc9a7 (ENSOMEG00000004298) CHST7 (ENSOMEG00000004282) tubgcp5 (ENSOMEG00000004268) cyfip1 (ENSOMEG00000004203) ENSOMEG00000004072 nipa2 (ENSOMEG00000004059) nipa1 (ENSOMEG00000004017) HERC2 (ENSOMEG00000003969) OCA2 (ENSOMEG00000003871) GABRG3 (ENSOMEG00000003739) GABRA5 (ENSOMEG00000003697) GABRB3 (ENSOMEG00000000649) ATP10A (ENSOMEG00000003604) ube3a (ENSOMEG00000003524) #22 CNGA3 (ENSOMEG00000003494) TMEM131 (ENSOMEG00000003442) BIVM (ENSOMEG00000003358) zgc:172121 (ENSOMEG00000003324) nme7 (ENSOMEG00000003291) ATP1B1 (ENSOMEG00000003241) dpt (ENSOMEG00000003058) zbtb11 (ENSOMEG00000003031) tp63 (ENSOMEG00000002996) tprg1 (ENSOMEG00000002969) lpp (ENSOMEG00000002950) bcl6aa (ENSOMEG00000002918) smx5 (ENSOMEG00000002892) INPP5D (ENSOMEG00000002876) GPR17 (ENSOMEG00000000061) Javanese ricefish MODERN SPECIES 18 ENSOJAG00000005071 ENSOJAG00000005062 jade3 (ENSOJAG00000005012) rp2 (ENSOJAG00000004974) slc9a7 (ENSOJAG00000004817) CHST7 (ENSOJAG00000004782) ENSOJAG00000004684 cyfip1 (ENSOJAG00000004536) nipa2 (ENSOJAG00000004455) nipa1 (ENSOJAG00000004419) OCA2 (ENSOJAG00000001674) GABRG3 (ENSOJAG00000001502) GABRA5 (ENSOJAG00000001471) GABRB3 (ENSOJAG00000001281) ATP10A (ENSOJAG00000001180) ube3a (ENSOJAG00000001085) #22 CNGA3 (ENSOJAG00000001045) BIVM (ENSOJAG00000000926) zgc:172121 (ENSOJAG00000000916) nme7 (ENSOJAG00000000826) ATP1B1 (ENSOJAG00000000760) dpt (ENSOJAG00000000754) tp63 (ENSOJAG00000000722) tprg1 (ENSOJAG00000000690) lpp (ENSOJAG00000000677) bcl6aa (ENSOJAG00000000663) smx5 (ENSOJAG00000000656) INPP5D (ENSOJAG00000000617) GPR17 (ENSOJAG00000000598) sap130a (ENSOJAG00000000219) amotl2a (ENSOJAG00000000111) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.d.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895.y ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a ENSGT01100000263537.b.a.a.b.a Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 18 jade3 (ENSORLG00000016052) rp2 (ENSORLG00000016045) slc9a7 (ENSORLG00000016036) CHST7 (ENSORLG00000016022) tubgcp5 (ENSORLG00000016018) ENSORLG00000015997 cyfip1 (ENSORLG00000015984) nipa2 (ENSORLG00000015929) nipa1 (ENSORLG00000015919) HERC2 (ENSORLG00000015913) oca2 (ENSORLG00000015893) GABRG3 (ENSORLG00000029938) GABRA5 (ENSORLG00000015867) GABRB3 (ENSORLG00000015836) ATP10A (ENSORLG00000015800) ube3a (ENSORLG00000015759) #22 CNGA3 (ENSORLG00000015748) TMEM131 (ENSORLG00000015740) BIVM (ENSORLG00000015711) zgc:172121 (ENSORLG00000015709) nme7 (ENSORLG00000015702) ENSORLG00000028494 dpt (ENSORLG00000028799) zbtb11 (ENSORLG00000015676) tp63 (ENSORLG00000015665) tprg1 (ENSORLG00000015610) lpp (ENSORLG00000015602) bcl6aa (ENSORLG00000015589) smx5 (ENSORLG00000029858) INPP5D (ENSORLG00000015584) GPR17 (ENSORLG00000015572) Chinese medaka MODERN SPECIES 95 jade3 (ENSOSIG00000008039) rp2 (ENSOSIG00000008198) slc9a7 (ENSOSIG00000008219) CHST7 (ENSOSIG00000009775) tubgcp5 (ENSOSIG00000009792) cyfip1 (ENSOSIG00000010070) ENSOSIG00000011463 nipa2 (ENSOSIG00000011465) nipa1 (ENSOSIG00000011470) OCA2 (ENSOSIG00000011692) GABRG3 (ENSOSIG00000013730) GABRA5 (ENSOSIG00000014213) ENSOSIG00000014215 GABRB3 (ENSOSIG00000014219) ATP10A (ENSOSIG00000014383) ube3a (ENSOSIG00000014433) #22 CNGA3 (ENSOSIG00000015947) TMEM131 (ENSOSIG00000015969) BIVM (ENSOSIG00000016317) zgc:172121 (ENSOSIG00000016323) nme7 (ENSOSIG00000016346) ENSOSIG00000016971 ATP1B1 (ENSOSIG00000016974) dpt (ENSOSIG00000016976) zbtb11 (ENSOSIG00000016977) tp63 (ENSOSIG00000016987) tprg1 (ENSOSIG00000017027) lpp (ENSOSIG00000017031) ENSOSIG00000017072 GPR17 (ENSOSIG00000017791) sap130a (ENSOSIG00000017881) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.d ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000156074.b ENSGT00910000148238 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.d ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00910000148238 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.d ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a Climbing perch MODERN SPECIES 17 jade3 (ENSATEG00000012713) rp2 (ENSATEG00000012683) slc9a7 (ENSATEG00000012632) CHST7 (ENSATEG00000012627) tubgcp5 (ENSATEG00000012523) ENSATEG00000012507 cyfip1 (ENSATEG00000012399) nipa2 (ENSATEG00000012354) nipa1 (ENSATEG00000012387) HERC2 (ENSATEG00000012078) OCA2 (ENSATEG00000012000) GABRG3 (ENSATEG00000011974) GABRA5 (ENSATEG00000011949) GABRB3 (ENSATEG00000028000) ATP10A (ENSATEG00000011849) ube3a (ENSATEG00000011812) #22 ENSATEG00000011786 ENSATEG00000011746 si:ch211-201h21.5 (ENSATEG00000011731) ENSATEG00000011710 zgc:172121 (ENSATEG00000030161) nme7 (ENSATEG00000011614) ENSATEG00000029473 dpt (ENSATEG00000011551) ENSATEG00000011539 tp63 (ENSATEG00000011498) tprg1 (ENSATEG00000011483) lpp (ENSATEG00000011442) bcl6aa (ENSATEG00000011384) smx5 (ENSATEG00000027281) ENSATEG00000011360 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 15 ENSBSLG00000003471 jade3 (ENSBSLG00000003473) rp2 (ENSBSLG00000003474) slc9a7 (ENSBSLG00000003480) CHST7 (ENSBSLG00000003487) tubgcp5 (ENSBSLG00000003488) cyfip1 (ENSBSLG00000003502) ENSBSLG00000003505 nipa2 (ENSBSLG00000003506) nipa1 (ENSBSLG00000003508) OCA2 (ENSBSLG00000003513) GABRG3 (ENSBSLG00000003514) GABRA5 (ENSBSLG00000003515) GABRB3 (ENSBSLG00000003516) ATP10A (ENSBSLG00000003517) ube3a (ENSBSLG00000003522) #22 CNGA3 (ENSBSLG00000003523) TMEM131 (ENSBSLG00000003525) si:ch211-201h21.5 (ENSBSLG00000003526) BIVM (ENSBSLG00000003527) zgc:172121 (ENSBSLG00000003528) nme7 (ENSBSLG00000003531) ATP1B1 (ENSBSLG00000003535) dpt (ENSBSLG00000003537) ENSBSLG00000003540 tp63 (ENSBSLG00000003548) lpp (ENSBSLG00000003550) bcl6aa (ENSBSLG00000000520) smx5 (ENSBSLG00000000623) INPP5D (ENSBSLG00000000668) ENSBSLG00000000724 Zig-zag eel MODERN SPECIES 18 rp2 (ENSMAMG00000012547) slc9a7 (ENSMAMG00000012503) CHST7 (ENSMAMG00000012492) tubgcp5 (ENSMAMG00000012416) ENSMAMG00000012407 cyfip1 (ENSMAMG00000012306) nipa2 (ENSMAMG00000012281) nipa1 (ENSMAMG00000012243) HERC2 (ENSMAMG00000012094) OCA2 (ENSMAMG00000011871) GABRG3 (ENSMAMG00000011836) GABRA5 (ENSMAMG00000010573) ENSMAMG00000028500 GABRB3 (ENSMAMG00000010538) ATP10A (ENSMAMG00000010499) ube3a (ENSMAMG00000010466) #22 ENSMAMG00000010447 ENSMAMG00000010374 si:ch211-201h21.5 (ENSMAMG00000010357) ENSMAMG00000010277 zgc:172121 (ENSMAMG00000010289) nme7 (ENSMAMG00000010221) ENSMAMG00000010199 dpt (ENSMAMG00000010188) ENSMAMG00000010180 tp63 (ENSMAMG00000010142) tprg1 (ENSMAMG00000026771) lpp (ENSMAMG00000010067) bcl6aa (ENSMAMG00000010010) smx5 (ENSMAMG00000010053) ENSMAMG00000009985 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00910000148238 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000165420 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a Turbot MODERN SPECIES 3 slc9a7 (ENSSMAG00000019578) CHST7 (ENSSMAG00000019672) tubgcp5 (ENSSMAG00000019676) cyfip1 (ENSSMAG00000019702) ENSSMAG00000019756 nipa2 (ENSSMAG00000019764) nipa1 (ENSSMAG00000019800) HERC2 (ENSSMAG00000019814) ENSSMAG00000021741 ENSSMAG00000023444 OCA2 (ENSSMAG00000019891) GABRG3 (ENSSMAG00000020062) GABRA5 (ENSSMAG00000020075) GABRB3 (ENSSMAG00000020084) ATP10A (ENSSMAG00000020092) ube3a (ENSSMAG00000020159) #22 ENSSMAG00000020180 ENSSMAG00000020195 si:ch211-201h21.5 (ENSSMAG00000020261) ENSSMAG00000020264 zgc:172121 (ENSSMAG00000000754) nme7 (ENSSMAG00000000794) ENSSMAG00000000869 dpt (ENSSMAG00000000904) zbtb11 (ENSSMAG00000000940) tp63 (ENSSMAG00000000978) tprg1 (ENSSMAG00000001003) lpp (ENSSMAG00000001016) bcl6aa (ENSSMAG00000001102) smx5 (ENSSMAG00000026432) ENSSMAG00000001138 Tongue sole MODERN SPECIES 11 sh3gl1b (ENSCSEG00000003235) rorca (ENSCSEG00000003244) SEMA6B (ENSCSEG00000003255) ENSCSEG00000003279 ENSCSEG00000003292 plin3 (ENSCSEG00000003294) rgl1 (ENSCSEG00000003296) colgalt2b (ENSCSEG00000003304) zgc:92140 (ENSCSEG00000003310) EDEM3 (ENSCSEG00000003313) ENSCSEG00000003321 ENSCSEG00000003325 dpt (ENSCSEG00000003326) nme7 (ENSCSEG00000003330) ATP1B1 (ENSCSEG00000003338) ube3a (ENSCSEG00000003344) #22 CNGA3 (ENSCSEG00000003357) TMEM131 (ENSCSEG00000003378) si:ch211-201h21.5 (ENSCSEG00000003423) BIVM (ENSCSEG00000003425) zgc:172121 (ENSCSEG00000003431) ENSCSEG00000003435 b3gnt5a (ENSCSEG00000003444) ect2 (ENSCSEG00000003447) ENSCSEG00000003458 lnx1 (ENSCSEG00000003465) gsx2 (ENSCSEG00000003487) pdgfra (ENSCSEG00000003502) ENSCSEG00000003542 kdr (ENSCSEG00000003569) tmem165 (ENSCSEG00000003591) Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000169724 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00910000148238 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 Seriola ANCESTRAL SPECIES 139 ENSGT00950000182930.C.f ENSGT00390000006932 ENSGT00950000182916.b ENSGT00940000156968 ENSGT00950000183070.a.a.mb.b ENSGT00390000000263 ENSGT00390000011943.b ENSGT00940000160274 ENSGT00390000008489 ENSGT00390000000568 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b Greater amberjack MODERN SPECIES 234 lrrc40 (ENSSDUG00000009744) phb2b (ENSSDUG00000009706) pde6d (ENSSDUG00000009693) rpl36 (ENSSDUG00000009676) lmnb2 (ENSSDUG00000009647) ENSSDUG00000009633 commd2 (ENSSDUG00000009619) TRAPPC8 (ENSSDUG00000009433) ube3a (ENSSDUG00000009378) #22 CNGA3 (ENSSDUG00000009340) TMEM131 (ENSSDUG00000009276) si:ch211-201h21.5 (ENSSDUG00000009255) BIVM (ENSSDUG00000009239) zgc:172121 (ENSSDUG00000009212) nme7 (ENSSDUG00000009171) ATP1B1 (ENSSDUG00000009143) dpt (ENSSDUG00000009134) ENSSDUG00000009123 tp63 (ENSSDUG00000009041) tprg1 (ENSSDUG00000008988) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2801 ENSSLDG00000013401 sass6 (ENSSLDG00000013374) ENSSLDG00000013421 lrrc40 (ENSSLDG00000013462) phb2b (ENSSLDG00000013525) pde6d (ENSSLDG00000013554) rpl36 (ENSSLDG00000013576) lmnb2 (ENSSLDG00000013615) commd2 (ENSSLDG00000013762) TRAPPC8 (ENSSLDG00000013797) ube3a (ENSSLDG00000013860) #22 CNGA3 (ENSSLDG00000013910) TMEM131 (ENSSLDG00000013977) si:ch211-201h21.5 (ENSSLDG00000014023) BIVM (ENSSLDG00000014041) zgc:172121 (ENSSLDG00000014067) nme7 (ENSSLDG00000014100) ATP1B1 (ENSSLDG00000014130) Barramundi perch MODERN SPECIES 106 ENSLCAG00010014230 jade3 (ENSLCAG00010014224) rp2 (ENSLCAG00010014220) slc9a7 (ENSLCAG00010014159) CHST7 (ENSLCAG00010014145) tubgcp5 (ENSLCAG00010014099) ENSLCAG00010014078 cyfip1 (ENSLCAG00010014059) nipa2 (ENSLCAG00010014048) nipa1 (ENSLCAG00010014047) OCA2 (ENSLCAG00010013690) GABRG3 (ENSLCAG00010013639) GABRA5 (ENSLCAG00010013480) GABRB3 (ENSLCAG00010013423) ATP10A (ENSLCAG00010013380) ube3a (ENSLCAG00010013353) #22 ENSLCAG00010013349 CNGA3 (ENSLCAG00010013347) TMEM131 (ENSLCAG00010012812) si:ch211-201h21.5 (ENSLCAG00010012663) BIVM (ENSLCAG00010012659) zgc:172121 (ENSLCAG00010012655) nme7 (ENSLCAG00010012402) ATP1B1 (ENSLCAG00010012327) dpt (ENSLCAG00010012319) ENSLCAG00010012311 ENSLCAG00010012309 ENSLCAG00010012299 tp63 (ENSLCAG00010012159) tprg1 (ENSLCAG00010012113) lpp (ENSLCAG00010012106) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a Tetraodon DUPLICATION Tetraodon MODERN SPECIES GTPBP6 (ENSTNIG00000010659) ENSTNIG00000010658 jade3 (ENSTNIG00000010657) rp2 (ENSTNIG00000010656) slc9a7 (ENSTNIG00000010655) tubgcp5 (ENSTNIG00000001039) cyfip1 (ENSTNIG00000000709) nipa2 (ENSTNIG00000010654) nipa1 (ENSTNIG00000010653) HERC2 (ENSTNIG00000010652) OCA2 (ENSTNIG00000010651) GABRG3 (ENSTNIG00000010650) GABRA5 (ENSTNIG00000010649) GABRB3 (ENSTNIG00000010648) ATP10A (ENSTNIG00000013785) ube3a (ENSTNIG00000013784) #22 CNGA3 (ENSTNIG00000013783) TMEM131 (ENSTNIG00000013782) si:ch211-201h21.5 (ENSTNIG00000013781) BIVM (ENSTNIG00000013780) zgc:172121 (ENSTNIG00000013779) nme7 (ENSTNIG00000013778) ATP1B1 (ENSTNIG00000013777) dpt (ENSTNIG00000013776) zbtb11 (ENSTNIG00000013775) tp63 (ENSTNIG00000013774) tprg1 (ENSTNIG00000013773) lpp (ENSTNIG00000013772) bcl6aa (ENSTNIG00000013771) smx5 (ENSTNIG00000013770) ENSTNIG00000013769 Tetraodon MODERN SPECIES gsx2 (ENSTNIG00000017658) pdgfra (ENSTNIG00000017657) ENSTNIG00000017656 kdr (ENSTNIG00000017655) srd5a3 (ENSTNIG00000017654) clocka (ENSTNIG00000017652) tmem165 (ENSTNIG00000017653) ENSTNIG00000000636 exoc1 (ENSTNIG00000017651) cep135 (ENSTNIG00000017650) chst14 (ENSTNIG00000017649) cracd (ENSTNIG00000017648) AASDH (ENSTNIG00000017647) ppat (ENSTNIG00000017646) paics (ENSTNIG00000017645) ube3a (ENSTNIG00000017644) #22 CNGA3 (ENSTNIG00000017643) OSBPL1A (ENSTNIG00000017642) impact (ENSTNIG00000017641) ENSTNIG00000017640 TGM1 (ENSTNIG00000017639) rabggta (ENSTNIG00000017638) ENSTNIG00000017637 CARMIL3 (ENSTNIG00000017636) nrl (ENSTNIG00000017635) ENSTNIG00000017634 