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ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00980000200525 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000163403 #24 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00960000192231 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505.d #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00980000200525 ENSGT00390000007818 #22 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Muroidea DUPLICATION Muroidea DUPLICATION Muroidea ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000015359 #7 ENSGT00940000154511.a #8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505.d #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818.qb.b.a #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000163403 #24 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000015359 #7 ENSGT00940000154511.a #8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 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Rat DUPLICATION Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 5 AABR07015559.1 (ENSRNOG00000055015) ENSRNOG00000067137 Ppargc1a (ENSRNOG00000004473) Dhx15 (ENSRNOG00000003844) Sod3 (ENSRNOG00000003869) ENSRNOG00000064588 Ccdc149 (ENSRNOG00000024454) Lgi2 (ENSRNOG00000066201) Sepsecs (ENSRNOG00000049244) Pi4k2b (ENSRNOG00000003924) Zcchc4 (ENSRNOG00000029064) Anapc4 (ENSRNOG00000004130) Slc34a2 (ENSRNOG00000004626) Sel1l3 (ENSRNOG00000004932) AABR07015507.1 (ENSRNOG00000051190) LOC100361259 (ENSRNOG00000055911) #22 Rbpj (ENSRNOG00000046327) Cckar (ENSRNOG00000043124) Tbc1d19 (ENSRNOG00000003003) Stim2 (ENSRNOG00000002956) ENSRNOG00000067114 Pcdh7 (ENSRNOG00000012367) Pcdh7 (ENSRNOG00000063828) ENSRNOG00000067336 AABR07015346.1 (ENSRNOG00000027791) ENSRNOG00000065159 LOC108348204 (ENSRNOG00000063351) ENSRNOG00000065472 Arap2 (ENSRNOG00000056826) AABR07015180.1 (ENSRNOG00000026134) Nwd2 (ENSRNOG00000051837) Rat MODERN SPECIES 15 Ptprd (ENSRNOG00000005711) Dmac1 (ENSRNOG00000023946) Kdm4c 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ENSGT00950000182832.D.a.i #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 Golden Hamster MODERN SPECIES 654 Mvd (ENSMAUG00000020072) #7 Snai3 (ENSMAUG00000001685) #8 Rnf166 (ENSMAUG00000018616) #9 Ctu2 (ENSMAUG00000020048) #10 Piezo1 (ENSMAUG00000021717) #11 Cdt1 (ENSMAUG00000022237) #12 Aprt (ENSMAUG00000021299) #13 Galns (ENSMAUG00000021453) #14 Trappc2l (ENSMAUG00000018071) #15 Pabpn1l (ENSMAUG00000014032) #16 Cbfa2t3 (ENSMAUG00000016035) #17 Acsf3 (ENSMAUG00000014775) #18 Cdh15 (ENSMAUG00000018802) #19 ENSMAUG00000009818 #20 Spg7 (ENSMAUG00000017872) #21 ENSMAUG00000020543 #22 Cpne7 (ENSMAUG00000021382) #23 Sult5a1 (ENSMAUG00000008375) #24 Dpep1 (ENSMAUG00000018227) #25 Chmp1a (ENSMAUG00000020494) #26 ENSMAUG00000021251 #27 Cdk10 (ENSMAUG00000003054) #28 Spata2l (ENSMAUG00000012181) #29 Vps9d1 (ENSMAUG00000021021) #30 Zfp276 (ENSMAUG00000017387) #31 Fanca (ENSMAUG00000004194) #32 Spire2 (ENSMAUG00000010721) #33 Tcf25 (ENSMAUG00000013285) #34 Mc1r (ENSMAUG00000009712) #35 Tubb3 (ENSMAUG00000001598) #36 Def8 (ENSMAUG00000011797) #37 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 112 Snai3 (ENSCGRG00001011389) #8 Rnf166 (ENSCGRG00001013400) #9 Ctu2 (ENSCGRG00001018738) #10 Piezo1 (ENSCGRG00001016495) #11 Cdt1 (ENSCGRG00001016566) #12 APRT (ENSCGRG00001009398) #13 Galns (ENSCGRG00001009443) #14 Trappc2l (ENSCGRG00001024305) #15 Pabpn1l (ENSCGRG00001013211) #16 Cbfa2t3 (ENSCGRG00001006537) #17 Acsf3 (ENSCGRG00001018446) #18 Cdh15 (ENSCGRG00001014367) #19 Ankrd11 (ENSCGRG00001017994) #20 ENSCGRG00001011924 Spg7 (ENSCGRG00001021214) #21 Rpl13 (ENSCGRG00001022563) #22 Cpne7 (ENSCGRG00001015474) #23 Sult5a1 (ENSCGRG00001017454) #24 Dpep1 (ENSCGRG00001023251) #25 Chmp1a (ENSCGRG00001021434) #26 ENSCGRG00001021128 #27 Cdk10 (ENSCGRG00001014991) #28 Spata2l (ENSCGRG00001001719) #29 Vps9d1 (ENSCGRG00001021065) #30 Zfp276 (ENSCGRG00001022243) #31 Fanca (ENSCGRG00001000132) #32 Spire2 (ENSCGRG00001024191) #33 Tcf25 (ENSCGRG00001013881) #34 Mc1r (ENSCGRG00001005438) #35 Tubb3 (ENSCGRG00001010067) #36 Def8 (ENSCGRG00001017815) #37 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000015359 #7 ENSGT00940000154511.a #8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505.d #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818.qb.b.a #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000163403 #24 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a.i #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 12 Mvd (ENSMOCG00000022955) #7 Snai3 (ENSMOCG00000003536) #8 Rnf166 (ENSMOCG00000018742) #9 Ctu2 (ENSMOCG00000004755) #10 Piezo1 (ENSMOCG00000008460) #11 Cdt1 (ENSMOCG00000008713) #12 Aprt (ENSMOCG00000000737) #13 Galns (ENSMOCG00000009269) #14 ENSMOCG00000017231 #15 Pabpn1l (ENSMOCG00000007955) #16 Cbfa2t3 (ENSMOCG00000021007) #17 Acsf3 (ENSMOCG00000016996) #18 Cdh15 (ENSMOCG00000003048) #19 ENSMOCG00000003172 #20 Spg7 (ENSMOCG00000022814) #21 ENSMOCG00000009058 #22 Cpne7 (ENSMOCG00000016113) #23 Sult5a1 (ENSMOCG00000018322) #24 Dpep1 (ENSMOCG00000003603) #25 ENSMOCG00000006103 #26 ENSMOCG00000002553 #27 ENSMOCG00000019950 Cdk10 (ENSMOCG00000013570) #28 Spata2l (ENSMOCG00000001425) #29 ENSMOCG00000022018 #30 Zfp276 (ENSMOCG00000005818) #31 ENSMOCG00000014977 #32 Spire2 (ENSMOCG00000004491) #33 Tcf25 (ENSMOCG00000019952) #34 Tubb3 (ENSMOCG00000006039) #36 Def8 (ENSMOCG00000002074) #37 Prairie vole MODERN SPECIES 353 ENSMOCG00000001905 Tigd2 (ENSMOCG00000011023) Fam13a (ENSMOCG00000014628) Herc3 (ENSMOCG00000021374) Nap1l5 (ENSMOCG00000006906) Abcg2 (ENSMOCG00000012726) ENSMOCG00000013438 Fkbp1b (ENSMOCG00000012542) Wdcp (ENSMOCG00000013612) Mfsd2b (ENSMOCG00000012318) Ubxn2a (ENSMOCG00000020669) Atad2b (ENSMOCG00000000408) Klhl29 (ENSMOCG00000007430) ENSMOCG00000012724 ENSMOCG00000013271 ENSMOCG00000002216 #22 Apob (ENSMOCG00000021753) Gdf7 (ENSMOCG00000010905) ENSMOCG00000021323 Hs1bp3 (ENSMOCG00000022226) Rhob (ENSMOCG00000007966) Slc7a15 (ENSMOCG00000003687) Pum2 (ENSMOCG00000013663) Sdc1 (ENSMOCG00000019532) ENSMOCG00000012688 Laptm4a (ENSMOCG00000013181) Matn3 (ENSMOCG00000013872) Wdr35 (ENSMOCG00000001393) Ttc32 (ENSMOCG00000021911) ENSMOCG00000007598 Osr1 (ENSMOCG00000012793) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.b.b ##22 Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1014 ENSNGAG00000018302 ENSNGAG00000013193 ENSNGAG00000013809 Ifit2 (ENSNGAG00000014540) Lipa (ENSNGAG00000015250) Fas (ENSNGAG00000017140) Acta2 (ENSNGAG00000019417) ENSNGAG00000020255 Ankrd22 (ENSNGAG00000000361) Lipm (ENSNGAG00000002563) Lipn (ENSNGAG00000005809) Lipk (ENSNGAG00000000514) Lipf (ENSNGAG00000009032) ENSNGAG00000012069 Rnls (ENSNGAG00000011466) ENSNGAG00000014655 ##22 ENSNGAG00000017270 ENSNGAG00000002931 Papss2 (ENSNGAG00000007513) Minpp1 (ENSNGAG00000008682) Sgms1 (ENSNGAG00000010973) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1108 Rnf166 (ENSNGAG00000021980) #9 Ctu2 (ENSNGAG00000023366) #10 Piezo1 (ENSNGAG00000017101) #11 Cdt1 (ENSNGAG00000022315) #12 ENSNGAG00000016112 #13 Galns (ENSNGAG00000022107) #14 ENSNGAG00000024083 #15 Pabpn1l (ENSNGAG00000023992) #16 Cbfa2t3 (ENSNGAG00000016320) #17 Acsf3 (ENSNGAG00000022957) #18 Cdh15 (ENSNGAG00000016069) #19 Ankrd11 (ENSNGAG00000015118) #20 ENSNGAG00000008560 #20 ENSNGAG00000024166 Spg7 (ENSNGAG00000020726) #21 Rpl13 (ENSNGAG00000018467) ##22 Cpne7 (ENSNGAG00000023423) #23 Sult5a1 (ENSNGAG00000022110) #24 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.b.b ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.b.b ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.b.b ##22 Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 15 Tvp23b (ENSMOCG00000018047) Fbxw10 (ENSMOCG00000004826) Zfp286 (ENSMOCG00000019959) Zfp287 (ENSMOCG00000021290) ENSMOCG00000003144 Lrrc75a (ENSMOCG00000005975) Trpv2 (ENSMOCG00000005798) ENSMOCG00000009869 Cenpv (ENSMOCG00000022318) Pigl (ENSMOCG00000003178) Ncor1 (ENSMOCG00000020819) Ttc19 (ENSMOCG00000022785) Zswim7 (ENSMOCG00000015607) Adora2b (ENSMOCG00000012952) Specc1 (ENSMOCG00000016774) ENSMOCG00000011602 ##22 Akap10 (ENSMOCG00000017550) Ulk2 (ENSMOCG00000012863) Prpsap2 (ENSMOCG00000001958) Slc5a10 (ENSMOCG00000015473) Fam83g (ENSMOCG00000018318) Grap (ENSMOCG00000020247) Epn2 (ENSMOCG00000017784) B9d1 (ENSMOCG00000010416) Mapk7 (ENSMOCG00000018009) Mfap4 (ENSMOCG00000012652) Rnf112 (ENSMOCG00000010911) Slc47a1 (ENSMOCG00000013787) Slc47a2 (ENSMOCG00000016547) Aldh3a2 (ENSMOCG00000018442) Aldh3a1 (ENSMOCG00000014708) Prairie vole MODERN SPECIES 13 ENSMOCG00000021474 ENSMOCG00000008845 ENSMOCG00000020404 Or8b49 (ENSMOCG00000018010) Or8b44 (ENSMOCG00000012548) ENSMOCG00000005803 ENSMOCG00000015638 ENSMOCG00000020879 ENSMOCG00000005209 ENSMOCG00000005898 Or8c9 (ENSMOCG00000006717) Or8c15 (ENSMOCG00000005900) Or8c17 (ENSMOCG00000005410) ENSMOCG00000006586 ENSMOCG00000017544 ENSMOCG00000016985 ##22 Or8b39 (ENSMOCG00000012341) Or8b101 (ENSMOCG00000010544) ENSMOCG00000001106 Or8b8 (ENSMOCG00000006874) Or8b12c (ENSMOCG00000011599) ENSMOCG00000006202 ENSMOCG00000021221 ENSMOCG00000008143 Panx3 (ENSMOCG00000004239) Tbrg1 (ENSMOCG00000018217) Siae (ENSMOCG00000020482) Spa17 (ENSMOCG00000014358) Nrgn (ENSMOCG00000013776) Vsig2 (ENSMOCG00000013088) Esam (ENSMOCG00000011840) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 18 Mvd (ENSPEMG00000018457) #7 Snai3 (ENSPEMG00000029324) #8 Rnf166 (ENSPEMG00000018748) #9 Ctu2 (ENSPEMG00000016552) #10 Cdt1 (ENSPEMG00000010002) #12 Aprt (ENSPEMG00000007366) #13 Galns (ENSPEMG00000018911) #14 Trappc2l (ENSPEMG00000026189) #15 Pabpn1l (ENSPEMG00000016624) #16 Cbfa2t3 (ENSPEMG00000008145) #17 Acsf3 (ENSPEMG00000014608) #18 Cdh15 (ENSPEMG00000018346) #19 Ankrd11 (ENSPEMG00000015479) #20 ENSPEMG00000027773 Spg7 (ENSPEMG00000016642) #21 Rpl13 (ENSPEMG00000010342) ##22 Cpne7 (ENSPEMG00000013758) #23 Sult5a1 (ENSPEMG00000007963) #24 Dpep1 (ENSPEMG00000012103) #25 Chmp1a (ENSPEMG00000013566) #26 ENSPEMG00000018787 #27 Cdk10 (ENSPEMG00000012841) #28 Spata2l (ENSPEMG00000027370) #29 ENSPEMG00000025161 #30 Fanca (ENSPEMG00000017722) #32 Spire2 (ENSPEMG00000000826) #33 Tcf25 (ENSPEMG00000016492) #34 Mc1r (ENSPEMG00000006381) #35 Tubb3 (ENSPEMG00000019163) #36 Def8 (ENSPEMG00000009051) #37 Afg3l1 (ENSPEMG00000008295) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.b.b ##22 Rat MODERN SPECIES 13 Ift52 (ENSRNOG00000007692) Sgk2 (ENSRNOG00000033573) L3mbtl1 (ENSRNOG00000007044) Srsf6 (ENSRNOG00000006380) Ptprt (ENSRNOG00000032656) Chd6 (ENSRNOG00000016744) Emilin3 (ENSRNOG00000016734) Lpin3 (ENSRNOG00000016636) Zhx3 (ENSRNOG00000027988) Plcg1 (ENSRNOG00000051490) Top1 (ENSRNOG00000047611) ENSRNOG00000066616 Mafb (ENSRNOG00000016037) Dhx35 (ENSRNOG00000015928) Fam83d (ENSRNOG00000015794) LOC120101775 (ENSRNOG00000029227) ##22 Ppp1r16b (ENSRNOG00000015614) Actr5 (ENSRNOG00000023989) Slc32a1 (ENSRNOG00000015393) Arhgap40 (ENSRNOG00000015359) Ralgapb (ENSRNOG00000014836) ENSRNOG00000065727 Lbp (ENSRNOG00000014532) Bpi (ENSRNOG00000034195) Kiaa1755 (ENSRNOG00000014424) Tgm2 (ENSRNOG00000012956) Rprd1b (ENSRNOG00000012923) Tti1 (ENSRNOG00000012880) Vstm2l (ENSRNOG00000034031) Mpc1l-ps3 (ENSRNOG00000049208) Ctnnbl1 (ENSRNOG00000012021) Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.b.b ##22 Shrew mouse MODERN SPECIES 12 Abce1 (MGP_PahariEiJ_G0022857) MGP_PahariEiJ_G0022856 Smad1 (MGP_PahariEiJ_G0022855) Mmaa (MGP_PahariEiJ_G0022854) 1700011L22Rik (MGP_PahariEiJ_G0022853) MGP_PahariEiJ_G0022852 Lsm6 (MGP_PahariEiJ_G0022851) Slc10a7 (MGP_PahariEiJ_G0022850) MGP_PahariEiJ_G0022849 Pou4f2 (MGP_PahariEiJ_G0022848) Ttc29 (MGP_PahariEiJ_G0022847) Ednra (MGP_PahariEiJ_G0022846) MGP_PahariEiJ_G0022845 Arhgap10 (MGP_PahariEiJ_G0022844) Nr3c2 (MGP_PahariEiJ_G0022843) MGP_PahariEiJ_G0022842 ##22 MGP_PahariEiJ_G0022841 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.b.