ENSTNIG00000017633 ENSTNIG00000000466 ankrd29 (ENSTNIG00000017632) VPS4B (ENSTNIG00000017631) plekhb2 (ENSTNIG00000017630) Fugu MODERN SPECIES 12 slc9a7 (ENSTRUG00000010581) CHST7 (ENSTRUG00000024334) tubgcp5 (ENSTRUG00000010285) ENSTRUG00000023160 cyfip1 (ENSTRUG00000009773) nipa2 (ENSTRUG00000009666) nipa1 (ENSTRUG00000009660) HERC2 (ENSTRUG00000009456) OCA2 (ENSTRUG00000009101) GABRG3 (ENSTRUG00000008857) GABRA5 (ENSTRUG00000008335) GABRB3 (ENSTRUG00000007550) ATP10A (ENSTRUG00000007000) ENSTRUG00000033259 ENSTRUG00000031703 ube3a (ENSTRUG00000006748) #22 CNGA3 (ENSTRUG00000006545) TMEM131 (ENSTRUG00000006114) si:ch211-201h21.5 (ENSTRUG00000006027) BIVM (ENSTRUG00000005881) zgc:172121 (ENSTRUG00000005847) ENSTRUG00000030706 nme7 (ENSTRUG00000019681) dpt (ENSTRUG00000023954) ATP1B1 (ENSTRUG00000023651) zbtb11 (ENSTRUG00000004329) tp63 (ENSTRUG00000003420) tprg1 (ENSTRUG00000003153) lpp (ENSTRUG00000002677) bcl6aa (ENSTRUG00000002214) INPP5D (ENSTRUG00000001313) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a Ballan wrasse MODERN SPECIES 2 jade3 (ENSLBEG00000024310) rp2 (ENSLBEG00000024350) slc9a7 (ENSLBEG00000024380) CHST7 (ENSLBEG00000024417) tubgcp5 (ENSLBEG00000024439) cyfip1 (ENSLBEG00000024517) ENSLBEG00000024604 nipa2 (ENSLBEG00000024624) nipa1 (ENSLBEG00000024639) HERC2 (ENSLBEG00000024711) OCA2 (ENSLBEG00000024910) GABRG3 (ENSLBEG00000024966) GABRA5 (ENSLBEG00000025020) GABRB3 (ENSLBEG00000025070) ATP10A (ENSLBEG00000025124) ube3a (ENSLBEG00000025168) #22 CNGA3 (ENSLBEG00000025206) TMEM131 (ENSLBEG00000025261) si:ch211-201h21.5 (ENSLBEG00000025371) plekhb2 (ENSLBEG00000025392) BIVM (ENSLBEG00000025429) zgc:172121 (ENSLBEG00000025460) nme7 (ENSLBEG00000025504) ATP1B1 (ENSLBEG00000025529) dpt (ENSLBEG00000025552) zbtb11 (ENSLBEG00000025568) tp63 (ENSLBEG00000025637) tprg1 (ENSLBEG00000025715) lpp (ENSLBEG00000025728) bcl6aa (ENSLBEG00000025751) smx5 (ENSLBEG00000025781) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a Perciformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00530000064649 ENSGT00940000160006 ENSGT00400000024256 ENSGT00940000159889.b.a ENSGT00940000160040.B.a.b Lumpfish MODERN SPECIES 19 jade3 (ENSCLMG00005001211) rp2 (ENSCLMG00005001212) slc9a7 (ENSCLMG00005001218) CHST7 (ENSCLMG00005001257) tubgcp5 (ENSCLMG00005001259) cyfip1 (ENSCLMG00005001270) ENSCLMG00005002217 nipa2 (ENSCLMG00005002218) nipa1 (ENSCLMG00005002220) OCA2 (ENSCLMG00005002479) GABRG3 (ENSCLMG00005002480) ENSCLMG00005002575 GABRA5 (ENSCLMG00005002576) GABRB3 (ENSCLMG00005002577) ATP10A (ENSCLMG00005002585) ube3a (ENSCLMG00005002745) #22 ENSCLMG00005002752 TMEM131 (ENSCLMG00005003152) si:ch211-201h21.5 (ENSCLMG00005005460) zgc:172121 (ENSCLMG00005005470) ENSCLMG00005005472 nme7 (ENSCLMG00005005477) ATP1B1 (ENSCLMG00005006063) dpt (ENSCLMG00005006127) zbtb11 (ENSCLMG00005006128) tp63 (ENSCLMG00005006130) ENSCLMG00005006175 ENSCLMG00005006176 ENSCLMG00005006177 GADD45B (ENSCLMG00005006178) ENSCLMG00005006465 Stickleback MODERN SPECIES 8 ENSGACG00000013847 ENSGACG00000013844 jade3 (ENSGACG00000013838) rp2 (ENSGACG00000013836) slc9a7 (ENSGACG00000013834) CHST7 (ENSGACG00000013833) tubgcp5 (ENSGACG00000013824) cyfip1 (ENSGACG00000013804) nipa2 (ENSGACG00000013790) nipa1 (ENSGACG00000013786) ENSGACG00000013776 GABRG3 (ENSGACG00000013771) GABRA5 (ENSGACG00000013764) GABRB3 (ENSGACG00000013753) ATP10A (ENSGACG00000013748) ube3a (ENSGACG00000013744) #22 CNGA3 (ENSGACG00000013729) TMEM131 (ENSGACG00000013702) BIVM (ENSGACG00000013697) zgc:172121 (ENSGACG00000013681) nme7 (ENSGACG00000013658) ATP1B1 (ENSGACG00000013647) dpt (ENSGACG00000013645) ENSGACG00000013644 zbtb11 (ENSGACG00000013636) ENSGACG00000013632 tp63 (ENSGACG00000013629) gadd45ba (ENSGACG00000013618) fam174c (ENSGACG00000013613) camk4 (ENSGACG00000013599) ENSGACG00000013592 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a Pike perch MODERN SPECIES 233 jade3 (ENSSLUG00000019660) rp2 (ENSSLUG00000019652) slc9a7 (ENSSLUG00000019122) CHST7 (ENSSLUG00000019090) tubgcp5 (ENSSLUG00000018946) ENSSLUG00000018898 cyfip1 (ENSSLUG00000018755) nipa2 (ENSSLUG00000018717) nipa1 (ENSSLUG00000018710) HERC2 (ENSSLUG00000017276) OCA2 (ENSSLUG00000017065) GABRG3 (ENSSLUG00000017044) GABRA5 (ENSSLUG00000017019) GABRB3 (ENSSLUG00000016876) ATP10A (ENSSLUG00000016652) ube3a (ENSSLUG00000016003) #22 CNGA3 (ENSSLUG00000015914) Channel bull blenny MODERN SPECIES 18 CTXN1 (ENSCGOG00000012568) timm44 (ENSCGOG00000012571) hnrnpm (ENSCGOG00000012800) dmap1 (ENSCGOG00000012828) RNF220 (ENSCGOG00000012976) guk1b (ENSCGOG00000012984) ENSCGOG00000013037 PTBP1 (ENSCGOG00000013058) EFNA2 (ENSCGOG00000013746) ENSCGOG00000013749 ENSCGOG00000013751 ENSCGOG00000013753 ENSCGOG00000013767 ENSCGOG00000013947 CARTPT (ENSCGOG00000013953) ube3a (ENSCGOG00000013962) #22 CNGA3 (ENSCGOG00000014710) TMEM131 (ENSCGOG00000014716) si:ch211-201h21.5 (ENSCGOG00000014841) BIVM (ENSCGOG00000014849) zgc:172121 (ENSCGOG00000014855) nme7 (ENSCGOG00000000124) ATP1B1 (ENSCGOG00000000207) dpt (ENSCGOG00000000217) zbtb11 (ENSCGOG00000000226) tp63 (ENSCGOG00000000256) ENSCGOG00000000285 zgc:172121 (ENSCGOG00000000286) ENSCGOG00000000288 BIVM (ENSCGOG00000000290) si:ch211-201h21.5 (ENSCGOG00000000292) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.m ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.t ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a European seabass MODERN SPECIES 17 jade3 (ENSDLAG00005012320) rp2 (ENSDLAG00005012427) slc9a7 (ENSDLAG00005012468) tubgcp5 (ENSDLAG00005014342) CHST7 (ENSDLAG00005014321) ENSDLAG00005032506 ENSDLAG00005015325 nipa2 (ENSDLAG00005034296) nipa1 (ENSDLAG00005027537) HERC2 (ENSDLAG00005015382) OCA2 (ENSDLAG00005016571) GABRG3 (ENSDLAG00005017038) GABRA5 (ENSDLAG00005017107) GABRB3 (ENSDLAG00005017323) ATP10A (ENSDLAG00005017439) ube3a (ENSDLAG00005017855) #22 ENSDLAG00005017939 ENSDLAG00005017985 si:ch211-201h21.5 (ENSDLAG00005032019) ENSDLAG00005032059 zgc:172121 (ENSDLAG00005019073) nme7 (ENSDLAG00005032296) ENSDLAG00005031886 ENSDLAG00005019354 DPT (ENSDLAG00005019220) ENSDLAG00005019244 tprg1 (ENSDLAG00005019556) lpp (ENSDLAG00005019565) bcl6aa (ENSDLAG00005019592) smx5 (ENSDLAG00005019631) ENSDLAG00005019662 Large yellow croaker MODERN SPECIES 489 jade3 (ENSLCRG00005006751) rp2 (ENSLCRG00005006759) slc9a7 (ENSLCRG00005006770) CHST7 (ENSLCRG00005007247) tubgcp5 (ENSLCRG00005007250) cyfip1 (ENSLCRG00005007699) ENSLCRG00005007727 nipa2 (ENSLCRG00005007728) nipa1 (ENSLCRG00005007730) HERC2 (ENSLCRG00005007758) OCA2 (ENSLCRG00005008588) GABRG3 (ENSLCRG00005008606) GABRA5 (ENSLCRG00005008610) GABRB3 (ENSLCRG00005008625) ATP10A (ENSLCRG00005008878) ube3a (ENSLCRG00005009077) #22 CNGA3 (ENSLCRG00005009079) TMEM131 (ENSLCRG00005009085) si:ch211-201h21.5 (ENSLCRG00005009325) BIVM (ENSLCRG00005009328) nme7 (ENSLCRG00005009336) zgc:172121 (ENSLCRG00005009338) ATP1B1 (ENSLCRG00005009340) ENSLCRG00005009342 tp63 (ENSLCRG00005009353) tprg1 (ENSLCRG00005010789) lpp (ENSLCRG00005010790) bcl6aa (ENSLCRG00005010795) smx5 (ENSLCRG00005010796) INPP5D (ENSLCRG00005010799) GPR17 (ENSLCRG00005011898) Gilthead seabream MODERN SPECIES 2 jade3 (ENSSAUG00010013081) rp2 (ENSSAUG00010013075) slc9a7 (ENSSAUG00010012855) CHST7 (ENSSAUG00010012851) tubgcp5 (ENSSAUG00010012769) ENSSAUG00010012759 cyfip1 (ENSSAUG00010012691) nipa2 (ENSSAUG00010012674) nipa1 (ENSSAUG00010012667) HERC2 (ENSSAUG00010012272) OCA2 (ENSSAUG00010011481) GABRG3 (ENSSAUG00010011353) GABRA5 (ENSSAUG00010011351) GABRB3 (ENSSAUG00010010416) ATP10A (ENSSAUG00010010224) ube3a (ENSSAUG00010010179) #22 CNGA3 (ENSSAUG00010010177) TMEM131 (ENSSAUG00010008738) si:ch211-201h21.5 (ENSSAUG00010008724) BIVM (ENSSAUG00010008723) zgc:172121 (ENSSAUG00010008722) nme7 (ENSSAUG00010008680) ATP1B1 (ENSSAUG00010008677) dpt (ENSSAUG00010008673) ENSSAUG00010008653 tp63 (ENSSAUG00010007523) lpp (ENSSAUG00010007485) bcl6aa (ENSSAUG00010007482) smx5 (ENSSAUG00010007481) INPP5D (ENSSAUG00010007412) GPR17 (ENSSAUG00010007403) Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 469 CHST7 (ENSHCOG00000012058) tubgcp5 (ENSHCOG00000012034) cyfip1 (ENSHCOG00000012003) ENSHCOG00000011909 nipa2 (ENSHCOG00000011899) ENSHCOG00000011880 ENSHCOG00000011852 ENSHCOG00000011824 ENSHCOG00000011812 HERC2 (ENSHCOG00000011788) OCA2 (ENSHCOG00000011615) GABRG3 (ENSHCOG00000011501) GABRA5 (ENSHCOG00000011438) GABRB3 (ENSHCOG00000010734) ATP10A (ENSHCOG00000010697) ube3a (ENSHCOG00000010668) #22 ENSHCOG00000010533 ENSHCOG00000010511 ENSHCOG00000010482 MUTYH (ENSHCOG00000010464) mpnd (ENSHCOG00000010434) sh3gl1b (ENSHCOG00000000320) rorca (ENSHCOG00000010378) SEMA6B (ENSHCOG00000010356) ENSHCOG00000010346 ENSHCOG00000010332 plin3 (ENSHCOG00000010324) zgc:77486 (ENSHCOG00000010297) ABHD17A (ENSHCOG00000010287) rgl1 (ENSHCOG00000010124) ENSHCOG00000009981 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 18 jade3 (ENSMMDG00005011710) rp2 (ENSMMDG00005011721) slc9a7 (ENSMMDG00005011735) CHST7 (ENSMMDG00005012008) tubgcp5 (ENSMMDG00005012024) cyfip1 (ENSMMDG00005012113) ENSMMDG00005012138 nipa2 (ENSMMDG00005012143) nipa1 (ENSMMDG00005012145) HERC2 (ENSMMDG00005012258) OCA2 (ENSMMDG00005017219) GABRG3 (ENSMMDG00005017233) GABRA5 (ENSMMDG00005017261) GABRB3 (ENSMMDG00005017960) ATP10A (ENSMMDG00005017988) ube3a (ENSMMDG00005018018) #22 CNGA3 (ENSMMDG00005018026) TMEM131 (ENSMMDG00005018054) si:ch211-201h21.5 (ENSMMDG00005019494) BIVM (ENSMMDG00005019496) zgc:172121 (ENSMMDG00005019501) nme7 (ENSMMDG00005019532) atp1b1b (ENSMMDG00005019666) dpt (ENSMMDG00005019669) zbtb11 (ENSMMDG00005019671) tp63 (ENSMMDG00005019683) tprg1 (ENSMMDG00005020137) lpp (ENSMMDG00005020138) bcl6aa (ENSMMDG00005020141) smx5 (ENSMMDG00005020144) INPP5D (ENSMMDG00005020146) Cod MODERN SPECIES 3 jade3 (ENSGMOG00000004705) rp2 (ENSGMOG00000004693) slc9a7 (ENSGMOG00000004657) CHST7 (ENSGMOG00000004648) tubgcp5 (ENSGMOG00000004608) cyfip1 (ENSGMOG00000004542) ENSGMOG00000032462 nipa2 (ENSGMOG00000004520) nipa1 (ENSGMOG00000004503) HERC2 (ENSGMOG00000031186) OCA2 (ENSGMOG00000025247) GABRG3 (ENSGMOG00000004418) GABRA5 (ENSGMOG00000004398) GABRB3 (ENSGMOG00000004379) ATP10A (ENSGMOG00000004322) ube3a (ENSGMOG00000004287) #22 ENSGMOG00000004260 ENSGMOG00000004175 si:ch211-201h21.5 (ENSGMOG00000004089) ENSGMOG00000004041 zgc:172121 (ENSGMOG00000004019) nme7 (ENSGMOG00000003984) ENSGMOG00000024366 dpt (ENSGMOG00000003950) zbtb11 (ENSGMOG00000003866) ENSGMOG00000037241 ENSGMOG00000023277 guk1b (ENSGMOG00000025995) guk1b (ENSGMOG00000007582) ENSGMOG00000007589 dmap1 (ENSGMOG00000007604) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 84 ENSGT00940000158722 ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b.g ENSGT00940000165545 ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895 ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000048601.a ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.s.a ENSGT00950000186445 ENSGT00900000141090.s.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1080 ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895.x ENSGT00940000155050.a #22 ENSGT00940000158737.g.k ENSGT00510000048601.a.k Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 135 ENSGT00940000159402 ENSGT00940000157095.e ENSGT00390000001397.h ENSGT00940000166880 ENSGT00940000158722.q.a ENSGT00940000158722.q.b ENSGT00940000158262 ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b.g.a ENSGT00940000155651 ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895.x ENSGT00940000155050.a.g #22 ENSGT00940000158737.g.l ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.s.a.a ENSGT00950000186445 ENSGT00900000141090.s.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a.i.a ENSGT00390000001652.f.b.e ENSGT00940000156022.b.i.a.b ENSGT01080000257714.a Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000234818 ENSGT00940000157095.f ENSGT00390000000191.l ENSGT00550000074838 ENSGT00940000165420 ENSGT00940000158722.q.b ENSGT00940000158262.k ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b.g.a ENSGT00940000155651.c ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895.w.a ENSGT00940000155050.a.g #22 ENSGT00940000158737.g.l ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.t.a.a ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.s.a.a ENSGT00390000001652.f.b.e ENSGT00940000156022.b.i.a.b ENSGT00940000156311.b.a.