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.b.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.b.b ##22 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 2931 ENSMSIG00000008113 Ska3 (ENSMSIG00000008137) Mrpl57 (ENSMSIG00000008177) ENSMSIG00000008195 Micu2 (ENSMSIG00000008286) ENSMSIG00000008391 ENSMSIG00000008451 ##22 ENSMSIG00000008463 ENSMSIG00000008485 Rcbtb1 (ENSMSIG00000008493) Steppe mouse MODERN SPECIES 3305 Ddx52 (ENSMSIG00000012043) Synrg (ENSMSIG00000011874) Dusp14 (ENSMSIG00000011867) Tada2a (ENSMSIG00000011818) Gm11437 (ENSMSIG00000011800) Acaca (ENSMSIG00000011559) Aatf (ENSMSIG00000011523) Lhx1 (ENSMSIG00000011492) Mrm1 (ENSMSIG00000011460) Dhrs11 (ENSMSIG00000011441) Ggnbp2 (ENSMSIG00000011309) Pigw (ENSMSIG00000011294) Myo19 (ENSMSIG00000011255) Znhit3 (ENSMSIG00000011245) Car4 (ENSMSIG00000011228) ENSMSIG00000011217 ##22 Usp32 (ENSMSIG00000011103) Chct1 (ENSMSIG00000011050) ENSMSIG00000011045 Appbp2 (ENSMSIG00000010989) ENSMSIG00000010975 Ppm1d (ENSMSIG00000010931) Bcas3 (ENSMSIG00000010472) Tbx2 (ENSMSIG00000010345) Tbx4 (ENSMSIG00000010313) ENSMSIG00000010306 ENSMSIG00000010296 Ints2 (ENSMSIG00000010230) Med13 (ENSMSIG00000010075) Rnft1 (ENSMSIG00000010045) Rps6kb1 (ENSMSIG00000009982) spretus MODERN SPECIES 16 Osbpl5 (MGP_SPRETEiJ_G0031854) Tnfrsf26 (MGP_SPRETEiJ_G0031853) Cars (MGP_SPRETEiJ_G0031852) Nap1l4 (MGP_SPRETEiJ_G0031851) Phlda2 (MGP_SPRETEiJ_G0031850) Slc22a18 (MGP_SPRETEiJ_G0031849) Cdkn1c (MGP_SPRETEiJ_G0031848) Kcnq1 (MGP_SPRETEiJ_G0031847) Tssc4 (MGP_SPRETEiJ_G0031846) Trpm5 (MGP_SPRETEiJ_G0031845) Cd81 (MGP_SPRETEiJ_G0031844) Tspan32 (MGP_SPRETEiJ_G0031843) Ascl2 (MGP_SPRETEiJ_G0031842) Th (MGP_SPRETEiJ_G0031841) MGP_SPRETEiJ_G0031840 MGP_SPRETEiJ_G0031839 ##22 Ins2 (MGP_SPRETEiJ_G0031838) Igf2 (MGP_SPRETEiJ_G0031837) Mrpl23 (MGP_SPRETEiJ_G0031836) Tnnt3 (MGP_SPRETEiJ_G0031835) MGP_SPRETEiJ_G0031834 Lsp1 (MGP_SPRETEiJ_G0031833) Tnni2 (MGP_SPRETEiJ_G0031832) Syt8 (MGP_SPRETEiJ_G0031831) Ctsd (MGP_SPRETEiJ_G0031830) Ifitm10 (MGP_SPRETEiJ_G0031829) MGP_SPRETEiJ_G0031828 MGP_SPRETEiJ_G0031827 MGP_SPRETEiJ_G0031826 MGP_SPRETEiJ_G0031825 MGP_SPRETEiJ_G0031824 Mouse MODERN SPECIES 17 Mvd (ENSMUSG00000006517) #7 Snai3 (ENSMUSG00000006587) #8 Rnf166 (ENSMUSG00000014470) #9 Ctu2 (ENSMUSG00000049482) #10 Piezo1 (ENSMUSG00000014444) #11 Cdt1 (ENSMUSG00000006585) #12 Aprt (ENSMUSG00000006589) #13 Galns (ENSMUSG00000015027) #14 Trappc2l (ENSMUSG00000015013) #15 Pabpn1l (ENSMUSG00000069867) #16 Cbfa2t3 (ENSMUSG00000006362) #17 