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a.g.b ENSGT00940000156577.a.d ENSGT00940000153190.B.b Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157095.f ENSGT00390000000191.l ENSGT00940000177684.f ENSGT00550000074838 ENSGT00940000165420 ENSGT00940000158722.q.b ENSGT00940000158262.k ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b.g.a ENSGT00940000155651.c ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895.w.a ENSGT00940000155050.a.g #22 ENSGT00940000158737.g.l ENSGT00530000063614.a.a ENSGT00940000166460 ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.t.a.a ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.s.a.a ENSGT00950000183153.c.b.a.a.i.a ENSGT00390000001652.f.b.e ENSGT00940000156022.b.i.a.b ENSGT00940000156311.b.a.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a.g.b ENSGT00940000156577.a.d Chinook salmon MODERN SPECIES 686 ENSOTSG00005039957 ube3a (ENSOTSG00005038861) #22 CNGA3 (ENSOTSG00005038788) mccc2 (ENSOTSG00005038784) ENSOTSG00005038782 ENSOTSG00005038780 ENSOTSG00005038778 Coho salmon MODERN SPECIES 24 jade3 (ENSOKIG00005011845) ENSOKIG00005011880 ENSOKIG00005011914 rp2 (ENSOKIG00005011922) slc9a7 (ENSOKIG00005011991) ENSOKIG00005012649 ENSOKIG00005012655 CHST7 (ENSOKIG00005012659) tubgcp5 (ENSOKIG00005012714) cyfip1 (ENSOKIG00005013096) nipa2 (ENSOKIG00005013716) nipa1 (ENSOKIG00005013739) GABRB3 (ENSOKIG00005013753) ATP10A (ENSOKIG00005013829) ENSOKIG00005014536 ube3a (ENSOKIG00005014593) #22 CNGA3 (ENSOKIG00005015475) TMEM131 (ENSOKIG00005015534) si:ch211-201h21.5 (ENSOKIG00005015953) zgc:172121 (ENSOKIG00005015966) nme7 (ENSOKIG00005016027) ATP1B1 (ENSOKIG00005016648) dpt (ENSOKIG00005016658) zbtb11 (ENSOKIG00005016694) tp63 (ENSOKIG00005017389) ENSOKIG00005018912 tprg1 (ENSOKIG00005018936) lpp (ENSOKIG00005027460) bcl6aa (ENSOKIG00005027538) smx5 (ENSOKIG00005027571) ENSOKIG00005027688 Rainbow trout MODERN SPECIES ENSOMYG00000053917 ENSOMYG00000046473 ENSOMYG00000000197 ENSOMYG00000000064 jade3 (ENSOMYG00000001344) rp2 (ENSOMYG00000001404) slc9a7 (ENSOMYG00000058744) CHST7 (ENSOMYG00000016784) tubgcp5 (ENSOMYG00000077012) ENSOMYG00000048481 cyfip1 (ENSOMYG00000056259) nipa2 (ENSOMYG00000001274) nipa1 (ENSOMYG00000001322) GABRB3 (ENSOMYG00000001367) ENSOMYG00000001424 ube3a (ENSOMYG00000001185) #22 ENSOMYG00000000403 ENSOMYG00000067656 si:ch211-201h21.5 (ENSOMYG00000001502) ENSOMYG00000001467 zgc:172121 (ENSOMYG00000001447) nme7 (ENSOMYG00000000475) ENSOMYG00000000460 dpt (ENSOMYG00000077750) ENSOMYG00000000412 ENSOMYG00000000588 ENSOMYG00000000583 ENSOMYG00000000561 ENSOMYG00000001189 ENSOMYG00000077295 ENSOMYG00000001186 Salmo ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01030000234818 ENSGT00940000157095.f ENSGT00390000000191.l ENSGT00550000074838 ENSGT00940000165420 ENSGT00940000158722.q.b ENSGT00940000158262.i ENSGT00940000153460.c.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000155962 ENSGT00500000044831.a.b.g.a ENSGT00940000155651.e ENSGT00940000159067 ENSGT00940000154713.A.c.a ENSGT00940000157895.x ENSGT00940000155050.a.g #22 ENSGT00940000158737.g.l ENSGT00530000063614.a.a.gb ENSGT00940000166460 ENSGT00510000049619 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C.v ENSGT00390000010760.f ENSGT00900000141090.s.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a.i.a ENSGT00390000001652.f.b.e ENSGT00940000156022.b.i.a.b ENSGT00940000156311.b.a.c ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a.g.b ENSGT00940000156577.a.d River trout MODERN SPECIES 8 tbc1d23 (ENSSTUG00000044388) nit2 (ENSSTUG00000044918) ENSSTUG00000045266 ENSSTUG00000045272 jade3 (ENSSTUG00000045277) rp2 (ENSSTUG00000045322) slc9a7 (ENSSTUG00000045357) CHST7 (ENSSTUG00000045784) tubgcp5 (ENSSTUG00000045857) cyfip1 (ENSSTUG00000046923) ENSSTUG00000047050 nipa2 (ENSSTUG00000047057) nipa1 (ENSSTUG00000047063) GABRB3 (ENSSTUG00000047073) ATP10A (ENSSTUG00000047133) ube3a (ENSSTUG00000002316) #22 CNGA3 (ENSSTUG00000002809) TMEM131 (ENSSTUG00000002978) zgc:172121 (ENSSTUG00000005864) si:ch211-201h21.5 (ENSSTUG00000005893) zgc:172121 (ENSSTUG00000005903) nme7 (ENSSTUG00000005919) ATP1B1 (ENSSTUG00000005977) dpt (ENSSTUG00000005988) zbtb11 (ENSSTUG00000005996) tp63 (ENSSTUG00000006050) ENSSTUG00000007674 tprg1 (ENSSTUG00000007680) ENSSTUG00000007701 ENSSTUG00000007706 lpp (ENSSTUG00000007717) Atlantic salmon MODERN SPECIES 7 ENSSSAG00000026950 ENSSSAG00000008169 ENSSSAG00000087205 nit2 (ENSSSAG00000047772) ENSSSAG00000048133 jade3 (ENSSSAG00000048145) rp2 (ENSSSAG00000097915) slc9a7 (ENSSSAG00000119707) ENSSSAG00000116209 CHST7 (ENSSSAG00000054689) tubgcp5 (ENSSSAG00000081450) cyfip1 (ENSSSAG00000074681) nipa2 (ENSSSAG00000024860) GABRB3 (ENSSSAG00000095267) ENSSSAG00000120810 ube3a (ENSSSAG00000036224) #22 ENSSSAG00000049199 ENSSSAG00000102808 ENSSSAG00000108972 si:ch211-201h21.5 (ENSSSAG00000015497) ENSSSAG00000115329 zgc:172121 (ENSSSAG00000015474) nme7 (ENSSSAG00000085260) ENSSSAG00000098185 dpt (ENSSSAG00000095344) ENSSSAG00000019551 zbtb11 (ENSSSAG00000019890) tp63 (ENSSSAG00000015551) tprg1 (ENSSSAG00000116062) ENSSSAG00000098890 lpp (ENSSSAG00000111702) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00500000044831.a.b.g.b ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000155050.a.h #22 ENSGT00940000158737.g.k ENSGT00510000048601.a.k ENSGT00900000141090.s.a.b ENSGT00390000001652.f.b.f ENSGT00940000156022.b.i.a.a ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a.g.b ENSGT00940000156577.a.d ENSGT00940000153190.B.b ENSGT00940000159656.a.a.b.b ENSGT01080000257336.a.c.b.c.a ENSGT00940000155119.g.a ENSGT00940000160730.c.a ENSGT00940000164964.a.b Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000157095.e ENSGT00390000001397.h ENSGT00940000166880 ENSGT00940000158722.q.a ENSGT00940000158262.l ENSGT00500000044831.a.b.g.b ENSGT00940000155651.d ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000155050.a.h #22 ENSGT00940000158737.g.k ENSGT00510000048601.a.k ENSGT00960000192080 ENSGT00940000166950 ENSGT01030000234579.C.t.a.b ENSGT00900000141090.s.a.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a.i.b.a ENSGT00390000001652.f.b.f ENSGT00940000156311.b.a.b ENSGT00940000156202.a.g.a ENSGT01100000263537.b.a.a.b.a ENSGT00940000157247.a.a ENSGT00440000037733.f ENSGT00940000156577.a.c ENSGT00940000159656.a.a.a Rainbow trout MODERN SPECIES 26 ENSOMYG00000060551 rp2 (ENSOMYG00000028614) cyfip1 (ENSOMYG00000019862) ENSOMYG00000069832 nipa2 (ENSOMYG00000014702) ENSOMYG00000051435 HERC2 (ENSOMYG00000066832) ENSOMYG00000060324 ENSOMYG00000049746 ENSOMYG00000059925 OCA2 (ENSOMYG00000067038) GABRG3 (ENSOMYG00000014688) ENSOMYG00000071632 GABRA5 (ENSOMYG00000002468) ENSOMYG00000049309 ENSOMYG00000002359 #22 ENSOMYG00000056827 ENSOMYG00000002266 ENSOMYG00000002176 ENSOMYG00000002206 ENSOMYG00000002239 ENSOMYG00000067548 ENSOMYG00000005180 ENSOMYG00000066282 ENSOMYG00000055689 TPRG1 (ENSOMYG00000076052) ENSOMYG00000014872 ENSOMYG00000015848 ENSOMYG00000075662 ENSOMYG00000014737 ENSOMYG00000029617 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000159402 ENSGT00940000157095.e ENSGT00390000001397.h ENSGT00940000166880 ENSGT00940000158722.q.a ENSGT00940000158262.l ENSGT00500000044831.a.b.g.b ENSGT00940000155651.d ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000155050.a.h #22 ENSGT00940000158737.g.k ENSGT00510000048601.a.k ENSGT00940000166950 ENSGT01030000234579.C.t.a.b ENSGT00900000141090.s.a.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a.i.b.a ENSGT00940000156311.b.a.b ENSGT00940000156202.a.g.a ENSGT01100000263537.b.a.a.b.a ENSGT00940000157247.a.a ENSGT00440000037733.f ENSGT00940000156577.a.c ENSGT00940000159656.a.a.a ENSGT01080000257336.a.c.b.c.b ENSGT00940000155119.g.b Coho salmon MODERN SPECIES 4 tomm70a (ENSOKIG00005032674) GTPBP6 (ENSOKIG00005032881) ENSOKIG00005032979 ENSOKIG00005032998 ENSOKIG00005033030 jade3 (ENSOKIG00005033037) rp2 (ENSOKIG00005033107) cyfip1 (ENSOKIG00005033147) nipa2 (ENSOKIG00005033580) HERC2 (ENSOKIG00005033924) ENSOKIG00005040195 OCA2 (ENSOKIG00005040294) GABRG3 (ENSOKIG00005042003) ENSOKIG00005042040 GABRA5 (ENSOKIG00005042072) ENSOKIG00005042404 #22 CNGA3 (ENSOKIG00005044435) ENSOKIG00005044448 BIVM (ENSOKIG00005044457) ENSOKIG00005044502 ATP1B1 (ENSOKIG00005044526) zbtb11 (ENSOKIG00005044536) tp63 (ENSOKIG00005044575) ENSOKIG00005044927 ENSOKIG00005044945 ENSOKIG00005044954 ENSOKIG00005044974 tprg1 (ENSOKIG00005044977) ENSOKIG00005044986 lpp (ENSOKIG00005044994) ENSOKIG00005016087 Salmo ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000159402 ENSGT00940000157095.e ENSGT00390000001397.h ENSGT00940000166880 ENSGT00940000158722.r ENSGT00940000158262.j ENSGT00500000044831.a.b.g.b ENSGT00940000155651.f ENSGT00940000154975 ENSGT01030000234550.b ENSGT00940000155607.mc.a ENSGT00530000064157.a.b ENSGT00940000167465 ENSGT00940000156234.a.a ENSGT00940000155050.a.h #22 ENSGT00940000158737.g.k ENSGT00510000048601.a.k ENSGT00960000192080 ENSGT00900000141090.s.a.b ENSGT00390000001652.f.b.f.a ENSGT00940000156022.b.i.a.a ENSGT00940000156311.b.a.d ENSGT00940000156202.a.g.a ENSGT01100000263537.b.a.a.b.a ENSGT00940000157247.a.a ENSGT00440000037733.f ENSGT00940000156577.a.c ENSGT00940000159656.a.a.a ENSGT01080000257336.a.c.b.c.b ENSGT00940000155119.g.b Atlantic salmon MODERN SPECIES 1 rl28 (ENSSSAG00000039626) ENSSSAG00000085747 ENSSSAG00000097913 ENSSSAG00000106925 ENSSSAG00000098708 ENSSSAG00000089189 ENSSSAG00000107180 ENSSSAG00000111198 ENSSSAG00000009201 ENSSSAG00000024944 ENSSSAG00000008856 ENSSSAG00000055674 ENSSSAG00000092691 ENSSSAG00000093905 ENSSSAG00000116034 ENSSSAG00000048351 #22 ENSSSAG00000054886 bivm (ENSSSAG00000055006) ENSSSAG00000115122 ENSSSAG00000110987 ENSSSAG00000055019 AT233 (ENSSSAG00000053842) ENSSSAG00000113656 ENSSSAG00000099477 ENSSSAG00000053855 ENSSSAG00000090324 tp63 (ENSSSAG00000006256) tprg1 (ENSSSAG00000068066) lpp (ENSSSAG00000099194) bcl6aa (ENSSSAG00000051883) ENSSSAG00000052012 River trout MODERN SPECIES 14 tomm70a (ENSSTUG00000031027) GTPBP6 (ENSSTUG00000030891) ENSSTUG00000030877 jade3 (ENSSTUG00000030855) ENSSTUG00000030847 rp2 (ENSSTUG00000030837) cyfip1 (ENSSTUG00000030385) nipa2 (ENSSTUG00000030362) HERC2 (ENSSTUG00000026936) OCA2 (ENSSTUG00000026716) ENSSTUG00000026702 GABRG3 (ENSSTUG00000026684) gng13a (ENSSTUG00000026670) ENSSTUG00000026550 GABRA5 (ENSSTUG00000026521) ube3a (ENSSTUG00000024172) #22 CNGA3 (ENSSTUG00000024061) BIVM (ENSSTUG00000023932) ENSSTUG00000023920 ATP1B1 (ENSSTUG00000023906) ENSSTUG00000023901 ENSSTUG00000023889 ENSSTUG00000023882 lpp (ENSSTUG00000023695) bcl6aa (ENSSTUG00000023616) ENSSTUG00000022440 GPR17 (ENSSTUG00000022409) MYO7B (ENSSTUG00000021272) sap130a (ENSSTUG00000020402) amotl2a (ENSSTUG00000020366) ENSSTUG00000020353 Huchen DUPLICATION Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 8819 ube3a (ENSHHUG00000014746) #22 Huchen MODERN SPECIES 9911 ENSHHUG00000009701 #22 Huchen MODERN SPECIES 9220 ENSHHUG00000006837 #22 Northern pike MODERN SPECIES 7 ENSELUG00000009921 ctbs (ENSELUG00000009902) slc9a7 (ENSELUG00000009857) CHST7 (ENSELUG00000009754) tubgcp5 (ENSELUG00000009725) cyfip1 (ENSELUG00000001279) ENSELUG00000009609 nipa2 (ENSELUG00000009595) nipa1 (ENSELUG00000029920) HERC2 (ENSELUG00000009492) OCA2 (ENSELUG00000009431) GABRG3 (ENSELUG00000009399) GABRA5 (ENSELUG00000009373) GABRB3 (ENSELUG00000009339) ATP10A (ENSELUG00000009308) ube3a (ENSELUG00000009232) #22 CNGA3 (ENSELUG00000030819) CNGA3 (ENSELUG00000009152) TMEM131 (ENSELUG00000009013) si:ch211-201h21.5 (ENSELUG00000008734) BIVM (ENSELUG00000008715) zgc:172121 (ENSELUG00000008699) nme7 (ENSELUG00000008663) ATP1B1 (ENSELUG00000008597) dpt (ENSELUG00000008580) zbtb11 (ENSELUG00000008519) tp63 (ENSELUG00000008470) lpp (ENSELUG00000008358) ENSELUG00000033731 bcl6aa (ENSELUG00000008285) si:ch73-14h10.2 (ENSELUG00000008241) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 397 ENSGT00940000160811.c.b ENSGT00940000156913.b.j.a ENSGT00390000008042.A.b.d ENSGT00940000154846.a.a ENSGT00940000156402.A.a ENSGT00940000165152 ENSGT00940000155607.mc.b ENSGT00940000156234.a.b ENSGT00940000154713.A.c.b ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 545 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 309 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00510000047120.gb ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000010308 ENSGT00940000164470.b Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000017193 ENSGT00940000169304 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000010308 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT00730000111141 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00530000063484.b.b.d.b ENSGT00940000154342.C ENSGT01030000234555.a.b.f.b ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466.e.a ENSGT00730000111141 ENSGT00940000162114 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00530000068760 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00940000169304 ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 ENSGT00920000150296 ENSGT01020000230582 ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT00940000161153 ENSGT00940000165158.b ENSGT00390000014753 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00730000111141 ENSGT00940000162114 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00530000068760 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 ENSGT00920000150296 ENSGT01020000230582 ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT00940000161153 ENSGT00940000165158.b ENSGT00390000014753 ENSGT00940000156607.a.a Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000165158.b ENSGT00940000161153 ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT01020000230582 ENSGT00920000150296 ENSGT00730000111141 ENSGT00940000162114 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00530000068760 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 ENSGT00940000160630 ENSGT00940000178385 ENSGT00940000159870 ENSGT00940000159602 ENSGT00690000103830 ENSGT00940000159255 ENSGT00390000000447 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000159832 ENSGT00940000156607.a.a ENSGT00390000014753 ENSGT00940000165158.b ENSGT00940000161153 ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT00730000111141 ENSGT00940000162114 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 ENSGT00940000160630 ENSGT00940000178385 ENSGT00940000159870 ENSGT00940000159602 ENSGT00690000103830 ENSGT00940000159255 ENSGT00390000000447 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000159832 ENSGT00940000156607.a.a ENSGT00390000014753 ENSGT00940000165158.b ENSGT00940000161153 ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT00730000111141 ENSGT00940000162114 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 ENSGT00940000160630 ENSGT00940000178385 ENSGT00940000159870 ENSGT00940000159602 ENSGT00690000103830 ENSGT00940000159255 ENSGT00390000000447 Climbing perch MODERN SPECIES 11 ENSATEG00000012902 nlgn4xa (ENSATEG00000012873) pudp (ENSATEG00000012775) ENSATEG00000012765 ENSATEG00000028001 anos1a (ENSATEG00000012748) ENSATEG00000012732 ENSATEG00000012671 CHRM4 (ENSATEG00000012653) ENSATEG00000012379 DGKZ (ENSATEG00000012081) cryaa (ENSATEG00000011924) ENSATEG00000011867 ankrd10a (ENSATEG00000011856) ENSATEG00000011704 ENSATEG00000011668 #22 ENSATEG00000011615 ENSATEG00000011557 ENSATEG00000011534 ENSATEG00000011523 ENSATEG00000011476 ENSATEG00000011463 ENSATEG00000011459 ENSATEG00000011449 ENSATEG00000011433 ENSATEG00000011339 ENSATEG00000011317 ENSATEG00000011270 ENSATEG00000011128 ENSATEG00000011112 ENSATEG00000011091 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 10 PRKX (ENSBSLG00000008426) nlgn4xa (ENSBSLG00000008212) pudp (ENSBSLG00000008201) ENSBSLG00000008139 STS (ENSBSLG00000008060) anos1a (ENSBSLG00000008036) ENSBSLG00000008007 ENSBSLG00000007981 CHRM4 (ENSBSLG00000007965) mdka (ENSBSLG00000007805) DGKZ (ENSBSLG00000007145) cryaa (ENSBSLG00000007055) ENSBSLG00000007039 ankrd10a (ENSBSLG00000007030) ddx4 (ENSBSLG00000006575) UBE3A (ENSBSLG00000005791) #22 CNGA3 (ENSBSLG00000005760) atp1b1b (ENSBSLG00000005737) ENSBSLG00000005693 ENSBSLG00000005466 atg3 (ENSBSLG00000005206) SLC19A2 (ENSBSLG00000005152) ENSBSLG00000005127 ENSBSLG00000004958 ENSBSLG00000000690 ENSBSLG00000000685 ENSBSLG00000000678 ENSBSLG00000000642 ENSBSLG00000000616 ENSBSLG00000000598 ENSBSLG00000000516 Zig-zag eel MODERN SPECIES 11 nlgn4xa (ENSMAMG00000000885) pudp (ENSMAMG00000028232) ENSMAMG00000003024 STS (ENSMAMG00000003049) ANOS1 (ENSMAMG00000025695) ENSMAMG00000025062 ENSMAMG00000003082 ENSMAMG00000003097 CHRM4 (ENSMAMG00000003136) ENSMAMG00000003164 DGKZ (ENSMAMG00000003210) cryaa (ENSMAMG00000003398) ENSMAMG00000003496 ankrd10a (ENSMAMG00000024434) ENSMAMG00000003574 ENSMAMG00000003752 #22 ENSMAMG00000003777 ENSMAMG00000003801 ENSMAMG00000003850 ENSMAMG00000003825 ENSMAMG00000003872 ENSMAMG00000003889 ENSMAMG00000003902 ENSMAMG00000027568 ENSMAMG00000003935 ENSMAMG00000003979 ENSMAMG00000027079 RUNX1 (ENSMAMG00000004023) ENSMAMG00000004082 ENSMAMG00000004151 ENSMAMG00000004193 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00530000063484.b.b.d.b ENSGT00940000154342.C ENSGT01030000234555.a.b.f.b ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466.e.a ENSGT00730000111141 ENSGT00940000162114 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00530000068760 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 ENSGT00940000160630 ENSGT00940000178385 ENSGT00940000159870 ENSGT00940000159602 ENSGT00690000103830 ENSGT00940000159255 ENSGT00390000000447 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00530000063484.b.b.d.b ENSGT00940000154342.C ENSGT01030000234555.a.b.f.b ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466.e.a ENSGT00730000111141 ENSGT00940000162114 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00530000068760 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308.d ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 ENSGT00940000160630 ENSGT00940000178385 ENSGT00940000159870 ENSGT00940000159602 ENSGT00690000103830 ENSGT00940000159255 ENSGT00390000000447 Seriola ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000162114 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00530000068760 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308.d ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 ENSGT00940000160630 ENSGT00940000178385 ENSGT00940000159870 ENSGT00940000159602 ENSGT00690000103830 ENSGT00940000159255 ENSGT00390000000447 Greater amberjack MODERN SPECIES 7 ENSSDUG00000022105 ENSSDUG00000022092 CHRM4 (ENSSDUG00000022079) mdka (ENSSDUG00000022077) DGKZ (ENSSDUG00000022061) cryaa (ENSSDUG00000022054) ENSSDUG00000022047 ankrd10a (ENSSDUG00000022041) ENSSDUG00000022034 ddx4 (ENSSDUG00000022015) UBE3A (ENSSDUG00000022003) #22 CNGA3 (ENSSDUG00000021992) atp1b1b (ENSSDUG00000021981) ENSSDUG00000021977 ENSSDUG00000021941 atg3 (ENSSDUG00000021919) SLC19A2 (ENSSDUG00000021912) ENSSDUG00000021909 ENSSDUG00000021902 ENSSDUG00000021899 RCAN1 (ENSSDUG00000021893) ENSSDUG00000021760 runx1 (ENSSDUG00000020634) DONSON (ENSSDUG00000020494) ENSSDUG00000020387 ENSSDUG00000020330 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3147 ENSSLDG00000015887 ENSSLDG00000015753 ENSSLDG00000015690 CHRM4 (ENSSLDG00000015668) mdka (ENSSLDG00000015648) ENSSLDG00000015584 cryaa (ENSSLDG00000015556) ENSSLDG00000015518 ankrd10a (ENSSLDG00000015476) ddx4 (ENSSLDG00000015312) UBE3A (ENSSLDG00000015239) #22 CNGA3 (ENSSLDG00000015216) atp1b1b (ENSSLDG00000015154) ENSSLDG00000015129 ENSSLDG00000015088 atg3 (ENSSLDG00000015032) SLC19A2 (ENSSLDG00000015009) ENSSLDG00000015000 arhgap1 (ENSSLDG00000014978) ENSSLDG00000014963 RCAN1 (ENSSLDG00000014941) ENSSLDG00000014919 ENSSLDG00000014901 runx1 (ENSSLDG00000014875) ENSSLDG00000014865 DONSON (ENSSLDG00000014741) Barramundi perch MODERN SPECIES 465 ENSLCAG00010006946 cryaa (ENSLCAG00010007150) ENSLCAG00010007164 ankrd10a (ENSLCAG00010007205) acp2 (ENSLCAG00010007211) ddx4 (ENSLCAG00010007444) UBE3A (ENSLCAG00010008476) #22 CNGA3 (ENSLCAG00010008502) atp1b1b (ENSLCAG00010008504) ENSLCAG00010008533 atg3 (ENSLCAG00010008555) SLC19A2 (ENSLCAG00010008651) ENSLCAG00010008656 ENSLCAG00010008659 ENSLCAG00010008663 ENSLCAG00010008669 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000162114 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00530000068760 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 Tongue sole MODERN SPECIES 5 CREB1 (ENSCSEG00000005881) KLF7 (ENSCSEG00000005892) RAMP1 (ENSCSEG00000005898) erbb4a (ENSCSEG00000005905) lancl1 (ENSCSEG00000005941) mylz3 (ENSCSEG00000005948) ENSCSEG00000005953 ENSCSEG00000005957 adarb1a (ENSCSEG00000005961) ENSCSEG00000005963 SLC19A2 (ENSCSEG00000005967) atg3 (ENSCSEG00000005972) ENSCSEG00000005993 DDRGK1 (ENSCSEG00000006009) atp1b1b (ENSCSEG00000006013) UBE3A (ENSCSEG00000006017) #22 CNGA3 (ENSCSEG00000006024) ddx4 (ENSCSEG00000006039) ENSCSEG00000006167 ankrd10a (ENSCSEG00000006172) ENSCSEG00000006174 gpd2 (ENSCSEG00000006181) nr4a2b (ENSCSEG00000006209) ENSCSEG00000006214 ENSCSEG00000006221 ENSCSEG00000006225 ENSCSEG00000006233 ENSCSEG00000006239 ENSCSEG00000006248 ENSCSEG00000006292 inpp4ab (ENSCSEG00000006311) Turbot MODERN SPECIES ecsit (ENSSMAG00000007704) ENSSMAG00000007677 ENSSMAG00000007653 men1 (ENSSMAG00000007623) map4k2 (ENSSMAG00000007591) ENSSMAG00000032254 ENSSMAG00000023269 ENSSMAG00000035075 CHRM4 (ENSSMAG00000009993) ENSSMAG00000009956 DGKZ (ENSSMAG00000009886) cryaa (ENSSMAG00000009877) ENSSMAG00000009868 ankrd10a (ENSSMAG00000021928) ENSSMAG00000009800 ENSSMAG00000009769 #22 ENSSMAG00000009742 ENSSMAG00000026899 ENSSMAG00000033842 ENSSMAG00000009661 ENSSMAG00000009630 ENSSMAG00000009608 ENSSMAG00000009622 ENSSMAG00000009505 ENSSMAG00000009464 slx9 (ENSSMAG00000009443) adarb1a (ENSSMAG00000009423) cep70 (ENSSMAG00000009376) ENSSMAG00000009359 dhrsx (ENSSMAG00000009324) ZBED1 (ENSSMAG00000037113) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00730000111141 ENSGT00940000162114 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00530000068760 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 ENSGT00920000150296 ENSGT01020000230582 ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT00940000161153 ENSGT00940000165158.b ENSGT00390000014753 ENSGT00940000156607.a.a Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000163494.a.a.c.b.b ENSGT00940000163322.a.a.b ENSGT00940000164501.a.a.a.b ENSGT00940000164501.a.a.a.a.a ENSGT00940000163494.a.b.a ENSGT00940000164501.a.a.b.a ENSGT00530000063480.a ENSGT00390000008096.B.e.b ENSGT00730000111141 ENSGT00940000160394.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 ENSGT01020000230582 ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT00940000161153 ENSGT00940000165158.b ENSGT00390000014753 ENSGT00940000156607.a.a.yb.b ENSGT00940000156607.a.a.xb Tetraodon MODERN SPECIES 18 etv5b (ENSTNIG00000014462) ENSTNIG00000014463 ENSTNIG00000000360 ENSTNIG00000000847 ENSTNIG00000014464 ENSTNIG00000014465 ENSTNIG00000014466 ENSTNIG00000014467 ENSTNIG00000014468 ENSTNIG00000014469 DGKZ (ENSTNIG00000014470) cryaa (ENSTNIG00000014471) ENSTNIG00000014472 ankrd10a (ENSTNIG00000014473) ddx4 (ENSTNIG00000014474) UBE3A (ENSTNIG00000014475) #22 CNGA3 (ENSTNIG00000014476) atp1b1b (ENSTNIG00000014477) ENSTNIG00000014478 ABHD8 (ENSTNIG00000014479) ENSTNIG00000014480 atg3 (ENSTNIG00000014481) SLC19A2 (ENSTNIG00000014482) ENSTNIG00000014483 ENSTNIG00000014484 anos1a (ENSTNIG00000014485) STS (ENSTNIG00000014486) ENSTNIG00000014487 pudp (ENSTNIG00000014488) ENSTNIG00000014489 PRKX (ENSTNIG00000014491) Fugu MODERN SPECIES 20 cacnb4.1 (ENSTRUG00000006633) etv5b (ENSTRUG00000028062) ENSTRUG00000006250 ENSTRUG00000023210 ENSTRUG00000005499 ENSTRUG00000020190 ENSTRUG00000021705 SATB2 (ENSTRUG00000032787) ENSTRUG00000019967 CHRM4 (ENSTRUG00000004253) DGKZ (ENSTRUG00000003102) cryaa (ENSTRUG00000002869) ENSTRUG00000025902 ankrd10a (ENSTRUG00000020089) vasa (ENSTRUG00000030182) UBE3A (ENSTRUG00000006347) #22 CNGA3 (ENSTRUG00000006140) atp1b1b (ENSTRUG00000027130) ENSTRUG00000022801 ENSTRUG00000005537 atg3 (ENSTRUG00000028024) SLC19A2 (ENSTRUG00000030191) ENSTRUG00000032654 arhgap1 (ENSTRUG00000004482) ENSTRUG00000031992 anos1a (ENSTRUG00000028299) STS (ENSTRUG00000027761) pnpla4 (ENSTRUG00000031102) pudp (ENSTRUG00000003358) nlgn4xa (ENSTRUG00000002232) ENSTRUG00000027168 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00730000111141 ENSGT00940000162114 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00530000068760 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 ENSGT00920000150296 ENSGT01020000230582 ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT00940000161153 ENSGT00940000162022 ENSGT00940000165158.b ENSGT00390000014753 Ballan wrasse MODERN SPECIES 962 ENSLBEG00000019198 ENSLBEG00000019217 ENSLBEG00000019230 ENSLBEG00000019284 SLC19A2 (ENSLBEG00000019294) atg3 (ENSLBEG00000019315) ENSLBEG00000019398 ENSLBEG00000019452 DDRGK1 (ENSLBEG00000019465) ddx4 (ENSLBEG00000019504) UBE3A (ENSLBEG00000019542) #22 CNGA3 (ENSLBEG00000019585) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00730000111141 ENSGT00940000162114 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00530000068760 