Acsf3 (ENSMUSG00000015016) #18 Cdh15 (ENSMUSG00000031962) #19 Ankrd11 (ENSMUSG00000035569) #20 Spg7 (ENSMUSG00000000738) #21 Rpl13 (ENSMUSG00000000740) ##22 Cpne7 (ENSMUSG00000034796) #23 Sult5a1 (ENSMUSG00000000739) #24 Dpep1 (ENSMUSG00000019278) #25 Chmp1a (ENSMUSG00000000743) #26 Spata33 (ENSMUSG00000048478) Cdk10 (ENSMUSG00000033862) #28 Spata2l (ENSMUSG00000033594) #29 Vps9d1 (ENSMUSG00000001062) #30 Zfp276 (ENSMUSG00000001065) #31 Fanca (ENSMUSG00000032815) #32 Spire2 (ENSMUSG00000010154) #33 Tcf25 (ENSMUSG00000001472) #34 Mc1r (ENSMUSG00000074037) #35 Tubb3 (ENSMUSG00000062380) #36 Def8 (ENSMUSG00000001482) #37 Muroidea DUPLICATION Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.a.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.a.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.a.a ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.a.a ##22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 188 ENSCGRG00001008839 Il36a (ENSCGRG00001005772) ENSCGRG00001015320 Tbpl2 (ENSCGRG00001015310) ENSCGRG00001009248 ENSCGRG00001001542 ENSCGRG00001024843 ENSCGRG00001008614 Spopl (ENSCGRG00001010346) Nxph2 (ENSCGRG00001024840) ENSCGRG00001024491 ENSCGRG00001009004 ENSCGRG00001012428 Kynu (ENSCGRG00001005556) Arhgap15 (ENSCGRG00001011371) ENSCGRG00001008381 ##22 Gtdc1 (ENSCGRG00001014426) ENSCGRG00001006690 Zeb2 (ENSCGRG00001003812) ENSCGRG00001000890 Acvr2a (ENSCGRG00001024754) Orc4 (ENSCGRG00001001352) Mbd5 (ENSCGRG00001001266) Epc2 (ENSCGRG00001024568) Kif5c (ENSCGRG00001021373) Lypd6b (ENSCGRG00001008503) Lypd6 (ENSCGRG00001009801) Mmadhc (ENSCGRG00001008423) Rnd3 (ENSCGRG00001018416) Tas2r134 (ENSCGRG00001008402) ENSCGRG00001014515 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1657 Cdc25a (ENSNGAG00000009307) Camp (ENSNGAG00000005185) Nme6 (ENSNGAG00000003988) Spink8 (ENSNGAG00000000582) ENSNGAG00000019896 Plxnb1 (ENSNGAG00000019575) Ccdc51 (ENSNGAG00000018471) Tma7 (ENSNGAG00000018078) ENSNGAG00000017174 Trex1 (ENSNGAG00000013292) ENSNGAG00000012072 ##22 Shisa5 (ENSNGAG00000000521) Pfkfb4 (ENSNGAG00000018540) ENSNGAG00000001944 Uqcrc1 (ENSNGAG00000018184) Tmem89 (ENSNGAG00000017089) ENSNGAG00000015652 ENSNGAG00000017439 Celsr3 (ENSNGAG00000021190) ENSNGAG00000018381 Ip6k2 (ENSNGAG00000017095) Prkar2a (ENSNGAG00000015534) Slc25a20 (ENSNGAG00000014160) Arih2 (ENSNGAG00000013630) P4htm (ENSNGAG00000006218) Wdr6 (ENSNGAG00000000962) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.a.