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 ENSGT00920000150296 ENSGT01020000230582 ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT00940000161153 ENSGT00940000162022 ENSGT00940000165158.b ENSGT00390000014753 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00730000111141 ENSGT00940000162114 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 ENSGT00940000160630 ENSGT00940000178385 ENSGT00920000150296 ENSGT01020000230582 ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT00940000161153 ENSGT00940000162022 Gilthead seabream MODERN SPECIES 16 SEMA5B (ENSSAUG00010006489) kpnb3 (ENSSAUG00010006451) atg13 (ENSSAUG00010006426) creb3l1 (ENSSAUG00010006419) ENSSAUG00010006418 ndufs1 (ENSSAUG00010006080) ENSSAUG00010006056 ENSSAUG00010006048 ENSSAUG00010006036 CHRM4 (ENSSAUG00010006031) cryaa (ENSSAUG00010006027) DGKZ (ENSSAUG00010005946) ENSSAUG00010005928 ankrd10a (ENSSAUG00010005925) ddx4 (ENSSAUG00010005870) UBE3A (ENSSAUG00010004959) #22 CNGA3 (ENSSAUG00010004923) atp1b1b (ENSSAUG00010004916) DDRGK1 (ENSSAUG00010004899) ENSSAUG00010002964 atg3 (ENSSAUG00010002856) SLC19A2 (ENSSAUG00010024858) ENSSAUG00010024857 arhgap1 (ENSSAUG00010024856) ENSSAUG00010024853 ENSSAUG00010024851 ENSSAUG00010024850 anos1a (ENSSAUG00010024849) STS (ENSSAUG00010024846) ENSSAUG00010024848 pudp (ENSSAUG00010024845) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00730000111141 ENSGT00940000162114 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 ENSGT00940000160630 ENSGT00940000178385 ENSGT00920000150296 ENSGT01020000230582 ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT00940000161153 ENSGT00940000162022 European seabass MODERN SPECIES 15 ENSDLAG00005007901 ENSDLAG00005007755 CHRM4 (ENSDLAG00005007732) ENSDLAG00005007726 DGKZ (ENSDLAG00005028495) cryaa (ENSDLAG00005007717) ENSDLAG00005007705 ankrd10a (ENSDLAG00005007698) ENSDLAG00005007298 ENSDLAG00005006603 #22 ENSDLAG00005006567 ENSDLAG00005006547 ENSDLAG00005030679 ENSDLAG00005006264 ENSDLAG00005029259 ENSDLAG00005006200 ENSDLAG00005006187 ENSDLAG00005006110 ENSDLAG00005006101 ENSDLAG00005006075 anos1a (ENSDLAG00005006002) ENSDLAG00005005876 ENSDLAG00005005863 ENSDLAG00005026482 ENSDLAG00005035097 Large yellow croaker MODERN SPECIES 484 ndufb9 (ENSLCRG00005010954) tatdn1 (ENSLCRG00005010955) ENSLCRG00005010974 pomca (ENSLCRG00005010975) ENSLCRG00005010978 ENSLCRG00005010984 ENSLCRG00005010992 CHRM4 (ENSLCRG00005011002) ENSLCRG00005011004 mdka (ENSLCRG00005011005) DGKZ (ENSLCRG00005011025) ENSLCRG00005013211 cryaa (ENSLCRG00005013212) ankrd10a (ENSLCRG00005013213) ddx4 (ENSLCRG00005013232) UBE3A (ENSLCRG00005014475) #22 CNGA3 (ENSLCRG00005014496) ENSLCRG00005014509 atp1b1b (ENSLCRG00005014513) ENSLCRG00005014515 ENSLCRG00005014522 atg3 (ENSLCRG00005014531) SLC19A2 (ENSLCRG00005014695) ENSLCRG00005014696 ENSLCRG00005014698 TCAIM (ENSLCRG00005014700) cnot10 (ENSLCRG00005014708) calhm6 (ENSLCRG00005014713) calhm5.1 (ENSLCRG00005014714) rwdd1 (ENSLCRG00005014715) ENSLCRG00005014716 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00730000111141 ENSGT00940000162114 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00530000068760 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 ENSGT00390000000447 ENSGT00940000159255 ENSGT00940000159602 ENSGT00940000159870 ENSGT00940000164013 ENSGT00940000156180.e ENSGT00390000015709 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00730000111141 ENSGT00940000162114 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00530000068760 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 ENSGT00390000000447 ENSGT00940000159255 ENSGT00940000159602 ENSGT00940000159870 ENSGT00940000164013 ENSGT00940000156180.e ENSGT00390000015709 Stickleback MODERN SPECIES ENSGACG00000015364 TAAR1 (ENSGACG00000015361) ENSGACG00000015358 ENSGACG00000015357 ENSGACG00000015355 ENSGACG00000015353 ENSGACG00000015352 CHRM4 (ENSGACG00000015349) mdka (ENSGACG00000015348) DGKZ (ENSGACG00000015339) cryaa (ENSGACG00000015336) ENSGACG00000015333 ankrd10a (ENSGACG00000015330) ENSGACG00000015328 ddx4 (ENSGACG00000015323) UBE3A (ENSGACG00000015321) #22 atp1b1b (ENSGACG00000015312) ENSGACG00000015303 CARS2 (ENSGACG00000015295) atg3 (ENSGACG00000015289) ENSGACG00000015287 SLC19A2 (ENSGACG00000015286) ENSGACG00000015285 ENSGACG00000015284 DONSON (ENSGACG00000015279) runx1 (ENSGACG00000015276) ENSGACG00000015274 ENSGACG00000015268 ENSGACG00000015263 ENSGACG00000015253 slx9 (ENSGACG00000015252) Lumpfish MODERN SPECIES 11 cep70 (ENSCLMG00005006534) adarb1a (ENSCLMG00005006588) ENSCLMG00005006591 slx9 (ENSCLMG00005006594) ENSCLMG00005006597 ENSCLMG00005006598 ENSCLMG00005006601 CHRM4 (ENSCLMG00005006604) DGKZ (ENSCLMG00005006628) ENSCLMG00005007668 cryaa (ENSCLMG00005007669) ENSCLMG00005007670 ENSCLMG00005007673 ENSCLMG00005007674 ENSCLMG00005007675 UBE3A (ENSCLMG00005007685) #22 CNGA3 (ENSCLMG00005008028) atp1b1b (ENSCLMG00005008029) ENSCLMG00005008033 atg3 (ENSCLMG00005008043) SLC19A2 (ENSCLMG00005008081) ENSCLMG00005008082 ENSCLMG00005008083 ENSCLMG00005008085 DONSON (ENSCLMG00005008086) runx1 (ENSCLMG00005008089) ENSCLMG00005008263 ENSCLMG00005008343 ENSCLMG00005008345 ENSCLMG00005008356 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000156607.a.a ENSGT00390000014753 ENSGT00940000165158.b ENSGT00940000161153 ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT01020000230582 ENSGT00730000111141 ENSGT00940000162114 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000160630 Channel bull blenny MODERN SPECIES 11 ENSCGOG00000003008 ENSCGOG00000003000 renbp (ENSCGOG00000002995) renbp (ENSCGOG00000002820) ENSCGOG00000002740 ENSCGOG00000002704 ENSCGOG00000002669 CHRM4 (ENSCGOG00000002650) ENSCGOG00000002621 mdka (ENSCGOG00000003349) DGKZ (ENSCGOG00000001381) cryaa (ENSCGOG00000001233) ENSCGOG00000001231 ankrd10a (ENSCGOG00000001229) ddx4 (ENSCGOG00000000854) UBE3A (ENSCGOG00000000574) #22 CNGA3 (ENSCGOG00000000502) atp1b1b (ENSCGOG00000000490) ENSCGOG00000000477 ENSCGOG00000000430 atg3 (ENSCGOG00000000416) SLC19A2 (ENSCGOG00000000406) ENSCGOG00000000408 arhgap1 (ENSCGOG00000000400) runx1 (ENSCGOG00000000380) ENSCGOG00000000371 adarb1a (ENSCGOG00000000348) slx9 (ENSCGOG00000000344) ENSCGOG00000000275 ENSCGOG00000000230 Pike perch MODERN SPECIES 173 cep70 (ENSSLUG00000010694) sowahcb (ENSSLUG00000010689) ZBED1 (ENSSLUG00000010686) ENSSLUG00000010683 ENSSLUG00000010680 ENSSLUG00000010672 ENSSLUG00000010665 CHRM4 (ENSSLUG00000010662) mdka (ENSSLUG00000010659) DGKZ (ENSSLUG00000008198) cryaa (ENSSLUG00000008088) ENSSLUG00000008081 ankrd10a (ENSSLUG00000008070) ENSSLUG00000008061 ddx4 (ENSSLUG00000005901) UBE3A (ENSSLUG00000005444) #22 CNGA3 (ENSSLUG00000005305) atp1b1b (ENSSLUG00000005269) ENSSLUG00000005259 ENSSLUG00000005134 atg3 (ENSSLUG00000005029) SLC19A2 (ENSSLUG00000004993) ENSSLUG00000004988 arhgap1 (ENSSLUG00000004984) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT01060000248575.D.c.b.a.a ENSGT00530000063484.b.b.d.b ENSGT00940000154342.C ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466.e.a ENSGT00730000111141 ENSGT00940000162114 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00530000068760 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00940000169304 ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 ENSGT00920000150296 ENSGT01020000230582 ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT00940000161153 ENSGT00940000165158.b ENSGT00390000014753 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466.e.a ENSGT00730000111141 ENSGT00940000160394.a ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00940000165508 ENSGT00390000009987 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000010308 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000017193 ENSGT00940000169304 ENSGT00940000161153 ENSGT00940000165158.b ENSGT00390000014753 ENSGT00940000156607.a.a ENSGT00940000159832 ENSGT00940000159942.a.c.a Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 67 ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466.e.a ENSGT00730000111141 ENSGT00940000160394.a ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00940000165508 ENSGT00390000009987 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000010308 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000017193 ENSGT01020000230582 ENSGT00440000033720.a.a.b Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00940000164022 ENSGT00940000154344.b ENSGT00940000161628 ENSGT00940000159942.a.c.a ENSGT00940000159832 ENSGT00940000156607.a.a ENSGT00390000014753 ENSGT00940000165158.b ENSGT00940000161153 ENSGT00730000111141 ENSGT00940000160394.a ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00940000165508 ENSGT00390000009987 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000010308 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000017193 ENSGT01020000230582.b ENSGT00440000033720.a.a.b Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000164022 ENSGT00940000154344.b ENSGT00940000161628 ENSGT00940000159942.a.c.a ENSGT00940000159832 ENSGT00940000156607.a.a ENSGT00390000014753 ENSGT00940000165158.b ENSGT00940000161153 ENSGT00730000111141 ENSGT00940000160394.a ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00940000165508 ENSGT00390000009987 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000010308 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000017193 ENSGT01020000230582.b ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT01020000230582.a ENSGT00940000156780 ENSGT00940000164897.a.b Poecilia ANCESTRAL SPECIES 67 ENSGT00940000164022 ENSGT00940000154344.b ENSGT00940000161628 ENSGT00940000159942.a.c.a ENSGT00940000159832 ENSGT00940000156607.a.a ENSGT00390000014753 ENSGT00940000165158.b ENSGT00940000161153 ENSGT00730000111141 ENSGT00940000160394.a ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00940000165508 ENSGT00390000009987 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000010308 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000017193 ENSGT01020000230582.b ENSGT01020000230582.a ENSGT00940000156780 ENSGT00940000164897.a.b NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 309 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00940000165508 ENSGT00390000009987 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000010308 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000017193 ENSGT01020000230582.b ENSGT01020000230582.a ENSGT00940000156780 ENSGT00940000164897.a.b Sailfin molly MODERN SPECIES 1891 ENSPLAG00000020756 ENSPLAG00000020742 ddx4 (ENSPLAG00000020726) UBE3A (ENSPLAG00000020695) #22 CNGA3 (ENSPLAG00000020661) atp1b1b (ENSPLAG00000020645) ENSPLAG00000020637 ENSPLAG00000020626 SLC19A2 (ENSPLAG00000020612) Amazon molly MODERN SPECIES 899 ENSPFOG00000018834 ddx4 (ENSPFOG00000018842) UBE3A (ENSPFOG00000018875) #22 CNGA3 (ENSPFOG00000018885) atp1b1b (ENSPFOG00000018892) ENSPFOG00000018903 ENSPFOG00000022122 SLC19A2 (ENSPFOG00000018920) atg3 (ENSPFOG00000018939) ENSPFOG00000018951 DDRGK1 (ENSPFOG00000018962) ENSPFOG00000018967 ENSPFOG00000020558 ENSPFOG00000018971 Guppy MODERN SPECIES 450 cd99 (ENSPREG00000018142) gyg2 (ENSPREG00000018121) MXRA5 (ENSPREG00000018101) PRKX (ENSPREG00000018074) nlgn4xa (ENSPREG00000018050) pudp (ENSPREG00000018021) ENSPREG00000018013 STS (ENSPREG00000018006) ENSPREG00000017979 CHRM4 (ENSPREG00000017969) ENSPREG00000017946 cryaa (ENSPREG00000017897) ENSPREG00000017886 ENSPREG00000017872 ddx4 (ENSPREG00000017840) UBE3A (ENSPREG00000017799) #22 CNGA3 (ENSPREG00000017756) atp1b1b (ENSPREG00000017732) ENSPREG00000017697 ENSPREG00000017679 SLC19A2 (ENSPREG00000017667) atg3 (ENSPREG00000017638) ENSPREG00000017622 ENSPREG00000017610 ENSPREG00000017596 ENSPREG00000017586 ENSPREG00000017519 ATP1A1 (ENSPREG00000017481) ENSPREG00000017463 ENSPREG00000017415 obsl1a (ENSPREG00000017290) Platyfish MODERN SPECIES 16 ENSXMAG00000020985 ENSXMAG00000021460 ENSXMAG00000004148 SLC5A3 (ENSXMAG00000002730) ENSXMAG00000002739 TGDS (ENSXMAG00000002759) GPR180 (ENSXMAG00000025201) ENSXMAG00000027811 ENSXMAG00000025239 ENSXMAG00000009655 ENSXMAG00000028695 cryaa (ENSXMAG00000026790) ENSXMAG00000029937 ankrd10a (ENSXMAG00000009672) ddx4 (ENSXMAG00000009677) UBE3A (ENSXMAG00000009731) #22 CNGA3 (ENSXMAG00000009749) atp1b1b (ENSXMAG00000027546) ENSXMAG00000009779 ENSXMAG00000028105 SLC19A2 (ENSXMAG00000009795) atg3 (ENSXMAG00000009806) ENSXMAG00000009824 ENSXMAG00000022662 ENSXMAG00000023949 ENSXMAG00000025376 ENSXMAG00000009847 ENSXMAG00000020169 ENSXMAG00000026199 ENSXMAG00000009852 