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.a.b ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.a.b ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.a.b ##22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 111 Atp6v1g1 (ENSCGRG00001012480) Tmem268 (ENSCGRG00001006011) Tex48 (ENSCGRG00001003062) Tnfsf15 (ENSCGRG00001002029) Tnfsf8 (ENSCGRG00001001108) Tnc (ENSCGRG00001018791) ENSCGRG00001006736 Pappa (ENSCGRG00001024813) Trim32 (ENSCGRG00001006161) Astn2 (ENSCGRG00001021662) TLR4 (ENSCGRG00001015165) ENSCGRG00001015949 Brinp1 (ENSCGRG00001000741) Cdk5rap2 (ENSCGRG00001010238) Megf9 (ENSCGRG00001023864) ENSCGRG00001023328 ##22 Tle1 (ENSCGRG00001010603) ENSCGRG00001003137 ENSCGRG00001001298 Rasef (ENSCGRG00001001324) 2310002L09Rik (ENSCGRG00001024634) ENSCGRG00001022505 Frmd3 (ENSCGRG00001020520) Kdm4c (ENSCGRG00001014973) ENSCGRG00001003314 Dmac1 (ENSCGRG00001012676) Ptprd (ENSCGRG00001001921) Tyrp1 (ENSCGRG00001020616) Lurap1l (ENSCGRG00001018238) ENSCGRG00001017051 Mpdz (ENSCGRG00001023758) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.pb ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.pb ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.pb ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.pb ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.pb ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.pb ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.pb ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3273 Gm10229 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Piezo1 (ENSRNOG00000056786) #11 Cdt1 (ENSRNOG00000013970) #12 Aprt (ENSRNOG00000014405) #13 Galns (ENSRNOG00000014461) #14 Trappc2l (ENSRNOG00000014581) #15 Pabpn1l (ENSRNOG00000029558) #16 Cbfa2t3 (ENSRNOG00000014723) #17 Acsf3 (ENSRNOG00000015077) #18 Cdh15 (ENSRNOG00000027954) #19 Ankrd11 (ENSRNOG00000027906) #20 Spg7 (ENSRNOG00000015150) #21 Rpl13 (ENSRNOG00000015335) ##22 Cpne7 (ENSRNOG00000015397) #23 Sult5a1 (ENSRNOG00000015695) #24 Dpep1 (ENSRNOG00000015880) #25 Chmp1a (ENSRNOG00000016001) #26 Spata33 (ENSRNOG00000038239) #27 Cdk10 (ENSRNOG00000016088) #28 Spata2L (ENSRNOG00000016167) #29 Vps9d1 (ENSRNOG00000028904) #30 Zfp276 (ENSRNOG00000016631) #31 Fanca (ENSRNOG00000016706) #32 Spire2 (ENSRNOG00000016920) #33 ENSRNOG00000062740 Tcf25 (ENSRNOG00000017023) #34 Mc1r (ENSRNOG00000038193) #35 Tubb3 (ENSRNOG00000017209) #36 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.pb ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.pb ##22 Golden Hamster MODERN SPECIES 700 Elavl3 (ENSMAUG00000016478) ENSMAUG00000008578 Cnn1 (ENSMAUG00000007541) Elof1 (ENSMAUG00000001142) Acp5 (ENSMAUG00000012370) Pigyl (ENSMAUG00000001605) ENSMAUG00000008928 Zfp599 (ENSMAUG00000000404) Zfp810 (ENSMAUG00000011262) Anln (ENSMAUG00000010570) ENSMAUG00000006644 9530077C05Rik (ENSMAUG00000018284) Rp9 (ENSMAUG00000006605) Bbs9 (ENSMAUG00000002422) Bmper (ENSMAUG00000017842) ENSMAUG00000016802 ##22 Npsr1 (ENSMAUG00000019292) Dpy19l1 (ENSMAUG00000019389) ENSMAUG00000015304 Dpy19l2 (ENSMAUG00000010798) Tbx20 (ENSMAUG00000007495) Herpud2 (ENSMAUG00000014475) ENSMAUG00000019492 Eepd1 (ENSMAUG00000003184) B3gat1 (ENSMAUG00000009593) Glb1l2 (ENSMAUG00000009296) ENSMAUG00000009095 Acad8 (ENSMAUG00000001610) Thyn1 (ENSMAUG00000000216) Vps26b (ENSMAUG00000010974) Ncapd3 (ENSMAUG00000014768) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.pb ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 15 Sphk1 (ENSMOCG00000014553) Ube2o (ENSMOCG00000014113) Aanat (ENSMOCG00000017216) Rhbdf2 (ENSMOCG00000012993) Cygb 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(ENSJJAG00000023219) #12 Aprt (ENSJJAG00000018585) #13 Galns (ENSJJAG00000011252) #14 Trappc2l (ENSJJAG00000017487) #15 ENSJJAG00000017894 Pabpn1l (ENSJJAG00000006433) #16 Cbfa2t3 (ENSJJAG00000023795) #17 Acsf3 (ENSJJAG00000016704) #18 Cdh15 (ENSJJAG00000005187) #19 ENSJJAG00000015097 #20 Spg7 (ENSJJAG00000008061) #21 Rpl13 (ENSJJAG00000014012) #22 Cpne7 (ENSJJAG00000000879) #23 Kangaroo rat MODERN SPECIES 533 Cbfa2t3 (ENSDORG00000015966) #17 Acsf3 (ENSDORG00000012903) #18 Cdh15 (ENSDORG00000025114) #19 ENSDORG00000023552 #20 Spg7 (ENSDORG00000005698) #21 Rpl13 (ENSDORG00000028330) #22 Cpne7 (ENSDORG00000005124) #23 Sult5a1 (ENSDORG00000025066) #24 Dpep1 (ENSDORG00000008048) #25 Chmp1a (ENSDORG00000023731) #26 ENSDORG00000027254 #27 Cdk10 (ENSDORG00000015084) #28 Vps9d1 (ENSDORG00000014825) #30 ENSDORG00000012257 #31 Fanca (ENSDORG00000012259) #32 ENSDORG00000029115 Spire2 (ENSDORG00000007062) #33 Tcf25 (ENSDORG00000015303) #34 Tubb3 (ENSDORG00000015304) #36 Def8 (ENSDORG00000009220) #37 Afg3l1 (ENSDORG00000028343) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505.d #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00980000200525 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000163403 #24 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00960000192231 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00940000154511.a #8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505.d #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000163403 #24 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00960000192231 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 26 SNAI3 (ENSHGLG00000018681) #8 RNF166 (ENSHGLG00000014545) #9 CTU2 (ENSHGLG00000015988) #10 ENSHGLG00000036225 #11 ENSHGLG00000036618 #13 GALNS (ENSHGLG00000011517) #14 TRAPPC2L (ENSHGLG00000010329) #15 PABPN1L (ENSHGLG00000043697) #16 ENSHGLG00000032090 #17 ENSHGLG00000038565 #17 ENSHGLG00000044301 ENSHGLG00000037687 #18 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ANCESTRAL SPECIES 82 ENSGT00940000154511.a #8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505.d #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000163403 #24 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 ENSGT00940000160625 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 248 SNAI3 (ENSCLAG00000000729) #8 RNF166 (ENSCLAG00000000806) #9 ENSCLAG00000000894 #10 PIEZO1 (ENSCLAG00000001688) #11 CDT1 (ENSCLAG00000002254) #12 APRT (ENSCLAG00000002341) #13 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