ENSXMAG00000009853 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 202 ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466.e.a ENSGT00730000111141 ENSGT00940000160394.a ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00940000160630 ENSGT00390000009987 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000010308 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000017193 ENSGT00940000159144.A.f ENSGT00940000175375 ENSGT00940000156877 ENSGT00390000013956 ENSGT01000000214434.B.a.b ENSGT00940000153695.B ENSGT00390000005596.a Mummichog MODERN SPECIES 2385 cyp20a1 (ENSFHEG00000018443) abi2b (ENSFHEG00000018481) dmd (ENSFHEG00000019360) ENSFHEG00000019459 tmem47 (ENSFHEG00000019497) ENSFHEG00000019526 gtf3c3 (ENSFHEG00000019622) HECW2 (ENSFHEG00000019687) ENSFHEG00000019700 ENSFHEG00000019794 cryaa (ENSFHEG00000019885) ENSFHEG00000019893 ENSFHEG00000019907 ankrd10a (ENSFHEG00000019912) ddx4 (ENSFHEG00000019935) UBE3A (ENSFHEG00000019962) #22 CNGA3 (ENSFHEG00000019981) Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1225 ENSCVAG00000021654 ENSCVAG00000021667 ENSCVAG00000021672 UBE3A (ENSCVAG00000021708) #22 CNGA3 (ENSCVAG00000021748) atp1b1b (ENSCVAG00000021778) Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 156 ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466.e.a ENSGT00730000111141 ENSGT00940000160394.a ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00940000165508 ENSGT00390000009987 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000010308 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000017193 ENSGT01020000230582 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1619 ENSNFUG00015009821 ENSNFUG00015010578 ENSNFUG00015010583 APG3L (ENSNFUG00015010599) CARS2 (ENSNFUG00015010636) ENSNFUG00015010684 GTF3C3 (ENSNFUG00015010693) ENSNFUG00015011011 CHRM4A (ENSNFUG00015011027) cryaa (ENSNFUG00015011042) ENSNFUG00015011055 ankrd10a (ENSNFUG00015011073) ENSNFUG00015011114 ENSNFUG00015011133 ENSNFUG00015011142 UBE3A (ENSNFUG00015011165) #22 CNGA3 (ENSNFUG00015011195) ATP1B1B (ENSNFUG00015011206) ENSNFUG00015011220 ENSNFUG00015011228 ENSNFUG00015011234 SLC19A2 (ENSNFUG00015011244) ENSNFUG00015011253 ebpl (ENSNFUG00015011262) arl11 (ENSNFUG00015011283) EEF1B2 (ENSNFUG00015011306) ENSNFUG00015011343 BX957297.2 (ENSNFUG00015011364) SNX9 (ENSNFUG00015011387) MLPH (ENSNFUG00015011558) pomca (ENSNFUG00015011582) Mangrove rivulus MODERN SPECIES 91 slc4a4a (ENSKMAG00000012938) NTNG2 (ENSKMAG00000012879) med27 (ENSKMAG00000012833) fnbp1a (ENSKMAG00000012787) ENSKMAG00000012770 OLFM1 (ENSKMAG00000012742) nlgn4xa (ENSKMAG00000012701) PRKX (ENSKMAG00000012679) MXRA5 (ENSKMAG00000012659) gyg2 (ENSKMAG00000012637) cd99 (ENSKMAG00000012598) STS (ENSKMAG00000012564) ENSKMAG00000012551 ENSKMAG00000012531 ddx4 (ENSKMAG00000012439) UBE3A (ENSKMAG00000012397) #22 CNGA3 (ENSKMAG00000012382) atp1b1b (ENSKMAG00000012367) ENSKMAG00000012300 ENSKMAG00000012282 SLC19A2 (ENSKMAG00000012238) atg3 (ENSKMAG00000012205) CARS2 (ENSKMAG00000012180) ankrd10a (ENSKMAG00000012158) cryaa (ENSKMAG00000012128) ENSKMAG00000012076 ENSKMAG00000012038 ENSKMAG00000012003 HECW2 (ENSKMAG00000011951) gtf3c3 (ENSKMAG00000011925) ENSKMAG00000011902 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000159255 ENSGT00690000103830 ENSGT00940000159602 ENSGT00940000159870 ENSGT00940000164013 ENSGT00940000156180.e ENSGT00390000015709 ENSGT00940000155992.c.b ENSGT00390000009029 ENSGT00730000111141 ENSGT00940000160394.a ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00940000165508 ENSGT00390000009987 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000010308 ENSGT00390000006347.b ENSGT00940000165158.b ENSGT00390000014753 ENSGT00940000156607.a.a ENSGT00940000159832 ENSGT00940000159942.a.c.a ENSGT00940000161628 ENSGT00940000161153 ENSGT00940000154344.b Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00390000000447 ENSGT00940000159255 ENSGT00940000159602 ENSGT00940000159870 ENSGT00940000164013 ENSGT00940000156180.e ENSGT00390000015709 ENSGT00940000155992.c.b ENSGT00390000009029 ENSGT00730000111141 ENSGT00940000160394.a ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00940000165508 ENSGT00390000009987 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000010308 ENSGT00390000006347.b Javanese ricefish MODERN SPECIES 11 DONSON (ENSOJAG00000019708) runx1 (ENSOJAG00000019546) ENSOJAG00000019517 ENSOJAG00000019501 RCAN1 (ENSOJAG00000019486) ENSOJAG00000019475 PLCD4 (ENSOJAG00000018752) slx9 (ENSOJAG00000018700) adarb1a (ENSOJAG00000018589) ENSOJAG00000018447 ENSOJAG00000018423 CHRM4 (ENSOJAG00000018412) cryaa (ENSOJAG00000018404) ENSOJAG00000018379 ankrd10a (ENSOJAG00000018363) UBE3A (ENSOJAG00000017694) #22 CNGA3 (ENSOJAG00000017585) atp1b1b (ENSOJAG00000017578) ENSOJAG00000017501 SLC19A2 (ENSOJAG00000017493) atg3 (ENSOJAG00000017399) ENSOJAG00000016984 ENSOJAG00000016957 ENSOJAG00000016926 ENSOJAG00000016893 dhrsx (ENSOJAG00000016890) ENSOJAG00000016676 ENSOJAG00000009784 ENSOJAG00000009767 dhrsx (ENSOJAG00000009717) Indian medaka MODERN SPECIES 743 DONSON (ENSOMEG00000011419) runx1 (ENSOMEG00000011353) ENSOMEG00000011318 RCAN1 (ENSOMEG00000011264) ENSOMEG00000011226 ENSOMEG00000011154 slx9 (ENSOMEG00000010999) adarb1a (ENSOMEG00000010969) cep70 (ENSOMEG00000010898) ENSOMEG00000010811 CHRM4 (ENSOMEG00000010799) cryaa (ENSOMEG00000010775) ENSOMEG00000010748 ankrd10a (ENSOMEG00000010694) ddx4 (ENSOMEG00000010651) UBE3A (ENSOMEG00000010563) #22 CNGA3 (ENSOMEG00000010486) atp1b1b (ENSOMEG00000010442) ENSOMEG00000010410 ENSOMEG00000010387 SLC19A2 (ENSOMEG00000010374) atg3 (ENSOMEG00000010344) CARS2 (ENSOMEG00000010290) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000159255 ENSGT00690000103830 ENSGT00940000159602 ENSGT00940000159870 ENSGT00940000164013 ENSGT00940000156180.e ENSGT00390000015709 ENSGT00940000155992.c.b ENSGT00390000009029 ENSGT00730000111141 ENSGT00940000160394.a ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00940000165508 ENSGT00390000009987 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000010308 ENSGT00390000006347.b ENSGT00940000159832 ENSGT00940000159942.a.c.a ENSGT00940000161628 ENSGT00940000161153 ENSGT00940000154344.b ENSGT00940000164022 ENSGT00940000155466.e.a ENSGT00940000154342.C Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 11 ENSORLG00000028942 ENSORLG00000020697 ENSORLG00000028169 ENSORLG00000020687 ENSORLG00000020685 slx9 (ENSORLG00000027350) adarb1a (ENSORLG00000020682) cep70 (ENSORLG00000025033) ENSORLG00000028757 ENSORLG00000027334 ENSORLG00000020679 cryaa (ENSORLG00000020678) ENSORLG00000020677 ankrd10a (ENSORLG00000020675) ddx4 (ENSORLG00000020672) UBE3A (ENSORLG00000020667) #22 ENSORLG00000020665 atp1b1b (ENSORLG00000026544) ENSORLG00000019363 ENSORLG00000019352 SLC19A2 (ENSORLG00000027666) atg3 (ENSORLG00000019346) CARS2 (ENSORLG00000019327) ENSORLG00000029327 ENSORLG00000025122 ENSORLG00000022134 ENSORLG00000024819 ENSORLG00000024646 ENSORLG00000028030 ENSORLG00000029114 ENSORLG00000027896 Chinese medaka MODERN SPECIES 91 cryaa (ENSOSIG00000007801) ENSOSIG00000007799 ankrd10a (ENSOSIG00000007797) UBE3A (ENSOSIG00000006126) #22 atp1b1b (ENSOSIG00000006117) ENSOSIG00000006116 ENSOSIG00000006115 SLC19A2 (ENSOSIG00000006113) atg3 (ENSOSIG00000006104) CARS2 (ENSOSIG00000006101) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000003758 ENSGT00530000063484.b.b.d.b ENSGT00940000154342.C ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466.e.a ENSGT00730000111141 ENSGT00940000162114 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00530000068760 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00940000169304 ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 ENSGT00920000150296 ENSGT01020000230582 ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT00940000161153 ENSGT00940000165158.b ENSGT00390000014753 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00530000063484.b.b.d.b ENSGT00940000154342.C ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466.e.a ENSGT00730000111141 ENSGT00940000160394.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00940000169304 ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 ENSGT00920000150296 ENSGT01020000230582 ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT00940000161153 ENSGT00940000162022 ENSGT00940000165158.b Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00530000063484.b.b.d.b ENSGT00940000154342.C ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466.e.a ENSGT00730000111141 ENSGT00940000160394.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00940000169304 ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 ENSGT00920000150296 ENSGT01020000230582.e ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT00940000161153 ENSGT00940000162022 ENSGT00940000165158.b Nile tilapia MODERN SPECIES 14 ENSONIG00000016604 ENSONIG00000041021 dmd (ENSONIG00000003787) gtf3c3 (ENSONIG00000003781) ENSONIG00000037365 HECW2 (ENSONIG00000003777) ENSONIG00000003775 ENSONIG00000021315 ENSONIG00000003771 ENSONIG00000028902 DGKZ (ENSONIG00000003759) cryaa (ENSONIG00000003758) ENSONIG00000003755 ankrd10a (ENSONIG00000003753) ddx4 (ENSONIG00000042460) UBE3A (ENSONIG00000003746) #22 CNGA3 (ENSONIG00000003742) atp1b1b (ENSONIG00000032786) DDRGK1 (ENSONIG00000003737) ENSONIG00000003730 atg3 (ENSONIG00000003724) ENSONIG00000003721 ENSONIG00000035581 ENSONIG00000003716 ENSONIG00000040391 anos1a (ENSONIG00000003710) ENSONIG00000038767 ENSONIG00000003700 ENSONIG00000003696 ENSONIG00000036860 ENSONIG00000037745 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00530000063484.b.b.d.b ENSGT00940000154342.C ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466.e.a ENSGT00730000111141 ENSGT00940000160394.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00940000169304 ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987.g ENSGT00940000165508 ENSGT00920000150296.a.a ENSGT01020000230582.e ENSGT01020000230582.f ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT00940000161153 ENSGT00940000162022 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00530000063484.b.b.d.b.c ENSGT00940000154342.C ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466.e.a ENSGT00730000111141 ENSGT00940000160394.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987.g ENSGT00940000165508 ENSGT00920000150296.a.a ENSGT01020000230582.e ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT00940000161153.i ENSGT00940000162022 ENSGT00390000014753 ENSGT00940000156607.a.a Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 523 ENSHBUG00000002192 dmd (ENSHBUG00000002127) gtf3c3 (ENSHBUG00000001999) ENSHBUG00000001984 ENSHBUG00000001964 ENSHBUG00000001937 DGKZ (ENSHBUG00000001926) ENSHBUG00000001917 ankrd10a (ENSHBUG00000001911) ddx4 (ENSHBUG00000001897) UBE3A (ENSHBUG00000001874) #22 CNGA3 (ENSHBUG00000001860) atp1b1b (ENSHBUG00000001844) ENSHBUG00000001836 ENSHBUG00000001824 atg3 (ENSHBUG00000001814) SLC19A2 (ENSHBUG00000001800) ENSHBUG00000001787 arhgap1 (ENSHBUG00000001779) anos1a (ENSHBUG00000001761) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000155021.i.a.a ENSGT00670000099148.B ENSGT00940000178734 ENSGT00530000063484.b.b.d.b.c ENSGT00940000165756.B.h ENSGT00940000154342.C ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466.e.a ENSGT00730000111141.db.a ENSGT00940000160394.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987.g ENSGT00940000165508 ENSGT00920000150296.a.a ENSGT01020000230582.e ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT00940000161153.i ENSGT00940000162022 ENSGT00390000014753 ENSGT00940000156607.a.a Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00670000099148.B ENSGT00940000178734 ENSGT00530000063484.b.b.d.b.c ENSGT00940000165756.B.h ENSGT00940000154342.C ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466.e.a ENSGT00730000111141.eb ENSGT00940000170955.d.a ENSGT00940000160394.a.g ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000009987.g ENSGT00940000165508 ENSGT00920000150296.a.a ENSGT01020000230582.e ENSGT01020000230582.f ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT00940000161153.i ENSGT00940000162022 ENSGT00390000014753 Eastern happy MODERN SPECIES 14 tmem47 (ENSACLG00000005217) ENSACLG00000006052 dmd (ENSACLG00000006126) gtf3c3 (ENSACLG00000006496) HECW2 (ENSACLG00000006965) ENSACLG00000007065 ENSACLG00000007098 ENSACLG00000007123 ENSACLG00000007130 DGKZ (ENSACLG00000007274) ENSACLG00000007352 cryaa (ENSACLG00000007367) ankrd10a (ENSACLG00000007413) ENSACLG00000007417 ddx4 (ENSACLG00000007422) UBE3A (ENSACLG00000007490) #22 CNGA3 (ENSACLG00000007510) atp1b1b (ENSACLG00000007517) DDRGK1 (ENSACLG00000007529) ENSACLG00000007545 atg3 (ENSACLG00000007586) SLC19A2 (ENSACLG00000007994) ENSACLG00000008143 ENSACLG00000008158 ENSACLG00000008187 ENSACLG00000008194 ENSACLG00000008203 ENSACLG00000008211 anos1a (ENSACLG00000008217) ENSACLG00000008218 ENSACLG00000008222 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1105 ENSMZEG00005017569 tmem47 (ENSMZEG00005017573) ENSMZEG00005017581 ENSMZEG00005017586 dmd (ENSMZEG00005017653) gtf3c3 (ENSMZEG00005018974) HECW2 (ENSMZEG00005018985) ENSMZEG00005018999 ENSMZEG00005019011 ENSMZEG00005019014 ENSMZEG00005019049 cryaa (ENSMZEG00005019090) ENSMZEG00005019095 ankrd10a (ENSMZEG00005019108) ddx4 (ENSMZEG00005019116) UBE3A (ENSMZEG00005019141) #22 CNGA3 (ENSMZEG00005019147) atp1b1b (ENSMZEG00005019152) DDRGK1 (ENSMZEG00005019156) ENSMZEG00005019169 atg3 (ENSMZEG00005019179) SLC19A2 (ENSMZEG00005019184) ENSMZEG00005019191 ENSMZEG00005019195 ENSMZEG00005019200 ENSMZEG00005019221 ENSMZEG00005019225 anos1a (ENSMZEG00005019232) ENSMZEG00005019250 pnpla4 (ENSMZEG00005019256) pudp (ENSMZEG00005019264) P. nyererei MODERN SPECIES 507 ENSPNYG00000022958 tmem47 (ENSPNYG00000022944) ENSPNYG00000022939 ENSPNYG00000022924 dmd (ENSPNYG00000022641) gtf3c3 (ENSPNYG00000022430) ENSPNYG00000022419 HECW2 (ENSPNYG00000022395) ENSPNYG00000022376 ENSPNYG00000022366 DGKZ (ENSPNYG00000022309) cryaa (ENSPNYG00000022260) ENSPNYG00000022241 ankrd10a (ENSPNYG00000022229) ddx4 (ENSPNYG00000022212) UBE3A (ENSPNYG00000022188) #22 CNGA3 (ENSPNYG00000022183) atp1b1b (ENSPNYG00000022156) DDRGK1 (ENSPNYG00000022139) ENSPNYG00000022118 atg3 (ENSPNYG00000022098) SLC19A2 (ENSPNYG00000022080) ENSPNYG00000022068 ENSPNYG00000022059 ENSPNYG00000022049 anos1a (ENSPNYG00000022034) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 384 ENSNBRG00000015388 tmem47 (ENSNBRG00000015378) ENSNBRG00000015322 dmd (ENSNBRG00000015200) gtf3c3 (ENSNBRG00000015155) ENSNBRG00000015128 HECW2 (ENSNBRG00000015082) ENSNBRG00000015073 ENSNBRG00000015044 DGKZ (ENSNBRG00000014924) ENSNBRG00000014893 cryaa (ENSNBRG00000014875) ENSNBRG00000014851 ankrd10a (ENSNBRG00000014781) ddx4 (ENSNBRG00000014442) UBE3A (ENSNBRG00000014367) #22 CNGA3 (ENSNBRG00000014284) atp1b1b (ENSNBRG00000014206) ENSNBRG00000014181 ENSNBRG00000014169 CARS2 (ENSNBRG00000014118) atg3 (ENSNBRG00000014016) SLC19A2 (ENSNBRG00000013987) ENSNBRG00000013977 ENSNBRG00000013961 ENSNBRG00000013927 ENSNBRG00000013913 anos1a (ENSNBRG00000013842) STS (ENSNBRG00000013801) pnpla4 (ENSNBRG00000013783) pudp (ENSNBRG00000013762) Midas cichlid MODERN SPECIES 556 ENSACIG00000017870 ENSACIG00000017866 CHRM4 (ENSACIG00000017856) DGKZ (ENSACIG00000017798) ENSACIG00000017779 cryaa (ENSACIG00000017726) ENSACIG00000017715 ankrd10a (ENSACIG00000017702) ddx4 (ENSACIG00000017623) UBE3A (ENSACIG00000017602) #22 CNGA3 (ENSACIG00000017593) atp1b1b (ENSACIG00000017185) Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 159 ENSGT00730000111141 ENSGT00940000162114 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00530000068760 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000010308 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 174 ENSGT00730000111141 ENSGT00940000162114 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00530000068760 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000010308 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 126 ENSGT00730000111141 ENSGT00940000162114 ENSGT00940000160394.a ENSGT00390000007640.b.a ENSGT00940000156152.e.b ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00940000156564.b ENSGT00530000068760 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.n ENSGT00390000017193 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000010308 ENSGT00390000006347.b ENSGT00390000009987 ENSGT00940000165508 ENSGT00950000183140.a.a ENSGT00550000074981 ENSGT00510000047334 ENSGT00940000155749.d ENSGT00940000154360.A.b.b ENSGT00940000162768.B.b ENSGT00390000004923.C Orange clownfish MODERN SPECIES 16 stk24b (ENSAPEG00000009608) ENSAPEG00000009464 gcga (ENSAPEG00000009262) dpp4 (ENSAPEG00000009208) gca (ENSAPEG00000009189) ENSAPEG00000009136 ENSAPEG00000009064 CHRM4 (ENSAPEG00000008958) mdka (ENSAPEG00000008827) DGKZ (ENSAPEG00000008756) cryaa (ENSAPEG00000008742) ENSAPEG00000008701 ankrd10a (ENSAPEG00000008689) ENSAPEG00000008675 ddx4 (ENSAPEG00000008490) UBE3A (ENSAPEG00000008455) #22 CNGA3 (ENSAPEG00000008425) atp1b1b (ENSAPEG00000008396) DDRGK1 (ENSAPEG00000008381) SLC19A2 (ENSAPEG00000008374) atg3 (ENSAPEG00000008361) ENSAPEG00000008343 ENSAPEG00000008318 ENSAPEG00000008265 ENSAPEG00000008229 pwp2h (ENSAPEG00000008152) eed (ENSAPEG00000008130) ATP7B (ENSAPEG00000008040) LRRC3 (ENSAPEG00000008027) ENSAPEG00000008011 ENSAPEG00000007995 Clown anemonefish MODERN SPECIES 810 UBE3A (ENSAOCG00000000965) #22 CNGA3 (ENSAOCG00000014603) atp1b1b (ENSAOCG00000014615) DDRGK1 (ENSAOCG00000014632) SLC19A2 (ENSAOCG00000014642) atg3 (ENSAOCG00000014661) ENSAOCG00000014696 ENSAOCG00000014713 ENSAOCG00000014763 ENSAOCG00000014780 pwp2h (ENSAOCG00000014853) eed (ENSAOCG00000014876) ATP7B (ENSAOCG00000001045) Spiny chromis MODERN SPECIES 1243 ATP7B (ENSAPOG00000021619) eed (ENSAPOG00000021554) pwp2h (ENSAPOG00000021522) ENSAPOG00000021434 ddx4 (ENSAPOG00000021394) UBE3A (ENSAPOG00000021260) #22 CNGA3 (ENSAPOG00000021215) atp1b1b (ENSAPOG00000021147) DDRGK1 (ENSAPOG00000021115) SLC19A2 (ENSAPOG00000021104) atg3 (ENSAPOG00000021088) ENSAPOG00000021034 ENSAPOG00000020945 ENSAPOG00000020920 ENSAPOG00000020878 ENSAPOG00000020859 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 406 ENDOV (ENSSPAG00000014755) SEC14L1 (ENSSPAG00000014718) ENSSPAG00000014666 trim25 (ENSSPAG00000014642) ENSSPAG00000014637 dgke (ENSSPAG00000014613) ENSSPAG00000014575 ENSSPAG00000014546 CHRM4 (ENSSPAG00000014525) mdka (ENSSPAG00000014513) DGKZ (ENSSPAG00000014452) cryaa (ENSSPAG00000014441) ENSSPAG00000014413 ankrd10a (ENSSPAG00000014397) ddx4 (ENSSPAG00000014307) UBE3A (ENSSPAG00000014281) #22 CNGA3 (ENSSPAG00000014227) atp1b1b (ENSSPAG00000014210) ENSSPAG00000014181 SLC19A2 (ENSSPAG00000014161) atg3 (ENSSPAG00000014130) ENSSPAG00000014061 ENSSPAG00000014115 ENSSPAG00000014036 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 144 scn1lab (ENSHCOG00000018000) PRKX (ENSHCOG00000018032) ENSHCOG00000018047 ENSHCOG00000018051 ENSHCOG00000018059 ENSHCOG00000018079 RCAN1 (ENSHCOG00000018113) ENSHCOG00000018124 CHRM4 (ENSHCOG00000018145) mdka (ENSHCOG00000018167) DGKZ (ENSHCOG00000018221) cryaa (ENSHCOG00000018233) ENSHCOG00000018269 ankrd10a (ENSHCOG00000018319) ddx4 (ENSHCOG00000018337) UBE3A (ENSHCOG00000018345) #22 CNGA3 (ENSHCOG00000018387) atp1b1b (ENSHCOG00000018395) ENSHCOG00000018400 ENSHCOG00000018413 atg3 (ENSHCOG00000018464) ENSHCOG00000018470 SLC19A2 (ENSHCOG00000018494) ENSHCOG00000018489 ENSHCOG00000018510 ENSHCOG00000018658 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 11 GPR180 (ENSMMDG00005012286) ENSMMDG00005012288 ENSMMDG00005012289 ENSMMDG00005012299 runx1 (ENSMMDG00005012382) DONSON (ENSMMDG00005012490) ENSMMDG00005012493 cnot9 (ENSMMDG00005012494) ENSMMDG00005012527 slx9 (ENSMMDG00005013812) adarb1a (ENSMMDG00005013819) ENSMMDG00005013927 DDRGK1 (ENSMMDG00005014127) ENSMMDG00005014129 ddx4 (ENSMMDG00005014160) UBE3A (ENSMMDG00005016321) #22 CNGA3 (ENSMMDG00005016743) kpnb3 (ENSMMDG00005016767) SEMA5B (ENSMMDG00005016835) CACNB4 (ENSMMDG00005016911) etv5b (ENSMMDG00005019229) tmem237b (ENSMMDG00005019232) MPP4 (ENSMMDG00005019240) ALS2 (ENSMMDG00005019353) cdk15 (ENSMMDG00005019730) fzd7a (ENSMMDG00005019732) ENSMMDG00005019733 ENSMMDG00005019738 ENSMMDG00005019740 clcn4 (ENSMMDG00005019786) ENSMMDG00005021501 Cod MODERN SPECIES 20 ENSGMOG00000026707 ENSGMOG00000019125 ENSGMOG00000023186 ENSGMOG00000032400 ENSGMOG00000036807 ENSGMOG00000013197 ENSGMOG00000023000 adarb1a (ENSGMOG00000002964) ENSGMOG00000025826 ENSGMOG00000002942 ENSGMOG00000002928 ENSGMOG00000034066 ENSGMOG00000033235 ENSGMOG00000000146 ENSGMOG00000030009 ENSGMOG00000018993 #22 ENSGMOG00000018946 ENSGMOG00000003146 ENSGMOG00000027949 ENSGMOG00000030541 ENSGMOG00000022325 ENSGMOG00000025130 ENSGMOG00000007206 mpc2a (ENSGMOG00000030387) ENSGMOG00000018726 ENSGMOG00000018766 ENSGMOG00000018780 ENSGMOG00000024581 ENSGMOG00000027432 ENSGMOG00000026743 ENSGMOG00000017494 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT01000000214434.B.a.b ENSGT00550000074981 ENSGT01000000221844 ENSGT00390000001718.b ENSGT00950000183038.a.b.b.b.r ENSGT00950000183165.a.a.b ENSGT00550000075037 ENSGT00940000160059.a.b.a ENSGT00390000004553.f ENSGT00940000155126.s.a ENSGT00940000161508.b ENSGT00390000003338 ENSGT00940000155502 ENSGT00940000166950 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT00390000001101 ENSGT00940000154505.A.c ENSGT00940000157694 ENSGT00940000154474.B.b ENSGT00940000154474.B.a ENSGT00940000154474.A ENSGT00940000158209 ENSGT00940000153118 ENSGT00390000005914.a ENSGT00390000018208 ENSGT00940000157831 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000154851.A ENSGT00940000166110 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155050.b.a.a.a #22 Huchen MODERN SPECIES 11008 UBE3A (ENSHHUG00000012132) #22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155050.b.a.a.a #22 Salmo ANCESTRAL SPECIES 529 ENSGT00940000155050.b.a.a.a #22 ENSGT00940000158737.h.c Atlantic salmon MODERN SPECIES 8 ENSSSAG00000099614 ENSSSAG00000114830 ENSSSAG00000006987 ENSSSAG00000007072 ENSSSAG00000012823 ENSSSAG00000013302 ENSSSAG00000008545 ENSSSAG00000042186 tuba8l2 (ENSSSAG00000015785) stk16 (ENSSSAG00000079250) ENSSSAG00000107415 ENSSSAG00000009429 ENSSSAG00000082766 ENSSSAG00000108422 ENSSSAG00000103060 ENSSSAG00000006910 #22 ENSSSAG00000114244 ENSSSAG00000006274 AT233 (ENSSSAG00000044419) pcid2 (ENSSSAG00000044313) prozb (ENSSSAG00000092239) f10 (ENSSSAG00000043518) f7i (ENSSSAG00000111241) f7 (ENSSSAG00000114558) ENSSSAG00000115840 ENSSSAG00000084376 ENSSSAG00000043040 ENSSSAG00000098395 ENSSSAG00000096261 ENSSSAG00000043274 ENSSSAG00000007328 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1571 ENSGT00940000155050.b.a.a.b #22 ENSGT00940000158737.h.d Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 506 ENSGT00940000155050.b.a.a.b #22 ENSGT00940000158737.h.d Salmo ANCESTRAL SPECIES 100 ENSGT00390000004553.f.a.b ENSGT00940000155126.s.a.k.b.a ENSGT00940000161508.b.o.a.f ENSGT00390000003338.z ENSGT00940000155502.x ENSGT00940000155050.b.a.a.b #22 ENSGT00940000158737.h.d ENSGT00530000063614.a.a.fb.a ENSGT01030000234579.C.u.a ENSGT00390000001101.c.b.a ENSGT00940000154505.A.c.c ENSGT00940000157694.u.a ENSGT00940000154474.B.b.a ENSGT00940000154474.B.a.h ENSGT00940000154474.B.a.g.d ENSGT00940000158209.f ENSGT00390000005914.a.c ENSGT00940000157831.j.b.a ENSGT00940000159723.g ENSGT00940000154851.A.g ENSGT00940000166110.i River trout DUPLICATION River trout MODERN SPECIES 36 ENSSTUG00000018432 ENSSTUG00000017764 ENSSTUG00000020363 gpd2 (ENSSTUG00000019084) nr4a2b (ENSSTUG00000018948) tuba8l2 (ENSSTUG00000018945) stk16 (ENSSTUG00000018934) mnx2b (ENSSTUG00000018928) atic (ENSSTUG00000018666) fn1b (ENSSTUG00000011785) cpo (ENSSTUG00000011526) cpo (ENSSTUG00000011487) nudt15 (ENSSTUG00000011453) kpnb3 (ENSSTUG00000011045) ENSSTUG00000011024 UBE3A (ENSSTUG00000010620) #22 CNGA3 (ENSSTUG00000010584) TMEM131 (ENSSTUG00000009816) atp1b1b (ENSSTUG00000009780) pcid2 (ENSSTUG00000009681) prozb (ENSSTUG00000009665) f7i (ENSSTUG00000009652) f7 (ENSSTUG00000009639) f7l (ENSSTUG00000009634) ENSSTUG00000009624 creg1 (ENSSTUG00000009616) CD247 (ENSSTUG00000009599) ENSSTUG00000009591 dusp27 (ENSSTUG00000009584) ENSSTUG00000009569 cybb (ENSSTUG00000009498) River trout MODERN SPECIES 32 ATP7B (ENSSTUG00000040444) ENSSTUG00000045582 ENSSTUG00000045611 pwp2h (ENSSTUG00000046190) gpd2 (ENSSTUG00000046498) NR4A2 (ENSSTUG00000046787) tuba8l2 (ENSSTUG00000046796) stk16 (ENSSTUG00000046809) mnx2b (ENSSTUG00000046816) atic (ENSSTUG00000046839) fn1b (ENSSTUG00000047017) cpo (ENSSTUG00000047754) cpo (ENSSTUG00000047773) nudt15 (ENSSTUG00000047788) kpnb3 (ENSSTUG00000047830) ENSSTUG00000048245 #22 CNGA3 (ENSSTUG00000048409) TMEM131 (ENSSTUG00000048577) ATP1B1 (ENSSTUG00000049004) pcid2 (ENSSTUG00000049019) prozb (ENSSTUG00000049041) f10 (ENSSTUG00000049047) f7i (ENSSTUG00000049078) f7 (ENSSTUG00000049085) ENSSTUG00000049097 ENSSTUG00000049098 creg1 (ENSSTUG00000049106) ENSSTUG00000049111 ENSSTUG00000049115 dusp27 (ENSSTUG00000049129) ENSSTUG00000049132 Atlantic salmon MODERN SPECIES 7 ENSSSAG00000046633 ENSSSAG00000093775 glpk3 (ENSSSAG00000045972) ENSSSAG00000045894 ENSSSAG00000116115 ENSSSAG00000042287 ENSSSAG00000015387 tuba8l2 (ENSSSAG00000042151) stk16 (ENSSSAG00000042133) ENSSSAG00000082902 atic (ENSSSAG00000054060) fn1b (ENSSSAG00000105424) cpo (ENSSSAG00000007265) ENSSSAG00000007260 ENSSSAG00000008813 ENSSSAG00000016020 #22 ENSSSAG00000049578 ENSSSAG00000108016 AT233 (ENSSSAG00000008620) pcid2 (ENSSSAG00000055926) prozb (ENSSSAG00000113317) f10 (ENSSSAG00000055842) f7i (ENSSSAG00000087792) f7 (ENSSSAG00000055123) ENSSSAG00000055076 CREG1 (ENSSSAG00000109988) CD247 (ENSSSAG00000055061) ENSSSAG00000043051 STYXL2 (ENSSSAG00000054884) ENSSSAG00000088747 ENSSSAG00000122111 Huchen MODERN SPECIES 6677 UBE3A (ENSHHUG00000008566) #22 CNGA3 (ENSHHUG00000008639) ENSHHUG00000008646 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155050.b.a.b #22 Huchen MODERN SPECIES 3213 cpo (ENSHHUG00000020395) nudt15 (ENSHHUG00000020387) kpnb3 (ENSHHUG00000020128) ENSHHUG00000020112 #22 CNGA3 (ENSHHUG00000020024) TMEM131 (ENSHHUG00000019970) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1570 ENSGT00940000155050.b.b #22 ENSGT00940000158737.h.c Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 505 ENSGT00940000155050.b.b #22 ENSGT00940000158737.h.c Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT01000000214434.B.a.b.a ENSGT00550000074981.c ENSGT01000000221844 ENSGT00390000001718.b.b.b ENSGT00390000001718.b.b.a.a ENSGT00950000183038.a.b.b.b.r ENSGT00950000183165.a.a.b ENSGT00550000075037.b ENSGT00940000160059.a.b.a ENSGT00390000004553.f.b.a.a ENSGT00940000155126.s.a.k.b ENSGT00940000161508.b.o.a ENSGT00940000161508.b.o.b.a ENSGT00390000003338.z ENSGT00940000155502 ENSGT00940000155050.b.b #22 ENSGT00940000158737.h.c ENSGT01030000234579.C.t.b.b ENSGT01030000234579.C.t.b.a ENSGT00390000001101.c.b.b.a ENSGT00940000154474.B.a.g ENSGT00940000154474.A ENSGT00940000158209.g.a ENSGT00390000001101.c.b.b.b ENSGT00940000154505.A.c ENSGT00940000157694.v ENSGT00940000154474.B.b ENSGT00940000154474.B.a.h ENSGT00940000158209.h ENSGT00390000005914.a ENSGT00390000018208 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 133 ENSGT00940000155126.s.a.l ENSGT00940000161508.b.o.a ENSGT00390000003338.z ENSGT00940000161508.b.o.b.a ENSGT00940000155502 ENSGT00940000155050.b.b #22 ENSGT00940000158737.h.c ENSGT00390000001101.c.b.b.b ENSGT00940000154505.A.c ENSGT00940000157694.v.c.a ENSGT00940000154474.B.b ENSGT00940000154474.B.a.h ENSGT00940000158209.h ENSGT00390000005914.a ENSGT01020000232945 ENSGT00940000157831.j.a ENSGT00940000159723.j.a ENSGT00940000154851.A.f ENSGT00940000154851.A.e ENSGT00940000166110 ENSGT00940000155009.a.b.a.b Chinook salmon DUPLICATION Chinook salmon MODERN SPECIES 13 CNGA3 (ENSOTSG00005039429) ENSOTSG00005038737 #22 cpo (ENSOTSG00005038732) nudt15 (ENSOTSG00005038729) cpo (ENSOTSG00005038725) ENSOTSG00005038722 ENSOTSG00005038715 il12ba (ENSOTSG00005038709) ENSOTSG00005038706 ENSOTSG00005038700 cpo (ENSOTSG00005038693) cpo (ENSOTSG00005038691) nudt15 (ENSOTSG00005038688) ENSOTSG00005038687 ENSOTSG00005038686 UBE3A (ENSOTSG00005038170) #22 TMEM131 (ENSOTSG00005038165) DRD1 (ENSOTSG00005038164) msx2a (ENSOTSG00005038163) ENSOTSG00005038125 STC2 (ENSOTSG00005038121) nkx2.5 (ENSOTSG00005038119) BNIP1 (ENSOTSG00005038118) rpl26 (ENSOTSG00005038116) hbegfa (ENSOTSG00005038114) ENSOTSG00005037933 hnrnph1 (ENSOTSG00005037927) cyfip2 (ENSOTSG00005037429) ENSOTSG00005037380 ENSOTSG00005037378 ENSOTSG00005037377 Chinook salmon MODERN SPECIES 13 TMEM131 (ENSOTSG00005038165) UBE3A (ENSOTSG00005038170) #22 ENSOTSG00005038686 ENSOTSG00005038687 nudt15 (ENSOTSG00005038688) cpo (ENSOTSG00005038691) cpo (ENSOTSG00005038693) ENSOTSG00005038700 ENSOTSG00005038706 il12ba (ENSOTSG00005038709) ENSOTSG00005038715 ENSOTSG00005038722 cpo (ENSOTSG00005038725) nudt15 (ENSOTSG00005038729) cpo (ENSOTSG00005038732) ENSOTSG00005038737 #22 CNGA3 (ENSOTSG00005039429) TMEM131 (ENSOTSG00005039430) kctd12b (ENSOTSG00005002577) znf711 (ENSOTSG00005002655) zgc:66447 (ENSOTSG00005002697) tmsb1 (ENSOTSG00005002814) SLC25A53 (ENSOTSG00005002816) prps1b (ENSOTSG00005002824) FRMPD3 (ENSOTSG00005002826) nsdhl (ENSOTSG00005002829) CETN1 (ENSOTSG00005002837) gcna (ENSOTSG00005002841) ENSOTSG00005002843 ENSOTSG00005002848 OGT (ENSOTSG00005002927) Coho salmon MODERN SPECIES 7 ENSOKIG00005018697 cpo (ENSOKIG00005018596) nudt15 (ENSOKIG00005018557) kpnb3 (ENSOKIG00005018345) UBE3A (ENSOKIG00005018121) #22 CNGA3 (ENSOKIG00005018085) TMEM131 (ENSOKIG00005017279) atp1b1b (ENSOKIG00005017184) ENSOKIG00005017177 pcid2 (ENSOKIG00005017101) f10 (ENSOKIG00005017006) f7i (ENSOKIG00005016867) f7 (ENSOKIG00005016822) ENSOKIG00005016802 CREG1 (ENSOKIG00005016795) ENSOKIG00005016781 ENSOKIG00005016771 dusp27 (ENSOKIG00005016765) ENSOKIG00005016700 ENSOKIG00005016580 Rainbow trout DUPLICATION Rainbow trout MODERN SPECIES 28 ENSOMYG00000007956 ENSOMYG00000069237 ENSOMYG00000056151 ENSOMYG00000060607 tuba8l2 (ENSOMYG00000009711) stk16 (ENSOMYG00000009701) ENSOMYG00000009675 atic (ENSOMYG00000008659) ENSOMYG00000060190 ENSOMYG00000074661 fn1b (ENSOMYG00000006459) cpo (ENSOMYG00000004128) cpo (ENSOMYG00000004234) ENSOMYG00000075093 ENSOMYG00000002611 ENSOMYG00000066580 #22 ENSOMYG00000007384 ENSOMYG00000053905 ENSOMYG00000008870 pcid2 (ENSOMYG00000008742) f10 (ENSOMYG00000008677) ENSOMYG00000065212 f7i (ENSOMYG00000074198) f7i (ENSOMYG00000073781) ENSOMYG00000065501 f7 (ENSOMYG00000023107) f7l (ENSOMYG00000050113) ENSOMYG00000052350 CREG1 (ENSOMYG00000039299) CD247 (ENSOMYG00000059631) ENSOMYG00000068460 Rainbow trout MODERN SPECIES 9 ck073 (ENSOMYG00000061426) ENSOMYG00000009899 ENSOMYG00000008599 ENSOMYG00000008375 ENSOMYG00000008885 ENSOMYG00000007725 ENSOMYG00000007694 tuba8l2 (ENSOMYG00000007598) ENSOMYG00000007531 ENSOMYG00000055057 atic (ENSOMYG00000059980) fn1b (ENSOMYG00000067929) cpo (ENSOMYG00000004299) ENSOMYG00000067824 ENSOMYG00000074365 ENSOMYG00000062246 #22 ENSOMYG00000007510 ENSOMYG00000006431 ENSOMYG00000071238 ENSOMYG00000060099 pcid2 (ENSOMYG00000062291) prozb (ENSOMYG00000073708) f10 (ENSOMYG00000005561) f7i (ENSOMYG00000005352) f7i (ENSOMYG00000058058) f7 (ENSOMYG00000042835) ENSOMYG00000042852 ENSOMYG00000042798 CREG1 (ENSOMYG00000042779) cd3z (ENSOMYG00000049807) ENSOMYG00000050933 Northern pike MODERN SPECIES 21 pwp2h (ENSELUG00000001878) ENSELUG00000034064 gpd2 (ENSELUG00000001876) NR4A2 (ENSELUG00000001873) tuba8l2 (ENSELUG00000001871) stk16 (ENSELUG00000001868) mnx2b (ENSELUG00000001866) atic (ENSELUG00000001864) fn1b (ENSELUG00000001859) cpo (ENSELUG00000000052) cpo (ENSELUG00000001515) cpo (ENSELUG00000000051) nudt15 (ENSELUG00000001847) kpnb3 (ENSELUG00000001242) ENSELUG00000001842 UBE3A (ENSELUG00000001840) #22 CNGA3 (ENSELUG00000001838) TMEM131 (ENSELUG00000001834) atp1b1b (ENSELUG00000001828) pcid2 (ENSELUG00000001821) prozb (ENSELUG00000029883) f10 (ENSELUG00000024556) f7i (ENSELUG00000024411) f7 (ENSELUG00000024395) f7l (ENSELUG00000028406) ENSELUG00000024242 ENSELUG00000024162 creg1 (ENSELUG00000024230) CD247 (ENSELUG00000024134) ENSELUG00000024126 dusp27 (ENSELUG00000024114) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 405 ENSGT00940000160811.d ENSGT00940000156913.b.j.a ENSGT00390000008042.A.b.d ENSGT00940000154846.a.a ENSGT00940000156402.A.a ENSGT00940000165152 ENSGT00940000155607.mc.b ENSGT00940000156234.a.b ENSGT00940000154713.A.c.b ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h ENSGT01030000234579.C.l ENSGT00510000047120.gb ENSGT00530000063970.e Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 429 ENSGT00940000160811.d ENSGT00940000156913.b.j.a ENSGT00390000008042.A.b.d ENSGT00940000154846.a.a ENSGT00940000156402.A.a ENSGT00940000165152 ENSGT00940000155607.mc.b.l ENSGT00940000156234.a.b ENSGT00940000154713.A.c.b ENSGT00940000155050.b #22 ENSGT00940000158737.h Denticle herring MODERN SPECIES 15 ptpn2a (ENSDCDG00000017720) cep76 (ENSDCDG00000017730) id4 (ENSDCDG00000017751) ncalda (ENSDCDG00000017754) grhl2a (ENSDCDG00000017763) ENSDCDG00000017821 entpd3 (ENSDCDG00000017852) EN1 (ENSDCDG00000017865) C1QL2 (ENSDCDG00000017868) STEAP3 (ENSDCDG00000017875) ENSDCDG00000017879 ENSDCDG00000017881 GABRG3 (ENSDCDG00000017889) GABRA5 (ENSDCDG00000017898) GABRB3 (ENSDCDG00000017930) UBE3A (ENSDCDG00000017993) #22 CNGA3 (ENSDCDG00000018363) TMEM131 (ENSDCDG00000018598) atp1b1b (ENSDCDG00000022565) ENSDCDG00000022579 slc5a3a (ENSDCDG00000022582) OXGR1 (ENSDCDG00000022585) OXGR1 (ENSDCDG00000022586) mbnl2 (ENSDCDG00000022597) rap2ab (ENSDCDG00000022625) kpnb3 (ENSDCDG00000022637) FARP1 (ENSDCDG00000022899) ggact.3 (ENSDCDG00000024812) gpc6a (ENSDCDG00000024818) gpc5a (ENSDCDG00000024827) ENSDCDG00000024834 Spotted gar MODERN SPECIES 655 rgn (ENSLOCG00000008081) jade3 (ENSLOCG00000008100) rp2 (ENSLOCG00000008112) slc9a7 (ENSLOCG00000008129) CHST7 (ENSLOCG00000017795) tubgcp5 (ENSLOCG00000008164) cyfip1 (ENSLOCG00000008180) nipa2 (ENSLOCG00000008207) nipa1 (ENSLOCG00000008231) HERC2 (ENSLOCG00000008243) OCA2 (ENSLOCG00000008282) GABRG3 (ENSLOCG00000008316) GABRA5 (ENSLOCG00000008325) GABRB3 (ENSLOCG00000008344) ATP10A (ENSLOCG00000008355) ube3a (ENSLOCG00000008388) #22 CNGA3 (ENSLOCG00000008409) ENSLOCG00000008427 TMEM131 (ENSLOCG00000008449) si:ch211-201h21.5 (ENSLOCG00000008477) BIVM (ENSLOCG00000008489) zgc:172121 (ENSLOCG00000008512) nme7 (ENSLOCG00000008530) atp1b1b (ENSLOCG00000008556) dpt (ENSLOCG00000008571) mpc2a (ENSLOCG00000008587) dcaf6 (ENSLOCG00000008600) gpr161b (ENSLOCG00000008616) inpp4ab (ENSLOCG00000008627) slc9a2 (ENSLOCG00000008661) MFSD9 (ENSLOCG00000008676) Reedfish MODERN SPECIES 12 rp2 (ENSECRG00000013421) slc9a7 (ENSECRG00000013531) CHST7 (ENSECRG00000013931) tubgcp5 (ENSECRG00000013959) cyfip1 (ENSECRG00000014091) ENSECRG00000014222 nipa2 (ENSECRG00000014249) nipa1 (ENSECRG00000014278) HERC2 (ENSECRG00000014410) OCA2 (ENSECRG00000014714) GABRG3 (ENSECRG00000014879) GABRG3 (ENSECRG00000014931) GABRA5 (ENSECRG00000014988) GABRB3 (ENSECRG00000015165) ATP10A (ENSECRG00000015254) ube3a (ENSECRG00000015315) #22 ENSECRG00000015383 ENSECRG00000015473 ENSECRG00000015817 ENSECRG00000000937 TMEM131 (ENSECRG00000000970) si:ch211-201h21.5 (ENSECRG00000001007) BIVM (ENSECRG00000001040) zgc:172121 (ENSECRG00000001066) ENSECRG00000001110 mettl21e (ENSECRG00000001136) mettl21cb (ENSECRG00000001152) TPP2 (ENSECRG00000001187) RASA3 (ENSECRG00000001322) pros1 (ENSECRG00000001522) ENSECRG00000001548 Elephant shark DUPLICATION Elephant shark MODERN SPECIES 1503 slc9a7 (ENSCMIG00000016559) CHST7 (ENSCMIG00000016591) tubgcp5 (ENSCMIG00000016637) ENSCMIG00000016748 ENSCMIG00000016770 ENSCMIG00000016802 nipa2 (ENSCMIG00000016806) nipa1 (ENSCMIG00000016809) HERC2 (ENSCMIG00000017070) OCA2 (ENSCMIG00000017634) GABRG3 (ENSCMIG00000017650) GABRA5 (ENSCMIG00000017664) GABRB3 (ENSCMIG00000017692) ENSCMIG00000017700 ATP10A (ENSCMIG00000017712) ube3a (ENSCMIG00000017756) #22 CNGA3 (ENSCMIG00000017789) ENSCMIG00000017791 ENSCMIG00000017796 ENSCMIG00000017798 ENSCMIG00000017799 TMEM131 (ENSCMIG00000017844) ENSCMIG00000017895 ENSCMIG00000017899 si:dkey-4e7.3 (ENSCMIG00000017901) inpp4ab (ENSCMIG00000017925) ENSCMIG00000017969 unc50 (ENSCMIG00000017970) MGAT4A (ENSCMIG00000017973) ENSCMIG00000017976 ENSCMIG00000017977 Elephant shark MODERN SPECIES 1510 GRXCR1 (ENSCMIG00000010434) kctd8 (ENSCMIG00000010437) ENSCMIG00000010440 GUF1 (ENSCMIG00000010448) ENSCMIG00000010469 ENSCMIG00000010562 gabra4 (ENSCMIG00000010750) GABRB1 (ENSCMIG00000010773) commd8 (ENSCMIG00000010776) ENSCMIG00000010806 CORIN (ENSCMIG00000010880) NFXL1 (ENSCMIG00000010935) ENSCMIG00000011061 #22 cnga1a (ENSCMIG00000011087) ENSCMIG00000011090 NIPAL1 (ENSCMIG00000011093) ENSCMIG00000011095 ENSCMIG00000011110 tec (ENSCMIG00000011174) slain2 (ENSCMIG00000011224) ENSCMIG00000011245 ENSCMIG00000011267 SLC10A4 (ENSCMIG00000011270) ZAR1 (ENSCMIG00000011272) fryl (ENSCMIG00000011534) OCIAD1 (ENSCMIG00000012271) ENSCMIG00000012278 CWH43 (ENSCMIG00000012282) Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155050 #22 Lamprey MODERN SPECIES 1816 ube3a (ENSPMAG00000009767) #22 dnaaf6 (ENSPMAG00000009770) Hagfish MODERN SPECIES 1353 ENSEBUG00000000916 ENSEBUG00000003327 ENSEBUG00000015131 HERC2 (ENSEBUG00000003264) ENSEBUG00000010438 ENSEBUG00000002802 ENSEBUG00000015839 ENSEBUG00000001856 ENSEBUG00000012934 ENSEBUG00000015990 ENSEBUG00000016961 ENSEBUG00000010489 ENSEBUG00000002372 ube3a (ENSEBUG00000014155) #22